607 445 298 31 77 chr5 3006179 3006401 -149530858 + RMER10A LTR ERVL 1 212 -230 7 607 391 235 131 36 chr5 3008581 3008718 -149528541 - RMER13A LTR ERVK 0 860 711 1 607 2797 180 41 23 chr5 3008718 3009235 -149528024 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 527 0 1 607 406 200 182 59 chr5 3009887 3010057 -149527202 + MYSERV6-int LTR ERVK 6465 6655 -2304 1 608 1796 221 34 84 chr5 3020747 3021376 -149515883 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 52 3 608 8630 250 26 24 chr5 3021397 3024741 -149512518 - MMERGLN-int LTR ERV1 0 7778 4266 3 608 17958 232 18 12 chr5 3024738 3028683 -149508576 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3510 4046 27 3 608 683 215 30 15 chr5 3035584 3035716 -149501543 + ETnERV2-int LTR ERVK 7059 7192 -214 4 608 2193 124 79 38 chr5 3036960 3037353 -149499906 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 608 3233 26 0 0 chr5 3038819 3039165 -149498094 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 608 2291 176 121 79 chr5 3045337 3045992 -149491267 - RMER6C LTR ERVK -8 682 1 5 608 470 264 11 84 chr5 3048163 3048341 -149488918 + RLTR19-int LTR ERVK 3548 3712 -2425 5 608 2651 143 77 38 chr5 3048350 3048872 -149488387 - MT2B2 LTR ERVL -42 542 1 5 608 666 222 11 11 chr5 3049148 3049326 -149487933 + RMER3D-int LTR ERVK 1098 1275 -1567 5 608 1547 204 84 42 chr5 3055801 3056160 -149481099 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 608 4460 110 149 28 chr5 3074368 3075161 -149462098 - RMER17D LTR ERVK 0 889 1 8 608 3285 198 14 121 chr5 3077453 3078421 -149458838 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 182 9 608 228 242 32 0 chr5 3078406 3078468 -149458791 - ORR1A4 LTR MaLR -265 64 1 9 608 1815 158 3 7 chr5 3078473 3078778 -149458481 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 24 9 608 3661 196 26 59 chr5 3083504 3084388 -149452871 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 1 608 921 224 153 101 chr5 3087549 3087966 -149449293 - RMER6B LTR ERVK -17 444 6 1 608 1278 222 79 21 chr5 3088264 3088610 -149448649 - RLTR19 LTR ERVK -7 489 108 1 608 1278 203 45 10 chr5 3088669 3088761 -149448498 - RLTR19 LTR ERVK -392 107 8 1 608 1345 224 101 22 chr5 3089811 3090099 -149447160 + RLTR19 LTR ERVK 1 319 -180 1 608 1345 224 101 22 chr5 3090128 3090204 -149447055 + RLTR19 LTR ERVK 320 393 -106 1 608 751 227 48 16 chr5 3090422 3090610 -149446649 - RLTR19 LTR ERVK -304 195 2 1 608 1825 160 22 16 chr5 3098683 3099001 -149438258 + RLTR46 LTR ERVK 1 320 0 1 608 271 202 22 56 chr5 3099001 3099090 -149438169 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 86 -7594 1 608 410 189 178 26 chr5 3099118 3099270 -149437989 + IAPEY3-int LTR ERVK 574 748 -6932 1 608 638 154 91 0 chr5 3099275 3099385 -149437874 + IAPEY3-int LTR ERVK 940 1059 -6621 1 608 688 144 9 9 chr5 3099742 3099854 -149437405 + MMVL30-int LTR ERV1 1252 1363 -2335 1 608 640 162 185 35 chr5 3100226 3100399 -149436860 + MMERVK10C-int LTR ERVK 439 637 -4769 1 608 333 140 18 0 chr5 3100510 3100567 -149436692 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1089 1146 -4260 1 608 7825 88 75 19 chr5 3100569 3102495 -149434764 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1885 3919 -3662 1 608 23347 105 7 3 chr5 3102494 3105851 -149431408 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4125 7513 0 1 608 1794 152 35 16 chr5 3105851 3106165 -149431094 + RLTR46 LTR ERVK 1 320 0 1 608 2797 184 7 9 chr5 3112885 3113438 -149423821 - MT2B LTR ERVL -49 552 1 1 608 918 206 99 16 chr5 3113438 3113670 -149423589 - ORR1A4-int LTR MaLR -394 1569 1318 1 608 3809 31 0 0 chr5 3113670 3114152 -149423107 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 1 608 4860 199 29 86 chr5 3114152 3115546 -149421713 - ORR1A4-int LTR MaLR -641 1322 10 1 608 952 212 118 70 chr5 3115556 3115870 -149421389 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 608 955 151 70 0 chr5 3115875 3116061 -149421198 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 129 1 608 7820 182 75 12 chr5 3116077 3117763 -149419496 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1792 1 1 608 1961 136 9 0 chr5 3117767 3118083 -149419176 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 608 1760 157 0 0 chr5 3118173 3118459 -149418800 - MYSERV6-int LTR ERVK -7667 1292 1007 1 608 4025 222 51 31 chr5 3118593 3119579 -149417680 - MYSERV6-int LTR ERVK -7954 1005 1 1 608 546 202 8 23 chr5 3119579 3119711 -149417548 - RMER6B LTR ERVK 0 461 332 1 608 633 165 55 0 chr5 3120317 3120444 -149416815 - RMER6B LTR ERVK -326 135 2 1 608 2095 198 119 0 chr5 3120932 3121377 -149415882 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 1 1 608 2050 212 28 30 chr5 3122438 3122938 -149414321 + RLTR19 LTR ERVK 1 715 0 1 608 2778 28 0 27 chr5 3128860 3129195 -149408064 - IAPLTR3 LTR ERVK 0 326 1 1 608 2387 66 119 11 chr5 3134398 3134750 -149402509 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 608 428 290 132 20 chr5 3137450 3137478 -149399781 + LTR16A LTR ERVL 228 255 -196 1 608 2370 133 59 38 chr5 3137478 3137899 -149399360 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 1 608 428 290 132 20 chr5 3137899 3138067 -149399192 + LTR16A LTR ERVL 256 446 -5 1 608 332 205 66 74 chr5 3138124 3138245 -149399014 - MTEa LTR MaLR 0 379 260 1 608 453 256 138 32 chr5 3138247 3138587 -149398672 + RMER10A LTR ERVL 3 426 -16 1 608 516 199 60 66 chr5 3138688 3138839 -149398420 - MTEa LTR MaLR -229 150 1 1 608 779 303 64 39 chr5 3141603 3142043 -149395216 + RLTR17 LTR ERVK 116 566 -126 1 608 291 206 32 0 chr5 3142112 3142175 -149395084 + RLTR31_Mur LTR ERVK 489 553 0 1 608 783 255 49 71 chr5 3143692 3144096 -149393163 + RLTR11B LTR ERVK 1 413 -28 1 608 1237 184 25 36 chr5 3145058 3145335 -149391924 + RLTR46 LTR ERVK 42 315 -5 1 609 316 343 22 0 chr5 3154037 3154171 -149383088 + RMER15 LTR ERVL 422 558 -17 1 609 434 252 50 52 chr5 3159849 3160095 -149377164 + LTRIS_Mm LTR ERV1 276 628 0 1 609 1460 132 97 39 chr5 3160095 3160726 -149376533 - RMER6C LTR ERVK -11 709 122 1 609 3090 56 26 0 chr5 3160730 3161120 -149376139 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 609 5166 69 72 86 chr5 3161120 3162042 -149375217 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 190 1 609 1753 115 28 28 chr5 3162042 3162364 -149374895 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 609 1489 36 0 0 chr5 3162364 3162559 -149374700 - MTB-int LTR MaLR -903 195 1 1 609 1659 35 70 0 chr5 3162585 3162812 -149374447 - ORR1A1 LTR MaLR -103 243 1 2 609 568 132 0 11 chr5 3162829 3162921 -149374338 - RMER6C LTR ERVK -599 91 1 1 609 11510 152 51 57 chr5 3166263 3169322 -149367937 + ETnERV3-int LTR ERVK 2235 6071 -1173 2 609 1685 145 0 4 chr5 3169336 3169593 -149367666 + ETnERV3-int LTR ERVK 5529 5784 -24 2 609 3205 127 31 24 chr5 3169603 3170142 -149367117 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 543 -359 2 609 3762 95 35 9 chr5 3170115 3170680 -149366579 + RLTR13D1 LTR ERVK 227 806 0 2 609 3128 25 42 6 chr5 3180450 3180804 -149356455 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 609 6762 54 89 76 chr5 3180804 3181831 -149355428 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1047 -5434 2 609 31777 16 1 2 chr5 3181820 3185324 -149351935 + IAPEz-int LTR ERVK 2982 6481 0 2 609 3128 25 42 6 chr5 3185324 3185678 -149351581 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 609 2133 137 98 36 chr5 3191184 3191631 -149345628 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 609 291 253 46 46 chr5 3218626 3218713 -149318546 - MLT1A0 LTR MaLR -114 251 165 2 609 1367 250 119 14 chr5 3220380 3220749 -149316510 + MTD LTR MaLR 12 419 0 2 609 2620 183 65 97 chr5 3226255 3227058 -149310201 + RMER19B LTR ERVK 1 900 -2 2 609 2547 159 116 9 chr5 3227272 3227728 -149309531 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 2 609 477 330 177 35 chr5 3230059 3230376 -149306883 + MLT1A0 LTR MaLR 1 362 -3 2 609 386 213 109 47 chr5 3233144 3233272 -149303987 + MLT1A1 LTR MaLR 271 406 -2 2 609 348 245 58 58 chr5 3234699 3234803 -149302456 + MLT1B LTR MaLR 16 119 -271 3 609 473 188 0 0 chr5 3234955 3235040 -149302219 - MTE2a LTR MaLR -294 85 1 3 609 662 253 45 15 chr5 3238017 3238218 -149299041 - MLT1B LTR MaLR -2 388 182 3 609 379 289 43 65 chr5 3238297 3238482 -149298777 - MLT1B LTR MaLR -208 182 2 3 609 874 276 56 61 chr5 3238482 3238841 -149298418 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 3 609 937 281 27 91 chr5 3241672 3241903 -149295356 + RLTR11B LTR ERVK 1 229 -224 3 609 937 281 27 91 chr5 3242067 3242286 -149294973 + RLTR11B LTR ERVK 230 422 -31 3 609 497 266 45 40 chr5 3242332 3242532 -149294727 - RLTR11A2 LTR ERVK -326 201 1 3 609 2858 156 175 36 chr5 3245353 3245959 -149291300 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 3 609 264 253 164 78 chr5 3248234 3248397 -149288862 - MTEb LTR MaLR -75 304 118 3 609 1553 287 90 11 chr5 3248394 3248859 -149288400 - MTE-int LTR MaLR -294 1286 785 3 609 279 353 8 72 chr5 3249708 3249833 -149287426 - MLT1A LTR MaLR -177 197 81 3 609 3020 9 3 0 chr5 3251614 3251935 -149285324 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 609 42676 23 1 6 chr5 3251935 3256804 -149280455 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 1 3 609 2984 12 3 0 chr5 3256805 3257125 -149280134 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -1 321 1 3 609 2528 176 81 21 chr5 3257259 3257686 -149279573 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 464 -96 3 609 2528 176 81 21 chr5 3257733 3257833 -149279426 + RLTR20B2 LTR ERVK 465 560 0 3 609 1786 169 134 110 chr5 3262167 3262613 -149274646 + MT2A LTR ERVL 4 460 -73 3 609 2034 171 47 32 chr5 3263546 3263931 -149273328 - MTD LTR MaLR -6 413 19 3 609 2034 171 47 32 chr5 3264481 3264500 -149272759 - MTD LTR MaLR -401 18 3 3 609 606 0 0 0 chr5 3267929 3267998 -149269261 - MTB LTR MaLR 0 400 332 3 609 441 366 38 36 chr5 3272472 3272851 -149264408 - LTR16D1 LTR ERVL -9 642 192 3 609 2630 120 133 25 chr5 3274428 3274863 -149262396 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 609 7788 160 13 17 chr5 3274863 3276376 -149260883 - RLTR45-int LTR ERVK -413 7804 6331 3 609 2644 60 18 6 chr5 3276359 3276692 -149260567 - RLTR45-int LTR ERVK -5596 1648 1312 3 610 738 124 0 0 chr5 3277463 3277584 -149259675 - RLTR45-int LTR ERVK -6211 1033 913 3 610 1811 64 0 0 chr5 3277708 3277927 -149259332 - RLTR45-int LTR ERVK -6334 910 692 3 610 4942 57 68 5 chr5 3278283 3278934 -149258325 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 1 3 610 2670 125 35 85 chr5 3278934 3279441 -149257818 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 610 2267 142 32 15 chr5 3281387 3281793 -149255466 - MTC LTR MaLR -8 413 1 3 610 1363 211 80 12 chr5 3284332 3284668 -149252591 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 4 3 610 1724 165 2 80 chr5 3291509 3291945 -149245314 + RMER17C LTR ERVK 1 402 -8 3 610 1357 168 61 157 chr5 3292711 3293120 -149244139 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 3 610 1875 148 109 27 chr5 3293779 3294190 -149243069 + BGLII_A LTR ERVK 1 445 0 4 610 1450 317 41 16 chr5 3296607 3297095 -149240164 - MLT2B2 LTR ERVL -8 507 8 4 610 1734 157 122 15 chr5 3298437 3298780 -149238479 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 4 610 544 288 45 54 chr5 3299063 3299305 -149237954 - RMER15 LTR ERVL -27 548 309 4 610 571 281 99 87 chr5 3303261 3303616 -149233643 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 610 1533 218 55 20 chr5 3304163 3304566 -149232693 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 4 610 3763 38 63 0 chr5 3306753 3307200 -149230059 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 610 1621 151 34 37 chr5 3307527 3307936 -149229323 + RMER17C LTR ERVK 14 410 0 4 610 2125 116 25 0 chr5 3310053 3310371 -149226888 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 1 4 610 677 279 81 45 chr5 3320954 3321317 -149215942 + MTEb LTR MaLR 1 370 0 4 610 2809 163 51 11 chr5 3323926 3324479 -149212780 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 4 610 657 254 90 14 chr5 3331959 3332308 -149204951 + MTD LTR MaLR 18 404 -15 4 610 2219 129 67 8 chr5 3334052 3334442 -149202817 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 610 1876 169 104 20 chr5 3346819 3347261 -149189998 - RMER15 LTR ERVL -96 479 1 4 610 1248 258 13 47 chr5 3359893 3360279 -149176980 - MTE2a LTR MaLR -2 377 5 4 610 1268 199 28 31 chr5 3368110 3368396 -149168863 + MTD LTR MaLR 12 296 -123 5 610 736 255 83 53 chr5 3370106 3370544 -149166715 + RLTR11B LTR ERVK 2 462 -65 5 610 526 297 92 111 chr5 3392304 3392664 -149144595 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 5 610 373 216 0 98 chr5 3393154 3393277 -149143982 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 5 611 469 314 35 34 chr5 3424530 3424969 -149112290 + RLTR15 LTR ERVK 10 317 -42 5 611 769 232 145 67 chr5 3426832 3427114 -149110145 - MTEa-int LTR MaLR -34 1546 1243 5 611 1526 315 116 78 chr5 3427117 3428133 -149109126 - MTEa-int LTR MaLR -524 1056 2 5 611 383 269 68 25 chr5 3428133 3428296 -149108963 - MTEa LTR MaLR -16 403 243 5 611 237 283 117 97 chr5 3460225 3460534 -149076725 + ORR1D2 LTR MaLR 44 358 -12 6 611 2137 198 17 2 chr5 3464064 3464475 -149072784 - MTC LTR MaLR -4 417 1 6 611 318 257 159 56 chr5 3471854 3472068 -149065191 - MLT1G3 LTR MaLR -216 379 144 6 611 2899 46 0 0 chr5 3484100 3484446 -149052813 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 611 1704 246 87 37 chr5 3485063 3485224 -149052035 - RMER19B LTR ERVK 0 902 740 6 611 1704 246 87 37 chr5 3485371 3485775 -149051484 - RMER19B LTR ERVK -163 739 309 6 611 318 253 75 39 chr5 3488283 3488526 -149048733 + MLT1E2 LTR MaLR 310 619 -8 6 611 261 229 14 14 chr5 3493796 3493867 -149043392 + ORR1E LTR MaLR 23 93 -266 6 611 532 276 144 26 chr5 3506397 3506668 -149030591 - MLT1A0 LTR MaLR -50 315 13 1 612 1955 153 89 13 chr5 3539543 3539926 -148997333 - MTC LTR MaLR 0 421 10 6 612 1769 175 89 3 chr5 3541838 3542176 -148995083 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 612 3543 126 101 20 chr5 3542349 3543040 -148994219 - RMER6A LTR ERVK -9 747 1 6 612 588 295 121 36 chr5 3557025 3557331 -148979928 - MER68 LTR ERVL -157 406 75 9 612 327 217 244 24 chr5 3572716 3572839 -148964420 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 418 1 612 1339 155 191 7 chr5 3574501 3574800 -148962459 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 612 650 305 108 4 chr5 3577408 3577668 -148959591 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 232 1 612 1666 87 114 14 chr5 3579949 3580239 -148957020 - ORR1A4 LTR MaLR -10 319 1 1 612 1558 181 104 29 chr5 3582378 3582753 -148954506 + MTC LTR MaLR 1 403 -18 1 612 322 216 13 13 chr5 3585306 3585381 -148951878 + RLTR24 LTR ERV1 1 75 -454 1 612 227 284 51 31 chr5 3585511 3585609 -148951650 + RLTR24 LTR ERV1 350 449 -80 1 612 1597 131 123 7 chr5 3587576 3587861 -148949398 + MTC LTR MaLR 104 421 0 1 612 2151 184 20 2 chr5 3598216 3598624 -148938635 - MTC LTR MaLR 0 421 7 1 612 4685 49 30 2 chr5 3601992 3602563 -148934696 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 1 612 559 317 102 52 chr5 3607187 3607530 -148929729 + MLT1A0 LTR MaLR 6 365 0 2 612 1757 152 132 3 chr5 3615366 3615715 -148921544 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 612 1798 96 85 0 chr5 3615928 3616221 -148921038 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 2 612 281 250 83 74 chr5 3618313 3618334 -148918925 + MT2B2 LTR ERVL 168 287 -297 2 612 1855 154 39 39 chr5 3622937 3623348 -148913911 - MTC LTR MaLR 0 421 11 2 612 1999 126 278 0 chr5 3630974 3631417 -148905842 + RMER4B LTR ERVK 10 575 -10 2 612 245 186 0 0 chr5 3642958 3643001 -148894258 + ORR1C2 LTR MaLR 340 382 -2 2 612 438 274 99 60 chr5 3643272 3643505 -148893754 + MLT1B LTR MaLR 149 390 0 2 612 3504 30 2 0 chr5 3650171 3650566 -148886693 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 612 381 153 82 0 chr5 3652322 3652407 -148884852 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 317 2 612 3019 21 0 0 chr5 3653124 3653461 -148883798 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 612 1401 170 113 32 chr5 3658809 3659155 -148878104 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 612 529 312 124 51 chr5 3660378 3660847 -148876412 - MLT1D LTR MaLR 0 505 3 2 613 2984 78 26 5 chr5 3673213 3673640 -148863619 - RLTR1B LTR ERV1 -76 436 1 3 613 6009 31 16 0 chr5 3673640 3674653 -148862606 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 2154 3 613 884 257 105 25 chr5 3679968 3680011 -148857248 - MT2A LTR ERVL 0 601 545 3 613 1302 188 191 99 chr5 3680040 3680453 -148856806 - MT2A LTR ERVL -82 451 1 3 613 26024 157 73 70 chr5 3680454 3680636 -148856623 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1 5760 5571 3 613 26024 157 73 70 chr5 3680817 3680891 -148856368 - MERVL_2A-int LTR ERVL -191 5570 5557 3 613 26024 157 73 70 chr5 3681040 3684966 -148852293 - MERVL_2A-int LTR ERVL -205 5556 1642 3 613 26024 157 73 70 chr5 3685171 3686269 -148850990 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4120 1641 465 3 613 270 123 211 0 chr5 3686269 3686326 -148850933 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5535 226 158 3 613 333 304 131 21 chr5 3687683 3687965 -148849294 + LTR40c LTR ERVL 151 463 -2 3 613 354 298 56 40 chr5 3705113 3705389 -148831870 + MLT1A LTR MaLR 17 296 -69 3 613 493 247 142 93 chr5 3717783 3717989 -148819270 + RMER15 LTR ERVL 275 496 -79 3 613 493 247 142 93 chr5 3718697 3718736 -148818523 + RMER15 LTR ERVL 497 532 -43 3 613 256 302 0 23 chr5 3719418 3719506 -148817753 - RMER15 LTR ERVL -154 421 336 3 613 1087 249 41 3 chr5 3719578 3719872 -148817387 + ORR1D2 LTR MaLR 66 370 0 3 613 250 253 12 118 chr5 3723086 3723171 -148814088 - ORR1D2 LTR MaLR -252 118 43 3 613 4093 146 55 9 chr5 3727931 3728701 -148808558 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 805 -1043 3 613 370 294 57 74 chr5 3728848 3729024 -148808235 + RMER12 LTR ERVK 1150 1322 0 3 613 2706 167 22 51 chr5 3741449 3742128 -148795131 - BGLII_B LTR ERVK 0 553 1 4 613 346 330 121 70 chr5 3743022 3743221 -148794038 + MLT1J1 LTR MaLR 84 292 -119 4 613 673 101 0 10 chr5 3748902 3749002 -148788257 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 298 4 613 1233 60 6 6 chr5 3748990 3749157 -148788102 - MTA_Mm LTR MaLR -229 167 1 4 613 8380 51 12 30 chr5 3749157 3750275 -148786984 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 613 3364 38 2 0 chr5 3750275 3750670 -148786589 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 613 3255 48 5 0 chr5 3753183 3753577 -148783682 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 613 234 152 21 21 chr5 3753956 3754003 -148783256 + ORR1D1 LTR MaLR 6 52 -322 4 613 233 163 0 93 chr5 3760592 3760646 -148776613 + ORR1E LTR MaLR 1 49 -310 4 613 515 281 18 0 chr5 3766940 3767054 -148770205 + ORR1E LTR MaLR 40 155 -204 4 613 343 213 73 109 chr5 3767210 3767347 -148769912 + ORR1E LTR MaLR 248 379 0 4 613 676 239 179 21 chr5 3768518 3768753 -148768506 + RMER21B LTR ERV1 296 567 -275 4 613 1972 227 75 20 chr5 3773248 3773700 -148763559 + MT2A LTR ERVL 3 458 -75 4 613 1972 227 75 20 chr5 3773780 3773829 -148763430 + MT2A LTR ERVL 459 532 -1 4 613 693 171 161 19 chr5 3783567 3783728 -148753531 + MTC LTR MaLR 23 206 -215 4 613 743 176 34 34 chr5 3783858 3784005 -148753254 + MTC LTR MaLR 204 350 -71 4 613 243 330 75 9 chr5 3785785 3785892 -148751367 + MER68 LTR ERVL 62 175 -388 4 613 846 259 68 0 chr5 3786327 3786547 -148750712 + MER68 LTR ERVL 253 487 -76 4 613 1744 288 110 75 chr5 3786784 3787306 -148749953 + MER68-int LTR ERVL 568 1115 -1875 4 613 1744 288 110 75 chr5 3787452 3787825 -148749434 + MER68-int LTR ERVL 1116 1491 -1499 4 613 3218 48 8 2 chr5 3787825 3788219 -148749040 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 613 1744 288 110 75 chr5 3788219 3788348 -148748911 + MER68-int LTR ERVL 1492 1629 -1361 4 613 2669 34 61 0 chr5 3796763 3797089 -148740170 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 613 13883 48 16 2 chr5 3797089 3798856 -148738403 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 5 613 2476 62 62 6 chr5 3798856 3799180 -148738079 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 5 5 614 281 250 42 83 chr5 3808268 3808364 -148728895 + MT2B LTR ERVL 173 264 -337 5 614 2595 93 45 108 chr5 3820882 3821365 -148715894 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 5 614 2503 14 0 0 chr5 3827588 3827883 -148709376 - ORR1A0 LTR MaLR -51 295 1 5 614 8088 47 26 1 chr5 3827883 3828936 -148708323 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 714 5 614 304 239 0 15 chr5 3832813 3832881 -148704378 - MLT1A0 LTR MaLR -28 337 271 5 614 1237 191 141 66 chr5 3843380 3843728 -148693531 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 614 256 306 86 114 chr5 3846170 3846211 -148691048 + MLT1K LTR MaLR 59 93 -502 5 614 256 306 86 114 chr5 3846432 3846600 -148690659 + MLT1K LTR MaLR 94 262 -333 5 614 255 253 94 10 chr5 3847357 3847453 -148689806 + LTR33 LTR ERVL 403 506 -9 6 614 1107 113 10 51 chr5 3847579 3847774 -148689485 - RLTR13B1 LTR ERVK -569 324 138 6 614 696 192 8 0 chr5 3847912 3848042 -148689217 - RLTR13B1 LTR ERVK -770 132 2 6 614 2127 181 19 19 chr5 3851663 3852080 -148685179 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 6 614 1644 242 54 94 chr5 3852555 3853321 -148683938 + RMER12 LTR ERVK 1 747 -1101 6 614 557 157 139 16 chr5 3853500 3853629 -148683630 + RMER12 LTR ERVK 1072 1216 -106 6 614 604 305 65 27 chr5 3868425 3868688 -148668571 - LTR88b LTR Gypsy? -530 307 35 6 614 691 210 20 15 chr5 3870160 3870380 -148666879 - RLTR17 LTR ERVK -76 616 284 6 614 2923 173 101 134 chr5 3870378 3870978 -148666281 + RLTR25A LTR ERVK 142 725 -303 6 614 2357 173 102 136 chr5 3871544 3871599 -148665660 + RLTR25A LTR ERVK 726 774 -254 6 614 497 182 104 32 chr5 3871577 3871702 -148665557 + RLTR25A LTR ERVK 895 1028 0 6 614 2577 89 39 32 chr5 3872256 3872662 -148664597 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 6 614 352 225 2 31 chr5 3873773 3873861 -148663398 - MER57E1 LTR ERV1 -306 96 16 6 614 1524 144 73 32 chr5 3874926 3875242 -148662017 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 614 3184 39 18 3 chr5 3877985 3878373 -148658886 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 6 614 1846 143 73 0 chr5 3881745 3882060 -148655199 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 6 614 242 241 241 42 chr5 3884880 3885071 -148652188 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 202 6 614 461 202 98 32 chr5 3885092 3885215 -148652044 - RLTR23 LTR ERV1 -292 138 8 6 614 1007 300 94 38 chr5 3885597 3886023 -148651236 + LTR40b LTR ERVL 13 462 0 6 614 3376 157 61 13 chr5 3895276 3895967 -148641292 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 6 614 1387 164 9 0 chr5 3895975 3896194 -148641065 - MTC LTR MaLR 0 421 201 6 614 3756 26 45 2 chr5 3896313 3896731 -148640528 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 614 1450 52 0 0 chr5 3896731 3896903 -148640356 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 172 -7409 6 614 230 321 0 0 chr5 3896903 3896956 -148640303 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 6 614 821 126 0 0 chr5 3896956 3897075 -148640184 + MMERVK10C-int LTR ERVK 225 343 -7238 6 614 786 205 5 10 chr5 3897073 3897265 -148639994 + MMERVK10C-int LTR ERVK 729 919 -6662 6 614 463 139 0 92 chr5 3897265 3897384 -148639875 + MMERVK10C-int LTR ERVK 845 952 -6629 6 614 847 172 285 8 chr5 3897476 3897711 -148639548 + MMERVK10C-int LTR ERVK 312 611 -4795 6 614 293 252 148 40 chr5 3897707 3897856 -148639403 + MMERVK10C-int LTR ERVK 524 688 -5449 6 614 388 138 6 58 chr5 3897840 3897968 -148639291 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1721 1947 -5634 6 614 44492 27 0 10 chr5 3897974 3903055 -148634204 + MMERVK10C-int LTR ERVK 2552 7581 0 6 614 3823 28 28 7 chr5 3903055 3903482 -148633777 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 614 421 193 451 7 chr5 3903956 3904100 -148633159 - MTC LTR MaLR -211 210 3 6 614 1789 149 86 9 chr5 3911857 3912183 -148625076 - RLTR17 LTR ERVK -341 351 1 6 614 3253 40 45 0 chr5 3918468 3918847 -148618412 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 614 284 261 32 32 chr5 3920096 3920191 -148617068 + MLT1A1 LTR MaLR 307 401 -7 7 614 797 279 110 102 chr5 3920572 3920946 -148616313 + MTC LTR MaLR 1 379 0 7 614 911 242 40 141 chr5 3920946 3921389 -148615870 + MTC-int LTR MaLR 1 340 -918 7 614 240 264 36 130 chr5 3921535 3921650 -148615609 + MTC-int LTR MaLR 625 676 -582 7 614 304 231 217 37 chr5 3921743 3921847 -148615412 - RLTR15 LTR ERVK -89 270 146 7 614 304 243 168 42 chr5 3921875 3921995 -148615264 - RLTR15 LTR ERVK -324 204 49 7 614 788 304 47 23 chr5 3922033 3922285 -148614974 + MTC-int LTR MaLR 966 1219 -361 7 614 667 111 0 39 chr5 3929472 3929575 -148607684 + MTC LTR MaLR 323 421 0 7 615 286 160 0 0 chr5 3932161 3932211 -148605048 + MTEa LTR MaLR 326 375 -4 7 615 853 285 84 38 chr5 3936823 3937166 -148600093 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 7 615 824 263 135 45 chr5 3939321 3939655 -148597604 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 3 7 615 425 274 16 49 chr5 3940296 3940308 -148596951 - ORR1E LTR MaLR -219 140 133 7 615 425 274 16 49 chr5 3940437 3940547 -148596712 - ORR1E LTR MaLR -227 132 22 7 615 2841 102 23 5 chr5 3943059 3943455 -148593804 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 7 615 225 319 7 94 chr5 3953147 3953296 -148583963 - MLT1K LTR MaLR -151 444 309 7 615 1423 193 157 25 chr5 3956862 3957218 -148580041 + MTC LTR MaLR 19 421 0 7 615 791 274 168 29 chr5 3963620 3963966 -148573293 - MTD LTR MaLR 0 419 26 7 615 386 299 139 0 chr5 3993444 3993581 -148543678 + MTEa LTR MaLR 12 167 -212 8 615 296 246 49 0 chr5 3993682 3993804 -148543455 + ORR1B1-int LTR MaLR 627 754 -755 8 615 255 238 0 16 chr5 3993855 3993919 -148543340 + MTEa LTR MaLR 306 368 -11 8 615 10971 82 27 1 chr5 4017161 4018585 -148518674 - MERVL-int LTR ERVL -2597 2888 1427 2 615 2521 92 11 3 chr5 4018585 4018934 -148518325 - MT2C_Mm LTR ERVL -123 352 1 2 615 1930 150 45 3 chr5 4021245 4021579 -148515680 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 37 3 615 1695 132 148 43 chr5 4035219 4035591 -148501668 + MTC LTR MaLR 3 413 -8 5 615 1976 111 3 62 chr5 4035604 4035942 -148501317 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 5 615 490 311 47 80 chr5 4044262 4044601 -148492658 - RLTR11B LTR ERVK -125 328 1 7 615 315 332 128 50 chr5 4047088 4047408 -148489851 - MER57D LTR ERV1 -40 371 27 7 615 2197 128 121 34 chr5 4051326 4051763 -148485496 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 7 615 638 229 73 99 chr5 4051975 4052208 -148485051 + RLTR40 LTR ERVK 69 295 -522 7 615 227 129 0 0 chr5 4054722 4054753 -148482506 + RLTR40 LTR ERVK 698 728 -89 8 615 231 296 29 67 chr5 4056285 4056390 -148480869 - ORR1E LTR MaLR -170 189 89 8 615 235 32 0 0 chr5 4056654 4056685 -148480574 - RMER15 LTR ERVL 0 575 545 8 616 575 146 107 0 chr5 4073376 4073479 -148463780 - MurERV4-int LTR ERVK -1364 3896 3783 1 616 14459 156 37 7 chr5 4073688 4076483 -148460776 - MurERV4-int LTR ERVK -83 5177 1833 1 616 1842 162 82 18 chr5 4081718 4082108 -148455151 - MTC LTR MaLR -6 415 1 1 616 1673 172 100 14 chr5 4094030 4094522 -148442737 - RMER4B LTR ERVK -5 580 17 1 616 2260 119 61 23 chr5 4106990 4107384 -148429875 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 1 616 4877 295 42 40 chr5 4108947 4112278 -148424981 - ETnERV-int LTR ERVK -3220 4186 118 1 616 258 184 0 0 chr5 4112616 4112665 -148424594 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 481 1 616 1350 149 116 4 chr5 4112741 4112983 -148424276 - RLTR24 LTR ERV1 -115 414 146 1 616 998 99 20 7 chr5 4113373 4113526 -148423733 - RLTR24 LTR ERV1 -374 155 1 1 616 777 260 159 38 chr5 4115366 4115599 -148421660 + ORR1E LTR MaLR 1 274 -85 1 616 2897 135 123 51 chr5 4115599 4116128 -148421131 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 1 616 777 260 159 38 chr5 4116128 4116214 -148421045 + ORR1E LTR MaLR 275 359 0 1 616 315 303 65 114 chr5 4116559 4116805 -148420454 - ORR1E LTR MaLR -13 346 113 1 616 2587 158 24 22 chr5 4117179 4117685 -148419574 + RMER3D-int LTR ERVK 1027 1533 -1309 1 616 1140 159 28 33 chr5 4117717 4117932 -148419327 + RMER3D-int LTR ERVK 1532 1745 -1097 1 616 2426 166 97 2 chr5 4117932 4118366 -148418893 + RLTR17 LTR ERVK 218 692 0 1 616 3032 136 123 8 chr5 4125681 4126184 -148411075 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 1 616 3092 35 9 0 chr5 4126607 4126950 -148410309 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 616 4138 117 44 12 chr5 4127499 4128180 -148409079 - RMER6A LTR ERVK 0 756 54 1 616 3096 9 0 3 chr5 4133718 4134045 -148403214 - IAPLTR3 LTR ERVK 0 326 1 1 616 414 138 0 0 chr5 4134789 4134854 -148402405 - RMER6A LTR ERVK -396 65 1 1 616 225 304 63 111 chr5 4153582 4153666 -148383593 - MLT1D LTR MaLR -364 141 62 1 616 225 304 63 111 chr5 4153783 4153824 -148383435 - MLT1D LTR MaLR -444 61 22 1 616 234 279 11 95 chr5 4159010 4159105 -148378154 - MT2B LTR ERVL -360 241 155 1 616 991 284 69 8 chr5 4162201 4162563 -148374696 + MLT1B LTR MaLR 5 388 -2 2 616 467 185 45 18 chr5 4163913 4164023 -148373236 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 257 2 616 1134 250 25 11 chr5 4167432 4167711 -148369548 - ORR1D2 LTR MaLR -87 283 1 2 616 293 312 113 26 chr5 4179292 4179486 -148357773 - ORR1D1 LTR MaLR -79 295 85 2 616 3499 118 105 13 chr5 4188661 4189118 -148348141 - RLTR33 LTR ERVK -12 666 167 2 616 1388 155 36 72 chr5 4189118 4189452 -148347807 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 616 3499 118 105 13 chr5 4189452 4189604 -148347655 - RLTR33 LTR ERVK -512 166 1 2 616 702 228 31 6 chr5 4189792 4189951 -148347308 + MTC LTR MaLR 48 210 -211 2 616 1477 142 4 0 chr5 4190141 4190366 -148346893 + MTC LTR MaLR 196 421 0 2 616 3242 172 59 12 chr5 4190357 4191049 -148346210 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 2 617 1390 167 96 100 chr5 4195080 4195519 -148341740 - RMER10A LTR ERVL -5 437 1 2 617 354 299 108 108 chr5 4198564 4198824 -148338435 + MLT1D LTR MaLR 108 397 -227 2 617 2814 47 16 53 chr5 4199934 4200313 -148336946 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 2 617 2180 98 13 7 chr5 4202389 4202696 -148334563 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 2 617 380 66 6 0 chr5 4202711 4202764 -148334495 + MMERVK10C-int LTR ERVK 163 267 -7314 2 617 682 225 55 70 chr5 4202796 4202997 -148334262 + MMERVK10C-int LTR ERVK 655 852 -1135 2 617 281 167 16 16 chr5 4203145 4203206 -148334053 + MMERVK10C-int LTR ERVK 855 915 -6765 2 617 7996 300 40 45 chr5 4203377 4207711 -148329548 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1166 5477 -2104 2 617 1423 244 40 29 chr5 4207940 4208494 -148328765 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6917 7581 0 2 617 2126 93 30 3 chr5 4208494 4208795 -148328464 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 2 617 926 293 94 38 chr5 4211426 4211852 -148325407 - LTR40b LTR ERVL 0 462 13 2 617 2081 136 63 3 chr5 4215169 4215531 -148321728 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 617 857 375 60 44 chr5 4226221 4226703 -148310556 + LTR41B LTR ERVL 7 496 -262 2 617 504 334 148 52 chr5 4226681 4227047 -148310212 + LTR41B LTR ERVL 354 754 -4 2 617 3524 124 42 77 chr5 4231381 4232003 -148305256 + MT2B LTR ERVL 2 601 0 2 617 1241 181 88 140 chr5 4233640 4233837 -148303422 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 192 3 617 1241 181 88 140 chr5 4234188 4234389 -148302870 - ORR1C1 LTR MaLR -187 191 1 3 617 3398 35 0 2 chr5 4240589 4240986 -148296273 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 617 668 221 83 0 chr5 4242278 4242423 -148294836 - ORR1D1 LTR MaLR -217 157 1 3 617 536 343 56 73 chr5 4243147 4243505 -148293754 - ORR1E LTR MaLR -7 352 1 3 617 350 316 84 87 chr5 4243507 4243829 -148293430 - MTEa LTR MaLR -11 368 48 3 617 849 361 74 21 chr5 4245916 4246445 -148290814 + LTR78 LTR ERV1 4 560 -744 3 617 1716 169 46 89 chr5 4258678 4259048 -148278211 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 3 617 1200 187 140 0 chr5 4268942 4269199 -148268060 - MTC LTR MaLR -128 293 1 3 617 295 237 92 123 chr5 4276424 4276554 -148260705 + MT2B LTR ERVL 139 264 -337 3 617 2176 109 52 12 chr5 4285212 4285555 -148251704 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 3 617 1177 278 83 59 chr5 4288374 4288783 -148248476 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 617 671 205 129 16 chr5 4290616 4290864 -148246395 - RMER17C LTR ERVK -134 276 1 3 617 352 329 50 84 chr5 4291074 4291313 -148245946 - MLT1A LTR MaLR -78 296 66 3 617 2047 127 116 40 chr5 4291353 4291723 -148245536 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 3 617 2338 106 6 0 chr5 4293595 4293917 -148243342 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 3 617 2588 116 34 73 chr5 4294763 4295201 -148242058 + RLTR23 LTR ERV1 2 422 -8 3 617 327 267 69 5 chr5 4301340 4301432 -148235827 - MTE2a LTR MaLR -13 406 290 3 617 1992 146 46 28 chr5 4301806 4302195 -148235064 + RMER10B LTR ERVL 1 396 -2 3 617 2297 176 49 25 chr5 4302207 4302696 -148234563 + RLTR28 LTR ERVL 23 523 -1 3 617 355 228 0 37 chr5 4304448 4304530 -148232729 + MER57E1 LTR ERV1 9 87 -285 3 617 3584 10 2 0 chr5 4305203 4305598 -148231661 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 617 1816 150 17 7 chr5 4307135 4307437 -148229822 + RLTR41 LTR ERV1 142 446 0 4 617 749 309 115 20 chr5 4307562 4307918 -148229341 + LTR88b LTR Gypsy? 35 424 -413 4 617 1165 258 61 33 chr5 4308236 4308565 -148228694 - MTEb LTR MaLR -37 342 5 4 617 2239 157 99 19 chr5 4308639 4309149 -148228110 + BGLII_B LTR ERVK 2 436 -5 4 617 4995 164 45 9 chr5 4309518 4310393 -148226866 + RMER13B LTR ERVK 3 908 0 4 617 2198 124 75 18 chr5 4314738 4315125 -148222134 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 617 1654 140 45 137 chr5 4315604 4316027 -148221232 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 617 2371 148 10 15 chr5 4318086 4318497 -148218762 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 617 4233 43 4 2 chr5 4318611 4319122 -148218137 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 4 617 4033 64 1 134 chr5 4319526 4320176 -148217083 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 4 617 256 83 0 0 chr5 4322532 4322568 -148214691 - MLT2B5 LTR ERVL -647 70 35 4 618 788 317 192 13 chr5 4326840 4327371 -148209888 - MER21B LTR ERV1 -23 840 215 4 618 1868 198 102 55 chr5 4331247 4331756 -148205503 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 4 618 742 324 65 65 chr5 4332637 4333035 -148204224 + MLT2C2 LTR ERVL 1 398 -66 4 618 4211 99 14 7 chr5 4333035 4333057 -148204202 + LTRIS2 LTR ERV1 3 23 -541 4 618 4211 99 14 7 chr5 4333083 4333618 -148203641 + LTRIS2 LTR ERV1 24 564 0 4 618 2780 157 45 63 chr5 4338056 4338627 -148198632 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 4 618 305 308 27 27 chr5 4350178 4350288 -148186971 + MLT1J LTR MaLR 11 120 -392 4 618 3634 40 0 0 chr5 4352320 4352716 -148184543 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 618 9206 48 19 1 chr5 4352716 4353794 -148183465 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 618 3755 23 0 0 chr5 4353794 4354190 -148183069 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 618 311 266 36 25 chr5 4356593 4356737 -148180522 + MLT1A0 LTR MaLR 248 408 0 4 618 4226 105 80 24 chr5 4359607 4360366 -148176893 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 8 4 618 5066 159 43 5 chr5 4360541 4361410 -148175849 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 4 618 383 291 138 54 chr5 4364908 4365225 -148172034 + ORR1C2 LTR MaLR 19 379 0 4 618 1993 95 78 0 chr5 4378948 4379243 -148158016 + ORR1A2 LTR MaLR 2 319 -8 5 618 2923 40 3 3 chr5 4380272 4380599 -148156660 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 5 618 6458 65 12 11 chr5 4380601 4381429 -148155830 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 5 618 11169 60 50 32 chr5 4381422 4382928 -148154331 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 168 5 618 240 302 0 0 chr5 4382928 4382981 -148154278 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 5 618 896 137 112 6 chr5 4382981 4383150 -148154109 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 9 5 618 2931 34 3 3 chr5 4383151 4383478 -148153781 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 5 618 807 276 146 4 chr5 4385537 4385777 -148151482 + ORR1D2 LTR MaLR 1 274 -96 5 618 442 194 45 18 chr5 4388976 4389086 -148148173 + ORR1D2 LTR MaLR 257 369 -1 5 618 936 287 69 11 chr5 4390436 4390799 -148146460 - MLT1B LTR MaLR -2 388 5 5 618 3717 18 2 0 chr5 4392709 4393104 -148144155 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 618 2392 100 154 11 chr5 4395249 4395612 -148141647 + RLTR9F LTR ERVK 1 415 0 5 618 1323 182 60 70 chr5 4401385 4401769 -148135490 + RMER17C LTR ERVK 1 380 -30 5 618 572 121 122 62 chr5 4401843 4402074 -148135185 + IAPLTR2b LTR ERVK 216 475 0 5 618 1740 220 110 20 chr5 4403985 4404440 -148132819 + RLTR1 LTR ERV1 129 624 0 5 618 796 241 52 75 chr5 4415178 4415529 -148121730 - RLTR20D LTR ERVK -83 451 1 5 618 5769 127 72 23 chr5 4415535 4415709 -148121550 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -7 2319 2146 5 618 5769 127 72 23 chr5 4415894 4416809 -148120450 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -181 2145 1177 5 618 2578 153 35 31 chr5 4418104 4418583 -148118676 + RLTR20B2 LTR ERVK 80 560 0 5 618 1087 202 118 16 chr5 4422351 4422610 -148114649 + MTD LTR MaLR 14 282 -137 5 618 1087 194 126 8 chr5 4422800 4422821 -148114438 + MTD LTR MaLR 283 310 -109 5 618 2487 69 35 37 chr5 4422824 4423198 -148114061 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 39 5 618 389 261 100 8 chr5 4423593 4423713 -148113546 + MTD LTR MaLR 289 419 0 5 618 1502 239 112 53 chr5 4434467 4434940 -148102319 + RMER15 LTR ERVL 5 505 -70 5 618 2452 175 80 12 chr5 4440413 4440899 -148096360 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 4 5 618 488 335 199 23 chr5 4441567 4442099 -148095160 - LTR82A LTR ERVL -236 636 11 6 619 2031 90 83 46 chr5 4458307 4458655 -148078604 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 5 6 619 297 71 0 0 chr5 4458676 4458718 -148078541 - RLTR10B2 LTR ERVK -250 42 1 6 619 7609 59 0 28 chr5 4458718 4459681 -148077578 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 6 619 22171 58 7 1 chr5 4459667 4462367 -148074892 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 3095 6 619 2510 73 0 0 chr5 4462674 4462991 -148074268 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7264 317 1 6 619 2021 93 83 46 chr5 4462991 4463339 -148073920 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 5 6 619 260 56 0 0 chr5 4463338 4463374 -148073885 - RLTR10B2 LTR ERVK -256 36 1 6 619 318 267 23 0 chr5 4469875 4469961 -148067298 + MLT2C2 LTR ERVL 1 88 -376 6 619 863 284 52 120 chr5 4470434 4470502 -148066757 + MLT2C2 LTR ERVL 70 134 -330 6 619 863 284 52 120 chr5 4470573 4470928 -148066331 + MLT2C2 LTR ERVL 135 464 0 6 619 615 294 126 103 chr5 4470989 4471395 -148065864 + LTR33 LTR ERVL 101 515 0 6 619 642 268 155 22 chr5 4471561 4471984 -148065275 + MLT2B4 LTR ERVL 3 459 -56 6 619 1010 291 46 6 chr5 4472926 4473275 -148063984 + MLT1A0 LTR MaLR 3 365 0 6 619 763 282 91 63 chr5 4475828 4476225 -148061034 - RLTR26 LTR ERVK -138 504 97 6 619 968 242 141 15 chr5 4477946 4478287 -148058972 - MTD LTR MaLR -7 412 29 6 619 239 296 56 22 chr5 4478587 4478677 -148058582 - ORR1D2 LTR MaLR -277 93 1 6 619 557 303 125 36 chr5 4480648 4480977 -148056282 + MER74C LTR ERVL 54 411 -49 6 619 2362 120 6 0 chr5 4482555 4482879 -148054380 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 619 926 332 67 38 chr5 4483045 4483464 -148053795 + MT2A LTR ERVL 103 533 0 6 619 681 190 72 56 chr5 4484068 4484183 -148053076 + ORR1B1 LTR MaLR 39 148 -246 6 619 681 190 72 56 chr5 4484212 4484291 -148052968 + ORR1B1 LTR MaLR 149 235 -159 6 619 257 327 10 19 chr5 4490731 4490834 -148046425 + LTR16C LTR ERVL 287 388 -101 6 619 1649 199 88 33 chr5 4493417 4493505 -148043754 - RLTR20A LTR ERVK -2 539 437 6 619 1649 199 88 33 chr5 4493685 4494053 -148043206 - RLTR20A LTR ERVK -105 436 58 6 619 1557 229 216 21 chr5 4494387 4494868 -148042391 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 6 619 229 254 160 56 chr5 4494872 4494997 -148042262 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -533 270 133 6 619 284 259 97 81 chr5 4504272 4504457 -148032802 - MLT1K LTR MaLR -29 566 379 1 619 1895 145 42 45 chr5 4509615 4509969 -148027290 - ORR1B2 LTR MaLR -12 355 3 1 619 274 329 88 60 chr5 4510534 4510751 -148026508 - MLT1J-int LTR MaLR -454 933 711 2 619 2464 111 39 8 chr5 4514497 4514853 -148022406 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 619 13793 46 115 26 chr5 4514883 4517021 -148020238 + IAPEz-int LTR ERVK 18 2345 -4136 2 619 394 89 0 0 chr5 4517020 4517076 -148020183 + IAPEz-int LTR ERVK 2719 2774 -3707 2 619 3189 20 0 0 chr5 4517074 4517431 -148019828 + IAPEz-int LTR ERVK 4001 4357 -2124 2 619 5924 63 13 18 chr5 4517422 4518197 -148019062 + IAPEz-int LTR ERVK 5709 6479 -2 2 619 2464 111 39 8 chr5 4518199 4518555 -148018704 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 619 2256 98 12 37 chr5 4529120 4529447 -148007812 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 3 619 595 301 95 56 chr5 4531240 4531472 -148005787 - MLT1J2 LTR MaLR -168 276 36 3 619 470 290 16 78 chr5 4531930 4532121 -148005138 + ORR1E LTR MaLR 1 179 -180 3 619 230 246 53 40 chr5 4536895 4536971 -148000288 - MLT1J2 LTR MaLR -295 153 77 4 619 514 315 72 116 chr5 4539915 4540278 -147996981 + MLT1A0 LTR MaLR 1 347 -18 4 619 1954 181 27 16 chr5 4558702 4559072 -147978187 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 619 1294 252 80 14 chr5 4571128 4571478 -147965781 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 9 619 2034 244 22 0 chr5 4571943 4572353 -147964906 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 619 517 314 20 40 chr5 4584575 4584774 -147952485 - MLT1J1 LTR MaLR -236 208 14 1 619 460 241 11 0 chr5 4584937 4585024 -147952235 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 481 1 77 1442 191 69 31 chr5 4587141 4587540 -147949719 + RLTR1 LTR ERV1 135 624 0 1 620 239 262 68 45 chr5 4587830 4587918 -147949341 - MTE2b LTR MaLR -21 358 269 1 620 1815 226 8 26 chr5 4589299 4589685 -147947574 - MTD LTR MaLR -8 411 33 1 620 609 273 71 31 chr5 4591190 4591482 -147945777 + MTEa LTR MaLR 1 365 -14 1 620 391 371 117 76 chr5 4591747 4592286 -147944973 - LTR16E2 LTR ERVL 0 568 8 1 620 1259 293 179 43 chr5 4592410 4593080 -147944179 + RMER13A LTR ERVK 98 858 -2 1 620 595 284 55 10 chr5 4609131 4609330 -147927929 - RMER15 LTR ERVL -18 557 350 1 620 1602 287 25 59 chr5 4616367 4616838 -147920421 - MT2A LTR ERVL -78 455 1 1 620 610 190 90 26 chr5 4616838 4617027 -147920232 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5561 1 620 2313 217 14 27 chr5 4617066 4617625 -147919634 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2751 3010 2459 1 620 860 203 27 10 chr5 4617625 4617831 -147919428 - ORR1D1 LTR MaLR 0 394 175 1 620 863 149 30 130 chr5 4617907 4618107 -147919152 - ORR1D1 LTR MaLR -187 187 8 1 620 1183 279 60 24 chr5 4618115 4618566 -147918693 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3298 2463 1997 1 620 1320 208 43 72 chr5 4618567 4618914 -147918345 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 38 1 620 408 296 8 16 chr5 4618924 4619051 -147918208 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3761 2000 1875 1 620 314 186 93 0 chr5 4619056 4619142 -147918117 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3985 1729 1636 1 620 2416 274 33 5 chr5 4619198 4619932 -147917327 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4185 1576 823 1 620 866 255 104 50 chr5 4619939 4620436 -147916823 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5193 521 6 1 620 307 255 131 9 chr5 4620451 4620558 -147916701 - MT2A LTR ERVL -10 523 404 1 620 545 344 55 48 chr5 4633027 4633461 -147903798 - MTE-int LTR MaLR -570 1010 574 1 620 1035 344 62 5 chr5 4633491 4633926 -147903333 - MTE-int LTR MaLR -1116 464 5 1 620 312 158 26 129 chr5 4634099 4634215 -147903044 + RLTR10-int LTR ERVK 749 852 -1135 1 620 540 168 16 25 chr5 4634276 4634301 -147902958 + RLTR10-int LTR ERVK 57 83 -6459 1 620 540 168 16 25 chr5 4634404 4634500 -147902759 + RLTR10-int LTR ERVK 84 176 -6366 1 620 769 179 6 6 chr5 4634494 4634651 -147902608 + RLTR10-int LTR ERVK 347 503 -6039 1 620 1956 53 86 10 chr5 4634651 4635135 -147902124 + RLTR10-int LTR ERVK 5007 5527 -1015 1 620 4682 96 23 8 chr5 4635147 4635877 -147901382 + RLTR10-int LTR ERVK 1288 1986 -1 1 620 2049 67 10 8 chr5 4635877 4636256 -147901003 + RLTR10A LTR ERVK 1 309 0 1 620 1349 181 32 68 chr5 4636256 4636540 -147900719 + RMER4A LTR ERVK 182 454 -12 1 620 3816 231 45 15 chr5 4636630 4637736 -147899523 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1192 -178 1 620 523 294 125 87 chr5 4639979 4640314 -147896945 - ORR1E LTR MaLR -5 354 7 1 620 1626 194 35 42 chr5 4641640 4642017 -147895242 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 620 370 313 155 76 chr5 4643418 4643785 -147893474 + MLT1A1 LTR MaLR 5 400 -8 1 620 1383 183 203 0 chr5 4646928 4647239 -147890020 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 620 752 305 44 40 chr5 4648242 4648515 -147888744 - MLT1A0 LTR MaLR -62 303 30 1 620 267 178 135 14 chr5 4650720 4650794 -147886465 - MLT1A0 LTR MaLR -19 486 404 1 620 288 343 98 29 chr5 4650814 4650988 -147886271 - MLT1A0 LTR MaLR -154 211 26 1 620 462 82 0 0 chr5 4656856 4656917 -147880342 + RMER6D LTR ERVK 1 61 -659 2 620 1667 186 24 66 chr5 4656941 4657350 -147879909 + RMER6D LTR ERVK 317 708 -12 2 620 311 326 97 97 chr5 4657588 4657958 -147879301 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 620 327 327 65 32 chr5 4658082 4658237 -147879022 + MLT1J1 LTR MaLR 156 315 -129 2 620 259 270 63 63 chr5 4659706 4659801 -147877458 + MLT1B LTR MaLR 1 95 -295 2 620 411 336 111 7 chr5 4660079 4660349 -147876910 + MLT1B LTR MaLR 89 386 -4 2 620 454 171 77 33 chr5 4667047 4667228 -147870031 + RMER17C LTR ERVK 87 275 -135 2 620 493 312 343 44 chr5 4667977 4668269 -147868990 - MTEb LTR MaLR -2 377 1 2 620 271 355 85 57 chr5 4668269 4668445 -147868814 - MLT1C LTR MaLR -87 380 200 2 620 379 292 100 38 chr5 4668514 4668674 -147868585 + MLT1C LTR MaLR 48 217 -250 2 620 523 245 104 25 chr5 4669246 4669409 -147867850 - MLT1C-int LTR MaLR -238 1133 958 2 620 259 319 28 69 chr5 4671818 4671963 -147865296 - LTR88b LTR Gypsy? -439 398 260 2 620 646 323 78 59 chr5 4672847 4673169 -147864090 - MLT1A LTR MaLR -46 328 1 2 620 396 292 33 8 chr5 4674751 4674872 -147862387 - MLT1A1 LTR MaLR -269 139 16 2 620 340 154 0 0 chr5 4680602 4680654 -147856605 - MTE2b LTR MaLR -46 333 282 2 620 610 205 109 71 chr5 4680655 4680839 -147856420 - MT2A LTR ERVL 0 533 343 2 620 1717 323 74 88 chr5 4680842 4681894 -147855365 - MTE2b-int LTR MaLR -332 1038 2 2 620 1321 282 65 33 chr5 4681896 4682263 -147854996 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 2 620 2293 135 213 24 chr5 4689854 4690346 -147846913 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 2 620 2349 204 63 24 chr5 4690840 4691381 -147845878 - RLTR20B1 LTR ERVK -1 562 1 2 620 468 319 46 23 chr5 4697311 4697484 -147839775 + MLT1G LTR MaLR 409 585 -6 2 620 225 332 52 117 chr5 4700748 4701072 -147836187 - MLT1K LTR MaLR -47 548 246 2 620 1647 316 104 18 chr5 4701902 4702530 -147834729 + ORR1E-int LTR MaLR 844 1527 -53 2 620 529 312 55 62 chr5 4702530 4702663 -147834596 + ORR1E LTR MaLR 1 132 -227 2 620 3138 48 5 10 chr5 4702663 4703061 -147834198 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 620 529 323 49 89 chr5 4703061 4703319 -147833940 + ORR1E LTR MaLR 125 365 -9 2 620 6813 25 18 1 chr5 4703510 4704300 -147832959 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 2 620 3247 31 13 8 chr5 4705552 4705946 -147831313 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 620 570 317 73 75 chr5 4707112 4707470 -147829789 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 2 620 2006 132 26 10 chr5 4711447 4711754 -147825505 + ORR1A2 LTR MaLR 16 327 0 3 620 311 250 0 45 chr5 4712073 4712161 -147825098 - MLT1H2 LTR MaLR -335 154 71 3 620 297 70 0 0 chr5 4713550 4713593 -147823666 + RLTR1B LTR ERV1 1 43 -469 3 620 3370 101 11 55 chr5 4713591 4714117 -147823142 + RLTR1B LTR ERV1 10 512 0 3 620 4891 132 113 73 chr5 4714197 4714778 -147822481 + RLTR25A LTR ERVK 1 681 -422 3 620 4891 132 113 73 chr5 4715323 4715795 -147821464 + RLTR25A LTR ERVK 682 1098 -5 3 621 1564 135 54 41 chr5 4720232 4720526 -147816733 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 132 3 621 391 359 26 32 chr5 4737672 4737862 -147799397 + ORR1E LTR MaLR 3 191 -168 3 621 2903 55 0 0 chr5 4738630 4738976 -147798283 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 621 401 281 110 22 chr5 4748459 4748641 -147788618 + MLT1D LTR MaLR 306 503 -2 3 621 283 303 112 24 chr5 4750763 4750888 -147786371 + MLT1A LTR MaLR 27 162 -212 3 621 365 269 0 88 chr5 4764639 4764655 -147772604 + MT2B LTR ERVL 153 158 -443 3 621 1801 227 32 25 chr5 4768756 4769170 -147768089 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 621 403 289 107 45 chr5 4770817 4771194 -147766065 + MLT1H2 LTR MaLR 23 422 -67 3 621 497 337 89 25 chr5 4776641 4776955 -147760304 - LTR16A1 LTR ERVL -115 341 8 3 621 228 315 0 63 chr5 4787756 4787851 -147749408 + MLT1F1 LTR MaLR 23 111 -458 4 621 394 332 169 13 chr5 4787946 4788343 -147748916 + MLT1F1-int LTR MaLR 797 1255 -234 4 621 1405 264 49 13 chr5 4788467 4788858 -147748401 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 621 240 319 93 46 chr5 4789220 4789371 -147747888 + MLT1F1 LTR MaLR 402 559 -10 4 621 916 133 143 2 chr5 4792487 4792687 -147744572 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 144 4 621 2156 101 6 66 chr5 4793065 4793415 -147743844 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 621 1101 253 107 18 chr5 4793682 4794020 -147743239 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 4 621 1062 130 11 16 chr5 4796154 4796341 -147740918 - RMER19C LTR ERVK 0 611 426 4 621 1998 46 0 0 chr5 4796374 4796635 -147740624 + RLTR10A LTR ERVK 1 261 -150 4 621 945 84 0 8 chr5 4796622 4796754 -147740505 + RLTR27 LTR ERVK 179 309 0 4 621 359 99 7 10 chr5 4796778 4796834 -147740425 + RLTR10-int LTR ERVK 160 267 -7314 4 621 372 182 0 113 chr5 4796980 4797104 -147740155 + RLTR10-int LTR ERVK 743 852 -1135 4 621 547 58 0 14 chr5 4797306 4797376 -147739883 + RLTR10-int LTR ERVK 105 173 -6369 4 621 729 179 82 7 chr5 4797373 4797519 -147739740 + RLTR10-int LTR ERVK 347 503 -6039 4 621 1839 72 100 0 chr5 4797519 4797770 -147739489 + RLTR10-int LTR ERVK 5007 5282 -1260 4 621 4895 108 23 14 chr5 4797778 4798513 -147738746 + RLTR10-int LTR ERVK 1288 1986 -1 4 621 1923 61 0 0 chr5 4798513 4798774 -147738485 + RLTR10A LTR ERVK 1 261 -150 4 621 924 102 7 0 chr5 4798755 4798892 -147738367 + RLTR27 LTR ERVK 172 309 0 4 621 1193 202 144 16 chr5 4798892 4799199 -147738060 - RMER19B LTR ERVK -247 655 309 4 621 4541 94 4 46 chr5 4799507 4800274 -147736985 + RMER17A LTR ERVK 1 735 -16 4 621 2308 141 104 5 chr5 4808766 4809207 -147728052 + RLTR17 LTR ERVK 98 582 -110 4 621 607 289 45 64 chr5 4809599 4809942 -147727317 + RLTR17 LTR ERVK 60 426 -266 4 621 260 316 142 19 chr5 4846814 4846969 -147690290 + ORR1E LTR MaLR 79 252 -107 4 622 2003 197 87 26 chr5 4856100 4856559 -147680700 - RMER5 LTR ERV1 -26 508 22 4 622 2894 90 57 24 chr5 4881020 4881475 -147655784 + RMER16 LTR ERVK 64 533 0 5 622 261 264 140 61 chr5 4890942 4891156 -147646103 + MER54A LTR ERVL 20 250 -651 5 622 622 299 71 25 chr5 4891169 4891450 -147645809 + MLT1A LTR MaLR 81 374 0 5 622 1545 214 79 15 chr5 4923437 4923831 -147613428 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 622 1784 208 25 0 chr5 4951088 4951453 -147585806 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 622 282 274 179 0 chr5 4956108 4956203 -147581056 + MTEb LTR MaLR 3 114 -245 6 622 282 270 65 70 chr5 4956349 4956527 -147580732 + RLTR20B1 LTR ERVK 59 244 -319 6 622 289 235 58 12 chr5 4956845 4956931 -147580328 + MTEb LTR MaLR 288 377 -2 6 622 986 235 36 20 chr5 4957145 4957397 -147579862 + MTE2b LTR MaLR 8 263 -116 6 622 254 207 17 0 chr5 4957408 4957466 -147579793 + MTE2b LTR MaLR 320 378 -1 6 622 522 226 106 12 chr5 4957472 4957642 -147579617 + ORR1C2 LTR MaLR 1 186 -188 6 622 727 208 67 62 chr5 4957898 4958108 -147579151 + ORR1C2 LTR MaLR 174 384 0 6 622 2485 152 34 5 chr5 4960791 4961239 -147576020 - RMER4A LTR ERVK 0 466 6 6 622 579 299 40 59 chr5 4961677 4962023 -147575236 + MLT1E1A LTR MaLR 318 672 -8 6 622 854 270 191 69 chr5 4963866 4964536 -147572723 + RMER13A LTR ERVK 109 860 0 6 622 1069 274 29 53 chr5 4965065 4965439 -147571820 + ORR1D2 LTR MaLR 4 368 -2 6 622 247 279 0 0 chr5 4965547 4965615 -147571644 - MLT1D LTR MaLR -106 399 332 6 622 1110 231 122 21 chr5 4976826 4977162 -147560097 - MTE2a LTR MaLR -9 370 1 6 622 706 298 82 95 chr5 4978461 4978828 -147558431 + MLT1A0 LTR MaLR 2 363 -2 6 623 263 320 20 10 chr5 4984563 4984664 -147552595 + MTEb LTR MaLR 278 379 0 6 623 2150 177 88 21 chr5 4985714 4986155 -147551104 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 456 -107 6 623 2150 177 88 21 chr5 4986288 4986314 -147550945 + RLTR20B1 LTR ERVK 457 498 -65 6 623 738 226 74 66 chr5 4988751 4988993 -147548266 + RMER17C-int LTR ERVK 2631 2874 -364 6 623 1983 133 16 124 chr5 4989272 4989717 -147547542 + RMER10B LTR ERVL 2 398 0 6 623 3525 140 54 3 chr5 4991731 4992303 -147544956 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 623 915 261 82 70 chr5 5001519 5001874 -147535385 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 623 504 297 103 26 chr5 5003468 5003721 -147533538 + MLT1G3 LTR MaLR 1 308 -287 6 623 3480 25 2 0 chr5 5012171 5012566 -147524693 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 623 2157 156 60 12 chr5 5022099 5022501 -147514758 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 623 1007 324 27 37 chr5 5026869 5027244 -147510015 - MTEa LTR MaLR 0 379 9 3 623 1030 298 87 6 chr5 5027507 5027851 -147509408 + MTE2b LTR MaLR 8 379 0 3 623 2650 45 3 0 chr5 5034181 5034518 -147502741 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 4 623 244 289 151 73 chr5 5038070 5038275 -147498984 + ORR1E LTR MaLR 33 253 -106 4 623 1586 226 18 121 chr5 5042657 5043104 -147494155 + MTD LTR MaLR 19 419 0 5 623 2049 223 21 119 chr5 5043158 5043836 -147493423 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 623 419 242 102 24 chr5 5057634 5057761 -147479498 + MLT1A1 LTR MaLR 267 403 -5 7 623 606 291 168 45 chr5 5071593 5071902 -147465357 - MER21B LTR ERV1 -99 764 418 8 623 479 278 44 146 chr5 5074342 5074637 -147462622 + MLT1A0 LTR MaLR 80 344 -21 9 623 1605 149 22 11 chr5 5075072 5075343 -147461916 + RLTR17 LTR ERVK 1 274 -418 9 623 834 169 21 58 chr5 5075337 5075526 -147461733 + RLTR17 LTR ERVK 510 691 -1 9 623 327 252 216 68 chr5 5075621 5075931 -147461328 + ORR1E LTR MaLR 1 377 -2 9 623 1712 179 12 6 chr5 5081743 5082069 -147455190 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 1 623 309 198 25 144 chr5 5083785 5083903 -147453356 + MT2B LTR ERVL 153 256 -345 1 623 1563 158 0 92 chr5 5084564 5084711 -147452548 + MERVK26-int LTR ERVK 6633 6757 -162 1 623 1563 158 0 92 chr5 5085201 5085359 -147451900 + MERVK26-int LTR ERVK 6758 6910 -9 1 623 2732 171 100 35 chr5 5087119 5087892 -147449367 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 1 623 1257 245 87 26 chr5 5099297 5099687 -147437572 - MTD LTR MaLR -1 418 5 1 623 1239 283 21 32 chr5 5110632 5111004 -147426255 + MTEa LTR MaLR 1 368 -11 1 624 3644 239 140 58 chr5 5116937 5118427 -147418832 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1611 -237 1 624 247 242 48 87 chr5 5118455 5118559 -147418700 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1747 1846 -2 1 624 3610 22 66 26 chr5 5118689 5119146 -147418113 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 624 244 224 69 0 chr5 5128744 5128802 -147408457 + MLT1N2 LTR MaLR 501 562 0 1 624 341 292 98 98 chr5 5131925 5132149 -147405110 + ORR1D2 LTR MaLR 1 224 -146 1 624 304 233 46 11 chr5 5132162 5132249 -147405010 + MTEb LTR MaLR 171 260 -110 1 624 391 202 85 34 chr5 5132309 5132427 -147404832 + MTEb LTR MaLR 256 379 0 1 624 575 250 228 35 chr5 5136154 5136352 -147400907 + MTD LTR MaLR 1 231 -190 1 624 575 221 236 31 chr5 5136377 5136523 -147400736 + MTD LTR MaLR 232 407 -12 1 624 2544 50 11 90 chr5 5141897 5141953 -147395306 + ORR1A1 LTR MaLR 1 56 -290 1 624 2544 50 11 90 chr5 5142097 5142416 -147394843 + ORR1A1 LTR MaLR 57 346 0 1 624 9611 152 26 82 chr5 5142416 5143501 -147393758 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 962 -1001 1 624 9611 152 26 82 chr5 5143901 5144893 -147392366 + ORR1A1-int LTR MaLR 963 1963 0 1 624 2610 37 65 0 chr5 5144893 5145218 -147392041 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 624 887 329 25 29 chr5 5147430 5147746 -147389513 + MTE2a LTR MaLR 59 373 -6 2 624 1038 209 162 7 chr5 5151132 5151435 -147385824 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 17 2 624 987 306 38 34 chr5 5164737 5165001 -147372258 + MTE2b LTR MaLR 2 266 -113 2 624 1547 227 57 31 chr5 5167365 5167719 -147369540 - MTE2a LTR MaLR -2 377 15 2 624 1859 167 16 87 chr5 5170835 5171216 -147366043 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 624 422 333 110 80 chr5 5173271 5173607 -147363652 + ORR1E LTR MaLR 1 346 -13 2 624 1758 172 87 3 chr5 5177322 5177666 -147359593 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 21 2 624 710 314 51 82 chr5 5191918 5192310 -147344949 + MLT1B LTR MaLR 1 380 -10 2 624 1975 185 57 18 chr5 5194299 5194700 -147342559 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 2 624 248 344 72 104 chr5 5197668 5197723 -147339536 - MamGypLTR1d LTR Gypsy -540 273 226 2 624 248 344 72 104 chr5 5197765 5197930 -147339329 - MamGypLTR1d LTR Gypsy -588 225 60 2 624 1385 190 29 185 chr5 5197961 5198414 -147338845 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 2 624 1885 175 23 46 chr5 5202713 5203108 -147334151 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 2 624 411 185 106 32 chr5 5207239 5207362 -147329897 - MTD LTR MaLR -12 407 276 2 624 672 252 219 33 chr5 5211457 5211818 -147325441 - MER31B LTR ERV1 -12 454 27 2 624 318 271 56 0 chr5 5218045 5218152 -147319107 + MLT1G1 LTR MaLR 2 114 -477 2 624 327 280 155 57 chr5 5219245 5219438 -147317821 + MLT1G1 LTR MaLR 362 573 -6 2 624 1441 242 67 77 chr5 5222162 5222685 -147314574 + RLTR31_Mur LTR ERVK 11 528 -25 2 624 275 288 116 79 chr5 5224577 5224818 -147312441 + RMER15 LTR ERVL 3 252 -323 3 624 3662 25 2 0 chr5 5233169 5233564 -147303695 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 624 3187 74 14 2 chr5 5235078 5235523 -147301736 + RLTR44E LTR ERVK 3 452 0 3 624 942 156 44 0 chr5 5235524 5235684 -147301575 + RLTR44-int LTR ERVK 24 190 -2622 3 624 15357 39 58 43 chr5 5235697 5236867 -147300392 + RLTR44-int LTR ERVK 781 2018 -794 3 624 228 221 36 83 chr5 5236867 5236951 -147300308 - LTR85c LTR Gypsy? -701 122 43 3 624 15357 39 58 43 chr5 5236951 5237699 -147299560 + RLTR44-int LTR ERVK 2019 2812 0 3 624 3678 65 9 0 chr5 5237699 5238147 -147299112 + RLTR44E LTR ERVK 1 452 0 3 624 542 316 163 18 chr5 5240684 5241022 -147296237 - MLT1B LTR MaLR 0 390 4 3 625 366 313 194 5 chr5 5251377 5251710 -147285549 + MLT1E1 LTR MaLR 296 678 -2 3 625 353 211 54 135 chr5 5277639 5277787 -147259472 + MTD LTR MaLR 269 404 -15 3 625 1019 253 51 80 chr5 5296066 5296456 -147240803 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 625 2002 88 18 13 chr5 5299736 5300063 -147237196 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 356 -1 4 625 4181 168 16 13 chr5 5304795 5305568 -147231691 + RMER13B LTR ERVK 8 782 -126 4 625 1974 177 71 3 chr5 5308267 5308635 -147228624 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 4 625 930 96 0 7 chr5 5310385 5310522 -147226737 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 194 4 625 445 273 39 83 chr5 5315523 5315703 -147221556 + MTEa LTR MaLR 1 172 -207 4 625 2542 43 61 50 chr5 5323677 5324019 -147213240 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 625 13613 66 16 2 chr5 5324019 5325785 -147211474 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 4 625 2866 44 12 0 chr5 5325785 5326127 -147211132 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 625 1176 286 106 13 chr5 5326658 5327132 -147210127 + MLT1F LTR MaLR 4 521 -27 4 625 912 250 39 67 chr5 5333885 5334168 -147203091 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 88 4 625 1134 216 69 92 chr5 5334177 5334649 -147202610 - MT2B LTR ERVL -22 579 1 4 625 456 274 0 0 chr5 5334649 5334751 -147202508 - ORR1D2 LTR MaLR -257 102 1 4 625 3411 40 0 2 chr5 5335106 5335503 -147201756 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 625 2390 124 44 5 chr5 5336821 5337226 -147200033 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 625 417 277 142 52 chr5 5343734 5344122 -147193137 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 8 4 625 487 247 80 51 chr5 5344461 5344636 -147192623 + RMER5 LTR ERV1 199 378 -156 4 625 286 248 53 120 chr5 5346631 5346764 -147190495 - MT2B LTR ERVL -323 278 155 4 625 20373 73 10 2 chr5 5349288 5351842 -147185417 + MERVL-int LTR ERVL 2782 5356 -129 4 625 289 186 14 41 chr5 5351962 5352035 -147185224 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 637 -1326 4 625 329 26 0 0 chr5 5352037 5352076 -147185183 + MERVL-int LTR ERVL 5447 5485 0 4 625 3326 92 8 35 chr5 5352076 5352562 -147184697 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 473 -2 4 625 2292 161 9 83 chr5 5366006 5366461 -147170798 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 626 287 325 78 48 chr5 5386111 5386294 -147150965 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 216 5 626 343 299 93 36 chr5 5389036 5389230 -147148029 - LTR52 LTR ERVL -209 212 8 5 626 607 284 174 53 chr5 5395927 5396284 -147140975 - MTC LTR MaLR -20 401 2 5 626 2392 179 55 39 chr5 5402181 5402691 -147134568 + RLTR12B LTR ERVK 2 519 -9 5 626 284 342 103 26 chr5 5411070 5411226 -147126033 - LTR33 LTR ERVL -337 178 11 5 626 736 293 52 43 chr5 5412307 5412653 -147124606 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 17 5 626 317 268 123 46 chr5 5420188 5420407 -147116852 - ORR1E LTR MaLR -105 254 19 5 626 792 307 74 0 chr5 5421270 5421514 -147115745 + MLT1B LTR MaLR 23 284 -106 5 626 2209 172 51 0 chr5 5421957 5422311 -147114948 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 5 626 751 278 123 12 chr5 5424081 5424325 -147112934 - MTEa LTR MaLR -7 372 102 5 626 274 291 89 63 chr5 5426786 5426944 -147110315 - MLT1L LTR MaLR -299 311 150 6 626 2138 152 60 22 chr5 5428782 5429232 -147108027 - RMER6A LTR ERVK -7 749 283 6 626 2158 178 26 14 chr5 5445399 5445703 -147091556 - MTC LTR MaLR 0 421 111 6 626 2158 178 26 14 chr5 5445933 5446044 -147091215 - MTC LTR MaLR -311 110 1 6 626 330 277 0 65 chr5 5454171 5454279 -147082980 - MT2B LTR ERVL -345 256 156 6 626 363 364 114 65 chr5 5457601 5458030 -147079229 + LTR16A1 LTR ERVL 6 455 -1 6 626 255 352 58 58 chr5 5459714 5459922 -147077337 + MLT1K-int LTR MaLR 1099 1306 -81 6 626 231 351 153 13 chr5 5460561 5460711 -147076548 + MLT1K LTR MaLR 411 581 -14 6 626 1905 170 25 76 chr5 5466824 5467218 -147070041 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 626 2692 164 43 4 chr5 5476300 5476809 -147060450 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 6 626 779 294 65 4 chr5 5480778 5481024 -147056235 + LTR16B LTR ERVL 203 463 0 6 626 719 293 94 50 chr5 5481110 5481473 -147055786 - MLT1B LTR MaLR -5 385 7 6 626 265 292 105 32 chr5 5482258 5482382 -147054877 - LTR33A LTR ERVL -387 133 1 6 626 1164 221 75 58 chr5 5484231 5484576 -147052683 - MTE2b LTR MaLR 0 379 29 6 626 698 301 135 18 chr5 5484970 5485251 -147052008 - MER90a LTR ERV1 -3 611 298 6 626 292 330 85 63 chr5 5491924 5492147 -147045112 - ORR1E LTR MaLR -111 248 21 7 626 316 86 0 65 chr5 5495196 5495258 -147042001 + ORR1B1 LTR MaLR 5 95 -299 7 626 2196 166 66 8 chr5 5496710 5497105 -147040154 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 7 626 2476 26 16 0 chr5 5499696 5499999 -147037260 + MTA_Mm LTR MaLR 1 308 -88 7 626 773 22 0 0 chr5 5500000 5500090 -147037169 + MTA_Mm LTR MaLR 307 396 0 1 626 2236 183 91 14 chr5 5501010 5501525 -147035734 + RLTR12A LTR ERVK 1 555 -13 5 626 3171 61 14 0 chr5 5504568 5504996 -147032263 + RLTR44E LTR ERVK 1 434 -18 1 627 382 250 124 26 chr5 5517029 5517227 -147020032 + MTEa LTR MaLR 114 351 -28 2 627 827 231 25 5 chr5 5520360 5520556 -147016703 + RLTR20A LTR ERVK 149 348 -186 3 627 932 206 77 18 chr5 5526952 5527174 -147010085 + RLTR20A LTR ERVK 307 541 0 3 627 1111 212 81 38 chr5 5527175 5527687 -147009572 - MYSERV6-int LTR ERVK -760 5790 5406 3 627 248 247 79 45 chr5 5527691 5527780 -147009479 - RMER4B LTR ERVK -45 540 449 3 627 428 256 22 65 chr5 5527785 5527960 -147009299 - MYSERV6-int LTR ERVK -359 5421 5100 3 627 238 367 16 48 chr5 5528492 5528618 -147008641 - RMER4A LTR ERVK -341 125 4 3 627 815 182 41 54 chr5 5531318 5531557 -147005702 - MYSERV6-int LTR ERVK -4544 4415 4224 3 627 3910 175 40 14 chr5 5532815 5533581 -147003678 - MYSERV6-int LTR ERVK -4740 4219 3434 3 627 1340 158 124 56 chr5 5534165 5534487 -147002772 + ORR1A4 LTR MaLR 43 386 -8 4 627 9015 161 76 92 chr5 5534491 5534807 -147002452 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 324 -1639 4 627 9015 161 76 92 chr5 5534993 5536670 -147000589 + ORR1A4-int LTR MaLR 325 1962 -1 4 627 1695 171 16 118 chr5 5536671 5537036 -147000223 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 4 627 226 276 141 10 chr5 5537264 5537363 -146999896 - RLTR10 LTR ERVK -181 209 98 5 627 2223 148 55 3 chr5 5540529 5540894 -146996365 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 627 239 232 23 58 chr5 5548269 5548356 -146988903 - RMER4A LTR ERVK -358 108 25 7 627 542 238 0 166 chr5 5554424 5554605 -146982654 + MTE2a LTR MaLR 1 151 -228 8 627 1272 172 114 8 chr5 5554607 5554853 -146982406 - ORR1D1 LTR MaLR -100 274 3 8 627 398 248 193 7 chr5 5564581 5564731 -146972528 + MTE2a LTR MaLR 202 379 0 1 627 733 287 102 46 chr5 5571342 5571691 -146965568 + MLT2B1 LTR ERVL 7 359 -55 1 627 397 291 103 113 chr5 5571774 5571822 -146965437 + MLT2B1 LTR ERVL 360 400 -14 1 627 1720 134 72 10 chr5 5591384 5591677 -146945582 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 76 1 627 901 257 35 27 chr5 5591664 5591924 -146945335 + MT2B LTR ERVL 290 551 -50 1 627 2682 55 55 3 chr5 5594210 5594556 -146942703 + RLTR10B2 LTR ERVK 2 365 0 1 627 1186 282 16 28 chr5 5594999 5595320 -146941939 + MTE2a LTR MaLR 63 379 0 1 627 317 192 232 40 chr5 5595332 5595457 -146941802 + MLT2B2 LTR ERVL 414 562 0 1 627 590 288 68 85 chr5 5622087 5622394 -146914865 + MLT1A0 LTR MaLR 19 320 -45 1 627 1151 246 99 36 chr5 5623146 5623538 -146913721 - MTD LTR MaLR -13 406 1 1 627 1431 224 121 27 chr5 5624524 5625043 -146912216 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 2 627 1940 214 63 22 chr5 5625119 5625612 -146911647 - RLTR11A2 LTR ERVK -14 513 1 2 627 3934 221 69 42 chr5 5628832 5629613 -146907646 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 857 1623 -703 2 627 2854 54 56 15 chr5 5629613 5630008 -146907251 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 2 627 3934 221 69 42 chr5 5630008 5630459 -146906800 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1624 2122 -204 2 628 412 259 28 56 chr5 5636889 5637069 -146900190 + MYSERV6-int LTR ERVK 8784 8958 -1 2 628 2069 107 61 12 chr5 5637070 5637412 -146899847 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 2 628 877 231 123 28 chr5 5638927 5639212 -146898047 + RLTR20B1 LTR ERVK 29 340 -223 2 628 286 279 12 12 chr5 5639202 5639282 -146897977 + RLTR20B1 LTR ERVK 455 534 0 2 628 3479 102 139 9 chr5 5643391 5643924 -146893335 + RLTR1D LTR ERV1 4 605 0 2 628 425 277 192 49 chr5 5647638 5647904 -146889355 + RMER15 LTR ERVL 272 575 0 2 628 1133 319 80 36 chr5 5647945 5648674 -146888585 + RMER15-int LTR ERVL 83 829 -4170 2 628 868 301 55 26 chr5 5648805 5649112 -146888147 - RMER15 LTR ERVL -5 570 255 2 628 878 277 43 84 chr5 5649235 5649653 -146887606 - RMER15-int LTR ERVL -5 4994 4594 2 628 790 241 188 40 chr5 5666963 5667261 -146869998 - MLT1B LTR MaLR -48 342 1 2 628 746 298 66 63 chr5 5681207 5681540 -146855719 + MTEa LTR MaLR 1 334 -45 2 628 1730 128 46 13 chr5 5690017 5690335 -146846924 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 628 2591 83 3 3 chr5 5696011 5696337 -146840922 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 2 628 1909 168 45 50 chr5 5696701 5697078 -146840181 + ORR1C1 LTR MaLR 4 378 0 3 628 3025 118 27 7 chr5 5699029 5699471 -146837788 + RLTR11B LTR ERVK 3 453 0 3 628 431 267 35 91 chr5 5705351 5705549 -146831710 + RLTR23 LTR ERV1 244 430 0 3 628 375 332 64 128 chr5 5707876 5708356 -146828903 + MLT1G3 LTR MaLR 57 572 -7 3 628 1649 221 88 51 chr5 5719046 5719513 -146817746 - RMER19C LTR ERVK -2 609 126 3 628 858 292 40 67 chr5 5727210 5727581 -146809678 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 173 3 628 1728 150 79 27 chr5 5732482 5732838 -146804421 + RLTR17 LTR ERVK 270 577 -115 3 628 232 351 100 50 chr5 5745012 5745273 -146791986 + MLT1K LTR MaLR 154 427 -168 4 628 817 245 15 59 chr5 5751700 5751973 -146785286 + RLTR11B LTR ERVK 1 261 -192 4 628 250 191 15 60 chr5 5752218 5752285 -146784974 - RLTR11A2 LTR ERVK -463 64 1 4 628 1054 282 60 25 chr5 5758215 5758615 -146778644 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 628 551 335 55 12 chr5 5765784 5766041 -146771218 - MER67C LTR ERV1 -307 404 137 4 628 264 290 10 51 chr5 5766136 5766234 -146771025 - MER67C LTR ERV1 -365 149 56 4 629 1961 177 33 36 chr5 5773468 5773831 -146763428 - ORR1B1 LTR MaLR -32 362 1 4 629 681 367 101 37 chr5 5773848 5774383 -146762876 - MLT1J-int LTR MaLR -2 1385 817 4 629 8739 35 9 9 chr5 5774569 5775623 -146761636 - MMETn-int LTR ERVK -1436 3408 2355 4 629 19276 35 0 6 chr5 5775622 5777887 -146759372 - MMETn-int LTR ERVK -2593 2251 1 4 629 1736 63 7 59 chr5 5777887 5778173 -146759086 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 52 4 629 9887 86 19 20 chr5 5778198 5779592 -146757667 + MMETn-int LTR ERVK 3452 4844 0 4 629 2410 44 6 50 chr5 5779592 5779929 -146757330 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 629 671 297 89 21 chr5 5780167 5780279 -146756980 - MER31B LTR ERV1 0 466 350 4 629 671 297 89 21 chr5 5780338 5780661 -146756598 - MER31B LTR ERV1 -117 349 2 4 629 1061 214 164 129 chr5 5780798 5781309 -146755950 - MT2A LTR ERVL -3 530 2 4 629 2936 18 0 3 chr5 5783868 5784196 -146753063 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 4 629 6454 59 19 12 chr5 5784198 5785021 -146752238 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 4 629 2767 61 0 3 chr5 5785014 5785357 -146751902 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1359 4 629 3537 97 13 29 chr5 5785357 5786171 -146751088 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 3 4 629 2976 9 0 3 chr5 5786173 5786500 -146750759 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 2 4 629 315 192 40 27 chr5 5789213 5789288 -146747971 + ORR1E LTR MaLR 284 359 0 4 629 272 307 0 66 chr5 5790550 5790672 -146746587 + MTEa LTR MaLR 69 182 -197 4 629 557 305 44 10 chr5 5790747 5790952 -146746307 + MTEa LTR MaLR 167 378 -1 4 629 1642 297 70 52 chr5 5790953 5791649 -146745610 + MTEa-int LTR MaLR 1 709 -871 4 629 469 255 51 7 chr5 5791776 5791914 -146745345 + MTEa-int LTR MaLR 1430 1573 -7 4 629 1412 298 40 70 chr5 5791922 5792318 -146744941 + ORR1A4-int LTR MaLR 856 1261 -319 4 629 1412 298 40 70 chr5 5793279 5793402 -146743857 + ORR1A4-int LTR MaLR 1262 1369 -211 4 629 689 341 42 25 chr5 5793406 5793689 -146743570 - MTE2a LTR MaLR -34 345 58 4 629 251 262 28 131 chr5 5793754 5793818 -146743441 + ORR1A4-int LTR MaLR 1348 1408 -101 4 629 359 264 28 90 chr5 5794017 5794134 -146743125 + ORR1A4-int LTR MaLR 1409 1534 -46 4 629 1307 248 46 38 chr5 5794153 5794522 -146742737 + MTEa LTR MaLR 6 377 -2 4 629 309 264 58 58 chr5 5794905 5795042 -146742217 - RMER20B LTR ERVK -25 602 466 4 629 1740 179 12 6 chr5 5797604 5797930 -146739329 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 4 629 1861 110 276 51 chr5 5805781 5806230 -146731029 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -68 586 37 4 629 244 182 227 0 chr5 5806270 5806336 -146730923 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -573 81 1 4 629 1006 155 36 10 chr5 5815104 5815300 -146721959 + RLTR41 LTR ERV1 246 446 0 4 629 621 261 97 17 chr5 5815656 5815894 -146721365 + MER34A1 LTR ERV1 223 479 -108 4 629 287 198 25 144 chr5 5818728 5818846 -146718413 - MT2B LTR ERVL -345 256 153 4 629 1758 146 0 91 chr5 5819915 5820062 -146717197 + MERVK26-int LTR ERVK 6633 6754 -165 5 629 1758 146 0 91 chr5 5820552 5820713 -146716546 + MERVK26-int LTR ERVK 6755 6913 -6 5 629 1210 194 223 9 chr5 5822153 5822480 -146714779 - RMER20B LTR ERVK -228 399 3 5 629 3414 92 106 16 chr5 5822631 5823148 -146714111 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 5 629 1855 147 6 158 chr5 5824299 5824793 -146712466 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 10 5 629 260 182 0 18 chr5 5825003 5825059 -146712200 - MER67D LTR ERV1 -309 402 348 5 629 242 298 24 0 chr5 5825105 5825189 -146712070 - MER67D LTR ERV1 -439 272 187 5 629 307 277 83 57 chr5 5825474 5825631 -146711628 - MER67D LTR ERV1 -353 161 1 5 629 409 341 130 45 chr5 5826141 5826648 -146710611 + MLT2B3 LTR ERVL 5 554 0 5 629 2002 164 238 0 chr5 5833858 5834328 -146702931 - RMER6C LTR ERVK -3 687 106 5 629 1838 135 44 9 chr5 5834874 5835217 -146702042 + RLTR15 LTR ERVK 1 355 -4 5 629 1724 154 311 78 chr5 5837426 5837912 -146699347 - MT2B LTR ERVL 0 601 3 5 629 865 295 139 14 chr5 5840745 5841185 -146696074 + MLT1D LTR MaLR 1 495 -10 5 629 537 289 88 46 chr5 5842941 5843082 -146694177 + LTR87 LTR ERVL? 279 422 -202 5 629 2154 104 3 63 chr5 5843082 5843432 -146693827 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 629 537 289 88 46 chr5 5843432 5843551 -146693708 + LTR87 LTR ERVL? 423 550 -74 5 629 1262 225 90 113 chr5 5847814 5848013 -146689246 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 301 5 629 1262 225 90 113 chr5 5848607 5848883 -146688376 - RLTR28B LTR ERVL -181 300 17 5 629 2029 238 79 19 chr5 5853128 5853651 -146683608 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 629 330 268 31 10 chr5 5856248 5856346 -146680913 - LTR53 LTR ERVL 0 519 420 5 629 684 322 67 40 chr5 5856481 5856808 -146680451 - LTR53 LTR ERVL -152 367 32 5 629 339 218 61 136 chr5 5857842 5858011 -146679248 - MTEb LTR MaLR -27 352 209 5 629 2416 182 83 21 chr5 5858071 5858538 -146678721 + RMER15 LTR ERVL 79 574 -1 5 629 2474 189 44 2 chr5 5859980 5860479 -146676780 + RLTR28 LTR ERVL 1 520 -4 5 629 548 299 127 29 chr5 5860762 5861038 -146676221 + ORR1E LTR MaLR 55 357 -2 5 629 3502 20 2 0 chr5 5864468 5864863 -146672396 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 629 363 287 78 51 chr5 5866018 5866267 -146670992 - MTE2b LTR MaLR 0 379 52 5 629 937 254 86 68 chr5 5868818 5869171 -146668088 - ORR1E LTR MaLR 0 379 4 5 629 3359 175 107 6 chr5 5873484 5874112 -146663147 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 1 6 629 1226 250 33 7 chr5 5874748 5875050 -146662209 + MTD LTR MaLR 11 320 -99 6 629 2233 187 152 46 chr5 5875083 5875734 -146661525 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 6 629 244 336 90 7 chr5 5875966 5876110 -146661149 + MER90 LTR ERV1 261 416 -159 6 629 1058 202 258 29 chr5 5877630 5877971 -146659288 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 629 261 361 102 16 chr5 5882330 5882404 -146654855 - MLT1H-int LTR MaLR -471 938 859 6 629 3403 38 0 0 chr5 5882404 5882800 -146654459 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 629 261 361 102 16 chr5 5882800 5882911 -146654348 - MLT1H-int LTR MaLR -551 858 737 6 629 243 341 135 21 chr5 5889387 5889528 -146647731 - MLT1H-int LTR MaLR -948 461 305 6 629 541 340 83 57 chr5 5891911 5892438 -146644821 - MLT1H LTR MaLR -4 545 5 6 629 2123 193 199 0 chr5 5893161 5893638 -146643621 + RMER15 LTR ERVL 4 575 0 6 630 231 245 0 19 chr5 5902226 5902280 -146634979 + MLT1B LTR MaLR 325 377 -13 6 630 939 293 33 90 chr5 5902626 5902919 -146634340 - MTD LTR MaLR -101 318 1 6 630 3703 18 5 0 chr5 5903164 5903558 -146633701 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 630 9452 42 12 0 chr5 5903558 5904643 -146632616 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 630 3571 33 5 0 chr5 5904643 5905037 -146632222 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 630 386 226 0 79 chr5 5911811 5911833 -146625426 - MLT1B LTR MaLR -1 389 375 6 630 1256 269 88 20 chr5 5911833 5912186 -146625073 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 6 630 386 245 9 58 chr5 5912186 5912305 -146624954 - MLT1B LTR MaLR -16 374 239 6 630 339 212 49 12 chr5 5916256 5916337 -146620922 + MTD LTR MaLR 6 89 -330 6 630 310 333 58 0 chr5 5926407 5926545 -146610714 - LTR16D LTR ERVL -17 634 489 6 630 349 323 86 40 chr5 5941358 5941532 -146595727 - ORR1E LTR MaLR -174 185 4 6 630 397 205 26 0 chr5 5944635 5944713 -146592546 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 449 6 630 645 319 67 67 chr5 5952518 5952834 -146584425 - MLT2D LTR ERVL -2 412 97 6 630 508 312 127 37 chr5 5953150 5953473 -146583786 - MLT1C LTR MaLR -8 459 108 6 630 243 306 47 0 chr5 5956020 5956100 -146581159 - MLT2B4 LTR ERVL -407 149 66 7 630 2508 104 17 27 chr5 5956100 5956513 -146580746 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 7 630 893 284 49 38 chr5 5969155 5969493 -146567766 + MLT2C2 LTR ERVL 42 363 -51 7 630 3728 183 72 73 chr5 5969990 5970880 -146566379 - RMER19B LTR ERVK -13 889 1 7 630 225 229 0 0 chr5 5973491 5973539 -146563720 + MLT1N2 LTR MaLR 493 540 -22 7 630 542 353 38 14 chr5 5974926 5975136 -146562123 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 175 7 630 634 225 6 96 chr5 5982438 5982456 -146554803 + ORR1D1 LTR MaLR 4 17 -357 7 630 634 239 181 61 chr5 5982933 5983198 -146554061 + ORR1D1 LTR MaLR 9 341 -29 7 630 1675 165 23 208 chr5 5983533 5984061 -146553198 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 7 630 744 262 120 52 chr5 5991692 5991996 -146545263 + MT2B LTR ERVL 156 511 -90 7 630 744 302 23 76 chr5 5992039 5992098 -146545161 + MT2B LTR ERVL 512 561 -40 7 630 234 92 30 30 chr5 5992181 5992248 -146545011 + MT2A LTR ERVL 467 533 0 7 630 1788 137 91 88 chr5 5998743 5999151 -146538108 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 7 630 2632 41 5 164 chr5 5999420 5999854 -146537405 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 7 630 1553 117 14 0 chr5 6010021 6010243 -146527016 + ORR1A2 LTR MaLR 1 225 -102 4 630 248 363 88 48 chr5 6012822 6013094 -146524165 + LTR84b LTR ERVL 467 749 -12 1 630 2756 84 36 26 chr5 6017445 6017862 -146519397 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 630 798 265 54 49 chr5 6021219 6021555 -146515704 + RLTR20D LTR ERVK 1 476 -102 2 630 434 247 119 32 chr5 6021639 6021730 -146515529 + RLTR20D LTR ERVK 437 561 -17 2 630 245 222 0 0 chr5 6022121 6022175 -146515084 + MLT2B4 LTR ERVL 62 115 -441 2 630 248 367 40 49 chr5 6022321 6022445 -146514814 + MLT2B1 LTR ERVL 392 515 -52 2 630 254 283 0 80 chr5 6022522 6022622 -146514637 - ORR1E LTR MaLR -174 185 94 2 631 1305 298 18 36 chr5 6030507 6030893 -146506366 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 631 304 230 159 11 chr5 6031443 6031531 -146505728 + MLT1B LTR MaLR 1 101 -289 4 631 249 300 21 32 chr5 6031713 6031806 -146505453 + MLT1B LTR MaLR 297 388 -2 4 631 417 314 36 76 chr5 6038824 6039048 -146498211 + MLT2B1 LTR ERVL 350 564 -3 4 631 364 267 104 11 chr5 6039053 6039235 -146498024 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1 199 -5515 4 631 3199 316 82 22 chr5 6039312 6040785 -146496474 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3609 5170 -544 4 631 3087 140 16 1 chr5 6041321 6041812 -146495447 - MT2B2 LTR ERVL -94 490 1 5 631 332 209 202 0 chr5 6041872 6042001 -146495258 + ERVL-B4-int LTR ERVL 5322 5476 -238 5 631 1766 176 17 77 chr5 6042326 6042721 -146494538 + ORR1B1 LTR MaLR 27 394 0 5 631 651 286 117 10 chr5 6042754 6043070 -146494189 + MLT2B4 LTR ERVL 7 373 -91 5 631 1323 220 102 31 chr5 6045883 6046235 -146491024 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 6 5 631 3472 28 0 0 chr5 6046903 6047299 -146489960 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 631 9223 31 1 2 chr5 6047299 6048398 -146488861 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 631 2602 55 7 3 chr5 6049339 6049706 -146487553 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -2 383 20 6 631 1227 352 85 48 chr5 6051646 6052781 -146484478 + ERVL-E-int LTR ERVL 645 1820 -3847 6 631 393 277 163 35 chr5 6063972 6064174 -146473085 + MER67C LTR ERV1 176 403 -308 8 631 1957 186 47 0 chr5 6069884 6070249 -146467010 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 8 631 414 330 26 57 chr5 6083412 6083640 -146453619 - RMER2 LTR ERV1 -18 549 329 1 631 371 293 144 16 chr5 6084545 6084739 -146452520 - RLTR42-int LTR ERVK -3664 1858 1640 1 631 558 196 34 34 chr5 6085097 6085219 -146452040 - RLTR18-int LTR ERVK -1892 3469 3345 1 631 558 196 34 34 chr5 6086444 6086469 -146450790 - RLTR18-int LTR ERVK -2017 3344 3322 1 631 447 231 48 0 chr5 6092718 6092822 -146444437 - RLTR18-int LTR ERVK -2063 3298 3190 1 631 1719 110 84 0 chr5 6092824 6093087 -146444172 + ORR1A2 LTR MaLR 1 285 -42 1 631 551 282 127 8 chr5 6093135 6093396 -146443863 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 104 1 631 313 192 0 0 chr5 6094617 6094669 -146442590 + ORR1A1 LTR MaLR 295 346 0 1 631 682 211 63 21 chr5 6094679 6094868 -146442391 - RLTR18-int LTR ERVK -2359 3002 2806 1 631 548 181 35 0 chr5 6096668 6096784 -146440475 - RLTR18-int LTR ERVK -2713 2648 2529 1 631 6488 58 2 23 chr5 6100336 6101175 -146436084 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 1 631 405 356 145 17 chr5 6104110 6104344 -146432915 + LTR16A LTR ERVL 122 385 -66 1 631 293 302 217 21 chr5 6107653 6107845 -146429414 - MTEa LTR MaLR -2 377 133 1 631 936 312 39 48 chr5 6108801 6109111 -146428148 - MTE-int LTR MaLR -211 1369 1063 1 631 1472 266 43 49 chr5 6114441 6114954 -146422305 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 3 1 631 231 279 59 79 chr5 6116931 6117032 -146420227 - MLT1E1A LTR MaLR -11 669 571 1 631 1882 199 5 28 chr5 6127200 6127587 -146409672 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 631 7032 107 9 7 chr5 6133751 6134782 -146402477 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 1033 0 1 631 1425 254 36 26 chr5 6142747 6143413 -146393846 - RMER19C LTR ERVK -16 886 1 1 631 1417 242 75 27 chr5 6146832 6147224 -146390035 - MTD LTR MaLR 0 400 1 1 631 322 368 30 30 chr5 6149783 6149951 -146387308 + MLT1F LTR MaLR 7 174 -374 1 631 1658 167 106 9 chr5 6150047 6150397 -146386862 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 631 4432 12 0 0 chr5 6151657 6152150 -146385109 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 631 1602 251 7 42 chr5 6158146 6158570 -146378689 - MTC LTR MaLR 0 421 13 2 632 1031 269 131 12 chr5 6169937 6170265 -146366994 + MTD LTR MaLR 1 367 -52 2 632 416 332 43 39 chr5 6174899 6175106 -146362153 + LTR79 LTR ERVL 297 504 -23 2 632 267 376 137 11 chr5 6176974 6177157 -146360102 + LTR33B LTR ERVL 79 284 -219 2 632 3003 8 5 71 chr5 6184072 6184465 -146352794 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 632 51142 33 12 19 chr5 6184465 6190984 -146346275 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 2 632 2938 8 5 101 chr5 6190984 6191390 -146345869 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 632 293 281 11 11 chr5 6192161 6192251 -146345008 + RLTR15 LTR ERVK 18 107 -252 2 632 675 324 76 49 chr5 6192294 6192700 -146344559 - RLTR17 LTR ERVK -74 618 202 2 632 1205 214 45 28 chr5 6194607 6194903 -146342356 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 46 2 632 485 206 28 9 chr5 6197358 6197466 -146339793 - ORR1B2 LTR MaLR -253 114 5 2 632 4541 141 22 95 chr5 6199399 6200376 -146336883 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 2 632 2491 185 75 2 chr5 6201327 6201783 -146335476 - RLTR19 LTR ERVK -10 489 1 2 632 1788 172 55 14 chr5 6201836 6202183 -146335076 - RLTR19-int LTR ERVK -1750 4387 4027 2 632 1210 184 56 114 chr5 6202615 6203158 -146334101 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 2 632 878 161 83 0 chr5 6204528 6204696 -146332563 + RLTR25A LTR ERVK 1 182 -921 2 632 1743 162 45 0 chr5 6204891 6205205 -146332054 + RLTR25A LTR ERVK 186 513 -590 2 632 6578 50 10 5 chr5 6206152 6206956 -146330303 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 2 632 2418 89 81 13 chr5 6227963 6228348 -146308911 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 632 5974 37 23 12 chr5 6228348 6229086 -146308173 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 2 632 2219 72 0 0 chr5 6229085 6229363 -146307896 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 2 632 3382 80 39 40 chr5 6229363 6230004 -146307255 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 2 632 244 302 0 0 chr5 6230004 6230057 -146307202 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 2 632 1139 120 40 84 chr5 6230057 6230333 -146306926 - IAPEz-int LTR ERVK -7329 252 10 2 632 317 167 107 0 chr5 6230330 6230414 -146306845 - IAPEz-int LTR ERVK -1892 95 3 2 632 2395 95 81 13 chr5 6230440 6230825 -146306434 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 632 1562 186 67 70 chr5 6233809 6234196 -146303063 + RLTR25A LTR ERVK 504 889 -214 2 632 871 198 85 121 chr5 6234406 6234688 -146302571 + RLTR25A LTR ERVK 832 1103 0 2 632 2483 175 131 19 chr5 6235431 6235725 -146301534 + RMER4B LTR ERVK 2 314 -271 2 632 4082 185 90 8 chr5 6235725 6236559 -146300700 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 2 632 2483 175 131 19 chr5 6236559 6236789 -146300470 + RMER4B LTR ERVK 315 584 -1 2 632 2413 212 27 4 chr5 6239449 6239961 -146297298 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 5 2 632 1004 262 167 92 chr5 6240395 6240929 -146296330 - RMER4B LTR ERVK -11 574 1 2 632 1875 205 67 13 chr5 6241163 6241549 -146295710 + MTC LTR MaLR 15 421 0 2 632 787 241 10 156 chr5 6243439 6243734 -146293525 + MTEb LTR MaLR 127 378 -1 2 632 2995 18 12 0 chr5 6248443 6248785 -146288474 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 632 3274 40 2 12 chr5 6255143 6255543 -146281716 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 632 983 248 112 70 chr5 6256312 6256519 -146280740 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 171 3 632 983 248 112 70 chr5 6256627 6256775 -146280484 - ORR1D1 LTR MaLR -204 170 1 3 632 434 298 37 37 chr5 6257100 6257264 -146279995 + ORR1E LTR MaLR 8 171 -188 3 632 2541 94 119 32 chr5 6257333 6257770 -146279489 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 632 4724 68 13 47 chr5 6257771 6258448 -146278811 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 3 632 967 59 0 0 chr5 6258448 6258567 -146278692 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 3 632 1842 107 8 0 chr5 6258562 6258814 -146278445 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 3 632 932 73 24 0 chr5 6258811 6258934 -146278325 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 3 632 26275 14 5 0 chr5 6258934 6261877 -146275382 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 3 632 2502 102 119 32 chr5 6261877 6262314 -146274945 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 632 351 232 12 35 chr5 6262314 6262399 -146274860 + ORR1E LTR MaLR 265 347 -32 3 632 522 282 60 11 chr5 6271451 6271634 -146265625 + LTR40b LTR ERVL 223 414 -48 3 632 539 269 141 12 chr5 6271688 6271929 -146265330 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 140 3 632 1757 221 13 28 chr5 6271970 6272458 -146264801 - RLTR45-int LTR ERVK -202 7042 6523 3 632 2289 329 49 40 chr5 6272586 6274508 -146262751 - IAP-d-int LTR ERVK -1335 5207 3268 3 632 293 208 0 0 chr5 6274565 6274637 -146262622 - IAP-d-int LTR ERVK -4230 3351 3280 3 632 964 283 55 45 chr5 6274637 6275129 -146262130 - IAP-d-int LTR ERVK -3833 2709 2213 3 632 258 211 54 32 chr5 6275221 6275314 -146261945 - IAP-d-int LTR ERVK -6389 153 59 3 632 404 202 61 52 chr5 6275300 6275415 -146261844 - RLTR45-int LTR ERVK -1554 433 318 3 632 533 245 150 33 chr5 6275431 6275679 -146261580 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 114 3 632 284 307 38 22 chr5 6279194 6279377 -146257882 + RLTR45-int LTR ERVK 181 366 -6878 3 632 2309 154 138 39 chr5 6279538 6280052 -146257207 + ETnERV2-int LTR ERVK 255 819 -4587 3 632 734 142 25 0 chr5 6280056 6280176 -146257083 + ETnERV2-int LTR ERVK 938 1060 -5077 3 632 873 200 0 6 chr5 6280189 6280345 -146256914 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2608 -4798 3 632 5582 165 75 33 chr5 6280345 6282169 -146255090 + ETnERV2-int LTR ERVK 1995 5465 -1779 3 632 1076 318 20 1 chr5 6282663 6283059 -146254200 + ETnERV2-int LTR ERVK 7411 7762 -455 3 632 394 303 6 84 chr5 6283108 6283274 -146253985 + ETnERV2-int LTR ERVK 6494 6646 -760 3 632 3082 52 31 0 chr5 6288014 6288398 -146248861 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 632 446 323 63 27 chr5 6288619 6288842 -146248417 + MER31B LTR ERV1 193 423 -43 3 633 372 267 248 49 chr5 6298511 6298818 -146238441 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 3 633 2254 196 20 2 chr5 6298889 6299293 -146237966 + MTC LTR MaLR 11 421 0 3 633 1052 217 23 14 chr5 6299292 6299507 -146237752 + MTC-int LTR MaLR 2 218 -1040 3 633 352 256 109 42 chr5 6303143 6303335 -146233924 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4238 4442 -1272 3 633 473 361 0 48 chr5 6303751 6303952 -146233307 + MLT2B1 LTR ERVL 149 340 -214 3 633 282 312 79 30 chr5 6304710 6304875 -146232384 - MLT1D LTR MaLR -332 173 1 3 633 1137 252 45 84 chr5 6308341 6308414 -146228845 + ORR1D1 LTR MaLR 3 76 -298 3 633 1137 252 45 84 chr5 6308757 6309064 -146228195 + ORR1D1 LTR MaLR 77 368 -6 3 633 299 223 122 78 chr5 6309074 6309254 -146228005 - MLT2B1 LTR ERVL -22 533 346 3 633 3511 15 2 0 chr5 6315398 6315793 -146221466 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 633 2865 87 19 7 chr5 6317632 6318048 -146219211 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 633 596 119 35 0 chr5 6318435 6318549 -146218710 + RMER3D-int LTR ERVK 486 583 -2259 3 633 1759 169 130 13 chr5 6318640 6319035 -146218224 + RMER3D-int LTR ERVK 1015 1435 -1407 3 633 3133 192 58 49 chr5 6319239 6320111 -146217148 + RMER3D-int LTR ERVK 1958 2837 -5 3 633 2891 91 5 7 chr5 6320116 6320538 -146216721 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 633 225 154 0 0 chr5 6326751 6326790 -146210469 + MT2A LTR ERVL 1 39 -494 3 633 384 317 26 42 chr5 6326857 6327048 -146210211 + MT2A LTR ERVL 193 380 -153 3 633 1201 246 59 90 chr5 6328463 6328922 -146208337 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 3 633 5103 110 57 4 chr5 6328922 6329708 -146207551 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 4579 3 633 1725 221 55 81 chr5 6329710 6330168 -146207091 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 633 17785 115 46 10 chr5 6330177 6331893 -146205366 - RMER16-int LTR ERVK -828 4578 2818 3 633 17785 122 46 18 chr5 6332827 6334534 -146202725 - RMER16-int LTR ERVK -2589 2817 1062 3 633 2469 93 60 23 chr5 6334534 6334920 -146202339 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 633 11168 136 46 33 chr5 6334920 6335204 -146202055 - RMER16-int LTR ERVK -4345 1061 798 3 633 432 184 243 18 chr5 6336906 6337017 -146200242 + MT2A LTR ERVL 192 327 -206 4 633 985 369 55 9 chr5 6345624 6346109 -146191150 - MT2A LTR ERVL 0 601 10 4 633 1192 262 206 32 chr5 6347092 6347533 -146189726 + RLTR20D LTR ERVK 51 568 0 4 633 889 271 171 13 chr5 6368281 6368662 -146168597 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 42 4 633 397 343 103 39 chr5 6371030 6371312 -146165947 + MTB LTR MaLR 11 310 -90 4 633 332 336 21 42 chr5 6374043 6374186 -146163073 - MLT1G LTR MaLR -202 389 250 4 633 524 342 96 23 chr5 6377503 6377805 -146159454 - RMER15 LTR ERVL -32 543 220 4 633 2332 226 112 108 chr5 6380942 6381410 -146155849 - RMER17B LTR ERVK -12 946 519 4 633 2332 226 112 108 chr5 6381717 6382184 -146155075 - RMER17B LTR ERVK -440 518 8 4 633 567 346 91 24 chr5 6390597 6391059 -146146200 + RMER5 LTR ERV1 40 532 -2 4 633 2152 118 10 0 chr5 6391526 6391832 -146145427 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 4 633 2892 79 13 10 chr5 6393377 6393772 -146143487 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 633 1973 150 77 8 chr5 6407773 6408150 -146129109 - RLTR9E LTR ERVK -6 403 1 5 633 1719 173 171 0 chr5 6412488 6412840 -146124419 + MTC LTR MaLR 10 421 0 5 634 1967 130 102 34 chr5 6423083 6423466 -146113793 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 5 634 1800 143 18 61 chr5 6423478 6423806 -146113453 + ORR1A4 LTR MaLR 1 314 -15 5 634 317 281 31 0 chr5 6429571 6429667 -146107592 - MLT1E1 LTR MaLR -3 651 553 5 634 612 322 17 6 chr5 6432407 6432588 -146104671 - ORR1E LTR MaLR -175 184 2 5 634 1923 114 16 35 chr5 6436425 6436743 -146100516 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 8 5 634 3003 71 2 21 chr5 6440581 6441010 -146096249 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 634 728 216 133 47 chr5 6443724 6444123 -146093136 - RMER6C LTR ERVK 0 720 216 5 634 406 183 168 21 chr5 6444127 6444222 -146093037 - RMER6C LTR ERVK -579 111 3 5 634 340 388 60 12 chr5 6444920 6445087 -146092172 - MLT1D LTR MaLR -135 370 196 5 634 1046 184 101 0 chr5 6445959 6446166 -146091093 + ORR1C2 LTR MaLR 1 228 -156 5 634 3308 170 48 27 chr5 6450539 6451168 -146086091 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 5 634 298 244 20 109 chr5 6453568 6453669 -146083590 + MT2B LTR ERVL 166 257 -344 5 634 2184 89 31 19 chr5 6456379 6456700 -146080559 - IAPLTR2b LTR ERVK -2 325 1 5 634 2478 144 15 22 chr5 6462945 6463351 -146073908 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 5 634 389 123 40 27 chr5 6463351 6463426 -146073833 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7331 5 634 3469 162 3 18 chr5 6463638 6464434 -146072825 - ETnERV2-int LTR ERVK -1179 6227 5686 5 634 2112 200 51 34 chr5 6464448 6465013 -146072246 - RMER16-int LTR ERVK -1983 3423 2849 5 634 3260 149 63 5 chr5 6465015 6465683 -146071576 - ETnERV2-int LTR ERVK -3643 3763 3057 5 634 3193 116 53 9 chr5 6472097 6472647 -146064612 - ETnERV2-int LTR ERVK -4337 3069 2496 5 634 5354 103 82 15 chr5 6472672 6473611 -146063648 - ETnERV2-int LTR ERVK -5321 2085 1083 5 634 5354 227 69 53 chr5 6473664 6474043 -146063216 - ETnERV2-int LTR ERVK -6324 1082 1060 5 634 276 186 0 0 chr5 6474051 6474094 -146063165 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 403 361 5 634 763 124 0 9 chr5 6474093 6474207 -146063052 - RLTR9B2 LTR ERVK -307 113 1 5 634 373 267 143 15 chr5 6474275 6474408 -146062851 - MTC LTR MaLR 0 421 272 5 634 2397 213 25 6 chr5 6475292 6475816 -146061443 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4096 1665 1132 5 634 4471 202 35 9 chr5 6475822 6476808 -146060451 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4735 1026 16 5 634 640 263 110 107 chr5 6476809 6477145 -146060114 - MT2A LTR ERVL -196 337 1 5 634 516 286 159 80 chr5 6483087 6483414 -146053845 + RMER4B LTR ERVK 36 388 -197 5 634 2342 115 210 27 chr5 6483540 6484021 -146053238 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 605 -49 5 634 64226 15 13 1 chr5 6484021 6491710 -146045549 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7778 0 5 634 2237 112 220 26 chr5 6491819 6492278 -146044981 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 5 634 1286 268 85 26 chr5 6495545 6496042 -146041217 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1038 4025 3533 6 634 562 269 35 16 chr5 6496372 6496616 -146040643 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1946 3117 2930 6 634 807 336 73 78 chr5 6496714 6497093 -146040166 - RLTR6-int LTR ERV1 -4675 3103 2720 6 634 807 337 68 77 chr5 6497134 6498774 -146038485 - RLTR6-int LTR ERV1 -5059 2719 1008 6 634 396 305 32 30 chr5 6498932 6499249 -146038010 - RLTR6-int LTR ERV1 -6796 810 526 6 634 372 180 66 57 chr5 6499824 6499930 -146037329 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 426 6 634 252 359 43 11 chr5 6501739 6501832 -146035427 - MLT1J1 LTR MaLR -283 161 66 7 634 2126 204 48 62 chr5 6504493 6505010 -146032249 - RLTR24 LTR ERV1 -19 510 1 1 634 815 264 36 14 chr5 6507102 6507325 -146029934 + RLTR42-int LTR ERVK 1160 1387 -4135 1 634 569 285 64 64 chr5 6507482 6507827 -146029432 - RLTR15 LTR ERVK -8 351 7 1 634 1017 150 60 64 chr5 6508328 6508643 -146028616 + ORR1A4-int LTR MaLR 1756 1962 -1 1 634 1238 168 51 72 chr5 6508644 6508920 -146028339 + ORR1A4 LTR MaLR 1 270 -59 1 634 241 354 95 0 chr5 6509923 6510081 -146027178 + RMER15 LTR ERVL 380 552 -23 2 634 3167 54 10 0 chr5 6516567 6516959 -146020300 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 634 2234 179 40 25 chr5 6517035 6517510 -146019749 - RLTR11A2 LTR ERVK -45 482 1 2 634 574 182 9 9 chr5 6518297 6518408 -146018851 + RLTR42-int LTR ERVK 2871 2981 -2541 2 634 672 241 101 9 chr5 6518464 6518682 -146018577 + RLTR42-int LTR ERVK 4002 4239 -1283 2 634 373 171 35 58 chr5 6530543 6530630 -146006629 + MTD LTR MaLR 3 87 -334 4 634 476 253 179 25 chr5 6530937 6531172 -146006087 + MTD LTR MaLR 149 419 0 4 634 3778 181 86 66 chr5 6531883 6532766 -146004493 + RMER19B LTR ERVK 2 902 0 4 634 958 248 36 0 chr5 6536500 6536722 -146000537 + ORR1D1 LTR MaLR 68 297 -77 5 634 259 404 57 6 chr5 6539507 6539664 -145997595 - LTR16E2 LTR ERVL -32 536 372 6 634 426 104 0 0 chr5 6540396 6540463 -145996796 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 356 6 634 3571 197 17 17 chr5 6542498 6543206 -145994053 - RMER6D LTR ERVK -12 708 1 6 634 3297 43 2 5 chr5 6552918 6553315 -145983944 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 79 7348 83 21 70 chr5 6553316 6554470 -145982789 - MTA_Mm-int LTR MaLR -1 1097 1 8 635 3082 43 5 18 chr5 6554470 6554871 -145982388 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 635 2147 121 15 6 chr5 6562134 6562468 -145974791 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 9 635 21547 75 43 19 chr5 6562468 6565465 -145971794 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 9 635 6485 61 12 18 chr5 6565451 6566306 -145970953 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6479 -2 9 635 2147 121 15 6 chr5 6566308 6566642 -145970617 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 9 635 3808 165 42 23 chr5 6567935 6568672 -145968587 - RMER6A LTR ERVK 0 756 6 9 635 606 199 40 54 chr5 6569011 6569160 -145968099 - ORR1C1 LTR MaLR -231 147 1 1 635 373 176 31 115 chr5 6573879 6573975 -145963284 - RLTR33 LTR ERVK -130 548 461 1 635 1674 166 23 70 chr5 6573975 6574264 -145962995 + ORR1A2 LTR MaLR 1 275 -52 1 635 1674 166 23 70 chr5 6574602 6574655 -145962604 + ORR1A2 LTR MaLR 276 327 0 1 635 548 169 62 10 chr5 6574655 6574846 -145962413 - RLTR33 LTR ERVK -213 465 182 1 635 533 271 93 79 chr5 6575621 6575837 -145961422 + MER67D LTR ERV1 37 255 -259 1 635 416 138 255 0 chr5 6575838 6575932 -145961327 - MTC LTR MaLR -297 124 7 1 635 730 343 45 50 chr5 6578277 6578655 -145958604 - MER74A LTR ERVL -61 497 122 1 635 1419 222 43 40 chr5 6582261 6582632 -145954627 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 1 635 1582 224 16 16 chr5 6582680 6583048 -145954211 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 1 635 3224 26 2 20 chr5 6590851 6591248 -145946011 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 635 11299 102 46 37 chr5 6591248 6593178 -145944081 - RLTR10-int LTR ERVK 0 1987 41 1 635 3224 26 2 20 chr5 6593188 6593585 -145943674 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 635 353 149 0 29 chr5 6597624 6597693 -145939566 - ORR1A4 LTR MaLR -261 68 2 1 635 1055 171 119 24 chr5 6598960 6599211 -145938048 - ORR1A4 LTR MaLR -52 277 3 1 635 415 318 60 20 chr5 6605634 6605785 -145931474 - MT2A LTR ERVL -114 419 263 1 635 272 260 82 52 chr5 6606022 6606156 -145931103 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1400 4361 4224 1 635 3733 104 19 8 chr5 6610713 6611284 -145925975 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 929 227 1 635 3119 130 38 15 chr5 6611257 6611788 -145925471 - RLTR13D1 LTR ERVK -359 543 1 1 635 1437 139 39 67 chr5 6612217 6612548 -145924711 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 635 1869 166 51 6 chr5 6612965 6613298 -145923961 + MTC LTR MaLR 1 348 -73 1 635 659 192 185 0 chr5 6613295 6613441 -145923818 + MTC LTR MaLR 248 420 -1 1 635 1063 259 21 14 chr5 6614984 6615266 -145921993 - MTD LTR MaLR -135 284 1 1 635 2900 12 0 43 chr5 6619922 6620274 -145916985 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 635 1580 138 12 81 chr5 6623103 6623449 -145913810 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 635 2827 218 14 11 chr5 6630978 6631539 -145905720 + RLTR17 LTR ERVK 108 670 -22 1 635 4336 130 46 42 chr5 6645025 6645828 -145891431 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 1 2 635 4119 49 8 10 chr5 6646022 6646535 -145890724 - LTRIS3 LTR ERV1 0 512 1 2 635 631 271 41 78 chr5 6649040 6649284 -145887975 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 794 2 635 2963 172 133 103 chr5 6649384 6650201 -145887058 - RLTR25B LTR ERVK -175 853 12 2 635 588 292 41 0 chr5 6650437 6650584 -145886675 - MTEa LTR MaLR -209 170 18 2 635 2401 318 74 49 chr5 6652500 6653636 -145883623 - MTE2b-int LTR MaLR -313 1267 104 2 635 287 262 26 1 chr5 6653841 6653926 -145883333 - MTE2b LTR MaLR -273 106 21 2 635 425 245 51 0 chr5 6653998 6654096 -145883163 - MTE2b-int LTR MaLR -1477 103 1 2 635 988 281 55 111 chr5 6654096 6654476 -145882783 - MTE2b LTR MaLR -3 376 18 2 635 236 282 33 66 chr5 6661471 6661623 -145875636 - MER67D LTR ERV1 -360 154 8 2 635 523 336 81 14 chr5 6662620 6662843 -145874416 + ORR1E LTR MaLR 1 238 -121 2 635 838 154 273 115 chr5 6669982 6670260 -145866999 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 635 475 325 46 7 chr5 6670944 6671096 -145866163 + MTEa LTR MaLR 39 196 -183 2 635 2414 181 165 104 chr5 6672017 6672701 -145864558 + RMER19A LTR ERVK 9 734 -3 2 635 1267 256 77 17 chr5 6673100 6673453 -145863806 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 635 852 94 113 18 chr5 6676147 6676305 -145860954 + RLTR9E LTR ERVK 1 173 -247 2 635 447 122 1 45 chr5 6676305 6676393 -145860866 + ETnERV2-int LTR ERVK 1879 1954 -5452 2 635 1035 106 165 10 chr5 6676393 6676593 -145860666 - RLTR9E LTR ERVK -178 231 1 2 79 2155 101 27 45 chr5 6684393 6684726 -145852533 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 2 636 5077 62 14 16 chr5 6684726 6685434 -145851825 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5775 2 636 3046 11 0 0 chr5 6685434 6685794 -145851465 - IAPEz-int LTR ERVK -2121 4360 4001 2 636 10599 70 73 25 chr5 6685792 6688351 -145848908 - IAPEz-int LTR ERVK -3707 2774 168 2 636 231 345 0 0 chr5 6688351 6688406 -145848853 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 2 636 866 156 27 32 chr5 6688406 6688592 -145848667 - IAPEz-int LTR ERVK -6288 193 9 2 636 2160 98 27 45 chr5 6688593 6688926 -145848333 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 2 636 1795 131 84 0 chr5 6691578 6691876 -145845383 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 35 2 636 2052 176 6 19 chr5 6696126 6696490 -145840769 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 3 636 2684 247 107 43 chr5 6698396 6699373 -145837886 + ORR1B2-int LTR MaLR 288 1293 -77 3 636 1239 260 57 83 chr5 6707308 6707744 -145829515 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 6 3 636 288 300 104 17 chr5 6707950 6708123 -145829136 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -201 7577 7390 3 636 708 341 76 53 chr5 6708150 6709553 -145827706 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3194 4584 3004 3 636 1884 141 56 104 chr5 6709553 6709966 -145827293 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 3 636 708 350 77 50 chr5 6709966 6710963 -145826296 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -4496 3060 2012 3 636 435 371 39 23 chr5 6711159 6711597 -145825662 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -5805 1751 1307 3 636 1128 250 78 89 chr5 6713362 6713700 -145823559 - RLTR23 LTR ERV1 -3 427 89 3 636 1128 250 78 89 chr5 6713749 6713836 -145823423 - RLTR23 LTR ERV1 -342 88 7 3 636 1532 249 117 58 chr5 6713905 6714557 -145822702 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 636 1981 120 55 0 chr5 6716208 6716516 -145820743 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 3 636 239 367 43 37 chr5 6718072 6718236 -145819023 - MLT1N2 LTR MaLR -387 175 11 3 636 1792 137 64 51 chr5 6718653 6719171 -145818088 + RLTR45 LTR ERVK 1 476 -6 3 636 229 219 47 0 chr5 6721650 6721714 -145815545 - MTEb LTR MaLR -18 361 295 3 636 466 318 104 78 chr5 6725977 6726514 -145810745 + RMER13A LTR ERVK 111 681 -227 3 636 801 301 67 44 chr5 6734543 6734904 -145802355 + RMER13A LTR ERVK 98 466 -394 3 636 1437 229 36 72 chr5 6781853 6782032 -145755227 + ORR1C1 LTR MaLR 1 163 -215 3 636 1437 229 36 72 chr5 6782097 6782307 -145754952 + ORR1C1 LTR MaLR 164 376 -2 3 636 3305 35 5 0 chr5 6785079 6785473 -145751786 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 636 833 298 34 59 chr5 6789787 6790111 -145747148 - MTE2a LTR MaLR 0 379 64 4 636 2097 342 35 27 chr5 6790326 6791452 -145745807 + RodERV21-int LTR ERV1 3171 4306 -685 4 636 914 316 26 37 chr5 6791564 6791992 -145745267 + RodERV21-int LTR ERV1 4463 4885 -106 4 636 4322 142 28 95 chr5 6795138 6796074 -145741185 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 873 -29 4 636 882 325 63 29 chr5 6796705 6797054 -145740205 + MTEa LTR MaLR 6 366 -13 4 636 642 259 26 114 chr5 6799827 6800054 -145737205 - MTEb LTR MaLR -32 347 141 4 636 2373 132 54 95 chr5 6801584 6802087 -145735172 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 636 4801 90 23 33 chr5 6802087 6802786 -145734473 + RLTR45-int LTR ERVK 1 692 -6552 4 636 1705 82 0 0 chr5 6803142 6803361 -145733898 + RLTR45-int LTR ERVK 692 910 -6334 4 636 732 154 0 0 chr5 6803472 6803595 -145733664 + RLTR45-int LTR ERVK 905 1027 -6217 4 636 350 356 24 17 chr5 6803911 6804208 -145733051 + RLTR45-int LTR ERVK 2246 2544 -3623 4 636 2583 39 26 0 chr5 6804471 6804783 -145732476 + RLTR45-int LTR ERVK 1329 1648 -5596 4 636 7344 152 13 13 chr5 6804872 6806276 -145730983 + RLTR45-int LTR ERVK 6331 7761 -456 4 636 2974 196 138 72 chr5 6807227 6808110 -145729149 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 4 637 780 51 0 0 chr5 6816037 6816135 -145721124 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 299 4 637 5602 89 16 38 chr5 6816135 6817030 -145720229 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 1 4 637 1916 55 114 0 chr5 6817030 6817303 -145719956 - MTA_Mm LTR MaLR -92 304 1 4 637 271 346 57 69 chr5 6828979 6829081 -145708178 - MLT1D LTR MaLR -2 503 396 4 637 2864 52 0 0 chr5 6829546 6829892 -145707367 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 637 271 346 57 69 chr5 6830165 6830307 -145706952 - MLT1D LTR MaLR -110 395 263 4 637 231 305 19 87 chr5 6831479 6831583 -145705676 + RLTR33 LTR ERVK 490 586 -92 4 637 3590 54 21 6 chr5 6834810 6835278 -145701981 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 637 1694 199 64 72 chr5 6853295 6853684 -145683575 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 637 3289 182 37 11 chr5 6853689 6854311 -145682948 + ORR1B1-int LTR MaLR 2 639 -1324 4 637 1090 248 29 136 chr5 6854341 6854356 -145682903 + ORR1B1-int LTR MaLR 583 611 -1352 4 637 1112 192 36 116 chr5 6854356 6854633 -145682626 + MT2B LTR ERVL 3 257 -344 4 637 1090 248 29 136 chr5 6854633 6854827 -145682432 + ORR1B1-int LTR MaLR 612 1016 -947 4 637 367 331 65 42 chr5 6869380 6869694 -145667565 + MTEb LTR MaLR 5 377 -2 5 637 441 213 94 8 chr5 6878622 6878750 -145658509 + RLTR21 LTR ERVK 955 1093 -479 5 637 254 105 0 0 chr5 6883770 6883808 -145653451 + MER57A-int LTR ERV1 1110 1147 -5040 5 637 462 297 393 73 chr5 6887604 6887866 -145649393 - ORR1E LTR MaLR -2 357 13 5 637 3340 41 30 94 chr5 6888964 6889472 -145647787 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 637 3536 84 16 28 chr5 6889473 6890288 -145646971 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 5 637 2135 86 0 0 chr5 6890288 6890566 -145646693 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 5 637 5717 68 14 0 chr5 6890565 6891299 -145645960 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 5 637 3231 31 124 12 chr5 6891301 6891728 -145645531 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 637 654 199 59 0 chr5 6918586 6918722 -145618537 + RodERV21-int LTR ERV1 143 286 -4705 5 637 1006 288 53 48 chr5 6918727 6919125 -145618134 + RodERV21-int LTR ERV1 455 854 -4137 5 637 503 200 201 48 chr5 6919383 6919651 -145617608 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 276 5 637 822 130 12 99 chr5 6919664 6919835 -145617424 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -498 156 1 5 637 732 256 63 43 chr5 6920299 6920917 -145616342 + RLTR42-int LTR ERVK 1863 2255 -3267 5 637 530 282 91 102 chr5 6922295 6923139 -145614120 + RLTR19-int LTR ERVK 2607 3962 -2175 5 637 2542 138 39 47 chr5 6927018 6927504 -145609755 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 637 2261 172 5 8 chr5 6932759 6933146 -145604113 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 5 637 2627 159 26 68 chr5 6938872 6939458 -145597801 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 6 79 667 307 70 0 chr5 6946683 6946911 -145590348 + MTD LTR MaLR 176 419 0 6 638 440 275 107 85 chr5 6978593 6978863 -145558396 + RMER20B LTR ERVK 90 365 -262 6 638 2293 200 86 78 chr5 6988681 6989365 -145547894 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 6 638 1132 301 30 33 chr5 6989369 6989478 -145547781 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 258 6 638 1132 301 30 33 chr5 6989671 6989922 -145547337 - ORR1D2 LTR MaLR -113 257 6 6 638 1815 236 199 4 chr5 6989969 6990536 -145546723 - ORR1D2-int LTR MaLR -679 691 14 6 638 1111 282 64 9 chr5 6990551 6990880 -145546379 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 20 6 638 1280 252 67 18 chr5 6995056 6995399 -145541860 - ORR1B2 LTR MaLR -7 360 1 6 638 417 175 23 13 chr5 6995874 6995965 -145541294 + MTC LTR MaLR 288 421 0 6 638 708 351 67 23 chr5 6996204 6996595 -145540664 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 1 6 638 2993 154 66 158 chr5 6999207 7000000 -145537259 - RLTR21 LTR ERVK -25 1547 828 6 638 2907 139 141 7 chr5 7000000 7000729 -145536530 - RLTR21 LTR ERVK -745 827 1 1 638 2967 84 2 38 chr5 7001718 7002140 -145535119 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 638 681 212 234 22 chr5 7004195 7004570 -145532689 + RMER6C LTR ERVK 1 497 -223 1 638 1326 85 70 0 chr5 7005047 7005247 -145532012 - RLTR27 LTR ERVK -95 214 1 1 638 2308 201 35 4 chr5 7009205 7009689 -145527570 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 1 638 543 289 19 26 chr5 7018164 7018320 -145518939 + MTE2b LTR MaLR 221 375 -4 2 638 1606 52 9 19 chr5 7026374 7026590 -145510669 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 183 4 638 1250 128 10 0 chr5 7027429 7027624 -145509635 - MTA_Mm LTR MaLR -203 197 1 4 638 637 303 58 98 chr5 7031614 7031991 -145505268 + MTE2a LTR MaLR 8 369 -10 5 638 357 344 182 13 chr5 7051812 7051971 -145485288 + RMER15 LTR ERVL 300 485 -90 7 638 3330 25 8 0 chr5 7054719 7055112 -145482147 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 638 436 340 94 26 chr5 7057340 7057635 -145479624 - ORR1E LTR MaLR -31 348 8 8 638 4078 36 0 0 chr5 7062328 7062800 -145474459 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 4 8 638 595 322 52 44 chr5 7064073 7064440 -145472819 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 8 638 268 377 19 6 chr5 7076474 7076634 -145460625 + MLT1B LTR MaLR 6 167 -223 1 639 807 210 172 40 chr5 7078290 7078612 -145458647 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 639 3015 41 5 53 chr5 7082645 7082881 -145454378 + MTA_Mm LTR MaLR 1 219 -177 1 639 3015 41 5 53 chr5 7083649 7083828 -145453431 + MTA_Mm LTR MaLR 220 396 0 1 639 423 163 0 140 chr5 7093070 7093177 -145444082 - MT2B LTR ERVL -337 264 173 1 639 719 329 25 17 chr5 7101211 7101449 -145435810 + MTE2b LTR MaLR 1 240 -139 1 639 389 246 58 39 chr5 7111172 7111318 -145425941 + MTE2b LTR MaLR 256 406 -13 1 639 2011 110 24 59 chr5 7120970 7121307 -145415952 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 1 639 226 276 27 54 chr5 7127018 7127129 -145410130 + RLTR13B4 LTR ERVK 160 267 -536 1 639 347 65 0 0 chr5 7130657 7130703 -145406556 - RLTR13D5 LTR ERVK -115 908 863 1 639 992 278 16 8 chr5 7138823 7139066 -145398193 + MTD LTR MaLR 146 390 -29 1 639 1802 161 29 11 chr5 7141897 7142248 -145395011 + RLTR15 LTR ERVK 3 359 0 2 639 2450 64 61 0 chr5 7142381 7142707 -145394552 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 639 514 321 22 49 chr5 7143492 7143718 -145393541 - MLT1B LTR MaLR -122 268 49 2 639 486 281 353 8 chr5 7151778 7152027 -145385232 + ORR1D2 LTR MaLR 33 367 -3 2 639 244 261 106 112 chr5 7155900 7156060 -145381199 + RMER15 LTR ERVL 2 160 -415 2 639 513 164 0 76 chr5 7160999 7161118 -145376141 + RMER3D-int LTR ERVK 2731 2840 -2 2 639 1981 144 311 5 chr5 7161120 7161567 -145375692 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 2 639 1138 197 133 68 chr5 7169795 7170133 -145367126 + ORR1C2 LTR MaLR 25 384 0 2 639 3529 20 0 0 chr5 7175025 7175421 -145361838 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 639 6779 27 2 0 chr5 7175421 7176247 -145361012 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 271 2 639 236 362 127 22 chr5 7182010 7182191 -145355068 - MLT1D LTR MaLR 0 505 306 2 639 538 307 36 26 chr5 7182246 7182440 -145354819 - MLT1D LTR MaLR -298 207 12 2 639 359 306 81 87 chr5 7191169 7191341 -145345918 - MLT2B2 LTR ERVL -192 328 158 2 639 770 241 82 13 chr5 7191341 7191572 -145345687 + ORR1D1 LTR MaLR 1 247 -127 2 639 307 235 167 86 chr5 7191683 7191869 -145345390 + ORR1A1 LTR MaLR 119 319 -27 2 639 258 172 86 0 chr5 7191884 7191942 -145345317 + ORR1A1 LTR MaLR 310 372 -2 2 639 440 278 118 0 chr5 7191945 7192089 -145345170 - MLT2B2 LTR ERVL -354 161 1 2 639 1245 224 73 10 chr5 7195589 7195877 -145341382 - MTC LTR MaLR 0 421 116 2 639 1330 216 52 15 chr5 7206542 7206867 -145330392 + RMER6C LTR ERVK 1 337 -353 2 640 916 262 60 111 chr5 7209122 7209508 -145327751 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 2 640 1241 290 56 35 chr5 7209532 7209583 -145327676 - MTD LTR MaLR -18 401 353 2 640 1241 290 56 35 chr5 7209614 7209937 -145327322 - MTD LTR MaLR -67 352 19 2 640 303 349 80 75 chr5 7218461 7218848 -145318411 - MT2A LTR ERVL -142 391 3 3 640 492 245 138 50 chr5 7222149 7222308 -145314951 - MT2B LTR ERVL -344 257 85 3 640 2599 172 44 92 chr5 7224051 7224691 -145312568 - RMER19C LTR ERVK -2 609 1 3 640 449 331 38 60 chr5 7232747 7233119 -145304140 - MTEb LTR MaLR 0 379 10 3 640 722 247 147 21 chr5 7237892 7238082 -145299177 - MTE2b LTR MaLR -59 320 107 3 640 1853 226 119 20 chr5 7238138 7238408 -145298851 - RLTR20B2 LTR ERVK -4 556 267 3 640 1853 226 119 20 chr5 7238441 7238676 -145298583 - RLTR20B2 LTR ERVK -294 266 3 3 640 394 252 72 16 chr5 7241478 7241603 -145295656 - MER77 LTR ERVL -6 601 470 3 640 1734 214 71 0 chr5 7258513 7258877 -145278382 + ORR1B1 LTR MaLR 1 390 -4 3 640 516 244 5 188 chr5 7260018 7260220 -145277039 - MT2A LTR ERVL -368 165 1 3 640 2650 101 28 8 chr5 7260990 7261389 -145275870 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 640 508 181 0 62 chr5 7275463 7275496 -145261763 + ORR1D1 LTR MaLR 1 32 -342 4 640 1935 179 30 22 chr5 7275496 7275857 -145261402 - ORR1B2 LTR MaLR -3 364 1 4 640 508 181 0 62 chr5 7275857 7275935 -145261324 + ORR1D1 LTR MaLR 33 105 -269 4 640 1362 227 66 30 chr5 7277342 7277674 -145259585 - ORR1B1 LTR MaLR -10 384 41 4 640 234 191 0 0 chr5 7281850 7281897 -145255362 + RMER6A LTR ERVK 1 47 -414 4 640 1030 195 15 5 chr5 7281910 7282116 -145255143 + RMER6A LTR ERVK 549 756 0 4 640 2223 98 6 0 chr5 7282493 7282810 -145254449 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 640 4686 126 23 59 chr5 7293050 7293883 -145243376 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 4 640 1072 223 169 21 chr5 7297831 7298157 -145239102 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 640 678 364 151 25 chr5 7306556 7306988 -145230271 + MLT1G1 LTR MaLR 9 494 -85 4 640 2990 60 13 0 chr5 7309735 7310120 -145227139 + MTA_Mm LTR MaLR 1 390 -6 4 640 305 247 98 55 chr5 7311274 7311437 -145225822 - ORR1E LTR MaLR -39 320 151 4 640 1626 171 23 67 chr5 7318974 7319318 -145217941 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 640 234 189 83 120 chr5 7321979 7322087 -145215172 + MLT1F-int LTR MaLR 24 127 -1362 4 640 388 273 64 40 chr5 7328083 7328279 -145208980 + LTR33B LTR ERVL 10 216 -315 4 640 1494 181 35 119 chr5 7330342 7330738 -145206521 + ORR1B2 LTR MaLR 1 363 -4 4 640 362 316 135 51 chr5 7336078 7336315 -145200944 - MLT1D LTR MaLR -8 497 241 4 641 702 288 164 45 chr5 7348859 7349255 -145188004 + MLT1C LTR MaLR 18 460 -7 5 641 1585 225 36 44 chr5 7357811 7358224 -145179035 - RLTR42-int LTR ERVK -3988 1534 1125 5 641 1605 216 46 19 chr5 7358646 7359014 -145178245 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 641 3069 146 4 4 chr5 7363357 7363844 -145173415 + RLTR1C LTR ERV1 2 488 -15 5 641 2221 148 12 22 chr5 7364729 7365142 -145172117 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 641 4576 142 108 17 chr5 7373228 7373596 -145163663 + RMER17A2 LTR ERVK 1 453 -453 5 641 4576 142 108 17 chr5 7373670 7374131 -145163128 + RMER17A2 LTR ERVK 454 905 -1 5 641 462 271 9 0 chr5 7374143 7374250 -145163009 - ORR1D1 LTR MaLR -17 357 250 5 641 586 299 19 0 chr5 7374294 7374451 -145162808 - ORR1D1 LTR MaLR -214 160 1 5 641 587 268 36 12 chr5 7379093 7379259 -145158000 - MTD LTR MaLR -232 187 18 5 641 1824 257 32 24 chr5 7380234 7380732 -145156527 + RMER19C LTR ERVK 110 611 0 5 641 291 271 154 92 chr5 7381237 7381477 -145155782 + LTR85c LTR Gypsy? 428 682 -141 5 641 1732 153 14 70 chr5 7386868 7387212 -145150047 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 1 5 641 515 313 211 36 chr5 7394479 7394978 -145142281 + MLT1E3 LTR MaLR 40 624 0 5 641 235 286 20 39 chr5 7395234 7395334 -145141925 + MLT2B2 LTR ERVL 16 113 -402 5 641 2004 204 24 44 chr5 7395334 7395744 -145141515 - MTC LTR MaLR 0 421 20 5 641 229 341 112 16 chr5 7395735 7395860 -145141399 + MLT2B2 LTR ERVL 186 322 -193 5 641 836 328 91 87 chr5 7406430 7406948 -145130311 - MT2A LTR ERVL -13 520 1 5 641 5289 136 0 0 chr5 7409426 7410193 -145127066 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3723 2038 1272 5 641 2861 87 5 10 chr5 7416992 7417389 -145119870 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 6 641 535 270 143 0 chr5 7425392 7425618 -145111641 + MTD LTR MaLR 140 419 0 6 641 2691 96 8 10 chr5 7428248 7428650 -145108609 - RLTR45 LTR ERVK 0 403 3 6 641 17746 42 13 5 chr5 7428879 7431041 -145106218 - RLTR45-int LTR ERVK -1 7243 5065 6 641 3905 85 30 33 chr5 7431034 7431643 -145105616 - RLTR45-int LTR ERVK -3258 3986 3380 6 641 11783 42 39 6 chr5 7431613 7433444 -145103815 - RLTR45-int LTR ERVK -4032 3212 1322 6 641 263 227 43 43 chr5 7433739 7433831 -145103428 - MMTV-int LTR ERVK -4749 2504 2413 6 641 1119 58 0 0 chr5 7434231 7434369 -145102890 - RLTR45-int LTR ERVK -6426 818 681 6 641 4755 50 87 16 chr5 7434667 7435313 -145101946 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 1 6 641 3187 81 56 15 chr5 7435313 7435776 -145101483 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 6 641 466 361 93 45 chr5 7439549 7439839 -145097420 + ORR1E LTR MaLR 13 316 -43 6 641 898 319 81 32 chr5 7442072 7442117 -145095142 - MTEa LTR MaLR -54 325 267 6 641 2998 128 72 110 chr5 7442117 7442742 -145094517 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 641 898 319 81 32 chr5 7442742 7443004 -145094255 - MTEa LTR MaLR -113 266 3 6 641 313 275 0 0 chr5 7443767 7443847 -145093412 - LTR68 LTR ERV1 -2 738 659 6 641 3123 76 2 0 chr5 7453072 7453467 -145083792 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 641 2070 213 27 152 chr5 7455619 7456317 -145080942 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 641 525 141 12 0 chr5 7460938 7461023 -145076236 + MTC LTR MaLR 1 86 -335 6 641 1850 205 55 5 chr5 7462561 7462958 -145074301 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 6 641 2384 111 123 19 chr5 7465586 7466016 -145071243 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 641 4078 82 27 42 chr5 7466017 7466764 -145070495 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 6 641 2189 72 0 0 chr5 7466764 7467042 -145070217 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 6 641 6109 39 3 19 chr5 7467041 7467799 -145069460 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6481 0 6 641 2361 116 123 19 chr5 7467799 7468229 -145069030 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 642 472 253 92 19 chr5 7471394 7471580 -145065679 - MTD LTR MaLR -14 405 193 6 642 270 257 0 75 chr5 7479678 7479758 -145057501 - RLTR22_Mus LTR ERVK -193 1615 1542 6 642 4224 169 84 43 chr5 7479925 7480756 -145056503 - RLTR22_Mur LTR ERVK -815 1033 173 6 642 4224 169 84 43 chr5 7480824 7480983 -145056276 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1676 172 5 6 642 788 281 95 71 chr5 7491873 7492210 -145045049 - MLT1C LTR MaLR -8 459 115 6 642 2839 25 5 59 chr5 7492597 7492985 -145044274 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 642 1017 119 74 0 chr5 7492985 7493161 -145044098 + IAPEz-int LTR ERVK 8 196 -6285 6 642 1047 142 16 21 chr5 7493132 7493319 -145043940 + MMERVK10C-int LTR ERVK 67 252 -7329 6 642 2317 26 0 0 chr5 7493319 7493584 -145043675 + IAPEz-int LTR ERVK 5290 5554 -927 6 642 6972 30 4 1 chr5 7493574 7494386 -145042873 + IAPEz-int LTR ERVK 5668 6481 0 6 642 2839 25 5 59 chr5 7494386 7494774 -145042485 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 642 401 332 58 95 chr5 7497644 7497970 -145039289 + RLTR25A LTR ERVK 1 314 -789 6 642 1432 245 25 30 chr5 7516824 7517190 -145020069 - RMER19C LTR ERVK 0 611 248 1 642 1410 256 103 11 chr5 7520541 7520920 -145016339 - MTD LTR MaLR -5 414 1 1 642 4426 18 0 0 chr5 7525493 7525986 -145011273 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 642 45282 15 7 0 chr5 7525986 7531319 -145005940 + MERVL-int LTR ERVL 1 5371 -114 2 642 399 123 13 40 chr5 7531319 7531395 -145005864 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 2 642 302 0 0 0 chr5 7531395 7531433 -145005826 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 2 642 4439 16 0 0 chr5 7531433 7531926 -145005333 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 642 1561 111 95 0 chr5 7552944 7553197 -144984062 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 81 357 0 5 642 29451 71 10 2 chr5 7553197 7557739 -144979520 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 4601 -3079 5 642 17488 128 16 3 chr5 7557737 7560590 -144976669 + IAPEY3-int LTR ERVK 4790 7678 -2 5 642 1869 118 81 0 chr5 7560598 7560895 -144976364 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 35 355 -2 5 642 2273 252 77 96 chr5 7560949 7561952 -144975307 + RMER17B LTR ERVK 1 856 -4 5 642 318 350 0 79 chr5 7579773 7579925 -144957334 - RLTR18 LTR ERVK -157 459 320 8 642 535 328 56 72 chr5 7579976 7580205 -144957054 - RLTR18 LTR ERVK -302 314 98 8 642 535 328 56 72 chr5 7580245 7580334 -144956925 - RLTR18 LTR ERVK -519 97 1 8 642 240 374 55 70 chr5 7584319 7584520 -144952739 - RMER13A LTR ERVK -93 815 618 9 642 900 292 75 73 chr5 7584533 7584577 -144952682 - RMER13A LTR ERVK -392 468 425 9 642 4533 85 14 138 chr5 7584577 7585434 -144951825 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 9 642 900 292 75 73 chr5 7585434 7585855 -144951404 - RMER13A LTR ERVK -436 424 2 9 642 1988 135 22 0 chr5 7586051 7586363 -144950896 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 642 10028 128 118 12 chr5 7586365 7588128 -144949131 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 15 1 642 2076 130 12 6 chr5 7588128 7588453 -144948806 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 642 1672 225 95 56 chr5 7590674 7591338 -144945921 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 642 717 355 115 29 chr5 7593088 7593594 -144943665 + MLT1F2 LTR MaLR 1 567 -2 1 642 1870 153 148 0 chr5 7599383 7599748 -144937511 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 1 80 869 276 27 54 chr5 7602049 7602309 -144934950 + MTEb LTR MaLR 127 379 0 1 643 2826 63 47 0 chr5 7608525 7608907 -144928352 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 643 719 297 173 94 chr5 7609404 7609947 -144927312 - RLTR18 LTR ERVK -27 589 4 1 643 866 374 35 43 chr5 7611170 7611682 -144925577 - MT2A LTR ERVL -16 517 10 1 643 1943 109 49 65 chr5 7613647 7613971 -144923288 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 643 407 309 49 35 chr5 7614115 7614253 -144923006 - MLT1C LTR MaLR -294 173 34 1 643 795 219 115 24 chr5 7632176 7632429 -144904830 + RMER4B LTR ERVK 17 292 -293 1 643 319 250 42 127 chr5 7632451 7632616 -144904643 + RMER4B LTR ERVK 421 571 -14 1 643 1778 154 28 79 chr5 7645749 7646180 -144891079 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 1 643 267 303 128 0 chr5 7646360 7646469 -144890790 - MLT1B LTR MaLR -258 132 10 1 643 2128 112 38 0 chr5 7651160 7651474 -144885785 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 643 250 342 60 30 chr5 7659465 7659700 -144877559 - RLTR15 LTR ERVK -32 327 86 1 643 362 330 62 33 chr5 7659675 7659885 -144877374 - RLTR12B LTR ERVK -308 220 5 1 643 230 428 36 67 chr5 7660796 7661019 -144876240 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 315 530 -538 1 643 483 332 123 37 chr5 7662057 7662326 -144874933 + RMER15 LTR ERVL 273 564 -11 1 643 251 304 83 42 chr5 7676243 7676363 -144860896 + MER70A LTR ERVL 52 176 -402 2 643 414 392 126 0 chr5 7676439 7676694 -144860565 + MER70A LTR ERVL 185 471 -1 2 643 574 294 68 129 chr5 7678387 7678978 -144858281 + RMER13A LTR ERVK 1 599 -28 2 643 410 285 116 6 chr5 7679577 7679750 -144857509 - MTEb LTR MaLR -12 367 176 2 643 1527 288 89 31 chr5 7679732 7680251 -144857008 - MTE-int LTR MaLR -401 1179 631 2 643 320 296 0 0 chr5 7680311 7680399 -144856860 - MTE-int LTR MaLR -322 1258 1171 2 643 1109 335 103 55 chr5 7693786 7694491 -144842768 + MER54B LTR ERVL 49 787 -6 2 643 1311 176 181 25 chr5 7702955 7703276 -144833983 + ORR1C1 LTR MaLR 1 371 -7 2 643 1223 230 10 38 chr5 7704573 7704866 -144832393 - RLTR12B LTR ERVK -7 521 237 2 643 1379 169 25 62 chr5 7704873 7705191 -144832068 - RLTR12B LTR ERVK -253 315 2 2 643 1735 145 12 56 chr5 7710008 7710345 -144826914 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 643 532 252 128 7 chr5 7714259 7714407 -144822852 + ORR1D2 LTR MaLR 2 167 -203 2 643 630 234 22 45 chr5 7714660 7714839 -144822420 + ORR1D2 LTR MaLR 196 370 0 2 643 1212 273 15 80 chr5 7719110 7719500 -144817759 - MTE2a LTR MaLR -14 365 1 2 643 2318 136 17 41 chr5 7723333 7723746 -144813513 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 2 643 902 342 65 76 chr5 7724919 7725486 -144811773 - MER21B LTR ERV1 -107 756 196 2 643 632 261 47 12 chr5 7725492 7725771 -144811488 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 34 2 643 1754 192 32 63 chr5 7725849 7726227 -144811032 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 2 643 2125 224 138 75 chr5 7732395 7733094 -144804165 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 748 -154 2 644 2125 220 24 39 chr5 7733480 7733623 -144803636 + RLTR13D6 LTR ERVK 659 856 -46 2 644 525 219 15 30 chr5 7741647 7741779 -144795480 + ORR1D1 LTR MaLR 112 241 -133 2 644 512 238 26 13 chr5 7741757 7741908 -144795351 + ORR1D1 LTR MaLR 173 327 -51 2 644 3566 218 49 83 chr5 7745322 7746313 -144790946 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 2 644 1483 190 31 14 chr5 7748631 7748925 -144788334 + ORR1D1 LTR MaLR 23 321 -53 2 644 3227 38 130 5 chr5 7751574 7751996 -144785263 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 644 6675 35 4 0 chr5 7751998 7752824 -144784435 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 2 644 2533 70 0 3 chr5 7752817 7753160 -144784099 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1359 2 644 3392 61 4 16 chr5 7753160 7753738 -144783521 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 2 644 226 321 0 0 chr5 7753738 7753791 -144783468 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 2 644 226 321 0 0 chr5 7753819 7753872 -144783387 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 2 644 966 110 25 81 chr5 7753872 7754070 -144783189 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 9 2 644 3227 38 130 5 chr5 7754071 7754493 -144782766 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 644 2830 128 139 12 chr5 7755370 7755886 -144781373 + RMER17A2 LTR ERVK 1 582 -324 2 644 1838 169 31 9 chr5 7762051 7762374 -144774885 + RMER17A2 LTR ERVK 573 902 -4 2 644 236 79 0 26 chr5 7778659 7778698 -144758561 + MTC-int LTR MaLR 172 209 -1049 3 644 628 288 84 0 chr5 7778723 7778914 -144758345 - MTE-int LTR MaLR -1371 209 3 3 644 1116 198 214 119 chr5 7780332 7780378 -144756881 - MT2A LTR ERVL 0 533 488 3 644 1116 198 214 119 chr5 7780450 7780890 -144756369 - MT2A LTR ERVL -46 487 2 3 644 641 222 181 33 chr5 7784748 7784958 -144752301 + RLTR14 LTR ERV1 1 241 -141 3 644 4105 131 64 17 chr5 7787045 7787762 -144749497 - RMER6A LTR ERVK -5 751 1 3 644 347 296 0 43 chr5 7787893 7787985 -144749274 - MLT1I LTR MaLR -204 207 120 3 644 425 301 45 20 chr5 7799773 7799955 -144737304 - MTEa LTR MaLR -1 378 183 3 644 557 297 12 6 chr5 7800192 7800358 -144736901 - MTE2a LTR MaLR 0 379 213 3 644 838 284 11 64 chr5 7800351 7800615 -144736644 - MTE2a LTR MaLR -122 257 8 3 644 311 346 88 67 chr5 7823443 7823740 -144713519 + ORR1E LTR MaLR 52 354 -5 3 644 2540 157 123 0 chr5 7825492 7825962 -144711297 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 3 644 1286 277 87 3 chr5 7834521 7834901 -144702358 - MTD LTR MaLR 0 419 8 3 644 1489 284 97 64 chr5 7834904 7835723 -144701536 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 314 3 644 357 227 15 112 chr5 7835778 7835912 -144701347 - MTD-int LTR MaLR -1123 135 15 3 644 1194 232 29 8 chr5 7844547 7844790 -144692469 - RMER13B LTR ERVK -38 870 623 3 644 1277 293 125 36 chr5 7849941 7850365 -144686894 - RMER15 LTR ERVL -1 574 99 3 644 1277 293 125 36 chr5 7850774 7850876 -144686383 - RMER15 LTR ERVL -477 98 1 3 644 1244 230 60 38 chr5 7852904 7853270 -144683989 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 644 2864 176 26 17 chr5 7859027 7859558 -144677701 + RLTR20B3 LTR ERVK 24 559 -18 4 645 667 266 77 34 chr5 7866824 7867058 -144670201 - MER21B LTR ERV1 -54 809 566 4 645 305 357 76 91 chr5 7869948 7870343 -144666916 + MLT1I LTR MaLR 3 391 -20 4 645 1511 227 110 0 chr5 7871040 7871414 -144665845 - MTD LTR MaLR -4 415 1 4 645 2714 36 0 0 chr5 7871828 7872159 -144665100 + MERVL-int LTR ERVL 4420 4750 -735 4 645 242 226 113 0 chr5 7873502 7873564 -144663695 + RLTR28 LTR ERVL 1 69 -412 4 645 1342 172 34 11 chr5 7873556 7873821 -144663438 + RLTR28 LTR ERVL 254 524 0 4 645 615 370 71 41 chr5 7873946 7874338 -144662921 + MT2A LTR ERVL 13 416 -117 4 645 356 321 17 35 chr5 7874483 7874599 -144662660 + MLT2B2 LTR ERVL 1 114 -401 4 645 306 202 10 128 chr5 7874656 7874693 -144662566 + MLT2B2 LTR ERVL 75 102 -454 4 645 306 202 10 128 chr5 7874859 7874923 -144662336 + MLT2B2 LTR ERVL 103 164 -392 4 645 993 244 62 97 chr5 7900555 7900885 -144636374 + MTE2a LTR MaLR 1 313 -66 4 645 993 244 62 97 chr5 7901052 7901110 -144636149 + MTE2a LTR MaLR 314 375 -4 4 645 2649 80 9 0 chr5 7901613 7901937 -144635322 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 645 4578 21 0 0 chr5 7902615 7903097 -144634162 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 4 645 4442 87 35 0 chr5 7904191 7904755 -144632504 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 4 645 1842 208 26 213 chr5 7913966 7914599 -144622660 + RMER19B LTR ERVK 308 806 -96 4 645 2057 168 16 0 chr5 7914599 7914921 -144622338 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 645 1842 208 26 213 chr5 7914921 7915019 -144622240 + RMER19B LTR ERVK 807 902 0 4 645 282 360 50 0 chr5 7917837 7917937 -144619322 + LTR16A LTR ERVL 281 385 -66 4 645 287 298 124 0 chr5 7922823 7922944 -144614315 - LTR16C LTR ERVL -21 468 333 4 645 280 295 104 94 chr5 7923363 7923565 -144613694 - MLT1H2 LTR MaLR -267 222 19 4 645 2589 185 120 35 chr5 7932155 7932721 -144604538 - RLTR18 LTR ERVK -2 614 1 4 645 2736 136 33 29 chr5 7934202 7934687 -144602572 + RLTR28 LTR ERVL 37 523 -1 5 645 479 308 73 82 chr5 7935983 7936312 -144600947 - MLT1C LTR MaLR -97 370 45 5 645 3224 11 49 0 chr5 7938035 7938385 -144598874 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 5 645 54627 31 12 7 chr5 7938395 7944884 -144592375 - IAPEz-int LTR ERVK -10 6471 8 5 645 3224 11 49 0 chr5 7944884 7945234 -144592025 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 5 645 623 325 138 28 chr5 7958127 7958519 -144578740 - RMER5 LTR ERV1 0 534 100 5 645 414 349 56 45 chr5 7972381 7972648 -144564611 - LTR16E2 LTR ERVL -38 530 261 5 645 310 203 14 0 chr5 7973810 7973879 -144563380 - BGLII_B LTR ERVK -2 439 370 5 645 2899 22 9 27 chr5 7983565 7983898 -144553361 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 645 2284 160 8 14 chr5 7985189 7985557 -144551702 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 2 5 645 520 335 120 19 chr5 7988433 7988758 -144548501 + LTR16B1 LTR ERVL 13 370 -110 5 645 1649 216 18 30 chr5 7988893 7989231 -144548028 + ORR1C1 LTR MaLR 6 339 -39 5 645 2698 168 24 79 chr5 7991860 7991956 -144545303 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 95 -466 5 645 2698 168 24 79 chr5 7992016 7992513 -144544746 + RLTR31_Mm LTR ERVK 96 561 0 5 646 445 281 91 48 chr5 8000775 8001088 -144536171 - RLTR16 LTR ERVK -296 396 24 3 646 2177 172 8 75 chr5 8001539 8002009 -144535250 + BGLII_B LTR ERVK 3 441 0 5 646 255 185 0 0 chr5 8002767 8002821 -144534438 - RMER10A LTR ERVL -68 374 321 1 646 1773 140 70 18 chr5 8003589 8003931 -144533328 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 35 1 646 1331 182 24 77 chr5 8003925 8004377 -144532882 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 1 646 322 94 0 0 chr5 8004381 8004434 -144532825 - ORR1B1 LTR MaLR -341 53 1 1 646 1401 189 21 10 chr5 8004434 8004722 -144532537 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1219 1 646 327 242 0 0 chr5 8004759 8004825 -144532434 + RMER6B LTR ERVK 69 134 -327 1 646 501 102 235 0 chr5 8004825 8004923 -144532336 + RMER6B LTR ERVK 67 187 -274 1 646 1301 213 76 69 chr5 8004965 8005384 -144531875 - RMER20A LTR ERVK -85 431 10 1 646 513 325 119 44 chr5 8005400 8006042 -144531217 - MERVK26-int LTR ERVK -7 6912 6223 1 646 454 226 212 113 chr5 8006415 8006750 -144530509 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 1 646 1645 171 113 18 chr5 8006962 8007343 -144529916 - RLTR31_Mur LTR ERVK -25 528 112 1 646 373 300 48 87 chr5 8007987 8008217 -144529042 - MERVK26-int LTR ERVK -6411 508 288 2 646 5576 120 59 8 chr5 8008259 8009237 -144528022 + RLTR21 LTR ERVK 109 1136 -436 2 646 436 144 17 126 chr5 8009356 8009475 -144527784 + RLTR21 LTR ERVK 1082 1187 -385 2 646 1165 184 132 0 chr5 8009464 8009752 -144527507 + RLTR25A LTR ERVK 778 1103 0 2 646 2447 194 172 72 chr5 8009752 8010302 -144526957 - ORR1B1-int LTR MaLR -252 1711 1073 2 646 4577 148 130 64 chr5 8010302 8011261 -144525998 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 1 2 646 2447 194 172 72 chr5 8011261 8011651 -144525608 - ORR1B1-int LTR MaLR -891 1072 677 2 646 831 209 0 248 chr5 8011463 8011806 -144525453 - MT2B LTR ERVL -343 258 1 2 646 250 75 25 0 chr5 8011807 8011847 -144525412 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2 5759 5719 2 646 2179 183 93 116 chr5 8011847 8012502 -144524757 - ORR1B1-int LTR MaLR -1323 640 1 2 646 426 125 0 0 chr5 8012502 8012574 -144524685 - ORR1B1 LTR MaLR 0 367 296 2 646 1401 178 45 17 chr5 8012776 8013068 -144524191 - ORR1B1 LTR MaLR -73 321 22 2 646 816 283 97 41 chr5 8013079 8013399 -144523860 + MER21B LTR ERV1 451 788 -75 3 646 1785 172 175 118 chr5 8016437 8016868 -144520391 + RMER20B LTR ERVK 1 458 -169 3 646 1785 172 175 118 chr5 8017030 8017189 -144520070 + RMER20B LTR ERVK 459 625 -2 3 646 697 267 12 6 chr5 8017271 8017437 -144519822 + MERVK26-int LTR ERVK 64 230 -6689 4 646 2947 36 0 0 chr5 8017569 8017901 -144519358 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 4 646 59088 60 15 7 chr5 8017901 8025520 -144511739 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 7680 0 4 646 2838 45 3 0 chr5 8025520 8025851 -144511408 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 4 646 254 215 109 101 chr5 8027988 8028107 -144509152 + RLTR19-int LTR ERVK 3829 3948 -2189 4 646 9701 115 67 18 chr5 8028254 8028590 -144508669 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 359 -1489 4 646 9701 115 67 18 chr5 8029231 8030156 -144507103 + RLTR22_Mur LTR ERVK 360 1326 -522 4 646 9701 115 67 18 chr5 8030227 8030722 -144506537 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1327 1842 -6 4 646 2091 233 37 0 chr5 8030747 8031184 -144506075 + MERVK26-int LTR ERVK 5533 5985 -934 4 646 1009 224 62 45 chr5 8031201 8031491 -144505768 - MYSERV-int LTR ERVK -1790 4760 4466 5 646 477 58 0 0 chr5 8031521 8031590 -144505669 + BGLII_B LTR ERVK 1 69 -372 5 646 1457 133 4 16 chr5 8031632 8031884 -144505375 + BGLII_B LTR ERVK 193 441 0 5 646 2461 221 99 29 chr5 8031888 8032578 -144504681 - MYSERV6-int LTR ERVK -131 5129 4392 5 646 867 149 0 7 chr5 8032584 8032726 -144504533 - MYSERV6-int LTR ERVK -5245 3714 3574 5 646 2178 98 3 0 chr5 8032727 8033045 -144504214 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 646 680 214 128 15 chr5 8033045 8033155 -144504104 - MYSERV6-int LTR ERVK -5378 3581 3452 5 646 2936 206 218 23 chr5 8033223 8033535 -144503724 - MYSERV6-int LTR ERVK -5508 3451 3104 5 646 2128 125 43 11 chr5 8033535 8033883 -144503376 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 5 646 2936 203 48 27 chr5 8033883 8034332 -144502927 - MYSERV6-int LTR ERVK -5856 3103 2628 5 646 463 299 48 48 chr5 8034334 8034608 -144502651 + RLTR15 LTR ERVK 3 279 -80 5 646 2453 120 51 23 chr5 8034608 8035000 -144502259 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 5 646 463 299 48 48 chr5 8035000 8035017 -144502242 + RLTR15 LTR ERVK 280 294 -65 5 646 1076 209 16 16 chr5 8035081 8035334 -144501925 - MYSERV6-int LTR ERVK -6327 2632 2380 5 646 318 203 0 0 chr5 8035334 8035393 -144501866 + ORR1D1-int LTR MaLR 1050 1108 -262 5 646 245 325 23 97 chr5 8035407 8035717 -144501542 + RMER10A LTR ERVL 12 298 -144 6 646 343 273 36 78 chr5 8035715 8035882 -144501377 + RMER10A LTR ERVL 258 417 -25 6 646 1186 172 40 0 chr5 8035893 8036120 -144501139 + ORR1D1-int LTR MaLR 1104 1339 -31 5 646 1372 182 97 46 chr5 8036113 8036464 -144500795 + ORR1D1 LTR MaLR 6 374 0 5 646 305 25 0 0 chr5 8038914 8038954 -144498305 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 464 6 646 305 25 0 0 chr5 8038962 8039002 -144498257 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 464 6 646 4114 50 16 6 chr5 8039010 8039508 -144497751 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 6 646 332 336 0 26 chr5 8039750 8039863 -144497396 + MTEa LTR MaLR 194 303 -76 6 646 267 236 16 6 chr5 8041865 8041959 -144495300 + MER57C2 LTR ERV1 145 250 -161 7 646 1042 201 134 32 chr5 8042575 8042852 -144494407 - MTD LTR MaLR -22 397 73 7 646 1690 114 75 23 chr5 8042852 8043158 -144494101 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 7 646 1042 191 86 33 chr5 8043158 8043210 -144494049 - MTD LTR MaLR -347 72 5 7 646 397 323 64 50 chr5 8043267 8043469 -144493790 - MLT1A0 LTR MaLR -11 354 150 7 646 1616 252 27 10 chr5 8043609 8044021 -144493238 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 646 730 180 503 0 chr5 8044217 8044398 -144492861 + ORR1D1 LTR MaLR 2 273 -111 8 646 424 213 11 0 chr5 8044447 8044541 -144492718 + ORR1D1 LTR MaLR 276 370 -14 8 646 1496 228 48 44 chr5 8048812 8049316 -144487943 + RLTR12B LTR ERVK 1 506 -22 8 646 699 159 136 15 chr5 8050287 8050485 -144486774 + RMER17B LTR ERVK 236 457 -501 9 646 320 235 12 12 chr5 8051958 8052044 -144485215 - MTEb LTR MaLR -4 375 290 9 646 1224 148 63 0 chr5 8052185 8052422 -144484837 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 273 9 646 511 177 62 0 chr5 8052426 8052522 -144484737 - RLTR28 LTR ERVL -422 102 1 9 646 258 298 114 40 chr5 8052536 8052711 -144484548 - MTEb LTR MaLR -171 188 1 9 646 578 318 88 40 chr5 8061520 8061917 -144475342 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 112 1 646 5576 82 29 10 chr5 8124593 8125386 -144411873 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 1 647 3173 51 5 5 chr5 8126483 8126879 -144410380 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 647 3856 138 42 32 chr5 8153149 8153892 -144383367 + RMER17A LTR ERVK 1 750 -1 2 647 294 314 61 71 chr5 8154145 8154343 -144382916 + MLT1F2 LTR MaLR 397 592 -61 2 647 591 305 75 44 chr5 8159988 8160307 -144376952 + MLT1B LTR MaLR 36 364 -26 2 647 1788 176 32 32 chr5 8163238 8163609 -144373650 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 2 647 1369 275 73 8 chr5 8164294 8164679 -144372580 + MTD LTR MaLR 10 419 0 2 647 840 183 11 58 chr5 8177391 8177582 -144359677 + RLTR17 LTR ERVK 510 691 -1 2 647 326 289 15 69 chr5 8177677 8177807 -144359452 + ORR1E LTR MaLR 1 123 -236 2 647 280 244 105 0 chr5 8177894 8177980 -144359279 + ORR1E LTR MaLR 283 377 -2 2 647 1592 175 41 9 chr5 8179050 8179368 -144357891 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 2 647 1006 155 36 10 chr5 8188552 8188748 -144348511 + RLTR41 LTR ERV1 246 446 0 2 647 448 273 75 11 chr5 8189201 8189375 -144347884 + MER34A1 LTR ERV1 295 479 -108 2 647 2180 106 237 26 chr5 8192928 8193384 -144343875 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 588 -66 2 647 4219 31 12 2 chr5 8193564 8194052 -144343207 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 647 1505 158 55 92 chr5 8204511 8204642 -144332617 + MERVK26-int LTR ERVK 6633 6759 -160 2 647 1505 158 55 92 chr5 8205127 8205287 -144331972 + MERVK26-int LTR ERVK 6760 6913 -6 2 647 2358 66 122 11 chr5 8206420 8206771 -144330488 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 647 288 314 116 51 chr5 8215019 8215311 -144321948 - MLT1C LTR MaLR 0 467 157 3 647 231 286 79 30 chr5 8235219 8235320 -144301939 - IAPLTR4 LTR ERVK -36 309 204 3 647 274 286 103 29 chr5 8242169 8242334 -144294925 + MLT1H1-int LTR MaLR 481 625 -864 3 647 326 335 156 0 chr5 8242486 8242659 -144294600 + MLT1H1-int LTR MaLR 581 780 -629 3 647 268 228 100 12 chr5 8244734 8244814 -144292445 + MLT1H1 LTR MaLR 8 94 -461 3 647 924 244 67 78 chr5 8245893 8246307 -144290952 + ORR1C2 LTR MaLR 1 392 -2 3 647 1270 86 0 0 chr5 8254642 8254816 -144282443 + ORR1A2 LTR MaLR 1 174 -153 3 647 1153 175 94 5 chr5 8256211 8256423 -144280836 + RLTR26 LTR ERVK 1 231 -411 3 647 1028 200 54 5 chr5 8256423 8256609 -144280650 + RLTR26 LTR ERVK 350 544 -98 3 647 765 177 60 18 chr5 8256582 8256749 -144280510 + RLTR26 LTR ERVK 469 642 0 3 648 3761 181 82 58 chr5 8276260 8277091 -144260168 + RMER13A LTR ERVK 3 853 -7 3 648 826 331 131 22 chr5 8280408 8280942 -144256317 + MLT1E1A LTR MaLR 74 665 -15 3 648 354 256 99 15 chr5 8292589 8292720 -144244539 + MLT1A0 LTR MaLR 224 365 0 4 648 2644 135 33 47 chr5 8296676 8297165 -144240094 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 648 2506 52 9 0 chr5 8297379 8297704 -144239555 - ORR1A1 LTR MaLR -18 328 1 4 648 868 284 29 8 chr5 8300755 8300993 -144236266 - MTD LTR MaLR -67 352 110 4 648 363 228 25 66 chr5 8306990 8307112 -144230147 - MTD LTR MaLR -301 120 4 4 648 237 283 15 4 chr5 8315208 8315274 -144221985 + MLT1E3 LTR MaLR 1 64 -616 4 648 3101 83 2 0 chr5 8318968 8319367 -144217892 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 648 7089 122 68 96 chr5 8319367 8321170 -144216089 - MTB-int LTR MaLR -425 1538 1 4 648 2151 105 12 22 chr5 8321174 8321496 -144215763 - MTB LTR MaLR -8 319 1 4 648 770 182 44 6 chr5 8328726 8328886 -144208373 + ORR1C2 LTR MaLR 219 384 0 4 648 881 280 118 23 chr5 8331541 8331888 -144205371 - MLT1B LTR MaLR -10 380 1 4 648 3088 189 40 44 chr5 8333496 8334217 -144203042 + RLTR13A LTR ERVK 1 718 -137 4 648 626 247 12 29 chr5 8339403 8339431 -144197828 + RLTR13A LTR ERVK 791 816 -142 4 648 943 106 21 0 chr5 8340428 8340570 -144196689 + RLTR13B1 LTR ERVK 749 893 0 4 648 352 331 153 35 chr5 8340994 8341282 -144195977 + MLT1D LTR MaLR 4 325 -180 4 648 259 304 0 42 chr5 8341472 8341568 -144195691 + MLT1D LTR MaLR 414 505 0 4 648 268 278 0 58 chr5 8341730 8341833 -144195426 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 307 4 648 1950 127 13 29 chr5 8369060 8369369 -144167890 + ORR1A2 LTR MaLR 24 327 0 5 648 2395 159 8 11 chr5 8369950 8370331 -144166928 + RLTR14 LTR ERV1 1 380 -2 5 648 614 324 99 39 chr5 8370960 8371114 -144166145 - MLT1A0 LTR MaLR -54 311 147 5 648 614 324 99 39 chr5 8371157 8371285 -144165974 - MLT1A0 LTR MaLR -219 146 12 5 648 7849 60 36 52 chr5 8376312 8377435 -144159824 - RLTR10-int LTR ERVK -565 1422 318 5 648 2213 59 122 6 chr5 8377435 8377778 -144159481 - RLTR10 LTR ERVK -7 383 1 5 648 992 218 92 22 chr5 8379040 8379355 -144157904 + RLTR15 LTR ERVK 1 337 -22 5 648 2980 52 9 0 chr5 8380944 8381287 -144155972 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 649 1350 163 216 19 chr5 8392507 8392826 -144144433 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 5 649 1176 238 131 43 chr5 8394602 8394976 -144142283 - MTD LTR MaLR -12 407 1 5 649 699 254 46 36 chr5 8414288 8414484 -144122775 - MTEa LTR MaLR 0 379 182 5 649 360 144 66 7 chr5 8414530 8414607 -144122652 - MTD LTR MaLR -35 384 247 5 649 860 244 103 113 chr5 8414799 8415266 -144121993 + RMER4A LTR ERVK 1 462 -4 5 649 427 185 62 0 chr5 8415321 8415402 -144121857 - MTD LTR MaLR -132 287 202 5 649 2152 143 191 72 chr5 8417437 8417950 -144119309 + RMER15 LTR ERVL 2 575 0 6 649 269 261 31 0 chr5 8440912 8440977 -144096282 - MER77 LTR ERVL -36 571 505 6 649 1479 180 177 0 chr5 8444750 8445083 -144092176 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 6 649 3102 53 8 5 chr5 8450157 8450552 -144086707 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 649 1125 193 153 108 chr5 8451363 8451670 -144085589 - ORR1B1 LTR MaLR -73 321 1 6 649 1684 171 97 17 chr5 8452328 8452679 -144084580 + ORR1C2 LTR MaLR 1 379 -5 6 649 968 208 12 78 chr5 8454891 8455136 -144082123 - RLTR11A LTR ERVK -65 463 235 6 649 992 274 107 43 chr5 8455142 8455562 -144081697 + RLTR17 LTR ERVK 105 551 -141 6 649 513 178 62 3 chr5 8455631 8455775 -144081484 - RLTR11A LTR ERVK -337 240 98 6 649 858 288 163 0 chr5 8456642 8456937 -144080322 + ORR1E LTR MaLR 2 344 -15 6 649 1460 244 16 35 chr5 8458971 8459337 -144077922 - MTC LTR MaLR -58 363 5 6 649 792 258 172 42 chr5 8460684 8461137 -144076122 + MT2B LTR ERVL 1 471 -130 6 649 728 230 235 15 chr5 8461330 8461366 -144075893 + MT2B LTR ERVL 376 412 -121 6 649 274 211 76 52 chr5 8461998 8462105 -144075154 + MT2B LTR ERVL 495 601 0 6 649 3381 167 75 27 chr5 8462105 8463056 -144074203 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 996 -4765 6 649 7249 152 48 38 chr5 8463051 8463425 -144073834 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1687 2023 -3738 6 649 7249 152 48 38 chr5 8463604 8464642 -144072617 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2024 3114 -2647 6 649 2078 92 3 74 chr5 8464642 8464993 -144072266 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 7 649 4440 53 69 3 chr5 8464994 8465615 -144071644 + IAPEz-int LTR ERVK 1 662 -5819 7 649 424 38 0 0 chr5 8465615 8465668 -144071591 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1411 -5070 7 649 1739 115 4 4 chr5 8465667 8465929 -144071330 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 7 649 871 81 24 0 chr5 8465926 8466049 -144071210 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 7 649 446 66 0 0 chr5 8466049 8466110 -144071149 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 3585 -2896 7 649 19902 19 6 0 chr5 8466102 8468454 -144068805 + IAPEz-int LTR ERVK 4117 6481 0 7 649 2057 111 3 72 chr5 8468454 8468815 -144068444 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 336 -1 7 649 1654 129 16 0 chr5 8468815 8469070 -144068189 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3111 3369 -2392 6 649 1949 158 71 15 chr5 8469074 8469414 -144067845 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 7 649 2061 151 15 0 chr5 8469414 8469752 -144067507 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3365 3707 -2054 6 649 1710 194 187 40 chr5 8469761 8470259 -144067000 - RMER4B LTR ERVK -14 571 1 7 649 323 231 54 11 chr5 8470259 8470351 -144066908 - MurERV4-int LTR ERVK 0 5260 5165 7 649 475 159 10 21 chr5 8470383 8470479 -144066780 - RMER4B LTR ERVK -470 115 21 7 649 859 190 33 0 chr5 8470494 8470678 -144066581 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3701 3890 -1871 6 649 5892 204 56 16 chr5 8470678 8471998 -144065261 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3841 5213 -272 6 649 513 134 319 0 chr5 8472000 8472160 -144065099 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5407 5617 -144 6 649 262 148 82 47 chr5 8472160 8472245 -144065014 + ORR1A3-int LTR MaLR 552 639 -1324 7 649 552 248 8 46 chr5 8472291 8472422 -144064837 + MT2A LTR ERVL 1 126 -407 7 649 280 146 0 18 chr5 8472573 8472632 -144064627 + MT2B2 LTR ERVL 542 601 0 7 649 1010 216 162 167 chr5 8473212 8473650 -144063609 + MT2B LTR ERVL 1 517 -84 7 649 248 200 0 20 chr5 8473720 8473771 -144063488 + MT2B LTR ERVL 535 584 0 7 649 346 290 136 43 chr5 8474634 8474796 -144062463 - RMER15 LTR ERVL 0 575 399 7 649 480 295 18 49 chr5 8474884 8475048 -144062211 - RMER15 LTR ERVL -416 159 1 7 649 381 356 75 88 chr5 8475474 8476031 -144061228 - MT2A LTR ERVL -2 552 3 7 649 412 289 58 31 chr5 8476213 8476438 -144060821 - MER34B-int LTR ERV1 -1612 3744 3514 7 649 588 294 160 21 chr5 8479763 8480045 -144057214 + RMER5 LTR ERV1 165 485 -49 7 649 1159 202 43 162 chr5 8484404 8484823 -144052436 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 7 649 3601 26 28 7 chr5 8484919 8485346 -144051913 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 649 238 313 11 57 chr5 8485430 8485518 -144051741 + RMER5 LTR ERV1 17 100 -434 7 649 1190 169 22 14 chr5 8485520 8485742 -144051517 - MTD LTR MaLR 0 419 196 7 649 2551 128 38 5 chr5 8494379 8494779 -144042480 - MTC LTR MaLR -8 413 1 7 649 2255 148 18 35 chr5 8507444 8507844 -144029415 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 1 649 500 254 182 62 chr5 8508266 8508573 -144028686 + MER57D LTR ERV1 49 392 -19 1 649 1321 154 44 8 chr5 8518816 8519065 -144018194 - RMER16-int LTR ERVK -3583 1823 1566 3 649 368 218 11 33 chr5 8519163 8519253 -144018006 - RLTR45-int LTR ERVK -3660 3584 3497 3 650 271 227 109 96 chr5 8524274 8524308 -144012951 - MT2B2 LTR ERVL -320 259 107 5 650 397 301 71 29 chr5 8539246 8539386 -143997873 + MER21B LTR ERV1 689 834 -29 7 650 491 262 246 11 chr5 8540996 8541264 -143995995 + RLTR12B LTR ERVK 11 335 -193 7 650 1698 174 24 114 chr5 8548530 8548952 -143988307 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 9 650 1150 265 49 35 chr5 8550061 8550405 -143986854 + ORR1E LTR MaLR 2 350 -9 9 650 3677 275 117 30 chr5 8550417 8551606 -143985653 + ORR1E-int LTR MaLR 4 1295 -285 9 650 1043 223 79 24 chr5 8557860 8558113 -143979146 + ORR1E-int LTR MaLR 1280 1546 -34 9 650 833 272 148 44 chr5 8564653 8564992 -143972267 - MTEa LTR MaLR -3 376 3 1 650 343 342 171 49 chr5 8574947 8575316 -143961943 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 214 1 650 262 241 69 108 chr5 8578062 8578093 -143959166 - MT2B LTR ERVL -437 164 139 1 650 1035 216 37 0 chr5 8612840 8613081 -143924178 - ORR1B1-int LTR MaLR -886 623 374 1 650 537 103 13 0 chr5 8613457 8613535 -143923724 + ORR1A3 LTR MaLR 248 326 0 1 650 1602 155 30 50 chr5 8619238 8619537 -143917722 - MTC LTR MaLR -8 413 121 1 650 566 153 0 67 chr5 8619768 8619873 -143917386 - MTC LTR MaLR -321 100 3 1 650 249 264 113 43 chr5 8620339 8620454 -143916805 + MT2B LTR ERVL 156 278 -323 1 650 559 311 164 39 chr5 8625794 8626105 -143911154 - ORR1E LTR MaLR -12 358 9 2 650 1758 169 121 9 chr5 8627291 8627614 -143909645 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 2 650 410 318 25 38 chr5 8628220 8628377 -143908882 - MLT1E3 LTR MaLR -33 591 437 2 650 1179 195 32 32 chr5 8629467 8629716 -143907543 - MTD LTR MaLR -14 405 157 2 650 1832 153 40 25 chr5 8635005 8635327 -143901932 - ORR1B2 LTR MaLR -9 358 32 2 650 4051 138 52 20 chr5 8643026 8643757 -143893502 + RMER6A LTR ERVK 1 754 -2 2 650 407 259 13 92 chr5 8649480 8649511 -143887748 - MT2B LTR ERVL -445 156 138 2 651 282 321 23 81 chr5 8651233 8651406 -143885853 - MTEb LTR MaLR -13 366 204 2 651 236 262 50 0 chr5 8651528 8651608 -143885651 - MLT1A1 LTR MaLR -268 140 57 2 651 805 267 129 20 chr5 8661192 8661494 -143875765 + RMER5 LTR ERV1 33 367 -167 2 651 620 292 104 14 chr5 8666372 8666584 -143870675 - MTD LTR MaLR -188 231 1 2 651 599 312 105 31 chr5 8666903 8667161 -143870098 - MER68 LTR ERVL -82 481 205 2 651 562 254 220 40 chr5 8669000 8669385 -143867874 - MLT1D LTR MaLR -47 458 7 2 651 255 250 20 102 chr5 8676984 8677082 -143860177 - MTEb LTR MaLR -3 376 287 2 651 315 265 87 10 chr5 8677785 8677888 -143859371 + MLT1A0 LTR MaLR 3 113 -252 2 651 253 293 36 96 chr5 8680722 8680888 -143856371 - MamGypLTR1d LTR Gypsy -612 201 46 2 651 577 199 7 14 chr5 8682593 8682710 -143854549 + RLTR33 LTR ERVK 545 635 -43 2 651 1643 177 34 62 chr5 8686599 8686984 -143850275 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 651 2044 140 48 8 chr5 8689695 8690048 -143847211 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 651 310 247 77 106 chr5 8697956 8698060 -143839199 + MT2B LTR ERVL 157 257 -344 2 651 2477 287 119 30 chr5 8699133 8700006 -143837253 - MTE-int LTR MaLR -7 1573 623 2 651 251 273 0 0 chr5 8699976 8700031 -143837228 - MTE2b LTR MaLR -324 55 1 2 651 252 311 66 133 chr5 8716610 8716836 -143820423 - ORR1E LTR MaLR -76 308 98 3 651 268 239 29 43 chr5 8716897 8716967 -143820292 - ORR1E LTR MaLR -290 69 1 3 651 1727 207 63 6 chr5 8723361 8723711 -143813548 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 651 398 209 0 122 chr5 8727561 8727589 -143809670 - MT2B LTR ERVL -447 154 143 3 651 1837 172 145 13 chr5 8727761 8728133 -143809126 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 651 3234 41 8 8 chr5 8731603 8731999 -143805260 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 651 1509 205 2 160 chr5 8733912 8734122 -143803137 - RMER10B LTR ERVL -2 396 203 3 651 1509 205 2 160 chr5 8734166 8734425 -143802834 - RMER10B LTR ERVL -196 202 1 3 651 961 226 101 84 chr5 8734522 8734988 -143802271 - RMER17C-int LTR ERVK -248 2990 2614 3 651 1930 207 45 61 chr5 8735297 8735791 -143801468 - RLTR19-int LTR ERVK -3110 3027 2542 3 651 264 224 39 13 chr5 8737093 8737170 -143800089 - MLT1H LTR MaLR -16 575 497 3 651 286 305 66 46 chr5 8737278 8737474 -143799785 - MLT1H LTR MaLR -347 202 3 3 651 19973 79 37 9 chr5 8748626 8749629 -143787630 + MERVK26-int LTR ERVK 3353 4400 -2519 3 651 19973 79 37 9 chr5 8749676 8751370 -143785889 + MERVK26-int LTR ERVK 4401 6125 -794 3 651 417 241 0 0 chr5 8751370 8751453 -143785806 + RLTR26 LTR ERVK 560 642 0 3 651 4203 32 0 0 chr5 8753216 8753689 -143783570 - MT2C_Mm LTR ERVL -2 473 1 3 651 3111 102 40 76 chr5 8754244 8754852 -143782407 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -68 586 1 3 651 2860 85 29 24 chr5 8757442 8757851 -143779408 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 3 651 5190 74 19 14 chr5 8757851 8758547 -143778712 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 1288 3 651 1628 83 5 5 chr5 8758548 8758766 -143778493 - IAP-d-int LTR ERVK -658 5884 5667 3 651 3607 60 85 26 chr5 8758770 8759262 -143777997 - IAP-d-int LTR ERVK -1015 5527 5007 3 651 701 204 33 7 chr5 8759262 8759415 -143777844 - IAP-d-int LTR ERVK -6039 503 347 3 651 1576 93 169 17 chr5 8759409 8759688 -143777571 - IAP-d-int LTR ERVK -1385 602 57 3 651 2828 80 29 24 chr5 8759688 8760097 -143777162 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 3 651 349 182 0 25 chr5 8764432 8764511 -143772748 - RLTR17 LTR ERVK -98 594 518 3 651 2916 159 4 6 chr5 8770737 8771244 -143766015 - RLTR17 LTR ERVK -185 507 2 3 651 4796 132 28 11 chr5 8772344 8772810 -143764449 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 341 3 651 4796 132 28 11 chr5 8772905 8773234 -143764025 - RMER17D2 LTR ERVK -469 340 2 3 651 276 176 40 13 chr5 8773449 8773524 -143763735 - MTEb LTR MaLR -120 259 183 3 651 287 158 34 34 chr5 8776438 8776497 -143760762 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 514 3 651 2286 148 37 5 chr5 8780500 8780874 -143756385 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 652 1858 165 71 41 chr5 8791540 8791951 -143745308 - RMER10A LTR ERVL -19 423 1 4 652 382 328 90 73 chr5 8794934 8795223 -143742036 + ORR1E LTR MaLR 64 357 -2 4 652 290 73 0 0 chr5 8795949 8795990 -143741269 - MTC LTR MaLR -380 41 1 4 652 1401 201 20 45 chr5 8807751 8808043 -143729216 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 276 4 652 1030 170 116 40 chr5 8808772 8809023 -143728236 - RLTR20B2 LTR ERVK -269 291 22 4 652 2379 176 15 61 chr5 8815909 8816453 -143720806 - RLTR31_Mm LTR ERVK -42 519 1 4 652 435 229 40 92 chr5 8821614 8821787 -143715472 - RLTR40 LTR ERVK -625 192 29 4 652 1999 171 32 15 chr5 8825901 8826304 -143710955 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 652 1988 231 14 12 chr5 8826689 8827106 -143710153 - MTD LTR MaLR -1 418 1 4 652 2246 155 69 19 chr5 8831363 8831422 -143705837 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 337 4 652 2246 155 69 19 chr5 8831501 8831816 -143705443 - ORR1B1 LTR MaLR -58 336 2 4 652 3514 30 0 0 chr5 8840183 8840579 -143696680 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 652 1242 208 54 60 chr5 8846339 8846708 -143690551 - RMER10B LTR ERVL -31 367 1 5 652 313 296 78 0 chr5 8846841 8846956 -143690303 - RMER17C-int LTR ERVK -182 3056 2933 5 652 378 204 74 154 chr5 8847249 8847411 -143689848 - RLTR19-int LTR ERVK -2175 3962 3814 5 652 290 252 38 57 chr5 8847606 8847711 -143689548 - RLTR19-int LTR ERVK -2846 3291 3189 5 652 1409 231 123 42 chr5 8847760 8848573 -143688686 - MYSERV6-int LTR ERVK -271 8688 8092 5 652 265 173 0 19 chr5 8848622 8848675 -143688584 - MYSERV6-int LTR ERVK -4076 2061 2010 5 652 281 321 195 6 chr5 8850606 8850775 -143686484 - MLT1H LTR MaLR -330 219 19 5 652 2059 166 77 37 chr5 8854841 8855242 -143682017 - MTC LTR MaLR 0 421 5 5 652 3554 118 45 70 chr5 8857268 8858025 -143679234 - RMER17A LTR ERVK -13 738 1 5 652 1144 186 75 26 chr5 8858446 8858711 -143678548 - RLTR16 LTR ERVK -5 500 223 5 652 371 329 47 102 chr5 8860859 8861181 -143676078 - MLT1D LTR MaLR -200 305 2 5 652 1560 203 195 80 chr5 8871598 8872075 -143665184 + MT2A LTR ERVL 2 533 0 5 652 237 337 0 0 chr5 8880013 8880099 -143657160 + LTR33 LTR ERVL 430 515 0 5 652 426 296 8 0 chr5 8880506 8880638 -143656621 + MTE-int LTR MaLR 73 205 -1375 5 652 1116 319 139 40 chr5 8880945 8881670 -143655589 + MTE-int LTR MaLR 324 1120 -460 5 652 324 287 93 93 chr5 8882294 8882540 -143654719 - ORR1E LTR MaLR -80 279 34 5 652 1026 264 33 14 chr5 8883980 8884406 -143652853 + RLTR16 LTR ERVK 1 473 -32 5 652 1737 181 37 23 chr5 8889135 8889486 -143647773 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 31 5 652 426 173 0 24 chr5 8890190 8890273 -143646986 + MTD LTR MaLR 7 87 -332 5 652 1122 214 8 11 chr5 8890553 8890813 -143646446 + RLTR22_Mur LTR ERVK 504 762 -1086 5 652 395 191 99 22 chr5 8891342 8891433 -143645826 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1588 1685 -163 5 653 670 254 131 29 chr5 8921177 8921448 -143615811 - MTC LTR MaLR -21 400 118 6 653 3112 56 69 0 chr5 8921562 8921970 -143615289 - RLTR1B LTR ERV1 -76 436 1 6 653 22260 42 84 102 chr5 8921970 8923969 -143613290 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 1105 6 653 230 166 78 89 chr5 8923969 8924148 -143613111 + RMER17D LTR ERVK 335 511 -378 6 653 22260 42 84 102 chr5 8924148 8924578 -143612681 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 1104 631 6 653 22260 42 84 102 chr5 8924621 8925372 -143611887 - RLTR1B-int LTR ERV1 -2669 630 3 6 653 1159 96 24 0 chr5 8925372 8925538 -143611721 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 343 6 653 409 131 0 0 chr5 8925542 8925603 -143611656 - RLTR1B LTR ERV1 -102 410 350 6 653 604 227 18 107 chr5 8933040 8933126 -143604133 + MTE2b LTR MaLR 1 76 -303 6 653 604 227 18 107 chr5 8933614 8933695 -143603564 + MTE2b LTR MaLR 77 153 -226 6 653 3575 41 0 0 chr5 8951428 8951822 -143585437 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 6 653 279 236 23 160 chr5 8953358 8953489 -143583770 - RLTR33 LTR ERVK -97 581 469 6 653 301 203 16 0 chr5 8953601 8953665 -143583594 - RLTR19C LTR ERVK -409 97 33 6 653 1198 211 46 54 chr5 8959945 8960316 -143576943 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 7 653 1415 211 109 4 chr5 8960491 8960823 -143576436 - MTD LTR MaLR -14 405 48 7 653 237 122 24 0 chr5 8961069 8961110 -143576149 - MTD LTR MaLR 0 370 329 7 653 1405 222 119 12 chr5 8961303 8961631 -143575628 - MTD LTR MaLR -56 363 1 7 653 244 380 19 12 chr5 8961780 8961940 -143575319 + RMER15 LTR ERVL 347 507 -68 7 653 506 304 49 69 chr5 8963703 8963950 -143573309 + RMER15 LTR ERVL 319 560 -15 7 653 523 284 262 10 chr5 8970460 8970666 -143566593 + MLT1F2 LTR MaLR 1 258 -302 7 653 777 286 98 68 chr5 8972645 8973077 -143564182 + MLT2B1 LTR ERVL 84 508 -7 7 653 2272 156 74 10 chr5 8982518 8982912 -143554347 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 653 819 185 20 0 chr5 8983268 8983419 -143553840 + ORR1C2 LTR MaLR 230 383 -1 7 653 2869 28 65 0 chr5 8986960 8987285 -143549974 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 653 600 320 78 23 chr5 8995908 8996164 -143541095 + MLT1E2 LTR MaLR 358 627 0 7 653 1810 186 26 9 chr5 8999154 8999501 -143537758 - RLTR28 LTR ERVL -171 353 1 7 653 2482 124 81 16 chr5 8999553 8999997 -143537262 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 334 7 653 859 236 54 67 chr5 9000002 9000455 -143536804 - RLTR13B1 LTR ERVK -408 447 1 1 653 741 151 128 20 chr5 9001269 9001408 -143535851 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 414 4 653 381 195 13 0 chr5 9001408 9001485 -143535774 + ORR1A2 LTR MaLR 1 78 -249 5 653 993 183 297 3 chr5 9001574 9001864 -143535395 - MTD LTR MaLR -44 375 1 6 653 1881 201 8 19 chr5 9003600 9003976 -143533283 + ORR1D1 LTR MaLR 2 373 -1 1 653 404 283 30 48 chr5 9004784 9004951 -143532308 + RNLTR23 LTR ERVK 479 642 0 1 653 1139 195 25 43 chr5 9005007 9005286 -143531973 + RLTR46 LTR ERVK 42 315 -5 1 653 1349 209 63 31 chr5 9006185 9006502 -143530757 + ORR1C2 LTR MaLR 1 327 -57 1 653 1929 150 65 8 chr5 9006640 9006996 -143530263 + RLTR9D LTR ERVK 1 376 -27 1 653 350 151 96 0 chr5 9007014 9007087 -143530172 + ORR1C2 LTR MaLR 305 384 0 1 653 326 349 45 98 chr5 9008107 9008444 -143528815 - ORR1E LTR MaLR -5 354 36 2 653 2195 194 39 10 chr5 9008731 9009220 -143528039 - RLTR11A2 LTR ERVK -24 503 1 2 653 1629 139 136 3 chr5 9009693 9010010 -143527249 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 2 653 3310 43 5 2 chr5 9014268 9014663 -143522596 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 653 367 352 70 29 chr5 9015330 9015643 -143521616 - ORR1E LTR MaLR -28 331 6 3 653 2451 108 74 88 chr5 9022490 9022979 -143514280 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 653 3104 59 10 10 chr5 9029588 9029984 -143507275 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 653 1749 97 40 37 chr5 9030868 9031167 -143506092 + RLTR9B LTR ERVK 1 300 -137 6 653 1105 185 24 36 chr5 9031158 9031405 -143505854 + ORR1C1-int LTR MaLR 1266 1509 0 6 653 1975 138 37 102 chr5 9031405 9031809 -143505450 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 653 423 297 0 0 chr5 9038141 9038242 -143499017 + MTEa LTR MaLR 1 101 -278 8 653 330 317 102 19 chr5 9038349 9038555 -143498704 + MT2A LTR ERVL 311 533 0 8 653 266 227 15 15 chr5 9041383 9041450 -143495809 - MLT1B LTR MaLR -80 310 244 9 653 950 252 68 53 chr5 9041808 9042147 -143495112 - MTD LTR MaLR -14 405 62 9 653 510 245 0 41 chr5 9042269 9042414 -143494845 - RMER15 LTR ERVL -141 434 296 9 654 895 227 287 16 chr5 9044116 9044435 -143492824 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 9 654 554 128 206 8 chr5 9048867 9048993 -143488266 + RLTR33 LTR ERVK 1 151 -527 1 654 381 66 0 90 chr5 9049221 9049288 -143487971 + RLTR33 LTR ERVK 155 215 -463 1 654 844 101 0 0 chr5 9055928 9056057 -143481202 + RLTR33 LTR ERVK 187 315 -363 1 654 840 269 45 33 chr5 9056303 9056634 -143480625 - MLT1C LTR MaLR -22 445 111 1 654 3280 51 8 0 chr5 9056686 9057079 -143480180 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 654 1185 211 165 12 chr5 9057319 9057646 -143479613 + MTD LTR MaLR 22 398 -21 1 654 1259 181 78 91 chr5 9062626 9062756 -143474503 + MT2A LTR ERVL 1 118 -415 1 654 1259 209 60 81 chr5 9062955 9063226 -143474033 + MT2A LTR ERVL 119 525 -76 1 654 3950 170 153 45 chr5 9063941 9064055 -143473204 + RLTR25A LTR ERVK 1 123 -980 1 654 3950 170 153 45 chr5 9064105 9064986 -143472273 + RLTR25A LTR ERVK 124 1103 0 1 654 2773 143 109 79 chr5 9069376 9069974 -143467285 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 1 654 1170 200 88 0 chr5 9070088 9070338 -143466921 + ORR1C1 LTR MaLR 107 378 0 1 654 737 253 31 126 chr5 9070889 9071206 -143466053 + MTEa LTR MaLR 84 370 -9 1 654 2434 92 0 24 chr5 9071774 9072109 -143465150 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 654 1834 172 24 0 chr5 9075851 9076188 -143461071 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 32 1 654 1118 260 82 15 chr5 9076334 9076677 -143460582 + MTE2b LTR MaLR 3 368 -11 1 654 351 292 48 30 chr5 9080355 9080521 -143456738 + RMER16-int LTR ERVK 4864 5032 -374 1 654 308 258 43 72 chr5 9081120 9081258 -143456001 + IAP-d-int LTR ERVK 6398 6531 -11 1 654 900 255 128 16 chr5 9081825 9082144 -143455115 + MER31A LTR ERV1 121 475 -10 1 654 1331 231 10 7 chr5 9082834 9083139 -143454120 - RLTR18B LTR ERVK -5 507 202 1 654 975 244 9 4 chr5 9083176 9083402 -143453857 - RLTR18B LTR ERVK -285 227 1 1 654 3053 38 0 29 chr5 9086254 9086630 -143450629 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 1 654 723 270 38 66 chr5 9087224 9087513 -143449746 - MTD LTR MaLR 0 419 139 1 654 1559 154 101 88 chr5 9087705 9088082 -143449177 + RLTR41 LTR ERV1 62 443 -3 1 654 695 294 5 28 chr5 9088346 9088563 -143448696 - MTD LTR MaLR -190 229 18 1 654 235 210 145 0 chr5 9089107 9089169 -143448090 + RMER5 LTR ERV1 13 83 -451 1 654 1943 206 45 41 chr5 9089345 9089836 -143447423 + RMER5 LTR ERV1 34 526 -8 1 654 581 176 13 155 chr5 9091355 9091510 -143445749 + ORR1C2 LTR MaLR 9 141 -233 1 654 969 174 97 9 chr5 9091669 9091895 -143445364 + ORR1C2 LTR MaLR 139 384 0 1 654 296 279 95 39 chr5 9092593 9092772 -143444487 + RMER15 LTR ERVL 380 568 -7 1 654 6065 123 54 55 chr5 9093968 9095108 -143442151 + RLTR19-int LTR ERVK 3265 4403 -1734 1 654 756 300 85 12 chr5 9095334 9095815 -143441444 + RLTR19-int LTR ERVK 4472 4987 -419 1 654 269 231 69 100 chr5 9096424 9096554 -143440705 + IAP-d-int LTR ERVK 6400 6525 -17 1 654 6499 56 6 30 chr5 9096793 9097635 -143439624 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 1 654 1791 136 161 3 chr5 9098412 9098729 -143438530 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 654 748 231 71 22 chr5 9109618 9109844 -143427415 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 171 2 654 1870 125 161 0 chr5 9110077 9110413 -143426846 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 2 654 889 196 183 20 chr5 9143078 9143336 -143393923 + RLTR9B2 LTR ERVK 2 281 -112 2 654 1048 156 20 8 chr5 9145323 9145521 -143391738 + RLTR9B2 LTR ERVK 168 420 0 2 654 1094 254 33 57 chr5 9150736 9151037 -143386222 + MTEa LTR MaLR 1 294 -85 2 654 1240 215 41 95 chr5 9159158 9159323 -143377936 + RLTR40 LTR ERVK 16 177 -640 2 654 1240 217 310 86 chr5 9159510 9159853 -143377406 + RLTR40 LTR ERVK 178 592 -225 2 654 1562 212 72 26 chr5 9163386 9163734 -143373525 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 3 2 654 476 340 39 7 chr5 9164550 9164704 -143372555 - MER21B LTR ERV1 -431 432 274 2 654 3867 157 18 141 chr5 9166189 9167121 -143370138 - RLTR25B LTR ERVK -210 818 1 2 654 265 224 12 84 chr5 9167628 9167711 -143369548 - MT2B2 LTR ERVL -312 272 196 2 654 1007 271 86 110 chr5 9170220 9170298 -143366961 - RLTR20D LTR ERVK -12 566 478 2 654 1227 241 67 76 chr5 9170344 9170845 -143366414 - RLTR20D LTR ERVK -101 477 1 2 655 2965 55 45 3 chr5 9182455 9182835 -143354424 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 655 1629 135 62 108 chr5 9183916 9183973 -143353286 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 273 3 655 1629 135 62 108 chr5 9184158 9184441 -143352818 - ORR1A3 LTR MaLR -54 272 1 3 655 385 326 141 13 chr5 9185373 9185609 -143351650 - MLT2B1 LTR ERVL 0 567 300 3 655 2746 87 64 5 chr5 9185874 9186300 -143350959 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 3 655 2747 165 25 23 chr5 9187691 9188218 -143349041 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 1 3 655 378 194 0 0 chr5 9200402 9200469 -143336790 - MTEb LTR MaLR -153 226 160 3 655 4763 80 31 92 chr5 9210436 9211236 -143326023 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 3 655 226 355 142 26 chr5 9214198 9214424 -143322835 + LTR89 LTR ERVL? 382 633 -246 3 655 2035 104 3 78 chr5 9215090 9215434 -143321825 + ORR1A4 LTR MaLR 2 319 -10 3 655 524 281 137 78 chr5 9217033 9217326 -143319933 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 99 3 655 397 280 0 36 chr5 9218031 9218142 -143319117 + MLT1C LTR MaLR 6 112 -355 3 655 801 301 42 71 chr5 9218533 9218841 -143318418 + MLT1C LTR MaLR 141 439 -28 3 655 2169 209 43 34 chr5 9219972 9220395 -143316864 + RLTR17 LTR ERVK 244 673 -19 3 655 2169 209 43 34 chr5 9220643 9220664 -143316595 + RLTR17 LTR ERVK 674 692 0 3 655 231 322 0 11 chr5 9224063 9224151 -143313108 + MLT1K LTR MaLR 503 589 -6 3 655 5086 184 60 55 chr5 9225222 9226903 -143310356 - RMER3D-int LTR ERVK -620 2222 10 3 655 1782 196 101 42 chr5 9226936 9227361 -143309898 - RLTR17 LTR ERVK -57 635 186 3 655 1819 211 62 66 chr5 9228917 9229420 -143307839 + RLTR11A2 LTR ERVK 27 527 0 3 655 255 352 30 30 chr5 9230952 9231084 -143306175 + ERVL-E-int LTR ERVL 864 995 -4672 3 655 411 185 111 0 chr5 9234741 9234822 -143302437 + MTEb LTR MaLR 4 93 -286 3 655 1977 209 97 26 chr5 9235341 9235512 -143301747 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 322 3 655 2410 95 3 0 chr5 9235512 9235838 -143301421 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 655 1977 209 97 26 chr5 9235838 9236132 -143301127 - RLTR19 LTR ERVK -178 321 2 3 655 1935 194 51 61 chr5 9237212 9237739 -143299520 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 3 3 655 488 294 52 17 chr5 9243156 9243329 -143293930 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 252 4 655 341 292 0 0 chr5 9251434 9251523 -143285736 + ERVL-E-int LTR ERVL 5012 5100 -567 4 655 1325 267 123 52 chr5 9253645 9254206 -143283053 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 4 655 759 301 106 12 chr5 9254535 9254946 -143282313 + MLT2B2 LTR ERVL 1 554 -8 4 655 252 242 153 71 chr5 9255032 9255130 -143282129 - MT2B LTR ERVL -341 260 155 4 655 1023 181 290 43 chr5 9258633 9258933 -143278326 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 655 401 225 227 19 chr5 9262656 9262810 -143274449 + MER57C2 LTR ERV1 1 186 -248 4 655 353 267 159 7 chr5 9263268 9263419 -143273840 + MER57C2 LTR ERV1 235 408 -3 4 655 1919 166 14 36 chr5 9271520 9271882 -143265377 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 4 655 241 325 37 12 chr5 9272264 9272345 -143264914 - MTEa LTR MaLR -15 364 282 4 655 314 300 130 91 chr5 9280847 9281177 -143256082 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 21 4 655 1119 264 66 9 chr5 9289038 9289355 -143247904 - MTE2b LTR MaLR -39 340 6 4 655 1599 170 144 50 chr5 9297356 9297739 -143239520 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 655 523 280 186 90 chr5 9298306 9298628 -143238631 - MLT1B LTR MaLR 0 390 38 4 655 3077 63 2 8 chr5 9299584 9299982 -143237277 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 655 766 238 228 27 chr5 9304213 9304558 -143232701 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 5 656 2925 18 27 0 chr5 9314956 9315293 -143221966 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 656 1972 159 23 23 chr5 9323627 9323981 -143213278 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 5 656 728 296 118 63 chr5 9326795 9327177 -143210082 - MTC LTR MaLR -14 407 5 5 656 1013 233 143 30 chr5 9327636 9327972 -143209287 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 656 354 261 80 0 chr5 9330328 9330416 -143206843 + MTD LTR MaLR 18 112 -307 5 656 822 233 237 24 chr5 9336781 9337072 -143200187 + MTD LTR MaLR 67 419 0 5 656 350 260 118 48 chr5 9342993 9343179 -143194080 - LTR81B LTR ERV1? -15 1378 1180 5 656 421 366 114 19 chr5 9347176 9347493 -143189766 + MLT1L LTR MaLR 262 608 -2 5 656 402 279 62 93 chr5 9350856 9351113 -143186146 + MLT1J LTR MaLR 186 434 -78 5 656 459 357 72 49 chr5 9355079 9355385 -143181874 + MLT1A LTR MaLR 20 332 -42 5 656 323 319 67 25 chr5 9358673 9358792 -143178467 - LTR33 LTR ERVL -350 165 42 5 656 830 235 36 40 chr5 9362701 9362923 -143174336 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 154 5 656 703 221 162 0 chr5 9363012 9363166 -143174093 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 3 5 656 284 306 119 58 chr5 9372348 9372570 -143164689 + ORR1E LTR MaLR 1 233 -126 5 656 388 309 121 34 chr5 9373664 9374052 -143163207 + LTR37A LTR ERV1 1 422 -4 6 656 2489 212 174 9 chr5 9375880 9376357 -143160902 - RMER19A LTR ERVK 0 737 194 6 656 2489 212 174 9 chr5 9376418 9376573 -143160686 - RMER19A LTR ERVK -544 193 3 6 656 1123 290 74 65 chr5 9377327 9377854 -143159405 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 1 6 656 387 311 84 32 chr5 9378320 9378569 -143158690 + MLT1-int LTR MaLR 6 267 -1104 6 656 1623 147 140 22 chr5 9378609 9378930 -143158329 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 6 656 251 205 35 82 chr5 9379096 9379181 -143158078 + MLT1-int LTR MaLR 517 597 -774 6 656 413 215 93 9 chr5 9395565 9395673 -143141586 + MTEb LTR MaLR 256 372 -7 6 656 1399 242 80 46 chr5 9397219 9397609 -143139650 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 6 656 234 241 126 46 chr5 9408494 9408581 -143128678 - MTEb LTR MaLR 0 379 286 6 656 225 310 55 44 chr5 9408814 9408905 -143128354 - MTEb LTR MaLR -287 92 1 6 656 1565 264 22 86 chr5 9430099 9430609 -143106650 - RMER19C LTR ERVK -78 533 57 6 656 487 87 0 0 chr5 9432288 9432357 -143104902 - RMER19C LTR ERVK -542 69 1 6 657 1698 162 35 65 chr5 9438231 9438633 -143098626 + RMER17C LTR ERVK 1 390 -20 6 657 1395 219 130 16 chr5 9443138 9443478 -143093781 + MTD LTR MaLR 1 379 -40 6 657 1395 219 130 16 chr5 9443882 9443917 -143093342 + MTD LTR MaLR 380 418 -1 6 657 526 294 36 62 chr5 9452077 9452269 -143084990 + MLT1A0 LTR MaLR 2 188 -177 7 657 3742 35 5 0 chr5 9452725 9453159 -143084100 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 657 322 320 99 66 chr5 9453201 9453412 -143083847 + MLT1A0 LTR MaLR 191 408 0 7 657 484 339 116 68 chr5 9464779 9465175 -143072084 - LTR40a LTR ERVL -8 511 97 7 657 484 275 62 6 chr5 9465373 9465534 -143071725 - HERVL40-int LTR ERVL -21 5509 5340 7 657 265 292 77 42 chr5 9467143 9467286 -143069973 - HERVL40-int LTR ERVL -1550 3980 3833 7 657 257 319 29 7 chr5 9470040 9470176 -143067083 - HERVL40-int LTR ERVL -3921 1609 1471 7 657 396 384 64 9 chr5 9470428 9470864 -143066395 - HERVL40-int LTR ERVL -4364 1166 707 7 657 238 290 108 0 chr5 9471540 9471633 -143065626 + ORR1A3 LTR MaLR 40 142 -184 7 657 227 298 86 17 chr5 9471665 9471781 -143065478 + ORR1A3 LTR MaLR 256 379 0 7 657 477 371 104 22 chr5 9474172 9474528 -143062731 - LTR40a LTR ERVL -82 437 53 7 657 282 270 0 63 chr5 9484016 9484095 -143053164 + MLT1D LTR MaLR 1 74 -431 7 657 237 335 61 55 chr5 9484141 9484305 -143052954 + MLT1D LTR MaLR 83 247 -258 7 657 348 369 72 32 chr5 9495650 9495871 -143041388 + MLT1H1 LTR MaLR 318 547 -8 7 657 1448 163 131 6 chr5 9496948 9497299 -143039960 + RMER17C LTR ERVK 16 410 0 7 657 814 187 204 44 chr5 9497300 9497618 -143039641 + RMER17C-int LTR ERVK 1 369 -2869 7 657 268 302 35 0 chr5 9498776 9498862 -143038397 + RMER17C-int LTR ERVK 379 467 -2771 7 657 841 183 225 28 chr5 9499208 9499633 -143037626 + RMER17C-int LTR ERVK 1509 2016 -1222 7 657 546 165 35 0 chr5 9499668 9499783 -143037476 + RMER17C-int LTR ERVK 2241 2359 -879 7 657 1876 149 136 13 chr5 9500641 9501184 -143036075 + RMER17C-int LTR ERVK 2576 3185 -53 2 657 1183 191 40 92 chr5 9501902 9502276 -143034983 + RMER17C-int LTR ERVK 1113 1437 -1801 5 657 230 295 167 0 chr5 9505874 9505952 -143031307 + LTR40b LTR ERVL 65 155 -364 9 657 370 328 52 47 chr5 9505965 9506157 -143031102 + LTR40b LTR ERVL 270 462 0 9 657 513 273 47 35 chr5 9508415 9508586 -143028673 + LTR40b LTR ERVL 290 462 0 1 657 5082 195 51 20 chr5 9513309 9514378 -143022881 + RLTR25A LTR ERVK 1 1103 0 2 657 2587 182 58 35 chr5 9516711 9517183 -143020076 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 491 -87 2 657 2587 182 58 35 chr5 9517224 9517316 -143019943 + RLTR20A2 LTR ERVK 492 578 0 2 657 410 319 38 13 chr5 9517521 9517680 -143019579 + MLT1D LTR MaLR 292 454 -51 2 657 235 216 20 0 chr5 9518221 9518272 -143018987 + MLT1D LTR MaLR 454 505 0 2 657 2114 148 63 8 chr5 9520399 9520766 -143016493 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 1 3 657 1011 175 185 55 chr5 9522111 9522473 -143014786 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 3 657 1095 294 96 25 chr5 9522555 9522991 -143014268 - MLT1C LTR MaLR 0 467 1 3 657 2933 43 0 0 chr5 9527899 9528245 -143009014 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 657 2258 181 44 55 chr5 9535241 9535808 -143001451 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 6 657 465 300 44 142 chr5 9550140 9550568 -142986691 + RMER10A LTR ERVL 27 412 -30 8 657 4720 53 260 1 chr5 9561831 9562569 -142974690 + MTA_Mm-int LTR MaLR 170 1098 0 1 657 530 43 0 28 chr5 9562571 9562642 -142974617 + MTA_Mm LTR MaLR 3 71 -325 1 657 653 25 0 0 chr5 9562644 9562723 -142974536 + MTA_Mm LTR MaLR 318 396 0 1 658 265 135 0 0 chr5 9584881 9584918 -142952341 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 505 1 658 1836 180 43 103 chr5 9585013 9585478 -142951781 - RLTR20A LTR ERVK -102 439 3 1 658 345 319 63 65 chr5 9586810 9587089 -142950170 + MTEa LTR MaLR 80 370 -9 1 658 299 337 14 114 chr5 9600720 9600759 -142936500 + RMER12 LTR ERVK 733 762 -560 1 658 299 337 14 114 chr5 9600798 9601039 -142936220 + RMER12 LTR ERVK 763 985 -337 1 658 1655 187 12 75 chr5 9609865 9610264 -142926995 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 658 227 398 35 17 chr5 9610714 9610829 -142926430 + MLT1A1 LTR MaLR 9 125 -240 1 658 229 279 76 104 chr5 9610962 9611106 -142926153 + MLT1A1 LTR MaLR 265 404 -4 1 658 613 315 32 18 chr5 9618032 9618249 -142919010 + MTD LTR MaLR 35 254 -165 1 658 423 240 31 27 chr5 9618432 9618592 -142918667 + MTD LTR MaLR 260 404 -15 1 658 1140 255 36 108 chr5 9619156 9619543 -142917716 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 658 1636 239 51 60 chr5 9619701 9620115 -142917144 + MTD LTR MaLR 1 410 -9 1 658 414 338 98 52 chr5 9630263 9630550 -142906709 + MLT1G3 LTR MaLR 109 408 -187 1 658 548 260 50 67 chr5 9633604 9633931 -142903328 + RLTR20D LTR ERVK 1 421 -113 1 658 520 236 25 45 chr5 9635438 9635586 -142901673 + RLTR20D LTR ERVK 387 578 0 1 658 2495 194 55 35 chr5 9637620 9638169 -142899090 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 1 658 3346 150 90 2 chr5 9641207 9641841 -142895418 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 1 658 311 274 163 39 chr5 9645254 9645383 -142891876 + MLT1A LTR MaLR 225 369 -5 1 658 274 274 139 41 chr5 9645471 9645593 -142891666 + MLT1G1 LTR MaLR 67 200 -379 1 658 379 195 48 24 chr5 9652752 9652836 -142884423 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 2 658 2748 181 109 45 chr5 9657994 9658597 -142878662 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 2 658 1507 11 53 0 chr5 9660323 9660510 -142876749 + MTA_Mm LTR MaLR 1 197 -199 2 658 1297 288 63 13 chr5 9667636 9668030 -142869229 + MTD LTR MaLR 6 419 0 2 658 575 306 160 52 chr5 9674872 9675310 -142861949 - MLT1D LTR MaLR -1 504 20 2 658 3394 30 5 0 chr5 9679124 9679518 -142857741 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 658 562 308 110 13 chr5 9681713 9681950 -142855309 + RMER15 LTR ERVL 298 557 -18 2 658 265 191 29 29 chr5 9682550 9682620 -142854639 + LTR37B LTR ERV1 224 293 -175 2 658 877 319 62 3 chr5 9682780 9683138 -142854121 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 2 658 295 176 0 0 chr5 9683677 9683728 -142853531 - ORR1B1 LTR MaLR -342 52 2 2 658 1262 236 56 33 chr5 9690981 9691318 -142845941 + MTD LTR MaLR 75 419 0 2 658 858 292 85 55 chr5 9694863 9695193 -142842066 + ORR1E LTR MaLR 5 344 -15 2 659 1603 190 36 109 chr5 9699331 9699745 -142837514 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 659 3935 48 64 9 chr5 9699941 9700469 -142836790 + LTRIS2 LTR ERV1 1 557 -7 2 659 382 331 46 26 chr5 9700570 9700722 -142836537 + MLT1F1 LTR MaLR 51 205 -364 2 659 278 275 248 4 chr5 9700794 9700929 -142836330 + MLT1F1 LTR MaLR 393 562 -7 2 659 325 202 168 53 chr5 9716037 9716168 -142821091 + ORR1B2 LTR MaLR 1 146 -221 2 659 226 264 322 0 chr5 9717342 9717429 -142819830 + MLT1A LTR MaLR 251 365 -9 2 659 264 340 119 52 chr5 9729944 9730230 -142807029 + LTR78 LTR ERV1 636 940 -364 3 659 287 325 104 40 chr5 9737208 9737381 -142799878 - MLT1I LTR MaLR -208 203 20 3 659 2077 207 61 107 chr5 9744085 9744722 -142792537 + RMER19C LTR ERVK 1 608 -3 3 659 1975 184 36 0 chr5 9745090 9745455 -142791804 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 659 1832 203 101 8 chr5 9747668 9748045 -142789214 + MTC LTR MaLR 9 420 -1 3 659 1405 191 84 46 chr5 9754456 9754802 -142782457 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 3 659 4352 161 74 20 chr5 9755475 9756331 -142780928 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 3 659 238 294 45 105 chr5 9762885 9763018 -142774241 - MTE2a LTR MaLR -1 378 254 3 659 2232 119 25 0 chr5 9765326 9765645 -142771614 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 659 2336 148 41 0 chr5 9776339 9776730 -142760529 + MTC LTR MaLR 1 407 -14 3 659 368 287 14 22 chr5 9776951 9777090 -142760169 - RLTR15 LTR ERVK -221 138 1 3 659 5804 179 52 9 chr5 9777090 9777678 -142759581 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 5940 3 659 5804 179 52 9 chr5 9777727 9778314 -142758945 - MYSERV-int LTR ERVK -611 5939 5327 3 659 575 285 79 9 chr5 9778314 9778429 -142758830 - RLTR15 LTR ERVK -128 231 114 3 659 575 285 79 9 chr5 9778490 9778590 -142758669 - RLTR15 LTR ERVK -246 113 3 3 659 900 227 70 44 chr5 9787638 9788046 -142749213 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 551 1 3 659 893 296 113 16 chr5 9811868 9812239 -142725020 - MTD LTR MaLR -12 407 1 4 659 3531 13 0 2 chr5 9821881 9822278 -142714981 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 659 301 274 31 21 chr5 9823044 9823141 -142714118 - MTE2a LTR MaLR 0 419 322 4 659 574 283 45 131 chr5 9823844 9824112 -142713147 - MTE2a LTR MaLR -134 245 1 4 659 896 313 31 51 chr5 9824404 9824774 -142712485 + MTE2a LTR MaLR 18 390 -29 4 659 709 264 60 11 chr5 9826152 9826336 -142710923 + MTD LTR MaLR 1 193 -226 4 659 753 256 102 44 chr5 9827966 9828191 -142709068 + MTD LTR MaLR 173 410 -9 4 659 1903 135 27 59 chr5 9829349 9829687 -142707572 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 660 535 293 56 55 chr5 9834805 9835151 -142702108 + RMER15 LTR ERVL 38 320 -255 4 660 1460 135 56 4 chr5 9835150 9835417 -142701842 + RLTR15 LTR ERVK 61 341 -18 4 660 1753 181 6 18 chr5 9841946 9842277 -142694982 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 4 660 2217 191 68 14 chr5 9844096 9844537 -142692722 + RLTR20B1 LTR ERVK 4 468 -95 4 660 312 278 0 14 chr5 9844582 9844655 -142692604 + RLTR20B1 LTR ERVK 456 527 -36 4 660 2021 184 129 72 chr5 9848655 9849228 -142688031 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 606 -48 4 660 61524 37 12 0 chr5 9849228 9856912 -142680347 + RLTR6-int LTR ERV1 3 7778 0 4 660 252 224 209 0 chr5 9856912 9856979 -142680280 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 81 -573 4 660 1947 132 261 27 chr5 9857019 9857463 -142679796 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 4 660 323 391 53 50 chr5 9865323 9865665 -142671594 + MLT1A LTR MaLR 20 362 -12 5 660 4165 123 64 65 chr5 9867361 9867830 -142669429 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 325 5 660 4165 123 64 65 chr5 9867930 9868270 -142668989 - RMER17D2 LTR ERVK -485 324 1 5 660 476 365 43 104 chr5 9871548 9872104 -142665155 - MLT1F2 LTR MaLR -38 522 1 5 660 1733 260 31 27 chr5 9877262 9877740 -142659519 - RLTR16 LTR ERVK -25 480 1 5 660 2156 202 50 72 chr5 9878229 9878745 -142658514 + RLTR18B LTR ERVK 8 512 0 5 660 2746 111 5 12 chr5 9887727 9888129 -142649130 + MTB_Mm LTR MaLR 9 407 0 5 660 1619 225 108 3 chr5 9895888 9896258 -142641001 + MTD LTR MaLR 11 419 0 5 660 2979 121 23 35 chr5 9900008 9900489 -142636770 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 660 284 54 0 0 chr5 9900490 9900527 -142636732 - MERVL-int LTR ERVL -1 5484 5448 5 660 274 131 213 0 chr5 9900527 9900588 -142636671 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 5 660 17313 109 7 4 chr5 9900712 9903122 -142634137 - MERVL-int LTR ERVL -133 5352 2937 5 660 4111 86 9 0 chr5 9903443 9903988 -142633271 + MERVL-int LTR ERVL 2341 2890 -2595 5 660 587 402 98 18 chr5 9905146 9905607 -142631652 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 66 5 660 587 402 98 18 chr5 9905660 9905710 -142631549 - MLT1F2 LTR MaLR -495 65 9 5 660 3583 63 39 0 chr5 9907392 9907849 -142629410 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 660 800 224 77 74 chr5 9908303 9908563 -142628696 - MT2B LTR ERVL -83 518 100 5 660 863 209 88 85 chr5 9909434 9909753 -142627506 + MT2A LTR ERVL 1 459 -142 5 660 3598 218 93 42 chr5 9914421 9915512 -142621747 + MYSERV6-int LTR ERVK 7813 8958 -1 5 660 693 281 17 73 chr5 9915517 9915744 -142621515 + RLTR11B LTR ERVK 4 218 -235 5 660 693 282 58 112 chr5 9915849 9916114 -142621145 + RLTR11B LTR ERVK 219 494 -34 5 660 291 384 78 23 chr5 9916929 9917144 -142620115 + MLT1J2 LTR MaLR 1 229 -219 5 660 652 316 43 98 chr5 9918024 9918329 -142618930 - MTE2a LTR MaLR -2 377 90 5 660 2038 95 3 66 chr5 9931150 9931498 -142605761 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 5 660 26200 16 4 0 chr5 9931498 9934442 -142602817 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 5 660 914 81 24 0 chr5 9934442 9934565 -142602694 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 5 660 1811 123 4 4 chr5 9934562 9934824 -142602435 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 5 660 442 66 0 32 chr5 9934813 9934876 -142602383 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 5 660 2737 65 25 1 chr5 9934876 9935556 -142601703 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 1 5 660 2044 95 3 66 chr5 9935557 9935905 -142601354 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 5 660 328 344 65 61 chr5 9940193 9940422 -142596837 + MLT1D LTR MaLR 251 480 -25 6 660 349 410 78 49 chr5 9944603 9944911 -142592348 - MLT1F2 LTR MaLR -240 320 4 6 660 540 261 50 103 chr5 9947074 9947368 -142589891 - MTD LTR MaLR -14 407 152 6 660 1668 154 61 15 chr5 9947368 9947711 -142589548 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 6 660 473 290 39 167 chr5 9947711 9947722 -142589537 - MTD LTR MaLR -270 151 141 6 660 233 346 46 8 chr5 9950859 9950990 -142586269 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 646 781 -1 6 660 3343 35 2 0 chr5 9951519 9951914 -142585345 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 660 2084 197 10 5 chr5 9959232 9959624 -142577635 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 661 3984 169 47 125 chr5 9962159 9962212 -142575047 + ORR1B1-int LTR MaLR 1032 1085 -878 6 661 3984 173 47 92 chr5 9962239 9963496 -142573763 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1935 -28 6 661 2641 78 239 2 chr5 9979040 9979454 -142557805 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 661 6292 68 2 26 chr5 9980398 9981240 -142556019 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 6 661 1890 224 32 12 chr5 9985107 9985519 -142551740 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 6 661 252 308 65 21 chr5 9985679 9985772 -142551487 - MLT1J LTR MaLR -312 200 104 6 661 866 266 131 28 chr5 9986059 9986380 -142550879 - MTEa LTR MaLR -8 371 18 6 661 873 303 97 9 chr5 9986394 9986734 -142550525 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 661 2674 221 40 28 chr5 9988581 9989265 -142547994 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 6 661 259 316 99 57 chr5 10002474 10002615 -142534644 - MLT1I LTR MaLR -206 205 59 5 661 2713 73 65 0 chr5 10004159 10004531 -142532728 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 661 8458 55 13 3 chr5 10004531 10005618 -142531641 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 7 661 2970 55 42 0 chr5 10005618 10005998 -142531261 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 661 479 358 0 28 chr5 10014607 10014785 -142522474 + RMER15 LTR ERVL 271 443 -132 1 661 516 369 18 7 chr5 10015718 10016054 -142521205 - ERVL-E-int LTR ERVL -3449 1547 1208 2 661 2406 202 45 8 chr5 10034761 10035270 -142501989 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 4 661 503 338 75 51 chr5 10035885 10036216 -142501043 - MLT2B1 LTR ERVL -174 346 8 5 661 638 281 151 30 chr5 10038415 10038784 -142498475 + MLT2C1 LTR ERVL 24 417 -47 5 661 456 337 111 55 chr5 10038826 10038871 -142498388 + MLT2C1 LTR ERVL 418 461 -3 5 661 958 144 29 35 chr5 10046973 10047146 -142490113 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1669 1840 -8 6 661 1004 202 15 15 chr5 10047525 10047731 -142489528 + ORR1B1 LTR MaLR 5 210 -184 6 661 1230 199 95 34 chr5 10051616 10051912 -142485347 + RLTR46 LTR ERVK 1 314 -6 7 661 3180 186 29 85 chr5 10053093 10053512 -142483747 + RMER6D LTR ERVK 1 369 -351 7 661 3180 186 29 85 chr5 10053588 10053931 -142483328 + RMER6D LTR ERVK 370 720 0 7 661 2868 30 0 6 chr5 10070697 10071036 -142466223 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 9 661 55116 21 14 7 chr5 10071038 10077425 -142459834 + IAPEz-int LTR ERVK 3 6481 0 9 661 2868 30 0 6 chr5 10077425 10077764 -142459495 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 9 661 875 173 80 99 chr5 10085900 10086112 -142451147 + ORR1C2 LTR MaLR 177 384 0 1 661 1872 193 60 18 chr5 10086601 10087001 -142450258 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 1 662 1293 227 57 37 chr5 10106292 10106677 -142430582 + RMER19B LTR ERVK 156 671 -231 1 662 646 194 53 66 chr5 10108045 10108237 -142429022 + RMER19C LTR ERVK 1 227 -384 1 662 457 311 8 153 chr5 10123547 10123782 -142413477 + MTE2a LTR MaLR 127 327 -52 1 662 1535 187 75 28 chr5 10124597 10124906 -142412353 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 34 1 662 528 236 119 6 chr5 10129308 10129450 -142407809 - ORR1B1 LTR MaLR -221 173 3 1 662 1741 173 54 6 chr5 10130207 10130538 -142406721 + RLTR15 LTR ERVK 10 356 -3 1 662 435 194 9 44 chr5 10138440 10138553 -142398706 + ORR1A2 LTR MaLR 3 111 -235 1 662 1543 133 9 0 chr5 10141306 10141539 -142395720 + ORR1A2 LTR MaLR 93 327 0 1 662 609 268 0 0 chr5 10141652 10141775 -142395484 - MTE2b LTR MaLR -252 127 5 1 662 736 280 113 22 chr5 10142113 10142343 -142394916 - MTEa LTR MaLR -128 251 1 1 662 1064 304 80 6 chr5 10144704 10145055 -142392204 + MTD LTR MaLR 20 396 -23 1 662 623 198 41 0 chr5 10148209 10148330 -142388929 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 259 2 662 499 248 165 30 chr5 10152542 10152675 -142384584 - ORR1C2 LTR MaLR -120 264 114 2 662 244 250 26 53 chr5 10152751 10152827 -142384432 - ORR1C2 LTR MaLR -263 111 38 2 662 246 287 115 57 chr5 10154032 10154154 -142383105 - MLT1F LTR MaLR -141 407 279 2 662 1605 215 44 0 chr5 10156803 10157142 -142380117 + ORR1C1 LTR MaLR 19 372 -6 2 662 334 64 0 21 chr5 10157145 10157193 -142380066 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 272 2 662 3132 202 32 43 chr5 10160544 10161394 -142375865 + RMER3D-int LTR ERVK 2002 2841 -1 2 662 2947 84 17 0 chr5 10161395 10161809 -142375450 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 662 2464 136 25 96 chr5 10162141 10162660 -142374599 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 662 3780 94 49 7 chr5 10162660 10163208 -142374051 + RLTR45-int LTR ERVK 1 571 -6673 2 662 1115 42 0 40 chr5 10163973 10164123 -142373136 + RLTR45-int LTR ERVK 549 692 -6552 2 662 1633 70 28 0 chr5 10164480 10164693 -142372566 + RLTR45-int LTR ERVK 692 910 -6334 2 662 1126 121 12 0 chr5 10164813 10164986 -142372273 + RLTR45-int LTR ERVK 913 1087 -6157 2 662 273 59 0 0 chr5 10164989 10165023 -142372236 + RLTR45 LTR ERVK 449 482 0 2 662 324 191 64 20 chr5 10171069 10171180 -142366079 + MTC LTR MaLR 271 408 -13 2 662 2352 206 35 35 chr5 10172044 10172616 -142364643 + RMER6C LTR ERVK 111 682 -8 2 662 273 319 34 17 chr5 10181619 10181737 -142355522 - LTR40b LTR ERVL -25 437 318 2 662 1152 208 82 26 chr5 10182564 10182904 -142354355 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 2 662 2037 210 106 49 chr5 10183847 10184377 -142352882 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 1 2 662 1966 181 176 7 chr5 10184397 10185221 -142352038 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -22 2304 1342 2 662 244 240 129 10 chr5 10185223 10185324 -142351935 - RLTR20B2 LTR ERVK -447 113 1 2 662 2723 28 61 0 chr5 10185637 10185963 -142351296 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 662 13862 53 14 1 chr5 10185963 10187731 -142349528 + ORR1A0-int LTR MaLR 2 1792 0 2 662 2943 35 0 0 chr5 10187731 10188077 -142349182 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 662 670 274 124 104 chr5 10189473 10189819 -142347440 + ORR1E LTR MaLR 7 359 0 2 662 5887 75 20 30 chr5 10189827 10190657 -142346602 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 2 662 445 314 44 99 chr5 10191330 10191602 -142345657 + MTE2b LTR MaLR 12 268 -111 2 662 1757 262 41 114 chr5 10191979 10192582 -142344677 - RMER13B LTR ERVK -107 801 225 2 662 1757 267 43 109 chr5 10192643 10192916 -142344343 - RMER13B LTR ERVK -684 224 2 2 662 3821 211 71 7 chr5 10196871 10197677 -142339582 - RMER13A LTR ERVK 0 860 4 2 662 705 295 32 107 chr5 10197944 10198225 -142339034 + RMER19C LTR ERVK 220 479 -132 2 662 1164 193 116 23 chr5 10199033 10199435 -142337824 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 2 662 443 272 167 40 chr5 10200053 10200379 -142336880 + RLTR9A LTR ERVK 1 437 0 2 662 1911 113 40 19 chr5 10200487 10200811 -142336448 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 2 662 915 284 69 41 chr5 10206834 10207175 -142330084 + ORR1E LTR MaLR 1 371 -3 2 662 463 196 67 26 chr5 10223386 10223513 -142313746 + MT2B2 LTR ERVL 2 123 -478 2 82 667 235 49 54 chr5 10223572 10223812 -142313447 + MT2B2 LTR ERVL 243 584 0 2 663 1275 263 33 0 chr5 10228595 10228926 -142308333 - RMER15 LTR ERVL -2 573 232 3 663 249 300 88 35 chr5 10228953 10229067 -142308192 - RMER15 LTR ERVL -434 141 22 3 663 2889 171 105 37 chr5 10229228 10229902 -142307357 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 3 663 1828 229 223 4 chr5 10230299 10230855 -142306404 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 3 663 260 323 63 21 chr5 10231681 10231776 -142305483 + ORR1E LTR MaLR 1 99 -260 3 663 1831 155 3 7 chr5 10233857 10234162 -142303097 + ORR1A2 LTR MaLR 24 327 0 3 663 1017 224 123 85 chr5 10234167 10234484 -142302775 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 663 3022 205 31 51 chr5 10234488 10235228 -142302031 + ORR1A4-int LTR MaLR 5 729 -1234 3 663 810 202 30 184 chr5 10235085 10235389 -142301870 + MT2B LTR ERVL 6 262 -339 3 663 1374 200 3 9 chr5 10235276 10235604 -142301655 + ORR1A4-int LTR MaLR 718 1043 -920 3 663 3738 169 53 14 chr5 10239518 10240296 -142296963 + RMER17D2 LTR ERVK 2 809 0 3 663 1327 218 26 9 chr5 10249117 10249459 -142287800 + ORR1A3-int LTR MaLR 718 1065 -898 3 663 983 176 37 5 chr5 10255675 10255863 -142281396 + RLTR19 LTR ERVK 2 195 -304 3 663 583 311 16 16 chr5 10256109 10256302 -142280957 - RLTR19A LTR ERVK -118 378 186 3 663 261 204 0 0 chr5 10256295 10256344 -142280915 + RLTR19 LTR ERVK 444 492 -7 3 663 525 145 25 235 chr5 10256638 10256800 -142280459 + RMER6B LTR ERVK 1 128 -333 3 663 968 199 109 17 chr5 10258192 10258422 -142278837 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 134 3 663 866 178 2 0 chr5 10265429 10265589 -142271670 - ORR1C2 LTR MaLR -235 149 1 3 663 753 166 11 109 chr5 10269556 10269739 -142267520 + ORR1C1 LTR MaLR 1 165 -213 3 663 235 154 0 0 chr5 10269745 10269784 -142267475 + ORR1C1 LTR MaLR 338 376 -2 3 663 2480 195 21 15 chr5 10275267 10275792 -142261467 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 663 1339 198 138 59 chr5 10276062 10276410 -142260849 - ORR1B1 LTR MaLR -8 359 3 3 663 2235 152 19 60 chr5 10282923 10283343 -142253916 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 3 663 3738 214 81 26 chr5 10288151 10289238 -142248021 + RMER12 LTR ERVK 1 1195 -127 3 663 446 271 51 56 chr5 10295391 10295597 -142241662 - RMER12 LTR ERVK -189 1383 1022 3 663 1348 291 47 82 chr5 10295705 10296565 -142240694 - RMER12 LTR ERVK -1035 813 1 3 663 855 312 70 49 chr5 10302163 10302533 -142234726 + MTEa LTR MaLR 1 378 -1 3 663 2904 85 10 15 chr5 10305759 10306166 -142231093 + MTB_Mm LTR MaLR 1 405 -2 3 663 688 272 57 62 chr5 10311248 10311695 -142225564 + RMER2 LTR ERV1 5 549 -18 3 663 408 314 14 14 chr5 10312277 10312419 -142224840 - MER54A LTR ERVL -757 144 3 3 663 1720 194 45 48 chr5 10315999 10316377 -142220882 + ORR1C1 LTR MaLR 1 377 -1 4 663 1958 189 160 19 chr5 10322477 10322537 -142214722 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 469 4 663 1958 189 160 19 chr5 10322560 10322962 -142214297 - RLTR11A LTR ERVK -60 468 2 4 663 2238 133 34 28 chr5 10326533 10326890 -142210369 + RLTR13D5 LTR ERVK 5 363 -660 4 663 2274 155 33 5 chr5 10326881 10327270 -142209989 + RLTR13D5 LTR ERVK 622 1021 -2 4 663 4237 21 0 0 chr5 10331669 10332151 -142205108 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 4 663 300 234 83 113 chr5 10334495 10334611 -142202648 + RLTR20A2 LTR ERVK 452 566 -12 4 663 3501 206 84 57 chr5 10335503 10337673 -142199586 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 2841 -1 4 663 526 187 70 75 chr5 10337673 10337854 -142199405 + RLTR20D LTR ERVK 1 203 -331 4 663 1192 272 94 52 chr5 10338282 10338783 -142198476 + RLTR20D LTR ERVK 47 568 0 4 663 327 229 36 0 chr5 10339538 10339621 -142197638 + MT2A LTR ERVL 2 87 -446 4 663 693 286 75 42 chr5 10340899 10341257 -142196002 + MT2A LTR ERVL 164 533 0 4 663 1051 248 181 77 chr5 10352895 10353376 -142183883 + MT2A LTR ERVL 3 533 0 4 664 2597 41 28 0 chr5 10355092 10355410 -142181849 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 4 664 6792 39 4 12 chr5 10355410 10356246 -142181013 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5653 4 664 2618 76 0 3 chr5 10356241 10356584 -142180675 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1359 4 664 992 106 0 53 chr5 10356584 10356746 -142180513 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 510 4 664 3654 37 9 2 chr5 10356746 10357179 -142180080 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 664 44014 22 0 10 chr5 10357179 10362262 -142174997 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 2552 4 664 369 111 0 0 chr5 10362268 10362331 -142174928 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5634 1947 1885 4 664 339 138 17 0 chr5 10362338 10362396 -142174863 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5627 1779 1721 4 664 323 250 104 22 chr5 10362396 10362531 -142174728 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5469 668 523 4 664 795 159 279 29 chr5 10362525 10362765 -142174494 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4795 611 312 4 664 778 191 10 42 chr5 10362857 10363148 -142174111 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 729 4 664 2677 67 0 3 chr5 10363146 10363490 -142173769 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7238 343 1 4 664 3628 44 5 2 chr5 10363490 10363925 -142173334 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 664 2734 72 0 0 chr5 10363925 10364273 -142172986 - IAPEz-int LTR ERVK -5966 515 168 4 664 252 244 0 0 chr5 10364273 10364318 -142172941 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 4 664 910 97 103 0 chr5 10364325 10364480 -142172779 - IAPEz-int LTR ERVK -6285 196 26 4 664 2593 41 28 0 chr5 10364486 10364804 -142172455 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 4 664 323 185 0 0 chr5 10370546 10370600 -142166659 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 186 239 -93 4 664 2422 112 23 3 chr5 10370607 10370957 -142166302 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 4 664 337 336 199 14 chr5 10384080 10384367 -142152892 - MER34A1 LTR ERV1 -99 488 149 4 664 809 262 55 187 chr5 10394357 10394940 -142142319 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 3 5 664 926 277 154 17 chr5 10399430 10399457 -142137802 - MTC LTR MaLR -14 407 383 5 664 3137 48 8 5 chr5 10399457 10399852 -142137407 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 664 926 277 154 17 chr5 10399852 10400180 -142137079 - MTC LTR MaLR -39 382 3 5 664 865 298 197 7 chr5 10405923 10406227 -142131032 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 9 5 664 1214 157 4 275 chr5 10414130 10414693 -142122566 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 664 658 357 71 9 chr5 10417546 10417885 -142119374 + LTR68 LTR ERV1 71 430 -310 5 664 1622 223 142 35 chr5 10418658 10419229 -142118030 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2607 5 664 700 280 47 19 chr5 10419252 10419463 -142117796 + RLTR16 LTR ERVK 24 240 -265 5 664 769 239 54 56 chr5 10419814 10420089 -142117170 - RMER17C-int LTR ERVK -630 2608 2403 5 664 499 272 117 9 chr5 10425351 10425681 -142111578 + MTD LTR MaLR 13 407 -12 5 664 1153 324 42 3 chr5 10458436 10458795 -142078464 + MTD LTR MaLR 33 405 -14 5 664 403 278 51 107 chr5 10459381 10459578 -142077681 + ORR1E LTR MaLR 6 191 -168 5 664 1882 336 104 52 chr5 10459827 10460899 -142076360 + MTE-int LTR MaLR 124 1251 -329 5 664 693 296 0 50 chr5 10461136 10461335 -142075924 - MTD LTR MaLR -11 408 220 6 664 3616 223 70 32 chr5 10461845 10462713 -142074546 + RMER13B LTR ERVK 8 908 0 6 664 607 342 69 17 chr5 10471512 10471744 -142065515 - MTEa LTR MaLR -135 244 1 6 664 1288 240 172 3 chr5 10476068 10476428 -142060831 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 664 286 338 89 7 chr5 10479184 10479330 -142057929 - MLT1E LTR MaLR 0 653 496 6 664 287 158 50 50 chr5 10480043 10480103 -142057156 + RMER10B LTR ERVL 276 335 -63 6 664 2184 182 86 38 chr5 10480985 10481488 -142055771 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 6 665 8375 24 1 1 chr5 10486141 10487099 -142050160 + RLTR13A2 LTR ERVK 1 958 0 6 665 1342 183 32 8 chr5 10488544 10488792 -142048467 + ORR1A4 LTR MaLR 17 270 -59 6 665 396 159 43 43 chr5 10488929 10488961 -142048298 + ORR1A4 LTR MaLR 238 273 -56 6 665 396 159 43 43 chr5 10488987 10489046 -142048213 + ORR1A4 LTR MaLR 274 329 0 6 665 299 340 11 0 chr5 10489888 10489982 -142047277 - LTR78 LTR ERV1 -114 1190 1096 6 665 240 296 11 100 chr5 10494845 10494935 -142042324 - MT2B LTR ERVL -368 233 152 6 665 1522 179 208 79 chr5 10495503 10495581 -142041678 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 415 6 665 1522 179 208 79 chr5 10495640 10495930 -142041329 - RLTR16 LTR ERVK -91 414 50 6 665 1522 179 208 79 chr5 10496248 10496320 -142040939 - RLTR16 LTR ERVK -456 49 9 6 665 627 280 56 48 chr5 10498866 10499222 -142038037 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 6 665 1708 235 63 0 chr5 10499269 10499682 -142037577 + IAP-d-int LTR ERVK 22 460 -6082 6 665 1355 227 3 0 chr5 10499702 10499993 -142037266 + IAP-d-int LTR ERVK 2499 2790 -3752 6 665 4504 291 25 24 chr5 10500000 10501784 -142035475 + IAP-d-int LTR ERVK 2798 4582 -1960 1 665 1313 283 42 27 chr5 10501897 10502376 -142034883 + IAP-d-int LTR ERVK 4696 5181 -1361 1 665 1621 81 5 0 chr5 10502481 10502690 -142034569 - MMERVK10C-int LTR ERVK -728 6952 6743 3 665 3277 92 18 2 chr5 10502680 10503127 -142034132 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1367 6214 5761 3 665 3149 96 5 16 chr5 10503118 10503551 -142033708 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1939 5642 5215 3 665 771 119 28 43 chr5 10503817 10503958 -142033301 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2911 4670 4532 3 665 445 162 28 43 chr5 10503976 10504099 -142033160 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 4 665 1684 149 148 3 chr5 10504101 10504669 -142032590 - ETnERV2-int LTR ERVK -3135 4271 3567 5 665 643 202 0 0 chr5 10504695 10504814 -142032445 - ETnERV2-int LTR ERVK -4653 2753 2635 5 665 280 279 0 55 chr5 10504826 10504917 -142032342 - ETnERV2-int LTR ERVK -4867 2539 2454 5 665 446 169 93 0 chr5 10504928 10505046 -142032213 - ETnERV2-int LTR ERVK -5557 1849 1721 5 665 1508 193 103 72 chr5 10505046 10505527 -142031732 - ETnERV2-int LTR ERVK -4783 623 255 5 665 623 109 59 0 chr5 10505550 10505651 -142031608 - IAPLTR4_I LTR ERVK -1356 114 8 6 665 1504 163 94 0 chr5 10505653 10505941 -142031318 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -17 315 1 7 665 1405 161 0 8 chr5 10505963 10506201 -142031058 + IAP-d-int LTR ERVK 6307 6542 0 1 665 795 284 50 45 chr5 10506201 10506558 -142030701 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 1 665 1493 235 114 24 chr5 10507352 10507862 -142029397 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 6 8 665 633 231 93 12 chr5 10513028 10513338 -142023921 - RMER6D LTR ERVK -2 688 311 1 665 1652 197 68 22 chr5 10513405 10513847 -142023412 - RMER6C LTR ERVK -259 461 1 1 665 7045 65 5 2 chr5 10518492 10519383 -142017876 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 2 665 2163 73 32 6 chr5 10521482 10521925 -142015334 + RLTR1B LTR ERV1 1 495 -17 3 665 804 276 214 20 chr5 10522820 10523260 -142013999 - RMER2 LTR ERV1 -42 525 1 3 665 2182 89 119 11 chr5 10526118 10526470 -142010789 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 3 665 1312 211 6 9 chr5 10529994 10530319 -142006940 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 720 3 665 701 188 18 201 chr5 10530214 10530487 -142006772 - MT2B LTR ERVL -344 257 35 3 665 2993 193 36 70 chr5 10530371 10531117 -142006142 - ORR1A4-int LTR MaLR -1234 729 9 3 665 821 234 191 68 chr5 10531122 10531415 -142005844 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 665 1715 168 3 7 chr5 10531420 10531725 -142005534 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 24 4 665 241 204 0 0 chr5 10535190 10535239 -142002020 - RLTR19 LTR ERVK -7 492 444 4 665 496 247 189 12 chr5 10535232 10535348 -142001911 + RLTR19A LTR ERVK 186 330 -166 4 665 496 247 189 12 chr5 10535404 10535449 -142001810 + RLTR19A LTR ERVK 331 375 -121 4 665 942 194 37 5 chr5 10535693 10535880 -142001379 - RLTR19 LTR ERVK -305 194 2 4 665 816 194 80 99 chr5 10548349 10548561 -141988698 + ORR1C2 LTR MaLR 177 384 0 6 665 1838 196 60 18 chr5 10549079 10549479 -141987780 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 6 665 775 218 36 21 chr5 10555869 10556061 -141981198 - RMER19C LTR ERVK -2 609 415 7 665 581 338 77 30 chr5 10572659 10572997 -141964262 + MER68 LTR ERVL 145 498 -65 9 665 616 161 74 37 chr5 10573013 10573174 -141964085 + MT2B LTR ERVL 1 191 -342 9 665 540 201 171 82 chr5 10573198 10573278 -141963981 + MT2B LTR ERVL 192 224 -309 9 665 633 159 18 9 chr5 10573454 10573568 -141963691 + ORR1B2 LTR MaLR 253 367 0 9 665 246 291 62 18 chr5 10578067 10578179 -141959080 + RMER17A2 LTR ERVK 247 363 -543 1 665 2070 182 30 27 chr5 10579905 10580306 -141956953 + MTB_Mm LTR MaLR 6 407 0 1 665 528 215 8 32 chr5 10584723 10584848 -141952411 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 404 1 665 1932 205 52 77 chr5 10584846 10585368 -141951891 + RLTR11A LTR ERVK 20 528 0 1 665 256 292 22 11 chr5 10585496 10585593 -141951666 - MTE2b LTR MaLR -1 378 281 1 665 1855 209 139 52 chr5 10587225 10587860 -141949399 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 1 665 520 295 38 5 chr5 10594817 10595001 -141942258 - MTD LTR MaLR 0 419 230 1 665 670 314 107 4 chr5 10596334 10596577 -141940682 - MTD LTR MaLR -151 268 1 1 665 504 367 48 38 chr5 10597876 10598165 -141939094 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 64 1 665 307 311 116 28 chr5 10598777 10599068 -141938191 - MTC LTR MaLR -85 334 3 1 665 3147 48 5 8 chr5 10602391 10602788 -141934471 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 665 1581 214 96 35 chr5 10605324 10605721 -141931538 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 666 2279 224 37 58 chr5 10617069 10617299 -141919960 - RMER3D-int LTR ERVK -415 2427 2207 1 666 2279 224 37 58 chr5 10617688 10618245 -141919014 - RMER3D-int LTR ERVK -636 2206 1657 1 666 2313 122 212 27 chr5 10621490 10621970 -141915289 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 605 -49 1 666 50341 16 16 0 chr5 10621970 10628043 -141909216 + RLTR6-int LTR ERV1 1 6170 -1608 1 666 12192 12 13 0 chr5 10628042 10629470 -141907789 + RLTR6-int LTR ERV1 6332 7778 0 1 666 2194 121 220 28 chr5 10629579 10630039 -141907220 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 1 666 2239 191 26 97 chr5 10630164 10630470 -141906789 - RMER3D-int LTR ERVK -1176 1666 1409 1 666 2239 232 46 83 chr5 10630616 10631572 -141905687 - RMER3D-int LTR ERVK -1434 1408 1 1 666 1227 194 121 16 chr5 10631572 10631898 -141905361 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 183 1 666 1376 127 9 0 chr5 10632027 10632240 -141905019 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -369 215 1 1 666 1513 212 45 43 chr5 10632457 10632860 -141904399 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 1 666 434 281 69 90 chr5 10639588 10639910 -141897349 + RLTR12B LTR ERVK 15 296 -232 1 666 396 189 191 36 chr5 10640748 10640858 -141896401 + RLTR9A LTR ERVK 1 127 -241 1 666 1645 192 15 63 chr5 10640857 10641252 -141896007 - RMER17C LTR ERVK -34 376 1 1 666 391 288 73 33 chr5 10641252 10641403 -141895856 + RLTR9A LTR ERVK 253 409 0 1 666 406 364 95 28 chr5 10650955 10651345 -141885914 - MLT1J-int LTR MaLR -592 795 380 2 666 3352 125 18 5 chr5 10652850 10653663 -141883596 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 1033 1 2 666 700 254 20 1 chr5 10655283 10655477 -141881782 + MLT1C LTR MaLR 244 409 -58 2 666 586 262 107 45 chr5 10656904 10657128 -141880131 - RMER20B LTR ERVK -229 398 161 2 666 1757 178 243 38 chr5 10657793 10658353 -141878906 + RMER6C LTR ERVK 16 690 0 2 666 2915 181 35 86 chr5 10660170 10660981 -141876278 - RMER17D2 LTR ERVK -15 794 26 2 666 723 354 31 44 chr5 10668715 10669099 -141868160 + RMER15-int LTR ERVL 1493 1871 -3128 2 666 614 247 77 107 chr5 10669889 10670161 -141867098 + RMER15-int LTR ERVL 4652 4915 -84 2 666 270 339 55 33 chr5 10670587 10670770 -141866489 + RMER15 LTR ERVL 373 559 -16 2 666 1662 129 104 13 chr5 10676370 10676668 -141860591 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 1 2 666 1950 214 34 5 chr5 10677259 10677704 -141859555 + RMER6B LTR ERVK 1 458 -3 2 666 1722 192 0 7 chr5 10677707 10678016 -141859243 + MYSERV6-int LTR ERVK 2 308 -8651 2 666 5540 214 75 23 chr5 10678022 10679622 -141857637 - ORR1A3-int LTR MaLR -195 1768 291 2 666 842 243 193 26 chr5 10680301 10680762 -141856497 - RLTR20C LTR ERVK 0 541 1 2 666 892 269 54 34 chr5 10680781 10681077 -141856182 + RLTR16 LTR ERVK 1 302 -203 2 666 5465 157 66 12 chr5 10681461 10682586 -141854673 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -75 2251 1067 2 666 3360 204 85 41 chr5 10682591 10683515 -141853744 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1461 1381 1 2 666 248 302 228 41 chr5 10685812 10685957 -141851302 + MLT1J LTR MaLR 229 400 -112 2 666 232 125 0 91 chr5 10695616 10695660 -141841599 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 327 2 666 1744 196 181 13 chr5 10695660 10696042 -141841217 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 2 666 311 317 51 51 chr5 10696720 10696896 -141840363 + MuRRS4-int LTR ERV1 587 762 -6794 2 666 1106 306 77 38 chr5 10697328 10698489 -141838770 + MuRRS4-int LTR ERV1 1051 2423 -5355 2 666 1816 307 51 55 chr5 10698545 10700177 -141837082 + MuRRS4-int LTR ERV1 2929 5610 -1996 2 666 932 310 17 8 chr5 10700444 10700802 -141836457 + RLTR6-int LTR ERV1 7328 7688 -90 2 666 518 215 0 9 chr5 10700920 10701028 -141836231 + RLTR41 LTR ERV1 3 109 -337 2 666 1146 234 45 81 chr5 10701053 10701411 -141835848 - ORR1D1 LTR MaLR -29 345 1 2 666 2563 244 54 8 chr5 10701428 10702033 -141835226 - ORR1D1-int LTR MaLR -36 1334 702 2 666 626 199 149 23 chr5 10702033 10702107 -141835152 + RMER15 LTR ERVL 1 81 -494 2 666 626 199 149 23 chr5 10702379 10702479 -141834780 + RMER15 LTR ERVL 82 196 -379 2 666 1798 213 51 15 chr5 10702696 10703087 -141834172 + RMER15 LTR ERVL 167 571 -4 2 666 2961 72 10 5 chr5 10715195 10715589 -141821670 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 666 371 357 82 0 chr5 10721433 10721629 -141815630 + MTEa LTR MaLR 148 359 -20 3 666 828 285 46 35 chr5 10722440 10722724 -141814535 + RMER15 LTR ERVL 276 562 -13 3 666 1002 218 157 33 chr5 10723183 10723515 -141813744 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 666 1269 272 16 50 chr5 10723517 10723665 -141813594 + ORR1D1-int LTR MaLR 2 146 -1224 3 666 1269 272 16 50 chr5 10723862 10724089 -141813170 + ORR1D1-int LTR MaLR 147 364 -1006 3 666 671 259 10 44 chr5 10724108 10724314 -141812945 + ORR1D1-int LTR MaLR 483 681 -689 3 666 707 243 23 23 chr5 10724338 10724515 -141812744 + ORR1D1-int LTR MaLR 1194 1370 0 3 666 762 246 90 11 chr5 10724518 10724707 -141812552 + ORR1D1 LTR MaLR 5 208 -166 3 666 614 225 34 9 chr5 10725539 10725713 -141811546 + ORR1D1 LTR MaLR 188 421 0 3 666 2575 163 98 100 chr5 10734535 10735147 -141802112 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 667 3375 173 29 17 chr5 10750840 10751428 -141785831 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 98 3 667 919 250 17 38 chr5 10753568 10753677 -141783582 + RMER6D LTR ERVK 1 108 -612 3 667 1806 167 9 58 chr5 10753677 10754021 -141783238 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 667 919 250 17 38 chr5 10754021 10754148 -141783111 + RMER6D LTR ERVK 109 232 -488 3 667 5291 181 43 81 chr5 10754349 10756002 -141781257 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 8 3 667 429 119 0 15 chr5 10760065 10760133 -141777126 - RMER13B LTR ERVK -545 363 297 3 667 2738 93 12 10 chr5 10763644 10764046 -141773213 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 3 667 2800 186 21 118 chr5 10764436 10765199 -141772060 + RMER6C LTR ERVK 1 689 -1 3 667 1956 234 19 149 chr5 10767957 10768647 -141768612 + RMER19C LTR ERVK 12 611 0 3 667 227 216 0 19 chr5 10770108 10770160 -141767099 - MTE2b LTR MaLR 0 379 329 3 667 257 174 0 21 chr5 10771067 10771114 -141766145 - MTE2b LTR MaLR -330 49 4 3 667 1461 183 90 3 chr5 10776497 10776801 -141760458 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -6 469 1 3 667 4761 104 14 22 chr5 10776801 10777694 -141759565 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7581 6743 3 667 3411 88 2 2 chr5 10777684 10778138 -141759121 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 3 667 3198 86 16 16 chr5 10778133 10778569 -141758690 - IAPEY3-int LTR ERVK -1943 5638 5203 3 667 6462 36 15 4 chr5 10778821 10779623 -141757636 - IAPLTR4_I LTR ERVK -649 821 11 3 667 1505 171 92 0 chr5 10779623 10779916 -141757343 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 3 667 820 307 61 38 chr5 10780188 10780533 -141756726 + ORR1D1 LTR MaLR 19 371 -3 3 667 2082 189 135 80 chr5 10782295 10782949 -141754310 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 667 2531 208 120 10 chr5 10783196 10783804 -141753455 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 4 4 667 999 224 22 35 chr5 10785954 10786181 -141751078 - RMER6B LTR ERVK -16 445 222 4 667 1043 200 37 0 chr5 10786231 10786446 -141750813 - RMER6B LTR ERVK -238 223 1 4 667 712 130 9 0 chr5 10786458 10786566 -141750693 - MYSERV6-int LTR ERVK -1205 7754 7646 4 667 414 241 0 0 chr5 10789423 10789510 -141747749 - MYSERV-int LTR ERVK -2854 3696 3610 4 667 721 197 27 43 chr5 10790033 10790219 -141747040 - MYSERV6-int LTR ERVK -5125 3834 3652 4 667 1379 165 47 17 chr5 10790752 10791048 -141746211 - MYSERV6-int LTR ERVK -5300 3659 3355 4 667 348 261 35 21 chr5 10791062 10791211 -141746048 - RLTR11A2 LTR ERVK -10 518 307 4 667 516 299 79 88 chr5 10791278 10791619 -141745640 - RLTR11A2 LTR ERVK -189 338 1 4 667 643 152 9 0 chr5 10791620 10791732 -141745527 - MYSERV6-int LTR ERVK -5603 3356 3244 4 667 1517 187 59 28 chr5 10791743 10792100 -141745159 - MYSERV6-int LTR ERVK -5885 3074 2707 4 667 3400 170 36 28 chr5 10792067 10792812 -141744447 - MYSERV6-int LTR ERVK -6930 2029 1279 4 667 2521 196 23 6 chr5 10792835 10793307 -141743952 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 20 4 667 4930 175 47 87 chr5 10793310 10794496 -141742763 - MYSERV6-int LTR ERVK -7818 1141 3 4 667 1724 217 30 55 chr5 10794497 10794970 -141742289 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 4 667 1489 193 259 14 chr5 10795374 10795924 -141741335 + RMER6D LTR ERVK 2 690 0 4 667 1672 231 59 5 chr5 10796282 10796602 -141740657 + ORR1B1 LTR MaLR 1 342 -52 4 667 1672 231 59 5 chr5 10796796 10796849 -141740410 + ORR1B1 LTR MaLR 343 394 0 4 667 2582 210 84 114 chr5 10796856 10797099 -141740160 + ORR1B1-int LTR MaLR 1166 1407 -556 4 667 3201 48 8 0 chr5 10797099 10797492 -141739767 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 667 2582 214 83 111 chr5 10797492 10798029 -141739230 + ORR1B1-int LTR MaLR 1408 1905 -58 4 667 1839 209 39 16 chr5 10798038 10798423 -141738836 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 667 246 292 130 33 chr5 10812412 10812504 -141724755 - RMER15 LTR ERVL -132 443 343 4 667 911 203 21 5 chr5 10812529 10812717 -141724542 - RMER6C LTR ERVK 0 690 500 4 667 730 188 32 7 chr5 10812810 10812965 -141724294 - RMER6C LTR ERVK -367 353 195 4 667 270 273 15 15 chr5 10813497 10813627 -141723632 + ORR1B1-int LTR MaLR 625 754 -755 4 667 3059 20 0 0 chr5 10838981 10839327 -141697932 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 667 4479 147 20 14 chr5 10846875 10847607 -141689652 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 667 3877 70 8 6 chr5 10848214 10848715 -141688544 - RLTR1C LTR ERV1 -1 502 1 4 667 1684 192 105 6 chr5 10855877 10856228 -141681031 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 5 667 341 181 0 89 chr5 10856561 10856640 -141680619 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 5 667 370 314 102 40 chr5 10861972 10862148 -141675111 - RMER5 LTR ERV1 -117 417 231 5 667 755 269 129 139 chr5 10865361 10865801 -141671458 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 5 667 3346 191 66 5 chr5 10872268 10873030 -141664229 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 5 667 1314 209 3 9 chr5 10877005 10877333 -141659926 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 718 5 667 677 188 18 204 chr5 10877225 10877499 -141659760 - MT2B LTR ERVL -344 257 35 5 667 2935 203 28 66 chr5 10877383 10878126 -141659133 - ORR1A4-int LTR MaLR -1234 729 15 5 667 869 242 133 75 chr5 10878136 10878444 -141658815 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 3 5 667 1803 180 3 0 chr5 10878450 10878772 -141658487 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 5 83 6353 148 45 7 chr5 10878776 10879909 -141657350 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 5 668 240 313 23 46 chr5 10879899 10879986 -141657273 - RMER6B LTR ERVK -80 381 297 5 668 697 198 108 12 chr5 10880434 10880691 -141656568 - RMER6B LTR ERVK -251 210 1 5 668 1675 196 38 82 chr5 10880916 10881316 -141655943 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 5 668 413 202 34 0 chr5 10881597 10881686 -141655573 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 5 668 4438 142 23 14 chr5 10889012 10889742 -141647517 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 5 668 3901 69 16 4 chr5 10890345 10890842 -141646417 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 5 668 1635 195 105 6 chr5 10898474 10898825 -141638434 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 5 668 339 181 0 89 chr5 10899159 10899238 -141638021 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 5 668 416 116 0 5 chr5 10906825 10906900 -141630359 + ORR1B2 LTR MaLR 306 394 0 5 668 723 226 191 0 chr5 10906900 10907104 -141630155 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 243 -1266 5 668 1578 211 77 10 chr5 10907604 10907666 -141629593 + ORR1B2-int LTR MaLR 200 268 -1241 5 668 1578 211 77 10 chr5 10907691 10908020 -141629239 + ORR1B2-int LTR MaLR 269 616 -893 5 668 3161 230 42 53 chr5 10914348 10915146 -141622113 + ORR1B2-int LTR MaLR 615 1403 -106 5 668 3161 230 42 53 chr5 10915293 10915307 -141621952 + ORR1B2-int LTR MaLR 1404 1416 -93 5 668 3161 230 42 53 chr5 10915374 10915465 -141621794 + ORR1B2-int LTR MaLR 1417 1507 -2 5 668 1043 188 267 27 chr5 10915465 10915761 -141621498 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 668 241 336 34 50 chr5 10917916 10918035 -141619224 - MTE2a LTR MaLR -15 364 248 5 668 340 292 68 37 chr5 10918129 10918304 -141618955 - MTE2a LTR MaLR -218 161 18 5 668 297 261 0 0 chr5 10918546 10918611 -141618648 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 5 668 629 258 153 88 chr5 10918600 10918940 -141618319 + RMER2 LTR ERV1 190 551 -16 5 668 480 334 54 51 chr5 10920524 10920919 -141616340 + MTEa LTR MaLR 6 368 -11 5 668 873 231 45 74 chr5 10923123 10923502 -141613757 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 5 668 233 325 60 0 chr5 10935029 10935112 -141602147 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 6 668 1709 181 32 20 chr5 10936507 10936912 -141600347 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 668 1443 252 109 43 chr5 10937065 10937207 -141600052 + RMER2 LTR ERV1 3 188 -379 6 668 1443 252 109 43 chr5 10937252 10937639 -141599620 + RMER2 LTR ERV1 189 567 0 6 668 254 280 27 0 chr5 10938998 10939073 -141598186 + RMER2 LTR ERV1 491 567 0 6 668 737 265 64 26 chr5 10940357 10940621 -141596638 + ORR1D1 LTR MaLR 1 283 -87 6 668 781 275 34 5 chr5 10940659 10940867 -141596392 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 6 668 573 352 25 40 chr5 10942181 10942456 -141594803 + MTEa LTR MaLR 103 373 -6 6 668 683 275 129 153 chr5 10947060 10947511 -141589748 - RMER6B LTR ERVK -21 440 1 6 668 3510 184 54 13 chr5 10954044 10954820 -141582439 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 6 668 1327 206 3 9 chr5 10958779 10959107 -141578152 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 718 6 668 699 210 14 197 chr5 10958994 10959273 -141577986 - MT2B LTR ERVL -339 262 35 6 668 2876 209 32 41 chr5 10959215 10959922 -141577337 - ORR1A4-int LTR MaLR -1258 705 5 6 668 913 234 133 74 chr5 10959926 10960235 -141577024 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 6 668 1838 171 3 0 chr5 10960241 10960563 -141576696 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 6 668 6278 150 49 7 chr5 10960567 10961696 -141575563 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 6 668 274 254 27 53 chr5 10961686 10961761 -141575498 - RMER6B LTR ERVK -80 381 309 6 668 679 189 111 12 chr5 10962237 10962493 -141574766 - RMER6B LTR ERVK -251 210 1 6 668 1712 196 38 82 chr5 10962718 10963118 -141574141 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 6 668 419 202 34 0 chr5 10963399 10963488 -141573771 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 6 668 583 282 161 30 chr5 10965877 10966144 -141571115 + RMER5 LTR ERV1 231 532 -2 6 668 496 209 40 71 chr5 10967264 10967516 -141569743 - RMER17C LTR ERVK -68 342 5 6 668 3011 29 0 0 chr5 10977799 10978145 -141559114 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 668 4421 152 18 14 chr5 10985668 10986396 -141550863 - RMER19A LTR ERVK -6 731 1 6 668 4043 70 0 4 chr5 10987000 10987505 -141549754 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 6 668 1616 198 105 6 chr5 10995115 10995466 -141541793 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 6 668 343 181 0 89 chr5 10995800 10995879 -141541380 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 6 668 263 157 0 38 chr5 11003471 11003524 -141533735 + ORR1B2 LTR MaLR 312 362 -22 6 668 321 256 12 0 chr5 11003527 11003613 -141533646 + ORR1B2-int LTR MaLR 157 243 -1266 6 668 4706 217 80 29 chr5 11004113 11005266 -141531993 + ORR1B2-int LTR MaLR 200 1425 -84 6 668 4706 217 80 29 chr5 11005445 11005536 -141531723 + ORR1B2-int LTR MaLR 1426 1508 -1 6 668 971 194 267 27 chr5 11005536 11005832 -141531427 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 669 493 297 109 122 chr5 11011008 11011319 -141525940 - MTE2a LTR MaLR -15 364 58 1 669 343 231 0 0 chr5 11011638 11011703 -141525556 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 1 669 376 282 99 123 chr5 11011701 11012033 -141525226 + RMER2 LTR ERV1 228 551 -16 1 669 414 319 62 122 chr5 11013608 11014011 -141523248 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 669 916 218 45 74 chr5 11016177 11016554 -141520705 + RLTR9A LTR ERVK 1 366 -2 2 669 248 325 60 0 chr5 11028326 11028409 -141508850 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 4 669 1627 201 30 20 chr5 11029804 11030210 -141507049 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 669 1306 249 149 43 chr5 11030363 11030495 -141506764 + RMER2 LTR ERV1 3 186 -381 4 669 1306 249 149 43 chr5 11030517 11030895 -141506364 + RMER2 LTR ERV1 187 566 -1 4 669 274 269 26 0 chr5 11032200 11032278 -141504981 + RMER2 LTR ERV1 488 567 0 5 669 663 230 60 7 chr5 11032701 11032850 -141504409 + ORR1D1 LTR MaLR 1 157 -217 5 669 767 280 34 5 chr5 11033026 11033234 -141504025 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 5 669 511 369 4 39 chr5 11034545 11034776 -141502483 + MTE2b LTR MaLR 103 325 -54 5 669 799 243 128 146 chr5 11039400 11039844 -141497415 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 6 669 3268 177 126 6 chr5 11046402 11047123 -141490136 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 6 669 1325 204 3 9 chr5 11051010 11051336 -141485923 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 720 7 669 730 196 14 194 chr5 11051225 11051503 -141485756 - MT2B LTR ERVL -339 262 35 7 669 3036 199 27 66 chr5 11051387 11052131 -141485128 - ORR1A4-int LTR MaLR -1234 729 15 7 669 790 244 116 148 chr5 11052141 11052478 -141484781 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 3 7 669 1848 171 3 0 chr5 11052484 11052806 -141484453 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 7 669 6333 151 42 8 chr5 11052810 11053947 -141483312 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 7 669 265 268 27 53 chr5 11053937 11054012 -141483247 - RMER6B LTR ERVK -80 381 309 7 669 485 241 158 18 chr5 11054472 11054637 -141482622 - RMER6B LTR ERVK -251 210 23 7 669 647 171 57 0 chr5 11054605 11054728 -141482531 - RMER6B LTR ERVK -331 130 1 7 669 1645 202 38 82 chr5 11054953 11055353 -141481906 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 8 669 376 204 45 0 chr5 11055634 11055722 -141481537 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 8 669 4393 143 23 14 chr5 11063030 11063760 -141473499 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 9 669 3914 82 0 0 chr5 11071179 11071682 -141465577 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 9 669 226 242 91 0 chr5 11079916 11079982 -141457277 + RMER5 LTR ERV1 463 534 0 1 669 1639 195 106 6 chr5 11080294 11080644 -141456615 + ORR1B1 LTR MaLR 2 386 -8 1 669 300 167 29 57 chr5 11081416 11081486 -141455773 + MT2B LTR ERVL 197 264 -337 1 669 263 157 0 38 chr5 11089100 11089153 -141448106 + ORR1B2 LTR MaLR 312 362 -22 1 669 363 233 12 0 chr5 11089156 11089242 -141448017 + ORR1B2-int LTR MaLR 157 243 -1266 1 669 4665 220 82 23 chr5 11089742 11090886 -141446373 + ORR1B2-int LTR MaLR 200 1425 -84 1 669 4665 220 82 23 chr5 11091065 11091156 -141446103 + ORR1B2-int LTR MaLR 1426 1508 -1 1 669 997 191 267 27 chr5 11091156 11091452 -141445807 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 669 3398 20 2 10 chr5 11094488 11094887 -141442372 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 669 9287 26 2 2 chr5 11094887 11095985 -141441274 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 669 3398 20 2 10 chr5 11095985 11096384 -141440875 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 669 493 297 109 122 chr5 11098524 11098835 -141438424 - MTE2a LTR MaLR -15 364 58 1 669 343 231 0 0 chr5 11099153 11099218 -141438041 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 1 669 367 285 99 123 chr5 11099216 11099548 -141437711 + RMER2 LTR ERV1 228 551 -16 1 669 389 322 62 122 chr5 11101123 11101526 -141435733 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 669 911 218 45 74 chr5 11103692 11104069 -141433190 + RLTR9A LTR ERVK 1 366 -2 1 669 248 325 60 0 chr5 11115832 11115915 -141421344 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 1 669 1608 208 27 17 chr5 11117310 11117716 -141419543 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 669 1332 245 149 43 chr5 11117869 11118001 -141419258 + RMER2 LTR ERV1 3 186 -381 1 669 1332 245 149 43 chr5 11118031 11118409 -141418850 + RMER2 LTR ERV1 187 566 -1 1 669 274 269 26 0 chr5 11119714 11119792 -141417467 + RMER2 LTR ERV1 488 567 0 1 669 663 230 60 7 chr5 11120215 11120364 -141416895 + ORR1D1 LTR MaLR 1 157 -217 1 669 767 280 34 5 chr5 11120542 11120750 -141416509 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 1 669 543 360 25 40 chr5 11122062 11122337 -141414922 + MTEa LTR MaLR 103 373 -6 1 669 749 245 128 150 chr5 11126917 11127363 -141409896 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 1 669 3556 175 60 13 chr5 11133931 11134703 -141402556 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 1 669 369 169 100 38 chr5 11135574 11135734 -141401525 + RMER17D LTR ERVK 237 406 -483 1 669 1321 206 3 9 chr5 11138655 11138983 -141398276 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 718 2 669 699 210 14 197 chr5 11138870 11139149 -141398110 - MT2B LTR ERVL -339 262 35 2 669 3024 196 30 66 chr5 11139033 11139775 -141397484 - ORR1A4-int LTR MaLR -1234 729 15 2 669 873 246 133 75 chr5 11139785 11140093 -141397166 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 3 2 669 665 173 34 6 chr5 11140099 11140262 -141396997 - ORR1A2 LTR MaLR 0 367 195 2 669 367 153 0 89 chr5 11140591 11140670 -141396589 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 2 670 416 100 0 0 chr5 11148270 11148330 -141388929 + ORR1B2 LTR MaLR 335 394 0 2 670 758 211 191 0 chr5 11148330 11148534 -141388725 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 243 -1266 2 670 4570 220 66 33 chr5 11149128 11150223 -141387036 + ORR1B2-int LTR MaLR 270 1403 -106 2 670 4570 220 66 33 chr5 11150370 11150383 -141386876 + ORR1B2-int LTR MaLR 1404 1417 -92 2 670 4570 220 66 33 chr5 11150415 11150506 -141386753 + ORR1B2-int LTR MaLR 1418 1508 -1 2 670 1067 190 264 24 chr5 11150506 11150802 -141386457 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 670 382 292 100 170 chr5 11153006 11153336 -141383923 - MTE2a LTR MaLR -15 364 58 2 670 343 231 0 0 chr5 11153655 11153720 -141383539 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 2 670 613 261 153 86 chr5 11153709 11154048 -141383211 + RMER2 LTR ERV1 190 551 -16 2 670 367 326 48 83 chr5 11155616 11155966 -141381293 + MTC LTR MaLR 1 323 -56 2 670 918 225 45 74 chr5 11158253 11158632 -141378627 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 670 225 329 73 0 chr5 11170435 11170517 -141366742 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 2 670 1659 191 30 20 chr5 11171784 11172190 -141365069 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 670 1406 247 155 47 chr5 11172343 11172465 -141364794 + RMER2 LTR ERV1 3 164 -403 2 670 1406 247 155 47 chr5 11172502 11172889 -141364370 + RMER2 LTR ERV1 165 566 -1 2 670 275 269 26 0 chr5 11174211 11174289 -141362970 + RMER2 LTR ERV1 488 567 0 2 670 661 236 61 0 chr5 11175574 11175722 -141361537 + ORR1D1 LTR MaLR 1 157 -217 2 670 790 271 34 10 chr5 11175926 11176135 -141361124 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 2 670 522 365 4 39 chr5 11177465 11177696 -141359563 + MTE2b LTR MaLR 103 325 -54 2 670 718 248 127 158 chr5 11182322 11182772 -141354487 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 2 670 3473 187 70 4 chr5 11189264 11190022 -141347237 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 2 670 4073 202 24 85 chr5 11193845 11194972 -141342287 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 15 2 670 944 231 133 74 chr5 11194985 11195294 -141341965 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 2 670 1846 171 3 0 chr5 11195300 11195622 -141341637 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 2 670 6318 156 42 3 chr5 11195626 11196759 -141340500 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 2 670 664 205 108 12 chr5 11197298 11197555 -141339704 - RMER6B LTR ERVK -251 210 1 2 670 1599 201 21 88 chr5 11197790 11198178 -141339081 + RLTR41 LTR ERV1 85 446 0 2 670 413 202 34 0 chr5 11198459 11198548 -141338711 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 2 670 4467 139 26 14 chr5 11205842 11206570 -141330689 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 670 4098 62 2 0 chr5 11207175 11207677 -141329582 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 3 670 295 254 14 0 chr5 11215936 11216007 -141321252 + RMER5 LTR ERV1 463 534 0 3 670 1653 195 105 6 chr5 11216318 11216669 -141320590 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 670 300 167 29 57 chr5 11217442 11217512 -141319747 + MT2B LTR ERVL 197 264 -337 3 670 379 161 0 5 chr5 11225758 11225833 -141311426 + ORR1B2 LTR MaLR 312 394 0 3 670 774 211 191 0 chr5 11225833 11226037 -141311222 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 243 -1266 3 670 4683 217 73 35 chr5 11226549 11227693 -141309566 + ORR1B2-int LTR MaLR 226 1425 -84 3 670 4683 217 73 35 chr5 11227906 11227997 -141309262 + ORR1B2-int LTR MaLR 1426 1508 -1 3 670 1045 188 267 27 chr5 11227997 11228293 -141308966 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 670 360 296 98 182 chr5 11229939 11230274 -141306985 - MTE2a LTR MaLR -15 364 58 3 670 497 277 60 99 chr5 11230593 11231005 -141306254 + RMER2 LTR ERV1 15 551 -16 3 670 350 340 47 82 chr5 11232575 11232925 -141304334 + MTC LTR MaLR 1 323 -56 3 670 1079 206 52 73 chr5 11235151 11235514 -141301745 + RLTR9A LTR ERVK 1 436 -1 3 670 232 322 20 61 chr5 11243115 11243214 -141294045 - MLT1A0 LTR MaLR -184 181 87 3 670 1691 181 32 20 chr5 11244605 11245010 -141292249 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 670 1605 235 112 46 chr5 11245163 11245663 -141291596 + RMER2 LTR ERV1 3 535 -32 3 670 694 232 58 6 chr5 11248500 11248656 -141288603 + ORR1D1 LTR MaLR 1 164 -210 3 670 791 271 34 5 chr5 11248843 11249051 -141288208 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 3 670 507 365 4 39 chr5 11250350 11250581 -141286678 + MTE2b LTR MaLR 103 325 -54 3 670 713 253 127 158 chr5 11255212 11255662 -141281597 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 3 670 3534 177 58 14 chr5 11262233 11263007 -141274252 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 3 670 1326 203 3 9 chr5 11266962 11267290 -141269969 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 718 3 670 690 210 14 197 chr5 11267177 11267456 -141269803 - MT2B LTR ERVL -339 262 35 3 670 2842 203 30 83 chr5 11267342 11268105 -141269154 - ORR1A4-int LTR MaLR -1236 727 5 3 670 932 231 133 74 chr5 11268109 11268418 -141268841 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 3 670 1417 185 25 8 chr5 11268424 11268744 -141268515 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 17 3 671 4435 142 23 14 chr5 11276027 11276757 -141260502 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 671 3829 73 18 4 chr5 11277362 11277858 -141259401 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 4 671 505 144 164 0 chr5 11286982 11287086 -141250173 + ORR1B1 LTR MaLR 1 121 -273 4 671 1061 218 82 8 chr5 11287203 11287448 -141249811 + ORR1B1 LTR MaLR 124 386 -8 4 671 367 153 0 89 chr5 11287781 11287860 -141249399 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 4 671 3612 48 5 0 chr5 11293336 11293770 -141243489 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 671 8017 37 0 1 chr5 11293770 11294707 -141242552 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 4 671 41527 43 0 1 chr5 11294693 11299636 -141237623 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 4 671 1411 88 38 5 chr5 11299634 11299936 -141237323 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 4 671 2440 49 14 0 chr5 11299936 11300434 -141236825 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 671 427 116 0 5 chr5 11301239 11301314 -141235945 + ORR1B2 LTR MaLR 306 394 0 4 671 763 211 191 0 chr5 11301314 11301518 -141235741 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 243 -1266 4 671 4658 218 64 28 chr5 11302146 11303236 -141234023 + ORR1B2-int LTR MaLR 270 1403 -106 4 671 4658 218 64 28 chr5 11303383 11303396 -141233863 + ORR1B2-int LTR MaLR 1404 1417 -92 4 671 4658 218 64 28 chr5 11303440 11303531 -141233728 + ORR1B2-int LTR MaLR 1418 1508 -1 4 671 1036 188 267 27 chr5 11303531 11303827 -141233432 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 671 225 351 32 11 chr5 11312157 11312252 -141225007 - MTE2a LTR MaLR -43 336 240 4 671 345 284 19 10 chr5 11312398 11312501 -141224758 - MTE2a LTR MaLR -218 161 58 4 671 273 308 26 0 chr5 11312501 11312579 -141224680 - MTE2a LTR MaLR -281 98 19 4 671 497 266 64 103 chr5 11312820 11313232 -141224027 + RMER2 LTR ERV1 15 551 -16 4 671 454 333 57 53 chr5 11314860 11315251 -141222008 + MTEa LTR MaLR 10 368 -11 4 671 1079 204 49 73 chr5 11317424 11317768 -141219491 + RLTR9A LTR ERVK 1 336 -32 4 671 233 325 60 0 chr5 11326009 11326092 -141211167 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 4 671 1712 186 30 20 chr5 11327483 11327889 -141209370 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 671 1455 244 116 45 chr5 11328042 11328182 -141209077 + RMER2 LTR ERV1 3 188 -379 4 671 1455 244 116 45 chr5 11328211 11328598 -141208661 + RMER2 LTR ERV1 189 567 0 4 671 254 280 27 0 chr5 11329958 11330033 -141207226 + RMER2 LTR ERV1 491 567 0 4 671 721 232 58 0 chr5 11333897 11334052 -141203207 + ORR1D1 LTR MaLR 1 164 -210 4 671 798 271 34 5 chr5 11334237 11334445 -141202814 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 4 671 581 356 4 39 chr5 11335932 11336163 -141201096 + MTE2b LTR MaLR 103 325 -54 4 671 686 278 132 143 chr5 11340792 11341233 -141196026 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 4 671 3425 194 56 4 chr5 11347740 11348508 -141188751 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 4 671 4055 205 25 91 chr5 11352466 11353593 -141183666 - ORR1A4-int LTR MaLR -896 1067 15 5 671 962 240 126 68 chr5 11353606 11353915 -141183344 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 5 671 1870 168 3 0 chr5 11353921 11354243 -141183016 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 5 671 6270 157 41 5 chr5 11354247 11355382 -141181877 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 5 671 235 273 98 43 chr5 11355372 11355464 -141181795 - RMER6B LTR ERVK -80 381 285 5 671 654 209 108 12 chr5 11355925 11356182 -141181077 - RMER6B LTR ERVK -251 210 1 5 671 1676 191 40 83 chr5 11356407 11356806 -141180453 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 5 671 413 202 34 0 chr5 11357087 11357176 -141180083 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 5 671 4356 147 23 14 chr5 11364481 11365211 -141172048 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 5 671 3997 75 0 0 chr5 11365815 11366318 -141170941 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 5 671 1658 189 105 6 chr5 11375580 11375931 -141161328 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 5 671 358 167 0 89 chr5 11376265 11376344 -141160915 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 5 671 416 100 0 0 chr5 11383954 11384014 -141153245 + ORR1B2 LTR MaLR 335 394 0 5 671 776 201 191 0 chr5 11384014 11384218 -141153041 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 243 -1266 5 671 4594 221 66 26 chr5 11384812 11385898 -141151361 + ORR1B2-int LTR MaLR 270 1403 -106 5 671 4594 221 66 26 chr5 11386045 11386058 -141151201 + ORR1B2-int LTR MaLR 1404 1417 -92 5 671 4594 221 66 26 chr5 11386090 11386181 -141151078 + ORR1B2-int LTR MaLR 1418 1508 -1 5 671 1025 197 264 24 chr5 11386181 11386477 -141150782 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 671 452 308 101 110 chr5 11388690 11389077 -141148182 - MTE2a LTR MaLR -15 364 18 5 671 343 231 0 0 chr5 11389319 11389384 -141147875 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 5 671 389 276 103 124 chr5 11389382 11389713 -141147546 + RMER2 LTR ERV1 228 551 -16 5 671 424 358 66 76 chr5 11391273 11391429 -141145830 + MTEa LTR MaLR 1 154 -267 5 671 3927 42 25 2 chr5 11391429 11391909 -141145350 + MT2_Mm LTR ERVL 3 493 0 5 671 424 346 63 91 chr5 11391909 11392162 -141145097 + MTEa LTR MaLR 121 368 -11 5 671 898 223 48 74 chr5 11395579 11395957 -141141302 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 5 671 247 348 70 48 chr5 11402934 11403121 -141134138 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 165 5 672 1728 176 42 20 chr5 11405219 11405620 -141131639 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 672 1228 242 192 50 chr5 11405773 11406268 -141130991 + RMER2 LTR ERV1 3 567 0 5 672 265 282 26 0 chr5 11407613 11407691 -141129568 + RMER2 LTR ERV1 488 567 0 5 672 738 244 51 23 chr5 11408990 11409166 -141128093 + ORR1D1 LTR MaLR 1 181 -193 5 672 779 253 40 15 chr5 11409320 11409521 -141127738 + ORR1D1 LTR MaLR 166 371 -3 5 672 527 365 4 39 chr5 11410829 11411060 -141126199 + MTE2b LTR MaLR 103 325 -54 6 672 499 275 180 149 chr5 11415698 11416121 -141121138 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 6 672 3392 190 64 4 chr5 11422689 11423451 -141113808 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 6 672 1330 206 3 9 chr5 11427411 11427739 -141109520 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 718 6 672 672 197 18 204 chr5 11427631 11427905 -141109354 - MT2B LTR ERVL -344 257 35 6 672 2896 204 35 26 chr5 11427847 11428532 -141108727 - ORR1A4-int LTR MaLR -1258 705 15 6 672 855 246 133 75 chr5 11428542 11428850 -141108409 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 3 6 672 1819 177 3 0 chr5 11428856 11429178 -141108081 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 6 672 6332 151 45 3 chr5 11429182 11430311 -141106948 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 6 672 261 301 23 46 chr5 11430301 11430388 -141106871 - RMER6B LTR ERVK -80 381 297 6 672 482 235 157 24 chr5 11430836 11431002 -141106257 - RMER6B LTR ERVK -251 210 23 6 672 679 154 57 0 chr5 11430970 11431093 -141106166 - RMER6B LTR ERVK -331 130 1 6 672 1675 196 38 82 chr5 11431318 11431718 -141105541 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 6 672 413 202 34 0 chr5 11431999 11432088 -141105171 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 6 672 4433 142 23 14 chr5 11439421 11440151 -141097108 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 6 672 3925 67 16 4 chr5 11440755 11441252 -141096007 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 6 672 1579 201 105 6 chr5 11448866 11449217 -141088042 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 6 672 339 181 0 89 chr5 11449551 11449630 -141087629 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 6 672 427 116 0 5 chr5 11457218 11457293 -141079966 + ORR1B2 LTR MaLR 306 394 0 6 672 777 211 191 0 chr5 11457293 11457497 -141079762 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 243 -1266 6 672 1599 209 77 10 chr5 11457997 11458059 -141079200 + ORR1B2-int LTR MaLR 200 268 -1241 6 672 1599 209 77 10 chr5 11458084 11458413 -141078846 + ORR1B2-int LTR MaLR 269 616 -893 6 672 3196 227 53 22 chr5 11464945 11465570 -141071689 + ORR1B2-int LTR MaLR 615 1262 -247 6 672 3196 227 53 22 chr5 11465605 11465740 -141071519 + ORR1B2-int LTR MaLR 1263 1402 -107 6 672 3196 227 53 22 chr5 11465887 11465901 -141071358 + ORR1B2-int LTR MaLR 1403 1415 -94 6 672 3196 227 53 22 chr5 11465964 11466055 -141071204 + ORR1B2-int LTR MaLR 1416 1506 -3 6 672 1017 191 267 27 chr5 11466055 11466351 -141070908 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 672 426 300 100 112 chr5 11468507 11468895 -141068364 - MTE2a LTR MaLR -15 364 18 6 672 320 246 0 0 chr5 11469137 11469202 -141068057 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 6 672 634 257 150 85 chr5 11469191 11469531 -141067728 + RMER2 LTR ERV1 190 551 -16 6 672 456 323 62 59 chr5 11471108 11471503 -141065756 + MTEa LTR MaLR 6 368 -11 6 672 863 234 45 74 chr5 11473702 11474081 -141063178 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 6 672 2363 140 40 42 chr5 11475613 11476089 -141061170 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 672 4449 43 116 0 chr5 11476089 11476676 -141060583 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 6 672 442 66 0 32 chr5 11476676 11476739 -141060520 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 6 672 1834 115 4 4 chr5 11476728 11476990 -141060269 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 6 672 932 73 24 0 chr5 11476987 11477110 -141060149 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 6 672 20913 17 3 0 chr5 11477112 11479464 -141057795 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 6 672 2361 140 40 42 chr5 11479464 11479940 -141057319 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 672 233 325 60 0 chr5 11489926 11490009 -141047250 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 7 672 1720 179 32 20 chr5 11491404 11491809 -141045450 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 7 672 1461 257 95 43 chr5 11491962 11492111 -141045148 + RMER2 LTR ERV1 3 188 -379 7 672 1461 257 95 43 chr5 11492138 11492525 -141044734 + RMER2 LTR ERV1 189 567 0 7 672 254 280 27 0 chr5 11493885 11493960 -141043299 + RMER2 LTR ERV1 491 567 0 7 672 758 256 65 27 chr5 11495242 11495506 -141041753 + ORR1D1 LTR MaLR 1 283 -87 7 672 781 275 34 5 chr5 11495544 11495752 -141041507 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 7 672 576 352 25 40 chr5 11497067 11497342 -141039917 + MTEa LTR MaLR 103 373 -6 7 672 693 277 130 145 chr5 11501941 11502388 -141034871 - RMER6B LTR ERVK -21 440 1 2 672 3538 182 53 12 chr5 11508872 11509648 -141027611 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 6 672 1306 209 3 9 chr5 11513632 11513960 -141023299 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 718 1 672 685 210 14 203 chr5 11513847 11514128 -141023131 - MT2B LTR ERVL -339 262 35 1 672 2864 206 28 80 chr5 11514014 11514777 -141022482 - ORR1A4-int LTR MaLR -1236 727 5 1 672 914 225 140 78 chr5 11514781 11515089 -141022170 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 1 672 1873 168 3 0 chr5 11515095 11515417 -141021842 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 1 672 6243 156 48 4 chr5 11515421 11516548 -141020711 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 1 672 274 254 27 53 chr5 11516538 11516613 -141020646 - RMER6B LTR ERVK -80 381 309 1 672 679 189 111 12 chr5 11517089 11517345 -141019914 - RMER6B LTR ERVK -251 210 1 1 672 1712 196 38 82 chr5 11517570 11517970 -141019289 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 1 672 419 202 34 0 chr5 11518251 11518340 -141018919 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 2 672 593 278 161 30 chr5 11520728 11520995 -141016264 + RMER5 LTR ERV1 231 532 -2 2 672 496 209 40 71 chr5 11522115 11522367 -141014892 - RMER17C LTR ERVK -68 342 5 2 672 3011 29 0 0 chr5 11532649 11532995 -141004264 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 673 4433 152 18 14 chr5 11540516 11541244 -140996015 - RMER19A LTR ERVK -6 731 1 3 673 4043 70 0 4 chr5 11541848 11542353 -140994906 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 4 673 1629 195 105 6 chr5 11549965 11550316 -140986943 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 6 673 334 194 0 89 chr5 11550650 11550729 -140986530 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 6 673 263 157 0 38 chr5 11558325 11558378 -140978881 + ORR1B2 LTR MaLR 312 362 -22 7 673 321 256 12 0 chr5 11558381 11558467 -140978792 + ORR1B2-int LTR MaLR 157 243 -1266 7 673 4716 217 80 27 chr5 11558967 11560118 -140977141 + ORR1B2-int LTR MaLR 200 1425 -84 7 673 4716 217 80 27 chr5 11560301 11560392 -140976867 + ORR1B2-int LTR MaLR 1426 1508 -1 7 673 971 194 267 27 chr5 11560392 11560688 -140976571 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 673 493 297 109 122 chr5 11565859 11566170 -140971089 - MTE2a LTR MaLR -15 364 58 8 673 343 231 0 0 chr5 11566489 11566554 -140970705 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 8 673 376 282 99 123 chr5 11566552 11566884 -140970375 + RMER2 LTR ERV1 228 551 -16 8 673 414 319 62 122 chr5 11568456 11568859 -140968400 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 8 673 916 218 45 74 chr5 11571025 11571402 -140965857 + RLTR9A LTR ERVK 1 366 -2 8 673 248 325 60 0 chr5 11583137 11583220 -140954039 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 1 673 1592 206 30 20 chr5 11584615 11585021 -140952238 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 673 1291 251 147 43 chr5 11585174 11585307 -140951952 + RMER2 LTR ERV1 3 186 -381 1 673 1291 251 147 43 chr5 11585329 11585707 -140951552 + RMER2 LTR ERV1 187 566 -1 1 673 274 269 26 0 chr5 11587012 11587090 -140950169 + RMER2 LTR ERV1 488 567 0 1 673 663 230 60 7 chr5 11587513 11587662 -140949597 + ORR1D1 LTR MaLR 1 157 -217 1 673 765 290 34 5 chr5 11587848 11588056 -140949203 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 1 673 511 369 4 39 chr5 11589369 11589600 -140947659 + MTE2b LTR MaLR 103 325 -54 1 673 799 243 128 146 chr5 11594241 11594685 -140942574 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 1 673 3275 177 126 6 chr5 11601238 11601959 -140935300 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 1 673 1325 204 3 9 chr5 11605841 11606167 -140931092 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 720 1 673 730 196 14 194 chr5 11606056 11606334 -140930925 - MT2B LTR ERVL -339 262 35 1 673 3022 200 27 66 chr5 11606218 11606962 -140930297 - ORR1A4-int LTR MaLR -1234 729 15 1 673 785 244 115 151 chr5 11606972 11607310 -140929949 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 3 1 673 1863 168 3 0 chr5 11607316 11607638 -140929621 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 1 673 6351 152 41 7 chr5 11607642 11608779 -140928480 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 1 673 265 268 27 53 chr5 11608769 11608844 -140928415 - RMER6B LTR ERVK -80 381 309 1 673 500 214 175 42 chr5 11609303 11609469 -140927790 - RMER6B LTR ERVK -251 210 23 1 673 647 171 57 0 chr5 11609437 11609560 -140927699 - RMER6B LTR ERVK -331 130 1 1 673 1663 199 38 82 chr5 11609785 11610185 -140927074 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 1 673 376 204 45 0 chr5 11610466 11610554 -140926705 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 1 673 4374 144 23 14 chr5 11617862 11618592 -140918667 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 1 673 3889 83 0 0 chr5 11625598 11626101 -140911158 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 1 673 226 242 91 0 chr5 11634306 11634372 -140902887 + RMER5 LTR ERV1 463 534 0 1 673 1647 195 106 6 chr5 11634684 11635034 -140902225 + ORR1B1 LTR MaLR 2 386 -8 1 673 300 167 29 57 chr5 11635807 11635877 -140901382 + MT2B LTR ERVL 197 264 -337 1 673 263 157 0 38 chr5 11643494 11643547 -140893712 + ORR1B2 LTR MaLR 312 362 -22 1 673 363 233 12 0 chr5 11643550 11643636 -140893623 + ORR1B2-int LTR MaLR 157 243 -1266 1 673 4694 219 82 22 chr5 11644136 11645279 -140891980 + ORR1B2-int LTR MaLR 200 1425 -84 1 673 4694 219 82 22 chr5 11645458 11645549 -140891710 + ORR1B2-int LTR MaLR 1426 1508 -1 1 673 971 194 267 27 chr5 11645549 11645845 -140891414 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 673 3398 20 2 10 chr5 11648861 11649260 -140887999 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 673 9287 26 2 2 chr5 11649260 11650358 -140886901 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 673 3398 20 2 10 chr5 11650358 11650757 -140886502 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 673 493 297 109 122 chr5 11652897 11653208 -140884051 - MTE2a LTR MaLR -15 364 58 2 673 343 231 0 0 chr5 11653526 11653591 -140883668 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 2 673 367 285 99 123 chr5 11653589 11653921 -140883338 + RMER2 LTR ERV1 228 551 -16 2 673 389 322 62 122 chr5 11655498 11655901 -140881358 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 673 911 218 45 74 chr5 11658067 11658444 -140878815 + RLTR9A LTR ERVK 1 366 -2 2 674 248 325 60 0 chr5 11670194 11670277 -140866982 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 2 674 1608 208 27 17 chr5 11671672 11672078 -140865181 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 674 1368 243 149 43 chr5 11672231 11672363 -140864896 + RMER2 LTR ERV1 3 186 -381 2 674 1368 243 149 43 chr5 11672389 11672767 -140864492 + RMER2 LTR ERV1 187 566 -1 2 674 274 269 26 0 chr5 11674073 11674151 -140863108 + RMER2 LTR ERV1 488 567 0 2 674 663 230 60 7 chr5 11674574 11674723 -140862536 + ORR1D1 LTR MaLR 1 157 -217 2 674 767 280 34 5 chr5 11674905 11675113 -140862146 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 2 674 546 360 25 40 chr5 11676425 11676700 -140860559 + MTEa LTR MaLR 103 373 -6 2 674 750 245 128 150 chr5 11681285 11681731 -140855528 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 2 674 3537 176 60 13 chr5 11688300 11689072 -140848187 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 2 674 1326 203 3 9 chr5 11693043 11693371 -140843888 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 718 2 674 690 210 14 197 chr5 11693258 11693537 -140843722 - MT2B LTR ERVL -339 262 35 2 674 2825 204 30 83 chr5 11693423 11694186 -140843073 - ORR1A4-int LTR MaLR -1236 727 5 2 674 939 231 133 74 chr5 11694190 11694499 -140842760 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 2 674 1870 168 3 0 chr5 11694505 11694827 -140842432 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 2 674 6336 152 41 7 chr5 11694831 11695968 -140841291 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 2 674 274 254 27 53 chr5 11695958 11696033 -140841226 - RMER6B LTR ERVK -80 381 309 2 674 674 188 107 15 chr5 11696511 11696769 -140840490 - RMER6B LTR ERVK -251 210 1 2 674 1644 202 38 82 chr5 11696994 11697394 -140839865 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 2 674 413 202 34 0 chr5 11697675 11697764 -140839495 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 2 674 4435 142 23 14 chr5 11705062 11705792 -140831467 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 674 3829 73 18 4 chr5 11706396 11706892 -140830367 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 2 674 505 144 164 0 chr5 11716029 11716133 -140821126 + ORR1B1 LTR MaLR 1 121 -273 3 674 1061 218 82 8 chr5 11716250 11716495 -140820764 + ORR1B1 LTR MaLR 124 386 -8 3 674 367 153 0 89 chr5 11716828 11716907 -140820352 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 3 674 3637 48 5 0 chr5 11722383 11722817 -140814442 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 674 7676 36 0 1 chr5 11722817 11723754 -140813505 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 3 674 39682 43 0 1 chr5 11723740 11728683 -140808576 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 3 674 1343 89 38 5 chr5 11728681 11728983 -140808276 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 3 674 2461 49 14 0 chr5 11728983 11729481 -140807778 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 674 426 116 0 5 chr5 11730286 11730361 -140806898 + ORR1B2 LTR MaLR 306 394 0 3 674 768 211 191 0 chr5 11730361 11730565 -140806694 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 243 -1266 3 674 4642 218 64 31 chr5 11731186 11732280 -140804979 + ORR1B2-int LTR MaLR 270 1403 -106 3 674 4642 218 64 31 chr5 11732427 11732440 -140804819 + ORR1B2-int LTR MaLR 1404 1417 -92 3 674 4642 218 64 31 chr5 11732484 11732575 -140804684 + ORR1B2-int LTR MaLR 1418 1508 -1 3 674 1029 188 267 27 chr5 11732575 11732871 -140804388 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 674 352 284 19 10 chr5 11741414 11741517 -140795742 - MTE2a LTR MaLR -218 161 58 3 674 275 308 26 0 chr5 11741517 11741595 -140795664 - MTE2a LTR MaLR -281 98 19 3 674 504 266 64 103 chr5 11741836 11742248 -140795011 + RMER2 LTR ERV1 15 551 -16 3 674 452 333 57 53 chr5 11743874 11744265 -140792994 + MTEa LTR MaLR 10 368 -11 3 674 1105 204 49 73 chr5 11746438 11746782 -140790477 + RLTR9A LTR ERVK 1 336 -32 3 674 235 325 60 0 chr5 11755035 11755118 -140782141 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 3 674 1726 186 30 20 chr5 11756509 11756915 -140780344 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 674 1460 241 112 42 chr5 11757068 11757208 -140780051 + RMER2 LTR ERV1 3 183 -384 3 674 1460 241 112 42 chr5 11757239 11757626 -140779633 + RMER2 LTR ERV1 184 566 -1 3 674 255 280 27 0 chr5 11758974 11759049 -140778210 + RMER2 LTR ERV1 491 567 0 3 674 724 232 58 0 chr5 11762903 11763058 -140774201 + ORR1D1 LTR MaLR 1 164 -210 3 674 777 275 34 5 chr5 11763235 11763443 -140773816 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 3 674 587 356 4 39 chr5 11764931 11765162 -140772097 + MTE2b LTR MaLR 103 325 -54 3 674 694 278 132 143 chr5 11769799 11770240 -140767019 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 3 674 3543 192 50 4 chr5 11776754 11777526 -140759733 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 3 674 4055 205 25 91 chr5 11781485 11782612 -140754647 - ORR1A4-int LTR MaLR -896 1067 15 3 674 962 240 126 68 chr5 11782625 11782934 -140754325 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 3 674 1859 171 3 0 chr5 11782940 11783262 -140753997 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 3 674 6261 158 41 5 chr5 11783266 11784401 -140752858 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 3 674 235 273 98 43 chr5 11784391 11784483 -140752776 - RMER6B LTR ERVK -80 381 285 3 674 654 209 108 12 chr5 11784944 11785201 -140752058 - RMER6B LTR ERVK -251 210 1 3 674 1676 191 40 83 chr5 11785426 11785825 -140751434 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 3 674 413 202 34 0 chr5 11786106 11786195 -140751064 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 3 674 4356 147 23 14 chr5 11793499 11794229 -140743030 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 674 4021 74 0 0 chr5 11794833 11795336 -140741923 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 4 675 1658 189 105 6 chr5 11804616 11804967 -140732292 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 675 358 167 0 89 chr5 11805301 11805380 -140731879 + MT2B LTR ERVL 197 268 -333 4 675 416 100 0 0 chr5 11812998 11813058 -140724201 + ORR1B2 LTR MaLR 335 394 0 4 675 776 201 191 0 chr5 11813058 11813262 -140723997 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 243 -1266 4 675 4588 221 67 24 chr5 11813856 11814939 -140722320 + ORR1B2-int LTR MaLR 270 1403 -106 4 675 4588 221 67 24 chr5 11815086 11815099 -140722160 + ORR1B2-int LTR MaLR 1404 1417 -92 4 675 4588 221 67 24 chr5 11815139 11815230 -140722029 + ORR1B2-int LTR MaLR 1418 1508 -1 4 675 999 201 264 24 chr5 11815230 11815526 -140721733 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 675 433 305 101 110 chr5 11817740 11818127 -140719132 - MTE2a LTR MaLR -15 364 18 4 675 343 231 0 0 chr5 11818369 11818434 -140718825 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 4 675 382 276 103 124 chr5 11818432 11818763 -140718496 + RMER2 LTR ERV1 228 551 -16 4 675 439 356 58 55 chr5 11820323 11820479 -140716780 + MTC LTR MaLR 1 154 -267 4 675 3954 40 25 2 chr5 11820479 11820959 -140716300 + MT2_Mm LTR ERVL 3 493 0 4 675 439 356 58 55 chr5 11820959 11821200 -140716059 + MTC LTR MaLR 155 399 -22 4 675 908 220 48 74 chr5 11824659 11825037 -140712222 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 4 675 247 348 70 48 chr5 11832033 11832220 -140705039 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 165 4 675 241 321 60 0 chr5 11832845 11832929 -140704330 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 86 4 675 1717 178 42 20 chr5 11834318 11834719 -140702540 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 675 1254 240 192 50 chr5 11834872 11835367 -140701892 + RMER2 LTR ERV1 3 567 0 4 675 280 265 24 24 chr5 11836726 11836802 -140700457 + RMER2 LTR ERV1 490 567 0 4 675 679 245 58 0 chr5 11838088 11838243 -140699016 + ORR1D1 LTR MaLR 1 164 -210 4 675 789 257 38 14 chr5 11838425 11838634 -140698625 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 4 675 536 360 4 39 chr5 11839942 11840173 -140697086 + MTE2b LTR MaLR 103 325 -54 4 675 499 275 180 149 chr5 11844819 11845242 -140692017 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 4 675 3305 174 126 6 chr5 11851807 11852528 -140684731 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 4 675 1306 207 3 9 chr5 11856427 11856753 -140680506 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 720 4 675 719 201 14 194 chr5 11856642 11856920 -140680339 - MT2B LTR ERVL -339 262 35 4 675 3010 195 30 68 chr5 11856804 11857548 -140679711 - ORR1A4-int LTR MaLR -1234 729 15 4 675 703 250 111 158 chr5 11857558 11857900 -140679359 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 3 4 675 1872 158 3 0 chr5 11857906 11858217 -140679042 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 16 5 675 6222 159 41 7 chr5 11858221 11859358 -140677901 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 788 5 675 261 301 23 46 chr5 11859348 11859435 -140677824 - RMER6B LTR ERVK -80 381 297 5 675 497 208 174 48 chr5 11859883 11860050 -140677209 - RMER6B LTR ERVK -251 210 23 5 675 637 179 57 0 chr5 11860018 11860141 -140677118 - RMER6B LTR ERVK -331 130 1 5 675 1645 202 38 82 chr5 11860366 11860766 -140676493 + RLTR41 LTR ERV1 65 446 0 5 675 376 204 45 0 chr5 11861047 11861135 -140676124 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 404 5 675 4356 147 23 14 chr5 11868431 11869161 -140668098 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 5 675 3904 86 0 0 chr5 11869765 11870268 -140666991 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 5 675 1647 195 106 6 chr5 11878836 11879186 -140658073 + ORR1B1 LTR MaLR 2 386 -8 5 675 290 182 29 57 chr5 11879958 11880028 -140657231 + MT2B LTR ERVL 197 264 -337 5 675 379 161 0 5 chr5 11886630 11886705 -140650554 + ORR1B2 LTR MaLR 312 394 0 5 675 805 206 191 0 chr5 11886705 11886909 -140650350 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 243 -1266 5 675 4579 228 62 36 chr5 11887405 11888576 -140648683 + ORR1B2-int LTR MaLR 200 1403 -106 5 675 4579 228 62 36 chr5 11888722 11888735 -140648524 + ORR1B2-int LTR MaLR 1404 1417 -92 5 675 4579 228 62 36 chr5 11888783 11888874 -140648385 + ORR1B2-int LTR MaLR 1418 1508 -1 5 675 1017 191 267 27 chr5 11888874 11889170 -140648089 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 675 301 322 187 21 chr5 11891376 11891563 -140645696 - MTE2a LTR MaLR -15 364 147 5 675 355 292 68 37 chr5 11891628 11891803 -140645456 - MTE2a LTR MaLR -218 161 18 5 675 343 231 0 0 chr5 11892045 11892110 -140645149 + RMER2 LTR ERV1 15 79 -488 5 675 372 312 70 88 chr5 11892108 11892438 -140644821 + RMER2 LTR ERV1 228 551 -16 5 675 444 354 58 55 chr5 11894040 11894196 -140643063 + MTC LTR MaLR 1 154 -267 5 675 3914 44 25 2 chr5 11894196 11894676 -140642583 + MT2_Mm LTR ERVL 3 493 0 5 675 444 354 58 55 chr5 11894676 11894917 -140642342 + MTC LTR MaLR 155 399 -22 5 675 1059 206 52 73 chr5 11897101 11897464 -140639795 + RLTR9A LTR ERVK 1 436 -1 5 675 238 325 60 0 chr5 11905300 11905383 -140631876 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 87 5 675 1744 181 30 20 chr5 11906774 11907180 -140630079 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 675 1424 249 146 48 chr5 11907333 11907460 -140629799 + RMER2 LTR ERV1 3 188 -379 5 675 1424 249 146 48 chr5 11907525 11907912 -140629347 + RMER2 LTR ERV1 189 567 0 5 675 280 265 24 24 chr5 11909245 11909321 -140627938 + RMER2 LTR ERV1 490 567 0 5 675 666 234 65 0 chr5 11910598 11910752 -140626507 + ORR1D1 LTR MaLR 1 164 -210 5 675 767 280 34 5 chr5 11910939 11911147 -140626112 + ORR1D1 LTR MaLR 158 371 -3 5 675 527 346 26 42 chr5 11912475 11912740 -140624519 + MTEa LTR MaLR 113 373 -6 5 675 786 267 132 141 chr5 11917332 11917772 -140619487 - RMER6B LTR ERVK -25 436 1 6 675 3304 189 80 7 chr5 11924274 11925027 -140612232 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 2 6 676 3796 207 25 102 chr5 11928987 11930102 -140607157 - ORR1A4-int LTR MaLR -920 1043 15 6 676 966 239 144 82 chr5 11930114 11930419 -140606840 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 3 6 676 1851 171 3 0 chr5 11930425 11930747 -140606512 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 6 676 3517 159 65 25 chr5 11930751 11931430 -140605829 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1258 6 676 468 243 39 61 chr5 11932277 11932533 -140604726 - RMER17C LTR ERVK -66 344 5 6 676 665 238 0 8 chr5 11946027 11946154 -140591105 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 567 6 676 3257 138 28 4 chr5 11946324 11946868 -140590391 - RLTR17 LTR ERVK -135 557 1 6 676 2369 193 38 74 chr5 11947669 11948251 -140589008 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 6 676 349 352 55 12 chr5 11949662 11949826 -140587433 - MLT1E2 LTR MaLR -113 514 344 6 676 277 273 13 13 chr5 11952995 11953073 -140584186 - LTR33A LTR ERVL 0 520 443 6 676 3355 20 8 2 chr5 11953509 11953903 -140583356 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 676 332 321 67 54 chr5 11969079 11969303 -140567956 - MER21B LTR ERV1 -198 665 439 6 676 564 333 124 29 chr5 11970543 11970923 -140566336 - MLT1C LTR MaLR 0 467 52 6 676 704 160 15 15 chr5 11973354 11973487 -140563772 + MTC LTR MaLR 1 133 -288 6 676 257 181 6 144 chr5 11974583 11974686 -140562573 + MTC LTR MaLR 125 184 -237 6 676 535 296 7 7 chr5 11982648 11982791 -140554468 - MLT1C LTR MaLR -28 439 297 6 676 2705 93 23 130 chr5 11989620 11990152 -140547107 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 676 4162 87 14 33 chr5 11990153 11990907 -140546352 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 6 676 2219 68 0 0 chr5 11990907 11991185 -140546074 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 6 676 6065 42 4 13 chr5 11991184 11991935 -140545324 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 6 676 2800 90 87 50 chr5 11991937 11992395 -140544864 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 676 595 185 123 6 chr5 11992651 11992814 -140544445 + RLTR47_MM LTR ERV1 350 531 -1 6 676 487 323 111 74 chr5 11993233 11994243 -140543016 + MuRRS4-int LTR ERV1 500 1545 -6011 6 676 1316 215 33 0 chr5 11994726 11995000 -140542259 - RLTR16 LTR ERVK -222 283 1 6 676 2463 185 76 18 chr5 11995059 11995665 -140541594 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -21 2305 1665 6 676 522 207 0 0 chr5 11996433 11996549 -140540710 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1934 392 277 6 676 1040 192 17 56 chr5 11996558 11996845 -140540414 - RMER3D-int LTR ERVK -1464 1378 1103 6 676 402 163 44 44 chr5 11997093 11997183 -140540076 - RMER3D-int LTR ERVK -1731 1111 1022 6 676 426 241 101 50 chr5 11997462 11997641 -140539618 - RMER3D-int LTR ERVK -2459 383 196 6 676 2183 194 18 98 chr5 11997824 11998016 -140539243 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 329 6 676 2183 194 18 98 chr5 11998603 11998956 -140538303 - RLTR16 LTR ERVK -177 328 1 6 676 3794 88 131 60 chr5 12018652 12019353 -140517906 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 2 676 350 343 158 46 chr5 12022337 12022710 -140514549 - MLT1E1 LTR MaLR -62 592 178 2 676 344 320 50 0 chr5 12022902 12023002 -140514257 - MLT1E1 LTR MaLR -572 108 4 2 676 456 337 61 12 chr5 12023155 12023274 -140513985 - MTE2b LTR MaLR 0 379 232 2 676 236 225 207 95 chr5 12023274 12023295 -140513964 - RMER10A LTR ERVL -18 424 408 3 676 6913 57 45 5 chr5 12023295 12024188 -140513071 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 3 676 456 337 61 12 chr5 12024188 12024212 -140513047 - MTE2b LTR MaLR -148 231 207 2 676 236 225 207 95 chr5 12024212 12024470 -140512789 - RMER10A LTR ERVL -35 407 87 3 676 683 289 91 53 chr5 12024501 12024764 -140512495 - MTE2a LTR MaLR -103 276 4 3 676 488 325 7 13 chr5 12041052 12041205 -140496054 - ORR1E LTR MaLR -207 152 1 4 676 846 236 55 9 chr5 12041205 12041398 -140495861 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1325 4 676 267 335 50 46 chr5 12041396 12041615 -140495644 + RMER12 LTR ERVK 749 968 -354 5 676 1017 285 40 7 chr5 12041608 12041912 -140495347 - ORR1E-int LTR MaLR -1259 321 8 4 676 1016 261 62 79 chr5 12041925 12042279 -140494980 - ORR1E LTR MaLR -5 354 7 4 676 2664 178 90 29 chr5 12047904 12048551 -140488708 - RMER6C LTR ERVK -4 686 1 5 676 4123 68 35 9 chr5 12049130 12049676 -140487583 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 6 676 1402 171 23 85 chr5 12049879 12050346 -140486913 + RLTR9F LTR ERVK 1 430 -7 6 676 1619 201 98 28 chr5 12056796 12056978 -140480281 - RLTR11B LTR ERVK -37 416 241 6 676 1619 201 98 28 chr5 12057248 12057447 -140479812 - RLTR11B LTR ERVK -246 207 2 6 677 403 286 0 99 chr5 12071426 12071597 -140465662 + RMER10B LTR ERVL 188 341 -57 8 677 3437 33 0 0 chr5 12071967 12072363 -140464896 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 677 519 335 65 40 chr5 12072676 12072874 -140464385 + MLT1B LTR MaLR 57 265 -125 8 677 519 335 65 40 chr5 12072910 12073034 -140464225 + MLT1B LTR MaLR 266 387 -3 8 677 1690 201 92 25 chr5 12073078 12073522 -140463737 + RMER6C LTR ERVK 1 474 -216 8 677 2033 200 8 10 chr5 12075331 12075720 -140461539 + ORR1B1 LTR MaLR 7 394 0 9 677 1154 218 98 83 chr5 12077128 12077464 -140459795 - MTB_Mm LTR MaLR -7 400 60 9 677 1762 242 54 5 chr5 12078998 12079426 -140457833 + RLTR16 LTR ERVK 1 449 -56 1 677 2931 27 118 16 chr5 12089341 12089714 -140447545 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 677 2261 78 119 11 chr5 12094590 12094942 -140442317 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 677 3116 83 0 2 chr5 12095543 12095951 -140441308 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 677 2004 99 111 36 chr5 12095986 12096372 -140440887 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 1 1 677 330 249 104 11 chr5 12117004 12117135 -140420124 - MLT1H2 LTR MaLR 0 579 390 1 677 1701 193 198 29 chr5 12120694 12120730 -140416529 - RMER2 LTR ERV1 0 567 529 1 677 1701 193 198 29 chr5 12120753 12121201 -140416058 - RMER2 LTR ERV1 -39 528 1 1 677 1872 176 84 47 chr5 12134286 12134716 -140402543 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 1 677 578 189 141 151 chr5 12136115 12136314 -140400945 - MTD LTR MaLR 0 419 223 1 677 2403 224 21 136 chr5 12136380 12136834 -140400425 - RMER6D LTR ERVK -25 695 337 2 677 2403 224 21 136 chr5 12136875 12137176 -140400083 - RMER6D LTR ERVK -384 336 27 2 677 430 240 30 0 chr5 12137171 12137271 -140399988 - MTD LTR MaLR -295 124 22 1 677 1539 169 47 87 chr5 12140216 12140643 -140396616 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 677 1313 129 10 10 chr5 12141439 12141642 -140395617 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 228 2 677 460 79 0 0 chr5 12141903 12141966 -140395293 - RLTR23 LTR ERV1 -367 63 1 2 677 2827 59 46 10 chr5 12143826 12144221 -140393038 + RLTR10A LTR ERVK 1 409 -2 2 677 2172 92 119 11 chr5 12144806 12145158 -140392101 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 677 2003 136 0 7 chr5 12152027 12152337 -140384922 - RLTR10E LTR ERVK -3 308 1 2 677 251 284 222 58 chr5 12153269 12153512 -140383747 - MER68 LTR ERVL -258 305 23 2 677 1396 184 67 4 chr5 12153958 12154226 -140383033 + ORR1B1 LTR MaLR 102 386 -8 2 677 825 301 70 15 chr5 12156626 12156896 -140380363 - MTE2a LTR MaLR -2 377 93 2 677 2726 12 95 6 chr5 12164305 12164642 -140372617 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 677 28728 23 1 1 chr5 12164642 12167913 -140369346 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 2 677 7188 97 93 43 chr5 12167912 12169156 -140368103 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 2 677 2726 12 95 6 chr5 12169156 12169493 -140367766 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 677 1135 127 17 0 chr5 12170633 12170806 -140366453 + ORR1B1 LTR MaLR 211 386 -8 2 677 854 238 90 45 chr5 12182277 12182598 -140354661 - RMER6B LTR ERVK 0 461 67 2 677 315 140 0 17 chr5 12182641 12182699 -140354560 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 8903 2 677 1356 111 119 0 chr5 12186402 12186646 -140350613 - RLTR47_MM LTR ERV1 -83 449 177 2 678 826 239 249 85 chr5 12193703 12193924 -140343335 + MT2A LTR ERVL 1 204 -329 2 678 826 239 249 85 chr5 12193951 12194187 -140343072 + MT2A LTR ERVL 205 533 0 2 678 331 252 39 108 chr5 12194302 12194431 -140342828 - MT2B LTR ERVL -345 256 137 2 678 3202 124 8 4 chr5 12201477 12201962 -140335297 + RLTR1C LTR ERV1 1 487 -16 2 678 3350 40 2 0 chr5 12202711 12203106 -140334153 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 678 6395 103 47 5 chr5 12209412 12210349 -140326910 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 8 3 678 2948 75 28 0 chr5 12212877 12213266 -140323993 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 678 6080 124 33 75 chr5 12213266 12214412 -140322847 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 3 678 2733 77 54 21 chr5 12214412 12214799 -140322460 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 678 1932 150 37 14 chr5 12216763 12217114 -140320145 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 3 678 1960 249 14 27 chr5 12217208 12217721 -140319538 - RLTR20A2 LTR ERVK -4 574 69 3 678 1663 162 25 66 chr5 12220421 12220881 -140316378 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 3 678 2476 136 151 18 chr5 12220884 12221395 -140315864 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2660 3 678 1307 203 299 54 chr5 12221611 12222089 -140315170 - RMER17C-int LTR ERVK -2642 596 2 3 678 1587 169 19 106 chr5 12222097 12222567 -140314692 - RMER17C LTR ERVK -517 441 16 3 678 1653 215 137 31 chr5 12222637 12223084 -140314175 - RMER15 LTR ERVL -45 530 37 3 678 1517 179 25 181 chr5 12223531 12223788 -140313471 + RMER10B LTR ERVL 1 209 -189 3 678 1517 179 25 181 chr5 12223844 12224057 -140313202 + RMER10B LTR ERVL 210 398 0 3 678 1315 141 9 5 chr5 12227836 12228057 -140309202 + RMER17B LTR ERVK 737 958 0 3 678 262 277 71 106 chr5 12229560 12229673 -140307586 + ORR1D2 LTR MaLR 7 115 -255 3 678 231 333 36 0 chr5 12235191 12235275 -140301984 + ORR1E LTR MaLR 261 347 -12 3 678 3588 205 67 70 chr5 12236244 12236341 -140300918 + RLTR25A LTR ERVK 1 97 -1006 3 678 3588 205 67 70 chr5 12236397 12236770 -140300489 + RLTR25A LTR ERVK 98 469 -634 3 678 3588 206 78 76 chr5 12236974 12237510 -140299749 + RLTR25A LTR ERVK 446 1027 -1 3 678 336 310 17 8 chr5 12237684 12237801 -140299458 - RLTR22_Mur LTR ERVK -141 1707 1590 3 678 311 294 415 16 chr5 12249351 12249613 -140287646 + MLT1A0 LTR MaLR 43 408 0 3 678 2907 24 0 3 chr5 12249645 12249983 -140287276 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 3 678 9366 25 2 5 chr5 12249983 12251065 -140286194 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5403 3 678 21034 37 36 15 chr5 12251043 12253653 -140283606 - IAPEz-int LTR ERVK -3807 2674 8 3 678 2908 30 0 0 chr5 12253653 12253990 -140283269 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 3 678 2524 190 25 24 chr5 12267664 12268255 -140269004 - RMER19A LTR ERVK -2 900 1 3 678 467 302 91 39 chr5 12290286 12290597 -140246662 - MLT1B LTR MaLR -2 503 60 3 678 1331 246 28 39 chr5 12305830 12306186 -140231073 - MTD LTR MaLR -55 364 13 4 678 655 234 127 115 chr5 12306236 12306550 -140230709 - MTD-int LTR MaLR -117 1141 781 4 678 3368 33 2 5 chr5 12308795 12309192 -140228067 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 678 285 295 26 0 chr5 12318250 12318328 -140218931 + MLT1K LTR MaLR 8 87 -508 4 679 4576 93 9 93 chr5 12331127 12331966 -140205293 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 4 679 779 282 60 28 chr5 12332712 12332954 -140204305 - MTEb LTR MaLR -9 370 121 4 679 2109 175 32 5 chr5 12332954 12333328 -140203931 + ORR1B1 LTR MaLR 3 386 -8 4 679 297 313 96 133 chr5 12341366 12341720 -140195539 - MLT1A LTR MaLR -30 344 4 4 679 1109 258 15 11 chr5 12342994 12343398 -140193861 + RLTR16 LTR ERVK 3 492 -13 4 679 435 280 48 0 chr5 12344051 12344176 -140193083 - ORR1D2 LTR MaLR -239 131 1 4 679 360 205 12 24 chr5 12354606 12354691 -140182568 - RMER6C LTR ERVK 0 690 607 4 679 794 248 47 75 chr5 12355566 12355854 -140181405 - MT2B LTR ERVL -55 546 217 5 679 355 266 128 135 chr5 12355995 12356199 -140181060 - MT2B LTR ERVL -259 216 20 5 679 2246 200 60 104 chr5 12356593 12357263 -140179996 - RMER6C LTR ERVK -50 640 1 4 679 228 288 98 60 chr5 12397287 12397420 -140139839 + MER68 LTR ERVL 418 555 -8 5 679 320 318 47 0 chr5 12397315 12397422 -140139837 + MER21B LTR ERV1 459 570 -293 5 679 832 320 98 70 chr5 12413337 12413890 -140123369 + MLT2B4 LTR ERVL 18 553 -1 5 679 348 222 12 12 chr5 12426943 12427025 -140110234 - MTE2a LTR MaLR -20 359 278 5 679 474 289 88 122 chr5 12443382 12443768 -140093491 + MTE2a LTR MaLR 7 379 0 6 679 937 260 244 26 chr5 12445276 12445319 -140091940 - MT2A LTR ERVL -21 512 461 6 679 937 260 244 26 chr5 12445383 12445683 -140091576 - MT2A LTR ERVL -73 460 94 6 679 397 210 55 63 chr5 12445718 12445845 -140091414 - MT2A LTR ERVL -407 126 1 6 680 267 338 50 50 chr5 12471841 12472000 -140065259 - LTR78 LTR ERV1 -446 858 700 6 680 2617 188 19 10 chr5 12479819 12480341 -140056918 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 1 6 680 1387 222 42 9 chr5 12482717 12483049 -140054210 + RLTR11A LTR ERVK 36 378 -150 6 680 417 196 18 97 chr5 12484090 12484102 -140053157 + MT2B LTR ERVL 154 156 -445 6 680 257 295 10 102 chr5 12496561 12496659 -140040600 + MT2B2 LTR ERVL 148 236 -348 7 680 1821 231 33 21 chr5 12499500 12499986 -140037273 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 2 7 680 281 242 9 157 chr5 12502905 12503013 -140034246 - MT2B LTR ERVL -361 240 149 1 680 613 332 22 6 chr5 12512144 12512441 -140024818 - MTE2b LTR MaLR -37 342 11 3 680 2956 21 0 0 chr5 12517090 12517427 -140019832 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 680 21212 11 1 2 chr5 12517427 12519789 -140017470 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4123 4 680 932 73 24 0 chr5 12519791 12519914 -140017345 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 4 680 1834 115 4 4 chr5 12519911 12520173 -140017086 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 4 680 442 66 0 32 chr5 12520162 12520225 -140017034 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 4 680 4213 64 49 2 chr5 12520225 12520813 -140016446 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 8 4 680 2889 21 9 0 chr5 12520813 12521147 -140016112 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 680 996 224 98 39 chr5 12531658 12531833 -140005426 - RMER17C LTR ERVK 0 410 228 5 680 996 224 98 39 chr5 12532018 12532228 -140005031 - RMER17C LTR ERVK -183 227 3 5 680 1556 175 42 7 chr5 12532993 12533303 -140003956 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 6 680 403 335 120 39 chr5 12549145 12549428 -139987831 - MLT2C1 LTR ERVL -51 346 41 7 680 309 309 105 43 chr5 12549938 12550248 -139987011 - ORR1E LTR MaLR 0 379 1 7 680 301 335 131 5 chr5 12554830 12555028 -139982231 - RMER15 LTR ERVL -53 522 300 8 681 3859 61 60 11 chr5 12589269 12589803 -139947456 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 1 681 259 279 21 41 chr5 12590029 12590126 -139947133 - MLT1A LTR MaLR -22 352 258 1 681 1431 184 166 117 chr5 12594837 12595553 -139941706 + RMER6C LTR ERVK 1 718 -38 1 681 596 200 62 0 chr5 12595735 12595865 -139941394 + RMER6D LTR ERVK 582 719 -1 1 681 263 374 41 31 chr5 12599214 12599410 -139937849 - MT2A LTR ERVL -105 428 231 1 681 1064 285 53 3 chr5 12605733 12606015 -139931244 - MTD LTR MaLR -123 296 1 1 681 853 353 29 20 chr5 12607754 12608104 -139929155 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 13 1 681 263 348 58 29 chr5 12608925 12609064 -139928195 - MER34-int LTR ERV1 -5809 2398 2256 1 681 1956 164 27 41 chr5 12610916 12611284 -139925975 + RLTR19A LTR ERVK 1 363 -133 1 681 3004 158 27 13 chr5 12619975 12620528 -139916731 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 1 681 3027 214 38 53 chr5 12620557 12621343 -139915916 - RMER3D-int LTR ERVK -25 2817 2045 1 681 3027 214 38 53 chr5 12621819 12621876 -139915383 - RMER3D-int LTR ERVK -798 2044 1987 1 681 1374 174 12 16 chr5 12621863 12622120 -139915139 - RMER3D-int LTR ERVK -1050 1792 1537 1 681 2746 229 28 68 chr5 12622155 12623236 -139914023 - RMER3D-int LTR ERVK -1309 1533 165 1 681 283 290 90 0 chr5 12646921 12647021 -139890238 + MTEb LTR MaLR 1 109 -270 1 681 230 325 12 36 chr5 12651851 12651934 -139885325 - LTR88b LTR Gypsy? 0 837 757 1 681 2340 179 57 23 chr5 12652562 12653032 -139884227 + RLTR28 LTR ERVL 1 486 -38 1 681 1602 243 33 13 chr5 12660283 12660675 -139876584 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1117 3946 3547 2 681 328 314 0 24 chr5 12661360 12661484 -139875775 + MMERGLN-int LTR ERV1 5418 5538 -2018 2 681 974 316 19 26 chr5 12661747 12662199 -139875060 + RLTR6-int LTR ERV1 7088 7727 -51 2 681 2441 78 139 0 chr5 12662283 12662670 -139874589 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 441 -91 2 681 2459 240 100 96 chr5 12666898 12667475 -139869784 - RMER17B LTR ERVK 0 958 440 2 681 2459 240 100 96 chr5 12667537 12667909 -139869350 - RMER17B LTR ERVK -519 439 6 2 681 2160 120 26 110 chr5 12668431 12668860 -139868399 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 2 681 4061 138 85 15 chr5 12669528 12669864 -139867395 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 470 2 681 4061 138 85 15 chr5 12669918 12670337 -139866922 - RMER17D2 LTR ERVK -340 469 1 2 681 2883 85 19 5 chr5 12688510 12688925 -139848334 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 681 987 320 65 22 chr5 12696139 12696602 -139840657 + HERVL74-int LTR ERVL 2885 3367 -2318 2 681 587 340 59 11 chr5 12697487 12697859 -139839400 + HERVL74-int LTR ERVL 3899 4288 -1397 2 681 910 333 48 3 chr5 12700347 12700660 -139836599 - MTE2b LTR MaLR -1 378 52 2 681 407 320 69 49 chr5 12709415 12709661 -139827598 + MER77 LTR ERVL 53 303 -304 2 681 260 296 28 14 chr5 12709971 12710043 -139827216 + MLT1E2 LTR MaLR 140 212 -415 2 682 475 260 185 63 chr5 12715645 12715850 -139821409 + MTD LTR MaLR 170 399 -20 2 682 1653 98 156 99 chr5 12716901 12717133 -139820126 + RLTR9C LTR ERVK 1 263 -130 2 682 1653 98 156 99 chr5 12717865 12718004 -139819255 + RLTR9C LTR ERVK 264 393 0 2 682 3999 194 70 74 chr5 12718006 12718628 -139818631 + MMETn-int LTR ERVK 3 563 -4281 2 682 3999 173 50 81 chr5 12718660 12719268 -139817991 + MMETn-int LTR ERVK 564 1163 -3681 2 682 556 193 9 27 chr5 12719301 12719413 -139817846 + ETnERV2-int LTR ERVK 2496 2605 -4801 2 682 909 128 6 24 chr5 12719417 12719585 -139817674 + RLTR13D1 LTR ERVK 486 650 -156 2 682 3998 187 24 42 chr5 12720086 12722117 -139815142 + MMETn-int LTR ERVK 2356 4085 -3321 2 682 421 153 21 2 chr5 12722322 12722408 -139814851 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7402 -4 2 682 2014 142 52 79 chr5 12722408 12722812 -139814447 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 2 682 552 227 42 74 chr5 12729359 12729549 -139807710 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 176 2 682 2717 218 119 77 chr5 12735875 12736741 -139800518 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 2 682 228 291 52 52 chr5 12748909 12749025 -139788234 - MTEb LTR MaLR -3 376 261 3 682 1668 243 35 7 chr5 12754742 12755336 -139781923 - ORR1C2-int LTR MaLR -1076 433 1 3 682 1063 243 119 12 chr5 12755338 12755683 -139781576 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 3 682 1686 216 22 85 chr5 12756211 12756656 -139780603 + MTC LTR MaLR 5 421 0 3 682 526 135 11 0 chr5 12757207 12757296 -139779963 + ORR1C1 LTR MaLR 1 90 -288 3 682 562 275 52 19 chr5 12765701 12765912 -139771347 + RLTR45 LTR ERVK 265 482 0 3 682 1866 169 16 72 chr5 12770033 12770408 -139766851 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 3 682 273 357 89 32 chr5 12770709 12771123 -139766136 + MLT1C LTR MaLR 34 464 -3 3 682 293 312 39 0 chr5 12771153 12771230 -139766029 + MLT1A0 LTR MaLR 22 101 -264 3 682 402 261 134 0 chr5 12771316 12771435 -139765824 + MLT1A0 LTR MaLR 223 357 -8 3 682 231 183 46 77 chr5 12776509 12776574 -139760685 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 3 682 383 329 7 20 chr5 12780148 12780294 -139756965 + MER34A1 LTR ERV1 284 427 -160 3 682 4283 65 28 0 chr5 12781523 12781603 -139755656 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 80 -507 3 682 4283 65 28 0 chr5 12782113 12782603 -139754656 + LTRIS_Mus LTR ERV1 81 585 -2 3 682 2078 139 70 36 chr5 12782674 12783061 -139754198 + RLTR9D LTR ERVK 1 400 -3 3 682 6734 205 57 82 chr5 12784134 12786497 -139750762 + RMER3D-int LTR ERVK 4 2651 -191 3 682 6734 200 55 87 chr5 12786837 12787022 -139750237 + RMER3D-int LTR ERVK 2652 2821 -21 3 682 2117 180 119 25 chr5 12787057 12787570 -139749689 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 3 682 469 315 53 104 chr5 12788090 12788427 -139748832 - MLT1A0 LTR MaLR -45 320 1 3 682 3291 36 10 0 chr5 12800521 12800913 -139736346 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 682 9318 28 3 0 chr5 12800913 12802008 -139735251 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 682 3272 25 5 53 chr5 12802008 12802424 -139734835 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 682 292 330 73 31 chr5 12819809 12820000 -139717259 + LTR79 LTR ERVL 1 199 -328 3 682 379 165 198 0 chr5 12825786 12825877 -139711382 - MT2B LTR ERVL 0 601 493 4 682 1234 282 82 36 chr5 12836963 12837353 -139699906 + MTD LTR MaLR 6 413 -6 4 682 345 285 126 31 chr5 12838738 12838865 -139698394 - MLT1C LTR MaLR -51 416 278 4 683 605 292 44 127 chr5 12845653 12845704 -139691555 - MLT1B LTR MaLR -132 258 218 4 683 605 292 44 127 chr5 12845896 12846119 -139691140 - MLT1B LTR MaLR -173 217 7 4 683 258 54 0 26 chr5 12846851 12846889 -139690370 - RLTR9E LTR ERVK -372 37 1 4 683 539 79 13 0 chr5 12846889 12846965 -139690294 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7330 4 683 2921 134 9 23 chr5 12847142 12847814 -139689445 - ETnERV2-int LTR ERVK -1179 6227 5835 4 683 2487 124 0 0 chr5 12847808 12848146 -139689113 - ETnERV2-int LTR ERVK -2507 4899 4562 4 683 1388 310 51 28 chr5 12848291 12848972 -139688287 - SRV_MM-int LTR ERVK -3767 2400 1704 4 683 3278 116 8 6 chr5 12849029 12849523 -139687736 - RLTR1C LTR ERV1 -8 495 1 4 683 8083 213 24 16 chr5 12849552 12851292 -139685967 - ETnERV-int LTR ERVK -3858 3386 2 4 683 2777 87 17 38 chr5 12851293 12851711 -139685548 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 683 252 32 0 0 chr5 12854806 12854837 -139682422 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1393 3670 3640 4 683 3335 162 131 91 chr5 12859482 12860306 -139676953 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 787 -236 4 683 1451 238 70 43 chr5 12861811 12862367 -139674892 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 6 4 683 350 167 136 10 chr5 12862373 12862476 -139674783 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 2211 4 683 5539 161 56 24 chr5 12862473 12863678 -139673581 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -17 2309 1067 4 683 3757 202 72 42 chr5 12863683 12864734 -139672525 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1484 1358 1 4 683 1078 259 48 37 chr5 12865458 12865919 -139671340 + RLTR20A2 LTR ERVK 2 566 -12 4 683 4894 170 61 50 chr5 12865947 12867158 -139670101 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2 2324 1101 4 683 1193 217 12 66 chr5 12867168 12867488 -139669771 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1391 935 633 4 683 1132 185 49 17 chr5 12867487 12867774 -139669485 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1782 544 277 4 683 1023 218 0 52 chr5 12867774 12868064 -139669195 - RMER3D-int LTR ERVK -1456 1386 1112 4 683 398 225 22 22 chr5 12868237 12868328 -139668931 - RMER3D-int LTR ERVK -1731 1111 1021 4 683 615 267 33 87 chr5 12868539 12868814 -139668445 - RMER3D-int LTR ERVK -2483 359 100 4 683 398 175 37 37 chr5 12868934 12869041 -139668218 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 399 4 683 1579 212 133 49 chr5 12869100 12869270 -139667989 + RLTR16 LTR ERVK 1 218 -287 4 683 1579 212 133 49 chr5 12869389 12869684 -139667575 + RLTR16 LTR ERVK 219 505 0 4 683 2299 210 46 10 chr5 12869922 12870418 -139666841 + RLTR11A LTR ERVK 10 523 -5 4 683 2156 147 52 30 chr5 12872713 12873113 -139664146 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 683 2771 92 41 32 chr5 12877563 12878024 -139659235 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 18 4 683 1968 223 98 54 chr5 12881079 12881447 -139655812 + RMER17B LTR ERVK 1 406 -552 4 683 1968 223 98 54 chr5 12881505 12881799 -139655460 + RMER17B LTR ERVK 407 692 -266 4 683 898 333 66 13 chr5 12886803 12887107 -139650152 - ORR1D2 LTR MaLR -48 322 3 4 683 1966 273 67 45 chr5 12887109 12887688 -139649571 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 779 4 683 1068 273 79 36 chr5 12887707 12888125 -139649134 - ORR1D2-int LTR MaLR -681 689 254 4 683 574 265 70 27 chr5 12888125 12888311 -139648948 + MTEa LTR MaLR 141 334 -45 4 683 2003 141 114 0 chr5 12892262 12892603 -139644656 - RLTR25A LTR ERVK -718 385 6 4 683 577 251 39 68 chr5 12892688 12892992 -139644267 + RMER17C LTR ERVK 1 482 -327 4 683 808 209 62 28 chr5 12893049 12893369 -139643890 + RMER17C LTR ERVK 80 410 0 4 683 961 178 80 107 chr5 12893634 12893923 -139643336 + RMER17C-int LTR ERVK 2 282 -2956 4 683 1314 251 21 68 chr5 12894206 12894677 -139642582 + RMER17C-int LTR ERVK 343 791 -2447 4 683 250 143 0 0 chr5 12895299 12895334 -139641925 + RMER17C-int LTR ERVK 1118 1152 -2086 4 683 5875 166 77 16 chr5 12895349 12895992 -139641267 + RMER17C-int LTR ERVK 1134 1814 -1424 4 683 5875 148 74 30 chr5 12896039 12896971 -139640288 + RMER17C-int LTR ERVK 1815 2874 -364 4 683 4267 131 70 44 chr5 12897010 12897333 -139639926 + RMER17C-int LTR ERVK 2875 3216 -22 4 683 1470 199 36 31 chr5 12897336 12897572 -139639687 + RMER17C LTR ERVK 1 236 -722 4 683 1470 197 33 33 chr5 12897727 12897901 -139639358 + RMER17C LTR ERVK 215 389 -21 4 683 748 300 56 26 chr5 12898721 12898865 -139638394 + RLTR16 LTR ERVK 1 154 -351 5 683 748 300 56 26 chr5 12898978 12899103 -139638156 + RLTR16 LTR ERVK 155 278 -227 5 683 239 344 55 25 chr5 12901157 12901357 -139635902 + LTR41 LTR ERVL 551 756 -12 5 683 528 314 79 24 chr5 12901673 12901927 -139635332 + MLT1C LTR MaLR 200 467 0 5 683 237 309 82 10 chr5 12902151 12902249 -139635010 - RMER15 LTR ERVL 0 575 471 5 683 790 330 88 44 chr5 12902276 12902935 -139634324 - RMER15-int LTR ERVL -129 4870 4183 5 683 397 305 40 6 chr5 12903556 12903731 -139633528 + RMER15-int LTR ERVL 1466 1646 -3353 5 683 286 323 51 19 chr5 12904029 12904187 -139633072 - RMER15-int LTR ERVL -3973 1026 864 5 683 310 344 15 0 chr5 12904481 12904612 -139632647 - RMER15-int LTR ERVL -4404 595 463 5 683 1614 167 289 46 chr5 12910733 12911057 -139626202 + RMER6C LTR ERVK 3 364 -326 5 683 1614 167 289 46 chr5 12911122 12911143 -139626116 + RMER6C LTR ERVK 365 410 -280 5 683 3352 46 0 0 chr5 12911143 12911538 -139625721 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 5 683 1614 205 182 92 chr5 12911538 12911932 -139625327 + RMER6C LTR ERVK 359 720 0 5 683 1510 151 104 20 chr5 12917568 12917580 -139619679 - ORR1A3 LTR MaLR -4 322 316 5 683 3474 23 2 0 chr5 12917580 12917975 -139619284 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 683 1510 151 104 20 chr5 12917975 12918259 -139619000 - ORR1A3 LTR MaLR -11 315 1 5 683 8680 168 107 23 chr5 12918259 12920071 -139617188 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1 5 683 1864 146 32 0 chr5 12920071 12920387 -139616872 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 683 2555 175 191 3 chr5 12921938 12922518 -139614741 + RMER6C LTR ERVK 2 690 0 5 683 367 231 9 88 chr5 12923566 12923579 -139613680 + MT2B LTR ERVL 153 156 -445 5 683 1025 239 21 30 chr5 12923814 12924047 -139613212 + RMER20B LTR ERVK 372 602 -25 5 683 1698 194 162 40 chr5 12927346 12927851 -139609408 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 5 683 373 162 0 75 chr5 12928688 12928765 -139608494 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 71 -506 5 683 2562 181 74 55 chr5 12928765 12928860 -139608399 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 495 5 683 2562 181 74 55 chr5 12928919 12929389 -139607870 - RLTR20A2 LTR ERVK -84 494 2 5 683 1421 241 78 37 chr5 12929389 12929815 -139607444 + RLTR20B3 LTR ERVK 74 517 -60 5 683 1010 286 116 3 chr5 12935394 12935738 -139601521 + MTD LTR MaLR 33 415 -4 5 683 741 185 82 6 chr5 12938134 12938292 -139598967 - MLT2D LTR ERVL -244 170 1 5 683 917 327 60 54 chr5 12938292 12938770 -139598489 - MER90 LTR ERV1 -93 482 2 5 683 552 297 40 20 chr5 12940527 12940678 -139596581 - ETnERV2-int LTR ERVK -183 7223 7070 5 683 306 252 128 83 chr5 12952045 12952063 -139585196 - MT2B LTR ERVL -262 339 177 5 683 1621 235 61 0 chr5 12956508 12956853 -139580406 + ORR1B2 LTR MaLR 2 367 0 6 683 3485 222 86 23 chr5 12956855 12957822 -139579437 + ORR1B2-int LTR MaLR 3 939 -570 6 683 2483 265 77 63 chr5 12958338 12958858 -139578401 + ORR1B2-int LTR MaLR 935 1530 -262 6 683 3347 33 2 0 chr5 12958858 12959253 -139578006 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 683 2483 202 43 43 chr5 12959253 12959592 -139577667 + ORR1B2-int LTR MaLR 1168 1509 0 6 683 1750 160 96 9 chr5 12959594 12959928 -139577331 + ORR1B2 LTR MaLR 3 365 -2 6 683 1795 208 101 23 chr5 12960902 12961287 -139575972 - MTC LTR MaLR -6 415 1 6 683 1958 188 85 15 chr5 12964740 12965135 -139572124 + MTC LTR MaLR 1 403 -18 6 683 1691 143 114 74 chr5 12965178 12965571 -139571688 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 6 683 1038 264 62 62 chr5 12965786 12966218 -139571041 + RLTR12B LTR ERVK 55 486 -42 6 683 317 257 75 92 chr5 12968141 12968261 -139568998 - MLT1J1 LTR MaLR -238 206 89 6 85 1872 175 41 69 chr5 12976052 12976470 -139560789 - MTC LTR MaLR -3 418 13 6 684 1071 177 21 0 chr5 12977712 12977904 -139559355 - RLTR11A2 LTR ERVK -25 502 307 6 684 1503 199 35 56 chr5 12980143 12980201 -139557058 + ORR1C2 LTR MaLR 50 106 -278 6 684 1503 199 35 56 chr5 12980706 12980937 -139556322 + ORR1C2 LTR MaLR 107 346 -38 6 684 1503 199 35 56 chr5 12981120 12981169 -139556090 + ORR1C2 LTR MaLR 347 382 -2 6 684 3034 63 15 2 chr5 12982661 12983056 -139554203 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 684 2008 159 11 22 chr5 12987360 12987721 -139549538 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 3 6 684 2911 148 20 142 chr5 12987723 12988377 -139548882 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 936 6 684 687 319 60 46 chr5 12988375 12988658 -139548601 + MTE2a LTR MaLR 91 377 -2 6 684 227 297 17 57 chr5 12991012 12991187 -139546072 - RLTR15 LTR ERVK -191 168 1 6 684 256 176 76 63 chr5 12999297 12999376 -139537883 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 430 6 684 3246 35 25 0 chr5 13004465 13004866 -139532393 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 9 684 286 314 110 23 chr5 13014257 13014430 -139522829 + MLT1A LTR MaLR 13 200 -174 2 684 268 300 52 30 chr5 13014441 13014575 -139522684 + MLT1A LTR MaLR 229 365 0 2 684 854 340 56 38 chr5 13016250 13016800 -139520459 + HERVL74-int LTR ERVL 3205 3764 -1921 2 684 540 322 28 11 chr5 13018575 13018757 -139518502 + HERVL74-int LTR ERVL 4151 4335 -1350 2 684 526 192 7 88 chr5 13021749 13021886 -139515373 - RLTR20B3 LTR ERVK -450 127 2 3 684 419 197 31 37 chr5 13023017 13023121 -139514138 - RLTR20A1 LTR ERVK 0 551 436 3 684 285 304 108 61 chr5 13024434 13024665 -139512594 + MLT1K LTR MaLR 280 521 -74 3 684 1118 231 75 31 chr5 13028151 13028473 -139508786 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 106 4 684 357 296 212 0 chr5 13030439 13030571 -139506688 - ORR1D1 LTR MaLR -212 162 3 5 684 1423 218 97 55 chr5 13043805 13044257 -139493002 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 471 -106 7 684 350 286 21 32 chr5 13044447 13044541 -139492718 + RLTR20B3 LTR ERVK 471 563 0 7 684 3259 51 2 0 chr5 13045305 13045700 -139491559 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 684 238 299 26 13 chr5 13048056 13048134 -139489125 - ORR1D1 LTR MaLR -13 357 279 8 684 652 298 42 0 chr5 13048317 13048485 -139488774 - ORR1D1 LTR MaLR -199 175 1 8 684 1009 307 40 30 chr5 13061105 13061478 -139475781 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 9 684 568 291 128 62 chr5 13063046 13063398 -139473861 + MTEb LTR MaLR 1 375 -4 1 684 226 280 75 65 chr5 13076457 13076564 -139460695 - ORR1D1 LTR MaLR -188 186 79 1 684 3129 42 5 13 chr5 13080890 13081278 -139455981 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 1 684 3905 101 3 17 chr5 13081925 13082519 -139454740 + RLTR19-int LTR ERVK 1427 2012 -4125 1 684 1486 194 25 56 chr5 13082995 13083318 -139453941 + ORR1C1 LTR MaLR 65 377 -1 1 684 324 275 101 88 chr5 13087894 13088121 -139449138 + MT2B2 LTR ERVL 49 278 -306 1 684 1229 234 35 28 chr5 13103185 13103493 -139433766 + ORR1B1 LTR MaLR 57 347 -23 1 685 1393 176 139 36 chr5 13113281 13113640 -139423619 + RMER10B LTR ERVL 1 396 -2 1 685 237 271 33 56 chr5 13115689 13115779 -139421480 - MTE2a LTR MaLR -14 365 278 1 685 1775 195 37 42 chr5 13118115 13118522 -139418737 - MTB_Mm LTR MaLR -2 405 1 1 685 2164 202 45 0 chr5 13123271 13123712 -139413547 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -123 461 1 1 685 274 359 73 95 chr5 13132395 13132669 -139404590 - ORR1E LTR MaLR -5 354 87 1 685 1591 188 109 3 chr5 13133287 13133618 -139403641 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 1 685 781 324 59 71 chr5 13134480 13134848 -139402411 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 1 685 325 245 2 74 chr5 13136299 13136425 -139400834 + MTD LTR MaLR 1 114 -293 1 685 998 277 70 44 chr5 13136768 13137111 -139400148 + MTD LTR MaLR 68 419 0 1 685 1546 180 270 8 chr5 13151959 13152493 -139384766 + RMER6D LTR ERVK 1 678 -12 2 685 2477 204 29 50 chr5 13154823 13154973 -139382286 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 433 2 685 2477 217 34 53 chr5 13155120 13155528 -139381731 - RLTR20D LTR ERVK -136 432 60 2 685 1226 254 111 28 chr5 13155781 13156170 -139381089 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 685 525 361 5 30 chr5 13182291 13182491 -139354768 + ORR1E LTR MaLR 1 195 -164 2 685 734 266 70 60 chr5 13184699 13185014 -139352245 + RLTR20D LTR ERVK 45 362 -189 2 685 1433 213 113 16 chr5 13185014 13185395 -139351864 - RMER16 LTR ERVK 0 533 116 2 685 801 299 12 47 chr5 13185400 13185653 -139351606 + RLTR20D LTR ERVK 325 568 0 2 685 364 301 11 109 chr5 13188733 13188916 -139348343 + RLTR17 LTR ERVK 105 269 -423 2 685 706 276 11 65 chr5 13189028 13189214 -139348045 + RLTR31_Mur LTR ERVK 378 553 0 2 685 6897 60 44 5 chr5 13209529 13210423 -139326836 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 2 685 973 237 5 0 chr5 13219547 13219754 -139317505 + MTC LTR MaLR 3 210 -211 2 685 794 210 68 0 chr5 13220156 13220318 -139316941 + MTC LTR MaLR 196 368 -53 2 685 263 274 0 0 chr5 13222412 13222474 -139314785 + MLT1D LTR MaLR 130 191 -436 3 685 276 296 114 48 chr5 13222537 13222704 -139314555 + MLT1D LTR MaLR 308 485 -20 3 685 1323 261 69 3 chr5 13223358 13223704 -139313555 - MTD LTR MaLR 0 419 51 3 685 331 259 52 61 chr5 13224307 13224422 -139312837 + RMER12 LTR ERVK 742 855 -467 3 685 1530 119 20 24 chr5 13226041 13226291 -139310968 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 249 -78 3 685 1982 88 40 4 chr5 13226291 13226747 -139310512 - IAPEz-int LTR ERVK -6075 406 9 3 685 2203 118 90 71 chr5 13226748 13227214 -139310045 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 686 826 293 58 69 chr5 13270084 13270432 -139266827 - ORR1E LTR MaLR -12 347 4 3 686 469 200 0 122 chr5 13273597 13273728 -139263531 - MT2B LTR ERVL -337 264 150 3 686 277 245 0 109 chr5 13273602 13273758 -139263501 - ORR1E-int LTR MaLR -755 754 616 3 686 1255 270 36 16 chr5 13276276 13276634 -139260625 + MTD LTR MaLR 12 388 -12 3 686 4326 166 25 37 chr5 13298535 13299371 -139237888 - RMER13A LTR ERVK -34 826 1 4 686 280 373 59 0 chr5 13299953 13300071 -139237188 - MTE2b LTR MaLR -83 296 172 4 686 540 283 43 0 chr5 13300621 13300759 -139236500 - MTE2b LTR MaLR -235 144 1 4 686 541 298 63 27 chr5 13301154 13301375 -139235884 - MTD LTR MaLR -7 412 184 4 686 904 288 39 95 chr5 13320243 13320673 -139216586 + MTE2a LTR MaLR 1 417 -2 4 686 1722 219 113 7 chr5 13355396 13355811 -139181448 - RMER15 LTR ERVL -112 463 5 4 686 538 272 9 128 chr5 13356120 13356160 -139181099 + MTEb LTR MaLR 183 220 -159 4 686 1358 260 44 17 chr5 13356160 13356520 -139180739 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 686 538 272 9 128 chr5 13356520 13356698 -139180561 + MTEb LTR MaLR 221 375 -4 4 686 3055 323 116 29 chr5 13356724 13358128 -139179131 + MTEb-int LTR MaLR 24 1550 -30 4 686 351 324 120 109 chr5 13358117 13358467 -139178792 + MTEb LTR MaLR 13 366 -4 4 686 423 184 0 117 chr5 13363115 13363226 -139174033 + MT2B LTR ERVL 167 264 -337 4 686 1939 208 67 46 chr5 13364039 13364607 -139172652 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 5 584 0 4 686 3726 11 121 0 chr5 13367044 13367484 -139169775 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 687 231 337 32 21 chr5 13376346 13376440 -139160819 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 314 5 687 279 240 102 19 chr5 13376627 13376742 -139160517 - MLT1A1 LTR MaLR -233 132 6 5 687 417 261 31 41 chr5 13387129 13387281 -139149978 + ORR1D2 LTR MaLR 1 141 -218 5 687 936 313 34 0 chr5 13387300 13387565 -139149694 + ORR1D2 LTR MaLR 89 362 -8 5 687 3598 190 63 60 chr5 13390677 13391444 -139145815 + RMER13A LTR ERVK 1 769 -91 5 687 832 266 70 113 chr5 13406932 13407332 -139129927 + MTE2a LTR MaLR 6 374 -5 5 687 596 288 90 33 chr5 13419210 13419540 -139117719 - MTEb LTR MaLR -6 353 1 5 687 1262 238 61 13 chr5 13422897 13423208 -139114051 + ORR1D1 LTR MaLR 14 339 -35 5 687 261 260 0 76 chr5 13426081 13426094 -139111165 - MT2B LTR ERVL -374 222 155 5 687 2731 206 44 26 chr5 13426090 13426699 -139110560 - ORR1B1-int LTR MaLR -889 620 1 5 687 2041 190 10 3 chr5 13426699 13427090 -139110169 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 687 505 314 136 24 chr5 13456717 13457047 -139080212 - MER31B LTR ERV1 -91 375 9 6 687 437 312 91 5 chr5 13462549 13462758 -139074501 + LTR40b LTR ERVL 207 433 -29 6 687 253 209 27 95 chr5 13466126 13466200 -139071059 - MLT2E LTR ERVL -553 75 7 6 687 416 341 55 57 chr5 13467594 13467961 -139069298 - MLT1B LTR MaLR -19 371 6 6 687 1686 206 110 8 chr5 13472816 13473198 -139064061 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 687 1207 217 174 0 chr5 13478955 13479277 -139057982 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 687 1197 281 78 84 chr5 13480580 13481271 -139055988 + RMER6C LTR ERVK 1 687 -3 6 687 1719 189 92 88 chr5 13482564 13483063 -139054196 - RLTR20B3 LTR ERVK -56 521 21 6 687 1430 216 43 87 chr5 13493422 13493838 -139043421 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 6 687 1677 65 13 17 chr5 13497116 13497350 -139039909 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 114 6 687 2240 236 60 75 chr5 13497258 13498009 -139039250 - RMER13B LTR ERVK -164 744 5 6 687 1009 164 0 6 chr5 13498920 13499092 -139038167 + RMER6C LTR ERVK 520 690 0 6 688 3544 10 2 0 chr5 13536490 13536885 -139000374 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 688 9053 36 5 1 chr5 13536885 13537979 -138999280 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 688 3544 10 2 0 chr5 13537979 13538374 -138998885 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 688 1854 170 107 0 chr5 13551133 13551480 -138985779 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 688 233 311 165 0 chr5 13553545 13553648 -138983611 - ORR1E LTR MaLR 0 379 260 7 688 643 346 6 0 chr5 13553693 13553875 -138983384 - ORR1E LTR MaLR -175 184 2 7 688 526 348 27 14 chr5 13562560 13562864 -138974395 - MTD LTR MaLR -55 364 22 8 688 3015 161 57 10 chr5 13570573 13571150 -138966109 - RMER6C LTR ERVK -39 651 48 9 688 8464 135 27 99 chr5 13612564 13612843 -138924416 - RLTR21 LTR ERVK -4 1568 1287 1 688 8464 135 27 99 chr5 13612882 13613060 -138924199 - RLTR21 LTR ERVK -286 1286 1121 1 688 8464 135 27 99 chr5 13613113 13614345 -138922914 - RLTR21 LTR ERVK -452 1120 1 1 688 2352 124 14 56 chr5 13614498 13614925 -138922334 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 1 688 367 317 54 29 chr5 13618142 13618347 -138918912 + RMER15 LTR ERVL 334 543 -32 1 688 247 281 68 38 chr5 13627453 13627586 -138909673 + MLT1C LTR MaLR 264 400 -67 1 689 408 162 0 51 chr5 13632229 13632307 -138904952 + RLTR21 LTR ERVK 1233 1306 -266 1 689 7668 141 58 126 chr5 13632912 13633166 -138904093 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1304 1 689 7668 141 58 126 chr5 13633233 13634279 -138902980 - RLTR21 LTR ERVK -269 1303 401 1 689 7668 141 58 126 chr5 13634384 13634768 -138902491 - RLTR21 LTR ERVK -1172 400 1 1 689 508 354 11 111 chr5 13642196 13642564 -138894695 - MTE2a LTR MaLR -34 345 14 1 689 625 350 45 5 chr5 13655143 13655364 -138881895 - MER74C LTR ERVL -102 358 129 2 689 1116 196 141 28 chr5 13658136 13658517 -138878742 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 135 2 689 244 281 29 74 chr5 13659237 13659479 -138877780 - RMER17D LTR ERVK -427 462 232 2 689 604 301 112 59 chr5 13662062 13662401 -138874858 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 2 689 337 362 31 111 chr5 13665631 13665784 -138871475 + MLT1A0 LTR MaLR 11 167 -198 2 689 337 362 31 111 chr5 13665864 13665999 -138871260 + MLT1A0 LTR MaLR 168 276 -89 2 689 1318 231 90 3 chr5 13671174 13671495 -138865764 - ORR1D1 LTR MaLR -25 349 1 2 689 2089 129 50 28 chr5 13673656 13674015 -138863244 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 689 6776 195 39 16 chr5 13674020 13675490 -138861769 - ORR1B2-int LTR MaLR -6 1503 1 2 689 1795 205 20 15 chr5 13675490 13675832 -138861427 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 24 2 689 1587 208 37 31 chr5 13682027 13682349 -138854910 - ORR1B2 LTR MaLR -43 324 1 2 689 233 387 36 0 chr5 13682350 13682461 -138854798 + LTR16B1 LTR ERVL 237 351 -129 2 689 1165 202 159 74 chr5 13683533 13683885 -138853374 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 2 689 1727 264 96 16 chr5 13684984 13685485 -138851774 - RMER15 LTR ERVL -34 541 1 2 689 2440 146 15 25 chr5 13687464 13687872 -138849387 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 4 2 689 7241 44 29 0 chr5 13688533 13689401 -138847858 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 2 689 276 337 0 10 chr5 13701053 13701155 -138836104 - HERV16-int LTR ERVL -3507 1489 1389 2 689 661 290 218 44 chr5 13709573 13710027 -138827232 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 2 689 1888 217 10 33 chr5 13710385 13710702 -138826557 - RLTR11A LTR ERVK -5 523 219 2 689 1888 220 49 36 chr5 13710776 13710936 -138826323 - RLTR11A LTR ERVK -308 219 2 2 689 1208 247 70 45 chr5 13714529 13714885 -138822374 + ORR1D1 LTR MaLR 10 374 0 2 689 3742 7 121 0 chr5 13714929 13715369 -138821890 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 689 327 377 49 40 chr5 13716657 13716881 -138820378 - MLT1A0 LTR MaLR -139 226 1 3 689 800 346 121 28 chr5 13731158 13731556 -138805703 + MER70A LTR ERVL 26 460 -12 3 689 580 264 21 0 chr5 13731695 13731839 -138805420 + ORR1D1 LTR MaLR 1 147 -227 3 689 850 281 49 13 chr5 13732015 13732239 -138805020 + ORR1D1 LTR MaLR 143 374 0 3 689 2493 161 142 61 chr5 13732259 13732894 -138804365 + RMER6C LTR ERVK 1 686 -4 3 689 5517 224 63 29 chr5 13732900 13734209 -138803050 + ORR1D1-int LTR MaLR 18 1370 0 3 689 1364 245 53 8 chr5 13734209 13734567 -138802692 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 689 2471 134 79 14 chr5 13738040 13738472 -138798787 - RMER6B LTR ERVK -1 460 1 3 689 576 179 47 0 chr5 13738473 13738579 -138798680 - RMER6B LTR ERVK -350 111 1 3 689 1765 200 38 27 chr5 13749072 13749442 -138787817 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 689 1779 107 90 64 chr5 13756820 13757131 -138780128 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 689 1607 221 38 88 chr5 13757970 13758388 -138778871 - RMER19C LTR ERVK 0 611 215 3 689 4237 131 65 18 chr5 13760349 13761122 -138776137 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 3 690 1287 222 3 9 chr5 13764991 13765318 -138771941 - ORR1A3-int LTR MaLR -920 1043 719 3 690 528 209 16 219 chr5 13765206 13765457 -138771802 - MT2B LTR ERVL -339 262 63 3 690 851 238 141 134 chr5 13765700 13766141 -138771118 - RMER6B LTR ERVK -17 444 1 3 690 498 289 26 67 chr5 13766488 13766681 -138770578 + RLTR19A LTR ERVK 194 378 -118 3 690 898 166 69 0 chr5 13766923 13767098 -138770161 - RLTR19 LTR ERVK -304 195 9 3 690 3221 201 88 7 chr5 13773700 13774127 -138763132 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 336 3 690 3221 201 88 7 chr5 13774234 13774554 -138762705 - RMER17D2 LTR ERVK -474 335 2 3 690 4030 206 26 97 chr5 13776993 13777234 -138760025 - ORR1A4-int LTR MaLR -898 1065 826 3 690 2477 91 64 15 chr5 13777234 13777626 -138759633 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 3 690 4030 206 26 97 chr5 13777626 13778516 -138758743 - ORR1A4-int LTR MaLR -1138 825 15 3 690 862 210 156 85 chr5 13778529 13778836 -138758423 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 690 1726 177 3 0 chr5 13778841 13779141 -138758118 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 27 3 690 861 228 145 122 chr5 13790101 13790535 -138746724 - RMER6B LTR ERVK -17 444 1 3 690 244 236 0 0 chr5 13790814 13790869 -138746390 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 444 4 690 446 248 9 27 chr5 13790862 13790974 -138746285 + RLTR19A LTR ERVK 186 295 -201 4 690 1003 156 43 11 chr5 13791311 13791499 -138745760 - RLTR19 LTR ERVK -304 195 2 4 690 3736 137 161 17 chr5 13798277 13799054 -138738205 - RMER17D LTR ERVK 0 889 1 4 690 3994 214 19 102 chr5 13801394 13802527 -138734732 - ORR1A4-int LTR MaLR -919 1044 5 4 690 779 232 162 76 chr5 13802531 13802587 -138734672 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 274 4 690 779 232 162 76 chr5 13802640 13802886 -138734373 - ORR1A4 LTR MaLR -56 273 1 4 690 1658 196 3 21 chr5 13802891 13803224 -138734035 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 690 234 200 329 0 chr5 13808783 13808853 -138728406 - RMER6B LTR ERVK -20 441 349 4 690 249 65 0 0 chr5 13808855 13808886 -138728373 - RMER6B LTR ERVK -430 31 1 4 690 457 204 11 21 chr5 13809213 13809308 -138727951 + RLTR19A LTR ERVK 186 279 -217 4 690 910 188 43 5 chr5 13809700 13809887 -138727372 - RLTR19 LTR ERVK -304 195 2 4 690 3644 178 92 1 chr5 13816269 13817011 -138720248 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 4 690 1538 191 141 47 chr5 13819956 13820521 -138716738 + RMER6D LTR ERVK 1 682 -8 4 690 522 274 7 0 chr5 13821187 13821322 -138715937 + MT2A LTR ERVL 1 136 -397 4 690 665 254 154 5 chr5 13821331 13821552 -138715707 + MT2A LTR ERVL 273 526 -7 4 690 1109 219 104 90 chr5 13821557 13821767 -138715492 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 159 4 690 1109 219 104 90 chr5 13821800 13821955 -138715304 - ORR1D1 LTR MaLR -216 158 2 4 690 1819 191 106 62 chr5 13826603 13827056 -138710203 - RMER20B LTR ERVK -154 473 1 4 690 414 273 31 15 chr5 13828330 13828460 -138708799 - RMER10B LTR ERVL 0 398 267 4 690 459 261 76 25 chr5 13829199 13829356 -138707903 - RLTR41 LTR ERV1 -15 431 267 4 690 974 169 40 0 chr5 13831029 13831230 -138706029 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2661 2824 2616 4 690 2276 217 55 3 chr5 13831230 13832218 -138705041 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3078 2683 1645 4 690 801 248 70 44 chr5 13832218 13832346 -138704913 - MTC LTR MaLR -166 255 137 4 690 4447 138 63 26 chr5 13832346 13833126 -138704133 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 4 690 790 248 70 44 chr5 13833126 13833225 -138704034 - MTC LTR MaLR -285 136 22 4 690 1217 224 49 76 chr5 13833288 13833617 -138703642 - ORR1A4 LTR MaLR -9 320 1 4 690 941 236 45 97 chr5 13836186 13836496 -138700763 - ORR1B1 LTR MaLR -58 336 43 4 690 588 175 73 9 chr5 13836849 13836974 -138700285 - RMER19B LTR ERVK -18 884 766 4 690 2767 212 88 26 chr5 13837466 13838183 -138699076 - RMER19B LTR ERVK -139 763 3 4 690 1059 218 0 0 chr5 13839520 13839759 -138697500 - RMER6-int LTR ERVK -2452 725 487 4 690 1608 250 16 7 chr5 13839798 13840221 -138697038 - RMER6-int LTR ERVK -2667 510 84 4 690 446 187 231 87 chr5 13840457 13840695 -138696564 - RMER6D LTR ERVK -400 320 1 4 690 1885 217 35 26 chr5 13840963 13841417 -138695842 + RMER6A LTR ERVK 1 458 -298 4 690 553 270 101 8 chr5 13845379 13845607 -138691652 + RLTR6-int LTR ERV1 4910 5090 -2688 4 690 1345 114 112 16 chr5 13847894 13848143 -138689116 + RMER16-int LTR ERVK 1000 1272 -4865 4 690 23045 146 38 21 chr5 13849378 13853326 -138683933 + RMER16-int LTR ERVK 1393 5404 -2 4 690 1143 241 114 42 chr5 13853366 13853752 -138683507 + RMER16 LTR ERVK 120 533 0 4 690 336 122 0 0 chr5 13856047 13856096 -138681163 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3136 2625 2577 4 690 1362 189 48 116 chr5 13856102 13856359 -138680900 + RMER19B LTR ERVK 501 755 -147 4 690 1362 189 48 116 chr5 13856872 13856907 -138680352 + RMER19B LTR ERVK 756 766 -136 4 690 1362 189 48 116 chr5 13856927 13857000 -138680259 + RMER19B LTR ERVK 767 846 -56 4 690 2728 80 90 0 chr5 13857000 13857377 -138679882 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 690 963 121 25 99 chr5 13857378 13857580 -138679679 + IAPEz-int LTR ERVK 9 195 -6286 5 690 250 302 0 0 chr5 13857580 13857633 -138679626 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 5 690 3959 57 2 18 chr5 13857633 13858136 -138679123 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 5 690 2181 79 0 0 chr5 13858136 13858414 -138678845 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 5 690 6204 42 4 12 chr5 13858413 13859163 -138678096 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 5 690 2721 82 90 0 chr5 13859166 13859543 -138677716 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 690 2967 47 0 3 chr5 13859784 13860122 -138677137 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 690 9637 23 3 0 chr5 13860122 13861201 -138676058 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5400 5 690 21172 34 48 14 chr5 13861176 13863756 -138673503 - IAPEz-int LTR ERVK -3807 2674 8 5 690 2967 47 0 3 chr5 13863756 13864094 -138673165 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 690 724 252 89 19 chr5 13872969 13873183 -138664076 + MTC LTR MaLR 23 251 -170 5 690 3645 241 22 52 chr5 13873183 13874203 -138663056 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1638 2627 -3134 5 690 6619 56 14 7 chr5 13878295 13879160 -138658099 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 871 -152 5 690 2110 215 85 80 chr5 13880346 13880461 -138656798 + RMER19B LTR ERVK 270 417 -485 5 690 3144 52 8 40 chr5 13880461 13880863 -138656396 + RLTR10 LTR ERVK 1 389 -1 5 690 2110 215 85 80 chr5 13880863 13881218 -138656041 + RMER19B LTR ERVK 418 763 -139 5 690 2110 215 85 80 chr5 13881701 13881841 -138655418 + RMER19B LTR ERVK 764 884 -18 5 690 1179 235 42 78 chr5 13882199 13882559 -138654700 + ORR1B1 LTR MaLR 47 393 -1 5 690 832 202 137 3 chr5 13883724 13884016 -138653243 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2042 2372 -3389 5 690 2320 217 74 0 chr5 13886677 13887180 -138650079 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2382 2921 -2840 5 690 2567 100 5 99 chr5 13887181 13887614 -138649645 + MTB LTR MaLR 1 392 -8 5 690 6765 222 52 22 chr5 13887615 13890023 -138647236 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2933 5460 -301 5 690 377 198 104 0 chr5 13890064 13890160 -138647099 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5535 5640 -121 5 690 3254 43 5 0 chr5 13890439 13890833 -138646426 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 690 270 202 124 31 chr5 13891230 13891327 -138645932 + MERVL-int LTR ERVL 5379 5484 -1 5 690 767 237 6 0 chr5 13891330 13891486 -138645773 + MT2B LTR ERVL 3 159 -442 5 690 2220 212 32 30 chr5 13891492 13892052 -138645207 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 5 690 2040 188 70 16 chr5 13892052 13892479 -138644780 + RLTR19-int LTR ERVK 3932 4381 -1756 5 86 2292 240 82 17 chr5 13893193 13893828 -138643431 + RLTR33 LTR ERVK 3 678 0 5 691 314 244 0 47 chr5 13893935 13894021 -138643238 - RMER6C LTR ERVK 0 690 609 5 691 407 209 88 0 chr5 13896328 13896419 -138640840 + ORR1D1 LTR MaLR 2 100 -274 5 691 300 253 11 84 chr5 13896842 13896937 -138640322 + ORR1D1 LTR MaLR 108 195 -189 5 691 908 214 22 57 chr5 13896959 13897187 -138640072 + ORR1D1 LTR MaLR 154 373 -1 5 691 2047 182 18 10 chr5 13897929 13898312 -138638947 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 5 691 256 328 80 85 chr5 13898863 13899063 -138638196 + MLT1A1 LTR MaLR 2 200 -208 5 691 548 330 97 49 chr5 13902485 13902589 -138634670 + MLT1A LTR MaLR 5 112 -262 5 691 2240 155 11 0 chr5 13902589 13902951 -138634308 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 5 691 548 330 97 49 chr5 13902951 13903196 -138634063 + MLT1A LTR MaLR 113 371 -3 5 691 269 347 95 27 chr5 13915140 13915288 -138621971 - LTR53 LTR ERVL -10 509 352 5 691 242 138 269 30 chr5 13916201 13916268 -138620991 + RLTR14 LTR ERV1 1 83 -299 5 691 1564 259 22 25 chr5 13916247 13916611 -138620648 + RLTR14 LTR ERV1 17 379 -3 5 691 1129 269 43 40 chr5 13916623 13916774 -138620485 + RLTR14-int LTR ERV1 24 183 -5134 5 691 2918 76 18 5 chr5 13916774 13917169 -138620090 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 691 1129 269 43 40 chr5 13917169 13917389 -138619870 + RLTR14-int LTR ERV1 184 396 -4921 5 691 511 144 42 132 chr5 13917813 13917957 -138619302 + RLTR14-int LTR ERV1 447 577 -4740 5 691 349 202 45 0 chr5 13917989 13918078 -138619181 + RLTR14-int LTR ERV1 826 918 -4399 5 691 504 309 49 53 chr5 13920051 13920335 -138616924 + RLTR14-int LTR ERV1 4027 4238 -3214 5 691 1382 200 33 7 chr5 13920754 13920827 -138616432 + RLTR14 LTR ERV1 104 176 -206 5 691 1382 200 33 7 chr5 13920867 13921065 -138616194 + RLTR14 LTR ERV1 177 382 0 5 691 236 398 25 0 chr5 13925134 13925252 -138612007 - MLT1A1 LTR MaLR -230 178 58 5 691 695 243 42 22 chr5 13925942 13926118 -138611141 + RLTR18B LTR ERVK 1 190 -322 5 691 327 325 0 0 chr5 13926208 13926291 -138610968 + RLTR18B LTR ERVK 122 204 -308 5 691 350 331 72 8 chr5 13926375 13926500 -138610759 + RLTR18B LTR ERVK 335 467 -45 5 691 1077 278 138 9 chr5 13926805 13927125 -138610134 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 8 5 691 2412 184 70 57 chr5 13930738 13931371 -138605888 + RMER6A LTR ERVK 116 756 0 5 691 868 209 77 53 chr5 13931371 13931578 -138605681 + ORR1C2 LTR MaLR 173 384 0 5 691 382 385 53 5 chr5 13931844 13932050 -138605209 + MLT1C LTR MaLR 252 467 0 5 691 2805 115 108 104 chr5 13932641 13933206 -138604053 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 5 691 506 308 99 44 chr5 13939815 13940087 -138597172 + RMER15 LTR ERVL 275 561 -14 5 691 447 227 130 68 chr5 13940093 13940254 -138597005 - MLT1A1 LTR MaLR -40 368 198 5 691 1597 247 63 3 chr5 13940351 13940717 -138596542 - MTD LTR MaLR -13 406 19 6 691 250 218 157 89 chr5 13942711 13942913 -138594346 - RMER17B LTR ERVK -42 818 559 6 691 660 149 241 11 chr5 13942953 13943183 -138594076 - RMER17B LTR ERVK -661 297 1 6 691 397 260 245 40 chr5 13948578 13948778 -138588481 - RLTR14 LTR ERV1 -140 242 2 6 691 235 384 11 23 chr5 13949324 13949412 -138587847 + MLT1J LTR MaLR 197 283 -229 6 691 406 322 50 67 chr5 13952496 13952890 -138584369 - RLTR16 LTR ERVK -237 455 31 6 691 259 299 0 22 chr5 13957125 13957214 -138580045 + RMER12 LTR ERVK 747 833 -489 6 691 357 304 120 17 chr5 13968325 13968528 -138568731 + MER57C2 LTR ERV1 8 239 -172 6 691 788 230 97 38 chr5 13971611 13972046 -138565213 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 1 6 691 1625 194 10 134 chr5 13976872 13977276 -138559983 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 6 691 255 340 86 6 chr5 13987210 13987373 -138549886 + MER54A LTR ERVL 89 264 -637 6 691 1790 303 29 2 chr5 13987389 13987879 -138549380 + MER54A LTR ERVL 396 898 -3 6 691 615 204 212 33 chr5 13990289 13990526 -138546733 - ORR1D2 LTR MaLR -57 313 1 6 691 226 258 106 0 chr5 13990527 13990593 -138546666 - ORR1D2-int LTR MaLR -1 1369 1297 6 691 857 200 10 31 chr5 13992506 13992702 -138544557 - RMER17C LTR ERVK 0 410 219 6 691 2733 57 3 8 chr5 13994176 13994533 -138542726 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 121 6 691 2169 144 41 15 chr5 13995620 13996009 -138541250 + RMER6A LTR ERVK 356 754 -2 7 691 2288 183 32 151 chr5 13997093 13997756 -138539503 + RMER4B LTR ERVK 2 585 0 7 691 613 257 123 44 chr5 13997874 13998102 -138539157 - MTEa LTR MaLR -49 330 85 7 691 226 259 16 122 chr5 14000609 14000732 -138536527 - MT2B LTR ERVL -338 263 154 4 691 280 243 74 139 chr5 14004006 14004250 -138533009 - RMER17C LTR ERVK -176 234 7 7 691 2088 138 0 52 chr5 14005734 14006140 -138531119 - RMER10B LTR ERVL -13 385 1 1 691 452 310 45 36 chr5 14014031 14014252 -138523007 - MLT2F LTR ERVL -2 661 439 3 691 246 329 45 89 chr5 14021320 14021477 -138515782 - MLT1J1 LTR MaLR -253 191 42 4 691 3168 178 47 30 chr5 14022561 14023221 -138514038 + RMER6C LTR ERVK 20 690 0 5 692 584 248 194 16 chr5 14047112 14047354 -138489905 + BGLII_B LTR ERVK 139 423 -18 8 692 291 296 14 0 chr5 14048301 14048372 -138488887 + MLT1I LTR MaLR 71 142 -269 8 692 232 244 95 95 chr5 14058515 14058610 -138478649 - MT2B LTR ERVL -343 258 164 1 692 293 302 31 0 chr5 14063090 14063186 -138474073 - MLT1L LTR MaLR -378 232 134 1 692 1557 237 87 5 chr5 14065390 14065771 -138471488 - MTD LTR MaLR 0 419 8 1 692 1803 199 97 40 chr5 14067371 14067795 -138469464 - RMER16 LTR ERVK -85 448 1 1 692 515 117 0 0 chr5 14067795 14067872 -138469387 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 5330 1 692 2329 127 68 2 chr5 14073959 14074355 -138462904 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 1 692 653 330 19 36 chr5 14079073 14079435 -138457824 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 8 1 692 4822 132 109 20 chr5 14080898 14081778 -138455481 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 1 692 240 349 63 104 chr5 14087429 14087650 -138449609 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 421 632 -150 1 692 227 86 0 0 chr5 14103848 14103883 -138433376 - RMER19C LTR ERVK 0 611 577 1 692 487 314 127 48 chr5 14104189 14104480 -138432779 - LTR16A LTR ERVL -91 360 47 1 692 236 286 47 12 chr5 14108437 14108522 -138428737 - MLT1D LTR MaLR -105 400 313 1 692 1642 244 106 58 chr5 14113834 14114373 -138422886 - RLTR20B3 LTR ERVK -7 570 6 1 692 516 317 148 16 chr5 14114691 14115008 -138422251 + MLT1A LTR MaLR 6 364 -10 1 692 1381 289 32 64 chr5 14116486 14116985 -138420274 + RMER15 LTR ERVL 3 485 -90 1 692 1784 137 17 7 chr5 14116985 14117279 -138419980 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 33 1 692 1541 167 66 30 chr5 14119657 14120053 -138417206 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 692 1597 244 76 17 chr5 14123071 14123161 -138414098 - RLTR16 LTR ERVK -1 504 415 1 692 1597 244 76 17 chr5 14123201 14123581 -138413678 - RLTR16 LTR ERVK -91 414 8 1 692 242 302 11 95 chr5 14124790 14124885 -138412374 - MTE2a LTR MaLR -15 364 278 1 692 599 325 23 11 chr5 14150574 14150748 -138386511 + ORR1D2 LTR MaLR 1 176 -194 2 692 323 197 30 0 chr5 14150889 14150955 -138386304 + ORR1D2 LTR MaLR 170 237 -133 2 692 1226 190 198 22 chr5 14154190 14154508 -138382751 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 693 611 362 148 19 chr5 14159347 14159780 -138377479 - LTR40a LTR ERVL -9 510 22 2 693 3426 23 5 0 chr5 14165719 14166113 -138371146 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 693 470 316 175 24 chr5 14170403 14170740 -138366519 - MLT1E1A LTR MaLR -1 679 292 2 693 563 50 100 0 chr5 14185298 14185378 -138351881 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 88 -734 2 693 1555 239 60 32 chr5 14191493 14191896 -138345363 - MTD LTR MaLR -2 417 4 2 693 1017 191 4 4 chr5 14199630 14199819 -138337440 - RMER17C LTR ERVK 0 410 222 2 693 1017 172 59 46 chr5 14199860 14199985 -138337274 - RMER17C LTR ERVK -189 221 1 2 693 3318 38 5 0 chr5 14202973 14203367 -138333892 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 693 1841 257 65 67 chr5 14204706 14205433 -138331826 - RMER13A LTR ERVK -94 814 42 2 693 387 347 95 36 chr5 14206270 14206491 -138330768 - MLT1D LTR MaLR -190 315 82 3 693 2141 127 12 0 chr5 14207932 14208255 -138329004 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 693 3201 143 145 15 chr5 14227292 14227961 -138309298 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 3 693 2768 161 51 22 chr5 14232269 14232814 -138304445 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 3 693 1093 327 44 23 chr5 14257441 14257923 -138279336 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 33 3 693 337 322 19 12 chr5 14259189 14259309 -138277950 - MTE2b LTR MaLR -261 118 1 3 693 1101 212 34 34 chr5 14260076 14260340 -138276919 - RMER19A LTR ERVK 0 737 474 3 693 1218 234 155 21 chr5 14260308 14260845 -138276414 - BGLII_B LTR ERVK -37 516 1 3 693 1975 247 22 51 chr5 14263096 14263680 -138273579 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 3 693 1983 133 48 3 chr5 14264046 14264377 -138272882 - RMER19A LTR ERVK -5 732 387 3 693 725 250 146 14 chr5 14265532 14265751 -138271508 - ORR1B2 LTR MaLR -119 248 1 3 693 1619 206 46 62 chr5 14266578 14266966 -138270293 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 3 693 1679 254 26 58 chr5 14277067 14277565 -138259694 - RMER19C LTR ERVK -4 607 126 3 693 3355 33 10 0 chr5 14285694 14286086 -138251173 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 694 2756 110 60 37 chr5 14288202 14288665 -138248594 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 474 -1 3 694 1383 216 116 57 chr5 14290411 14290764 -138246495 + ORR1C1 LTR MaLR 1 374 -4 4 694 1546 120 38 26 chr5 14290968 14291384 -138245875 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 15 4 694 1043 302 91 34 chr5 14294358 14294629 -138242630 + ORR1C1-int LTR MaLR 5 285 -1224 4 694 1043 302 91 34 chr5 14294663 14294895 -138242364 + ORR1C1-int LTR MaLR 286 536 -973 4 694 905 78 8 0 chr5 14304052 14304180 -138233079 + RMER19A LTR ERVK 13 141 -596 4 694 3002 143 120 7 chr5 14306458 14306999 -138230260 + RMER19A LTR ERVK 131 732 -5 4 694 2191 234 28 55 chr5 14307243 14307807 -138229452 + RMER2 LTR ERV1 1 549 -18 4 694 1944 147 3 7 chr5 14308076 14308385 -138228874 - RLTR10E LTR ERVK -3 308 1 4 694 3036 224 60 31 chr5 14309216 14310138 -138227121 + ORR1C1-int LTR MaLR 420 1509 0 4 694 1565 162 107 66 chr5 14310138 14310315 -138226944 + ORR1C1 LTR MaLR 1 165 -213 4 694 1565 162 107 66 chr5 14310338 14310523 -138226736 + ORR1C1 LTR MaLR 166 377 -1 4 694 291 293 12 24 chr5 14312530 14312614 -138224645 + ORR1E LTR MaLR 3 85 -274 4 694 287 237 26 53 chr5 14313070 14313173 -138224086 + ORR1E LTR MaLR 247 365 -14 4 694 2729 44 0 0 chr5 14313294 14313632 -138223627 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 4 694 1138 296 34 12 chr5 14314600 14314922 -138222337 - MTE2b LTR MaLR -50 329 1 4 694 234 351 378 30 chr5 14314967 14315270 -138221989 - LTR40c LTR ERVL -19 500 93 4 694 942 166 191 51 chr5 14315530 14315803 -138221456 + RMER2 LTR ERV1 1 311 -256 4 694 558 288 33 103 chr5 14317815 14318028 -138219231 + RMER2 LTR ERV1 370 567 0 4 694 5491 82 9 11 chr5 14318635 14319419 -138217840 + RLTR13C2 LTR ERVK 4 785 -23 4 694 609 329 77 47 chr5 14322756 14323094 -138214165 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 4 694 4086 160 41 8 chr5 14333309 14334023 -138203236 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 694 705 282 20 10 chr5 14335198 14335402 -138201857 - RMER15 LTR ERVL -68 507 302 4 694 610 267 70 48 chr5 14339311 14339462 -138197797 + RLTR16 LTR ERVK 1 154 -351 4 694 3332 35 2 5 chr5 14339462 14339859 -138197400 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 694 610 292 74 76 chr5 14339859 14340081 -138197178 + RLTR16 LTR ERVK 155 433 -259 4 694 1929 182 12 51 chr5 14341102 14341512 -138195747 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 694 234 352 123 0 chr5 14344041 14344163 -138193096 - MT2A LTR ERVL -76 457 321 4 694 535 310 97 11 chr5 14344155 14344320 -138192939 - MT2A LTR ERVL -108 425 245 4 694 343 278 108 23 chr5 14344428 14344557 -138192702 - MTE2a LTR MaLR -239 140 1 4 694 713 258 41 184 chr5 14349784 14350220 -138187039 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 694 4680 240 64 31 chr5 14350220 14351447 -138185812 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1267 -103 4 694 335 284 72 66 chr5 14351458 14351639 -138185620 - ORR1D-int LTR MaLR -602 768 587 4 694 272 254 0 0 chr5 14351637 14351700 -138185559 + ORR1D1-int LTR MaLR 1276 1338 -32 4 694 2034 148 6 6 chr5 14351865 14352192 -138185067 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 694 2784 106 94 28 chr5 14352666 14353229 -138184030 + RMER17A2 LTR ERVK 1 581 -228 4 694 3203 46 13 0 chr5 14357087 14357478 -138179781 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 694 7891 67 29 15 chr5 14357478 14358561 -138178698 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 694 3230 61 0 0 chr5 14358561 14358957 -138178302 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 694 2978 137 22 35 chr5 14361372 14361908 -138175351 + RMER16 LTR ERVK 5 533 0 4 694 282 152 0 0 chr5 14367185 14367231 -138170028 + MT2B LTR ERVL 1 46 -555 5 694 3431 164 64 24 chr5 14370893 14371594 -138165665 + RLTR13D6 LTR ERVK 174 902 0 5 694 1181 215 44 30 chr5 14393508 14393805 -138143454 + ORR1D1 LTR MaLR 3 303 -71 5 694 246 128 81 7 chr5 14393857 14393919 -138143340 + ORR1D1 LTR MaLR 292 407 -14 5 694 3168 65 15 117 chr5 14403316 14403853 -138133406 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 5 694 1135 36 0 0 chr5 14407700 14407837 -138129422 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 137 -338 5 694 885 139 62 84 chr5 14407837 14408156 -138129103 + IAPEz-int LTR ERVK 211 429 -6052 5 694 3469 62 0 24 chr5 14408156 14408619 -138128640 + IAPEz-int LTR ERVK 211 662 -5819 5 694 2754 53 0 3 chr5 14408619 14408962 -138128297 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 5 694 6262 57 19 17 chr5 14408957 14409782 -138127477 + IAPEz-int LTR ERVK 5653 6479 -2 5 694 3148 42 108 11 chr5 14409784 14410217 -138127042 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 694 2375 179 148 23 chr5 14413173 14413786 -138123473 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 695 1957 150 0 58 chr5 14421597 14421943 -138115316 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 695 235 182 114 0 chr5 14422230 14422274 -138114985 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 462 5 695 427 279 60 29 chr5 14422291 14422477 -138114782 + RMER17C-int LTR ERVK 7343 7504 -1455 5 695 360 245 49 117 chr5 14422699 14422861 -138114398 + RMER17C-int LTR ERVK 2858 3008 -3129 5 695 629 222 440 10 chr5 14423500 14423700 -138113559 + ORR1C1 LTR MaLR 3 288 -90 5 695 578 259 66 45 chr5 14424155 14424464 -138112795 + RMER17C-int LTR ERVK 2628 2858 -380 5 695 268 309 48 24 chr5 14424667 14424793 -138112466 + RMER17C-int LTR ERVK 4220 4348 -1789 5 695 391 226 86 0 chr5 14424825 14424918 -138112341 + RLTR28B LTR ERVL 3 103 -421 5 695 403 261 100 77 chr5 14424996 14425107 -138112152 + RLTR28B LTR ERVL 117 221 -260 5 695 1966 163 80 0 chr5 14425107 14425469 -138111790 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 5 695 403 261 100 77 chr5 14425469 14425527 -138111732 + RLTR28B LTR ERVL 222 289 -192 5 695 227 266 15 30 chr5 14425754 14425820 -138111439 + RLTR28B LTR ERVL 446 510 -14 5 695 434 378 79 29 chr5 14426245 14426588 -138110671 - MLT1B LTR MaLR -30 360 1 5 695 242 200 73 0 chr5 14427027 14427082 -138110177 + MLT1A1 LTR MaLR 45 103 -305 5 695 270 365 0 0 chr5 14441701 14441797 -138095462 - MLT1B LTR MaLR -9 381 286 5 695 3493 18 2 0 chr5 14443585 14443980 -138093279 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 695 1999 146 53 37 chr5 14451125 14451503 -138085756 + RMER10B LTR ERVL 5 388 -10 6 695 560 217 9 0 chr5 14452173 14452279 -138084980 + RLTR23 LTR ERV1 324 430 0 6 695 398 330 100 64 chr5 14464263 14464593 -138072666 + LTR80A LTR ERVL 242 583 0 6 695 2309 140 11 6 chr5 14472864 14473230 -138064029 - RLTR17 LTR ERVK -324 368 1 6 695 1450 222 22 37 chr5 14473230 14473636 -138063623 - RMER3D-int LTR ERVK 0 2842 2443 6 695 4747 219 94 82 chr5 14473656 14475688 -138061571 - RMER3D-int LTR ERVK -483 2359 2 6 695 694 173 160 46 chr5 14475689 14475883 -138061376 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 477 6 695 673 264 89 16 chr5 14475882 14476128 -138061131 - MLT1B LTR MaLR -114 276 13 6 695 3933 97 32 144 chr5 14481402 14482248 -138055011 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 6 695 4412 140 26 99 chr5 14493994 14494120 -138043139 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 778 6 695 4412 140 26 99 chr5 14494268 14495114 -138042145 - RLTR13D6 LTR ERVK -125 777 1 6 695 4026 201 65 65 chr5 14503579 14504469 -138032790 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 5 695 2946 245 40 93 chr5 14504491 14505315 -138031944 - RMER19B LTR ERVK -122 780 1 6 695 1805 164 54 6 chr5 14505352 14505683 -138031576 - MurERV4_19-int LTR ERVK -2928 2852 2506 7 695 670 143 0 0 chr5 14512302 14512400 -138024859 + RMER6A LTR ERVK 1 98 -622 1 695 1434 198 87 17 chr5 14512403 14512854 -138024405 + RMER6A LTR ERVK 432 720 0 1 695 474 245 9 9 chr5 14545869 14545976 -137991283 - MTC LTR MaLR -6 415 309 5 695 812 241 4 96 chr5 14546253 14546492 -137990767 - MTD LTR MaLR -9 412 196 5 696 846 264 21 0 chr5 14552751 14552944 -137984315 - MTD LTR MaLR -213 206 10 5 696 2295 177 172 33 chr5 14555078 14555338 -137981921 + RMER6C LTR ERVK 2 332 -358 6 696 2295 177 172 33 chr5 14555370 14555712 -137981547 + RMER6C LTR ERVK 333 688 -2 6 696 645 299 93 21 chr5 14556992 14557282 -137979977 - LTR40c LTR ERVL -108 357 47 6 696 242 250 88 0 chr5 14564731 14564799 -137972460 - MLT1E1A LTR MaLR -547 133 60 7 696 1908 92 8 8 chr5 14572975 14573238 -137964021 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 65 9 696 1578 232 98 8 chr5 14573359 14573740 -137963519 - MTD LTR MaLR -15 404 1 9 696 1449 71 0 25 chr5 14585423 14585625 -137951634 + MTB LTR MaLR 1 197 -210 1 696 1577 80 5 0 chr5 14586813 14587025 -137950234 + MTB LTR MaLR 188 400 0 1 696 1422 282 27 32 chr5 14596085 14596459 -137940800 - MTEa LTR MaLR -2 377 6 1 696 1503 204 122 9 chr5 14596819 14597140 -137940119 + MTD LTR MaLR 63 419 0 1 696 1033 287 107 47 chr5 14600311 14600355 -137936904 + MT2A LTR ERVL 1 39 -494 1 696 1033 287 107 47 chr5 14600394 14600467 -137936792 + MT2A LTR ERVL 40 104 -429 1 696 1033 288 101 57 chr5 14600549 14600920 -137936339 + MT2A LTR ERVL 105 601 0 1 696 280 274 114 23 chr5 14603292 14603423 -137933836 + MLT1B LTR MaLR 1 143 -247 1 696 710 170 27 20 chr5 14605473 14605623 -137931636 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 492 1 696 1241 146 16 16 chr5 14605650 14605982 -137931277 - RLTR26 LTR ERVK -247 395 1 1 696 267 293 0 89 chr5 14610028 14610129 -137927130 - MTEb LTR MaLR -287 92 1 1 696 571 335 97 31 chr5 14623015 14623335 -137913924 + MLT1A0 LTR MaLR 1 341 -24 1 696 3175 144 81 60 chr5 14623352 14623830 -137913429 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 181 1 696 3175 144 81 60 chr5 14623930 14624079 -137913180 - RLTR26 LTR ERVK -462 180 4 1 696 1748 178 0 59 chr5 14632177 14632518 -137904741 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 1 696 3170 119 20 39 chr5 14632518 14633027 -137904232 - MT2B LTR ERVL -95 506 8 1 696 1133 184 98 13 chr5 14633122 14633358 -137903901 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1593 1 696 694 139 9 0 chr5 14633692 14633807 -137903452 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 690 1 696 1372 191 9 92 chr5 14636127 14636284 -137900975 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1187 661 533 1 696 1372 191 9 92 chr5 14636450 14636626 -137900633 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1316 532 356 1 696 1018 287 90 9 chr5 14639255 14639600 -137897659 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 2 696 3251 23 23 0 chr5 14642653 14643040 -137894219 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 696 9137 22 20 0 chr5 14643040 14644116 -137893143 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 696 3408 20 8 0 chr5 14644116 14644509 -137892750 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 696 771 358 149 57 chr5 14645769 14647027 -137890232 - MTE-int LTR MaLR -206 1374 1 2 696 1763 132 5 150 chr5 14655054 14655427 -137881832 - ORR1A4 LTR MaLR -10 319 1 2 696 415 309 101 103 chr5 14655780 14656280 -137880979 - RMER13A LTR ERVK -61 566 21 2 696 1949 144 114 30 chr5 14656286 14656724 -137880535 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 696 1155 291 57 46 chr5 14657263 14657630 -137879629 + MTE2b LTR MaLR 3 373 -6 2 696 3466 20 2 0 chr5 14663799 14664194 -137873065 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 696 9033 31 10 1 chr5 14664194 14665282 -137871977 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 696 3477 18 2 0 chr5 14665282 14665677 -137871582 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 697 1137 226 63 56 chr5 14688673 14688992 -137848267 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 64 2 697 2214 178 8 61 chr5 14691344 14691834 -137845425 - RMER4A LTR ERVK 0 466 3 2 697 1062 244 4 120 chr5 14700174 14700440 -137836819 - RLTR25B LTR ERVK -793 235 1 2 697 444 294 22 0 chr5 14704602 14704738 -137832521 + MTE2b LTR MaLR 241 379 0 2 697 1717 207 28 22 chr5 14726047 14726447 -137810812 - RMER3D-int LTR ERVK -30 2812 2411 3 697 5702 187 78 47 chr5 14726631 14728193 -137809066 - RMER3D-int LTR ERVK -426 2416 486 3 697 1352 205 83 44 chr5 14728317 14728811 -137808448 - RMER3D-int LTR ERVK -1990 852 1 3 697 2775 152 45 6 chr5 14728811 14729282 -137807977 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 204 3 697 2077 213 37 33 chr5 14730666 14731180 -137806079 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 3 697 673 311 111 35 chr5 14737994 14738092 -137799167 - ORR1D2-int LTR MaLR -1016 354 257 3 697 673 311 111 35 chr5 14738293 14738510 -137798749 - ORR1D2-int LTR MaLR -1114 256 16 3 697 427 320 26 22 chr5 14738523 14738749 -137798510 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 143 3 697 472 384 48 0 chr5 14740610 14740881 -137796378 - MLT1E1A LTR MaLR -102 578 295 3 697 2244 138 10 40 chr5 14744483 14744882 -137792377 - RMER16 LTR ERVK -83 450 64 3 697 316 73 0 0 chr5 14744907 14744948 -137792311 - RMER16-int LTR ERVK -4 5402 5362 3 697 3328 40 0 10 chr5 14756792 14757192 -137780067 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 697 1780 122 330 0 chr5 14771358 14771758 -137765501 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 3 697 1918 224 31 44 chr5 14775781 14776352 -137760907 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 1 3 697 2702 178 91 25 chr5 14779217 14779788 -137757471 - RMER19C LTR ERVK 0 611 3 3 697 791 202 51 19 chr5 14807818 14808090 -137729169 - RMER6C LTR ERVK -15 675 356 4 697 746 181 319 18 chr5 14808278 14808559 -137728700 - RMER6C LTR ERVK -401 355 1 4 698 3030 64 2 8 chr5 14822532 14822928 -137714331 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 4 698 803 277 71 42 chr5 14823216 14823525 -137713734 + MTE2a LTR MaLR 1 318 -61 4 698 277 229 55 142 chr5 14827191 14827318 -137709941 - MT2B LTR ERVL -344 257 142 4 698 2385 110 26 47 chr5 14828970 14829399 -137707860 - RLTR25A LTR ERVK -226 877 458 4 698 2417 104 0 0 chr5 14830316 14830643 -137706616 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 698 775 212 155 5 chr5 14831166 14831379 -137705880 + RMER10B LTR ERVL 27 271 -127 4 698 378 282 18 24 chr5 14831426 14831593 -137705666 + RMER10B LTR ERVL 193 358 -40 4 698 1245 170 132 171 chr5 14834947 14835386 -137701873 - RMER15 LTR ERVL 0 575 154 4 698 2136 127 15 6 chr5 14835831 14836165 -137701094 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 698 5289 63 13 20 chr5 14836167 14836916 -137700343 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 4 698 1977 76 11 0 chr5 14836915 14837190 -137700069 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 4 698 3060 75 26 17 chr5 14837190 14837758 -137699501 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 165 4 698 229 244 0 0 chr5 14837758 14837799 -137699460 - RLTR27 LTR ERVK -37 272 232 4 698 229 267 0 0 chr5 14837836 14837881 -137699378 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 4 698 487 106 17 119 chr5 14837881 14837999 -137699260 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 18 4 698 2136 127 15 6 chr5 14838046 14838380 -137698879 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 698 1938 140 35 0 chr5 14839279 14839594 -137697665 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 4 698 2959 158 101 31 chr5 14843133 14843775 -137693484 - RMER6C LTR ERVK 0 690 4 4 698 1878 192 13 27 chr5 14852398 14852773 -137684486 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 4 698 334 277 80 168 chr5 14865155 14865381 -137671878 - MER67C LTR ERV1 -334 377 172 4 698 3760 93 27 20 chr5 14866832 14867397 -137669862 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 784 -249 5 698 2323 152 15 204 chr5 14867630 14867939 -137669320 + RLTR13C2 LTR ERVK 785 1033 0 5 698 328 261 67 14 chr5 14868405 14868615 -137668644 + RMER17C LTR ERVK 1 221 -189 5 698 261 333 0 0 chr5 14869716 14869785 -137667474 - MTE2b LTR MaLR -101 278 210 5 698 1173 294 13 50 chr5 14870058 14870438 -137666821 + MTE2a LTR MaLR 14 379 0 5 698 976 167 89 181 chr5 14870619 14870720 -137666539 + RLTR23 LTR ERV1 4 100 -330 5 698 976 167 89 181 chr5 14870743 14870933 -137666326 + RLTR23 LTR ERV1 101 268 -162 5 698 1536 127 45 4 chr5 14870933 14871179 -137666080 + RLTR23 LTR ERV1 150 405 -25 5 698 235 255 108 39 chr5 14871237 14871339 -137665920 - MER67D LTR ERV1 -381 133 25 5 698 1070 212 63 40 chr5 14872376 14872830 -137664429 - RMER20A LTR ERVK 0 516 2 5 698 768 63 0 0 chr5 14876204 14876315 -137660944 + MTA_Mm-int LTR MaLR 988 1098 0 5 698 2491 79 3 11 chr5 14876315 14876662 -137660597 + MTA_Mm LTR MaLR 1 344 -52 5 698 3052 303 49 29 chr5 14876672 14878187 -137659072 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2814 2900 1356 5 698 642 136 76 0 chr5 14878894 14879012 -137658247 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 682 5 698 881 183 44 9 chr5 14878980 14879164 -137658095 - RLTR13C2 LTR ERVK -721 257 1 5 698 2908 172 35 28 chr5 14881460 14882035 -137655224 + RMER13B LTR ERVK 72 650 -258 5 698 300 321 12 0 chr5 14882312 14882393 -137654866 + MLT1A1 LTR MaLR 258 339 -69 5 698 3199 24 45 0 chr5 14884067 14884446 -137652813 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 698 793 254 107 39 chr5 14887168 14887493 -137649766 - RMER13A LTR ERVK -416 492 177 5 698 3786 158 34 19 chr5 14889164 14889846 -137647413 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 5 698 376 302 22 3 chr5 14891033 14891212 -137646047 - MuLV-int LTR ERV1 -1984 5617 5381 5 698 3489 322 67 54 chr5 14891353 14893890 -137643369 - MuLV-int LTR ERV1 -2300 5306 2737 5 698 979 334 99 58 chr5 14894042 14895257 -137642002 - MuLV-int LTR ERV1 -5105 2451 1187 5 698 268 336 74 22 chr5 14895767 14896017 -137641242 - MuLV-int LTR ERV1 -6720 836 449 5 698 2010 120 27 34 chr5 14900498 14900826 -137636433 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 698 1619 161 224 28 chr5 14902173 14902709 -137634550 + RMER6D LTR ERVK 33 688 -2 5 698 575 271 12 8 chr5 14915711 14915888 -137621371 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 321 5 698 1141 222 55 3 chr5 14916001 14916308 -137620951 - RLTR19 LTR ERVK -176 323 1 5 698 1842 197 87 42 chr5 14917363 14917452 -137619807 + RLTR19 LTR ERVK 1 90 -409 5 698 2458 98 3 9 chr5 14917452 14917800 -137619459 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 698 13039 75 17 3 chr5 14917800 14919568 -137617691 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 5 698 2509 93 6 0 chr5 14919568 14919911 -137617348 + ORR1A1 LTR MaLR 1 345 -1 5 698 1842 197 87 42 chr5 14919911 14920290 -137616969 + RLTR19 LTR ERVK 91 490 -9 5 698 496 167 28 149 chr5 14920589 14920730 -137616529 + RMER6B LTR ERVK 5 128 -333 5 698 566 232 184 123 chr5 14920741 14920911 -137616348 + RMER6B LTR ERVK 76 253 -208 5 698 566 232 184 123 chr5 14921055 14921243 -137616016 + RMER6B LTR ERVK 254 456 -5 5 698 7508 46 46 3 chr5 14922202 14923121 -137614138 - RLTR13A2 LTR ERVK 0 958 1 5 698 1845 153 255 21 chr5 14924941 14925467 -137611792 + RMER6C LTR ERVK 40 688 -2 5 698 546 276 23 4 chr5 14939289 14939474 -137597785 - RLTR19 LTR ERVK 0 678 314 5 698 1086 231 58 3 chr5 14939562 14939871 -137597388 - RLTR19 LTR ERVK -170 329 4 5 698 1564 175 67 53 chr5 14940931 14941020 -137596239 + RLTR19 LTR ERVK 1 90 -409 5 698 2644 72 3 9 chr5 14941020 14941368 -137595891 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 87 12937 79 16 3 chr5 14941368 14943137 -137594122 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 5 699 2525 90 6 0 chr5 14943137 14943480 -137593779 + ORR1A1 LTR MaLR 1 345 -1 5 699 1564 193 72 53 chr5 14943480 14943860 -137593399 + RLTR19 LTR ERVK 91 489 -7 5 699 699 215 124 217 chr5 14944159 14944481 -137592778 + RMER6B LTR ERVK 5 250 -211 5 699 699 215 124 217 chr5 14944624 14944799 -137592460 + RMER6B LTR ERVK 251 456 -5 5 699 7950 42 46 3 chr5 14945754 14946673 -137590586 - RLTR13A2 LTR ERVK 0 958 1 5 699 1344 195 88 13 chr5 14947922 14948229 -137589030 + ORR1C1 LTR MaLR 48 377 -1 6 699 2009 120 3 70 chr5 14948963 14949304 -137587955 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 6 699 805 344 71 40 chr5 14950077 14950431 -137586828 - MTEa LTR MaLR -12 367 3 6 699 2919 119 55 60 chr5 14955982 14956562 -137580697 - RMER17A LTR ERVK 0 751 175 6 699 2109 117 27 34 chr5 14959640 14959968 -137577291 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 699 1773 157 225 27 chr5 14961726 14962262 -137574997 + RMER6D LTR ERVK 33 688 -2 6 699 1502 234 55 115 chr5 14979760 14980291 -137556968 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 6 699 2019 191 87 42 chr5 14981346 14981435 -137555824 + RLTR19 LTR ERVK 1 85 -414 6 699 2857 70 3 0 chr5 14981435 14981780 -137555479 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 699 13579 81 16 3 chr5 14981780 14983549 -137553710 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 6 699 2515 82 45 6 chr5 14983549 14983881 -137553378 + ORR1A1 LTR MaLR 1 345 -1 6 699 2019 191 87 42 chr5 14983881 14984260 -137552999 + RLTR19 LTR ERVK 86 490 -9 6 699 548 160 36 150 chr5 14984558 14984698 -137552561 + RMER6B LTR ERVK 5 128 -333 6 699 416 162 250 10 chr5 14984709 14984809 -137552450 + RMER6B LTR ERVK 76 199 -262 6 699 590 202 139 67 chr5 14985029 14985209 -137552050 + RMER6B LTR ERVK 264 456 -5 6 699 1376 188 85 10 chr5 14987434 14987741 -137549518 + ORR1C1 LTR MaLR 48 377 -1 6 699 2001 120 3 70 chr5 14988476 14988817 -137548442 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 6 699 839 326 71 40 chr5 14989602 14989956 -137547303 - MTEa LTR MaLR -12 367 3 6 699 280 304 48 19 chr5 14991209 14991313 -137545946 + MTD LTR MaLR 13 119 -300 6 699 239 333 32 21 chr5 14994290 14994385 -137542874 + MTD LTR MaLR 106 201 -218 6 699 3936 39 5 0 chr5 14998242 14998676 -137538583 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 699 8238 35 0 0 chr5 14998676 14999612 -137537647 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 6 699 3336 52 0 2 chr5 14999598 15000000 -137537259 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 5410 6 699 38937 43 0 1 chr5 15000001 15004545 -137532714 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2173 5408 870 1 699 990 17 0 0 chr5 15004575 15004692 -137532567 - RLTR10C LTR ERVK -319 117 1 2 699 3084 125 40 24 chr5 15010672 15011222 -137526037 - RMER17A LTR ERVK -18 733 175 8 699 232 167 46 77 chr5 15016059 15016124 -137521135 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 1 699 2086 123 27 34 chr5 15018317 15018645 -137518614 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 699 1723 165 124 43 chr5 15020285 15020833 -137516426 + RMER6D LTR ERVK 19 688 -2 1 699 1337 243 39 166 chr5 15033821 15034393 -137502866 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 3 699 2026 192 85 42 chr5 15035447 15035536 -137501723 + RLTR19 LTR ERVK 1 85 -414 3 699 2810 72 3 0 chr5 15035536 15035881 -137501378 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 699 13582 81 16 3 chr5 15035881 15037650 -137499609 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 3 699 2627 82 6 11 chr5 15037650 15037997 -137499262 + ORR1A1 LTR MaLR 1 345 -1 3 699 2026 192 85 42 chr5 15037997 15038377 -137498882 + RLTR19 LTR ERVK 86 490 -9 3 699 537 160 36 150 chr5 15038675 15038815 -137498444 + RMER6B LTR ERVK 5 128 -333 3 699 602 240 195 119 chr5 15038826 15038996 -137498263 + RMER6B LTR ERVK 76 253 -208 3 699 602 240 195 119 chr5 15039143 15039326 -137497933 + RMER6B LTR ERVK 254 456 -5 3 699 1386 184 85 10 chr5 15041547 15041854 -137495405 + ORR1C1 LTR MaLR 48 377 -1 4 699 2016 117 3 70 chr5 15042589 15042930 -137494329 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 4 699 911 308 76 45 chr5 15043704 15044058 -137493201 - MTEa LTR MaLR -12 367 3 4 699 254 324 48 19 chr5 15045296 15045400 -137491859 + MTD LTR MaLR 13 119 -300 5 699 227 307 91 0 chr5 15050914 15051002 -137486257 + MTD LTR MaLR 106 201 -218 5 699 3846 46 7 0 chr5 15054856 15055289 -137481970 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 699 8010 46 1 0 chr5 15055289 15056224 -137481035 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 6 699 42172 44 0 1 chr5 15056210 15061154 -137476105 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 6 699 2555 111 53 3 chr5 15061152 15061532 -137475727 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 6 699 3417 44 0 128 chr5 15061532 15062032 -137475227 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 700 768 326 71 40 chr5 15113953 15114307 -137422952 + MTEa LTR MaLR 3 367 -12 6 700 1892 117 3 70 chr5 15115073 15115414 -137421845 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 6 700 1204 205 91 16 chr5 15116146 15116453 -137420806 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 48 6 700 804 209 112 191 chr5 15118651 15118836 -137418423 - RMER6B LTR ERVK -5 456 254 7 700 804 209 112 191 chr5 15118983 15119288 -137417971 - RMER6B LTR ERVK -208 253 5 7 700 1892 189 87 42 chr5 15119587 15119966 -137417293 - RLTR19 LTR ERVK -7 492 91 7 700 2500 93 6 0 chr5 15119966 15120309 -137416950 - ORR1A1 LTR MaLR -1 345 1 7 700 12748 81 18 4 chr5 15120309 15122077 -137415182 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 7 700 2598 78 3 9 chr5 15122077 15122425 -137414834 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 700 1892 189 87 42 chr5 15122425 15122514 -137414745 - RLTR19 LTR ERVK -409 90 3 7 700 1537 239 54 52 chr5 15123568 15124066 -137413193 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 7 700 1590 170 226 28 chr5 15137823 15138361 -137398898 - RMER6D LTR ERVK 0 690 33 9 700 2006 114 27 34 chr5 15140114 15140442 -137396817 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 700 2938 117 38 31 chr5 15143125 15143681 -137393578 + RMER17A LTR ERVK 175 734 -17 1 700 1992 120 27 34 chr5 15147294 15147622 -137389637 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 700 2088 143 242 19 chr5 15149379 15149915 -137387344 + RMER6C LTR ERVK 33 688 -2 1 700 1168 240 39 168 chr5 15163711 15164282 -137372977 - RLTR19 LTR ERVK -2 497 1 1 700 758 184 5 93 chr5 15165336 15165425 -137371834 + RLTR19 LTR ERVK 1 90 -409 1 700 2734 64 3 0 chr5 15165425 15165770 -137371489 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 700 12993 79 16 3 chr5 15165770 15167539 -137369720 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 1 700 2613 90 6 11 chr5 15167539 15167886 -137369373 + ORR1A1 LTR MaLR 1 345 -1 1 700 1733 182 106 29 chr5 15167887 15168265 -137368994 + RLTR19 LTR ERVK 86 492 -7 1 700 542 167 29 143 chr5 15168564 15168704 -137368555 + RMER6B LTR ERVK 5 128 -333 1 700 648 228 194 124 chr5 15168715 15168885 -137368374 + RMER6B LTR ERVK 76 253 -208 1 700 648 228 194 124 chr5 15169032 15169217 -137368042 + RMER6B LTR ERVK 254 456 -5 1 700 1370 188 88 7 chr5 15176866 15177171 -137360088 + ORR1C1 LTR MaLR 48 377 -1 1 700 2016 117 3 70 chr5 15177908 15178249 -137359010 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 1 700 907 306 71 40 chr5 15179037 15179391 -137357868 - MTEb LTR MaLR -12 367 3 1 700 280 304 48 19 chr5 15180642 15180746 -137356513 + MTD LTR MaLR 13 119 -300 1 700 248 284 91 0 chr5 15183728 15183816 -137353443 + MTD LTR MaLR 106 201 -218 1 700 3659 39 0 128 chr5 15187632 15188132 -137349127 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 700 8176 39 0 0 chr5 15188132 15189068 -137348191 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 1 700 42310 45 0 1 chr5 15189054 15193998 -137343261 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 1 700 2524 99 72 3 chr5 15193996 15194369 -137342890 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 1 700 3672 37 0 128 chr5 15194369 15194869 -137342390 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 700 3101 112 37 56 chr5 15200833 15201421 -137335838 - RMER17A LTR ERVK 0 751 175 1 701 2005 123 30 37 chr5 15204483 15204811 -137332448 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 701 2245 146 242 19 chr5 15206570 15207106 -137330153 + RMER6C LTR ERVK 33 688 -2 1 701 1552 231 48 126 chr5 15220904 15221445 -137315814 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 1 701 1158 297 48 21 chr5 15224572 15225009 -137312250 + RMER5 LTR ERV1 86 534 0 1 701 8099 25 2 3 chr5 15225177 15226107 -137311152 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 1 701 281 374 5 18 chr5 15226152 15226375 -137310884 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1727 1946 -5832 1 701 290 301 59 92 chr5 15226521 15226759 -137310500 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1958 2187 -5414 1 701 1160 333 54 37 chr5 15227203 15228237 -137309022 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 2633 3684 -3917 1 701 1250 144 5 0 chr5 15228256 15228444 -137308815 - RLTR41 LTR ERV1 -74 372 184 1 701 1366 161 33 124 chr5 15232851 15233213 -137304046 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 701 322 310 53 15 chr5 15233440 15233571 -137303688 + RMER5 LTR ERV1 399 534 0 1 701 1700 162 39 110 chr5 15233665 15233724 -137303535 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 292 1 701 1700 162 39 110 chr5 15233748 15234070 -137303189 - ORR1B2 LTR MaLR -76 291 6 1 701 388 329 23 95 chr5 15247042 15247436 -137289823 + MTE2a LTR MaLR 40 379 0 2 701 3585 8 2 0 chr5 15247648 15248043 -137289216 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 701 2263 170 131 15 chr5 15248422 15248894 -137288365 + RLTR24 LTR ERV1 3 529 0 2 701 920 325 43 73 chr5 15249415 15249783 -137287476 - MTE2a LTR MaLR -4 375 19 2 701 1502 236 65 0 chr5 15250051 15250402 -137286857 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 701 3788 52 128 2 chr5 15257149 15257650 -137279609 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 2 701 280 180 49 0 chr5 15258183 15258244 -137279015 + RMER6D LTR ERVK 2 65 -655 2 701 734 261 90 48 chr5 15264734 15264901 -137272358 + MLT1A0 LTR MaLR 4 174 -191 2 701 734 250 181 19 chr5 15264980 15265146 -137272113 + MLT1A0 LTR MaLR 175 408 0 2 701 279 290 0 0 chr5 15274881 15274943 -137262316 - MTEa LTR MaLR -317 62 1 2 701 756 247 86 48 chr5 15275036 15275304 -137261955 + MTEb LTR MaLR 100 377 -2 2 701 1683 183 47 32 chr5 15278336 15278828 -137258431 + RMER17C LTR ERVK 19 439 -519 2 701 504 259 75 17 chr5 15279986 15280159 -137257100 + RLTR41 LTR ERV1 264 446 0 2 701 620 242 93 85 chr5 15280311 15280676 -137256583 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 701 298 395 40 13 chr5 15280776 15280925 -137256334 - ORR1E LTR MaLR -206 153 1 2 701 3032 139 110 31 chr5 15282207 15282844 -137254415 - RMER6C LTR ERVK -3 687 1 2 701 389 247 104 36 chr5 15283031 15283212 -137254047 + MLT1A LTR MaLR 39 312 -62 2 701 966 253 90 29 chr5 15284524 15284876 -137252383 - MTD LTR MaLR -7 400 5 2 701 368 304 0 97 chr5 15286440 15286553 -137250706 + MT2B LTR ERVL 157 258 -343 2 701 774 255 105 103 chr5 15302979 15303440 -137233819 - MT2B LTR ERVL -2 599 1 2 701 2220 166 34 20 chr5 15303968 15304375 -137232884 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 701 357 316 75 32 chr5 15307700 15308008 -137229251 - RLTR12A LTR ERVK -10 558 238 2 701 482 254 47 123 chr5 15308130 15308331 -137228928 + MTEa LTR MaLR 163 365 -14 2 701 1898 248 48 54 chr5 15308785 15309283 -137227976 - RMER19C LTR ERVK 0 611 117 3 701 251 224 0 33 chr5 15331729 15331789 -137205470 + MTE2a LTR MaLR 284 341 -38 3 701 367 323 145 25 chr5 15333978 15334137 -137203122 - MTE2a LTR MaLR 0 379 202 3 701 1558 193 43 81 chr5 15334210 15334670 -137202589 + RLTR1B LTR ERV1 57 512 0 3 701 360 313 0 0 chr5 15334682 15334765 -137202494 - MTE2a LTR MaLR -215 164 82 3 702 4875 120 12 64 chr5 15340512 15341359 -137195900 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 3 702 306 228 0 98 chr5 15341747 15341859 -137195400 - MLT1B LTR MaLR -74 316 216 3 702 1870 179 52 6 chr5 15357695 15358043 -137179216 + ORR1C1 LTR MaLR 1 364 -14 3 702 628 272 90 25 chr5 15362173 15362461 -137174798 + RMER20B LTR ERVK 234 591 -36 3 702 2886 43 3 0 chr5 15364277 15364622 -137172637 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 702 1342 267 46 20 chr5 15367380 15367720 -137169539 + MTD LTR MaLR 1 344 -75 3 702 1342 267 46 20 chr5 15367765 15367818 -137169441 + MTD LTR MaLR 345 403 -16 3 702 2128 200 88 94 chr5 15367913 15368247 -137169012 + RMER6D LTR ERVK 1 358 -362 3 702 2128 200 88 94 chr5 15368326 15368714 -137168545 + RMER6D LTR ERVK 359 719 -1 3 702 241 280 20 120 chr5 15370977 15371127 -137166132 + RLTR43B LTR ERVK 241 375 0 3 702 334 289 90 21 chr5 15372162 15372307 -137164952 + MLT1A1 LTR MaLR 1 155 -253 4 702 2083 100 48 0 chr5 15375611 15375922 -137161337 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 1 4 702 2084 160 31 8 chr5 15377201 15377555 -137159704 + ORR1B2 LTR MaLR 2 363 -4 4 702 1924 167 76 20 chr5 15378213 15378568 -137158691 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 154 4 702 1723 193 178 33 chr5 15384516 15384603 -137152656 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 88 -496 4 702 1723 193 178 33 chr5 15384671 15385093 -137152166 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 89 584 0 4 702 277 151 19 19 chr5 15385491 15385545 -137151714 - MLT1D LTR MaLR -4 501 448 4 702 509 337 28 11 chr5 15388136 15388313 -137148946 - MLT1D LTR MaLR -46 459 280 4 702 415 277 118 64 chr5 15393018 15393238 -137144021 - MER90 LTR ERV1 -310 265 34 4 702 230 125 0 0 chr5 15395767 15395799 -137141460 - MLT1A1 LTR MaLR -69 339 308 4 702 251 317 12 12 chr5 15402316 15402399 -137134860 + MLT1B LTR MaLR 1 83 -384 4 702 561 248 119 107 chr5 15402500 15402753 -137134506 + MLT1B LTR MaLR 134 389 -1 4 702 3737 129 138 5 chr5 15403594 15404238 -137133021 + RMER19A LTR ERVK 8 737 0 4 702 2134 151 21 103 chr5 15404926 15405392 -137131867 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 1 4 702 1104 145 5 78 chr5 15406449 15406666 -137130593 - ORR1D1 LTR MaLR -173 201 1 4 702 539 106 0 12 chr5 15408309 15408395 -137128864 + ORR1D1 LTR MaLR 1 85 -289 4 702 384 179 0 0 chr5 15408398 15408465 -137128794 + ORR1D1 LTR MaLR 308 374 0 4 702 3426 25 5 0 chr5 15408492 15408886 -137128373 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 702 700 130 9 0 chr5 15409346 15409454 -137127805 + RLTR25A LTR ERVK 591 699 -404 4 702 1656 143 74 52 chr5 15409451 15409843 -137127416 - RLTR25B LTR ERVK -502 526 157 4 702 2856 9 3 0 chr5 15409853 15410174 -137127085 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 702 3992 14 8 2 chr5 15410174 15410656 -137126603 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 4360 4 702 377 208 69 10 chr5 15410661 15410763 -137126496 - RLTR25B LTR ERVK -169 358 251 4 702 1036 156 0 0 chr5 15413494 15413661 -137123598 - MT2B LTR ERVL 0 601 435 4 702 1731 200 162 46 chr5 15413656 15414223 -137123036 - RMER13B LTR ERVK -4 904 272 4 702 1566 225 62 33 chr5 15414209 15414726 -137122533 - RMER17B LTR ERVK -417 489 1 4 702 2719 90 84 12 chr5 15414726 15415123 -137122136 - MT2B2 LTR ERVL -158 426 1 4 702 1995 159 3 0 chr5 15420538 15420858 -137116401 + ORR1A2 LTR MaLR 5 325 -2 4 702 2419 167 2 85 chr5 15425408 15425727 -137111532 - MTC LTR MaLR 0 421 119 4 702 2419 167 2 85 chr5 15426669 15426801 -137110458 - MTC LTR MaLR -303 118 1 4 702 603 309 107 59 chr5 15427470 15427910 -137109349 - MLT1D LTR MaLR -5 500 40 4 702 2168 127 54 35 chr5 15449834 15450203 -137087056 + ORR1C2 LTR MaLR 9 384 0 5 702 273 323 34 60 chr5 15456905 15457111 -137080148 - MLT1E1 LTR MaLR -344 336 136 5 702 316 200 0 91 chr5 15460971 15461048 -137076211 + MT2B LTR ERVL 170 239 -362 5 702 2014 186 44 7 chr5 15465210 15465616 -137071643 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 703 369 325 139 25 chr5 15466993 15467195 -137070064 + MLT1C LTR MaLR 5 229 -238 5 703 758 235 23 6 chr5 15471049 15471220 -137066039 + MTD LTR MaLR 12 185 -234 5 703 495 293 43 0 chr5 15471231 15471371 -137065888 + MTD LTR MaLR 232 377 -42 5 703 1176 250 149 11 chr5 15479472 15479828 -137057431 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 5 703 809 307 90 34 chr5 15481632 15482020 -137055239 - BGLII_B LTR ERVK -27 414 5 5 703 722 322 65 19 chr5 15490018 15490328 -137046931 - MLT1A LTR MaLR -15 359 36 5 703 634 282 73 76 chr5 15504958 15505288 -137031971 + MTE2a LTR MaLR 1 329 -50 1 703 276 148 16 47 chr5 15505552 15505616 -137031643 - MTE2a LTR MaLR 0 379 318 1 703 240 348 76 76 chr5 15506382 15506699 -137030560 - RLTR12B LTR ERVK -194 334 18 1 703 838 260 69 22 chr5 15513417 15513692 -137023567 + MTE2a LTR MaLR 10 297 -82 2 703 238 237 70 30 chr5 15513744 15513844 -137023415 - MER34 LTR ERV1 -62 480 377 2 703 254 313 69 29 chr5 15515836 15515938 -137021321 + MER34 LTR ERV1 401 506 -36 2 703 1866 194 52 45 chr5 15529040 15529591 -137007668 + RMER4A LTR ERVK 2 585 0 3 703 340 280 181 32 chr5 15535954 15536175 -137001084 - RMER15 LTR ERVL -14 561 308 4 703 1797 153 64 86 chr5 15537420 15537827 -136999432 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 5 703 385 277 0 0 chr5 15538290 15538373 -136998886 - RMER15-int LTR ERVL -411 4588 4506 4 703 1425 322 58 49 chr5 15538480 15538959 -136998300 - RMER15-int LTR ERVL -3306 1693 1196 4 703 1896 125 18 59 chr5 15538959 15539299 -136997960 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 1 5 703 1425 322 58 49 chr5 15539299 15539573 -136997686 - RMER15-int LTR ERVL -3804 1195 933 4 703 512 373 78 29 chr5 15540270 15540656 -136996603 - RMER15-int LTR ERVL -4592 407 3 4 703 636 298 127 22 chr5 15540656 15540924 -136996335 - RMER15 LTR ERVL -5 570 275 4 703 1160 209 158 19 chr5 15554610 15554976 -136982283 + MTD LTR MaLR 3 419 0 7 703 323 200 60 36 chr5 15556203 15556286 -136980973 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 324 7 703 719 271 132 23 chr5 15557179 15557489 -136979770 + MLT1B LTR MaLR 1 344 -46 8 703 315 257 96 29 chr5 15579073 15579177 -136958082 + MLT1A0 LTR MaLR 1 111 -254 1 703 1709 210 91 33 chr5 15580348 15580746 -136956513 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 703 2394 147 125 112 chr5 15582172 15582853 -136954406 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 703 226 319 0 0 chr5 15583164 15583233 -136954026 + MLT1L LTR MaLR 540 608 -2 1 703 1055 221 93 24 chr5 15585495 15585758 -136951501 - ORR1D1 LTR MaLR -124 250 8 1 703 3315 180 23 7 chr5 15586517 15587120 -136950139 - RLTR17 LTR ERVK -77 615 3 1 703 544 320 50 22 chr5 15596319 15596501 -136940758 - ORR1E LTR MaLR -169 190 4 1 704 407 219 33 93 chr5 15599978 15600129 -136937130 + MT2B LTR ERVL 113 254 -347 1 704 2839 46 0 14 chr5 15603449 15603800 -136933459 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 704 550 171 176 52 chr5 15605119 15605255 -136932004 - ORR1D1 LTR MaLR -212 162 10 1 704 1590 188 81 13 chr5 15608368 15608751 -136928508 - RLTR28B LTR ERVL -72 409 1 1 704 543 360 70 27 chr5 15613689 15614092 -136923167 + MTE-int LTR MaLR 81 500 -1080 1 704 2690 112 12 17 chr5 15616832 15617250 -136920009 - RLTR23 LTR ERV1 -14 416 1 1 704 1681 183 22 20 chr5 15621943 15622252 -136915007 - RLTR15 LTR ERVK -1 358 53 1 704 1681 183 22 20 chr5 15622303 15622350 -136914909 - RLTR15 LTR ERVK -307 52 2 1 704 2749 138 54 16 chr5 15628128 15628627 -136908632 - RLTR28 LTR ERVL -4 520 3 1 704 565 317 0 66 chr5 15631281 15631543 -136905716 + ORR1E LTR MaLR 1 251 -123 1 704 524 319 17 143 chr5 15631573 15631730 -136905529 + ORR1E LTR MaLR 252 367 -7 1 704 308 293 42 70 chr5 15638103 15638246 -136899013 + MLT1A0 LTR MaLR 151 289 -76 1 704 259 243 194 45 chr5 15651329 15651484 -136885775 + RLTR40 LTR ERVK 578 755 -62 2 704 423 335 100 28 chr5 15653246 15653322 -136883937 + MLT1A0 LTR MaLR 41 128 -237 2 704 937 197 108 113 chr5 15653322 15653694 -136883565 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 2 704 423 335 100 28 chr5 15653694 15653866 -136883393 + MLT1A0 LTR MaLR 129 306 -59 2 704 860 266 123 64 chr5 15653879 15654237 -136883022 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 2 704 2329 168 54 43 chr5 15655595 15656150 -136881109 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 2 704 4265 194 72 36 chr5 15656151 15657233 -136880026 - RMER3D-int LTR ERVK -1 2841 1721 2 704 500 311 96 86 chr5 15658858 15659171 -136878088 + MER73 LTR ERVL 277 592 -52 2 704 959 256 46 33 chr5 15685711 15686078 -136851181 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 704 643 318 34 57 chr5 15686513 15686862 -136850397 - RMER5 LTR ERV1 -21 513 173 2 704 1488 184 212 5 chr5 15686862 15687229 -136850030 + RLTR41 LTR ERV1 1 443 -3 2 704 340 229 119 44 chr5 15687447 15687607 -136849652 - RMER5 LTR ERV1 -358 176 5 2 704 2554 173 43 62 chr5 15691937 15692306 -136844953 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 369 -158 2 704 3358 30 5 0 chr5 15692306 15692700 -136844559 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 704 2554 173 43 62 chr5 15692700 15692867 -136844392 + RLTR11A2 LTR ERVK 370 527 0 2 704 1517 253 62 28 chr5 15694822 15695293 -136841966 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 40 2 704 357 276 0 0 chr5 15701015 15701113 -136836146 + MTE2b LTR MaLR 1 98 -281 2 704 807 312 16 12 chr5 15701116 15701369 -136835890 + MTE2b LTR MaLR 61 314 -65 2 704 306 196 27 75 chr5 15713683 15713871 -136823388 - RMER17C LTR ERVK -136 274 96 2 705 382 294 24 36 chr5 15728772 15728938 -136808321 + MLT1B LTR MaLR 227 390 0 3 705 265 298 49 73 chr5 15752051 15752268 -136784991 + RLTR25A LTR ERVK 813 1103 0 3 705 251 382 39 0 chr5 15767070 15767172 -136770087 - LTR41 LTR ERVL -226 542 437 3 705 359 351 101 42 chr5 15767369 15767607 -136769652 - LTR41 LTR ERVL -502 266 15 3 705 622 283 171 67 chr5 15774944 15775500 -136761759 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 3 3 705 371 374 72 0 chr5 15777876 15778042 -136759217 - LTR16C LTR ERVL -13 476 299 3 705 2294 96 12 3 chr5 15779344 15779668 -136757591 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 705 2834 94 12 19 chr5 15780560 15780970 -136756289 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 705 3137 171 59 32 chr5 15783885 15784542 -136752717 - RMER6C LTR ERVK 0 690 16 3 705 493 295 55 45 chr5 15785170 15785390 -136751869 + LTR40b LTR ERVL 229 450 -12 3 705 559 291 133 67 chr5 15786227 15786558 -136750701 - ORR1E LTR MaLR -4 355 3 3 705 2746 15 95 6 chr5 15790729 15791066 -136746193 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 705 51492 32 15 3 chr5 15791066 15797462 -136739797 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 3 705 2746 15 95 6 chr5 15797462 15797799 -136739460 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 705 2244 169 137 24 chr5 15825227 15825724 -136711535 - RLTR20B3 LTR ERVK -4 573 21 4 705 464 272 89 80 chr5 15827633 15827908 -136709351 - MLT1A0 LTR MaLR -24 350 74 4 705 994 314 62 30 chr5 15851592 15851963 -136685296 - MTD LTR MaLR -18 401 19 4 705 1771 262 20 5 chr5 15853798 15854197 -136683062 - MTD LTR MaLR -14 405 1 4 705 1059 280 187 38 chr5 15854197 15854672 -136682587 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 713 4 706 483 184 23 0 chr5 15873768 15873855 -136663404 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 480 4 706 3055 57 31 0 chr5 15890791 15891179 -136646080 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 706 7771 130 36 80 chr5 15891179 15892481 -136644778 - MTB-int LTR MaLR -425 1538 328 5 706 4112 106 153 16 chr5 15892481 15893192 -136644067 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 5 706 7771 148 57 18 chr5 15893192 15893647 -136643612 - MTB-int LTR MaLR -1497 466 3 5 706 3030 58 7 60 chr5 15893647 15894067 -136643192 - MTB LTR MaLR 0 400 3 5 706 441 340 194 11 chr5 15894067 15894337 -136642922 - MTE2b LTR MaLR -59 320 1 5 706 1482 212 75 19 chr5 15897353 15897713 -136639546 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 5 706 3954 242 126 23 chr5 15897717 15898956 -136638303 + ORR1C2-int LTR MaLR 5 1370 0 5 706 1444 209 129 6 chr5 15898956 15899125 -136638134 + ORR1C2 LTR MaLR 1 189 -195 5 706 1444 209 129 6 chr5 15899174 15899346 -136637913 + ORR1C2 LTR MaLR 190 383 -1 5 706 2192 85 27 39 chr5 15905968 15906299 -136630960 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 706 578 317 47 87 chr5 15906301 15906802 -136630457 - RLTR23 LTR ERV1 -3 427 8 5 706 681 215 28 52 chr5 15907549 15907638 -136629621 + RMER17C LTR ERVK 1 90 -320 5 706 681 215 28 52 chr5 15907662 15907822 -136629437 + RMER17C LTR ERVK 91 244 -166 5 706 948 238 38 9 chr5 15907793 15908111 -136629148 + RMER17C LTR ERVK 84 410 0 5 706 1218 196 40 93 chr5 15908936 15909364 -136627895 - RMER17C LTR ERVK -5 405 1 5 706 975 128 99 26 chr5 15911009 15911201 -136626058 + RMER17C LTR ERVK 205 410 0 5 706 1770 175 22 50 chr5 15911443 15911890 -136625369 - RMER17C LTR ERVK -520 438 19 5 706 382 319 48 8 chr5 15918738 15918884 -136618375 + MTEa LTR MaLR 218 377 -2 5 706 760 273 160 12 chr5 15921249 15921559 -136615700 - MTEa LTR MaLR -24 355 5 5 706 2006 171 93 5 chr5 15922534 15922921 -136614338 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 706 3452 224 64 16 chr5 15930007 15930870 -136606389 + RMER13B LTR ERVK 5 908 0 5 706 2357 108 135 0 chr5 15931196 15931566 -136605693 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 5 706 1386 231 16 36 chr5 15931729 15932034 -136605225 + ORR1C1 LTR MaLR 6 304 -74 5 706 1388 118 276 6 chr5 15935884 15936061 -136601198 - RMER17C LTR ERVK 0 410 232 6 706 1388 118 276 6 chr5 15936102 15936247 -136601012 - RMER17C LTR ERVK -179 231 2 6 706 5915 283 20 51 chr5 15940195 15942248 -136595011 + RodERV21-int LTR ERV1 728 2718 -2273 6 706 4237 179 112 6 chr5 15942780 15943557 -136593702 + RMER13A LTR ERVK 1 859 -1 6 706 289 309 28 35 chr5 15943921 15944065 -136593194 + RodERV21-int LTR ERV1 3571 3713 -3893 6 706 3568 344 33 38 chr5 15945770 15947854 -136589405 + RodERV21-int LTR ERV1 2718 4789 -202 6 706 239 311 89 32 chr5 15947894 15948017 -136589242 + RMER4B LTR ERVK 349 478 -107 6 706 814 256 79 127 chr5 15948939 15949279 -136587980 - MTE2a LTR MaLR -52 327 4 6 706 3343 40 0 2 chr5 15955245 15955642 -136581617 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 706 9274 21 5 1 chr5 15955642 15956734 -136580525 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1096 -2 6 706 3336 40 0 2 chr5 15956736 15957133 -136580126 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 706 248 289 79 0 chr5 15958273 15958349 -136578910 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 400 6 706 682 264 11 17 chr5 15958382 15958563 -136578696 - RLTR28B LTR ERVL -168 313 134 6 706 486 210 60 139 chr5 15958965 15958978 -136578281 - RLTR28B LTR ERVL -328 153 143 6 706 486 210 60 139 chr5 15959060 15959212 -136578047 - RLTR28B LTR ERVL -339 142 1 6 706 2235 122 35 102 chr5 15959456 15959965 -136577294 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 706 5980 30 20 28 chr5 15959965 15960717 -136576542 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 6 706 2241 65 0 0 chr5 15960716 15960994 -136576265 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 6 706 4249 64 5 26 chr5 15960994 15961575 -136575684 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 94 6 706 227 267 0 0 chr5 15961578 15961623 -136575636 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 6 706 604 115 16 124 chr5 15961623 15961752 -136575507 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 9 6 706 2311 112 57 93 chr5 15961753 15962246 -136575013 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 706 4484 148 14 10 chr5 15967459 15968190 -136569069 - RMER19A LTR ERVK 0 737 4 6 706 1523 185 14 127 chr5 15972428 15972799 -136564460 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 706 1484 115 21 58 chr5 15980206 15980515 -136556744 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -4 379 1 6 706 1253 217 35 69 chr5 15984183 15984676 -136552583 + RMER6D LTR ERVK 1 524 -196 6 706 311 244 36 24 chr5 15988078 15988162 -136549097 + MTEb LTR MaLR 278 362 -17 6 707 232 297 125 9 chr5 15992879 15992991 -136544268 + MT2C_Mm LTR ERVL 89 213 -262 6 707 257 255 103 9 chr5 15994657 15994764 -136542495 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 258 6 707 2097 148 73 13 chr5 16006391 16006788 -136530471 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 707 2775 209 68 13 chr5 16006995 16007354 -136529905 + RMER6D LTR ERVK 5 369 -351 1 707 2775 209 68 13 chr5 16007380 16007695 -136529564 + RMER6D LTR ERVK 370 716 -4 1 707 4351 168 98 8 chr5 16009904 16010737 -136526522 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 1 707 2420 188 93 45 chr5 16017182 16017841 -136519418 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 2 707 2199 173 37 10 chr5 16024685 16025093 -136512166 + MTC LTR MaLR 3 421 0 3 707 785 180 75 16 chr5 16025093 16025279 -136511980 + MTC-int LTR MaLR 3 199 -1059 3 707 1389 268 82 10 chr5 16025741 16026129 -136511130 + MTD LTR MaLR 4 419 0 4 707 2059 116 138 50 chr5 16026206 16026649 -136510610 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 707 1601 172 14 78 chr5 16027946 16028423 -136508836 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 4 707 2267 139 106 12 chr5 16028868 16029282 -136507977 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 5 707 555 205 74 0 chr5 16032612 16032734 -136504525 - RMER17C LTR ERVK -279 131 1 5 707 1378 235 28 229 chr5 16040775 16041536 -136495723 - RMER19C LTR ERVK -3 608 1 6 707 1542 244 25 19 chr5 16049760 16049965 -136487294 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 172 8 707 1542 244 25 19 chr5 16050121 16050283 -136486976 - ORR1C1 LTR MaLR -207 171 2 8 707 277 320 9 99 chr5 16050546 16050657 -136486602 + MT2B LTR ERVL 157 257 -344 8 707 1482 229 103 8 chr5 16054168 16054546 -136482713 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 8 707 1110 225 72 53 chr5 16056248 16056567 -136480692 + ORR1C2 LTR MaLR 17 341 -43 9 707 709 363 37 28 chr5 16095704 16096056 -136441203 + MLT1A LTR MaLR 1 355 -19 1 707 1543 223 109 46 chr5 16100933 16101455 -136435804 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 3 1 707 1966 113 83 0 chr5 16112206 16112508 -136424751 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 708 497 323 76 55 chr5 16144021 16144257 -136393002 + MTEa LTR MaLR 3 243 -136 2 708 392 276 53 79 chr5 16144604 16144793 -136392466 + RLTR23 LTR ERV1 247 430 0 2 708 345 231 55 0 chr5 16157085 16157176 -136380083 - MLT1H LTR MaLR -388 161 66 2 708 497 213 9 27 chr5 16157632 16157743 -136379516 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 300 2 708 1466 192 23 88 chr5 16164162 16164550 -136372709 - RMER16 LTR ERVK 0 533 171 2 708 735 226 27 67 chr5 16169262 16169485 -136367774 - RMER17C-int LTR ERVK -325 2913 2700 2 708 2805 181 98 29 chr5 16169486 16170068 -136367191 + RMER19B LTR ERVK 272 893 -9 2 708 733 263 46 27 chr5 16172239 16172458 -136364801 + LTRIS4 LTR ERV1 285 507 0 2 708 427 243 44 70 chr5 16172460 16172724 -136364535 + MuRRS4-int LTR ERV1 5 244 -7534 2 708 526 209 6 86 chr5 16173090 16173252 -136364007 + MuRRS4-int LTR ERV1 333 481 -4582 2 708 1937 126 3 87 chr5 16173252 16173608 -136363651 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 2 708 58045 15 4 18 chr5 16173608 16180182 -136357077 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 1 2 708 1948 134 5 87 chr5 16180183 16180561 -136356698 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 2 708 846 205 93 6 chr5 16180561 16180733 -136356526 + MuRRS4-int LTR ERV1 489 675 -4388 2 708 5055 122 18 21 chr5 16180768 16181541 -136355718 + RMER16-int LTR ERVK 678 1448 -3958 2 708 301 173 0 0 chr5 16181525 16181577 -136355682 + MuRRS4-int LTR ERV1 750 801 -4262 2 708 1509 272 26 2 chr5 16181826 16182311 -136354948 + MuRRS4-int LTR ERV1 906 1441 -3622 2 708 4676 191 52 65 chr5 16182293 16184534 -136352725 + MuRRS4-int LTR ERV1 1300 4271 -792 2 708 850 200 136 13 chr5 16184525 16184753 -136352506 + MuRRS4-int LTR ERV1 4788 5043 -20 2 708 699 265 48 31 chr5 16184776 16185011 -136352248 + LTRIS4 LTR ERV1 254 489 -18 2 708 473 229 110 102 chr5 16185017 16185345 -136351914 - MYSERV-int LTR ERVK -742 5808 5538 2 708 261 154 0 37 chr5 16185384 16185438 -136351821 - MYSERV-int LTR ERVK -5193 944 893 2 708 1838 182 22 81 chr5 16186883 16187112 -136350147 - RMER10A LTR ERVL -8 434 214 2 708 2544 173 31 26 chr5 16187112 16187569 -136349690 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 2 708 1838 182 22 81 chr5 16187569 16187798 -136349461 - RMER10A LTR ERVL -229 213 3 2 708 1473 256 119 70 chr5 16189509 16190210 -136347049 + RMER13B LTR ERVK 288 904 -4 2 708 703 298 129 22 chr5 16190179 16190438 -136346821 + MTE2a-int LTR MaLR 764 1051 -529 2 708 298 303 45 27 chr5 16190586 16190698 -136346561 + MTE2a-int LTR MaLR 1253 1366 -4 2 708 747 309 60 43 chr5 16190735 16191104 -136346155 + MTE2a LTR MaLR 5 379 0 2 708 350 188 14 0 chr5 16192259 16192328 -136344931 - MTC LTR MaLR 0 421 352 2 708 388 171 0 0 chr5 16192321 16192397 -136344862 + ORR1A3-int LTR MaLR 682 757 -1206 2 708 2967 128 25 33 chr5 16192330 16192809 -136344450 + MT2B LTR ERVL 127 601 0 2 708 4027 204 118 6 chr5 16192810 16193710 -136343549 - MTC-int LTR MaLR -257 1001 1 2 708 1821 174 33 44 chr5 16193710 16194071 -136343188 - MTC LTR MaLR -2 419 63 2 708 503 317 47 75 chr5 16194090 16194601 -136342658 - RLTR12B LTR ERVK -24 504 1 2 708 483 123 0 0 chr5 16194604 16194677 -136342582 - MTC LTR MaLR -348 73 1 2 708 3512 43 8 0 chr5 16197044 16197437 -136339822 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 708 9189 57 6 1 chr5 16197437 16198530 -136338729 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 708 3385 29 42 0 chr5 16198530 16198908 -136338351 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 2 708 6637 158 36 30 chr5 16204588 16205829 -136331430 - MYSERV6-int LTR ERVK -2712 6247 4999 2 708 11500 166 70 38 chr5 16206221 16206464 -136330795 - MYSERV6-int LTR ERVK -3841 5118 4886 2 708 11500 166 70 38 chr5 16206904 16208508 -136328751 - MYSERV6-int LTR ERVK -4074 4885 3219 2 708 2213 199 111 24 chr5 16208508 16208967 -136328292 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 2 708 11500 166 70 38 chr5 16208967 16209631 -136327628 - MYSERV6-int LTR ERVK -5741 3218 2525 2 708 1320 276 22 20 chr5 16209831 16210231 -136327028 - MurERV4-int LTR ERVK -2187 3073 2673 2 708 934 300 26 24 chr5 16213200 16213631 -136323628 - RMER19B LTR ERVK -53 849 142 2 708 916 237 16 99 chr5 16213630 16213934 -136323325 - RMER19C LTR ERVK -332 279 1 2 708 1183 169 87 25 chr5 16214410 16214652 -136322607 + RMER6B LTR ERVK 202 458 -3 2 708 3533 194 45 58 chr5 16214654 16215135 -136322124 + MYSERV6-int LTR ERVK 2 458 -8501 2 708 3533 194 45 58 chr5 16215324 16215722 -136321537 + MYSERV6-int LTR ERVK 459 870 -8089 2 708 1831 160 54 25 chr5 16217698 16218046 -136319213 + MYSERV6-int LTR ERVK 856 1214 -7745 2 708 264 275 0 0 chr5 16218268 16218337 -136318922 + RLTR6-int LTR ERV1 4479 4547 -3231 2 708 555 324 17 0 chr5 16218565 16218741 -136318518 - RLTR6-int LTR ERV1 -2383 5395 5217 2 708 298 250 59 12 chr5 16218743 16218828 -136318431 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1412 3651 3563 2 708 1448 210 182 56 chr5 16219051 16219551 -136317708 + RMER2 LTR ERV1 1 563 -4 2 708 997 134 75 93 chr5 16220179 16220393 -136316866 - RMER6B LTR ERVK -251 210 1 2 708 1546 182 156 25 chr5 16222391 16222796 -136314463 + RMER6B LTR ERVK 1 458 -3 3 708 2597 62 23 149 chr5 16223139 16223609 -136313650 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 3 708 5009 73 4 31 chr5 16223609 16224342 -136312917 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 1274 3 708 2624 289 40 37 chr5 16224487 16226951 -136310308 - RLTR10-int LTR ERVK -1329 5213 986 3 708 924 326 48 10 chr5 16226972 16227551 -136309708 - RLTR10-int LTR ERVK -5120 1422 822 3 708 1042 148 16 11 chr5 16227682 16227873 -136309386 - RLTR10-int LTR ERVK -988 999 808 3 708 1875 57 4 12 chr5 16228334 16228584 -136308675 - RLTR10-int LTR ERVK -1438 549 302 3 708 2544 60 23 170 chr5 16228584 16229066 -136308193 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 3 708 1415 254 61 5 chr5 16233262 16233658 -136303601 + MTD LTR MaLR 2 419 0 3 708 3862 76 5 24 chr5 16235429 16236023 -136301236 - RLTR19-int LTR ERVK -4125 2012 1430 3 708 598 333 67 33 chr5 16241177 16241537 -136295722 + MT2A LTR ERVL 1 372 -161 3 708 325 224 182 19 chr5 16242745 16242883 -136294376 - RMER20B LTR ERVK -248 379 234 3 708 2101 121 16 0 chr5 16243169 16243483 -136293776 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 3 708 646 308 54 36 chr5 16244022 16244384 -136292875 - MT2A LTR ERVL -125 408 5 3 708 773 188 30 6 chr5 16251332 16251498 -136285761 - RMER5 LTR ERV1 -27 507 338 3 709 1009 287 48 39 chr5 16255030 16255367 -136281892 - RMER5 LTR ERV1 -194 340 1 3 709 842 286 92 37 chr5 16274489 16274816 -136262443 - ORR1E LTR MaLR -10 349 5 3 709 233 349 70 0 chr5 16278286 16278372 -136258887 + MLT1G LTR MaLR 103 194 -385 3 709 2460 174 90 117 chr5 16278516 16279225 -136258034 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 709 292 345 0 12 chr5 16279264 16279349 -136257910 + MLT1G LTR MaLR 353 436 -155 3 709 1677 208 15 12 chr5 16281852 16282183 -136255076 + ORR1B1 LTR MaLR 60 391 -3 3 709 327 341 115 38 chr5 16285159 16285342 -136251917 - MLT1J2 LTR MaLR -139 309 113 3 709 1444 181 105 12 chr5 16285850 16286174 -136251085 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 3 709 2312 107 3 0 chr5 16287208 16287534 -136249725 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 709 1217 166 63 8 chr5 16289232 16289487 -136247772 - RMER6C LTR ERVK 0 690 422 3 709 573 142 8 131 chr5 16290365 16290487 -136246772 - MT2B LTR ERVL -318 283 177 3 709 358 122 0 0 chr5 16290464 16290513 -136246746 - RMER6C LTR ERVK -599 157 109 3 709 427 323 8 23 chr5 16290610 16290740 -136246519 + ORR1E LTR MaLR 1 128 -231 3 709 807 153 47 0 chr5 16291633 16291783 -136245476 + RMER19C LTR ERVK 1 157 -454 3 709 333 338 84 103 chr5 16293185 16293554 -136243705 - LTR40b LTR ERVL -100 362 1 3 709 1855 200 3 21 chr5 16304065 16304448 -136232811 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 1 4 709 452 329 126 21 chr5 16316545 16316784 -136220475 - MLT2F LTR ERVL -117 546 283 4 709 854 335 43 40 chr5 16331922 16332295 -136204964 + MTEa LTR MaLR 6 379 0 4 709 2835 94 37 0 chr5 16334325 16334728 -136202531 - BGLII LTR ERVK -1 420 3 4 709 1075 301 44 32 chr5 16340944 16341377 -136195882 - BGLII_B LTR ERVK -3 438 1 4 709 350 311 103 78 chr5 16344839 16345198 -136192061 + MLT1B LTR MaLR 6 373 -17 4 709 305 337 104 75 chr5 16356021 16356300 -136180959 - MLT2B3 LTR ERVL -247 307 21 4 709 422 272 100 12 chr5 16358286 16358446 -136178813 - MTE2a LTR MaLR 0 379 206 4 709 3155 31 36 8 chr5 16359077 16359462 -136177797 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 709 482 289 15 62 chr5 16364085 16364284 -136172975 - MLT1A0 LTR MaLR -203 205 15 4 709 1393 173 157 38 chr5 16370148 16370309 -136166950 + ORR1C2 LTR MaLR 1 189 -195 5 709 1393 173 157 38 chr5 16370389 16370570 -136166689 + ORR1C2 LTR MaLR 190 383 -1 5 709 3454 25 2 0 chr5 16383228 16383623 -136153636 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 88 5046 124 30 26 chr5 16383879 16384764 -136152495 + RMER17D LTR ERVK 1 889 0 5 710 312 239 0 0 chr5 16387453 16387520 -136149739 - RLTR40 LTR ERVK -744 73 7 5 710 715 245 86 0 chr5 16390744 16390907 -136146352 - MTD LTR MaLR -106 313 137 5 710 1703 182 85 3 chr5 16401869 16402221 -136135038 + RLTR14 LTR ERV1 2 382 0 5 710 1126 207 116 44 chr5 16405071 16405434 -136131825 + RLTR9C LTR ERVK 5 393 0 5 710 3794 228 66 41 chr5 16438578 16439564 -136097695 + RLTR25B LTR ERVK 15 1025 -3 5 710 1654 131 121 148 chr5 16439956 16440387 -136096872 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 12 5 710 1104 189 20 24 chr5 16441017 16441267 -136095992 - RLTR16 LTR ERVK -13 492 244 5 710 1894 243 35 55 chr5 16441304 16441817 -136095442 + RMER20A LTR ERVK 14 516 0 5 710 803 341 72 19 chr5 16444032 16444465 -136092794 - MER31A LTR ERV1 -7 478 23 5 710 2861 209 125 42 chr5 16444505 16445340 -136091919 - RMER13B LTR ERVK -4 904 1 5 710 266 289 63 51 chr5 16453604 16453779 -136083480 + RLTR42-int LTR ERVK 4257 4433 -1089 5 710 2373 203 52 75 chr5 16455996 16456331 -136080928 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 239 5 710 2373 203 52 75 chr5 16456437 16456691 -136080568 - RLTR20B3 LTR ERVK -339 238 1 5 710 249 380 33 52 chr5 16460776 16460987 -136076272 - RMER15 LTR ERVL -17 558 352 5 710 1781 227 72 62 chr5 16464354 16464871 -136072388 + RLTR11A LTR ERVK 1 522 -6 6 710 294 355 45 27 chr5 16467875 16468095 -136069164 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 142 6 710 1481 195 45 15 chr5 16468333 16468666 -136068593 - RMER6C LTR ERVK -3 687 345 6 710 267 213 0 0 chr5 16468708 16468755 -136068504 - MT2B LTR ERVL -374 227 181 6 710 537 141 53 21 chr5 16468739 16468833 -136068426 - RMER6C LTR ERVK -579 111 15 6 710 247 325 81 73 chr5 16472964 16473100 -136064159 - MLT1A0 LTR MaLR -229 145 9 6 710 4150 170 76 26 chr5 16474424 16475283 -136061976 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 6 710 1135 275 117 35 chr5 16477466 16477809 -136059450 + MTD LTR MaLR 41 411 -8 6 710 684 307 94 47 chr5 16478180 16478498 -136058761 + MLT1C LTR MaLR 3 335 -132 6 710 249 350 59 10 chr5 16480919 16481020 -136056239 + MLT1A1 LTR MaLR 9 114 -294 6 710 3863 51 6 0 chr5 16482236 16482708 -136054551 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 710 7285 90 48 2 chr5 16482710 16483760 -136053499 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 710 3013 64 13 5 chr5 16483760 16484153 -136053106 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 710 1090 290 37 15 chr5 16495141 16495551 -136041708 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 710 346 339 44 33 chr5 16495703 16495886 -136041373 - MER57E1 LTR ERV1 0 372 188 6 710 328 335 136 55 chr5 16496135 16496334 -136040925 - ORR1E LTR MaLR -144 215 1 6 710 2187 177 60 70 chr5 16497386 16497915 -136039344 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 6 710 368 332 129 42 chr5 16501205 16501501 -136035758 + MLT1F-int LTR MaLR 1106 1431 -58 1 710 4309 66 11 12 chr5 16501501 16502066 -136035193 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 2 710 368 332 129 42 chr5 16502066 16502102 -136035157 + MLT1F-int LTR MaLR 1432 1467 -22 1 710 3733 186 56 130 chr5 16507863 16508898 -136028361 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 7 710 558 333 137 31 chr5 16513751 16514110 -136023149 - RMER15 LTR ERVL 0 575 179 1 711 3559 176 74 5 chr5 16524691 16525338 -136011921 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 3 711 445 328 75 97 chr5 16526807 16527178 -136010081 + ORR1D2 LTR MaLR 8 370 0 3 711 1024 194 78 53 chr5 16531254 16531537 -136005722 + RLTR20C LTR ERVK 1 290 -244 4 711 426 160 252 46 chr5 16531541 16531605 -136005654 + RLTR20C LTR ERVK 421 491 -87 4 711 426 160 252 46 chr5 16531654 16531720 -136005539 + RLTR20C LTR ERVK 492 578 0 4 711 2633 208 69 29 chr5 16533097 16533336 -136003923 - RMER6C LTR ERVK -10 680 424 4 711 2633 208 69 29 chr5 16533363 16533777 -136003482 - RMER6C LTR ERVK -267 423 1 4 711 2465 204 61 18 chr5 16533790 16534348 -136002911 - RMER6-int LTR ERVK -14 3163 2582 4 711 420 119 15 0 chr5 16548459 16548526 -135988733 - MTD LTR MaLR -8 411 344 6 711 342 280 100 0 chr5 16548525 16548625 -135988634 - MTD LTR MaLR -261 158 49 6 711 2193 183 62 17 chr5 16558633 16559100 -135978159 + RLTR28 LTR ERVL 1 488 -36 7 711 683 256 99 99 chr5 16560223 16560557 -135976702 + MYSERV6-int LTR ERVK 7166 7499 -1460 7 711 261 171 23 136 chr5 16560745 16560833 -135976426 + RLTR19-int LTR ERVK 2946 3023 -3114 7 711 2934 41 5 65 chr5 16563023 16563436 -135973823 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 7 711 2801 152 150 23 chr5 16575093 16575705 -135961554 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 8 711 302 274 71 0 chr5 16575945 16576029 -135961230 - ORR1E LTR MaLR 0 379 290 8 711 490 272 104 0 chr5 16576109 16576234 -135961025 - ORR1E LTR MaLR -216 143 6 8 711 1810 136 9 62 chr5 16576792 16577130 -135960129 - ORR1A4 LTR MaLR -9 320 1 8 711 5468 185 86 33 chr5 16577138 16578638 -135958621 - ORR1A4-int LTR MaLR -191 1772 448 8 711 292 256 0 44 chr5 16579643 16579733 -135957526 + MTEb LTR MaLR 294 379 0 9 711 1447 192 41 4 chr5 16581220 16581487 -135955772 + RMER13B LTR ERVK 1 277 -631 9 711 4043 173 118 119 chr5 16584858 16585123 -135952136 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 897 9 711 4043 173 118 119 chr5 16585170 16585576 -135951683 - RLTR25A LTR ERVK -207 896 408 9 711 2484 100 162 0 chr5 16585576 16586034 -135951225 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 9 711 4043 173 118 119 chr5 16586034 16586457 -135950802 - RLTR25A LTR ERVK -696 407 9 9 711 317 220 68 8 chr5 16596562 16596588 -135940671 + ORR1D1-int LTR MaLR 614 647 -862 1 711 319 253 67 0 chr5 16596737 16596812 -135940447 - MTE2a LTR MaLR -87 292 213 1 711 374 157 43 0 chr5 16599427 16599497 -135937762 + ORR1D1 LTR MaLR 43 115 -259 1 711 380 370 92 39 chr5 16599493 16599774 -135937485 + MT2A LTR ERVL 153 448 -85 1 711 3322 41 2 0 chr5 16611689 16612083 -135925176 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 1 711 9540 17 0 4 chr5 16612086 16613185 -135924074 - MTA_Mm-int LTR MaLR -3 1095 1 1 711 3410 28 2 0 chr5 16613185 16613580 -135923679 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 711 716 272 176 20 chr5 16614994 16615238 -135922021 - MTD LTR MaLR -22 397 116 1 711 305 350 146 33 chr5 16620173 16620536 -135916723 + MLT1F LTR MaLR 73 476 -72 1 711 780 273 70 113 chr5 16622652 16622729 -135914530 - MT2B2 LTR ERVL -1 583 531 1 711 780 273 70 113 chr5 16622764 16623083 -135914176 - MT2B2 LTR ERVL -54 530 204 1 711 377 145 211 0 chr5 16623088 16623164 -135914095 - MT2B2 LTR ERVL -441 92 1 1 711 322 138 19 1 chr5 16623365 16623417 -135913842 - ORR1B1 LTR MaLR 0 367 316 1 711 750 169 18 8 chr5 16623690 16623833 -135913426 - ORR1B1 LTR MaLR -30 364 218 1 711 1070 230 14 69 chr5 16624028 16624303 -135912956 - ORR1B1 LTR MaLR -134 260 1 1 711 1478 95 39 9 chr5 16625389 16625622 -135911637 - RLTR27 LTR ERVK -2 307 68 1 711 855 293 81 39 chr5 16629185 16629519 -135907740 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 27 1 711 386 318 101 58 chr5 16631860 16632117 -135905142 - RMER2 LTR ERV1 0 567 300 1 711 361 345 17 8 chr5 16640454 16640574 -135896685 + MER54A LTR ERVL 303 423 -478 1 711 1304 294 64 0 chr5 16645771 16646115 -135891144 - MTC LTR MaLR 0 421 56 1 712 433 306 72 5 chr5 16647509 16647716 -135889543 + HERVL40-int LTR ERVL 5277 5497 -33 1 712 1267 246 29 93 chr5 16649983 16650507 -135886752 + RMER13B LTR ERVK 410 899 -9 1 712 269 319 10 21 chr5 16650625 16650721 -135886538 - RMER15 LTR ERVL -156 419 325 2 712 4285 175 35 81 chr5 16652149 16653095 -135884164 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 2 712 4773 139 65 46 chr5 16653956 16654896 -135882363 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 2 712 2301 191 30 19 chr5 16669150 16669691 -135867568 - RLTR31_Mur LTR ERVK -6 555 1 2 712 3229 41 8 0 chr5 16675455 16675848 -135861411 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 712 322 344 18 78 chr5 16679498 16679665 -135857594 - LTR40a LTR ERVL -335 184 28 2 712 1048 194 116 59 chr5 16684835 16685223 -135852036 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 712 2698 221 11 14 chr5 16702119 16702820 -135834439 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4487 1274 453 2 712 2008 205 78 59 chr5 16702825 16702874 -135834385 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 53 -507 2 712 2008 205 78 59 chr5 16703675 16704062 -135833197 + RLTR20B2 LTR ERVK 54 451 -109 2 712 2008 205 78 59 chr5 16704122 16704213 -135833046 + RLTR20B2 LTR ERVK 452 538 -22 2 712 3936 186 69 62 chr5 16705384 16706115 -135831144 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 5 1358 -1484 2 712 3936 182 70 64 chr5 16706262 16706486 -135830773 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 738 932 -1394 2 712 5774 176 64 2 chr5 16706492 16706610 -135830649 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1067 1199 -1127 2 712 5774 176 64 2 chr5 16706683 16707751 -135829508 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1200 2325 -1 2 712 384 99 111 14 chr5 16707751 16707823 -135829436 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 79 -481 2 712 1331 214 62 29 chr5 16707814 16708029 -135829230 + RLTR20B1 LTR ERVK 246 471 -92 2 712 1331 214 62 29 chr5 16708068 16708160 -135829099 + RLTR20B1 LTR ERVK 472 563 0 2 712 2079 223 74 4 chr5 16708160 16708659 -135828600 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5226 535 2 2 712 1150 274 56 58 chr5 16708662 16709204 -135828055 - MT2B LTR ERVL -2 599 5 2 712 489 360 32 47 chr5 16755248 16755525 -135781734 + LTR85a LTR Gypsy? 394 666 -36 3 712 2748 188 14 23 chr5 16760201 16760772 -135776487 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 3 3 712 2997 21 0 0 chr5 16771718 16772055 -135765204 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 3 712 20263 13 1 0 chr5 16772055 16774411 -135762848 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4123 3 712 886 73 24 0 chr5 16774413 16774536 -135762723 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 3 712 1741 111 4 4 chr5 16774533 16774795 -135762464 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 3 712 424 38 0 0 chr5 16774794 16774847 -135762412 - IAPEz-int LTR ERVK -5070 1411 1359 3 712 4687 56 5 33 chr5 16774847 16775512 -135761747 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 17 3 712 2982 18 3 0 chr5 16775535 16775871 -135761388 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 3 713 351 241 126 29 chr5 16781806 16781981 -135755278 - RLTR16 LTR ERVK -299 206 15 3 713 3993 98 66 90 chr5 16783099 16783868 -135753391 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 3 713 241 248 47 47 chr5 16787076 16787219 -135750040 - RMER17D LTR ERVK -430 459 317 3 713 241 248 47 47 chr5 16787266 16787355 -135749904 - RMER17D LTR ERVK -573 316 227 3 713 1906 190 146 82 chr5 16791882 16792456 -135744803 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 713 359 331 60 34 chr5 16803464 16803733 -135733526 + MLT1B LTR MaLR 3 278 -112 3 713 269 266 78 39 chr5 16804228 16804357 -135732902 - LTR40b LTR ERVL -62 400 267 3 713 345 318 147 15 chr5 16816676 16816874 -135720385 + MLT1A0 LTR MaLR 142 365 0 4 713 3507 19 139 0 chr5 16818667 16819100 -135718159 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 713 46882 17 9 0 chr5 16819100 16824414 -135712845 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 4 713 367 179 46 35 chr5 16824414 16824501 -135712758 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 4 713 314 0 0 0 chr5 16824501 16824539 -135712720 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 4 713 3535 21 136 0 chr5 16824539 16824973 -135712286 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 713 3367 25 5 0 chr5 16829189 16829583 -135707676 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 713 785 311 43 47 chr5 16834517 16834866 -135702393 + MLT1A0 LTR MaLR 8 399 -9 4 713 2569 64 0 0 chr5 16836955 16837266 -135699993 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 4 713 1879 216 63 78 chr5 16854699 16855187 -135682072 - RLTR19 LTR ERVK -18 481 1 4 713 3296 35 5 18 chr5 16857060 16857461 -135679798 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 713 8361 66 6 2 chr5 16857461 16858554 -135678705 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 713 3223 46 15 3 chr5 16858554 16858945 -135678314 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 713 918 108 44 13 chr5 16860273 16860432 -135676827 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 227 4 713 2452 47 3 6 chr5 16860498 16860817 -135676442 - RLTR10 LTR ERVK -72 318 1 4 713 10453 91 66 52 chr5 16860819 16862737 -135674522 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 4 713 933 102 44 13 chr5 16862747 16862906 -135674353 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 227 4 713 2452 47 3 6 chr5 16862972 16863291 -135673968 - RLTR10 LTR ERVK -72 318 1 4 713 726 302 103 9 chr5 16865523 16865844 -135671415 + MER31A LTR ERV1 1 351 -134 4 713 705 257 17 84 chr5 16867350 16867588 -135669671 + RMER15 LTR ERVL 41 262 -313 4 713 1818 208 137 52 chr5 16869034 16869856 -135667403 + RMER6C LTR ERVK 1 718 -38 4 713 408 222 42 85 chr5 16871680 16871699 -135665560 + MT2B LTR ERVL 151 164 -437 4 713 1434 239 41 113 chr5 16877631 16878169 -135659090 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 4 713 1926 79 27 67 chr5 16885132 16885429 -135651830 - ORR1A1 LTR MaLR -61 285 1 4 713 390 224 0 0 chr5 16885429 16885514 -135651745 - RLTR19 LTR ERVK -409 90 6 4 713 922 257 133 54 chr5 16888822 16889437 -135647822 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 537 -16 4 713 264 280 75 57 chr5 16892698 16892804 -135644455 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 300 5 713 1899 176 14 81 chr5 16893708 16894128 -135643131 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 5 713 1756 118 63 47 chr5 16903777 16904096 -135633163 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 3 5 713 812 216 12 6 chr5 16907157 16907320 -135629939 - RLTR18 LTR ERVK -447 169 6 5 714 766 197 52 47 chr5 16913575 16913771 -135623488 + MLT1E LTR MaLR 80 277 -376 5 714 237 400 34 14 chr5 16913840 16913987 -135623272 + MLT1E LTR MaLR 504 653 0 5 714 590 231 186 61 chr5 16916209 16916536 -135620723 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 714 8523 259 63 22 chr5 16917045 16920389 -135616870 - ETnERV2-int LTR ERVK -1202 6204 1939 5 714 2647 307 42 47 chr5 16921104 16922645 -135614614 - ETnERV2-int LTR ERVK -4951 2455 328 5 714 436 292 31 49 chr5 16922934 16923096 -135614163 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 210 5 714 1178 108 23 0 chr5 16930289 16930465 -135606794 + ORR1B1 LTR MaLR 215 394 0 5 714 2008 147 0 50 chr5 16938790 16939133 -135598126 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 714 833 145 71 88 chr5 16940673 16940855 -135596404 - ORR1C1 LTR MaLR 0 367 189 5 714 677 274 64 70 chr5 16940855 16941018 -135596241 + RLTR15 LTR ERVK 1 167 -192 5 714 3382 30 5 0 chr5 16941018 16941412 -135595847 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 714 677 274 64 70 chr5 16941412 16941578 -135595681 + RLTR15 LTR ERVK 168 328 -31 5 714 921 169 18 114 chr5 16941595 16941822 -135595437 - ORR1C1 LTR MaLR -173 205 1 5 714 561 256 148 94 chr5 16942126 16942424 -135594835 - ORR1E LTR MaLR -42 317 4 5 714 3074 63 0 15 chr5 16946988 16947390 -135589869 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 714 2632 196 39 13 chr5 16948473 16948924 -135588335 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 465 -95 5 714 2632 196 39 13 chr5 16948965 16949056 -135588203 + RLTR20B2 LTR ERVK 466 556 -4 5 714 6500 179 52 142 chr5 16952317 16954124 -135583135 - ORR1B1-int LTR MaLR -317 1646 3 5 714 1525 225 39 36 chr5 16954123 16954480 -135582779 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 714 350 274 55 51 chr5 16954480 16954660 -135582599 + RLTR17 LTR ERVK 27 258 -434 5 714 3812 169 26 13 chr5 16965859 16966542 -135570717 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 6 714 382 295 22 58 chr5 16971188 16971325 -135565934 - MT2B LTR ERVL -323 278 147 6 714 2656 239 101 13 chr5 16971481 16972312 -135564947 + RMER13B LTR ERVK 5 908 0 6 714 925 193 154 210 chr5 16975089 16975256 -135562003 - RMER6B LTR ERVK -17 444 254 6 714 925 193 154 210 chr5 16975403 16975701 -135561558 - RMER6B LTR ERVK -208 253 5 6 714 2000 197 85 42 chr5 16976000 16976380 -135560879 - RLTR19 LTR ERVK -7 492 91 6 714 2608 79 6 0 chr5 16976380 16976723 -135560536 - ORR1A1 LTR MaLR -1 345 1 6 714 12464 77 25 3 chr5 16976723 16978477 -135558782 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 6 714 2562 65 27 0 chr5 16978477 16978814 -135558445 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 714 2000 197 85 42 chr5 16978814 16978903 -135558356 - RLTR19 LTR ERVK -409 90 3 6 714 3450 27 0 192 chr5 16979757 16980345 -135556914 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 714 1624 232 57 107 chr5 16980550 16981075 -135556184 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 6 714 471 191 0 9 chr5 16999894 17000000 -135537259 + RLTR19-int LTR ERVK 1429 1533 -4604 6 714 2789 125 17 15 chr5 17000000 17000478 -135536781 + RLTR19-int LTR ERVK 1534 2012 -4125 1 714 1605 249 25 50 chr5 17001357 17001842 -135535417 - RMER19C LTR ERVK -1 610 138 2 714 303 303 53 33 chr5 17005964 17006114 -135531145 + LTR88a LTR Gypsy 648 800 -16 4 714 3119 217 128 31 chr5 17007100 17007822 -135529437 + RLTR25B LTR ERVK 1 816 -212 5 714 3119 217 128 31 chr5 17007927 17008111 -135529148 + RLTR25B LTR ERVK 817 995 -33 5 714 1794 256 117 46 chr5 17013934 17014568 -135522691 - RMER17B LTR ERVK -279 679 1 2 714 2349 165 128 90 chr5 17020686 17021332 -135515927 + RMER6C LTR ERVK 5 675 -15 3 714 1590 193 63 18 chr5 17021812 17022144 -135515115 - ORR1B2 LTR MaLR -20 347 1 3 714 1277 253 142 19 chr5 17022144 17022556 -135514703 - RMER15 LTR ERVL -90 485 23 4 714 423 310 0 0 chr5 17027332 17027432 -135509827 + MTD LTR MaLR 18 117 -302 4 714 375 72 0 35 chr5 17030117 17030175 -135507084 + ORR1A4 LTR MaLR 1 56 -273 5 714 627 135 0 0 chr5 17030175 17030271 -135506988 + ORR1A4 LTR MaLR 220 315 -14 5 714 594 348 48 18 chr5 17032083 17032414 -135504845 + LTR41 LTR ERVL 422 762 -6 5 715 3186 56 2 2 chr5 17043227 17043621 -135493638 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 7 715 7099 92 12 70 chr5 17043623 17044788 -135492471 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 7 715 3055 64 8 2 chr5 17044788 17045182 -135492077 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 715 400 295 109 70 chr5 17055927 17056211 -135481048 - MTEa LTR MaLR -58 321 27 9 715 1179 301 92 33 chr5 17056601 17057089 -135480170 - MT2A LTR ERVL -14 519 3 9 715 302 329 92 70 chr5 17068751 17069082 -135468177 - MLT1B LTR MaLR -21 369 39 1 715 302 329 92 70 chr5 17069120 17069147 -135468112 - MLT1B LTR MaLR -352 38 4 1 715 3228 21 21 3 chr5 17076268 17076655 -135460604 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 1 715 253 276 14 86 chr5 17083908 17084047 -135453212 - RMER17D LTR ERVK -374 515 387 1 715 3630 104 51 5 chr5 17096499 17097050 -135440209 - MT2B2 LTR ERVL -8 576 1 1 715 1933 211 71 2 chr5 17110663 17111057 -135426202 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 715 1656 167 0 108 chr5 17127830 17128199 -135409060 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 715 230 327 87 94 chr5 17130159 17130436 -135406823 + MLT1D LTR MaLR 3 277 -228 1 715 537 245 75 37 chr5 17130441 17130602 -135406657 - MTEa LTR MaLR -8 371 205 1 715 2964 65 31 5 chr5 17133141 17133527 -135403732 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 715 2779 72 33 10 chr5 17136113 17136504 -135400755 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 715 261 187 62 74 chr5 17137896 17137977 -135399282 - RLTR25A LTR ERVK -433 670 591 1 715 360 342 109 10 chr5 17151877 17152069 -135385190 - MTE2b LTR MaLR -2 377 167 1 715 2696 201 31 23 chr5 17152107 17152662 -135384597 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 559 -4 1 715 307 264 0 0 chr5 17152663 17152735 -135384524 - MTE2b LTR MaLR -250 129 58 1 715 256 312 54 0 chr5 17152735 17152828 -135384431 - MTE2b LTR MaLR -281 98 1 1 715 529 261 108 0 chr5 17157326 17157456 -135379803 + MTD LTR MaLR 208 351 -68 2 715 269 346 19 9 chr5 17163683 17163788 -135373471 + ORR1E LTR MaLR 1 106 -253 2 716 590 194 108 36 chr5 17170747 17170886 -135366373 - MTE2a LTR MaLR 0 379 231 2 716 2770 55 6 0 chr5 17179197 17179541 -135357718 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 716 3011 50 5 33 chr5 17182688 17183085 -135354174 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 3 2 716 2796 18 2 227 chr5 17187969 17188472 -135348787 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 716 8012 50 8 8 chr5 17188473 17189486 -135347773 + RLTR10-int LTR ERVK 9 998 -989 2 716 366 258 39 15 chr5 17189550 17189680 -135347579 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 2 716 8810 18 0 0 chr5 17189763 17190756 -135346503 + RLTR10-int LTR ERVK 992 1984 -3 2 716 2796 18 2 227 chr5 17190758 17191261 -135345998 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 716 290 375 72 24 chr5 17207052 17207215 -135330044 + MLT1D LTR MaLR 9 177 -328 2 716 290 375 72 24 chr5 17207296 17207463 -135329796 + MLT1D LTR MaLR 178 354 -151 2 716 1381 161 5 5 chr5 17232010 17232234 -135305025 - MTC LTR MaLR 0 421 198 2 716 963 192 100 10 chr5 17232706 17232906 -135304353 - MTC LTR MaLR -203 218 1 2 716 2328 131 18 26 chr5 17238499 17238968 -135298291 + RMER17A LTR ERVK 2 481 -328 2 716 2470 181 129 29 chr5 17241103 17241730 -135295529 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 716 697 318 71 0 chr5 17244180 17244447 -135292812 + MER73 LTR ERVL 3 288 -356 3 716 337 343 75 48 chr5 17244500 17244727 -135292532 + MER73 LTR ERVL 409 641 -3 3 716 1830 199 54 56 chr5 17255565 17256012 -135281247 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 716 2296 155 39 51 chr5 17256906 17257252 -135280007 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 88 3 716 4823 151 39 48 chr5 17257252 17258168 -135279091 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 3 716 2296 155 39 51 chr5 17258168 17258256 -135279003 - RLTR23 LTR ERV1 -343 87 1 3 716 3681 150 68 21 chr5 17268500 17269160 -135268099 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 2 3 716 525 360 35 32 chr5 17269705 17269989 -135267270 + MLT1A LTR MaLR 32 316 -58 3 716 2346 161 106 48 chr5 17270795 17271331 -135265928 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 3 716 385 354 88 37 chr5 17274758 17275054 -135262205 - ORR1E LTR MaLR -48 311 1 3 716 699 271 40 106 chr5 17280333 17280606 -135256653 + LTRIS4 LTR ERV1 265 519 0 3 716 307 268 51 87 chr5 17280673 17280869 -135256390 + MuRRS4-int LTR ERV1 77 265 -7513 3 716 1273 240 59 8 chr5 17281340 17281663 -135255596 + MuRRS4-int LTR ERV1 374 682 -6924 3 716 4499 121 42 15 chr5 17281698 17282428 -135254831 + RMER16-int LTR ERVK 678 1427 -3979 3 716 343 123 0 58 chr5 17282420 17282489 -135254770 + MuRRS4-int LTR ERV1 734 798 -4265 3 716 1164 258 14 7 chr5 17282702 17282999 -135254260 + MuRRS4-int LTR ERV1 1000 1298 -3765 3 716 434 173 55 46 chr5 17283000 17283109 -135254150 + MURVY-LTR LTR ERV1 410 519 0 3 716 1948 173 67 26 chr5 17283840 17284231 -135253028 - RLTR9B2 LTR ERVK -13 407 1 3 716 339 130 68 68 chr5 17284232 17284306 -135252953 - ETnERV2-int LTR ERVK -2 7404 7331 3 716 1548 148 127 30 chr5 17284517 17284887 -135252372 + RLTR9E LTR ERVK 1 406 -3 3 716 260 237 26 0 chr5 17284891 17284967 -135252292 - ETnERV2-int LTR ERVK -992 6414 6337 3 716 737 191 52 29 chr5 17284967 17285140 -135252119 + RLTR9B2 LTR ERVK 156 332 -88 3 716 504 200 0 0 chr5 17285434 17285534 -135251725 + RLTR9B2 LTR ERVK 338 437 0 3 717 279 302 67 25 chr5 17304388 17304497 -135232762 + MTD LTR MaLR 1 114 -305 4 717 552 227 52 7 chr5 17304497 17304644 -135232615 + ORR1C1 LTR MaLR 1 153 -221 4 717 1156 178 74 4 chr5 17304650 17304892 -135232367 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 259 -1250 4 717 2840 251 93 35 chr5 17311832 17312711 -135224548 + ORR1C1-int LTR MaLR 295 1224 -146 4 717 676 168 22 22 chr5 17313551 17313684 -135223575 + ORR1C1-int LTR MaLR 1372 1504 -5 4 717 1652 191 69 6 chr5 17313684 17314032 -135223227 + ORR1C1 LTR MaLR 1 370 -8 4 717 469 297 0 82 chr5 17314043 17314201 -135223058 + MTC LTR MaLR 117 261 -160 4 717 226 226 129 0 chr5 17314247 17314309 -135222950 + MTC LTR MaLR 294 363 -56 4 717 1834 209 134 56 chr5 17338893 17339533 -135197726 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 717 247 270 42 67 chr5 17353273 17353392 -135183867 - RMER12 LTR ERVK -477 845 730 4 717 1952 129 45 6 chr5 17357768 17358080 -135179179 + ORR1A3 LTR MaLR 3 326 0 4 717 406 269 45 40 chr5 17361136 17361487 -135175772 - IAPEz-int LTR ERVK -2839 3642 3522 4 717 1985 182 42 0 chr5 17365221 17365599 -135171660 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 717 1942 153 3 59 chr5 17370887 17371228 -135166031 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 4 717 234 310 59 12 chr5 17374426 17374511 -135162748 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1298 1386 -462 4 717 1982 179 268 9 chr5 17379142 17379690 -135157569 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 717 236 241 0 18 chr5 17380785 17380840 -135156419 - MER21B LTR ERV1 -137 726 673 5 717 295 328 172 47 chr5 17380937 17381385 -135155874 + LTR31 LTR ERV1 106 610 -9 5 717 382 358 105 41 chr5 17381390 17381684 -135155575 - MER21B LTR ERV1 -165 698 386 5 717 674 266 216 1 chr5 17385064 17385338 -135151921 + MER90a LTR ERV1 40 358 -217 5 717 253 364 21 0 chr5 17385408 17385548 -135151711 + MLT1A0 LTR MaLR 1 143 -222 5 717 475 238 10 0 chr5 17406247 17406348 -135130911 - RMER6A LTR ERVK 0 756 655 5 717 2588 213 111 26 chr5 17406349 17407023 -135130236 - RMER13B LTR ERVK -100 808 91 5 717 963 172 0 0 chr5 17408445 17408598 -135128661 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 177 5 717 816 198 3 106 chr5 17408598 17408880 -135128379 + RMER17C LTR ERVK 1 253 -157 5 717 271 331 38 132 chr5 17415044 17415256 -135122003 + MER77 LTR ERVL 412 603 -4 5 717 775 311 56 63 chr5 17415083 17415402 -135121857 + MER21B LTR ERV1 415 731 -132 5 717 3113 40 25 12 chr5 17427952 17428358 -135108901 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 89 475 313 75 43 chr5 17432389 17432766 -135104493 + RLTR16 LTR ERVK 1 490 -38 5 718 507 251 49 68 chr5 17433712 17433917 -135103342 + RMER3D-int LTR ERVK 159 359 -2483 5 718 454 148 0 36 chr5 17434071 17434155 -135103104 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1094 -1748 5 718 1379 178 7 39 chr5 17434705 17435010 -135102249 + RMER3D-int LTR ERVK 1084 1378 -1464 5 718 3599 101 38 25 chr5 17435033 17435593 -135101666 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 5 718 813 245 60 44 chr5 17435594 17435846 -135101413 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 288 543 -1783 5 718 830 248 91 55 chr5 17435860 17436167 -135101092 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 616 933 -1393 5 718 334 119 60 0 chr5 17436174 17436241 -135101018 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1069 1139 -1187 5 718 3523 196 68 35 chr5 17436654 17437574 -135099685 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1374 2687 -155 5 718 2593 108 16 138 chr5 17437574 17438067 -135099192 + RLTR10C LTR ERVK 4 436 0 5 718 3523 183 63 24 chr5 17438067 17438090 -135099169 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2156 2177 -149 5 718 2823 82 5 13 chr5 17438090 17438487 -135098772 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 5 718 3523 183 63 24 chr5 17438487 17438575 -135098684 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2178 2257 -69 5 718 323 317 60 60 chr5 17440098 17440313 -135096946 + RLTR16 LTR ERVK 41 255 -250 5 718 468 364 67 4 chr5 17441244 17441498 -135095761 - MER21-int LTR ERV1 -885 3306 3037 5 718 292 260 129 58 chr5 17444553 17444692 -135092567 - ORR1D2 LTR MaLR -10 360 212 5 718 344 315 45 45 chr5 17444760 17445029 -135092230 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 73 5 718 263 258 29 29 chr5 17445686 17445754 -135091505 - ORR1D2 LTR MaLR -269 90 23 5 718 2191 184 93 75 chr5 17451903 17452579 -135084680 + RMER6C LTR ERVK 1 688 -2 6 718 1515 171 11 19 chr5 17456002 17456291 -135080968 - ORR1A2 LTR MaLR -61 333 14 6 718 296 353 10 0 chr5 17460905 17461007 -135076252 + MLT1B LTR MaLR 199 301 -89 6 718 286 236 27 14 chr5 17461044 17461117 -135076142 + MER68 LTR ERVL 486 559 -4 6 718 252 254 44 15 chr5 17461318 17461386 -135075873 + MLT1B LTR MaLR 392 461 -6 6 718 469 332 135 52 chr5 17461679 17461968 -135075291 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 92 6 718 352 331 159 6 chr5 17462223 17462393 -135074866 - MLT2B1 LTR ERVL -127 393 198 6 718 1926 176 49 44 chr5 17464247 17464652 -135072607 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 718 339 274 12 0 chr5 17469675 17469759 -135067500 + MTE2b LTR MaLR 204 288 -91 6 718 1040 121 60 6 chr5 17477198 17477364 -135059895 + MTB LTR MaLR 222 396 0 6 718 7329 78 70 6 chr5 17477364 17478396 -135058863 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 6 718 2759 86 44 0 chr5 17478396 17478779 -135058480 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 718 474 244 154 49 chr5 17484172 17484393 -135052866 - LTRIS5 LTR ERV1 0 482 237 6 718 4086 69 25 35 chr5 17484891 17485461 -135051798 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 6 718 2504 189 21 60 chr5 17485587 17486122 -135051137 - RMER20A LTR ERVK -1 515 2 6 718 609 250 11 27 chr5 17486737 17486922 -135050337 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6369 6 718 467 191 175 54 chr5 17486937 17487103 -135050156 - RLTR19-int LTR ERVK -2464 3673 3488 6 718 1247 226 72 73 chr5 17487404 17488143 -135049116 - MYSERV6-int LTR ERVK -388 8571 8092 6 718 249 260 27 27 chr5 17503491 17503566 -135033693 - RMER20B LTR ERVK -31 596 522 6 718 5285 115 71 15 chr5 17510634 17511492 -135025767 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 1 718 401 232 168 85 chr5 17523596 17523936 -135013323 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 718 1984 170 19 22 chr5 17533298 17533665 -135003594 - RLTR17 LTR ERVK -326 366 1 4 718 7274 191 65 56 chr5 17533667 17535806 -135001453 - RMER3D-int LTR ERVK -2 2840 163 4 718 2922 40 184 0 chr5 17535843 17536244 -135001015 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 718 1799 176 208 15 chr5 17536317 17536731 -135000528 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 198 4 718 409 332 48 52 chr5 17537654 17537864 -134999395 + MLT1A0 LTR MaLR 157 365 0 5 718 263 311 21 39 chr5 17542543 17542649 -134994610 + MLT1E3 LTR MaLR 426 531 -122 5 718 1256 238 50 100 chr5 17545052 17545271 -134991988 - MTD LTR MaLR -2 417 188 6 718 1256 238 50 100 chr5 17545417 17545636 -134991623 - MTD LTR MaLR -232 187 1 6 718 758 250 78 43 chr5 17546213 17546512 -134990747 - MT2B LTR ERVL -89 512 174 6 718 590 208 0 19 chr5 17548022 17548130 -134989129 - MT2B LTR ERVL -415 118 13 6 718 360 326 52 128 chr5 17552648 17552692 -134984567 - ORR1E LTR MaLR -5 365 320 7 718 496 322 26 128 chr5 17552893 17553171 -134984088 - ORR1E LTR MaLR -54 316 61 7 718 328 282 87 81 chr5 17554474 17554659 -134982600 + RMER21B LTR ERV1 322 507 -335 8 718 275 294 45 34 chr5 17554698 17554786 -134982473 + RMER21B LTR ERV1 630 718 -124 8 718 1069 314 104 12 chr5 17554806 17555219 -134982040 - MLT2C2 LTR ERVL -11 453 3 8 718 1784 132 54 63 chr5 17556478 17556810 -134980449 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 8 718 1129 261 52 57 chr5 17558712 17559081 -134978178 + MTEb LTR MaLR 9 375 -4 8 718 363 263 42 0 chr5 17560078 17560173 -134977086 - MLT1B LTR MaLR -5 385 287 8 718 745 196 111 20 chr5 17562726 17562924 -134974335 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 808 9 719 2027 173 70 20 chr5 17566737 17567138 -134970121 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 719 712 234 12 6 chr5 17567138 17567310 -134969949 + MTC-int LTR MaLR 3 175 -1083 9 719 4223 179 54 57 chr5 17568171 17569082 -134968177 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 1 719 2510 206 29 31 chr5 17572732 17573313 -134963946 + MTC-int LTR MaLR 520 1099 -159 9 719 452 209 25 68 chr5 17582132 17582321 -134954938 - RLTR9A LTR ERVK -2 435 255 1 719 823 151 0 0 chr5 17582316 17582442 -134954817 + RMER2 LTR ERV1 442 567 0 1 719 1661 162 18 51 chr5 17582456 17582843 -134954416 - RMER3D-int LTR ERVK -1456 1386 1022 1 719 16860 143 79 72 chr5 17584284 17587976 -134949283 - RMER16-int LTR ERVK -1201 6205 319 1 719 1571 210 101 34 chr5 17587976 17588255 -134949004 + RLTR41 LTR ERV1 1 305 -141 1 719 1792 155 62 89 chr5 17588255 17588659 -134948600 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 1 719 1571 210 101 34 chr5 17588659 17588797 -134948462 + RLTR41 LTR ERV1 306 445 -1 1 719 235 347 84 50 chr5 17589190 17589369 -134947890 + LTR16A LTR ERVL 218 402 -49 1 719 717 253 31 122 chr5 17589775 17590095 -134947164 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 78 1 719 427 331 112 48 chr5 17593993 17594288 -134942971 + ORR1E LTR MaLR 1 314 -45 1 719 1208 186 33 72 chr5 17599248 17599583 -134937676 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 719 269 322 57 27 chr5 17599868 17600130 -134937129 + RLTR15 LTR ERVK 72 341 -18 1 719 2154 201 35 112 chr5 17600181 17600843 -134936416 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 719 2386 181 46 49 chr5 17607465 17608373 -134928886 + RMER17D2 LTR ERVK 1 889 0 1 719 905 240 17 0 chr5 17612076 17612255 -134925004 + ORR1D1 LTR MaLR 193 374 0 1 719 490 225 92 122 chr5 17612370 17612464 -134924795 - RMER12 LTR ERVK -104 1218 1139 1 719 4196 130 31 73 chr5 17612464 17613304 -134923955 + RMER17D2 LTR ERVK 1 805 -4 1 719 490 225 92 122 chr5 17613304 17613447 -134923812 - RMER12 LTR ERVK -184 1138 988 1 719 1236 242 63 99 chr5 17613730 17614589 -134922670 - RMER12 LTR ERVK -969 839 41 1 719 572 289 50 25 chr5 17620716 17620918 -134916341 + MTEa LTR MaLR 168 374 -5 1 719 3284 81 11 15 chr5 17626826 17627303 -134909956 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 719 4883 72 5 49 chr5 17627305 17628025 -134909234 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 1 719 968 59 0 0 chr5 17628025 17628144 -134909115 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 1 719 1854 99 8 0 chr5 17628139 17628391 -134908868 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 1 719 15197 38 3 1 chr5 17628409 17630208 -134907051 + IAPEz-int LTR ERVK 4678 6481 0 1 719 3249 85 11 15 chr5 17630208 17630685 -134906574 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 719 284 377 57 10 chr5 17631183 17631392 -134905867 + LTR16A1 LTR ERVL 238 456 0 1 719 228 304 25 0 chr5 17633571 17633650 -134903609 - MLT1-int LTR MaLR -329 1042 962 1 719 795 179 8 0 chr5 17635708 17635831 -134901428 - ETnERV2-int LTR ERVK -213 7193 7070 1 719 750 324 86 18 chr5 17635851 17636190 -134901069 + ORR1D2 LTR MaLR 1 362 -8 1 719 1020 254 52 38 chr5 17638546 17638833 -134898426 + MTD LTR MaLR 92 382 -37 1 719 3175 166 27 93 chr5 17638834 17639573 -134897686 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 1 719 2574 180 54 15 chr5 17639580 17640099 -134897160 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 23 1 719 4613 124 11 52 chr5 17646554 17647398 -134889861 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 2 719 293 375 112 6 chr5 17655501 17655662 -134881597 - LTR33 LTR ERVL -337 178 1 2 719 384 349 59 14 chr5 17660055 17660276 -134876983 - ERVL-E-int LTR ERVL -1134 4533 4303 2 719 333 342 8 8 chr5 17660277 17660420 -134876839 - ERVL-E-int LTR ERVL -1381 4376 4159 2 719 631 370 69 25 chr5 17661685 17662209 -134875050 - ERVL-E-int LTR ERVL -2835 2832 2286 2 719 1814 201 128 106 chr5 17664132 17664548 -134872711 - RMER6D LTR ERVK 0 720 347 2 719 1814 201 128 106 chr5 17664668 17664953 -134872306 - RMER6D LTR ERVK -374 346 1 2 719 4390 128 113 79 chr5 17664953 17665523 -134871736 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 2551 2 719 4390 128 113 79 chr5 17665584 17665944 -134871315 - RMER6-int LTR ERVK 0 2550 2153 2 719 1117 179 9 37 chr5 17665944 17666159 -134871100 - RMER6C LTR ERVK 0 690 482 2 719 1892 174 56 0 chr5 17666234 17666573 -134870686 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 142 2 719 1031 210 203 3 chr5 17668679 17668985 -134868274 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 719 502 295 52 36 chr5 17669212 17669462 -134867797 - MER31-int LTR ERV1 -45 4891 4638 2 719 374 305 82 41 chr5 17669577 17669748 -134867511 - MER31-int LTR ERV1 -374 4562 4385 2 719 1464 231 17 17 chr5 17669875 17670223 -134867036 - MER31-int LTR ERV1 -996 3940 3593 2 719 987 272 72 69 chr5 17673492 17673812 -134863447 + MTEa LTR MaLR 5 325 -54 2 719 267 200 14 58 chr5 17674060 17674129 -134863130 + MTEa LTR MaLR 314 379 0 2 719 287 299 103 93 chr5 17685347 17685661 -134851598 - ORR1E LTR MaLR -36 290 3 2 719 3200 23 59 0 chr5 17687532 17687920 -134849339 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 719 702 239 158 10 chr5 17688206 17688409 -134848850 - ORR1D1 LTR MaLR -141 233 1 2 719 651 367 34 53 chr5 17694136 17694493 -134842766 - MLT2B1 LTR ERVL -166 354 5 2 720 1341 249 144 3 chr5 17697980 17698347 -134838912 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 720 472 270 0 0 chr5 17708316 17708416 -134828843 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3039 2675 2576 2 720 377 280 48 42 chr5 17708458 17708644 -134828615 - MLT2B4 LTR ERVL -61 495 196 2 720 4638 166 32 28 chr5 17708646 17709478 -134827781 + RMER13A LTR ERVK 1 836 -24 2 720 3354 28 89 5 chr5 17720674 17721112 -134816147 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 720 2015 125 16 73 chr5 17722843 17722922 -134814337 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 285 3 720 2015 125 16 73 chr5 17723069 17723370 -134813889 - RLTR15 LTR ERVK -75 284 1 3 720 1901 211 38 20 chr5 17727743 17728135 -134809124 + RLTR18B LTR ERVK 1 399 -113 3 720 745 275 36 52 chr5 17730251 17730500 -134806759 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 126 3 720 721 300 72 60 chr5 17730511 17730769 -134806490 + ORR1D2 LTR MaLR 3 274 -110 3 720 970 269 112 39 chr5 17730770 17731056 -134806203 - MTD LTR MaLR -26 393 81 3 720 378 252 29 10 chr5 17731617 17731721 -134805538 - MTD LTR MaLR -304 115 10 3 720 245 351 82 48 chr5 17731887 17732243 -134805016 + RMER5 LTR ERV1 41 408 -126 3 720 437 261 112 68 chr5 17732803 17733068 -134804191 - RLTR16 LTR ERVK -243 262 6 3 720 695 244 36 18 chr5 17737271 17737438 -134799821 + MTEb LTR MaLR 1 170 -209 3 720 449 267 212 29 chr5 17745978 17746148 -134791111 - MTEb LTR MaLR -20 359 159 3 720 549 241 87 32 chr5 17748042 17748193 -134789066 - RLTR18-int LTR ERVK -1789 3572 3406 3 720 1868 189 89 87 chr5 17748193 17748721 -134788538 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 3 720 549 241 87 32 chr5 17748721 17748788 -134788471 - RLTR18-int LTR ERVK -1956 3405 3342 3 720 812 300 77 75 chr5 17750264 17750693 -134786566 - RMER10A LTR ERVL -2 440 11 3 720 260 180 16 32 chr5 17753042 17753105 -134784154 + MER4B-int LTR ERV1 1135 1196 -5562 3 720 3880 204 39 85 chr5 17753105 17754124 -134783135 + RLTR25A LTR ERVK 129 1100 -3 3 720 399 360 18 0 chr5 17757292 17757456 -134779803 + MLT1D LTR MaLR 5 171 -334 3 720 2144 124 3 9 chr5 17757460 17757786 -134779473 + ORR1A2 LTR MaLR 3 326 -1 3 720 377 294 78 16 chr5 17757786 17757911 -134779348 + MLT1D LTR MaLR 223 355 -150 3 720 303 242 15 0 chr5 17760782 17760848 -134776411 - MTE2b LTR MaLR -14 365 299 3 720 1856 220 59 68 chr5 17764815 17765326 -134771933 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 590 1 3 720 246 271 81 23 chr5 17765734 17765787 -134771472 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 353 3 720 246 271 81 23 chr5 17765834 17765867 -134771392 - MLT1A1 LTR MaLR -56 352 315 3 720 2838 132 327 4 chr5 17766916 17767473 -134769786 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 3 720 318 332 85 26 chr5 17787621 17787810 -134749449 + MLT2C1 LTR ERVL 120 319 -78 3 720 288 341 125 31 chr5 17788281 17788505 -134748754 + MLT1C LTR MaLR 214 458 -9 3 720 257 346 92 18 chr5 17791804 17791820 -134745439 + MT2B LTR ERVL 145 168 -433 4 720 2016 173 199 19 chr5 17792352 17792934 -134744325 + RMER6C LTR ERVK 4 690 0 4 720 788 255 34 54 chr5 17796369 17796721 -134740538 - RLTR15 LTR ERVK -14 345 1 4 720 318 271 42 0 chr5 17820747 17820843 -134716416 + MER67C LTR ERV1 43 142 -569 4 720 436 300 236 47 chr5 17820894 17821237 -134716022 + MER67C LTR ERV1 234 641 -70 4 720 233 299 24 79 chr5 17825346 17825473 -134711786 + MLT1J LTR MaLR 309 428 -84 4 721 493 259 209 30 chr5 17830888 17831190 -134706069 + ORR1E LTR MaLR 4 359 0 4 721 856 313 47 47 chr5 17850805 17851445 -134685814 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3384 4023 -3558 4 721 407 314 17 23 chr5 17851440 17851613 -134685646 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6898 7069 -512 4 721 1489 169 0 22 chr5 17851747 17852014 -134685245 + MMERVK10C-int LTR ERVK 7321 7581 0 4 721 2334 80 23 3 chr5 17852014 17852317 -134684942 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 4 721 258 291 112 86 chr5 17859162 17859198 -134678061 + MLT1-int LTR MaLR 178 209 -1162 4 721 258 291 112 86 chr5 17859363 17859494 -134677765 + MLT1-int LTR MaLR 210 344 -1027 4 721 3140 20 11 107 chr5 17859494 17859932 -134677327 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 721 258 291 112 86 chr5 17859932 17860029 -134677230 + MLT1-int LTR MaLR 345 450 -921 4 721 304 297 95 43 chr5 17867825 17867941 -134669318 - MLT1A LTR MaLR -16 358 237 5 721 293 275 107 27 chr5 17868003 17868115 -134669144 - MLT1A LTR MaLR -248 126 6 5 721 2044 214 12 27 chr5 17869095 17869576 -134667683 + RMER19C LTR ERVK 138 611 0 5 721 349 300 0 35 chr5 17870379 17870493 -134666766 + MTE2a LTR MaLR 1 110 -269 5 721 658 209 23 55 chr5 17872808 17873026 -134664233 - RMER17C LTR ERVK -199 211 1 5 721 363 318 18 89 chr5 17882791 17882960 -134654299 + MLT1H LTR MaLR 146 302 -247 5 721 1932 171 80 91 chr5 17883813 17884264 -134652995 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 721 904 269 26 30 chr5 17884367 17884670 -134652589 - RLTR6-int LTR ERV1 -76 7702 7401 5 721 264 192 0 0 chr5 17884663 17884715 -134652544 - MuRRS4-int LTR ERV1 -468 4595 4544 5 721 1703 286 71 80 chr5 17884977 17886491 -134650768 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1991 5610 2929 5 721 419 318 92 54 chr5 17886678 17887030 -134650229 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5140 2466 2079 5 721 1016 288 54 21 chr5 17887232 17887658 -134649601 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3319 1744 1305 5 721 2086 132 82 115 chr5 17888944 17889405 -134647854 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 721 610 350 44 27 chr5 17898379 17898717 -134638542 - MLT1C LTR MaLR -8 459 116 5 721 263 268 0 12 chr5 17898875 17898958 -134638301 + MLT1F LTR MaLR 466 547 -1 5 721 238 212 98 41 chr5 17899511 17899634 -134637625 - LTR37A LTR ERV1 -4 422 293 5 721 358 233 57 32 chr5 17899742 17899866 -134637393 - LTR37A LTR ERV1 -299 127 1 5 721 466 328 159 28 chr5 17901787 17902151 -134635108 + MLT1F2 LTR MaLR 3 414 -146 5 721 1639 243 109 49 chr5 17909994 17910570 -134626689 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 721 1715 51 25 25 chr5 17911939 17912179 -134625080 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -82 240 1 5 721 959 253 78 23 chr5 17912420 17912768 -134624491 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 5 721 225 323 42 31 chr5 17915701 17915797 -134621462 + LTR16D LTR ERVL 286 382 -269 5 721 3455 28 0 2 chr5 17917443 17917840 -134619419 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 721 1658 142 114 10 chr5 17928195 17928493 -134608766 - ORR1B1 LTR MaLR -25 369 41 5 721 283 346 15 66 chr5 17928700 17928836 -134608423 - RMER10B LTR ERVL 0 398 270 5 721 329 167 61 0 chr5 17931411 17931477 -134605782 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 460 5 721 1861 113 12 65 chr5 17931497 17931819 -134605440 - RLTR24 LTR ERV1 -175 354 50 5 721 491 264 36 23 chr5 17932716 17932937 -134604322 + LTR37A LTR ERV1 191 414 -12 5 721 243 340 9 36 chr5 17934384 17934494 -134602765 - MLT2B4 LTR ERVL -40 527 421 5 721 600 335 69 11 chr5 17934522 17934797 -134602462 - MLT2B4 LTR ERVL -265 291 1 5 721 1475 176 45 103 chr5 17938372 17938752 -134598507 + ORR1B1 LTR MaLR 29 386 -8 6 721 1202 213 73 26 chr5 17938756 17939069 -134598190 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 328 -1635 6 721 671 280 146 87 chr5 17943582 17943936 -134593323 + MTE2a LTR MaLR 1 374 0 6 721 1678 176 65 55 chr5 17947335 17947738 -134589521 + RMER10A LTR ERVL 1 407 -35 6 721 312 291 130 83 chr5 17949791 17950208 -134587051 + MLT1E1A LTR MaLR 83 635 -45 6 722 1332 282 64 31 chr5 17957061 17957547 -134579712 - RMER5 LTR ERV1 0 534 33 6 722 1406 160 136 71 chr5 17957858 17958167 -134579092 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 722 1968 173 112 5 chr5 17958629 17959047 -134578212 + RLTR13D6 LTR ERVK 77 539 -363 6 722 563 26 0 50 chr5 17959047 17959127 -134578132 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7406 0 6 722 2554 106 29 41 chr5 17959127 17959541 -134577718 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 6 722 1778 185 111 3 chr5 17960321 17960662 -134576597 - ORR1B1 LTR MaLR -16 378 1 6 722 2568 185 41 26 chr5 17960958 17961499 -134575760 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 553 0 6 722 1673 165 87 15 chr5 17964250 17964582 -134572677 + RMER10A LTR ERVL 7 362 -80 6 722 235 229 180 88 chr5 17965647 17965886 -134571373 - RMER6C LTR ERVK -87 603 343 6 722 254 308 0 11 chr5 17967176 17967268 -134569991 + MuRRS4-int LTR ERV1 4360 4450 -3156 6 722 1663 280 19 8 chr5 17967571 17968104 -134569155 + MuRRS4-int LTR ERV1 3533 4015 -1048 6 722 352 298 22 27 chr5 17968930 17969147 -134568112 + MuRRS4-int LTR ERV1 4663 4820 -243 6 722 2635 103 167 0 chr5 17969290 17969746 -134567513 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 532 0 6 722 1294 345 67 51 chr5 17970935 17973542 -134563717 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -2319 5282 2633 6 722 1256 211 24 24 chr5 17974572 17974824 -134562435 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 179 6 722 412 176 149 32 chr5 17974952 17975046 -134562213 - RLTR23 LTR ERV1 -325 105 1 6 722 3118 61 8 2 chr5 17977072 17977466 -134559793 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 722 321 287 64 112 chr5 17979585 17979773 -134557486 + MLT1E2 LTR MaLR 10 188 -439 6 722 1784 137 191 11 chr5 17980600 17980955 -134556304 + MTC LTR MaLR 2 420 -1 6 722 239 395 0 44 chr5 17982643 17982757 -134554502 - MLT1J1 LTR MaLR -294 150 42 6 722 2499 201 112 171 chr5 17984144 17984648 -134552611 - RMER19B LTR ERVK 0 902 448 6 722 2499 201 112 171 chr5 17984675 17985129 -134552130 - RMER19B LTR ERVK -455 447 1 6 722 877 290 206 16 chr5 17987059 17987423 -134549836 - RLTR16 LTR ERVK -72 433 1 6 722 1188 157 110 37 chr5 17991416 17991651 -134545608 + RMER6C LTR ERVK 8 260 -430 6 722 393 263 255 45 chr5 17991651 17991918 -134545341 - RLTR22_Mur LTR ERVK -3 1845 1523 6 722 2601 222 122 40 chr5 17992493 17992856 -134544403 - RLTR22_Mur LTR ERVK -814 994 582 6 722 1862 141 30 72 chr5 17992856 17993284 -134543975 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 722 2601 203 101 37 chr5 17993284 17993828 -134543431 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1267 581 1 6 722 1670 180 86 38 chr5 17993828 17994245 -134543014 + RMER6C LTR ERVK 254 690 0 6 722 4381 126 204 4 chr5 18000487 18001284 -134535975 - RMER17B LTR ERVK -1 957 1 1 722 2026 163 41 0 chr5 18006375 18006743 -134530516 + ORR1B1 LTR MaLR 1 383 -11 9 722 319 306 47 39 chr5 18008871 18009000 -134528259 + RMER10B LTR ERVL 269 398 0 1 722 252 357 116 27 chr5 18009957 18010104 -134527155 + MTD LTR MaLR 1 160 -259 1 722 3230 39 5 0 chr5 18013281 18013664 -134523595 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 2 722 379 264 39 99 chr5 18014354 18014535 -134522724 + RLTR40 LTR ERVK 125 294 -523 2 722 1136 253 169 98 chr5 18017102 18017509 -134519750 + MT2A LTR ERVL 1 436 -97 2 722 3925 206 66 26 chr5 18017788 18018657 -134518602 + RMER13B LTR ERVK 1 903 -5 2 722 632 252 75 0 chr5 18033847 18034006 -134503253 - MTE2a LTR MaLR -3 376 206 4 722 234 312 56 117 chr5 18037812 18038026 -134499233 - MTE2a LTR MaLR -150 209 9 4 722 2580 44 2 191 chr5 18041296 18041773 -134495486 + RLTR10 LTR ERVK 1 387 -3 5 722 2741 92 30 117 chr5 18060153 18060681 -134476578 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 6 722 906 79 63 14 chr5 18067195 18067337 -134469922 + RLTR9E LTR ERVK 1 149 -260 6 722 225 258 149 79 chr5 18067205 18067420 -134469839 + RLTR28 LTR ERVL 19 248 -276 6 722 443 125 0 0 chr5 18067420 18067492 -134469767 + RLTR45-int LTR ERVK 2591 2662 -4582 6 722 5035 176 57 35 chr5 18067475 18068878 -134468381 + ETnERV2-int LTR ERVK 1067 3448 -3958 6 722 2902 114 22 9 chr5 18069142 18069593 -134467666 + ETnERV2-int LTR ERVK 3441 3897 -3509 6 722 1888 211 47 91 chr5 18069588 18070422 -134466837 + MMETn-int LTR ERVK 2611 3141 -1703 6 722 346 109 0 59 chr5 18070518 18070586 -134466673 + RLTR45-int LTR ERVK 6009 6072 -1172 6 722 1541 133 29 4 chr5 18070599 18070841 -134466418 + ETnERV3-int LTR ERVK 5529 5776 -32 6 722 2053 176 153 4 chr5 18070860 18071329 -134465930 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 539 -363 6 722 580 26 0 62 chr5 18071329 18071410 -134465849 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7406 0 7 722 2587 126 7 24 chr5 18071410 18071826 -134465433 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 7 722 2396 176 160 44 chr5 18072010 18072624 -134464635 - RMER6C LTR ERVK 0 690 6 7 722 3086 63 8 2 chr5 18076886 18077284 -134459975 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 722 358 102 0 0 chr5 18077704 18077753 -134459506 + RMER20B LTR ERVK 11 59 -568 8 722 1938 214 144 20 chr5 18078042 18078534 -134458725 + RMER20B LTR ERVK 75 627 0 8 722 962 130 25 0 chr5 18087377 18087539 -134449720 + BGLII_A LTR ERVK 1 166 -279 1 90 2295 229 73 85 chr5 18087536 18088041 -134449218 + RLTR40 LTR ERVK 60 550 -267 1 723 2295 229 73 85 chr5 18088085 18088343 -134448916 + RLTR40 LTR ERVK 551 814 -3 1 723 228 315 25 107 chr5 18088336 18088457 -134448802 - RLTR8 LTR ERVK -3 362 252 1 723 2072 204 50 20 chr5 18088919 18089430 -134447829 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 460 1 723 3225 56 2 0 chr5 18094268 18094663 -134442596 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 723 358 222 11 0 chr5 18097648 18097738 -134439521 - MERVL_2A-int LTR ERVL -14 5747 5657 1 723 327 274 49 62 chr5 18097738 18097882 -134439377 - ORR1A3-int LTR MaLR -1309 654 513 1 723 3007 204 90 16 chr5 18097904 18099148 -134438111 - MERVL_2A-int LTR ERVL -204 5557 4193 1 723 14148 189 53 22 chr5 18099153 18099764 -134437495 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2762 2999 2332 1 723 14148 189 53 22 chr5 18100132 18102427 -134434832 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3430 2331 2 1 723 646 298 133 86 chr5 18102575 18102776 -134434483 - MT2A LTR ERVL -44 489 249 1 723 2623 20 191 0 chr5 18102776 18103121 -134434138 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 723 646 298 133 86 chr5 18103121 18103385 -134433874 - MT2A LTR ERVL -285 248 2 1 723 335 314 51 0 chr5 18104424 18104542 -134432717 + MER67D LTR ERV1 2 125 -389 1 723 1705 254 69 7 chr5 18107777 18108241 -134429018 + RLTR16 LTR ERVK 1 493 -12 1 723 2590 226 22 13 chr5 18109167 18109722 -134427537 + RLTR20B1 LTR ERVK 2 561 -2 1 723 314 89 0 0 chr5 18110946 18110991 -134426268 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2073 253 209 1 723 1252 204 54 8 chr5 18112116 18112264 -134424995 + RLTR20B2 LTR ERVK 305 464 -96 1 723 1252 204 54 8 chr5 18112315 18112408 -134424851 + RLTR20B2 LTR ERVK 465 557 -3 1 723 2087 281 29 36 chr5 18122655 18123632 -134413627 - RMER16-int LTR ERVK -458 4948 3979 1 723 1621 172 23 40 chr5 18123861 18124207 -134413052 - RMER16-int LTR ERVK -1416 3990 3651 1 723 1446 144 78 15 chr5 18124617 18125077 -134412182 - RLTR19-int LTR ERVK -2168 3969 3481 1 723 1703 224 28 11 chr5 18129024 18129458 -134407801 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 1 723 1597 128 25 0 chr5 18133554 18133797 -134403462 - ORR1A3 LTR MaLR -77 249 1 1 723 642 195 164 98 chr5 18134581 18134631 -134402628 + RMER6B LTR ERVK 1 50 -411 1 723 642 201 151 81 chr5 18135178 18135511 -134401748 + RMER6B LTR ERVK 51 461 0 1 723 3558 186 57 41 chr5 18135511 18136405 -134400854 + MYSERV6-int LTR ERVK 1 908 -8051 1 723 7411 42 11 1 chr5 18136406 18137290 -134399969 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 1 723 1365 212 20 36 chr5 18147834 18148170 -134389089 + ORR1D1 LTR MaLR 1 324 -54 1 723 300 152 167 0 chr5 18150960 18151026 -134386233 + ORR1D1 LTR MaLR 308 384 0 1 723 1581 145 415 16 chr5 18152619 18153111 -134384148 + RMER6C LTR ERVK 1 688 -2 1 723 244 127 0 191 chr5 18153191 18153259 -134384000 + MTC LTR MaLR 3 57 -364 1 723 316 369 98 86 chr5 18159069 18159324 -134377935 - MTEa LTR MaLR -71 308 51 1 723 262 302 46 82 chr5 18159737 18159932 -134377327 - RLTR14 LTR ERV1 -40 342 155 1 723 982 199 320 42 chr5 18162081 18162553 -134374706 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 603 -51 1 723 918 158 31 77 chr5 18162557 18162818 -134374441 + MMVL30-int LTR ERV1 4 252 -7526 1 723 4606 96 20 18 chr5 18162892 18163622 -134373637 + MMVL30-int LTR ERV1 738 1469 -2229 1 723 15932 62 17 18 chr5 18163685 18166012 -134371247 + MMVL30-int LTR ERV1 993 3698 0 1 723 768 196 108 108 chr5 18166012 18166479 -134370780 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 590 -64 1 723 1015 291 55 86 chr5 18176229 18176646 -134360613 + MTD LTR MaLR 3 406 -13 2 723 405 152 46 37 chr5 18177708 18177817 -134359442 + RMER3D-int LTR ERVK 1049 1158 -1684 2 723 4136 142 48 13 chr5 18177817 18178549 -134358710 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 2 723 3842 174 68 77 chr5 18178551 18179558 -134357701 + RMER3D-int LTR ERVK 1155 2153 -689 2 723 684 309 17 77 chr5 18181323 18181455 -134355804 - MT2A LTR ERVL -241 292 167 2 723 684 309 17 77 chr5 18181602 18181704 -134355555 - MT2A LTR ERVL -367 166 72 2 723 262 347 39 46 chr5 18181644 18181774 -134355485 - MTE2a LTR MaLR -248 131 3 2 723 1297 197 11 33 chr5 18181845 18182118 -134355141 - RMER6C LTR ERVK 0 690 424 2 723 271 182 0 0 chr5 18182209 18182253 -134355006 - MT2B LTR ERVL -376 225 182 2 723 451 153 0 0 chr5 18182297 18182369 -134354890 - RMER6C LTR ERVK -647 73 2 2 723 6555 56 3 18 chr5 18183566 18184455 -134352804 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 1 2 723 2810 55 3 0 chr5 18186026 18186371 -134350888 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 723 2690 99 10 24 chr5 18194370 18194785 -134342474 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 723 342 379 74 19 chr5 18195225 18195440 -134341819 - LTR40a LTR ERVL -288 231 5 2 723 2009 218 84 22 chr5 18205683 18206180 -134331079 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 2 723 440 300 178 29 chr5 18208462 18208743 -134328516 - MTE2a LTR MaLR -39 340 19 2 723 1258 178 18 22 chr5 18209114 18209355 -134327904 + RLTR33 LTR ERVK 2 349 -150 2 723 1605 203 53 6 chr5 18215553 18215956 -134321303 + RLTR33 LTR ERVK 211 678 0 2 723 2252 173 204 3 chr5 18218334 18218616 -134318643 + RMER6C LTR ERVK 1 373 -317 2 723 2252 173 204 3 chr5 18218640 18218930 -134318329 + RMER6C LTR ERVK 374 687 -3 2 724 620 401 38 3 chr5 18220313 18220653 -134316606 + MER74C LTR ERVL 10 361 -99 2 724 2631 93 61 0 chr5 18224802 18225179 -134312080 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 724 469 176 44 0 chr5 18226256 18226347 -134310912 - ORR1B1 LTR MaLR -254 140 46 2 724 1214 128 10 0 chr5 18227707 18227903 -134309356 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 612 2 724 572 200 94 16 chr5 18227903 18228030 -134309229 - ORR1C1 LTR MaLR -237 141 5 2 724 1625 197 100 40 chr5 18229021 18229154 -134308105 + MTC LTR MaLR 1 163 -258 2 724 2045 125 19 22 chr5 18229154 18229474 -134307785 + ORR1A3 LTR MaLR 4 322 -4 2 724 1625 201 97 39 chr5 18229474 18229728 -134307531 + MTC LTR MaLR 164 403 -18 2 724 301 381 25 6 chr5 18232094 18232255 -134305004 - LTR40a LTR ERVL -267 252 89 2 724 385 265 13 87 chr5 18233900 18233950 -134303309 + MT2B2 LTR ERVL 117 164 -420 2 724 385 265 13 87 chr5 18234111 18234209 -134303050 + MT2B2 LTR ERVL 165 253 -331 2 724 1923 146 35 0 chr5 18253381 18253697 -134283562 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 724 477 296 75 6 chr5 18253779 18253939 -134283320 + RMER15 LTR ERVL 404 574 -1 3 724 441 353 95 17 chr5 18257360 18257597 -134279662 + MTD LTR MaLR 113 358 -42 3 724 1989 123 52 3 chr5 18268387 18268714 -134268545 - RLTR15 LTR ERVK -14 345 3 3 724 281 214 36 0 chr5 18268729 18268813 -134268446 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -13 2313 2227 3 724 1138 276 73 9 chr5 18270350 18270679 -134266580 - MTD LTR MaLR 0 419 70 3 724 429 275 76 33 chr5 18270732 18270916 -134266343 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 1065 3 724 816 296 85 9 chr5 18273074 18273564 -134263695 - MTD-int LTR MaLR -253 1005 376 3 724 437 191 12 0 chr5 18273537 18273621 -134263638 - MTD-int LTR MaLR -1143 115 31 3 724 382 275 18 9 chr5 18273640 18273750 -134263509 - MTD LTR MaLR 0 419 309 3 724 496 257 124 7 chr5 18273751 18273904 -134263355 + MTD LTR MaLR 231 401 -18 3 724 875 198 178 0 chr5 18274424 18274626 -134262633 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 454 3 724 992 321 52 0 chr5 18282179 18282522 -134254737 - MTE2b LTR MaLR -18 361 1 3 724 1051 181 45 0 chr5 18286437 18286636 -134250623 + RMER19C LTR ERVK 388 595 -16 3 724 3103 70 5 0 chr5 18294229 18294627 -134242632 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 724 668 258 158 46 chr5 18294869 18295045 -134242214 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 149 3 724 668 258 158 46 chr5 18295102 18295123 -134242136 - ORR1D2 LTR MaLR -222 148 127 3 724 668 258 158 46 chr5 18295144 18295274 -134241985 - ORR1D2 LTR MaLR -244 126 2 3 724 297 290 55 27 chr5 18296287 18296397 -134240862 + MER68 LTR ERVL 157 269 -294 3 724 653 319 108 36 chr5 18296643 18296975 -134240284 - LTR40c LTR ERVL -42 423 68 3 724 291 305 118 7 chr5 18298114 18298266 -134238993 + RLTR21 LTR ERVK 1085 1253 -319 3 724 2158 122 40 30 chr5 18299639 18300044 -134237215 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 724 536 92 0 0 chr5 18300044 18300120 -134237139 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7331 3 724 1237 164 15 7 chr5 18300329 18300540 -134236719 - ETnERV2-int LTR ERVK -977 6429 6222 3 724 7478 189 98 67 chr5 18300898 18302967 -134234292 - ETnERV2-int LTR ERVK -3316 4090 2054 3 724 7478 189 98 67 chr5 18303030 18304265 -134232994 - ETnERV2-int LTR ERVK -3316 2053 836 3 724 877 184 84 58 chr5 18304271 18304496 -134232763 - ETnERV2-int LTR ERVK -5035 371 141 3 724 327 146 0 18 chr5 18304950 18305006 -134232253 - RLTR45-int LTR ERVK -5099 2145 2091 3 724 444 254 77 38 chr5 18304996 18305218 -134232041 - MMETn-int LTR ERVK -2942 372 109 3 724 2244 133 29 29 chr5 18305326 18305735 -134231524 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 724 1014 286 134 22 chr5 18306512 18306870 -134230389 + MTD LTR MaLR 8 405 -14 3 724 1266 154 62 37 chr5 18316843 18317085 -134220174 - MTC LTR MaLR -11 410 163 3 724 772 222 99 31 chr5 18321010 18321201 -134216058 + ORR1D2 LTR MaLR 155 358 -12 3 724 2187 86 86 0 chr5 18321249 18321576 -134215683 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -2 355 1 3 724 743 386 38 24 chr5 18322558 18323027 -134214232 + ORR1D1-int LTR MaLR 3 478 -1102 4 724 1261 234 83 18 chr5 18323125 18323512 -134213747 + RLTR20D LTR ERVK 5 465 -103 4 724 712 260 101 19 chr5 18323556 18323642 -134213617 + RLTR20D LTR ERVK 466 567 -1 4 724 386 242 161 42 chr5 18324081 18324249 -134213010 - MTD LTR MaLR -1 418 231 4 724 710 276 33 53 chr5 18324288 18324533 -134212726 - MTD LTR MaLR -133 286 47 4 724 667 278 65 103 chr5 18324608 18325053 -134212206 + ORR1D1-int LTR MaLR 1315 1546 -34 4 724 1780 165 24 85 chr5 18327403 18327780 -134209479 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 4 724 2052 61 18 0 chr5 18328887 18329167 -134208092 + RLTR10 LTR ERVK 1 285 -105 4 724 380 40 0 0 chr5 18336148 18336198 -134201061 + RLTR10-int LTR ERVK 252 301 -1686 4 724 1064 209 155 83 chr5 18340223 18340572 -134196687 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 724 2051 122 3 0 chr5 18345642 18345944 -134191315 + ORR1A2 LTR MaLR 25 327 0 4 725 677 83 0 2 chr5 18352247 18352356 -134184903 + MuRRS4-int LTR ERV1 139 293 -3006 4 725 847 126 68 19 chr5 18352703 18352865 -134184394 + RMER16-int LTR ERVK 141 310 -5096 4 725 2593 122 38 7 chr5 18352910 18353331 -134183928 + RMER16-int LTR ERVK 702 1135 -4271 4 725 233 320 70 54 chr5 18353331 18353460 -134183799 + MTC-int LTR MaLR 842 972 -286 4 725 2117 200 109 8 chr5 18353472 18354005 -134183254 + MuRRS4-int LTR ERV1 760 1346 -3717 4 725 915 224 33 4 chr5 18354137 18354379 -134182880 + MuRRS4-int LTR ERV1 4788 5036 -27 4 725 1246 58 205 11 chr5 18354384 18354574 -134182685 + LTRIS2 LTR ERV1 3 229 -335 4 725 2352 50 73 33 chr5 18355043 18355372 -134181887 + LTRIS2 LTR ERV1 223 564 0 4 725 1643 171 84 0 chr5 18368954 18369253 -134168006 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 4 4 725 297 301 52 63 chr5 18375006 18375291 -134161968 - MER90 LTR ERV1 -62 607 231 4 725 351 288 11 103 chr5 18376572 18376746 -134160513 - RLTR31_Mur LTR ERVK -5 548 391 4 725 3144 162 60 7 chr5 18376815 18377380 -134159879 + RLTR17 LTR ERVK 98 692 0 4 725 1120 198 140 54 chr5 18377380 18377720 -134159539 - RLTR31_Mur LTR ERVK -183 370 1 4 725 1249 218 47 10 chr5 18377722 18378301 -134158958 + ORR1C1 LTR MaLR 87 758 -612 4 725 438 152 0 37 chr5 18378306 18378388 -134158871 + ORR1C1 LTR MaLR 285 363 -15 4 725 1776 154 220 66 chr5 18381357 18381843 -134155416 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 4 725 807 220 75 33 chr5 18382874 18383114 -134154145 + RMER20B LTR ERVK 156 405 -222 4 725 9064 182 28 20 chr5 18383607 18385440 -134151819 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1 4 725 502 221 0 17 chr5 18389505 18389620 -134147639 + RLTR12B LTR ERVK 14 126 -442 4 725 1085 259 65 13 chr5 18395132 18395534 -134141725 + RLTR12B LTR ERVK 112 553 -15 4 725 869 282 52 41 chr5 18397686 18398052 -134139207 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 725 2445 170 36 83 chr5 18402061 18402650 -134134609 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 4 725 1710 189 120 3 chr5 18410479 18410871 -134126388 - BGLII_B LTR ERVK -3 438 1 5 725 351 349 138 31 chr5 18412798 18413058 -134124201 + MLT1A0 LTR MaLR 77 364 -1 5 725 4612 116 14 11 chr5 18417017 18417730 -134119529 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 309 5 725 816 327 82 26 chr5 18425881 18426308 -134110951 - MLT2B2 LTR ERVL -59 456 6 5 725 662 258 93 44 chr5 18426471 18426847 -134110412 - RLTR11B LTR ERVK -27 414 1 5 725 3645 20 123 0 chr5 18433955 18434394 -134102865 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 725 48021 15 0 0 chr5 18434394 18439765 -134097494 + MERVL-int LTR ERVL 1 5371 -114 5 725 350 139 26 53 chr5 18439765 18439841 -134097418 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 5 725 292 26 0 0 chr5 18439841 18439879 -134097380 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 725 3619 23 123 0 chr5 18439879 18440318 -134096941 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 725 1855 205 40 33 chr5 18447850 18448279 -134088980 + RMER10A LTR ERVL 1 432 -10 5 725 675 346 79 22 chr5 18449209 18449680 -134087579 - MER54B LTR ERVL -29 764 224 5 725 1086 289 32 64 chr5 18449686 18450082 -134087177 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 725 998 258 102 31 chr5 18450810 18451162 -134086097 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 5 725 434 336 52 62 chr5 18454981 18455286 -134081973 + MLT1D LTR MaLR 45 346 -159 5 725 245 299 22 44 chr5 18466695 18466786 -134070473 - MLT1A1 LTR MaLR -15 393 305 5 725 372 261 98 26 chr5 18469435 18469628 -134067631 + MT2A LTR ERVL 323 529 -4 5 725 1193 225 55 110 chr5 18471025 18471425 -134065834 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 725 2695 67 19 16 chr5 18472378 18472742 -134064517 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 5 725 3259 18 39 0 chr5 18478887 18479268 -134057991 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 725 9136 31 3 2 chr5 18479270 18480365 -134056894 - MTA_Mm-int LTR MaLR -2 1096 1 5 725 3259 18 39 0 chr5 18480365 18480746 -134056513 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 726 610 246 120 55 chr5 18485307 18485582 -134051677 + RLTR15 LTR ERVK 1 293 -66 6 726 229 291 46 46 chr5 18495550 18495658 -134041601 + RMER12 LTR ERVK 744 851 -471 6 726 2799 93 83 2 chr5 18501227 18501659 -134035600 + RLTR44C LTR ERVK 11 477 -25 3 726 1684 185 24 112 chr5 18521594 18522003 -134015256 + ORR1B1 LTR MaLR 1 373 -21 2 726 318 346 141 24 chr5 18541355 18541662 -133995597 - MLT1F LTR MaLR -84 485 114 5 726 3387 38 0 0 chr5 18545287 18545683 -133991576 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 726 7318 84 27 71 chr5 18545683 18546829 -133990430 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1096 -2 5 726 3248 51 2 0 chr5 18546831 18547226 -133990033 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 726 804 168 102 23 chr5 18549530 18549707 -133987552 + RMER6C LTR ERVK 1 191 -499 6 726 1248 276 163 34 chr5 18551915 18552387 -133984872 - RMER15 LTR ERVL -14 561 29 6 726 5753 186 36 46 chr5 18555710 18555905 -133981354 - RMER12B LTR ERVK -154 1250 1053 7 726 5753 186 36 46 chr5 18555948 18557015 -133980244 - RMER12B LTR ERVK -352 1052 3 7 726 2507 122 23 5 chr5 18558411 18558807 -133978452 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 8 726 1114 330 19 3 chr5 18572952 18573262 -133963997 - MTE2b LTR MaLR -64 315 1 9 726 998 321 42 20 chr5 18573567 18573934 -133963325 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 9 726 460 325 19 6 chr5 18573935 18574093 -133963166 + MTE2b-int LTR MaLR 2 161 -1419 9 726 2907 179 108 10 chr5 18574097 18574718 -133962541 + RMER6C LTR ERVK 6 687 -3 9 726 1015 265 23 40 chr5 18574793 18575175 -133962084 + RMER10B LTR ERVL 1 394 -48 9 726 758 188 111 42 chr5 18575165 18575354 -133961905 + RMER10B LTR ERVL 197 398 0 9 726 530 319 6 24 chr5 18576081 18576232 -133961027 + MTE2b-int LTR MaLR 187 333 -1247 9 726 530 319 6 24 chr5 18576992 18577010 -133960249 + MTE2b-int LTR MaLR 334 352 -1228 9 726 781 341 59 38 chr5 18577763 18578186 -133959073 + MTE2b-int LTR MaLR 293 724 -856 9 726 463 292 76 33 chr5 18578247 18578431 -133958828 + MTE2b-int LTR MaLR 790 981 -599 9 726 1735 207 32 9 chr5 18593508 18593854 -133943405 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 726 579 233 77 10 chr5 18595870 18596038 -133941221 - ORR1B1-int LTR MaLR -29 1551 1216 1 726 553 401 49 21 chr5 18596083 18596412 -133940847 - ORR1B1-int LTR MaLR -577 1003 666 1 726 276 353 56 56 chr5 18598981 18599176 -133938083 + MTD LTR MaLR 20 214 -205 1 726 386 302 86 13 chr5 18599965 18600116 -133937143 - MLT1D LTR MaLR -341 164 3 1 726 246 239 132 33 chr5 18600150 18600241 -133937018 + MLT1A1 LTR MaLR 46 145 -263 1 726 3081 184 116 9 chr5 18602111 18602423 -133934836 + RMER6D LTR ERVK 1 372 -348 1 726 3081 184 116 9 chr5 18602831 18603163 -133934096 + RMER6D LTR ERVK 373 714 -6 1 726 546 139 156 9 chr5 18603281 18603390 -133933869 + RMER6C LTR ERVK 566 690 0 1 726 4174 171 89 30 chr5 18603390 18604909 -133932350 + RMER6-int LTR ERVK 1 1607 -1570 1 726 1577 196 45 98 chr5 18604944 18605454 -133931805 + RMER6C LTR ERVK 208 690 0 1 726 7273 17 1 1 chr5 18608271 18609093 -133928166 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 1 727 6855 75 9 0 chr5 18625956 18626841 -133910418 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 1 727 1446 217 74 17 chr5 18639588 18639939 -133897320 + ORR1D1 LTR MaLR 1 371 -3 1 727 1081 218 76 22 chr5 18639942 18640219 -133897040 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 292 -1078 1 727 1900 218 63 41 chr5 18640227 18640716 -133896543 + RLTR12B LTR ERVK 1 500 -28 1 727 2884 255 80 72 chr5 18640770 18640904 -133896355 + ORR1D1-int LTR MaLR 296 438 -932 1 727 2884 255 80 72 chr5 18641493 18642292 -133894967 + ORR1D1-int LTR MaLR 439 1238 -132 1 727 2884 255 80 72 chr5 18643154 18643213 -133894046 + ORR1D1-int LTR MaLR 1239 1299 -71 1 727 2759 191 31 32 chr5 18643213 18643769 -133893490 + RLTR20B2 LTR ERVK 3 557 -3 1 727 446 214 38 19 chr5 18643769 18643847 -133893412 + ORR1D1-int LTR MaLR 1430 1509 0 1 727 877 164 28 97 chr5 18643857 18644033 -133893226 + ORR1D1 LTR MaLR 11 174 -200 1 727 691 204 25 95 chr5 18644013 18644213 -133893046 - ORR1C2 LTR MaLR -32 352 167 1 727 602 363 33 59 chr5 18644288 18644407 -133892852 - MT2A LTR ERVL -120 413 293 1 727 4055 132 106 98 chr5 18644407 18645306 -133891953 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 1 727 602 363 33 59 chr5 18645306 18645610 -133891649 - MT2A LTR ERVL -241 292 2 1 727 1036 225 109 46 chr5 18651734 18651848 -133885411 + RMER4B LTR ERVK 12 126 -459 1 727 1036 225 109 46 chr5 18651901 18652056 -133885203 + RMER4B LTR ERVK 127 314 -271 1 727 1036 225 109 46 chr5 18652625 18652704 -133884555 + RMER4B LTR ERVK 315 382 -203 1 727 308 64 0 0 chr5 18652736 18652783 -133884476 - RMER4A LTR ERVK 0 466 420 1 727 543 179 32 49 chr5 18653401 18653524 -133883735 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 264 1 727 1757 180 30 90 chr5 18653526 18653928 -133883331 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 135 2 727 10553 113 91 134 chr5 18654015 18656195 -133881064 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 1172 2 727 10553 115 87 126 chr5 18656246 18656739 -133880520 - RLTR1B-int LTR ERV1 -2231 1467 783 2 727 891 256 49 68 chr5 18657303 18657773 -133879486 - RLTR1B-int LTR ERV1 -2838 461 1 2 727 1733 190 25 82 chr5 18657773 18658174 -133879085 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 135 2 727 817 245 113 8 chr5 18658261 18658500 -133878759 - ORR1C2 LTR MaLR -119 265 2 1 727 351 205 38 25 chr5 18658501 18658581 -133878678 - ORR1C2-int LTR MaLR -3 1506 1426 1 727 311 278 28 76 chr5 18658742 18658886 -133878373 - RMER4A LTR ERVK -303 163 27 1 727 3821 245 72 55 chr5 18658979 18660126 -133877133 - ORR1D-int LTR MaLR -74 1296 131 2 727 373 77 0 0 chr5 18660163 18660215 -133877044 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 333 2 727 1338 227 147 6 chr5 18660215 18660555 -133876704 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 305 2 727 1707 180 50 6 chr5 18660555 18660874 -133876385 + RLTR17 LTR ERVK 4 336 -356 2 727 269 226 0 0 chr5 18665461 18665514 -133871745 - MTE2b LTR MaLR -260 119 67 2 727 326 297 62 9 chr5 18677517 18677629 -133859630 - MLT1A1 LTR MaLR -26 382 265 2 727 2498 106 95 18 chr5 18689388 18689829 -133847430 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 727 2722 144 117 17 chr5 18690532 18691112 -133846147 + RMER17B LTR ERVK 321 958 0 2 727 336 362 63 39 chr5 18691902 18692233 -133845026 + HERV16-int LTR ERVL 801 1139 -3857 2 727 264 320 62 0 chr5 18692299 18692427 -133844832 + HERV16-int LTR ERVL 1250 1385 -3611 2 727 264 311 40 40 chr5 18693498 18693622 -133843637 - MLT1A0 LTR MaLR -4 370 247 2 727 272 300 120 14 chr5 18693715 18693857 -133843402 - MLT1A0 LTR MaLR -188 177 21 2 727 281 205 68 120 chr5 18699571 18699704 -133837555 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 384 2 727 627 318 103 50 chr5 18700077 18700389 -133836870 + ORR1D2 LTR MaLR 7 357 -17 2 727 255 226 32 0 chr5 18701101 18701163 -133836096 + ORR1D2 LTR MaLR 7 70 -300 2 727 475 352 93 38 chr5 18706727 18707178 -133830081 - ERVL-int LTR ERVL -3350 2407 1932 2 727 5485 114 9 26 chr5 18727323 18728234 -133809025 + RMER17A2 LTR ERVK 1 895 -11 2 727 3006 115 0 5 chr5 18728830 18729265 -133807994 + RLTR10C LTR ERVK 1 433 -3 3 727 1384 252 55 42 chr5 18729990 18730392 -133806867 - MTD LTR MaLR 0 419 13 3 728 476 332 115 76 chr5 18743898 18744334 -133792925 + MLT1L LTR MaLR 15 467 -143 3 728 663 222 56 18 chr5 18746395 18746592 -133790667 - ORR1D1 LTR MaLR -163 231 26 3 728 312 309 153 8 chr5 18748006 18748130 -133789129 - MLT2B4 LTR ERVL -198 358 217 3 728 575 337 82 84 chr5 18749066 18749520 -133787739 - MLT2B4 LTR ERVL 0 464 12 3 728 506 270 125 11 chr5 18760538 18760714 -133776545 - MLT1L LTR MaLR 0 610 415 3 728 2760 178 71 21 chr5 18768244 18768871 -133768388 + RMER17B LTR ERVK 1 580 -378 3 728 916 318 92 24 chr5 18776986 18777444 -133759815 - MLT1D LTR MaLR -2 503 15 3 728 3173 58 5 2 chr5 18786332 18786727 -133750532 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 728 1427 201 8 124 chr5 18796741 18797128 -133740131 - MTB_Mm LTR MaLR -14 393 52 3 728 1523 267 47 56 chr5 18806496 18806586 -133730673 - RLTR20B3 LTR ERVK -1 576 483 4 728 1523 267 47 56 chr5 18806666 18806690 -133730569 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 475 4 728 1523 267 47 56 chr5 18807110 18807566 -133729693 - RLTR20B3 LTR ERVK -103 474 10 4 728 319 304 124 60 chr5 18815179 18815413 -133721846 + MTD LTR MaLR 111 359 -60 4 728 582 258 51 74 chr5 18818309 18818485 -133718774 - ORR1D2 LTR MaLR -198 172 1 4 728 1272 211 168 9 chr5 18821617 18821957 -133715302 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 728 3201 58 8 5 chr5 18823303 18823698 -133713561 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 728 396 291 86 20 chr5 18826202 18826353 -133710906 - MLT1C LTR MaLR -7 460 300 4 728 321 306 42 63 chr5 18830828 18830855 -133706404 + ORR1D1 LTR MaLR 8 31 -339 4 728 587 271 280 30 chr5 18830886 18831157 -133706102 + ORR1D1 LTR MaLR 32 373 -1 4 728 463 325 64 5 chr5 18858556 18858760 -133678499 - MLT1C LTR MaLR -181 286 71 4 728 227 198 93 0 chr5 18871777 18871812 -133665447 - ORR1B1-int LTR MaLR -862 647 605 5 729 1131 287 84 3 chr5 18875788 18876120 -133661139 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 5 729 1445 213 52 23 chr5 18881764 18882110 -133655149 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 4 5 729 479 206 135 0 chr5 18894585 18894711 -133642548 + MTD LTR MaLR 277 419 0 5 729 345 43 0 0 chr5 18900665 18900711 -133636548 + RMER17A LTR ERVK 3 48 -703 5 729 819 316 65 6 chr5 18906071 18906427 -133630832 - MLT1B LTR MaLR -1 389 13 5 729 5195 121 18 70 chr5 18909879 18910823 -133626436 - RLTR13D6 LTR ERVK -7 895 1 5 729 243 291 35 63 chr5 18924539 18924682 -133612577 + RMER15 LTR ERVL 300 438 -137 5 729 426 319 71 46 chr5 18928007 18928204 -133609055 + MTEb LTR MaLR 178 379 0 5 729 229 258 16 24 chr5 18933232 18933355 -133603904 + ORR1B1-int LTR MaLR 633 754 -755 5 729 400 145 14 0 chr5 18937893 18937962 -133599297 + MTC LTR MaLR 13 82 -339 5 729 502 139 23 0 chr5 18937967 18938053 -133599206 + MTC LTR MaLR 331 418 -1 5 729 4489 215 84 26 chr5 18938053 18939241 -133598018 + MTC-int LTR MaLR 2 1258 0 5 729 1336 183 8 16 chr5 18939241 18939486 -133597773 + MTC LTR MaLR 1 243 -178 5 729 299 200 23 81 chr5 18939501 18939588 -133597671 + MTC LTR MaLR 330 411 -8 5 729 2710 72 3 0 chr5 18941414 18941759 -133595500 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 729 691 296 118 20 chr5 18941993 18942321 -133594938 - MER67D LTR ERV1 -43 471 127 6 729 3164 18 76 0 chr5 18944685 18945067 -133592192 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 729 728 226 116 27 chr5 18966914 18967134 -133570125 + ORR1A3-int LTR MaLR 407 640 -1323 6 729 3043 64 8 2 chr5 18975291 18975685 -133561574 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 729 474 324 99 39 chr5 18982061 18982344 -133554915 + RMER13A LTR ERVK 4 303 -557 6 729 402 286 133 28 chr5 18988674 18988854 -133548405 + RMER20B LTR ERVK 422 620 -7 6 730 228 367 165 44 chr5 19028686 19028934 -133508325 - LTR16A LTR ERVL -51 400 123 4 730 658 297 81 33 chr5 19036869 19037234 -133500025 + MLT1C LTR MaLR 21 390 0 5 730 2181 145 89 13 chr5 19048613 19049004 -133488255 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 730 244 265 47 84 chr5 19054781 19054888 -133482371 - MT2B2 LTR ERVL -330 254 152 7 730 4343 148 47 42 chr5 19056402 19057291 -133479968 - RMER17A2 LTR ERVK -12 894 1 7 730 934 315 44 28 chr5 19066239 19066601 -133470658 - MLT1B LTR MaLR 0 390 23 8 730 741 335 129 17 chr5 19066923 19067327 -133469932 - MLT1D LTR MaLR -54 451 3 8 730 837 222 215 42 chr5 19068249 19068358 -133468901 - MT2A LTR ERVL -1 532 429 8 730 837 222 215 42 chr5 19068426 19068768 -133468491 - MT2A LTR ERVL -105 428 3 8 730 1524 279 23 49 chr5 19070222 19070416 -133466843 + MTD LTR MaLR 1 190 -229 8 730 1524 279 23 49 chr5 19070445 19070680 -133466579 + MTD LTR MaLR 191 419 0 8 730 4535 152 84 61 chr5 19071640 19072601 -133464658 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 9 730 317 242 90 15 chr5 19074782 19074916 -133462343 - MTD LTR MaLR -14 405 262 9 730 1314 182 212 13 chr5 19079841 19080147 -133457112 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 730 526 357 85 23 chr5 19095254 19095641 -133441618 - MLT1E2 LTR MaLR -216 411 1 1 730 677 224 126 0 chr5 19099414 19099588 -133437671 - MTEb LTR MaLR -183 196 1 1 730 3135 228 70 20 chr5 19101142 19101980 -133435279 - ORR1B1-int LTR MaLR -384 1125 246 1 730 565 143 10 0 chr5 19101981 19102079 -133435180 - ORR1B1-int LTR MaLR -1836 127 29 1 730 1677 142 212 9 chr5 19102096 19102422 -133434837 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 1 730 1852 262 28 36 chr5 19108938 19109469 -133427790 - RLTR20C LTR ERVK -7 527 1 1 730 11024 81 47 91 chr5 19122501 19123715 -133413544 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 732 1 730 11024 81 47 91 chr5 19123741 19124189 -133413070 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1117 731 307 1 730 11024 81 47 91 chr5 19124315 19124584 -133412675 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1542 306 3 1 730 695 267 116 41 chr5 19125987 19126307 -133410952 + RLTR15 LTR ERVK 1 344 -15 1 730 283 260 109 110 chr5 19128462 19128640 -133408619 + MTE2a LTR MaLR 195 379 0 1 730 4944 119 16 21 chr5 19132807 19133620 -133403639 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 1 730 266 315 109 51 chr5 19135150 19135287 -133401972 - ORR1E LTR MaLR -214 145 1 1 730 235 296 128 43 chr5 19135476 19135617 -133401642 - MER90 LTR ERV1 0 614 462 1 730 412 298 58 16 chr5 19135828 19136019 -133401240 - MER90 LTR ERV1 -301 274 76 1 731 315 268 113 128 chr5 19136595 19136860 -133400399 - RLTR9A LTR ERVK -32 336 76 1 731 3552 150 29 16 chr5 19137331 19137953 -133399306 - RMER16-int LTR ERVK -3838 1568 939 1 731 2547 162 124 63 chr5 19139771 19140424 -133396835 - RMER16-int LTR ERVK -4450 956 263 1 731 418 265 162 77 chr5 19140990 19141329 -133395930 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 1 731 1083 214 243 18 chr5 19145738 19146080 -133391179 + MTC LTR MaLR 3 421 0 1 731 295 209 184 79 chr5 19146938 19146988 -133390271 - MLT1B LTR MaLR -42 348 296 1 731 3330 38 2 5 chr5 19146988 19147385 -133389874 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 731 439 290 74 56 chr5 19147385 19147648 -133389611 - MLT1B LTR MaLR -95 295 1 1 731 4285 191 26 83 chr5 19148941 19149902 -133387357 - RMER13B LTR ERVK 0 908 3 1 731 323 388 37 27 chr5 19175894 19176082 -133361177 + MLT1A LTR MaLR 178 367 -7 2 731 782 302 142 3 chr5 19180640 19180972 -133356287 + MTD LTR MaLR 42 419 0 2 731 4733 134 26 9 chr5 19181468 19182263 -133354996 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 2 731 236 143 52 0 chr5 19182305 19182382 -133354877 - MT2A LTR ERVL 0 533 453 2 731 2167 187 53 13 chr5 19182421 19182817 -133354442 - MTC LTR MaLR -1 420 9 2 731 859 270 67 11 chr5 19182996 19183319 -133353940 - MT2A LTR ERVL -91 510 1 2 731 3404 183 58 16 chr5 19193744 19194432 -133342827 + RMER6D LTR ERVK 2 718 -2 2 731 364 212 35 23 chr5 19197340 19197427 -133339832 - ORR1D2 LTR MaLR -281 89 2 2 731 2740 256 60 99 chr5 19197429 19197580 -133339679 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 1194 2 731 2740 256 60 99 chr5 19197604 19198046 -133339213 - ORR1D2-int LTR MaLR -177 1193 783 2 731 2740 256 60 99 chr5 19198189 19198575 -133338684 - ORR1D2-int LTR MaLR -588 782 429 2 731 229 163 0 23 chr5 19201908 19201952 -133335307 + MT2B LTR ERVL 364 406 -195 2 731 2301 205 36 14 chr5 19206572 19207067 -133330192 - RLTR11A2 LTR ERVK -21 506 1 2 731 3008 161 58 14 chr5 19215795 19216345 -133320914 - RMER4B LTR ERVK -11 574 1 2 731 3986 113 59 52 chr5 19223808 19224209 -133313050 - RMER17A LTR ERVK 0 751 315 2 731 3986 113 59 52 chr5 19224322 19224666 -133312593 - RMER17A LTR ERVK -437 314 1 2 731 1648 224 30 69 chr5 19228034 19228096 -133309163 + MTD LTR MaLR 1 60 -359 3 731 3234 48 2 5 chr5 19228096 19228493 -133308766 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 731 1648 224 30 69 chr5 19228493 19228866 -133308393 + MTD LTR MaLR 61 419 0 3 731 784 265 75 23 chr5 19229773 19229947 -133307312 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7020 3 731 2940 26 9 0 chr5 19230223 19230566 -133306693 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 731 855 254 135 37 chr5 19234293 19234620 -133302639 + MTEb LTR MaLR 13 371 -8 3 731 620 330 129 33 chr5 19259533 19259991 -133277268 + MLT1D LTR MaLR 1 502 -3 3 732 503 325 123 67 chr5 19268849 19269238 -133268021 + MER21B LTR ERV1 332 742 -121 3 732 280 293 20 10 chr5 19275521 19275621 -133261638 + MTEb LTR MaLR 275 375 -4 3 732 1812 146 174 14 chr5 19280286 19280647 -133256612 - MTC LTR MaLR 0 421 3 3 732 588 325 74 70 chr5 19290902 19291259 -133246000 + MTEb LTR MaLR 1 361 -18 3 732 428 148 37 0 chr5 19297480 19297561 -133239698 - RMER6C LTR ERVK 0 690 607 4 732 3056 149 39 69 chr5 19297857 19298505 -133238754 - RMER6C LTR ERVK -62 628 1 4 732 2006 137 112 19 chr5 19305889 19306254 -133231005 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 4 732 1794 248 20 12 chr5 19315092 19315500 -133221759 + MTD LTR MaLR 6 416 -3 4 732 3458 18 5 0 chr5 19315921 19316315 -133220944 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 732 3804 171 103 20 chr5 19322542 19323335 -133213924 - RMER13A LTR ERVK -1 859 1 4 732 1087 239 105 23 chr5 19324248 19324590 -133212669 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 732 3821 198 63 72 chr5 19337654 19338567 -133198692 - RMER13B LTR ERVK -3 905 1 4 732 317 283 70 81 chr5 19338823 19339081 -133198178 - ORR1E LTR MaLR -13 346 92 4 732 239 311 0 118 chr5 19347854 19347956 -133189303 - MT2B LTR ERVL -364 237 148 4 732 7063 97 22 3 chr5 19352990 19353994 -133183265 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 4 732 1564 179 47 87 chr5 19358498 19358925 -133178334 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 732 2105 154 80 5 chr5 19366094 19366480 -133170779 - MTC LTR MaLR 0 421 7 5 732 486 234 1 2 chr5 19369295 19369395 -133167864 + ORR1D1 LTR MaLR 1 99 -260 5 732 424 335 50 40 chr5 19372008 19372207 -133165052 - LTR79 LTR ERVL -2 525 325 5 732 549 282 60 60 chr5 19372639 19372969 -133164290 + RLTR15 LTR ERVK 45 344 -15 5 732 935 254 56 136 chr5 19373569 19373980 -133163279 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 5 732 2188 136 3 0 chr5 19375219 19375543 -133161716 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 5 732 594 288 93 25 chr5 19386255 19386608 -133150651 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 5 732 1096 277 84 21 chr5 19398156 19398488 -133138771 + MTE2b LTR MaLR 1 353 -26 5 733 1282 228 167 20 chr5 19401755 19402118 -133135141 - MTD LTR MaLR -14 405 1 5 733 1327 254 126 3 chr5 19406801 19407157 -133130102 - MTD LTR MaLR -2 417 18 5 733 2088 183 98 21 chr5 19410984 19411453 -133125806 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 5 733 3291 48 5 0 chr5 19418474 19418868 -133118391 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 733 578 300 104 56 chr5 19432123 19432391 -133104868 + MER90a LTR ERV1 24 304 -310 6 733 2353 229 51 35 chr5 19435713 19436127 -133101132 - RLTR17 LTR ERVK -77 615 192 6 733 2353 229 51 35 chr5 19436156 19436344 -133100915 - RLTR17 LTR ERVK -501 191 4 6 733 2034 249 45 12 chr5 19454605 19455094 -133082165 + RLTR17 LTR ERVK 114 618 -74 6 733 1042 237 213 22 chr5 19459424 19459748 -133077511 - MTD LTR MaLR -22 397 12 6 733 3478 242 149 29 chr5 19459759 19460881 -133076378 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 1 6 733 225 304 51 0 chr5 19477219 19477298 -133059961 + LTR86A1 LTR ERVL 5 87 -421 6 733 227 342 41 41 chr5 19477388 19477510 -133059749 + LTR86A1 LTR ERVL 235 356 -157 6 733 2912 104 56 0 chr5 19481022 19481472 -133055787 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 733 13550 53 9 3 chr5 19481474 19483235 -133054024 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 4708 6 733 1802 84 12 0 chr5 19483262 19483513 -133053746 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2244 6 733 894 59 0 0 chr5 19483508 19483627 -133053632 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 1359 6 733 3391 83 14 26 chr5 19483627 19484429 -133052830 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 3 6 733 2836 104 75 0 chr5 19484431 19484873 -133052386 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 733 1998 149 14 3 chr5 19511380 19511729 -133025530 + RLTR15 LTR ERVK 1 353 -6 1 733 828 257 98 54 chr5 19514078 19514374 -133022885 + ORR1E LTR MaLR 40 348 -11 1 733 3362 157 43 19 chr5 19517400 19518023 -133019236 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 5 1 733 2081 142 3 3 chr5 19518948 19519273 -133017986 + ORR1A1 LTR MaLR 1 325 -21 2 734 1129 244 45 74 chr5 19531831 19532330 -133004929 - MT2B LTR ERVL -2 599 4 3 734 807 287 73 104 chr5 19532332 19532776 -133004483 + MLT2B4 LTR ERVL 86 527 -40 3 734 1528 206 75 9 chr5 19546154 19546501 -132990758 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 5 734 3605 166 98 83 chr5 19548690 19549531 -132987728 - RMER19B LTR ERVK -49 853 1 6 734 1475 161 77 62 chr5 19557728 19558052 -132979207 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 734 2110 231 37 39 chr5 19572881 19573400 -132963859 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 11 8 734 1234 154 304 30 chr5 19603880 19604242 -132933017 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 1 734 250 376 103 23 chr5 19615387 19615648 -132921611 - LTR88c LTR Genie? -580 282 1 1 734 296 298 50 50 chr5 19617459 19617579 -132919680 - MTEa LTR MaLR -259 120 1 1 734 404 341 58 58 chr5 19620420 19620678 -132916581 - MER34A1 LTR ERV1 -272 315 58 1 734 244 313 24 0 chr5 19638493 19638576 -132898683 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 405 1 734 1489 298 49 5 chr5 19644271 19644739 -132892520 - MT2A LTR ERVL -34 550 1 1 734 2799 167 16 25 chr5 19648402 19648917 -132888342 - RLTR20B3 LTR ERVK -67 510 1 1 734 1106 275 76 12 chr5 19660282 19660583 -132876676 + MTE2b LTR MaLR 3 314 -65 2 734 1106 275 76 12 chr5 19660625 19660665 -132876594 + MTE2b LTR MaLR 315 365 -14 2 735 355 309 122 58 chr5 19661350 19661693 -132875566 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 2 735 292 334 297 60 chr5 19661947 19662339 -132874920 - MER90a LTR ERV1 -17 597 113 2 735 3152 160 28 34 chr5 19676791 19676893 -132860366 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 492 2 735 3152 160 28 34 chr5 19676947 19677426 -132859833 - RLTR20A2 LTR ERVK -87 491 3 2 735 287 274 100 58 chr5 19678935 19679055 -132858204 + MTE2a LTR MaLR 128 252 -127 2 735 2068 123 41 41 chr5 19689567 19689932 -132847327 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK -2 365 1 2 735 54159 19 5 6 chr5 19689932 19696408 -132840851 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 735 2047 128 41 41 chr5 19696408 19696775 -132840484 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 735 255 343 132 72 chr5 19698459 19698861 -132838398 - MLT2B3 LTR ERVL -12 542 117 2 735 3142 66 2 0 chr5 19705224 19705619 -132831640 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 735 1103 208 252 97 chr5 19707370 19707781 -132829478 + MT2A LTR ERVL 8 489 -44 2 735 1103 208 252 97 chr5 19707856 19707897 -132829362 + MT2A LTR ERVL 490 530 -3 2 735 7688 187 39 49 chr5 19707899 19709200 -132828059 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 1287 -4474 2 735 7688 187 39 49 chr5 19709635 19710099 -132827160 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1288 1747 -4014 2 735 3712 130 26 122 chr5 19710099 19710870 -132826389 - RMER6A LTR ERVK 0 756 60 2 735 316 173 13 51 chr5 19710888 19710967 -132826292 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1743 1818 -3943 2 735 664 179 189 6 chr5 19710966 19711146 -132826113 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2345 3416 3204 2 735 4568 192 42 46 chr5 19711163 19712223 -132825036 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1821 2875 -2886 2 735 237 231 25 25 chr5 19712223 19712303 -132824956 - RMER2 LTR ERV1 0 567 488 2 735 4348 204 50 25 chr5 19712303 19712888 -132824371 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3488 4114 -1647 2 735 4348 204 50 25 chr5 19713251 19713612 -132823647 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4115 4457 -1304 2 735 340 174 9 124 chr5 19713612 19713717 -132823542 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5522 5614 -147 2 735 238 246 56 42 chr5 19713720 19713792 -132823467 + ORR1A3-int LTR MaLR 552 624 -1339 2 735 639 209 7 0 chr5 19713792 19713931 -132823328 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5621 5760 -1 2 735 963 231 166 142 chr5 19713935 19714455 -132822804 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 735 410 284 46 0 chr5 19717492 19717601 -132819658 + MLT1C LTR MaLR 51 164 -303 2 735 245 366 129 35 chr5 19718455 19718687 -132818572 + LTR79 LTR ERVL 265 518 -9 2 735 472 332 61 31 chr5 19720603 19720864 -132816395 - MLT1D LTR MaLR -236 269 1 2 735 1082 213 34 109 chr5 19723667 19724088 -132813171 - ORR1D1 LTR MaLR -10 360 3 2 735 1408 241 75 18 chr5 19732349 19732734 -132804525 + MTD LTR MaLR 13 419 0 2 735 744 223 250 10 chr5 19741131 19741457 -132795802 - MTD LTR MaLR -14 405 9 3 735 1298 288 79 22 chr5 19744880 19745235 -132792024 - MTEb LTR MaLR 0 379 5 3 735 320 115 19 0 chr5 19750873 19750925 -132786334 - RMER6A LTR ERVK -596 160 108 3 735 1134 264 68 107 chr5 19751131 19751513 -132785746 - MTE2b LTR MaLR -12 367 1 3 735 237 235 247 0 chr5 19751782 19751863 -132785396 - ORR1A4 LTR MaLR -5 374 274 3 735 823 169 19 13 chr5 19752061 19752207 -132785052 - ORR1A4 LTR MaLR -6 323 177 3 735 1037 131 54 0 chr5 19752207 19752254 -132785005 + RMER6A LTR ERVK 1 50 -706 3 735 1037 131 54 0 chr5 19752344 19752464 -132784795 + RMER6A LTR ERVK 51 176 -580 3 735 917 137 13 60 chr5 19752470 19752695 -132784564 - ORR1A4 LTR MaLR -169 225 1 3 735 5763 118 42 7 chr5 19760444 19761319 -132775940 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 3 735 497 252 87 0 chr5 19764777 19764904 -132772355 - RMER20B LTR ERVK -310 317 180 3 735 232 224 99 16 chr5 19777795 19777977 -132759282 + RMER17D LTR ERVK 243 439 -450 3 735 270 212 61 0 chr5 19782025 19782091 -132755168 + LTR16A1 LTR ERVL 387 456 0 3 735 3164 46 5 20 chr5 19782368 19782770 -132754489 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 736 277 244 124 16 chr5 19795331 19795460 -132741799 + MTD LTR MaLR 277 419 0 3 736 684 139 43 2 chr5 19800023 19800156 -132737103 - ORR1B1 LTR MaLR -62 312 170 4 736 455 301 169 33 chr5 19814529 19814742 -132722517 - MLT1A0 LTR MaLR -92 273 32 4 736 1294 193 37 66 chr5 19818055 19818405 -132718854 - RLTR31_Mur LTR ERVK -213 340 1 4 736 350 149 47 0 chr5 19818405 19818505 -132718754 - RMER3D-int LTR ERVK -37 2805 2742 4 736 470 297 112 54 chr5 19824353 19824613 -132712646 - LTR48B LTR ERV1 -246 398 124 4 736 1925 201 52 108 chr5 19825881 19826439 -132710820 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 4 736 3095 192 29 90 chr5 19826812 19827670 -132709589 - RLTR19-int LTR ERVK -1758 4379 3574 4 736 1675 171 14 41 chr5 19827893 19828181 -132709078 - RLTR19-int LTR ERVK -2944 3193 2917 4 736 2847 132 128 11 chr5 19828181 19828704 -132708555 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 4 736 1675 171 14 41 chr5 19828704 19828781 -132708478 - RLTR19-int LTR ERVK -3221 2916 2838 4 736 780 162 12 22 chr5 19828798 19828965 -132708294 + RLTR19-int LTR ERVK 3056 3193 -2944 4 736 2536 43 64 15 chr5 19829761 19830091 -132707168 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 736 1693 200 24 24 chr5 19831768 19832142 -132705117 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 736 1443 239 90 6 chr5 19852426 19852783 -132684476 + MTD LTR MaLR 33 419 0 4 736 495 336 105 103 chr5 19854006 19854586 -132682673 + MER21B LTR ERV1 279 859 -4 4 736 1827 152 64 149 chr5 19876729 19876996 -132660263 - MTC LTR MaLR 0 421 211 4 736 1827 152 64 149 chr5 19877164 19877352 -132659907 - MTC LTR MaLR -211 210 5 4 736 2195 40 0 21 chr5 19880952 19881233 -132656026 - IAPLTR3 LTR ERVK -51 275 1 5 736 1792 173 53 0 chr5 19887726 19888049 -132649210 - RMER6D LTR ERVK -13 707 368 5 736 234 306 159 25 chr5 19903385 19903587 -132633672 - MLT1H1 LTR MaLR -268 281 12 5 736 4152 191 39 59 chr5 19906329 19907251 -132630008 - RMER13B LTR ERVK 0 908 5 5 737 1271 234 63 75 chr5 19923092 19923518 -132613741 - RMER16 LTR ERVK 0 533 113 5 737 4469 127 17 24 chr5 19923661 19924422 -132612837 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 5 737 453 210 99 53 chr5 19937224 19937355 -132599904 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 246 5 737 879 161 93 0 chr5 19939829 19939991 -132597268 + ORR1B1 LTR MaLR 215 391 -3 5 737 260 154 0 88 chr5 19940190 19940247 -132597012 - MTD LTR MaLR 0 419 368 5 737 1380 181 172 6 chr5 19940563 19940707 -132596552 - MTD LTR MaLR -35 384 215 5 737 1380 178 178 0 chr5 19941493 19941683 -132595576 - MTD LTR MaLR -205 214 5 5 737 1515 172 35 12 chr5 19942885 19943177 -132594082 - ORR1B1 LTR MaLR -114 280 1 6 737 1163 232 60 89 chr5 19944460 19944843 -132592416 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 6 737 2073 218 129 17 chr5 19945647 19946188 -132591071 - RMER20B LTR ERVK -25 602 1 6 737 233 208 73 36 chr5 19976330 19976365 -132560894 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 496 6 737 2783 156 339 6 chr5 19976365 19977009 -132560250 - RMER13A LTR ERVK -2 858 1 6 737 233 208 73 36 chr5 19977009 19977028 -132560231 - RLTR24 LTR ERV1 -34 495 473 6 737 1208 191 66 15 chr5 19977096 19977367 -132559892 - RLTR24 LTR ERV1 -244 285 1 6 737 629 267 49 81 chr5 19977957 19978362 -132558897 - MTD LTR MaLR -21 398 6 6 737 4495 42 20 5 chr5 19978566 19979118 -132558141 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 6 737 1617 160 26 90 chr5 19982877 19983097 -132554162 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 97 6 737 1617 160 26 90 chr5 19983135 19983257 -132554002 - ORR1A4 LTR MaLR -233 96 1 6 737 1126 194 3 20 chr5 19983946 19984184 -132553075 - MT2B LTR ERVL 0 601 243 6 737 561 228 53 189 chr5 20000979 20001175 -132536084 + MTE2b LTR MaLR 1 170 -209 2 737 605 295 90 35 chr5 20001704 20001904 -132535355 + MTE2b LTR MaLR 167 377 -2 2 737 1984 207 66 37 chr5 20013009 20013626 -132523633 - BGLII_B LTR ERVK -39 514 1 1 737 286 267 45 45 chr5 20016674 20016780 -132520479 - MLT1E2 LTR MaLR 0 505 400 2 737 715 201 217 56 chr5 20016780 20017102 -132520157 - MTE2b LTR MaLR -1 378 5 2 737 636 330 63 38 chr5 20017173 20017460 -132519799 - MLT1E2 LTR MaLR -332 295 2 2 737 2510 164 15 37 chr5 20020168 20020631 -132516628 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 2 738 1202 285 87 10 chr5 20058187 20058591 -132478668 - MER70B LTR ERVL -141 437 3 6 738 316 310 73 45 chr5 20058593 20058772 -132478487 - MER77 LTR ERVL -11 596 413 6 738 286 291 23 13 chr5 20072191 20072307 -132464952 - MTEa LTR MaLR -13 366 238 8 738 4353 108 75 6 chr5 20078151 20078830 -132458429 - RMER19A LTR ERVK 0 737 12 8 738 865 207 189 20 chr5 20082099 20082407 -132454852 - MTD LTR MaLR -13 406 47 9 738 361 265 201 0 chr5 20082433 20082622 -132454637 - MTD-int LTR MaLR -22 1236 1010 9 738 1744 255 146 55 chr5 20082622 20083390 -132453869 - MTD-int LTR MaLR -412 846 9 9 738 1150 239 137 47 chr5 20083390 20083734 -132453525 - MTD LTR MaLR -12 407 32 9 738 2413 92 3 6 chr5 20092978 20093308 -132443951 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 738 1461 165 88 60 chr5 20108993 20109392 -132427867 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 738 924 239 77 93 chr5 20125433 20125500 -132411759 - MTE2b LTR MaLR -7 372 326 1 738 944 239 77 93 chr5 20125647 20125957 -132411302 - MTE2b LTR MaLR -54 325 1 1 738 980 180 147 31 chr5 20134875 20135185 -132402074 - RMER20B LTR ERVK -20 607 234 1 738 2113 170 52 48 chr5 20142269 20142688 -132394571 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 738 247 318 47 0 chr5 20142827 20142934 -132394325 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 281 1 738 795 262 121 49 chr5 20145222 20145587 -132391672 - MLT1D LTR MaLR -4 501 111 1 738 256 152 68 0 chr5 20145905 20145964 -132391295 - MLT1D LTR MaLR -533 94 32 1 738 350 282 86 54 chr5 20146065 20146286 -132390973 + LTR33 LTR ERVL 235 462 -53 1 738 1081 89 6 0 chr5 20151758 20151915 -132385344 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 355 1 738 569 62 12 0 chr5 20151932 20152012 -132385247 - RLTR1B LTR ERV1 -102 410 330 1 738 2016 121 146 16 chr5 20155310 20155681 -132381578 - MTC LTR MaLR 0 421 3 1 738 672 215 6 47 chr5 20157567 20157738 -132379521 - ORR1C2 LTR MaLR -54 330 167 1 738 446 297 110 53 chr5 20159597 20159878 -132377381 - MER68 LTR ERVL -264 299 3 1 738 309 340 136 0 chr5 20169487 20169634 -132367625 - LTR31 LTR ERV1 -156 463 297 2 738 476 361 20 67 chr5 20172789 20173086 -132364173 + MTE-int LTR MaLR 1 283 -1297 2 738 562 260 167 35 chr5 20174553 20174843 -132362416 + ORR1E LTR MaLR 25 379 0 2 739 1521 98 28 107 chr5 20193110 20193429 -132343830 - ORR1B1 LTR MaLR -75 319 26 2 739 370 234 32 119 chr5 20194320 20194343 -132342916 + MT2B LTR ERVL 143 154 -447 2 739 7278 97 9 4 chr5 20195449 20196227 -132341032 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 200 2 739 7278 97 9 4 chr5 20196455 20196654 -132340605 - RLTR13C1 LTR ERVK -784 199 1 2 739 3671 46 2 18 chr5 20200373 20200877 -132336382 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 2 739 4285 146 11 19 chr5 20203463 20204160 -132333099 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 2 739 3631 68 30 2 chr5 20212672 20213141 -132324118 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 739 2347 141 10 24 chr5 20216521 20216936 -132320323 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 2 739 2332 148 39 5 chr5 20218541 20218922 -132318337 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 739 4522 69 12 2 chr5 20219233 20219813 -132317446 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -1 586 1 2 739 4310 151 194 14 chr5 20220152 20220985 -132316274 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 1 2 739 4020 77 30 28 chr5 20221926 20222489 -132314770 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 2 739 4370 39 2 15 chr5 20224091 20224610 -132312649 - LTRIS3 LTR ERV1 0 512 1 2 739 487 62 0 165 chr5 20225276 20225373 -132311886 + MT2B LTR ERVL 207 287 -314 2 739 3153 132 48 23 chr5 20225355 20225427 -132311832 + RMER6A LTR ERVK 135 214 -542 2 739 3153 132 48 23 chr5 20225612 20226146 -132311113 + RMER6A LTR ERVK 215 756 0 2 739 2919 99 60 8 chr5 20226933 20227401 -132309858 - RMER19A LTR ERVK -245 492 1 2 739 798 220 173 111 chr5 20229798 20230030 -132307229 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 2 739 798 220 173 111 chr5 20230053 20230172 -132307087 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 2 739 1269 162 37 60 chr5 20230841 20231224 -132306035 - MTA_Mm LTR MaLR 0 374 1 3 739 8973 40 14 1 chr5 20231224 20232308 -132304951 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 739 3361 46 5 0 chr5 20232308 20232702 -132304557 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 739 480 158 0 0 chr5 20232702 20232784 -132304475 - ORR1D1 LTR MaLR -292 82 1 3 739 381 302 54 89 chr5 20234918 20235176 -132302083 + MLT1E1 LTR MaLR 302 550 -104 3 739 986 264 36 57 chr5 20235215 20235721 -132301538 - RLTR12B LTR ERVK -73 495 1 3 739 266 260 50 50 chr5 20235725 20235826 -132301433 + MLT1E1 LTR MaLR 580 680 0 3 739 246 287 69 62 chr5 20238742 20238753 -132298506 + MLT1A1 LTR MaLR 15 25 -383 3 739 246 287 69 62 chr5 20238823 20238955 -132298304 + MLT1A1 LTR MaLR 26 159 -249 3 739 1297 265 135 35 chr5 20239595 20239917 -132297342 - MTD-int LTR MaLR -340 918 470 3 739 2113 113 3 16 chr5 20239917 20240232 -132297027 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 739 1297 270 93 57 chr5 20240232 20240672 -132296587 - MTD-int LTR MaLR -775 483 9 3 739 1224 259 96 8 chr5 20240701 20241067 -132296192 - MTD LTR MaLR -21 398 1 3 739 790 191 96 23 chr5 20244490 20244710 -132292549 + RMER4B LTR ERVK 17 252 -333 3 739 394 205 22 254 chr5 20244855 20245130 -132292129 + RMER4B LTR ERVK 343 599 -12 3 739 2920 54 40 22 chr5 20245751 20246151 -132291108 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 739 2586 131 18 29 chr5 20246965 20247407 -132289852 - RLTR9B LTR ERVK 0 437 1 3 739 1999 155 141 12 chr5 20248728 20248763 -132288496 + RMER4A LTR ERVK 1 35 -431 3 739 1999 155 141 12 chr5 20248788 20249164 -132288095 + RMER4A LTR ERVK 36 464 -2 3 739 291 177 222 103 chr5 20249170 20249296 -132287963 + RMER4A LTR ERVK 326 466 0 3 739 2611 143 42 18 chr5 20260740 20261244 -132276015 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 3 739 237 349 125 23 chr5 20262421 20262597 -132274662 + MER21B LTR ERV1 194 387 -476 3 739 2927 69 6 45 chr5 20263683 20264050 -132273209 - ORR1A1-int LTR MaLR -571 1221 874 3 739 2927 69 6 45 chr5 20264272 20264372 -132272887 - ORR1A1-int LTR MaLR -919 873 772 3 739 334 236 22 26 chr5 20282690 20282801 -132254458 - MTE2b LTR MaLR -311 108 1 3 739 323 186 17 0 chr5 20285337 20285396 -132251863 - MTEa LTR MaLR -319 60 1 3 739 3656 135 110 3 chr5 20297663 20298288 -132238971 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 4 739 1298 216 70 52 chr5 20302581 20303022 -132234237 + RLTR16 LTR ERVK 1 493 -12 4 740 1270 189 41 153 chr5 20316367 20316785 -132220474 + ORR1D1 LTR MaLR 3 373 -1 4 740 2899 132 86 2 chr5 20324768 20325255 -132212004 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 4 740 2135 231 30 81 chr5 20327973 20329005 -132208254 + RMER17B LTR ERVK 1 899 -9 4 740 4430 12 2 0 chr5 20329404 20329896 -132207363 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 740 35053 13 7 0 chr5 20329896 20335221 -132202038 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 4 740 390 167 46 35 chr5 20335221 20335308 -132201951 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 4 740 302 0 0 0 chr5 20335308 20335346 -132201913 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 4 740 4430 12 2 0 chr5 20335346 20335838 -132201421 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 740 227 330 99 10 chr5 20338762 20338863 -132198396 + ORR1E LTR MaLR 22 131 -228 4 740 284 286 76 45 chr5 20339043 20339175 -132198084 + MLT1A1 LTR MaLR 267 402 -6 4 740 4499 135 17 9 chr5 20341720 20342470 -132194789 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 4 740 1596 174 42 0 chr5 20342470 20342780 -132194479 - RMER6-int LTR ERVK -2 3175 2853 4 740 1364 129 15 54 chr5 20342806 20343067 -132194192 - RMER6-int LTR ERVK -403 2774 2524 4 740 2983 124 110 18 chr5 20343080 20343636 -132193623 - RMER6-int LTR ERVK -2563 614 8 4 740 1374 153 51 4 chr5 20343687 20343962 -132193297 + MYSERV6-int LTR ERVK 8672 8959 0 4 740 1424 168 158 162 chr5 20343963 20344426 -132192833 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 4 740 475 354 68 32 chr5 20355363 20355614 -132181645 - MLT1L LTR MaLR -317 293 34 5 740 313 302 114 45 chr5 20355711 20355912 -132181347 + MLT1K LTR MaLR 374 588 -7 5 740 2397 168 102 10 chr5 20356015 20356509 -132180750 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 569 -9 5 740 290 139 253 11 chr5 20368838 20368925 -132168334 + RMER17C LTR ERVK 169 276 -134 5 740 2281 74 29 13 chr5 20369715 20370029 -132167230 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 740 841 172 69 23 chr5 20370036 20370209 -132167050 + ORR1A2-int LTR MaLR 8 188 -1775 5 740 1541 73 22 31 chr5 20370188 20370415 -132166844 + ORR1A2-int LTR MaLR 893 1117 -846 5 740 304 217 164 62 chr5 20373302 20373430 -132163829 - MT2B LTR ERVL -337 264 124 5 740 262 286 18 152 chr5 20379625 20379742 -132157517 - MT2B LTR ERVL -353 248 154 5 740 383 58 19 0 chr5 20379742 20379794 -132157465 - MTB LTR MaLR 0 400 348 5 740 2668 78 0 6 chr5 20380679 20381039 -132156220 - MTB LTR MaLR -42 358 1 5 740 902 230 77 17 chr5 20381043 20381277 -132155982 + ORR1D1 LTR MaLR 98 345 -29 5 740 555 134 0 0 chr5 20381263 20381345 -132155914 + ORR1D1-int LTR MaLR 1428 1509 0 5 740 995 169 277 43 chr5 20381345 20381648 -132155611 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 740 1373 213 84 40 chr5 20384107 20384454 -132152805 + ORR1D1 LTR MaLR 1 362 -12 5 740 303 231 38 91 chr5 20404825 20404981 -132132278 + MTEb LTR MaLR 218 377 -2 6 740 2080 116 54 13 chr5 20419286 20419601 -132117658 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 6 740 1321 191 94 56 chr5 20424160 20424520 -132112739 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 740 2990 151 33 56 chr5 20428949 20429489 -132107770 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 6 740 601 220 67 54 chr5 20441254 20441647 -132095612 - RMER10A LTR ERVL 0 442 7 7 740 1317 199 169 20 chr5 20442143 20442491 -132094768 + MTD LTR MaLR 12 411 -8 7 92 1279 209 105 13 chr5 20447125 20447430 -132089829 + ORR1D2 LTR MaLR 38 370 0 7 741 385 257 64 43 chr5 20451279 20451458 -132085801 + MLT1B LTR MaLR 190 374 0 7 741 255 282 23 86 chr5 20462757 20462885 -132074374 - MT2B LTR ERVL -341 260 141 7 741 3277 36 8 8 chr5 20464773 20465169 -132072090 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 741 2833 96 88 2 chr5 20466645 20467041 -132070218 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 7 741 1470 156 117 41 chr5 20467041 20467084 -132070175 - ORR1C2 LTR MaLR -7 377 343 7 741 1470 156 117 41 chr5 20467267 20467564 -132069695 - ORR1C2 LTR MaLR -42 342 11 7 741 560 261 67 75 chr5 20467568 20467850 -132069409 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 300 -277 7 741 679 212 136 62 chr5 20468204 20468461 -132068798 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 309 7 741 849 182 309 7 chr5 20471739 20472057 -132065202 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 8 741 705 241 48 92 chr5 20474256 20474356 -132062903 - RMER5 LTR ERV1 -26 508 405 8 741 705 241 48 92 chr5 20474545 20474736 -132062523 - RMER5 LTR ERV1 -130 404 230 8 741 464 188 112 45 chr5 20474747 20474881 -132062378 - RMER5 LTR ERV1 -360 174 32 8 741 276 241 125 72 chr5 20479744 20479896 -132057363 - RLTR9A LTR ERVK -6 397 236 8 741 331 165 22 76 chr5 20479946 20480038 -132057221 - RLTR9A LTR ERVK -281 87 1 8 741 1416 196 64 19 chr5 20485884 20486196 -132051063 - MTD LTR MaLR -81 338 13 8 741 1729 177 27 85 chr5 20486651 20487000 -132050259 + ORR1C1 LTR MaLR 1 335 -43 8 741 1729 177 27 85 chr5 20487189 20487240 -132050019 + ORR1C1 LTR MaLR 336 378 0 8 741 1283 229 221 22 chr5 20489457 20489873 -132047386 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 8 741 363 67 108 96 chr5 20490317 20490354 -132046905 + ORR1C2 LTR MaLR 298 341 -43 8 741 363 67 108 96 chr5 20490755 20490800 -132046459 + ORR1C2 LTR MaLR 342 381 -3 8 741 1806 155 78 9 chr5 20500004 20500337 -132036922 + RMER13A LTR ERVK 76 431 -429 1 741 512 226 105 22 chr5 20500327 20500465 -132036794 + RMER13A LTR ERVK 563 759 -149 1 741 247 250 132 0 chr5 20500491 20500559 -132036700 + RMER13A LTR ERVK 671 747 -113 2 741 588 235 64 42 chr5 20513044 20513333 -132023926 + ORR1E LTR MaLR 5 370 0 3 741 1935 182 27 15 chr5 20516305 20516707 -132020552 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 741 1799 115 59 135 chr5 20533296 20533610 -132003649 + ORR1B1 LTR MaLR 33 339 -55 8 741 1799 115 59 135 chr5 20533798 20533875 -132003384 + ORR1B1 LTR MaLR 340 394 0 8 741 844 274 129 12 chr5 20533897 20534222 -132003037 + MLT1A0 LTR MaLR 3 365 0 8 741 715 239 105 56 chr5 20540401 20540739 -131996520 - MTD LTR MaLR -14 365 1 9 741 270 238 32 198 chr5 20542485 20542642 -131994617 + MT2B LTR ERVL 105 235 -366 1 741 945 305 144 29 chr5 20544426 20544878 -131992381 - MER68 LTR ERVL -59 504 1 1 741 844 295 77 47 chr5 20546094 20546393 -131990866 + ORR1E LTR MaLR 32 339 -20 1 741 1907 199 26 26 chr5 20551179 20551598 -131985661 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 741 248 328 126 16 chr5 20566131 20566258 -131971001 + MLT1M LTR MaLR 188 328 -344 1 741 438 281 100 100 chr5 20570637 20570938 -131966321 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 1 741 844 261 63 19 chr5 20573448 20573720 -131963539 + MTD LTR MaLR 1 322 -97 1 741 725 253 226 32 chr5 20573720 20574034 -131963225 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 1 741 565 317 157 34 chr5 20576629 20577037 -131960222 + MLT1F LTR MaLR 4 461 -87 1 741 957 186 50 85 chr5 20578018 20578103 -131959156 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 413 1 741 957 186 50 85 chr5 20578146 20578170 -131959089 - RLTR16 LTR ERVK -93 412 405 1 742 957 186 50 85 chr5 20578359 20578505 -131958754 - RLTR16 LTR ERVK -101 404 258 1 742 2588 30 3 3 chr5 20578505 20578836 -131958423 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 55 1 742 1412 157 31 8 chr5 20578836 20579093 -131958166 - RLTR16 LTR ERVK -242 263 1 1 742 905 202 26 60 chr5 20580280 20580329 -131956930 + MTD LTR MaLR 1 44 -375 2 742 2254 121 3 0 chr5 20580329 20580651 -131956608 + ORR1A2 LTR MaLR 3 325 -2 2 742 905 202 26 60 chr5 20580651 20580833 -131956426 + MTD LTR MaLR 45 224 -195 2 742 432 218 8 31 chr5 20581042 20581170 -131956089 + MTD LTR MaLR 202 326 -93 2 742 2760 70 72 3 chr5 20581554 20581928 -131955331 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 742 2356 102 3 11 chr5 20582142 20582500 -131954759 + RLTR19 LTR ERVK 1 355 -144 2 742 1936 59 118 0 chr5 20584032 20584319 -131952940 + MTB LTR MaLR 80 400 0 2 742 2542 151 0 10 chr5 20585201 20585609 -131951650 + MTB_Mm LTR MaLR 1 404 -3 2 742 374 216 0 58 chr5 20596057 20596160 -131941099 - MLT1F2 LTR MaLR -16 544 458 2 742 334 195 50 121 chr5 20596242 20596341 -131940918 + RMER20A LTR ERVK 70 161 -355 2 742 322 283 0 11 chr5 20596691 20596784 -131940475 - MTEb LTR MaLR -9 370 279 2 742 435 200 129 182 chr5 20597971 20598234 -131939025 + MTE2a LTR MaLR 130 378 -1 2 742 501 289 54 32 chr5 20600935 20601121 -131936138 - RMER15 LTR ERVL -14 561 372 2 742 1915 148 16 7 chr5 20601841 20602147 -131935112 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 2 742 1414 143 64 24 chr5 20602147 20602398 -131934861 - IAP-d-int LTR ERVK 0 7581 7321 2 742 1499 91 5 0 chr5 20602537 20602734 -131934525 - IAP-d-int LTR ERVK -217 6325 6128 2 742 692 96 0 0 chr5 20602737 20602831 -131934428 - IAP-d-int LTR ERVK -521 6021 5928 2 742 2108 48 116 3 chr5 20602881 20603251 -131934008 - IAP-d-int LTR ERVK -1124 5418 5007 2 742 686 205 40 7 chr5 20603251 20603403 -131933856 - IAP-d-int LTR ERVK -6039 503 347 2 742 652 100 0 39 chr5 20603397 20603501 -131933758 - IAP-d-int LTR ERVK -6365 177 78 2 742 770 238 23 32 chr5 20603595 20603912 -131933347 - RLTR10-int LTR ERVK -6716 865 553 2 742 276 217 0 0 chr5 20604134 20604180 -131933079 - RLTR10-int LTR ERVK -7314 267 222 2 742 1904 140 30 3 chr5 20604217 20604518 -131932741 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 2 742 321 235 31 85 chr5 20604750 20604866 -131932393 + RLTR15 LTR ERVK 1 112 -247 2 742 321 235 31 85 chr5 20604897 20604910 -131932349 + RLTR15 LTR ERVK 113 123 -236 2 742 3050 18 0 0 chr5 20606556 20606893 -131930366 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 742 51283 17 12 4 chr5 20606893 20613287 -131923972 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 2 742 3022 15 3 0 chr5 20613287 20613623 -131923636 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 742 659 204 62 29 chr5 20619241 20619481 -131917778 - RLTR20B2 LTR ERVK -109 451 83 2 742 3386 30 5 2 chr5 20633196 20633591 -131903668 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 742 580 286 191 10 chr5 20636274 20636567 -131900692 - MLT1A0 LTR MaLR -19 346 1 2 742 2505 92 3 0 chr5 20644270 20644595 -131892664 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 742 339 332 26 91 chr5 20650373 20650638 -131886621 + MLT1N2 LTR MaLR 154 401 -161 3 742 3077 66 5 10 chr5 20651310 20651708 -131885551 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 742 289 83 42 0 chr5 20653542 20653590 -131883669 + ORR1B1 LTR MaLR 345 394 0 3 742 280 290 105 55 chr5 20655533 20655752 -131881507 - ORR1E LTR MaLR -62 297 68 3 742 1119 206 95 171 chr5 20656708 20657212 -131880047 + RMER4B LTR ERVK 1 466 0 3 742 354 202 15 15 chr5 20659494 20659625 -131877634 - RMER17A LTR ERVK -299 452 322 3 742 3626 139 74 15 chr5 20663566 20664217 -131873042 - RMER6C LTR ERVK -1 689 1 3 742 1773 180 27 109 chr5 20664366 20664778 -131872481 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 742 3918 157 81 84 chr5 20667363 20668268 -131868991 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 3 742 323 102 104 54 chr5 20668628 20668706 -131868553 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 308 3 742 4479 154 70 62 chr5 20668690 20669740 -131867519 - ORR1C1-int LTR MaLR -112 1397 339 3 742 1393 233 27 96 chr5 20669810 20670480 -131866779 + RMER20A LTR ERVK 26 603 -24 3 742 364 223 30 119 chr5 20670788 20670852 -131866407 + MT2B LTR ERVL 106 154 -430 3 742 3978 125 30 45 chr5 20671212 20671563 -131865696 + RMER17A LTR ERVK 1 354 -397 3 742 3978 125 30 45 chr5 20671668 20672078 -131865181 + RMER17A LTR ERVK 355 751 0 3 742 522 290 80 13 chr5 20675908 20676132 -131861127 - MTC LTR MaLR -165 256 18 3 742 1641 205 65 8 chr5 20676269 20676652 -131860607 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 742 1154 202 168 43 chr5 20680002 20680395 -131856864 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 3 742 1093 227 48 56 chr5 20683360 20683790 -131853469 + RLTR20B3 LTR ERVK 86 564 -13 3 742 1667 161 199 79 chr5 20684134 20684872 -131852387 - RMER6C LTR ERVK -5 715 5 3 742 442 302 105 68 chr5 20685267 20685562 -131851697 + MLT1J LTR MaLR 170 475 -37 3 742 438 285 81 32 chr5 20686246 20686514 -131850745 - MTD LTR MaLR -55 364 48 4 742 381 249 90 65 chr5 20697628 20698022 -131839237 + RLTR15 LTR ERVK 1 356 -3 4 742 238 300 109 0 chr5 20698724 20698834 -131838425 + MER76 LTR ERVL 121 242 -449 4 742 514 200 48 72 chr5 20698998 20699165 -131838094 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 480 4 742 3083 85 2 0 chr5 20701172 20701571 -131835688 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 742 380 240 73 52 chr5 20705805 20705941 -131831318 - MLT1A1 LTR MaLR -9 399 261 4 742 2002 118 36 46 chr5 20708984 20709313 -131827946 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 4 743 233 276 75 33 chr5 20716568 20716688 -131820571 - LTR16C LTR ERVL -1 488 364 4 743 1168 263 59 27 chr5 20718606 20718981 -131818278 + MTD LTR MaLR 18 404 -15 4 743 2170 92 6 0 chr5 20720955 20721272 -131815987 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 743 3178 136 199 5 chr5 20735827 20736395 -131800864 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 4 743 3056 15 0 0 chr5 20741235 20741572 -131795687 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 743 57308 24 3 9 chr5 20741572 20748083 -131789176 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 4 743 3056 15 0 0 chr5 20748083 20748420 -131788839 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 743 707 254 40 10 chr5 20749167 20749366 -131787893 - LTRIS4 LTR ERV1 -18 489 285 4 743 1405 150 111 118 chr5 20750114 20750255 -131787004 - RMER16 LTR ERVK 0 533 396 4 743 1405 150 111 118 chr5 20750443 20750725 -131786534 - RMER16 LTR ERVK -138 395 113 4 743 1320 150 251 36 chr5 20751078 20751436 -131785823 - RLTR41 LTR ERV1 -11 435 1 4 743 807 318 29 6 chr5 20751540 20751888 -131785371 - RLTR6-int LTR ERV1 -72 7706 7401 4 743 422 152 184 49 chr5 20752414 20752587 -131784672 - RLTR41 LTR ERV1 -205 241 1 4 743 310 257 60 76 chr5 20754550 20754735 -131782524 - MLT1D LTR MaLR -22 483 302 4 743 2397 111 3 0 chr5 20755363 20755687 -131781572 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 4 743 231 197 106 76 chr5 20757460 20757526 -131779733 + MT2B2 LTR ERVL 189 256 -328 5 743 444 317 104 62 chr5 20762259 20762568 -131774691 - MTEa LTR MaLR 0 379 58 5 743 293 183 79 79 chr5 20766054 20766143 -131771116 + MLT1A LTR MaLR 19 107 -267 5 743 410 296 110 16 chr5 20770078 20770260 -131766999 - RMER15 LTR ERVL 0 575 377 5 743 1241 233 38 77 chr5 20771629 20771847 -131765412 - MTD LTR MaLR 0 419 224 5 743 1241 233 38 77 chr5 20771868 20772067 -131765192 - MTD LTR MaLR -196 223 19 5 743 3210 36 20 15 chr5 20782306 20782697 -131754562 + MTA_Mm LTR MaLR 4 396 0 5 743 691 180 0 0 chr5 20789847 20789969 -131747290 + MTC LTR MaLR 1 122 -299 5 743 1596 162 13 22 chr5 20791670 20791985 -131745274 + MTC LTR MaLR 110 421 0 5 743 574 290 150 6 chr5 20800697 20801030 -131736229 - MTD LTR MaLR -38 381 1 5 743 458 243 40 74 chr5 20810245 20810538 -131726721 - RLTR20C LTR ERVK -231 303 1 5 743 927 270 93 9 chr5 20819725 20820046 -131717213 + MER90 LTR ERV1 79 426 -149 5 743 1049 265 54 36 chr5 20824177 20824564 -131712695 + MTD LTR MaLR 1 394 -25 5 743 463 237 94 12 chr5 20828064 20828235 -131709024 + ORR1D1 LTR MaLR 158 342 -32 5 743 250 305 115 32 chr5 20838613 20838769 -131698490 + LTR16E1 LTR ERVL 370 538 0 6 743 3405 56 2 10 chr5 20839942 20840341 -131696918 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 744 3638 23 5 0 chr5 20849073 20849467 -131687792 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 744 9754 34 4 1 chr5 20849467 20850562 -131686697 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 744 3638 23 5 0 chr5 20850562 20850956 -131686303 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 744 1037 270 167 9 chr5 20854698 20855045 -131682214 + MTD LTR MaLR 18 419 0 6 744 1026 295 120 56 chr5 20858365 20858832 -131678427 + MLT1D LTR MaLR 1 497 -8 6 744 236 156 0 22 chr5 20867755 20867801 -131669458 - LTR52 LTR ERVL -48 373 329 6 744 3700 158 36 10 chr5 20868019 20868703 -131668556 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1621 2322 -4 6 744 337 294 9 38 chr5 20868703 20868809 -131668450 + RLTR20B2 LTR ERVK 69 171 -389 6 744 996 261 126 49 chr5 20868937 20869287 -131667972 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 6 744 2338 132 6 6 chr5 20871576 20871935 -131665324 - ORR1B1 LTR MaLR -12 382 24 6 744 967 250 34 53 chr5 20891167 20891488 -131645771 + MER74A LTR ERVL 218 532 -26 6 744 2670 176 24 6 chr5 20892457 20892959 -131644300 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 511 -16 6 744 322 182 143 57 chr5 20893492 20893597 -131643662 - RLTR21 LTR ERVK -121 1451 1338 6 744 4051 164 42 29 chr5 20893727 20893799 -131643460 - RMER12 LTR ERVK -486 836 770 6 744 4051 164 42 29 chr5 20893862 20894614 -131642645 - RMER12 LTR ERVK -553 769 1 6 744 750 250 26 0 chr5 20903138 20903294 -131633965 + MTE2b LTR MaLR 125 284 -95 7 744 1785 219 68 93 chr5 20903792 20904276 -131632983 + RMER19C LTR ERVK 138 609 -2 7 744 1858 88 0 0 chr5 20905153 20905403 -131631856 + ORR1A3 LTR MaLR 77 326 0 7 744 2130 112 43 30 chr5 20907113 20907418 -131629841 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 7 744 2303 152 11 24 chr5 20909283 20909653 -131627606 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 7 744 297 186 42 14 chr5 20916662 20916733 -131620526 + ORR1D1 LTR MaLR 301 373 -1 7 744 1921 103 242 25 chr5 20927143 20927337 -131609922 + RMER10B LTR ERVL 1 200 -198 7 744 1921 103 242 25 chr5 20927457 20927588 -131609671 + RMER10B LTR ERVL 201 397 -1 7 744 1203 189 184 55 chr5 20932811 20933159 -131604100 + MTD LTR MaLR 1 393 -26 7 744 1131 243 109 18 chr5 20938152 20938503 -131598756 + MTD LTR MaLR 14 379 0 7 744 1054 316 91 10 chr5 20946621 20947037 -131590222 - LTR16A LTR ERVL 0 451 2 7 744 244 285 39 31 chr5 20950344 20950471 -131586788 + RMER17C LTR ERVK 181 308 -102 7 744 817 324 168 7 chr5 20951592 20951996 -131585263 - MLT1F2 LTR MaLR -83 477 9 7 744 3725 28 136 0 chr5 20959018 20959452 -131577807 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 744 1044 192 231 23 chr5 20962693 20962992 -131574267 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 10 7 745 322 352 66 62 chr5 20987089 20987377 -131549882 - MLT1E1 LTR MaLR -92 562 274 7 745 332 284 58 151 chr5 20993684 20993876 -131543383 + MLT1H2 LTR MaLR 270 470 -79 8 745 332 284 31 164 chr5 20994066 20994150 -131543109 + MLT1H2 LTR MaLR 425 549 0 8 745 491 278 94 19 chr5 20995652 20995865 -131541394 + LTR37B LTR ERV1 198 426 -42 8 745 1897 119 26 70 chr5 20997155 20997497 -131539762 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 8 745 393 113 0 0 chr5 21000575 21000637 -131536622 - RMER6B LTR ERVK -1 460 399 2 745 1729 124 93 77 chr5 21000727 21001103 -131536156 - RMER6B LTR ERVK -73 388 7 2 745 241 294 103 36 chr5 21005843 21006099 -131531160 - MTEb LTR MaLR -3 376 85 8 745 316 331 14 34 chr5 21010770 21010917 -131526342 - RMER15 LTR ERVL -85 490 347 1 745 2039 100 3 0 chr5 21016125 21016415 -131520844 - ORR1A2 LTR MaLR -36 291 1 2 745 1221 155 14 0 chr5 21018694 21018907 -131518352 + RMER6A LTR ERVK 541 756 0 2 745 1402 174 11 39 chr5 21022278 21022314 -131514945 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 348 3 745 3439 45 0 0 chr5 21022314 21022710 -131514549 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 745 1402 174 11 39 chr5 21022710 21022954 -131514305 - ORR1C1 LTR MaLR -31 347 106 3 745 236 33 0 0 chr5 21023100 21023130 -131514129 - ORR1C1 LTR MaLR -354 30 1 3 745 1492 198 112 23 chr5 21023486 21023833 -131513426 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 745 745 92 0 0 chr5 21032095 21032204 -131505055 + ORR1A4 LTR MaLR 221 329 0 4 745 239 225 53 63 chr5 21032337 21032417 -131504842 - MLT2C1 LTR ERVL 0 559 481 4 745 398 303 18 122 chr5 21032570 21032792 -131504467 - MLT2C1 LTR ERVL -57 340 142 4 745 1305 198 86 22 chr5 21036668 21036983 -131500276 + ORR1D1 LTR MaLR 40 374 0 5 745 1778 195 58 80 chr5 21036983 21037460 -131499799 + ORR1D1-int LTR MaLR 97 562 -808 5 745 806 297 46 68 chr5 21039281 21039675 -131497584 - MLT1B LTR MaLR -4 386 2 5 745 778 290 42 84 chr5 21041399 21041757 -131495502 - ORR1E LTR MaLR -9 350 8 6 745 1487 244 109 8 chr5 21042228 21042703 -131494556 + RMER5 LTR ERV1 1 523 -11 6 745 2847 95 16 0 chr5 21042856 21043244 -131494015 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 745 2149 143 48 38 chr5 21045805 21045868 -131491391 + MTC LTR MaLR 18 79 -342 7 745 2149 143 48 38 chr5 21046008 21046344 -131490915 + MTC LTR MaLR 80 421 0 7 745 539 243 98 119 chr5 21048061 21048346 -131488913 - MER67D LTR ERV1 -216 298 20 7 745 1764 122 81 0 chr5 21053633 21053928 -131483331 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 745 1357 133 353 4 chr5 21054663 21054935 -131482324 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 9 745 1070 268 115 14 chr5 21075218 21075566 -131461693 - MTD LTR MaLR -36 383 1 1 745 970 291 57 38 chr5 21080184 21080609 -131456650 - MER67C LTR ERV1 -34 677 245 1 745 1172 182 62 43 chr5 21083801 21084105 -131453154 + RLTR20C LTR ERVK 1 310 -224 1 745 380 224 207 0 chr5 21084099 21084154 -131453105 + RLTR20C LTR ERVK 416 472 -106 1 745 380 224 207 0 chr5 21084197 21084257 -131453002 + RLTR20C LTR ERVK 473 554 -24 1 745 395 264 51 63 chr5 21084490 21084648 -131452611 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 212 367 -2475 1 745 1548 193 45 24 chr5 21085242 21085641 -131451618 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 290 -2036 1 745 2586 168 30 51 chr5 21087144 21087709 -131449550 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 553 0 1 745 480 261 161 107 chr5 21093133 21093229 -131444030 + RLTR12B LTR ERVK 12 109 -419 1 745 480 261 161 107 chr5 21093584 21093964 -131443295 + RLTR12B LTR ERVK 110 514 -14 1 745 232 208 19 0 chr5 21095195 21095248 -131442011 - LTR68 LTR ERV1 -1 739 686 1 745 262 261 114 0 chr5 21095616 21095704 -131441555 - LTR68 LTR ERV1 -104 636 539 1 745 526 301 51 0 chr5 21095962 21096138 -131441121 - MLT1D LTR MaLR -300 205 21 1 745 251 216 40 26 chr5 21099445 21099521 -131437738 - MTC LTR MaLR -71 348 272 1 745 253 221 37 61 chr5 21099514 21099596 -131437663 - MTC LTR MaLR -339 82 3 1 745 1115 261 90 36 chr5 21100556 21100977 -131436282 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4460 4903 -811 1 745 651 281 147 11 chr5 21100990 21101263 -131435996 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4999 5308 -449 1 745 970 123 82 0 chr5 21101298 21101468 -131435791 - MTC LTR MaLR -217 204 21 1 746 495 276 73 76 chr5 21103110 21103412 -131433847 + RLTR17 LTR ERVK 125 425 -267 1 746 3010 35 0 0 chr5 21109379 21109725 -131427534 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 746 4023 158 148 8 chr5 21110783 21111574 -131425685 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 746 1209 152 238 0 chr5 21112467 21112769 -131424490 - MTB_Mm LTR MaLR -29 378 5 1 746 1963 134 6 38 chr5 21113118 21113458 -131423801 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 746 730 213 112 54 chr5 21114034 21114257 -131423002 + RMER10A LTR ERVL 2 237 -205 1 746 1743 188 60 35 chr5 21116095 21116464 -131420795 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 746 280 262 143 75 chr5 21117595 21117756 -131419503 + RLTR12B LTR ERVK 127 298 -230 2 746 1378 198 4 4 chr5 21121617 21121860 -131415399 + RodERV21-int LTR ERV1 3924 4166 -825 2 746 2441 165 30 36 chr5 21121977 21122443 -131414816 + RodERV21-int LTR ERV1 4370 4832 -159 2 746 285 289 0 0 chr5 21122450 21122533 -131414726 + RMER4B LTR ERVK 359 441 -144 2 746 414 194 240 29 chr5 21122690 21122865 -131414394 + RMER21B LTR ERV1 356 567 -275 2 746 4969 112 43 36 chr5 21129961 21130843 -131406416 - RMER12 LTR ERVK -434 888 1 2 746 1749 148 54 6 chr5 21130843 21131174 -131406085 + ORR1C2 LTR MaLR 17 363 -21 2 746 387 41 0 0 chr5 21131174 21131223 -131406036 + ORR1C2 LTR MaLR 336 384 0 2 746 1097 165 32 5 chr5 21131223 21131442 -131405817 - MTC LTR MaLR -196 225 1 2 746 345 285 80 7 chr5 21132133 21132271 -131404988 - RMER15 LTR ERVL -22 553 406 2 746 2742 120 5 8 chr5 21134956 21135351 -131401908 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 746 7487 161 45 55 chr5 21135351 21136638 -131400621 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 244 2 746 7487 161 45 55 chr5 21136785 21137022 -131400237 - ORR1B1-int LTR MaLR -1266 243 1 2 746 1165 144 15 0 chr5 21137024 21137219 -131400040 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 195 2 746 269 147 64 18 chr5 21137197 21137271 -131399988 - ORR1B1 LTR MaLR -352 42 1 2 746 2127 94 94 25 chr5 21141681 21142042 -131395217 + LTRIS4 LTR ERV1 122 507 0 2 746 1407 174 87 26 chr5 21155311 21155820 -131381439 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 1 2 746 1928 192 174 27 chr5 21156313 21156467 -131380792 - RLTR40 LTR ERVK -97 720 537 2 746 2429 132 0 8 chr5 21156467 21156835 -131380424 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 2 746 1928 192 174 27 chr5 21156835 21157302 -131379957 - RLTR40 LTR ERVK -281 536 8 2 746 231 216 0 0 chr5 21157818 21157869 -131379390 + RLTR12B LTR ERVK 14 64 -464 2 746 290 292 107 37 chr5 21157937 21158207 -131379052 + RLTR15 LTR ERVK 34 322 -37 2 746 3406 28 5 2 chr5 21160476 21160871 -131376388 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 746 9319 31 6 1 chr5 21160871 21161963 -131375296 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 746 3474 23 8 0 chr5 21161963 21162356 -131374903 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 746 4199 116 4 181 chr5 21173982 21174485 -131362774 + RMER6A LTR ERVK 1 358 -398 3 746 4199 116 4 181 chr5 21174512 21174926 -131362333 + RMER6A LTR ERVK 359 756 0 3 746 929 200 77 3 chr5 21183828 21184135 -131353124 + ORR1D2 LTR MaLR 1 354 -5 3 746 2140 218 169 39 chr5 21194288 21195049 -131342210 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 3 746 3315 83 49 0 chr5 21198360 21198851 -131338408 + RLTR13D4 LTR ERVK 18 532 -501 3 746 445 310 65 69 chr5 21210329 21210575 -131326684 + MLT1D LTR MaLR 1 245 -260 3 746 303 279 115 8 chr5 21210603 21210733 -131326526 + MLT1D LTR MaLR 346 489 -16 3 746 3917 30 35 84 chr5 21211394 21211487 -131325772 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 93 -426 3 746 3917 30 35 84 chr5 21211673 21212125 -131325134 + MURVY-LTR LTR ERV1 94 519 0 3 746 2781 134 47 4 chr5 21213986 21214474 -131322785 + ORR1B1-int LTR MaLR 1001 1509 0 3 746 1923 131 53 20 chr5 21214474 21214816 -131322443 + ORR1B1 LTR MaLR 1 353 -41 3 746 2180 171 113 60 chr5 21215030 21215702 -131321557 - ORR1A3-int LTR MaLR -534 1429 722 3 746 1024 264 81 30 chr5 21215720 21216114 -131321145 - BGLII_B LTR ERVK -18 423 10 3 746 260 185 215 0 chr5 21216164 21216229 -131321030 - MT2B LTR ERVL -447 154 76 3 746 738 138 31 0 chr5 21216477 21216607 -131320652 - MT2B LTR ERVL -467 134 1 3 746 800 221 17 58 chr5 21216833 21217127 -131320132 + ORR1D1 LTR MaLR 3 368 -6 3 746 240 343 0 0 chr5 21217134 21217204 -131320055 + MLT1A LTR MaLR 45 114 -260 3 746 792 243 82 13 chr5 21217798 21218031 -131319228 + MLT-int LTR MaLR 1425 1673 -62 3 746 396 241 52 58 chr5 21219667 21219821 -131317438 + MT2B LTR ERVL 126 278 -323 3 746 405 193 193 0 chr5 21219881 21219995 -131317264 - MTEb LTR MaLR -122 257 122 3 746 238 211 132 0 chr5 21221339 21221415 -131315844 + MTD LTR MaLR 1 86 -333 4 746 1332 222 63 15 chr5 21221515 21221848 -131315411 + MTD LTR MaLR 71 419 0 4 746 745 287 72 94 chr5 21222487 21223040 -131314219 + RLTR26 LTR ERVK 97 637 -5 4 746 1279 256 57 9 chr5 21223160 21223491 -131313768 + RMER15-int LTR ERVL 4358 4704 -295 4 746 328 305 66 12 chr5 21223874 21224040 -131313219 + RMER15 LTR ERVL 276 450 -125 4 746 561 195 97 0 chr5 21224086 21224199 -131313060 - RMER19B LTR ERVK -192 710 587 4 746 281 204 83 58 chr5 21224535 21224655 -131312604 - ORR1E LTR MaLR -157 202 80 4 746 264 246 0 15 chr5 21225066 21225132 -131312127 + MLT1A LTR MaLR 3 67 -307 4 746 1611 234 45 47 chr5 21225159 21225629 -131311630 + RLTR28B LTR ERVL 13 481 0 4 746 573 242 26 62 chr5 21226137 21226331 -131310928 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 244 4 746 2040 83 21 60 chr5 21227065 21227396 -131309863 + ORR1A2 LTR MaLR 10 327 0 4 746 644 217 64 21 chr5 21228462 21228650 -131308609 - RLTR20A2 LTR ERVK -338 240 45 4 746 244 211 69 14 chr5 21229138 21229210 -131308049 + MLT1A LTR MaLR 299 374 0 4 746 1201 201 92 28 chr5 21229460 21229836 -131307423 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 4 747 3122 20 0 0 chr5 21233695 21234041 -131303218 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 747 372 305 103 62 chr5 21235261 21235534 -131301725 - LTR16A1 LTR ERVL -89 367 84 4 747 540 298 112 66 chr5 21237715 21238186 -131299073 + RLTR11A2 LTR ERVK 19 511 -16 4 747 1241 142 32 5 chr5 21239715 21239935 -131297324 + RMER6A LTR ERVK 531 756 0 4 747 738 265 69 4 chr5 21241408 21241639 -131295620 - ORR1E LTR MaLR -72 287 42 4 747 1419 166 127 9 chr5 21243742 21243922 -131293337 - ORR1C1 LTR MaLR -16 362 165 4 747 1419 166 127 9 chr5 21243943 21244085 -131293174 - ORR1C1 LTR MaLR -214 164 2 4 747 245 286 20 81 chr5 21271726 21271825 -131265434 + RMER15 LTR ERVL 425 517 -58 4 747 3142 47 37 3 chr5 21272645 21273028 -131264231 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 747 3447 23 5 5 chr5 21276580 21276976 -131260283 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 747 9634 28 0 0 chr5 21276976 21278074 -131259185 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 747 3545 20 2 0 chr5 21278074 21278469 -131258790 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 747 3437 166 98 70 chr5 21285019 21285899 -131251360 + RMER13B LTR ERVK 5 908 0 5 747 696 209 144 86 chr5 21295875 21296153 -131241106 - MER68 LTR ERVL -267 296 3 5 747 667 149 134 176 chr5 21297605 21297735 -131239524 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 481 5 747 1987 124 60 15 chr5 21297779 21298158 -131239101 - RLTR20D LTR ERVK -88 480 1 5 747 270 262 17 142 chr5 21310250 21310370 -131226889 - MT2B LTR ERVL -341 260 156 5 747 3121 63 10 0 chr5 21314332 21314728 -131222531 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 747 1871 156 121 84 chr5 21323958 21324304 -131212955 + MTC LTR MaLR 1 377 -44 5 747 1871 156 121 84 chr5 21324451 21324510 -131212749 + MTC LTR MaLR 378 421 0 5 747 806 188 34 11 chr5 21325130 21325308 -131211951 + RLTR16 LTR ERVK 1 182 -323 5 747 1360 133 196 103 chr5 21330932 21331252 -131206007 - ORR1B1 LTR MaLR -9 320 3 6 747 2052 300 95 25 chr5 21331720 21332634 -131204625 + MTE-int LTR MaLR 24 1002 -578 6 747 405 287 45 27 chr5 21332634 21332827 -131204432 + ORR1E LTR MaLR 1 195 -175 6 747 1122 276 86 3 chr5 21335128 21335477 -131201782 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 6 747 1652 273 50 56 chr5 21344018 21344624 -131192635 + RLTR18 LTR ERVK 15 616 0 6 747 717 256 32 38 chr5 21345095 21345440 -131191819 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 6 747 1358 244 47 11 chr5 21346681 21347041 -131190218 + MTE2b LTR MaLR 3 375 -4 6 747 521 239 199 80 chr5 21352459 21352795 -131184464 + MTE2a LTR MaLR 3 378 -1 6 747 231 289 238 13 chr5 21354494 21354645 -131182614 - ORR1E LTR MaLR -169 190 6 6 747 702 227 130 61 chr5 21355102 21355461 -131181798 + MTD LTR MaLR 1 421 0 6 747 423 229 95 0 chr5 21356132 21356237 -131181022 + MTD LTR MaLR 1 115 -304 6 747 433 179 80 40 chr5 21358401 21358576 -131178683 + RMER17C LTR ERVK 91 272 -138 6 748 614 295 126 48 chr5 21381500 21381959 -131155300 + LTR40a LTR ERVL 3 497 -22 7 748 1355 236 94 0 chr5 21386168 21386549 -131150710 + MTD LTR MaLR 3 419 0 7 748 1485 234 133 68 chr5 21386549 21387605 -131149654 + MTD-int LTR MaLR 1 1258 0 7 748 772 251 219 10 chr5 21387605 21387911 -131149348 + MTD LTR MaLR 1 370 -51 7 748 584 256 26 26 chr5 21388245 21388434 -131148825 - ORR1E LTR MaLR -165 194 6 7 748 375 223 9 97 chr5 21418251 21418365 -131118894 - MT2B LTR ERVL -343 258 155 7 748 953 279 36 71 chr5 21451094 21451487 -131085772 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 8 748 642 286 165 25 chr5 21464228 21464544 -131072715 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 5 8 748 652 248 150 22 chr5 21476225 21476452 -131060807 + MTE2b LTR MaLR 1 256 -123 8 748 1015 225 119 32 chr5 21483040 21483143 -131054116 + MTEb LTR MaLR 5 105 -274 8 748 3268 58 2 0 chr5 21483143 21483542 -131053717 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 748 1015 225 119 32 chr5 21483542 21483783 -131053476 + MTEb LTR MaLR 106 379 0 8 748 254 240 58 29 chr5 21484301 21484404 -131052855 - LTR33A_ LTR ERVL -18 513 408 8 748 509 311 41 30 chr5 21487791 21487847 -131049412 + MLT1F1 LTR MaLR 1 54 -515 8 748 509 311 41 30 chr5 21488036 21488148 -131049111 + MLT1F1 LTR MaLR 55 171 -398 8 748 305 328 59 15 chr5 21488602 21488738 -131048521 + MLT1F2 LTR MaLR 403 544 -16 8 748 314 290 72 8 chr5 21489873 21489998 -131047261 + MLT1F1 LTR MaLR 279 411 0 8 749 1047 158 10 10 chr5 21496226 21496424 -131040835 + RLTR1 LTR ERV1 427 624 0 8 749 308 279 95 47 chr5 21497709 21497878 -131039381 + MLT1H-int LTR MaLR 931 1107 -302 8 749 233 355 91 0 chr5 21498258 21498379 -131038880 - MLT1I LTR MaLR 0 411 280 8 749 2303 174 20 66 chr5 21507292 21507819 -131029440 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 561 1 9 749 1035 145 320 0 chr5 21508358 21508617 -131028642 + ORR1C1 LTR MaLR 37 378 0 1 749 2317 129 46 35 chr5 21518659 21519029 -131018230 + ORR1C1 LTR MaLR 1 374 -4 3 749 546 301 116 63 chr5 21585000 21585334 -130951925 - MTE2a LTR MaLR -8 371 22 1 749 1650 140 45 86 chr5 21606633 21606969 -130930290 + ORR1A3 LTR MaLR 5 326 0 1 749 422 293 133 33 chr5 21608266 21608446 -130928813 - MLT1A0 LTR MaLR -166 199 2 1 749 400 223 25 82 chr5 21608755 21608877 -130928382 - MT2B LTR ERVL -344 257 143 1 749 1457 254 30 32 chr5 21616374 21616744 -130920515 + MTEa LTR MaLR 3 371 -8 1 749 2139 180 71 3 chr5 21618531 21618898 -130918361 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 1 750 633 297 253 9 chr5 21630477 21630813 -130906446 - MTD LTR MaLR -1 418 1 1 750 4488 170 40 160 chr5 21642930 21644183 -130893076 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 1 750 226 316 133 15 chr5 21651545 21651680 -130885579 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 649 799 -4 1 750 278 149 21 0 chr5 21654600 21654647 -130882612 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 279 1 750 4158 157 26 3 chr5 21654630 21655390 -130881869 - ORR1A2-int LTR MaLR -1014 778 1 1 750 2481 88 22 12 chr5 21655390 21655714 -130881545 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 750 542 243 184 0 chr5 21656316 21656452 -130880807 + MTD LTR MaLR 18 178 -241 1 750 736 243 145 38 chr5 21656689 21656924 -130880335 + MTD LTR MaLR 146 405 -14 1 750 7098 95 15 7 chr5 21657102 21658053 -130879206 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 1 750 1303 289 16 5 chr5 21664974 21665343 -130871916 + MTEb LTR MaLR 3 375 -4 1 750 417 257 117 7 chr5 21670245 21670390 -130866869 + MER90 LTR ERV1 4 164 -411 1 750 527 259 9 0 chr5 21684914 21685030 -130852229 - MTEb LTR MaLR -262 117 1 2 750 1098 238 157 17 chr5 21685033 21685383 -130851876 - MTEb-int LTR MaLR -14 1566 1168 2 750 1752 179 37 37 chr5 21686173 21686527 -130850732 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 750 606 279 94 30 chr5 21689568 21689801 -130847458 + MTEb LTR MaLR 130 377 -2 2 750 3303 8 5 47 chr5 21706853 21707236 -130830023 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 750 1032 86 159 0 chr5 21707236 21707399 -130829860 + IAPEz-int LTR ERVK 8 196 -6285 2 750 7742 70 98 35 chr5 21707370 21708594 -130828665 + IAPEz-int LTR ERVK 67 1313 -5168 2 750 29607 18 1 1 chr5 21708593 21711867 -130825392 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6481 0 2 750 3317 6 5 47 chr5 21711867 21712250 -130825009 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 750 1020 266 26 9 chr5 21717867 21718095 -130819164 - MTE2b LTR MaLR -147 232 1 2 750 847 249 32 65 chr5 21729900 21730209 -130807050 + RLTR15 LTR ERVK 54 352 -7 2 750 478 330 53 41 chr5 21732704 21732947 -130804312 + ORR1E LTR MaLR 3 248 -111 2 750 296 299 100 30 chr5 21733978 21734178 -130803081 - MER90a LTR ERV1 -182 432 219 2 750 348 265 51 11 chr5 21734206 21734333 -130802926 - MER90a LTR ERV1 -443 171 5 2 750 1429 243 55 6 chr5 21745722 21746070 -130791189 + ORR1D1 LTR MaLR 10 374 0 2 750 1365 169 48 0 chr5 21751691 21751922 -130785337 + MTC LTR MaLR 3 244 -177 2 751 704 331 25 28 chr5 21773657 21773968 -130763291 - MTD LTR MaLR -108 311 2 3 751 285 268 61 18 chr5 21774982 21775096 -130762163 + RMER15 LTR ERVL 384 502 -73 3 751 1796 179 124 164 chr5 21784131 21784767 -130752492 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 751 777 282 38 58 chr5 21789180 21789523 -130747736 + MTE2b LTR MaLR 42 377 -2 3 751 303 298 207 44 chr5 21794017 21794351 -130742908 - MTE2a LTR MaLR -26 353 2 3 751 473 315 147 16 chr5 21808096 21808333 -130728926 - LTR16C LTR ERVL -194 295 27 3 751 3340 50 0 0 chr5 21811351 21811748 -130725511 - MTB LTR MaLR -3 397 1 3 751 3127 18 18 0 chr5 21813929 21814327 -130722932 - LTRIS_Mm LTR ERV1 -77 405 1 3 751 1015 35 21 7 chr5 21814327 21814454 -130722805 + ORR1C2 LTR MaLR 218 346 0 3 751 793 54 0 0 chr5 21814454 21814565 -130722694 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 111 -1681 3 751 1034 152 45 45 chr5 21814735 21814952 -130722307 + ORR1C2 LTR MaLR 138 357 -27 3 751 753 223 165 40 chr5 21814952 21815279 -130721980 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 3 751 1034 152 45 45 chr5 21815279 21815308 -130721951 + ORR1C2 LTR MaLR 358 384 0 3 751 769 257 42 32 chr5 21816232 21816542 -130720717 + RLTR15 LTR ERVK 10 322 -37 3 751 438 286 131 6 chr5 21818894 21819070 -130718189 + MLT1A0 LTR MaLR 114 311 -54 3 751 1112 240 43 81 chr5 21820587 21820981 -130716278 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 751 773 320 51 12 chr5 21823806 21824138 -130713121 - MTEa LTR MaLR -34 345 1 3 751 3288 53 2 2 chr5 21832235 21832631 -130704628 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 751 1623 112 26 4 chr5 21839495 21839765 -130697494 - RMER6C LTR ERVK 0 690 415 4 751 612 148 0 76 chr5 21839853 21839998 -130697261 - RMER6C LTR ERVK -537 183 1 4 751 226 276 45 22 chr5 21858197 21858286 -130678973 - MLT1K LTR MaLR -13 582 492 4 751 3422 35 0 5 chr5 21865669 21866067 -130671192 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 751 297 271 18 18 chr5 21866245 21866354 -130670905 - RMER12 LTR ERVK -482 840 732 4 751 3503 23 2 0 chr5 21881564 21881959 -130655300 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 751 397 262 160 7 chr5 21884668 21884818 -130652441 - MTD LTR MaLR -5 414 242 4 751 815 122 15 0 chr5 21884916 21885047 -130652212 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 197 4 752 2507 160 120 42 chr5 21895361 21895904 -130641355 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 752 248 324 70 57 chr5 21897869 21898026 -130639233 - MLT1L LTR MaLR -307 303 145 4 752 481 286 210 14 chr5 21901817 21902108 -130635151 - MT2A LTR ERVL -106 427 80 4 752 254 313 159 7 chr5 21902033 21902184 -130635075 - MTE2a LTR MaLR -205 174 1 4 752 1722 179 76 11 chr5 21903290 21903645 -130633614 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 752 1569 215 18 23 chr5 21904627 21904970 -130632289 + ORR1D1 LTR MaLR 1 341 -33 5 752 321 290 43 0 chr5 21907089 21907182 -130630077 + MLT1J2 LTR MaLR 352 448 0 5 752 505 306 54 68 chr5 21907796 21908090 -130629169 - MMERGLN-int LTR ERV1 -6741 815 526 5 752 253 146 514 0 chr5 21908578 21908696 -130628563 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 355 5 752 3175 37 34 8 chr5 21911023 21911409 -130625850 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 752 9457 37 0 0 chr5 21911409 21912507 -130624752 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 752 3126 23 3 0 chr5 21912511 21912898 -130624361 + MTA_Mm LTR MaLR 9 396 0 5 752 3327 168 8 12 chr5 21915867 21916464 -130620795 + RLTR17 LTR ERVK 98 692 0 5 752 1493 199 89 84 chr5 21921740 21922179 -130615080 - RMER19C LTR ERVK 0 611 171 5 752 435 311 92 13 chr5 21923464 21923692 -130613567 - MLT1E1A LTR MaLR -23 657 412 5 752 483 231 144 67 chr5 21924123 21924318 -130612941 - MLT1E1A LTR MaLR -423 257 1 5 752 4286 143 27 94 chr5 21931419 21932386 -130604873 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 5 752 1679 107 15 8 chr5 21932387 21932652 -130604607 + ORR1A3 LTR MaLR 60 326 0 5 752 393 305 97 75 chr5 21933850 21934178 -130603081 - ORR1E LTR MaLR -2 357 22 5 752 636 259 131 65 chr5 21937021 21937118 -130600141 + MTD LTR MaLR 12 114 -305 5 752 636 259 131 65 chr5 21937534 21937692 -130599567 + MTD LTR MaLR 115 288 -131 5 752 444 340 76 57 chr5 21938085 21938400 -130598859 + MLT1A0 LTR MaLR 15 335 -30 5 752 360 268 136 14 chr5 21945271 21945411 -130591848 - MLT1J LTR MaLR -33 479 323 5 752 1219 218 196 28 chr5 21946696 21946739 -130590520 - RLTR11A LTR ERVK -27 501 459 5 752 1219 218 196 28 chr5 21946786 21946955 -130590304 - RLTR11A LTR ERVK -70 458 281 5 752 1219 218 196 28 chr5 21947016 21947231 -130590028 - RLTR11A LTR ERVK -248 280 2 5 752 397 275 64 53 chr5 21949307 21949495 -130587764 - ORR1E LTR MaLR -159 200 11 5 752 1298 256 30 8 chr5 21955320 21955683 -130581576 + MTEa LTR MaLR 6 376 -3 5 752 1219 221 23 63 chr5 21973451 21973798 -130563461 - MYSERV-int LTR ERVK -2443 4107 3775 5 752 747 229 75 21 chr5 21974553 21974737 -130562522 - RLTR15 LTR ERVK -56 303 104 5 752 747 229 75 21 chr5 21974796 21974892 -130562367 - RLTR15 LTR ERVK -256 103 9 5 752 519 238 132 0 chr5 21986201 21986352 -130550907 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 224 6 752 1235 209 99 43 chr5 22003373 22003478 -130533781 + MTD LTR MaLR 3 118 -301 1 752 1235 209 99 43 chr5 22003505 22003794 -130533465 + MTD LTR MaLR 119 418 -1 1 752 3159 19 0 0 chr5 22019289 22019663 -130517596 + MT-int LTR MaLR 651 1024 -74 2 753 2275 215 32 102 chr5 22024115 22024716 -130512543 + RMER19C LTR ERVK 1 559 -52 2 753 228 32 0 0 chr5 22024979 22025010 -130512249 + RMER19C LTR ERVK 581 611 0 2 753 524 279 97 38 chr5 22025158 22025423 -130511836 + MLT1J1 LTR MaLR 5 276 -168 3 753 232 270 31 73 chr5 22025448 22025544 -130511715 + MLT1J1 LTR MaLR 320 411 0 3 753 1706 185 80 9 chr5 22033281 22033630 -130503629 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 753 846 268 94 51 chr5 22033677 22034050 -130503209 - RMER5 LTR ERV1 -141 393 5 4 753 644 333 56 51 chr5 22035693 22036085 -130501174 + MER21B LTR ERV1 415 808 -55 4 753 2180 159 88 34 chr5 22040698 22041142 -130496117 + RLTR18 LTR ERVK 149 616 0 5 753 702 288 105 57 chr5 22042145 22042498 -130494761 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 753 537 301 121 78 chr5 22044248 22044712 -130492547 - MLT1D LTR MaLR -16 489 6 6 753 1362 169 293 21 chr5 22045511 22045849 -130491410 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 6 753 659 334 44 23 chr5 22046827 22047335 -130489924 + MuRRS4-int LTR ERV1 1073 1735 -5821 6 753 351 238 18 62 chr5 22047381 22047493 -130489766 + MuRRS4-int LTR ERV1 2987 3093 -4463 6 753 502 284 12 6 chr5 22048309 22048472 -130488787 + RNERVK23-int LTR ERVK 7400 7563 -654 6 753 1416 178 246 23 chr5 22048629 22048979 -130488280 + RLTR23 LTR ERV1 1 428 -2 6 753 426 69 17 0 chr5 22050282 22050340 -130486919 - MTB LTR MaLR 0 407 349 7 753 777 90 56 0 chr5 22050340 22050484 -130486775 + RMER17B LTR ERVK 312 463 -495 7 753 2493 91 25 3 chr5 22050508 22050861 -130486398 - MTB LTR MaLR -39 361 1 7 753 687 145 8 8 chr5 22051140 22051272 -130485987 - MERVK26-int LTR ERVK -2092 4827 4696 7 753 1790 183 31 0 chr5 22051268 22051618 -130485641 - MERVK26-int LTR ERVK -4664 2255 1895 7 753 249 294 78 0 chr5 22052781 22052883 -130484376 + LTR33 LTR ERVL 395 504 -11 7 753 444 196 0 137 chr5 22053956 22054080 -130483179 - MT2B LTR ERVL -337 264 158 7 753 1182 211 155 28 chr5 22054359 22054681 -130482578 - MTC LTR MaLR -13 408 46 7 753 3090 60 207 0 chr5 22060253 22060683 -130476576 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 8 753 412 255 108 51 chr5 22065133 22065444 -130471815 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 9 753 4715 112 27 58 chr5 22066620 22067576 -130469683 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 924 -59 1 753 2540 148 226 37 chr5 22068148 22068662 -130468597 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 753 549 207 9 9 chr5 22071276 22071388 -130465871 + RodERV21-int LTR ERV1 4715 4826 -165 1 753 404 282 0 28 chr5 22071392 22071498 -130465761 + RMER4B LTR ERVK 349 451 -134 1 753 516 237 183 0 chr5 22071569 22071755 -130465504 + RMER21A LTR ERV1 394 613 -334 1 753 4505 12 2 0 chr5 22071934 22072426 -130464833 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 753 41433 15 14 0 chr5 22072426 22077715 -130459544 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 1 753 362 167 46 35 chr5 22077715 22077802 -130459457 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 1 753 321 0 0 0 chr5 22077802 22077840 -130459419 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 753 4505 12 2 0 chr5 22077840 22078332 -130458927 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 753 274 281 66 33 chr5 22078428 22078579 -130458680 - LTR83 LTR ERVL -420 360 205 1 753 618 167 40 0 chr5 22081497 22081623 -130455636 - RMER17C LTR ERVK 0 410 280 1 753 498 349 99 45 chr5 22087624 22088129 -130449130 + MT2A LTR ERVL 2 533 0 1 753 1764 109 149 6 chr5 22090562 22090890 -130446369 - RLTR14 LTR ERV1 -7 375 1 1 753 987 279 53 101 chr5 22090981 22091379 -130445880 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 1 753 914 328 56 20 chr5 22094358 22094700 -130442559 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 1 753 585 360 77 23 chr5 22095468 22095820 -130441439 + LTR16A LTR ERVL 16 386 -65 1 753 1920 168 105 26 chr5 22103048 22103438 -130433821 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 753 276 312 62 38 chr5 22114959 22115169 -130422090 + RMER17C LTR ERVK 133 347 -63 1 753 2461 185 57 45 chr5 22115255 22115748 -130421511 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 1 753 606 251 38 38 chr5 22116609 22116795 -130420464 - RLTR28B LTR ERVL -295 186 1 1 753 1085 232 34 26 chr5 22116795 22117061 -130420198 + RLTR24 LTR ERV1 262 529 0 1 753 1210 231 118 24 chr5 22121581 22121963 -130415296 + MTD LTR MaLR 2 419 0 1 753 2382 133 0 0 chr5 22121968 22122291 -130414968 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 4 1 753 2514 99 150 5 chr5 22122738 22123105 -130414154 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 1 753 1966 125 102 118 chr5 22123405 22123719 -130413540 + ORR1B1 LTR MaLR 1 348 -46 1 753 1966 125 102 118 chr5 22123858 22123943 -130413316 + ORR1B1 LTR MaLR 349 394 0 1 753 1501 123 15 47 chr5 22123943 22124217 -130413042 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 265 -1244 1 753 311 131 0 2 chr5 22124200 22124252 -130413007 + ORR1B1-int LTR MaLR 460 518 -1274 1 753 455 204 0 0 chr5 22127637 22127725 -130409534 + ORR1B1-int LTR MaLR 535 622 -887 1 753 310 239 0 40 chr5 22127869 22127943 -130409316 + ORR1B1-int LTR MaLR 884 954 -555 1 753 745 208 62 9 chr5 22127943 22128170 -130409089 - RMER6-int LTR ERVK -4450 4509 4298 1 753 9203 155 62 20 chr5 22128281 22130662 -130406597 - RMER6-int LTR ERVK -660 2517 1 1 753 1736 154 251 100 chr5 22130668 22131409 -130405850 - RMER6C LTR ERVK 0 720 19 1 753 1523 182 143 0 chr5 22131419 22131726 -130405533 + ORR1B1 LTR MaLR 24 374 -20 1 753 443 246 88 83 chr5 22132765 22132969 -130404290 - RMER2 LTR ERV1 -29 538 334 1 753 3316 58 8 2 chr5 22133294 22133688 -130403571 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 753 8673 74 10 6 chr5 22133690 22134782 -130402477 + MTA_Mm-int LTR MaLR 3 1098 0 1 753 3073 61 48 3 chr5 22134782 22135161 -130402098 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 753 4280 154 34 27 chr5 22135649 22136364 -130400895 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 1 753 1524 189 64 47 chr5 22146662 22147058 -130390201 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 1 753 267 374 81 0 chr5 22148695 22148818 -130388441 - MLT1A LTR MaLR -39 351 219 1 753 433 333 0 30 chr5 22149222 22149389 -130387870 - MLT1A LTR MaLR -212 162 1 1 94 4811 166 38 78 chr5 22150714 22151443 -130385816 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 326 2 754 4811 166 38 78 chr5 22151949 22152290 -130384969 - RLTR25B LTR ERVK -703 325 1 2 754 3310 189 111 22 chr5 22153937 22154614 -130382645 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 754 689 134 32 1 chr5 22159672 22159813 -130377446 + RMER19A LTR ERVK 1 201 -536 2 754 1093 259 106 48 chr5 22161999 22162398 -130374861 + RMER19A LTR ERVK 188 697 -40 2 754 3612 70 29 2 chr5 22166485 22166968 -130370291 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 2 754 483 339 106 89 chr5 22168286 22168665 -130368594 - MLT1F2 LTR MaLR -3 557 170 2 754 679 326 40 88 chr5 22168665 22169042 -130368217 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 5 2 754 483 339 106 89 chr5 22169042 22169190 -130368069 - MLT1F2 LTR MaLR -391 169 21 2 754 300 264 120 19 chr5 22169576 22169684 -130367575 - MLT1L LTR MaLR -471 139 21 2 754 733 322 71 20 chr5 22169755 22170050 -130367209 + MLT1D LTR MaLR 74 383 -122 2 754 314 281 33 33 chr5 22172048 22172140 -130365119 + MLT1D LTR MaLR 382 473 -32 2 754 2404 135 8 24 chr5 22174160 22174531 -130362728 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 2 754 436 281 119 39 chr5 22174722 22174925 -130362334 + MTD LTR MaLR 1 204 -203 2 754 351 211 177 20 chr5 22175416 22175562 -130361697 + MTD LTR MaLR 238 406 -13 2 754 960 215 227 47 chr5 22177708 22178025 -130359234 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 754 280 309 85 26 chr5 22178616 22178769 -130358490 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 623 784 0 2 754 1910 189 67 8 chr5 22180425 22180815 -130356444 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 754 1540 205 117 6 chr5 22184385 22184718 -130352541 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 2 754 4453 29 0 0 chr5 22188152 22188634 -130348625 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 2 754 237 305 119 37 chr5 22209035 22209144 -130328115 + MLT1A1 LTR MaLR 259 376 -32 2 754 2477 211 126 74 chr5 22211744 22212599 -130324660 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 900 -2 2 754 3059 68 10 0 chr5 22228304 22228700 -130308559 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 754 1013 255 94 3 chr5 22233524 22233823 -130303436 - MLT2C2 LTR ERVL -138 326 1 3 754 2411 96 9 0 chr5 22238398 22238722 -130298537 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 754 618 164 58 121 chr5 22239901 22240074 -130297185 - MTE2b LTR MaLR -200 179 18 3 754 1177 246 275 8 chr5 22240311 22240795 -130296464 - MTE2b-int LTR MaLR -26 1554 942 3 754 306 279 0 0 chr5 22240793 22240861 -130296398 - MTE2b LTR MaLR -250 129 62 3 754 1179 196 52 3 chr5 22241548 22241899 -130295360 - RMER10B LTR ERVL 0 398 3 3 754 1047 254 41 19 chr5 22277948 22278217 -130259042 - ORR1E LTR MaLR -10 349 75 3 754 1489 140 186 4 chr5 22278383 22278662 -130258597 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 45 3 755 1581 192 142 3 chr5 22283126 22283465 -130253794 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 755 1333 238 67 71 chr5 22283599 22284020 -130253239 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 755 1770 128 6 104 chr5 22292929 22293286 -130243973 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 755 348 218 0 117 chr5 22294871 22294974 -130242285 - RLTR20D LTR ERVK 0 578 445 4 755 382 291 66 25 chr5 22295041 22295253 -130242006 - RLTR20D LTR ERVK -227 336 143 4 755 3385 40 0 0 chr5 22308572 22308968 -130228291 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 755 7680 65 13 70 chr5 22308968 22310133 -130227126 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 755 3264 48 2 0 chr5 22310134 22310528 -130226731 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 4 755 2161 122 7 35 chr5 22311683 22312051 -130225208 - ORR1A4 LTR MaLR -11 348 1 4 755 2182 259 75 33 chr5 22312748 22313503 -130223756 - RLTR40 LTR ERVK -30 787 1 4 755 370 347 58 6 chr5 22331822 22331993 -130205266 - LTR80B LTR ERVL -3 581 402 4 755 412 159 83 21 chr5 22337063 22337159 -130200100 + MLT1C LTR MaLR 1 102 -365 4 755 419 355 34 15 chr5 22337605 22337811 -130199448 + MLT1C LTR MaLR 256 465 -2 4 755 575 141 6 219 chr5 22340977 22341141 -130196118 + MT2B LTR ERVL 2 130 -471 4 755 525 349 54 44 chr5 22343029 22343326 -130193933 - ORR1E LTR MaLR -54 305 6 4 755 690 305 53 41 chr5 22344507 22344825 -130192434 + MLT1A0 LTR MaLR 16 337 -28 4 755 486 283 103 60 chr5 22346624 22346857 -130190402 - ORR1E LTR MaLR -107 252 10 4 755 3710 38 52 20 chr5 22348477 22348937 -130188322 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 4 755 306 353 52 37 chr5 22354039 22354230 -130183029 - MER21B LTR ERV1 -132 731 538 5 755 2682 148 2 5 chr5 22356081 22356503 -130180756 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 755 761 194 108 147 chr5 22357340 22357673 -130179586 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -2 320 1 5 755 2210 207 23 35 chr5 22360562 22361042 -130176217 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 5 755 1188 268 120 25 chr5 22364469 22364837 -130172422 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 5 755 1045 249 68 34 chr5 22364875 22365229 -130172030 + RLTR14 LTR ERV1 17 382 0 5 755 666 281 134 63 chr5 22369188 22369598 -130167661 - MER67D LTR ERV1 0 514 76 5 755 330 342 105 84 chr5 22372308 22372726 -130164533 + LTR33A_ LTR ERVL 86 512 -19 5 755 307 190 0 0 chr5 22384638 22384696 -130152563 - MERVL_2A-int LTR ERVL -390 5371 5314 5 755 564 214 100 33 chr5 22387769 22387863 -130149396 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 551 461 5 755 564 214 100 33 chr5 22387944 22387991 -130149268 - RLTR20A2 LTR ERVK -91 460 403 5 755 474 233 124 35 chr5 22388034 22388060 -130149199 - RLTR20A2 LTR ERVK -147 387 352 5 755 1967 198 41 21 chr5 22390762 22391180 -130146079 - RLTR20A2 LTR ERVK -152 426 1 5 755 752 351 65 43 chr5 22393636 22394008 -130143251 + LTR16A1 LTR ERVL 77 456 0 5 755 367 303 33 98 chr5 22398399 22398644 -130138615 + RMER12 LTR ERVK 770 998 -324 5 755 871 180 35 11 chr5 22412455 22412629 -130124630 + ORR1A4 LTR MaLR 1 178 -151 5 756 227 302 111 56 chr5 22429235 22429361 -130107898 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -511 292 160 6 756 1235 330 51 3 chr5 22431551 22431904 -130105355 + MTE2b LTR MaLR 2 371 -8 6 756 3558 151 10 23 chr5 22435839 22436442 -130100817 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 98 6 756 539 317 71 55 chr5 22438150 22438644 -130098615 + MLT1D LTR MaLR 4 505 0 6 756 2111 157 132 5 chr5 22439958 22440367 -130096892 + RMER4A LTR ERVK 6 466 0 6 756 2086 184 5 37 chr5 22444549 22444956 -130092303 + MTB_Mm LTR MaLR 1 394 -13 6 756 271 313 39 77 chr5 22446754 22446898 -130090361 + MTE2b LTR MaLR 226 367 -12 6 756 499 259 39 58 chr5 22446906 22447062 -130090197 - MLT2B4 LTR ERVL -403 153 1 6 756 255 226 0 16 chr5 22452342 22452405 -130084854 + MLT1A0 LTR MaLR 1 62 -303 6 756 927 323 145 25 chr5 22452541 22452988 -130084271 - MLT2B3 LTR ERVL -47 507 7 6 756 627 335 122 4 chr5 22452991 22453228 -130084031 + MLT1A0 LTR MaLR 89 353 -12 6 756 2263 164 5 17 chr5 22453326 22453736 -130083523 + MTB_Mm LTR MaLR 3 407 0 6 756 234 336 103 8 chr5 22462889 22463006 -130074253 - ORR1E LTR MaLR -210 149 22 6 756 283 293 73 104 chr5 22472828 22473037 -130064222 + MER34A LTR ERV1 27 247 -324 6 756 723 230 201 27 chr5 22479146 22479409 -130057850 + ORR1D1 LTR MaLR 1 309 -65 6 756 1026 175 192 9 chr5 22482764 22482977 -130054282 - RLTR11A2 LTR ERVK -274 253 2 6 756 400 204 70 53 chr5 22482986 22483100 -130054159 - RMER15-int LTR ERVL -3713 1286 1171 6 756 508 173 2 43 chr5 22483965 22484091 -130053168 - MTC LTR MaLR 0 421 304 6 756 1255 176 154 4 chr5 22484672 22484951 -130052308 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 39 6 756 3053 241 89 96 chr5 22484951 22486787 -130050472 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -519 1807 5 6 756 753 144 157 119 chr5 22487479 22487747 -130049512 - MYSERV6-int LTR ERVK -2253 6706 6429 6 756 1101 255 90 9 chr5 22487828 22488172 -130049087 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 7 756 1597 206 66 15 chr5 22493109 22493444 -130043815 + ORR1B1 LTR MaLR 41 392 -2 7 756 464 191 125 147 chr5 22495160 22495404 -130041855 - MER67D LTR ERV1 -435 276 13 7 756 1894 170 37 45 chr5 22498533 22498914 -130038345 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 756 434 355 108 39 chr5 22501070 22501404 -130035855 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 1 756 2045 138 37 11 chr5 22503459 22503834 -130033425 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 2 5 756 294 281 108 25 chr5 22509964 22510121 -130027138 - MLT2B5 LTR ERVL -72 483 314 1 756 339 311 63 46 chr5 22510477 22510652 -130026607 - LTR41 LTR ERVL -167 601 424 1 756 2204 109 12 56 chr5 22512448 22512788 -130024471 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 1 756 617 194 16 31 chr5 22519152 22519280 -130017979 - RLTR28 LTR ERVL -394 130 5 2 756 1324 249 58 11 chr5 22525909 22526271 -130010988 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 756 469 202 67 8 chr5 22526294 22526433 -130010826 - MTD LTR MaLR -15 404 267 4 756 413 296 16 108 chr5 22526469 22526658 -130010601 - MTD LTR MaLR -121 279 117 4 756 2056 54 7 0 chr5 22530541 22530821 -130006438 + ORR1A2 LTR MaLR 1 282 -45 4 756 467 18 0 0 chr5 22537444 22537501 -129999758 + ORR1A3 LTR MaLR 270 326 0 4 756 1915 173 48 8 chr5 22542027 22542383 -129994876 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 5 757 236 352 119 9 chr5 22545551 22545660 -129991599 + ORR1D2 LTR MaLR 85 205 -165 6 757 723 239 45 71 chr5 22553727 22553951 -129983308 - ORR1E LTR MaLR -21 338 121 7 757 1564 226 205 31 chr5 22553951 22554434 -129982825 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 7 757 723 239 45 71 chr5 22554434 22554475 -129982784 - ORR1E LTR MaLR -239 120 80 7 757 1636 168 121 12 chr5 22560654 22560986 -129976273 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 5 8 757 6023 206 47 29 chr5 22560990 22562320 -129974939 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 15 8 757 1234 190 182 9 chr5 22562320 22562639 -129974620 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 8 757 229 305 63 99 chr5 22563415 22563557 -129973702 - ORR1E LTR MaLR -179 180 44 9 757 2533 56 17 40 chr5 22564919 22565230 -129972029 + ORR1A1 LTR MaLR 1 309 -37 9 757 3389 33 5 0 chr5 22565230 22565624 -129971635 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 757 2533 56 17 40 chr5 22565624 22565666 -129971593 + ORR1A1 LTR MaLR 310 346 0 9 757 1782 270 30 45 chr5 22567984 22568477 -129968782 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 14 1 757 265 235 24 0 chr5 22569396 22569475 -129967784 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 475 1 757 670 297 135 28 chr5 22569495 22569814 -129967445 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 1 757 301 330 116 23 chr5 22569814 22570006 -129967253 - MLT1F2 LTR MaLR -89 471 258 1 757 248 275 147 84 chr5 22570414 22570557 -129966702 + MTEb LTR MaLR 121 272 -107 1 757 538 263 47 25 chr5 22571502 22571728 -129965531 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 577 335 1 757 788 189 55 34 chr5 22572056 22572371 -129964888 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2151 175 1 1 757 1481 269 61 42 chr5 22573420 22573925 -129963334 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 49 1 757 430 312 233 33 chr5 22574481 22574726 -129962533 - MER21B LTR ERV1 -367 496 203 1 757 256 349 83 0 chr5 22574752 22574884 -129962375 - MER21B LTR ERV1 -702 161 19 1 757 866 308 73 32 chr5 22576033 22576375 -129960884 - MLT1A0 LTR MaLR -9 356 1 1 757 853 293 60 33 chr5 22578924 22579288 -129957971 - MTEa LTR MaLR -4 375 2 1 757 417 306 162 21 chr5 22594566 22594883 -129942376 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 2 1 757 355 308 56 63 chr5 22594889 22595031 -129942228 + MLT1D LTR MaLR 252 392 -113 1 757 1668 187 102 21 chr5 22602246 22602628 -129934631 - MTD LTR MaLR -2 417 5 1 757 4584 113 124 6 chr5 22602693 22603167 -129934092 - RMER17D LTR ERVK -4 885 343 1 757 4584 113 124 6 chr5 22603332 22603649 -129933610 - RMER17D LTR ERVK -547 342 2 1 757 376 292 144 42 chr5 22611762 22612026 -129925233 - LTR89 LTR ERVL? -461 418 128 1 757 1634 160 167 15 chr5 22616092 22616434 -129920825 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 757 1498 223 68 76 chr5 22621241 22621730 -129915529 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 44 1 757 6325 154 32 9 chr5 22621943 22623095 -129914164 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -21 2305 1128 1 757 2694 309 121 45 chr5 22627605 22628201 -129909058 - MTE-int LTR MaLR -39 1541 886 1 757 4454 172 52 40 chr5 22628201 22628852 -129908407 - RMER17B LTR ERVK 0 958 295 1 757 4454 172 52 40 chr5 22628993 22629288 -129907971 - RMER17B LTR ERVK -664 294 1 1 757 2694 309 121 45 chr5 22629288 22630124 -129907135 - MTE-int LTR MaLR -695 885 1 1 757 3588 23 0 0 chr5 22632216 22632612 -129904647 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 757 359 282 142 47 chr5 22632709 22632986 -129904273 - ORR1E LTR MaLR -77 293 1 2 757 1520 168 49 52 chr5 22637238 22637583 -129899676 + ORR1B1 LTR MaLR 43 386 -8 2 757 2427 158 62 26 chr5 22637590 22638090 -129899169 + ORR1B1-int LTR MaLR 8 525 -1438 2 757 1087 156 5 5 chr5 22638090 22638277 -129898982 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 267 2 757 2064 156 79 3 chr5 22643391 22643757 -129893502 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 757 965 278 129 45 chr5 22646947 22647103 -129890156 + MLT1C LTR MaLR 3 186 -281 2 757 965 278 129 45 chr5 22647249 22647517 -129889742 + MLT1C LTR MaLR 187 463 -4 2 757 1226 215 45 162 chr5 22653296 22653807 -129883452 - RLTR18 LTR ERVK -165 451 1 2 757 2162 103 31 12 chr5 22658948 22659271 -129877988 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 757 1010 76 6 42 chr5 22659271 22659436 -129877823 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1805 2 757 1444 174 80 155 chr5 22659432 22659942 -129877317 - RMER2 LTR ERV1 -73 494 23 2 757 565 79 11 0 chr5 22660027 22660116 -129877143 - ORR1A4-int LTR MaLR -1844 119 30 2 757 947 258 77 34 chr5 22660989 22661338 -129875921 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 1 2 757 1757 123 259 20 chr5 22673646 22673993 -129863266 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 2 758 297 405 25 15 chr5 22681103 22681306 -129855953 + MamGypLTR2 LTR Gypsy 503 707 -482 2 758 752 278 160 3 chr5 22682297 22682579 -129854680 + MLT1A0 LTR MaLR 40 365 0 2 758 397 332 134 41 chr5 22688568 22688860 -129848399 + MLT1F2 LTR MaLR 5 323 -237 2 758 3335 38 114 32 chr5 22690857 22691296 -129845963 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 758 1184 93 10 85 chr5 22691297 22691497 -129845762 + IAPEz-int LTR ERVK 9 193 -6288 2 758 235 309 0 0 chr5 22691497 22691552 -129845707 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 2 758 924 53 9 0 chr5 22691552 22691666 -129845593 + IAPEz-int LTR ERVK 168 282 -6199 2 758 10773 58 45 33 chr5 22691669 22693104 -129844155 + IAPEz-int LTR ERVK 211 1663 -4818 2 758 6345 61 14 12 chr5 22693106 22693920 -129843339 + IAPEz-int LTR ERVK 5665 6479 -2 2 758 3328 38 114 32 chr5 22693922 22694361 -129842898 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 758 672 256 99 174 chr5 22694597 22694970 -129842289 + MLT1C LTR MaLR 40 461 -6 2 758 482 189 21 64 chr5 22707252 22707439 -129829820 + RMER17C LTR ERVK 96 274 -136 3 758 3294 62 0 7 chr5 22723488 22723912 -129813347 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 758 760 248 170 58 chr5 22724176 22724488 -129812771 - MTE2a LTR MaLR -9 370 24 3 758 304 239 22 11 chr5 22726293 22726382 -129810877 - RMER15 LTR ERVL -51 524 435 3 758 231 250 12 95 chr5 22743069 22743153 -129794106 - MER34A1 LTR ERV1 -498 89 13 3 758 5113 144 28 5 chr5 22748335 22749195 -129788064 - RMER19B LTR ERVK -19 883 4 3 758 2552 156 72 42 chr5 22751884 22752428 -129784831 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 1 3 758 2206 119 73 154 chr5 22753454 22753922 -129783337 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 3 758 726 233 97 5 chr5 22755687 22755894 -129781365 + RLTR16 LTR ERVK 1 226 -279 3 758 1478 217 122 15 chr5 22759302 22759770 -129777489 - RLTR20B3 LTR ERVK -42 535 18 3 758 1118 208 213 14 chr5 22759914 22760261 -129776998 + MTC LTR MaLR 1 416 -5 3 758 1946 170 51 32 chr5 22763855 22764226 -129773033 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 758 315 179 47 12 chr5 22770798 22770883 -129766376 - RMER12 LTR ERVK -93 1229 1142 4 758 4777 148 72 45 chr5 22771223 22772256 -129765003 - RMER12 LTR ERVK -262 1060 1 4 758 1106 253 91 15 chr5 22781467 22781796 -129755463 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 4 758 319 279 69 35 chr5 22789732 22789877 -129747382 + MTEa LTR MaLR 230 379 0 4 758 655 293 65 51 chr5 22792276 22792730 -129744529 + RLTR12B LTR ERVK 47 490 -38 4 758 341 258 42 68 chr5 22797132 22797323 -129739936 + RMER10A LTR ERVL 241 426 -16 4 758 1393 215 62 16 chr5 22798794 22799101 -129738158 + RodERV21-int LTR ERV1 2 322 -4669 4 758 553 248 53 20 chr5 22799079 22799231 -129738028 + RodERV21-int LTR ERV1 457 613 -4378 4 758 879 264 96 68 chr5 22799256 22799683 -129737576 + RLTR12B LTR ERVK 47 485 -43 4 758 387 250 58 0 chr5 22799802 22799906 -129737353 + RodERV21-int LTR ERV1 629 738 -4253 4 759 1634 220 66 3 chr5 22808215 22808607 -129728652 + MTD LTR MaLR 3 419 0 4 759 5586 113 34 6 chr5 22811262 22812123 -129725136 + RMER17D LTR ERVK 3 887 -2 4 759 1600 210 68 23 chr5 22832452 22832851 -129704408 + MTD LTR MaLR 3 419 0 5 759 846 320 35 27 chr5 22845515 22845881 -129691378 + RodERV21-int LTR ERV1 4425 4793 -198 5 759 2438 48 6 0 chr5 22846150 22846480 -129690779 - MT-int LTR MaLR -74 1024 693 5 759 2201 75 34 7 chr5 22848671 22849049 -129688210 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 58 5 759 2620 307 7 5 chr5 22850416 22851266 -129685993 - MYSERV6-int LTR ERVK -7656 1303 452 5 759 2390 118 57 5 chr5 22852891 22853292 -129683967 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 5 759 2942 71 46 0 chr5 22856260 22856653 -129680606 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 5 759 678 122 0 26 chr5 22856655 22856804 -129680455 + RLTR10-int LTR ERVK 22 130 -6412 5 759 3748 62 80 10 chr5 22857005 22857492 -129679767 + RLTR10-int LTR ERVK 5007 5527 -1015 5 759 4952 96 25 14 chr5 22857496 22858237 -129679022 + RLTR10-int LTR ERVK 1288 1986 -1 5 759 2913 77 48 0 chr5 22858237 22858629 -129678630 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 5 759 1956 151 0 0 chr5 22863363 22863635 -129673624 + MMETn-int LTR ERVK 4422 4693 -2713 5 759 10328 125 29 24 chr5 22863630 22865376 -129671883 + MMETn-int LTR ERVK 3219 4814 -30 5 759 10328 118 27 22 chr5 22865399 22865414 -129671845 + MMETn-int LTR ERVK 4815 4836 -8 5 759 2062 104 12 51 chr5 22865421 22865756 -129671503 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 759 1595 143 212 26 chr5 22868333 22868678 -129668581 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 759 2897 74 25 2 chr5 22871009 22871417 -129665842 - LTRIS2 LTR ERV1 -79 485 69 5 759 717 226 138 0 chr5 22871417 22871634 -129665625 - RLTR1B-int LTR ERV1 -26 5037 4791 5 759 1213 264 100 26 chr5 22871750 22872139 -129665120 - RLTR1B-int LTR ERV1 -941 4122 3705 5 759 9443 117 103 51 chr5 22872126 22874371 -129662888 - RLTR1B-int LTR ERV1 -744 2555 760 5 759 4093 151 76 19 chr5 22874362 22875083 -129662176 - RMER16-int LTR ERVK -3962 1444 683 5 759 952 160 57 11 chr5 22875068 22875245 -129662014 - RMER16-int LTR ERVK -5076 330 146 5 759 656 124 57 13 chr5 22875602 22875768 -129661491 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3011 288 63 5 759 259 207 24 105 chr5 22875797 22875921 -129661338 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3584 114 1 5 759 1266 42 0 6 chr5 22875921 22876090 -129661169 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 397 5 759 2683 45 32 26 chr5 22876266 22876610 -129660649 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 759 817 257 51 77 chr5 22880420 22880732 -129656527 + MTE2a LTR MaLR 17 320 -59 5 759 485 282 89 111 chr5 22881217 22881360 -129655899 + RLTR12B LTR ERVK 119 262 -266 5 759 485 282 89 111 chr5 22881405 22881532 -129655727 + RLTR12B LTR ERVK 263 383 -145 5 759 1950 221 68 68 chr5 22881605 22882296 -129654963 + RMER17B LTR ERVK 268 958 0 5 759 2297 127 36 45 chr5 22885382 22885853 -129651406 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 467 -8 5 759 1716 87 67 30 chr5 22888024 22888321 -129648938 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 61 5 759 347 272 120 104 chr5 22888821 22889071 -129648188 + MLT1B LTR MaLR 77 330 -60 5 759 296 292 58 105 chr5 22894162 22894334 -129642925 - LTR79 LTR ERVL -342 185 22 6 759 2340 136 40 10 chr5 22894771 22895172 -129642087 - MTC LTR MaLR 0 421 9 6 759 1906 128 13 19 chr5 22898329 22898639 -129638620 + ORR1B2 LTR MaLR 1 308 -59 6 759 327 161 0 0 chr5 22899010 22899066 -129638193 + ORR1B2 LTR MaLR 312 367 0 6 759 299 242 30 10 chr5 22899066 22899165 -129638094 + MTEb LTR MaLR 279 379 0 6 759 553 217 39 8 chr5 22905221 22905351 -129631908 - RMER10A LTR ERVL -305 137 4 6 759 450 289 20 18 chr5 22905363 22905608 -129631651 + MTE2a LTR MaLR 58 337 -42 6 759 230 239 60 0 chr5 22906499 22906566 -129630693 + MTE2a LTR MaLR 307 377 -2 6 759 1107 222 160 22 chr5 22906778 22907146 -129630113 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 759 439 292 70 37 chr5 22908912 22909211 -129628048 - RMER10A LTR ERVL -12 430 122 6 759 532 286 86 0 chr5 22910654 22910829 -129626430 + MTEb LTR MaLR 190 379 0 6 759 4150 265 131 25 chr5 22911002 22912283 -129624976 + MTEb-int LTR MaLR 1 1403 -177 6 759 4150 265 131 25 chr5 22912440 22912584 -129624675 + MTEb-int LTR MaLR 1404 1577 -3 6 759 526 244 83 0 chr5 22912596 22912752 -129624507 + MTEb LTR MaLR 18 186 -193 6 759 230 282 103 23 chr5 22912818 22912905 -129624354 + MT2B LTR ERVL 183 276 -325 6 759 303 291 0 11 chr5 22918462 22918549 -129618710 - MLT1F2 LTR MaLR -77 483 398 6 759 2107 155 94 30 chr5 22934116 22934607 -129602652 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 1 7 760 254 294 9 121 chr5 22951477 22951593 -129585666 - MT2B2 LTR ERVL -329 255 153 7 760 299 267 47 0 chr5 22976982 22977068 -129560191 + MT2B LTR ERVL 153 242 -359 8 760 1667 196 92 74 chr5 23015688 23016146 -129521113 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 1 760 1529 224 31 3 chr5 23027578 23027928 -129509331 - MTD LTR MaLR -14 405 46 3 760 501 172 31 39 chr5 23039279 23039406 -129497853 + RMER4B LTR ERVK 17 142 -443 6 760 339 269 29 116 chr5 23039452 23039658 -129497601 + RMER4B LTR ERVK 415 571 -40 6 760 1183 203 79 68 chr5 23044244 23044598 -129492661 + ORR1D1 LTR MaLR 17 374 0 7 760 2943 43 3 0 chr5 23045190 23045535 -129491724 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 760 3882 52 19 0 chr5 23046854 23047320 -129489939 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 7 760 2052 55 97 0 chr5 23047998 23048306 -129488953 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 8 760 1542 186 52 6 chr5 23053890 23054214 -129483045 + ORR1B1 LTR MaLR 48 386 -8 1 760 281 322 7 47 chr5 23057506 23057656 -129479603 + MER57C2 LTR ERV1 2 145 -289 1 760 395 253 171 20 chr5 23059364 23059549 -129477710 + MTC LTR MaLR 104 325 -94 1 760 631 161 18 0 chr5 23059655 23059767 -129477492 - MTD LTR MaLR -305 114 1 1 760 457 208 90 47 chr5 23059838 23060031 -129477228 + RLTR18 LTR ERVK 1 200 -312 1 760 760 239 72 112 chr5 23060182 23060531 -129476728 + RLTR18 LTR ERVK 282 616 0 1 760 2085 132 161 11 chr5 23062005 23062451 -129474808 + RLTR28 LTR ERVL 1 513 -11 1 760 2447 91 50 46 chr5 23066239 23066699 -129470560 + RMER17A LTR ERVK 1 462 -289 1 761 1026 267 41 40 chr5 23073783 23074190 -129463069 + MTE2a LTR MaLR 6 405 -14 1 761 2290 146 44 54 chr5 23075806 23076284 -129460975 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -2 473 1 1 761 6855 29 4 0 chr5 23076284 23077065 -129460194 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5698 1 761 5864 9 2 0 chr5 23077064 23077702 -129459557 - IAPEz-int LTR ERVK -1720 4761 4123 1 761 953 80 24 0 chr5 23077704 23077829 -129459430 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 1 761 1835 119 4 4 chr5 23077824 23078086 -129459173 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 1 761 454 66 0 32 chr5 23078075 23078138 -129459121 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 1 761 4439 63 38 2 chr5 23078138 23078737 -129458522 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 3 1 761 2290 146 44 54 chr5 23078737 23079215 -129458044 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -2 473 1 1 761 467 309 273 48 chr5 23088599 23089235 -129448024 + MER21B LTR ERV1 1 780 -83 1 761 3419 30 5 0 chr5 23089235 23089629 -129447630 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 761 9022 43 7 1 chr5 23089629 23090720 -129446539 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 761 3474 20 8 0 chr5 23090720 23091113 -129446146 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 761 402 317 37 82 chr5 23091113 23091133 -129446126 + MER21B LTR ERV1 781 798 -65 1 761 1100 164 59 154 chr5 23095293 23095457 -129441802 - RMER17C LTR ERVK -56 354 207 1 761 1100 164 59 154 chr5 23095518 23095742 -129441517 - RMER17C LTR ERVK -204 206 3 1 761 234 190 34 17 chr5 23101373 23101432 -129435827 - MLT1A0 LTR MaLR -302 63 4 1 761 530 266 88 29 chr5 23103179 23103379 -129433880 + MTC LTR MaLR 2 213 -208 1 761 451 190 94 8 chr5 23103846 23103963 -129433296 + MTC LTR MaLR 279 405 -14 1 761 1448 171 51 113 chr5 23105930 23106320 -129430939 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 2 761 629 304 72 27 chr5 23142343 23142678 -129394581 - RMER5 LTR ERV1 0 534 185 2 761 230 257 82 20 chr5 23153479 23153626 -129383633 + RMER10A LTR ERVL 265 420 -22 3 761 2193 108 9 55 chr5 23154576 23154919 -129382340 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 761 490 188 173 0 chr5 23160114 23160247 -129377012 - RMER4A LTR ERVK -3 463 308 3 761 2332 156 49 20 chr5 23160250 23160702 -129376557 - RMER4A LTR ERVK 0 466 2 3 761 378 282 16 33 chr5 23167640 23167761 -129369498 - ORR1D2 LTR MaLR -206 164 46 3 761 1115 246 195 39 chr5 23184110 23184452 -129352807 + RLTR20C LTR ERVK 1 444 -90 4 761 1115 239 204 38 chr5 23184497 23184598 -129352661 + RLTR20C LTR ERVK 445 534 0 4 761 1590 180 146 3 chr5 23184789 23185124 -129352135 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 1 4 761 4735 201 111 29 chr5 23185128 23186390 -129350869 - ORR1C2-int LTR MaLR -4 1366 1 4 761 1179 152 300 37 chr5 23186393 23186538 -129350721 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 193 4 761 1179 152 300 37 chr5 23186622 23186775 -129350484 - ORR1C2 LTR MaLR -192 192 4 4 761 1220 249 85 21 chr5 23190161 23190543 -129346716 - MLT1F1 LTR MaLR -49 530 100 4 761 2038 168 9 3 chr5 23193860 23194206 -129343053 + ORR1B1 LTR MaLR 47 394 0 4 761 3211 161 28 28 chr5 23194779 23195310 -129341949 + RMER2 LTR ERV1 4 537 -30 4 761 3211 161 28 28 chr5 23195337 23195369 -129341890 + RMER2 LTR ERV1 538 567 0 4 761 377 229 164 48 chr5 23196558 23196723 -129340536 + MLT1C LTR MaLR 284 467 0 4 761 2965 38 0 14 chr5 23197285 23197636 -129339623 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 761 1778 181 219 13 chr5 23197655 23198118 -129339141 - RMER13B LTR ERVK 0 908 349 4 95 1802 311 60 55 chr5 23198167 23200202 -129337057 - MuRRS4-int LTR ERV1 -204 7352 4252 4 762 568 201 29 12 chr5 23200208 23200321 -129336938 - RLTR16 LTR ERVK -304 224 1 4 762 3036 263 32 7 chr5 23200484 23201382 -129335877 - MYSERV6-int LTR ERVK -92 5168 4367 4 762 485 215 75 0 chr5 23201378 23201525 -129335734 - MYSERV6-int LTR ERVK -1168 4092 3820 4 762 4543 189 89 77 chr5 23201910 23202204 -129335055 - MYSERV6-int LTR ERVK -5585 3374 3118 4 762 4543 189 89 77 chr5 23202384 23203100 -129334159 - MYSERV6-int LTR ERVK -5842 3117 2357 4 762 1142 243 195 14 chr5 23203100 23203546 -129333713 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 4 762 4543 189 89 77 chr5 23203546 23203799 -129333460 - MYSERV6-int LTR ERVK -6603 2356 2095 4 762 374 323 38 70 chr5 23204066 23204279 -129332980 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 225 4 762 2208 68 0 20 chr5 23206396 23206697 -129330562 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 448 4 762 1713 78 70 8 chr5 23206671 23206929 -129330330 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -468 274 1 4 762 62340 66 2 1 chr5 23206931 23214528 -129322731 - MuLV-int LTR ERV1 0 7606 1 4 762 2208 68 0 20 chr5 23214530 23214831 -129322428 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 448 4 762 1713 78 70 8 chr5 23214805 23215063 -129322196 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -468 274 1 4 762 388 306 139 10 chr5 23219286 23219494 -129317765 + MLT1C LTR MaLR 233 467 0 4 762 1029 244 191 16 chr5 23220209 23220513 -129316746 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 7 4 762 1100 240 268 3 chr5 23221870 23222183 -129315076 + RLTR33 LTR ERVK 197 592 -86 4 762 435 271 14 35 chr5 23222596 23222741 -129314518 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 367 4 762 900 93 248 63 chr5 23222888 23223158 -129314101 + ORR1A3 LTR MaLR 8 326 0 4 762 1117 183 48 13 chr5 23224886 23225113 -129312146 - RLTR19A LTR ERVK 0 496 262 4 762 1051 261 3 47 chr5 23225894 23226192 -129311067 + RLTR18B LTR ERVK 5 289 -223 4 762 2354 164 30 49 chr5 23226239 23226956 -129310303 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 25 4 762 343 206 14 0 chr5 23227138 23227211 -129310048 + RLTR18B LTR ERVK 297 370 -142 4 762 14212 118 40 16 chr5 23227978 23229042 -129308217 - RMER16-int LTR ERVK -1534 3872 2808 5 762 14212 127 42 18 chr5 23229229 23230504 -129306755 - RMER16-int LTR ERVK -2599 2807 1534 5 762 2162 325 92 68 chr5 23230645 23231270 -129305989 - SRV_MM-int LTR ERVK -3240 2927 2319 5 762 2162 325 92 68 chr5 23231418 23231962 -129305297 - SRV_MM-int LTR ERVK -3849 2318 1729 5 762 390 169 26 0 chr5 23232031 23232108 -129305151 - RMER16 LTR ERVK -454 79 1 5 762 3151 31 62 0 chr5 23232230 23232617 -129304642 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 762 3516 66 20 35 chr5 23232618 23233360 -129303899 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 5 762 1001 50 0 0 chr5 23233360 23233479 -129303780 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 5 762 1902 93 0 0 chr5 23233480 23233726 -129303533 + IAPEz-int LTR ERVK 2252 2497 -5183 5 762 14651 62 8 4 chr5 23233725 23235542 -129301717 + IAPEz-int LTR ERVK 4656 6479 -2 5 762 3087 29 84 0 chr5 23235544 23235923 -129301336 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 762 356 280 15 39 chr5 23237830 23237960 -129299299 - LTR16A LTR ERVL -298 153 27 5 762 920 120 89 0 chr5 23238614 23238772 -129298487 - ORR1A4 LTR MaLR -157 172 1 5 762 283 279 116 30 chr5 23238772 23238995 -129298264 - MER31A LTR ERV1 -225 260 11 5 762 677 183 280 40 chr5 23241354 23241604 -129295655 - MTD LTR MaLR -1 418 109 5 762 303 307 159 29 chr5 23242549 23242794 -129294465 + MER21B LTR ERV1 386 662 -201 5 762 4234 134 31 13 chr5 23243003 23243681 -129293578 + RLTR17 LTR ERVK 3 692 0 5 762 1755 130 88 0 chr5 23245096 23245426 -129291833 - RMER15 LTR ERVL -155 420 62 5 762 2087 150 89 25 chr5 23245427 23245831 -129291428 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 5 762 445 346 18 12 chr5 23250617 23250781 -129286478 + MTD LTR MaLR 1 165 -254 5 762 407 306 71 28 chr5 23250915 23251198 -129286061 + MLT2B2 LTR ERVL 185 562 0 5 762 996 191 133 30 chr5 23280161 23280431 -129256828 + ORR1A4 LTR MaLR 30 327 -2 6 762 523 186 52 0 chr5 23290397 23290494 -129246765 + MTE2b LTR MaLR 1 102 -277 6 762 1595 175 98 53 chr5 23291122 23291478 -129245781 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 6 762 346 228 82 52 chr5 23292749 23292846 -129244413 + MT2B LTR ERVL 165 264 -337 6 762 319 113 0 0 chr5 23301650 23301703 -129235556 - MTD LTR MaLR -121 298 246 7 762 2100 129 102 11 chr5 23302266 23302619 -129234640 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 1 7 762 342 214 29 0 chr5 23302810 23302880 -129234379 - MTD LTR MaLR -14 405 334 7 762 591 249 156 36 chr5 23302869 23303061 -129234198 - MTD LTR MaLR -201 218 4 7 762 8719 21 5 0 chr5 23305296 23306269 -129230990 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 1 7 762 1953 138 78 12 chr5 23311822 23312166 -129225093 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 762 397 154 48 117 chr5 23325428 23325531 -129211728 + MT2B LTR ERVL 169 264 -337 7 763 1439 130 159 7 chr5 23331387 23331675 -129205584 + ORR1A3 LTR MaLR 1 338 -8 8 763 1200 233 130 12 chr5 23332135 23332474 -129204785 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 8 763 269 140 58 39 chr5 23332507 23332559 -129204700 + RMER20A LTR ERVK 4 56 -460 8 763 2395 176 55 7 chr5 23332856 23333292 -129203967 + RMER20A LTR ERVK 47 503 -13 8 763 487 65 0 0 chr5 23333566 23333628 -129203631 + MTC LTR MaLR 1 62 -359 8 763 4157 106 104 3 chr5 23333628 23334272 -129202987 + RMER19A LTR ERVK 1 709 -28 8 763 252 222 147 53 chr5 23335328 23335423 -129201836 - MLT1F LTR MaLR -176 372 269 8 763 1233 243 30 51 chr5 23353418 23353752 -129183507 + RLTR18B LTR ERVK 1 327 -185 8 763 4201 59 76 0 chr5 23353896 23354420 -129182839 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 8 763 1569 104 101 0 chr5 23354563 23354831 -129182428 + RLTR10A LTR ERVK 117 411 0 8 763 687 272 11 27 chr5 23354831 23355016 -129182243 + RLTR18B LTR ERVK 327 508 -4 8 763 1118 238 113 10 chr5 23355425 23355738 -129181521 - RLTR33 LTR ERVK -86 592 197 8 763 304 265 132 97 chr5 23360407 23360567 -129176692 + RLTR41 LTR ERV1 118 293 -153 8 763 304 265 132 97 chr5 23360757 23360884 -129176375 + RLTR41 LTR ERV1 294 415 -31 8 763 380 205 216 35 chr5 23361115 23361231 -129176028 + MERVK26-int LTR ERVK 220 356 -6563 8 763 2203 344 53 21 chr5 23361901 23363021 -129174238 + MERVK26-int LTR ERVK 1271 2425 -4494 8 763 567 297 43 16 chr5 23363155 23363382 -129173877 + MERVK26-int LTR ERVK 2584 2721 -4198 8 763 568 203 106 28 chr5 23363533 23363675 -129173584 + RMER17A-int LTR ERVK 1268 1420 -308 8 763 1482 267 174 76 chr5 23363947 23364725 -129172534 + RMER13A LTR ERVK 5 858 -2 8 763 239 238 248 0 chr5 23365006 23365107 -129172152 + RMER20A LTR ERVK 391 516 0 8 763 1066 276 11 0 chr5 23365198 23365459 -129171800 + RMER20A LTR ERVK 136 399 -117 8 763 1000 358 7 7 chr5 23365542 23365947 -129171312 + MERVK26-int LTR ERVK 1224 1628 -5291 8 763 998 284 69 39 chr5 23365943 23366379 -129170880 + MERVK26-int LTR ERVK 5041 5489 -1430 8 763 484 200 45 18 chr5 23366606 23366718 -129170541 + MERVK26-int LTR ERVK 5856 5970 -949 8 763 470 303 70 24 chr5 23367134 23367347 -129169912 + MERVK26-int LTR ERVK 6669 6891 -28 8 763 403 223 21 21 chr5 23372116 23372212 -129165047 + MTD LTR MaLR 1 96 -323 8 763 765 246 106 5 chr5 23372229 23372437 -129164822 + MTD LTR MaLR 180 408 -11 8 763 2877 89 142 0 chr5 23377028 23377491 -129159768 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 4 9 763 367 369 83 56 chr5 23378553 23378877 -129158382 + LTR16E1 LTR ERVL 205 537 -1 9 763 3525 155 35 10 chr5 23385423 23386028 -129151231 + RMER16-int LTR ERVK 804 1423 -3983 9 763 13072 132 30 8 chr5 23386031 23387760 -129149499 + RMER16-int LTR ERVK 1539 3312 -2094 9 763 13072 152 31 31 chr5 23387962 23388528 -129148731 + RMER16-int LTR ERVK 3313 3973 -1433 9 763 330 338 46 36 chr5 23389216 23389523 -129147736 + RMER16-int LTR ERVK 4390 4699 -707 9 763 571 311 90 12 chr5 23389543 23389787 -129147472 + MuRRS4-int LTR ERV1 4622 4884 -179 9 763 314 287 11 0 chr5 23390391 23390478 -129146781 + MuRRS4-int LTR ERV1 5436 5523 -2033 9 763 771 315 45 39 chr5 23391020 23391571 -129145688 + RLTR6-int LTR ERV1 7345 7713 -65 9 763 820 275 44 15 chr5 23391698 23391971 -129145288 + RLTR41 LTR ERV1 166 446 0 9 763 1905 169 97 105 chr5 23392073 23392317 -129144942 + RLTR19 LTR ERVK 1 238 -261 9 763 1905 169 97 105 chr5 23393039 23393297 -129143962 + RLTR19 LTR ERVK 239 499 0 9 763 249 59 0 0 chr5 23400958 23400992 -129136267 + RMER17C LTR ERVK 1 34 -376 9 763 1027 170 0 40 chr5 23400991 23401218 -129136041 + RMER17C LTR ERVK 189 406 -4 9 763 454 312 133 34 chr5 23403749 23403801 -129133458 - ORR1E LTR MaLR 0 359 299 9 763 454 312 133 34 chr5 23403847 23404116 -129133143 - ORR1E LTR MaLR -61 298 7 9 763 4320 94 102 8 chr5 23404468 23405088 -129132171 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 9 763 2395 109 109 104 chr5 23406547 23406989 -129130270 + RLTR41 LTR ERV1 1 444 -2 9 763 488 224 43 8 chr5 23408326 23408443 -129128816 + MTE2b LTR MaLR 1 121 -258 9 763 1027 235 70 8 chr5 23409464 23409721 -129127538 + MTE2b LTR MaLR 107 379 0 9 763 486 296 242 3 chr5 23413951 23414249 -129123010 + MTEa LTR MaLR 1 369 -10 9 763 1531 131 116 102 chr5 23414666 23415250 -129122009 + RMER17B LTR ERVK 146 717 -92 9 763 1287 216 63 24 chr5 23415340 23415743 -129121516 + RLTR1 LTR ERV1 135 624 0 9 763 288 106 0 0 chr5 23415743 23415790 -129121469 + RMER17B LTR ERVK 816 862 -44 9 763 5589 119 68 5 chr5 23415795 23416689 -129120570 + RMER17A-int LTR ERVK 772 1722 -6 9 763 848 121 1 26 chr5 23416693 23416863 -129120396 + RMER17B LTR ERVK 1 168 -474 9 763 274 244 132 11 chr5 23418110 23418201 -129119058 + MTEb LTR MaLR 205 306 -73 9 763 1085 294 66 35 chr5 23418240 23418726 -129118533 + MTE-int LTR MaLR 14 514 -1066 9 763 251 320 78 0 chr5 23419130 23419233 -129118026 + MTE-int LTR MaLR 769 879 -701 9 763 806 298 47 22 chr5 23419409 23419559 -129117700 + MTE-int LTR MaLR 1210 1367 -213 9 763 806 298 47 22 chr5 23419616 23419743 -129117516 + MTE-int LTR MaLR 1368 1493 -87 9 763 2748 78 65 10 chr5 23419752 23419905 -129117354 + BGLII LTR ERVK 1 153 -268 9 763 2748 78 65 10 chr5 23419936 23420181 -129117078 + BGLII LTR ERVK 154 420 -1 9 763 386 310 142 47 chr5 23420214 23420532 -129116727 + MTEa LTR MaLR 22 369 -10 9 763 666 166 52 26 chr5 23421703 23421858 -129115401 - RMER4A LTR ERVK 0 466 308 9 763 1534 145 100 136 chr5 23421857 23422293 -129114966 - RMER4A LTR ERVK -8 458 48 9 763 1534 145 100 136 chr5 23422430 23422462 -129114797 - RMER4A LTR ERVK -419 47 7 9 763 2834 127 120 22 chr5 23423990 23424523 -129112736 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 9 763 323 216 67 22 chr5 23425390 23425480 -129111779 - RMER10A LTR ERVL -31 411 318 9 763 252 319 114 42 chr5 23425638 23425900 -129111359 - RMER10A LTR ERVL -144 298 18 9 763 2162 118 60 16 chr5 23428313 23428693 -129108566 - MTC LTR MaLR -21 400 4 9 763 2051 155 139 14 chr5 23429014 23429459 -129107800 + RMER13A LTR ERVK 1 501 -359 9 763 678 206 76 41 chr5 23429549 23429721 -129107538 + RMER13A LTR ERVK 683 860 0 9 763 3492 30 2 0 chr5 23432637 23433032 -129104227 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 763 509 271 45 146 chr5 23433757 23434272 -129102987 + MYSERV6-int LTR ERVK 5513 5975 -2984 9 763 299 328 25 23 chr5 23434149 23434372 -129102887 + MERVL-int LTR ERVL 3828 4134 -1627 9 763 1617 188 82 53 chr5 23443895 23444084 -129093175 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 175 1 763 4528 19 0 0 chr5 23444084 23444566 -129092693 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 1 763 1617 188 82 53 chr5 23444566 23444595 -129092664 - ORR1B2 LTR MaLR -193 174 156 1 763 1617 188 82 53 chr5 23444623 23444758 -129092501 - ORR1B2 LTR MaLR -212 155 3 1 763 6235 154 63 8 chr5 23444760 23445920 -129091339 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 286 1 763 1408 239 118 63 chr5 23446084 23446532 -129090727 + RLTR20B3 LTR ERVK 15 471 -106 1 763 1408 250 105 55 chr5 23446573 23446648 -129090611 + RLTR20B3 LTR ERVK 449 548 -29 1 763 650 336 137 6 chr5 23447124 23447483 -129089776 + MER77 LTR ERVL 199 604 -3 1 763 3090 160 27 138 chr5 23448086 23448860 -129088399 + RMER6C LTR ERVK 3 690 0 1 763 1176 231 156 89 chr5 23450121 23450807 -129086452 + RMER12 LTR ERVK 1 686 -1122 1 763 738 208 208 85 chr5 23450918 23451245 -129086014 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 958 1 763 350 205 108 165 chr5 23451295 23451340 -129085919 - RMER12 LTR ERVK -205 1199 1156 1 763 1790 140 107 16 chr5 23452616 23452935 -129084324 + ORR1B2 LTR MaLR 20 367 0 1 763 1307 234 60 103 chr5 23453285 23453771 -129083488 + RLTR11A LTR ERVK 53 517 -11 1 763 6932 157 36 43 chr5 23454727 23456063 -129081196 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 1358 -1484 1 763 2762 165 23 0 chr5 23456636 23457120 -129080139 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -531 1795 1301 1 763 414 272 113 60 chr5 23460305 23460473 -129076786 - MER68 LTR ERVL -45 518 342 1 764 1063 234 83 3 chr5 23461896 23462164 -129075095 + MTEb LTR MaLR 1 280 -99 1 764 354 212 20 114 chr5 23462486 23462635 -129074624 + MTEb LTR MaLR 213 347 -32 1 764 250 206 95 0 chr5 23463016 23463079 -129074180 - ERVL-E-int LTR ERVL -1738 3929 3861 1 764 3499 51 2 0 chr5 23477290 23477685 -129059574 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 764 447 243 93 51 chr5 23481745 23482022 -129055237 + MTE2b LTR MaLR 21 360 -19 1 764 1396 184 68 48 chr5 23482174 23482318 -129054941 + ORR1D1 LTR MaLR 29 170 -204 1 764 1396 184 68 48 chr5 23482497 23482688 -129054571 + ORR1D1 LTR MaLR 171 371 -3 1 764 245 271 196 10 chr5 23496612 23496709 -129040550 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 294 1 764 1175 141 202 7 chr5 23503588 23503865 -129033394 - MTC LTR MaLR -8 413 83 8 764 449 246 8 24 chr5 23504031 23504127 -129033132 - MTC LTR MaLR -327 94 1 8 764 1253 255 181 26 chr5 23504574 23505150 -129032109 + LTR65 LTR ERV1 1 665 -4 1 764 603 230 61 20 chr5 23508297 23508572 -129028687 + ORR1D1 LTR MaLR 8 326 -48 1 764 1937 173 120 9 chr5 23512142 23512610 -129024649 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1533 -1309 2 764 3378 193 46 40 chr5 23512642 23513711 -129023548 + RMER3D-int LTR ERVK 1532 2835 -7 2 764 3183 68 27 0 chr5 23513718 23514128 -129023131 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 764 6354 45 38 8 chr5 23516679 23517463 -129019796 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 3 764 1840 172 157 36 chr5 23518075 23518546 -129018713 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 2 3 764 1536 169 177 6 chr5 23522768 23523084 -129014175 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 4 764 307 271 173 37 chr5 23526995 23527206 -129010053 - MLT1C LTR MaLR -9 458 161 5 764 583 239 36 100 chr5 23538665 23538995 -128998264 + RLTR15 LTR ERVK 33 341 -18 7 764 1440 119 4 0 chr5 23539021 23539247 -128998012 + RLTR15 LTR ERVK 133 359 0 7 764 898 300 116 70 chr5 23542700 23543216 -128994043 + MER21B LTR ERV1 273 812 -51 8 764 2532 133 65 30 chr5 23548325 23548799 -128988460 - RLTR19 LTR ERVK -8 491 1 9 764 319 260 70 0 chr5 23550186 23550286 -128986973 + MLT1A1 LTR MaLR 3 109 -299 9 764 441 223 18 9 chr5 23550364 23550477 -128986782 + MLT1A1 LTR MaLR 282 395 -13 9 764 3271 86 73 22 chr5 23557412 23557946 -128979313 + RMER2 LTR ERV1 1 561 -6 1 764 572 283 47 26 chr5 23561628 23561820 -128975439 + MTD LTR MaLR 1 196 -223 1 764 2724 153 43 22 chr5 23562473 23562962 -128974297 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 1 764 889 168 73 54 chr5 23563038 23563423 -128973836 + RLTR24 LTR ERV1 5 455 -74 1 764 940 161 247 26 chr5 23567454 23567762 -128969497 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 1 1 764 784 156 21 7 chr5 23569743 23569885 -128967374 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 224 1 764 737 277 64 57 chr5 23570826 23571237 -128966022 + RLTR11B LTR ERVK 1 424 -17 1 764 707 291 124 81 chr5 23572706 23573236 -128964023 + MLT1F2 LTR MaLR 8 560 0 1 764 1589 193 85 0 chr5 23575626 23576216 -128961043 + RLTR33 LTR ERVK 1 673 -5 1 764 596 281 25 58 chr5 23576221 23576412 -128960847 + ORR1E LTR MaLR 3 205 -179 1 764 238 258 45 15 chr5 23576478 23576545 -128960714 + ORR1E LTR MaLR 279 347 -32 1 764 1762 315 204 38 chr5 23576550 23576932 -128960327 + ORR1E-int LTR MaLR 12 511 -1069 1 764 7299 63 5 0 chr5 23576932 23577821 -128959438 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 1 764 1762 315 204 38 chr5 23577821 23578682 -128958577 + ORR1E-int LTR MaLR 512 1462 -118 1 764 2824 32 67 6 chr5 23581093 23581437 -128955822 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 1 764 326 267 89 24 chr5 23582093 23582262 -128954997 + LTR37A LTR ERV1 81 260 -166 1 764 451 104 0 122 chr5 23583716 23583818 -128953441 - RMER10A LTR ERVL -282 116 28 1 764 412 355 79 23 chr5 23585608 23585911 -128951348 + RMER5 LTR ERV1 145 464 -70 1 764 252 217 50 0 chr5 23586092 23586152 -128951107 + RMER5 LTR ERV1 472 534 0 1 764 719 261 163 4 chr5 23587255 23587494 -128949765 + MTEb LTR MaLR 1 277 -102 1 764 437 195 0 139 chr5 23590368 23590505 -128946754 - MT2B LTR ERVL -337 264 147 1 764 635 193 0 0 chr5 23591646 23591765 -128945494 - MTD LTR MaLR -300 119 1 1 765 665 302 70 52 chr5 23598342 23598614 -128938645 - MER70B LTR ERVL -135 443 167 1 765 3038 42 0 3 chr5 23599904 23600262 -128936997 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 1 765 552 318 107 60 chr5 23601377 23601914 -128935345 - RMER13A LTR ERVK -229 679 91 1 765 1723 171 60 81 chr5 23602205 23602588 -128934671 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 4 1 765 288 137 0 0 chr5 23608299 23608350 -128928909 - ORR1B2-int LTR MaLR -1032 931 881 2 765 1629 189 134 15 chr5 23608405 23608463 -128928796 - ORR1B2-int LTR MaLR -664 845 760 2 765 1629 189 134 15 chr5 23608592 23608917 -128928342 - ORR1B2-int LTR MaLR -664 759 273 2 765 3152 99 80 20 chr5 23608943 23609668 -128927591 - RLTR13D1 LTR ERVK -25 998 1 2 765 864 167 83 0 chr5 23609668 23609859 -128927400 - ORR1B2-int LTR MaLR -1231 278 72 2 765 1279 158 192 11 chr5 23609857 23610138 -128927121 - ORR1B2 LTR MaLR -31 336 5 2 765 1228 179 81 4 chr5 23612433 23612656 -128924603 - RMER21B LTR ERV1 -78 764 524 2 765 1232 152 232 119 chr5 23612656 23613052 -128924207 + RMER6B LTR ERVK 1 441 -20 2 765 2571 168 43 159 chr5 23613052 23613135 -128924124 - RMER21A LTR ERV1 -313 634 561 2 765 2571 168 43 159 chr5 23613282 23613915 -128923344 - RMER21A LTR ERV1 -387 560 1 2 765 340 257 28 75 chr5 23614747 23614899 -128922360 - ORR1D2 LTR MaLR -59 311 157 2 765 4016 147 128 77 chr5 23615919 23616820 -128920439 + RMER21A LTR ERV1 1 947 0 2 765 495 331 131 97 chr5 23617035 23617510 -128919749 - MTE-int LTR MaLR -705 875 385 2 765 3342 162 15 14 chr5 23618041 23618635 -128918624 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 98 2 765 1118 206 52 138 chr5 23621563 23621963 -128915296 + ORR1B2 LTR MaLR 2 367 0 2 765 1955 205 37 7 chr5 23621963 23622366 -128914893 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 415 -955 2 765 565 205 53 18 chr5 23622366 23622480 -128914779 + RMER10A LTR ERVL 1 118 -324 2 765 899 223 101 67 chr5 23622470 23622797 -128914462 - RMER10A LTR ERVL -104 338 1 2 765 863 237 5 16 chr5 23622798 23622991 -128914268 + ORR1B2-int LTR MaLR 412 602 -768 2 765 2432 214 73 32 chr5 23623010 23623595 -128913664 + ORR1B2-int LTR MaLR 668 1276 -94 2 765 674 128 23 1 chr5 23624546 23624666 -128912593 + ORR1B2-int LTR MaLR 1265 1370 0 2 765 498 186 39 10 chr5 23624666 23624745 -128912514 + ORR1B2 LTR MaLR 23 104 -270 2 765 647 200 95 61 chr5 23624961 23625208 -128912051 + ORR1C2 LTR MaLR 48 381 -3 2 765 2103 182 26 10 chr5 23625229 23625617 -128911642 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 765 1569 241 50 32 chr5 23625802 23626300 -128910959 - MYSERV-int LTR ERVK -1695 4855 4349 2 765 1608 139 28 83 chr5 23626306 23626688 -128910571 - ORR1A3 LTR MaLR -23 351 1 2 765 357 299 58 48 chr5 23627963 23628170 -128909089 - MYSERV-int LTR ERVK -4587 4372 4164 2 765 885 288 13 35 chr5 23628206 23628516 -128908743 - MurERV4-int LTR ERVK -423 4837 4535 2 765 2740 112 91 39 chr5 23628787 23629280 -128907979 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 2 765 917 214 69 112 chr5 23630346 23630694 -128906565 - RLTR15 LTR ERVK -26 333 1 2 765 3329 33 2 10 chr5 23635439 23635838 -128901421 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 765 230 299 21 84 chr5 23639214 23639309 -128897950 + MT2B2 LTR ERVL 152 240 -344 2 765 247 182 0 0 chr5 23641518 23641562 -128895697 + MLT1D LTR MaLR 449 492 -13 2 765 1938 171 83 16 chr5 23642877 23643262 -128893997 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 765 1052 252 32 87 chr5 23651190 23651214 -128886045 - MT2B LTR ERVL 0 601 586 2 765 1052 252 32 87 chr5 23651450 23651488 -128885771 - MT2B LTR ERVL -16 585 555 2 765 1052 214 81 117 chr5 23651512 23651941 -128885318 - MT2B LTR ERVL -47 554 1 2 765 278 294 50 109 chr5 23652659 23652880 -128884379 - RLTR41 LTR ERV1 -53 393 186 2 765 1333 77 11 6 chr5 23655714 23655897 -128881362 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 211 2 765 1016 108 210 5 chr5 23658147 23658333 -128878926 - ORR1B1 LTR MaLR -169 225 2 2 765 838 131 281 4 chr5 23660215 23660460 -128876799 - ORR1B1 LTR MaLR -63 315 3 3 765 1202 156 61 9 chr5 23663421 23663635 -128873624 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 135 3 765 352 241 132 18 chr5 23667704 23667818 -128869441 - MLT1C LTR MaLR -335 132 6 3 765 1404 102 111 0 chr5 23667864 23668108 -128869151 - RMER6A LTR ERVK 0 756 486 3 765 988 274 76 22 chr5 23669534 23669917 -128867342 - MTEb LTR MaLR -13 366 1 3 765 235 198 283 0 chr5 23670287 23670393 -128866866 - LTR65 LTR ERV1 -330 339 204 3 765 1313 121 39 9 chr5 23672013 23672246 -128865013 - RMER6A LTR ERVK -409 347 108 3 765 1065 259 71 31 chr5 23678529 23678883 -128858376 - MTD LTR MaLR 0 419 52 3 765 1559 156 71 91 chr5 23681455 23681808 -128855451 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 3 765 3056 112 122 9 chr5 23681812 23682387 -128854872 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 640 -1323 3 765 273 122 0 0 chr5 23682387 23682428 -128854831 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5719 5759 -2 3 765 691 168 35 104 chr5 23682471 23682644 -128854615 + MT2B LTR ERVL 127 287 -314 3 765 3438 124 16 6 chr5 23682603 23683229 -128854030 + ORR1B1-int LTR MaLR 718 1349 -614 3 765 513 53 0 26 chr5 23683231 23683309 -128853950 - ORR1A4 LTR MaLR -253 76 1 3 765 1039 170 16 50 chr5 23689454 23689738 -128847521 - RMER19B LTR ERVK -666 236 1 3 765 2180 186 107 38 chr5 23689739 23690293 -128846966 + RMER13A LTR ERVK 269 860 0 3 765 352 136 46 160 chr5 23690451 23690465 -128846794 - ORR1D1 LTR MaLR -258 116 104 3 765 352 136 46 160 chr5 23690611 23690727 -128846532 - ORR1D1 LTR MaLR -271 103 1 3 765 1929 124 135 25 chr5 23690852 23691207 -128846052 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 765 245 269 35 78 chr5 23691408 23691549 -128845710 + ORR1E LTR MaLR 52 186 -173 3 765 4145 151 77 80 chr5 23691603 23692501 -128844758 - RMER19B LTR ERVK -7 895 1 3 765 2788 139 36 83 chr5 23693941 23694530 -128842729 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 3 765 393 333 58 55 chr5 23698675 23698967 -128838292 + MuRRS4-int LTR ERV1 1313 1605 -3458 3 765 1274 191 107 25 chr5 23699240 23699595 -128837664 + RMER16 LTR ERVK 150 533 0 3 765 6940 159 102 26 chr5 23699595 23699849 -128837410 + RMER16-int LTR ERVK 1 254 -5152 3 765 6940 159 102 26 chr5 23699967 23701052 -128836207 + RMER16-int LTR ERVK 255 1440 -3966 3 765 416 255 18 67 chr5 23701205 23701369 -128835890 + MuRRS4-int LTR ERV1 4357 4512 -3266 3 765 1371 264 22 8 chr5 23701836 23702243 -128835016 + MuRRS4-int LTR ERV1 3614 3954 -1109 3 765 685 205 98 19 chr5 23702477 23702691 -128834568 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1618 3 765 2824 169 92 99 chr5 23702699 23702969 -128834290 - RMER12 LTR ERVK -242 1080 789 3 765 2824 169 92 99 chr5 23703000 23703435 -128833824 - RMER12 LTR ERVK -534 788 385 3 765 2824 169 92 99 chr5 23703584 23703692 -128833567 - RMER12 LTR ERVK -938 384 272 3 765 3261 176 38 18 chr5 23703692 23704321 -128832938 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 4 765 563 130 297 0 chr5 23704327 23704465 -128832794 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1578 270 92 4 765 408 157 12 24 chr5 23706752 23706837 -128830422 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1764 84 1 4 765 502 278 66 56 chr5 23708909 23709229 -128828030 - ETnERV-int LTR ERVK -2988 326 4 4 765 2716 127 7 37 chr5 23709231 23709664 -128827595 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 4 765 3730 24 21 2 chr5 23710232 23710660 -128826599 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 765 2814 155 63 16 chr5 23712410 23712914 -128824345 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 1 4 765 2630 162 115 21 chr5 23712991 23713565 -128823694 - RMER13A LTR ERVK 0 860 233 4 765 493 153 0 0 chr5 23713559 23713644 -128823615 - RMER13A LTR ERVK -775 85 1 4 765 3217 166 123 10 chr5 23716114 23716168 -128821091 - RMER19B LTR ERVK -145 757 693 4 765 3217 166 123 10 chr5 23716247 23716872 -128820387 - RMER19B LTR ERVK -210 692 1 4 765 325 147 6 0 chr5 23719904 23719966 -128817293 - ORR1B1 LTR MaLR 0 378 267 4 765 792 279 107 4 chr5 23719967 23720237 -128817022 + RLTR16 LTR ERVK 1 298 -207 4 765 491 165 0 0 chr5 23720442 23720527 -128816732 + ORR1B1-int LTR MaLR 93 177 -1332 4 765 506 163 41 0 chr5 23720518 23720616 -128816643 - ORR1B1-int LTR MaLR -1407 102 1 4 765 2053 138 49 8 chr5 23720614 23720979 -128816280 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 13 4 765 1610 88 45 11 chr5 23721125 23721390 -128815869 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 274 -468 4 765 2030 42 20 24 chr5 23721367 23721660 -128815599 + RLTR4_Mm LTR ERV1 451 742 0 4 765 17913 19 1 5 chr5 23721660 23723777 -128813482 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1 2110 -5491 4 95 28697 58 4 3 chr5 23723766 23727434 -128809825 + MuLV-int LTR ERV1 3936 7606 0 4 766 1738 88 45 11 chr5 23727436 23727701 -128809558 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 274 -468 4 766 2175 42 20 24 chr5 23727678 23727970 -128809289 + RLTR4_Mm LTR ERV1 451 741 -1 4 766 4157 38 0 0 chr5 23727970 23728442 -128808817 - MT2C_Mm LTR ERVL -3 472 1 4 766 635 178 64 32 chr5 23730095 23730252 -128807007 + RMER16 LTR ERVK 1 162 -371 4 766 2295 150 8 16 chr5 23730306 23730675 -128806584 + MTC LTR MaLR 1 366 -55 4 766 1198 206 23 47 chr5 23730675 23731017 -128806242 - RMER17C LTR ERVK 0 410 77 4 766 971 176 48 39 chr5 23731015 23731062 -128806197 - RMER17C LTR ERVK -177 233 187 4 766 971 176 48 39 chr5 23731133 23731316 -128805943 - RMER17C LTR ERVK -224 186 1 4 766 365 188 73 24 chr5 23731316 23731364 -128805895 + MTC LTR MaLR 358 409 -12 4 766 2018 88 49 7 chr5 23733037 23733322 -128803937 + ORR1A2 LTR MaLR 31 327 0 4 766 6677 106 15 65 chr5 23733820 23734897 -128802362 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 4 766 2332 151 62 5 chr5 23735422 23735795 -128801464 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 766 1713 190 108 18 chr5 23736863 23737243 -128800016 - MTD LTR MaLR -2 417 4 4 766 3396 115 84 32 chr5 23739557 23740113 -128797146 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 766 477 196 103 0 chr5 23740113 23740220 -128797039 + MurERV4-int LTR ERVK 1 118 -5142 4 766 2838 133 136 32 chr5 23741400 23741881 -128795378 - RMER4B LTR ERVK 0 585 49 4 766 2838 133 136 32 chr5 23742059 23742107 -128795152 - RMER4B LTR ERVK -537 48 1 4 766 1055 190 47 69 chr5 23743660 23743892 -128793367 + RMER19A LTR ERVK 511 737 0 4 766 394 257 7 97 chr5 23743971 23744126 -128793133 + RLTR15 LTR ERVK 49 189 -170 4 766 362 341 71 34 chr5 23744160 23744427 -128792832 + RLTR15 LTR ERVK 83 359 0 4 766 3021 60 34 8 chr5 23747972 23748358 -128788901 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 766 3887 158 64 28 chr5 23748358 23749081 -128788178 + RMER13B LTR ERVK 157 905 -3 4 766 546 272 126 20 chr5 23750546 23750745 -128786514 + RMER15 LTR ERVL 353 572 -3 4 766 2968 46 144 136 chr5 23751851 23752359 -128784900 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 4 766 453 241 61 116 chr5 23753299 23753397 -128783862 - MLT1C LTR MaLR -312 155 57 4 766 453 241 61 116 chr5 23753617 23753682 -128783577 - MLT1C LTR MaLR -411 56 1 4 766 2006 131 121 58 chr5 23755271 23755718 -128781541 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 766 3329 41 10 0 chr5 23756232 23756624 -128780635 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 766 9583 27 1 0 chr5 23756624 23757721 -128779538 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 766 3307 30 2 15 chr5 23757721 23757838 -128779421 + MTA_Mm LTR MaLR 1 117 -279 4 766 3117 23 0 0 chr5 23757838 23758184 -128779075 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 766 3307 30 2 15 chr5 23758184 23758467 -128778792 + MTA_Mm LTR MaLR 118 396 0 4 766 2309 101 87 6 chr5 23759676 23760033 -128777226 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 766 4468 122 24 13 chr5 23761419 23761740 -128775519 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 322 -792 5 766 3035 35 0 0 chr5 23761740 23762086 -128775173 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 766 4468 132 24 15 chr5 23762086 23762530 -128774729 + RLTR13D3 LTR ERVK 316 765 -268 5 766 2156 96 51 9 chr5 23763477 23763793 -128773466 + RLTR13D3 LTR ERVK 786 1114 0 5 766 528 272 36 14 chr5 23764715 23764853 -128772406 + MTEa LTR MaLR 1 141 -238 5 766 439 298 129 25 chr5 23764937 23765081 -128772178 + MT2A LTR ERVL 268 426 -107 5 766 901 261 141 12 chr5 23765081 23765407 -128771852 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 5 766 439 298 129 25 chr5 23765407 23765503 -128771756 + MT2A LTR ERVL 427 533 0 5 766 814 309 57 30 chr5 23765503 23765799 -128771460 - MLT1A0 LTR MaLR -41 324 21 5 766 347 252 72 80 chr5 23765919 23766057 -128771202 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 373 5 766 252 235 18 140 chr5 23766165 23766279 -128770980 + MT2B LTR ERVL 165 264 -337 5 766 269 318 35 12 chr5 23769050 23769136 -128768123 + MLT1C LTR MaLR 380 467 0 5 766 2478 175 47 59 chr5 23773244 23773771 -128763488 - RLTR20B3 LTR ERVK -56 521 1 5 766 3513 162 55 64 chr5 23773781 23774579 -128762680 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -14 2312 1516 5 766 3513 162 55 64 chr5 23774653 23774679 -128762580 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -811 1515 1496 5 766 722 299 55 73 chr5 23774946 23775328 -128761931 - MTE2b LTR MaLR -2 377 3 5 766 2543 161 163 0 chr5 23776299 23776784 -128760475 + RLTR12A LTR ERVK 1 564 -4 5 766 260 326 11 21 chr5 23777691 23777785 -128759474 - MTE-int LTR MaLR -70 1510 1418 5 766 346 241 11 33 chr5 23777788 23777878 -128759381 + ORR1E LTR MaLR 4 91 -268 5 766 230 331 55 83 chr5 23778101 23778282 -128758977 - ORR1E LTR MaLR -164 195 20 5 766 1928 213 89 19 chr5 23781242 23781477 -128755782 + RLTR12B LTR ERVK 8 248 -280 5 766 1928 213 89 19 chr5 23781501 23781749 -128755510 + RLTR12B LTR ERVK 249 525 -3 5 766 338 194 96 61 chr5 23783847 23783962 -128753297 + MLT1A1 LTR MaLR 287 405 -3 5 766 5153 126 47 68 chr5 23784989 23785897 -128751362 + RMER19B LTR ERVK 2 890 -12 5 766 616 347 33 66 chr5 23786286 23786678 -128750581 + LTR83 LTR ERVL 47 425 -355 5 766 370 361 83 0 chr5 23794623 23794853 -128742406 + MLT1K LTR MaLR 339 587 -8 5 766 1940 197 31 0 chr5 23795255 23795610 -128741649 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 9 5 766 1019 264 32 73 chr5 23795633 23795879 -128741380 + RMER5 LTR ERV1 112 359 -175 5 766 1019 264 32 73 chr5 23796022 23796147 -128741112 + RMER5 LTR ERV1 360 468 -66 5 766 535 341 63 41 chr5 23799470 23799785 -128737474 + RLTR26 LTR ERVK 96 417 -225 5 766 1932 208 57 29 chr5 23800397 23801051 -128736208 - RMER19B LTR ERVK -125 777 1 5 766 420 322 142 9 chr5 23803138 23803370 -128733889 + LTR16A LTR ERVL 26 288 -163 5 766 2168 162 36 0 chr5 23804326 23804689 -128732570 + ORR1C1 LTR MaLR 1 376 -2 5 766 512 73 0 0 chr5 23805695 23805763 -128731496 + ORR1C2 LTR MaLR 315 382 -2 5 766 358 226 11 97 chr5 23806337 23806430 -128730829 - MTE2a LTR MaLR -14 365 275 5 766 1697 145 106 108 chr5 23806430 23806502 -128730757 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 324 5 766 1697 145 106 108 chr5 23806642 23806948 -128730311 - ORR1C1 LTR MaLR -55 323 1 5 766 358 296 128 90 chr5 23806948 23807099 -128730160 - MTE2a LTR MaLR -87 292 124 5 766 637 244 8 0 chr5 23808223 23808350 -128728909 - MT2A LTR ERVL -314 219 92 6 766 247 309 0 0 chr5 23808344 23808399 -128728860 - MT2A LTR ERVL -401 132 78 6 766 540 138 11 22 chr5 23810291 23810380 -128726879 - MT2A LTR ERVL -445 88 1 6 766 1504 177 168 18 chr5 23810380 23810719 -128726540 - MTD LTR MaLR -24 395 6 6 766 587 311 128 80 chr5 23811923 23812259 -128725000 + ORR1E LTR MaLR 8 359 0 6 766 299 330 99 10 chr5 23813081 23813182 -128724077 - ORR1E LTR MaLR -236 123 14 6 766 226 311 129 41 chr5 23814104 23814275 -128722984 + LTR85c LTR Gypsy? 601 786 -37 6 766 602 203 185 25 chr5 23815778 23815923 -128721336 + ORR1D1 LTR MaLR 2 172 -202 6 766 602 203 185 25 chr5 23816102 23816113 -128721146 + ORR1D1 LTR MaLR 173 183 -191 6 766 885 181 70 53 chr5 23816318 23816408 -128720851 + ORR1D1 LTR MaLR 185 275 -99 6 766 3320 130 193 21 chr5 23816408 23817035 -128720224 - RMER19A LTR ERVK 0 737 3 6 766 885 181 70 53 chr5 23817035 23817131 -128720128 + ORR1D1 LTR MaLR 276 374 0 6 766 527 288 68 34 chr5 23817742 23817949 -128719310 - MT2A LTR ERVL -28 573 279 6 766 413 86 17 0 chr5 23818044 23818102 -128719157 - RLTR14 LTR ERV1 -323 59 1 6 766 412 286 43 115 chr5 23818272 23818481 -128718778 - RLTR14-int LTR ERV1 -176 5141 4948 6 766 304 271 43 86 chr5 23818506 23818517 -128718742 + MT2B LTR ERVL 169 276 -321 6 766 1609 208 102 22 chr5 23819112 23819524 -128717735 + RMER4A LTR ERVK 17 461 -5 6 766 4350 134 20 27 chr5 23819527 23820294 -128716965 + MurERV4-int LTR ERVK 85 845 -4415 6 766 664 249 87 73 chr5 23820305 23820955 -128716304 - RMER17A2 LTR ERVK -9 899 311 6 766 1147 244 27 45 chr5 23821121 23821456 -128715803 - RMER17A2 LTR ERVK -577 329 1 6 766 1902 143 24 3 chr5 23821473 23821802 -128715457 + MurERV4-int LTR ERVK 902 1237 -4023 6 766 517 211 17 17 chr5 23821802 23821918 -128715341 + RMER4B LTR ERVK 170 285 -300 6 766 2271 172 73 11 chr5 23821918 23822371 -128714888 + MurERV4-int LTR ERVK 1255 1735 -3525 6 766 1992 118 9 6 chr5 23822373 23822688 -128714571 + MurERV4-int LTR ERVK 4944 5259 -1 6 766 2109 141 94 46 chr5 23822688 23823178 -128714081 + RMER4B LTR ERVK 1 457 -9 6 766 365 277 73 55 chr5 23852764 23852928 -128684331 + RLTR23 LTR ERV1 222 388 -42 6 767 650 295 101 43 chr5 23861161 23861335 -128675924 - MLT1G3 LTR MaLR -226 369 198 6 767 650 295 101 43 chr5 23861515 23861687 -128675572 - MLT1G3 LTR MaLR -398 197 3 6 767 237 170 0 21 chr5 23865005 23865053 -128672206 + MTEb LTR MaLR 275 321 -58 6 767 278 333 65 45 chr5 23868412 23868613 -128668646 - LTR16B1 LTR ERVL 0 480 276 6 767 1225 217 117 11 chr5 23874953 23875303 -128661956 - MTD LTR MaLR -14 405 3 6 767 295 274 41 111 chr5 23902436 23902608 -128634651 - MT2B LTR ERVL -338 263 104 7 767 515 183 5 62 chr5 23904390 23904582 -128632677 + RMER17C LTR ERVK 97 277 -133 7 767 301 275 17 92 chr5 23918224 23918344 -128618915 - RLTR25A LTR ERVK -471 632 522 7 767 297 208 29 68 chr5 23956447 23956550 -128580709 - MT2B LTR ERVL -351 250 152 8 767 382 277 29 7 chr5 23965380 23965518 -128571741 + RLTR15 LTR ERVK 1 141 -218 8 767 425 253 183 12 chr5 23965849 23966013 -128571246 - MTD LTR MaLR -41 378 187 8 767 689 183 151 40 chr5 23966206 23966405 -128570854 - MTD LTR MaLR -198 221 1 8 767 1013 212 261 23 chr5 23970244 23970543 -128566716 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 8 767 306 253 96 175 chr5 23974832 23975009 -128562250 - MLT1C LTR MaLR -5 462 223 8 767 1142 273 88 0 chr5 23975662 23975959 -128561300 - MTEa LTR MaLR -3 376 54 8 767 652 214 214 0 chr5 23977497 23977675 -128559584 - MTC LTR MaLR -8 413 196 8 768 3745 152 75 42 chr5 24012159 24012826 -128524433 + RLTR17 LTR ERVK 1 689 -3 3 768 1573 233 70 18 chr5 24019288 24019673 -128517586 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 768 234 218 68 114 chr5 24020530 24020544 -128516715 + ORR1A3-int LTR MaLR 1878 1891 -72 2 768 802 129 166 21 chr5 24020702 24020951 -128516308 + ORR1A3 LTR MaLR 1 212 -114 2 768 234 202 110 37 chr5 24025713 24025795 -128511464 + MT2B2 LTR ERVL 184 271 -313 4 768 447 181 23 108 chr5 24042095 24042225 -128495034 - MT2B LTR ERVL -344 257 139 8 768 1150 256 84 7 chr5 24048231 24048541 -128488718 - MTE2b LTR MaLR -39 340 7 1 768 1151 245 50 66 chr5 24061635 24062009 -128475250 - ORR1D2 LTR MaLR -5 374 3 1 768 1272 282 65 8 chr5 24064056 24064438 -128472821 + MTD LTR MaLR 16 419 0 1 768 527 244 68 15 chr5 24066555 24066688 -128470571 + MTD LTR MaLR 105 244 -175 1 768 4273 27 16 2 chr5 24070222 24070708 -128466551 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 768 468 310 109 0 chr5 24080964 24081138 -128456121 + MTD LTR MaLR 18 210 -209 1 768 337 241 13 0 chr5 24081477 24081556 -128455703 + MTD LTR MaLR 326 405 -14 1 768 1639 126 33 63 chr5 24087940 24088241 -128449018 - ORR1B2-int LTR MaLR -1188 321 30 1 768 1639 126 33 63 chr5 24088426 24088455 -128448804 - ORR1B2-int LTR MaLR -1480 29 1 1 768 1032 168 170 108 chr5 24088455 24088506 -128448753 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 324 1 768 1032 168 170 108 chr5 24088692 24088981 -128448278 - ORR1B2 LTR MaLR -44 323 6 1 768 1528 195 111 53 chr5 24089879 24090275 -128446984 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 768 969 275 114 0 chr5 24090483 24090763 -128446496 + MTE2b LTR MaLR 3 314 -65 1 768 244 326 181 30 chr5 24090829 24091028 -128446231 + RMER20B LTR ERVK 341 569 -58 1 769 314 286 83 8 chr5 24136872 24136992 -128400267 + MLT1D LTR MaLR 264 392 -113 2 769 530 290 64 106 chr5 24140472 24140927 -128396332 + RMER20B LTR ERVK 95 599 -28 2 769 546 294 91 27 chr5 24143567 24143787 -128393472 + MER21B LTR ERV1 468 701 -162 2 769 228 189 75 0 chr5 24143791 24143844 -128393415 - MTD LTR MaLR -5 374 318 2 769 579 284 66 30 chr5 24143992 24144229 -128393030 - MTD LTR MaLR -127 294 60 2 769 527 284 57 13 chr5 24144979 24145136 -128392123 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1167 4547 4384 2 769 2099 109 15 36 chr5 24150158 24150438 -128386821 + ORR1A2 LTR MaLR 1 285 -42 3 769 2099 109 15 36 chr5 24150630 24150683 -128386576 + ORR1A2 LTR MaLR 286 327 0 3 769 296 303 98 105 chr5 24151229 24151495 -128385764 + ORR1D2 LTR MaLR 74 337 -33 3 769 1555 221 48 75 chr5 24155122 24155334 -128381925 + MTD LTR MaLR 1 209 -210 3 769 1555 221 48 75 chr5 24155481 24155684 -128381575 + MTD LTR MaLR 210 405 -14 3 769 577 198 194 17 chr5 24155697 24155872 -128381387 + MTD-int LTR MaLR 1 206 -1052 3 769 452 286 89 30 chr5 24155936 24156172 -128381087 + MTD-int LTR MaLR 394 548 -710 3 769 1090 253 178 19 chr5 24156176 24156480 -128380779 + MTD-int LTR MaLR 783 1110 -148 3 769 1090 253 178 19 chr5 24156614 24156720 -128380539 + MTD-int LTR MaLR 1111 1258 0 3 769 1343 201 91 14 chr5 24156740 24157082 -128380177 + MTD LTR MaLR 41 405 -14 3 769 270 292 15 77 chr5 24157579 24157709 -128379550 + MLT1D LTR MaLR 70 191 -314 3 769 1831 162 61 14 chr5 24160541 24160903 -128376356 - MTD LTR MaLR 0 419 41 3 769 777 263 118 37 chr5 24161201 24161549 -128375710 - MTEa LTR MaLR -1 378 3 3 769 269 306 109 7 chr5 24161967 24162105 -128375154 - MLT1G3 LTR MaLR -23 568 417 3 769 594 286 31 132 chr5 24162996 24163299 -128373960 - MLT1G3 LTR MaLR -194 401 71 3 769 3757 60 28 2 chr5 24164633 24165132 -128372127 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 3 769 427 227 48 90 chr5 24166813 24166845 -128370414 - MT2B LTR ERVL -450 151 126 3 769 1228 159 76 0 chr5 24167423 24167687 -128369572 - RMER19B LTR ERVK -554 348 1 3 769 607 192 41 24 chr5 24167687 24167806 -128369453 + RLTR19 LTR ERVK 378 498 -1 3 769 675 140 169 0 chr5 24167806 24167942 -128369317 + MurERV4-int LTR ERVK 3303 3461 -1799 3 769 4108 209 28 35 chr5 24168090 24168739 -128368520 + MurERV4-int LTR ERVK 3445 4096 -1164 3 769 4108 209 28 35 chr5 24168907 24169284 -128367975 + MurERV4-int LTR ERVK 4097 4466 -794 3 769 1886 189 0 26 chr5 24169580 24169806 -128367453 + MYSERV6-int LTR ERVK 3902 4126 -4833 3 769 1864 132 140 25 chr5 24169806 24170171 -128367088 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 769 1886 189 0 26 chr5 24170171 24170325 -128366934 + MYSERV6-int LTR ERVK 4127 4272 -4687 3 769 1624 150 3 39 chr5 24170321 24170606 -128366653 + RMER6-int LTR ERVK 2895 3169 -8 3 769 3615 142 87 37 chr5 24170607 24170819 -128366440 + RMER6D LTR ERVK 8 220 -500 3 769 3615 142 87 37 chr5 24170965 24171118 -128366141 + RMER6D LTR ERVK 221 371 -349 3 769 3615 142 87 37 chr5 24171148 24171435 -128365824 + RMER6D LTR ERVK 372 694 -26 3 769 3615 142 87 37 chr5 24171463 24171487 -128365772 + RMER6D LTR ERVK 695 718 -2 3 769 6355 165 55 31 chr5 24171589 24172649 -128364610 + RodERV21-int LTR ERV1 3503 4594 -397 3 769 6355 165 55 31 chr5 24172838 24173063 -128364196 + RodERV21-int LTR ERV1 4595 4819 -172 3 769 346 260 0 103 chr5 24173063 24173179 -128364080 + RMER4B LTR ERVK 348 451 -134 3 769 630 280 142 16 chr5 24173314 24173561 -128363698 + RMER21B LTR ERV1 288 565 -277 3 769 228 306 85 59 chr5 24173629 24173782 -128363477 - MER31B LTR ERV1 -309 157 1 3 769 881 244 77 82 chr5 24173792 24174171 -128363088 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 3 769 318 275 107 96 chr5 24175434 24175631 -128361628 - MLT1A0 LTR MaLR -164 201 3 3 769 353 221 10 104 chr5 24176022 24176052 -128361207 - MT2B LTR ERVL -362 239 215 3 769 4915 45 16 0 chr5 24176052 24176629 -128360630 + LTRIS_Mus LTR ERV1 2 587 0 3 769 353 221 10 104 chr5 24176682 24176694 -128360565 - MT2B LTR ERVL -387 214 153 3 769 1464 211 36 10 chr5 24176698 24176802 -128360457 + RLTR18B LTR ERVK 2 106 -406 3 769 1464 211 36 10 chr5 24176825 24177022 -128360237 + RLTR18B LTR ERVK 107 311 -201 3 769 1244 193 235 80 chr5 24177022 24177473 -128359786 + RMER2 LTR ERV1 1 521 -46 3 769 909 339 73 50 chr5 24178390 24179339 -128357920 + MMERGLN-int LTR ERV1 1317 2287 -5491 3 769 322 276 88 22 chr5 24179381 24179518 -128357741 + MMERGLN-int LTR ERV1 2226 2371 -5230 3 769 1317 338 39 36 chr5 24179664 24180839 -128356420 + MMERGLN-int LTR ERV1 2552 3781 -3775 3 769 1027 193 7 97 chr5 24180849 24181118 -128356141 + RMER17A-int LTR ERVK 1217 1461 -267 3 769 892 228 92 11 chr5 24181111 24181400 -128355859 + MMERGLN-int LTR ERV1 3702 3915 -1148 3 769 314 266 39 39 chr5 24181595 24181724 -128355535 + RLTR14-int LTR ERV1 3748 3876 -1441 3 769 770 326 26 3 chr5 24183355 24183742 -128353517 + MuLV-int LTR ERV1 7092 7487 -119 4 769 1430 181 126 90 chr5 24183839 24184252 -128353007 + RMER2 LTR ERV1 1 428 -139 4 769 471 165 35 23 chr5 24184515 24184581 -128352678 + RLTR18B LTR ERVK 308 374 -138 4 769 5525 119 171 2 chr5 24184581 24185525 -128351734 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 4 769 377 256 13 0 chr5 24185525 24185586 -128351673 + RLTR18B LTR ERVK 367 428 -84 4 769 1124 297 23 42 chr5 24185914 24185937 -128351322 + MT2A LTR ERVL 152 178 -355 4 769 1124 297 23 42 chr5 24185979 24186264 -128350995 + MT2A LTR ERVL 179 453 -80 4 769 808 271 148 30 chr5 24186750 24187004 -128350255 + MTE2a LTR MaLR 1 297 -82 4 769 808 271 148 30 chr5 24187198 24187281 -128349978 + MTE2a LTR MaLR 298 378 -1 4 769 1886 162 35 50 chr5 24187286 24187747 -128349512 + RLTR12B LTR ERVK 1 509 -19 4 769 294 292 38 86 chr5 24188672 24188777 -128348482 + RMER10B LTR ERVL 292 391 -7 4 769 311 315 161 35 chr5 24190408 24190668 -128346591 - MLT1H LTR MaLR -20 529 237 4 769 463 231 78 108 chr5 24194093 24194297 -128342962 - MT2B LTR ERVL -337 264 67 4 769 347 240 83 83 chr5 24194885 24195017 -128342242 + MT2B LTR ERVL 145 276 -325 4 769 239 337 233 0 chr5 24196420 24196592 -128340667 + MER21B LTR ERV1 1 212 -651 4 769 1875 202 112 43 chr5 24196629 24197145 -128340114 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 552 -1 4 769 288 196 18 0 chr5 24200158 24200214 -128337045 + MT2B2 LTR ERVL 175 231 -353 4 769 249 316 48 48 chr5 24202381 24202484 -128334775 + MLT1I LTR MaLR 171 273 -138 4 769 501 279 219 27 chr5 24204892 24205220 -128332039 - RLTR12B LTR ERVK -96 432 42 4 769 3956 142 62 17 chr5 24211367 24212028 -128325231 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 1 4 769 554 270 126 126 chr5 24219676 24220024 -128317235 + MTE2a LTR MaLR 20 367 -12 4 769 1055 244 40 7 chr5 24225355 24225632 -128311627 + MTEb LTR MaLR 1 286 -93 5 769 1994 230 28 55 chr5 24225654 24226054 -128311205 + RLTR11A2 LTR ERVK 32 424 -103 5 769 1994 230 28 55 chr5 24226450 24226559 -128310700 + RLTR11A2 LTR ERVK 425 527 0 5 769 2052 149 99 5 chr5 24234315 24234700 -128302559 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 769 240 307 37 93 chr5 24237815 24238084 -128299175 - RMER17C LTR ERVK -32 378 125 5 769 808 226 45 13 chr5 24241436 24241649 -128295610 - MTD LTR MaLR -190 210 1 5 769 976 149 21 32 chr5 24242900 24243087 -128294172 + ORR1B1 LTR MaLR 41 225 -169 5 769 977 141 27 48 chr5 24243198 24243321 -128293938 + ORR1B1 LTR MaLR 211 330 -64 5 769 977 141 27 48 chr5 24243467 24243530 -128293729 + ORR1B1 LTR MaLR 331 393 -1 5 769 594 287 159 48 chr5 24243806 24244231 -128293028 - RLTR18 LTR ERVK -135 481 24 5 769 316 261 22 11 chr5 24248180 24248269 -128288990 - RMER5 LTR ERV1 -113 421 332 5 96 628 209 100 42 chr5 24248280 24248446 -128288813 + MTE2b LTR MaLR 1 181 -198 5 770 628 209 100 42 chr5 24248671 24248691 -128288568 + MTE2b LTR MaLR 182 201 -178 5 770 690 243 44 39 chr5 24248879 24249059 -128288200 - RLTR18B LTR ERVK -329 183 3 5 770 414 295 92 15 chr5 24249712 24249843 -128287416 + RLTR18 LTR ERVK 383 523 -93 5 770 609 297 110 62 chr5 24252141 24252478 -128284781 + ORR1E LTR MaLR 7 359 0 5 770 4428 105 60 6 chr5 24253813 24254495 -128282764 + RMER19A LTR ERVK 1 720 -17 5 770 506 143 0 0 chr5 24265086 24265163 -128272096 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 423 6 770 307 282 86 31 chr5 24265169 24265297 -128271962 + MT2A LTR ERVL 211 345 -188 6 770 2118 139 63 40 chr5 24265288 24265686 -128271573 - RLTR19 LTR ERVK -92 407 1 6 770 266 304 32 11 chr5 24265756 24265849 -128271410 - MT2A LTR ERVL -103 430 336 6 770 3160 39 180 2 chr5 24265927 24266360 -128270899 - RLTR1B LTR ERV1 -2 510 1 6 770 4077 21 0 0 chr5 24266360 24266841 -128270418 - MMERGLN-int LTR ERV1 0 7556 7076 6 770 22829 37 0 1 chr5 24273650 24276382 -128260877 - MMERGLN-int LTR ERV1 -467 7089 4360 6 770 36795 42 6 4 chr5 24277673 24282022 -128255237 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3199 4357 1 6 770 3113 47 207 2 chr5 24282022 24282447 -128254812 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 770 460 167 48 0 chr5 24282447 24282531 -128254728 - MTE2b LTR MaLR -286 93 6 6 770 1568 240 97 102 chr5 24284050 24285002 -128252257 + RMER17B LTR ERVK 5 951 -7 6 770 280 297 14 61 chr5 24285597 24285744 -128251515 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 267 6 770 735 218 96 85 chr5 24288472 24288743 -128248516 - MTD LTR MaLR -145 274 1 6 770 448 207 9 35 chr5 24289421 24289536 -128247723 + ORR1D1 LTR MaLR 1 112 -262 6 770 1298 156 15 52 chr5 24289643 24289913 -128247346 + ORR1D1 LTR MaLR 80 339 -35 6 770 1461 166 13 2 chr5 24289918 24290215 -128247044 + RMER6A LTR ERVK 1 306 -384 6 770 2049 140 134 137 chr5 24290443 24290890 -128246369 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 6 770 1365 185 24 28 chr5 24291282 24291659 -128245600 + BGLII_B LTR ERVK 41 435 -6 6 770 294 283 56 9 chr5 24299123 24299230 -128238029 - LTR31 LTR ERV1 -291 328 217 6 770 1463 172 103 73 chr5 24300060 24300133 -128237126 + ORR1B1 LTR MaLR 26 90 -304 6 770 1463 172 103 73 chr5 24300627 24300911 -128236348 + ORR1B1 LTR MaLR 91 394 0 6 770 4897 188 55 55 chr5 24301447 24302588 -128234671 + MYSERV-int LTR ERVK 5385 6450 -100 6 770 4897 186 61 54 chr5 24302735 24302859 -128234400 + MYSERV-int LTR ERVK 6451 6548 -2 6 770 639 161 56 5 chr5 24302861 24302996 -128234263 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 134 -319 6 770 834 174 115 13 chr5 24321069 24321368 -128215891 + RLTR20B2 LTR ERVK 3 560 0 6 770 1714 91 225 15 chr5 24324226 24324493 -128212766 + ORR1A2 LTR MaLR 1 323 -4 6 770 3357 41 5 0 chr5 24324937 24325331 -128211928 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 770 1396 104 77 51 chr5 24325715 24325988 -128211271 + ORR1A3 LTR MaLR 25 304 -22 6 770 895 274 40 33 chr5 24333404 24333676 -128203583 + MTEa LTR MaLR 16 289 -90 7 770 2208 151 3 30 chr5 24351449 24351812 -128185447 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 42 7 770 514 298 105 57 chr5 24352182 24352574 -128184685 + MLT1D LTR MaLR 3 500 -5 7 770 1970 142 16 3 chr5 24354185 24354490 -128182769 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 7 770 225 287 57 47 chr5 24355095 24355201 -128182058 + RLTR14 LTR ERV1 263 369 -13 7 770 440 298 58 62 chr5 24355220 24355478 -128181781 + RLTR14-int LTR ERV1 2 258 -5059 7 770 386 238 38 38 chr5 24356123 24356228 -128181031 + RLTR14-int LTR ERV1 447 551 -4766 7 770 330 326 30 52 chr5 24356267 24356497 -128180762 + RLTR14-int LTR ERV1 5092 5316 -1 7 770 703 283 116 89 chr5 24356498 24356870 -128180389 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 7 770 2022 202 77 54 chr5 24359302 24359729 -128177530 + RLTR20C LTR ERVK 1 432 -102 7 770 2022 202 77 54 chr5 24359759 24359853 -128177406 + RLTR20C LTR ERVK 433 534 0 7 770 1050 184 11 7 chr5 24360080 24360272 -128176987 + RMER13B LTR ERVK 1 185 -723 7 770 599 106 0 12 chr5 24364685 24364771 -128172488 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 294 8 770 1080 247 26 53 chr5 24364757 24365061 -128172198 + RLTR16 LTR ERVK 210 505 0 8 770 489 187 96 16 chr5 24365069 24365194 -128172065 - ORR1C1 LTR MaLR -243 135 1 8 770 2159 135 105 5 chr5 24365797 24366178 -128171081 - MTC LTR MaLR 0 421 3 8 770 656 261 117 22 chr5 24366620 24366894 -128170365 - MLT1C LTR MaLR -167 300 1 8 770 444 35 0 17 chr5 24375677 24375735 -128161524 + RLTR17 LTR ERVK 98 154 -538 8 770 1150 153 51 28 chr5 24375726 24375941 -128161318 + RLTR17 LTR ERVK 473 692 0 8 771 1860 72 326 0 chr5 24386709 24387016 -128150243 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 771 744 238 11 75 chr5 24388365 24388586 -128148673 + MTC LTR MaLR 187 421 0 8 771 4014 26 30 2 chr5 24389462 24389924 -128147335 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 8 771 1678 113 12 12 chr5 24389926 24390185 -128147074 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 259 -839 8 771 1844 48 18 18 chr5 24390156 24390434 -128146825 + MTA_Mm-int LTR MaLR 821 1098 0 8 771 1868 48 342 0 chr5 24390434 24390729 -128146530 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 771 277 238 80 109 chr5 24392877 24393014 -128144245 - MT2B LTR ERVL -323 278 146 8 771 373 314 47 47 chr5 24396693 24396820 -128140439 - MTEa LTR MaLR -252 127 1 8 771 578 278 42 130 chr5 24397043 24397209 -128140050 + RLTR15 LTR ERVK 1 150 -209 8 771 578 278 42 130 chr5 24397354 24397564 -128139695 + RLTR15 LTR ERVK 151 344 -15 8 771 304 300 116 97 chr5 24397988 24398350 -128138909 + MLT1C LTR MaLR 48 416 -51 8 771 406 292 147 12 chr5 24399812 24400067 -128137192 + MTEa LTR MaLR 17 304 -75 8 771 601 310 71 22 chr5 24401924 24402191 -128135068 - MER21B LTR ERV1 -58 805 526 8 771 803 325 69 25 chr5 24402259 24402578 -128134681 - MER21B LTR ERV1 -496 367 35 8 771 3475 25 2 8 chr5 24403863 24404261 -128132998 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 771 8060 62 9 69 chr5 24404261 24405429 -128131830 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1097 -1 8 771 3049 33 3 0 chr5 24405437 24405800 -128131459 + MTA_Mm LTR MaLR 33 396 0 8 771 1337 172 203 19 chr5 24406347 24406667 -128130592 + MTD LTR MaLR 1 379 -40 8 771 1744 209 63 35 chr5 24409800 24410196 -128127063 + MTD LTR MaLR 13 419 0 8 771 1514 188 138 37 chr5 24420352 24420701 -128116558 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 8 771 2214 120 98 0 chr5 24420835 24421194 -128116065 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 8 771 387 322 89 52 chr5 24422392 24422703 -128114556 + MTEa LTR MaLR 2 342 -37 9 771 675 216 50 67 chr5 24423005 24423184 -128114075 + MTD LTR MaLR 12 187 -232 9 771 1167 286 52 11 chr5 24423200 24423564 -128113695 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 9 771 307 357 52 57 chr5 24425317 24425510 -128111749 + MLT1L LTR MaLR 418 609 -1 9 771 318 253 152 9 chr5 24427131 24427293 -128109966 + MTC LTR MaLR 1 211 -210 9 771 301 216 57 16 chr5 24427331 24427421 -128109838 + MTC LTR MaLR 286 419 0 9 771 1208 241 59 20 chr5 24427525 24427830 -128109429 + MTE2a LTR MaLR 1 317 -62 9 771 1157 289 49 13 chr5 24427866 24428252 -128109007 + MTE-int LTR MaLR 2 401 -1179 9 771 226 257 40 79 chr5 24429778 24429836 -128107423 - ORR1B1-int LTR MaLR -864 645 594 9 771 1583 218 81 25 chr5 24434351 24434747 -128102512 + MTD LTR MaLR 2 419 0 9 771 311 232 113 21 chr5 24438352 24438449 -128098810 + RLTR25B LTR ERVK 404 509 -519 9 771 3016 70 36 0 chr5 24440451 24440837 -128096422 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 771 237 302 87 56 chr5 24441980 24442106 -128095153 + RMER15 LTR ERVL 27 156 -419 9 771 420 260 36 108 chr5 24442130 24442324 -128094935 + RMER15 LTR ERVL 380 559 -16 9 771 319 368 70 52 chr5 24443162 24443449 -128093810 - ORR1E LTR MaLR -67 292 1 9 771 256 281 121 36 chr5 24448022 24448188 -128089071 + MLT1B LTR MaLR 108 287 -103 9 771 597 318 39 58 chr5 24448551 24448808 -128088451 + MTD LTR MaLR 13 264 -155 9 771 551 318 31 5 chr5 24451749 24451945 -128085314 + MLT1B LTR MaLR 1 201 -189 9 771 376 317 54 11 chr5 24454244 24454418 -128082841 - MLT1C LTR MaLR -285 182 1 9 771 1234 184 198 10 chr5 24456254 24456567 -128080692 + MTEb LTR MaLR 2 373 -6 9 771 281 382 66 57 chr5 24457264 24457614 -128079645 - ORR1E LTR MaLR 0 359 7 1 771 1574 196 63 54 chr5 24461911 24462105 -128075154 - MTD LTR MaLR 0 419 207 1 771 2904 61 0 0 chr5 24462105 24462451 -128074808 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 771 1574 196 63 54 chr5 24462451 24462666 -128074593 - MTD LTR MaLR -213 206 6 1 771 657 291 85 54 chr5 24465665 24465981 -128071278 - ORR1E LTR MaLR -2 357 32 1 771 3430 40 2 2 chr5 24470857 24471253 -128066006 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 771 857 246 147 50 chr5 24486345 24486747 -128050512 + RMER10A LTR ERVL 2 442 0 1 771 383 308 43 43 chr5 24488433 24488596 -128048663 - ERVL-E-int LTR ERVL -3813 1854 1692 1 771 601 286 72 34 chr5 24492411 24492704 -128044555 - MER74A LTR ERVL 0 558 255 1 771 2153 146 29 57 chr5 24493411 24493796 -128043463 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 1 771 570 126 11 0 chr5 24493829 24493924 -128043335 + ORR1D1 LTR MaLR 1 96 -278 1 771 387 171 40 0 chr5 24493922 24494008 -128043251 + ORR1D1 LTR MaLR 240 378 0 1 771 2301 144 59 22 chr5 24494097 24494501 -128042758 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 771 379 166 55 45 chr5 24498424 24498522 -128038737 + MTC LTR MaLR 1 98 -298 1 771 1759 136 93 10 chr5 24498677 24498990 -128038269 + MTC LTR MaLR 83 421 0 1 771 355 254 79 39 chr5 24503096 24503223 -128034036 + ORR1E LTR MaLR 49 180 -179 5 772 342 185 80 80 chr5 24519179 24519279 -128017980 + MTEa LTR MaLR 1 100 -279 3 772 404 298 91 30 chr5 24519812 24520011 -128017248 - MLT1C LTR MaLR -186 204 1 3 772 441 318 24 0 chr5 24522017 24522143 -128015116 + MLT1C LTR MaLR 53 181 -286 3 772 427 309 116 45 chr5 24522186 24522521 -128014738 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 772 979 223 114 73 chr5 24526733 24527076 -128010183 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 4 772 1059 247 60 21 chr5 24535121 24535402 -128001857 - MTE2b LTR MaLR -4 375 84 4 772 867 233 80 0 chr5 24536599 24536848 -128000411 + ORR1D2 LTR MaLR 5 273 -97 5 772 2978 49 29 3 chr5 24538890 24539276 -127997983 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 772 1028 283 15 55 chr5 24541108 24541437 -127995822 + MLT1B LTR MaLR 22 337 -53 6 772 2042 141 57 35 chr5 24542550 24542954 -127994305 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 772 1058 254 80 36 chr5 24548624 24548987 -127988272 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 7 772 433 388 57 0 chr5 24550078 24550305 -127986954 + MLT2C2 LTR ERVL 54 293 -171 7 772 939 139 6 0 chr5 24551948 24552106 -127985153 - ORR1C1 LTR MaLR -219 159 1 8 772 296 255 20 50 chr5 24552135 24552234 -127985025 + RMER15 LTR ERVL 1 96 -479 8 772 300 321 69 35 chr5 24552792 24552937 -127984322 + RMER15 LTR ERVL 423 572 -3 8 772 913 233 41 8 chr5 24555633 24555875 -127981384 + RMER15 LTR ERVL 326 575 0 8 772 364 271 113 84 chr5 24555876 24556203 -127981056 + MLT1A LTR MaLR 26 400 -8 9 772 259 279 47 0 chr5 24558787 24558873 -127978386 + MTE2b LTR MaLR 1 90 -289 9 772 274 250 0 0 chr5 24566086 24566142 -127971117 + MER74A LTR ERVL 269 324 -234 1 772 413 200 73 11 chr5 24568687 24568836 -127968423 + MTD LTR MaLR 222 405 -14 1 772 274 232 29 0 chr5 24576185 24576254 -127961005 - MLT1C LTR MaLR -220 247 177 1 772 2078 136 43 16 chr5 24576741 24577116 -127960143 + ORR1B1 LTR MaLR 1 385 -9 1 772 2841 115 12 14 chr5 24578840 24579255 -127958004 - MTC LTR MaLR -3 418 5 1 772 718 131 93 40 chr5 24581871 24581895 -127955364 - ORR1C2 LTR MaLR -32 352 331 1 772 718 131 93 40 chr5 24582649 24582775 -127954484 - ORR1C2 LTR MaLR -54 330 194 1 772 249 174 0 0 chr5 24582866 24582912 -127954347 - ORR1C2 LTR MaLR -326 48 3 1 772 1734 271 55 40 chr5 24585544 24586070 -127951189 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 1 772 285 248 33 74 chr5 24596507 24596629 -127940630 + LTR16A LTR ERVL 225 341 -110 1 772 676 307 100 59 chr5 24599308 24599647 -127937612 + MLT1B LTR MaLR 38 390 0 1 772 2047 163 69 13 chr5 24601404 24601795 -127935464 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 772 655 233 203 16 chr5 24602982 24603174 -127934085 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 1 772 1951 145 21 52 chr5 24612115 24612522 -127924737 + RMER17C LTR ERVK 1 394 -16 1 772 1951 145 21 52 chr5 24612636 24612651 -127924608 + RMER17C LTR ERVK 395 409 -1 1 772 1036 296 79 7 chr5 24615081 24615452 -127921807 + MLT2D LTR ERVL 1 540 -19 1 772 746 326 50 7 chr5 24617921 24618199 -127919060 + RMER15-int LTR ERVL 4489 4778 -221 1 772 1008 237 108 27 chr5 24620826 24621086 -127916173 - MTE2b LTR MaLR -14 365 85 1 772 3107 52 10 5 chr5 24622933 24623321 -127913938 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 772 2552 78 26 0 chr5 24624332 24624680 -127912579 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 1 772 704 250 189 96 chr5 24626048 24626125 -127911134 + MTD LTR MaLR 1 47 -372 1 772 704 250 189 96 chr5 24626271 24626569 -127910690 + MTD LTR MaLR 48 411 -8 1 772 1348 180 205 3 chr5 24630935 24631242 -127906017 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 2 772 756 288 106 11 chr5 24633099 24633373 -127903886 - MLT1C LTR MaLR -167 300 1 2 772 229 235 23 69 chr5 24633395 24633482 -127903777 - MER34A LTR ERV1 -427 144 62 2 772 3046 23 9 0 chr5 24634086 24634429 -127902830 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 772 1864 253 24 32 chr5 24634439 24634937 -127902322 - RLTR16 LTR ERVK -4 501 8 2 773 1078 191 221 24 chr5 24643873 24644162 -127893097 - RMER6C LTR ERVK -7 683 338 2 773 1433 113 7 18 chr5 24645350 24645637 -127891622 - RMER6C LTR ERVK -369 321 1 2 773 3292 43 2 15 chr5 24646437 24646838 -127890421 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 773 3225 196 181 55 chr5 24648143 24648946 -127888313 + RMER13B LTR ERVK 5 908 0 2 773 325 315 176 28 chr5 24649200 24649455 -127887804 - MLT1C LTR MaLR 0 467 175 2 773 2426 158 22 101 chr5 24651147 24651653 -127885606 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 2 773 780 130 61 0 chr5 24651653 24651784 -127885475 + MurERV4-int LTR ERVK 1 139 -5121 2 773 2113 140 14 41 chr5 24651791 24652155 -127885104 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 773 2291 163 52 5 chr5 24652156 24652562 -127884697 + ORR1B1-int LTR MaLR 2 426 -1537 2 773 313 261 10 42 chr5 24652562 24652658 -127884601 + ORR1B1 LTR MaLR 1 93 -236 2 773 3660 122 18 83 chr5 24652666 24653353 -127883906 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 2 773 1353 135 92 110 chr5 24653353 24653645 -127883614 + ORR1B1 LTR MaLR 43 329 0 2 773 7881 136 49 142 chr5 24653645 24655477 -127881782 + ORR1B1-int LTR MaLR 302 1963 0 2 773 2034 127 45 51 chr5 24655484 24655840 -127881419 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 773 8880 177 65 35 chr5 24655842 24657236 -127880023 + MurERV4-int LTR ERVK 134 1540 -3720 2 773 8880 143 95 19 chr5 24657382 24658785 -127878474 + MurERV4-int LTR ERVK 1541 3080 -2180 2 773 1289 99 11 0 chr5 24658771 24658952 -127878307 + MurERV4-int LTR ERVK 5078 5260 0 2 773 2476 152 46 9 chr5 24658968 24659401 -127877858 + RMER4A LTR ERVK 8 456 -10 2 773 294 345 110 12 chr5 24660950 24661123 -127876136 + LTR33 LTR ERVL 326 515 0 2 773 996 224 153 10 chr5 24662804 24663092 -127874167 + MTEa LTR MaLR 25 353 -26 2 773 1878 162 58 85 chr5 24663092 24663490 -127873769 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 60 2 773 2833 158 46 22 chr5 24664813 24665601 -127871658 + RMER19B LTR ERVK 1 864 -38 2 773 3604 15 2 0 chr5 24665601 24665996 -127871263 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 773 2833 167 73 31 chr5 24665996 24666040 -127871219 + RMER19B LTR ERVK 865 902 0 2 773 1406 253 88 37 chr5 24671346 24671915 -127865344 + RLTR26 LTR ERVK 5 642 0 2 773 1990 143 91 12 chr5 24677828 24678245 -127859014 - RMER6A LTR ERVK 0 756 307 2 773 2036 115 6 26 chr5 24678410 24678750 -127858509 - RMER6A LTR ERVK -423 333 1 2 773 368 238 91 120 chr5 24678981 24679193 -127858066 - MTEa LTR MaLR 0 379 156 2 773 1332 151 46 0 chr5 24679244 24679483 -127857776 + ORR1A4 LTR MaLR 59 308 -21 2 773 2392 202 102 9 chr5 24680712 24681270 -127855989 + RMER19C LTR ERVK 2 611 0 2 773 334 320 31 8 chr5 24682584 24682713 -127854546 + MLT1B LTR MaLR 247 378 -12 2 773 340 248 30 53 chr5 24684030 24684162 -127853097 - RLTR13D3 LTR ERVK -42 1072 944 2 773 1083 264 63 35 chr5 24687928 24688246 -127849013 - MTE2b LTR MaLR -52 327 1 3 773 281 325 187 0 chr5 24690576 24690742 -127846517 - MLT1B LTR MaLR -25 365 169 3 773 491 319 82 19 chr5 24695222 24695430 -127841829 + MTE2a LTR MaLR 155 375 -4 3 773 894 181 31 0 chr5 24697586 24697813 -127839446 - ORR1B1-int LTR MaLR -618 891 658 3 773 1782 129 212 3 chr5 24698112 24698438 -127838821 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 773 345 255 207 45 chr5 24703330 24703552 -127833707 - MLT1A0 LTR MaLR -103 262 5 3 773 956 260 55 17 chr5 24704395 24704685 -127832574 - ORR1E LTR MaLR -57 302 2 3 773 879 194 183 19 chr5 24705956 24706213 -127831046 + ORR1D1 LTR MaLR 76 374 0 3 773 629 289 93 121 chr5 24706687 24707181 -127830078 + RMER13A LTR ERVK 30 557 -70 3 773 1829 166 99 3 chr5 24708538 24708913 -127828346 + MTC LTR MaLR 3 413 -8 3 773 399 95 0 31 chr5 24712712 24712777 -127824482 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 368 3 773 1659 114 19 38 chr5 24712752 24713070 -127824189 - BGLII_A LTR ERVK -48 397 86 3 773 1991 174 124 71 chr5 24713137 24713546 -127823713 + RMER12B LTR ERVK 1 454 -950 3 773 1991 174 124 71 chr5 24713891 24713989 -127823270 + RMER12B LTR ERVK 455 535 -869 3 773 4085 160 16 45 chr5 24713993 24714826 -127822433 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 1033 1 3 773 1749 250 68 57 chr5 24714826 24715527 -127821732 + RMER12 LTR ERVK 452 1160 -162 3 773 462 195 128 128 chr5 24717015 24717036 -127820223 + RLTR26 LTR ERVK 5 25 -883 3 773 3678 77 8 2 chr5 24717036 24717508 -127819751 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 3 773 1858 224 70 68 chr5 24717508 24718078 -127819181 + RLTR26 LTR ERVK 26 642 0 3 773 352 279 127 25 chr5 24719016 24719174 -127818085 - MTE2b LTR MaLR -63 316 143 3 773 475 263 134 6 chr5 24719241 24719413 -127817846 - MTE2b LTR MaLR -185 194 1 3 773 1218 215 176 8 chr5 24724013 24724370 -127812889 - MTD LTR MaLR 0 419 3 3 773 944 251 71 104 chr5 24725052 24725361 -127811898 - MT2B LTR ERVL 0 533 214 3 773 944 249 65 102 chr5 24725421 24725612 -127811647 - MT2B LTR ERVL -244 357 43 3 773 931 227 73 157 chr5 24727062 24727150 -127810109 + MTEb LTR MaLR 6 73 -306 4 773 931 227 73 157 chr5 24727301 24727620 -127809639 + MTEb LTR MaLR 74 379 0 4 773 539 309 110 65 chr5 24727897 24728233 -127809026 - ORR1E LTR MaLR 0 359 9 4 773 998 209 109 113 chr5 24729822 24730277 -127806982 + MT2B LTR ERVL 7 599 -2 4 773 4996 41 3 0 chr5 24732089 24732674 -127804585 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 4 773 269 293 50 10 chr5 24733639 24733739 -127803520 + RMER15 LTR ERVL 414 517 -58 4 773 3789 101 64 5 chr5 24734475 24735035 -127802224 + MT2B LTR ERVL 1 593 -8 4 773 6779 14 1 0 chr5 24736516 24737257 -127800002 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 4 773 63238 16 6 0 chr5 24737257 24744243 -127793016 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1 7028 -573 4 773 4395 19 0 0 chr5 24744265 24744747 -127792512 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 7120 7601 0 4 773 6779 14 1 0 chr5 24744747 24745488 -127791771 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 4 773 3446 107 46 66 chr5 24746170 24746779 -127790480 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 597 -57 4 773 3662 55 39 2 chr5 24750937 24751395 -127785864 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 773 301 237 104 77 chr5 24754876 24755059 -127782200 - RLTR12A LTR ERVK -10 558 371 4 773 271 196 0 51 chr5 24755363 24755422 -127781837 - RLTR25A LTR ERVK -527 576 521 4 773 238 196 140 18 chr5 24755435 24755492 -127781767 - MT2B LTR ERVL -520 81 18 4 773 1726 189 73 3 chr5 24758034 24758378 -127778881 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 1 4 774 241 259 21 105 chr5 24773900 24773995 -127763264 + MT2B2 LTR ERVL 153 239 -345 4 774 297 227 53 0 chr5 24774785 24774917 -127762342 + ORR1B1-int LTR MaLR 616 754 -755 4 774 227 254 113 81 chr5 24777173 24777204 -127760055 - MT2B2 LTR ERVL -422 162 128 4 774 261 343 148 45 chr5 24779909 24780153 -127757106 + RMER5 LTR ERV1 15 283 -251 4 774 452 231 57 137 chr5 24785319 24785655 -127751604 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 33 4 774 3254 48 0 10 chr5 24786134 24786534 -127750725 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 774 324 283 92 81 chr5 24793074 24793136 -127744123 + MT2B LTR ERVL 75 245 -352 5 774 342 220 0 99 chr5 24795673 24795804 -127741455 - MT2B LTR ERVL -337 264 147 5 774 350 260 45 0 chr5 24795827 24795981 -127741278 - RMER17C LTR ERVK -136 274 114 5 774 1700 239 49 27 chr5 24845747 24846152 -127691107 + MTD LTR MaLR 6 419 0 5 774 1793 204 30 19 chr5 24873576 24873946 -127663313 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 774 235 362 9 0 chr5 24894391 24894496 -127642763 - RMER12 LTR ERVK -480 842 737 6 774 4343 105 40 44 chr5 24896257 24897011 -127640248 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 6 775 259 253 39 117 chr5 24907563 24907666 -127629593 - MT2B LTR ERVL -344 257 163 7 775 254 264 20 112 chr5 24925229 24925244 -127612015 + MT2B LTR ERVL 152 157 -444 7 775 369 287 43 17 chr5 24925506 24925623 -127611636 + MTD LTR MaLR 7 126 -293 7 775 435 289 63 32 chr5 24926298 24926504 -127610755 + MTD LTR MaLR 208 405 -14 7 775 1424 137 160 30 chr5 24952198 24952498 -127584761 + ORR1C2 LTR MaLR 46 384 0 8 775 824 274 113 82 chr5 24952947 24953226 -127584033 + ORR1D2 LTR MaLR 1 288 -82 8 775 496 266 9 0 chr5 24953394 24953507 -127583752 + ORR1D2 LTR MaLR 257 370 0 8 775 233 289 198 74 chr5 24954339 24954556 -127582703 + MT2A LTR ERVL 191 434 -99 8 775 256 328 58 51 chr5 24957890 24957926 -127579333 - MT2B LTR ERVL -439 162 126 8 775 390 233 92 77 chr5 24960594 24960633 -127576626 - MT2B LTR ERVL -316 285 185 8 775 233 261 0 42 chr5 24960714 24960778 -127576481 + MTEb LTR MaLR 311 371 -8 8 775 278 213 37 74 chr5 24960822 24960903 -127576356 + MLT1B LTR MaLR 41 118 -272 8 775 472 273 65 65 chr5 24961619 24961803 -127575456 + MLT1B LTR MaLR 183 366 -24 8 775 1936 123 60 0 chr5 24965830 24966131 -127571128 + ORR1A2 LTR MaLR 9 327 0 8 775 4429 162 87 79 chr5 24966916 24967810 -127569449 + RMER19B LTR ERVK 1 901 -1 8 775 1183 262 49 30 chr5 24971061 24971431 -127565828 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 8 775 3552 13 2 0 chr5 24982102 24982497 -127554762 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 775 251 211 38 38 chr5 24989448 24989527 -127547732 + MT2B LTR ERVL 163 241 -360 9 775 253 324 132 40 chr5 24993930 24994081 -127543178 - MLT1H2 LTR MaLR -54 495 301 9 775 252 305 28 105 chr5 25008224 25008256 -127529003 + MT2B2 LTR ERVL 177 288 -296 3 775 2162 143 8 75 chr5 25009703 25010103 -127527156 + RLTR24 LTR ERV1 1 373 -156 3 775 1106 145 6 0 chr5 25010194 25010366 -127526893 + RLTR24 LTR ERV1 357 529 0 3 775 288 229 105 85 chr5 25010960 25011113 -127526146 - MLT1B LTR MaLR -170 220 65 4 775 807 222 211 23 chr5 25017599 25017921 -127519338 - MTD LTR MaLR 0 419 13 7 775 281 179 31 125 chr5 25027725 25027821 -127509438 + MT2B LTR ERVL 156 242 -359 1 775 1614 146 202 3 chr5 25028110 25028427 -127508832 + ORR1B1 LTR MaLR 1 380 -14 1 776 378 254 86 26 chr5 25041356 25041473 -127495786 - MLT1B LTR MaLR -264 126 3 1 776 2339 142 55 5 chr5 25041800 25042219 -127495040 - RMER10A LTR ERVL -2 440 1 1 776 2400 133 158 7 chr5 25043735 25044166 -127493093 - RLTR19A LTR ERVK 0 496 1 1 776 242 315 62 111 chr5 25049137 25049258 -127488001 + MT2B LTR ERVL 44 153 -448 1 776 2495 115 52 21 chr5 25052112 25052493 -127484766 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 2 776 3150 30 3 3 chr5 25053228 25053592 -127483667 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 364 -1 2 776 421 86 0 0 chr5 25053935 25053993 -127483266 - ORR1B1 LTR MaLR -45 349 292 2 776 227 100 175 0 chr5 25054304 25054344 -127482915 - MTD LTR MaLR -14 405 359 2 776 485 298 50 22 chr5 25054440 25054622 -127482637 + MLT1B LTR MaLR 92 278 -112 2 776 2383 84 16 0 chr5 25054823 25055145 -127482114 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 776 1531 165 114 121 chr5 25056300 25056389 -127480870 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 328 2 776 1380 168 148 0 chr5 25056676 25056973 -127480286 - ORR1C2 LTR MaLR -43 341 1 2 776 1650 142 75 15 chr5 25056973 25057308 -127479951 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1509 1155 2 776 392 204 10 39 chr5 25057514 25057616 -127479643 - ORR1C2-int LTR MaLR -305 1204 1106 2 776 1657 185 43 17 chr5 25058985 25059332 -127477927 + ORR1D1 LTR MaLR 17 372 -2 2 776 1993 174 36 17 chr5 25059577 25059934 -127477325 + ORR1B2 LTR MaLR 1 364 -3 2 776 1727 169 44 33 chr5 25060096 25060456 -127476803 + RMER20B LTR ERVK 112 475 -152 2 776 3213 174 48 142 chr5 25060489 25061461 -127475798 - RLTR25A LTR ERVK -175 853 5 2 776 3437 168 20 63 chr5 25061465 25062248 -127475011 + ORR1B2-int LTR MaLR 1072 1821 -142 2 776 1262 174 40 125 chr5 25063962 25064410 -127472849 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 776 1711 161 11 86 chr5 25068675 25069057 -127468202 + ORR1B2 LTR MaLR 42 394 0 2 776 1248 197 161 19 chr5 25069071 25069450 -127467809 - RMER4B LTR ERVK -152 433 1 2 776 1796 172 52 92 chr5 25069522 25069868 -127467391 + RMER5 LTR ERV1 13 354 -180 2 776 1796 172 52 92 chr5 25070014 25070165 -127467094 + RMER5 LTR ERV1 355 490 -44 2 776 1840 206 143 82 chr5 25077461 25077963 -127459296 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 776 3160 156 80 17 chr5 25077963 25078551 -127458708 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 625 -5136 2 776 1641 113 104 24 chr5 25078934 25079223 -127458036 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5449 312 1 2 776 514 252 0 56 chr5 25079499 25079642 -127457617 - RLTR20D LTR ERVK -21 557 423 2 776 642 263 60 67 chr5 25079632 25079917 -127457342 - RLTR20D LTR ERVK -285 283 1 2 776 647 123 95 77 chr5 25079919 25080087 -127457172 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2 2324 2154 2 776 357 130 0 36 chr5 25080096 25080152 -127457107 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4725 1036 983 2 776 1369 129 17 4 chr5 25080194 25080428 -127456831 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -202 2124 1888 2 776 1608 174 61 9 chr5 25080622 25080964 -127456295 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -428 1898 1539 2 776 1113 133 10 29 chr5 25080965 25081174 -127456085 - ORR1A4 LTR MaLR -49 280 76 2 776 2551 172 96 25 chr5 25081145 25081706 -127455553 - RLTR33 LTR ERVK -77 601 1 2 776 2418 146 70 20 chr5 25081834 25082109 -127455150 + MERVL_2A-int LTR ERVL 914 1186 -4575 2 776 2418 146 70 20 chr5 25082255 25082420 -127454839 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1187 1376 -4385 2 776 286 225 42 0 chr5 25082450 25082521 -127454738 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5550 5623 -138 2 776 754 170 197 57 chr5 25082515 25082592 -127454667 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5409 5485 -276 2 776 754 170 197 57 chr5 25082787 25082901 -127454358 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5486 5627 -134 2 776 323 275 0 32 chr5 25082901 25082995 -127454264 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 657 -1306 2 776 3457 25 5 2 chr5 25084321 25084716 -127452543 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 776 3283 30 110 2 chr5 25085091 25085520 -127451739 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 776 6465 56 12 19 chr5 25085522 25086357 -127450902 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 2 776 11580 71 37 82 chr5 25086350 25088123 -127449136 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 9 2 776 3317 22 139 2 chr5 25088124 25088542 -127448717 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 776 2638 56 55 14 chr5 25089540 25089885 -127447374 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 2 776 1265 164 119 3 chr5 25093919 25094212 -127443047 + RMER5 LTR ERV1 13 339 -195 2 776 3718 118 10 16 chr5 25094211 25094560 -127442699 - RMER6A LTR ERVK -138 618 276 2 776 2418 92 3 0 chr5 25094560 25094886 -127442373 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 776 3718 118 10 16 chr5 25094886 25095158 -127442101 - RMER6A LTR ERVK -481 275 1 2 776 630 273 88 58 chr5 25095641 25095983 -127441276 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 2 776 1376 210 75 12 chr5 25097261 25097594 -127439665 + ORR1C2 LTR MaLR 1 354 -30 2 776 1756 162 19 84 chr5 25097600 25097970 -127439289 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 2 776 1983 164 11 0 chr5 25097974 25098327 -127438932 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 357 -1152 2 776 6652 156 35 133 chr5 25099133 25099183 -127438076 + ORR1B1-int LTR MaLR 336 375 -1588 2 776 6652 156 35 133 chr5 25099370 25101123 -127436136 + ORR1B1-int LTR MaLR 376 1963 0 2 776 1805 134 14 156 chr5 25101123 25101528 -127435731 + ORR1B1 LTR MaLR 1 350 -44 2 776 1805 134 14 156 chr5 25101721 25101758 -127435501 + ORR1B1 LTR MaLR 351 380 -14 2 776 2903 160 203 11 chr5 25102145 25102810 -127434449 - RMER19B LTR ERVK -7 895 103 3 776 263 250 0 35 chr5 25102946 25103004 -127434255 - RMER19B LTR ERVK -814 88 33 3 776 339 194 41 107 chr5 25107672 25107793 -127429466 - MT2B LTR ERVL -344 257 145 3 776 487 286 122 14 chr5 25111334 25111621 -127425638 + LTR73 LTR ERV1 28 345 -227 3 776 292 223 56 97 chr5 25114164 25114196 -127423063 - MT2B LTR ERVL -449 152 127 3 776 751 244 17 56 chr5 25117234 25117468 -127419791 + RLTR16 LTR ERVK 2 226 -279 3 776 246 271 149 99 chr5 25117565 25117807 -127419452 - MLT1F LTR MaLR -53 495 242 3 776 239 241 53 122 chr5 25126358 25126396 -127410863 + RLTR25A LTR ERVK 419 538 -565 3 776 239 241 53 122 chr5 25126471 25126492 -127410767 + RLTR25A LTR ERVK 539 612 -491 3 776 1810 199 120 89 chr5 25132235 25133151 -127404108 - RMER17B LTR ERVK -53 855 4 4 776 1708 135 67 186 chr5 25137200 25137636 -127399623 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 776 2244 70 12 68 chr5 25138412 25138750 -127398509 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 776 275 247 39 0 chr5 25138820 25138897 -127398362 + ORR1E LTR MaLR 8 87 -272 4 776 1976 127 135 3 chr5 25140108 25140449 -127396810 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 776 944 162 172 40 chr5 25140450 25140765 -127396494 + MTD LTR MaLR 5 414 -7 4 776 448 317 26 46 chr5 25142081 25142276 -127394983 + RMER4B LTR ERVK 24 214 -371 4 776 747 291 181 10 chr5 25143512 25143804 -127393455 - MTE2b LTR MaLR -3 376 35 4 776 273 276 110 20 chr5 25146788 25146888 -127390371 - RLTR25A LTR ERVK -473 630 522 4 776 422 219 45 116 chr5 25148944 25148976 -127388283 - MT2B LTR ERVL -325 276 133 4 776 1669 161 255 6 chr5 25150870 25151207 -127386052 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 776 1949 153 28 50 chr5 25152679 25152780 -127384479 - RLTR14 LTR ERV1 -33 349 261 4 776 1949 153 28 50 chr5 25152983 25153234 -127384025 - RLTR14 LTR ERV1 -122 260 1 4 776 2656 149 158 4 chr5 25154804 25155304 -127381955 + RMER4B LTR ERVK 1 577 -8 4 776 1141 109 283 0 chr5 25155438 25155718 -127381541 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 8 5 776 1848 164 147 3 chr5 25159140 25159507 -127377752 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 11 5 776 1101 248 74 82 chr5 25160553 25160924 -127376335 - MTEa LTR MaLR -2 357 2 5 776 3171 49 20 8 chr5 25161414 25161805 -127375454 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 776 768 155 153 88 chr5 25165234 25165490 -127371769 + RLTR41 LTR ERV1 3 227 -219 5 777 1338 144 92 5 chr5 25166191 25166408 -127370851 + RLTR41 LTR ERV1 211 446 0 5 777 279 331 21 69 chr5 25168380 25168403 -127368856 + MTE-int LTR MaLR 1366 1386 -349 5 777 389 337 41 62 chr5 25168609 25168913 -127368346 + MTE-int LTR MaLR 1235 1544 -191 5 777 2966 56 9 68 chr5 25169254 25169279 -127367980 - MTB LTR MaLR 0 400 376 5 777 2966 56 9 68 chr5 25169314 25169713 -127367546 - MTB LTR MaLR -25 375 1 5 777 2380 66 30 0 chr5 25169805 25170107 -127367152 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 777 257 267 13 13 chr5 25173258 25173334 -127363925 + ORR1E LTR MaLR 2 77 -282 5 777 851 198 283 0 chr5 25173860 25174118 -127363141 - MTD LTR MaLR -88 331 1 5 777 466 164 296 15 chr5 25174118 25174312 -127362947 - MTD LTR MaLR -123 296 46 5 777 2154 143 31 11 chr5 25180335 25180695 -127356564 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 777 563 280 178 25 chr5 25182506 25182594 -127354665 - MTEa-int LTR MaLR -619 961 853 5 777 563 280 178 25 chr5 25182652 25182878 -127354381 - MTEa-int LTR MaLR -728 852 601 5 777 886 282 141 9 chr5 25182912 25183352 -127353907 - MTEa-int LTR MaLR -1078 502 5 5 777 680 261 136 162 chr5 25183353 25183742 -127353517 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 777 2166 126 12 6 chr5 25184939 25185266 -127351993 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 777 1788 139 60 58 chr5 25185540 25185905 -127351354 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 5 5 777 237 263 0 0 chr5 25190450 25190564 -127346695 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 641 6 777 879 221 295 31 chr5 25196713 25197035 -127340224 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 777 356 232 49 69 chr5 25204613 25204715 -127332544 + MTE-int LTR MaLR 1184 1283 -297 6 777 4284 102 91 21 chr5 25205372 25206077 -127331182 - RMER6A LTR ERVK -2 754 1 6 777 1263 213 95 72 chr5 25206190 25206401 -127330858 + MTC LTR MaLR 1 203 -218 6 777 1263 211 73 58 chr5 25206589 25206775 -127330484 + MTC LTR MaLR 204 398 -23 6 777 738 248 92 31 chr5 25208255 25208484 -127328775 - MTEa LTR MaLR -133 246 4 6 777 1026 155 6 0 chr5 25213725 25213886 -127323373 + MTC LTR MaLR 107 268 -153 6 777 2095 117 41 9 chr5 25214242 25214586 -127322673 - RLTR15 LTR ERVK -4 355 1 6 777 3137 208 46 71 chr5 25214587 25214896 -127322363 - MYSERV-int LTR ERVK -1 6549 6262 6 777 3137 208 46 71 chr5 25215043 25215644 -127321615 - MYSERV-int LTR ERVK -289 6261 5662 6 777 1764 153 24 33 chr5 25215676 25216008 -127321251 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 777 708 204 117 43 chr5 25216454 25216736 -127320523 - MYSERV6-int LTR ERVK -887 8072 7770 6 777 243 256 67 79 chr5 25216748 25216837 -127320422 - RMER4B LTR ERVK -49 536 449 6 777 2733 230 21 60 chr5 25216837 25217615 -127319644 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1376 950 204 6 777 834 228 53 5 chr5 25217717 25217926 -127319333 - MYSERV-int LTR ERVK -2056 4494 4293 6 777 257 235 0 96 chr5 25217997 25218091 -127319168 - MYSERV-int LTR ERVK -1626 1216 1132 6 777 259 119 0 0 chr5 25218401 25218443 -127318816 - MYSERV6-int LTR ERVK -2464 6495 6454 6 777 1289 181 62 1 chr5 25218838 25219140 -127318119 - ORR1C1 LTR MaLR -9 375 54 6 777 265 58 0 188 chr5 25219133 25219197 -127318062 - ORR1C1 LTR MaLR -257 110 59 6 777 264 70 0 0 chr5 25219186 25219229 -127318030 - ORR1C1 LTR MaLR -245 133 91 6 777 662 146 39 28 chr5 25219218 25219378 -127317881 - ORR1C1 LTR MaLR -250 144 1 6 777 1188 203 124 6 chr5 25220710 25221032 -127316227 - ORR1D1 LTR MaLR -11 363 4 6 777 727 276 48 92 chr5 25223001 25223372 -127313887 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 6 777 3382 136 183 77 chr5 25225521 25226326 -127310933 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 6 777 3875 124 110 163 chr5 25226326 25227404 -127309855 - MurERV4_19-int LTR ERVK 0 5780 4760 6 777 611 222 59 29 chr5 25228095 25228299 -127308960 + ORR1D2 LTR MaLR 53 262 -108 7 777 428 185 0 12 chr5 25228763 25228845 -127308414 + ORR1D2 LTR MaLR 247 327 -43 7 777 843 158 132 39 chr5 25228842 25229046 -127308213 + ORR1D2-int LTR MaLR 54 276 -1094 7 777 3240 56 5 0 chr5 25230840 25231234 -127306025 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 777 3135 49 7 2 chr5 25231234 25231664 -127305595 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 432 -666 7 777 1559 103 33 0 chr5 25232701 25232943 -127304316 - ORR1A2 LTR MaLR -77 250 1 7 777 2013 110 46 58 chr5 25251096 25251423 -127285836 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 3 7 777 226 278 32 43 chr5 25255598 25255692 -127281567 + RMER15 LTR ERVL 439 531 -44 7 777 1776 163 168 27 chr5 25256889 25257293 -127279966 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 7 777 446 306 115 29 chr5 25261505 25261550 -127275709 + MLT1C LTR MaLR 145 187 -280 7 777 446 306 115 29 chr5 25261847 25261866 -127275393 + MLT1C LTR MaLR 188 204 -263 7 777 446 306 115 29 chr5 25261899 25262112 -127275147 + MLT1C LTR MaLR 205 446 -21 7 777 1871 126 51 0 chr5 25262288 25262582 -127274677 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 7 777 578 286 196 0 chr5 25263772 25264083 -127273176 - MTEa LTR MaLR -6 353 2 7 777 952 233 207 58 chr5 25269187 25269732 -127267527 - RMER20B LTR ERVK -25 602 1 7 777 2404 79 28 0 chr5 25273325 25273643 -127263616 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 777 402 250 98 29 chr5 25275425 25275598 -127261661 + RLTR23 LTR ERV1 246 430 0 8 777 278 310 7 128 chr5 25278207 25278355 -127258904 - RMER10B LTR ERVL 0 398 269 8 777 291 294 69 31 chr5 25280641 25280771 -127256488 - MER68 LTR ERVL -423 140 6 8 777 830 235 9 112 chr5 25282755 25283076 -127254183 + RMER17A-int LTR ERVK 1133 1420 -308 8 777 977 217 32 20 chr5 25283292 25283541 -127253718 + RMER13A LTR ERVK 1 252 -608 8 777 1948 130 60 6 chr5 25291545 25291633 -127245626 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 446 8 777 1948 119 41 4 chr5 25291683 25292071 -127245188 - RLTR20C LTR ERVK -89 445 1 8 777 1108 230 156 41 chr5 25292071 25292505 -127244754 - RMER15 LTR ERVL -88 487 4 8 777 471 217 156 42 chr5 25294062 25294254 -127243005 - RLTR42-int LTR ERVK -4134 1388 1175 8 777 936 265 77 38 chr5 25294460 25294825 -127242434 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 8 778 1207 113 5 25 chr5 25300456 25300655 -127236604 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 165 8 778 1523 194 0 3 chr5 25300654 25300964 -127236295 - ORR1B2-int LTR MaLR -896 613 305 8 778 377 331 74 58 chr5 25305260 25305571 -127231688 - MLT1B LTR MaLR -7 383 68 8 778 3147 136 44 15 chr5 25306044 25306589 -127230670 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 8 778 334 274 45 75 chr5 25324786 25324920 -127212339 - MT2B LTR ERVL -305 296 167 9 778 1375 213 31 105 chr5 25327054 25327500 -127209759 - MTC LTR MaLR -8 413 1 9 778 2952 43 3 0 chr5 25328622 25328967 -127208292 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 9 778 2123 109 116 0 chr5 25331860 25332189 -127205070 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 9 778 1754 197 33 28 chr5 25340379 25340739 -127196520 - MTD LTR MaLR -8 411 50 9 778 553 280 53 32 chr5 25347252 25347496 -127189763 - ORR1E LTR MaLR -118 256 2 9 778 1640 144 234 20 chr5 25347699 25348053 -127189206 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 9 778 1342 164 194 53 chr5 25348627 25348685 -127188574 - MTD LTR MaLR -8 411 355 9 778 2037 136 0 7 chr5 25348685 25348995 -127188264 + RLTR10E LTR ERVK 1 308 -3 9 778 1342 164 194 53 chr5 25348995 25349296 -127187963 - MTD LTR MaLR -65 354 1 9 778 1988 207 121 2 chr5 25353489 25353929 -127183330 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 27 9 778 1208 212 169 8 chr5 25360232 25360593 -127176666 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 778 2450 82 52 23 chr5 25365361 25365710 -127171549 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 9 778 2068 158 87 10 chr5 25366552 25366941 -127170318 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 9 778 702 191 73 28 chr5 25367531 25367709 -127169550 - MTEa LTR MaLR 0 379 194 9 778 1337 183 70 77 chr5 25367717 25368090 -127169169 + RLTR20C LTR ERVK 1 457 -94 9 778 605 255 75 19 chr5 25368127 25368222 -127169037 + RLTR20C LTR ERVK 458 550 -1 9 778 4109 184 84 41 chr5 25368918 25369945 -127167314 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 1393 -1449 9 778 3180 137 82 11 chr5 25369951 25371101 -127166158 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1068 2298 -28 9 778 793 249 42 83 chr5 25371263 25371502 -127165757 + RLTR20C LTR ERVK 84 312 -222 9 778 473 160 298 16 chr5 25371500 25371557 -127165702 + RLTR20C LTR ERVK 423 479 -99 9 778 473 160 298 16 chr5 25371606 25371669 -127165590 + RLTR20C LTR ERVK 480 576 -2 9 778 529 298 85 20 chr5 25371684 25371883 -127165376 - MTEa LTR MaLR -167 212 1 9 778 243 256 0 109 chr5 25373446 25373538 -127163721 - MLT1C LTR MaLR -274 193 112 9 778 907 222 77 17 chr5 25375030 25375335 -127161924 + ORR1D2 LTR MaLR 3 365 -9 9 778 397 287 160 52 chr5 25375387 25375637 -127161622 + MLT2C1 LTR ERVL 116 392 -5 9 778 935 289 111 22 chr5 25379399 25379563 -127157696 + RMER5 LTR ERV1 33 205 -329 1 778 935 289 111 22 chr5 25379605 25379900 -127157359 + RMER5 LTR ERV1 206 532 -2 1 778 262 218 18 0 chr5 25380367 25380422 -127156837 + RMER15 LTR ERVL 1 56 -519 1 778 429 252 67 112 chr5 25382240 25382463 -127154796 + MTD LTR MaLR 10 222 -197 1 778 248 370 125 75 chr5 25382366 25382687 -127154572 + MT2A LTR ERVL 101 437 -96 1 778 246 279 78 91 chr5 25383680 25383834 -127153425 - MT2B2 LTR ERVL -321 263 112 1 778 237 316 46 100 chr5 25383766 25383896 -127153363 - MLT1J LTR MaLR -171 341 219 1 778 3268 67 2 0 chr5 25386684 25387104 -127150155 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 778 964 182 40 93 chr5 25388843 25389145 -127148114 - RMER10A LTR ERVL 0 442 157 1 778 1301 143 134 17 chr5 25391171 25391463 -127145796 - IAPLTR4 LTR ERVK -19 326 1 1 778 3046 161 56 35 chr5 25391692 25392295 -127144964 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 1 778 2485 199 14 53 chr5 25403509 25404037 -127133222 + RMER19C LTR ERVK 19 584 -27 1 778 2485 191 13 50 chr5 25404069 25404095 -127133164 + RMER19C LTR ERVK 585 610 -1 1 778 1063 216 67 125 chr5 25405990 25406381 -127130878 + MTE2a LTR MaLR 5 372 -7 1 778 2122 210 23 80 chr5 25406502 25407053 -127130206 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 778 227 279 105 83 chr5 25408774 25408907 -127128352 - MLT1G3 LTR MaLR -399 196 61 1 778 579 229 83 25 chr5 25411148 25411392 -127125867 - MTD LTR MaLR -17 391 1 1 778 1029 261 108 68 chr5 25412236 25412709 -127124550 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 33 1 785 847 284 74 32 chr5 26324430 26324933 -126212326 - BGLII_B LTR ERVK -81 480 39 2 785 1432 241 49 101 chr5 26332136 26332662 -126204597 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 8 785 368 265 10 0 chr5 26335856 26335958 -126201301 + RLTR19 LTR ERVK 1 103 -396 1 785 2169 114 12 39 chr5 26337057 26337393 -126199866 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 785 774 238 199 16 chr5 26342892 26343264 -126193995 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 2 2 786 1446 246 45 100 chr5 26350299 26350827 -126186432 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 2 786 326 274 10 0 chr5 26351893 26351995 -126185264 + RLTR19 LTR ERVK 1 103 -396 2 786 2185 108 12 39 chr5 26353108 26353444 -126183815 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 786 4350 29 2 0 chr5 26358570 26359062 -126178197 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 786 728 273 153 27 chr5 26359227 26359755 -126177504 - BGLII_B LTR ERVK -80 481 2 3 786 1372 255 48 95 chr5 26366880 26367404 -126169855 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 4 786 388 245 10 0 chr5 26368470 26368572 -126168687 + RLTR19 LTR ERVK 1 103 -396 4 786 2162 114 38 0 chr5 26369685 26370000 -126167259 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 786 2351 72 116 17 chr5 26370710 26371065 -126166194 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 5 786 8796 29 0 3 chr5 26371067 26372065 -126165194 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 5 786 615 331 28 28 chr5 26372147 26372570 -126164689 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1172 5 786 5534 35 9 69 chr5 26372595 26373330 -126163929 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 302 5 786 2390 66 119 11 chr5 26373330 26373682 -126163577 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 5 786 710 282 57 31 chr5 26378260 26378743 -126158516 - BGLII_B LTR ERVK -80 481 39 5 786 1469 245 41 98 chr5 26385918 26386430 -126150829 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 17 6 786 366 255 10 0 chr5 26387512 26387614 -126149645 + RLTR19 LTR ERVK 1 103 -396 6 786 2255 99 12 39 chr5 26388722 26389058 -126148201 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 786 4369 28 0 0 chr5 26394198 26394691 -126142568 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 786 1381 251 47 102 chr5 26395363 26395515 -126141744 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 360 7 786 1381 251 47 102 chr5 26395700 26395764 -126141495 - RLTR19 LTR ERVK -140 359 318 7 786 1381 251 47 102 chr5 26395787 26396097 -126141162 - RLTR19 LTR ERVK -182 317 1 7 786 3801 35 5 0 chr5 26398012 26398446 -126138813 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 786 2006 76 15 4 chr5 26398446 26398710 -126138549 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 267 -7314 7 786 2102 45 71 2 chr5 26398886 26399368 -126137891 + MMERVK10C-int LTR ERVK 566 887 -1100 7 786 8820 42 1 0 chr5 26399361 26400381 -126136878 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4790 5810 -1771 7 786 8107 42 0 1 chr5 26400372 26401304 -126135955 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6651 7581 0 7 786 3778 37 5 0 chr5 26401304 26401738 -126135521 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 786 401 235 10 0 chr5 26403014 26403116 -126134143 + RLTR19 LTR ERVK 1 103 -396 8 786 720 248 208 22 chr5 26409130 26409501 -126127758 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 2 9 786 1395 247 47 101 chr5 26416630 26417157 -126120102 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 9 786 401 235 10 0 chr5 26418217 26418319 -126118940 + RLTR19 LTR ERVK 1 103 -396 9 786 2264 99 12 39 chr5 26419426 26419762 -126117497 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 786 699 285 58 31 chr5 26425048 26425528 -126111731 - BGLII_B LTR ERVK -82 479 39 1 786 1476 241 43 98 chr5 26432699 26433210 -126104049 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 17 1 786 401 235 10 0 chr5 26434293 26434395 -126102864 + RLTR19 LTR ERVK 1 103 -396 1 786 2255 99 12 39 chr5 26435503 26435839 -126101420 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 786 726 279 58 35 chr5 26441143 26441625 -126095634 - BGLII_B LTR ERVK -81 480 39 1 786 1437 244 45 102 chr5 26448758 26449287 -126087972 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 1 786 1937 190 92 20 chr5 26450399 26450844 -126086415 + RLTR19 LTR ERVK 16 492 -7 1 786 435 181 0 118 chr5 26451334 26451453 -126085806 + RMER6B LTR ERVK 12 116 -345 1 786 347 147 260 10 chr5 26451469 26451565 -126085694 + RMER6B LTR ERVK 76 195 -266 1 786 499 174 154 74 chr5 26456917 26457066 -126080193 + RMER6B LTR ERVK 284 444 -17 1 786 935 248 36 5 chr5 26468589 26468812 -126068447 + MTEb LTR MaLR 143 372 -7 1 786 934 244 56 121 chr5 26468803 26469143 -126068116 - ORR1E LTR MaLR -41 318 1 1 786 1551 157 50 58 chr5 26474661 26475020 -126062239 + ORR1D1 LTR MaLR 1 356 -18 1 786 2733 48 39 0 chr5 26475443 26475776 -126061483 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 98 7873 55 57 3 chr5 26475776 26476940 -126060319 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 566 1 787 1196 105 10 34 chr5 26476863 26477070 -126060189 - MT2C_Mm LTR ERVL -273 202 1 1 787 664 248 12 6 chr5 26485144 26485306 -126051953 - ORR1E-int LTR MaLR -27 1553 1391 1 787 459 330 186 24 chr5 26485349 26485644 -126051615 - ORR1E-int LTR MaLR -494 1086 744 1 787 2191 126 12 0 chr5 26486710 26487035 -126050224 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 787 1135 298 121 40 chr5 26487221 26487766 -126049493 - ORR1E-int LTR MaLR -991 589 1 1 787 595 302 41 63 chr5 26487768 26488135 -126049124 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 787 948 268 166 18 chr5 26490895 26491233 -126046026 - MTD LTR MaLR -31 388 1 1 787 1801 207 139 38 chr5 26493791 26494324 -126042935 + RMER19C LTR ERVK 1 587 -24 1 787 250 271 65 41 chr5 26494742 26494865 -126042394 - MER77 LTR ERVL -428 179 54 1 787 2494 206 17 31 chr5 26495832 26496417 -126040842 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 1 1 787 3590 60 21 0 chr5 26500074 26500560 -126036699 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 1 787 1272 246 98 15 chr5 26509548 26509883 -126027376 + MTEa LTR MaLR 15 377 -2 9 787 704 250 78 14 chr5 26509885 26510104 -126027155 + MTEa-int LTR MaLR 1 233 -1347 9 787 230 204 0 0 chr5 26510108 26510157 -126027102 + MTEa-int LTR MaLR 542 590 -990 9 787 244 244 21 85 chr5 26510215 26510309 -126026950 + MTEa LTR MaLR 190 277 -102 1 787 284 308 16 41 chr5 26516488 26516610 -126020649 - MLT1K LTR MaLR -13 582 464 1 787 1966 214 22 89 chr5 26519686 26520324 -126016935 + ORR1A3-int LTR MaLR 365 959 -1004 2 787 1942 149 5 29 chr5 26520326 26520697 -126016562 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 787 4127 117 81 107 chr5 26520697 26521686 -126015573 + ORR1B1-int LTR MaLR 912 1963 0 2 787 1503 151 78 200 chr5 26521686 26522135 -126015124 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 787 3456 25 5 0 chr5 26528122 26528516 -126008743 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 787 852 287 52 24 chr5 26531966 26532255 -126005004 + ORR1E LTR MaLR 22 318 -41 4 787 345 336 27 20 chr5 26532452 26532598 -126004661 - LTR53 LTR ERVL -157 362 216 4 787 238 219 16 0 chr5 26532670 26532734 -126004525 + ORR1E LTR MaLR 71 135 -224 4 787 4284 104 119 107 chr5 26534517 26535409 -126001850 + RMER17A2 LTR ERVK 1 903 -3 4 787 799 175 82 24 chr5 26536292 26536462 -126000797 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 195 4 787 786 268 80 10 chr5 26542256 26542514 -125994745 - MLT1A1 LTR MaLR -131 277 1 5 787 1080 256 89 9 chr5 26547619 26547946 -125989313 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 7 787 240 311 110 106 chr5 26551493 26551766 -125985493 - MTEa LTR MaLR -2 377 104 7 787 346 309 68 91 chr5 26566620 26566916 -125970343 - ORR1E LTR MaLR -63 296 8 9 787 1671 146 86 26 chr5 26568275 26568614 -125968645 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 9 787 427 282 29 64 chr5 26568828 26568968 -125968291 + MTEa LTR MaLR 18 152 -227 9 787 234 250 26 65 chr5 26569081 26569158 -125968101 + MTEa LTR MaLR 281 354 -25 9 787 519 291 141 25 chr5 26569864 26570171 -125967088 - ORR1E LTR MaLR -8 371 1 9 787 2209 323 111 35 chr5 26570171 26571393 -125965866 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 212 9 787 680 153 25 219 chr5 26574435 26574677 -125962582 - RMER6B LTR ERVK -266 195 1 1 787 1923 190 92 25 chr5 26575154 26575601 -125961658 - RLTR19 LTR ERVK -7 492 16 1 787 1423 228 57 115 chr5 26582927 26583457 -125953802 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 1 787 650 251 208 22 chr5 26590460 26590831 -125946428 + BGLII_B LTR ERVK 2 441 0 1 787 2245 102 12 39 chr5 26596345 26596681 -125940578 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 787 2254 211 7 53 chr5 26599233 26599813 -125937446 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 553 0 1 787 3171 173 3 11 chr5 26600722 26601289 -125935970 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 1 1 787 5077 123 15 1 chr5 26601404 26602127 -125935132 + RMER19A LTR ERVK 1 733 -4 1 787 8716 147 42 1 chr5 26602131 26603506 -125933753 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1 1431 -4349 1 787 3809 120 40 3 chr5 26603506 26604101 -125933158 - RMER19A LTR ERVK -72 665 49 1 787 274 132 19 0 chr5 26604174 26604227 -125933032 - RMER19A LTR ERVK -683 54 1 1 787 492 212 42 8 chr5 26605833 26605952 -125931307 + RMER5 LTR ERV1 396 518 -16 1 788 1598 157 3 68 chr5 26610990 26611311 -125925948 + MTD LTR MaLR 1 300 -119 1 788 458 245 47 52 chr5 26611311 26611483 -125925776 + MTD LTR MaLR 247 417 -2 1 788 2180 119 25 0 chr5 26613049 26613368 -125923891 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 788 8666 154 149 18 chr5 26613368 26615104 -125922155 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 1 788 2150 113 25 3 chr5 26615104 26615424 -125921835 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 788 255 205 115 0 chr5 26617667 26617745 -125919514 + LTR33A LTR ERVL 431 517 -3 1 788 905 282 163 3 chr5 26621058 26621371 -125915888 + ORR1D2 LTR MaLR 2 364 -6 1 788 971 232 46 39 chr5 26623622 26623882 -125913377 + MTE2a LTR MaLR 1 262 -117 1 788 662 273 74 136 chr5 26627076 26627466 -125909793 + MTE2a LTR MaLR 9 374 -5 1 788 962 249 112 54 chr5 26628327 26628414 -125908845 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 268 1 788 962 249 112 54 chr5 26628454 26628715 -125908544 - ORR1D2 LTR MaLR -103 267 1 1 788 2045 156 33 3 chr5 26630676 26631037 -125906222 + ORR1C1 LTR MaLR 7 378 0 1 788 697 288 60 14 chr5 26639924 26640139 -125897120 + MT2A LTR ERVL 209 433 -100 1 788 241 279 47 0 chr5 26640326 26640412 -125896847 + MLT1A0 LTR MaLR 276 365 0 1 788 1065 257 67 17 chr5 26640661 26641006 -125896253 - MTE2b LTR MaLR -17 362 1 1 788 287 315 129 43 chr5 26642940 26643126 -125894133 + MLT2B1 LTR ERVL 253 454 -66 1 788 3188 77 5 0 chr5 26643133 26643536 -125893723 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 1 788 1115 248 61 46 chr5 26644687 26645000 -125892259 + ORR1D2 LTR MaLR 6 323 -47 1 788 226 94 0 0 chr5 26645000 26645032 -125892227 - MT2A LTR ERVL -2 531 500 1 788 305 132 19 0 chr5 26645142 26645195 -125892064 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 328 1 788 764 216 86 5 chr5 26645285 26645471 -125891788 - ORR1C2 LTR MaLR -183 201 1 1 788 523 281 180 65 chr5 26648076 26648291 -125888968 - MTEa LTR MaLR 0 379 195 2 788 4562 144 25 12 chr5 26648291 26649090 -125888169 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 2 788 523 267 225 42 chr5 26649090 26649237 -125888022 - MTEa LTR MaLR -185 194 3 2 788 2743 67 93 3 chr5 26653885 26654262 -125882997 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 788 4982 198 112 59 chr5 26654262 26655860 -125881399 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 304 2 788 2773 56 99 0 chr5 26655862 26656235 -125881024 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 2 2 788 480 280 92 64 chr5 26658740 26658963 -125878296 + MTD LTR MaLR 18 222 -157 2 788 475 259 117 87 chr5 26659006 26659160 -125878099 + MTD LTR MaLR 223 374 -5 2 788 270 224 35 76 chr5 26659161 26659306 -125877953 + RLTR15 LTR ERVK 1 139 -220 2 788 2325 108 62 30 chr5 26661738 26662109 -125875150 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 2 788 1796 141 183 0 chr5 26662685 26663018 -125874241 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 788 1091 252 52 62 chr5 26667742 26668044 -125869215 + MTE2a LTR MaLR 11 326 -93 2 788 1091 227 46 64 chr5 26668296 26668397 -125868862 + MTE2a LTR MaLR 288 379 0 2 788 421 220 105 8 chr5 26670924 26671057 -125866202 - MT2A LTR ERVL 0 533 388 2 788 831 253 125 45 chr5 26672697 26673032 -125864227 - MTD LTR MaLR -37 382 21 2 788 4589 166 36 44 chr5 26673252 26674156 -125863103 - RMER19B LTR ERVK 0 902 6 2 788 1216 204 119 34 chr5 26674380 26674700 -125862559 - ORR1D2 LTR MaLR -23 347 1 2 788 1092 269 77 6 chr5 26675240 26675551 -125861708 + MTE2b LTR MaLR 8 340 -39 2 788 1024 256 108 32 chr5 26679425 26679796 -125857463 + MTD LTR MaLR 6 404 -15 2 788 3730 39 7 0 chr5 26704819 26705252 -125832007 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 788 2055 61 11 4 chr5 26705252 26705517 -125831742 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 267 -7314 2 788 317 68 23 0 chr5 26705677 26705721 -125831538 + RLTR10-int LTR ERVK 93 137 -6405 2 788 1955 22 9 4 chr5 26705724 26705957 -125831302 + RLTR10-int LTR ERVK 652 885 -1102 2 788 1767 33 0 0 chr5 26713237 26713449 -125823810 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3532 3743 -3838 2 788 8962 34 0 0 chr5 26713442 26714463 -125822796 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4790 5810 -1771 2 788 8198 36 0 0 chr5 26714454 26715385 -125821874 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6651 7581 0 2 788 3656 42 7 5 chr5 26715385 26715820 -125821439 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 788 251 299 111 9 chr5 26721498 26721606 -125815653 - MLT1B LTR MaLR -84 306 188 2 788 255 297 0 73 chr5 26721918 26722027 -125815232 - MLT1B LTR MaLR -289 101 1 2 788 1636 196 84 55 chr5 26726072 26726439 -125810820 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 788 4084 19 51 0 chr5 26737872 26738341 -125798918 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 789 255 197 106 16 chr5 26740386 26740472 -125796787 + ORR1E LTR MaLR 270 368 -11 3 789 787 229 239 29 chr5 26748841 26749150 -125788109 + MTE2b LTR MaLR 6 379 0 3 789 2848 34 0 3 chr5 26752641 26752969 -125784290 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 3 789 1256 249 40 27 chr5 26753697 26754103 -125783156 - MTD LTR MaLR 0 421 1 3 789 393 303 96 73 chr5 26755047 26755307 -125781952 + RLTR17 LTR ERVK 125 390 -302 3 789 776 239 61 54 chr5 26758172 26758343 -125778916 + RMER15 LTR ERVL 295 466 -109 3 789 1862 171 9 130 chr5 26758343 26758773 -125778486 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 789 776 239 61 54 chr5 26758773 26758846 -125778413 + RMER15 LTR ERVL 467 540 -35 3 789 776 239 61 54 chr5 26758886 26758919 -125778340 + RMER15 LTR ERVL 541 574 -1 3 789 1442 190 90 6 chr5 26768907 26769105 -125768154 + ORR1D1 LTR MaLR 1 198 -176 3 789 1442 190 90 6 chr5 26769164 26769277 -125767982 + ORR1D1 LTR MaLR 199 337 -37 3 789 3303 189 78 26 chr5 26769277 26769935 -125767324 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 3 789 1789 194 18 35 chr5 26769935 26770335 -125766924 - RMER3D-int LTR ERVK 0 2842 2450 3 789 2505 169 95 41 chr5 26770342 26770899 -125766360 - RMER3D-int LTR ERVK -548 2294 1708 3 789 1396 138 8 36 chr5 26770900 26771148 -125766111 - RLTR17 LTR ERVK -451 241 1 3 789 705 248 197 30 chr5 26774844 26775143 -125762116 + MTEb LTR MaLR 30 378 -1 3 789 291 277 85 0 chr5 26775707 26775801 -125761458 + MTE2b LTR MaLR 45 146 -233 3 789 2748 124 55 8 chr5 26782069 26782557 -125754702 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 14 3 789 571 253 98 35 chr5 26783884 26784138 -125753121 + MTD LTR MaLR 25 294 -125 3 789 497 218 102 24 chr5 26784177 26784304 -125752955 + MTD LTR MaLR 269 405 -14 3 789 274 363 82 68 chr5 26786777 26787117 -125750142 + MLT1F1 LTR MaLR 4 348 -200 3 789 329 248 48 38 chr5 26787153 26787258 -125750001 + MLT1F1 LTR MaLR 460 565 -4 3 789 310 284 143 9 chr5 26787794 26788004 -125749255 - MLT1D LTR MaLR -20 485 248 3 789 316 221 183 0 chr5 26789275 26789379 -125747880 - MTEb LTR MaLR -17 362 240 3 789 2069 93 3 3 chr5 26790233 26790544 -125746715 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 311 -1497 3 789 3602 62 0 6 chr5 26790870 26791376 -125745883 + RLTR22_Mus LTR ERVK 303 805 -1003 3 789 444 279 83 60 chr5 26793451 26793668 -125743591 + RMER12 LTR ERVK 1101 1322 0 3 789 513 309 13 3 chr5 26798104 26798338 -125738921 + MLT1A0 LTR MaLR 74 349 -16 3 789 877 272 165 3 chr5 26799431 26799752 -125737507 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 3 789 427 244 91 62 chr5 26800591 26800801 -125736458 - RMER21A LTR ERV1 -346 601 386 3 789 1018 245 56 52 chr5 26801119 26801595 -125735664 + BGLII_B LTR ERVK 1 481 -211 3 789 1437 120 73 12 chr5 26802672 26802905 -125734354 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 143 3 789 3819 125 34 64 chr5 26802905 26803665 -125733594 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 789 -234 3 789 1967 237 127 121 chr5 26803809 26804065 -125733194 + RLTR13D6 LTR ERVK 790 1022 -1 3 789 682 157 8 16 chr5 26804065 26804188 -125733071 - ORR1B1 LTR MaLR -245 122 1 3 789 1763 112 25 50 chr5 26804965 26805285 -125731974 + ORR1A2 LTR MaLR 1 312 -15 3 789 1263 191 191 112 chr5 26807568 26807986 -125729273 - RMER19B LTR ERVK -451 451 1 3 789 786 239 84 44 chr5 26816341 26816616 -125720643 - RLTR20B3 LTR ERVK -271 306 21 3 789 262 342 68 65 chr5 26818186 26818511 -125718748 + RLTR17 LTR ERVK 126 451 -241 4 789 2454 150 25 11 chr5 26826242 26826343 -125710916 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 480 4 789 2454 150 25 11 chr5 26826387 26826722 -125710537 - RLTR20A2 LTR ERVK -99 479 136 4 789 2821 33 0 48 chr5 26826825 26827179 -125710080 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 789 9062 27 2 5 chr5 26827179 26828211 -125709048 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5453 4 789 35194 22 24 10 chr5 26828209 26832247 -125705012 - IAPEz-int LTR ERVK -2378 4103 8 4 789 2821 33 0 48 chr5 26832247 26832601 -125704658 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 789 4520 127 107 69 chr5 26833461 26834434 -125702825 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1010 -13 4 789 807 259 122 59 chr5 26837893 26838230 -125699029 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 4 789 1062 217 80 58 chr5 26840750 26841112 -125696147 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 9 4 789 227 267 28 56 chr5 26841999 26842106 -125695153 - MT2B LTR ERVL -323 278 175 4 789 969 286 11 73 chr5 26849085 26849437 -125687822 - ORR1E LTR MaLR -2 357 26 4 789 793 291 43 47 chr5 26849672 26849950 -125687309 - RMER15 LTR ERVL -3 572 296 4 789 231 212 15 29 chr5 26850401 26850469 -125686790 + MLT1A1 LTR MaLR 304 370 -38 4 789 377 290 19 9 chr5 26851484 26851592 -125685667 + MTEa LTR MaLR 8 116 -263 4 789 1262 244 64 19 chr5 26853549 26853720 -125683539 + MTE2a LTR MaLR 5 179 -200 4 789 1262 244 64 19 chr5 26853745 26853932 -125683327 + MTE2a LTR MaLR 180 378 -1 4 789 291 182 0 0 chr5 26855737 26855792 -125681467 - ORR1E LTR MaLR -233 126 72 4 789 2426 187 125 101 chr5 26858662 26859172 -125678087 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 450 4 789 2426 187 125 101 chr5 26859205 26859420 -125677839 - RLTR25B LTR ERVK -579 449 285 4 789 335 307 236 25 chr5 26863336 26863574 -125673685 - MLT1E3 LTR MaLR -52 572 280 4 789 1826 162 112 136 chr5 26863574 26864031 -125673228 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 4 789 335 326 167 25 chr5 26864031 26864279 -125672980 - MLT1E3 LTR MaLR -345 279 1 4 789 2878 86 139 2 chr5 26865440 26865908 -125671351 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 4 789 3211 171 78 9 chr5 26867033 26867671 -125669588 + RLTR17 LTR ERVK 9 690 -2 4 790 598 285 15 16 chr5 26871182 26871396 -125665863 + ORR1E LTR MaLR 85 297 -73 4 790 1273 163 19 35 chr5 26871653 26871914 -125665345 + ORR1C1 LTR MaLR 114 370 -8 4 790 1796 176 65 92 chr5 26872767 26873104 -125664155 - MTC LTR MaLR 0 421 94 4 790 1796 176 65 92 chr5 26873507 26873602 -125663657 - MTC LTR MaLR -328 93 1 4 790 696 160 135 6 chr5 26874438 26874608 -125662651 - MTD LTR MaLR 0 419 228 4 790 391 361 38 0 chr5 26875259 26875442 -125661817 - MTD LTR MaLR -206 213 24 4 790 291 240 139 10 chr5 26876335 26876436 -125660823 - MLT1B LTR MaLR -82 308 195 4 790 1180 176 35 137 chr5 26876716 26877169 -125660090 + RMER17C LTR ERVK 4 410 0 4 790 1506 163 169 0 chr5 26878627 26878971 -125658288 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 4 790 4119 189 38 64 chr5 26881015 26881940 -125655319 + RMER13B LTR ERVK 5 905 -3 4 790 1081 262 129 20 chr5 26889820 26890170 -125647089 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 4 790 2465 92 6 0 chr5 26893777 26894102 -125643157 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 790 243 248 152 53 chr5 26896710 26896842 -125640417 - MLT2B4 LTR ERVL -6 550 406 5 790 631 289 91 71 chr5 26896851 26897335 -125639924 + RLTR12B LTR ERVK 15 509 -59 5 790 641 276 49 57 chr5 26897409 26897655 -125639604 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 264 -313 5 790 1023 119 121 24 chr5 26897652 26897858 -125639401 + MTC LTR MaLR 196 421 0 5 790 3518 23 5 0 chr5 26897904 26898298 -125638961 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 790 988 248 169 3 chr5 26903365 26903697 -125633562 + MTD LTR MaLR 18 404 -15 5 790 384 194 252 0 chr5 26905082 26905185 -125632074 - MTD LTR MaLR -14 405 277 5 790 422 206 30 20 chr5 26905564 26905663 -125631596 + RMER15 LTR ERVL 27 126 -449 5 790 735 245 131 89 chr5 26905667 26905981 -125631278 - MTE2a LTR MaLR -48 331 5 5 790 2655 173 148 229 chr5 26906276 26907264 -125629995 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 5 790 352 228 40 0 chr5 26908565 26908666 -125628593 + MTD LTR MaLR 1 105 -314 5 790 882 71 24 0 chr5 26908670 26908797 -125628462 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 189 5 790 2114 199 23 105 chr5 26908801 26909119 -125628140 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 305 -272 5 790 2114 199 23 105 chr5 26909265 26909553 -125627706 + RLTR20B3 LTR ERVK 306 577 0 5 790 1159 112 0 93 chr5 26909553 26909767 -125627492 - ORR1A4 LTR MaLR -135 194 1 5 790 1055 250 100 17 chr5 26909767 26910003 -125627256 + MTD LTR MaLR 101 347 -72 5 790 1055 250 100 17 chr5 26910085 26910134 -125627125 + MTD LTR MaLR 348 410 -9 5 790 1001 260 12 0 chr5 26910680 26910915 -125626344 + MTD LTR MaLR 59 296 -123 5 790 432 252 87 22 chr5 26910915 26911053 -125626206 + MTD LTR MaLR 1 147 -272 5 790 235 301 117 29 chr5 26917036 26917207 -125620052 - LTR68 LTR ERV1 -145 595 410 5 790 1158 236 74 6 chr5 26918639 26918950 -125618309 - RLTR17 LTR ERVK -73 619 288 5 790 1255 228 106 40 chr5 26920002 26920400 -125616859 - BGLII_B LTR ERVK -17 424 1 5 790 4012 110 120 38 chr5 26920761 26921442 -125615817 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 790 1091 222 111 60 chr5 26921688 26922038 -125615221 - MTE2a LTR MaLR -9 370 3 5 790 1206 249 70 39 chr5 26922428 26922787 -125614472 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 790 1010 152 16 61 chr5 26922959 26923205 -125614054 - RMER17C LTR ERVK -35 375 141 5 790 1798 203 20 81 chr5 26923871 26924315 -125612944 - MTC LTR MaLR -2 419 3 5 790 440 307 40 13 chr5 26929076 26929228 -125608031 - RMER5 LTR ERV1 -221 313 158 5 790 3337 330 65 55 chr5 26930668 26931909 -125605350 - RodERV21-int LTR ERV1 -105 4886 3631 5 790 2786 33 45 0 chr5 26931909 26932240 -125605019 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 790 3337 330 65 55 chr5 26932240 26933147 -125604112 - RodERV21-int LTR ERV1 -1361 3630 2717 5 790 296 203 13 35 chr5 26933476 26933588 -125603671 - MER52-int LTR ERV1 -2657 4949 4890 5 790 256 189 19 19 chr5 26934043 26934097 -125603162 - MER52-int LTR ERV1 -1987 5104 5051 5 790 439 336 34 52 chr5 26935062 26935507 -125601752 - MER52-int LTR ERV1 -3017 4074 3638 5 790 375 295 57 14 chr5 26942171 26942312 -125594947 + MTD LTR MaLR 15 161 -258 5 790 664 333 99 24 chr5 26943050 26943425 -125593834 - MTD LTR MaLR -14 405 3 5 790 239 281 0 0 chr5 26944829 26944893 -125592366 - RMER15 LTR ERVL -217 358 295 5 790 847 276 103 11 chr5 26946547 26946904 -125590355 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 790 1277 234 129 23 chr5 26946904 26947425 -125589834 + MTD-int LTR MaLR 1 576 -682 5 790 447 132 176 0 chr5 26947414 26947505 -125589754 + MTD LTR MaLR 177 283 -136 5 790 1470 75 12 102 chr5 26948684 26948938 -125588321 - RLTR9B2 LTR ERVK -189 231 1 5 790 372 257 128 73 chr5 26950891 26951015 -125586244 - RMER12B LTR ERVK -149 1423 1256 6 790 372 216 160 74 chr5 26951066 26951160 -125586099 - RMER12B LTR ERVK -149 1255 1164 6 790 372 216 160 74 chr5 26951231 26951265 -125585994 - RMER12B LTR ERVK -241 1163 1124 6 790 1008 182 13 21 chr5 26951700 26951901 -125585358 - RLTR20B1 LTR ERVK -384 194 1 6 790 4213 237 41 31 chr5 26951903 26953138 -125584121 - MYSERV6-int LTR ERVK -7562 1397 150 6 790 728 278 128 26 chr5 26954254 26954708 -125582551 - RLTR12B LTR ERVK -28 500 1 6 790 1299 270 69 61 chr5 26954785 26955306 -125581953 - MT2A LTR ERVL -8 525 1 6 790 10131 179 43 22 chr5 26955306 26959327 -125577932 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 1609 6 790 1777 173 28 6 chr5 26959418 26959779 -125577480 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5390 371 3 6 790 617 310 4 4 chr5 26968692 26968951 -125568308 - RMER16-int LTR ERVK -422 4984 4726 6 790 1602 268 27 39 chr5 26969000 26969622 -125567637 - RMER16-int LTR ERVK -812 4594 3980 6 790 2147 175 10 53 chr5 26970096 26970489 -125566770 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 6 790 2046 208 17 7 chr5 26972851 26973268 -125563991 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 790 452 347 45 25 chr5 26987725 26987926 -125549333 + MTD LTR MaLR 1 205 -214 6 790 934 315 87 32 chr5 26987819 26988163 -125549096 + MT2A LTR ERVL 63 425 -108 6 790 620 308 112 0 chr5 26988402 26988671 -125548588 + MTE2b LTR MaLR 75 359 0 6 790 559 261 114 0 chr5 26988673 26988857 -125548402 + MTE2b-int LTR MaLR 1 205 -1375 6 790 4352 167 126 11 chr5 26989753 26990612 -125546647 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 6 790 226 372 112 61 chr5 26995177 26995472 -125541787 - MLT1I LTR MaLR -22 389 80 6 790 278 178 0 0 chr5 26998675 26998720 -125538539 - MTEa LTR MaLR 0 379 335 6 790 795 281 50 16 chr5 27000000 27000242 -125537017 - MTE2b LTR MaLR -128 251 2 1 791 3614 39 0 130 chr5 27005881 27006382 -125530877 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 791 416 256 34 0 chr5 27008793 27008910 -125528349 + MLT2B4 LTR ERVL 13 133 -423 1 791 272 301 10 173 chr5 27009204 27009401 -125527858 + MLT2B4 LTR ERVL 320 484 -72 1 791 855 258 64 104 chr5 27010001 27010442 -125526817 + MT2B LTR ERVL 1 523 -78 1 791 1237 284 34 11 chr5 27010599 27010948 -125526311 - ORR1E LTR MaLR -1 358 2 1 791 500 230 84 6 chr5 27012584 27012745 -125524514 - MTD LTR MaLR 0 421 244 2 791 314 212 11 91 chr5 27012804 27012892 -125524367 - MTD LTR MaLR -326 93 13 2 791 1193 156 163 28 chr5 27014251 27014502 -125522757 + RMER19A LTR ERVK 1 285 -452 2 791 242 291 22 65 chr5 27014505 27014597 -125522662 - MTE-int LTR MaLR -674 906 819 2 791 325 250 191 0 chr5 27014867 27014951 -125522308 + MTE-int LTR MaLR 951 1050 -530 2 791 354 364 76 69 chr5 27015104 27015393 -125521866 + MLT1G LTR MaLR 7 297 -294 2 791 264 295 272 52 chr5 27020604 27020865 -125516394 - MLT1F LTR MaLR -15 533 216 3 791 2750 84 64 16 chr5 27021418 27021806 -125515453 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 791 5603 139 121 101 chr5 27021806 27023038 -125514221 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1258 2 3 791 1624 138 6 29 chr5 27023038 27023333 -125513926 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 61 3 791 1321 208 18 57 chr5 27023327 27023608 -125513651 - RMER13B LTR ERVK -624 284 15 3 791 838 281 70 23 chr5 27023633 27023932 -125513327 + RMER13B LTR ERVK 580 892 -16 4 791 655 79 11 0 chr5 27023951 27024040 -125513219 - MTB_Mm LTR MaLR -317 90 1 4 791 1270 259 120 11 chr5 27025886 27026261 -125510998 + MTD LTR MaLR 4 419 0 4 791 4196 156 92 29 chr5 27030039 27030876 -125506383 - RLTR13D6 LTR ERVK -12 890 1 5 791 1363 246 45 28 chr5 27033436 27033795 -125503464 + ORR1D2 LTR MaLR 6 370 0 6 791 868 264 79 96 chr5 27037175 27037510 -125499749 - MTE2a LTR MaLR 0 370 48 6 791 1331 255 20 60 chr5 27037526 27037873 -125499386 - MTEb LTR MaLR -43 336 4 6 791 317 284 120 47 chr5 27041220 27041412 -125495847 - ERVL-E-int LTR ERVL -3413 2254 2049 6 791 421 302 31 0 chr5 27043069 27043198 -125494061 + ORR1E LTR MaLR 4 136 -223 7 791 1036 264 147 12 chr5 27044344 27044663 -125492596 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 9 7 791 301 286 23 29 chr5 27051914 27052033 -125485226 + MTEa LTR MaLR 19 130 -249 7 791 1211 251 66 44 chr5 27052088 27052451 -125484808 - MTE2b LTR MaLR -8 371 1 7 791 848 268 56 30 chr5 27053677 27053987 -125483272 - MTE2b LTR MaLR -15 364 1 7 791 546 269 33 72 chr5 27054598 27054778 -125482481 - ORR1E LTR MaLR -186 173 1 8 791 315 261 51 29 chr5 27056660 27056798 -125480461 + RLTR42-int LTR ERVK 1175 1315 -4207 8 791 1716 230 31 6 chr5 27058205 27058520 -125478739 + ORR1D2 LTR MaLR 3 326 -44 9 791 672 314 68 27 chr5 27058520 27058788 -125478471 - ORR1E LTR MaLR -3 375 58 9 791 3380 30 5 0 chr5 27058788 27059182 -125478077 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 791 238 331 196 49 chr5 27059182 27059240 -125478019 - ORR1E LTR MaLR -321 57 1 9 791 1860 148 70 0 chr5 27059955 27060253 -125477006 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 20 9 791 480 267 120 58 chr5 27067933 27067977 -125469282 - RLTR12B LTR ERVK -26 502 459 1 791 1407 193 111 24 chr5 27068041 27068412 -125468847 - RLTR12B LTR ERVK -70 458 1 1 791 929 292 108 54 chr5 27070500 27071036 -125466223 + RLTR40 LTR ERVK 1 565 -252 1 791 534 256 88 46 chr5 27075319 27075564 -125461695 + ORR1D2 LTR MaLR 8 272 -87 1 791 414 315 49 0 chr5 27076324 27076486 -125460773 - RMER15 LTR ERVL -17 558 389 1 791 334 280 9 18 chr5 27076894 27077003 -125460256 - RMER15-int LTR ERVL -26 4973 4866 1 791 2804 183 91 110 chr5 27077751 27078670 -125458589 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 1 791 861 170 122 5 chr5 27079650 27079839 -125457420 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 174 1 791 812 213 64 12 chr5 27080073 27080310 -125456949 - ORR1D1 LTR MaLR -119 265 12 1 791 3253 96 47 52 chr5 27080536 27081051 -125456208 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 791 1725 208 169 16 chr5 27082701 27083146 -125454113 + RMER15 LTR ERVL 27 539 -36 1 791 1023 229 31 49 chr5 27089359 27089710 -125447549 - BGLII_B LTR ERVK -6 435 69 1 791 2180 173 124 19 chr5 27091714 27092191 -125445068 + RLTR24 LTR ERV1 1 527 -2 1 791 845 302 139 27 chr5 27094141 27094509 -125442750 - MTE-int LTR MaLR -990 590 182 1 791 2297 148 93 8 chr5 27095086 27095474 -125441785 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 791 2172 215 34 40 chr5 27095687 27096215 -125441044 + RLTR11A LTR ERVK 1 525 -3 1 791 906 281 36 134 chr5 27096272 27096683 -125440576 + MTE2a LTR MaLR 1 371 -8 1 791 260 289 147 60 chr5 27097398 27097582 -125439677 - RMER20A LTR ERVK -38 589 390 1 791 726 228 272 28 chr5 27098953 27099333 -125437926 - RMER20A LTR ERVK -431 429 1 1 791 3102 51 8 8 chr5 27101444 27101840 -125435419 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 791 1087 267 155 37 chr5 27108026 27108400 -125428859 - MTD LTR MaLR -1 418 1 1 791 1163 260 80 68 chr5 27109317 27109365 -125427894 - MT2A LTR ERVL -11 522 479 1 791 2483 84 3 0 chr5 27109365 27109688 -125427571 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 1 791 1163 260 80 68 chr5 27109688 27110155 -125427104 - MT2A LTR ERVL -55 478 1 1 791 339 150 0 0 chr5 27110155 27110215 -125427044 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5702 1 791 1536 118 72 0 chr5 27110241 27110504 -125426755 - MERVL_2A-int LTR ERVL -359 5402 5121 1 791 9181 180 38 2 chr5 27110511 27112243 -125425016 - MERVL_2A-int LTR ERVL -930 4831 3030 1 791 1032 239 14 0 chr5 27112244 27112462 -125424797 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2877 2884 2664 1 791 2532 243 96 98 chr5 27112462 27113323 -125423936 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 1 791 494 212 10 0 chr5 27114477 27114576 -125422683 + RMER17A-int LTR ERVK 988 1087 -641 1 791 382 172 0 0 chr5 27114712 27114776 -125422483 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3109 2652 2589 1 791 633 154 55 39 chr5 27114779 27114907 -125422352 - RMER4B LTR ERVK -3 582 453 1 791 3507 109 82 26 chr5 27116805 27117342 -125419917 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 1 791 1329 275 59 9 chr5 27121574 27121912 -125415347 - MTEa LTR MaLR -2 377 23 2 791 1113 236 64 135 chr5 27124419 27124870 -125412389 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 791 1225 287 53 17 chr5 27127683 27128044 -125409215 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 2 791 301 316 151 6 chr5 27128774 27128933 -125408326 - ORR1E-int LTR MaLR -1395 185 4 2 791 299 346 87 76 chr5 27128939 27129283 -125407976 - ORR1E LTR MaLR -1 358 11 2 792 1218 283 21 64 chr5 27133350 27133727 -125403532 + ORR1D2 LTR MaLR 8 368 -2 2 792 2136 89 49 3 chr5 27134599 27134904 -125402355 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 792 2556 169 89 26 chr5 27136317 27136845 -125400414 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 2 792 3275 66 2 34 chr5 27140470 27140879 -125396380 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 792 1992 168 60 9 chr5 27147728 27148077 -125389182 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 792 479 295 40 17 chr5 27151915 27152091 -125385168 - RMER15 LTR ERVL -16 559 380 2 792 1627 182 66 13 chr5 27152263 27152580 -125384679 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 34 2 792 1690 131 73 73 chr5 27156494 27156848 -125380411 + RMER4B LTR ERVK 1 354 -231 2 792 9353 139 12 6 chr5 27156851 27158302 -125378957 + MurERV4-int LTR ERVK 2070 3530 -1730 2 792 9215 163 32 35 chr5 27158477 27159786 -125377473 + MurERV4-int LTR ERVK 3516 4866 -394 2 792 9215 163 32 35 chr5 27159885 27160317 -125376942 + MurERV4-int LTR ERVK 4867 5252 -8 2 792 511 202 0 58 chr5 27160323 27160413 -125376846 + RMER4B LTR ERVK 1 83 -383 2 792 833 128 26 20 chr5 27160413 27160565 -125376694 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 490 2 792 725 195 24 0 chr5 27160568 27160691 -125376568 - RLTR26 LTR ERVK -516 126 1 2 792 430 141 0 0 chr5 27160691 27160755 -125376504 + RMER4B LTR ERVK 83 146 -439 2 792 548 190 50 25 chr5 27160767 27160886 -125376373 + RMER4B LTR ERVK 464 585 0 2 792 1929 122 25 28 chr5 27161823 27162143 -125375116 - ORR1A3 LTR MaLR -7 319 1 2 792 3471 106 4 35 chr5 27165083 27165573 -125371686 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 2 792 1746 152 135 19 chr5 27172233 27172603 -125364656 + MTC LTR MaLR 9 421 0 2 792 2218 165 5 8 chr5 27177858 27178249 -125359010 + ORR1B1 LTR MaLR 2 391 -3 2 792 1592 176 85 28 chr5 27183367 27183550 -125353709 + ORR1C2 LTR MaLR 1 188 -196 2 792 1592 176 85 28 chr5 27183627 27183806 -125353453 + ORR1C2 LTR MaLR 189 384 0 2 792 648 258 6 14 chr5 27184662 27184856 -125352403 + MTD LTR MaLR 1 190 -231 2 792 1416 204 60 28 chr5 27185371 27185782 -125351477 + RLTR20D LTR ERVK 4 461 -107 2 792 1252 201 83 0 chr5 27185824 27185912 -125351347 + RLTR20D LTR ERVK 462 567 -1 2 792 1365 181 81 4 chr5 27186733 27187005 -125350254 + ORR1C2 LTR MaLR 92 384 0 3 792 3360 48 2 2 chr5 27187133 27187529 -125349730 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 792 279 326 113 14 chr5 27191961 27192182 -125345077 + MLT2B2 LTR ERVL 1 243 -311 3 792 312 330 1 0 chr5 27192194 27192298 -125344961 + MLT2B2 LTR ERVL 352 456 -111 3 792 1973 153 89 9 chr5 27197330 27197679 -125339580 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 3 792 1014 171 286 52 chr5 27199995 27200303 -125336956 + ORR1C2 LTR MaLR 3 382 -2 3 792 2560 121 40 52 chr5 27206129 27206555 -125330704 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 792 3375 223 42 87 chr5 27206562 27207706 -125329553 - MTC-int LTR MaLR -5 1093 2 3 792 1350 197 117 115 chr5 27207709 27207953 -125329306 - MTC LTR MaLR 0 421 156 3 792 1350 197 117 115 chr5 27207979 27208091 -125329168 - MTC LTR MaLR -266 155 64 3 792 1350 197 117 115 chr5 27208359 27208419 -125328840 - MTC LTR MaLR -358 63 3 3 792 325 244 167 8 chr5 27209240 27209372 -125327887 - MTE2a LTR MaLR -192 187 35 3 792 5039 164 41 19 chr5 27210489 27210609 -125326650 - RMER19B LTR ERVK 0 902 759 3 792 5039 164 41 19 chr5 27210634 27211396 -125325863 - RMER19B LTR ERVK -144 758 2 3 792 234 232 56 8 chr5 27212082 27212102 -125325157 + ORR1B1-int LTR MaLR 623 648 -861 3 792 431 152 9 132 chr5 27213410 27213524 -125323735 - RLTR18B LTR ERVK -412 100 1 3 792 455 239 45 51 chr5 27219887 27220063 -125317196 + MTD LTR MaLR 221 395 -24 3 792 920 281 68 37 chr5 27224515 27224836 -125312423 + ORR1E LTR MaLR 1 331 -28 3 792 3136 56 8 5 chr5 27225075 27225470 -125311789 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 792 7158 107 10 13 chr5 27226235 27227261 -125309998 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 3 792 799 280 72 10 chr5 27229508 27229824 -125307435 - ORR1D2 LTR MaLR 0 359 5 3 792 234 305 49 0 chr5 27229938 27230020 -125307239 + MLT1A0 LTR MaLR 107 192 -173 3 792 429 236 28 180 chr5 27239341 27239558 -125297701 - MTEa LTR MaLR 0 379 196 3 792 257 182 0 0 chr5 27239550 27239594 -125297665 - MTEa LTR MaLR -331 48 5 3 792 1620 197 88 30 chr5 27240874 27241079 -125296180 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 168 3 792 1620 197 88 30 chr5 27241151 27241307 -125295952 - ORR1C2 LTR MaLR -217 167 1 3 792 243 313 32 112 chr5 27242439 27242720 -125294539 - MTEa LTR MaLR -6 373 107 3 792 305 238 0 45 chr5 27242732 27242798 -125294461 - MTE2b LTR MaLR -14 365 303 3 792 775 305 43 78 chr5 27242872 27243220 -125294039 - MTE2b LTR MaLR -71 348 13 3 792 3677 172 55 3 chr5 27243544 27244202 -125293057 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 3 792 511 286 139 12 chr5 27244309 27244560 -125292699 - LTR48 LTR ERV1 -37 750 468 3 792 398 268 108 5 chr5 27244532 27244738 -125292521 - LTR48 LTR ERV1 -335 309 1 3 792 941 308 99 22 chr5 27244783 27245410 -125291849 - MER67C LTR ERV1 -2 709 1 3 792 464 326 181 62 chr5 27247266 27247636 -125289623 + MLT2D LTR ERVL 1 414 0 3 792 2126 243 67 137 chr5 27256336 27257284 -125279975 - RMER17B LTR ERVK -77 881 1 4 792 548 228 73 234 chr5 27257964 27258416 -125278843 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 792 1901 186 72 19 chr5 27260665 27261042 -125276217 + MTD LTR MaLR 5 401 -18 4 12 580 284 56 28 chr5 27262785 27262999 -125274260 - MLT1A0 LTR MaLR -145 220 1 4 793 697 246 197 20 chr5 27263878 27264081 -125273178 - MTEa LTR MaLR -48 331 93 4 793 958 258 65 52 chr5 27269346 27269714 -125267545 - MTE2b LTR MaLR -4 375 3 4 793 2828 155 97 4 chr5 27273583 27274108 -125263151 - RMER4B LTR ERVK -11 574 1 4 793 256 329 207 0 chr5 27275057 27275197 -125262062 - MLT1C LTR MaLR -1 466 298 4 793 357 297 43 37 chr5 27275214 27275375 -125261884 - MER34 LTR ERV1 -6 536 375 4 793 2045 165 30 14 chr5 27276588 27276957 -125260302 - RLTR11B LTR ERVK -78 375 1 4 793 400 360 59 38 chr5 27280016 27280305 -125256954 - MLT2C1 LTR ERVL -92 305 11 4 793 502 284 46 28 chr5 27280474 27280691 -125256568 + MLT2D LTR ERVL 8 228 -186 4 793 1072 228 133 35 chr5 27282816 27283161 -125254098 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 4 793 789 245 107 77 chr5 27289953 27290316 -125246943 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 4 793 1148 232 52 118 chr5 27290562 27290962 -125246297 - MTE2a LTR MaLR -2 377 4 4 793 508 273 45 92 chr5 27290998 27291283 -125245976 - ORR1E LTR MaLR -98 272 10 4 793 973 250 177 6 chr5 27294279 27294601 -125242658 + MTEb LTR MaLR 1 377 -2 4 793 4264 122 21 13 chr5 27294603 27295366 -125241893 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 41 4 793 1450 175 74 11 chr5 27295807 27296112 -125241147 - RLTR20B2 LTR ERVK -238 339 1 4 793 308 329 66 26 chr5 27301321 27301549 -125235710 + MuRRS4-int LTR ERV1 1219 1455 -3608 4 793 285 236 60 52 chr5 27301803 27301919 -125235340 + RLTR6-int LTR ERV1 4236 4352 -3426 4 793 1117 304 41 19 chr5 27302287 27302837 -125234422 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4799 5194 -2407 4 793 348 302 47 0 chr5 27303102 27303208 -125234051 + RLTR19-int LTR ERVK 4376 4486 -1651 4 793 312 326 38 8 chr5 27303956 27304089 -125233170 + MuLV-int LTR ERV1 7120 7256 -350 4 793 456 250 44 9 chr5 27303979 27304092 -125233167 + RNERVK23-int LTR ERVK 7411 7527 -690 4 793 1945 143 65 162 chr5 27304259 27304735 -125232524 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 4 793 1120 273 99 12 chr5 27307900 27308312 -125228947 - RMER5 LTR ERV1 -39 495 48 4 793 250 188 21 0 chr5 27312164 27312212 -125225047 - ORR1E LTR MaLR -310 49 1 4 793 763 295 57 45 chr5 27321638 27321805 -125215454 - MTE2b LTR MaLR -17 362 207 4 793 763 295 57 45 chr5 27321869 27322035 -125215224 - MTE2b LTR MaLR -173 206 26 4 793 1606 194 83 122 chr5 27322094 27322375 -125214884 - MTC LTR MaLR -3 418 106 4 793 1606 194 83 122 chr5 27322522 27322675 -125214584 - MTC LTR MaLR -316 105 1 4 793 1801 127 21 108 chr5 27331378 27331766 -125205493 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 793 3161 162 60 63 chr5 27332929 27333529 -125203730 + RMER6D LTR ERVK 6 616 -104 5 793 3161 162 60 63 chr5 27333682 27333794 -125203465 + RMER6D LTR ERVK 617 716 -4 5 793 1264 272 53 3 chr5 27335188 27335549 -125201710 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 5 793 3158 11 0 3 chr5 27345803 27346150 -125191109 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 793 12988 53 3 5 chr5 27346150 27347469 -125189790 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1317 -475 5 793 4530 59 2 18 chr5 27347469 27348042 -125189217 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 5 793 12988 53 3 5 chr5 27348042 27348516 -125188743 + ORR1A0-int LTR MaLR 1318 1792 0 5 793 2963 40 0 3 chr5 27348516 27348863 -125188396 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 793 342 156 16 0 chr5 27349039 27349103 -125188156 - MTEa LTR MaLR 0 379 315 5 793 1190 218 102 0 chr5 27349168 27349461 -125187798 - MTEa LTR MaLR -55 324 2 5 793 389 338 138 74 chr5 27350588 27351045 -125186214 + MER77 LTR ERVL 25 510 -97 5 793 279 289 11 32 chr5 27351446 27351539 -125185720 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 318 5 793 1250 233 134 6 chr5 27356274 27356602 -125180657 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 793 1605 243 45 5 chr5 27356891 27357288 -125179971 + MTD LTR MaLR 6 418 -1 5 793 1990 249 105 30 chr5 27363840 27364691 -125172568 + RMER13A LTR ERVK 1 801 -107 5 793 1455 243 11 27 chr5 27365038 27365406 -125171853 + ORR1D2 LTR MaLR 5 366 -4 5 793 2897 65 41 20 chr5 27365998 27366390 -125170869 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 793 2309 138 65 3 chr5 27367134 27367505 -125169754 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 793 1247 252 76 3 chr5 27379290 27379632 -125157627 - MTD LTR MaLR 0 419 53 5 793 1320 296 24 19 chr5 27380464 27380839 -125156420 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 5 793 373 276 79 20 chr5 27392139 27392342 -125144917 + MLT1A0 LTR MaLR 109 323 -42 5 793 491 294 157 5 chr5 27392701 27392899 -125144360 - RMER15 LTR ERVL 0 575 348 5 794 344 287 50 22 chr5 27394522 27394661 -125142598 - MLT1C LTR MaLR -25 442 300 5 794 480 271 137 47 chr5 27406315 27406636 -125130623 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 21 6 794 1769 218 35 0 chr5 27408414 27408814 -125128445 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 794 740 275 25 86 chr5 27416972 27417369 -125119890 - ORR1E LTR MaLR -8 362 11 6 794 2070 224 73 93 chr5 27420966 27421586 -125115673 - RMER19C LTR ERVK -4 607 1 6 794 1737 174 41 19 chr5 27424158 27424521 -125112738 + ORR1B1 LTR MaLR 24 394 0 6 794 854 289 130 63 chr5 27427946 27428328 -125108931 + MTD LTR MaLR 1 407 0 6 794 350 219 60 24 chr5 27435384 27435468 -125101791 + ORR1E LTR MaLR 1 87 -272 6 794 1873 249 66 49 chr5 27440164 27440752 -125096507 + RMER20B LTR ERVK 1 598 -29 6 794 311 296 0 12 chr5 27440754 27440836 -125096423 + RMER20B LTR ERVK 525 605 -22 6 794 1044 321 44 6 chr5 27443299 27443659 -125093600 - MTEa LTR MaLR -5 374 1 6 794 1199 258 85 15 chr5 27444189 27444531 -125092728 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 6 794 1057 333 59 20 chr5 27454328 27454784 -125082475 - MLT2B3 LTR ERVL -46 508 35 6 794 2646 118 35 55 chr5 27457852 27458311 -125078948 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 4 6 794 295 359 103 60 chr5 27458357 27458525 -125078734 + MTEa LTR MaLR 4 179 -200 6 794 1227 263 48 22 chr5 27458525 27458883 -125078376 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 6 794 295 320 171 37 chr5 27458883 27459059 -125078200 + MTEa LTR MaLR 180 379 0 6 794 1392 236 40 40 chr5 27467245 27467650 -125069609 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 794 1577 247 37 56 chr5 27469517 27470069 -125067190 - RMER19C LTR ERVK -2 609 4 6 794 392 267 99 0 chr5 27471877 27472008 -125065251 - RMER15 LTR ERVL -14 561 418 6 794 790 287 91 46 chr5 27472543 27472920 -125064339 + MTD LTR MaLR 18 401 -18 6 794 890 248 61 4 chr5 27475255 27475486 -125061773 + RMER15 LTR ERVL 220 463 -112 6 794 951 241 182 7 chr5 27475520 27475817 -125061442 - ORR1D1 LTR MaLR -19 355 7 6 794 2815 55 93 3 chr5 27478348 27478533 -125058726 - MTB LTR MaLR 0 400 216 6 794 2815 55 93 3 chr5 27478709 27478890 -125058369 - MTB LTR MaLR -185 215 2 6 794 1064 251 108 20 chr5 27479437 27479779 -125057480 - MTEa LTR MaLR -2 377 6 7 794 382 289 51 23 chr5 27480473 27480650 -125056609 + MLT1E2 LTR MaLR 415 596 -31 7 794 503 215 99 46 chr5 27481362 27481513 -125055746 - MTE2a LTR MaLR -3 376 218 7 794 430 328 33 16 chr5 27481682 27481865 -125055394 - MTE2a LTR MaLR -226 193 8 7 794 1238 262 92 26 chr5 27491558 27492013 -125045246 - RMER5 LTR ERV1 0 534 50 7 794 1063 283 66 18 chr5 27493676 27493831 -125043428 - MTEa LTR MaLR -26 353 197 7 794 1063 283 66 18 chr5 27493859 27494038 -125043221 - MTEa LTR MaLR -183 196 4 7 794 1601 60 5 5 chr5 27497968 27498187 -125039072 - MTB LTR MaLR 0 400 182 7 794 1355 86 10 5 chr5 27498353 27498551 -125038708 - MTB LTR MaLR -194 202 4 7 794 970 261 21 0 chr5 27502004 27502242 -125035017 - MTEa LTR MaLR -4 375 133 5 794 252 250 0 0 chr5 27505367 27505423 -125031836 - RMER15 LTR ERVL -113 462 407 1 794 821 190 162 70 chr5 27510605 27510877 -125026382 - MTE2a LTR MaLR 0 379 83 1 794 356 271 152 111 chr5 27510936 27510969 -125026290 - MTE2a LTR MaLR -303 116 102 1 794 356 271 152 111 chr5 27510996 27511092 -125026167 - MTE2a LTR MaLR -318 101 1 1 794 495 228 212 7 chr5 27515809 27515955 -125021304 + MTD LTR MaLR 13 188 -231 2 794 810 248 224 3 chr5 27518921 27519224 -125018035 + MTD LTR MaLR 35 404 -15 2 794 1037 284 17 83 chr5 27519598 27519948 -125017311 - MTEa LTR MaLR -52 327 1 2 794 760 266 88 72 chr5 27520068 27520444 -125016815 - MTD LTR MaLR -14 405 24 3 794 464 248 8 30 chr5 27520671 27520818 -125016441 - MTE2b LTR MaLR -1 378 225 3 794 825 263 167 25 chr5 27522066 27522390 -125014869 - MTE2b LTR MaLR -1 378 9 3 795 647 234 96 0 chr5 27528136 27528324 -125008935 - MTEa LTR MaLR 0 379 174 4 795 779 268 19 5 chr5 27528325 27528535 -125008724 - MTEa LTR MaLR -113 266 54 4 795 362 270 120 14 chr5 27529278 27529457 -125007802 + MLT1C LTR MaLR 235 395 -72 4 795 244 306 64 18 chr5 27538187 27538297 -124998962 - MTEb LTR MaLR 0 379 265 5 795 3224 183 98 31 chr5 27541372 27542043 -124995216 - RMER6D LTR ERVK -4 716 1 6 795 1640 170 113 18 chr5 27543998 27544333 -124992926 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 795 278 243 8 119 chr5 27544862 27544879 -124992380 + MT2B LTR ERVL 168 279 -322 6 795 481 276 249 0 chr5 27548469 27548730 -124988529 + MLT1B LTR MaLR 57 382 -8 7 795 815 301 56 40 chr5 27550673 27550977 -124986282 - MTE2a LTR MaLR -13 366 58 7 795 611 274 120 112 chr5 27558911 27559141 -124978118 - MLT1A1 LTR MaLR -22 386 156 8 795 611 274 120 112 chr5 27559476 27559628 -124977631 - MLT1A1 LTR MaLR -253 155 1 8 795 361 244 12 0 chr5 27562408 27562494 -124974765 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 293 8 795 2043 144 73 3 chr5 27563889 27564229 -124973030 + ORR1B2 LTR MaLR 1 364 -3 8 795 1030 255 22 162 chr5 27564819 27565189 -124972070 - ORR1D2 LTR MaLR -52 318 1 8 795 956 284 122 0 chr5 27567068 27567322 -124969937 + MTD LTR MaLR 50 334 -85 9 795 391 176 0 0 chr5 27567482 27567550 -124969709 + MTD LTR MaLR 344 411 -8 9 795 1408 210 228 47 chr5 27570956 27571420 -124965839 - RMER13B LTR ERVK -4 904 357 9 795 329 219 41 0 chr5 27573098 27573171 -124964088 - ORR1E LTR MaLR -5 374 299 1 795 644 315 52 88 chr5 27573470 27573776 -124963483 - ORR1E LTR MaLR -60 299 5 1 795 321 270 67 0 chr5 27574160 27574249 -124963010 + ORR1E LTR MaLR 21 115 -244 1 795 2580 226 63 102 chr5 27576359 27577347 -124959912 - RMER17B LTR ERVK -4 904 1 1 795 5667 74 12 8 chr5 27579655 27580420 -124956839 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 768 -1040 1 795 398 293 40 85 chr5 27580659 27580883 -124956376 + RMER12 LTR ERVK 1101 1314 -8 1 795 745 243 10 36 chr5 27593829 27594021 -124943238 - RMER13B LTR ERVK -4 904 718 1 795 2025 228 86 144 chr5 27594024 27594885 -124942374 - RMER17B LTR ERVK -147 811 1 1 795 1271 252 118 3 chr5 27595075 27595389 -124941870 - MTE2b LTR MaLR -11 368 19 1 795 261 276 45 71 chr5 27603772 27604041 -124933218 + RMER17A LTR ERVK 232 493 -258 1 795 2429 158 7 10 chr5 27606989 27607397 -124929862 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 795 226 314 120 111 chr5 27607733 27607941 -124929318 - MLT1A1 LTR MaLR -198 210 1 1 795 243 328 32 32 chr5 27613820 27613943 -124923316 - MTE2b LTR MaLR -17 362 240 1 795 256 254 221 21 chr5 27616342 27616487 -124920772 - MTE2a LTR MaLR 0 379 206 1 795 308 188 16 0 chr5 27619657 27619721 -124917538 - MT2A LTR ERVL -391 142 78 1 795 346 134 134 0 chr5 27619945 27620012 -124917247 - MT2A LTR ERVL -457 76 1 1 795 427 281 32 7 chr5 27630061 27630215 -124907044 - RLTR42-int LTR ERVK -4206 1316 1159 1 795 1243 104 0 10 chr5 27631281 27631475 -124905784 + MTB LTR MaLR 1 192 -215 1 795 1664 46 0 9 chr5 27632321 27632541 -124904718 + MTB LTR MaLR 183 400 0 1 795 372 310 151 5 chr5 27638532 27638717 -124898542 - MLT1A LTR MaLR -44 330 119 1 795 379 206 31 10 chr5 27641423 27641521 -124895738 + ORR1D2 LTR MaLR 1 100 -270 1 795 354 312 116 52 chr5 27655857 27656107 -124881152 + MLT1A LTR MaLR 14 279 -95 1 796 234 217 32 108 chr5 27658486 27658579 -124878680 - MTEb LTR MaLR 0 379 294 1 796 234 215 52 31 chr5 27658929 27659025 -124878234 - MLT1A1 LTR MaLR -275 133 36 1 796 397 269 42 0 chr5 27663552 27663671 -124873588 - MTEa LTR MaLR -5 374 251 1 796 903 259 113 33 chr5 27665868 27666203 -124871056 - ORR1E LTR MaLR 0 419 1 1 796 263 226 0 0 chr5 27669058 27669111 -124868148 - MLT1A0 LTR MaLR -57 308 256 2 796 374 202 93 47 chr5 27669252 27669418 -124867841 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 851 2 796 1263 254 91 11 chr5 27674702 27675052 -124862207 + MTE2b LTR MaLR 1 378 -1 2 796 2030 138 30 3 chr5 27677161 27677495 -124859764 - ORR1C1 LTR MaLR -15 363 21 2 796 1718 157 119 31 chr5 27681055 27681442 -124855817 - RMER10A LTR ERVL 0 442 22 2 796 1736 174 26 29 chr5 27681580 27681928 -124855331 + ORR1B1 LTR MaLR 47 393 -1 2 796 469 282 184 0 chr5 27692124 27692369 -124844890 + MLT1B LTR MaLR 95 384 -6 2 796 1490 238 58 19 chr5 27693125 27693490 -124843769 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 2 796 342 304 67 7 chr5 27696733 27696882 -124840377 - MLT1D LTR MaLR -57 448 291 2 796 946 268 97 15 chr5 27706509 27706867 -124830392 + MTD LTR MaLR 18 421 0 2 796 796 241 79 4 chr5 27711683 27711912 -124825347 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 121 2 796 286 197 68 27 chr5 27714249 27714322 -124822937 - RLTR23 LTR ERV1 -31 399 324 2 796 976 200 280 17 chr5 27718180 27718480 -124818779 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 2 796 2205 145 3 0 chr5 27718890 27719215 -124818044 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 796 320 317 53 32 chr5 27719781 27719945 -124817314 - MLT1B LTR MaLR -17 373 209 2 796 320 317 53 32 chr5 27720021 27720045 -124817214 - MLT1B LTR MaLR -182 208 181 2 796 1034 162 0 16 chr5 27728549 27728743 -124808516 - ORR1C2 LTR MaLR -20 364 174 2 796 751 231 15 76 chr5 27728783 27728980 -124808279 - ORR1C2 LTR MaLR -191 187 3 2 796 657 234 34 39 chr5 27730731 27730909 -124806350 - MTEb LTR MaLR -13 366 190 2 796 1414 192 133 3 chr5 27730916 27731261 -124805998 - MTD LTR MaLR -12 407 18 2 796 484 283 121 6 chr5 27731277 27731451 -124805808 - MTEb LTR MaLR -185 194 1 2 796 1296 259 67 64 chr5 27733705 27734081 -124803178 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 2 796 1380 217 159 11 chr5 27737957 27738321 -124798938 - MTD LTR MaLR -1 418 1 3 796 2482 152 24 26 chr5 27739875 27740370 -124796889 - RLTR28 LTR ERVL -3 521 28 3 796 973 255 112 12 chr5 27741173 27741495 -124795764 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 3 796 351 182 0 147 chr5 27746634 27746750 -124790509 + MT2B LTR ERVL 167 265 -336 3 796 797 142 64 87 chr5 27746705 27746915 -124790344 - RLTR9D LTR ERVK -11 404 208 3 796 2964 59 27 44 chr5 27747540 27747950 -124789309 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 3 796 1784 216 30 5 chr5 27748261 27748665 -124788594 + MTD LTR MaLR 6 419 0 3 796 338 240 27 0 chr5 27749558 27749633 -124787626 - MTEb LTR MaLR -299 80 4 3 796 549 163 218 0 chr5 27750552 27750699 -124786560 - MTEa LTR MaLR -152 227 49 3 796 3107 23 0 0 chr5 27756245 27756591 -124780668 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 796 1123 212 138 22 chr5 27758501 27758868 -124778391 - MTD LTR MaLR -21 398 5 3 796 912 219 223 21 chr5 27762048 27762380 -124774879 + MTD LTR MaLR 3 401 -18 3 796 1456 186 24 3 chr5 27767874 27768165 -124769094 - ORR1D1 LTR MaLR -30 344 48 3 796 1628 232 58 5 chr5 27775115 27775509 -124761750 + MTD LTR MaLR 2 416 -3 3 796 400 306 124 15 chr5 27779888 27780147 -124757112 - ORR1E LTR MaLR -9 350 64 3 796 340 259 11 11 chr5 27780767 27780857 -124756402 - MTEb LTR MaLR -2 377 288 3 796 569 292 73 6 chr5 27780874 27781053 -124756206 + MTEb-int LTR MaLR 1388 1578 -2 3 796 354 309 214 0 chr5 27781055 27781280 -124755979 + MTEb LTR MaLR 1 273 -106 3 796 240 252 94 70 chr5 27784771 27784899 -124752360 - MTE2a LTR MaLR -248 131 1 3 796 2042 144 136 0 chr5 27785082 27785449 -124751810 - MTC LTR MaLR 0 421 5 3 797 266 167 82 16 chr5 27788441 27788502 -124748757 - RMER15 LTR ERVL -105 470 406 3 797 1192 251 96 38 chr5 27789416 27789869 -124747390 - RLTR20B3 LTR ERVK -56 521 20 3 797 2883 159 37 24 chr5 27789875 27790421 -124746838 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1774 3 797 893 195 23 0 chr5 27790422 27790596 -124746663 + ORR1D1 LTR MaLR 197 374 0 3 797 305 316 0 21 chr5 27790950 27791047 -124746212 + MLT1A1 LTR MaLR 305 399 -9 3 797 333 336 25 0 chr5 27799406 27799528 -124737731 - MLT1F2 LTR MaLR -34 526 402 4 797 270 318 107 117 chr5 27799969 27800165 -124737094 - MLT1F2 LTR MaLR -167 393 200 4 797 1154 241 104 4 chr5 27813540 27813819 -124723440 - MTE2a LTR MaLR -30 349 43 4 797 2150 92 6 16 chr5 27816147 27816469 -124720790 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 797 1268 243 46 126 chr5 27828756 27829298 -124707961 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 4 797 1959 189 89 24 chr5 27830402 27830852 -124706407 + RLTR19 LTR ERVK 14 492 -7 4 797 1027 209 131 112 chr5 27831146 27831433 -124705826 + RMER6B LTR ERVK 1 280 -181 4 797 1027 209 131 112 chr5 27831568 27831716 -124705543 + RMER6B LTR ERVK 281 444 -17 4 797 1807 211 25 42 chr5 27846495 27846900 -124690359 + MTD LTR MaLR 8 405 -14 4 797 1784 178 41 22 chr5 27849177 27849540 -124687719 - ORR1C2 LTR MaLR -14 370 1 4 797 1318 230 78 46 chr5 27855956 27856329 -124680930 + MTD LTR MaLR 20 404 -15 4 797 3859 117 20 50 chr5 27856535 27856946 -124680313 - RMER17A LTR ERVK -15 736 341 4 797 3859 117 20 50 chr5 27857046 27857393 -124679866 - RMER17A LTR ERVK -411 340 1 4 797 844 220 8 37 chr5 27858976 27859262 -124677997 + MTA_Mm LTR MaLR 7 396 0 4 797 7317 60 11 34 chr5 27859262 27860228 -124677031 + MERVL-int LTR ERVL 3 946 -4539 4 797 1385 39 0 27 chr5 27860228 27860413 -124676846 + MTA_Mm LTR MaLR 217 396 0 4 797 233 238 154 82 chr5 27871838 27871948 -124665311 + MTE2a LTR MaLR 210 327 -52 4 797 676 236 256 3 chr5 27885444 27885745 -124651514 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 5 797 1718 139 18 44 chr5 27887702 27888040 -124649219 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 797 983 217 14 101 chr5 27892787 27893064 -124644195 + ORR1B1 LTR MaLR 38 290 -104 5 797 1267 196 71 56 chr5 27893271 27893595 -124643664 - ORR1D1 LTR MaLR -45 329 1 5 797 908 156 5 90 chr5 27900756 27900967 -124636292 - ORR1A4 LTR MaLR -136 193 1 5 797 999 279 72 25 chr5 27902143 27902503 -124634756 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 5 797 4941 161 90 2 chr5 27904818 27905771 -124631488 - MTC-int LTR MaLR -194 1064 28 5 797 832 261 17 111 chr5 27905771 27906068 -124631191 + ORR1E LTR MaLR 89 357 -2 5 797 1815 201 78 0 chr5 27907941 27908324 -124628935 - MTD LTR MaLR -6 413 1 5 797 229 349 28 0 chr5 27908493 27908599 -124628660 - MLT1A0 LTR MaLR -237 128 20 5 797 1083 154 139 13 chr5 27909439 27909676 -124627583 - ORR1B1 LTR MaLR -127 267 1 5 797 472 278 80 0 chr5 27910594 27910745 -124626514 - MTE2a LTR MaLR -43 336 174 5 797 410 262 72 94 chr5 27911526 27911707 -124625552 - MTE2a LTR MaLR -202 177 1 5 797 429 274 56 7 chr5 27912457 27912608 -124624651 + MTE2b LTR MaLR 2 167 -212 5 797 230 293 22 96 chr5 27913311 27913447 -124623812 + MT2A LTR ERVL 5 130 -403 5 797 811 275 146 31 chr5 27913333 27913656 -124623603 + MTE2a LTR MaLR 20 379 0 5 99 1737 210 64 20 chr5 27918322 27918715 -124618544 + MTC LTR MaLR 1 410 -11 5 798 2338 170 3 0 chr5 27920609 27920986 -124616273 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 798 1533 214 68 11 chr5 27921523 27921877 -124615382 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 798 992 246 105 56 chr5 27921899 27922222 -124615037 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 32 5 798 909 305 87 3 chr5 27926025 27926311 -124610948 - MTE2b LTR MaLR -67 312 3 5 798 1222 259 83 16 chr5 27929259 27929632 -124607627 - MTD LTR MaLR -17 402 5 5 798 265 280 140 0 chr5 27938119 27938226 -124599033 - ORR1E LTR MaLR -235 124 3 5 798 570 253 58 0 chr5 27938226 27938376 -124598883 - ORR1E-int LTR MaLR -51 1529 1370 5 798 292 291 102 8 chr5 27938451 27938569 -124598690 - ORR1E-int LTR MaLR -887 693 565 5 798 918 180 212 13 chr5 27938763 27938994 -124598265 - MTC LTR MaLR -8 413 137 5 798 251 258 29 101 chr5 27945155 27945293 -124591966 - MT2B LTR ERVL -343 258 131 5 798 661 205 145 53 chr5 27951195 27951422 -124585837 - MLT1C LTR MaLR -208 259 12 5 798 1692 221 85 11 chr5 27952006 27952381 -124584878 - MTD LTR MaLR -2 417 15 5 798 1088 243 107 16 chr5 27958341 27958659 -124578600 + MLT1A0 LTR MaLR 19 365 0 6 798 241 255 90 20 chr5 27959514 27959603 -124577656 - MLT1A LTR MaLR -255 119 24 6 798 4442 145 12 57 chr5 27963732 27964498 -124572761 - RMER19A LTR ERVK 0 737 7 6 798 921 193 27 27 chr5 27972025 27972211 -124565048 - ORR1C2 LTR MaLR -64 320 135 6 798 610 186 43 21 chr5 27974648 27974793 -124562466 - ORR1C2 LTR MaLR -233 141 1 6 798 1059 266 79 10 chr5 27981522 27981826 -124555433 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 46 6 798 726 240 72 15 chr5 27981833 27981860 -124555399 + MTEa LTR MaLR 174 209 -170 6 798 726 240 72 15 chr5 27981913 27982080 -124555179 + MTEa LTR MaLR 210 379 0 6 798 934 256 57 75 chr5 27982836 27983220 -124554039 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 6 798 229 260 0 39 chr5 27991709 27991761 -124545498 + RLTR12B LTR ERVK 187 236 -292 6 798 248 322 223 51 chr5 27994343 27994500 -124542759 - MLT1C LTR MaLR -66 401 218 6 798 368 295 35 18 chr5 27994514 27994628 -124542631 - MLT1C LTR MaLR -344 123 8 6 798 250 246 13 40 chr5 27997255 27997331 -124539928 + MTE2a LTR MaLR 290 363 -16 6 798 1316 198 106 124 chr5 28000689 28001075 -124536184 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 798 231 94 0 0 chr5 28002249 28002281 -124534978 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 338 3 798 874 245 116 101 chr5 28004533 28004851 -124532408 + MTE2a LTR MaLR 14 336 -43 9 798 304 242 0 0 chr5 28005269 28005331 -124531928 + MTE2a LTR MaLR 312 373 -6 9 798 251 343 157 0 chr5 28006709 28006849 -124530410 + MLT1C LTR MaLR 232 393 -74 1 798 2102 171 17 68 chr5 28008381 28008796 -124528463 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 798 1664 216 39 19 chr5 28013972 28014331 -124522928 + ORR1D2 LTR MaLR 2 367 -3 3 798 332 238 36 0 chr5 28015031 28015115 -124522144 + MTEb LTR MaLR 291 377 -2 3 798 2207 202 33 59 chr5 28020644 28021323 -124515936 + BGLII_B LTR ERVK 1 553 0 5 798 3043 26 3 0 chr5 28021405 28021750 -124515509 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 798 403 315 192 43 chr5 28024003 28024305 -124512954 - MER31B LTR ERV1 -94 372 26 6 798 375 266 144 80 chr5 28026191 28026379 -124510880 - MLT1B LTR MaLR -187 203 4 6 798 1746 194 132 0 chr5 28034099 28034471 -124502788 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 798 896 243 201 20 chr5 28041382 28041680 -124495579 - ORR1E LTR MaLR -2 357 6 9 798 2072 156 82 3 chr5 28042073 28042440 -124494819 - RMER10B LTR ERVL 0 398 3 9 798 607 304 85 65 chr5 28042730 28043082 -124494177 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 9 798 353 253 99 83 chr5 28045757 28045938 -124491321 - MTEa LTR MaLR -8 371 188 9 799 3165 54 46 0 chr5 28054083 28054472 -124482787 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 799 2361 86 9 24 chr5 28054687 28055019 -124482240 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 799 237 254 0 0 chr5 28055246 28055301 -124481958 - RMER15 LTR ERVL -106 469 415 1 799 233 349 64 0 chr5 28058537 28058646 -124478613 + MLT1E LTR MaLR 499 614 -39 1 799 521 209 77 58 chr5 28059376 28059615 -124477644 - RMER17C LTR ERVK -107 303 1 1 799 3724 125 154 24 chr5 28060670 28061453 -124475806 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1023 0 1 799 655 201 170 36 chr5 28061942 28062107 -124475152 + ORR1D1 LTR MaLR 1 187 -187 1 799 2298 175 10 29 chr5 28062171 28062308 -124474951 + MTC LTR MaLR 1 131 -290 1 799 2298 175 10 29 chr5 28062496 28062775 -124474484 + MTC LTR MaLR 132 409 -12 1 799 3091 165 46 7 chr5 28062775 28063317 -124473942 + RLTR18 LTR ERVK 1 563 -53 1 799 277 288 111 52 chr5 28064436 28064630 -124472629 - MLT1B LTR MaLR 0 374 167 1 799 523 264 89 42 chr5 28064850 28065034 -124472225 + RLTR20B1 LTR ERVK 376 554 -9 1 799 277 238 111 12 chr5 28065081 28065162 -124472097 - MLT1D LTR MaLR -44 461 373 1 799 2668 196 77 53 chr5 28071851 28072512 -124464747 - RLTR40 LTR ERVK -1 816 140 1 799 790 241 21 103 chr5 28072516 28072798 -124464461 + MYSERV-int LTR ERVK 4284 4542 -2008 1 799 387 160 112 41 chr5 28072804 28072902 -124464357 + MYSERV6-int LTR ERVK 8007 8111 -848 1 799 2058 123 16 3 chr5 28072902 28073219 -124464040 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 1 799 2615 188 84 19 chr5 28073221 28073861 -124463398 + MYSERV6-int LTR ERVK 8105 8786 -173 1 799 447 228 108 0 chr5 28073845 28074003 -124463256 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2151 2325 -1 1 799 1977 110 86 30 chr5 28074004 28074342 -124462917 + RLTR15 LTR ERVK 3 359 0 1 799 1917 198 79 35 chr5 28075565 28075948 -124461311 + MTC LTR MaLR 1 408 -13 1 799 6502 50 20 8 chr5 28075948 28076746 -124460513 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 1 799 1917 198 79 35 chr5 28076746 28076765 -124460494 + MTC LTR MaLR 409 421 0 1 799 2923 157 48 22 chr5 28087470 28088017 -124449242 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 1 799 708 293 176 40 chr5 28099653 28099977 -124437282 + MTE2b LTR MaLR 1 368 -11 1 799 897 220 258 62 chr5 28101351 28101739 -124435520 + MT2A LTR ERVL 1 464 -69 1 799 1402 184 89 47 chr5 28104842 28105201 -124432058 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 799 2420 205 90 14 chr5 28112368 28112936 -124424323 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 2 799 717 163 66 122 chr5 28112949 28113085 -124424174 + ORR1C1 LTR MaLR 3 127 -251 2 799 717 163 66 122 chr5 28113226 28113285 -124423974 + ORR1C1 LTR MaLR 128 187 -191 2 799 673 206 97 39 chr5 28113278 28113480 -124423779 + RLTR12B LTR ERVK 61 262 -266 2 799 321 272 134 16 chr5 28113645 28113839 -124423420 + RLTR12B LTR ERVK 293 509 -19 2 799 885 297 114 16 chr5 28122173 28122488 -124414771 - ORR1E LTR MaLR -9 350 5 2 799 281 301 109 14 chr5 28122733 28122871 -124414388 - MER66-int LTR ERV1 0 6676 6526 2 799 4884 112 54 1 chr5 28122890 28123590 -124413669 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 799 589 256 41 82 chr5 28125326 28125594 -124411665 - RMER5 LTR ERV1 -54 480 224 2 799 1769 152 149 3 chr5 28126984 28127339 -124409920 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 799 2040 131 25 0 chr5 28130617 28130938 -124406321 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 799 2847 132 85 14 chr5 28135798 28136290 -124400969 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 2 799 708 181 64 114 chr5 28143748 28144029 -124393230 - RMER17C LTR ERVK -62 348 82 2 799 477 88 54 21 chr5 28145581 28145674 -124391585 - RMER6A LTR ERVK -621 135 40 2 799 1801 202 150 53 chr5 28145948 28146092 -124391167 + RMER6C LTR ERVK 1 135 -555 2 799 1801 202 150 53 chr5 28146283 28146765 -124390494 + RMER6C LTR ERVK 136 687 -3 2 799 2500 186 98 92 chr5 28146833 28147520 -124389739 + RMER6-int LTR ERVK 35 725 -2452 2 799 1298 184 14 99 chr5 28149316 28149663 -124387596 + ORR1B1 LTR MaLR 4 357 -37 2 799 1680 169 9 63 chr5 28151939 28152286 -124384973 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 2 799 913 215 75 0 chr5 28152359 28152573 -124384686 + MTC LTR MaLR 22 251 -170 2 799 4618 194 55 16 chr5 28152573 28153469 -124383790 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1638 2568 -3193 2 799 615 183 33 16 chr5 28153463 28153585 -124383674 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3066 2695 2572 2 799 2243 215 106 78 chr5 28153599 28153984 -124383275 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4936 5346 -415 2 799 2243 215 106 78 chr5 28154125 28154467 -124382792 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5347 5683 -78 2 799 362 155 23 35 chr5 28154467 28154554 -124382705 + ORR1A4-int LTR MaLR 552 637 -1326 2 799 273 103 0 0 chr5 28154556 28154595 -124382664 + MERVL-int LTR ERVL 5447 5485 0 2 799 338 151 108 14 chr5 28156066 28156140 -124381119 + MT2B LTR ERVL 45 125 -476 2 799 279 209 30 0 chr5 28157779 28157846 -124379413 + ORR1E LTR MaLR 3 71 -288 2 799 677 272 0 0 chr5 28157892 28158039 -124379220 - MTE2a LTR MaLR -21 358 212 2 799 505 235 13 183 chr5 28158135 28158359 -124378900 - MTE2a LTR MaLR -184 195 10 2 799 250 188 78 0 chr5 28159222 28159286 -124377973 - MTE2b LTR MaLR 0 379 311 2 799 698 167 179 51 chr5 28159287 28159483 -124377776 + ORR1B1 LTR MaLR 1 287 -107 2 799 6320 141 49 76 chr5 28159515 28160897 -124376362 + ORR1B1-int LTR MaLR 619 1963 0 2 799 1915 134 33 55 chr5 28160904 28161266 -124375993 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 799 672 264 14 0 chr5 28161266 28161414 -124375845 - MTE2b LTR MaLR -65 314 165 2 799 679 230 2 178 chr5 28161585 28161807 -124375452 - MTE2b LTR MaLR -208 211 1 3 799 287 219 0 15 chr5 28162091 28162156 -124375103 - MLT1A LTR MaLR 0 408 345 3 799 381 284 34 41 chr5 28162539 28162686 -124374573 - MLT1A LTR MaLR -225 149 4 3 799 1010 236 80 104 chr5 28164637 28165011 -124372248 - MTE2b LTR MaLR -14 365 1 3 799 1056 252 122 9 chr5 28174519 28174855 -124362404 + MTD LTR MaLR 16 389 -30 3 799 883 269 162 9 chr5 28175989 28176299 -124360960 - MTEa LTR MaLR -2 377 45 3 799 1041 259 15 158 chr5 28176325 28176566 -124360693 - MTD LTR MaLR -14 405 213 3 799 1041 257 15 166 chr5 28176759 28177001 -124360258 - MTD LTR MaLR -207 212 6 3 800 778 224 63 187 chr5 28183054 28183111 -124354148 + MTE2a LTR MaLR 1 46 -333 3 800 778 224 63 187 chr5 28183300 28183587 -124353672 + MTE2a LTR MaLR 47 304 -75 3 800 3236 48 5 12 chr5 28190143 28190542 -124346717 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 800 268 211 32 135 chr5 28201232 28201358 -124335901 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 3 800 2802 87 71 12 chr5 28202593 28202999 -124334260 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 3 800 364 281 44 52 chr5 28206123 28206258 -124331001 + MLT1A1 LTR MaLR 270 403 -5 3 800 2135 207 107 30 chr5 28206455 28206987 -124330272 - RLTR20B3 LTR ERVK -4 573 1 3 800 5931 80 5 83 chr5 28208482 28209407 -124327852 - MTB-int LTR MaLR -245 853 1 3 800 330 49 0 0 chr5 28209407 28209448 -124327811 - MTB LTR MaLR 0 400 360 3 800 275 218 49 49 chr5 28209443 28209525 -124327734 - RLTR9A LTR ERVK -286 82 1 3 800 3030 142 75 1 chr5 28209525 28210249 -124327010 - MERVL_2A-int LTR ERVL -754 5007 4231 3 800 11156 159 45 30 chr5 28210921 28211805 -124325454 - MERVL-int LTR ERVL -3431 2054 1142 3 800 11156 159 45 30 chr5 28211969 28213101 -124324158 - MERVL-int LTR ERVL -4344 1141 7 3 800 1970 168 72 22 chr5 28213101 28213526 -124323733 - MT2B LTR ERVL -12 589 1 3 800 2080 168 31 8 chr5 28214292 28214677 -124322582 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 800 1088 287 80 6 chr5 28215638 28215950 -124321309 + ORR1D2 LTR MaLR 1 335 -35 3 800 802 306 53 35 chr5 28217842 28218184 -124319075 + RodERV21-int LTR ERV1 806 1153 -3838 4 800 250 245 0 0 chr5 28218673 28218726 -124318533 + MLT1A1 LTR MaLR 299 351 -57 4 800 1724 185 42 32 chr5 28218896 28219210 -124318049 - MTC LTR MaLR 0 421 74 4 800 657 307 48 85 chr5 28219355 28219392 -124317867 - MTC LTR MaLR -306 73 41 4 800 405 309 68 58 chr5 28221298 28221504 -124315755 - MLT1N2 LTR MaLR -352 210 3 4 800 340 240 116 65 chr5 28223444 28223582 -124313677 - MLT1F2 LTR MaLR -415 145 1 4 800 2461 104 8 5 chr5 28229453 28229838 -124307421 + LTRIS4 LTR ERV1 122 507 0 4 800 423 244 9 9 chr5 28231108 28231224 -124306035 + MLT1A1 LTR MaLR 291 406 -2 4 800 752 219 51 5 chr5 28242755 28242952 -124294307 - MTEb LTR MaLR -5 374 169 4 800 1116 194 149 26 chr5 28243194 28243544 -124293715 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 4 800 456 297 136 22 chr5 28245188 28245453 -124291806 - RMER20B LTR ERVK -142 485 168 4 800 1851 189 35 33 chr5 28247835 28248234 -124289025 + MTB_Mm LTR MaLR 1 400 -7 4 800 944 157 6 0 chr5 28255545 28255711 -124281548 - RMER16 LTR ERVK 0 533 367 4 800 508 144 20 10 chr5 28255711 28255809 -124281450 - RMER16 LTR ERVK -434 99 1 4 800 239 262 57 100 chr5 28256932 28257072 -124280187 - RLTR41 LTR ERV1 -62 384 251 4 800 440 323 0 0 chr5 28258845 28258975 -124278284 + MTE2b LTR MaLR 20 149 -230 4 800 830 243 69 124 chr5 28260337 28260699 -124276560 - MTE2b LTR MaLR -2 377 36 4 800 2055 134 86 3 chr5 28264434 28264785 -124272474 + RLTR14 LTR ERV1 1 380 -2 4 800 1758 212 64 2 chr5 28266432 28266825 -124270434 + MTD LTR MaLR 3 419 0 4 800 5463 111 47 8 chr5 28270514 28271366 -124265893 + RMER17D LTR ERVK 3 887 -2 5 800 1673 215 66 5 chr5 28289871 28290263 -124246996 + MTD LTR MaLR 3 418 -1 5 800 935 306 36 22 chr5 28303922 28304286 -124232973 + RodERV21-int LTR ERV1 4425 4793 -198 5 12 854 259 122 62 chr5 28311315 28311734 -124225525 - RLTR31_Mur LTR ERVK -7 546 103 5 801 4496 16 0 0 chr5 28311734 28312227 -124225032 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 801 321 0 0 0 chr5 28312227 28312265 -124224994 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 5 801 362 167 46 35 chr5 28312265 28312352 -124224907 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 5 801 12787 26 1 0 chr5 28312352 28313787 -124223472 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 3925 5 801 32314 10 0 5 chr5 28313779 28317320 -124219939 - MERVL-int LTR ERVL -1962 3523 1 5 801 4525 14 0 0 chr5 28317320 28317813 -124219446 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 801 558 241 173 26 chr5 28322772 28322998 -124214261 + RMER5 LTR ERV1 229 487 -47 5 801 242 328 53 8 chr5 28323416 28323548 -124213711 - RMER15 LTR ERVL -14 561 424 5 801 372 177 30 30 chr5 28323530 28323629 -124213630 - ORR1D2 LTR MaLR -235 139 41 5 801 924 233 60 82 chr5 28323914 28324232 -124213027 - MTE2a LTR MaLR -17 362 52 5 801 445 102 227 0 chr5 28325402 28325490 -124211769 + MTB_Mm LTR MaLR 3 110 -297 5 801 1972 86 3 35 chr5 28327955 28328268 -124208991 + MTB LTR MaLR 98 400 0 5 801 641 256 37 131 chr5 28330263 28330560 -124206699 + MTE2a LTR MaLR 20 288 -91 5 801 1618 211 59 18 chr5 28333382 28333719 -124203540 - MTE2b LTR MaLR -13 366 16 5 801 687 321 81 76 chr5 28336349 28336878 -124200381 - RMER5 LTR ERV1 0 534 3 5 801 322 290 0 98 chr5 28337343 28337496 -124199763 - MLT1C LTR MaLR -270 197 60 5 801 311 111 74 0 chr5 28340848 28340902 -124196357 - RMER6C LTR ERVK -429 261 204 5 801 1617 143 181 12 chr5 28341442 28341501 -124195758 + RMER6C LTR ERVK 310 397 -293 5 801 1617 143 181 12 chr5 28341539 28341805 -124195454 + RMER6C LTR ERVK 398 690 0 5 801 2227 171 23 10 chr5 28345048 28345437 -124191822 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 801 343 176 0 68 chr5 28345837 28345910 -124191349 - RMER21A LTR ERV1 -485 462 395 5 801 1575 187 119 117 chr5 28345919 28345949 -124191310 - RMER21A LTR ERV1 -450 497 459 5 801 2496 94 15 3 chr5 28345949 28346289 -124190970 - ORR1A1 LTR MaLR -2 344 1 5 801 1575 187 119 117 chr5 28346289 28346754 -124190505 - RMER21A LTR ERV1 -489 458 1 5 801 476 330 21 21 chr5 28349365 28349551 -124187708 + MLT1J LTR MaLR 23 208 -304 6 801 983 249 38 151 chr5 28358636 28359012 -124178247 - MTEa LTR MaLR 0 379 48 6 801 983 249 38 151 chr5 28359158 28359206 -124178053 - MTEa LTR MaLR -332 47 3 6 801 4600 191 15 40 chr5 28359704 28360631 -124176628 - RMER13B LTR ERVK -4 904 1 6 801 2375 143 11 0 chr5 28361282 28361645 -124175614 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 801 316 327 9 37 chr5 28362759 28362867 -124174392 + MLT1C LTR MaLR 1 105 -362 6 801 709 298 62 41 chr5 28366010 28366301 -124170958 + MLT1A LTR MaLR 49 345 -29 6 801 2857 80 3 3 chr5 28371816 28372190 -124165069 + RLTR13D5 LTR ERVK 3 376 -647 6 801 640 201 48 52 chr5 28373847 28374022 -124163237 - MTEb LTR MaLR -162 217 48 6 801 245 264 48 117 chr5 28377759 28377862 -124159397 - MLT1A1 LTR MaLR -310 98 3 6 801 868 258 157 56 chr5 28381504 28381841 -124155418 + MTEa LTR MaLR 2 372 -7 6 801 1128 294 63 60 chr5 28384204 28384360 -124152899 + MTEa LTR MaLR 1 155 -224 6 801 3061 26 3 0 chr5 28384360 28384705 -124152554 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 801 14422 47 12 1 chr5 28384705 28386478 -124150781 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 6 801 3061 26 3 0 chr5 28386478 28386823 -124150436 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 801 1128 294 63 60 chr5 28386823 28387029 -124150230 + MTEa LTR MaLR 156 364 -15 6 801 1558 177 119 29 chr5 28388241 28388404 -124148855 + ORR1D1 LTR MaLR 1 156 -218 6 801 1558 177 119 29 chr5 28388441 28388620 -124148639 + ORR1D1 LTR MaLR 157 374 0 6 801 344 310 87 105 chr5 28391662 28391994 -124145265 + MLT1D LTR MaLR 55 380 -125 6 801 248 297 0 15 chr5 28392570 28392635 -124144624 - MLT1C LTR MaLR -344 123 60 6 801 313 356 22 0 chr5 28393697 28393832 -124143427 - RMER15 LTR ERVL -16 559 422 6 801 469 308 90 69 chr5 28406829 28407048 -124130211 + MLT1C LTR MaLR 3 222 -245 6 801 1604 139 174 25 chr5 28407048 28407365 -124129894 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 4 6 801 469 308 90 69 chr5 28407365 28407522 -124129737 + MLT1C LTR MaLR 223 387 -80 6 801 2061 192 32 25 chr5 28408279 28408700 -124128559 + RLTR11A LTR ERVK 101 485 -43 6 801 2061 184 32 22 chr5 28408810 28408834 -124128425 + RLTR11A LTR ERVK 497 519 -9 6 801 1268 257 76 39 chr5 28411904 28412260 -124124999 + MTEa LTR MaLR 6 374 -5 6 801 906 308 160 6 chr5 28415420 28415770 -124121489 + MTD LTR MaLR 2 405 -14 7 801 772 251 142 15 chr5 28418038 28418305 -124118954 + MLT1B LTR MaLR 27 327 -63 7 801 1783 141 20 93 chr5 28418922 28418988 -124118271 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 349 7 801 1783 141 20 93 chr5 28419181 28419459 -124117800 - ORR1B1 LTR MaLR -46 348 75 7 801 228 370 96 12 chr5 28421493 28421660 -124115599 + MLT1B LTR MaLR 278 458 -9 7 801 2826 108 34 47 chr5 28426667 28427135 -124110124 + RMER4A LTR ERVK 5 466 0 7 801 28507 136 49 34 chr5 28427135 28427320 -124109939 + MurERV4-int LTR ERVK 1 207 -5053 7 801 28507 136 49 34 chr5 28427439 28428231 -124109028 + MurERV4-int LTR ERVK 208 1079 -4181 7 801 28507 136 49 34 chr5 28428412 28432518 -124104741 + MurERV4-int LTR ERVK 1080 5255 -5 7 801 2262 129 119 19 chr5 28432526 28432946 -124104313 + RMER4A LTR ERVK 1 462 -4 7 801 2441 256 52 90 chr5 28433789 28434831 -124102428 + RMER17B LTR ERVK 5 899 -9 7 801 342 210 48 61 chr5 28441283 28441430 -124095829 + RMER17A LTR ERVK 327 471 -280 7 802 937 211 147 21 chr5 28453454 28453739 -124083520 + MTEa LTR MaLR 29 349 -30 7 802 618 283 91 0 chr5 28464087 28464306 -124072953 + MER73 LTR ERVL 315 553 -91 7 802 350 231 113 45 chr5 28464461 28464624 -124072635 + MLT2B1 LTR ERVL 359 523 -33 7 802 2339 155 85 0 chr5 28466007 28466395 -124070864 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 802 849 247 90 73 chr5 28467329 28467683 -124069576 + MTE2a LTR MaLR 1 360 -19 7 802 1420 236 69 31 chr5 28467691 28468080 -124069179 - MTD LTR MaLR -15 404 1 7 802 314 351 72 41 chr5 28472567 28472952 -124064307 + MLT2B1 LTR ERVL 10 503 -64 7 802 227 182 0 0 chr5 28473013 28473057 -124064202 + MLT2B1 LTR ERVL 513 556 -4 7 802 1096 118 16 0 chr5 28473683 28473869 -124063390 - RLTR15 LTR ERVK -170 189 1 7 802 967 271 84 7 chr5 28475859 28476134 -124061125 - MTD LTR MaLR -122 297 2 7 802 463 345 193 35 chr5 28476904 28477298 -124059961 + MT2A LTR ERVL 1 456 -77 7 802 359 250 61 20 chr5 28479535 28479633 -124057626 + MLT1D LTR MaLR 6 107 -398 7 802 1242 184 262 15 chr5 28509843 28510158 -124027101 - MTD LTR MaLR 0 419 21 1 802 1242 184 262 15 chr5 28510184 28510204 -124027055 - MTD LTR MaLR -399 20 1 1 802 2812 172 132 10 chr5 28514637 28515431 -124021828 - RMER19B LTR ERVK -11 891 1 2 802 2066 181 54 32 chr5 28519584 28520143 -124017116 - RMER4A LTR ERVK 0 585 4 3 802 495 254 146 71 chr5 28542245 28542373 -123994886 + MLT1B LTR MaLR 52 179 -211 5 802 495 254 146 71 chr5 28542489 28542669 -123994590 + MLT1B LTR MaLR 180 383 -7 5 802 225 233 31 62 chr5 28542738 28542802 -123994457 - MER57C2 LTR ERV1 -356 78 17 5 802 532 200 44 3 chr5 28546419 28546553 -123990706 - MTC-int LTR MaLR -862 396 304 6 802 1781 226 50 3 chr5 28546653 28547012 -123990247 + MTD LTR MaLR 32 407 -12 6 802 329 333 104 58 chr5 28555707 28556016 -123981243 + MLT1C LTR MaLR 79 401 -66 7 802 3014 154 58 26 chr5 28557869 28558434 -123978825 - RMER4B LTR ERVK -2 583 1 7 802 1686 190 126 13 chr5 28561122 28561496 -123975763 - MTD LTR MaLR 0 419 4 8 802 231 287 51 134 chr5 28563203 28563360 -123973899 - RLTR25A LTR ERVK -439 664 521 9 803 512 290 115 62 chr5 28577213 28577518 -123959741 - MLT1B LTR MaLR -69 321 1 1 803 325 286 34 45 chr5 28577850 28577938 -123959321 - MLT1L LTR MaLR -473 137 51 1 803 845 195 61 31 chr5 28580193 28580389 -123956870 + ORR1D2 LTR MaLR 162 363 -7 1 803 2727 110 36 23 chr5 28582180 28582619 -123954640 + BGLII_A LTR ERVK 1 445 0 1 803 339 336 56 28 chr5 28590371 28590515 -123946744 + MLT1J LTR MaLR 361 508 -4 1 803 1154 251 52 67 chr5 28590836 28591238 -123946021 - MTC LTR MaLR -8 413 18 1 803 2048 134 70 68 chr5 28592333 28592716 -123944543 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 803 258 301 94 94 chr5 28594063 28594243 -123943016 + MER77 LTR ERVL 405 584 -23 1 803 226 299 166 55 chr5 28594127 28594290 -123942969 + MER21B LTR ERV1 420 600 -263 1 803 1140 235 80 53 chr5 28596294 28596638 -123940621 + ORR1E LTR MaLR 3 379 0 1 803 2301 131 49 0 chr5 28597783 28597978 -123939281 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 175 1 803 2301 131 49 0 chr5 28598005 28598175 -123939084 - ORR1C2 LTR MaLR -210 174 2 1 803 362 235 30 190 chr5 28599297 28599525 -123937734 - RMER4B LTR ERVK -139 763 339 1 803 766 202 132 11 chr5 28599743 28599933 -123937326 - RMER4B LTR ERVK -338 247 35 1 803 1854 150 18 92 chr5 28604070 28604504 -123932755 - RMER17C LTR ERVK 0 410 9 1 803 660 308 97 26 chr5 28605009 28605432 -123931827 + MER89 LTR ERV1 48 500 -59 1 803 1984 138 79 66 chr5 28606658 28607039 -123930220 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 7 1 803 2462 101 8 11 chr5 28608663 28609023 -123928236 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 803 2243 151 29 8 chr5 28610685 28611059 -123926200 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 1 803 421 289 43 48 chr5 28615784 28615991 -123921268 + MLT1A0 LTR MaLR 142 347 -18 1 803 1497 185 198 6 chr5 28617626 28617974 -123919285 - MTD LTR MaLR 0 419 5 1 803 410 258 81 16 chr5 28618643 28618828 -123918431 - RMER15 LTR ERVL -71 504 308 1 803 988 247 200 37 chr5 28619095 28619554 -123917705 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 1 803 1648 219 58 23 chr5 28622534 28622931 -123914328 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 803 683 285 16 0 chr5 28623257 28623443 -123913816 + MLT1A1 LTR MaLR 218 406 -2 2 803 4293 35 0 2 chr5 28629877 28630371 -123906888 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 803 1975 138 125 3 chr5 28631224 28631551 -123905708 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 803 323 265 179 0 chr5 28633696 28633813 -123903446 - MTEa LTR MaLR -219 160 23 2 803 3295 46 5 2 chr5 28636592 28636987 -123900272 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 803 1279 138 21 9 chr5 28637341 28637574 -123899685 + RMER4B LTR ERVK 12 247 -338 2 803 498 205 285 42 chr5 28637804 28637996 -123899263 + RMER4B LTR ERVK 345 585 0 2 803 2124 111 12 0 chr5 28638001 28638333 -123898926 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 249 2 803 747 288 50 63 chr5 28638851 28639151 -123898108 - ORR1E LTR MaLR -63 296 1 2 803 292 205 53 64 chr5 28641171 28641265 -123895994 - ORR1D2 LTR MaLR -53 317 225 2 803 324 98 0 38 chr5 28641653 28641706 -123895553 - RLTR14 LTR ERV1 -45 337 287 2 803 328 310 183 39 chr5 28641930 28641999 -123895260 + LTR87 LTR ERVL? 268 344 -280 2 803 328 310 183 39 chr5 28642141 28642383 -123894876 + LTR87 LTR ERVL? 345 624 0 2 803 2271 154 111 30 chr5 28645353 28645874 -123891385 - RMER6A LTR ERVK -133 623 61 2 803 2271 154 111 30 chr5 28645908 28645961 -123891298 - RMER6A LTR ERVK -696 60 4 2 803 767 224 194 22 chr5 28649488 28649810 -123887449 - MTD LTR MaLR -9 398 1 2 803 359 252 32 32 chr5 28651885 28652008 -123885251 - MLT1C LTR MaLR -303 164 42 2 803 242 326 157 20 chr5 28652047 28652194 -123885065 + MER21B LTR ERV1 25 191 -672 2 803 326 230 57 69 chr5 28653987 28654146 -123883113 - MLT1B LTR MaLR -166 224 68 2 803 1848 162 101 20 chr5 28655475 28655524 -123881735 - RMER15 LTR ERVL 0 575 532 2 803 1848 162 101 20 chr5 28655607 28655954 -123881305 - RMER15 LTR ERVL -44 531 147 2 803 2967 83 13 2 chr5 28659372 28659768 -123877491 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 803 3050 23 0 0 chr5 28672466 28672812 -123864447 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 803 235 230 63 63 chr5 28679677 28679756 -123857503 - RLTR13B4 LTR ERVK -517 286 208 3 803 1286 200 134 26 chr5 28680397 28680710 -123856549 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 28 3 803 3916 165 72 89 chr5 28689378 28690268 -123846991 + RMER19B LTR ERVK 1 875 -27 3 803 339 245 215 36 chr5 28693632 28693827 -123843432 - MLT1B LTR MaLR -105 285 56 3 803 854 176 138 18 chr5 28696252 28696469 -123840790 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 127 3 803 2538 158 115 15 chr5 28697093 28697614 -123839645 - RMER15 LTR ERVL -2 573 1 3 804 922 243 39 5 chr5 28709984 28710187 -123827072 + MTD LTR MaLR 2 211 -208 3 804 312 225 42 0 chr5 28710200 28710271 -123826988 + MTD LTR MaLR 346 419 0 3 804 3069 176 82 9 chr5 28713466 28714137 -123823122 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 3 804 269 279 85 85 chr5 28727130 28727271 -123809988 - RMER15 LTR ERVL -13 562 422 3 804 245 309 176 66 chr5 28733535 28733837 -123803422 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 58 3 804 231 293 16 65 chr5 28748720 28748844 -123788415 - MTEb LTR MaLR -24 355 238 3 804 1031 303 171 28 chr5 28749070 28749718 -123787541 - MTE-int LTR MaLR -97 1483 743 3 804 424 309 172 25 chr5 28750404 28750722 -123786537 - MTEa LTR MaLR -12 367 1 3 804 384 326 68 0 chr5 28750722 28750853 -123786406 - MLT1C LTR MaLR -7 460 321 3 804 281 204 78 22 chr5 28750853 28750943 -123786316 - RMER15 LTR ERVL 0 575 481 4 804 1092 167 270 7 chr5 28750956 28751104 -123786155 + MTD LTR MaLR 18 210 -209 4 804 1092 167 270 7 chr5 28751416 28751573 -123785686 + MTD LTR MaLR 211 404 -15 4 804 791 145 168 32 chr5 28751581 28751766 -123785493 - RMER15 LTR ERVL -86 489 280 4 804 292 297 59 0 chr5 28751959 28752077 -123785182 - MTE2b LTR MaLR -5 374 250 4 804 3148 140 23 28 chr5 28752951 28753185 -123784074 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 331 4 804 3185 68 2 2 chr5 28753185 28753583 -123783676 - MTB LTR MaLR -2 398 1 4 804 3148 140 23 28 chr5 28753583 28753915 -123783344 - RLTR12A LTR ERVK -238 330 1 4 804 11647 127 50 29 chr5 28754666 28755765 -123781494 - RMER16-int LTR ERVK -1547 3859 2756 4 804 11647 127 50 29 chr5 28756365 28757229 -123780030 - RMER16-int LTR ERVK -2651 2755 1853 4 804 5513 219 69 68 chr5 28763605 28765473 -123771786 - ETnERV2-int LTR ERVK -4483 2923 1053 4 804 262 244 69 118 chr5 28765642 28765846 -123771413 - ETnERV2-int LTR ERVK -3117 197 4 4 804 501 235 64 127 chr5 28765848 28766131 -123771128 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 104 4 804 2178 101 9 0 chr5 28774529 28774845 -123762414 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 804 407 207 34 74 chr5 28777412 28777635 -123759624 + MTD LTR MaLR 142 419 0 4 804 412 85 17 0 chr5 28778143 28778202 -123759057 - RLTR17 LTR ERVK -317 375 316 4 804 3778 155 48 12 chr5 28779650 28780318 -123756941 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 4 804 1417 234 76 10 chr5 28798206 28798599 -123738660 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 804 981 273 106 20 chr5 28800523 28800848 -123736411 - MTE2b LTR MaLR 0 379 53 4 804 1564 205 80 23 chr5 28807218 28807568 -123729691 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 804 1733 219 66 8 chr5 28809537 28809915 -123727344 - MTD LTR MaLR -5 414 15 4 804 245 297 109 72 chr5 28819837 28819975 -123717284 + LTR16C LTR ERVL 119 261 -228 4 804 252 343 121 28 chr5 28823076 28823325 -123713934 - ORR1E LTR MaLR 0 359 88 4 804 2311 133 62 19 chr5 28831259 28831368 -123705891 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 281 4 804 2428 96 16 0 chr5 28831368 28831690 -123705569 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 804 2311 133 62 19 chr5 28831690 28831948 -123705311 - ORR1C2 LTR MaLR -104 280 1 4 804 299 336 53 38 chr5 28832574 28832707 -123704552 + RMER15 LTR ERVL 336 470 -105 4 804 1389 241 26 56 chr5 28832735 28833019 -123704240 + MTE2a LTR MaLR 7 280 -99 4 804 2318 96 12 24 chr5 28833019 28833350 -123703909 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 804 1250 241 26 56 chr5 28833350 28833443 -123703816 + MTE2a LTR MaLR 281 373 -6 4 804 1381 251 39 6 chr5 28833449 28833805 -123703454 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 4 805 1411 236 19 6 chr5 28853951 28854267 -123682992 + MTD LTR MaLR 1 320 -99 5 805 1277 223 7 14 chr5 28854275 28854557 -123682702 + MTD LTR MaLR 104 383 -36 5 805 748 210 100 45 chr5 28854569 28854812 -123682447 + MTD LTR MaLR 95 348 -73 5 805 613 234 46 20 chr5 28854848 28855044 -123682215 - MLT1B LTR MaLR -168 222 22 5 805 230 118 19 19 chr5 28861698 28861750 -123675509 - RMER19A LTR ERVK -2 735 684 5 805 3187 169 81 39 chr5 28862503 28863168 -123674091 - RMER19A LTR ERVK -44 693 1 5 805 787 270 129 30 chr5 28863459 28863888 -123673371 + RLTR17 LTR ERVK 60 566 -126 5 805 3306 36 8 0 chr5 28874471 28874860 -123662399 + MTA_Mm LTR MaLR 1 392 -4 5 805 8659 53 7 20 chr5 28874860 28875971 -123661288 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 805 3431 35 2 2 chr5 28875971 28876367 -123660892 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 805 512 257 103 58 chr5 28878355 28878578 -123658681 + MTD LTR MaLR 1 233 -186 5 805 478 221 16 32 chr5 28878713 28878839 -123658420 + MTD LTR MaLR 282 405 -14 5 805 847 266 158 108 chr5 28883267 28883745 -123653514 - MT2A LTR ERVL 0 520 11 5 805 2577 167 34 38 chr5 28886711 28887190 -123650069 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 38 5 805 2577 167 34 38 chr5 28887238 28887287 -123649972 - RLTR11A2 LTR ERVK -490 37 1 5 805 355 286 64 54 chr5 28887526 28887721 -123649538 + MTEb LTR MaLR 121 342 -37 5 805 556 258 77 52 chr5 28892214 28892447 -123644812 + ORR1E LTR MaLR 104 342 -17 5 805 373 273 91 0 chr5 28895663 28895773 -123641486 + MTE-int LTR MaLR 827 946 -634 5 805 247 239 0 56 chr5 28896734 28896805 -123640454 - MTEb LTR MaLR -8 371 305 5 805 1775 114 15 71 chr5 28898944 28899284 -123637975 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 5 805 991 206 5 0 chr5 28904466 28904670 -123632589 + MTD LTR MaLR 1 205 -214 5 805 863 186 75 9 chr5 28912609 28912821 -123624438 + MTD LTR MaLR 194 419 0 5 805 512 284 59 15 chr5 28921898 28922102 -123615157 - MLT1B LTR MaLR -93 297 85 5 805 817 125 0 0 chr5 28928199 28928319 -123608940 - BGLII_B LTR ERVK -321 120 1 5 805 616 144 18 9 chr5 28939293 28939405 -123597854 - MTD LTR MaLR -16 403 291 6 805 649 286 70 5 chr5 28939637 28939823 -123597436 - MTD LTR MaLR -221 198 1 6 805 413 256 50 28 chr5 28940604 28940745 -123596514 - MTEa LTR MaLR -2 377 234 6 805 1607 304 83 53 chr5 28943787 28944489 -123592770 - MTE-int LTR MaLR -34 1546 824 6 805 2452 304 92 37 chr5 28945570 28946173 -123591086 - RMER15-int LTR ERVL -3027 1972 1335 6 805 2452 304 92 37 chr5 28946410 28946793 -123590466 - RMER15-int LTR ERVL -3665 1334 938 6 805 2452 270 274 27 chr5 28946995 28947286 -123589973 - RMER15-int LTR ERVL -4062 937 568 6 805 309 358 51 0 chr5 28947447 28947584 -123589675 - RMER15-int LTR ERVL -4832 167 24 6 805 482 371 9 9 chr5 28947654 28947866 -123589393 - RMER15 LTR ERVL -48 527 316 6 806 247 289 110 30 chr5 28966994 28967094 -123570165 + ORR1E LTR MaLR 35 142 -217 6 806 873 245 69 136 chr5 28971684 28971726 -123565533 + MTE2a LTR MaLR 1 40 -339 6 806 1611 194 73 35 chr5 28971726 28972094 -123565165 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 6 806 873 245 69 136 chr5 28972094 28972457 -123564802 + MTE2a LTR MaLR 41 379 0 6 806 465 225 8 62 chr5 28976252 28976380 -123560879 + MTD LTR MaLR 1 121 -298 6 806 922 265 50 39 chr5 29001569 29001907 -123535352 + RLTR15 LTR ERVK 1 342 -17 5 806 497 285 64 54 chr5 29006707 29006911 -123530348 - MLT1B LTR MaLR -91 299 94 1 806 2739 59 3 11 chr5 29010729 29011088 -123526171 - MTA_Mm LTR MaLR -40 356 1 1 806 316 303 48 16 chr5 29014536 29014660 -123522599 - RMER15 LTR ERVL -156 419 292 1 806 234 254 189 91 chr5 29014694 29014837 -123522422 - RMER15 LTR ERVL -418 157 1 1 806 3593 193 64 80 chr5 29021322 29022277 -123514982 + RMER19B LTR ERVK 16 902 0 2 806 1280 246 71 23 chr5 29024532 29024885 -123512374 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 806 337 222 9 66 chr5 29029171 29029277 -123507982 + MLT1A1 LTR MaLR 309 408 0 3 806 940 250 93 53 chr5 29030083 29030438 -123506821 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 3 806 800 285 47 0 chr5 29044031 29044224 -123493035 + MTE2a LTR MaLR 1 202 -177 5 806 373 222 90 10 chr5 29045994 29046094 -123491165 + MLT1C LTR MaLR 1 108 -359 5 806 2816 132 39 4 chr5 29060246 29060739 -123476520 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 1 8 806 303 246 42 43 chr5 29062760 29062866 -123474393 - MLT1A1 LTR MaLR -17 450 304 8 806 318 338 137 55 chr5 29063273 29063639 -123473620 - MLT-int LTR MaLR -739 996 601 8 806 258 313 60 76 chr5 29063670 29063919 -123473340 - ORR1E LTR MaLR -20 339 95 8 806 387 279 0 0 chr5 29064579 29064683 -123472576 - MLT1A1 LTR MaLR -9 399 296 8 806 3170 164 124 63 chr5 29069869 29070003 -123467256 + RMER19A LTR ERVK 1 142 -595 9 806 3170 164 124 63 chr5 29070150 29070710 -123466549 + RMER19A LTR ERVK 143 737 0 9 806 3976 91 147 41 chr5 29072707 29073021 -123464238 + RMER17A LTR ERVK 1 320 -431 1 806 3976 91 147 41 chr5 29073170 29073534 -123463725 + RMER17A LTR ERVK 321 751 0 1 806 232 167 0 69 chr5 29073937 29073995 -123463264 - ORR1D2 LTR MaLR -4 370 317 1 806 1241 216 87 14 chr5 29074080 29074367 -123462892 - ORR1D2 LTR MaLR -62 308 1 1 806 538 311 104 68 chr5 29076107 29076414 -123460845 + MLT1A LTR MaLR 4 321 -53 1 806 550 231 21 7 chr5 29077029 29077173 -123460086 + RLTR15 LTR ERVK 1 146 -213 1 806 1133 139 5 69 chr5 29080274 29080491 -123456768 + RLTR15 LTR ERVK 157 359 0 1 806 3741 154 212 25 chr5 29085466 29086095 -123451164 + RMER19B LTR ERVK 1 755 -147 1 806 3741 154 212 25 chr5 29086144 29086274 -123450985 + RMER19B LTR ERVK 756 901 -1 1 806 481 252 8 0 chr5 29088768 29088887 -123448372 + MTC-int LTR MaLR 318 437 -821 1 806 276 208 80 16 chr5 29096132 29096244 -123441015 - MTC LTR MaLR -293 126 6 1 806 279 303 14 138 chr5 29096707 29096845 -123440414 - MTEa LTR MaLR -258 121 1 1 807 585 208 175 30 chr5 29100739 29100932 -123436327 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 174 1 807 769 214 45 34 chr5 29101022 29101201 -123436058 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 1 1 807 868 280 67 41 chr5 29104387 29104778 -123432481 - MTD LTR MaLR -14 405 5 1 807 287 312 43 73 chr5 29105298 29105530 -123431729 + RMER15 LTR ERVL 1 225 -350 1 807 798 238 35 0 chr5 29105547 29105749 -123431510 + RMER15 LTR ERVL 326 534 -41 1 807 417 276 0 62 chr5 29107250 29107362 -123429897 - MTEa LTR MaLR -245 134 30 1 807 1839 130 20 0 chr5 29107359 29107652 -123429607 + ORR1B2 LTR MaLR 69 367 0 1 807 560 235 72 43 chr5 29111320 29111529 -123425730 + RMER15 LTR ERVL 345 559 -16 1 807 1537 251 55 3 chr5 29116405 29116748 -123420511 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 7 1 807 2499 156 126 12 chr5 29120465 29120976 -123416283 - RMER4B LTR ERVK 0 585 15 1 807 1764 223 58 5 chr5 29123343 29123721 -123413538 + MTD LTR MaLR 3 400 -19 1 807 301 313 66 7 chr5 29127326 29127477 -123409782 - MER92B LTR ERV1 -371 265 106 1 807 1170 252 79 37 chr5 29132259 29132613 -123404646 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 1 807 500 263 174 27 chr5 29133252 29133317 -123403942 + MLT1B LTR MaLR 59 126 -264 1 807 500 263 174 27 chr5 29133366 29133519 -123403740 + MLT1B LTR MaLR 127 308 -82 1 807 2668 37 75 0 chr5 29136199 29136521 -123400738 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 807 1931 75 4 8 chr5 29136521 29136788 -123400471 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1527 1 807 4797 75 13 1 chr5 29136786 29137458 -123399801 - ORR1A1-int LTR MaLR -1111 681 2 1 807 2278 77 0 122 chr5 29137459 29137828 -123399431 - ORR1A1 LTR MaLR 0 327 4 1 807 244 294 164 9 chr5 29143379 29143489 -123393770 - MLT1A0 LTR MaLR -70 295 169 1 807 692 252 38 92 chr5 29143545 29143807 -123393452 - RMER15 LTR ERVL -16 559 312 1 807 1274 201 43 17 chr5 29145180 29145538 -123391721 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 1 807 432 318 0 0 chr5 29166552 29166662 -123370597 + MTE2a-int LTR MaLR 291 400 -1180 2 807 1332 289 226 41 chr5 29166670 29167545 -123369714 + MTE2a-int LTR MaLR 542 1578 -2 2 807 1095 272 42 44 chr5 29167547 29167900 -123369359 + MTE2a LTR MaLR 1 366 -53 2 807 701 279 198 34 chr5 29174652 29174975 -123362284 + MLT1B LTR MaLR 1 376 -14 2 807 279 365 96 48 chr5 29178023 29178273 -123358986 + MLT1F2 LTR MaLR 55 316 -244 2 807 1024 301 58 33 chr5 29179548 29179825 -123357434 - MTD LTR MaLR -2 417 131 2 807 1024 301 58 33 chr5 29180058 29180175 -123357084 - MTD LTR MaLR -289 130 14 2 807 640 268 142 18 chr5 29181829 29182100 -123355159 - MLT-int LTR MaLR 0 1735 1431 2 807 341 331 339 24 chr5 29187649 29188032 -123349227 + MLT1E1 LTR MaLR 124 627 0 2 807 797 302 80 49 chr5 29189370 29189618 -123347641 - MLT1C LTR MaLR -43 424 168 2 807 1037 230 139 27 chr5 29189618 29189949 -123347310 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 2 807 797 302 80 49 chr5 29189949 29190087 -123347172 - MLT1C LTR MaLR -300 167 26 2 807 332 244 165 0 chr5 29192870 29192985 -123344274 + MLT1A0 LTR MaLR 8 141 -224 2 807 474 284 59 63 chr5 29195152 29195374 -123341885 - ORR1E LTR MaLR -7 352 132 2 807 941 281 106 69 chr5 29209244 29209604 -123327655 + MTEb LTR MaLR 1 373 -6 2 807 328 252 34 134 chr5 29212447 29212534 -123324725 + MT2B LTR ERVL 19 87 -514 2 807 780 260 217 10 chr5 29216116 29216415 -123320844 + MLT1B LTR MaLR 23 383 -7 2 807 1313 216 119 0 chr5 29226205 29226525 -123310734 + ORR1D1 LTR MaLR 17 374 0 2 807 1537 216 124 3 chr5 29227172 29227534 -123309725 - MTD LTR MaLR -1 418 13 2 807 840 197 92 19 chr5 29227561 29227768 -123309491 + MTD LTR MaLR 172 393 -26 2 808 977 244 62 133 chr5 29229198 29229604 -123307655 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 2 808 304 265 118 0 chr5 29232539 29232641 -123304618 + RMER15 LTR ERVL 462 575 0 2 808 295 286 36 0 chr5 29237125 29237237 -123300022 + RMER15 LTR ERVL 416 531 -44 3 808 1334 242 115 35 chr5 29249433 29249895 -123287364 - MT2A LTR ERVL 0 533 35 3 808 1561 218 37 11 chr5 29250823 29251176 -123286083 + ORR1D1 LTR MaLR 7 368 -6 3 808 317 245 76 68 chr5 29251173 29251291 -123285968 - MTEa LTR MaLR -70 309 191 3 808 275 308 101 32 chr5 29253653 29253841 -123283418 - MLT2C1 LTR ERVL -52 345 145 3 808 2644 131 9 28 chr5 29264990 29265452 -123271807 + RLTR11A LTR ERVK 76 528 0 3 808 642 198 0 0 chr5 29265452 29265573 -123271686 + ORR1D1 LTR MaLR 34 154 -220 3 808 1600 75 22 0 chr5 29265573 29265799 -123271460 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 231 -244 3 808 3617 15 0 0 chr5 29279227 29279623 -123257636 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 808 9201 36 4 1 chr5 29279623 29280718 -123256541 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 808 3600 18 0 0 chr5 29280718 29281114 -123256145 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 808 255 333 9 9 chr5 29281947 29282056 -123255203 + LTR16E1 LTR ERVL 411 519 -19 3 808 860 277 93 58 chr5 29282368 29282732 -123254527 + MTEb LTR MaLR 1 377 -2 3 808 1784 151 73 9 chr5 29284347 29284688 -123252571 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 20 3 808 261 341 132 37 chr5 29298452 29298641 -123238618 - LTR81B LTR ERV1? -430 963 757 3 808 858 227 21 54 chr5 29302656 29302752 -123234507 + MTE2a LTR MaLR 1 80 -339 3 808 1024 245 40 70 chr5 29303094 29303436 -123233823 + MTE2a LTR MaLR 57 404 -15 3 808 269 320 87 48 chr5 29307892 29308099 -123229160 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 143 3 808 3203 130 20 23 chr5 29310485 29311046 -123226213 - ORR1A3-int LTR MaLR -1403 560 2 3 808 2079 111 65 0 chr5 29311047 29311353 -123225906 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 808 362 206 172 22 chr5 29311860 29311994 -123225265 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 254 3 808 244 263 0 0 chr5 29312104 29312161 -123225098 - MLT1A1 LTR MaLR -308 100 44 3 808 919 272 90 30 chr5 29312358 29312657 -123224602 + MTEa LTR MaLR 1 317 -62 3 808 600 323 210 33 chr5 29312657 29312990 -123224269 + MTD LTR MaLR 1 392 -27 3 808 627 309 204 7 chr5 29313355 29313792 -123223467 - MLT-int LTR MaLR -27 1708 1186 3 808 318 237 148 32 chr5 29316451 29316640 -123220619 + MLT2B4 LTR ERVL 366 561 -1 3 808 3444 28 5 0 chr5 29318198 29318592 -123218667 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 808 640 310 171 23 chr5 29319792 29319938 -123217321 - ORR1D2 LTR MaLR 0 359 166 4 808 640 310 171 23 chr5 29320012 29320175 -123217084 - ORR1D2 LTR MaLR -184 175 4 4 808 348 314 101 8 chr5 29327217 29327308 -123209951 + ORR1D2 LTR MaLR 74 165 -205 4 808 350 240 511 10 chr5 29327378 29327499 -123209760 + ORR1D2 LTR MaLR 166 355 -15 4 808 410 320 144 12 chr5 29341457 29341707 -123195552 + MLT1A0 LTR MaLR 24 306 -68 4 808 417 353 51 35 chr5 29342078 29342275 -123194984 + MLT2B1 LTR ERVL 253 452 -68 4 808 1689 221 60 57 chr5 29354047 29354465 -123182794 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 809 25005 49 11 31 chr5 29367047 29367730 -123169529 - MMETn-int LTR ERVK -1619 3225 2557 4 809 25005 49 11 31 chr5 29368458 29368645 -123168614 - MMETn-int LTR ERVK -2288 2556 2378 4 809 25005 49 11 31 chr5 29368668 29370083 -123167176 - MMETn-int LTR ERVK -2467 2377 985 4 809 25005 49 11 31 chr5 29370344 29371347 -123165912 - MMETn-int LTR ERVK -3860 984 5 4 809 2009 113 9 51 chr5 29371349 29371685 -123165574 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 809 2743 102 18 2 chr5 29378408 29378802 -123158457 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 809 1323 227 30 72 chr5 29380054 29380482 -123156777 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 809 997 221 158 78 chr5 29380491 29381142 -123156117 + RMER17C-int LTR ERVK 9 711 -2527 4 809 294 216 0 0 chr5 29381298 29381349 -123155910 + RMER17C-int LTR ERVK 1100 1150 -2088 4 809 1806 55 88 62 chr5 29381486 29381742 -123155517 + ORR1A1 LTR MaLR 24 292 -54 4 809 1806 55 88 62 chr5 29381787 29381837 -123155422 + ORR1A1 LTR MaLR 293 338 -8 4 809 1685 167 51 66 chr5 29389726 29390060 -123147199 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 809 563 263 225 13 chr5 29395355 29395586 -123141673 + RMER15 LTR ERVL 294 573 -2 4 809 330 328 159 51 chr5 29403082 29403397 -123133862 + ORR1E LTR MaLR 7 355 -4 4 809 576 213 23 47 chr5 29403475 29403603 -123133656 - MTE2b LTR MaLR -14 365 241 4 809 232 318 11 11 chr5 29403807 29403896 -123133363 - MT2A LTR ERVL -443 90 2 4 809 1437 323 50 41 chr5 29406901 29407463 -123129796 + MTE-int LTR MaLR 580 1146 -434 4 809 3258 43 51 0 chr5 29415632 29416023 -123121236 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 5 809 1066 209 61 24 chr5 29416419 29416712 -123120547 - MTEb LTR MaLR -14 365 1 5 809 263 224 14 29 chr5 29418408 29418477 -123118782 - MTEb LTR MaLR -25 354 287 5 809 4289 48 0 0 chr5 29422666 29423141 -123114118 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 809 2974 91 29 12 chr5 29426872 29427000 -123110259 + BGLII LTR ERVK 1 128 -293 5 809 2974 91 29 12 chr5 29427041 29427326 -123109933 + BGLII LTR ERVK 129 421 0 5 809 2997 38 15 3 chr5 29430949 29431291 -123105968 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 809 947 231 160 39 chr5 29436524 29436563 -123100696 - MLT1B LTR MaLR -8 382 346 5 809 1974 250 31 139 chr5 29436563 29437247 -123100012 - RMER19C LTR ERVK 0 611 2 5 809 947 231 160 39 chr5 29437247 29437544 -123099715 - MLT1B LTR MaLR -45 345 5 5 809 663 268 104 0 chr5 29438124 29438307 -123098952 - MTD LTR MaLR -209 210 9 5 809 5123 160 57 74 chr5 29438592 29439510 -123097749 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 809 2366 66 66 0 chr5 29441488 29441805 -123095454 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 5 809 530 286 213 20 chr5 29460323 29460624 -123076635 + MTE2b LTR MaLR 19 377 -2 5 809 2283 160 51 10 chr5 29462405 29462797 -123074462 + MTC LTR MaLR 1 408 -13 5 809 2261 161 15 40 chr5 29463528 29463555 -123073704 + ORR1B1 LTR MaLR 1 25 -369 5 809 2261 161 15 40 chr5 29463698 29464072 -123073187 + ORR1B1 LTR MaLR 26 392 -2 5 809 1311 218 214 6 chr5 29464477 29464814 -123072445 - MTC LTR MaLR -14 407 1 5 809 310 280 71 39 chr5 29465450 29465601 -123071658 + MLT1A0 LTR MaLR 246 408 0 5 809 290 254 30 136 chr5 29477186 29477210 -123060049 + MT2B LTR ERVL 161 278 -323 5 809 559 208 199 19 chr5 29477307 29477582 -123059677 + RMER4B LTR ERVK 217 580 -5 5 809 461 197 555 12 chr5 29487720 29487956 -123049303 + MTD LTR MaLR 1 365 -54 6 810 947 230 139 103 chr5 29492124 29492604 -123044655 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 810 402 258 48 24 chr5 29494211 29494378 -123042881 + MLT1C LTR MaLR 205 457 -10 6 810 476 240 58 0 chr5 29517835 29517939 -123019320 + RMER15 LTR ERVL 466 575 0 2 810 772 268 59 62 chr5 29527777 29528165 -123009094 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 1 3 810 231 243 40 79 chr5 29542368 29542444 -122994815 - RMER15 LTR ERVL -415 160 88 5 810 331 302 42 96 chr5 29550226 29550485 -122986774 - MER34A LTR ERV1 0 571 284 6 810 4010 46 43 66 chr5 29555668 29556199 -122981060 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 6 810 571 39 52 0 chr5 29562424 29562501 -122974758 - MTB LTR MaLR 0 396 316 7 810 449 0 0 0 chr5 29562485 29562540 -122974719 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1044 1098 0 7 810 3367 41 5 55 chr5 29562540 29562957 -122974302 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 810 2491 53 8 63 chr5 29562959 29563321 -122973938 - MTB LTR MaLR -58 342 1 7 810 297 210 134 63 chr5 29582835 29582962 -122954297 + MER34A1 LTR ERV1 436 587 0 9 810 1321 227 19 4 chr5 29587780 29588045 -122949214 - MTD LTR MaLR 0 419 151 1 810 228 128 26 0 chr5 29588257 29588296 -122948963 - MTD LTR MaLR -379 40 1 1 810 231 300 113 73 chr5 29595888 29595999 -122941260 - ORR1D2 LTR MaLR -172 198 82 1 810 231 300 113 73 chr5 29596220 29596259 -122941000 - ORR1D2 LTR MaLR -289 81 42 1 810 291 271 105 79 chr5 29597428 29597580 -122939679 - MLT1D LTR MaLR 0 610 455 1 810 310 331 108 57 chr5 29599574 29599750 -122937509 - MLT1D LTR MaLR -63 404 220 1 810 319 164 13 107 chr5 29599823 29599898 -122937361 - MLT1D LTR MaLR -414 91 24 1 810 1190 169 4 78 chr5 29609336 29609580 -122927679 + ORR1C2 LTR MaLR 1 226 -158 1 810 4217 149 45 14 chr5 29609632 29610365 -122926894 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 1 810 3280 33 13 0 chr5 29612648 29613039 -122924220 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 811 2038 132 3 12 chr5 29630074 29630403 -122906856 + MurERV4_19-int LTR ERVK 608 933 -4847 1 811 1100 126 27 51 chr5 29630403 29630653 -122906606 - ORR1A4 LTR MaLR -79 250 1 1 811 9289 142 18 169 chr5 29630657 29631671 -122905588 - ORR1A4-int LTR MaLR -4 1959 1043 1 811 9289 142 18 169 chr5 29631815 29632592 -122904667 - ORR1A4-int LTR MaLR -921 1042 381 1 811 9289 142 18 169 chr5 29633389 29633902 -122903357 - ORR1A4-int LTR MaLR -1583 380 1 1 811 2009 141 6 33 chr5 29633906 29634236 -122903023 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 1 811 960 146 73 0 chr5 29634236 29634398 -122902861 - MTC LTR MaLR -214 207 34 1 811 387 314 48 8 chr5 29635410 29635535 -122901724 - MTEb LTR MaLR -249 130 1 1 811 822 149 11 111 chr5 29635862 29636043 -122901216 - ORR1C1 LTR MaLR -215 163 1 1 811 3345 30 2 12 chr5 29645715 29646115 -122891144 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 811 3019 23 0 11 chr5 29646697 29647047 -122890212 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 811 287 371 16 16 chr5 29651602 29651791 -122885468 + RMER15 LTR ERVL 255 443 -132 1 811 3262 41 5 10 chr5 29653497 29653895 -122883364 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 811 1065 45 0 0 chr5 29655611 29655745 -122881514 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 213 2 811 12302 53 7 3 chr5 29655717 29657354 -122879905 - ORR1A1-int LTR MaLR -178 1614 1 2 811 2902 41 3 0 chr5 29657354 29657699 -122879560 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 811 228 355 0 0 chr5 29659134 29659196 -122878063 + MLT1A LTR MaLR 31 92 -282 2 811 1545 31 5 10 chr5 29663240 29663438 -122873821 - MTA_Mm LTR MaLR -199 197 1 2 811 308 143 18 0 chr5 29663516 29663572 -122873687 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3263 3319 -2395 2 811 357 238 53 38 chr5 29663625 29663756 -122873503 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3410 3542 -2172 2 811 1863 205 59 25 chr5 29672783 29673188 -122864071 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 811 238 385 39 0 chr5 29683235 29683365 -122853894 + ORR1E LTR MaLR 1 135 -224 2 811 1483 128 4 62 chr5 29684593 29684793 -122852466 + ORR1A3 LTR MaLR 68 255 -71 2 811 1483 128 4 62 chr5 29685025 29685099 -122852160 + ORR1A3 LTR MaLR 256 326 0 2 811 1036 117 12 0 chr5 29685099 29685262 -122851997 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 165 -1798 2 811 1049 117 0 12 chr5 29685253 29685417 -122851842 - ORR1A3 LTR MaLR -160 166 5 2 811 3395 73 23 0 chr5 29685969 29686406 -122850853 + LTRIS5 LTR ERV1 1 447 0 2 811 2967 74 35 2 chr5 29686599 29686993 -122850266 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 811 285 197 30 0 chr5 29687377 29687443 -122849816 + RLTR25B LTR ERVK 421 488 -540 2 811 2177 77 86 3 chr5 29688099 29688401 -122848858 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 811 1368 202 56 104 chr5 29694479 29694549 -122842710 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 306 2 811 1368 202 56 104 chr5 29694724 29695045 -122842214 - ORR1D1 LTR MaLR -69 305 2 2 811 3465 28 5 0 chr5 29695367 29695761 -122841498 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 811 7958 65 35 4 chr5 29695761 29696825 -122840434 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1097 -1 2 811 3543 23 2 0 chr5 29696826 29697221 -122840038 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 811 2021 211 54 36 chr5 29698207 29698728 -122838531 + RLTR20A2 LTR ERVK 49 578 0 2 811 1751 172 118 83 chr5 29706316 29706394 -122830865 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 374 2 811 1751 172 118 83 chr5 29706538 29706890 -122830369 - RLTR41 LTR ERV1 -73 373 2 2 811 3740 168 106 113 chr5 29707260 29707473 -122829786 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 852 2 811 3740 168 106 113 chr5 29707507 29708328 -122828931 - RLTR25B LTR ERVK -177 851 1 2 811 1518 129 52 30 chr5 29709276 29709547 -122827712 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 83 2 811 813 211 113 110 chr5 29709763 29710126 -122827133 - MT2A LTR ERVL -167 366 3 2 811 4240 152 73 85 chr5 29710525 29711438 -122825821 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 2 811 880 154 0 0 chr5 29712706 29712855 -122824404 + ORR1A2 LTR MaLR 1 149 -178 2 811 2633 36 3 0 chr5 29727118 29727455 -122809804 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 3 811 2499 134 59 74 chr5 29728110 29728349 -122808910 + RMER16 LTR ERVK 1 251 -282 3 811 2549 29 51 127 chr5 29728349 29728743 -122808516 - RLTR10B2 LTR ERVK -1 364 1 3 811 2499 134 59 74 chr5 29728743 29729044 -122808215 + RMER16 LTR ERVK 252 533 0 3 811 2048 128 87 10 chr5 29729911 29730282 -122806977 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 15 3 811 1007 236 130 53 chr5 29730319 29730735 -122806524 + RLTR20B3 LTR ERVK 47 494 -83 3 811 979 192 30 121 chr5 29735524 29735871 -122801388 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 409 8 3 811 871 77 132 7 chr5 29736620 29736754 -122800505 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 175 3 811 3212 142 31 42 chr5 29736754 29737081 -122800178 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 333 -1515 3 811 3176 70 18 2 chr5 29737081 29737482 -122799777 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 811 3212 142 31 42 chr5 29737482 29737822 -122799437 + RLTR22_Mur LTR ERVK 334 661 -1187 3 811 1111 172 148 35 chr5 29739308 29739591 -122797668 - RLTR46 LTR ERVK -5 315 1 3 811 405 214 25 67 chr5 29741470 29741531 -122795728 - MTD LTR MaLR 0 419 363 3 811 1724 164 104 15 chr5 29741531 29741866 -122795393 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 3 811 405 214 25 67 chr5 29741866 29741924 -122795335 - MTD LTR MaLR -57 362 305 3 811 2379 65 18 33 chr5 29745761 29746093 -122791166 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 3 811 234 221 0 140 chr5 29747844 29747944 -122789315 + MT2B LTR ERVL 154 239 -362 3 811 4971 75 25 51 chr5 29749569 29750340 -122786919 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 3 811 1118 189 295 28 chr5 29751227 29751586 -122785673 + RMER6B LTR ERVK 5 459 -2 3 811 7157 156 41 33 chr5 29751588 29752872 -122784387 + MYSERV6-int LTR ERVK 1 1295 -7664 3 812 17943 118 42 40 chr5 29753933 29757019 -122780240 - MYSERV6-int LTR ERVK -4282 4677 1583 3 812 904 114 35 21 chr5 29757008 29757151 -122780108 - MYSERV6-int LTR ERVK -7533 1426 1282 3 812 2316 129 81 15 chr5 29758816 29759211 -122778048 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 812 431 331 22 77 chr5 29759641 29759913 -122777346 - MTEa LTR MaLR -117 262 6 3 812 697 211 60 11 chr5 29760626 29760808 -122776451 - MTD LTR MaLR -24 395 205 3 812 852 196 86 90 chr5 29773974 29774342 -122762917 - MTC LTR MaLR -8 392 1 4 812 950 230 128 67 chr5 29774683 29774971 -122762288 - MT2A LTR ERVL -10 591 120 4 812 950 225 85 61 chr5 29775160 29775278 -122761981 - MT2A LTR ERVL -414 119 2 4 812 1616 29 14 0 chr5 29776252 29776460 -122760799 + MT2_Mm LTR ERVL 283 493 0 4 812 779 93 37 0 chr5 29776460 29776568 -122760691 + MERVL-int LTR ERVL 1 112 -5373 4 812 943 220 216 0 chr5 29779038 29779330 -122757929 - MTEb LTR MaLR -7 372 18 4 812 281 128 21 0 chr5 29781562 29781609 -122755650 + MTE2b LTR MaLR 331 378 -1 4 812 1071 201 205 0 chr5 29782854 29783113 -122754146 - MTD LTR MaLR -16 403 92 4 812 272 208 63 25 chr5 29783262 29783341 -122753918 - MTD LTR MaLR -324 97 16 4 812 925 214 45 0 chr5 29792035 29792213 -122745046 + MTEa LTR MaLR 1 186 -193 4 812 378 367 35 15 chr5 29792213 29792234 -122745025 + MT2A LTR ERVL 1 203 -330 4 812 456 194 11 14 chr5 29792358 29792456 -122744803 + MTEa LTR MaLR 278 373 -6 4 812 424 202 0 132 chr5 29820104 29820218 -122717041 - MT2B LTR ERVL -347 254 156 4 812 1517 132 99 57 chr5 29827609 29827923 -122709336 - ORR1C2 LTR MaLR -57 327 1 5 812 1958 173 43 14 chr5 29830469 29830815 -122706444 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 31 5 812 229 216 18 105 chr5 29831620 29831677 -122705582 + MLT1D LTR MaLR 1 52 -453 5 812 342 298 55 66 chr5 29831950 29832133 -122705126 - MLT1C LTR MaLR -209 181 1 5 812 1619 147 44 0 chr5 29834320 29834592 -122702667 + ORR1C1 LTR MaLR 1 284 -94 5 812 651 301 105 20 chr5 29836127 29836479 -122700780 - MLT1C LTR MaLR -3 464 83 5 812 1996 194 50 159 chr5 29836579 29837136 -122700123 + RMER19C LTR ERVK 12 488 -123 5 812 1996 194 50 159 chr5 29837600 29837715 -122699544 + RMER19C LTR ERVK 489 610 -1 5 812 1405 238 87 14 chr5 29839117 29839462 -122697797 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 812 367 313 59 7 chr5 29851349 29851538 -122685721 + MLT1F1 LTR MaLR 216 382 -187 5 812 963 231 82 186 chr5 29859915 29860247 -122677012 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 252 5 812 963 231 82 186 chr5 29860398 29860629 -122676630 - RLTR16 LTR ERVK -254 251 1 5 812 3095 249 50 99 chr5 29860629 29860648 -122676611 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2842 2824 5 812 6447 161 70 20 chr5 29860673 29862364 -122674895 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -19 2823 388 5 812 3209 43 8 5 chr5 29871726 29872121 -122665138 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 812 658 24 0 0 chr5 29872121 29872206 -122665053 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 85 -1013 5 812 1151 88 0 0 chr5 29873421 29873591 -122663668 - ORR1A3 LTR MaLR -156 170 1 5 812 1359 220 86 0 chr5 29873769 29874073 -122663186 + MTD LTR MaLR 1 330 -89 5 812 936 147 125 0 chr5 29879109 29879293 -122657966 + MTC LTR MaLR 1 207 -214 6 812 331 304 0 0 chr5 29879512 29879614 -122657645 + MER57-int LTR ERV1 7155 7256 -281 6 812 982 163 47 77 chr5 29880124 29880289 -122656970 + MTC LTR MaLR 196 366 -55 6 812 2111 87 93 3 chr5 29880289 29880589 -122656670 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 812 11135 126 63 14 chr5 29880589 29882458 -122654801 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 4 6 812 2390 108 3 3 chr5 29882463 29882788 -122654471 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 6 812 982 163 47 77 chr5 29882788 29882848 -122654411 + MTC LTR MaLR 367 420 -1 6 101 1087 244 73 52 chr5 29884375 29884631 -122652628 + ORR1D2 LTR MaLR 1 269 -101 6 813 2198 106 0 63 chr5 29884631 29884982 -122652277 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 813 1087 244 73 52 chr5 29884982 29885011 -122652248 + ORR1D2 LTR MaLR 270 292 -78 6 813 400 153 165 0 chr5 29884984 29885069 -122652190 - ORR1D1 LTR MaLR -279 99 1 6 813 1314 215 49 82 chr5 29885069 29885744 -122651515 - ORR1D1-int LTR MaLR -41 1922 830 6 813 3576 186 51 73 chr5 29885744 29886011 -122651248 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 712 6 813 3576 186 51 73 chr5 29886157 29886894 -122650365 - RLTR13C1 LTR ERVK -272 711 1 6 813 2966 210 53 65 chr5 29886894 29887314 -122649945 - ORR1D1-int LTR MaLR -541 829 443 6 813 2966 210 53 65 chr5 29887492 29887887 -122649372 - ORR1D1-int LTR MaLR -928 442 24 6 813 2676 71 188 0 chr5 29888076 29888443 -122648816 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 813 1244 216 138 6 chr5 29889533 29889836 -122647423 - ORR1D1 LTR MaLR -31 343 1 6 813 553 317 127 30 chr5 29890787 29891119 -122646140 + MLT1D LTR MaLR 117 480 -25 6 813 762 286 279 26 chr5 29892027 29892407 -122644852 - MLT2B2 LTR ERVL -88 479 4 6 813 2513 141 42 35 chr5 29900800 29901279 -122635980 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 6 813 3160 47 36 3 chr5 29903985 29904372 -122632887 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 813 2168 81 57 25 chr5 29904628 29904945 -122632314 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 813 624 224 161 93 chr5 29904976 29905256 -122632003 + RMER15 LTR ERVL 277 575 0 6 813 2061 97 32 13 chr5 29907447 29907759 -122629500 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 6 813 3158 63 5 0 chr5 29920834 29921228 -122616031 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 813 469 308 35 7 chr5 29928086 29928230 -122609029 - MER21B LTR ERV1 -169 694 547 7 813 284 148 66 0 chr5 29932475 29932536 -122604723 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5565 5629 -132 7 813 283 247 14 0 chr5 29932536 29932609 -122604650 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 7 813 229 125 25 0 chr5 29932644 29932684 -122604575 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 41 -452 7 813 1352 130 14 6 chr5 29932659 29932881 -122604378 + MT2C_Mm LTR ERVL 264 475 0 7 813 389 221 7 136 chr5 29945695 29945725 -122591534 - MT2B LTR ERVL -454 147 137 7 813 1858 141 69 7 chr5 29949713 29950019 -122587240 - ORR1B2 LTR MaLR -42 325 1 7 813 1053 260 106 70 chr5 29954994 29955408 -122581851 - RMER13A LTR ERVK -421 439 11 7 813 1012 212 345 65 chr5 29960052 29960495 -122576764 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 7 813 251 228 0 140 chr5 29962989 29963013 -122574246 + MT2B LTR ERVL 147 155 -446 7 813 1930 118 67 3 chr5 29966080 29966379 -122570880 - ORR1A2 LTR MaLR -9 318 1 8 813 6960 115 16 5 chr5 29966379 29967446 -122569813 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 8 813 3523 126 140 11 chr5 29967771 29968384 -122568875 - RMER6A LTR ERVK -4 752 74 8 813 3523 126 140 11 chr5 29968449 29968501 -122568758 - RMER6A LTR ERVK -683 73 1 8 813 3324 30 5 10 chr5 29969604 29970002 -122567257 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 813 1479 180 22 42 chr5 29974416 29974729 -122562530 + RLTR11A2 LTR ERVK 221 527 0 8 813 1823 181 82 21 chr5 29987278 29987666 -122549593 - MTD LTR MaLR -5 414 3 8 813 3227 55 0 8 chr5 29993574 29993973 -122543286 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 813 1529 208 9 52 chr5 29997215 29997472 -122539787 - MTC LTR MaLR -61 360 118 8 813 711 107 8 51 chr5 29997660 29997778 -122539481 - MTC LTR MaLR -308 113 1 8 813 1727 216 79 0 chr5 30005052 30005389 -122531870 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 168 1 813 1727 216 79 0 chr5 30005544 30005585 -122531674 - RMER5 LTR ERV1 -367 167 119 1 813 2335 182 98 34 chr5 30008107 30008608 -122528651 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 2 813 1613 190 109 50 chr5 30008678 30008743 -122528516 - RMER10A LTR ERVL -14 428 372 3 813 3187 71 20 35 chr5 30008743 30009197 -122528062 - LTRIS5 LTR ERV1 0 447 1 3 813 1613 190 109 50 chr5 30009197 30009535 -122527724 - RMER10A LTR ERVL -71 371 1 3 813 363 312 147 0 chr5 30011094 30011264 -122525995 - MLT1C LTR MaLR -49 418 224 3 813 384 216 102 0 chr5 30012811 30012899 -122524360 - MTEb LTR MaLR -2 377 281 4 813 245 258 0 192 chr5 30015354 30015474 -122521785 - MT2B LTR ERVL -350 251 155 5 814 3154 55 134 0 chr5 30016466 30016885 -122520374 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 814 483 123 0 24 chr5 30018337 30018420 -122518839 + RMER17A2 LTR ERVK 1 81 -825 6 814 584 126 225 0 chr5 30018420 30018531 -122518728 - MERVK26-int LTR ERVK -5798 1121 986 6 814 2700 51 30 3 chr5 30018511 30018846 -122518413 - MERVK26-int LTR ERVK -2655 4264 3921 6 814 1135 182 31 55 chr5 30018846 30019101 -122518158 - RLTR26 LTR ERVK -393 249 1 6 814 1474 163 48 0 chr5 30019105 30019356 -122517903 - MTC LTR MaLR -54 367 105 6 814 241 172 121 30 chr5 30020612 30020678 -122516581 + RMER10A LTR ERVL 318 389 -53 7 814 3721 151 93 7 chr5 30021539 30022268 -122514991 + RMER13A LTR ERVK 43 860 0 7 814 1357 206 187 67 chr5 30023690 30023859 -122513400 - RMER4B LTR ERVK -16 569 358 8 814 1357 206 187 67 chr5 30024030 30024293 -122512966 - RMER4B LTR ERVK -228 357 58 8 814 1357 206 187 67 chr5 30024677 30024696 -122512563 - RMER4B LTR ERVK -528 57 44 8 814 1357 206 187 67 chr5 30024882 30024913 -122512346 - RMER4B LTR ERVK -542 43 19 8 814 4579 54 28 12 chr5 30027363 30027941 -122509318 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 9 814 241 282 83 14 chr5 30028425 30028497 -122508762 + RMER10A LTR ERVL 318 394 -48 9 814 266 306 35 26 chr5 30029158 30029272 -122507987 + RMER21B LTR ERV1 453 567 -275 9 814 1371 291 96 8 chr5 30033974 30034359 -122502900 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 814 1775 180 3 3 chr5 30034430 30034736 -122502523 - RLTR16 LTR ERVK -199 306 1 1 814 441 194 41 0 chr5 30034999 30035097 -122502162 + MLT1C LTR MaLR 81 182 -285 1 814 317 115 34 0 chr5 30035167 30035222 -122502037 - ORR1D2 LTR MaLR 0 421 323 1 814 1002 246 103 72 chr5 30035637 30035749 -122501510 - ORR1D2 LTR MaLR -37 333 196 1 814 1002 246 103 72 chr5 30035933 30036140 -122501119 - ORR1D2 LTR MaLR -175 195 4 1 814 684 290 156 4 chr5 30036891 30037147 -122500112 - RLTR28 LTR ERVL -229 295 1 1 814 849 167 272 89 chr5 30038705 30038960 -122498299 - RLTR18B LTR ERVK -48 464 163 1 814 586 248 7 52 chr5 30038971 30039107 -122498152 - RLTR18B LTR ERVK -486 130 1 1 814 243 300 136 95 chr5 30039293 30039669 -122497590 - RMER10A LTR ERVL -28 414 23 1 814 773 184 0 0 chr5 30039669 30039810 -122497449 + ORR1C1 LTR MaLR 1 141 -237 1 814 251 225 62 97 chr5 30040070 30040183 -122497076 - RLTR25B LTR ERVK -530 498 390 1 814 529 148 175 42 chr5 30040355 30040470 -122496789 + ORR1C1 LTR MaLR 138 268 -110 1 814 866 253 81 56 chr5 30040470 30040755 -122496504 - RMER20A LTR ERVK 0 516 225 1 814 602 286 30 18 chr5 30040767 30040931 -122496328 - RMER20A LTR ERVK -453 174 9 1 814 582 176 46 0 chr5 30040939 30041047 -122496212 + ORR1C1 LTR MaLR 266 378 0 1 814 3245 46 8 0 chr5 30041497 30041886 -122495373 - MTA_Mm LTR MaLR -4 392 1 1 814 3906 47 12 4 chr5 30042512 30043004 -122494255 + RLTR1C LTR ERV1 1 496 -7 1 814 2142 92 86 5 chr5 30044101 30044521 -122492738 - LTRIS3 LTR ERV1 -93 419 1 1 814 592 95 32 0 chr5 30046268 30046363 -122490896 - MT2C_Mm LTR ERVL -77 398 301 1 814 1002 271 136 21 chr5 30046968 30047386 -122489873 + RMER5 LTR ERV1 30 495 -39 1 814 284 267 194 22 chr5 30048258 30048392 -122488867 + RMER5 LTR ERV1 33 189 -345 1 814 473 286 79 26 chr5 30049509 30049699 -122487560 + RMER5 LTR ERV1 195 394 -140 1 814 506 162 15 140 chr5 30049683 30049701 -122487558 + MT2B LTR ERVL 146 240 -361 1 814 3244 75 170 12 chr5 30049788 30050275 -122486984 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 1 814 506 162 15 140 chr5 30050275 30050305 -122486954 + MT2B LTR ERVL 241 264 -337 1 814 526 252 176 80 chr5 30053576 30053912 -122483347 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 1 814 793 239 55 94 chr5 30054260 30054422 -122482837 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 293 1 814 793 239 55 94 chr5 30054568 30054659 -122482600 - RLTR41 LTR ERV1 -154 292 203 1 814 1580 95 113 0 chr5 30054823 30055054 -122482205 - ORR1A2 LTR MaLR -61 266 10 1 814 634 247 114 126 chr5 30056987 30057321 -122479938 - RMER5 LTR ERV1 -189 345 16 2 814 608 232 230 88 chr5 30076169 30076500 -122460759 - MTE2a LTR MaLR 0 379 2 2 814 2122 179 122 13 chr5 30096195 30096671 -122440588 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 814 265 242 116 0 chr5 30098564 30098659 -122438600 + MTE2a LTR MaLR 47 152 -227 3 814 1812 212 174 32 chr5 30123404 30123508 -122413751 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 470 3 814 1812 212 174 32 chr5 30123547 30123935 -122413324 - RLTR20B1 LTR ERVK -94 469 3 3 814 902 157 0 35 chr5 30125352 30125524 -122411735 + MTB_Mm LTR MaLR 1 166 -241 3 814 2450 175 63 59 chr5 30126400 30127312 -122409947 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 855 1 3 814 3492 98 95 62 chr5 30130007 30130723 -122406536 - RMER17A LTR ERVK -11 740 1 3 814 2935 43 0 3 chr5 30135838 30136185 -122401074 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 814 3059 159 70 154 chr5 30137950 30138922 -122398337 - RLTR13D6 LTR ERVK -12 890 1 3 814 313 273 13 0 chr5 30139510 30139587 -122397672 + LTR41 LTR ERVL 89 166 -602 3 814 254 179 0 18 chr5 30139644 30139701 -122397558 + ORR1B2 LTR MaLR 284 339 -28 3 814 4434 61 5 16 chr5 30140469 30141039 -122396220 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 3 814 342 253 353 25 chr5 30144932 30145222 -122392037 - MLT1B LTR MaLR -3 387 4 4 814 876 224 50 44 chr5 30145726 30146014 -122391245 + ORR1D1 LTR MaLR 26 343 -16 4 815 1048 218 236 19 chr5 30152411 30152858 -122384401 + MT2A LTR ERVL 47 496 -37 4 815 2347 154 66 142 chr5 30165386 30165962 -122371297 - RLTR18 LTR ERVK -5 611 71 4 815 2347 154 66 142 chr5 30166097 30166154 -122371105 - RLTR18 LTR ERVK -546 70 26 4 815 498 301 30 81 chr5 30174386 30174621 -122362638 - MLT1B LTR MaLR -29 361 139 4 815 328 321 42 21 chr5 30181597 30181740 -122355519 - MLT1H2 LTR MaLR -8 481 336 4 815 560 308 143 82 chr5 30186905 30187271 -122349988 + MER21B LTR ERV1 87 466 -397 4 815 560 308 143 82 chr5 30187412 30187639 -122349620 + MER21B LTR ERV1 467 716 -147 4 815 3402 40 2 0 chr5 30188482 30188877 -122348382 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 815 276 340 66 70 chr5 30197132 30197404 -122339855 - ORR1E LTR MaLR -7 352 82 5 815 299 261 28 96 chr5 30198982 30199160 -122338099 - RMER15 LTR ERVL -73 502 337 5 815 1002 268 108 15 chr5 30200455 30200789 -122336470 + ORR1D2 LTR MaLR 6 370 0 5 815 361 313 67 90 chr5 30202458 30202770 -122334489 - RMER10A LTR ERVL -120 322 18 5 815 1356 194 117 35 chr5 30208567 30208909 -122328350 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 5 815 409 278 43 86 chr5 30209373 30209605 -122327654 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1101 5 815 5411 64 46 1 chr5 30209906 30210688 -122326571 - RLTR22_Mus LTR ERVK -991 817 1 5 815 3409 38 2 0 chr5 30212151 30212546 -122324713 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 815 1499 160 150 0 chr5 30212753 30213046 -122324213 - MTC LTR MaLR -52 369 33 5 815 306 342 53 27 chr5 30214923 30215073 -122322186 - LTR16E2 LTR ERVL -199 369 216 5 815 1529 145 141 3 chr5 30216591 30216887 -122320372 + MTC LTR MaLR 5 341 -80 5 815 1384 161 77 46 chr5 30216887 30216946 -122320313 + ORR1B1 LTR MaLR 1 95 -299 5 815 1384 179 33 145 chr5 30217214 30217555 -122319704 + ORR1B1 LTR MaLR 96 390 -4 5 815 293 195 95 24 chr5 30225586 30225670 -122311589 + MTD LTR MaLR 272 361 -58 5 815 232 316 94 33 chr5 30225872 30226052 -122311207 + ORR1E LTR MaLR 5 195 -164 5 815 819 294 76 44 chr5 30227700 30228042 -122309217 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 5 815 384 145 0 16 chr5 30228334 30228397 -122308862 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2494 3267 3206 5 815 383 188 36 54 chr5 30229548 30229687 -122307572 + ORR1A1 LTR MaLR 2 139 -207 5 815 11809 91 20 1 chr5 30229688 30231251 -122306008 + MERVL-int LTR ERVL 2089 3682 -1803 5 815 10421 127 66 48 chr5 30231251 30231491 -122305768 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 159 -1804 5 815 10421 127 66 48 chr5 30231825 30233513 -122303746 + ORR1A1-int LTR MaLR 160 1963 0 5 815 577 131 0 0 chr5 30233513 30233612 -122303647 + ORR1A1 LTR MaLR 1 99 -247 5 815 256 217 0 0 chr5 30243432 30243478 -122293781 - MMERVK10C-int LTR ERVK -978 6603 6558 5 815 240 316 100 29 chr5 30246454 30246594 -122290665 - MLT2C2 LTR ERVL -261 203 54 5 815 314 207 360 0 chr5 30246657 30246768 -122290491 - MLT1E1 LTR MaLR -503 151 1 5 815 3907 66 98 19 chr5 30247453 30247976 -122289283 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 5 815 1470 204 50 23 chr5 30248171 30248555 -122288704 - RMER16 LTR ERVK -85 448 21 5 815 5862 75 3 11 chr5 30248614 30249374 -122287885 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 4653 5 815 496 263 81 25 chr5 30252416 30252576 -122284683 + RLTR9E LTR ERVK 239 407 -2 6 815 719 256 155 83 chr5 30252863 30253199 -122284060 + MTEa LTR MaLR 20 379 0 6 815 386 309 24 20 chr5 30253286 30253414 -122283845 - MLT1C LTR MaLR -3 464 245 6 815 234 310 44 94 chr5 30253461 30253621 -122283638 - MLT1C LTR MaLR -252 215 64 6 815 232 252 85 115 chr5 30262871 30263001 -122274258 + RLTR41 LTR ERV1 251 376 -70 6 815 233 331 91 49 chr5 30265358 30265501 -122271758 + LTR16A LTR ERVL 107 255 -196 6 815 955 181 40 58 chr5 30266785 30267008 -122270251 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 156 6 815 389 224 53 7 chr5 30267132 30267264 -122269995 - ORR1D1 LTR MaLR -198 169 1 6 815 933 284 131 56 chr5 30268454 30268829 -122268430 + MLT1F1 LTR MaLR 101 541 -19 6 815 624 354 69 6 chr5 30269702 30270051 -122267208 + HERV16-int LTR ERVL 1632 2002 -2994 6 815 363 404 62 52 chr5 30272240 30272353 -122264906 + LTR16A LTR ERVL 26 137 -314 6 815 363 404 62 52 chr5 30272528 30272724 -122264535 + LTR16A LTR ERVL 138 333 -118 6 816 787 246 28 6 chr5 30282226 30282402 -122254857 + MTE2a LTR MaLR 195 374 -5 6 816 392 235 0 0 chr5 30285723 30285804 -122251455 + RMER17B LTR ERVK 674 754 -204 6 816 1951 152 197 3 chr5 30292146 30292476 -122244783 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 816 1215 143 0 0 chr5 30308310 30308492 -122228767 + ORR1A3 LTR MaLR 145 326 0 6 816 3155 57 8 213 chr5 30309690 30310287 -122226972 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 7 816 430 292 75 0 chr5 30310355 30310475 -122226784 + MLT1A1 LTR MaLR 6 134 -274 7 816 1382 208 11 22 chr5 30311874 30312144 -122225115 - MTC LTR MaLR 0 421 155 7 816 582 179 36 0 chr5 30314199 30314311 -122222948 - MTC LTR MaLR -303 118 3 7 816 240 271 29 33 chr5 30315182 30315280 -122221979 + MLT1A1 LTR MaLR 274 404 -4 7 816 4870 79 2 0 chr5 30317056 30317639 -122219620 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 7 816 1472 189 186 36 chr5 30325006 30325340 -122211919 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 816 3013 134 55 24 chr5 30349004 30349614 -122187645 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 117 7 816 2051 196 159 115 chr5 30349807 30349968 -122187291 - RLTR13D2 LTR ERVK -690 116 1 7 816 4277 47 10 2 chr5 30360726 30361234 -122176025 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 7 816 239 254 57 100 chr5 30361251 30361391 -122175868 + RLTR41 LTR ERV1 251 384 -62 7 816 2255 167 85 28 chr5 30362532 30363026 -122174233 + RMER16 LTR ERVK 12 533 0 7 816 530 272 59 14 chr5 30366646 30366856 -122170403 + MLT2C2 LTR ERVL 85 305 -159 7 816 2096 119 81 13 chr5 30372306 30372494 -122164765 + RLTR9E LTR ERVK 1 212 -197 8 816 2681 65 168 133 chr5 30372494 30372989 -122164270 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 8 816 2096 119 81 13 chr5 30372989 30373183 -122164076 + RLTR9E LTR ERVK 213 408 -1 8 816 8300 259 43 24 chr5 30373184 30376306 -122160953 + ETnERV-int LTR ERVK 2 3055 -3112 8 816 17398 105 16 38 chr5 30382553 30385214 -122152045 + ETnERV2-int LTR ERVK 1656 6429 -977 8 816 343 157 0 50 chr5 30385312 30385392 -122151867 + RLTR45-int LTR ERVK 6010 6072 -1172 8 816 798 145 93 122 chr5 30385392 30385596 -122151663 + ETnERV3-int LTR ERVK 5529 5726 -82 8 816 1465 164 136 6 chr5 30385617 30386094 -122151165 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 539 -363 8 816 455 43 101 0 chr5 30386094 30386163 -122151096 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7406 0 8 816 2943 80 20 10 chr5 30386163 30386568 -122150691 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 8 816 1797 156 107 6 chr5 30394030 30394366 -122142893 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 8 816 229 341 112 112 chr5 30394907 30395254 -122142005 + RMER21A LTR ERV1 418 764 -183 8 816 4114 56 87 2 chr5 30406266 30406786 -122130473 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 8 817 4682 114 59 76 chr5 30410813 30411735 -122125524 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 8 817 4563 73 0 30 chr5 30414138 30414743 -122122516 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 8 817 706 138 26 0 chr5 30415664 30415780 -122121479 + RLTR40 LTR ERVK 1 119 -698 8 817 6644 50 5 5 chr5 30416203 30417005 -122120254 + RLTR13C2 LTR ERVK 4 805 -3 8 817 2999 64 149 87 chr5 30417385 30417867 -122119392 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 8 817 710 134 175 7 chr5 30419969 30420112 -122117147 + RMER6A LTR ERVK 590 756 0 8 817 3434 23 5 12 chr5 30421400 30421799 -122115460 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 817 3151 69 2 5 chr5 30425211 30425606 -122111653 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 8 817 2390 148 202 4 chr5 30430024 30430504 -122106755 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 8 817 287 216 68 0 chr5 30451567 30451641 -122085618 + MLT1H LTR MaLR 81 159 -390 9 817 741 132 0 0 chr5 30461751 30461865 -122075394 + MTC LTR MaLR 308 421 0 9 817 389 218 81 0 chr5 30462462 30462549 -122074710 + ERVL-E-int LTR ERVL 5096 5189 -478 9 817 325 329 45 62 chr5 30462552 30462730 -122074529 + MER76 LTR ERVL 102 276 -415 9 817 226 148 200 18 chr5 30462788 30462843 -122074416 + MER76 LTR ERVL 404 468 -223 9 817 1553 175 25 79 chr5 30463964 30464330 -122072929 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 9 817 539 262 214 18 chr5 30474804 30475080 -122062179 + MLT1D LTR MaLR 79 408 -97 9 817 307 331 0 78 chr5 30485867 30486008 -122051251 - MT2B LTR ERVL -345 256 127 9 817 721 282 205 13 chr5 30486176 30486571 -122050688 - MLT1F LTR MaLR -77 471 1 9 817 1197 100 66 120 chr5 30499726 30500000 -122037259 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 135 1 817 728 127 0 113 chr5 30500000 30500151 -122037108 - RLTR9C LTR ERVK -259 134 1 1 817 1452 205 64 17 chr5 30512853 30513210 -122024049 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 817 3795 93 10 68 chr5 30532817 30533437 -122003822 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 584 -70 9 817 1533 232 83 16 chr5 30537004 30537256 -122000003 - MTD LTR MaLR -19 400 120 1 817 1533 232 83 16 chr5 30537493 30537601 -121999658 - MTD LTR MaLR -306 113 5 1 817 2280 92 6 9 chr5 30538329 30538648 -121998611 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 1 817 666 323 112 11 chr5 30539197 30539457 -121997802 - MER21B LTR ERV1 -548 315 30 1 818 2339 88 24 45 chr5 30540161 30540217 -121997042 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 286 1 818 2339 88 24 45 chr5 30540410 30540687 -121996572 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 1 818 1259 318 113 6 chr5 30542089 30542576 -121994683 - MER21B LTR ERV1 -227 636 98 1 818 2325 95 9 12 chr5 30544742 30545071 -121992188 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 1 818 2517 65 6 27 chr5 30549584 30549918 -121987341 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 1 818 56147 25 15 11 chr5 30549920 30556362 -121980897 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 9 1 818 2513 62 6 27 chr5 30556363 30556697 -121980562 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 1 818 730 179 13 19 chr5 30566325 30566479 -121970780 + MTD LTR MaLR 2 154 -265 1 818 238 301 79 43 chr5 30568582 30568721 -121968538 - MLT1F2 LTR MaLR -405 155 12 1 818 882 224 215 10 chr5 30569184 30569491 -121967768 - MTE2b LTR MaLR 0 379 10 1 818 269 167 11 97 chr5 30573334 30573427 -121963832 + RLTR25B LTR ERVK 424 508 -520 1 818 347 155 17 17 chr5 30578178 30578259 -121959000 - RLTR9A2 LTR ERVK -96 324 222 1 818 1437 124 127 25 chr5 30578665 30578980 -121958279 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 41 1 818 1761 133 142 4 chr5 30590423 30590784 -121946475 - RMER16 LTR ERVK -1 532 1 2 818 1103 197 109 15 chr5 30591339 30591679 -121945580 - MTEb LTR MaLR 0 379 8 2 818 2079 183 71 47 chr5 30601751 30602243 -121935016 + RMER20A LTR ERVK 11 514 -2 2 818 1457 163 58 63 chr5 30602863 30603211 -121934048 - MT2B LTR ERVL -59 542 197 2 818 267 53 0 0 chr5 30603230 30603268 -121933991 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 818 275 214 86 43 chr5 30603268 30603361 -121933898 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 544 2 818 9073 147 72 5 chr5 30603361 30604848 -121932411 - MERVL_2A-int LTR ERVL -153 5608 4022 2 818 4975 118 50 1 chr5 30604948 30605667 -121931592 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1932 3829 3076 2 818 3141 173 68 2 chr5 30605674 30606237 -121931022 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3664 2097 1498 2 818 291 179 0 0 chr5 30606629 30606685 -121930574 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4429 1332 1277 2 818 313 352 0 0 chr5 30608783 30608905 -121928354 - HERV16-int LTR ERVL -3209 2552 2431 2 818 413 322 73 0 chr5 30609145 30609350 -121927909 - HERV16-int LTR ERVL -3049 1947 1728 2 818 3312 122 59 136 chr5 30611322 30612070 -121925189 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 818 248 291 95 78 chr5 30615736 30615915 -121921344 - RLTR25B LTR ERVK -493 535 354 2 818 2090 156 34 99 chr5 30642457 30642806 -121894453 + MTC LTR MaLR 1 329 -92 2 818 2090 156 34 99 chr5 30642949 30643041 -121894218 + MTC LTR MaLR 330 413 -8 2 818 477 269 186 4 chr5 30643442 30643672 -121893587 - MTE2a LTR MaLR -2 377 3 2 818 264 246 33 139 chr5 30643834 30643985 -121893274 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 123 2 818 674 253 72 0 chr5 30646947 30647113 -121890146 - MTE2b LTR MaLR 0 379 202 2 818 226 317 0 0 chr5 30647224 30647284 -121889975 - MTE2b LTR MaLR -171 208 149 2 818 263 329 14 0 chr5 30647334 30647404 -121889855 - MTE2b LTR MaLR -308 71 1 2 818 339 217 69 167 chr5 30649782 30649998 -121887261 - MTEb LTR MaLR -39 340 146 3 818 2226 77 3 138 chr5 30654837 30654907 -121882352 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 280 3 818 2226 77 3 138 chr5 30655053 30655359 -121881900 - ORR1A3 LTR MaLR -47 279 1 3 818 242 173 101 51 chr5 30656383 30656462 -121880797 + RLTR25B LTR ERVK 427 509 -519 3 818 236 293 26 124 chr5 30658663 30658776 -121878483 + RLTR44B LTR ERVK 178 279 -170 3 818 2268 155 104 5 chr5 30664799 30665182 -121872077 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 819 1953 147 97 23 chr5 30699383 30699725 -121837534 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 819 471 243 140 9 chr5 30731584 30731800 -121805459 + RMER20B LTR ERVK 132 386 -130 4 819 2106 141 108 5 chr5 30732715 30733087 -121804172 + MTC LTR MaLR 4 413 -8 4 819 545 244 21 38 chr5 30733880 30734077 -121803182 + MLT1A1 LTR MaLR 166 408 0 4 819 373 289 163 10 chr5 30735452 30735648 -121801611 + MLT1H LTR MaLR 57 282 -267 4 819 1638 233 29 10 chr5 30748507 30748918 -121788341 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 819 666 235 147 23 chr5 30751712 30751930 -121785329 + MTD LTR MaLR 1 245 -174 4 819 274 185 11 147 chr5 30751947 30751983 -121785276 + MTD LTR MaLR 340 374 -47 4 819 274 185 11 147 chr5 30752135 30752193 -121785066 + MTD LTR MaLR 375 421 0 4 819 2167 140 60 10 chr5 30757066 30757449 -121779810 + MTC LTR MaLR 12 413 -8 4 819 269 261 15 0 chr5 30757453 30757518 -121779741 + RMER15-int LTR ERVL 270 335 -4664 4 819 261 267 152 0 chr5 30767572 30767677 -121769582 - MTEa LTR MaLR 0 379 259 5 819 227 293 12 62 chr5 30767938 30768018 -121769241 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 166 5 819 1691 157 111 31 chr5 30774648 30775036 -121762223 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 819 1146 183 20 56 chr5 30776749 30776998 -121760261 - ORR1B2 LTR MaLR -3 364 125 5 819 721 136 254 53 chr5 30777195 30777404 -121759855 - ORR1B2 LTR MaLR -116 251 1 5 819 3875 184 16 20 chr5 30780047 30780781 -121756478 + ORR1C2-int LTR MaLR 757 1487 -22 5 819 1684 134 103 66 chr5 30780778 30781128 -121756131 + ORR1C2 LTR MaLR 22 384 0 5 819 1304 226 89 51 chr5 30782022 30782437 -121754822 - RMER5 LTR ERV1 -31 503 73 5 819 2016 207 32 12 chr5 30783236 30783637 -121753622 - MTD LTR MaLR -9 410 2 5 819 276 242 61 0 chr5 30791813 30791879 -121745380 + MLT1J LTR MaLR 89 158 -354 5 819 292 344 31 31 chr5 30793309 30793438 -121743821 + MLT1J LTR MaLR 92 220 -292 5 819 250 271 89 128 chr5 30793490 30793693 -121743566 + MLT1J LTR MaLR 226 420 -92 5 819 432 340 38 86 chr5 30795558 30795825 -121741434 + MLT1E3 LTR MaLR 253 506 -118 5 819 649 189 15 30 chr5 30797719 30797850 -121739409 + MLT2B2 LTR ERVL 1 129 -386 5 819 240 235 0 0 chr5 30798004 30798055 -121739204 + RMER15 LTR ERVL 403 453 -122 5 819 303 324 118 0 chr5 30798568 30798704 -121738555 + MLT2B2 LTR ERVL 333 484 -78 5 819 237 213 21 0 chr5 30799309 30799356 -121737903 - MLT2B1 LTR ERVL -246 274 227 5 819 555 301 29 104 chr5 30799801 30800187 -121737072 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 5 820 1229 261 49 30 chr5 30803414 30803781 -121733478 + MLT1C LTR MaLR 3 376 -91 5 820 495 242 115 30 chr5 30805000 30805200 -121732059 + RMER15 LTR ERVL 339 555 -20 5 820 3435 28 2 8 chr5 30805503 30805901 -121731358 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 820 346 42 146 0 chr5 30808504 30808552 -121728707 - ORR1A1 LTR MaLR 0 326 272 5 820 2352 53 20 0 chr5 30808751 30809049 -121728210 - ORR1A1 LTR MaLR -42 304 1 5 820 13974 58 12 3 chr5 30809049 30810824 -121726435 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 5 820 877 45 9 0 chr5 30810824 30810935 -121726324 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 364 5 820 1408 30 0 0 chr5 30810935 30811100 -121726159 - MT2C_Mm LTR ERVL -310 165 1 5 820 234 216 239 0 chr5 30811597 30811685 -121725574 + MT2C_Mm LTR ERVL 193 301 -174 5 820 2596 42 6 228 chr5 30813275 30813771 -121723488 + RLTR10 LTR ERVK 1 386 -4 6 820 1546 217 140 8 chr5 30823491 30823849 -121713410 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 820 271 325 39 31 chr5 30838557 30838687 -121698572 + LTR33 LTR ERVL 54 184 -331 6 820 3160 34 45 0 chr5 30844303 30844682 -121692577 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 820 627 280 67 108 chr5 30844972 30845344 -121691915 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 6 820 4843 31 0 2 chr5 30847437 30848016 -121689243 - MERVL-int LTR ERVL -381 5104 4527 6 820 232 289 138 15 chr5 30848670 30848800 -121688459 - LTR33 LTR ERVL -3 512 367 6 820 2585 68 12 0 chr5 30851818 30852141 -121685118 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 820 235 361 146 94 chr5 30853787 30853950 -121683309 + LTR16E1 LTR ERVL 1 179 -359 6 820 235 361 146 94 chr5 30854120 30854231 -121683028 + LTR16E1 LTR ERVL 180 289 -249 6 820 3559 20 2 0 chr5 30855094 30855489 -121681770 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 820 2673 68 6 0 chr5 30855510 30855835 -121681424 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 820 225 341 107 12 chr5 30861775 30861944 -121675315 - MLT1K LTR MaLR -5 590 406 6 820 297 276 52 13 chr5 30866014 30866091 -121671168 + LTR16B1 LTR ERVL 150 229 -251 6 820 393 291 91 64 chr5 30866545 30866893 -121670366 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 1 6 820 839 249 167 15 chr5 30868636 30868945 -121668314 - MTE2b LTR MaLR -13 366 59 7 820 487 176 24 0 chr5 30869007 30869092 -121668167 - MTE2b LTR MaLR -289 90 4 7 820 1065 271 107 14 chr5 30871876 30872221 -121665038 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 7 820 1673 167 106 12 chr5 30876308 30876648 -121660611 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 7 820 247 337 59 0 chr5 30876712 30876813 -121660446 + MLT1N2 LTR MaLR 113 219 -343 7 820 581 340 14 14 chr5 30876862 30877071 -121660188 + MLT1N2 LTR MaLR 337 545 -17 7 820 338 349 31 44 chr5 30898583 30898742 -121638517 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 209 7 820 383 270 108 0 chr5 30898965 30899076 -121638183 - MLT1A0 LTR MaLR -217 148 26 7 820 1384 189 141 18 chr5 30899359 30899699 -121637560 - MTD LTR MaLR -27 392 11 7 820 251 326 35 113 chr5 30900006 30900262 -121636997 - MLT2C1 LTR ERVL 0 397 162 7 820 289 308 37 37 chr5 30900302 30900410 -121636849 - MLT1E3 LTR MaLR -452 172 65 7 820 397 240 60 0 chr5 30900319 30900419 -121636840 - MLT2C1 LTR ERVL -257 140 35 7 820 1182 196 83 172 chr5 30911005 30911412 -121625847 - MTE2a LTR MaLR -4 375 5 7 820 2840 31 2 208 chr5 30914551 30915042 -121622217 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 7 820 257 292 99 35 chr5 30932322 30932464 -121604795 + MLT1L LTR MaLR 239 389 -221 8 821 231 261 28 28 chr5 30935606 30935677 -121601582 + MER66C LTR ERV1 428 498 -57 8 821 297 212 41 133 chr5 30945339 30945356 -121591903 + MT2B LTR ERVL 151 158 -443 8 821 1435 167 191 12 chr5 30954527 30954873 -121582386 - RMER17C LTR ERVK -2 408 1 8 821 2378 99 87 97 chr5 30962255 30962407 -121574852 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 276 8 821 2378 99 87 97 chr5 30962539 30962583 -121574676 - RLTR9B2 LTR ERVK -145 275 261 8 821 2378 99 87 97 chr5 30962604 30962830 -121574429 - RLTR9B2 LTR ERVK -160 260 1 8 821 1745 214 45 55 chr5 30963330 30963805 -121573454 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 8 821 2195 217 132 30 chr5 30964875 30965622 -121571637 - RMER13A LTR ERVK 0 860 2 8 821 754 291 100 67 chr5 30967274 30967818 -121569441 + RMER13A LTR ERVK 113 697 -211 8 821 647 274 47 126 chr5 30970146 30970523 -121566736 + RLTR12B LTR ERVK 1 396 -132 8 821 647 260 39 138 chr5 30970669 30970720 -121566539 + RLTR12B LTR ERVK 397 451 -77 8 821 1089 226 174 26 chr5 30971931 30972281 -121564978 + MTD LTR MaLR 6 407 -12 8 821 311 299 51 77 chr5 30978022 30978178 -121559081 + MTEb LTR MaLR 228 379 0 9 821 227 267 117 33 chr5 30978679 30978799 -121558460 - LTR33A_ LTR ERVL -353 178 49 9 821 383 234 73 18 chr5 30980201 30980215 -121557044 + ORR1A3-int LTR MaLR 591 610 -1353 9 821 987 56 0 23 chr5 30980215 30980341 -121556918 + MT2B2 LTR ERVL 1 123 -461 9 821 1323 141 19 10 chr5 30980341 30980549 -121556710 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 210 -596 9 821 694 93 0 0 chr5 30980543 30980640 -121556619 + RLTR13D1 LTR ERVK 542 638 -395 9 821 464 35 11 0 chr5 30981138 30981202 -121556057 + RLTR13D6 LTR ERVK 625 677 -356 9 821 484 164 0 0 chr5 30981199 30981272 -121555987 + RLTR13D6 LTR ERVK 829 901 -1 9 821 3210 94 20 5 chr5 30981272 30981721 -121555538 + MT2B2 LTR ERVL 117 572 -12 9 821 2422 130 152 23 chr5 30981973 30982414 -121554845 + RLTR19 LTR ERVK 2 499 0 9 821 2147 101 97 4 chr5 30985593 30985944 -121551315 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 9 821 4003 155 96 83 chr5 30986665 30987532 -121549727 - RMER19B LTR ERVK -17 885 8 9 821 1286 265 112 0 chr5 30988690 30989030 -121548229 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 9 821 748 180 72 42 chr5 30992295 30992470 -121544789 - MTC LTR MaLR -41 380 163 9 821 1014 168 109 14 chr5 30992936 30993147 -121544112 - MTC LTR MaLR -190 231 1 9 821 236 254 34 42 chr5 30993781 30993900 -121543359 - RLTR40 LTR ERVK -140 677 560 9 821 404 282 138 24 chr5 30994008 30994175 -121543084 + MLT1B LTR MaLR 193 378 -12 9 821 1351 63 5 45 chr5 30995611 30995810 -121541449 + RMER10B LTR ERVL 1 191 -207 9 821 1116 183 15 5 chr5 30998619 30998822 -121538437 + RMER10B LTR ERVL 194 398 0 9 821 623 275 88 20 chr5 31001924 31002128 -121535131 - MTEa LTR MaLR -161 218 1 7 821 297 333 108 0 chr5 31003001 31003130 -121534129 + ORR1E LTR MaLR 3 145 -214 1 821 2413 44 0 0 chr5 31003294 31003587 -121533672 + ORR1A2 LTR MaLR 1 293 -34 1 821 2301 154 59 34 chr5 31003592 31004197 -121533062 - RMER17A2 LTR ERVK -215 691 1 1 821 335 120 0 0 chr5 31004197 31004237 -121533022 + ORR1A3 LTR MaLR 287 326 0 1 821 312 179 18 0 chr5 31004247 31004303 -121532956 + MTEa LTR MaLR 319 375 -4 1 821 1931 165 42 35 chr5 31005044 31005250 -121532009 - RMER10B LTR ERVL 0 398 189 1 821 1931 165 42 35 chr5 31005331 31005500 -121531759 - RMER10B LTR ERVL -210 188 20 1 821 251 284 10 111 chr5 31007864 31007963 -121529296 + MTE2a LTR MaLR 2 90 -289 2 821 2107 204 72 51 chr5 31008408 31008894 -121528365 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 4 2 821 271 204 160 20 chr5 31008917 31009017 -121528242 - MTEb LTR MaLR 0 379 266 2 821 490 236 16 147 chr5 31009249 31009433 -121527826 - MTEb LTR MaLR 0 379 220 3 821 731 248 144 0 chr5 31009681 31009883 -121527376 - MTEb LTR MaLR -146 233 3 3 821 507 315 38 57 chr5 31019791 31020000 -121517259 - MLT2C1 LTR ERVL -77 320 116 4 821 381 285 119 52 chr5 31025155 31025360 -121511899 - ORR1E LTR MaLR -111 248 19 6 821 1638 165 46 74 chr5 31028396 31028844 -121508415 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 821 830 232 384 21 chr5 31028992 31029242 -121508017 - MTE2a LTR MaLR -1 378 36 6 821 253 288 0 88 chr5 31029447 31029487 -121507772 - MTE2a LTR MaLR -344 35 1 6 821 542 259 136 50 chr5 31033972 31034252 -121503007 - ORR1E LTR MaLR -5 354 51 7 821 967 171 93 42 chr5 31038206 31038703 -121498556 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 8 821 710 308 101 54 chr5 31041505 31041820 -121495439 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 19 8 821 533 275 136 117 chr5 31042885 31043252 -121494007 - MLT1B LTR MaLR -1 389 16 8 821 1996 123 195 0 chr5 31045026 31045359 -121491900 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 9 821 1376 231 121 15 chr5 31045593 31045931 -121491328 + MTD LTR MaLR 34 407 -12 9 821 280 279 138 93 chr5 31048905 31049158 -121488101 - RLTR47_MM LTR ERV1 -56 476 242 1 821 717 257 164 109 chr5 31055867 31056299 -121480960 - MLT1E3 LTR MaLR -18 606 151 1 821 945 62 15 15 chr5 31060821 31060953 -121476306 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 259 1 821 265 183 0 0 chr5 31060959 31061019 -121476240 - RLTR10 LTR ERVK -72 318 259 1 821 2224 39 3 111 chr5 31061053 31061397 -121475862 - RLTR10 LTR ERVK -83 307 1 1 821 8583 16 1 2 chr5 31061397 31062393 -121474866 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 992 1 821 283 297 39 15 chr5 31062477 31062607 -121474652 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 1 821 7373 39 10 38 chr5 31062671 31063656 -121473603 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 41 1 821 945 62 15 15 chr5 31063666 31063798 -121473461 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 259 1 821 265 183 0 0 chr5 31063804 31063864 -121473395 - RLTR10 LTR ERVK -72 318 259 1 102 2224 39 3 111 chr5 31063898 31064242 -121473017 - RLTR10 LTR ERVK -83 307 1 1 822 2809 142 110 23 chr5 31066685 31067212 -121470047 - RMER15 LTR ERVL -2 573 1 1 822 2153 125 65 20 chr5 31069429 31069780 -121467479 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 822 1012 176 173 23 chr5 31076055 31076380 -121460879 + MTD LTR MaLR 1 413 -8 1 822 489 265 119 68 chr5 31081493 31081728 -121455531 - ORR1E LTR MaLR -105 254 8 1 822 1022 236 118 52 chr5 31087145 31087494 -121449765 - MTEb LTR MaLR 0 379 8 1 822 904 199 111 15 chr5 31091273 31091554 -121445705 - MT2A LTR ERVL -8 525 163 1 822 379 230 0 26 chr5 31091641 31091717 -121445542 + MT2A LTR ERVL 76 149 -384 1 822 473 288 60 88 chr5 31094129 31094380 -121442879 - MLT1B LTR MaLR -146 244 1 2 822 361 250 168 10 chr5 31094989 31095090 -121442169 - ORR1E LTR MaLR -242 117 1 2 822 680 165 47 0 chr5 31102041 31102168 -121435091 - ORR1B1 LTR MaLR -44 350 218 2 822 758 158 204 11 chr5 31102341 31102527 -121434732 - ORR1B1 LTR MaLR -171 223 2 2 822 3828 159 83 13 chr5 31102528 31103279 -121433980 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 707 2 822 2115 139 11 9 chr5 31109371 31109735 -121427524 + ORR1A4 LTR MaLR 6 367 0 2 822 258 276 47 142 chr5 31109685 31109875 -121427384 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 175 2 822 1871 154 265 47 chr5 31110797 31111149 -121426110 + RLTR20A1 LTR ERVK 15 449 -102 2 822 1871 154 22 58 chr5 31111207 31111275 -121425984 + RLTR20A1 LTR ERVK 450 509 -42 2 822 641 295 158 11 chr5 31112613 31112897 -121424362 + MLT1G-int LTR MaLR 1122 1447 -42 2 822 327 364 79 7 chr5 31113606 31113758 -121423501 + MLT1G LTR MaLR 109 271 -320 2 822 247 206 202 20 chr5 31113813 31113912 -121423347 + MLT1G LTR MaLR 396 512 -57 2 822 1093 167 22 181 chr5 31114787 31115057 -121422202 + RMER19B LTR ERVK 1 227 -675 2 822 2754 175 58 31 chr5 31115073 31115622 -121421637 + RMER19B LTR ERVK 339 902 0 2 822 268 327 48 19 chr5 31129183 31129286 -121407973 - ORR1E LTR MaLR -248 111 6 2 822 1858 154 146 19 chr5 31131890 31132007 -121405252 - MTC LTR MaLR 0 421 305 2 822 1858 154 146 19 chr5 31132199 31132445 -121404814 - MTC LTR MaLR -117 304 13 2 822 520 271 108 22 chr5 31135187 31135410 -121401849 - RLTR15 LTR ERVK -117 242 1 2 822 528 307 90 31 chr5 31135749 31135971 -121401288 + MLT1C LTR MaLR 227 461 -6 2 822 548 299 383 7 chr5 31135969 31136244 -121401015 - MLT1D LTR MaLR -108 397 20 2 822 1993 132 81 0 chr5 31139553 31139885 -121397374 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 2 822 3493 23 5 0 chr5 31141530 31141924 -121395335 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 822 1430 164 55 33 chr5 31144538 31144809 -121392450 - MTC LTR MaLR -139 282 6 3 822 1027 244 77 103 chr5 31150505 31150894 -121386365 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 822 1437 159 32 8 chr5 31162386 31162633 -121374626 - RLTR22_Mur LTR ERVK -5 1843 1591 3 822 5382 75 56 1 chr5 31162854 31163623 -121373636 - RLTR22_Mus LTR ERVK -997 811 1 3 822 267 161 125 0 chr5 31180099 31180155 -121357104 - LTR83 LTR ERVL -61 719 657 3 822 2734 55 3 0 chr5 31187430 31187756 -121349503 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 823 297 244 0 95 chr5 31231471 31231566 -121305693 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 4 823 247 253 20 121 chr5 31239757 31239774 -121297485 + MT2B2 LTR ERVL 152 240 -344 4 823 1380 173 24 166 chr5 31242540 31243004 -121294255 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 823 232 314 29 19 chr5 31244200 31244304 -121292955 + MLT1G1 LTR MaLR 18 122 -447 4 823 283 336 88 24 chr5 31244460 31244585 -121292674 + MLT1G1 LTR MaLR 408 540 -39 4 823 435 300 47 59 chr5 31249518 31249688 -121287571 + MLT1A0 LTR MaLR 161 328 -37 4 823 232 140 20 20 chr5 31249909 31249960 -121287299 + MLT1A0 LTR MaLR 350 400 -8 4 823 372 237 47 78 chr5 31250674 31250802 -121286457 - MT2B LTR ERVL -323 278 155 4 823 987 350 80 66 chr5 31263370 31264004 -121273255 + MER21B LTR ERV1 166 808 -55 5 823 426 301 84 128 chr5 31265318 31265763 -121271496 + RMER20B LTR ERVK 98 570 -57 5 823 1856 194 60 8 chr5 31266402 31266802 -121270457 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 823 227 293 125 39 chr5 31267306 31267434 -121269825 - MLT1A1 LTR MaLR -267 141 3 5 823 292 189 78 39 chr5 31267639 31267716 -121269543 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 430 5 823 4737 114 128 3 chr5 31272887 31273739 -121263520 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 5 823 236 339 10 9 chr5 31278649 31278771 -121258488 + MLT2B3 LTR ERVL 5 123 -397 5 823 284 292 14 137 chr5 31279021 31279160 -121258099 + MTEa LTR MaLR 240 361 -18 5 823 515 169 11 0 chr5 31282771 31282860 -121254399 - MTC LTR MaLR 0 419 330 5 823 3942 93 39 5 chr5 31283181 31283741 -121253518 - MT2B2 LTR ERVL -5 579 1 5 823 1967 141 3 59 chr5 31283752 31284092 -121253167 - MTC LTR MaLR -100 321 1 5 823 316 257 95 30 chr5 31284188 31284316 -121252943 + MTE2a LTR MaLR 1 124 -295 5 823 781 294 87 29 chr5 31284443 31284720 -121252539 + MTE2a LTR MaLR 81 373 -6 5 823 294 260 56 65 chr5 31284822 31284929 -121252330 + LTR50 LTR ERVL 77 182 -613 5 823 234 272 116 58 chr5 31287643 31287729 -121249530 + MT2B LTR ERVL 167 257 -344 5 823 2853 9 28 0 chr5 31290406 31290724 -121246535 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 823 1075 223 165 36 chr5 31292000 31292203 -121245056 + MTD LTR MaLR 1 210 -209 5 823 1075 218 163 28 chr5 31292393 31292545 -121244714 + MTD LTR MaLR 201 406 -13 5 823 636 132 37 31 chr5 31292873 31293044 -121244215 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -169 272 1 5 823 1957 178 61 3 chr5 31293260 31293621 -121243638 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 5 823 2032 137 121 11 chr5 31293625 31293980 -121243279 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 823 4073 123 70 17 chr5 31294196 31294891 -121242368 - RMER6A LTR ERVK 0 756 25 5 823 305 323 162 71 chr5 31297014 31297297 -121239962 + MLT1L LTR MaLR 102 410 -200 6 823 4231 48 2 4 chr5 31299031 31299535 -121237724 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 6 823 260 332 139 43 chr5 31300125 31300333 -121236926 + MLT1N2 LTR MaLR 335 562 0 6 823 1545 166 61 14 chr5 31302133 31302426 -121234833 - RMER5 LTR ERV1 -5 529 223 6 823 412 330 57 66 chr5 31306828 31307285 -121229974 + MER52-int LTR ERV1 4664 5116 -1975 6 823 1993 154 58 6 chr5 31307756 31308115 -121229144 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 823 255 342 62 44 chr5 31308127 31308402 -121228857 + MER52-int LTR ERV1 5606 5885 -1206 6 823 876 189 57 38 chr5 31308831 31309040 -121228219 + ORR1C2 LTR MaLR 172 384 0 6 823 1478 168 93 29 chr5 31310928 31311313 -121225946 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 823 521 231 76 14 chr5 31312041 31312186 -121225073 - RLTR42-int LTR ERVK -4150 1372 1219 6 823 330 161 18 0 chr5 31312321 31312377 -121224882 - RLTR11A2 LTR ERVK -25 502 446 6 823 1921 206 61 16 chr5 31312584 31313028 -121224231 - RLTR11A2 LTR ERVK -63 464 1 6 823 2227 238 73 50 chr5 31315902 31316539 -121220720 + RLTR18 LTR ERVK 1 568 -48 6 823 349 229 132 0 chr5 31317091 31317182 -121220077 - RLTR42-int LTR ERVK -3774 1748 1639 6 823 1522 169 44 74 chr5 31319191 31319212 -121218047 - RLTR14 LTR ERV1 -47 335 319 6 823 1522 169 44 74 chr5 31319276 31319438 -121217821 - RLTR14 LTR ERV1 -64 318 162 6 823 1522 169 44 74 chr5 31319585 31319739 -121217520 - RLTR14 LTR ERV1 -221 161 7 6 823 1264 132 84 80 chr5 31319916 31320145 -121217114 - RLTR14-int LTR ERV1 -268 5049 4808 6 823 14285 173 147 64 chr5 31320304 31321272 -121215987 - RLTR14-int LTR ERV1 -510 4807 3693 6 823 3923 124 131 8 chr5 31321272 31321928 -121215331 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 6 823 14285 174 72 63 chr5 31321928 31322277 -121214982 - RLTR14-int LTR ERV1 -1625 3692 3349 6 823 14285 174 72 63 chr5 31322630 31323330 -121213929 - RLTR14-int LTR ERV1 -1969 3348 2660 6 823 14285 174 72 63 chr5 31323463 31324400 -121212859 - RLTR14-int LTR ERV1 -2658 2659 1743 6 823 14285 174 72 63 chr5 31324592 31324817 -121212442 - RLTR14-int LTR ERV1 -3575 1742 1536 6 823 296 243 42 14 chr5 31324826 31324897 -121212362 + RLTR14-int LTR ERV1 1912 1984 -3333 6 102 6563 165 72 102 chr5 31324893 31326478 -121210781 - RLTR14-int LTR ERV1 -3779 1538 2 6 824 2182 142 18 40 chr5 31326490 31326870 -121210389 - RLTR14 LTR ERV1 -10 372 1 6 824 926 180 122 33 chr5 31327140 31327331 -121209928 + RLTR33 LTR ERVK 1 210 -468 6 824 3615 150 72 55 chr5 31327331 31327655 -121209604 + RMER19A LTR ERVK 1 356 -381 6 824 3615 150 72 55 chr5 31327802 31328184 -121209075 + RMER19A LTR ERVK 357 719 -18 6 824 236 0 0 0 chr5 31328591 31328618 -121208641 + RMER19A LTR ERVK 711 737 0 6 824 1902 157 142 42 chr5 31328618 31329049 -121208210 + RLTR33 LTR ERVK 205 678 0 6 824 365 265 118 28 chr5 31337334 31337595 -121199664 + RLTR12B LTR ERVK 1 311 -217 7 824 284 288 18 46 chr5 31349018 31349127 -121188132 + MT2B2 LTR ERVL 152 257 -327 7 824 2649 99 10 27 chr5 31373382 31373676 -121163583 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 117 8 824 3089 62 31 8 chr5 31373676 31374067 -121163192 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 824 2649 99 10 27 chr5 31374067 31374186 -121163073 - MTB_Mm LTR MaLR -291 116 1 8 824 2382 51 13 0 chr5 31399396 31399711 -121137548 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 824 310 228 19 132 chr5 31401066 31401082 -121136177 + MT2B LTR ERVL 151 154 -447 8 824 2607 78 60 0 chr5 31401249 31401646 -121135613 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 8 824 324 175 0 0 chr5 31404653 31404710 -121132549 + MT2A LTR ERVL 1 57 -476 8 824 990 195 216 31 chr5 31405003 31405320 -121131939 + MT2A LTR ERVL 81 429 -104 8 824 1705 162 116 20 chr5 31405320 31405666 -121131593 - RLTR30 LTR ERV1 0 379 1 8 824 990 191 236 31 chr5 31405666 31405713 -121131546 + MT2A LTR ERVL 430 474 -59 8 824 3302 33 2 0 chr5 31415723 31416118 -121121141 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 824 9179 20 2 1 chr5 31416118 31417215 -121120044 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 8 824 3302 33 2 0 chr5 31417215 31417610 -121119649 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 824 1405 169 51 44 chr5 31417705 31417978 -121119281 + RLTR41 LTR ERV1 172 446 0 8 824 267 232 35 124 chr5 31422809 31422922 -121114337 + MT2B2 LTR ERVL 152 254 -330 9 824 289 213 0 96 chr5 31424216 31424299 -121112960 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 498 9 824 589 196 64 14 chr5 31429827 31429967 -121107292 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 379 9 824 261 229 43 0 chr5 31430325 31430395 -121106864 - RMER5 LTR ERV1 -133 401 329 9 824 718 283 47 72 chr5 31430556 31430876 -121106383 - RMER5 LTR ERV1 -190 344 33 9 824 293 347 111 39 chr5 31431769 31432048 -121105211 - MLT1J LTR MaLR -172 340 42 9 824 1903 138 30 27 chr5 31433688 31434023 -121103236 - MTC LTR MaLR -69 352 17 9 824 462 225 93 80 chr5 31446306 31446456 -121090803 - MT2B LTR ERVL -337 264 113 9 824 452 160 68 105 chr5 31453284 31453417 -121083842 + MT2B LTR ERVL 137 264 -337 9 825 1614 118 283 0 chr5 31464848 31465152 -121072107 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 1 825 8361 157 50 109 chr5 31465153 31467240 -121070019 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 1 1 825 941 146 466 4 chr5 31467240 31467509 -121069750 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 825 365 261 11 33 chr5 31471601 31471692 -121065567 + MTE2b LTR MaLR 9 97 -282 1 825 987 256 57 81 chr5 31471876 31472174 -121065085 + MTE2b LTR MaLR 75 365 -14 1 825 603 94 62 0 chr5 31484385 31484481 -121052778 + RMER6B LTR ERVK 1 102 -359 1 825 644 158 186 48 chr5 31484573 31484813 -121052446 + RMER6B LTR ERVK 78 392 -69 1 825 386 258 0 130 chr5 31511063 31511201 -121026058 - MT2B LTR ERVL -337 264 145 1 825 305 268 36 12 chr5 31513883 31513966 -121023293 + MLT1A1 LTR MaLR 320 404 -4 1 825 231 288 45 0 chr5 31517426 31517492 -121019767 - MER21B LTR ERV1 -297 566 498 3 825 909 293 157 12 chr5 31517536 31517881 -121019378 - MER21B LTR ERV1 -467 396 2 3 825 407 199 89 122 chr5 31521117 31521249 -121016010 - ORR1B1-int LTR MaLR -862 647 524 5 825 3707 45 5 2 chr5 31525242 31525688 -121011571 - LTRIS5 LTR ERV1 0 447 1 6 825 351 282 131 94 chr5 31529275 31529650 -121007609 + MER74B LTR ERVL 72 487 -71 7 825 289 293 99 87 chr5 31539675 31539697 -120997562 + MT2B LTR ERVL 78 112 -489 9 825 289 293 99 87 chr5 31539759 31539836 -120997423 + MT2B LTR ERVL 113 240 -361 9 825 307 356 65 37 chr5 31559437 31559653 -120977606 + RMER12 LTR ERVK 737 958 -364 1 825 252 360 30 67 chr5 31561864 31562028 -120975231 + MTEa LTR MaLR 15 172 -207 1 825 961 262 247 12 chr5 31561887 31562300 -120974959 + MLT2B4 LTR ERVL 39 548 -8 1 825 1309 182 180 9 chr5 31572797 31573113 -120964146 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 1 825 455 90 25 13 chr5 31578687 31578766 -120958493 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 730 1 825 232 36 0 0 chr5 31578763 31578791 -120958468 - RMER17D2 LTR ERVK -781 28 1 1 825 256 279 8 112 chr5 31585704 31585829 -120951430 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 1 826 1933 166 119 5 chr5 31610742 31611111 -120926148 - MTD LTR MaLR -8 411 1 2 826 767 192 102 10 chr5 31613798 31614003 -120923256 - MTD LTR MaLR 0 419 196 2 826 578 182 220 0 chr5 31614406 31614564 -120922695 - MTD LTR MaLR -211 210 18 2 826 941 207 167 49 chr5 31617303 31617669 -120919590 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 2 826 516 143 173 8 chr5 31617669 31617796 -120919463 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 4697 2 826 698 192 63 35 chr5 31617799 31618051 -120919208 - RLTR13B1 LTR ERVK -465 437 153 2 826 7380 111 9 1 chr5 31618051 31619025 -120918234 - ETnERV2-int LTR ERVK -203 7203 6222 2 826 16694 187 25 14 chr5 31619074 31623746 -120913513 - ETnERV2-int LTR ERVK -1179 6227 841 2 826 1694 170 101 26 chr5 31624028 31624373 -120912886 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 2 826 1233 239 104 11 chr5 31625094 31625441 -120911818 - MTD LTR MaLR 0 419 41 2 826 3169 145 52 84 chr5 31627241 31627872 -120909387 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 2 2 826 358 345 45 35 chr5 31628126 31628436 -120908823 - MLT1K LTR MaLR -257 338 26 2 826 4302 25 0 2 chr5 31631326 31631809 -120905450 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 2 826 22556 52 2 27 chr5 31631809 31634628 -120902631 - MuRRS-int LTR ERV1 0 4690 1941 2 826 906 46 0 0 chr5 31634625 31634733 -120902526 + MuRRS-int LTR ERV1 2385 2492 -2198 2 826 11673 57 24 6 chr5 31634731 31636408 -120900851 - MuRRS-int LTR ERV1 -2750 1940 1 2 826 1036 274 65 27 chr5 31636966 31637334 -120899925 - RodERV21-int LTR ERV1 -198 4793 4412 2 826 545 355 55 68 chr5 31637340 31637997 -120899262 - RodERV21-int LTR ERV1 -1444 3547 2900 2 826 293 158 26 62 chr5 31638524 31638636 -120898623 - MER52-int LTR ERV1 -2658 4948 4890 2 826 377 296 66 30 chr5 31639024 31639334 -120897925 - MER52-int LTR ERV1 -1973 5118 4978 2 826 259 374 13 18 chr5 31639633 31639859 -120897400 - MER52-int LTR ERV1 -3906 3695 3471 2 826 537 322 26 50 chr5 31640100 31640440 -120896819 - RodERV21-int LTR ERV1 -3017 4074 3743 2 826 4156 250 36 13 chr5 31640695 31641675 -120895584 - RodERV21-int LTR ERV1 -2273 2718 1717 2 826 267 290 76 121 chr5 31641743 31641900 -120895359 - RMER17C-int LTR ERVK -2714 524 375 2 826 3196 152 137 14 chr5 31642744 31642999 -120894260 + RMER19A LTR ERVK 1 287 -450 2 826 3310 53 5 0 chr5 31642999 31643397 -120893862 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 826 3196 152 137 14 chr5 31643397 31643797 -120893462 + RMER19A LTR ERVK 288 737 0 2 826 3214 53 8 0 chr5 31657643 31658040 -120879219 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 826 1122 270 35 3 chr5 31660723 31661039 -120876220 - MLT2C2 LTR ERVL -138 326 1 3 826 2360 166 87 35 chr5 31664154 31664661 -120872598 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 3 826 369 324 0 0 chr5 31667478 31667580 -120869679 + MTE2a LTR MaLR 20 121 -258 3 826 2955 193 58 53 chr5 31668098 31668606 -120868653 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 95 3 826 2955 193 58 53 chr5 31668641 31668734 -120868525 - RLTR1D LTR ERV1 -511 94 2 3 826 626 63 0 0 chr5 31668734 31668813 -120868446 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 3221 3 826 3194 94 9 7 chr5 31668867 31669297 -120867962 - MMVL30-int LTR ERV1 -68 3630 3200 3 826 2304 141 44 3 chr5 31671833 31672197 -120865062 + RLTR14 LTR ERV1 2 380 -2 3 826 262 372 13 22 chr5 31676657 31676885 -120860374 + MER52-int LTR ERV1 3470 3695 -3906 3 826 409 302 29 48 chr5 31677211 31677536 -120859723 + MER52-int LTR ERV1 4978 5118 -1973 3 826 3401 96 47 31 chr5 31677664 31678237 -120859022 - RMER17A LTR ERVK -169 582 1 3 826 1879 343 57 26 chr5 31678285 31679412 -120857847 + RodERV21-int LTR ERV1 3166 4327 -664 3 826 1591 178 62 12 chr5 31692316 31692709 -120844550 + RLTR1 LTR ERV1 126 624 0 3 826 2414 295 7 18 chr5 31693500 31694271 -120842988 + MYSERV6-int LTR ERVK 452 1213 -7746 3 826 7650 251 32 30 chr5 31694619 31696635 -120840624 + MYSERV6-int LTR ERVK 1244 3263 -5696 3 826 229 293 75 81 chr5 31704408 31704568 -120832691 - RMER4B LTR ERVK -80 505 347 3 826 886 309 35 27 chr5 31704624 31704990 -120832269 - RodERV21-int LTR ERV1 -198 4793 4425 3 826 225 354 12 0 chr5 31712300 31712382 -120824877 + LTR45C LTR ERV1 325 407 -132 3 826 1861 214 64 2 chr5 31717503 31717896 -120819363 - MTD LTR MaLR 0 419 3 3 827 859 237 69 124 chr5 31729854 31730216 -120807043 + MTE2b LTR MaLR 36 377 -2 3 827 364 338 0 44 chr5 31732217 31732353 -120804906 - MTE2a LTR MaLR -230 149 20 4 827 3582 72 146 30 chr5 31734589 31735115 -120802144 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 4 827 2147 170 87 34 chr5 31735465 31735959 -120801300 + RMER16 LTR ERVK 14 533 0 4 827 3478 30 4 128 chr5 31737215 31737713 -120799546 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 827 2496 86 9 0 chr5 31765120 31765444 -120771815 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 827 531 218 70 154 chr5 31766424 31766625 -120770634 - MTE2b LTR MaLR -193 186 3 4 827 1030 246 241 66 chr5 31766627 31766685 -120770574 - MTE2b-int LTR MaLR 0 1580 1539 4 827 1030 246 241 66 chr5 31766847 31767332 -120769927 - MTE2b-int LTR MaLR -42 1538 942 4 827 524 218 40 34 chr5 31770237 31770413 -120766846 - ORR1E LTR MaLR -182 177 1 4 827 1214 159 171 34 chr5 31773613 31773906 -120763353 - ORR1D1 LTR MaLR -41 333 1 4 827 394 179 62 12 chr5 31776358 31776461 -120760798 - ORR1D2 LTR MaLR -15 404 283 4 827 1666 117 69 20 chr5 31776455 31776760 -120760499 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 2 4 827 1542 177 35 24 chr5 31776851 31777207 -120760052 + ORR1D1 LTR MaLR 3 346 -28 4 827 487 284 29 33 chr5 31779962 31780148 -120757111 - RLTR16 LTR ERVK -219 309 1 4 827 1633 222 60 15 chr5 31785443 31785840 -120751419 - MTD LTR MaLR -2 417 3 4 827 2302 80 70 0 chr5 31786434 31786736 -120750523 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 4 827 361 216 83 124 chr5 31787630 31787674 -120749585 - MT2B2 LTR ERVL -431 153 117 5 827 1282 229 82 49 chr5 31788954 31789251 -120748008 - MTD LTR MaLR 0 419 104 5 827 1282 229 82 49 chr5 31789439 31789546 -120747713 - MTD LTR MaLR -316 103 2 5 827 2704 65 84 10 chr5 31791315 31791707 -120745552 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 5 827 394 168 18 1 chr5 31794272 31794363 -120742896 - ORR1C2 LTR MaLR -21 398 259 5 827 1555 149 155 3 chr5 31794357 31794660 -120742599 - ORR1C2 LTR MaLR -11 373 25 5 827 362 264 98 23 chr5 31794776 31794908 -120742351 - MTC LTR MaLR -279 142 1 5 827 235 182 0 43 chr5 31801915 31801961 -120735298 - MTEa LTR MaLR -76 303 260 5 827 249 259 57 88 chr5 31811955 31812185 -120725074 - ORR1E LTR MaLR -12 347 141 5 827 2103 169 223 54 chr5 31814920 31815440 -120721819 + RMER20B LTR ERVK 1 608 -19 5 827 785 150 510 24 chr5 31815519 31815765 -120721494 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 827 2964 184 95 30 chr5 31819350 31819983 -120717276 + RMER13A LTR ERVK 1 674 -186 5 827 277 171 211 14 chr5 31820008 31820079 -120717180 + RMER13A LTR ERVK 824 908 0 5 827 2384 177 49 12 chr5 31826325 31826417 -120710842 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 413 5 827 2384 177 49 12 chr5 31826482 31826876 -120710383 - RLTR16 LTR ERVK -93 412 2 5 827 231 306 122 61 chr5 31841036 31841151 -120696108 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 335 6 827 368 242 21 0 chr5 31844228 31844323 -120692936 - MTC LTR MaLR -324 97 1 6 827 347 266 219 57 chr5 31844365 31844644 -120692615 - MLT1B LTR MaLR -64 326 3 6 828 670 316 120 8 chr5 31851460 31851817 -120685442 - MER68 LTR ERVL -36 527 131 6 828 263 218 63 24 chr5 31852438 31852456 -120684803 + ORR1B1-int LTR MaLR 623 645 -864 6 828 276 208 12 111 chr5 31852672 31852753 -120684506 + MT2B LTR ERVL 168 240 -361 6 828 2466 85 19 0 chr5 31853997 31854316 -120682943 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 6 828 236 197 40 66 chr5 31856865 31856941 -120680318 - RMER5 LTR ERV1 -421 113 40 7 828 742 167 251 38 chr5 31858243 31858666 -120678593 + RLTR20A1 LTR ERVK 1 551 0 7 828 499 234 77 33 chr5 31862353 31862534 -120674725 - MTE2b LTR MaLR -25 354 166 7 828 601 221 97 0 chr5 31862635 31862789 -120674470 - MTE2b LTR MaLR -200 179 11 7 828 444 194 32 22 chr5 31871609 31871718 -120665541 - MLT1A1 LTR MaLR -26 382 243 7 828 314 169 76 33 chr5 31878160 31878252 -120659007 - RMER10A LTR ERVL -25 417 322 7 828 406 328 83 74 chr5 31879692 31880028 -120657231 - ORR1E LTR MaLR -18 341 3 7 828 1841 141 75 53 chr5 31886841 31887178 -120650081 + ORR1C2 LTR MaLR 1 347 -37 7 828 1841 141 75 53 chr5 31887370 31887408 -120649851 + ORR1C2 LTR MaLR 348 384 0 7 828 243 191 0 0 chr5 31892785 31892827 -120644432 + MTEb LTR MaLR 22 63 -316 7 828 758 270 51 0 chr5 31892865 31893061 -120644198 + MTEb LTR MaLR 174 379 0 7 828 276 275 23 91 chr5 31895488 31895620 -120641639 + MT2B LTR ERVL 151 273 -328 7 828 227 395 16 32 chr5 31896937 31897060 -120640199 + MLT1K LTR MaLR 214 334 -261 7 828 282 309 35 139 chr5 31898624 31898797 -120638462 - LTR85b LTR Gypsy? -581 203 49 8 828 2282 95 156 3 chr5 31906604 31906963 -120630296 - MTC LTR MaLR 0 421 8 8 828 675 228 272 5 chr5 31930295 31930509 -120606750 + MTD LTR MaLR 123 393 -26 8 828 274 315 406 37 chr5 31931605 31931879 -120605380 - MTEa LTR MaLR -1 378 5 8 828 2836 64 143 139 chr5 31933804 31934314 -120602945 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 8 828 2824 52 3 9 chr5 31942080 31942428 -120594831 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 9 828 301 191 167 11 chr5 31943713 31943803 -120593456 - MLT1B LTR MaLR 0 390 287 9 828 282 293 267 0 chr5 31952627 31952794 -120584465 + MLT1G3 LTR MaLR 292 503 -92 9 828 1571 163 72 0 chr5 31956105 31956408 -120580851 + ORR1D1 LTR MaLR 6 332 -42 9 828 1918 193 25 0 chr5 31956408 31956761 -120580498 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 17 9 828 286 161 89 0 chr5 31956757 31956813 -120580446 + ORR1D2 LTR MaLR 310 370 0 9 828 2115 99 3 19 chr5 31964063 31964382 -120572877 + ORR1A2 LTR MaLR 14 327 0 9 828 2642 178 74 34 chr5 31980126 31980353 -120556906 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 395 9 828 2642 178 74 34 chr5 31980572 31980936 -120556323 - RLTR18 LTR ERVK -222 394 1 9 103 1039 241 75 80 chr5 31981441 31981815 -120555444 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 9 829 1741 128 77 7 chr5 31982860 31983160 -120554099 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 1 829 589 297 160 16 chr5 31996213 31996638 -120540621 + MLT1D LTR MaLR 20 505 0 1 829 2257 67 13 0 chr5 31997543 31997858 -120539401 + ORR1A2 LTR MaLR 9 327 0 1 829 1242 242 76 22 chr5 32005098 32005453 -120531806 + MTD LTR MaLR 46 419 0 7 829 2819 191 183 36 chr5 32008874 32009654 -120527605 + RMER19B LTR ERVK 8 902 0 1 829 234 333 47 9 chr5 32012062 32012168 -120525091 + MLT1H LTR MaLR 105 214 -335 2 829 1069 275 92 24 chr5 32021786 32022121 -120515138 - MLT1A0 LTR MaLR -7 358 1 4 829 2164 165 107 93 chr5 32026603 32027427 -120509832 + RMER19B LTR ERVK 1 875 -27 4 829 2203 152 12 24 chr5 32028573 32028985 -120508274 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 829 285 188 0 0 chr5 32036214 32036262 -120500997 - MTC LTR MaLR 0 374 327 6 829 387 266 93 7 chr5 32036247 32036387 -120500872 - MTC LTR MaLR -264 157 6 6 829 434 213 23 56 chr5 32048682 32048720 -120488539 + MT2B LTR ERVL 156 195 -389 9 829 492 236 0 39 chr5 32056517 32056645 -120480614 + ORR1E-int LTR MaLR 20 142 -1116 1 829 858 251 175 32 chr5 32056638 32057059 -120480200 + ORR1E-int LTR MaLR 639 1319 -644 1 829 337 315 117 60 chr5 32057053 32057254 -120480005 + ORR1E LTR MaLR 106 341 -38 1 829 685 295 170 95 chr5 32057567 32058091 -120479168 + MLT1G LTR MaLR 31 593 -2 1 829 3337 39 5 12 chr5 32058268 32058682 -120478577 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 829 800 216 287 24 chr5 32064371 32064683 -120472576 - MTD LTR MaLR -1 418 5 1 829 1724 162 95 15 chr5 32068360 32068698 -120468561 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 1 829 308 300 11 22 chr5 32069456 32069548 -120467711 - LTR16E1 LTR ERVL 0 538 448 1 829 1084 251 164 19 chr5 32069556 32069922 -120467337 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 829 268 253 51 31 chr5 32072728 32072826 -120464433 + MTEb LTR MaLR 278 377 -2 1 829 334 180 16 7 chr5 32075853 32075927 -120461332 + MTD LTR MaLR 6 77 -330 1 829 2977 172 40 9 chr5 32075952 32076039 -120461220 - RLTR20B3 LTR ERVK -9 568 483 1 829 2977 172 40 9 chr5 32076072 32076535 -120460724 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 3 1 829 3744 145 41 4 chr5 32076539 32077264 -120459995 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2 2324 1573 1 829 897 217 116 70 chr5 32077276 32077454 -120459805 + MTD LTR MaLR 138 341 -78 1 829 3892 157 43 6 chr5 32077454 32078121 -120459138 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 1 829 897 217 116 70 chr5 32078121 32078200 -120459059 + MTD LTR MaLR 342 407 -12 1 829 832 292 31 62 chr5 32081541 32081800 -120455459 - MLT2B3 LTR ERVL -2 552 302 1 829 1323 239 136 19 chr5 32089395 32089770 -120447489 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 829 264 343 59 29 chr5 32094461 32094563 -120442696 - RMER12 LTR ERVK -472 850 746 1 829 243 206 108 14 chr5 32096774 32096848 -120440411 - LTR41 LTR ERVL -2 766 686 1 829 2943 129 123 0 chr5 32099167 32099688 -120437571 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 1 829 1786 145 128 26 chr5 32100958 32101340 -120435919 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 830 443 328 147 85 chr5 32125669 32126152 -120411107 - MLT1F2 LTR MaLR -8 552 40 2 830 368 307 98 0 chr5 32126612 32126765 -120410494 - MLT1D LTR MaLR -2 503 336 2 830 2252 192 17 17 chr5 32137670 32138088 -120399171 - MTC LTR MaLR 0 421 4 2 830 3574 46 50 2 chr5 32140701 32140911 -120396348 + RLTR10C LTR ERVK 1 222 -214 2 830 3574 46 50 2 chr5 32140955 32141160 -120396099 + RLTR10C LTR ERVK 223 434 -2 2 830 347 317 198 11 chr5 32143260 32143442 -120393817 + MLT1A LTR MaLR 157 372 -2 2 830 828 289 190 0 chr5 32143834 32144145 -120393114 - MTE2b LTR MaLR -5 374 5 2 830 1483 207 158 3 chr5 32144146 32144500 -120392759 - MTD LTR MaLR 0 419 11 2 830 3499 23 18 3 chr5 32148047 32148437 -120388822 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 830 229 279 127 0 chr5 32153149 32153228 -120384031 - MLT1F1 LTR MaLR -476 93 5 2 830 2285 182 336 11 chr5 32153416 32153972 -120383287 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 830 2300 85 124 40 chr5 32161200 32161579 -120375680 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 830 567 274 97 7 chr5 32173014 32173168 -120364091 - MTEa-int LTR MaLR -1398 182 15 3 830 339 300 71 87 chr5 32173184 32173472 -120363787 - MTEa LTR MaLR 0 379 79 3 830 3312 24 45 5 chr5 32180405 32180786 -120356473 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 830 621 286 105 16 chr5 32182900 32183147 -120354112 - MTD LTR MaLR -36 383 85 3 830 460 224 47 0 chr5 32183450 32183557 -120353702 - MTD LTR MaLR -303 116 5 3 830 317 282 37 73 chr5 32192852 32193043 -120344216 + ORR1C1 LTR MaLR 6 189 -189 3 830 354 320 48 8 chr5 32215464 32215590 -120321669 - MLT1A LTR MaLR 0 374 244 3 830 452 307 79 48 chr5 32215732 32215961 -120321298 - MLT1A LTR MaLR -112 262 27 3 830 2291 168 30 108 chr5 32216224 32216252 -120321007 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 539 3 830 2291 168 30 108 chr5 32216750 32217330 -120319929 - RLTR31_Mm LTR ERVK -23 538 1 3 830 2644 44 0 29 chr5 32221601 32221949 -120315310 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 4 830 552 286 70 5 chr5 32238183 32238397 -120298862 + MLT1B LTR MaLR 1 228 -162 4 831 2279 150 68 8 chr5 32246194 32246591 -120290668 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 831 227 339 181 9 chr5 32253345 32253461 -120283798 + ORR1E LTR MaLR 3 138 -221 4 831 666 275 165 29 chr5 32256021 32256336 -120280923 - MLT1A0 LTR MaLR -7 358 1 4 831 296 313 150 53 chr5 32280507 32280733 -120256526 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 433 4 831 1962 141 137 29 chr5 32281241 32281621 -120255638 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 831 294 242 15 0 chr5 32281621 32281687 -120255572 - MLT1E1A LTR MaLR -560 67 1 4 831 1148 255 39 24 chr5 32297848 32298182 -120239077 - MTEb LTR MaLR -36 343 5 5 831 246 292 0 33 chr5 32311479 32311571 -120225688 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 320 5 831 307 304 29 53 chr5 32354848 32355018 -120182241 - MLT1L LTR MaLR -249 361 196 5 831 895 126 6 48 chr5 32355968 32356135 -120181124 + RMER17D2 LTR ERVK 648 807 -2 5 831 276 278 26 61 chr5 32363848 32363963 -120173296 - RLTR25A LTR ERVK -471 632 522 5 831 662 274 19 44 chr5 32364712 32364918 -120172341 - MLT1E2 LTR MaLR -200 427 227 5 832 5047 110 84 44 chr5 32395057 32395928 -120141331 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 6 832 266 207 113 105 chr5 32408395 32408519 -120128740 - MLT1A1 LTR MaLR -283 125 1 6 832 313 320 97 13 chr5 32412472 32412627 -120124632 - LTR16A LTR ERVL -239 212 45 6 832 229 330 19 102 chr5 32416054 32416162 -120121097 + MT2B2 LTR ERVL 156 254 -330 6 832 289 303 71 0 chr5 32431153 32431252 -120106007 - MLT1K LTR MaLR -9 586 481 6 832 326 270 149 79 chr5 32431378 32431619 -120105640 - MLT1K LTR MaLR -317 278 21 6 832 465 222 127 0 chr5 32431979 32432105 -120105154 + MTD LTR MaLR 3 144 -275 6 832 1689 197 45 50 chr5 32433894 32434294 -120102965 + MTD LTR MaLR 21 418 -1 6 832 1673 239 52 22 chr5 32464415 32464822 -120072437 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 832 233 360 27 73 chr5 32466444 32466501 -120070758 - MLT1J-int LTR MaLR -622 765 712 7 832 2649 155 19 2 chr5 32466501 32466914 -120070345 - MTC LTR MaLR 0 421 2 7 832 233 360 27 73 chr5 32466914 32467006 -120070253 - MLT1J-int LTR MaLR -676 711 623 7 832 436 259 79 64 chr5 32470841 32471043 -120066216 - LTR81B LTR ERV1? -1188 205 1 7 832 467 287 152 23 chr5 32478357 32478744 -120058515 + MLT1D LTR MaLR 5 505 0 7 832 461 262 39 84 chr5 32478827 32479006 -120058253 - MLT1B LTR MaLR -41 349 179 7 832 505 278 109 22 chr5 32479190 32479374 -120057885 - MLT1B LTR MaLR -186 204 5 7 832 444 343 69 72 chr5 32480747 32480798 -120056461 + RMER13A LTR ERVK 32 74 -786 7 832 2836 47 7 149 chr5 32480798 32481249 -120056010 - RLTR10 LTR ERVK -3 387 1 7 832 444 287 82 101 chr5 32481249 32481711 -120055548 + RMER13A LTR ERVK 75 557 -70 7 832 296 340 20 10 chr5 32481817 32481915 -120055344 + RMER13A LTR ERVK 514 612 -15 7 832 491 241 95 0 chr5 32483034 32483150 -120054109 + MTEa LTR MaLR 1 127 -252 7 832 1547 217 104 3 chr5 32483396 32483734 -120053525 - MTD LTR MaLR -46 373 2 7 832 846 225 19 139 chr5 32483736 32483994 -120053265 + MTEa LTR MaLR 153 379 0 7 832 227 318 100 22 chr5 32493006 32493096 -120044163 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 491 587 -216 7 832 289 341 116 10 chr5 32494268 32494475 -120042784 - RLTR21 LTR ERVK -176 1396 1168 7 832 262 210 62 46 chr5 32496500 32496565 -120040694 + MLT1B LTR MaLR 286 351 -39 7 832 1067 253 74 110 chr5 32505294 32505792 -120031467 - RLTR12B LTR ERVK -29 499 20 1 833 2453 174 236 30 chr5 32508310 32508919 -120028340 - RMER19A LTR ERVK 0 737 3 2 833 2326 158 39 2 chr5 32514446 32514852 -120022407 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 833 665 197 71 65 chr5 32518990 32519158 -120018101 + RMER13A LTR ERVK 152 320 -540 4 833 2442 182 26 33 chr5 32520466 32520920 -120016339 - RMER13B LTR ERVK -277 631 181 5 833 590 257 43 36 chr5 32520913 32521137 -120016122 - RLTR26 LTR ERVK -372 270 12 5 833 1597 166 23 65 chr5 32521830 32522139 -120015120 + ORR1B1 LTR MaLR 91 386 -8 5 833 2074 145 34 50 chr5 32524230 32524614 -120012645 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 833 822 232 20 12 chr5 32525966 32526279 -120010980 - MTEa LTR MaLR 0 379 27 6 833 2021 155 3 19 chr5 32526422 32526745 -120010514 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 6 833 416 108 62 0 chr5 32526742 32526807 -120010452 - ORR1D1 LTR MaLR -28 346 278 6 833 259 286 0 0 chr5 32526815 32526871 -120010388 - MTEa LTR MaLR -323 56 1 6 833 1500 196 92 15 chr5 32526943 32527269 -120009990 + MTEa LTR MaLR 14 364 -15 7 833 1763 187 74 37 chr5 32528482 32528888 -120008371 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 833 2683 72 55 13 chr5 32533425 32533805 -120003454 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 833 229 319 63 89 chr5 32535792 32535950 -120001309 + LTR81B LTR ERV1? 492 645 -748 8 833 2224 152 65 15 chr5 32538139 32538540 -119998719 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 833 4136 39 2 89 chr5 32548663 32549224 -119988035 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 833 629 283 94 55 chr5 32550977 32551231 -119986028 - MER89 LTR ERV1 0 559 296 1 833 579 324 42 55 chr5 32552718 32553080 -119984179 - RLTR16 LTR ERVK -253 439 32 1 833 327 326 17 28 chr5 32554185 32554341 -119982918 - MLT1H LTR MaLR -5 586 440 1 833 891 273 65 68 chr5 32558594 32558948 -119978311 - ORR1E LTR MaLR -5 354 2 1 833 267 250 16 107 chr5 32563721 32563842 -119973417 + MT2B LTR ERVL 154 263 -338 1 833 1186 97 26 41 chr5 32570328 32570488 -119966771 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 163 1 833 1186 97 26 41 chr5 32570552 32570585 -119966674 - ORR1A2 LTR MaLR -165 162 135 1 833 1247 241 33 48 chr5 32576705 32577037 -119960222 - MTEa LTR MaLR -28 351 25 1 833 2742 125 87 19 chr5 32584331 32584804 -119952455 - RLTR28 LTR ERVL -19 505 1 1 833 949 177 294 16 chr5 32585560 32585883 -119951376 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 833 2674 187 89 54 chr5 32585885 32586548 -119950711 + MTC-int LTR MaLR 1 686 -572 1 833 504 212 26 0 chr5 32586556 32586669 -119950590 + MTC-int LTR MaLR 1143 1258 0 1 833 1857 159 92 42 chr5 32586669 32587070 -119950189 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 833 358 212 51 154 chr5 32596766 32596829 -119940430 + MT2B LTR ERVL 118 182 -419 1 833 358 212 51 154 chr5 32596854 32596946 -119940313 + MT2B LTR ERVL 183 257 -344 1 833 234 262 90 53 chr5 32597372 32597505 -119939754 - ORR1E LTR MaLR -218 141 4 1 833 3173 127 111 11 chr5 32602767 32603309 -119933950 + ORR1A3-int LTR MaLR 45 640 -1323 2 833 4066 93 28 139 chr5 32603321 32604132 -119933127 + ORR1A4-int LTR MaLR 491 1962 -1 2 833 1585 93 73 246 chr5 32604133 32604531 -119932728 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 833 1742 120 35 35 chr5 32614671 32614956 -119922303 - ORR1A3 LTR MaLR -41 285 1 2 833 2039 164 21 58 chr5 32621432 32621813 -119915446 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 833 1093 251 128 33 chr5 32634392 32634439 -119902820 - MTEa LTR MaLR -5 374 328 2 833 1093 251 128 33 chr5 32634581 32634870 -119902389 - MTEa LTR MaLR -52 327 6 2 834 747 307 124 31 chr5 32642860 32643246 -119894013 + RMER5 LTR ERV1 45 466 -68 2 834 239 151 54 54 chr5 32643295 32643351 -119893908 + RMER5 LTR ERV1 479 534 0 2 834 402 254 16 85 chr5 32647072 32647201 -119890058 - MT2B LTR ERVL -337 264 145 2 834 309 261 45 0 chr5 32655704 32655792 -119881467 - ORR1E LTR MaLR -223 136 45 2 834 2096 170 62 15 chr5 32661433 32661833 -119875426 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 834 2199 224 46 27 chr5 32667031 32667555 -119869704 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 1 3 834 2913 167 36 14 chr5 32668527 32669032 -119868227 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 3 834 910 282 54 78 chr5 32671936 32672404 -119864855 - RLTR26 LTR ERVK -161 481 2 3 834 1497 212 98 23 chr5 32676681 32677029 -119860230 + MTE2b LTR MaLR 1 374 -5 3 834 326 354 87 53 chr5 32686156 32686362 -119850897 + MLT1J LTR MaLR 293 505 -7 3 834 870 281 106 43 chr5 32686582 32686932 -119850327 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 3 834 369 294 83 14 chr5 32688502 32688647 -119848612 + MLT1A1 LTR MaLR 3 157 -251 3 834 316 327 102 99 chr5 32689407 32689750 -119847509 - MLT1F2 LTR MaLR -108 452 109 3 834 1758 158 49 161 chr5 32690438 32690867 -119846392 + ORR1C2 LTR MaLR 4 384 0 3 834 992 244 111 13 chr5 32693281 32693597 -119843662 - ORR1E LTR MaLR -12 347 1 3 834 241 232 0 18 chr5 32693913 32693970 -119843289 - MLT1A1 LTR MaLR 0 365 310 3 834 389 312 56 69 chr5 32694357 32694588 -119842671 - MLT1A1 LTR MaLR -180 228 1 3 834 2285 106 16 0 chr5 32696012 32696334 -119840925 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 834 2257 111 140 40 chr5 32701875 32702297 -119834962 + RMER4A LTR ERVK 3 466 0 3 834 279 297 64 56 chr5 32704312 32704437 -119832822 - LTR33A_ LTR ERVL -359 172 47 3 834 328 344 70 30 chr5 32705514 32705715 -119831544 - MLT1A0 LTR MaLR -13 352 144 3 834 1283 206 88 7 chr5 32710762 32711045 -119826214 + MTC LTR MaLR 10 315 -106 3 834 426 259 120 30 chr5 32711728 32711895 -119825364 - MTEa LTR MaLR -4 375 194 3 834 606 288 75 129 chr5 32714718 32715013 -119822246 + MLT1D LTR MaLR 189 505 0 4 834 4235 141 65 93 chr5 32726008 32726940 -119810319 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 4 834 383 233 19 46 chr5 32727208 32727219 -119810040 + MT2B LTR ERVL 156 163 -438 4 834 2489 72 12 9 chr5 32730564 32730888 -119806371 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 4 834 2348 151 58 5 chr5 32734866 32735266 -119801993 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 834 7012 108 12 9 chr5 32736118 32737138 -119800121 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 1 4 834 286 157 32 15 chr5 32738114 32738191 -119799068 + MTD LTR MaLR 1 78 -301 4 834 249 218 0 35 chr5 32738220 32738277 -119798982 + MTD LTR MaLR 168 222 -197 4 834 912 175 54 24 chr5 32739810 32740015 -119797244 + MTD LTR MaLR 196 406 -13 4 834 316 277 116 0 chr5 32753780 32753892 -119783367 + MT2A LTR ERVL 1 125 -408 5 834 1426 246 51 3 chr5 32753793 32754128 -119783131 + MTE2b LTR MaLR 18 368 -11 5 834 595 196 65 7 chr5 32760159 32760298 -119776961 + RMER10A LTR ERVL 1 147 -295 5 834 570 248 18 18 chr5 32760278 32760442 -119776817 + RMER10A LTR ERVL 273 436 -6 5 835 339 118 0 0 chr5 32772998 32773049 -119764210 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 334 5 835 6271 47 6 2 chr5 32773358 32774204 -119763055 - MTA_Mm-int LTR MaLR -249 849 1 5 835 3519 20 5 0 chr5 32774204 32774598 -119762661 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 835 1272 216 33 13 chr5 32774598 32774863 -119762396 - ORR1C2-int LTR MaLR -243 1266 994 5 835 1128 254 63 12 chr5 32774878 32775213 -119762046 - ORR1C2-int LTR MaLR -1018 352 1 5 835 1067 201 100 102 chr5 32775211 32775277 -119761982 - ORR1C2 LTR MaLR -2 372 324 5 835 1115 196 129 7 chr5 32775407 32775711 -119761548 - ORR1C2 LTR MaLR -42 342 3 5 835 338 338 45 51 chr5 32782875 32783031 -119754228 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 406 5 835 3533 20 0 0 chr5 32785267 32785663 -119751596 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 835 266 228 23 81 chr5 32786794 32786880 -119750379 + MT2B LTR ERVL 160 240 -361 5 835 913 224 92 9 chr5 32788499 32788764 -119748495 - ORR1D1 LTR MaLR -31 343 29 5 835 304 350 40 0 chr5 32799594 32799694 -119737565 + MLT1I LTR MaLR 170 273 -138 6 835 257 294 53 100 chr5 32804173 32804343 -119732916 - RMER12 LTR ERVK -439 883 722 6 835 232 309 120 67 chr5 32808175 32808383 -119728876 - MLT1G3 LTR MaLR -39 556 338 6 835 460 255 213 60 chr5 32812488 32812798 -119724461 + MLT2B2 LTR ERVL 106 451 -64 6 835 2594 80 0 0 chr5 32813603 32813930 -119723329 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 835 3368 46 2 0 chr5 32816829 32817224 -119720035 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 835 238 132 135 81 chr5 32818133 32818207 -119719052 - MTB_Mm LTR MaLR -52 355 278 6 835 1322 214 143 15 chr5 32822462 32822790 -119714469 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 835 1815 9 9 0 chr5 32833217 32833428 -119703831 + ORR1A1 LTR MaLR 134 346 0 6 835 357 245 98 115 chr5 32834054 32834347 -119702912 + MTEb LTR MaLR 33 353 -26 6 835 2679 33 12 21 chr5 32834580 32834863 -119702396 + IAPEY_LTR LTR ERVK 53 339 -46 6 835 4003 35 5 0 chr5 32834863 32835297 -119701962 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 835 2679 33 12 21 chr5 32835297 32835349 -119701910 + IAPEY_LTR LTR ERVK 340 385 0 6 835 59381 67 3 8 chr5 32835349 32839034 -119698225 + IAPEy-int LTR ERVK 1 3677 -3836 6 835 59381 67 3 8 chr5 32839220 32839428 -119697831 + IAPEy-int LTR ERVK 3678 3876 -3637 6 835 59381 67 3 8 chr5 32839636 32843291 -119693968 + IAPEy-int LTR ERVK 3877 7513 0 6 835 1161 74 0 0 chr5 32843291 32843439 -119693820 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 148 -209 6 835 236 297 97 21 chr5 32843702 32843795 -119693464 + LTR40a LTR ERVL 397 496 -23 6 835 1491 137 66 8 chr5 32843889 32844147 -119693112 + RLTR15 LTR ERVK 87 359 0 6 835 1925 116 14 7 chr5 32844147 32844424 -119692835 - RMER6B LTR ERVK -182 279 1 6 835 519 178 19 65 chr5 32851281 32851389 -119685870 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 706 7 835 3102 96 9 7 chr5 32851550 32851971 -119685288 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 7 835 694 251 94 147 chr5 32852082 32852559 -119684700 + RLTR12B LTR ERVK 56 507 -21 7 835 357 258 98 108 chr5 32857179 32857383 -119679876 - MLT1A1 LTR MaLR -206 202 1 7 835 1319 236 97 24 chr5 32857931 32858214 -119679045 - MTD LTR MaLR -65 354 49 7 835 4996 155 62 58 chr5 32858214 32859193 -119678066 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 7 835 1319 236 97 24 chr5 32859193 32859239 -119678020 - MTD LTR MaLR -371 48 1 7 835 264 255 77 94 chr5 32861787 32861904 -119675355 + RLTR25B LTR ERVK 441 555 -473 7 835 970 242 129 79 chr5 32866933 32867351 -119669908 - RLTR28B LTR ERVL -42 439 1 7 835 427 317 0 16 chr5 32869778 32869903 -119667356 - MLT2C2 LTR ERVL -336 128 6 7 835 365 322 84 39 chr5 32870964 32871119 -119666140 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -15 1053 769 7 835 310 371 58 74 chr5 32871692 32871881 -119665378 - MER21B LTR ERV1 -578 285 100 7 835 477 243 65 38 chr5 32877319 32877503 -119659756 + RLTR15 LTR ERVK 1 189 -170 7 835 924 288 33 7 chr5 32877550 32877826 -119659433 + MYSERV-int LTR ERVK 4844 5126 -1424 7 835 410 293 41 67 chr5 32877826 32878020 -119659239 + RMER4A LTR ERVK 251 439 -27 7 835 5005 164 81 69 chr5 32878020 32878328 -119658931 + MYSERV6-int LTR ERVK 7764 8075 -884 7 835 3587 111 59 20 chr5 32878328 32878871 -119658388 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 7 835 5005 164 81 69 chr5 32878871 32878945 -119658314 + MYSERV6-int LTR ERVK 8076 8155 -804 7 835 5005 164 81 69 chr5 32878995 32879793 -119657466 + MYSERV6-int LTR ERVK 8156 8959 0 7 835 536 248 77 133 chr5 32879821 32879873 -119657386 + RLTR15 LTR ERVK 14 54 -305 7 835 536 248 77 133 chr5 32880066 32880202 -119657057 + RLTR15 LTR ERVK 55 163 -196 7 835 536 248 77 133 chr5 32880343 32880492 -119656767 + RLTR15 LTR ERVK 164 333 -26 7 835 300 143 20 0 chr5 32880511 32880560 -119656699 - ORR1C1 LTR MaLR -144 234 185 7 835 2479 80 72 29 chr5 32880589 32880660 -119656599 + RLTR9D LTR ERVK 1 70 -333 7 835 3271 34 78 5 chr5 32880660 32881043 -119656216 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 7 835 2479 80 72 29 chr5 32881043 32881357 -119655902 + RLTR9D LTR ERVK 71 403 0 7 835 717 206 54 86 chr5 32881372 32881558 -119655701 - ORR1C1 LTR MaLR -198 180 1 7 835 4554 56 41 7 chr5 32883085 32883627 -119653632 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 8 835 1223 209 135 39 chr5 32884331 32884553 -119652706 + ORR1D1 LTR MaLR 1 256 -118 8 835 4314 50 20 6 chr5 32884553 32885058 -119652201 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 8 835 1223 209 135 39 chr5 32885058 32885169 -119652090 + ORR1D1 LTR MaLR 257 366 -8 8 835 3225 17 0 17 chr5 32885547 32885899 -119651360 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 8 835 1529 160 96 28 chr5 32886273 32886444 -119650815 + ORR1B2 LTR MaLR 1 192 -175 8 835 4722 79 5 28 chr5 32886444 32887045 -119650214 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 8 835 1529 160 96 28 chr5 32887045 32887106 -119650153 + ORR1B2 LTR MaLR 193 248 -119 8 835 3878 71 85 42 chr5 32887106 32887647 -119649612 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 8 835 1529 160 96 28 chr5 32887647 32887735 -119649524 + ORR1B2 LTR MaLR 249 343 -24 8 835 437 223 43 26 chr5 32887735 32887850 -119649409 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 314 8 835 1279 264 71 30 chr5 32888686 32888861 -119648398 + MTEa LTR MaLR 1 169 -210 8 835 1279 264 71 30 chr5 32888961 32889148 -119648111 + MTEa LTR MaLR 170 378 -1 8 835 586 274 285 4 chr5 32892083 32892350 -119644909 - ORR1E LTR MaLR -17 342 1 8 835 231 253 35 81 chr5 32895745 32895831 -119641428 + MLT1I LTR MaLR 326 407 -4 8 836 2350 117 17 6 chr5 32902729 32903082 -119634177 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 8 836 380 287 207 0 chr5 32903703 32903853 -119633406 + MLT2B4 LTR ERVL 373 553 -3 8 836 3179 70 7 0 chr5 32904650 32905066 -119632193 - BGLII LTR ERVK -2 419 1 8 836 2483 177 209 16 chr5 32907963 32908531 -119628728 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 8 836 255 276 53 0 chr5 32910776 32910852 -119626407 - MLT1N2 LTR MaLR -1 561 482 8 836 255 309 60 99 chr5 32911583 32911734 -119625525 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -169 753 609 8 836 3083 70 14 5 chr5 32919596 32920013 -119617246 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 8 836 253 250 54 187 chr5 32920328 32920643 -119616616 + RMER10A LTR ERVL 77 349 -93 8 836 2047 191 72 5 chr5 32923418 32923808 -119613451 - MTD LTR MaLR 0 419 4 8 836 1196 247 64 39 chr5 32924677 32925086 -119612173 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 836 315 189 42 42 chr5 32925501 32925573 -119611686 + RMER15 LTR ERVL 1 72 -503 9 836 2080 195 98 52 chr5 32925611 32926131 -119611128 + RMER15 LTR ERVL 29 572 -3 9 836 337 215 152 32 chr5 32927756 32927881 -119609378 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 226 9 836 1190 228 35 32 chr5 32929676 32929961 -119607298 - MTD LTR MaLR -129 290 5 9 836 3271 21 39 0 chr5 32932010 32932391 -119604868 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 836 9144 32 3 2 chr5 32932391 32933486 -119603773 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1096 -2 9 836 3271 21 39 0 chr5 32933488 32933869 -119603390 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 836 233 345 44 33 chr5 32934310 32934400 -119602859 - MTE2b LTR MaLR -247 132 42 9 836 438 260 99 43 chr5 32934990 32935243 -119602016 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 76 9 836 1047 202 121 23 chr5 32935562 32935953 -119601306 + RMER4B LTR ERVK 17 452 -14 9 836 281 275 102 34 chr5 32936786 32936933 -119600326 - MTEa LTR MaLR -24 355 199 9 836 705 179 99 25 chr5 32937542 32937729 -119599530 - MTE2a LTR MaLR -18 361 166 9 836 740 123 90 0 chr5 32938270 32938392 -119598867 + MTC LTR MaLR 68 200 -221 9 836 255 296 19 175 chr5 32938396 32938556 -119598703 - MTE2a LTR MaLR -244 135 1 9 836 361 271 49 79 chr5 32942448 32942612 -119594647 - MT2B LTR ERVL -263 338 180 9 836 468 0 0 0 chr5 32951248 32951301 -119585958 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 294 9 836 1047 28 139 0 chr5 32951307 32951451 -119585808 - ORR1A1 LTR MaLR -182 164 1 9 836 13322 65 9 4 chr5 32951451 32953233 -119584026 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 9 836 2616 40 65 0 chr5 32953233 32953558 -119583701 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 9 836 2264 155 35 20 chr5 32968225 32968438 -119568821 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 184 1 836 2264 155 35 20 chr5 32968473 32968660 -119568599 - MTB_Mm LTR MaLR -224 183 1 1 836 2349 240 53 48 chr5 32969612 32970457 -119566802 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -497 1829 977 1 836 3141 12 0 0 chr5 32970457 32970803 -119566456 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 836 2349 240 53 48 chr5 32970803 32970901 -119566358 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1350 976 881 1 836 1159 155 154 8 chr5 32971225 32971478 -119565781 - RLTR15 LTR ERVK -69 290 1 1 836 3134 27 53 0 chr5 32974895 32975271 -119561988 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 836 4404 14 2 0 chr5 32976772 32977264 -119559995 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 836 302 0 0 0 chr5 32977264 32977302 -119559957 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 1 836 390 167 46 35 chr5 32977302 32977389 -119559870 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 1 836 37262 17 27 13 chr5 32977389 32978054 -119559205 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 4679 1 836 225 123 29 174 chr5 32978054 32978123 -119559136 + RLTR22_Mus LTR ERVK 370 428 -1380 1 836 37262 17 27 13 chr5 32978123 32982676 -119554583 - MERVL-int LTR ERVL -125 4678 1 1 836 4404 14 2 0 chr5 32982676 32983168 -119554091 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 836 309 282 9 55 chr5 32984902 32985011 -119552248 - RMER4B LTR ERVK -474 111 8 1 836 1623 147 60 3 chr5 32985236 32985536 -119551723 - RLTR28 LTR ERVL -4 520 204 1 836 1352 119 99 0 chr5 32985669 32985871 -119551388 - RLTR28 LTR ERVL -302 222 1 1 836 1181 217 137 30 chr5 32986189 32986526 -119550733 - ORR1C2 LTR MaLR -11 373 1 1 836 770 103 0 17 chr5 32986634 32986752 -119550507 - ORR1B1 LTR MaLR -238 156 41 1 836 737 246 138 34 chr5 32990520 32990673 -119546586 - MT2B2 LTR ERVL -13 571 385 1 836 737 179 101 192 chr5 32990860 32991107 -119546152 - MT2B2 LTR ERVL -200 384 14 1 836 485 274 96 19 chr5 32993465 32993621 -119543638 + MLT1A1 LTR MaLR 241 408 0 1 836 595 317 175 27 chr5 33007678 33008182 -119529077 - MER21B LTR ERV1 -246 617 39 4 836 233 299 28 69 chr5 33008654 33008726 -119528533 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -883 306 238 7 836 7138 58 43 0 chr5 33013921 33014777 -119522482 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 2 837 338 141 56 14 chr5 33067941 33068013 -119469246 - RMER4A LTR ERVK 0 466 392 2 837 1415 126 67 0 chr5 33068050 33068289 -119468970 - RMER4A LTR ERVK -119 347 93 2 837 355 338 29 29 chr5 33069736 33069873 -119467386 - MT2A LTR ERVL -155 378 242 2 837 261 244 123 85 chr5 33070271 33070401 -119466858 - MT2A LTR ERVL -327 257 123 2 837 3459 18 0 0 chr5 33074126 33074522 -119462737 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 837 8787 36 4 1 chr5 33074522 33075617 -119461642 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 837 3459 18 0 0 chr5 33075617 33076013 -119461246 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 837 1179 194 139 22 chr5 33092961 33093278 -119443981 + ORR1C2 LTR MaLR 14 367 -17 4 837 583 219 121 6 chr5 33093279 33093444 -119443815 + RLTR28B LTR ERVL 1 184 -297 4 837 386 274 35 26 chr5 33093729 33093845 -119443414 + MT2B LTR ERVL 141 257 -344 4 837 263 243 223 0 chr5 33094166 33094269 -119442990 + RMER20B LTR ERVK 180 305 -322 5 837 762 170 65 7 chr5 33102658 33102812 -119434447 + MTC LTR MaLR 251 413 -8 7 837 2113 43 0 0 chr5 33102838 33103114 -119434145 + RLTR10A LTR ERVK 1 276 -135 7 837 1180 109 0 11 chr5 33103137 33103322 -119433937 + RLTR27 LTR ERVK 127 309 0 7 837 655 235 19 7 chr5 33103322 33103472 -119433787 + MTC-int LTR MaLR 19 170 -1088 7 837 292 220 25 152 chr5 33103869 33103920 -119433339 + MTC-int LTR MaLR 208 258 -1000 7 837 292 220 25 152 chr5 33104067 33104133 -119433126 + MTC-int LTR MaLR 259 310 -948 7 837 237 114 68 0 chr5 33104139 33104183 -119433076 - ORR1B1 LTR MaLR -347 47 1 8 837 5138 182 118 7 chr5 33104183 33105167 -119432092 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 413 8 837 5138 182 118 7 chr5 33105194 33105423 -119431836 - ORR1B1-int LTR MaLR -1097 412 162 8 837 319 259 118 62 chr5 33110616 33110760 -119426499 + RLTR14 LTR ERV1 224 375 -7 9 837 566 231 97 14 chr5 33112369 33112514 -119424745 + RLTR42-int LTR ERVK 1639 1795 -3727 1 837 282 354 8 0 chr5 33113911 33114038 -119423221 + MER52-int LTR ERV1 1734 1861 -5230 1 837 299 164 229 0 chr5 33114804 33114865 -119422394 + RLTR42-int LTR ERVK 2872 2946 -2576 1 837 267 294 107 16 chr5 33115282 33115403 -119421856 + RLTR42-int LTR ERVK 4108 4239 -1283 1 837 1223 198 178 6 chr5 33121188 33121514 -119415745 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 1 837 344 245 0 101 chr5 33121607 33121716 -119415543 - MT2B LTR ERVL -348 253 156 1 837 1079 195 172 0 chr5 33121906 33122168 -119415091 + MTC LTR MaLR 107 413 -8 1 837 1847 241 112 135 chr5 33122171 33123628 -119413631 + MTC-int LTR MaLR 2 1258 0 1 837 440 132 66 0 chr5 33123628 33123704 -119413555 + MTC LTR MaLR 1 81 -340 1 837 884 174 33 7 chr5 33124056 33124282 -119412977 + MTC LTR MaLR 48 412 -9 1 837 928 136 91 175 chr5 33130619 33130905 -119406354 + MTC LTR MaLR 152 413 -8 1 837 1145 164 135 37 chr5 33139652 33140252 -119397007 + RMER19B LTR ERVK 165 877 -25 1 837 3132 14 3 0 chr5 33141413 33141758 -119395501 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 837 2022 136 61 3 chr5 33143464 33143840 -119393419 + RMER20A LTR ERVK 1 398 -118 1 837 463 190 10 39 chr5 33144627 33144731 -119392528 + RLTR19-int LTR ERVK 1090 1190 -4947 1 837 3634 206 87 62 chr5 33145441 33146327 -119390932 + RodERV21-int LTR ERV1 3664 4660 -331 1 837 3634 204 70 77 chr5 33146544 33146602 -119390657 + RodERV21-int LTR ERV1 4661 4680 -311 1 837 3634 204 70 77 chr5 33146739 33146895 -119390364 + RodERV21-int LTR ERV1 4681 4823 -168 1 837 391 214 0 43 chr5 33146895 33146988 -119390271 + RMER4B LTR ERVK 346 434 -151 1 837 247 245 126 53 chr5 33147166 33147317 -119389942 + RMER21B LTR ERV1 318 479 -363 1 837 246 277 10 50 chr5 33152518 33152617 -119384642 + MTC LTR MaLR 20 114 -307 2 837 1152 147 22 22 chr5 33155016 33155238 -119382021 + ORR1A3 LTR MaLR 105 326 0 2 104 5089 101 46 79 chr5 33160945 33161882 -119375377 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 2 838 432 176 196 0 chr5 33177237 33177339 -119359920 + RMER5 LTR ERV1 21 142 -392 2 838 1470 153 140 11 chr5 33181547 33181679 -119355580 + RMER10A LTR ERVL 8 155 -287 2 838 1470 153 140 11 chr5 33181700 33181931 -119355328 + RMER10A LTR ERVL 156 417 -25 2 838 1486 182 97 34 chr5 33184852 33185204 -119352055 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 838 234 196 71 0 chr5 33200398 33200454 -119336805 - RLTR42 LTR ERVK -28 211 152 3 838 326 65 0 0 chr5 33200682 33200728 -119336531 - RLTR42 LTR ERVK -193 46 1 3 838 550 77 10 71 chr5 33200760 33200858 -119336401 - RLTR42-int LTR ERVK -47 5475 5384 3 838 260 139 0 0 chr5 33201085 33201121 -119336138 - RLTR42-int LTR ERVK -124 5398 5363 3 838 779 183 32 32 chr5 33201127 33201285 -119335974 - RLTR42-int LTR ERVK -70 5452 5295 3 838 2772 173 92 133 chr5 33201359 33201624 -119335635 - RLTR42-int LTR ERVK -210 5312 5043 3 838 2772 173 92 133 chr5 33201658 33201992 -119335267 - RLTR42-int LTR ERVK -210 5042 4700 3 838 2772 173 92 133 chr5 33202138 33202166 -119335093 - RLTR42-int LTR ERVK -823 4699 4699 3 838 2772 173 92 133 chr5 33202355 33202519 -119334740 - RLTR42-int LTR ERVK -823 4699 4520 3 838 1489 177 57 11 chr5 33202666 33202946 -119334313 - RLTR42-int LTR ERVK -1009 4513 4221 3 838 1607 108 30 79 chr5 33203289 33203592 -119333667 - RLTR42-int LTR ERVK -1309 4213 3926 3 838 4443 184 139 157 chr5 33203932 33204242 -119333017 - RLTR42-int LTR ERVK -1572 3950 3608 3 838 4443 184 139 157 chr5 33204321 33205389 -119331870 - RLTR42-int LTR ERVK -1915 3607 2426 3 838 4443 184 139 157 chr5 33205530 33205851 -119331408 - RLTR42-int LTR ERVK -1572 2425 2067 3 838 576 104 0 50 chr5 33223920 33224021 -119313238 - RMER6D LTR ERVK -624 96 1 4 838 400 134 146 0 chr5 33224021 33224103 -119313156 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 3084 4 838 11436 123 94 67 chr5 33224103 33224531 -119312728 - RMER6-int LTR ERVK -209 2968 2515 4 838 11436 123 94 67 chr5 33224601 33226233 -119311026 - RMER6-int LTR ERVK -209 2514 780 4 838 864 123 19 25 chr5 33226255 33226413 -119310846 - RMER6-int LTR ERVK -2516 661 505 4 838 1154 98 332 24 chr5 33226698 33226948 -119310311 - RMER6-int LTR ERVK -2831 346 20 4 838 1426 152 0 17 chr5 33226967 33227208 -119310051 - RMER6D LTR ERVK -4 716 480 4 838 4587 65 7 15 chr5 33232036 33232628 -119304631 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 4 838 2309 223 114 21 chr5 33250092 33250835 -119286424 - RLTR40 LTR ERVK -5 812 1 5 838 713 208 181 14 chr5 33254327 33254542 -119282717 - MTD LTR MaLR 0 419 169 5 838 430 171 13 0 chr5 33254560 33254636 -119282623 - MTD LTR MaLR -344 77 1 5 838 2094 72 3 0 chr5 33261869 33262159 -119275100 - ORR1A1 LTR MaLR -55 291 1 5 838 338 298 9 28 chr5 33266459 33266566 -119270693 - MLT1J-int LTR MaLR -19 1368 1264 6 838 2386 130 15 17 chr5 33281017 33281434 -119255825 - MTC LTR MaLR -20 401 2 6 838 234 347 0 0 chr5 33282121 33282196 -119255063 - RLTR24 LTR ERV1 -454 75 1 6 839 2102 162 45 7 chr5 33292350 33292754 -119244505 - MTC LTR MaLR -2 419 1 6 839 452 317 119 15 chr5 33295297 33295499 -119241760 - LTR16A LTR ERVL 0 451 229 6 839 3919 40 22 98 chr5 33296658 33297290 -119239969 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 584 -70 6 839 1879 161 21 48 chr5 33308595 33308968 -119228291 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 7 839 1146 161 173 40 chr5 33313019 33313348 -119223911 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 7 839 262 250 8 145 chr5 33323725 33323753 -119213506 + MT2B LTR ERVL 145 154 -447 7 839 340 161 9 143 chr5 33324779 33324989 -119212270 + RMER17C LTR ERVK 93 274 -136 7 839 1395 265 78 11 chr5 33345635 33345982 -119191277 - MTE2b LTR MaLR -8 371 2 8 839 544 189 12 133 chr5 33350241 33350296 -119186963 + RLTR11B LTR ERVK 309 356 -97 8 839 544 189 12 133 chr5 33350428 33350537 -119186722 + RLTR11B LTR ERVK 357 453 0 8 839 356 309 37 86 chr5 33368076 33368239 -119169020 - MLT1B LTR MaLR -34 356 202 8 839 318 287 22 22 chr5 33368229 33368318 -119168941 - MLT1B LTR MaLR -378 89 1 8 839 495 301 61 28 chr5 33375321 33375533 -119161726 - MLT2C1 LTR ERVL -100 297 79 8 839 1505 138 87 185 chr5 33377354 33377780 -119159479 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 9 839 291 317 18 132 chr5 33382763 33382930 -119154329 - MT2B2 LTR ERVL -299 285 138 9 839 372 225 14 19 chr5 33383520 33383610 -119153649 - ORR1D2 LTR MaLR 0 421 309 9 839 805 246 114 29 chr5 33383887 33384153 -119153106 - ORR1D2 LTR MaLR -65 305 1 9 839 2894 112 119 8 chr5 33387081 33387157 -119150102 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 443 9 839 2894 112 119 8 chr5 33387191 33387601 -119149658 - RLTR20A LTR ERVK -99 442 2 9 839 1775 216 31 36 chr5 33388021 33388406 -119148853 - MTD LTR MaLR -36 383 1 9 839 245 198 20 206 chr5 33390643 33390745 -119146514 - MT2B2 LTR ERVL -335 249 167 9 839 2113 171 40 20 chr5 33392049 33392454 -119144805 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 839 387 242 142 9 chr5 33397322 33397494 -119139765 + MLT1B LTR MaLR 148 346 -44 9 839 1129 167 45 268 chr5 33403304 33403627 -119133632 + ORR1B1 LTR MaLR 1 205 -189 9 839 1129 167 45 268 chr5 33403653 33403836 -119133423 + ORR1B1 LTR MaLR 206 394 0 9 839 488 321 117 90 chr5 33410706 33411141 -119126118 - MLT1C LTR MaLR -3 464 18 9 839 779 249 235 26 chr5 33411342 33411725 -119125534 - MLT1C LTR MaLR -3 464 2 9 839 799 277 56 7 chr5 33412529 33412816 -119124443 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 1 839 795 268 26 52 chr5 33413186 33413533 -119123726 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 5 1 839 1884 194 11 112 chr5 33413834 33414066 -119123193 - MTD LTR MaLR 0 419 211 1 839 1884 194 11 112 chr5 33414256 33414395 -119122864 - MTD LTR MaLR -209 210 94 1 839 1884 194 11 112 chr5 33414607 33414699 -119122560 - MTD LTR MaLR -326 93 2 1 839 277 298 11 0 chr5 33415060 33415154 -119122105 + MER57E1 LTR ERV1 278 372 0 1 839 229 291 10 140 chr5 33415792 33415892 -119121367 + MT2B2 LTR ERVL 154 240 -344 1 839 3413 33 5 0 chr5 33416522 33416916 -119120343 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 839 2105 118 81 17 chr5 33420080 33420426 -119116833 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 1 840 275 319 102 53 chr5 33428611 33429056 -119108203 + MER34A LTR ERV1 75 513 -29 1 840 1055 242 36 0 chr5 33450558 33450781 -119086478 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2219 3542 3312 1 840 2151 209 5 23 chr5 33450782 33451222 -119086037 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2569 3192 2761 1 840 1155 191 22 4 chr5 33451222 33451453 -119085806 + ORR1D-int LTR MaLR 152 386 -984 1 840 455 219 42 48 chr5 33454136 33454304 -119082955 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 177 1 840 423 215 0 76 chr5 33467548 33467574 -119069685 + MT2B LTR ERVL 144 159 -442 1 840 295 316 44 57 chr5 33468231 33468389 -119068870 - MLT1A LTR MaLR -187 187 32 1 840 832 274 140 0 chr5 33472499 33472827 -119064432 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 840 760 89 20 7 chr5 33473331 33473478 -119063781 - RMER17B LTR ERVK -498 460 312 1 840 1486 158 182 91 chr5 33494328 33494746 -119042513 - MT2A LTR ERVL -73 460 5 1 840 2637 116 5 0 chr5 33507778 33508156 -119029103 - ORR1B1 LTR MaLR -10 384 5 1 840 1805 220 46 20 chr5 33510478 33510873 -119026386 + MTD LTR MaLR 8 412 -7 2 840 3264 53 2 2 chr5 33520344 33520740 -119016519 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 840 4666 120 98 86 chr5 33520995 33521131 -119016128 - RMER19B LTR ERVK 0 902 764 4 840 4666 120 98 86 chr5 33521324 33522079 -119015180 - RMER19B LTR ERVK -139 763 1 4 840 4832 147 80 7 chr5 33522470 33523298 -119013961 + RMER19B LTR ERVK 3 890 -12 4 840 226 301 13 76 chr5 33524047 33524126 -119013133 + MTE2b LTR MaLR 64 137 -242 5 840 1850 204 25 6 chr5 33524064 33524418 -119012841 + MT2A LTR ERVL 76 436 -97 5 840 2904 54 54 0 chr5 33527106 33527476 -119009783 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 5 840 1993 99 72 71 chr5 33527476 33527933 -119009326 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 426 -7155 5 840 3581 34 17 107 chr5 33527939 33528461 -119008798 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 840 808 153 7 0 chr5 33528560 33528697 -119008562 + MMERVK10C-int LTR ERVK 708 845 -6736 5 840 359 218 112 4 chr5 33528698 33528832 -119008427 + MMERVK10C-int LTR ERVK 335 503 -4903 5 840 304 139 0 0 chr5 33528953 33528996 -119008263 + MMERVK10C-int LTR ERVK 950 992 -995 5 840 649 299 28 25 chr5 33529161 33529446 -119007813 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1309 1594 -5987 5 840 8567 28 15 3 chr5 33529528 33530513 -119006746 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 6 840 2867 67 51 0 chr5 33530513 33530884 -119006375 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 840 3147 60 8 2 chr5 33542106 33542504 -118994755 - MTB LTR MaLR 0 400 1 8 840 250 62 0 0 chr5 33544707 33544739 -118992520 + MT2B2 LTR ERVL 167 198 -386 9 840 323 227 130 43 chr5 33552219 33552311 -118984948 - MT2B LTR ERVL -344 257 158 1 840 1130 113 0 35 chr5 33553574 33553748 -118983511 + ORR1B1 LTR MaLR 227 394 0 1 840 1905 112 220 0 chr5 33553866 33554189 -118983070 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 841 1916 120 9 76 chr5 33554572 33554915 -118982344 - ORR1A4 LTR MaLR -9 320 1 1 841 2154 216 15 106 chr5 33566246 33566831 -118970428 - RMER5 LTR ERV1 0 534 3 1 841 359 289 193 50 chr5 33567722 33568002 -118969257 + ORR1E LTR MaLR 39 358 -1 1 841 596 198 214 6 chr5 33568228 33568401 -118968858 - RMER21A LTR ERV1 -265 682 474 1 841 661 352 104 37 chr5 33568870 33569416 -118967843 + RMER15-int LTR ERVL 1622 2204 -2795 1 841 261 267 147 0 chr5 33569434 33569509 -118967750 + RMER15-int LTR ERVL 2293 2378 -2621 1 841 1700 291 59 4 chr5 33569571 33570079 -118967180 + RMER15-int LTR ERVL 4167 4702 -297 1 841 262 361 136 0 chr5 33574489 33574658 -118962601 + ORR1D2 LTR MaLR 1 192 -178 1 841 1309 209 171 3 chr5 33575389 33575710 -118961549 - MTD LTR MaLR -21 398 24 1 841 1652 162 193 3 chr5 33578423 33578775 -118958484 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 841 334 351 11 83 chr5 33578863 33579043 -118958216 + RMER15 LTR ERVL 403 569 -6 1 841 320 24 0 0 chr5 33579814 33579856 -118957403 + RLTR10B LTR ERVK 1 42 -250 1 841 1904 39 3 121 chr5 33579864 33580186 -118957073 + RLTR10B LTR ERVK 9 292 0 1 841 1876 147 33 0 chr5 33582302 33582608 -118954651 + MTC LTR MaLR 106 421 0 1 841 4457 152 115 125 chr5 33582608 33583879 -118953380 + MTC-int LTR MaLR 1 1258 0 1 841 2521 134 5 24 chr5 33583879 33584300 -118952959 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 841 1566 195 111 26 chr5 33587485 33587851 -118949408 + MTD LTR MaLR 1 401 -18 1 841 1566 195 111 26 chr5 33587877 33587889 -118949370 + MTD LTR MaLR 402 411 -8 1 841 673 153 189 40 chr5 33596127 33596374 -118940885 + ORR1D1 LTR MaLR 3 338 -8 1 841 2540 157 25 25 chr5 33596378 33596854 -118940405 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 476 -1033 1 841 2157 213 14 137 chr5 33596873 33597537 -118939722 + RMER19C LTR ERVK 30 611 0 1 841 1877 206 63 18 chr5 33597537 33598005 -118939254 + ORR1D1-int LTR MaLR 502 991 -518 1 841 868 105 140 0 chr5 33598265 33598408 -118938851 + ORR1D1 LTR MaLR 1 163 -211 1 841 958 163 45 20 chr5 33598523 33598723 -118938536 + ORR1D1 LTR MaLR 166 370 -4 1 841 294 196 336 0 chr5 33604287 33604394 -118932865 + RMER4B LTR ERVK 17 159 -307 1 841 384 228 17 180 chr5 33604485 33604614 -118932645 + RMER4B LTR ERVK 335 533 -78 1 841 1795 206 65 6 chr5 33620620 33620961 -118916298 + ORR1D1 LTR MaLR 5 365 -9 1 841 581 257 40 122 chr5 33621057 33621409 -118915850 - MTEa LTR MaLR 0 379 39 1 841 226 301 125 10 chr5 33622260 33622364 -118914895 + MTEb LTR MaLR 250 365 -14 1 841 2459 123 51 137 chr5 33628591 33629101 -118908158 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 1 841 3327 126 148 19 chr5 33630105 33630832 -118906427 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 1 841 2315 192 42 7 chr5 33630881 33631070 -118906189 + RLTR20D LTR ERVK 2 190 -378 2 841 2315 192 31 53 chr5 33631092 33631518 -118905741 + RLTR20D LTR ERVK 191 568 0 2 841 3668 155 74 76 chr5 33632350 33633130 -118904129 - RMER21A LTR ERV1 0 947 169 2 841 1876 121 6 135 chr5 33635434 33635696 -118901563 + RMER17C LTR ERVK 1 210 -200 2 841 1876 121 6 135 chr5 33635735 33635939 -118901320 + RMER17C LTR ERVK 211 406 -4 2 841 547 227 125 0 chr5 33638108 33638236 -118899023 + MTEa LTR MaLR 1 144 -235 2 841 1354 163 344 15 chr5 33638905 33639364 -118897895 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 2 841 260 259 35 0 chr5 33640683 33640741 -118896518 + MLT1F1 LTR MaLR 50 109 -460 2 841 580 269 70 78 chr5 33640761 33641120 -118896139 + RLTR15 LTR ERVK 1 356 -3 2 841 448 218 40 0 chr5 33642246 33642347 -118894912 + RLTR23 LTR ERV1 324 428 -2 2 841 571 238 16 109 chr5 33643276 33643381 -118893878 + RLTR42-int LTR ERVK 1105 1207 -4315 2 841 571 238 16 109 chr5 33643533 33643611 -118893648 + RLTR42-int LTR ERVK 1208 1271 -4251 2 841 1220 209 34 96 chr5 33643639 33643994 -118893265 + RMER17C LTR ERVK 3 335 -75 2 841 461 251 34 151 chr5 33644059 33644265 -118892994 + RLTR42-int LTR ERVK 1677 1858 -3664 2 841 1059 190 66 101 chr5 33644903 33645275 -118891984 + RLTR42-int LTR ERVK 1870 2231 -3291 2 841 3299 53 0 8 chr5 33645275 33645672 -118891587 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 2 841 1059 196 47 123 chr5 33645672 33645927 -118891332 + RLTR42-int LTR ERVK 2232 2309 -3213 2 841 1332 137 43 86 chr5 33645936 33646159 -118891100 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 171 2 841 1332 137 43 86 chr5 33646227 33646258 -118891001 - ORR1C2 LTR MaLR -214 170 141 2 841 855 125 13 46 chr5 33646457 33646608 -118890651 - ORR1C2 LTR MaLR -238 146 1 2 841 1059 206 116 58 chr5 33646861 33647222 -118890037 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 2 841 348 351 12 70 chr5 33647410 33647471 -118889788 - RLTR14-int LTR ERV1 -182 5135 5081 2 841 348 351 12 70 chr5 33647617 33647812 -118889447 - RLTR14-int LTR ERV1 -237 5080 4894 2 841 723 295 127 48 chr5 33648478 33649084 -118888175 - RLTR14-int LTR ERV1 -1420 3897 3244 2 841 1850 144 69 84 chr5 33649096 33649475 -118887784 + ORR1C2 LTR MaLR 12 384 0 2 841 353 266 30 68 chr5 33649484 33649617 -118887642 - RLTR6-int LTR ERV1 -2760 5018 4891 2 841 1874 109 152 0 chr5 33649806 33650089 -118887170 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 841 2419 150 51 0 chr5 33650147 33650540 -118886719 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 841 656 331 68 75 chr5 33650544 33651371 -118885888 - RLTR14-int LTR ERV1 -3217 4561 3648 2 841 300 257 134 62 chr5 33651717 33651781 -118885478 - RLTR14-int LTR ERV1 -4167 1150 1077 2 841 300 257 134 62 chr5 33651956 33652003 -118885256 - RLTR14-int LTR ERV1 -4241 1076 1031 2 841 254 339 45 30 chr5 33652034 33652235 -118885024 - RLTR14-int LTR ERV1 -3536 1527 1324 2 841 431 204 11 0 chr5 33652446 33652534 -118884725 - RLTR14-int LTR ERV1 -4408 909 821 2 841 501 308 88 60 chr5 33653110 33653507 -118883752 - RLTR14-int LTR ERV1 -4908 409 2 2 841 924 236 83 124 chr5 33653509 33653788 -118883471 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 119 2 841 2201 135 34 6 chr5 33653788 33654145 -118883114 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 841 924 236 83 124 chr5 33654145 33654261 -118882998 - RLTR14 LTR ERV1 -264 118 1 2 841 351 214 11 43 chr5 33654264 33654357 -118882902 + RLTR19-int LTR ERVK 2946 3035 -3102 2 841 830 222 57 83 chr5 33654573 33654838 -118882421 + RLTR14 LTR ERV1 124 381 -1 2 841 392 232 12 0 chr5 33660564 33660646 -118876613 + ORR1A1 LTR MaLR 1 83 -338 2 841 280 178 0 0 chr5 33660924 33660969 -118876290 + ORR1A1 LTR MaLR 74 118 -303 2 841 916 190 162 25 chr5 33661730 33661991 -118875268 + ORR1A1 LTR MaLR 95 419 0 2 841 1141 305 134 133 chr5 33661990 33662173 -118875086 + ORR1A1-int LTR MaLR 3 194 -1386 2 841 6052 179 69 37 chr5 33662319 33663711 -118873548 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1574 -6 2 841 679 139 83 0 chr5 33663713 33663821 -118873438 + ORR1A1 LTR MaLR 3 119 -302 2 841 1411 167 130 32 chr5 33663994 33664279 -118872980 + ORR1A1 LTR MaLR 105 417 -4 2 841 380 156 16 0 chr5 33664582 33664646 -118872613 + RMER15 LTR ERVL 403 467 -108 2 841 313 341 83 45 chr5 33665181 33665470 -118871789 + ORR1D2 LTR MaLR 67 366 -4 2 841 1305 283 152 56 chr5 33665907 33666498 -118870761 + MTE-int LTR MaLR 289 937 -643 2 841 3712 20 121 0 chr5 33666498 33666938 -118870321 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 841 1305 283 152 56 chr5 33666938 33666952 -118870307 + MTE-int LTR MaLR 938 951 -629 2 841 1890 143 108 31 chr5 33666989 33667379 -118869880 - RMER10A LTR ERVL -18 424 5 2 841 496 301 256 15 chr5 33667546 33667812 -118869447 + MTE-int LTR MaLR 989 1318 -262 2 841 603 335 75 0 chr5 33667937 33668176 -118869083 + MT2A LTR ERVL 170 426 -107 2 841 732 286 101 10 chr5 33668248 33668456 -118868803 + MTE-int LTR MaLR 1312 1538 -42 2 841 3810 54 21 0 chr5 33668462 33668927 -118868332 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 2 841 2586 102 77 37 chr5 33670433 33670890 -118866369 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 841 26671 17 5 0 chr5 33670890 33673833 -118863426 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 2 841 951 80 24 0 chr5 33673833 33673958 -118863301 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 2 841 1862 111 4 4 chr5 33673953 33674215 -118863044 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 2 841 470 78 0 30 chr5 33674201 33674267 -118862992 - IAPEz-int LTR ERVK -5059 1422 1359 2 841 4627 48 70 32 chr5 33674267 33674898 -118862361 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 8 2 841 2586 102 77 37 chr5 33674898 33675355 -118861904 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 841 2719 51 45 113 chr5 33675587 33676029 -118861230 + RLTR1B LTR ERV1 1 412 -100 2 841 544 252 159 21 chr5 33676085 33676324 -118860935 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 2 841 1242 57 6 0 chr5 33676326 33676483 -118860776 + RLTR1B LTR ERV1 355 512 0 2 842 326 246 54 92 chr5 33702447 33702577 -118834682 + MT2B LTR ERVL 152 276 -325 3 842 1159 252 71 14 chr5 33704658 33705012 -118832247 - MTEb LTR MaLR -1 378 5 3 842 2374 237 81 75 chr5 33708740 33709740 -118827519 - RMER17B LTR ERVK -4 904 1 3 842 1410 186 128 24 chr5 33717274 33717610 -118819649 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 3 842 369 306 362 7 chr5 33718410 33718684 -118818575 + RMER15-int LTR ERVL 2017 2387 -2612 3 842 1669 199 104 0 chr5 33723575 33723912 -118813347 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 3 842 558 188 0 10 chr5 33724512 33724609 -118812650 - MTD LTR MaLR -309 110 15 3 842 1755 155 83 44 chr5 33726426 33726808 -118810451 - MTD LTR MaLR -14 405 18 3 842 627 191 319 5 chr5 33726912 33727122 -118810137 + ORR1D1 LTR MaLR 99 374 0 3 842 2480 96 3 0 chr5 33734044 33734368 -118802891 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 5 4 842 238 204 99 72 chr5 33738127 33738238 -118799021 - MLT1L LTR MaLR -143 467 354 4 842 271 167 0 0 chr5 33744461 33744503 -118792756 - MT2B LTR ERVL -313 288 247 4 842 688 144 0 78 chr5 33764692 33764820 -118772439 - MTC LTR MaLR -36 385 268 4 842 3031 167 11 78 chr5 33770279 33770762 -118766497 + RMER15 LTR ERVL 1 464 -111 4 842 3031 167 11 78 chr5 33770938 33771069 -118766190 + RMER15 LTR ERVL 465 574 -1 4 842 334 278 165 40 chr5 33798976 33799152 -118738107 - MLT1D LTR MaLR -103 402 205 5 842 3563 30 0 0 chr5 33812642 33813038 -118724221 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 842 2548 139 25 15 chr5 33814982 33815385 -118721874 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 843 566 290 80 100 chr5 33819158 33819507 -118717752 + ORR1E LTR MaLR 1 342 -17 5 843 2368 326 99 45 chr5 33819522 33819649 -118717610 + ORR1E-int LTR MaLR 1 139 -1441 5 843 2110 135 98 33 chr5 33819649 33820017 -118717242 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 5 843 2368 326 99 45 chr5 33820017 33820711 -118716548 + ORR1E-int LTR MaLR 140 853 -727 5 843 2368 326 99 45 chr5 33820857 33821331 -118715928 + ORR1E-int LTR MaLR 854 1368 -212 5 843 986 236 132 27 chr5 33821376 33821677 -118715582 + RMER19C LTR ERVK 223 527 -84 5 843 282 282 168 0 chr5 33833242 33833373 -118703886 - MLT1B LTR MaLR -193 197 45 5 843 252 258 91 91 chr5 33841370 33841545 -118695714 - MTE-int LTR MaLR -492 1088 914 5 843 583 91 140 10 chr5 33847613 33847713 -118689546 + RMER4B LTR ERVK 473 585 0 5 843 340 223 69 69 chr5 33850370 33850500 -118686759 + RLTR15 LTR ERVK 1 130 -229 5 843 295 299 62 62 chr5 33850493 33850782 -118686477 + RLTR15 LTR ERVK 71 359 0 5 843 2086 184 88 8 chr5 33856748 33857136 -118680123 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 843 276 290 244 0 chr5 33858423 33858554 -118678705 + MLT1C LTR MaLR 161 323 -144 5 843 334 332 42 72 chr5 33867422 33867659 -118669600 - ORR1E LTR MaLR -128 231 2 5 843 2510 56 25 19 chr5 33868411 33868736 -118668523 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 843 474 242 143 149 chr5 33875994 33876363 -118660896 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 843 2769 166 110 4 chr5 33884029 33884549 -118652710 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 5 843 430 322 125 54 chr5 33888850 33889185 -118648074 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 5 843 372 305 101 43 chr5 33890192 33890449 -118646810 - ERVL-E-int LTR ERVL -1521 4146 3875 5 843 302 132 57 0 chr5 33892809 33892862 -118644397 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 312 6 843 1887 98 70 19 chr5 33894391 33894703 -118642556 - ORR1B2 LTR MaLR -39 328 1 6 843 439 132 0 0 chr5 33895212 33895280 -118641979 + ORR1D1 LTR MaLR 25 92 -282 6 843 532 82 11 45 chr5 33895290 33895379 -118641880 - RMER19B LTR ERVK 0 902 817 6 843 1217 130 109 36 chr5 33895406 33895654 -118641605 + ORR1D1 LTR MaLR 109 374 0 6 843 473 241 54 23 chr5 33896437 33896599 -118640660 + MTEa LTR MaLR 201 372 -2 6 843 4242 20 0 0 chr5 33903477 33903970 -118633289 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 843 2259 78 21 21 chr5 33913637 33913964 -118623295 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 6 843 230 352 8 16 chr5 33918606 33918730 -118618529 - RMER12 LTR ERVK -464 858 736 6 843 393 261 43 9 chr5 33923962 33924078 -118613181 + ORR1E LTR MaLR 3 122 -237 6 843 304 275 159 8 chr5 33924090 33924222 -118613037 + ORR1E LTR MaLR 199 350 -29 6 843 1389 320 73 95 chr5 33924242 33924763 -118612496 + ORR1E-int LTR MaLR 14 528 -1052 6 843 1389 320 73 95 chr5 33925307 33925318 -118611941 + ORR1E-int LTR MaLR 529 539 -1041 6 843 1389 320 73 95 chr5 33925550 33925920 -118611339 + ORR1E-int LTR MaLR 559 905 -675 6 843 226 357 31 0 chr5 33926815 33926913 -118610346 + MLT1J-int LTR MaLR 81 181 -1206 6 843 1111 221 46 85 chr5 33938345 33938735 -118598524 + MTE2a LTR MaLR 3 377 -2 6 844 385 200 78 0 chr5 33961422 33961512 -118575747 - MLT1C LTR MaLR -368 99 3 7 844 566 212 54 36 chr5 33962529 33962695 -118574564 - MLT1C LTR MaLR -257 210 42 7 844 2372 123 67 44 chr5 33965197 33965606 -118571653 - RMER4A LTR ERVK 0 466 48 7 844 2372 123 67 44 chr5 33965745 33965769 -118571490 - RMER4A LTR ERVK -419 47 23 7 844 379 284 24 22 chr5 33966236 33966411 -118570848 + MLT1F1 LTR MaLR 411 668 -12 7 844 258 299 39 79 chr5 33968243 33968421 -118568838 + MLT1A1 LTR MaLR 182 352 -56 7 844 389 278 120 99 chr5 33975267 33975570 -118561689 + ORR1E LTR MaLR 8 317 -53 7 844 827 265 49 68 chr5 33975625 33975743 -118561516 + MT2B LTR ERVL 1 118 -415 7 844 1030 259 40 67 chr5 33975906 33976280 -118560979 + MT2B LTR ERVL 119 599 -2 7 844 3382 38 2 2 chr5 33976761 33977156 -118560103 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 7 844 2359 166 48 104 chr5 33977856 33978282 -118558977 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 89 7 844 2359 166 48 104 chr5 33978611 33978735 -118558524 - RLTR12B LTR ERVK -440 88 1 7 844 256 333 90 47 chr5 33981682 33981893 -118555366 - MLT1H-int LTR MaLR -477 932 713 7 844 1625 158 158 19 chr5 33992006 33992380 -118544879 + RMER4A LTR ERVK 33 458 -8 8 844 842 94 0 16 chr5 34002282 34002411 -118534848 + MTA_Mm LTR MaLR 120 246 -150 1 844 1062 75 11 20 chr5 34002313 34002524 -118534735 - MTA_Mm LTR MaLR -201 206 1 2 844 1353 39 11 16 chr5 34002580 34002768 -118534491 + MTA_Mm LTR MaLR 202 396 0 3 844 1290 208 16 31 chr5 34004502 34004971 -118532288 - BGLII_B LTR ERVK -15 426 4 7 844 2612 148 38 118 chr5 34007544 34007621 -118529638 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 463 1 844 2612 148 38 118 chr5 34007811 34008307 -118528952 - RLTR12B LTR ERVK -66 462 1 1 844 271 50 0 24 chr5 34008606 34008642 -118528617 - MTD LTR MaLR -8 411 376 2 844 268 186 0 0 chr5 34008928 34008942 -118528317 - MTD LTR MaLR -51 370 357 2 844 1838 138 111 3 chr5 34012852 34013149 -118524110 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 844 534 247 17 90 chr5 34014887 34014943 -118522316 - RMER15 LTR ERVL -382 193 145 3 844 534 247 17 90 chr5 34015153 34015274 -118521985 - RMER15 LTR ERVL -431 144 29 3 844 308 305 67 0 chr5 34017577 34017682 -118519577 + MLT1A LTR MaLR 30 141 -233 3 844 1670 177 83 145 chr5 34019466 34019852 -118517407 + RLTR18 LTR ERVK 1 372 -244 3 844 1670 177 83 145 chr5 34020165 34020253 -118517006 + RLTR18 LTR ERVK 373 453 -163 3 844 231 209 0 0 chr5 34020257 34020300 -118516959 + RLTR18 LTR ERVK 430 472 -144 3 844 850 121 64 0 chr5 34020811 34020951 -118516308 - RMER19B LTR ERVK -2 900 752 4 844 657 212 9 53 chr5 34020951 34021172 -118516087 - RMER19B LTR ERVK -557 180 1 4 844 708 178 29 7 chr5 34021172 34021307 -118515952 + RLTR18 LTR ERVK 479 616 0 3 844 2943 187 42 70 chr5 34025131 34026101 -118511158 + RMER19A LTR ERVK 1 882 -20 4 844 253 295 46 71 chr5 34049692 34049889 -118487370 + RMER17A LTR ERVK 326 517 -234 6 844 804 194 156 0 chr5 34052798 34052978 -118484281 + RMER15 LTR ERVL 368 575 0 7 844 456 300 131 48 chr5 34062080 34062455 -118474804 + MLT1C LTR MaLR 1 406 -61 9 845 1945 105 86 3 chr5 34095976 34096300 -118440959 + RMER4B LTR ERVK 1 351 -234 1 845 1518 151 12 12 chr5 34096574 34096829 -118440430 + RMER4B LTR ERVK 322 576 -9 1 845 269 288 61 26 chr5 34097637 34097751 -118439508 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 118 -409 1 845 260 293 73 0 chr5 34097752 34097834 -118439425 + BGLII_B LTR ERVK 290 377 -64 1 845 2524 132 42 42 chr5 34102314 34102789 -118434470 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 845 878 296 103 23 chr5 34105562 34105691 -118431568 - ORR1E-int LTR MaLR -895 685 555 1 845 878 296 103 23 chr5 34105891 34106197 -118431062 - ORR1E-int LTR MaLR -1026 554 216 1 845 400 254 296 11 chr5 34106455 34106634 -118430625 - ORR1E-int LTR MaLR -1350 230 1 1 845 270 336 130 40 chr5 34106645 34106868 -118430391 - ORR1E LTR MaLR -8 351 109 1 845 454 295 40 40 chr5 34109886 34110133 -118427126 + RLTR15 LTR ERVK 45 291 -68 1 845 1479 191 61 47 chr5 34110458 34110821 -118426438 + ORR1C1 LTR MaLR 11 378 0 1 845 225 230 90 51 chr5 34123066 34123144 -118414115 - MER21B LTR ERV1 -287 576 496 2 845 291 231 261 17 chr5 34123082 34123201 -118414058 - MER77 LTR ERVL -17 590 443 2 845 3443 30 2 10 chr5 34127991 34128390 -118408869 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 845 8995 41 13 2 chr5 34128390 34129476 -118407783 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 845 3478 28 2 2 chr5 34129476 34129872 -118407387 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 845 581 112 22 0 chr5 34130422 34130505 -118406754 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1019 2 845 1688 221 133 21 chr5 34130505 34130898 -118406361 + RLTR20C LTR ERVK 1 432 -102 2 845 1688 221 133 21 chr5 34130944 34131030 -118406229 + RLTR20C LTR ERVK 433 533 -1 2 845 972 137 253 49 chr5 34131030 34131103 -118406156 - RLTR25A LTR ERVK -79 1024 941 2 845 972 137 253 49 chr5 34131189 34131359 -118405900 - RLTR25A LTR ERVK -163 940 731 2 845 4318 147 82 74 chr5 34131364 34132233 -118405026 + RMER19B LTR ERVK 2 877 -25 2 845 1407 226 32 62 chr5 34132113 34132526 -118404733 - RMER19B LTR ERVK -528 374 1 2 845 5724 127 38 23 chr5 34132527 34133115 -118404144 + MYSERV6-int LTR ERVK 3013 3606 -5353 2 845 3831 136 152 0 chr5 34133115 34133755 -118403504 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 2 845 5724 127 38 23 chr5 34133755 34133921 -118403338 + MYSERV6-int LTR ERVK 3607 3785 -5174 2 845 3977 166 83 76 chr5 34133921 34134817 -118402442 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 2 845 5724 127 38 23 chr5 34134817 34135064 -118402195 + MYSERV6-int LTR ERVK 3786 4030 -4929 2 845 921 250 88 31 chr5 34135071 34135331 -118401928 + RLTR16 LTR ERVK 24 298 -207 2 845 6220 221 139 105 chr5 34135792 34136239 -118401020 + MYSERV-int LTR ERVK 3810 4261 -2289 2 845 6220 221 139 105 chr5 34136288 34136945 -118400314 + MYSERV-int LTR ERVK 4262 4970 -1580 2 845 3055 30 0 85 chr5 34136945 34137344 -118399915 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 2 845 6220 219 122 91 chr5 34137344 34137871 -118399388 + MYSERV-int LTR ERVK 4971 5510 -1040 2 845 6220 221 139 105 chr5 34138035 34138808 -118398451 + MYSERV-int LTR ERVK 5511 6297 -253 2 845 2055 129 16 0 chr5 34138838 34139149 -118398110 - ORR1A3 LTR MaLR -10 316 1 2 845 10775 126 55 79 chr5 34139149 34141161 -118396098 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1 2 845 1560 156 103 57 chr5 34141165 34141465 -118395794 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 5 2 845 1072 147 16 94 chr5 34141472 34141728 -118395531 + MYSERV6-int LTR ERVK 8723 8958 -1 2 845 1141 284 30 51 chr5 34141755 34142222 -118395037 + RLTR12B LTR ERVK 47 503 -25 2 845 4132 165 18 30 chr5 34142579 34143361 -118393898 + MYSERV6-int LTR ERVK 2504 3724 -1536 2 845 2395 219 142 18 chr5 34143361 34144017 -118393242 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 845 4132 156 14 30 chr5 34144017 34144115 -118393144 + MYSERV6-int LTR ERVK 3174 3264 -5695 2 845 444 256 52 85 chr5 34144154 34144490 -118392769 + RLTR15 LTR ERVK 30 344 -15 2 845 2738 144 43 40 chr5 34145874 34146385 -118390874 - RLTR19 LTR ERVK -3 496 1 2 845 2556 263 57 48 chr5 34146553 34147394 -118389865 + MYSERV6-int LTR ERVK 3750 4598 -1952 2 845 354 165 21 96 chr5 34147413 34147507 -118389752 + MYSERV6-int LTR ERVK 4653 4739 -1811 2 845 586 260 67 19 chr5 34147570 34147778 -118389481 - RLTR15 LTR ERVK -93 266 49 2 845 237 275 44 37 chr5 34148109 34148152 -118389107 + ORR1B1-int LTR MaLR 603 646 -863 2 845 280 271 11 34 chr5 34148198 34148286 -118388973 + RLTR25A LTR ERVK 522 607 -496 2 845 331 190 1 17 chr5 34148289 34148370 -118388889 - MYSERV6-int LTR ERVK -208 8751 8682 2 845 2405 155 67 2 chr5 34148429 34148862 -118388397 - RMER4A LTR ERVK 0 466 6 2 845 993 251 22 59 chr5 34148985 34149341 -118387918 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 2 845 1697 132 20 0 chr5 34150436 34150687 -118386572 - MTC LTR MaLR -55 366 111 2 845 527 79 118 0 chr5 34151503 34151579 -118385680 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 323 2 845 1672 21 0 0 chr5 34151580 34151772 -118385487 + MTB LTR MaLR 209 400 0 2 845 7427 94 3 67 chr5 34151772 34152945 -118384314 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 2 845 2482 61 106 22 chr5 34152945 34153314 -118383945 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 845 341 245 48 19 chr5 34154631 34154735 -118382524 + MLT1F LTR MaLR 441 547 -1 2 845 3634 154 116 86 chr5 34155189 34156025 -118381234 + RMER19B LTR ERVK 1 861 -41 2 845 252 247 61 61 chr5 34159304 34159403 -118377856 + MLT1C LTR MaLR 6 104 -363 2 845 467 242 55 113 chr5 34170971 34171209 -118366050 - RMER2 LTR ERV1 0 567 344 3 845 289 152 0 5 chr5 34177884 34177939 -118359320 + RMER19B LTR ERVK 856 902 0 3 845 848 263 37 37 chr5 34179435 34179783 -118357476 - RLTR15 LTR ERVK -9 350 3 3 845 257 216 0 0 chr5 34187897 34187948 -118349311 + BGLII LTR ERVK 312 362 -59 3 845 241 299 54 88 chr5 34192728 34192875 -118344384 - MT2B2 LTR ERVL -288 296 155 4 845 3563 100 8 2 chr5 34199570 34200073 -118337186 - RLTR19C LTR ERVK 0 506 1 4 845 1617 206 59 34 chr5 34204545 34204901 -118332358 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 8 4 846 3234 38 125 23 chr5 34226047 34226478 -118310781 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 846 275 269 25 92 chr5 34231663 34231674 -118305585 - MT2B2 LTR ERVL -313 271 166 4 846 4531 12 0 0 chr5 34246776 34247269 -118289990 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 846 321 0 0 0 chr5 34247269 34247307 -118289952 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 5 846 362 167 46 35 chr5 34247307 34247394 -118289865 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 5 846 21476 23 0 0 chr5 34247394 34249784 -118287475 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 2970 5 846 4472 8 2 12 chr5 34249784 34250282 -118286977 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 846 2273 20 0 0 chr5 34250282 34250536 -118286723 + MERVL-int LTR ERVL 1 254 -5231 5 846 2951 26 3 0 chr5 34250527 34250867 -118286392 + MERVL-int LTR ERVL 5020 5360 -125 5 846 344 179 46 35 chr5 34250867 34250954 -118286305 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 5 846 321 0 0 0 chr5 34250954 34250992 -118286267 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 846 4472 8 2 12 chr5 34250992 34251490 -118285769 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 846 26778 12 11 0 chr5 34251490 34254431 -118282828 - MERVL-int LTR ERVL -2511 2974 1 5 846 4531 12 0 0 chr5 34254431 34254924 -118282335 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 846 2928 35 9 0 chr5 34256002 34256345 -118280914 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 846 14149 48 19 3 chr5 34256345 34258108 -118279151 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 5 846 2630 31 55 58 chr5 34258108 34258455 -118278804 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 846 1180 165 68 62 chr5 34258914 34259250 -118278009 + RLTR15 LTR ERVK 1 338 -21 5 846 582 283 58 0 chr5 34260224 34260397 -118276862 + MYSERV6-int LTR ERVK 4118 4300 -4659 5 846 572 264 35 12 chr5 34260387 34260556 -118276703 + MYSERV-int LTR ERVK 3917 4089 -2461 5 846 1426 277 134 69 chr5 34260587 34261458 -118275801 + MYSERV-int LTR ERVK 4199 5126 -1424 5 846 530 273 39 28 chr5 34261462 34261643 -118275616 + RMER4A LTR ERVK 255 437 -29 5 846 3553 160 99 40 chr5 34261661 34262713 -118274546 + MYSERV6-int LTR ERVK 7818 8728 -231 5 846 1394 175 26 24 chr5 34262758 34263098 -118274161 + RLTR15 LTR ERVK 3 343 -16 5 846 793 246 58 50 chr5 34265695 34265956 -118271303 + ORR1D1 LTR MaLR 106 368 -6 5 846 307 167 0 3 chr5 34269084 34269145 -118268114 + MTA_Mm LTR MaLR 52 111 -310 5 846 967 326 34 5 chr5 34269899 34270267 -118266992 + MYSERV6-int LTR ERVK 1742 2096 -6863 5 846 4473 198 54 26 chr5 34270399 34271431 -118265828 + MYSERV6-int LTR ERVK 2099 3159 -5800 5 846 1733 149 56 0 chr5 34271446 34271768 -118265491 + ORR1B1 LTR MaLR 47 386 -8 5 846 1156 158 54 9 chr5 34271769 34271993 -118265266 + MYSERV6-int LTR ERVK 3152 3385 -5574 5 846 788 210 186 14 chr5 34271988 34272263 -118264996 + MYSERV6-int LTR ERVK 4245 4566 -4393 5 846 1942 114 100 0 chr5 34272456 34272746 -118264513 - ORR1A3 LTR MaLR -4 322 4 5 846 436 300 91 133 chr5 34272768 34273272 -118263987 + MYSERV6-int LTR ERVK 4653 5135 -1415 5 846 1952 232 62 71 chr5 34273527 34274309 -118262950 + MYSERV6-int LTR ERVK 7952 8643 -316 5 846 401 171 24 12 chr5 34274505 34274615 -118262644 + MYSERV6-int LTR ERVK 8704 8779 -180 5 846 442 226 25 25 chr5 34274900 34275018 -118262241 + MYSERV-int LTR ERVK 6433 6550 0 5 846 1001 142 262 10 chr5 34276005 34276410 -118260849 + RLTR12B LTR ERVK 2 509 -19 5 846 2087 128 127 24 chr5 34280288 34280704 -118256555 - RMER4A LTR ERVK 0 466 8 5 846 3322 160 127 82 chr5 34280859 34281708 -118255551 + RMER19B LTR ERVK 1 887 -15 5 846 2445 162 174 23 chr5 34281722 34282317 -118254942 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1 700 -5080 5 846 2445 138 23 62 chr5 34282480 34282708 -118254551 + MurERV4_19-int LTR ERVK 701 906 -4874 5 846 1934 207 82 45 chr5 34284560 34285097 -118252162 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 1 5 846 798 87 8 0 chr5 34289145 34289271 -118247988 + ORR1A4 LTR MaLR 1 127 -202 5 846 1007 83 21 0 chr5 34289472 34289617 -118247642 + BGLII_B LTR ERVK 21 168 -273 5 846 2005 109 25 19 chr5 34289618 34289936 -118247323 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 5 846 1937 104 2 1 chr5 34289936 34290213 -118247046 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 7232 5 846 1613 163 27 13 chr5 34290405 34290425 -118246834 - MMERVK10C-int LTR ERVK -282 7231 7212 5 846 20286 113 26 40 chr5 34290423 34293673 -118243586 - MMERVK10C-int LTR ERVK -253 7328 4125 5 846 8163 92 21 0 chr5 34293672 34294756 -118242503 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3662 3919 2813 5 846 4069 73 54 9 chr5 34294778 34295315 -118241944 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5136 2445 1885 5 846 408 161 123 0 chr5 34295306 34295387 -118241872 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5109 1028 938 5 846 1711 173 181 32 chr5 34295392 34295833 -118241426 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4587 819 313 5 846 595 179 72 16 chr5 34295814 34295939 -118241320 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6913 668 537 5 846 2236 251 72 101 chr5 34295934 34296822 -118240437 - IAPEY3-int LTR ERVK -6760 920 54 5 846 2236 251 72 101 chr5 34296848 34296904 -118240355 - IAPEY3-int LTR ERVK -7627 53 3 5 846 2064 112 19 0 chr5 34296906 34297220 -118240039 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 5 846 1157 145 116 8 chr5 34297220 34297471 -118239788 + BGLII_B LTR ERVK 164 441 0 5 846 1322 119 5 0 chr5 34297473 34297675 -118239584 + ORR1A4 LTR MaLR 127 329 0 5 846 243 176 58 14 chr5 34297675 34297744 -118239515 - RLTR12B LTR ERVK -326 202 131 5 846 2230 111 22 20 chr5 34299112 34299470 -118237789 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 846 1426 133 131 186 chr5 34299492 34299889 -118237370 - ORR1C1 LTR MaLR -3 375 1 5 846 1520 173 25 25 chr5 34300144 34300459 -118236800 - RMER15 LTR ERVL 0 575 261 5 846 5027 145 87 10 chr5 34300606 34301443 -118235816 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 5 846 281 253 108 0 chr5 34301856 34301939 -118235320 + RMER10A LTR ERVL 318 409 -33 5 846 255 264 18 62 chr5 34302463 34302576 -118234683 - RLTR14 LTR ERV1 -8 374 267 5 846 920 234 273 39 chr5 34303072 34303530 -118233729 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 3 5 846 326 253 188 20 chr5 34304031 34304180 -118233079 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 394 5 846 627 232 130 44 chr5 34304186 34304501 -118232758 + RLTR15 LTR ERVK 1 342 -17 5 846 7493 254 76 65 chr5 34306208 34307347 -118229912 + MYSERV6-int LTR ERVK 368 1530 -7429 5 846 7493 254 76 65 chr5 34307379 34307512 -118229747 + MYSERV6-int LTR ERVK 1531 1668 -7291 5 846 7493 254 76 65 chr5 34307532 34307728 -118229531 + MYSERV6-int LTR ERVK 1669 1848 -7111 5 846 3938 58 56 0 chr5 34307728 34307790 -118229469 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 438 6 846 3938 58 56 0 chr5 34307840 34308262 -118228997 - RLTR1B LTR ERV1 -75 437 2 6 846 7493 254 76 65 chr5 34308262 34309949 -118227310 + MYSERV6-int LTR ERVK 1849 3553 -5406 5 846 7493 254 76 65 chr5 34310094 34310415 -118226844 + MYSERV6-int LTR ERVK 3554 3886 -5073 5 846 2834 258 96 51 chr5 34310412 34311545 -118225714 + MYSERV6-int LTR ERVK 3827 5010 -1540 5 846 255 104 104 0 chr5 34311560 34311608 -118225651 + RLTR15 LTR ERVK 1 53 -306 6 846 1566 139 13 77 chr5 34311693 34311856 -118225403 + RLTR15 LTR ERVK 69 235 -124 6 846 1566 139 13 77 chr5 34312168 34312315 -118224944 + RLTR15 LTR ERVK 236 359 0 6 846 2368 290 121 42 chr5 34313105 34314368 -118222891 + MYSERV-int LTR ERVK 3774 5136 -1414 6 846 241 371 52 13 chr5 34314374 34314527 -118222732 + RMER4A LTR ERVK 266 424 -42 6 846 1389 213 80 24 chr5 34314614 34315040 -118222219 + MYSERV-int LTR ERVK 5373 5781 -769 6 846 4330 145 39 71 chr5 34315256 34316169 -118221090 - RMER19B LTR ERVK -16 886 3 6 846 535 115 11 11 chr5 34316170 34316258 -118221001 + MYSERV6-int LTR ERVK 8198 8285 -674 6 846 1331 263 98 16 chr5 34316259 34316383 -118220876 - RMER19A LTR ERVK 0 737 599 6 846 1331 263 98 16 chr5 34316529 34316844 -118220415 - RMER19A LTR ERVK -139 598 262 6 846 2029 220 43 10 chr5 34316846 34317352 -118219907 + MYSERV-int LTR ERVK 5843 6365 -185 6 846 299 228 128 0 chr5 34317335 34317484 -118219775 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2158 2325 -1 6 846 2006 153 38 3 chr5 34317485 34317832 -118219427 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 6 846 254 299 20 30 chr5 34317838 34317938 -118219321 + MYSERV-int LTR ERVK 5267 5365 -415 6 846 469 253 29 51 chr5 34317938 34318113 -118219146 + RMER4A LTR ERVK 253 423 -43 6 846 1621 201 105 12 chr5 34318118 34318526 -118218733 + MYSERV-int LTR ERVK 5312 5757 -793 6 846 872 169 0 7 chr5 34318558 34318707 -118218552 - MYSERV6-int LTR ERVK -632 8327 8180 6 846 536 203 17 8 chr5 34319898 34320009 -118217250 - RMER19B LTR ERVK -4 898 787 6 846 471 206 52 0 chr5 34320009 34320106 -118217153 + RMER19B LTR ERVK 1 102 -800 6 846 286 145 48 0 chr5 34320130 34320192 -118217067 + RMER10B LTR ERVL 118 182 -216 6 846 379 243 108 27 chr5 34320220 34320368 -118216891 + RLTR12B LTR ERVK 48 207 -321 6 846 264 289 32 40 chr5 34320508 34320634 -118216625 - RLTR12B LTR ERVK -225 303 179 6 846 535 265 46 13 chr5 34320664 34320817 -118216442 + RMER10B LTR ERVL 160 317 -81 6 846 324 241 24 24 chr5 34321048 34321133 -118216126 + MLT1A1 LTR MaLR 312 396 -12 6 846 321 292 150 36 chr5 34321402 34321569 -118215690 + RLTR18B LTR ERVK 11 196 -316 6 846 400 303 97 60 chr5 34321563 34321830 -118215429 + RLTR18 LTR ERVK 111 387 -125 6 846 293 62 83 0 chr5 34321850 34321898 -118215361 + ORR1C2 LTR MaLR 332 383 -1 6 846 405 186 75 38 chr5 34321898 34322000 -118215259 + RLTR18 LTR ERVK 510 615 -1 6 846 1200 168 139 89 chr5 34322131 34322379 -118214880 + ORR1C2 LTR MaLR 7 251 -133 6 846 1200 168 139 89 chr5 34322407 34322436 -118214823 + ORR1C2 LTR MaLR 252 280 -104 6 846 4854 121 19 68 chr5 34322436 34323280 -118213979 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 6 846 1200 168 139 89 chr5 34323280 34323361 -118213898 + ORR1C2 LTR MaLR 281 383 -1 6 846 1999 147 86 9 chr5 34324156 34324506 -118212753 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 6 846 7684 75 24 2 chr5 34330785 34331786 -118205473 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 6 846 1525 117 93 0 chr5 34331794 34332041 -118205218 - ETnERV3-int LTR ERVK -10 5798 5529 6 846 6271 116 109 67 chr5 34332055 34333213 -118204046 - RLTR45-int LTR ERVK -1173 6071 4865 6 846 10019 111 20 33 chr5 34333226 34334175 -118203084 - ETnERV2-int LTR ERVK -4008 3398 2443 6 846 3330 46 5 0 chr5 34334175 34334569 -118202690 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 846 8826 49 9 6 chr5 34334569 34335664 -118201595 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 846 3522 38 0 0 chr5 34335664 34336060 -118201199 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 846 10019 111 20 33 chr5 34336060 34336728 -118200531 - ETnERV2-int LTR ERVK -4964 2442 1803 6 847 1281 220 91 71 chr5 34357635 34358144 -118179115 - MT2B LTR ERVL -7 594 1 6 847 25258 143 37 28 chr5 34358144 34358290 -118178969 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5612 6 847 267 246 57 14 chr5 34358290 34358360 -118178899 - ORR1A3-int LTR MaLR -1346 617 545 6 847 25258 143 37 28 chr5 34358360 34361296 -118175963 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5611 2588 6 847 4690 160 66 54 chr5 34361296 34362187 -118175072 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 6 847 25258 143 37 28 chr5 34362187 34363224 -118174035 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3174 2587 1534 6 847 993 205 48 143 chr5 34363339 34363747 -118173512 - MT2B2 LTR ERVL -61 523 1 6 847 321 257 0 122 chr5 34366170 34366285 -118170974 - MT2B LTR ERVL -346 255 155 6 847 1085 79 0 26 chr5 34366288 34366443 -118170816 + RMER4B LTR ERVK 1 151 -434 6 847 1360 116 133 4 chr5 34366444 34366669 -118170590 + RMER4B LTR ERVK 332 585 0 6 847 349 259 74 34 chr5 34369699 34369847 -118167412 + MTE-int LTR MaLR 3 156 -1424 6 847 526 273 22 159 chr5 34369923 34370138 -118167121 + MTE-int LTR MaLR 125 312 -1268 6 847 1567 275 190 43 chr5 34370168 34370838 -118166421 + MTE-int LTR MaLR 747 1514 -66 6 847 1192 235 92 92 chr5 34371067 34371438 -118165821 + MTE2a LTR MaLR 9 421 0 6 847 2044 194 24 36 chr5 34371878 34372294 -118164965 - MTD LTR MaLR -8 411 1 6 847 3482 30 2 0 chr5 34378128 34378523 -118158736 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 847 9619 23 2 1 chr5 34378523 34379620 -118157639 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 847 3584 18 2 0 chr5 34379620 34380015 -118157244 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 847 1576 236 80 6 chr5 34391001 34391351 -118145908 - MTEa LTR MaLR -3 376 1 6 847 699 263 123 26 chr5 34396812 34397075 -118140184 - MTEb LTR MaLR 0 379 62 7 847 292 289 12 0 chr5 34397075 34397158 -118140101 + RLTR24 LTR ERV1 1 84 -445 7 847 346 186 0 0 chr5 34397460 34397519 -118139740 - MTEb LTR MaLR -314 65 7 7 847 4170 252 152 33 chr5 34397524 34397704 -118139555 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 1367 7 847 4170 252 152 33 chr5 34397733 34398963 -118138296 - MTEb-int LTR MaLR -214 1366 2 7 847 336 100 16 62 chr5 34398972 34399036 -118138223 - MTEb LTR MaLR -20 359 299 7 847 262 400 64 6 chr5 34411160 34411331 -118125928 - MLT1J-int LTR MaLR -558 829 649 7 847 1883 160 119 3 chr5 34417853 34418197 -118119062 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 847 624 284 82 71 chr5 34425244 34425525 -118111734 - MTEb LTR MaLR 0 379 96 7 847 238 337 59 0 chr5 34425724 34425825 -118111434 + RMER12 LTR ERVK 743 849 -473 7 847 278 264 14 0 chr5 34426390 34426462 -118110797 + MTEa LTR MaLR 294 366 -13 7 847 607 209 6 63 chr5 34427622 34427780 -118109479 + MER31B LTR ERV1 242 390 -76 7 847 3267 204 52 58 chr5 34430035 34430847 -118106412 + RLTR40 LTR ERVK 1 807 -10 7 847 1667 269 67 74 chr5 34433345 34434034 -118103225 + RMER19C LTR ERVK 1 717 -20 7 847 1156 233 30 23 chr5 34434346 34434609 -118102650 - MTD LTR MaLR -28 391 127 7 847 322 152 0 4 chr5 34434609 34434662 -118102597 - MTD LTR MaLR -264 155 105 7 847 316 238 37 12 chr5 34434673 34434754 -118102505 + MTE2a LTR MaLR 290 372 -7 7 847 799 235 27 63 chr5 34437508 34437847 -118099412 + RLTR15 LTR ERVK 45 344 -15 7 847 673 271 104 141 chr5 34443804 34443929 -118093330 + MT2B LTR ERVL 16 128 -405 8 847 2931 143 132 0 chr5 34443929 34444446 -118092813 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 8 847 790 258 122 95 chr5 34444446 34444833 -118092426 + MT2B LTR ERVL 129 577 -24 8 847 790 254 128 81 chr5 34445037 34445061 -118092198 + MT2B LTR ERVL 578 601 0 8 847 927 213 131 222 chr5 34446939 34447525 -118089734 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 8 847 4323 166 87 71 chr5 34448113 34448989 -118088270 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 8 847 622 318 108 36 chr5 34453450 34453522 -118083737 - ORR1C2 LTR MaLR 0 359 284 8 847 1225 179 33 19 chr5 34453663 34453923 -118083336 - ORR1C2 LTR MaLR -76 283 4 8 847 5451 191 77 67 chr5 34453925 34455419 -118081840 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1509 1 8 847 2234 128 55 16 chr5 34455419 34455784 -118081475 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 6 8 847 907 263 152 16 chr5 34462855 34463209 -118074050 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 847 240 254 45 45 chr5 34464185 34464251 -118073008 - MLT1A1 LTR MaLR -271 137 72 8 847 2294 142 29 10 chr5 34467935 34468319 -118068940 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 8 847 1458 250 24 11 chr5 34469676 34469998 -118067261 + MTEa LTR MaLR 1 323 -56 8 847 1458 250 24 11 chr5 34470024 34470073 -118067186 + MTEa LTR MaLR 324 376 -3 8 848 3501 170 156 19 chr5 34478126 34478892 -118058367 - RMER19B LTR ERVK 0 902 55 8 848 2744 51 26 0 chr5 34478894 34479245 -118058014 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 360 -115 8 848 249 108 0 0 chr5 34479229 34479266 -118057993 + ORR1A0 LTR MaLR 290 326 0 8 848 14386 44 3 1 chr5 34479266 34481054 -118056205 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 8 848 2945 9 42 0 chr5 34481054 34481386 -118055873 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 8 848 567 124 22 0 chr5 34481737 34481820 -118055439 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1019 8 848 822 64 9 18 chr5 34481820 34481931 -118055328 + RLTR20A LTR ERVK 1 110 -431 8 848 302 154 73 44 chr5 34481942 34482010 -118055249 - RMER19B LTR ERVK -832 70 1 8 848 305 274 14 0 chr5 34482614 34482687 -118054572 + LTR41 LTR ERVL 100 173 -585 8 848 417 256 154 6 chr5 34482682 34482851 -118054408 + LTR41 LTR ERVL 561 754 -14 8 848 3543 158 93 3 chr5 34483514 34483577 -118053682 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4932 5004 -757 8 848 3543 158 93 3 chr5 34483629 34484261 -118052998 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5005 5689 -72 8 848 303 222 0 14 chr5 34484270 34484343 -118052916 + ORR1A3-int LTR MaLR 568 639 -1324 8 848 343 143 0 0 chr5 34484343 34484399 -118052860 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5706 5761 0 8 848 710 266 38 33 chr5 34484399 34484693 -118052566 + MT2A LTR ERVL 1 297 -196 8 848 232 294 108 0 chr5 34484797 34484899 -118052360 + MT2A LTR ERVL 167 300 -233 8 848 5327 142 78 6 chr5 34488402 34489499 -118047760 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1150 2325 -1 8 848 2455 139 35 82 chr5 34489500 34489963 -118047296 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 8 848 238 269 107 71 chr5 34491002 34491114 -118046145 - MLT1J LTR MaLR -50 462 347 8 848 327 333 45 70 chr5 34497766 34497966 -118039293 + RMER15 LTR ERVL 363 557 -18 9 848 309 151 90 34 chr5 34502862 34502951 -118034308 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 820 913 -1413 9 848 313 233 144 17 chr5 34502951 34503069 -118034190 + RMER4A LTR ERVK 298 430 -36 1 848 3660 177 99 12 chr5 34503069 34504255 -118033004 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1037 2326 0 9 848 2313 177 23 77 chr5 34504255 34504813 -118032446 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 9 848 237 295 75 69 chr5 34533366 34533526 -118003733 + LTR41 LTR ERVL 171 331 -437 4 848 1274 234 99 3 chr5 34535193 34535340 -118001919 + ORR1D2 LTR MaLR 5 165 -205 4 848 1274 234 99 3 chr5 34535398 34535584 -118001675 + ORR1D2 LTR MaLR 166 369 -1 4 848 1916 224 39 17 chr5 34542446 34542854 -117994405 - MTD LTR MaLR 0 419 3 5 848 632 336 118 19 chr5 34543166 34543592 -117993667 + MLT1C LTR MaLR 1 450 -17 5 848 1619 193 57 12 chr5 34548064 34548395 -117988864 + MTC LTR MaLR 58 403 -18 6 848 1075 267 120 14 chr5 34548558 34548926 -117988333 + MLT1C LTR MaLR 1 407 -60 6 848 253 167 0 0 chr5 34555394 34555436 -117981823 + MT2A LTR ERVL 1 42 -491 7 848 407 260 54 47 chr5 34555450 34555579 -117981680 + MTE2b LTR MaLR 13 142 -237 7 848 2155 188 28 0 chr5 34555483 34555871 -117981388 + MT2A LTR ERVL 45 443 -90 7 848 1654 187 126 43 chr5 34562573 34562947 -117974312 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 848 1224 239 132 20 chr5 34563158 34563499 -117973760 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 8 848 3309 48 5 0 chr5 34563608 34564002 -117973257 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 848 790 248 109 49 chr5 34568947 34569231 -117968028 - MLT2D LTR ERVL -109 305 5 9 848 246 311 130 77 chr5 34574298 34574545 -117962714 + LTR53 LTR ERVL 22 281 -238 1 848 372 314 263 40 chr5 34583475 34583727 -117953532 + MER21B LTR ERV1 39 346 -517 1 848 2225 134 116 49 chr5 34588198 34588629 -117948630 - RMER4A LTR ERVK 0 466 7 1 848 313 297 95 63 chr5 34596480 34596638 -117940621 + MLT1A LTR MaLR 1 163 -211 1 848 1258 252 95 14 chr5 34598291 34598637 -117938622 + MTEb LTR MaLR 3 376 -3 1 848 430 218 37 56 chr5 34599394 34599501 -117937758 - MTEb LTR MaLR 0 379 275 1 848 357 296 55 23 chr5 34599572 34599700 -117937559 - MTEb LTR MaLR -224 135 4 1 848 244 298 28 71 chr5 34599832 34599973 -117937286 + MT2B2 LTR ERVL 123 257 -327 1 849 300 293 40 24 chr5 34604630 34604756 -117932503 + ORR1E LTR MaLR 9 136 -223 1 849 318 299 25 17 chr5 34612157 34612276 -117924983 - MLT1E3 LTR MaLR -6 618 499 1 849 1654 210 166 67 chr5 34620019 34620575 -117916684 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 849 1198 208 226 0 chr5 34620701 34621028 -117916231 - MTD LTR MaLR -18 401 1 1 849 1431 253 27 62 chr5 34621823 34622274 -117914985 + RMER19C LTR ERVK 138 572 -39 1 849 328 309 91 65 chr5 34624490 34624753 -117912506 - MLT1J2 LTR MaLR -29 419 150 2 849 2950 48 7 37 chr5 34628543 34628951 -117908308 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 849 322 365 85 31 chr5 34633228 34633488 -117903771 - MLT1J LTR MaLR -204 308 35 2 849 2564 144 85 20 chr5 34633510 34634006 -117903253 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 2 849 470 264 25 222 chr5 34635052 34635407 -117901852 + MTE2b LTR MaLR 16 300 -79 2 849 855 235 45 5 chr5 34639387 34639588 -117897671 - MTE2a LTR MaLR -3 376 168 2 849 2191 152 57 9 chr5 34645810 34646229 -117891030 - BGLII_B LTR ERVK -2 439 1 2 849 922 325 201 14 chr5 34655009 34655497 -117881762 - MER21B LTR ERV1 -174 689 111 2 849 256 374 30 30 chr5 34656281 34656449 -117880810 - MER21B LTR ERV1 -91 772 605 2 849 330 24 0 0 chr5 34658273 34658315 -117878944 - MT2A LTR ERVL -1 532 491 2 849 762 235 5 38 chr5 34658387 34658573 -117878686 - MT2B LTR ERVL -40 561 382 2 849 558 238 113 35 chr5 34659446 34659677 -117877582 - RLTR15 LTR ERVK -66 293 45 2 849 683 109 80 0 chr5 34660131 34660268 -117876991 + RMER17B LTR ERVK 316 463 -495 2 849 365 274 111 88 chr5 34660829 34660949 -117876310 - ORR1E LTR MaLR -135 224 107 2 849 365 274 111 88 chr5 34661176 34661271 -117875988 - ORR1E LTR MaLR -253 106 4 2 849 507 333 39 17 chr5 34666324 34666556 -117870703 - RMER15 LTR ERVL -43 532 296 2 849 1041 271 57 47 chr5 34666560 34666943 -117870316 - RMER15 LTR ERVL 0 575 189 2 849 371 268 93 16 chr5 34672358 34672540 -117864719 + MLT1H LTR MaLR 91 286 -263 2 849 2141 136 72 0 chr5 34672718 34673078 -117864181 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 2 849 459 187 24 24 chr5 34673229 34673269 -117863990 - RMER10B LTR ERVL -117 281 239 2 849 3512 45 31 5 chr5 34673269 34673694 -117863565 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 849 520 95 203 14 chr5 34673694 34673879 -117863380 - RMER10B LTR ERVL -160 238 1 2 849 1142 257 74 77 chr5 34673981 34674252 -117863007 - RMER17C-int LTR ERVK -141 3097 2818 2 849 1142 257 74 77 chr5 34674443 34674668 -117862591 - RMER17C-int LTR ERVK -421 2817 2602 2 849 2241 139 24 75 chr5 34675997 34676307 -117860952 + RLTR28B LTR ERVL 1 305 -176 3 849 2241 139 24 75 chr5 34676677 34676808 -117860451 + RLTR28B LTR ERVL 306 429 -52 3 849 359 247 171 67 chr5 34681363 34681496 -117855763 - MT2A LTR ERVL -337 264 139 3 849 424 206 57 15 chr5 34681633 34681738 -117855521 - MT2A LTR ERVL -463 138 1 3 849 370 225 30 90 chr5 34687591 34687757 -117849502 + RLTR15 LTR ERVK 33 188 -171 3 849 260 316 57 25 chr5 34687790 34687949 -117849310 + RLTR15 LTR ERVK 186 349 -10 3 849 1227 236 124 108 chr5 34696535 34697101 -117840158 - RMER4B LTR ERVK -10 575 1 3 849 347 244 79 153 chr5 34700190 34700340 -117836919 - MTEb LTR MaLR -62 317 169 3 849 347 244 79 153 chr5 34700483 34700528 -117836731 - MTEb LTR MaLR -211 168 137 3 849 2048 169 70 143 chr5 34700528 34700886 -117836373 - RMER15 LTR ERVL -4 571 291 3 849 2048 169 70 143 chr5 34701071 34701328 -117835931 - RMER15 LTR ERVL -285 290 1 3 849 2593 222 117 8 chr5 34701768 34702430 -117834829 - RMER15-int LTR ERVL -233 4766 4033 3 849 2176 261 31 55 chr5 34702416 34703068 -117834191 - RMER15-int LTR ERVL -2600 2399 1764 3 849 408 270 99 35 chr5 34703107 34703391 -117833868 - RLTR15 LTR ERVK -57 302 1 3 849 715 234 77 20 chr5 34703391 34703587 -117833672 - RMER15-int LTR ERVL -3229 1770 1564 3 849 2694 229 29 24 chr5 34703608 34704191 -117833068 - RMER15-int LTR ERVL -3507 1492 907 3 849 696 232 65 0 chr5 34704317 34704455 -117832804 - RMER15-int LTR ERVL -4376 623 477 3 849 1448 147 25 18 chr5 34704569 34704847 -117832412 + RMER15 LTR ERVL 296 575 0 3 849 1413 260 9 10 chr5 34704848 34705242 -117832017 + RMER15-int LTR ERVL 2 436 -4563 3 849 2333 218 110 73 chr5 34705552 34706410 -117830849 + RMER19B LTR ERVK 2 890 -12 3 849 343 276 48 75 chr5 34707411 34707638 -117829621 - RLTR15 LTR ERVK -89 270 50 3 849 1153 152 9 23 chr5 34708233 34708448 -117828811 + RMER19C LTR ERVK 400 611 0 3 849 255 243 0 63 chr5 34719086 34719165 -117818094 - RLTR25B LTR ERVK -526 502 429 4 849 660 187 179 12 chr5 34719867 34720040 -117817219 + MTD LTR MaLR 1 202 -217 4 849 578 261 24 77 chr5 34724218 34724388 -117812871 - ORR1D1 LTR MaLR -211 163 3 4 849 1987 158 88 30 chr5 34724460 34724858 -117812401 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 849 1317 262 44 179 chr5 34728190 34728935 -117808324 - RMER19C LTR ERVK -39 698 1 4 849 676 301 53 44 chr5 34730840 34731180 -117806079 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 4 849 1236 197 8 0 chr5 34731180 34731429 -117805830 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6300 4 849 2531 158 179 59 chr5 34731822 34732690 -117804569 - MYSERV6-int LTR ERVK -222 8737 7765 4 849 558 263 85 6 chr5 34732694 34732870 -117804389 - RMER4A LTR ERVK -27 439 250 4 849 844 271 19 125 chr5 34732874 34733028 -117804231 - MYSERV-int LTR ERVK -1422 5128 5000 4 849 860 261 58 67 chr5 34733173 34733540 -117803719 - MYSERV-int LTR ERVK -1573 753 395 4 849 547 183 98 8 chr5 34733543 34733675 -117803584 + RMER19B LTR ERVK 678 821 -81 4 106 721 195 115 78 chr5 34734074 34734203 -117803056 + RMER19B LTR ERVK 766 902 0 4 850 435 111 48 0 chr5 34734203 34734266 -117802993 - MYSERV6-int LTR ERVK -7567 1392 1327 4 850 1959 193 38 108 chr5 34735456 34735645 -117801614 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 175 -386 4 850 1959 193 38 108 chr5 34735790 34736203 -117801056 + RLTR31_Mm LTR ERVK 176 561 0 4 850 2277 102 45 3 chr5 34737277 34737591 -117799668 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 850 327 292 195 82 chr5 34740104 34740335 -117796924 - LTR41B LTR ERVL -151 607 351 5 850 242 277 48 12 chr5 34740663 34740747 -117796512 - LTR41B LTR ERVL -558 210 124 5 850 314 236 117 11 chr5 34743074 34743168 -117794091 - ERVL-int LTR ERVL -1350 4407 4271 5 850 4213 38 6 0 chr5 34746153 34746625 -117790634 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 850 1941 207 92 24 chr5 34748706 34749207 -117788052 - RMER19C LTR ERVK 0 611 77 5 850 282 299 56 35 chr5 34753704 34753846 -117783413 - MLT1J-int LTR MaLR -623 764 620 5 850 1147 331 11 49 chr5 34755518 34755966 -117781293 - MT2A LTR ERVL -102 431 1 5 850 3705 23 2 0 chr5 34756245 34756640 -117780619 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 850 491 219 180 0 chr5 34760158 34760286 -117776973 - ORR1D1 LTR MaLR -82 292 142 5 850 543 223 36 0 chr5 34760429 34760541 -117776718 - MTEa-int LTR MaLR -1449 131 16 5 850 403 307 35 1 chr5 34760544 34760666 -117776593 - MTEa LTR MaLR -22 357 210 5 850 1242 196 102 64 chr5 34765480 34765763 -117771496 + RLTR11A LTR ERVK 1 294 -234 5 850 343 304 355 5 chr5 34765904 34766087 -117771172 + RLTR11A LTR ERVK 282 528 0 5 850 818 219 6 6 chr5 34766087 34766241 -117771018 + RLTR11A LTR ERVK 375 528 0 5 850 1532 215 103 18 chr5 34777745 34778086 -117759173 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 850 5655 112 67 10 chr5 34788873 34789779 -117747480 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 6 850 320 293 77 47 chr5 34792464 34792697 -117744562 - RLTR15 LTR ERVK -9 350 111 6 850 1178 189 174 0 chr5 34792717 34792992 -117744267 + ORR1C2 LTR MaLR 62 384 0 6 850 605 278 39 19 chr5 34794549 34794806 -117742453 + RLTR15 LTR ERVK 1 262 -97 6 850 491 237 193 40 chr5 34802556 34802758 -117734501 - MTE2a LTR MaLR -7 372 140 6 850 1186 203 0 20 chr5 34809637 34809883 -117727376 - MTD LTR MaLR -176 243 3 6 850 1745 135 82 28 chr5 34810864 34811253 -117726006 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 850 1653 151 30 68 chr5 34811262 34811661 -117725598 - RMER17C LTR ERVK -26 384 1 6 850 298 234 141 54 chr5 34815794 34815943 -117721316 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 247 6 850 1639 214 182 43 chr5 34820215 34820683 -117716576 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 6 850 1747 197 164 15 chr5 34821767 34822225 -117715034 - MT2A LTR ERVL -7 526 1 6 850 1343 152 157 84 chr5 34830729 34831074 -117706185 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 6 850 392 206 25 116 chr5 34832871 34832884 -117704375 + MT2B LTR ERVL 155 156 -445 7 850 937 261 225 3 chr5 34838238 34838549 -117698710 - MTE-int LTR MaLR -115 1465 1086 7 850 704 125 69 0 chr5 34843173 34843317 -117693942 - RMER17B LTR ERVK -495 463 310 7 850 670 264 102 57 chr5 34844887 34845245 -117692014 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 7 850 532 257 126 54 chr5 34847147 34847386 -117689873 + MLT1B LTR MaLR 135 390 0 7 850 472 175 29 137 chr5 34851796 34851935 -117685324 - MT2B LTR ERVL -326 275 152 7 850 690 173 23 30 chr5 34852539 34852670 -117684589 + ORR1D1 LTR MaLR 1 130 -244 7 850 2250 152 40 5 chr5 34855160 34855531 -117681728 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 7 850 715 232 106 42 chr5 34857594 34857875 -117679384 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 3 7 850 1099 218 141 40 chr5 34859749 34860046 -117677213 + MTEa LTR MaLR 51 377 -2 7 851 1633 190 108 12 chr5 34887785 34888126 -117649133 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 8 851 393 270 71 97 chr5 34895995 34896221 -117641038 - RMER12 LTR ERVK -2 1320 1101 8 851 6268 59 6 8 chr5 34896475 34897301 -117639958 - RLTR22_Mus LTR ERVK -984 824 1 8 851 2742 121 36 51 chr5 34897571 34898043 -117639216 + RMER4A LTR ERVK 1 465 -1 8 851 257 291 119 100 chr5 34908768 34908978 -117628281 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -257 546 333 8 851 406 211 0 111 chr5 34911299 34911314 -117625945 + MT2B LTR ERVL 155 156 -445 8 851 261 256 60 60 chr5 34911359 34911442 -117625817 + RLTR25A LTR ERVK 523 605 -498 8 851 2009 159 56 14 chr5 34913726 34914084 -117623175 + RLTR14 LTR ERV1 1 373 -9 8 851 3742 14 0 0 chr5 34914923 34915352 -117621907 + MERVL-int LTR ERVL 2003 2431 -3054 8 851 1860 164 92 25 chr5 34917993 34918386 -117618873 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 851 679 232 53 7 chr5 34919705 34919857 -117617402 - MTC LTR MaLR -8 413 255 8 851 565 239 30 0 chr5 34919861 34919995 -117617264 - MTC LTR MaLR -281 138 1 8 851 1281 213 118 15 chr5 34921284 34921622 -117615637 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 8 851 328 214 155 48 chr5 34927797 34927900 -117609359 - MTEa LTR MaLR -264 115 2 9 851 1365 144 244 9 chr5 34931712 34932027 -117605232 - MTC LTR MaLR -32 389 1 9 851 912 257 120 0 chr5 34939985 34940285 -117596974 - MLT1C LTR MaLR -15 452 117 9 851 581 242 128 50 chr5 34957914 34958132 -117579127 - MTD LTR MaLR -94 325 82 9 851 316 338 159 60 chr5 34958523 34958756 -117578503 - MLT1F2 LTR MaLR -16 544 289 9 851 344 140 0 0 chr5 34965232 34965282 -117571977 - MTEb LTR MaLR -3 376 327 9 851 3166 51 18 8 chr5 34987777 34988169 -117549090 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 851 235 247 113 85 chr5 34993436 34993542 -117543717 + ORR1D1 LTR MaLR 25 133 -241 1 851 1943 121 0 58 chr5 34993938 34994281 -117542978 + BGLII LTR ERVK 1 323 -98 1 852 232 200 0 43 chr5 35001600 35001647 -117535612 - MT2B LTR ERVL -370 231 187 5 852 1466 180 83 7 chr5 35002123 35002447 -117534812 + MTC LTR MaLR 3 374 -45 6 852 1123 192 45 5 chr5 35006791 35007011 -117530248 - MTC LTR MaLR 0 421 193 1 852 2636 212 109 52 chr5 35007164 35007290 -117529969 - MTC-int LTR MaLR -24 1234 1103 1 852 2696 184 81 77 chr5 35007481 35008344 -117528915 - MTC-int LTR MaLR -156 1102 119 1 852 2696 166 63 93 chr5 35008536 35008670 -117528589 - MTC-int LTR MaLR -1140 118 1 1 852 333 111 0 0 chr5 35008670 35008715 -117528544 - MTC LTR MaLR 0 421 377 1 852 1083 131 57 6 chr5 35008700 35008876 -117528383 - MTC LTR MaLR -236 185 1 1 852 1036 210 134 9 chr5 35013613 35013844 -117523415 - MTD LTR MaLR -112 307 48 3 852 5137 119 19 42 chr5 35014676 35015575 -117521684 + RLTR13A3 LTR ERVK 1 978 0 4 852 3423 41 10 0 chr5 35016433 35016825 -117520434 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 852 869 250 15 45 chr5 35018190 35018214 -117519045 - MTEb LTR MaLR -183 196 177 5 852 869 250 15 45 chr5 35018392 35018568 -117518691 - MTEb LTR MaLR -203 176 2 5 852 225 293 158 57 chr5 35023037 35023085 -117514174 - MLT1A1 LTR MaLR -213 195 146 6 852 225 293 158 57 chr5 35023305 35023433 -117513826 - MLT1A1 LTR MaLR -263 145 1 6 852 1341 81 65 0 chr5 35032281 35032534 -117504725 - ORR1A1 LTR MaLR -10 336 1 8 852 11236 139 52 15 chr5 35038764 35040574 -117496685 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3622 5499 -262 1 852 243 243 125 45 chr5 35041156 35041268 -117495991 + ORR1A3-int LTR MaLR 544 664 -1299 1 852 675 188 0 8 chr5 35041296 35041414 -117495845 + MT2A LTR ERVL 1 117 -416 1 852 1407 163 298 12 chr5 35043809 35044151 -117493108 + MT2A LTR ERVL 94 533 0 1 852 3677 15 5 2 chr5 35049285 35049680 -117487579 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 852 2268 157 45 6 chr5 35053230 35053583 -117483676 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 852 1251 239 130 6 chr5 35054940 35055296 -117481963 - MTD LTR MaLR 0 419 19 1 852 1231 151 149 8 chr5 35056596 35056812 -117480447 + RLTR11A LTR ERVK 1 250 -278 1 852 376 223 79 86 chr5 35056812 35056964 -117480295 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 964 1 852 1816 142 0 39 chr5 35057742 35058050 -117479209 + RLTR11A LTR ERVK 233 528 0 1 852 1473 242 49 16 chr5 35059001 35059367 -117477892 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 1 852 2185 137 114 0 chr5 35070509 35070852 -117466407 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 1 852 4196 123 33 5 chr5 35071202 35071830 -117465429 - RLTR13D3 LTR ERVK -468 646 1 1 852 245 290 52 31 chr5 35089321 35089417 -117447842 - MTD LTR MaLR -319 100 3 1 852 3507 43 5 2 chr5 35092960 35093356 -117443903 - MTB LTR MaLR -3 397 1 2 852 4550 108 8 65 chr5 35095167 35095995 -117441264 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 29 2 852 257 263 122 31 chr5 35098916 35099014 -117438245 - MLT2C2 LTR ERVL -5 554 448 2 852 690 295 104 39 chr5 35098994 35099301 -117437958 - MT2A LTR ERVL -139 394 68 2 852 278 203 46 15 chr5 35099409 35099474 -117437785 + MTE2b LTR MaLR 313 379 0 2 852 1217 284 74 71 chr5 35099474 35100261 -117436998 - MTEb-int LTR MaLR -552 1028 159 2 852 671 267 52 19 chr5 35101024 35101234 -117436025 - MTEb-int LTR MaLR -1359 221 5 2 852 256 196 18 0 chr5 35101238 35101294 -117435965 - MTEb LTR MaLR 0 379 323 2 852 439 320 110 6 chr5 35101464 35101646 -117435613 + MTE-int LTR MaLR 935 1135 -445 2 852 405 298 139 14 chr5 35102048 35102266 -117434993 + MLT1B LTR MaLR 114 390 0 2 852 503 285 121 59 chr5 35102266 35102769 -117434490 - MLT1F2 LTR MaLR -14 666 3 2 852 7859 50 27 5 chr5 35106233 35107171 -117430088 - RLTR13A2 LTR ERVK 0 958 1 2 852 3957 143 64 73 chr5 35119338 35120101 -117417158 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 2 852 262 113 0 0 chr5 35120621 35120680 -117416579 - MT2A LTR ERVL 0 533 475 2 852 965 189 72 68 chr5 35120680 35121068 -117416191 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 852 1342 185 30 34 chr5 35121115 35121383 -117415876 - MT2A LTR ERVL -44 489 223 2 852 1207 142 66 0 chr5 35121596 35121808 -117415451 - MT2A LTR ERVL -304 229 4 2 852 3718 15 3 0 chr5 35124075 35124467 -117412792 + MTA_Mm LTR MaLR 1 393 -3 2 106 1385 206 62 17 chr5 35126979 35127339 -117409920 - MTC LTR MaLR -8 411 1 2 853 263 220 33 33 chr5 35127725 35127786 -117409473 + MLT1A LTR MaLR 1 61 -313 2 853 522 332 133 39 chr5 35127784 35128166 -117409093 - MER21B LTR ERV1 -113 750 333 2 853 987 250 51 4 chr5 35128987 35129240 -117408019 - RMER15 LTR ERVL -36 539 275 2 853 762 152 211 75 chr5 35129273 35129413 -117407846 - MTD LTR MaLR -1 418 241 2 853 762 152 211 75 chr5 35129586 35129644 -117407615 - MTD LTR MaLR -179 240 193 2 853 275 188 47 0 chr5 35131247 35131311 -117405948 - RMER15 LTR ERVL -447 128 62 2 853 1021 281 40 90 chr5 35135258 35135657 -117401602 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 853 2123 128 95 6 chr5 35135847 35136184 -117401075 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 853 1853 120 89 38 chr5 35137255 35137601 -117399658 - RMER16 LTR ERVK -84 449 1 3 853 4835 102 10 10 chr5 35137601 35138284 -117398975 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 4724 3 853 1736 174 213 9 chr5 35152245 35152593 -117384666 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 853 306 311 50 43 chr5 35153031 35153172 -117384087 - MTEb LTR MaLR -8 371 230 3 853 386 93 0 0 chr5 35157636 35157690 -117379569 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 340 3 853 649 113 32 80 chr5 35157865 35157899 -117379360 - ORR1B1 LTR MaLR -35 359 332 3 853 649 141 45 86 chr5 35158081 35158203 -117379056 - ORR1B1 LTR MaLR -63 331 186 3 853 495 347 40 36 chr5 35159259 35159507 -117377752 - RMER15 LTR ERVL -4 571 323 3 853 398 221 51 20 chr5 35174455 35174600 -117362659 - MLT1A LTR MaLR -173 201 34 3 853 2221 103 31 0 chr5 35178671 35178990 -117358269 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 853 917 174 155 0 chr5 35179162 35179369 -117357890 - RLTR42 LTR ERVK 0 239 1 3 853 3372 184 46 32 chr5 35179369 35179806 -117357453 - RLTR42-int LTR ERVK 0 5522 5089 3 853 3372 169 96 29 chr5 35179951 35181057 -117356202 - RLTR42-int LTR ERVK -434 5088 3899 3 853 2164 161 143 161 chr5 35183508 35183736 -117353523 - RLTR42-int LTR ERVK -3114 2408 2188 3 853 2164 161 143 161 chr5 35183880 35184546 -117352713 - RLTR42-int LTR ERVK -3335 2187 1530 3 853 889 193 76 5 chr5 35184827 35185025 -117352234 - RLTR42 LTR ERVK -27 212 1 3 853 2591 176 59 27 chr5 35189222 35189781 -117347478 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 1 3 853 436 178 114 7 chr5 35189781 35189933 -117347326 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 2217 3 853 1177 180 143 25 chr5 35192875 35193154 -117344105 - ORR1D-int LTR MaLR -4 1366 1055 3 853 890 197 51 9 chr5 35193361 35193576 -117343683 + ORR1D-int LTR MaLR 263 486 -884 4 853 2354 147 49 17 chr5 35222637 35222965 -117314294 - MTC LTR MaLR 0 421 82 4 853 2354 147 49 17 chr5 35223113 35223192 -117314067 - MTC LTR MaLR -340 81 1 4 853 1205 252 123 9 chr5 35223512 35223852 -117313407 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 4 853 666 46 9 18 chr5 35224852 35224963 -117312296 + RMER17B LTR ERVK 351 460 -498 4 853 2284 122 6 3 chr5 35229952 35230280 -117306979 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 853 1873 147 78 48 chr5 35235135 35235492 -117301767 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 17 4 853 2118 202 30 2 chr5 35235708 35236114 -117301145 - MTD LTR MaLR -2 417 1 4 853 517 252 61 0 chr5 35243077 35243208 -117294051 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 268 4 853 474 280 44 33 chr5 35244491 35244672 -117292587 - RMER15 LTR ERVL -56 519 337 4 853 639 300 111 27 chr5 35245362 35245660 -117291599 - MER68 LTR ERVL -83 480 158 4 854 1498 264 31 17 chr5 35268930 35269285 -117267974 + ORR1D2 LTR MaLR 1 360 -10 4 854 591 217 96 32 chr5 35277104 35277309 -117259950 + RLTR41 LTR ERV1 264 499 -33 4 854 1217 134 39 35 chr5 35277309 35277541 -117259718 + RLTR9A LTR ERVK 136 368 0 5 854 229 314 113 91 chr5 35280261 35280492 -117256767 - ORR1C2 LTR MaLR -53 331 96 5 854 2217 138 134 3 chr5 35283238 35283610 -117253649 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 854 598 161 0 0 chr5 35286926 35287019 -117250240 + RMER10A LTR ERVL 1 93 -349 5 854 309 333 48 78 chr5 35287183 35287349 -117249910 - MLT-int LTR MaLR -621 1114 954 5 854 251 233 137 0 chr5 35293803 35293876 -117243383 - MLT1D LTR MaLR -38 467 385 5 854 991 280 89 62 chr5 35298335 35298704 -117238555 - MLT1F2 LTR MaLR -181 379 1 5 854 356 286 126 15 chr5 35299056 35299255 -117238004 - MLT1F2-int LTR MaLR -460 1029 809 5 854 647 251 79 109 chr5 35300155 35300459 -117236800 - ORR1E LTR MaLR -10 349 55 5 854 295 242 61 51 chr5 35300937 35301032 -117236227 - MLT1F2 LTR MaLR -304 104 10 5 854 244 234 182 50 chr5 35304547 35304646 -117232613 - MLT1D LTR MaLR -50 455 344 5 854 308 345 57 33 chr5 35304679 35304889 -117232370 - MLT1D LTR MaLR -289 216 2 5 854 1141 273 41 88 chr5 35305912 35306259 -117231000 + MER68 LTR ERVL 143 462 -101 5 854 1141 273 41 88 chr5 35306452 35306546 -117230713 + MER68 LTR ERVL 463 563 0 5 854 1753 187 135 5 chr5 35314637 35315008 -117222251 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 854 279 315 53 27 chr5 35316873 35317023 -117220236 - RMER15 LTR ERVL -95 480 327 5 854 235 214 165 82 chr5 35320754 35320821 -117216438 - MT2B LTR ERVL -344 257 183 5 854 1118 211 101 149 chr5 35321010 35321222 -117216037 - MTE2a LTR MaLR -32 347 112 5 854 1118 211 101 149 chr5 35321372 35321515 -117215744 - MTE2a LTR MaLR -268 111 9 5 854 461 312 105 69 chr5 35322197 35322503 -117214756 + ORR1E LTR MaLR 1 317 -42 5 854 270 301 13 95 chr5 35324430 35324588 -117212671 + ORR1E LTR MaLR 4 148 -211 5 854 2656 126 43 0 chr5 35327366 35327762 -117209497 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 854 3184 54 13 3 chr5 35330829 35331221 -117206038 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 854 531 276 24 0 chr5 35336878 35337005 -117200254 - MTD LTR MaLR 0 419 290 5 854 886 235 45 58 chr5 35350014 35350301 -117186958 + RLTR11B LTR ERVK 1 283 -162 6 854 948 189 10 13 chr5 35350369 35350568 -117186691 + RLTR11B LTR ERVK 285 512 -16 6 854 1432 222 102 29 chr5 35351246 35351589 -117185670 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 6 854 227 297 0 39 chr5 35364883 35364960 -117172299 - ORR1D-int LTR MaLR -1177 193 120 6 855 349 328 45 15 chr5 35392478 35392611 -117144648 + MLT1B LTR MaLR 124 260 -130 6 855 519 272 99 0 chr5 35393127 35393289 -117143970 - MTEa LTR MaLR -34 345 168 6 855 667 262 36 30 chr5 35393509 35393567 -117143692 - MTEa LTR MaLR -207 172 116 6 855 1686 174 199 107 chr5 35393567 35394055 -117143204 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 6 855 667 262 36 30 chr5 35394055 35394161 -117143098 - MTEa LTR MaLR -264 115 7 6 855 1466 229 73 34 chr5 35394277 35394662 -117142597 - MTD LTR MaLR -14 405 6 6 855 390 311 66 66 chr5 35394752 35394948 -117142311 - MLT1A LTR MaLR -178 196 1 6 855 248 329 23 99 chr5 35395297 35395469 -117141790 - MLT1A LTR MaLR 0 489 331 6 855 492 324 109 60 chr5 35395737 35396085 -117141174 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 6 855 244 336 67 9 chr5 35396374 35396479 -117140780 - ORR1E LTR MaLR -248 111 1 6 855 550 314 67 79 chr5 35396584 35396917 -117140342 - MLT1A LTR MaLR -49 341 1 6 855 389 229 133 30 chr5 35405744 35405820 -117131439 - ORR1D2 LTR MaLR -51 319 231 6 855 389 229 133 30 chr5 35405855 35405913 -117131346 - ORR1D2 LTR MaLR -140 230 171 6 855 253 317 379 32 chr5 35412283 35412566 -117124693 - MLT1D LTR MaLR -33 434 54 6 855 281 259 172 65 chr5 35414943 35415158 -117122101 - MLT1G1 LTR MaLR -339 240 3 6 855 3126 46 8 0 chr5 35448959 35449352 -117087907 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 855 397 221 8 133 chr5 35449565 35449685 -117087574 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 6 855 601 279 86 5 chr5 35463661 35463870 -117073389 - MLT1C LTR MaLR -224 243 18 7 855 875 185 132 36 chr5 35464276 35464495 -117072764 - RLTR14 LTR ERV1 -139 243 4 7 855 318 235 0 0 chr5 35464872 35464940 -117072319 - MTE-int LTR MaLR -130 1450 1383 7 855 990 218 33 44 chr5 35464948 35465222 -117072037 + MTD LTR MaLR 1 271 -148 7 855 240 241 93 0 chr5 35465273 35465327 -117071932 - MTE-int LTR MaLR -227 1353 1295 7 855 247 302 68 23 chr5 35465451 35465539 -117071720 - MTE-int LTR MaLR -447 811 720 7 855 280 311 78 0 chr5 35465567 35465670 -117071589 - ORR1E-int LTR MaLR -606 974 864 7 855 298 231 63 13 chr5 35465723 35465802 -117071457 - ORR1E-int LTR MaLR -1188 392 310 7 855 618 265 59 32 chr5 35466205 35466392 -117070867 - ORR1E-int LTR MaLR -1387 193 2 7 855 337 230 0 13 chr5 35466392 35466463 -117070796 - ORR1E LTR MaLR -15 364 295 7 855 394 311 10 0 chr5 35466691 35466794 -117070465 - ORR1E LTR MaLR -254 105 2 7 855 346 283 98 83 chr5 35467094 35467298 -117069961 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 334 7 855 280 167 65 32 chr5 35467949 35468011 -117069248 - ORR1D2 LTR MaLR -302 68 5 7 855 3553 113 42 60 chr5 35469485 35470097 -117067162 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 7 855 281 203 0 26 chr5 35470337 35470413 -117066846 + RLTR15 LTR ERVK 48 121 -238 7 855 1439 126 114 0 chr5 35471094 35471349 -117065910 + ORR1B1 LTR MaLR 1 284 -110 7 855 244 226 32 16 chr5 35473568 35473631 -117063628 + ORR1B1 LTR MaLR 279 342 -37 7 855 900 233 76 0 chr5 35475156 35475366 -117061893 - MTD LTR MaLR -87 332 107 7 855 488 163 0 0 chr5 35475960 35476046 -117061213 - MTD LTR MaLR -300 119 34 7 855 237 316 62 21 chr5 35480078 35480175 -117057084 - RMER12 LTR ERVK -479 843 743 7 855 576 300 97 9 chr5 35483001 35483342 -117053917 - RMER15-int LTR ERVL -4370 629 259 7 855 403 326 0 30 chr5 35483556 35483689 -117053570 - RMER15 LTR ERVL -41 534 406 7 855 1945 211 26 17 chr5 35491494 35491909 -117045350 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 855 2380 139 2 39 chr5 35493157 35493570 -117043689 + MTB_Mm LTR MaLR 2 399 -8 7 855 2557 132 24 26 chr5 35497187 35497639 -117039620 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 451 -109 7 855 430 308 164 16 chr5 35501857 35502167 -117035092 + MLT1C LTR MaLR 71 426 -41 2 855 355 295 93 55 chr5 35503832 35504015 -117033244 - MER21B LTR ERV1 -224 639 450 3 855 774 294 91 37 chr5 35504033 35504386 -117032873 - MER21B LTR ERV1 -491 372 1 3 855 481 332 126 16 chr5 35508586 35508904 -117028355 + ORR1E LTR MaLR 6 358 -1 1 855 2511 186 242 5 chr5 35510301 35510897 -117026362 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 855 1682 163 77 14 chr5 35515874 35516223 -117021036 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 8 2 855 327 301 67 15 chr5 35517801 35517936 -117019323 + ORR1E LTR MaLR 4 145 -214 2 855 303 252 29 39 chr5 35518804 35518907 -117018352 + ORR1E LTR MaLR 278 379 0 2 856 314 316 101 39 chr5 35523064 35523242 -117014017 - ORR1E LTR MaLR -170 189 1 3 856 1932 179 117 5 chr5 35525292 35525669 -117011590 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 856 1129 250 55 41 chr5 35529883 35530246 -117007013 + MTD LTR MaLR 37 404 -15 4 856 386 273 118 13 chr5 35533022 35533174 -117004085 + MLT1C LTR MaLR 81 248 -219 5 856 427 223 8 104 chr5 35542315 35542336 -116994923 + MT2B LTR ERVL 148 156 -445 6 856 2184 152 125 5 chr5 35542594 35542970 -116994289 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 856 1620 222 52 8 chr5 35547565 35547928 -116989331 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 7 856 974 250 171 6 chr5 35555786 35555837 -116981422 - MTE2b LTR MaLR -4 375 315 9 856 974 250 171 6 chr5 35555905 35556175 -116981084 - MTE2b LTR MaLR -65 314 2 9 856 233 247 11 76 chr5 35560230 35560322 -116976937 + MTEa LTR MaLR 67 152 -207 9 856 347 297 78 8 chr5 35560368 35560497 -116976762 + MTEa LTR MaLR 241 378 -1 9 856 323 286 16 139 chr5 35560486 35560608 -116976651 + MTEa-int LTR MaLR 2 108 -1472 9 856 819 263 70 4 chr5 35560611 35560855 -116976404 + MTEa-int LTR MaLR 235 494 -1086 9 856 833 316 76 54 chr5 35561557 35561877 -116975382 + MTEa-int LTR MaLR 680 1007 -573 9 856 833 316 76 54 chr5 35561937 35562024 -116975235 + MTEa-int LTR MaLR 1008 1095 -485 9 856 344 340 156 40 chr5 35570730 35570954 -116966305 + RMER15 LTR ERVL 326 575 0 1 856 251 294 98 0 chr5 35575052 35575154 -116962105 + LTR16D2 LTR ERVL 440 551 -21 1 856 346 253 36 0 chr5 35579273 35579356 -116957903 - LTR16D LTR ERVL -15 636 551 1 856 228 302 47 0 chr5 35580631 35580717 -116956542 + MLT2B3 LTR ERVL 45 134 -420 1 856 2350 179 11 61 chr5 35584119 35584644 -116952615 - RMER20A LTR ERVK -7 509 11 1 856 979 289 84 32 chr5 35584647 35584958 -116952301 + MTEb LTR MaLR 50 376 -3 1 856 2492 272 18 18 chr5 35584961 35585635 -116951624 + MTEb-int LTR MaLR 1 674 -906 1 856 656 216 22 0 chr5 35585642 35585781 -116951478 + MTE2b LTR MaLR 1 142 -237 1 856 556 336 48 111 chr5 35595746 35596141 -116941118 + MTEa LTR MaLR 10 379 0 1 856 341 321 135 42 chr5 35596213 35596405 -116940854 + MTE-int LTR MaLR 238 447 -1133 1 856 664 162 19 84 chr5 35596437 35596592 -116940667 + MTC LTR MaLR 277 421 0 1 856 286 302 68 19 chr5 35597347 35597509 -116939750 + MLT2D LTR ERVL 158 327 -87 1 856 389 301 135 35 chr5 35598883 35599083 -116938176 - RMER20B LTR ERVK -228 399 180 1 856 2012 209 30 26 chr5 35602354 35602854 -116934405 + RMER5 LTR ERV1 33 534 0 1 856 1783 185 90 14 chr5 35607092 35607459 -116929800 + MTD LTR MaLR 25 419 0 1 856 792 245 199 10 chr5 35608233 35608534 -116928725 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 1 856 464 275 25 143 chr5 35612942 35613222 -116924037 - MLT1B LTR MaLR -74 316 70 1 856 464 314 23 23 chr5 35613428 35613601 -116923658 + MLT1J LTR MaLR 69 241 -271 1 856 937 260 71 48 chr5 35615203 35615596 -116921663 - MTE2a LTR MaLR -14 405 6 1 856 3103 40 48 0 chr5 35615653 35616025 -116921234 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 856 289 342 78 54 chr5 35617085 35617289 -116919970 - MLT1D LTR MaLR -273 232 24 1 856 228 325 60 0 chr5 35617406 35617489 -116919770 - MLT1L LTR MaLR -188 422 335 1 856 437 239 34 17 chr5 35633566 35633685 -116903574 + MER34A LTR ERV1 2 122 -449 1 856 373 302 61 12 chr5 35639778 35639942 -116897317 + MLT1C LTR MaLR 68 239 -228 2 857 2817 107 7 19 chr5 35651793 35651822 -116885437 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 377 2 857 2817 107 7 19 chr5 35651862 35652244 -116885015 - MTB_Mm LTR MaLR -31 376 2 2 857 373 339 118 26 chr5 35662250 35662529 -116874730 - MLT1C LTR MaLR -67 400 89 2 857 1114 238 76 105 chr5 35662529 35662909 -116874350 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 2 857 373 339 118 26 chr5 35662909 35662935 -116874324 - MLT1C LTR MaLR -379 88 67 2 857 2760 224 95 61 chr5 35667875 35668698 -116868561 + RMER19B LTR ERVK 1 859 -43 2 857 2760 224 95 61 chr5 35668845 35668893 -116868366 + RMER19B LTR ERVK 860 902 0 2 857 1528 194 80 108 chr5 35669608 35670197 -116867062 - RMER20A LTR ERVK -80 547 2 2 857 1315 176 37 0 chr5 35675905 35676149 -116861110 + RMER19B LTR ERVK 1 253 -649 2 857 2433 83 3 58 chr5 35679480 35679826 -116857433 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 857 2603 83 0 0 chr5 35684273 35684600 -116852659 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 857 2057 210 5 12 chr5 35684797 35685211 -116852048 - MTD LTR MaLR -8 411 1 2 857 332 280 120 47 chr5 35685746 35685896 -116851363 + MLT1J1 LTR MaLR 5 165 -279 2 857 567 255 81 16 chr5 35690760 35690948 -116846311 + ORR1E LTR MaLR 1 218 -156 2 857 1248 244 14 101 chr5 35700152 35700567 -116836692 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 857 1054 132 17 6 chr5 35700784 35700959 -116836300 + RMER10A LTR ERVL 1 177 -265 2 857 797 142 19 51 chr5 35700949 35701105 -116836154 + RMER10A LTR ERVL 290 440 -2 2 857 2111 181 88 32 chr5 35701365 35701862 -116835397 + RLTR11A LTR ERVK 1 525 -3 2 857 1310 229 77 79 chr5 35704145 35704524 -116832735 + MTE2b LTR MaLR 1 378 -1 2 857 1768 187 79 8 chr5 35713003 35713359 -116823900 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 4 2 857 374 341 58 78 chr5 35713483 35713791 -116823468 + ORR1E LTR MaLR 55 356 -3 2 857 1991 211 21 40 chr5 35716539 35716905 -116820354 - MTD LTR MaLR -2 417 46 2 857 1991 211 21 40 chr5 35717099 35717157 -116820102 - MTD LTR MaLR -374 45 1 2 857 356 294 97 92 chr5 35723633 35723945 -116813314 + ORR1E LTR MaLR 39 370 0 3 857 460 265 43 50 chr5 35723986 35724125 -116813134 - MLT1A1 LTR MaLR -28 380 243 3 857 684 318 135 12 chr5 35744665 35744990 -116792269 - MLT2C2 LTR ERVL -99 365 1 3 857 1975 118 68 10 chr5 35753422 35753730 -116783529 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 857 518 323 69 122 chr5 35766002 35766379 -116770880 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 3 857 507 284 56 91 chr5 35766429 35766681 -116770578 + ORR1E LTR MaLR 112 354 -5 3 857 1222 244 149 9 chr5 35771856 35772179 -116765080 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 3 857 1567 258 41 23 chr5 35772270 35772663 -116764596 - MTD LTR MaLR -19 400 1 3 857 602 296 69 83 chr5 35778084 35778445 -116758814 - ORR1E LTR MaLR -3 356 1 3 857 285 337 0 12 chr5 35778445 35778529 -116758730 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1445 3 857 2691 308 141 15 chr5 35778740 35780037 -116757222 - ORR1E-int LTR MaLR -118 1462 1 3 857 571 285 153 52 chr5 35780039 35780209 -116757050 - ORR1E LTR MaLR 0 359 176 3 857 571 285 153 52 chr5 35780249 35780404 -116756855 - ORR1E LTR MaLR -184 175 2 3 857 228 306 23 23 chr5 35781828 35781915 -116755344 + RMER21A LTR ERV1 251 337 -610 3 858 2629 58 65 0 chr5 35786747 35787072 -116750187 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 858 3781 141 2 28 chr5 35788340 35788772 -116748487 + RMER19A LTR ERVK 1 430 -307 3 858 3781 141 2 28 chr5 35789439 35789641 -116747618 + RMER19A LTR ERVK 431 618 -119 3 858 591 275 29 29 chr5 35789658 35789860 -116747399 - MTD LTR MaLR -204 215 1 3 858 407 319 93 82 chr5 35793062 35793417 -116743842 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 3 858 349 267 33 106 chr5 35793473 35793624 -116743635 - MLT1C LTR MaLR -320 147 8 3 858 294 361 44 28 chr5 35805261 35805443 -116731816 - MLT1C LTR MaLR 0 467 283 4 858 1000 256 102 30 chr5 35815738 35816072 -116721187 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 4 858 232 269 10 88 chr5 35822295 35822397 -116714862 - MLT1H LTR MaLR -195 354 261 4 858 3577 15 5 0 chr5 35827748 35828142 -116709117 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 858 1116 258 9 136 chr5 35828339 35828765 -116708494 + MTE2a LTR MaLR 1 372 -7 4 858 1483 223 122 11 chr5 35830389 35830766 -116706493 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 858 227 314 143 0 chr5 35837016 35837121 -116700138 - MLT1D LTR MaLR -47 458 339 4 858 500 327 137 22 chr5 35841934 35842212 -116695047 - MLT1A LTR MaLR -15 359 50 4 858 507 229 18 0 chr5 35845909 35846018 -116691241 + ORR1E LTR MaLR 1 111 -248 4 858 316 287 139 0 chr5 35846015 35846123 -116691136 + ORR1E LTR MaLR 252 374 -5 4 858 263 291 61 95 chr5 35857313 35857414 -116679845 - MT2B LTR ERVL -337 264 176 4 858 3568 30 0 0 chr5 35857414 35857810 -116679449 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 858 263 291 61 95 chr5 35857810 35857856 -116679403 - MT2B LTR ERVL -426 175 122 4 858 361 301 31 79 chr5 35865274 35865501 -116671758 - MLT1B LTR MaLR -7 383 168 4 858 1269 182 173 18 chr5 35866076 35866417 -116670842 + MTD LTR MaLR 12 405 -14 4 858 2986 174 115 20 chr5 35869431 35870142 -116667117 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 779 -27 4 858 774 265 215 18 chr5 35871249 35871630 -116665629 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 77 4 858 776 263 10 10 chr5 35878994 35879186 -116658073 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 4 858 245 348 160 28 chr5 35880397 35880610 -116656649 - MLT1E3 LTR MaLR -241 383 143 4 858 941 282 165 14 chr5 35885795 35886220 -116651039 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 39 5 858 390 278 29 87 chr5 35888521 35888659 -116648600 + RMER10B LTR ERVL 269 398 0 5 858 2103 159 41 48 chr5 35889036 35889452 -116647807 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 858 3022 213 80 55 chr5 35889452 35889626 -116647633 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1081 5 858 3022 197 59 30 chr5 35890172 35890947 -116646312 - MTC-int LTR MaLR -178 1080 187 5 858 3416 26 3 5 chr5 35890947 35891338 -116645921 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 5 858 16541 20 18 0 chr5 35891338 35893289 -116643970 + RLTR10-int LTR ERVK 1 1986 -1 5 858 3416 26 3 5 chr5 35893289 35893680 -116643579 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 5 858 1014 109 37 26 chr5 35893680 35893869 -116643390 - MTC-int LTR MaLR -1066 192 2 5 858 1703 139 172 6 chr5 35893872 35894226 -116643033 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 858 1854 150 114 24 chr5 35903665 35903989 -116633270 + MTC LTR MaLR 12 361 -60 5 858 2146 119 21 62 chr5 35903989 35904329 -116632930 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 858 1854 150 114 24 chr5 35904329 35904380 -116632879 + MTC LTR MaLR 362 421 0 5 858 1822 130 95 0 chr5 35910307 35910623 -116626636 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 5 859 313 306 86 8 chr5 35915923 35916047 -116621212 + MLT1A0 LTR MaLR 6 129 -236 5 859 543 268 134 13 chr5 35918099 35918330 -116618929 + RMER5 LTR ERV1 33 291 -243 5 859 4260 60 46 9 chr5 35918338 35918878 -116618381 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 5 859 294 253 250 12 chr5 35918920 35919080 -116618179 + RMER5 LTR ERV1 196 393 -141 5 859 363 253 11 11 chr5 35919099 35919187 -116618072 + RMER5 LTR ERV1 447 534 0 5 859 384 267 24 24 chr5 35926327 35926450 -116610809 - MER57A-int LTR ERV1 -261 5926 5804 5 859 380 195 61 0 chr5 35927487 35927569 -116609690 - MTEa LTR MaLR 0 379 293 5 859 465 285 58 52 chr5 35927969 35928143 -116609116 - MTEa LTR MaLR -204 175 1 5 859 2454 78 15 9 chr5 35928679 35929004 -116608255 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 859 958 191 48 0 chr5 35932630 35932819 -116604440 - RMER20A LTR ERVK 0 516 319 5 859 3990 152 29 54 chr5 35932819 35933397 -116603862 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 466 5 859 3990 126 10 38 chr5 35933582 35933859 -116603400 - RLTR25A LTR ERVK -638 465 190 5 859 317 312 87 8 chr5 35935373 35935499 -116601760 - ORR1E LTR MaLR -6 353 218 5 859 1056 206 193 10 chr5 35941322 35941625 -116595634 - ORR1D1 LTR MaLR 0 378 13 5 859 313 266 97 124 chr5 35962260 35962538 -116574721 + ORR1E LTR MaLR 89 377 -2 5 859 753 308 112 6 chr5 35962734 35963064 -116574195 + MLT1B LTR MaLR 8 372 -18 5 859 1965 133 136 3 chr5 35965524 35965847 -116571412 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 2 5 859 1081 294 80 52 chr5 35968079 35968595 -116568664 + MT2A LTR ERVL 3 532 -1 5 859 2134 133 12 0 chr5 35969313 35969643 -116567616 - MTC LTR MaLR -82 339 6 5 859 1072 202 78 39 chr5 35973388 35973722 -116563537 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 13 6 859 1279 207 133 30 chr5 35977547 35977916 -116559343 + MTD LTR MaLR 13 419 0 6 859 362 277 32 32 chr5 35978433 35978556 -116558703 - MLT1K LTR MaLR -13 582 460 6 859 1550 194 248 81 chr5 35983083 35983538 -116553721 - MT2A LTR ERVL -2 531 1 6 859 228 333 9 66 chr5 35987434 35987540 -116549719 + ORR1E LTR MaLR 74 173 -186 6 859 368 236 38 0 chr5 35988652 35988759 -116548500 - ORR1E LTR MaLR -252 118 1 6 859 563 41 0 0 chr5 35991982 35992055 -116545204 + ORR1A0 LTR MaLR 1 73 -273 6 859 711 0 11 0 chr5 35992050 35992138 -116545121 + ORR1A0 LTR MaLR 258 346 0 6 859 14706 47 8 1 chr5 35992138 35993917 -116543342 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 6 859 3041 35 3 0 chr5 35993917 35994262 -116542997 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 859 330 308 108 94 chr5 35997690 35998053 -116539206 + MLT1C LTR MaLR 48 460 -7 6 859 230 342 97 19 chr5 36002131 36002286 -116534973 - RMER21A LTR ERV1 -42 905 739 3 859 246 333 125 18 chr5 36011614 36011955 -116525304 + MLT1C LTR MaLR 3 378 -12 1 859 2521 154 107 44 chr5 36024548 36025045 -116512214 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 2 2 859 294 325 111 46 chr5 36028790 36029006 -116508253 + MLT1A LTR MaLR 73 302 -72 2 859 2288 136 16 8 chr5 36031562 36031932 -116505327 - ORR1B1 LTR MaLR -21 373 1 3 860 1894 181 94 16 chr5 36044865 36045246 -116492013 + MTD LTR MaLR 2 412 -7 4 860 271 273 25 25 chr5 36063614 36063693 -116473566 + MLT1A LTR MaLR 24 102 -272 5 860 252 282 155 95 chr5 36070475 36070675 -116466584 + MLT1B LTR MaLR 178 389 -1 6 860 930 176 228 151 chr5 36078038 36078124 -116459135 + MT2A LTR ERVL 3 88 -445 7 860 930 176 228 151 chr5 36078305 36078687 -116458572 + MT2A LTR ERVL 89 507 -26 7 860 1509 166 81 22 chr5 36078984 36079305 -116457954 + ORR1D1 LTR MaLR 28 367 -7 8 860 607 226 179 11 chr5 36080744 36080923 -116456336 + MTD LTR MaLR 1 209 -210 8 860 499 242 171 2 chr5 36081049 36081230 -116456029 + MTD LTR MaLR 182 412 -7 8 860 432 128 102 0 chr5 36091841 36091941 -116445318 - RMER4A LTR ERVK -64 402 309 9 860 2492 121 58 95 chr5 36091944 36092390 -116444869 - RMER4A LTR ERVK 0 466 38 1 860 2492 121 58 95 chr5 36092425 36092462 -116444797 - RMER4A LTR ERVK -429 37 1 1 860 235 323 0 0 chr5 36093896 36093961 -116443298 + MLT1B LTR MaLR 10 74 -316 1 860 841 270 46 33 chr5 36094546 36094797 -116442462 - MTE2b LTR MaLR -41 338 87 1 860 807 306 39 92 chr5 36094993 36095098 -116442161 - MTE2b LTR MaLR -293 86 1 1 860 332 312 142 66 chr5 36095100 36095388 -116441871 + MLT1B LTR MaLR 67 376 -14 1 860 999 278 78 6 chr5 36103156 36103478 -116433781 - MLT1B LTR MaLR -21 369 25 1 860 436 301 151 26 chr5 36108963 36109195 -116428064 + MLT1D LTR MaLR 39 299 -206 1 860 377 353 91 30 chr5 36109744 36110042 -116427217 - MLT1D LTR MaLR -182 323 8 1 860 237 359 30 30 chr5 36111051 36111183 -116426076 - MTE-int LTR MaLR -42 1538 1407 1 860 739 352 129 62 chr5 36111244 36112135 -116425124 - MTE-int LTR MaLR -547 1033 83 1 860 252 280 63 99 chr5 36112197 36112308 -116424951 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 257 1 860 946 210 278 27 chr5 36112442 36112741 -116424518 + MTE2b LTR MaLR 4 377 -2 1 860 1947 142 44 10 chr5 36112855 36113193 -116424066 - ORR1B2 LTR MaLR -19 360 1 1 860 484 270 117 0 chr5 36114237 36114374 -116422885 + MTEa LTR MaLR 1 153 -226 1 860 348 226 317 0 chr5 36119021 36119199 -116418060 - MLT1A0 LTR MaLR -103 271 37 1 860 229 309 36 36 chr5 36121292 36121376 -116415883 - MLT1A1 LTR MaLR -254 154 71 1 860 4244 65 2 0 chr5 36124248 36124759 -116412500 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 860 252 298 81 73 chr5 36126595 36126841 -116410418 - MLT1I LTR MaLR -102 309 62 1 860 2590 112 5 0 chr5 36126881 36127265 -116409994 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 860 2470 130 73 8 chr5 36129969 36130364 -116406895 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 860 443 307 119 27 chr5 36139358 36139693 -116397566 - MER89 LTR ERV1 -187 372 7 1 860 390 191 134 94 chr5 36146980 36147107 -116390152 - MTEb LTR MaLR -245 134 3 1 860 1120 270 89 6 chr5 36148630 36148954 -116388305 + ORR1E LTR MaLR 6 356 -3 1 860 1771 124 33 3 chr5 36149819 36150126 -116387133 - RMER4A LTR ERVK -150 316 1 1 860 233 326 34 23 chr5 36159337 36159352 -116377907 + MT2B LTR ERVL 151 166 -435 1 860 267 217 34 42 chr5 36163825 36163937 -116373322 + RLTR20B2 LTR ERVK 97 212 -351 1 860 873 252 85 138 chr5 36168618 36169018 -116368241 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 860 265 325 50 66 chr5 36169032 36169213 -116368046 - MER31B LTR ERV1 -235 231 54 1 860 293 341 58 29 chr5 36174544 36174639 -116362620 - MLT1B LTR MaLR -86 304 206 1 860 293 303 328 15 chr5 36174682 36174837 -116362422 - MLT1B LTR MaLR -185 205 3 1 861 2384 124 82 6 chr5 36180144 36180509 -116356750 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 2 2 861 1171 266 77 10 chr5 36195591 36195891 -116341368 - MTE2b LTR MaLR -12 367 48 2 861 309 291 7 112 chr5 36213974 36214010 -116323249 + MT2B LTR ERVL 136 156 -445 2 861 265 246 93 2 chr5 36220471 36220582 -116316677 - MLT1J1 LTR MaLR -310 138 19 2 861 390 273 50 7 chr5 36222351 36222491 -116314768 - MLT2C2 LTR ERVL -266 198 53 2 861 805 132 97 0 chr5 36224689 36224833 -116312426 - MTC LTR MaLR -263 158 1 2 861 1077 280 51 26 chr5 36234679 36235031 -116302228 - MTE2b LTR MaLR -13 366 6 2 861 420 338 40 96 chr5 36244083 36244407 -116292852 + MER21B LTR ERV1 173 478 -385 2 861 906 198 16 0 chr5 36245730 36245912 -116291347 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 185 2 861 654 259 140 45 chr5 36246002 36246338 -116290921 + MLT1A LTR MaLR 7 374 0 2 861 1450 231 74 16 chr5 36252754 36253133 -116284126 - MTD LTR MaLR -14 405 5 3 861 1522 179 34 167 chr5 36253407 36253843 -116283416 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 861 1493 226 83 25 chr5 36254788 36255183 -116282076 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 3 861 2116 192 152 63 chr5 36255185 36255851 -116281408 + MTD-int LTR MaLR 2 726 -532 3 861 1033 162 45 15 chr5 36255818 36256019 -116281240 + MTD LTR MaLR 213 419 0 3 861 517 245 161 55 chr5 36260240 36260552 -116276707 + MTD LTR MaLR 1 356 -63 3 861 637 239 66 70 chr5 36274946 36275277 -116261982 + MTD LTR MaLR 48 405 -14 3 861 611 249 50 77 chr5 36281561 36281822 -116255437 + ORR1D2-int LTR MaLR 24 278 -980 3 861 413 231 28 37 chr5 36281844 36281952 -116255307 + MTE2a LTR MaLR 267 373 -6 3 861 633 332 76 31 chr5 36282962 36283319 -116253940 - ORR1C1 LTR MaLR -5 373 1 3 861 473 272 14 9 chr5 36283319 36283467 -116253792 + ORR1D2 LTR MaLR 33 149 -221 3 861 596 242 183 72 chr5 36285314 36285604 -116251655 + MTD LTR MaLR 84 405 -14 3 861 2550 51 12 0 chr5 36287184 36287518 -116249741 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 3 861 575 312 133 0 chr5 36294390 36294669 -116242590 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 48 3 861 549 282 115 9 chr5 36295198 36295505 -116241754 - MTEb LTR MaLR -16 403 22 3 861 245 268 70 0 chr5 36297427 36297498 -116239761 + RMER15 LTR ERVL 401 476 -99 3 861 507 292 114 44 chr5 36303480 36303745 -116233514 - MLT1A0 LTR MaLR -76 289 6 3 862 5261 95 11 3 chr5 36308788 36309519 -116227740 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 862 423 232 116 0 chr5 36323078 36323190 -116214069 - MTD LTR MaLR -8 411 287 4 862 235 268 31 125 chr5 36325676 36325804 -116211455 - MER21B LTR ERV1 -221 642 527 4 862 276 276 49 105 chr5 36334394 36334556 -116202703 + MTD LTR MaLR 188 340 -79 4 862 368 245 32 0 chr5 36335275 36335369 -116201890 - MTE2a LTR MaLR -1 378 282 4 862 441 252 104 78 chr5 36335592 36335929 -116201330 - MTD LTR MaLR -75 344 2 4 862 1810 129 24 86 chr5 36337537 36337769 -116199490 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 88 4 862 1810 129 24 86 chr5 36338279 36338383 -116198876 - ORR1A3 LTR MaLR -239 87 1 4 862 3044 62 52 0 chr5 36351071 36351458 -116185801 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 862 2964 68 47 0 chr5 36354895 36355277 -116181982 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 862 317 280 15 53 chr5 36355657 36355789 -116181470 + MER83B-int LTR ERV1 881 1007 -3873 4 862 273 302 50 8 chr5 36356287 36356407 -116180852 + RLTR42-int LTR ERVK 1236 1360 -4162 4 862 3544 20 5 0 chr5 36357695 36358089 -116179170 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 862 8650 46 29 5 chr5 36358089 36359161 -116178098 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 862 3210 37 42 0 chr5 36359161 36359541 -116177718 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 862 1009 291 132 35 chr5 36372378 36372837 -116164422 + ORR1E-int LTR MaLR 1023 1528 -52 4 862 586 353 51 48 chr5 36372837 36373191 -116164068 + ORR1E LTR MaLR 2 356 -3 4 862 3300 45 17 5 chr5 36375305 36375707 -116161552 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 862 372 253 142 29 chr5 36381246 36381506 -116155753 + MER31A LTR ERV1 15 347 -138 4 862 461 299 161 50 chr5 36394866 36395302 -116141957 - MLT1D LTR MaLR -19 486 3 4 862 340 344 134 50 chr5 36395482 36395825 -116141434 - MLT1D-int LTR MaLR -198 1173 802 4 862 2947 112 16 8 chr5 36395826 36396310 -116140949 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 37 4 862 634 334 107 20 chr5 36401234 36401625 -116135634 - MLT1J LTR MaLR -81 431 7 4 862 352 303 214 53 chr5 36405412 36405707 -116131552 + MTEa LTR MaLR 31 373 -6 4 862 373 225 75 0 chr5 36407451 36407531 -116129728 + MTE2b LTR MaLR 2 87 -292 4 862 2313 133 73 5 chr5 36418971 36419340 -116117919 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 862 315 358 8 0 chr5 36419956 36420079 -116117180 + MLT1D LTR MaLR 378 501 -4 5 862 534 242 90 8 chr5 36422425 36422558 -116114701 - MTD LTR MaLR -233 186 43 5 862 567 174 181 14 chr5 36430191 36430342 -116106917 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 168 5 862 506 253 76 45 chr5 36430417 36430548 -116106711 - ORR1D2 LTR MaLR -203 167 25 5 862 335 153 13 40 chr5 36432527 36432602 -116104657 + RMER10A LTR ERVL 345 417 -25 5 862 251 284 130 37 chr5 36432700 36432861 -116104398 + ORR1E LTR MaLR 19 194 -165 5 862 2231 171 105 94 chr5 36433009 36433552 -116103707 - RMER4B LTR ERVK 0 585 35 5 862 2231 171 105 94 chr5 36433653 36433671 -116103588 - RMER4B LTR ERVK -551 34 18 5 863 1600 228 24 24 chr5 36447048 36447421 -116089838 + MTE2a LTR MaLR 4 376 -3 5 863 1693 211 75 5 chr5 36447889 36448274 -116088985 - MTD LTR MaLR 0 419 8 5 863 336 351 11 67 chr5 36448457 36448637 -116088622 + MLT1E2 LTR MaLR 1 170 -457 5 863 227 315 33 11 chr5 36448667 36448757 -116088502 + MLT1E2 LTR MaLR 304 395 -110 5 863 393 324 95 33 chr5 36451936 36452147 -116085112 + MER21B LTR ERV1 116 339 -524 5 863 372 353 72 40 chr5 36452473 36452750 -116084509 + MER21B LTR ERV1 485 770 -93 5 863 268 322 60 91 chr5 36454674 36454906 -116082353 + MLT1F LTR MaLR 226 450 -110 5 863 3002 51 96 0 chr5 36456763 36457138 -116080121 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 5 863 1713 154 119 28 chr5 36457173 36457534 -116079725 - MTD LTR MaLR -8 411 18 5 863 286 390 61 22 chr5 36461405 36461633 -116075626 - MLT1A LTR MaLR -77 297 61 5 863 279 200 206 20 chr5 36462341 36462443 -116074816 + RMER4B LTR ERVK 465 585 0 5 863 260 276 69 0 chr5 36475499 36475586 -116061673 + MLT1B LTR MaLR 54 146 -244 5 863 296 361 0 0 chr5 36476600 36476697 -116060562 + MLT1C LTR MaLR 33 129 -338 5 863 280 311 70 49 chr5 36485625 36485767 -116051492 + MLT1D LTR MaLR 345 489 -16 5 863 632 290 38 47 chr5 36485989 36486224 -116051035 - MLT1D LTR MaLR -272 233 1 5 863 459 328 179 8 chr5 36499017 36499182 -116038077 - MLT1D LTR MaLR -9 496 304 6 863 459 328 179 8 chr5 36499389 36499613 -116037646 - MLT1D LTR MaLR -202 303 40 6 863 858 270 68 14 chr5 36507693 36507986 -116029273 + MTD LTR MaLR 104 404 -15 5 863 341 185 176 6 chr5 36510368 36510496 -116026763 + ORR1D1 LTR MaLR 1 159 -215 7 863 680 152 10 35 chr5 36510660 36510804 -116026455 + ORR1D1 LTR MaLR 149 289 -85 7 863 864 188 126 10 chr5 36511323 36511522 -116025737 + MTD LTR MaLR 184 405 -14 9 863 259 256 48 12 chr5 36518730 36518813 -116018446 - ORR1E LTR MaLR -264 95 10 1 863 824 234 31 48 chr5 36526028 36526312 -116010947 + ORR1C2 LTR MaLR 1 281 -89 2 863 944 215 24 5 chr5 36526542 36526752 -116010507 + ORR1C2 LTR MaLR 171 384 0 2 863 1369 253 46 35 chr5 36531922 36532270 -116004989 + MTEa LTR MaLR 18 369 -10 3 863 261 285 187 0 chr5 36535962 36536085 -116001174 + LTR16C LTR ERVL 190 335 -154 3 863 255 336 124 40 chr5 36540171 36540469 -115996790 + MLT1B LTR MaLR 22 344 -46 4 863 393 271 51 36 chr5 36555064 36555202 -115982057 + MLT1A1 LTR MaLR 269 408 0 5 863 263 314 93 93 chr5 36556809 36556981 -115980278 + MLT1J2 LTR MaLR 157 328 -120 5 863 783 286 14 27 chr5 36558329 36558536 -115978723 + MTEa LTR MaLR 1 206 -173 6 863 783 286 14 27 chr5 36558707 36558722 -115978537 + MTEa LTR MaLR 207 220 -159 6 863 699 195 88 21 chr5 36559078 36559261 -115977998 + MTEa LTR MaLR 163 376 -3 6 863 802 205 422 59 chr5 36561697 36561957 -115975302 - ORR1E LTR MaLR -2 357 4 7 864 559 147 0 21 chr5 36569555 36569652 -115967607 + RMER10A LTR ERVL 2 96 -346 7 864 602 215 109 48 chr5 36569648 36569858 -115967401 + RMER10A LTR ERVL 220 442 0 7 864 636 275 140 3 chr5 36572172 36572500 -115964759 + MTEa LTR MaLR 3 375 -4 8 864 1721 176 59 59 chr5 36573825 36574199 -115963060 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 8 864 2197 100 0 9 chr5 36577350 36577672 -115959587 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 864 466 88 0 42 chr5 36580141 36580212 -115957047 + IAPLTR4 LTR ERVK 278 345 0 9 864 1648 126 111 21 chr5 36589657 36589982 -115947277 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 9 864 849 178 19 30 chr5 36594157 36594344 -115942915 - ORR1A4 LTR MaLR -168 226 3 9 864 1400 261 49 14 chr5 36595084 36595434 -115941825 + MTEa LTR MaLR 1 362 -17 1 864 826 276 106 67 chr5 36598737 36599067 -115938192 - MTD LTR MaLR 0 419 77 1 864 775 301 75 99 chr5 36607357 36607730 -115929529 - MTEa LTR MaLR -11 368 5 1 864 265 207 107 83 chr5 36612228 36612349 -115924910 + MLT1B LTR MaLR 106 229 -161 1 864 2009 128 25 25 chr5 36613216 36613569 -115923690 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 42 1 864 645 272 128 17 chr5 36616015 36616303 -115920956 + MLT1A0 LTR MaLR 33 352 -13 1 864 1252 253 86 26 chr5 36620388 36620770 -115916489 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 864 386 344 78 70 chr5 36630820 36630841 -115906418 + MLT1B LTR MaLR 3 23 -367 1 864 2114 121 82 9 chr5 36630841 36631183 -115906076 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 864 386 344 78 70 chr5 36631183 36631546 -115905713 + MLT1B LTR MaLR 24 390 0 1 864 938 246 102 49 chr5 36645056 36645360 -115891899 + MTEa LTR MaLR 10 329 -50 1 864 799 308 41 38 chr5 36650426 36650770 -115886489 - MLT1B LTR MaLR -43 347 3 1 864 3068 123 77 8 chr5 36662060 36662553 -115874706 + RLTR11A LTR ERVK 2 528 0 1 864 2734 143 19 5 chr5 36671989 36672404 -115864855 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 864 2485 104 3 9 chr5 36686295 36686626 -115850633 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 864 544 299 31 91 chr5 36686853 36687084 -115850175 + MTE2a LTR MaLR 126 365 -56 2 864 365 290 98 80 chr5 36696439 36696682 -115840577 + MLT1J LTR MaLR 130 443 -167 2 864 270 261 0 98 chr5 36697244 36697346 -115839913 + MLT1J LTR MaLR 407 498 -97 2 865 321 273 148 20 chr5 36703606 36703707 -115833552 + MER68 LTR ERVL 186 299 -264 2 865 275 312 118 0 chr5 36703731 36703875 -115833384 + MER68 LTR ERVL 363 523 -40 2 865 662 204 128 17 chr5 36707587 36707662 -115829597 + MTEb LTR MaLR 1 84 -295 2 865 662 204 128 17 chr5 36707683 36707786 -115829473 + MTEb LTR MaLR 85 198 -181 2 865 1832 192 111 29 chr5 36712600 36712986 -115824273 - MTD LTR MaLR -1 418 1 2 865 1764 167 56 61 chr5 36714711 36714879 -115822380 + ORR1D1 LTR MaLR 1 176 -198 2 865 1764 167 56 61 chr5 36714942 36715148 -115822111 + ORR1D1 LTR MaLR 177 373 -1 2 865 538 249 87 0 chr5 36715257 36715430 -115821829 + MLT1B LTR MaLR 119 306 -84 2 865 267 356 156 11 chr5 36724288 36724467 -115812792 + MLT1K LTR MaLR 385 589 -6 2 865 352 331 83 12 chr5 36736623 36736791 -115800468 + MLT1B LTR MaLR 21 200 -190 2 865 2830 139 7 2 chr5 36751617 36752036 -115785223 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 865 2794 19 75 0 chr5 36752223 36752545 -115784714 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 865 971 123 20 175 chr5 36754099 36754345 -115782914 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 1 2 865 2066 118 13 3 chr5 36755015 36755330 -115781929 - ORR1A2 LTR MaLR -9 318 1 3 865 255 316 13 113 chr5 36756484 36756634 -115780625 + MLT1C LTR MaLR 48 182 -285 3 865 1559 185 183 12 chr5 36756750 36757073 -115780186 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 865 353 304 76 63 chr5 36757118 36757229 -115780030 + MLT1C LTR MaLR 94 200 -267 3 865 353 304 76 63 chr5 36757297 36757487 -115779772 + MLT1C LTR MaLR 201 399 -68 3 865 406 314 143 12 chr5 36758332 36758552 -115778707 + MLT2B1 LTR ERVL 181 429 -91 3 865 275 287 100 60 chr5 36759338 36759538 -115777721 - ORR1D2 LTR MaLR -146 224 17 3 865 394 165 0 117 chr5 36759602 36759705 -115777554 - MT2B LTR ERVL -344 257 167 3 865 308 283 9 57 chr5 36759700 36759805 -115777454 - MLT2B3 LTR ERVL -454 100 1 3 865 455 319 43 6 chr5 36760684 36760845 -115776414 + MLT1A LTR MaLR 1 167 -207 3 865 301 307 106 7 chr5 36761019 36761035 -115776224 + MLT1A LTR MaLR 179 194 -196 3 865 298 328 72 0 chr5 36761167 36761292 -115775967 + MLT1A LTR MaLR 225 358 -32 3 865 319 213 16 0 chr5 36761977 36762038 -115775221 + MTE2a LTR MaLR 276 337 -42 3 865 2673 124 8 0 chr5 36762152 36762514 -115774745 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 3 865 2254 123 47 33 chr5 36763274 36763636 -115773623 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 865 1087 231 140 0 chr5 36763792 36764056 -115773203 + ORR1D2 LTR MaLR 46 346 -24 3 865 289 313 128 7 chr5 36764048 36764196 -115773063 + MER67A LTR ERV1 338 503 -40 3 865 392 312 88 42 chr5 36764440 36764657 -115772602 + MLT1A1 LTR MaLR 179 405 -3 3 865 257 333 130 6 chr5 36772145 36772314 -115764945 - MLT2D LTR ERVL -52 362 173 3 865 3412 121 42 0 chr5 36773271 36773774 -115763485 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 3 865 247 319 11 87 chr5 36775603 36775788 -115761471 - ORR1E LTR MaLR -10 349 179 3 865 2502 121 79 35 chr5 36780123 36780526 -115756733 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 865 486 321 70 26 chr5 36781110 36781382 -115755877 - MTD LTR MaLR -135 284 1 3 865 235 332 102 63 chr5 36781678 36781932 -115755327 + ORR1E LTR MaLR 52 315 -44 3 865 1487 201 34 50 chr5 36786410 36786788 -115750471 - MTE2b LTR MaLR 0 379 8 3 865 301 213 0 0 chr5 36786801 36786862 -115750397 - MTE2b-int LTR MaLR 0 1580 1520 3 865 1007 210 206 91 chr5 36789505 36789845 -115747414 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 865 1014 199 5 43 chr5 36790178 36790251 -115747008 - MTC LTR MaLR 0 421 357 3 865 3422 156 72 2 chr5 36790251 36790821 -115746438 - RMER19C LTR ERVK -1 610 1 3 865 1014 168 395 22 chr5 36790821 36791073 -115746186 - MTC LTR MaLR -65 356 5 3 865 235 302 173 25 chr5 36791489 36791643 -115745616 - MLT1C LTR MaLR -212 255 74 3 865 3395 20 13 10 chr5 36791643 36792038 -115745221 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 865 235 302 173 25 chr5 36792038 36792080 -115745179 - MLT1C LTR MaLR -394 73 30 3 865 1173 231 184 0 chr5 36795725 36796045 -115741214 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 3 865 2261 154 25 12 chr5 36798319 36798720 -115738539 - RMER15 LTR ERVL -2 573 168 3 865 721 257 90 34 chr5 36800575 36800960 -115736299 + RLTR28 LTR ERVL 1 420 -61 4 865 230 260 88 38 chr5 36802408 36802488 -115734771 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 279 4 865 376 295 201 22 chr5 36804260 36804632 -115732627 - MLT1E3 LTR MaLR -186 494 2 4 865 1283 251 54 43 chr5 36804643 36805013 -115732246 - MTEa LTR MaLR -5 374 1 4 865 1722 240 92 6 chr5 36806362 36806853 -115730406 + RMER5 LTR ERV1 2 534 0 4 865 324 210 296 8 chr5 36814691 36814816 -115722443 - RLTR12B LTR ERVK -321 207 47 4 866 229 277 0 58 chr5 36835047 36835116 -115702143 + RLTR46 LTR ERVK 240 304 -16 4 866 3247 51 8 0 chr5 36841835 36842228 -115695031 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 866 473 212 57 64 chr5 36842357 36842498 -115694761 - MLT1B LTR MaLR -48 342 203 4 866 257 328 49 8 chr5 36859395 36859518 -115677741 - RLTR12B LTR ERVK -400 128 1 4 866 828 202 110 37 chr5 36866170 36866481 -115670778 + MTEa LTR MaLR 1 371 -8 4 866 1050 235 124 12 chr5 36877311 36877634 -115659625 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 4 866 233 125 41 20 chr5 36888132 36888181 -115649078 + ORR1E LTR MaLR 21 70 -289 5 866 270 271 82 0 chr5 36888401 36888486 -115648773 + MTEa LTR MaLR 288 379 0 5 866 3136 71 13 2 chr5 36888640 36889036 -115648223 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 866 291 282 0 53 chr5 36906793 36906868 -115630391 + MLT1A0 LTR MaLR 2 72 -302 5 866 292 233 82 0 chr5 36906882 36906955 -115630304 + MLT1A0 LTR MaLR 114 192 -173 5 866 774 234 217 29 chr5 36907157 36907466 -115629793 + MTEb LTR MaLR 13 379 0 5 866 232 284 0 11 chr5 36909229 36909318 -115627941 - LTR33B LTR ERVL -21 482 395 5 866 2301 123 97 25 chr5 36911751 36912144 -115625115 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 866 2297 148 68 8 chr5 36917498 36917893 -115619366 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 5 866 480 306 23 88 chr5 36930224 36930375 -115606884 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1182 5 866 480 306 23 88 chr5 36930558 36930621 -115606638 - RMER12 LTR ERVK -141 1181 1122 5 866 3195 180 93 61 chr5 36930717 36931356 -115605903 - RMER12 LTR ERVK -85 1237 584 5 866 3195 180 93 61 chr5 36931542 36931694 -115605565 - RMER12 LTR ERVK -739 583 420 5 866 1504 233 49 33 chr5 36931880 36932306 -115604953 - RMER12 LTR ERVK -889 433 1 5 866 523 257 116 35 chr5 36939290 36939488 -115597771 - ORR1D2 LTR MaLR -36 334 121 6 866 251 182 0 52 chr5 36951869 36951927 -115585332 - IAPEy-int LTR ERVK -5093 2420 2366 6 867 2116 99 43 37 chr5 36967970 36968295 -115568964 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 867 269 185 20 89 chr5 36970002 36970103 -115567156 + MTEa LTR MaLR 235 328 -51 6 867 3934 121 40 0 chr5 36970374 36970952 -115566307 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 6 867 2018 127 6 28 chr5 37056180 37056505 -115480754 + ORR1A2 LTR MaLR 1 318 -9 6 867 278 244 155 163 chr5 37059407 37059634 -115477625 + ORR1E LTR MaLR 98 326 -33 1 867 278 244 155 163 chr5 37059670 37059706 -115477553 + ORR1E LTR MaLR 327 359 0 1 867 2729 196 83 38 chr5 37059787 37059887 -115477372 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 543 1 867 2729 196 83 38 chr5 37059922 37060435 -115476824 - RLTR26 LTR ERVK -100 542 1 1 867 229 286 63 0 chr5 37063366 37063421 -115473838 + MTE2b LTR MaLR 35 93 -286 2 867 1205 219 87 45 chr5 37063615 37063926 -115473333 + MTE2b LTR MaLR 56 379 0 2 867 752 202 0 15 chr5 37066121 37066252 -115471007 + RLTR18B LTR ERVK 1 129 -383 2 867 1585 236 68 5 chr5 37066524 37066891 -115470368 + RLTR18B LTR ERVK 123 512 0 2 867 411 329 92 77 chr5 37070411 37070731 -115466528 - MLT1I LTR MaLR -4 407 83 4 867 559 315 88 53 chr5 37077793 37078135 -115459124 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 6 867 248 308 104 25 chr5 37078137 37078300 -115458959 + ORR1E-int LTR MaLR 1 176 -1404 6 867 2189 84 62 0 chr5 37078896 37079204 -115458055 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 867 1619 294 119 51 chr5 37079239 37079847 -115457412 + ORR1E-int LTR MaLR 712 1366 -214 6 867 1386 207 129 3 chr5 37079847 37080181 -115457078 - MTEa LTR MaLR -3 376 1 6 867 1619 294 119 51 chr5 37080181 37080243 -115457016 + ORR1E-int LTR MaLR 1367 1428 -152 6 867 383 291 102 0 chr5 37080478 37080605 -115456654 + ORR1E-int LTR MaLR 1407 1546 -34 6 867 304 291 238 44 chr5 37080592 37080886 -115456373 + ORR1E LTR MaLR 7 357 -2 6 867 226 284 97 54 chr5 37081593 37081686 -115455573 + ORR1E LTR MaLR 1 97 -262 6 867 1810 281 243 68 chr5 37081845 37081955 -115455304 + MTE-int LTR MaLR 1 113 -1467 7 867 1810 281 243 68 chr5 37082103 37083252 -115454007 + MTE-int LTR MaLR 114 1480 -100 7 867 599 304 160 49 chr5 37083285 37083572 -115453687 + ORR1E LTR MaLR 11 329 -41 7 867 303 274 49 49 chr5 37091416 37091539 -115445720 - MLT1C LTR MaLR -337 130 8 9 868 1188 177 213 29 chr5 37097666 37097980 -115439279 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 1 868 500 266 198 22 chr5 37108617 37108890 -115428369 + MLT2C2 LTR ERVL 14 498 -65 1 868 414 310 35 7 chr5 37111059 37111202 -115426057 - MLT1A0 LTR MaLR -69 296 150 1 868 827 95 8 0 chr5 37112086 37112212 -115425047 + MTB LTR MaLR 274 400 0 1 868 2685 152 100 17 chr5 37114749 37115289 -115421970 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 1 868 289 333 47 7 chr5 37119658 37119806 -115417453 - RMER15 LTR ERVL -17 558 405 1 868 2407 152 32 9 chr5 37131567 37131998 -115405261 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 1 868 402 114 41 102 chr5 37137401 37137499 -115399760 - MT2B LTR ERVL -343 258 167 1 868 286 232 78 89 chr5 37140149 37140239 -115397020 + MT2B LTR ERVL 152 240 -361 1 868 321 324 67 39 chr5 37141099 37141279 -115395980 + MLT1F-int LTR MaLR 656 840 -649 1 868 724 269 163 106 chr5 37143756 37144247 -115393012 - RMER4B LTR ERVK -7 578 60 2 868 949 183 37 69 chr5 37144444 37144661 -115392598 + ORR1D1 LTR MaLR 143 352 -22 2 868 1639 173 104 6 chr5 37144661 37144998 -115392261 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 13 2 868 1363 249 12 83 chr5 37150285 37150528 -115386731 + MTE2a LTR MaLR 2 213 -166 2 868 2099 98 132 11 chr5 37150528 37150898 -115386361 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 1 2 868 1363 249 12 83 chr5 37150898 37151061 -115386198 + MTE2a LTR MaLR 214 379 0 2 868 1273 114 45 9 chr5 37151923 37152145 -115385114 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 100 2 868 1855 212 69 2 chr5 37160059 37160452 -115376807 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 868 406 266 86 0 chr5 37162084 37162212 -115375047 + ORR1E LTR MaLR 51 189 -170 2 868 1359 313 104 24 chr5 37162905 37163482 -115373777 + MTE-int LTR MaLR 1 623 -957 2 868 1518 202 58 22 chr5 37163734 37164094 -115373165 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 2 868 1110 220 120 25 chr5 37169498 37169749 -115367510 + RMER10A LTR ERVL 1 273 -169 2 868 1110 220 120 25 chr5 37170137 37170236 -115367023 + RMER10A LTR ERVL 283 391 -51 2 868 394 183 0 114 chr5 37170510 37170615 -115366644 - MT2B LTR ERVL -337 264 172 2 868 1956 167 62 38 chr5 37171663 37172086 -115365173 - RMER4A LTR ERVK 0 466 34 2 868 2882 12 3 0 chr5 37172276 37172597 -115364662 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 868 13841 26 1 2 chr5 37172597 37174295 -115362964 + MMETn-int LTR ERVK 1 1695 -3149 2 868 4051 52 0 4 chr5 37174296 37174802 -115362457 + MMETn-int LTR ERVK 3919 4422 -422 2 868 539 0 0 0 chr5 37174802 37174866 -115362393 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 259 322 0 2 868 1324 201 66 16 chr5 37175751 37175999 -115361260 + RMER5 LTR ERV1 31 281 -253 2 868 4024 58 0 75 chr5 37175999 37176560 -115360699 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 3 868 1324 201 66 16 chr5 37176560 37176615 -115360644 + RMER5 LTR ERV1 282 348 -186 2 868 312 238 185 28 chr5 37178576 37178684 -115358575 - MLT1B LTR MaLR -20 370 246 3 868 347 309 216 35 chr5 37180749 37181124 -115356135 + MLT1C LTR MaLR 18 460 -7 3 868 362 293 51 45 chr5 37184140 37184297 -115352962 - MLT1I LTR MaLR -248 163 6 3 868 2992 177 91 39 chr5 37189310 37189981 -115347278 - RLTR40 LTR ERVK -7 810 105 3 868 3781 27 88 115 chr5 37189986 37190622 -115346637 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -35 619 1 3 868 455 174 107 8 chr5 37190622 37190694 -115346565 - RLTR40 LTR ERVK -716 101 18 3 868 2766 176 161 40 chr5 37195592 37196249 -115341010 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 3 868 299 341 89 24 chr5 37200921 37201089 -115336170 + MTEa LTR MaLR 1 179 -200 3 868 225 310 76 25 chr5 37218764 37218883 -115318376 + ORR1C1 LTR MaLR 1 125 -253 3 868 266 245 202 19 chr5 37222625 37222729 -115314530 + MLT1J1 LTR MaLR 13 135 -309 3 868 3435 113 14 12 chr5 37223716 37224235 -115313024 + RLTR28 LTR ERVL 1 520 -4 3 108 1016 261 41 73 chr5 37224312 37224491 -115312768 + ORR1E LTR MaLR 1 175 -184 3 869 1016 261 41 73 chr5 37224630 37224814 -115312445 + ORR1E LTR MaLR 176 347 -12 3 869 2860 133 15 112 chr5 37224999 37225483 -115311776 + RLTR24 LTR ERV1 3 441 -88 3 869 2860 133 15 112 chr5 37225687 37225785 -115311474 + RLTR24 LTR ERV1 442 529 0 3 869 652 262 55 65 chr5 37226732 37227080 -115310179 - MTE2a LTR MaLR -5 365 1 3 869 876 281 118 30 chr5 37230056 37230394 -115306865 + MTD LTR MaLR 52 419 0 4 869 385 272 39 16 chr5 37230846 37230973 -115306286 + MLT1C LTR MaLR 14 143 -324 4 869 3610 118 96 5 chr5 37232043 37232647 -115304612 + RLTR33 LTR ERVK 20 678 0 4 869 2112 113 77 31 chr5 37233556 37233948 -115303311 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 869 1091 221 30 155 chr5 37234106 37234539 -115302720 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 869 1270 164 170 22 chr5 37234650 37234796 -115302463 + ORR1D1 LTR MaLR 1 175 -199 4 869 1270 164 170 22 chr5 37234817 37234982 -115302277 + ORR1D1 LTR MaLR 176 357 -17 4 869 1903 208 43 39 chr5 37236330 37236746 -115300513 - MTD LTR MaLR -1 418 1 4 869 467 113 0 0 chr5 37237545 37237616 -115299643 + MTC LTR MaLR 4 74 -347 4 869 1644 140 7 72 chr5 37238556 37238863 -115298396 + MTC LTR MaLR 1 287 -134 4 869 767 250 55 109 chr5 37239254 37239658 -115297601 + RMER20B LTR ERVK 234 615 -12 4 869 870 212 62 0 chr5 37241140 37241366 -115295893 + MTEa LTR MaLR 140 379 0 4 869 2086 154 7 75 chr5 37242268 37242681 -115294578 + ORR1B1 LTR MaLR 2 386 -8 4 869 2172 131 14 71 chr5 37243426 37243861 -115293398 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 869 2320 130 23 23 chr5 37245313 37245747 -115291512 - RMER10A LTR ERVL 0 442 9 4 869 2941 21 33 6 chr5 37247205 37247542 -115289717 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 869 1766 201 70 3 chr5 37250040 37250399 -115286860 + MTD LTR MaLR 36 418 -1 4 869 1893 131 107 102 chr5 37250561 37250953 -115286306 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 869 1103 118 16 16 chr5 37250963 37251153 -115286106 - ORR1B2 LTR MaLR -177 190 1 4 869 383 277 10 0 chr5 37254478 37254579 -115282680 - MLT1I LTR MaLR 0 411 310 4 869 1043 261 75 49 chr5 37255647 37255994 -115281265 + MTD LTR MaLR 1 356 -63 4 869 481 348 63 5 chr5 37256091 37256313 -115280946 - MLT1A LTR MaLR -33 341 107 4 869 534 265 44 100 chr5 37256735 37256986 -115280273 - MLT1A LTR MaLR -4 370 134 4 869 1944 161 80 19 chr5 37262754 37263116 -115274143 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 869 4111 216 72 47 chr5 37263120 37264239 -115273020 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 1146 -224 4 869 238 253 0 85 chr5 37264992 37265074 -115272185 - LTR86A1 LTR ERVL -403 110 36 4 869 1049 270 73 49 chr5 37269461 37269831 -115267428 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 4 869 282 241 193 44 chr5 37269986 37270153 -115267106 - MLT1J LTR MaLR -343 169 1 4 869 1035 285 56 59 chr5 37271121 37271332 -115265927 - MLT1B LTR MaLR 0 390 165 4 869 1035 285 56 59 chr5 37271364 37271525 -115265734 - MLT1B LTR MaLR -226 164 19 4 869 458 270 144 11 chr5 37273153 37273333 -115263926 + MLT1A LTR MaLR 164 367 -7 4 869 857 291 131 16 chr5 37274040 37274361 -115262898 + MTE2b LTR MaLR 19 376 -3 4 869 830 233 225 59 chr5 37276062 37276386 -115260873 - MTEb LTR MaLR 0 379 2 4 869 389 271 221 55 chr5 37287926 37288274 -115248985 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 1 5 869 626 298 55 35 chr5 37293667 37293921 -115243338 + MLT1B LTR MaLR 80 338 -52 5 869 809 245 20 167 chr5 37294472 37294771 -115242488 - MTE2a LTR MaLR -124 255 1 5 869 317 286 47 9 chr5 37294985 37295091 -115242168 - MLT1A1 LTR MaLR -279 129 20 5 869 694 249 120 37 chr5 37298075 37298292 -115238967 - MTEa LTR MaLR -87 292 58 5 869 3140 168 25 70 chr5 37300456 37301128 -115236131 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 5 869 2377 120 81 5 chr5 37307166 37307550 -115229709 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 869 238 254 0 0 chr5 37312185 37312248 -115225011 - MLT1H2 LTR MaLR -343 146 84 5 869 3444 30 8 0 chr5 37316667 37317060 -115220199 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 869 544 274 123 22 chr5 37318123 37318351 -115218908 - MLT2D LTR ERVL -154 260 10 5 869 2471 184 46 39 chr5 37318993 37319537 -115217722 - RMER15 LTR ERVL -5 570 23 5 869 834 321 101 20 chr5 37321509 37321637 -115215622 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 392 5 869 834 321 101 20 chr5 37321815 37322131 -115215128 - RMER5 LTR ERV1 -143 391 44 5 869 3760 62 46 22 chr5 37323262 37323761 -115213498 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 2 5 869 334 357 93 30 chr5 37326735 37327035 -115210224 + MLT1B LTR MaLR 56 374 -16 5 869 452 249 235 6 chr5 37328753 37328923 -115208336 + MTEb LTR MaLR 1 209 -170 5 869 325 239 0 0 chr5 37329280 37329347 -115207912 + MTEb LTR MaLR 313 379 0 5 869 4855 106 39 35 chr5 37330153 37330958 -115206301 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 5 869 495 256 25 0 chr5 37334226 37334347 -115202912 - MTE2a LTR MaLR 0 379 256 5 869 332 278 56 95 chr5 37334339 37334570 -115202689 - RMER10A LTR ERVL -16 426 205 5 869 576 231 17 8 chr5 37334789 37334907 -115202352 - MTE2a LTR MaLR -108 271 153 5 869 1460 275 75 31 chr5 37334886 37335135 -115202124 - MTE2b-int LTR MaLR -1034 546 278 5 869 1989 109 77 30 chr5 37335135 37335474 -115201785 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 5 5 869 1460 275 75 31 chr5 37335474 37335746 -115201513 - MTE2b-int LTR MaLR -1303 277 2 5 869 1221 277 56 22 chr5 37335746 37336098 -115201161 - MTE2b LTR MaLR -15 364 1 5 869 268 257 78 19 chr5 37337083 37337186 -115200073 - MLT1D LTR MaLR -123 382 274 5 869 2296 161 44 77 chr5 37348535 37349040 -115188219 + RMER19B LTR ERVK 1 488 -414 5 869 596 207 71 7 chr5 37349017 37349158 -115188101 - RMER19B LTR ERVK -752 150 1 5 869 938 269 171 27 chr5 37353099 37353539 -115183720 + RMER5 LTR ERV1 32 534 0 5 870 1065 261 41 56 chr5 37356470 37356860 -115180399 + MTD LTR MaLR 19 402 -17 5 870 1318 195 144 35 chr5 37360157 37360503 -115176756 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 870 572 306 72 28 chr5 37368611 37368860 -115168399 - MLT1A0 LTR MaLR -32 333 74 6 870 582 294 130 44 chr5 37381422 37381760 -115155499 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 42 6 870 1261 198 2 117 chr5 37383593 37384056 -115153203 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 870 1363 189 20 0 chr5 37384266 37384510 -115152749 - MTD LTR MaLR 0 419 171 6 870 430 236 111 41 chr5 37384760 37384932 -115152327 + MLT1D LTR MaLR 82 265 -240 6 870 2962 62 2 19 chr5 37385520 37385780 -115151479 + MTB_Mm LTR MaLR 1 260 -147 6 870 2590 21 223 0 chr5 37385780 37386116 -115151143 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 6 870 2962 62 2 19 chr5 37386116 37386269 -115150990 + MTB_Mm LTR MaLR 261 407 0 6 870 1899 181 52 52 chr5 37386441 37386560 -115150699 + MTD LTR MaLR 1 120 -299 6 870 1899 184 52 51 chr5 37386752 37387053 -115150206 + MTD LTR MaLR 121 407 -12 6 870 895 221 66 162 chr5 37390782 37391189 -115146070 + RLTR18 LTR ERVK 1 467 -149 6 870 365 232 56 84 chr5 37391196 37391375 -115145884 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 169 6 870 1309 122 60 44 chr5 37391375 37391623 -115145636 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 313 6 870 242 219 14 72 chr5 37391741 37391810 -115145449 - MURVY-LTR LTR ERV1 -388 131 67 6 870 471 249 39 56 chr5 37391828 37392007 -115145252 - RLTR15 LTR ERVK -183 176 1 6 870 392 214 192 7 chr5 37392007 37392137 -115145122 + RLTR18B LTR ERVK 356 512 0 6 870 2029 137 63 50 chr5 37394190 37394552 -115142707 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 870 2164 189 14 14 chr5 37394571 37394990 -115142269 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 870 286 326 56 0 chr5 37395434 37395523 -115141736 + MTEa LTR MaLR 8 101 -278 6 870 8128 76 9 50 chr5 37395816 37396190 -115141069 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 378 -736 6 870 8128 76 9 50 chr5 37396335 37397116 -115140143 + RLTR13D3 LTR ERVK 379 1109 -5 6 870 664 331 94 43 chr5 37397139 37397467 -115139792 + MT2A LTR ERVL 189 533 0 6 870 1381 251 51 87 chr5 37397472 37397865 -115139394 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 870 2614 120 58 245 chr5 37399126 37399975 -115137284 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 6 870 320 252 210 8 chr5 37403091 37403215 -115134044 + MLT1B LTR MaLR 1 149 -241 6 870 516 289 19 32 chr5 37403329 37403486 -115133773 + MLT1J LTR MaLR 55 209 -303 6 870 1275 214 173 15 chr5 37403826 37404162 -115133097 - MTD LTR MaLR -13 406 18 6 870 902 322 96 29 chr5 37405171 37405484 -115131775 + MTEa LTR MaLR 1 334 -45 6 870 1759 157 11 112 chr5 37405558 37405924 -115131335 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 870 4169 30 2 4 chr5 37411213 37411689 -115125570 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 870 1934 242 108 49 chr5 37413466 37414182 -115123077 - RLTR40 LTR ERVK -59 758 1 6 870 244 361 41 73 chr5 37417485 37417730 -115119529 + MLT1J LTR MaLR 118 354 -158 7 870 600 263 68 28 chr5 37417983 37418148 -115119111 - MLT1C LTR MaLR -235 232 62 7 870 258 315 122 11 chr5 37418391 37418481 -115118778 + MLT1I LTR MaLR 33 132 -279 7 870 283 238 16 0 chr5 37418666 37418729 -115118530 + MLT1I LTR MaLR 348 411 0 7 870 1753 239 30 15 chr5 37423893 37424292 -115112967 + MTD LTR MaLR 15 419 0 7 870 2515 248 125 59 chr5 37424292 37424782 -115112477 + MTD-int LTR MaLR 1 582 -676 7 870 2515 240 100 20 chr5 37424803 37425233 -115112026 + MTD-int LTR MaLR 583 1063 -195 7 870 2515 240 100 20 chr5 37425472 37425519 -115111740 + MTD-int LTR MaLR 1064 1110 -148 7 870 449 225 89 61 chr5 37425652 37425832 -115111427 + MTD-int LTR MaLR 1070 1254 -4 7 870 1328 186 163 34 chr5 37426031 37426387 -115110872 + MTD LTR MaLR 18 419 0 7 870 2155 113 10 9 chr5 37429351 37429678 -115107581 - ORR1A2 LTR MaLR -1 418 1 7 870 525 299 70 11 chr5 37431078 37431264 -115105995 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 169 7 870 354 305 79 24 chr5 37435079 37435325 -115101934 - MLT1A0 LTR MaLR -15 359 100 7 870 1134 161 43 42 chr5 37440098 37440558 -115096701 - RMER17C LTR ERVK 0 410 11 7 870 570 324 48 68 chr5 37442357 37442687 -115094572 - ORR1E LTR MaLR -1 369 29 7 870 2287 185 54 23 chr5 37446488 37447013 -115090246 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 557 1 7 870 703 313 179 11 chr5 37451318 37451693 -115085566 - MLT1C LTR MaLR -10 457 20 7 870 1381 236 58 7 chr5 37451927 37452221 -115085038 - MTEa LTR MaLR -56 323 15 7 870 1730 200 102 8 chr5 37453563 37453946 -115083313 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 870 3265 26 42 0 chr5 37454875 37455255 -115082004 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 870 1364 126 4 52 chr5 37465378 37465629 -115071630 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 272 7 870 1526 181 25 0 chr5 37467110 37467392 -115069867 - RLTR28 LTR ERVL -234 290 2 7 870 942 172 191 0 chr5 37468261 37468465 -115068794 - RMER15 LTR ERVL -60 515 273 7 870 465 208 111 59 chr5 37468486 37468639 -115068620 - RMER15 LTR ERVL -414 161 1 7 870 453 311 49 17 chr5 37470624 37470943 -115066316 - RLTR12B LTR ERVK -68 291 53 7 870 231 237 118 0 chr5 37471258 37471334 -115065925 - MLT1J1 LTR MaLR -293 151 67 7 870 581 211 8 26 chr5 37474703 37474820 -115062439 + MTD LTR MaLR 1 115 -304 7 870 977 186 29 26 chr5 37474797 37474992 -115062267 + MTD LTR MaLR 223 397 -22 7 870 924 266 19 80 chr5 37477323 37477634 -115059625 - MTE2b LTR MaLR -87 292 1 8 870 261 351 33 13 chr5 37477634 37477780 -115059479 - MLT1B LTR MaLR -241 149 1 8 870 1905 128 161 66 chr5 37478181 37478591 -115058668 + RMER4A LTR ERVK 18 466 0 8 870 608 130 33 0 chr5 37478884 37478976 -115058283 + RMER4A LTR ERVK 369 463 -3 8 870 2747 51 30 0 chr5 37479321 37479657 -115057602 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 8 870 1043 279 47 75 chr5 37480885 37481262 -115055997 - MTEa LTR MaLR 0 379 14 8 870 1005 284 59 13 chr5 37481262 37481565 -115055694 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 1262 8 870 268 204 0 0 chr5 37481998 37482047 -115055212 + MYSERV6-int LTR ERVK 3721 3769 -5190 8 870 1091 255 95 39 chr5 37484961 37485299 -115051960 - MTEa LTR MaLR -22 357 1 8 870 262 325 187 7 chr5 37486284 37486439 -115050820 - MLT1A1 LTR MaLR -100 308 126 8 871 697 288 127 17 chr5 37490108 37490454 -115046805 - MLT1C LTR MaLR -73 394 11 8 871 272 368 56 8 chr5 37490921 37491047 -115046212 - MLT1D LTR MaLR -96 409 278 8 871 428 293 82 115 chr5 37499481 37499815 -115037444 - MLT1B LTR MaLR -2 388 68 8 871 428 293 82 115 chr5 37499857 37499923 -115037336 - MLT1B LTR MaLR -323 67 2 8 871 602 271 45 120 chr5 37502219 37502569 -115034690 - ORR1E LTR MaLR 0 370 32 4 871 1343 246 97 13 chr5 37503297 37503680 -115033579 - MTD LTR MaLR 0 419 5 5 871 598 349 108 52 chr5 37513159 37513658 -115023601 - MLT1H LTR MaLR -20 529 3 2 871 2502 77 3 58 chr5 37531854 37532200 -115005059 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 871 326 245 42 11 chr5 37544143 37544238 -114993021 - MER67C LTR ERV1 -37 674 577 5 871 379 268 26 35 chr5 37544333 37544449 -114992810 - MER67C LTR ERV1 -272 439 325 5 871 246 276 70 20 chr5 37546899 37546999 -114990260 - MTE2a LTR MaLR 0 379 275 5 871 468 210 55 24 chr5 37552622 37552749 -114984510 + MTD LTR MaLR 99 229 -190 7 871 404 241 104 25 chr5 37555366 37555599 -114981660 + MTEb LTR MaLR 98 419 0 7 871 387 275 165 18 chr5 37555634 37555854 -114981405 - MLT1A0 LTR MaLR -95 270 13 7 871 825 245 280 32 chr5 37559663 37559937 -114977322 - ORR1E LTR MaLR -8 371 30 8 871 2592 118 37 8 chr5 37573694 37574095 -114963164 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 871 1631 224 54 22 chr5 37580318 37580724 -114956535 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 871 3001 65 52 0 chr5 37582167 37582554 -114954705 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 871 409 355 60 14 chr5 37582884 37583101 -114954158 + MTD LTR MaLR 193 419 0 1 871 578 316 46 62 chr5 37594766 37595024 -114942235 + ORR1E LTR MaLR 1 250 -109 1 871 2605 103 56 56 chr5 37595024 37595454 -114941805 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 1 871 578 321 46 72 chr5 37595454 37595555 -114941704 + ORR1E LTR MaLR 251 354 -5 1 871 2070 112 29 96 chr5 37599612 37599997 -114937262 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 1 871 3209 23 2 85 chr5 37606851 37607274 -114929985 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 871 4129 46 25 2 chr5 37607278 37608180 -114929079 + RLTR10-int LTR ERVK 3 998 -989 1 871 329 326 13 13 chr5 37608225 37608374 -114928885 + RLTR10-int LTR ERVK 1446 1594 -5987 1 871 8507 19 5 0 chr5 37608456 37609446 -114927813 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 1 871 3195 26 2 85 chr5 37609448 37609871 -114927388 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 871 265 358 37 7 chr5 37611556 37611691 -114925568 - MLT1L LTR MaLR -129 481 343 1 871 294 284 165 59 chr5 37613576 37613859 -114923400 + MER74A LTR ERVL 299 614 -8 1 871 1126 243 111 24 chr5 37615480 37615821 -114921438 - RMER5 LTR ERV1 -12 522 152 1 872 667 271 84 23 chr5 37628492 37628707 -114908552 - MLT1D LTR MaLR -70 435 208 1 872 640 203 26 45 chr5 37644971 37645126 -114892133 - MTD LTR MaLR 0 419 268 1 872 856 280 38 42 chr5 37645150 37645437 -114891822 - MTD LTR MaLR -124 295 10 1 872 230 310 0 45 chr5 37646512 37646600 -114890659 + MLT1C LTR MaLR 366 449 -18 1 872 1447 228 72 35 chr5 37653749 37654153 -114883106 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 872 1293 199 51 38 chr5 37655661 37655794 -114881465 - ORR1D1 LTR MaLR -61 313 177 2 872 1293 199 51 38 chr5 37655974 37656133 -114881126 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 17 2 872 307 292 116 20 chr5 37658224 37658371 -114878888 - MLT1B LTR MaLR -92 298 138 2 872 492 287 70 0 chr5 37659310 37659467 -114877792 - MLT1B LTR MaLR -220 170 3 2 872 1319 190 111 26 chr5 37662513 37662581 -114874678 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 302 2 872 2194 142 5 21 chr5 37662581 37662954 -114874305 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 872 1319 190 111 26 chr5 37662954 37663226 -114874033 - ORR1D1 LTR MaLR -73 301 1 2 872 556 181 24 57 chr5 37663227 37663350 -114873909 - ORR1D1-int LTR MaLR -1 1369 1251 2 872 2725 229 34 8 chr5 37663346 37663988 -114873271 - ORR1D1-int LTR MaLR -711 659 1 2 872 1168 216 113 12 chr5 37663991 37664328 -114872931 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 2 872 2088 108 6 58 chr5 37668756 37669101 -114868158 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 872 245 146 0 0 chr5 37669789 37669830 -114867429 - MT2A LTR ERVL 0 533 493 2 872 1424 251 17 64 chr5 37684473 37684882 -114852377 + MTC-int LTR MaLR 634 1257 -706 2 872 258 180 111 32 chr5 37686648 37686711 -114850548 + RLTR26 LTR ERVK 14 81 -779 2 872 3278 155 92 158 chr5 37686737 37687019 -114850240 + RMER19B LTR ERVK 1 242 -660 2 872 3278 155 92 158 chr5 37687042 37687217 -114850042 + RMER19B LTR ERVK 243 434 -468 2 872 3278 155 92 158 chr5 37687264 37687756 -114849503 + RMER19B LTR ERVK 435 888 -14 2 872 793 268 26 71 chr5 37687770 37688094 -114849165 + RLTR26 LTR ERVK 98 451 -191 2 872 461 229 70 19 chr5 37689074 37689230 -114848029 + MTC-int LTR MaLR 1070 1233 -25 2 872 1951 163 54 0 chr5 37689226 37689575 -114847684 + MTD LTR MaLR 44 411 -8 2 872 1339 221 109 23 chr5 37696253 37696637 -114840622 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 2 872 385 322 28 28 chr5 37702462 37702641 -114834618 + MLT1B LTR MaLR 170 348 -42 2 872 1282 261 68 48 chr5 37707196 37707550 -114829709 + MTEa LTR MaLR 11 371 -8 2 872 878 235 119 4 chr5 37712397 37712632 -114824627 + MTEa LTR MaLR 113 374 -5 2 872 988 200 78 5 chr5 37712639 37712845 -114824414 + ORR1D2 LTR MaLR 15 235 -135 2 872 408 282 78 46 chr5 37714095 37714314 -114822945 + LTR79 LTR ERVL 135 360 -167 2 872 1556 194 35 19 chr5 37716711 37717027 -114820232 + ORR1D1 LTR MaLR 54 374 0 2 872 815 247 125 8 chr5 37720256 37720614 -114816645 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 872 522 214 168 12 chr5 37724595 37724756 -114812503 + MTE2a LTR MaLR 194 379 0 3 872 1181 231 43 120 chr5 37730645 37731038 -114806221 + MTE2a LTR MaLR 3 365 -14 3 872 1991 113 20 7 chr5 37732085 37732379 -114804880 - ORR1B2 LTR MaLR -11 356 59 3 872 1699 171 148 56 chr5 37733650 37733874 -114803385 - MTC LTR MaLR -5 416 208 3 872 1699 171 148 56 chr5 37734021 37734174 -114803085 - MTC LTR MaLR -214 207 4 3 872 961 289 76 32 chr5 37735278 37735452 -114801807 + MTE2a LTR MaLR 2 186 -193 3 872 961 289 76 32 chr5 37735478 37735646 -114801613 + MTE2a LTR MaLR 187 359 -20 3 872 1168 249 91 52 chr5 37736871 37736936 -114800323 - RMER5 LTR ERV1 -93 441 368 3 872 1168 249 91 52 chr5 37736962 37737303 -114799956 - RMER5 LTR ERV1 -167 367 19 3 872 300 303 30 10 chr5 37737360 37737460 -114799799 + MLT-int LTR MaLR 259 360 -1375 3 872 296 224 0 0 chr5 37737635 37737693 -114799566 + MLT1A1 LTR MaLR 349 406 -2 3 872 301 204 0 0 chr5 37742585 37742638 -114794621 + MTEa LTR MaLR 1 53 -326 3 872 1058 233 194 44 chr5 37742638 37742957 -114794302 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 3 872 416 262 37 9 chr5 37742957 37743064 -114794195 + MTEa LTR MaLR 50 159 -220 3 872 1100 274 96 75 chr5 37746087 37746167 -114791092 - MT2A LTR ERVL -2 531 434 3 872 1100 274 96 75 chr5 37746391 37746830 -114790429 - MT2A LTR ERVL -100 433 1 3 873 911 204 191 148 chr5 37749438 37749795 -114787464 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 3 873 809 299 25 13 chr5 37761374 37761611 -114775648 - ORR1E LTR MaLR -117 242 3 3 873 290 353 56 28 chr5 37763553 37763696 -114773563 - RMER15 LTR ERVL -154 421 275 3 873 308 210 126 132 chr5 37763690 37763849 -114773410 - RMER15 LTR ERVL -414 161 4 3 873 1475 201 73 67 chr5 37765736 37766093 -114771166 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 873 1330 262 30 68 chr5 37766093 37766451 -114770808 - MTE2a LTR MaLR -11 368 22 3 873 329 271 179 0 chr5 37767846 37767997 -114769262 - MLT1E1 LTR MaLR -71 583 406 3 873 228 194 194 0 chr5 37773894 37773956 -114763303 - MLT1A0 LTR MaLR -334 74 1 3 873 506 340 123 17 chr5 37782104 37782471 -114754788 - MLT1C LTR MaLR -10 457 58 4 873 506 340 123 17 chr5 37782495 37782540 -114754719 - MLT1C LTR MaLR -410 57 2 4 873 258 294 142 51 chr5 37783888 37784085 -114753174 + LTR16A1 LTR ERVL 240 454 -2 4 873 6637 118 35 81 chr5 37793002 37794191 -114743068 + ORR1A4-int LTR MaLR 830 1963 0 4 873 2224 98 3 81 chr5 37794191 37794548 -114742711 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 873 270 189 69 59 chr5 37798612 37798713 -114738546 + RLTR25B LTR ERVK 397 498 -530 4 873 241 200 58 70 chr5 37798979 37799065 -114738194 + LTR81B LTR ERV1? 272 356 -1037 4 873 927 208 293 4 chr5 37804409 37804675 -114732584 - ORR1D1 LTR MaLR -30 344 2 4 873 1716 155 131 3 chr5 37815046 37815382 -114721877 + ORR1C2 LTR MaLR 1 379 -5 4 873 1967 166 3 18 chr5 37820941 37821279 -114715980 + ORR1B1 LTR MaLR 3 335 -59 4 873 313 306 64 9 chr5 37822006 37822115 -114715144 - MLT1B LTR MaLR -25 365 251 4 873 1879 187 106 11 chr5 37822649 37823028 -114714231 + MTD LTR MaLR 5 419 0 4 873 2965 48 74 3 chr5 37827362 37827739 -114709520 - MTB_Mm LTR MaLR -3 404 1 4 873 251 279 0 55 chr5 37828521 37828612 -114708647 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 285 4 873 1537 222 81 8 chr5 37828760 37829141 -114708118 - MTD LTR MaLR -10 409 1 4 873 231 375 62 0 chr5 37830687 37830815 -114706444 - LTR16A1 LTR ERVL -26 430 295 4 873 316 260 41 0 chr5 37831163 37831236 -114706023 - MTE2a LTR MaLR -22 357 282 4 873 1406 229 69 3 chr5 37831245 37831414 -114705845 - MTEa LTR MaLR -24 355 166 4 873 1406 229 69 3 chr5 37831503 37831666 -114705593 - MTEa LTR MaLR -214 165 2 4 873 1494 235 81 77 chr5 37834885 37835470 -114701789 + RLTR26 LTR ERVK 5 635 -7 5 873 518 271 70 44 chr5 37835924 37836152 -114701107 - RMER15 LTR ERVL -341 234 1 5 873 568 266 25 31 chr5 37836455 37836614 -114700645 + RMER15 LTR ERVL 1 158 -417 5 873 719 292 141 8 chr5 37836615 37836877 -114700382 + RMER15 LTR ERVL 276 572 -3 5 873 508 330 99 17 chr5 37837648 37837950 -114699309 + ORR1E LTR MaLR 22 348 -11 5 873 1303 271 41 16 chr5 37843766 37844134 -114693125 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 5 873 416 298 109 26 chr5 37846775 37846968 -114690291 + MLT1C LTR MaLR 1 209 -258 5 873 1293 261 4 7 chr5 37847326 37847630 -114689629 + MTEa LTR MaLR 23 318 -61 5 873 247 318 23 137 chr5 37851421 37851444 -114685815 + RMER12 LTR ERVK 704 724 -598 5 873 247 318 23 137 chr5 37851615 37851766 -114685493 + RMER12 LTR ERVK 725 858 -464 5 873 1316 255 31 56 chr5 37859269 37859664 -114677595 + MTE2a LTR MaLR 22 417 -2 5 873 470 300 135 73 chr5 37860600 37861019 -114676240 + MLT1C LTR MaLR 6 460 -7 5 873 1433 207 49 88 chr5 37865730 37866116 -114671143 + MTE2a LTR MaLR 1 371 -8 5 873 1068 240 134 9 chr5 37866154 37866490 -114670769 - MTEb LTR MaLR 0 379 2 5 873 1845 174 54 6 chr5 37878041 37878393 -114658866 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 5 874 626 327 72 64 chr5 37880118 37880346 -114656913 - ORR1E LTR MaLR 0 359 122 5 874 2446 65 6 61 chr5 37880346 37880691 -114656568 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 5 874 626 327 72 64 chr5 37880691 37880808 -114656451 - ORR1E LTR MaLR -238 121 11 5 874 303 151 0 19 chr5 37883864 37883918 -114653341 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 352 5 874 740 260 214 23 chr5 37884544 37884716 -114652543 - ORR1E LTR MaLR 0 359 179 5 874 740 260 214 23 chr5 37884893 37885019 -114652240 - ORR1E LTR MaLR -181 178 5 5 874 1157 250 4 0 chr5 37885020 37885256 -114652003 + MTE2b LTR MaLR 1 237 -142 5 874 351 294 60 93 chr5 37885408 37885465 -114651794 - MLT1A LTR MaLR -196 178 130 5 874 1990 147 100 6 chr5 37885465 37885595 -114651664 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 251 5 874 1990 147 100 6 chr5 37885619 37885838 -114651421 - ORR1C2 LTR MaLR -134 250 3 5 874 351 294 60 93 chr5 37885838 37885930 -114651329 - MLT1A LTR MaLR -245 129 34 5 874 536 264 154 36 chr5 37888783 37889003 -114648256 + MLT1B LTR MaLR 19 264 -126 5 874 241 303 132 29 chr5 37898145 37898281 -114638978 + MLT2C1 LTR ERVL 195 344 -53 5 874 278 246 68 14 chr5 37903356 37903636 -114633623 + RMER17D LTR ERVK 170 464 -425 5 874 579 238 189 44 chr5 37906053 37906370 -114630889 + MLT1A0 LTR MaLR 3 365 0 5 874 335 314 68 136 chr5 37906532 37906930 -114630329 - MLT1C LTR MaLR -6 461 14 5 874 1967 140 92 0 chr5 37906938 37907274 -114629985 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 874 1345 221 132 3 chr5 37908618 37908958 -114628301 + MTD LTR MaLR 36 419 0 5 874 229 314 47 0 chr5 37910068 37910154 -114627105 + MER31B LTR ERV1 3 92 -374 6 874 252 342 0 0 chr5 37910186 37910262 -114626997 + MTC LTR MaLR 19 94 -327 6 874 466 317 105 87 chr5 37911331 37911711 -114625548 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 21 6 874 398 264 18 26 chr5 37923350 37923463 -114613796 + MTEa LTR MaLR 268 379 0 6 874 373 185 235 0 chr5 37928222 37928303 -114608956 + ORR1E LTR MaLR 1 100 -259 6 874 337 281 85 114 chr5 37928903 37929104 -114608155 + LTR79 LTR ERVL 22 216 -311 6 874 608 245 32 74 chr5 37932153 37932376 -114604883 + MTEa LTR MaLR 2 216 -163 6 874 2264 94 28 9 chr5 37939276 37939599 -114597660 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 874 4095 36 8 0 chr5 37940083 37940554 -114596705 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 874 1343 202 113 29 chr5 37946700 37947046 -114590213 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 6 874 987 272 79 16 chr5 37951816 37952166 -114585093 + MTE2b LTR MaLR 39 417 -2 6 874 423 264 53 35 chr5 37953526 37953695 -114583564 + RMER15 LTR ERVL 356 527 -48 6 874 668 314 22 48 chr5 37954613 37954881 -114582378 + MTE2a LTR MaLR 59 319 -60 6 874 919 261 141 0 chr5 37963700 37964006 -114573253 - MTE2a LTR MaLR -30 349 1 6 874 2422 107 146 12 chr5 37968179 37968604 -114568655 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 7 874 269 248 20 171 chr5 37986779 37986925 -114550334 + MT2B LTR ERVL 141 264 -337 7 874 1459 182 39 8 chr5 37988419 37988748 -114548511 - MTD LTR MaLR 0 419 13 7 874 1277 237 55 22 chr5 37990318 37990685 -114546574 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 7 874 2413 60 119 11 chr5 37991324 37991676 -114545583 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 7 874 375 317 28 14 chr5 37995514 37995658 -114541601 - ORR1E LTR MaLR -210 149 4 7 874 1556 190 21 101 chr5 38007954 38008382 -114528877 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 9 875 465 294 84 104 chr5 38015081 38015438 -114521821 + ORR1E LTR MaLR 5 354 -5 1 875 414 135 8 53 chr5 38015817 38015950 -114521309 + RMER17A LTR ERVK 321 447 -304 1 875 2151 179 60 52 chr5 38016952 38017506 -114519753 - RLTR20B3 LTR ERVK -13 564 7 1 875 1279 241 140 29 chr5 38020862 38021306 -114515953 + ORR1E-int LTR MaLR 1059 1551 -29 1 875 920 205 32 13 chr5 38021286 38021525 -114515734 + ORR1E LTR MaLR 5 241 -133 1 875 468 121 87 39 chr5 38027868 38027971 -114509288 + RMER19B LTR ERVK 1 108 -794 3 875 4085 162 43 76 chr5 38029129 38030049 -114507210 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 3 875 2029 199 40 5 chr5 38032374 38032779 -114504480 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 875 548 259 174 8 chr5 38033056 38033321 -114503938 + MLT1B LTR MaLR 5 313 -77 3 875 243 233 50 0 chr5 38033329 38033389 -114503870 + ORR1B1 LTR MaLR 10 72 -287 3 875 1414 156 31 4 chr5 38036806 38037063 -114500196 + ORR1B1 LTR MaLR 123 386 -8 3 875 716 258 62 9 chr5 38037540 38037751 -114499508 - MTEa LTR MaLR -11 368 147 4 875 980 176 253 47 chr5 38039133 38039473 -114497786 - MTD LTR MaLR 0 419 10 4 875 229 281 16 109 chr5 38039599 38039727 -114497532 + MTEb LTR MaLR 256 371 -8 4 875 270 288 86 43 chr5 38042950 38043066 -114494193 - MTEb LTR MaLR -8 371 251 4 875 3522 23 2 0 chr5 38043114 38043507 -114493752 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 4 875 1119 215 50 11 chr5 38043686 38043981 -114493278 - MTD LTR MaLR -14 405 100 5 875 526 311 70 77 chr5 38045317 38045589 -114491670 - MTE2a LTR MaLR -52 327 58 5 875 291 176 0 0 chr5 38045849 38045900 -114491359 - MTE2a LTR MaLR -328 51 1 5 875 493 276 215 36 chr5 38046996 38047270 -114489989 - MTE2a LTR MaLR 0 379 57 5 875 330 353 30 15 chr5 38047375 38047510 -114489749 - MLT1C LTR MaLR -8 459 323 5 875 251 282 125 18 chr5 38048584 38048696 -114488563 + MLT1B LTR MaLR 122 245 -145 5 875 236 291 23 11 chr5 38052042 38052129 -114485130 + ORR1E LTR MaLR 15 102 -257 6 875 311 180 108 20 chr5 38053854 38053956 -114483303 - MLT1A0 LTR MaLR -204 161 51 6 875 1059 261 46 0 chr5 38054023 38054326 -114482933 - MTE2b LTR MaLR -62 317 1 6 875 353 276 100 63 chr5 38054679 38055079 -114482180 + MLT2B4 LTR ERVL 13 559 -8 6 875 411 385 79 10 chr5 38055136 38055527 -114481732 + LTR16C LTR ERVL 72 489 0 6 875 1319 225 86 32 chr5 38055603 38056044 -114481215 + RMER5 LTR ERV1 40 504 -30 6 875 626 249 270 3 chr5 38056865 38057158 -114480101 + MTE2b LTR MaLR 6 377 -2 6 875 373 271 76 0 chr5 38062688 38062806 -114474453 + ORR1C1 LTR MaLR 8 134 -244 7 875 1644 167 68 13 chr5 38064714 38065024 -114472235 + ORR1B1 LTR MaLR 1 327 -2 7 875 7334 166 60 14 chr5 38065026 38066466 -114470793 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1507 -2 7 875 1928 179 64 19 chr5 38066468 38066843 -114470416 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 7 875 630 236 111 0 chr5 38066971 38067151 -114470108 + MLT1D LTR MaLR 252 431 -74 8 875 327 357 39 8 chr5 38067719 38067846 -114469413 + MLT1H LTR MaLR 77 207 -342 8 875 2077 153 31 67 chr5 38067856 38068247 -114469012 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 1 8 875 301 276 333 15 chr5 38068558 38068753 -114468506 + MLT1H LTR MaLR 293 549 0 8 875 1195 263 73 27 chr5 38069302 38069630 -114467629 + ORR1E LTR MaLR 13 355 -4 8 875 557 257 175 60 chr5 38070505 38070885 -114466374 + RMER15 LTR ERVL 8 531 -44 8 875 239 262 32 16 chr5 38072607 38072669 -114464590 + MTEb LTR MaLR 116 178 -201 9 875 300 262 0 15 chr5 38075423 38075489 -114461770 + ORR1E LTR MaLR 6 70 -300 9 875 804 220 21 62 chr5 38075489 38075683 -114461576 + ORR1D1 LTR MaLR 1 186 -188 9 875 793 162 157 31 chr5 38075799 38075874 -114461385 + ORR1D1 LTR MaLR 157 226 -148 9 875 793 162 157 31 chr5 38075908 38076023 -114461236 + ORR1D1 LTR MaLR 227 370 -4 9 875 903 234 105 34 chr5 38076021 38076260 -114460999 + ORR1E LTR MaLR 61 316 -43 9 875 2442 68 6 44 chr5 38077689 38078029 -114459230 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 1 875 374 73 0 18 chr5 38078031 38078087 -114459172 + IAPEz-int LTR ERVK 3 57 -1930 1 875 4333 82 15 54 chr5 38078070 38078832 -114458427 + IAPEz-int LTR ERVK 10 662 -5819 1 875 1019 42 0 0 chr5 38078832 38078951 -114458308 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 1 875 1909 86 4 0 chr5 38078952 38079197 -114458062 + IAPEz-int LTR ERVK 2252 2497 -5183 1 875 15778 32 3 0 chr5 38079215 38081013 -114456246 + IAPEz-int LTR ERVK 4678 6481 0 1 875 2672 101 14 40 chr5 38081013 38081435 -114455824 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 875 239 200 33 16 chr5 38082264 38082325 -114454934 + ORR1E LTR MaLR 304 365 -5 9 875 232 291 36 151 chr5 38083260 38083426 -114453833 + MT2B LTR ERVL 95 241 -360 1 875 1523 262 79 14 chr5 38087835 38088057 -114449202 + MT2A LTR ERVL 1 233 -300 1 875 1523 262 79 14 chr5 38088108 38088314 -114448945 + MT2A LTR ERVL 234 457 -76 1 875 460 180 0 1 chr5 38090787 38090870 -114446389 + ORR1C1 LTR MaLR 3 84 -310 1 875 626 239 198 21 chr5 38093515 38093707 -114443552 - MTD LTR MaLR -67 352 127 1 875 405 298 22 51 chr5 38093820 38093958 -114443301 - MTD LTR MaLR -285 134 1 1 875 351 295 45 0 chr5 38094872 38094984 -114442275 + MT2A LTR ERVL 3 119 -414 1 875 1451 236 57 31 chr5 38094885 38095239 -114442020 + MTE2a LTR MaLR 17 379 0 1 875 550 166 6 55 chr5 38095544 38095684 -114441575 + MTD LTR MaLR 1 128 -268 1 875 295 282 0 0 chr5 38095619 38095697 -114441562 - MTD LTR MaLR -240 179 102 1 875 2159 156 29 18 chr5 38096172 38096552 -114440707 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 875 1872 189 35 76 chr5 38100000 38100105 -114437154 + MTD LTR MaLR 13 118 -301 1 875 1872 189 35 76 chr5 38100134 38100451 -114436808 + MTD LTR MaLR 119 417 -2 1 875 1360 237 41 39 chr5 38103655 38103993 -114433266 + ORR1E LTR MaLR 1 339 -20 1 875 335 288 30 13 chr5 38104276 38104402 -114432857 + ORR1E LTR MaLR 275 372 -7 1 875 260 329 104 52 chr5 38111101 38111274 -114425985 - MLT1C LTR MaLR -56 411 230 1 875 282 327 58 69 chr5 38112927 38113101 -114424158 + LTR48B LTR ERV1 126 297 -490 1 875 366 280 48 8 chr5 38113218 38113344 -114423915 + LTR48B LTR ERV1 386 516 -128 1 875 815 270 75 66 chr5 38113348 38113691 -114423568 - ORR1E LTR MaLR -8 371 1 1 875 1273 221 136 7 chr5 38114192 38114502 -114422757 - MTD LTR MaLR 0 419 70 1 875 2158 162 5 76 chr5 38120712 38121119 -114416140 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 875 235 297 11 42 chr5 38122843 38122938 -114414321 - ORR1E LTR MaLR -13 357 266 1 875 696 305 67 54 chr5 38123179 38123477 -114413782 - ORR1E LTR MaLR -49 310 9 1 875 265 321 0 12 chr5 38132449 38132534 -114404725 - MLT1C LTR MaLR -350 117 34 2 875 533 349 127 35 chr5 38133912 38134251 -114403008 + MLT2B1 LTR ERVL 65 434 -86 2 875 881 230 88 153 chr5 38135912 38136277 -114400982 + MTE2a LTR MaLR 1 341 -38 2 875 2012 194 63 5 chr5 38136453 38136847 -114400412 - MTC LTR MaLR -1 420 4 2 875 4280 141 153 36 chr5 38137850 38137945 -114399314 + RLTR25B LTR ERVK 1 116 -912 2 875 4280 141 153 36 chr5 38137984 38138748 -114398511 + RLTR25B LTR ERVK 117 961 -67 2 875 2603 136 36 19 chr5 38140022 38140435 -114396824 - MTC LTR MaLR 0 421 2 2 876 484 273 121 90 chr5 38157249 38157595 -114379664 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 2 876 2084 175 73 13 chr5 38162708 38163090 -114374169 + MTB_Mm LTR MaLR 1 405 -2 2 876 926 242 97 160 chr5 38163097 38163529 -114373730 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 876 781 290 55 0 chr5 38172754 38172954 -114364305 + ORR1E LTR MaLR 31 241 -118 2 876 937 203 36 51 chr5 38173354 38173593 -114363666 + MTD LTR MaLR 3 218 -201 2 876 247 330 137 22 chr5 38177103 38177329 -114359930 + LTR16C LTR ERVL 50 301 -188 3 876 3078 146 15 8 chr5 38177984 38178508 -114358751 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 876 4566 211 172 120 chr5 38178509 38180719 -114356540 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2 2324 1 3 876 352 205 233 53 chr5 38181557 38181763 -114355496 - MYSERV6-int LTR ERVK -2285 6674 6432 3 876 440 231 9 27 chr5 38189302 38189413 -114347846 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 296 3 876 446 273 190 8 chr5 38190537 38190795 -114346464 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 61 3 876 704 313 111 8 chr5 38190929 38191164 -114346095 - MTEa LTR MaLR -88 291 33 3 876 273 336 11 23 chr5 38192517 38192658 -114344601 + MLT1A LTR MaLR 232 384 -24 3 876 1795 168 123 6 chr5 38194308 38194673 -114342586 + MTC LTR MaLR 5 412 -9 3 876 469 321 32 5 chr5 38195003 38195191 -114342068 - MLT1D LTR MaLR -180 325 133 3 876 1434 256 66 0 chr5 38197263 38197627 -114339632 - MTD LTR MaLR -15 404 17 3 876 2815 142 30 10 chr5 38199327 38199826 -114337433 + RLTR11A LTR ERVK 1 509 -19 3 876 579 290 59 108 chr5 38199826 38200270 -114336989 + RMER10A LTR ERVL 3 424 -18 3 876 226 234 0 163 chr5 38203207 38203299 -114333960 - ORR1E LTR MaLR -162 197 121 3 876 296 221 163 81 chr5 38204211 38204334 -114332925 + MTEa LTR MaLR 228 360 -19 3 876 228 295 20 69 chr5 38220061 38220163 -114317096 + LTR87 LTR ERVL? 384 480 -144 3 876 915 318 107 17 chr5 38226242 38226661 -114310598 - MLT1C LTR MaLR -10 457 1 3 876 570 271 13 89 chr5 38231954 38232230 -114305029 - ORR1D2 LTR MaLR -3 371 120 3 876 1441 232 50 30 chr5 38233738 38233764 -114303495 - ORR1E LTR MaLR -12 347 326 3 876 2357 164 10 23 chr5 38233764 38234163 -114303096 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 876 1441 232 50 30 chr5 38234163 38234473 -114302786 - ORR1E LTR MaLR -34 325 4 3 876 444 332 78 31 chr5 38234608 38234864 -114302395 - MLT1B LTR MaLR -79 311 22 3 876 2258 132 25 5 chr5 38235191 38235558 -114301701 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 1 3 876 239 292 176 22 chr5 38237159 38237341 -114299918 - MLT1C LTR MaLR -205 262 53 3 876 531 288 104 50 chr5 38238862 38239140 -114298119 - MTEa LTR MaLR -68 311 19 3 876 274 267 45 90 chr5 38245842 38245953 -114291306 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 4 876 1244 166 45 5 chr5 38247239 38247533 -114289726 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 876 1033 273 93 22 chr5 38249837 38250159 -114287100 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 21 4 876 359 344 171 25 chr5 38256186 38256466 -114280793 - MLT1D LTR MaLR -160 345 25 4 876 409 248 58 111 chr5 38259249 38259421 -114277838 + MT2B LTR ERVL 102 264 -337 4 876 268 284 111 8 chr5 38266912 38267029 -114270230 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 237 4 876 553 293 184 21 chr5 38267586 38267820 -114269439 + MLT1J LTR MaLR 38 309 -203 4 876 761 104 0 28 chr5 38267963 38268072 -114269187 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 291 4 876 7015 76 52 89 chr5 38268074 38268459 -114268800 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 393 -705 4 876 7015 76 52 89 chr5 38268652 38269407 -114267852 + MTA_Mm-int LTR MaLR 394 1098 0 4 876 3091 52 34 8 chr5 38269407 38269793 -114267466 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 876 758 245 6 25 chr5 38269794 38269953 -114267306 + MTE2b LTR MaLR 91 246 -133 4 877 472 348 9 35 chr5 38273407 38273703 -114263556 + MLT1L LTR MaLR 110 462 -148 4 877 909 201 128 16 chr5 38275324 38275427 -114261832 - MTD LTR MaLR -14 405 295 4 877 909 196 137 13 chr5 38276121 38276258 -114261001 - MTD LTR MaLR -119 300 144 4 877 323 195 75 65 chr5 38276394 38276487 -114260772 - MTD LTR MaLR -276 143 50 4 877 285 213 16 0 chr5 38277493 38277554 -114259705 - MTD LTR MaLR -353 66 5 4 877 280 242 16 0 chr5 38277902 38277964 -114259295 + MLT1H LTR MaLR 28 90 -354 4 877 299 146 0 0 chr5 38280715 38280763 -114256496 + MTE2b LTR MaLR 332 379 0 4 877 431 248 41 105 chr5 38281183 38281329 -114255930 + MLT1H LTR MaLR 82 257 -292 4 877 225 244 68 114 chr5 38281437 38281525 -114255734 + MLT1H LTR MaLR 377 460 -29 4 877 266 188 84 28 chr5 38292226 38292297 -114244962 - RLTR25B LTR ERVK -509 519 445 4 877 412 313 144 58 chr5 38297946 38298258 -114239001 + MT2A LTR ERVL 1 339 -194 5 877 449 123 48 36 chr5 38298425 38298509 -114238750 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 286 5 877 1489 165 85 11 chr5 38298509 38298779 -114238480 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 78 5 877 977 213 118 15 chr5 38298829 38299091 -114238168 - ORR1D2 LTR MaLR -81 289 1 5 877 630 266 108 108 chr5 38299270 38299315 -114237944 - MTE2a LTR MaLR 0 379 335 5 877 630 266 108 108 chr5 38299518 38299851 -114237408 - MTE2a LTR MaLR -45 334 3 5 877 2379 164 124 14 chr5 38300883 38301450 -114235809 + RMER19B LTR ERVK 2 874 -28 5 877 2370 179 37 26 chr5 38302178 38302642 -114234617 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 469 -109 5 877 544 287 116 11 chr5 38303222 38303412 -114233847 - LTR33A_ LTR ERVL -315 216 7 5 877 275 274 19 128 chr5 38305031 38305211 -114232048 - ORR1D1 LTR MaLR 0 419 243 5 877 2398 196 38 42 chr5 38306272 38306799 -114230460 - RLTR20C LTR ERVK -9 525 1 5 877 361 266 123 77 chr5 38313132 38313352 -114223907 + RLTR14 LTR ERV1 153 382 0 5 877 1267 251 156 8 chr5 38314767 38315132 -114222127 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 877 3170 8 43 0 chr5 38315591 38315943 -114221316 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 877 4696 59 41 14 chr5 38315943 38316581 -114220678 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 5 877 434 66 0 32 chr5 38316581 38316644 -114220615 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 5 877 1682 114 0 12 chr5 38316649 38316898 -114220361 + IAPEz-int LTR ERVK 2252 2497 -5183 5 877 889 88 24 0 chr5 38316893 38317018 -114220241 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 5 877 25292 18 4 2 chr5 38317018 38319967 -114217292 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 5 877 3170 8 43 0 chr5 38319967 38320319 -114216940 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 877 336 228 67 1 chr5 38321210 38321304 -114215955 + MLT2D LTR ERVL 113 209 -347 5 877 673 231 88 100 chr5 38321401 38321641 -114215618 - RMER15 LTR ERVL 0 575 339 5 877 1005 201 106 58 chr5 38324874 38325320 -114211939 + RLTR20C LTR ERVK 3 575 -3 5 877 382 279 165 66 chr5 38328118 38328257 -114209002 - MLT1C LTR MaLR -293 174 3 5 877 272 289 107 113 chr5 38328596 38328951 -114208308 + ORR1E LTR MaLR 4 356 -14 5 877 1558 227 81 23 chr5 38336726 38337122 -114200137 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 877 600 88 18 89 chr5 38338169 38338281 -114198978 - MTD LTR MaLR -315 104 1 5 877 2590 173 57 20 chr5 38338400 38338908 -114198351 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 5 877 501 329 70 79 chr5 38339342 38339685 -114197574 + ORR1E LTR MaLR 11 350 -9 5 877 260 366 117 36 chr5 38340623 38340655 -114196604 + LTR16C LTR ERVL 106 136 -353 5 877 260 366 117 36 chr5 38340684 38340985 -114196274 + LTR16C LTR ERVL 137 466 -23 5 877 278 184 0 0 chr5 38341379 38341428 -114195831 + MLT2C1 LTR ERVL 515 563 0 5 877 334 301 102 66 chr5 38342033 38342307 -114194952 - MLT1F1 LTR MaLR -220 349 66 5 877 2026 157 57 27 chr5 38348726 38349093 -114188166 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 877 2517 145 37 12 chr5 38349726 38350132 -114187127 - MTC LTR MaLR -5 416 1 6 877 1745 214 43 58 chr5 38350619 38351035 -114186224 + MTD LTR MaLR 5 414 -5 6 877 447 257 180 25 chr5 38354454 38354737 -114182522 - MLT1B LTR MaLR 0 390 64 6 877 2330 105 64 44 chr5 38356065 38356454 -114180805 - RMER10B LTR ERVL -1 397 1 6 877 2035 172 55 50 chr5 38357250 38357690 -114179569 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 6 877 298 303 51 42 chr5 38360863 38361048 -114176211 + MLT1C LTR MaLR 72 253 -137 6 877 319 288 151 27 chr5 38361109 38361276 -114175983 - MER34 LTR ERV1 -5 566 375 6 877 2150 195 45 15 chr5 38362472 38362872 -114174387 + MTC LTR MaLR 2 413 -8 6 877 1010 225 115 33 chr5 38363004 38363335 -114173924 + ORR1E LTR MaLR 1 358 -1 6 877 486 306 273 43 chr5 38363689 38364020 -114173239 - MLT1C LTR MaLR -6 461 55 6 877 280 185 253 24 chr5 38365498 38365581 -114171678 + MTEa LTR MaLR 274 375 -4 6 877 1101 215 148 0 chr5 38366957 38367213 -114170046 - MTD LTR MaLR 0 419 126 6 877 1312 259 92 9 chr5 38367214 38367549 -114169710 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 7 6 877 583 227 16 8 chr5 38367547 38367676 -114169583 - MTD LTR MaLR -280 139 10 6 877 419 255 29 0 chr5 38369526 38369628 -114167631 + ORR1E LTR MaLR 1 105 -254 6 877 1772 148 48 22 chr5 38372519 38372831 -114164428 + ORR1B2 LTR MaLR 21 340 -27 6 877 474 263 222 65 chr5 38377238 38377486 -114159773 - RMER15 LTR ERVL -14 561 275 6 877 423 275 104 89 chr5 38379961 38380300 -114156959 + ORR1E LTR MaLR 1 352 -27 6 877 361 229 115 33 chr5 38380334 38380348 -114156911 + ORR1E LTR MaLR 353 377 -2 6 877 3768 148 98 17 chr5 38380505 38381165 -114156094 - RMER19B LTR ERVK -7 895 182 6 877 318 269 55 46 chr5 38382290 38382399 -114154860 - MLT1G3 LTR MaLR -298 297 188 6 877 505 214 194 25 chr5 38383673 38383874 -114153385 + MLT1A0 LTR MaLR 131 365 0 6 877 900 274 52 110 chr5 38385480 38385913 -114151346 + MTE2a LTR MaLR 3 406 -13 6 877 481 348 129 58 chr5 38386019 38386411 -114150848 + MLT1G1 LTR MaLR 160 579 0 6 877 397 284 80 76 chr5 38386412 38386703 -114150556 + MLT1L LTR MaLR 206 421 -91 6 877 555 325 90 12 chr5 38391559 38391904 -114145355 - MLT1A LTR MaLR 0 374 3 6 877 310 299 137 63 chr5 38394997 38395268 -114141991 + MLT1C LTR MaLR 173 463 -4 7 877 543 327 99 53 chr5 38399813 38399936 -114137323 + MLT1D LTR MaLR 5 122 -383 7 877 543 327 99 53 chr5 38400009 38400297 -114136962 + MLT1D LTR MaLR 123 435 -70 7 877 265 267 56 34 chr5 38401647 38401736 -114135523 + MLT1A1 LTR MaLR 318 408 0 7 878 1861 203 134 62 chr5 38404731 38405292 -114131967 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 7 878 346 228 10 115 chr5 38405647 38405751 -114131508 + MT2B LTR ERVL 165 257 -344 7 878 528 294 118 75 chr5 38407951 38408300 -114128959 + MLT1A LTR MaLR 4 367 -7 7 878 1491 213 67 24 chr5 38410823 38411164 -114126095 - MTEa LTR MaLR 0 379 24 7 878 481 218 195 60 chr5 38412906 38413121 -114124138 + RMER13A LTR ERVK 96 339 -521 7 878 2917 209 87 132 chr5 38421597 38422510 -114114749 - RMER19B LTR ERVK -30 872 1 7 878 669 258 96 114 chr5 38422510 38422819 -114114440 + MLT1A1 LTR MaLR 32 337 -71 7 878 823 273 49 122 chr5 38422819 38423228 -114114031 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 7 878 669 258 96 114 chr5 38423228 38423290 -114113969 + MLT1A1 LTR MaLR 338 396 -12 7 878 446 278 164 19 chr5 38427398 38427611 -114109648 - MLT1D LTR MaLR 0 505 262 7 878 271 246 200 9 chr5 38428208 38428323 -114108936 - LTR85c LTR Gypsy? -594 229 93 7 878 815 77 34 27 chr5 38433040 38433187 -114104072 - RMER17B LTR ERVK -495 463 316 7 878 862 277 43 97 chr5 38439458 38439830 -114097429 + ORR1E LTR MaLR 2 353 -6 8 878 435 218 19 19 chr5 38479010 38479113 -114058146 + MER57-int LTR ERV1 7155 7257 -280 8 878 1553 211 118 0 chr5 38483937 38484311 -114052948 - MTD LTR MaLR 0 419 2 8 878 546 238 266 3 chr5 38489107 38489393 -114047866 + MTE2b LTR MaLR 19 379 0 8 878 233 283 104 77 chr5 38490199 38490421 -114046838 - LTR79 LTR ERVL -287 240 13 8 878 2929 40 43 0 chr5 38521582 38521934 -114015325 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 878 9037 29 2 5 chr5 38521934 38523019 -114014240 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5400 2 878 20259 37 47 14 chr5 38522997 38525574 -114011685 - IAPEz-int LTR ERVK -3811 2670 8 2 878 2929 40 43 0 chr5 38525574 38525926 -114011333 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 879 458 258 89 118 chr5 38536807 38537111 -114000148 + MLT1B LTR MaLR 80 374 -16 3 879 275 259 26 61 chr5 38539070 38539185 -113998074 + MLT1D LTR MaLR 110 220 -285 3 879 411 280 173 20 chr5 38552382 38552579 -113984680 - MLT1D LTR MaLR -12 493 267 4 879 313 269 25 25 chr5 38552711 38552791 -113984468 - MLT1D LTR MaLR -425 80 1 4 879 554 248 16 0 chr5 38553327 38553448 -113983811 + MTE2b LTR MaLR 6 128 -251 4 879 647 245 91 18 chr5 38553468 38553688 -113983571 - MTEa LTR MaLR -35 344 109 4 879 249 200 94 0 chr5 38554559 38554644 -113982615 - MTEa LTR MaLR -232 127 33 4 879 1081 254 41 10 chr5 38556855 38557163 -113980096 + MTE2b LTR MaLR 1 311 -68 4 879 255 261 15 0 chr5 38561536 38561601 -113975658 + MLT1J LTR MaLR 442 507 -5 5 879 252 292 52 10 chr5 38561837 38561934 -113975325 - MLT1D LTR MaLR -335 170 70 5 879 4649 109 42 8 chr5 38562300 38563013 -113974246 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 879 1216 205 141 0 chr5 38567206 38567489 -113969770 - MTEa LTR MaLR -56 323 1 6 879 2671 35 32 0 chr5 38569460 38569806 -113967453 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 7 879 231 329 0 0 chr5 38571373 38571452 -113965807 + MLT1C LTR MaLR 357 435 -32 7 879 267 277 24 12 chr5 38572094 38572178 -113965081 - MER21B LTR ERV1 -364 499 415 7 879 285 265 86 29 chr5 38572464 38572569 -113964690 + MLT1A1 LTR MaLR 291 401 -7 7 879 655 355 124 77 chr5 38572576 38573636 -113963623 + MTE-int LTR MaLR 1 1109 -471 8 879 276 274 176 46 chr5 38577325 38577478 -113959781 + MLT1C LTR MaLR 268 440 -27 9 879 1071 225 80 63 chr5 38577732 38578102 -113959157 - MTE2a LTR MaLR 0 419 35 9 879 2156 124 46 3 chr5 38579449 38579796 -113957463 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 33 9 879 1888 150 81 0 chr5 38580924 38581270 -113955989 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 879 720 275 38 17 chr5 38582365 38582589 -113954670 - MLT1C LTR MaLR 0 505 269 1 879 917 296 96 6 chr5 38583715 38584048 -113953211 + MLT1B LTR MaLR 3 365 -25 1 879 1864 167 57 22 chr5 38584858 38584878 -113952381 + MTD LTR MaLR 1 17 -402 1 879 1864 167 57 22 chr5 38584901 38585285 -113951974 + MTD LTR MaLR 18 419 0 1 879 1242 256 69 20 chr5 38586149 38586496 -113950763 - MTEa LTR MaLR -15 364 1 1 879 776 229 105 41 chr5 38587108 38587462 -113949797 - MLT1C LTR MaLR -3 387 30 1 879 338 304 0 0 chr5 38592823 38592915 -113944344 + ORR1E LTR MaLR 53 144 -215 1 879 2565 96 28 5 chr5 38593978 38594376 -113942883 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 879 367 267 7 123 chr5 38603717 38603871 -113933388 - MT2B LTR ERVL -343 258 123 1 879 1143 251 104 9 chr5 38608202 38608548 -113928711 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 1 879 696 297 44 60 chr5 38609171 38609486 -113927773 + RLTR18B LTR ERVK 1 310 -306 1 879 796 325 22 56 chr5 38609456 38609870 -113927389 + RLTR18B LTR ERVK 135 512 0 1 879 577 330 103 32 chr5 38610774 38611084 -113926175 + MLT1B LTR MaLR 52 383 -7 1 879 4004 90 59 12 chr5 38613100 38613674 -113923585 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 1 879 265 164 162 15 chr5 38613776 38613844 -113923415 + MTD LTR MaLR 342 419 0 1 879 355 253 42 48 chr5 38616323 38616489 -113920770 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 177 1 879 234 294 65 32 chr5 38621211 38621334 -113915925 + ORR1B1 LTR MaLR 23 149 -245 1 879 242 225 83 8 chr5 38623512 38623633 -113913626 + ORR1B1-int LTR MaLR 625 754 -755 1 879 2312 150 62 15 chr5 38629449 38629849 -113907410 - MTC LTR MaLR -2 419 1 1 879 1432 246 46 32 chr5 38633310 38633655 -113903604 + ORR1D2 LTR MaLR 1 350 -20 1 879 335 198 89 57 chr5 38634113 38634236 -113903023 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 247 1 879 340 210 87 138 chr5 38635632 38635770 -113901489 - MT2B LTR ERVL -344 257 127 1 879 3461 25 5 2 chr5 38637933 38638328 -113898931 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 879 644 281 91 93 chr5 38647029 38647382 -113889877 - ORR1E LTR MaLR -2 357 6 2 879 788 82 18 30 chr5 38647799 38647930 -113889329 - ORR1C2 LTR MaLR -270 114 1 2 879 286 321 147 59 chr5 38654992 38655188 -113882071 + LTR79 LTR ERVL 122 340 -187 2 879 286 321 147 59 chr5 38655329 38655473 -113881786 + LTR79 LTR ERVL 341 492 -35 2 879 791 233 100 25 chr5 38664738 38664997 -113872262 - MLT1G1 LTR MaLR 0 579 227 2 879 259 365 78 5 chr5 38665127 38665320 -113871939 + ERVL-E-int LTR ERVL 3035 3241 -2426 2 879 331 339 17 0 chr5 38665331 38665449 -113871810 + ERVL-E-int LTR ERVL 3453 3572 -2189 2 879 490 304 97 59 chr5 38665558 38665878 -113871381 + ERVL-E-int LTR ERVL 3554 3952 -1533 2 880 2233 117 54 30 chr5 38673809 38674178 -113863081 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 880 1966 144 31 145 chr5 38678373 38678787 -113858472 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 880 640 286 53 49 chr5 38679811 38680119 -113857140 + ORR1E LTR MaLR 57 379 0 2 880 652 203 161 21 chr5 38684098 38684284 -113852975 - MTD LTR MaLR 0 419 208 2 880 762 278 62 0 chr5 38684478 38684658 -113852601 - MTD LTR MaLR -209 210 18 2 880 272 377 48 21 chr5 38688252 38688439 -113848820 - MLT1L LTR MaLR -104 506 315 3 880 344 259 148 53 chr5 38692761 38693016 -113844243 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 247 3 880 258 279 97 171 chr5 38697535 38697885 -113839374 - MLT1A0 LTR MaLR -22 343 20 3 880 1512 189 77 53 chr5 38702298 38702673 -113834586 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 880 597 262 126 26 chr5 38702933 38703302 -113833957 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 880 3226 87 11 16 chr5 38704442 38704877 -113832382 - RLTR10C LTR ERVK -3 433 1 3 880 1084 267 93 19 chr5 38706299 38706623 -113830636 - ORR1D2 LTR MaLR -22 348 1 3 880 261 230 44 44 chr5 38707130 38707221 -113830038 - MLT1G3 LTR MaLR -16 579 489 3 880 244 289 18 44 chr5 38707201 38707429 -113829830 + RMER17D LTR ERVK 243 464 -425 3 880 298 310 251 58 chr5 38707740 38708030 -113829229 - MLT1G3 LTR MaLR -174 421 76 3 880 403 319 141 20 chr5 38716761 38717027 -113820232 + ORR1E LTR MaLR 19 298 -76 3 880 3062 17 3 11 chr5 38718713 38719062 -113818197 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 880 286 232 110 77 chr5 38719534 38719716 -113817543 - RMER17D LTR ERVK -485 404 217 3 880 1538 161 83 4 chr5 38719836 38720162 -113817097 + ORR1D1-int LTR MaLR 1000 1528 -52 3 880 1157 182 52 188 chr5 38720162 38720588 -113816671 + ORR1D1 LTR MaLR 5 372 -2 3 880 2140 201 41 3 chr5 38723056 38723446 -113813813 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 880 3745 228 115 52 chr5 38723446 38724536 -113812723 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 101 3 880 461 296 37 79 chr5 38725739 38725955 -113811304 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 199 3 880 371 274 72 94 chr5 38726105 38726378 -113810881 + ORR1E LTR MaLR 98 378 -1 3 880 319 281 18 88 chr5 38726380 38726493 -113810766 - MLT1A1 LTR MaLR -230 135 31 3 880 387 369 117 20 chr5 38726870 38727213 -113810046 + MLT1J-int LTR MaLR 4 379 -1008 3 880 1121 290 46 19 chr5 38730058 38730424 -113806835 - MTEa LTR MaLR -2 377 2 3 880 1060 254 36 123 chr5 38731055 38731477 -113805782 + MTE2a LTR MaLR 6 404 -15 3 880 688 259 197 11 chr5 38731642 38731911 -113805348 + RMER21B LTR ERV1 249 567 -275 3 880 296 243 0 86 chr5 38731918 38731999 -113805260 + RMER21B LTR ERV1 761 834 -113 3 880 527 353 33 21 chr5 38733072 38733312 -113803947 + MLT1H1 LTR MaLR 313 555 0 3 880 415 295 85 111 chr5 38733318 38733634 -113803625 + MLT1K LTR MaLR 288 595 0 3 880 319 330 156 54 chr5 38736598 38736803 -113800456 - MLT1H2 LTR MaLR -38 451 226 3 880 408 324 110 0 chr5 38744415 38744588 -113792671 + MLT1A0 LTR MaLR 73 264 -101 3 880 2598 105 18 48 chr5 38745688 38746088 -113791171 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 7 3 880 286 273 107 84 chr5 38749350 38749601 -113787658 + ORR1E LTR MaLR 49 286 -81 3 880 250 309 115 84 chr5 38752929 38753155 -113784104 + LTR86B2 LTR ERVL 133 365 -122 3 880 2132 104 25 19 chr5 38755254 38755578 -113781681 + RLTR26 LTR ERVK 1 326 -316 4 880 1087 273 58 24 chr5 38760132 38760462 -113776797 + MLT1A0 LTR MaLR 4 344 -21 4 880 373 295 61 69 chr5 38762371 38762391 -113774868 + MLT1B LTR MaLR 245 268 -122 4 880 373 295 61 69 chr5 38762558 38762668 -113774591 + MLT1B LTR MaLR 269 374 -16 4 880 239 224 36 84 chr5 38762879 38762962 -113774297 + MT2B LTR ERVL 156 234 -367 4 880 781 258 125 127 chr5 38762976 38763023 -113774236 - MT2B LTR ERVL 0 533 489 4 880 928 249 113 117 chr5 38763104 38763585 -113773674 - MT2B LTR ERVL -31 570 4 4 880 310 303 50 0 chr5 38764537 38764636 -113772623 - MLT1D LTR MaLR -3 502 399 4 880 287 282 83 90 chr5 38764782 38764850 -113772409 + ORR1D1 LTR MaLR 6 68 -306 4 880 287 295 81 67 chr5 38764933 38765064 -113772195 + ORR1D1 LTR MaLR 69 228 -131 4 880 242 247 19 160 chr5 38765099 38765205 -113772054 + ORR1B1 LTR MaLR 91 181 -178 4 880 610 113 279 0 chr5 38765655 38765785 -113771474 + ORR1B1 LTR MaLR 160 391 -3 4 880 965 233 70 130 chr5 38765882 38766267 -113770992 + MTE2a LTR MaLR 1 362 -17 4 880 283 356 49 40 chr5 38766464 38766689 -113770570 + LTR33 LTR ERVL 253 479 -36 4 880 1786 118 119 14 chr5 38767675 38767857 -113769402 + RMER17C LTR ERVK 2 187 -223 4 880 1786 118 119 14 chr5 38767941 38768112 -113769147 + RMER17C LTR ERVK 188 391 -19 4 880 1798 187 112 23 chr5 38769547 38769931 -113767328 - MTD LTR MaLR -1 418 1 4 880 585 271 107 64 chr5 38779074 38779354 -113757905 - MLT1C LTR MaLR -148 319 28 4 880 273 345 124 72 chr5 38780265 38780739 -113756520 - MLT1D LTR MaLR -6 499 1 4 880 576 91 0 0 chr5 38782241 38782318 -113754941 + RLTR10C LTR ERVK 314 390 -46 4 880 237 341 68 79 chr5 38784041 38784321 -113752938 + RMER10A LTR ERVL 19 295 -147 4 880 327 306 92 0 chr5 38786575 38786673 -113750586 - ORR1E LTR MaLR -252 107 1 4 880 402 302 127 48 chr5 38786726 38787042 -113750217 + MLT1D LTR MaLR 17 357 -148 4 880 225 324 14 14 chr5 38792000 38792072 -113745187 + MLT1J LTR MaLR 320 391 -121 4 880 258 169 0 92 chr5 38793304 38793369 -113743890 + RMER6B LTR ERVK 372 430 -31 4 880 1547 217 70 31 chr5 38793622 38793978 -113743281 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 880 274 341 24 0 chr5 38796120 38796202 -113741057 - MLT1A LTR MaLR -290 84 1 4 880 3042 21 0 0 chr5 38796929 38797266 -113739993 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 13 54552 21 8 9 chr5 38797266 38803751 -113733508 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 4 881 3078 15 0 0 chr5 38803751 38804088 -113733171 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 881 228 315 207 39 chr5 38806401 38806609 -113730650 + ORR1E LTR MaLR 97 339 -20 4 881 2209 150 148 27 chr5 38806878 38807289 -113729970 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 4 881 307 176 49 58 chr5 38814437 38814660 -113722599 + RMER17D2 LTR ERVK 254 474 -335 5 881 4817 142 53 98 chr5 38816420 38817365 -113719894 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 881 1574 210 83 0 chr5 38818661 38818985 -113718274 + MTD LTR MaLR 61 411 -8 5 881 887 188 52 28 chr5 38820717 38820913 -113716346 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 172 5 881 690 234 47 62 chr5 38828080 38828328 -113708931 + ORR1D2 LTR MaLR 9 210 -116 5 881 1908 111 210 0 chr5 38830535 38830859 -113706400 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 5 881 261 340 0 80 chr5 38834446 38834558 -113702701 + LTR33A_ LTR ERVL 276 378 -153 5 881 519 341 26 73 chr5 38839226 38839539 -113697720 - RLTR25B LTR ERVK -730 298 1 5 881 260 303 187 0 chr5 38840124 38840279 -113696980 + MLT1K LTR MaLR 373 556 -39 5 881 3347 46 2 2 chr5 38853984 38854380 -113682879 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 881 614 196 43 86 chr5 38858601 38858858 -113678401 + RMER17C LTR ERVK 1 246 -164 5 881 1198 199 27 36 chr5 38858859 38859193 -113678066 + RMER17C LTR ERVK 80 410 0 5 881 2188 118 21 12 chr5 38862701 38863035 -113674224 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 881 6274 63 13 13 chr5 38863037 38863887 -113673372 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5630 5 881 23540 45 30 14 chr5 38863873 38866892 -113670367 - IAPEz-int LTR ERVK -3405 3076 8 5 881 2188 118 21 12 chr5 38866892 38867226 -113670033 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 881 876 316 89 73 chr5 38878736 38879176 -113658083 + MLT2C2 LTR ERVL 12 458 -6 6 881 267 259 35 0 chr5 38879684 38879742 -113657517 + MLT2C2 LTR ERVL 438 497 -62 6 881 646 233 141 45 chr5 38883894 38884136 -113653123 - MTD LTR MaLR -32 387 143 6 881 2331 188 14 10 chr5 38884406 38884820 -113652439 + MTC LTR MaLR 6 421 0 6 881 1954 176 38 25 chr5 38885024 38885392 -113651867 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 2 6 881 3545 56 162 18 chr5 38885884 38886377 -113650882 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 6 881 563 217 143 49 chr5 38889128 38889387 -113647872 + RMER20B LTR ERVK 206 476 -151 6 881 1118 167 239 38 chr5 38891306 38891729 -113645530 + RMER19B LTR ERVK 317 664 -238 6 881 568 252 25 44 chr5 38898543 38898701 -113638558 + RLTR11B LTR ERVK 10 164 -289 6 881 562 313 42 35 chr5 38899204 38899492 -113637767 + BGLII_B LTR ERVK 125 414 -27 6 881 1313 218 102 25 chr5 38899647 38899971 -113637288 - MTEa LTR MaLR -3 376 28 6 881 3221 118 7 15 chr5 38900034 38900499 -113636760 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 6 881 289 354 27 27 chr5 38900749 38900897 -113636362 - MTE2b LTR MaLR -163 216 69 6 881 368 221 11 23 chr5 38901140 38901228 -113636031 + MLT1A1 LTR MaLR 300 386 -22 6 881 402 329 155 57 chr5 38901748 38902074 -113635185 + MLT1F2 LTR MaLR 43 399 -170 6 881 2089 132 76 76 chr5 38902349 38902743 -113634516 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 881 1731 137 33 141 chr5 38903144 38903604 -113633655 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 881 261 311 139 40 chr5 38905012 38905213 -113632046 + MER34 LTR ERV1 4 224 -318 6 881 460 329 68 83 chr5 38906510 38906587 -113630672 - MLT2B2 LTR ERVL 0 515 439 6 881 2030 161 50 3 chr5 38906587 38906948 -113630311 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 881 460 325 83 96 chr5 38906948 38907183 -113630076 - MLT2B2 LTR ERVL -66 488 246 6 881 1022 210 75 8 chr5 38907296 38907536 -113629723 + MTC LTR MaLR 134 389 -32 6 881 1744 157 63 21 chr5 38908412 38908790 -113628469 - RMER17C LTR ERVK 0 410 17 6 881 324 277 36 12 chr5 38909485 38909569 -113627690 - MTEa LTR MaLR -4 375 290 6 881 417 243 46 9 chr5 38909853 38909961 -113627298 - RLTR18 LTR ERVK -1 615 504 6 881 1018 228 0 45 chr5 38909950 38910171 -113627088 - RLTR18 LTR ERVK -405 211 1 6 881 696 263 14 72 chr5 38910216 38910437 -113626822 - MTEa LTR MaLR -164 215 8 6 881 596 286 104 46 chr5 38912035 38912394 -113624865 + RMER20B LTR ERVK 126 492 -24 6 881 2091 90 88 20 chr5 38912467 38912772 -113624487 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 6 881 1776 174 48 3 chr5 38912778 38913089 -113624170 + ORR1A1 LTR MaLR 20 344 -2 6 881 1433 108 22 9 chr5 38913087 38913311 -113623948 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 227 -1736 6 881 900 197 77 8 chr5 38913305 38913551 -113623708 - ORR1A2-int LTR MaLR -983 980 718 6 881 889 142 79 51 chr5 38913498 38913676 -113623583 - MT2B LTR ERVL -287 314 132 6 881 463 182 20 0 chr5 38913613 38913712 -113623547 - ORR1A2-int LTR MaLR -1205 758 658 6 881 277 260 180 40 chr5 38921722 38921822 -113615437 + MT2A LTR ERVL 1 114 -419 6 881 780 172 165 6 chr5 38922022 38922192 -113615067 + MT2A LTR ERVL 85 281 -252 6 881 579 281 106 40 chr5 38924169 38924421 -113612838 + MTD LTR MaLR 28 294 -85 6 881 518 283 145 115 chr5 38924568 38924654 -113612605 + MTD LTR MaLR 295 379 0 6 882 1802 183 132 15 chr5 38930169 38930551 -113606708 + MTC LTR MaLR 1 386 -35 6 882 767 120 0 0 chr5 38933718 38933826 -113603433 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2359 3402 3295 6 882 1618 168 61 71 chr5 38953963 38954374 -113582885 - RMER17C LTR ERVK 0 410 4 7 882 3249 127 18 14 chr5 38955562 38956074 -113581185 + RLTR28 LTR ERVL 1 514 -10 7 882 983 234 130 75 chr5 38957559 38957943 -113579316 - MTD LTR MaLR -5 414 10 7 882 3938 157 124 71 chr5 38958066 38958923 -113578336 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 7 882 521 290 97 66 chr5 38960769 38961027 -113576232 - MLT1C LTR MaLR -3 464 199 7 882 1562 194 152 0 chr5 38961601 38961957 -113575302 - MTD LTR MaLR -8 411 2 7 882 1894 227 148 27 chr5 38963931 38964443 -113572816 - RMER19B LTR ERVK -13 889 316 7 882 1112 239 56 23 chr5 38965035 38965301 -113571958 + RMER19B LTR ERVK 346 620 -282 7 882 324 237 90 1 chr5 38967228 38967332 -113569927 + ORR1B1 LTR MaLR 262 394 0 7 882 1774 137 19 139 chr5 38968861 38969235 -113568024 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 882 3026 35 0 0 chr5 38969740 38970086 -113567173 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 882 398 340 94 40 chr5 38972811 38973013 -113564246 - MTD LTR MaLR -206 213 1 7 882 318 227 153 10 chr5 38974597 38974695 -113562564 - ORR1D2 LTR MaLR -127 243 132 7 882 731 263 71 110 chr5 38975501 38975838 -113561421 - MTE2a LTR MaLR -4 375 52 7 882 342 315 22 0 chr5 38975836 38975925 -113561334 - MTE2a LTR MaLR -284 95 5 7 882 254 324 166 0 chr5 38976016 38976161 -113561098 - MT2A LTR ERVL -7 526 358 7 882 581 282 180 55 chr5 38976206 38976533 -113560726 - MT2A LTR ERVL -162 371 4 7 882 396 310 105 64 chr5 38977541 38977837 -113559422 - ORR1E LTR MaLR -41 318 11 7 882 2249 150 28 6 chr5 38978068 38978111 -113559148 - MTC LTR MaLR -8 413 371 7 882 2270 128 68 8 chr5 38978111 38978480 -113558779 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 7 882 2249 150 28 6 chr5 38978480 38978799 -113558460 - MTC LTR MaLR -51 370 44 7 882 475 171 69 3 chr5 38979028 38979129 -113558130 - MTD LTR MaLR -14 405 260 7 882 2552 150 25 82 chr5 38980939 38981491 -113555768 - RLTR28 LTR ERVL -3 521 1 7 882 1218 232 24 86 chr5 38988699 38988824 -113548435 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 471 7 882 1218 241 72 90 chr5 38988969 38989327 -113547932 - RLTR20B3 LTR ERVK -107 470 13 7 882 3306 101 2 37 chr5 38989616 38990108 -113547151 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 882 226 289 219 15 chr5 38990916 38991053 -113546206 - RMER5 LTR ERV1 -14 520 356 7 882 806 281 74 18 chr5 38992408 38992691 -113544568 - RMER5 LTR ERV1 -197 337 39 7 882 380 297 147 65 chr5 38995100 38995543 -113541716 - ERVL-E-int LTR ERVL -2383 3284 2806 7 882 296 293 37 0 chr5 38996287 38996369 -113540890 - MLT2B2 LTR ERVL -55 507 423 7 882 2055 126 29 0 chr5 38996621 38996931 -113540328 + ORR1B1 LTR MaLR 75 393 -1 7 882 407 136 15 0 chr5 38998524 38998590 -113538669 + ORR1C1 LTR MaLR 1 67 -311 7 882 296 145 0 98 chr5 38998591 38998652 -113538607 + RMER17A2 LTR ERVK 1 55 -851 7 882 401 64 0 0 chr5 38998652 38998699 -113538560 - MERVK26-int LTR ERVK -4436 2483 2437 7 882 2428 77 3 6 chr5 38998697 38999010 -113538249 - MERVK26-int LTR ERVK -4665 2254 1943 7 882 714 131 10 0 chr5 38999006 38999105 -113538154 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7169 -237 7 882 1067 195 235 9 chr5 38999108 38999444 -113537815 + RLTR13D6 LTR ERVK 126 537 -365 7 882 534 40 25 62 chr5 38999444 38999524 -113537735 + ETnERV2-int LTR ERVK 7329 7405 -1 7 882 2099 152 17 47 chr5 38999524 38999946 -113537313 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 7 882 463 37 0 0 chr5 38999946 39000000 -113537259 - MERVK26-int LTR ERVK -4966 1953 1900 7 882 2045 75 83 0 chr5 39000001 39000279 -113536980 - MERVK26-int LTR ERVK -5021 1898 1598 1 882 1546 150 60 23 chr5 39000284 39000585 -113536674 + ORR1C1 LTR MaLR 59 370 -8 2 882 580 131 0 10 chr5 39001017 39001117 -113536142 + ORR1B2 LTR MaLR 269 367 0 3 882 1505 303 87 67 chr5 39001426 39001970 -113535289 + RMER15-int LTR ERVL 152 710 -4289 4 882 1505 303 87 67 chr5 39002119 39002537 -113534722 + RMER15-int LTR ERVL 711 1134 -3865 4 882 755 330 58 66 chr5 39002645 39003209 -113534050 + RMER15-int LTR ERVL 1309 1868 -3131 4 882 359 267 98 46 chr5 39003596 39003749 -113533510 + RMER15-int LTR ERVL 2298 2458 -2541 4 882 267 195 104 0 chr5 39004323 39004400 -113532859 - MT2B LTR ERVL -366 235 151 7 882 3257 37 37 0 chr5 39008123 39008505 -113528754 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 882 1167 215 114 24 chr5 39009535 39009869 -113527390 + ORR1D2 LTR MaLR 1 364 -6 1 882 547 158 42 10 chr5 39010577 39010724 -113526535 + MT2B LTR ERVL 1 157 -376 1 882 2752 72 5 18 chr5 39013827 39014223 -113523036 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 6 1 882 2807 73 1356 28 chr5 39015861 39015919 -113521340 + RMER6C LTR ERVK 111 136 -554 2 882 1985 148 153 16 chr5 39015919 39016297 -113520962 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 2 882 2807 118 34 87 chr5 39016297 39016882 -113520377 + RMER6C LTR ERVK 137 690 0 2 882 251 188 84 28 chr5 39019675 39019746 -113517513 - RMER4B LTR ERVK -127 458 384 3 882 4788 175 51 32 chr5 39019760 39020697 -113516562 - RodERV21-int LTR ERV1 -818 4173 3219 3 882 593 220 47 135 chr5 39020786 39021001 -113516258 - MTC-int LTR MaLR -590 668 473 3 882 1043 227 106 8 chr5 39021001 39021115 -113516144 - RodERV21-int LTR ERV1 -4733 258 144 3 882 1043 227 106 8 chr5 39021144 39021264 -113515995 - RodERV21-int LTR ERV1 -4848 143 2 3 882 1308 111 158 0 chr5 39028871 39029105 -113508154 + ORR1A4 LTR MaLR 44 314 -15 4 882 636 251 51 81 chr5 39029775 39030009 -113507250 + RMER15 LTR ERVL 336 562 -13 5 882 598 233 19 76 chr5 39030717 39031055 -113506204 - RMER5 LTR ERV1 -67 467 58 5 882 591 366 72 26 chr5 39031354 39031627 -113505632 + RMER15-int LTR ERVL 200 490 -4509 5 882 591 366 72 26 chr5 39031816 39031848 -113505411 + RMER15-int LTR ERVL 491 518 -4481 5 882 2898 160 104 26 chr5 39031848 39032387 -113504872 + RMER4B LTR ERVK 5 585 0 5 882 7995 145 43 44 chr5 39032413 39033853 -113503406 + MurERV4-int LTR ERVK 38 1475 -3785 5 882 849 285 16 77 chr5 39033860 39034301 -113502958 + BGLII_B LTR ERVK 1 414 -27 5 882 7061 138 52 4 chr5 39034331 39035454 -113501805 + MurERV4-int LTR ERVK 1482 2658 -2602 5 882 1951 190 60 36 chr5 39035465 39036119 -113501140 - RMER6A LTR ERVK -11 679 1 6 882 11665 138 26 14 chr5 39036119 39036144 -113501115 + MurERV4-int LTR ERVK 2653 2676 -2584 5 882 11665 138 26 14 chr5 39036325 39037379 -113499880 + MurERV4-int LTR ERVK 2677 3749 -1511 5 882 11665 138 26 14 chr5 39037528 39038341 -113498918 + MurERV4-int LTR ERVK 3750 4569 -691 5 882 3137 160 169 79 chr5 39038341 39039168 -113498091 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 6 882 3791 139 5 2 chr5 39039168 39039745 -113497514 + MurERV4-int LTR ERVK 4564 5142 -118 5 882 1013 248 70 29 chr5 39040240 39040552 -113496707 + RMER15-int LTR ERVL 4148 4472 -527 5 882 1038 244 129 35 chr5 39040555 39040895 -113496364 + MTEa LTR MaLR 8 379 0 6 882 914 251 83 73 chr5 39040895 39041196 -113496063 + RMER15-int LTR ERVL 4463 4766 -233 5 882 359 231 106 53 chr5 39041441 39041592 -113495667 + RLTR14 LTR ERV1 224 382 0 6 882 1542 224 72 32 chr5 39042270 39042744 -113494515 + RMER5 LTR ERV1 33 525 -9 6 882 977 168 68 231 chr5 39044206 39044664 -113492595 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 1 6 882 1628 184 9 25 chr5 39046559 39046883 -113490376 - RMER20B LTR ERVK -308 319 1 7 882 566 245 127 16 chr5 39046883 39047165 -113490094 + ORR1E LTR MaLR 6 362 -8 7 882 2390 107 3 0 chr5 39049336 39049662 -113487597 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 882 699 139 0 9 chr5 39051074 39051188 -113486071 + RLTR33 LTR ERVK 175 287 -391 8 882 1782 177 11 20 chr5 39051188 39051545 -113485714 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 8 882 1011 216 143 7 chr5 39051552 39051845 -113485414 + RLTR33 LTR ERVK 283 615 -63 8 882 341 306 18 0 chr5 39052192 39052303 -113484956 + MLT1A0 LTR MaLR 146 258 -107 8 883 2013 104 32 19 chr5 39077234 39077272 -113459987 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 286 1 883 2013 104 32 19 chr5 39077413 39077689 -113459570 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 1 883 601 276 129 87 chr5 39078658 39079007 -113458252 + MLT1C LTR MaLR 6 376 -91 1 883 601 286 109 81 chr5 39079147 39079245 -113458014 + MLT1C LTR MaLR 377 496 -9 1 883 2250 144 70 38 chr5 39081475 39081559 -113455700 - MTC LTR MaLR -10 411 328 1 883 2250 144 70 38 chr5 39081759 39082071 -113455188 - MTC LTR MaLR -94 327 2 1 883 569 349 75 70 chr5 39083364 39083805 -113453454 + MLT1J LTR MaLR 9 451 -61 1 883 493 294 80 6 chr5 39084747 39084981 -113452278 + MTEa LTR MaLR 131 379 0 1 883 2045 122 38 96 chr5 39085427 39085811 -113451448 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 36 1 883 2045 122 38 96 chr5 39085970 39085982 -113451277 - ORR1B1 LTR MaLR -359 35 21 1 883 436 229 15 103 chr5 39086487 39086530 -113450729 + MT2B LTR ERVL 134 164 -437 1 883 1047 232 133 80 chr5 39088129 39088624 -113448635 + MT2A LTR ERVL 1 577 -24 1 883 830 292 41 64 chr5 39088843 39088867 -113448392 + MT2A LTR ERVL 578 601 0 1 883 257 325 108 60 chr5 39095712 39095879 -113441380 + LTR16B1 LTR ERVL 146 320 -160 1 883 863 259 194 29 chr5 39101732 39102042 -113435217 - MTE2b LTR MaLR -15 364 4 1 883 625 241 62 94 chr5 39102263 39102487 -113434772 - MLT1B LTR MaLR 0 390 174 1 883 263 236 116 80 chr5 39104783 39104921 -113432338 + ORR1E LTR MaLR 96 238 -121 1 883 257 347 107 13 chr5 39105107 39105256 -113432003 + MLT1I LTR MaLR 1 163 -248 1 883 252 250 0 0 chr5 39105355 39105411 -113431848 + MLT1I LTR MaLR 347 402 -9 1 883 2636 128 5 27 chr5 39111632 39112035 -113425224 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 883 2855 158 41 16 chr5 39114805 39115320 -113421939 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 883 4315 106 13 3 chr5 39117923 39118518 -113418741 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 1 883 794 273 123 47 chr5 39128555 39128920 -113408339 + MTD LTR MaLR 11 403 -16 1 883 1792 158 68 58 chr5 39129551 39129948 -113407311 + MTD LTR MaLR 10 410 -9 1 883 4617 86 33 47 chr5 39140797 39141556 -113395703 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1053 1800 -48 2 883 2555 148 86 12 chr5 39144097 39144584 -113392675 + RLTR28 LTR ERVL 2 524 0 2 883 805 250 67 9 chr5 39150413 39150623 -113386636 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 149 2 883 258 296 185 7 chr5 39161374 39161520 -113375739 + MLT1E3 LTR MaLR 1 172 -452 2 883 249 243 53 0 chr5 39162075 39162161 -113375098 + MLT1E3 LTR MaLR 233 400 -67 2 883 1346 220 105 17 chr5 39168106 39168467 -113368792 - MTD LTR MaLR -14 405 13 2 883 844 305 71 29 chr5 39168551 39168902 -113368357 + MER31A LTR ERV1 41 406 -79 2 883 226 288 0 59 chr5 39170226 39170311 -113366948 + MTEb LTR MaLR 282 361 -18 2 883 354 350 122 72 chr5 39171404 39171749 -113365510 + MLT1J LTR MaLR 129 490 -22 2 884 469 156 104 0 chr5 39190714 39190810 -113346449 + MTD LTR MaLR 3 108 -276 2 884 493 194 238 16 chr5 39191104 39191230 -113346029 + MTD LTR MaLR 196 349 -70 2 884 654 209 19 45 chr5 39191208 39191363 -113345896 + ORR1B2 LTR MaLR 27 177 -190 2 884 751 292 200 3 chr5 39191395 39191447 -113345812 + MT2A LTR ERVL 186 237 -296 2 884 751 292 200 3 chr5 39191640 39191872 -113345387 + MT2A LTR ERVL 238 525 -8 2 884 365 310 48 101 chr5 39192078 39192353 -113344906 + ORR1E LTR MaLR 1 296 -83 2 884 242 350 65 32 chr5 39194484 39194608 -113342651 - MLT1F1 LTR MaLR -128 441 314 2 884 1188 342 98 60 chr5 39194668 39195321 -113341938 + MER21B LTR ERV1 149 826 -37 2 884 479 291 111 75 chr5 39200863 39201213 -113336046 + MLT1A0 LTR MaLR 4 408 0 3 884 1716 184 49 57 chr5 39209831 39210218 -113327041 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 884 542 261 51 80 chr5 39212354 39212529 -113324730 + MTE2a LTR MaLR 1 170 -209 3 884 485 296 122 10 chr5 39212835 39213040 -113324219 + MLT1C LTR MaLR 1 228 -239 3 884 1596 193 102 9 chr5 39213042 39213376 -113323883 + ORR1D1 LTR MaLR 10 374 0 3 884 335 235 18 105 chr5 39213421 39213485 -113323774 + MLT1C LTR MaLR 287 349 -41 3 884 2556 169 69 40 chr5 39213485 39214033 -113323226 + RLTR12A LTR ERVK 1 564 -4 3 884 335 235 18 105 chr5 39214033 39214082 -113323177 + MLT1C LTR MaLR 350 390 0 3 884 1855 93 4 37 chr5 39214972 39215241 -113322018 + ORR1A2 LTR MaLR 1 260 -67 3 884 229 224 36 84 chr5 39215433 39215516 -113321743 - MER73 LTR ERVL -27 617 539 3 884 517 221 128 76 chr5 39216316 39216527 -113320732 - MLT1B LTR MaLR -168 222 1 3 884 1153 255 69 26 chr5 39230469 39230819 -113306440 - MTE2a LTR MaLR -2 377 13 3 884 550 277 51 64 chr5 39235991 39236303 -113300956 + RMER17C LTR ERVK 77 384 -26 3 884 687 241 83 25 chr5 39237945 39238149 -113299110 - MTD LTR MaLR -2 417 202 3 884 454 248 40 13 chr5 39238253 39238404 -113298855 - MTD LTR MaLR -252 167 13 3 884 1384 276 43 33 chr5 39239928 39240444 -113296815 + RMER5 LTR ERV1 5 525 -9 3 884 1034 205 150 84 chr5 39243941 39244287 -113292972 - MTE2b LTR MaLR 0 379 11 3 884 290 98 0 0 chr5 39244573 39244614 -113292645 - MTE2a LTR MaLR -47 332 292 3 884 260 328 31 147 chr5 39244829 39245122 -113292137 + MTEa LTR MaLR 107 365 -14 3 884 1437 233 75 6 chr5 39246194 39246543 -113290716 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 3 884 2690 111 29 51 chr5 39248595 39249120 -113288139 - RLTR28 LTR ERVL -11 513 1 3 884 839 341 20 9 chr5 39249122 39249465 -113287794 + MLT1A0 LTR MaLR 18 364 -1 3 884 494 278 137 58 chr5 39251034 39251378 -113285881 + MLT1C LTR MaLR 53 423 -44 3 884 338 339 8 8 chr5 39252277 39252399 -113284860 - MTEb LTR MaLR 0 379 258 3 884 247 391 86 9 chr5 39254311 39254533 -113282726 - LTR33 LTR ERVL -247 268 30 3 884 826 232 263 14 chr5 39258048 39258373 -113278886 - MTD LTR MaLR 0 419 6 3 884 908 234 81 73 chr5 39268888 39269271 -113267988 - MLT1B LTR MaLR 0 390 5 3 884 831 218 11 28 chr5 39275133 39275312 -113261947 + ORR1B1 LTR MaLR 246 421 0 4 884 5562 165 65 66 chr5 39275311 39276667 -113260592 + ORR1B1-int LTR MaLR 2 1356 -607 4 884 1331 170 19 31 chr5 39276652 39276913 -113260346 + ORR1B1 LTR MaLR 129 386 -8 4 884 231 283 60 26 chr5 39278575 39278691 -113258568 + MLT1C LTR MaLR 1 120 -347 4 884 275 272 100 93 chr5 39278826 39278976 -113258283 + MLT1C LTR MaLR 211 463 -4 4 884 1234 244 23 68 chr5 39279830 39280214 -113257045 - MTEa LTR MaLR -4 355 1 4 884 2070 100 6 9 chr5 39281948 39282248 -113255011 + RMER17A LTR ERVK 1 301 -450 4 884 2070 160 48 51 chr5 39282381 39282636 -113254623 + RMER17A LTR ERVK 302 654 -97 4 884 1283 169 54 56 chr5 39282668 39282767 -113254492 + RMER17A LTR ERVK 655 750 -1 4 884 277 308 4 18 chr5 39284125 39284244 -113253015 + MTEb LTR MaLR 253 369 -1 4 884 377 329 131 42 chr5 39284931 39285402 -113251857 + MLT2B1 LTR ERVL 13 555 -1 4 884 1169 243 56 21 chr5 39287417 39287757 -113249502 + ORR1E LTR MaLR 4 355 -4 4 884 1256 251 55 22 chr5 39289090 39289457 -113247802 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 4 884 351 355 52 6 chr5 39291542 39291715 -113245544 - MLT1D LTR MaLR -76 429 249 4 884 235 257 61 87 chr5 39291887 39292002 -113245257 - MLT1D LTR MaLR -302 203 92 4 884 1649 152 8 114 chr5 39292049 39292436 -113244823 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 4 884 583 270 79 138 chr5 39292558 39292936 -113244323 - RMER20B LTR ERVK -38 589 234 4 884 591 284 25 30 chr5 39294041 39294244 -113243015 + MLT1H LTR MaLR 13 214 -335 4 884 374 337 84 56 chr5 39296638 39296996 -113240263 + LTR78 LTR ERV1 3 370 -934 4 884 234 308 44 61 chr5 39297149 39297263 -113239996 + LTR78 LTR ERV1 469 580 -724 4 884 800 308 66 61 chr5 39316767 39317023 -113220236 - MLT1C LTR MaLR -40 427 151 4 884 800 308 66 61 chr5 39317197 39317208 -113220051 - MLT1C LTR MaLR -317 150 150 4 884 800 308 66 61 chr5 39317236 39317388 -113219871 - MLT1C LTR MaLR -317 150 1 4 884 1269 258 14 121 chr5 39317646 39318066 -113219193 + MTEb LTR MaLR 5 379 0 4 884 4048 185 55 39 chr5 39318863 39319753 -113217506 + RMER13B LTR ERVK 1 904 -4 4 885 2161 136 35 0 chr5 39321622 39321967 -113215292 + RMER19A LTR ERVK 2 358 -379 4 885 2446 133 5 13 chr5 39322361 39322756 -113214503 + RMER19A LTR ERVK 346 737 0 4 885 418 273 102 0 chr5 39329274 39329402 -113207857 + MTEa LTR MaLR 1 141 -238 4 885 1809 193 20 6 chr5 39334319 39334673 -113202586 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 4 885 382 194 0 0 chr5 39339211 39339283 -113197976 - MTEb LTR MaLR -1 378 307 4 885 4358 110 3 2 chr5 39343791 39344391 -113192868 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 5 885 668 258 21 16 chr5 39346365 39346554 -113190705 - MTEb LTR MaLR -60 319 130 5 885 1587 193 90 3 chr5 39346993 39347336 -113189923 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 5 885 319 388 62 59 chr5 39354520 39354761 -113182498 + ORR1E LTR MaLR 1 243 -116 5 885 2001 94 31 99 chr5 39354761 39355114 -113182145 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 885 319 388 62 59 chr5 39355114 39355176 -113182083 + ORR1E LTR MaLR 244 305 -54 5 885 3411 45 0 0 chr5 39355176 39355572 -113181687 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 885 289 365 54 44 chr5 39356287 39356582 -113180677 - LTR16C LTR ERVL -41 448 151 5 885 239 388 37 21 chr5 39358680 39358867 -113178392 + LTR16A LTR ERVL 1 190 -261 5 885 361 198 22 44 chr5 39358962 39359052 -113178207 + MLT1B LTR MaLR 50 137 -253 5 885 273 324 102 23 chr5 39359488 39359665 -113177594 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2394 2584 -3130 5 885 962 255 158 25 chr5 39360989 39361351 -113175908 - MTD LTR MaLR 0 419 10 5 885 507 315 92 32 chr5 39363850 39364165 -113173094 - MLT1D LTR MaLR -72 433 100 5 885 333 250 63 27 chr5 39365126 39365237 -113172022 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 282 5 885 3344 104 2 37 chr5 39368894 39369384 -113167875 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 473 -2 5 885 284 289 10 10 chr5 39376889 39376987 -113160272 + MTEb LTR MaLR 1 98 -281 5 885 635 295 85 12 chr5 39383218 39383465 -113153794 + MTEb LTR MaLR 102 366 -13 5 885 337 370 23 103 chr5 39385806 39386107 -113151152 - ORR1E LTR MaLR -42 317 41 5 885 265 333 204 25 chr5 39387028 39387385 -113149874 + MLT1C LTR MaLR 43 463 -4 5 885 312 357 113 21 chr5 39397863 39398049 -113139210 - MLT1C LTR MaLR -79 388 186 5 885 4360 12 12 0 chr5 39401207 39401694 -113135565 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 885 469 277 8 0 chr5 39404559 39404678 -113132581 + MER67A LTR ERV1 34 153 -390 5 885 2809 56 12 0 chr5 39405043 39405385 -113131874 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 885 310 291 95 47 chr5 39411861 39412006 -113125253 + MER67A LTR ERV1 327 478 -65 5 885 1834 218 50 8 chr5 39412006 39412408 -113124851 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 885 608 320 84 60 chr5 39412660 39412846 -113124413 - MTE2a LTR MaLR 0 379 185 5 885 608 320 84 60 chr5 39412880 39413062 -113124197 - MTE2a LTR MaLR -195 184 2 5 885 783 308 53 73 chr5 39414637 39415033 -113122226 + MLT1B LTR MaLR 1 388 -2 5 885 1203 255 84 41 chr5 39415078 39415363 -113121896 + ORR1E LTR MaLR 1 312 -47 5 885 1203 255 84 41 chr5 39415796 39415854 -113121405 + ORR1E LTR MaLR 313 358 -1 5 885 357 333 23 47 chr5 39416439 39416568 -113120691 + MLT1G3 LTR MaLR 209 334 -261 6 885 251 310 159 2 chr5 39416711 39416816 -113120443 + MLT1G3 LTR MaLR 396 521 -74 6 885 2028 148 63 9 chr5 39433345 39433693 -113103566 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 885 707 313 61 12 chr5 39433757 39434003 -113103256 - MLT1E2 LTR MaLR -23 604 347 6 885 227 308 76 9 chr5 39434250 39434355 -113102904 - MLT1E2 LTR MaLR -423 201 90 6 885 496 241 152 0 chr5 39434363 39434515 -113102744 - MTD LTR MaLR 0 419 244 6 885 699 242 31 62 chr5 39434728 39434956 -113102303 - MTD LTR MaLR -157 262 5 6 885 1044 294 32 43 chr5 39438990 39439335 -113097924 - ORR1E LTR MaLR -4 355 15 6 885 422 288 111 6 chr5 39439493 39439670 -113097589 - ORR1E-int LTR MaLR -39 1541 1326 6 885 409 397 53 35 chr5 39439666 39440042 -113097217 - ORR1E-int LTR MaLR -169 1411 1029 6 885 423 329 25 12 chr5 39440122 39440282 -113096977 - MLT1D LTR MaLR -263 242 81 6 885 626 323 34 96 chr5 39442564 39442735 -113094524 + MTD LTR MaLR 43 208 -211 6 885 626 323 34 96 chr5 39442880 39443030 -113094229 + MTD LTR MaLR 209 344 -75 6 885 423 337 70 100 chr5 39443063 39443432 -113093827 - LTR81B LTR ERV1? -1009 384 27 6 885 313 236 225 9 chr5 39452379 39452490 -113084769 + MuRRS4-int LTR ERV1 1012 1146 -4171 6 886 374 288 34 26 chr5 39452832 39453005 -113084254 + MuRRS4-int LTR ERV1 2344 2496 -2567 6 886 468 305 39 0 chr5 39453027 39453155 -113084104 + MLT-int LTR MaLR 336 468 -1267 6 886 530 275 188 0 chr5 39454028 39454166 -113083093 + MTD LTR MaLR 111 274 -145 6 886 568 355 93 25 chr5 39456729 39457085 -113080174 + MLT1A1 LTR MaLR 26 405 -3 6 886 228 333 0 0 chr5 39457497 39457569 -113079690 - MLT1F1 LTR MaLR -9 560 489 6 886 228 365 12 12 chr5 39457782 39457868 -113079391 - MLT1F1 LTR MaLR -505 86 1 6 886 1718 199 75 31 chr5 39460761 39461119 -113076140 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 886 833 246 31 10 chr5 39465396 39465589 -113071670 + MTE2b LTR MaLR 1 197 -182 6 886 1976 181 10 78 chr5 39466174 39466259 -113071000 + ORR1C1 LTR MaLR 1 82 -296 6 886 1976 181 10 78 chr5 39466417 39466727 -113070532 + ORR1C1 LTR MaLR 83 369 -9 6 886 490 242 223 22 chr5 39466722 39466946 -113070313 + MTD LTR MaLR 151 419 0 6 886 1586 149 78 111 chr5 39468689 39469113 -113068146 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 886 370 259 22 24 chr5 39470538 39470657 -113066602 - MLT1C LTR MaLR -53 414 289 6 886 343 309 47 51 chr5 39470905 39471120 -113066139 - MLT1C LTR MaLR -173 217 4 6 886 387 378 94 16 chr5 39472929 39473174 -113064085 - MLT1E1A LTR MaLR -131 549 286 6 886 585 320 83 43 chr5 39473700 39474026 -113063233 - MLT1B LTR MaLR -42 348 10 6 886 1539 244 116 49 chr5 39484490 39485016 -113052243 - RMER4B LTR ERVK -8 577 17 6 886 234 340 30 55 chr5 39485525 39485690 -113051569 + MER110A LTR ERV1 289 449 -19 6 886 596 309 57 26 chr5 39489866 39490095 -113047164 + MTE2b LTR MaLR 43 278 -101 6 886 881 282 98 21 chr5 39490684 39491073 -113046186 + MLT1D LTR MaLR 3 381 -124 6 886 397 330 139 10 chr5 39494129 39494331 -113042928 - MLT1C LTR MaLR -26 441 214 7 886 229 266 218 0 chr5 39494346 39494470 -113042789 - MLT1C LTR MaLR -343 162 12 7 886 578 279 137 79 chr5 39494471 39494814 -113042445 + MTE2a LTR MaLR 3 365 -14 7 886 1018 233 103 44 chr5 39496791 39496975 -113040284 - RLTR14 LTR ERV1 -44 338 142 7 886 2565 169 34 5 chr5 39496975 39497384 -113039875 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 886 1018 233 103 44 chr5 39497384 39497518 -113039741 - RLTR14 LTR ERV1 -241 141 1 7 886 279 306 68 31 chr5 39498099 39498261 -113038998 - MER65-int LTR ERV1 -92 4779 4612 7 886 383 365 89 43 chr5 39499069 39499438 -113037821 - RMER15-int LTR ERVL -2775 2224 1839 7 886 360 315 196 45 chr5 39500818 39501191 -113036068 - MLT1H LTR MaLR -2 487 99 2 886 254 400 62 54 chr5 39505077 39505260 -113031999 - LTR16C LTR ERVL -80 409 217 1 886 254 400 62 54 chr5 39505398 39505586 -113031673 - LTR16C LTR ERVL -273 216 35 1 886 1045 257 112 14 chr5 39510877 39511153 -113026106 - MTEa LTR MaLR -67 312 10 2 886 538 306 16 29 chr5 39511157 39511365 -113025894 + MLT1A0 LTR MaLR 118 426 -41 3 886 1283 277 67 6 chr5 39527364 39527705 -113009554 - MTD LTR MaLR -50 369 8 4 886 1673 251 51 8 chr5 39537929 39538318 -112998941 + MTD LTR MaLR 14 419 0 5 886 254 466 32 5 chr5 39540111 39540301 -112996958 - LTR16A LTR ERVL -195 256 62 6 886 234 236 81 27 chr5 39540689 39540763 -112996496 - LTR16A LTR ERVL -395 85 8 6 886 493 364 47 54 chr5 39540943 39541239 -112996020 + ORR1E LTR MaLR 1 294 -65 6 886 1475 281 155 52 chr5 39541239 39541340 -112995919 + MTE-int LTR MaLR 361 451 -1129 6 886 1475 281 155 52 chr5 39541531 39542211 -112995048 + MTE-int LTR MaLR 452 1222 -358 6 886 318 384 57 38 chr5 39546587 39546798 -112990461 + MLT2E LTR ERVL 227 441 -187 7 886 591 268 142 92 chr5 39547848 39548185 -112989074 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 7 886 1177 332 132 34 chr5 39548185 39548787 -112988472 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 864 7 886 235 337 114 45 chr5 39561257 39561459 -112975800 - MLT1K LTR MaLR -49 546 331 8 886 1234 263 45 92 chr5 39570484 39571041 -112966218 - MT2A LTR ERVL 0 533 3 9 886 877 241 10 20 chr5 39576067 39576270 -112960989 + MTE2a LTR MaLR 179 379 0 1 886 2704 313 126 17 chr5 39576270 39577378 -112959881 - MTEa-int LTR MaLR -322 1258 28 1 886 694 286 126 45 chr5 39577400 39577623 -112959636 - MTEa LTR MaLR -12 367 127 1 886 376 331 21 7 chr5 39577696 39577836 -112959423 + MLT1A1 LTR MaLR 267 408 0 1 886 551 355 65 70 chr5 39581725 39582128 -112955131 + MLT1C LTR MaLR 1 401 -66 1 887 2442 54 193 0 chr5 39595891 39596223 -112941036 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 887 8376 69 8 1 chr5 39596223 39597313 -112939946 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 887 3257 51 2 0 chr5 39597315 39597708 -112939551 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 1 887 298 339 44 50 chr5 39597813 39597993 -112939266 - MLT1B LTR MaLR -2 388 210 1 887 1345 284 40 17 chr5 39607292 39607643 -112929616 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 887 655 239 112 63 chr5 39609155 39609500 -112927759 + MTD LTR MaLR 14 419 0 1 887 236 296 52 61 chr5 39609887 39610002 -112927257 + MLT1C LTR MaLR 4 117 -350 1 887 762 317 73 35 chr5 39613299 39613668 -112923591 + MLT1B LTR MaLR 4 386 -4 1 887 3011 33 0 6 chr5 39616074 39616413 -112920846 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 887 57216 21 8 7 chr5 39616413 39622876 -112914383 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 1 887 3000 36 0 6 chr5 39622876 39623215 -112914044 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 887 4477 148 113 21 chr5 39630435 39631249 -112906010 + RMER19B LTR ERVK 2 890 -12 1 887 1596 162 21 100 chr5 39640123 39640595 -112896664 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 1 887 1146 162 37 32 chr5 39645696 39645913 -112891346 - MTC LTR MaLR -203 218 1 1 887 1785 179 83 25 chr5 39645916 39646323 -112890936 - MTC-int LTR MaLR -3 1255 825 1 887 1031 166 286 11 chr5 39646319 39646576 -112890683 - MTC LTR MaLR -33 388 61 1 887 745 322 89 11 chr5 39652600 39652961 -112884298 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 6 1 887 799 288 16 144 chr5 39653914 39654344 -112882915 - MTE2a LTR MaLR 0 379 5 1 887 789 312 44 112 chr5 39655033 39655444 -112881815 + MTC LTR MaLR 20 402 -19 1 887 287 232 29 0 chr5 39655460 39655529 -112881730 + MLT1E1A LTR MaLR 174 244 -436 2 887 414 316 129 82 chr5 39657290 39657593 -112879666 - ORR1E LTR MaLR -4 355 39 2 887 379 316 0 0 chr5 39657703 39657801 -112879458 - MTE-int LTR MaLR -34 1546 1449 2 887 487 311 198 9 chr5 39657815 39658042 -112879217 - MTE-int LTR MaLR -249 1331 1062 2 887 1033 317 38 15 chr5 39658051 39658394 -112878865 + ORR1E LTR MaLR 1 351 -8 2 887 697 293 73 21 chr5 39658415 39658649 -112878610 + ORR1E-int LTR MaLR 18 263 -1317 2 887 909 326 124 14 chr5 39658978 39659342 -112877917 - MTC LTR MaLR 0 421 18 2 887 1049 268 45 118 chr5 39659370 39659751 -112877508 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 2 887 1059 101 62 12 chr5 39662579 39662740 -112874519 + MTB LTR MaLR 232 400 0 2 887 242 339 35 9 chr5 39666259 39666375 -112870884 + MLT1F1 LTR MaLR 371 489 -80 2 887 265 369 65 77 chr5 39667251 39667512 -112869747 - LTR16E1 LTR ERVL -40 498 241 2 887 764 262 84 14 chr5 39668705 39668918 -112868341 + MTD LTR MaLR 1 228 -191 2 887 386 283 92 6 chr5 39668987 39669161 -112868098 + MTD LTR MaLR 231 419 0 2 887 2274 261 117 74 chr5 39669161 39670367 -112866892 + MTD-int LTR MaLR 1 1258 0 2 887 279 279 0 0 chr5 39670419 39670480 -112866779 - MTE2b LTR MaLR -309 70 10 2 887 260 298 152 18 chr5 39671029 39671200 -112866059 - MLT1C LTR MaLR -128 339 146 2 887 240 320 107 20 chr5 39672685 39672835 -112864424 + MER68 LTR ERVL 126 288 -275 2 887 1010 330 41 72 chr5 39680457 39680973 -112856286 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 33 2 887 672 347 83 15 chr5 39681952 39682291 -112854968 - MLT1C LTR MaLR -72 395 34 2 887 588 288 128 24 chr5 39683220 39683486 -112853773 + MLT1E2 LTR MaLR 83 352 -275 2 887 663 233 3 23 chr5 39686246 39686445 -112850814 + MTD LTR MaLR 8 204 -203 2 887 783 241 58 10 chr5 39687859 39688064 -112849195 + MTD LTR MaLR 196 410 -9 2 887 1073 281 98 18 chr5 39691456 39691844 -112845415 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 887 357 285 77 42 chr5 39694122 39694265 -112842994 + MLT1A0 LTR MaLR 218 365 0 2 887 689 294 102 30 chr5 39698561 39698894 -112838365 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 2 887 944 273 49 112 chr5 39699575 39700004 -112837255 + MTE2a LTR MaLR 3 419 0 2 887 308 284 80 27 chr5 39701689 39701801 -112835458 + MLT1L LTR MaLR 139 256 -354 2 887 228 320 112 10 chr5 39707128 39707226 -112830033 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 293 2 887 731 107 91 0 chr5 39714523 39714644 -112822615 + BGLII_B LTR ERVK 307 438 -3 2 888 335 345 66 6 chr5 39720485 39720651 -112816608 + LTR33 LTR ERVL 321 496 -19 2 888 1537 262 74 10 chr5 39720825 39721219 -112816040 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 888 307 340 36 122 chr5 39725468 39725689 -112811570 + MLT1K LTR MaLR 233 434 -161 3 888 461 300 127 57 chr5 39733059 39733391 -112803868 - MLT1C LTR MaLR -6 461 107 3 888 577 305 42 32 chr5 39733993 39734210 -112803049 - RMER15 LTR ERVL -45 530 312 3 888 258 354 113 27 chr5 39741506 39741692 -112795567 + LTR16B1 LTR ERVL 10 211 -269 3 888 401 343 116 65 chr5 39742573 39743063 -112794196 - LTR55 LTR ERV -11 537 23 3 888 2843 156 43 8 chr5 39747312 39747822 -112789437 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 888 1073 251 135 12 chr5 39748583 39748917 -112788342 + MTD LTR MaLR 45 419 0 3 888 1084 239 156 12 chr5 39749365 39749691 -112787568 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 888 329 266 35 44 chr5 39755769 39755883 -112781376 + MER89 LTR ERV1 415 527 -32 3 888 333 313 305 53 chr5 39756474 39756720 -112780539 - ORR1E LTR MaLR -23 356 49 3 888 616 383 47 28 chr5 39760351 39760815 -112776444 + MLT1G LTR MaLR 71 591 -4 3 888 463 313 66 84 chr5 39766323 39766536 -112770723 - MTE2a LTR MaLR -57 322 114 3 888 957 161 11 39 chr5 39769347 39769528 -112767731 - ORR1A4 LTR MaLR -61 268 93 3 888 287 288 35 113 chr5 39776800 39776941 -112760318 - MLT1A0 LTR MaLR -50 315 186 3 888 2338 189 34 12 chr5 39786277 39786689 -112750570 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 888 515 274 88 11 chr5 39790333 39790421 -112746838 + MLT1B LTR MaLR 3 100 -290 4 888 1803 186 187 98 chr5 39790421 39790982 -112746277 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 888 515 292 90 28 chr5 39790982 39791120 -112746139 + MLT1B LTR MaLR 101 235 -232 4 888 238 384 31 74 chr5 39795856 39796019 -112741240 - LTR33A_ LTR ERVL -260 271 116 4 888 881 163 104 140 chr5 39801452 39801673 -112735586 + ORR1B1 LTR MaLR 41 253 -141 4 888 704 193 47 0 chr5 39801657 39801807 -112735452 - ORR1A4-int LTR MaLR -1804 159 3 4 888 1340 159 146 38 chr5 39801813 39802101 -112735158 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 3 4 888 1980 218 88 26 chr5 39802211 39802287 -112734972 - RLTR20B2 LTR ERVK -11 566 486 4 888 2156 178 30 38 chr5 39802333 39802789 -112734470 - RLTR20B2 LTR ERVK -92 485 1 4 888 668 280 68 62 chr5 39803594 39803902 -112733357 + MTEa LTR MaLR 3 312 -67 4 888 330 341 15 15 chr5 39804215 39804346 -112732913 - ORR1E LTR MaLR -188 171 41 4 888 417 209 0 193 chr5 39805454 39805620 -112731639 - MT2B LTR ERVL -337 264 131 4 888 307 210 16 0 chr5 39809603 39809665 -112727594 + ORR1D1 LTR MaLR 1 63 -311 4 888 641 256 87 29 chr5 39810414 39810655 -112726604 + MLT1C LTR MaLR 28 282 -185 4 888 381 209 44 35 chr5 39814084 39814198 -112723061 - RMER10B LTR ERVL -56 342 228 4 888 889 272 127 57 chr5 39817691 39818045 -112719214 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 4 888 259 281 94 108 chr5 39818449 39818672 -112718587 + RMER17C LTR ERVK 127 346 -64 4 888 2104 102 41 16 chr5 39820010 39820328 -112716931 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 4 4 888 1545 288 95 27 chr5 39822039 39822595 -112714664 + MTE-int LTR MaLR 847 1440 -140 4 888 575 296 20 45 chr5 39822655 39822853 -112714406 + ORR1E LTR MaLR 10 202 -157 4 888 317 280 0 0 chr5 39822977 39823052 -112714207 + MTE-int LTR MaLR 981 1055 -525 4 888 255 324 118 0 chr5 39825916 39826018 -112711241 + ORR1E LTR MaLR 197 310 -69 4 888 3489 30 0 0 chr5 39826533 39826929 -112710330 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 888 1808 205 86 3 chr5 39830957 39831342 -112705917 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 888 2129 190 13 10 chr5 39838545 39838938 -112698321 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 888 523 286 47 5 chr5 39840760 39840950 -112696309 - MLT2B4 LTR ERVL -358 198 1 4 888 1820 222 66 3 chr5 39841410 39841789 -112695470 - MTD LTR MaLR -14 405 3 4 888 729 242 23 16 chr5 39843213 39843414 -112693845 - MLT1A0 LTR MaLR -19 371 176 4 888 407 226 130 0 chr5 39843592 39843707 -112693552 + MLT1A0 LTR MaLR 25 154 -211 4 888 513 343 32 32 chr5 39844053 39844273 -112692986 + MLT1A0 LTR MaLR 142 361 -4 4 888 232 326 20 59 chr5 39844475 39844576 -112692683 - LTR16E1 LTR ERVL -11 527 431 4 889 1105 287 77 16 chr5 39845909 39846288 -112690971 + MTD LTR MaLR 18 419 0 4 889 1329 265 103 21 chr5 39860821 39861199 -112676060 + MTD LTR MaLR 11 419 0 5 889 347 282 9 28 chr5 39863220 39863326 -112673933 + MTEb LTR MaLR 1 104 -275 5 889 817 266 45 0 chr5 39863458 39863657 -112673602 + MTEb LTR MaLR 154 361 -18 5 889 676 273 91 25 chr5 39868383 39868747 -112668512 - MLT1B LTR MaLR -2 388 1 5 889 260 314 46 28 chr5 39877516 39877624 -112659635 + MLT1K LTR MaLR 438 547 -48 5 889 350 172 0 0 chr5 39877625 39877689 -112659570 + MT2A LTR ERVL 3 66 -467 5 889 550 212 126 22 chr5 39877726 39877861 -112659398 + MT2A LTR ERVL 316 464 -69 5 889 241 362 58 13 chr5 39881393 39881547 -112655712 + LTR84a LTR ERVL 431 591 -166 5 889 378 343 43 23 chr5 39901446 39901632 -112635627 - MLT1E1A LTR MaLR -1 679 461 5 889 2668 34 12 3 chr5 39908446 39908770 -112628489 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 5 889 254 323 107 54 chr5 39914211 39914364 -112622895 + MLT1J2 LTR MaLR 48 246 -266 5 889 1147 294 43 9 chr5 39915622 39915985 -112621274 + MTE2b LTR MaLR 1 359 0 5 889 408 389 60 31 chr5 39916193 39916501 -112620758 - MLT1H1 LTR MaLR -220 335 35 5 889 4276 89 3 2 chr5 39917076 39917659 -112619600 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 5 889 1283 255 23 73 chr5 39918597 39918995 -112618264 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 5 889 2458 189 95 26 chr5 39923857 39924404 -112612855 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 6 889 623 275 73 149 chr5 39926153 39926563 -112610696 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 889 538 318 81 65 chr5 39929057 39929345 -112607914 + MLT1F2 LTR MaLR 273 654 -26 6 889 1849 172 47 53 chr5 39933046 39933426 -112603833 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 889 2968 69 10 18 chr5 39939779 39940178 -112597081 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 889 610 301 182 69 chr5 39946204 39946639 -112590620 - MLT1D LTR MaLR 0 505 22 6 889 412 310 150 76 chr5 39946904 39947218 -112590041 + MTEa LTR MaLR 1 337 -42 6 889 1714 181 59 51 chr5 39953881 39954254 -112583005 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 1 6 889 484 256 80 18 chr5 39954777 39954940 -112582319 + MLT1B LTR MaLR 9 181 -209 6 889 1697 232 18 192 chr5 39959704 39960440 -112576819 - RMER19C LTR ERVK -3 608 1 6 889 599 345 96 20 chr5 39960905 39961248 -112576011 - MLT1B LTR MaLR -2 388 20 6 889 2154 217 47 29 chr5 39963513 39964026 -112573233 + RLTR11A LTR ERVK 7 528 0 6 889 2106 120 9 25 chr5 39965509 39965833 -112571426 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 889 4438 183 89 20 chr5 39965837 39966853 -112570406 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1086 -877 6 890 580 322 125 26 chr5 39977664 39977976 -112559283 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 19 6 890 246 286 176 22 chr5 39981367 39981503 -112555756 - MLT1A LTR MaLR -216 158 2 6 890 1179 73 44 17 chr5 39984259 39984440 -112552819 - MTA_Mm LTR MaLR -210 186 1 6 890 3101 61 0 45 chr5 39988696 39989122 -112548137 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 890 7864 40 17 1 chr5 39989912 39990913 -112546346 - MT-int LTR MaLR -71 1027 20 6 890 264 346 92 0 chr5 39992870 39993000 -112544259 + LTR55 LTR ERV 88 229 -319 6 890 458 143 39 48 chr5 39993330 39993433 -112543826 - MTEb LTR MaLR -2 377 276 6 890 348 260 94 51 chr5 39993400 39993538 -112543721 - MTEb LTR MaLR -219 160 17 6 890 1157 255 108 15 chr5 39994583 39994917 -112542342 + ORR1D2 LTR MaLR 1 365 -5 6 890 494 339 66 84 chr5 39995459 39995852 -112541407 - MER21B LTR ERV1 -66 797 412 6 890 339 295 18 37 chr5 39997343 39997452 -112539807 + MLT1F LTR MaLR 6 112 -436 6 890 339 300 165 0 chr5 39998317 39998487 -112538772 - MLT1E LTR MaLR -24 629 432 6 890 473 329 14 14 chr5 39998686 39998831 -112538428 - MLT1E LTR MaLR -506 147 3 6 890 250 308 98 0 chr5 40000464 40000607 -112536652 - LTR16A1 LTR ERVL -81 375 219 2 890 3266 90 9 22 chr5 40009689 40010142 -112527117 - LTRIS5 LTR ERV1 0 447 1 1 890 477 328 34 45 chr5 40017222 40017490 -112519769 + MLT1A LTR MaLR 48 312 -62 2 890 547 245 33 56 chr5 40044689 40044887 -112492372 + MLT1C LTR MaLR 197 449 -18 5 890 654 321 94 47 chr5 40045162 40045695 -112491564 - MLT1F2 LTR MaLR -2 558 1 5 890 1152 266 42 65 chr5 40050087 40050473 -112486786 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 6 890 383 319 24 24 chr5 40051579 40051743 -112485516 + MLT1F2 LTR MaLR 343 506 -54 6 890 2217 216 22 75 chr5 40052305 40052729 -112484530 - RLTR18B LTR ERVK -3 509 108 6 890 2217 216 22 75 chr5 40053149 40053259 -112484000 - RLTR18B LTR ERVK -405 107 3 6 890 4558 187 74 39 chr5 40053274 40054280 -112482979 - RLTR18-int LTR ERVK -10 5351 4311 6 890 4184 66 40 4 chr5 40065226 40065770 -112471489 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 7 890 1298 285 38 19 chr5 40067103 40067475 -112469784 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 8 890 3236 51 5 0 chr5 40068218 40068612 -112468647 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 890 1094 278 87 6 chr5 40069412 40069723 -112467536 + MTE2b LTR MaLR 5 340 -39 8 890 524 317 92 67 chr5 40075867 40076181 -112461078 + MLT1A0 LTR MaLR 32 353 -12 9 890 1168 309 17 6 chr5 40077895 40078250 -112459009 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 2 1 890 228 387 25 74 chr5 40079161 40079323 -112457936 - LTR16B1 LTR ERVL -94 386 233 1 890 1879 187 24 70 chr5 40086107 40086562 -112450697 - RMER10A LTR ERVL -1 441 8 1 890 572 331 76 53 chr5 40086587 40086944 -112450315 - MLT1D LTR MaLR -122 383 19 1 890 523 292 214 25 chr5 40089947 40090274 -112446985 + MTD LTR MaLR 5 404 -15 1 890 2300 189 44 33 chr5 40090916 40091292 -112445967 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 386 -141 1 890 2300 189 44 33 chr5 40091533 40091676 -112445583 + RLTR11A2 LTR ERVK 387 527 0 1 890 285 315 61 72 chr5 40091692 40091873 -112445386 - MER73 LTR ERVL -104 540 362 1 890 743 332 43 25 chr5 40091887 40092168 -112445091 - MER73 LTR ERVL -351 293 8 1 890 305 360 93 27 chr5 40099634 40099891 -112437368 + MLT1E2 LTR MaLR 146 419 -208 1 890 722 362 9 18 chr5 40099987 40100212 -112437047 - ORR1D2 LTR MaLR -113 257 35 1 890 370 260 37 66 chr5 40100809 40100945 -112436314 + MLT1E2 LTR MaLR 493 624 -3 1 890 255 403 67 8 chr5 40101203 40101441 -112435818 - LTR16A LTR ERVL -13 438 187 1 890 2411 187 81 138 chr5 40102001 40102366 -112434893 - RMER6C LTR ERVK 0 690 342 1 890 2411 187 81 138 chr5 40102616 40102975 -112434284 - RMER6C LTR ERVK -349 341 7 1 890 854 281 105 15 chr5 40103852 40104185 -112433074 + MLT1B LTR MaLR 28 390 0 1 890 1015 281 44 38 chr5 40104513 40104880 -112432379 - MTE2a LTR MaLR -2 377 9 1 890 344 369 49 16 chr5 40105766 40106011 -112431248 + MLT1C LTR MaLR 213 465 -2 1 891 517 327 127 29 chr5 40118627 40119005 -112418254 - MTD LTR MaLR 0 419 5 1 891 390 330 153 81 chr5 40121652 40122097 -112415162 - MLT2F LTR ERVL -1 662 186 1 891 267 381 57 63 chr5 40122415 40122715 -112414544 - MLT1J LTR MaLR -115 397 100 1 891 337 307 79 44 chr5 40125397 40125737 -112411522 - MLT1D LTR MaLR 0 505 75 1 891 753 319 101 18 chr5 40125826 40126037 -112411222 + MLT1B LTR MaLR 25 244 -146 1 891 753 319 101 18 chr5 40126100 40126226 -112411033 + MLT1B LTR MaLR 245 389 -1 1 891 976 182 119 5 chr5 40126605 40126798 -112410461 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 164 1 891 765 241 46 6 chr5 40126918 40127093 -112410166 - ORR1C1 LTR MaLR -196 182 1 1 891 259 189 88 70 chr5 40130080 40130137 -112407122 + ORR1D2 LTR MaLR 15 72 -298 1 891 2012 247 84 35 chr5 40131139 40131469 -112405790 - RMER20B LTR ERVK -18 609 256 1 891 2012 247 84 35 chr5 40131511 40131751 -112405508 - RMER20B LTR ERVK -372 255 12 1 891 1143 162 4 124 chr5 40133461 40133735 -112403524 - ORR1A4 LTR MaLR -88 241 1 1 891 306 308 77 0 chr5 40135876 40136019 -112401240 - MLT1D LTR MaLR -8 497 344 1 891 289 342 40 83 chr5 40136078 40136330 -112400929 - MLT1D LTR MaLR -259 246 6 1 891 531 175 51 26 chr5 40136824 40136941 -112400318 + RMER19C LTR ERVK 1 120 -491 1 891 260 275 73 132 chr5 40138615 40138766 -112398493 + ORR1D2 LTR MaLR 46 187 -183 1 891 1898 154 29 0 chr5 40140167 40140479 -112396780 + ORR1A2 LTR MaLR 7 327 0 1 891 7786 151 83 30 chr5 40140479 40141568 -112395691 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1194 -769 1 891 3928 111 2 16 chr5 40141568 40142143 -112395116 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 1 891 7786 151 83 30 chr5 40142143 40142690 -112394569 + ORR1A2-int LTR MaLR 1195 1724 -239 1 891 2130 192 179 8 chr5 40143312 40143832 -112393427 + RMER19C LTR ERVK 3 611 0 1 891 2056 199 34 24 chr5 40145226 40145639 -112391620 + MTC LTR MaLR 3 419 -2 2 891 971 257 45 31 chr5 40146622 40146976 -112390283 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 2 891 2178 89 86 0 chr5 40148474 40148801 -112388458 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 355 -2 2 891 665 313 110 39 chr5 40151182 40151591 -112385668 + MTE-int LTR MaLR 1107 1544 -36 2 891 1331 261 42 12 chr5 40158290 40158697 -112378562 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 891 914 320 65 69 chr5 40161728 40162204 -112375055 - MLT2B1 LTR ERVL -46 474 1 2 891 321 318 37 22 chr5 40176908 40177043 -112360216 - RMER15 LTR ERVL -15 560 424 2 891 1277 220 141 27 chr5 40177198 40177637 -112359622 + RMER19B LTR ERVK 150 673 -229 2 891 389 337 102 72 chr5 40181025 40181358 -112355901 + MLT2C1 LTR ERVL 55 397 0 2 891 1632 219 79 18 chr5 40182989 40183380 -112353879 - MTD LTR MaLR -4 415 1 2 891 1159 210 48 248 chr5 40183674 40183895 -112353364 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 221 2 891 1159 210 48 248 chr5 40183919 40184254 -112353005 - RLTR41 LTR ERV1 -226 220 1 2 891 270 367 59 34 chr5 40215533 40215865 -112321394 - ORR1E LTR MaLR -1 378 20 2 891 654 350 73 17 chr5 40216454 40216811 -112320448 + MER54A LTR ERVL 60 436 -465 2 891 634 314 111 28 chr5 40227757 40228117 -112309142 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 3 891 545 354 148 17 chr5 40234156 40234575 -112302684 - MLT1D LTR MaLR -5 500 27 3 891 229 432 90 0 chr5 40237357 40237512 -112299747 + LTR33 LTR ERVL 10 178 -337 3 892 2071 206 30 8 chr5 40243470 40243867 -112293392 + MTC LTR MaLR 8 413 -8 3 892 1020 292 120 19 chr5 40243942 40244308 -112292951 - MTD LTR MaLR -14 405 3 3 892 1102 283 96 6 chr5 40249509 40249843 -112287416 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 1 3 892 465 339 81 49 chr5 40254471 40254778 -112282481 + MLT1B LTR MaLR 46 362 -28 3 892 326 247 9 142 chr5 40258584 40258697 -112278562 + MTEb LTR MaLR 269 366 -13 3 892 516 293 264 17 chr5 40264189 40264484 -112272775 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 3 892 1855 148 24 59 chr5 40265424 40265762 -112271497 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 892 1654 115 10 77 chr5 40265762 40266074 -112271185 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 1673 3 892 811 254 84 8 chr5 40270723 40270975 -112266284 - MTE2a LTR MaLR 0 379 118 3 892 690 278 188 22 chr5 40271582 40271902 -112265357 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 3 3 892 1334 254 68 20 chr5 40287293 40287647 -112249612 + MTE2b LTR MaLR 6 376 -3 3 892 458 309 98 39 chr5 40293343 40293599 -112243660 - MTEa LTR MaLR -34 345 75 3 892 345 342 106 29 chr5 40295646 40295986 -112241273 + RMER5 LTR ERV1 159 524 -10 4 892 371 247 82 72 chr5 40320666 40320836 -112216423 + MTE2a LTR MaLR 167 346 -73 4 892 946 282 9 70 chr5 40320911 40321227 -112216032 - MTD-int LTR MaLR -947 311 15 4 892 1082 274 114 27 chr5 40321242 40321610 -112215649 - MTD LTR MaLR -2 417 18 4 892 2581 216 21 83 chr5 40324158 40324724 -112212535 - RMER19C LTR ERVK 0 611 72 4 892 2581 216 21 83 chr5 40324975 40325059 -112212200 - RMER19C LTR ERVK -540 71 1 4 892 1615 280 169 35 chr5 40327907 40328612 -112208647 + RMER13A LTR ERVK 14 859 -49 4 892 258 328 196 28 chr5 40330212 40330391 -112206868 - MLT1C LTR MaLR -6 461 253 4 892 299 265 93 68 chr5 40346658 40346820 -112190439 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 265 4 892 578 333 86 50 chr5 40349938 40350159 -112187100 + ORR1D2 LTR MaLR 1 229 -141 4 892 962 337 40 38 chr5 40351387 40351809 -112185450 + MER54B LTR ERVL 371 793 0 4 892 243 296 11 22 chr5 40355675 40355765 -112181494 - MLT1A1 LTR MaLR -10 398 310 4 892 241 326 20 10 chr5 40357715 40357814 -112179445 - MLT1B LTR MaLR 0 390 291 4 892 660 313 48 139 chr5 40361908 40362081 -112175178 - MTD LTR MaLR -41 378 206 5 892 660 313 48 139 chr5 40362840 40363082 -112174177 - MTD LTR MaLR -214 205 1 5 892 620 212 31 14 chr5 40364927 40365089 -112172170 + RMER20B LTR ERVK 1 161 -355 5 892 406 342 66 46 chr5 40366553 40366689 -112170570 - MLT1A0 LTR MaLR -17 348 204 5 892 406 342 66 46 chr5 40366735 40366901 -112170358 - MLT1A0 LTR MaLR -162 203 41 5 893 1659 242 54 22 chr5 40375199 40375605 -112161654 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 893 2990 59 31 0 chr5 40376661 40377049 -112160210 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 893 400 271 45 110 chr5 40381931 40382159 -112155100 + MTEa LTR MaLR 118 355 -24 5 893 2811 9 3 0 chr5 40383034 40383355 -112153904 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 893 225 323 20 50 chr5 40385889 40385990 -112151269 + MLT1E1A LTR MaLR 572 669 -11 5 893 718 250 137 36 chr5 40389488 40389824 -112147435 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 893 1194 309 69 20 chr5 40401925 40402430 -112134829 + RMER5 LTR ERV1 1 530 -4 5 893 475 343 45 66 chr5 40406684 40407080 -112130179 - MLT1B LTR MaLR 0 390 3 5 893 2295 109 98 0 chr5 40407196 40407563 -112129696 - RLTR44A LTR ERVK -2 403 1 5 893 1166 241 77 69 chr5 40410204 40410378 -112126881 + ORR1C2 LTR MaLR 1 181 -203 5 893 1166 241 77 69 chr5 40410447 40410651 -112126608 + ORR1C2 LTR MaLR 182 381 -3 5 893 3435 35 0 0 chr5 40434324 40434720 -112102539 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 893 2778 319 68 56 chr5 40441406 40443521 -112093738 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1297 3437 -4164 5 893 903 329 81 60 chr5 40449901 40451448 -112085811 + MuRRS4-int LTR ERV1 1901 3811 -1252 6 893 752 354 63 45 chr5 40455511 40456002 -112081257 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 61 6 893 4448 52 14 2 chr5 40480784 40481337 -112055922 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 6 893 2881 128 35 21 chr5 40494528 40494636 -112042623 - RMER17A LTR ERVK -228 523 415 6 893 2881 128 35 21 chr5 40494723 40495127 -112042132 - RMER17A LTR ERVK -337 414 4 6 893 1137 287 25 79 chr5 40499643 40499999 -112037260 - MTD LTR MaLR -14 405 69 6 893 345 179 0 69 chr5 40500000 40500072 -112037187 - MTC LTR MaLR -354 67 1 1 893 550 264 5 78 chr5 40501026 40501076 -112036183 + MT2A LTR ERVL 307 351 -182 4 894 550 264 5 78 chr5 40502065 40502207 -112035052 + MT2A LTR ERVL 352 485 -48 4 894 298 311 115 65 chr5 40503508 40503739 -112033520 + MLT1A LTR MaLR 34 271 -103 9 894 298 311 115 65 chr5 40503907 40503998 -112033261 + MLT1A LTR MaLR 272 372 -2 9 894 534 191 27 25 chr5 40504192 40504332 -112032927 + MTEa LTR MaLR 212 379 0 1 894 238 293 0 0 chr5 40504367 40504425 -112032834 - MLT1F2 LTR MaLR -67 493 436 1 894 1040 212 40 106 chr5 40509366 40509706 -112027553 + ORR1A4 LTR MaLR 1 370 -4 1 894 1125 276 75 21 chr5 40513787 40514120 -112023139 + MTD LTR MaLR 69 419 0 2 894 453 330 66 33 chr5 40515286 40515499 -112021760 - RMER15 LTR ERVL -15 560 341 2 894 679 231 65 79 chr5 40518892 40519169 -112018090 + MT2B LTR ERVL 329 601 0 3 894 305 286 9 9 chr5 40535708 40535814 -112001445 - MLT1C LTR MaLR -6 461 356 4 894 286 353 44 7 chr5 40535994 40536131 -112001128 - MLT1C LTR MaLR -325 142 1 4 894 474 305 74 46 chr5 40536297 40536620 -112000639 - MLT1B LTR MaLR -28 362 31 4 894 859 288 63 126 chr5 40557904 40558301 -111978958 - MTE2a LTR MaLR -1 378 7 7 894 307 341 47 60 chr5 40558653 40558887 -111978372 - MLT2B2 LTR ERVL -282 233 3 7 894 393 362 6 24 chr5 40565651 40565815 -111971444 - MT2A LTR ERVL -72 461 301 8 894 799 230 45 59 chr5 40573029 40573251 -111964008 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1630 1 894 3026 190 30 19 chr5 40574810 40575432 -111961827 - RLTR22_Mur LTR ERVK -229 1619 991 1 894 3001 208 68 47 chr5 40577595 40578429 -111958830 - RLTR22_Mur LTR ERVK -831 1017 166 1 894 546 238 19 56 chr5 40578571 40578731 -111958528 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1694 154 1 1 894 471 253 17 3 chr5 40587909 40588038 -111949221 - ORR1D2 LTR MaLR -14 405 253 1 894 1968 279 41 70 chr5 40588104 40588733 -111948526 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 894 227 302 22 44 chr5 40588733 40588823 -111948436 - ORR1D2 LTR MaLR -283 101 14 1 894 1227 270 81 6 chr5 40589509 40589853 -111947406 - ORR1D1 LTR MaLR -2 417 4 1 894 852 370 50 38 chr5 40589985 40590541 -111946718 - MLT1E3 LTR MaLR -2 622 60 1 894 248 368 29 52 chr5 40593579 40593751 -111943508 - MLT1J LTR MaLR -106 406 239 1 894 3066 191 77 107 chr5 40595504 40596512 -111940747 + RMER21A LTR ERV1 2 947 0 1 894 2581 180 29 151 chr5 40601308 40602094 -111935165 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 1 894 2444 169 142 14 chr5 40602196 40602712 -111934547 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 3 584 0 1 894 2644 37 3 38 chr5 40608582 40608921 -111928338 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 1 894 2951 39 7 79 chr5 40609900 40610320 -111926939 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 894 1246 234 146 19 chr5 40613786 40614156 -111923103 - MTD LTR MaLR -2 417 1 1 894 2912 180 101 28 chr5 40618237 40618882 -111918377 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 1 894 436 331 163 0 chr5 40620402 40620659 -111916600 - MLT1D LTR MaLR -28 477 179 1 894 385 218 57 53 chr5 40621182 40621343 -111915916 - MLT1A0 LTR MaLR -6 384 224 1 894 7483 84 19 13 chr5 40625672 40626689 -111910570 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 1 894 1690 234 102 25 chr5 40627667 40628084 -111909175 + RLTR20B3 LTR ERVK 27 481 -96 1 894 1690 234 102 25 chr5 40628187 40628241 -111909018 + RLTR20B3 LTR ERVK 482 534 -43 1 894 288 247 71 61 chr5 40629175 40629274 -111907985 + MTC LTR MaLR 306 405 -14 1 894 933 299 202 44 chr5 40629288 40630371 -111906888 + MTC-int LTR MaLR 1 1254 -4 1 894 364 283 88 14 chr5 40630376 40630523 -111906736 + MTC LTR MaLR 2 159 -262 1 894 403 340 93 66 chr5 40630737 40631144 -111906115 - MLT1H2 LTR MaLR -69 420 3 1 895 2897 86 2 21 chr5 40645655 40646084 -111891175 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 895 865 179 0 43 chr5 40646901 40647111 -111890148 + RMER3D-int LTR ERVK 651 851 -1991 1 895 408 229 117 46 chr5 40647175 40647372 -111889887 + RMER3D-int LTR ERVK 633 843 -1999 1 895 512 106 27 0 chr5 40647468 40647578 -111889681 + RMER3D-int LTR ERVK 489 583 -2259 1 895 1889 181 112 17 chr5 40647766 40648241 -111889018 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1533 -1309 1 895 634 192 42 60 chr5 40648273 40648439 -111888820 + RMER3D-int LTR ERVK 1532 1694 -1148 1 895 2845 224 45 43 chr5 40648441 40649351 -111887908 + RMER3D-int LTR ERVK 1926 2837 -5 1 895 2907 75 9 33 chr5 40649355 40649783 -111887476 + BGLII LTR ERVK 4 421 0 1 895 467 321 122 28 chr5 40658736 40659130 -111878129 + MLT1C LTR MaLR 3 433 -34 2 895 1262 203 125 34 chr5 40669102 40669454 -111867805 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 895 772 278 10 17 chr5 40674739 40675010 -111862249 + MTE2b LTR MaLR 62 375 -4 2 895 3123 56 5 2 chr5 40677618 40678013 -111859246 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 895 996 249 63 79 chr5 40703975 40704019 -111833240 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 331 2 895 996 249 63 79 chr5 40704349 40704684 -111832575 - ORR1D1 LTR MaLR -44 330 3 2 895 265 382 36 52 chr5 40709798 40709991 -111827268 - MTB_Mm LTR MaLR -79 328 139 2 895 274 291 28 44 chr5 40710313 40710465 -111826794 - MTE-int LTR MaLR -1112 146 2 2 895 400 368 50 0 chr5 40716064 40716246 -111821013 + MTD LTR MaLR 1 191 -228 2 895 6076 118 39 16 chr5 40716234 40717224 -111820035 - RLTR13D2 LTR ERVK -10 1013 1 2 895 769 234 139 9 chr5 40717224 40717440 -111819819 + MTD LTR MaLR 176 419 0 2 895 361 260 57 9 chr5 40721222 40721327 -111815932 - MLT1D LTR MaLR -46 459 350 2 895 237 289 181 104 chr5 40721406 40721599 -111815660 - MLT1D LTR MaLR -297 208 1 2 895 354 314 8 41 chr5 40725284 40725407 -111811852 - MLT1A1 LTR MaLR -41 367 249 2 895 1877 188 88 3 chr5 40726827 40727190 -111810069 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 895 1086 281 30 81 chr5 40728611 40728982 -111808277 + RMER19C LTR ERVK 191 611 0 3 895 900 246 10 0 chr5 40731496 40731695 -111805564 + RMER4B LTR ERVK 33 233 -352 3 895 258 248 29 40 chr5 40736457 40736562 -111800697 + MLT1D LTR MaLR 361 501 -4 3 895 1514 167 17 93 chr5 40738545 40738901 -111798358 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 895 432 360 13 13 chr5 40738941 40739093 -111798166 + MER70B LTR ERVL 3 154 -424 3 895 1930 167 37 17 chr5 40739898 40740300 -111796959 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 410 -151 3 895 321 344 32 8 chr5 40753877 40754000 -111783259 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 240 3 895 585 249 1 16 chr5 40756764 40756928 -111780331 + MT2A LTR ERVL 343 545 -56 3 895 585 221 0 22 chr5 40756958 40756973 -111780286 + MT2A LTR ERVL 465 478 -55 3 895 693 281 50 63 chr5 40761149 40761513 -111775746 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 3 895 1977 135 15 21 chr5 40762392 40762468 -111774791 + ORR1A2 LTR MaLR 1 80 -247 3 895 5101 147 78 1 chr5 40762468 40763358 -111773901 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 3 111 1977 135 15 21 chr5 40763358 40763606 -111773653 + ORR1A2 LTR MaLR 81 323 -4 3 896 1105 279 0 46 chr5 40764926 40765208 -111772051 + MT2A LTR ERVL 157 425 -108 3 896 233 98 0 89 chr5 40769438 40769483 -111767776 + MTC LTR MaLR 380 420 -1 3 896 1908 191 31 26 chr5 40769558 40769944 -111767315 - MTC LTR MaLR -33 388 1 3 896 240 338 0 0 chr5 40778305 40778376 -111758883 + RLTR24 LTR ERV1 1 71 -458 3 896 731 278 198 6 chr5 40780836 40781184 -111756075 - MTD LTR MaLR -1 418 4 3 896 998 227 258 6 chr5 40783367 40783700 -111753559 - MTC LTR MaLR -4 417 1 3 896 292 261 262 33 chr5 40786215 40786425 -111750834 + ORR1E LTR MaLR 1 258 -101 3 896 450 307 102 17 chr5 40797171 40797556 -111739703 + MLT2B1 LTR ERVL 58 567 0 4 896 913 247 165 8 chr5 40805109 40805370 -111731889 - MTD LTR MaLR -14 405 104 4 896 260 311 14 0 chr5 40805564 40805638 -111731621 - MTD LTR MaLR -308 111 37 4 896 239 359 22 0 chr5 40805840 40805932 -111731327 + ORR1E LTR MaLR 266 359 0 4 896 477 374 78 71 chr5 40812100 40812610 -111724649 - MER67D LTR ERV1 0 514 1 4 896 295 380 77 5 chr5 40814147 40814343 -111722916 - LTR16C LTR ERVL -6 483 274 4 896 262 185 18 18 chr5 40819567 40819622 -111717637 + MTD LTR MaLR 365 419 0 4 896 465 316 75 29 chr5 40820358 40820599 -111716660 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 114 4 896 1138 275 55 65 chr5 40830103 40830504 -111706755 + MTD LTR MaLR 1 397 -22 4 896 390 304 81 27 chr5 40833647 40833833 -111703426 + MLT1B LTR MaLR 192 387 -3 4 896 2655 102 5 22 chr5 40843883 40844286 -111692973 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 896 1154 188 50 120 chr5 40848010 40848451 -111688808 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 896 3862 191 68 56 chr5 40855024 40855120 -111682139 + RLTR25A LTR ERVK 1 98 -1005 5 896 3862 191 68 56 chr5 40855183 40855614 -111681645 + RLTR25A LTR ERVK 99 520 -583 5 896 3862 204 73 67 chr5 40855648 40856163 -111681096 + RLTR25A LTR ERVK 521 1026 -2 5 896 1708 227 91 50 chr5 40861236 40861981 -111675278 + RMER19B LTR ERVK 1 836 -66 5 896 2223 136 83 50 chr5 40862511 40862969 -111674290 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -2 473 1 5 896 54366 15 7 10 chr5 40862969 40869467 -111667792 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3 5 896 2212 138 83 50 chr5 40869467 40869925 -111667334 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -2 473 1 5 896 485 165 0 23 chr5 40870081 40870168 -111667091 + RMER19B LTR ERVK 818 902 0 5 896 370 407 59 10 chr5 40875238 40875509 -111661750 - MLT1G LTR MaLR -120 475 190 5 896 553 326 64 78 chr5 40876169 40876452 -111660807 + MTEa LTR MaLR 91 369 -10 5 896 247 416 60 25 chr5 40876858 40876964 -111660295 - MLT1G-int LTR MaLR -515 894 791 5 896 247 400 83 20 chr5 40877148 40877439 -111659820 - MLT1G-int LTR MaLR -623 866 567 5 896 267 331 43 36 chr5 40880059 40880197 -111657062 + MLT1B LTR MaLR 12 150 -240 5 896 409 257 19 0 chr5 40881532 40881637 -111655622 + MLT2B3 LTR ERVL 1 107 -447 5 896 311 278 125 82 chr5 40882149 40882333 -111654926 + MLT2B3 LTR ERVL 21 212 -342 5 896 1916 94 41 22 chr5 40885623 40885939 -111651320 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 896 2248 114 9 0 chr5 40886829 40887153 -111650106 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 896 2342 214 41 72 chr5 40890108 40890655 -111646604 + RMER15 LTR ERVL 14 532 -43 5 896 2342 214 41 72 chr5 40890687 40890719 -111646540 + RMER15 LTR ERVL 533 574 -1 5 897 5049 222 45 3 chr5 40903805 40904992 -111632267 - ORR1C1-int LTR MaLR -272 1237 1 5 897 1108 213 212 7 chr5 40905017 40905319 -111631940 - ORR1C1 LTR MaLR -14 364 1 5 897 638 316 51 57 chr5 40905343 40905695 -111631564 + RMER5 LTR ERV1 156 505 -29 5 897 509 292 99 0 chr5 40905760 40905921 -111631338 - MT2A LTR ERVL -58 475 299 5 897 248 250 97 54 chr5 40907167 40907260 -111629999 - MLT1J LTR MaLR -8 504 408 5 897 2474 89 3 0 chr5 40909545 40909883 -111627376 - MTB LTR MaLR 0 400 62 5 897 383 286 96 41 chr5 40914939 40915136 -111622123 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 377 5 897 280 360 131 27 chr5 40924028 40924211 -111613048 + MLT1G1 LTR MaLR 347 548 -31 6 897 694 242 0 88 chr5 40930611 40930815 -111606444 - RMER20B LTR ERVK -14 613 428 6 897 1328 256 31 39 chr5 40931655 40932069 -111605190 - MERVK26-int LTR ERVK -6443 476 66 6 897 242 234 12 61 chr5 40932186 40932268 -111604991 - RMER20B LTR ERVK 0 627 550 6 897 854 329 89 12 chr5 40951298 40951636 -111585623 - MTD LTR MaLR -14 405 42 6 897 2180 15 114 0 chr5 40952142 40952404 -111584855 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 6 897 1965 56 12 0 chr5 40952404 40952653 -111584606 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 252 -7329 6 897 269 245 0 0 chr5 40952653 40952706 -111584553 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 6 897 349 21 106 0 chr5 40952706 40952753 -111584506 + MMERVK10C-int LTR ERVK 225 276 -7305 6 897 695 65 213 0 chr5 40952739 40952847 -111584412 + MMERVK10C-int LTR ERVK 5436 5566 -2015 6 897 894 107 0 6 chr5 40952847 40953048 -111584211 + MMERVK10C-int LTR ERVK 7442 7581 0 6 897 2165 19 114 0 chr5 40953048 40953310 -111583949 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 6 897 2259 243 76 9 chr5 40953524 40953950 -111583309 + RMER20B LTR ERVK 7 471 -156 6 897 2259 243 76 9 chr5 40953974 40954129 -111583130 + RMER20B LTR ERVK 472 626 -1 6 897 643 315 57 54 chr5 40956889 40957238 -111580021 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 13 6 897 1208 263 27 94 chr5 40961858 40962261 -111574998 + MTE2b LTR MaLR 1 376 -3 6 897 3419 30 0 8 chr5 40973250 40973649 -111563610 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 897 8816 37 10 3 chr5 40973649 40974739 -111562520 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 897 3393 33 0 8 chr5 40974739 40975138 -111562121 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 897 742 332 63 14 chr5 40975817 40976101 -111561158 + MLT1D LTR MaLR 188 485 -20 6 897 1547 287 27 46 chr5 40988158 40988637 -111548622 + RMER19C LTR ERVK 142 611 0 6 897 3253 40 22 0 chr5 40993842 40994244 -111543015 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 897 6424 50 12 18 chr5 40994246 40995078 -111542181 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5653 6 897 2725 56 0 3 chr5 40995073 40995416 -111541843 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1359 6 897 3916 51 2 18 chr5 40995416 40995919 -111541340 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 6 897 244 302 0 0 chr5 40995919 40995972 -111541287 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 6 897 227 267 0 0 chr5 40996000 40996045 -111541214 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 6 897 461 110 108 110 chr5 40996045 40996165 -111541094 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 11 6 897 402 55 0 0 chr5 40996163 40996218 -111541041 - IAPEz-int LTR ERVK -1930 57 3 6 897 3277 37 22 0 chr5 40996220 40996622 -111540637 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 897 669 314 81 65 chr5 40999281 40999554 -111537705 - ORR1D2 LTR MaLR -51 319 32 6 897 669 314 81 65 chr5 40999805 40999841 -111537418 - ORR1D2 LTR MaLR -339 31 5 6 897 405 374 82 38 chr5 41000210 41000502 -111536757 + LTR16B LTR ERVL 68 372 -91 2 897 846 265 69 16 chr5 41007028 41007352 -111529907 - ORR1D1 LTR MaLR -2 368 1 1 898 276 354 71 24 chr5 41031808 41031976 -111505283 - MLT1B LTR MaLR -23 367 192 5 898 608 173 0 0 chr5 41032024 41032128 -111505131 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 424 5 898 230 351 53 11 chr5 41033150 41033245 -111504014 - MLT1B LTR MaLR -291 99 1 5 898 707 262 117 53 chr5 41046355 41046689 -111490570 + ORR1D-int LTR MaLR 6 335 -923 7 898 638 308 177 52 chr5 41046734 41047275 -111489984 + ORR1D-int LTR MaLR 668 1418 -162 7 898 342 255 82 0 chr5 41054451 41054549 -111482710 + RMER15 LTR ERVL 422 527 -48 9 898 255 360 30 30 chr5 41054527 41054696 -111482563 + RMER15 LTR ERVL 389 557 -18 9 898 499 350 39 17 chr5 41055113 41055343 -111481916 + RMER15-int LTR ERVL 1987 2221 -2778 9 898 596 301 44 26 chr5 41057041 41057330 -111479929 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2063 2361 -3306 9 898 255 240 0 0 chr5 41070493 41070543 -111466716 + MERVK26-int LTR ERVK 6863 6912 -7 1 898 1038 236 123 47 chr5 41070634 41070999 -111466260 + RMER13A LTR ERVK 101 493 -367 1 898 2298 69 119 11 chr5 41077544 41077896 -111459363 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 898 245 307 14 55 chr5 41080157 41080302 -111456957 - RLTR11B LTR ERVK -58 395 257 1 898 656 272 15 34 chr5 41080380 41080605 -111456654 - RLTR11B LTR ERVK -303 225 3 1 898 272 320 134 29 chr5 41080820 41081058 -111456201 - MLT2C1 LTR ERVL -95 302 40 1 898 249 333 22 0 chr5 41081620 41081710 -111455549 + MLT1I LTR MaLR 317 408 -3 1 898 2218 105 223 30 chr5 41083460 41083922 -111453337 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -67 587 37 1 898 686 232 414 31 chr5 41093460 41093716 -111443543 - ORR1D2 LTR MaLR -5 354 1 1 898 1649 223 69 3 chr5 41096556 41096947 -111440312 + MTC LTR MaLR 5 421 0 1 898 3014 91 2 0 chr5 41098321 41098741 -111438518 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 898 1474 262 8 39 chr5 41099180 41099562 -111437697 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 898 354 316 90 40 chr5 41109911 41110112 -111427147 - MLT1A0 LTR MaLR -154 211 1 1 898 389 352 81 53 chr5 41110224 41110509 -111426750 - MLT-int LTR MaLR -124 1611 1319 1 898 1263 184 127 0 chr5 41110540 41110807 -111426452 - RMER20A LTR ERVK -206 310 10 1 898 858 306 50 124 chr5 41110988 41111675 -111425584 - MLT-int LTR MaLR -1013 722 87 1 898 618 358 57 39 chr5 41111781 41111875 -111425384 + MT2A LTR ERVL 143 235 -298 1 898 618 358 57 39 chr5 41111912 41112201 -111425058 + MT2A LTR ERVL 236 532 -1 1 898 860 285 72 54 chr5 41112276 41112638 -111424621 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 1 1 898 1158 286 18 43 chr5 41113823 41114152 -111423107 - ORR1E LTR MaLR 0 359 39 1 898 365 206 53 21 chr5 41117636 41117730 -111419529 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 310 1 898 914 311 21 29 chr5 41124771 41125052 -111412207 + MTEb LTR MaLR 4 282 -97 2 898 232 88 0 0 chr5 41125165 41125199 -111412060 + MTEb LTR MaLR 346 379 0 2 898 2111 194 32 17 chr5 41128135 41128539 -111408720 - MTC LTR MaLR -2 419 10 2 898 1255 267 62 28 chr5 41132793 41133148 -111404111 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 2 898 443 353 35 30 chr5 41133639 41133856 -111403403 + LTR40a LTR ERVL 102 319 -200 2 898 2440 91 56 0 chr5 41134208 41134548 -111402711 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 2 898 1405 194 35 165 chr5 41135830 41136011 -111401248 + ORR1D1 LTR MaLR 5 140 -234 2 898 1405 194 35 165 chr5 41136277 41136520 -111400739 + ORR1D1 LTR MaLR 141 374 0 2 898 5181 53 5 3 chr5 41138852 41139509 -111397750 - RLTR13C2 LTR ERVK -150 658 1 2 898 3349 43 2 0 chr5 41139615 41140010 -111397249 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 898 743 309 50 45 chr5 41140187 41140563 -111396696 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 2 898 369 231 13 13 chr5 41155295 41155374 -111381885 + MTEb LTR MaLR 205 283 -96 2 899 309 247 39 0 chr5 41156985 41157062 -111380197 + LTR41B LTR ERVL 78 157 -601 2 899 1672 134 93 7 chr5 41157877 41158178 -111379081 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 2 899 1261 242 140 13 chr5 41164930 41165302 -111371957 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 899 1950 133 101 57 chr5 41170317 41170772 -111366487 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 899 583 353 35 76 chr5 41177106 41177394 -111359865 + MLT1A0 LTR MaLR 88 363 -2 2 899 1529 246 33 3 chr5 41178655 41178990 -111358269 + ORR1D1 LTR MaLR 30 374 0 2 899 2057 118 132 31 chr5 41181403 41181740 -111355519 + RLTR44E LTR ERVK 1 384 -68 2 899 2057 130 116 29 chr5 41182401 41182458 -111354801 + RLTR44E LTR ERVK 336 424 -28 2 899 1704 48 0 0 chr5 41184066 41184273 -111352986 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 207 -312 2 899 2486 40 3 41 chr5 41186796 41187134 -111350125 + MURVY-LTR LTR ERV1 195 519 0 2 899 1198 210 79 60 chr5 41188653 41189054 -111348205 - RMER16 LTR ERVK 0 533 2 2 899 705 295 198 18 chr5 41198209 41198547 -111338712 - MTD LTR MaLR 0 419 21 2 899 418 278 81 23 chr5 41198644 41198817 -111338442 - MTEa LTR MaLR -4 375 193 3 899 341 238 34 170 chr5 41200188 41200335 -111336924 - MTEa LTR MaLR -244 135 9 3 899 659 286 0 51 chr5 41203095 41203272 -111333987 - MTEa LTR MaLR -209 170 3 3 899 410 335 95 19 chr5 41203278 41203488 -111333771 + MLT1A0 LTR MaLR 102 327 -38 3 899 771 303 42 87 chr5 41204919 41205252 -111332007 + MLT2B5 LTR ERVL 87 404 -313 3 899 2017 106 3 70 chr5 41208812 41209168 -111328091 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 3 899 25147 15 3 0 chr5 41209168 41212115 -111325144 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 3 899 873 81 24 0 chr5 41212115 41212238 -111325021 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 3 899 1728 115 4 4 chr5 41212235 41212497 -111324762 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 3 899 424 38 0 0 chr5 41212496 41212549 -111324710 - IAPEz-int LTR ERVK -5070 1411 1359 3 899 3255 57 4 53 chr5 41212549 41213316 -111323943 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 9 3 899 2040 102 3 70 chr5 41213316 41213675 -111323584 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -2 335 1 3 899 1269 322 6 6 chr5 41220867 41221232 -111316027 - MTEa LTR MaLR -4 375 11 3 899 345 198 19 21 chr5 41226266 41226399 -111310860 - MTD LTR MaLR -2 419 234 3 899 604 269 23 35 chr5 41226411 41226584 -111310675 - MTD LTR MaLR -243 176 6 3 899 265 308 21 21 chr5 41227793 41227886 -111309373 + MLT1A0 LTR MaLR 33 125 -240 3 899 1009 307 25 32 chr5 41228251 41228567 -111308692 - MTE2b LTR MaLR -5 374 61 3 899 799 202 55 31 chr5 41228944 41229187 -111308072 - RMER15 LTR ERVL 0 575 277 3 899 3731 60 0 0 chr5 41229200 41229679 -111307580 - RLTR13B3 LTR ERVK -97 832 354 3 899 1290 205 22 14 chr5 41229680 41229957 -111307302 - RMER15 LTR ERVL -296 279 1 3 899 705 335 32 12 chr5 41230220 41230468 -111306791 + MTE2a LTR MaLR 123 375 -4 3 899 237 291 38 12 chr5 41231210 41231290 -111305969 - MTEb LTR MaLR -19 360 279 3 899 1176 237 179 16 chr5 41231655 41232084 -111305175 + RLTR11A2 LTR ERVK 5 503 -24 3 899 256 289 215 36 chr5 41244284 41244503 -111292756 - ORR1E LTR MaLR -101 258 1 3 899 715 311 42 23 chr5 41244503 41244760 -111292499 + MLT1A0 LTR MaLR 118 371 -3 3 899 851 319 148 20 chr5 41246151 41246509 -111290750 - MTD LTR MaLR 0 419 16 3 899 1175 253 81 17 chr5 41246508 41246854 -111290405 + MTD LTR MaLR 43 405 -14 3 899 293 358 88 95 chr5 41248267 41248539 -111288720 - MLT1C LTR MaLR -38 429 146 3 899 674 326 88 14 chr5 41248539 41248890 -111288369 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 3 899 293 358 88 95 chr5 41248890 41249049 -111288210 - MLT1C LTR MaLR -322 145 1 3 899 389 313 110 29 chr5 41252334 41252546 -111284713 - MLT1B LTR MaLR -155 219 3 3 899 708 237 15 0 chr5 41253727 41253858 -111283401 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 3 899 386 355 108 54 chr5 41267796 41268112 -111269147 - ORR1E LTR MaLR -18 341 9 3 899 266 242 51 71 chr5 41275574 41275672 -111261587 + RMER15 LTR ERVL 1 96 -479 4 899 564 283 49 49 chr5 41275718 41275941 -111261318 + RMER15 LTR ERVL 254 476 -99 4 899 461 252 183 40 chr5 41281837 41282159 -111255100 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 4 899 706 294 18 14 chr5 41282600 41282876 -111254383 - RLTR6-int LTR ERV1 -115 7663 7387 4 899 16055 129 37 21 chr5 41282871 41285343 -111251916 - RMER16-int LTR ERVK -1068 4338 1823 4 899 16055 129 37 21 chr5 41285906 41286160 -111251099 - RMER16-int LTR ERVK -3584 1822 1568 4 899 812 271 89 64 chr5 41286311 41286761 -111250498 - RMER16-int LTR ERVK -3909 2258 1798 4 899 234 138 259 0 chr5 41286762 41286820 -111250439 - RMER16 LTR ERVK -219 314 242 4 899 361 194 0 15 chr5 41286822 41286890 -111250369 - ETnERV2-int LTR ERVK -4866 2540 2474 4 899 1563 173 158 81 chr5 41286921 41287492 -111249767 - RMER16-int LTR ERVK -5283 854 255 4 900 432 275 199 47 chr5 41287930 41288247 -111249012 - RLTR9A LTR ERVK -3 365 1 4 900 1860 178 112 74 chr5 41288976 41289406 -111247853 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 4 900 3089 51 8 5 chr5 41289571 41289966 -111247293 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 900 1323 229 82 27 chr5 41290830 41291158 -111246101 + ORR1C1 LTR MaLR 5 350 -28 4 900 834 338 34 73 chr5 41291850 41292204 -111245055 + ORR1E LTR MaLR 9 348 -11 4 900 1307 232 214 19 chr5 41292310 41292736 -111244523 + MT2B2 LTR ERVL 11 519 -65 4 900 2902 189 56 30 chr5 41292777 41293441 -111243818 - RMER6C LTR ERVK -4 686 6 4 900 1052 175 9 75 chr5 41295559 41295787 -111241472 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 172 4 900 290 167 107 40 chr5 41295920 41295995 -111241264 - ORR1C2 LTR MaLR -190 194 115 4 900 3759 197 174 48 chr5 41300117 41301097 -111236162 + RLTR25A LTR ERVK 1 1103 0 4 900 412 252 27 0 chr5 41301519 41301630 -111235629 - MTEa LTR MaLR 0 379 266 4 900 288 398 93 55 chr5 41307869 41308159 -111229100 - LTR16B2 LTR ERVL -161 301 1 4 900 2380 98 3 0 chr5 41308636 41308962 -111228297 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 900 445 248 18 44 chr5 41321479 41321593 -111215666 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 274 4 900 653 241 6 66 chr5 41321612 41321794 -111215465 - ORR1C2 LTR MaLR -213 171 1 4 900 252 287 55 94 chr5 41322242 41322369 -111214890 + ORR1D1 LTR MaLR 19 140 -234 4 900 667 244 10 69 chr5 41323534 41323762 -111213497 + ORR1B2 LTR MaLR 1 191 -138 4 900 2022 233 69 35 chr5 41327341 41327849 -111209410 - MT2A LTR ERVL -6 527 3 4 900 624 59 0 0 chr5 41328505 41328590 -111208669 - MT-int LTR MaLR -508 590 506 4 900 2312 47 14 0 chr5 41328605 41328902 -111208357 + MTA_Mm LTR MaLR 96 396 0 4 900 9083 42 0 0 chr5 41328902 41330000 -111207259 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 900 3282 51 2 0 chr5 41330000 41330395 -111206864 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 900 387 288 132 34 chr5 41332179 41332384 -111204875 - RMER15 LTR ERVL -15 560 336 4 900 413 373 105 4 chr5 41337322 41337551 -111199708 + LTR16B2 LTR ERVL 1 252 -210 5 900 277 328 65 16 chr5 41337723 41337847 -111199412 + LTR16B2 LTR ERVL 360 489 0 5 900 3003 32 0 0 chr5 41337955 41338301 -111198958 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 900 920 266 40 98 chr5 41339879 41340154 -111197105 - MTEa LTR MaLR -55 324 66 5 900 617 338 145 10 chr5 41340210 41340596 -111196663 - MTEa-int LTR MaLR -519 1061 624 5 900 231 317 61 45 chr5 41340637 41340769 -111196490 - RMER20B LTR ERVK -38 589 456 5 900 1721 293 38 12 chr5 41341158 41341656 -111195603 - MTEa-int LTR MaLR -1067 513 3 5 900 612 286 115 82 chr5 41341657 41342023 -111195236 - MTEa LTR MaLR 0 379 2 5 900 1031 322 41 0 chr5 41352466 41352804 -111184455 - MTC LTR MaLR -15 406 55 5 900 341 282 2 75 chr5 41358930 41359067 -111178192 - MTC LTR MaLR -271 125 1 5 900 1984 148 6 44 chr5 41359103 41359161 -111178098 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 271 5 900 1984 148 6 44 chr5 41359194 41359475 -111177784 - ORR1A2 LTR MaLR -57 270 1 5 900 676 363 66 54 chr5 41360537 41360962 -111176297 - MT2A LTR ERVL -103 430 1 5 900 497 304 139 59 chr5 41362293 41362391 -111174868 + MTD LTR MaLR 1 108 -311 5 900 497 304 139 59 chr5 41362830 41362953 -111174306 + MTD LTR MaLR 109 248 -171 5 900 497 304 139 59 chr5 41363031 41363182 -111174077 + MTD LTR MaLR 249 404 -15 5 900 348 298 52 30 chr5 41367473 41367608 -111169651 - LTR79 LTR ERVL -38 489 352 5 900 346 343 82 31 chr5 41368578 41368955 -111168304 + MLT2B3 LTR ERVL 32 525 -42 5 900 3087 58 8 5 chr5 41370938 41371337 -111165922 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 900 488 288 88 65 chr5 41376151 41376564 -111160695 + MLT1D LTR MaLR 13 496 -9 5 900 321 286 90 103 chr5 41376885 41377119 -111160140 + RMER15 LTR ERVL 4 234 -341 5 900 746 359 53 5 chr5 41377372 41377750 -111159509 + MLT1C LTR MaLR 16 411 -56 5 900 922 298 30 42 chr5 41378909 41379270 -111157989 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 5 900 946 275 30 46 chr5 41381062 41381586 -111155673 + MYSERV-int LTR ERVK 4325 4647 -1903 5 900 504 320 108 5 chr5 41381656 41381879 -111155380 + MYSERV-int LTR ERVK 4843 5088 -1462 5 900 391 288 8 78 chr5 41381895 41382023 -111155236 + RMER4A LTR ERVK 274 392 -74 5 900 798 356 25 19 chr5 41384871 41385232 -111152027 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 3 5 900 542 346 27 30 chr5 41386571 41386833 -111150426 - MLT1B LTR MaLR -2 388 128 5 900 239 271 68 93 chr5 41401297 41401415 -111135844 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1227 1341 -467 5 900 2897 172 29 45 chr5 41401797 41402346 -111134913 - RLTR20B2 LTR ERVK -20 540 1 5 900 921 275 82 24 chr5 41402346 41402607 -111134652 - MTD LTR MaLR -55 364 83 5 900 225 300 30 91 chr5 41402752 41402851 -111134408 + MLT1A LTR MaLR 4 96 -278 5 900 1936 156 67 14 chr5 41403245 41403591 -111133668 + ORR1B2 LTR MaLR 2 365 -2 5 900 3043 66 15 0 chr5 41403950 41404344 -111132915 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 900 1613 150 136 0 chr5 41408639 41408926 -111128333 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 900 903 267 0 25 chr5 41409166 41409366 -111127893 - MTD LTR MaLR -224 195 1 5 901 408 297 79 26 chr5 41420941 41421131 -111116128 + MTD LTR MaLR 1 200 -219 6 901 513 263 25 44 chr5 41421475 41421634 -111115625 - MTD LTR MaLR 0 419 264 6 901 231 235 43 29 chr5 41421714 41421784 -111115475 - MTD LTR MaLR -270 109 39 6 901 1145 352 51 4 chr5 41424242 41424699 -111112560 - MER77 LTR ERVL -148 459 6 6 901 480 325 114 30 chr5 41428210 41428473 -111108786 + MLT1H1-int LTR MaLR 104 388 -999 6 901 230 379 112 24 chr5 41428714 41429001 -111108258 + MLT1H1-int LTR MaLR 425 736 -651 6 901 833 355 99 0 chr5 41429900 41430283 -111106976 + MLT1H1 LTR MaLR 13 433 -122 6 901 424 289 79 36 chr5 41430431 41430599 -111106660 + MLT1H1 LTR MaLR 372 552 -3 6 901 652 249 89 24 chr5 41437113 41437320 -111099939 - ORR1C2 LTR MaLR 0 394 172 6 901 980 311 80 39 chr5 41438840 41439204 -111098055 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 6 901 259 308 29 9 chr5 41444586 41444691 -111092568 + LTR16B1 LTR ERVL 207 313 -167 6 901 597 206 63 8 chr5 41447077 41447204 -111090055 - RLTR25A LTR ERVK -8 1095 962 6 901 236 321 101 36 chr5 41450168 41450307 -111086952 + ORR1C2 LTR MaLR 47 194 -190 6 901 1182 267 33 137 chr5 41460370 41460800 -111076459 - MTD LTR MaLR -30 389 5 6 901 267 239 30 0 chr5 41466127 41466194 -111071065 + MTD LTR MaLR 1 69 -352 6 901 880 296 81 13 chr5 41466325 41466633 -111070626 + MTD LTR MaLR 50 378 -41 6 901 1786 340 40 65 chr5 41467255 41468105 -111069154 - MTE-int LTR MaLR -42 1538 710 6 901 229 334 179 54 chr5 41468686 41469037 -111068222 - MTE-int LTR MaLR -884 696 302 6 901 239 263 0 17 chr5 41469072 41469130 -111068129 - MTE-int LTR MaLR -1372 208 152 6 901 1072 280 117 14 chr5 41486668 41487030 -111050229 + MTC LTR MaLR 18 406 -15 7 901 1663 255 63 0 chr5 41487882 41488263 -111048996 - MTD LTR MaLR 0 419 15 7 901 4009 46 0 2 chr5 41489305 41489788 -111047471 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 7 901 2188 107 65 6 chr5 41494198 41494535 -111042724 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 7 901 371 316 48 176 chr5 41496480 41496753 -111040506 + MTEa LTR MaLR 1 238 -141 7 901 284 224 0 0 chr5 41502389 41502447 -111034812 - MLT1A0 LTR MaLR -17 348 291 4 901 484 301 28 42 chr5 41507218 41507430 -111029829 - MLT1B LTR MaLR -181 209 1 1 901 492 344 43 22 chr5 41538963 41539195 -110998064 + MLT1B LTR MaLR 5 241 -149 5 901 1130 280 80 22 chr5 41540701 41541066 -110996193 + MTD LTR MaLR 18 403 -16 5 901 236 201 28 11 chr5 41547304 41547365 -110989894 - MLT1H2 LTR MaLR -16 539 434 6 902 376 376 114 19 chr5 41551457 41551779 -110985480 + MLT1C LTR MaLR 59 411 -56 6 902 1108 258 36 59 chr5 41558914 41559301 -110977958 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 7 902 443 381 27 9 chr5 41559754 41559979 -110977280 + MLT1D LTR MaLR 277 505 0 7 902 494 334 42 62 chr5 41560026 41560412 -110976847 + MLT1D-int LTR MaLR 183 560 -811 7 902 233 393 69 35 chr5 41566836 41566952 -110970307 + MLT1C LTR MaLR 300 419 -48 8 902 1341 271 80 13 chr5 41569121 41569584 -110967675 + RMER5 LTR ERV1 41 534 0 9 902 698 320 110 42 chr5 41569613 41570021 -110967238 + MLT2B1 LTR ERVL 1 436 -84 9 902 464 300 8 8 chr5 41572026 41572147 -110965112 + ORR1E LTR MaLR 11 131 -228 9 902 332 302 8 45 chr5 41572157 41572289 -110964970 + ORR1E LTR MaLR 253 379 0 9 902 1047 323 27 27 chr5 41573960 41574109 -110963150 - MLT1A0-int LTR MaLR -20 1715 1567 1 902 1047 323 27 27 chr5 41574536 41574758 -110962501 - MLT1A0-int LTR MaLR -169 1566 1344 1 902 923 354 101 29 chr5 41575222 41575749 -110961510 - MLT1A0-int LTR MaLR -1167 568 4 1 902 711 317 114 9 chr5 41575759 41576084 -110961175 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 3 1 902 1408 224 88 22 chr5 41581836 41582155 -110955104 + ORR1B2 LTR MaLR 20 359 -8 1 902 235 244 66 55 chr5 41586017 41586108 -110951151 + MLT1B LTR MaLR 83 174 -216 1 902 318 335 70 70 chr5 41586114 41586342 -110950917 - MLT1F2 LTR MaLR -323 237 10 1 902 2148 163 29 3 chr5 41587290 41587666 -110949593 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 902 274 358 118 23 chr5 41588119 41588382 -110948877 + MLT2F LTR ERVL 1 288 -375 1 902 277 359 51 29 chr5 41588360 41588535 -110948724 + MLT2F LTR ERVL 480 658 -5 1 902 444 307 163 41 chr5 41592186 41592366 -110944893 - MLT1C LTR MaLR -25 442 250 1 902 444 307 163 41 chr5 41592842 41593048 -110944211 - MLT1C LTR MaLR -218 249 9 1 902 334 390 64 17 chr5 41596675 41596847 -110940412 - MLT1J LTR MaLR -98 414 235 1 902 405 146 135 0 chr5 41596875 41596904 -110940355 - ORR1C2 LTR MaLR -13 371 331 1 902 405 146 135 0 chr5 41597018 41597077 -110940182 - ORR1C2 LTR MaLR -54 330 272 1 902 233 257 135 0 chr5 41597200 41597274 -110939985 - MLT1J LTR MaLR -372 140 57 1 902 2556 55 61 3 chr5 41601940 41602267 -110934992 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 902 2037 147 9 9 chr5 41603538 41603867 -110933392 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 902 2894 61 2 32 chr5 41604971 41605048 -110932211 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 326 1 902 3117 28 12 82 chr5 41605048 41605474 -110931785 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 902 7525 75 19 70 chr5 41605474 41606631 -110930628 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 902 3032 45 59 0 chr5 41606631 41607005 -110930254 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 902 2894 61 2 32 chr5 41607005 41607333 -110929926 - MTA_Mm LTR MaLR -71 325 3 1 902 1136 259 50 40 chr5 41615124 41615426 -110921833 - ORR1C2-int LTR MaLR -104 1405 1101 1 902 1719 237 79 23 chr5 41615795 41616274 -110920985 - RMER20A LTR ERVK 0 516 11 1 902 239 283 20 80 chr5 41616378 41616478 -110920781 - RMER10A LTR ERVL -331 111 18 1 902 862 290 32 72 chr5 41616621 41616870 -110920389 - ORR1C2-int LTR MaLR -426 1083 845 1 902 468 222 60 52 chr5 41617503 41617683 -110919576 - ORR1C2-int LTR MaLR -647 723 531 1 902 1224 179 122 0 chr5 41617669 41617915 -110919344 - ORR1C2 LTR MaLR -108 276 1 1 902 280 300 25 0 chr5 41621443 41621523 -110915736 + MTC LTR MaLR 8 89 -332 1 902 427 220 106 67 chr5 41629349 41629529 -110907730 - MT2A LTR ERVL -324 209 23 1 902 327 288 92 39 chr5 41629423 41629553 -110907706 - MTE2a LTR MaLR -242 137 1 1 902 272 203 13 115 chr5 41638084 41638162 -110899097 - MTEb LTR MaLR -309 70 1 1 902 2021 235 10 5 chr5 41644404 41644815 -110892444 + MTD LTR MaLR 1 413 -6 1 902 231 326 48 120 chr5 41646029 41646196 -110891063 + MLT1H2 LTR MaLR 322 476 -13 1 902 950 302 66 9 chr5 41650992 41651433 -110885826 + MLT1C LTR MaLR 2 467 0 2 902 394 328 65 36 chr5 41655704 41655982 -110881277 - MLT1D LTR MaLR -219 286 1 2 902 1358 189 126 7 chr5 41675367 41675644 -110861615 + ORR1C1 LTR MaLR 1 310 -68 2 903 673 266 195 27 chr5 41685919 41686251 -110851008 - RMER5 LTR ERV1 -114 420 33 2 903 226 345 67 7 chr5 41702260 41702409 -110834850 - LTR33A LTR ERVL -15 505 348 2 903 1690 214 9 35 chr5 41704149 41704196 -110833063 - RMER15 LTR ERVL 0 575 537 2 903 1851 123 32 87 chr5 41704196 41704542 -110832717 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 2 903 1690 214 9 35 chr5 41704542 41704842 -110832417 - RMER15 LTR ERVL -39 536 237 2 903 881 288 68 70 chr5 41707133 41707302 -110829957 - MTEa LTR MaLR -10 369 191 2 903 881 288 68 70 chr5 41708061 41708261 -110828998 - MTEa LTR MaLR -189 190 1 2 903 1765 169 42 96 chr5 41711500 41711905 -110825354 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 2 903 385 354 50 103 chr5 41719404 41719763 -110817496 + ORR1E LTR MaLR 9 348 -11 2 903 404 308 45 48 chr5 41720567 41720917 -110816342 + MTEb LTR MaLR 24 363 -7 2 903 302 295 56 75 chr5 41721116 41721277 -110815982 + LTR79 LTR ERVL 370 527 0 2 903 329 316 88 48 chr5 41722454 41722583 -110814676 - MLT1A LTR MaLR -56 352 225 2 903 519 244 16 0 chr5 41724037 41724160 -110813099 + MLT1A0 LTR MaLR 238 362 -3 2 903 498 294 89 156 chr5 41724160 41724551 -110812708 + MTE2a LTR MaLR 1 365 -14 2 903 1017 124 0 0 chr5 41724734 41724879 -110812380 - ORR1A2 LTR MaLR -93 234 90 2 903 740 89 0 0 chr5 41724877 41724978 -110812281 + ORR1A3 LTR MaLR 218 318 -8 2 903 2748 212 35 10 chr5 41727477 41728072 -110809187 - RLTR17 LTR ERVK -82 610 1 3 903 915 390 44 7 chr5 41731261 41731718 -110805541 - MER74A LTR ERVL -6 552 79 3 903 1191 260 95 69 chr5 41734953 41735653 -110801606 + RMER6C LTR ERVK 1 720 0 3 903 650 295 53 93 chr5 41736725 41737121 -110800138 + MLT1B LTR MaLR 11 390 0 3 903 842 308 72 36 chr5 41737259 41737592 -110799667 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 11 3 903 5086 132 44 13 chr5 41744413 41745278 -110791981 - RMER17B LTR ERVK 0 958 67 3 903 407 139 56 0 chr5 41751742 41751814 -110785445 - RMER17B LTR ERVK -882 76 1 3 903 2313 212 13 52 chr5 41756057 41756580 -110780679 - RLTR18B LTR ERVK -9 503 1 3 903 682 254 167 55 chr5 41758076 41758405 -110778854 + RMER13A LTR ERVK 31 396 -464 3 903 311 359 86 31 chr5 41758443 41758699 -110778560 + RMER13A LTR ERVK 545 814 -94 3 903 296 272 86 11 chr5 41777675 41777768 -110759491 - ORR1E LTR MaLR -239 120 21 3 903 356 318 248 5 chr5 41777999 41778217 -110759042 - MLT1F2 LTR MaLR -43 517 235 3 903 1919 327 117 75 chr5 41780170 41780589 -110756670 + MTE-int LTR MaLR 59 497 -1083 3 903 1919 327 117 75 chr5 41780756 41781646 -110755613 + MTE-int LTR MaLR 498 1423 -157 3 903 470 345 20 27 chr5 41786328 41786477 -110750782 + ORR1E LTR MaLR 1 148 -211 3 903 2158 131 47 41 chr5 41786521 41786886 -110750373 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 903 58042 17 7 4 chr5 41786886 41793337 -110743922 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 3 903 2119 137 47 41 chr5 41793337 41793702 -110743557 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 903 237 317 167 0 chr5 41793716 41793836 -110743423 + ORR1E LTR MaLR 237 376 -3 3 903 866 309 46 31 chr5 41795881 41796232 -110741027 + MTD LTR MaLR 64 419 0 3 903 1156 148 110 0 chr5 41797662 41797871 -110739388 + MTC LTR MaLR 1 232 -189 3 903 307 250 65 43 chr5 41803203 41803295 -110733964 + MLT1A LTR MaLR 1 94 -280 3 903 416 298 136 68 chr5 41805791 41806086 -110731173 + ORR1E LTR MaLR 11 325 -34 3 904 2295 110 0 63 chr5 41821898 41822246 -110715013 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 904 264 268 29 67 chr5 41823686 41823790 -110713469 - MLT1B LTR MaLR -33 357 258 4 904 767 271 100 45 chr5 41823796 41824086 -110713173 + ORR1E LTR MaLR 5 310 -49 4 904 434 374 106 32 chr5 41829113 41829207 -110708052 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 280 4 904 434 374 106 32 chr5 41829353 41829598 -110707661 - MLT1A0 LTR MaLR -86 279 1 4 904 1172 254 53 62 chr5 41830302 41830606 -110706653 + ORR1E LTR MaLR 5 301 -58 4 904 2093 164 39 8 chr5 41830606 41830969 -110706290 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 904 1172 254 53 62 chr5 41830969 41831020 -110706239 + ORR1E LTR MaLR 302 357 -2 4 904 343 346 154 105 chr5 41834885 41835295 -110701964 + MLT1F2 LTR MaLR 71 500 -60 4 904 898 310 66 27 chr5 41839306 41839638 -110697621 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 21 4 904 2091 147 15 12 chr5 41840918 41841242 -110696017 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 4 904 239 265 29 0 chr5 41843511 41843579 -110693680 + ORR1E LTR MaLR 269 338 -21 4 904 1716 152 3 128 chr5 41848273 41848345 -110688914 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 272 4 904 1716 152 3 128 chr5 41848609 41848912 -110688347 - ORR1A4 LTR MaLR -58 271 1 4 904 244 276 55 23 chr5 41849598 41849729 -110687530 + MLT2D LTR ERVL 1 143 -254 4 904 593 293 77 161 chr5 41850132 41850628 -110686631 + MLT2C2 LTR ERVL 4 457 -7 4 904 1371 245 66 30 chr5 41852288 41852650 -110684609 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 4 904 376 303 107 24 chr5 41865308 41865477 -110671782 - MLT1I LTR MaLR -17 394 212 4 904 1893 175 39 29 chr5 41868556 41868938 -110668321 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 904 1092 169 108 28 chr5 41875636 41875885 -110661374 - ORR1A3 LTR MaLR -57 269 1 4 904 927 289 32 28 chr5 41878706 41878959 -110658300 - ORR1E LTR MaLR -105 254 1 4 904 295 281 21 43 chr5 41892617 41892710 -110644549 - LTR37B LTR ERV1 -377 91 1 4 904 1239 282 95 8 chr5 41898471 41898839 -110638420 - MTD LTR MaLR -14 405 6 4 904 798 137 86 11 chr5 41909843 41910013 -110627246 - ORR1A3 LTR MaLR -52 277 100 5 904 390 330 92 27 chr5 41912630 41912814 -110624445 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 166 5 904 3359 171 7 5 chr5 41916305 41916863 -110620396 + RLTR17 LTR ERVK 1 559 -133 5 904 2595 152 14 9 chr5 41918884 41919303 -110617956 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 904 680 330 35 32 chr5 41924297 41924613 -110612646 + LTR40b LTR ERVL 146 462 0 5 904 254 254 218 0 chr5 41927691 41927801 -110609458 - MLT1I LTR MaLR -277 134 1 5 904 3330 58 21 17 chr5 41934727 41935146 -110602113 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 904 227 214 71 0 chr5 41937030 41937086 -110600173 + ORR1E LTR MaLR 52 111 -248 5 904 382 321 70 73 chr5 41937511 41937770 -110599489 + MTEa LTR MaLR 10 267 -112 5 904 257 333 11 21 chr5 41937779 41937874 -110599385 + MT2A LTR ERVL 334 427 -106 5 904 2053 151 97 11 chr5 41941167 41941548 -110595711 - MTC LTR MaLR 0 421 8 5 905 2387 120 3 0 chr5 41951068 41951392 -110585867 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 5 905 366 247 63 25 chr5 41951502 41951660 -110585599 + RMER17C LTR ERVK 112 275 -135 5 905 357 315 255 78 chr5 41954583 41954882 -110582377 + ORR1E LTR MaLR 4 355 -4 5 905 3280 128 14 44 chr5 41964002 41964566 -110572693 - RLTR20A1 LTR ERVK -1 550 4 5 905 1836 185 39 78 chr5 41967419 41967829 -110569430 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 905 723 284 35 0 chr5 41986599 41986800 -110550459 + MLT2B1 LTR ERVL 351 558 -9 5 905 3869 211 74 60 chr5 41987972 41988863 -110548396 + RMER13B LTR ERVK 5 908 0 5 905 2298 153 220 7 chr5 41989043 41989333 -110547926 + RMER6A LTR ERVK 1 330 -390 5 905 2298 163 101 32 chr5 41989440 41989729 -110547530 + RMER6A LTR ERVK 313 744 -12 5 905 383 314 48 101 chr5 41991373 41991600 -110545659 - LTR33B LTR ERVL -288 215 1 6 905 235 247 37 99 chr5 41994698 41994779 -110542480 + LTR88b LTR Gypsy? 661 736 -101 6 905 648 252 32 19 chr5 41998020 41998178 -110539081 - MTE2a LTR MaLR -14 365 206 6 905 760 269 75 34 chr5 41998214 41998506 -110538753 - MTD LTR MaLR -115 304 1 6 905 2134 126 99 19 chr5 41998670 41999035 -110538224 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 905 555 326 89 62 chr5 41999129 41999545 -110537714 + MLT1D LTR MaLR 45 471 -34 6 905 231 264 151 14 chr5 42003188 42003261 -110533998 + MLT2B2 LTR ERVL 24 106 -409 5 905 640 307 88 30 chr5 42003445 42003707 -110533552 + MLT2B2 LTR ERVL 237 513 -2 5 905 379 286 62 0 chr5 42008954 42009066 -110528193 - MLT1H1 LTR MaLR -9 546 428 1 905 446 153 4 44 chr5 42009068 42009166 -110528093 + ORR1C1 LTR MaLR 1 93 -301 1 905 672 250 92 11 chr5 42028423 42028597 -110508662 - MTE2b LTR MaLR -191 188 1 5 905 1899 54 96 4 chr5 42034984 42035245 -110502014 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 285 -42 5 905 294 205 93 35 chr5 42056398 42056484 -110480775 + MT2B LTR ERVL 167 257 -344 9 905 2138 165 53 127 chr5 42056848 42057431 -110479828 + RMER21A LTR ERV1 1 540 -407 9 905 604 204 48 0 chr5 42057402 42057549 -110479710 + RMER21A LTR ERV1 681 834 -8 9 906 457 57 180 11 chr5 42075001 42075090 -110462169 + RMER21B LTR ERV1 327 430 -412 1 906 784 268 134 26 chr5 42078647 42078915 -110458344 - MLT1A0 LTR MaLR -66 299 3 1 906 425 272 40 0 chr5 42083138 42083263 -110453996 - RMER15 LTR ERVL -43 532 403 1 906 873 199 97 0 chr5 42083551 42083727 -110453532 + ORR1D2 LTR MaLR 178 370 0 1 906 426 292 0 26 chr5 42086748 42086771 -110450488 + MT2B LTR ERVL 145 164 -437 1 906 835 315 92 35 chr5 42100906 42101310 -110435949 + MLT1D LTR MaLR 79 505 0 1 906 372 39 0 0 chr5 42102210 42102261 -110434998 - RLTR10 LTR ERVK -339 51 1 1 906 642 160 6 68 chr5 42108149 42108294 -110428965 + RMER17B LTR ERVK 317 454 -504 1 906 642 160 6 68 chr5 42108327 42108342 -110428917 + RMER17B LTR ERVK 455 467 -491 1 906 568 272 79 54 chr5 42109570 42109811 -110427448 + MLT1A0 LTR MaLR 31 277 -88 1 906 1643 176 111 12 chr5 42110337 42110671 -110426588 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 906 1971 212 104 9 chr5 42111357 42111819 -110425440 - RMER20A LTR ERVK 0 516 11 1 906 400 141 0 105 chr5 42140440 42140535 -110396724 - MT2B LTR ERVL -361 240 156 2 906 1584 194 32 18 chr5 42161310 42161652 -110375607 - ORR1C1 LTR MaLR -3 375 29 2 906 3316 38 5 2 chr5 42161746 42162141 -110375118 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 906 732 256 106 0 chr5 42165810 42166037 -110371222 + MTEb LTR MaLR 1 251 -128 2 906 328 225 87 35 chr5 42168417 42168532 -110368727 - ERVL-int LTR ERVL -93 5621 5501 2 906 1305 259 174 19 chr5 42168728 42169256 -110368003 - ERVL-int LTR ERVL -339 5418 4809 2 906 4196 167 40 83 chr5 42169477 42170281 -110366978 + RMER19B LTR ERVK 1 768 -134 2 906 4196 167 40 83 chr5 42170429 42170551 -110366708 + RMER19B LTR ERVK 769 887 -15 2 906 1960 275 115 25 chr5 42171323 42172012 -110365247 - ERVL-int LTR ERVL -2504 3253 2503 2 906 1134 243 30 73 chr5 42172013 42172412 -110364847 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 2 906 1039 213 108 0 chr5 42172424 42172508 -110364751 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 446 2 906 1039 213 108 0 chr5 42172574 42172747 -110364512 - RLTR20C LTR ERVK -89 445 250 2 906 3728 131 8 35 chr5 42172756 42173412 -110363847 - RLTR26 LTR ERVK -3 639 2 2 906 992 184 51 19 chr5 42173423 42173652 -110363607 - RLTR20C LTR ERVK -323 218 5 2 906 308 296 0 0 chr5 42173661 42173742 -110363517 - ERVL-int LTR ERVL -3266 2491 2411 2 906 503 219 25 0 chr5 42173752 42173871 -110363388 + MTEa LTR MaLR 250 371 -8 2 906 1248 284 54 52 chr5 42173877 42174319 -110362940 - ERVL-int LTR ERVL -3532 2182 1740 2 906 436 275 35 14 chr5 42174315 42174459 -110362800 - ERVL-int LTR ERVL -3243 2242 2096 2 906 1582 292 70 65 chr5 42174530 42174923 -110362336 - ERVL-int LTR ERVL -4019 1738 1328 2 906 3127 69 8 0 chr5 42174923 42175316 -110361943 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 906 1582 292 70 65 chr5 42175316 42175597 -110361662 - ERVL-int LTR ERVL -4430 1327 1061 2 906 490 309 76 27 chr5 42175657 42175920 -110361339 - ERVL-int LTR ERVL -4852 862 587 2 906 419 285 106 66 chr5 42187364 42187638 -110349621 + RLTR12B LTR ERVK 19 303 -225 2 906 3183 75 0 0 chr5 42189958 42190358 -110346901 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 906 873 305 124 10 chr5 42203232 42203546 -110333713 - ORR1E LTR MaLR -2 357 8 3 907 2327 72 216 0 chr5 42214829 42215028 -110322231 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 256 -166 3 907 2327 72 216 0 chr5 42215054 42215201 -110322058 + BGLII_Mus LTR ERVK 257 421 -1 3 907 342 340 62 56 chr5 42220530 42220692 -110316567 - MER57E1 LTR ERV1 -207 165 3 3 907 352 189 51 94 chr5 42234631 42234748 -110302511 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 3 907 1880 179 31 58 chr5 42236226 42236662 -110300597 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 907 237 86 0 0 chr5 42246784 42246819 -110290440 - RMER19C LTR ERVK -576 35 1 3 907 1821 160 12 24 chr5 42246819 42247111 -110290148 + ORR1B2 LTR MaLR 40 330 -37 3 907 2380 116 116 104 chr5 42247111 42247552 -110289707 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 907 1821 160 12 24 chr5 42247552 42247567 -110289692 + ORR1B2 LTR MaLR 331 342 -25 3 907 1821 160 12 24 chr5 42248415 42248438 -110288821 + ORR1B2 LTR MaLR 343 367 0 3 907 996 217 5 14 chr5 42248438 42248648 -110288611 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 208 -1301 3 907 558 182 88 36 chr5 42248616 42248753 -110288506 + ORR1B2-int LTR MaLR 1031 1174 -335 3 907 728 239 77 0 chr5 42250730 42250926 -110286333 + MTC-int LTR MaLR 866 1058 -200 3 907 320 182 108 9 chr5 42251119 42251229 -110286030 + MTC-int LTR MaLR 1134 1254 -4 3 907 731 98 27 0 chr5 42251277 42251378 -110285881 + MTC LTR MaLR 1 104 -317 3 907 3890 151 62 47 chr5 42251378 42252313 -110284946 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 3 907 1406 171 125 0 chr5 42252313 42252353 -110284906 + MTC LTR MaLR 99 145 -276 3 907 1406 171 125 0 chr5 42252386 42252632 -110284627 + MTC LTR MaLR 146 420 -1 3 907 316 314 9 9 chr5 42252632 42252721 -110284538 + MTD LTR MaLR 43 131 -288 3 907 338 337 76 17 chr5 42256154 42256326 -110280933 - MER34-int LTR ERV1 -7121 1086 905 3 907 1722 127 43 58 chr5 42256781 42257107 -110280152 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 907 2936 74 165 7 chr5 42257688 42258136 -110279123 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 3 907 433 77 31 0 chr5 42258908 42258973 -110278286 - ORR1A1-int LTR MaLR -1725 67 1 3 907 702 12 0 0 chr5 42258977 42259063 -110278196 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 253 3 907 795 76 0 0 chr5 42259057 42259176 -110278083 - ORR1A1 LTR MaLR -227 119 1 3 907 309 349 9 9 chr5 42266611 42266721 -110270538 + MLT1A0 LTR MaLR 19 128 -237 4 907 766 234 96 79 chr5 42267176 42267519 -110269740 + MTE2a LTR MaLR 1 349 -30 4 907 411 224 13 0 chr5 42269679 42269755 -110267504 - RLTR20C LTR ERVK -10 568 492 4 907 1592 172 66 52 chr5 42269829 42270210 -110267049 - RLTR20C LTR ERVK -148 386 1 4 907 341 277 51 63 chr5 42275863 42276021 -110261238 + LTR41B LTR ERVL 13 168 -590 4 907 277 226 91 36 chr5 42276488 42276598 -110260661 + LTR41B LTR ERVL 574 689 -69 4 907 462 286 60 50 chr5 42285434 42285728 -110251531 - MLT1A0 LTR MaLR 0 390 53 4 907 267 252 85 36 chr5 42285734 42285861 -110251398 + MTEa LTR MaLR 6 142 -237 4 907 683 260 43 75 chr5 42286253 42286507 -110250752 - MLT-int LTR MaLR -16 1719 1474 4 907 2219 96 115 9 chr5 42287274 42287621 -110249638 + MTB_Mm LTR MaLR 16 399 -8 4 907 367 271 113 30 chr5 42289545 42289678 -110247581 - MLT1A0 LTR MaLR -213 152 9 4 907 2673 170 7 9 chr5 42290528 42290950 -110246309 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 907 4301 112 16 47 chr5 42291020 42291640 -110245619 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 4 907 1127 274 57 37 chr5 42291729 42292078 -110245181 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 10 4 907 762 305 54 67 chr5 42292786 42293069 -110244190 - MLT1B LTR MaLR -2 388 114 4 907 762 305 54 67 chr5 42293223 42293329 -110243930 - MLT1B LTR MaLR -277 113 4 4 907 537 312 36 60 chr5 42294122 42294276 -110242983 + MLT1C LTR MaLR 225 382 -85 4 907 1680 141 72 124 chr5 42294276 42294623 -110242636 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 907 537 312 36 60 chr5 42294623 42294717 -110242542 + MLT1C LTR MaLR 383 467 0 4 907 1864 316 67 71 chr5 42295544 42295636 -110241623 - ORR1E-int LTR MaLR -122 1458 1365 4 907 1864 316 67 71 chr5 42295761 42296539 -110240720 - ORR1E-int LTR MaLR -216 1364 592 4 907 1108 307 97 28 chr5 42296855 42297392 -110239867 - ORR1E-int LTR MaLR -1006 574 1 4 907 628 293 103 44 chr5 42297394 42297733 -110239526 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 4 907 1071 248 69 51 chr5 42298621 42299042 -110238217 - MER89 LTR ERV1 -69 490 1 4 907 329 309 210 0 chr5 42299687 42299868 -110237391 - MLT1L LTR MaLR -223 387 169 4 907 804 328 35 24 chr5 42308467 42308807 -110228452 - MLT1A0 LTR MaLR -19 346 3 4 907 2068 171 62 6 chr5 42313480 42313834 -110223425 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 907 306 311 146 43 chr5 42315061 42315288 -110221971 - MLT1C LTR MaLR -134 333 83 4 907 3266 50 44 0 chr5 42315288 42315671 -110221588 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 907 306 311 146 43 chr5 42315671 42315745 -110221514 - MLT1C LTR MaLR -385 82 1 4 907 2865 162 127 2 chr5 42315934 42316454 -110220805 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 907 1819 108 73 73 chr5 42317155 42317484 -110219775 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 907 237 346 75 70 chr5 42319771 42319998 -110217261 + MLT1K LTR MaLR 202 429 -166 4 907 402 274 238 42 chr5 42322574 42322860 -110214399 - MER21B LTR ERV1 -52 811 470 4 907 643 305 117 30 chr5 42323298 42323562 -110213697 - MLT2B3 LTR ERVL -44 626 340 4 907 310 256 35 47 chr5 42323699 42323785 -110213474 - MLT2B3 LTR ERVL -422 295 211 4 907 660 383 59 16 chr5 42323908 42324229 -110213030 - MER21B LTR ERV1 -431 432 98 4 907 338 274 97 0 chr5 42328262 42328375 -110208884 - LTR16A LTR ERVL -96 355 232 4 907 527 327 112 73 chr5 42334132 42334514 -110202745 - LTR16B2 LTR ERVL -34 428 26 5 907 527 327 112 73 chr5 42334867 42334896 -110202363 - LTR16B2 LTR ERVL -437 25 1 5 908 465 349 72 43 chr5 42338515 42338862 -110198397 - MLT1G1 LTR MaLR -222 357 1 5 908 428 294 68 0 chr5 42345645 42345791 -110191468 - RMER15 LTR ERVL -14 561 406 5 908 2768 27 12 0 chr5 42345836 42346170 -110191089 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 1 5 908 14166 44 14 1 chr5 42346170 42347938 -110189321 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 2 5 908 2922 35 3 3 chr5 42347939 42348285 -110188974 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 908 337 235 58 12 chr5 42348295 42348381 -110188878 - RMER15 LTR ERVL -210 365 276 5 908 267 267 138 69 chr5 42348525 42348670 -110188589 - MLT1A1 LTR MaLR -58 350 196 5 908 381 362 25 6 chr5 42353921 42354082 -110183177 - RMER15 LTR ERVL -65 510 347 5 908 679 291 122 37 chr5 42356992 42357022 -110180237 + MTEa LTR MaLR 1 33 -346 5 908 679 276 100 34 chr5 42357190 42357507 -110179752 + MTEa LTR MaLR 34 358 -1 5 908 587 299 78 37 chr5 42366181 42366424 -110170835 - MER57D LTR ERV1 0 411 159 5 908 1344 241 60 57 chr5 42368708 42368950 -110168309 + ORR1D2 LTR MaLR 1 257 -113 5 908 1701 189 63 33 chr5 42368950 42369312 -110167947 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 5 908 1344 241 60 57 chr5 42369312 42369438 -110167821 + ORR1D2 LTR MaLR 258 370 0 5 908 1417 238 72 3 chr5 42369806 42370152 -110167107 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 908 1108 281 77 12 chr5 42376259 42376609 -110160650 + MTD LTR MaLR 1 361 -35 5 908 376 160 245 0 chr5 42380896 42380990 -110156269 + ORR1B2 LTR MaLR 251 367 0 5 908 509 271 127 42 chr5 42380990 42381161 -110156098 + RMER21B LTR ERV1 381 567 -275 5 908 1794 233 25 81 chr5 42381333 42381805 -110155454 - RMER15 LTR ERVL -129 446 1 5 908 1223 216 35 21 chr5 42389355 42389639 -110147620 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 95 5 908 509 218 10 0 chr5 42409101 42409202 -110128057 - ORR1C2 LTR MaLR -272 102 1 5 908 1870 270 51 2 chr5 42410278 42410764 -110126495 + MTE-int LTR MaLR 840 1349 -231 6 908 558 230 108 36 chr5 42411750 42411917 -110125342 + MTE-int LTR MaLR 1355 1533 -47 6 908 374 310 81 92 chr5 42411951 42412235 -110125024 + ORR1E LTR MaLR 71 351 -8 6 908 315 347 95 65 chr5 42412633 42412895 -110124364 - ORR1E LTR MaLR -13 346 77 6 908 555 284 44 39 chr5 42414798 42415003 -110122256 + LTR40a LTR ERVL 312 517 -2 6 908 1473 278 21 19 chr5 42416815 42417189 -110120070 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 6 908 614 347 72 5 chr5 42427189 42427485 -110109774 + MER74A LTR ERVL 26 397 -225 6 908 351 315 111 18 chr5 42446145 42446316 -110090943 - LTR33 LTR ERVL 0 515 329 6 908 2170 180 48 8 chr5 42460480 42460877 -110076382 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 908 6909 60 6 7 chr5 42461408 42461547 -110075712 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 760 6 908 3363 30 5 0 chr5 42461547 42461941 -110075318 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 908 6909 60 6 7 chr5 42461941 42462695 -110074564 - RLTR13B1 LTR ERVK -134 759 1 6 908 819 312 67 29 chr5 42462952 42463265 -110073994 + MLT1A LTR MaLR 2 326 -48 6 908 427 310 96 17 chr5 42465297 42465474 -110071785 - MLT1J1 LTR MaLR -129 315 125 6 908 276 273 91 0 chr5 42465988 42466087 -110071172 + MLT1A LTR MaLR 255 362 -12 6 908 1050 308 91 40 chr5 42466129 42466931 -110070328 + MLT1A-int LTR MaLR 60 886 -849 6 908 276 330 0 76 chr5 42467109 42467227 -110070032 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 6 909 1107 258 140 38 chr5 42467421 42467901 -110069358 - MT2A LTR ERVL -4 529 1 6 909 1378 235 0 231 chr5 42469327 42469869 -110067390 - RMER19C LTR ERVK -194 417 1 6 909 296 282 89 49 chr5 42474118 42474192 -110063067 - MER31B LTR ERV1 -160 306 223 6 909 296 282 89 49 chr5 42474295 42474343 -110062916 - MER31B LTR ERV1 -244 222 180 6 909 483 296 107 0 chr5 42474769 42474938 -110062321 - MER31B LTR ERV1 -269 197 11 6 909 913 218 267 8 chr5 42483938 42484174 -110053085 - RMER15 LTR ERVL -162 413 117 6 909 225 186 67 17 chr5 42497517 42497577 -110039682 - MLT1A LTR MaLR -10 364 302 7 909 563 304 43 154 chr5 42499120 42499470 -110037789 - MLT1A LTR MaLR -58 316 6 7 909 273 315 71 0 chr5 42509419 42509546 -110027713 + MLT1N2 LTR MaLR 419 554 -8 1 909 512 362 84 73 chr5 42510320 42510376 -110026883 + LTR85c LTR Gypsy? 120 175 -648 1 909 1901 177 99 0 chr5 42510376 42510710 -110026549 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 909 512 362 84 73 chr5 42510710 42511306 -110025953 + LTR85c LTR Gypsy? 176 779 -44 1 909 298 340 73 117 chr5 42516033 42516333 -110020926 - MLT1G1 LTR MaLR -22 557 271 2 909 232 346 130 43 chr5 42519970 42520224 -110017035 + MLT1L LTR MaLR 285 560 -50 2 909 425 360 112 7 chr5 42522780 42523049 -110014210 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 64 2 909 239 304 78 128 chr5 42523083 42523130 -110014129 + ORR1D1 LTR MaLR 23 66 -308 3 909 239 304 78 128 chr5 42523889 42524098 -110013161 + ORR1D1 LTR MaLR 67 266 -108 3 909 583 325 66 11 chr5 42535759 42536030 -110001229 + RMER15 LTR ERVL 275 560 -15 4 909 1520 231 87 18 chr5 42536154 42536547 -110000712 + RMER10A LTR ERVL 1 420 -22 4 909 1282 222 123 32 chr5 42536999 42537404 -109999855 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 4 909 265 196 39 43 chr5 42537425 42537508 -109999751 + MLT1A1 LTR MaLR 284 373 -17 4 909 233 293 59 25 chr5 42537662 42537781 -109999478 + MLT1A1 LTR MaLR 488 610 0 4 909 1850 168 7 10 chr5 42539926 42540232 -109997027 + ORR1B2 LTR MaLR 3 307 -60 4 909 447 330 162 6 chr5 42545631 42545951 -109991308 + MLT1L LTR MaLR 215 584 -26 6 909 1518 264 19 13 chr5 42551224 42551600 -109985659 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 6 909 232 213 0 41 chr5 42552383 42552432 -109984827 - MTD LTR MaLR -12 407 361 7 909 313 242 105 0 chr5 42558814 42558909 -109978350 + MLT1H LTR MaLR 43 147 -402 8 909 346 346 7 113 chr5 42561231 42561381 -109975878 - MLT1A LTR MaLR -177 197 64 8 909 327 280 194 63 chr5 42565133 42565339 -109971920 - RMER4B LTR ERVK -11 574 342 9 909 418 302 66 94 chr5 42567930 42568142 -109969117 + MTEb LTR MaLR 161 366 -13 9 909 278 266 139 80 chr5 42579031 42579182 -109958077 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 247 1 910 345 400 114 22 chr5 42599500 42599817 -109937442 - LTR16A LTR ERVL -49 402 57 1 910 281 344 101 62 chr5 42605818 42606026 -109931233 - MLT1J LTR MaLR -173 339 124 1 910 788 296 115 12 chr5 42606988 42607241 -109930018 + MTD LTR MaLR 117 395 -24 1 910 245 419 48 6 chr5 42613184 42613352 -109923907 - MER21B LTR ERV1 -76 787 613 1 910 397 391 122 25 chr5 42613563 42613883 -109923376 - MER21B LTR ERV1 -415 448 98 1 910 725 346 25 8 chr5 42615261 42615506 -109921753 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 117 1 910 2482 169 17 2 chr5 42615525 42615929 -109921330 + MTC LTR MaLR 1 410 -11 1 910 1538 190 152 0 chr5 42622733 42623075 -109914184 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 910 8153 181 52 100 chr5 42623075 42623612 -109913647 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 1441 1 910 8153 181 52 100 chr5 42623665 42625176 -109912083 - ORR1B1-int LTR MaLR -523 1440 16 1 910 307 127 156 16 chr5 42625176 42625240 -109912019 - ORR1B1-int LTR MaLR -1435 74 2 1 910 2067 159 29 19 chr5 42625247 42625624 -109911635 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 1 1 910 361 349 8 8 chr5 42631680 42631807 -109905452 - MLT1C LTR MaLR 0 467 341 1 910 387 320 88 42 chr5 42631856 42632071 -109905188 - MLT1C LTR MaLR -204 263 39 1 910 765 340 89 32 chr5 42646817 42647313 -109889946 - MT2A LTR ERVL -2 531 8 2 910 372 329 94 9 chr5 42650218 42650546 -109886713 - ERVL-E-int LTR ERVL -237 5430 5075 2 910 337 276 125 32 chr5 42651065 42651282 -109885977 + MLT1H-int LTR MaLR 1149 1386 -23 2 910 2948 49 7 47 chr5 42656509 42656913 -109880346 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 2 910 281 333 75 38 chr5 42664821 42664980 -109872279 + ORR1E LTR MaLR 1 165 -194 2 910 2358 42 41 6 chr5 42666992 42667307 -109869952 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 357 0 2 910 2965 18 3 0 chr5 42671464 42671800 -109865459 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 910 13700 21 10 1 chr5 42671800 42673440 -109863819 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4827 2 910 30376 24 9 11 chr5 42673426 42677153 -109860106 - IAPEz-int LTR ERVK -2752 3729 8 2 910 2955 21 3 0 chr5 42677153 42677489 -109859770 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 910 260 226 18 36 chr5 42678434 42678489 -109858770 - ORR1D1 LTR MaLR -22 397 306 2 910 799 274 22 105 chr5 42679857 42680134 -109857125 - ORR1D1 LTR MaLR -55 319 66 2 910 511 313 127 78 chr5 42680135 42680208 -109857051 + ORR1D2 LTR MaLR 73 135 -235 2 910 511 313 127 78 chr5 42680608 42680815 -109856444 + ORR1D2 LTR MaLR 136 370 0 2 910 1480 191 51 85 chr5 42682338 42682516 -109854743 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 195 2 910 1480 191 51 85 chr5 42682577 42682788 -109854471 - ORR1C2 LTR MaLR -190 194 6 2 910 592 342 39 59 chr5 42683723 42684107 -109853152 - MLT2B2 LTR ERVL -62 500 32 2 910 4050 151 104 79 chr5 42688838 42689707 -109847552 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 2 910 3073 61 13 3 chr5 42692254 42692646 -109844613 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 910 252 292 113 10 chr5 42694607 42694704 -109842555 + MLT1F2 LTR MaLR 31 137 -423 2 910 2135 183 31 5 chr5 42707101 42707491 -109829768 + MTC LTR MaLR 14 413 -8 2 910 244 330 110 0 chr5 42712909 42713018 -109824241 + RMER12 LTR ERVK 736 856 -466 2 910 239 268 18 0 chr5 42714908 42714964 -109822295 + RMER15 LTR ERVL 4 60 -515 2 910 1418 262 136 32 chr5 42714990 42715458 -109821801 + RMER15 LTR ERVL 29 546 -29 2 910 1418 262 136 32 chr5 42715500 42715524 -109821735 + RMER15 LTR ERVL 547 572 -3 2 910 979 264 95 17 chr5 42717489 42717836 -109819423 + MLT1B LTR MaLR 10 383 -7 3 910 708 324 105 20 chr5 42720010 42720401 -109816858 + MER89 LTR ERV1 126 549 -10 3 910 1081 182 5 34 chr5 42721315 42721520 -109815739 + MTC LTR MaLR 1 199 -208 3 910 1300 182 0 18 chr5 42723535 42723764 -109813495 + MTC LTR MaLR 197 421 0 3 910 1778 203 34 10 chr5 42726629 42727037 -109810222 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 3 911 710 346 35 50 chr5 42729680 42730081 -109807178 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 286 3 911 318 335 135 11 chr5 42732582 42732760 -109804499 - MLT1E1A LTR MaLR -292 257 58 3 911 679 210 27 20 chr5 42733105 42733251 -109804008 + ORR1D2 LTR MaLR 1 147 -223 3 911 854 283 98 19 chr5 42733411 42733728 -109803531 - MLT1B LTR MaLR -46 344 3 3 911 2984 177 40 8 chr5 42734430 42734954 -109802305 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 3 911 1892 170 10 79 chr5 42736825 42737228 -109800031 - ORR1C1 LTR MaLR -3 375 1 3 911 2383 210 27 80 chr5 42739947 42740548 -109796711 + RMER20B LTR ERVK 3 571 -56 3 911 237 358 10 21 chr5 42748534 42748649 -109788610 + MLT2B4 LTR ERVL 19 136 -379 3 911 325 264 43 94 chr5 42748835 42748859 -109788400 - MLT2B1 LTR ERVL -389 131 1 3 911 357 260 9 88 chr5 42748859 42748973 -109788286 - MTEa LTR MaLR -274 105 1 3 911 836 287 123 101 chr5 42753854 42754269 -109782990 + MLT2B2 LTR ERVL 1 424 -40 3 911 986 335 72 43 chr5 42755408 42755953 -109781306 - MER74A LTR ERVL -52 506 1 3 911 640 66 11 11 chr5 42763673 42763765 -109773494 + RLTR11A2 LTR ERVK 433 524 -3 3 911 1154 270 52 32 chr5 42773548 42773896 -109763363 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 3 911 895 301 13 0 chr5 42773909 42774135 -109763124 + ORR1E-int LTR MaLR 9 237 -1343 3 911 1816 304 72 32 chr5 42774151 42774807 -109762452 + ORR1E-int LTR MaLR 307 988 -592 3 911 331 289 62 62 chr5 42784706 42784835 -109752424 + MLT1I LTR MaLR 275 403 -8 3 911 2088 94 61 10 chr5 42785593 42785906 -109751353 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 911 367 335 171 0 chr5 42786263 42786421 -109750838 + MLT1H LTR MaLR 120 304 -245 3 911 347 348 20 70 chr5 42786396 42786597 -109750662 - MLT1F2 LTR MaLR -347 213 23 3 911 248 297 89 103 chr5 42793721 42793935 -109743324 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 158 4 911 3257 177 43 7 chr5 42796371 42796958 -109740301 - RMER20B LTR ERVK -11 616 9 4 911 409 300 40 67 chr5 42800429 42800579 -109736680 + MLT1A1 LTR MaLR 259 404 -4 4 911 526 305 146 31 chr5 42805105 42805393 -109731866 - MLT2B4 LTR ERVL -231 325 5 4 911 1742 165 57 11 chr5 42807647 42807996 -109729263 + ORR1B2 LTR MaLR 1 365 -2 4 911 1425 205 101 99 chr5 42812762 42813259 -109724000 - RLTR11A LTR ERVK -30 498 1 4 911 267 289 41 178 chr5 42814892 42815111 -109722148 - ORR1E LTR MaLR -55 304 116 4 911 1750 191 53 66 chr5 42815377 42815757 -109721502 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 3 4 911 1179 289 10 118 chr5 42817853 42818269 -109718990 + MTE2a LTR MaLR 1 371 -8 4 911 1423 265 44 6 chr5 42827041 42827379 -109709880 + MTD LTR MaLR 13 363 -56 4 911 349 254 0 0 chr5 42829367 42829434 -109707825 + MTD LTR MaLR 351 417 -2 4 911 766 43 0 0 chr5 42830126 42830219 -109707040 + MT2_Mm LTR ERVL 1 93 -400 4 911 1677 10 0 0 chr5 42830213 42830407 -109706852 + MTA_Mm LTR MaLR 203 396 0 4 911 9135 33 4 2 chr5 42830407 42831503 -109705756 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 911 3523 15 2 0 chr5 42831503 42831898 -109705361 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 911 1005 257 121 27 chr5 42833605 42833937 -109703322 + ORR1D2 LTR MaLR 1 363 -7 4 911 2882 55 0 0 chr5 42834036 42834382 -109702877 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 911 1473 216 117 21 chr5 42841894 42842399 -109694860 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 911 2159 175 5 13 chr5 42842954 42843331 -109693928 + MTB_Mm LTR MaLR 7 380 -27 4 911 811 287 70 26 chr5 42848887 42849116 -109688143 - MTEb LTR MaLR -140 239 1 4 911 1222 216 21 170 chr5 42849302 42849732 -109687527 - ORR1C1 LTR MaLR -12 366 1 4 911 649 195 28 89 chr5 42851293 42851473 -109685786 + ORR1B2 LTR MaLR 1 169 -198 4 911 1161 192 10 0 chr5 42851541 42851739 -109685520 + ORR1B2 LTR MaLR 160 359 -8 4 911 2379 196 32 28 chr5 42851944 42852443 -109684816 + RLTR24 LTR ERV1 22 522 -7 4 911 855 307 91 6 chr5 42853910 42854241 -109683018 + MLT2B4 LTR ERVL 9 367 -189 4 911 837 176 25 0 chr5 42854516 42854675 -109682584 + RMER15 LTR ERVL 10 172 -403 4 911 1994 187 52 37 chr5 42854730 42854929 -109682330 + RMER15 LTR ERVL 165 352 -223 4 911 1994 187 52 37 chr5 42854986 42855191 -109682068 + RMER15 LTR ERVL 353 574 -1 4 911 243 268 0 53 chr5 42859396 42859471 -109677788 - MLT2C2 LTR ERVL -210 254 184 5 912 1033 299 123 7 chr5 42860683 42861097 -109676162 - MT2A LTR ERVL -71 462 1 5 912 486 306 92 67 chr5 42867103 42867361 -109669898 + MLT1A LTR MaLR 81 325 -40 5 912 896 287 136 46 chr5 42870192 42870671 -109666588 + RLTR26 LTR ERVK 1 575 -52 5 912 294 362 47 0 chr5 42874744 42874893 -109662366 - LTR79 LTR ERVL -4 523 368 5 912 692 303 46 135 chr5 42875646 42876062 -109661197 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 912 226 258 65 0 chr5 42886999 42887061 -109650198 + MLT1B LTR MaLR 321 386 -4 5 912 393 357 75 57 chr5 42894995 42895313 -109641946 - LTR40a LTR ERVL -37 482 159 5 912 948 298 43 86 chr5 42903335 42903731 -109633528 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 912 919 274 139 45 chr5 42905141 42905428 -109631831 + MTE2b LTR MaLR 31 344 -35 5 912 639 253 237 28 chr5 42905480 42905772 -109631487 - MTD LTR MaLR -8 411 1 5 912 539 258 85 13 chr5 42907779 42907868 -109629391 - RLTR20C LTR ERVK -1 550 452 5 912 1074 217 266 104 chr5 42907899 42908290 -109628969 - RLTR20C LTR ERVK -100 451 1 5 912 4463 129 113 25 chr5 42918590 42919423 -109617836 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 5 912 1349 307 54 5 chr5 42920224 42920610 -109616649 + MTD LTR MaLR 15 419 0 5 912 1671 191 110 8 chr5 42921045 42921426 -109615833 + MTC LTR MaLR 2 421 0 5 912 1432 244 39 31 chr5 42923005 42923419 -109613840 + MTD LTR MaLR 3 419 0 5 912 320 333 42 69 chr5 42936843 42937123 -109600136 - MTEa LTR MaLR -23 356 98 5 912 342 383 84 42 chr5 42944371 42944795 -109592464 + LTR16B2 LTR ERVL 1 463 0 6 912 325 345 19 90 chr5 42953467 42953623 -109583636 - MLT1D LTR MaLR -76 429 285 6 912 450 314 81 15 chr5 42953636 42953833 -109583426 - MLT1D LTR MaLR -295 210 1 6 912 350 201 5 167 chr5 42960451 42960672 -109576587 + RMER17C LTR ERVK 91 275 -135 6 912 262 167 79 53 chr5 42966187 42966263 -109570996 + RLTR25B LTR ERVK 432 509 -519 6 912 268 347 143 0 chr5 42982674 42982821 -109554438 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 241 6 912 663 253 65 74 chr5 42982842 42983028 -109554231 - ORR1D1 LTR MaLR 0 394 185 6 912 663 249 53 87 chr5 42983079 42983132 -109554127 - ORR1D1 LTR MaLR -190 184 132 6 912 453 327 9 3 chr5 42983108 42983243 -109554016 + MTE-int LTR MaLR 1016 1141 -368 6 912 347 255 53 0 chr5 42988008 42988102 -109549157 + MLT1A1 LTR MaLR 307 405 -3 6 912 1599 236 104 3 chr5 42991135 42991509 -109545750 + MTD LTR MaLR 1 412 -7 6 912 336 200 114 0 chr5 42991506 42991576 -109545683 - ORR1D2 LTR MaLR -31 339 262 6 913 1039 308 13 46 chr5 42993082 42993385 -109543874 - ORR1D2 LTR MaLR -77 293 1 6 913 594 301 140 40 chr5 43001271 43001600 -109535659 - MTEa LTR MaLR -17 362 1 3 913 359 256 0 0 chr5 43011224 43011302 -109525957 - MLT1E2 LTR MaLR -2 625 548 1 913 298 389 70 42 chr5 43011372 43011758 -109525501 - MLT1E2 LTR MaLR -206 421 25 1 913 1770 203 89 25 chr5 43015959 43016353 -109520906 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 2 913 724 285 167 22 chr5 43018702 43019014 -109518245 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 3 913 793 236 89 15 chr5 43020213 43020415 -109516844 - MTD LTR MaLR 0 419 203 3 913 399 326 30 43 chr5 43021396 43021640 -109515619 + MLT1A1 LTR MaLR 83 363 -45 3 913 1173 284 76 3 chr5 43025276 43025605 -109511654 + MTD LTR MaLR 14 366 -53 4 913 305 289 51 45 chr5 43028336 43028492 -109508767 - MamGypLTR2c LTR Gypsy -84 984 828 4 913 228 357 128 9 chr5 43028745 43028971 -109508288 + MLT1D LTR MaLR 119 371 -134 4 913 628 316 36 27 chr5 43040760 43040981 -109496278 + RMER15 LTR ERVL 338 560 -15 6 913 261 310 118 39 chr5 43041579 43041757 -109495502 + RMER15 LTR ERVL 348 539 -36 7 913 1079 219 187 157 chr5 43041765 43042225 -109495034 + MT2A LTR ERVL 1 474 -59 7 913 340 316 115 55 chr5 43047149 43047537 -109489722 + MLT2B1 LTR ERVL 28 491 -63 7 913 1078 264 123 33 chr5 43049129 43049462 -109487797 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 1 8 913 2484 177 46 29 chr5 43050984 43051502 -109485757 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 8 913 631 299 59 99 chr5 43051799 43052223 -109485036 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 8 913 477 289 136 105 chr5 43052285 43052741 -109484518 + MTC-int LTR MaLR 531 1104 -154 8 913 798 273 36 116 chr5 43052776 43053112 -109484147 + MTE2a LTR MaLR 7 315 -64 8 913 680 270 242 8 chr5 43064650 43064963 -109472296 + MTD LTR MaLR 18 419 0 1 913 396 313 87 58 chr5 43068984 43069191 -109468068 + MLT1A1 LTR MaLR 1 213 -195 1 913 3880 190 20 144 chr5 43074559 43075480 -109461779 - RMER19B LTR ERVK 0 902 111 1 913 3880 190 20 144 chr5 43075912 43076019 -109461240 - RMER19B LTR ERVK -792 110 1 1 913 782 314 35 4 chr5 43077717 43077976 -109459283 - RMER5 LTR ERV1 -31 503 237 1 913 343 240 106 16 chr5 43078002 43078125 -109459134 - RMER5 LTR ERV1 -368 166 33 1 913 2047 213 29 207 chr5 43087725 43087748 -109449511 - RMER19C LTR ERVK -18 593 578 1 913 2047 213 29 207 chr5 43087772 43088469 -109448790 - RMER19C LTR ERVK -34 577 1 1 913 1357 172 80 55 chr5 43113955 43114355 -109422904 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 913 783 343 52 23 chr5 43119804 43120147 -109417112 + MLT1A0 LTR MaLR 1 353 -12 1 914 349 225 70 26 chr5 43133336 43133450 -109403809 - ORR1D1 LTR MaLR -61 313 195 1 914 1755 222 84 0 chr5 43134303 43134659 -109402600 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 914 2234 238 27 25 chr5 43134669 43135281 -109401978 + ORR1B1-int LTR MaLR 3 560 -949 1 914 321 143 0 0 chr5 43135277 43135326 -109401933 + ORR1B1 LTR MaLR 328 376 -2 1 914 411 285 54 104 chr5 43154855 43155137 -109382122 - MLT1E1 LTR MaLR -6 674 406 1 914 557 240 75 43 chr5 43158900 43158996 -109378263 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 434 1 914 784 211 330 72 chr5 43159035 43159333 -109377926 - RLTR20C LTR ERVK -101 433 60 1 914 251 238 96 89 chr5 43162423 43162580 -109374679 + ORR1B1-int LTR MaLR 269 426 -1083 1 914 323 323 118 57 chr5 43166172 43166226 -109371033 + MT2A LTR ERVL 182 238 -295 1 914 323 323 118 57 chr5 43166278 43166555 -109370704 + MT2A LTR ERVL 239 533 0 1 914 318 335 143 25 chr5 43170252 43170497 -109366762 - MLT2B5 LTR ERVL -196 405 132 1 914 245 389 33 46 chr5 43170453 43170604 -109366655 - MTEb LTR MaLR -230 149 1 2 914 2586 89 75 3 chr5 43182414 43182787 -109354472 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 914 1034 306 19 44 chr5 43183300 43183621 -109353638 + MTE2a LTR MaLR 65 377 -2 2 914 1146 319 30 3 chr5 43193052 43193391 -109343868 - MTE2b LTR MaLR -31 348 1 2 914 531 311 47 14 chr5 43193391 43193606 -109343653 - MTE2b-int LTR MaLR 0 1580 1359 2 914 1779 234 63 44 chr5 43196958 43197463 -109339796 + RLTR17 LTR ERVK 105 619 -73 2 914 239 191 0 21 chr5 43197452 43197500 -109339759 + RLTR31_Mur LTR ERVK 507 553 0 2 914 1275 304 79 29 chr5 43197841 43198501 -109338758 + RMER15-int LTR ERVL 947 1639 -3360 2 914 515 41 164 0 chr5 43199922 43199995 -109337264 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 242 2 914 412 108 163 35 chr5 43200083 43200095 -109337164 - ORR1A3 LTR MaLR -87 280 271 2 914 1672 124 43 10 chr5 43202079 43202362 -109334897 - ORR1A2 LTR MaLR -23 347 1 2 914 930 302 56 50 chr5 43205980 43206301 -109330958 + MTE2a LTR MaLR 57 379 0 2 914 2310 71 15 21 chr5 43222150 43222479 -109314780 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 2 914 52186 27 12 11 chr5 43222480 43228946 -109308313 + IAPEz-int LTR ERVK 9 6479 -2 2 914 2355 68 15 21 chr5 43228948 43229277 -109307982 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 2 914 278 327 29 118 chr5 43234645 43234815 -109302444 + MTEb LTR MaLR 5 159 -220 2 914 327 337 10 0 chr5 43236350 43236448 -109300811 - MTEb LTR MaLR -2 377 279 2 914 791 360 113 3 chr5 43236540 43236921 -109300338 - MTE-int LTR MaLR -242 1338 916 2 914 250 354 86 68 chr5 43236924 43237145 -109300114 + MTE-int LTR MaLR 492 716 -864 2 914 369 321 17 43 chr5 43237358 43237475 -109299784 + MTE-int LTR MaLR 318 431 -1149 2 914 348 361 132 0 chr5 43237539 43237744 -109299515 - MTE-int LTR MaLR -1348 232 1 2 914 300 374 0 0 chr5 43238458 43238557 -109298702 - ORR1E LTR MaLR -251 108 10 2 914 3413 33 0 2 chr5 43238632 43239029 -109298230 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 914 9110 37 9 0 chr5 43239029 43240117 -109297142 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 914 3403 35 0 0 chr5 43240117 43240513 -109296746 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 914 2099 125 25 0 chr5 43241066 43241385 -109295874 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 914 1059 262 51 97 chr5 43242480 43242873 -109294386 - MTEb LTR MaLR -2 377 3 2 914 273 353 114 34 chr5 43243135 43243399 -109293860 - MLT1H-int LTR MaLR -619 790 506 2 914 1313 130 10 5 chr5 43245015 43245224 -109292035 + ORR1B1 LTR MaLR 183 392 -2 2 914 6662 186 102 127 chr5 43245226 43245672 -109291587 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 523 -1440 2 914 6662 186 102 127 chr5 43246006 43246425 -109290834 + ORR1B1-int LTR MaLR 524 860 -1103 2 914 6662 186 102 127 chr5 43246468 43247554 -109289705 + ORR1B1-int LTR MaLR 861 1904 -59 2 914 2240 158 0 54 chr5 43247581 43247989 -109289270 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 2 914 356 361 123 36 chr5 43248323 43248682 -109288577 - LTR16A LTR ERVL -31 420 31 2 914 324 170 0 0 chr5 43248708 43248761 -109288498 - ORR1B1 LTR MaLR -338 56 4 2 914 384 293 38 109 chr5 43251421 43251632 -109285627 - RMER20B LTR ERVK -7 620 425 2 914 480 214 82 0 chr5 43251956 43252054 -109285205 - RMER20B LTR ERVK -215 412 307 2 114 886 222 189 11 chr5 43253648 43253911 -109283348 - RMER20B LTR ERVK -317 310 1 2 915 1098 300 49 38 chr5 43259858 43260225 -109277034 - MLT1B LTR MaLR -19 371 1 3 915 822 306 82 26 chr5 43265568 43265910 -109271349 + MLT2B4 LTR ERVL 10 370 -186 3 915 1564 216 10 19 chr5 43265916 43266228 -109271031 - MTD LTR MaLR -2 417 109 3 915 358 265 100 20 chr5 43268019 43268119 -109269140 - MTD LTR MaLR -299 120 13 3 915 1757 203 65 51 chr5 43268437 43268454 -109268805 - MTC LTR MaLR 0 421 411 3 915 2907 114 99 26 chr5 43268454 43268951 -109268308 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 3 915 1757 203 65 51 chr5 43268951 43269348 -109267911 - MTC LTR MaLR -11 410 1 3 915 1003 265 22 122 chr5 43269348 43269718 -109267541 + MTE2a LTR MaLR 50 379 0 3 915 828 336 38 84 chr5 43271484 43271958 -109265301 + MLT1C LTR MaLR 1 452 -15 3 915 483 271 32 79 chr5 43272641 43272951 -109264308 + RMER13A LTR ERVK 565 852 -56 3 915 273 272 17 29 chr5 43277912 43277972 -109259287 - RMER17D LTR ERVK -384 505 444 3 915 273 272 17 29 chr5 43278012 43278125 -109259134 - RMER17D LTR ERVK -446 443 334 3 915 273 296 114 97 chr5 43280639 43280867 -109256392 + ORR1E LTR MaLR 1 232 -127 3 915 2167 156 80 0 chr5 43286755 43287120 -109250139 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 915 2312 169 35 10 chr5 43289377 43289783 -109247476 - MTC LTR MaLR -3 418 3 3 915 285 324 32 29 chr5 43296691 43296806 -109240453 - MLT1D LTR MaLR -386 119 6 3 915 1530 162 86 0 chr5 43302250 43302528 -109234731 - ORR1B1 LTR MaLR -89 305 4 3 915 2339 70 3 22 chr5 43302983 43303303 -109233956 - MTA_Mm LTR MaLR -55 341 28 3 915 274 321 152 35 chr5 43307974 43308145 -109229114 - LTR50 LTR ERVL -592 203 13 3 915 609 287 169 62 chr5 43308989 43309309 -109227950 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 3 915 270 294 76 29 chr5 43311947 43312052 -109225207 + MLT1E1A LTR MaLR 3 112 -448 3 915 667 300 125 45 chr5 43312124 43312501 -109224758 + MLT1E1A LTR MaLR 274 680 0 3 915 497 279 102 35 chr5 43314688 43314942 -109222317 - MTEa LTR MaLR 0 379 15 3 915 225 345 35 52 chr5 43318249 43318365 -109218894 + MLT1A1 LTR MaLR 19 132 -242 3 915 283 262 23 23 chr5 43318560 43318646 -109218613 + MLT1A1 LTR MaLR 318 403 -5 3 915 2345 161 39 10 chr5 43318848 43319257 -109218002 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 915 525 214 0 19 chr5 43322951 43323056 -109214203 - MTC LTR MaLR -4 417 315 3 915 245 276 58 132 chr5 43322976 43323097 -109214162 - MamGypLTR1d LTR Gypsy -633 180 69 3 915 622 256 135 40 chr5 43327464 43327790 -109209469 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 4 915 313 367 0 0 chr5 43330919 43330998 -109206261 + ORR1D2 LTR MaLR 117 195 -175 4 915 2315 158 90 53 chr5 43357002 43357491 -109179768 - RMER15 LTR ERVL -57 518 12 4 915 590 249 43 58 chr5 43360027 43360215 -109177044 + MLT1A0 LTR MaLR 17 201 -164 4 915 1394 203 88 9 chr5 43360502 43360845 -109176414 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 915 521 345 70 65 chr5 43363999 43364371 -109172888 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 21 4 915 243 263 51 26 chr5 43368334 43368412 -109168847 - MTE2a LTR MaLR -18 361 282 4 915 392 282 48 0 chr5 43369576 43369679 -109167580 - MLT1A1 LTR MaLR -279 129 22 4 915 516 316 93 52 chr5 43370604 43370914 -109166345 - MLT1B LTR MaLR -52 338 16 4 915 529 227 31 151 chr5 43371183 43371232 -109166027 + MTEa LTR MaLR 206 251 -128 4 915 3311 38 2 12 chr5 43371232 43371632 -109165627 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 915 529 227 31 151 chr5 43371632 43371774 -109165485 + MTEa LTR MaLR 252 374 -5 4 915 573 311 141 8 chr5 43371816 43372072 -109165187 - MLT1C LTR MaLR -173 294 5 4 915 419 308 90 46 chr5 43375345 43375624 -109161635 + MLT2B1 LTR ERVL 107 489 -78 4 915 901 274 50 84 chr5 43376475 43376834 -109160425 + MTEa LTR MaLR 4 350 -29 4 915 459 260 152 33 chr5 43378654 43379012 -109158247 - MLT1B LTR MaLR -56 411 2 4 915 3137 64 8 2 chr5 43380111 43380505 -109156754 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 915 892 200 219 16 chr5 43380965 43381300 -109155959 - MTD LTR MaLR 0 419 6 4 916 285 335 158 18 chr5 43398475 43398761 -109138498 - MLT1H LTR MaLR -181 368 43 4 916 266 354 0 0 chr5 43409003 43409082 -109128177 - MLT1J LTR MaLR -203 309 231 4 916 236 250 18 0 chr5 43411537 43411593 -109125666 - MLT1H LTR MaLR -454 58 2 4 916 896 295 46 114 chr5 43417743 43418137 -109119122 - MTE2a LTR MaLR -12 367 1 5 916 436 358 96 57 chr5 43425973 43426391 -109110868 + LTR16A LTR ERVL 1 434 -17 5 916 632 280 47 137 chr5 43428830 43429173 -109108086 - ORR1E LTR MaLR -41 318 7 5 916 596 311 55 100 chr5 43430810 43431139 -109106120 - MLT1A LTR MaLR -4 370 57 5 916 447 293 223 52 chr5 43432113 43432424 -109104835 - MLT1D LTR MaLR -27 478 124 5 916 2723 169 182 11 chr5 43432424 43432946 -109104313 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 916 447 293 223 52 chr5 43432946 43433037 -109104222 - MLT1D LTR MaLR -382 123 7 5 916 620 323 15 15 chr5 43435196 43435397 -109101862 - MLT1A0 LTR MaLR -164 201 1 5 916 349 320 102 32 chr5 43436032 43436212 -109101047 + MLT1C LTR MaLR 262 433 -34 5 916 349 310 113 25 chr5 43436260 43436280 -109100979 + MLT1C LTR MaLR 434 459 -8 5 916 227 256 93 62 chr5 43437253 43437382 -109099877 + LTR16E1 LTR ERVL 403 535 -3 5 916 800 311 90 58 chr5 43449040 43449527 -109087732 + MER89 LTR ERV1 3 505 -54 5 916 3603 13 2 0 chr5 43450290 43450685 -109086574 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 916 9270 34 4 2 chr5 43450685 43451781 -109085478 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 916 3603 13 2 0 chr5 43451781 43452176 -109085083 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 916 305 280 158 8 chr5 43452502 43452635 -109084624 + MLT1B LTR MaLR 1 153 -237 5 916 553 283 91 26 chr5 43453172 43453404 -109083855 + MLT1B LTR MaLR 45 291 -99 5 916 556 284 78 133 chr5 43454661 43455173 -109082086 - MLT2B4 LTR ERVL -67 489 6 5 916 330 250 9 36 chr5 43465409 43465521 -109071738 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 300 5 916 273 314 150 26 chr5 43465869 43466095 -109071164 + MLT1H LTR MaLR 36 289 -260 5 916 1750 201 7 54 chr5 43471846 43472292 -109064967 + RMER10A LTR ERVL 1 425 -17 5 916 651 296 102 28 chr5 43477447 43477472 -109059787 - MLT1C LTR MaLR 0 467 443 5 916 1882 213 56 23 chr5 43477472 43477900 -109059359 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 5 5 916 651 296 102 28 chr5 43477900 43478274 -109058985 - MLT1C LTR MaLR -25 442 38 5 916 5186 126 64 16 chr5 43506606 43507452 -109029807 - RMER19B LTR ERVK -16 886 1 8 916 344 255 60 60 chr5 43510933 43511083 -109026176 + MLT1C LTR MaLR 82 231 -159 1 916 427 244 106 32 chr5 43511465 43511544 -109025715 + MLT1C LTR MaLR 336 427 -40 1 916 1552 138 206 13 chr5 43511544 43511845 -109025414 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 916 427 244 106 32 chr5 43511845 43511888 -109025371 + MLT1C LTR MaLR 428 467 0 1 114 1864 189 46 48 chr5 43515822 43516255 -109021004 - BGLII_B LTR ERVK -9 432 1 2 917 2156 136 196 3 chr5 43516527 43516880 -109020379 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 917 293 263 97 39 chr5 43517717 43517820 -109019439 - MLT1C LTR MaLR -73 394 286 2 917 1654 201 24 120 chr5 43519308 43519485 -109017774 + ORR1C2 LTR MaLR 1 154 -230 3 917 1654 201 24 120 chr5 43519632 43519879 -109017380 + ORR1C2 LTR MaLR 155 384 0 3 917 3121 232 93 33 chr5 43519879 43520729 -109016530 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 901 -469 3 917 1074 182 32 28 chr5 43520762 43520992 -109016267 + ORR1C2 LTR MaLR 97 383 -1 3 917 226 258 15 61 chr5 43530361 43530427 -109006832 - MLT1D LTR MaLR -9 586 524 4 917 242 226 55 77 chr5 43532874 43532965 -109004294 - MLT1D LTR MaLR 0 467 379 4 917 485 286 83 0 chr5 43533133 43533266 -109003993 - MLT1D LTR MaLR -344 161 18 4 917 849 264 100 36 chr5 43538979 43539258 -108998001 - MLT2C2 LTR ERVL -60 404 108 5 917 280 316 29 21 chr5 43550861 43551012 -108986247 + MuRRS4-int LTR ERV1 4572 4690 -373 7 917 276 303 41 34 chr5 43552302 43552449 -108984810 - ORR1E LTR MaLR -211 148 1 7 917 384 229 126 9 chr5 43556806 43556911 -108980348 - MTD LTR MaLR 0 419 267 8 917 263 271 121 57 chr5 43557253 43557394 -108979865 - MTD LTR MaLR -129 292 143 8 917 407 256 113 0 chr5 43557992 43558125 -108979134 - MTD LTR MaLR -267 152 5 8 917 229 372 11 48 chr5 43558965 43559154 -108978105 + MLT1C LTR MaLR 286 467 0 9 917 809 279 8 21 chr5 43564105 43564333 -108972926 + ORR1E LTR MaLR 1 221 -149 1 917 853 264 63 93 chr5 43566135 43566469 -108970790 - ORR1D2 LTR MaLR -17 353 18 1 917 853 264 63 93 chr5 43567099 43567128 -108970131 - ORR1D2 LTR MaLR -353 17 1 1 917 581 260 73 44 chr5 43567701 43567906 -108969353 - MTEa LTR MaLR -163 216 6 1 917 1623 230 64 0 chr5 43574851 43575242 -108962017 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 1 917 239 229 13 103 chr5 43576049 43576127 -108961132 + MTEa LTR MaLR 22 92 -287 1 917 238 258 109 63 chr5 43576183 43576357 -108960902 + MTEa LTR MaLR 67 248 -111 1 917 356 260 38 30 chr5 43578666 43578797 -108958462 + ORR1E LTR MaLR 20 151 -208 1 917 974 248 131 7 chr5 43578786 43579083 -108958176 - MTD LTR MaLR -83 336 3 1 917 273 228 104 47 chr5 43579216 43579322 -108957937 - MLT1A1 LTR MaLR -296 112 1 1 917 260 384 83 18 chr5 43581332 43581560 -108955699 - LTR16B1 LTR ERVL -2 478 236 1 917 677 325 21 86 chr5 43590135 43590461 -108946798 + ORR1E LTR MaLR 20 324 -35 1 917 1576 187 46 76 chr5 43591145 43591185 -108946074 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 346 1 917 1576 187 46 76 chr5 43591356 43591503 -108945756 - ORR1C2 LTR MaLR -39 345 187 1 917 1576 187 46 76 chr5 43591529 43591734 -108945525 - ORR1C2 LTR MaLR -198 186 2 1 917 889 222 53 41 chr5 43591799 43592137 -108945122 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 1 917 741 233 5 43 chr5 43593255 43593434 -108943825 - ORR1C2 LTR MaLR -15 369 199 1 917 741 233 5 43 chr5 43593461 43593492 -108943767 - ORR1C2 LTR MaLR -186 198 168 1 917 625 238 5 145 chr5 43593557 43593778 -108943481 - ORR1C2 LTR MaLR -184 190 1 1 917 4512 210 58 45 chr5 43593778 43594964 -108942295 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 170 1 917 2445 29 16 3 chr5 43595984 43596301 -108940958 + MT2_Mm LTR ERVL 53 373 -120 1 917 6724 16 1 0 chr5 43599179 43599920 -108937339 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 1 917 68162 15 6 0 chr5 43599920 43607479 -108929780 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1 7601 0 1 917 6709 18 1 0 chr5 43607479 43608220 -108929039 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 1 917 1247 154 8 38 chr5 43609107 43609343 -108927916 - MT2B LTR ERVL -372 229 1 1 917 330 214 39 39 chr5 43609252 43609354 -108927905 - ORR1A3-int LTR MaLR -1259 704 603 1 917 248 222 19 0 chr5 43611901 43611955 -108925304 - MTD LTR MaLR -7 414 360 1 917 705 243 81 17 chr5 43611951 43612123 -108925136 - MTD LTR MaLR -233 186 4 1 917 1135 288 32 62 chr5 43616305 43616675 -108920584 + MTEa LTR MaLR 6 364 -15 1 917 970 308 65 50 chr5 43620230 43620750 -108916509 - MT2A LTR ERVL -5 528 1 1 917 1429 184 181 17 chr5 43636127 43636395 -108900864 - MTC LTR MaLR -1 420 138 2 917 1429 184 181 17 chr5 43636425 43636515 -108900744 - MTC LTR MaLR -284 137 4 2 917 824 274 113 75 chr5 43638048 43638474 -108898785 - MLT1F LTR MaLR 0 548 107 2 918 1354 229 113 0 chr5 43649783 43650119 -108887140 + ORR1C2 LTR MaLR 11 384 0 2 918 228 373 93 28 chr5 43650124 43650339 -108886920 - MLT1J LTR MaLR -153 359 131 2 918 481 258 75 37 chr5 43665585 43665746 -108871513 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 361 2 918 301 264 11 11 chr5 43666440 43666528 -108870731 - RMER5 LTR ERV1 -217 317 230 2 918 3068 50 41 28 chr5 43683452 43683843 -108853416 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 918 4597 87 17 5 chr5 43685815 43686407 -108850852 - MT2B LTR ERVL 0 601 3 2 918 680 324 55 50 chr5 43687406 43687786 -108849473 - MTE-int LTR MaLR -1136 444 63 2 918 245 343 73 45 chr5 43694278 43694388 -108842871 - MER77 LTR ERVL -277 330 218 2 918 388 307 102 18 chr5 43694299 43694465 -108842794 - MER21B LTR ERV1 -556 307 128 2 918 3208 28 3 11 chr5 43695930 43696290 -108840969 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 2 918 226 198 112 56 chr5 43698922 43699029 -108838230 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 2 918 903 311 58 17 chr5 43699187 43699572 -108837687 - MLT2B2 LTR ERVL -65 497 1 3 918 398 217 25 11 chr5 43700343 43700443 -108836816 + ORR1D2 LTR MaLR 272 374 -5 3 918 1754 359 91 34 chr5 43701812 43702407 -108834852 - MTE-int LTR MaLR -357 1223 621 3 918 1291 224 75 45 chr5 43702407 43702766 -108834493 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 918 1754 359 91 34 chr5 43702766 43703166 -108834093 - MTE-int LTR MaLR -960 620 171 3 918 532 199 95 7 chr5 43703216 43703353 -108833906 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2178 2326 0 3 918 1767 198 106 72 chr5 43703354 43703881 -108833378 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 545 -32 3 918 432 341 18 18 chr5 43704644 43704811 -108832448 - MTE-int LTR MaLR -1400 180 14 3 918 367 244 9 1 chr5 43710628 43710734 -108826525 - MTEa LTR MaLR -2 377 273 3 918 2039 116 22 16 chr5 43710738 43711054 -108826205 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 3 918 331 307 15 59 chr5 43711097 43711232 -108826027 - MTEa LTR MaLR -157 222 94 3 918 369 222 63 25 chr5 43715914 43716042 -108821217 + MLT1A1 LTR MaLR 300 460 -7 3 918 1216 280 101 45 chr5 43717098 43717409 -108819850 - MTD LTR MaLR 0 419 75 3 918 1216 280 101 45 chr5 43717586 43717671 -108819588 - MTD LTR MaLR -345 74 1 3 918 536 167 0 0 chr5 43717931 43718021 -108819238 - ORR1D2 LTR MaLR -12 358 269 3 918 2474 77 61 0 chr5 43724233 43724559 -108812700 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 918 464 308 143 52 chr5 43726249 43726578 -108810681 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 37 3 918 500 289 53 43 chr5 43727621 43727809 -108809450 + MLT1A0 LTR MaLR 10 199 -166 3 918 2673 145 67 18 chr5 43733674 43734167 -108803092 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 10 3 918 234 222 51 198 chr5 43735078 43735275 -108801984 + MTEb LTR MaLR 201 368 -11 3 918 1404 209 88 26 chr5 43735714 43736082 -108801177 + MTD LTR MaLR 12 405 -14 3 918 2293 116 39 8 chr5 43736212 43736568 -108800691 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 918 7355 24 9 7 chr5 43736570 43737418 -108799841 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5630 3 918 25426 30 36 4 chr5 43737404 43740380 -108796879 - IAPEz-int LTR ERVK -3405 3076 8 3 918 2293 116 39 8 chr5 43740380 43740736 -108796523 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 918 859 263 73 23 chr5 43746912 43747212 -108790047 - MTEb LTR MaLR -2 377 63 3 918 236 143 0 0 chr5 43747271 43747313 -108789946 - MTEb LTR MaLR -332 47 6 3 918 398 281 10 0 chr5 43753811 43753907 -108783352 - MLT2B3 LTR ERVL -457 97 1 3 918 402 293 67 79 chr5 43753907 43754163 -108783096 + MLT1B LTR MaLR 114 366 -24 3 918 618 267 265 7 chr5 43755918 43756212 -108781047 + MTE2b LTR MaLR 8 377 -2 3 918 576 319 95 4 chr5 43765568 43765842 -108771417 - MLT1B LTR MaLR -91 299 1 3 918 2247 130 120 25 chr5 43767427 43767861 -108769398 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 918 227 143 24 0 chr5 43768524 43768566 -108768693 + MLT1J2 LTR MaLR 389 431 -17 3 918 273 323 21 63 chr5 43770088 43770230 -108767029 + MLT1J1 LTR MaLR 26 162 -286 4 918 1956 129 3 80 chr5 43772352 43772714 -108764545 + ORR1B1 LTR MaLR 53 386 -8 4 918 251 284 20 40 chr5 43775304 43775403 -108761856 - MTEa LTR MaLR -4 375 279 4 918 320 313 25 57 chr5 43776367 43776526 -108760733 + ORR1D2 LTR MaLR 27 180 -190 4 919 316 295 11 11 chr5 43778210 43778299 -108758960 - RMER20B LTR ERVK -14 613 525 4 919 1753 228 183 8 chr5 43778392 43778901 -108758358 - RMER20B LTR ERVK -29 598 1 4 919 298 161 0 75 chr5 43779586 43779653 -108757606 + ORR1C2 LTR MaLR 101 162 -222 4 919 780 198 148 6 chr5 43780323 43780506 -108756753 + ORR1C2 LTR MaLR 175 383 -1 4 919 468 344 119 22 chr5 43780857 43781125 -108756134 + LTR16B LTR ERVL 170 463 0 4 919 771 229 72 128 chr5 43790805 43791125 -108746134 + MTEb LTR MaLR 65 366 -13 4 919 447 311 153 32 chr5 43794144 43794482 -108742777 - MLT1A1 LTR MaLR 0 365 1 4 919 400 189 72 116 chr5 43812830 43812937 -108724322 - MLT1A0 LTR MaLR -233 132 22 4 919 2210 108 69 0 chr5 43812937 43813243 -108724016 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 919 400 189 72 116 chr5 43813243 43813273 -108723986 - MLT1A0 LTR MaLR -344 21 1 4 919 1203 176 85 37 chr5 43816630 43816717 -108720542 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 446 4 919 1203 160 262 21 chr5 43816793 43817074 -108720185 - RLTR20C LTR ERVK -89 445 1 4 919 1000 50 0 0 chr5 43817298 43817419 -108719840 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 172 4 919 2134 42 5 11 chr5 43823647 43824060 -108713199 - RLTR10C LTR ERVK -96 340 1 4 919 655 343 93 66 chr5 43827206 43827721 -108709538 + MER21B LTR ERV1 131 659 -204 4 919 716 301 37 29 chr5 43835077 43835280 -108701979 - MTD LTR MaLR -171 248 40 5 919 716 301 37 29 chr5 43835498 43835540 -108701719 - MTD LTR MaLR -380 39 1 5 919 1129 204 21 29 chr5 43837099 43837337 -108699922 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 139 5 919 2757 128 35 0 chr5 43841516 43841939 -108695320 + RMER19A LTR ERVK 1 438 -299 5 919 1566 255 39 22 chr5 43842044 43842517 -108694742 + RLTR20B3 LTR ERVK 92 548 -15 5 919 1899 84 75 20 chr5 43842529 43842821 -108694438 + RMER19A LTR ERVK 430 737 0 5 919 592 173 228 0 chr5 43846448 43846575 -108690684 - ORR1D1 LTR MaLR -218 156 1 5 919 660 278 286 11 chr5 43850275 43850555 -108686704 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 5 919 3461 185 120 10 chr5 43851407 43852173 -108685086 + RLTR25B LTR ERVK 5 854 -174 5 919 613 225 100 132 chr5 43852523 43852682 -108684577 + RLTR25B LTR ERVK 758 893 -135 5 919 613 225 100 132 chr5 43852762 43852853 -108684406 + RLTR25B LTR ERVK 894 1000 -28 5 919 379 286 60 60 chr5 43859234 43859383 -108677876 - LTR52 LTR ERVL -262 159 11 5 919 281 309 103 54 chr5 43862745 43862930 -108674329 + ORR1D2 LTR MaLR 61 254 -116 5 919 236 297 31 0 chr5 43865158 43865222 -108672037 - RMER15 LTR ERVL -116 459 394 5 919 239 279 41 110 chr5 43865453 43865598 -108671661 - MLT1I LTR MaLR -1 410 276 5 919 339 321 97 32 chr5 43867303 43867519 -108669740 + MLT1D LTR MaLR 262 491 -14 5 919 294 328 84 27 chr5 43870201 43870339 -108666920 + MLT1A0 LTR MaLR 211 371 -37 5 919 1758 189 61 3 chr5 43871306 43871650 -108665609 + MTEb LTR MaLR 15 378 -1 5 919 2369 186 10 17 chr5 43871957 43872367 -108664892 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 919 5055 38 2 0 chr5 43882449 43883063 -108654196 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 189 5 919 1350 90 15 0 chr5 43889355 43889556 -108647703 - RLTR13B4 LTR ERVK -599 204 1 5 919 518 329 76 60 chr5 43891765 43892147 -108645112 - MLT2C1 LTR ERVL -5 392 5 5 919 1385 251 28 31 chr5 43893496 43893849 -108643410 - MTE2b LTR MaLR -26 353 2 5 919 1787 135 12 63 chr5 43896443 43896775 -108640484 - ORR1A4 LTR MaLR -5 324 10 5 919 3646 211 91 49 chr5 43896793 43897884 -108639375 + RMER12 LTR ERVK 1 1137 -185 5 919 538 311 28 22 chr5 43898076 43898257 -108639002 + RMER12 LTR ERVK 1141 1322 0 5 919 422 302 40 13 chr5 43898909 43899060 -108638199 - MLT1A LTR MaLR -214 160 6 5 919 326 191 130 28 chr5 43901146 43901254 -108636005 + ORR1E LTR MaLR 7 125 -234 5 919 234 372 83 21 chr5 43905111 43905438 -108631821 - MLT1J-int LTR MaLR -1040 347 1 5 920 296 258 0 20 chr5 43911646 43911745 -108625514 - MamGypLTR1b LTR Gypsy -13 769 673 5 920 305 213 120 0 chr5 43914596 43914671 -108622588 + MLT1A1 LTR MaLR 316 399 -9 6 920 1443 258 11 17 chr5 43915409 43915771 -108621488 - MTE2b LTR MaLR -7 372 13 6 920 2172 77 6 87 chr5 43927179 43927250 -108610009 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 270 6 920 2172 77 6 87 chr5 43927447 43927731 -108609528 - ORR1A2 LTR MaLR -58 269 1 6 920 245 307 36 73 chr5 43928424 43928561 -108608698 - ORR1E LTR MaLR -224 135 4 6 920 476 310 88 59 chr5 43931495 43931834 -108605425 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 17 6 920 365 284 112 0 chr5 43934319 43934435 -108602824 - MLT1K LTR MaLR -2 593 465 6 920 488 282 119 68 chr5 43940024 43940291 -108596968 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 87 6 920 300 370 5 32 chr5 43947599 43947786 -108589473 - MLT1J LTR MaLR -78 434 253 6 920 429 180 16 32 chr5 43957884 43958010 -108579249 - RMER17B LTR ERVK -499 459 336 6 920 410 376 44 28 chr5 43961069 43961318 -108575941 - MER74A LTR ERVL -250 308 56 6 920 357 188 68 55 chr5 43962888 43963051 -108574208 + RMER17C LTR ERVK 108 272 -138 6 920 589 344 37 34 chr5 43966394 43966749 -108570510 + ORR1E LTR MaLR 2 357 -2 6 920 300 250 0 140 chr5 43968041 43968063 -108569196 + MT2B LTR ERVL 149 155 -446 6 920 241 316 181 36 chr5 43970387 43970525 -108566734 + MLT1A LTR MaLR 1 158 -216 6 920 3058 35 0 0 chr5 43971086 43971484 -108565775 + BGLII LTR ERVK 24 421 0 6 920 401 305 5 118 chr5 43971845 43972031 -108565228 - MTEb LTR MaLR -11 368 204 6 920 583 286 13 44 chr5 43972061 43972288 -108564971 - MTE-int LTR MaLR -1329 251 32 6 920 287 320 10 0 chr5 43972430 43972533 -108564726 - MTEb LTR MaLR -255 104 1 6 920 454 285 82 78 chr5 43974259 43974491 -108562768 - MLT1D LTR MaLR -135 370 138 6 920 563 219 121 52 chr5 43975764 43975937 -108561322 - MTE2a LTR MaLR 0 379 195 6 920 300 333 55 34 chr5 43975957 43976103 -108561156 - MTE2a LTR MaLR -230 149 1 6 920 601 204 9 32 chr5 43979366 43979503 -108557756 - MTE2a LTR MaLR -1 378 244 6 920 268 339 106 30 chr5 43986399 43986636 -108550623 - MLT2B1 LTR ERVL -97 423 169 7 920 282 318 32 45 chr5 43998643 43998798 -108538461 + MLT1A1 LTR MaLR 240 392 -16 7 920 306 295 67 15 chr5 44010276 44010410 -108526849 + MLT1A LTR MaLR 234 374 0 1 920 251 381 103 5 chr5 44011132 44011327 -108525932 - MLT1K LTR MaLR -313 282 69 1 920 271 252 0 31 chr5 44013883 44013984 -108523275 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 377 1 920 569 290 120 73 chr5 44014671 44014731 -108522528 - RLTR20A LTR ERVK -150 428 370 1 920 1218 194 122 35 chr5 44014783 44015131 -108522128 - RLTR20A LTR ERVK -209 369 1 1 920 248 303 52 13 chr5 44018675 44018752 -108518507 - LTR16C LTR ERVL -14 475 396 2 920 235 418 67 14 chr5 44035944 44036153 -108501106 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 567 786 -53 4 920 1037 152 6 0 chr5 44037035 44037206 -108500053 - MTC LTR MaLR -123 298 127 4 920 451 286 57 11 chr5 44037200 44037377 -108499882 + MTE2a LTR MaLR 195 379 0 4 920 582 320 157 20 chr5 44038479 44038874 -108498385 - MLT1G LTR MaLR -128 463 15 4 14 457 239 138 152 chr5 44040044 44040233 -108497026 + RLTR23 LTR ERV1 8 157 -273 4 921 457 239 138 152 chr5 44040279 44040518 -108496741 + RLTR23 LTR ERV1 158 430 0 4 921 2407 92 111 3 chr5 44048922 44049293 -108487966 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 921 3756 177 44 110 chr5 44049530 44050478 -108486781 + RMER19B LTR ERVK 1 886 -16 5 921 624 280 47 118 chr5 44051193 44051500 -108485759 - MLT1B LTR MaLR -6 384 100 5 921 2494 163 37 0 chr5 44051500 44051906 -108485353 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 921 624 280 47 118 chr5 44051906 44051979 -108485280 - MLT1B LTR MaLR -291 99 31 5 921 398 343 112 43 chr5 44052429 44052758 -108484501 - MER74B LTR ERVL -197 425 74 6 921 550 114 0 0 chr5 44060154 44060233 -108477026 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 246 6 921 286 281 114 106 chr5 44060222 44060449 -108476810 - MER57D LTR ERV1 -182 229 1 7 921 1044 232 129 20 chr5 44062669 44062972 -108474287 + MTD LTR MaLR 79 414 -5 7 921 760 299 86 31 chr5 44073771 44074075 -108463184 - MTD LTR MaLR -14 405 101 8 921 760 312 85 39 chr5 44074163 44074258 -108463001 - MTD LTR MaLR -319 100 1 8 921 381 223 71 40 chr5 44080742 44080868 -108456391 - MLT1A1 LTR MaLR -11 397 268 9 921 790 231 18 3 chr5 44086684 44087005 -108450254 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 1 921 2237 127 82 8 chr5 44093568 44093932 -108443327 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 1 921 2166 151 86 177 chr5 44098759 44099340 -108437919 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 921 4463 8 0 0 chr5 44104505 44104987 -108432272 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 1 921 1125 173 60 52 chr5 44122450 44122637 -108414622 - ORR1D1-int LTR MaLR -1114 256 57 1 921 1125 173 60 52 chr5 44122671 44122733 -108414526 - ORR1D1-int LTR MaLR -1314 56 5 1 921 593 208 212 200 chr5 44122728 44123058 -108414201 - ORR1D1 LTR MaLR -40 334 1 1 921 525 131 40 10 chr5 44132738 44132838 -108404421 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2198 128 26 1 921 295 196 0 128 chr5 44133580 44133697 -108403562 + RMER3D-int LTR ERVK 1112 1213 -1629 1 921 3613 164 106 21 chr5 44133781 44134529 -108402730 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 811 -1515 1 921 914 171 10 41 chr5 44134529 44134724 -108402535 + RLTR20B2 LTR ERVK 190 378 -182 1 921 2163 182 113 76 chr5 44142623 44143164 -108394095 - RLTR18 LTR ERVK -1 615 55 1 921 1515 160 57 119 chr5 44159753 44160149 -108377110 + ORR1C2 LTR MaLR 1 350 -34 2 921 887 263 139 44 chr5 44162763 44163015 -108374244 + ORR1D2 LTR MaLR 1 266 -104 2 921 887 263 139 44 chr5 44163049 44163134 -108374125 + ORR1D2 LTR MaLR 267 369 -1 2 921 343 293 0 0 chr5 44164451 44164526 -108372733 + MER31B LTR ERV1 206 280 -186 2 922 529 209 83 33 chr5 44176443 44176641 -108360618 + MTEa LTR MaLR 139 375 -4 2 922 4133 149 88 19 chr5 44176912 44177745 -108359514 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 2 922 266 245 38 0 chr5 44177881 44177934 -108359325 + ORR1E LTR MaLR 53 107 -252 2 922 1058 212 200 86 chr5 44179969 44180480 -108356779 + RMER4B LTR ERVK 17 585 0 2 922 1343 236 51 20 chr5 44185750 44186100 -108351159 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 1 2 922 721 279 149 4 chr5 44186473 44186728 -108350531 - MTEb LTR MaLR -19 360 69 2 922 297 284 132 59 chr5 44186615 44186918 -108350341 - MLT2B5 LTR ERVL -392 325 1 2 922 2417 288 104 16 chr5 44188767 44189781 -108347478 + ORR1E-int LTR MaLR 8 1111 -469 2 922 573 306 28 9 chr5 44189967 44190159 -108347100 + ORR1E-int LTR MaLR 1332 1527 -53 2 922 441 314 26 26 chr5 44190159 44190352 -108346907 + ORR1E LTR MaLR 1 193 -166 2 922 2441 142 3 0 chr5 44194121 44194487 -108342772 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 922 6509 48 23 8 chr5 44195631 44196427 -108340832 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 3 922 1637 164 35 109 chr5 44196588 44196992 -108340267 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 922 331 302 84 28 chr5 44201871 44202100 -108335159 + RMER20B LTR ERVK 176 419 -208 3 922 10096 196 42 44 chr5 44202160 44203624 -108333635 + MERVK26-int LTR ERVK 946 2398 -4521 3 922 1870 172 161 23 chr5 44203624 44204016 -108333243 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 3 922 10096 196 42 44 chr5 44204016 44204770 -108332489 + MERVK26-int LTR ERVK 2399 3161 -3758 3 922 12366 161 43 18 chr5 44204763 44206489 -108330770 + MERVK26-int LTR ERVK 4753 6525 -394 3 922 12366 161 43 18 chr5 44206667 44207053 -108330206 + MERVK26-int LTR ERVK 6526 6916 -3 3 922 428 320 82 63 chr5 44207134 44207451 -108329808 + RLTR26 LTR ERVK 95 417 -225 3 922 546 322 76 42 chr5 44209385 44209742 -108327517 - MLT1-int LTR MaLR -6 1365 997 3 922 235 341 169 11 chr5 44215955 44216222 -108321037 + MLT1I LTR MaLR 102 410 -1 3 922 1887 144 6 8 chr5 44220079 44220436 -108316823 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK -11 356 1 3 922 50789 10 3 11 chr5 44220436 44226960 -108310299 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 9 3 922 2086 123 41 44 chr5 44226960 44227326 -108309933 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK -2 365 1 3 922 313 220 20 108 chr5 44229292 44229394 -108307865 - MT2B LTR ERVL -351 250 158 3 922 1589 129 25 129 chr5 44238609 44238966 -108298293 - ORR1A4 LTR MaLR -9 320 1 3 922 3357 33 5 8 chr5 44240337 44240734 -108296525 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 922 309 352 49 43 chr5 44242256 44242440 -108294819 + ORR1E LTR MaLR 1 185 -174 3 922 977 215 46 173 chr5 44242976 44243295 -108293964 + ORR1C1 LTR MaLR 1 266 -112 3 922 3494 60 40 35 chr5 44243295 44243775 -108293484 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 922 977 215 46 173 chr5 44243775 44243888 -108293371 + ORR1C1 LTR MaLR 267 378 0 3 922 422 227 0 6 chr5 44245389 44245497 -108291762 + ORR1D2 LTR MaLR 1 105 -254 3 922 255 193 174 35 chr5 44246991 44247077 -108290182 + MER34A LTR ERV1 4 101 -470 3 922 257 260 115 91 chr5 44247574 44247739 -108289520 + LTR48 LTR ERV1 613 781 -6 3 922 4259 53 2 2 chr5 44248346 44248858 -108288401 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 3 922 945 286 62 59 chr5 44248898 44249270 -108287989 - MTEa LTR MaLR -1 378 6 3 922 3405 55 42 10 chr5 44249545 44250026 -108287233 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 3 922 2224 124 99 8 chr5 44251827 44252202 -108285057 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 922 509 325 68 72 chr5 44255533 44255782 -108281477 + MTE2b LTR MaLR 36 283 -96 3 922 743 295 47 42 chr5 44256016 44256377 -108280882 + MLT1B LTR MaLR 22 384 -6 3 922 263 253 51 31 chr5 44256876 44256974 -108280285 - ORR1E LTR MaLR -2 377 278 3 922 398 320 24 42 chr5 44257226 44257438 -108279821 - ORR1E LTR MaLR -149 210 3 3 922 2135 141 54 6 chr5 44263029 44263379 -108273880 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 4 922 325 373 101 18 chr5 44263750 44264187 -108273072 - MLT1H-int LTR MaLR -887 522 50 4 922 505 234 102 35 chr5 44264351 44264577 -108272682 - MLT2D LTR ERVL -155 259 19 4 922 3061 29 0 0 chr5 44265416 44265762 -108271497 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 922 1378 211 66 54 chr5 44266042 44266096 -108271163 - ORR1D1 LTR MaLR -35 339 294 4 922 1042 201 198 32 chr5 44266096 44266409 -108270850 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 4 922 1378 211 66 54 chr5 44266409 44266689 -108270570 - ORR1D1 LTR MaLR -81 293 1 4 922 721 277 92 95 chr5 44267144 44267471 -108269788 + MTEb LTR MaLR 1 326 -53 4 922 818 285 9 26 chr5 44267510 44267709 -108269550 + MTE2b LTR MaLR 1 200 -179 4 922 818 235 128 30 chr5 44267745 44267847 -108269412 + MTE2b LTR MaLR 201 372 -7 4 922 270 292 37 9 chr5 44268863 44268970 -108268289 + MTEa LTR MaLR 267 376 -3 4 922 344 167 41 14 chr5 44274095 44274168 -108263091 - MTD LTR MaLR 0 419 345 4 922 1226 243 68 49 chr5 44275120 44275531 -108261728 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 922 446 317 71 11 chr5 44277032 44277214 -108260045 - MLT1C LTR MaLR -4 463 271 4 922 300 250 86 11 chr5 44278054 44278147 -108259112 - MLT1C LTR MaLR -367 100 1 4 922 379 345 121 57 chr5 44278152 44278524 -108258735 - MLT1L LTR MaLR 0 610 215 4 922 515 276 69 72 chr5 44279560 44279865 -108257394 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 114 4 922 360 299 127 42 chr5 44286471 44286803 -108250456 - MER90a LTR ERV1 -146 468 109 4 922 225 397 53 53 chr5 44287219 44287408 -108249851 + LTR80A LTR ERVL 373 561 -22 4 922 1185 205 80 59 chr5 44287690 44288048 -108249211 + ORR1D1 LTR MaLR 2 354 -20 4 922 856 172 56 152 chr5 44300341 44300697 -108236562 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 923 2248 118 12 3 chr5 44302956 44303278 -108233981 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 4 923 457 226 11 0 chr5 44304292 44304385 -108232874 - MT2A LTR ERVL -118 483 390 4 923 548 196 81 22 chr5 44305196 44305222 -108232037 - MT2A LTR ERVL -298 235 210 4 923 548 196 81 22 chr5 44305253 44305362 -108231897 - MT2A LTR ERVL -324 209 92 4 923 568 208 0 8 chr5 44305359 44305394 -108231865 - MT2A LTR ERVL -404 129 95 4 923 568 208 0 8 chr5 44305421 44305511 -108231748 - MT2A LTR ERVL -439 94 6 4 923 597 318 20 36 chr5 44310763 44311014 -108226245 + MTD LTR MaLR 28 274 -145 5 923 668 241 0 7 chr5 44311065 44311203 -108226056 + MTD LTR MaLR 268 404 -15 5 923 1287 210 167 36 chr5 44312758 44313414 -108223845 + RMER17B LTR ERVK 1 804 -104 5 923 319 326 82 72 chr5 44315869 44316077 -108221182 - MLT1J LTR MaLR -187 325 116 5 923 2648 73 101 5 chr5 44316108 44316493 -108220766 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 5 923 1032 239 176 15 chr5 44319125 44319643 -108217616 + RMER20B LTR ERVK 1 602 -25 5 923 2119 111 9 100 chr5 44324661 44325112 -108212147 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 923 414 296 0 0 chr5 44328318 44328426 -108208833 + MTEa LTR MaLR 8 115 -264 5 923 1255 344 71 10 chr5 44329903 44330520 -108206739 - MTE-int LTR MaLR -122 1458 804 5 923 766 207 40 11 chr5 44332019 44332195 -108205064 + MTE2a LTR MaLR 191 371 -8 5 923 239 294 54 11 chr5 44333003 44333096 -108204163 - MLT1E2 LTR MaLR -107 398 302 5 923 289 317 34 79 chr5 44333166 44333344 -108203915 - MLT1E2 LTR MaLR -451 176 7 5 923 261 322 129 9 chr5 44333571 44333687 -108203572 + ORR1E LTR MaLR 1 130 -229 5 923 1433 281 23 9 chr5 44341018 44341409 -108195850 - MTD LTR MaLR -26 393 15 5 923 839 302 87 41 chr5 44341609 44342071 -108195188 + MLT1D LTR MaLR 10 492 -13 5 923 1465 210 140 30 chr5 44343216 44343623 -108193636 + RLTR33 LTR ERVK 175 626 -52 5 923 635 262 46 71 chr5 44343835 44344185 -108193074 + RLTR15 LTR ERVK 1 341 -18 5 923 230 338 0 0 chr5 44344504 44344581 -108192678 - LTR84a LTR ERVL -49 708 632 5 923 276 289 38 76 chr5 44344653 44344671 -108192588 - MER74A LTR ERVL -3 555 540 5 923 276 284 202 22 chr5 44344967 44345085 -108192174 - MER74A LTR ERVL -28 594 455 5 923 1176 230 176 3 chr5 44345085 44345442 -108191817 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 923 899 135 190 10 chr5 44346066 44346261 -108190998 - RMER5 LTR ERV1 -18 516 287 5 923 3826 107 89 2 chr5 44346359 44346912 -108190347 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 5 923 2088 104 27 57 chr5 44347660 44347996 -108189263 + ORR1A4 LTR MaLR 1 326 -3 5 923 253 259 70 12 chr5 44349209 44349339 -108187920 + MTE2a LTR MaLR 1 139 -282 5 923 3327 21 10 0 chr5 44350255 44350639 -108186620 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 5 923 2201 31 2 0 chr5 44350641 44350902 -108186357 + RLTR10-int LTR ERVK 1 291 -1696 5 923 575 155 0 10 chr5 44352939 44353037 -108184222 - MTC LTR MaLR 0 421 325 5 923 3325 62 0 0 chr5 44353038 44353438 -108183821 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 923 7619 82 30 35 chr5 44353438 44354542 -108182717 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 5 923 3093 40 42 8 chr5 44354542 44354925 -108182334 + MTB LTR MaLR 1 396 0 5 923 2917 296 20 64 chr5 44354978 44356234 -108181025 + ETnERV-int LTR ERVK 585 2519 -3289 5 923 4639 115 10 3 chr5 44358305 44358978 -108178281 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 5 923 617 259 198 29 chr5 44360031 44360345 -108176914 + RLTR9A LTR ERVK 2 368 0 5 923 267 349 26 26 chr5 44367536 44367689 -108169570 - ORR1E LTR MaLR -206 153 1 6 923 337 198 97 70 chr5 44376184 44376298 -108160961 - HERVL74-int LTR ERVL -1659 4026 3910 6 923 1868 337 35 23 chr5 44376437 44377230 -108160029 - HERVL74-int LTR ERVL -2345 3340 2538 6 923 1809 119 35 90 chr5 44377950 44378384 -108158875 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 923 329 348 43 14 chr5 44380965 44381105 -108156154 - MER74A LTR ERVL -404 154 11 6 923 435 306 74 12 chr5 44381376 44381538 -108155721 - HERVL74-int LTR ERVL -3555 2112 1941 6 923 1390 236 20 23 chr5 44387369 44387716 -108149543 + MTEb LTR MaLR 13 358 -21 6 923 643 253 38 21 chr5 44390753 44390939 -108146320 + MLT1A0 LTR MaLR 176 364 -1 6 923 2617 154 78 22 chr5 44393461 44393960 -108143299 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 6 923 2030 137 9 94 chr5 44397696 44398131 -108139128 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 6 923 7719 66 34 3 chr5 44399366 44400358 -108136901 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 6 923 1244 142 24 139 chr5 44401472 44401766 -108135493 + ORR1D1 LTR MaLR 1 260 -114 6 923 748 194 416 23 chr5 44409155 44409453 -108127806 + RLTR20C LTR ERVK 1 417 -117 6 923 248 167 18 18 chr5 44409449 44409504 -108127755 + RLTR16 LTR ERVK 451 505 0 6 923 286 301 0 0 chr5 44412547 44412610 -108124649 + MTE2b LTR MaLR 20 82 -297 6 923 789 251 37 0 chr5 44412610 44412801 -108124458 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 173 6 923 249 297 0 0 chr5 44413021 44413095 -108124164 + RLTR15 LTR ERVK 48 121 -238 6 923 756 161 13 13 chr5 44413303 44413454 -108123805 - ORR1D2 LTR MaLR -209 165 15 6 923 898 296 71 0 chr5 44413435 44413749 -108123510 + MTE2b LTR MaLR 46 379 0 6 923 2962 67 36 3 chr5 44418185 44418572 -108118687 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 923 3266 29 39 0 chr5 44424837 44425218 -108112041 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 923 756 203 16 21 chr5 44426451 44426637 -108110622 + RMER12 LTR ERVK 1 185 -1137 6 923 806 262 27 46 chr5 44426656 44426916 -108110343 + RMER12 LTR ERVK 1059 1313 -9 6 923 1248 244 92 19 chr5 44427201 44427569 -108109690 + MTD LTR MaLR 11 405 -14 6 923 281 253 0 78 chr5 44429549 44429626 -108107633 + ORR1D2-int LTR MaLR 1006 1075 -295 6 923 1917 172 134 61 chr5 44429626 44429726 -108107533 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 102 -482 7 923 1917 172 134 61 chr5 44429757 44430200 -108107059 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 103 583 -1 7 923 1151 171 73 86 chr5 44430200 44430501 -108106758 + ORR1D2-int LTR MaLR 1074 1370 0 6 923 524 248 337 76 chr5 44430501 44430789 -108106470 + ORR1D2 LTR MaLR 4 366 -4 6 923 1180 176 13 13 chr5 44431721 44431952 -108105307 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 92 7 924 1752 170 113 9 chr5 44433469 44433813 -108103446 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 7 924 291 336 107 44 chr5 44437064 44437316 -108099943 - MLT1H LTR MaLR -165 384 117 7 924 2322 120 0 6 chr5 44451778 44452106 -108085153 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 7 924 327 308 117 32 chr5 44455085 44455273 -108081986 - RMER20B LTR ERVK -323 304 101 7 924 823 260 90 74 chr5 44457556 44457921 -108079338 - MTEb LTR MaLR -8 371 1 7 924 1818 181 83 48 chr5 44460781 44461176 -108076083 + MTC LTR MaLR 1 409 -12 7 924 2217 104 3 6 chr5 44463280 44463600 -108073659 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 924 3537 157 92 76 chr5 44463679 44463986 -108073273 + RMER13A LTR ERVK 1 310 -550 7 924 3090 40 61 5 chr5 44463986 44464365 -108072894 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 924 3537 157 92 76 chr5 44464365 44464829 -108072430 + RMER13A LTR ERVK 311 784 -76 7 924 274 275 75 32 chr5 44465880 44465974 -108071285 - MLT1A1 LTR MaLR -306 102 5 7 924 1360 204 97 3 chr5 44473292 44473582 -108063677 + ORR1D1 LTR MaLR 58 374 0 7 924 602 239 49 93 chr5 44474262 44474323 -108062936 - MLT1C LTR MaLR -250 217 154 8 924 602 239 49 93 chr5 44474633 44474788 -108062471 - MLT1C LTR MaLR -323 144 2 8 924 1843 121 110 68 chr5 44481471 44481826 -108055433 + ORR1C1 LTR MaLR 1 370 -8 8 924 3065 66 13 5 chr5 44481974 44482371 -108054888 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 924 374 294 18 18 chr5 44482432 44482543 -108054716 + MLT1A LTR MaLR 191 301 -73 8 924 2083 170 0 0 chr5 44482979 44483297 -108053962 - MTC LTR MaLR 0 421 104 8 924 614 115 0 0 chr5 44483302 44483389 -108053870 - MTC LTR MaLR -225 196 110 8 924 908 244 63 123 chr5 44484090 44484488 -108052771 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 8 924 504 327 89 31 chr5 44494669 44494893 -108042366 - RMER15 LTR ERVL 0 575 339 8 924 301 281 31 69 chr5 44495134 44495264 -108041995 - RMER15 LTR ERVL -449 126 2 8 924 348 294 40 74 chr5 44497293 44497477 -108039782 + LTR37B LTR ERV1 240 464 -4 8 924 2075 210 25 10 chr5 44497988 44498396 -108038863 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 8 924 5170 158 29 37 chr5 44498908 44499818 -108037441 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 8 924 409 328 61 161 chr5 44500935 44501213 -108036046 - MLT1C LTR MaLR 0 390 149 3 924 246 328 61 161 chr5 44501383 44501445 -108035814 - MLT1C LTR MaLR -242 148 84 3 924 1915 166 49 52 chr5 44505931 44506083 -108031176 + ORR1B2 LTR MaLR 1 136 -231 1 924 1915 166 49 52 chr5 44506180 44506391 -108030868 + ORR1B2 LTR MaLR 137 362 -5 1 924 1449 293 13 31 chr5 44506950 44507334 -108029925 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 1 924 291 351 27 0 chr5 44507334 44507444 -108029815 + ORR1E LTR MaLR 22 134 -225 1 924 1771 202 106 35 chr5 44508531 44509023 -108028236 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 1 924 265 182 57 125 chr5 44509762 44509850 -108027409 + RLTR25B LTR ERVK 428 509 -519 2 924 236 274 103 95 chr5 44510236 44510478 -108026781 + MER101B LTR ERV1 240 483 -87 2 924 1043 294 136 45 chr5 44512851 44513321 -108023938 + MER21B LTR ERV1 273 785 -78 3 924 1313 254 115 3 chr5 44515178 44515553 -108021706 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 924 3143 254 91 89 chr5 44515558 44515710 -108021549 + MTD-int LTR MaLR 6 165 -1093 3 924 3143 254 91 89 chr5 44516173 44516735 -108020524 + MTD-int LTR MaLR 166 689 -569 3 924 3143 254 91 89 chr5 44517064 44517598 -108019661 + MTD-int LTR MaLR 690 1257 -1 3 924 1293 246 103 48 chr5 44517598 44517749 -108019510 + MTD LTR MaLR 1 143 -276 3 924 2697 122 50 44 chr5 44517749 44518228 -108019031 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 924 1293 246 103 48 chr5 44518228 44518473 -108018786 + MTD LTR MaLR 144 419 0 3 924 238 278 75 32 chr5 44518641 44518734 -108018525 - RMER10A LTR ERVL -28 414 318 3 924 5675 47 65 0 chr5 44525598 44526295 -108010964 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 5 924 69691 10 2 0 chr5 44526295 44533883 -108003376 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1 7601 0 5 924 5675 47 65 0 chr5 44533883 44534580 -108002679 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 5 924 761 274 67 67 chr5 44534593 44534965 -108002294 + MLT1B LTR MaLR 12 383 -7 5 924 458 261 16 25 chr5 44535527 44535649 -108001610 - RMER5 LTR ERV1 0 534 414 5 924 3660 193 117 23 chr5 44535661 44536531 -108000728 + RMER17B LTR ERVK 1 952 -6 5 924 406 128 125 14 chr5 44541139 44541245 -107996014 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 212 6 924 4256 45 8 4 chr5 44541276 44541786 -107995473 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 924 508 384 49 8 chr5 44541886 44542133 -107995126 - MER77 LTR ERVL -267 340 84 6 924 297 342 101 101 chr5 44543655 44544013 -107993246 - MLT1C LTR MaLR 0 467 110 7 924 384 282 67 92 chr5 44546046 44546396 -107990863 + MLT1C LTR MaLR 1 329 -61 7 924 2776 181 156 18 chr5 44546396 44547004 -107990255 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 8 924 284 292 83 133 chr5 44547004 44547052 -107990207 + MLT1C LTR MaLR 330 379 -11 7 924 1133 278 40 32 chr5 44547188 44547564 -107989695 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 8 924 2505 143 46 11 chr5 44549378 44549816 -107987443 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 8 924 1556 272 74 57 chr5 44551047 44551638 -107985621 - RLTR18B LTR ERVK -4 612 1 8 925 342 270 29 87 chr5 44583071 44583209 -107954050 + RMER10B LTR ERVL 269 398 0 1 925 600 245 146 0 chr5 44596452 44596644 -107940615 + MLT1B LTR MaLR 150 369 -21 1 925 3915 129 112 38 chr5 44601564 44602267 -107934992 - RMER6A LTR ERVK -1 755 1 1 925 1403 184 85 58 chr5 44603281 44603504 -107933755 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 1 925 1403 184 85 58 chr5 44603524 44603664 -107933595 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 1 925 313 290 32 0 chr5 44603868 44603961 -107933298 + ORR1E LTR MaLR 32 127 -232 1 925 1169 214 122 15 chr5 44625861 44626189 -107911070 + MTEa LTR MaLR 17 379 0 1 925 311 258 35 11 chr5 44627164 44627280 -107909979 + MLT1A1 LTR MaLR 1 124 -284 1 925 808 302 127 23 chr5 44627434 44627742 -107909517 + MTE2b LTR MaLR 1 340 -39 1 925 923 277 52 27 chr5 44627739 44628075 -107909184 + MTE2a LTR MaLR 25 381 -38 1 925 923 280 60 29 chr5 44628121 44628159 -107909100 + MTE2a LTR MaLR 339 364 -15 1 925 292 227 80 0 chr5 44628147 44628222 -107909037 + MTEa LTR MaLR 299 379 0 1 925 256 254 0 40 chr5 44628242 44628316 -107908943 + MLT1A1 LTR MaLR 293 363 -2 1 925 260 77 154 0 chr5 44631374 44631426 -107905833 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 465 1 925 1082 272 61 13 chr5 44633037 44633425 -107903834 + RMER5 LTR ERV1 128 534 0 1 925 835 301 60 24 chr5 44634396 44634811 -107902448 + MER57F LTR ERV1 1 430 -6 1 925 1022 206 14 14 chr5 44636296 44636504 -107900755 + MTD LTR MaLR 2 209 -210 1 925 500 254 29 14 chr5 44636662 44636802 -107900457 + MTD LTR MaLR 221 362 -57 1 925 278 103 68 17 chr5 44637670 44637729 -107899530 + MTD LTR MaLR 344 405 -14 1 925 291 299 21 0 chr5 44639266 44639363 -107897896 + MLT1N2 LTR MaLR 410 508 -54 2 925 1667 210 52 57 chr5 44642476 44642895 -107894364 - MTD LTR MaLR -2 417 1 2 925 694 209 193 60 chr5 44643355 44643604 -107893655 + MTEb LTR MaLR 43 324 -55 2 925 2220 149 62 0 chr5 44644795 44645165 -107892094 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 2 925 359 123 26 40 chr5 44645667 44645743 -107891516 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 303 2 925 779 275 40 16 chr5 44646924 44647175 -107890084 + MTEa LTR MaLR 19 275 -104 2 925 1544 233 67 25 chr5 44647762 44648163 -107889096 + MTD LTR MaLR 2 419 0 2 925 749 238 203 18 chr5 44649376 44649706 -107887553 + MLT1A1 LTR MaLR 15 405 -3 2 925 1533 230 73 8 chr5 44650324 44650705 -107886554 + MTD LTR MaLR 14 419 0 2 925 1257 217 98 53 chr5 44651356 44651755 -107885504 + MTD LTR MaLR 3 419 0 2 925 499 239 0 17 chr5 44652054 44652173 -107885086 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 292 2 925 327 257 74 28 chr5 44652265 44652373 -107884886 - MLT1A1 LTR MaLR -295 113 1 2 925 270 83 83 0 chr5 44652375 44652423 -107884836 - MLT2B1 LTR ERVL -1 566 515 2 925 532 309 156 15 chr5 44652573 44652836 -107884423 - MLT2D LTR ERVL -110 304 5 2 925 3590 20 0 0 chr5 44659214 44659610 -107877649 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 925 395 253 96 51 chr5 44661195 44661243 -107876016 - ORR1E LTR MaLR -3 376 312 2 925 680 270 105 21 chr5 44661307 44661563 -107875696 - ORR1E LTR MaLR -67 312 2 2 925 250 271 11 34 chr5 44662771 44662859 -107874400 + RMER15 LTR ERVL 1 86 -489 2 925 1156 156 19 0 chr5 44664555 44664760 -107872499 + MTC LTR MaLR 6 214 -207 2 925 2050 170 35 15 chr5 44664770 44665170 -107872089 - MTC LTR MaLR -13 408 1 2 925 5054 150 98 105 chr5 44665170 44665318 -107871941 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1085 2 925 5054 150 98 105 chr5 44666045 44666121 -107871138 - MTC-int LTR MaLR -174 1084 1062 2 925 5054 150 98 105 chr5 44666303 44667328 -107869931 - MTC-int LTR MaLR -197 1061 16 2 925 1997 146 77 33 chr5 44667330 44667720 -107869539 - MTC LTR MaLR 0 407 1 2 925 681 216 29 0 chr5 44667728 44667867 -107869392 + MTC LTR MaLR 279 421 0 2 925 715 298 96 46 chr5 44671255 44671579 -107865680 + ORR1E LTR MaLR 2 341 -18 2 925 524 289 69 45 chr5 44672579 44672825 -107864434 - MLT1C LTR MaLR -3 464 213 2 925 291 239 108 18 chr5 44673080 44673191 -107864068 - MLT1C LTR MaLR -291 176 56 2 925 1685 197 49 11 chr5 44673364 44673733 -107863526 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 2 925 2294 142 19 6 chr5 44673978 44674339 -107862920 + ORR1B2 LTR MaLR 2 367 0 2 925 1723 142 92 122 chr5 44689499 44689989 -107847270 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 925 1928 120 31 31 chr5 44691046 44691373 -107845886 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 925 317 319 35 28 chr5 44693735 44693877 -107843382 + MLT1C LTR MaLR 39 181 -286 2 926 394 297 22 108 chr5 44697494 44697679 -107839580 - MTEb LTR MaLR -209 170 2 3 926 480 295 139 21 chr5 44701620 44701814 -107835445 + MTEb LTR MaLR 125 341 -38 3 926 2157 143 0 7 chr5 44724111 44724421 -107812838 - RLTR10E LTR ERVK -3 308 1 3 926 6439 109 1 107 chr5 44724421 44725490 -107811769 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6626 3 926 1892 153 51 7 chr5 44725498 44725793 -107811466 + RLTR10E LTR ERVK 1 308 -3 3 926 793 317 16 0 chr5 44730406 44730649 -107806610 - MLT1D LTR MaLR -2 503 257 3 926 264 308 34 17 chr5 44730731 44730850 -107806409 - MLT1D LTR MaLR -291 214 94 3 926 3134 157 62 46 chr5 44733851 44734346 -107802913 - RMER15 LTR ERVL 0 575 71 3 926 3134 157 62 46 chr5 44734372 44734438 -107802821 - RMER15 LTR ERVL -505 70 5 3 926 297 309 81 9 chr5 44739027 44739138 -107798121 - LTR16A1 LTR ERVL -12 444 326 3 926 259 300 36 48 chr5 44740139 44740223 -107797036 - MLT1E2 LTR MaLR -544 83 1 3 926 1069 289 19 67 chr5 44740741 44741115 -107796144 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 3 926 547 277 63 11 chr5 44748306 44748496 -107788763 - MLT1B LTR MaLR 0 390 191 3 926 522 300 122 33 chr5 44748950 44749195 -107788064 - LTR16A1 LTR ERVL -15 441 175 3 926 879 322 19 15 chr5 44751980 44752248 -107785011 - MTE2b LTR MaLR -110 269 1 3 926 386 306 106 61 chr5 44752325 44752523 -107784736 - HERV16-int LTR ERVL -2402 2594 2388 3 926 395 332 152 60 chr5 44753409 44753909 -107783350 - HERV16-int LTR ERVL -2760 2236 1691 3 926 1815 159 33 142 chr5 44756640 44757064 -107780195 - ORR1B2 LTR MaLR 0 378 1 3 926 610 276 139 9 chr5 44757582 44757812 -107779447 + MLT1A0 LTR MaLR 106 365 0 3 926 227 357 70 87 chr5 44757838 44758010 -107779249 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 265 433 -406 3 926 411 273 26 26 chr5 44759132 44759245 -107778014 + MTEa LTR MaLR 1 113 -266 3 926 279 335 97 34 chr5 44759245 44759308 -107777951 + MT2A LTR ERVL 1 187 -346 3 926 695 271 76 97 chr5 44759452 44759865 -107777394 + RMER13A LTR ERVK 115 549 -359 4 926 1028 234 166 31 chr5 44762424 44762750 -107774509 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 926 318 335 82 67 chr5 44763100 44763500 -107773759 + MLT1H LTR MaLR 42 530 -49 4 926 944 309 128 12 chr5 44764565 44764994 -107772265 + MER31A LTR ERV1 1 479 -6 4 926 2282 182 26 3 chr5 44765950 44766335 -107770924 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 926 246 217 0 0 chr5 44769623 44769669 -107767590 + MTE2b LTR MaLR 6 51 -328 4 926 534 276 57 13 chr5 44769760 44769918 -107767341 + MTD LTR MaLR 253 417 -2 4 926 2470 142 77 51 chr5 44771556 44772010 -107765249 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 4 926 855 290 95 27 chr5 44773987 44774281 -107762978 + MER21B LTR ERV1 1 314 -549 4 926 283 286 37 68 chr5 44778889 44779080 -107758179 + LTR85b LTR Gypsy? 272 456 -328 4 926 307 364 66 24 chr5 44781973 44782184 -107755075 + MTEb LTR MaLR 1 220 -159 4 926 377 408 52 11 chr5 44782595 44782865 -107754394 + MT2A LTR ERVL 181 461 -72 4 926 2088 182 78 12 chr5 44786453 44787018 -107750241 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 4 926 727 257 96 37 chr5 44787683 44787901 -107749358 - MTE2a LTR MaLR -100 279 49 4 926 225 232 101 34 chr5 44788191 44788280 -107748979 - MER57F LTR ERV1 -319 117 23 4 926 710 162 36 83 chr5 44788229 44788397 -107748862 - RMER20B LTR ERVK -467 160 1 4 926 253 304 32 21 chr5 44788399 44788493 -107748766 - MTD LTR MaLR -319 100 6 4 926 437 288 127 118 chr5 44789941 44790176 -107747083 - ORR1E LTR MaLR -17 342 97 4 926 437 288 127 118 chr5 44790334 44790437 -107746822 - ORR1E LTR MaLR -263 96 1 4 926 645 275 112 29 chr5 44791488 44791882 -107745377 + MLT2B4 LTR ERVL 1 416 -48 4 926 3571 38 5 0 chr5 44800561 44800955 -107736304 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 926 9604 42 2 14 chr5 44800955 44802066 -107735193 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 926 1271 39 0 0 chr5 44802066 44802219 -107735040 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 244 4 926 464 234 14 92 chr5 44804767 44804785 -107732474 - MTE2a LTR MaLR -4 375 362 4 926 869 217 231 67 chr5 44804785 44805101 -107732158 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 3 4 926 464 234 14 92 chr5 44805101 44805223 -107732036 - MTE2a LTR MaLR -18 361 246 4 926 1207 191 62 18 chr5 44805237 44805529 -107731730 - RMER19C LTR ERVK -2 609 380 4 926 449 300 176 16 chr5 44811018 44811211 -107726048 + MLT1A0 LTR MaLR 36 259 -106 4 926 257 270 147 45 chr5 44814251 44814449 -107722810 + MT2B LTR ERVL 53 270 -331 5 926 523 333 16 16 chr5 44817921 44818113 -107719146 - MLT1B LTR MaLR -7 383 192 5 926 377 339 107 59 chr5 44823490 44823995 -107713264 + MER68 LTR ERVL 3 531 -32 5 927 405 290 167 25 chr5 44830729 44830927 -107706332 + RMER15 LTR ERVL 336 561 -14 5 927 333 364 27 20 chr5 44832564 44832710 -107704549 - MLT1N2 LTR MaLR -318 244 98 5 927 278 265 204 0 chr5 44834464 44834562 -107702697 + MER21B LTR ERV1 58 175 -688 5 927 611 297 93 29 chr5 44834626 44834947 -107702312 + MTD LTR MaLR 65 405 -14 5 927 274 357 20 48 chr5 44835151 44835298 -107701961 - ORR1E LTR MaLR -210 149 7 5 927 523 292 39 0 chr5 44835322 44835476 -107701783 + MER21B LTR ERV1 193 352 -511 5 927 315 312 110 17 chr5 44835673 44835846 -107701413 + MER21B LTR ERV1 618 806 -57 5 927 1043 287 25 64 chr5 44835892 44836250 -107701009 + MTE2b LTR MaLR 3 346 -33 5 927 836 222 112 25 chr5 44836297 44836537 -107700722 + ORR1D2 LTR MaLR 27 287 -83 5 927 480 165 10 10 chr5 44836789 44836887 -107700372 + ORR1D2 LTR MaLR 273 370 0 5 927 238 320 53 0 chr5 44836918 44836993 -107700266 - MLT1N2 LTR MaLR -388 79 1 5 927 361 240 8 40 chr5 44846318 44846444 -107690815 + RLTR15 LTR ERVK 4 125 -234 5 927 721 315 140 29 chr5 44849078 44849556 -107687703 - MT2A LTR ERVL 0 533 3 5 927 1766 217 45 41 chr5 44854326 44854744 -107682515 + MTC LTR MaLR 2 421 0 5 927 836 252 52 67 chr5 44857932 44858259 -107679000 + RLTR14 LTR ERV1 61 382 0 5 927 363 287 126 78 chr5 44858259 44858656 -107678603 + RLTR14-int LTR ERV1 2 417 -4900 5 927 286 233 75 32 chr5 44858759 44858852 -107678407 + RLTR14-int LTR ERV1 461 557 -4760 5 927 230 268 84 0 chr5 44859142 44859213 -107678046 + MLT1G1 LTR MaLR 503 579 0 5 927 244 355 64 71 chr5 44859616 44859898 -107677361 + LTR16A1 LTR ERVL 168 447 -9 5 927 246 304 0 14 chr5 44860505 44860575 -107676684 + MLT1A0 LTR MaLR 35 103 -305 5 927 280 325 0 17 chr5 44862245 44862361 -107674898 + MLT1A0 LTR MaLR 252 365 0 5 927 623 306 109 19 chr5 44879388 44879736 -107657523 - MLT1C LTR MaLR -71 396 17 5 927 438 239 64 0 chr5 44880818 44880927 -107656332 - MLT2C1 LTR ERVL -210 187 72 6 927 1437 237 39 6 chr5 44881580 44881937 -107655322 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 6 927 269 264 0 33 chr5 44890648 44890738 -107646521 - MTEb LTR MaLR -14 365 279 6 927 230 332 152 72 chr5 44891094 44891357 -107645902 - ORR1E LTR MaLR 0 359 76 6 927 2042 207 35 7 chr5 44900753 44901157 -107636102 - MTD LTR MaLR -1 418 4 6 927 772 291 165 41 chr5 44906385 44906754 -107630505 - MTD LTR MaLR 0 419 5 6 927 4497 80 24 29 chr5 44907376 44907966 -107629293 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 6 927 1198 265 73 12 chr5 44915519 44915848 -107621411 - ORR1E LTR MaLR -7 352 4 6 927 227 282 14 27 chr5 44935076 44935149 -107602110 + ORR1A1-int LTR MaLR 1181 1252 -540 6 927 1200 283 71 50 chr5 44936095 44936590 -107600669 - MLT1D LTR MaLR 0 505 1 6 927 3365 161 11 14 chr5 44940879 44941441 -107595818 - RLTR31_Mm LTR ERVK -1 560 1 6 927 426 380 36 20 chr5 44955589 44955785 -107581474 + MLT1F2 LTR MaLR 293 491 -69 6 928 1176 257 88 34 chr5 44966716 44967067 -107570192 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 928 636 324 64 46 chr5 44974807 44975153 -107562106 + ORR1E LTR MaLR 6 357 -2 7 928 1078 248 50 112 chr5 44982015 44982415 -107554844 - MTEb LTR MaLR 0 379 5 7 928 1020 228 113 74 chr5 44982798 44983134 -107554125 + ORR1E LTR MaLR 6 354 -5 7 928 607 335 54 36 chr5 44984390 44984724 -107552535 + MLT1C LTR MaLR 112 451 -16 7 928 1220 268 65 17 chr5 44994991 44995344 -107541915 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 7 928 530 323 130 76 chr5 44995519 44995874 -107541385 + MTEb LTR MaLR 5 378 -1 7 928 1531 218 161 21 chr5 44998534 44998907 -107538352 + RLTR20A1 LTR ERVK 1 443 -108 7 928 1531 218 161 21 chr5 44998952 44999061 -107538198 + RLTR20A1 LTR ERVK 444 551 0 7 928 704 339 98 53 chr5 45000093 45000582 -107536677 + MLT1E3 LTR MaLR 95 605 -19 1 928 488 296 83 79 chr5 45005748 45006001 -107531258 + MLT1A1 LTR MaLR 23 276 -132 8 928 1108 280 40 21 chr5 45008235 45008607 -107528652 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 1 928 754 270 185 33 chr5 45016183 45016512 -107520747 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 2 928 1588 273 9 6 chr5 45020053 45020403 -107516856 - ORR1D2 LTR MaLR -18 352 2 2 928 304 340 0 0 chr5 45024338 45024438 -107512821 + MLT1A0 LTR MaLR 262 361 -4 3 928 322 208 28 0 chr5 45028313 45028385 -107508874 + ORR1D1 LTR MaLR 1 74 -300 4 928 1538 284 58 17 chr5 45032416 45032946 -107504313 + MER89 LTR ERV1 3 554 -5 5 928 250 366 78 18 chr5 45048509 45048676 -107488583 + MLT1E LTR MaLR 17 193 -461 6 928 309 266 102 86 chr5 45048687 45048881 -107488378 + MLT1E LTR MaLR 282 478 -175 6 928 352 330 163 13 chr5 45049925 45050152 -107487107 + MLT1E LTR MaLR 419 679 -1 6 928 531 284 45 30 chr5 45074075 45074368 -107462891 + MTEa LTR MaLR 68 379 0 9 928 346 289 75 12 chr5 45079169 45079330 -107457929 - MLT1C LTR MaLR -108 359 189 1 928 924 260 42 102 chr5 45088264 45088425 -107448834 - MTE2a LTR MaLR 0 379 208 1 928 924 260 42 102 chr5 45088476 45088716 -107448543 - MTE2a LTR MaLR -172 207 3 1 929 735 312 113 41 chr5 45089182 45089670 -107447589 + MT2A LTR ERVL 4 526 -7 1 929 394 236 65 113 chr5 45101806 45101992 -107435267 - MLT1B LTR MaLR -25 365 173 1 929 302 315 74 0 chr5 45121697 45121805 -107415454 + MTEa LTR MaLR 1 116 -263 1 929 255 293 0 0 chr5 45121830 45121888 -107415371 + MTEa LTR MaLR 313 370 -9 1 929 1773 168 192 0 chr5 45130762 45131084 -107406175 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 929 340 297 169 15 chr5 45131257 45131307 -107405952 + MLT1J LTR MaLR 41 104 -408 2 929 340 297 169 15 chr5 45131342 45131421 -107405838 + MLT1J LTR MaLR 105 189 -323 2 929 541 304 135 15 chr5 45132952 45133219 -107404040 + MTEa LTR MaLR 74 372 -7 2 929 317 310 14 100 chr5 45135670 45135810 -107401449 - MTE2b LTR MaLR -13 366 239 2 929 1182 201 197 67 chr5 45135950 45135978 -107401281 + ORR1D1 LTR MaLR 1 28 -346 2 929 1182 201 197 67 chr5 45136141 45136243 -107401016 + ORR1D1 LTR MaLR 29 168 -206 2 929 1182 201 197 67 chr5 45136317 45136514 -107400745 + ORR1D1 LTR MaLR 169 371 -3 2 929 468 358 25 0 chr5 45137528 45137690 -107399569 + MLT1H2 LTR MaLR 1 166 -323 2 929 594 288 25 0 chr5 45142474 45142634 -107394625 - MTEb LTR MaLR -12 367 204 2 929 352 242 0 0 chr5 45142657 45142723 -107394536 - MTEb LTR MaLR -293 66 1 2 929 1146 295 39 58 chr5 45149033 45149393 -107387866 + ORR1D2 LTR MaLR 1 353 -17 2 929 307 201 25 51 chr5 45153863 45153959 -107383300 - RMER17A LTR ERVK -281 470 376 2 929 307 201 25 51 chr5 45154139 45154199 -107383060 - RMER17A LTR ERVK -376 375 319 2 929 349 350 74 106 chr5 45162628 45162967 -107374292 + MLT1G1 LTR MaLR 179 506 -73 2 929 3621 35 2 0 chr5 45173041 45173436 -107363823 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 929 1141 297 69 44 chr5 45196203 45196636 -107340623 - MT2A LTR ERVL -87 446 3 3 929 545 336 85 17 chr5 45196959 45197195 -107340064 + MTE2b LTR MaLR 100 351 -28 3 929 279 338 44 15 chr5 45199525 45199660 -107337599 - MLT1K LTR MaLR -44 551 413 3 929 333 220 10 117 chr5 45202691 45202794 -107334465 - MT2B LTR ERVL -337 264 173 3 929 510 270 36 0 chr5 45203704 45203841 -107333418 + MLT2B4 LTR ERVL 1 142 -414 3 929 1419 230 127 23 chr5 45203842 45204269 -107332990 + ERVL-B4-int LTR ERVL 737 1207 -4507 3 929 741 254 42 11 chr5 45204282 45204473 -107332786 + MTD LTR MaLR 5 201 -218 3 929 1108 274 83 8 chr5 45205913 45206003 -107331256 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3523 3618 -2096 3 929 1108 274 83 8 chr5 45206024 45206293 -107330966 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3619 3908 -1806 3 929 2711 268 113 57 chr5 45206410 45206882 -107330377 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4030 4548 -1166 3 929 2711 268 113 57 chr5 45206924 45207451 -107329808 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4549 5129 -585 3 929 232 267 12 128 chr5 45207519 45207547 -107329712 - MTD LTR MaLR -342 77 51 3 929 232 267 12 128 chr5 45207719 45207776 -107329483 - MTD LTR MaLR -369 50 2 3 929 977 253 80 48 chr5 45207908 45208219 -107329040 + MLT2B4 LTR ERVL 3 323 -233 3 929 1147 330 37 63 chr5 45208447 45208906 -107328353 - MLT2B2 LTR ERVL -68 447 1 3 929 1023 218 94 18 chr5 45209934 45210198 -107327061 - MTD LTR MaLR -20 399 133 3 929 1704 123 36 69 chr5 45211868 45212201 -107325058 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 929 325 344 152 47 chr5 45212645 45212987 -107324272 - LTR16B2 LTR ERVL -80 382 5 3 929 3771 10 2 0 chr5 45214315 45214710 -107322549 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 929 9760 39 4 0 chr5 45214710 45215804 -107321455 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 929 3611 28 2 10 chr5 45215804 45216203 -107321056 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 929 407 272 56 44 chr5 45217187 45217381 -107319878 - MLT1C LTR MaLR -27 533 293 3 929 410 296 63 38 chr5 45217751 45217909 -107319350 - MLT1C LTR MaLR -305 162 1 3 930 886 206 166 28 chr5 45227246 45227565 -107309694 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 5 3 930 256 375 134 29 chr5 45231697 45231936 -107305323 + MER21B LTR ERV1 476 739 -124 4 930 271 389 92 18 chr5 45233759 45234042 -107303217 + LTR16C LTR ERVL 186 489 0 4 930 383 243 125 28 chr5 45234527 45234697 -107302562 - MLT1C LTR MaLR -214 176 3 4 930 1124 266 42 30 chr5 45249717 45250054 -107287205 - RMER5 LTR ERV1 0 534 194 4 930 282 255 92 41 chr5 45250280 45250338 -107286921 + MLT1C LTR MaLR 117 182 -285 4 930 282 255 92 41 chr5 45250384 45250423 -107286836 + MLT1C LTR MaLR 183 219 -248 4 930 809 244 114 29 chr5 45250609 45250854 -107286405 - MLT1C LTR MaLR -113 354 89 4 930 615 304 85 85 chr5 45253615 45253967 -107283292 + MLT1D LTR MaLR 152 503 -2 4 930 1488 151 218 59 chr5 45257788 45258127 -107279132 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 4 930 276 346 112 0 chr5 45260944 45261051 -107276208 + ORR1E LTR MaLR 75 193 -166 4 930 586 294 103 43 chr5 45264992 45265273 -107271986 + MLT1B LTR MaLR 93 390 0 4 930 1546 239 86 30 chr5 45273405 45273802 -107263457 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 930 639 268 163 59 chr5 45276503 45276773 -107260486 + MLT1A0 LTR MaLR 111 408 0 4 930 802 214 63 21 chr5 45277059 45277250 -107260009 + ORR1B1 LTR MaLR 41 239 -155 4 930 366 288 68 0 chr5 45278279 45278397 -107258862 - MLT1G LTR MaLR -36 512 387 4 930 437 298 0 76 chr5 45278491 45278622 -107258637 - MLT1G LTR MaLR -320 271 151 4 930 228 188 145 0 chr5 45278779 45278848 -107258411 - MLT1G LTR MaLR -506 89 11 4 930 1002 304 38 0 chr5 45282273 45282562 -107254697 + MTE2b LTR MaLR 1 300 -79 4 930 483 336 81 13 chr5 45282634 45282869 -107254390 + MLT1E1A LTR MaLR 415 665 -15 4 930 1834 218 82 16 chr5 45285824 45286324 -107250935 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 4 930 983 236 133 27 chr5 45286991 45287322 -107249937 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 4 930 1551 246 48 51 chr5 45289350 45289762 -107247497 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 4 930 2904 24 21 0 chr5 45291264 45291324 -107245935 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 287 5 930 2904 24 21 0 chr5 45291358 45291636 -107245623 - ORR1A0 LTR MaLR -60 286 2 5 930 251 368 0 10 chr5 45291641 45291737 -107245522 + MLT1H LTR MaLR 58 152 -397 5 930 472 255 120 37 chr5 45302037 45302228 -107235031 - MTEa LTR MaLR -162 217 11 5 930 691 306 83 80 chr5 45306724 45307061 -107230198 - ORR1E LTR MaLR -21 338 1 5 930 333 294 116 51 chr5 45310879 45311152 -107226107 - MTEa LTR MaLR -8 371 60 5 930 873 272 32 36 chr5 45311602 45311880 -107225379 - ORR1E LTR MaLR -1 358 82 5 930 467 262 10 10 chr5 45312085 45312183 -107225076 - ORR1E LTR MaLR -259 100 3 5 930 711 279 86 48 chr5 45312628 45312941 -107224318 + MTEa LTR MaLR 55 379 0 5 930 252 275 43 11 chr5 45314366 45314458 -107222801 + MLT2C1 LTR ERVL 1 95 -302 5 930 488 252 47 0 chr5 45318902 45319029 -107218230 + ORR1E LTR MaLR 1 133 -226 5 930 297 315 11 0 chr5 45330446 45330535 -107206724 + MLT1A LTR MaLR 284 373 -1 5 930 1432 234 81 25 chr5 45333569 45333929 -107203330 - MTD LTR MaLR -39 380 1 5 930 967 320 53 48 chr5 45341225 45341602 -107195657 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 5 930 398 355 111 39 chr5 45344285 45344619 -107192640 - ORR1E LTR MaLR -1 358 1 5 930 638 271 140 45 chr5 45345943 45346042 -107191217 - MTD LTR MaLR -15 364 266 5 930 648 272 123 42 chr5 45346087 45346333 -107190926 - MTD LTR MaLR -114 265 18 5 931 358 236 111 19 chr5 45351174 45351282 -107185977 - ORR1E LTR MaLR -241 118 1 5 931 1452 331 95 57 chr5 45364653 45365445 -107171814 + MER21B LTR ERV1 24 845 -18 5 931 232 250 29 14 chr5 45366193 45366262 -107170997 + MTE2b LTR MaLR 293 362 -17 6 931 395 296 150 18 chr5 45370352 45370572 -107166687 - RMER5 LTR ERV1 -251 283 35 6 931 459 338 120 65 chr5 45391735 45392152 -107145107 + MLT1H LTR MaLR 3 442 -107 6 931 725 265 60 14 chr5 45393260 45393478 -107143781 + MLT2C1 LTR ERVL 59 286 -111 6 931 2488 152 0 24 chr5 45394753 45395170 -107142089 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 931 2196 85 6 62 chr5 45403914 45404251 -107133008 + ORR1A2 LTR MaLR 2 319 -8 6 931 277 276 115 3 chr5 45408833 45408953 -107128306 + MLT1A1 LTR MaLR 211 383 -25 6 931 2022 114 69 0 chr5 45409943 45410249 -107127010 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 931 1245 271 54 48 chr5 45410880 45411253 -107126006 + MTEa LTR MaLR 2 376 -3 6 931 293 247 31 73 chr5 45420456 45420552 -107116707 - MLT1M LTR MaLR -463 209 118 6 931 745 285 107 50 chr5 45424914 45425213 -107112046 + MLT2D LTR ERVL 1 316 -98 6 931 379 302 118 20 chr5 45428588 45428740 -107108519 + MLT2B3 LTR ERVL 34 200 -354 6 931 602 311 71 35 chr5 45428926 45429209 -107108050 + MLT2B3 LTR ERVL 250 542 -12 6 931 282 263 26 13 chr5 45429220 45429297 -107107962 + MLT1H LTR MaLR 59 136 -413 6 931 233 341 85 31 chr5 45432243 45432373 -107104886 - ORR1E LTR MaLR -163 196 60 7 931 432 294 179 76 chr5 45434219 45434660 -107102599 - LTR50 LTR ERVL -1 794 139 7 931 332 295 105 66 chr5 45437769 45438151 -107099108 - RLTR12B LTR ERVK -234 294 12 7 931 3181 51 2 10 chr5 45438872 45439271 -107097988 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 931 731 306 44 20 chr5 45439396 45439702 -107097557 - MLT1A1 LTR MaLR -2 465 67 7 931 299 272 37 0 chr5 45443309 45443390 -107093869 - MER67D LTR ERV1 -137 377 294 7 931 767 294 140 34 chr5 45448764 45449120 -107088139 - MER77 LTR ERVL -2 605 212 7 931 1301 229 69 60 chr5 45449694 45450043 -107087216 + ORR1D2 LTR MaLR 4 355 -15 7 931 1016 182 27 25 chr5 45451492 45451814 -107085445 - RMER6A LTR ERVK 0 756 423 7 931 226 339 25 92 chr5 45451799 45451919 -107085340 - ORR1D2 LTR MaLR -244 126 15 7 931 2837 73 64 5 chr5 45454002 45454376 -107082883 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 931 650 336 76 47 chr5 45456892 45457338 -107079921 - LTR40b LTR ERVL 0 462 4 7 931 1516 234 84 3 chr5 45461557 45461904 -107075355 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 7 931 365 260 86 39 chr5 45462498 45462626 -107074633 + LTR48 LTR ERV1 29 162 -625 7 931 1326 224 201 3 chr5 45466000 45466349 -107070910 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 7 931 531 261 158 5 chr5 45468779 45468975 -107068284 + RMER15 LTR ERVL 336 561 -14 7 931 577 162 29 0 chr5 45469776 45469881 -107067378 + ORR1C1 LTR MaLR 271 378 0 7 931 302 333 99 12 chr5 45471625 45471786 -107065473 + MTE2b LTR MaLR 1 175 -204 7 931 285 328 47 58 chr5 45471786 45471816 -107065443 + MT2A LTR ERVL 1 189 -344 7 931 611 329 22 31 chr5 45472605 45472834 -107064425 + MT2A LTR ERVL 197 423 -110 7 931 2068 284 28 20 chr5 45473224 45473861 -107063398 - ORR1E-int LTR MaLR -937 643 2 7 931 1269 244 71 24 chr5 45473867 45474203 -107063056 - ORR1E LTR MaLR -6 353 2 7 932 285 333 76 43 chr5 45487756 45487966 -107049293 + ORR1E LTR MaLR 77 293 -66 8 932 259 235 0 0 chr5 45489139 45489190 -107048069 - MLT1N2 LTR MaLR -8 554 504 8 932 3274 71 5 2 chr5 45499343 45499738 -107037521 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 932 1289 242 81 24 chr5 45504884 45505256 -107032003 - MTD LTR MaLR 0 419 27 9 932 549 300 130 34 chr5 45505323 45505592 -107031667 + ORR1E LTR MaLR 64 358 -1 1 932 320 152 17 0 chr5 45506817 45506876 -107030383 + MTD LTR MaLR 248 307 -112 1 932 1572 193 82 48 chr5 45508683 45509037 -107028222 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 1 932 586 295 129 48 chr5 45509842 45510137 -107027122 - MLT1B LTR MaLR -4 386 68 1 932 1911 222 32 24 chr5 45510161 45510572 -107026687 - MTD LTR MaLR 0 419 6 1 932 389 303 0 10 chr5 45517411 45517511 -107019748 + MLT1H LTR MaLR 46 144 -405 3 932 736 313 44 13 chr5 45520257 45520574 -107016685 + MTE-int LTR MaLR 1 327 -1253 3 932 616 259 171 29 chr5 45522539 45522813 -107014446 - MLT2B4 LTR ERVL -212 344 32 4 932 329 349 7 57 chr5 45527980 45528120 -107009139 - MLT1A LTR MaLR -221 153 21 5 932 1277 230 64 26 chr5 45530288 45530632 -107006627 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 6 932 301 316 76 41 chr5 45534424 45534569 -107002690 - MLT1J LTR MaLR -322 190 41 6 932 293 327 50 28 chr5 45534893 45535055 -107002204 - MLT1H LTR MaLR -163 248 91 6 932 1868 161 104 35 chr5 45547331 45547509 -106989750 + MTC LTR MaLR 1 195 -226 8 932 1868 161 104 35 chr5 45548256 45548471 -106988788 + MTC LTR MaLR 196 421 0 8 932 332 271 118 53 chr5 45549796 45549948 -106987311 + MLT1E2 LTR MaLR 74 235 -392 8 932 628 359 38 35 chr5 45551187 45551554 -106985705 + MLT1E2 LTR MaLR 204 571 -56 8 932 313 326 40 88 chr5 45551826 45551974 -106985285 - LTR33A_ LTR ERVL -383 148 8 9 932 1086 259 165 3 chr5 45555810 45556132 -106981127 + MTD LTR MaLR 46 419 0 9 932 1994 147 104 5 chr5 45557243 45557626 -106979633 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 932 258 202 117 20 chr5 45566810 45566887 -106970372 - MTEa LTR MaLR -14 365 286 1 932 541 331 114 37 chr5 45567123 45567421 -106969838 - MLT1F2 LTR MaLR -75 485 165 1 932 2463 217 70 68 chr5 45567657 45568025 -106969234 + RMER17D2 LTR ERVK 3 389 -420 1 932 2463 217 70 68 chr5 45568119 45568516 -106968743 + RMER17D2 LTR ERVK 390 794 -15 1 932 432 359 92 44 chr5 45570020 45570314 -106966945 - ORR1E LTR MaLR 0 359 52 1 932 762 234 184 15 chr5 45572967 45573254 -106964005 + MTD LTR MaLR 39 407 -12 1 932 603 326 108 19 chr5 45574144 45574460 -106962799 - MLT1D LTR MaLR 0 505 162 1 932 1268 285 41 14 chr5 45579202 45579547 -106957712 + ORR1D2 LTR MaLR 13 366 -4 1 932 399 404 53 55 chr5 45590800 45591233 -106946026 - LTR16D1 LTR ERVL -241 434 3 1 932 228 287 29 79 chr5 45591495 45591538 -106945721 + MLT1A1 LTR MaLR 276 313 -95 1 932 1114 206 248 23 chr5 45591538 45591841 -106945418 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 2 1 932 228 287 29 79 chr5 45591841 45591937 -106945322 + MLT1A1 LTR MaLR 314 408 0 1 932 1043 285 103 9 chr5 45594579 45594919 -106942340 + MTE2b LTR MaLR 1 372 -7 1 932 308 382 99 35 chr5 45595225 45595537 -106941722 - MLT1L LTR MaLR -122 488 157 1 932 628 307 94 34 chr5 45602799 45603065 -106934194 - MLT1A0 LTR MaLR -74 291 10 1 932 474 264 41 14 chr5 45611980 45612126 -106925133 + MER57C2 LTR ERV1 285 434 0 1 933 793 283 0 5 chr5 45618020 45618208 -106919051 + MTE2b LTR MaLR 10 196 -183 1 933 1866 173 28 14 chr5 45618211 45618568 -106918691 + ORR1B1 LTR MaLR 33 394 0 1 933 1256 230 100 17 chr5 45619016 45619366 -106917893 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 2 933 330 291 91 50 chr5 45621317 45621538 -106915721 - LTR85b LTR Gypsy? -159 625 396 2 933 685 240 84 61 chr5 45622197 45622515 -106914744 + ORR1E LTR MaLR 1 375 -4 2 933 2439 93 3 3 chr5 45622585 45622909 -106914350 + ORR1A2 LTR MaLR 4 327 0 2 933 1589 243 24 19 chr5 45623970 45624347 -106912912 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 2 933 1731 154 136 14 chr5 45625027 45625396 -106911863 - MTC LTR MaLR -2 419 6 2 933 234 194 14 56 chr5 45625639 45625710 -106911549 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 325 2 933 1056 223 175 9 chr5 45631264 45631612 -106905647 - MTD LTR MaLR 0 419 14 2 933 247 330 121 9 chr5 45631825 45631941 -106905318 - ORR1D2 LTR MaLR -230 140 12 2 933 2882 71 45 10 chr5 45633140 45633537 -106903722 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 933 5401 62 8 14 chr5 45633537 45634240 -106903019 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 1288 2 933 1664 69 5 5 chr5 45634241 45634459 -106902800 - IAP-d-int LTR ERVK -658 5884 5667 2 933 1938 50 131 22 chr5 45634463 45634730 -106902529 - IAP-d-int LTR ERVK -1015 5527 5232 2 933 1681 75 48 4 chr5 45642303 45642523 -106894736 - IAP-d-int LTR ERVK -1305 5237 5007 2 933 502 202 37 0 chr5 45642540 45642649 -106894610 - IAP-d-int LTR ERVK -6083 459 347 2 933 1902 81 2 41 chr5 45642643 45643061 -106894198 - IAP-d-int LTR ERVK -1385 602 302 2 933 2801 63 76 0 chr5 45643061 45643443 -106893816 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 933 252 326 129 7 chr5 45651366 45651505 -106885754 - MLT1I LTR MaLR -1 410 255 2 933 232 321 133 9 chr5 45651630 45651743 -106885516 + MLT1A1 LTR MaLR 1 127 -281 2 933 826 360 75 32 chr5 45652613 45653270 -106883989 + MTE-int LTR MaLR 1 685 -895 2 933 914 167 0 24 chr5 45653313 45653479 -106883780 + ORR1D1 LTR MaLR 1 162 -212 2 933 799 161 61 24 chr5 45653625 45653790 -106883469 + ORR1D1 LTR MaLR 164 334 -40 2 933 1821 332 47 51 chr5 45653966 45654755 -106882504 + MTE-int LTR MaLR 766 1551 -29 2 933 318 259 53 112 chr5 45674758 45674910 -106862349 + ORR1E LTR MaLR 217 359 0 2 933 669 243 115 70 chr5 45675050 45675293 -106861966 + MTD LTR MaLR 1 254 -165 2 933 482 317 66 96 chr5 45682047 45682486 -106854773 + MLT1C LTR MaLR 34 459 -8 3 933 805 273 64 62 chr5 45686200 45686606 -106850653 - MLT2B2 LTR ERVL -7 555 5 3 933 293 284 121 50 chr5 45687376 45687517 -106849742 + LTR84a LTR ERVL 69 219 -538 3 933 353 326 98 75 chr5 45687959 45688264 -106848995 + ORR1E LTR MaLR 1 312 -47 3 933 734 254 214 12 chr5 45689312 45689635 -106847624 + RMER5 LTR ERV1 147 534 0 3 933 653 264 106 33 chr5 45691161 45691556 -106845703 - LTR37A LTR ERV1 0 426 3 3 933 236 386 69 10 chr5 45691973 45692075 -106845184 - LTR16C LTR ERVL -227 262 155 3 933 386 311 57 57 chr5 45694816 45694956 -106842303 + MLT1F2 LTR MaLR 17 156 -404 3 933 293 315 108 51 chr5 45695057 45695271 -106841988 - ORR1E LTR MaLR -130 229 4 3 933 248 311 18 54 chr5 45695753 45695865 -106841394 + MLT1A LTR MaLR 5 112 -262 3 933 3047 180 43 19 chr5 45695877 45696708 -106840551 - RMER19B LTR ERVK -7 895 1 3 933 317 369 23 40 chr5 45700343 45700518 -106836741 + MLT1F2 LTR MaLR 203 374 0 3 933 614 261 181 34 chr5 45701021 45701348 -106835911 - MTD LTR MaLR -32 387 6 3 933 598 303 20 0 chr5 45705259 45705411 -106831848 + MTD LTR MaLR 35 189 -230 3 933 528 209 36 42 chr5 45705430 45705572 -106831687 + MTD LTR MaLR 240 381 -38 3 933 460 273 77 30 chr5 45707926 45708091 -106829168 + MLT1F2 LTR MaLR 17 189 -380 3 933 301 329 84 112 chr5 45708079 45708329 -106828930 + MLT1F2 LTR MaLR 309 551 -103 3 933 423 269 0 16 chr5 45708344 45708465 -106828794 + LTR82A LTR ERVL 263 381 -491 3 933 228 253 100 114 chr5 45708484 45708694 -106828565 - MLT1B LTR MaLR -20 370 164 3 933 530 347 97 7 chr5 45708944 45709234 -106828025 + LTR82A LTR ERVL 424 739 -133 3 933 371 206 0 0 chr5 45709543 45709606 -106827653 + MTEb LTR MaLR 1 63 -316 3 933 433 253 113 60 chr5 45709601 45709769 -106827490 + MTEb LTR MaLR 201 377 -2 3 933 1045 255 100 7 chr5 45710146 45710415 -106826844 - ORR1E LTR MaLR -65 294 1 3 933 331 306 91 65 chr5 45714723 45714922 -106822337 + MLT1F2 LTR MaLR 103 306 -254 3 933 322 280 118 22 chr5 45714978 45715113 -106822146 - MLT1E1A LTR MaLR -249 431 284 3 933 800 251 191 17 chr5 45720506 45720741 -106816518 - MTEb LTR MaLR -100 279 4 3 933 3453 256 218 32 chr5 45720745 45720920 -106816339 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 1344 3 933 3453 256 218 32 chr5 45721124 45721992 -106815267 - MTEb-int LTR MaLR -237 1343 294 3 933 3045 43 0 9 chr5 45721992 45722341 -106814918 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 933 2256 256 51 26 chr5 45722341 45722605 -106814654 - MTEb-int LTR MaLR -1287 293 27 3 933 405 279 96 0 chr5 45722661 45722841 -106814418 - MTEa LTR MaLR -123 256 1 3 933 660 223 138 34 chr5 45733210 45733629 -106803630 - MTD LTR MaLR -14 405 33 3 933 263 272 73 12 chr5 45734081 45734163 -106803096 + ORR1E LTR MaLR 269 355 -4 3 933 2351 167 53 32 chr5 45734325 45734758 -106802501 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 4 933 482 211 34 26 chr5 45736151 45736268 -106800991 + MLT1A1 LTR MaLR 291 408 0 4 933 449 338 89 35 chr5 45736377 45736579 -106800680 - LTR16A LTR ERVL -108 343 131 4 933 249 241 17 0 chr5 45736897 45736955 -106800304 + RMER15 LTR ERVL 2 60 -515 4 933 1045 261 108 54 chr5 45743453 45743822 -106793437 + RMER15 LTR ERVL 187 575 0 4 116 274 286 82 107 chr5 45743944 45744187 -106793072 + MLT1B LTR MaLR 3 239 -151 4 934 492 321 14 0 chr5 45744304 45744444 -106792815 + MLT1B LTR MaLR 245 386 -4 4 934 298 172 52 0 chr5 45744609 45744667 -106792592 - ORR1E LTR MaLR 0 379 319 4 934 890 310 92 44 chr5 45744667 45744832 -106792427 - RMER5 LTR ERV1 0 534 369 4 934 890 310 92 44 chr5 45744915 45745249 -106792010 - RMER5 LTR ERV1 -166 368 11 4 934 583 259 143 30 chr5 45745251 45745557 -106791702 - ORR1E LTR MaLR -37 357 2 4 934 243 236 70 70 chr5 45751046 45751160 -106786099 + LTR79 LTR ERVL 67 180 -347 4 934 440 287 59 0 chr5 45752353 45752489 -106784770 - MLT1D LTR MaLR -7 498 355 4 934 368 318 15 36 chr5 45752605 45752742 -106784517 - MLT1D LTR MaLR -371 134 1 4 934 268 300 44 35 chr5 45756742 45756856 -106780403 - ORR1E LTR MaLR -237 122 8 4 934 952 271 192 39 chr5 45759674 45760112 -106777147 - LTR86C LTR ERVL -58 563 59 4 934 2640 123 60 31 chr5 45761147 45761565 -106775694 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 4 934 279 209 10 131 chr5 45761729 45761828 -106775431 + MLT1I LTR MaLR 325 411 0 4 934 454 200 14 120 chr5 45762260 45762402 -106774857 - MT2B LTR ERVL -337 264 138 4 934 855 273 45 16 chr5 45766087 45766333 -106770926 - MTD LTR MaLR -166 253 1 4 934 2150 149 53 22 chr5 45767147 45767299 -106769960 + ORR1B2 LTR MaLR 1 146 -221 4 934 2150 149 53 22 chr5 45767362 45767565 -106769694 + ORR1B2 LTR MaLR 147 367 0 4 934 1455 262 95 8 chr5 45770586 45771060 -106766199 + RMER5 LTR ERV1 20 534 0 4 934 2985 115 36 2 chr5 45775587 45776031 -106761228 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 4 934 258 189 19 0 chr5 45778874 45778927 -106758332 - MTD LTR MaLR -14 405 352 4 934 3102 83 2 12 chr5 45782013 45782438 -106754821 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 4 934 434 330 113 0 chr5 45785902 45786087 -106751172 + MLT1I LTR MaLR 157 362 -49 4 934 3010 17 42 6 chr5 45786665 45787019 -106750240 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 4 934 25422 31 36 4 chr5 45787019 45789994 -106747265 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 4 934 7510 26 3 0 chr5 45789980 45790829 -106746430 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6481 0 4 934 3010 17 42 6 chr5 45790829 45791183 -106746076 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 4 934 643 307 64 52 chr5 45793674 45794004 -106743255 - LTR41B LTR ERVL 0 758 425 4 934 441 233 139 0 chr5 45794072 45794201 -106743058 - LTR41B LTR ERVL -597 161 15 4 934 615 310 99 26 chr5 45798729 45799176 -106738083 + MLT2B4 LTR ERVL 1 551 -3 4 934 1335 197 130 36 chr5 45799237 45799707 -106737552 + RLTR20C LTR ERVK 4 541 0 4 934 389 327 105 25 chr5 45807470 45807746 -106729513 - MTEa LTR MaLR -6 373 76 5 934 471 281 7 0 chr5 45808143 45808278 -106728981 - MTE-int LTR MaLR -5 1575 1440 5 934 595 335 75 35 chr5 45808328 45808674 -106728585 + MLT1A0 LTR MaLR 1 360 -5 5 934 1118 261 118 51 chr5 45813010 45813519 -106723740 + MER67A LTR ERV1 1 543 0 5 934 2860 174 71 100 chr5 45816692 45817578 -106719681 - RLTR13D6 LTR ERVK -38 940 1 5 934 228 308 97 21 chr5 45821265 45821358 -106715901 - RMER20A LTR ERVK 0 516 417 5 934 337 161 32 0 chr5 45821581 45821643 -106715616 - RMER20B LTR ERVK -563 64 1 5 934 623 217 151 28 chr5 45822926 45823144 -106714115 + RMER4B LTR ERVK 6 250 -335 5 934 358 277 188 24 chr5 45823349 45823519 -106713740 + RMER4B LTR ERVK 359 556 -29 5 934 227 114 0 0 chr5 45823608 45823643 -106713616 - MTB-int LTR MaLR -1063 35 1 5 934 2931 71 50 3 chr5 45823643 45824025 -106713234 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 934 828 281 103 18 chr5 45830073 45830403 -106706856 + MLT1A0 LTR MaLR 1 358 -7 5 934 702 234 50 20 chr5 45833636 45833837 -106703422 + MLT1B LTR MaLR 44 250 -140 5 934 323 279 120 27 chr5 45840039 45840265 -106696994 - MTD LTR MaLR -160 247 1 5 934 405 345 77 0 chr5 45856178 45856398 -106680861 + LTR50 LTR ERVL 402 638 -157 5 934 260 276 259 13 chr5 45856754 45856912 -106680347 + MLT2D LTR ERVL 4 200 -214 5 934 233 262 83 0 chr5 45857655 45857739 -106679520 + MLT2D LTR ERVL 418 508 -55 5 934 1004 231 25 30 chr5 45859638 45859874 -106677385 + MTD LTR MaLR 12 246 -173 5 934 788 233 17 6 chr5 45860408 45860589 -106676670 - ORR1D2 LTR MaLR -187 183 1 5 934 249 304 0 42 chr5 45861821 45861893 -106675366 - RMER20B LTR ERVK -22 605 537 5 934 484 274 62 47 chr5 45861893 45862104 -106675155 - RMER20B LTR ERVK -14 613 400 5 934 761 156 94 23 chr5 45862483 45862654 -106674605 - RMER20B LTR ERVK -215 412 230 5 934 318 214 196 39 chr5 45862639 45862741 -106674518 - RMER20B LTR ERVK -500 127 10 5 934 398 292 60 23 chr5 45870066 45870199 -106667060 + ORR1E LTR MaLR 1 138 -221 6 934 922 214 88 49 chr5 45871289 45871646 -106665613 + RLTR20C LTR ERVK 1 492 -86 6 934 482 225 95 34 chr5 45871672 45871760 -106665499 + RLTR20C LTR ERVK 493 577 -1 6 934 225 333 50 50 chr5 45874419 45874580 -106662679 - MLT1J LTR MaLR -115 397 237 6 116 436 260 156 91 chr5 45874888 45875305 -106661954 - RLTR33 LTR ERVK 0 499 11 6 935 2485 110 26 46 chr5 45876649 45877106 -106660153 + RMER4A LTR ERVK 18 465 -1 6 935 2110 139 32 75 chr5 45878770 45879181 -106658078 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 6 935 615 212 41 0 chr5 45882354 45882500 -106654759 + RLTR40 LTR ERVK 1 152 -665 6 935 1007 213 112 93 chr5 45882550 45882917 -106654342 + RLTR40 LTR ERVK 434 807 -10 6 935 233 327 120 96 chr5 45883537 45883838 -106653421 - ORR1E LTR MaLR -1 358 51 6 935 369 272 186 27 chr5 45883989 45884407 -106652852 + MER34A1 LTR ERV1 1 492 -50 6 935 1902 193 85 13 chr5 45891861 45892250 -106645009 + MTD LTR MaLR 3 419 0 6 935 525 346 78 62 chr5 45905880 45906400 -106630859 - MuRRS-int LTR ERV1 -4553 3003 2512 6 935 551 322 65 52 chr5 45906547 45906986 -106630273 - MuRRS-int LTR ERV1 -5045 2511 1816 6 935 751 346 93 41 chr5 45907136 45907747 -106629512 - RLTR6-int LTR ERV1 -5844 1934 1292 6 935 242 186 0 0 chr5 45908163 45908206 -106629053 - RLTR23 LTR ERV1 -380 50 8 6 935 519 268 34 162 chr5 45908556 45908971 -106628288 - RLTR20A1 LTR ERVK -71 507 3 6 935 285 196 0 0 chr5 45908946 45908992 -106628267 + RLTR23 LTR ERV1 45 90 -340 6 935 3910 108 107 57 chr5 45909145 45909864 -106627395 - RMER6A LTR ERVK -1 755 1 6 935 2360 157 98 2 chr5 45910483 45910931 -106626328 + RLTR28 LTR ERVL 1 491 -33 6 935 297 324 75 47 chr5 45914526 45914740 -106622519 - RMER12 LTR ERVK -462 860 641 6 935 955 229 203 4 chr5 45919540 45919821 -106617438 + MTEa LTR MaLR 6 342 -37 6 935 311 250 105 0 chr5 45920308 45920384 -106616875 + MLT1A1 LTR MaLR 87 170 -195 6 935 3229 53 5 2 chr5 45922312 45922707 -106614552 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 935 241 324 0 0 chr5 45934379 45934450 -106602809 + MER87 LTR ERV1 390 460 -81 7 935 1041 315 87 65 chr5 45937071 45937810 -106599449 + RMER13A LTR ERVK 1 848 -12 7 935 2822 202 49 91 chr5 45939936 45940828 -106596431 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 7 935 1975 130 64 20 chr5 45942996 45943388 -106593871 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1895 2303 -23 7 935 897 262 58 29 chr5 45943426 45943701 -106593558 + RLTR20D LTR ERVK 1 283 -285 7 935 262 183 148 16 chr5 45943708 45943732 -106593527 + RLTR20D LTR ERVK 456 479 -99 7 935 262 183 148 16 chr5 45943794 45943830 -106593429 + RLTR20D LTR ERVK 480 523 -55 7 935 1069 29 15 0 chr5 45945676 45945812 -106591447 + MT2B LTR ERVL 1 138 -463 7 935 1122 87 0 6 chr5 45945808 45945970 -106591289 + MT2B LTR ERVL 441 601 0 7 935 474 62 0 0 chr5 45948875 45948940 -106588319 + ORR1A0 LTR MaLR 2 66 -280 7 935 1172 21 0 0 chr5 45948940 45949085 -106588174 + ORR1A0 LTR MaLR 202 346 0 7 935 3998 72 43 18 chr5 45949085 45949753 -106587506 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 685 -1107 7 935 236 163 0 0 chr5 45949742 45949785 -106587474 + ORR1A0-int LTR MaLR 1550 1592 -200 7 935 783 341 60 29 chr5 45955443 45955733 -106581526 - MLT1C LTR MaLR 0 467 170 7 935 783 341 60 29 chr5 45956051 45956210 -106581049 - MLT1C LTR MaLR -298 169 4 7 935 1861 196 10 47 chr5 45957646 45957785 -106579474 + ORR1D1 LTR MaLR 4 125 -249 7 935 1861 196 10 47 chr5 45957981 45958226 -106579033 + ORR1D1 LTR MaLR 126 374 0 7 935 2439 113 206 139 chr5 45977384 45977932 -106559327 + RLTR25B LTR ERVK 283 825 -203 7 935 2439 113 206 139 chr5 45977977 45978127 -106559132 + RLTR25B LTR ERVK 826 1028 0 7 935 451 222 143 0 chr5 45980540 45980666 -106556593 - MER68 LTR ERVL -16 547 404 7 935 499 336 74 30 chr5 45981130 45981400 -106555859 - MER68 LTR ERVL -279 284 3 7 935 1507 158 123 12 chr5 45986007 45986339 -106550920 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 7 935 1652 180 68 6 chr5 45988064 45988416 -106548843 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 935 4092 118 92 2 chr5 45988614 45989232 -106548027 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 5 7 935 575 98 0 0 chr5 45994794 45994886 -106542373 + RLTR28 LTR ERVL 166 257 -267 7 935 1164 117 0 6 chr5 45999820 46000000 -106537259 + ORR1A2 LTR MaLR 1 179 -148 7 935 956 97 27 14 chr5 46000000 46000146 -106537113 + ORR1A1 LTR MaLR 199 346 0 1 935 473 331 191 32 chr5 46001453 46001862 -106535397 - MLT1E3 LTR MaLR -88 536 63 6 935 1876 186 38 22 chr5 46002205 46002573 -106534686 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 935 5204 203 80 94 chr5 46002573 46003962 -106533297 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1370 0 7 935 1540 183 128 12 chr5 46003962 46004305 -106532954 + ORR1D1 LTR MaLR 1 383 -1 7 935 519 338 97 35 chr5 46004622 46004932 -106532327 + LTR16B1 LTR ERVL 43 371 -109 8 936 353 56 0 129 chr5 46006366 46006428 -106530831 + ORR1A1 LTR MaLR 285 338 -8 1 936 3165 175 91 13 chr5 46006418 46007031 -106530228 + RMER19B LTR ERVK 241 901 -1 1 936 2832 75 145 141 chr5 46009229 46009739 -106527520 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 936 1865 165 119 121 chr5 46010138 46010585 -106526674 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 936 3903 79 22 12 chr5 46011186 46011688 -106525571 + LTRIS4 LTR ERV1 1 507 0 2 936 1796 135 11 0 chr5 46011826 46012100 -106525159 + ORR1A2 LTR MaLR 50 326 -1 2 936 1837 105 169 16 chr5 46012821 46013140 -106524119 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 936 4575 80 7 4 chr5 46014600 46015162 -106522097 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 3 936 5648 142 9 113 chr5 46015449 46016546 -106520713 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 3 936 640 287 100 67 chr5 46017034 46017333 -106519926 + MLT1A LTR MaLR 58 366 -8 3 936 318 292 66 82 chr5 46020436 46020619 -106516640 - MLT1E2 LTR MaLR -7 673 466 4 936 1861 155 92 17 chr5 46020696 46021056 -106516203 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 1 4 936 241 268 91 38 chr5 46021056 46021185 -106516074 - MLT1E2 LTR MaLR -304 201 66 4 936 1889 60 4 12 chr5 46021983 46022234 -106515025 - MTA_Mm LTR MaLR -147 249 1 4 936 1534 239 19 54 chr5 46023141 46023513 -106513746 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 4 936 334 285 30 68 chr5 46024134 46024148 -106513111 + MT2B LTR ERVL 152 160 -441 5 936 1530 195 131 9 chr5 46028244 46028580 -106508679 - MTD LTR MaLR -7 412 36 6 936 378 170 19 87 chr5 46033895 46033998 -106503261 - MYSERV6-int LTR ERVK -4192 4767 4672 7 936 1316 180 71 84 chr5 46034016 46034326 -106502933 - MYSERV6-int LTR ERVK -4262 4697 4392 7 936 508 162 0 0 chr5 46034324 46034404 -106502855 - MYSERV6-int LTR ERVK -4922 4037 3958 7 936 1453 162 32 0 chr5 46034404 46034651 -106502608 + ORR1A4 LTR MaLR 1 255 -74 7 936 3717 136 11 26 chr5 46034798 46035410 -106501849 - MYSERV6-int LTR ERVK -7428 1531 929 7 936 249 280 0 22 chr5 46036069 46036204 -106501055 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 623 7 936 3031 47 5 10 chr5 46036835 46037225 -106500034 - MTA_Mm LTR MaLR -8 388 1 7 936 249 225 114 134 chr5 46042362 46042511 -106494748 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 958 8 936 270 231 93 37 chr5 46043948 46044056 -106493203 - RLTR20B3 LTR ERVK -355 222 109 8 936 856 264 50 50 chr5 46049637 46049996 -106487263 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 8 936 1549 184 77 37 chr5 46049996 46050374 -106486885 + IAP-d-int LTR ERVK 1 393 -6149 8 936 9935 284 20 18 chr5 46050366 46053711 -106483548 + IAP-d-int LTR ERVK 1830 5155 -1387 8 936 1435 143 4 9 chr5 46053997 46054229 -106483030 + IAP-d-int LTR ERVK 6310 6540 -2 8 936 770 249 61 61 chr5 46054229 46054588 -106482671 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 8 936 1791 259 121 80 chr5 46055092 46056295 -106480964 + RMER12 LTR ERVK 1 1304 -18 9 936 3113 44 5 0 chr5 46056497 46056887 -106480372 - MTA_Mm LTR MaLR -4 392 1 9 936 7931 62 39 1 chr5 46056887 46057945 -106479314 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 9 936 3181 51 5 5 chr5 46058605 46059000 -106478259 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 9 936 3294 23 10 2 chr5 46062950 46063343 -106473916 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 936 2187 96 12 42 chr5 46068342 46068679 -106468580 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 936 1837 186 60 13 chr5 46068819 46069217 -106468042 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 936 466 252 98 9 chr5 46071718 46071830 -106465429 + MTE2b LTR MaLR 1 122 -257 1 936 361 336 35 14 chr5 46071989 46072131 -106465128 + MTE2b LTR MaLR 197 341 -38 1 936 1004 233 83 102 chr5 46072173 46072498 -106464761 - MTEa LTR MaLR -54 325 7 1 936 1896 112 7 0 chr5 46075136 46075414 -106461845 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 47 1 936 420 88 0 0 chr5 46076633 46076690 -106460569 - ORR1A2 LTR MaLR -270 57 1 1 936 505 282 97 93 chr5 46076692 46077013 -106460246 - MTEb LTR MaLR -53 326 5 1 936 2905 171 41 14 chr5 46077837 46078395 -106458864 - RMER15 LTR ERVL 0 575 3 1 936 226 426 66 44 chr5 46086439 46086665 -106450594 - LTR16A LTR ERVL -97 354 124 1 936 1973 178 28 25 chr5 46098898 46099207 -106438052 + RMER10B LTR ERVL 1 310 -88 1 936 2469 66 99 27 chr5 46099207 46099580 -106437679 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 936 1973 178 28 25 chr5 46099580 46099667 -106437592 + RMER10B LTR ERVL 311 398 0 1 936 555 274 153 35 chr5 46100959 46101220 -106436039 + MLT1A0 LTR MaLR 70 361 -4 1 936 802 250 129 61 chr5 46102713 46103098 -106434161 + RLTR16 LTR ERVK 1 407 -98 1 936 802 250 129 61 chr5 46103173 46103260 -106433999 + RLTR16 LTR ERVK 408 504 -1 1 936 376 138 113 31 chr5 46104364 46104461 -106432798 + MLT1A1 LTR MaLR 292 396 -12 1 936 1820 170 39 9 chr5 46128337 46128675 -106408584 + ORR1B1 LTR MaLR 47 394 0 1 936 4114 245 84 17 chr5 46133161 46134219 -106403040 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3963 5091 -670 1 936 2385 209 59 82 chr5 46134462 46135157 -106402102 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5076 5754 -7 1 936 1269 242 156 8 chr5 46135170 46135529 -106401730 + MTD LTR MaLR 8 419 0 1 937 257 299 75 106 chr5 46141474 46141635 -106395624 + MLT1E1A LTR MaLR 495 650 -30 2 937 264 207 103 0 chr5 46141673 46141731 -106395528 + MLT1E1A-int LTR MaLR 17 80 -1409 2 937 351 296 121 15 chr5 46142025 46142224 -106395035 + MLT1E1A-int LTR MaLR 285 504 -985 2 937 699 228 7 20 chr5 46146040 46146188 -106391071 + MTD LTR MaLR 248 393 -26 2 937 229 301 100 64 chr5 46150059 46150169 -106387090 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 128 2 937 2609 98 45 5 chr5 46156335 46156756 -106380503 + BGLII_B LTR ERVK 4 441 0 2 937 316 218 135 94 chr5 46164357 46164564 -106372695 + MTEb LTR MaLR 184 379 0 2 937 461 232 40 164 chr5 46175089 46175290 -106361969 + MTE2a LTR MaLR 1 176 -203 2 937 316 247 175 0 chr5 46176390 46176487 -106360772 + MTE2a LTR MaLR 266 379 0 2 937 1871 131 70 29 chr5 46183998 46184343 -106352916 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 2 937 379 156 0 0 chr5 46189399 46189463 -106347796 - MTB_Mm LTR MaLR -343 64 1 2 937 2113 154 37 19 chr5 46190327 46190704 -106346555 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 937 2679 223 48 17 chr5 46190704 46191307 -106345952 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 622 -887 2 937 3595 160 43 35 chr5 46197925 46198645 -106338614 + ORR1C2-int LTR MaLR 784 1509 0 2 937 1700 175 48 61 chr5 46198645 46199022 -106338237 + ORR1C2 LTR MaLR 1 372 -12 2 937 531 188 12 163 chr5 46199220 46199392 -106337867 + MT2A LTR ERVL 1 146 -387 2 937 1426 207 99 31 chr5 46202334 46202688 -106334571 + ORR1C2 LTR MaLR 1 378 -6 3 937 812 259 32 18 chr5 46202701 46202921 -106334338 - MTE2b LTR MaLR -1 378 156 3 937 399 237 51 26 chr5 46204207 46204324 -106332935 + MLT1D LTR MaLR 386 505 0 3 937 2556 52 55 3 chr5 46205686 46206015 -106331244 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 937 2916 27 0 0 chr5 46206437 46206769 -106330490 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 937 4670 128 14 9 chr5 46206769 46207726 -106329533 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 921 -6592 3 937 49274 55 14 2 chr5 46207721 46214097 -106323162 + IAPEY3-int LTR ERVK 1229 7680 0 3 937 2926 24 0 0 chr5 46214097 46214429 -106322830 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 937 612 262 135 75 chr5 46215037 46215384 -106321875 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 3 937 1201 206 81 27 chr5 46215384 46215434 -106321825 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 53 -1317 3 937 1201 211 272 22 chr5 46215465 46215759 -106321500 + ORR1D2-int LTR MaLR 54 420 -950 3 937 1025 250 97 57 chr5 46216536 46216999 -106320260 - RLTR26 LTR ERVK -137 505 1 3 937 1961 151 28 3 chr5 46217002 46217327 -106319932 - MERVK26-int LTR ERVK -2 6917 6585 3 937 799 226 19 130 chr5 46218137 46218452 -106318807 + RLTR11B LTR ERVK 7 286 -167 3 937 263 296 73 39 chr5 46218460 46218639 -106318620 + BGLII_B LTR ERVK 248 432 -9 3 937 3293 129 96 60 chr5 46220511 46221177 -106316082 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 937 267 265 0 14 chr5 46222388 46222457 -106314802 - MLT1E2 LTR MaLR -414 213 146 3 937 227 214 18 0 chr5 46250336 46250392 -106286867 - MLT1H2 LTR MaLR -9 540 484 3 937 249 306 13 40 chr5 46250474 46250549 -106286710 - MLT1H2 LTR MaLR -261 288 216 3 937 376 219 49 0 chr5 46250686 46250768 -106286491 - MLT1H2 LTR MaLR -330 159 74 3 937 953 42 0 0 chr5 46257842 46257960 -106279299 - ORR1A0 LTR MaLR -88 258 141 3 937 331 384 48 66 chr5 46262775 46263152 -106274107 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 937 403 403 116 16 chr5 46265638 46265827 -106271432 - MLT1K LTR MaLR -369 226 19 3 937 1097 282 47 95 chr5 46265851 46266231 -106271028 + MTE2b LTR MaLR 18 379 0 3 937 321 272 196 0 chr5 46267513 46267671 -106269588 + MLT2B3 LTR ERVL 30 218 -336 3 937 288 276 90 84 chr5 46267548 46267714 -106269545 + MTEb LTR MaLR 56 222 -157 3 938 955 187 13 71 chr5 46269087 46269312 -106267947 - MTB_Mm LTR MaLR -195 212 1 3 938 639 295 98 62 chr5 46269358 46269633 -106267626 + MLT1B LTR MaLR 1 285 -105 3 938 297 262 126 0 chr5 46275733 46275836 -106261423 - MLT1C LTR MaLR -351 116 1 3 938 609 324 131 72 chr5 46276685 46276768 -106260491 + MLT2B1 LTR ERVL 1 97 -423 3 938 609 324 131 72 chr5 46277141 46277462 -106259797 + MLT2B1 LTR ERVL 98 428 -92 3 938 1228 263 92 14 chr5 46288182 46288529 -106248730 + MTD LTR MaLR 46 419 0 4 938 690 330 17 75 chr5 46288971 46289384 -106247875 + MLT2C1 LTR ERVL 1 389 -8 4 938 262 304 132 81 chr5 46293088 46293360 -106243899 + LTR50 LTR ERVL 132 417 -378 4 938 610 283 18 54 chr5 46296050 46296254 -106241005 + RMER15 LTR ERVL 344 542 -33 4 938 610 283 18 54 chr5 46296281 46296300 -106240959 + RMER15 LTR ERVL 543 559 -16 4 938 1049 199 258 20 chr5 46297342 46297644 -106239615 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 938 546 284 47 8 chr5 46297917 46298113 -106239146 - MLT1A LTR MaLR -170 220 8 4 938 508 266 133 14 chr5 46298328 46298538 -106238721 - RMER5 LTR ERV1 -264 270 36 4 938 2981 26 0 14 chr5 46299717 46300068 -106237191 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 938 730 264 153 31 chr5 46302926 46303177 -106234082 + MER31A LTR ERV1 1 292 -193 4 938 730 264 153 31 chr5 46303202 46303270 -106233989 + MER31A LTR ERV1 293 359 -126 4 938 1617 219 46 14 chr5 46303260 46303607 -106233652 - ORR1D2 LTR MaLR -12 358 1 4 938 2101 257 113 14 chr5 46305050 46305669 -106231590 + MTEa-int LTR MaLR 900 1579 -1 4 938 1103 333 0 9 chr5 46305670 46305985 -106231274 + MTEa LTR MaLR 1 312 -67 4 938 1229 282 71 13 chr5 46308048 46308357 -106228902 + MTE2b LTR MaLR 46 372 -7 4 938 346 357 0 35 chr5 46323453 46323569 -106213690 - MLT1N2 LTR MaLR -427 135 24 4 938 939 254 121 48 chr5 46326036 46326084 -106211175 + MTEa LTR MaLR 24 86 -293 4 938 939 254 121 48 chr5 46326110 46326392 -106210867 + MTEa LTR MaLR 87 378 -1 4 938 2464 166 5 2 chr5 46338002 46338418 -106198841 - MTC LTR MaLR -4 417 1 4 938 794 290 133 0 chr5 46344056 46344349 -106192910 + MER68 LTR ERVL 25 356 -207 5 938 241 366 49 0 chr5 46344376 46344499 -106192760 + MER68 LTR ERVL 410 538 -25 5 938 2938 42 5 21 chr5 46345259 46345646 -106191613 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 16 5 938 360 310 100 12 chr5 46361069 46361229 -106176030 + MLT1H LTR MaLR 374 547 -2 5 938 641 352 70 3 chr5 46375783 46376068 -106161191 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 62 5 938 234 345 100 0 chr5 46387717 46387827 -106149432 + LTR33 LTR ERVL 45 165 -350 5 938 1513 253 54 6 chr5 46388100 46388454 -106148805 + MTE2b LTR MaLR 1 371 -8 5 938 1041 309 25 18 chr5 46389053 46389458 -106147801 - MER89 LTR ERV1 -15 544 39 5 938 2700 161 62 22 chr5 46390229 46390731 -106146528 - RLTR11A LTR ERVK -6 522 1 5 938 475 330 48 94 chr5 46393289 46393663 -106143596 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 5 938 2601 127 28 33 chr5 46393683 46394108 -106143151 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 5 938 262 247 7 127 chr5 46396581 46396727 -106140532 + ORR1E LTR MaLR 1 127 -247 5 938 2140 0 192 0 chr5 46399034 46399315 -106137944 - MT2_Mm LTR ERVL -130 363 29 5 939 247 321 25 0 chr5 46419977 46420058 -106117201 - LTR16C LTR ERVL -17 472 390 6 939 789 236 190 22 chr5 46423476 46423792 -106113467 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 6 939 235 310 0 44 chr5 46427803 46427894 -106109365 + MLT1F2 LTR MaLR 318 404 -4 6 939 256 284 57 49 chr5 46429884 46430006 -106107253 + MLT1F2 LTR MaLR 436 558 -2 6 939 772 206 7 7 chr5 46431054 46431201 -106106058 + ORR1D2 LTR MaLR 3 149 -221 6 939 1903 175 31 51 chr5 46432937 46433329 -106103930 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 939 1606 202 65 11 chr5 46435443 46435794 -106101465 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 939 485 326 124 40 chr5 46437773 46438048 -106099211 + MLT1K LTR MaLR 298 595 0 6 939 423 336 81 40 chr5 46443765 46443988 -106093271 + MLT1D LTR MaLR 1 232 -273 6 939 252 301 92 42 chr5 46446795 46446937 -106090322 + MTEb LTR MaLR 231 379 0 6 939 751 342 114 43 chr5 46451128 46451618 -106085641 - MLT1F2 LTR MaLR -8 619 1 6 939 3181 46 5 10 chr5 46453194 46453592 -106083667 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 939 269 299 170 75 chr5 46464077 46464265 -106072994 - MLT1J LTR MaLR -47 397 192 6 939 393 336 10 0 chr5 46464588 46464692 -106072567 - MLT1J LTR MaLR -313 199 95 6 939 533 386 77 27 chr5 46468165 46468604 -106068655 - LTR16B2 LTR ERVL 0 462 2 6 939 4231 40 77 2 chr5 46472303 46472824 -106064435 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 6 939 358 301 310 16 chr5 46479066 46479324 -106057935 + MLT2B4 LTR ERVL 1 334 -80 6 939 285 200 56 45 chr5 46479326 46479415 -106057844 - MTEb LTR MaLR -2 377 288 6 939 789 283 92 52 chr5 46480109 46480437 -106056822 + MTEa LTR MaLR 15 355 -24 7 939 228 262 53 61 chr5 46480630 46480744 -106056515 + MLT1A1 LTR MaLR 268 380 -28 7 939 2206 132 80 0 chr5 46484742 46485107 -106052152 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 939 493 326 70 25 chr5 46494898 46495099 -106042160 - MLT1I LTR MaLR -1 410 201 7 939 230 250 31 0 chr5 46506780 46506844 -106030415 - RMER5 LTR ERV1 -436 98 33 1 939 403 362 136 30 chr5 46507391 46507721 -106029538 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 1 939 1231 195 34 34 chr5 46511798 46512064 -106025195 + ORR1B1 LTR MaLR 129 394 0 2 939 231 309 29 49 chr5 46515370 46515472 -106021787 + MLT1C LTR MaLR 350 449 -18 3 939 367 360 40 13 chr5 46516492 46516641 -106020618 - MLT2B4 LTR ERVL -382 174 22 3 939 525 332 88 90 chr5 46517617 46518004 -106019255 + MLT1B LTR MaLR 1 386 -4 3 939 4238 42 2 25 chr5 46518180 46518711 -106018548 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 3 940 406 304 18 0 chr5 46538267 46538379 -105998880 + MTE2b LTR MaLR 1 114 -265 6 940 3262 38 5 5 chr5 46544312 46544708 -105992551 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 940 733 330 92 4 chr5 46544930 46545192 -105992067 - LTR40a LTR ERVL -234 285 1 7 940 354 190 0 0 chr5 46546726 46546784 -105990475 + RLTR28 LTR ERVL 1 58 -423 7 940 2042 167 87 5 chr5 46547294 46547721 -105989538 + RLTR28 LTR ERVL 47 508 -16 7 940 231 306 180 92 chr5 46548925 46549220 -105988039 - MLT1H LTR MaLR -192 357 37 8 940 525 334 75 57 chr5 46550203 46550552 -105986707 - ORR1E LTR MaLR -2 357 3 8 940 3286 209 53 53 chr5 46550572 46551284 -105985975 + RMER19B LTR ERVK 1 712 -190 8 940 625 154 0 0 chr5 46551274 46551378 -105985881 - RMER19B LTR ERVK -798 104 1 8 940 394 354 27 13 chr5 46555786 46555935 -105981324 - LTR31 LTR ERV1 -258 361 211 9 940 281 315 53 38 chr5 46559676 46559791 -105977468 + MLT1H LTR MaLR 46 162 -387 1 940 994 296 40 25 chr5 46559791 46560243 -105977016 + MER89 LTR ERV1 1 556 -3 1 940 1095 242 60 25 chr5 46565139 46565453 -105971806 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 42 1 940 1883 171 3 55 chr5 46567813 46568177 -105969082 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 41 1 940 2129 176 74 82 chr5 46568184 46568686 -105968573 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1012 1 940 441 355 79 24 chr5 46574890 46575144 -105962115 - MLT1J LTR MaLR -7 505 238 1 940 1250 222 171 3 chr5 46581095 46581411 -105955848 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 6 1 940 350 264 114 24 chr5 46583865 46584024 -105953235 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 216 1 940 278 278 73 95 chr5 46590503 46590682 -105946577 - ORR1E LTR MaLR -166 193 19 1 940 477 348 26 40 chr5 46591165 46591371 -105945888 + MLT1A0 LTR MaLR 4 203 -205 1 940 464 361 4 18 chr5 46591520 46591727 -105945532 + MLT1A0 LTR MaLR 204 404 -4 1 940 335 294 161 78 chr5 46598243 46598652 -105938607 + LTR55 LTR ERV 10 452 -96 1 940 236 264 230 26 chr5 46602451 46602564 -105934695 + MLT1J2 LTR MaLR 47 182 -266 1 940 333 349 0 9 chr5 46604813 46604923 -105932336 - MLT1D LTR MaLR -64 441 333 1 940 642 341 180 19 chr5 46605404 46605446 -105931813 - MER21B LTR ERV1 -51 812 765 1 940 642 341 180 19 chr5 46605492 46605933 -105931326 - MER21B LTR ERV1 -99 764 251 1 940 266 273 15 15 chr5 46606366 46606433 -105930826 - MER21B LTR ERV1 -796 67 1 1 940 803 356 12 66 chr5 46611219 46611576 -105925683 - MTE-int LTR MaLR -1260 320 1 1 940 456 274 61 110 chr5 46611674 46611920 -105925339 - MTEb LTR MaLR -131 248 15 1 940 349 132 0 0 chr5 46621806 46621859 -105915400 + RMER19A LTR ERVK 1 53 -684 1 940 1589 201 139 92 chr5 46622932 46623441 -105913818 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 1 940 605 313 59 14 chr5 46624897 46625117 -105912142 - MLT1D LTR MaLR -17 488 259 1 940 475 312 64 64 chr5 46629119 46629355 -105907904 - RMER15 LTR ERVL -15 560 325 1 940 287 277 55 92 chr5 46629377 46629540 -105907719 - RMER15 LTR ERVL -418 157 1 1 940 2052 300 41 55 chr5 46629540 46630351 -105906908 - RMER15-int LTR ERVL -26 4973 4175 1 940 2446 339 74 27 chr5 46630731 46631593 -105905666 - RMER15-int LTR ERVL -2775 2224 1276 1 940 2446 336 81 35 chr5 46631948 46632712 -105904547 - RMER15-int LTR ERVL -3724 1275 484 1 940 873 331 75 49 chr5 46641735 46642202 -105895057 - MER67D LTR ERV1 -28 486 8 2 940 230 330 69 35 chr5 46642278 46642394 -105894865 - MLT1K LTR MaLR -43 552 433 2 940 4447 129 24 22 chr5 46649449 46650204 -105887055 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 2 940 460 285 54 20 chr5 46652127 46652274 -105884985 - MTD LTR MaLR -260 159 8 2 941 1503 179 29 7 chr5 46666537 46666818 -105870441 + RLTR25B LTR ERVK 3 289 -814 2 941 2691 164 84 11 chr5 46668406 46668944 -105868315 + RLTR25B LTR ERVK 270 846 -182 2 941 804 227 14 185 chr5 46669258 46669414 -105867845 + RLTR25B LTR ERVK 742 859 -169 2 941 804 227 14 185 chr5 46669528 46669716 -105867543 + RLTR25B LTR ERVK 860 1027 -1 2 941 1410 174 187 37 chr5 46669748 46670149 -105867110 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 2 941 3105 37 0 0 chr5 46676436 46676790 -105860469 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 2 941 560 164 44 52 chr5 46676791 46676926 -105860333 + IAPLTR4_I LTR ERVK 47 180 -1290 2 941 8778 123 11 37 chr5 46676925 46678422 -105858837 + IAPEY3-int LTR ERVK 524 1982 -5698 2 941 3279 63 23 0 chr5 46678399 46678841 -105858418 + IAPEY3-int LTR ERVK 2238 2689 -4991 2 941 2671 122 18 32 chr5 46678970 46679625 -105857634 + IAPEY3-int LTR ERVK 6984 7581 0 2 941 3083 42 0 0 chr5 46679625 46679982 -105857277 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 2 941 318 277 0 24 chr5 46681277 46681362 -105855897 - MTE-int LTR MaLR -30 1550 1468 2 941 714 321 190 59 chr5 46682313 46683028 -105854231 - MTE-int LTR MaLR -610 970 162 2 941 631 307 54 91 chr5 46684004 46684377 -105852882 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 941 2334 75 119 11 chr5 46684475 46684827 -105852432 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 941 14029 20 6 0 chr5 46684829 46686502 -105850757 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 302 2 941 2334 75 119 11 chr5 46686502 46686854 -105850405 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 941 929 245 181 11 chr5 46697660 46698080 -105839179 - RMER15 LTR ERVL 0 575 27 2 941 268 276 55 87 chr5 46698524 46698651 -105838608 - RMER15 LTR ERVL -447 128 6 2 941 920 301 0 99 chr5 46700666 46701031 -105836228 - MTEa LTR MaLR 0 379 51 2 941 2687 79 38 3 chr5 46701102 46701470 -105835789 + MTB LTR MaLR 20 400 0 2 941 6657 121 3 81 chr5 46701470 46702661 -105834598 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 2 941 2934 65 41 8 chr5 46702661 46703048 -105834211 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 941 1638 174 118 9 chr5 46703813 46704143 -105833116 + ORR1B2 LTR MaLR 1 356 -14 2 941 398 109 0 0 chr5 46706321 46706376 -105830883 + ORR1B2 LTR MaLR 340 394 0 2 941 994 294 39 48 chr5 46720922 46721279 -105815980 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 2 941 722 184 21 7 chr5 46721486 46721628 -105815631 + MTD LTR MaLR 264 407 -12 2 941 921 249 114 31 chr5 46724017 46724402 -105812857 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 2 941 1408 272 22 3 chr5 46731711 46732076 -105805183 + MTE2b LTR MaLR 5 376 -3 3 941 497 329 92 69 chr5 46733045 46733394 -105803865 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 3 941 336 310 17 8 chr5 46734122 46734239 -105803020 + MTD LTR MaLR 3 120 -299 3 941 769 284 80 15 chr5 46736542 46736837 -105800422 + MTD LTR MaLR 87 392 -8 3 941 254 274 160 0 chr5 46744044 46744150 -105793109 - MER67A LTR ERV1 -44 499 377 3 941 486 309 67 16 chr5 46744251 46744445 -105792814 - MER67A LTR ERV1 -336 207 4 3 941 1851 195 45 16 chr5 46751031 46751407 -105785852 - MTD LTR MaLR -32 387 1 3 941 268 326 0 0 chr5 46754689 46754778 -105782481 + MLT1A LTR MaLR 30 118 -256 3 941 2806 102 28 83 chr5 46772057 46772562 -105764697 - RLTR44C LTR ERVK -25 477 1 3 941 441 293 51 6 chr5 46780246 46780404 -105756855 - LTR83 LTR ERVL -607 173 9 3 941 235 296 71 44 chr5 46782525 46782638 -105754621 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1206 1321 -487 3 941 542 350 22 45 chr5 46782706 46782930 -105754329 - LTR33 LTR ERVL 0 515 297 3 941 568 353 84 27 chr5 46784667 46784929 -105752330 + MLT1A1 LTR MaLR 3 279 -129 3 942 371 322 141 0 chr5 46797798 46797947 -105739312 + MLT1B LTR MaLR 272 502 -3 3 942 452 337 41 74 chr5 46809078 46809347 -105727912 - LTR55 LTR ERV -240 308 49 4 942 655 263 41 0 chr5 46811845 46811931 -105725328 - MT2A LTR ERVL -355 178 89 4 942 655 263 41 0 chr5 46811985 46812069 -105725190 - MT2A LTR ERVL -445 88 3 4 942 334 246 0 0 chr5 46812841 46812910 -105724349 + RMER15 LTR ERVL 1 69 -506 4 942 693 307 136 15 chr5 46817334 46817665 -105719594 - MLT1A1 LTR MaLR -35 373 3 4 942 1197 326 41 39 chr5 46820381 46820872 -105716387 + MLT1D LTR MaLR 5 496 -9 4 942 1312 264 95 18 chr5 46825983 46826372 -105710887 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 942 646 169 146 12 chr5 46831129 46831327 -105705932 + RLTR41 LTR ERV1 1 266 -180 4 942 1233 111 11 11 chr5 46831488 46831670 -105705589 + RLTR41 LTR ERV1 265 446 0 4 942 856 302 37 27 chr5 46833016 46833315 -105703944 - MLT2D LTR ERVL -109 305 4 4 942 421 309 111 33 chr5 46846599 46846870 -105690389 - MLT1F LTR MaLR 0 548 257 4 942 386 294 140 93 chr5 46846945 46847245 -105690014 + MLT1B LTR MaLR 9 322 -145 4 942 262 294 106 27 chr5 46848929 46849065 -105688194 + MLT1A0 LTR MaLR 23 170 -238 4 942 436 290 22 30 chr5 46849257 46849392 -105687867 + ORR1E LTR MaLR 58 191 -168 4 942 3928 50 8 25 chr5 46868951 46869463 -105667796 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 4 942 846 296 87 102 chr5 46873288 46874013 -105663246 + RMER13A LTR ERVK 21 734 -126 5 942 295 250 10 61 chr5 46880056 46880154 -105657105 + ORR1E LTR MaLR 267 359 0 5 942 2816 76 27 17 chr5 46881961 46882374 -105654885 + BGLII LTR ERVK 5 421 0 5 942 489 328 51 16 chr5 46883474 46883782 -105653477 + MLT1C LTR MaLR 37 463 -4 5 942 459 242 171 16 chr5 46884897 46885090 -105652169 - MLT-int LTR MaLR -19 1716 1494 5 942 492 385 217 53 chr5 46885315 46885863 -105651396 - MLT-int LTR MaLR -270 1465 829 5 942 804 359 60 69 chr5 46886989 46887686 -105649573 - MLT-int LTR MaLR -964 771 81 5 942 917 320 24 5 chr5 46887749 46888129 -105649130 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4596 1118 732 5 942 231 163 0 0 chr5 46901861 46901904 -105635355 - MT2A LTR ERVL 0 584 542 5 942 1294 234 166 95 chr5 46902000 46902421 -105634838 - MT2A LTR ERVL -82 451 1 5 942 381 300 119 48 chr5 46907135 46907345 -105629914 - MLT1A LTR MaLR -17 357 133 5 942 259 366 78 7 chr5 46907365 46907519 -105629740 - MLT2B2 LTR ERVL -173 381 217 5 942 352 291 121 42 chr5 46907790 46907935 -105629324 - MLT2B2 LTR ERVL -310 205 48 5 942 352 291 121 42 chr5 46908564 46908608 -105628651 - MLT2B2 LTR ERVL -468 47 1 5 942 258 314 159 63 chr5 46908608 46908734 -105628525 - MLT1A LTR MaLR -269 139 2 5 942 624 220 42 0 chr5 46917638 46917756 -105619503 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7192 -214 5 942 1477 169 76 62 chr5 46919073 46919290 -105617969 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 141 5 942 1477 169 76 62 chr5 46919354 46919490 -105617769 - RLTR15 LTR ERVK -219 140 3 5 942 527 276 140 17 chr5 46921306 46921542 -105615717 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 147 5 943 1471 216 20 3 chr5 46926521 46926813 -105610446 + MTC LTR MaLR 1 297 -124 5 943 1566 208 201 77 chr5 46928300 46929069 -105608190 - RMER6C LTR ERVK 0 720 1 5 943 3079 93 52 48 chr5 46945791 46946308 -105590951 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 6 943 395 287 153 78 chr5 46946382 46946715 -105590544 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 6 943 795 256 0 67 chr5 46952677 46952886 -105584373 - MTE2b LTR MaLR -165 214 20 6 943 1833 220 135 55 chr5 46958499 46959138 -105578121 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 6 943 417 332 23 23 chr5 46966671 46966887 -105570372 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4015 4230 -3371 6 943 883 346 73 26 chr5 46967448 46968183 -105569076 + MuRRS4-int LTR ERV1 3164 4030 -1033 6 943 353 293 20 29 chr5 46968104 46968206 -105569053 + RLTR19-int LTR ERVK 4394 4494 -1643 6 943 2556 178 47 16 chr5 46982000 46982513 -105554746 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 6 943 1005 310 61 34 chr5 46984691 46985102 -105552157 - MLT2C2 LTR ERVL -40 424 3 6 943 3056 138 8 2 chr5 46986102 46986574 -105550685 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 943 425 287 27 27 chr5 47001859 47002006 -105535253 + MLT1A0 LTR MaLR 4 150 -215 5 943 321 307 21 35 chr5 47002252 47002394 -105534865 + MLT1A0 LTR MaLR 230 369 -5 5 943 981 122 171 76 chr5 47007550 47007823 -105529436 - ORR1A3 LTR MaLR -9 337 1 1 943 895 235 93 0 chr5 47008239 47008443 -105528816 - MTD LTR MaLR 0 419 197 1 943 924 184 118 5 chr5 47008899 47009085 -105528174 - MTD LTR MaLR -210 209 3 1 943 1049 150 155 0 chr5 47013546 47013575 -105523684 + RMER4B LTR ERVK 16 44 -541 3 943 1049 150 155 0 chr5 47013619 47013789 -105523470 + RMER4B LTR ERVK 45 244 -341 3 943 267 77 0 0 chr5 47023802 47023841 -105513418 + ORR1D2 LTR MaLR 1 39 -331 4 943 1087 256 112 0 chr5 47023970 47024239 -105513020 + ORR1D2 LTR MaLR 17 315 -55 4 943 453 288 63 23 chr5 47026389 47026563 -105510696 - MLT1A0 LTR MaLR -12 353 173 4 943 262 216 155 0 chr5 47040800 47040897 -105496362 - MT2A LTR ERVL -3 530 419 7 943 587 291 55 122 chr5 47041470 47041799 -105495460 + MTE2a LTR MaLR 14 320 -59 7 943 1329 243 33 80 chr5 47042199 47042564 -105494695 + MTEb LTR MaLR 1 353 -26 7 943 1329 243 33 80 chr5 47042594 47042626 -105494633 + MTEb LTR MaLR 354 379 0 7 943 585 347 146 6 chr5 47042842 47043164 -105494095 + MTE-int LTR MaLR 2 368 -1212 8 943 1426 291 144 16 chr5 47043190 47043697 -105493562 + MTE-int LTR MaLR 555 1126 -454 8 943 836 330 65 44 chr5 47044273 47044640 -105492619 + MTEb LTR MaLR 1 375 -4 8 943 1001 258 103 43 chr5 47048380 47048729 -105488530 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 9 943 533 384 58 16 chr5 47049251 47049561 -105487698 - ORR1E LTR MaLR -9 350 28 9 943 872 274 82 119 chr5 47049619 47050257 -105487002 - RLTR18 LTR ERVK -2 614 1 9 943 356 240 9 103 chr5 47054451 47054567 -105482692 - MT2B LTR ERVL -337 264 160 1 944 1034 324 61 11 chr5 47058377 47058736 -105478523 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 1 944 492 300 124 63 chr5 47061738 47062101 -105475158 - MLT1B LTR MaLR -2 388 4 1 944 525 327 36 78 chr5 47066072 47066260 -105470999 - ORR1E LTR MaLR -16 343 163 1 944 525 327 36 78 chr5 47066432 47066551 -105470708 - ORR1E LTR MaLR -197 162 49 1 944 4450 52 14 2 chr5 47074320 47074873 -105462386 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 1 944 3254 41 5 2 chr5 47075249 47075644 -105461615 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 944 3179 61 5 0 chr5 47077009 47077403 -105459856 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 944 1958 173 170 55 chr5 47080087 47080600 -105456659 - RLTR25A LTR ERVK -24 1079 508 1 944 2330 179 64 37 chr5 47080739 47081226 -105456033 - RLTR25A LTR ERVK -603 500 1 1 944 509 251 234 0 chr5 47081408 47081575 -105455684 + MTD LTR MaLR 1 206 -213 1 944 1006 232 134 18 chr5 47081580 47081596 -105455663 - ORR1A1 LTR MaLR 0 367 351 1 944 1700 168 20 5 chr5 47082018 47082330 -105454929 - ORR1A1 LTR MaLR -17 350 1 1 944 1548 149 4 29 chr5 47084493 47084769 -105452490 + ORR1A4 LTR MaLR 61 329 0 1 944 1166 315 63 0 chr5 47087223 47087617 -105449642 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 944 2385 217 15 79 chr5 47098345 47098955 -105438304 - RMER15 LTR ERVL -3 572 2 1 944 513 277 48 159 chr5 47099339 47099798 -105437461 - RMER21B LTR ERV1 -345 497 90 1 944 411 151 0 40 chr5 47101765 47101841 -105435418 + ORR1A4 LTR MaLR 232 304 -25 1 944 1656 151 89 45 chr5 47102298 47102611 -105434648 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 1 944 414 301 112 29 chr5 47103656 47103896 -105433363 - MLT1D LTR MaLR -59 446 187 1 944 1943 153 20 20 chr5 47108206 47108553 -105428706 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 682 1 944 423 229 19 28 chr5 47108557 47108665 -105428594 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 324 1 944 3003 197 58 33 chr5 47109112 47109780 -105427479 - RLTR25B LTR ERVK -334 694 10 1 944 270 201 48 41 chr5 47110697 47110842 -105426417 + RMER17D2 LTR ERVK 381 526 -283 1 944 248 258 95 21 chr5 47114642 47114737 -105422522 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 541 440 1 944 392 236 175 21 chr5 47115295 47115438 -105421821 - RLTR20B1 LTR ERVK -350 213 49 1 944 538 282 19 19 chr5 47116922 47117081 -105420178 + MLT1A0 LTR MaLR 186 344 -21 2 944 1055 289 58 15 chr5 47118013 47118413 -105418846 + MTD LTR MaLR 3 419 0 2 944 631 311 63 25 chr5 47119736 47119996 -105417263 + ORR1E LTR MaLR 1 252 -118 2 944 2053 148 14 28 chr5 47126898 47127259 -105410000 + ORR1B1 LTR MaLR 39 394 0 2 944 2650 52 2 146 chr5 47130573 47131025 -105406234 + RLTR10 LTR ERVK 1 387 -3 2 944 668 282 148 33 chr5 47134150 47134480 -105402779 - MLT1B LTR MaLR -15 375 8 2 944 238 326 35 64 chr5 47139172 47139277 -105397982 - MER34A LTR ERV1 -368 203 107 2 944 238 326 35 64 chr5 47139307 47139404 -105397855 - MER34A LTR ERV1 -465 106 7 2 944 492 167 42 85 chr5 47142957 47143075 -105394184 + ORR1D1 LTR MaLR 9 121 -253 2 944 1934 171 47 96 chr5 47143404 47143871 -105393388 + RLTR41 LTR ERV1 3 446 0 2 944 2814 78 44 8 chr5 47144097 47144483 -105392776 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 944 2472 196 13 17 chr5 47159172 47159645 -105377614 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 222 2 944 966 277 127 12 chr5 47173704 47174036 -105363223 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 944 2466 210 28 12 chr5 47175021 47175517 -105361742 + RMER20A LTR ERVK 11 514 -2 2 945 329 341 29 73 chr5 47188049 47188185 -105349074 + MLT1A LTR MaLR 23 152 -222 3 945 495 328 100 33 chr5 47188818 47189118 -105348141 + MLT1B LTR MaLR 1 320 -70 3 945 4023 132 132 57 chr5 47198418 47199259 -105338000 + RMER17A2 LTR ERVK 3 906 0 3 945 287 398 40 30 chr5 47202325 47202527 -105334732 - RMER15 LTR ERVL -16 559 356 3 945 792 312 28 93 chr5 47203574 47203962 -105333297 + ORR1D2 LTR MaLR 8 370 0 3 945 1483 197 11 95 chr5 47217322 47217503 -105319756 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 152 3 945 1483 197 11 95 chr5 47217705 47217880 -105319379 - ORR1A4 LTR MaLR -178 151 3 3 945 284 336 50 50 chr5 47217898 47218058 -105319201 + MTEa LTR MaLR 22 181 -198 3 945 283 352 55 91 chr5 47218407 47218609 -105318650 + RMER10A LTR ERVL 12 206 -236 3 945 283 254 79 0 chr5 47218717 47218780 -105318479 + RMER10A LTR ERVL 207 221 -221 3 945 846 334 20 34 chr5 47219504 47219857 -105317402 + MLT1A0 LTR MaLR 13 360 -5 3 945 309 337 55 87 chr5 47229925 47230143 -105307116 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 330 3 945 3590 72 24 0 chr5 47232467 47232927 -105304332 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 5 3 945 980 308 142 0 chr5 47237345 47237676 -105299583 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 3 945 1133 294 63 25 chr5 47240206 47240570 -105296689 - MTE2b LTR MaLR -2 368 1 3 945 355 333 43 65 chr5 47241463 47241754 -105295505 - MTE2a LTR MaLR -20 399 140 3 945 2068 87 18 61 chr5 47241752 47242081 -105295178 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 5 3 945 484 344 127 31 chr5 47243751 47244075 -105293184 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 1 3 945 1994 153 3 3 chr5 47244879 47245200 -105292059 - RMER6A LTR ERVK -434 322 2 3 945 561 132 0 0 chr5 47245201 47245292 -105291967 - RMER6-int LTR ERVK -2 3175 3085 3 945 623 310 86 92 chr5 47248489 47248976 -105288283 + MLT1D LTR MaLR 1 484 -21 3 945 1827 200 98 42 chr5 47251605 47252158 -105285101 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 3 945 1641 180 26 134 chr5 47252328 47252752 -105284507 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 945 355 235 22 56 chr5 47254682 47254772 -105282487 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 492 4 945 763 232 110 76 chr5 47256720 47256767 -105280492 - MT2B LTR ERVL 0 601 549 4 945 763 256 148 73 chr5 47256873 47257289 -105279970 - MT2B LTR ERVL -53 548 2 4 945 234 315 53 32 chr5 47259809 47259904 -105277355 - MLT1A LTR MaLR -276 98 2 4 945 286 287 71 36 chr5 47262167 47262279 -105274980 - MLT1B LTR MaLR -19 371 256 4 945 3135 71 0 2 chr5 47264325 47264722 -105272537 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 945 708 332 77 28 chr5 47266437 47266790 -105270469 + MLT2B4 LTR ERVL 5 374 -182 4 945 1816 87 4 8 chr5 47267970 47268224 -105269035 + MT2B2 LTR ERVL 1 253 -348 4 945 2209 130 6 6 chr5 47270868 47271217 -105266042 + MT2B2 LTR ERVL 236 584 0 4 945 1286 192 0 38 chr5 47271217 47271509 -105265750 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 281 -1682 4 945 1778 171 0 0 chr5 47271470 47271756 -105265503 - MT2B LTR ERVL -315 286 1 4 945 279 254 63 84 chr5 47271756 47271806 -105265453 - ORR1A3-int LTR MaLR -1350 613 567 4 945 2102 240 81 46 chr5 47273467 47274057 -105263202 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 945 271 328 39 15 chr5 47281037 47281167 -105256092 + RMER15 LTR ERVL 439 571 -4 4 945 246 389 75 30 chr5 47291278 47291477 -105245782 - MLT1D LTR MaLR -264 241 34 4 945 229 344 58 58 chr5 47295677 47295850 -105241409 - MER21B LTR ERV1 -190 673 501 4 945 2571 218 102 71 chr5 47299494 47300359 -105236900 + RLTR13D6 LTR ERVK 6 1021 -12 4 945 1425 190 76 60 chr5 47303509 47303879 -105233380 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 4 945 523 375 29 7 chr5 47306516 47306790 -105230469 + RMER15-int LTR ERVL 206 485 -4514 4 945 1190 247 158 6 chr5 47312873 47312977 -105224282 + MTD LTR MaLR 12 118 -301 4 945 1190 247 158 6 chr5 47313018 47313267 -105223992 + MTD LTR MaLR 119 418 -1 4 945 237 189 83 42 chr5 47314165 47314237 -105223022 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 334 5 945 248 316 121 35 chr5 47314651 47314825 -105222434 - RLTR21 LTR ERVK -321 1251 1063 5 945 852 344 67 28 chr5 47315125 47315169 -105222090 - LTR33B LTR ERVL 0 503 460 5 945 852 344 67 28 chr5 47315332 47315748 -105221511 - LTR33B LTR ERVL -44 459 27 5 946 412 309 8 0 chr5 47317609 47317732 -105219527 + MLT1J2 LTR MaLR 51 174 -274 5 946 1198 270 106 14 chr5 47328124 47328492 -105208767 + MTD LTR MaLR 18 419 0 5 946 424 307 47 8 chr5 47328835 47328963 -105208296 + LTR55 LTR ERV 1 133 -415 5 946 238 270 63 126 chr5 47328969 47329096 -105208163 - RLTR42 LTR ERVK -21 218 100 5 946 563 265 67 83 chr5 47331163 47331538 -105205721 + RMER10A LTR ERVL 59 427 -15 5 946 1973 129 46 49 chr5 47331759 47332127 -105205132 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 946 56845 16 7 10 chr5 47332127 47338621 -105198638 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 5 946 1973 129 46 49 chr5 47338621 47338989 -105198270 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 946 2856 148 110 56 chr5 47339731 47340340 -105196919 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 5 946 1100 201 220 48 chr5 47345554 47345867 -105191392 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 946 1121 251 194 36 chr5 47346212 47346650 -105190609 - RMER20A LTR ERVK 0 516 10 5 946 231 326 39 59 chr5 47346754 47346907 -105190352 - RMER4A LTR ERVK -409 176 27 5 946 4165 218 57 8 chr5 47351532 47352667 -105184592 + ORR1B2-int LTR MaLR 308 1509 0 5 946 1637 188 42 69 chr5 47352674 47353035 -105184224 + ORR1B2 LTR MaLR 9 359 -8 5 946 331 340 10 0 chr5 47355676 47355776 -105181483 - MLT1B LTR MaLR -8 459 359 5 946 355 305 131 60 chr5 47356233 47356432 -105180827 - MLT1B LTR MaLR -108 282 70 5 946 2566 191 16 19 chr5 47356502 47357015 -105180244 - RLTR28 LTR ERVL -11 513 3 5 946 1157 207 205 22 chr5 47369104 47369475 -105167784 + RMER10A LTR ERVL 1 439 -3 5 946 275 303 31 52 chr5 47374393 47374592 -105162667 - RLTR11A2 LTR ERVK -243 284 96 5 946 861 351 72 43 chr5 47376609 47377092 -105160167 + MLT2B3 LTR ERVL 12 508 -46 5 946 934 289 116 40 chr5 47377779 47378157 -105159102 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 946 300 231 62 44 chr5 47388686 47388786 -105148473 + MLT1A1 LTR MaLR 250 383 -25 6 946 3338 40 0 2 chr5 47389828 47390225 -105147034 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 946 7766 75 18 6 chr5 47390225 47391310 -105145949 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 946 1457 194 61 25 chr5 47395164 47395590 -105141669 - RMER17C LTR ERVK -517 441 19 6 946 3181 99 0 0 chr5 47407962 47408395 -105128864 - RLTR10C LTR ERVK -3 433 1 6 946 694 271 170 22 chr5 47411241 47411492 -105125767 + RLTR9A LTR ERVK 1 297 -71 6 946 694 271 170 22 chr5 47411668 47411733 -105125526 + RLTR9A LTR ERVK 298 363 -5 6 946 435 288 64 70 chr5 47426103 47426275 -105110984 - MLT2D LTR ERVL -11 549 379 6 946 2658 177 73 10 chr5 47430770 47430858 -105106401 - RLTR20A1 LTR ERVK 0 551 464 6 946 2658 177 73 10 chr5 47430910 47431338 -105105921 - RLTR20A1 LTR ERVK -88 463 2 6 946 283 330 28 9 chr5 47438581 47438688 -105098571 + MLT1A LTR MaLR 221 329 -45 6 946 231 399 33 11 chr5 47438700 47438880 -105098379 + MER34A1 LTR ERV1 5 188 -399 6 947 435 309 78 48 chr5 47449142 47449373 -105087886 + MLT1C LTR MaLR 10 247 -220 6 947 258 336 88 14 chr5 47449639 47449787 -105087472 + MLT1C LTR MaLR 289 447 -20 6 947 975 268 64 8 chr5 47452318 47452585 -105084674 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 282 -245 7 947 1113 187 62 0 chr5 47452869 47453094 -105084165 + RLTR11A2 LTR ERVK 289 527 0 7 947 506 394 59 80 chr5 47458455 47459133 -105078126 + MER21B LTR ERV1 1 664 -199 7 947 1618 178 18 0 chr5 47460059 47460340 -105076919 - ORR1A3 LTR MaLR -40 286 1 7 947 1488 171 8 0 chr5 47467198 47467449 -105069810 - RMER6D LTR ERVK -467 253 1 7 947 2956 136 71 37 chr5 47477884 47478446 -105058813 - RLTR1D LTR ERV1 -16 589 1 7 947 2847 83 8 0 chr5 47478446 47478843 -105058416 - BGLII LTR ERVK -1 420 21 7 947 270 281 0 0 chr5 47488863 47488927 -105048332 - RMER15 LTR ERVL -109 466 403 7 947 456 316 106 35 chr5 47501030 47501256 -105036003 + MLT1D LTR MaLR 256 497 -8 4 947 607 249 109 28 chr5 47502148 47502359 -105034900 - MTEb LTR MaLR -151 228 1 7 947 1271 245 43 14 chr5 47512471 47512823 -105024436 + RMER5 LTR ERV1 152 513 -21 2 947 2551 86 8 0 chr5 47515645 47515996 -105021263 + MTA_Mm LTR MaLR 1 354 -42 2 947 333 109 55 0 chr5 47522230 47522285 -105014974 + MTA_Mm LTR MaLR 343 400 0 2 947 3843 70 22 4 chr5 47522285 47522818 -105014441 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 543 -555 2 947 612 220 102 30 chr5 47529557 47529754 -105007505 + RLTR15 LTR ERVK 1 211 -148 4 947 402 209 68 30 chr5 47530970 47531103 -105006156 + RLTR15 LTR ERVK 206 343 -16 4 947 2327 112 151 12 chr5 47533066 47533483 -105003776 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 947 530 125 23 125 chr5 47533484 47533612 -105003647 + IAPEz-int LTR ERVK 9 123 -6358 4 947 229 267 0 0 chr5 47533612 47533657 -105003602 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 4 947 226 321 0 0 chr5 47533685 47533738 -105003521 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 4 947 3985 68 2 18 chr5 47533738 47534322 -105002937 + IAPEz-int LTR ERVK 116 662 -5819 4 947 2555 70 0 3 chr5 47534322 47534665 -105002594 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 4 947 6501 47 2 6 chr5 47534658 47535490 -105001769 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 4 947 2460 107 132 16 chr5 47535492 47535918 -105001341 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 947 6867 66 16 0 chr5 47537559 47538453 -104998806 - RLTR13D5 LTR ERVK -113 910 3 5 947 2376 60 54 3 chr5 47539566 47539883 -104997376 + IAPEY_LTR LTR ERVK 53 385 0 5 947 4466 12 0 0 chr5 47544064 47544557 -104992702 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 947 45241 15 6 0 chr5 47544557 47549883 -104987376 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 6 947 390 167 46 35 chr5 47549883 47549970 -104987289 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 6 947 302 0 0 0 chr5 47549970 47550008 -104987251 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 6 947 4466 12 0 0 chr5 47550008 47550501 -104986758 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 947 3066 66 2 5 chr5 47557939 47558336 -104978923 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 947 1270 205 48 74 chr5 47558719 47559030 -104978229 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 78 6 947 291 362 14 47 chr5 47560598 47560746 -104976513 - MLT1A0 LTR MaLR -218 147 5 7 947 649 242 71 4 chr5 47560962 47561118 -104976141 + MTC LTR MaLR 113 271 -136 7 947 4753 188 89 63 chr5 47561244 47562106 -104975153 - RMER12 LTR ERVK -143 1179 287 7 947 4753 188 89 63 chr5 47562312 47562599 -104974660 - RMER12 LTR ERVK -1036 286 2 7 947 494 235 37 29 chr5 47562599 47562723 -104974536 + MTC LTR MaLR 289 413 -8 7 948 1044 226 90 37 chr5 47588716 47589015 -104948244 + RLTR46 LTR ERVK 1 315 -5 1 948 456 243 35 111 chr5 47589024 47589223 -104948036 + IAPEY3-int LTR ERVK 3 186 -7494 1 948 672 218 62 10 chr5 47589219 47589427 -104947832 + IAPEY3-int LTR ERVK 535 753 -6927 1 948 755 176 13 48 chr5 47589633 47589907 -104947352 + IAP-d-int LTR ERVK 55 503 -6039 1 948 1381 130 103 0 chr5 47589907 47590130 -104947129 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5252 -1290 1 948 1694 158 74 0 chr5 47590133 47590499 -104946760 + IAPEY3-int LTR ERVK 6965 7383 -297 1 948 1216 209 60 15 chr5 47590484 47590819 -104946440 + IAP-d-int LTR ERVK 6129 6478 -3 1 948 1123 211 101 40 chr5 47590823 47591120 -104946139 + RLTR46 LTR ERVK 1 315 -5 1 948 1858 218 9 50 chr5 47599171 47599610 -104937649 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 948 341 346 18 24 chr5 47603021 47603187 -104934072 + MER89 LTR ERV1 391 555 -4 1 948 290 275 136 53 chr5 47606607 47606776 -104930483 + RMER15 LTR ERVL 393 575 0 1 948 3297 158 36 40 chr5 47606899 47607501 -104929758 - MT2B LTR ERVL 0 601 2 1 948 388 304 35 96 chr5 47611122 47611364 -104925895 + RLTR12B LTR ERVK 213 503 -25 1 948 1412 180 34 104 chr5 47626346 47626524 -104910735 - RMER17C LTR ERVK 0 410 223 1 948 2759 18 2 217 chr5 47626524 47627021 -104910238 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 948 1412 180 34 104 chr5 47627021 47627283 -104909976 - RMER17C LTR ERVK -188 222 1 1 948 1838 171 36 73 chr5 47628571 47628982 -104908277 - RMER10B LTR ERVL 0 398 3 1 948 1707 219 172 25 chr5 47629926 47630525 -104906734 - RMER6C LTR ERVK -3 687 1 1 948 512 331 103 43 chr5 47631624 47631905 -104905354 - RMER15 LTR ERVL -3 572 275 1 948 282 200 15 44 chr5 47632060 47632128 -104905131 - RMER15 LTR ERVL -509 66 1 1 948 269 353 103 27 chr5 47633467 47633727 -104903532 + MLT1C LTR MaLR 61 340 -127 1 948 1778 147 19 40 chr5 47633727 47634052 -104903207 + ORR1A4 LTR MaLR 4 321 -8 1 948 347 284 43 0 chr5 47634057 47634173 -104903086 + MLT1C LTR MaLR 347 467 0 1 948 528 314 63 89 chr5 47634650 47635032 -104902227 - MTE2a LTR MaLR -14 405 14 1 948 2119 198 14 5 chr5 47638084 47638501 -104898758 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 948 825 324 51 100 chr5 47640122 47640513 -104896746 - MTE2a LTR MaLR -4 375 4 1 948 2016 71 36 0 chr5 47640628 47640909 -104896350 - ORR1A1 LTR MaLR -55 291 1 1 948 366 310 102 127 chr5 47648941 47649303 -104887956 + ORR1E LTR MaLR 5 357 -2 2 948 1970 247 59 13 chr5 47650488 47651017 -104886242 + RLTR12A LTR ERVK 1 553 -15 2 948 265 381 57 11 chr5 47657505 47657680 -104879579 - MER31A LTR ERV1 -124 361 179 2 948 290 294 109 0 chr5 47658049 47658168 -104879091 - MLT1D LTR MaLR -7 498 367 2 948 550 267 27 27 chr5 47658176 47658326 -104878933 + RLTR15 LTR ERVK 1 150 -209 2 948 642 239 58 11 chr5 47663084 47663274 -104873985 + RLTR15 LTR ERVK 136 334 -25 2 948 568 351 84 64 chr5 47663299 47663658 -104873601 - MLT1D LTR MaLR -134 371 6 2 948 526 308 79 54 chr5 47663963 47664239 -104873020 + ORR1E LTR MaLR 1 284 -90 2 948 4126 181 53 76 chr5 47670499 47671402 -104865857 + RMER19B LTR ERVK 1 884 -18 2 948 589 343 58 74 chr5 47682302 47682718 -104854541 + MTEa LTR MaLR 1 405 -14 2 948 1568 190 44 44 chr5 47685122 47685326 -104851933 - RMER17C LTR ERVK -3 407 200 2 948 1568 190 44 44 chr5 47685487 47685689 -104851570 - RMER17C LTR ERVK -211 199 1 2 948 1245 266 84 72 chr5 47689195 47689682 -104847577 + RMER13A LTR ERVK 1 493 -367 2 948 492 234 101 23 chr5 47690247 47690424 -104846835 + MTD LTR MaLR 191 404 -15 2 948 237 299 212 7 chr5 47691534 47691699 -104845560 + MLT2B4 LTR ERVL 14 209 -255 2 948 231 394 28 62 chr5 47693806 47694017 -104843242 - MLT1E3 LTR MaLR -5 619 416 2 948 3351 39 0 130 chr5 47694371 47694872 -104842387 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 948 402 293 115 39 chr5 47700758 47700914 -104836345 + MLT1-int LTR MaLR 1193 1360 -11 2 948 241 289 25 12 chr5 47703837 47703968 -104833291 - MLT1E3 LTR MaLR -8 646 506 2 948 351 320 191 42 chr5 47704855 47705185 -104832074 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 2 949 312 324 83 35 chr5 47710770 47710914 -104826345 + RMER15 LTR ERVL 425 575 0 2 949 1235 231 8 122 chr5 47711710 47712079 -104825180 + ORR1C1 LTR MaLR 1 327 -51 2 949 252 182 23 0 chr5 47712749 47712793 -104824466 + ORR1C1 LTR MaLR 326 370 -8 2 949 787 256 86 102 chr5 47716850 47717233 -104820026 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 2 949 852 224 129 47 chr5 47724802 47725144 -104812115 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 3 949 1904 136 11 85 chr5 47730531 47730884 -104806375 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 949 261 315 0 0 chr5 47734415 47734504 -104802755 - RMER15 LTR ERVL -105 470 382 3 949 3079 34 3 3 chr5 47743784 47744172 -104793087 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 3 949 642 245 20 25 chr5 47746372 47746569 -104790690 + ORR1D2 LTR MaLR 155 350 -20 3 949 1398 244 68 6 chr5 47752362 47752688 -104784571 - MTD LTR MaLR -34 385 40 3 949 1207 268 80 17 chr5 47755247 47755596 -104781663 + ORR1D1 LTR MaLR 3 373 -1 3 949 267 375 66 58 chr5 47757930 47758173 -104779086 - MLT1D LTR MaLR -258 247 3 3 949 253 339 169 76 chr5 47759508 47759757 -104777502 + MTE-int LTR MaLR 199 470 -1110 3 949 2673 84 0 3 chr5 47763324 47763671 -104773588 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 949 6238 81 1 2 chr5 47763671 47764521 -104772738 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 944 3 949 246 309 42 68 chr5 47772073 47772191 -104765068 - MLT1A LTR MaLR -226 148 34 3 949 1089 266 119 3 chr5 47776168 47776462 -104760797 - ORR1D2 LTR MaLR -42 328 1 3 949 349 315 121 31 chr5 47777558 47777884 -104759375 - MLT1C LTR MaLR -21 446 89 3 949 366 317 36 164 chr5 47778910 47779185 -104758074 - ORR1D2 LTR MaLR -98 272 33 3 949 282 309 45 18 chr5 47788693 47788805 -104748454 - MLT1D LTR MaLR -139 366 252 4 949 1310 264 8 18 chr5 47789303 47789685 -104747574 + RLTR14 LTR ERV1 3 380 -2 4 949 592 331 111 12 chr5 47799867 47800200 -104737059 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 4 949 394 339 85 16 chr5 47814619 47814808 -104722451 - MLT2B4 LTR ERVL -65 491 290 4 949 237 321 161 31 chr5 47821711 47821872 -104715387 + MLT1N2 LTR MaLR 24 205 -357 4 949 406 189 0 126 chr5 47822129 47822232 -104715027 - MT2B LTR ERVL -344 257 168 4 949 1862 176 38 14 chr5 47827041 47827410 -104709849 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 949 480 326 131 24 chr5 47829274 47829572 -104707687 + MLT1D LTR MaLR 176 505 0 4 949 466 206 41 0 chr5 47832982 47833079 -104704180 + MTC LTR MaLR 6 106 -315 4 949 979 190 30 30 chr5 47833173 47833374 -104703885 + MTC LTR MaLR 105 305 -116 4 949 951 228 80 75 chr5 47836968 47837429 -104699830 - RLTR20C LTR ERVK 0 551 12 4 949 225 268 41 27 chr5 47839057 47839130 -104698129 - LTR48 LTR ERV1 -713 74 1 4 950 738 327 70 21 chr5 47843792 47844079 -104693180 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 64 4 950 699 287 68 8 chr5 47844126 47844383 -104692876 + MLT1A0 LTR MaLR 91 406 -2 4 950 2267 88 180 3 chr5 47857583 47857938 -104679321 - BGLII LTR ERVK 0 421 4 5 950 356 311 0 11 chr5 47858040 47858131 -104679128 + MTEa LTR MaLR 22 111 -268 5 950 2045 169 47 6 chr5 47858135 47858499 -104678760 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 1 5 950 426 278 38 45 chr5 47858548 47858631 -104678628 + MTEa LTR MaLR 249 331 -48 5 950 3655 55 78 2 chr5 47858631 47859107 -104678152 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 5 950 426 278 38 45 chr5 47859107 47859155 -104678104 + MTEa LTR MaLR 332 379 0 5 950 484 232 54 0 chr5 47859415 47859527 -104677732 + MTD LTR MaLR 1 118 -301 5 950 1187 209 17 20 chr5 47859558 47859818 -104677441 + MTD LTR MaLR 158 403 -16 5 950 466 253 19 73 chr5 47873752 47873835 -104663424 + RMER17C LTR ERVK 1 83 -327 5 950 466 268 30 64 chr5 47873969 47874194 -104663065 + RMER17C LTR ERVK 84 364 -46 5 950 1029 288 96 20 chr5 47874246 47874590 -104662669 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 950 547 302 58 65 chr5 47875011 47875305 -104661954 + MLT1D LTR MaLR 191 482 -23 5 950 230 305 57 41 chr5 47876239 47876362 -104660897 - MLT1H LTR MaLR 0 489 365 5 950 1172 269 43 71 chr5 47876530 47876695 -104660564 + MTD LTR MaLR 62 232 -187 5 950 1172 269 43 71 chr5 47876855 47877056 -104660203 + MTD LTR MaLR 233 418 -1 5 950 4062 137 25 112 chr5 47877072 47878064 -104659195 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 5 950 232 341 33 33 chr5 47878105 47878196 -104659063 - MLT1H LTR MaLR -337 212 122 5 950 4714 141 43 40 chr5 47879164 47880057 -104657202 - RMER17A2 LTR ERVK -11 895 1 5 950 475 280 48 42 chr5 47896383 47896551 -104640708 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1090 5 950 250 250 80 14 chr5 47900682 47900820 -104636439 - RMER17D2 LTR ERVK -272 537 391 5 950 839 281 101 23 chr5 47904850 47905196 -104632063 + MTD LTR MaLR 26 398 -21 5 950 1703 178 30 102 chr5 47909039 47909497 -104627762 - RMER19B LTR ERVK -241 661 77 5 950 306 347 19 22 chr5 47910226 47910394 -104626865 - MLT1B LTR MaLR 0 467 284 5 950 307 296 16 73 chr5 47911398 47911522 -104625737 - MLT1B LTR MaLR -217 173 57 5 950 452 327 26 0 chr5 47911645 47911801 -104625458 - MLT1A LTR MaLR -212 162 3 5 950 346 365 0 42 chr5 47914217 47914337 -104622922 + ORR1E LTR MaLR 7 121 -238 5 950 2370 191 99 53 chr5 47926396 47927054 -104610205 + RMER6C LTR ERVK 1 688 -2 6 950 1483 219 25 33 chr5 47932231 47932550 -104604709 - MTC LTR MaLR 0 421 64 6 950 1908 215 12 15 chr5 47934387 47934793 -104602466 + MTB_Mm LTR MaLR 1 405 -2 6 950 2183 96 26 0 chr5 47935851 47936163 -104601096 - ORR1A2 LTR MaLR -7 320 1 6 950 3873 142 71 42 chr5 47939296 47939661 -104597598 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 465 6 950 3873 142 71 42 chr5 47939774 47940194 -104597065 - RMER17D2 LTR ERVK -345 464 1 6 950 652 278 35 78 chr5 47940646 47940876 -104596383 - MTE2a LTR MaLR -34 345 126 6 950 917 318 40 22 chr5 47945279 47945552 -104591707 - MTE2b LTR MaLR -39 340 63 6 950 2659 47 3 0 chr5 47953771 47954109 -104583150 + ORR1A0 LTR MaLR 1 339 -7 6 950 231 179 0 67 chr5 47958179 47958239 -104579020 + MER67B LTR ERV1 442 497 -164 6 950 2022 166 70 11 chr5 47958258 47958630 -104578629 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 951 248 401 34 34 chr5 47979922 47980069 -104557190 + MLT1F2 LTR MaLR 350 496 -64 6 951 2608 99 16 68 chr5 47980274 47980718 -104556541 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 951 226 348 42 24 chr5 47981989 47982157 -104555102 + MLT1D LTR MaLR 63 233 -272 6 951 327 331 54 14 chr5 47982190 47982337 -104554922 + MLT1D LTR MaLR 344 496 -9 6 951 1082 299 115 9 chr5 47984519 47984885 -104552374 - MTD LTR MaLR 0 419 6 6 951 2319 238 19 87 chr5 47988700 47989387 -104547872 + RMER6C LTR ERVK 51 690 0 6 951 1388 198 43 31 chr5 47992538 47992861 -104544398 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5299 5625 -136 6 951 1910 174 85 6 chr5 47995420 47995785 -104541474 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 951 3295 253 72 98 chr5 47995849 47997023 -104540236 - ORR1B1-int LTR MaLR -226 1144 1 6 951 2136 145 78 0 chr5 47997027 47997385 -104539874 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 951 747 297 118 29 chr5 47998186 47998526 -104538733 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 951 706 274 25 54 chr5 48000940 48001244 -104536015 + MT2B LTR ERVL 96 551 -50 4 951 290 269 48 38 chr5 48001288 48001497 -104535762 - RMER17D2 LTR ERVK -358 451 241 6 951 237 217 0 0 chr5 48001456 48001502 -104535757 + MLT2C2 LTR ERVL 514 559 0 7 951 3143 185 68 26 chr5 48023576 48024240 -104513019 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 4 951 603 208 58 0 chr5 48029034 48029188 -104508071 + MYSERV-int LTR ERVK 6371 6533 -17 5 951 895 269 44 35 chr5 48029211 48029550 -104507709 + RLTR15 LTR ERVK 1 342 -17 5 951 503 264 22 70 chr5 48030741 48030909 -104506350 + RMER20B LTR ERVK 1 159 -357 5 951 2441 119 67 35 chr5 48034595 48035055 -104502204 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 951 237 330 88 75 chr5 48042671 48042966 -104494293 - MLT1C LTR MaLR -108 359 61 6 951 1138 313 49 14 chr5 48043661 48044005 -104493254 + ORR1D2 LTR MaLR 1 356 -14 6 951 284 374 0 0 chr5 48044673 48044780 -104492479 + MTE2a LTR MaLR 1 107 -272 6 951 286 271 61 70 chr5 48044865 48044980 -104492279 + MTE2a LTR MaLR 121 234 -145 6 951 463 344 73 38 chr5 48047012 48047326 -104489933 + MLT1A1 LTR MaLR 44 368 -40 6 951 798 252 68 55 chr5 48048215 48048580 -104488679 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 951 243 348 98 16 chr5 48064876 48065060 -104472199 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 210 8 951 2123 175 36 22 chr5 48069211 48069626 -104467633 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 951 310 357 64 0 chr5 48076091 48076248 -104461011 - LTR33 LTR ERVL -338 177 11 9 951 1735 249 132 65 chr5 48084720 48085552 -104451707 - RMER17B LTR ERVK -70 888 1 1 951 413 301 78 26 chr5 48091021 48091236 -104446023 - MLT1A0 LTR MaLR -2 406 175 1 951 237 353 50 55 chr5 48093260 48093461 -104443798 - MLT2F LTR ERVL -49 614 415 1 951 233 390 0 0 chr5 48094710 48094810 -104442449 + MTEb LTR MaLR 278 377 -2 1 951 457 36 0 0 chr5 48097391 48097446 -104439813 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 292 1 951 427 113 0 0 chr5 48098564 48098626 -104438633 - ORR1A1 LTR MaLR -41 305 244 1 952 403 267 10 0 chr5 48103526 48103627 -104433632 + ORR1E LTR MaLR 8 109 -250 1 952 300 348 30 30 chr5 48103649 48103815 -104433444 + ORR1E LTR MaLR 210 375 -4 1 952 1210 238 128 21 chr5 48110429 48110803 -104426456 - MTC LTR MaLR -3 418 5 1 952 701 303 81 76 chr5 48132443 48132613 -104404646 + MLT1B LTR MaLR 29 191 -199 1 952 701 303 81 76 chr5 48132840 48133026 -104404233 + MLT1B LTR MaLR 192 387 -3 1 952 237 324 138 44 chr5 48133256 48133437 -104403822 + MLT1I LTR MaLR 101 298 -113 1 952 2125 231 54 19 chr5 48134240 48134756 -104402503 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 1 952 314 240 13 26 chr5 48137332 48137409 -104399850 + MTE2b LTR MaLR 253 328 -51 1 952 506 351 67 51 chr5 48137898 48138273 -104398986 + MLT1J-int LTR MaLR 981 1361 -26 1 952 295 368 39 39 chr5 48139815 48139945 -104397314 - MLT1H LTR MaLR -37 512 383 1 952 249 301 0 112 chr5 48143154 48143270 -104393989 + MER110A LTR ERV1 70 172 -296 1 952 1470 247 56 68 chr5 48143687 48144099 -104393160 - MTD LTR MaLR -12 407 1 1 952 304 365 80 20 chr5 48147317 48147518 -104389741 + MLT1J LTR MaLR 1 213 -299 2 952 652 328 69 55 chr5 48163786 48164219 -104373040 - LTR86B2 LTR ERVL -41 446 8 2 952 633 314 5 58 chr5 48165756 48165962 -104371297 - MTE2b LTR MaLR -183 196 2 2 952 2793 163 132 16 chr5 48168394 48168886 -104368373 - RMER6C LTR ERVK -2 688 123 2 952 2793 163 132 16 chr5 48168929 48169052 -104368207 - RMER6C LTR ERVK -568 122 3 2 952 405 324 25 76 chr5 48170438 48170635 -104366624 - LTR33A_ LTR ERVL -324 207 21 2 952 1145 299 113 0 chr5 48179543 48179878 -104357381 - MTD LTR MaLR 0 419 47 2 952 620 321 42 126 chr5 48180295 48180768 -104356491 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 446 -82 2 952 462 316 11 23 chr5 48183768 48183943 -104353316 + MLT1B LTR MaLR 1 173 -217 2 952 253 211 0 34 chr5 48190499 48190558 -104346701 - MTE2b LTR MaLR -15 364 308 2 952 1358 223 46 98 chr5 48191129 48191517 -104345742 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 5 2 952 821 316 73 11 chr5 48191634 48191909 -104345350 + ORR1D2 LTR MaLR 74 365 -5 2 952 840 311 80 37 chr5 48191976 48192377 -104344882 + MLT2B1 LTR ERVL 3 420 -100 2 952 846 275 121 58 chr5 48202173 48202520 -104334739 - MTE2b LTR MaLR -10 369 1 2 952 342 266 32 0 chr5 48202521 48202615 -104334644 + MLT1A1 LTR MaLR 295 391 -17 2 952 537 218 18 48 chr5 48202832 48202981 -104334278 + RMER19C LTR ERVK 1 214 -397 2 952 2134 192 16 26 chr5 48202981 48203493 -104333766 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 464 -93 2 952 2152 204 20 5 chr5 48203551 48203959 -104333300 + RMER19C LTR ERVK 198 611 0 2 952 228 264 57 11 chr5 48219072 48219160 -104318099 - MER77 LTR ERVL -89 518 427 2 952 633 294 54 50 chr5 48219195 48219411 -104317848 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 152 2 952 633 294 54 50 chr5 48220073 48220096 -104317163 - ORR1D2 LTR MaLR -219 151 130 2 952 2406 189 38 31 chr5 48220119 48220642 -104316617 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 2 952 455 287 0 0 chr5 48220679 48220808 -104316451 - ORR1D2 LTR MaLR -241 133 5 2 952 574 232 154 37 chr5 48224908 48225156 -104312103 + RLTR10A LTR ERVK 114 411 0 3 953 289 289 98 30 chr5 48245221 48245385 -104291874 + MLT1B LTR MaLR 1 175 -215 3 953 507 194 111 1 chr5 48245965 48246092 -104291167 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3930 4170 -1591 3 953 266 153 54 27 chr5 48247864 48247938 -104289321 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5662 5737 -24 3 953 2020 212 48 59 chr5 48247955 48248431 -104288828 + MT2A LTR ERVL 1 462 -71 3 953 2020 212 48 59 chr5 48248497 48248545 -104288714 + MT2A LTR ERVL 463 518 -15 3 953 571 353 62 36 chr5 48249847 48250123 -104287136 - MTEa LTR MaLR -4 375 93 3 953 1362 227 103 21 chr5 48251846 48252233 -104285026 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 953 631 303 6 0 chr5 48260741 48260916 -104276343 + LTR33 LTR ERVL 337 512 -3 3 953 495 264 16 8 chr5 48264693 48264815 -104272444 - MLT1D LTR MaLR -346 159 37 3 953 1579 162 97 9 chr5 48272001 48272331 -104264928 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 3 953 310 362 46 17 chr5 48273106 48273280 -104263979 - LTR33 LTR ERVL -8 507 329 3 953 3467 20 2 0 chr5 48279446 48279841 -104257418 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 953 1817 223 36 15 chr5 48281770 48282239 -104255020 + RLTR16 LTR ERVK 1 479 -26 3 953 288 277 21 0 chr5 48282925 48283019 -104254240 + ERVL-int LTR ERVL 5519 5614 -143 3 953 420 328 81 37 chr5 48283134 48283406 -104253853 + MLT2B2 LTR ERVL 6 289 -226 3 953 285 315 53 32 chr5 48284592 48284687 -104252572 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 586 682 -100 3 953 2398 192 30 59 chr5 48285615 48286156 -104251103 - RLTR20B3 LTR ERVK -44 533 9 3 953 2948 75 27 0 chr5 48291427 48291838 -104245421 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 4 953 233 269 63 21 chr5 48295553 48295648 -104241611 + LTR82A LTR ERVL 274 372 -500 4 953 1244 230 59 35 chr5 48298047 48298385 -104238874 + MTD LTR MaLR 43 388 -31 4 953 280 157 0 19 chr5 48298493 48298545 -104238714 + MTD LTR MaLR 371 421 0 4 953 2628 46 61 0 chr5 48298944 48299270 -104237989 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 953 12954 79 6 9 chr5 48299270 48301067 -104236192 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 4 953 2898 49 0 0 chr5 48301067 48301413 -104235846 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 953 423 265 55 62 chr5 48308153 48308298 -104228961 + MLT2B1 LTR ERVL 38 181 -339 4 953 234 350 50 0 chr5 48308516 48308596 -104228663 + MLT2B1 LTR ERVL 404 487 -75 4 953 389 335 64 81 chr5 48310338 48310634 -104226625 - ORR1E LTR MaLR -50 309 19 4 953 241 313 72 0 chr5 48311093 48311176 -104226083 + MLT2B2 LTR ERVL 25 113 -402 4 953 232 321 102 73 chr5 48311368 48311573 -104225686 + MLT2B2 LTR ERVL 105 315 -200 4 953 2403 82 31 0 chr5 48320630 48320947 -104216312 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 953 575 267 7 7 chr5 48322693 48322829 -104214430 - MTD LTR MaLR -264 155 20 4 953 328 261 11 16 chr5 48329798 48329896 -104207363 + ORR1D1 LTR MaLR 301 417 -2 4 953 331 183 14 14 chr5 48330596 48330668 -104206591 + ORR1D1 LTR MaLR 301 372 -2 4 953 726 256 156 116 chr5 48335182 48335543 -104201716 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 6 4 953 1747 152 304 16 chr5 48337152 48337579 -104199680 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 479 4 953 1107 235 129 18 chr5 48338707 48339040 -104198219 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 4 953 4027 114 109 12 chr5 48343224 48343913 -104193346 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 4 953 309 361 72 79 chr5 48345771 48346075 -104191184 + MLT1H-int LTR MaLR 931 1232 -177 4 953 429 343 87 28 chr5 48351082 48351334 -104185925 - RMER15 LTR ERVL -33 542 276 5 953 1642 166 10 17 chr5 48353896 48354196 -104183063 - RLTR10E LTR ERVK -13 298 1 5 953 2722 18 95 6 chr5 48357406 48357743 -104179516 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 5 953 27658 20 1 0 chr5 48357743 48361013 -104176246 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3209 5 953 6884 108 87 14 chr5 48361011 48362228 -104175031 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 5 953 2708 21 95 6 chr5 48362228 48362565 -104174694 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 5 953 2158 101 3 56 chr5 48362582 48362919 -104174340 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 953 10386 132 66 10 chr5 48362923 48364779 -104172480 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1959 -4 5 953 2367 87 9 47 chr5 48364783 48365122 -104172137 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 5 954 2701 134 59 72 chr5 48369218 48369742 -104167517 - RLTR17 LTR ERVK -77 615 99 5 954 236 299 79 40 chr5 48374021 48374122 -104163137 + LTR33A LTR ERVL 213 317 -203 5 954 227 268 33 99 chr5 48411207 48411298 -104125961 + MLT1A1 LTR MaLR 26 110 -298 5 954 1587 212 87 72 chr5 48411409 48411611 -104125648 - MTD LTR MaLR -10 409 211 5 954 1587 212 87 72 chr5 48412651 48412849 -104124410 - MTD LTR MaLR -209 210 3 5 954 288 353 36 43 chr5 48413184 48413323 -104123936 + MLT1A1 LTR MaLR 259 396 -12 5 954 324 365 73 24 chr5 48428103 48428308 -104108951 + MLT1H2 LTR MaLR 3 217 -272 5 954 2369 203 61 87 chr5 48431929 48432571 -104104688 - RMER20B LTR ERVK 0 627 3 6 954 301 330 26 9 chr5 48446168 48446281 -104090978 + RMER12 LTR ERVK 737 851 -471 6 954 664 324 50 100 chr5 48455108 48455468 -104081791 - MTEa LTR MaLR -23 356 15 6 954 2402 179 2 16 chr5 48456358 48456785 -104080474 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 954 340 364 47 50 chr5 48489272 48489608 -104047651 - MLT1C LTR MaLR -9 458 57 6 955 316 345 16 90 chr5 48502423 48502611 -104034648 + MLT1E2 LTR MaLR 324 497 -130 6 955 237 324 98 7 chr5 48504028 48504171 -104033088 + RMER12 LTR ERVK 701 856 -466 1 955 341 78 20 0 chr5 48529254 48529305 -104007954 - MYSERV6-int LTR ERVK -2077 6882 6831 3 955 1034 269 84 55 chr5 48536235 48536687 -104000572 - MLT1C LTR MaLR 0 467 3 4 955 984 287 162 3 chr5 48553061 48553376 -103983883 + MTD LTR MaLR 5 369 -50 6 955 318 344 135 57 chr5 48600319 48600397 -103936862 - LTR33A LTR ERVL -250 270 195 1 955 318 344 135 57 chr5 48601031 48601196 -103936063 - LTR33A LTR ERVL -326 194 8 1 955 831 323 99 22 chr5 48617635 48617958 -103919301 - ORR1E LTR MaLR -7 352 5 1 955 388 279 206 7 chr5 48617943 48618098 -103919161 - ORR1D2-int LTR MaLR -34 1546 1361 1 955 2608 328 72 76 chr5 48618426 48619638 -103917621 - ORR1D2-int LTR MaLR -242 1338 60 1 955 566 324 41 117 chr5 48619676 48619723 -103917536 - ORR1D2-int LTR MaLR -1904 59 17 1 955 293 229 116 25 chr5 48619815 48619936 -103917323 - ORR1D2 LTR MaLR -23 351 220 1 955 489 217 117 0 chr5 48619992 48620112 -103917147 - ORR1D2 LTR MaLR -235 135 2 1 955 253 240 133 0 chr5 48624582 48624657 -103912602 - MLT1B LTR MaLR -302 88 4 1 955 1412 272 52 30 chr5 48625305 48625707 -103911552 - MTD LTR MaLR -8 411 1 1 956 869 291 82 44 chr5 48629764 48630106 -103907153 - MTE2a LTR MaLR -2 377 23 1 956 1338 195 78 98 chr5 48636175 48636561 -103900698 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 956 671 151 28 14 chr5 48650423 48650564 -103886695 - RLTR31_Mm LTR ERVK -418 143 1 1 956 863 288 67 85 chr5 48670424 48670800 -103866459 - MTE2a LTR MaLR -10 369 1 2 956 327 373 84 84 chr5 48674889 48675246 -103862013 - MLT1A1 LTR MaLR -20 388 32 2 956 652 224 60 12 chr5 48691679 48691846 -103845413 - MTEa LTR MaLR -2 377 203 2 956 1244 266 19 43 chr5 48691956 48692278 -103844981 + MTE2b LTR MaLR 58 371 -8 2 956 1816 211 47 17 chr5 48698888 48699293 -103837966 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 2 956 715 266 154 3 chr5 48699487 48699787 -103837472 - MTD LTR MaLR -59 360 14 2 956 235 265 89 57 chr5 48702777 48702901 -103834358 - LTR85a LTR Gypsy? -224 478 351 2 956 240 320 48 78 chr5 48704289 48704455 -103832804 - MLT1A0 LTR MaLR -14 351 191 2 956 862 331 26 38 chr5 48704448 48704793 -103832466 - MTEa LTR MaLR -17 362 22 2 956 228 395 9 0 chr5 48705163 48705272 -103831987 - MLT1F LTR MaLR -253 295 186 2 956 317 267 28 56 chr5 48707323 48707363 -103829896 - ORR1E-int LTR MaLR -878 702 662 2 956 317 267 28 56 chr5 48707403 48707469 -103829790 - ORR1E-int LTR MaLR -919 661 599 2 956 1720 267 43 23 chr5 48708333 48708850 -103828409 - ORR1E-int LTR MaLR -1048 532 6 2 956 684 272 36 106 chr5 48708857 48709243 -103828016 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 956 248 333 50 17 chr5 48710006 48710125 -103827134 - LTR16C LTR ERVL -18 471 317 2 956 1415 266 58 18 chr5 48710135 48710533 -103826726 - MTD LTR MaLR -5 414 1 2 956 403 325 91 30 chr5 48714173 48714405 -103822854 + MER31A LTR ERV1 150 395 -90 2 956 690 196 94 7 chr5 48717210 48717359 -103819900 - MTD LTR MaLR -8 411 250 2 956 573 258 151 34 chr5 48717569 48717774 -103819485 - MTD LTR MaLR -124 255 27 2 956 251 268 125 46 chr5 48719480 48719621 -103817638 + MTD LTR MaLR 258 404 -17 2 956 652 221 63 17 chr5 48719630 48719805 -103817454 + MTD-int LTR MaLR 8 190 -1068 2 956 2144 230 81 74 chr5 48719779 48720479 -103816780 + MTD-int LTR MaLR 554 1258 0 2 956 1622 215 55 11 chr5 48720556 48720923 -103816336 + MTD LTR MaLR 21 403 -16 2 956 2350 131 57 13 chr5 48726267 48726653 -103810606 + MTC LTR MaLR 11 413 -8 2 956 389 345 53 34 chr5 48727482 48727746 -103809513 + MLT1C LTR MaLR 192 460 -7 2 956 531 371 37 66 chr5 48728405 48728783 -103808476 - MLT1A LTR MaLR -7 367 1 3 956 507 291 53 68 chr5 48738240 48738529 -103798730 - MLT2B4 LTR ERVL -132 282 1 3 956 1540 211 10 121 chr5 48738843 48738999 -103798260 - MTC LTR MaLR -55 366 210 3 956 1540 211 10 121 chr5 48739167 48739320 -103797939 - MTC LTR MaLR -212 209 97 3 956 1540 211 10 121 chr5 48739620 48739695 -103797564 - MTC LTR MaLR -325 96 22 3 956 327 297 10 29 chr5 48739804 48739908 -103797351 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2733 2981 2880 3 956 2547 128 47 16 chr5 48740564 48741008 -103796251 - RMER6B LTR ERVK -3 458 1 3 956 521 306 97 20 chr5 48741445 48741692 -103795567 - MLT2C1 LTR ERVL -21 376 111 3 956 344 244 13 0 chr5 48742016 48742094 -103795165 - MLT2C1 LTR ERVL -292 105 27 3 956 483 308 108 75 chr5 48742545 48742906 -103794353 + MLT1H2 LTR MaLR 81 453 -36 3 956 812 296 100 16 chr5 48750523 48750774 -103786485 - MTEa LTR MaLR -107 272 1 3 956 2433 211 82 13 chr5 48752847 48753374 -103783885 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 1 3 956 456 222 173 8 chr5 48754037 48754164 -103783095 - MTE2a LTR MaLR -1 378 231 3 957 3323 186 37 33 chr5 48761000 48761674 -103775585 + ORR1C2-int LTR MaLR 833 1509 0 3 957 1713 187 54 43 chr5 48761881 48762250 -103775009 + ORR1C2 LTR MaLR 10 382 -2 3 957 240 304 67 29 chr5 48771559 48771664 -103765595 - MTE2b LTR MaLR -6 373 265 3 957 327 250 45 0 chr5 48776792 48776924 -103760335 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 617 3 957 264 212 86 12 chr5 48782455 48782536 -103754723 + MT2A LTR ERVL 2 88 -445 3 957 1358 216 152 3 chr5 48785309 48785638 -103751621 + MT2A LTR ERVL 78 455 -78 3 957 1133 219 136 16 chr5 48810756 48811113 -103726146 - MTD LTR MaLR -21 398 3 4 957 413 281 8 58 chr5 48822552 48822673 -103714586 - MTE2b LTR MaLR -262 117 3 4 957 2544 50 71 0 chr5 48829327 48829650 -103707609 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 957 229 289 0 12 chr5 48830550 48830634 -103706625 + MLT1H LTR MaLR 461 543 -6 4 957 372 341 112 58 chr5 48830642 48830990 -103706269 + MLT1H-int LTR MaLR 2 368 -1041 4 957 273 133 0 0 chr5 48835536 48835581 -103701678 + RLTR15 LTR ERVK 198 242 -117 4 957 2014 206 55 36 chr5 48836766 48837240 -103700019 + RMER19C LTR ERVK 115 611 0 4 957 615 293 151 60 chr5 48839190 48839521 -103697738 - MTEa LTR MaLR -6 373 13 4 957 235 345 58 93 chr5 48841927 48842218 -103695041 + MLT1L LTR MaLR 9 289 -321 4 957 399 317 104 68 chr5 48843655 48843933 -103693326 - MTEa LTR MaLR -74 305 18 4 957 1034 281 57 3 chr5 48849822 48850157 -103687102 - MLT1B LTR MaLR -37 353 1 4 957 1409 216 47 86 chr5 48851049 48851247 -103686012 + ORR1D1 LTR MaLR 1 181 -193 4 957 1409 216 47 86 chr5 48851292 48851478 -103685781 + ORR1D1 LTR MaLR 182 370 -4 4 957 363 269 18 55 chr5 48857252 48857362 -103679897 - MLT2C2 LTR ERVL -341 123 18 4 957 824 326 62 26 chr5 48860245 48860747 -103676512 + MER68 LTR ERVL 3 563 0 4 957 1914 153 18 24 chr5 48862156 48862485 -103674774 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 5 957 2236 121 12 0 chr5 48864498 48864821 -103672438 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 957 526 359 66 25 chr5 48866064 48866427 -103670832 + MLT1E1A LTR MaLR 293 670 -10 5 957 429 295 48 68 chr5 48887940 48888147 -103649112 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 338 5 958 3129 70 17 0 chr5 48895566 48895980 -103641279 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 958 292 371 18 30 chr5 48899384 48899548 -103637711 + MLT2B1 LTR ERVL 8 169 -351 5 958 278 274 43 41 chr5 48903412 48903538 -103633721 + MTE2a LTR MaLR 241 364 -15 5 958 407 329 76 19 chr5 48914140 48914298 -103622961 + MLT1C LTR MaLR 1 167 -300 5 958 765 321 139 3 chr5 48929944 48930281 -103606978 - MLT1B LTR MaLR -4 386 4 5 958 2093 166 117 13 chr5 48932527 48933004 -103604255 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 6 958 426 317 49 0 chr5 48937371 48937513 -103599746 + MLT1A0 LTR MaLR 217 365 0 6 958 3007 59 13 8 chr5 48937643 48938035 -103599224 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 6 958 1855 198 24 3 chr5 48945510 48945880 -103591379 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 958 1480 318 25 27 chr5 48946754 48947281 -103589978 - MER68 LTR ERVL -37 526 1 6 958 411 337 26 159 chr5 48964310 48964402 -103572857 + MLT1B LTR MaLR 11 102 -272 6 958 493 330 19 90 chr5 48964584 48964911 -103572348 + MLT1B LTR MaLR 103 390 0 6 958 891 234 14 28 chr5 48968734 48968945 -103568314 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 166 6 958 3742 159 192 63 chr5 48972017 48972927 -103564332 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 1 6 958 1526 189 81 17 chr5 48977394 48977690 -103559569 - ORR1B2 LTR MaLR -52 315 1 6 958 1103 164 82 0 chr5 48977700 48977908 -103559351 - ORR1B2-int LTR MaLR -27 1482 1258 6 958 1142 29 0 0 chr5 48977908 48978047 -103559212 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 139 -448 6 958 257 260 71 20 chr5 48983693 48983791 -103553468 + MER90a LTR ERV1 10 112 -463 6 958 670 352 25 31 chr5 48984162 48984479 -103552780 + MER90a LTR ERV1 298 612 -2 6 958 505 300 26 54 chr5 48994001 48994214 -103543045 + MER34A LTR ERV1 4 216 -371 6 958 360 297 41 8 chr5 48999217 48999358 -103537901 - MLT1D LTR MaLR -8 497 381 7 958 335 337 70 85 chr5 48999456 48999657 -103537602 - MLT1D LTR MaLR -296 209 12 7 958 3708 134 105 49 chr5 49000752 49001530 -103535729 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 3 959 539 302 69 91 chr5 49021115 49021574 -103515685 - MLT1B LTR MaLR -3 464 6 2 959 326 295 83 30 chr5 49057000 49057133 -103480126 + MLT1A LTR MaLR 60 210 -164 7 959 250 297 0 56 chr5 49059639 49059746 -103477513 + MLT1A LTR MaLR 271 371 -3 7 959 3074 8 43 0 chr5 49060998 49061350 -103475909 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 959 4700 61 46 16 chr5 49061350 49061986 -103475273 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 7 959 442 66 0 32 chr5 49061986 49062049 -103475210 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 7 959 1821 119 4 4 chr5 49062038 49062300 -103474959 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 7 959 932 73 24 0 chr5 49062297 49062420 -103474839 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 7 959 26367 15 1 0 chr5 49062420 49065373 -103471886 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 7 959 3074 8 43 0 chr5 49065373 49065725 -103471534 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 959 1290 205 51 34 chr5 49066892 49067245 -103470014 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 7 959 470 266 74 89 chr5 49068130 49068320 -103468939 + MLT1B LTR MaLR 16 202 -188 7 959 384 331 49 22 chr5 49069634 49069819 -103467440 + MLT1B LTR MaLR 162 351 -39 7 959 288 308 120 0 chr5 49070156 49070273 -103466986 - MLT2B4 LTR ERVL -422 134 4 8 959 1129 210 210 18 chr5 49076391 49076684 -103460575 + RMER10B LTR ERVL 1 339 -59 9 959 1129 210 210 18 chr5 49076732 49076772 -103460487 + RMER10B LTR ERVL 340 397 -1 9 959 2107 118 12 27 chr5 49079579 49079911 -103457348 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 959 473 211 90 52 chr5 49087724 49087879 -103449380 - RMER3D-int LTR ERVK -548 2294 2134 1 959 525 313 7 13 chr5 49090153 49090302 -103446957 + MLT1C LTR MaLR 320 467 0 1 959 258 353 99 47 chr5 49091285 49091496 -103445763 + ORR1E LTR MaLR 35 256 -103 1 959 904 280 33 78 chr5 49091621 49091927 -103445332 - ORR1E LTR MaLR -42 317 26 1 959 329 329 125 71 chr5 49093794 49094105 -103443154 + MTE-int LTR MaLR 1196 1523 -57 1 959 306 344 52 46 chr5 49096002 49096219 -103441040 + MLT1F LTR MaLR 93 307 -262 1 959 981 229 80 90 chr5 49103597 49103950 -103433309 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 959 699 270 494 5 chr5 49105651 49105786 -103431473 - MTD LTR MaLR -21 398 199 1 959 699 283 57 24 chr5 49105829 49106008 -103431251 - MTD LTR MaLR -221 198 12 1 959 552 326 129 36 chr5 49106452 49106786 -103430473 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 1 959 987 261 82 44 chr5 49116573 49116913 -103420346 + ORR1D2 LTR MaLR 1 353 -17 1 959 2386 52 22 6 chr5 49117887 49118199 -103419060 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 317 -10 1 959 330 237 0 50 chr5 49125501 49125581 -103411678 - MT2B2 LTR ERVL -340 244 169 1 959 721 252 89 128 chr5 49127480 49127871 -103409388 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 1 959 969 240 108 29 chr5 49133688 49134031 -103403228 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 1 959 241 425 100 4 chr5 49136046 49136287 -103400972 + MLT1E2 LTR MaLR 111 374 -253 1 959 475 258 211 114 chr5 49145340 49145620 -103391639 - MLT1A LTR MaLR -22 352 46 1 959 2141 55 0 118 chr5 49145740 49146071 -103391188 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 1 960 283 358 81 20 chr5 49160678 49160926 -103376333 + MER67D LTR ERV1 240 502 -12 1 960 391 397 29 5 chr5 49163539 49163744 -103373515 - MLT1A0 LTR MaLR -128 237 28 2 960 3724 182 92 15 chr5 49164434 49165226 -103372033 + RLTR25B LTR ERVK 1 853 -175 2 960 661 250 143 60 chr5 49165485 49165600 -103371659 + RLTR25B LTR ERVK 832 962 -141 2 960 661 250 143 60 chr5 49165694 49165828 -103371431 + RLTR25B LTR ERVK 963 1102 -1 2 960 239 265 116 66 chr5 49170836 49170957 -103366302 - RLTR19A LTR ERVK -355 141 15 2 960 269 296 8 115 chr5 49181538 49181668 -103355591 + MTE2b LTR MaLR 150 265 -114 2 960 911 307 29 51 chr5 49183810 49184217 -103353042 + MTE2a LTR MaLR 1 405 -14 2 960 391 278 60 17 chr5 49200695 49200812 -103336447 + MTEb LTR MaLR 245 366 -13 2 960 280 238 104 47 chr5 49205112 49205218 -103332041 + MLT1D LTR MaLR 391 502 -3 2 960 1245 300 30 3 chr5 49207605 49207943 -103329316 + MTEa LTR MaLR 1 347 -32 2 960 1024 259 95 44 chr5 49209044 49209449 -103327810 - MTD LTR MaLR -15 404 1 2 960 744 273 82 4 chr5 49212243 49212486 -103324773 + MLT1C LTR MaLR 10 271 -196 2 960 1198 152 38 40 chr5 49219860 49220107 -103317152 + ORR1A2 LTR MaLR 1 284 -100 2 960 386 295 80 50 chr5 49220188 49220388 -103316871 + MLT2B5 LTR ERVL 310 515 -40 2 960 635 271 75 95 chr5 49221965 49222353 -103314906 + ORR1C2 LTR MaLR 1 380 -4 2 960 1273 178 13 0 chr5 49222412 49222648 -103314611 + ORR1A2 LTR MaLR 1 239 -88 2 960 5994 134 12 21 chr5 49230339 49231305 -103305954 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 3 960 238 266 77 68 chr5 49241751 49241868 -103295391 - RMER15 LTR ERVL -92 483 366 3 960 378 256 119 8 chr5 49242006 49242124 -103295135 - RMER15 LTR ERVL -444 131 1 3 960 766 285 48 94 chr5 49243014 49243409 -103293850 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 3 960 544 305 54 20 chr5 49248493 49248697 -103288562 - MTE2a LTR MaLR 0 379 169 3 960 240 233 0 0 chr5 49253755 49253798 -103283461 + MLT1B LTR MaLR 269 311 -79 3 960 6939 191 28 14 chr5 49258119 49259508 -103277751 + MERVL_2A-int LTR ERVL 436 1844 -3917 3 960 5426 169 32 16 chr5 49259499 49259625 -103277634 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2189 2313 -3448 3 960 1940 120 177 3 chr5 49259625 49259959 -103277300 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 3 960 5426 169 32 16 chr5 49259959 49260811 -103276448 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2314 3182 -2579 3 960 2546 213 25 18 chr5 49260802 49260829 -103276430 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4453 4479 -1282 3 960 2992 83 5 10 chr5 49260829 49261240 -103276019 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 960 2546 213 25 18 chr5 49261240 49261724 -103275535 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4480 4968 -793 3 960 232 366 68 12 chr5 49262368 49262531 -103274728 - LTR16A1 LTR ERVL -17 439 268 3 960 878 319 81 31 chr5 49268686 49269045 -103268214 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 3 961 442 331 74 50 chr5 49291636 49291894 -103245365 - MLT1E LTR MaLR -331 322 59 3 961 1057 250 27 97 chr5 49310220 49310623 -103226636 - MTE2a LTR MaLR -3 376 2 3 961 542 336 73 67 chr5 49329876 49330233 -103207026 - MTE2a LTR MaLR -2 377 19 4 961 371 372 83 0 chr5 49330486 49330666 -103206593 + MLT1C LTR MaLR 113 307 -160 4 961 240 326 54 33 chr5 49338731 49338823 -103198436 + MLT2B1 LTR ERVL 372 465 -102 4 961 463 377 56 4 chr5 49341276 49341542 -103195717 + MLT1C LTR MaLR 171 450 -17 4 961 747 284 91 44 chr5 49352462 49352804 -103184455 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 4 961 541 329 53 26 chr5 49354909 49355137 -103182122 + MLT1A1 LTR MaLR 175 408 0 4 961 300 318 88 63 chr5 49371539 49371744 -103165515 + MLT1B LTR MaLR 117 326 -64 4 961 1736 223 43 36 chr5 49374461 49374879 -103162380 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 961 932 253 120 52 chr5 49376367 49376692 -103160567 + ORR1D2 LTR MaLR 20 366 -4 4 961 580 264 27 20 chr5 49387776 49387953 -103149306 + MLT1D LTR MaLR 353 624 0 5 961 443 269 171 50 chr5 49390253 49390492 -103146767 + MLT1K LTR MaLR 302 569 -26 5 961 446 381 54 43 chr5 49396977 49397254 -103140005 - MLT1A1 LTR MaLR -127 281 2 5 961 735 271 58 58 chr5 49398063 49398357 -103138902 + MER31A LTR ERV1 84 377 -108 5 961 640 270 51 131 chr5 49398386 49398441 -103138818 + MER31A LTR ERV1 376 421 -45 5 961 233 307 45 52 chr5 49399908 49400042 -103137217 - LTR37A LTR ERV1 -78 348 216 5 961 336 287 56 24 chr5 49400436 49400561 -103136698 - MTEa LTR MaLR 0 379 251 5 961 461 358 18 57 chr5 49400572 49400800 -103136459 - MTEa LTR MaLR -117 262 44 5 961 563 229 11 11 chr5 49402863 49403028 -103134231 + ORR1A3 LTR MaLR 1 165 -164 5 961 8569 156 67 91 chr5 49403031 49403253 -103134006 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 241 -1722 5 961 8569 156 67 91 chr5 49403295 49405084 -103132175 + ORR1A3-int LTR MaLR 242 1963 0 5 961 1647 144 36 0 chr5 49405085 49405362 -103131897 + ORR1A3 LTR MaLR 2 288 -38 5 961 607 374 42 66 chr5 49405656 49406183 -103131076 + MLT1F1 LTR MaLR 1 514 -55 5 961 278 295 19 38 chr5 49409776 49409895 -103127364 + MLT1F1 LTR MaLR 486 602 -8 5 961 340 196 26 43 chr5 49412164 49412281 -103124978 + RMER17B LTR ERVK 343 457 -501 5 961 814 226 0 6 chr5 49413054 49413223 -103124036 + MTD LTR MaLR 244 411 -8 5 962 1985 215 45 68 chr5 49419108 49419411 -103117848 + RMER5 LTR ERV1 16 307 -227 5 962 1985 215 45 68 chr5 49419552 49419777 -103117482 + RMER5 LTR ERV1 308 532 -2 5 962 1530 213 43 21 chr5 49420357 49420731 -103116528 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 5 962 227 324 78 58 chr5 49424553 49424707 -103112552 + LTR50 LTR ERVL 419 575 -220 5 962 1754 180 8 48 chr5 49438018 49438392 -103098867 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 962 228 370 33 50 chr5 49438454 49438636 -103098623 + MLT1L LTR MaLR 206 384 -226 5 962 392 390 38 24 chr5 49440546 49440919 -103096340 + MLT1L-int LTR MaLR 605 1024 -465 5 962 251 302 59 114 chr5 49441008 49441210 -103096049 + MLT1L-int LTR MaLR 1005 1195 -176 5 962 934 50 0 8 chr5 49452935 49453057 -103084202 - MTB_Mm LTR MaLR -286 121 1 5 962 5382 185 97 10 chr5 49453062 49454212 -103083047 - MTB_Mm-int LTR MaLR -6 1252 3 5 962 2596 68 112 0 chr5 49454212 49454578 -103082681 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 962 291 224 47 0 chr5 49454652 49454737 -103082522 - MTA_Mm LTR MaLR -262 134 46 5 962 234 194 13 130 chr5 49457457 49457492 -103079767 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 338 6 962 822 262 241 50 chr5 49458010 49458294 -103078965 - ORR1D1 LTR MaLR -37 337 1 6 962 362 301 63 5 chr5 49461433 49461592 -103075667 + MLT1B LTR MaLR 195 388 -2 6 962 513 348 32 24 chr5 49470580 49470830 -103066429 - MTD LTR MaLR -167 252 1 6 962 746 262 35 78 chr5 49487432 49487653 -103049606 + RMER17C LTR ERVK 1 223 -187 6 962 746 262 35 78 chr5 49487678 49487775 -103049484 + RMER17C LTR ERVK 224 305 -105 6 962 1471 298 105 85 chr5 49487840 49489071 -103048188 + RMER17C-int LTR ERVK 1 1255 -1983 6 962 4016 182 121 45 chr5 49489085 49490116 -103047143 + RMER17C-int LTR ERVK 1379 2488 -750 6 962 312 265 24 0 chr5 49490125 49490208 -103047051 + RMER17C LTR ERVK 292 376 -34 6 962 237 269 114 65 chr5 49492787 49492910 -103044349 + MLT1A1 LTR MaLR 268 396 -12 6 962 225 250 320 0 chr5 49495678 49495778 -103041481 + MLT1A0 LTR MaLR 21 152 -213 6 962 1386 251 2 128 chr5 49497025 49497492 -103039767 - MTD LTR MaLR -6 413 6 6 962 1901 201 45 8 chr5 49501090 49501492 -103035767 + MTC LTR MaLR 3 419 -2 4 962 623 61 50 20 chr5 49508112 49508212 -103029047 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 103 -458 2 962 1719 222 18 61 chr5 49508320 49508793 -103028466 + RLTR31_Mm LTR ERVK 87 610 -82 2 962 926 274 46 15 chr5 49514940 49515199 -103022060 + ORR1D2 LTR MaLR 2 268 -102 3 962 260 263 63 50 chr5 49518381 49518502 -103018757 + MTEb LTR MaLR 1 128 -237 3 962 287 255 40 20 chr5 49518718 49518818 -103018441 + MTEb LTR MaLR 272 373 -6 3 962 2683 160 152 125 chr5 49521761 49522624 -103014635 - RMER17D LTR ERVK -3 886 1 4 963 546 246 14 86 chr5 49551953 49552193 -102985066 - ORR1D1 LTR MaLR -172 195 1 8 963 272 330 87 68 chr5 49552584 49552937 -102984322 + MLT1A0 LTR MaLR 4 396 -12 8 963 3156 193 12 31 chr5 49553732 49554233 -102983026 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 492 -86 8 963 3156 193 12 31 chr5 49554296 49554383 -102982876 + RLTR20A2 LTR ERVK 493 578 0 8 963 347 162 0 86 chr5 49561645 49561726 -102975533 - MTC LTR MaLR -1 418 345 9 963 1774 195 40 3 chr5 49561821 49562150 -102975109 - MTC LTR MaLR -80 341 1 9 963 345 305 79 16 chr5 49563893 49564083 -102973176 + LTR37A LTR ERV1 225 426 0 9 963 808 286 112 52 chr5 49565191 49565630 -102971629 - RMER13A LTR ERVK -394 466 2 1 963 613 295 28 28 chr5 49581840 49582053 -102955206 - RMER15 LTR ERVL -13 562 350 1 963 634 350 84 35 chr5 49582456 49582743 -102954516 + MTEa LTR MaLR 7 307 -72 1 963 2418 92 48 71 chr5 49582744 49583165 -102954094 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 963 3413 66 16 30 chr5 49583166 49583906 -102953353 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 1 963 951 59 0 0 chr5 49583906 49584025 -102953234 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 1 963 1780 111 8 4 chr5 49584020 49584273 -102952986 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 1 963 1015 63 0 0 chr5 49584270 49584396 -102952863 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 1 963 26267 16 3 0 chr5 49584396 49587345 -102949914 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 1 963 2408 95 48 71 chr5 49587345 49587766 -102949493 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 963 295 300 0 0 chr5 49587766 49587836 -102949423 + MTEa LTR MaLR 303 372 -7 1 963 450 317 176 9 chr5 49594002 49594416 -102942843 - MLT1D LTR MaLR -1 504 33 1 963 3302 182 22 5 chr5 49594610 49595201 -102942058 + RMER13A LTR ERVK 1 601 -259 1 963 548 273 79 7 chr5 49595191 49595331 -102941928 + RMER13A LTR ERVK 711 860 0 1 963 494 321 165 43 chr5 49595744 49596230 -102941029 - MLT1D LTR MaLR -27 600 30 1 963 235 275 83 52 chr5 49596758 49596854 -102940405 + RMER4B LTR ERVK 458 556 -29 1 963 333 282 89 47 chr5 49598675 49598865 -102938394 - MLT1B LTR MaLR -154 236 39 1 963 561 360 45 75 chr5 49600495 49600803 -102936456 + MLT1F LTR MaLR 28 390 -189 1 963 273 287 11 33 chr5 49600903 49600993 -102936266 + MTD LTR MaLR 7 94 -325 1 963 1024 266 95 20 chr5 49601100 49601395 -102935864 + MTD LTR MaLR 103 419 0 1 963 399 361 116 19 chr5 49603176 49603495 -102933764 - MLT1C LTR MaLR -6 461 112 1 963 2126 199 10 2 chr5 49626484 49626902 -102910357 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 963 593 325 44 53 chr5 49627271 49627631 -102909628 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3869 1845 1489 1 963 1870 221 39 10 chr5 49628781 49629170 -102908089 + MTD LTR MaLR 20 419 0 1 963 779 383 50 23 chr5 49633554 49633952 -102903307 - MLT1E3 LTR MaLR -2 622 214 1 963 839 313 76 0 chr5 49639221 49639483 -102897776 - MLT1C LTR MaLR -2 465 184 2 963 814 320 65 53 chr5 49640559 49640971 -102896288 - MTD LTR MaLR 0 419 3 2 963 254 270 69 10 chr5 49641923 49642024 -102895235 + ORR1E LTR MaLR 253 359 0 2 963 350 362 183 46 chr5 49655541 49656006 -102881253 - MLT1F1 LTR MaLR -4 565 37 2 963 757 336 38 60 chr5 49661839 49662238 -102875021 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 2 964 1657 148 100 7 chr5 49683725 49684025 -102853234 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 2 964 1783 231 22 12 chr5 49689169 49689580 -102847679 - MTD LTR MaLR -2 417 3 2 964 318 243 61 26 chr5 49708170 49708284 -102828975 + LTR41 LTR ERVL 649 766 -2 3 964 687 357 64 24 chr5 49719788 49720210 -102817049 - MLT1D LTR MaLR -2 503 65 3 964 458 206 63 31 chr5 49722112 49722303 -102814956 + RMER17C LTR ERVK 81 277 -133 3 964 382 341 57 61 chr5 49724517 49724745 -102812514 - RLTR25B LTR ERVK -801 227 1 3 964 289 333 83 83 chr5 49731736 49732060 -102805199 + ORR1C2 LTR MaLR 23 346 -38 3 964 3065 61 5 10 chr5 49734536 49734934 -102802325 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 964 754 289 135 13 chr5 49736615 49736927 -102800332 + ORR1E LTR MaLR 8 357 -2 3 964 1185 201 188 19 chr5 49737292 49737611 -102799648 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 964 450 280 271 30 chr5 49742223 49742521 -102794738 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 964 252 386 0 0 chr5 49750345 49750459 -102786800 - MLT1C LTR MaLR -2 465 352 3 964 576 326 94 12 chr5 49750525 49750770 -102786489 - MLT1C LTR MaLR -202 265 1 3 964 1009 258 73 41 chr5 49752373 49752621 -102784638 - MTD LTR MaLR -59 360 70 3 964 1009 260 77 27 chr5 49752679 49752748 -102784511 - MTD LTR MaLR -350 69 2 3 964 253 274 118 36 chr5 49756775 49756885 -102780374 + RMER12 LTR ERVK 726 844 -478 3 964 1746 176 39 34 chr5 49759793 49760151 -102777108 - RMER10B LTR ERVL 0 398 39 3 964 923 240 89 31 chr5 49765117 49765375 -102771884 + ORR1D2 LTR MaLR 2 274 -96 3 964 617 268 18 64 chr5 49767166 49767385 -102769874 + RLTR12B LTR ERVK 47 255 -273 3 964 2152 170 38 29 chr5 49768815 49769232 -102768027 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 964 1622 159 86 3 chr5 49771829 49772131 -102765128 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 3 964 694 307 89 60 chr5 49773901 49774432 -102762827 - MER90 LTR ERV1 -24 590 3 3 964 1839 242 34 53 chr5 49777148 49777611 -102759648 + RMER5 LTR ERV1 1 463 -71 4 964 1840 242 34 53 chr5 49777757 49777816 -102759443 + RMER5 LTR ERV1 464 513 -21 4 964 356 227 184 10 chr5 49779570 49779668 -102757591 + MLT2B2 LTR ERVL 17 131 -389 4 964 408 366 30 89 chr5 49780071 49780308 -102756951 + MLT2B2 LTR ERVL 131 353 -162 4 964 258 337 92 109 chr5 49792189 49792602 -102744657 + MLT1H2 LTR MaLR 84 489 0 4 964 289 301 34 87 chr5 49796538 49796687 -102740572 + ORR1E LTR MaLR 51 191 -168 4 964 724 312 142 21 chr5 49799606 49799979 -102737280 - MTD LTR MaLR -1 418 1 4 964 3201 51 5 0 chr5 49804548 49804942 -102732317 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 965 232 333 11 0 chr5 49817206 49817293 -102719966 - MLT1F2 LTR MaLR -396 164 77 4 965 1621 135 15 11 chr5 49817758 49818028 -102719231 + ORR1A3 LTR MaLR 5 275 -51 4 965 238 290 69 20 chr5 49825457 49825559 -102711700 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 259 4 965 296 326 51 36 chr5 49825777 49825914 -102711345 - MLT1A0 LTR MaLR -151 214 76 4 965 2535 76 52 14 chr5 49830613 49830959 -102706300 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 4 965 512 331 96 58 chr5 49833538 49833903 -102703356 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 4 965 2854 103 2 2 chr5 49834857 49835264 -102701995 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 965 941 265 188 0 chr5 49839072 49839387 -102697872 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 1 4 965 444 277 46 94 chr5 49839387 49839722 -102697537 + RMER17D2 LTR ERVK 165 482 -327 4 965 1378 192 20 36 chr5 49852555 49852858 -102684401 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 87 5 965 237 382 46 0 chr5 49854300 49854431 -102682828 - MLT1A1 LTR MaLR -259 149 13 5 965 824 292 68 58 chr5 49854890 49855306 -102681953 + BGLII_B LTR ERVK 1 414 -27 5 965 561 254 42 7 chr5 49860057 49860200 -102677059 - MTD LTR MaLR 0 419 272 5 965 241 381 0 23 chr5 49861377 49861463 -102675796 - MTD LTR MaLR -219 200 117 5 965 372 257 0 28 chr5 49861526 49861634 -102675625 - MTD LTR MaLR -314 105 1 5 965 447 268 23 104 chr5 49862591 49862812 -102674447 + RLTR42-int LTR ERVK 1189 1391 -4131 5 965 856 296 161 10 chr5 49871123 49871433 -102665826 - MTD LTR MaLR -14 405 49 5 965 253 273 116 43 chr5 49875024 49875162 -102662097 + MLT1C LTR MaLR 275 422 -45 5 965 317 263 201 44 chr5 49882026 49882185 -102655074 + MLT1A1 LTR MaLR 198 381 -27 5 965 418 312 128 14 chr5 49893993 49894204 -102643055 - MLT1D LTR MaLR -43 462 228 5 965 411 254 7 69 chr5 49919867 49920011 -102617248 + MLT1B LTR MaLR 240 374 -16 5 965 619 238 86 17 chr5 49921308 49921483 -102615776 + MTC LTR MaLR 2 188 -231 5 965 489 152 425 7 chr5 49921576 49921715 -102615544 - RMER4B LTR ERVK 0 585 389 5 965 855 212 100 8 chr5 49921720 49921909 -102615350 + MTC LTR MaLR 219 409 -12 5 965 671 292 86 12 chr5 49922694 49923013 -102614246 + MTE2a LTR MaLR 6 379 0 5 965 1404 222 37 55 chr5 49923256 49923637 -102613622 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 965 500 230 120 13 chr5 49924008 49924158 -102613101 - MLT1H LTR MaLR -2 547 382 5 965 311 283 43 26 chr5 49924476 49924592 -102612667 + MLT1A0 LTR MaLR 12 129 -236 5 965 373 303 98 8 chr5 49924617 49924734 -102612525 + MLT1A0 LTR MaLR 200 327 -38 5 965 269 325 94 84 chr5 49927259 49927534 -102609725 + ORR1E LTR MaLR 75 352 -7 5 965 3082 208 247 6 chr5 49927738 49928431 -102608828 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 5 966 531 330 31 13 chr5 49940992 49941216 -102596043 - MLT1D LTR MaLR -20 485 258 6 966 497 339 93 75 chr5 49945088 49945420 -102591839 + ORR1E LTR MaLR 18 355 -4 6 966 2358 91 233 5 chr5 49947041 49947428 -102589831 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 966 421 255 37 73 chr5 49952018 49952289 -102584970 - MLT1A0 LTR MaLR -2 372 1 6 966 315 291 77 65 chr5 49956230 49956399 -102580860 - MLT1C LTR MaLR -10 457 287 6 966 255 324 85 9 chr5 49956612 49956718 -102580541 - MTD LTR MaLR 0 419 306 6 966 854 257 68 18 chr5 49957141 49957405 -102579854 - MTD LTR MaLR -108 311 1 6 966 1203 277 204 18 chr5 49957405 49957894 -102579365 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 679 6 966 291 343 39 19 chr5 49957923 49958027 -102579232 - MTC-int LTR MaLR -779 479 374 6 966 340 224 26 0 chr5 49958038 49958114 -102579145 - MTC-int LTR MaLR -1140 118 41 6 966 420 302 8 0 chr5 49958638 49958764 -102578495 - MLT1A0 LTR MaLR -11 354 228 6 966 1032 256 96 23 chr5 49958768 49959112 -102578147 - MTE2b LTR MaLR -10 369 1 6 966 1199 217 76 62 chr5 49963625 49963994 -102573265 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 966 594 212 72 18 chr5 49964995 49965166 -102572093 + MTD LTR MaLR 195 416 -3 6 966 718 205 288 37 chr5 49973444 49973626 -102563633 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 147 6 966 718 205 288 37 chr5 49973715 49973831 -102563428 - ORR1D1 LTR MaLR -228 146 2 6 966 1431 297 46 28 chr5 49974647 49975143 -102562116 - RMER19C LTR ERVK 0 611 107 6 966 1147 287 57 15 chr5 49975235 49975571 -102561688 - ORR1E LTR MaLR -9 350 1 6 966 1572 133 16 100 chr5 49981994 49982304 -102554955 + ORR1B1 LTR MaLR 39 322 -72 6 966 2764 99 47 68 chr5 49982571 49983058 -102554201 + RLTR44C LTR ERVK 1 477 -25 6 966 604 81 0 33 chr5 49983234 49983324 -102553935 + ORR1A4 LTR MaLR 243 329 0 6 966 973 285 58 23 chr5 49983840 49984114 -102553145 - MTD LTR MaLR -15 404 120 6 966 973 286 84 23 chr5 49984174 49984253 -102553006 - MTD LTR MaLR -300 119 40 6 966 287 344 81 38 chr5 49992275 49992435 -102544824 + MLT1A0 LTR MaLR 119 285 -80 6 966 3531 149 42 14 chr5 49993918 49994623 -102542636 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 6 966 474 172 120 82 chr5 49995586 49995635 -102541624 - RMER6C LTR ERVK -37 653 596 6 966 474 172 120 82 chr5 49995828 49995946 -102541313 - RMER6C LTR ERVK -95 595 489 6 966 4216 52 0 0 chr5 49995946 49996449 -102540810 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 6 966 474 172 120 82 chr5 49996449 49996464 -102540795 - RMER6C LTR ERVK -202 488 463 6 966 2161 201 128 15 chr5 49996513 49997099 -102540160 - RMER6C LTR ERVK -38 652 1 7 966 1093 203 51 4 chr5 49999509 49999745 -102537514 + MT2A LTR ERVL 1 247 -286 7 966 1415 158 59 31 chr5 49999745 50000000 -102537259 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 121 7 966 677 176 8 0 chr5 50000000 50000119 -102537140 - RLTR14 LTR ERV1 -262 120 1 1 966 895 205 89 10 chr5 50000119 50000319 -102536940 + MT2A LTR ERVL 244 459 -74 2 966 1720 141 8 0 chr5 50000527 50000783 -102536476 + ORR1A3 LTR MaLR 61 318 -8 5 966 769 257 24 90 chr5 50000847 50001344 -102535915 + RLTR11B LTR ERVK 7 427 -26 7 966 232 133 17 0 chr5 50001453 50001513 -102535746 + MT2A LTR ERVL 473 533 0 9 966 244 251 14 27 chr5 50003086 50003168 -102534091 - MTE2b LTR MaLR -31 348 268 1 966 545 214 51 44 chr5 50003467 50003604 -102533655 + RMER5 LTR ERV1 393 530 -4 1 966 325 325 90 35 chr5 50003628 50003924 -102533335 + MLT1G LTR MaLR 86 471 -120 1 966 354 322 87 32 chr5 50004155 50004373 -102532886 - LTR33B LTR ERVL -15 488 259 1 966 275 315 0 90 chr5 50004396 50004518 -102532741 - LTR33B LTR ERVL -459 170 60 1 966 587 221 165 22 chr5 50005212 50005403 -102531856 + ORR1D2 LTR MaLR 168 394 0 1 966 1738 193 123 3 chr5 50005563 50005937 -102531322 - MTC LTR MaLR -2 419 1 1 966 238 319 25 42 chr5 50007452 50007570 -102529689 + MLT1H LTR MaLR 432 547 -2 1 966 335 273 96 32 chr5 50007572 50007697 -102529562 - MLT1J1 LTR MaLR -276 168 36 1 966 230 218 55 0 chr5 50008289 50008344 -102528915 + MTD LTR MaLR 1 58 -361 2 966 1153 253 63 71 chr5 50008402 50008696 -102528563 + MTD LTR MaLR 57 347 -72 2 966 1153 253 63 71 chr5 50008723 50008794 -102528465 + MTD LTR MaLR 348 419 0 2 966 2276 169 14 21 chr5 50009052 50009335 -102527924 + RLTR28 LTR ERVL 98 374 -150 2 966 1776 138 48 66 chr5 50009335 50009668 -102527591 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 966 2276 169 14 21 chr5 50009668 50009814 -102527445 + RLTR28 LTR ERVL 375 524 0 2 966 238 284 97 10 chr5 50009929 50010032 -102527227 + MLT1A1 LTR MaLR 11 122 -286 2 966 287 286 0 61 chr5 50010122 50010204 -102527055 + MLT1A1 LTR MaLR 288 364 -44 2 966 329 321 189 25 chr5 50010609 50010852 -102526407 - MLT1J1-int LTR MaLR -636 751 469 3 966 243 330 49 147 chr5 50011003 50011248 -102526011 - MLT1J1-int LTR MaLR -1156 231 11 3 966 540 363 87 10 chr5 50011346 50011644 -102525615 - MLT1J1 LTR MaLR -116 328 8 3 966 328 260 8 112 chr5 50017535 50017669 -102519590 + MT2B LTR ERVL 145 264 -337 4 966 2349 211 43 27 chr5 50017978 50018069 -102519190 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 470 5 966 2349 211 43 27 chr5 50018118 50018580 -102518679 - RLTR20B1 LTR ERVK -94 469 3 5 966 1671 184 11 13 chr5 50018833 50019164 -102518095 - ORR1B2 LTR MaLR -14 353 1 5 966 1822 146 104 166 chr5 50019198 50019494 -102517765 + RLTR11A LTR ERVK 1 253 -275 5 966 1822 146 104 166 chr5 50019648 50019845 -102517414 + RLTR11A LTR ERVK 254 444 -84 5 966 1822 146 104 166 chr5 50019885 50019950 -102517309 + RLTR11A LTR ERVK 445 524 -4 5 966 660 329 93 20 chr5 50020572 50020873 -102516386 - MER21B LTR ERV1 -528 335 13 5 966 837 270 20 44 chr5 50026199 50026497 -102510762 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 1 6 966 484 342 52 21 chr5 50032149 50032362 -102504897 + ORR1E LTR MaLR 1 218 -160 6 966 288 355 90 71 chr5 50032436 50032589 -102504670 + ORR1E LTR MaLR 219 374 -4 6 966 1984 189 314 0 chr5 50034529 50035090 -102502169 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 7 966 313 314 86 25 chr5 50040001 50040133 -102497126 + MLT1B LTR MaLR 1 157 -233 8 966 936 274 69 53 chr5 50040133 50040658 -102496601 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 8 966 313 306 185 46 chr5 50040658 50040800 -102496459 + MLT1B LTR MaLR 158 334 -56 8 966 1269 222 62 111 chr5 50042845 50043234 -102494025 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 8 966 239 184 60 20 chr5 50043601 50043651 -102493608 + ORR1D1 LTR MaLR 107 158 -216 9 966 353 324 10 104 chr5 50047561 50047754 -102489505 + MER34A1 LTR ERV1 18 192 -395 9 966 335 294 88 0 chr5 50047899 50048035 -102489224 + MER34A1 LTR ERV1 420 567 -20 9 966 235 299 44 33 chr5 50054712 50054802 -102482457 + MER87 LTR ERV1 400 490 -51 1 966 576 275 66 81 chr5 50054953 50055289 -102481970 - ORR1E LTR MaLR -3 376 29 1 966 1628 295 61 30 chr5 50055292 50055852 -102481407 - ORR1E-int LTR MaLR -42 1538 962 1 966 2431 338 39 24 chr5 50056521 50057462 -102479797 - ORR1E-int LTR MaLR -625 955 1 1 966 753 310 80 77 chr5 50057464 50057814 -102479445 - ORR1E LTR MaLR 0 359 9 1 966 455 332 150 9 chr5 50065490 50065703 -102471556 - MLT1A0 LTR MaLR -21 344 102 1 966 235 370 33 16 chr5 50065893 50066014 -102471245 + LTR16A LTR ERVL 208 330 -121 1 967 558 317 102 19 chr5 50074210 50074474 -102462785 - MLT2B1 LTR ERVL -135 385 100 1 967 632 356 42 10 chr5 50075569 50075881 -102461378 + MLT1A0 LTR MaLR 32 353 -12 1 967 1817 159 30 3 chr5 50077044 50077347 -102459912 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 1 967 442 274 268 0 chr5 50077882 50078050 -102459209 - MTE2b LTR MaLR 0 379 167 1 967 570 257 54 7 chr5 50079597 50079746 -102457513 - MTD LTR MaLR 0 419 264 1 967 1121 210 103 70 chr5 50081002 50081299 -102455960 + ORR1D2 LTR MaLR 1 310 -60 1 967 1445 210 27 108 chr5 50081299 50081705 -102455554 + ORR1C1 LTR MaLR 5 377 -1 1 967 1121 210 103 70 chr5 50081705 50081765 -102455494 + ORR1D2 LTR MaLR 311 370 0 1 967 2989 21 0 0 chr5 50088366 50088703 -102448556 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 967 9560 20 3 0 chr5 50088703 50089837 -102447422 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5345 1 967 24847 22 34 9 chr5 50089826 50092908 -102444351 - IAPEz-int LTR ERVK -3316 3165 8 1 967 2989 21 0 0 chr5 50092908 50093245 -102444014 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 967 2423 70 41 3 chr5 50105180 50105495 -102431764 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 967 1101 226 37 20 chr5 50109860 50110104 -102427155 - MTD LTR MaLR 0 419 172 1 967 1668 186 3 11 chr5 50110111 50110394 -102426865 - MTC LTR MaLR -53 368 88 1 967 1843 251 67 33 chr5 50110383 50111385 -102425874 - ORR1D-int LTR MaLR -373 1136 91 1 967 514 232 155 30 chr5 50126083 50126283 -102410976 - MLT2C1 LTR ERVL -172 225 1 1 967 1061 269 79 69 chr5 50138813 50139220 -102398039 - RMER13A LTR ERVK -449 411 1 1 967 2541 31 81 6 chr5 50147429 50147751 -102389508 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 967 14255 49 6 1 chr5 50147751 50149533 -102387726 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 1 967 2709 40 3 75 chr5 50149533 50149906 -102387353 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 967 270 270 174 45 chr5 50151151 50151283 -102385976 - RMER15 LTR ERVL -2 573 425 1 967 843 295 45 37 chr5 50154015 50154370 -102382889 + MLT1B LTR MaLR 29 386 -4 1 967 762 313 105 54 chr5 50157389 50157760 -102379499 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 7 1 967 299 318 90 9 chr5 50157751 50157862 -102379397 - MLT1A0 LTR MaLR -229 136 17 1 967 349 346 153 35 chr5 50159084 50159592 -102377667 + MLT1E1A LTR MaLR 92 653 0 1 967 271 350 110 18 chr5 50160093 50160256 -102377003 - MLT1E1 LTR MaLR -361 293 116 1 967 252 257 41 74 chr5 50170243 50170365 -102366894 - MLT1A LTR MaLR 0 374 257 2 967 3061 42 0 0 chr5 50171637 50171991 -102365268 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 2 967 320 287 53 11 chr5 50172316 50172411 -102364848 - MLT1A LTR MaLR -261 113 15 2 967 789 253 123 15 chr5 50178397 50178658 -102358601 - MLT1B LTR MaLR -7 383 95 2 967 295 278 50 17 chr5 50181425 50181557 -102355702 + MLT1F-int LTR MaLR 1063 1209 -200 2 967 307 331 173 53 chr5 50181841 50182141 -102355118 + MLT1F LTR MaLR 186 521 -27 2 967 1265 251 143 3 chr5 50186057 50186385 -102350874 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 967 356 168 295 0 chr5 50192826 50192921 -102344338 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 906 2 967 2951 189 50 131 chr5 50192897 50193612 -102343647 - RLTR25B LTR ERVK -262 766 118 2 967 2951 189 50 131 chr5 50193639 50193723 -102343536 - RLTR25B LTR ERVK -911 117 32 2 967 2733 41 0 0 chr5 50194700 50195038 -102342221 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 2 968 783 306 36 29 chr5 50213271 50213547 -102323712 - RMER5 LTR ERV1 -216 318 41 2 968 3658 133 72 53 chr5 50213733 50214542 -102322717 + RLTR25B LTR ERVK 16 860 -243 2 968 3658 130 60 48 chr5 50214618 50214650 -102322609 + RLTR25B LTR ERVK 784 824 -204 2 968 676 223 8 8 chr5 50214625 50214756 -102322503 + RLTR25B LTR ERVK 973 1103 0 2 968 287 302 66 32 chr5 50215393 50215532 -102321727 - MLT1A0 LTR MaLR -217 157 5 2 968 448 314 31 25 chr5 50219222 50219382 -102317877 + MLT1A0 LTR MaLR 163 323 -42 2 968 616 253 55 42 chr5 50223156 50223486 -102313773 - RMER17C LTR ERVK 0 410 77 2 968 758 188 16 92 chr5 50223485 50223790 -102313469 - RMER17B LTR ERVK -520 438 16 2 968 1137 214 45 113 chr5 50223787 50224124 -102313135 - MTE2a LTR MaLR -63 316 3 2 968 3070 71 0 8 chr5 50224135 50224534 -102312725 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 968 249 291 49 98 chr5 50226473 50226595 -102310664 + MT2B LTR ERVL 156 271 -330 2 968 2063 117 12 58 chr5 50227553 50227898 -102309361 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 968 2148 113 0 63 chr5 50227898 50228246 -102309013 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 1 2 968 1617 111 8 11 chr5 50230910 50231175 -102306084 - BGLII LTR ERVK 0 421 158 3 968 464 169 0 0 chr5 50231387 50231470 -102305789 - RMER3D-int LTR ERVK -2271 571 489 3 968 612 207 35 40 chr5 50231603 50231804 -102305455 - RMER3D-int LTR ERVK -1991 851 652 3 968 925 157 13 13 chr5 50231980 50232135 -102305124 - BGLII LTR ERVK 0 421 267 3 968 1346 62 122 19 chr5 50233166 50233379 -102303880 - BGLII LTR ERVK -186 235 1 3 968 2708 213 68 42 chr5 50233380 50234274 -102302985 - RMER3D-int LTR ERVK -1 2841 1925 3 968 2269 181 97 57 chr5 50234293 50234950 -102302309 - RMER3D-int LTR ERVK -1163 1679 470 3 968 238 233 12 99 chr5 50235069 50235150 -102302109 + MT2B2 LTR ERVL 167 240 -344 3 968 646 296 161 45 chr5 50235866 50236308 -102300951 + MT2A LTR ERVL 1 601 0 3 968 320 173 0 0 chr5 50237874 50237926 -102299333 - ORR1D1 LTR MaLR -55 319 268 3 968 227 195 0 0 chr5 50238260 50238301 -102298958 - ORR1D1 LTR MaLR -282 92 52 3 968 706 220 142 3 chr5 50238282 50238476 -102298783 + ORR1D1 LTR MaLR 103 366 -8 3 968 444 350 20 25 chr5 50241026 50241228 -102296031 - MLT1A LTR MaLR -8 366 166 3 968 358 287 24 65 chr5 50244014 50244137 -102293122 + MLT1B LTR MaLR 40 157 -233 3 968 724 258 185 18 chr5 50244561 50244829 -102292430 + ORR1E LTR MaLR 9 336 -43 3 968 426 269 16 63 chr5 50246342 50246469 -102290790 - ORR1E LTR MaLR -164 195 75 3 968 433 352 57 31 chr5 50248576 50248878 -102288381 - MLT1J-int LTR MaLR -13 1374 1071 3 968 256 336 9 45 chr5 50249104 50249216 -102288043 - MLT1J-int LTR MaLR -589 798 691 3 968 1551 146 54 23 chr5 50249594 50249853 -102287406 + RLTR21 LTR ERVK 1 267 -1305 3 968 5791 143 40 18 chr5 50251347 50252382 -102284877 + RLTR21 LTR ERVK 250 1306 -266 3 968 363 346 51 20 chr5 50262319 50262514 -102274745 - MLT1D LTR MaLR -2 503 303 3 968 405 353 21 59 chr5 50263148 50263437 -102273822 - MLT1D LTR MaLR -227 278 1 3 968 2746 88 10 10 chr5 50264144 50264544 -102272715 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 968 1607 229 195 23 chr5 50266445 50266887 -102270372 + RLTR20D LTR ERVK 51 568 0 3 968 345 306 80 35 chr5 50268475 50268535 -102268724 - MLT1D LTR MaLR -270 235 177 3 968 2219 94 154 14 chr5 50268535 50268892 -102268367 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 968 345 306 80 35 chr5 50268892 50269031 -102268228 - MLT1D LTR MaLR -329 176 27 3 968 790 313 97 17 chr5 50273223 50273574 -102263685 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 968 227 235 135 58 chr5 50274034 50274138 -102263121 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 294 3 968 2330 179 95 20 chr5 50279956 50280452 -102256807 + RMER5 LTR ERV1 1 533 -1 3 968 1882 191 18 36 chr5 50280965 50281350 -102255909 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 968 246 381 25 25 chr5 50288903 50289024 -102248235 - MLT1J-int LTR MaLR -1262 125 5 3 968 3376 30 5 0 chr5 50290367 50290761 -102246498 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 968 438 334 144 22 chr5 50293906 50294351 -102242908 + MER34A1 LTR ERV1 12 510 -77 3 968 407 319 41 41 chr5 50294908 50295055 -102242204 - MLT1A LTR MaLR -227 147 1 3 968 416 274 8 25 chr5 50299107 50299227 -102238032 + MLT1A1 LTR MaLR 291 408 0 3 968 420 257 123 14 chr5 50303192 50303364 -102233895 + ORR1E LTR MaLR 5 186 -184 4 968 283 302 132 20 chr5 50303470 50303622 -102233637 + ORR1E LTR MaLR 211 379 0 4 968 974 257 30 63 chr5 50304248 50304551 -102232708 + RLTR18 LTR ERVK 15 307 -309 4 968 236 328 110 17 chr5 50304585 50304703 -102232556 + RLTR18B LTR ERVK 163 291 -221 4 968 529 308 10 46 chr5 50305470 50305664 -102231595 + RLTR18B LTR ERVK 307 493 -19 4 968 252 298 74 30 chr5 50310500 50310635 -102226624 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 268 4 968 380 270 62 20 chr5 50311508 50311617 -102225642 - MTE2b LTR MaLR 0 379 267 4 968 1293 246 72 51 chr5 50312221 50312611 -102224648 - MTD LTR MaLR -17 402 5 4 968 236 321 76 76 chr5 50314006 50314151 -102223108 - MLT1J LTR MaLR -34 478 334 4 968 242 335 211 26 chr5 50315027 50315217 -102222042 - LTR86A2 LTR ERVL -282 226 2 4 968 2256 170 33 47 chr5 50315327 50315752 -102221507 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 4 968 443 323 125 17 chr5 50316098 50316385 -102220874 - MLT1J-int LTR MaLR -31 1378 1061 4 968 535 293 138 79 chr5 50324539 50324880 -102212379 - MLT1B LTR MaLR -10 364 4 4 968 239 367 39 48 chr5 50326252 50326355 -102210904 - LTR78 LTR ERV1 -637 667 566 4 1 1961 219 46 0 chr5 50331577 50331970 -102205289 - MTD LTR MaLR -8 411 1 4 969 2013 104 46 0 chr5 50332504 50332811 -102204448 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 6 4 969 957 292 83 76 chr5 50339864 50340312 -102196947 - MT2A LTR ERVL -75 458 8 4 969 2191 142 69 3 chr5 50342703 50343063 -102194196 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 969 964 227 128 6 chr5 50343919 50344238 -102193021 - ERVL-B4-int LTR ERVL -87 5627 5270 4 969 358 285 144 10 chr5 50344234 50344441 -102192818 - ERVL-B4-int LTR ERVL -538 5129 4871 4 969 320 222 82 41 chr5 50344462 50344584 -102192675 - ERVL-B4-int LTR ERVL -832 4882 4756 4 969 625 301 117 17 chr5 50344584 50344935 -102192324 + MLT1A0-int LTR MaLR 1337 1722 -13 4 969 285 307 106 14 chr5 50344944 50345086 -102192173 + MLT1A0 LTR MaLR 12 166 -199 4 969 308 322 45 39 chr5 50345406 50345584 -102191675 + MLT1J1 LTR MaLR 26 204 -240 4 969 2767 116 110 2 chr5 50346657 50347131 -102190128 - ORR1A3-int LTR MaLR -1438 525 1 4 969 2099 123 28 0 chr5 50347131 50347448 -102189811 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 969 286 225 86 7 chr5 50349229 50349368 -102187891 + ORR1B1-int LTR MaLR 605 754 -755 4 969 359 274 102 57 chr5 50357768 50358140 -102179119 + RMER10A LTR ERVL 29 417 -25 4 969 264 271 144 0 chr5 50360408 50360526 -102176733 + ORR1C2 LTR MaLR 224 358 -26 4 969 535 256 130 19 chr5 50364148 50364355 -102172904 - ORR1E LTR MaLR -50 309 80 4 969 304 248 57 49 chr5 50383238 50383361 -102153898 + RLTR42-int LTR ERVK 4315 4438 -1084 5 969 264 273 82 54 chr5 50398615 50398762 -102138497 + MLT1A0 LTR MaLR 215 365 0 5 969 355 277 58 61 chr5 50411926 50412144 -102125115 + ORR1E LTR MaLR 1 204 -166 5 969 347 278 73 133 chr5 50413923 50414238 -102123021 + ORR1E LTR MaLR 6 301 -58 5 969 1367 268 28 8 chr5 50414269 50414627 -102122632 + ORR1D2 LTR MaLR 1 365 -5 5 969 498 272 76 130 chr5 50420825 50420881 -102116378 + MTE2a LTR MaLR 9 58 -321 5 969 1646 138 174 31 chr5 50420881 50421202 -102116057 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 969 498 272 76 130 chr5 50421202 50421513 -102115746 + MTE2a LTR MaLR 59 356 -23 5 969 910 274 55 47 chr5 50428428 50428792 -102108467 + MER31B LTR ERV1 4 370 -96 5 969 301 273 113 109 chr5 50434999 50435202 -102102057 + MLT2B2 LTR ERVL 251 511 -43 5 969 266 281 174 20 chr5 50435262 50435293 -102101966 + MLT2B2 LTR ERVL 512 544 -10 5 969 354 245 56 19 chr5 50435539 50435647 -102101612 - RMER15 LTR ERVL -60 515 404 5 969 401 158 120 57 chr5 50442744 50442919 -102094340 + RMER17C LTR ERVK 89 274 -136 5 969 252 317 72 97 chr5 50447312 50447777 -102089482 + MLT1D LTR MaLR 21 503 -2 5 969 1224 289 8 64 chr5 50457551 50457943 -102079316 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 969 1552 187 88 34 chr5 50460513 50460867 -102076392 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 5 970 414 259 142 34 chr5 50466222 50466398 -102070861 - MLT1A LTR MaLR -5 369 175 6 970 363 308 107 8 chr5 50466575 50466706 -102070553 - MLT1A LTR MaLR -246 144 1 6 970 4126 76 4 0 chr5 50471342 50471843 -102065416 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 6 970 517 294 37 58 chr5 50474831 50475023 -102062236 + MER31-int LTR ERV1 711 899 -4037 6 970 517 294 37 58 chr5 50475085 50475134 -102062125 + MER31-int LTR ERV1 900 947 -3989 6 970 434 264 153 28 chr5 50475160 50475304 -102061955 + ORR1D2 LTR MaLR 126 287 -83 6 970 1680 165 76 38 chr5 50476288 50476556 -102060703 + MTC LTR MaLR 1 317 -104 6 970 1963 129 122 30 chr5 50476556 50476892 -102060367 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 970 1680 145 78 41 chr5 50476892 50476907 -102060352 + MTC LTR MaLR 318 332 -89 6 970 2113 154 25 129 chr5 50476907 50477347 -102059912 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 970 1680 145 78 41 chr5 50477347 50477386 -102059873 + MTC LTR MaLR 333 366 -55 6 970 541 264 181 33 chr5 50477516 50477759 -102059500 - RMER20B LTR ERVK -223 404 126 6 970 270 271 0 0 chr5 50477909 50477968 -102059291 + MTC LTR MaLR 363 421 0 6 970 266 283 40 74 chr5 50477968 50478114 -102059145 - LTR79 LTR ERVL -218 309 169 6 970 283 301 46 12 chr5 50479455 50479485 -102057774 + MT2B LTR ERVL 134 195 -389 6 970 283 301 46 12 chr5 50479552 50479581 -102057678 + MT2B LTR ERVL 196 261 -323 6 970 903 312 61 23 chr5 50479748 50480092 -102057167 - MTE2b LTR MaLR -20 359 3 6 970 1063 291 112 3 chr5 50481859 50482190 -102055069 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 6 970 260 324 28 28 chr5 50482490 50482633 -102054626 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 538 6 970 365 322 90 17 chr5 50482846 50483023 -102054236 + MLT1A0 LTR MaLR 172 361 -4 6 970 526 341 135 45 chr5 50483227 50483605 -102053654 + MER70A LTR ERVL 53 464 -8 6 970 1466 121 27 0 chr5 50484185 50484409 -102052850 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 230 -97 6 970 272 322 109 38 chr5 50510346 50510530 -102026729 + MLT1K LTR MaLR 378 574 -21 3 970 369 322 59 37 chr5 50510831 50511018 -102026241 - MER76 LTR ERVL 0 691 501 4 970 2771 58 6 0 chr5 50511018 50511362 -102025897 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 970 334 333 162 40 chr5 50511377 50511649 -102025610 + ORR1E LTR MaLR 9 313 -46 6 970 314 327 18 9 chr5 50512634 50512745 -102024514 - MER76 LTR ERVL -201 490 379 4 970 435 319 87 22 chr5 50513435 50513618 -102023641 - MER76 LTR ERVL -376 315 121 4 970 346 192 72 60 chr5 50514335 50514418 -102022841 - MER76 LTR ERVL -583 108 25 4 970 1363 268 44 3 chr5 50515845 50516189 -102021070 + RLTR42-int LTR ERVK 456 813 -4709 1 970 950 169 17 0 chr5 50517406 50517578 -102019681 + RMER15 LTR ERVL 378 552 -23 1 970 570 314 48 35 chr5 50518002 50518233 -102019026 - MLT1F1 LTR MaLR -306 263 30 1 970 1021 285 37 45 chr5 50518320 50518673 -102018586 - MLT1A0 LTR MaLR -15 350 1 1 970 522 326 105 55 chr5 50519764 50520222 -102017037 + MLT1D LTR MaLR 25 505 0 2 970 350 221 39 0 chr5 50521549 50521626 -102015633 - MLT1F2 LTR MaLR -60 500 421 2 970 730 263 25 9 chr5 50521901 50522092 -102015167 - MTE2a LTR MaLR 0 379 174 2 970 715 290 43 5 chr5 50523278 50523486 -102013773 - MLT1C LTR MaLR 0 467 252 3 970 567 243 61 61 chr5 50523912 50524140 -102013119 - MLT1C LTR MaLR -207 260 33 3 970 272 311 12 112 chr5 50527132 50527302 -102009957 + MLT1B LTR MaLR 76 228 -162 3 970 326 276 73 172 chr5 50528671 50528744 -102008515 + MTD-int LTR MaLR 2 63 -1195 4 970 1176 268 136 125 chr5 50528779 50529505 -102007754 + MTD-int LTR MaLR 64 1044 -214 4 970 1176 286 94 51 chr5 50529677 50529895 -102007364 + MTD-int LTR MaLR 1045 1253 -5 4 970 1165 272 41 41 chr5 50529899 50530317 -102006942 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 4 970 417 302 87 59 chr5 50531688 50531941 -102005318 - MER21B LTR ERV1 -107 756 497 4 970 229 333 255 25 chr5 50534845 50535002 -102002257 - MER21B LTR ERV1 -619 244 52 4 970 728 196 57 6 chr5 50536238 50536397 -102000862 - RLTR42 LTR ERVK -22 217 51 5 970 549 193 61 0 chr5 50536397 50536511 -102000748 + MurERV4_19-int LTR ERVK 4667 4787 -735 5 970 636 116 165 0 chr5 50536518 50536639 -102000620 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5640 5780 0 5 970 3142 158 22 5 chr5 50536650 50537202 -102000057 + RLTR42-int LTR ERVK 4962 5522 0 5 970 1161 238 17 0 chr5 50537202 50537437 -101999822 + RLTR42 LTR ERVK 1 239 0 5 970 2430 185 39 14 chr5 50537525 50538039 -101999220 + RLTR24 LTR ERV1 3 529 0 5 970 551 222 64 25 chr5 50542537 50542694 -101994565 + RMER19A LTR ERVK 330 492 -245 6 970 1060 150 5 46 chr5 50543320 50543516 -101993743 - RMER19A LTR ERVK 0 737 550 6 970 332 370 55 8 chr5 50546811 50546939 -101990320 - MLT1H LTR MaLR -344 205 72 7 970 279 261 15 85 chr5 50552742 50552872 -101984387 + MT2B LTR ERVL 156 276 -325 8 970 813 291 204 42 chr5 50554146 50554601 -101982658 + MT2A LTR ERVL 3 531 -2 8 970 926 293 75 35 chr5 50567654 50567882 -101969377 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 126 1 970 1044 277 62 38 chr5 50567882 50568250 -101969009 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 1 970 926 293 75 35 chr5 50568250 50568367 -101968892 - MLT1A0 LTR MaLR -240 125 2 1 970 238 223 93 37 chr5 50570992 50571030 -101966229 + RLTR25B LTR ERVK 397 480 -548 1 970 238 223 93 37 chr5 50571088 50571099 -101966160 + RLTR25B LTR ERVK 481 509 -519 1 970 290 354 59 47 chr5 50571849 50572104 -101965155 + MER31B LTR ERV1 118 375 -91 1 970 807 285 102 74 chr5 50572999 50573420 -101963839 - MER89 LTR ERV1 -47 512 80 1 970 242 360 13 105 chr5 50575003 50575155 -101962104 + LTR88c LTR Genie? 633 770 -92 1 970 324 338 75 34 chr5 50575073 50575220 -101962039 + LTR88a LTR Gypsy 640 792 -24 1 970 1274 260 25 22 chr5 50576014 50576333 -101960926 - MTE2b LTR MaLR -59 320 1 1 970 511 337 16 26 chr5 50580841 50581030 -101956229 - MER57E1 LTR ERV1 -175 197 11 1 970 1825 242 115 13 chr5 50582943 50583411 -101953848 + RLTR24 LTR ERV1 14 529 0 1 970 680 234 6 47 chr5 50584477 50584647 -101952612 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 416 1 970 239 252 118 29 chr5 50584791 50584893 -101952366 + MER34A LTR ERV1 395 505 -66 1 970 480 301 116 67 chr5 50589358 50589686 -101947573 + MLT1A0 LTR MaLR 3 346 -19 1 970 289 335 144 12 chr5 50589703 50589863 -101947396 - MER34A1 LTR ERV1 -23 519 339 1 970 295 260 65 76 chr5 50589903 50590140 -101947119 - MER34A1 LTR ERV1 -315 227 4 1 970 513 200 47 12 chr5 50591796 50591912 -101945347 - RMER19B LTR ERVK -612 125 1 1 971 581 273 42 111 chr5 50594839 50595259 -101942000 + MTC LTR MaLR 6 404 -17 1 971 1312 215 171 93 chr5 50595949 50596359 -101940900 + MT2A LTR ERVL 1 442 -91 1 971 399 250 0 11 chr5 50596818 50596911 -101940348 + MTD LTR MaLR 153 244 -175 1 971 263 167 21 0 chr5 50596932 50596980 -101940279 - MERVL-int LTR ERVL -978 4507 4459 1 971 353 261 57 43 chr5 50596987 50597127 -101940132 + MTD LTR MaLR 263 404 -15 1 971 1312 215 171 93 chr5 50597824 50598234 -101939025 + MT2A LTR ERVL 1 442 -91 1 971 1220 116 42 11 chr5 50599579 50599770 -101937489 + RMER19B LTR ERVK 697 893 -9 1 971 250 300 0 12 chr5 50600390 50600471 -101936788 + MTEb LTR MaLR 11 90 -284 1 971 413 245 102 32 chr5 50601540 50601743 -101935516 + MTEb LTR MaLR 139 368 -11 1 971 528 315 77 39 chr5 50609841 50610151 -101927108 + MLT1C LTR MaLR 93 414 -53 1 971 643 260 206 30 chr5 50611057 50611319 -101925940 - MER57C2 LTR ERV1 0 434 127 1 971 696 339 91 21 chr5 50617091 50617420 -101919839 - MER57D LTR ERV1 0 411 60 2 971 404 356 77 45 chr5 50620448 50620610 -101916649 - ORR1E LTR MaLR -8 351 186 2 971 404 356 77 45 chr5 50620680 50620829 -101916430 - ORR1E LTR MaLR -174 185 31 2 971 1043 269 141 6 chr5 50636460 50636793 -101900466 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 2 971 249 236 41 14 chr5 50637496 50637569 -101899690 + LTR33 LTR ERVL 441 515 0 2 971 410 335 115 59 chr5 50638030 50638106 -101899153 + MLT1B LTR MaLR 110 181 -286 2 971 414 335 115 59 chr5 50638252 50638514 -101898745 + MLT1B LTR MaLR 182 467 0 2 971 592 327 233 16 chr5 50638744 50639057 -101898202 - MLT1B LTR MaLR 0 390 10 2 971 1133 253 67 35 chr5 50650050 50650394 -101886865 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 13 2 971 2530 113 96 31 chr5 50659377 50659823 -101877436 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 971 339 109 0 0 chr5 50659825 50659880 -101877379 + IAPEz-int LTR ERVK 3 57 -1930 2 971 3411 78 8 25 chr5 50659878 50660697 -101876562 + IAPEz-int LTR ERVK 10 662 -5819 2 971 2316 76 39 3 chr5 50660697 50661027 -101876232 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 2 971 6581 36 4 11 chr5 50661022 50661855 -101875404 + IAPEz-int LTR ERVK 5653 6479 -2 2 971 582 271 55 53 chr5 50667835 50668141 -101869118 + RMER13B LTR ERVK 350 889 -19 2 971 2627 53 22 0 chr5 50676400 50676720 -101860539 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 2 971 857 296 103 28 chr5 50683251 50683717 -101853542 + MLT1D LTR MaLR 5 505 0 2 971 440 329 129 81 chr5 50686412 50686769 -101850490 - MLT1E2 LTR MaLR -245 382 9 2 971 1095 271 65 46 chr5 50687070 50687441 -101849818 + MER89 LTR ERV1 179 556 -3 2 971 344 288 184 101 chr5 50692231 50692579 -101844680 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 3 971 1553 155 45 102 chr5 50696073 50696425 -101840834 - ORR1B1 LTR MaLR -22 372 41 3 971 234 296 25 0 chr5 50700003 50700084 -101837175 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1383 1465 -383 3 971 238 251 94 90 chr5 50700595 50700818 -101836441 - RLTR21 LTR ERVK -267 1305 1082 3 971 3306 43 5 0 chr5 50702503 50702897 -101834362 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 971 2792 192 18 92 chr5 50711464 50712306 -101824953 + RMER6C LTR ERVK 20 713 -7 3 971 1846 168 6 55 chr5 50714348 50714694 -101822565 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 971 1179 189 4 17 chr5 50714694 50714925 -101822334 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1736 3 971 1993 167 21 29 chr5 50714926 50715308 -101821951 - ORR1A4-int LTR MaLR -1584 379 1 3 971 1940 159 9 58 chr5 50715308 50715654 -101821605 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 971 1289 269 24 55 chr5 50718251 50718331 -101818928 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 299 3 971 1289 269 24 55 chr5 50718755 50719055 -101818204 - ORR1D2 LTR MaLR -72 298 4 3 971 817 232 38 76 chr5 50719532 50719742 -101817517 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 169 3 972 783 327 67 35 chr5 50748403 50748717 -101788542 + MT2A LTR ERVL 100 423 -110 3 972 284 391 9 0 chr5 50748721 50748836 -101788423 + MT2A LTR ERVL 345 460 -73 3 972 753 326 94 12 chr5 50760696 50761025 -101776234 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 3 972 532 297 64 42 chr5 50765339 50765692 -101771567 + MLT2B4 LTR ERVL 9 353 -61 4 972 663 253 141 18 chr5 50773370 50773628 -101763631 - ORR1E LTR MaLR -14 356 53 4 972 671 263 9 26 chr5 50775669 50775873 -101761386 - MLT1C LTR MaLR -6 499 259 4 972 246 178 0 0 chr5 50776363 50776408 -101760851 + MTEa LTR MaLR 1 45 -334 4 972 1895 177 46 24 chr5 50777516 50777928 -101759331 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 972 841 339 30 24 chr5 50781193 50781531 -101755728 + MLT1A0 LTR MaLR 18 357 -8 4 972 1918 180 40 11 chr5 50795960 50796331 -101740928 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 4 972 1113 251 81 31 chr5 50801719 50802076 -101735183 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 4 972 359 288 275 9 chr5 50802952 50803178 -101734081 - MLT2B4 LTR ERVL -269 287 3 4 972 820 275 95 128 chr5 50804923 50805323 -101731936 - MTD LTR MaLR -30 389 3 4 972 620 358 51 77 chr5 50809774 50810228 -101727031 - MLT1F2 LTR MaLR -3 557 116 4 972 2626 77 56 8 chr5 50820026 50820404 -101716855 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 972 6894 93 25 70 chr5 50820406 50821546 -101715713 + MTA_Mm-int LTR MaLR 3 1091 -7 4 972 2981 49 18 15 chr5 50821555 50821950 -101715309 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 972 873 293 109 27 chr5 50824151 50824481 -101712778 + ORR1D2 LTR MaLR 1 357 -13 5 972 569 404 54 9 chr5 50825586 50825901 -101711358 + LTR16A LTR ERVL 122 450 -1 5 972 233 396 42 35 chr5 50826246 50826390 -101710869 + MLT1J-int LTR MaLR 801 945 -442 5 972 520 277 244 14 chr5 50829957 50830166 -101707093 - MER57C2 LTR ERV1 -50 384 128 5 972 1279 225 93 17 chr5 50832001 50832290 -101704969 + MTD LTR MaLR 1 311 -108 5 972 1173 241 53 55 chr5 50832290 50832784 -101704475 - RMER19B LTR ERVK 0 902 182 5 972 971 294 48 27 chr5 50836093 50836425 -101700834 + ORR1E LTR MaLR 4 342 -17 5 972 1720 174 82 9 chr5 50836845 50837187 -101700072 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 972 1246 220 65 0 chr5 50837188 50837465 -101699794 + ORR1B2-int LTR MaLR 2 296 -1213 5 972 2864 58 46 2 chr5 50839283 50839677 -101697582 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 5 972 1426 223 65 23 chr5 50840022 50840375 -101696884 + ORR1B2 LTR MaLR 1 368 -16 5 972 231 359 121 27 chr5 50840379 50840528 -101696731 - MLT1J LTR MaLR -196 316 154 5 972 1970 157 6 19 chr5 50840631 50840956 -101696303 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 5 972 325 321 53 60 chr5 50846735 50846981 -101690278 + MLT1B LTR MaLR 16 262 -205 5 972 1973 172 70 0 chr5 50854477 50854820 -101682439 + ORR1B1 LTR MaLR 12 378 -16 5 973 523 324 52 69 chr5 50856134 50856430 -101680829 + ORR1E LTR MaLR 65 355 -4 5 973 1813 185 53 19 chr5 50858149 50858508 -101678751 + ORR1B1 LTR MaLR 24 394 0 5 973 282 306 62 18 chr5 50858891 50859004 -101678255 + MLT1A1 LTR MaLR 89 206 -202 5 973 246 253 146 22 chr5 50859035 50859124 -101678135 + MLT1A1 LTR MaLR 304 403 -5 5 973 252 371 63 81 chr5 50863137 50863360 -101673899 - MLT1F2 LTR MaLR -23 537 319 5 973 281 286 21 21 chr5 50863461 50863554 -101673705 - MLT1F2 LTR MaLR -467 93 1 5 973 231 310 14 27 chr5 50865580 50865653 -101671606 - ORR1E LTR MaLR -54 325 254 5 973 363 303 50 110 chr5 50865669 50865777 -101671482 - ORR1E LTR MaLR -171 188 91 5 973 363 303 50 110 chr5 50865980 50866071 -101671188 - ORR1E LTR MaLR -269 90 1 5 973 443 288 44 25 chr5 50866284 50866444 -101670815 - MLT1C LTR MaLR 0 467 305 5 973 283 299 16 93 chr5 50866445 50866574 -101670685 + MLT1A1 LTR MaLR 29 147 -261 5 973 330 309 34 16 chr5 50867152 50867291 -101669968 + MLT1A1 LTR MaLR 174 353 -55 5 973 639 314 53 16 chr5 50872198 50872489 -101664770 + MLT1A0 LTR MaLR 13 362 -3 5 973 464 320 38 46 chr5 50873774 50874013 -101663246 + RMER15 LTR ERVL 336 572 -3 5 973 1231 295 52 11 chr5 50877310 50877657 -101659602 - MTE2b LTR MaLR -43 336 1 5 973 1233 271 55 62 chr5 50889621 50890023 -101647236 - MTD LTR MaLR -15 404 6 5 973 528 308 65 47 chr5 50891139 50891418 -101645841 - MLT2C1 LTR ERVL -113 284 1 5 973 530 345 25 91 chr5 50892816 50893224 -101644035 + MLT1B LTR MaLR 1 381 -9 6 973 297 390 34 20 chr5 50900840 50901044 -101636215 + MLT1L LTR MaLR 395 601 -9 6 973 359 307 164 38 chr5 50902831 50903044 -101634215 + RMER15 LTR ERVL 336 575 0 6 973 369 233 0 0 chr5 50905015 50905088 -101632171 + ORR1B1 LTR MaLR 1 73 -321 6 973 3756 192 18 49 chr5 50905093 50905925 -101631334 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 806 -1157 6 973 1236 188 66 66 chr5 50905722 50905995 -101631264 + MT2B LTR ERVL 18 290 -311 6 973 813 235 13 4 chr5 50905952 50906187 -101631072 + ORR1B1-int LTR MaLR 719 955 -1008 6 973 654 139 28 0 chr5 50906186 50906294 -101630965 + ORR1B1-int LTR MaLR 1166 1276 -687 6 973 273 314 0 25 chr5 50906342 50906499 -101630760 + RMER17A LTR ERVK 310 462 -289 6 973 398 303 59 22 chr5 50912875 50913010 -101624249 - MLT1C LTR MaLR -9 458 319 6 973 2825 188 190 70 chr5 50915123 50915907 -101621352 - RMER19B LTR ERVK -24 878 1 6 973 494 215 56 88 chr5 50931577 50931789 -101605470 + ORR1D2 LTR MaLR 139 370 0 6 973 837 295 50 75 chr5 50941048 50941407 -101595852 - ORR1E LTR MaLR -4 355 6 6 973 525 335 35 22 chr5 50958704 50958936 -101578323 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 255 6 973 902 347 72 35 chr5 50966165 50967055 -101570204 - HERVL40-int LTR ERVL -1205 4325 3403 6 973 580 323 92 19 chr5 50967416 50967785 -101569474 - HERVL40-int LTR ERVL -2604 2926 2531 6 973 789 335 40 57 chr5 50967802 50968308 -101568951 - HERVL40-int LTR ERVL -3928 1602 1106 6 973 715 311 77 100 chr5 50968353 50968732 -101568527 - MTE2a LTR MaLR 0 379 10 6 973 408 306 56 0 chr5 50969321 50969465 -101567794 - HERVL40-int LTR ERVL -4784 746 595 6 973 2346 124 92 29 chr5 50971848 50972295 -101564964 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 973 5991 46 7 12 chr5 50972295 50973045 -101564214 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 7 973 2283 54 0 0 chr5 50973044 50973322 -101563937 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 7 973 4017 69 26 26 chr5 50973322 50973891 -101563368 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 94 7 973 231 321 0 0 chr5 50973894 50973950 -101563309 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 220 7 973 411 110 0 221 chr5 50973950 50974090 -101563169 - IAPEz-int LTR ERVK -6369 112 4 7 973 2361 122 92 29 chr5 50974109 50974556 -101562703 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 973 2190 37 4 4 chr5 50981918 50982191 -101555068 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 124 7 973 3153 60 0 0 chr5 50982185 50982600 -101554659 - MT-int LTR MaLR -681 417 3 7 973 1043 32 0 0 chr5 50982604 50982730 -101554529 - MTA_Mm LTR MaLR -270 126 1 7 973 467 371 65 13 chr5 50983359 50983665 -101553594 - MLT1F LTR MaLR -194 354 33 7 973 1348 268 21 42 chr5 50984695 50985073 -101552186 + MTD LTR MaLR 1 370 -49 7 973 314 266 50 79 chr5 50985985 50986124 -101551135 - MLT1H1 LTR MaLR 0 555 421 7 973 255 301 55 0 chr5 50986290 50986363 -101550896 - MLT1H1 LTR MaLR -411 149 73 7 973 232 247 106 96 chr5 50986650 50986744 -101550515 - MT2C_Mm LTR ERVL -277 198 104 7 974 2542 117 31 3 chr5 50990618 50991005 -101546254 + MTB LTR MaLR 3 400 0 7 974 5850 120 41 91 chr5 50991005 50992161 -101545098 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 7 974 1149 115 17 0 chr5 50992161 50992335 -101544924 + MTB LTR MaLR 1 177 -223 7 974 288 299 29 61 chr5 51003849 51004037 -101533222 - MTEb LTR MaLR -10 369 191 6 974 246 243 52 91 chr5 51017087 51017164 -101520095 + MER67B LTR ERV1 51 124 -537 1 974 572 274 141 53 chr5 51020244 51020584 -101516675 - MTE2b LTR MaLR 0 379 10 2 974 252 329 44 66 chr5 51027933 51028115 -101509144 - MTEa LTR MaLR -1 378 201 3 974 639 326 121 68 chr5 51033895 51034310 -101502949 - MLT2B4 LTR ERVL -108 448 10 3 974 233 320 13 0 chr5 51036026 51036104 -101501155 - MTEa LTR MaLR -13 366 288 4 974 231 284 49 12 chr5 51037838 51037920 -101499339 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 316 4 974 1479 188 40 16 chr5 51043694 51043997 -101493262 + MTC LTR MaLR 110 419 -2 5 974 525 221 25 26 chr5 51044235 51044410 -101492849 + ORR1C2 LTR MaLR 1 166 -218 5 974 3281 165 29 0 chr5 51044516 51045068 -101492191 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 1 6 974 547 191 0 0 chr5 51045145 51045250 -101492009 + ORR1C2 LTR MaLR 278 382 -2 5 974 3027 204 79 101 chr5 51057401 51058250 -101479009 + RMER21B LTR ERV1 13 842 0 8 974 228 196 71 0 chr5 51059677 51059733 -101477526 - MLT2C2 LTR ERVL -1 566 507 9 974 373 313 130 34 chr5 51059966 51060278 -101476981 - MLT2C2 LTR ERVL -53 344 5 9 974 670 313 138 112 chr5 51061853 51062202 -101475057 - MLT1A LTR MaLR -50 358 1 9 974 1779 172 26 23 chr5 51063670 51064021 -101473238 + ORR1B2 LTR MaLR 1 352 -15 9 974 1664 199 123 11 chr5 51068357 51068723 -101468536 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 1 974 282 281 0 0 chr5 51070839 51070896 -101466363 - MT2A LTR ERVL -82 451 395 1 974 820 164 0 67 chr5 51070875 51071025 -101466234 + ORR1A4 LTR MaLR 105 244 -85 1 974 1122 222 128 19 chr5 51074843 51075203 -101462056 - MT2A LTR ERVL -134 399 1 1 974 799 315 28 51 chr5 51075332 51075686 -101461573 + ORR1E LTR MaLR 3 348 -11 1 974 737 328 29 14 chr5 51077459 51077737 -101459522 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 119 1 974 381 260 114 0 chr5 51078570 51078693 -101458566 - MTD LTR MaLR -14 405 269 1 974 533 284 110 95 chr5 51081793 51082167 -101455092 + MLT1B LTR MaLR 3 467 0 1 974 1359 235 82 3 chr5 51083806 51084109 -101453150 + MTD LTR MaLR 79 405 -14 1 974 892 319 76 42 chr5 51084818 51085136 -101452123 + ORR1D2 LTR MaLR 1 341 -29 1 974 3034 42 0 0 chr5 51085136 51085490 -101451769 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 1 974 892 319 76 42 chr5 51086134 51086169 -101451090 + ORR1D2 LTR MaLR 342 369 -1 1 974 274 138 36 216 chr5 51094452 51094674 -101442585 - RMER17C LTR ERVK -134 276 95 1 974 554 329 98 13 chr5 51101168 51101393 -101435866 + MTEa LTR MaLR 123 366 -13 1 974 475 340 74 18 chr5 51101391 51101695 -101435564 + MLT2D LTR ERVL 24 343 -121 1 974 253 320 73 16 chr5 51101903 51102027 -101435232 + ORR1D2 LTR MaLR 5 135 -235 1 974 2142 151 90 19 chr5 51102131 51102544 -101434715 + RLTR20B2 LTR ERVK 16 457 -103 1 974 676 213 297 64 chr5 51114178 51114348 -101422911 + ORR1D1 LTR MaLR 1 166 -208 1 974 676 213 297 64 chr5 51114415 51114540 -101422719 + ORR1D1 LTR MaLR 167 364 -10 1 974 236 341 0 64 chr5 51114546 51114640 -101422619 - MLT1E1A LTR MaLR -215 465 378 1 974 313 350 94 33 chr5 51116087 51116332 -101420927 + LTR16C LTR ERVL 230 489 0 1 975 237 258 0 46 chr5 51120931 51120996 -101416263 - MTE2b LTR MaLR -40 339 278 1 975 2291 125 9 3 chr5 51121728 51122072 -101415187 + RLTR15 LTR ERVK 14 359 0 1 975 260 296 82 0 chr5 51135833 51135931 -101401328 + ORR1E LTR MaLR 19 124 -235 2 975 247 345 53 78 chr5 51137936 51138219 -101399040 + RMER17D2 LTR ERVK 155 430 -379 2 975 367 318 30 22 chr5 51146252 51146387 -101390872 + MLT2B3 LTR ERVL 194 329 -388 2 975 476 346 6 12 chr5 51146504 51146665 -101390594 + MLT2B3 LTR ERVL 340 499 -171 2 975 369 279 21 6 chr5 51147539 51147677 -101389582 + MLT1A0 LTR MaLR 265 407 -1 2 975 1587 21 0 0 chr5 51147742 51147929 -101389330 + ORR1A0 LTR MaLR 160 346 0 2 975 338 277 45 23 chr5 51149953 51150072 -101387187 + MTE2b LTR MaLR 247 368 -2 2 975 670 350 38 72 chr5 51150075 51150395 -101386864 - LTR16C LTR ERVL -39 450 142 2 975 1153 292 107 27 chr5 51152365 51152850 -101384409 + MT2A LTR ERVL 10 533 0 2 975 1037 249 85 47 chr5 51153449 51153812 -101383447 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 2 975 307 250 14 0 chr5 51159236 51159308 -101377951 + MLT1A0 LTR MaLR 291 363 -2 2 975 564 275 143 27 chr5 51167277 51167655 -101369604 + MT2A LTR ERVL 13 455 -78 2 975 760 311 121 22 chr5 51184159 51184514 -101352745 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 19 2 975 316 354 0 0 chr5 51189233 51189329 -101347930 - MLT1B LTR MaLR -244 146 51 2 975 452 242 37 45 chr5 51191221 51191355 -101345904 + MLT1A1 LTR MaLR 3 135 -273 2 975 3259 18 39 0 chr5 51202770 51203151 -101334108 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 975 9075 34 3 2 chr5 51203153 51204248 -101333011 - MTA_Mm-int LTR MaLR -2 1096 1 3 975 3259 18 39 0 chr5 51204248 51204629 -101332630 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 975 736 286 88 58 chr5 51206866 51207208 -101330051 - RMER13A LTR ERVK -495 365 14 3 975 2314 181 14 7 chr5 51211084 51211502 -101325757 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 975 2506 182 31 68 chr5 51216296 51216903 -101320356 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 3 975 1385 205 17 23 chr5 51218597 51218689 -101318570 + RLTR10E LTR ERVK 1 94 -217 3 975 1385 205 17 23 chr5 51219155 51219362 -101317897 + RLTR10E LTR ERVK 95 298 -13 3 975 1378 184 109 71 chr5 51221093 51221461 -101315798 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 3 975 887 290 133 22 chr5 51225961 51226321 -101310938 - MTD LTR MaLR -2 417 18 3 975 2778 47 6 0 chr5 51232138 51232482 -101304777 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 975 13601 64 6 1 chr5 51232482 51234265 -101302994 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 3 975 2746 44 24 0 chr5 51234265 51234603 -101302656 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 975 747 335 40 76 chr5 51235015 51235491 -101301768 - MT2B LTR ERVL -40 561 2 3 976 1161 249 108 34 chr5 51249831 51250184 -101287075 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 3 976 1556 233 28 70 chr5 51255391 51255770 -101281489 - RMER15 LTR ERVL 0 575 213 3 976 255 146 0 0 chr5 51255964 51256005 -101281254 - RMER15 LTR ERVL -355 220 180 3 976 809 215 57 48 chr5 51256040 51256250 -101281009 - RMER15 LTR ERVL -360 215 4 3 976 1996 152 224 25 chr5 51265951 51266425 -101270834 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 3 976 488 352 106 84 chr5 51271812 51272314 -101264945 - MLT1F2 LTR MaLR -34 526 14 4 976 2828 71 42 5 chr5 51274956 51275338 -101261921 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 976 1787 219 113 11 chr5 51280529 51280895 -101256364 + RLTR16 LTR ERVK 1 401 -104 4 976 1787 219 113 11 chr5 51280982 51281073 -101256186 + RLTR16 LTR ERVK 402 503 -2 4 976 1274 301 48 15 chr5 51282808 51283170 -101254089 - MTE2b LTR MaLR -2 419 3 4 976 289 345 92 76 chr5 51287956 51287991 -101249268 + MLT1E1 LTR MaLR 392 430 -224 4 976 289 345 92 76 chr5 51288294 51288509 -101248750 + MLT1E1 LTR MaLR 431 646 -8 4 976 255 389 24 12 chr5 51296253 51296417 -101240842 - MLT1A LTR MaLR -16 358 193 4 976 712 323 86 50 chr5 51297417 51297801 -101239458 - MLT1C LTR MaLR -3 464 67 4 976 2797 42 31 6 chr5 51303261 51303617 -101233642 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 4 976 264 367 0 25 chr5 51332712 51332793 -101204466 + MTEa LTR MaLR 19 97 -282 4 976 260 295 168 9 chr5 51332890 51333003 -101204256 + MT2A LTR ERVL 332 462 -71 4 976 364 248 48 19 chr5 51333782 51333885 -101203374 + LTR33 LTR ERVL 410 515 0 5 976 694 172 38 193 chr5 51334286 51334365 -101202894 - ORR1A2 LTR MaLR 0 384 327 5 976 1247 146 14 33 chr5 51334481 51334703 -101202556 - ORR1A2 LTR MaLR -58 326 68 5 976 572 170 0 54 chr5 51340423 51340535 -101196724 - ORR1A2 LTR MaLR -221 106 1 5 976 474 314 139 8 chr5 51343625 51343891 -101193368 - MLT1C LTR MaLR -141 326 26 5 976 2888 47 0 29 chr5 51344800 51345176 -101192083 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 5 976 424 328 8 0 chr5 51346598 51346732 -101190527 - RLTR40 LTR ERVK -10 807 673 5 976 574 221 65 79 chr5 51346768 51346984 -101190275 - RLTR40 LTR ERVK -307 510 298 5 976 825 272 118 29 chr5 51356974 51357130 -101180129 + MTEa LTR MaLR 1 183 -196 5 976 825 272 118 29 chr5 51357210 51357400 -101179859 + MTEa LTR MaLR 184 378 -1 5 976 1704 141 138 51 chr5 51361056 51361494 -101175765 - RMER16 LTR ERVK -138 395 1 5 976 423 368 64 83 chr5 51364508 51364881 -101172378 + MLT1G3 LTR MaLR 10 375 -204 5 976 3243 39 84 29 chr5 51366741 51367191 -101170068 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 976 2281 70 121 11 chr5 51367207 51367555 -101169704 + RLTR10 LTR ERVK 5 390 0 5 976 1745 184 40 29 chr5 51369427 51369801 -101167458 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 5 977 989 325 16 57 chr5 51381353 51381741 -101155518 - MTE2b LTR MaLR -5 374 3 5 977 2792 55 0 3 chr5 51382777 51383123 -101154136 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 5 977 2061 98 3 71 chr5 51392104 51392455 -101144804 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -10 327 1 5 977 55869 8 3 2 chr5 51392455 51398929 -101138330 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 1 5 977 2063 95 3 71 chr5 51398930 51399280 -101137979 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 5 977 240 337 12 0 chr5 51404022 51404105 -101133154 - MLT1B LTR MaLR -332 180 97 5 977 319 131 15 62 chr5 51411714 51411779 -101125480 + MURVY-LTR LTR ERV1 102 163 -356 5 977 336 304 34 34 chr5 51412074 51412182 -101125077 - MLT1B LTR MaLR -282 108 1 5 977 743 298 68 15 chr5 51425123 51425431 -101111828 - ORR1E LTR MaLR -6 373 3 6 977 1675 146 51 78 chr5 51429167 51429502 -101107757 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 6 977 2259 105 10 106 chr5 51448498 51448902 -101088357 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 6 977 683 300 61 46 chr5 51457836 51458116 -101079143 + ORR1E LTR MaLR 74 357 -2 6 977 311 379 34 34 chr5 51460881 51461056 -101076203 - LTR85c LTR Gypsy? -648 175 1 6 977 2161 133 12 0 chr5 51465957 51466280 -101070979 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 977 397 354 48 57 chr5 51468638 51468846 -101068413 + MLT1D LTR MaLR 6 211 -294 6 977 323 342 0 8 chr5 51490314 51490435 -101046824 - MLT1E1 LTR MaLR -391 263 144 7 977 1029 318 65 3 chr5 51491555 51491707 -101045552 + MTD LTR MaLR 49 206 -213 7 977 1029 318 65 3 chr5 51491742 51491927 -101045332 + MTD LTR MaLR 207 406 -13 7 977 394 332 129 27 chr5 51492914 51493208 -101044051 - MLT1A0 LTR MaLR -41 324 1 7 977 617 356 29 89 chr5 51493881 51494263 -101042996 - MLT2D LTR ERVL -55 359 1 7 977 2028 176 49 16 chr5 51494336 51494829 -101042430 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 1 7 977 444 327 43 62 chr5 51495487 51495858 -101041401 - MTEa LTR MaLR 0 379 9 7 977 274 246 0 0 chr5 51497882 51497943 -101039316 - MLT1G3 LTR MaLR -16 579 519 7 978 402 304 46 104 chr5 51520806 51521174 -101016085 - MTEb LTR MaLR -8 371 1 3 978 454 352 72 8 chr5 51534614 51534849 -101002410 - MLT1C LTR MaLR -16 451 202 5 978 593 326 111 38 chr5 51554462 51554778 -100982481 + MLT1A LTR MaLR 36 374 0 8 978 1010 335 72 12 chr5 51554995 51555397 -100981862 + MLT1C LTR MaLR 42 467 0 8 978 332 293 108 45 chr5 51556058 51556215 -100981044 - MLT1A0 LTR MaLR -198 167 1 9 978 239 258 32 0 chr5 51559036 51559098 -100978161 - MLT1A1 LTR MaLR -56 352 289 1 978 976 326 46 15 chr5 51560144 51560471 -100976788 - MTE2b LTR MaLR -42 337 1 1 978 437 352 22 118 chr5 51560584 51560960 -100976299 - MLT1G1 LTR MaLR -180 399 1 1 978 235 286 80 45 chr5 51564293 51564381 -100972878 - MLT1G1 LTR MaLR -60 488 398 1 978 479 339 57 31 chr5 51564562 51564790 -100972469 - MLT1G1 LTR MaLR -343 236 3 1 978 2670 312 122 52 chr5 51565654 51566593 -100970666 - MTE-int LTR MaLR -42 1538 554 1 978 2670 312 122 52 chr5 51566613 51567109 -100970150 - MTE-int LTR MaLR -1027 553 3 1 978 258 358 0 31 chr5 51567146 51567244 -100970015 - MTE2a LTR MaLR -38 341 247 1 978 578 278 61 73 chr5 51567249 51567591 -100969668 + RLTR15 LTR ERVK 1 338 -21 1 978 845 271 53 5 chr5 51572476 51572684 -100964575 + MTC LTR MaLR 196 413 -8 1 978 5143 192 65 46 chr5 51572688 51573919 -100963340 + MTC-int LTR MaLR 1 1254 -4 1 978 1439 215 141 5 chr5 51573923 51574292 -100962967 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 1 978 250 280 59 74 chr5 51582050 51582185 -100955074 + LTR82A LTR ERVL 23 155 -717 1 978 324 276 23 0 chr5 51588462 51588549 -100948710 + MLT1N2 LTR MaLR 462 550 -12 1 978 1687 267 18 42 chr5 51591242 51591683 -100945576 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 97 1 978 1566 189 114 6 chr5 51591683 51592024 -100945235 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 978 1687 267 18 42 chr5 51592024 51592082 -100945177 - RMER5 LTR ERV1 -438 96 39 1 978 335 246 73 37 chr5 51596133 51596396 -100940863 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 1 978 389 292 0 9 chr5 51597353 51597467 -100939792 + MLT1A1 LTR MaLR 296 408 0 1 978 1109 289 53 6 chr5 51598385 51598743 -100938516 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 1 978 813 230 25 25 chr5 51600272 51600582 -100936677 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 978 905 295 29 35 chr5 51604315 51604628 -100932631 + MTE2a-int LTR MaLR 61 371 -1209 1 978 296 383 0 30 chr5 51604611 51604743 -100932516 + MTE2a-int LTR MaLR 484 611 -969 1 978 260 211 19 0 chr5 51604765 51604817 -100932442 + MTE2a-int LTR MaLR 768 820 -760 1 978 1121 302 44 31 chr5 51604826 51605217 -100932042 + MTE2a-int LTR MaLR 790 1417 -163 1 978 303 298 48 32 chr5 51605470 51605595 -100931664 + MTE2a-int LTR MaLR 1453 1579 -1 1 978 1255 257 53 69 chr5 51605609 51605869 -100931390 + MTE2a LTR MaLR 10 267 -112 1 978 1440 186 282 11 chr5 51605869 51606217 -100931042 + RLTR41 LTR ERV1 5 446 0 1 978 1255 257 53 69 chr5 51606217 51606332 -100930927 + MTE2a LTR MaLR 268 379 0 1 978 2789 99 14 2 chr5 51614414 51614827 -100922432 - BGLII LTR ERVK -3 418 1 1 978 623 289 21 7 chr5 51615015 51615158 -100922101 + MER21B LTR ERV1 184 328 -535 1 978 319 289 96 32 chr5 51615229 51615354 -100921905 + MER21B LTR ERV1 436 568 -295 1 978 441 231 56 32 chr5 51615439 51615564 -100921695 + MER21B LTR ERV1 702 829 -34 1 978 379 284 191 50 chr5 51615595 51615877 -100921382 + MLT1C LTR MaLR 136 457 -10 1 978 1853 235 71 57 chr5 51621147 51621652 -100915607 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 1 2 978 467 289 202 33 chr5 51622823 51623095 -100914164 + MLT1A0 LTR MaLR 48 365 0 2 978 2861 33 2 171 chr5 51629170 51629639 -100907620 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 978 10273 102 55 48 chr5 51629639 51631571 -100905688 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 41 2 978 2861 33 2 171 chr5 51631581 51632050 -100905209 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 978 1077 218 138 15 chr5 51636277 51636603 -100900656 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 4 2 122 316 341 41 62 chr5 51642166 51642531 -100894728 - MTEb LTR MaLR -7 372 8 2 979 332 346 55 67 chr5 51645319 51645629 -100891630 + MTEa LTR MaLR 1 320 -59 2 979 884 337 49 38 chr5 51647033 51647601 -100889658 - MLT1-int LTR MaLR -707 664 66 2 979 526 382 58 48 chr5 51648144 51648318 -100888941 - MLT2B4 LTR ERVL -138 382 199 2 979 550 355 14 8 chr5 51648368 51648570 -100888689 - MLT2B4 LTR ERVL -322 198 2 2 979 311 286 102 0 chr5 51663804 51663902 -100873357 - MTEb LTR MaLR -148 231 124 2 979 502 312 111 42 chr5 51663906 51664240 -100873019 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 2 979 2239 238 57 81 chr5 51667413 51668281 -100868978 + RMER17B LTR ERVK 5 851 -107 2 979 495 371 102 70 chr5 51678914 51679384 -100857875 - MLT1F2 LTR MaLR -62 498 14 2 979 277 184 103 26 chr5 51679514 51679592 -100857667 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 312 2 979 237 287 116 121 chr5 51679603 51679793 -100857466 - MLT1A1 LTR MaLR -197 211 23 2 979 615 314 44 57 chr5 51683385 51683854 -100853405 + RMER15 LTR ERVL 12 566 -9 2 979 1055 341 21 0 chr5 51691476 51691816 -100845443 - MTE2b LTR MaLR -17 362 16 2 979 1725 225 58 2 chr5 51692775 51692789 -100844470 - RMER10A LTR ERVL -20 422 409 2 979 1725 225 58 2 chr5 51692967 51693349 -100843910 - RMER10A LTR ERVL -34 408 5 2 979 236 287 99 69 chr5 51697302 51697433 -100839826 - MLT2B4 LTR ERVL -63 499 365 3 979 548 256 69 19 chr5 51697587 51697746 -100839513 - MLT2B4 LTR ERVL -369 187 21 3 979 2063 205 24 160 chr5 51699733 51700396 -100836863 + RMER20B LTR ERVK 50 622 -5 3 979 1003 181 268 48 chr5 51700829 51701101 -100836158 - MT2A LTR ERVL -81 452 121 3 979 981 278 33 101 chr5 51701859 51702372 -100834887 + RLTR12B LTR ERVK 47 524 -4 3 979 383 284 240 35 chr5 51704739 51705041 -100832218 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 3 3 979 2597 208 25 2 chr5 51706627 51707175 -100830084 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 3 979 1739 235 22 8 chr5 51707980 51708349 -100828910 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 979 1661 185 51 94 chr5 51712904 51713298 -100823961 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 1 3 979 1409 266 82 0 chr5 51721556 51721909 -100815350 + MTD LTR MaLR 1 382 -37 3 979 481 325 127 53 chr5 51725066 51725388 -100811871 + MLT1A0 LTR MaLR 20 365 0 3 979 1515 237 86 8 chr5 51726421 51726795 -100810464 - MTD LTR MaLR -15 404 2 3 979 245 338 91 39 chr5 51731727 51731881 -100805378 + MLT1M LTR MaLR 129 290 -382 3 979 400 371 63 78 chr5 51746497 51746766 -100790493 - MTE2b LTR MaLR -114 265 1 3 979 1286 247 34 53 chr5 51752754 51753134 -100784125 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 979 620 276 120 8 chr5 51753295 51753536 -100783723 - MLT2C2 LTR ERVL -195 269 2 3 979 911 247 58 35 chr5 51758189 51758338 -100778921 - MT2B LTR ERVL -58 543 304 3 979 911 265 117 45 chr5 51758423 51758690 -100778569 - MT2B LTR ERVL -209 392 4 3 980 284 293 69 62 chr5 51775422 51775559 -100761700 - MLT1A0 LTR MaLR -226 133 1 4 980 1230 244 71 74 chr5 51790398 51790441 -100746818 - RLTR41 LTR ERV1 -53 393 352 4 980 1230 244 71 74 chr5 51791102 51791452 -100745807 - RLTR41 LTR ERV1 -95 351 2 4 980 2139 209 35 5 chr5 51792092 51792496 -100744763 - MTC LTR MaLR -5 416 1 4 980 1239 235 37 20 chr5 51796288 51796583 -100740676 + ORR1D1 LTR MaLR 8 307 -67 4 980 464 270 73 51 chr5 51798775 51799069 -100738190 - RMER15 LTR ERVL -154 421 1 4 980 442 267 53 143 chr5 51805832 51806077 -100731182 + MLT1C LTR MaLR 168 467 0 4 980 291 390 75 31 chr5 51806843 51807002 -100730257 + LTR33 LTR ERVL 29 194 -321 4 980 636 269 98 89 chr5 51807649 51807889 -100729370 - ORR1E LTR MaLR -30 329 83 4 980 2057 206 17 14 chr5 51807889 51808308 -100728951 - MTC LTR MaLR 0 421 2 4 980 636 269 98 89 chr5 51808308 51808393 -100728866 - ORR1E LTR MaLR -277 82 1 4 980 253 258 65 43 chr5 51818483 51818576 -100718683 - MLT1A1 LTR MaLR -275 133 39 4 980 413 341 73 39 chr5 51819315 51819574 -100717685 + MLT1J-int LTR MaLR 1063 1330 -57 4 980 884 337 51 33 chr5 51828224 51828675 -100708584 + MT2A LTR ERVL 3 461 -72 4 980 2953 64 28 5 chr5 51840226 51840617 -100696642 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 980 250 323 21 78 chr5 51859016 51859157 -100678102 - RMER12 LTR ERVK -466 856 724 5 981 298 209 72 118 chr5 51916155 51916307 -100620952 + RLTR11A2 LTR ERVK 6 150 -377 5 981 354 194 103 0 chr5 51920280 51920366 -100616893 - RLTR33 LTR ERVK -43 672 573 5 981 3420 33 2 0 chr5 51931262 51931657 -100605602 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 981 284 293 107 55 chr5 51933001 51933163 -100604096 - RMER17A LTR ERVK -170 581 403 6 981 284 293 107 55 chr5 51933209 51933335 -100603924 - RMER17A LTR ERVK -349 402 279 6 981 3286 46 2 2 chr5 51996420 51996816 -100540443 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 981 892 293 81 58 chr5 52002046 52002405 -100534854 + MTE2b LTR MaLR 6 372 -7 5 981 1538 268 23 6 chr5 52009963 52010316 -100526943 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 12 1 982 293 284 57 50 chr5 52041172 52041313 -100495946 + ORR1E LTR MaLR 50 191 -168 5 982 3581 15 0 0 chr5 52041747 52042143 -100495116 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 982 438 244 39 54 chr5 52043083 52043213 -100494046 + ORR1E LTR MaLR 228 355 -4 5 982 2130 182 55 2 chr5 52061426 52061823 -100475436 - MTC LTR MaLR -3 418 1 7 982 426 317 133 20 chr5 52071851 52072099 -100465160 - MLT1E1 LTR MaLR 0 654 379 8 982 371 48 0 8 chr5 52073219 52073278 -100463981 - MTC LTR MaLR 0 421 314 9 982 517 184 20 101 chr5 52080283 52080378 -100456881 + RMER17C LTR ERVK 91 184 -226 9 982 517 184 20 101 chr5 52080554 52080657 -100456602 + RMER17C LTR ERVK 185 273 -137 9 982 627 214 83 0 chr5 52099673 52099818 -100437441 + LTR33 LTR ERVL 357 513 -2 1 982 263 247 116 21 chr5 52107459 52107554 -100429705 - ORR1E LTR MaLR -21 338 235 1 982 1031 241 45 19 chr5 52108879 52109145 -100428114 - MTE2a LTR MaLR 0 379 107 1 982 1491 246 83 0 chr5 52112802 52113127 -100424132 + ORR1D2 LTR MaLR 3 354 -16 1 982 1065 214 97 116 chr5 52127857 52128238 -100409021 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 982 909 244 162 24 chr5 52134382 52134659 -100402600 + MTEa LTR MaLR 3 325 -54 1 982 909 244 162 24 chr5 52134697 52134747 -100402512 + MTEa LTR MaLR 326 375 -4 1 982 855 291 80 32 chr5 52147749 52148087 -100389172 + MLT1C LTR MaLR 1 354 -113 1 982 3060 101 8 0 chr5 52150532 52150929 -100386330 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 982 276 312 159 96 chr5 52158239 52158459 -100378800 + MLT1H LTR MaLR 42 275 -274 2 122 441 299 97 90 chr5 52166512 52166802 -100370457 + MLT1L LTR MaLR 210 501 -109 2 983 974 247 6 96 chr5 52173311 52173633 -100363626 - MTEa LTR MaLR -12 367 75 2 983 335 294 213 9 chr5 52173689 52173905 -100363354 + MLT1A0 LTR MaLR 101 360 -5 2 983 1834 147 51 3 chr5 52178736 52179050 -100358209 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 983 455 345 86 40 chr5 52189448 52189774 -100347485 + MLT1B LTR MaLR 1 341 -49 2 983 715 317 12 36 chr5 52196097 52196346 -100340913 + MTEb LTR MaLR 134 376 -3 2 983 613 309 91 25 chr5 52205285 52205604 -100331655 - MLT1A LTR MaLR -16 358 19 2 983 1048 248 89 69 chr5 52219056 52219403 -100317856 + ORR1E LTR MaLR 4 357 -2 2 983 1975 168 69 44 chr5 52224998 52225404 -100311855 + MTC LTR MaLR 6 421 0 2 983 265 281 52 9 chr5 52231137 52231252 -100306007 + MLT1H LTR MaLR 430 549 0 2 983 232 375 0 20 chr5 52231905 52232003 -100305256 + MTE2a LTR MaLR 67 162 -217 2 983 425 248 26 17 chr5 52232127 52232242 -100305017 + MTE2a LTR MaLR 264 379 0 2 983 1193 176 36 9 chr5 52247798 52248021 -100289238 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 154 3 983 513 195 66 126 chr5 52248203 52248385 -100288874 - ORR1C2 LTR MaLR -211 173 3 3 983 778 294 36 125 chr5 52258020 52258436 -100278823 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 3 983 282 256 26 0 chr5 52274097 52274175 -100263084 - LTR33A LTR ERVL -20 500 421 3 983 299 287 114 28 chr5 52274536 52274693 -100262566 + MLT1A0 LTR MaLR 181 366 -8 3 984 540 318 90 48 chr5 52307056 52307425 -100229834 - MTD LTR MaLR 0 419 10 3 984 1869 180 6 139 chr5 52311601 52312110 -100225149 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 3 984 537 305 76 53 chr5 52317809 52318110 -100219149 + MLT2B4 LTR ERVL 8 315 -241 4 984 2451 80 3 66 chr5 52329211 52329560 -100207699 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 984 3305 58 0 2 chr5 52333306 52333703 -100203556 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 984 416 295 71 88 chr5 52334421 52334799 -100202460 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 115 4 984 334 252 90 22 chr5 52345520 52345654 -100191605 + MLT1J LTR MaLR 38 180 -332 4 984 394 311 98 64 chr5 52352595 52352936 -100184323 + ORR1E LTR MaLR 6 379 0 4 984 2282 110 3 58 chr5 52361624 52361972 -100175287 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 984 233 271 78 70 chr5 52364681 52364796 -100172463 + MLT1A0 LTR MaLR 1 116 -249 4 984 453 327 49 0 chr5 52371439 52371601 -100165658 + MLT1A0 LTR MaLR 159 328 -37 4 984 824 287 125 10 chr5 52373117 52373420 -100163839 - MTEa LTR MaLR -1 378 41 4 984 261 228 133 39 chr5 52375807 52375935 -100161324 + ORR1E LTR MaLR 115 254 -105 4 984 240 307 27 0 chr5 52384151 52384226 -100153033 + MLT1G3 LTR MaLR 73 149 -446 4 984 391 274 280 10 chr5 52395147 52395432 -100141827 + MLT1A0 LTR MaLR 1 362 -3 5 984 312 332 95 9 chr5 52401088 52401319 -100135940 - MLT1D LTR MaLR -6 499 249 5 984 1484 224 62 14 chr5 52404522 52404879 -100132380 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 984 263 340 0 87 chr5 52420230 52420333 -100116926 - MTEa LTR MaLR -281 98 5 5 985 269 302 152 48 chr5 52444491 52444741 -100092518 + MLT1H1 LTR MaLR 27 302 -253 5 985 530 308 49 37 chr5 52457613 52457859 -100079400 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 117 6 985 4093 84 27 31 chr5 52458111 52458697 -100078562 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 6 985 1221 245 97 18 chr5 52464558 52464899 -100072360 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 6 985 1008 250 82 33 chr5 52465650 52465968 -100071291 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 6 985 1241 251 53 40 chr5 52484479 52484853 -100052406 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 985 501 324 114 38 chr5 52488074 52488402 -100048857 + MLT2C1 LTR ERVL 1 358 -39 6 985 501 324 114 38 chr5 52488524 52488564 -100048695 + MLT2C1 LTR ERVL 359 397 0 6 985 495 336 108 0 chr5 52489471 52489712 -100047547 + MLT1B LTR MaLR 124 390 0 6 985 575 352 78 15 chr5 52490185 52490594 -100046665 + MLT1H LTR MaLR 83 517 -32 6 985 462 337 83 17 chr5 52511219 52511521 -100025738 - LTR16C LTR ERVL -162 327 6 1 985 293 308 45 27 chr5 52511849 52511959 -100025300 + MLT1K LTR MaLR 450 561 -34 1 985 567 255 33 125 chr5 52514588 52515030 -100022229 + MTD LTR MaLR 6 404 -15 2 985 349 283 50 0 chr5 52520686 52520785 -100016474 + MTEa LTR MaLR 1 104 -275 3 985 1515 190 48 26 chr5 52520803 52521155 -100016104 - ORR1D1 LTR MaLR -14 360 1 3 985 590 242 49 33 chr5 52521240 52521424 -100015835 + MTEa LTR MaLR 192 378 -1 3 985 310 169 31 0 chr5 52524451 52524516 -100012743 + MLT1G3 LTR MaLR 529 595 0 4 985 301 238 53 83 chr5 52525758 52525891 -100011368 - RMER15 LTR ERVL -14 561 433 4 985 2014 128 201 56 chr5 52527216 52527713 -100009546 - RMER4B LTR ERVK -2 583 15 5 985 385 249 91 47 chr5 52529935 52530138 -100007121 + MLT1A0 LTR MaLR 189 369 -39 5 986 849 280 100 29 chr5 52564764 52565073 -99972186 + MTEb LTR MaLR 49 379 0 1 986 997 193 224 26 chr5 52567463 52567766 -99969493 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 6 1 986 2327 80 16 0 chr5 52583441 52583755 -99953504 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 986 1178 211 123 33 chr5 52583809 52584176 -99953083 - MT2A LTR ERVL 0 533 134 1 986 467 167 24 0 chr5 52584316 52584400 -99952859 - MT2A LTR ERVL -445 88 3 1 986 1783 153 43 6 chr5 52585665 52585993 -99951266 - RMER5 LTR ERV1 0 534 195 1 986 1438 229 198 31 chr5 52586138 52586688 -99950571 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 1 986 822 211 50 6 chr5 52587211 52587392 -99949867 - RMER5 LTR ERV1 -342 192 4 1 986 1262 182 18 9 chr5 52587927 52588154 -99949105 + RLTR17 LTR ERVK 194 422 -270 1 986 574 232 40 0 chr5 52591082 52591207 -99946052 - ORR1E LTR MaLR -229 130 1 1 986 2655 155 2 58 chr5 52591271 52591717 -99945542 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 986 725 307 31 111 chr5 52595440 52595828 -99941431 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 1 986 3359 59 3 3 chr5 52596653 52597045 -99940214 + MTA_Mm LTR MaLR 5 396 0 1 986 905 256 30 5 chr5 52603852 52604052 -99933207 - MTD LTR MaLR -209 210 6 2 986 494 243 38 103 chr5 52605504 52605766 -99931493 - ORR1E LTR MaLR -112 247 3 2 986 626 323 43 80 chr5 52609805 52610219 -99927040 - MLT1H LTR MaLR -133 416 18 2 986 349 279 63 82 chr5 52613093 52613300 -99923959 - MLT1K LTR MaLR -10 585 383 2 986 1040 228 154 45 chr5 52613449 52613780 -99923479 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 2 986 3085 71 15 2 chr5 52616407 52616802 -99920457 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 986 331 289 0 11 chr5 52617100 52617191 -99920068 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 435 2 986 238 265 136 29 chr5 52617237 52617377 -99919882 - RMER5 LTR ERV1 -347 187 33 2 986 339 237 53 0 chr5 52620655 52620731 -99916528 - ORR1E LTR MaLR -9 350 271 2 986 722 164 113 26 chr5 52622060 52622254 -99915005 - RMER5 LTR ERV1 -281 253 43 2 986 744 118 8 8 chr5 52622549 52622677 -99914582 + MTC LTR MaLR 103 230 -191 2 986 1222 197 11 19 chr5 52622710 52622974 -99914285 + RMER12 LTR ERVK 1 262 -1060 2 986 1819 157 10 86 chr5 52623007 52623386 -99913873 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 3 2 986 1830 165 112 17 chr5 52626711 52627068 -99910191 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 2 986 1115 266 98 19 chr5 52628270 52628595 -99908664 - MTD LTR MaLR -68 351 1 2 986 352 331 108 36 chr5 52631754 52632005 -99905254 + MLT1J LTR MaLR 226 494 -18 2 986 275 356 63 16 chr5 52632279 52632533 -99904726 + LTR16C LTR ERVL 153 418 -71 2 986 734 150 0 0 chr5 52633240 52633360 -99903899 + ORR1D1 LTR MaLR 1 120 -254 2 986 1344 248 12 27 chr5 52634673 52635005 -99902254 - MTEa LTR MaLR -3 376 50 2 986 246 167 0 0 chr5 52635058 52635100 -99902159 - MTEa LTR MaLR -320 59 18 2 986 225 271 51 0 chr5 52635111 52635170 -99902089 - LTR16A LTR ERVL -102 349 288 2 986 228 274 68 14 chr5 52640524 52640598 -99896661 - MTE2a LTR MaLR -16 363 286 2 986 508 286 112 72 chr5 52640882 52641187 -99896072 - MTE2a LTR MaLR -44 335 19 2 986 495 308 14 0 chr5 52641320 52641463 -99895796 - ORR1E LTR MaLR -214 145 1 2 986 1444 217 118 12 chr5 52643111 52643442 -99893817 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 2 986 844 212 137 24 chr5 52645316 52645603 -99891656 + MTD LTR MaLR 90 405 -14 2 986 444 176 38 29 chr5 52646960 52647065 -99890194 + MLT1A1 LTR MaLR 291 396 -12 3 986 485 280 41 26 chr5 52647080 52647337 -99889922 + MLT1A1-int LTR MaLR 2 275 -1305 3 986 1289 257 19 55 chr5 52655643 52656009 -99881250 - MTEa LTR MaLR 0 379 27 3 986 398 292 146 40 chr5 52659370 52659691 -99877568 - MLT1J1 LTR MaLR -29 415 61 3 986 276 290 87 24 chr5 52659716 52659843 -99877416 - MLT1J1-int LTR MaLR -3 1384 1250 3 986 739 293 202 50 chr5 52660584 52660669 -99876590 - ORR1E LTR MaLR -2 368 241 3 986 3017 92 10 12 chr5 52660669 52661077 -99876182 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 986 739 294 59 17 chr5 52661077 52661307 -99875952 - ORR1E LTR MaLR -118 241 1 3 986 1449 190 23 29 chr5 52663234 52663442 -99873817 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 166 3 986 1449 190 23 29 chr5 52663480 52663580 -99873679 - ORR1D1 LTR MaLR -209 165 66 3 986 233 88 0 0 chr5 52664525 52664559 -99872700 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 345 3 986 1352 185 97 47 chr5 52664561 52664901 -99872358 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 178 3 986 899 148 122 91 chr5 52666173 52666403 -99870856 - ORR1C1 LTR MaLR -141 237 1 3 986 230 204 0 0 chr5 52667259 52667303 -99869956 - ORR1A4 LTR MaLR -134 195 152 3 986 2035 123 12 21 chr5 52667382 52667714 -99869545 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 986 824 263 179 36 chr5 52670933 52671296 -99865963 + MTD LTR MaLR 5 419 0 3 986 1013 264 49 26 chr5 52672323 52672669 -99864590 - RMER5 LTR ERV1 -69 465 112 3 986 3851 125 21 35 chr5 52677426 52678172 -99859087 + RMER17A LTR ERVK 1 736 -15 3 986 3153 63 0 27 chr5 52679011 52679418 -99857841 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 986 718 290 28 8 chr5 52681497 52681744 -99855515 + MLT1B LTR MaLR 26 277 -113 3 986 368 307 61 26 chr5 52683617 52683848 -99853411 + MLT1A LTR MaLR 135 373 -1 3 986 1387 243 38 6 chr5 52684933 52685273 -99851986 - MTE2b LTR MaLR -5 374 24 3 987 807 265 38 92 chr5 52697098 52697468 -99839791 - ORR1E LTR MaLR -9 350 1 4 987 604 224 128 6 chr5 52698467 52698647 -99838612 + MLT2D LTR ERVL 4 205 -209 4 987 1107 221 93 36 chr5 52698691 52699025 -99838234 - ORR1E LTR MaLR 0 359 7 4 987 458 296 26 138 chr5 52699466 52699697 -99837562 + MLT2D LTR ERVL 206 410 -4 4 987 842 261 156 3 chr5 52701817 52702143 -99835116 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 4 987 2359 96 0 42 chr5 52702639 52702976 -99834283 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 4 987 855 250 85 16 chr5 52703872 52704120 -99833139 + MTEa LTR MaLR 6 270 -109 4 987 396 314 89 73 chr5 52704366 52704685 -99832574 - MTEa LTR MaLR -37 342 7 4 987 706 306 62 14 chr5 52706034 52706322 -99830937 + LTR53 LTR ERVL 2 303 -216 4 987 758 243 177 45 chr5 52706393 52706703 -99830556 - MTEa LTR MaLR -28 351 1 4 987 1018 240 86 37 chr5 52707178 52707529 -99829730 - RMER13A LTR ERVK -395 465 98 4 987 2335 110 166 21 chr5 52708073 52708548 -99828711 - MTC-int LTR MaLR -712 546 3 4 987 283 299 119 46 chr5 52708551 52708622 -99828637 - RMER20B LTR ERVK -38 589 520 4 987 283 299 119 46 chr5 52708658 52708737 -99828522 - RMER20B LTR ERVK -108 519 428 4 987 391 262 48 43 chr5 52708762 52708949 -99828310 - RMER20B LTR ERVK -310 317 130 4 987 2104 144 69 15 chr5 52709119 52709508 -99827751 - MTC LTR MaLR -10 411 2 4 987 378 312 124 6 chr5 52714256 52714433 -99822826 + MER89 LTR ERV1 132 329 -230 4 987 276 338 83 19 chr5 52720574 52720731 -99816528 + MLT1L LTR MaLR 442 608 -2 4 987 1184 232 46 28 chr5 52721832 52722155 -99815104 + RLTR14 LTR ERV1 54 382 0 4 987 431 270 72 52 chr5 52722514 52722846 -99814413 + RLTR15 LTR ERVK 45 359 0 4 987 455 288 14 18 chr5 52723364 52723525 -99813734 + MLT1N2 LTR MaLR 432 665 -7 4 987 369 302 59 51 chr5 52729787 52729926 -99807333 - MLT1F LTR MaLR 0 595 450 4 987 3114 84 0 7 chr5 52729926 52730335 -99806924 + MTB_Mm LTR MaLR 2 407 0 4 987 369 329 91 107 chr5 52730335 52730704 -99806555 - MLT1F LTR MaLR -120 449 66 4 987 722 300 40 79 chr5 52731080 52731384 -99805875 - MLT1F-int LTR MaLR -1113 296 5 4 987 555 285 136 53 chr5 52731388 52731866 -99805393 - MLT1F LTR MaLR 0 595 90 4 987 309 269 119 14 chr5 52732711 52732854 -99804405 + MLT1B LTR MaLR 31 188 -202 4 987 474 208 57 111 chr5 52733493 52733681 -99803578 + MLT1B LTR MaLR 160 384 -6 4 987 1676 162 142 15 chr5 52734918 52735063 -99802196 + ORR1D1 LTR MaLR 1 163 -211 4 987 1676 162 142 15 chr5 52735203 52735388 -99801871 + ORR1D1 LTR MaLR 164 373 -1 4 987 564 317 94 97 chr5 52735415 52735775 -99801484 + MT2A LTR ERVL 157 533 0 4 987 1503 271 91 14 chr5 52736876 52737370 -99799889 + RLTR20A2 LTR ERVK 47 578 0 4 987 287 218 139 13 chr5 52738216 52738295 -99798964 + MLT2B4 LTR ERVL 1 89 -467 4 987 598 203 67 15 chr5 52739185 52739320 -99797939 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 233 4 987 407 207 25 75 chr5 52739307 52739427 -99797832 - ORR1D1 LTR MaLR -252 122 9 4 987 270 295 0 50 chr5 52740086 52740186 -99797073 - MLT1K LTR MaLR -7 588 494 4 987 270 230 40 13 chr5 52742206 52742281 -99794978 - MLT1K LTR MaLR -533 77 1 4 987 364 306 95 65 chr5 52749573 52749741 -99787518 - MLT2D LTR ERVL -8 552 380 5 987 256 283 151 84 chr5 52765469 52765635 -99771624 + MLT1L LTR MaLR 194 370 -240 5 987 2034 129 144 40 chr5 52769916 52770086 -99767173 + RLTR11B LTR ERVK 8 231 -222 5 987 2034 129 144 40 chr5 52770156 52770389 -99766870 + RLTR11B LTR ERVK 232 452 -1 5 987 381 296 125 42 chr5 52770805 52771188 -99766071 - MLT1D LTR MaLR -22 483 51 5 987 4352 163 61 52 chr5 52775257 52776202 -99761057 + RMER17B LTR ERVK 5 958 0 5 987 1369 224 73 43 chr5 52776523 52776882 -99760377 + MTE2a LTR MaLR 1 370 -9 5 987 2175 106 12 64 chr5 52780982 52781326 -99755933 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 987 2132 146 3 36 chr5 52790303 52790546 -99746713 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 80 5 987 2132 146 3 36 chr5 52790708 52790794 -99746465 - ORR1A2 LTR MaLR -248 79 1 5 987 1198 220 126 46 chr5 52798949 52799302 -99737957 - MTD LTR MaLR 0 419 13 5 987 460 212 7 132 chr5 52802106 52802148 -99735111 + MT2B LTR ERVL 132 154 -447 5 987 2390 171 41 17 chr5 52805040 52805451 -99731808 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 987 255 271 0 28 chr5 52809407 52809479 -99727780 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 320 5 987 2394 156 5 52 chr5 52809497 52809922 -99727337 + MTB_Mm LTR MaLR 3 407 0 5 987 527 267 102 30 chr5 52810671 52810868 -99726391 + MTE2b LTR MaLR 1 211 -168 5 987 2015 145 124 16 chr5 52818131 52818502 -99718757 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 6 987 1456 212 80 25 chr5 52821492 52821854 -99715405 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 6 988 689 195 103 20 chr5 52822142 52822323 -99714936 + MT2A LTR ERVL 1 264 -229 6 988 376 192 0 82 chr5 52822304 52822389 -99714870 + MT2A LTR ERVL 387 464 -69 6 988 288 231 31 0 chr5 52822468 52822533 -99714726 + MT2A LTR ERVL 535 601 0 6 988 1450 182 185 178 chr5 52828778 52828862 -99708397 + MT2A LTR ERVL 1 81 -452 6 988 1450 182 185 178 chr5 52828913 52829006 -99708253 + MT2A LTR ERVL 82 94 -439 6 988 1450 182 185 178 chr5 52829151 52829455 -99707804 + MT2A LTR ERVL 95 487 -46 6 988 1450 182 185 178 chr5 52829552 52829597 -99707662 + MT2A LTR ERVL 488 532 -1 6 988 990 200 145 12 chr5 52833473 52833721 -99703538 + MTE2a LTR MaLR 96 376 -3 6 988 1789 240 52 136 chr5 52833962 52834571 -99702688 + RLTR1D LTR ERV1 48 605 0 6 988 331 332 126 35 chr5 52837854 52838085 -99699174 + ORR1E LTR MaLR 4 255 -104 6 988 1509 149 132 15 chr5 52849306 52849409 -99687850 - ORR1C2 LTR MaLR -79 305 198 6 988 1509 149 132 15 chr5 52849435 52849604 -99687655 - ORR1C2 LTR MaLR -187 197 2 6 988 366 341 93 43 chr5 52850003 52850260 -99686999 - ORR1E LTR MaLR -17 342 73 6 988 276 246 125 78 chr5 52850287 52850415 -99686844 - MLT1A1 LTR MaLR -270 138 5 6 988 260 291 27 184 chr5 52850541 52850726 -99686533 + RMER15 LTR ERVL 4 159 -416 6 988 357 319 103 7 chr5 52850726 52850974 -99686285 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 6 988 394 277 89 55 chr5 52851777 52852014 -99685245 + RLTR42-int LTR ERVK 1156 1400 -4122 6 988 464 350 29 93 chr5 52856062 52856453 -99680806 + MLT1J2 LTR MaLR 45 454 -58 6 988 469 296 101 58 chr5 52857428 52857812 -99679447 - MLT1C LTR MaLR -13 454 1 6 988 1705 137 146 19 chr5 52857920 52858097 -99679162 + RMER17C LTR ERVK 1 187 -223 6 988 1705 137 146 19 chr5 52858174 52858360 -99678899 + RMER17C LTR ERVK 188 409 -1 6 988 817 268 123 36 chr5 52858581 52858914 -99678345 + MTEb LTR MaLR 18 379 0 6 988 228 284 54 0 chr5 52859606 52859680 -99677579 - MLT1C LTR MaLR -198 269 192 6 988 3374 46 2 2 chr5 52859701 52860097 -99677162 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 988 315 337 60 27 chr5 52860108 52860291 -99676968 - MLT1C LTR MaLR -293 212 24 6 988 995 157 342 7 chr5 52864691 52864966 -99672293 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 988 277 308 35 103 chr5 52868869 52868955 -99668304 - LTR84b LTR ERVL -11 750 663 6 988 277 308 35 103 chr5 52869034 52869092 -99668167 - LTR84b LTR ERVL -99 662 616 6 988 1746 153 97 61 chr5 52869639 52869981 -99667278 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 7 988 255 335 125 0 chr5 52870029 52870181 -99667078 - LTR84b LTR ERVL -345 416 246 6 988 1363 216 139 6 chr5 52870440 52870771 -99666488 + MTD LTR MaLR 1 375 -44 7 988 720 255 94 32 chr5 52870786 52871094 -99666165 - RLTR15 LTR ERVK -32 327 1 7 988 273 135 37 37 chr5 52871094 52871148 -99666111 + MTD LTR MaLR 361 414 -7 7 988 1012 259 35 64 chr5 52872491 52872536 -99664723 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 325 7 988 1530 208 67 43 chr5 52872536 52872908 -99664351 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 4 7 988 1012 259 35 64 chr5 52872908 52873175 -99664084 - ORR1D2 LTR MaLR -46 324 67 7 988 305 296 43 94 chr5 52873340 52873478 -99663781 - ORR1E LTR MaLR -154 205 75 7 988 2385 166 12 54 chr5 52873645 52874071 -99663188 + MTC LTR MaLR 14 421 0 7 988 1002 285 87 41 chr5 52874608 52874977 -99662282 - MLT1B LTR MaLR 0 390 5 7 988 421 293 167 29 chr5 52876551 52876755 -99660504 + MLT1G3 LTR MaLR 363 594 -1 7 988 298 297 57 33 chr5 52877234 52877356 -99659903 - MLT1B-int LTR MaLR -46 1443 1319 7 988 285 313 89 35 chr5 52877422 52877591 -99659668 - MLT1B-int LTR MaLR -428 981 804 7 988 269 168 112 56 chr5 52877692 52877799 -99659460 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 7 988 245 352 114 52 chr5 52878068 52878278 -99658981 - MLT1B-int LTR MaLR -690 799 577 7 988 256 297 164 0 chr5 52878437 52878565 -99658694 - MLT1B-int LTR MaLR -1130 359 211 7 988 689 318 138 72 chr5 52878781 52879296 -99657963 - MLT1B LTR MaLR -46 549 1 7 988 2437 141 46 15 chr5 52880017 52880412 -99656847 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 988 246 225 25 83 chr5 52881357 52881444 -99655815 + MTE2a LTR MaLR 4 80 -328 7 988 270 242 0 31 chr5 52881683 52881747 -99655512 + MTE2a LTR MaLR 278 339 -40 7 988 1044 245 113 15 chr5 52884842 52885169 -99652090 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 7 988 268 305 61 0 chr5 52888346 52888428 -99648831 - MLT1J2 LTR MaLR 0 489 403 7 988 280 224 35 0 chr5 52888423 52888481 -99648778 - MLT1J2 LTR MaLR -308 140 81 7 988 587 319 58 94 chr5 52888664 52889045 -99648214 - MTEa LTR MaLR -11 368 2 7 988 996 322 43 18 chr5 52889997 52890392 -99646867 + MLT1C LTR MaLR 63 467 0 7 988 243 247 120 30 chr5 52890849 52890949 -99646310 + MLT1N2 LTR MaLR 431 539 -23 7 988 338 333 30 114 chr5 52891043 52891307 -99645952 + MLT1A1 LTR MaLR 1 242 -166 7 988 1892 112 52 93 chr5 52894168 52894511 -99642748 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 988 1606 179 83 104 chr5 52894560 52894983 -99642276 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 7 988 281 310 159 0 chr5 52897218 52897331 -99639928 - MLT1A1 LTR MaLR -276 132 2 7 988 231 220 74 42 chr5 52900223 52900244 -99637015 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 355 7 988 231 227 69 43 chr5 52900327 52900411 -99636848 - ORR1C1 LTR MaLR -24 354 266 7 988 343 279 104 56 chr5 52902803 52902902 -99634357 + RLTR25B LTR ERVK 441 548 -480 7 988 343 279 104 56 chr5 52903031 52903075 -99634184 + RLTR25B LTR ERVK 549 591 -437 7 988 458 246 103 0 chr5 52903310 52903436 -99633823 + MLT1A0 LTR MaLR 225 363 -2 7 988 433 346 72 64 chr5 52903772 52904118 -99633141 - LTR16C LTR ERVL -34 455 107 7 988 240 313 59 33 chr5 52904185 52904337 -99632922 + MLT1A0 LTR MaLR 417 572 -23 7 988 4611 209 110 57 chr5 52904568 52905746 -99631513 + ORR1D1-int LTR MaLR 130 1370 0 7 988 1220 199 132 23 chr5 52905748 52905957 -99631302 + ORR1D1 LTR MaLR 4 233 -141 7 988 1220 199 132 23 chr5 52906013 52906106 -99631153 + ORR1D1 LTR MaLR 234 338 -36 7 988 553 232 111 204 chr5 52908862 52909258 -99628001 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 7 988 268 226 137 21 chr5 52909990 52910085 -99627174 + MLT1J LTR MaLR 213 318 -194 7 988 663 339 107 9 chr5 52910219 52910564 -99626695 - MT2A LTR ERVL -149 384 6 7 988 3977 90 16 31 chr5 52910907 52911480 -99625779 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 7 988 811 255 56 59 chr5 52912638 52912926 -99624333 + ORR1E LTR MaLR 1 287 -72 7 988 239 309 10 50 chr5 52913741 52913840 -99623419 - MLT1H1 LTR MaLR -28 527 433 7 988 235 295 53 79 chr5 52914266 52914380 -99622879 - MLT1H1 LTR MaLR -364 215 105 7 988 2477 101 3 0 chr5 52914573 52914899 -99622360 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 988 421 279 141 13 chr5 52921308 52921464 -99615795 - MLT1F1 LTR MaLR -27 542 367 8 988 353 288 26 26 chr5 52921767 52921881 -99615378 - MLT1F1 LTR MaLR -439 130 17 8 988 456 309 118 39 chr5 52923840 52924139 -99613120 + MLT1E1A LTR MaLR 302 608 -46 8 988 1692 199 67 81 chr5 52930415 52930836 -99606423 - MTD LTR MaLR 0 419 5 8 988 2328 154 65 12 chr5 52930996 52931396 -99605863 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 988 239 340 155 0 chr5 52931862 52931965 -99605294 + MLT1A0 LTR MaLR 72 190 -175 8 988 540 210 119 13 chr5 52932274 52932423 -99604836 + MLT1A0 LTR MaLR 232 390 0 8 988 295 250 95 98 chr5 52942644 52942990 -99594269 + RMER17A2 LTR ERVK 124 491 -415 8 988 2997 68 32 22 chr5 52945874 52946277 -99590982 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 8 989 320 239 0 0 chr5 52958976 52959043 -99578216 - ORR1D1 LTR MaLR -1 378 312 8 989 3209 152 69 46 chr5 52959026 52959638 -99577621 - RMER19B LTR ERVK -276 626 1 8 989 296 310 103 65 chr5 52959638 52959734 -99577525 - MTE2b LTR MaLR -279 100 1 8 989 1072 157 5 66 chr5 52959836 52960048 -99577211 - ORR1D1 LTR MaLR -173 201 3 8 989 557 259 36 22 chr5 52962423 52962561 -99574698 + MTE2a LTR MaLR 40 179 -200 8 989 680 242 37 6 chr5 52962943 52963105 -99574154 + MTE2a LTR MaLR 209 375 -4 8 989 270 264 34 22 chr5 52963263 52963352 -99573907 + MLT1K LTR MaLR 475 564 -31 8 989 668 313 21 37 chr5 52965119 52965361 -99571898 + ORR1E LTR MaLR 1 238 -121 8 989 475 307 3 25 chr5 52965421 52965585 -99571674 + ORR1E LTR MaLR 209 379 0 8 989 266 176 19 19 chr5 52965585 52965637 -99571622 + ORR1E-int LTR MaLR 2 53 -1527 8 989 678 279 12 6 chr5 52965638 52965811 -99571448 + ORR1E-int LTR MaLR 7 180 -1400 8 989 227 240 27 155 chr5 52965807 52965955 -99571304 + MTD LTR MaLR 180 308 -111 8 989 535 183 47 19 chr5 52966064 52966170 -99571089 - MTC LTR MaLR -289 132 24 8 989 2094 200 26 14 chr5 52966405 52966821 -99570438 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 989 2233 107 6 3 chr5 52967200 52967518 -99569741 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 989 4497 117 67 7 chr5 52968285 52968998 -99568261 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 8 989 468 305 19 82 chr5 52970072 52970390 -99566869 - LTR16B1 LTR ERVL -157 323 26 8 989 2192 191 25 34 chr5 52971160 52971631 -99565628 + RLTR11A LTR ERVK 16 482 -46 8 989 303 361 24 61 chr5 52975880 52976045 -99561214 - MLT1C LTR MaLR -303 164 6 8 989 283 303 107 0 chr5 52976382 52976504 -99560755 + MLT1A1 LTR MaLR 270 404 -4 8 989 697 290 102 7 chr5 52979298 52979593 -99557666 - MLT1D LTR MaLR -155 350 28 8 989 783 321 101 45 chr5 52979714 52980207 -99557052 + LTR33A_ LTR ERVL 8 528 -3 8 989 403 350 95 48 chr5 52980990 52981214 -99556045 - MLT1D LTR MaLR -246 259 25 8 989 1910 169 50 19 chr5 52982676 52983039 -99554220 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 989 1181 249 57 60 chr5 52985120 52985248 -99552011 - MTE2b LTR MaLR -41 338 211 9 989 1181 249 57 60 chr5 52985439 52985643 -99551616 - MTE2b LTR MaLR -169 210 7 9 989 3237 131 117 54 chr5 52986921 52987290 -99549969 - RMER17A LTR ERVK -7 744 354 9 989 3237 131 117 54 chr5 52987416 52987746 -99549513 - RMER17A LTR ERVK -398 353 3 9 989 1368 193 211 103 chr5 52988259 52988675 -99548584 + MT2A LTR ERVL 1 461 -72 9 989 1622 157 188 20 chr5 52990553 52990910 -99546349 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 9 989 263 132 0 102 chr5 52993756 52993815 -99543444 - MLT1J2 LTR MaLR 0 448 396 9 989 692 309 98 48 chr5 52998333 52998670 -99538589 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 9 989 1164 246 157 6 chr5 52998782 52999101 -99538158 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 4 9 989 798 147 112 0 chr5 52999378 52999521 -99537738 - RMER4A LTR ERVK 0 466 308 9 989 2873 115 32 22 chr5 52999523 52999984 -99537275 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 9 989 1799 149 61 67 chr5 53000242 53000310 -99536949 + ORR1B2 LTR MaLR 2 60 -307 1 989 1799 149 61 67 chr5 53000483 53000774 -99536485 + ORR1B2 LTR MaLR 61 359 -8 1 989 389 303 56 14 chr5 53001124 53001268 -99535991 - LTR82A LTR ERVL -186 686 537 4 989 226 264 185 39 chr5 53003521 53003651 -99533608 + MLT1A0 LTR MaLR 215 363 -2 9 989 1080 233 114 60 chr5 53004699 53005050 -99532209 + MTEa LTR MaLR 10 379 0 1 989 455 291 72 63 chr5 53005598 53005984 -99531275 + MLT1D LTR MaLR 27 505 0 1 989 420 278 182 94 chr5 53013213 53013543 -99523716 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 2 989 576 267 146 17 chr5 53019779 53020019 -99517240 + MLT1C LTR MaLR 43 313 -154 4 989 2237 213 23 121 chr5 53022227 53022503 -99514756 - RMER15 LTR ERVL 0 575 299 4 989 2428 86 26 84 chr5 53022503 53022884 -99514375 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 989 2237 213 23 121 chr5 53022884 53023221 -99514038 - RMER15 LTR ERVL -277 298 22 4 989 285 217 0 48 chr5 53023302 53023365 -99513894 - RMER15 LTR ERVL -510 65 6 4 989 273 283 67 48 chr5 53023813 53023917 -99513342 + MLT1C LTR MaLR 291 396 -12 4 989 559 278 98 6 chr5 53024127 53024283 -99512976 + MTEa LTR MaLR 18 189 -190 4 989 1305 246 73 21 chr5 53024283 53024658 -99512601 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 4 4 989 994 248 114 40 chr5 53028120 53028470 -99508789 - MTD LTR MaLR -5 374 12 5 989 1731 139 69 69 chr5 53036411 53036789 -99500470 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 989 962 266 75 63 chr5 53036935 53037349 -99499910 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 989 1765 184 46 19 chr5 53053153 53053519 -99483740 + ORR1C1 LTR MaLR 2 377 -1 9 989 306 229 119 12 chr5 53057936 53058020 -99479239 + MLT1H2 LTR MaLR 373 465 -24 1 989 768 252 122 55 chr5 53059263 53059591 -99477668 + RMER5 LTR ERV1 159 512 -22 1 989 768 252 122 55 chr5 53059779 53059794 -99477465 + RMER5 LTR ERV1 513 525 -9 1 989 589 333 102 62 chr5 53061718 53062434 -99474825 + MER89-int LTR ERV1 3812 4556 -2245 1 989 365 299 34 46 chr5 53063018 53063193 -99474066 + MER89-int LTR ERV1 5144 5316 -1485 1 989 1183 311 79 41 chr5 53063271 53063827 -99473432 + MER89-int LTR ERV1 5435 6011 -790 1 989 375 246 73 22 chr5 53063871 53064008 -99473251 + MER89 LTR ERV1 308 451 -108 1 989 1008 199 88 141 chr5 53065127 53065294 -99471965 + RMER10B LTR ERVL 1 163 -235 1 989 1008 199 88 141 chr5 53065317 53065569 -99471690 + RMER10B LTR ERVL 164 398 0 1 989 244 295 0 0 chr5 53068967 53069028 -99468231 + MLT1G1 LTR MaLR 231 291 -258 1 989 245 226 65 0 chr5 53069143 53069200 -99468059 + MLT1G1 LTR MaLR 491 551 -28 1 989 1624 171 87 52 chr5 53069200 53069625 -99467634 + RMER10A LTR ERVL 1 440 -2 1 989 472 293 124 85 chr5 53072291 53072679 -99464580 + MLT1A1 LTR MaLR 1 403 -5 1 989 357 314 49 78 chr5 53077011 53077150 -99460109 + MLT1C LTR MaLR 267 408 -59 1 989 357 314 49 78 chr5 53077335 53077399 -99459860 + MLT1C LTR MaLR 409 464 -3 1 989 1627 224 85 11 chr5 53078084 53078437 -99458822 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 1 989 689 290 75 37 chr5 53079690 53079984 -99457275 - RMER20B LTR ERVK -214 413 109 1 989 2331 150 65 19 chr5 53081056 53081485 -99455774 - RLTR44B LTR ERVK 0 449 1 1 989 4841 37 44 0 chr5 53081485 53082059 -99455200 - RLTR44-int LTR ERVK 0 2812 2214 1 989 4990 82 11 45 chr5 53082357 53083073 -99454186 - RLTR44-int LTR ERVK -1323 1489 798 1 989 397 171 57 0 chr5 53083102 53083172 -99454087 - RLTR44-int LTR ERVK -2738 74 1 1 989 1769 147 101 19 chr5 53083182 53083549 -99453710 - RLTR44B LTR ERVK -8 397 1 1 989 2944 36 0 0 chr5 53083769 53084101 -99453158 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 1 990 615 296 57 23 chr5 53087874 53088160 -99449099 - MLT1B LTR MaLR -10 457 82 1 990 302 317 15 73 chr5 53096600 53096843 -99440416 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1650 4111 3835 1 990 437 309 49 99 chr5 53096855 53097423 -99439836 - MYSERV6-int LTR ERVK -3091 5868 5329 1 990 282 265 0 0 chr5 53097640 53097708 -99439551 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2723 2944 2877 1 990 1223 98 39 14 chr5 53102749 53102956 -99434303 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 198 1 990 262 310 138 81 chr5 53108190 53108450 -99428809 + MLT1L LTR MaLR 224 498 -112 1 990 628 274 69 135 chr5 53108453 53108757 -99428502 - MTE2b LTR MaLR -95 284 1 1 990 383 252 0 65 chr5 53109739 53109862 -99427397 + MTC LTR MaLR 6 120 -301 1 990 543 217 0 17 chr5 53110078 53110195 -99427064 + MTC LTR MaLR 109 223 -198 1 990 1257 152 5 5 chr5 53110323 53110541 -99426718 + MTC LTR MaLR 196 413 -8 1 990 254 240 172 37 chr5 53113192 53113326 -99423933 - RMER20B LTR ERVK -264 363 212 2 990 242 240 122 64 chr5 53114393 53114549 -99422710 - MTEa LTR MaLR -14 365 201 2 990 304 228 39 107 chr5 53114715 53114818 -99422441 - MTEa LTR MaLR -283 96 1 2 990 4472 20 0 0 chr5 53114912 53115405 -99421854 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 990 649 306 116 11 chr5 53117564 53117927 -99419332 + MER89 LTR ERV1 145 545 -14 2 990 374 274 40 76 chr5 53119190 53119347 -99417912 + MLT1A LTR MaLR 3 159 -215 2 990 578 271 167 6 chr5 53121630 53121972 -99415287 + MLT2C1 LTR ERVL 1 397 0 2 990 324 277 35 18 chr5 53122127 53122241 -99415018 - LTR48 LTR ERV1 -83 704 589 2 990 305 282 25 25 chr5 53123495 53123615 -99413644 + MTD LTR MaLR 1 120 -299 2 990 750 217 263 115 chr5 53124025 53124390 -99412869 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 990 495 270 44 27 chr5 53125271 53125454 -99411805 + ORR1E LTR MaLR 30 215 -144 2 990 238 253 28 128 chr5 53125539 53125648 -99411611 + ORR1E LTR MaLR 282 379 0 2 990 1752 194 197 7 chr5 53128085 53128527 -99408732 - RLTR11A2 LTR ERVK -1 526 1 2 990 469 180 0 20 chr5 53129034 53129187 -99408072 + RMER17A LTR ERVK 303 452 -299 2 990 288 340 107 50 chr5 53129355 53129693 -99407566 + ORR1E LTR MaLR 2 358 -1 2 990 711 247 24 0 chr5 53131654 53131820 -99405439 - MTD LTR MaLR -249 170 1 2 990 230 272 19 107 chr5 53141070 53141173 -99396086 - MT2B2 LTR ERVL -340 244 151 2 990 1624 157 138 12 chr5 53145408 53145749 -99391510 - MTC LTR MaLR -10 411 28 2 990 1762 171 58 3 chr5 53146926 53147271 -99389988 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 11 2 990 440 221 21 90 chr5 53151043 53151187 -99386072 - MTEa LTR MaLR -6 373 240 2 990 227 216 0 56 chr5 53156465 53156519 -99380740 - MT2B LTR ERVL -361 240 190 3 990 236 231 15 15 chr5 53160680 53160746 -99376513 - MTEb LTR MaLR -109 270 205 3 990 592 170 26 66 chr5 53161205 53161356 -99375903 + ORR1B1 LTR MaLR 41 185 -209 3 990 508 155 0 40 chr5 53161347 53161448 -99375811 + ORR1B1 LTR MaLR 298 394 0 3 990 4011 78 27 14 chr5 53162147 53162707 -99374552 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 3 990 1400 198 53 26 chr5 53163222 53163359 -99373900 + RMER6A LTR ERVK 2 204 -552 3 990 1400 198 53 26 chr5 53163472 53163842 -99373417 + RMER6A LTR ERVK 205 756 0 3 990 388 174 255 0 chr5 53165735 53165833 -99371426 - MTD LTR MaLR -2 417 295 3 990 439 274 32 25 chr5 53167283 53167440 -99369819 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 225 3 990 3326 33 15 3 chr5 53167736 53168127 -99369132 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 990 905 191 112 10 chr5 53169861 53170067 -99367192 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 148 3 990 807 196 19 7 chr5 53170404 53170558 -99366701 - ORR1D1 LTR MaLR -218 156 1 3 990 2252 145 49 18 chr5 53171725 53172175 -99365084 + RMER6A LTR ERVK 293 756 0 3 990 676 252 67 92 chr5 53178297 53178499 -99358760 - RLTR15 LTR ERVK -39 320 105 3 990 676 252 67 92 chr5 53178530 53178655 -99358604 - RLTR15 LTR ERVK -255 104 1 3 990 1189 226 113 12 chr5 53181552 53181888 -99355371 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 990 988 283 104 9 chr5 53182021 53182339 -99354920 - MTE2b LTR MaLR -8 371 24 3 990 1228 198 111 6 chr5 53198716 53199031 -99338228 - MTD LTR MaLR -14 405 58 3 991 1458 254 48 15 chr5 53218767 53219159 -99318100 - MTC LTR MaLR -14 407 3 4 991 2774 58 12 0 chr5 53220332 53220674 -99316585 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 991 13088 73 8 26 chr5 53220674 53222498 -99314761 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 4 991 2529 62 0 0 chr5 53222502 53222840 -99314419 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 4 991 2055 95 16 19 chr5 53223272 53223593 -99313666 + ORR1A2 LTR MaLR 6 325 -2 4 991 3131 124 51 0 chr5 53223595 53224128 -99313131 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 560 -1403 4 991 236 108 27 0 chr5 53224121 53224132 -99313127 + MT2B LTR ERVL 249 260 -341 4 991 1488 110 4 0 chr5 53224196 53224432 -99312827 - ORR1A2 LTR MaLR -90 237 1 4 991 1306 206 149 9 chr5 53244189 53244517 -99292742 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 991 1030 246 75 103 chr5 53245723 53246112 -99291147 - MTE2a LTR MaLR 0 379 2 4 991 247 282 148 35 chr5 53250647 53250816 -99286443 - MER21B LTR ERV1 -128 735 548 4 991 457 288 131 40 chr5 53250851 53251126 -99286133 - MER21B LTR ERV1 -398 465 166 4 991 2970 38 75 8 chr5 53251234 53251609 -99285650 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 991 301 270 52 147 chr5 53259934 53260125 -99277134 - MTEa LTR MaLR -1 378 206 5 991 266 264 108 9 chr5 53262260 53262371 -99274888 + RMER15 LTR ERVL 402 523 -52 5 991 831 234 0 45 chr5 53264986 53265187 -99272072 + MTEb LTR MaLR 78 269 -110 5 991 323 333 17 26 chr5 53265179 53265296 -99271963 - MTE2a LTR MaLR -244 135 20 5 991 340 150 0 0 chr5 53266700 53266760 -99270499 - ORR1B1 LTR MaLR -334 60 1 5 991 417 303 45 6 chr5 53266760 53266928 -99270331 - MT2A LTR ERVL -303 230 56 5 991 1345 203 87 14 chr5 53268018 53268285 -99268974 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 80 5 991 1345 203 87 14 chr5 53268314 53268391 -99268868 - ORR1D2 LTR MaLR -291 79 2 5 991 1485 229 60 18 chr5 53268439 53268786 -99268473 - MTD LTR MaLR -8 411 44 5 991 1694 121 193 32 chr5 53268786 53269102 -99268157 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 991 1485 229 60 18 chr5 53269102 53269137 -99268122 - MTD LTR MaLR -376 43 13 5 991 747 267 16 10 chr5 53274653 53274846 -99262413 - ORR1E LTR MaLR -161 198 5 5 991 476 282 136 33 chr5 53275225 53275362 -99261897 + MTEa LTR MaLR 5 169 -210 5 991 476 282 136 33 chr5 53275382 53275486 -99261773 + MTEa LTR MaLR 170 270 -109 5 991 440 326 52 16 chr5 53278988 53279181 -99258078 + RMER15 LTR ERVL 332 531 -44 5 991 313 271 0 91 chr5 53280674 53280926 -99256333 - RMER17D LTR ERVK -420 469 241 5 991 2311 137 108 2 chr5 53282100 53282407 -99254852 + RMER4A LTR ERVK 6 346 -120 5 991 2311 137 108 2 chr5 53282493 53282602 -99254657 + RMER4A LTR ERVK 347 465 -1 5 991 1678 92 8 7 chr5 53284073 53284383 -99252876 + MTB_Mm LTR MaLR 1 419 0 5 991 264 292 93 10 chr5 53294106 53294203 -99243056 + MT2A LTR ERVL 13 117 -416 5 991 874 297 81 10 chr5 53294137 53294433 -99242826 + MTE2a LTR MaLR 52 368 -11 5 991 1837 120 63 28 chr5 53297542 53297860 -99239399 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 991 270 309 71 74 chr5 53298503 53298800 -99238459 + RMER10A LTR ERVL 122 417 -25 5 991 3228 60 8 2 chr5 53300852 53301250 -99236009 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 991 625 303 18 109 chr5 53306848 53307133 -99230126 - MLT1B LTR MaLR -131 259 1 5 991 1905 136 93 12 chr5 53307954 53308275 -99228984 - ORR1B1 LTR MaLR -46 348 2 6 991 258 331 29 44 chr5 53308314 53308450 -99228809 - RMER15 LTR ERVL -71 504 371 6 991 2619 152 100 24 chr5 53310361 53310526 -99226733 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 355 6 991 3355 43 2 2 chr5 53310526 53310922 -99226337 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 991 2619 152 100 24 chr5 53310922 53311247 -99226012 - RLTR11A LTR ERVK -174 354 1 6 991 731 274 6 6 chr5 53311608 53311784 -99225475 + MTEb LTR MaLR 203 378 -1 6 991 375 338 122 14 chr5 53311886 53312108 -99225151 - RMER15-int LTR ERVL -2458 2541 2296 6 991 1014 314 117 39 chr5 53312213 53312809 -99224450 - RMER15-int LTR ERVL -2848 2151 1509 6 991 302 241 17 85 chr5 53313396 53313514 -99223745 - RMER15-int LTR ERVL -3367 1632 1523 6 991 820 293 53 10 chr5 53313707 53314007 -99223252 - RMER15-int LTR ERVL -3474 1525 1213 6 991 733 342 74 23 chr5 53314103 53314456 -99222803 - RMER15-int LTR ERVL -4607 392 22 6 991 2397 93 37 67 chr5 53314540 53314944 -99222315 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 16 6 991 424 211 0 133 chr5 53315183 53315303 -99221956 - MT2B LTR ERVL -323 278 175 6 991 760 274 74 22 chr5 53318535 53318804 -99218455 + RMER5 LTR ERV1 242 524 -10 6 991 1157 234 26 38 chr5 53319032 53319378 -99217881 + RLTR15 LTR ERVK 2 343 -16 6 991 1013 238 109 87 chr5 53323516 53323884 -99213375 - MTEb LTR MaLR 0 379 4 6 991 477 150 0 91 chr5 53324366 53324476 -99212783 + RMER10A LTR ERVL 343 442 0 6 991 2330 148 74 2 chr5 53324664 53325057 -99212202 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 991 493 301 104 91 chr5 53344402 53344632 -99192627 - MLT1A LTR MaLR -3 405 173 7 123 383 241 87 81 chr5 53346168 53346353 -99190906 + MLT1C LTR MaLR 6 191 -276 7 992 3132 67 13 8 chr5 53346740 53347134 -99190125 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 992 2345 112 81 0 chr5 53347623 53347980 -99189279 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 7 992 1551 196 97 9 chr5 53349097 53349437 -99187822 + ORR1D1 LTR MaLR 3 372 -2 7 992 2993 75 17 10 chr5 53354566 53354970 -99182289 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 992 1442 196 125 15 chr5 53360551 53360888 -99176371 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 992 788 240 58 71 chr5 53361158 53361367 -99175892 + MTD LTR MaLR 1 206 -213 7 992 2919 87 30 5 chr5 53362744 53363137 -99174122 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 5 7 992 316 197 0 43 chr5 53364948 53365008 -99172251 - MTEb LTR MaLR 0 379 323 7 992 1361 104 0 52 chr5 53365219 53365431 -99171828 - RLTR11B LTR ERVK -1 452 252 7 992 1226 214 102 57 chr5 53365434 53365861 -99171398 - RLTR11A LTR ERVK -18 510 21 7 992 450 277 15 0 chr5 53365862 53365992 -99171267 - MTEb LTR MaLR -80 299 168 7 992 518 228 68 75 chr5 53366330 53366468 -99170791 - MTEb LTR MaLR -192 187 51 7 992 264 233 40 27 chr5 53374447 53374522 -99162737 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 430 7 992 2318 190 50 15 chr5 53374520 53374605 -99162654 - RLTR16 LTR ERVK -13 492 413 7 992 2318 190 50 15 chr5 53374649 53375038 -99162221 - RLTR16 LTR ERVK -93 412 1 7 992 1519 217 77 12 chr5 53375095 53375435 -99161824 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 1 7 992 498 232 132 3 chr5 53375435 53375570 -99161689 - MTEb LTR MaLR -47 332 163 7 992 2451 151 85 30 chr5 53379249 53379415 -99157844 - RLTR19A LTR ERVK 0 496 314 8 992 2451 151 85 30 chr5 53379455 53379758 -99157501 - RLTR19A LTR ERVK -183 313 1 8 992 235 308 26 0 chr5 53390377 53390455 -99146804 - RMER13A LTR ERVK 0 860 781 8 992 264 271 67 86 chr5 53390545 53390650 -99146609 + MT2B LTR ERVL 138 240 -361 8 992 658 146 0 0 chr5 53396169 53396272 -99140987 - ORR1C2 LTR MaLR -16 368 266 8 992 3523 128 79 16 chr5 53396301 53396911 -99140348 - RMER6A LTR ERVK 0 756 109 8 992 910 138 68 77 chr5 53396937 53397145 -99140114 - ORR1C2 LTR MaLR -204 180 1 8 992 285 267 47 94 chr5 53398618 53398660 -99138599 - MT2B LTR ERVL -446 155 120 8 992 443 278 0 143 chr5 53399728 53399917 -99137342 - MT2B LTR ERVL -337 264 103 8 992 822 244 173 62 chr5 53400987 53401328 -99135931 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 8 992 230 139 0 132 chr5 53406982 53407065 -99130194 - RMER10B LTR ERVL -99 299 228 9 992 385 191 15 0 chr5 53411676 53411744 -99125515 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 302 9 992 291 263 222 0 chr5 53412139 53412238 -99125021 - ORR1D1 LTR MaLR -55 315 195 9 992 457 227 11 0 chr5 53412388 53412476 -99124783 - ORR1D1 LTR MaLR -164 210 122 9 992 745 164 31 0 chr5 53412617 53412745 -99124514 - ORR1D1 LTR MaLR -223 151 20 9 992 1074 239 281 9 chr5 53415156 53415486 -99121773 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 992 1610 203 126 31 chr5 53416175 53416556 -99120703 - MTD LTR MaLR 0 419 3 9 992 2762 71 143 139 chr5 53419807 53420317 -99116942 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 9 992 233 185 70 53 chr5 53431359 53431416 -99105843 - MT2B2 LTR ERVL -282 302 245 1 992 229 340 36 36 chr5 53435079 53435189 -99102070 - MTE2a LTR MaLR 0 379 270 1 992 249 188 52 104 chr5 53451401 53451478 -99085781 - MT2B2 LTR ERVL -361 223 151 1 992 226 220 20 0 chr5 53463241 53463291 -99073968 - MLT1G LTR MaLR -5 586 536 1 992 475 265 17 8 chr5 53465155 53465273 -99071986 + MER57F LTR ERV1 1 119 -317 1 992 297 167 59 29 chr5 53465696 53465764 -99071495 + MER57F LTR ERV1 133 202 -234 1 992 324 267 58 29 chr5 53471574 53471678 -99065581 - MLT1C LTR MaLR -7 482 376 1 992 3643 15 0 0 chr5 53471752 53472148 -99065111 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 992 241 250 56 42 chr5 53472214 53472285 -99064974 - MLT1C LTR MaLR -328 251 180 1 992 362 386 112 41 chr5 53472577 53472871 -99064388 - MLT1C-int LTR MaLR -5 1484 1170 1 992 368 326 15 22 chr5 53473022 53473127 -99064132 - MLT1C LTR MaLR -25 442 339 1 992 2054 135 53 12 chr5 53473127 53473465 -99063794 + ORR1B2 LTR MaLR 1 352 -15 1 992 1018 164 23 6 chr5 53473462 53473634 -99063625 + ORR1B2 LTR MaLR 185 359 -8 1 992 279 289 24 139 chr5 53473667 53473832 -99063427 - MLT1C LTR MaLR -193 274 129 1 992 1425 254 31 40 chr5 53474224 53474576 -99062683 + ORR1D2 LTR MaLR 22 370 0 1 992 231 347 0 0 chr5 53475127 53475199 -99062060 - MLT1C LTR MaLR -510 81 10 1 992 303 221 31 112 chr5 53475752 53475795 -99061464 - MT2B LTR ERVL -311 164 155 1 15 5372 156 13 7 chr5 53476806 53477660 -99059599 - RMER13A LTR ERVK -1 859 1 1 993 1026 251 94 20 chr5 53478897 53479247 -99058012 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 1 993 373 262 171 24 chr5 53479448 53479612 -99057647 - RMER15 LTR ERVL -51 524 337 1 993 397 335 101 41 chr5 53481603 53481921 -99055338 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 29 1 993 1294 154 23 0 chr5 53482104 53482318 -99054941 + RLTR14 LTR ERV1 2 220 -162 1 993 1149 163 74 28 chr5 53482318 53482413 -99054846 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 463 1 993 2189 164 29 14 chr5 53482488 53482895 -99054364 - RLTR20D LTR ERVK -106 462 1 1 993 609 112 336 0 chr5 53482896 53483021 -99054238 + RLTR14 LTR ERV1 216 382 0 1 993 1327 210 123 6 chr5 53483175 53483501 -99053758 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 1 1 993 1200 213 169 3 chr5 53486404 53486729 -99050530 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 993 2600 232 109 87 chr5 53487032 53487873 -99049386 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 1 993 1126 204 162 55 chr5 53489241 53489604 -99047655 + MTD LTR MaLR 18 419 0 1 993 1899 304 65 64 chr5 53489608 53490645 -99046614 + MTD-int LTR MaLR 4 1088 -170 1 993 338 284 88 0 chr5 53492041 53492143 -99045116 + MTD-int LTR MaLR 1148 1258 0 1 993 1066 262 127 102 chr5 53492143 53492518 -99044741 + MTD LTR MaLR 14 389 -30 1 993 500 305 55 0 chr5 53492971 53493135 -99044124 - MER34A LTR ERV1 -327 244 72 1 993 1050 280 45 13 chr5 53494268 53494576 -99042683 - MTE2b LTR MaLR -44 335 18 1 993 367 195 148 23 chr5 53494920 53495030 -99042229 - MLT1B LTR MaLR 0 390 254 1 993 247 320 87 0 chr5 53496252 53496355 -99040904 - LTR81C LTR ERV1? -1 1152 1041 1 993 240 292 99 111 chr5 53496355 53496414 -99040845 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -1 1188 1029 1 993 888 244 22 126 chr5 53496815 53497092 -99040167 + ORR1E LTR MaLR 1 248 -111 1 993 1377 237 72 12 chr5 53497135 53497455 -99039804 + ORR1D2 LTR MaLR 29 367 -3 1 993 240 333 56 77 chr5 53503700 53503934 -99033325 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 14 242 -542 8 993 1004 240 55 0 chr5 53511645 53511862 -99025397 + ORR1E LTR MaLR 1 229 -130 2 993 343 177 62 2 chr5 53511950 53512022 -99025237 + ORR1E LTR MaLR 275 358 -21 2 993 435 322 8 0 chr5 53513639 53513760 -99023499 + MTD LTR MaLR 18 139 -280 2 993 606 340 73 34 chr5 53513764 53514118 -99023141 - LTR33A LTR ERVL -87 433 72 2 993 363 108 67 0 chr5 53528430 53528498 -99008761 + ORR1A2 LTR MaLR 1 105 -289 5 993 2044 129 3 10 chr5 53528498 53528836 -99008423 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 993 538 105 13 0 chr5 53532468 53532544 -99004715 + MTC LTR MaLR 1 77 -344 6 993 2440 103 38 3 chr5 53532706 53533048 -99004211 + MTC LTR MaLR 68 421 0 6 993 326 273 11 22 chr5 53542081 53542171 -98995088 - MLT1B LTR MaLR -299 91 3 8 993 1174 227 147 70 chr5 53545805 53546032 -98991227 + MLT2B1 LTR ERVL 1 233 -287 9 993 1174 227 147 70 chr5 53546052 53546307 -98990952 + MLT2B1 LTR ERVL 234 519 -1 9 993 364 309 37 75 chr5 53574179 53574340 -98962919 + MLT1A LTR MaLR 17 171 -203 1 994 1967 162 75 63 chr5 53608713 53609128 -98928131 - MTC LTR MaLR 0 421 2 2 994 286 330 72 85 chr5 53611716 53612034 -98925225 + MLT1H2 LTR MaLR 176 489 0 2 994 342 373 87 62 chr5 53613329 53613718 -98923541 + MLT1C LTR MaLR 8 412 -55 2 994 342 373 87 62 chr5 53613922 53613981 -98923278 + MLT1C LTR MaLR 413 467 0 2 994 811 284 140 14 chr5 53618521 53618807 -98918452 + MLT1A0 LTR MaLR 43 364 -1 2 994 268 221 0 29 chr5 53624653 53624723 -98912536 + ORR1E LTR MaLR 64 131 -228 2 994 263 295 31 21 chr5 53624831 53624928 -98912331 + ORR1E LTR MaLR 278 375 -4 2 994 369 299 85 28 chr5 53630313 53630454 -98906805 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 217 2 994 457 325 70 58 chr5 53634550 53635079 -98902180 + MLT1H LTR MaLR 40 555 0 2 994 817 289 43 0 chr5 53635798 53636009 -98901250 - MLT2D LTR ERVL -112 302 83 2 994 330 305 0 0 chr5 53636459 53636541 -98900718 - MLT2D LTR ERVL -327 87 6 2 994 719 322 115 57 chr5 53636551 53636976 -98900283 + MLT1C LTR MaLR 6 455 -12 2 994 1327 236 75 16 chr5 53637986 53638292 -98898967 - MTE2b LTR MaLR -55 324 1 2 994 389 296 113 84 chr5 53641609 53641986 -98895273 - MLT1A LTR MaLR 0 374 1 2 994 371 248 33 107 chr5 53643834 53643851 -98893408 + MLT1A LTR MaLR 38 47 -318 2 994 1800 226 36 19 chr5 53643851 53644262 -98892997 + MTD LTR MaLR 2 419 0 2 994 471 289 60 62 chr5 53644262 53644673 -98892586 + MLT1A LTR MaLR 48 405 -3 2 994 760 211 338 32 chr5 53644839 53645156 -98892103 - MTD LTR MaLR 0 419 6 2 994 284 287 20 50 chr5 53646877 53646976 -98890283 + MT2B LTR ERVL 169 264 -337 2 994 256 320 58 10 chr5 53648553 53648657 -98888602 + MLT1A1 LTR MaLR 300 408 0 2 994 2344 86 41 0 chr5 53651810 53652124 -98885135 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 994 1241 198 86 102 chr5 53653176 53653548 -98883711 + MTEa LTR MaLR 6 371 -8 2 994 1102 215 84 120 chr5 53654190 53654581 -98882678 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 3 994 235 254 18 0 chr5 53655416 53655471 -98881788 + RLTR19C LTR ERVK 42 97 -409 3 994 253 284 27 0 chr5 53656034 53656108 -98881151 + RLTR33 LTR ERVK 516 591 -87 3 994 3051 40 2 108 chr5 53656286 53656729 -98880530 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 994 1998 167 25 82 chr5 53661529 53661921 -98875338 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 3 994 921 219 57 86 chr5 53670073 53670508 -98866751 - MT2A LTR ERVL -12 589 1 3 994 980 264 77 4 chr5 53677258 53677592 -98859667 + MLT1B LTR MaLR 12 443 -24 3 994 2144 146 3 40 chr5 53678237 53678607 -98858652 - ORR1B2 LTR MaLR -11 356 1 3 994 578 310 29 0 chr5 53678722 53678896 -98858363 + MLT1B LTR MaLR 449 627 -26 3 994 310 254 0 27 chr5 53679655 53679728 -98857531 - ORR1E LTR MaLR -288 71 1 3 994 404 265 102 12 chr5 53681255 53681421 -98855838 - MTEb LTR MaLR 0 359 198 3 994 2837 83 162 0 chr5 53683681 53684139 -98853120 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 3 994 1269 314 59 18 chr5 53686069 53686507 -98850752 - MLT1C LTR MaLR -4 463 8 3 994 1009 233 88 154 chr5 53686600 53687260 -98849999 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 1 3 994 241 261 10 154 chr5 53688214 53688318 -98848941 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 304 3 994 466 248 80 40 chr5 53689028 53689179 -98848080 - RMER5 LTR ERV1 0 534 378 3 994 523 277 195 18 chr5 53690792 53691089 -98846170 + MLT1A0 LTR MaLR 3 359 -6 3 994 265 193 25 0 chr5 53692083 53692158 -98845101 - MLT2B4 LTR ERVL -2 727 638 3 994 634 271 143 43 chr5 53692718 53693141 -98844118 - MLT2B4 LTR ERVL -39 679 163 3 994 379 250 223 0 chr5 53694558 53694670 -98842589 + MER21B LTR ERV1 16 152 -711 3 994 701 302 39 60 chr5 53696200 53696584 -98840675 + MTEb LTR MaLR 4 379 0 3 994 262 292 61 30 chr5 53696801 53696900 -98840359 + ORR1E LTR MaLR 76 177 -182 3 994 291 385 69 0 chr5 53698793 53698923 -98838336 + LTR16C LTR ERVL 304 442 -47 3 994 528 281 104 45 chr5 53699062 53699330 -98837929 - MLT1M LTR MaLR -252 420 137 3 994 586 329 130 39 chr5 53709308 53709722 -98827537 - MLT1C LTR MaLR 0 467 16 3 994 269 324 71 91 chr5 53710369 53710566 -98826693 + MLT1A1 LTR MaLR 1 193 -215 3 994 236 247 45 154 chr5 53712003 53712113 -98825146 + MLT1A1 LTR MaLR 1 98 -310 3 994 816 253 91 11 chr5 53714002 53714278 -98822981 - MLT1B LTR MaLR -21 369 72 3 994 453 291 34 22 chr5 53718791 53718970 -98818289 - LTR33A LTR ERVL -35 485 305 4 994 604 279 48 48 chr5 53719199 53719387 -98817872 - LTR33A LTR ERVL -317 203 16 4 994 632 230 73 7 chr5 53720060 53720196 -98817063 + MTC LTR MaLR 269 413 -8 4 994 990 271 92 60 chr5 53721823 53722236 -98815023 - MLT1C LTR MaLR -31 436 11 4 994 254 362 72 20 chr5 53722681 53722833 -98814426 + LTR16A LTR ERVL 34 193 -258 4 994 310 373 22 0 chr5 53724105 53724239 -98813020 + MLT1K LTR MaLR 455 591 -4 4 994 888 319 66 34 chr5 53725055 53725435 -98811824 + LTR48B LTR ERV1 243 634 -10 4 994 1118 274 84 10 chr5 53727333 53727375 -98809884 - MLT2D LTR ERVL -1 413 372 4 994 1118 274 84 10 chr5 53727424 53727764 -98809495 - MLT2D LTR ERVL -43 371 3 4 994 925 280 96 33 chr5 53729086 53729418 -98807841 + ORR1E LTR MaLR 7 359 0 4 994 694 335 35 31 chr5 53730695 53730954 -98806305 + MLT1A LTR MaLR 109 368 -6 4 994 2230 209 62 31 chr5 53732520 53732946 -98804313 + RLTR20A LTR ERVK 1 445 -96 4 994 2230 209 62 31 chr5 53733014 53733105 -98804154 + RLTR20A LTR ERVK 446 533 -8 4 994 468 311 100 94 chr5 53733732 53734073 -98803186 - MLT1A0 LTR MaLR -22 343 1 4 994 316 324 20 72 chr5 53734734 53734887 -98802372 + MLT1C LTR MaLR 317 461 -6 4 994 1253 235 87 32 chr5 53735884 53736253 -98801006 - RMER13A LTR ERVK -395 465 77 4 994 648 312 106 7 chr5 53737241 53737525 -98799734 - MLT1K LTR MaLR -36 559 248 4 124 411 258 11 0 chr5 53739496 53739585 -98797674 - ORR1D2 LTR MaLR -278 92 3 4 995 649 263 115 19 chr5 53739587 53739796 -98797463 - ORR1E LTR MaLR -34 325 97 4 995 1062 288 14 20 chr5 53743186 53743480 -98793779 - RMER15 LTR ERVL -11 564 273 4 995 323 248 32 114 chr5 53743455 53743578 -98793681 - RMER15 LTR ERVL -405 170 58 4 995 496 175 17 104 chr5 53743633 53743748 -98793511 - MT2B LTR ERVL -337 264 160 4 995 242 252 92 67 chr5 53743854 53743973 -98793286 + MLT1J LTR MaLR 387 508 -4 4 995 454 321 118 23 chr5 53747092 53747312 -98789947 + RMER5 LTR ERV1 41 281 -253 4 995 360 300 29 44 chr5 53747326 53747462 -98789797 + RMER5 LTR ERV1 381 514 -20 4 995 485 308 78 66 chr5 53752450 53752784 -98784475 - MLT1H2 LTR MaLR -151 338 1 4 995 362 346 115 7 chr5 53753287 53753497 -98783762 - LTR33A_ LTR ERVL -269 262 15 4 995 280 318 204 18 chr5 53754625 53754846 -98782413 + ORR1D2 LTR MaLR 88 349 -21 4 995 405 162 112 9 chr5 53755638 53755738 -98781521 - MTD LTR MaLR -9 410 295 4 995 3720 112 97 2 chr5 53758686 53759232 -98778027 - MT2B LTR ERVL -3 598 1 4 995 1814 117 8 0 chr5 53759698 53759955 -98777304 + MTC LTR MaLR 1 259 -162 4 995 922 169 74 12 chr5 53760244 53760406 -98776853 + MTC LTR MaLR 250 421 0 4 995 1840 144 81 3 chr5 53760867 53761200 -98776059 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 4 995 804 193 65 57 chr5 53761968 53762272 -98774987 + RMER10A LTR ERVL 1 344 -98 4 995 2171 136 21 3 chr5 53762272 53762612 -98774647 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 995 804 185 106 91 chr5 53762612 53762705 -98774554 + RMER10A LTR ERVL 345 441 -1 4 995 249 328 8 49 chr5 53773223 53773345 -98763914 + MLT2F LTR ERVL 5 121 -542 5 995 2235 101 13 0 chr5 53774081 53774398 -98762861 + ORR1A4 LTR MaLR 7 327 -2 5 995 229 345 0 35 chr5 53774412 53774499 -98762760 - MLT1J LTR MaLR -260 252 169 5 995 308 306 39 55 chr5 53775968 53776096 -98761163 + MLT1A LTR MaLR 2 127 -247 5 995 273 246 33 0 chr5 53776182 53776243 -98761016 + MTD LTR MaLR 35 97 -324 5 995 1136 235 119 14 chr5 53776324 53776609 -98760650 + MTD LTR MaLR 105 419 0 5 995 228 273 31 102 chr5 53777294 53777392 -98759867 - RLTR25B LTR ERVK -496 532 442 5 995 633 265 214 72 chr5 53777580 53777598 -98759661 + MTD LTR MaLR 13 23 -384 5 995 693 252 116 42 chr5 53777624 53777951 -98759308 + MTD LTR MaLR 24 419 0 5 995 403 308 119 30 chr5 53779751 53779952 -98757307 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 147 5 995 483 202 16 16 chr5 53780274 53780400 -98756859 - MLT1A0 LTR MaLR -210 155 30 5 995 1204 248 19 105 chr5 53782831 53783241 -98754018 - MTE2a LTR MaLR 0 379 5 5 995 675 286 128 4 chr5 53785052 53785287 -98751972 + MTE2a LTR MaLR 1 264 -115 5 995 229 163 0 20 chr5 53786310 53786360 -98750899 - MTEb LTR MaLR -5 374 326 5 995 1312 240 48 7 chr5 53788958 53789248 -98748011 - MTD LTR MaLR -1 418 117 5 995 246 229 0 0 chr5 53800351 53800412 -98736847 - MLT1C LTR MaLR 0 505 445 5 995 306 311 115 62 chr5 53800451 53800711 -98736548 - MLT1C LTR MaLR -128 339 66 5 995 392 246 33 58 chr5 53801750 53801871 -98735388 + MLT1A1 LTR MaLR 291 408 0 5 995 525 272 159 37 chr5 53802288 53802686 -98734573 + MLT1C LTR MaLR 31 502 -3 5 995 281 265 160 20 chr5 53805941 53806041 -98731218 - MLT1A LTR MaLR 0 374 261 5 995 285 324 79 45 chr5 53807039 53807217 -98730042 + MLT1G3 LTR MaLR 106 289 -306 5 995 309 331 109 76 chr5 53807328 53807603 -98729656 + MLT1A1 LTR MaLR 26 309 -99 5 995 303 127 32 0 chr5 53809078 53809141 -98728118 - MER57C2 LTR ERV1 -5 429 365 5 995 1244 249 35 0 chr5 53809471 53809760 -98727499 - MER57C2 LTR ERV1 -135 299 1 5 995 248 291 109 151 chr5 53809950 53810234 -98727025 + MLT1H2-int LTR MaLR 318 589 -820 6 995 369 236 114 0 chr5 53810627 53810750 -98726509 - RMER15 LTR ERVL -37 538 402 6 995 555 287 72 122 chr5 53810973 53811161 -98726098 + MLT1H2-int LTR MaLR 715 878 -531 6 995 555 287 72 122 chr5 53811297 53811485 -98725774 + MLT1H2-int LTR MaLR 879 1072 -337 6 995 285 316 86 41 chr5 53811999 53812257 -98725002 + MLT1H2 LTR MaLR 306 579 0 6 995 571 281 109 59 chr5 53818853 53819193 -98718066 + MLT1J LTR MaLR 3 359 -153 6 995 582 332 79 47 chr5 53819442 53819783 -98717476 - ORR1E LTR MaLR -5 354 3 6 995 241 297 44 26 chr5 53824489 53824603 -98712656 + MTEb LTR MaLR 19 134 -225 6 995 321 262 4 11 chr5 53824739 53824841 -98712418 + MTEb LTR MaLR 278 379 0 6 995 261 217 81 46 chr5 53831332 53831419 -98705840 - MT2B2 LTR ERVL -326 258 169 6 995 294 297 3 91 chr5 53832305 53832510 -98704749 - MLT1J LTR MaLR -236 276 55 6 995 399 325 101 39 chr5 53834245 53834424 -98702835 - LTR16A LTR ERVL -257 194 5 6 995 494 306 14 69 chr5 53836105 53836249 -98701010 - MTEa LTR MaLR -233 146 11 6 995 549 328 102 34 chr5 53836313 53836592 -98700667 + MLT1D LTR MaLR 3 293 -212 6 995 549 328 102 34 chr5 53836858 53837048 -98700211 + MLT1D LTR MaLR 294 504 -1 6 995 373 330 115 63 chr5 53841246 53841595 -98695664 - MLT1K LTR MaLR -16 579 213 6 995 232 271 34 45 chr5 53842689 53842778 -98694481 + LTR81A LTR ERV1? 1040 1127 -223 6 995 227 271 68 0 chr5 53847170 53847229 -98690030 + MLT1J1 LTR MaLR 97 159 -285 6 995 524 311 108 60 chr5 53847554 53847906 -98689353 - MLT1A LTR MaLR -5 369 1 6 995 457 234 35 35 chr5 53852394 53852527 -98684732 - MLT1H LTR MaLR -32 528 388 6 995 290 347 86 86 chr5 53853430 53853780 -98683479 + ORR1E LTR MaLR 1 350 -9 6 995 338 251 210 9 chr5 53854363 53854579 -98682680 + MLT1H LTR MaLR 254 539 -10 6 995 269 339 122 63 chr5 53865843 53866145 -98671114 + ORR1E LTR MaLR 2 321 -38 7 124 325 299 128 13 chr5 53870561 53870717 -98666542 - MER31B LTR ERV1 -292 174 1 7 996 268 244 171 32 chr5 53874595 53874718 -98662541 - MLT1A1 LTR MaLR -252 156 17 7 996 520 318 115 35 chr5 53875754 53876041 -98661218 - MER68 LTR ERVL -2 561 252 7 996 241 271 219 8 chr5 53876373 53876492 -98660767 + MER57C2 LTR ERV1 15 158 -276 7 996 231 222 18 36 chr5 53876686 53876742 -98660517 - MER68 LTR ERVL -491 72 18 7 996 1472 253 63 29 chr5 53877285 53877773 -98659486 + MLT1D LTR MaLR 1 505 0 7 996 230 233 0 0 chr5 53883490 53883533 -98653726 - MTEa LTR MaLR 0 379 337 7 996 792 212 14 0 chr5 53886048 53886194 -98651065 + MTEa LTR MaLR 18 165 -214 7 996 981 226 167 25 chr5 53889557 53889874 -98647385 + ORR1D2 LTR MaLR 9 370 0 7 996 941 73 6 18 chr5 53890486 53890653 -98646606 - RMER17B LTR ERVK -495 463 299 7 996 595 290 51 71 chr5 53894841 53895196 -98642063 - ORR1E LTR MaLR -6 364 23 7 996 634 279 88 15 chr5 53896031 53896293 -98640966 + MLT1C LTR MaLR 104 384 -83 7 996 968 252 42 8 chr5 53896589 53896849 -98640410 - ORR1D2 LTR MaLR -29 341 73 7 996 272 234 16 0 chr5 53897288 53897352 -98639907 - ORR1D2 LTR MaLR -305 65 1 7 996 761 251 216 27 chr5 53898783 53899111 -98638148 - MTD LTR MaLR -20 399 10 7 996 256 308 165 73 chr5 53901687 53901960 -98635299 - ORR1E LTR MaLR 0 359 62 7 996 826 254 41 112 chr5 53905402 53905769 -98631490 - MTE2a LTR MaLR -18 401 54 7 996 365 300 143 64 chr5 53913831 53914159 -98623100 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 8 996 359 333 21 14 chr5 53915040 53915183 -98622076 - MLT1F LTR MaLR -93 455 312 8 996 712 259 49 36 chr5 53923407 53923683 -98613576 + MTE2b LTR MaLR 150 419 0 8 996 789 273 70 68 chr5 53933944 53934357 -98602902 + RMER10A LTR ERVL 29 442 0 8 996 865 271 30 52 chr5 53939078 53939424 -98597835 - MTE2a LTR MaLR -43 376 37 8 996 534 159 26 94 chr5 53941599 53941781 -98595478 + ORR1C2 LTR MaLR 1 142 -242 8 996 228 56 0 0 chr5 53941751 53941787 -98595472 + ORR1C2 LTR MaLR 82 117 -277 8 996 1494 180 34 28 chr5 53941789 53941906 -98595353 + ORR1B2 LTR MaLR 41 154 -213 8 996 1494 180 34 28 chr5 53941984 53942191 -98595068 + ORR1B2 LTR MaLR 155 366 -1 8 996 256 249 36 11 chr5 53943568 53943664 -98593595 - LTR37B LTR ERV1 -11 457 317 8 996 277 276 93 71 chr5 53946405 53946588 -98590671 + RLTR23 LTR ERV1 242 428 -2 8 996 336 169 68 16 chr5 53946759 53946864 -98590395 - MTC LTR MaLR -2 419 262 8 996 439 268 38 32 chr5 53973244 53973402 -98563857 - RMER10B LTR ERVL -46 352 194 9 996 328 206 16 116 chr5 53999211 53999332 -98537927 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 1 997 1683 256 45 65 chr5 54004794 54005409 -98531850 - RLTR40 LTR ERVK -4 813 211 1 997 448 211 74 68 chr5 54005570 54005733 -98531526 - RLTR40 LTR ERVK -653 164 1 1 997 804 318 65 46 chr5 54006914 54007286 -98529973 - MER21B LTR ERV1 -89 774 396 1 997 472 325 35 12 chr5 54010329 54010500 -98526759 + RMER15 LTR ERVL 380 554 -21 2 997 1608 145 151 57 chr5 54014336 54014687 -98522572 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 997 923 194 133 110 chr5 54015563 54015961 -98521298 + MT2A LTR ERVL 1 528 -73 2 997 1234 149 104 36 chr5 54016027 54016305 -98520954 + ORR1C2 LTR MaLR 78 374 -10 2 997 1367 256 109 27 chr5 54024321 54024798 -98512461 - RMER5 LTR ERV1 -18 516 1 4 997 1030 213 215 16 chr5 54027842 54028205 -98509054 - RMER5 LTR ERV1 -52 482 48 4 997 296 280 55 27 chr5 54050410 54050520 -98486739 - MLT1A LTR MaLR -69 305 193 7 997 1964 180 82 8 chr5 54053594 54053986 -98483273 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 997 303 261 171 132 chr5 54055997 54056248 -98481011 - MTEb LTR MaLR -1 378 118 8 997 343 269 141 27 chr5 54057158 54057307 -98479952 - MT2B LTR ERVL -2 599 434 8 997 1242 84 0 0 chr5 54059411 54059577 -98477682 + ORR1A2 LTR MaLR 2 167 -160 9 997 3147 53 8 8 chr5 54059837 54060233 -98477026 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 997 420 255 254 21 chr5 54061537 54061773 -98475486 - MER67A LTR ERV1 -237 306 16 9 997 748 235 42 117 chr5 54061941 54062326 -98474933 + RMER17C LTR ERVK 6 361 -49 9 997 1377 157 11 64 chr5 54062668 54062933 -98474326 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 179 1 997 424 223 40 33 chr5 54062926 54063078 -98474181 - RLTR23 LTR ERV1 -159 271 86 1 997 563 165 39 0 chr5 54064565 54064668 -98472591 + MTD LTR MaLR 5 111 -308 1 997 2669 140 39 39 chr5 54065011 54065493 -98471766 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 997 6319 115 126 64 chr5 54065629 54066232 -98471027 + RMER17C-int LTR ERVK 1917 2595 -643 1 997 6319 115 126 64 chr5 54066282 54066528 -98470731 + RMER17C-int LTR ERVK 2596 2874 -364 1 997 6319 115 126 64 chr5 54066559 54066871 -98470388 + RMER17C-int LTR ERVK 2875 3202 -36 1 997 1132 175 34 31 chr5 54066872 54067180 -98470079 + RMER17C LTR ERVK 27 512 -297 1 997 928 118 26 13 chr5 54067501 54067656 -98469603 + RMER17C LTR ERVK 253 409 -1 1 997 294 119 33 17 chr5 54069133 54069193 -98468066 + RLTR19-int LTR ERVK 2330 2390 -3747 1 997 270 375 66 31 chr5 54070871 54071099 -98466160 - ORR1E LTR MaLR -105 254 19 1 997 4651 75 20 0 chr5 54072848 54073435 -98463824 - MT2B LTR ERVL 0 601 3 1 997 744 257 34 159 chr5 54073784 54074165 -98463094 + MTE2a LTR MaLR 1 391 -28 1 997 2668 65 3 20 chr5 54080361 54080719 -98456540 + RLTR8 LTR ERVK 3 354 -11 1 997 585 302 107 78 chr5 54081324 54081697 -98455562 + MLT1B LTR MaLR 7 390 0 1 997 415 241 13 122 chr5 54082314 54082470 -98454789 + MLT1D LTR MaLR 213 351 -154 1 997 469 322 74 14 chr5 54083251 54083572 -98453687 - MLT1B LTR MaLR -5 385 1 1 997 2481 173 31 72 chr5 54085718 54085751 -98451508 - RLTR20B3 LTR ERVK -58 519 487 1 997 2481 173 31 72 chr5 54085790 54086297 -98450962 - RLTR20B3 LTR ERVK -91 486 3 1 997 646 331 122 23 chr5 54100389 54100782 -98436477 + MT2A LTR ERVL 1 432 -101 1 997 267 238 133 120 chr5 54100804 54100919 -98436340 + MT2A LTR ERVL 372 489 -44 1 997 267 238 133 120 chr5 54100965 54101007 -98436252 + MT2A LTR ERVL 490 531 -2 1 997 353 319 80 27 chr5 54112030 54112217 -98425042 + MLT1A0 LTR MaLR 162 358 -7 1 997 416 256 177 115 chr5 54117096 54117480 -98419779 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 2 997 509 325 139 13 chr5 54119323 54119632 -98417627 - ORR1E LTR MaLR -3 356 9 2 997 1431 294 168 31 chr5 54119641 54120283 -98416976 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 798 2 997 864 261 105 17 chr5 54120633 54120871 -98416388 - MTEb LTR MaLR -118 261 3 2 997 311 212 53 34 chr5 54121809 54121906 -98415353 - MLT1A0 LTR MaLR -260 114 20 2 997 1060 191 73 30 chr5 54122224 54122553 -98414706 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 2 997 271 357 28 14 chr5 54128935 54129077 -98408182 + MLT1J1 LTR MaLR 23 166 -278 2 997 322 276 0 75 chr5 54129484 54129578 -98407681 + MLT2C1 LTR ERVL 469 555 -8 2 998 267 308 224 20 chr5 54138022 54138277 -98398982 + MLT1G1 LTR MaLR 110 416 -163 2 998 540 273 52 37 chr5 54138901 54139104 -98398155 - ORR1E LTR MaLR -136 234 32 2 998 248 213 33 0 chr5 54145741 54145802 -98391457 + RMER20B LTR ERVK 243 305 -322 2 998 444 283 88 29 chr5 54150793 54150980 -98386279 + MTD LTR MaLR 10 179 -200 2 998 263 265 237 22 chr5 54150987 54151126 -98386133 - MTD LTR MaLR -27 392 224 2 998 500 242 90 69 chr5 54153013 54153302 -98383957 + RMER10A LTR ERVL 1 295 -147 2 998 229 237 123 92 chr5 54155728 54155923 -98381336 - MLT1C LTR MaLR -194 273 73 2 998 342 269 311 32 chr5 54157572 54157782 -98379477 - MLT1A0 LTR MaLR -23 342 96 2 998 1193 269 131 0 chr5 54159081 54159416 -98377843 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 2 998 240 317 55 39 chr5 54159858 54159986 -98377273 - ORR1E LTR MaLR -210 149 20 2 998 633 245 4 128 chr5 54160893 54161127 -98376132 + RMER5 LTR ERV1 13 217 -317 2 998 1548 148 11 25 chr5 54161172 54161449 -98375810 + ORR1B2 LTR MaLR 95 367 0 2 998 1092 261 16 29 chr5 54161449 54161759 -98375500 + RMER5 LTR ERV1 229 534 0 2 998 628 264 49 58 chr5 54162818 54163099 -98374160 + MTD LTR MaLR 6 283 -136 2 998 475 268 71 0 chr5 54163138 54163265 -98373994 + MTD LTR MaLR 270 405 -14 2 998 1569 241 35 22 chr5 54175100 54175469 -98361790 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 998 1181 243 128 44 chr5 54179259 54179642 -98357617 + MTD LTR MaLR 3 417 -2 2 998 865 319 28 13 chr5 54180464 54180781 -98356478 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 44 2 998 418 292 54 27 chr5 54182060 54182208 -98355051 + MLT1B LTR MaLR 211 362 -28 2 998 2083 159 58 32 chr5 54188070 54188447 -98348812 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 8 3 998 2081 185 104 31 chr5 54190302 54190820 -98346439 + RLTR31_Mm LTR ERVK 6 561 0 3 998 2034 92 81 21 chr5 54190826 54191158 -98346101 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 8 3 998 397 271 44 6 chr5 54191453 54191569 -98345690 + MTB_Mm LTR MaLR 1 130 -277 3 998 397 314 208 41 chr5 54191603 54191800 -98345459 + MTB_Mm LTR MaLR 131 375 -44 3 998 617 260 94 24 chr5 54193650 54193910 -98343349 + MLT2C2 LTR ERVL 6 308 -156 3 998 1480 198 3 81 chr5 54193910 54194267 -98342992 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 998 617 214 99 43 chr5 54194267 54194284 -98342975 + MLT2C2 LTR ERVL 309 325 -139 3 998 2401 121 63 0 chr5 54197491 54197854 -98339405 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 998 1136 278 100 29 chr5 54202094 54202475 -98334784 + MTD LTR MaLR 1 408 -11 3 998 1742 151 18 153 chr5 54204748 54205185 -98332074 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 998 1697 80 50 0 chr5 54217791 54218029 -98319230 - MT2B2 LTR ERVL -334 250 1 3 998 1617 231 11 58 chr5 54222541 54222923 -98314336 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 1 3 998 264 330 16 25 chr5 54223324 54223445 -98313814 - LTR79 LTR ERVL -1 526 407 3 998 328 242 131 0 chr5 54223628 54223727 -98313532 + MLT1A1 LTR MaLR 1 112 -296 3 998 226 286 0 16 chr5 54223809 54223873 -98313386 + MLT1A1 LTR MaLR 291 353 -55 3 998 1812 165 3 65 chr5 54225171 54225522 -98311737 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 998 1102 206 145 7 chr5 54226738 54227021 -98310238 - ORR1D2 LTR MaLR -48 322 1 3 998 314 333 64 45 chr5 54257701 54257921 -98279338 - MLT1D LTR MaLR -15 490 267 4 998 412 309 177 21 chr5 54257943 54258135 -98279124 - MLT1D LTR MaLR -189 316 95 4 998 227 356 55 0 chr5 54259272 54259345 -98277914 - MLT1D LTR MaLR -420 85 9 4 998 2507 97 91 3 chr5 54260297 54260661 -98276598 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 999 1665 181 74 57 chr5 54265219 54265623 -98271636 - MTC LTR MaLR -1 420 10 4 999 3235 71 15 2 chr5 54282088 54282483 -98254776 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 999 248 275 8 121 chr5 54305307 54305431 -98231828 - RMER4B LTR ERVK -417 168 59 4 999 885 317 25 61 chr5 54305791 54306158 -98231101 + MLT1A LTR MaLR 24 627 0 4 999 328 274 14 0 chr5 54308581 54308654 -98228605 + MER76 LTR ERVL 32 105 -586 4 999 628 298 124 42 chr5 54308671 54309081 -98228178 + MER76 LTR ERVL 205 648 -43 4 999 417 284 90 36 chr5 54310153 54310433 -98226826 + MLT1A1 LTR MaLR 1 403 -5 4 999 281 355 25 89 chr5 54315308 54315543 -98221716 - LTR52 LTR ERVL -42 379 160 5 999 233 276 121 65 chr5 54322308 54322432 -98214827 + MLT1J2 LTR MaLR 3 133 -315 5 999 1975 135 154 0 chr5 54325492 54325626 -98211633 + ORR1B2 LTR MaLR 1 151 -216 5 999 1975 135 154 0 chr5 54325673 54325856 -98211403 + ORR1B2 LTR MaLR 152 366 -1 5 999 508 306 112 68 chr5 54325972 54326312 -98210947 - MLT1K LTR MaLR -114 481 127 5 999 231 275 42 42 chr5 54328396 54328468 -98208791 - MLT1H2 LTR MaLR -67 422 351 5 999 572 311 82 21 chr5 54328505 54328748 -98208511 - MLT1H2 LTR MaLR -231 258 1 5 999 597 284 113 0 chr5 54331393 54331587 -98205672 + MLT1A0 LTR MaLR 150 365 0 5 999 377 253 209 28 chr5 54332228 54332466 -98204793 - MLT1A0 LTR MaLR -11 379 65 5 999 297 333 31 49 chr5 54335497 54335721 -98201538 + MLT1C LTR MaLR 190 409 -58 5 999 308 288 152 40 chr5 54337584 54337808 -98199451 + LTR33 LTR ERVL 38 286 -229 5 999 225 319 42 14 chr5 54338077 54338220 -98199039 + LTR33 LTR ERVL 358 504 -11 5 999 275 231 35 23 chr5 54338936 54339029 -98198230 + LTR16E1 LTR ERVL 361 535 -3 5 999 3192 51 38 2 chr5 54346491 54346884 -98190375 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 999 907 142 43 63 chr5 54350747 54351222 -98186037 - RMER17C LTR ERVK -5 405 1 5 999 460 267 50 71 chr5 54351885 54352148 -98185111 + MTEb LTR MaLR 100 379 0 5 999 2255 101 9 15 chr5 54355509 54355840 -98181419 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 999 564 268 40 22 chr5 54360164 54360553 -98176706 + MLT1D LTR MaLR 44 475 -30 5 999 788 302 46 94 chr5 54369683 54370077 -98167182 + MTEa LTR MaLR 1 375 -4 5 999 240 247 92 23 chr5 54373748 54373835 -98163424 - MLT1L LTR MaLR -3 607 515 5 999 1306 175 8 134 chr5 54376460 54376817 -98160442 - MTD LTR MaLR -107 312 1 5 999 313 192 110 0 chr5 54377652 54377725 -98159534 + MLT1C LTR MaLR 1 81 -386 6 999 258 231 123 37 chr5 54378517 54378598 -98158661 + MLT1C LTR MaLR 298 385 -82 6 999 578 358 97 28 chr5 54380325 54380788 -98156471 + ORR1D-int LTR MaLR 775 1269 -101 6 999 2987 121 37 35 chr5 54381348 54381797 -98155462 + RLTR20A LTR ERVK 1 442 -99 6 999 2987 121 37 35 chr5 54382058 54382146 -98155113 + RLTR20A LTR ERVK 443 541 0 6 999 247 268 42 0 chr5 54382586 54382657 -98154602 + ORR1D-int LTR MaLR 1409 1482 -98 6 999 1721 170 111 24 chr5 54382668 54383048 -98154211 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 999 501 276 86 6 chr5 54383078 54383253 -98154006 + ORR1E LTR MaLR 1 189 -170 6 1000 329 255 0 109 chr5 54406517 54406636 -98130623 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 6 1000 264 324 119 60 chr5 54407501 54407770 -98129489 + ORR1E LTR MaLR 1 285 -74 6 1000 269 321 184 45 chr5 54411809 54412119 -98125140 + MLT1A0 LTR MaLR 1 353 -12 6 1000 1242 251 65 17 chr5 54418093 54418446 -98118813 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 1000 291 323 14 76 chr5 54418567 54418711 -98118548 - MLT2C1 LTR ERVL -51 346 212 6 1000 1154 283 108 14 chr5 54418765 54419358 -98117901 - ERVL-B4-int LTR ERVL -735 4979 4334 6 1000 1375 312 79 16 chr5 54419383 54420067 -98117192 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1512 4202 3476 6 1000 867 274 96 11 chr5 54420270 54420647 -98116612 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2246 3421 3013 6 1000 377 261 36 22 chr5 54420730 54420867 -98116392 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3120 2594 2456 6 1000 269 253 44 0 chr5 54420869 54420960 -98116299 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3971 1743 1649 6 1000 632 333 96 9 chr5 54420999 54421550 -98115709 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4148 1566 968 6 1000 1173 282 99 19 chr5 54422069 54422657 -98114602 - ERVL-B4-int LTR ERVL -5079 635 1 6 1000 722 320 90 17 chr5 54422664 54423010 -98114249 - MLT2C1 LTR ERVL -26 371 1 6 1000 353 372 43 14 chr5 54434230 54434440 -98102819 - LTR83 LTR ERVL -29 751 536 6 1000 401 332 59 81 chr5 54438681 54439033 -98098226 - ORR1E LTR MaLR -13 366 9 7 1000 242 299 0 0 chr5 54439886 54439963 -98097296 + RMER12B LTR ERVK 867 943 -461 7 1000 290 324 79 26 chr5 54442368 54442558 -98094701 - MLT1A1 LTR MaLR -208 200 1 7 1000 588 297 133 39 chr5 54445207 54445515 -98091744 - MLT1H2 LTR MaLR -88 401 65 7 1000 473 331 83 57 chr5 54448654 54448990 -98088269 - ORR1E LTR MaLR -8 351 7 7 1000 295 192 238 25 chr5 54449174 54449254 -98088005 - MLT1F2 LTR MaLR -286 274 168 7 1000 227 355 86 31 chr5 54449488 54449646 -98087613 - MLT1F2 LTR MaLR -393 167 1 7 1000 1925 153 11 8 chr5 54452580 54452936 -98084323 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 3 7 1000 2993 62 26 0 chr5 54457022 54457412 -98079847 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1000 3322 28 2 34 chr5 54465760 54466169 -98071090 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1000 370 151 36 26 chr5 54467818 54467942 -98069317 + RMER17B LTR ERVK 353 509 -397 7 1000 464 319 126 69 chr5 54470237 54470758 -98066501 + RMER20B LTR ERVK 97 619 -23 7 1000 1830 110 11 117 chr5 54481189 54481549 -98055710 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 5 7 1000 1701 158 90 18 chr5 54485729 54486064 -98051195 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 7 1000 639 296 102 28 chr5 54507533 54507787 -98029472 - MLT1E3 LTR MaLR -31 593 321 5 1000 438 150 24 48 chr5 54513946 54514072 -98023187 - RMER17C LTR ERVK -135 275 153 1 1000 2426 157 13 20 chr5 54521886 54522283 -98014976 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1000 462 156 33 11 chr5 54522850 54522941 -98014318 + MTE2a LTR MaLR 279 371 -8 2 1000 2382 47 6 6 chr5 54523383 54523708 -98013551 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 33 2 1001 1699 189 67 8 chr5 54526160 54526518 -98010741 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 5 3 1001 2556 173 46 58 chr5 54526518 54526637 -98010622 - ORR1C2-int LTR MaLR -6 1503 1406 3 1001 2556 173 46 58 chr5 54526823 54527286 -98009973 - ORR1C2-int LTR MaLR -104 1405 928 3 1001 808 19 0 0 chr5 54527303 54527406 -98009853 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 103 -379 3 1001 3053 28 3 0 chr5 54533901 54534289 -98002970 + LTRIS_Mm LTR ERV1 94 482 0 3 1001 2929 62 25 0 chr5 54534289 54534657 -98002602 + MuRRS-int LTR ERV1 1 377 -4313 3 1001 7563 41 4 16 chr5 54534654 54535574 -98001685 + MuRRS-int LTR ERV1 574 1482 -3208 3 1001 25646 34 4 18 chr5 54535571 54538618 -97998641 + MuRRS-int LTR ERV1 1686 4690 0 3 1001 4264 11 25 0 chr5 54538618 54539088 -97998171 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 3 1001 1905 200 105 13 chr5 54539091 54539668 -97997591 - ORR1C2-int LTR MaLR -987 805 141 3 1001 404 264 72 87 chr5 54539943 54540138 -97997121 + RMER2 LTR ERV1 334 525 -42 3 1001 608 199 53 15 chr5 54540190 54540323 -97996936 - ORR1C2-int LTR MaLR -1232 138 1 3 1001 866 201 73 0 chr5 54540330 54540509 -97996750 - ORR1C2 LTR MaLR -13 371 180 3 1001 3690 159 25 43 chr5 54540535 54541293 -97995966 + RLTR25B LTR ERVK 28 771 -257 3 1001 796 183 134 65 chr5 54541508 54541562 -97995697 + RLTR25B LTR ERVK 766 825 -203 3 1001 796 183 134 65 chr5 54541611 54541802 -97995457 + RLTR25B LTR ERVK 826 1028 0 3 1001 339 204 26 77 chr5 54541817 54541934 -97995325 - ORR1C2 LTR MaLR -267 111 1 3 1001 983 324 70 20 chr5 54541938 54542436 -97994823 - ORR1E-int LTR MaLR -1057 523 1 3 1001 255 196 120 0 chr5 54542442 54542534 -97994725 - ORR1E LTR MaLR -4 355 253 3 1001 230 260 71 20 chr5 54543123 54543221 -97994038 - ORR1E LTR MaLR -258 126 24 3 1001 381 219 71 36 chr5 54545801 54545961 -97991298 - ORR1E LTR MaLR -210 160 4 4 1001 555 306 60 22 chr5 54555120 54555387 -97981872 + MLT1H LTR MaLR 14 290 -259 5 1001 374 304 29 23 chr5 54559094 54559266 -97977993 + MLT1F2 LTR MaLR 388 560 0 6 1001 880 9 0 0 chr5 54561810 54561916 -97975343 + MTA_Mm LTR MaLR 291 396 0 6 1001 1658 167 102 34 chr5 54564161 54564346 -97972913 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 168 7 1001 1658 167 102 34 chr5 54564526 54564693 -97972566 - ORR1C1 LTR MaLR -211 167 1 7 1001 7011 192 43 20 chr5 54564693 54565867 -97971392 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 284 7 1001 7011 192 43 20 chr5 54565901 54566202 -97971057 - ORR1C1-int LTR MaLR -1226 283 1 7 1001 1329 188 115 44 chr5 54566213 54566553 -97970706 - ORR1C1 LTR MaLR -14 364 1 7 1001 2056 76 34 120 chr5 54569281 54569639 -97967620 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1001 313 360 24 75 chr5 54571369 54571640 -97965619 + MLT1H1 LTR MaLR 1 302 -293 8 1001 300 243 178 0 chr5 54571664 54571771 -97965488 + MLT1H1 LTR MaLR 386 511 -38 8 1001 424 238 75 19 chr5 54575210 54575317 -97961942 - MTEa LTR MaLR -7 372 260 9 1001 233 300 14 14 chr5 54575534 54575605 -97961654 - MTEa LTR MaLR -267 92 22 9 1001 228 316 76 17 chr5 54575882 54576001 -97961258 + MER90a LTR ERV1 471 596 -18 9 1001 345 321 44 6 chr5 54576108 54576268 -97960991 + ORR1E LTR MaLR 22 187 -172 9 1001 1052 196 135 43 chr5 54578264 54578568 -97958691 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 1 1001 3071 71 10 2 chr5 54579781 54580178 -97957081 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1001 559 304 98 4 chr5 54584006 54584250 -97953009 + MLT1C LTR MaLR 182 448 -19 1 1001 393 327 42 57 chr5 54587383 54587646 -97949613 - RMER15 LTR ERVL -42 533 275 1 1001 225 266 50 12 chr5 54587836 54587916 -97949343 + MLT1G1 LTR MaLR 401 483 -96 1 1001 749 248 133 61 chr5 54599419 54599780 -97937479 - MTD LTR MaLR -32 387 1 1 1001 984 218 20 10 chr5 54601910 54602109 -97935150 + MTE2b LTR MaLR 178 378 -1 1 1001 509 276 13 19 chr5 54602116 54602275 -97934984 - RMER15 LTR ERVL -70 505 348 1 1001 430 288 105 0 chr5 54604865 54605018 -97932241 - MLT1C LTR MaLR -17 450 282 1 1001 456 321 78 22 chr5 54605130 54605401 -97931858 + MLT1B LTR MaLR 103 388 -2 1 1001 630 316 84 45 chr5 54613944 54614371 -97922888 - MLT1C LTR MaLR -3 464 21 1 1001 306 241 170 0 chr5 54617981 54618093 -97919166 + MLT1J1 LTR MaLR 1 131 -313 1 1001 298 275 0 35 chr5 54622335 54622448 -97914811 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 298 1 1001 244 274 35 62 chr5 54626017 54626130 -97911129 + MLT1L LTR MaLR 92 201 -409 1 1001 633 319 104 21 chr5 54627457 54627784 -97909475 + MLT1A0 LTR MaLR 1 354 -11 1 1001 365 370 12 0 chr5 54631063 54631236 -97906023 - MLT-int LTR MaLR -1129 606 432 1 1001 556 349 30 49 chr5 54631504 54631832 -97905427 - MLT-int LTR MaLR -1323 412 91 1 1001 579 326 36 76 chr5 54631902 54632204 -97905055 - MLT1A LTR MaLR 0 374 85 1 1001 903 234 98 119 chr5 54633719 54633866 -97903393 + MLT1B LTR MaLR 30 187 -203 1 1001 903 234 98 119 chr5 54634046 54634267 -97902992 + MLT1B LTR MaLR 188 390 0 1 1001 314 301 119 33 chr5 54634579 54634789 -97902470 - MLT1H1 LTR MaLR -195 360 133 1 1001 3227 61 8 0 chr5 54634996 54635391 -97901868 - MTB LTR MaLR 0 400 3 1 1001 852 291 24 82 chr5 54635492 54635870 -97901389 - MLT1B LTR MaLR -27 363 8 1 1001 1154 219 116 29 chr5 54636717 54637061 -97900198 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1001 1392 182 65 152 chr5 54637090 54637492 -97899767 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1001 1772 200 205 16 chr5 54640894 54641397 -97895862 + RMER19B LTR ERVK 305 902 0 1 1001 485 309 126 24 chr5 54642424 54642679 -97894580 - MLT2B2 LTR ERVL -14 501 221 2 1001 310 278 20 10 chr5 54643255 54643353 -97893906 - MLT2B2 LTR ERVL -380 135 37 2 1001 353 296 66 29 chr5 54644064 54644200 -97893059 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 268 2 1001 237 339 35 26 chr5 54644296 54644411 -97892848 - MLT1A1 LTR MaLR -224 141 26 2 1001 429 386 43 0 chr5 54648533 54648813 -97888446 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 71 2 1001 2604 148 5 15 chr5 54654598 54655009 -97882250 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1002 1644 188 53 12 chr5 54663213 54663553 -97873706 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 2 1002 550 288 100 32 chr5 54666875 54667184 -97870075 - MTEa LTR MaLR 0 379 6 2 1002 1593 110 28 0 chr5 54667558 54667813 -97869446 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 267 2 1002 382 287 92 35 chr5 54673653 54673794 -97863465 + MLT1A0 LTR MaLR 4 152 -222 2 1002 717 249 92 26 chr5 54673907 54674132 -97863127 + MLT1A0 LTR MaLR 126 365 0 2 1002 541 353 166 13 chr5 54674581 54674960 -97862299 - MLT1K LTR MaLR -10 585 149 2 1002 4299 45 6 0 chr5 54693953 54694462 -97842797 + LTRIS3 LTR ERV1 1 512 0 2 1002 1510 196 89 29 chr5 54712035 54712382 -97824877 + ORR1D1 LTR MaLR 1 368 -6 2 1002 339 260 84 65 chr5 54720745 54720852 -97816407 - MLT1B LTR MaLR -7 460 352 3 1002 609 296 75 75 chr5 54720876 54721154 -97816105 - MLT1B LTR MaLR -187 280 3 3 1002 253 375 132 0 chr5 54726889 54727033 -97810226 + LTR86A2 LTR ERVL 5 167 -341 3 1002 289 326 144 24 chr5 54731985 54732198 -97805061 + MLT1F2 LTR MaLR 304 548 -12 3 1002 1136 274 82 36 chr5 54732825 54732989 -97804270 - MTE2b LTR MaLR -4 375 212 3 1002 1136 274 82 36 chr5 54733038 54733229 -97804030 - MTE2b LTR MaLR -168 211 4 3 1002 2052 235 16 128 chr5 54736442 54737130 -97800129 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 1002 282 364 16 56 chr5 54739740 54739865 -97797394 - MLT1I LTR MaLR -278 133 14 3 1002 984 261 80 56 chr5 54743229 54743602 -97793657 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 3 1002 2239 162 8 3 chr5 54753980 54754345 -97782914 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1002 3667 220 90 32 chr5 54754348 54755620 -97781639 - ORR1B2-int LTR MaLR -10 1360 1 3 1002 2233 151 25 3 chr5 54755620 54755979 -97781280 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1002 712 261 87 13 chr5 54757067 54757271 -97779988 - ORR1D2 LTR MaLR -58 316 96 3 1002 641 297 68 29 chr5 54760394 54760751 -97776508 - MTD LTR MaLR -15 404 5 3 1002 290 320 51 11 chr5 54761924 54762043 -97775216 + MLT1G3 LTR MaLR 306 421 -158 3 1002 1099 298 50 18 chr5 54769318 54769755 -97767504 + RMER15-int LTR ERVL 4197 4647 -352 3 1002 410 200 11 22 chr5 54769781 54769873 -97767386 + RMER15-int LTR ERVL 4888 4978 -21 3 1002 249 256 126 99 chr5 54769880 54770071 -97767188 + RMER15 LTR ERVL 8 203 -372 3 1002 463 296 0 34 chr5 54770088 54770235 -97767024 + RMER15 LTR ERVL 345 486 -89 3 1002 1718 309 80 43 chr5 54770619 54771584 -97765675 - MLT1H-int LTR MaLR -191 1298 181 3 1002 333 320 63 17 chr5 54771610 54771785 -97765474 + MLT1D LTR MaLR 34 216 -289 3 1002 1345 285 101 33 chr5 54773993 54774537 -97762722 + LTR69 LTR ERVL 1 581 -7 3 1002 359 312 83 122 chr5 54784971 54785332 -97751927 + MLT1A0 LTR MaLR 11 357 -8 3 1002 319 298 98 27 chr5 54787015 54787037 -97750222 - RLTR21 LTR ERVK -351 971 951 3 1002 587 234 77 26 chr5 54787106 54787341 -97749918 - RLTR21 LTR ERVK -266 1306 1066 3 1003 1565 263 22 79 chr5 54789338 54789783 -97747476 - RMER19C LTR ERVK 0 611 190 3 1003 1565 263 22 79 chr5 54789878 54789927 -97747332 - RMER19C LTR ERVK -422 189 145 3 1003 1439 235 51 13 chr5 54791179 54791494 -97745765 - RLTR21 LTR ERVK -1245 327 1 3 1003 1886 136 27 59 chr5 54795291 54795628 -97741631 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 1003 894 267 117 8 chr5 54796592 54796841 -97740418 + MLT1A0 LTR MaLR 81 356 -9 4 1003 708 322 132 50 chr5 54798035 54798453 -97738806 - MLT1E2 LTR MaLR -4 623 172 4 1003 311 306 66 8 chr5 54799246 54799368 -97737891 - MLT1E2 LTR MaLR -426 198 70 4 1003 611 339 134 49 chr5 54799942 54800459 -97736800 - MER67C LTR ERV1 0 514 1 4 1003 834 310 32 109 chr5 54800620 54801025 -97736234 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 4 1003 1066 336 37 47 chr5 54803596 54804086 -97733173 + MLT2B1 LTR ERVL 30 514 -6 4 1003 1132 218 129 9 chr5 54804799 54805133 -97732126 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1003 529 150 0 1 chr5 54808743 54808832 -97728427 + MT2B LTR ERVL 1 88 -445 4 1003 777 241 118 117 chr5 54808931 54809133 -97728126 + MT2B LTR ERVL 57 337 -264 4 1003 848 229 24 75 chr5 54809566 54809799 -97727460 + MT2B LTR ERVL 180 540 -61 4 1003 255 169 0 3 chr5 54809983 54810033 -97727226 + MT2B2 LTR ERVL 542 584 0 4 1003 269 231 19 0 chr5 54810033 54810084 -97727175 - MLT1A0 LTR MaLR -87 278 227 4 1003 302 346 161 36 chr5 54814575 54814824 -97722435 - MLT1K LTR MaLR -16 579 300 4 1003 313 268 29 73 chr5 54818916 54819053 -97718206 + RMER15 LTR ERVL 1 131 -444 4 1003 712 248 104 36 chr5 54819133 54819355 -97717904 + RMER15 LTR ERVL 327 563 -12 4 1003 334 332 129 37 chr5 54823417 54823689 -97713570 + MLT1L LTR MaLR 311 607 -3 4 1003 235 327 75 19 chr5 54826650 54826756 -97710503 + MLT1J2 LTR MaLR 3 114 -334 4 1003 278 53 0 0 chr5 54833319 54833357 -97703902 + RLTR10 LTR ERVK 1 38 -352 4 1003 257 0 0 0 chr5 54833362 54833398 -97703861 - RLTR10 LTR ERVK -354 36 1 4 1003 3525 69 6 42 chr5 54834113 54834613 -97702646 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 4 1003 1302 278 21 83 chr5 54838468 54838852 -97698407 + MTE2b LTR MaLR 16 375 -4 4 1003 2174 121 15 6 chr5 54839987 54840321 -97696938 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1003 24674 25 15 12 chr5 54840321 54843380 -97693879 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 4 1003 6278 55 12 18 chr5 54843366 54844221 -97693038 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6479 -2 4 1003 2174 121 15 6 chr5 54844223 54844557 -97692702 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1003 1918 124 48 0 chr5 54844557 54844847 -97692412 + ORR1A2 LTR MaLR 24 327 0 4 1003 548 344 22 16 chr5 54845880 54846063 -97691196 - MLT1B LTR MaLR -3 387 204 4 1003 232 366 85 19 chr5 54846824 54847094 -97690165 - LTR16B1 LTR ERVL -89 391 104 4 1003 637 270 55 113 chr5 54848303 54848529 -97688730 - MTE2b-int LTR MaLR -529 1051 901 4 1003 302 247 24 24 chr5 54848524 54848607 -97688652 - MTE2b LTR MaLR -6 373 291 4 1003 1044 250 99 135 chr5 54866519 54867014 -97670245 + RMER5 LTR ERV1 38 514 -20 4 1003 654 317 97 129 chr5 54869045 54869427 -97667832 + ORR1E LTR MaLR 1 377 -2 4 1003 964 255 194 22 chr5 54871586 54871922 -97665337 + MTD LTR MaLR 21 395 -24 5 1003 571 374 38 56 chr5 54876993 54877313 -97659946 + MLT1G LTR MaLR 239 552 -39 5 1003 299 267 57 65 chr5 54877769 54877893 -97659366 + MTEb LTR MaLR 2 124 -255 5 1003 744 338 81 76 chr5 54879846 54880515 -97656744 + MLT1G-int LTR MaLR 228 899 -510 5 1003 242 385 16 32 chr5 54881078 54881204 -97656055 + MLT1G LTR MaLR 417 540 -55 5 1003 1333 259 114 8 chr5 54881960 54882337 -97654922 - MTD LTR MaLR -2 417 1 5 1003 270 224 39 13 chr5 54885511 54885588 -97651671 - MTEa LTR MaLR -7 372 294 5 1003 569 310 96 18 chr5 54887982 54888202 -97649057 + MER74A LTR ERVL 134 370 -188 5 1003 249 295 27 62 chr5 54889338 54889450 -97647809 - MER110A LTR ERV1 -27 441 334 5 1003 681 355 81 21 chr5 54896958 54897392 -97639867 - LTR86C LTR ERVL -150 471 12 5 1003 305 149 0 0 chr5 54903515 54903562 -97633697 - MLT2D LTR ERVL -2 558 512 5 1003 339 227 13 0 chr5 54903780 54903855 -97633404 - MT2B LTR ERVL -134 467 392 5 1003 577 276 82 55 chr5 54903989 54904280 -97632979 - MLT2C1 LTR ERVL -96 301 3 5 1003 1515 151 12 81 chr5 54905177 54905523 -97631736 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 1003 711 307 35 62 chr5 54908339 54908657 -97628602 - ORR1E LTR MaLR 0 379 56 5 1003 229 298 107 53 chr5 54909187 54909318 -97627941 + ORR1E LTR MaLR 84 221 -138 5 1004 762 209 7 0 chr5 54921675 54921814 -97615445 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 235 5 1004 604 293 37 5 chr5 54921810 54921995 -97615264 - RMER20B LTR ERVK -21 606 416 5 1004 786 206 202 12 chr5 54922201 54922550 -97614709 - RMER20B LTR ERVK -202 425 11 5 1004 495 238 165 5 chr5 54922557 54922759 -97614500 - ORR1D1 LTR MaLR -119 265 1 5 1004 676 284 44 58 chr5 54923482 54923826 -97613433 - RLTR15 LTR ERVK -20 339 1 5 1004 349 393 22 14 chr5 54936910 54937186 -97600073 + ERVL-int LTR ERVL 2922 3199 -2558 6 1004 227 244 126 34 chr5 54939182 54939301 -97597958 - RLTR40 LTR ERVK -194 623 494 6 1004 2994 65 10 0 chr5 54939806 54940192 -97597067 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1004 8921 12 0 0 chr5 54940192 54941189 -97596070 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 990 6 1004 358 269 31 43 chr5 54941271 54941434 -97595825 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1434 6 1004 7796 38 0 71 chr5 54941478 54942533 -97594726 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 13 6 1004 254 167 0 69 chr5 54942534 54942592 -97594667 - RLTR10-int LTR ERVK -1931 56 3 6 1004 3013 62 10 0 chr5 54942594 54942980 -97594279 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1004 8729 15 8 0 chr5 54942980 54943969 -97593290 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 990 6 1004 314 269 31 43 chr5 54944051 54944214 -97593045 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1434 6 1004 7437 37 0 71 chr5 54944258 54945313 -97591946 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 13 6 1004 3054 60 10 0 chr5 54945374 54945760 -97591499 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1004 574 286 28 22 chr5 54959286 54959468 -97577791 + MLT1A0 LTR MaLR 42 224 -141 6 1004 313 241 34 77 chr5 54961170 54961287 -97575972 + RMER6C LTR ERVK 1 112 -578 6 1004 3201 56 5 0 chr5 54962637 54963031 -97574228 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1004 4482 103 20 87 chr5 54967167 54967972 -97569287 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 6 1004 2218 157 74 37 chr5 54969801 54969999 -97567260 + RMER6C LTR ERVK 161 362 -328 6 1004 2218 157 74 37 chr5 54970027 54970339 -97566920 + RMER6C LTR ERVK 363 690 0 6 1004 2557 195 39 105 chr5 54974193 54974908 -97562351 + RMER6C LTR ERVK 1 668 -22 6 1004 241 88 0 0 chr5 54976231 54976265 -97560994 + RMER19C LTR ERVK 1 34 -577 6 1004 231 286 24 83 chr5 54976272 54976356 -97560903 + RMER19C LTR ERVK 205 283 -619 6 1004 1294 186 19 125 chr5 54977596 54977915 -97559344 + RMER19C LTR ERVK 327 611 0 6 1004 232 269 112 63 chr5 54979090 54979212 -97558047 - ORR1E LTR MaLR -206 153 24 6 1004 232 269 112 63 chr5 54979242 54979262 -97557997 - ORR1E LTR MaLR -336 23 4 6 1004 291 329 12 0 chr5 54979673 54979755 -97557504 - MLT1E3 LTR MaLR -402 222 140 6 1004 512 236 12 128 chr5 54987399 54987618 -97549641 + MTEb LTR MaLR 153 379 0 6 1004 1305 230 129 11 chr5 54990399 54990755 -97546504 + MTD LTR MaLR 2 399 -20 6 1004 2094 219 7 45 chr5 54995536 54995962 -97541297 + MTC LTR MaLR 11 420 -1 6 1004 5405 116 21 58 chr5 55007622 55008558 -97528701 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 7 1004 462 315 107 13 chr5 55016257 55016482 -97520777 + MLT2C1 LTR ERVL 18 263 -134 1 1004 357 354 65 34 chr5 55017877 55018140 -97519119 - HERV16-int LTR ERVL -3119 1877 1607 1 1004 232 214 81 54 chr5 55027338 55027412 -97509847 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 430 3 1004 2198 179 52 23 chr5 55027409 55027888 -97509371 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 1 3 1004 348 190 55 77 chr5 55028122 55028213 -97509046 - RMER12 LTR ERVK -276 1046 958 3 1004 518 243 61 164 chr5 55028911 55029271 -97507988 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1055 753 431 3 1004 242 302 144 31 chr5 55029427 55029511 -97507748 + MLT1B LTR MaLR 159 248 -142 3 1004 242 302 144 31 chr5 55029546 55029656 -97507603 + MLT1B LTR MaLR 249 374 -16 3 1004 238 315 141 8 chr5 55032207 55032335 -97504924 - MLT1A0 LTR MaLR -187 178 34 4 1004 1074 255 51 11 chr5 55033878 55034152 -97503107 + MTD LTR MaLR 130 414 -5 4 1004 349 259 103 8 chr5 55037339 55037456 -97499803 - MLT1A1 LTR MaLR -171 237 110 4 1004 1283 216 168 28 chr5 55038944 55039302 -97497957 - MTD LTR MaLR -2 417 10 5 1005 1518 186 53 18 chr5 55056617 55056956 -97480303 + ORR1B1 LTR MaLR 41 391 -3 6 1005 277 352 71 33 chr5 55057245 55057514 -97479745 + LTR53 LTR ERVL 41 349 -170 6 1005 258 317 68 19 chr5 55065545 55065648 -97471611 - MLT1H LTR MaLR -383 166 59 7 1005 1549 235 18 12 chr5 55074982 55075318 -97461941 + ORR1D1 LTR MaLR 37 374 0 9 1005 2198 68 32 19 chr5 55092026 55092339 -97444920 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 317 -10 1 1005 2834 33 191 0 chr5 55108994 55109360 -97427899 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1005 1172 243 115 0 chr5 55116407 55116711 -97420548 + MTD LTR MaLR 13 351 -68 1 1005 992 285 49 41 chr5 55122197 55122646 -97414613 - RMER15 LTR ERVL 0 575 65 1 1005 429 326 74 30 chr5 55127182 55127413 -97409846 + LTR16A1 LTR ERVL 216 456 0 1 1005 1589 244 80 0 chr5 55136449 55136826 -97400433 - MTD LTR MaLR 0 419 13 1 1005 301 304 76 93 chr5 55140507 55140743 -97396516 - ORR1E LTR MaLR -51 308 77 1 1005 1197 217 141 89 chr5 55142189 55142542 -97394717 - RMER13A LTR ERVK -277 631 212 1 1005 2353 91 45 3 chr5 55142542 55142874 -97394385 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1005 1197 191 107 61 chr5 55142874 55143082 -97394177 - RMER13A LTR ERVK -649 211 1 1 1005 242 340 19 19 chr5 55146258 55146363 -97390896 - MLT1I-int LTR MaLR -1015 372 268 1 1005 1165 305 34 34 chr5 55146450 55146867 -97390392 - MER67D LTR ERV1 -78 436 20 1 1005 242 352 66 70 chr5 55147164 55147436 -97389823 - MLT1I LTR MaLR -40 371 101 1 1005 294 211 0 106 chr5 55148842 55148927 -97388332 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1497 1 1005 2201 262 122 83 chr5 55148912 55149324 -97387935 - RMER12 LTR ERVK -54 1268 852 1 1005 2201 262 122 83 chr5 55149489 55150294 -97386965 - RMER12 LTR ERVK -471 851 4 1 1005 323 229 10 90 chr5 55160081 55160235 -97377024 + RLTR18 LTR ERVK 1 183 -329 2 1005 786 299 43 36 chr5 55160400 55160792 -97376467 + RLTR18 LTR ERVK 111 612 -4 2 1005 1001 300 51 34 chr5 55161983 55162335 -97374924 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 2 1005 225 183 46 77 chr5 55169202 55169267 -97367992 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 2 1006 832 169 151 0 chr5 55184580 55184746 -97352513 + RLTR18B LTR ERVK 1 191 -321 2 1006 1275 220 151 92 chr5 55184756 55185286 -97351973 - RMER4B LTR ERVK -8 577 17 2 1006 1227 265 7 3 chr5 55185352 55185651 -97351608 + RLTR18B LTR ERVK 212 511 -1 2 1006 2449 159 59 24 chr5 55191137 55191677 -97345582 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 3 2 1006 670 316 73 90 chr5 55192714 55193046 -97344213 - MLT2B3 LTR ERVL -6 550 253 2 1006 343 365 50 87 chr5 55193070 55193179 -97344080 - MLT2B3 LTR ERVL -268 252 149 2 1006 449 329 80 38 chr5 55199211 55199473 -97337786 + MLT1D LTR MaLR 231 503 -2 2 1006 579 308 53 37 chr5 55209843 55210089 -97327170 - MLT2B4 LTR ERVL -304 252 3 2 1006 282 280 13 26 chr5 55214802 55214879 -97322380 + RMER5 LTR ERV1 44 119 -415 2 1006 348 239 18 5 chr5 55215843 55215942 -97321317 + MLT1H2 LTR MaLR 390 549 0 2 1006 508 341 74 45 chr5 55227015 55227325 -97309934 - ORR1E LTR MaLR -38 321 3 3 1006 1620 193 127 62 chr5 55235805 55236224 -97301035 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 3 1006 257 276 50 10 chr5 55238518 55238617 -97298642 + HERV16-int LTR ERVL 1023 1125 -3871 3 1006 839 300 52 43 chr5 55246432 55246801 -97290458 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 3 1006 261 314 148 49 chr5 55250847 55251181 -97286078 - MLT1E3 LTR MaLR -3 650 242 3 1006 2831 73 29 3 chr5 55251541 55251927 -97285332 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1006 1080 279 31 97 chr5 55257039 55257492 -97279767 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 3 1006 332 306 153 20 chr5 55265662 55265682 -97271577 + MLT1E2 LTR MaLR 396 421 -206 3 1006 690 304 97 11 chr5 55265682 55266031 -97271228 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 3 1006 332 306 153 20 chr5 55266031 55266213 -97271046 + MLT1E2 LTR MaLR 422 625 -2 3 1006 313 361 110 4 chr5 55290268 55290513 -97246746 - MLT1J-int LTR MaLR -1106 281 11 3 1006 1889 213 74 20 chr5 55294185 55294630 -97242629 - RMER6D LTR ERVK -1 719 251 4 1006 2008 127 8 85 chr5 55296612 55296965 -97240294 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1006 312 257 161 94 chr5 55302280 55302495 -97234764 + MTEa LTR MaLR 121 366 -13 4 1006 325 335 41 57 chr5 55303872 55304178 -97233081 + MTEa LTR MaLR 64 379 0 4 1006 716 271 54 59 chr5 55304405 55304884 -97232375 + BGLII_B LTR ERVK 5 424 -17 4 1006 1230 293 14 38 chr5 55309149 55309515 -97227744 - ORR1D2 LTR MaLR -10 360 4 4 1007 281 308 77 92 chr5 55316398 55316694 -97220565 + MLT1B LTR MaLR 1 310 -157 4 1007 2212 139 94 8 chr5 55329251 55329622 -97207637 - RLTR44A LTR ERVK 0 405 3 4 1007 5645 43 1 0 chr5 55329624 55330294 -97206965 - RLTR44-int LTR ERVK 0 2812 2142 4 1007 2704 323 47 51 chr5 55330469 55334139 -97203120 - IAP-d-int LTR ERVK -2051 5530 1520 4 1007 382 125 0 0 chr5 55334198 55334254 -97203005 - RLTR44-int LTR ERVK -2756 56 1 4 1007 2494 112 54 5 chr5 55334254 55334640 -97202619 - RLTR44A LTR ERVK 0 405 1 4 1007 2333 40 40 2 chr5 55341921 55342231 -97195028 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 310 -17 4 1007 261 365 61 14 chr5 55343713 55343860 -97193399 + MTEa LTR MaLR 211 364 -15 4 1007 320 315 85 46 chr5 55348468 55348621 -97188638 + MTEa LTR MaLR 212 379 0 4 1007 1301 201 45 28 chr5 55350552 55350905 -97186354 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 1007 354 349 31 44 chr5 55357677 55357905 -97179354 + MLT1B LTR MaLR 133 357 -33 4 1007 884 310 23 60 chr5 55358798 55359148 -97178111 + RLTR18 LTR ERVK 3 339 -277 4 1007 749 237 35 44 chr5 55359143 55359346 -97177913 + RLTR18B LTR ERVK 187 387 -125 4 1007 3426 20 5 0 chr5 55359522 55359916 -97177343 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1007 656 154 199 8 chr5 55362671 55362802 -97174457 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 298 5 1007 708 155 78 0 chr5 55362804 55362933 -97174326 + RLTR11A LTR ERVK 390 528 0 5 1007 601 167 0 0 chr5 55378952 55379054 -97158205 - ORR1B2 LTR MaLR 0 378 277 5 1007 1057 226 14 0 chr5 55386057 55386274 -97150985 - ORR1B2 LTR MaLR -96 271 52 5 1007 282 370 66 7 chr5 55386405 55386541 -97150718 + ORR1E LTR MaLR 3 146 -213 5 1007 330 228 57 38 chr5 55387453 55387558 -97149701 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 299 5 1007 274 344 48 85 chr5 55389487 55389652 -97147607 - MLT1J2 LTR MaLR -31 417 259 5 1007 812 293 11 57 chr5 55398516 55398780 -97138479 + MTE2b LTR MaLR 126 377 -2 5 1007 1708 238 35 50 chr5 55400563 55401081 -97136178 - RLTR18B LTR ERVK -2 510 1 5 1007 2854 13 2 191 chr5 55401301 55401782 -97135477 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 5 1007 8849 13 2 0 chr5 55401784 55402777 -97134482 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 5 1007 319 270 54 31 chr5 55402859 55402989 -97134270 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 5 1007 4036 49 20 8 chr5 55403053 55403984 -97133275 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 6 5 1007 2917 16 2 159 chr5 55403984 55404444 -97132815 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 5 1007 253 214 25 79 chr5 55407212 55407415 -97129844 + RMER17C LTR ERVK 84 275 -135 5 1007 367 302 77 55 chr5 55407660 55407842 -97129417 + MLT2B4 LTR ERVL 16 201 -355 5 1007 237 388 45 45 chr5 55408692 55408846 -97128413 - MLT1D LTR MaLR -93 412 259 5 1007 301 333 79 53 chr5 55415238 55415466 -97121793 + MTC LTR MaLR 135 368 -53 5 1007 584 180 21 14 chr5 55417635 55417844 -97119415 - ORR1A3 LTR MaLR -4 322 6 5 1007 4819 95 34 45 chr5 55437056 55437850 -97099409 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 785 -23 6 1008 371 187 25 31 chr5 55443536 55443696 -97093563 + RMER17B LTR ERVK 301 459 -499 6 1008 589 318 206 3 chr5 55444278 55444594 -97092665 - MTD LTR MaLR -20 399 20 6 1008 1104 285 123 64 chr5 55444616 55445193 -97092066 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 648 6 1008 1162 183 76 8 chr5 55450575 55450812 -97086447 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1596 6 1008 3346 168 93 42 chr5 55451032 55451795 -97085464 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1044 804 3 6 1008 414 291 54 142 chr5 55455012 55455364 -97081895 - RMER20B LTR ERVK -55 572 252 6 1008 3016 71 126 0 chr5 55458180 55458602 -97078657 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1008 1669 158 29 91 chr5 55459020 55459439 -97077820 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 6 1008 901 189 24 0 chr5 55459717 55459881 -97077378 - ETnERV2-int LTR ERVK -969 6437 6270 6 1008 811 146 49 0 chr5 55459884 55460007 -97077252 - ETnERV2-int LTR ERVK -3312 4094 3966 6 1008 353 179 12 71 chr5 55460043 55460127 -97077132 - ETnERV-int LTR ERVK -3234 80 2 6 1008 2324 111 135 47 chr5 55468519 55468962 -97068297 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 6 1008 478 147 0 0 chr5 55469292 55469367 -97067892 - RMER6C LTR ERVK -480 210 136 6 1008 419 193 125 0 chr5 55469590 55469678 -97067581 - RMER6C LTR ERVK -621 99 1 6 1008 2083 137 6 0 chr5 55469746 55470067 -97067192 + ORR1A2 LTR MaLR 1 323 -4 6 1008 2332 234 97 100 chr5 55473472 55473664 -97063595 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 983 844 6 1008 4809 92 26 67 chr5 55473897 55474690 -97062569 - RLTR13D6 LTR ERVK -141 761 1 6 1008 1658 98 55 0 chr5 55476080 55476336 -97060923 + ORR1A3-int LTR MaLR 1008 1277 -686 6 1008 2760 222 50 52 chr5 55477365 55477734 -97059525 + RMER6D LTR ERVK 1 367 -353 6 1008 2760 222 50 52 chr5 55477765 55478112 -97059147 + RMER6D LTR ERVK 368 716 -4 6 1008 2203 136 146 14 chr5 55481897 55482323 -97054936 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 6 1008 260 328 56 24 chr5 55486770 55486895 -97050364 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3076 3204 -2510 6 1008 279 250 82 55 chr5 55487260 55487370 -97049889 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3264 3376 -2338 6 1008 381 314 50 0 chr5 55496501 55496622 -97040637 + MTE2b LTR MaLR 1 127 -252 6 1008 1015 280 73 16 chr5 55499149 55499465 -97037794 - MTD LTR MaLR -53 366 33 7 1008 2065 116 3 62 chr5 55500006 55500347 -97036912 + ORR1A2 LTR MaLR 1 321 -6 1 1008 437 323 73 16 chr5 55500709 55500901 -97036358 + MTD LTR MaLR 1 203 -216 2 1008 347 286 117 50 chr5 55502455 55502635 -97034624 + MTD LTR MaLR 214 405 -14 2 1008 306 283 74 89 chr5 55502643 55502845 -97034414 + MTD-int LTR MaLR 1 199 -1059 2 1008 3859 125 33 0 chr5 55504799 55505381 -97031878 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 7 1008 308 184 12 62 chr5 55512313 55512394 -97024865 + MT2A LTR ERVL 404 480 -53 1 1008 331 191 0 14 chr5 55512492 55512561 -97024698 + MT2A LTR ERVL 406 473 -60 2 1008 377 341 67 0 chr5 55512563 55512698 -97024561 - MT2A LTR ERVL -87 514 371 2 1008 532 250 97 13 chr5 55512838 55512992 -97024267 - MT2A LTR ERVL -366 167 1 2 1008 313 289 26 0 chr5 55518301 55518377 -97018882 - MTE2a LTR MaLR -71 308 231 2 1008 1650 194 15 68 chr5 55520726 55521125 -97016134 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1008 1014 264 112 98 chr5 55522828 55523366 -97013893 - RMER19B LTR ERVK -18 884 340 3 1008 567 237 9 9 chr5 55523762 55523877 -97013382 - RMER19B LTR ERVK -586 316 202 3 1008 1329 243 82 19 chr5 55525497 55525977 -97011282 + RMER19B LTR ERVK 142 642 -260 3 1008 2599 204 133 17 chr5 55546721 55547359 -96989900 - RMER6D LTR ERVK -5 715 4 5 1008 269 366 12 0 chr5 55563631 55563713 -96973546 - MTD LTR MaLR -257 162 80 7 1008 809 259 76 97 chr5 55563764 55564209 -96973050 + RLTR12B LTR ERVK 80 515 -13 7 1008 442 200 12 0 chr5 55564222 55564307 -96972952 - MTD LTR MaLR -332 87 2 7 1009 1755 174 6 59 chr5 55580150 55580487 -96956772 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 3 9 1009 1628 241 31 130 chr5 55581240 55581918 -96955341 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 9 1009 333 355 36 62 chr5 55584780 55585005 -96952254 + MTE2b LTR MaLR 1 219 -160 1 1009 627 253 162 63 chr5 55585203 55585536 -96951723 + MTE2b-int LTR MaLR 1208 1573 -7 1 1009 354 239 0 0 chr5 55585544 55585611 -96951648 + MTE2b LTR MaLR 2 68 -311 1 1009 1015 282 70 35 chr5 55588041 55588353 -96948906 + MTD LTR MaLR 97 419 0 1 1009 267 314 124 46 chr5 55606287 55606504 -96930755 - MLT1J-int LTR MaLR -962 425 192 1 1009 489 227 62 18 chr5 55606991 55607103 -96930156 + RMER4B LTR ERVK 279 395 -190 1 1009 1073 201 69 23 chr5 55607610 55607982 -96929277 + RMER6D LTR ERVK 1 611 -79 1 1009 944 209 61 12 chr5 55608729 55608800 -96928459 + RMER6D LTR ERVK 612 689 -1 1 1009 844 231 134 47 chr5 55618497 55618796 -96918463 + MTC LTR MaLR 89 413 -8 1 1009 2319 145 133 45 chr5 55623788 55624278 -96912981 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 1 1009 2833 89 14 9 chr5 55626231 55626650 -96910609 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1009 3406 60 45 30 chr5 55627693 55628161 -96909098 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 1009 684 297 97 74 chr5 55635189 55635582 -96901677 - MTD LTR MaLR 0 419 18 1 1009 937 235 69 44 chr5 55637122 55637483 -96899776 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 1 1009 307 286 40 10 chr5 55644911 55645010 -96892249 + RMER15 LTR ERVL 425 526 -49 1 1009 330 223 26 13 chr5 55648570 55648678 -96888581 - RLTR6-int LTR ERV1 -2743 5035 4979 1 1009 3469 10 10 0 chr5 55649301 55649693 -96887566 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1009 9017 36 5 1 chr5 55649693 55650785 -96886474 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 3 1 1009 3632 18 121 0 chr5 55650789 55651229 -96886030 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1009 3102 59 10 0 chr5 55658213 55658605 -96878654 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1009 317 250 103 8 chr5 55659925 55660042 -96877217 - MER70A LTR ERVL 0 472 345 2 1009 443 379 20 15 chr5 55666108 55666309 -96870950 - MTC LTR MaLR -134 287 86 2 1009 1574 179 96 18 chr5 55694037 55694372 -96842887 + ORR1B2 LTR MaLR 3 363 -4 2 1009 739 220 45 0 chr5 55695754 55695917 -96841342 + RMER6C LTR ERVK 1 175 -545 2 1009 2281 217 92 34 chr5 55695956 55696566 -96840693 + RMER6C LTR ERVK 1 645 -45 2 1009 308 270 96 67 chr5 55701636 55701771 -96835488 + MLT1A1 LTR MaLR 256 394 -14 2 1009 442 288 51 28 chr5 55702238 55702448 -96834811 - RLTR9E LTR ERVK -3 406 153 2 1009 333 337 32 42 chr5 55703163 55703352 -96833907 + LTR33 LTR ERVL 329 515 0 2 1010 755 280 131 51 chr5 55713304 55713639 -96823620 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 9 2 1010 926 269 53 48 chr5 55713928 55714389 -96822870 - BGLII_B LTR ERVK -11 430 16 2 1010 322 319 48 105 chr5 55720700 55720928 -96816331 - MLT1D LTR MaLR -2 503 289 2 1010 541 218 128 13 chr5 55721153 55721302 -96815957 - ORR1B1 LTR MaLR -228 166 1 2 1010 297 342 124 21 chr5 55721996 55722238 -96815021 - LTR16C LTR ERVL 0 489 223 2 1010 1787 204 31 8 chr5 55723285 55723641 -96813618 + ORR1C1 LTR MaLR 1 364 -14 2 1010 478 339 79 55 chr5 55737259 55737549 -96799710 + MTEa LTR MaLR 18 314 -65 3 1010 463 356 40 46 chr5 55737260 55737631 -96799628 + MT2A LTR ERVL 19 387 -146 3 1010 493 330 112 44 chr5 55739148 55739468 -96797791 + MLT1B LTR MaLR 31 372 -18 3 1010 256 261 11 25 chr5 55740585 55740665 -96796594 + MLT1B-int LTR MaLR 1097 1156 -215 3 1010 234 324 52 43 chr5 55740798 55740914 -96796345 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 290 3 1010 249 346 98 12 chr5 55740999 55741163 -96796096 - MLT1A1 LTR MaLR -230 178 1 3 1010 910 348 95 96 chr5 55742029 55742529 -96794730 - MLT-int LTR MaLR -656 1079 612 3 1010 910 348 95 96 chr5 55742573 55743143 -96794116 - MLT-int LTR MaLR -1124 611 11 3 1010 421 305 0 37 chr5 55750113 55750222 -96787037 + MTEa LTR MaLR 1 105 -274 3 1010 354 400 112 19 chr5 55754740 55755107 -96782152 - MLT1D LTR MaLR -50 455 55 3 1010 349 336 142 21 chr5 55761177 55761466 -96775793 + MLT1C LTR MaLR 108 431 -36 3 1010 2378 217 82 57 chr5 55765194 55765867 -96771392 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 3 1010 489 165 0 0 chr5 55773522 55773601 -96763658 + MTC LTR MaLR 1 79 -342 3 1010 1706 224 23 47 chr5 55773883 55774267 -96762992 + MTC LTR MaLR 47 421 0 3 1010 414 367 95 29 chr5 55779075 55779381 -96757878 - MLT1A0 LTR MaLR -11 354 29 3 1010 313 255 40 52 chr5 55779374 55779548 -96757711 - RMER17A LTR ERVK -280 471 300 3 1010 320 353 57 34 chr5 55782581 55782877 -96754382 - LTR29 LTR ERV1 -222 400 98 3 1010 1991 241 63 20 chr5 55786372 55786926 -96750333 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -4 580 3 3 1010 228 327 125 0 chr5 55791087 55791191 -96746068 + ORR1D2 LTR MaLR 1 117 -253 3 1010 412 293 107 77 chr5 55799078 55799507 -96737752 - MER67C LTR ERV1 -5 509 72 4 1010 287 317 8 169 chr5 55799950 55800216 -96737043 - RLTR11B LTR ERVK -22 431 209 4 1010 2072 247 106 88 chr5 55800283 55800742 -96736517 + RMER17B LTR ERVK 1 527 -431 4 1010 2072 251 98 98 chr5 55801538 55802014 -96735245 + RMER17B LTR ERVK 425 890 -68 4 1010 528 298 4 65 chr5 55802162 55802392 -96734867 - RLTR11B LTR ERVK -237 216 1 4 1010 1647 214 95 39 chr5 55802396 55802912 -96734347 - MYSERV-int LTR ERVK -6 6544 6000 4 1010 573 350 49 11 chr5 55802924 55803190 -96734069 - RMER15 LTR ERVL -25 550 275 4 1010 245 304 0 0 chr5 55803356 55803412 -96733847 - MTE-int LTR MaLR -73 1507 1452 4 1010 434 356 42 51 chr5 55803664 55804057 -96733202 + MTD LTR MaLR 25 405 -14 4 1010 787 314 123 35 chr5 55813753 55814242 -96723017 - MT2A LTR ERVL 0 533 2 4 1010 254 186 0 0 chr5 55815648 55815691 -96721568 + ORR1B2 LTR MaLR 9 51 -316 4 1010 318 312 87 77 chr5 55817895 55818268 -96718991 + MLT1C LTR MaLR 2 387 -3 4 1010 928 262 91 83 chr5 55822514 55822876 -96714383 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 7 4 1010 3470 30 0 0 chr5 55823403 55823799 -96713460 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1011 423 313 98 28 chr5 55839093 55839391 -96697868 - MTD LTR MaLR -19 400 50 4 1011 651 214 0 67 chr5 55843302 55843467 -96693792 - RMER10B LTR ERVL -46 352 199 4 1011 535 245 57 78 chr5 55846382 55846612 -96690647 - RMER13B LTR ERVK -124 784 560 4 1011 407 248 127 107 chr5 55846579 55846823 -96690436 - RMER17A2 LTR ERVK -657 249 1 4 1011 303 273 0 33 chr5 55846824 55846915 -96690344 + MTEa LTR MaLR 5 92 -287 4 1011 602 349 41 62 chr5 55847771 55847994 -96689265 + MTEa LTR MaLR 94 315 -64 4 1011 602 349 41 62 chr5 55848183 55848249 -96689010 + MTEa LTR MaLR 316 377 -2 4 1011 1674 190 80 10 chr5 55852628 55853016 -96684243 + RLTR9F LTR ERVK 1 415 0 5 1011 1793 231 106 45 chr5 55857247 55857890 -96679369 + RMER6C LTR ERVK 9 690 0 5 1011 2634 187 57 25 chr5 55858532 55858614 -96678645 - RLTR20B1 LTR ERVK -15 548 470 5 1011 2634 187 57 25 chr5 55858667 55859115 -96678144 - RLTR20B1 LTR ERVK -94 469 3 5 1011 409 298 33 70 chr5 55859128 55859324 -96677935 + MTE2a LTR MaLR 57 290 -129 5 1011 1282 252 198 20 chr5 55861609 55861860 -96675399 - RLTR19A LTR ERVK 0 496 176 5 1011 1282 252 198 20 chr5 55862073 55862225 -96675034 - RLTR19A LTR ERVK -321 175 22 5 1011 931 221 157 63 chr5 55862578 55862941 -96674318 - RMER10B LTR ERVL -1 397 1 5 1011 247 214 157 0 chr5 55867151 55867221 -96670038 + MLT2B1 LTR ERVL 432 512 -55 5 1011 2760 177 14 34 chr5 55872350 55872917 -96664342 + RLTR31_Mm LTR ERVK 3 558 -3 5 1011 1936 209 18 13 chr5 55876611 55877009 -96660250 - MTC LTR MaLR -2 419 20 5 1011 925 299 105 21 chr5 55891257 55891589 -96645670 - MTD LTR MaLR -14 405 46 5 1011 793 326 89 18 chr5 55894114 55894495 -96642764 - MLT2B4 LTR ERVL -131 425 18 5 1011 980 231 35 193 chr5 55896865 55897321 -96639938 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 1011 379 294 134 35 chr5 55899882 55900083 -96637176 + MLT1A0 LTR MaLR 13 233 -132 5 1011 458 278 70 70 chr5 55901880 55902081 -96635178 - MTEa LTR MaLR -8 371 171 5 1011 1176 159 90 102 chr5 55920915 55921238 -96616021 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 76 5 1011 234 296 25 115 chr5 55921241 55921363 -96615896 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 255 5 1011 244 75 47 54 chr5 55921596 55921656 -96615603 - ORR1B1 LTR MaLR -280 87 12 5 1011 1085 212 61 77 chr5 55924634 55924946 -96612313 + RLTR20C LTR ERVK 1 307 -227 5 1011 569 214 112 22 chr5 55924957 55925006 -96612253 + RLTR20C LTR ERVK 431 479 -99 5 1011 569 214 112 22 chr5 55925057 55925141 -96612118 + RLTR20C LTR ERVK 480 576 -2 5 1011 229 382 191 0 chr5 55928409 55928587 -96608672 - MLT1G1 LTR MaLR -9 570 359 5 1011 243 286 161 79 chr5 55929133 55929387 -96607872 - MER57F LTR ERV1 -143 293 19 6 1011 239 224 43 43 chr5 55931833 55931903 -96605356 - RLTR25B LTR ERVK -508 520 451 6 1011 506 214 9 2 chr5 55931841 55932009 -96605250 - ORR1A1-int LTR MaLR -1124 668 517 6 1011 6817 144 12 7 chr5 55932001 55933128 -96604131 + ORR1A2-int LTR MaLR 831 1963 0 6 1011 2217 128 0 0 chr5 55933128 55933455 -96603804 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1011 998 182 52 38 chr5 55936578 55936789 -96600470 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 217 6 1011 1129 219 54 57 chr5 55936799 55937171 -96600088 - RMER17C LTR ERVK 0 410 40 6 1011 966 89 42 48 chr5 55937159 55937324 -96599935 - RLTR23 LTR ERV1 -266 164 1 6 1011 4200 150 44 6 chr5 55941054 55941764 -96595495 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 6 1011 2898 88 67 122 chr5 55943430 55944054 -96593205 + MTB-int LTR MaLR 549 1536 -427 6 1011 2909 94 8 0 chr5 55944056 55944451 -96592808 + MTB LTR MaLR 3 400 0 6 1011 785 122 61 0 chr5 55946479 55946625 -96590634 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 155 -402 6 1011 540 110 114 55 chr5 55946625 55946856 -96590403 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 475 216 6 1011 1453 108 31 5 chr5 55947823 55948047 -96589212 - IAPLTR2b LTR ERVK -97 230 1 6 1011 1106 236 170 16 chr5 55948055 55948425 -96588834 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 131 557 0 6 1011 225 279 29 14 chr5 55954775 55954844 -96582415 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 436 6 1011 261 200 27 67 chr5 55954823 55954898 -96582361 - RLTR16 LTR ERVK -17 488 417 6 1011 1351 174 60 11 chr5 55955135 55955420 -96581839 - RLTR16 LTR ERVK -206 299 1 6 1011 645 262 73 106 chr5 55955800 55956127 -96581132 + RMER10A LTR ERVL 1 386 -12 6 1011 2964 29 3 0 chr5 55964861 55965206 -96572053 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1012 2275 77 63 18 chr5 55968308 55968639 -96568620 - MTB LTR MaLR -54 346 1 6 1012 843 196 34 42 chr5 55968639 55968864 -96568395 - MTB-int LTR MaLR 0 1258 914 6 1012 485 174 45 62 chr5 55969374 55969552 -96567707 + RMER17C LTR ERVK 100 274 -136 6 1012 2968 29 3 0 chr5 55983913 55984258 -96553001 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 1012 13717 56 10 1 chr5 55984258 55986034 -96551225 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 6 1012 2757 27 3 0 chr5 55986038 55986375 -96550884 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 1 6 1012 311 307 58 47 chr5 55993248 55993493 -96543766 + MLT1E3 LTR MaLR 60 283 -344 6 1012 530 244 112 11 chr5 56003617 56003795 -96533464 + ORR1D2 LTR MaLR 168 363 -7 7 1012 248 203 34 0 chr5 56004115 56004174 -96533085 + MTEa LTR MaLR 317 377 -2 9 1012 309 382 62 0 chr5 56004402 56004546 -96532713 - ORR1E LTR MaLR -206 153 1 1 1012 803 144 70 26 chr5 56011248 56011489 -96525770 + RMER6C LTR ERVK 3 287 -403 1 1012 2242 195 93 19 chr5 56014488 56015017 -96522242 + RLTR12A LTR ERVK 1 568 0 2 1012 3444 65 65 0 chr5 56020201 56020647 -96516612 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 1012 543 69 62 22 chr5 56020649 56020795 -96516464 + MTB-int LTR MaLR 1 76 -1022 3 1012 228 367 54 61 chr5 56026353 56026501 -96510758 + MLT1D LTR MaLR 21 167 -338 4 1012 443 339 42 58 chr5 56028732 56028914 -96508345 + MTEa LTR MaLR 1 179 -200 4 1012 578 139 0 10 chr5 56033748 56033850 -96503409 - RLTR11A2 LTR ERVK -2 525 425 6 1012 1167 189 30 17 chr5 56033846 56034083 -96503176 - RLTR11A2 LTR ERVK -287 240 1 6 1012 2379 134 40 42 chr5 56043963 56044439 -96492820 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1012 4333 63 66 22 chr5 56044441 56045080 -96492179 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 6 1012 442 66 0 32 chr5 56045080 56045143 -96492116 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 6 1012 1839 111 4 4 chr5 56045132 56045394 -96491865 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 6 1012 932 73 24 0 chr5 56045391 56045514 -96491745 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 6 1012 26375 13 2 2 chr5 56045514 56048470 -96488789 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 6 1012 2334 132 41 43 chr5 56048470 56048937 -96488322 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 466 -9 6 1012 2596 99 47 5 chr5 56068916 56069303 -96467956 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 1 1012 1189 220 42 74 chr5 56078230 56078583 -96458676 - RMER6C LTR ERVK 0 690 349 1 1012 1234 168 191 11 chr5 56081729 56082012 -96455247 - RMER6C LTR ERVK -356 334 1 1 1012 4157 116 44 42 chr5 56084187 56084934 -96452325 + RMER17A LTR ERVK 1 749 -2 1 1012 3004 79 7 2 chr5 56086364 56086769 -96450490 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1012 747 83 0 16 chr5 56086769 56086891 -96450368 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1098 979 1 1012 236 320 73 59 chr5 56088950 56089086 -96448173 - LTR48 LTR ERV1 -649 138 1 1 1012 2947 46 2 124 chr5 56092647 56093098 -96444161 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1013 615 249 52 36 chr5 56104975 56105167 -96432092 + MTE2a LTR MaLR 174 368 -11 1 1013 557 356 77 45 chr5 56124344 56124747 -96412512 - MER31A LTR ERV1 -69 416 1 1 1013 1389 214 105 14 chr5 56126532 56126893 -96410366 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1013 324 325 54 74 chr5 56151011 56151214 -96386045 + RMER5 LTR ERV1 111 309 -225 1 1013 994 147 21 29 chr5 56151331 56151531 -96385728 - LTRIS2 LTR ERV1 0 587 391 1 1013 910 234 71 20 chr5 56151967 56152163 -96385096 + ORR1D1 LTR MaLR 8 213 -161 1 1013 248 304 109 33 chr5 56160562 56160773 -96376486 + MER34A1 LTR ERV1 294 520 -67 1 1013 3002 216 157 34 chr5 56177932 56178914 -96358345 + RMER12B LTR ERVK 1 1159 -245 2 1013 2700 112 22 12 chr5 56182891 56183296 -96353963 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 2 1013 2280 124 144 25 chr5 56185533 56185964 -96351295 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1013 4023 131 19 61 chr5 56193289 56193636 -96343623 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 331 -477 2 1013 4023 131 19 61 chr5 56194413 56194807 -96342452 + RLTR13C2 LTR ERVK 332 711 -97 2 1013 724 251 44 9 chr5 56200040 56200254 -96337005 - MTE2b LTR MaLR -58 321 96 2 1013 263 367 59 48 chr5 56200286 56200472 -96336787 + ORR1E LTR MaLR 4 191 -168 2 1013 1132 285 77 21 chr5 56213483 56213809 -96323450 - MTD LTR MaLR -8 411 68 2 1013 477 231 45 36 chr5 56214085 56214197 -96323062 - MTD LTR MaLR -306 113 1 2 1013 832 132 83 109 chr5 56214400 56214629 -96322630 + RMER17B LTR ERVK 217 439 -519 2 1013 2325 215 32 11 chr5 56215771 56216294 -96320965 + RMER17B LTR ERVK 425 958 0 2 1013 507 331 11 28 chr5 56225053 56225233 -96312026 - MTEb LTR MaLR 0 379 203 2 1013 272 343 127 6 chr5 56227558 56227731 -96309528 - MLT2B4 LTR ERVL -362 194 1 2 1014 234 215 69 92 chr5 56235675 56235762 -96301497 + RLTR25B LTR ERVK 425 509 -519 2 1014 301 278 52 0 chr5 56243788 56243885 -96293374 + MTEb LTR MaLR 278 379 0 3 1014 240 384 22 36 chr5 56251138 56251276 -96285983 + MTEa LTR MaLR 1 136 -243 3 1014 627 325 107 99 chr5 56259934 56260309 -96276950 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 3 1014 273 232 0 0 chr5 56260309 56260365 -96276894 + MTEa-int LTR MaLR 1 56 -1524 3 1014 2073 105 74 6 chr5 56262307 56262672 -96274587 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 3 1014 2739 118 2 2 chr5 56269932 56270339 -96266920 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1014 5720 127 45 20 chr5 56278748 56279683 -96257576 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 3 1014 425 312 176 58 chr5 56281853 56282178 -96255081 - MTE2b LTR MaLR -1 378 3 3 1014 3826 108 21 9 chr5 56288331 56288903 -96248356 + MT2B2 LTR ERVL 6 584 0 3 1014 254 27 0 26 chr5 56288905 56288943 -96248316 + ORR1B1-int LTR MaLR 3 39 -1470 3 1014 2260 104 147 5 chr5 56290074 56290490 -96246769 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1014 999 100 87 17 chr5 56290491 56290664 -96246595 + IAPEz-int LTR ERVK 9 193 -6288 3 1014 245 309 0 0 chr5 56290664 56290719 -96246540 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 3 1014 3598 60 1 16 chr5 56290719 56291297 -96245962 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 3 1014 2252 61 0 0 chr5 56291297 56291575 -96245684 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 3 1014 5864 54 4 22 chr5 56291574 56292334 -96244925 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6481 0 3 1014 793 166 35 20 chr5 56292334 56292516 -96244743 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 174 -152 3 1014 1827 157 10 3 chr5 56293015 56293316 -96243943 - ORR1A1 LTR MaLR -43 303 1 3 1014 279 336 95 0 chr5 56293321 56293437 -96243822 - ORR1D2 LTR MaLR -234 136 10 3 1014 2420 195 72 22 chr5 56297595 56298188 -96239071 + RMER6C LTR ERVK 68 690 0 3 1014 335 360 119 22 chr5 56298378 56298679 -96238580 + MLT1C LTR MaLR 16 339 -128 3 1014 335 360 119 22 chr5 56298742 56298809 -96238450 + MLT1C LTR MaLR 340 420 -47 3 1014 1644 225 30 0 chr5 56300170 56300543 -96236716 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1014 764 261 84 25 chr5 56306170 56306425 -96230834 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 292 -236 4 1014 1163 178 8 17 chr5 56306430 56306664 -96230595 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 91 322 0 4 1014 1030 212 30 4 chr5 56306664 56306885 -96230374 + RLTR11A2 LTR ERVK 301 527 0 4 1014 1280 272 113 11 chr5 56307006 56307388 -96229871 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1014 322 307 32 73 chr5 56310382 56310505 -96226754 - RLTR25B LTR ERVK -908 120 3 4 1014 756 269 61 106 chr5 56333612 56334042 -96203217 + MT2A LTR ERVL 1 546 -55 4 1014 1204 264 83 50 chr5 56334152 56334659 -96202600 + RLTR20A2 LTR ERVK 8 465 -103 4 1014 1154 271 49 120 chr5 56334700 56334762 -96202497 + RLTR20A2 LTR ERVK 466 535 -33 4 1014 3017 31 2 120 chr5 56341398 56341840 -96195419 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 4 1014 8764 18 0 3 chr5 56341840 56342840 -96194419 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 990 4 1014 8272 25 0 0 chr5 56342918 56343866 -96193393 - RLTR10-int LTR ERVK -999 988 41 4 1014 2302 118 68 96 chr5 56343876 56344365 -96192894 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 1014 1119 300 113 0 chr5 56345888 56346225 -96191034 + MTD LTR MaLR 14 388 -31 4 1014 2392 109 108 2 chr5 56346881 56347287 -96189972 - RLTR47_MM LTR ERV1 -83 449 1 4 1014 817 323 9 0 chr5 56347385 56347701 -96189558 - RLTR6-int LTR ERV1 -57 7721 7403 4 1014 3425 20 5 0 chr5 56347991 56348385 -96188874 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1014 485 383 51 33 chr5 56351467 56351802 -96185457 + ORR1E LTR MaLR 9 349 -10 4 1014 2546 133 5 2 chr5 56354752 56355150 -96182109 - BGLII LTR ERVK 0 421 23 4 1014 608 293 89 57 chr5 56358544 56358929 -96178330 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 1 4 1015 316 280 65 48 chr5 56371588 56371712 -96165547 + MT2B LTR ERVL 132 257 -344 4 1015 1569 177 12 86 chr5 56371998 56372325 -96164934 + ORR1B1 LTR MaLR 41 343 -51 4 1015 872 279 25 31 chr5 56379031 56379353 -96157906 + RLTR15 LTR ERVK 1 320 -39 4 1015 1887 150 3 3 chr5 56380470 56380765 -96156494 + ORR1A1 LTR MaLR 1 295 -51 5 1015 2094 161 12 3 chr5 56384603 56384946 -96152313 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1015 1568 178 34 82 chr5 56387070 56387425 -96149834 + RMER6A LTR ERVK 1 338 -418 5 1015 1066 136 96 0 chr5 56387436 56387635 -96149624 + RMER6-int LTR ERVK 2641 2858 -319 5 1015 239 260 123 0 chr5 56387642 56387715 -96149544 + RLTR19C LTR ERVK 1 82 -424 5 1015 2955 32 0 14 chr5 56389015 56389366 -96147893 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 1015 14218 50 1 1 chr5 56389366 56391159 -96146100 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 5 1015 3047 17 0 14 chr5 56391159 56391510 -96145749 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 1015 433 231 161 54 chr5 56397095 56397284 -96139975 + RMER6C LTR ERVK 2 257 -463 5 1015 1140 258 57 11 chr5 56404065 56404418 -96132841 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 5 5 1015 327 241 89 102 chr5 56410528 56410685 -96126574 - MLT1H LTR MaLR 0 549 395 5 1015 1187 270 81 8 chr5 56413318 56413702 -96123557 + MTD LTR MaLR 6 417 -2 5 1015 363 301 71 41 chr5 56418049 56418246 -96119013 + ORR1E LTR MaLR 3 205 -154 5 1015 273 256 32 32 chr5 56418269 56418362 -96118897 + ORR1E LTR MaLR 267 359 0 5 1015 360 374 93 15 chr5 56419835 56420169 -96117090 - MLT1A LTR MaLR -7 367 8 5 1015 852 173 11 55 chr5 56422883 56423066 -96114193 + RMER6C LTR ERVK 516 690 0 5 1015 409 197 0 0 chr5 56423406 56423482 -96113777 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 303 5 1015 1420 226 12 48 chr5 56424009 56424339 -96112920 - ORR1C1 LTR MaLR -58 320 3 5 1015 936 256 28 9 chr5 56426912 56427125 -96110134 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 158 5 1015 536 282 87 71 chr5 56427175 56427427 -96109832 - ORR1D1 LTR MaLR -118 256 1 5 1015 259 207 153 35 chr5 56427986 56428071 -96109188 - MLT1J-int LTR MaLR -1145 242 148 5 1015 818 314 16 8 chr5 56430090 56430347 -96106912 + RMER15 LTR ERVL 211 469 -106 5 1015 1231 253 90 127 chr5 56449732 56449938 -96087321 + RMER6D LTR ERVK 14 249 -471 6 1015 1231 253 90 127 chr5 56450116 56450643 -96086616 + RMER6D LTR ERVK 250 720 0 6 1015 264 327 47 41 chr5 56452070 56452239 -96085020 + MLT1A LTR MaLR 192 361 -13 6 1015 344 164 30 0 chr5 56456030 56456097 -96081162 - ORR1B2 LTR MaLR -2 376 308 6 1015 822 221 21 13 chr5 56458072 56458278 -96078981 - ORR1B2 LTR MaLR -166 212 13 6 1015 226 183 46 77 chr5 56460171 56460236 -96077023 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 6 1015 235 393 92 28 chr5 56467286 56467503 -96069756 - MLT1H1 LTR MaLR -32 523 293 6 1015 269 374 5 70 chr5 56467667 56467687 -96069572 - MLT2B2 LTR ERVL -14 548 531 6 1015 269 369 40 56 chr5 56467784 56468013 -96069246 - MLT2B2 LTR ERVL -32 530 301 6 1015 1686 131 93 7 chr5 56478671 56478972 -96058287 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 6 1016 261 326 56 21 chr5 56500006 56500150 -96037109 - MLT1C LTR MaLR -314 153 5 1 1016 227 321 53 192 chr5 56502229 56502437 -96034822 + LTR16A1 LTR ERVL 109 287 -169 3 1016 977 271 318 0 chr5 56502866 56503184 -96034075 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1016 499 354 96 44 chr5 56503760 56504126 -96033133 - LTR52 LTR ERVL -26 395 11 5 1016 334 253 46 0 chr5 56510042 56510129 -96027130 - MTC LTR MaLR 0 421 331 1 1016 348 194 0 53 chr5 56511102 56511178 -96026081 - RMER6C LTR ERVK 0 690 619 1 1016 2285 178 21 25 chr5 56511255 56511859 -96025400 + RLTR25B LTR ERVK 141 786 -242 1 1016 489 182 101 0 chr5 56511852 56511951 -96025308 + RLTR25B LTR ERVK 898 1006 -22 1 1016 500 139 0 0 chr5 56512062 56512141 -96025118 - RMER6C LTR ERVK -608 82 4 1 1016 267 286 208 31 chr5 56512712 56512842 -96024417 + MTC LTR MaLR 136 288 -133 1 1016 2090 158 29 3 chr5 56522473 56522821 -96014438 - RLTR13D4 LTR ERVK -676 357 1 2 1016 335 235 39 102 chr5 56548957 56549085 -95988174 - RLTR40 LTR ERVK -341 476 357 6 1016 5038 103 30 21 chr5 56551369 56552175 -95985084 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 813 -1035 7 1016 937 150 280 0 chr5 56552359 56552559 -95984700 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1591 1846 -2 7 1016 2764 21 0 27 chr5 56561986 56562322 -95974937 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 9 1016 361 197 22 53 chr5 56567477 56567600 -95969659 + MTE2a LTR MaLR 1 127 -292 1 1016 711 317 79 6 chr5 56567971 56568301 -95968958 + LTR53 LTR ERVL 126 479 -40 1 1016 494 329 29 40 chr5 56575402 56575576 -95961683 + MTE-int LTR MaLR 827 998 -582 1 1016 646 290 30 30 chr5 56576048 56576315 -95960944 + RLTR15 LTR ERVK 1 267 -92 1 1016 742 189 13 13 chr5 56577525 56577680 -95959579 + RLTR42-int LTR ERVK 1230 1384 -4138 1 1016 1626 205 76 37 chr5 56595759 56596114 -95941145 + ORR1C1 LTR MaLR 5 373 -5 1 1016 656 302 89 36 chr5 56596233 56596594 -95940665 + MER90a LTR ERV1 1 380 -234 1 1016 242 351 16 73 chr5 56597415 56597538 -95939721 + MTD LTR MaLR 6 121 -258 1 1016 518 304 83 65 chr5 56597660 56597889 -95939370 + MTD LTR MaLR 177 409 -10 1 1016 283 329 63 6 chr5 56600475 56600634 -95936625 + MLT1B LTR MaLR 62 229 -161 1 1016 842 151 182 11 chr5 56600715 56600902 -95936357 + RMER19C LTR ERVK 1 219 -392 1 1016 3049 194 43 16 chr5 56600916 56601538 -95935721 + MurERV4_19-int LTR ERVK 204 842 -4938 1 1016 4515 164 44 7 chr5 56601756 56602577 -95934682 + MurERV4_19-int LTR ERVK 835 1685 -4095 1 1016 273 164 0 18 chr5 56602601 56602657 -95934602 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1736 1790 -3990 1 1016 5699 154 95 83 chr5 56602639 56602716 -95934543 + MurERV4_19-int LTR ERVK 4254 4336 -1444 1 1016 5699 154 95 83 chr5 56602739 56603475 -95933784 + MurERV4_19-int LTR ERVK 4337 5075 -705 1 1016 5699 154 95 83 chr5 56603527 56604216 -95933043 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5076 5773 -7 1 1016 2770 184 24 108 chr5 56604223 56604888 -95932371 + RMER19C LTR ERVK 3 611 0 1 1016 1243 261 6 112 chr5 56612363 56612721 -95924538 - MTC LTR MaLR -2 419 100 1 1016 1838 173 21 6 chr5 56613372 56613698 -95923561 + ORR1A1 LTR MaLR 16 346 0 1 1016 332 153 311 0 chr5 56615866 56615962 -95921297 - MTC LTR MaLR -292 127 1 1 1016 3578 186 84 4 chr5 56618529 56618791 -95918468 - RLTR25B LTR ERVK -219 809 521 1 1016 3578 186 84 4 chr5 56619576 56620062 -95917197 - RLTR25B LTR ERVK -508 520 3 1 1016 304 309 138 40 chr5 56622522 56622775 -95914484 + RLTR12B LTR ERVK 1 278 -250 1 1017 472 283 102 11 chr5 56631756 56631942 -95905317 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 166 1 1017 601 215 123 14 chr5 56632113 56632259 -95905000 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 3 1 1017 312 242 30 10 chr5 56632343 56632445 -95904814 - MTD LTR MaLR -12 407 247 1 1017 619 354 40 37 chr5 56632474 56632850 -95904409 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 1 1017 252 362 30 45 chr5 56634970 56635103 -95902156 + MTEa LTR MaLR 249 379 0 2 1017 310 388 54 42 chr5 56660071 56660367 -95876892 - MLT1E1 LTR MaLR -17 637 305 2 1017 368 287 43 35 chr5 56663016 56663157 -95874102 + MT2A LTR ERVL 222 363 -170 2 1017 1163 221 182 60 chr5 56664141 56664541 -95872718 - RMER6C LTR ERVK 0 690 261 2 1017 1163 221 182 60 chr5 56664574 56664788 -95872471 - RMER6C LTR ERVK -430 260 2 2 1017 279 341 93 82 chr5 56667489 56667853 -95869406 - MLT1E3 LTR MaLR -117 507 140 2 1017 3688 16 121 0 chr5 56678103 56678543 -95858716 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 1017 1738 152 101 24 chr5 56682815 56683193 -95854066 - RLTR9E LTR ERVK -2 407 1 2 1017 1914 205 81 45 chr5 56697718 56698225 -95839034 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 1 2 1017 270 375 108 42 chr5 56704001 56704168 -95833091 - MLT1F2 LTR MaLR -190 370 193 2 1017 396 349 60 65 chr5 56706899 56707290 -95829969 - RLTR11A2 LTR ERVK -27 418 5 2 1017 502 269 100 25 chr5 56729386 56729546 -95807713 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 199 3 1017 924 272 145 6 chr5 56730336 56730661 -95806598 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 3 1017 635 312 48 48 chr5 56740143 56740456 -95796803 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 50 3 1017 2785 87 50 2 chr5 56744678 56745081 -95792178 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 3 1017 450 361 93 56 chr5 56752450 56752825 -95784434 - MT2A LTR ERVL -134 399 11 3 1018 278 231 108 21 chr5 56761643 56761736 -95775523 + ORR1D1 LTR MaLR 274 374 0 3 1018 397 353 12 17 chr5 56762276 56762449 -95774810 + MLT1C LTR MaLR 294 465 -2 3 1018 795 283 93 0 chr5 56766405 56766642 -95770617 - MTD LTR MaLR -38 381 123 3 1018 916 174 160 0 chr5 56776799 56776860 -95760399 - MT2B LTR ERVL 0 601 541 4 1018 916 174 160 0 chr5 56776885 56777036 -95760223 - MT2B LTR ERVL -61 540 356 4 1018 310 382 72 34 chr5 56777045 56777338 -95759921 + RMER15 LTR ERVL 272 575 0 4 1018 3312 226 66 83 chr5 56785068 56786382 -95750877 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 7848 4 1018 3103 256 123 110 chr5 56786417 56787058 -95750201 - MYSERV6-int LTR ERVK -1274 5276 4568 4 1018 599 281 40 50 chr5 56789157 56789434 -95747825 - RLTR15 LTR ERVK -76 283 10 4 1018 447 147 0 0 chr5 56790995 56791063 -95746196 - ORR1B2 LTR MaLR -52 315 248 4 1018 939 300 72 11 chr5 56792019 56792366 -95744893 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 4 1018 1839 193 15 80 chr5 56796161 56796573 -95740686 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 1 4 1018 268 302 43 80 chr5 56804154 56804341 -95732918 - MT2B LTR ERVL -344 257 78 4 1018 324 296 66 7 chr5 56805486 56805622 -95731637 + MER67C LTR ERV1 1 144 -370 4 1018 347 328 48 67 chr5 56805642 56805851 -95731408 + MER67C LTR ERV1 175 379 -332 4 1018 750 192 366 85 chr5 56809162 56809617 -95727642 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 1 4 1018 3202 48 0 25 chr5 56813040 56813446 -95723813 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1018 1129 258 21 159 chr5 56814704 56814763 -95722496 - ORR1B1 LTR MaLR -1 377 337 4 1018 1590 215 34 38 chr5 56814966 56815339 -95721920 - ORR1B1 LTR MaLR -46 348 5 4 1018 1879 216 195 23 chr5 56836485 56837130 -95700129 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 4 1018 1433 231 71 6 chr5 56848244 56848597 -95688662 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 1 5 1018 1561 222 61 23 chr5 56855741 56856137 -95681122 - RMER6A LTR ERVK 0 756 346 5 1018 267 250 0 191 chr5 56858084 56858168 -95679091 - RLTR25A LTR ERVK -515 588 521 5 1018 486 190 0 0 chr5 56858110 56858189 -95679070 - MT2B LTR ERVL -342 259 181 5 1018 371 371 36 64 chr5 56878601 56878820 -95658439 + MLT1F1 LTR MaLR 261 473 -96 5 1018 647 329 83 83 chr5 56882543 56883188 -95654071 + MLT1E2 LTR MaLR 1 622 -5 5 1019 301 297 35 43 chr5 56893243 56893359 -95643900 + MLT1B LTR MaLR 195 309 -81 5 1019 484 276 43 36 chr5 56894121 56894260 -95642999 + MLT1A0 LTR MaLR 1 140 -225 5 1019 310 253 110 0 chr5 56897384 56897475 -95639784 + MLT1A0 LTR MaLR 315 415 -52 5 1019 277 283 29 57 chr5 56903827 56903932 -95633327 + RLTR25B LTR ERVK 915 1016 -12 5 1019 345 233 31 1 chr5 56904120 56904209 -95633050 - MLT1A LTR MaLR 0 408 283 5 1019 899 314 25 80 chr5 56907390 56907826 -95629433 - MTD LTR MaLR -2 417 6 5 1019 524 229 281 12 chr5 56909914 56910164 -95627095 + ORR1D1 LTR MaLR 6 322 -52 5 1019 4177 29 12 0 chr5 56920651 56921138 -95616121 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1019 1292 209 40 15 chr5 56936404 56936773 -95600486 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 118 6 1019 588 244 57 0 chr5 56937548 56937671 -95599588 - RLTR28 LTR ERVL -351 130 1 6 1019 1599 216 24 21 chr5 56937943 56938279 -95598980 - RMER15 LTR ERVL -233 342 6 6 1019 6695 108 12 32 chr5 56940609 56941652 -95595607 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 6 1019 929 236 188 3 chr5 56941763 56942077 -95595182 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 6 1019 542 163 132 1 chr5 56944365 56944485 -95592774 + ORR1B1 LTR MaLR 184 394 0 6 1019 1959 276 69 42 chr5 56944485 56945513 -95591746 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 985 -978 6 1019 1171 163 86 12 chr5 56950192 56950447 -95586812 - RMER6A LTR ERVK -11 745 472 6 1019 376 251 26 38 chr5 56950640 56950740 -95586519 - MT2B LTR ERVL -325 259 173 6 1019 607 157 28 0 chr5 56950717 56950825 -95586434 - RMER6A LTR ERVK -579 111 1 6 1019 632 304 22 5 chr5 56955582 56955767 -95581492 - MTEb LTR MaLR -31 348 161 6 1019 521 350 71 102 chr5 56959544 56960132 -95577127 + RLTR18 LTR ERVK 38 607 -9 6 1019 249 384 55 71 chr5 56966088 56966399 -95570860 - MLT1D LTR MaLR -8 497 192 6 1019 738 314 120 3 chr5 56980226 56980542 -95556717 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 5 6 1019 2023 304 99 30 chr5 56980523 56981372 -95555887 - ORR1D2-int LTR MaLR -27 1553 487 6 1019 638 305 198 67 chr5 56982001 56982556 -95554703 - MTD-int LTR MaLR -400 858 231 6 1019 314 280 50 112 chr5 56982902 56983063 -95554196 - MTD-int LTR MaLR -1107 151 1 6 1019 447 260 9 9 chr5 56983063 56983197 -95554062 - MTD LTR MaLR -15 404 267 6 1019 1168 248 77 12 chr5 56983197 56983536 -95553723 + ORR1B2 LTR MaLR 3 363 -4 6 1019 265 239 29 15 chr5 56983596 56983664 -95553595 - MTD LTR MaLR -299 120 52 6 1019 290 300 0 29 chr5 56989382 56989485 -95547774 - MLT1B LTR MaLR -210 180 81 6 1019 1627 208 52 26 chr5 57007425 57008196 -95529063 - RMER6A LTR ERVK -25 731 1 1 1019 376 336 64 56 chr5 57015708 57015957 -95521302 + RLTR18 LTR ERVK 31 281 -335 2 1020 3532 156 5 7 chr5 57016991 57017591 -95519668 + MT2B LTR ERVL 3 601 0 2 1020 4600 139 33 79 chr5 57024678 57025624 -95511635 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 4 1020 1242 142 15 5 chr5 57025679 57025877 -95511382 - LTRIS2 LTR ERV1 -364 200 1 4 1020 883 200 74 5 chr5 57025878 57026094 -95511165 - MuRRS4-int LTR ERV1 -42 5021 4791 4 1020 4742 129 28 14 chr5 57026455 57027217 -95510042 - RMER16-int LTR ERVK -3962 1444 673 4 1020 897 131 106 12 chr5 57027203 57027373 -95509886 - RMER16-int LTR ERVK -5080 326 141 4 1020 3311 100 102 17 chr5 57027982 57028502 -95508757 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 5 1020 427 207 45 140 chr5 57037025 57037182 -95500077 + MT2B LTR ERVL 123 264 -337 6 1020 291 276 59 30 chr5 57045613 57045714 -95491545 - MTC LTR MaLR -292 104 1 7 1020 228 111 0 0 chr5 57047840 57047876 -95489383 + RMER6A LTR ERVK 721 756 0 8 1020 226 174 0 0 chr5 57050217 57050263 -95486996 - MT2A LTR ERVL -3 530 485 9 1020 890 277 34 17 chr5 57051032 57051267 -95485992 - MT2A LTR ERVL -292 241 3 9 1020 1655 175 24 30 chr5 57059322 57059652 -95477607 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 1 1020 490 0 0 0 chr5 57059781 57059837 -95477422 - MTB LTR MaLR 0 400 345 1 1020 791 11 0 0 chr5 57059831 57059923 -95477336 - MTA_Mm LTR MaLR -304 92 1 1 1020 9579 13 3 0 chr5 57059923 57061018 -95476241 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1020 490 0 0 0 chr5 57061018 57061074 -95476185 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 345 1 1020 791 11 0 0 chr5 57061068 57061160 -95476099 - MTA_Mm LTR MaLR -304 92 1 1 1020 773 262 71 9 chr5 57062596 57062808 -95474451 + MERVK26-int LTR ERVK 6217 6441 -478 1 1020 614 287 30 18 chr5 57063062 57063229 -95474030 + MERVK26-int LTR ERVK 6750 6918 -1 1 1020 2658 196 87 16 chr5 57063233 57063808 -95473451 + RMER20B LTR ERVK 1 616 -11 1 1020 248 393 9 18 chr5 57065357 57065471 -95471788 + MLT1E1A LTR MaLR 18 130 -550 1 1020 1191 204 23 23 chr5 57066865 57067131 -95470128 + RMER6C LTR ERVK 418 683 -7 1 1020 1557 122 127 10 chr5 57071294 57071593 -95465666 + RLTR9E LTR ERVK 76 409 0 1 1020 1144 230 79 3 chr5 57072622 57072914 -95464345 + ORR1C1 LTR MaLR 45 358 -20 1 1020 1072 266 204 44 chr5 57074776 57075251 -95462008 - RMER15 LTR ERVL -24 551 1 1 1020 1094 261 73 13 chr5 57078291 57078594 -95458665 - RMER19C LTR ERVK 0 611 291 1 1020 586 318 94 74 chr5 57102387 57102846 -95434413 + RMER13A LTR ERVK 21 488 -372 1 1020 506 331 66 76 chr5 57119286 57119587 -95417672 - MTEa LTR MaLR -26 353 56 2 1020 296 280 0 0 chr5 57133121 57133196 -95404063 + MLT1E3 LTR MaLR 84 158 -522 2 1020 324 368 75 35 chr5 57133282 57133589 -95403670 + MLT1E3 LTR MaLR 337 640 -14 2 1020 2374 139 24 122 chr5 57144045 57144579 -95392680 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1021 369 339 149 41 chr5 57152234 57152255 -95385004 + MLT1E2 LTR MaLR 56 75 -552 2 1021 3187 58 5 0 chr5 57152255 57152649 -95384610 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1021 369 339 140 39 chr5 57152649 57153103 -95384156 + MLT1E2 LTR MaLR 76 572 -52 2 1021 3231 84 13 26 chr5 57156831 57157283 -95379976 - LTRIS5 LTR ERV1 -1 446 1 2 1021 4300 138 165 22 chr5 57157681 57158529 -95378730 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 969 -14 2 1021 472 305 24 71 chr5 57163890 57164021 -95373238 - RMER15 LTR ERVL -373 202 82 2 1021 3768 70 30 4 chr5 57164021 57164520 -95372739 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 1021 472 305 24 71 chr5 57164520 57164600 -95372659 - RMER15 LTR ERVL -494 81 1 2 1021 2546 167 67 114 chr5 57177924 57178513 -95358746 + RMER17D LTR ERVK 1 538 -351 2 1021 2546 167 67 114 chr5 57178659 57178881 -95358378 + RMER17D LTR ERVK 539 773 -116 2 1021 406 130 0 145 chr5 57180186 57180303 -95356956 - RMER17A LTR ERVK 0 751 652 2 1021 531 250 62 34 chr5 57181122 57181405 -95355854 - MTD LTR MaLR -4 417 13 2 1021 233 280 123 62 chr5 57185978 57186157 -95351102 + MLT1D LTR MaLR 315 504 -1 2 1021 1582 184 91 15 chr5 57194340 57194681 -95342578 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1021 376 337 60 97 chr5 57194958 57195227 -95342032 + RLTR26 LTR ERVK 184 442 -200 3 1021 922 219 154 53 chr5 57211477 57211815 -95325444 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 3 1021 1226 254 58 103 chr5 57214924 57215089 -95322170 + RMER6A LTR ERVK 1 177 -513 3 1021 1889 219 53 44 chr5 57215144 57215776 -95321483 + RMER6A LTR ERVK 178 756 0 3 1021 1599 240 55 16 chr5 57217739 57218124 -95319135 + MTB_Mm LTR MaLR 3 402 -5 3 1021 435 125 14 0 chr5 57220535 57220607 -95316652 + MYSERV6-int LTR ERVK 1219 1291 -7668 3 1021 392 148 12 58 chr5 57220610 57220696 -95316563 + MYSERV6-int LTR ERVK 4946 5027 -3932 3 1021 3487 199 70 19 chr5 57220759 57221536 -95315723 + MYSERV6-int LTR ERVK 4995 5810 -3149 3 1021 873 277 140 57 chr5 57221536 57221568 -95315691 - RLTR19 LTR ERVK -26 473 448 3 1021 3010 68 2 30 chr5 57221568 57221975 -95315284 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1021 873 277 140 57 chr5 57221975 57222229 -95315030 - RLTR19 LTR ERVK -52 447 170 3 1021 878 270 143 59 chr5 57222276 57222425 -95314834 - RLTR19 LTR ERVK -330 169 1 3 1021 707 215 128 11 chr5 57222599 57222778 -95314481 - RLTR19-int LTR ERVK -1756 4381 4182 3 1021 267 340 70 14 chr5 57230194 57230337 -95306922 - RMER20B LTR ERVK -243 384 234 3 1021 1016 215 60 101 chr5 57234848 57235215 -95302044 - RLTR24 LTR ERV1 -135 394 43 3 1021 658 208 150 27 chr5 57254395 57254718 -95282541 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1533 1844 -4 3 1021 2648 83 59 3 chr5 57260839 57261214 -95276045 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1021 936 317 69 6 chr5 57269544 57269890 -95267369 - MTEa LTR MaLR -2 377 10 3 1021 602 231 0 0 chr5 57272146 57272263 -95264996 + MTD LTR MaLR 4 120 -299 4 1021 552 266 162 124 chr5 57272446 57272729 -95264530 + MTD LTR MaLR 126 419 0 4 1021 314 303 111 28 chr5 57275754 57275971 -95261288 + MER89 LTR ERV1 293 527 -32 4 1022 519 367 24 5 chr5 57283558 57283766 -95253493 + ORR1E LTR MaLR 28 239 -120 4 1022 616 329 93 63 chr5 57286323 57286687 -95250572 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 4 1022 500 226 106 31 chr5 57305082 57305242 -95232017 - RLTR24 LTR ERV1 -339 190 19 4 1022 275 186 0 0 chr5 57307195 57307238 -95230021 - RLTR24 LTR ERV1 -486 43 1 4 1022 471 322 33 33 chr5 57307759 57308035 -95229224 - RLTR12B LTR ERVK -252 276 1 4 1022 522 217 0 9 chr5 57310943 57311050 -95226209 + MTC LTR MaLR 314 419 -2 4 1022 469 356 57 87 chr5 57317794 57318160 -95219099 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 4 1022 437 324 57 21 chr5 57322647 57322839 -95214420 - MER31A LTR ERV1 -157 328 130 4 1022 1160 296 33 14 chr5 57327711 57328074 -95209185 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 1022 1555 162 79 71 chr5 57328985 57329391 -95207868 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 1022 643 245 20 78 chr5 57329400 57329719 -95207540 + MMETn-int LTR ERVK 10 372 -2942 4 1022 309 196 0 0 chr5 57329714 57329770 -95207489 + RLTR45-int LTR ERVK 2091 2146 -5098 4 1022 253 130 0 0 chr5 57330194 57330240 -95207019 + RMER16-int LTR ERVK 141 186 -5220 4 1022 326 140 0 0 chr5 57330314 57330364 -95206895 + ETnERV2-int LTR ERVK 1721 1770 -5636 4 1022 2682 177 57 42 chr5 57331065 57331630 -95205629 + RLTR20B3 LTR ERVK 5 577 0 4 1022 268 213 0 62 chr5 57336608 57336673 -95200586 + MT2C_Mm LTR ERVL 377 437 -38 5 1022 1379 255 13 31 chr5 57336744 57337129 -95200130 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 5 1022 3503 211 120 88 chr5 57337674 57338731 -95198528 - RLTR25A LTR ERVK -12 1091 1 5 1022 258 214 54 87 chr5 57338732 57338824 -95198435 - RLTR25A LTR ERVK -1014 89 1 5 1022 328 330 70 21 chr5 57339814 57340000 -95197259 - MER110A LTR ERV1 -219 249 55 5 1022 482 281 57 34 chr5 57350358 57350535 -95186724 - MTD LTR MaLR 0 419 239 5 1022 288 319 39 16 chr5 57354427 57354609 -95182650 + RMER16-int LTR ERVK 181 366 -6878 5 1022 1699 167 112 21 chr5 57354815 57355240 -95182019 + RMER16-int LTR ERVK 214 670 -4736 5 1022 482 200 25 34 chr5 57355248 57355367 -95181892 + RMER16-int LTR ERVK 952 1060 -5077 5 1022 638 252 0 43 chr5 57355380 57355542 -95181717 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2608 -4798 5 1022 9637 134 36 11 chr5 57355542 57356136 -95181123 + ETnERV2-int LTR ERVK 3055 3669 -3737 5 1022 2033 108 16 13 chr5 57356136 57356444 -95180815 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 5 1022 9637 134 36 11 chr5 57356444 57357434 -95179825 + ETnERV2-int LTR ERVK 3670 4679 -2727 5 1022 3114 62 7 0 chr5 57357432 57357836 -95179423 + ETnERV2-int LTR ERVK 5356 5762 -1644 5 1022 6337 141 74 91 chr5 57357824 57359248 -95178011 + RLTR45-int LTR ERVK 4672 6071 -1173 5 1022 1236 60 43 1 chr5 57359286 57359482 -95177777 + RLTR13D5 LTR ERVK 291 509 -524 5 1022 252 284 0 0 chr5 57359513 57359594 -95177665 + RLTR45-int LTR ERVK 6808 6888 -1329 5 1022 455 329 13 0 chr5 57359931 57360080 -95177179 + ETnERV2-int LTR ERVK 6496 6646 -760 5 1022 408 231 0 11 chr5 57368988 57369080 -95168179 - RMER17B LTR ERVK 0 958 868 5 1022 1014 298 44 104 chr5 57380405 57380816 -95156443 - MTE2b LTR MaLR -20 359 3 5 1022 2755 70 137 139 chr5 57392869 57393381 -95143878 + RLTR1B LTR ERV1 2 512 0 5 1022 487 337 87 0 chr5 57393640 57393836 -95143423 + ORR1D1 LTR MaLR 1 213 -161 5 1022 2410 248 161 31 chr5 57393974 57394549 -95142710 + ORR1D1-int LTR MaLR 4 683 -687 5 1022 7043 68 5 0 chr5 57394549 57395438 -95141821 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 5 1022 2410 248 161 31 chr5 57395438 57395645 -95141614 + ORR1D1-int LTR MaLR 684 888 -482 5 1022 3981 181 34 9 chr5 57396214 57397007 -95140252 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 813 -1035 5 1022 1047 217 61 8 chr5 57397328 57397574 -95139685 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1590 1848 0 5 1022 614 283 110 23 chr5 57397577 57398005 -95139254 + ORR1D1-int LTR MaLR 886 1370 0 5 1022 294 253 89 0 chr5 57398005 57398072 -95139187 + ORR1D1 LTR MaLR 1 74 -300 5 1022 430 200 24 0 chr5 57398072 57398157 -95139102 + RMER6C LTR ERVK 1 87 -603 5 1022 4186 173 66 48 chr5 57398168 57399108 -95138151 + RMER17B LTR ERVK 2 958 0 5 1022 1705 212 91 40 chr5 57399133 57399260 -95137999 + RMER6C LTR ERVK 135 265 -425 5 1022 1705 212 91 40 chr5 57399723 57400121 -95137138 + RMER6C LTR ERVK 266 687 -3 5 1022 1470 265 51 15 chr5 57402213 57402607 -95134652 - MTD LTR MaLR -2 417 10 5 1022 520 297 55 34 chr5 57405273 57405510 -95131749 - MER92B LTR ERV1 -394 242 1 5 1022 581 340 104 36 chr5 57407583 57408083 -95129176 - RMER5 LTR ERV1 0 534 1 5 1022 3169 14 0 8 chr5 57408949 57409319 -95127940 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 127 55278 23 18 0 chr5 57409319 57415669 -95121590 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6468 -13 5 1023 3192 11 0 8 chr5 57415682 57416052 -95121207 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1023 805 284 123 30 chr5 57418262 57418596 -95118663 + ORR1D1 LTR MaLR 1 365 -9 5 1023 238 274 126 0 chr5 57421097 57421192 -95116067 - MLT1A0 LTR MaLR -256 109 3 5 1023 1839 181 25 14 chr5 57447709 57448063 -95089196 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 2 6 1023 253 284 12 36 chr5 57450796 57450880 -95086379 + RLTR25B LTR ERVK 417 498 -530 6 1023 324 207 0 107 chr5 57450820 57450923 -95086336 + MT2B LTR ERVL 196 287 -314 6 1023 1696 189 6 12 chr5 57451057 57451378 -95085881 + RMER6C LTR ERVK 370 688 -2 6 1023 297 246 75 27 chr5 57453457 57453593 -95083666 - MTD LTR MaLR 0 379 233 6 1023 573 264 723 2 chr5 57453634 57453768 -95083491 - MTD LTR MaLR -147 232 1 6 1023 1140 216 143 60 chr5 57453977 57454326 -95082933 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1023 415 154 76 11 chr5 57455962 57456049 -95081210 - RLTR1B LTR ERV1 -76 436 343 6 1023 2789 70 57 2 chr5 57456036 57456437 -95080822 - RLTR1B LTR ERV1 -89 423 1 6 1023 6228 102 35 75 chr5 57456437 57458602 -95078657 - RLTR1B-int LTR ERV1 -700 3990 1 6 1023 1051 126 18 0 chr5 57458602 57458769 -95078490 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 343 6 1023 282 182 0 0 chr5 57458773 57458828 -95078431 - RLTR1B LTR ERV1 -102 410 356 6 1023 4925 71 6 20 chr5 57459918 57460607 -95076652 + ORR1A1-int LTR MaLR 1114 1792 0 6 1023 2172 105 3 3 chr5 57460607 57460912 -95076347 + ORR1A1 LTR MaLR 1 305 -41 6 1023 1010 134 29 0 chr5 57465302 57465473 -95071786 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 176 -207 6 1023 1395 198 57 13 chr5 57465564 57465882 -95071377 + RLTR9B LTR ERVK 106 437 0 6 1023 1512 191 48 23 chr5 57469884 57470194 -95067065 - ORR1A4 LTR MaLR -11 318 1 6 1023 674 235 26 19 chr5 57476733 57476889 -95060370 + RLTR40 LTR ERVK 566 722 -95 6 1023 231 367 68 62 chr5 57480325 57480517 -95056742 - MLT1E3 LTR MaLR -61 563 371 6 1023 248 275 87 55 chr5 57481833 57481960 -95055299 - MLT2D LTR ERVL -279 135 5 6 1023 3407 184 22 26 chr5 57492346 57493105 -95044154 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 6 1023 1122 227 21 144 chr5 57496072 57496142 -95041117 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 327 6 1023 1122 227 21 144 chr5 57496335 57496598 -95040661 - ORR1B1 LTR MaLR -68 326 102 6 1023 1815 244 46 39 chr5 57508356 57508842 -95028417 + RMER19C LTR ERVK 76 606 -5 2 1023 554 319 93 18 chr5 57523087 57523486 -95013773 + MER57C2 LTR ERV1 5 433 -1 4 1023 977 308 67 16 chr5 57525627 57526003 -95011256 - MTD LTR MaLR -14 407 1 4 1023 1132 288 75 41 chr5 57530825 57531335 -95005924 + RMER5 LTR ERV1 8 534 0 5 1023 456 336 77 48 chr5 57532514 57532898 -95004361 + MTB LTR MaLR 1 405 -14 6 1023 783 321 68 61 chr5 57533822 57534591 -95002668 + MTC-int LTR MaLR 150 914 -184 6 1023 1328 131 207 8 chr5 57535604 57535870 -95001389 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 1024 1035 290 83 16 chr5 57544225 57544600 -94992659 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 7 1024 1808 209 44 29 chr5 57545663 57546076 -94991183 - MTC LTR MaLR 0 421 3 7 1024 522 323 125 39 chr5 57555908 57555993 -94981266 + MTEb LTR MaLR 6 86 -293 9 1024 528 323 125 39 chr5 57556259 57556405 -94980854 + MTEb LTR MaLR 87 257 -122 9 1024 2722 89 7 42 chr5 57563553 57563734 -94973525 + MTA_Mm LTR MaLR 1 181 -215 1 1024 2722 89 7 42 chr5 57564276 57564504 -94972755 + MTA_Mm LTR MaLR 182 396 0 1 1024 474 282 75 79 chr5 57564602 57564856 -94972403 + RMER15 LTR ERVL 310 562 -13 1 1024 1581 211 77 75 chr5 57573176 57573314 -94963945 + MTC LTR MaLR 6 120 -301 1 1024 1581 211 77 75 chr5 57573347 57573623 -94963636 + MTC LTR MaLR 121 421 0 1 1024 916 331 81 33 chr5 57578735 57579069 -94958190 - ORR1D2 LTR MaLR -18 352 3 1 1024 1433 221 26 29 chr5 57581429 57581773 -94955486 - RMER6C LTR ERVK 0 690 348 1 1024 442 256 15 114 chr5 57581861 57581961 -94955298 - MT2B LTR ERVL -341 260 174 1 1024 364 213 67 0 chr5 57581939 57582014 -94955245 - RMER6C LTR ERVK -579 111 32 1 1024 261 312 26 78 chr5 57585072 57585225 -94952034 + MTEa LTR MaLR 204 348 -31 1 1024 1216 317 50 6 chr5 57586245 57586607 -94950652 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 1 1024 234 341 55 39 chr5 57587490 57587618 -94949641 - MLT1D LTR MaLR -312 193 64 1 1024 264 254 0 48 chr5 57606977 57607039 -94930220 + RMER13B LTR ERVK 850 908 0 1 1024 1178 206 117 0 chr5 57607474 57607731 -94929528 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 96 1 1024 359 268 128 47 chr5 57607751 57607900 -94929359 - ORR1C2-int LTR MaLR -588 782 622 1 1024 2654 106 8 15 chr5 57611344 57611746 -94925513 - MTB LTR MaLR 0 400 2 1 1024 2846 53 0 0 chr5 57612957 57613299 -94923960 + ORR1A1 LTR MaLR 1 342 -4 1 1024 358 356 84 88 chr5 57616645 57616953 -94920306 + MLT2B2 LTR ERVL 190 496 -19 1 1024 566 313 132 32 chr5 57635365 57635797 -94901462 - RLTR12B LTR ERVK -6 522 48 2 1024 316 356 98 64 chr5 57644241 57644568 -94892691 + ORR1E LTR MaLR 13 350 -9 2 1024 328 221 22 34 chr5 57647335 57647424 -94889835 - RMER17C LTR ERVK 0 410 323 2 1024 1021 232 98 0 chr5 57647727 57647973 -94889286 + ORR1C1 LTR MaLR 16 285 -93 2 1024 687 305 119 13 chr5 57651561 57651873 -94885386 - MTEa LTR MaLR -15 364 20 2 1024 1603 111 19 38 chr5 57661049 57661311 -94875948 + RLTR45 LTR ERVK 1 257 -225 2 1024 625 204 0 0 chr5 57667335 57667448 -94869811 + RMER6B LTR ERVK 82 194 -267 2 1024 1876 214 14 88 chr5 57667991 57668477 -94868782 + RMER6B LTR ERVK 12 461 0 2 1025 1356 272 92 81 chr5 57678934 57679411 -94857848 - RLTR40 LTR ERVK -35 782 302 2 1025 1356 272 92 81 chr5 57679489 57679728 -94857531 - RLTR40 LTR ERVK -516 301 58 2 1025 1962 226 13 38 chr5 57679817 57680294 -94856965 + RMER19C LTR ERVK 138 602 -9 2 1025 1593 211 83 28 chr5 57682467 57682866 -94854393 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1025 711 134 9 0 chr5 57684267 57684379 -94852880 + RMER6C LTR ERVK 578 690 0 2 1025 1268 255 50 39 chr5 57692873 57693236 -94844023 + ORR1D1 LTR MaLR 8 374 0 3 1025 1501 211 124 11 chr5 57698951 57699305 -94837954 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1025 1424 223 20 7 chr5 57701166 57701468 -94835791 + ORR1C1 LTR MaLR 73 378 0 3 1025 1552 247 37 41 chr5 57705221 57705686 -94831573 - RMER19C LTR ERVK -2 609 147 3 1025 1046 197 263 0 chr5 57710494 57710783 -94826476 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 3 1025 308 301 79 22 chr5 57718492 57718631 -94818628 - RMER15 LTR ERVL -14 561 415 3 1025 267 357 68 54 chr5 57719791 57719939 -94817320 - RMER15 LTR ERVL -154 421 272 3 1025 363 373 80 57 chr5 57720091 57720529 -94816730 - MER21B LTR ERV1 -161 702 255 3 1025 603 253 60 135 chr5 57720529 57720863 -94816396 - RMER10A LTR ERVL -13 429 121 3 1025 300 289 43 22 chr5 57720923 57721015 -94816244 - MER21B LTR ERV1 -602 261 168 3 1025 625 337 5 0 chr5 57721105 57721292 -94815967 + MTD LTR MaLR 14 201 -218 3 1025 242 286 61 10 chr5 57732886 57732985 -94804274 + MLT1B LTR MaLR 266 369 -21 3 1025 1861 199 157 98 chr5 57735914 57736488 -94800771 + RMER19C LTR ERVK 1 608 -3 3 1025 4025 48 38 2 chr5 57745544 57746045 -94791214 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 3 1025 1781 169 0 62 chr5 57750664 57751004 -94786255 + ORR1A4 LTR MaLR 3 321 -8 4 1025 2292 125 14 17 chr5 57752857 57753215 -94784044 + MT2C_Mm LTR ERVL 119 475 0 4 1025 254 326 46 46 chr5 57756691 57756842 -94780417 + MLT2B4 LTR ERVL 76 226 -330 4 1025 273 346 9 18 chr5 57756945 57757054 -94780205 + MLT2B4 LTR ERVL 369 476 -80 4 1025 2027 72 0 0 chr5 57758429 57758693 -94778566 + MTA_Mm LTR MaLR 133 396 0 4 1025 1287 241 88 0 chr5 57765715 57766035 -94771224 + MTD LTR MaLR 1 348 -71 4 1025 1193 271 49 30 chr5 57766086 57766451 -94770808 - RLTR11A LTR ERVK -27 501 130 4 1025 257 265 35 24 chr5 57766530 57766615 -94770644 + MTE2b LTR MaLR 294 379 0 4 1025 728 192 30 55 chr5 57770636 57770801 -94766458 - RMER19C LTR ERVK -447 164 4 4 1025 677 204 22 50 chr5 57779707 57779938 -94757321 - RMER6D LTR ERVK -59 697 523 4 1025 1613 215 15 78 chr5 57780553 57781028 -94756231 - RMER6C LTR ERVK -20 670 226 4 1025 1262 128 113 0 chr5 57781595 57781799 -94755460 + MTB_Mm LTR MaLR 181 407 0 4 1025 1277 244 39 23 chr5 57781812 57782122 -94755137 - MTC LTR MaLR -106 315 1 4 1025 666 274 16 26 chr5 57783713 57783904 -94753355 - MTD LTR MaLR -211 208 20 4 1025 370 352 132 40 chr5 57790669 57790941 -94746318 - MLT1I LTR MaLR -22 389 93 4 1025 232 340 98 62 chr5 57792619 57792895 -94744364 - MLT1I-int LTR MaLR -1098 289 4 4 1025 262 235 17 183 chr5 57798058 57798178 -94739081 + HERVL74-int LTR ERVL 2257 2356 -3329 4 1025 398 317 133 20 chr5 57798423 57798792 -94738467 + HERVL74-int LTR ERVL 2593 3183 -373 4 1025 889 246 101 23 chr5 57798945 57799186 -94738073 + ORR1B1 LTR MaLR 1 240 -130 4 1025 1900 98 4 4 chr5 57800314 57800592 -94736667 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 278 -48 4 1026 327 319 121 0 chr5 57806318 57806484 -94730775 - MLT2B1 LTR ERVL -3 564 379 4 1026 2024 148 40 30 chr5 57813541 57813946 -94723313 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 1026 1079 242 45 66 chr5 57830492 57830522 -94706737 - MT2B LTR ERVL 0 601 571 5 1026 1079 247 47 69 chr5 57830605 57830931 -94706328 - MT2B LTR ERVL -31 570 162 5 1026 655 304 70 97 chr5 57830954 57831122 -94706137 - MT2B LTR ERVL -372 161 3 5 1026 1648 221 73 8 chr5 57831733 57832129 -94705130 + RMER4B LTR ERVK 18 439 -146 5 1026 818 309 33 65 chr5 57834337 57834804 -94702455 - MT2B LTR ERVL -61 540 1 5 1026 607 210 0 0 chr5 57846936 57847055 -94690204 - ORR1A1-int LTR MaLR -833 959 841 5 1026 2865 237 30 148 chr5 57847397 57848608 -94688651 - ORR1B1-int LTR MaLR -939 1024 3 5 1026 1657 190 62 18 chr5 57848610 57848948 -94688311 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 41 5 1026 741 328 100 26 chr5 57849668 57850373 -94686886 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1929 2685 -3029 5 1026 280 365 24 0 chr5 57850535 57850661 -94686598 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2979 3107 -2654 5 1026 740 317 77 3 chr5 57850732 57851083 -94686176 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4861 5237 -477 5 1026 3261 42 3 0 chr5 57853660 57854044 -94683215 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 5 1026 358 320 8 8 chr5 57855513 57855639 -94681620 + MLT2B1 LTR ERVL 403 528 -39 5 1026 2924 96 5 0 chr5 57857194 57857592 -94679667 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1026 1032 237 26 15 chr5 57857606 57857966 -94679293 + RMER19B LTR ERVK 686 902 0 5 1026 1812 162 39 0 chr5 57857966 57858272 -94678987 - ORR1B1 LTR MaLR -76 318 1 5 1026 869 209 35 126 chr5 57860108 57860447 -94676812 - RMER16 LTR ERVK -101 432 1 5 1026 392 241 233 41 chr5 57861705 57861902 -94675357 + RMER4B LTR ERVK 343 577 -8 5 1026 730 287 41 32 chr5 57878727 57879066 -94658193 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 6 1026 238 220 20 20 chr5 57888323 57888374 -94648885 - ORR1A4 LTR MaLR -197 132 82 6 1026 348 311 23 60 chr5 57896540 57896673 -94640586 + MLT1D LTR MaLR 386 614 -13 6 1026 238 245 0 0 chr5 57905254 57905307 -94631952 + MLT1A0 LTR MaLR 42 94 -280 6 1026 325 256 13 0 chr5 57905419 57905497 -94631762 + MLT1A0 LTR MaLR 286 364 -1 6 1026 253 404 97 39 chr5 57906937 57907298 -94629961 - LTR80A LTR ERVL -129 454 73 6 1026 2168 196 77 59 chr5 57909696 57910206 -94627053 + RLTR24 LTR ERV1 11 529 0 6 1026 314 322 12 62 chr5 57911090 57911252 -94626007 + MLT1C LTR MaLR 1 154 -313 6 1026 1961 180 17 3 chr5 57911600 57911962 -94625297 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1026 931 197 91 5 chr5 57920627 57920826 -94616433 + MTD LTR MaLR 204 419 0 6 1026 476 111 83 100 chr5 57922799 57922919 -94614340 + MT2B LTR ERVL 147 264 -337 6 1026 2689 70 6 0 chr5 57925462 57925806 -94611453 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 1027 2810 24 0 0 chr5 57942743 57943081 -94594178 + ORR1A0 LTR MaLR 1 338 -8 7 1027 1796 122 22 40 chr5 57957721 57957766 -94579493 + RLTR46 LTR ERVK 1 45 -275 7 1027 1796 122 22 40 chr5 57957941 57958218 -94579041 + RLTR46 LTR ERVK 46 317 -3 7 1027 1372 267 27 34 chr5 57970413 57970820 -94566439 + MTD LTR MaLR 14 417 -2 7 1027 3708 262 84 56 chr5 57970847 57970995 -94566264 + ORR1D2-int LTR MaLR 53 203 -1167 7 1027 3708 262 84 56 chr5 57971290 57972417 -94564842 + ORR1D2-int LTR MaLR 204 1363 -7 7 1027 1048 264 110 6 chr5 57972422 57972750 -94564509 + ORR1D2 LTR MaLR 1 362 -8 7 1027 2214 83 120 6 chr5 57977757 57978107 -94559152 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 7 1027 2559 103 27 15 chr5 57978337 57978741 -94558518 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 7 1027 341 231 13 13 chr5 57986556 57986609 -94550650 - MTEb LTR MaLR -14 365 314 7 1027 341 231 13 13 chr5 57986639 57986664 -94550595 - MTEb LTR MaLR -66 313 288 7 1027 235 338 0 0 chr5 57986954 57987028 -94550231 - MLT1A LTR MaLR -292 82 9 7 1027 358 323 106 87 chr5 57990544 57990913 -94546346 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 20 7 1027 1317 246 84 3 chr5 57992282 57992641 -94544618 - RMER15 LTR ERVL 0 575 188 7 1027 232 357 12 0 chr5 57995966 57996050 -94541209 - MLT1A0 LTR MaLR -169 196 112 7 1027 564 283 148 46 chr5 58004814 58005077 -94532182 + RMER5 LTR ERV1 245 534 0 3 1027 934 344 65 22 chr5 58005078 58005491 -94531768 + MER70B LTR ERVL 43 473 -105 4 1027 1554 232 39 94 chr5 58008589 58009056 -94528203 - RLTR41 LTR ERV1 -5 441 1 8 1027 840 171 12 235 chr5 58016138 58016466 -94520793 - RLTR23 LTR ERV1 -175 255 1 1 1027 335 258 108 0 chr5 58017409 58017502 -94519757 + RLTR47_MM LTR ERV1 321 423 -109 1 1027 1539 171 70 121 chr5 58029132 58029572 -94507687 + RLTR25A LTR ERVK 686 1103 0 2 1027 839 196 25 55 chr5 58031743 58031940 -94505319 - MTC LTR MaLR 0 421 201 3 1027 1392 182 225 11 chr5 58036160 58036538 -94500721 - RMER6B LTR ERVK 0 461 3 3 1027 417 342 72 46 chr5 58038281 58038647 -94498612 + MLT1A LTR MaLR 1 467 0 4 1027 2719 106 49 36 chr5 58040489 58040958 -94496301 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1027 995 93 91 23 chr5 58040959 58041134 -94496125 + IAPEz-int LTR ERVK 9 195 -6286 4 1027 237 250 0 0 chr5 58041143 58041187 -94496072 + RLTR27 LTR ERVK 232 275 -34 4 1027 3462 77 37 36 chr5 58041187 58041827 -94495432 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 4 1027 939 59 0 0 chr5 58041827 58041946 -94495313 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 4 1027 1896 84 12 0 chr5 58041941 58042192 -94495067 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 4 1027 14680 40 5 8 chr5 58042219 58043998 -94493261 + IAPEz-int LTR ERVK 4708 6481 0 4 1027 2338 110 134 16 chr5 58043998 58044423 -94492836 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1027 369 243 163 48 chr5 58050428 58050575 -94486684 + MLT1C LTR MaLR 4 167 -300 5 1027 492 42 14 14 chr5 58051506 58051578 -94485681 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1032 5 1028 329 350 77 49 chr5 58076268 58076451 -94460808 + MLT1N2 LTR MaLR 77 264 -298 8 1028 2925 15 95 6 chr5 58082606 58082943 -94454316 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 9 1028 8037 81 81 49 chr5 58082943 58084209 -94453050 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1313 -5168 9 1028 29345 21 1 2 chr5 58084208 58087485 -94449774 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6481 0 9 1028 2925 15 95 6 chr5 58087485 58087822 -94449437 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 9 1028 912 272 48 70 chr5 58093589 58093960 -94443299 + RMER10A LTR ERVL 1 363 -79 9 1028 230 385 45 22 chr5 58094322 58094500 -94442759 - MLT1F LTR MaLR -364 184 3 9 1028 425 335 22 0 chr5 58097358 58097537 -94439722 + MLT2B4 LTR ERVL 16 198 -358 1 1028 314 276 161 56 chr5 58097704 58097884 -94439375 + MLT2B4 LTR ERVL 230 428 -128 1 1028 470 336 78 29 chr5 58099719 58099961 -94437298 - MLT1H1 LTR MaLR -1 554 301 1 1028 419 266 120 33 chr5 58100670 58100853 -94436406 - MER34A LTR ERV1 -8 563 365 1 1028 1196 231 84 71 chr5 58124005 58124411 -94412848 + MTD LTR MaLR 9 419 0 1 1028 324 278 128 90 chr5 58127717 58128093 -94409166 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 1 1028 1372 218 67 36 chr5 58131467 58131828 -94405431 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 1 1028 579 317 48 36 chr5 58137413 58137662 -94399597 - MLT1D LTR MaLR -2 503 252 1 1028 1366 254 101 18 chr5 58143837 58144222 -94393037 - MTD LTR MaLR 0 419 3 1 1028 268 120 78 20 chr5 58145280 58145331 -94391928 - ORR1C2 LTR MaLR 0 374 321 1 1028 564 226 12 81 chr5 58146376 58146549 -94390710 - ORR1C2 LTR MaLR -57 327 167 1 1028 570 204 134 110 chr5 58146556 58146629 -94390630 - ORR1D1 LTR MaLR -114 260 172 1 1028 570 204 134 110 chr5 58146668 58146848 -94390411 - ORR1D1 LTR MaLR -203 171 1 1 1028 275 281 36 12 chr5 58173115 58173198 -94364061 - MER34 LTR ERV1 -83 459 375 2 1028 235 337 49 77 chr5 58173298 58173481 -94363778 - MER34 LTR ERV1 -325 246 69 2 1028 1905 81 52 13 chr5 58180733 58181128 -94356131 - RLTR1B LTR ERV1 -35 477 1 2 1028 3090 49 196 2 chr5 58181625 58182054 -94355205 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 1028 463 185 13 21 chr5 58187814 58187917 -94349342 + MTC LTR MaLR 315 419 0 2 1028 1260 206 49 43 chr5 58193102 58193406 -94343853 - MTC LTR MaLR -2 419 114 2 1028 550 142 112 9 chr5 58193647 58193754 -94343505 - MTC LTR MaLR -303 118 1 2 1029 247 303 0 13 chr5 58201099 58201176 -94336083 - MTEb LTR MaLR -10 369 294 2 1029 614 300 125 42 chr5 58210147 58210460 -94326799 + MTE2b LTR MaLR 18 356 -23 2 1029 745 277 45 98 chr5 58213679 58214079 -94323180 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1029 888 114 0 0 chr5 58216937 58217068 -94320191 + MT-int LTR MaLR 90 220 -878 2 1029 471 358 32 11 chr5 58225980 58226169 -94311090 - MLT1D LTR MaLR -64 441 249 2 1029 469 307 73 29 chr5 58255765 58255970 -94281289 + RMER15 LTR ERVL 347 560 -15 3 1029 4416 192 23 21 chr5 58267255 58268113 -94269146 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 3 1029 892 265 172 15 chr5 58268660 58269062 -94268197 - MLT1C LTR MaLR -2 465 1 3 1029 400 103 0 0 chr5 58270268 58270326 -94266933 - RLTR11A2 LTR ERVK -469 58 1 3 1029 680 276 170 59 chr5 58272021 58272344 -94264915 + MTE2b LTR MaLR 16 374 -5 3 1029 405 379 48 32 chr5 58272771 58273022 -94264237 - ORR1E LTR MaLR -103 256 2 3 1029 271 238 74 12 chr5 58278257 58278338 -94258921 - MLT1A0 LTR MaLR -45 320 235 3 1029 502 383 87 39 chr5 58293069 58293531 -94243728 - MLT1D LTR MaLR -6 499 16 3 1030 1488 164 18 117 chr5 58330011 58330234 -94207025 - RMER17C LTR ERVK 0 410 222 4 1030 1488 164 18 117 chr5 58330414 58330439 -94206820 - RMER17C LTR ERVK -189 221 201 4 1030 1488 164 18 117 chr5 58330609 58330814 -94206445 - RMER17C LTR ERVK -210 200 1 4 1030 287 237 28 102 chr5 58366375 58366483 -94170776 - MT2B LTR ERVL -347 254 155 4 1030 979 280 102 31 chr5 58374428 58374848 -94162411 - MTE-int LTR MaLR -1082 498 49 4 1030 268 305 50 132 chr5 58375161 58375403 -94161856 - ORR1E LTR MaLR -42 317 96 4 1030 327 273 54 9 chr5 58375461 58375572 -94161687 - MLT2B2 LTR ERVL -399 116 1 4 1030 883 330 112 20 chr5 58376710 58377165 -94160094 - MLT1D LTR MaLR -8 497 1 4 1030 262 250 17 0 chr5 58378121 58378181 -94159078 - RMER15-int LTR ERVL -416 4583 4523 4 1030 345 318 99 7 chr5 58378327 58378479 -94158780 - RMER15-int LTR ERVL -659 4340 4175 4 1030 1854 330 77 58 chr5 58378640 58379489 -94157770 - RMER15-int LTR ERVL -2776 2223 1371 4 1030 1854 330 77 58 chr5 58379541 58379938 -94157321 - RMER15-int LTR ERVL -3629 1370 955 4 1030 282 264 52 52 chr5 58380536 58380652 -94156607 - RMER15-int LTR ERVL -4842 157 42 4 1030 791 170 65 24 chr5 58382979 58383148 -94154111 - MTC LTR MaLR -52 369 194 4 1030 1144 183 51 25 chr5 58392500 58392735 -94144524 + RLTR11A2 LTR ERVK 56 296 -231 4 1030 337 318 9 26 chr5 58400387 58400500 -94136759 + MTEa LTR MaLR 269 379 0 5 1030 697 308 76 73 chr5 58421740 58422041 -94115218 + ORR1E LTR MaLR 44 345 -14 5 1030 238 171 0 24 chr5 58446650 58446692 -94090567 + MLT1A1 LTR MaLR 361 401 -7 5 1030 236 373 54 23 chr5 58453343 58453472 -94083787 - RMER12 LTR ERVK -464 858 726 5 1031 250 259 24 24 chr5 58479825 58479908 -94057351 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 318 6 1031 339 329 103 56 chr5 58509802 58510198 -94027061 - MLT1D LTR MaLR -11 494 80 1 1031 241 318 0 23 chr5 58510242 58510329 -94026930 - MLT1D LTR MaLR -542 85 1 1 1031 561 319 100 94 chr5 58524650 58525259 -94012000 - RLTR18 LTR ERVK -3 613 1 3 1031 2951 100 25 44 chr5 58531031 58531222 -94006037 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 277 4 1031 2951 100 25 44 chr5 58531863 58532153 -94005106 - MT2C_Mm LTR ERVL -199 276 3 4 1031 288 185 0 3 chr5 58532504 58532569 -94004690 - MTD LTR MaLR -14 405 307 4 1031 343 358 39 39 chr5 58532746 58532900 -94004359 - MTD LTR MaLR -112 307 154 4 1031 570 304 106 118 chr5 58535289 58535756 -94001503 - MTE-int LTR MaLR -779 591 154 5 1031 502 262 31 31 chr5 58540370 58540500 -93996759 - RMER15 LTR ERVL 0 575 446 6 1031 291 257 113 42 chr5 58546627 58546769 -93990490 - MER34 LTR ERV1 -2 540 389 6 1031 658 324 23 10 chr5 58546829 58547125 -93990134 - MER34 LTR ERV1 -269 302 1 6 1031 1529 161 59 59 chr5 58555830 58556153 -93981106 + ORR1A4 LTR MaLR 1 323 -6 8 1031 572 331 103 28 chr5 58556227 58556479 -93980780 + ORR1D2 LTR MaLR 1 271 -99 8 1031 2255 156 110 5 chr5 58556493 58556912 -93980347 + RLTR17 LTR ERVK 230 692 0 8 1031 417 333 21 14 chr5 58556939 58557079 -93980180 + ORR1D2-int LTR MaLR 6 146 -1224 8 1031 1592 191 165 69 chr5 58559177 58559696 -93977563 - RMER4B LTR ERVK 0 585 17 8 1031 635 318 70 18 chr5 58561003 58561230 -93976029 + MTD LTR MaLR 50 288 -131 8 1031 1063 263 48 30 chr5 58570994 58571360 -93965899 + MTE2b LTR MaLR 5 421 0 1 1031 293 348 144 38 chr5 58574243 58574479 -93962780 + MLT1F LTR MaLR 155 415 -133 1 1031 345 293 40 0 chr5 58575029 58575128 -93962131 + MLT1D LTR MaLR 253 355 -150 1 1031 534 322 45 57 chr5 58580135 58580382 -93956877 + MTC LTR MaLR 2 245 -114 1 1031 910 229 84 5 chr5 58582505 58582707 -93954552 + MTC LTR MaLR 204 421 0 1 1031 4351 218 65 91 chr5 58582708 58583993 -93953266 + MTC-int LTR MaLR 2 1253 -5 1 1031 1807 204 93 10 chr5 58583998 58584385 -93952874 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 1 1031 332 303 68 37 chr5 58584463 58584624 -93952635 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 265 1 1031 1644 228 97 52 chr5 58585418 58585634 -93951625 + RLTR11A LTR ERVK 1 223 -305 1 1031 1644 228 97 52 chr5 58585778 58586066 -93951193 + RLTR11A LTR ERVK 224 528 0 1 1031 2536 186 91 60 chr5 58586785 58587098 -93950161 + RMER20B LTR ERVK 4 331 -296 1 1031 2536 186 91 60 chr5 58587150 58587441 -93949818 + RMER20B LTR ERVK 332 626 -1 1 1031 1940 259 24 59 chr5 58588022 58588596 -93948663 + RMER15 LTR ERVL 22 575 0 1 1032 1953 122 9 51 chr5 58589939 58590275 -93946984 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 1032 1154 260 117 34 chr5 58592686 58593072 -93944187 + MTD LTR MaLR 2 419 0 1 1032 1663 134 70 67 chr5 58594717 58595030 -93942229 - ORR1A3 LTR MaLR -12 314 1 1 1032 6523 173 23 48 chr5 58595030 58596682 -93940577 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 270 1 1032 364 314 85 56 chr5 58598945 58599215 -93938044 - MLT1D LTR MaLR -222 283 6 1 1032 252 241 171 27 chr5 58602063 58602174 -93935085 + MLT1L LTR MaLR 418 544 -66 1 1032 257 237 81 88 chr5 58603037 58603185 -93934074 + LTR86A2 LTR ERVL 135 281 -227 1 1032 1793 203 48 6 chr5 58604396 58604753 -93932506 - ORR1C2 LTR MaLR -12 372 1 1 1032 320 326 42 3 chr5 58605431 58605594 -93931665 - MLT1A1 LTR MaLR -176 189 25 1 1032 613 293 82 98 chr5 58606379 58606746 -93930513 - MTD LTR MaLR -54 365 5 1 1032 2877 177 47 73 chr5 58612011 58612707 -93924552 - RMER6C LTR ERVK -12 678 1 1 1032 2730 105 92 6 chr5 58617527 58618017 -93919242 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 532 0 1 1032 2777 200 32 69 chr5 58618651 58619302 -93917957 + RMER20B LTR ERVK 1 627 0 1 1032 729 311 54 57 chr5 58622292 58622589 -93914670 + MLT1D LTR MaLR 184 479 -26 1 1032 320 329 95 38 chr5 58622609 58622842 -93914417 + MLT1D-int LTR MaLR 1 248 -1487 1 1032 2297 66 28 6 chr5 58625280 58625598 -93911661 - IAPLTR2b LTR ERVK -2 325 1 1 1032 13222 84 10 14 chr5 58625598 58627431 -93909828 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4656 1 1032 1933 59 4 0 chr5 58627430 58627669 -93909590 - IAPEY3-int LTR ERVK -5183 2497 2258 1 1032 2126 75 0 0 chr5 58627731 58627999 -93909260 - IAPLTR4_I LTR ERVK -288 1182 915 1 1032 2530 122 18 13 chr5 58627985 58628441 -93908818 - IAPEz-int LTR ERVK -5904 577 1 1 1032 2097 105 25 9 chr5 58628443 58628761 -93908498 - IAPLTR2b LTR ERVK -2 325 3 1 1032 1524 183 48 38 chr5 58629657 58630060 -93907199 - RLTR20A2 LTR ERVK -102 432 1 2 1032 248 370 122 37 chr5 58634440 58634816 -93902443 - MLT1H LTR MaLR -115 434 27 2 1032 792 316 113 31 chr5 58650538 58650989 -93886270 + MER34 LTR ERV1 53 540 -2 2 1032 688 277 33 0 chr5 58653265 58653449 -93883810 - RMER15 LTR ERVL 0 575 386 2 1032 292 327 0 56 chr5 58656478 58656543 -93880716 - MLT1B LTR MaLR -5 385 326 2 1032 292 331 14 103 chr5 58656574 58656697 -93880562 - MLT1B LTR MaLR -65 325 193 2 1032 1126 261 65 19 chr5 58656895 58657203 -93880056 + MTD LTR MaLR 1 323 -96 2 1032 725 194 199 0 chr5 58657203 58657389 -93879870 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 162 2 1032 601 352 36 64 chr5 58657719 58658108 -93879151 + LTR55 LTR ERV 1 378 -170 2 1032 347 209 176 0 chr5 58658176 58658264 -93878995 - MTD LTR MaLR -9 410 307 2 1032 1247 279 45 21 chr5 58658478 58658789 -93878470 - MTD LTR MaLR -94 325 6 2 1032 1457 228 49 6 chr5 58660283 58660479 -93876780 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 174 2 1032 1457 228 49 6 chr5 58660557 58660726 -93876533 - ORR1C2 LTR MaLR -211 173 3 2 1032 465 248 65 26 chr5 58671289 58671442 -93865817 + RMER10B LTR ERVL 194 352 -46 2 1032 753 276 62 56 chr5 58672204 58672561 -93864698 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 2 1032 2324 214 63 70 chr5 58676330 58677013 -93860246 - RMER6C LTR ERVK -12 678 1 2 1032 279 266 101 0 chr5 58677409 58677488 -93859771 + MTEb LTR MaLR 15 101 -258 2 1032 297 308 49 55 chr5 58677552 58677713 -93859546 + MTEb LTR MaLR 207 367 -12 2 1032 601 369 55 55 chr5 58681735 58682119 -93855140 - MLT1F2 LTR MaLR -162 398 15 2 1032 1323 230 57 26 chr5 58683735 58684087 -93853172 + RLTR31_Mm LTR ERVK 199 561 0 2 1032 468 314 112 58 chr5 58686204 58686410 -93850849 + ORR1E LTR MaLR 1 217 -153 2 1032 376 240 20 19 chr5 58707886 58707989 -93829270 - MTEb LTR MaLR 0 374 264 3 1032 2448 106 3 0 chr5 58708021 58708362 -93828897 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 55 3 1032 2286 95 261 27 chr5 58708782 58709226 -93828033 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 37 3 1032 60972 16 14 1 chr5 58709335 58716946 -93820313 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 1 3 1032 2416 95 249 28 chr5 58716946 58717412 -93819847 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -49 605 37 3 1032 265 250 56 0 chr5 58719127 58719199 -93818060 + RMER15-int LTR ERVL 2399 2474 -2525 3 1033 344 284 17 25 chr5 58720312 58720431 -93816828 + RMER15 LTR ERVL 422 539 -36 3 1033 779 365 11 38 chr5 58723504 58723869 -93813390 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 6 3 1033 1457 191 64 7 chr5 58727119 58727399 -93809860 + ORR1B2 LTR MaLR 1 296 -71 3 1033 1574 283 86 48 chr5 58734358 58735022 -93802237 - RLTR40 LTR ERVK -20 797 109 3 1033 377 294 43 35 chr5 58736056 58736197 -93801062 - RLTR40 LTR ERVK -675 142 1 3 1033 288 167 86 102 chr5 58741521 58741708 -93795551 - RMER17C LTR ERVK -137 273 90 3 1033 1376 209 29 21 chr5 58744431 58744813 -93792446 - MTC LTR MaLR -8 413 1 3 1033 1169 233 10 17 chr5 58748349 58748642 -93788617 - MYSERV6-int LTR ERVK -1185 7774 7484 3 1033 1063 179 0 15 chr5 58748641 58748839 -93788420 - MYSERV6-int LTR ERVK -3529 5430 5236 3 1033 1254 246 106 17 chr5 58748839 58749187 -93788072 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 16 3 1033 839 171 0 112 chr5 58749187 58749384 -93787875 - MYSERV6-int LTR ERVK -3744 5215 5041 3 1033 7197 158 48 89 chr5 58749477 58750183 -93787076 - MYSERV6-int LTR ERVK -3931 5028 4374 3 1033 7197 158 48 89 chr5 58750486 58750814 -93786445 - MYSERV6-int LTR ERVK -4586 4373 4079 3 1033 7197 158 48 89 chr5 58751305 58751979 -93785280 - MYSERV6-int LTR ERVK -4881 4078 3390 3 1033 13731 154 43 36 chr5 58755694 58757556 -93779703 - MYSERV6-int LTR ERVK -6089 2870 1032 3 1033 13731 154 43 36 chr5 58757580 58758375 -93778884 - MYSERV6-int LTR ERVK -7928 1031 194 3 1033 13731 154 43 36 chr5 58759173 58759250 -93778009 - MYSERV6-int LTR ERVK -8766 193 117 3 1033 2264 188 9 36 chr5 58759813 58760254 -93777005 - RMER6B LTR ERVK -32 429 1 3 1033 1507 244 37 12 chr5 58761558 58761965 -93775294 - MTD LTR MaLR 0 419 3 3 1033 233 288 225 0 chr5 58762224 58762304 -93774955 + MLT1A1 LTR MaLR 264 361 -47 3 1033 296 330 148 80 chr5 58767230 58767467 -93769792 + RMER15 LTR ERVL 305 557 -18 3 1033 313 373 31 77 chr5 58768856 58769117 -93768142 + MLT1H LTR MaLR 56 304 -245 3 1033 2064 93 99 0 chr5 58807265 58807588 -93729671 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 355 -2 4 1033 234 278 0 27 chr5 58808853 58808927 -93728332 + MLT2B4 LTR ERVL 89 160 -396 4 1033 2871 186 193 30 chr5 58810329 58810748 -93726511 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 457 4 1033 2871 186 193 30 chr5 58810807 58811166 -93726093 - RMER17A2 LTR ERVK -450 456 2 4 1033 1689 162 33 42 chr5 58830912 58831361 -93705898 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 4 1033 3435 20 5 0 chr5 58842309 58842703 -93694556 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1033 1245 228 220 46 chr5 58843758 58844277 -93692982 - RMER19C LTR ERVK 0 611 3 4 1033 260 273 11 33 chr5 58844717 58844808 -93692451 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 320 4 1033 1081 208 128 39 chr5 58846033 58846338 -93690921 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 4 1033 1124 285 58 25 chr5 58847738 58848098 -93689161 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 4 1034 3370 211 22 6 chr5 58861814 58862506 -93674753 + RMER6D LTR ERVK 2 704 -16 5 1034 5119 167 68 62 chr5 58862794 58863891 -93673368 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 5 1034 2962 254 39 11 chr5 58864597 58865263 -93671996 - MERVK26-int LTR ERVK 0 6919 6235 5 1034 1743 265 33 31 chr5 58865621 58866139 -93671120 - MERVK26-int LTR ERVK -616 6303 5785 5 1034 805 172 129 77 chr5 58867968 58868201 -93669058 - MERVK26-int LTR ERVK -2185 4734 4490 5 1034 4743 261 24 22 chr5 58868177 58869400 -93667859 - MERVK26-int LTR ERVK -2673 4246 3022 5 1034 260 315 225 32 chr5 58896001 58896250 -93641009 + MER67A LTR ERV1 247 543 0 5 1034 823 287 214 10 chr5 58918847 58919150 -93618109 + ORR1D1 LTR MaLR 9 373 -1 5 1034 243 368 9 17 chr5 58919252 58919368 -93617891 - MLT1C LTR MaLR -5 462 348 5 1034 375 252 57 38 chr5 58923790 58923947 -93613312 + RLTR23 LTR ERV1 265 424 -6 6 1034 755 350 79 48 chr5 58924730 58925875 -93611384 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1957 3136 -4465 6 1034 888 282 71 91 chr5 58928481 58928945 -93608314 - RMER13A LTR ERVK -394 466 12 6 1034 535 336 79 65 chr5 58929008 58929504 -93607755 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 3874 4391 -3215 6 1034 601 278 7 3 chr5 58929890 58930100 -93607159 + MMERGLN-int LTR ERV1 4771 4942 -2614 6 1034 1527 255 111 0 chr5 58931528 58931896 -93605363 - MTC LTR MaLR 0 421 13 6 1034 1524 272 60 10 chr5 58933532 58934034 -93603225 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1034 3262 247 63 31 chr5 58934035 58935105 -93602154 - MYSERV-int LTR ERVK -2 6548 5445 6 1034 619 259 38 69 chr5 58935265 58935560 -93601699 + MurERV4_19-int LTR ERVK 5210 5429 -351 6 1034 355 302 49 32 chr5 58935560 58935683 -93601576 + MTD LTR MaLR 280 404 -15 6 1034 1709 216 43 34 chr5 58947908 58948325 -93588934 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1034 1196 306 64 34 chr5 58948699 58948777 -93588482 - MTE-int LTR MaLR -400 1180 1104 6 1034 1196 306 64 34 chr5 58949004 58949392 -93587867 - MTE-int LTR MaLR -477 1103 700 6 1034 440 311 15 7 chr5 58949776 58949912 -93587347 - MTE-int LTR MaLR -886 694 558 6 1034 1169 304 44 22 chr5 58950656 58951126 -93586133 - MTE-int LTR MaLR -1087 493 5 6 1034 995 310 58 11 chr5 58951131 58951493 -93585766 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 6 1034 1053 258 19 69 chr5 58954453 58954792 -93582467 - RLTR11A LTR ERVK -5 523 200 6 1034 2155 204 170 10 chr5 58958317 58958906 -93578353 - RMER6C LTR ERVK -4 686 4 6 1034 2721 26 0 229 chr5 58961811 58962314 -93574945 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 6 1034 8082 37 1 2 chr5 58962326 58963285 -93573974 + RLTR10-int LTR ERVK 41 998 -989 6 1034 8522 33 0 2 chr5 58963561 58964560 -93572699 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 6 1034 2661 23 0 254 chr5 58964560 58965083 -93572176 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 1034 530 231 152 34 chr5 58968779 58969016 -93568243 + RLTR10A LTR ERVK 147 411 0 6 1034 370 222 61 53 chr5 58969033 58969147 -93568112 + RLTR10-int LTR ERVK 319 433 -1554 6 1034 380 350 40 31 chr5 58969369 58969690 -93567569 + MMERVK10C-int LTR ERVK 203 526 -6016 6 1034 4442 315 32 38 chr5 58970039 58972636 -93564623 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1233 3813 -3768 6 1034 2132 298 56 46 chr5 58972629 58974817 -93562442 + IAP-d-int LTR ERVK 992 5080 -1462 6 1034 543 248 140 21 chr5 58974856 58975099 -93562160 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 6 1034 270 384 92 46 chr5 58977166 58977513 -93559746 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 3 6 1034 767 300 131 30 chr5 58977843 58978011 -93559248 + MTEa LTR MaLR 9 206 -173 6 1034 767 300 131 30 chr5 58978065 58978233 -93559026 + MTEa LTR MaLR 207 378 -1 6 1035 1183 278 60 33 chr5 58995454 58995818 -93541441 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1035 774 346 47 55 chr5 59011147 59011508 -93525751 - MTEa LTR MaLR -19 360 3 2 1035 463 321 86 11 chr5 59013391 59013659 -93523600 + MLT1A0 LTR MaLR 75 362 -3 2 1035 437 301 39 65 chr5 59014361 59014592 -93522667 + RLTR23 LTR ERV1 206 430 0 2 1035 285 314 12 1 chr5 59015876 59015966 -93521293 + MLT1B LTR MaLR 286 378 -12 2 1035 2884 71 46 54 chr5 59025684 59026162 -93511097 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 474 -1 4 1035 11196 80 48 38 chr5 59026165 59027929 -93509330 + IAPEz-int LTR ERVK 3 1700 -4781 4 1035 6217 63 14 17 chr5 59027922 59028749 -93508510 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6475 -6 4 1035 2707 36 135 3 chr5 59028755 59029118 -93508141 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1035 308 311 98 12 chr5 59034730 59034893 -93502366 - MLT1D LTR MaLR -1 504 328 5 1035 2775 65 2 74 chr5 59038221 59038639 -93498620 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 6 1035 8412 38 2 2 chr5 59038639 59039636 -93497623 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 990 6 1035 4238 55 24 0 chr5 59040166 59041061 -93496198 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 1 6 1035 2850 73 10 5 chr5 59041063 59041449 -93495810 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 6 1035 2091 74 17 10 chr5 59044296 59044596 -93492663 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 507 7 1035 3928 64 3 16 chr5 59047865 59048430 -93488829 - RLTR13C2 LTR ERVK -192 841 1 7 1035 923 228 13 19 chr5 59050378 59050624 -93486635 + RMER19B LTR ERVK 684 902 0 7 1035 429 329 41 29 chr5 59059902 59060146 -93477113 + MLT1B LTR MaLR 1 247 -143 8 1035 1722 192 13 82 chr5 59063672 59064052 -93473207 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 9 1035 626 188 22 3 chr5 59066717 59066869 -93470390 + RMER6D LTR ERVK 156 312 -378 1 1035 953 172 64 170 chr5 59067922 59068139 -93469120 + RMER6D LTR ERVK 196 413 -307 1 1035 953 172 64 170 chr5 59068296 59068407 -93468852 + RMER6D LTR ERVK 414 489 -231 1 1035 538 325 106 73 chr5 59070352 59070681 -93466578 + ORR1D2-int LTR MaLR 586 925 -445 1 1035 723 332 34 52 chr5 59070673 59070997 -93466262 + ORR1D2 LTR MaLR 17 334 -36 1 1035 10082 163 50 35 chr5 59073693 59075728 -93461531 + MYSERV6-int LTR ERVK 568 2632 -6327 1 1035 2652 135 0 16 chr5 59076015 59076458 -93460801 + MYSERV6-int LTR ERVK 3129 3564 -5395 1 1035 5204 166 75 5 chr5 59077562 59078662 -93458597 + MYSERV6-int LTR ERVK 3565 4958 -4001 1 1035 243 303 103 61 chr5 59078716 59078881 -93458378 + MT2B LTR ERVL 128 299 -302 1 1035 8031 168 34 20 chr5 59078881 59080494 -93456765 + MYSERV6-int LTR ERVK 6325 7959 -1000 1 1035 684 160 4 4 chr5 59080489 59080633 -93456626 + MYSERV6-int LTR ERVK 8074 8191 -768 1 1035 661 219 14 7 chr5 59080707 59080845 -93456414 + RMER6B LTR ERVK 322 460 -1 1 1035 940 256 94 8 chr5 59082915 59083159 -93454100 - ORR1B2 LTR MaLR -102 265 1 1 1035 359 164 0 0 chr5 59083794 59083855 -93453404 - ORR1B2 LTR MaLR -306 61 1 1 1035 1033 213 72 42 chr5 59091897 59092263 -93444996 + ORR1C2 LTR MaLR 22 381 -13 1 1035 568 282 91 45 chr5 59097042 59097373 -93439886 - RLTR15 LTR ERVK -12 347 2 1 1035 274 226 16 31 chr5 59098392 59098456 -93438803 + RLTR25B LTR ERVK 436 498 -530 1 1035 233 211 0 50 chr5 59103553 59103633 -93433626 + MTC-int LTR MaLR 985 1060 -198 1 1036 2046 124 12 12 chr5 59114532 59114859 -93422400 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1036 351 332 61 35 chr5 59114931 59115128 -93422131 - ORR1E LTR MaLR -107 252 51 1 1036 416 303 105 40 chr5 59135561 59135840 -93401419 + RMER20B LTR ERVK 174 466 -50 1 1036 1310 249 91 68 chr5 59140930 59141434 -93395825 - RLTR40 LTR ERVK -162 655 140 1 1036 1879 251 45 99 chr5 59142646 59143571 -93393688 + RMER17B LTR ERVK 1 884 -74 1 1036 809 270 105 51 chr5 59148636 59148987 -93388272 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 2 1036 1037 192 19 15 chr5 59151136 59151342 -93385917 + ORR1B1 LTR MaLR 188 394 0 2 1036 1811 223 45 12 chr5 59157595 59157995 -93379264 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1036 1308 201 100 11 chr5 59160566 59160750 -93376509 + ORR1B1 LTR MaLR 88 284 -110 2 1036 1308 201 100 11 chr5 59160776 59160872 -93376387 + ORR1B1 LTR MaLR 285 393 -1 2 1036 904 317 35 38 chr5 59162387 59162705 -93374554 + MTE2a LTR MaLR 63 379 0 2 1036 277 278 22 0 chr5 59162705 59162794 -93374465 - MLT2C1 LTR ERVL -306 91 1 2 1036 378 175 0 0 chr5 59164100 59164157 -93373102 + RLTR26 LTR ERVK 5 61 -581 2 1036 1717 166 21 59 chr5 59164460 59164799 -93372460 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1036 1177 222 38 56 chr5 59167053 59167320 -93369939 - RLTR41 LTR ERV1 -17 429 168 2 1036 312 103 31 94 chr5 59167508 59167572 -93369687 - RLTR41 LTR ERV1 -386 60 1 2 1036 614 113 6 117 chr5 59177105 59177276 -93359983 - RMER17B LTR ERVK -495 463 312 2 1036 772 362 92 22 chr5 59179237 59179684 -93357575 + MLT2B3 LTR ERVL 1 478 -76 2 1036 2405 153 65 26 chr5 59191423 59191887 -93345372 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1036 2121 144 3 0 chr5 59195813 59196139 -93341120 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1036 1848 117 9 60 chr5 59196483 59196819 -93340440 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 319 -3 2 1036 1492 188 46 37 chr5 59199836 59200162 -93337097 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1036 374 317 50 70 chr5 59213110 59213351 -93323908 + ORR1E LTR MaLR 1 236 -123 3 1036 652 241 122 81 chr5 59218699 59218970 -93318289 + RLTR12B LTR ERVK 18 299 -229 3 1036 259 265 217 104 chr5 59219192 59219432 -93317827 + RLTR12B LTR ERVK 258 524 -4 3 1036 335 338 46 58 chr5 59241259 59241466 -93295793 + ORR1E LTR MaLR 9 201 -169 3 1036 735 348 76 148 chr5 59241587 59241743 -93295516 + MTE-int LTR MaLR 6 162 -1418 3 1036 735 348 76 148 chr5 59242120 59242959 -93294300 + MTE-int LTR MaLR 163 930 -650 3 1037 390 410 37 17 chr5 59247768 59248068 -93289191 - MTE-int LTR MaLR -410 1170 865 3 1037 227 356 77 54 chr5 59248450 59248747 -93288512 - MTE-int LTR MaLR -1202 378 75 3 1037 957 227 19 52 chr5 59260144 59260413 -93276846 + RMER3D-int LTR ERVK 2578 2837 -5 3 1037 2538 185 40 28 chr5 59260418 59260964 -93276295 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 553 0 3 1037 732 218 8 0 chr5 59271694 59271827 -93265432 - BGLII_B LTR ERVK -26 415 282 3 1037 428 279 18 61 chr5 59271917 59271979 -93265280 + RLTR20A2 LTR ERVK 421 481 -97 3 1037 428 279 18 61 chr5 59272095 59272196 -93265063 + RLTR20A2 LTR ERVK 482 577 -1 3 1037 2194 190 188 3 chr5 59275368 59275948 -93261311 - RMER6C LTR ERVK 0 690 4 3 1037 916 332 15 0 chr5 59279811 59280142 -93257117 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1332 1667 -4047 3 1037 276 306 33 8 chr5 59280214 59280341 -93256918 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2126 2262 -3223 3 1037 266 439 40 6 chr5 59280347 59280521 -93256738 - MLT1D LTR MaLR -16 637 458 3 1037 256 276 136 57 chr5 59280691 59280868 -93256391 - MLT1E1A LTR MaLR -465 215 25 3 1037 389 295 74 17 chr5 59281496 59281672 -93255587 - MLT1D LTR MaLR -19 486 301 3 1037 1008 296 47 49 chr5 59294560 59294968 -93242291 - MTD LTR MaLR -12 407 1 4 1037 381 355 96 10 chr5 59297836 59298035 -93239224 - MTE-int LTR MaLR -1163 417 202 4 1037 562 312 180 50 chr5 59301505 59301829 -93235430 - MTD LTR MaLR -15 404 24 4 1037 442 285 91 23 chr5 59303776 59303825 -93233434 - MTD LTR MaLR -10 409 362 4 1037 442 285 91 23 chr5 59303894 59304020 -93233239 - MTD LTR MaLR -58 361 222 4 1037 348 319 8 8 chr5 59304038 59304158 -93233101 - MTD LTR MaLR -287 132 13 4 1037 1716 221 138 47 chr5 59312491 59313263 -93223996 - RMER6C LTR ERVK -4 716 9 4 1037 605 143 23 120 chr5 59331700 59331875 -93205384 - RMER19B LTR ERVK -441 461 304 4 1037 689 318 14 40 chr5 59331878 59332101 -93205158 + MTEa LTR MaLR 1 217 -162 4 1037 2298 115 43 8 chr5 59332723 59333091 -93204168 + RLTR9A2 LTR ERVK 3 383 0 4 1037 295 264 77 87 chr5 59333093 59333416 -93203843 + ETnERV2-int LTR ERVK 4 323 -2991 4 1037 13095 144 42 51 chr5 59333483 59336129 -93201130 + ETnERV2-int LTR ERVK 1059 3680 -3726 4 1037 333 130 68 68 chr5 59336620 59336694 -93200565 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7404 -2 4 1037 1340 108 40 94 chr5 59336695 59336970 -93200289 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 260 -123 4 1037 227 197 45 76 chr5 59338922 59338988 -93198271 + RMER20A LTR ERVK 185 248 -268 4 1037 819 172 14 15 chr5 59339312 59339467 -93197792 + RLTR9A2 LTR ERVK 234 383 0 4 1037 413 343 55 20 chr5 59369126 59369328 -93167931 - MLT2B2 LTR ERVL -74 441 233 4 1037 230 299 103 0 chr5 59369452 59369539 -93167720 - MLT2B2 LTR ERVL -438 116 21 4 1038 5951 140 22 26 chr5 59376215 59377088 -93160171 + RLTR13D2 LTR ERVK 3 874 -149 5 1038 5951 140 22 26 chr5 59377129 59377272 -93159987 + RLTR13D2 LTR ERVK 875 1014 -9 5 1038 340 321 100 66 chr5 59379458 59379778 -93157481 - MER67D LTR ERV1 -105 409 79 5 1038 475 295 92 46 chr5 59381409 59381647 -93155612 + RMER15 LTR ERVL 325 573 -2 5 1038 343 348 119 53 chr5 59384661 59384946 -93152313 + MLT1D LTR MaLR 183 486 -19 5 1038 2209 204 58 44 chr5 59387651 59388154 -93149105 + RLTR11A LTR ERVK 1 510 -18 5 1038 367 326 97 7 chr5 59388968 59389113 -93148146 + LTR82A LTR ERVL 96 253 -619 5 1038 2944 27 0 0 chr5 59394425 59394760 -93142499 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 5 1038 52603 24 17 6 chr5 59394760 59401161 -93136098 + IAPEz-int LTR ERVK 9 6481 0 5 1038 2992 15 3 0 chr5 59401161 59401497 -93135762 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 5 1038 235 116 0 0 chr5 59404882 59404925 -93132334 + MTC-int LTR MaLR 1002 1044 -214 5 1038 244 231 61 15 chr5 59408411 59408477 -93128782 - ORR1D1 LTR MaLR 0 379 311 5 1038 261 377 42 54 chr5 59408616 59408784 -93128475 - ORR1D1 LTR MaLR -124 250 85 5 1038 7080 193 22 49 chr5 59415989 59417922 -93119337 + RMER3D-int LTR ERVK 438 2842 0 5 1038 1960 241 76 65 chr5 59417922 59418025 -93119234 + RLTR17 LTR ERVK 1 106 -586 5 1038 2001 133 10 3 chr5 59418025 59418334 -93118925 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 1038 1960 241 76 65 chr5 59418334 59418846 -93118413 + RLTR17 LTR ERVK 107 623 -69 5 1038 409 350 23 69 chr5 59419153 59419328 -93117931 + ORR1D2 LTR MaLR 1 167 -203 5 1038 1957 196 175 82 chr5 59419340 59419972 -93117287 - RMER6C LTR ERVK 0 720 137 5 1038 1957 188 218 45 chr5 59420118 59420240 -93117019 - RMER6C LTR ERVK -554 136 20 5 1038 708 323 45 35 chr5 59421079 59421454 -93115805 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 1038 1172 234 118 20 chr5 59421625 59421922 -93115337 - RLTR25B LTR ERVK -702 326 1 5 1038 225 311 11 22 chr5 59421922 59422013 -93115246 - RMER20B LTR ERVK -303 324 235 5 1038 594 253 29 8 chr5 59422199 59422358 -93114901 - ORR1C2 LTR MaLR -214 156 2 5 1038 238 357 7 58 chr5 59426009 59426146 -93111113 + MTEa LTR MaLR 250 379 0 5 1038 283 351 55 39 chr5 59427271 59427452 -93109807 + MTE-int LTR MaLR 138 321 -1049 5 1038 318 378 69 51 chr5 59428725 59429001 -93108258 + MTE-int LTR MaLR 633 913 -667 5 1038 451 322 98 8 chr5 59429922 59430157 -93107102 + MLT1B LTR MaLR 13 268 -122 5 1038 349 291 36 18 chr5 59431516 59431628 -93105631 + MTEa LTR MaLR 4 117 -262 5 1038 428 322 93 41 chr5 59448886 59449132 -93088127 + MLT1C LTR MaLR 6 264 -203 5 1038 462 291 49 76 chr5 59450089 59450353 -93086906 + RLTR15 LTR ERVK 9 265 -94 6 1038 492 345 31 67 chr5 59450614 59450869 -93086390 - MTE2a LTR MaLR -80 299 54 6 1038 371 355 157 36 chr5 59455645 59456102 -93081157 - MLT-int LTR MaLR -1179 556 45 6 1038 395 360 73 54 chr5 59456191 59456508 -93080751 - MLT1A LTR MaLR -51 323 1 6 1038 914 275 166 15 chr5 59464800 59465143 -93072116 - MTD LTR MaLR -14 405 11 6 1038 470 193 11 11 chr5 59468108 59468216 -93069043 + MT2B LTR ERVL 1 108 -425 6 1038 286 140 0 39 chr5 59468535 59468587 -93068672 + MT2B LTR ERVL 535 584 0 6 1038 1802 222 25 27 chr5 59472762 59473170 -93064089 - MTD LTR MaLR -11 408 2 6 1038 1253 235 43 75 chr5 59473359 59473708 -93063551 + ORR1C1 LTR MaLR 37 374 -4 6 1038 3122 47 37 0 chr5 59476437 59476819 -93060440 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1038 7544 71 51 2 chr5 59476819 59477866 -93059393 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1038 2970 58 40 0 chr5 59477868 59478247 -93059012 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 6 1038 2912 223 16 63 chr5 59483494 59484245 -93053014 + RMER6D LTR ERVK 1 716 -4 6 1038 3187 55 3 0 chr5 59487992 59488376 -93048883 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 6 1038 508 239 30 72 chr5 59488480 59488647 -93048612 - RLTR22_Mus LTR ERVK -2 1320 1161 6 1038 882 220 35 103 chr5 59488988 59489298 -93047961 - RLTR22_Mus LTR ERVK -189 1619 1040 6 1038 2194 248 56 40 chr5 59489394 59490141 -93047118 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1074 774 16 6 1038 1809 190 72 45 chr5 59491031 59491450 -93045809 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 6 1038 1229 154 60 180 chr5 59492073 59492176 -93045083 + RMER17C LTR ERVK 1 103 -307 6 1038 1229 154 60 180 chr5 59492239 59492601 -93044658 + RMER17C LTR ERVK 104 410 0 6 1038 1339 224 113 12 chr5 59498910 59499236 -93038023 + RLTR16 LTR ERVK 1 359 -146 6 1038 2498 231 109 71 chr5 59501980 59502713 -93034546 + RMER19B LTR ERVK 1 761 -141 3 1038 2260 165 15 90 chr5 59506176 59506641 -93030618 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 8 1039 1015 233 206 26 chr5 59507013 59507324 -93029935 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 9 1039 3877 218 71 6 chr5 59507324 59508269 -93028990 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 504 9 1039 1133 181 37 0 chr5 59508259 59508424 -93028835 - ORR1B2-int LTR MaLR -1286 223 58 9 1039 1133 181 37 0 chr5 59508447 59508496 -93028763 - ORR1B2-int LTR MaLR -1452 57 2 9 1039 1041 239 39 71 chr5 59508500 59508814 -93028445 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 9 1039 265 336 109 0 chr5 59509199 59509309 -93027950 + MLT1J LTR MaLR 15 136 -376 1 1039 1918 132 3 85 chr5 59510702 59511067 -93026192 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -2 335 1 1 1039 56981 17 4 8 chr5 59511067 59517565 -93019694 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 9 1 1039 1918 132 3 85 chr5 59517565 59517930 -93019329 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -2 335 1 1 1039 1725 224 70 85 chr5 59519343 59519875 -93017384 - RLTR24 LTR ERV1 -5 524 1 2 1039 487 335 74 54 chr5 59522197 59522550 -93014709 - MLT1A LTR MaLR -14 360 1 2 1039 6114 173 40 1 chr5 59523220 59524292 -93012967 - MERVL-int LTR ERVL -1066 4419 3306 2 1039 808 139 8 0 chr5 59524277 59524406 -93012853 - MERVL-int LTR ERVL -2404 3081 2952 2 1039 4054 161 31 31 chr5 59524406 59525157 -93012102 + ORR1A2-int LTR MaLR 1213 1963 0 2 1039 2208 123 9 0 chr5 59525157 59525481 -93011778 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1039 3447 20 2 0 chr5 59525974 59526369 -93010890 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1039 290 172 62 0 chr5 59530687 59530751 -93006508 + RMER15 LTR ERVL 7 74 -501 3 1039 1516 184 147 119 chr5 59530767 59531272 -93005987 - RMER15 LTR ERVL -53 522 4 3 1039 349 294 201 26 chr5 59534991 59535180 -93002079 - MTEb LTR MaLR -143 236 15 3 1039 2190 206 40 24 chr5 59535277 59535774 -93001485 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 3 1039 1326 217 30 89 chr5 59541513 59541949 -92995310 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 1039 263 304 179 29 chr5 59554523 59554696 -92982563 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 203 6 1039 400 309 9 0 chr5 59561732 59561842 -92975417 - ORR1E LTR MaLR -248 111 1 6 1039 2395 190 67 42 chr5 59562586 59563136 -92974123 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 1 7 1039 2967 56 10 20 chr5 59563273 59563673 -92973586 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1039 1306 244 24 32 chr5 59564593 59564970 -92972289 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1039 2828 36 0 3 chr5 59572629 59572967 -92964292 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 8 1039 7224 29 2 8 chr5 59572967 59573824 -92963435 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5630 8 1039 24735 28 31 13 chr5 59573810 59576795 -92960464 - IAPEz-int LTR ERVK -3405 3076 38 8 1039 2816 39 0 3 chr5 59576808 59577146 -92960113 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 9 1039 4782 152 43 13 chr5 59587275 59588140 -92949119 - RMER17A2 LTR ERVK -12 894 4 1 1039 2884 36 2 149 chr5 59589508 59589965 -92947294 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 1039 811 299 108 11 chr5 59593385 59593662 -92943597 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 67 1 1039 2298 212 101 45 chr5 59594800 59595352 -92941907 + RMER20B LTR ERVK 1 583 -44 1 1039 1132 228 91 31 chr5 59595456 59595977 -92941282 + RMER6C LTR ERVK 1 678 -12 1 1039 2449 201 70 92 chr5 59595989 59596670 -92940589 + RMER6-int LTR ERVK 1 666 -2511 1 1039 2577 157 99 23 chr5 59597178 59597861 -92939398 + RMER6-int LTR ERVK 658 1392 -1785 1 1039 783 179 12 6 chr5 59598346 59598509 -92938750 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 743 1 1039 511 288 158 35 chr5 59600367 59600626 -92936633 + MLT1B LTR MaLR 87 377 -13 1 1039 2109 123 3 3 chr5 59600998 59601317 -92935942 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1039 2989 187 41 30 chr5 59603166 59603843 -92933416 + RMER6C LTR ERVK 6 690 0 1 1039 1357 87 0 0 chr5 59615029 59615214 -92922045 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 335 1 1039 2205 55 0 166 chr5 59615865 59616282 -92920977 - MURVY-LTR LTR ERV1 -171 348 1 1 1039 879 197 30 66 chr5 59621540 59621844 -92915415 - MYSERV6-int LTR ERVK -893 8066 7774 1 1039 229 276 83 28 chr5 59624819 59624927 -92912332 - MLT1A1 LTR MaLR -294 114 1 1 1039 1510 190 41 23 chr5 59627191 59627585 -92909674 - RMER17C LTR ERVK -2 408 8 1 1039 1692 161 52 52 chr5 59627820 59628206 -92909053 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 122 1 1039 260 50 0 24 chr5 59628214 59628255 -92909004 - MuRRS4-int LTR ERV1 0 5063 5024 1 1039 379 285 87 46 chr5 59628950 59629123 -92908136 - RLTR41 LTR ERV1 -2 444 265 1 1039 373 231 202 0 chr5 59629667 59629771 -92907488 + RMER20A LTR ERVK 336 460 -56 1 1039 380 319 93 59 chr5 59631952 59632222 -92905037 + MERVK26-int LTR ERVK 6223 6501 -418 1 1039 1571 178 87 38 chr5 59632284 59632483 -92904776 + RMER17C LTR ERVK 1 222 -188 1 1039 1571 178 87 38 chr5 59632526 59632717 -92904542 + RMER17C LTR ERVK 223 410 0 1 1039 402 338 18 31 chr5 59632821 59633050 -92904209 + MERVK26-int LTR ERVK 6691 6916 -3 1 1039 552 220 3 20 chr5 59633061 59633187 -92904072 + RMER20A LTR ERVK 11 135 -492 1 1039 400 292 62 62 chr5 59634750 59634896 -92902363 + ORR1E LTR MaLR 208 353 -6 1 1039 927 207 9 60 chr5 59637430 59637646 -92899613 - RMER6B LTR ERVK 0 461 257 1 129 329 163 239 0 chr5 59637676 59637768 -92899491 - RMER6B LTR ERVK -347 114 1 1 1040 403 108 15 0 chr5 59646170 59646235 -92891024 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 253 1 1040 2591 39 2 239 chr5 59655559 59656070 -92881189 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 1040 1718 211 36 43 chr5 59663088 59663482 -92873777 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 1 2 1040 423 191 30 50 chr5 59671515 59671614 -92865645 + RMER6C LTR ERVK 24 120 -570 2 1040 294 264 74 60 chr5 59671619 59671768 -92865491 + RLTR22_Mur LTR ERVK 3 153 -1695 2 1040 2009 255 71 87 chr5 59672808 59673690 -92863569 + RLTR22_Mur LTR ERVK 126 993 -855 2 1040 599 285 36 0 chr5 59674353 59674518 -92862741 - ORR1D1-int LTR MaLR -1183 187 17 2 1040 815 293 176 3 chr5 59674534 59674846 -92862413 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 2 1040 414 379 99 8 chr5 59680022 59680275 -92856984 - MTD LTR MaLR -14 405 130 2 1040 2025 228 35 37 chr5 59680327 59680740 -92856519 + RMER19C LTR ERVK 1 435 -302 2 1040 2025 171 8 59 chr5 59680835 59681168 -92856091 + RMER19C LTR ERVK 287 611 0 2 1040 482 297 71 82 chr5 59682817 59683051 -92854208 - MERVL_2A-int LTR ERVL -202 5559 5336 2 1040 3243 45 2 5 chr5 59683051 59683448 -92853811 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1040 482 332 52 47 chr5 59683448 59683734 -92853525 - MERVL_2A-int LTR ERVL -426 5335 4964 2 1040 426 285 30 15 chr5 59683789 59683921 -92853338 - MERVL_2A-int LTR ERVL -769 4992 4859 2 1040 583 357 36 23 chr5 59683943 59684247 -92853012 - MTE-int LTR MaLR -1146 434 127 2 1040 2985 74 179 2 chr5 59686895 59687330 -92849929 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 1040 621 310 140 60 chr5 59689217 59689422 -92847837 - MTD LTR MaLR 0 419 179 2 1040 2276 97 15 142 chr5 59689422 59689893 -92847366 - RLTR9F LTR ERVK -4 411 1 2 1040 621 310 140 60 chr5 59689893 59690037 -92847222 - MTD LTR MaLR -241 178 42 2 1040 1077 311 126 48 chr5 59690079 59690853 -92846406 - MTD-int LTR MaLR -426 1537 605 2 1040 371 312 55 71 chr5 59691870 59692027 -92845232 - MTD-int LTR MaLR -1007 251 99 2 1040 371 312 55 71 chr5 59692049 59692146 -92845113 - MTD-int LTR MaLR -1160 98 1 2 1040 863 306 109 20 chr5 59692146 59692503 -92844756 - MTD LTR MaLR 0 419 31 2 1040 260 277 33 157 chr5 59694788 59695004 -92842255 - MTE-int LTR MaLR -516 1064 879 2 1040 904 304 29 22 chr5 59701055 59701327 -92835932 + ORR1D2 LTR MaLR 97 370 0 2 1040 1051 286 85 49 chr5 59711756 59712146 -92825113 - MTD LTR MaLR -15 404 1 2 1040 631 333 101 66 chr5 59713531 59714091 -92823168 - MTC-int LTR MaLR -244 1014 336 3 1040 683 322 93 24 chr5 59714425 59714773 -92822486 - MTD LTR MaLR -31 388 12 3 1040 690 204 192 6 chr5 59738729 59738906 -92798353 + RLTR25A LTR ERVK 1 210 -893 3 1040 350 90 45 0 chr5 59739330 59739397 -92797862 + MMVL30-int LTR ERV1 1442 1511 -2187 3 1040 8840 106 34 11 chr5 59739737 59741128 -92796131 + MMVL30-int LTR ERV1 1527 3421 -1642 3 1040 3786 93 9 29 chr5 59741128 59741683 -92795576 + MMVL30-int LTR ERV1 3088 3631 -67 3 1040 629 135 22 57 chr5 59741667 59741815 -92795444 + RLTR1B-int LTR ERV1 3221 3299 0 3 1040 3611 74 4 76 chr5 59741815 59742357 -92794902 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 3 1040 1365 291 20 33 chr5 59747168 59747559 -92789700 - MTC LTR MaLR -11 410 25 3 1040 2767 55 85 0 chr5 59749182 59749547 -92787712 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1040 10936 64 0 1 chr5 59751160 59752514 -92784745 + RLTR45-int LTR ERVK 5893 7244 0 3 1040 2371 156 58 21 chr5 59752514 59752979 -92784280 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1040 679 296 80 146 chr5 59761212 59761810 -92775449 - MTC-int LTR MaLR -170 1088 436 3 1040 1586 170 26 62 chr5 59767355 59767694 -92769565 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 3 1040 278 401 74 6 chr5 59767908 59768071 -92769188 - MLT1F LTR MaLR -362 186 13 3 1041 298 323 92 72 chr5 59788764 59788971 -92748288 + MTE-int LTR MaLR 1 211 -1369 4 1041 351 388 89 22 chr5 59789232 59789456 -92747803 + MTE2a LTR MaLR 141 379 0 4 1041 1227 258 45 25 chr5 59790034 59790388 -92746871 - ORR1C2 LTR MaLR -23 361 1 4 1041 651 216 126 34 chr5 59796110 59796146 -92741113 - RMER12 LTR ERVK -133 1189 1147 4 1041 651 216 126 34 chr5 59796218 59796387 -92740872 - RMER12 LTR ERVK -176 1146 965 4 1041 3393 194 45 16 chr5 59796503 59797243 -92740016 - RMER12 LTR ERVK -561 761 1 4 1041 1508 166 76 67 chr5 59797705 59798111 -92739148 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1041 1439 220 49 61 chr5 59798674 59798871 -92738388 + RMER17A LTR ERVK 143 339 -412 4 1041 1439 220 49 61 chr5 59798963 59799260 -92737999 + RMER17A LTR ERVK 340 630 -121 4 1041 1439 220 49 61 chr5 59799492 59799505 -92737754 + RMER17A LTR ERVK 631 643 -108 4 1041 2054 195 144 42 chr5 59803900 59804526 -92732733 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 1041 580 334 71 104 chr5 59804627 59804782 -92732477 - RMER20B LTR ERVK -13 614 461 4 1041 1902 188 40 57 chr5 59804782 59805206 -92732053 + RLTR9B2 LTR ERVK 4 420 0 4 1041 580 334 71 104 chr5 59805206 59805444 -92731815 - RMER20B LTR ERVK -167 460 234 4 1041 2849 96 5 21 chr5 59814363 59814791 -92722468 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 4 1041 348 178 0 27 chr5 59815488 59815563 -92721696 - ORR1A3-int LTR MaLR -446 1517 1445 4 1041 277 316 96 6 chr5 59821642 59821798 -92715461 + RMER15 LTR ERVL 406 575 0 4 1041 2883 27 0 3 chr5 59830823 59831161 -92706098 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1041 23471 19 8 4 chr5 59831161 59834279 -92702980 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3165 -3316 4 1041 10073 17 3 0 chr5 59834268 59835402 -92701857 + IAPEz-int LTR ERVK 5345 6481 0 4 1041 2893 27 0 3 chr5 59835402 59835740 -92701519 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1041 281 168 125 81 chr5 59835820 59835956 -92701303 + RMER17B LTR ERVK 316 457 -501 4 1041 304 264 169 27 chr5 59838830 59838978 -92698281 + RLTR41 LTR ERV1 276 444 -2 4 1041 2348 120 23 20 chr5 59840846 59841237 -92696022 + RLTR9E LTR ERVK 14 405 -4 5 1041 270 291 36 85 chr5 59842556 59842721 -92694538 + RMER12 LTR ERVK 666 822 -500 5 1041 539 177 49 54 chr5 59844351 59844554 -92692705 + RMER17C LTR ERVK 74 275 -135 5 1041 872 290 69 28 chr5 59845062 59845381 -92691878 + MTC LTR MaLR 3 334 -87 5 1041 353 65 0 0 chr5 59851124 59851170 -92686089 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 247 5 1041 349 47 0 0 chr5 59851170 59851213 -92686046 + RLTR10-int LTR ERVK 484 526 -1461 5 1041 2711 55 14 5 chr5 59851213 59851581 -92685678 - RLTR10 LTR ERVK -19 371 1 5 1041 618 290 94 94 chr5 59851584 59851999 -92685260 + MT2A LTR ERVL 1 539 -62 5 1041 329 362 43 65 chr5 59853045 59853380 -92683879 - ORR1E LTR MaLR -2 377 29 5 1041 1158 199 98 72 chr5 59863933 59863956 -92673303 - RMER17C LTR ERVK 0 410 390 5 1041 1158 199 98 72 chr5 59864148 59864389 -92672870 - RMER17C LTR ERVK -21 389 146 5 1041 1158 199 98 72 chr5 59864495 59864629 -92672630 - RMER17C LTR ERVK -265 145 1 5 1041 394 250 38 9 chr5 59866135 59866240 -92671019 - RLTR28 LTR ERVL -3 521 414 5 1041 1678 175 47 7 chr5 59866879 59867178 -92670081 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 1041 1620 198 72 8 chr5 59870903 59871279 -92665980 - RLTR28 LTR ERVL -122 402 3 5 1041 615 360 82 20 chr5 59872502 59872808 -92664451 - MTEa LTR MaLR -53 326 2 5 1041 1583 198 67 61 chr5 59875826 59876121 -92661138 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 89 5 1041 1583 168 91 46 chr5 59876266 59876358 -92660901 - ORR1B1 LTR MaLR -306 88 9 5 1041 1818 183 3 3 chr5 59877542 59877871 -92659388 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1041 306 269 0 0 chr5 59879517 59879584 -92657675 - ORR1D2 LTR MaLR -39 331 265 5 1041 1027 214 108 51 chr5 59880929 59881123 -92656136 - RMER4B LTR ERVK -236 349 139 5 1041 1027 214 108 51 chr5 59881680 59881800 -92655459 - RMER4B LTR ERVK -447 138 17 5 1041 1508 174 63 16 chr5 59890984 59891287 -92645972 + ORR1A3 LTR MaLR 1 317 -9 5 1041 356 404 77 1 chr5 59893739 59894001 -92643258 - MLT1E2 LTR MaLR -45 579 298 5 1041 4954 138 43 21 chr5 59897895 59898808 -92638451 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1 5 1042 320 326 54 13 chr5 59904763 59904912 -92632347 + MLT1A0 LTR MaLR 211 365 0 6 1042 1267 265 18 81 chr5 59922003 59922713 -92614546 - RMER19C LTR ERVK 0 902 24 6 1042 232 370 88 7 chr5 59925829 59925965 -92611294 + MER90 LTR ERV1 266 412 -163 6 1042 372 269 82 37 chr5 59929415 59929550 -92607709 + ORR1D2 LTR MaLR 6 146 -224 6 1042 880 309 97 37 chr5 59929676 59930026 -92607233 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 6 1042 483 225 26 84 chr5 59934106 59934261 -92602998 + ORR1D1 LTR MaLR 1 146 -228 6 1042 867 270 27 0 chr5 59935616 59935635 -92601624 + ORR1D1 LTR MaLR 147 167 -207 6 1042 867 270 27 0 chr5 59935707 59935909 -92601350 + ORR1D1 LTR MaLR 168 373 -1 6 1042 334 209 15 160 chr5 59938590 59938721 -92598538 + MT2B2 LTR ERVL 153 264 -320 6 1042 840 294 108 19 chr5 59942524 59942902 -92594357 + MTC LTR MaLR 2 413 -8 6 1042 1527 222 55 18 chr5 59944379 59944764 -92592495 + RLTR12A LTR ERVK 170 568 0 6 1042 275 374 14 81 chr5 59944764 59944980 -92592279 - MTEb-int LTR MaLR -1366 214 14 6 1042 390 288 128 59 chr5 59945000 59945203 -92592056 - MTEb LTR MaLR 0 379 163 6 1042 257 357 38 61 chr5 59946317 59946529 -92590730 - LTR52 LTR ERVL -211 210 4 6 1042 2553 88 90 0 chr5 59950613 59950990 -92586269 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 1042 4241 195 77 53 chr5 59956609 59957005 -92580254 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 650 7 1042 4241 195 77 53 chr5 59957691 59958298 -92578961 - RLTR25B LTR ERVK -379 649 2 7 1042 323 392 17 35 chr5 59958432 59958604 -92578655 + MLT1H LTR MaLR 3 171 -378 7 1042 3184 29 39 0 chr5 59963808 59964189 -92573070 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1042 9385 24 1 1 chr5 59964191 59965287 -92571972 - MTA_Mm-int LTR MaLR -2 1096 1 7 1042 3121 34 39 0 chr5 59965287 59965668 -92571591 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1042 648 263 5 89 chr5 59977055 59977268 -92559991 - MER57F LTR ERV1 -241 195 1 7 1042 247 319 69 69 chr5 59977362 59977463 -92559796 - MLT1A0 LTR MaLR -174 191 91 7 1042 1176 232 57 37 chr5 59977500 59977800 -92559459 + ORR1B1 LTR MaLR 82 387 -7 7 1042 718 158 120 0 chr5 59990209 59990342 -92546917 - RLTR20B3 LTR ERVK -427 150 2 7 1042 298 275 9 56 chr5 59993206 59993314 -92543945 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 258 7 1042 265 339 31 16 chr5 59993629 59993758 -92543501 - RMER15 LTR ERVL -71 504 374 7 1042 2036 205 75 0 chr5 60010321 60010721 -92526538 + RMER19B LTR ERVK 460 889 -13 7 1042 706 291 14 33 chr5 60013979 60014192 -92523067 + MTE2b LTR MaLR 1 209 -170 1 1042 246 339 83 93 chr5 60014477 60014682 -92522577 + MLT1A0 LTR MaLR 40 242 -123 1 1042 370 295 98 30 chr5 60016886 60017019 -92520240 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 220 2 1042 1083 304 94 22 chr5 60029517 60030008 -92507251 + RMER5 LTR ERV1 1 526 -8 5 1042 811 261 168 21 chr5 60030535 60030852 -92506407 + MTD LTR MaLR 5 365 -14 5 1043 336 269 75 11 chr5 60031606 60031700 -92505559 - RMER5 LTR ERV1 -18 516 417 5 1043 767 265 120 41 chr5 60032768 60033110 -92504149 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 5 1043 822 295 11 30 chr5 60042207 60042476 -92494783 + RMER5 LTR ERV1 1 264 -270 6 1043 543 271 116 37 chr5 60042671 60042912 -92494347 + RMER5 LTR ERV1 272 531 -3 6 1043 257 331 46 23 chr5 60043071 60043201 -92494058 - MLT1A LTR MaLR -241 133 1 6 1043 1148 273 27 25 chr5 60043327 60043695 -92493564 + ORR1D1 LTR MaLR 6 374 0 6 1043 2788 94 17 12 chr5 60045925 60046344 -92490915 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 1043 381 322 65 57 chr5 60048035 60048323 -92488936 + MER67D LTR ERV1 86 416 -295 7 1043 1012 284 69 50 chr5 60050284 60050647 -92486612 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1043 1691 187 36 87 chr5 60061604 60062019 -92475240 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1043 3394 25 5 0 chr5 60066201 60066595 -92470664 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1043 3079 66 0 8 chr5 60074858 60075257 -92462002 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1043 230 355 53 35 chr5 60075430 60075544 -92461715 - MLT1D LTR MaLR -69 436 321 1 1043 331 312 62 31 chr5 60078277 60078439 -92458820 + LTR40a LTR ERVL 3 169 -350 1 1043 695 330 43 27 chr5 60079026 60079325 -92457934 + MT2A LTR ERVL 1 304 -229 1 1043 2227 196 71 11 chr5 60079648 60080098 -92457161 - RLTR19 LTR ERVK -15 484 8 1 1043 1535 169 40 58 chr5 60080102 60080429 -92456830 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 1 1043 2009 222 35 47 chr5 60081634 60082311 -92454948 - RLTR31_Mm LTR ERVK -26 558 1 1 1043 511 329 59 56 chr5 60087747 60088075 -92449184 + MLT1A0 LTR MaLR 6 336 -29 1 1043 2120 233 91 40 chr5 60088075 60088268 -92448991 + RMER19A LTR ERVK 1 189 -548 1 1043 2120 233 91 40 chr5 60088341 60088848 -92448411 + RMER19A LTR ERVK 190 736 -1 1 1043 511 329 59 56 chr5 60088848 60088876 -92448383 + MLT1A0 LTR MaLR 337 363 -2 1 1043 376 353 38 0 chr5 60092383 60092516 -92444743 - MTEb LTR MaLR -241 138 1 1 1043 661 359 38 31 chr5 60092516 60092832 -92444427 - MTEb-int LTR MaLR -24 1556 1239 1 1043 376 396 31 0 chr5 60093021 60093213 -92444046 - MTEb-int LTR MaLR -342 1238 1041 1 1043 1763 230 5 29 chr5 60093214 60093599 -92443660 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 7 1 1043 279 275 0 0 chr5 60093675 60093744 -92443515 - MTD LTR MaLR -277 142 74 1 1043 606 325 161 47 chr5 60094123 60094165 -92443094 - MTEb-int LTR MaLR -815 765 734 1 1043 606 325 161 47 chr5 60094199 60094540 -92442719 - MTEb-int LTR MaLR -847 733 338 1 1043 365 320 114 103 chr5 60098670 60099039 -92438220 - MTD LTR MaLR -46 373 1 1 1043 447 360 33 11 chr5 60099052 60099232 -92438027 - MTEb LTR MaLR -195 184 1 1 1043 594 278 35 8 chr5 60099851 60100104 -92437155 - ORR1D1 LTR MaLR -84 300 1 1 1043 230 309 0 14 chr5 60100154 60100223 -92437036 - MTEb LTR MaLR -18 361 294 1 1043 521 314 98 83 chr5 60106486 60106945 -92430314 + RMER20B LTR ERVK 130 595 -32 1 1043 1401 234 79 35 chr5 60119822 60120251 -92417008 - RMER6C LTR ERVK 0 690 243 1 1043 232 289 31 82 chr5 60122220 60122318 -92414941 - MT2B LTR ERVL -343 258 166 1 1043 228 231 0 122 chr5 60124895 60124910 -92412349 + MT2B LTR ERVL 152 157 -444 2 1043 4976 193 106 82 chr5 60134917 60135311 -92401948 - RLTR22_Mur LTR ERVK -325 1523 1128 2 1043 4976 193 106 82 chr5 60135475 60136562 -92400697 - RLTR22_Mur LTR ERVK -721 1127 6 2 1043 306 320 147 33 chr5 60136573 60136757 -92400502 + MTE2b LTR MaLR 24 228 -151 2 1043 239 297 103 93 chr5 60138625 60138937 -92398322 - RLTR12B LTR ERVK -77 451 137 2 1043 282 297 108 79 chr5 60147952 60148275 -92388984 + MLT1F2 LTR MaLR 154 610 -14 2 1043 875 275 36 71 chr5 60151295 60151604 -92385655 - RMER19B LTR ERVK -300 602 305 2 1044 678 297 83 32 chr5 60162918 60163255 -92374004 + ORR1D2 LTR MaLR 1 355 -4 2 1044 238 265 50 64 chr5 60164516 60164657 -92372602 + RMER17A2 LTR ERVK 244 382 -524 2 1044 277 253 33 44 chr5 60166999 60167090 -92370169 + RLTR25B LTR ERVK 418 507 -521 2 1044 501 272 80 7 chr5 60169005 60169142 -92368117 + ORR1D1 LTR MaLR 62 208 -166 2 1044 438 233 8 65 chr5 60169814 60169938 -92367321 + ORR1D1 LTR MaLR 204 320 -58 2 1044 297 106 70 3 chr5 60173775 60173836 -92363423 - MT2B LTR ERVL -408 67 1 2 1044 669 388 11 4 chr5 60173836 60174113 -92363146 - MTD LTR MaLR -91 328 50 2 1044 310 377 0 8 chr5 60176974 60177097 -92360162 - RMER15 LTR ERVL -178 397 276 2 1044 1648 349 88 43 chr5 60177238 60178740 -92358519 - RMER15-int LTR ERVL -3 4996 3428 2 1044 597 387 41 37 chr5 60178809 60179461 -92357798 - RMER15-int LTR ERVL -1679 3320 2666 2 1044 478 341 18 33 chr5 60181821 60182033 -92355226 + ORR1E LTR MaLR 3 201 -169 2 1044 753 322 26 26 chr5 60183669 60183978 -92353281 + MTE2b LTR MaLR 13 321 -58 2 1044 7831 154 21 123 chr5 60184394 60186141 -92351118 + RLTR21 LTR ERVK 1 1568 -4 2 1044 252 218 18 0 chr5 60187687 60187742 -92349517 - MLT1A1 LTR MaLR -62 346 291 2 1044 3302 89 30 0 chr5 60189499 60189784 -92347475 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 298 -177 3 1044 3302 89 30 0 chr5 60189827 60190002 -92347257 + MT2C_Mm LTR ERVL 299 474 -1 3 1044 1211 136 5 0 chr5 60196144 60196328 -92340931 + MT2C_Mm LTR ERVL 291 475 0 3 1044 1901 203 156 2 chr5 60207005 60207468 -92329791 + RMER6C LTR ERVK 1 534 -156 3 1044 743 203 7 0 chr5 60208803 60208951 -92328308 + RMER6C LTR ERVK 520 668 -22 3 1044 4258 134 60 46 chr5 60218440 60219186 -92318073 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 762 -140 3 1044 4258 134 60 46 chr5 60219218 60219274 -92317985 + RLTR13D6 LTR ERVK 763 814 -88 3 1044 618 286 48 35 chr5 60222407 60222697 -92314562 + RLTR15 LTR ERVK 1 294 -65 3 1044 1508 224 40 20 chr5 60223651 60223998 -92313261 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 3 1044 3962 252 96 74 chr5 60224264 60226964 -92310295 + MYSERV6-int LTR ERVK 3772 8903 -56 3 1044 289 285 110 61 chr5 60226971 60227199 -92310060 + RLTR15 LTR ERVK 102 340 -19 3 1044 290 336 32 57 chr5 60238355 60238513 -92298746 - MLT1A LTR MaLR -218 156 3 3 1044 260 323 112 61 chr5 60238541 60238755 -92298504 - MLT1E1A LTR MaLR -116 564 340 3 1044 864 313 78 23 chr5 60238880 60239227 -92298032 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 3 1044 2848 9 0 0 chr5 60239818 60240140 -92297119 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1044 4426 29 0 13 chr5 60240140 60240670 -92296589 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 4322 3 1044 1369 189 97 26 chr5 60241121 60241502 -92295757 + RMER17C LTR ERVK 3 410 0 3 1044 272 307 42 34 chr5 60242898 60243016 -92294243 - MTEb LTR MaLR -5 374 256 3 1044 1460 191 39 36 chr5 60243538 60243878 -92293381 - RMER17C LTR ERVK -9 401 60 3 1044 5005 117 34 29 chr5 60243878 60244682 -92292577 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 3 1044 1460 206 41 36 chr5 60244682 60244775 -92292484 - RMER17C LTR ERVK -351 59 16 3 1044 1630 184 9 69 chr5 60244837 60245187 -92292072 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1044 242 246 49 0 chr5 60249070 60249131 -92288128 - RMER10B LTR ERVL -63 335 272 4 1044 4688 68 2 0 chr5 60252459 60253045 -92284214 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 4 1044 442 223 0 87 chr5 60253223 60253326 -92283933 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 563 470 4 1044 1394 225 39 30 chr5 60253374 60253736 -92283523 - RLTR20B3 LTR ERVK -212 365 1 4 1044 1977 133 9 9 chr5 60256361 60256688 -92280571 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 4 1044 8911 117 4 17 chr5 60256688 60258048 -92279211 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 6171 4 1044 2009 133 41 0 chr5 60258029 60258345 -92278914 - IAPEY3-int LTR ERVK -6469 1211 883 4 1044 428 349 67 64 chr5 60284154 60284451 -92252808 + MLT1A LTR MaLR 23 320 -54 4 1044 3427 23 5 0 chr5 60286108 60286502 -92250757 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1044 5227 100 29 8 chr5 60290376 60291167 -92246092 + RLTR13C2 LTR ERVK 2 983 0 4 1044 821 297 103 16 chr5 60292187 60292498 -92244761 - MTEb LTR MaLR 0 379 42 4 1045 414 241 2 2 chr5 60307244 60307351 -92229908 - MTC LTR MaLR -289 107 1 5 1045 732 257 107 60 chr5 60313234 60313366 -92223893 - RMER12B LTR ERVK -113 1459 1287 5 1045 732 241 162 90 chr5 60313505 60313588 -92223671 - RMER12B LTR ERVK -202 1370 1306 5 1045 6070 189 27 47 chr5 60313622 60314995 -92222264 - RMER12B LTR ERVK -267 1305 1 5 1045 744 243 88 60 chr5 60315469 60315788 -92221471 + RLTR15 LTR ERVK 6 333 -26 5 1045 2456 202 209 109 chr5 60316225 60316290 -92220969 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 965 5 1045 2456 202 209 109 chr5 60316329 60317198 -92220061 - RLTR25B LTR ERVK -64 964 3 5 1045 3959 129 19 2 chr5 60317301 60317885 -92219374 - MT2B LTR ERVL 0 601 8 5 1045 226 143 0 0 chr5 60318038 60318073 -92219186 - MLT1A LTR MaLR -265 109 75 5 1045 2809 126 43 6 chr5 60321394 60321864 -92215395 + RMER17B LTR ERVK 1 487 -471 5 1045 1971 251 25 15 chr5 60321969 60322439 -92214820 + RMER17B LTR ERVK 479 953 -5 5 1045 861 229 112 48 chr5 60322539 60322851 -92214408 + RMER6A LTR ERVK 2 333 -357 5 1045 1197 219 63 30 chr5 60323108 60323487 -92213772 + RMER6A LTR ERVK 377 719 -1 5 1045 2029 80 28 16 chr5 60340189 60340507 -92196752 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1045 18118 150 30 22 chr5 60340507 60347329 -92189930 - ETnERV2-int LTR ERVK -271 7135 1 5 1045 2053 77 28 16 chr5 60347329 60347647 -92189612 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1045 713 281 57 93 chr5 60348602 60348955 -92188304 - RLTR18B LTR ERVK -9 503 182 5 1045 622 297 76 70 chr5 60348951 60349266 -92187993 - RLTR18 LTR ERVK -286 330 14 5 1045 1974 206 54 20 chr5 60350076 60350483 -92186776 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1045 4466 227 94 32 chr5 60350486 60350682 -92186577 - MTC-int LTR MaLR -3 1255 1051 5 1045 4466 227 94 32 chr5 60351649 60352634 -92184625 - MTC-int LTR MaLR -208 1050 1 5 1045 1744 213 34 13 chr5 60352634 60353020 -92184239 - MTC LTR MaLR 0 394 1 5 1045 1003 320 18 102 chr5 60361738 60362180 -92175079 + MTD LTR MaLR 15 419 0 5 1045 517 319 42 23 chr5 60365692 60365907 -92171352 + MLT2B2 LTR ERVL 12 230 -285 5 1045 282 295 44 9 chr5 60376061 60376174 -92161085 - MLT2C2 LTR ERVL -331 133 17 6 1045 1680 145 9 84 chr5 60382990 60383322 -92153937 + ORR1A2 LTR MaLR 13 319 -8 6 1045 1249 252 32 67 chr5 60386990 60387394 -92149865 + RMER10A LTR ERVL 1 390 -52 6 1045 227 346 57 35 chr5 60387554 60387695 -92149564 - MLT1D LTR MaLR -361 144 1 6 1045 4644 162 49 19 chr5 60398408 60399284 -92137975 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 6 1045 951 311 59 12 chr5 60403532 60403871 -92133388 + ORR1D1 LTR MaLR 1 355 -19 6 1045 856 302 119 15 chr5 60404480 60404834 -92132425 - MTD LTR MaLR -9 410 15 6 1045 367 350 50 19 chr5 60412660 60412820 -92124439 - ORR1E LTR MaLR -194 165 1 6 1045 972 387 112 41 chr5 60412820 60414244 -92123015 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 1 6 1045 423 354 51 84 chr5 60414268 60414579 -92122680 - ORR1E LTR MaLR -55 304 4 6 1045 1563 37 5 0 chr5 60415938 60416129 -92121130 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 205 6 130 848 280 81 15 chr5 60424050 60424405 -92112854 + MTD LTR MaLR 13 417 -2 6 1046 387 267 78 2 chr5 60438181 60438296 -92098963 + ORR1B2 LTR MaLR 169 301 -73 6 1046 2591 55 61 0 chr5 60447999 60448325 -92088934 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 1046 262 352 91 41 chr5 60451473 60451716 -92085543 + MLT1D LTR MaLR 251 505 0 7 1046 338 213 16 129 chr5 60451799 60451923 -92085336 + MT2B LTR ERVL 155 264 -337 7 1046 264 226 58 5 chr5 60456070 60456159 -92081100 - MTD LTR MaLR -15 404 294 7 1046 899 194 13 84 chr5 60459774 60459999 -92077260 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 316 7 1046 3338 43 2 0 chr5 60460323 60460718 -92076541 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1046 1188 46 0 0 chr5 60460718 60460869 -92076390 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 151 -947 7 1046 7809 29 2 0 chr5 60462616 60463575 -92073684 + MTA_Mm-int LTR MaLR 138 1098 0 7 1046 3412 30 2 0 chr5 60463575 60463970 -92073289 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1046 1600 187 47 0 chr5 60464710 60465010 -92072249 - RLTR28 LTR ERVL -210 314 1 7 1046 605 335 37 64 chr5 60465694 60466102 -92071157 - MER67D LTR ERV1 -111 403 7 7 1046 7236 85 14 19 chr5 60468352 60469380 -92067879 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 7 1046 813 322 57 30 chr5 60475389 60475722 -92061537 + ORR1D2 LTR MaLR 29 370 0 7 1046 2950 81 8 2 chr5 60479219 60479617 -92057642 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1046 381 325 99 76 chr5 60481637 60481978 -92055281 - MLT1A0 LTR MaLR -18 390 4 7 1046 987 282 70 46 chr5 60482513 60482904 -92054355 - MTD LTR MaLR -14 405 6 7 1046 611 409 41 51 chr5 60487353 60487647 -92049612 + MTE2b LTR MaLR 2 292 -87 7 1046 1695 139 9 59 chr5 60488350 60488687 -92048572 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 320 -2 7 1046 2240 121 12 0 chr5 60492084 60492407 -92044852 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1046 425 358 97 48 chr5 60494236 60494547 -92042712 + MLT1F2 LTR MaLR 70 395 -165 7 1046 357 283 102 131 chr5 60494548 60494784 -92042475 + MLT2C2 LTR ERVL 3 231 -233 7 1046 371 314 28 35 chr5 60495286 60495431 -92041828 + MLT1F2 LTR MaLR 537 680 0 7 1046 641 302 43 28 chr5 60500664 60500875 -92036384 + ORR1D1 LTR MaLR 1 214 -160 2 1046 225 235 247 0 chr5 60501824 60501909 -92035350 + ORR1D1 LTR MaLR 269 374 0 2 1046 2893 267 26 8 chr5 60501910 60502651 -92034608 + ORR1D1-int LTR MaLR 2 755 -615 2 1046 1149 286 59 23 chr5 60502663 60503017 -92034242 + ORR1D1-int LTR MaLR 815 1181 -189 2 1046 399 284 0 0 chr5 60503021 60503102 -92034157 - RLTR18B LTR ERVK -5 507 427 6 1046 226 229 0 0 chr5 60503248 60503296 -92033963 + ORR1D1 LTR MaLR 321 368 -2 2 1046 1395 284 44 114 chr5 60503715 60504423 -92032836 + RMER19C LTR ERVK 10 737 0 8 1046 344 337 73 6 chr5 60505740 60505919 -92031340 - MER57C2 LTR ERV1 -8 426 236 1 1046 1672 225 11 90 chr5 60505982 60506426 -92030833 + MTC LTR MaLR 1 409 -12 1 1046 2110 184 76 39 chr5 60517291 60517828 -92019431 + RMER6C LTR ERVK 5 561 -129 3 1046 327 364 54 5 chr5 60518054 60518239 -92019020 - MLT2D LTR ERVL -218 196 3 4 1046 1223 217 251 52 chr5 60519678 60520276 -92016983 + RMER6C LTR ERVK 3 697 -59 4 1046 782 133 14 14 chr5 60521509 60521654 -92015605 - RMER6-int LTR ERVK -443 2734 2590 4 1046 1532 181 10 29 chr5 60521718 60522025 -92015234 - RMER6-int LTR ERVK -660 2517 2217 4 1046 1723 212 31 33 chr5 60522052 60522506 -92014753 - RMER6-int LTR ERVK -1046 2131 1679 4 1046 2036 195 10 20 chr5 60522545 60522943 -92014316 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1046 310 178 151 0 chr5 60522952 60523025 -92014234 - RMER6-int LTR ERVK -1588 1589 1506 4 1046 2359 204 54 14 chr5 60523035 60523532 -92013727 - RLTR12B LTR ERVK -11 517 1 4 1046 1741 248 47 84 chr5 60525592 60525724 -92011535 - RMER20B LTR ERVK -28 599 465 4 1046 1741 248 47 84 chr5 60525788 60526272 -92010987 - RMER20B LTR ERVK -163 464 6 4 1046 2800 42 0 3 chr5 60528864 60529202 -92008057 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 5 1046 419 315 85 49 chr5 60536187 60536434 -92000825 + LTR48B LTR ERV1 123 378 -266 6 1046 252 322 94 78 chr5 60536451 60536643 -92000616 + LTR48B LTR ERV1 587 781 -6 6 1046 375 298 100 128 chr5 60541285 60541691 -91995568 - MLT1C LTR MaLR -7 460 1 7 1046 541 332 97 37 chr5 60545409 60545759 -91991500 + MLT1E2 LTR MaLR 225 595 -32 8 1046 482 190 0 0 chr5 60545804 60545883 -91991376 + MT2B LTR ERVL 181 259 -342 8 1046 377 195 11 79 chr5 60545887 60545976 -91991283 + MT2B2 LTR ERVL 155 237 -347 8 1046 1415 203 65 26 chr5 60546013 60546352 -91990907 + RMER6C LTR ERVK 339 690 0 8 1046 719 305 91 16 chr5 60547136 60547443 -91989816 - MTD LTR MaLR -69 350 21 8 1046 883 244 71 17 chr5 60554440 60554678 -91982581 + RMER5 LTR ERV1 20 270 -264 9 1046 932 234 37 16 chr5 60554778 60555021 -91982238 + RMER5 LTR ERV1 260 507 -27 9 1047 1785 230 18 18 chr5 60557142 60557536 -91979723 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 9 1047 262 396 33 20 chr5 60558120 60558272 -91978987 + ORR1E LTR MaLR 19 172 -187 9 1047 815 235 55 14 chr5 60561467 60561687 -91975572 - RLTR16 LTR ERVK -31 474 246 1 1047 1133 255 124 34 chr5 60566074 60566460 -91970799 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1047 239 336 27 36 chr5 60566529 60566640 -91970619 + RMER12 LTR ERVK 742 851 -471 1 1047 767 268 73 110 chr5 60568311 60568776 -91968483 + RLTR12B LTR ERVK 48 495 -33 1 1047 329 272 25 34 chr5 60569338 60569456 -91967803 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 314 1 1047 356 221 8 96 chr5 60569857 60569982 -91967277 + RLTR11B LTR ERVK 127 240 -213 1 1047 257 309 37 93 chr5 60569990 60570236 -91967023 + RLTR12B LTR ERVK 241 472 -56 1 1047 439 303 77 64 chr5 60570429 60570633 -91966626 - MTE-int LTR MaLR -1178 402 170 1 1047 369 231 62 44 chr5 60570602 60570715 -91966544 - MTE2b LTR MaLR -262 117 3 1 1047 3063 37 0 0 chr5 60578732 60579086 -91958173 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 1 1047 822 135 49 37 chr5 60579086 60579248 -91958011 + IAPLTR4_I LTR ERVK 17 180 -1290 1 1047 9005 132 15 37 chr5 60579247 60580739 -91956520 + IAPEY3-int LTR ERVK 524 1982 -5698 1 1047 3356 80 9 0 chr5 60580716 60581153 -91956106 + IAPEY3-int LTR ERVK 2238 2678 -5002 1 1047 2829 122 19 32 chr5 60581293 60581947 -91955312 + IAPEY3-int LTR ERVK 6984 7581 0 1 1047 3023 48 0 0 chr5 60581947 60582304 -91954955 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 1 1047 2879 91 5 2 chr5 60582708 60583103 -91954156 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1047 1457 208 134 48 chr5 60596445 60596929 -91940330 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 527 0 1 1047 982 191 20 61 chr5 60610501 60610749 -91926510 - RMER17C LTR ERVK 0 410 166 1 1047 982 212 82 52 chr5 60610800 60610913 -91926346 - RMER17C LTR ERVK -245 165 7 1 1047 1662 128 267 18 chr5 60613347 60613673 -91923586 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1047 6994 102 23 3 chr5 60616140 60617143 -91920116 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 1 1047 544 288 77 58 chr5 60617904 60618217 -91919042 + RLTR15 LTR ERVK 9 327 -32 1 1047 368 329 13 39 chr5 60619162 60619317 -91917942 + MTE2a LTR MaLR 212 362 -17 1 1047 791 268 49 57 chr5 60625545 60625682 -91911577 - RMER17B LTR ERVK -524 434 260 2 1047 791 166 15 53 chr5 60625727 60625955 -91911304 - RMER17B LTR ERVK -559 399 1 2 1047 232 255 60 94 chr5 60631677 60631794 -91905465 - RLTR20D LTR ERVK -396 172 60 2 1047 247 363 30 53 chr5 60642824 60642955 -91894304 + ORR1D1 LTR MaLR 1 128 -246 2 1047 253 288 67 73 chr5 60651603 60651768 -91885491 + RLTR25A LTR ERVK 937 1100 -3 2 1047 379 336 8 15 chr5 60653805 60653935 -91883324 + MTD LTR MaLR 15 143 -276 2 1047 591 309 29 0 chr5 60653953 60654128 -91883131 + MTC-int LTR MaLR 321 500 -758 2 1047 823 228 30 0 chr5 60654129 60654296 -91882963 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 211 2 1047 3760 150 122 35 chr5 60655139 60655969 -91881290 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 2 1047 1585 191 7 10 chr5 60659332 60659639 -91877620 + ORR1A1 LTR MaLR 21 326 -20 2 1047 3415 55 52 20 chr5 60663684 60664144 -91873115 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 2 1047 446 300 183 32 chr5 60664613 60665051 -91872208 - MLT1D LTR MaLR 0 505 2 2 1048 2728 211 73 63 chr5 60692412 60693306 -91843953 + RMER3D-int LTR ERVK 1917 2819 -23 3 1048 2728 211 73 63 chr5 60693356 60693376 -91843883 + RMER3D-int LTR ERVK 2820 2839 -3 3 1048 1468 197 67 22 chr5 60693378 60693800 -91843459 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 582 -2 3 1048 1322 249 26 11 chr5 60695554 60695903 -91841356 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 6 3 1048 273 352 48 38 chr5 60696528 60696547 -91840712 + IAPEY_LTR LTR ERVK 51 67 -318 3 1048 2274 94 85 11 chr5 60696579 60696954 -91840305 + IAPLTR2a LTR ERVK 9 411 0 3 1048 366 305 63 46 chr5 60698003 60698178 -91839081 + RMER15 LTR ERVL 165 342 -233 3 1048 233 316 38 12 chr5 60701048 60701128 -91836131 - RMER13B LTR ERVK -76 784 703 3 1048 670 243 39 62 chr5 60701182 60701441 -91835818 - RMER13B LTR ERVK -180 728 476 3 1048 554 330 43 39 chr5 60714958 60715182 -91822077 - MTE2b LTR MaLR -14 365 139 3 1048 2329 241 60 97 chr5 60715182 60716127 -91821132 + RMER17B LTR ERVK 6 915 -43 3 1048 471 321 22 15 chr5 60716132 60716268 -91820991 - MTE2b LTR MaLR -225 154 18 3 1048 2064 126 7 3 chr5 60722547 60722857 -91814402 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 1048 1519 183 40 3 chr5 60722960 60723256 -91814003 + ORR1A2 LTR MaLR 1 307 -20 3 1048 2356 114 155 2 chr5 60724184 60724596 -91812663 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 1048 333 65 22 0 chr5 60724652 60724698 -91812561 + ORR1A2 LTR MaLR 272 318 -8 3 1048 731 265 128 79 chr5 60725620 60726108 -91811151 - MT2B LTR ERVL -51 550 1 3 1048 314 227 59 40 chr5 60737083 60737184 -91800075 - RMER2 LTR ERV1 -5 562 460 3 1048 574 257 62 67 chr5 60743611 60743932 -91793327 - RMER2 LTR ERV1 -212 355 1 3 1048 240 211 0 37 chr5 60759108 60759162 -91778097 - MTD LTR MaLR -367 52 1 3 1048 557 325 68 87 chr5 60760994 60761419 -91775840 - RMER10A LTR ERVL -25 417 1 3 1048 713 283 175 36 chr5 60761746 60762134 -91775125 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 3 1048 246 163 41 0 chr5 60763027 60763076 -91774183 + ORR1D2 LTR MaLR 318 368 -2 3 1048 997 202 43 30 chr5 60769065 60769295 -91767964 + RLTR20B2 LTR ERVK 328 560 0 3 1048 1268 186 62 65 chr5 60770014 60770336 -91766923 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 3 1048 3125 133 123 0 chr5 60770504 60771024 -91766235 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 4 1048 676 266 62 144 chr5 60772968 60773337 -91763922 - RMER20B LTR ERVK -55 572 234 4 1048 984 254 35 152 chr5 60775289 60775516 -91761743 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 202 4 1048 984 254 35 152 chr5 60775661 60775861 -91761398 - ORR1C1 LTR MaLR -177 201 1 4 1048 729 322 101 8 chr5 60787855 60788212 -91749047 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 4 1048 1391 217 139 12 chr5 60789034 60789379 -91747880 + ORR1B1 LTR MaLR 1 389 -5 4 1048 496 318 31 29 chr5 60791802 60792096 -91745163 - ORR1E LTR MaLR 0 379 10 4 1048 252 220 17 17 chr5 60792172 60792232 -91745027 + MTEb LTR MaLR 320 379 0 4 1048 291 355 82 73 chr5 60794564 60794783 -91742476 + MLT1E1A LTR MaLR 396 616 -64 4 1048 1370 243 140 56 chr5 60800041 60800801 -91736458 - RMER6C LTR ERVK -3 717 27 4 1048 964 169 17 11 chr5 60808616 60808790 -91728469 + RMER17D2 LTR ERVK 635 809 0 4 1048 3860 165 23 24 chr5 60814187 60814931 -91722328 + RMER6A LTR ERVK 14 756 0 4 1048 1331 206 151 21 chr5 60815603 60815935 -91721324 - MTC LTR MaLR -46 375 1 4 1048 1010 275 70 28 chr5 60816230 60816343 -91720916 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 253 4 1048 1010 275 70 28 chr5 60816363 60816442 -91720817 - ORR1D1 LTR MaLR -122 252 166 4 1048 1010 275 70 28 chr5 60816521 60816685 -91720574 - ORR1D1 LTR MaLR -209 165 3 4 1048 430 323 27 47 chr5 60817088 60817355 -91719904 + RMER20B LTR ERVK 168 418 -209 4 1049 2526 212 68 9 chr5 60818636 60819179 -91718080 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 575 -2 4 1049 689 336 70 37 chr5 60834246 60834731 -91702528 + RMER5 LTR ERV1 22 522 -12 5 1049 3032 71 5 5 chr5 60841609 60842005 -91695254 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1049 1222 302 93 36 chr5 60842434 60842897 -91694362 - RLTR40 LTR ERVK -4 813 301 5 1049 1222 274 93 28 chr5 60843015 60843218 -91694041 - RLTR40 LTR ERVK -517 300 74 5 1049 410 200 28 65 chr5 60848379 60848486 -91688773 + RMER6C LTR ERVK 1 103 -617 5 1049 1810 183 101 50 chr5 60849735 60849839 -91687420 + RMER6C LTR ERVK 202 308 -382 5 1049 1810 183 101 50 chr5 60849969 60850329 -91686930 + RMER6C LTR ERVK 309 690 0 5 1049 785 275 98 5 chr5 60850925 60851195 -91686064 - MT2A LTR ERVL 0 601 209 5 1049 818 329 56 7 chr5 60852077 60852365 -91684894 - ORR1D2 LTR MaLR -61 309 8 5 1049 3907 180 127 14 chr5 60858665 60859526 -91677733 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 5 1049 1499 105 65 23 chr5 60861440 60861737 -91675522 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 1023 506 5 1049 3450 107 34 2 chr5 60865026 60865533 -91671726 - RLTR13C2 LTR ERVK -285 523 1 5 1049 3231 107 13 8 chr5 60869084 60869557 -91667702 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 1049 2853 246 58 24 chr5 60872772 60872825 -91664434 - RMER19B LTR ERVK 0 902 847 5 1049 2853 246 58 24 chr5 60873250 60873908 -91663351 - RMER19B LTR ERVK -56 846 167 5 1049 595 241 3 58 chr5 60874062 60874279 -91662980 - RMER19B LTR ERVK -557 180 1 5 1049 999 343 109 55 chr5 60877845 60879074 -91658185 - ORR1D2-int LTR MaLR -45 1464 4 5 1049 616 276 44 25 chr5 60879076 60879280 -91657979 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 163 5 1049 1745 225 67 10 chr5 60879945 60880511 -91656748 + RMER20B LTR ERVK 1 627 0 5 1049 713 278 52 38 chr5 60897025 60897313 -91639946 - RLTR40 LTR ERVK -525 292 1 5 1049 590 209 16 3 chr5 60906728 60906859 -91630400 + RMER19B LTR ERVK 3 141 -596 6 1049 1510 165 77 0 chr5 60915257 60915542 -91621717 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 14 6 1049 4675 114 13 22 chr5 60915550 60916445 -91620814 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7581 6743 6 1049 3262 108 0 2 chr5 60916435 60916890 -91620369 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 6 1049 3084 88 22 38 chr5 60916881 60917328 -91619931 - IAPEY3-int LTR ERVK -1939 5642 5203 6 1049 798 96 35 49 chr5 60917583 60917726 -91619533 - IAPEY3-int LTR ERVK -2911 4670 4530 6 1049 440 179 18 36 chr5 60917752 60917862 -91619397 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 6 1049 1952 139 117 3 chr5 60917867 60918451 -91618808 - IAPEY3-int LTR ERVK -3135 4271 3567 6 1049 595 210 0 8 chr5 60918477 60918597 -91618662 - IAPEY3-int LTR ERVK -4653 2753 2635 6 1049 298 267 0 55 chr5 60918609 60918700 -91618559 - IAPEY3-int LTR ERVK -4867 2539 2454 6 1049 302 310 88 0 chr5 60918713 60918826 -91618433 - RMER16-int LTR ERVK -5077 1060 938 6 1049 1433 209 112 47 chr5 60918811 60919327 -91617932 - RMER16-int LTR ERVK -4783 623 237 6 1049 9402 144 20 15 chr5 60919419 60921010 -91616249 - IAPEY3-int LTR ERVK -6081 1599 1 6 1049 1483 186 78 0 chr5 60921010 60921306 -91615953 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 14 6 1049 11926 85 30 52 chr5 60925921 60927770 -91609489 - RLTR22_Mus LTR ERVK 0 1808 1 6 1049 261 182 0 0 chr5 60930816 60930860 -91606399 - MTC LTR MaLR -295 126 83 6 1049 2208 204 36 118 chr5 60932757 60933472 -91603787 + RMER6C LTR ERVK 26 682 -8 6 1050 2847 196 52 36 chr5 60953827 60954638 -91582621 - RMER6C LTR ERVK 0 720 1 6 1050 2036 171 26 148 chr5 60968295 60968802 -91568457 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 6 1050 640 261 63 47 chr5 60973042 60973360 -91563899 + RLTR15 LTR ERVK 1 323 -36 6 1050 272 271 31 184 chr5 60973516 60973679 -91563580 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 237 6 1050 687 243 297 62 chr5 60976889 60977281 -91559978 + RLTR11A LTR ERVK 1 500 -28 6 1050 3692 206 116 26 chr5 60985637 60986524 -91550735 + RLTR25A LTR ERVK 1 967 -136 6 1050 429 238 19 28 chr5 60986542 60986650 -91550609 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 324 6 1050 833 182 19 7 chr5 60987087 60987242 -91550017 + RLTR25B LTR ERVK 872 1028 0 6 1050 2274 205 69 12 chr5 60996273 60996782 -91540477 + RLTR20A LTR ERVK 4 541 0 7 1050 418 199 38 54 chr5 61005148 61005334 -91531925 + RMER17C LTR ERVK 91 273 -137 1 1050 927 301 47 20 chr5 61009007 61009350 -91527909 - MER70A LTR ERVL -16 456 105 1 1050 1479 196 174 15 chr5 61014612 61015104 -91522155 - RMER4B LTR ERVK 0 585 16 2 1050 3028 50 26 5 chr5 61031460 61031846 -91505413 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 4 1050 8303 53 38 2 chr5 61031846 61032906 -91504353 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1050 3127 63 2 5 chr5 61032906 61033302 -91503957 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1050 1489 122 72 215 chr5 61033463 61034017 -91503242 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1050 235 403 49 40 chr5 61039390 61039615 -91497644 - MER31A LTR ERV1 -101 384 158 5 1050 406 305 91 118 chr5 61042224 61042749 -91494510 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 511 -16 6 1050 437 293 78 50 chr5 61060307 61060526 -91476733 + RMER15 LTR ERVL 351 575 0 7 1050 3421 30 0 0 chr5 61071864 61072260 -91464999 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1050 9481 21 2 0 chr5 61072260 61073356 -91463903 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 8 1050 3411 33 0 0 chr5 61073356 61073752 -91463507 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1050 543 330 19 162 chr5 61073870 61074235 -91463024 - MTE2a LTR MaLR -48 331 19 8 1050 518 349 53 45 chr5 61074648 61074912 -91462347 - MER70A LTR ERVL -3 469 204 9 1050 717 232 13 72 chr5 61075048 61075285 -91461974 - RLTR31_Mur LTR ERVK -330 223 1 9 1050 2188 220 70 56 chr5 61075524 61076135 -91461124 - RMER6C LTR ERVK -70 620 1 9 1050 2298 198 30 46 chr5 61076135 61076678 -91460581 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 2662 9 1051 2294 272 85 48 chr5 61083289 61084078 -91453181 + RMER15-int LTR ERVL 4156 4973 -26 1 1051 2006 258 97 6 chr5 61084078 61084358 -91452901 + RMER15 LTR ERVL 1 285 -290 1 1051 2006 258 97 6 chr5 61085296 61085542 -91451717 + RMER15 LTR ERVL 286 573 -2 1 1051 252 290 0 28 chr5 61086440 61086511 -91450748 - RMER15 LTR ERVL -291 284 216 1 1051 865 311 81 32 chr5 61090410 61090756 -91446503 - MTD LTR MaLR -52 367 5 1 1051 3175 147 54 64 chr5 61090880 61091525 -91445734 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 4 1 1051 1095 302 159 74 chr5 61091880 61092484 -91444775 - MTC-int LTR MaLR -215 1043 382 1 1051 1095 302 159 74 chr5 61092635 61092695 -91444564 - MTC-int LTR MaLR -877 381 322 1 1051 645 312 176 26 chr5 61092976 61093327 -91443932 - MTD LTR MaLR -15 404 1 1 1051 3347 137 54 68 chr5 61094668 61095318 -91441941 - RLTR26 LTR ERVK -1 641 1 1 1051 1036 178 21 29 chr5 61096192 61096506 -91440753 + RMER17C LTR ERVK 1 408 -2 1 1051 1197 207 69 4 chr5 61096953 61097215 -91440044 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 116 1 1051 376 373 14 50 chr5 61097237 61097457 -91439802 + MLT1B LTR MaLR 177 388 -2 1 1051 1058 255 108 12 chr5 61101020 61101353 -91435906 + ORR1B2 LTR MaLR 1 365 -2 1 1051 443 316 10 123 chr5 61103057 61103252 -91434007 + RLTR18B LTR ERVK 1 173 -443 1 1051 484 314 106 48 chr5 61103401 61103704 -91433555 + RLTR18B LTR ERVK 132 558 -58 1 1051 539 292 48 36 chr5 61103682 61103931 -91433328 - RLTR15 LTR ERVK -4 355 104 1 1051 1419 189 23 13 chr5 61103941 61104242 -91433017 - RMER19C LTR ERVK -2 609 306 1 1051 2878 57 48 3 chr5 61107612 61107983 -91429276 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 1051 270 302 144 102 chr5 61110567 61110786 -91426473 + MLT1B LTR MaLR 14 260 -130 1 1051 270 302 144 102 chr5 61110914 61111055 -91426204 + MLT1B LTR MaLR 261 389 -1 1 1051 578 201 48 7 chr5 61111535 61111674 -91425585 - ORR1D1 LTR MaLR -220 164 13 1 1051 2130 135 0 58 chr5 61118132 61118479 -91418780 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1051 529 330 25 5 chr5 61133824 61134022 -91403237 - MTD LTR MaLR -208 211 10 1 1051 1982 132 21 59 chr5 61134552 61134891 -91402368 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1051 508 317 87 29 chr5 61136331 61136539 -91400720 - MTD LTR MaLR -181 238 19 1 1051 3435 47 28 9 chr5 61143375 61143803 -91393456 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1051 891 320 92 6 chr5 61144037 61144383 -91392876 + MTD LTR MaLR 44 419 0 1 1051 2188 118 15 6 chr5 61145717 61146051 -91391208 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 1051 6594 38 3 17 chr5 61146053 61146915 -91390344 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5630 1 1051 21443 67 37 5 chr5 61146901 61149875 -91387384 - IAPEz-int LTR ERVK -3405 3076 8 1 1051 2147 118 18 6 chr5 61149875 61150208 -91387051 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 1051 1292 252 66 9 chr5 61150251 61150583 -91386676 + MTD LTR MaLR 1 351 -68 1 1051 3065 74 5 19 chr5 61160305 61160732 -91376527 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 1051 3537 20 0 0 chr5 61165090 61165486 -91371773 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1051 2972 32 0 0 chr5 61170012 61170358 -91366901 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1051 13016 55 16 18 chr5 61170358 61171126 -91366133 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1028 2 1051 2998 63 25 112 chr5 61171126 61171646 -91365613 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1051 13016 55 16 18 chr5 61171646 61172673 -91364586 - ORR1A0-int LTR MaLR -765 1027 1 2 1051 2912 35 3 0 chr5 61172673 61173018 -91364241 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1051 2183 127 141 37 chr5 61188181 61188663 -91348596 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 2 1051 623 356 13 56 chr5 61191369 61191675 -91345584 + ORR1E LTR MaLR 67 359 0 2 1051 3001 6 5 88 chr5 61194877 61195277 -91341982 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1051 29016 17 1 1 chr5 61195277 61198551 -91338708 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 2 1051 8511 78 53 23 chr5 61198550 61199877 -91337382 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 3 2 1051 3001 6 5 88 chr5 61199879 61200279 -91336980 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1051 838 281 87 61 chr5 61201916 61202229 -91335030 + ORR1E LTR MaLR 1 321 -38 2 1051 838 281 87 61 chr5 61202423 61202454 -91334805 + ORR1E LTR MaLR 322 354 -5 2 1051 324 229 0 28 chr5 61202461 61202533 -91334726 - MTE2b LTR MaLR -309 70 1 2 1051 1066 161 114 18 chr5 61202571 61202780 -91334479 - RMER6C LTR ERVK 0 690 460 2 1051 2140 214 28 87 chr5 61202780 61203321 -91333938 + MT2B LTR ERVL 3 511 -90 2 1051 1775 247 35 29 chr5 61203323 61203807 -91333452 + RLTR19C LTR ERVK 20 506 0 2 1051 359 226 86 0 chr5 61203807 61203900 -91333359 + MT2B LTR ERVL 501 601 0 2 1051 1070 228 17 65 chr5 61203901 61204303 -91332956 - RMER6C LTR ERVK -228 462 3 2 1051 229 356 72 40 chr5 61204364 61204516 -91332743 + MLT1A LTR MaLR 206 362 -12 2 1051 530 356 117 35 chr5 61205568 61205885 -91331374 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 23 2 1051 259 348 35 21 chr5 61209146 61209287 -91327972 - MLT1A LTR MaLR -11 363 212 2 1052 2251 117 2 94 chr5 61210686 61211081 -91326178 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 2 1052 233 222 56 0 chr5 61216443 61216497 -91320762 - MTE2a LTR MaLR -322 57 1 2 1052 969 331 41 15 chr5 61217525 61217868 -91319391 + MTE2b LTR MaLR 23 374 -5 2 1052 1233 207 21 50 chr5 61220920 61221072 -91316187 + RMER12 LTR ERVK 1 152 -1170 2 1052 1765 174 87 163 chr5 61221072 61221649 -91315610 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 2 1052 1233 207 21 50 chr5 61221649 61221776 -91315483 + RMER12 LTR ERVK 153 272 -1050 2 1052 917 189 173 44 chr5 61221771 61221917 -91315342 + RMER12 LTR ERVK 601 770 -552 2 1052 917 189 173 44 chr5 61221983 61222085 -91315174 + RMER12 LTR ERVK 771 880 -442 2 1052 2475 186 84 29 chr5 61222265 61222989 -91314270 + RLTR25A LTR ERVK 13 885 -218 2 1052 617 242 93 73 chr5 61223976 61224094 -91313165 + RLTR25A LTR ERVK 832 941 -162 2 1052 617 242 93 73 chr5 61224232 61224372 -91312887 + RLTR25A LTR ERVK 942 1095 -8 2 1052 761 262 30 15 chr5 61224370 61224568 -91312691 + RMER12 LTR ERVK 901 1101 -221 2 1052 2204 193 128 6 chr5 61225802 61225869 -91311390 - RMER6C LTR ERVK 0 690 622 2 1052 2204 195 126 5 chr5 61226176 61226690 -91310569 - RMER6C LTR ERVK -69 621 1 2 1052 679 316 146 3 chr5 61228206 61228508 -91308751 + MTD LTR MaLR 22 366 -53 3 1052 2807 52 3 0 chr5 61233660 61234005 -91303254 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1052 2749 34 0 44 chr5 61239997 61240339 -91296920 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 3 1052 3632 98 126 34 chr5 61241317 61241712 -91295547 - RMER17A LTR ERVK -14 737 310 3 1052 3632 98 126 34 chr5 61241898 61242177 -91295082 - RMER17A LTR ERVK -442 309 2 3 1052 445 350 32 46 chr5 61243851 61244067 -91293192 + MTEa LTR MaLR 121 333 -46 3 1052 408 307 57 16 chr5 61244229 61244421 -91292838 + MER67C LTR ERV1 511 710 -1 3 1052 4301 22 0 12 chr5 61246275 61246774 -91290485 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1052 2414 211 33 39 chr5 61255776 61256128 -91281131 + RMER6D LTR ERVK 1 365 -355 3 1052 2414 211 33 39 chr5 61256179 61256366 -91280893 + RMER6D LTR ERVK 366 537 -183 3 1052 2114 212 37 55 chr5 61256366 61256782 -91280477 + RLTR16 LTR ERVK 2 401 -104 3 1052 2114 258 66 20 chr5 61256973 61257226 -91280033 + RLTR16 LTR ERVK 402 703 -17 3 1052 227 174 65 0 chr5 61261409 61261455 -91275804 - MER67D LTR ERV1 -153 361 313 3 1052 238 322 101 87 chr5 61263527 61263745 -91273514 + RMER5 LTR ERV1 238 458 -76 3 1052 505 331 34 58 chr5 61263767 61264098 -91273161 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 3 1052 547 235 138 48 chr5 61268334 61268522 -91268737 + RMER6D LTR ERVK 516 720 0 3 1052 4315 178 57 13 chr5 61273528 61274392 -91262867 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 3 1052 558 375 57 42 chr5 61276369 61276723 -91260536 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 3 1052 1288 235 62 3 chr5 61277156 61277446 -91259813 + MTC LTR MaLR 115 421 0 3 1052 460 352 6 22 chr5 61283511 61283694 -91253565 + MTE-int LTR MaLR 4 183 -1397 3 1052 249 295 13 0 chr5 61285332 61285410 -91251849 + ORR1D2 LTR MaLR 272 350 -20 4 1052 556 238 58 18 chr5 61303205 61303376 -91233883 - MT2A LTR ERVL 0 533 356 4 1052 339 192 95 103 chr5 61303679 61303795 -91233464 - MT2A LTR ERVL -337 264 150 4 1052 241 300 33 22 chr5 61307014 61307106 -91230153 - MLT1A1 LTR MaLR -310 98 6 4 1052 1110 234 179 9 chr5 61314479 61314815 -91222444 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 4 1052 663 290 64 18 chr5 61330603 61330867 -91206392 - ORR1D1 LTR MaLR -63 296 1 4 1052 959 304 45 39 chr5 61332181 61332516 -91204743 - MTE2b LTR MaLR -40 339 3 4 1052 1405 204 55 136 chr5 61332783 61333139 -91204120 - RLTR23 LTR ERV1 -3 427 97 4 1052 1405 204 55 136 chr5 61333166 61333264 -91203995 - RLTR23 LTR ERV1 -334 96 10 4 1052 285 336 9 18 chr5 61334410 61334519 -91202740 - MTEb LTR MaLR -13 366 259 4 1052 2809 284 78 62 chr5 61335160 61336105 -91201154 + MTD-int LTR MaLR 31 1010 -248 4 1052 2809 284 78 62 chr5 61336144 61336396 -91200863 + MTD-int LTR MaLR 1011 1246 -12 4 1052 858 276 72 79 chr5 61336405 61336588 -91200671 + MTD LTR MaLR 1 194 -225 4 1052 858 276 72 79 chr5 61337344 61337478 -91199781 + MTD LTR MaLR 195 316 -103 4 1052 744 235 23 51 chr5 61341299 61341682 -91195577 + RMER3D-int LTR ERVK 163 854 -1988 4 1053 712 322 85 23 chr5 61342516 61342869 -91194390 + RMER15 LTR ERVL 37 411 -164 4 1053 228 333 48 0 chr5 61344559 61344643 -91192616 - RLTR25B LTR ERVK -940 88 1 4 1053 490 310 45 0 chr5 61344644 61344799 -91192460 + RMER15 LTR ERVL 411 572 -3 4 1053 2309 228 142 26 chr5 61348596 61349372 -91187887 - ORR1A3-int LTR MaLR -786 1177 312 4 1053 1560 126 27 8 chr5 61355564 61355821 -91181438 - ORR1A3-int LTR MaLR -1607 356 95 4 1053 817 325 81 6 chr5 61367352 61367696 -91169563 + MTE2b LTR MaLR 1 370 -9 4 1053 3056 79 83 2 chr5 61369895 61370341 -91166918 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1053 2717 31 0 3 chr5 61378986 61379309 -91157950 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 1053 4737 149 22 62 chr5 61380343 61381282 -91155977 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 5 1053 5387 109 29 46 chr5 61385907 61386826 -91150433 + RMER17A2 LTR ERVK 3 906 0 5 1053 749 224 7 0 chr5 61389600 61389752 -91147507 + RMER6D LTR ERVK 2 154 -566 5 1053 1537 221 32 51 chr5 61390464 61390874 -91146385 + RMER6D LTR ERVK 166 567 -153 5 1053 230 167 46 77 chr5 61418276 61418341 -91118918 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 5 1053 1164 129 6 0 chr5 61425333 61425511 -91111748 - ORR1A2 LTR MaLR -51 276 98 5 1053 3843 170 22 36 chr5 61429825 61430595 -91106664 + RMER12 LTR ERVK 5 763 -559 5 1053 571 249 123 64 chr5 61430582 61430801 -91106458 + RMER12 LTR ERVK 958 1189 -133 5 1053 1952 124 103 19 chr5 61440721 61441098 -91096161 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 1053 1293 287 51 8 chr5 61442174 61442525 -91094734 + MTD LTR MaLR 12 377 -42 5 1053 6234 70 6 22 chr5 61453387 61454222 -91083037 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 5 1053 774 272 166 40 chr5 61456775 61457154 -91080105 - RMER13A LTR ERVK -420 440 14 5 1053 2141 174 154 62 chr5 61458736 61459366 -91077893 + RMER6C LTR ERVK 1 688 -2 5 1053 2149 201 133 84 chr5 61461499 61462070 -91075189 - RMER19C LTR ERVK -12 599 1 5 1053 507 365 85 7 chr5 61464442 61464737 -91072522 - MTE2a LTR MaLR -57 322 4 6 1053 573 281 26 40 chr5 61465179 61465331 -91071928 + MTE2b LTR MaLR 218 367 -12 6 1053 1019 320 67 65 chr5 61465341 61465860 -91071399 - MT2A LTR ERVL -2 531 12 6 1053 226 283 19 0 chr5 61469385 61469438 -91067821 - MTE2b LTR MaLR -8 371 318 6 1053 452 331 55 11 chr5 61470124 61470307 -91066952 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 180 6 1054 308 360 29 87 chr5 61474071 61474278 -91062981 - ORR1D2 LTR MaLR -201 195 1 6 1054 264 322 18 86 chr5 61474303 61474466 -91062793 - MER92B LTR ERV1 -56 580 429 6 1054 2194 249 169 27 chr5 61476798 61477586 -91059673 - RMER19B LTR ERVK 0 902 3 6 1054 846 297 112 16 chr5 61489892 61490213 -91047046 + ORR1D2 LTR MaLR 5 356 -14 6 1054 475 324 104 16 chr5 61490852 61491034 -91046225 + MER70B LTR ERVL 279 476 -102 6 1054 1209 112 21 31 chr5 61492204 61492398 -91044861 - LTRIS2 LTR ERV1 -304 260 69 6 1054 2537 60 18 0 chr5 61493799 61494135 -91043124 + LTRIS2 LTR ERV1 223 564 0 6 1054 1532 89 106 0 chr5 61494675 61494912 -91042347 - MTB LTR MaLR 0 400 139 6 1054 3670 149 15 0 chr5 61501773 61502365 -91034894 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 4 1054 482 176 71 0 chr5 61505697 61505782 -91031477 + RMER2 LTR ERV1 25 115 -452 8 1054 4543 124 75 54 chr5 61508358 61509242 -91028017 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 1 1054 893 241 29 48 chr5 61509600 61509975 -91027284 - RMER2 LTR ERV1 -139 428 1 1 1054 1426 284 56 93 chr5 61513518 61514181 -91023078 + RLTR26 LTR ERVK 5 642 0 2 1054 288 341 70 77 chr5 61530189 61530488 -91006771 + MER67D LTR ERV1 124 420 -94 4 1054 489 231 28 0 chr5 61544620 61544728 -90992531 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 264 6 1054 1472 226 35 35 chr5 61544729 61545101 -90992158 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 6 1054 329 296 227 14 chr5 61545366 61545582 -90991677 + MER67C LTR ERV1 58 319 -392 6 1054 2173 167 23 144 chr5 61569436 61570045 -90967214 + RMER6C LTR ERVK 156 690 0 1 1054 340 85 17 0 chr5 61571141 61571200 -90966059 + RLTR11B LTR ERVK 229 288 -165 1 1054 1776 211 71 33 chr5 61575951 61576398 -90960861 - RLTR9D LTR ERVK 0 420 1 1 1054 345 373 58 51 chr5 61578682 61578939 -90958320 - LTR89 LTR ERVL? -37 842 584 1 1055 266 358 9 18 chr5 61612955 61613066 -90924193 + RMER12 LTR ERVK 742 851 -471 1 1055 922 248 152 41 chr5 61619152 61619539 -90917720 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 1 1055 2730 70 63 16 chr5 61621564 61621944 -90915315 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 1 1055 1377 203 43 182 chr5 61634308 61634932 -90902327 - RMER6A LTR ERVK 0 690 115 1 1055 1032 213 102 0 chr5 61640834 61641078 -90896181 - ORR1C1 LTR MaLR -64 314 46 1 1055 3452 20 2 0 chr5 61641931 61642326 -90894933 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1055 9443 21 1 3 chr5 61642326 61643426 -90893833 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1055 3362 33 2 0 chr5 61643426 61643821 -90893438 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1055 386 319 123 94 chr5 61644215 61644492 -90892767 - MTD LTR MaLR -128 291 7 1 1055 403 232 183 9 chr5 61647418 61647631 -90889628 + MTC-int LTR MaLR 1007 1256 -2 2 1055 398 295 118 21 chr5 61647845 61648032 -90889227 + MTC LTR MaLR 203 407 -14 2 1055 320 375 61 30 chr5 61652468 61652666 -90884593 + MLT2F LTR ERVL 239 442 -221 2 1055 2539 203 34 19 chr5 61653609 61653692 -90883567 - RLTR20A LTR ERVK -10 531 441 2 1055 2539 203 34 19 chr5 61653802 61654241 -90883018 - RLTR20A LTR ERVK -101 440 2 2 1055 763 346 52 52 chr5 61654263 61654629 -90882630 - MTE2b LTR MaLR -13 366 1 2 1055 3007 48 0 3 chr5 61658461 61658819 -90878440 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 2 1055 1300 216 25 25 chr5 61673042 61673317 -90863942 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1298 2 1055 6286 162 14 13 chr5 61673474 61674562 -90862697 - RLTR21 LTR ERVK -479 1093 5 2 1055 747 321 81 58 chr5 61681476 61682092 -90855167 - MLT1-int LTR MaLR -741 630 1 2 1055 4440 167 126 38 chr5 61692637 61693649 -90843610 - RLTR25A LTR ERVK -2 1101 1 2 1055 564 318 95 39 chr5 61696415 61696700 -90840559 + RMER5 LTR ERV1 234 534 0 2 1055 755 200 75 16 chr5 61710036 61710241 -90827018 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 1033 828 2 1055 506 101 11 11 chr5 61710833 61710923 -90826336 - MT-int LTR MaLR -118 980 891 2 1055 2991 143 41 32 chr5 61710920 61711533 -90825726 - RLTR13C1 LTR ERVK -237 877 1 2 1055 997 278 20 97 chr5 61712613 61713016 -90824243 - RLTR20B3 LTR ERVK -185 392 21 2 1055 819 229 64 37 chr5 61715336 61715554 -90821705 + MTD LTR MaLR 196 419 0 2 1055 3480 18 2 0 chr5 61718141 61718536 -90818723 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1055 231 344 99 0 chr5 61720282 61720433 -90816826 + MLT1B LTR MaLR 212 377 -13 2 1055 2561 23 2 274 chr5 61722742 61723278 -90813981 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 1055 8623 15 10 1 chr5 61723280 61724266 -90812993 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 2 1055 7896 26 0 0 chr5 61724360 61725273 -90811986 - RLTR10-int LTR ERVK -1034 953 41 2 1055 2521 23 4 275 chr5 61725283 61725818 -90811441 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 1055 2694 188 91 101 chr5 61730606 61731498 -90805761 - RLTR13D6 LTR ERVK -19 883 1 3 1055 2902 66 200 9 chr5 61731850 61732280 -90804979 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 3 1056 4081 229 24 31 chr5 61737520 61738434 -90798825 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 3 1056 227 346 29 10 chr5 61740042 61740144 -90797115 + LTR83 LTR ERVL 223 326 -454 3 1056 710 211 77 16 chr5 61743202 61743385 -90793874 + RMER6D LTR ERVK 1 194 -526 3 1056 2227 226 46 23 chr5 61745645 61746165 -90791094 + RMER6D LTR ERVK 189 720 0 3 1056 1885 191 14 72 chr5 61747786 61748204 -90789055 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1056 781 331 29 13 chr5 61757309 61757621 -90779638 - MER67D LTR ERV1 -197 317 1 3 1056 371 389 84 84 chr5 61759745 61760000 -90777259 - MTE-int LTR MaLR -45 1535 1285 3 1056 371 389 84 84 chr5 61760213 61760723 -90776536 - MTE-int LTR MaLR -296 1284 770 3 1056 1615 178 11 28 chr5 61761604 61761919 -90775340 + RLTR10E LTR ERVK 1 358 -9 3 1056 340 339 109 23 chr5 61763275 61763577 -90773682 - MER57C2 LTR ERV1 0 411 76 3 1056 1132 232 46 8 chr5 61768304 61768565 -90768694 + RMER12 LTR ERVK 1 271 -1051 3 1056 236 78 6 0 chr5 61768565 61768606 -90768653 - RMER19B LTR ERVK 0 902 872 3 1056 860 241 191 24 chr5 61768709 61769002 -90768257 + RMER12 LTR ERVK 835 1176 -146 3 1056 2101 82 56 70 chr5 61786194 61786549 -90750710 - MTB_Mm LTR MaLR -55 352 3 3 1056 3233 146 81 37 chr5 61792447 61793152 -90744107 - RMER17A LTR ERVK -15 736 1 3 1056 1371 251 52 47 chr5 61794686 61795006 -90742253 - RMER6D LTR ERVK 0 720 397 3 1056 1371 251 52 47 chr5 61795170 61795296 -90741963 - RMER6D LTR ERVK -324 396 272 3 1056 225 371 23 68 chr5 61801679 61801812 -90735447 - MLT1B LTR MaLR -32 358 232 4 1056 1830 238 43 45 chr5 61804477 61804643 -90732616 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 319 4 1056 1830 238 43 45 chr5 61804717 61805042 -90732217 - RLTR19 LTR ERVK -181 318 11 4 1056 619 110 162 20 chr5 61805271 61805438 -90731821 + RMER6C LTR ERVK 110 333 -357 4 1056 1724 156 145 86 chr5 61816210 61816630 -90720629 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 2 4 1056 687 282 153 8 chr5 61822618 61822879 -90714380 + MTD LTR MaLR 105 403 -16 4 1056 331 226 97 0 chr5 61831138 61831231 -90706028 - ORR1C1-int LTR MaLR -1032 477 376 4 1056 393 198 22 11 chr5 61833072 61833164 -90704095 - ORR1C1-int LTR MaLR -1410 99 7 4 1056 1356 226 118 0 chr5 61833171 61833503 -90703756 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 8 4 1056 1364 216 118 8 chr5 61839759 61840114 -90697145 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1056 531 269 208 40 chr5 61846397 61846710 -90690549 - MER57D LTR ERV1 -44 390 1 4 1057 2925 185 56 99 chr5 61866598 61866966 -90670293 - RMER6D LTR ERVK -4 716 362 5 1057 2925 185 56 99 chr5 61867503 61867882 -90669377 - RMER6D LTR ERVK -359 361 1 5 1057 1527 163 7 47 chr5 61871965 61872261 -90664998 + RMER6C LTR ERVK 407 690 0 5 1057 1170 175 202 0 chr5 61872936 61873188 -90664071 + RMER6C LTR ERVK 4 306 -384 5 1057 546 302 46 15 chr5 61873970 61874165 -90663094 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 230 5 1057 518 237 8 25 chr5 61874343 61874464 -90662795 - RLTR23 LTR ERV1 -302 128 10 5 1057 598 358 62 54 chr5 61875547 61875937 -90661322 + LTR33A LTR ERVL 106 498 -22 5 1057 454 333 54 24 chr5 61898613 61898934 -90638325 + ORR1E LTR MaLR 19 359 0 5 1057 245 333 25 83 chr5 61898893 61899014 -90638245 - MER76 LTR ERVL 0 691 578 5 1057 2120 116 42 0 chr5 61902820 61903130 -90634129 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 3 5 1057 6258 143 40 7 chr5 61903132 61904165 -90633094 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 897 5 1057 466 219 55 47 chr5 61909393 61909553 -90627706 - MTD LTR MaLR -24 395 251 5 1057 740 338 30 48 chr5 61914830 61915147 -90622112 + MTE2a LTR MaLR 63 419 -2 5 1057 664 249 167 54 chr5 61915368 61915697 -90621562 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 5 1057 1503 304 7 58 chr5 61941667 61942019 -90595240 - MTD LTR MaLR -8 411 73 6 1057 1503 304 7 58 chr5 61942736 61942816 -90594443 - MTD LTR MaLR -347 72 1 6 1057 1706 148 93 89 chr5 61943116 61943589 -90593670 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1057 1435 96 5 14 chr5 61952239 61952450 -90584809 + RLTR13B1 LTR ERVK 685 893 0 6 1057 1280 207 129 182 chr5 61954372 61954489 -90582770 - RMER6C LTR ERVK -102 588 478 6 1057 1280 207 129 182 chr5 61954649 61954663 -90582596 - RMER6C LTR ERVK -213 477 477 6 1057 1280 207 129 182 chr5 61954822 61955305 -90581954 - RMER6C LTR ERVK -213 477 1 6 1057 696 294 43 0 chr5 61955305 61955488 -90581771 + MTD LTR MaLR 41 231 -188 6 1057 308 262 78 0 chr5 61955944 61956047 -90581212 + RMER12 LTR ERVK 726 836 -486 6 1057 1807 120 11 105 chr5 61966778 61967140 -90570119 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 6 1057 403 241 200 17 chr5 61979127 61979280 -90557979 + MTD LTR MaLR 196 367 -54 6 1057 2367 114 103 42 chr5 61987935 61988383 -90548876 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1058 282 167 0 0 chr5 62000345 62000393 -90536866 + RMER6C LTR ERVK 643 690 0 2 1058 1078 237 80 53 chr5 62001199 62001821 -90535438 - RMER6C LTR ERVK -12 678 129 3 1058 3691 198 90 15 chr5 62003964 62004809 -90532450 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 6 1058 1497 280 18 21 chr5 62007043 62007423 -90529836 + MTC LTR MaLR 36 414 -7 8 1058 619 347 126 17 chr5 62008032 62008381 -90528878 - MTD LTR MaLR 0 419 33 1 1058 593 287 61 10 chr5 62011677 62011874 -90525385 + RLTR40 LTR ERVK 607 813 -4 1 1058 4457 139 50 26 chr5 62022206 62023006 -90514253 - RLTR13D6 LTR ERVK -83 819 1 3 1058 1596 145 8 0 chr5 62023021 62023269 -90513990 - ETnERV3-int LTR ERVK -30 5778 5529 3 1058 2528 86 10 28 chr5 62023283 62023676 -90513583 - RLTR45-int LTR ERVK -1173 6071 5686 3 1058 588 240 96 46 chr5 62023928 62024141 -90513118 + LTRIS4 LTR ERV1 285 587 0 3 1058 2146 133 53 11 chr5 62024143 62024499 -90512760 - ETnERV3-int LTR ERVK -905 4903 4533 3 1058 578 323 77 86 chr5 62033087 62033540 -90503719 - RLTR26 LTR ERVK -75 552 14 4 1058 2334 216 15 66 chr5 62038613 62039013 -90498246 + RMER6C LTR ERVK 1 377 -313 5 1058 2334 216 15 66 chr5 62039086 62039411 -90497848 + RMER6C LTR ERVK 378 689 -1 5 1058 1661 232 34 3 chr5 62051468 62051848 -90485411 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 8 1058 1495 208 49 87 chr5 62052680 62053048 -90484211 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 8 1058 3137 57 8 0 chr5 62054254 62054642 -90482617 - IAPEY3-int LTR ERVK -2438 5242 4852 8 1058 7939 119 64 19 chr5 62054635 62056856 -90480403 - IAPEY3-int LTR ERVK -4991 2689 22 8 1058 2428 56 6 6 chr5 62056856 62057180 -90480079 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 34 8 1058 4690 171 30 22 chr5 62068003 62068191 -90469068 - RMER6-int LTR ERVK -1724 1453 1270 1 1058 1948 210 185 7 chr5 62068191 62068487 -90468772 + RMER6C LTR ERVK 2 386 -304 1 1058 1948 210 185 7 chr5 62068566 62068854 -90468405 + RMER6C LTR ERVK 387 690 0 1 1058 4690 171 30 22 chr5 62068854 62069617 -90467642 - RMER6-int LTR ERVK -1908 1269 494 1 1058 509 333 19 24 chr5 62091455 62091661 -90445598 + RMER15 LTR ERVL 273 477 -98 1 1058 4276 19 0 0 chr5 62095781 62096263 -90440996 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 1 1058 1537 249 14 0 chr5 62097346 62097695 -90439564 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 155 1 1058 292 363 29 23 chr5 62100260 62100435 -90436824 - MLT2D LTR ERVL -216 198 23 1 1058 1283 205 76 49 chr5 62101606 62102121 -90435138 - RMER6C LTR ERVK 0 690 2 1 1058 3120 188 72 96 chr5 62106584 62107273 -90429986 + RLTR42-int LTR ERVK 1154 1816 -3706 1 1058 3120 188 72 96 chr5 62107447 62107686 -90429573 + RLTR42-int LTR ERVK 1817 2060 -3462 1 1058 5182 189 61 17 chr5 62108730 62109906 -90427353 + RLTR42-int LTR ERVK 2707 3934 -1588 1 1058 3576 229 83 43 chr5 62109975 62111033 -90426226 + RLTR42-int LTR ERVK 4374 5473 -49 1 1058 861 272 30 35 chr5 62111055 62111287 -90425972 + RLTR42 LTR ERVK 9 239 0 1 1058 667 339 40 14 chr5 62116400 62116696 -90420563 + RMER15 LTR ERVL 272 575 0 1 1058 8219 189 51 25 chr5 62119593 62121377 -90415882 - ORR1A3-int LTR MaLR -132 1831 1 1 1058 1510 196 28 46 chr5 62121382 62121709 -90415550 - ORR1A3 LTR MaLR -5 321 1 1 1058 293 377 91 16 chr5 62123198 62123384 -90413875 + MTE-int LTR MaLR 85 284 -1296 1 1058 643 391 72 72 chr5 62123794 62124767 -90412492 + MTE-int LTR MaLR 328 1300 -280 1 1058 655 333 67 46 chr5 62125474 62125779 -90411480 - ORR1E LTR MaLR -2 357 51 1 1058 655 333 67 46 chr5 62125802 62125842 -90411417 - ORR1E LTR MaLR -309 50 5 1 1058 1579 313 35 46 chr5 62125825 62126569 -90410690 - ORR1E-int LTR MaLR -32 1548 742 1 1058 629 205 23 8 chr5 62126490 62126618 -90410641 - RLTR22_Mur LTR ERVK -147 1701 1572 1 1059 2396 189 76 21 chr5 62132789 62133302 -90403957 + RLTR20A LTR ERVK 1 541 0 1 1059 453 314 20 20 chr5 62141634 62141832 -90395427 + RLTR42-int LTR ERVK 1203 1400 -4122 2 1059 238 273 0 0 chr5 62144137 62144192 -90393067 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 330 2 1059 1150 233 55 20 chr5 62144299 62144553 -90392706 - RMER20B LTR ERVK -31 596 334 2 1059 1406 221 14 0 chr5 62146152 62146428 -90390831 - RMER20B LTR ERVK -284 343 64 2 1059 956 223 108 9 chr5 62146586 62146808 -90390451 - ORR1C2 LTR MaLR -66 318 75 2 1059 281 235 29 14 chr5 62146864 62146933 -90390326 - ORR1C2 LTR MaLR -314 70 1 2 1059 1805 226 51 2 chr5 62157086 62157146 -90380113 + MTC LTR MaLR 1 61 -360 2 1059 1805 226 51 2 chr5 62157188 62157521 -90379738 + MTC LTR MaLR 62 412 -9 2 1059 406 248 0 87 chr5 62162930 62163045 -90374214 + MT2B LTR ERVL 150 254 -347 2 1059 5345 34 0 0 chr5 62167226 62167851 -90369408 - RLTR10-int LTR ERVK -373 1614 990 2 1059 359 271 31 8 chr5 62167933 62168063 -90369196 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 2 1059 5645 50 1 3 chr5 62168127 62168825 -90368434 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 302 2 1059 2301 78 119 11 chr5 62168825 62169177 -90368082 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 1059 846 226 32 29 chr5 62176932 62177166 -90360093 + MTC LTR MaLR 168 400 -21 2 1059 225 346 88 10 chr5 62177231 62177333 -90359926 - MTEb LTR MaLR -17 362 253 2 1059 317 337 119 38 chr5 62178603 62178788 -90358471 - MLT2B2 LTR ERVL -315 200 1 2 1059 1417 242 129 28 chr5 62181393 62181767 -90355492 + RLTR20B1 LTR ERVK 53 460 -103 2 1059 1417 242 129 28 chr5 62181804 62181893 -90355366 + RLTR20B1 LTR ERVK 461 562 -1 2 1059 546 291 40 20 chr5 62196267 62196467 -90340792 - MLT2D LTR ERVL -189 225 22 2 1059 1328 236 77 58 chr5 62198501 62198932 -90338327 + RMER10A LTR ERVL 4 442 0 2 1059 2936 59 0 0 chr5 62203040 62203397 -90333862 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 2 1059 1367 244 52 22 chr5 62227266 62227673 -90309586 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 3 1059 496 227 37 29 chr5 62227683 62227819 -90309440 + MTC-int LTR MaLR 13 149 -1109 3 1059 1147 257 71 0 chr5 62227868 62228179 -90309080 + ORR1C2 LTR MaLR 1 333 -51 3 1059 233 159 23 0 chr5 62228753 62228797 -90308462 + ORR1C2 LTR MaLR 332 376 -8 3 1059 2285 225 70 29 chr5 62238875 62239462 -90297797 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 1059 230 406 51 0 chr5 62240253 62240391 -90296868 + MTD LTR MaLR 21 165 -254 3 1059 885 269 61 90 chr5 62240740 62241116 -90296143 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 4 3 1059 692 302 228 14 chr5 62243978 62244394 -90292865 + MTE-int LTR MaLR 83 587 -993 3 1059 2709 57 52 0 chr5 62247047 62247416 -90289843 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 3 1059 6976 54 54 1 chr5 62247428 62248332 -90288927 + RLTR10-int LTR ERVK 41 992 -995 3 1059 500 311 43 43 chr5 62248357 62248780 -90288479 + RLTR10-int LTR ERVK 1172 1594 -5987 3 1059 5352 86 22 15 chr5 62248861 62249221 -90288038 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1364 -623 3 1059 5352 98 26 18 chr5 62249271 62249683 -90287576 + RLTR10-int LTR ERVK 1365 1733 -254 3 1059 1076 177 93 34 chr5 62249683 62249974 -90287285 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 14 385 -5 3 1059 1578 155 3 59 chr5 62250349 62250637 -90286622 - MT2C_Mm LTR ERVL -103 372 101 3 1059 255 362 88 63 chr5 62253751 62254069 -90283190 - MLT1A LTR MaLR -19 355 30 3 1059 1877 180 91 0 chr5 62258093 62258443 -90278816 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 3 1060 518 319 23 29 chr5 62259639 62259813 -90277446 + MT2A LTR ERVL 290 462 -71 3 1060 2772 23 2 209 chr5 62269115 62269604 -90267655 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 3 1060 15772 32 18 29 chr5 62269606 62271584 -90265675 + RLTR10-int LTR ERVK 1 1984 -3 3 1060 2772 23 2 209 chr5 62271586 62272075 -90265184 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 3 1060 2143 261 79 67 chr5 62279237 62280074 -90257185 + RMER13A LTR ERVK 14 860 0 4 1060 3096 61 8 0 chr5 62281934 62282327 -90254932 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1060 9027 43 5 0 chr5 62282327 62283420 -90253839 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1060 338 266 16 74 chr5 62284039 62284161 -90253098 + RMER15-int LTR ERVL 4846 4960 -39 4 1060 4226 103 28 62 chr5 62284565 62284749 -90252510 + RMER17A LTR ERVK 1 183 -568 4 1060 4226 103 28 62 chr5 62284894 62285471 -90251788 + RMER17A LTR ERVK 184 736 -15 4 1060 534 299 18 6 chr5 62286360 62286528 -90250731 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 201 4 1060 412 309 18 9 chr5 62286659 62286770 -90250489 - ORR1D2 LTR MaLR -258 112 1 4 1060 1661 264 101 36 chr5 62293334 62293979 -90243280 + RMER6C LTR ERVK 1 687 -3 4 1060 1631 245 49 16 chr5 62294618 62295004 -90242255 + MTC LTR MaLR 15 413 -8 4 1060 756 307 97 0 chr5 62296541 62296798 -90240461 - MTD LTR MaLR -97 322 41 4 1060 2515 61 99 8 chr5 62312564 62312927 -90224332 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1060 798 232 39 17 chr5 62314868 62315048 -90222211 - RLTR28B LTR ERVL -297 184 1 4 1060 555 139 19 15 chr5 62317941 62318055 -90219204 - ORR1A4 LTR MaLR -221 157 1 4 1060 246 317 79 31 chr5 62318748 62318875 -90218384 - RMER15 LTR ERVL -102 473 341 4 1060 657 268 53 10 chr5 62323744 62323951 -90213308 + RLTR45 LTR ERVK 265 480 -2 4 1060 391 328 45 6 chr5 62325005 62325183 -90212076 - MER31A LTR ERV1 -219 266 82 4 1060 2851 92 5 5 chr5 62328254 62328649 -90208610 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 4 1060 422 376 34 21 chr5 62330003 62330227 -90207032 - RMER15 LTR ERVL -70 505 279 4 1060 929 324 44 6 chr5 62355707 62356070 -90181189 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 5 1060 595 298 62 14 chr5 62356984 62357192 -90180067 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 265 5 1060 610 284 128 56 chr5 62357726 62358032 -90179227 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 45 5 1060 488 287 35 23 chr5 62358196 62358398 -90178861 + MTE-int LTR MaLR 1 122 -1248 5 1060 972 335 149 25 chr5 62359236 62359753 -90177506 + MTE-int LTR MaLR 721 1301 -279 5 1060 329 379 83 10 chr5 62362894 62363099 -90174160 - MTE-int LTR MaLR -423 1157 938 5 1060 302 287 0 44 chr5 62364956 62365047 -90172212 - MER34A1 LTR ERV1 -500 87 1 5 1060 927 257 111 28 chr5 62367364 62367585 -90169674 + ORR1C2 LTR MaLR 4 251 -133 5 1060 927 257 111 28 chr5 62367620 62367750 -90169509 + ORR1C2 LTR MaLR 252 384 0 5 1060 226 326 82 11 chr5 62386254 62386437 -90150822 - ORR1D-int LTR MaLR -162 1208 1013 5 1060 295 225 28 0 chr5 62387797 62387868 -90149391 + MTEb LTR MaLR 307 379 0 5 1060 424 316 19 37 chr5 62387987 62388148 -90149111 + MER21B LTR ERV1 583 740 -123 5 1061 1551 191 49 0 chr5 62390497 62390801 -90146458 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 8 5 1061 258 348 164 30 chr5 62391549 62391780 -90145479 + MLT2B3 LTR ERVL 6 267 -287 5 1061 3180 48 8 0 chr5 62393450 62393843 -90143416 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1061 8932 48 2 0 chr5 62393843 62394939 -90142320 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1061 3149 68 5 0 chr5 62394939 62395333 -90141926 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1061 432 345 40 40 chr5 62402303 62402581 -90134678 - MLT2B4 LTR ERVL 0 556 279 6 1061 1800 295 41 76 chr5 62410691 62411400 -90125859 - MER67C LTR ERV1 -2 709 26 6 1061 1021 259 132 6 chr5 62413216 62413290 -90123969 + ORR1D1 LTR MaLR 1 76 -298 6 1061 1021 259 132 6 chr5 62413575 62413826 -90123433 + ORR1D1 LTR MaLR 77 366 -8 6 1061 999 261 90 28 chr5 62414097 62414198 -90123061 + ORR1D1 LTR MaLR 63 163 -211 6 1061 999 261 90 28 chr5 62414220 62414406 -90122853 + ORR1D1 LTR MaLR 164 367 -7 6 1061 1311 208 11 15 chr5 62414441 62414709 -90122550 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 101 6 1061 1714 155 50 34 chr5 62415494 62415814 -90121445 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 6 1061 5071 158 25 19 chr5 62415816 62416728 -90120531 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1046 6 1061 4208 195 89 38 chr5 62417600 62418647 -90118612 - ORR1A2-int LTR MaLR -863 1100 1 6 1061 1869 143 42 7 chr5 62418647 62418956 -90118303 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 8 6 1061 229 183 46 77 chr5 62425206 62425271 -90111988 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 6 1061 339 222 12 36 chr5 62432858 62432932 -90104327 - RLTR20B2 LTR ERVK -14 563 492 6 1061 2467 163 60 21 chr5 62433550 62434046 -90103213 - RLTR20B2 LTR ERVK -42 499 1 6 1061 265 224 0 17 chr5 62435635 62435694 -90101565 + MTD LTR MaLR 1 58 -363 6 1061 458 331 42 18 chr5 62436202 62436356 -90100903 + MTD LTR MaLR 48 205 -214 6 1061 2398 232 52 33 chr5 62436356 62436970 -90100289 + RMER20B LTR ERVK 2 627 0 6 1061 618 274 39 11 chr5 62436985 62437166 -90100093 + MTD LTR MaLR 226 411 -8 6 1061 626 306 37 44 chr5 62437170 62437196 -90100063 + MTD-int LTR MaLR 1 29 -1229 6 1061 626 306 37 44 chr5 62437224 62437470 -90099789 + MTD-int LTR MaLR 30 271 -987 6 1061 2516 251 78 82 chr5 62438821 62439775 -90097484 + MTD-int LTR MaLR 309 1258 0 6 1061 624 207 30 24 chr5 62440098 62440266 -90096993 - RLTR18B LTR ERVK -127 385 217 6 1061 771 208 168 5 chr5 62440310 62440513 -90096746 - RLTR18B LTR ERVK -274 238 3 6 1061 364 246 45 94 chr5 62440516 62440711 -90096548 + MTE2a LTR MaLR 209 378 -1 6 1061 258 274 80 54 chr5 62442501 62442613 -90094646 - MLT1D LTR MaLR -390 115 1 6 1061 714 331 124 19 chr5 62442789 62443266 -90093993 + RMER5 LTR ERV1 1 527 -7 6 1061 1653 244 72 135 chr5 62447093 62447153 -90090106 - RMER19C LTR ERVK -2 609 578 6 1061 1653 244 72 135 chr5 62447300 62447353 -90089906 - RMER19C LTR ERVK -34 577 521 6 1061 1653 244 72 135 chr5 62447437 62447972 -90089287 - RMER19C LTR ERVK -91 520 2 6 1061 317 299 96 58 chr5 62454253 62454441 -90082818 - MLT1A1 LTR MaLR -195 213 19 6 1061 255 253 33 44 chr5 62463514 62463605 -90073654 + MLT1A0 LTR MaLR 2 91 -274 6 1061 440 292 57 129 chr5 62468385 62468719 -90068540 + RLTR18 LTR ERVK 1 310 -306 7 1061 268 322 48 24 chr5 62468823 62468947 -90068312 + RLTR18 LTR ERVK 363 489 -127 7 1061 918 209 223 26 chr5 62472199 62472548 -90064711 - MTC LTR MaLR -24 383 1 7 1061 1338 212 89 10 chr5 62472924 62473238 -90064021 - MTC LTR MaLR 0 421 83 7 1061 398 264 0 0 chr5 62473792 62473883 -90063376 - MTC LTR MaLR -330 91 1 7 1061 341 274 117 44 chr5 62485230 62485436 -90051823 + RMER20B LTR ERVK 179 399 -228 7 1061 404 344 44 86 chr5 62487490 62487805 -90049454 - MLT1D LTR MaLR -178 327 26 7 1061 808 288 45 5 chr5 62489263 62489486 -90047773 + MTD LTR MaLR 155 386 -33 7 1061 400 341 133 56 chr5 62491977 62492337 -90044922 + MT2A LTR ERVL 138 525 -8 7 1061 637 338 56 13 chr5 62493369 62493672 -90043587 + MER54B LTR ERVL 11 326 -467 7 1061 1745 204 17 8 chr5 62499246 62499597 -90037662 - MTC LTR MaLR 0 421 68 7 1061 488 152 0 0 chr5 62500059 62500138 -90037121 - MTC LTR MaLR -341 80 2 1 1061 1024 245 82 71 chr5 62500487 62500939 -90036320 - RLTR40 LTR ERVK -340 477 21 4 1061 338 315 84 60 chr5 62503604 62503893 -90033366 + MLT1D LTR MaLR 88 388 -117 1 1061 664 272 81 31 chr5 62504142 62504465 -90032794 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 5 1 1061 227 346 50 57 chr5 62505902 62506043 -90031216 - MLT1E2 LTR MaLR -25 602 463 1 1061 1908 203 107 27 chr5 62511202 62511693 -90025566 - RMER4B LTR ERVK -2 583 54 2 1061 2907 176 68 2 chr5 62511693 62512255 -90025004 - MT2B LTR ERVL -2 599 1 2 1061 1908 213 40 26 chr5 62512255 62512306 -90024953 - RMER4B LTR ERVK -532 53 1 2 1061 606 294 46 88 chr5 62514323 62514825 -90022434 - RLTR12B LTR ERVK -32 495 47 3 1062 460 300 38 53 chr5 62521509 62521773 -90015486 - RLTR15 LTR ERVK -62 297 38 3 1062 2712 93 27 3 chr5 62529772 62530148 -90007111 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 4 1062 757 378 42 19 chr5 62535567 62535944 -90001315 + MTD LTR MaLR 20 405 -14 5 1062 683 327 34 26 chr5 62538705 62538972 -89998287 - MTEa-int LTR MaLR -1311 269 1 6 1062 349 325 105 0 chr5 62538972 62539086 -89998173 - MTEa LTR MaLR -2 377 252 6 1062 546 239 15 22 chr5 62541587 62541724 -89995535 + MT2A LTR ERVL 327 462 -71 6 1062 717 323 27 121 chr5 62546804 62547216 -89990043 - MTE2a LTR MaLR -6 373 1 7 1062 378 336 65 27 chr5 62547949 62548255 -89989004 - RMER13A LTR ERVK -83 777 514 7 1062 575 160 63 56 chr5 62548272 62548398 -89988861 - RMER6D LTR ERVK -593 127 1 7 1062 1022 203 101 89 chr5 62558447 62558621 -89978638 - RMER17C LTR ERVK 0 410 219 9 1062 1022 203 101 89 chr5 62559037 62559262 -89977997 - RMER17C LTR ERVK -192 218 2 9 1062 3221 174 104 80 chr5 62560524 62560558 -89976701 - RMER19B LTR ERVK -162 740 706 1 1062 3221 174 104 80 chr5 62560583 62561271 -89975988 - RMER19B LTR ERVK -197 705 3 1 1062 236 316 12 12 chr5 62579535 62579615 -89957644 - MLT1C LTR MaLR -6 461 382 1 1062 353 288 94 43 chr5 62579755 62579893 -89957366 - MLT1C LTR MaLR -312 155 11 1 1062 711 282 61 0 chr5 62580588 62580806 -89956453 - ORR1D1 LTR MaLR -139 239 1 1 1062 2125 252 88 13 chr5 62580806 62581420 -89955839 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 711 1 1062 630 220 14 0 chr5 62581420 62581561 -89955698 - ORR1D1 LTR MaLR -231 143 1 1 1062 498 330 45 71 chr5 62582451 62582787 -89954472 + MTEb LTR MaLR 51 377 -2 1 1062 234 291 236 43 chr5 62591608 62591748 -89945511 + MLT2C2 LTR ERVL 23 189 -275 1 1062 2645 75 67 8 chr5 62592650 62593025 -89944234 + MTB LTR MaLR 1 397 -3 1 1062 4189 42 2 10 chr5 62594804 62595311 -89941948 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 1 1062 227 395 139 18 chr5 62598744 62598909 -89938350 - MLT1E1A LTR MaLR -493 187 3 1 1062 894 280 307 13 chr5 62609629 62609932 -89927327 - MTD LTR MaLR -8 411 20 1 1062 1512 292 99 106 chr5 62609975 62610813 -89926446 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 425 1 1062 1332 249 66 25 chr5 62617488 62617854 -89919405 - MTD-int LTR MaLR -865 393 13 1 1062 1354 308 27 27 chr5 62617854 62618265 -89918994 - MTD LTR MaLR -8 411 1 1 1062 2563 214 84 16 chr5 62618316 62618961 -89918298 + RLTR40 LTR ERVK 26 714 -103 1 1062 613 246 0 8 chr5 62625805 62625932 -89911327 + RLTR40 LTR ERVK 685 810 -7 1 1062 270 418 115 16 chr5 62630589 62630893 -89906366 - LTR33 LTR ERVL -50 465 132 1 1062 380 374 37 25 chr5 62638015 62638259 -89899000 + MLT1C LTR MaLR 171 417 -50 1 1062 747 364 67 26 chr5 62642401 62642821 -89894438 - MER70A LTR ERVL -4 468 32 1 1062 1699 198 61 37 chr5 62645472 62645849 -89891410 + ORR1B1 LTR MaLR 6 391 -3 1 1062 238 261 76 67 chr5 62649566 62649685 -89887574 + RLTR12B LTR ERVK 149 268 -260 1 1062 403 304 30 42 chr5 62649730 62649898 -89887361 + RLTR17 LTR ERVK 282 447 -245 2 1063 306 315 117 49 chr5 62655997 62656244 -89881015 + MLT1B LTR MaLR 117 380 -10 2 1063 375 357 91 25 chr5 62656470 62656711 -89880548 + MER74C LTR ERVL 4 260 -200 2 1063 2962 69 0 0 chr5 62657021 62657398 -89879861 + MTB LTR MaLR 8 384 -16 2 1063 1297 274 73 13 chr5 62659690 62660075 -89877184 + MTC LTR MaLR 10 417 -4 2 1063 4413 14 2 0 chr5 62663021 62663513 -89873746 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1063 302 0 0 0 chr5 62663513 62663551 -89873708 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 1063 390 167 46 35 chr5 62663551 62663638 -89873621 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 2 1063 36880 20 9 0 chr5 62663638 62668211 -89869048 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 886 2 1063 6118 11 0 0 chr5 62668211 62668925 -89868334 - MERVL-int LTR ERVL -4771 714 1 2 1063 4413 14 2 0 chr5 62668925 62669417 -89867842 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1063 1042 276 134 8 chr5 62674019 62674391 -89862868 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1063 378 341 96 84 chr5 62676837 62677180 -89860079 - ORR1E LTR MaLR 0 359 13 2 1063 800 307 84 22 chr5 62679271 62679628 -89857631 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 2 1063 1078 301 3 61 chr5 62679878 62680257 -89857002 - BGLII_B LTR ERVK -3 438 82 2 1063 421 315 14 14 chr5 62681519 62681667 -89855592 - MTEa LTR MaLR -230 149 2 2 1063 631 292 29 10 chr5 62682547 62682751 -89854508 - RMER5 LTR ERV1 0 534 327 2 1063 1068 175 167 47 chr5 62684099 62684464 -89852795 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 1063 3957 191 37 88 chr5 62684465 62685691 -89851568 + MMETn-int LTR ERVK 1 1163 -3681 2 1063 502 283 6 39 chr5 62685704 62685884 -89851375 + ETnERV2-int LTR ERVK 2435 2608 -4798 2 1063 1586 140 61 51 chr5 62685884 62686324 -89850935 + ETnERV2-int LTR ERVK 3055 3447 -3959 2 1063 3404 120 24 0 chr5 62686549 62687124 -89850135 + ETnERV2-int LTR ERVK 3441 4029 -3377 2 1063 3804 200 17 37 chr5 62687119 62688835 -89848424 + ETnERV2-int LTR ERVK 2356 3810 -1034 2 1063 4780 119 20 7 chr5 62688887 62689588 -89847671 + ETnERV2-int LTR ERVK 6494 7203 -203 2 1063 814 190 174 151 chr5 62689590 62689907 -89847352 + RLTR13D6 LTR ERVK 154 477 -378 2 1063 456 29 27 68 chr5 62689907 62689980 -89847279 + ETnERV2-int LTR ERVK 7334 7403 -3 2 1063 1104 174 178 42 chr5 62689982 62690342 -89846917 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 1063 339 270 11 22 chr5 62707674 62707765 -89829494 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 591 2 1063 1827 208 41 22 chr5 62709997 62710410 -89826849 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1063 642 295 100 32 chr5 62716707 62716956 -89820303 - MTD LTR MaLR -152 267 2 2 1063 1014 316 101 37 chr5 62725963 62726127 -89811132 - RMER19C LTR ERVK 0 902 745 2 1063 1014 316 101 37 chr5 62726189 62726265 -89810994 - RMER19C LTR ERVK -158 744 637 2 1063 1307 263 12 92 chr5 62726410 62726815 -89810444 - RMER19C LTR ERVK -196 415 42 2 1063 546 309 172 36 chr5 62731336 62731726 -89805533 + LTR50 LTR ERVL 24 466 -329 3 1063 290 185 270 15 chr5 62735218 62735355 -89801904 + RMER17B LTR ERVK 293 464 -494 3 1063 313 303 38 103 chr5 62736146 62736330 -89800929 + MLT2B4 LTR ERVL 1 172 -242 3 1063 231 317 7 109 chr5 62737981 62738119 -89799140 + MT2B LTR ERVL 137 260 -341 3 1063 244 359 47 20 chr5 62753039 62753187 -89784072 + MTE-int LTR MaLR 1427 1578 -2 3 1063 1326 173 180 0 chr5 62762560 62762838 -89774421 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 3 1063 424 320 131 60 chr5 62769765 62770117 -89767142 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 3 1063 502 312 168 44 chr5 62776128 62776443 -89760816 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 3 1063 386 296 39 16 chr5 62778564 62778691 -89758568 - LTR33 LTR ERVL -371 144 15 3 1064 572 349 26 4 chr5 62784293 62784523 -89752736 - MLT2D LTR ERVL -179 235 1 3 1064 236 167 46 77 chr5 62806443 62806508 -89730751 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 3 1064 1264 183 152 48 chr5 62809088 62809278 -89727981 + ORR1B1 LTR MaLR 41 253 -141 3 1064 4877 110 30 22 chr5 62809278 62810079 -89727180 + RMER17D2 LTR ERVK 1 807 -2 3 1064 1264 183 152 48 chr5 62810079 62810204 -89727055 + ORR1B1 LTR MaLR 254 389 -5 3 1064 229 328 146 22 chr5 62811269 62811447 -89725812 - MLT1A1 LTR MaLR -208 200 1 3 1064 1175 264 77 29 chr5 62812827 62813178 -89724081 + MTE2b LTR MaLR 3 370 -9 4 1064 2711 160 77 55 chr5 62827339 62828014 -89709245 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 1064 308 342 66 51 chr5 62828130 62828327 -89708932 + MER21B LTR ERV1 336 535 -328 4 1064 890 268 129 32 chr5 62828771 62829142 -89708117 - MTD LTR MaLR 0 419 6 4 1064 288 250 0 129 chr5 62831014 62831115 -89706144 + RMER15 LTR ERVL 367 454 -121 4 1064 257 328 76 0 chr5 62831338 62831457 -89705802 + RMER15 LTR ERVL 448 575 0 4 1064 306 343 90 58 chr5 62831459 62831648 -89705611 + MER21B LTR ERV1 538 732 -131 4 1064 1063 292 73 39 chr5 62842455 62842937 -89694322 - RMER5 LTR ERV1 -28 506 9 4 1064 379 283 80 109 chr5 62843285 62843587 -89693672 + RMER10A LTR ERVL 122 414 -28 4 1064 250 277 55 82 chr5 62843900 62844010 -89693249 + MER67C LTR ERV1 4 110 -601 4 1064 294 232 52 21 chr5 62848267 62848364 -89688895 - MLT1G3 LTR MaLR -8 587 488 4 1064 1668 152 161 18 chr5 62852138 62852479 -89684780 + MTC LTR MaLR 24 413 -8 4 1064 2227 180 175 46 chr5 62852560 62853171 -89684088 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 1064 941 222 25 98 chr5 62853437 62853752 -89683507 + RLTR9A LTR ERVK 77 368 0 4 1064 3762 169 28 59 chr5 62854899 62855664 -89681595 + RMER6A LTR ERVK 4 744 -12 4 1064 2593 63 134 3 chr5 62858264 62858614 -89678645 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1064 733 299 90 34 chr5 62863974 62864241 -89673018 + MTE2b LTR MaLR 70 351 -28 4 1064 370 362 58 23 chr5 62866213 62866470 -89670789 + MLT1C LTR MaLR 202 467 0 4 1064 432 332 65 35 chr5 62871685 62871885 -89665374 - LTR40c LTR ERVL -216 249 44 4 1064 769 328 113 26 chr5 62880039 62880465 -89656794 + MLT1C LTR MaLR 1 463 -4 4 1064 1046 308 101 90 chr5 62894117 62894891 -89642368 - LTR48 LTR ERV1 -3 784 3 5 1064 2075 141 0 12 chr5 62898424 62898754 -89638505 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 1064 595 327 31 34 chr5 62902351 62902645 -89634614 + LTR37A LTR ERV1 111 403 -23 5 1065 763 309 69 0 chr5 62922753 62922970 -89614289 - MLT1A0 LTR MaLR -72 293 62 5 1065 551 295 108 69 chr5 62930605 62930911 -89606348 + LTR53 LTR ERVL 190 507 -12 5 1065 677 260 0 26 chr5 62943799 62943953 -89593306 + ORR1D1 LTR MaLR 13 162 -212 5 1065 475 292 56 20 chr5 62944585 62944781 -89592478 + ORR1D1 LTR MaLR 172 374 0 5 1065 236 299 30 107 chr5 62946141 62946272 -89590987 - MTEa LTR MaLR -18 361 241 5 1065 590 331 43 13 chr5 62947016 62947293 -89589966 - MER54A LTR ERVL -5 896 550 5 1065 631 311 106 51 chr5 62947317 62947571 -89589688 + MTEa LTR MaLR 3 270 -109 5 1065 596 342 128 43 chr5 62947685 62948195 -89589064 - MER54A LTR ERVL -327 574 22 5 1065 1002 305 9 25 chr5 62949915 62950231 -89587028 + MTE2b LTR MaLR 16 326 -53 5 1065 547 223 86 166 chr5 62954909 62955372 -89581887 + RLTR23 LTR ERV1 1 426 -4 6 1065 472 236 36 25 chr5 62956261 62956393 -89580866 + MLT1B LTR MaLR 262 378 -12 6 1065 318 241 36 60 chr5 62958572 62958656 -89578603 - MT2A LTR ERVL -73 460 379 6 1065 537 250 8 8 chr5 62958685 62958814 -89578445 - MT2A LTR ERVL -404 129 1 6 1065 8136 26 0 3 chr5 62958902 62959834 -89577425 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 6 1065 4087 185 97 8 chr5 62960478 62961262 -89575997 + RMER13A LTR ERVK 3 856 -4 6 1065 783 304 75 39 chr5 62965728 62966060 -89571199 - ORR1E LTR MaLR -9 350 7 6 1065 568 229 32 86 chr5 62984100 62984286 -89552973 - MTD LTR MaLR -6 413 238 6 1065 1679 249 146 36 chr5 62984198 62984727 -89552532 + MTC-int LTR MaLR 574 1160 -98 6 1065 849 191 103 30 chr5 62984738 62985027 -89552232 - MT2A LTR ERVL -2 531 170 6 1065 531 228 121 17 chr5 62985020 62985194 -89552065 - MTD-int LTR MaLR -1055 203 12 6 1065 1085 232 55 0 chr5 62985203 62985457 -89551802 - MTD LTR MaLR 0 419 152 6 1065 2192 189 88 32 chr5 62986569 62987107 -89550152 - RMER16 LTR ERVK 0 533 9 6 1065 2063 185 43 42 chr5 62987708 62988215 -89549044 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 561 1 6 1065 1382 191 221 33 chr5 63004571 63005020 -89532239 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 5 1065 1833 162 89 0 chr5 63007765 63008075 -89529184 + RLTR28B LTR ERVL 1 322 -159 9 1065 1833 162 89 0 chr5 63008178 63008226 -89529033 + RLTR28B LTR ERVL 323 390 -91 9 1065 393 247 45 0 chr5 63008284 63008373 -89528886 + RLTR28B LTR ERVL 386 478 -3 9 1065 890 228 97 16 chr5 63020277 63020546 -89516713 - ORR1C2 LTR MaLR -77 307 6 3 1065 574 374 20 13 chr5 63025156 63025457 -89511802 + MTE-int LTR MaLR 47 349 -1231 3 1066 1316 220 58 17 chr5 63057010 63057302 -89479957 + MTD LTR MaLR 58 361 -58 7 1066 1823 146 14 84 chr5 63072641 63073082 -89464177 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 9 1066 959 274 64 36 chr5 63088767 63089126 -89448133 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 1 1066 295 334 57 68 chr5 63089985 63090330 -89446929 + ORR1E LTR MaLR 9 363 -16 1 1066 245 288 24 105 chr5 63097637 63097761 -89439498 + MT2B LTR ERVL 141 254 -347 1 1066 396 344 96 57 chr5 63099043 63099376 -89437883 + ORR1E LTR MaLR 3 348 -11 1 1066 2780 71 53 0 chr5 63103546 63103926 -89433333 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1066 650 128 69 0 chr5 63129698 63129800 -89407459 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 251 1 1066 2017 153 48 3 chr5 63133926 63134241 -89403018 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1066 331 251 131 116 chr5 63137038 63137236 -89400023 + MER34 LTR ERV1 35 235 -307 2 1066 3183 64 10 8 chr5 63141544 63141939 -89395320 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1066 521 293 108 48 chr5 63143659 63143974 -89393285 + MLT1A LTR MaLR 26 359 -15 2 1066 491 257 171 69 chr5 63146457 63146720 -89390539 - MLT1A0 LTR MaLR -3 405 75 2 1066 943 236 231 7 chr5 63161044 63161339 -89375920 + MTD LTR MaLR 20 380 -39 2 1066 2000 158 12 56 chr5 63161922 63162264 -89374995 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1066 4715 14 0 0 chr5 63163814 63164307 -89372952 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1066 285 0 27 0 chr5 63164307 63164344 -89372915 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 1066 297 183 14 40 chr5 63164344 63164418 -89372841 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 569 2 1066 16290 31 1 0 chr5 63164419 63166275 -89370984 - MERVL-int LTR ERVL -113 5372 3516 2 1066 2878 30 0 0 chr5 63166265 63166594 -89370665 - MERVL-int LTR ERVL -5156 329 1 2 1066 4662 14 0 10 chr5 63166594 63167092 -89370167 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1066 702 286 56 57 chr5 63174129 63174439 -89362820 + MT2B LTR ERVL 145 546 -55 2 1066 406 296 156 54 chr5 63174463 63174505 -89362754 + MT2B LTR ERVL 492 533 0 2 1066 578 157 26 44 chr5 63174505 63174618 -89362641 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 111 -5650 2 1066 1944 140 7 0 chr5 63174856 63175163 -89362096 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 11 2 1066 644 304 116 62 chr5 63175194 63175531 -89361728 + MLT1A0 LTR MaLR 1 355 -10 2 1066 304 360 78 24 chr5 63175561 63175788 -89361471 - MLT1J LTR MaLR -159 289 52 2 1067 693 230 145 29 chr5 63177166 63177428 -89359831 - RMER2 LTR ERV1 -241 326 1 2 1067 301 342 69 59 chr5 63182305 63182507 -89354752 - MLT2E LTR ERVL -304 324 121 2 1067 729 319 97 23 chr5 63182506 63182805 -89354454 + ORR1E LTR MaLR 37 357 -2 2 1067 2126 175 156 108 chr5 63183248 63183831 -89353428 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 1067 561 306 193 65 chr5 63195452 63195679 -89341580 - MER90a LTR ERV1 -2 612 357 2 1067 561 306 193 65 chr5 63195772 63196083 -89341176 - MER90a LTR ERV1 -258 356 5 2 1067 3139 174 84 11 chr5 63199658 63200298 -89336961 + RMER6C LTR ERVK 4 690 0 3 1067 226 304 100 12 chr5 63204913 63204993 -89332266 + LTR34 LTR ERV1 323 409 -290 3 1067 549 253 105 21 chr5 63205704 63205894 -89331365 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 160 3 1067 3393 43 0 0 chr5 63216513 63216909 -89320350 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1067 1105 239 182 20 chr5 63222551 63222897 -89314362 - MTC LTR MaLR -8 413 12 3 1067 2073 92 6 35 chr5 63226280 63226596 -89310663 - IAPLTR2b LTR ERVK -20 307 1 3 1067 230 348 120 21 chr5 63231168 63231359 -89305900 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 247 3 1067 802 309 74 65 chr5 63246659 63247026 -89290233 - MTEa LTR MaLR -9 370 1 3 1067 4205 115 2 5 chr5 63247387 63247990 -89289269 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 3 1067 584 215 57 10 chr5 63248077 63248230 -89289029 - ORR1A4 LTR MaLR -174 200 1 3 1067 2682 200 25 66 chr5 63255415 63256003 -89281256 - RMER19C LTR ERVK -47 564 1 3 1067 1506 221 40 0 chr5 63256732 63257058 -89280201 + RMER15 LTR ERVL 234 572 -3 3 1067 723 255 51 143 chr5 63268418 63268830 -89268429 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1067 256 268 102 149 chr5 63275545 63275760 -89261499 - ORR1E LTR MaLR -100 259 55 4 1067 2531 155 27 0 chr5 63276459 63276872 -89260387 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 7 4 1067 2793 157 88 29 chr5 63279677 63279751 -89257508 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 481 4 1067 2793 157 88 29 chr5 63279789 63280260 -89256999 - RLTR20A2 LTR ERVK -98 480 2 4 1067 334 372 178 0 chr5 63282780 63282971 -89254288 + LTR33 LTR ERVL 112 336 -179 4 1067 1117 283 183 17 chr5 63285429 63285947 -89251312 + LTR65 LTR ERV1 46 649 -20 4 1067 514 368 67 64 chr5 63291795 63292138 -89245121 + ORR1E LTR MaLR 6 349 -10 4 1067 430 353 84 5 chr5 63292146 63292337 -89244922 + ORR1E-int LTR MaLR 1 206 -1374 4 1067 1986 231 114 40 chr5 63292549 63293354 -89243905 - RMER6C LTR ERVK 0 720 10 4 1067 1199 263 125 112 chr5 63293451 63294041 -89243218 - MT2B LTR ERVL -3 598 1 4 1067 379 373 30 30 chr5 63295841 63296073 -89241186 + MLT1E2 LTR MaLR 24 255 -372 4 1067 1194 261 103 5 chr5 63296402 63296772 -89240487 + MTD LTR MaLR 14 419 0 4 1067 230 313 150 43 chr5 63300290 63300430 -89236829 - MLT1B LTR MaLR -235 155 1 4 1067 490 264 23 69 chr5 63301080 63301255 -89236004 - MT2A LTR ERVL -152 381 215 4 1067 409 305 56 14 chr5 63301261 63301326 -89235933 - MTE2a LTR MaLR -230 149 85 4 1067 409 305 56 14 chr5 63301377 63301454 -89235805 - MTE2a LTR MaLR -295 84 2 4 1067 4162 123 80 18 chr5 63302152 63302863 -89234396 - RMER6A LTR ERVK -1 755 1 4 1068 889 258 68 137 chr5 63312240 63312763 -89224496 - MT2B LTR ERVL -2 582 1 4 1068 358 314 42 69 chr5 63313758 63313902 -89223357 - RMER15 LTR ERVL -33 542 403 4 1068 374 333 42 36 chr5 63313914 63314079 -89223180 - RMER15 LTR ERVL -137 438 273 4 1068 1696 226 27 0 chr5 63314330 63314698 -89222561 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1068 227 342 8 66 chr5 63318040 63318162 -89219097 + MLT1E3 LTR MaLR 80 194 -430 4 1068 1594 258 15 5 chr5 63325193 63325583 -89211676 + MTD LTR MaLR 13 406 -13 4 1068 758 259 68 56 chr5 63328266 63328516 -89208743 + MTE2a LTR MaLR 123 375 -4 4 1068 281 346 100 6 chr5 63354798 63354958 -89182301 + RMER15 LTR ERVL 261 435 -140 5 1068 317 387 21 0 chr5 63356115 63356257 -89181002 + RMER15 LTR ERVL 415 559 -16 5 1068 272 380 101 0 chr5 63358552 63358731 -89178528 - MLT1D LTR MaLR 0 505 309 5 1068 297 376 39 24 chr5 63358762 63358969 -89178290 - MLT1D LTR MaLR -276 229 20 5 1068 2549 43 71 0 chr5 63359883 63360206 -89177053 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1068 1319 235 109 18 chr5 63365813 63366143 -89171116 + ORR1D2 LTR MaLR 7 366 -4 5 1068 325 205 72 116 chr5 63366411 63366549 -89170710 + RMER2 LTR ERV1 435 566 -1 5 1068 665 323 57 83 chr5 63367424 63367843 -89169416 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 5 1068 299 258 15 0 chr5 63368287 63368353 -89168906 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 345 5 1068 3303 42 3 0 chr5 63368353 63368737 -89168522 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 5 1068 1205 44 0 19 chr5 63368737 63368899 -89168360 + IAPEy-int LTR ERVK 1 159 -7354 5 1068 2704 142 14 12 chr5 63368900 63369415 -89167844 + IAPEy-int LTR ERVK 543 1058 -6455 5 1068 20744 46 3 6 chr5 63369415 63372133 -89165126 + IAPEy-int LTR ERVK 4804 7513 0 5 1068 3254 47 3 0 chr5 63372133 63372517 -89164742 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 5 1068 368 248 6 135 chr5 63372529 63372692 -89164567 - RLTR10A LTR ERVK -123 288 147 5 1068 1820 281 33 45 chr5 63376499 63377103 -89160156 - ORR1D2-int LTR MaLR -772 598 2 5 1068 533 286 93 25 chr5 63377104 63377308 -89159951 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 153 5 1068 321 358 0 0 chr5 63377670 63377765 -89159494 - ORR1D2 LTR MaLR -274 96 2 5 1068 1750 253 10 5 chr5 63383559 63383972 -89153287 + MTC LTR MaLR 5 419 -2 5 1068 1572 216 45 31 chr5 63387858 63388211 -89149048 - ORR1B2 LTR MaLR -9 358 1 5 1068 316 328 22 45 chr5 63391228 63391362 -89145897 - MLT1A1 LTR MaLR -275 133 3 5 1068 1213 298 65 25 chr5 63393201 63393690 -89143569 + RMER5 LTR ERV1 26 534 0 5 1068 441 275 78 35 chr5 63408776 63409006 -89128253 + RLTR12B LTR ERVK 247 486 -42 5 1068 2997 71 10 2 chr5 63411577 63411970 -89125289 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1068 7232 92 18 69 chr5 63411970 63413127 -89124132 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1068 2903 68 3 5 chr5 63413127 63413514 -89123745 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 11 5 1068 604 298 22 82 chr5 63423905 63424172 -89113087 - ORR1E LTR MaLR -105 254 4 5 1068 421 340 21 0 chr5 63424944 63425085 -89112174 - ORR1E LTR MaLR -214 145 2 5 1068 1600 346 108 66 chr5 63425085 63426030 -89111229 + MLT-int LTR MaLR 704 1688 -47 5 1068 584 308 79 34 chr5 63426030 63426306 -89110953 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 89 5 1068 272 368 72 0 chr5 63426518 63426643 -89110616 + MLT1A0 LTR MaLR 5 138 -227 5 1068 814 286 41 90 chr5 63429134 63429602 -89107657 - RLTR12B LTR ERVK -42 486 42 5 1068 2276 243 11 59 chr5 63432139 63432682 -89104577 + RMER12B LTR ERVK 1 517 -887 5 1068 591 160 23 60 chr5 63434020 63434153 -89103106 - RMER19C LTR ERVK -481 130 3 6 1068 2711 233 39 12 chr5 63434154 63434802 -89102457 + RMER12B LTR ERVK 515 1179 -225 5 1068 378 239 11 0 chr5 63434878 63434966 -89102293 + RLTR21 LTR ERVK 1438 1526 -46 6 1069 1253 239 50 28 chr5 63438932 63439294 -89097965 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 6 1069 631 340 83 57 chr5 63439459 63439808 -89097451 - MLT1H LTR MaLR -181 368 11 6 1069 2889 169 42 17 chr5 63439840 63440382 -89096877 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 556 -7 6 1069 488 220 92 38 chr5 63443418 63443602 -89093657 + RMER13B LTR ERVK 624 817 -91 6 1069 878 305 60 57 chr5 63448231 63448582 -89088677 - ORR1D2 LTR MaLR -10 360 9 6 1069 423 333 14 7 chr5 63458603 63458742 -89078517 + LTR16C LTR ERVL 302 441 -48 6 1069 240 343 58 58 chr5 63459327 63459516 -89077743 + MER68 LTR ERVL 347 535 -28 6 1069 356 229 16 128 chr5 63461094 63461219 -89076040 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 6 1069 406 299 0 38 chr5 63465000 63465132 -89072127 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 393 6 1069 233 311 191 6 chr5 63465258 63465426 -89071833 - RMER5 LTR ERV1 -287 247 49 6 1069 969 283 114 39 chr5 63466855 63467267 -89069992 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 443 -1405 6 1069 285 301 94 94 chr5 63467639 63467819 -89069440 - MLT1B LTR MaLR -141 249 70 6 1069 654 212 46 186 chr5 63467975 63468282 -89068977 + RLTR22_Mur LTR ERVK 484 747 -1101 6 1069 643 332 122 67 chr5 63469340 63469461 -89067798 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1192 1317 -531 6 1069 643 332 122 67 chr5 63469516 63469845 -89067414 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1318 1666 -182 6 1069 1667 129 19 53 chr5 63475510 63475828 -89061431 - IAPLTR2b LTR ERVK -20 307 1 6 1069 455 269 87 141 chr5 63484708 63485041 -89052218 - MER31B LTR ERV1 0 466 152 6 1069 2161 197 5 3 chr5 63492395 63492787 -89044472 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 6 1069 742 118 79 0 chr5 63497162 63497289 -89039970 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 432 7 1069 2335 168 12 19 chr5 63497800 63498214 -89039045 - RLTR12A LTR ERVK -125 443 33 7 1069 900 217 133 47 chr5 63498489 63498789 -89038470 - ORR1C1 LTR MaLR -18 360 2 7 1069 2512 211 99 22 chr5 63498790 63499377 -89037882 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 878 7 1069 481 163 11 0 chr5 63499360 63499452 -89037807 - ORR1C1-int LTR MaLR -1416 93 1 7 1069 233 442 18 0 chr5 63502508 63502621 -89034638 - MLT1K LTR MaLR -325 270 156 4 1069 2255 82 82 0 chr5 63506631 63506959 -89030300 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -2 355 1 1 1069 2735 56 0 32 chr5 63515819 63515963 -89021296 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 144 -213 2 1069 2735 56 0 32 chr5 63516260 63516484 -89020775 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 145 357 0 2 1069 2128 190 36 17 chr5 63518145 63518558 -89018701 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1069 3322 53 0 0 chr5 63521495 63521891 -89015368 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1069 595 312 117 51 chr5 63523394 63523803 -89013456 - MLT1D LTR MaLR -69 436 1 4 1069 286 305 102 14 chr5 63529439 63529544 -89007715 + RMER17D2 LTR ERVK 162 282 -527 5 1069 286 305 102 14 chr5 63529718 63529895 -89007364 + RMER17D2 LTR ERVK 283 469 -340 5 1069 360 337 127 98 chr5 63533828 63534308 -89002951 - MLT1F2 LTR MaLR -1 559 66 6 1069 1133 270 97 12 chr5 63550135 63550465 -88986794 + MTE2b LTR MaLR 20 377 -2 7 1069 606 324 141 45 chr5 63551754 63551869 -88985390 - MER67D LTR ERV1 0 514 379 8 1069 606 324 141 45 chr5 63552147 63552500 -88984759 - MER67D LTR ERV1 -136 378 1 8 1069 310 77 0 0 chr5 63558849 63558888 -88978371 + ORR1A0 LTR MaLR 139 177 -169 9 1069 1669 244 21 60 chr5 63559450 63559886 -88977373 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1069 2654 236 96 70 chr5 63565616 63565821 -88971438 - RLTR25A LTR ERVK -6 1022 797 1 1069 2876 186 71 30 chr5 63565994 63566784 -88970475 - RLTR25A LTR ERVK -232 796 1 1 1069 1045 208 18 23 chr5 63568339 63568556 -88968703 + ORR1C1 LTR MaLR 1 216 -162 1 1070 2776 108 10 5 chr5 63576634 63577035 -88960224 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 1 1070 3460 20 2 0 chr5 63577814 63578209 -88959050 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1070 299 402 34 24 chr5 63588700 63588909 -88948350 - MLT1F2 LTR MaLR -1 559 349 1 1070 489 301 31 19 chr5 63588979 63589138 -88948121 - MLT1F2 LTR MaLR -323 237 77 1 1070 292 314 97 23 chr5 63589556 63589732 -88947527 + MER90a LTR ERV1 3 191 -423 1 1070 500 305 45 45 chr5 63596252 63596475 -88940784 - MER57F LTR ERV1 -204 232 10 1 1070 1766 228 31 8 chr5 63597203 63597588 -88939671 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1070 1357 261 18 70 chr5 63599577 63599736 -88937523 + ORR1D1 LTR MaLR 1 145 -229 1 1070 1357 261 18 70 chr5 63599881 63600108 -88937151 + ORR1D1 LTR MaLR 146 367 -7 1 1070 423 340 53 21 chr5 63601258 63601447 -88935812 - ORR1E LTR MaLR -164 195 1 1 1070 1318 238 68 34 chr5 63606596 63606960 -88930299 + MTD LTR MaLR 3 362 -57 1 1070 748 322 26 56 chr5 63608843 63609234 -88928025 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1070 2807 70 2 65 chr5 63616205 63616619 -88920640 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 1 1070 8911 13 0 0 chr5 63616619 63617616 -88919643 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 990 1 1070 371 245 64 32 chr5 63617698 63617854 -88919405 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1434 1 1070 8028 33 8 0 chr5 63617897 63618848 -88918411 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 34 1 1070 2848 78 5 33 chr5 63618855 63619254 -88918005 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 1 1070 240 188 21 0 chr5 63622101 63622149 -88915110 - MTC LTR MaLR -49 372 324 2 1070 2983 75 2 5 chr5 63622892 63623293 -88913966 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1070 429 232 35 18 chr5 63633285 63633399 -88903860 - RMER15 LTR ERVL -71 504 389 2 1070 225 341 103 59 chr5 63634131 63634471 -88902788 + LTR48 LTR ERV1 412 766 -21 2 1070 1110 264 138 9 chr5 63639154 63639268 -88897991 - MTD LTR MaLR -30 389 248 2 1070 1110 264 138 9 chr5 63639300 63639525 -88897734 - MTD LTR MaLR -172 247 7 2 1070 3845 187 191 16 chr5 63642229 63643137 -88894122 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 38 2 1070 242 226 0 36 chr5 63644903 63644958 -88892301 + MLT1C LTR MaLR 4 56 -411 2 1070 982 246 160 30 chr5 63652312 63652643 -88884616 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1070 546 356 53 25 chr5 63652865 63653147 -88884112 + LTR53 LTR ERVL 140 429 -90 2 1070 705 306 97 20 chr5 63655584 63655884 -88881375 + ORR1E LTR MaLR 5 327 -32 2 1070 279 316 85 85 chr5 63658651 63658862 -88878397 + MLT1C LTR MaLR 55 265 -202 2 1070 289 333 31 39 chr5 63664381 63664509 -88872750 + MTEa LTR MaLR 250 376 -3 2 1070 577 304 60 22 chr5 63664851 63665180 -88872079 - MTD LTR MaLR -14 405 52 2 1070 1234 278 81 69 chr5 63665752 63666320 -88870939 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 2 1070 240 298 89 47 chr5 63672188 63672378 -88864881 + ORR1D1 LTR MaLR 174 371 -3 2 1070 271 224 15 15 chr5 63675515 63675583 -88861676 - MLT1K LTR MaLR -11 584 517 2 1070 1734 251 71 90 chr5 63691444 63691990 -88845269 + RMER15 LTR ERVL 3 538 -37 3 1070 357 282 18 55 chr5 63697430 63697539 -88839720 + MTEb LTR MaLR 260 364 -15 3 1070 363 211 102 31 chr5 63699388 63699486 -88837773 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 449 3 1071 368 311 116 86 chr5 63705804 63706165 -88831094 - LTR40b LTR ERVL 0 519 150 3 1071 654 224 27 0 chr5 63707058 63707205 -88830054 + MTD LTR MaLR 3 153 -266 3 1071 794 233 39 33 chr5 63707577 63707787 -88829472 + MTD LTR MaLR 203 396 -23 3 1071 6617 79 6 32 chr5 63711226 63712143 -88825116 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 3 1071 2508 82 15 3 chr5 63712473 63712816 -88824443 - IAPEY_LTR LTR ERVK -2 383 37 3 1071 681 186 99 113 chr5 63720355 63720567 -88816692 - ORR1C2 LTR MaLR -18 366 148 3 1071 761 247 5 21 chr5 63720579 63720769 -88816490 - ORR1C2 LTR MaLR -197 187 1 3 1071 2185 163 39 65 chr5 63721302 63721767 -88815492 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 3 1071 231 375 100 18 chr5 63724689 63724909 -88812350 - MLT1E1-int LTR MaLR -305 1082 845 3 1071 575 358 19 58 chr5 63725678 63725936 -88811323 - MLT1E1 LTR MaLR 0 654 407 3 1071 1710 180 71 9 chr5 63732736 63733072 -88804187 + RMER12B LTR ERVK 1 357 -1047 3 1071 515 294 104 137 chr5 63737902 63738218 -88799041 + RMER5 LTR ERV1 70 388 -146 3 1071 3427 23 2 0 chr5 63738218 63738612 -88798647 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 3 1071 515 294 104 137 chr5 63738612 63738776 -88798483 + RMER5 LTR ERV1 389 534 0 3 1071 1747 134 69 66 chr5 63742800 63743150 -88794109 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 80 3 1071 515 147 0 0 chr5 63743257 63743332 -88793927 - RLTR23 LTR ERV1 -355 75 1 3 1071 1087 268 86 36 chr5 63759403 63759740 -88777519 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 4 1071 718 256 49 25 chr5 63765993 63766197 -88771062 + ERVL-int LTR ERVL 5262 5470 -287 4 1071 282 253 33 0 chr5 63773055 63773146 -88764113 + ERVL-int LTR ERVL 5658 5751 -6 4 1071 699 310 134 72 chr5 63773151 63773651 -88763608 + MT2A LTR ERVL 1 531 -2 4 1071 624 306 57 0 chr5 63774352 63774561 -88762698 + ERVL-int LTR ERVL 1276 1496 -4261 4 1071 1027 338 48 93 chr5 63774571 63775202 -88762057 + MTE-int LTR MaLR 950 1551 -29 4 1071 311 308 118 43 chr5 63788428 63788754 -88748505 + ORR1D2 LTR MaLR 21 378 -1 4 1071 932 194 31 5 chr5 63790439 63790515 -88746744 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 447 4 1071 932 194 31 5 chr5 63790575 63790690 -88746569 - RLTR11A LTR ERVK -82 446 332 4 1071 1628 158 90 0 chr5 63791049 63791061 -88746198 - RLTR11A LTR ERVK -176 352 340 4 1071 1628 158 90 0 chr5 63791547 63791857 -88745402 - RLTR11A LTR ERVK -189 339 2 4 1071 272 225 52 104 chr5 63797048 63797102 -88740157 - RLTR11A2 LTR ERVK -80 447 397 4 1071 4827 122 41 81 chr5 63797102 63798045 -88739214 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 4 1071 272 225 52 104 chr5 63798045 63798124 -88739135 - RLTR11A2 LTR ERVK -131 396 321 4 1071 249 355 46 40 chr5 63808580 63808753 -88728506 + MLT1E2 LTR MaLR 14 187 -373 4 1071 341 309 92 77 chr5 63808781 63808977 -88728282 + MLT1E2 LTR MaLR 372 578 -76 4 1071 1702 161 164 3 chr5 63815597 63815927 -88721332 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 4 1071 295 342 9 9 chr5 63818469 63818581 -88718678 + MLT1J LTR MaLR 254 365 -147 4 1071 333 288 18 46 chr5 63819508 63819617 -88717642 + RMER5 LTR ERV1 1 106 -428 4 1071 885 302 63 21 chr5 63819743 63820078 -88717181 + RMER5 LTR ERV1 186 534 0 4 1071 794 241 29 0 chr5 63820945 63821115 -88716144 + MTE2a LTR MaLR 205 379 0 4 1071 1756 71 0 4 chr5 63823422 63823661 -88713598 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 238 -1570 4 1071 1690 175 47 53 chr5 63827689 63828069 -88709190 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1072 748 266 106 31 chr5 63836440 63836841 -88700418 - MER34 LTR ERV1 -48 494 27 5 1072 315 295 62 47 chr5 63837286 63837414 -88699845 - MLT1A LTR MaLR -1 373 244 5 1072 302 225 56 0 chr5 63837515 63837586 -88699673 - MLT1A LTR MaLR -297 77 3 5 1072 2054 171 57 12 chr5 63841185 63841588 -88695671 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1072 256 229 21 0 chr5 63841674 63841722 -88695537 + MLT1J LTR MaLR 110 158 -354 5 1072 1045 308 41 78 chr5 63846708 63847120 -88690139 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 127 5 1072 1940 180 31 8 chr5 63849775 63850133 -88687126 + ORR1B2 LTR MaLR 2 367 0 5 1072 311 306 100 54 chr5 63850289 63850547 -88686712 + ORR1E LTR MaLR 75 365 -14 5 1072 449 256 95 104 chr5 63851403 63851634 -88685625 - ORR1E LTR MaLR -128 231 3 5 1072 380 302 106 18 chr5 63852180 63852394 -88684865 + MLT1A0 LTR MaLR 173 406 -2 5 1072 438 231 52 137 chr5 63855817 63856028 -88681231 - MER67D LTR ERV1 -311 203 11 5 1072 1020 218 14 24 chr5 63856453 63856660 -88680599 + ORR1D1 LTR MaLR 1 205 -169 5 1072 805 212 42 42 chr5 63858963 63859155 -88678104 + ORR1D1 LTR MaLR 183 374 0 5 1072 341 98 0 56 chr5 63861956 63862010 -88675249 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 276 5 1072 1798 122 21 7 chr5 63864279 63864559 -88672700 - ORR1A3 LTR MaLR -42 284 1 5 1072 398 305 130 12 chr5 63866457 63866626 -88670633 + MTD LTR MaLR 15 203 -216 5 1072 388 298 124 20 chr5 63866851 63867053 -88670206 + MTD LTR MaLR 197 419 0 5 1072 242 172 58 106 chr5 63870515 63870589 -88666670 - RMER4A LTR ERVK -82 384 311 5 1072 242 172 58 106 chr5 63870689 63870718 -88666541 - RMER4A LTR ERVK -156 310 286 5 1072 923 353 128 24 chr5 63871016 63871596 -88665663 - MLT-int LTR MaLR -1 1734 1095 5 1072 1050 280 120 40 chr5 63871783 63872233 -88665026 - MLT-int LTR MaLR -989 746 261 5 1072 4240 163 29 22 chr5 63875776 63876612 -88660647 + RMER12 LTR ERVK 1 1039 -283 5 1072 238 252 0 196 chr5 63876733 63876793 -88660466 + RLTR21 LTR ERVK 1350 1397 -175 5 1072 294 276 39 58 chr5 63877136 63877240 -88660019 + RMER12 LTR ERVK 1220 1321 -1 5 1072 836 208 0 26 chr5 63878374 63878527 -88658732 + ORR1D1 LTR MaLR 16 164 -210 5 1072 1569 226 33 14 chr5 63879308 63879675 -88657584 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1072 836 136 77 7 chr5 63880458 63880613 -88656646 + RMER4B LTR ERVK 1 166 -419 5 1072 4927 159 46 22 chr5 63885131 63886040 -88651219 + MurERV4-int LTR ERVK 1877 2807 -2453 5 1072 1832 138 96 0 chr5 63888346 63888858 -88648401 + MurERV4-int LTR ERVK 2813 3373 -1887 5 1072 447 313 71 27 chr5 63889293 63889477 -88647782 + ORR1E LTR MaLR 1 192 -167 5 1072 225 269 51 51 chr5 63889691 63889789 -88647470 + ORR1E LTR MaLR 317 414 -5 5 1072 849 219 122 91 chr5 63891223 63891585 -88645674 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 5 1072 420 262 32 24 chr5 63896245 63896370 -88640889 - ORR1E LTR MaLR -233 126 1 6 1072 6600 68 40 0 chr5 63900624 63901483 -88635776 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 6 1072 2389 115 0 14 chr5 63901497 63901866 -88635393 - ETnERV3-int LTR ERVK -28 5780 5417 6 1072 1939 129 68 27 chr5 63909325 63909690 -88627569 - RLTR9E LTR ERVK -29 380 1 6 1072 569 360 84 34 chr5 63913546 63913986 -88623273 + MT2A LTR ERVL 1 462 -71 6 1072 1863 207 182 28 chr5 63917399 63917997 -88619262 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 6 1072 1157 292 23 14 chr5 63933443 63933794 -88603465 + MTE2b LTR MaLR 26 379 0 6 1072 3223 50 5 2 chr5 63934885 63935284 -88601975 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1072 398 302 119 38 chr5 63936134 63936445 -88600814 - MLT1A LTR MaLR 0 374 34 6 1072 226 328 32 32 chr5 63938938 63939064 -88598195 + LTR34 LTR ERV1 530 655 -44 6 1072 1080 320 39 67 chr5 63940550 63940753 -88596506 + MT2A LTR ERVL 1 185 -348 6 1072 1080 320 39 67 chr5 63941526 63941788 -88595471 + MT2A LTR ERVL 186 453 -80 6 1072 617 342 35 49 chr5 63950116 63950402 -88586857 + MLT1A0 LTR MaLR 84 365 0 6 1072 283 381 17 35 chr5 63951839 63952013 -88585246 + LTR16A LTR ERVL 4 174 -277 6 1072 497 343 79 5 chr5 63953297 63953511 -88583748 + MTEa LTR MaLR 1 230 -149 6 1072 272 305 33 17 chr5 63953537 63953657 -88583602 + MTEa LTR MaLR 249 370 0 6 1072 7152 89 9 14 chr5 63956829 63957817 -88579442 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 6 1072 326 200 14 14 chr5 63958103 63958174 -88579085 - MER74A LTR ERVL -2 620 550 6 1072 689 340 94 38 chr5 63958209 63958604 -88578655 + MLT2B1 LTR ERVL 1 417 -103 6 1072 869 341 60 34 chr5 63958856 63959269 -88577990 - MER74A LTR ERVL -116 442 19 6 1072 1142 264 95 36 chr5 63960778 63960791 -88576468 + MTE2a LTR MaLR 1 13 -366 7 1072 3335 155 210 70 chr5 63960791 63961582 -88575677 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 7 1072 1142 264 95 36 chr5 63961582 63961926 -88575333 + MTE2a LTR MaLR 14 379 0 7 1072 756 255 151 57 chr5 63962602 63962881 -88574378 + MTEb LTR MaLR 75 379 0 7 1073 2192 198 19 12 chr5 63967325 63967740 -88569519 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 7 1073 1832 209 52 10 chr5 63967843 63968245 -88569014 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1073 272 245 217 38 chr5 63970090 63970196 -88567063 + RMER20B LTR ERVK 1 125 -502 7 1073 1754 233 49 8 chr5 63971160 63971549 -88565710 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1073 1498 262 33 6 chr5 63973562 63973926 -88563333 + MTD LTR MaLR 45 418 -1 7 1073 233 203 25 75 chr5 63981296 63981376 -88555883 - MLT1A1 LTR MaLR -332 76 1 7 1073 244 345 89 105 chr5 63989775 63990099 -88547160 + MLT1I LTR MaLR 84 402 -9 7 1073 252 345 85 51 chr5 63990108 63990285 -88546974 - MLT1A0 LTR MaLR -2 510 328 7 1073 599 309 90 25 chr5 63990423 63990702 -88546557 - MLT1A0 LTR MaLR -65 300 4 7 1073 412 285 8 24 chr5 64001609 64001735 -88535524 - ORR1E LTR MaLR -235 124 1 2 1073 528 297 19 39 chr5 64006154 64006308 -88530951 + MER70B LTR ERVL 12 162 -416 6 1073 753 312 67 17 chr5 64006446 64006743 -88530516 + MER70B LTR ERVL 241 552 -26 6 1073 1218 311 86 20 chr5 64010944 64011477 -88525782 - MT2A LTR ERVL 0 554 1 1 1073 454 328 113 26 chr5 64021551 64021861 -88515398 + MLT1I LTR MaLR 1 337 -74 2 1073 1587 198 87 34 chr5 64023374 64023729 -88513530 - RLTR11A LTR ERVK -154 374 1 2 1073 5031 85 186 17 chr5 64027891 64028666 -88508593 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 3 1073 6856 79 50 5 chr5 64031535 64032424 -88504835 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 3 1073 250 314 104 39 chr5 64045352 64045523 -88491736 - LTR79 LTR ERVL -130 397 215 5 1073 256 274 0 19 chr5 64047442 64047490 -88489769 + ORR1B1-int LTR MaLR 602 646 -863 6 1073 275 262 135 10 chr5 64047784 64047888 -88489371 - MLT1H1 LTR MaLR 0 555 439 6 1073 408 294 87 10 chr5 64059006 64059294 -88477965 - MTD LTR MaLR -2 417 42 7 1073 1287 252 109 72 chr5 64059327 64060271 -88476988 - MTC-int LTR MaLR -122 1136 60 7 1073 761 218 67 139 chr5 64060294 64060332 -88476927 - MTC-int LTR MaLR -1199 59 19 7 1073 312 276 75 19 chr5 64060448 64060555 -88476704 - MTD LTR MaLR -44 375 263 7 1073 577 289 129 30 chr5 64060665 64060897 -88476362 - MTD LTR MaLR -159 260 6 7 1073 287 390 111 14 chr5 64061192 64061408 -88475851 + MLT1G1 LTR MaLR 334 570 -9 7 1073 775 264 20 15 chr5 64065051 64065251 -88472008 - MTE2a LTR MaLR -13 366 166 8 1073 423 291 34 135 chr5 64065334 64065541 -88471718 - MTE2a LTR MaLR -191 188 3 8 1073 1560 190 98 3 chr5 64066069 64066396 -88470863 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 5 8 1073 639 313 149 61 chr5 64072848 64073310 -88463949 - MLT1D LTR MaLR 0 505 3 9 1073 1736 171 162 3 chr5 64073657 64073997 -88463262 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 9 1073 330 243 284 7 chr5 64073997 64074127 -88463132 - MTC LTR MaLR -51 368 199 9 1073 366 330 112 16 chr5 64076428 64076616 -88460643 - MTC LTR MaLR -211 210 5 9 1073 3045 77 13 0 chr5 64076912 64077303 -88459956 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1073 1199 209 94 34 chr5 64077550 64077847 -88459412 - RLTR46 LTR ERVK -5 315 1 1 1073 985 288 23 8 chr5 64089084 64089350 -88447909 - MLT1A0 LTR MaLR -88 277 8 1 1073 1465 195 114 12 chr5 64089559 64089902 -88447357 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1073 341 354 48 40 chr5 64091475 64091725 -88445534 - ORR1E LTR MaLR -105 254 3 1 1073 2761 159 15 38 chr5 64092184 64092706 -88444553 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 1 1 1074 1852 184 11 28 chr5 64098292 64098645 -88438614 - RMER6D LTR ERVK 0 720 374 1 1074 4141 150 14 9 chr5 64099410 64100063 -88437196 + RLTR17 LTR ERVK 1 656 -36 1 1074 407 283 160 65 chr5 64102466 64102741 -88434518 + MLT1A0 LTR MaLR 3 304 -61 1 1074 1056 192 5 0 chr5 64106744 64106931 -88430328 + MTC LTR MaLR 234 421 0 1 1074 293 53 0 0 chr5 64108241 64108279 -88428980 - RMER19C LTR ERVK 0 611 574 1 1074 1724 243 61 100 chr5 64108917 64109506 -88427753 - RMER19C LTR ERVK -45 566 1 1 1074 1007 290 74 19 chr5 64127916 64128239 -88409020 + MTE2b LTR MaLR 1 341 -38 1 1074 790 219 21 177 chr5 64137546 64137874 -88399385 - ORR1C2 LTR MaLR -107 277 1 2 1074 1191 239 76 36 chr5 64138811 64139167 -88398092 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 1074 2056 194 73 35 chr5 64143317 64143825 -88393434 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 1074 1543 238 54 5 chr5 64144493 64144885 -88392374 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 1074 2817 66 79 3 chr5 64145212 64145590 -88391669 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1074 1524 200 58 15 chr5 64146582 64146912 -88390347 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 26 2 1074 522 267 34 105 chr5 64147445 64147654 -88389605 - MTEa LTR MaLR -13 366 173 2 1074 601 189 138 14 chr5 64147716 64147861 -88389398 - MTEa LTR MaLR -201 178 16 2 1074 328 306 139 23 chr5 64152794 64153139 -88384120 - LTR79 LTR ERVL -15 512 128 2 1074 420 248 74 27 chr5 64159519 64159668 -88377591 - MTD LTR MaLR -13 406 251 2 1074 225 272 107 36 chr5 64163266 64163434 -88373825 + MLT2D LTR ERVL 110 289 -125 2 1074 268 204 69 79 chr5 64167462 64167563 -88369696 - MLT1A LTR MaLR -264 110 11 2 1074 1308 228 36 41 chr5 64173295 64173881 -88363378 + RLTR20D LTR ERVK 49 568 0 2 1074 667 294 66 100 chr5 64175046 64175425 -88361834 - MTE2a LTR MaLR -43 376 1 2 1074 1021 263 46 76 chr5 64177670 64178040 -88359219 + MTEb LTR MaLR 8 366 -13 2 1074 1542 255 3 11 chr5 64178376 64178745 -88358514 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 2 1074 1186 214 123 20 chr5 64183134 64183508 -88353751 + MTD LTR MaLR 1 398 -21 2 1074 989 312 55 28 chr5 64186243 64186715 -88350544 - RMER5 LTR ERV1 -12 522 38 2 1074 294 188 176 0 chr5 64187297 64187382 -88349877 - RMER5 LTR ERV1 -66 468 369 3 1074 1065 182 16 9 chr5 64189758 64189977 -88347282 - MTD LTR MaLR -14 405 196 3 1074 720 224 75 12 chr5 64190294 64190483 -88346776 - MTD LTR MaLR -208 211 5 3 1074 537 321 171 52 chr5 64208619 64209059 -88328200 - MLT1H LTR MaLR -39 510 19 3 1074 315 273 63 9 chr5 64217948 64218059 -88319200 - MER57D LTR ERV1 -131 280 164 3 1074 1904 170 22 34 chr5 64218742 64219157 -88318102 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 1075 467 269 52 56 chr5 64228491 64228723 -88308536 - MLT1B LTR MaLR -83 307 77 3 1075 235 250 36 95 chr5 64229180 64229264 -88307995 - MLT1A LTR MaLR -212 162 84 3 1075 379 293 171 36 chr5 64229774 64230025 -88307234 + MLT1A0 LTR MaLR 41 325 -40 3 1075 405 317 178 0 chr5 64236493 64236701 -88300558 + ORR1E LTR MaLR 62 306 -53 3 1075 422 335 68 59 chr5 64236702 64237041 -88300218 + ORR1E LTR MaLR 1 342 -17 3 1075 4521 10 2 0 chr5 64239461 64239953 -88297306 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1075 41528 15 14 0 chr5 64239953 64245240 -88292019 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 3 1075 362 167 46 35 chr5 64245240 64245327 -88291932 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 1075 321 0 0 0 chr5 64245327 64245365 -88291894 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 1075 4521 10 2 0 chr5 64245365 64245857 -88291402 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1075 796 295 65 51 chr5 64250578 64250932 -88286327 - MLT1A LTR MaLR -6 368 10 4 1075 657 261 123 30 chr5 64251509 64251777 -88285482 - MLT-int LTR MaLR 0 1735 1443 4 1075 317 324 40 40 chr5 64251988 64252139 -88285120 - MLT-int LTR MaLR -341 1394 1244 4 1075 1476 279 68 45 chr5 64252411 64253117 -88284142 - MLT-int LTR MaLR -955 780 59 4 1075 355 274 0 19 chr5 64253156 64253264 -88283995 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 300 4 1075 363 326 100 90 chr5 64253708 64254008 -88283251 + MLT1A0 LTR MaLR 24 326 -39 4 1075 339 327 92 29 chr5 64254018 64254159 -88283100 - MLT1A1 LTR MaLR -411 184 28 4 1075 2400 90 19 0 chr5 64254159 64254480 -88282779 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1075 339 327 92 29 chr5 64254480 64254511 -88282748 - MLT1A1 LTR MaLR -568 27 1 4 1075 257 315 148 27 chr5 64255766 64256063 -88281196 - LTR82A LTR ERVL -303 569 237 4 1075 604 291 96 36 chr5 64262115 64262450 -88274809 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 4 1075 574 243 107 23 chr5 64267042 64267219 -88270040 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 164 4 1075 381 234 102 9 chr5 64267231 64267339 -88269920 - MLT1A0 LTR MaLR -240 125 8 4 1075 343 321 36 26 chr5 64268473 64268668 -88268591 + ORR1E LTR MaLR 1 197 -162 4 1075 244 302 3 47 chr5 64271329 64271447 -88265812 - MLT1C LTR MaLR 0 467 274 4 1075 2096 164 13 44 chr5 64272060 64272450 -88264809 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1075 397 283 56 28 chr5 64272765 64272943 -88264316 - MER21B LTR ERV1 -117 746 564 4 1075 271 232 12 47 chr5 64272962 64273048 -88264211 - MER21B LTR ERV1 -346 517 435 4 1075 257 284 99 18 chr5 64273435 64273546 -88263713 - MER21B LTR ERV1 -646 217 98 4 1075 4072 89 36 2 chr5 64274935 64275497 -88261762 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 4 4 1075 3397 83 22 0 chr5 64279047 64279505 -88257754 + MT2B LTR ERVL 134 601 0 4 1075 2289 126 79 3 chr5 64281260 64281626 -88255633 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1075 263 277 134 78 chr5 64285543 64285774 -88251485 - MLT1D LTR MaLR -260 245 2 4 1075 266 311 77 11 chr5 64286641 64286732 -88250527 - ORR1A4 LTR MaLR -11 368 272 4 1075 1918 101 12 92 chr5 64286951 64287278 -88249981 - ORR1A4 LTR MaLR -28 301 1 4 1075 292 309 10 41 chr5 64297002 64297100 -88240159 + MLT1A1 LTR MaLR 302 396 -12 4 1075 2450 140 103 19 chr5 64298559 64299046 -88238213 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 5 1075 422 269 101 39 chr5 64299281 64299459 -88237800 + MLT1C LTR MaLR 36 224 -243 5 1075 278 232 59 72 chr5 64323480 64323632 -88213627 + MLT1A0 LTR MaLR 214 404 -4 5 1075 245 305 27 168 chr5 64324061 64324246 -88213013 + MER21B LTR ERV1 63 221 -642 5 1075 412 270 191 44 chr5 64324249 64324501 -88212758 + MER21B LTR ERV1 468 756 -107 5 1075 491 262 26 52 chr5 64326003 64326156 -88211103 + MLT1A1 LTR MaLR 248 396 -12 5 1075 338 267 53 32 chr5 64333289 64333479 -88203780 + MLT1G1 LTR MaLR 218 468 -111 5 1075 689 211 105 6 chr5 64334348 64334519 -88202740 + ORR1C2 LTR MaLR 25 195 -164 5 1075 249 307 21 54 chr5 64335771 64335864 -88201395 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 305 5 1075 600 299 211 17 chr5 64346617 64346705 -88190554 - MER21B LTR ERV1 -125 738 647 5 1075 600 299 211 17 chr5 64346839 64347168 -88190091 - MER21B LTR ERV1 -217 646 241 5 1075 277 256 21 85 chr5 64349337 64349431 -88187828 + RLTR25A LTR ERVK 485 572 -531 5 1075 292 229 11 67 chr5 64351841 64351930 -88185329 + MLT1A LTR MaLR 38 121 -253 5 1076 1987 151 109 39 chr5 64361380 64361393 -88175866 + MTC LTR MaLR 1 13 -408 6 1076 1987 151 109 39 chr5 64361421 64361738 -88175521 + MTC LTR MaLR 14 364 -57 6 1076 1746 166 102 3 chr5 64361738 64362082 -88175177 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1076 1987 168 88 65 chr5 64362082 64362149 -88175110 + MTC LTR MaLR 326 409 -12 6 1076 303 246 86 86 chr5 64365281 64365432 -88171827 + RMER15 LTR ERVL 403 553 -22 6 1076 2146 135 49 23 chr5 64365465 64365851 -88171408 - MTC LTR MaLR -19 402 7 6 1076 2717 147 24 34 chr5 64367035 64367501 -88169758 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 6 1076 1828 118 108 36 chr5 64369063 64369398 -88167861 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 6 1076 266 279 76 23 chr5 64369788 64369920 -88167339 + LTR16A LTR ERVL 227 365 -86 6 1076 1162 323 72 8 chr5 64370511 64370986 -88166273 + MLT1D LTR MaLR 1 505 0 6 1076 1254 283 96 22 chr5 64373734 64374303 -88162956 - MLT1C-int LTR MaLR -630 741 10 6 1076 1007 229 80 20 chr5 64374306 64374659 -88162600 - MLT1C LTR MaLR 0 467 2 6 1076 4045 168 75 91 chr5 64375769 64376667 -88160592 - RMER19B LTR ERVK -17 885 1 6 1076 400 302 87 0 chr5 64378708 64378834 -88158425 + MLT1G1 LTR MaLR 139 275 -304 6 1076 1269 181 92 8 chr5 64379836 64380086 -88157173 - MTD LTR MaLR 0 419 149 6 1076 266 113 211 0 chr5 64380087 64380158 -88157101 + MTEb LTR MaLR 294 379 0 6 1076 3407 47 2 2 chr5 64382359 64382766 -88154493 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1076 390 189 26 259 chr5 64388116 64388140 -88149119 + ORR1A3-int LTR MaLR 588 735 -1228 6 1076 1291 71 12 0 chr5 64388140 64388309 -88148950 + MT2B2 LTR ERVL 1 171 -413 6 1076 1674 79 104 0 chr5 64388306 64388547 -88148712 + MT2B2 LTR ERVL 319 584 0 6 1076 268 307 221 30 chr5 64390156 64390391 -88146868 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 86 6 1076 588 285 221 11 chr5 64395102 64395365 -88141894 + MLT1G LTR MaLR 208 525 -66 6 1076 239 359 0 0 chr5 64395732 64395810 -88141449 + MLT1A LTR MaLR 65 142 -232 6 1076 678 316 100 22 chr5 64397651 64397971 -88139288 + MLT1A LTR MaLR 15 359 -15 6 1076 635 179 18 0 chr5 64399782 64399894 -88137365 + MTC LTR MaLR 1 114 -305 6 1076 1044 207 212 12 chr5 64400554 64400813 -88136446 + MTC LTR MaLR 111 421 0 6 1076 289 280 48 63 chr5 64401557 64401683 -88135576 + ORR1E LTR MaLR 5 128 -231 7 1076 408 309 90 110 chr5 64402472 64402817 -88134442 - ORR1E LTR MaLR 0 359 22 7 1076 249 310 52 87 chr5 64402852 64403025 -88134234 + RMER12 LTR ERVK 708 874 -448 7 1076 234 368 23 31 chr5 64404342 64404471 -88132788 + MLT1J LTR MaLR 15 142 -370 7 1076 1960 99 31 22 chr5 64404479 64404798 -88132461 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 7 1076 14807 20 1 19 chr5 64404798 64405886 -88131373 + ETnERV2-int LTR ERVK 1 1087 -2227 7 1076 17755 165 42 31 chr5 64406033 64408464 -88128795 + ETnERV2-int LTR ERVK 1088 3659 -3747 7 1076 17755 165 42 31 chr5 64408507 64411780 -88125479 + ETnERV2-int LTR ERVK 3660 7124 -282 7 1076 1959 99 31 22 chr5 64411780 64412099 -88125160 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 7 1076 2466 104 0 0 chr5 64412304 64412631 -88124628 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1076 691 247 41 24 chr5 64415111 64415332 -88121927 - MTD LTR MaLR 0 419 181 7 1076 234 281 0 0 chr5 64415459 64415516 -88121743 - MTD LTR MaLR -353 68 12 7 1076 609 246 120 0 chr5 64417772 64417914 -88119345 + ORR1C1 LTR MaLR 32 190 -188 7 1076 237 300 28 46 chr5 64417974 64418257 -88119002 + RMER17D2 LTR ERVK 278 555 -254 7 1076 874 195 70 65 chr5 64418159 64418373 -88118886 + ORR1C1 LTR MaLR 164 378 0 7 1076 1436 265 69 0 chr5 64419826 64420173 -88117086 - MTEa LTR MaLR -7 372 2 7 1076 463 318 98 24 chr5 64420378 64420691 -88116568 + MLT1D LTR MaLR 131 503 -2 7 1076 2385 140 46 52 chr5 64422072 64422548 -88114711 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 473 -2 7 1076 58299 16 5 10 chr5 64422548 64429060 -88108199 + IAPEz-int LTR ERVK 3 6481 0 7 1076 2385 140 46 52 chr5 64429060 64429536 -88107723 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 473 -2 7 1076 1048 282 121 3 chr5 64429592 64429930 -88107329 + MTEa LTR MaLR 1 378 -1 7 1076 369 214 38 3 chr5 64430399 64430487 -88106772 + MTEb LTR MaLR 273 379 0 7 1076 326 391 33 27 chr5 64431372 64431556 -88105703 - MLT1K LTR MaLR -16 579 395 7 1076 289 279 0 45 chr5 64433634 64433743 -88103516 + MLT1J LTR MaLR 29 165 -347 7 1076 1611 131 40 36 chr5 64437581 64437859 -88099400 + RLTR20B2 LTR ERVK 2 280 -280 7 1076 344 318 53 13 chr5 64437871 64438021 -88099238 + MLT1D LTR MaLR 290 445 -60 7 1076 413 231 67 9 chr5 64440946 64441051 -88096208 + MER74A LTR ERVL 15 125 -433 7 1076 232 276 106 71 chr5 64441178 64441291 -88095968 + MER74A LTR ERVL 388 504 -54 7 1076 3994 116 127 10 chr5 64443101 64443519 -88093740 - RMER6A LTR ERVK 0 756 324 7 1076 3994 116 127 10 chr5 64443574 64443832 -88093427 - RMER6A LTR ERVK -433 323 3 7 1076 1974 105 129 30 chr5 64444030 64444364 -88092895 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1076 333 295 191 20 chr5 64446472 64446718 -88090541 + MLT2B1 LTR ERVL 25 312 -208 7 1076 977 162 65 15 chr5 64446718 64446901 -88090358 + ORR1D1 LTR MaLR 1 193 -181 7 1076 1809 137 33 21 chr5 64446901 64447176 -88090083 - RMER6A LTR ERVK 0 756 477 7 1076 1998 104 12 51 chr5 64447176 64447511 -88089748 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 7 1076 1809 137 33 21 chr5 64447511 64447571 -88089688 - RMER6A LTR ERVK -280 476 417 7 1076 418 113 0 0 chr5 64447565 64447627 -88089632 - RMER6A LTR ERVK -636 120 59 7 1076 1010 183 5 11 chr5 64447644 64447832 -88089427 + ORR1D1 LTR MaLR 188 374 0 7 1076 851 211 76 20 chr5 64450930 64451128 -88086131 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 166 7 1076 911 171 12 17 chr5 64451308 64451481 -88085778 - ORR1D1 LTR MaLR -191 183 12 7 1076 300 197 0 0 chr5 64453033 64453094 -88084165 - LTR85a LTR Gypsy? -620 82 22 7 1076 3780 134 101 13 chr5 64456472 64457167 -88080092 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 7 1076 1567 211 92 32 chr5 64464730 64465197 -88072062 - RMER19C LTR ERVK 0 902 227 7 1076 709 182 87 11 chr5 64465331 64465514 -88071745 - RMER19C LTR ERVK -414 197 1 7 1076 3122 49 28 10 chr5 64467747 64468140 -88069119 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1076 349 281 53 82 chr5 64469679 64469988 -88067271 + MTEa LTR MaLR 56 379 0 8 1076 599 338 34 0 chr5 64471637 64471841 -88065418 + MLT1A0 LTR MaLR 149 359 -6 8 1076 2868 150 149 30 chr5 64471976 64472513 -88064746 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 8 1076 486 172 10 0 chr5 64472970 64473069 -88064190 + RMER5 LTR ERV1 2 101 -433 8 1076 1979 192 63 20 chr5 64473082 64473570 -88063689 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 2 8 1076 1615 201 89 22 chr5 64473570 64473976 -88063283 + RMER5 LTR ERV1 102 534 0 8 1076 1746 128 13 65 chr5 64477206 64477516 -88059743 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 31 8 1076 1279 245 54 0 chr5 64477727 64478041 -88059218 + ERVL-B4-int LTR ERVL 5125 5455 -259 8 1076 1248 205 115 9 chr5 64478253 64478583 -88058676 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 3 8 1076 429 319 143 25 chr5 64479236 64479557 -88057702 + LTR84b LTR ERVL 47 405 -356 8 1076 2414 182 2 5 chr5 64479650 64480070 -88057189 - MTC LTR MaLR 0 421 3 8 1076 4372 131 48 32 chr5 64481701 64482445 -88054814 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 8 1076 1819 111 38 35 chr5 64486213 64486530 -88050729 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 12 8 1077 441 190 19 48 chr5 64499887 64499992 -88037267 + RMER10A LTR ERVL 1 102 -340 8 1077 949 223 91 39 chr5 64500000 64500285 -88036974 + RMER10A LTR ERVL 137 436 -6 1 1077 462 281 52 117 chr5 64505286 64505576 -88031683 - ORR1E LTR MaLR -8 351 81 1 1077 2399 104 6 0 chr5 64506832 64507159 -88030100 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1077 275 274 0 97 chr5 64518462 64518473 -88018786 + MT2B LTR ERVL 155 156 -445 3 1077 2294 73 51 6 chr5 64518610 64518925 -88018334 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1077 558 210 108 60 chr5 64520005 64520172 -88017087 + RMER5 LTR ERV1 360 534 0 3 1077 1876 220 41 78 chr5 64521116 64521734 -88015525 + RLTR31_Mur LTR ERVK 12 553 0 4 1077 274 232 265 65 chr5 64522870 64523097 -88014162 + RMER10A LTR ERVL 1 273 -169 4 1077 273 103 4 0 chr5 64524670 64524716 -88012543 - MT2A LTR ERVL -3 530 444 5 1077 1064 194 4 101 chr5 64524736 64524983 -88012276 - MT2A LTR ERVL -309 224 2 5 1077 2511 129 10 20 chr5 64526915 64527311 -88009948 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 5 1077 2672 139 101 34 chr5 64528551 64528639 -88008620 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 450 6 1077 2672 139 101 34 chr5 64528685 64529101 -88008158 - RLTR20A LTR ERVK -92 449 4 6 1077 348 350 102 55 chr5 64530084 64530377 -88006882 - ORR1E LTR MaLR -43 316 10 6 1077 1912 109 111 10 chr5 64530829 64531126 -88006133 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1077 654 302 89 67 chr5 64532477 64532885 -88004374 + RMER13A LTR ERVK 145 607 -20 7 1077 632 180 140 26 chr5 64533296 64533455 -88003804 - MTD LTR MaLR -14 405 237 7 1077 346 296 61 88 chr5 64533421 64533467 -88003792 + MT2B LTR ERVL 130 270 -328 7 1077 261 244 123 57 chr5 64533489 64533611 -88003648 + RLTR25B LTR ERVK 442 571 -457 7 1077 425 255 86 75 chr5 64533585 64533759 -88003500 - MTD LTR MaLR -190 189 14 7 1077 230 203 68 0 chr5 64534627 64534686 -88002573 + LTR40a LTR ERVL 1 63 -456 8 1077 2297 168 11 5 chr5 64534690 64535072 -88002187 - ORR1B1 LTR MaLR -10 384 1 8 1077 419 233 114 100 chr5 64535086 64535296 -88001963 + LTR40a LTR ERVL 72 284 -235 8 1077 2022 77 0 0 chr5 64536138 64536412 -88000847 - MTB-int LTR MaLR -824 274 1 8 1077 1636 75 15 13 chr5 64536414 64536642 -88000617 - MTB LTR MaLR -2 398 135 8 1077 264 242 20 59 chr5 64542467 64542487 -87994772 + MT2B2 LTR ERVL 144 159 -425 9 1077 2545 152 12 33 chr5 64542918 64543346 -87993913 - MTC LTR MaLR -2 419 1 9 1077 2287 164 35 21 chr5 64546636 64547059 -87990200 + RMER10A LTR ERVL 1 429 -13 1 1077 1532 238 71 13 chr5 64556362 64556758 -87980501 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1077 241 270 77 39 chr5 64557012 64557116 -87980143 - ORR1E LTR MaLR -248 111 4 1 1077 437 254 0 26 chr5 64558105 64558218 -87979041 - MTEb LTR MaLR 0 379 270 1 1077 501 320 17 19 chr5 64559765 64559978 -87977281 + LTR40a LTR ERVL 2 223 -239 1 1077 1182 237 185 27 chr5 64562801 64562829 -87974430 - RLTR20A2 LTR ERVK -17 561 535 1 1077 1182 237 185 27 chr5 64562866 64563318 -87973941 - RLTR20A2 LTR ERVK -44 534 5 1 1077 862 299 76 45 chr5 64570899 64571256 -87966003 - MTEb LTR MaLR -9 370 3 1 1077 298 205 167 67 chr5 64573186 64573306 -87963953 - MLT2B4 LTR ERVL -424 132 1 1 1077 513 213 0 36 chr5 64576102 64576214 -87961045 + ORR1D1 LTR MaLR 259 366 -8 1 1077 551 261 36 12 chr5 64583306 64583473 -87953786 + ORR1D2 LTR MaLR 22 192 -178 1 1077 791 272 19 148 chr5 64597681 64598108 -87939151 + MTE2b LTR MaLR 8 379 0 2 1077 477 179 69 34 chr5 64600360 64600536 -87936723 - RMER4B LTR ERVK -194 272 74 2 1077 327 252 10 76 chr5 64602878 64603009 -87934250 + MLT1A1 LTR MaLR 241 408 0 2 1077 242 280 88 36 chr5 64607486 64607623 -87929636 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 265 2 1077 2526 105 108 22 chr5 64612127 64612544 -87924715 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 2 1077 2997 184 16 27 chr5 64613730 64613929 -87923330 - RMER15 LTR ERVL 0 575 381 2 1077 2997 184 16 27 chr5 64614130 64614478 -87922781 - RMER15 LTR ERVL -195 380 34 2 1077 2127 144 10 67 chr5 64614790 64614862 -87922397 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 308 2 1077 2127 144 10 67 chr5 64615046 64615374 -87921885 - ORR1C1 LTR MaLR -71 307 1 2 1077 977 254 39 51 chr5 64616869 64617126 -87920133 - MTEa LTR MaLR -108 271 18 2 1078 439 327 43 48 chr5 64618774 64618983 -87918276 - MER21B LTR ERV1 -61 802 595 2 1078 595 299 167 10 chr5 64619080 64619192 -87918067 - MER21B LTR ERV1 -266 597 466 2 1078 595 299 167 10 chr5 64619399 64619580 -87917679 - MER21B LTR ERV1 -398 465 258 2 1078 427 256 89 26 chr5 64620307 64620460 -87916799 + MLT1F2 LTR MaLR 40 249 -346 2 1078 243 216 27 95 chr5 64622348 64622496 -87914763 + RMER17A LTR ERVK 329 466 -285 2 1078 591 263 191 68 chr5 64639707 64640090 -87897169 - MER21B LTR ERV1 -202 661 232 2 1078 1319 139 21 17 chr5 64640282 64640516 -87896743 + RLTR22_Mus LTR ERVK 504 738 -1070 3 1078 583 256 91 0 chr5 64653708 64653884 -87883375 - MTE2a LTR MaLR -179 200 9 3 1078 2619 131 33 0 chr5 64657793 64658190 -87879069 - MTC LTR MaLR -11 410 1 3 1078 2366 137 65 8 chr5 64673788 64674186 -87863073 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1078 279 253 33 98 chr5 64677700 64677792 -87859467 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 3 1078 4290 87 7 2 chr5 64685033 64685606 -87851653 + MT2B2 LTR ERVL 1 576 -8 3 1078 245 329 0 0 chr5 64685826 64685899 -87851360 - MLT1J LTR MaLR -340 172 100 3 1078 246 274 14 14 chr5 64690839 64690913 -87846346 + MLT1A LTR MaLR 3 76 -298 3 1078 4149 129 28 52 chr5 64695759 64696533 -87840726 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 3 1078 776 223 199 79 chr5 64705663 64705980 -87831279 - MTD LTR MaLR 0 419 65 4 1078 1136 206 60 50 chr5 64709526 64709933 -87827326 - BGLII_B LTR ERVK -12 433 1 4 1078 276 288 15 0 chr5 64713374 64713440 -87823819 - MLT1D LTR MaLR 0 505 439 4 1078 242 310 133 62 chr5 64714663 64714873 -87822386 - MLT1D LTR MaLR -269 236 12 4 1078 1266 229 19 120 chr5 64719949 64720366 -87816893 + MTE2a LTR MaLR 2 376 -3 4 1078 240 308 37 128 chr5 64724751 64724915 -87812344 - LTR86B1 LTR ERVL -160 333 185 4 1078 322 248 168 64 chr5 64731637 64731869 -87805390 - MLT2B3 LTR ERVL -65 652 414 4 1078 276 347 79 15 chr5 64732282 64732484 -87804775 - MLT2B3 LTR ERVL -339 331 117 4 1078 745 300 96 8 chr5 64735029 64735268 -87801991 + MTE2b LTR MaLR 1 260 -119 4 1078 365 250 144 29 chr5 64735444 64735609 -87801650 + MTEb LTR MaLR 208 379 0 4 1078 320 319 120 7 chr5 64743537 64743679 -87793580 - MLT2E LTR ERVL -468 160 3 4 1078 766 254 22 11 chr5 64745915 64746098 -87791161 + MTE2a LTR MaLR 195 379 0 4 1079 3208 54 8 3 chr5 64752066 64752458 -87784801 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 4 1079 8455 66 7 4 chr5 64752461 64753555 -87783704 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1079 268 272 73 42 chr5 64757272 64757368 -87779891 - MLT1A LTR MaLR -220 154 56 4 1079 816 196 174 51 chr5 64758179 64758332 -87778927 + MTEa LTR MaLR 1 181 -198 4 1079 816 217 324 33 chr5 64758356 64758510 -87778749 + MTEa LTR MaLR 182 372 -7 4 1079 546 356 102 47 chr5 64758511 64759197 -87778062 - LTR78 LTR ERV1 -62 1242 519 4 1079 366 335 73 30 chr5 64761332 64761744 -87775515 + MLT1J LTR MaLR 13 481 -31 4 1079 2196 168 37 27 chr5 64762286 64762495 -87774764 - MTC LTR MaLR -13 408 205 4 1079 2196 168 37 27 chr5 64762518 64762712 -87774547 - MTC LTR MaLR -217 204 1 4 1079 730 278 205 26 chr5 64763203 64763506 -87773753 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 7 4 1079 228 370 11 0 chr5 64764308 64764400 -87772859 + MLT1J LTR MaLR 38 130 -382 4 1079 305 276 26 0 chr5 64764461 64764537 -87772722 + MLT1J LTR MaLR 242 319 -193 4 1079 339 355 61 44 chr5 64767097 64767277 -87769982 - LTR79 LTR ERVL -344 183 1 4 1079 3409 38 5 0 chr5 64775187 64775581 -87761678 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1079 859 277 104 8 chr5 64776766 64777017 -87760242 - MTEa LTR MaLR -2 377 103 5 1079 391 320 38 45 chr5 64777225 64777382 -87759877 - ORR1D2 LTR MaLR -214 156 1 5 1079 1020 316 70 6 chr5 64777382 64777690 -87759569 - ORR1D2-int LTR MaLR -53 1527 1199 5 1079 1522 311 78 68 chr5 64778395 64778731 -87758528 - ORR1D2-int LTR MaLR -893 687 336 5 1079 1522 311 78 68 chr5 64778875 64779218 -87758041 - ORR1D2-int LTR MaLR -1245 335 1 5 1079 242 279 41 83 chr5 64779320 64779441 -87757818 - MTEb LTR MaLR -60 319 204 5 1079 1483 184 189 77 chr5 64779708 64780185 -87757074 - RLTR20C LTR ERVK -3 575 1 5 1079 1800 201 94 5 chr5 64786228 64786612 -87750647 - MTD LTR MaLR -1 418 1 5 1079 731 204 23 9 chr5 64790605 64790772 -87746487 + MTD LTR MaLR 250 402 -17 5 1079 1066 247 72 89 chr5 64790821 64791168 -87746091 + ORR1E LTR MaLR 6 346 -13 5 1079 536 313 47 79 chr5 64791748 64792129 -87745130 - MLT1H LTR MaLR -168 381 13 5 1079 549 231 244 68 chr5 64802539 64802818 -87734441 + MTD LTR MaLR 3 330 -89 5 1079 383 167 15 0 chr5 64802846 64802912 -87734347 - MTEa LTR MaLR -311 68 2 5 1079 2260 180 32 12 chr5 64804504 64804909 -87732350 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 1079 710 128 142 47 chr5 64805034 64805182 -87732077 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 209 5 1079 2248 99 12 12 chr5 64807527 64807854 -87729405 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1079 4064 197 37 67 chr5 64807854 64809010 -87728249 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 359 5 1079 2101 111 14 72 chr5 64809010 64809359 -87727900 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1079 4064 222 62 32 chr5 64809359 64809525 -87727734 - ORR1A2-int LTR MaLR -1012 358 195 5 1079 1661 87 17 0 chr5 64809549 64809780 -87727479 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 93 5 1079 733 114 27 12 chr5 64810097 64810227 -87727032 - ORR1A2 LTR MaLR -241 137 1 5 1079 243 232 44 182 chr5 64810227 64810293 -87726966 - ORR1A2-int LTR MaLR -1275 95 43 5 1079 243 232 44 182 chr5 64810383 64810430 -87726829 - ORR1A2-int LTR MaLR -1328 42 1 5 1079 561 241 59 147 chr5 64810433 64810494 -87726765 - ORR1A2 LTR MaLR -7 367 308 5 1079 561 241 59 147 chr5 64810680 64810822 -87726437 - ORR1A2 LTR MaLR -67 307 182 5 1079 2812 247 162 56 chr5 64810820 64811853 -87725406 + MTD-int LTR MaLR 113 1254 -4 5 1079 1109 279 72 33 chr5 64811860 64812253 -87725006 + MTD LTR MaLR 5 404 -15 5 1079 324 330 150 19 chr5 64815498 64815705 -87721554 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 130 5 1079 371 306 44 7 chr5 64816084 64816219 -87721040 - MLT1A0 LTR MaLR -223 142 3 5 1079 715 326 63 95 chr5 64816229 64816660 -87720599 - MLT1A0-int LTR MaLR -55 1525 964 5 1079 1060 193 5 29 chr5 64817087 64817295 -87719964 + ORR1C2 LTR MaLR 180 382 -2 5 1079 3059 34 2 116 chr5 64817295 64817733 -87719526 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 5 1079 17159 27 5 3 chr5 64817745 64819686 -87717573 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1984 -3 5 1079 2954 39 2 117 chr5 64819688 64820124 -87717135 + RLTR10 LTR ERVK 1 386 -4 5 1079 2595 197 25 55 chr5 64824922 64825457 -87711802 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 1079 373 396 32 55 chr5 64825826 64826121 -87711138 - MLT1I LTR MaLR 0 411 119 6 1079 1551 204 132 0 chr5 64826121 64826454 -87710805 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 6 1079 373 396 32 55 chr5 64826454 64826505 -87710754 - MLT1I LTR MaLR -293 118 73 6 1079 292 405 58 0 chr5 64829317 64829490 -87707769 - LTR33 LTR ERVL 0 515 333 6 1079 3477 25 5 0 chr5 64834042 64834436 -87702823 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1079 422 230 71 45 chr5 64835663 64835818 -87701441 + MLT1A0 LTR MaLR 1 159 -206 6 1079 629 272 44 0 chr5 64835956 64836114 -87701145 + MLT1A0 LTR MaLR 201 365 0 6 1079 2036 136 9 58 chr5 64836790 64837133 -87700126 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 6 1079 1885 156 20 11 chr5 64842326 64842677 -87694582 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 6 1079 443 278 15 8 chr5 64845616 64845750 -87691509 - MTE-int LTR MaLR -1417 163 29 6 1079 934 268 124 21 chr5 64855066 64855486 -87681773 - MLT1C LTR MaLR 0 467 5 6 1079 963 216 42 17 chr5 64855592 64855832 -87681427 + RLTR15 LTR ERVK 1 246 -113 6 1079 339 291 9 19 chr5 64856170 64856275 -87680984 + MLT1D LTR MaLR 244 347 -158 6 1079 2207 133 75 0 chr5 64856564 64856939 -87680320 + MTC LTR MaLR 1 403 -18 6 1079 280 229 98 62 chr5 64860323 64860435 -87676824 - MT2B LTR ERVL -337 264 149 6 1079 229 137 19 56 chr5 64861883 64861937 -87675322 + RLTR11A LTR ERVK 125 176 -352 6 1079 2312 107 113 0 chr5 64862336 64862690 -87674569 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1079 273 294 136 38 chr5 64864923 64865107 -87672152 - LTR81C LTR ERV1? -7 1146 945 6 1079 226 378 0 40 chr5 64865503 64865627 -87671632 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -781 408 290 6 1079 348 282 62 18 chr5 64866639 64866751 -87670508 - MTE2b LTR MaLR -224 155 39 6 1079 520 211 11 0 chr5 64866730 64866825 -87670434 - MTE2b LTR MaLR -281 98 3 6 1079 1988 167 76 20 chr5 64867396 64867793 -87669466 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1079 4376 121 45 22 chr5 64871409 64872145 -87665114 - RMER6A LTR ERVK 0 756 4 7 1079 1184 187 205 6 chr5 64872210 64872522 -87664737 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1079 499 281 58 7 chr5 64874323 64874477 -87662782 + MLT1F LTR MaLR 1 162 -386 7 1079 399 312 134 19 chr5 64874657 64874814 -87662445 + MLT1F LTR MaLR 286 460 -88 7 1079 964 327 156 37 chr5 64874995 64875991 -87661268 + MLT1F-int LTR MaLR 156 1269 -220 7 1079 548 278 76 85 chr5 64876289 64876525 -87660734 + MLT1F LTR MaLR 15 248 -300 7 1079 238 260 77 39 chr5 64876533 64876637 -87660622 + MLT1F LTR MaLR 462 569 0 7 1079 233 262 49 12 chr5 64876697 64876778 -87660481 - MTEb LTR MaLR -2 377 294 7 1079 467 309 83 22 chr5 64877459 64877687 -87659572 + RMER15 LTR ERVL 319 560 -15 7 1080 312 300 16 86 chr5 64886163 64886349 -87650910 + MER65-int LTR ERV1 4605 4777 -94 7 1080 2501 172 62 64 chr5 64890238 64890772 -87646487 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 7 1080 236 146 0 40 chr5 64893980 64894030 -87643229 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 357 7 1080 294 279 206 51 chr5 64894658 64894911 -87642348 + MLT1B LTR MaLR 91 382 -8 7 1080 893 244 122 47 chr5 64898600 64898944 -87638315 + MTEa LTR MaLR 3 372 -7 7 1080 399 350 113 12 chr5 64903330 64903587 -87633672 - MLT1J LTR MaLR -127 385 103 7 1080 323 323 158 25 chr5 64907320 64907759 -87629500 - LTR50 LTR ERVL -178 617 23 7 1080 2969 136 17 45 chr5 64911930 64912468 -87624791 - RLTR28 LTR ERVL -1 523 1 7 1080 1485 188 130 110 chr5 64917576 64918103 -87619156 + RMER19B LTR ERVK 1 714 -188 7 1080 313 351 68 36 chr5 64918955 64919147 -87618112 + LTR16E2 LTR ERVL 369 566 -2 7 1080 326 260 8 60 chr5 64919763 64919876 -87617383 + MLT1C LTR MaLR 60 175 -215 7 1080 307 292 65 130 chr5 64919933 64920173 -87617086 + MLT1C LTR MaLR 176 390 0 7 1080 1689 198 20 20 chr5 64920502 64920848 -87616411 + ORR1A4 LTR MaLR 9 354 -40 7 1080 9852 138 16 84 chr5 64920838 64922896 -87614363 + ORR1A4-int LTR MaLR 46 1963 0 7 1080 1887 125 0 154 chr5 64922896 64923285 -87613974 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1080 3884 105 56 2 chr5 64924648 64925202 -87612057 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 8 1080 1406 229 33 52 chr5 64925227 64925710 -87611549 + RLTR20A LTR ERVK 67 540 -1 8 1080 585 240 222 18 chr5 64926259 64926607 -87610652 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 8 1080 698 293 48 46 chr5 64931976 64932336 -87604923 - MTE2a LTR MaLR -54 365 1 8 1080 512 243 9 0 chr5 64933476 64933583 -87603676 + MTEa LTR MaLR 8 115 -264 8 1080 3214 80 37 116 chr5 64935172 64935735 -87601524 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 8 1080 1048 250 60 18 chr5 64942983 64943264 -87593995 + MTEa LTR MaLR 87 379 0 8 1080 797 289 96 60 chr5 64944130 64944495 -87592764 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 8 1080 354 319 42 0 chr5 64944526 64944645 -87592614 + LTR16A LTR ERVL 230 353 -98 8 1080 894 132 78 18 chr5 64945416 64945689 -87591570 + ORR1A4 LTR MaLR 1 360 -14 8 1080 260 311 172 71 chr5 64948146 64948513 -87588746 + LTR81B LTR ERV1? 981 1384 -9 8 1080 2865 26 45 6 chr5 64949199 64949552 -87587707 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 8 1080 55043 33 16 3 chr5 64949552 64955948 -87581311 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 8 1080 2865 26 45 6 chr5 64955948 64956301 -87580958 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 8 1080 748 210 71 35 chr5 64956337 64956653 -87580606 - RMER19B LTR ERVK -261 350 1 8 1080 321 259 11 148 chr5 64957814 64957963 -87579296 + MLT1F2 LTR MaLR 10 149 -411 8 1080 505 238 166 25 chr5 64959623 64959864 -87577395 + ORR1E LTR MaLR 43 317 -42 8 1080 270 262 12 36 chr5 64960797 64960880 -87576379 - LTR40b LTR ERVL -59 403 323 8 1080 385 315 94 29 chr5 64960914 64961084 -87576175 - MTEa LTR MaLR -4 375 195 8 1080 310 266 10 41 chr5 64961471 64961569 -87575690 - MTEa LTR MaLR -281 98 4 8 1080 243 338 107 7 chr5 64961698 64961762 -87575497 - LTR40b LTR ERVL -362 157 81 8 1080 243 338 107 7 chr5 64961983 64962058 -87575201 - LTR40b LTR ERVL -439 80 4 8 1080 2484 122 25 50 chr5 64962213 64962617 -87574642 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 1080 1130 257 4 4 chr5 64981202 64981456 -87555803 - MTEa-int LTR MaLR -1319 261 8 8 1080 718 312 118 9 chr5 64981467 64981806 -87555453 - MTEa LTR MaLR -3 376 1 8 1080 574 347 118 60 chr5 64982085 64982566 -87554693 - MLT1F2 LTR MaLR -5 543 35 8 1080 1138 274 54 40 chr5 64985124 64985553 -87551706 + MLT1C LTR MaLR 1 435 -32 8 1080 3182 68 0 17 chr5 64988968 64989375 -87547884 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1080 1298 263 34 58 chr5 64996479 64996859 -87540400 + MTE2b LTR MaLR 1 371 -8 9 1080 715 296 69 4 chr5 64998272 64998533 -87538726 - MLT1B LTR MaLR -5 385 108 9 1080 1940 212 29 22 chr5 64998535 64999027 -87538232 + RLTR16 LTR ERVK 6 500 -5 9 1080 776 133 16 0 chr5 64999871 64999999 -87537260 - RMER6A LTR ERVK 0 756 627 9 1080 3431 124 78 14 chr5 65000000 65000587 -87536672 - RMER6A LTR ERVK -131 625 1 1 1080 710 269 62 142 chr5 65003812 65003963 -87533296 + MLT1A1 LTR MaLR 1 154 -254 6 1080 710 269 62 142 chr5 65004109 65004281 -87532978 + MLT1A1 LTR MaLR 155 298 -110 6 1080 472 292 176 40 chr5 65008893 65009171 -87528088 + MLT1B LTR MaLR 1 316 -74 1 1080 789 301 53 80 chr5 65009835 65010196 -87527063 - MLT2D LTR ERVL -63 351 1 1 1080 1146 230 61 127 chr5 65011074 65011189 -87526070 + ORR1D2 LTR MaLR 3 128 -242 1 1080 2602 145 19 12 chr5 65011189 65011607 -87525652 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 16 1146 230 61 127 chr5 65011607 65011814 -87525445 + ORR1D2 LTR MaLR 129 313 -57 1 1081 1146 230 61 127 chr5 65011960 65012030 -87525229 + ORR1D2 LTR MaLR 314 370 0 1 1081 563 131 101 18 chr5 65012420 65012529 -87524730 + RMER17C LTR ERVK 293 410 0 2 1081 522 230 45 68 chr5 65012912 65013089 -87524170 - MTEa LTR MaLR -4 375 203 2 1081 542 253 113 93 chr5 65013135 65013392 -87523867 - ORR1E LTR MaLR -108 262 1 2 1081 1604 163 48 72 chr5 65013633 65014050 -87523209 + RMER17C LTR ERVK 4 410 0 2 1081 528 317 71 6 chr5 65023934 65024027 -87513232 + ORR1E LTR MaLR 4 107 -252 4 1081 528 271 31 22 chr5 65024048 65024200 -87513059 + ORR1E LTR MaLR 108 354 -25 4 1081 255 388 82 36 chr5 65028686 65028881 -87508378 - ORR1E LTR MaLR -155 204 1 6 1081 312 310 45 85 chr5 65028941 65029301 -87507958 + MLT1J2 LTR MaLR 1 421 -27 6 1081 226 253 253 0 chr5 65031730 65031821 -87505438 + MLT1K LTR MaLR 327 440 -155 7 1081 476 301 75 34 chr5 65032479 65032703 -87504556 + RLTR12B LTR ERVK 1 238 -290 7 1081 476 311 60 29 chr5 65032739 65032866 -87504393 + RLTR12B LTR ERVK 105 279 -249 7 1081 273 250 79 53 chr5 65033275 65033389 -87503870 + MLT1H LTR MaLR 71 187 -362 7 1081 3953 167 116 67 chr5 65035486 65036346 -87500913 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 8 1081 1823 114 135 0 chr5 65036989 65037286 -87499973 - MTC LTR MaLR -84 337 1 8 1081 1959 173 17 17 chr5 65040534 65040893 -87496366 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 9 1081 1982 130 15 50 chr5 65041329 65041670 -87495589 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 1081 357 240 30 104 chr5 65043170 65043305 -87493954 + MT2B LTR ERVL 141 265 -336 1 1081 572 275 69 60 chr5 65049024 65049256 -87488003 - ORR1E LTR MaLR -94 265 32 1 1081 407 258 65 24 chr5 65049688 65049811 -87487448 + MLT1A LTR MaLR 27 154 -220 1 1081 770 337 66 18 chr5 65050604 65050936 -87486323 - LTR33 LTR ERVL -159 356 9 1 1081 276 319 72 92 chr5 65054770 65054922 -87482337 + RMER21A LTR ERV1 577 842 -105 1 1081 748 266 75 115 chr5 65057320 65057651 -87479608 - MLT1B LTR MaLR -42 348 31 1 1081 246 267 17 129 chr5 65057955 65058071 -87479188 + MT2B LTR ERVL 154 256 -345 1 1081 262 270 0 98 chr5 65072316 65072398 -87464861 + MLT1A LTR MaLR 4 77 -297 1 1081 241 335 99 35 chr5 65072412 65072613 -87464646 + MLT1A LTR MaLR 143 356 -18 1 1081 497 291 45 32 chr5 65074606 65074762 -87462497 + MLT1A LTR MaLR 19 176 -198 1 1081 1174 155 106 18 chr5 65074868 65075085 -87462174 + RLTR42 LTR ERVK 2 237 -2 1 1081 232 258 84 63 chr5 65079316 65079411 -87457848 - MLT1B LTR MaLR -8 382 286 1 1081 2499 120 28 10 chr5 65079516 65079903 -87457356 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1081 1831 161 129 110 chr5 65084134 65084624 -87452635 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 1 1081 422 258 0 29 chr5 65085154 65085276 -87451983 + MLT1A1 LTR MaLR 248 408 0 1 1081 1043 243 100 12 chr5 65088553 65088882 -87448377 + ORR1E LTR MaLR 1 358 -1 1 1081 2049 125 125 27 chr5 65090621 65090990 -87446269 + MTB_Mm LTR MaLR 3 407 0 1 1081 1421 272 106 8 chr5 65092997 65093467 -87443792 - LTR33A_ LTR ERVL -7 524 9 2 1081 269 231 0 161 chr5 65093971 65094064 -87443195 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 495 2 1081 988 293 66 56 chr5 65108010 65108404 -87428855 + MLT1C LTR MaLR 50 447 -20 2 1081 2306 83 3 84 chr5 65111050 65111117 -87426142 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 269 2 1081 2306 83 3 84 chr5 65111330 65111618 -87425641 - ORR1A2 LTR MaLR -59 268 1 2 1081 3337 43 5 2 chr5 65111926 65112321 -87424938 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1081 2626 148 212 3 chr5 65112467 65113038 -87424221 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 1081 513 342 68 26 chr5 65113420 65113759 -87423500 + MLT1H LTR MaLR 13 365 -184 2 1081 2338 119 3 0 chr5 65114123 65114451 -87422808 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1081 1042 188 5 9 chr5 65114451 65114661 -87422598 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 209 -1754 2 1081 802 210 0 12 chr5 65114655 65114824 -87422435 - ORR1B2 LTR MaLR -200 167 1 2 1081 909 258 207 3 chr5 65114907 65115245 -87422014 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1081 1923 153 41 9 chr5 65115196 65115539 -87421720 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 2 1081 829 280 100 64 chr5 65115623 65116073 -87421186 - MLT1D LTR MaLR -9 496 31 2 1081 1698 119 253 0 chr5 65116077 65116370 -87420889 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1081 1975 238 30 115 chr5 65116371 65116807 -87420452 + ORR1B2-int LTR MaLR 2 399 -971 2 1081 1975 238 30 115 chr5 65116952 65117142 -87420117 + ORR1B2-int LTR MaLR 400 575 -795 2 1081 418 136 193 5 chr5 65117140 65117283 -87419976 + ORR1B2-int LTR MaLR 1405 1527 -53 2 1081 549 155 0 0 chr5 65117283 65117386 -87419873 + ORR1B2 LTR MaLR 1 103 -264 2 1081 641 111 0 0 chr5 65117386 65117485 -87419774 + ORR1B2 LTR MaLR 269 367 0 2 1081 736 285 146 73 chr5 65119046 65119099 -87418160 + MLT1F LTR MaLR 1 58 -490 2 1081 736 285 146 73 chr5 65119144 65119529 -87417730 + MLT1F LTR MaLR 59 471 -77 2 1081 1630 135 239 3 chr5 65124116 65124413 -87412846 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1081 509 188 139 165 chr5 65128371 65128556 -87408703 + ORR1C1 LTR MaLR 1 164 -214 2 1081 509 188 139 165 chr5 65128664 65128708 -87408551 + ORR1C1 LTR MaLR 165 224 -154 2 1081 2467 157 31 14 chr5 65133064 65133478 -87403781 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1081 1279 229 93 20 chr5 65134155 65134498 -87402761 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 3 1081 329 213 26 13 chr5 65134498 65134574 -87402685 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 77 -1293 3 1081 1797 181 33 72 chr5 65134575 65134776 -87402483 + MTD LTR MaLR 1 210 -209 3 1081 1797 181 33 72 chr5 65135051 65135277 -87401982 + MTD LTR MaLR 211 411 -8 3 1081 4050 235 72 48 chr5 65135280 65136379 -87400880 + ORR1D2-int LTR MaLR 73 1189 -181 3 1081 4050 235 72 48 chr5 65136402 65136531 -87400728 + ORR1D2-int LTR MaLR 1190 1330 -40 3 1081 914 275 98 11 chr5 65136546 65136833 -87400426 + ORR1D2 LTR MaLR 1 312 -58 3 1081 273 180 0 0 chr5 65137019 65137069 -87400190 + ORR1D2 LTR MaLR 317 366 -8 3 1082 448 95 0 0 chr5 65146091 65146154 -87391105 + MTC LTR MaLR 1 63 -358 3 1082 470 186 0 38 chr5 65146157 65146263 -87390996 + MTC LTR MaLR 320 421 0 3 1082 737 230 60 57 chr5 65146322 65146654 -87390605 - RLTR15 LTR ERVK -26 333 1 3 1082 4597 165 128 87 chr5 65146654 65146794 -87390465 + MTC-int LTR MaLR 36 173 -1085 3 1082 4597 165 128 87 chr5 65146945 65147761 -87389498 + MTC-int LTR MaLR 174 1076 -182 3 1082 4597 165 128 87 chr5 65147908 65148086 -87389173 + MTC-int LTR MaLR 1077 1217 -41 3 1082 374 178 0 0 chr5 65148086 65148159 -87389100 + MTC LTR MaLR 1 73 -348 3 1082 437 145 12 12 chr5 65148165 65148249 -87389010 + MTC LTR MaLR 330 413 -8 3 1082 587 295 72 98 chr5 65150698 65151033 -87386226 + MTEa LTR MaLR 1 326 -53 3 1082 2157 155 51 15 chr5 65151622 65152015 -87385244 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1082 1212 232 72 20 chr5 65153559 65153907 -87383352 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 3 1082 2186 206 45 67 chr5 65154007 65154270 -87382989 + ORR1D-int LTR MaLR 34 269 -1101 3 1082 2186 206 45 67 chr5 65154301 65154666 -87382593 + ORR1D-int LTR MaLR 270 648 -722 3 1082 2210 138 129 15 chr5 65156005 65156462 -87380797 + RLTR11A2 LTR ERVK 19 527 0 3 1082 2189 123 25 0 chr5 65157392 65157710 -87379549 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 1082 369 179 63 111 chr5 65158940 65159066 -87378193 - MT2B LTR ERVL -322 279 160 3 1082 1660 199 224 55 chr5 65159571 65160313 -87376946 + RMER6C LTR ERVK 4 720 0 3 1082 780 213 75 0 chr5 65160806 65160994 -87376265 + ORR1D2 LTR MaLR 158 359 -11 3 1082 252 270 137 51 chr5 65163201 65163318 -87373941 - MTEa LTR MaLR -250 129 3 3 1082 1783 161 34 31 chr5 65164688 65165041 -87372218 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 3 1082 3991 41 19 0 chr5 65165736 65166202 -87371057 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 1082 1178 218 161 19 chr5 65166701 65167024 -87370235 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 3 1082 3064 214 119 27 chr5 65167029 65168282 -87368977 - ORR1D2-int LTR MaLR -2 1368 1 3 1082 353 211 0 27 chr5 65169356 65169429 -87367830 - RLTR25A LTR ERVK -511 592 522 3 1082 412 159 10 83 chr5 65169372 65169468 -87367791 - MT2B LTR ERVL -344 257 169 3 1082 746 167 74 6 chr5 65170092 65170255 -87367004 - ORR1D2 LTR MaLR -191 176 3 3 1082 254 322 83 68 chr5 65170365 65170710 -87366549 + MLT1A LTR MaLR 1 359 0 3 1082 280 264 28 0 chr5 65171570 65171642 -87365617 - ORR1E LTR MaLR -221 138 65 3 1082 702 184 0 54 chr5 65174318 65174405 -87362854 + MT2A LTR ERVL 376 462 -71 4 1082 702 184 0 54 chr5 65174458 65174537 -87362722 + MT2A LTR ERVL 463 533 0 4 1082 452 174 76 0 chr5 65174541 65174633 -87362626 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5 103 -5658 4 1082 1639 164 42 29 chr5 65174626 65174866 -87362393 + MERVL_2A-int LTR ERVL 205 456 -5305 4 1082 1639 164 42 29 chr5 65175081 65175147 -87362112 + MERVL_2A-int LTR ERVL 457 515 -5246 4 1082 1958 133 21 18 chr5 65175155 65175483 -87361776 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1082 6460 122 24 27 chr5 65175483 65176758 -87360501 - ORR1A4-int LTR MaLR -191 1772 795 4 1082 1406 131 208 0 chr5 65176817 65177025 -87360234 - MT2B LTR ERVL -342 259 3 4 1082 23076 142 76 41 chr5 65177026 65177734 -87359525 + MERVL_2A-int LTR ERVL 531 1284 -4477 4 1082 23076 142 76 41 chr5 65177838 65179874 -87357385 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1285 3454 -2307 4 1082 3522 132 209 8 chr5 65179874 65180486 -87356773 - RMER19A LTR ERVK 0 737 3 4 1082 23076 142 76 41 chr5 65180486 65181644 -87355615 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3455 4676 -1085 4 1082 1011 198 130 106 chr5 65181684 65182137 -87355122 + MT2B LTR ERVL 1 599 -2 4 1082 2835 140 158 76 chr5 65186040 65186678 -87350581 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 1082 607 284 217 27 chr5 65188226 65188526 -87348733 + MTEa LTR MaLR 21 377 -2 4 1082 316 361 147 10 chr5 65188617 65188821 -87348438 - MLT1L LTR MaLR -225 385 154 4 1082 1364 157 147 67 chr5 65189044 65189344 -87347915 + ORR1A3 LTR MaLR 1 324 -2 4 1082 2420 133 3 3 chr5 65189344 65189722 -87347537 + ORR1A3-int LTR MaLR 3 380 -1583 4 1082 489 203 54 47 chr5 65189952 65190081 -87347178 + ORR1D2 LTR MaLR 1 130 -240 4 1082 2416 155 31 61 chr5 65190096 65190871 -87346388 - RMER6C LTR ERVK 0 756 56 4 1082 776 206 62 47 chr5 65190888 65191081 -87346178 + ORR1D2 LTR MaLR 170 365 -5 4 1082 4957 219 92 11 chr5 65191086 65192354 -87344905 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 1370 0 4 1082 966 253 109 24 chr5 65192355 65192695 -87344564 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 4 1082 593 228 203 37 chr5 65209457 65209698 -87327561 - MTD LTR MaLR -133 286 6 4 1082 1246 209 95 65 chr5 65224434 65224864 -87312395 - MTD-int LTR MaLR -815 443 1 4 1082 1545 199 44 93 chr5 65224877 65225056 -87312203 - MTD LTR MaLR -30 389 211 4 1082 1545 199 44 93 chr5 65225241 65225470 -87311789 - MTD LTR MaLR -209 210 1 4 1082 410 155 46 55 chr5 65225749 65225858 -87311401 + MLT1A1 LTR MaLR 300 407 -1 4 1082 344 270 239 0 chr5 65226898 65227057 -87310202 - MTE-int LTR MaLR -57 1523 1327 4 1082 318 248 58 19 chr5 65227061 65227164 -87310095 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 322 4 1082 1529 217 34 13 chr5 65227214 65227601 -87309658 + RLTR22_Mur LTR ERVK 415 809 -1039 4 1082 417 256 14 43 chr5 65227639 65227778 -87309481 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1581 1715 -133 4 1082 707 166 79 6 chr5 65227817 65227981 -87309278 - MTE-int LTR MaLR -1404 176 1 4 1082 431 292 99 0 chr5 65228136 65228297 -87308962 - ORR1E LTR MaLR -182 177 1 4 1082 1333 162 283 30 chr5 65230372 65230740 -87306519 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 5 1082 253 155 51 17 chr5 65231981 65232040 -87305219 - MTC LTR MaLR 0 421 361 5 1082 1461 225 39 31 chr5 65232040 65232398 -87304861 - ORR1B1 LTR MaLR -1 369 9 5 1082 269 224 35 12 chr5 65232440 65232526 -87304733 - ORR1B1-int LTR MaLR -42 1328 1241 5 1082 4128 164 75 106 chr5 65232695 65233626 -87303633 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 1082 1202 150 26 22 chr5 65234812 65235044 -87302215 - ORR1B1-int LTR MaLR -112 1258 1026 5 1082 963 239 98 4 chr5 65235045 65235322 -87301937 - ORR1B1-int LTR MaLR -1067 303 1 5 1082 1205 231 64 38 chr5 65235322 65235692 -87301567 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 15 5 1082 6043 169 122 29 chr5 65235692 65237073 -87300186 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1 5 1082 2121 154 45 11 chr5 65237073 65237453 -87299806 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 2 5 1082 349 277 0 47 chr5 65237454 65237560 -87299699 - ORR1D2 LTR MaLR -267 103 3 5 1082 1405 241 55 9 chr5 65237562 65237905 -87299354 - MTD LTR MaLR -58 361 3 5 1082 1719 160 82 51 chr5 65238572 65238928 -87298331 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1082 1004 136 11 33 chr5 65240181 65240364 -87296895 + ORR1D1 LTR MaLR 3 181 -193 5 1082 754 175 46 25 chr5 65240465 65240674 -87296585 + ORR1D1 LTR MaLR 174 384 0 5 1082 4566 138 52 11 chr5 65245893 65246001 -87291258 + RLTR25A LTR ERVK 1 115 -988 5 1082 4566 138 52 11 chr5 65246089 65246794 -87290465 + RLTR25A LTR ERVK 116 845 -258 5 1082 885 212 152 4 chr5 65247262 65247499 -87289760 + RLTR25B LTR ERVK 757 1028 0 5 1082 1192 157 276 58 chr5 65248967 65249274 -87287985 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1082 246 211 62 50 chr5 65249616 65249696 -87287563 - MER34A1 LTR ERV1 -444 143 63 5 1082 2635 175 37 26 chr5 65249706 65250276 -87286983 - RLTR20B3 LTR ERVK -1 576 1 5 1082 748 132 152 7 chr5 65251008 65251153 -87286106 + ORR1B2 LTR MaLR 4 169 -198 5 1082 812 209 110 0 chr5 65251273 65251464 -87285795 + ORR1B2 LTR MaLR 156 367 0 5 1082 260 86 0 0 chr5 65254278 65254313 -87282946 - ORR1A3 LTR MaLR -199 127 93 5 1082 437 323 8 8 chr5 65256843 65256974 -87280285 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 235 5 1082 777 227 159 69 chr5 65259235 65259581 -87277678 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 5 1082 238 336 45 8 chr5 65259840 65259972 -87277287 + ORR1E LTR MaLR 1 137 -222 5 1082 269 335 55 87 chr5 65260458 65260641 -87276618 - MLT1J1 LTR MaLR -265 179 3 5 1082 324 275 95 40 chr5 65261749 65261851 -87275408 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 477 5 1082 324 275 95 40 chr5 65261911 65261956 -87275303 - RLTR20C LTR ERVK -102 476 424 5 1082 448 187 41 128 chr5 65261972 65262116 -87275143 - RLTR20C LTR ERVK -261 273 147 5 1082 2525 140 50 145 chr5 65262116 65262513 -87274746 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 167 5 1082 2525 140 50 145 chr5 65262545 65262767 -87274492 - RLTR31_Mm LTR ERVK -395 166 1 5 1082 448 187 41 128 chr5 65262767 65262818 -87274441 - RLTR20C LTR ERVK -388 146 95 5 1082 2950 37 3 5 chr5 65263072 65263456 -87273803 + MTA_Mm LTR MaLR 3 385 -11 5 1082 643 37 0 0 chr5 65263577 65263658 -87273601 + MTA_Mm LTR MaLR 316 396 0 5 1082 833 168 152 49 chr5 65265111 65265488 -87271771 - MT2A LTR ERVL -165 328 1 5 1082 2235 231 84 29 chr5 65265488 65266140 -87271119 + ORR1D-int LTR MaLR 128 815 -555 5 1082 1488 197 76 101 chr5 65266124 65266530 -87270729 - RLTR18B LTR ERVK -53 459 64 5 1082 676 194 39 33 chr5 65266537 65266718 -87270541 - RMER13B LTR ERVK -722 186 5 5 1082 401 276 86 56 chr5 65268173 65268407 -87268852 + RMER5 LTR ERV1 51 291 -243 6 1082 354 291 44 15 chr5 65268426 65268562 -87268697 + RMER5 LTR ERV1 349 488 -46 6 1082 1994 144 39 17 chr5 65270345 65270704 -87266555 - MTC LTR MaLR -53 368 2 6 1082 569 246 16 0 chr5 65272682 65272804 -87264455 + MTE2a LTR MaLR 206 329 -50 6 1082 558 229 114 6 chr5 65273378 65273536 -87263723 + MTE2b LTR MaLR 202 376 -3 6 1083 2259 119 47 51 chr5 65280950 65281419 -87255840 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -8 467 1 6 1083 29448 14 4 0 chr5 65281419 65284644 -87252615 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3244 6 1083 24009 11 12 32 chr5 65284636 65287444 -87249815 - IAPEz-int LTR ERVK -3730 2751 1 6 1083 2259 119 47 51 chr5 65287445 65287914 -87249345 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -8 467 1 6 1083 2721 81 53 30 chr5 65292551 65292948 -87244311 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 4 6 1083 3889 38 31 95 chr5 65293725 65294272 -87242987 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 1083 7640 51 22 110 chr5 65294272 65294621 -87242638 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 2937 6 1083 9521 106 53 56 chr5 65294803 65297214 -87240045 - RLTR1B-int LTR ERV1 -363 2936 1020 6 1083 278 89 16 97 chr5 65297340 65297402 -87239857 - RLTR1B-int LTR ERV1 -2521 778 722 6 1083 1281 70 65 0 chr5 65297554 65297740 -87239519 - RLTR1B-int LTR ERV1 -2838 461 264 6 1083 967 165 148 22 chr5 65297711 65297934 -87239325 - MMERGLN-int LTR ERV1 -7178 378 128 6 1083 1625 126 63 2 chr5 65297909 65298211 -87239048 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3024 275 1 6 1083 4263 47 6 2 chr5 65298211 65298721 -87238538 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 1083 447 94 0 0 chr5 65302227 65302291 -87234968 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 319 6 1083 1409 171 21 52 chr5 65302508 65302834 -87234425 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 7 6 1083 8001 137 11 32 chr5 65302846 65304222 -87233037 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 3498 6 1083 6201 144 18 20 chr5 65304218 65305575 -87231684 - MMETn-int LTR ERVK -3306 4100 2356 6 1083 4556 8 0 0 chr5 65305575 65306068 -87231191 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1083 2141 147 26 34 chr5 65306068 65306152 -87231107 - MMETn-int LTR ERVK -3595 3811 3724 6 1083 4028 89 5 76 chr5 65306360 65307015 -87230244 - MMETn-int LTR ERVK -2657 2187 1580 6 1083 8338 99 14 49 chr5 65307029 65308350 -87228909 - MMETn-int LTR ERVK -3538 1306 33 6 1083 1324 187 50 3 chr5 65308363 65308663 -87228596 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 9 6 1083 1424 203 85 34 chr5 65310609 65310987 -87226272 - MTC LTR MaLR -17 404 8 6 1083 328 279 130 35 chr5 65314067 65314297 -87222962 + MLT1C LTR MaLR 163 414 -53 6 1083 265 259 134 25 chr5 65319035 65319154 -87218105 + MLT1B LTR MaLR 247 378 -12 6 1083 2185 145 75 0 chr5 65319191 65319577 -87217682 + MTC LTR MaLR 6 420 -1 6 1083 1155 225 138 12 chr5 65320463 65320614 -87216645 - ORR1E LTR MaLR 0 359 172 6 1083 1155 225 138 12 chr5 65320660 65320827 -87216432 - ORR1E LTR MaLR -188 171 2 6 1083 453 330 90 10 chr5 65321619 65321907 -87215352 + MLT1A0 LTR MaLR 1 311 -54 6 1083 1215 201 238 84 chr5 65326199 65326661 -87210598 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 7 1083 1588 107 4 0 chr5 65329551 65329785 -87207474 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 93 7 1083 3478 38 0 0 chr5 65332583 65332979 -87204280 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1083 9568 31 0 0 chr5 65332979 65334077 -87203182 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 7 1083 3487 38 0 0 chr5 65334077 65334473 -87202786 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1083 256 150 0 0 chr5 65337925 65337965 -87199294 - ORR1A2 LTR MaLR -218 108 69 7 1083 1683 113 127 0 chr5 65338854 65339137 -87198122 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1083 316 200 167 20 chr5 65339954 65340056 -87197203 - ORR1A2 LTR MaLR -262 117 1 7 1083 502 150 48 39 chr5 65340121 65340225 -87197034 - RMER20B LTR ERVK -16 611 507 7 1083 1141 219 155 19 chr5 65340265 65340403 -87196856 - RMER20B LTR ERVK -248 379 235 7 1083 3133 39 0 0 chr5 65340403 65340760 -87196499 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 7 1083 1141 219 155 19 chr5 65340760 65340937 -87196322 - RMER20B LTR ERVK -393 234 23 7 1083 307 343 38 52 chr5 65343442 65343654 -87193605 + LTR81A LTR ERV1? 791 1170 -180 7 1083 299 342 0 43 chr5 65347439 65347555 -87189704 - MLT1A0 LTR MaLR -254 111 1 7 1083 283 253 130 3 chr5 65347598 65347715 -87189544 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 215 7 1083 288 306 8 21 chr5 65353230 65353358 -87183901 + MLT1D LTR MaLR 336 503 -2 7 1083 2392 125 23 8 chr5 65355036 65355190 -87182069 + ORR1B1 LTR MaLR 1 159 -235 7 1083 2392 125 23 8 chr5 65355210 65355443 -87181816 + ORR1B1 LTR MaLR 160 394 0 7 1083 2502 134 167 2 chr5 65358064 65358514 -87178745 + RLTR11A LTR ERVK 1 524 -4 7 1083 1995 85 6 62 chr5 65360132 65360457 -87176802 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 13 7 1083 301 266 8 99 chr5 65365873 65365994 -87171265 + MT2B LTR ERVL 154 263 -338 7 1083 638 247 78 30 chr5 65367400 65367726 -87169533 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4034 1727 1195 7 1083 769 306 36 96 chr5 65370317 65370794 -87166465 - MLT1D LTR MaLR -31 474 27 7 1083 2276 82 3 0 chr5 65374518 65374836 -87162423 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 1083 259 335 29 77 chr5 65377242 65377449 -87159810 - ORR1E LTR MaLR -45 314 118 8 1083 1710 221 31 62 chr5 65378726 65378828 -87158431 + MTD LTR MaLR 5 97 -322 8 1083 1710 221 31 62 chr5 65379008 65379325 -87157934 + MTD LTR MaLR 98 411 -8 8 1083 269 288 117 58 chr5 65379768 65380008 -87157251 - LTR82A LTR ERVL -156 716 463 8 1083 716 331 75 11 chr5 65380220 65380593 -87156666 - LTR82A LTR ERVL -475 397 1 8 1083 305 263 68 26 chr5 65380939 65381056 -87156203 + MLT1A1 LTR MaLR 268 389 -19 8 1083 2633 91 30 2 chr5 65385397 65385803 -87151456 - BGLII_Mus LTR ERVK -5 417 1 8 1083 1017 257 9 0 chr5 65388128 65388342 -87148917 - MTE2b LTR MaLR -1 378 163 8 1083 778 206 26 189 chr5 65388503 65388721 -87148538 - MTE2b LTR MaLR -198 181 1 8 1083 273 283 87 0 chr5 65388905 65388997 -87148262 - ORR1E LTR MaLR -4 355 256 8 1083 252 141 0 15 chr5 65390936 65391001 -87146258 - MT2A LTR ERVL -3 530 467 8 1083 1048 199 100 94 chr5 65391099 65391536 -87145723 - MT2A LTR ERVL -57 544 2 8 1083 490 314 65 92 chr5 65398904 65399272 -87137987 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 8 1083 357 304 39 81 chr5 65401358 65401616 -87135643 - LTR16B2 LTR ERVL -6 456 210 8 1083 397 298 103 88 chr5 65402454 65402785 -87134474 - ORR1E LTR MaLR -4 355 20 8 1083 232 281 146 58 chr5 65404444 65404546 -87132713 + RMER10B LTR ERVL 8 96 -302 8 1083 232 281 146 58 chr5 65404597 65404755 -87132504 + RMER10B LTR ERVL 97 290 -108 8 1084 1927 179 56 112 chr5 65405030 65405496 -87131763 - RLTR41 LTR ERV1 -6 440 1 8 1084 354 271 13 114 chr5 65407527 65407685 -87129574 - LTR37A LTR ERV1 -2 424 283 8 1084 300 293 37 0 chr5 65407746 65407828 -87129431 - LTR37A LTR ERV1 -250 176 92 8 1084 291 261 124 50 chr5 65408635 65408796 -87128463 - ORR1E LTR MaLR -167 192 20 8 1084 1486 187 35 156 chr5 65413640 65413794 -87123465 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 210 8 1084 1486 187 35 156 chr5 65413939 65414208 -87123051 - ORR1D1 LTR MaLR -165 209 1 8 1084 875 269 78 0 chr5 65418125 65418370 -87118889 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 100 8 1084 236 327 29 19 chr5 65420323 65420426 -87116833 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -654 149 46 9 1084 316 343 42 35 chr5 65422608 65422750 -87114509 + RMER12 LTR ERVK 714 856 -466 9 1084 230 220 32 48 chr5 65427622 65427684 -87109575 - MER70B LTR ERVL -477 101 41 9 1084 1274 95 25 6 chr5 65433537 65433814 -87103445 + ORR1A3 LTR MaLR 1 321 -8 9 1084 263 249 89 179 chr5 65435060 65435295 -87101964 - ORR1E LTR MaLR -120 239 26 9 1084 2178 108 9 104 chr5 65437762 65438215 -87099044 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 9 1084 2096 144 3 32 chr5 65439831 65440204 -87097055 + RLTR11B LTR ERVK 1 362 -91 9 1084 731 265 54 82 chr5 65441997 65442387 -87094872 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 9 1084 2929 67 47 3 chr5 65444386 65444773 -87092486 + MTB_Mm LTR MaLR 1 404 -3 9 1084 1909 182 83 77 chr5 65446481 65447012 -87090247 + RLTR20C LTR ERVK 1 534 0 9 1084 2196 163 11 21 chr5 65448779 65449161 -87088098 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 9 1084 2484 184 69 6 chr5 65451194 65451687 -87085572 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 524 -3 9 1084 963 293 164 24 chr5 65456927 65457420 -87079839 + MLT1E1A LTR MaLR 119 680 0 9 1084 406 226 50 1 chr5 65464596 65464713 -87072546 - MTD LTR MaLR -15 404 256 9 1084 323 237 13 0 chr5 65467356 65467432 -87069827 - MLT1C LTR MaLR -199 268 192 9 1084 469 254 88 44 chr5 65467722 65467899 -87069360 - MLT1C LTR MaLR -282 185 1 9 1084 249 123 138 0 chr5 65472340 65472405 -87064854 - MLT2B5 LTR ERVL -6 549 476 1 1084 596 232 37 27 chr5 65472452 65472682 -87064577 - MT2A LTR ERVL -63 538 316 1 1084 2996 142 31 20 chr5 65472684 65473237 -87064022 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 2 1 1084 248 204 193 0 chr5 65477199 65477287 -87059972 + MLT1B LTR MaLR 5 109 -281 1 1084 239 237 51 10 chr5 65484527 65484625 -87052634 - MTEb LTR MaLR 0 379 278 1 1084 378 108 25 75 chr5 65485593 65485673 -87051586 + ORR1A3 LTR MaLR 1 76 -251 1 1084 1712 119 0 7 chr5 65485942 65486213 -87051046 + ORR1A3 LTR MaLR 50 318 -8 1 1084 1370 143 248 10 chr5 65486834 65487004 -87050255 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 173 1 1084 1370 143 248 10 chr5 65487103 65487242 -87050017 - ORR1C2 LTR MaLR -212 172 2 1 1084 897 262 97 78 chr5 65487382 65487892 -87049367 + RMER4B LTR ERVK 1 588 -23 1 1084 4403 183 39 53 chr5 65488863 65489855 -87047404 - MTC-int LTR MaLR -274 984 7 1 1084 819 130 102 30 chr5 65489869 65490035 -87047224 - MTC LTR MaLR 0 421 244 1 1084 778 205 232 0 chr5 65495510 65495734 -87041525 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 91 1 1084 641 279 152 30 chr5 65501951 65502313 -87034946 - MLT1I LTR MaLR -1 410 5 2 1084 3101 47 34 3 chr5 65503534 65503922 -87033337 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1084 409 301 208 35 chr5 65504942 65505259 -87032000 + LTR87 LTR ERVL? 241 612 -12 8 1084 379 186 0 134 chr5 65508107 65508219 -87029040 + MT2B LTR ERVL 155 251 -350 1 1084 1342 157 65 94 chr5 65508385 65508850 -87028409 + RMER4A LTR ERVK 30 585 0 1 1084 1268 211 112 17 chr5 65511153 65511447 -87025812 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 49 2 1084 6371 188 95 42 chr5 65511447 65513573 -87023686 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2860 5571 -190 2 1084 6371 194 76 65 chr5 65513687 65513894 -87023365 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5572 5761 0 2 1084 1677 219 202 5 chr5 65513894 65514339 -87022920 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 1084 4027 147 63 55 chr5 65514932 65515270 -87021989 - RLTR13B1 LTR ERVK -89 934 476 2 1084 4027 136 68 50 chr5 65515306 65515762 -87021497 - RLTR13B1 LTR ERVK -418 475 6 2 1085 627 244 44 39 chr5 65556683 65556928 -86980331 - ORR1D1 LTR MaLR -115 244 1 1 1085 477 234 150 12 chr5 65556930 65557090 -86980169 - MTEa LTR MaLR -190 189 8 1 1085 781 190 49 27 chr5 65557642 65557826 -86979433 - RLTR24 LTR ERV1 -79 450 263 1 1085 309 102 20 0 chr5 65557809 65557858 -86979401 - RLTR24 LTR ERV1 -439 90 41 1 1085 2525 142 114 100 chr5 65565561 65566133 -86971126 - RMER19C LTR ERVK -27 584 5 1 1085 486 295 77 31 chr5 65572889 65573085 -86964174 - LTR40b LTR ERVL -15 447 243 1 1085 473 246 78 0 chr5 65573229 65573371 -86963888 - LTR41 LTR ERVL -612 156 4 1 1085 473 176 24 0 chr5 65573645 65573730 -86963529 + MTEb LTR MaLR 1 87 -292 1 1085 324 226 96 11 chr5 65573735 65573829 -86963430 - MTD LTR MaLR -166 253 152 1 1085 2281 192 63 70 chr5 65574644 65574784 -86962475 + RMER15 LTR ERVL 9 140 -435 1 1085 2647 155 52 10 chr5 65574784 65575287 -86961972 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 1 1085 2281 192 63 70 chr5 65575287 65575683 -86961576 + RMER15 LTR ERVL 141 533 -42 1 1085 2281 192 63 70 chr5 65575725 65575754 -86961505 + RMER15 LTR ERVL 534 570 -5 1 1085 341 262 115 55 chr5 65578122 65578517 -86958742 + RLTR12B LTR ERVK 1 294 -65 1 1085 342 196 1 143 chr5 65580490 65580591 -86956668 - ORR1D1 LTR MaLR -270 89 1 1 1085 2457 101 0 0 chr5 65580659 65580986 -86956273 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1085 305 114 0 0 chr5 65580986 65581030 -86956229 + ORR1B1 LTR MaLR 24 67 -327 1 1085 2719 137 9 7 chr5 65581030 65581494 -86955765 + RMER12B LTR ERVK 1 465 -939 1 1085 770 107 0 0 chr5 65581651 65581763 -86955496 + ORR1B1 LTR MaLR 283 394 0 1 1085 4106 41 61 0 chr5 65584723 65585212 -86952047 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 1 1085 308 327 9 17 chr5 65585685 65585800 -86951459 + MLT1H1 LTR MaLR 11 124 -431 1 1085 1773 130 101 3 chr5 65588285 65588601 -86948658 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 47 1 1085 242 170 75 0 chr5 65589070 65589123 -86948136 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 521 1 1085 932 272 37 48 chr5 65593055 65593410 -86943849 - MTE2a LTR MaLR 0 379 29 1 1085 2042 181 26 12 chr5 65595840 65596255 -86941004 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1085 5248 173 61 24 chr5 65596263 65597460 -86939799 - MTC-int LTR MaLR -16 1242 2 1 1085 509 172 45 20 chr5 65597461 65597592 -86939667 - MTC LTR MaLR 0 421 246 1 1085 367 240 18 46 chr5 65598528 65598637 -86938622 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 1 1085 566 63 0 0 chr5 65602021 65602100 -86935159 + ORR1A3 LTR MaLR 220 298 -28 1 1085 1487 135 0 4 chr5 65602099 65602337 -86934922 - MTC LTR MaLR -109 237 1 1 1085 306 45 0 22 chr5 65602693 65602738 -86934521 + ORR1A3 LTR MaLR 283 326 0 1 1085 237 316 43 57 chr5 65603273 65603414 -86933845 - RMER4B LTR ERVK -442 143 5 2 1085 476 283 80 0 chr5 65608218 65608356 -86928903 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 412 2 1085 275 235 57 76 chr5 65608353 65608485 -86928774 - MLT1F2 LTR MaLR -191 462 308 2 1085 450 316 226 4 chr5 65616110 65616367 -86920892 - LTR87 LTR ERVL? -138 486 173 2 1085 639 229 35 186 chr5 65625477 65625785 -86911474 - ORR1A3 LTR MaLR -70 324 1 2 1085 2142 119 118 11 chr5 65629281 65629442 -86907817 - RLTR11B LTR ERVK -58 395 207 2 1085 2142 119 118 11 chr5 65629470 65629665 -86907594 - RLTR11B LTR ERVK -247 206 2 2 1085 1349 234 52 19 chr5 65634944 65635310 -86901949 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 2 1085 627 279 81 37 chr5 65646593 65646839 -86890420 - MER68 LTR ERVL -118 445 189 3 1085 364 261 10 42 chr5 65656223 65656319 -86880940 + MT2B LTR ERVL 164 256 -345 3 1085 265 282 33 56 chr5 65660645 65660735 -86876524 + MLT1A LTR MaLR 278 365 -9 3 1085 348 229 45 62 chr5 65662666 65662778 -86874481 - MT2B LTR ERVL -323 278 169 3 1085 1263 191 162 2 chr5 65666087 65666409 -86870850 + MTC LTR MaLR 1 365 -14 3 1086 2194 140 90 8 chr5 65669010 65669398 -86867861 - MTC LTR MaLR 0 421 2 3 1086 734 245 124 17 chr5 65677925 65678166 -86859093 - MTC LTR MaLR 0 421 155 3 1086 566 178 70 76 chr5 65680813 65680971 -86856288 + RMER10B LTR ERVL 195 351 -47 3 1086 2199 122 19 0 chr5 65699237 65699557 -86837702 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 4 1086 966 281 81 21 chr5 65700099 65700434 -86836825 + MTE2b LTR MaLR 20 374 -5 4 1086 294 258 43 11 chr5 65702847 65702941 -86834318 - MLT1D LTR MaLR -158 347 251 4 1086 798 298 129 11 chr5 65705923 65706296 -86830963 + MLT2B4 LTR ERVL 132 548 -8 4 1086 235 289 224 17 chr5 65706305 65706421 -86830838 + MLT1B-int LTR MaLR 3 142 -1347 4 1086 3024 57 20 15 chr5 65707200 65707594 -86829665 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1086 611 282 103 20 chr5 65707680 65707933 -86829326 + MLT1B-int LTR MaLR 382 655 -716 4 1086 392 321 204 8 chr5 65708192 65708456 -86828803 + MLT-int LTR MaLR 1316 1631 -104 4 1086 436 279 49 25 chr5 65708785 65708947 -86828312 + MLT1B LTR MaLR 209 374 -16 4 1086 1866 115 81 19 chr5 65729980 65730290 -86806969 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1086 345 230 24 41 chr5 65744475 65744598 -86792661 - MLT1K LTR MaLR 0 610 494 6 1086 257 295 9 95 chr5 65748698 65748814 -86788445 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 6 1086 3407 28 5 2 chr5 65750000 65750395 -86786864 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1086 1488 131 188 7 chr5 65754323 65754616 -86782643 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 47 6 1086 632 197 176 0 chr5 65767300 65767442 -86769817 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 212 6 1086 277 119 0 0 chr5 65767441 65767483 -86769776 - ORR1C1 LTR MaLR -325 42 1 6 1086 291 158 11 146 chr5 65771358 65771379 -86765880 + MT2B LTR ERVL 148 224 -377 7 1087 351 296 164 81 chr5 65819631 65819929 -86717330 + MLT1A1 LTR MaLR 26 348 -17 8 1087 289 325 100 70 chr5 65821006 65821150 -86716109 - RLTR21 LTR ERVK -319 1253 1100 8 1087 289 325 100 70 chr5 65821272 65821428 -86715831 - RLTR21 LTR ERVK -473 1099 944 8 1087 1061 207 43 17 chr5 65829425 65829656 -86707603 - RMER5 LTR ERV1 -297 237 1 8 1087 817 198 9 65 chr5 65830135 65830351 -86706908 - RMER10B LTR ERVL -1 397 194 8 1087 1119 169 25 83 chr5 65830374 65830652 -86706607 - RMER10B LTR ERVL -131 267 6 8 1087 2002 36 71 0 chr5 65832044 65832296 -86704963 - MTB LTR MaLR -1 399 130 9 1087 1567 185 72 35 chr5 65858150 65858497 -86678762 + RMER21A LTR ERV1 1 360 -587 9 1087 1026 216 225 23 chr5 65859225 65859571 -86677688 + MTD LTR MaLR 2 417 -2 9 1087 522 282 40 17 chr5 65874355 65874528 -86662731 - MLT1A0 LTR MaLR -152 213 37 1 1087 283 211 92 0 chr5 65875302 65875378 -86661881 - MLT-int LTR MaLR -127 1608 1526 1 1087 259 283 175 35 chr5 65875500 65875643 -86661616 - MLT-int LTR MaLR -943 792 630 1 1087 274 283 33 117 chr5 65877970 65878090 -86659169 - MT2B LTR ERVL -345 256 147 1 1087 2448 159 116 91 chr5 65886768 65887364 -86649895 + RLTR18 LTR ERVK 3 613 -3 1 1087 293 299 108 23 chr5 65888091 65888221 -86649038 + MLT1F1 LTR MaLR 140 280 -289 1 1087 360 277 25 25 chr5 65890907 65891029 -86646230 - MLT1B LTR MaLR -68 322 201 1 1087 1164 252 40 132 chr5 65891062 65891747 -86645512 - RMER19C LTR ERVK -27 710 18 1 1087 252 296 0 24 chr5 65898562 65898645 -86638614 + MTEb LTR MaLR 278 358 -21 1 1087 1796 117 70 98 chr5 65901127 65901526 -86635733 + RMER6A LTR ERVK 1 388 -368 1 1087 994 148 122 0 chr5 65903529 65903718 -86633541 + MTD LTR MaLR 196 407 -12 1 1087 332 202 23 81 chr5 65904316 65904402 -86632857 - MT2B LTR ERVL -361 240 160 1 1087 766 274 99 60 chr5 65907989 65908354 -86628905 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 1 1087 882 255 108 31 chr5 65908354 65908678 -86628581 + MTEb-int LTR MaLR 1 349 -1231 1 1087 1401 195 82 34 chr5 65911173 65911550 -86625709 + RMER17C LTR ERVK 1 396 -14 1 1087 457 169 0 12 chr5 65912027 65912111 -86625148 - MTC LTR MaLR -10 411 329 1 1087 1170 46 0 0 chr5 65913473 65913625 -86623634 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 256 1 1087 1158 47 23 34 chr5 65913825 65914002 -86623257 - MTB_Mm LTR MaLR -230 177 3 1 1087 615 272 80 80 chr5 65916024 65916360 -86620899 + ORR1E LTR MaLR 1 336 -23 1 1087 765 211 160 18 chr5 65916729 65917183 -86620076 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 13 1 1087 1183 237 102 15 chr5 65919108 65919450 -86617809 - MTEb LTR MaLR -5 374 3 1 1087 330 213 13 0 chr5 65920603 65920678 -86616581 + RMER15 LTR ERVL 422 497 -78 1 1087 406 146 60 80 chr5 65920694 65920895 -86616364 - RMER17C LTR ERVK -134 276 80 1 1087 391 329 0 83 chr5 65921725 65921881 -86615378 - LTR33 LTR ERVL -355 160 18 1 1087 3331 133 209 2 chr5 65923888 65924497 -86612762 + RMER19A LTR ERVK 1 735 -2 1 1088 1905 133 76 57 chr5 65945131 65945498 -86591761 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 1 1088 2906 149 58 78 chr5 65952452 65953107 -86584152 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 1 1088 1620 219 61 15 chr5 65964406 65964813 -86572446 - BGLII_B LTR ERVK -10 431 6 1 1088 3900 108 68 63 chr5 65965781 65966528 -86570731 + RMER6A LTR ERVK 1 751 -5 1 1088 915 283 100 41 chr5 65976191 65976530 -86560729 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1088 766 11 0 0 chr5 65994500 65994589 -86542670 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 405 1 1088 7202 19 8 0 chr5 65994593 65995455 -86541804 - MT-int LTR MaLR -73 1025 157 1 1088 3796 16 0 0 chr5 65995457 65995906 -86541353 - MERVL-int LTR ERVL -1287 4198 3750 1 1088 1419 223 111 12 chr5 66025732 66026064 -86511195 + ORR1D1 LTR MaLR 3 367 -7 6 1088 674 313 80 66 chr5 66034535 66034898 -86502361 + MLT1B LTR MaLR 18 385 -5 8 1088 499 260 44 57 chr5 66038697 66038856 -86498403 + MTEa LTR MaLR 223 379 0 9 1088 1171 207 109 181 chr5 66047885 66048381 -86488878 + RMER4B LTR ERVK 1 467 -118 1 1088 253 291 190 22 chr5 66058308 66058487 -86478772 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 361 1 1088 226 286 0 0 chr5 66058601 66058664 -86478595 - MLT1F1 LTR MaLR -428 120 58 1 1088 280 151 19 19 chr5 66058730 66058784 -86478475 + MTD LTR MaLR 1 54 -365 1 1088 880 198 132 184 chr5 66059243 66059431 -86477828 + MTD LTR MaLR 66 215 -204 1 1088 880 198 132 184 chr5 66059578 66059754 -86477505 + MTD LTR MaLR 216 411 -8 1 1088 292 323 137 87 chr5 66059757 66059998 -86477261 + MLT1H2 LTR MaLR 31 283 -206 1 1089 375 302 75 66 chr5 66061799 66061892 -86475367 - MER21B LTR ERV1 -109 754 655 1 1089 375 302 75 66 chr5 66062076 66062209 -86475050 - MER21B LTR ERV1 -209 654 526 1 1089 455 197 241 33 chr5 66062596 66062780 -86474479 - MTD LTR MaLR -14 405 194 1 1089 1359 200 76 68 chr5 66063980 66064195 -86473064 + MTD LTR MaLR 6 209 -210 1 1089 1359 200 76 68 chr5 66064319 66064500 -86472759 + MTD LTR MaLR 210 405 -14 1 1089 352 260 36 0 chr5 66066008 66066117 -86471142 + MTD LTR MaLR 14 135 -286 1 1089 716 216 88 16 chr5 66066136 66066329 -86470930 + MTD LTR MaLR 200 406 -13 1 1089 4385 155 104 18 chr5 66069804 66070633 -86466626 + RMER19B LTR ERVK 3 902 0 1 1089 440 247 0 0 chr5 66080840 66080937 -86456322 + MTD LTR MaLR 11 107 -312 2 1089 548 224 132 26 chr5 66081267 66081418 -86455841 + MTD LTR MaLR 108 274 -145 2 1089 1571 154 191 8 chr5 66085763 66086130 -86451129 + RMER4A LTR ERVK 33 466 0 2 1089 963 182 325 14 chr5 66091278 66091567 -86445692 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 4 2 1089 2182 86 13 6 chr5 66093879 66094196 -86443063 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1089 293 211 0 0 chr5 66098189 66098246 -86439013 + MER31A LTR ERV1 27 83 -402 2 1089 798 260 60 60 chr5 66098261 66098609 -86438650 + MER54A LTR ERVL 530 877 -24 2 1089 408 239 54 30 chr5 66099213 66099381 -86437878 + MER57A-int LTR ERV1 1404 1575 -4612 2 1089 525 236 203 31 chr5 66102260 66102491 -86434768 + RMER4B LTR ERVK 343 576 -9 3 1089 362 85 51 0 chr5 66110953 66111012 -86426247 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 268 3 1089 396 198 12 0 chr5 66111213 66111294 -86425965 - ORR1A4 LTR MaLR -244 85 4 3 1089 433 327 0 6 chr5 66111437 66111597 -86425662 - MuRRS4-int LTR ERV1 -242 4821 4663 3 1089 362 355 6 6 chr5 66112122 66112292 -86424967 - MMERGLN-int LTR ERV1 -2030 5526 5357 3 1089 1863 244 66 19 chr5 66112403 66112871 -86424388 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1043 4020 3531 3 1089 697 309 77 36 chr5 66113164 66113580 -86423679 - MuLV-int LTR ERV1 -3156 4450 4018 3 1089 1214 277 121 82 chr5 66113579 66114565 -86422694 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5210 2568 1545 3 1089 300 325 70 23 chr5 66115850 66115979 -86421280 + ERVL-B4-int LTR ERVL 572 706 -5008 3 1089 890 272 70 60 chr5 66116109 66116500 -86420759 + ERVL-B4-int LTR ERVL 723 1157 -4600 3 1089 1043 184 45 12 chr5 66117475 66117690 -86419569 - MTC LTR MaLR -1 420 181 3 1089 883 253 16 0 chr5 66118037 66118223 -86419036 - MTC LTR MaLR -183 236 48 3 1089 573 121 0 0 chr5 66120370 66120453 -86416806 + RLTR23 LTR ERV1 8 90 -340 3 1089 431 254 113 70 chr5 66120798 66120984 -86416275 + RLTR23 LTR ERV1 237 430 0 3 1089 1241 236 100 46 chr5 66122175 66122213 -86415046 - MTD LTR MaLR -8 411 374 3 1089 1241 236 100 46 chr5 66122409 66122760 -86414499 - MTD LTR MaLR -46 373 1 3 1089 515 251 25 94 chr5 66123227 66123429 -86413830 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1297 1484 -4230 3 1089 277 225 24 145 chr5 66123994 66124077 -86413182 - MT2B LTR ERVL -361 240 168 4 1089 623 251 41 87 chr5 66125872 66125936 -86411323 - MTEb LTR MaLR -6 373 311 4 1089 623 251 41 87 chr5 66126098 66126226 -86411033 - MTEb LTR MaLR -69 310 187 4 1089 4761 163 148 6 chr5 66126226 66127126 -86410133 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 1 4 1089 5848 52 17 7 chr5 66128534 66129283 -86407976 - RLTR13B3 LTR ERVK -163 766 10 4 1089 872 281 23 46 chr5 66129891 66130152 -86407107 - MTEa LTR MaLR -1 378 124 4 1089 301 289 172 59 chr5 66130520 66130638 -86406621 + MER89 LTR ERV1 184 314 -245 4 1089 2236 139 71 34 chr5 66130638 66131018 -86406241 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1089 301 289 172 59 chr5 66131018 66131068 -86406191 + MER89 LTR ERV1 315 371 -188 4 1089 3169 151 23 102 chr5 66135164 66135359 -86401900 + MT2B LTR ERVL 1 176 -425 4 1089 3169 151 23 102 chr5 66135554 66136002 -86401257 + MT2B LTR ERVL 177 593 -8 4 1089 4052 182 50 53 chr5 66136819 66137419 -86399840 - RMER13B LTR ERVK -50 858 275 4 1089 4052 182 50 53 chr5 66137474 66137732 -86399527 - RMER13B LTR ERVK -634 274 3 4 1089 622 295 138 55 chr5 66138514 66138912 -86398347 + LTR73 LTR ERV1 2 432 -140 4 1089 1024 242 47 110 chr5 66139770 66140205 -86397054 + RMER17C LTR ERVK 3 484 -422 4 1089 709 164 102 23 chr5 66140231 66140502 -86396757 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 1089 615 354 82 36 chr5 66145757 66146147 -86391112 + MLT2B3 LTR ERVL 91 498 -56 4 1089 244 288 36 36 chr5 66147317 66147400 -86389859 + ORR1E LTR MaLR 2 84 -275 4 1089 3729 116 51 3 chr5 66149911 66150475 -86386784 + MT2B LTR ERVL 1 591 -10 4 1089 641 176 353 0 chr5 66151182 66151250 -86386009 - RLTR20B2 LTR ERVK -112 451 408 5 1089 1105 170 79 45 chr5 66151284 66151610 -86385649 - RLTR20B2 LTR ERVK -156 407 1 5 1089 1801 184 118 3 chr5 66167395 66167743 -86369516 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 5 5 1089 537 239 23 142 chr5 66167809 66168083 -86369176 - RMER4B LTR ERVK 0 611 330 5 1089 453 206 18 27 chr5 66168142 66168252 -86369007 - RMER4B LTR ERVK -460 125 17 5 1089 2713 112 61 46 chr5 66170939 66171398 -86365861 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 5 1089 382 179 24 12 chr5 66188800 66188885 -86348374 - RMER10A LTR ERVL -13 429 344 6 1090 240 262 22 101 chr5 66192397 66192486 -86344773 + MLT2B2 LTR ERVL 320 401 -161 6 1090 472 185 17 100 chr5 66201676 66201796 -86335463 + MT2B LTR ERVL 155 264 -337 6 1090 342 280 117 14 chr5 66213699 66213834 -86323425 - RMER15 LTR ERVL 0 575 426 6 1090 1126 203 89 8 chr5 66213834 66214092 -86323167 + ORR1D1 LTR MaLR 1 279 -95 6 1090 240 394 45 10 chr5 66222376 66222576 -86314683 - MLT1J LTR MaLR -262 250 44 6 1090 406 178 154 11 chr5 66225989 66226080 -86311179 - MTE2b LTR MaLR -7 372 269 6 1090 5955 64 2 1 chr5 66226116 66226909 -86310350 + RLTR13B4 LTR ERVK 10 803 0 6 1090 368 254 104 9 chr5 66226910 66227025 -86310234 - MTE2b LTR MaLR -249 130 5 6 1090 2082 114 15 41 chr5 66229738 66230076 -86307183 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 7 1090 1396 127 4 17 chr5 66231925 66232157 -86305102 - MTC LTR MaLR -8 413 185 7 1090 246 294 29 139 chr5 66233115 66233360 -86303899 - RLTR25B LTR ERVK -796 232 15 7 1090 997 122 29 6 chr5 66233377 66233550 -86303709 - MTB LTR MaLR -223 177 1 7 1090 380 248 12 134 chr5 66236457 66236629 -86300630 - MLT1G3 LTR MaLR 0 595 445 7 1090 309 299 35 28 chr5 66236737 66236878 -86300381 + RLTR15 LTR ERVK 150 291 -68 7 1090 283 265 29 0 chr5 66244218 66244286 -86292973 - MLT1J2 LTR MaLR -306 142 73 7 1090 279 262 23 69 chr5 66273271 66273402 -86263857 - RMER20B LTR ERVK -502 125 1 8 1090 327 250 14 27 chr5 66278604 66278645 -86258614 + ORR1B1-int LTR MaLR 609 647 -862 8 1090 248 219 103 58 chr5 66278690 66278777 -86258482 + RLTR25A LTR ERVK 522 612 -491 8 1090 329 245 68 98 chr5 66281478 66281535 -86255724 - MT2B2 LTR ERVL -426 158 107 8 1090 455 283 128 60 chr5 66286899 66287156 -86250103 - MLT1A LTR MaLR -10 380 94 8 1090 784 256 46 98 chr5 66292805 66293031 -86244228 - RMER16 LTR ERVK -27 506 292 8 1090 784 233 54 93 chr5 66293177 66293342 -86243917 - RMER16 LTR ERVK -242 291 2 8 1090 2158 141 42 51 chr5 66293571 66293981 -86243278 + MTB_Mm LTR MaLR 2 407 0 8 1090 1250 255 118 11 chr5 66294450 66294799 -86242460 + MTD LTR MaLR 33 418 -1 8 1090 313 342 42 56 chr5 66296384 66296598 -86240661 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1112 8 1090 5131 99 69 6 chr5 66296866 66297649 -86239610 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 1 8 1090 961 229 22 26 chr5 66298703 66298932 -86238327 + ORR1D1 LTR MaLR 147 374 0 8 1090 359 266 65 79 chr5 66300389 66300409 -86236850 + MT2B LTR ERVL 142 159 -442 8 1090 418 271 60 46 chr5 66300772 66300923 -86236336 + MER34 LTR ERV1 5 157 -385 8 1090 485 326 29 54 chr5 66301030 66301234 -86236025 + MER34 LTR ERV1 321 519 -23 8 1090 3456 25 5 2 chr5 66306634 66307029 -86230230 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1090 2110 152 43 9 chr5 66308090 66308435 -86228824 - ORR1B2 LTR MaLR -10 357 1 8 1090 248 355 138 32 chr5 66310750 66311032 -86226227 - LTR85a LTR Gypsy? -61 641 330 9 1090 2553 72 6 0 chr5 66311756 66312077 -86225182 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 9 1090 307 336 77 54 chr5 66312078 66312273 -86224986 - LTR85a LTR Gypsy? -433 269 76 9 1090 307 336 77 54 chr5 66312299 66312364 -86224895 - LTR85a LTR Gypsy? -627 75 4 9 1090 697 253 127 12 chr5 66313335 66313587 -86223672 - MLT2D LTR ERVL -50 364 84 9 1090 622 283 119 89 chr5 66313908 66314245 -86223014 + MLT1A0 LTR MaLR 1 347 -18 9 1090 1337 255 52 3 chr5 66317364 66317691 -86219568 - ORR1E LTR MaLR -11 348 6 9 1091 285 301 86 0 chr5 66322828 66322921 -86214338 - LTR16B LTR ERVL -361 102 2 9 1091 977 323 97 32 chr5 66323754 66324166 -86213093 + MLT1J LTR MaLR 4 442 -70 9 1091 2585 55 61 3 chr5 66325612 66325939 -86211320 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 9 1091 2281 146 92 13 chr5 66332438 66332757 -86204502 - MTC LTR MaLR 0 421 107 9 1091 2281 146 92 13 chr5 66332904 66332974 -86204285 - MTC LTR MaLR -315 106 1 9 1091 1526 160 206 25 chr5 66334980 66335301 -86201958 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 8 9 1091 2070 138 36 9 chr5 66335644 66335974 -86201285 - ORR1C1 LTR MaLR -39 339 1 9 1091 304 256 0 71 chr5 66342581 66342665 -86194594 + MLT1A1 LTR MaLR 323 400 -8 9 1091 413 265 19 19 chr5 66345510 66345614 -86191645 + MTEa LTR MaLR 14 117 -242 1 1091 420 218 48 38 chr5 66345914 66346019 -86191240 + MTEa LTR MaLR 272 377 -2 1 1091 1716 141 139 32 chr5 66348280 66348618 -86188641 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1091 814 271 84 29 chr5 66348972 66349283 -86187976 - RMER15 LTR ERVL -28 547 220 1 1091 453 235 258 0 chr5 66350923 66351055 -86186204 - ORR1C1 LTR MaLR -31 336 171 1 1091 781 232 26 88 chr5 66351228 66351455 -86185804 - ORR1C1 LTR MaLR -165 213 1 1 1091 977 79 14 5 chr5 66353319 66353464 -86183795 + ORR1A4 LTR MaLR 203 374 0 1 1091 244 297 164 71 chr5 66364433 66364473 -86172786 - LTR84a LTR ERVL -369 392 345 1 1091 248 299 160 70 chr5 66364583 66364824 -86172435 - LTR84a LTR ERVL -417 344 86 1 1091 271 315 93 53 chr5 66370329 66370480 -86166779 + MLT1D LTR MaLR 128 284 -221 1 1091 404 266 120 8 chr5 66370512 66370637 -86166622 + MLT1D LTR MaLR 365 503 -2 1 1091 324 308 117 137 chr5 66370678 66371028 -86166231 + ORR1E LTR MaLR 6 348 -11 1 1091 546 311 44 104 chr5 66376104 66376488 -86160771 - MLT1B LTR MaLR -4 386 26 1 1091 964 266 91 91 chr5 66376507 66376840 -86160419 - MTE2a LTR MaLR -6 373 40 1 1091 964 266 91 91 chr5 66377036 66377075 -86160184 - MTE2a LTR MaLR -340 39 1 1 1091 379 293 0 39 chr5 66378135 66378238 -86159021 + RMER15 LTR ERVL 371 469 -106 1 1091 1811 123 14 117 chr5 66378396 66378450 -86158809 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 278 1 1091 1811 123 14 117 chr5 66378619 66378914 -86158345 - ORR1A2 LTR MaLR -50 277 14 1 1091 227 273 44 80 chr5 66379883 66380134 -86157125 + RMER17D2 LTR ERVK 241 482 -327 1 1091 1219 118 136 9 chr5 66382584 66382797 -86154462 + ORR1B1 LTR MaLR 1 240 -154 1 1091 316 297 8 85 chr5 66384661 66384790 -86152469 - MLT1F2 LTR MaLR -7 553 435 1 1091 266 295 159 23 chr5 66384883 66385015 -86152244 - MLT1F2 LTR MaLR -169 400 251 1 1091 311 290 59 20 chr5 66385280 66385382 -86151877 + MLT1B LTR MaLR 66 171 -219 1 1091 1634 141 96 4 chr5 66387977 66388248 -86149011 + MTC LTR MaLR 2 297 -124 1 1091 3408 129 17 0 chr5 66388846 66389366 -86147893 - ORR1A4-int LTR MaLR -1434 529 1 1 1091 1656 174 48 19 chr5 66389366 66389682 -86147577 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 5 1 1091 277 284 19 112 chr5 66389686 66389793 -86147466 + MTE2a LTR MaLR 116 212 -167 1 1091 235 273 96 71 chr5 66393715 66394038 -86143221 + RLTR21 LTR ERVK 1097 1427 -145 1 1091 318 268 0 196 chr5 66397140 66397181 -86140078 + MT2B LTR ERVL 129 251 -350 1 1091 631 251 55 92 chr5 66399870 66400206 -86137053 + RMER2 LTR ERV1 4 425 -142 1 1091 324 298 162 59 chr5 66400672 66400975 -86136284 + MLT1A LTR MaLR 41 374 0 1 1091 1844 142 27 45 chr5 66401866 66401917 -86135342 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 288 1 1091 1844 142 27 45 chr5 66402106 66402386 -86134873 - ORR1A3 LTR MaLR -39 287 1 1 1091 757 297 90 37 chr5 66403327 66403557 -86133702 + MTEb LTR MaLR 2 240 -139 1 1091 757 304 95 41 chr5 66403825 66403952 -86133307 + MTEb LTR MaLR 241 379 0 1 1091 268 303 33 33 chr5 66406064 66406156 -86131103 - MT2B LTR ERVL -346 255 164 1 1091 226 152 164 33 chr5 66406225 66406286 -86130973 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 504 1 1091 561 186 9 26 chr5 66407259 66407375 -86129884 + RMER17C LTR ERVK 1 114 -296 1 1091 259 270 31 92 chr5 66412083 66412181 -86125078 + MT2B LTR ERVL 149 240 -361 1 1091 627 251 62 16 chr5 66421484 66421678 -86115581 + ORR1D2 LTR MaLR 168 370 0 1 1091 498 142 110 42 chr5 66430936 66431054 -86106205 + RLTR15 LTR ERVK 1 126 -233 1 1091 1464 135 0 0 chr5 66431074 66431304 -86105955 - ORR1A2-int LTR MaLR -1733 230 1 1 1091 2374 73 6 25 chr5 66431308 66431633 -86105626 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1091 360 276 0 136 chr5 66439871 66439923 -86097336 + MT2B LTR ERVL 124 154 -447 1 1091 1180 207 94 24 chr5 66450836 66451099 -86086160 - MTD LTR MaLR 0 419 136 1 1091 1669 152 67 42 chr5 66451099 66451455 -86085804 + ORR1D1 LTR MaLR 1 365 -9 1 1091 319 302 55 16 chr5 66451468 66451596 -86085663 - MTD LTR MaLR -286 133 1 1 1092 453 235 18 92 chr5 66454928 66455092 -86082167 + ORR1E LTR MaLR 208 359 0 1 1092 458 167 0 72 chr5 66460101 66460198 -86077061 - MTEa LTR MaLR 0 379 290 1 1092 491 237 44 5 chr5 66466251 66466395 -86070864 + ORR1D1 LTR MaLR 1 140 -234 1 1092 427 206 35 53 chr5 66466583 66466696 -86070563 + ORR1D1 LTR MaLR 140 250 -109 1 1092 229 242 38 104 chr5 66468926 66469032 -86068227 + LTR41 LTR ERVL 166 264 -504 1 1092 2239 126 76 3 chr5 66485041 66485408 -86051851 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1092 238 265 89 133 chr5 66489112 66489247 -86048012 + MT2B LTR ERVL 177 305 -296 1 1092 527 277 98 49 chr5 66490001 66490200 -86047059 + MLT1B LTR MaLR 31 239 -151 1 1092 294 354 26 0 chr5 66490380 66490493 -86046766 + MLT1B LTR MaLR 274 389 -1 1 1092 238 279 36 71 chr5 66493703 66493815 -86043444 - MT2B2 LTR ERVL -279 305 198 1 1092 2357 159 29 21 chr5 66498832 66499250 -86038009 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1092 234 273 11 115 chr5 66499518 66499605 -86037654 + MT2B LTR ERVL 194 271 -330 1 1092 2546 56 78 0 chr5 66501102 66501423 -86035836 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1092 231 328 22 88 chr5 66511299 66511436 -86025823 - MLT1H LTR MaLR -366 183 56 4 1092 1177 173 198 41 chr5 66512670 66512989 -86024270 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 5 1092 246 276 77 112 chr5 66514930 66515073 -86022186 - MT2B LTR ERVL -285 316 179 5 1092 264 57 0 28 chr5 66521544 66521580 -86015679 + ORR1C1 LTR MaLR 1 35 -349 8 1092 1836 135 127 63 chr5 66521709 66522041 -86015218 + ORR1C1 LTR MaLR 24 376 -2 8 1092 2921 150 40 55 chr5 66532536 66533115 -86004144 + RMER15 LTR ERVL 6 575 0 1 1092 249 191 0 45 chr5 66551335 66551401 -85985858 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1311 1373 -475 1 1092 1975 142 85 28 chr5 66552815 66552849 -85984410 - RMER15 LTR ERVL 0 575 542 1 1092 1975 142 85 28 chr5 66552885 66553213 -85984046 - RMER15 LTR ERVL -34 541 193 1 1092 295 238 62 12 chr5 66556946 66557027 -85980232 + LTR16C LTR ERVL 401 485 -4 2 1092 1881 164 5 92 chr5 66560780 66561170 -85976089 + MTC LTR MaLR 62 417 -4 2 1092 342 237 59 40 chr5 66562315 66562416 -85974843 - MT2B LTR ERVL -344 257 155 2 1092 517 301 73 43 chr5 66564087 66564373 -85972886 + MTD LTR MaLR 1 292 -127 2 1092 532 217 16 16 chr5 66564403 66564525 -85972734 + MTD LTR MaLR 282 403 -16 2 1092 683 181 13 46 chr5 66564532 66564683 -85972576 + MTEa LTR MaLR 38 183 -196 2 1092 840 194 49 27 chr5 66564818 66565003 -85972256 + MTEa LTR MaLR 191 379 0 2 1092 1527 151 175 9 chr5 66567026 66567341 -85969918 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1092 1512 205 63 33 chr5 66568110 66568473 -85968786 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1092 1205 218 234 0 chr5 66568497 66568800 -85968459 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1092 399 345 33 47 chr5 66575680 66575954 -85961305 + MYSERV6-int LTR ERVK 5322 5591 -3368 2 1092 250 323 48 108 chr5 66576024 66576277 -85960982 + MYSERV6-int LTR ERVK 5639 6093 -2866 2 1092 355 266 46 92 chr5 66576277 66576527 -85960732 + MER70-int LTR ERVL 2559 2647 -2376 2 1092 250 323 48 108 chr5 66576527 66576544 -85960715 + MYSERV6-int LTR ERVK 6094 6127 -2832 2 1092 336 228 19 25 chr5 66576974 66577072 -85960187 + MTE2a LTR MaLR 268 367 -7 2 1092 296 220 25 8 chr5 66581394 66581513 -85955746 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 634 2 1092 392 280 18 53 chr5 66583254 66583367 -85953892 - MLT1E3 LTR MaLR -209 415 307 2 1093 3170 58 5 8 chr5 66585294 66585691 -85951568 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1093 1699 141 52 13 chr5 66588177 66588487 -85948772 - RMER6A LTR ERVK 0 756 435 3 1093 1374 88 42 0 chr5 66588483 66588676 -85948583 - RMER6A LTR ERVK -529 227 27 3 1093 362 291 87 18 chr5 66588865 66589086 -85948173 - MTEb LTR MaLR 0 379 103 3 1093 369 196 17 121 chr5 66593512 66593628 -85943631 + MT2B LTR ERVL 154 257 -344 3 1093 1835 193 159 30 chr5 66596674 66596769 -85940490 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 479 3 1093 1835 193 159 30 chr5 66596809 66597172 -85940087 - RLTR20D LTR ERVK -90 478 53 3 1093 2713 168 13 8 chr5 66597288 66597762 -85939497 + RLTR20D LTR ERVK 1 476 -92 3 1093 351 238 23 45 chr5 66597792 66597880 -85939379 + RLTR20D LTR ERVK 465 550 -18 3 1093 252 321 93 19 chr5 66598110 66598218 -85939041 + ORR1E LTR MaLR 2 117 -242 3 1093 288 215 154 0 chr5 66599002 66599067 -85938192 + MTE2b LTR MaLR 57 131 -248 3 1093 638 238 68 31 chr5 66599298 66599609 -85937650 + RMER17C LTR ERVK 1 378 -32 3 1093 403 282 16 16 chr5 66599769 66599895 -85937364 + RMER17C-int LTR ERVK 81 206 -3032 3 1093 362 216 83 83 chr5 66600618 66600739 -85936520 + RodERV21-int LTR ERV1 898 1018 -3973 3 1093 1681 158 11 93 chr5 66601192 66601556 -85935703 + RMER17C-int LTR ERVK 1116 1449 -1789 3 1093 583 85 0 0 chr5 66601557 66601639 -85935620 + RMER17C-int LTR ERVK 2556 2637 -601 3 1093 4099 160 42 58 chr5 66601645 66602362 -85934897 + RMER17C-int LTR ERVK 1431 2155 -1083 3 1093 4099 160 42 58 chr5 66602507 66602606 -85934653 + RMER17C-int LTR ERVK 2156 2234 -1004 3 1093 4729 143 81 106 chr5 66602893 66603246 -85934013 + RMER17C-int LTR ERVK 2223 2584 -654 3 1093 4729 143 81 106 chr5 66603301 66603935 -85933324 + RMER17C-int LTR ERVK 2585 3238 0 3 1093 474 203 113 21 chr5 66603935 66604076 -85933183 + RMER17C LTR ERVK 1 154 -256 3 1093 1542 175 52 40 chr5 66605473 66605878 -85931381 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 1093 328 190 11 92 chr5 66606548 66606620 -85930639 - MTC LTR MaLR -131 290 221 3 1093 328 190 11 92 chr5 66606768 66606782 -85930477 - MTC LTR MaLR -201 220 211 3 1093 227 254 160 56 chr5 66606966 66607216 -85930043 + RMER10A LTR ERVL 167 442 0 3 1093 303 244 100 25 chr5 66607834 66607914 -85929345 + MLT1G1 LTR MaLR 423 508 -71 3 1093 256 299 74 33 chr5 66619253 66619374 -85917885 + MLT1A1 LTR MaLR 265 390 -18 4 1093 597 299 68 65 chr5 66634960 66635318 -85901941 - RLTR26 LTR ERVK -207 420 1 4 1093 1603 165 64 22 chr5 66638891 66639300 -85897959 + RMER19B LTR ERVK 142 662 -240 5 1093 388 331 93 12 chr5 66641739 66641996 -85895263 + MER90a LTR ERV1 320 597 -17 5 1093 4815 115 45 96 chr5 66643013 66643967 -85893292 + RMER17A2 LTR ERVK 2 906 0 5 1093 339 307 78 0 chr5 66650317 66650470 -85886789 + MLT1J LTR MaLR 106 270 -242 5 1093 242 273 33 22 chr5 66656634 66656724 -85880535 + MLT1A0 LTR MaLR 20 110 -255 5 1093 230 200 0 18 chr5 66657563 66657619 -85879640 + MLT1A0 LTR MaLR 342 396 -12 5 1093 293 239 16 124 chr5 66662822 66662867 -85874392 + MT2B LTR ERVL 125 155 -446 5 1093 2086 151 58 73 chr5 66671734 66672133 -85865126 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 5 1093 1556 215 96 14 chr5 66673858 66674202 -85863057 - MTD LTR MaLR -47 372 1 5 1093 2200 118 0 65 chr5 66676702 66677054 -85860205 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1093 9575 121 114 110 chr5 66677054 66679006 -85858253 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1959 -4 5 1093 2000 83 31 103 chr5 66679015 66679364 -85857895 + ORR1A4 LTR MaLR 6 329 0 5 1093 463 209 184 54 chr5 66682247 66682394 -85854865 - MTC LTR MaLR -9 412 247 6 1093 504 190 50 10 chr5 66709174 66709275 -85827984 + MLT1D LTR MaLR 396 500 -5 6 1093 1543 124 50 148 chr5 66712414 66712718 -85824541 + ORR1A4 LTR MaLR 1 286 -43 6 1093 1543 124 50 148 chr5 66712887 66712940 -85824319 + ORR1A4 LTR MaLR 287 323 -6 6 1094 2549 102 11 6 chr5 66720597 66720962 -85816297 + RLTR9A LTR ERVK 1 367 -1 6 1094 241 291 104 22 chr5 66721797 66721853 -85815406 + RLTR21 LTR ERVK 1055 1116 -456 6 1094 241 291 104 22 chr5 66721971 66722013 -85815246 + RLTR21 LTR ERVK 1117 1252 -320 6 1094 368 209 120 17 chr5 66723477 66723594 -85813665 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 280 6 1094 512 286 211 31 chr5 66730340 66730690 -85806569 + MER77 LTR ERVL 183 595 -12 6 1094 2982 155 165 13 chr5 66733593 66734194 -85803065 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 7 1094 1177 254 235 47 chr5 66734589 66735129 -85802130 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 7 1094 242 312 71 55 chr5 66738494 66738677 -85798582 - ORR1E LTR MaLR -142 217 32 7 1094 1234 200 55 22 chr5 66739668 66739939 -85797320 - MTEb LTR MaLR -99 280 1 7 1094 410 316 71 27 chr5 66741915 66742139 -85795120 + MLT1D LTR MaLR 210 443 -62 7 1094 2084 108 8 97 chr5 66743891 66744251 -85793008 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 7 1094 2539 158 33 18 chr5 66745253 66745705 -85791554 + RMER20B LTR ERVK 1 459 -168 7 1094 2157 131 19 0 chr5 66746913 66747233 -85790026 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 7 1094 604 297 132 41 chr5 66747476 66747795 -85789464 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 7 1094 233 356 50 0 chr5 66748515 66748616 -85788643 - LTR50 LTR ERVL -119 676 571 7 1094 279 307 98 38 chr5 66750477 66750660 -85786599 + LTR84a LTR ERVL 19 212 -545 7 1094 306 315 44 66 chr5 66750942 66751090 -85786169 + LTR84a LTR ERVL 613 761 0 7 1094 486 270 98 53 chr5 66775020 66775286 -85761973 - ORR1E LTR MaLR -3 356 79 7 1094 292 277 164 85 chr5 66776831 66777223 -85760036 + MLT1H LTR MaLR 51 539 -16 7 1094 3115 55 60 0 chr5 66787089 66787473 -85749786 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1094 2150 151 60 67 chr5 66797746 66797955 -85739304 + MTD LTR MaLR 1 210 -209 8 1094 2150 151 60 67 chr5 66798146 66798356 -85738903 + MTD LTR MaLR 211 417 -2 8 1094 288 182 36 0 chr5 66802762 66802817 -85734442 + MLT1J1 LTR MaLR 50 106 -338 8 1094 2000 154 47 28 chr5 66805439 66805799 -85731460 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 8 1094 266 319 11 21 chr5 66811688 66811781 -85725478 - MLT1B LTR MaLR -56 411 320 8 1094 323 226 158 24 chr5 66812167 66812294 -85724965 - MLT1B LTR MaLR -246 144 1 8 1094 2232 104 28 0 chr5 66813850 66814168 -85723091 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1094 252 333 128 46 chr5 66818156 66818351 -85718908 + MLT1E1 LTR MaLR 41 251 -403 8 1094 1367 239 97 5 chr5 66818432 66818803 -85718456 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 1094 496 253 85 11 chr5 66820382 66820570 -85716689 + MLT1B LTR MaLR 186 387 -3 8 1094 1961 93 82 53 chr5 66825828 66826146 -85711113 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1094 244 271 7 157 chr5 66830729 66830760 -85706499 + MT2B LTR ERVL 139 232 -369 8 1095 437 267 236 74 chr5 66848468 66848786 -85688473 + MTE2b LTR MaLR 10 378 -1 9 1095 2327 114 23 44 chr5 66851805 66852191 -85685068 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 9 1095 242 315 123 26 chr5 66852389 66852503 -85684756 - RMER15 LTR ERVL -108 467 343 9 1095 1570 193 68 35 chr5 66856308 66856646 -85680613 + ORR1D1 LTR MaLR 26 374 0 9 1095 1584 172 176 22 chr5 66858410 66858773 -85678486 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 1095 226 340 32 128 chr5 66862334 66862553 -85674706 + MLT1H LTR MaLR 238 435 -114 9 1095 275 260 122 85 chr5 66865664 66865828 -85671431 - RMER13A LTR ERVK -673 187 18 9 1095 520 239 60 87 chr5 66867531 66867882 -85669377 + MTEa LTR MaLR 18 379 0 9 1095 861 256 86 70 chr5 66868307 66868829 -85668430 + RLTR12B LTR ERVK 1 485 -43 9 1095 253 234 216 29 chr5 66870527 66870709 -85666550 - MLT1J LTR MaLR -79 531 233 9 1095 381 347 29 11 chr5 66872279 66872454 -85664805 - MTEb LTR MaLR -4 375 198 9 1095 407 250 52 26 chr5 66876883 66876998 -85660261 + MLT1D LTR MaLR 384 501 -4 9 1095 2725 112 28 33 chr5 66877575 66877998 -85659261 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1095 1146 245 35 24 chr5 66878777 66879032 -85658227 + ORR1C1 LTR MaLR 121 378 0 9 1095 3150 101 39 13 chr5 66887612 66888075 -85649184 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 9 1095 789 285 169 57 chr5 66890404 66890932 -85646327 + RLTR18 LTR ERVK 5 591 -25 9 1095 2044 168 73 14 chr5 66890991 66891360 -85645899 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 9 1095 1016 157 203 35 chr5 66891448 66891834 -85645425 - RMER6B LTR ERVK -10 451 1 9 1095 901 113 157 0 chr5 66893318 66893477 -85643782 + ORR1B2 LTR MaLR 2 185 -182 9 1095 318 343 105 92 chr5 66894795 66895100 -85642159 + MLT1N2 LTR MaLR 34 342 -220 9 1095 694 246 35 15 chr5 66917269 66917467 -85619792 + RMER15-int LTR ERVL 4581 4782 -217 1 1095 258 211 30 16 chr5 66920286 66920359 -85616900 - MTE2a LTR MaLR 0 379 306 1 1095 349 253 40 40 chr5 66920370 66920469 -85616790 - MTE2a LTR MaLR -115 264 166 1 1095 482 254 221 71 chr5 66924625 66924951 -85612308 - MLT1B LTR MaLR -11 379 5 1 1095 1766 138 3 42 chr5 66931473 66931784 -85605475 + MTC LTR MaLR 1 299 -122 1 1095 597 259 5 84 chr5 66932213 66932403 -85604856 - MTD LTR MaLR -244 175 1 1 1095 311 256 0 91 chr5 66942645 66942689 -85594570 + MTE2b LTR MaLR 9 52 -327 1 1095 311 256 0 91 chr5 66942863 66942917 -85594342 + MTE2b LTR MaLR 53 98 -281 1 1095 593 255 121 94 chr5 66942996 66943303 -85593956 + MTE2a LTR MaLR 1 315 -64 1 1095 517 251 19 7 chr5 66943306 66943451 -85593808 + MTE2b LTR MaLR 224 373 -6 1 1095 1727 251 64 88 chr5 66943511 66944166 -85593093 - RLTR26 LTR ERVK -3 639 1 1 1095 346 273 162 71 chr5 66948678 66948971 -85588288 + ORR1E LTR MaLR 13 353 -6 1 1095 1131 210 184 3 chr5 66948981 66949297 -85587962 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 1 1095 2589 56 267 0 chr5 66955330 66955571 -85581688 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 285 -190 1 1095 2589 56 267 0 chr5 66955625 66955758 -85581501 + MT2C_Mm LTR ERVL 286 473 -2 1 1095 1885 122 24 56 chr5 66955778 66956118 -85581141 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1095 242 341 0 12 chr5 66956401 66956487 -85580772 - MER21B LTR ERV1 -516 347 263 1 1095 254 225 95 63 chr5 66961025 66961120 -85576139 + RMER15 LTR ERVL 359 456 -119 1 1095 1166 226 37 158 chr5 66961140 66961192 -85576067 - MTE2a LTR MaLR 0 379 326 1 1095 1166 226 37 158 chr5 66961324 66961702 -85575557 - MTE2a LTR MaLR -54 325 1 1 1095 343 296 60 9 chr5 66962728 66962844 -85574415 + MTE-int LTR MaLR 349 470 -1110 1 1095 323 302 0 0 chr5 66963334 66963420 -85573839 + MTE-int LTR MaLR 623 708 -872 1 1095 1426 244 95 14 chr5 66972717 66973088 -85564171 - MTD LTR MaLR -14 405 13 1 1095 1594 112 11 72 chr5 66976189 66976468 -85560791 - ORR1A4 LTR MaLR -67 262 1 1 1096 1303 187 129 20 chr5 66978885 66979180 -85558079 - ORR1D1 LTR MaLR -45 329 3 1 1096 606 328 88 91 chr5 66980077 66980450 -85556809 + MLT1A LTR MaLR 1 372 -2 1 1096 1090 165 79 14 chr5 66981118 66981333 -85555926 - MTD LTR MaLR -11 408 180 1 1096 280 368 56 78 chr5 66984892 66985213 -85552046 + ORR1E LTR MaLR 3 316 -43 1 1096 544 330 43 43 chr5 66988902 66989184 -85548075 - MLT1C LTR MaLR -181 286 5 1 1096 2500 89 6 0 chr5 66989663 66989988 -85547271 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1096 2513 156 45 49 chr5 66990219 66990675 -85546584 + RLTR11A LTR ERVK 4 458 -70 1 1096 2513 156 45 49 chr5 66990698 66990768 -85546491 + RLTR11A LTR ERVK 459 528 0 1 1096 666 209 214 51 chr5 66990797 66991054 -85546205 + ORR1C2 LTR MaLR 86 384 0 1 1096 1061 135 12 0 chr5 66999831 66999994 -85537265 + ORR1D1 LTR MaLR 1 165 -209 1 1096 1110 158 44 10 chr5 67000062 67000266 -85536993 + ORR1C2 LTR MaLR 174 384 0 2 1096 1468 304 4 48 chr5 67014170 67014668 -85522591 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 49 2 1096 3106 21 14 238 chr5 67015116 67015678 -85521581 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 1096 610 264 95 0 chr5 67023106 67023254 -85514005 + MLT1C LTR MaLR 300 461 -6 4 1096 1520 141 195 26 chr5 67023958 67024265 -85512994 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 1096 1793 207 54 27 chr5 67027376 67027759 -85509500 - MTD LTR MaLR 0 419 20 5 1096 1793 207 54 27 chr5 67027796 67027819 -85509440 - MTD LTR MaLR -400 19 2 5 1096 371 300 91 142 chr5 67028848 67029180 -85508079 - MTEb LTR MaLR -13 366 52 6 1096 252 306 194 30 chr5 67029032 67029197 -85508062 - MLT2B3 LTR ERVL -319 235 44 6 1096 345 198 24 138 chr5 67029249 67029372 -85507887 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 6 1096 1378 284 14 17 chr5 67032410 67032765 -85504494 + MTE2b LTR MaLR 20 373 -6 7 1096 342 224 200 0 chr5 67032762 67032847 -85504412 + ORR1D1 LTR MaLR 273 374 0 7 1096 1685 214 24 21 chr5 67034175 67034378 -85502881 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 167 8 1096 1685 214 24 21 chr5 67034609 67034777 -85502482 - ORR1D1 LTR MaLR -208 166 2 8 1096 2433 163 42 2 chr5 67036088 67036493 -85500766 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1096 1881 169 145 3 chr5 67037077 67037422 -85499837 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 9 1096 1347 238 48 11 chr5 67038823 67039176 -85498083 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 9 1096 9086 143 20 63 chr5 67040830 67042446 -85494813 + RLTR21 LTR ERVK 1 1546 -26 1 1096 484 268 277 33 chr5 67043125 67043519 -85493740 - MER76 LTR ERVL -60 631 142 1 1096 1582 204 94 50 chr5 67049197 67049492 -85487767 - MTD LTR MaLR -1 418 99 1 1096 1385 217 135 3 chr5 67049492 67049862 -85487397 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1096 1582 204 94 50 chr5 67049862 67049948 -85487311 - MTD LTR MaLR -321 98 20 1 1096 301 272 91 45 chr5 67050702 67050856 -85486403 - RMER15 LTR ERVL -64 511 351 1 1096 1103 251 82 20 chr5 67055041 67055394 -85481865 - MTE2b LTR MaLR -3 376 2 1 1096 2116 174 73 8 chr5 67058666 67059061 -85478198 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1096 280 336 84 92 chr5 67060011 67060368 -85476891 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 1 1096 1832 175 117 11 chr5 67063602 67063977 -85473282 - MTC LTR MaLR -6 415 1 1 1096 1212 229 122 36 chr5 67079635 67080021 -85457238 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1096 457 259 51 71 chr5 67080887 67081299 -85455960 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 33 1 1096 1155 221 25 42 chr5 67081499 67081782 -85455477 - MTE2b LTR MaLR 0 379 102 1 1096 423 364 78 17 chr5 67090604 67090836 -85446423 + MLT1E3 LTR MaLR 1 246 -378 2 1096 504 311 55 25 chr5 67090812 67091082 -85446177 + MLT1E3 LTR MaLR 376 651 -3 2 1096 423 192 0 0 chr5 67097233 67097306 -85439953 + LTR16A1 LTR ERVL 54 126 -330 2 1096 300 159 55 6 chr5 67103694 67103859 -85433400 - RMER17C LTR ERVK -135 275 103 2 1096 961 264 99 32 chr5 67104108 67104483 -85432776 - MLT1F LTR MaLR -13 535 136 2 1096 250 245 0 0 chr5 67104582 67104635 -85432624 - MTEb LTR MaLR -7 372 320 2 1096 335 241 50 12 chr5 67105247 67105327 -85431932 - ORR1E LTR MaLR -276 83 1 2 1096 1013 291 126 24 chr5 67107380 67107841 -85429418 - MT2A LTR ERVL -25 508 1 2 1096 540 279 68 105 chr5 67108234 67108559 -85428700 + ORR1E LTR MaLR 46 370 0 2 0 798 250 86 129 chr5 67108686 67109058 -85428201 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 27 2 1097 1396 233 55 50 chr5 67109071 67109487 -85427772 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 2 1097 268 311 0 11 chr5 67118416 67118507 -85418752 + MLT1C LTR MaLR 375 464 -3 3 1097 303 293 12 0 chr5 67120371 67120453 -85416806 + RLTR18B LTR ERVK 426 508 -4 3 1097 384 234 97 13 chr5 67125344 67125490 -85411769 + MTEa LTR MaLR 258 414 -5 3 1097 880 298 31 39 chr5 67129408 67129795 -85407464 - MTD LTR MaLR -14 405 22 3 1097 252 309 75 0 chr5 67130727 67130821 -85406438 + LTR16B2 LTR ERVL 126 226 -236 3 1097 255 281 31 109 chr5 67132179 67132307 -85404952 + MT2B LTR ERVL 140 257 -344 3 1097 3504 135 36 7 chr5 67132933 67133174 -85404085 + RLTR12A LTR ERVK 1 252 -316 3 1097 3504 135 36 7 chr5 67133352 67133662 -85403597 + RLTR12A LTR ERVK 253 567 -1 3 1097 3095 127 33 52 chr5 67134840 67135421 -85401838 + RMER15 LTR ERVL 1 570 -5 3 1097 1492 147 100 12 chr5 67136098 67136438 -85400821 - MTC LTR MaLR -8 413 1 3 1097 235 262 15 15 chr5 67149895 67149961 -85387298 - ORR1E LTR MaLR -1 378 313 3 1097 488 268 24 0 chr5 67149962 67150085 -85387174 - ORR1E LTR MaLR -230 129 4 3 1097 250 288 25 0 chr5 67153452 67153532 -85383727 - MLT1H2 LTR MaLR -337 152 71 3 1097 225 170 0 21 chr5 67155900 67155948 -85381311 - MLT1F1 LTR MaLR -12 612 566 3 1097 855 344 68 4 chr5 67156375 67156828 -85380431 - MLT1F1 LTR MaLR -86 483 2 3 1097 249 247 39 58 chr5 67169248 67169351 -85367908 - MLT1A1 LTR MaLR -307 101 1 4 1097 843 192 262 7 chr5 67172000 67172294 -85364965 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 6 4 1097 877 265 75 42 chr5 67173101 67173432 -85363827 + MTEb LTR MaLR 1 342 -37 4 1097 546 174 8 18 chr5 67175054 67175179 -85362080 + ORR1A4 LTR MaLR 232 356 -14 4 1097 1267 238 20 103 chr5 67178696 67179094 -85358165 - MTE2a LTR MaLR -10 369 5 4 1097 704 245 23 120 chr5 67185614 67186070 -85351189 + MTD LTR MaLR 3 406 -13 4 1097 2620 127 10 29 chr5 67186476 67186889 -85350370 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 4 1097 461 347 97 21 chr5 67194750 67195130 -85342129 - MLT1I LTR MaLR -2 409 1 4 1097 258 276 293 0 chr5 67198529 67198703 -85338556 + MLT1D LTR MaLR 139 363 -142 4 1097 2993 45 85 8 chr5 67203306 67203684 -85333575 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1097 451 332 48 60 chr5 67204610 67204946 -85332313 - MLT1A LTR MaLR -42 332 1 4 1097 542 349 73 49 chr5 67214551 67214895 -85322364 - ORR1E LTR MaLR -7 352 1 4 1097 958 176 101 39 chr5 67218835 67219143 -85318116 - RMER17C LTR ERVK 0 410 84 5 1097 655 243 24 60 chr5 67219140 67219230 -85318029 - RMER17C LTR ERVK -166 244 191 5 1097 655 224 21 42 chr5 67219410 67219591 -85317668 - RMER17C LTR ERVK -220 190 12 5 1097 271 228 84 0 chr5 67221015 67221093 -85316166 - MLT1G3 LTR MaLR -251 328 244 5 1097 1011 241 71 44 chr5 67222699 67223037 -85314222 + MTD LTR MaLR 49 395 -24 5 1097 397 306 68 79 chr5 67228247 67228628 -85308631 - MTEa LTR MaLR 0 379 6 5 1097 1657 218 162 19 chr5 67231409 67231891 -85305368 - RMER15 LTR ERVL -3 572 22 5 1097 454 196 10 10 chr5 67235158 67235261 -85301998 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 306 5 1097 304 295 44 18 chr5 67235444 67235558 -85301701 - MLT1A1 LTR MaLR -291 117 1 5 1098 1781 125 10 3 chr5 67249906 67250204 -85287055 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 228 5 1098 417 183 9 46 chr5 67250224 67250333 -85286926 - RLTR11A2 LTR ERVK -267 260 156 5 1098 952 197 25 5 chr5 67251046 67251238 -85286021 + MTD LTR MaLR 18 213 -206 5 1098 917 237 23 9 chr5 67251371 67251592 -85285667 + MTD LTR MaLR 196 419 0 5 1098 239 298 12 12 chr5 67254557 67254642 -85282617 - MER21B LTR ERV1 -169 694 610 5 1098 301 277 97 40 chr5 67259384 67259508 -85277751 - ORR1E LTR MaLR -210 149 19 5 1098 3819 189 28 52 chr5 67260067 67260972 -85276287 + RMER13B LTR ERVK 1 883 -25 5 1098 1601 196 90 41 chr5 67264338 67264726 -85272533 - MTD LTR MaLR 0 419 13 5 1098 1997 192 17 5 chr5 67267599 67268003 -85269256 - MTC LTR MaLR -2 419 11 5 1098 506 234 31 55 chr5 67276995 67277158 -85260101 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 224 6 1098 467 219 98 42 chr5 67282838 67282981 -85254278 - MLT1F2 LTR MaLR 0 548 398 6 1098 525 277 68 59 chr5 67283061 67283280 -85253979 - MLT1F2 LTR MaLR -339 221 1 6 1098 1358 239 49 49 chr5 67283684 67284137 -85253122 + RLTR11A2 LTR ERVK 73 525 -2 6 1098 378 241 116 20 chr5 67285102 67285214 -85252045 - MLT1A1 LTR MaLR -285 123 10 6 1098 655 246 180 30 chr5 67286226 67286557 -85250702 - MLT1B LTR MaLR 0 467 1 6 1098 1276 236 78 14 chr5 67312921 67313305 -85223954 - MTD LTR MaLR -14 405 18 6 1098 258 284 33 92 chr5 67315242 67315362 -85221897 - MT2B LTR ERVL -336 265 153 6 1098 789 333 27 13 chr5 67323139 67323437 -85213822 + ORR1D2 LTR MaLR 1 302 -68 6 1098 665 245 87 44 chr5 67326387 67326823 -85210436 + RLTR15 LTR ERVK 1 333 -26 6 1098 600 263 176 34 chr5 67329781 67330089 -85207170 - MLT1A0 LTR MaLR -14 351 1 6 1098 247 348 95 26 chr5 67332854 67333158 -85204101 - LTR79 LTR ERVL -60 467 143 6 1098 614 301 46 23 chr5 67342353 67342571 -85194688 - MLT1E3 LTR MaLR -2 622 400 7 1098 240 217 116 0 chr5 67342739 67342808 -85194451 - MLT1E3 LTR MaLR -573 81 5 7 1098 1459 189 88 3 chr5 67343916 67344245 -85193014 - ORR1D1 LTR MaLR -9 365 9 7 1098 500 277 64 85 chr5 67355170 67355498 -85181761 - MLT1J LTR MaLR -74 438 118 7 1098 334 181 72 19 chr5 67355703 67355809 -85181450 + MLT1A1 LTR MaLR 259 401 -7 7 1098 593 338 35 67 chr5 67367907 67368278 -85168981 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 7 1099 655 317 123 37 chr5 67393982 67394241 -85143018 - MLT1C LTR MaLR 0 467 205 7 1099 655 317 123 37 chr5 67394356 67394479 -85142780 - MLT1C LTR MaLR -263 204 54 7 1099 1051 265 147 15 chr5 67400613 67400946 -85136313 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 7 1099 426 311 0 8 chr5 67405854 67405977 -85131282 + RMER12 LTR ERVK 770 891 -431 7 1099 1914 173 3 44 chr5 67409237 67409420 -85127839 - ORR1D1 LTR MaLR -23 351 176 7 1099 1914 173 3 44 chr5 67409589 67409767 -85127492 - ORR1D1 LTR MaLR -199 175 5 7 1099 860 228 11 6 chr5 67419623 67419804 -85117455 - ORR1E LTR MaLR -177 182 1 8 1099 2176 140 91 30 chr5 67428424 67428821 -85108438 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1099 4467 10 4 0 chr5 67428847 67429338 -85107921 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 8 1099 48665 13 6 0 chr5 67429338 67434668 -85102591 + MERVL-int LTR ERVL 1 5364 -121 8 1099 386 132 12 50 chr5 67434668 67434748 -85102511 + ORR1A3-int LTR MaLR 564 640 -1323 8 1099 319 0 0 0 chr5 67434748 67434786 -85102473 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 8 1099 4467 10 4 0 chr5 67434786 67435277 -85101982 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 8 1099 1700 171 64 20 chr5 67437511 67437868 -85099391 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 8 1099 799 269 33 51 chr5 67454927 67455100 -85082159 - ORR1E LTR MaLR -88 271 102 8 1099 799 269 33 51 chr5 67455301 67455401 -85081858 - ORR1E LTR MaLR -258 101 3 8 1099 4447 106 66 31 chr5 67458024 67458755 -85078504 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 8 1099 386 179 0 59 chr5 67461179 67461280 -85075979 + MLT1A1 LTR MaLR 313 407 -1 8 1099 2032 139 40 9 chr5 67465772 67466120 -85071139 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 8 1099 235 212 45 15 chr5 67466185 67466252 -85071007 - ORR1B1 LTR MaLR -320 74 6 8 1099 1162 223 156 68 chr5 67472149 67472297 -85064962 - RMER10B LTR ERVL 0 398 195 8 1099 1162 223 156 68 chr5 67472364 67472580 -85064679 - RMER10B LTR ERVL -204 194 2 8 1099 238 178 0 0 chr5 67476119 67476164 -85061095 + RMER19C LTR ERVK 1 45 -566 9 1099 1314 243 39 89 chr5 67476174 67476705 -85060554 + RMER19C LTR ERVK 159 611 0 9 1099 777 249 107 69 chr5 67476705 67477068 -85060191 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 9 1099 235 259 22 45 chr5 67477304 67477393 -85059866 - MLT1A LTR MaLR -218 156 70 9 1099 335 349 142 4 chr5 67497951 67498190 -85039069 + MLT1I LTR MaLR 17 288 -123 9 1099 2033 157 49 27 chr5 67498337 67498453 -85038806 + MTC LTR MaLR 1 130 -291 9 1099 3400 38 0 5 chr5 67498453 67498851 -85038408 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1099 2033 157 49 27 chr5 67498851 67499139 -85038120 + MTC LTR MaLR 131 414 -7 9 1100 2116 123 35 0 chr5 67507237 67507553 -85029706 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1100 7569 121 22 40 chr5 67507553 67508923 -85028336 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 619 1 1100 313 268 71 21 chr5 67510982 67511123 -85026136 - RMER15 LTR ERVL -13 562 415 2 1100 2015 149 131 11 chr5 67513370 67513743 -85023516 + MTC LTR MaLR 4 421 0 2 1100 1070 158 16 83 chr5 67515254 67515496 -85021763 - MTC LTR MaLR 0 421 196 3 1100 1139 121 75 10 chr5 67516437 67516637 -85020622 - MTC LTR MaLR -207 214 2 3 1100 373 261 110 13 chr5 67518274 67518429 -85018830 + MLT1I LTR MaLR 19 188 -223 3 1100 3180 65 8 12 chr5 67518840 67519242 -85018017 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1100 2610 160 60 22 chr5 67520544 67521082 -85016177 + RLTR12A LTR ERVK 1 558 -10 4 1100 2176 95 6 0 chr5 67524665 67524982 -85012277 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1100 876 265 125 37 chr5 67534993 67535346 -85001913 - MTD LTR MaLR -30 389 6 7 1100 460 143 40 30 chr5 67539551 67539652 -84997607 + MLT1A1 LTR MaLR 303 404 -4 8 1100 3677 40 67 9 chr5 67539824 67540273 -84996986 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 8 1100 528 224 87 29 chr5 67545234 67545372 -84991887 - ORR1D2 LTR MaLR -224 146 1 9 1100 898 294 92 9 chr5 67545613 67545959 -84991300 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 9 1100 491 297 88 70 chr5 67547582 67547801 -84989458 - MLT1F1 LTR MaLR -233 327 108 9 1100 491 284 88 55 chr5 67547948 67548050 -84989209 - MLT1F1 LTR MaLR -462 107 6 9 1100 783 304 86 32 chr5 67548891 67549265 -84987994 - MT2A LTR ERVL -139 394 1 1 1100 3535 121 18 63 chr5 67555917 67556517 -84980742 - RMER15 LTR ERVL -2 573 1 1 1100 1730 150 31 19 chr5 67558431 67558485 -84978774 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 345 1 1100 1730 150 31 19 chr5 67558632 67558896 -84978363 - ORR1B1 LTR MaLR -50 344 72 1 1100 439 158 24 0 chr5 67560261 67560343 -84976916 - ORR1B1 LTR MaLR -310 84 1 1 1100 233 282 136 61 chr5 67573217 67573349 -84963910 - MLT1J LTR MaLR -146 366 225 1 1100 273 293 16 57 chr5 67573567 67573690 -84963569 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 291 1 1100 442 196 103 0 chr5 67576672 67576779 -84960480 + RLTR42-int LTR ERVK 2855 2972 -2550 1 1100 4349 183 38 56 chr5 67577043 67578009 -84959250 + RLTR42-int LTR ERVK 4002 4950 -572 1 1100 341 225 0 22 chr5 67577997 67578088 -84959171 + RLTR42-int LTR ERVK 5390 5478 -44 1 1100 236 234 118 47 chr5 67579085 67579170 -84958089 - MT2B LTR ERVL -344 257 167 1 1100 637 329 107 40 chr5 67579854 67580228 -84957031 - MLT2C2 LTR ERVL -64 400 2 1 1100 348 277 79 22 chr5 67585453 67585614 -84951645 + MLT1J LTR MaLR 51 263 -249 1 1100 789 298 52 75 chr5 67590660 67591079 -84946180 + MTE2a LTR MaLR 1 419 0 1 1100 1515 159 72 113 chr5 67592328 67592718 -84944541 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1100 2035 186 40 10 chr5 67602234 67602635 -84934624 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1100 1587 165 61 35 chr5 67627635 67627980 -84909279 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 1101 2226 130 42 50 chr5 67634612 67634993 -84902266 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1101 1511 201 7 19 chr5 67636534 67636844 -84900415 + MTD LTR MaLR 6 311 -108 2 1101 1009 222 166 17 chr5 67639231 67639533 -84897726 + ORR1D2 LTR MaLR 24 370 0 2 1101 540 316 122 15 chr5 67640348 67640745 -84896514 - MLT1C LTR MaLR -1 466 27 2 1101 290 333 82 78 chr5 67642108 67642352 -84894907 + MLT1I LTR MaLR 46 290 -121 2 1101 287 275 208 0 chr5 67643193 67643342 -84893917 - LTR31 LTR ERV1 -125 494 315 2 1101 702 189 25 6 chr5 67643421 67643576 -84893683 + ORR1C2 LTR MaLR 3 161 -213 2 1101 1404 201 110 34 chr5 67643637 67644081 -84893178 + RMER19B LTR ERVK 138 620 -282 2 1101 1082 168 33 14 chr5 67644151 67644363 -84892896 + ORR1C2 LTR MaLR 167 382 -2 2 1101 642 316 77 55 chr5 67646372 67646827 -84890432 + MLT1D LTR MaLR 41 505 0 2 1101 421 273 44 22 chr5 67650325 67650460 -84886799 + MLT1B LTR MaLR 253 390 0 2 1101 1818 154 117 23 chr5 67660560 67660945 -84876314 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1101 4487 14 2 0 chr5 67661365 67661857 -84875402 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1101 321 0 0 0 chr5 67661857 67661895 -84875364 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 1101 362 167 46 35 chr5 67661895 67661982 -84875277 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 3 1101 48503 14 6 0 chr5 67661982 67667308 -84869951 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 3 1101 4694 14 2 0 chr5 67667308 67667800 -84869459 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1101 2195 161 102 19 chr5 67673060 67673530 -84863729 - RMER20A LTR ERVK -7 509 1 3 1101 1609 212 114 21 chr5 67684837 67685213 -84852046 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 3 1101 3367 216 236 37 chr5 67685217 67686266 -84850993 + MTD-int LTR MaLR 1 1258 0 3 1101 1313 209 50 139 chr5 67686266 67686726 -84850533 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1101 225 303 65 13 chr5 67690949 67691026 -84846233 - MLT1C LTR MaLR -6 461 381 3 1101 4014 108 114 39 chr5 67696334 67696486 -84840773 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 551 3 1101 4014 108 114 39 chr5 67696691 67697195 -84840064 - RLTR19B LTR ERVK -165 550 1 3 1101 352 237 36 60 chr5 67708517 67708683 -84828576 + RMER17A2 LTR ERVK 251 412 -494 4 1101 1667 183 106 34 chr5 67709297 67709654 -84827605 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 1 4 1101 952 224 232 107 chr5 67709825 67710235 -84827024 + MT2A LTR ERVL 1 461 -72 4 1101 295 116 76 65 chr5 67723373 67723465 -84813794 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK -52 315 223 4 1101 2015 174 93 3 chr5 67728399 67728785 -84808474 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1101 373 268 55 31 chr5 67739635 67739762 -84797497 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 278 4 1101 1431 189 114 17 chr5 67750582 67750932 -84786327 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1101 270 310 99 155 chr5 67753482 67753856 -84783403 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 4 1102 3509 127 112 26 chr5 67810046 67810707 -84726552 + RMER6A LTR ERVK 5 722 -34 6 1102 243 250 97 11 chr5 67817165 67817258 -84720001 - ORR1A1-int LTR MaLR -568 1224 1124 6 1102 321 286 30 67 chr5 67821395 67821530 -84715729 + MLT1A1 LTR MaLR 39 168 -240 6 1102 324 333 102 0 chr5 67821728 67821874 -84715385 + MLT1A0-int LTR MaLR 4 164 -1571 6 1102 710 217 138 6 chr5 67821874 67822055 -84715204 + RMER6B LTR ERVK 1 205 -256 6 1102 603 202 144 79 chr5 67822187 67822402 -84714857 + RMER6B LTR ERVK 233 461 0 6 1102 1092 302 200 74 chr5 67822606 67822673 -84714586 + MLT1A0-int LTR MaLR 259 336 -1399 6 1102 1092 302 200 74 chr5 67822811 67823484 -84713775 + MLT1A0-int LTR MaLR 337 1092 -643 6 1102 507 301 150 18 chr5 67824038 67824265 -84712994 + MLT1A0-int LTR MaLR 1474 1730 -5 6 1102 449 297 156 55 chr5 67824287 67824615 -84712644 + MLT1A0 LTR MaLR 5 365 0 6 1102 812 285 112 55 chr5 67824959 67825431 -84711828 + RMER5 LTR ERV1 36 534 0 6 1102 347 224 0 26 chr5 67827141 67827219 -84710040 - LTR37A LTR ERV1 -4 422 347 6 1102 2014 91 3 119 chr5 67830157 67830518 -84706741 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1102 277 292 94 0 chr5 67831279 67831375 -84705884 - MLT1C LTR MaLR -6 461 357 6 1102 1374 208 147 3 chr5 67842268 67842615 -84694644 - MTD LTR MaLR -2 417 21 6 1102 2387 137 20 35 chr5 67845830 67846230 -84691029 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1102 1932 107 5 121 chr5 67847994 67848366 -84688893 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1102 247 254 58 58 chr5 67848948 67849069 -84688190 + MLT1C LTR MaLR 5 125 -342 6 1102 805 328 47 47 chr5 67850861 67851203 -84686056 + MLT1C LTR MaLR 117 458 -9 6 1102 278 356 35 104 chr5 67851361 67851562 -84685697 + ORR1E LTR MaLR 8 194 -165 6 1102 814 252 87 77 chr5 67854948 67855271 -84681988 + ORR1D2 LTR MaLR 4 329 -41 7 1102 1201 172 118 0 chr5 67855439 67855677 -84681582 - MTC LTR MaLR -152 269 4 7 1102 423 340 35 0 chr5 67857075 67857219 -84680040 + LTR16A LTR ERVL 140 288 -163 7 1102 1721 171 116 14 chr5 67859334 67859689 -84677570 + ORR1B1 LTR MaLR 3 393 -1 7 1102 2201 139 47 53 chr5 67860987 67861367 -84675892 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 7 1102 1089 307 93 5 chr5 67862235 67862612 -84674647 - MER70B LTR ERVL -104 474 65 7 1102 1060 254 108 12 chr5 67862834 67863157 -84674102 - MTEa LTR MaLR -25 354 1 7 1102 253 295 45 11 chr5 67876162 67876251 -84661008 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 314 7 1102 1044 252 54 95 chr5 67876995 67877385 -84659874 - MTEa LTR MaLR -5 374 1 7 1102 242 301 93 115 chr5 67882924 67883194 -84654065 + MLT1I LTR MaLR 146 409 -2 7 1102 1126 219 55 87 chr5 67883316 67883511 -84653748 + ORR1E LTR MaLR 6 198 -161 7 1102 1858 168 77 6 chr5 67883511 67883877 -84653382 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 7 1102 1126 219 55 87 chr5 67883877 67884047 -84653212 + ORR1E LTR MaLR 199 359 0 7 1102 466 337 102 16 chr5 67889207 67889327 -84647932 + MLT1A0 LTR MaLR 1 133 -232 7 1102 466 337 102 16 chr5 67889348 67889483 -84647776 + MLT1A0 LTR MaLR 134 278 -87 7 1102 1202 254 41 62 chr5 67890969 67891338 -84645921 - MTE2a LTR MaLR -16 363 3 7 1102 594 332 75 59 chr5 67891951 67892352 -84644907 + MLT2B3 LTR ERVL 88 496 -71 7 1103 251 353 43 35 chr5 67895433 67895574 -84641685 - MLT1J2 LTR MaLR -285 163 22 7 1103 2256 152 25 10 chr5 67895700 67896098 -84641161 - MTC LTR MaLR -17 404 1 7 1103 520 302 53 29 chr5 67897246 67897469 -84639790 - MLT1E LTR MaLR -8 672 441 7 1103 252 310 132 60 chr5 67897477 67897779 -84639480 - MLT1E LTR MaLR -356 324 1 7 1103 633 268 20 0 chr5 67906761 67906914 -84630345 - MTE2b LTR MaLR -223 156 1 8 1103 2268 85 13 7 chr5 67907129 67907436 -84629823 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 8 1103 757 263 54 173 chr5 67908360 67908985 -84628274 + RMER15 LTR ERVL 1 551 -24 8 1103 1158 275 68 11 chr5 67912787 67913169 -84624090 - RMER15 LTR ERVL 0 575 172 8 1103 306 274 60 60 chr5 67914023 67914190 -84623069 + LTR48 LTR ERV1 510 676 -111 8 1103 229 305 0 24 chr5 67914504 67914560 -84622699 - MER34 LTR ERV1 -44 498 443 8 1103 229 305 0 24 chr5 67914603 67914630 -84622629 - MER34 LTR ERV1 -100 442 417 8 1103 326 225 14 0 chr5 67914776 67914847 -84622412 - MER34 LTR ERV1 -101 441 370 8 1103 572 305 34 22 chr5 67916385 67916652 -84620607 - MER34 LTR ERV1 -300 271 5 8 1103 3199 58 12 10 chr5 67918219 67918618 -84618641 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1103 264 315 52 30 chr5 67919834 67919968 -84617291 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 272 8 1103 2803 73 65 0 chr5 67930139 67930511 -84606748 - MTB LTR MaLR 0 400 5 8 1103 273 303 30 70 chr5 67932119 67932318 -84604941 - MLT1H LTR MaLR -249 300 110 8 1103 491 283 155 20 chr5 67932333 67932615 -84604644 + ORR1E LTR MaLR 1 340 -39 8 1103 268 253 55 0 chr5 67933844 67933935 -84603324 + MLT1A LTR MaLR 5 100 -274 8 1103 257 358 8 32 chr5 67934121 67934245 -84603014 + MLT1A LTR MaLR 254 374 0 8 1103 270 341 46 38 chr5 67934245 67934374 -84602885 + MTEb LTR MaLR 248 377 -2 8 1103 984 213 195 19 chr5 67937359 67937666 -84599593 + ORR1D2 LTR MaLR 2 362 -8 8 1103 554 196 18 0 chr5 67938043 67938155 -84599104 + MLT1C LTR MaLR 308 421 -46 8 1103 1654 233 72 95 chr5 67940751 67941268 -84595991 + RLTR18B LTR ERVK 2 506 -6 8 1103 1855 219 17 7 chr5 67944138 67944547 -84592712 - MTD LTR MaLR -5 414 2 8 1103 660 190 75 87 chr5 67944548 67944893 -84592366 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 950 8 1103 1008 244 51 94 chr5 67945481 67945833 -84591426 - ORR1E LTR MaLR -2 357 21 8 1103 4059 152 194 20 chr5 67946676 67947552 -84589707 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 8 1103 465 254 76 25 chr5 67955015 67955208 -84582051 - MLT1A0 LTR MaLR -210 198 3 8 1103 1649 118 66 21 chr5 67957125 67957532 -84579727 + ORR1A2 LTR MaLR 1 386 -8 8 1103 375 258 200 41 chr5 67958538 67958751 -84578508 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 102 8 1103 375 258 200 41 chr5 67958797 67958878 -84578381 - RLTR15 LTR ERVK -258 101 1 8 1103 422 236 135 0 chr5 67967195 67967343 -84569916 - MLT1D LTR MaLR 0 505 338 8 1103 882 189 87 0 chr5 67967343 67967539 -84569720 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 166 9 1103 700 217 32 48 chr5 67967632 67967821 -84569438 - ORR1C1 LTR MaLR -188 186 1 9 1103 930 286 45 48 chr5 67968009 67968147 -84569112 + MLT1A LTR MaLR 2 139 -235 9 1103 2920 132 107 0 chr5 67968147 67968623 -84568636 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 9 1103 930 286 45 48 chr5 67968623 67968858 -84568401 + MLT1A LTR MaLR 140 374 0 9 1103 233 122 0 24 chr5 67968911 67968953 -84568306 + MTC LTR MaLR 13 53 -368 9 1103 270 81 0 0 chr5 67969435 67969472 -84567787 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 521 9 1103 2721 67 3 11 chr5 67973174 67973523 -84563736 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 9 1103 601 308 67 38 chr5 67975172 67975513 -84561746 - MLT1D LTR MaLR -140 365 15 9 1103 282 355 45 82 chr5 67981526 67981793 -84555466 - LTR80B LTR ERVL -322 262 6 9 1103 1745 179 68 84 chr5 67985339 67985765 -84551494 + MTC LTR MaLR 3 421 0 9 1103 2876 50 55 21 chr5 67992600 67992985 -84544274 - MTB LTR MaLR 0 400 3 9 1103 933 249 70 114 chr5 68018110 68018495 -84518764 + MTD LTR MaLR 1 368 -51 1 1104 313 78 24 83 chr5 68026432 68026516 -84510743 - RMER17C LTR ERVK -135 275 197 2 1104 2286 198 14 48 chr5 68028654 68029169 -84508090 + RLTR18B LTR ERVK 2 498 -14 3 1104 1831 170 0 6 chr5 68034415 68034740 -84502519 + RLTR15 LTR ERVK 37 359 0 4 1104 2059 167 65 20 chr5 68040344 68040747 -84496512 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1104 255 253 34 67 chr5 68040814 68040903 -84496356 + MTEa LTR MaLR 33 118 -261 4 1104 2274 226 60 86 chr5 68040992 68041802 -84495457 - MTD-int LTR MaLR -469 789 1 4 1104 367 198 138 16 chr5 68041804 68041927 -84495332 - MTD LTR MaLR -2 417 280 4 1104 2137 90 34 11 chr5 68042320 68042669 -84494590 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 85 4 1104 720 254 83 18 chr5 68056998 68057226 -84480033 + MurERV4-int LTR ERVK 1459 1701 -3559 6 1104 314 295 68 74 chr5 68057889 68058226 -84479033 - RLTR15 LTR ERVK -21 338 4 6 1104 958 213 56 60 chr5 68061413 68061682 -84475577 + MTEa LTR MaLR 4 271 -108 7 1104 708 193 62 7 chr5 68063398 68063544 -84473715 + MTEa LTR MaLR 225 378 -1 7 1104 1109 239 121 27 chr5 68065141 68065506 -84471753 - MTD LTR MaLR -16 403 5 8 1104 317 185 57 132 chr5 68077198 68077304 -84459955 + MTD LTR MaLR 2 99 -320 9 1104 661 257 87 5 chr5 68077323 68077507 -84459752 + MTD LTR MaLR 205 403 -16 9 1104 605 314 88 58 chr5 68079204 68079546 -84457713 + MLT1A0 LTR MaLR 14 365 0 9 1104 1044 120 100 5 chr5 68080209 68080419 -84456840 + RMER4B LTR ERVK 17 246 -339 9 1104 267 250 32 154 chr5 68080479 68080496 -84456763 + RMER4B LTR ERVK 388 404 -207 9 1104 385 236 74 42 chr5 68080523 68080661 -84456598 + RMER4B LTR ERVK 343 524 -87 9 1104 1197 240 73 16 chr5 68089261 68089574 -84447685 + MTD LTR MaLR 75 405 -14 1 1104 836 290 69 24 chr5 68091903 68092193 -84445066 + MTE2a LTR MaLR 19 321 -58 1 1104 435 244 0 97 chr5 68093619 68093662 -84443597 + MT2B LTR ERVL 126 154 -447 1 1104 1379 214 82 43 chr5 68096272 68096663 -84440596 - MTD LTR MaLR -13 406 1 1 1104 240 246 17 34 chr5 68097423 68097482 -84439777 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 515 1 1104 2084 142 49 39 chr5 68114555 68114942 -84422317 + ORR1B1 LTR MaLR 4 394 0 1 1104 1913 158 91 6 chr5 68126094 68126445 -84410814 + ORR1C2 LTR MaLR 1 381 -3 1 1104 533 40 67 0 chr5 68126462 68126537 -84410722 + ORR1C2 LTR MaLR 285 364 -20 1 1104 4289 132 25 3 chr5 68130950 68131686 -84405573 + ORR1B1-int LTR MaLR 758 1509 0 1 1104 2218 148 15 57 chr5 68131686 68132031 -84405228 + ORR1B1 LTR MaLR 1 348 -46 1 1104 2218 148 15 57 chr5 68132777 68132833 -84404426 + ORR1B1 LTR MaLR 349 385 -9 1 1104 360 266 80 31 chr5 68134683 68134846 -84402413 + ORR1E LTR MaLR 19 189 -170 1 1105 373 296 44 0 chr5 68160665 68160800 -84376459 + MLT1A LTR MaLR 39 179 -195 1 1105 1981 141 21 116 chr5 68160849 68161282 -84375977 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 1 1105 241 294 106 0 chr5 68164283 68164368 -84372891 + MLT1A0 LTR MaLR 15 108 -257 2 1105 3120 62 20 15 chr5 68179428 68179822 -84357437 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1105 1819 142 108 9 chr5 68191097 68191432 -84345827 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 1105 3533 162 78 42 chr5 68208793 68209483 -84327776 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 1 2 1105 237 247 60 24 chr5 68212862 68212945 -84324314 + MTEb LTR MaLR 294 379 0 2 1105 282 238 34 137 chr5 68219842 68219959 -84317300 + MLT1A LTR MaLR 19 123 -251 2 1105 231 284 23 80 chr5 68220328 68220416 -84316843 + MLT1A LTR MaLR 305 387 -21 2 1105 1717 124 12 84 chr5 68225223 68225567 -84311692 + ORR1A2 LTR MaLR 9 327 0 2 1105 1119 194 4 29 chr5 68227896 68228135 -84309124 + RMER4B LTR ERVK 14 246 -339 2 1105 448 214 237 0 chr5 68228179 68228366 -84308893 + RMER4B LTR ERVK 343 574 -11 2 1105 1171 253 101 0 chr5 68230099 68230478 -84306781 - MTD LTR MaLR -16 403 4 2 1105 1557 225 52 80 chr5 68232332 68232405 -84304854 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 457 2 1105 1557 225 52 80 chr5 68232434 68232838 -84304421 - RLTR11A LTR ERVK -72 456 66 2 1105 1350 114 0 0 chr5 68241698 68241900 -84295359 + MTC LTR MaLR 1 202 -219 3 1105 286 338 2 8 chr5 68242106 68242226 -84295033 + MLT1A1 LTR MaLR 239 402 -6 3 1105 1751 135 171 14 chr5 68242466 68242811 -84294448 + MTC LTR MaLR 1 399 -22 3 1105 296 322 54 92 chr5 68244203 68244474 -84292785 + MLT2B3 LTR ERVL 187 488 -66 3 1105 1717 165 122 32 chr5 68252417 68252762 -84284497 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 3 1105 250 321 29 81 chr5 68256771 68256944 -84280315 - MLT2B5 LTR ERVL -313 288 125 3 1105 276 311 39 39 chr5 68256829 68256956 -84280303 - MTEa LTR MaLR -166 213 87 3 1105 1414 324 58 8 chr5 68257383 68257918 -84279341 + MTE-int LTR MaLR 864 1425 -155 3 1105 280 390 82 31 chr5 68259643 68259900 -84277359 - MLT1L LTR MaLR -242 368 99 3 1105 2064 217 32 149 chr5 68260460 68261152 -84276107 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1105 234 263 35 0 chr5 68262929 68262986 -84274273 + MLT1D LTR MaLR 5 63 -442 3 1105 609 249 97 24 chr5 68268984 68269231 -84268028 - MER34 LTR ERV1 -200 342 78 3 1105 277 274 36 0 chr5 68271721 68271805 -84265454 - MLT1J LTR MaLR -179 333 247 3 1105 255 256 88 11 chr5 68272876 68272967 -84264292 - MLT1J LTR MaLR -230 282 185 3 1105 1989 172 99 5 chr5 68273205 68273590 -84263669 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1105 2124 247 63 66 chr5 68277304 68278005 -84259254 - RLTR40 LTR ERVK -118 699 1 3 1105 1916 168 46 35 chr5 68278616 68278791 -84258468 + ORR1D1 LTR MaLR 1 180 -194 3 1105 1916 168 46 35 chr5 68278811 68279005 -84258254 + ORR1D1 LTR MaLR 181 374 0 3 1105 317 241 0 54 chr5 68279550 68279642 -84257617 - MLT1A0 LTR MaLR -4 404 318 3 1105 353 250 118 129 chr5 68279786 68279956 -84257303 - MLT1A0 LTR MaLR -240 168 1 3 1105 269 327 56 9 chr5 68282911 68283019 -84254240 - LTR33A_ LTR ERVL -403 128 16 3 1105 509 270 201 15 chr5 68285920 68286183 -84251076 - LTR50 LTR ERVL -40 755 444 3 1105 500 316 132 11 chr5 68286287 68286476 -84250783 + MLT1A0 LTR MaLR 133 344 -21 3 1105 453 268 21 0 chr5 68287976 68288073 -84249186 - MTEa LTR MaLR -262 117 19 3 1106 1509 236 57 12 chr5 68289596 68289930 -84247329 - ORR1D1 LTR MaLR -24 350 2 4 1106 2539 183 82 10 chr5 68289930 68290501 -84246758 - ORR1D1-int LTR MaLR -52 1528 849 4 1106 447 221 92 85 chr5 68290404 68290557 -84246702 + MTD LTR MaLR 252 405 -14 4 1106 1156 305 30 25 chr5 68290843 68291247 -84246012 - MLT1C LTR MaLR -2 465 60 4 1106 552 219 76 22 chr5 68292921 68293090 -84244169 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 173 4 1106 622 324 63 74 chr5 68294572 68294952 -84242307 + MLT1B LTR MaLR 15 390 0 4 1106 3413 28 2 2 chr5 68308034 68308430 -84228829 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1106 5752 26 0 0 chr5 68308430 68309125 -84228134 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 404 4 1106 557 320 192 10 chr5 68314820 68315132 -84222127 - MLT1D LTR MaLR -64 441 73 4 1106 238 250 27 13 chr5 68325469 68325552 -84211707 - LTR41 LTR ERVL -2 766 673 4 1106 695 305 67 48 chr5 68325741 68326054 -84211205 + MTEa LTR MaLR 1 319 -60 4 1106 4562 80 22 121 chr5 68332253 68333087 -84204172 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 4 1106 244 243 69 16 chr5 68333772 68333960 -84203299 + RMER17D LTR ERVK 242 439 -450 4 1106 504 384 83 47 chr5 68335177 68335474 -84201785 + LTR33 LTR ERVL 91 401 -114 4 1106 504 384 83 47 chr5 68335585 68335694 -84201565 + LTR33 LTR ERVL 402 512 -3 4 1106 245 348 53 18 chr5 68337793 68337907 -84199352 + LTR40b LTR ERVL 1 118 -347 4 1106 401 295 70 21 chr5 68338264 68338549 -84198710 + LTR40b LTR ERVL 159 457 -5 4 1106 1654 143 49 3 chr5 68347843 68348131 -84189128 + ORR1A2 LTR MaLR 46 327 0 4 1106 2205 206 55 28 chr5 68350057 68350565 -84186694 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 7 5 1106 2859 43 3 3 chr5 68359689 68360035 -84177224 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 1106 1386 214 125 133 chr5 68369918 68370413 -84166846 + RMER19C LTR ERVK 1 491 -120 5 1106 878 264 56 22 chr5 68370763 68371030 -84166229 - RLTR16 LTR ERVK -207 298 23 5 1106 728 192 0 0 chr5 68371033 68371163 -84166096 + RMER19C LTR ERVK 482 611 0 5 1106 928 308 55 25 chr5 68372332 68372671 -84164588 - ORR1E LTR MaLR 0 379 1 5 1106 1187 319 82 52 chr5 68381014 68381549 -84155710 + MER21B LTR ERV1 293 843 -20 5 1106 974 262 133 3 chr5 68387035 68387357 -84149902 - MER57E1 LTR ERV1 0 372 9 5 1106 251 268 136 38 chr5 68390154 68390286 -84146973 + RMER13A LTR ERVK 253 397 -463 5 1106 348 301 110 171 chr5 68392019 68392283 -84144976 + MLT1A0 LTR MaLR 47 294 -71 5 1106 1634 214 29 9 chr5 68392662 68392978 -84144281 + MTD LTR MaLR 98 419 0 5 1106 252 333 28 56 chr5 68395785 68395963 -84141296 - MLT1A1 LTR MaLR -235 173 1 5 1106 1019 258 8 36 chr5 68396216 68396465 -84140794 - MTEa LTR MaLR 0 379 138 5 1106 1357 188 4 4 chr5 68396632 68396867 -84140392 + RMER10B LTR ERVL 1 235 -163 5 1106 270 131 0 21 chr5 68396860 68396907 -84140352 + RMER10B LTR ERVL 353 398 0 5 1106 251 287 102 11 chr5 68396908 68396996 -84140263 - MTEa LTR MaLR -278 101 6 5 1106 281 201 34 48 chr5 68410290 68410395 -84126864 - RLTR12A LTR ERVK -435 133 24 5 1106 1919 137 0 0 chr5 68416357 68416642 -84120617 + MTC LTR MaLR 137 421 0 6 1107 667 279 177 0 chr5 68432595 68432849 -84104410 - MLT1D LTR MaLR -7 498 200 6 1107 411 296 69 126 chr5 68432910 68433243 -84104016 + ORR1E LTR MaLR 27 340 -19 6 1107 981 358 68 30 chr5 68433255 68433846 -84103413 + ORR1E-int LTR MaLR 3 615 -965 6 1107 1148 349 72 51 chr5 68435890 68436670 -84100589 + MLT-int LTR MaLR 38 833 -902 6 1107 1793 190 87 15 chr5 68443002 68443414 -84093845 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 6 1107 754 343 113 58 chr5 68448172 68448704 -84088555 - LTR16E2 LTR ERVL -7 561 1 6 1107 2150 95 42 13 chr5 68449494 68449804 -84087455 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1107 967 146 45 72 chr5 68453489 68453648 -84083611 - RMER17A LTR ERVK -175 634 470 6 1107 2351 78 6 39 chr5 68453825 68454178 -84083081 - RMER17A LTR ERVK -409 342 1 6 1107 380 308 105 38 chr5 68461189 68461438 -84075821 - MLT1A1 LTR MaLR -21 344 86 6 1107 790 66 19 0 chr5 68474692 68474798 -84062461 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 368 6 1107 5184 58 13 0 chr5 68474798 68475431 -84061828 - MERVL-int LTR ERVL -4844 641 1 6 1107 4280 36 8 0 chr5 68475431 68475902 -84061357 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1107 3384 83 0 2 chr5 68481973 68482381 -84054878 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1107 465 332 49 71 chr5 68483112 68483336 -84053923 + MLT1D LTR MaLR 1 219 -408 6 1107 881 236 79 47 chr5 68485290 68485585 -84051674 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1107 444 356 70 44 chr5 68485768 68485997 -84051262 - MLT2B3 LTR ERVL -289 265 31 6 1107 1986 200 60 19 chr5 68497998 68498480 -84038779 - RMER4B LTR ERVK -9 576 60 7 1107 1986 194 72 22 chr5 68498509 68498550 -84038709 - RMER4B LTR ERVK -526 59 3 7 1107 241 324 28 9 chr5 68499092 68499201 -84038058 + MTEb LTR MaLR 268 378 -1 7 1107 2867 71 7 22 chr5 68506416 68506821 -84030438 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 8 1107 266 189 20 0 chr5 68507801 68507856 -84029403 - MLT1H1 LTR MaLR 0 560 500 1 1107 264 392 33 16 chr5 68509416 68509538 -84027721 - MLT1H2 LTR MaLR -304 185 62 1 1107 1471 211 49 62 chr5 68510295 68510684 -84026575 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1107 3532 162 31 2 chr5 68510930 68511519 -84025740 + RMER19C LTR ERVK 1 606 -5 1 1107 304 234 3 40 chr5 68515337 68515433 -84021826 + MTE2a LTR MaLR 276 369 -10 2 1107 466 329 114 0 chr5 68515885 68516043 -84021216 - MLT1B LTR MaLR 0 390 215 2 1107 242 248 200 44 chr5 68516565 68516700 -84020559 - MLT1A0 LTR MaLR -39 326 171 2 1107 2863 141 31 19 chr5 68521652 68522130 -84015129 + RLTR25B LTR ERVK 1 484 -544 3 1107 340 294 24 0 chr5 68522758 68522843 -84014416 - MTD LTR MaLR -239 180 94 4 1107 3045 119 53 38 chr5 68522843 68523349 -84013910 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 71 4 1107 3412 149 67 26 chr5 68523349 68524318 -84012941 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 1 4 1107 566 92 0 0 chr5 68524318 68524394 -84012865 - MT2B LTR ERVL -525 76 1 4 1107 860 145 14 0 chr5 68525441 68525579 -84011680 - RMER19C LTR ERVK 0 611 472 4 1107 802 315 21 76 chr5 68536484 68536865 -84000394 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 4 5 1107 906 161 75 0 chr5 68537011 68537172 -84000087 - MTC LTR MaLR -248 173 1 5 1107 2202 184 65 31 chr5 68537424 68537967 -83999292 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 6 1107 3464 155 63 64 chr5 68539586 68539738 -83997521 + RLTR19B LTR ERVK 1 142 -573 6 1107 3464 155 63 64 chr5 68539764 68540327 -83996932 + RLTR19B LTR ERVK 143 715 0 6 1107 2270 177 45 5 chr5 68549122 68549519 -83987740 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 7 1107 971 204 57 77 chr5 68550010 68550366 -83986893 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 403 6 7 1108 286 314 102 42 chr5 68556352 68556568 -83980691 - LTR81B LTR ERV1? -1158 235 7 8 1108 1497 216 74 11 chr5 68561107 68561459 -83975800 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 9 1108 532 182 96 32 chr5 68563401 68563526 -83973733 + RLTR15 LTR ERVK 1 133 -226 9 1108 270 289 55 36 chr5 68575682 68575847 -83961412 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4870 5037 -677 1 1108 2597 95 55 3 chr5 68582999 68583379 -83953880 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1108 5169 151 95 110 chr5 68583379 68584283 -83952976 - MTB-int LTR MaLR 0 1258 390 1 1108 5169 151 95 110 chr5 68584445 68584817 -83952442 - MTB-int LTR MaLR -869 389 2 1 1108 2670 83 39 3 chr5 68584818 68585202 -83952057 - MTB LTR MaLR -2 398 1 1 1108 306 184 0 0 chr5 68589861 68589910 -83947349 + RLTR21 LTR ERVK 5 53 -1519 1 1108 1968 195 37 111 chr5 68593246 68593490 -83943769 + RLTR21 LTR ERVK 1097 1336 -236 1 1108 1968 195 37 111 chr5 68593627 68593896 -83943363 + RLTR21 LTR ERVK 1337 1572 0 1 1108 591 271 94 52 chr5 68596191 68596479 -83940780 - MER67C LTR ERV1 -407 304 5 1 1108 4361 24 0 0 chr5 68601626 68602119 -83935140 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1108 484 246 209 16 chr5 68602231 68602413 -83934846 - MTD LTR MaLR 0 419 203 1 1108 555 75 0 0 chr5 68617497 68617577 -83919682 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1019 1098 0 1 1108 3054 76 0 2 chr5 68617577 68617972 -83919287 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 1 1108 272 355 87 17 chr5 68623695 68623867 -83913392 - LTR33A_ LTR ERVL -319 212 29 1 1108 249 300 21 53 chr5 68626834 68626929 -83910330 + MLT1G LTR MaLR 60 151 -440 1 1108 316 378 107 85 chr5 68629770 68630134 -83907125 - LTR16A1 LTR ERVL -9 447 76 1 1108 1662 235 40 13 chr5 68631400 68631796 -83905463 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 1 1108 301 325 119 37 chr5 68634605 68634848 -83902411 + MLT1B LTR MaLR 40 302 -88 1 1108 2304 152 137 122 chr5 68635685 68636365 -83900894 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 2 1108 324 360 96 78 chr5 68658901 68659223 -83878036 + LTR33 LTR ERVL 118 445 -70 2 1108 422 253 159 5 chr5 68661951 68662146 -83875113 - MER34A1 LTR ERV1 -76 511 287 2 1108 1338 206 76 68 chr5 68662412 68662781 -83874478 + ORR1C2 LTR MaLR 1 372 -12 2 1108 643 228 63 23 chr5 68669119 68669294 -83867965 + RMER12 LTR ERVK 1141 1322 0 2 1108 1103 155 188 56 chr5 68669294 68669559 -83867700 - RMER6A LTR ERVK -448 308 9 2 1108 282 324 64 7 chr5 68670255 68670395 -83866864 - MLT1A LTR MaLR -205 185 38 2 1108 230 175 140 0 chr5 68675840 68675897 -83861362 + RLTR15 LTR ERVK 1 65 -294 2 1108 1119 219 35 21 chr5 68676361 68676650 -83860609 + RLTR15 LTR ERVK 49 341 -18 2 1109 374 275 197 0 chr5 68684780 68684922 -83852337 - RMER15 LTR ERVL -68 507 338 2 1109 2272 147 21 10 chr5 68686897 68687282 -83849977 - RLTR9D LTR ERVK -14 389 1 2 1109 349 213 116 11 chr5 68689136 68689231 -83848028 + MLT1A0 LTR MaLR 23 127 -238 2 1109 673 334 116 19 chr5 68689839 68690159 -83847100 + LTR53 LTR ERVL 148 498 -21 2 1109 978 339 43 21 chr5 68700548 68700990 -83836269 - MLT2B3 LTR ERVL -73 442 3 2 1109 1802 164 15 6 chr5 68701646 68701971 -83835288 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 2 1109 3882 106 10 25 chr5 68703055 68703663 -83833596 + RLTR5_Mm LTR ERV1 1 599 -29 2 1109 3436 18 5 0 chr5 68707463 68707857 -83829402 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1109 1579 243 79 53 chr5 68707981 68708249 -83829010 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 312 2 1109 1579 243 79 53 chr5 68708557 68708835 -83828424 - RLTR31_Mm LTR ERVK -250 311 2 2 1109 641 282 170 14 chr5 68709530 68709742 -83827517 - MTD LTR MaLR -14 405 161 3 1109 3254 51 2 0 chr5 68712017 68712412 -83824847 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1109 709 256 160 93 chr5 68726252 68726448 -83810811 - RLTR22_Mur LTR ERVK -674 1174 905 3 1109 709 256 160 93 chr5 68726575 68726803 -83810456 - RLTR22_Mur LTR ERVK -674 904 587 3 1109 1167 283 99 48 chr5 68729780 68730325 -83806934 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1272 576 4 3 1109 986 159 85 4 chr5 68731112 68731353 -83805906 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 175 3 1109 4032 87 125 46 chr5 68745224 68745550 -83791709 + RMER17A LTR ERVK 1 366 -385 3 1109 4032 87 125 46 chr5 68745611 68745980 -83791279 + RMER17A LTR ERVK 367 750 -1 3 1109 406 273 19 39 chr5 68747232 68747388 -83789871 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 490 3 1109 1771 196 91 69 chr5 68747404 68747892 -83789367 - RLTR26 LTR ERVK -97 545 2 3 1109 3093 19 87 0 chr5 68755738 68756116 -83781143 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 1109 393 246 134 45 chr5 68756666 68756845 -83780414 - MLT1B LTR MaLR -164 226 32 3 1109 484 350 75 52 chr5 68757379 68757528 -83779731 - ORR1E LTR MaLR -1 358 201 3 1109 484 350 75 52 chr5 68757574 68757773 -83779486 - ORR1E LTR MaLR -159 200 2 3 1109 2762 135 4 26 chr5 68759417 68759880 -83777379 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 3 1109 296 250 0 0 chr5 68761690 68761746 -83775513 + ORR1C1 LTR MaLR 1 56 -322 3 1109 227 361 81 8 chr5 68764188 68764311 -83772948 - MLT1E1 LTR MaLR -14 640 509 3 1109 326 384 109 0 chr5 68776775 68776913 -83760346 - LTR16A LTR ERVL -232 219 67 3 1109 357 332 135 86 chr5 68796825 68797254 -83740005 + MLT1C LTR MaLR 16 465 -2 4 1109 1132 258 135 52 chr5 68801030 68801533 -83735726 + RMER4B LTR ERVK 30 574 -11 4 1109 2777 157 20 32 chr5 68801773 68802063 -83735196 - RLTR12B LTR ERVK -35 493 215 4 1109 2777 157 20 32 chr5 68802378 68802586 -83734673 - RLTR12B LTR ERVK -314 214 1 4 1109 253 279 92 62 chr5 68803787 68803917 -83733342 + LTR86B1 LTR ERVL 1 134 -359 4 1109 748 214 187 31 chr5 68803939 68804233 -83733026 + RLTR9A LTR ERVK 1 340 -28 4 1109 2811 39 0 3 chr5 68804233 68804571 -83732688 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1109 24238 31 35 12 chr5 68804571 68807658 -83729601 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3165 -3316 4 1109 9356 25 2 8 chr5 68807647 68808791 -83728468 + IAPEz-int LTR ERVK 5345 6481 0 4 1109 2811 39 0 3 chr5 68808791 68809129 -83728130 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1109 251 333 141 0 chr5 68812054 68812153 -83725106 + MLT1A0 LTR MaLR 163 275 -90 4 1109 836 295 66 52 chr5 68812433 68812798 -83724461 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1110 2613 147 32 206 chr5 68816372 68817100 -83720159 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 4 1110 1504 202 17 78 chr5 68817145 68817554 -83719705 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1110 283 224 39 13 chr5 68817765 68817842 -83719417 - MLT1A0 LTR MaLR -273 92 14 4 1110 1902 224 62 29 chr5 68819698 68820149 -83717110 - RMER19C LTR ERVK 0 611 146 4 1110 4053 42 2 0 chr5 68820335 68820836 -83716423 + RLTR13A LTR ERVK 1 502 -353 4 1110 2240 61 98 0 chr5 68829286 68829624 -83707635 + RLTR13A LTR ERVK 485 855 0 4 1110 488 270 72 69 chr5 68838415 68838649 -83698610 - MTEa LTR MaLR 0 379 142 4 1110 262 306 154 73 chr5 68839315 68839608 -83697651 + MLT1F2 LTR MaLR 74 390 -170 4 1110 2155 152 56 21 chr5 68853128 68853494 -83683765 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 336 4 1110 2155 130 18 40 chr5 68853624 68853714 -83683545 - RMER17D2 LTR ERVK -474 335 251 4 1110 5103 87 80 102 chr5 68853714 68854627 -83682632 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 4 1110 2155 130 18 40 chr5 68854627 68854875 -83682384 - RMER17D2 LTR ERVK -559 250 2 4 1110 4028 188 70 8 chr5 68855206 68856003 -83681256 + RLTR25A LTR ERVK 1 847 -256 4 1110 2033 152 15 78 chr5 68857820 68858219 -83679040 + RMER6B LTR ERVK 1 374 -87 4 1110 2101 127 15 21 chr5 68858699 68859030 -83678229 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1110 2652 20 184 3 chr5 68862848 68863196 -83674063 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1110 1430 80 0 34 chr5 68864200 68864407 -83672852 + MTB LTR MaLR 201 400 0 4 1110 462 90 64 0 chr5 68864407 68864485 -83672774 + MTB-int LTR MaLR 1 83 -1015 4 1110 240 264 14 27 chr5 68872153 68872227 -83665032 + RMER15 LTR ERVL 3 75 -500 5 1110 2050 231 53 49 chr5 68872250 68872777 -83664482 + RMER15 LTR ERVL 35 563 -12 5 1110 3209 30 29 162 chr5 68877061 68877609 -83659650 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1110 2567 160 47 27 chr5 68878831 68879228 -83658031 + RLTR19 LTR ERVK 1 401 -98 5 1110 2567 160 47 27 chr5 68879276 68879367 -83657892 + RLTR19 LTR ERVK 402 498 -1 5 1110 1806 197 203 57 chr5 68879580 68880331 -83656928 + RMER6C LTR ERVK 1 716 -4 5 1110 2180 85 3 75 chr5 68884163 68884521 -83652738 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 5 1110 4963 51 6 14 chr5 68884533 68885166 -83652093 + IAPEz-int LTR ERVK 35 662 -5819 5 1110 956 59 0 0 chr5 68885166 68885285 -83651974 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 5 1110 1829 92 12 4 chr5 68885280 68885532 -83651727 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 5 1110 932 73 24 0 chr5 68885529 68885652 -83651607 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 5 1110 26289 12 6 0 chr5 68885652 68888591 -83648668 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 5 1110 2180 85 3 75 chr5 68888591 68888949 -83648310 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 5 1110 2966 118 16 39 chr5 68893511 68893996 -83643263 - MT2C_Mm LTR ERVL -1 474 1 5 1110 1863 262 100 21 chr5 68894456 68895086 -83642173 + RMER6C LTR ERVK 9 688 -2 5 1110 3181 33 18 5 chr5 68895201 68895592 -83641667 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1110 263 98 24 0 chr5 68896016 68896057 -83641202 - MT2A LTR ERVL 0 533 492 5 1110 2023 170 132 76 chr5 68900201 68900756 -83636503 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -68 586 1 5 1110 256 297 163 8 chr5 68910802 68910931 -83626328 - MER57C2 LTR ERV1 0 434 286 5 1110 2868 102 5 7 chr5 68912804 68913227 -83624032 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 5 1110 3529 42 28 0 chr5 68914362 68914786 -83622473 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1110 364 243 40 9 chr5 68917133 68917236 -83620023 - ORR1D1 LTR MaLR 0 421 285 5 1110 265 262 143 0 chr5 68917216 68917300 -83619959 - ORR1D1 LTR MaLR -204 180 85 5 1110 480 240 10 0 chr5 68917562 68917662 -83619597 - ORR1D1 LTR MaLR -273 101 1 5 1110 710 289 137 48 chr5 68921155 68921570 -83615689 + LTR55 LTR ERV 8 459 -89 5 1110 562 278 127 41 chr5 68921638 68921859 -83615400 + MLT1F1 LTR MaLR 175 414 -155 5 1110 361 371 36 72 chr5 68925090 68925421 -83611838 + ORR1E LTR MaLR 39 357 -2 5 1110 735 326 99 46 chr5 68934595 68935141 -83602118 + MER67C LTR ERV1 37 611 -100 5 1110 239 224 47 106 chr5 68937238 68937323 -83599936 - MTEa LTR MaLR -299 80 1 5 1110 2491 166 68 20 chr5 68938204 68938701 -83598558 + RLTR11A LTR ERVK 7 527 -1 5 1111 490 318 48 35 chr5 68950740 68950968 -83586291 - MLT1B LTR MaLR -22 368 138 6 1111 2209 15 114 0 chr5 68953743 68954005 -83583254 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 1 6 1111 254 214 26 79 chr5 68954672 68954748 -83582511 - RLTR9A LTR ERVK -296 72 1 6 1111 3060 68 5 2 chr5 68964827 68965224 -83572035 - MTB LTR MaLR -2 398 1 6 1111 451 313 27 0 chr5 68965652 68965799 -83571460 - RMER15-int LTR ERVL -2550 2449 2299 6 1111 456 318 76 31 chr5 68966347 68966636 -83570623 - RMER15-int LTR ERVL -3314 1685 1384 6 1111 423 301 123 48 chr5 68969902 68970195 -83567064 - MLT1A0 LTR MaLR -50 315 1 6 1111 620 164 0 159 chr5 68974238 68974383 -83562876 - ORR1B1 LTR MaLR -239 155 1 6 1111 376 177 49 25 chr5 68974817 68974898 -83562361 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 287 6 1111 515 336 14 0 chr5 68974895 68975035 -83562224 - ORR1D2 LTR MaLR -191 179 38 6 1111 802 272 176 10 chr5 68983833 68984145 -83553114 + ORR1D1 LTR MaLR 3 366 -8 6 1111 226 267 22 65 chr5 68996050 68996142 -83541117 + MLT1A LTR MaLR 247 334 -40 6 1111 412 322 92 67 chr5 69009233 69009549 -83527710 - MER67D LTR ERV1 -171 343 20 1 1111 2400 175 77 32 chr5 69013291 69013346 -83523913 - RLTR20B3 LTR ERVK -21 556 485 1 1111 2400 175 77 32 chr5 69013392 69013868 -83523391 - RLTR20B3 LTR ERVK -93 484 2 1 1111 4016 158 57 1 chr5 69014984 69015682 -83521577 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 1111 1060 272 48 8 chr5 69018843 69019199 -83518060 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1111 2610 62 26 15 chr5 69021996 69022338 -83514921 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1111 559 119 69 48 chr5 69024950 69025123 -83512136 - RLTR13D1 LTR ERVK -8 800 562 4 1111 2792 88 69 7 chr5 69025097 69025519 -83511740 - RLTR13D1 LTR ERVK -358 448 1 4 1111 520 306 124 83 chr5 69029077 69029473 -83507786 + MER67D LTR ERV1 4 415 -99 5 1111 628 255 147 53 chr5 69035172 69035491 -83501768 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -10 6 1111 322 398 50 6 chr5 69038515 69038775 -83498484 + MLT1E1A LTR MaLR 343 624 0 6 1111 1842 207 32 43 chr5 69041778 69042128 -83495131 + RMER4A LTR ERVK 8 354 -112 6 1111 1842 207 32 43 chr5 69042304 69042417 -83494842 + RMER4A LTR ERVK 355 466 0 6 1111 2506 86 26 0 chr5 69042614 69042962 -83494297 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 7 1111 3438 25 2 0 chr5 69043633 69044028 -83493231 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1111 259 255 70 84 chr5 69048334 69048561 -83488698 - RMER17A LTR ERVK -250 501 278 8 1111 609 204 14 49 chr5 69051423 69051567 -83485692 - RMER20A LTR ERVK -377 139 1 8 1111 513 214 88 132 chr5 69056992 69057197 -83480062 - RMER12 LTR ERVK -101 1221 1026 9 1111 1281 244 111 109 chr5 69058127 69059112 -83478147 - RMER12 LTR ERVK -182 1222 1 1 1111 910 310 73 41 chr5 69061752 69062095 -83475164 + ORR1E LTR MaLR 3 356 -3 1 1111 545 309 21 26 chr5 69066071 69066264 -83470995 + RMER15 LTR ERVL 343 534 -41 1 1111 235 278 21 53 chr5 69072031 69072054 -83465205 + ORR1A3-int LTR MaLR 592 611 -1352 1 1111 1283 138 60 39 chr5 69072054 69072287 -83464972 + MT2B LTR ERVL 1 238 -363 1 1111 290 406 72 47 chr5 69074433 69074795 -83462464 - MER77 LTR ERVL -6 601 231 1 138 372 337 41 110 chr5 69074714 69075004 -83462255 - MER21B LTR ERV1 -558 305 36 1 1112 477 271 146 35 chr5 69075121 69075320 -83461939 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 154 1 1112 1107 285 63 78 chr5 69077317 69077763 -83459496 + RMER15 LTR ERVL 63 501 -74 1 1112 1873 193 181 109 chr5 69084326 69084961 -83452298 - RMER6C LTR ERVK -7 683 3 1 1112 1617 184 4 11 chr5 69093393 69093673 -83443586 - MTC LTR MaLR -54 367 90 1 1112 2523 68 127 0 chr5 69095838 69096193 -83441066 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1112 2492 176 78 25 chr5 69107333 69107418 -83429841 - RLTR20B3 LTR ERVK -4 573 468 1 1112 2492 176 78 25 chr5 69107470 69107909 -83429350 - RLTR20B3 LTR ERVK -110 467 22 1 1112 297 290 190 56 chr5 69108697 69108868 -83428391 + MTD LTR MaLR 203 397 -22 1 1112 269 316 37 20 chr5 69109092 69109245 -83428014 - MTEa LTR MaLR -12 367 215 1 1112 389 361 48 24 chr5 69122381 69122591 -83414668 + RMER15 LTR ERVL 296 510 -65 2 1112 3682 11 123 0 chr5 69128995 69129434 -83407825 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1112 314 0 0 0 chr5 69129434 69129472 -83407787 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 1112 400 123 13 40 chr5 69129472 69129548 -83407711 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 2 1112 40649 16 14 0 chr5 69129548 69134846 -83402413 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 1 2 1112 4275 12 16 0 chr5 69134846 69135331 -83401928 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1112 239 224 14 43 chr5 69143277 69143347 -83393912 + LTRIS5 LTR ERV1 235 302 -145 2 1112 884 214 214 109 chr5 69148132 69148463 -83388796 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 2 1112 2644 200 69 2 chr5 69155926 69156451 -83380808 - RMER15 LTR ERVL -8 567 8 2 1112 230 279 36 79 chr5 69159448 69159588 -83377671 + MER72B LTR ERV1 280 413 -355 2 1112 342 323 85 47 chr5 69164342 69164553 -83372706 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1104 2 1112 3404 150 57 14 chr5 69164823 69165474 -83371785 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 127 2 1112 806 253 65 127 chr5 69170023 69170408 -83366851 + MTE2a LTR MaLR 1 361 -18 2 1112 734 311 63 36 chr5 69184979 69185232 -83352027 + MTD LTR MaLR 11 270 -149 2 1112 1891 122 81 0 chr5 69187033 69187328 -83349931 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 1112 747 367 85 22 chr5 69195741 69196318 -83340941 + MLT1E3 LTR MaLR 2 614 -10 3 1112 295 331 106 19 chr5 69196838 69196998 -83340261 - MLT1J1 LTR MaLR -178 266 93 3 1112 1544 194 25 15 chr5 69201910 69202234 -83335025 - RMER20B LTR ERVK -300 327 1 3 1112 295 328 114 8 chr5 69202667 69202904 -83334355 - MLT1C LTR MaLR -172 295 34 3 1112 399 294 31 31 chr5 69204704 69204834 -83332425 + LTR48 LTR ERV1 1 130 -657 3 1112 386 285 34 27 chr5 69204849 69204997 -83332262 + LTR48 LTR ERV1 623 771 -16 3 1112 4771 97 67 51 chr5 69205449 69205750 -83331509 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 855 513 3 1113 4771 83 70 48 chr5 69206097 69206585 -83330674 - RLTR13C2 LTR ERVK -296 512 1 3 1113 2471 159 111 40 chr5 69215017 69215548 -83321711 - RLTR26 LTR ERVK -46 596 28 3 1113 1340 187 34 14 chr5 69216574 69216867 -83320392 + RLTR11A LTR ERVK 146 444 -84 3 1113 366 326 58 7 chr5 69218024 69218163 -83319096 - MLT1A0 LTR MaLR -219 146 1 3 1113 2709 202 81 26 chr5 69222322 69222976 -83314283 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 1113 505 350 1 59 chr5 69223120 69223323 -83313936 + MTEa LTR MaLR 5 193 -186 3 1113 601 240 52 17 chr5 69223417 69223591 -83313668 - RLTR11A2 LTR ERVK -346 181 2 3 1113 1332 244 50 22 chr5 69224847 69225011 -83312248 + ORR1C2 LTR MaLR 1 171 -213 3 1113 1332 244 50 22 chr5 69225093 69225285 -83311974 + ORR1C2 LTR MaLR 172 366 -18 3 1113 1644 258 68 18 chr5 69225345 69225846 -83311413 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 2 3 1113 490 240 26 8 chr5 69227610 69227740 -83309519 - ORR1D1 LTR MaLR -269 125 3 3 1113 1554 261 72 134 chr5 69247149 69248013 -83289246 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 810 -1038 3 1113 1257 212 64 56 chr5 69252106 69252466 -83284793 - RMER6C LTR ERVK 0 690 328 3 1113 1514 81 9 7 chr5 69253192 69253431 -83283828 + MTB LTR MaLR 180 421 0 3 1113 1226 176 227 0 chr5 69253865 69254160 -83283099 - RMER6C LTR ERVK -358 362 1 3 1113 1033 279 59 22 chr5 69256235 69256557 -83280702 - ORR1D1 LTR MaLR -40 334 1 4 1113 286 369 56 81 chr5 69262494 69262937 -83274322 + MLT2B3 LTR ERVL 1 432 -122 4 1113 243 348 116 0 chr5 69272803 69272967 -83264292 + LTR33 LTR ERVL 242 424 -91 4 1113 405 274 70 87 chr5 69285567 69285739 -83251520 + MLT1E2 LTR MaLR 1 169 -458 4 1113 764 345 13 40 chr5 69286239 69286541 -83250718 - ORR1E LTR MaLR -64 295 2 4 1113 688 178 282 0 chr5 69286569 69286743 -83250516 + RMER6D LTR ERVK 1 223 -497 4 1113 885 331 75 20 chr5 69286762 69287172 -83250087 - ORR1E-int LTR MaLR -191 1601 998 4 1113 978 291 68 10 chr5 69290011 69290406 -83246853 + MTD LTR MaLR 2 419 0 4 1113 573 219 16 0 chr5 69295038 69295161 -83242098 + RMER15 LTR ERVL 451 575 0 4 1113 894 318 47 19 chr5 69295586 69295951 -83241308 + MTEb LTR MaLR 3 377 -2 4 1113 275 313 12 0 chr5 69297586 69297669 -83239590 + MER67A LTR ERV1 1 84 -459 4 1113 514 206 73 44 chr5 69298687 69298824 -83238435 + MT2A LTR ERVL 11 151 -382 4 1113 4726 146 15 10 chr5 69298824 69299626 -83237633 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 806 -1042 4 1113 403 337 40 23 chr5 69300217 69300390 -83236869 + RMER12 LTR ERVK 1101 1276 -46 4 1113 1364 264 25 49 chr5 69300401 69300816 -83236443 + MT2A LTR ERVL 77 554 -30 4 1113 553 381 22 44 chr5 69301901 69302261 -83234998 + MLT1A LTR MaLR 23 374 0 4 1113 555 355 58 78 chr5 69321176 69321524 -83215735 - ORR1E LTR MaLR -15 344 4 4 1113 877 338 58 9 chr5 69321798 69322124 -83215135 + ORR1E LTR MaLR 7 348 -11 4 1113 3346 192 18 25 chr5 69322419 69323236 -83214023 + RLTR25A LTR ERVK 1 795 -233 4 1113 1598 178 6 22 chr5 69326950 69327261 -83209998 + RLTR10E LTR ERVK 1 306 -5 5 1113 386 219 40 87 chr5 69327269 69327419 -83209840 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 143 -7537 5 1113 1969 260 55 16 chr5 69327470 69328379 -83208880 + IAPEY3-int LTR ERVK 535 1566 -6015 5 1113 334 193 0 0 chr5 69328396 69328453 -83208806 + IAP-d-int LTR ERVK 447 503 -6039 5 1113 1356 140 87 0 chr5 69328453 69328682 -83208577 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5255 -1287 5 1113 4097 110 18 1 chr5 69328682 69329360 -83207899 + IAPEY3-int LTR ERVK 6965 7680 0 5 1113 1621 178 6 19 chr5 69329360 69329677 -83207582 + RLTR10E LTR ERVK 1 390 0 5 1113 831 266 10 10 chr5 69331982 69332187 -83205072 + MTC LTR MaLR 209 413 -8 5 1113 479 338 95 0 chr5 69332290 69332512 -83204747 - MTE-int LTR MaLR -164 1416 1174 5 1113 294 382 69 23 chr5 69332519 69332822 -83204437 + MT2A LTR ERVL 146 462 -71 5 1113 515 222 17 25 chr5 69333480 69333600 -83203659 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 250 5 1113 703 272 161 25 chr5 69333609 69333933 -83203326 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 5 1114 2431 177 0 38 chr5 69342449 69342920 -83194339 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 5 1114 348 324 65 75 chr5 69348899 69349099 -83188160 - ORR1E LTR MaLR -149 210 13 5 1114 646 308 117 39 chr5 69349439 69349825 -83187434 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 1114 1181 284 103 26 chr5 69353182 69353581 -83183678 + RLTR20A2 LTR ERVK 46 486 -92 5 1114 1181 284 103 26 chr5 69353631 69353726 -83183533 + RLTR20A2 LTR ERVK 487 578 0 5 1114 501 320 163 25 chr5 69353973 69354329 -83182930 + MLT1D LTR MaLR 90 494 -11 5 1114 2764 117 35 33 chr5 69356093 69356545 -83180714 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 5 1114 2347 110 3 3 chr5 69360186 69360513 -83176746 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1114 430 390 119 20 chr5 69372186 69372489 -83164770 + LTR16E2 LTR ERVL 11 343 -225 5 1114 7012 161 73 12 chr5 69373083 69373558 -83163701 - RMER12B LTR ERVK 0 1404 858 5 1114 7012 161 73 12 chr5 69373985 69374832 -83162427 - RMER12B LTR ERVK -547 857 1 5 1114 290 193 182 0 chr5 69378977 69379065 -83158194 + MER73 LTR ERVL 12 115 -529 5 1114 418 286 64 0 chr5 69380327 69380479 -83156780 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2364 2598 -3163 5 1114 2820 58 13 0 chr5 69380741 69381123 -83156136 - RLTR10 LTR ERVK -3 387 1 5 1114 343 345 37 28 chr5 69382846 69383061 -83154198 + RMER15 LTR ERVL 342 558 -17 5 1114 1304 237 118 16 chr5 69388815 69389196 -83148063 - MTC LTR MaLR -1 420 1 6 1114 262 285 63 94 chr5 69399790 69399949 -83137310 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 716 869 -53 6 1114 434 330 122 5 chr5 69402279 69402483 -83134776 + MLT1B LTR MaLR 96 323 -67 6 1114 236 222 0 0 chr5 69402671 69402716 -83134543 + MLT1B LTR MaLR 378 422 -45 6 1114 610 240 5 103 chr5 69402965 69403169 -83134090 + ORR1C2 LTR MaLR 2 185 -199 6 1114 952 209 10 15 chr5 69403298 69403502 -83133757 + ORR1C2 LTR MaLR 174 376 -8 6 1114 448 368 44 68 chr5 69403568 69403933 -83133326 - ORR1E LTR MaLR -3 356 1 6 1114 696 286 82 27 chr5 69407520 69407739 -83129520 + MTE2b LTR MaLR 35 265 -114 6 1114 645 350 80 18 chr5 69408034 69408360 -83128899 + MTE-int LTR MaLR 5 350 -1230 6 1114 610 255 239 23 chr5 69408441 69408750 -83128509 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 6 1114 242 233 96 40 chr5 69412711 69412836 -83124423 - MLT2C1 LTR ERVL -231 166 35 6 1114 269 308 131 40 chr5 69412857 69413033 -83124226 + MLT1J-int LTR MaLR 520 711 -676 6 1114 3479 18 2 0 chr5 69415828 69416223 -83121036 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1114 246 308 86 9 chr5 69421925 69422030 -83115229 - ORR1E LTR MaLR -215 144 32 6 1114 288 214 112 56 chr5 69422659 69422748 -83114511 + MT2B LTR ERVL 171 264 -337 6 1114 4605 89 86 148 chr5 69432925 69433916 -83103343 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 6 1114 466 305 76 5 chr5 69434358 69434582 -83102677 - LTR48 LTR ERV1 -46 741 502 6 1114 4194 184 43 69 chr5 69435093 69436019 -83101240 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 6 1114 417 308 103 83 chr5 69436058 69436359 -83100900 - MER31B LTR ERV1 -89 377 71 6 1114 2246 78 15 24 chr5 69436687 69437017 -83100242 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 6 1114 6527 54 12 6 chr5 69437019 69437843 -83099416 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 6 1114 11166 56 30 27 chr5 69437836 69439438 -83097821 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 168 6 1114 231 321 0 0 chr5 69439438 69439494 -83097765 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 220 6 1114 565 69 16 164 chr5 69439494 69439616 -83097643 - IAPEz-int LTR ERVK -6369 112 9 6 1114 2217 81 15 24 chr5 69439617 69439946 -83097313 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 2 6 1114 346 319 81 0 chr5 69445870 69446030 -83091229 - MER67C LTR ERV1 -443 268 96 7 1114 2255 210 27 20 chr5 69448620 69449068 -83088191 + RMER6B LTR ERVK 1 451 -10 7 1114 458 365 58 0 chr5 69450595 69450751 -83086508 - MLT2B1 LTR ERVL -59 508 344 7 1114 645 301 43 32 chr5 69453167 69453513 -83083746 + RLTR15 LTR ERVK 1 350 -9 7 1114 416 283 171 58 chr5 69461421 69461714 -83075545 - MLT1A0 LTR MaLR -37 328 3 7 1114 2137 176 102 33 chr5 69463872 69464353 -83072906 - RMER5 LTR ERV1 0 534 21 7 1114 241 311 45 123 chr5 69464831 69465051 -83072208 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 338 7 1114 830 312 43 13 chr5 69465717 69466022 -83071237 + MLT1A0 LTR MaLR 48 361 -4 7 1114 383 273 60 0 chr5 69466242 69466369 -83070890 - LTR40b LTR ERVL -15 504 348 7 1114 499 47 16 0 chr5 69466607 69466671 -83070588 - ORR1A3 LTR MaLR -51 275 211 7 1114 824 300 77 28 chr5 69467538 69467891 -83069368 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 7 1115 1151 280 63 112 chr5 69474675 69475246 -83062013 - RMER15 LTR ERVL -5 570 28 7 1115 243 321 14 64 chr5 69480148 69480288 -83056971 + LTR90B LTR LTR 660 792 -4 7 1115 449 354 80 9 chr5 69481445 69481670 -83055589 - LTR83 LTR ERVL -536 244 4 7 1115 671 304 44 152 chr5 69481860 69482268 -83054991 + MTE2a LTR MaLR 9 372 -7 7 1115 285 266 16 114 chr5 69490735 69490858 -83046401 - MT2B LTR ERVL -344 257 147 7 1115 4183 197 216 43 chr5 69494406 69495069 -83042190 - RLTR22_Mur LTR ERVK -145 1703 959 7 1115 4183 197 216 43 chr5 69495748 69496535 -83040724 - RLTR22_Mur LTR ERVK -890 958 2 7 1115 272 411 64 37 chr5 69516223 69516410 -83020849 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 1 1115 1187 245 49 63 chr5 69525436 69525802 -83011457 + MTEa LTR MaLR 12 372 -7 2 1115 239 276 117 21 chr5 69526778 69526883 -83010376 + MLT1A0 LTR MaLR 9 123 -285 3 1115 1036 163 59 30 chr5 69527324 69527544 -83009715 - ORR1C1 LTR MaLR 0 421 200 3 1115 644 305 111 31 chr5 69531454 69531806 -83005453 - MTD LTR MaLR -25 394 15 3 1115 225 292 46 0 chr5 69535562 69535627 -83001632 + MTEb LTR MaLR 294 361 -18 4 1115 421 259 63 74 chr5 69538706 69538881 -82998378 - RMER13B LTR ERVK -735 173 1 5 1115 778 315 64 43 chr5 69539648 69539976 -82997283 + ORR1D2 LTR MaLR 1 335 -35 5 1115 287 248 83 37 chr5 69539980 69540089 -82997170 + MT2A LTR ERVL 1 114 -419 5 1115 1169 228 146 24 chr5 69540935 69541303 -82995956 + MT2A LTR ERVL 121 533 0 5 1115 655 320 60 16 chr5 69545351 69545602 -82991657 - MTD LTR MaLR -116 303 42 6 1115 490 293 61 25 chr5 69545701 69545897 -82991362 - MLT1B LTR MaLR -173 217 15 6 1115 332 263 178 23 chr5 69552260 69552564 -82984695 + RMER17A2 LTR ERVK 171 521 -385 7 1115 564 120 0 99 chr5 69553788 69553899 -82983360 + ORR1A4 LTR MaLR 1 100 -229 7 1115 931 82 8 0 chr5 69553893 69554015 -82983244 + ORR1A4 LTR MaLR 207 329 0 7 1115 2315 168 29 17 chr5 69555120 69555531 -82981728 - MTC LTR MaLR -5 416 1 8 1115 383 302 9 19 chr5 69556547 69556655 -82980604 - MTD LTR MaLR -201 218 112 8 1115 238 356 0 10 chr5 69557771 69557873 -82979386 - MTD LTR MaLR -299 120 20 8 1115 275 181 35 190 chr5 69559181 69559297 -82977962 + RMER20B LTR ERVK 21 118 -509 8 1115 344 270 157 21 chr5 69559485 69559625 -82977634 + RMER20B LTR ERVK 181 339 -288 8 1115 2172 171 14 10 chr5 69566443 69566834 -82970425 - ORR1B1 LTR MaLR 0 419 1 9 1115 2111 132 0 58 chr5 69567491 69567836 -82969423 + ORR1A3 LTR MaLR 1 325 -1 9 1115 613 318 138 15 chr5 69575973 69576241 -82961018 + RMER15 LTR ERVL 272 572 -3 1 1115 443 280 94 103 chr5 69582790 69583013 -82954246 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 347 1 1115 2695 112 0 8 chr5 69583097 69583476 -82953783 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 21 1 1115 2223 191 85 20 chr5 69585033 69585529 -82951730 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 1 139 2061 266 70 76 chr5 69598887 69599784 -82937475 - RMER17B LTR ERVK -4 904 1 1 1116 378 351 0 44 chr5 69600189 69600326 -82936933 - MLT1E3 LTR MaLR -8 616 486 1 1116 2698 175 37 22 chr5 69603082 69603142 -82934117 - RMER20A LTR ERVK 0 516 456 1 1116 2698 175 37 22 chr5 69603167 69603614 -82933645 - RMER20A LTR ERVK -61 455 1 1 1116 929 198 148 74 chr5 69606753 69606901 -82930358 - MTD LTR MaLR -55 364 194 1 1116 929 198 148 74 chr5 69607060 69607194 -82930065 - MTD LTR MaLR -226 193 61 1 1116 243 366 80 68 chr5 69611605 69611930 -82925329 - MLT1J LTR MaLR -46 466 138 1 1116 776 242 60 93 chr5 69614415 69614684 -82922575 - RMER21B LTR ERV1 -279 563 304 1 1116 1982 177 92 3 chr5 69615077 69615456 -82921803 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1116 3323 183 106 43 chr5 69631638 69632374 -82904885 + RLTR25A LTR ERVK 1 782 -321 2 1116 664 114 106 0 chr5 69632407 69632530 -82904729 + RLTR23 LTR ERV1 11 146 -284 2 1116 1759 147 11 92 chr5 69632585 69632944 -82904315 + RLTR23 LTR ERV1 101 430 0 2 1116 831 195 0 19 chr5 69632944 69633101 -82904158 + RLTR25A LTR ERVK 950 1103 0 2 1116 276 278 25 34 chr5 69633852 69633971 -82903288 + RLTR40 LTR ERVK 131 248 -569 2 1116 1119 285 107 52 chr5 69634960 69635009 -82902250 + RLTR40 LTR ERVK 231 280 -537 2 1116 1119 285 107 52 chr5 69635071 69635535 -82901724 + RLTR40 LTR ERVK 281 771 -46 2 1116 751 216 62 153 chr5 69635820 69636094 -82901165 + ORR1C2 LTR MaLR 135 383 -1 2 1116 296 384 94 26 chr5 69639045 69639310 -82897949 + MLT1E2 LTR MaLR 199 481 -146 2 1116 260 287 28 9 chr5 69640469 69640576 -82896683 - MTE2a LTR MaLR -310 109 1 2 1116 4788 223 85 50 chr5 69665701 69667040 -82870219 + ORR1B1-int LTR MaLR 35 1420 -89 2 1116 267 383 102 5 chr5 69672615 69672812 -82864447 - MLT2B1 LTR ERVL -81 439 224 2 1116 6074 145 87 18 chr5 69673457 69674624 -82862635 + MTB-int LTR MaLR 2 1248 -10 2 1116 2958 68 8 3 chr5 69674605 69674990 -82862269 + MTB LTR MaLR 14 400 0 2 1116 254 372 80 63 chr5 69678595 69678882 -82858377 - MLT1D LTR MaLR -91 414 123 2 1116 443 319 156 55 chr5 69696670 69696998 -82840261 + ORR1D2 LTR MaLR 1 361 -9 3 1116 328 337 83 58 chr5 69701050 69701255 -82836004 + MLT1D LTR MaLR 293 502 -3 3 1116 244 228 0 0 chr5 69702004 69702061 -82835198 + LTR84a LTR ERVL 648 704 -53 3 1116 1479 261 30 17 chr5 69703943 69704305 -82832954 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 3 1116 344 348 82 124 chr5 69706525 69706840 -82830419 + ORR1E LTR MaLR 57 358 -1 3 1116 1043 256 44 54 chr5 69707595 69707983 -82829276 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1116 548 254 30 124 chr5 69707993 69708195 -82829064 + MLT1B LTR MaLR 208 390 0 3 1116 782 321 65 60 chr5 69708701 69709052 -82828207 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 3 1116 2794 108 9 5 chr5 69711654 69712073 -82825186 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1116 882 314 82 50 chr5 69712577 69713042 -82824217 - LTR80A LTR ERVL -103 480 1 3 1116 413 278 72 13 chr5 69714845 69714998 -82822261 + RMER5 LTR ERV1 15 176 -358 3 1116 478 263 29 14 chr5 69715025 69715164 -82822095 + RMER5 LTR ERV1 384 524 -10 3 1116 777 365 54 48 chr5 69716137 69716638 -82820621 + MLT1J-int LTR MaLR 707 1210 -177 3 1116 1230 245 40 48 chr5 69716839 69717212 -82820047 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1116 497 369 40 51 chr5 69718645 69718919 -82818340 - MLT1C LTR MaLR -24 443 173 3 1116 723 220 21 0 chr5 69720190 69720331 -82816928 + ORR1D1 LTR MaLR 3 146 -228 3 1116 1062 272 36 8 chr5 69723686 69724049 -82813210 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 1117 491 315 86 42 chr5 69740323 69740609 -82796650 - MLT1G1 LTR MaLR -244 305 1 3 1117 350 362 93 39 chr5 69745893 69746226 -82791033 - MER77 LTR ERVL -4 603 253 3 1117 693 249 152 0 chr5 69750104 69750281 -82786978 - ORR1C1 LTR MaLR -174 204 1 3 1117 1761 216 154 14 chr5 69751309 69751821 -82785438 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 3 1117 5991 174 20 22 chr5 69751884 69753056 -82784203 + RMER12B LTR ERVK 1 1169 -235 4 1117 254 232 162 20 chr5 69753109 69753327 -82783932 + RLTR21 LTR ERVK 1077 1253 -319 4 1117 1148 215 34 135 chr5 69757297 69757711 -82779548 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 4 1117 4347 14 2 12 chr5 69759530 69760028 -82777231 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1117 302 0 0 0 chr5 69760028 69760066 -82777193 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1117 390 167 46 35 chr5 69760066 69760153 -82777106 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 4 1117 38735 16 14 0 chr5 69760153 69765440 -82771819 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 1117 4342 12 2 24 chr5 69765440 69765944 -82771315 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1117 1542 242 58 64 chr5 69766335 69766803 -82770456 + RMER19C LTR ERVK 147 611 0 4 1117 758 301 36 60 chr5 69772550 69773091 -82764168 + RLTR12B LTR ERVK 1 499 -29 4 1117 624 144 108 31 chr5 69773929 69774058 -82763201 - RMER12B LTR ERVK -151 1253 1115 4 1117 2798 156 73 4 chr5 69777411 69777893 -82759366 - RMER12B LTR ERVK -889 515 1 4 1117 296 221 19 57 chr5 69791761 69791855 -82745404 + MTE2a LTR MaLR 1 86 -293 4 1117 490 278 65 70 chr5 69791902 69792088 -82745171 + MTE2a LTR MaLR 194 378 -1 4 1117 423 375 17 11 chr5 69797959 69798137 -82739122 - LTR85b LTR Gypsy? 0 784 606 4 1117 2751 170 43 4 chr5 69802156 69802663 -82734596 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 4 1117 813 296 70 14 chr5 69806110 69806466 -82730793 - MTE2b LTR MaLR -2 377 2 4 1117 1486 257 102 19 chr5 69808068 69808553 -82728706 - RLTR20B3 LTR ERVK -27 541 21 4 1117 814 170 7 0 chr5 69810853 69810994 -82726265 + RMER19B LTR ERVK 5 146 -756 4 1117 2457 103 56 0 chr5 69812075 69812169 -82725090 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 266 4 1117 2457 103 56 0 chr5 69812225 69812470 -82724789 - RLTR10D LTR ERVK -94 265 2 4 1117 46820 75 10 18 chr5 69812470 69819061 -82718198 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 1 4 1117 2556 98 0 45 chr5 69819061 69819437 -82717822 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 1117 3447 188 51 5 chr5 69819776 69820425 -82716834 + RMER19B LTR ERVK 210 878 -24 4 1117 794 265 65 48 chr5 69832433 69832770 -82704489 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 4 1117 646 196 44 35 chr5 69834467 69834621 -82702638 - MTD LTR MaLR -15 404 248 5 1117 290 338 33 67 chr5 69834651 69834794 -82702465 - MTD LTR MaLR -148 271 115 5 1117 1750 208 26 6 chr5 69841948 69842292 -82694967 + ORR1D1 LTR MaLR 1 351 -23 5 1117 483 293 58 40 chr5 69850938 69851112 -82686147 - MER34 LTR ERV1 -340 202 26 5 1117 560 183 269 35 chr5 69858061 69858290 -82678969 + ORR1C1 LTR MaLR 11 378 0 5 1117 319 284 64 9 chr5 69858311 69858421 -82678838 - RMER15 LTR ERVL -15 560 445 5 1118 283 246 58 0 chr5 69862071 69862140 -82675119 - ORR1D2 LTR MaLR -290 80 8 5 1118 357 188 12 59 chr5 69862988 69863073 -82674186 + MTEa LTR MaLR 279 359 -20 5 1118 647 199 89 0 chr5 69864589 69864735 -82672524 - RMER4A LTR ERVK 0 466 308 5 1118 2051 160 94 28 chr5 69864737 69865174 -82672085 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 5 1118 638 275 53 0 chr5 69874031 69874238 -82663021 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 265 5 1118 2229 205 64 60 chr5 69876894 69877412 -82659847 + RLTR25A LTR ERVK 1 520 -583 5 1118 995 248 147 27 chr5 69877344 69877443 -82659816 + ORR1A3-int LTR MaLR 499 742 -1221 5 1118 1044 184 80 33 chr5 69877443 69877656 -82659603 + MT2B LTR ERVL 35 257 -344 5 1118 995 248 147 27 chr5 69877656 69877731 -82659528 + ORR1A3-int LTR MaLR 743 932 -1031 5 1118 995 248 147 27 chr5 69877810 69877824 -82659435 + ORR1A3-int LTR MaLR 933 948 -1015 5 1118 614 205 19 146 chr5 69880325 69880531 -82656728 + RLTR25A LTR ERVK 617 796 -232 5 1118 314 359 0 17 chr5 69888596 69888715 -82648544 + MTEa LTR MaLR 4 120 -259 5 1118 294 386 31 36 chr5 69888715 69888819 -82648440 + MT2A LTR ERVL 4 225 -308 5 1118 535 321 52 35 chr5 69888863 69889092 -82648167 + MT2A LTR ERVL 228 460 -73 5 1118 352 286 75 41 chr5 69889405 69889551 -82647708 - MLT1B LTR MaLR -229 161 11 5 1118 626 356 29 41 chr5 69889786 69890126 -82647133 + MT2A LTR ERVL 76 411 -122 5 1118 234 389 37 31 chr5 69891463 69891625 -82645634 - MER76 LTR ERVL -528 163 1 5 1118 3271 21 39 0 chr5 69894544 69894925 -82642334 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1118 9175 31 3 2 chr5 69894927 69896022 -82641237 - MTA_Mm-int LTR MaLR -2 1096 1 5 1118 3271 21 39 0 chr5 69896022 69896403 -82640856 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1118 1159 238 180 41 chr5 69898211 69898627 -82638632 - RLTR33 LTR ERVK -30 648 175 5 1118 312 329 90 23 chr5 69899936 69900113 -82637146 + MLT1B LTR MaLR 191 379 -11 5 1118 259 338 117 67 chr5 69906162 69906444 -82630815 - ORR1E LTR MaLR 0 359 64 6 1118 1004 279 53 82 chr5 69921381 69921759 -82615500 + MTEa LTR MaLR 1 367 -12 6 1118 3070 175 62 26 chr5 69921869 69922533 -82614726 + RMER6C LTR ERVK 1 688 -2 6 1118 249 254 80 88 chr5 69935577 69935702 -82601557 - MT2B LTR ERVL -341 260 137 6 1118 2268 191 12 40 chr5 69935950 69936041 -82601218 - MTC LTR MaLR -8 413 323 6 1118 3172 51 2 5 chr5 69936041 69936436 -82600823 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 6 1118 2268 191 12 40 chr5 69936436 69936769 -82600490 - MTC LTR MaLR -99 322 1 6 1118 1869 228 33 50 chr5 69937369 69937854 -82599405 + RMER19C LTR ERVK 135 611 0 6 1118 263 341 86 72 chr5 69941219 69941440 -82595819 - MLT1H1 LTR MaLR -331 224 1 6 1118 2059 221 27 10 chr5 69943246 69943652 -82593607 + MTD LTR MaLR 1 413 -6 6 1118 252 250 0 32 chr5 69944504 69944566 -82592693 + MLT1B LTR MaLR 32 91 -299 6 1118 532 333 74 58 chr5 69944670 69944912 -82592347 + MTEa LTR MaLR 8 253 -126 6 1118 599 334 257 23 chr5 69945134 69945452 -82591807 + MTE-int LTR MaLR 3 413 -1167 6 1118 1950 216 11 39 chr5 69945452 69945885 -82591374 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1118 518 288 32 43 chr5 69945987 69946128 -82591131 + MTE-int LTR MaLR 542 684 -896 6 1118 1895 154 22 3 chr5 69946128 69946448 -82590811 + ORR1A4 LTR MaLR 2 327 -2 6 1118 518 288 32 43 chr5 69946448 69946491 -82590768 + MTE-int LTR MaLR 685 724 -856 6 1118 599 249 40 40 chr5 69946493 69946694 -82590565 + MTD LTR MaLR 5 205 -214 6 1118 351 264 182 48 chr5 69947477 69947664 -82589595 + RMER5 LTR ERV1 323 534 0 6 1118 1863 162 83 0 chr5 69951777 69952128 -82585131 - MTC LTR MaLR 0 421 42 6 1118 1101 238 127 29 chr5 69963587 69963903 -82573356 - ORR1C1 LTR MaLR -31 347 1 6 1118 230 266 59 50 chr5 69965649 69965768 -82571491 + MLT2B5 LTR ERVL 396 515 -40 6 1118 2005 132 35 0 chr5 69970186 69970503 -82566756 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 6 1118 320 319 59 0 chr5 69973415 69973550 -82563709 + LTR79 LTR ERVL 354 496 -31 6 1118 651 316 46 15 chr5 69983842 69984102 -82553157 - RMER5 LTR ERV1 -26 508 241 7 1118 332 297 90 42 chr5 69984929 69985073 -82552186 - LTR65 LTR ERV1 -267 402 252 7 1118 1891 193 56 173 chr5 69986463 69987103 -82550156 + RMER15 LTR ERVL 3 567 -8 7 1118 432 349 149 19 chr5 69988254 69988523 -82548736 + ORR1E LTR MaLR 56 359 0 7 1118 546 232 19 47 chr5 69989807 69990004 -82547255 + MT2B LTR ERVL 1 177 -356 7 1119 576 278 21 31 chr5 69996338 69996531 -82540728 - MLT1D LTR MaLR 0 505 315 7 1119 418 298 44 101 chr5 69996581 69996809 -82540450 - MLT1D LTR MaLR -412 215 1 7 1119 890 246 26 53 chr5 69997112 69997426 -82539833 - RLTR22_Mur LTR ERVK -959 363 72 7 1119 991 234 164 19 chr5 69998762 69999128 -82538131 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1119 1636 213 97 29 chr5 70000561 70001053 -82536206 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 529 -12 2 1119 242 305 21 21 chr5 70002495 70002592 -82534667 + LTR59 LTR ERV1 225 321 -276 5 1119 866 220 13 56 chr5 70003041 70003279 -82533980 - RLTR20B2 LTR ERVK -38 539 303 9 1119 1352 146 0 0 chr5 70005691 70005903 -82531356 - RMER6C LTR ERVK 0 690 479 1 1119 1707 166 90 154 chr5 70006919 70007069 -82530190 - RMER6C LTR ERVK -190 500 347 1 1119 1707 166 90 154 chr5 70007157 70007540 -82529719 - RMER6C LTR ERVK -344 346 1 1 1119 491 340 34 29 chr5 70009225 70009431 -82527828 + RMER15 LTR ERVL 353 559 -16 1 1119 282 184 0 0 chr5 70009714 70009763 -82527496 + MTD LTR MaLR 3 51 -368 1 1119 900 252 55 8 chr5 70010555 70010791 -82526468 + MTD LTR MaLR 68 314 -105 1 1119 1027 243 128 35 chr5 70014990 70015336 -82521923 + MTD LTR MaLR 7 405 -14 3 1119 294 261 33 22 chr5 70016088 70016178 -82521081 + MLT2B1 LTR ERVL 469 559 -8 3 1119 482 393 21 49 chr5 70016915 70017303 -82519956 - LTR40a LTR ERVL -16 503 127 3 1119 2210 44 3 119 chr5 70029753 70030115 -82507144 + RLTR10 LTR ERVK 1 320 -70 5 1119 933 89 29 24 chr5 70030167 70030326 -82506933 + RLTR10 LTR ERVK 249 411 0 5 1119 14718 32 51 31 chr5 70030336 70032244 -82505015 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1986 -1 5 1119 2210 44 3 119 chr5 70032244 70032606 -82504653 + RLTR10 LTR ERVK 1 320 -70 5 1119 933 89 29 24 chr5 70032658 70032817 -82504442 + RLTR10 LTR ERVK 249 411 0 5 1119 690 299 142 36 chr5 70033881 70034211 -82503048 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 5 1119 311 274 108 46 chr5 70037227 70037386 -82499873 - MLT1C LTR MaLR -219 171 6 6 1119 334 333 104 0 chr5 70038841 70038976 -82498283 - MLT1A0 LTR MaLR -171 194 46 6 1119 719 300 38 10 chr5 70038982 70039256 -82498003 + ORR1E LTR MaLR 6 379 0 6 1119 752 305 109 122 chr5 70039306 70039940 -82497319 - MLT-int LTR MaLR -2 1733 1108 7 1119 228 296 122 22 chr5 70039974 70040064 -82497195 - MLT-int LTR MaLR -588 1147 1049 7 1119 287 306 67 67 chr5 70040077 70040182 -82497077 - MLT-int LTR MaLR -969 766 662 7 1119 561 312 81 8 chr5 70040206 70040464 -82496795 - MLT-int LTR MaLR -1237 498 222 7 1119 643 234 30 97 chr5 70044912 70045412 -82491847 + RMER17C LTR ERVK 1 378 -32 7 1119 479 342 35 5 chr5 70055332 70055518 -82481741 - MLT1F LTR MaLR -360 195 1 9 1119 2003 194 30 8 chr5 70055975 70056369 -82480890 - MTC LTR MaLR -18 403 1 9 1119 820 200 23 38 chr5 70065735 70065955 -82471304 + LTRIS3 LTR ERV1 251 512 0 1 1119 2910 41 0 3 chr5 70067089 70067435 -82469824 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 1 1119 1271 249 131 50 chr5 70086640 70087021 -82450238 - MTD LTR MaLR -3 416 5 1 1119 2790 47 7 114 chr5 70088563 70089000 -82448259 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1119 16805 25 3 5 chr5 70089000 70090960 -82446299 + RLTR10-int LTR ERVK 1 1986 -1 1 1119 2842 41 7 110 chr5 70090960 70091395 -82445864 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1119 2449 202 55 96 chr5 70094793 70095428 -82441831 + RMER19C LTR ERVK 3 611 0 1 1119 1276 196 41 57 chr5 70101774 70101816 -82435443 - MT2B LTR ERVL -8 593 544 1 1119 1276 196 41 57 chr5 70101883 70102154 -82435105 - MT2B LTR ERVL -58 543 285 1 1119 1685 242 34 29 chr5 70109863 70110275 -82426984 + MTC LTR MaLR 8 421 0 1 1119 4694 168 51 28 chr5 70112520 70113383 -82423876 - RMER19B LTR ERVK -11 891 9 1 1119 790 318 90 51 chr5 70113816 70113880 -82423379 - MTE2b LTR MaLR -1 378 318 1 1119 790 318 90 51 chr5 70114022 70114289 -82422970 - MTE2b LTR MaLR -62 317 34 1 1120 227 243 0 0 chr5 70127680 70127750 -82409509 - LTR37A LTR ERV1 -276 150 81 1 1120 695 278 132 50 chr5 70131328 70131646 -82405613 + ORR1E LTR MaLR 27 370 0 1 1120 255 336 35 49 chr5 70133496 70133640 -82403619 + MLT1D LTR MaLR 1 142 -485 2 1120 327 352 82 0 chr5 70133696 70133818 -82403441 + MLT1D LTR MaLR 281 412 -93 2 1120 651 309 72 30 chr5 70137521 70137855 -82399404 - MLT1A0 LTR MaLR -6 359 12 2 1120 2689 182 2 47 chr5 70148059 70148590 -82388669 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 4 2 1120 489 283 133 20 chr5 70150628 70150823 -82386436 + RMER15 LTR ERVL 339 555 -20 2 1120 613 325 91 57 chr5 70154820 70155179 -82382080 - MLT2B1 LTR ERVL -21 499 143 2 1120 613 325 91 57 chr5 70155278 70155371 -82381888 - MLT2B1 LTR ERVL -378 142 32 2 1120 4306 24 2 0 chr5 70163050 70163542 -82373717 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 1120 39855 13 6 0 chr5 70163542 70168868 -82368391 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 2 1120 392 167 46 35 chr5 70168868 70168955 -82368304 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 2 1120 314 0 0 0 chr5 70168955 70168993 -82368266 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 2 1120 4306 24 2 0 chr5 70168993 70169485 -82367774 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 1120 1125 236 56 38 chr5 70170752 70171089 -82366170 - RMER19C LTR ERVK 0 902 364 2 1120 1744 216 37 90 chr5 70172032 70172541 -82364718 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 482 -95 2 1120 697 261 4 102 chr5 70181113 70181248 -82356011 - RMER5 LTR ERV1 -13 521 390 2 1120 697 261 4 102 chr5 70181341 70181440 -82355819 - RMER5 LTR ERV1 -145 389 310 2 1120 360 328 112 49 chr5 70181676 70181961 -82355298 - RMER5 LTR ERV1 -230 304 2 2 1120 1269 273 48 11 chr5 70190034 70190408 -82346851 - MLT1F1 LTR MaLR -5 564 177 2 1120 401 308 45 23 chr5 70191405 70191581 -82345678 + MLT1B LTR MaLR 208 387 -3 2 1120 292 288 30 74 chr5 70195998 70196133 -82341126 - MTE2a LTR MaLR -29 350 222 2 1120 363 242 30 104 chr5 70197469 70197603 -82339656 - MT2B LTR ERVL -344 257 134 3 1120 3401 44 4 111 chr5 70231018 70231550 -82305709 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 1120 1815 148 36 7 chr5 70245786 70246091 -82291168 + ORR1A2 LTR MaLR 94 407 0 3 1120 9119 151 123 11 chr5 70246091 70246803 -82290456 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 893 -1070 3 1120 9119 151 123 11 chr5 70246823 70247875 -82289384 + ORR1A2-int LTR MaLR 894 1962 -1 3 1120 2229 111 9 6 chr5 70247875 70248201 -82289058 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1121 230 299 25 38 chr5 70256813 70256893 -82280366 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 318 3 1121 1371 295 63 70 chr5 70266184 70266782 -82270477 - MTD-int LTR MaLR -663 595 2 3 1121 530 239 264 34 chr5 70266787 70267040 -82270219 - MTD LTR MaLR -20 399 83 3 1121 243 241 0 0 chr5 70267477 70267531 -82269728 + MLT2B4 LTR ERVL 5 58 -498 3 1121 644 323 39 77 chr5 70267712 70267997 -82269262 + ORR1E LTR MaLR 84 357 -2 3 1121 256 333 11 0 chr5 70269219 70269309 -82267950 - ERVL-E-int LTR ERVL -646 5021 4931 3 1121 503 301 131 78 chr5 70270584 70270786 -82266473 - MTE2a LTR MaLR 0 379 175 3 1121 503 301 131 78 chr5 70271161 70271318 -82265941 - MTE2a LTR MaLR -205 174 1 3 1121 471 354 24 53 chr5 70280698 70280904 -82256355 - MTE2a LTR MaLR -140 239 40 3 1121 250 317 163 34 chr5 70281415 70281562 -82255697 - MLT1H LTR MaLR -259 290 125 3 1121 350 299 35 50 chr5 70283119 70283260 -82253999 + MTE2a LTR MaLR 66 204 -175 4 1121 1017 280 67 36 chr5 70310871 70311230 -82226029 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1121 1045 262 66 13 chr5 70314422 70314717 -82222542 - MTD LTR MaLR -2 417 107 4 1121 270 254 63 0 chr5 70314897 70314960 -82222299 - MTD LTR MaLR -332 87 21 4 1121 3884 216 107 28 chr5 70315296 70316034 -82221225 + RMER12 LTR ERVK 1 761 -561 4 1121 3884 231 114 34 chr5 70316161 70316684 -82220575 + RMER12 LTR ERVK 762 1167 -155 4 1121 407 370 118 39 chr5 70317062 70317417 -82219842 - MLT2B2 LTR ERVL -78 437 55 4 1121 3043 163 43 88 chr5 70331923 70332595 -82204664 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 4 1121 1278 98 16 0 chr5 70333501 70333685 -82203574 + ORR1A2 LTR MaLR 2 188 -139 4 1121 3905 208 72 38 chr5 70333981 70334937 -82202322 + RLTR25B LTR ERVK 25 1013 -15 4 1121 919 259 31 47 chr5 70342562 70342870 -82194389 + MTD LTR MaLR 64 419 0 4 1121 338 337 59 35 chr5 70348391 70348560 -82188699 - MLT1J2 LTR MaLR -224 220 48 4 1121 1204 251 23 55 chr5 70352847 70353231 -82184028 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 4 1121 2255 216 87 43 chr5 70353253 70353910 -82183349 + RMER6C LTR ERVK 1 686 -4 4 1121 1238 61 6 12 chr5 70358793 70358959 -82178300 + MTB LTR MaLR 180 344 -56 4 1121 1955 351 77 77 chr5 70362024 70362477 -82174782 - MTE-int LTR MaLR -261 1319 849 4 1121 2371 117 14 11 chr5 70362477 70362841 -82174418 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 5 1121 1955 351 77 77 chr5 70362841 70363705 -82173554 - MTE-int LTR MaLR -732 848 2 4 1121 618 298 96 59 chr5 70363751 70364054 -82173205 - ORR1E LTR MaLR -37 322 9 5 1121 1287 267 74 23 chr5 70364321 70364470 -82172789 + ORR1C2 LTR MaLR 14 170 -214 5 1121 1287 267 74 23 chr5 70364503 70364706 -82172553 + ORR1C2 LTR MaLR 171 384 0 5 1121 635 312 199 3 chr5 70365079 70365391 -82171868 - LTR52 LTR ERVL -46 375 3 5 1121 278 277 34 57 chr5 70373150 70373238 -82164021 - MLT2C1 LTR ERVL -215 249 164 5 1121 329 266 133 64 chr5 70375051 70375113 -82162146 - MLT2C1 LTR ERVL -191 206 132 5 1121 329 266 133 64 chr5 70375275 70375385 -82161874 - MLT2C1 LTR ERVL -266 131 22 5 1121 1089 349 47 27 chr5 70377657 70378172 -82159087 - MT2A LTR ERVL -8 525 1 5 1121 1720 204 38 50 chr5 70378990 70379407 -82157852 + MTC LTR MaLR 2 413 -8 5 1122 3194 170 131 65 chr5 70386444 70386809 -82150450 + RMER6-int LTR ERVK 2154 2583 -594 5 1122 3194 170 131 65 chr5 70386854 70386902 -82150357 + RMER6-int LTR ERVK 2584 2642 -535 5 1122 3332 44 97 0 chr5 70386902 70387335 -82149924 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1122 3194 170 131 65 chr5 70387335 70387671 -82149588 + RMER6-int LTR ERVK 2643 3000 -177 5 1122 1840 182 50 0 chr5 70391209 70391550 -82145709 + RLTR14 LTR ERV1 15 372 -10 5 1122 231 353 47 0 chr5 70401207 70401292 -82135967 + MLT1J1 LTR MaLR 3 91 -353 5 1122 750 303 40 39 chr5 70401502 70401808 -82135451 + ORR1E LTR MaLR 49 379 0 5 1122 727 286 51 40 chr5 70418489 70418878 -82118381 - RLTR40 LTR ERVK -4 813 337 5 1122 727 270 61 58 chr5 70419076 70419148 -82118111 - RLTR40 LTR ERVK -481 336 259 5 1122 355 157 29 0 chr5 70419246 70419316 -82117943 - RLTR40 LTR ERVK -534 283 212 5 1122 518 237 70 0 chr5 70419352 70419508 -82117751 - RLTR40 LTR ERVK -601 216 50 5 1122 234 280 109 98 chr5 70424069 70424243 -82113016 - MLT1K LTR MaLR -27 568 393 5 1122 624 316 64 62 chr5 70424549 70424907 -82112352 + MLT1A0 LTR MaLR 1 359 -6 5 1122 258 354 61 28 chr5 70424915 70425127 -82112132 + MLT2B3 LTR ERVL 1 219 -335 5 1122 335 436 30 0 chr5 70425720 70425917 -82111342 - LTR16D2 LTR ERVL -216 356 154 5 1122 225 322 144 0 chr5 70426739 70426829 -82110430 + MTEa LTR MaLR 19 121 -238 5 1122 256 339 8 17 chr5 70426931 70427048 -82110211 + MTEa LTR MaLR 256 371 -8 5 1122 291 265 67 17 chr5 70431168 70431287 -82105972 + RMER15 LTR ERVL 341 465 -110 5 1122 1498 282 22 65 chr5 70433327 70433835 -82103424 - RMER19C LTR ERVK 0 611 126 6 1122 244 340 37 19 chr5 70450524 70450632 -82086627 - ORR1E LTR MaLR -5 374 265 6 1122 395 310 144 86 chr5 70450655 70450697 -82086562 - ORR1E LTR MaLR -124 235 200 6 1122 395 310 144 86 chr5 70450808 70450987 -82086272 - ORR1E LTR MaLR -160 199 1 6 1122 355 372 56 5 chr5 70456138 70456335 -82080924 + MTEb LTR MaLR 5 211 -168 6 1122 1294 348 106 37 chr5 70456452 70457560 -82079699 + MTE-int LTR MaLR 2 1306 -274 6 1122 1294 343 109 22 chr5 70458230 70458438 -82078821 + MTE-int LTR MaLR 1307 1533 -47 6 1122 483 349 45 13 chr5 70458471 70458695 -82078564 + MTEb LTR MaLR 1 231 -148 6 1122 332 201 63 63 chr5 70472844 70473035 -82064224 - RMER17C LTR ERVK -133 277 87 6 1122 2694 125 10 0 chr5 70474218 70474619 -82062640 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 6 1122 2125 122 3 59 chr5 70476629 70476970 -82060289 - ORR1A2 LTR MaLR -5 322 1 6 1122 266 364 65 50 chr5 70486307 70486567 -82050692 + MLT1B LTR MaLR 76 339 -51 6 1122 291 356 97 65 chr5 70487325 70487604 -82049655 - MLT2D LTR ERVL -4 410 123 6 1122 293 303 98 72 chr5 70487649 70487802 -82049457 - MTE2a LTR MaLR -124 255 99 6 1122 1644 205 30 19 chr5 70488342 70488705 -82048554 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 1122 225 164 0 187 chr5 70490562 70490637 -82046622 + MLT2D LTR ERVL 489 549 -11 6 1122 1872 183 68 10 chr5 70503480 70503878 -82033381 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1122 358 294 102 55 chr5 70505180 70505516 -82031743 - MT2A LTR ERVL -1 566 181 1 1122 1729 262 38 16 chr5 70505625 70506071 -82031188 - RMER20B LTR ERVK -77 550 95 1 1122 2941 73 27 7 chr5 70506279 70506692 -82030567 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1122 396 373 41 32 chr5 70507681 70507900 -82029359 + MLT1D LTR MaLR 229 449 -56 2 1122 3296 70 47 21 chr5 70508264 70508734 -82028525 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1122 835 137 0 0 chr5 70508734 70508858 -82028401 + RLTR45-int LTR ERVK 1 124 -7120 2 1122 6793 43 14 27 chr5 70508858 70509760 -82027499 + RLTR45-int LTR ERVK 2321 3211 -4033 2 1122 4428 56 7 15 chr5 70509750 70510350 -82026909 + RLTR45-int LTR ERVK 3392 3986 -3258 2 1122 9322 50 19 7 chr5 70510343 70512455 -82024804 + RLTR45-int LTR ERVK 5065 7242 -2 2 1122 3076 169 103 57 chr5 70513277 70513624 -82023635 + RMER6A LTR ERVK 7 383 -373 2 1122 3076 169 103 57 chr5 70513684 70514053 -82023206 + RMER6A LTR ERVK 384 755 -1 2 1123 545 350 50 60 chr5 70518852 70519153 -82018106 - MLT2B1 LTR ERVL -94 426 129 3 1123 618 329 86 42 chr5 70523236 70523668 -82013591 + MLT1D LTR MaLR 7 457 -48 4 1123 244 333 129 0 chr5 70531613 70531745 -82005514 + RMER15 LTR ERVL 426 574 -1 5 1123 415 295 477 0 chr5 70532468 70532701 -82004558 + ORR1C2 LTR MaLR 3 346 -38 6 1123 492 243 269 39 chr5 70539003 70539336 -81997923 + MTD LTR MaLR 11 419 0 7 1123 1614 330 73 64 chr5 70547777 70548355 -81988904 + MTE-int LTR MaLR 680 1265 -315 8 1123 1614 330 73 64 chr5 70548775 70549059 -81988200 + MTE-int LTR MaLR 1266 1550 -30 8 1123 251 246 18 0 chr5 70553172 70553229 -81984030 - MTD LTR MaLR -36 383 326 1 1123 252 342 0 37 chr5 70559189 70559271 -81977988 + MLT1A0 LTR MaLR 47 125 -240 1 1123 506 384 40 33 chr5 70577257 70577555 -81959704 + MTC LTR MaLR 1 300 -121 1 1123 765 180 97 67 chr5 70577555 70577793 -81959466 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 784 1 1123 1923 226 184 32 chr5 70578087 70578249 -81959010 - RLTR25B LTR ERVK -226 802 624 1 1123 1923 226 184 32 chr5 70578340 70578823 -81958436 - RLTR25B LTR ERVK -405 623 60 1 1123 268 307 57 33 chr5 70578783 70578933 -81958326 + ORR1E LTR MaLR 214 364 -15 1 1123 519 334 60 48 chr5 70580964 70581316 -81955943 - MLT1B LTR MaLR -34 356 1 1 1123 2167 62 37 7 chr5 70583859 70584180 -81953079 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 357 0 1 1123 4032 56 87 0 chr5 70588572 70589091 -81948168 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 1 1123 2330 125 22 77 chr5 70590095 70590511 -81946748 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 1 1123 1594 214 97 171 chr5 70593264 70593923 -81943336 - RMER19C LTR ERVK 0 611 2 1 1123 2479 166 47 0 chr5 70594421 70594849 -81942410 - RLTR20B2 LTR ERVK -112 448 1 1 1123 1371 164 65 18 chr5 70594946 70595225 -81942034 - RMER12 LTR ERVK -540 782 491 1 1123 438 271 22 43 chr5 70607224 70607363 -81929896 - MT2A LTR ERVL -397 136 1 1 1123 273 345 18 0 chr5 70615410 70615523 -81921736 + MLT1E3 LTR MaLR 79 193 -434 1 1123 336 369 39 86 chr5 70615529 70615784 -81921475 + MLT1E3 LTR MaLR 307 549 -131 1 1123 1342 142 46 25 chr5 70625962 70626201 -81911058 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 284 1 1123 1056 236 71 8 chr5 70626977 70627229 -81910030 - RLTR11A2 LTR ERVK -259 268 1 1 1123 319 325 83 71 chr5 70627368 70627620 -81909639 + RLTR12B LTR ERVK 17 271 -257 2 1123 548 156 9 35 chr5 70628915 70629028 -81908231 - RMER6B LTR ERVK -5 456 347 2 1123 1615 129 100 148 chr5 70634629 70635128 -81902131 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1123 2848 48 17 8 chr5 70635914 70636268 -81900991 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 2 1123 1511 179 80 35 chr5 70644886 70645198 -81892061 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1124 2609 78 3 9 chr5 70657908 70658255 -81879004 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 2 1124 2135 261 56 83 chr5 70658271 70659327 -81877932 + IAPLTR3-int LTR ERVK 19 952 -6629 2 1124 1178 207 104 78 chr5 70659439 70659901 -81877358 + RMER16-int LTR ERVK 251 623 -4783 2 1124 440 174 96 0 chr5 70659947 70660062 -81877197 + ETnERV3-int LTR ERVK 1724 1849 -5557 2 1124 291 267 0 65 chr5 70660073 70660165 -81877094 + ETnERV3-int LTR ERVK 2454 2539 -4867 2 1124 6724 108 53 7 chr5 70660177 70661545 -81875714 + ETnERV3-int LTR ERVK 2735 4271 -3135 2 1124 531 194 12 0 chr5 70661547 70661666 -81875593 + ETnERV3-int LTR ERVK 2357 2464 -2380 2 1124 792 93 17 8 chr5 70661683 70661802 -81875457 + IAPLTR3-int LTR ERVK 4530 4649 -2932 2 1124 6043 253 48 42 chr5 70661944 70664457 -81872802 + IAPLTR3-int LTR ERVK 4881 7296 -384 2 1124 2676 64 6 14 chr5 70664462 70664810 -81872449 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 2 1124 3059 79 10 0 chr5 70672578 70672994 -81864265 + BGLII LTR ERVK 1 420 -1 2 1124 470 147 34 0 chr5 70674544 70674655 -81862604 + RMER3D-int LTR ERVK 489 583 -2259 2 1124 2521 187 83 68 chr5 70675064 70675740 -81861519 + RMER3D-int LTR ERVK 470 1679 -1163 2 1124 2810 199 112 48 chr5 70675745 70676721 -81860538 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1289 2326 0 2 1124 3041 89 2 2 chr5 70676721 70677139 -81860120 + BGLII LTR ERVK 4 421 0 2 1124 322 261 59 50 chr5 70679753 70679928 -81857331 + MLT1A0 LTR MaLR 43 217 -148 2 1124 255 297 42 42 chr5 70680019 70680114 -81857145 - MTEa LTR MaLR -6 373 279 2 1124 560 211 0 39 chr5 70689292 70689445 -81847814 - RMER10B LTR ERVL -52 346 200 2 1124 2616 149 0 67 chr5 70689603 70690064 -81847195 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 2 1124 1720 156 29 39 chr5 70690177 70690591 -81846668 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 1124 551 286 21 46 chr5 70691398 70691592 -81845667 - RMER17C LTR ERVK -221 189 1 2 1124 366 224 80 53 chr5 70692891 70692961 -81844298 + RMER17C LTR ERVK 1 79 -331 2 1124 366 224 80 53 chr5 70693006 70693086 -81844173 + RMER17C LTR ERVK 80 155 -255 2 1124 931 263 119 0 chr5 70694724 70694975 -81842284 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 104 3 1124 1612 178 31 25 chr5 70698988 70699310 -81837949 + RMER6B LTR ERVK 138 461 0 3 1124 900 290 21 47 chr5 70700468 70700848 -81836411 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1124 1841 189 26 55 chr5 70709681 70710062 -81827197 + ORR1C1 LTR MaLR 1 370 -8 3 1124 903 257 58 15 chr5 70710072 70710301 -81826958 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 240 -1269 3 1124 1197 153 30 21 chr5 70710301 70710534 -81826725 + RMER4B LTR ERVK 1 235 -350 3 1124 348 279 61 155 chr5 70710553 70710850 -81826409 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 272 3 1124 687 263 18 62 chr5 70710816 70711070 -81826189 + ORR1C1 LTR MaLR 139 366 -1 3 1124 1661 276 17 19 chr5 70714039 70714450 -81822809 - MTD LTR MaLR 0 419 10 3 1124 424 229 34 76 chr5 70719802 70719920 -81817339 - RMER20B LTR ERVK -505 122 10 3 1124 2036 198 21 0 chr5 70722655 70723033 -81814226 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 1124 1555 242 146 19 chr5 70723496 70723963 -81813296 - RMER15 LTR ERVL -23 552 27 3 1124 243 298 0 0 chr5 70727561 70727618 -81809641 - MLT1B LTR MaLR -34 356 300 3 1124 233 205 128 35 chr5 70728912 70728998 -81808261 - MLT1B LTR MaLR -34 340 247 3 1124 4564 227 83 66 chr5 70729484 70730850 -81806409 + RMER12B LTR ERVK 15 1404 0 3 1124 663 293 82 32 chr5 70731766 70732108 -81805151 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 3 1124 955 311 41 3 chr5 70751395 70751689 -81785570 - MTD LTR MaLR 0 419 115 3 1124 1189 304 39 13 chr5 70755287 70755674 -81781585 - MTD LTR MaLR -14 405 9 3 1124 277 373 105 29 chr5 70757392 70757602 -81779657 + MLT2C1 LTR ERVL 63 288 -109 3 1124 293 281 106 62 chr5 70761419 70761811 -81775448 - MER34B-int LTR ERV1 -1737 3619 3099 4 1124 248 345 53 9 chr5 70762050 70762164 -81775095 - MLT1A0 LTR MaLR -224 141 23 4 1124 1286 293 48 8 chr5 70766533 70766884 -81770375 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 4 1125 228 296 60 20 chr5 70807182 70807282 -81729977 + MLT1A1 LTR MaLR 259 362 -46 4 1125 2169 182 36 59 chr5 70808766 70809244 -81728015 + RLTR20B3 LTR ERVK 111 577 0 4 1125 575 75 25 0 chr5 70811387 70811467 -81725792 - MTB LTR MaLR 0 400 319 4 1125 2515 94 43 34 chr5 70813431 70813848 -81723411 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1125 492 363 63 4 chr5 70814471 70814723 -81722536 - MLT1F-int LTR MaLR -7 1482 1216 4 1125 537 196 5 12 chr5 70821585 70821711 -81715548 - MTB_Mm LTR MaLR 0 421 257 4 1125 979 238 121 45 chr5 70824941 70825231 -81712028 - MTB_Mm LTR MaLR -94 313 2 4 1125 1452 210 35 30 chr5 70825588 70825961 -81711298 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 4 4 1125 1413 103 9 43 chr5 70828467 70828700 -81708559 - MTB_Mm LTR MaLR -181 226 2 4 1125 394 239 0 0 chr5 70828700 70828785 -81708474 + RLTR11A2 LTR ERVK 443 527 0 4 1125 1112 232 28 26 chr5 70829495 70829818 -81707441 + RLTR26 LTR ERVK 1 349 -293 4 1125 1081 224 6 167 chr5 70830130 70830495 -81706764 + RLTR26 LTR ERVK 337 642 0 4 1125 1367 230 46 40 chr5 70837225 70837597 -81699662 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1125 459 359 50 63 chr5 70837850 70838231 -81699028 + MTEa LTR MaLR 2 377 -2 4 1125 1110 357 81 112 chr5 70838256 70838502 -81698757 + MTEa-int LTR MaLR 19 230 -1350 4 1125 1110 357 81 112 chr5 70838886 70839156 -81698103 + MTEa-int LTR MaLR 231 453 -1127 4 1125 1110 357 81 112 chr5 70839179 70839818 -81697441 + MTEa-int LTR MaLR 454 1139 -441 4 1125 253 363 10 10 chr5 70839951 70840054 -81697205 + HERV16-int LTR ERVL 1215 1317 -3679 4 1125 3335 38 2 0 chr5 70841447 70841842 -81695417 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1125 383 256 35 0 chr5 70849082 70849168 -81688091 + MTD LTR MaLR 198 286 -133 5 1125 484 324 55 39 chr5 70853534 70853788 -81683471 + MLT1F1 LTR MaLR 299 556 -13 5 1125 449 319 50 141 chr5 70854453 70854935 -81682324 + RMER13A LTR ERVK 22 507 -120 5 1125 2489 160 207 4 chr5 70857035 70857543 -81679716 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 1125 377 357 95 21 chr5 70861594 70862015 -81675244 - MLT1C LTR MaLR -9 458 7 5 1125 260 344 61 45 chr5 70866246 70866444 -81670815 + HERV16-int LTR ERVL 2851 3051 -1945 5 1125 1922 349 104 21 chr5 70869339 70870363 -81666896 - MTE2b-int LTR MaLR -384 1196 88 5 1125 265 280 46 92 chr5 70870475 70870605 -81666654 - MTE2b-int LTR MaLR -1456 124 1 5 1125 369 303 25 0 chr5 70870667 70870803 -81666456 - MTE2b LTR MaLR -20 359 213 5 1125 452 405 0 33 chr5 70871063 70871275 -81665984 - MTE2b LTR MaLR -128 251 47 5 1125 831 372 40 44 chr5 70872028 70872531 -81664728 + MLT1D LTR MaLR 3 503 -2 5 1125 1471 231 48 0 chr5 70888995 70889307 -81647952 - MTC LTR MaLR -90 331 5 5 1125 253 343 84 28 chr5 70891845 70892058 -81645201 - LTR83 LTR ERVL -370 410 186 5 1125 539 350 98 50 chr5 70897662 70898119 -81639140 - MER34A1 LTR ERV1 -90 497 19 5 1126 428 351 58 51 chr5 70919214 70919508 -81617751 + MTD LTR MaLR 110 405 -14 5 1126 595 94 41 10 chr5 70924243 70924340 -81612919 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 100 -793 5 1126 4117 169 27 24 chr5 70924344 70925195 -81612064 + RLTR13A LTR ERVK 2 855 0 5 1126 1413 200 18 152 chr5 70925720 70926233 -81611026 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 2 5 1126 491 292 73 33 chr5 70926249 70926550 -81610709 + MER34 LTR ERV1 92 404 -138 5 1126 2008 180 36 6 chr5 70926943 70927306 -81609953 + ORR1B1 LTR MaLR 1 374 -20 5 1126 3033 164 121 48 chr5 70929977 70930682 -81606577 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 6 1126 4383 16 2 0 chr5 70933533 70934025 -81603234 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1126 314 0 0 0 chr5 70934025 70934063 -81603196 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 6 1126 392 167 46 35 chr5 70934063 70934150 -81603109 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 6 1126 47297 16 6 0 chr5 70934150 70939476 -81597783 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 6 1126 4398 14 2 0 chr5 70939476 70939968 -81597291 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1126 359 343 5 64 chr5 70941688 70941875 -81595384 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 195 6 1126 681 291 50 5 chr5 70942186 70942386 -81594873 - ORR1D2 LTR MaLR -161 209 1 6 1126 2400 135 19 24 chr5 70943040 70943451 -81593808 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 6 1126 1014 261 104 30 chr5 70944096 70944498 -81592761 - MTD LTR MaLR -14 405 11 6 1126 1011 214 109 51 chr5 70945892 70946203 -81591056 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 4 6 1126 1315 191 60 15 chr5 70946205 70946539 -81590720 - IAP-d-int LTR ERVK -8 6473 6125 6 1126 1648 138 47 25 chr5 70946556 70946895 -81590364 - IAPEY3-int LTR ERVK -342 7338 6965 6 1126 1379 129 107 0 chr5 70946895 70947120 -81590139 - IAP-d-int LTR ERVK -1287 5255 5007 6 1126 373 140 0 0 chr5 70947120 70947177 -81590082 - IAP-d-int LTR ERVK -6039 503 447 6 1126 280 192 58 0 chr5 70947369 70947421 -81589838 - RMER16-int LTR ERVK -983 1004 950 6 1126 284 241 50 12 chr5 70947416 70947496 -81589763 - RMER16-int LTR ERVK -4591 815 733 6 1126 789 195 22 37 chr5 70947619 70947893 -81589366 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6715 866 713 6 1126 2876 122 2 7 chr5 70948000 70948422 -81588837 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7159 422 3 6 1126 4369 20 0 0 chr5 70949272 70949765 -81587494 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 1126 5195 12 0 0 chr5 70949765 70950348 -81586911 + MERVL-int LTR ERVL 1 583 -4902 6 1126 1943 126 252 35 chr5 70950348 70950808 -81586451 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -58 596 37 6 1126 246 218 200 38 chr5 70950810 70950915 -81586344 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -532 122 1 6 1126 13883 16 10 24 chr5 70950915 70952561 -81584698 + MERVL-int LTR ERVL 595 2217 -3268 6 1126 3588 48 5 2 chr5 70952561 70952996 -81584263 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1126 2759 58 0 0 chr5 70952996 70953339 -81583920 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 343 -7238 6 1126 915 143 4 177 chr5 70953337 70953608 -81583651 + MMERVK10C-int LTR ERVK 729 952 -6629 6 1126 656 240 124 55 chr5 70953698 70954069 -81583190 + MMERVK10C-int LTR ERVK 318 668 -5469 6 1126 315 146 18 0 chr5 70954072 70954127 -81583132 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1724 1779 -5627 6 1126 381 95 0 0 chr5 70954134 70954197 -81583062 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1885 1947 -5634 6 1126 43842 22 0 10 chr5 70954203 70959286 -81577973 + MMERVK10C-int LTR ERVK 2552 7581 0 6 1126 3459 47 21 2 chr5 70959286 70959714 -81577545 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1126 10917 16 1 0 chr5 70959714 70960935 -81576324 + MERVL-int LTR ERVL 2212 3433 -2052 6 1126 3412 19 2 0 chr5 70960935 70961347 -81575912 + MTA_Mm-int LTR MaLR 686 1098 0 6 1126 3592 10 0 0 chr5 70961347 70961743 -81575516 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1126 1768 216 63 18 chr5 70962129 70962524 -81574735 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 1126 1424 206 67 40 chr5 70975076 70975451 -81561808 - RMER6C LTR ERVK -11 679 295 6 1126 1401 223 10 20 chr5 70975594 70975887 -81561372 - RMER6C LTR ERVK -400 290 1 6 1126 1912 218 73 26 chr5 70982769 70983274 -81553985 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 6 1126 1501 258 53 25 chr5 70998597 70999110 -81538149 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 6 1126 3405 28 2 0 chr5 70999390 70999785 -81537474 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1126 1610 23 9 0 chr5 70999785 71000000 -81537259 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 882 6 1126 6888 46 2 1 chr5 71000000 71000880 -81536379 - MTA_Mm-int LTR MaLR -217 881 1 1 1126 3405 28 2 0 chr5 71000880 71001275 -81535984 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1126 305 391 24 18 chr5 71004963 71005127 -81532132 + MLT1H LTR MaLR 64 228 -321 8 1126 1219 160 33 9 chr5 71006918 71007133 -81530126 + ORR1A3 LTR MaLR 95 314 -12 1 1126 299 290 129 41 chr5 71014131 71014325 -81522934 - MLT1E1 LTR MaLR -364 290 80 2 1126 808 255 28 14 chr5 71017395 71017651 -81519608 - ORR1A3-int LTR MaLR -1180 400 164 3 1126 3013 157 69 39 chr5 71024149 71024817 -81512442 - RMER6C LTR ERVK 0 690 3 3 1126 398 350 39 72 chr5 71025905 71026210 -81511049 + MLT1A0 LTR MaLR 1 295 -70 4 1126 752 321 55 76 chr5 71032818 71033108 -81504151 + ORR1E LTR MaLR 69 352 -7 4 1126 701 340 184 48 chr5 71035070 71035569 -81501690 - LTR69 LTR ERVL -12 576 11 4 1126 1772 208 15 54 chr5 71035585 71035787 -81501472 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 177 4 1126 1772 208 15 54 chr5 71035877 71036065 -81501194 - ORR1C1 LTR MaLR -202 176 4 4 1126 523 242 59 34 chr5 71036280 71036464 -81500795 + MTE2b LTR MaLR 199 379 0 5 1126 2302 202 36 54 chr5 71037174 71037232 -81500027 + RLTR25A LTR ERVK 35 93 -1010 5 1126 2302 199 31 35 chr5 71037255 71037865 -81499394 + RLTR25A LTR ERVK 94 749 -279 5 1126 3021 36 65 0 chr5 71037866 71038252 -81499007 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 5 1126 6419 60 12 11 chr5 71038254 71039082 -81498177 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 5 1126 10899 74 40 76 chr5 71039075 71040923 -81496336 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 9 5 140 3095 34 59 0 chr5 71040924 71041312 -81495947 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 5 1127 851 199 126 93 chr5 71041569 71041847 -81495412 + RLTR25A LTR ERVK 742 1028 0 5 1127 284 228 18 0 chr5 71049131 71049188 -81488071 + MTC LTR MaLR 4 61 -360 7 1127 3313 32 99 25 chr5 71052295 71052737 -81484522 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 8 1127 995 124 25 84 chr5 71053255 71053457 -81483802 + IAPEz-int LTR ERVK 4 193 -6288 8 1127 245 309 0 0 chr5 71053457 71053512 -81483747 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 8 1127 3553 69 33 18 chr5 71053512 71054000 -81483259 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 8 1127 2159 76 0 4 chr5 71054000 71054279 -81482980 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 8 1127 5561 63 17 19 chr5 71054278 71055023 -81482236 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 8 1127 3227 27 17 24 chr5 71055025 71055439 -81481820 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 8 1127 1291 254 21 47 chr5 71060917 71061301 -81475958 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 1127 2259 204 63 0 chr5 71066280 71066756 -81470503 - RMER6D LTR ERVK -5 715 210 1 1127 1471 163 24 0 chr5 71066796 71067048 -81470211 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1591 1 1127 5020 110 16 32 chr5 71067238 71068057 -81469202 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1042 806 1 1 1127 288 163 0 0 chr5 71068057 71068106 -81469153 - RMER6D LTR ERVK -671 49 1 1 1127 498 333 33 23 chr5 71068310 71068525 -81468734 - MLT1C LTR MaLR 0 467 251 1 1127 1132 294 102 30 chr5 71069614 71070172 -81467087 + MER67C LTR ERV1 9 606 -105 1 1127 4587 141 229 10 chr5 71072097 71073011 -81464248 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 1 1127 262 315 18 108 chr5 71079670 71079837 -81457422 + MLT1A LTR MaLR 10 161 -213 1 1127 273 324 153 6 chr5 71086119 71086302 -81450957 + RMER5 LTR ERV1 33 242 -292 1 1127 934 209 57 70 chr5 71087995 71088216 -81449043 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 885 1 1127 934 209 57 70 chr5 71088271 71088347 -81448912 - RLTR25A LTR ERVK -219 884 810 1 1127 302 170 0 0 chr5 71088728 71088781 -81448478 - RLTR25A LTR ERVK -298 805 753 1 1127 468 347 22 28 chr5 71090836 71091014 -81446245 + MTC LTR MaLR 8 184 -175 1 1127 1292 188 80 0 chr5 71094720 71094970 -81442289 + ORR1A4 LTR MaLR 47 316 -13 1 1127 4561 223 84 132 chr5 71094976 71096274 -81440985 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1373 -419 1 1127 1418 193 86 212 chr5 71096274 71096419 -81440840 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 319 1 1127 1418 193 86 212 chr5 71096453 71096582 -81440677 - RLTR19 LTR ERVK -181 318 203 1 1127 1418 193 86 212 chr5 71096681 71096976 -81440283 - RLTR19 LTR ERVK -297 202 2 1 1127 4561 223 84 132 chr5 71096976 71097557 -81439702 + ORR1A4-int LTR MaLR 1374 1789 -3 1 1127 676 211 155 11 chr5 71097528 71097562 -81439697 + MTC LTR MaLR 208 242 -179 1 1127 1718 149 20 80 chr5 71097562 71097912 -81439347 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1127 676 211 155 11 chr5 71097912 71098064 -81439195 + MTC LTR MaLR 243 420 -1 1 1127 1293 183 85 118 chr5 71100642 71100947 -81436312 + ORR1B1 LTR MaLR 41 342 -52 1 1127 1293 183 85 118 chr5 71101327 71101387 -81435872 + ORR1B1 LTR MaLR 343 394 0 1 1127 892 261 118 12 chr5 71106954 71107276 -81429983 + MER67C LTR ERV1 356 711 0 1 1127 628 357 64 26 chr5 71109258 71109600 -81427659 - MER70B LTR ERVL -213 365 11 1 1127 494 362 62 4 chr5 71111106 71111331 -81425928 + MER70B LTR ERVL 3 240 -338 1 1127 4073 195 155 23 chr5 71113082 71114122 -81423137 - RMER12 LTR ERVK -145 1177 1 1 1127 1222 280 25 38 chr5 71114707 71114771 -81422488 + ORR1D1 LTR MaLR 10 68 -306 1 1127 1222 280 25 38 chr5 71115479 71115782 -81421477 + ORR1D1 LTR MaLR 69 371 -3 1 1127 2856 52 0 3 chr5 71125770 71126117 -81411142 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1127 755 277 78 84 chr5 71127292 71127651 -81409608 - MTEa LTR MaLR -20 359 3 1 1127 432 364 56 0 chr5 71130757 71131007 -81406252 + LTR16B LTR ERVL 173 436 -27 1 1127 718 316 109 33 chr5 71131893 71132197 -81405062 - MTD LTR MaLR -28 391 65 1 1127 2284 208 122 23 chr5 71134972 71135528 -81401731 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1127 604 259 145 39 chr5 71162672 71162825 -81374434 + ORR1D1 LTR MaLR 1 169 -205 2 1127 604 259 145 39 chr5 71162932 71163115 -81374144 + ORR1D1 LTR MaLR 170 373 -1 2 1127 230 390 34 14 chr5 71165927 71166075 -81371184 + MLT1J LTR MaLR 11 161 -351 2 1128 655 290 66 61 chr5 71178646 71179042 -81358217 - MLT2D LTR ERVL -14 400 3 2 1128 256 361 22 22 chr5 71184178 71184314 -81352945 + MLT1B LTR MaLR 11 146 -244 2 1128 729 270 179 96 chr5 71185383 71185768 -81351491 - MTD LTR MaLR -2 417 1 2 1128 331 299 43 43 chr5 71190989 71191153 -81346106 + RNLTR23 LTR ERVK 479 642 0 2 1128 1107 254 27 7 chr5 71191468 71191765 -81345494 + RNERVK23-int LTR ERVK 235 537 -7680 2 1128 432 196 94 6 chr5 71197066 71197246 -81340013 + RMER17C LTR ERVK 82 277 -133 3 1128 226 288 28 64 chr5 71201615 71201756 -81335503 - MER72B LTR ERV1 -356 412 277 3 1128 4031 129 94 35 chr5 71209038 71209802 -81327457 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 3 1128 408 318 141 18 chr5 71222743 71223070 -81314189 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 4 3 1128 615 209 25 56 chr5 71239644 71239856 -81297403 - RMER6C LTR ERVK -401 289 1 3 1128 244 321 37 0 chr5 71244838 71244919 -81292340 - ORR1E LTR MaLR -5 354 271 3 1128 547 347 89 16 chr5 71245753 71246069 -81291190 + MLT1A0 LTR MaLR 16 354 -11 3 1128 484 302 79 14 chr5 71257581 71257796 -81279463 + RLTR15 LTR ERVK 3 231 -128 3 1128 1386 240 101 14 chr5 71261956 71262323 -81274936 + MTD LTR MaLR 13 411 -8 3 1128 254 250 83 77 chr5 71263327 71263496 -81273763 - RMER13A LTR ERVK -161 747 578 3 1128 930 228 139 58 chr5 71263542 71263872 -81273387 - RMER13A LTR ERVK -432 428 72 3 1128 402 324 101 0 chr5 71266867 71267046 -81270213 + MER67A LTR ERV1 1 197 -346 3 1128 253 402 18 59 chr5 71267074 71267243 -81270016 + MER67A LTR ERV1 362 523 -138 3 1128 227 373 53 96 chr5 71273836 71274118 -81263141 - ORR1D2 LTR MaLR -36 334 65 3 1128 895 196 24 52 chr5 71275407 71275773 -81261486 + RMER6A LTR ERVK 472 704 -16 3 1128 959 270 55 23 chr5 71280478 71280785 -81256474 + ORR1D1 LTR MaLR 1 317 -57 4 1128 2621 105 137 59 chr5 71283627 71284102 -81253157 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 4 1128 239 344 11 32 chr5 71285472 71285565 -81251694 + MLT1E1A LTR MaLR 130 220 -460 4 1128 2596 86 89 15 chr5 71287860 71288251 -81249008 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 4 1128 7200 81 33 6 chr5 71289258 71290254 -81247005 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 4 1128 764 300 121 25 chr5 71291293 71291742 -81245517 - RMER15 LTR ERVL 0 575 27 4 1128 3359 40 0 8 chr5 71294819 71295218 -81242041 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1128 7417 58 50 83 chr5 71295218 71296353 -81240906 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1128 3293 46 2 0 chr5 71296353 71296748 -81240511 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1128 489 314 101 109 chr5 71298721 71299097 -81238162 + MTEa LTR MaLR 3 375 -4 4 17 5534 92 14 12 chr5 71302546 71303353 -81233906 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 4 1129 2706 57 46 5 chr5 71304364 71304752 -81232507 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 8 4 1129 843 286 109 49 chr5 71306232 71306725 -81230534 + RLTR40 LTR ERVK 133 655 -162 4 1129 341 327 114 25 chr5 71313350 71313545 -81223714 + ORR1E LTR MaLR 20 222 -148 4 1129 296 257 54 0 chr5 71313579 71313653 -81223606 + ORR1E LTR MaLR 282 359 0 4 1129 352 262 0 0 chr5 71318556 71318636 -81218623 + MT2A LTR ERVL 1 80 -453 4 1129 230 167 0 0 chr5 71319054 71319096 -81218163 + MT2A LTR ERVL 492 533 0 4 1129 3427 25 0 5 chr5 71332687 71333085 -81204174 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1129 3220 51 2 2 chr5 71342660 71343056 -81194203 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1129 8766 53 3 2 chr5 71343056 71344153 -81193106 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1129 3175 53 2 12 chr5 71344153 71344553 -81192706 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1129 550 125 0 0 chr5 71366815 71366895 -81170364 + MTC LTR MaLR 3 82 -339 5 1129 1618 185 20 0 chr5 71368778 71369070 -81168189 + MTC LTR MaLR 104 401 -20 5 1129 236 319 62 21 chr5 71400211 71400307 -81136952 - LTR86A2 LTR ERVL -380 128 29 5 1129 394 307 16 8 chr5 71417795 71417923 -81119336 - MTE2a LTR MaLR -52 327 199 6 1129 237 272 91 57 chr5 71432003 71432299 -81104960 + RLTR21 LTR ERVK 959 1264 -308 6 1130 624 275 41 96 chr5 71436503 71436817 -81100442 + RMER5 LTR ERV1 1 297 -237 6 1130 1794 122 102 92 chr5 71450627 71451097 -81086162 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1130 919 288 152 19 chr5 71457804 71458172 -81079087 - MTD LTR MaLR 0 419 3 6 1130 366 255 10 20 chr5 71459656 71459756 -81077503 + MTD-int LTR MaLR 1157 1255 -3 6 1130 889 282 26 19 chr5 71459766 71460030 -81077229 + MTD LTR MaLR 20 285 -134 6 1130 499 327 125 45 chr5 71461163 71461627 -81075632 - MLT1E LTR MaLR 0 653 153 6 1130 236 258 49 49 chr5 71493672 71493774 -81043485 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 307 7 1130 895 358 51 58 chr5 71506422 71507048 -81030211 - MTE-int LTR MaLR -221 1359 738 1 1130 379 326 66 21 chr5 71507127 71507481 -81029778 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 1 1130 657 263 39 17 chr5 71513810 71513981 -81023278 + MTEb LTR MaLR 5 179 -200 2 1130 295 289 37 45 chr5 71514257 71514391 -81022868 + MTEb LTR MaLR 242 374 -5 2 1130 963 226 50 18 chr5 71517775 71518107 -81019152 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1130 258 307 130 30 chr5 71518618 71518749 -81018510 + MLT1L LTR MaLR 171 314 -296 3 1130 246 318 54 102 chr5 71518825 71518972 -81018287 + MLT1L LTR MaLR 424 563 -47 3 1130 1914 181 66 8 chr5 71522339 71522717 -81014542 + MTC LTR MaLR 1 400 -21 3 1130 438 269 15 75 chr5 71531593 71531714 -81005545 - RMER17C LTR ERVK -221 189 77 4 1130 438 267 16 23 chr5 71531813 71531899 -81005360 - RMER17C LTR ERVK -334 76 2 4 1130 966 308 95 85 chr5 71540341 71540880 -80996379 - RMER15 LTR ERVL -5 570 27 5 1130 238 222 19 0 chr5 71540904 71540958 -80996301 - RMER15 LTR ERVL -515 60 6 5 1130 1839 148 38 9 chr5 71543859 71544179 -80993080 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1130 607 118 0 134 chr5 71550077 71550204 -80987055 + ORR1A2 LTR MaLR 1 110 -219 7 1130 1333 137 41 3 chr5 71550499 71550754 -80986505 + ORR1A2 LTR MaLR 110 394 0 7 1130 226 296 12 36 chr5 71552925 71553009 -80984250 + MLT1D LTR MaLR 25 106 -399 7 1130 407 335 44 29 chr5 71553294 71553500 -80983759 + MLT1D LTR MaLR 294 502 -3 7 1130 262 312 154 96 chr5 71562997 71563309 -80973950 + MER31A LTR ERV1 156 485 0 9 1130 1247 180 123 36 chr5 71563996 71564417 -80972842 + RMER17C LTR ERVK 19 453 -505 9 1131 622 286 74 35 chr5 71565906 71566109 -80971150 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 174 1 1131 776 242 22 0 chr5 71566179 71566357 -80970902 - ORR1D1 LTR MaLR -192 182 1 1 1131 1712 188 26 59 chr5 71567590 71567930 -80969329 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1131 807 306 91 65 chr5 71572222 71572620 -80964639 + MT2A LTR ERVL 41 448 -85 1 1131 1738 237 17 32 chr5 71583767 71584177 -80953082 + MTD LTR MaLR 3 406 -13 1 1131 1159 266 119 63 chr5 71584186 71584831 -80952428 + MTC-int LTR MaLR 259 1325 -467 1 1131 324 48 0 0 chr5 71585076 71585118 -80952141 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 42 -250 1 1131 2001 88 84 39 chr5 71585140 71585473 -80951786 + RLTR10B2 LTR ERVK 18 365 0 1 1131 282 310 62 14 chr5 71586257 71586401 -80950858 + MTD-int LTR MaLR 1108 1258 0 1 1131 869 249 162 14 chr5 71586401 71586670 -80950589 + MTD LTR MaLR 14 323 -96 1 1131 626 298 36 91 chr5 71589158 71589465 -80947794 + RLTR12B LTR ERVK 12 301 -227 1 1131 629 290 39 54 chr5 71594069 71594210 -80943049 - MLT1B LTR MaLR -153 237 104 1 1131 1843 162 74 69 chr5 71594210 71594602 -80942657 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1131 629 290 39 54 chr5 71594602 71594664 -80942595 - MLT1B LTR MaLR -287 103 37 1 1131 1266 236 101 18 chr5 71595459 71595787 -80941472 - ORR1D1 LTR MaLR -15 359 5 1 1131 1100 293 44 12 chr5 71603142 71603480 -80933779 - MTE2a LTR MaLR -30 349 1 1 1131 407 239 88 0 chr5 71605898 71606011 -80931248 + MLT1E1A LTR MaLR 556 678 -2 1 1131 2845 182 27 8 chr5 71608000 71608526 -80928733 + RMER20B LTR ERVK 1 536 -91 1 1131 1793 152 31 28 chr5 71609818 71610176 -80927083 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 1131 468 303 73 120 chr5 71611000 71611274 -80925985 - RMER15 LTR ERVL -14 561 301 1 1131 522 371 105 45 chr5 71613572 71614021 -80923238 + MLT1D LTR MaLR 5 480 -25 1 1131 525 282 64 46 chr5 71615817 71616036 -80921223 + RMER5 LTR ERV1 112 334 -200 1 1131 288 315 11 21 chr5 71616818 71616912 -80920347 + MLT1C LTR MaLR 3 95 -372 1 1131 231 352 64 53 chr5 71635758 71635929 -80901330 - MLT1K LTR MaLR -19 576 404 1 1131 712 339 57 80 chr5 71666118 71666178 -80871081 - MT2A LTR ERVL 0 533 471 2 1131 712 339 57 80 chr5 71666221 71666575 -80870684 - MT2A LTR ERVL -63 470 109 2 1131 712 339 57 80 chr5 71666752 71666877 -80870382 - MT2A LTR ERVL -425 108 6 2 1131 362 275 72 26 chr5 71666882 71667035 -80870224 - ERVL-B4-int LTR ERVL 0 5667 5508 2 1131 1096 279 54 81 chr5 71667215 71667442 -80869817 - ERVL-B4-int LTR ERVL -273 5488 5281 2 1131 1096 276 52 101 chr5 71668425 71668779 -80868480 - ERVL-B4-int LTR ERVL -457 5304 4981 2 1131 1098 277 52 16 chr5 71668844 71669152 -80868107 - ERVL-B4-int LTR ERVL -844 4870 4552 2 1131 1630 160 3 14 chr5 71669153 71669444 -80867815 - RMER6A LTR ERVK 0 756 469 2 1131 1320 247 62 33 chr5 71669529 71670010 -80867249 - RMER6A LTR ERVK -254 502 8 2 1131 515 313 39 29 chr5 71670025 71670232 -80867027 - MTEa LTR MaLR 0 379 171 2 1131 319 358 40 20 chr5 71672017 71672168 -80865091 - MTEa LTR MaLR -186 193 40 2 1131 573 347 73 16 chr5 71674145 71674391 -80862868 - MLT1A0 LTR MaLR -105 260 1 2 1131 253 324 211 20 chr5 71676756 71677012 -80860247 - MLT2B1 LTR ERVL -78 442 123 2 1131 1234 222 70 4 chr5 71677406 71677677 -80859582 - MTC LTR MaLR -52 369 81 2 1131 1540 239 137 30 chr5 71677679 71678145 -80859114 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 2 1131 513 134 12 0 chr5 71678148 71678230 -80859029 - MTC LTR MaLR -338 83 1 2 1131 319 250 109 46 chr5 71678247 71678428 -80858831 + MTE-int LTR MaLR 1209 1546 -34 2 1131 959 219 72 125 chr5 71692821 71693252 -80844007 - MT2A LTR ERVL -57 544 1 2 141 1725 83 8 8 chr5 71696380 71696634 -80840625 - MT-int LTR MaLR -468 630 377 2 1132 6885 61 8 1 chr5 71697379 71698294 -80838965 - MTA_Mm-int LTR MaLR -176 922 2 2 1132 2968 52 15 25 chr5 71698297 71698694 -80838565 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 2 2 1132 2576 104 2 30 chr5 71700741 71701147 -80836112 + RLTR44B LTR ERVK 55 449 0 2 1132 258 283 54 54 chr5 71712424 71712536 -80824723 + MER73 LTR ERVL 14 125 -519 2 1132 575 314 0 91 chr5 71712545 71712720 -80824539 + ORR1D2 LTR MaLR 7 165 -194 2 1132 608 254 92 48 chr5 71713109 71713316 -80823943 + ORR1D2 LTR MaLR 155 370 0 2 1132 350 311 85 13 chr5 71713920 71714073 -80823186 - HERVL74-int LTR ERVL -2035 3650 3487 2 1132 275 258 0 43 chr5 71715714 71715807 -80821452 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 320 2 1132 2726 72 152 0 chr5 71724055 71724469 -80812790 + RLTR44C LTR ERVK 1 477 -25 3 1132 389 268 70 74 chr5 71742227 71742469 -80794790 + MLT1B LTR MaLR 78 318 -72 3 1132 649 315 14 59 chr5 71744549 71744903 -80792356 + RLTR15 LTR ERVK 1 338 -21 3 1132 429 352 56 6 chr5 71758614 71758794 -80778465 - MLT1A0 LTR MaLR -176 189 1 3 1132 589 259 84 30 chr5 71765037 71765240 -80772019 + MTEb LTR MaLR 165 378 -1 3 1132 2911 34 17 86 chr5 71790523 71790940 -80746319 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 3 1132 10456 112 48 42 chr5 71790942 71792914 -80744345 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 1 3 1132 3087 42 13 5 chr5 71792915 71793300 -80743959 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 3 1132 763 282 138 45 chr5 71795022 71795312 -80741947 - ORR1E LTR MaLR -4 355 39 3 1132 2752 118 5 0 chr5 71802111 71802516 -80734743 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1132 1298 200 141 21 chr5 71809077 71809404 -80727855 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 19 3 1132 576 214 0 91 chr5 71813381 71813535 -80723724 + RMER19B LTR ERVK 309 448 -454 3 1132 2853 98 0 51 chr5 71813914 71814343 -80722916 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1132 1155 269 67 56 chr5 71818016 71818358 -80718901 + ORR1E LTR MaLR 9 354 -5 3 1132 253 354 66 33 chr5 71818657 71818809 -80718450 - MLT1K LTR MaLR -15 580 424 3 1132 448 325 131 31 chr5 71819406 71819666 -80717593 + RMER15 LTR ERVL 273 558 -17 3 1132 288 218 62 25 chr5 71821085 71821165 -80716094 - ORR1E LTR MaLR 0 379 297 4 1132 1269 258 55 9 chr5 71821175 71821519 -80715740 + ORR1D2 LTR MaLR 8 367 -3 4 1132 979 314 4 4 chr5 71821525 71821771 -80715488 - ORR1E LTR MaLR -111 248 3 4 1132 1324 188 54 22 chr5 71825723 71826000 -80711259 + ORR1B2 LTR MaLR 1 286 -81 4 1132 647 264 70 100 chr5 71826003 71826373 -80710886 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 4 1132 543 115 0 0 chr5 71826373 71826451 -80710808 + ORR1B2 LTR MaLR 290 367 0 4 1133 340 374 17 11 chr5 71832108 71832284 -80704975 + ERVL-E-int LTR ERVL 4564 4740 -927 4 1133 272 365 95 15 chr5 71832350 71832550 -80704709 + MLT1F2 LTR MaLR 329 544 -16 4 1133 450 359 40 89 chr5 71836151 71836509 -80700750 + ORR1E LTR MaLR 9 379 0 4 1133 1607 169 102 46 chr5 71853285 71853658 -80683601 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1133 2740 53 0 12 chr5 71858753 71859099 -80678160 - ORR1A0 LTR MaLR -4 342 1 4 1133 577 299 139 39 chr5 71865182 71865519 -80671740 + ERVL-E-int LTR ERVL 3105 3475 -2192 4 1133 1093 289 35 55 chr5 71875228 71875594 -80661665 + MTEb LTR MaLR 14 372 -7 4 1133 1641 187 57 9 chr5 71880846 71881196 -80656063 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 1133 821 251 205 0 chr5 71882468 71882760 -80654499 - MTD LTR MaLR -67 352 1 5 1133 1770 176 102 5 chr5 71888498 71888880 -80648379 - MTC LTR MaLR 0 421 3 5 1133 1978 216 87 57 chr5 71889133 71890054 -80647205 - MTC-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1133 2039 201 19 30 chr5 71890054 71890480 -80646779 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1133 648 88 122 9 chr5 71894087 71894202 -80643057 - RMER6B LTR ERVK -326 135 8 5 1133 230 200 52 72 chr5 71895196 71895293 -80641966 + RLTR25B LTR ERVK 415 509 -519 5 1133 799 320 89 33 chr5 71896885 71897405 -80639854 + MLT1E1 LTR MaLR 9 645 -9 5 1133 580 228 50 71 chr5 71898941 71899185 -80638074 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 276 5 1133 2320 101 164 5 chr5 71901632 71902009 -80635250 + RLTR9B LTR ERVK 1 437 0 5 1133 799 233 29 17 chr5 71902282 71902457 -80634802 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 332 5 1133 1602 202 61 55 chr5 71903951 71904312 -80632947 - RLTR18B LTR ERVK -149 363 1 5 1133 4207 135 39 12 chr5 71906075 71906382 -80630877 + RMER6A LTR ERVK 1 326 -430 5 1133 4207 135 39 12 chr5 71906426 71906854 -80630405 + RMER6A LTR ERVK 327 755 -1 5 1133 1823 228 88 24 chr5 71926264 71926865 -80610394 + RLTR18 LTR ERVK 1 527 -89 5 1133 1376 99 298 0 chr5 71934833 71935085 -80602174 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 5 1133 1357 214 56 96 chr5 71940285 71940662 -80596597 + ORR1D1 LTR MaLR 11 372 -2 5 1134 3076 8 43 0 chr5 71967745 71968097 -80569162 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1134 318 341 122 29 chr5 71972018 71972190 -80565069 + MLT1H LTR MaLR 23 210 -339 5 1134 601 312 55 34 chr5 71972855 71972953 -80564306 + LTR37B LTR ERV1 9 107 -361 5 1134 601 312 55 34 chr5 71972984 71973177 -80564082 + LTR37B LTR ERV1 108 306 -162 5 1134 2416 160 134 10 chr5 71982799 71983298 -80553961 - RMER4B LTR ERVK -10 575 15 6 1134 264 271 175 42 chr5 71987710 71987899 -80549360 + RMER4A LTR ERVK 17 230 -236 6 1134 1174 309 41 39 chr5 71992572 71992986 -80544273 + MTD LTR MaLR 1 415 -4 6 1134 2039 91 56 109 chr5 72009885 72010148 -80527111 + RLTR28B LTR ERVL 32 313 -168 1 1134 2039 91 56 109 chr5 72010288 72010417 -80526842 + RLTR28B LTR ERVL 314 403 -78 1 1134 2670 156 49 23 chr5 72014374 72014887 -80522372 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 32 2 1134 332 294 85 30 chr5 72023190 72023460 -80513799 + ORR1E LTR MaLR 43 359 -20 3 1134 522 309 139 34 chr5 72027898 72028193 -80509066 + MLT1A0 LTR MaLR 40 365 0 4 1134 817 282 25 21 chr5 72036813 72037052 -80500207 + MLT1B LTR MaLR 7 246 -144 5 1134 272 221 72 14 chr5 72037070 72037139 -80500120 + MLT1B LTR MaLR 287 359 -15 5 1134 2186 114 3 58 chr5 72040497 72040842 -80496417 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 5 1134 2828 57 74 13 chr5 72052347 72052724 -80484535 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1134 539 224 178 13 chr5 72052861 72053134 -80484125 - ORR1D2 LTR MaLR -28 342 1 7 1134 260 278 0 0 chr5 72054734 72054788 -80482471 - MLT1G LTR MaLR -316 275 222 7 1134 280 245 45 45 chr5 72055044 72055155 -80482104 + MLT2D LTR ERVL 1 111 -303 7 1134 340 305 72 48 chr5 72055196 72055343 -80481916 + MLT2D LTR ERVL 97 246 -218 7 1134 368 269 66 74 chr5 72060234 72060456 -80476803 - MTEa LTR MaLR -18 382 116 8 1134 352 291 56 46 chr5 72060470 72060686 -80476573 - RMER15 LTR ERVL -14 561 344 8 1134 3729 106 34 3 chr5 72060844 72061411 -80475848 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 8 1134 1600 221 129 0 chr5 72068675 72069046 -80468213 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1134 274 314 133 67 chr5 72075334 72075484 -80461775 - MER21B LTR ERV1 -115 748 589 1 1134 887 374 61 21 chr5 72077087 72077614 -80459645 - MER21B LTR ERV1 -266 597 50 1 1135 306 331 142 0 chr5 72106114 72106283 -80430976 - MLT1A0 LTR MaLR -163 202 10 1 1135 1404 113 70 1 chr5 72110391 72110647 -80426612 + MTB LTR MaLR 125 399 -1 1 1135 1058 289 51 16 chr5 72110797 72111168 -80426091 - MTD LTR MaLR -12 395 1 1 1135 293 406 36 69 chr5 72112097 72112401 -80424858 - LTR16A LTR ERVL -127 324 31 1 1135 1019 269 67 96 chr5 72130507 72130894 -80406365 + MTEa LTR MaLR 4 379 0 1 1135 227 345 190 24 chr5 72133883 72134088 -80403171 + LTR16A1 LTR ERVL 58 296 -160 2 1135 1948 180 46 8 chr5 72142476 72142846 -80394413 - RMER6B LTR ERVK -2 459 76 2 1135 726 286 11 0 chr5 72154586 72154761 -80382498 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2077 2253 -3508 2 1135 2282 221 44 15 chr5 72154863 72155386 -80381873 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2263 2800 -2961 2 1135 397 161 60 24 chr5 72155594 72155677 -80381582 - MERVL-int LTR ERVL -3426 2059 1974 2 1135 383 286 69 66 chr5 72157479 72157680 -80379579 - MTEb LTR MaLR -114 265 1 2 1135 1283 253 99 13 chr5 72161678 72162051 -80375208 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1135 3022 83 0 5 chr5 72178418 72178816 -80358443 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1135 7216 86 12 69 chr5 72178816 72179980 -80357279 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1135 2951 73 29 3 chr5 72179980 72180364 -80356895 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 2 1135 1307 232 149 3 chr5 72188676 72189031 -80348228 + MTD LTR MaLR 5 411 -8 2 1135 315 242 198 22 chr5 72189194 72189376 -80347883 - LTR50 LTR ERVL -2 793 580 2 1135 332 216 35 113 chr5 72196016 72196131 -80341128 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 2 1135 3226 154 39 25 chr5 72201301 72202100 -80335159 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 3 2 1135 275 204 0 18 chr5 72202803 72202858 -80334401 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1269 3 1135 3130 198 44 22 chr5 72203020 72203752 -80333507 - RMER12 LTR ERVK -574 748 1 3 1135 2746 28 0 49 chr5 72211368 72211712 -80325547 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 3 1135 846 181 7 0 chr5 72212198 72212342 -80324917 + ORR1C1 LTR MaLR 13 157 -221 3 1135 279 257 13 13 chr5 72212530 72212605 -80324654 + ORR1C1 LTR MaLR 310 384 0 3 1135 226 313 172 38 chr5 72215737 72215946 -80321313 - MLT1C LTR MaLR -46 421 185 3 1136 422 231 203 7 chr5 72233406 72233554 -80303705 + MTD LTR MaLR 241 417 -2 3 1136 571 275 154 61 chr5 72234571 72234675 -80302584 + MTE2b LTR MaLR 3 108 -271 3 1136 571 275 154 61 chr5 72234866 72235105 -80302154 + MTE2b LTR MaLR 109 378 -1 3 1136 1826 232 22 172 chr5 72245966 72246685 -80290574 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1136 1994 161 153 52 chr5 72246685 72247222 -80290037 - MurERV4_19-int LTR ERVK 0 5780 5190 3 1136 4914 101 11 17 chr5 72247301 72248047 -80289212 - MurERV4_19-int LTR ERVK -564 5216 4476 3 1136 2651 67 176 0 chr5 72254354 72254758 -80282501 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1136 1262 80 29 82 chr5 72254759 72255039 -80282220 + IAPEz-int LTR ERVK 9 252 -7329 3 1136 236 321 0 0 chr5 72255039 72255092 -80282167 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 3 1136 3532 62 1 16 chr5 72255092 72255670 -80281589 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 3 1136 2165 83 0 0 chr5 72255670 72255948 -80281311 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 3 1136 6100 42 3 21 chr5 72255947 72256707 -80280552 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6481 0 3 1136 2643 62 182 0 chr5 72256707 72257109 -80280150 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1136 910 269 72 75 chr5 72267324 72267698 -80269561 - MLT1B LTR MaLR -6 384 12 3 1136 3320 187 82 57 chr5 72269532 72270246 -80267013 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1029 1704 -622 3 1136 3320 191 72 42 chr5 72270282 72270495 -80266764 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1705 1920 -406 3 1136 1752 254 54 40 chr5 72270533 72271037 -80266222 - RLTR17 LTR ERVK -77 615 105 3 1136 1528 210 11 38 chr5 72271043 72271448 -80265811 + MYSERV-int LTR ERVK 6189 6546 -4 3 1136 2867 155 23 17 chr5 72271453 72271977 -80265282 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 3 1136 370 250 36 18 chr5 72281169 72281279 -80255980 - MTEb LTR MaLR -8 371 260 4 1136 2268 338 55 74 chr5 72281461 72282088 -80255171 - MTE-int LTR MaLR -27 1553 929 4 1136 2268 338 55 74 chr5 72282296 72282756 -80254503 - MTE-int LTR MaLR -652 928 482 4 1136 2268 338 55 74 chr5 72282970 72283270 -80253989 - MTE-int LTR MaLR -1099 481 192 4 1136 245 346 137 0 chr5 72283278 72283431 -80253828 - MTEb LTR MaLR -182 177 4 4 1136 342 317 41 53 chr5 72283899 72284069 -80253190 + ORR1E LTR MaLR 10 177 -182 4 1136 3285 38 5 2 chr5 72290099 72290494 -80246765 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1136 352 282 13 1 chr5 72291384 72291485 -80245774 + MTD LTR MaLR 275 417 -2 4 1136 282 318 58 61 chr5 72292909 72293187 -80244072 - RLTR15 LTR ERVK -25 334 58 4 1136 1466 236 77 15 chr5 72297388 72297728 -80239531 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 9 4 1136 1535 283 78 37 chr5 72303803 72304505 -80232754 + MLT1D-int LTR MaLR 6 718 -1017 4 1136 470 321 62 26 chr5 72304616 72304808 -80232451 + MLT1D LTR MaLR 5 203 -302 4 1136 248 289 44 0 chr5 72304878 72304968 -80232291 + MLT1D-int LTR MaLR 1225 1318 -53 4 1136 273 360 30 0 chr5 72305022 72305122 -80232137 + MLT1D LTR MaLR 311 413 -92 4 1136 4214 162 70 28 chr5 72315631 72316456 -80220803 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 4 1136 537 367 68 8 chr5 72319957 72320207 -80217052 + MLT1J LTR MaLR 240 504 -8 4 1136 436 168 11 36 chr5 72324904 72325000 -80212259 + MTC LTR MaLR 340 421 0 4 1136 2621 260 76 91 chr5 72325002 72325311 -80211948 + MTC-int LTR MaLR 1 332 -766 4 1136 2672 211 71 70 chr5 72325337 72325996 -80211263 + MTC-int LTR MaLR 333 1121 -137 4 1136 3019 86 5 2 chr5 72325996 72326402 -80210857 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1136 2672 202 70 66 chr5 72326402 72326544 -80210715 + MTC-int LTR MaLR 1122 1256 -2 4 1136 351 64 0 0 chr5 72326546 72326593 -80210666 + MTC LTR MaLR 7 53 -368 4 1136 1147 154 16 8 chr5 72326570 72326792 -80210467 + MTC LTR MaLR 188 421 0 4 1136 280 401 59 41 chr5 72329050 72329219 -80208040 + MLT1H2 LTR MaLR 3 174 -315 4 1136 546 297 147 44 chr5 72329276 72329654 -80207605 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 4 1136 534 257 37 0 chr5 72330633 72330769 -80206490 - MTD LTR MaLR 0 419 279 4 1136 583 301 25 41 chr5 72331948 72332191 -80205068 - MER31B LTR ERV1 -3 463 225 4 1136 647 321 80 62 chr5 72334670 72335006 -80202253 - MLT1B LTR MaLR -47 343 2 4 1136 330 388 72 68 chr5 72335015 72335336 -80201923 - MLT1B-int LTR MaLR -26 1345 1024 4 1136 260 313 50 74 chr5 72337177 72337298 -80199961 - LTR33 LTR ERVL -318 197 80 4 1136 1398 222 110 34 chr5 72339527 72339937 -80197322 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 4 1137 1377 239 127 0 chr5 72355224 72355554 -80181705 + MTD LTR MaLR 43 414 -5 5 1137 249 349 53 115 chr5 72367305 72367626 -80169633 - ORR1E LTR MaLR -52 307 7 5 1137 305 279 187 7 chr5 72384037 72384192 -80153067 - MLT1D LTR MaLR 0 505 323 5 1137 671 351 119 63 chr5 72389407 72389933 -80147326 + MLT1F2 LTR MaLR 1 625 -2 5 1137 329 323 20 16 chr5 72392733 72392884 -80144375 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 209 5 1137 751 310 117 21 chr5 72395794 72396120 -80141139 - MTD LTR MaLR -3 416 60 5 1137 1515 130 144 0 chr5 72410625 72410902 -80126357 + RMER17B LTR ERVK 1 317 -641 5 1137 1691 172 96 30 chr5 72410882 72411336 -80125923 + RMER17B LTR ERVK 468 948 -10 5 1137 669 286 82 39 chr5 72412840 72413120 -80124139 + MLT1D LTR MaLR 117 408 -97 5 1137 373 247 32 11 chr5 72413573 72413667 -80123592 + MLT1D LTR MaLR 402 497 -8 5 1137 507 269 57 52 chr5 72424768 72424960 -80112299 - RMER15 LTR ERVL -87 488 296 6 1137 287 180 49 0 chr5 72425207 72425268 -80111991 + MLT1A0 LTR MaLR 3 66 -299 6 1137 270 306 65 102 chr5 72425281 72425307 -80111952 - MTA_Mm LTR MaLR -172 207 186 6 1137 1252 55 43 32 chr5 72425552 72425740 -80111519 - MTA_Mm LTR MaLR -206 190 1 6 1137 317 315 99 90 chr5 72425878 72426101 -80111158 + MLT1A0 LTR MaLR 89 313 -52 6 1137 1072 299 95 55 chr5 72427180 72427687 -80109572 - MLT2B4 LTR ERVL -3 553 27 6 1137 894 161 9 115 chr5 72435920 72436138 -80101121 + ORR1C1 LTR MaLR 1 195 -183 6 1137 1182 179 49 4 chr5 72436132 72436357 -80100902 + ORR1B2 LTR MaLR 133 367 0 6 1137 317 301 28 37 chr5 72436962 72437069 -80100190 - RMER12 LTR ERVK -471 851 746 6 1137 3596 127 15 138 chr5 72437541 72438336 -80098923 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 876 6 1137 6013 113 13 3 chr5 72439392 72440261 -80096998 - RLTR21 LTR ERVK -695 877 1 6 1137 479 204 29 10 chr5 72448743 72448847 -80088412 - MTEa LTR MaLR 0 379 274 6 1137 1609 154 115 31 chr5 72450348 72450669 -80086590 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 29 6 1137 3432 14 0 3 chr5 72460911 72461279 -80075980 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1137 56396 20 20 2 chr5 72461279 72467639 -80069620 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 6 1137 3432 14 0 3 chr5 72467639 72468007 -80069252 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1137 575 304 56 89 chr5 72468047 72468405 -80068854 + LTR33 LTR ERVL 169 514 -1 6 1137 2081 199 69 96 chr5 72473193 72473715 -80063544 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 1 6 1137 789 300 92 18 chr5 72474563 72474889 -80062370 - LTR53 LTR ERVL -139 380 31 6 1137 565 262 66 101 chr5 72479478 72479885 -80057374 + RMER10A LTR ERVL 12 404 -38 6 1137 671 302 38 6 chr5 72479968 72480151 -80057108 + MTD LTR MaLR 1 189 -230 6 1137 637 247 81 20 chr5 72481077 72481275 -80055984 + MTD LTR MaLR 196 405 -14 6 142 1025 283 110 35 chr5 72482566 72482939 -80054320 - MTD LTR MaLR -9 410 10 6 1138 460 204 155 30 chr5 72487837 72488070 -80049189 + MTEa LTR MaLR 90 375 -4 6 1138 642 318 124 63 chr5 72490134 72490608 -80046651 - MER21B LTR ERV1 -72 791 289 6 1138 501 340 74 5 chr5 72490630 72490819 -80046440 - MER21B LTR ERV1 -634 229 28 6 1138 234 308 9 80 chr5 72511785 72511898 -80025361 - MT2B LTR ERVL -343 258 154 1 1138 329 310 73 54 chr5 72513617 72513966 -80023293 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 7 1 1138 289 336 0 0 chr5 72514613 72514711 -80022548 + MTE2b LTR MaLR 3 100 -279 1 1138 337 270 55 83 chr5 72514710 72514819 -80022440 + MTE2b LTR MaLR 60 165 -214 1 1138 545 117 2 3 chr5 72515827 72515918 -80021341 - MTD LTR MaLR -6 413 314 1 1138 1932 191 87 5 chr5 72516711 72517100 -80020159 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1138 310 402 50 77 chr5 72518417 72518794 -80018465 - MLT1K LTR MaLR -164 431 65 2 1138 500 245 55 152 chr5 72520747 72520983 -80016276 - MLT2C1 LTR ERVL -3 394 182 2 1138 1743 99 114 52 chr5 72521803 72521856 -80015403 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 287 3 1138 1743 99 114 52 chr5 72522267 72522521 -80014738 - ORR1A2 LTR MaLR -41 286 1 3 1138 611 169 182 15 chr5 72524970 72525168 -80012091 + MTD-int LTR MaLR 1027 1257 -1 3 1138 1715 208 40 37 chr5 72525169 72525573 -80011686 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 1138 1221 277 82 8 chr5 72525594 72525962 -80011297 + MTD LTR MaLR 1 395 -24 3 1138 2068 147 6 9 chr5 72525963 72526286 -80010973 - MTC LTR MaLR 0 421 100 3 1138 454 154 168 16 chr5 72526264 72526389 -80010870 + MTC-int LTR MaLR 1114 1257 -1 4 1138 308 293 68 17 chr5 72526390 72526508 -80010751 + MTC LTR MaLR 1 124 -297 4 1138 546 172 67 25 chr5 72526453 72526572 -80010687 - MTC LTR MaLR -297 124 1 4 1138 416 256 103 40 chr5 72526871 72527167 -80010092 + RLTR12B LTR ERVK 164 507 -21 4 1138 2193 184 30 11 chr5 72547079 72547512 -79989747 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 6 1138 2034 162 76 5 chr5 72561853 72562220 -79975039 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 8 1138 378 357 93 28 chr5 72562593 72562809 -79974450 - MLT1J2 LTR MaLR -182 266 37 8 1138 323 292 49 94 chr5 72567995 72568260 -79968999 - MER67D LTR ERV1 -210 304 52 9 1138 831 256 173 3 chr5 72570081 72570387 -79966872 - MTE2b LTR MaLR 0 379 22 9 1138 267 314 36 146 chr5 72571697 72571817 -79965442 + MLT2D LTR ERVL 3 118 -296 9 1138 267 314 36 146 chr5 72571934 72572115 -79965144 + MLT2D LTR ERVL 119 271 -143 9 1138 409 94 0 0 chr5 72576152 72576216 -79961043 - RMER10A LTR ERVL -6 436 373 1 1138 1234 157 108 54 chr5 72576216 72576562 -79960697 + RMER17C LTR ERVK 20 381 -29 1 1138 1234 157 108 54 chr5 72576726 72576749 -79960510 + RMER17C LTR ERVK 382 409 -1 1 1138 913 198 34 181 chr5 72576749 72577173 -79960086 - RMER10A LTR ERVL -81 361 3 1 1138 530 129 0 0 chr5 72578327 72578412 -79958847 + RMER10B LTR ERVL 1 85 -313 1 1138 267 241 50 12 chr5 72578538 72578618 -79958641 + RLTR19-int LTR ERVK 4235 4317 -1820 1 1138 1180 152 0 0 chr5 72578664 72578861 -79958398 + RMER10B LTR ERVL 3 199 -199 1 1138 2131 171 11 8 chr5 72580335 72580701 -79956558 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1138 4620 248 49 24 chr5 72580706 72581313 -79955946 + ORR1B2-int LTR MaLR 19 642 -728 1 1138 4620 248 49 24 chr5 72581457 72582168 -79955091 + ORR1B2-int LTR MaLR 643 1369 -1 1 1138 2089 139 60 17 chr5 72582168 72582518 -79954741 + ORR1B2 LTR MaLR 1 365 -2 1 1138 1383 180 50 70 chr5 72582518 72583015 -79954244 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 561 2 1 1138 2849 160 53 29 chr5 72583058 72583637 -79953622 + MT2B LTR ERVL 1 593 -8 1 1138 642 134 34 25 chr5 72584056 72584193 -79953066 + ORR1C2 LTR MaLR 257 394 0 1 1138 1029 233 24 24 chr5 72584193 72584444 -79952815 - ORR1D2 LTR MaLR -119 251 1 1 1138 865 215 75 84 chr5 72587701 72588072 -79949187 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 1 1138 2095 116 0 57 chr5 72588588 72588687 -79948572 + ORR1A4 LTR MaLR 1 96 -233 1 1138 2095 116 0 57 chr5 72588749 72588997 -79948262 + ORR1A4 LTR MaLR 97 327 -2 1 1138 3158 49 39 0 chr5 72589404 72589789 -79947470 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1138 3995 108 5 59 chr5 72605477 72606108 -79931151 + MT2B LTR ERVL 3 599 -2 1 1138 3280 40 28 0 chr5 72606598 72606998 -79930261 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 1 1139 226 259 17 17 chr5 72614525 72614580 -79922679 - ORR1D2 LTR MaLR 0 359 305 1 1139 277 302 115 36 chr5 72614722 72614887 -79922372 - ORR1D2 LTR MaLR -192 182 5 1 1139 3454 46 2 2 chr5 72642813 72643209 -79894050 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1139 2124 164 55 33 chr5 72644736 72645133 -79892126 - MTC LTR MaLR -7 414 9 2 1139 894 222 166 15 chr5 72650272 72650537 -79886722 - MTEa LTR MaLR -12 367 63 2 1139 342 153 115 14 chr5 72650573 72650651 -79886608 - MTEa LTR MaLR -288 91 7 2 1139 2097 169 10 42 chr5 72669283 72669757 -79867502 - ORR1A3-int LTR MaLR -1356 436 1 2 1139 1995 157 25 25 chr5 72669761 72670087 -79867172 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1139 1409 206 42 16 chr5 72670097 72670403 -79866856 + MTD LTR MaLR 90 403 -16 2 1139 319 351 57 46 chr5 72672834 72673028 -79864231 - MLT1A0 LTR MaLR -159 206 11 2 1139 833 234 46 54 chr5 72674322 72674562 -79862697 - RMER12 LTR ERVK -127 1195 958 2 1139 4182 136 51 23 chr5 72674633 72675380 -79861879 - RMER12 LTR ERVK -554 768 1 2 1139 279 304 68 10 chr5 72678294 72678397 -79858862 - ORR1E LTR MaLR -250 109 1 2 1139 2497 133 43 0 chr5 72681299 72681675 -79855584 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 3 1139 8008 79 19 65 chr5 72683364 72684514 -79852745 + MTA_Mm-int LTR MaLR 2 1098 0 3 1139 3293 59 15 3 chr5 72684514 72684905 -79852354 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1139 480 275 122 6 chr5 72687372 72687544 -79849715 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 217 3 1139 484 290 49 47 chr5 72697615 72697825 -79839434 - MTEb LTR MaLR -20 359 139 3 1139 260 307 46 30 chr5 72723436 72723567 -79813692 + MTEa LTR MaLR 247 379 0 3 1139 3186 48 64 0 chr5 72728165 72728541 -79808718 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1139 3456 24 39 0 chr5 72735977 72736358 -79800901 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1139 9665 37 3 2 chr5 72736360 72737455 -79799804 - MTA_Mm-int LTR MaLR -2 1096 1 3 1139 3456 24 39 0 chr5 72737455 72737836 -79799423 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1139 451 364 15 25 chr5 72739802 72740002 -79797257 + MLT1A LTR MaLR 177 374 0 3 1139 771 324 63 21 chr5 72740546 72740880 -79796379 + MLT1A0 LTR MaLR 17 364 -1 3 1140 1223 279 110 20 chr5 72752645 72753135 -79784124 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 3 1140 322 223 52 41 chr5 72773025 72773149 -79764110 + MLT1B LTR MaLR 261 372 -18 4 1140 1925 147 70 13 chr5 72777837 72778214 -79759045 + MTB_Mm LTR MaLR 1 421 0 4 1140 306 298 108 51 chr5 72778819 72779232 -79758027 - MLT1D LTR MaLR 0 505 1 4 1140 441 246 0 119 chr5 72782592 72782726 -79754533 - MT2B LTR ERVL -337 264 147 4 1140 245 324 66 33 chr5 72784680 72784862 -79752397 - ORR1C2 LTR MaLR -196 188 1 4 1140 978 278 266 28 chr5 72789068 72789461 -79747798 + RMER5 LTR ERV1 48 534 0 4 1140 370 325 26 7 chr5 72792001 72792153 -79745106 + MER57-int LTR ERV1 7151 7305 -232 4 1140 389 265 8 72 chr5 72793114 72793267 -79743992 + ORR1E LTR MaLR 4 151 -219 4 1140 655 264 111 58 chr5 72793326 72793740 -79743519 + MER57A-int LTR ERV1 5717 6040 -147 4 1140 286 375 110 24 chr5 72806907 72807197 -79730062 + LTR16A LTR ERVL 137 451 0 4 1140 2132 163 80 0 chr5 72807480 72807830 -79729429 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1140 1753 183 94 11 chr5 72808230 72808590 -79728669 + MTD LTR MaLR 18 407 -12 4 1140 528 228 192 7 chr5 72810193 72810337 -79726922 + MTD LTR MaLR 154 324 -95 4 1140 294 116 0 0 chr5 72810337 72810380 -79726879 - MT2B LTR ERVL 0 584 542 4 1140 467 182 22 22 chr5 72810435 72810525 -79726734 + RMER6B LTR ERVK 4 93 -368 4 1140 1731 189 224 13 chr5 72810589 72811040 -79726219 - MT2B LTR ERVL -55 546 1 4 1140 250 204 0 0 chr5 72811040 72811084 -79726175 + MTD LTR MaLR 324 367 -54 4 1140 267 310 43 70 chr5 72812284 72812471 -79724788 - ORR1E LTR MaLR -170 189 8 4 1140 1911 153 94 6 chr5 72815826 72816167 -79721092 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 4 1140 670 329 126 46 chr5 72818694 72819176 -79718083 + MLT1F2 LTR MaLR 11 640 -14 4 1140 365 371 116 40 chr5 72819819 72820190 -79717069 - LTR33 LTR ERVL 0 515 117 4 1140 624 317 78 49 chr5 72824854 72825265 -79711994 + MLT1C LTR MaLR 45 467 0 5 1140 610 254 112 81 chr5 72835216 72835512 -79701747 - MTEa LTR MaLR -1 378 74 5 1140 303 356 318 36 chr5 72849023 72849415 -79687844 + MLT1D LTR MaLR 5 505 0 5 1140 226 343 94 61 chr5 72850304 72850484 -79686775 + MLT1I LTR MaLR 224 409 -2 5 1140 582 354 75 9 chr5 72853729 72854072 -79683187 + RMER15-int LTR ERVL 6 515 -4484 5 1140 2303 321 68 43 chr5 72855702 72856944 -79680315 + RMER15-int LTR ERVL 568 1840 -3159 5 1140 1284 196 301 78 chr5 72865771 72866207 -79671052 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 5 1140 282 260 91 0 chr5 72866866 72866943 -79670316 + MTD LTR MaLR 127 210 -209 5 1140 608 269 28 37 chr5 72872816 72873032 -79664227 - MTD LTR MaLR 0 419 206 5 1140 952 156 12 6 chr5 72873125 72873293 -79663966 - MTD LTR MaLR -242 177 9 5 1141 1953 225 50 12 chr5 72877617 72878098 -79659161 + RLTR16 LTR ERVK 7 505 0 5 1141 289 277 33 67 chr5 72880324 72880444 -79656815 + ORR1E LTR MaLR 4 119 -240 5 1141 794 236 55 137 chr5 72881785 72882114 -79655145 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 302 -143 5 1141 615 214 25 14 chr5 72882139 72882320 -79654939 + RLTR11A2 LTR ERVK 285 501 -27 5 1141 1659 174 9 46 chr5 72882827 72883267 -79653992 - ORR1B2 LTR MaLR 0 394 1 5 1141 239 207 26 18 chr5 72883267 72883350 -79653909 - ORR1B2 LTR MaLR -272 122 44 5 1141 258 138 0 15 chr5 72883345 72883411 -79653848 - ORR1B1 LTR MaLR -254 140 76 5 1141 409 174 32 80 chr5 72883415 72883540 -79653719 - ORR1B1 LTR MaLR -248 146 28 5 1141 3368 35 5 0 chr5 72884049 72884443 -79652816 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1141 527 324 80 25 chr5 72886878 72887277 -79649982 - MLT1D LTR MaLR -4 501 81 5 1141 1083 275 224 37 chr5 72888522 72889119 -79648140 + MER21B LTR ERV1 31 739 -124 6 1141 544 316 110 31 chr5 72890958 72891285 -79645974 + MLT1C LTR MaLR 63 415 -52 6 1141 3679 155 75 19 chr5 72899039 72899717 -79637542 + RMER6D LTR ERVK 1 716 -4 6 1141 1958 188 160 20 chr5 72899790 72900241 -79637018 + RLTR21 LTR ERVK 4 517 -1055 6 1141 5404 187 76 65 chr5 72910053 72911533 -79625726 + RLTR21 LTR ERVK 7 1404 0 6 1141 631 128 0 0 chr5 72912663 72912757 -79624502 + RMER19C LTR ERVK 518 611 0 6 1141 257 279 23 81 chr5 72918360 72918446 -79618813 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 161 6 1141 477 186 0 20 chr5 72945394 72945493 -79591766 - RLTR13B1 LTR ERVK -92 801 705 6 1141 402 296 71 138 chr5 72953748 72953987 -79583272 - MLT1A LTR MaLR -185 223 1 6 1141 2657 67 53 0 chr5 72954013 72954354 -79582905 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 6 1141 1238 240 191 7 chr5 72954520 72954939 -79582320 + RLTR1 LTR ERV1 129 624 0 6 1141 735 114 57 8 chr5 72954939 72955063 -79582196 + MMERGLN-int LTR ERV1 1 130 -3169 6 1141 29748 251 19 25 chr5 72955099 72956940 -79580319 + MMERGLN-int LTR ERV1 430 2273 -5283 6 1141 29748 251 19 25 chr5 72956975 72962300 -79574959 + MMERGLN-int LTR ERV1 2274 7554 -2 6 1141 499 256 71 16 chr5 72962390 72962573 -79574686 + RLTR1 LTR ERV1 129 321 -303 6 1141 254 245 0 0 chr5 72985740 72985793 -79551466 + MTEa LTR MaLR 18 70 -309 7 1141 232 184 0 20 chr5 72985968 72986018 -79551241 + MTEa LTR MaLR 61 109 -270 7 1141 1723 109 59 59 chr5 72986042 72986363 -79550896 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 7 1141 2557 133 56 29 chr5 72986420 72986830 -79550429 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1141 581 232 40 45 chr5 72987079 72987255 -79550004 + MTEa LTR MaLR 205 379 0 7 1141 1909 193 81 69 chr5 72987925 72988218 -79549041 - RMER4B LTR ERVK 0 585 316 7 1141 1909 193 81 69 chr5 72988271 72988555 -79548704 - RMER4B LTR ERVK -270 315 1 7 1141 229 277 60 12 chr5 72988555 72988620 -79548639 + MLT1A1 LTR MaLR 340 408 0 7 1141 1952 199 81 62 chr5 72990097 72990860 -79546399 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 7 1141 367 301 71 138 chr5 72992013 72992252 -79545007 - MLT1A LTR MaLR -185 223 1 7 1141 1568 213 84 95 chr5 72992437 72992993 -79544266 + RLTR31_Mur LTR ERVK 4 553 0 7 1141 280 186 0 0 chr5 72992993 72993052 -79544207 + ORR1D2 LTR MaLR 271 329 -41 7 1141 882 294 85 30 chr5 72996996 72997206 -79540053 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1097 7 1141 4087 228 79 26 chr5 72997240 72997501 -79539758 - RMER12 LTR ERVK -226 1096 770 7 1141 4087 159 73 22 chr5 72997548 72998287 -79538972 - RMER12 LTR ERVK -553 769 1 7 1141 770 332 126 48 chr5 72998520 72999188 -79538071 + MER21B LTR ERV1 19 738 -125 7 1141 1914 188 89 23 chr5 73005744 73006135 -79531124 - MTC LTR MaLR 0 421 5 8 1141 368 300 32 51 chr5 73006418 73006576 -79530683 + ERVL-E-int LTR ERVL 4750 4904 -763 9 1142 317 305 51 0 chr5 73007555 73007673 -79529586 + LTR16A LTR ERVL 314 437 -14 1 1142 2527 165 20 76 chr5 73019971 73020561 -79516698 + RLTR31_Mm LTR ERVK 5 561 0 3 1142 1314 196 133 19 chr5 73020945 73021320 -79515939 - MTD LTR MaLR -1 418 1 3 1142 466 325 100 0 chr5 73023949 73024109 -79513150 - MTE2b LTR MaLR -197 182 7 4 1142 301 330 62 52 chr5 73026887 73027239 -79510020 - MTEb LTR MaLR -4 375 1 4 1142 231 255 29 48 chr5 73029251 73029354 -79507905 + MLT1A LTR MaLR 240 340 -34 5 1142 3205 70 0 2 chr5 73030575 73030976 -79506283 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1142 3424 95 127 21 chr5 73042372 73042900 -79494359 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 7 1142 386 172 19 123 chr5 73043910 73044016 -79493243 + MT2B LTR ERVL 162 256 -345 7 1142 2181 104 6 38 chr5 73045817 73046157 -79491102 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 8 1142 2412 75 14 11 chr5 73055806 73056157 -79481102 + MTB LTR MaLR 1 352 -48 9 1142 1125 224 47 25 chr5 73056156 73056431 -79480828 - MTD LTR MaLR -137 282 2 9 1142 229 286 40 101 chr5 73060248 73060396 -79476863 - MT2B LTR ERVL -350 251 113 1 1142 3376 127 31 120 chr5 73064182 73064949 -79472310 + RMER6A LTR ERVK 58 756 0 1 1142 872 257 13 146 chr5 73064949 73065328 -79471931 - MTE2a LTR MaLR -33 346 19 1 1142 355 357 61 19 chr5 73067690 73067953 -79469306 + MLT1A LTR MaLR 23 296 -78 1 1142 960 269 93 9 chr5 73068090 73068435 -79468824 - MTEa LTR MaLR 0 379 6 1 1142 1398 187 65 4 chr5 73068715 73068994 -79468265 + ORR1C1 LTR MaLR 1 296 -82 1 1142 291 345 43 14 chr5 73070111 73070252 -79467007 + LTR52 LTR ERVL 14 158 -263 1 1142 1822 127 61 80 chr5 73070831 73071192 -79466067 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 1142 520 237 172 56 chr5 73076749 73076999 -79460260 + MER31B LTR ERV1 115 393 -73 1 1142 1884 137 286 5 chr5 73077016 73077436 -79459823 + MT2B LTR ERVL 2 545 -56 1 1142 1884 137 286 5 chr5 73077618 73077630 -79459629 + MT2B LTR ERVL 546 556 -45 1 1142 317 118 0 0 chr5 73077875 73077926 -79459333 + MT2B LTR ERVL 534 584 0 1 1142 234 270 0 0 chr5 73077930 73077993 -79459266 + MER31B LTR ERV1 395 457 -9 1 1142 1995 153 56 8 chr5 73079929 73080232 -79457027 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 73 1 1142 3425 33 2 5 chr5 73080232 73080629 -79456630 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1142 1995 153 56 8 chr5 73080629 73080700 -79456559 - ORR1B1 LTR MaLR -322 72 2 1 1142 2081 111 69 20 chr5 73082058 73082096 -79455163 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 332 1 1142 3152 108 0 5 chr5 73082096 73082532 -79454727 + RLTR10C LTR ERVK 1 434 -2 1 1142 2081 111 69 20 chr5 73082532 73082841 -79454418 - ORR1B2 LTR MaLR -36 331 1 1 1142 2869 166 57 27 chr5 73096628 73097186 -79440073 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 1 1142 458 185 58 69 chr5 73098021 73098195 -79439064 + RMER21B LTR ERV1 323 494 -348 1 1142 239 119 0 45 chr5 73100457 73100501 -79436758 - RMER21A LTR ERV1 -65 882 841 1 1142 949 221 142 28 chr5 73109758 73110047 -79427212 + MTD LTR MaLR 84 405 -14 1 1142 1839 127 45 14 chr5 73110137 73110507 -79426752 - MTC LTR MaLR -8 399 1 1 1142 737 227 29 58 chr5 73114383 73114589 -79422670 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 167 2 1142 500 239 0 0 chr5 73116487 73116596 -79420663 + MTE2a LTR MaLR 213 321 -58 2 1142 671 219 62 0 chr5 73118559 73118719 -79418540 - MTE2a LTR MaLR 0 379 210 2 1142 739 244 85 33 chr5 73118717 73118981 -79418278 + MT2B LTR ERVL 195 596 -5 2 1142 450 272 53 76 chr5 73119010 73119181 -79418078 - MTE2a LTR MaLR -212 167 1 2 1142 662 295 19 83 chr5 73135477 73135885 -79401374 + MTEb LTR MaLR 1 368 -11 2 1142 653 292 123 53 chr5 73136584 73136782 -79400477 - MLT2D LTR ERVL -50 364 140 2 1142 2678 64 0 12 chr5 73136782 73137113 -79400146 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1142 653 292 123 53 chr5 73137113 73137254 -79400005 - MLT2D LTR ERVL -275 139 1 2 1143 2845 122 33 14 chr5 73141135 73141644 -79395615 - RLTR28 LTR ERVL -5 519 1 2 1143 282 331 140 6 chr5 73141738 73141902 -79395357 - MLT1F2 LTR MaLR -374 186 1 2 1143 3121 166 49 18 chr5 73145654 73146269 -79390990 + RLTR26 LTR ERVK 1 634 -8 2 1143 1314 108 5 27 chr5 73160590 73160809 -79376450 + RLTR15 LTR ERVK 117 330 -29 2 1143 532 289 10 48 chr5 73164119 73164326 -79372933 + MLT1B LTR MaLR 60 258 -132 2 1143 2537 164 81 2 chr5 73164372 73164818 -79372441 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 1 2 1143 226 310 18 9 chr5 73165487 73165601 -79371658 - MamGypLTR1a LTR Gypsy -2 782 668 2 1143 2071 189 71 32 chr5 73166116 73166581 -79370678 + RMER15 LTR ERVL 1 483 -92 2 1143 2951 118 42 51 chr5 73167517 73168044 -79369215 + RLTR28 LTR ERVL 3 524 0 2 1143 1743 222 39 8 chr5 73174299 73174767 -79362492 + RLTR16 LTR ERVK 2 483 -22 2 1143 2456 166 47 11 chr5 73178816 73179266 -79357993 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 2 1143 11782 72 13 70 chr5 73180957 73182915 -79354344 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1845 -3 3 1143 401 200 9 95 chr5 73186768 73186781 -79350478 + MT2B LTR ERVL 152 154 -447 3 1143 471 235 99 13 chr5 73188531 73188682 -79348577 + MTEa LTR MaLR 209 372 -7 3 1143 1405 189 68 0 chr5 73190452 73190733 -79346526 + ORR1D1 LTR MaLR 1 300 -74 3 1143 3000 91 31 14 chr5 73193282 73193726 -79343533 + RLTR11B LTR ERVK 1 452 -1 3 1143 262 273 106 71 chr5 73195325 73195550 -79341709 + MTEa LTR MaLR 123 377 -2 3 1143 343 326 117 96 chr5 73196857 73197284 -79339975 + MLT1J LTR MaLR 6 441 -71 3 1143 579 312 85 13 chr5 73200451 73200675 -79336584 + MER68 LTR ERVL 324 563 0 3 1143 522 132 16 40 chr5 73208340 73208466 -79328793 + RMER21B LTR ERV1 300 422 -420 3 1143 253 221 175 58 chr5 73208732 73208852 -79328407 + RMER21B LTR ERV1 418 551 -291 3 1143 2871 131 122 24 chr5 73218634 73219167 -79318092 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 3 1143 426 238 8 54 chr5 73222817 73222946 -79314313 - MER57-int LTR ERV1 -270 7267 7145 3 1143 244 296 49 56 chr5 73237358 73237501 -79299758 - MLT1H2 LTR MaLR -304 185 44 4 1143 554 236 51 16 chr5 73240469 73240669 -79296590 - ORR1C2 LTR MaLR 0 394 175 4 1143 371 264 109 12 chr5 73240750 73240915 -79296344 - ORR1C2 LTR MaLR -193 181 1 4 1143 1500 158 19 201 chr5 73241653 73242121 -79295138 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 4 1143 285 321 44 58 chr5 73242937 73243142 -79294117 + MLT1H LTR MaLR 346 547 -2 4 1143 942 227 147 32 chr5 73243575 73243889 -79293370 + MTE2b LTR MaLR 23 372 -7 4 1143 305 320 96 0 chr5 73247838 73247963 -79289296 - MLT1K LTR MaLR -354 241 105 4 1143 2103 134 56 26 chr5 73250181 73250572 -79286687 - MTC LTR MaLR -18 403 1 4 1143 480 288 68 38 chr5 73250797 73251032 -79286227 + ORR1E LTR MaLR 12 253 -106 4 1143 328 204 57 34 chr5 73251171 73251284 -79285975 + ORR1E LTR MaLR 227 359 -20 4 1143 502 189 15 62 chr5 73264915 73265045 -79272214 + RMER20B LTR ERVK 1 124 -503 4 1143 725 185 85 12 chr5 73268715 73268879 -79268380 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 351 4 1144 442 253 36 61 chr5 73269359 73269752 -79267507 - RMER17C LTR ERVK -70 340 1 4 1144 1693 165 38 6 chr5 73269754 73270096 -79267163 - RMER5 LTR ERV1 -181 353 1 4 1144 1335 264 30 75 chr5 73279265 73279855 -79257404 - RLTR20A2 LTR ERVK -1 567 8 5 1144 1419 176 68 89 chr5 73281930 73282059 -79255200 + RLTR30 LTR ERV1 11 144 -235 5 1144 1419 176 68 89 chr5 73282263 73282502 -79254757 + RLTR30 LTR ERV1 145 371 -8 5 1144 1915 98 3 0 chr5 73285944 73286229 -79251030 + ORR1A2 LTR MaLR 1 286 -41 5 1144 330 89 0 0 chr5 73286371 73286416 -79250843 + ORR1A2 LTR MaLR 274 318 -8 5 1144 265 378 20 94 chr5 73287780 73287929 -79249330 + MLT1I LTR MaLR 98 235 -176 5 1144 1831 181 37 13 chr5 73290943 73291323 -79245936 - MTD LTR MaLR -30 389 1 5 1144 282 296 25 34 chr5 73291910 73292029 -79245230 - ORR1E LTR MaLR -23 356 239 5 1144 666 230 31 6 chr5 73292065 73292227 -79245032 - ORR1E LTR MaLR -192 167 2 5 1144 891 253 166 11 chr5 73295495 73295779 -79241480 + MTE2b LTR MaLR 1 328 -51 5 1144 331 263 119 0 chr5 73317624 73317742 -79219517 + ORR1E LTR MaLR 9 140 -219 5 1144 1688 114 46 123 chr5 73330677 73330922 -79206337 + ORR1A3 LTR MaLR 1 233 -93 6 1144 1688 114 46 123 chr5 73331083 73331185 -79206074 + ORR1A3 LTR MaLR 234 321 -5 6 1144 374 279 67 24 chr5 73333559 73333724 -79203535 - MTD LTR MaLR -3 416 245 6 1144 805 176 8 0 chr5 73334015 73334140 -79203119 - ETnERV2-int LTR ERVK -211 7195 7070 6 1144 597 174 248 0 chr5 73334144 73334293 -79202966 - MTD LTR MaLR -67 352 167 6 1144 2860 89 32 15 chr5 73334518 73334918 -79202341 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1144 3278 33 0 22 chr5 73336294 73336696 -79200563 - MTA_Mm LTR MaLR -3 393 1 6 1144 1407 180 115 67 chr5 73337523 73337880 -79199379 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1144 309 290 28 65 chr5 73364373 73364480 -79172779 - MTEa LTR MaLR -226 153 51 6 1144 305 365 125 26 chr5 73376827 73377139 -79160120 + MLT1I LTR MaLR 63 405 -6 7 1144 423 283 92 82 chr5 73377510 73377791 -79159468 + MLT2B4 LTR ERVL 36 319 -237 7 1144 1046 228 79 11 chr5 73382972 73383317 -79153942 - MTC LTR MaLR -8 413 18 7 1144 229 277 60 12 chr5 73388215 73388280 -79148979 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 340 7 1144 1553 165 79 6 chr5 73388280 73388597 -79148662 + RMER4B LTR ERVK 1 340 -245 7 1144 731 158 4 19 chr5 73388740 73388971 -79148288 + RMER4B LTR ERVK 318 585 0 7 1144 556 260 34 40 chr5 73389732 73389908 -79147351 - MTEb LTR MaLR 0 379 205 7 1144 2707 134 29 29 chr5 73390160 73390581 -79146678 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1144 1572 103 107 25 chr5 73390638 73390996 -79146263 - ORR1A4 LTR MaLR -8 386 1 7 1144 232 184 0 20 chr5 73391020 73391070 -79146189 - MTEb LTR MaLR -270 109 61 7 1144 277 245 0 0 chr5 73391254 73391307 -79145952 - MTEb LTR MaLR -309 70 18 7 1145 233 340 108 99 chr5 73421314 73421788 -79115471 - MLT1H2 LTR MaLR -6 483 6 7 1145 780 257 90 106 chr5 73435337 73435715 -79101544 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 7 1145 919 185 104 28 chr5 73446221 73446432 -79090827 + MTD LTR MaLR 193 419 0 8 1145 1649 172 88 88 chr5 73449945 73450366 -79086893 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1145 1628 187 14 89 chr5 73468542 73468889 -79068370 + ORR1B1 LTR MaLR 41 361 -33 8 1145 3570 20 2 0 chr5 73471542 73471937 -79065322 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1145 516 279 53 70 chr5 73478915 73479216 -79058043 + RLTR15 LTR ERVK 1 296 -63 8 1145 225 143 0 0 chr5 73485831 73485866 -79051393 + MTE-int LTR MaLR 742 776 -804 8 1145 948 311 72 20 chr5 73496616 73496964 -79040295 + MTE2b LTR MaLR 1 366 -13 8 1145 1220 164 187 9 chr5 73500293 73500608 -79036651 + ORR1C2 LTR MaLR 1 371 -13 1 1145 1440 228 87 47 chr5 73502753 73503154 -79034105 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 2 1145 524 350 107 57 chr5 73517170 73517664 -79019595 + MER34A LTR ERV1 50 568 -3 2 1145 301 239 32 21 chr5 73525520 73525614 -79011645 + MTEb LTR MaLR 278 372 -7 3 1145 3588 171 44 53 chr5 73529175 73529985 -79007274 - RLTR40 LTR ERVK -10 807 5 4 1145 614 290 5 21 chr5 73530935 73531122 -79006137 + MLT2B3 LTR ERVL 1 184 -370 4 1146 1734 123 57 98 chr5 73533049 73533436 -79003823 + ORR1C2 LTR MaLR 14 384 0 5 1146 3420 30 2 5 chr5 73534822 73535219 -79002040 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1146 739 202 9 45 chr5 73542410 73542633 -78994626 + MTD LTR MaLR 203 417 -2 7 1146 912 318 96 61 chr5 73548108 73548747 -78988512 + MTE-int LTR MaLR 780 1440 -140 8 1146 363 173 24 120 chr5 73549189 73549314 -78987945 + MT2B LTR ERVL 152 264 -337 8 1146 4605 121 22 31 chr5 73553657 73554419 -78982840 - RMER6A LTR ERVK 0 756 2 9 1146 246 221 114 25 chr5 73563959 73564038 -78973221 + MLT1A0 LTR MaLR 1 86 -279 1 1146 822 308 62 9 chr5 73564374 73564695 -78972564 + MER68 LTR ERVL 1 338 -225 1 1146 1953 127 93 60 chr5 73566517 73566870 -78970389 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 1 1146 371 260 63 0 chr5 73570552 73570679 -78966580 + ORR1D2 LTR MaLR 1 135 -235 1 1146 393 172 118 0 chr5 73570693 73570786 -78966473 + ORR1D2 LTR MaLR 267 370 0 1 1146 3593 154 38 42 chr5 73575492 73575822 -78961437 + RMER6D LTR ERVK 1 332 -388 1 1146 3593 154 38 42 chr5 73576000 73576385 -78960874 + RMER6D LTR ERVK 333 713 -7 1 1146 291 222 0 65 chr5 73589000 73589077 -78948182 + MT2B LTR ERVL 193 264 -337 1 1146 3155 34 45 0 chr5 73598782 73599161 -78938098 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1146 235 258 93 50 chr5 73604700 73604839 -78932420 + MTE2b LTR MaLR 81 225 -196 1 1146 520 224 23 46 chr5 73604928 73605059 -78932200 + MTE2b LTR MaLR 222 349 -30 1 1146 490 261 77 56 chr5 73605186 73605381 -78931878 - MTEb LTR MaLR -173 206 8 1 1146 238 333 23 11 chr5 73607084 73607172 -78930087 + MLT1F2 LTR MaLR 43 131 -429 2 1146 225 331 11 147 chr5 73607730 73607907 -78929352 + MLT1F2 LTR MaLR 291 443 -117 2 1146 1480 160 89 33 chr5 73610351 73610687 -78926572 + ORR1B2 LTR MaLR 5 359 -8 2 1146 344 222 41 82 chr5 73611657 73611755 -78925504 + MTEb LTR MaLR 286 379 0 2 1146 372 246 174 15 chr5 73615798 73615930 -78921329 + MLT1A0 LTR MaLR 212 364 -1 2 1146 335 261 91 0 chr5 73624320 73624408 -78912851 + MTE2b LTR MaLR 5 100 -279 2 1146 738 251 131 145 chr5 73624610 73624730 -78912529 + MLT2D LTR ERVL 1 143 -271 2 1146 738 251 131 145 chr5 73624846 73625101 -78912158 + MLT2D LTR ERVL 144 377 -37 2 1146 738 251 131 145 chr5 73625146 73625189 -78912070 + MLT2D LTR ERVL 378 414 0 2 1146 419 304 157 59 chr5 73628014 73628502 -78908757 + MLT1H1 LTR MaLR 4 577 -2 2 1146 226 211 102 119 chr5 73629372 73629412 -78907847 - MT2B LTR ERVL -443 158 121 2 1146 331 384 33 28 chr5 73629988 73630164 -78907095 + MLT1J LTR MaLR 26 202 -310 2 1146 672 178 158 8 chr5 73630164 73630362 -78906897 - MTD LTR MaLR 0 419 181 2 1146 878 205 61 56 chr5 73630657 73630853 -78906406 - MTD LTR MaLR -213 206 10 2 1146 1667 148 99 62 chr5 73634393 73634747 -78902512 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1146 653 275 76 42 chr5 73640102 73640364 -78896895 - MLT1D LTR MaLR -3 502 232 2 1146 1913 167 49 54 chr5 73656282 73656650 -78880609 + ORR1C1 LTR MaLR 11 376 -2 3 1146 2289 240 145 56 chr5 73657470 73658270 -78878989 + RMER19B LTR ERVK 1 871 -31 3 1147 3299 58 0 2 chr5 73667503 73667904 -78869355 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1147 2277 141 41 134 chr5 73668334 73668922 -78868337 - RMER15 LTR ERVL -11 564 32 3 1147 1313 232 83 32 chr5 73672414 73672713 -78864546 + ORR1D2 LTR MaLR 12 333 -37 3 1147 1475 210 228 5 chr5 73672713 73673148 -78864111 - MT2A LTR ERVL 0 533 2 3 1147 1313 232 83 32 chr5 73673148 73673186 -78864073 + ORR1D2 LTR MaLR 334 366 -4 3 1147 1778 143 125 3 chr5 73673604 73673825 -78863434 + ORR1B1 LTR MaLR 1 245 -149 3 1147 1778 143 125 3 chr5 73673856 73673978 -78863281 + ORR1B1 LTR MaLR 246 386 -8 3 1147 364 302 79 104 chr5 73674853 73675093 -78862166 + MLT1F LTR MaLR 32 265 -202 3 1147 465 268 43 13 chr5 73676142 73676337 -78860922 + MLT1F LTR MaLR 307 483 -65 3 1147 638 146 55 0 chr5 73676337 73676447 -78860812 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 257 3 1147 504 135 0 22 chr5 73676491 73676582 -78860677 - ORR1D1 LTR MaLR -216 158 70 3 1147 2009 111 9 0 chr5 73679608 73679923 -78857336 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 3 1147 394 117 4 0 chr5 73680726 73680798 -78856461 + RMER17C LTR ERVK 4 56 -354 3 1147 580 246 28 0 chr5 73690975 73691117 -78846142 - MER68 LTR ERVL -272 291 146 4 1147 1553 151 108 10 chr5 73692868 73693175 -78844084 - ORR1B1 LTR MaLR -57 337 1 4 1147 237 231 32 129 chr5 73696903 73697027 -78840232 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 4 1147 343 276 34 95 chr5 73702014 73702162 -78835097 - MT2B LTR ERVL -344 257 119 4 1147 410 331 135 16 chr5 73705669 73706043 -78831216 - MLT1F-int LTR MaLR -184 1305 776 4 1147 3086 42 44 0 chr5 73706198 73706581 -78830678 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1147 2405 154 125 125 chr5 73711386 73711565 -78825694 - RMER6C LTR ERVK 0 690 520 4 1147 2405 154 125 125 chr5 73711589 73711641 -78825618 - RMER6C LTR ERVK -171 519 511 4 1147 2405 154 125 125 chr5 73711789 73712042 -78825217 - RMER6C LTR ERVK -180 510 212 4 1147 2405 154 125 125 chr5 73712217 73712420 -78824839 - RMER6C LTR ERVK -479 211 1 4 1147 1984 187 43 160 chr5 73712790 73713370 -78823889 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 1 4 1147 627 342 127 11 chr5 73719563 73719918 -78817341 + MLT1D LTR MaLR 7 402 -103 4 1147 849 240 124 0 chr5 73719915 73720173 -78817086 + ORR1E LTR MaLR 59 365 -14 4 1147 1299 156 261 79 chr5 73724736 73724818 -78812441 + MTC LTR MaLR 1 80 -341 4 1147 1299 156 261 79 chr5 73725018 73725290 -78811969 + MTC LTR MaLR 81 420 -1 4 1147 229 265 20 93 chr5 73730340 73730490 -78806769 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1307 1445 -403 4 1147 830 197 48 21 chr5 73730629 73730816 -78806443 + RMER5 LTR ERV1 1 192 -342 4 1147 404 216 70 25 chr5 73733132 73733331 -78803928 - RMER17D LTR ERVK -374 515 308 4 1147 2048 107 12 51 chr5 73739612 73739947 -78797312 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1147 1558 144 197 10 chr5 73742391 73742700 -78794559 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1147 894 291 37 108 chr5 73742920 73743355 -78793904 - RLTR18 LTR ERVK -212 404 1 5 1147 389 324 92 45 chr5 73744351 73744686 -78792573 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 5 5 1147 434 266 47 8 chr5 73753338 73753467 -78783792 + RMER20A LTR ERVK 238 371 -145 5 1147 318 283 10 20 chr5 73755007 73755108 -78782151 + MLT1A1 LTR MaLR 302 401 -7 5 1147 227 286 0 87 chr5 73756031 73756100 -78781159 - LTR33 LTR ERVL -433 82 20 5 1147 497 217 24 55 chr5 73757455 73757582 -78779677 + MTD LTR MaLR 1 123 -296 5 1147 1209 226 20 8 chr5 73757771 73758016 -78779243 + MTD LTR MaLR 107 354 -65 5 1147 304 206 54 89 chr5 73758426 73758538 -78778721 + ORR1D1 LTR MaLR 266 373 -1 5 1147 1531 199 10 7 chr5 73758821 73759115 -78778144 - RLTR14 LTR ERV1 -85 297 3 5 1147 1653 165 106 56 chr5 73759255 73759614 -78777645 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 5 1147 492 379 57 35 chr5 73759743 73760060 -78777199 - ORR1E LTR MaLR -4 355 32 5 1147 1626 204 155 40 chr5 73760876 73761380 -78775879 - RMER4B LTR ERVK -6 579 18 5 1147 967 190 62 214 chr5 73761864 73762313 -78774946 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 3 5 1147 1448 234 69 3 chr5 73762564 73762911 -78774348 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 5 1147 275 229 107 12 chr5 73765274 73765358 -78771901 + RMER5 LTR ERV1 45 136 -398 5 1147 3617 13 2 0 chr5 73777253 73777648 -78759611 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1147 1016 158 203 65 chr5 73778493 73778730 -78758529 + ORR1C2 LTR MaLR 38 317 -67 5 1147 1016 167 131 41 chr5 73778784 73778837 -78758422 + ORR1C2 LTR MaLR 318 378 -6 5 1147 995 234 161 25 chr5 73786431 73786711 -78750548 - MTEa LTR MaLR -55 324 7 6 1147 2311 123 12 0 chr5 73786814 73787148 -78750111 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 6 1147 3301 46 5 0 chr5 73787422 73787816 -78749443 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1147 225 322 45 11 chr5 73789428 73789516 -78747743 - ORR1E LTR MaLR -1 358 268 6 1147 1297 228 26 80 chr5 73792087 73792231 -78745028 + MTEb LTR MaLR 13 149 -230 6 1147 1297 228 26 80 chr5 73792411 73792618 -78744641 + MTEb LTR MaLR 150 345 -34 6 1148 2029 88 8 131 chr5 73794084 73794450 -78742809 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 6 1148 1060 201 174 25 chr5 73795974 73796296 -78740963 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 1148 452 281 9 17 chr5 73801526 73801642 -78735617 - MTE2b LTR MaLR -1 378 264 6 1148 259 308 39 0 chr5 73801659 73801737 -78735522 - MTE2b LTR MaLR -298 81 1 6 1148 476 212 27 114 chr5 73808083 73808122 -78729137 + MT2B LTR ERVL 129 154 -447 6 1148 426 235 93 24 chr5 73814681 73814886 -78722373 - RMER17C LTR ERVK -158 252 34 6 1148 2648 172 87 12 chr5 73815639 73816134 -78721125 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 33 6 1148 298 333 44 104 chr5 73818636 73818954 -78718305 - RMER12 LTR ERVK -263 1059 761 6 1148 246 303 66 0 chr5 73819104 73819180 -78718079 - MTE2a LTR MaLR -10 369 289 6 1148 881 307 167 19 chr5 73823941 73824291 -78712968 + LTR33A LTR ERVL 30 439 -81 7 1148 881 307 167 19 chr5 73824430 73824498 -78712761 + LTR33A LTR ERVL 440 509 -11 7 1148 338 250 11 54 chr5 73826229 73826322 -78710937 - MLT1G1 LTR MaLR -48 531 443 7 1148 408 322 168 27 chr5 73826405 73826667 -78710592 - MLT1G1 LTR MaLR -280 299 1 7 1148 249 315 32 21 chr5 73827851 73827945 -78709314 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 295 7 1148 248 202 5 53 chr5 73829224 73829283 -78707976 + LTR33A LTR ERVL 156 216 -315 7 1148 245 305 132 72 chr5 73829454 73829606 -78707653 - RMER21A LTR ERV1 -86 861 701 7 1148 233 313 0 57 chr5 73831053 73831141 -78706118 - MLT1A LTR MaLR -8 366 284 7 1148 1192 125 69 10 chr5 73833949 73834151 -78703108 - MTC LTR MaLR -1 420 207 7 1148 1216 189 0 0 chr5 73835343 73835549 -78701710 - MTC LTR MaLR -213 208 3 7 1148 3023 23 42 3 chr5 73850366 73850719 -78686540 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 1148 56104 25 13 3 chr5 73850719 73857124 -78680135 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 67 7 1148 226 216 0 0 chr5 73857126 73857163 -78680096 - RLTR27 LTR ERVK -37 272 236 7 1148 557 84 263 0 chr5 73857163 73857258 -78680001 - IAPEz-int LTR ERVK -6354 127 8 7 1148 3023 23 42 3 chr5 73857258 73857611 -78679648 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 1148 485 285 47 98 chr5 73860870 73860950 -78676309 + MLT1J LTR MaLR 6 83 -429 7 1148 1506 194 166 95 chr5 73860950 73861445 -78675814 + MT2A LTR ERVL 3 532 -1 7 1148 485 285 47 98 chr5 73861445 73861578 -78675681 + MLT1J LTR MaLR 84 208 -304 7 1148 1967 172 87 8 chr5 73862969 73863327 -78673932 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 7 1148 438 288 120 34 chr5 73863343 73863594 -78673665 - MLT1B LTR MaLR -19 371 47 7 1148 933 276 33 8 chr5 73863596 73863837 -78673422 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 119 7 1148 321 382 75 24 chr5 73869274 73869486 -78667773 + MLT1A1 LTR MaLR 4 226 -182 7 1148 2896 114 18 9 chr5 73869514 73869948 -78667311 + MT2B LTR ERVL 163 600 -1 7 1148 612 218 58 117 chr5 73870529 73870573 -78666686 - MTE2b LTR MaLR -1 378 339 7 1148 642 250 67 11 chr5 73870762 73870940 -78666319 - MTE2b LTR MaLR -23 356 169 7 1148 677 247 12 47 chr5 73871179 73871349 -78665910 - MTE2b LTR MaLR -200 179 16 7 1148 3675 72 16 0 chr5 73873716 73874200 -78663059 - RLTR13D4 LTR ERVK -541 492 1 7 1148 764 261 185 30 chr5 73877441 73877804 -78659455 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1148 3499 117 73 35 chr5 73878955 73879533 -78657726 + MT2B LTR ERVL 2 601 0 8 1148 1295 180 182 111 chr5 73885431 73885533 -78651726 - MT2A LTR ERVL -10 523 440 8 1148 1295 180 182 111 chr5 73885589 73885974 -78651285 - MT2A LTR ERVL -94 439 1 8 1148 671 235 28 66 chr5 73886518 73886700 -78650559 - MTEb LTR MaLR 0 379 205 8 1148 417 284 108 95 chr5 73886965 73887206 -78650053 - MTEb LTR MaLR -135 244 1 8 1148 396 292 146 0 chr5 73887505 73887635 -78649624 - ORR1E LTR MaLR -210 149 1 8 1148 241 313 128 71 chr5 73888899 73889040 -78648219 + MLT1N2 LTR MaLR 407 555 -7 8 1148 1469 180 54 51 chr5 73889215 73889624 -78647635 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 8 1148 1296 224 101 72 chr5 73902794 73903222 -78634037 - RMER10A LTR ERVL 0 442 3 8 1148 454 280 262 11 chr5 73903492 73903779 -78633480 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 2 8 1148 228 288 34 67 chr5 73905060 73905179 -78632080 + RMER12 LTR ERVK 731 845 -477 8 1148 2215 139 94 6 chr5 73908646 73909008 -78628251 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 1148 317 259 449 8 chr5 73917134 73917312 -78619947 - MTC LTR MaLR -16 391 134 8 1148 601 218 73 22 chr5 73918655 73918731 -78618528 - MTC LTR MaLR -278 143 58 8 1148 601 218 73 22 chr5 73918959 73919018 -78618241 - MTC LTR MaLR -364 57 1 8 1148 262 280 26 132 chr5 73919132 73919284 -78617975 - RLTR25B LTR ERVK -449 579 444 8 1148 332 230 21 75 chr5 73919211 73919305 -78617954 - MT2B LTR ERVL -338 263 175 8 1149 263 228 59 98 chr5 73928074 73928088 -78609171 - ORR1E LTR MaLR -36 343 337 8 1149 1265 205 97 9 chr5 73928088 73928428 -78608831 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 8 1149 263 228 59 98 chr5 73928428 73928515 -78608744 - ORR1E LTR MaLR -43 336 246 8 1149 303 351 27 0 chr5 73928517 73928628 -78608631 - ORR1E LTR MaLR -230 129 16 8 1149 3087 281 93 84 chr5 73928601 73929275 -78607984 - ORR1E-int LTR MaLR -32 1760 901 8 1149 3087 283 111 80 chr5 73929421 73930205 -78607054 - ORR1E-int LTR MaLR -680 900 35 8 1149 638 260 23 23 chr5 73930207 73930380 -78606879 - MTEa LTR MaLR -205 174 2 8 1149 580 333 80 18 chr5 73930719 73930945 -78606314 - MLT1A0 LTR MaLR -56 309 70 8 1149 407 281 39 10 chr5 73934080 73934184 -78603075 - MER88 LTR ERVL -216 248 142 8 1149 5946 162 76 23 chr5 73940781 73941960 -78595299 - RMER12 LTR ERVK -109 1739 1 9 1149 1796 144 52 10 chr5 73952864 73953172 -78584087 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 9 1149 1309 251 64 10 chr5 73955716 73956014 -78581245 - ORR1D2 LTR MaLR -56 314 1 9 1149 434 284 116 65 chr5 73956416 73956631 -78580628 + MLT1A0 LTR MaLR 119 344 -21 9 1149 603 253 20 0 chr5 73956678 73956824 -78580435 - ERVL-B4-int LTR ERVL -358 5356 5208 9 1149 384 239 84 63 chr5 73957196 73957339 -78579920 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4417 4562 -1152 9 1149 3521 233 93 27 chr5 73957392 73958466 -78578793 - ERVL-B4-int LTR ERVL -735 4979 3809 9 1149 1506 288 24 18 chr5 73958485 73958937 -78578322 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1962 3752 3298 9 1149 660 199 52 46 chr5 73958943 73959096 -78578163 - MT2A LTR ERVL -379 154 1 9 1149 654 293 72 45 chr5 73959120 73959452 -78577807 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2595 3119 2779 9 1149 1030 279 91 3 chr5 73959894 73960214 -78577045 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2978 2736 2389 9 1149 910 263 113 15 chr5 73960210 73960538 -78576721 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3673 2041 1682 9 1149 232 190 12 37 chr5 73960539 73960621 -78576638 - ORR1D1 LTR MaLR -249 118 39 9 1149 593 165 22 43 chr5 73960603 73960742 -78576517 - ORR1D1 LTR MaLR -236 138 3 9 1149 1682 136 72 19 chr5 73962945 73963303 -78573956 - ORR1A4 LTR MaLR 0 394 1 9 1149 2356 85 25 0 chr5 73964528 73964846 -78572413 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 9 1149 274 303 208 18 chr5 73965049 73965217 -78572042 - LTR40c LTR ERVL -226 239 40 9 1149 259 145 41 91 chr5 73968370 73968491 -78568768 - RMER17D LTR ERVK -382 507 393 9 1149 2364 164 27 7 chr5 73970151 73970471 -78566788 + MTC LTR MaLR 1 330 -91 9 1149 1729 126 8 151 chr5 73970471 73970855 -78566404 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 1149 2364 164 27 7 chr5 73970855 73970939 -78566320 + MTC LTR MaLR 331 413 -8 9 1149 260 342 80 18 chr5 73971791 73971904 -78565355 - LTR81C LTR ERV1? 0 1153 1034 9 1149 3418 40 2 0 chr5 73972727 73973122 -78564137 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1149 366 89 18 18 chr5 73973839 73973896 -78563363 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 390 9 1149 1596 174 40 10 chr5 73973917 73974214 -78563045 + RLTR41 LTR ERV1 141 446 0 9 1149 4169 52 6 10 chr5 73974931 73975436 -78561823 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 9 1149 3092 57 0 3 chr5 73975451 73975839 -78561420 - MTB LTR MaLR 0 400 14 9 1149 3622 201 51 43 chr5 73977896 73978707 -78558552 - RLTR40 LTR ERVK 0 817 1 9 1149 1504 209 34 91 chr5 73985443 73985885 -78551374 - MTD LTR MaLR -2 417 1 9 1149 519 283 38 25 chr5 73986120 73986356 -78550903 + RLTR15 LTR ERVK 102 340 -19 9 1149 972 310 184 10 chr5 73986377 73986803 -78550456 - MTE-int LTR MaLR -422 1158 750 9 1149 2186 168 26 24 chr5 73986818 73987238 -78550021 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1149 638 290 62 31 chr5 73987252 73987508 -78549751 - RMER5 LTR ERV1 -238 296 33 9 1149 306 325 8 49 chr5 73987787 73987910 -78549349 - MTEb LTR MaLR 0 379 262 9 1149 262 227 39 146 chr5 73988133 73988236 -78549023 - MTEb LTR MaLR -287 92 1 9 1149 1281 246 164 32 chr5 73988401 73988841 -78548418 + RMER5 LTR ERV1 37 534 0 9 1149 735 211 60 26 chr5 73988932 73989083 -78548176 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 423 9 1149 722 221 90 33 chr5 73989074 73989353 -78547906 - RLTR20A2 LTR ERVK -285 283 1 9 1149 398 344 100 32 chr5 73989433 73989691 -78547568 - MLT1H1 LTR MaLR -316 275 9 9 1149 1215 167 53 158 chr5 73989801 73990256 -78547003 - RMER17C LTR ERVK 0 410 4 9 1149 885 272 52 12 chr5 73994171 73994420 -78542839 + MLT2B2 LTR ERVL 5 263 -252 9 1149 717 357 17 24 chr5 73995058 73995356 -78541903 + MLT2B2 LTR ERVL 225 520 0 9 1149 2767 141 223 18 chr5 73996225 73996732 -78540527 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 9 1149 7918 69 11 16 chr5 73996747 73997775 -78539484 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 9 1149 1526 147 81 0 chr5 74001344 74001603 -78535656 + ORR1B2 LTR MaLR 1 280 -87 5 1149 532 165 0 0 chr5 74001784 74001869 -78535390 + ORR1B2 LTR MaLR 294 378 0 5 1149 469 342 96 58 chr5 74004789 74005323 -78531936 + MLT1F2 LTR MaLR 3 556 -4 1 1149 879 246 79 138 chr5 74007862 74008349 -78528910 - RMER4A LTR ERVK -4 581 17 1 1149 2458 148 10 82 chr5 74008832 74009334 -78527925 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 1 1149 229 249 20 36 chr5 74009797 74009993 -78527266 - RMER17C LTR ERVK -138 272 80 2 1149 1832 179 40 40 chr5 74010965 74011343 -78525916 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1149 5297 208 51 53 chr5 74011343 74012714 -78524545 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1370 3 2 1149 880 268 133 36 chr5 74013707 74014107 -78523152 + MTD LTR MaLR 1 388 -31 2 1149 2215 164 127 29 chr5 74014887 74015366 -78521893 + RLTR11A LTR ERVK 1 526 -2 3 1149 258 291 148 113 chr5 74017519 74017856 -78519403 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -10 3 1149 712 290 106 24 chr5 74018845 74019174 -78518085 - ORR1E LTR MaLR -1 358 3 3 1149 355 329 199 35 chr5 74048256 74048628 -78488631 - MLT1J2 LTR MaLR -13 435 3 7 1149 507 183 18 88 chr5 74050942 74051056 -78486203 - MTEa LTR MaLR -2 377 272 8 1149 280 145 0 114 chr5 74051067 74051137 -78486122 - MTEa LTR MaLR -253 126 65 8 1149 241 234 0 94 chr5 74051068 74051153 -78486106 - MT2A LTR ERVL -408 125 49 8 1149 1365 174 113 18 chr5 74052404 74052679 -78484580 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 78 8 1149 357 236 32 11 chr5 74053585 74053679 -78483580 - MTEa LTR MaLR 0 379 284 9 1149 778 312 50 64 chr5 74054390 74054766 -78482493 - MTEa LTR MaLR -6 373 3 9 143 3259 282 114 77 chr5 74054965 74056337 -78480922 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 156 9 1150 868 268 43 94 chr5 74056380 74056419 -78480840 - MTEa LTR MaLR -4 375 341 9 1150 1563 186 183 3 chr5 74056419 74056774 -78480485 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1150 868 268 43 94 chr5 74056774 74057129 -78480130 - MTEa LTR MaLR -39 340 1 9 1150 2054 153 47 53 chr5 74057216 74057717 -78479542 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -16 545 1 9 1150 888 212 11 52 chr5 74083427 74083698 -78453561 + ORR1D1 LTR MaLR 1 251 -127 1 1150 277 260 46 83 chr5 74087031 74087230 -78450029 - MTEa LTR MaLR -2 377 185 1 1150 307 329 115 61 chr5 74088424 74088719 -78448540 + MLT1J LTR MaLR 116 426 -86 1 1150 282 250 12 12 chr5 74107408 74107489 -78429770 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 307 1 1150 274 162 0 93 chr5 74109975 74110050 -78427209 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 339 1 1150 478 313 116 57 chr5 74111747 74112119 -78425140 + LTR16C LTR ERVL 94 487 -2 1 1150 392 229 0 103 chr5 74112276 74112383 -78424876 + MT2B LTR ERVL 157 252 -349 1 1150 523 200 30 8 chr5 74124779 74124910 -78412349 - ORR1D2 LTR MaLR -236 134 1 2 1150 1316 226 60 75 chr5 74130717 74131185 -78406074 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 2 1150 400 261 44 32 chr5 74133579 74133737 -78403522 - RMER15 LTR ERVL -13 562 403 2 1150 317 333 74 56 chr5 74134335 74134551 -78402708 + MT2A LTR ERVL 188 407 -126 2 1150 235 200 0 0 chr5 74134592 74134642 -78402617 + MT2A LTR ERVL 484 533 0 2 1150 269 345 156 22 chr5 74139650 74139881 -78397378 + MER74A LTR ERVL 243 504 -54 2 1150 239 310 38 161 chr5 74142367 74142659 -78394600 + MLT1K LTR MaLR 331 586 -9 2 1150 2211 164 2 5 chr5 74144529 74144922 -78392337 + MTC LTR MaLR 5 396 -25 2 1150 460 299 31 95 chr5 74152475 74152504 -78384755 + ORR1E LTR MaLR 29 57 -302 2 1150 460 299 31 95 chr5 74152574 74152766 -78384493 + ORR1E LTR MaLR 58 236 -123 2 1150 1836 112 9 78 chr5 74163129 74163477 -78373782 + ORR1A4 LTR MaLR 1 324 -5 2 1150 1059 335 81 7 chr5 74163898 74164340 -78372919 - MTE-int LTR MaLR -152 1428 954 2 1150 1140 303 110 2 chr5 74164479 74164879 -78372380 - MTE-int LTR MaLR -1114 466 24 2 1150 292 275 118 86 chr5 74165077 74165264 -78371995 - ORR1E LTR MaLR -164 195 3 2 1150 1112 195 127 46 chr5 74165447 74165754 -78371505 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 2 1150 448 272 131 128 chr5 74169963 74170194 -78367065 + MLT2B2 LTR ERVL 241 470 -45 2 1150 448 272 131 128 chr5 74170229 74170271 -78366988 + MLT2B2 LTR ERVL 471 514 -1 2 1150 510 205 335 23 chr5 74172929 74173096 -78364163 - ORR1E LTR MaLR -82 297 79 2 1150 270 243 13 63 chr5 74173165 74173244 -78364015 - RMER10A LTR ERVL -356 86 12 2 1150 1045 273 43 62 chr5 74176466 74176837 -78360422 + MTE2b LTR MaLR 16 379 0 2 1150 1500 235 45 17 chr5 74185341 74185700 -78351559 - MTE2b LTR MaLR -1 378 10 3 1151 349 299 55 55 chr5 74187936 74188173 -78349086 - MLT1A0 LTR MaLR -16 349 113 3 1151 736 280 31 10 chr5 74188735 74188930 -78348329 + ORR1E LTR MaLR 38 236 -123 3 1151 280 263 0 0 chr5 74189751 74189827 -78347432 - MLT1A1 LTR MaLR -27 381 306 3 1151 353 237 55 9 chr5 74193071 74193216 -78344043 - MTD LTR MaLR -14 405 235 3 1151 559 247 136 74 chr5 74193294 74193552 -78343707 - MTD LTR MaLR -145 274 1 3 1151 569 229 8 14 chr5 74196279 74196436 -78340823 + ORR1D1 LTR MaLR 3 149 -245 3 1151 868 267 108 4 chr5 74196478 74196756 -78340503 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1735 2041 -3673 3 1151 1318 278 75 38 chr5 74196752 74197087 -78340172 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2389 2739 -2975 3 1151 1318 278 75 38 chr5 74197367 74197552 -78339707 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2740 2928 -2786 3 1151 1425 236 128 0 chr5 74201799 74202159 -78335100 + MTD LTR MaLR 3 408 -11 3 1151 371 268 21 0 chr5 74204156 74204253 -78333006 - MTEb LTR MaLR -21 358 260 3 1151 2707 165 68 15 chr5 74204262 74204474 -78332785 + RMER15 LTR ERVL 1 216 -359 3 1151 2707 165 68 15 chr5 74204553 74204707 -78332552 + RMER15 LTR ERVL 217 396 -179 3 1151 4672 141 11 3 chr5 74204707 74205421 -78331838 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 3 1151 2707 165 68 15 chr5 74205421 74205581 -78331678 + RMER15 LTR ERVL 397 555 -20 3 1151 526 312 125 5 chr5 74205577 74205793 -78331466 - MTEb LTR MaLR -125 254 13 3 1151 4050 152 179 25 chr5 74206793 74207630 -78329629 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 117 3 1151 4050 152 179 25 chr5 74207655 74207773 -78329486 - RLTR25A LTR ERVK -987 116 1 3 1151 619 299 79 54 chr5 74211916 74212270 -78324989 - MLT1F2 LTR MaLR -197 363 1 3 1151 1157 235 56 13 chr5 74219928 74220242 -78317017 + MTE2b LTR MaLR 10 334 -45 3 1151 922 270 5 0 chr5 74220239 74220450 -78316809 - ORR1D2 LTR MaLR -158 212 1 3 1151 314 252 55 30 chr5 74220578 74220742 -78316517 - MTE2a LTR MaLR 0 419 253 3 1151 610 196 15 8 chr5 74226762 74226896 -78310363 - ORR1D2 LTR MaLR -235 135 1 3 1151 406 252 81 76 chr5 74236382 74236592 -78300667 + RMER2 LTR ERV1 334 544 -23 3 1151 237 246 53 53 chr5 74242778 74242911 -78294348 - RMER12 LTR ERVK -476 846 714 4 1151 1023 238 165 6 chr5 74242856 74243195 -78294064 + RMER20A LTR ERVK 61 453 -63 4 1151 1139 214 62 45 chr5 74247511 74247821 -78289438 + ORR1C1 LTR MaLR 1 339 -39 4 1151 1555 153 15 96 chr5 74250247 74250736 -78286523 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 4 1151 2558 28 15 0 chr5 74250992 74251318 -78285941 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 55 4 1151 2014 138 12 93 chr5 74252573 74252981 -78284278 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 20 4 1151 817 147 0 0 chr5 74253164 74253293 -78283966 + RMER15 LTR ERVL 427 555 -20 4 1151 229 182 0 22 chr5 74253632 74253677 -78283582 - MER21B LTR ERV1 -779 84 41 4 1151 283 288 53 118 chr5 74256223 74256546 -78280713 - RMER17C LTR ERVK -81 329 28 4 1151 3931 175 82 55 chr5 74256593 74257544 -78279715 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2262 4 1151 254 159 12 138 chr5 74259345 74259425 -78277834 - RMER17C-int LTR ERVK -3839 2298 2229 4 1151 442 262 21 174 chr5 74259467 74259841 -78277418 - RMER17C-int LTR ERVK -1800 1438 1122 4 1151 1037 304 88 24 chr5 74263299 74263801 -78273458 - MER89 LTR ERV1 -9 550 17 4 1151 1354 265 24 29 chr5 74265478 74265855 -78271404 - MTEa LTR MaLR -2 377 3 4 1151 366 219 0 0 chr5 74267862 74267944 -78269315 + MTEb LTR MaLR 154 235 -144 4 1151 430 245 30 26 chr5 74271149 74271305 -78265954 - MLT1B LTR MaLR -1 389 216 4 1151 1967 133 94 14 chr5 74274526 74274876 -78262383 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1151 746 295 30 144 chr5 74278093 74278141 -78259118 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 466 4 1151 5006 136 63 36 chr5 74278141 74278459 -78258800 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 335 -567 4 1151 5006 136 63 36 chr5 74278487 74279047 -78258212 + RLTR13D6 LTR ERVK 336 902 0 4 1151 746 295 30 144 chr5 74279047 74279283 -78257976 - RLTR18B LTR ERVK -47 465 234 4 1151 746 295 30 144 chr5 74279430 74279575 -78257684 - RLTR18B LTR ERVK -279 233 127 4 1151 804 206 41 31 chr5 74279709 74279904 -78257355 - RLTR18B LTR ERVK -311 201 5 4 1151 336 311 27 102 chr5 74281705 74281858 -78255401 - MLT1J LTR MaLR -340 172 33 4 1151 2048 142 3 6 chr5 74281858 74282170 -78255089 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 4 1151 336 311 27 102 chr5 74282170 74282202 -78255057 - MLT1J LTR MaLR -480 32 1 4 1151 7311 71 132 2 chr5 74285702 74286688 -78250571 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1 4 1151 270 159 0 0 chr5 74286736 74286780 -78250479 - RLTR24 LTR ERV1 -485 44 1 4 1151 620 362 42 39 chr5 74286780 74287090 -78250169 + MT2A LTR ERVL 109 419 -114 4 1151 1139 248 16 43 chr5 74287406 74287709 -78249550 + MTE2a LTR MaLR 85 379 0 4 1151 1107 224 150 51 chr5 74289099 74289433 -78247826 + ORR1D2 LTR MaLR 3 369 -1 4 1151 1063 257 136 17 chr5 74291631 74291976 -78245283 + MTD LTR MaLR 19 404 -15 4 1151 237 295 0 0 chr5 74292789 74292850 -78244409 + MT2A LTR ERVL 178 238 -295 4 1151 2477 83 9 6 chr5 74294925 74295251 -78242008 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1151 768 293 32 35 chr5 74295347 74295630 -78241629 + MLT1A0 LTR MaLR 26 307 -58 4 1151 3129 23 2 116 chr5 74296062 74296500 -78240759 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 4 1151 11454 89 57 62 chr5 74296502 74298457 -78238802 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 40 4 1151 3310 21 2 42 chr5 74298468 74298872 -78238387 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 4 1151 359 261 60 108 chr5 74300578 74300934 -78236325 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 354 -99 4 1151 2092 144 73 5 chr5 74302921 74303290 -78233969 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1151 2377 107 0 21 chr5 74303675 74304009 -78233250 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1151 795 289 146 20 chr5 74304056 74304494 -78232765 - MLT2B4 LTR ERVL -63 493 1 4 1151 670 261 110 21 chr5 74308892 74309187 -78228072 - ORR1E LTR MaLR -24 355 8 5 1151 455 287 137 8 chr5 74310312 74310554 -78226705 + MLT1A0 LTR MaLR 6 278 -87 5 1151 440 291 29 34 chr5 74311881 74312040 -78225219 + MLT1B LTR MaLR 15 179 -288 5 1151 288 330 9 9 chr5 74312239 74312349 -78224910 + MLT1B LTR MaLR 281 390 0 5 1151 757 260 65 133 chr5 74314065 74314433 -78222826 + RMER20B LTR ERVK 244 586 -41 5 1152 386 297 87 54 chr5 74320701 74320886 -78216373 + MLT1D LTR MaLR 1 191 -314 5 1152 444 269 150 0 chr5 74320932 74321125 -78216134 + MLT1D LTR MaLR 267 488 -17 5 1152 7337 27 0 4 chr5 74322841 74323666 -78213593 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 5 1152 464 283 22 103 chr5 74325573 74325758 -78211501 + MTE2a LTR MaLR 1 170 -209 5 1152 1730 144 47 92 chr5 74330347 74330751 -78206508 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 5 1152 286 200 0 0 chr5 74332709 74332769 -78204490 - MLT1B LTR MaLR -1 389 330 5 1152 230 152 147 29 chr5 74332911 74332979 -78204280 + RMER10A LTR ERVL 319 394 -48 5 1152 1566 159 40 118 chr5 74333105 74333192 -78204067 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 311 5 1152 1566 159 40 118 chr5 74333376 74333686 -78203573 - ORR1B2 LTR MaLR -57 310 1 5 1152 2318 148 42 17 chr5 74335204 74335611 -78201648 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 5 1152 553 313 147 0 chr5 74336471 74336736 -78200523 - MER70A LTR ERVL 0 472 169 5 1152 1885 129 52 61 chr5 74336754 74337083 -78200176 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 1152 3534 145 42 32 chr5 74337421 74338085 -78199174 + RLTR17 LTR ERVK 1 671 -21 5 1152 251 325 0 12 chr5 74338800 74338881 -78198378 + MER21B LTR ERV1 92 171 -692 5 1152 1844 181 116 52 chr5 74340003 74340469 -78196790 + MT2A LTR ERVL 38 533 0 5 1152 4070 120 106 12 chr5 74340708 74341399 -78195860 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 5 1152 2080 141 110 3 chr5 74347743 74348099 -78189160 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1152 432 327 67 95 chr5 74348184 74348759 -78188500 + MLT1F2 LTR MaLR 18 560 0 5 1152 561 318 189 52 chr5 74349114 74349607 -78187652 - MLT1F2 LTR MaLR -8 561 3 5 1152 3313 48 5 2 chr5 74351972 74352371 -78184888 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1152 3003 73 2 30 chr5 74357592 74357999 -78179260 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1152 295 290 109 89 chr5 74360841 74361189 -78176070 - MLT1C LTR MaLR -79 388 34 6 1152 640 214 95 6 chr5 74362252 74362421 -78174838 + ORR1D1 LTR MaLR 3 186 -188 6 1152 635 264 72 26 chr5 74362688 74362914 -78174345 + ORR1D1 LTR MaLR 149 384 0 6 1152 1684 215 83 3 chr5 74364886 74365273 -78171986 - MTD LTR MaLR 0 419 2 6 1152 601 261 45 67 chr5 74365444 74365711 -78171548 - MTEa LTR MaLR -118 261 1 6 1152 4976 121 34 79 chr5 74366558 74367507 -78169752 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 6 1152 557 168 0 0 chr5 74369242 74369343 -78167916 + RMER17A2 LTR ERVK 715 815 -91 6 1152 315 260 110 55 chr5 74371093 74371256 -78166003 + RMER5 LTR ERV1 34 205 -329 6 1152 2482 143 249 4 chr5 74386739 74387230 -78150029 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1152 827 337 115 23 chr5 74390241 74390764 -78146495 - MER90a LTR ERV1 -20 594 24 6 1152 2262 108 9 0 chr5 74401422 74401738 -78135521 + ORR1A2 LTR MaLR 9 327 0 6 1152 2163 90 54 13 chr5 74406436 74406750 -78130509 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1152 1156 278 38 71 chr5 74410323 74410715 -78126544 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 1152 936 184 70 28 chr5 74413767 74413980 -78123279 - RMER20B LTR ERVK -172 455 234 6 1152 442 306 122 42 chr5 74426618 74426881 -78110378 - ORR1E LTR MaLR -23 336 53 7 1152 3193 161 37 12 chr5 74431809 74432370 -78104889 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 7 1152 822 209 136 139 chr5 74433966 74434363 -78102896 + MT2A LTR ERVL 1 451 -82 7 1152 343 288 35 124 chr5 74436834 74437036 -78100223 + ORR1E LTR MaLR 6 189 -170 7 1152 585 280 98 65 chr5 74438899 74439249 -78098010 + RMER15 LTR ERVL 6 463 -112 7 1152 585 275 128 56 chr5 74439440 74439491 -78097768 + RMER15 LTR ERVL 464 505 -70 7 1152 485 325 153 25 chr5 74439985 74440351 -78096908 + MLT1D LTR MaLR 7 419 -86 7 1152 637 313 81 39 chr5 74441565 74441908 -78095351 + MLT1D LTR MaLR 8 375 -252 7 1152 582 308 106 57 chr5 74443251 74443683 -78093576 - MLT1J LTR MaLR -26 422 12 7 1152 465 189 6 7 chr5 74447014 74447131 -78090128 + ORR1A1 LTR MaLR 1 141 -253 7 1152 626 157 13 60 chr5 74447121 74447270 -78089989 + ORR1A1 LTR MaLR 20 161 -185 7 1153 266 184 12 106 chr5 74456052 74456137 -78081122 - MLT1A1 LTR MaLR -296 112 36 7 1153 2110 69 116 26 chr5 74468104 74468415 -78068844 - MTB LTR MaLR 0 400 62 8 1153 1212 122 3 48 chr5 74468575 74468837 -78068422 - ORR1A1 LTR MaLR -23 371 56 8 1153 496 259 137 64 chr5 74469346 74469689 -78067570 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 8 1153 323 316 152 6 chr5 74469924 74470102 -78067157 + MLT1K LTR MaLR 384 587 -8 8 1153 1779 124 63 125 chr5 74474587 74474775 -78062484 + ORR1A4 LTR MaLR 1 162 -167 8 1153 1779 124 63 125 chr5 74474965 74475127 -78062132 + ORR1A4 LTR MaLR 163 329 0 8 1153 1752 176 62 17 chr5 74485070 74485428 -78051831 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 8 1153 231 250 105 0 chr5 74492349 74492425 -78044834 + MT2B2 LTR ERVL 167 250 -334 8 1153 1017 157 45 15 chr5 74497936 74498136 -78039123 + MTC LTR MaLR 1 206 -215 8 1153 864 202 60 41 chr5 74498378 74498591 -78038668 + MTC LTR MaLR 198 407 -12 8 1153 344 267 13 0 chr5 74499776 74499851 -78037408 + MLT1D LTR MaLR 70 145 -360 9 1153 793 139 58 7 chr5 74499861 74499999 -78037260 - RMER6C LTR ERVK 0 690 546 9 1153 241 207 52 0 chr5 74500000 74500058 -78037201 - RMER6C LTR ERVK -146 544 484 1 1153 2157 120 33 3 chr5 74500183 74500517 -78036742 - RMER6C LTR ERVK -346 344 1 1 1153 662 328 75 24 chr5 74500533 74500827 -78036432 + MLT1D LTR MaLR 196 504 -1 3 1153 1496 174 4 20 chr5 74502232 74502484 -78034775 + RLTR17 LTR ERVK 200 447 -245 9 1153 260 231 0 0 chr5 74502455 74502507 -78034752 + BGLII_B LTR ERVK 54 105 -336 1 1153 561 191 11 0 chr5 74503342 74503436 -78033823 + RLTR17 LTR ERVK 200 294 -398 1 1153 1091 179 144 40 chr5 74504781 74505108 -78032151 + ORR1C1 LTR MaLR 16 376 -2 1 1153 264 239 32 177 chr5 74506105 74506263 -78030996 - RLTR25B LTR ERVK -453 575 441 1 1153 621 325 37 82 chr5 74506527 74506717 -78030542 + ORR1E LTR MaLR 1 181 -178 2 1153 621 325 37 82 chr5 74506797 74506982 -78030277 + ORR1E LTR MaLR 182 359 0 2 1153 242 292 84 54 chr5 74507141 74507380 -78029879 + RMER17C LTR ERVK 123 368 -42 2 1153 2255 148 51 5 chr5 74507969 74508344 -78028915 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 2 1153 561 273 45 56 chr5 74510699 74510897 -78026362 - MLT2B4 LTR ERVL -349 207 12 3 1153 929 284 83 54 chr5 74515847 74516197 -78021062 + MTD LTR MaLR 1 360 -59 5 1153 2789 133 88 77 chr5 74516200 74516763 -78020496 + MT2B LTR ERVL 1 543 -58 5 1153 255 61 0 0 chr5 74516907 74516940 -78020319 + MT2B LTR ERVL 542 574 -10 5 1153 490 318 87 55 chr5 74518128 74518494 -78018765 - MER34-int LTR ERV1 -5 8202 7825 6 1153 627 240 124 67 chr5 74519341 74519551 -78017708 - MTD LTR MaLR 0 419 198 6 1153 1599 161 115 47 chr5 74519594 74519934 -78017325 + ORR1D1 LTR MaLR 1 363 -11 6 1153 658 243 5 28 chr5 74519937 74520095 -78017164 - MTD LTR MaLR -226 193 13 6 1153 1316 228 60 40 chr5 74524913 74525265 -78011994 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 5 7 1153 269 306 39 69 chr5 74530468 74530598 -78006661 + ORR1E LTR MaLR 24 149 -210 9 1153 311 308 61 25 chr5 74531557 74531720 -78005539 + LTR33C LTR ERVL 131 299 -330 9 1153 313 280 111 47 chr5 74531806 74531978 -78005281 + LTR33C LTR ERVL 432 614 -15 9 1153 2866 92 24 19 chr5 74533473 74533883 -78003376 - MTC LTR MaLR 0 421 10 1 1153 1133 261 20 114 chr5 74534188 74534582 -78002677 + MTE2a LTR MaLR 6 362 -17 1 1153 271 301 75 0 chr5 74538256 74538349 -77998910 + MLT1N2 LTR MaLR 3 102 -460 1 1153 249 350 0 37 chr5 74538714 74538821 -77998438 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 263 1 1153 523 192 146 28 chr5 74541103 74541284 -77995975 - ORR1D2 LTR MaLR -1 383 171 1 1153 228 333 132 9 chr5 74541819 74541925 -77995334 + MLT1J1 LTR MaLR 75 193 -251 1 1153 2439 111 59 3 chr5 74542127 74542499 -77994760 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 2 1 1153 510 296 176 36 chr5 74544694 74544996 -77992263 - ORR1E LTR MaLR -14 345 2 1 1153 331 285 53 107 chr5 74545999 74546168 -77991091 + MTEb LTR MaLR 1 160 -219 1 1153 3103 34 3 3 chr5 74546985 74547342 -77989917 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 1 1153 1212 271 38 29 chr5 74547686 74548032 -77989227 + MTEb LTR MaLR 10 358 -21 1 1153 1049 238 150 88 chr5 74551250 74551784 -77985475 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 1 1153 523 325 76 34 chr5 74552207 74552443 -77984816 - MT2A LTR ERVL -79 454 209 1 1153 562 261 179 47 chr5 74553047 74553342 -77983917 + MLT2D LTR ERVL 23 362 -35 1 1153 456 306 129 88 chr5 74556522 74556895 -77980364 - MLT1B LTR MaLR -2 388 1 1 1153 290 351 97 75 chr5 74559875 74560143 -77977116 + MLT1J LTR MaLR 105 378 -134 1 1153 253 309 81 58 chr5 74563132 74563218 -77974041 + LTR16A1 LTR ERVL 194 281 -175 1 1153 795 336 98 37 chr5 74564974 74565435 -77971824 - MLT1F LTR MaLR 0 548 60 1 1153 285 297 158 62 chr5 74565513 74565786 -77971473 - RMER12 LTR ERVK -332 990 692 1 1153 328 326 0 77 chr5 74567963 74568106 -77969153 + LTR33A_ LTR ERVL 95 226 -305 1 1153 509 275 266 17 chr5 74575376 74575672 -77961587 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1153 375 317 45 65 chr5 74575989 74576188 -77961071 + MLT1K LTR MaLR 373 567 -28 1 1154 327 168 23 70 chr5 74586746 74586874 -77950385 - RMER17A LTR ERVK -295 456 335 2 1154 287 338 29 44 chr5 74588531 74588738 -77948521 + MLT1H1 LTR MaLR 9 258 -321 2 1154 243 271 34 0 chr5 74599053 74599112 -77938147 + ORR1E LTR MaLR 1 61 -298 2 1154 321 281 12 12 chr5 74599424 74599507 -77937752 + MTEb LTR MaLR 279 361 -18 2 1154 365 318 62 56 chr5 74607833 74607993 -77929266 + ORR1E LTR MaLR 28 196 -163 2 1154 268 131 36 96 chr5 74612160 74612215 -77925044 - MTD LTR MaLR -16 403 325 2 1154 268 113 34 102 chr5 74612425 74612443 -77924816 - MTD LTR MaLR -53 366 349 2 1154 2485 64 0 38 chr5 74612444 74612577 -77924682 + ORR1A2 LTR MaLR 1 127 -200 2 1154 2885 77 0 0 chr5 74612577 74612942 -77924317 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 2 1154 2485 64 0 38 chr5 74612942 74613148 -77924111 + ORR1A2 LTR MaLR 128 327 0 2 1154 879 235 239 15 chr5 74613148 74613409 -77923850 - MTD LTR MaLR -97 322 3 2 1154 1689 174 119 29 chr5 74622935 74623126 -77914133 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 161 2 1154 1689 174 119 29 chr5 74623185 74623336 -77913923 - ORR1C1 LTR MaLR -218 160 5 2 1154 805 267 119 55 chr5 74624070 74624415 -77912844 - MTEa LTR MaLR -12 367 1 2 1154 506 301 121 56 chr5 74624428 74624807 -77912452 + MLT1J LTR MaLR 150 493 -19 2 1154 236 303 79 32 chr5 74625555 74625681 -77911578 + LTR50 LTR ERVL 104 235 -560 2 1154 1284 255 69 18 chr5 74626620 74626952 -77910307 - LTR87 LTR ERVL? 0 624 276 2 1154 292 279 0 0 chr5 74629987 74630055 -77907204 - ORR1D2 LTR MaLR -247 123 56 2 1154 1048 227 179 23 chr5 74633869 74634176 -77903083 + ORR1E LTR MaLR 5 359 0 2 1154 327 326 113 96 chr5 74634194 74634557 -77902702 - MLT1A1 LTR MaLR -15 393 25 2 1154 304 282 0 34 chr5 74650670 74650758 -77886501 + MLT1A1 LTR MaLR 320 404 -4 2 1154 416 285 102 43 chr5 74651996 74652036 -77885223 + RMER15 LTR ERVL 363 400 -175 2 1154 2237 142 126 0 chr5 74652036 74652410 -77884849 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1154 416 285 102 43 chr5 74652410 74652556 -77884703 + RMER15 LTR ERVL 401 560 -15 2 1154 313 250 71 20 chr5 74652570 74652668 -77884591 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 306 2 1154 263 304 38 12 chr5 74652699 74652779 -77884480 - MLT1A1 LTR MaLR -227 181 100 2 1154 445 132 80 0 chr5 74657645 74657736 -77879523 + ORR1C1 LTR MaLR 5 111 -259 3 1154 292 277 71 12 chr5 74660735 74660819 -77876440 - MLT1K LTR MaLR -1 594 506 3 1154 294 295 55 93 chr5 74664869 74665052 -77872207 + MLT1K LTR MaLR 268 443 -152 3 1154 371 367 73 34 chr5 74673695 74674076 -77863183 + MLT1I LTR MaLR 9 404 -7 3 1154 354 219 89 50 chr5 74686957 74687058 -77850201 - MT2A LTR ERVL -344 189 85 3 1154 636 188 45 30 chr5 74687033 74687165 -77850094 - MT2A LTR ERVL -387 146 13 3 1154 650 324 50 88 chr5 74690165 74690504 -77846755 + ORR1E LTR MaLR 34 359 0 3 1154 497 283 104 93 chr5 74699886 74700241 -77837018 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1154 356 207 0 44 chr5 74704249 74704340 -77832919 - RMER12 LTR ERVK -466 856 770 3 1155 262 298 31 41 chr5 74713300 74713398 -77823861 + MLT1J2 LTR MaLR 7 103 -345 3 1155 288 378 68 61 chr5 74717694 74717987 -77819272 + ORR1E LTR MaLR 15 309 -50 3 1155 236 259 11 100 chr5 74721018 74721108 -77816151 - MT2B2 LTR ERVL -342 242 161 3 1155 705 259 5 89 chr5 74721996 74722199 -77815060 + MTEa LTR MaLR 141 326 -53 3 1155 527 81 0 26 chr5 74737743 74737819 -77799440 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 255 4 1155 268 365 0 60 chr5 74741192 74741326 -77795933 + MTEa LTR MaLR 6 131 -248 4 1155 1089 215 66 105 chr5 74741210 74741592 -77795667 + MT2A LTR ERVL 19 517 -84 4 1155 1206 203 208 7 chr5 74742250 74742558 -77794701 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 1155 3339 48 20 2 chr5 74743407 74743800 -77793459 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1155 413 324 99 0 chr5 74745163 74745305 -77791954 + MTEa LTR MaLR 1 156 -223 4 1155 254 302 0 0 chr5 74745412 74745456 -77791803 + MTEa LTR MaLR 332 375 -4 4 1155 234 371 48 16 chr5 74752256 74752382 -77784877 + MLT1J LTR MaLR 100 229 -283 4 1155 403 319 47 35 chr5 74754783 74754952 -77782307 + MLT1J LTR MaLR 339 509 -3 4 1155 388 179 22 56 chr5 74755298 74755387 -77781872 + MTE2b LTR MaLR 294 379 0 4 1155 2797 53 26 15 chr5 74755602 74755944 -77781315 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1155 559 261 90 43 chr5 74760663 74760851 -77776408 - MLT2B1 LTR ERVL -323 197 1 4 1155 711 275 35 29 chr5 74764085 74764381 -77772878 + MLT2B1 LTR ERVL 170 567 0 4 1155 925 273 106 12 chr5 74764389 74764719 -77772540 + MLT1A0-int LTR MaLR 10 370 -1365 4 1155 227 352 41 47 chr5 74767803 74767973 -77769286 + MLT1-int LTR MaLR 431 599 -772 4 1155 1193 311 34 27 chr5 74768273 74768680 -77768579 + MLT1A0-int LTR MaLR 1313 1722 -13 4 1155 252 267 53 0 chr5 74768814 74768889 -77768370 + MLT1A0 LTR MaLR 16 94 -280 4 1155 489 279 54 65 chr5 74768933 74769117 -77768142 + MLT1A0 LTR MaLR 178 359 -6 4 1155 1572 152 31 21 chr5 74769697 74769970 -77767289 + ORR1B1 LTR MaLR 2 277 -117 4 1155 531 268 41 121 chr5 74769970 74770450 -77766809 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 565 -3 4 1155 453 164 2 163 chr5 74770450 74770560 -77766699 + ORR1B1 LTR MaLR 228 386 -8 4 1155 453 316 69 9 chr5 74773822 74774068 -77763191 - MLT2B3 LTR ERVL -342 375 117 4 1155 319 308 25 119 chr5 74774600 74774843 -77762416 + ORR1E LTR MaLR 43 262 -97 4 1155 528 262 57 143 chr5 74778647 74779101 -77758158 + RMER10A LTR ERVL 15 429 -13 4 1155 475 258 41 32 chr5 74779567 74779756 -77757503 + MTD LTR MaLR 10 203 -204 4 1155 322 175 0 200 chr5 74779757 74779857 -77757402 + MTD LTR MaLR 338 417 -2 4 1155 1398 237 42 55 chr5 74779876 74780331 -77756928 + RLTR17 LTR ERVK 105 553 -139 4 1155 480 156 61 69 chr5 74782781 74782912 -77754347 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 79 4 1155 773 226 192 37 chr5 74788566 74788888 -77748371 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 4 1155 1255 296 43 45 chr5 74799345 74799858 -77737401 - MTE-int LTR MaLR -926 654 143 5 1155 283 262 43 71 chr5 74800112 74800252 -77737007 - MTE-int LTR MaLR -1444 136 1 5 1155 246 358 0 21 chr5 74800276 74800373 -77736886 - MTEb LTR MaLR -36 343 249 5 1155 370 334 91 18 chr5 74801092 74801367 -77735892 + MLT1D LTR MaLR 101 397 -108 5 1155 1015 199 111 12 chr5 74801647 74801956 -77735303 + ORR1C2 LTR MaLR 12 374 -10 5 1155 396 295 91 46 chr5 74814690 74814953 -77722306 + ORR1E LTR MaLR 6 280 -79 5 1155 320 290 0 21 chr5 74815161 74815256 -77722003 + MLT1J1 LTR MaLR 63 155 -289 5 1155 524 283 38 198 chr5 74819718 74819951 -77717308 - MLT1A LTR MaLR 0 374 192 5 1155 524 283 38 198 chr5 74819994 74820205 -77717054 - MLT1A LTR MaLR -183 191 1 5 1155 1046 204 9 5 chr5 74823147 74823364 -77713895 + ORR1B2 LTR MaLR 1 218 -149 5 1155 1613 166 80 3 chr5 74823354 74823656 -77713603 - MTC LTR MaLR -96 325 1 5 1155 6365 161 66 10 chr5 74823656 74824846 -77712413 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 2 5 1155 226 158 0 0 chr5 74824846 74824884 -77712375 - MTC LTR MaLR -1 418 381 5 1155 303 279 0 12 chr5 74832082 74832162 -77705097 + MER21B LTR ERV1 1 79 -784 5 1155 259 271 46 23 chr5 74832815 74832902 -77704357 + MER21B LTR ERV1 607 695 -168 5 1155 517 304 139 34 chr5 74833045 74833369 -77703890 - MLT1A LTR MaLR -16 358 1 5 1155 467 284 87 31 chr5 74838809 74839005 -77698254 - RMER15 LTR ERVL -13 562 356 5 1156 283 333 79 30 chr5 74844943 74845107 -77692152 + ORR1E LTR MaLR 19 190 -169 5 1156 267 137 12 141 chr5 74845332 74845417 -77691842 + ORR1E LTR MaLR 287 360 -19 5 1156 367 302 40 101 chr5 74845536 74845783 -77691476 - RMER13A LTR ERVK -628 232 1 5 1156 1999 160 18 33 chr5 74848882 74849397 -77687862 + RLTR20A LTR ERVK 85 551 0 5 1156 923 221 224 0 chr5 74858172 74858471 -77678788 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 5 1156 390 169 153 0 chr5 74874236 74874360 -77662899 - LTR50 LTR ERVL -585 210 68 6 1156 897 313 74 11 chr5 74881859 74882172 -77655087 - MTEa LTR MaLR 0 379 61 6 1156 897 313 74 11 chr5 74882216 74882254 -77655005 - MTEa LTR MaLR -319 60 7 6 1156 2728 248 57 46 chr5 74882260 74883063 -77654196 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 767 6 1156 700 274 45 5 chr5 74883616 74883818 -77653441 - MTEa-int LTR MaLR -1173 407 198 6 1156 962 209 129 54 chr5 74916775 74917236 -77620023 + MT2B LTR ERVL 1 600 -1 6 1156 316 269 65 65 chr5 74918572 74918594 -77618665 + MT2B2 LTR ERVL 144 262 -318 6 1156 656 289 56 17 chr5 74920446 74920678 -77616581 - RMER15 LTR ERVL -13 562 322 6 1156 250 273 0 0 chr5 74923279 74923334 -77613925 + MTD LTR MaLR 41 95 -324 6 1156 1168 200 150 10 chr5 74923575 74923868 -77613391 + MTD LTR MaLR 86 419 0 6 1156 1160 166 30 34 chr5 74926214 74926451 -77610808 + MTC LTR MaLR 186 421 0 7 1156 788 149 35 0 chr5 74930861 74931002 -77606257 - MTC LTR MaLR -272 149 4 7 1156 313 250 0 115 chr5 74933601 74933714 -77603545 - MT2B LTR ERVL -344 257 158 7 1156 272 256 33 99 chr5 74955546 74955637 -77581622 + MT2B LTR ERVL 153 237 -364 7 1157 1381 230 139 3 chr5 74979039 74979405 -77557854 - MTD LTR MaLR 0 419 4 8 1157 232 261 24 145 chr5 74985409 74985520 -77551739 + RMER15 LTR ERVL 347 450 -125 8 1157 232 261 24 145 chr5 74985671 74985704 -77551555 + RMER15 LTR ERVL 451 471 -104 8 1157 384 280 114 51 chr5 74985826 74985984 -77551275 - MER34A1 LTR ERV1 -362 225 58 8 1157 1268 165 237 107 chr5 74994870 74995339 -77541920 + MT2A LTR ERVL 4 533 0 8 1157 424 301 30 85 chr5 75005178 75005378 -77531881 + LTR80B LTR ERVL 136 324 -260 3 1157 360 186 294 8 chr5 75008146 75008265 -77528994 + MLT1A0 LTR MaLR 5 157 -208 7 1157 260 282 0 96 chr5 75008687 75008781 -77528478 + MLT1A0 LTR MaLR 281 365 0 7 1157 241 329 143 25 chr5 75015567 75015804 -77521455 - RMER12 LTR ERVK -321 1001 737 1 1157 794 320 81 45 chr5 75030893 75031400 -77505859 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 3 5 1157 396 341 76 50 chr5 75041898 75042160 -77495099 + ORR1E LTR MaLR 87 355 -4 7 1157 1910 233 24 28 chr5 75042999 75043506 -77493753 + RLTR20B3 LTR ERVK 78 573 -4 7 1157 247 332 79 43 chr5 75045710 75045987 -77491272 + RMER12 LTR ERVK 771 1057 -265 8 1157 1980 161 41 22 chr5 75054783 75055151 -77482108 + ORR1C1 LTR MaLR 1 375 -3 9 1157 2965 155 198 88 chr5 75062402 75063161 -77474098 + RMER21B LTR ERV1 1 842 0 1 1157 349 315 99 20 chr5 75071824 75071976 -77465283 + MLT1C LTR MaLR 304 467 0 1 1157 302 295 56 75 chr5 75075712 75075873 -77461386 + MLT1J LTR MaLR 285 442 -70 1 1157 3447 25 5 2 chr5 75076292 75076687 -77460572 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1157 544 271 73 73 chr5 75079270 75079489 -77457770 + MLT1D LTR MaLR 287 505 0 1 1157 1734 197 116 8 chr5 75080286 75080649 -77456610 + MTD LTR MaLR 1 402 -17 1 1157 552 311 262 8 chr5 75080840 75081096 -77456163 - ORR1E LTR MaLR -49 321 1 1 1157 282 248 144 68 chr5 75083722 75084066 -77453193 + ORR1D2 LTR MaLR 5 376 -2 1 1157 954 291 50 86 chr5 75085664 75086064 -77451195 + MTE2a LTR MaLR 25 405 -14 1 1157 900 243 126 7 chr5 75088157 75088426 -77448833 + MTEb LTR MaLR 79 379 0 1 1157 352 276 75 40 chr5 75092981 75093155 -77444104 + MLT1D LTR MaLR 46 225 -280 1 1157 286 363 126 47 chr5 75093167 75093358 -77443901 + MLT1D LTR MaLR 296 501 -4 1 1158 2485 177 75 34 chr5 75113452 75113960 -77423299 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 1 1158 615 277 46 41 chr5 75114576 75114846 -77422413 - BGLII_B LTR ERVK -76 365 8 1 1158 1501 228 66 6 chr5 75120619 75120968 -77416291 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1158 3983 247 81 84 chr5 75120968 75121302 -77415957 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 998 1 1158 3983 247 81 84 chr5 75121358 75122348 -77414911 - ORR1D2-int LTR MaLR -373 997 50 1 1158 1186 230 68 63 chr5 75133102 75133468 -77403791 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 2 1158 1878 111 10 178 chr5 75137461 75137854 -77399405 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1158 834 290 36 20 chr5 75138275 75138327 -77398932 + MTEa LTR MaLR 1 51 -328 2 1158 834 290 36 20 chr5 75138527 75138724 -77398535 + MTEa LTR MaLR 52 254 -125 2 1158 287 313 64 47 chr5 75138782 75138953 -77398306 + MTEa LTR MaLR 206 379 0 2 1158 521 252 238 5 chr5 75141309 75141532 -77395727 + ORR1D1 LTR MaLR 3 277 -97 2 1158 305 320 41 73 chr5 75141489 75141579 -77395680 + RMER10A LTR ERVL 212 296 -146 2 1158 305 320 41 73 chr5 75141617 75141745 -77395514 + RMER10A LTR ERVL 297 423 -19 2 1158 1387 211 141 29 chr5 75143876 75144252 -77393007 - MTD LTR MaLR -1 418 1 2 1158 1972 127 3 76 chr5 75144965 75145307 -77391952 + ORR1A4 LTR MaLR 5 321 -8 2 1158 301 310 58 40 chr5 75152548 75152704 -77384555 + MLT1H LTR MaLR 432 579 0 2 1158 566 274 5 78 chr5 75153147 75153282 -77383977 + ORR1E LTR MaLR 151 276 -83 2 1158 1822 150 125 6 chr5 75153282 75153610 -77383649 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1158 566 274 5 78 chr5 75153610 75153663 -77383596 + ORR1E LTR MaLR 277 326 -33 2 1158 566 274 5 78 chr5 75153691 75153707 -77383552 + ORR1E LTR MaLR 327 341 -18 2 1158 2050 147 78 39 chr5 75157154 75157634 -77379625 - RMER6A LTR ERVK 0 756 132 2 1158 2050 146 67 49 chr5 75157668 75157782 -77379477 - RMER6A LTR ERVK -625 131 2 2 1158 1101 245 141 7 chr5 75158298 75158602 -77378657 + ORR1E LTR MaLR 4 348 -11 2 1158 352 306 73 75 chr5 75159775 75160033 -77377226 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 111 2 1158 343 322 108 111 chr5 75160242 75160340 -77376919 - ORR1D2 LTR MaLR -249 110 6 2 1158 925 263 68 87 chr5 75163707 75164074 -77373185 + MTEb LTR MaLR 20 379 0 2 1158 344 289 64 51 chr5 75164380 75164537 -77372722 + ORR1E LTR MaLR 28 186 -173 2 1158 1090 196 69 65 chr5 75168121 75168422 -77368837 + ORR1D1 LTR MaLR 7 357 -2 2 1158 973 299 82 20 chr5 75171827 75172179 -77365080 - MLT1C LTR MaLR 0 467 94 2 1158 432 312 146 0 chr5 75172597 75172741 -77364518 - MTE2b LTR MaLR -9 370 206 2 1158 1219 285 225 32 chr5 75175196 75175819 -77361440 + RMER13A LTR ERVK 1 743 -117 2 1158 1305 160 148 14 chr5 75176264 75176555 -77360704 + MTC LTR MaLR 61 390 -31 2 1158 3021 36 2 113 chr5 75181159 75181593 -77355666 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 3 1158 17232 23 8 1 chr5 75181595 75183525 -77353734 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 3 1158 2898 39 2 142 chr5 75183541 75183990 -77353269 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 3 1158 665 302 69 69 chr5 75190183 75190517 -77346742 - ORR1E LTR MaLR -18 341 8 3 1158 378 214 8 125 chr5 75190883 75191011 -77346248 + LTR79 LTR ERVL 69 181 -346 3 1158 228 254 75 0 chr5 75191144 75191211 -77346048 + LTR79 LTR ERVL 382 453 -74 3 1158 3602 142 219 14 chr5 75194626 75195360 -77341899 - RMER19B LTR ERVK -17 885 1 3 1158 1468 192 80 7 chr5 75199829 75200117 -77337142 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 3 1158 336 262 59 75 chr5 75204391 75204577 -77332682 - MLT1K LTR MaLR -17 578 396 3 1158 251 355 146 38 chr5 75210898 75211185 -77326074 - MLT1K LTR MaLR -100 495 178 3 1158 459 291 70 97 chr5 75211549 75211777 -77325482 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 144 3 1158 477 264 18 66 chr5 75212320 75212486 -77324773 - MLT1A0 LTR MaLR -202 163 6 3 1158 238 289 48 108 chr5 75217220 75217406 -77319853 - LTR41 LTR ERVL -34 724 550 3 1158 1128 224 54 97 chr5 75217700 75218090 -77319169 + MTE2a LTR MaLR 6 378 -1 3 1158 258 327 34 92 chr5 75218090 75218383 -77318876 - LTR41 LTR ERVL -491 277 2 3 1158 522 337 92 15 chr5 75220383 75220645 -77316614 - MLT1L LTR MaLR -182 428 147 3 1158 501 309 12 29 chr5 75224993 75225292 -77311967 + MLT1B LTR MaLR 12 386 -4 3 1158 228 264 19 0 chr5 75225770 75225823 -77311436 - MLT1J LTR MaLR -145 367 314 4 1158 2432 157 69 17 chr5 75228785 75229264 -77307995 - RLTR11A2 LTR ERVK -23 504 1 4 1158 421 276 0 0 chr5 75229444 75229542 -77307717 + MTEb LTR MaLR 1 98 -281 4 1158 483 298 16 16 chr5 75229542 75229668 -77307591 + MTEb LTR MaLR 58 183 -196 4 1158 814 292 5 14 chr5 75229699 75229911 -77307348 + MTEb LTR MaLR 168 377 -2 4 1158 227 330 85 66 chr5 75230220 75230525 -77306734 - RLTR12B LTR ERVK -201 327 17 4 1158 1616 146 43 52 chr5 75230993 75231318 -77305941 + ORR1A4 LTR MaLR 8 329 0 4 1158 2015 174 22 11 chr5 75231849 75232209 -77305050 - MTC LTR MaLR 0 421 58 4 1159 397 321 19 9 chr5 75238733 75238840 -77298419 + MLT1K LTR MaLR 166 273 -322 4 1159 300 350 133 39 chr5 75239072 75239357 -77297902 + MLT1K LTR MaLR 223 534 -61 4 1159 323 286 114 40 chr5 75240574 75240749 -77296510 + LTR33A_ LTR ERVL 282 469 -62 4 1159 920 325 33 115 chr5 75241334 75241759 -77295500 + MLT2D LTR ERVL 5 394 -20 4 1159 2536 72 28 39 chr5 75242179 75242542 -77294717 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 4 1159 297 377 96 60 chr5 75244353 75244377 -77292882 - MLT1D LTR MaLR -16 451 420 4 1159 550 342 112 41 chr5 75244569 75244960 -77292299 - MLT1D LTR MaLR -48 419 20 4 1159 348 302 140 113 chr5 75245156 75245571 -77291688 - MLT1J LTR MaLR -86 426 1 4 1159 398 297 46 15 chr5 75246144 75246274 -77290985 - MTEa LTR MaLR 0 379 246 4 1159 880 304 74 19 chr5 75246742 75247121 -77290138 - LTR86A1 LTR ERVL -113 400 1 4 1159 3640 44 53 4 chr5 75249471 75249924 -77287335 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1159 295 328 25 16 chr5 75250837 75250958 -77286301 + MLT1D LTR MaLR 267 388 -117 4 1159 309 261 93 59 chr5 75253626 75253744 -77283515 + MLT1J2 LTR MaLR 327 448 0 4 1159 388 338 129 33 chr5 75257279 75257551 -77279708 - MLT1K LTR MaLR -2 593 296 4 1159 609 330 125 33 chr5 75258267 75258596 -77278663 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 1159 403 291 14 36 chr5 75262263 75262402 -77274857 - RMER15 LTR ERVL -104 471 336 4 1159 248 146 83 0 chr5 75265693 75265741 -77271518 - MLT1J LTR MaLR -51 461 410 4 1159 359 368 34 17 chr5 75266166 75266343 -77270916 - MLT1J LTR MaLR -314 198 19 4 1159 549 324 153 37 chr5 75267865 75268186 -77269073 + MLT1J LTR MaLR 1 358 -154 4 1159 318 217 0 0 chr5 75269137 75269197 -77268062 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 4 1159 2233 194 41 92 chr5 75269241 75269825 -77267434 + RMER15 LTR ERVL 22 575 0 4 1159 269 302 61 30 chr5 75280505 75280604 -77256655 + MTEa LTR MaLR 51 152 -227 4 1159 369 164 167 32 chr5 75280695 75280821 -77256438 + MTEa LTR MaLR 172 314 -65 4 1159 726 286 137 31 chr5 75281068 75281389 -77255870 - MTEa LTR MaLR -8 371 17 4 1159 1832 61 0 0 chr5 75283104 75283335 -77253924 + MTB_Mm LTR MaLR 177 407 0 5 1159 1746 209 99 38 chr5 75289251 75289754 -77247505 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 5 1159 1341 195 189 81 chr5 75291117 75291598 -77245661 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 5 1159 871 254 99 25 chr5 75292224 75292506 -77244753 - ORR1E LTR MaLR -10 349 47 5 1159 681 292 49 31 chr5 75294248 75294474 -77242785 + MTEb LTR MaLR 150 379 0 5 1159 849 264 166 38 chr5 75306912 75307255 -77230004 + MTD LTR MaLR 30 416 -3 5 1159 1006 298 63 40 chr5 75307406 75307756 -77229503 + MTEb LTR MaLR 6 363 -16 5 1159 405 267 96 40 chr5 75308489 75308614 -77228645 + MLT1H2 LTR MaLR 42 173 -316 5 1159 786 314 75 16 chr5 75313226 75313533 -77223726 + MLT1A1 LTR MaLR 8 332 -76 5 1159 776 123 135 64 chr5 75313737 75313893 -77223366 + ORR1B2 LTR MaLR 1 167 -200 5 1159 402 111 0 0 chr5 75313865 75313919 -77223340 + ORR1B2 LTR MaLR 341 394 0 5 1159 533 308 132 71 chr5 75314703 75315089 -77222170 + MLT2B4 LTR ERVL 90 520 0 5 1159 269 267 22 55 chr5 75326896 75326987 -77210272 - ORR1E LTR MaLR -4 366 279 5 1159 349 306 79 70 chr5 75330292 75330506 -77206753 - ORR1E LTR MaLR -40 319 104 5 1159 261 322 44 0 chr5 75330565 75330655 -77206604 - ORR1E LTR MaLR -265 94 1 5 1159 3219 53 18 0 chr5 75332737 75333130 -77204129 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1159 2942 128 65 8 chr5 75348074 75348568 -77188691 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 3 6 1159 325 241 35 35 chr5 75348715 75348831 -77188428 + MER57A-int LTR ERV1 5798 5913 -274 6 1159 233 275 8 8 chr5 75351728 75351744 -77185515 + ORR1B1-int LTR MaLR 634 649 -860 6 1159 315 241 0 75 chr5 75362345 75362439 -77174820 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 482 6 1160 616 238 66 7 chr5 75368468 75368620 -77168639 - MTEa LTR MaLR -8 371 211 7 1160 1120 208 204 77 chr5 75368621 75369110 -77168149 + RLTR20C LTR ERVK 1 551 0 7 1160 653 224 206 0 chr5 75369112 75369277 -77167982 - MTEa LTR MaLR -180 199 1 7 1160 227 321 67 67 chr5 75375559 75375739 -77161520 + MTB_Mm LTR MaLR 122 301 -106 7 1160 1115 241 134 12 chr5 75382031 75382351 -77154908 - ORR1D2 LTR MaLR -11 359 1 7 1160 1091 322 76 39 chr5 75382351 75382788 -77154471 - MTE-int LTR MaLR -289 1291 838 7 1160 405 350 193 28 chr5 75382992 75383372 -77153887 - MTE-int LTR MaLR -770 810 367 7 1160 2784 25 3 60 chr5 75383867 75384214 -77153045 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 7 1160 507 112 16 137 chr5 75384214 75384331 -77152928 + IAPEz-int LTR ERVK 8 110 -6371 7 1160 242 262 49 0 chr5 75384331 75384392 -77152867 + RLTR27 LTR ERVK 212 275 -34 7 1160 231 327 0 0 chr5 75384418 75384473 -77152786 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 7 1160 3407 65 1 16 chr5 75384473 75385051 -77152208 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 7 1160 2595 65 3 3 chr5 75385051 75385393 -77151866 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 7 1160 6088 71 12 7 chr5 75385386 75386211 -77151048 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 7 1160 2744 31 3 60 chr5 75386213 75386560 -77150699 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 7 1160 1827 213 34 15 chr5 75387351 75387760 -77149499 + MTD LTR MaLR 2 418 -1 7 1160 4102 203 183 12 chr5 75387761 75387850 -77149409 + MTD-int LTR MaLR 2 95 -1163 7 1160 4351 202 183 12 chr5 75387885 75388867 -77148392 + MTD-int LTR MaLR 96 1256 -2 7 1160 2286 179 24 12 chr5 75388869 75389283 -77147976 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1160 435 236 159 12 chr5 75396402 75396565 -77140694 + RMER5 LTR ERV1 100 286 -248 7 1160 595 179 17 17 chr5 75414262 75414381 -77122878 - MTD LTR MaLR -300 119 1 8 1160 1776 199 82 33 chr5 75427098 75427487 -77109772 + MTC LTR MaLR 14 421 0 8 1160 2079 174 70 22 chr5 75429051 75429451 -77107808 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1160 267 256 50 113 chr5 75430616 75430757 -77106502 + MT2B LTR ERVL 156 287 -314 8 1160 504 316 108 42 chr5 75444124 75444411 -77092848 + MLT1A LTR MaLR 26 331 -43 8 1160 2879 62 67 8 chr5 75445374 75445748 -77091511 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1160 225 239 0 21 chr5 75454389 75454433 -77082826 + MLT1A1 LTR MaLR 366 408 0 9 1160 3021 139 95 10 chr5 75460021 75460524 -77076735 - RMER15 LTR ERVL -27 548 3 9 1160 1793 186 192 20 chr5 75461117 75461562 -77075697 - RMER4B LTR ERVK 0 585 65 9 1160 1793 186 192 20 chr5 75461587 75461640 -77075619 - RMER4B LTR ERVK -521 64 2 9 1160 355 252 73 18 chr5 75485407 75485516 -77051743 + MLT1A0 LTR MaLR 35 149 -216 9 1160 2174 74 3 0 chr5 75488444 75488727 -77048532 + ORR1A2 LTR MaLR 1 284 -43 9 1160 375 43 0 0 chr5 75489010 75489056 -77048203 + ORR1A2 LTR MaLR 273 318 -8 9 1160 244 311 47 28 chr5 75489714 75489820 -77047439 + MLT1A0 LTR MaLR 22 129 -279 9 1160 285 382 18 74 chr5 75489873 75490102 -77047157 + ORR1E LTR MaLR 98 313 -46 9 1160 2426 144 120 11 chr5 75492385 75492861 -77044398 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1160 605 289 47 77 chr5 75493832 75493987 -77043272 + MLT1A0 LTR MaLR 103 260 -114 9 1160 605 267 35 79 chr5 75494167 75494279 -77042980 + MLT1A0 LTR MaLR 250 358 -7 9 1160 478 326 52 47 chr5 75494644 75494689 -77042570 + MLT2B1 LTR ERVL 40 80 -440 1 1160 3577 33 33 5 chr5 75494689 75495113 -77042146 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 1160 478 307 120 65 chr5 75495113 75495404 -77041855 + MLT2B1 LTR ERVL 78 538 -16 1 1160 364 232 82 118 chr5 75495757 75495938 -77041321 + MTE2b LTR MaLR 1 178 -201 1 1160 1909 129 180 3 chr5 75496064 75496398 -77040861 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 1 2 1643 159 93 13 chr5 75497438 75497738 -77039521 + MTC LTR MaLR 1 324 -97 1 1161 333 264 0 22 chr5 75497770 75497859 -77039400 + MLT1A1 LTR MaLR 319 405 -3 1 1161 334 272 51 142 chr5 75498691 75498785 -77038474 - MT2B LTR ERVL -445 156 79 1 1161 1026 189 44 227 chr5 75498826 75499279 -77037980 + ORR1D1 LTR MaLR 2 371 -3 1 1161 239 265 139 35 chr5 75500486 75500572 -77036687 + MTD LTR MaLR 12 106 -313 1 1161 312 151 10 165 chr5 75500599 75500702 -77036557 - RLTR25B LTR ERVK -536 492 406 3 1161 295 294 132 16 chr5 75500637 75500758 -77036501 - MLT1A1 LTR MaLR -137 271 137 4 1161 1534 226 72 14 chr5 75507712 75508057 -77029202 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 8 3 1161 2283 153 68 5 chr5 75510275 75510670 -77026589 - MTC LTR MaLR 0 421 2 4 1161 548 258 40 105 chr5 75512612 75512963 -77024296 + RMER10A LTR ERVL 79 429 -13 5 1161 445 196 32 11 chr5 75516321 75516414 -77020845 - MTE2a LTR MaLR -6 373 279 6 1161 294 226 153 12 chr5 75516413 75516498 -77020761 - MTE2a LTR MaLR -282 97 1 6 1161 2402 66 27 59 chr5 75519247 75519585 -77017674 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1161 436 248 43 83 chr5 75520792 75520997 -77016262 + ORR1D1 LTR MaLR 7 209 -165 8 1161 582 178 124 175 chr5 75521758 75521894 -77015365 + ORR1D1 LTR MaLR 196 329 -45 8 1161 1984 151 66 22 chr5 75521894 75522260 -77014999 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 8 1161 582 178 124 175 chr5 75522260 75522300 -77014959 + ORR1D1 LTR MaLR 330 363 -11 8 1161 1138 225 105 25 chr5 75522300 75522614 -77014645 + MTD LTR MaLR 81 419 0 8 1161 237 295 25 37 chr5 75589804 75589885 -76947374 + MER110A LTR ERV1 186 265 -203 2 1161 3935 111 58 2 chr5 75597361 75597930 -76939329 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 2 1161 929 253 40 9 chr5 75603137 75603364 -76933895 - ORR1E LTR MaLR -110 249 16 2 1161 2249 171 42 12 chr5 75605279 75605688 -76931571 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1161 1951 128 3 99 chr5 75607888 75608243 -76929016 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 2 1161 225 390 90 29 chr5 75611864 75612141 -76925118 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -539 650 357 2 1161 512 311 83 55 chr5 75612373 75612662 -76924597 + MLT1E2 LTR MaLR 329 625 -2 2 1161 1767 193 54 14 chr5 75614538 75614906 -76922353 - MTD LTR MaLR -17 402 20 3 1161 827 272 46 32 chr5 75617671 75618017 -76919242 + RLTR15 LTR ERVK 3 353 -6 3 1161 952 257 120 4 chr5 75622628 75622870 -76914389 - MLT2B1 LTR ERVL -248 272 3 3 1161 237 378 97 19 chr5 75624119 75624273 -76912986 - MLT1G3 LTR MaLR -52 527 362 3 1161 336 322 61 82 chr5 75624318 75624514 -76912745 - MLT1G3 LTR MaLR -332 263 72 3 1162 2120 194 109 52 chr5 75629055 75629144 -76908115 + MT2A LTR ERVL 1 88 -445 3 1162 2120 194 109 52 chr5 75629543 75629957 -76907302 + MT2A LTR ERVL 89 533 0 3 1162 359 265 19 48 chr5 75630062 75630165 -76907094 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 307 3 1162 321 311 14 96 chr5 75630282 75630428 -76906831 - MLT1A1 LTR MaLR -274 134 1 3 1162 1708 198 48 35 chr5 75630977 75631348 -76905911 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 1 3 1162 1499 251 52 16 chr5 75631592 75631957 -76905302 - MTEa LTR MaLR 0 379 2 3 1162 318 295 8 11 chr5 75633488 75633581 -76903678 + MTEb LTR MaLR 279 367 -3 3 1162 2042 134 53 12 chr5 75636481 75636821 -76900438 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 3 1162 231 393 99 18 chr5 75637015 75637186 -76900073 + MLT1H LTR MaLR 106 290 -259 3 1162 322 297 13 29 chr5 75637260 75637384 -76899875 + MTEa LTR MaLR 217 348 -31 3 1162 2526 74 3 3 chr5 75640825 75641151 -76896108 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 3 1162 2174 112 22 0 chr5 75646566 75646877 -76890382 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 3 1162 359 367 13 39 chr5 75647508 75647661 -76889598 + MLT1E1A LTR MaLR 19 167 -393 3 1162 243 232 73 136 chr5 75647653 75647763 -76889496 - MT2B2 LTR ERVL -307 277 175 3 1162 785 253 60 36 chr5 75647785 75648117 -76889142 + MLT1E1A LTR MaLR 314 668 -12 3 1162 241 276 229 52 chr5 75648487 75648640 -76888619 - LTR33 LTR ERVL -331 184 5 3 1162 230 239 0 0 chr5 75649309 75649355 -76887904 - LTR88b LTR Gypsy? -31 806 761 3 1162 2470 178 50 26 chr5 75649995 75650492 -76886767 + RMER20A LTR ERVK 1 509 -7 3 1162 272 333 31 41 chr5 75652254 75652351 -76884908 + MLT1A1 LTR MaLR 65 160 -214 3 1162 331 232 69 29 chr5 75652408 75652510 -76884749 + MLT1A1 LTR MaLR 281 386 -22 3 1162 839 241 96 85 chr5 75652893 75653246 -76884013 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 3 1162 272 195 105 84 chr5 75653964 75654059 -76883200 + MT2B LTR ERVL 168 264 -337 3 1162 2935 142 21 35 chr5 75655182 75655699 -76881560 + RLTR28 LTR ERVL 1 510 -14 3 1162 405 327 121 52 chr5 75657288 75657520 -76879739 + ORR1D2 LTR MaLR 85 332 -38 3 1162 1053 312 65 100 chr5 75661186 75661313 -76875946 + MT2B LTR ERVL 2 112 -489 4 1162 1053 312 65 100 chr5 75661411 75661903 -76875356 + MT2B LTR ERVL 113 599 -2 4 1162 2494 144 45 0 chr5 75665657 75666060 -76871199 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1162 550 285 100 39 chr5 75669063 75669373 -76867886 - MLT1A LTR MaLR -45 329 1 4 1162 480 321 6 0 chr5 75670119 75670278 -76866981 + MLT1B LTR MaLR 12 171 -219 4 1162 720 223 106 5 chr5 75670834 75671032 -76866227 + MLT1B LTR MaLR 161 378 -12 4 1162 1037 306 44 9 chr5 75671542 75671882 -76865377 + MER21B LTR ERV1 76 427 -436 4 1162 408 213 35 44 chr5 75671944 75672057 -76865202 - MLT1A1 LTR MaLR -28 380 269 4 1162 490 302 40 6 chr5 75672235 75672408 -76864851 + MER21B LTR ERV1 500 678 -185 4 1162 277 306 142 16 chr5 75674351 75674534 -76862725 - MLT1C LTR MaLR -3 464 259 4 1162 885 258 68 42 chr5 75675637 75675900 -76861359 - ORR1D2 LTR MaLR -100 270 1 4 1162 260 275 30 84 chr5 75678692 75678823 -76858436 + MLT1A0 LTR MaLR 108 231 -134 4 1162 390 284 48 36 chr5 75684609 75684777 -76852482 - MLT1I LTR MaLR -44 367 198 4 1162 535 260 67 20 chr5 75693937 75694086 -76843173 + MTE2b LTR MaLR 1 156 -223 4 1162 231 271 119 18 chr5 75695793 75695902 -76841357 + MER34A LTR ERV1 11 130 -441 4 1162 285 312 83 34 chr5 75696024 75696243 -76841016 + MER34A LTR ERV1 404 633 -11 4 1162 358 137 93 175 chr5 75698481 75698616 -76838643 - MTE2b LTR MaLR -4 375 256 4 1162 1075 264 50 7 chr5 75698675 75698953 -76838306 - MTE2b LTR MaLR -89 290 1 4 1162 1973 174 91 16 chr5 75699079 75699528 -76837731 + RMER19A LTR ERVK 1 483 -254 4 1162 1094 98 98 0 chr5 75699529 75699723 -76837536 + ORR1A4 LTR MaLR 109 321 -8 4 1162 1075 241 31 8 chr5 75699724 75699979 -76837280 + MTD LTR MaLR 145 405 -14 4 1162 2109 169 42 5 chr5 75700095 75700481 -76836778 + MTC LTR MaLR 22 421 0 4 1162 539 295 73 53 chr5 75700746 75700993 -76836266 - MTE2a LTR MaLR -5 374 123 4 1162 2773 111 56 32 chr5 75701295 75701759 -76835500 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1162 20541 58 47 29 chr5 75701760 75704479 -76832780 + IAPEz-int LTR ERVK 9 2774 -3707 4 1162 3208 14 0 0 chr5 75704477 75704834 -76832425 + IAPEz-int LTR ERVK 4001 4357 -2124 4 1162 6094 58 12 18 chr5 75704825 75705603 -76831656 + IAPEz-int LTR ERVK 5709 6481 0 4 1162 2805 107 56 34 chr5 75705603 75706068 -76831191 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1162 443 317 84 132 chr5 75707066 75707422 -76829837 - MLT2B2 LTR ERVL -176 339 1 4 1162 1103 244 66 41 chr5 75709475 75709795 -76827464 - MTD LTR MaLR -86 333 6 4 1162 544 224 16 8 chr5 75710117 75710237 -76827022 + ORR1E LTR MaLR 1 121 -238 4 1162 632 162 47 133 chr5 75710237 75710538 -76826721 + RLTR20D LTR ERVK 1 283 -285 4 1162 416 252 33 148 chr5 75710527 75710709 -76826550 + RLTR20D LTR ERVK 407 567 -1 4 1162 634 252 70 48 chr5 75710712 75710941 -76826318 + ORR1E LTR MaLR 120 353 -6 4 1162 531 251 55 0 chr5 75712787 75712950 -76824309 - MLT1A0 LTR MaLR -47 318 147 5 1162 1847 144 62 18 chr5 75713213 75713552 -76823707 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1162 306 284 127 58 chr5 75715637 75715935 -76821324 + MLT1H2 LTR MaLR 81 463 -86 5 1162 411 341 114 17 chr5 75721559 75721848 -76815411 + ORR1E LTR MaLR 2 318 -41 5 1162 250 230 65 65 chr5 75726207 75726300 -76810959 - MER51-int LTR ERV1 -400 7416 7324 5 1162 2238 72 65 7 chr5 75736913 75737222 -76800037 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1162 1750 189 107 6 chr5 75737490 75737835 -76799424 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 1 5 1162 378 308 143 35 chr5 75751083 75751342 -76785917 - LTR33 LTR ERVL -58 457 171 5 1162 1293 179 14 75 chr5 75752401 75752696 -76784563 - ORR1A4 LTR MaLR -52 277 1 5 1162 525 264 259 47 chr5 75753630 75753933 -76783326 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 5 1162 1986 130 38 0 chr5 75755634 75755980 -76781279 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 5 1163 2981 77 20 5 chr5 75765625 75766019 -76771240 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1163 1010 137 100 127 chr5 75767608 75767677 -76769582 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 288 5 1163 1010 137 100 127 chr5 75767823 75768053 -76769206 - ORR1A4 LTR MaLR -42 287 38 5 1163 248 281 83 38 chr5 75770660 75770793 -76766466 - MTE2b LTR MaLR -7 372 234 5 1163 231 220 165 29 chr5 75770810 75770913 -76766346 - MTE2b LTR MaLR -209 161 45 5 1163 241 255 91 10 chr5 75772556 75772655 -76764604 + ORR1E LTR MaLR 4 110 -249 5 1163 2506 83 3 3 chr5 75774327 75774654 -76762605 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1163 965 136 43 57 chr5 75774880 75775161 -76762098 + RMER17C LTR ERVK 1 277 -133 5 1163 2541 121 9 69 chr5 75776831 75777250 -76760009 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1163 1216 235 102 0 chr5 75780653 75780977 -76756282 - MTEb LTR MaLR -20 359 3 6 1163 285 239 8 114 chr5 75781623 75781755 -76755504 - MT2B LTR ERVL -337 264 147 6 1163 910 299 55 32 chr5 75782744 75783090 -76754169 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 6 1163 303 308 39 83 chr5 75788830 75788986 -76748273 + MLT1A0 LTR MaLR 1 149 -216 6 1163 537 273 50 31 chr5 75789279 75789438 -76747821 + MLT1A0 LTR MaLR 158 319 -46 6 1163 357 310 105 70 chr5 75789454 75789711 -76747548 + LTR79 LTR ERVL 257 522 -5 6 1163 574 139 176 11 chr5 75790727 75790924 -76746335 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 111 6 1163 303 357 70 15 chr5 75798698 75798897 -76738362 - MLT1N2 LTR MaLR -6 556 347 6 1163 346 257 19 19 chr5 75799281 75799384 -76737875 + ORR1D2 LTR MaLR 1 103 -267 6 1163 507 186 26 55 chr5 75799392 75799546 -76737713 + ORR1D2 LTR MaLR 214 377 -2 6 1163 1162 140 117 13 chr5 75801889 75802128 -76735131 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 96 6 1163 503 110 0 0 chr5 75802156 75802229 -76735030 + RLTR15 LTR ERVK 287 359 0 6 1163 761 293 81 55 chr5 75813430 75813556 -76723703 - MLT2B4 LTR ERVL -148 408 287 6 1163 3614 13 2 0 chr5 75813556 75813951 -76723308 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1163 9384 30 4 3 chr5 75813951 75815048 -76722211 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1163 3614 13 2 0 chr5 75815048 75815443 -76721816 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1163 761 293 81 55 chr5 75815443 75815697 -76721562 - MLT2B4 LTR ERVL -270 286 18 6 1163 1053 277 17 40 chr5 75818474 75818824 -76718435 - MTE2b LTR MaLR -28 351 10 6 1163 1902 125 0 116 chr5 75820229 75820600 -76716659 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 6 1163 743 282 43 43 chr5 75820852 75821108 -76716151 + MTD LTR MaLR 15 270 -149 6 1163 552 250 20 7 chr5 75821163 75821312 -76715947 + MTD LTR MaLR 269 419 0 6 1163 3265 53 2 0 chr5 75821317 75821712 -76715547 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1163 3559 18 2 0 chr5 75821809 75822204 -76715055 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1163 319 328 33 0 chr5 75825956 75826078 -76711181 - ORR1E LTR MaLR -233 126 1 6 1163 541 256 121 5 chr5 75826226 75826450 -76710809 + MLT1B LTR MaLR 141 390 0 6 1163 232 326 20 20 chr5 75826923 75827023 -76710236 + RMER15 LTR ERVL 371 470 -105 6 1163 488 245 229 30 chr5 75828894 75829219 -76708040 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 6 1163 3581 178 77 88 chr5 75829490 75829698 -76707561 + RMER19B LTR ERVK 1 159 -743 7 1163 3581 178 77 88 chr5 75830045 75830748 -76706511 + RMER19B LTR ERVK 160 902 0 7 1163 2546 86 3 0 chr5 75831704 75832030 -76705229 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1163 2099 174 6 22 chr5 75832636 75833001 -76704258 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 7 1163 255 157 0 73 chr5 75833324 75833379 -76703880 - ORR1E LTR MaLR 0 359 309 7 1163 584 258 131 81 chr5 75833388 75833463 -76703796 - RLTR12B LTR ERVK -30 498 404 7 1163 3274 62 0 0 chr5 75833463 75833863 -76703396 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1163 584 258 131 81 chr5 75833863 75834259 -76703000 - RLTR12B LTR ERVK -125 403 3 7 1163 828 234 122 17 chr5 75834262 75834492 -76702767 - MTD LTR MaLR -44 375 122 7 1163 227 271 33 33 chr5 75836499 75836560 -76700699 + MLT1J LTR MaLR 112 172 -340 7 1163 621 289 123 11 chr5 75838025 75838335 -76698924 - ORR1E LTR MaLR 0 370 7 7 1163 275 206 30 89 chr5 75839738 75839839 -76697420 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 314 7 1163 279 264 96 104 chr5 75840373 75840508 -76696751 - MLT1A1 LTR MaLR -274 134 1 7 1163 992 172 75 5 chr5 75840738 75840937 -76696322 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 172 7 1163 328 190 106 39 chr5 75841057 75841161 -76696098 - ORR1C2 LTR MaLR -198 131 21 7 1163 2152 134 5 126 chr5 75841167 75841602 -76695657 - ORR1C2-int LTR MaLR -1 1508 1127 7 1163 232 302 98 77 chr5 75852317 75852511 -76684748 + LTR85a LTR Gypsy? 224 421 -281 7 1163 387 260 40 110 chr5 75854111 75854297 -76682962 + MTEb LTR MaLR 152 348 -31 7 1163 293 294 35 56 chr5 75858929 75859073 -76678186 - MLT1A0 LTR MaLR -224 141 1 7 1163 727 214 75 184 chr5 75859807 75860199 -76677060 + MTE2a LTR MaLR 7 364 -15 7 1163 270 316 196 77 chr5 75860334 75860660 -76676599 + MLT1L LTR MaLR 237 601 -9 7 1163 270 265 48 58 chr5 75860950 75861054 -76676205 + ORR1E LTR MaLR 1 103 -256 7 1163 396 238 207 14 chr5 75861302 75861447 -76675812 + MLT1D LTR MaLR 320 492 -13 7 1163 468 334 119 56 chr5 75861950 75862327 -76674932 - LTR16C LTR ERVL -2 487 87 7 1163 546 360 5 50 chr5 75866484 75866683 -76670576 + ORR1E LTR MaLR 1 190 -169 7 1163 2688 48 0 0 chr5 75870697 75871008 -76666251 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 7 1163 1502 208 81 2 chr5 75871045 75871440 -76665819 - RMER10A LTR ERVL -5 437 12 7 1163 1131 232 125 49 chr5 75876298 75876642 -76660617 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1163 1646 219 51 22 chr5 75876953 75877308 -76659951 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 7 1163 365 325 105 102 chr5 75881302 75881634 -76655625 + MTEa LTR MaLR 1 333 -46 8 1163 4713 178 63 60 chr5 75883019 75883262 -76653997 - RLTR25B LTR ERVK -2 1026 813 8 1163 4713 178 63 60 chr5 75883310 75884089 -76653170 - RLTR25B LTR ERVK -216 812 1 8 1163 337 226 26 121 chr5 75885718 75885834 -76651425 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 8 1164 554 295 127 48 chr5 75897418 75897629 -76639630 + ORR1E LTR MaLR 3 221 -138 8 1164 554 295 127 48 chr5 75897678 75897797 -76639462 + ORR1E LTR MaLR 222 359 0 8 1164 563 306 75 130 chr5 75897799 75898145 -76639114 + ORR1E-int LTR MaLR 1 327 -1253 8 1164 2083 278 74 5 chr5 75898153 75898723 -76638536 + ORR1E-int LTR MaLR 917 1527 -53 8 1164 691 271 141 28 chr5 75898723 75899042 -76638217 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 8 1164 254 306 80 40 chr5 75904749 75904950 -76632309 - LTR82A LTR ERVL -368 504 296 8 1164 964 145 271 8 chr5 75909287 75909538 -76627721 + ORR1B2 LTR MaLR 43 359 -8 8 1164 277 308 54 66 chr5 75909540 75909707 -76627552 + LTR40b LTR ERVL 102 266 -253 8 1164 283 293 56 16 chr5 75910111 75910236 -76627023 + LTR40b LTR ERVL 333 462 0 8 1164 757 287 80 55 chr5 75913161 75913563 -76623696 + MLT1C LTR MaLR 56 467 0 8 1164 2127 115 12 58 chr5 75918988 75919331 -76617928 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1164 616 264 130 10 chr5 75920646 75920907 -76616352 + MLT1A0 LTR MaLR 61 400 -8 8 1164 786 145 0 8 chr5 75920908 75921040 -76616219 + ORR1C1 LTR MaLR 248 378 0 8 1164 332 85 0 0 chr5 75921627 75921674 -76615585 - RMER6D LTR ERVK -671 49 3 8 1164 3376 38 2 10 chr5 75921766 75922169 -76615090 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1164 2348 125 37 42 chr5 75922954 75923363 -76613896 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 9 1164 1351 231 18 161 chr5 75923764 75924390 -76612869 + MT2B LTR ERVL 1 536 -65 9 1164 814 234 130 19 chr5 75924928 75925189 -76612070 + MLT1A0 LTR MaLR 1 290 -75 9 1164 1248 204 90 0 chr5 75926719 75927008 -76610251 - ORR1D1-int LTR MaLR -1052 318 4 9 1164 1589 205 83 20 chr5 75927011 75927359 -76609900 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 9 1164 1162 144 43 168 chr5 75927364 75927700 -76609559 + MTD-int LTR MaLR 911 1203 -55 9 1164 1162 144 43 168 chr5 75928033 75928089 -76609170 + MTD-int LTR MaLR 1204 1254 -4 9 1164 1652 218 67 3 chr5 75928098 75928485 -76608774 + MTD LTR MaLR 6 417 -2 9 1164 531 258 117 30 chr5 75929769 75930007 -76607252 + MTE2a LTR MaLR 1 256 -123 9 1164 904 248 21 8 chr5 75930455 75930691 -76606568 + ORR1D2 LTR MaLR 1 239 -131 9 1164 310 274 19 19 chr5 75930801 75930909 -76606350 + ORR1D2 LTR MaLR 258 365 -5 9 1164 242 158 65 81 chr5 75931744 75931806 -76605453 + ORR1D2 LTR MaLR 296 356 -14 9 1164 1147 259 87 26 chr5 75938074 75938440 -76598819 + MTD LTR MaLR 3 396 -23 9 1164 1147 259 87 26 chr5 75938478 75938492 -76598767 + MTD LTR MaLR 397 406 -13 9 1164 1246 251 76 76 chr5 75947535 75947869 -76589390 - MTD LTR MaLR -23 396 55 9 1164 1246 251 76 76 chr5 75948243 75948303 -76588956 - MTD LTR MaLR -365 54 2 9 1164 2334 99 12 12 chr5 75948462 75948789 -76588470 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1164 1351 234 76 141 chr5 75954078 75954526 -76582733 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 1164 871 273 126 9 chr5 75957981 75958314 -76578945 + MTEb LTR MaLR 4 375 -4 1 1164 1991 155 3 6 chr5 75958786 75959111 -76578148 + ORR1A1 LTR MaLR 1 324 -22 1 1164 405 287 160 60 chr5 75967018 75967135 -76570124 - MT2B LTR ERVL -444 157 21 1 1164 348 354 141 51 chr5 75967021 75967193 -76570066 + MLT1K LTR MaLR 9 184 -411 1 1164 348 354 141 51 chr5 75967325 75967465 -76569794 + MLT1K LTR MaLR 185 348 -247 1 1164 389 229 9 86 chr5 75969780 75969885 -76567374 + MT2B LTR ERVL 161 257 -344 1 1164 1409 231 95 16 chr5 75982631 75983009 -76554250 - MTD LTR MaLR -11 408 1 1 1164 355 281 118 123 chr5 76013649 76013998 -76523261 - ORR1E LTR MaLR -12 347 1 2 1164 304 289 113 113 chr5 76020052 76020309 -76516950 - ORR1E LTR MaLR -15 344 88 3 1164 919 163 203 5 chr5 76020646 76020707 -76516552 - MT2A LTR ERVL 0 533 469 3 1164 919 163 203 5 chr5 76020767 76020927 -76516332 - MT2A LTR ERVL -65 468 268 3 1164 776 164 8 0 chr5 76020926 76021054 -76516205 - MT2A LTR ERVL -401 132 4 3 1165 2646 31 10 236 chr5 76038598 76039102 -76498157 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1165 10272 21 1 1 chr5 76039104 76040992 -76496267 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 6 1165 2672 34 10 233 chr5 76041002 76041504 -76495755 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1165 301 322 0 0 chr5 76048222 76048312 -76488947 - MLT1J LTR MaLR -340 172 83 6 1165 1598 236 85 10 chr5 76054984 76055373 -76481886 - MTD LTR MaLR -1 418 1 7 1165 701 142 0 52 chr5 76059352 76059486 -76477773 + MT2B LTR ERVL 1 127 -406 8 1165 756 289 31 65 chr5 76060187 76060488 -76476771 + MT2B LTR ERVL 274 546 -55 8 1165 251 222 37 0 chr5 76060604 76060639 -76476620 + MLT2B5 LTR ERVL 472 509 -46 8 1165 322 67 0 0 chr5 76060678 76060723 -76476536 + MT2B LTR ERVL 489 533 0 8 1165 922 260 24 99 chr5 76061399 76061613 -76475646 + ORR1D1 LTR MaLR 9 201 -173 9 1165 3492 23 5 0 chr5 76061613 76062007 -76475252 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1165 922 260 24 99 chr5 76062007 76062125 -76475134 + ORR1D1 LTR MaLR 202 316 -58 9 1165 1707 152 11 95 chr5 76065701 76066079 -76471180 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 1 1165 345 262 0 96 chr5 76067045 76067180 -76470079 - MTEa LTR MaLR -254 125 4 1 1165 2588 41 77 12 chr5 76071071 76071395 -76465864 + ORR1A1 LTR MaLR 1 345 -1 1 1165 845 244 77 23 chr5 76072047 76072307 -76464952 - MLT2B4 LTR ERVL -271 285 12 1 1165 2475 168 30 34 chr5 76074802 76075270 -76461989 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 1 1165 235 306 38 64 chr5 76075929 76076086 -76461173 + MLT1A LTR MaLR 34 186 -188 1 1165 612 229 121 11 chr5 76076062 76076252 -76461007 + ORR1E LTR MaLR 96 306 -53 1 1165 2226 153 11 16 chr5 76079027 76079406 -76457853 - RLTR14 LTR ERV1 -3 379 3 1 1165 555 303 60 36 chr5 76080043 76080324 -76456935 - MLT1H2-int LTR MaLR -1003 406 119 1 1165 386 239 110 0 chr5 76080418 76080527 -76456732 - MLT1H2 LTR MaLR -8 481 361 1 1165 3002 177 86 23 chr5 76081620 76082269 -76454990 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 1 1165 918 241 70 39 chr5 76082269 76082589 -76454670 + MT2B LTR ERVL 211 588 -13 1 1165 1811 98 62 109 chr5 76084794 76085162 -76452097 + ORR1B1 LTR MaLR 43 393 -1 1 1165 1433 205 108 38 chr5 76093020 76093390 -76443869 - MTD LTR MaLR -14 405 10 1 1165 236 279 0 32 chr5 76105703 76105766 -76431493 + MTE2b LTR MaLR 283 343 -36 1 1165 650 235 112 14 chr5 76107186 76107471 -76429788 + RLTR15 LTR ERVK 30 342 -17 1 1165 478 398 47 9 chr5 76107777 76108119 -76429140 + MLT1J LTR MaLR 1 355 -157 1 1165 758 261 41 0 chr5 76108493 76108711 -76428548 - MLT1B LTR MaLR -2 388 162 1 1165 1335 246 30 21 chr5 76108817 76109153 -76428106 - MTE2a LTR MaLR 0 379 41 1 1165 2485 136 5 38 chr5 76109289 76109680 -76427579 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1165 236 320 119 8 chr5 76113265 76113391 -76423868 - ORR1E LTR MaLR -168 191 52 2 1165 2243 142 55 18 chr5 76113462 76113842 -76423417 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1165 717 337 61 12 chr5 76117015 76117342 -76419917 + MLT1A0 LTR MaLR 1 343 -22 2 1165 869 266 136 19 chr5 76120435 76120810 -76416449 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1165 578 337 52 67 chr5 76134754 76134930 -76402329 + MLT1B LTR MaLR 9 165 -225 2 1165 578 337 52 67 chr5 76135132 76135343 -76401916 + MLT1B LTR MaLR 166 390 0 2 1165 703 267 115 15 chr5 76145032 76145207 -76392052 - MLT1B LTR MaLR -16 374 185 2 1165 2253 139 10 90 chr5 76145207 76145618 -76391641 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1165 703 267 115 15 chr5 76145618 76145712 -76391547 - MLT1B LTR MaLR -206 184 78 2 1165 244 263 25 62 chr5 76146235 76146316 -76390943 - MLT1B LTR MaLR -312 78 1 2 1165 359 306 14 78 chr5 76147811 76147997 -76389262 + MLT1J2 LTR MaLR 263 443 -5 2 1166 362 289 0 0 chr5 76153065 76153162 -76384097 + MLT1A1 LTR MaLR 300 396 -12 2 1166 780 263 71 29 chr5 76155195 76155434 -76381825 + ORR1D2 LTR MaLR 6 254 -116 2 1166 826 212 15 29 chr5 76161441 76161645 -76375614 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 168 2 1166 322 206 0 0 chr5 76161642 76161705 -76375554 - ORR1D2 LTR MaLR -306 64 2 2 1166 271 353 47 109 chr5 76163426 76163785 -76373474 + MLT1I LTR MaLR 75 411 0 2 1166 539 309 58 89 chr5 76169526 76169885 -76367374 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 2 1166 370 244 78 0 chr5 76170376 76170466 -76366793 + LTR53 LTR ERVL 6 102 -417 3 1166 288 345 53 29 chr5 76170553 76170798 -76366461 + LTR53 LTR ERVL 244 494 -25 3 1166 719 241 206 10 chr5 76175751 76176061 -76361198 - MLT1A LTR MaLR 0 374 4 3 1166 861 324 68 16 chr5 76181603 76182045 -76355214 - MLT1C LTR MaLR 0 467 3 3 1166 2226 137 72 0 chr5 76182110 76182497 -76354762 + MTC LTR MaLR 7 421 0 3 1166 243 353 106 7 chr5 76183861 76184012 -76353247 + MLT1F2 LTR MaLR 134 299 -261 3 1166 271 339 9 18 chr5 76184111 76184222 -76353037 + MLT1F2 LTR MaLR 451 560 0 3 1166 517 219 23 47 chr5 76184472 76184601 -76352658 + LTR85c LTR Gypsy? 2 127 -696 3 1166 259 323 29 103 chr5 76184577 76184822 -76352437 + LTR85c LTR Gypsy? 521 761 -62 3 1166 1462 203 12 138 chr5 76189864 76190046 -76347213 + ORR1D1 LTR MaLR 1 128 -246 3 1166 1462 203 12 138 chr5 76190193 76190438 -76346821 + ORR1D1 LTR MaLR 129 374 0 3 1166 1622 136 22 0 chr5 76190676 76190948 -76346311 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 32 3 1166 2088 47 0 0 chr5 76190949 76191225 -76346034 - RLTR10A LTR ERVK -135 276 1 3 1166 382 303 26 65 chr5 76192203 76192486 -76344773 - ORR1E LTR MaLR 0 379 95 3 1166 225 179 0 0 chr5 76192566 76192605 -76344654 - MLT2B5 LTR ERVL -493 108 70 3 1166 368 253 0 44 chr5 76192572 76192663 -76344596 - ORR1E LTR MaLR -287 92 6 3 1166 435 347 46 52 chr5 76194492 76194799 -76342460 + MLT1B LTR MaLR 50 354 -36 3 1166 775 245 109 44 chr5 76197440 76197918 -76339341 + MT2A LTR ERVL 1 493 -40 3 1166 238 284 39 39 chr5 76199141 76199218 -76338041 - MER21B LTR ERV1 -91 772 696 3 1166 523 316 232 10 chr5 76199388 76199694 -76337565 - MER21B LTR ERV1 -295 568 195 3 1166 314 271 83 0 chr5 76199737 76199833 -76337426 - MER21B LTR ERV1 -754 109 6 3 1166 1738 189 20 6 chr5 76201144 76201490 -76335769 + ORR1B2 LTR MaLR 17 367 0 3 1166 461 351 89 25 chr5 76203470 76203707 -76333552 + MLT1H1 LTR MaLR 12 263 -292 3 1166 490 260 37 85 chr5 76204124 76204288 -76332971 + MTEb LTR MaLR 1 156 -223 3 1166 387 269 78 0 chr5 76204431 76204572 -76332687 - RMER20B LTR ERVK -296 331 180 3 1166 743 220 55 5 chr5 76204737 76204938 -76332321 + MTEb LTR MaLR 167 377 -2 3 1166 495 342 53 69 chr5 76216094 76216383 -76320876 - MLT1C LTR MaLR -4 463 184 4 1166 495 342 53 69 chr5 76216565 76216693 -76320566 - MLT1C LTR MaLR -284 183 53 4 1166 599 330 60 68 chr5 76216718 76217099 -76320160 - MLT1C-int LTR MaLR 0 1371 994 4 1166 836 286 38 58 chr5 76217097 76217305 -76319954 - MLT1C-int LTR MaLR -939 432 233 4 1166 836 286 38 58 chr5 76217460 76217596 -76319663 - MLT1C-int LTR MaLR -1139 232 95 4 1166 318 310 10 0 chr5 76218092 76218192 -76319067 - MLT1C-int LTR MaLR -1270 101 1 4 1166 649 286 33 0 chr5 76218291 76218473 -76318786 - MLT2C1 LTR ERVL -192 205 18 4 1166 412 342 214 12 chr5 76225782 76226030 -76311229 + MLT1G1 LTR MaLR 214 511 -68 4 1166 237 333 54 82 chr5 76227858 76228005 -76309254 - MLT1G1 LTR MaLR -14 565 423 4 1166 225 300 29 0 chr5 76228043 76228113 -76309146 - LTR81A LTR ERV1? -1098 252 181 4 1166 3449 64 28 0 chr5 76234135 76234557 -76302702 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 3 4 1166 1194 322 34 22 chr5 76237759 76237814 -76299445 - MLT2B4 LTR ERVL -6 550 496 4 1166 1194 322 34 22 chr5 76237861 76238342 -76298917 - MLT2B4 LTR ERVL -61 495 8 4 1166 631 264 110 21 chr5 76238345 76238581 -76298678 + MLT1B LTR MaLR 134 390 0 4 1166 261 325 73 67 chr5 76239821 76239986 -76297273 - MLT1D LTR MaLR -308 197 32 4 1166 955 307 70 6 chr5 76240265 76240580 -76296679 - MLT1A0 LTR MaLR -14 351 17 4 1166 257 321 226 0 chr5 76244394 76244562 -76292697 - MLT1I LTR MaLR -205 206 1 4 1166 634 253 19 49 chr5 76244806 76244968 -76292291 - RLTR20D LTR ERVK -5 563 407 4 1166 551 233 115 77 chr5 76244943 76245203 -76292056 - RLTR16 LTR ERVK -235 270 1 4 1166 311 284 12 0 chr5 76245203 76245281 -76291978 + MTEb LTR MaLR 299 377 -2 4 1166 492 323 95 68 chr5 76246889 76247214 -76290045 + MLT1A LTR MaLR 11 344 -30 4 1166 373 298 25 0 chr5 76247760 76247881 -76289378 + ERVL-E-int LTR ERVL 4607 4730 -937 4 1166 2139 120 6 6 chr5 76248376 76248695 -76288564 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1166 334 299 85 80 chr5 76250665 76250692 -76286567 - LTR33A LTR ERVL -314 206 180 4 1166 334 299 85 80 chr5 76250772 76250944 -76286315 - LTR33A LTR ERVL -341 179 7 4 1166 487 263 9 9 chr5 76252095 76252210 -76285049 + MLT1A0 LTR MaLR 6 120 -245 4 1166 241 262 69 112 chr5 76252623 76252739 -76284520 + MLT1A0 LTR MaLR 330 440 -27 4 1166 279 194 81 168 chr5 76255635 76255784 -76281475 + MTE2a LTR MaLR 195 330 -49 4 1166 238 264 54 54 chr5 76255939 76256031 -76281228 - MLT1J LTR MaLR -180 332 241 4 1166 254 293 30 117 chr5 76256109 76256186 -76281073 - MLT1J LTR MaLR -303 209 136 4 1166 2977 72 23 18 chr5 76256186 76256584 -76280675 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1166 254 293 30 117 chr5 76256584 76256703 -76280556 - MLT1J LTR MaLR -377 135 31 4 1166 1731 206 59 36 chr5 76266005 76266397 -76270862 + MTD LTR MaLR 18 418 -1 4 1166 401 260 165 60 chr5 76268145 76268509 -76268750 + MLT1A1 LTR MaLR 4 405 -3 5 1166 262 399 51 51 chr5 76268699 76268955 -76268304 - MLT1N2 LTR MaLR -303 259 4 5 1166 1295 232 40 156 chr5 76271821 76272271 -76264988 + MTC LTR MaLR 24 421 0 5 1166 676 285 175 58 chr5 76275057 76275366 -76261893 - ORR1E LTR MaLR -2 357 13 5 1166 285 345 8 8 chr5 76279452 76279569 -76257690 + MLT1A1 LTR MaLR 29 145 -263 5 1166 2890 161 39 51 chr5 76282355 76282923 -76254336 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 5 1167 240 272 42 32 chr5 76286213 76286308 -76250951 - MLT1J2 LTR MaLR -305 143 48 5 1167 2105 145 55 20 chr5 76287552 76287953 -76249306 - MTC LTR MaLR -6 415 1 5 1167 1454 182 19 16 chr5 76290875 76291182 -76246077 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 146 5 1167 1221 258 54 21 chr5 76294641 76294977 -76242282 - MTEa LTR MaLR -8 371 25 5 1167 1701 182 125 22 chr5 76297992 76298407 -76238852 + RLTR16 LTR ERVK 1 458 -47 5 1167 3988 138 38 22 chr5 76298459 76299140 -76238119 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 5 1167 298 263 226 26 chr5 76300730 76300964 -76236295 - LTR16A1 LTR ERVL -3 453 173 5 1167 1884 99 126 96 chr5 76305736 76306092 -76231167 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1167 2128 132 3 3 chr5 76311431 76311757 -76225502 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1167 571 253 176 17 chr5 76323625 76323787 -76213472 + MTEa LTR MaLR 1 198 -181 5 1167 571 253 176 17 chr5 76323851 76323921 -76213338 + MTEa LTR MaLR 199 269 -110 5 1167 288 331 88 72 chr5 76325420 76325726 -76211533 + MLT1A LTR MaLR 62 372 -2 5 1167 3090 68 2 5 chr5 76356087 76356488 -76180771 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1167 1044 225 135 6 chr5 76378676 76378994 -76158265 - ORR1D2 LTR MaLR -11 359 1 6 1167 927 255 138 4 chr5 76381514 76381789 -76155470 + ORR1E LTR MaLR 1 312 -47 6 1167 494 350 28 9 chr5 76385758 76385974 -76151285 - MLT1F-int LTR MaLR -595 894 675 6 1167 258 347 48 70 chr5 76385998 76386227 -76151032 - MLT1F-int LTR MaLR -1262 227 4 6 1167 790 298 116 11 chr5 76386235 76386615 -76150644 - MLT1F LTR MaLR -5 543 124 6 1167 1387 218 72 3 chr5 76386850 76387182 -76150077 - MTD LTR MaLR -64 355 1 6 1167 2160 154 41 36 chr5 76393557 76393653 -76143606 + MTC LTR MaLR 1 95 -326 6 1167 2160 154 41 36 chr5 76393800 76394114 -76143145 + MTC LTR MaLR 96 413 -8 6 1167 507 309 128 17 chr5 76405278 76405568 -76131691 - MLT1K LTR MaLR -113 482 161 7 1167 1122 277 74 6 chr5 76406501 76406839 -76130420 - MTE2b LTR MaLR -18 361 1 7 1168 254 154 88 44 chr5 76418038 76418106 -76119153 + MTEb LTR MaLR 278 348 -31 7 1168 278 323 32 0 chr5 76426171 76426264 -76110995 + MLT1A1 LTR MaLR 3 98 -310 7 1168 470 252 63 25 chr5 76426270 76426429 -76110830 + MLT1A1 LTR MaLR 244 408 0 7 1168 2637 98 95 2 chr5 76432271 76432718 -76104541 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 7 1168 400 355 60 13 chr5 76434226 76434597 -76102662 - MLT1D LTR MaLR -76 429 7 7 1168 332 242 154 29 chr5 76434650 76434786 -76102473 - RLTR14 LTR ERV1 -6 376 224 7 1168 247 233 17 0 chr5 76435012 76435072 -76102187 + RLTR19C LTR ERVK 36 96 -410 7 1168 519 254 81 30 chr5 76437916 76438151 -76099108 + MLT2B2 LTR ERVL 304 562 0 7 1168 1831 128 26 57 chr5 76438686 76439142 -76098117 - RMER17C LTR ERVK -524 434 16 7 1168 633 306 65 45 chr5 76447662 76448080 -76089179 - RLTR23 LTR ERV1 -4 426 1 7 1168 1332 189 160 93 chr5 76448091 76448523 -76088736 - MT2A LTR ERVL -69 464 4 7 1168 1234 258 41 22 chr5 76450687 76451056 -76086203 - MTEb LTR MaLR -1 378 3 7 1168 543 302 79 88 chr5 76454751 76455158 -76082101 + MLT1C LTR MaLR 61 463 -4 7 1168 225 150 0 0 chr5 76465701 76465741 -76071518 - MLT2C2 LTR ERVL -424 40 1 7 1168 535 309 159 26 chr5 76468708 76469047 -76068212 - LTR16B1 LTR ERVL -96 384 1 8 1168 3382 32 4 33 chr5 76476984 76477440 -76059819 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 451 8 1168 3202 58 27 2 chr5 76477432 76477879 -76059380 - RLTR13B3 LTR ERVK -308 621 164 8 1168 3986 12 0 12 chr5 76527879 76528373 -76008886 - MT2_Mm LTR ERVL -5 488 1 1 1168 263 298 11 35 chr5 76530102 76530189 -76007070 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 476 6 1168 1807 156 31 38 chr5 76530202 76530661 -76006598 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 410 -151 7 1168 1033 209 0 0 chr5 76530669 76530851 -76006408 - RLTR20B1 LTR ERVK -381 182 1 8 1168 2839 105 5 5 chr5 76532767 76533170 -76004089 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 1 1168 1030 256 100 12 chr5 76535333 76535654 -76001605 + MLT2D LTR ERVL 2 350 -64 1 1168 616 301 79 5 chr5 76537510 76537724 -75999535 + LTR88c LTR Genie? 61 290 -572 2 1168 1275 143 8 102 chr5 76541754 76542018 -75995241 + ORR1C2 LTR MaLR 143 381 -3 3 1168 1057 239 26 20 chr5 76542914 76543255 -75994004 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 3 1168 331 249 98 108 chr5 76545913 76545927 -75991332 + ORR1D2 LTR MaLR 170 182 -188 3 18 331 249 98 108 chr5 76546023 76546211 -75991048 + ORR1D2 LTR MaLR 183 370 0 3 1169 2114 217 40 106 chr5 76551545 76552199 -75985060 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 1169 2118 175 84 108 chr5 76555345 76555891 -75981368 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 6 1169 966 181 6 22 chr5 76557757 76557938 -75979321 + MTC LTR MaLR 66 243 -178 7 1169 2853 113 20 25 chr5 76559889 76560399 -75976860 + RLTR28 LTR ERVL 18 524 0 8 1169 818 186 62 29 chr5 76561615 76561825 -75975434 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 311 8 1169 1409 236 53 20 chr5 76561873 76562081 -75975178 - MYSERV-int LTR ERVK -1834 4716 4493 8 1169 1409 251 70 22 chr5 76562105 76562366 -75974893 - MYSERV-int LTR ERVK -4344 4615 4311 8 1169 316 281 14 72 chr5 76563040 76563178 -75974081 - RLTR18-int LTR ERVK -512 4849 4720 8 1169 969 186 117 50 chr5 76563181 76563464 -75973795 - MYSERV6-int LTR ERVK -2247 6712 6411 8 1169 449 179 50 94 chr5 76563686 76563846 -75973413 - MYSERV6-int LTR ERVK -3980 4979 4827 8 1169 278 271 121 71 chr5 76563926 76564298 -75972961 - RLTR12B LTR ERVK 0 568 161 9 1169 1982 202 63 20 chr5 76565031 76565536 -75971723 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 9 1169 1719 158 39 114 chr5 76565558 76566022 -75971237 + RMER15 LTR ERVL 1 429 -146 9 1169 1671 130 73 7 chr5 76566022 76566308 -75970951 + ORR1B1 LTR MaLR 1 305 -89 9 1169 318 283 9 62 chr5 76566327 76566440 -75970819 - RMER10B LTR ERVL 0 398 292 9 1169 2278 109 22 0 chr5 76566555 76566875 -75970384 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1169 360 309 21 52 chr5 76566941 76567132 -75970127 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 246 9 1169 539 221 47 0 chr5 76567512 76567639 -75969620 + RMER15 LTR ERVL 442 574 -1 9 1169 461 147 151 68 chr5 76567778 76567924 -75969335 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 213 9 1169 251 158 33 50 chr5 76567946 76568006 -75969253 + MTC LTR MaLR 8 66 -355 9 1169 1720 120 128 29 chr5 76575348 76575699 -75961560 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 1169 1064 273 62 0 chr5 76579989 76580330 -75956929 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 9 1 1169 3625 33 28 5 chr5 76580566 76580992 -75956267 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1169 279 210 18 99 chr5 76582085 76582196 -75955063 - MT2B LTR ERVL -344 257 156 1 1169 1872 169 154 23 chr5 76585235 76585669 -75951590 - RMER15 LTR ERVL -52 523 33 1 1169 250 324 54 36 chr5 76587465 76587577 -75949682 - RMER15 LTR ERVL -5 570 457 1 1169 754 287 35 22 chr5 76588998 76589226 -75948033 - RMER15-int LTR ERVL -2770 2229 1999 1 1169 463 332 29 68 chr5 76589426 76589707 -75947552 - ORR1E LTR MaLR -59 300 31 1 1169 278 252 36 72 chr5 76589710 76589821 -75947438 + RLTR25B LTR ERVK 450 556 -472 1 1169 2336 122 22 30 chr5 76596344 76596714 -75940545 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1169 2441 165 179 37 chr5 76597196 76597731 -75939528 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1169 714 252 98 35 chr5 76599868 76600123 -75937136 + MLT2C1 LTR ERVL 1 271 -126 1 1169 305 235 0 0 chr5 76600446 76600514 -75936745 - RMER16 LTR ERVK 0 533 466 1 1169 1987 144 12 19 chr5 76604194 76604519 -75932740 - RMER16-int LTR ERVK -1433 3973 3651 1 1169 2983 163 42 32 chr5 76604627 76605553 -75931706 - RLTR19-int LTR ERVK -5250 2156 572 1 1169 1343 177 8 35 chr5 76605544 76605802 -75931457 - RLTR19-int LTR ERVK -4968 438 188 1 1169 321 312 139 6 chr5 76605937 76606095 -75931164 - RLTR19-int LTR ERVK -5208 198 20 1 1169 892 191 120 45 chr5 76606120 76606444 -75930815 - RMER16 LTR ERVK -18 515 1 1 1169 1490 202 80 26 chr5 76608841 76609267 -75927992 - RLTR11A2 LTR ERVK -78 449 1 1 1169 269 188 0 99 chr5 76610313 76610384 -75926875 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 509 1 1169 388 287 77 29 chr5 76619713 76619921 -75917338 - MLT2C2 LTR ERVL -246 218 1 1 1169 1653 104 104 0 chr5 76620528 76620815 -75916444 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 3 1 1169 1718 188 14 92 chr5 76624045 76624109 -75913150 - ORR1B1 LTR MaLR -5 389 355 2 1169 1718 188 14 92 chr5 76624257 76624614 -75912645 - ORR1B1 LTR MaLR -40 354 1 2 1169 1660 148 14 3 chr5 76625409 76625694 -75911565 + ORR1A4 LTR MaLR 1 288 -41 2 1169 383 73 0 0 chr5 76626938 76626993 -75910266 + ORR1A4 LTR MaLR 272 326 0 2 1169 808 261 94 4 chr5 76635726 76635991 -75901268 + MTE2b LTR MaLR 78 366 -13 2 1169 1267 143 93 4 chr5 76646361 76646607 -75890652 - RMER4B LTR ERVK 0 585 318 2 1169 1460 126 153 3 chr5 76653373 76653660 -75883599 - RMER4B LTR ERVK -255 330 1 2 1169 3163 46 8 2 chr5 76670132 76670526 -75866733 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1170 1987 68 4 0 chr5 76679089 76679355 -75857904 + MTB LTR MaLR 9 275 -125 2 1170 440 273 124 40 chr5 76691052 76691254 -75846005 + MLT1A0 LTR MaLR 19 237 -128 2 1170 1231 207 81 3 chr5 76699330 76699658 -75837601 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 1170 893 256 170 6 chr5 76699855 76700173 -75837086 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 3 1170 2142 118 15 3 chr5 76704874 76705198 -75832061 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 328 -9 3 1170 296 119 56 69 chr5 76705208 76705280 -75831979 + IAPEz-int LTR ERVK 3 73 -1914 3 1170 10334 111 108 31 chr5 76705279 76707443 -75829816 + IAPEz-int LTR ERVK 17 2345 -4136 3 1170 368 89 0 0 chr5 76707442 76707498 -75829761 + IAPEz-int LTR ERVK 2719 2774 -3707 3 1170 2974 20 0 0 chr5 76707496 76707853 -75829406 + IAPEz-int LTR ERVK 4001 4357 -2124 3 1170 5579 59 13 18 chr5 76707844 76708619 -75828640 + IAPEz-int LTR ERVK 5709 6479 -2 3 1170 2142 118 15 3 chr5 76708621 76708945 -75828314 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 328 -9 3 1170 397 286 45 69 chr5 76709770 76710055 -75827204 + MTEb LTR MaLR 18 305 -74 3 1170 1704 210 40 92 chr5 76718399 76718897 -75818362 + RMER19C LTR ERVK 140 611 0 3 1170 571 238 164 39 chr5 76719372 76719604 -75817655 + MLT1A0 LTR MaLR 1 261 -104 3 1170 316 228 51 0 chr5 76726746 76726825 -75810434 + MTEa LTR MaLR 290 372 -7 3 1170 887 227 202 72 chr5 76744503 76744835 -75792424 - MTE2a LTR MaLR -3 376 2 3 1170 2514 108 15 3 chr5 76745603 76745945 -75791314 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1170 2133 153 21 8 chr5 76748795 76749177 -75788082 + RMER15 LTR ERVL 1 387 -188 3 1170 614 225 101 20 chr5 76749151 76749376 -75787883 + MTE2b LTR MaLR 100 366 -13 3 1170 460 375 6 12 chr5 76749855 76750025 -75787234 + MER74A LTR ERVL 18 186 -372 3 1170 758 265 106 4 chr5 76750295 76750530 -75786729 + MER74A LTR ERVL 215 473 -85 3 1170 340 298 122 32 chr5 76750892 76751048 -75786211 - MLT1N2 LTR MaLR -30 532 363 3 1170 758 283 128 15 chr5 76752502 76752775 -75784484 - ORR1D2 LTR MaLR -40 330 27 3 1170 248 278 43 164 chr5 76754754 76754870 -75782389 + MLT1E1A LTR MaLR 313 414 -266 4 1170 381 195 37 0 chr5 76755826 76755908 -75781351 - MTD LTR MaLR 0 419 335 4 1170 258 149 21 0 chr5 76757192 76757239 -75780020 - MER57A-int LTR ERV1 -5040 1147 1100 4 1170 3981 35 5 0 chr5 76757790 76758224 -75779035 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1170 1029 226 169 23 chr5 76777652 76777960 -75759299 + ORR1E LTR MaLR 3 355 -4 4 1170 259 193 198 35 chr5 76789302 76789388 -75747871 - MLT1A1 LTR MaLR -41 367 268 4 1170 1556 235 36 19 chr5 76798242 76798654 -75738605 - MTC LTR MaLR 0 421 3 4 1170 600 137 3 9 chr5 76799368 76799479 -75737780 - MTC LTR MaLR -293 114 1 4 1170 301 349 18 28 chr5 76805237 76805346 -75731913 + LTR16E2 LTR ERVL 93 200 -368 4 1170 1989 116 9 15 chr5 76805983 76806307 -75730952 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 8 4 1171 696 265 92 9 chr5 76818442 76818659 -75718600 + MTEb LTR MaLR 4 238 -141 5 1171 2242 137 55 11 chr5 76828671 76829033 -75708226 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 1171 2116 89 19 3 chr5 76829777 76830091 -75707168 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 89 5 1171 490 303 97 0 chr5 76830189 76830344 -75706915 + MTD LTR MaLR 17 186 -233 5 1171 1159 212 69 50 chr5 76836620 76836962 -75700297 + MT2A LTR ERVL 6 483 -118 5 1171 437 175 2 0 chr5 76837009 76837091 -75700168 - MT2A LTR ERVL -47 554 391 5 1171 985 230 63 20 chr5 76838629 76838882 -75698377 - MTD LTR MaLR 0 419 156 5 1171 1458 162 142 6 chr5 76839075 76839392 -75697867 + RLTR11A LTR ERVK 1 360 -168 5 1171 2100 89 15 57 chr5 76839993 76840326 -75696933 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 1171 828 258 182 33 chr5 76840916 76841128 -75696131 - MTE2a LTR MaLR -1 378 118 5 1171 3081 48 20 42 chr5 76841128 76841537 -75695722 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1171 828 258 182 33 chr5 76841537 76841653 -75695606 - MTE2a LTR MaLR -262 117 1 5 1171 700 283 73 145 chr5 76842341 76842713 -75694546 + MTEa LTR MaLR 1 345 -34 5 1171 854 309 50 6 chr5 76844396 76844734 -75692525 + MLT1A0 LTR MaLR 1 353 -12 5 1171 289 364 50 13 chr5 76847139 76847378 -75689881 - MER74A LTR ERVL -138 420 173 5 1171 689 226 6 6 chr5 76849040 76849196 -75688063 - MTD LTR MaLR -263 156 1 5 1171 4461 102 88 21 chr5 76851568 76852326 -75684933 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 5 1171 633 268 145 57 chr5 76856958 76857278 -75679981 + MTEa LTR MaLR 1 340 -30 5 1171 275 278 22 0 chr5 76857904 76857994 -75679265 - MLT1A1 LTR MaLR -24 384 293 5 1171 345 371 54 31 chr5 76861452 76861803 -75675456 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 5 1171 3595 129 24 19 chr5 76862137 76862776 -75674483 - RMER6A LTR ERVK -6 750 109 5 1171 3012 30 0 88 chr5 76863733 76864133 -75673126 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 5 1171 3596 13 2 0 chr5 76869034 76869429 -75667830 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1171 2278 123 3 0 chr5 76871429 76871754 -75665505 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 6 1171 3423 152 94 142 chr5 76871817 76872757 -75664502 + RMER19B LTR ERVK 1 895 -7 6 1171 1984 122 82 7 chr5 76879811 76880117 -75657142 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1171 1271 299 45 0 chr5 76882048 76882403 -75654856 - MTE2b LTR MaLR -8 371 1 6 1171 951 232 129 38 chr5 76889345 76889710 -75647549 - MTD LTR MaLR 0 419 6 6 1171 373 345 166 31 chr5 76890891 76891247 -75646012 - LTR16A1 LTR ERVL -2 454 51 6 1171 481 200 9 19 chr5 76891756 76891863 -75645396 - MTD LTR MaLR -272 147 42 6 1171 270 287 22 22 chr5 76892106 76892195 -75645064 - ORR1E LTR MaLR -224 135 47 6 1171 1369 82 260 72 chr5 76895384 76895661 -75641598 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1171 272 247 39 0 chr5 76897571 76897648 -75639611 + MTE2b LTR MaLR 300 379 0 6 1171 513 251 64 64 chr5 76900922 76901156 -75636103 - RMER2 LTR ERV1 0 567 334 6 1171 1102 266 28 68 chr5 76902800 76903195 -75634064 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 6 1171 817 198 215 42 chr5 76905189 76905542 -75631717 - RMER10A LTR ERVL 0 442 29 6 1171 894 290 30 26 chr5 76907213 76907577 -75629682 - MTE2a LTR MaLR -44 375 1 6 1171 2165 117 263 25 chr5 76907780 76908183 -75629076 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 6 1171 2236 134 0 3 chr5 76908955 76909283 -75627976 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1171 638 280 114 27 chr5 76910512 76910804 -75626455 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 77 6 1171 245 186 140 75 chr5 76910804 76910897 -75626362 - RLTR42 LTR ERVK 0 239 141 6 1171 659 176 0 0 chr5 76911897 76912016 -75625243 + ORR1D1 LTR MaLR 1 119 -255 7 1171 1039 187 15 20 chr5 76912246 76912448 -75624811 + ORR1D1 LTR MaLR 166 366 -8 7 1171 4811 126 33 18 chr5 76915882 76916679 -75620580 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 7 1171 1921 134 87 34 chr5 76924843 76925106 -75612153 + MTB_Mm LTR MaLR 1 288 -119 7 1171 2582 62 19 0 chr5 76925106 76925427 -75611832 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1171 1921 134 87 34 chr5 76925427 76925542 -75611717 + MTB_Mm LTR MaLR 289 399 -8 7 1171 3535 20 2 0 chr5 76927320 76927715 -75609544 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1171 499 249 158 120 chr5 76927901 76928293 -75608966 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 1 7 1172 2133 187 76 7 chr5 76944297 76944743 -75592516 + RLTR18B LTR ERVK 1 477 -35 7 1172 295 302 129 70 chr5 76949465 76949554 -75587705 - MER89 LTR ERV1 -217 342 250 7 1172 295 302 129 70 chr5 76949700 76949912 -75587347 - MER89 LTR ERV1 -310 249 23 7 1172 874 178 119 209 chr5 76949994 76950178 -75587081 + ORR1D1 LTR MaLR 1 156 -218 7 1172 874 178 119 209 chr5 76950208 76950434 -75586825 + ORR1D1 LTR MaLR 157 374 0 7 1172 2925 119 71 12 chr5 76954201 76954696 -75582563 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 7 1172 637 188 0 0 chr5 76956315 76956432 -75580827 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 254 7 1172 3005 60 39 0 chr5 76960490 76960875 -75576384 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1172 570 168 101 7 chr5 76960878 76961038 -75576221 + MTC LTR MaLR 2 167 -240 7 1172 1369 226 75 23 chr5 76965646 76966044 -75571215 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1172 1039 245 94 123 chr5 76989554 76989927 -75547332 - MTE2b LTR MaLR -17 362 1 8 1172 277 254 34 47 chr5 76992579 76992757 -75544502 - RLTR11A2 LTR ERVK -34 494 257 8 1172 663 259 62 75 chr5 76992732 76993100 -75544159 - RLTR11A2 LTR ERVK -123 330 1 8 1172 903 248 138 52 chr5 76994906 76995255 -75542004 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 8 1172 621 166 89 7 chr5 77001392 77001538 -75535721 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 371 3 1172 3679 68 3 95 chr5 77001690 77002261 -75534998 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 5 1172 1579 173 19 47 chr5 77002262 77002487 -75534772 - RLTR12B LTR ERVK -174 354 129 3 1172 4281 27 0 0 chr5 77002487 77002969 -75534290 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 6 1172 1579 173 19 47 chr5 77002969 77003107 -75534152 - RLTR12B LTR ERVK -400 128 2 3 1172 1225 44 61 0 chr5 77004552 77004733 -75532526 - MTB LTR MaLR 0 400 209 8 1172 1202 98 14 55 chr5 77004719 77004936 -75532323 + ORR1A2-int LTR MaLR 1756 1963 0 9 1172 1950 104 12 61 chr5 77004951 77005222 -75532037 + ORR1A2 LTR MaLR 9 273 -54 9 1172 1950 104 12 61 chr5 77005368 77005423 -75531836 + ORR1A2 LTR MaLR 274 319 -8 9 1172 239 325 139 29 chr5 77006872 77007116 -75530143 + ORR1E LTR MaLR 89 359 0 1 1172 741 113 0 0 chr5 77007993 77008108 -75529151 - ORR1B2 LTR MaLR 0 394 280 1 1172 1686 125 46 36 chr5 77008108 77008414 -75528845 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 19 1 1172 1246 109 137 13 chr5 77008417 77008650 -75528609 - ORR1B2 LTR MaLR -105 262 1 1 1172 877 70 0 8 chr5 77009022 77009152 -75528107 + ORR1A4-int LTR MaLR 1835 1963 0 1 1172 2057 136 19 0 chr5 77009152 77009475 -75527784 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1172 228 312 96 50 chr5 77010178 77010377 -75526882 + MTEb LTR MaLR 80 287 -72 2 1172 351 214 24 0 chr5 77010464 77010548 -75526711 + MTEb LTR MaLR 294 379 0 2 1172 1456 137 84 7 chr5 77011501 77011774 -75525485 + ORR1B1 LTR MaLR 99 392 -2 2 1172 897 266 28 0 chr5 77012046 77012264 -75524995 + MYSERV-int LTR ERVK 3989 4212 -4747 2 1172 1837 238 33 106 chr5 77012416 77013144 -75524115 + MYSERV-int LTR ERVK 4481 5155 -1395 2 1172 452 238 46 39 chr5 77013158 77013311 -75523948 + RMER4A LTR ERVK 283 436 -30 2 1172 4045 156 115 22 chr5 77013313 77014172 -75523087 + MYSERV6-int LTR ERVK 7764 8702 -257 2 1172 861 215 31 13 chr5 77014145 77014371 -75522888 + MYSERV-int LTR ERVK 6317 6546 -4 2 1172 634 248 70 42 chr5 77014374 77014660 -75522599 + RLTR15 LTR ERVK 1 294 -65 2 1172 258 274 94 10 chr5 77015094 77015189 -75522070 - ORR1E LTR MaLR -237 122 20 2 1172 887 187 87 91 chr5 77015189 77015278 -75521981 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 267 3 1172 2491 77 3 41 chr5 77015278 77015618 -75521641 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1172 887 187 87 91 chr5 77015618 77015699 -75521560 - ORR1D1 LTR MaLR -108 266 202 3 1172 887 187 87 91 chr5 77015857 77015942 -75521317 - ORR1D1 LTR MaLR -173 201 123 3 1172 748 169 0 41 chr5 77016233 77016410 -75520849 - ORR1D1 LTR MaLR -246 128 1 3 1172 339 188 16 0 chr5 77032544 77032608 -75504651 - MT2B LTR ERVL -370 231 167 5 1172 1355 175 125 12 chr5 77043557 77043886 -75493373 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 2 7 1172 484 300 194 43 chr5 77051423 77052043 -75485216 - MTE-int LTR MaLR -745 835 123 8 1172 371 314 85 55 chr5 77052162 77052469 -75484790 - ORR1E LTR MaLR -43 316 1 9 1172 324 356 27 0 chr5 77064349 77064495 -75472764 + MLT1-int LTR MaLR 1 150 -1221 1 1172 839 234 91 25 chr5 77064590 77064921 -75472338 - ORR1E LTR MaLR -2 419 4 1 1173 427 304 57 48 chr5 77072825 77073053 -75464206 - MER21B LTR ERV1 -107 756 527 1 1173 297 265 49 70 chr5 77073143 77073285 -75463974 - MER21B LTR ERV1 -505 358 220 1 1173 627 241 68 60 chr5 77074192 77074459 -75462800 - ORR1D2 LTR MaLR -57 302 4 1 1173 2008 152 48 32 chr5 77078181 77078581 -75458678 + RMER4B LTR ERVK 18 423 -162 1 1173 920 315 70 14 chr5 77079505 77079936 -75457323 - LTR40c LTR ERVL -5 460 6 1 1173 278 254 43 118 chr5 77080267 77080385 -75456874 - HERVL40-int LTR ERVL -478 5052 4942 1 1173 1320 219 103 14 chr5 77080385 77080733 -75456526 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 1 1173 278 254 43 118 chr5 77080733 77080775 -75456484 - HERVL40-int LTR ERVL -589 4941 4904 1 1173 550 275 64 0 chr5 77097585 77097756 -75439503 + MLT1A0 LTR MaLR 181 362 -3 1 1173 1440 191 91 8 chr5 77103040 77103415 -75433844 - MTD LTR MaLR -13 406 1 1 1173 1381 196 134 9 chr5 77103652 77103981 -75433278 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 3 1 1173 1050 239 105 3 chr5 77107983 77108269 -75428990 + MTE2a LTR MaLR 63 377 -2 1 1173 1399 255 36 26 chr5 77108277 77108504 -75428755 + MTE2a-int LTR MaLR 12 235 -1345 1 1173 1399 255 36 26 chr5 77108924 77109082 -75428177 + MTE2a-int LTR MaLR 236 401 -1179 1 1173 1725 295 165 19 chr5 77109052 77109875 -75427384 + MTE2a-int LTR MaLR 516 1458 -122 1 1173 900 238 127 24 chr5 77109935 77110116 -75427143 + MTE2a LTR MaLR 12 209 -170 1 1173 900 238 127 24 chr5 77110139 77110288 -75426971 + MTE2a LTR MaLR 210 376 -3 1 1173 244 211 39 13 chr5 77110511 77110588 -75426671 + MLT1B LTR MaLR 295 373 -17 1 1173 500 220 222 34 chr5 77111263 77111509 -75425750 - MER57C2 LTR ERV1 -29 382 99 1 1173 673 260 46 52 chr5 77115646 77115991 -75421268 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 2 1173 840 248 102 23 chr5 77116584 77116848 -75420411 + MTE2b LTR MaLR 1 285 -94 2 1173 881 281 78 63 chr5 77120114 77120631 -75416628 + MT2A LTR ERVL 1 563 0 2 1173 297 318 0 52 chr5 77122445 77122581 -75414678 + MTE2b LTR MaLR 246 374 -5 2 1173 1712 118 95 45 chr5 77124577 77124914 -75412345 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 2 1173 727 267 188 0 chr5 77127292 77127558 -75409701 + MLT1B LTR MaLR 4 319 -71 2 1173 303 250 0 132 chr5 77133176 77133282 -75403977 + MT2B LTR ERVL 150 241 -360 2 1173 2017 151 93 54 chr5 77134046 77134488 -75402771 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 2 1173 373 325 96 34 chr5 77144373 77144666 -75392593 - MLT1A LTR MaLR -63 311 1 2 1173 1878 177 77 0 chr5 77150744 77151095 -75386164 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1173 2348 108 89 3 chr5 77151615 77151976 -75385283 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 2 1173 3425 33 2 2 chr5 77156575 77156972 -75380287 + MTB LTR MaLR 3 399 -1 2 1173 1905 170 36 0 chr5 77158615 77158980 -75378279 - MTC-int LTR MaLR -389 869 492 2 1173 693 213 155 15 chr5 77159000 77159200 -75378059 - MTC-int LTR MaLR -1030 228 1 2 1173 2247 161 19 24 chr5 77159204 77159617 -75377642 - MTC LTR MaLR -8 413 3 2 1173 254 291 22 34 chr5 77163601 77163690 -75373569 - MTE-int LTR MaLR -1207 373 286 3 1173 372 305 125 48 chr5 77163921 77164169 -75373090 - ORR1E LTR MaLR -11 348 82 3 1173 903 248 39 129 chr5 77164207 77164540 -75372719 + MTE2b LTR MaLR 15 317 -62 3 1173 2416 115 5 15 chr5 77164540 77164930 -75372329 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 1173 234 227 30 0 chr5 77164975 77165041 -75372218 - ORR1E LTR MaLR -291 68 1 3 1173 250 208 0 0 chr5 77165483 77165536 -75371723 + MTEa LTR MaLR 1 53 -326 3 1173 870 304 74 40 chr5 77168118 77168495 -75368764 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 3 1173 1918 152 110 0 chr5 77172226 77172580 -75364679 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 3 1173 358 355 51 41 chr5 77173624 77173821 -75363438 - MLT1I LTR MaLR -41 370 172 3 1173 1927 152 64 14 chr5 77176068 77176428 -75360831 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 1173 243 262 30 15 chr5 77176777 77176843 -75360416 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 475 3 1173 1277 202 25 29 chr5 77176888 77177215 -75360044 - RLTR20A LTR ERVK -106 435 1 3 1173 656 213 6 51 chr5 77179522 77179680 -75357579 - MTD LTR MaLR -268 151 1 3 1173 308 218 0 71 chr5 77183961 77184045 -75353214 + MT2B LTR ERVL 187 264 -337 3 1173 395 263 78 35 chr5 77189660 77189719 -75347540 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 351 3 1173 395 263 78 35 chr5 77189744 77189826 -75347433 - MLT1A1 LTR MaLR -58 350 261 3 1173 490 253 81 77 chr5 77194154 77194389 -75342870 + MTEb LTR MaLR 53 288 -91 3 1173 433 301 56 58 chr5 77194669 77195025 -75342234 - MLT1D LTR MaLR -117 388 41 3 1173 877 262 40 18 chr5 77196573 77196845 -75340414 + MLT1A0 LTR MaLR 88 365 0 3 1173 1023 243 26 107 chr5 77197530 77197876 -75339383 + MTEa LTR MaLR 62 379 0 3 1174 1256 14 0 0 chr5 77205484 77205627 -75331632 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 254 3 1174 5606 44 19 1 chr5 77205625 77206328 -75330931 - MTA_Mm-int LTR MaLR -383 715 1 3 1174 3593 15 2 0 chr5 77206328 77206723 -75330536 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1174 623 160 0 10 chr5 77209927 77210028 -75327231 + RLTR26 LTR ERVK 1 100 -542 4 1174 911 318 103 32 chr5 77210617 77210958 -75326301 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 4 1174 1138 268 110 41 chr5 77212264 77212700 -75324559 - MLT1C LTR MaLR 0 467 2 4 1174 1929 161 126 0 chr5 77215018 77215366 -75321893 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 4 1174 2359 123 3 6 chr5 77215379 77215722 -75321537 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 5 4 1174 270 318 37 83 chr5 77218099 77218395 -75318864 - ORR1E LTR MaLR -10 360 86 4 1174 448 315 101 9 chr5 77221660 77221878 -75315381 + MLT1A1 LTR MaLR 76 313 -95 4 1174 252 231 57 104 chr5 77228116 77228222 -75309037 - ORR1E LTR MaLR -258 101 1 4 1174 255 231 11 114 chr5 77229041 77229129 -75308130 - MER34 LTR ERV1 -89 453 375 4 1174 2230 112 3 3 chr5 77232499 77232813 -75304446 + ORR1A1 LTR MaLR 25 338 -8 4 1174 238 250 84 32 chr5 77233172 77233267 -75303992 - MTEa LTR MaLR -2 377 278 4 1174 3002 51 19 53 chr5 77236990 77237404 -75299855 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1174 2635 77 28 39 chr5 77241278 77241641 -75295618 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 1174 996 269 59 59 chr5 77245380 77245755 -75291504 - MTEb LTR MaLR -4 375 1 4 1174 1833 154 19 23 chr5 77250242 77250564 -75286695 - ORR1B1 LTR MaLR -61 333 4 4 1174 270 327 100 83 chr5 77256561 77256741 -75280518 - ORR1E LTR MaLR -125 234 52 5 1174 1814 144 24 63 chr5 77260029 77260362 -75276897 + ORR1A4 LTR MaLR 2 321 -8 5 1174 2061 127 7 0 chr5 77260366 77260674 -75276585 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 310 -1653 5 1174 410 82 33 0 chr5 77260672 77260733 -75276526 + ORR1A4 LTR MaLR 259 321 -8 5 1174 3491 142 9 71 chr5 77265625 77266260 -75270999 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 97 5 1174 935 259 138 40 chr5 77276480 77276858 -75260401 - MTD LTR MaLR 0 419 5 5 1174 1029 244 196 6 chr5 77284905 77285222 -75252037 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 5 1174 3578 186 31 58 chr5 77290379 77291258 -75246001 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 5 1174 1629 149 17 33 chr5 77291714 77292013 -75245246 - RLTR28 LTR ERVL -16 508 215 5 1174 1220 147 50 18 chr5 77292178 77292400 -75244859 - RLTR28 LTR ERVL -295 229 1 5 1174 594 292 92 61 chr5 77297821 77298278 -75238981 - RLTR11B LTR ERVK -46 481 2 5 1174 613 311 93 84 chr5 77303612 77304024 -75233235 - MLT2B1 LTR ERVL -51 469 54 5 1174 238 287 125 21 chr5 77304024 77304120 -75233139 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 303 5 1174 2524 161 26 12 chr5 77304419 77304834 -75232425 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1174 1132 313 43 43 chr5 77310527 77310965 -75226294 + MLT1F1 LTR MaLR 6 443 -126 6 1174 681 284 127 36 chr5 77314169 77314610 -75222649 + MLT2B1 LTR ERVL 1 567 0 6 1174 388 241 202 60 chr5 77314623 77314954 -75222305 + MTEa LTR MaLR 1 378 -1 6 1174 237 378 0 0 chr5 77321519 77321601 -75215658 + MLT2F LTR ERVL 1 82 -581 6 1174 253 266 0 15 chr5 77324191 77324256 -75213003 + RMER6B LTR ERVK 367 430 -31 6 1174 1342 161 85 93 chr5 77327253 77327617 -75209642 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 6 1174 934 258 50 18 chr5 77331571 77331851 -75205408 + RMER5 LTR ERV1 230 518 -16 6 1175 1785 157 79 77 chr5 77335344 77335773 -75201486 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 6 1175 582 173 271 7 chr5 77335862 77336042 -75201217 - MTD LTR MaLR -14 405 196 6 1175 554 177 289 7 chr5 77336212 77336354 -75200905 - MTD LTR MaLR -237 182 1 6 1175 2371 60 69 3 chr5 77337404 77337739 -75199520 + MTB LTR MaLR 44 400 0 6 1175 2231 165 120 35 chr5 77337879 77338370 -75198889 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 6 1175 2124 145 83 10 chr5 77339141 77339537 -75197722 + RMER6B LTR ERVK 34 458 -3 6 1175 1252 150 271 10 chr5 77339726 77340036 -75197223 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 6 1175 278 290 68 29 chr5 77340292 77340395 -75196864 + LTR40c LTR ERVL 31 137 -328 6 1175 271 275 191 21 chr5 77341697 77341838 -75195421 - MLT2C2 LTR ERVL -65 399 235 6 1175 408 110 137 0 chr5 77345918 77345991 -75191268 + MTC LTR MaLR 4 86 -335 7 1175 1775 107 138 13 chr5 77346206 77346518 -75190741 + MTC LTR MaLR 71 421 0 7 1175 314 208 0 172 chr5 77350055 77350183 -75187076 + MT2B LTR ERVL 151 256 -345 7 1175 1110 335 104 12 chr5 77353701 77354267 -75182992 + MER21B LTR ERV1 39 656 -207 7 1175 5675 47 65 0 chr5 77359540 77360237 -75177022 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 7 1175 69689 10 2 0 chr5 77360237 77367825 -75169434 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1 7601 0 7 1175 5675 47 65 0 chr5 77367825 77368522 -75168737 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 7 1175 326 252 88 53 chr5 77369360 77369473 -75167786 + MLT1A LTR MaLR 22 138 -236 7 1175 3435 151 115 13 chr5 77383506 77384192 -75153067 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 7 1175 560 246 135 14 chr5 77386127 77386275 -75150984 - ORR1D1 LTR MaLR -66 308 143 7 1175 1341 153 164 0 chr5 77386263 77386538 -75150721 - ORR1A2 LTR MaLR -6 321 2 7 1175 498 232 113 6 chr5 77386538 77386678 -75150581 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 10 7 1175 364 155 14 0 chr5 77397850 77397930 -75139329 - RMER19B LTR ERVK -651 86 1 8 1175 426 244 290 14 chr5 77398388 77398600 -75138659 - MTEb LTR MaLR -108 271 2 8 1175 646 97 52 26 chr5 77407395 77407511 -75129748 + RMER4A LTR ERVK 348 466 0 8 1175 1242 239 127 24 chr5 77422090 77422468 -75114791 - MTD LTR MaLR 0 419 3 8 1175 1268 154 15 139 chr5 77426022 77426353 -75110906 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 40 8 1175 341 240 0 26 chr5 77434250 77434327 -75102932 + MT2B LTR ERVL 187 261 -340 8 1175 1836 202 55 21 chr5 77441437 77441822 -75095437 - MTD LTR MaLR -20 399 2 9 1175 2379 68 15 33 chr5 77448001 77448334 -75088925 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 9 1175 15034 53 9 3 chr5 77448336 77450150 -75087109 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 4656 9 1175 1907 89 0 0 chr5 77450149 77450395 -75086864 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2252 9 1175 9859 66 47 91 chr5 77450396 77452012 -75085247 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 9 9 1175 2325 78 15 33 chr5 77452013 77452346 -75084913 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 9 1175 1191 96 0 114 chr5 77456099 77456335 -75080924 + ORR1A3 LTR MaLR 1 209 -117 9 1175 2036 114 84 19 chr5 77458028 77458396 -75078863 - MTB_Mm LTR MaLR -15 392 1 9 1175 256 237 13 38 chr5 77458396 77458468 -75078791 - MTC LTR MaLR -334 87 18 9 1175 414 134 0 0 chr5 77459199 77459266 -75077993 + MTC LTR MaLR 139 205 -216 9 1176 289 261 63 56 chr5 77467995 77468121 -75069138 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1196 9 1176 5042 140 82 36 chr5 77468155 77469192 -75068067 - RMER12 LTR ERVK -237 1085 1 9 1176 5021 145 39 22 chr5 77479537 77480490 -75056769 + RLTR13C1 LTR ERVK 13 981 -2 1 1176 3392 125 33 14 chr5 77480789 77481340 -75055919 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 1 1176 403 171 93 28 chr5 77485148 77485256 -75052003 - MTEa LTR MaLR -7 372 258 1 1176 1717 133 85 3 chr5 77493785 77494114 -75043145 + RMER4B LTR ERVK 1 356 -229 1 1176 1121 102 0 0 chr5 77494114 77494271 -75042988 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 449 1 1176 1069 101 0 0 chr5 77494268 77494426 -75042833 - MTA_Mm LTR MaLR -238 158 1 1 1176 6757 106 23 79 chr5 77494426 77495589 -75041670 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1176 2688 59 32 3 chr5 77495593 77495970 -75041289 - MTA_Mm LTR MaLR -8 388 1 1 1176 667 245 138 8 chr5 77497041 77497288 -75039971 - RLTR40 LTR ERVK -48 769 491 1 1176 1941 129 87 40 chr5 77497289 77497636 -75039623 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 1 1176 837 164 482 26 chr5 77498847 77499106 -75038153 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1176 582 309 151 46 chr5 77502165 77502796 -75034463 - MamGypLTR1d LTR Gypsy -23 790 42 5 1176 3842 23 5 2 chr5 77505452 77505887 -75031372 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 1176 3519 29 50 2 chr5 77507677 77507882 -75029377 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 233 1 1176 3519 29 50 2 chr5 77507904 77508114 -75029145 - RLTR10C LTR ERVK -204 232 2 1 1176 457 290 169 59 chr5 77508177 77508479 -75028780 - MLT1A0 LTR MaLR -2 465 23 2 1176 2209 170 196 12 chr5 77508495 77509001 -75028258 + RMER19B LTR ERVK 304 902 0 2 1176 230 308 97 58 chr5 77510363 77510518 -75026741 - MLT1J2 LTR MaLR -28 420 260 2 1176 346 329 8 120 chr5 77511201 77511443 -75025816 + MLT1L LTR MaLR 180 394 -216 2 1176 1888 225 48 40 chr5 77512441 77512895 -75024364 + RLTR20C LTR ERVK 1 458 -76 2 1176 230 268 36 0 chr5 77515254 77515310 -75021949 + MLT1L LTR MaLR 202 259 -351 3 1176 1481 185 72 115 chr5 77527718 77528109 -75009150 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1176 259 257 131 85 chr5 77531272 77531425 -75005834 + BGLII_Mus LTR ERVK 23 182 -240 6 1176 5760 129 109 25 chr5 77532920 77533938 -75003321 + RLTR25A LTR ERVK 1 1103 0 6 1176 232 380 141 23 chr5 77545757 77546061 -74991198 - MLT1L LTR MaLR -52 558 219 8 1176 3672 143 112 19 chr5 77547388 77548128 -74989131 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 9 1176 1651 128 31 88 chr5 77550633 77551019 -74986240 + RMER17C LTR ERVK 47 410 0 9 1176 335 92 162 44 chr5 77551019 77551084 -74986175 - MT2B LTR ERVL -528 73 1 9 1176 315 332 125 70 chr5 77552518 77552872 -74984387 - MLT1G LTR MaLR -53 502 88 1 1176 520 331 41 23 chr5 77553967 77554233 -74983026 - RMER15-int LTR ERVL -498 4501 4231 1 1176 4164 59 60 8 chr5 77554299 77554831 -74982428 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 1 1176 3323 38 2 8 chr5 77554998 77555396 -74981863 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1176 401 153 56 56 chr5 77556071 77556161 -74981098 + RLTR24 LTR ERV1 1 90 -439 1 1176 2073 156 102 84 chr5 77556294 77556756 -74980503 + RLTR24 LTR ERV1 58 527 -2 1 1176 597 296 221 14 chr5 77557257 77557551 -74979708 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 11 1 1176 4311 163 191 31 chr5 77557572 77558523 -74978736 + RLTR25A LTR ERVK 1 1103 0 1 1176 2703 97 36 70 chr5 77560086 77560531 -74976728 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 1 1176 644 307 91 127 chr5 77561463 77561881 -74975378 + MLT2D LTR ERVL 4 406 -8 1 1176 336 305 170 58 chr5 77561893 77562081 -74975178 + MLT1J LTR MaLR 108 316 -196 1 1176 640 232 15 35 chr5 77562308 77562475 -74974784 + RMER20B LTR ERVK 1 161 -355 1 1176 249 295 97 35 chr5 77562676 77562820 -74974439 + RMER20B LTR ERVK 364 516 0 1 1176 462 178 133 0 chr5 77563325 77563415 -74973844 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 273 1 1176 2498 122 25 50 chr5 77565600 77566039 -74971220 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 3 1 1176 337 320 50 0 chr5 77568083 77568183 -74969076 - MLT2C1 LTR ERVL -290 107 3 1 1176 383 351 41 29 chr5 77568384 77568554 -74968705 + MLT1E2 LTR MaLR 2 173 -454 1 1176 239 310 82 12 chr5 77569147 77569232 -74968027 + MLT1E2 LTR MaLR 293 383 -7 1 1176 2981 68 17 27 chr5 77571336 77571747 -74965512 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 1176 402 198 117 0 chr5 77572879 77572990 -74964269 - ORR1D2 LTR MaLR -246 124 1 1 1176 479 203 196 33 chr5 77573389 77573542 -74963717 - MTE2a LTR MaLR -3 376 199 1 1176 857 198 143 46 chr5 77573800 77574017 -74963242 + RLTR30 LTR ERV1 135 372 -7 1 1176 397 377 66 0 chr5 77575482 77575665 -74961594 - LTR16A LTR ERVL -118 333 139 1 1176 1516 196 158 3 chr5 77576587 77576909 -74960350 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 1 1176 1063 274 32 70 chr5 77577076 77577445 -74959814 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 1 1176 400 290 24 12 chr5 77580613 77580740 -74956519 + MTD-int LTR MaLR 1152 1254 -4 1 1176 1009 183 354 33 chr5 77580750 77581015 -74956244 + MTD LTR MaLR 25 379 -40 1 1176 723 255 134 110 chr5 77581015 77581380 -74955879 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1176 358 258 37 75 chr5 77581380 77581426 -74955833 + MTD LTR MaLR 380 419 0 1 1176 255 319 71 63 chr5 77581428 77581555 -74955704 - MLT1F2 LTR MaLR -185 468 341 1 1176 355 362 89 17 chr5 77581625 77581805 -74955454 - MLT1F2 LTR MaLR -338 222 30 1 1176 1860 128 17 114 chr5 77590727 77591087 -74946172 + ORR1A4 LTR MaLR 1 325 -4 1 1176 2477 78 19 0 chr5 77591296 77591617 -74945642 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1176 401 226 50 50 chr5 77592882 77593022 -74944237 - MLT1A0 LTR MaLR -224 141 2 1 1176 277 314 105 0 chr5 77593201 77593306 -74943953 - MLT1C LTR MaLR 0 467 352 1 1176 275 335 97 51 chr5 77593407 77593624 -74943635 - MLT1C LTR MaLR -278 227 1 1 1177 272 307 0 0 chr5 77598862 77598937 -74938322 - MLT1H LTR MaLR -342 207 133 2 1177 278 263 56 171 chr5 77599957 77600173 -74937086 + MLT1H LTR MaLR 78 268 -287 2 1177 793 258 128 84 chr5 77602823 77603137 -74934122 - ORR1E LTR MaLR -5 374 27 2 1177 2659 171 116 0 chr5 77603137 77603611 -74933648 + MT2A LTR ERVL 1 529 -4 2 1177 793 258 136 87 chr5 77603611 77603642 -74933617 - ORR1E LTR MaLR -333 26 1 2 1177 3021 62 28 3 chr5 77605678 77606068 -74931191 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1177 248 164 53 35 chr5 77607518 77607575 -74929684 - MLT1A0 LTR MaLR -27 440 383 2 1177 347 248 153 54 chr5 77607696 77607807 -74929452 - MLT1A0 LTR MaLR -235 130 9 2 1177 249 294 56 45 chr5 77608600 77608618 -74928641 + MT2B2 LTR ERVL 152 170 -414 2 1177 282 270 152 9 chr5 77609392 77609504 -74927755 + MLT1B LTR MaLR 3 130 -260 2 1177 239 288 216 0 chr5 77609740 77609865 -74927394 + MLT1B LTR MaLR 222 373 -1 2 1177 2290 142 36 16 chr5 77611357 77611742 -74925517 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 2 1177 957 149 82 20 chr5 77611841 77612048 -74925211 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 159 2 1177 836 138 18 185 chr5 77612475 77612697 -74924562 - ORR1C2 LTR MaLR -199 185 1 2 1177 2705 99 28 20 chr5 77613073 77613473 -74923786 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 2 1177 1112 268 60 28 chr5 77613634 77613987 -74923272 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 1 2 1177 1472 243 128 20 chr5 77614200 77614472 -74922787 - RMER5 LTR ERV1 0 534 222 2 1177 2225 145 37 32 chr5 77614472 77614877 -74922382 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1177 1472 243 128 20 chr5 77614877 77615057 -74922202 - RMER5 LTR ERV1 -313 221 33 2 1177 294 254 50 76 chr5 77615925 77616044 -74921215 + MLT1B LTR MaLR 90 205 -185 2 1177 274 315 128 41 chr5 77616847 77616916 -74920343 - ORR1E LTR MaLR -169 190 112 2 1177 274 315 128 41 chr5 77616965 77617067 -74920192 - ORR1E LTR MaLR -248 111 4 2 1177 1659 203 119 121 chr5 77617256 77617912 -74919347 - RMER12B LTR ERVK -129 1275 654 2 1177 811 230 179 47 chr5 77617912 77618209 -74919050 + RLTR9A LTR ERVK 1 336 -32 2 1177 315 146 0 0 chr5 77618235 77618283 -74918976 - RMER12B LTR ERVK -784 538 491 2 1177 2942 158 82 95 chr5 77618489 77619089 -74918170 - RMER12B LTR ERVK -801 603 12 2 1177 3288 38 13 2 chr5 77619461 77619857 -74917402 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1177 639 140 181 14 chr5 77624702 77624840 -74912419 + RMER16 LTR ERVK 241 401 -132 2 1177 2133 149 39 47 chr5 77627842 77628249 -74909010 + MTB_Mm LTR MaLR 3 406 -1 2 1177 332 286 85 39 chr5 77633934 77634087 -74903172 + MER34 LTR ERV1 369 528 -14 3 1177 973 249 159 8 chr5 77638026 77638403 -74898856 + MER89 LTR ERV1 126 559 0 3 1177 2733 195 28 6 chr5 77643412 77643949 -74893310 - MTC-int LTR MaLR -708 550 2 3 1177 2580 130 35 10 chr5 77643952 77644355 -74892904 - MTC LTR MaLR -8 413 1 3 1177 940 164 21 10 chr5 77647781 77647952 -74889307 - ORR1B2 LTR MaLR 0 419 214 3 1177 226 65 0 0 chr5 77648285 77648316 -74888943 - RMER19C LTR ERVK 0 611 581 3 1177 1562 208 23 255 chr5 77648640 77649383 -74887876 - RMER19C LTR ERVK -18 593 24 3 1177 2091 174 83 12 chr5 77649745 77649836 -74887423 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 415 3 1177 2091 174 83 12 chr5 77649898 77650226 -74887033 - RLTR16 LTR ERVK -91 414 57 3 1177 712 260 70 63 chr5 77650717 77651031 -74886228 + RLTR42-int LTR ERVK 1128 1345 -4177 3 1177 253 204 0 0 chr5 77651021 77651070 -74886189 + RLTR42-int LTR ERVK 1486 1534 -3988 3 1177 955 161 152 27 chr5 77651365 77651589 -74885670 + RLTR14-int LTR ERV1 1018 1269 -4048 3 1177 784 172 0 0 chr5 77659687 77659821 -74877438 + ORR1D1 LTR MaLR 1 134 -240 3 1177 945 228 22 49 chr5 77660065 77660252 -74877007 + ORR1D1 LTR MaLR 155 343 -31 3 1177 1918 111 5 154 chr5 77660252 77660324 -74876935 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 285 3 1177 1918 111 5 154 chr5 77660480 77660686 -74876573 - ORR1A2 LTR MaLR -43 284 80 3 1177 1918 111 5 154 chr5 77660829 77660931 -74876328 - ORR1A2 LTR MaLR -248 79 1 3 1177 945 228 22 49 chr5 77660931 77660969 -74876290 + ORR1D1 LTR MaLR 344 374 0 3 1177 351 261 50 207 chr5 77661039 77661151 -74876108 - MER57C2 LTR ERV1 -235 199 119 3 1177 351 261 50 207 chr5 77661293 77661402 -74875857 - MER57C2 LTR ERV1 -316 118 13 3 1177 549 257 233 15 chr5 77661443 77661713 -74875546 + RMER5 LTR ERV1 206 534 0 3 1177 1678 175 43 25 chr5 77664129 77664528 -74872731 + RMER17C LTR ERVK 3 408 -2 4 1177 345 293 143 35 chr5 77664984 77665295 -74871964 - MLT1F1 LTR MaLR -148 412 66 4 1177 374 241 11 0 chr5 77665763 77665850 -74871409 + RLTR41 LTR ERV1 200 287 -159 4 1177 305 264 43 21 chr5 77671613 77671706 -74865553 + MLT1F LTR MaLR 4 98 -450 4 1177 2014 118 47 44 chr5 77672805 77673214 -74864045 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 1177 3259 108 91 17 chr5 77677365 77677895 -74859364 + MT2B LTR ERVL 1 569 -32 4 1177 267 293 140 43 chr5 77678496 77678731 -74858528 - RMER10A LTR ERVL -25 417 160 4 1177 812 265 74 81 chr5 77680597 77680810 -74856449 + RMER10A LTR ERVL 14 222 -220 4 1177 812 265 74 81 chr5 77680845 77681050 -74856209 + RMER10A LTR ERVL 223 428 -14 4 1177 470 202 138 46 chr5 77687321 77687451 -74849808 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 233 5 1177 925 141 288 0 chr5 77687533 77687614 -74849645 + ORR1C2 LTR MaLR 71 172 -212 5 1177 925 145 273 8 chr5 77687697 77687823 -74849436 + ORR1C2 LTR MaLR 173 324 -60 5 1177 331 224 0 0 chr5 77692516 77692574 -74844685 - MTE2b LTR MaLR -253 126 69 5 1177 1467 170 55 36 chr5 77706206 77706650 -74830609 + RMER19A LTR ERVK 187 737 0 6 1177 1077 230 108 35 chr5 77718984 77719299 -74817960 - ORR1D2 LTR MaLR -32 338 1 6 1177 343 299 39 59 chr5 77722759 77722912 -74814347 + ORR1E LTR MaLR 50 199 -160 6 1178 305 258 9 82 chr5 77728091 77728122 -74809137 - MT2B LTR ERVL -440 161 139 6 1178 231 172 154 15 chr5 77729609 77729674 -74807585 + MT2B2 LTR ERVL 168 241 -343 6 1178 382 214 0 120 chr5 77734045 77734162 -74803097 - MT2B LTR ERVL -344 257 155 6 1178 234 317 76 115 chr5 77741239 77741371 -74795888 - MLT1G LTR MaLR -401 190 55 7 1178 234 317 76 115 chr5 77741493 77741517 -74795742 - MLT1G LTR MaLR -537 54 40 7 1178 1067 205 120 18 chr5 77764974 77765307 -74771952 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 2 7 1178 2123 98 54 11 chr5 77769524 77769873 -74767386 - RLTR19B LTR ERVK -351 364 1 7 1178 343 244 166 0 chr5 77772819 77772937 -74764322 - MTD LTR MaLR -17 402 240 8 1178 386 229 82 114 chr5 77784076 77784328 -74752931 + MTEa LTR MaLR 106 379 0 8 1178 250 258 45 0 chr5 77798448 77798514 -74738745 + MTEb LTR MaLR 301 369 -10 8 1178 296 174 42 42 chr5 77801826 77801898 -74735361 - MTEa LTR MaLR -6 373 302 8 1178 1104 292 54 59 chr5 77804127 77804490 -74732769 + MLT1F1 LTR MaLR 41 373 -196 8 1178 1104 325 46 79 chr5 77804556 77804606 -74732653 + MLT1F1 LTR MaLR 374 399 -170 8 1178 1104 325 46 79 chr5 77804857 77805030 -74732229 + MLT1F1 LTR MaLR 400 569 0 8 1178 265 283 137 100 chr5 77808457 77808838 -74728421 + MLT1A1 LTR MaLR 14 408 0 8 1178 358 325 199 15 chr5 77810530 77810803 -74726456 - MLT1A0 LTR MaLR -51 323 1 8 1178 1489 213 72 38 chr5 77810834 77811181 -74726078 + ORR1D1 LTR MaLR 1 359 -15 8 1178 792 335 68 15 chr5 77811626 77811962 -74725297 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 8 1178 258 329 78 35 chr5 77814789 77814931 -74722328 + ORR1E LTR MaLR 1 148 -211 8 1178 492 288 185 48 chr5 77816621 77816935 -74720324 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 8 1178 1000 92 7 27 chr5 77819230 77819376 -74717883 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 185 9 1178 1941 114 31 31 chr5 77819861 77820179 -74717080 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 2 9 1178 2049 88 25 48 chr5 77838189 77838545 -74698714 + RLTR10B2 LTR ERVK 18 365 0 9 1178 288 290 33 86 chr5 77845850 77846001 -74691258 - LTR16C LTR ERVL -2 487 345 9 1178 1999 96 116 0 chr5 77846757 77847050 -74690209 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1178 452 171 81 10 chr5 77847746 77847845 -74689414 - MLT1B LTR MaLR 0 390 268 9 1178 438 282 89 57 chr5 77847990 77848238 -74689021 + MLT1B LTR MaLR 1 256 -134 9 1178 479 269 189 7 chr5 77848693 77848995 -74688264 + MER90a LTR ERV1 1 316 -259 9 1178 232 278 0 0 chr5 77849473 77849527 -74687732 + MER90a LTR ERV1 561 614 0 9 1178 4041 71 2 10 chr5 77851086 77851609 -74685650 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 9 1178 1534 122 24 14 chr5 77852283 77852630 -74684629 + RLTR1D LTR ERV1 149 605 0 9 1178 445 262 7 187 chr5 77855980 77856290 -74680969 + RLTR11B LTR ERVK 32 285 -168 9 1179 1350 205 59 13 chr5 77858689 77858996 -74678263 + ORR1D2 LTR MaLR 43 363 -7 9 1179 2014 185 36 22 chr5 77862111 77862526 -74674733 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1179 1404 122 27 13 chr5 77869426 77869651 -74667608 + MTC LTR MaLR 184 411 -10 9 1179 1340 225 87 17 chr5 77872890 77873234 -74664025 + MTD LTR MaLR 21 388 -31 9 1179 640 279 162 60 chr5 77875600 77875703 -74661556 - MER34A LTR ERV1 -11 560 461 9 1179 640 279 162 60 chr5 77875786 77876083 -74661176 - MER34A LTR ERV1 -111 460 119 9 1179 369 284 43 0 chr5 77876203 77876319 -74660940 - MER34A LTR ERV1 -450 121 1 9 1179 385 225 39 70 chr5 77877361 77877490 -74659769 + MLT1A1 LTR MaLR 6 130 -278 9 1179 298 208 211 24 chr5 77880020 77880143 -74657116 - MTEa LTR MaLR -50 329 184 9 1179 531 287 0 7 chr5 77880155 77880292 -74656967 - MTEa LTR MaLR -240 139 4 9 1179 337 276 0 39 chr5 77881106 77881208 -74656051 + MLT2B4 LTR ERVL 1 98 -458 9 1179 539 285 58 84 chr5 77881213 77881523 -74655736 + ORR1E LTR MaLR 1 302 -57 9 1179 234 299 0 15 chr5 77882037 77882105 -74655154 + ORR1E LTR MaLR 313 379 0 9 1179 1717 218 52 3 chr5 77882587 77882973 -74654286 + MTD LTR MaLR 2 406 -13 1 1179 1634 137 25 0 chr5 77883751 77884035 -74653224 + MTB_Mm LTR MaLR 2 292 -115 1 1179 6064 139 44 9 chr5 77884033 77885100 -74652159 - RLTR21 LTR ERVK -468 1104 1 1 1179 361 89 0 35 chr5 77885100 77885158 -74652101 + MTB_Mm LTR MaLR 366 421 0 1 1179 704 255 28 78 chr5 77887543 77887798 -74649461 + MER57D LTR ERV1 154 395 -16 1 1179 602 209 9 0 chr5 77894729 77894839 -74642420 - MER77 LTR ERVL -9 598 488 1 1179 262 365 98 71 chr5 77900839 77901195 -74636064 - MLT1J LTR MaLR -109 339 1 1 1179 1025 286 117 6 chr5 77903912 77904253 -74633006 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1179 674 332 64 20 chr5 77905050 77905345 -74631914 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 56 1 1179 307 305 10 31 chr5 77909976 77910074 -74627185 + RLTR14 LTR ERV1 274 369 -13 1 1179 1554 173 42 45 chr5 77915193 77915628 -74621631 + RMER17C LTR ERVK 19 439 -519 1 1179 446 256 106 45 chr5 77918089 77918391 -74618868 + MLT1A0 LTR MaLR 10 354 -11 1 1179 382 265 94 75 chr5 77919458 77919617 -74617642 - ORR1E LTR MaLR -166 193 32 1 1179 284 329 11 85 chr5 77920271 77920447 -74616812 + MLT1A0 LTR MaLR 410 572 -23 1 1179 296 205 46 0 chr5 77921358 77921435 -74615824 + MLT1J2 LTR MaLR 57 149 -363 1 1179 233 331 124 45 chr5 77924093 77924270 -74612989 - LTR84a LTR ERVL 0 757 567 1 1179 3916 132 18 66 chr5 77924971 77925756 -74611503 + RMER17A LTR ERVK 2 748 -3 1 1179 1167 254 65 76 chr5 77927253 77927636 -74609623 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1179 561 299 111 57 chr5 77929494 77929921 -74607338 + MLT1F2 LTR MaLR 21 564 -60 1 1179 264 302 11 23 chr5 77930256 77930344 -74606915 - ORR1E LTR MaLR -272 87 1 1 1179 285 323 70 19 chr5 77930642 77930800 -74606459 + LTR33A LTR ERVL 327 492 -28 1 1179 600 264 180 8 chr5 77932371 77932615 -74604644 + MLT1D LTR MaLR 3 288 -217 1 1179 310 260 101 21 chr5 77932610 77932730 -74604529 + MLT1D LTR MaLR 387 621 -6 1 1179 234 196 131 120 chr5 77933540 77933731 -74603528 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 376 1 1179 288 216 0 26 chr5 77934277 77934353 -74602906 - RLTR15 LTR ERVK -238 121 48 1 1179 1771 124 122 10 chr5 77937552 77937846 -74599413 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1179 341 259 11 23 chr5 77945095 77945182 -74592077 - ORR1E LTR MaLR 0 359 274 1 1179 574 213 102 11 chr5 77945363 77945539 -74591720 - MTD LTR MaLR 0 419 228 1 1179 417 354 111 0 chr5 77945678 77945994 -74591265 + MLT1A0 LTR MaLR 4 354 -11 1 1179 355 327 105 47 chr5 77946112 77946388 -74590871 - MER21B LTR ERV1 -157 706 415 1 1179 582 330 50 34 chr5 77946259 77946557 -74590702 - MER77 LTR ERVL -25 582 280 1 1179 279 258 66 51 chr5 77948542 77948713 -74588546 + MLT1G1 LTR MaLR 70 254 -337 1 1179 4754 151 83 4 chr5 77952653 77953607 -74583652 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 1 1 1179 733 217 14 48 chr5 77956529 77956737 -74580522 - RMER17C LTR ERVK -209 201 1 1 1179 2045 206 124 54 chr5 77958131 77958600 -74578659 - RMER19C LTR ERVK 0 611 171 1 1179 2045 206 124 54 chr5 77959048 77959149 -74578110 - RMER19C LTR ERVK -441 170 3 1 1179 472 306 67 26 chr5 77959156 77959448 -74577811 + MLT1C LTR MaLR 78 464 -3 1 1179 2931 68 0 2 chr5 77972421 77972817 -74564442 - MTB LTR MaLR -5 395 1 1 1179 991 225 2 208 chr5 77972931 77973218 -74564041 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 165 1 1179 991 225 2 208 chr5 77973269 77973442 -74563817 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 1 1 1180 3184 16 5 5 chr5 77988653 77989020 -74548239 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1180 56303 24 16 4 chr5 77989020 77995415 -74541844 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 1 1180 3184 16 5 5 chr5 77995415 77995782 -74541477 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1180 357 387 20 13 chr5 77996352 77996504 -74540755 + MLT1J LTR MaLR 100 252 -260 1 1180 334 277 24 10 chr5 77998126 77998225 -74539034 - MTEa LTR MaLR -269 110 11 1 1180 244 216 65 39 chr5 77998457 77998534 -74538725 + MLT1A1 LTR MaLR 2 80 -328 1 1180 348 248 83 25 chr5 77998735 77998855 -74538404 + MLT1A1 LTR MaLR 270 396 -12 1 1180 1193 20 0 0 chr5 78001356 78001502 -74535757 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 251 4 1180 421 304 142 48 chr5 78001605 78002101 -74535158 + RLTR18 LTR ERVK 31 511 -105 5 1180 3119 54 26 0 chr5 78002417 78002807 -74534452 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1180 295 336 173 10 chr5 78003922 78004211 -74533048 - LTR16A LTR ERVL -21 430 95 9 1180 283 336 61 17 chr5 78004308 78004423 -74532836 + LTR88b LTR Gypsy? 705 824 -13 1 1180 719 283 153 27 chr5 78007287 78007588 -74529671 - MTE2a LTR MaLR 0 379 41 1 1180 3518 25 2 0 chr5 78016103 78016498 -74520761 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1180 9815 17 0 0 chr5 78016498 78017596 -74519663 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1180 3518 25 2 0 chr5 78017596 78017991 -74519268 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1180 412 262 34 54 chr5 78020943 78021092 -74516167 + RLTR14 LTR ERV1 224 369 -13 2 1180 2818 212 17 36 chr5 78021115 78021756 -74515503 + RLTR17 LTR ERVK 1 629 -63 2 1180 1477 149 243 3 chr5 78022204 78022500 -74514759 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 1180 6217 168 113 74 chr5 78022500 78023952 -74513307 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 1509 0 3 1180 1256 169 151 125 chr5 78023952 78024237 -74513022 + ORR1B2 LTR MaLR 1 300 -67 3 1180 1256 169 151 125 chr5 78024375 78024441 -74512818 + ORR1B2 LTR MaLR 301 361 -6 3 1180 422 254 78 54 chr5 78026541 78026745 -74510514 + MLT1B LTR MaLR 1 209 -181 3 1180 378 313 16 22 chr5 78032491 78032647 -74504612 - MLT1H2 LTR MaLR -14 541 358 5 1180 1198 261 88 16 chr5 78035614 78036000 -74501259 + MTD LTR MaLR 3 416 -3 5 1180 1278 261 21 9 chr5 78042152 78042488 -74494771 + MTE2b LTR MaLR 38 377 -2 6 1180 1634 206 160 38 chr5 78042843 78043445 -74493814 + RMER19A LTR ERVK 1 722 -15 6 1180 503 252 118 35 chr5 78043552 78043696 -74493563 - MTE2b LTR MaLR -52 327 172 7 1180 1896 164 6 16 chr5 78047216 78047585 -74489674 - ORR1B2 LTR MaLR -10 374 17 7 1180 709 292 160 13 chr5 78048513 78048825 -74488434 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 8 1180 617 313 54 15 chr5 78065442 78065782 -74471477 - MLT1A1 LTR MaLR 0 365 23 9 1180 3170 73 2 2 chr5 78069433 78069833 -74467426 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1180 683 204 14 0 chr5 78079241 78079383 -74457876 - RLTR20D LTR ERVK -104 464 321 1 1180 1290 127 0 5 chr5 78079380 78079585 -74457674 - RLTR20D LTR ERVK -364 204 1 1 1180 260 325 100 31 chr5 78079612 78079742 -74457517 + MLT1D LTR MaLR 252 390 -115 1 1180 249 393 6 39 chr5 78081432 78081588 -74455671 + MLT1K LTR MaLR 16 166 -429 1 1180 944 332 67 38 chr5 78087995 78088440 -74448819 - MLT1G LTR MaLR -13 578 121 1 1180 248 305 89 41 chr5 78092408 78092531 -74444728 + MLT1J1 LTR MaLR 283 411 -33 1 1180 2287 200 28 19 chr5 78094288 78094817 -74442442 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 1 1180 244 326 51 117 chr5 78109139 78109413 -74427846 + ORR1E LTR MaLR 99 354 -5 1 1180 428 252 64 18 chr5 78113456 78113626 -74423633 + MLT1A1 LTR MaLR 232 395 -13 1 1180 1418 158 22 26 chr5 78114041 78114313 -74422946 + RLTR17 LTR ERVK 1 271 -421 1 1180 866 171 5 62 chr5 78114311 78114504 -74422755 + RLTR17 LTR ERVK 510 691 -1 1 1180 346 283 24 55 chr5 78114599 78114726 -74422533 + ORR1E LTR MaLR 1 123 -236 1 1180 299 261 187 30 chr5 78114762 78114896 -74422363 + ORR1E LTR MaLR 225 379 0 1 1181 963 134 74 11 chr5 78132076 78132265 -74404994 + RLTR41 LTR ERV1 246 446 0 1 1181 649 283 101 32 chr5 78132589 78132867 -74404392 + MER34A1 LTR ERV1 183 479 -108 1 1181 270 210 34 152 chr5 78134949 78135067 -74402192 - MT2B LTR ERVL -345 256 153 2 1181 1794 139 0 91 chr5 78136105 78136252 -74401007 + MERVK26-int LTR ERVK 6633 6754 -165 2 1181 1794 139 0 91 chr5 78136727 78136888 -74400371 + MERVK26-int LTR ERVK 6755 6913 -6 2 1181 746 248 111 47 chr5 78139626 78139905 -74397354 + MTEb LTR MaLR 83 379 0 2 1181 1104 282 56 6 chr5 78143103 78143447 -74393812 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 4 2 1181 1151 334 56 25 chr5 78144976 78145458 -74391801 + MLT2B3 LTR ERVL 1 497 -57 2 1181 266 127 22 0 chr5 78145787 78145841 -74391418 + MLT2B3 LTR ERVL 507 561 -2 2 1181 984 227 249 16 chr5 78152453 78152593 -74384666 + MTEa LTR MaLR 1 189 -190 2 1181 984 227 249 16 chr5 78152653 78152817 -74384442 + MTEa LTR MaLR 190 375 -4 2 1181 534 279 30 18 chr5 78162212 78162376 -74374883 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 198 2 1181 1884 221 9 17 chr5 78162459 78162878 -74374381 - MTD LTR MaLR 0 419 4 2 1181 967 228 68 146 chr5 78163436 78163847 -74373412 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1181 514 281 35 17 chr5 78168439 78168613 -74368646 - MLT2B4 LTR ERVL -278 278 102 2 1181 279 281 0 86 chr5 78168812 78168917 -74368342 - MLT2B4 LTR ERVL -445 111 16 2 1181 771 318 51 69 chr5 78169245 78169620 -74367639 - MTEa LTR MaLR -2 377 10 2 1181 443 201 200 20 chr5 78173965 78174140 -74363119 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 154 2 1181 308 130 0 0 chr5 78174146 78174192 -74363067 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 346 2 1181 256 136 0 0 chr5 78174183 78174227 -74363032 - ORR1B1 LTR MaLR -346 48 5 2 1181 3823 170 13 3 chr5 78174231 78174920 -74362339 - ORR1B1-int LTR MaLR -1 1508 813 2 1181 505 285 44 6 chr5 78178191 78178371 -74358888 - MTE2a LTR MaLR 0 379 193 2 1181 3051 67 7 54 chr5 78178415 78178842 -74358417 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1181 264 319 56 111 chr5 78186140 78186320 -74350939 - MTE2a LTR MaLR -209 170 1 2 1181 1943 155 3 58 chr5 78186331 78186674 -74350585 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 4 2 1181 2473 85 188 0 chr5 78187112 78187512 -74349747 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1181 4100 92 36 26 chr5 78187514 78188230 -74349029 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 2 1181 2128 97 0 0 chr5 78188230 78188508 -74348751 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 2 1181 6157 46 3 19 chr5 78188507 78189265 -74347994 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6481 0 2 1181 2460 90 188 0 chr5 78189265 78189665 -74347594 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1181 327 261 19 14 chr5 78189730 78189845 -74347414 - MTEb LTR MaLR -3 376 264 2 1181 257 368 43 50 chr5 78189967 78190107 -74347152 - MTEb LTR MaLR -168 191 53 2 1181 2955 33 0 0 chr5 78199412 78199749 -74337510 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1181 24986 34 36 13 chr5 78199749 78202747 -74334512 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 2 1181 7770 12 1 6 chr5 78202733 78203589 -74333670 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6481 0 2 1181 2966 30 0 0 chr5 78203589 78203926 -74333333 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 1181 419 300 58 23 chr5 78208306 78208480 -74328779 - MLT1J1 LTR MaLR -225 219 40 3 1181 1811 147 16 91 chr5 78209415 78209789 -74327470 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 3 1181 276 276 142 19 chr5 78209866 78210029 -74327230 + MLT1B LTR MaLR 262 487 -18 3 1181 346 290 126 26 chr5 78214898 78215182 -74322077 - MLT2B4 LTR ERVL -240 316 6 3 1181 1814 118 37 62 chr5 78215803 78216128 -74321131 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 2 3 1181 1702 230 130 87 chr5 78221828 78222414 -74314845 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1181 463 273 158 40 chr5 78227079 78227357 -74309902 + LTR81B LTR ERV1? 1039 1349 -44 3 1181 259 301 117 56 chr5 78237957 78238154 -74299105 + MLT2B1 LTR ERVL 23 231 -289 3 1181 411 233 31 1 chr5 78238187 78238299 -74298960 + MLT2B1 LTR ERVL 397 517 -37 3 1181 2285 139 121 7 chr5 78238824 78239238 -74298021 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 3 1181 242 307 27 0 chr5 78242553 78242628 -74294631 + MLT1F LTR MaLR 386 462 -86 3 1181 343 325 76 73 chr5 78242636 78242978 -74294281 + MLT1A0 LTR MaLR 1 343 -22 3 1181 770 315 87 26 chr5 78243694 78243725 -74293534 - MLT1A1 LTR MaLR -42 366 336 3 1181 770 315 87 26 chr5 78243745 78244058 -74293201 - MLT1A1 LTR MaLR -73 335 2 3 1181 275 292 22 11 chr5 78244140 78244230 -74293029 - ORR1E LTR MaLR 0 359 269 3 1181 1134 210 174 15 chr5 78244461 78244795 -74292464 + MTC LTR MaLR 20 406 -15 3 1181 409 328 37 67 chr5 78246951 78247219 -74290040 + MLT1J1 LTR MaLR 38 297 -147 3 1182 3169 151 86 17 chr5 78252240 78253147 -74284112 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 4 3 1182 3770 167 75 45 chr5 78256064 78256973 -74280286 + RMER17B LTR ERVK 15 950 -8 3 1182 395 295 85 99 chr5 78257061 78257461 -74279798 + RLTR18B LTR ERVK 25 400 -216 3 1182 8077 145 61 16 chr5 78258613 78260206 -74277053 + ORR1A2-int LTR MaLR 300 1963 0 3 1182 2305 85 28 6 chr5 78260206 78260526 -74276733 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1182 1628 196 75 39 chr5 78262649 78263037 -74274222 - MTC LTR MaLR -13 408 7 3 1182 290 342 49 43 chr5 78269231 78269393 -74267866 - MLT1L LTR MaLR -87 523 361 3 1182 299 237 46 168 chr5 78270868 78271029 -74266230 + MTEa LTR MaLR 222 367 -12 4 1182 449 314 7 67 chr5 78285286 78285436 -74251823 + ORR1E LTR MaLR 1 141 -218 4 1182 287 309 64 0 chr5 78287245 78287355 -74249904 + ERVL-E-int LTR ERVL 3157 3273 -2394 4 1182 744 347 59 25 chr5 78288742 78289100 -74248159 + MLT1A1 LTR MaLR 26 395 -13 4 1182 421 364 75 25 chr5 78289675 78289957 -74247302 + MLT1I LTR MaLR 115 410 -1 4 1182 311 266 36 18 chr5 78291057 78291168 -74246091 + MLT1I LTR MaLR 440 552 -10 4 1182 1257 246 65 3 chr5 78302755 78303048 -74234211 - MTEa LTR MaLR -9 370 60 4 1182 1009 210 4 17 chr5 78309530 78309763 -74227496 + RMER17C LTR ERVK 181 410 0 4 1182 1871 183 88 8 chr5 78313629 78314014 -74223245 - MTC LTR MaLR -5 416 1 4 1182 731 316 57 65 chr5 78314014 78314378 -74222881 - MLT2B1 LTR ERVL -34 520 64 4 1182 731 312 47 79 chr5 78314462 78314491 -74222768 - MLT2B1 LTR ERVL -457 63 32 4 1182 642 308 107 49 chr5 78322471 78322799 -74214460 - ORR1E LTR MaLR -6 353 7 4 1182 238 86 0 0 chr5 78326608 78326643 -74210616 - RMER19C LTR ERVK 0 611 577 4 1182 1827 234 38 159 chr5 78326772 78327438 -74209821 - RMER19C LTR ERVK -19 592 8 4 1182 495 343 95 72 chr5 78328643 78328989 -74208270 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 4 1182 445 344 45 30 chr5 78331801 78332065 -74205194 - MLT1H-int LTR MaLR -557 852 585 4 1182 940 295 31 79 chr5 78332091 78332439 -74204820 + MTEa LTR MaLR 4 324 -55 4 1182 1615 218 94 5 chr5 78333156 78333539 -74203720 - MTD LTR MaLR 0 419 3 4 1182 487 246 58 34 chr5 78334126 78334274 -74202985 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 228 4 1182 305 96 0 0 chr5 78334672 78334724 -74202535 - ORR1D2 LTR MaLR -243 131 80 4 1182 555 306 7 7 chr5 78343740 78343878 -74193381 + MLT1C LTR MaLR 330 467 0 4 1182 527 320 107 36 chr5 78349494 78349802 -74187457 - MLT1A0 LTR MaLR -6 359 30 5 1182 548 365 37 5 chr5 78350423 78350638 -74186621 + MLT1J1 LTR MaLR 52 273 -171 5 1182 249 225 84 0 chr5 78361528 78361599 -74175660 - ORR1E LTR MaLR -12 347 271 5 1182 235 323 40 40 chr5 78362320 78362420 -74174839 - ORR1E LTR MaLR -267 112 13 5 1182 502 339 5 31 chr5 78364420 78364612 -74172647 - MLT1A LTR MaLR -15 359 173 5 1182 3192 65 2 0 chr5 78370418 78370817 -74166442 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1182 2133 155 65 3 chr5 78371900 78372256 -74165003 + ORR1B1 LTR MaLR 17 394 0 5 1182 424 60 90 0 chr5 78372385 78372452 -74164807 + ORR1B1 LTR MaLR 322 394 0 5 1182 2805 214 93 20 chr5 78372452 78373213 -74164046 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 817 -692 5 1182 258 290 54 36 chr5 78376573 78376684 -74160575 + MLT1A1 LTR MaLR 29 141 -267 5 1182 256 292 10 101 chr5 78378680 78378779 -74158480 + MLT1A1 LTR MaLR 238 327 -222 5 1182 570 317 10 60 chr5 78379851 78380114 -74157145 + MTE2a LTR MaLR 6 223 -156 5 1182 597 211 128 26 chr5 78380277 78380433 -74156826 + MTE2a LTR MaLR 208 379 0 5 1183 629 272 168 54 chr5 78381152 78381467 -74155792 - ORR1E LTR MaLR -3 356 6 5 1183 2865 86 8 5 chr5 78388357 78388756 -74148503 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1183 279 373 42 7 chr5 78396118 78396261 -74140998 + MLT1G LTR MaLR 405 552 -39 5 1183 379 197 14 0 chr5 78415301 78415372 -74121887 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 448 5 1183 328 254 167 0 chr5 78425977 78426091 -74111168 - MTE2a LTR MaLR -242 137 5 6 1183 1147 246 48 50 chr5 78438731 78439107 -74098152 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 6 1183 282 322 51 137 chr5 78440713 78440947 -74096312 + MTEb LTR MaLR 1 214 -165 6 1183 2025 184 39 17 chr5 78441693 78442103 -74095156 - MTC LTR MaLR -2 419 1 6 1183 1725 207 138 28 chr5 78445475 78445932 -74091327 - RLTR11A2 LTR ERVK -2 525 19 6 1183 510 331 101 26 chr5 78451006 78451273 -74085986 + MLT1C LTR MaLR 179 465 -2 6 1183 1273 247 93 22 chr5 78451486 78451850 -74085409 - RMER15 LTR ERVL -2 573 184 6 1183 1155 269 118 7 chr5 78451885 78452205 -74085054 + ORR1D2 LTR MaLR 21 377 -2 6 1183 548 178 20 10 chr5 78452205 78452304 -74084955 - RMER15 LTR ERVL -449 126 27 6 1183 374 152 17 0 chr5 78452360 78452419 -74084840 - RMER15 LTR ERVL -515 60 1 6 1183 530 122 53 8 chr5 78456795 78456894 -74080365 + ORR1A3 LTR MaLR 242 369 -1 6 1183 1940 168 14 26 chr5 78459552 78459967 -74077292 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 1183 333 347 143 39 chr5 78463520 78463904 -74073355 - MLT1K LTR MaLR -3 592 169 6 1183 258 261 84 84 chr5 78478865 78479007 -74058252 + MLT1H LTR MaLR 60 201 -348 6 1183 2661 140 87 8 chr5 78480049 78480118 -74057141 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 448 6 1183 2661 140 87 8 chr5 78480164 78480578 -74056681 - RLTR11A LTR ERVK -81 447 8 6 1183 624 252 61 61 chr5 78481095 78481340 -74055919 - MLT1B LTR MaLR -119 271 27 6 1183 292 286 11 26 chr5 78483235 78483341 -74053918 - ORR1E LTR MaLR -4 375 256 6 1183 311 346 57 103 chr5 78483811 78484111 -74053148 - ORR1E LTR MaLR -68 291 6 6 1183 512 317 80 38 chr5 78484473 78484762 -74052497 + MLT1A0 LTR MaLR 1 301 -64 6 1183 296 348 53 57 chr5 78486133 78486381 -74050878 - MLT1H LTR MaLR -296 253 1 6 1183 1638 159 81 78 chr5 78491311 78491658 -74045601 + ORR1B1 LTR MaLR 47 394 0 6 1183 660 243 61 89 chr5 78494403 78494838 -74042421 + RMER2 LTR ERV1 1 541 -26 6 1183 312 350 66 85 chr5 78497425 78497790 -74039469 + ORR1E LTR MaLR 1 358 -1 6 1183 359 288 45 104 chr5 78500463 78500701 -74036558 - MTEa LTR MaLR -2 377 141 3 1183 411 262 46 9 chr5 78500715 78500823 -74036436 - MTEa LTR MaLR -205 174 63 3 1183 1528 262 34 31 chr5 78503377 78503536 -74033723 + MTC LTR MaLR 4 154 -267 8 1183 1528 262 34 31 chr5 78504283 78504540 -74032719 + MTC LTR MaLR 155 421 0 8 1183 888 284 92 82 chr5 78509807 78510175 -74027084 - MTEa LTR MaLR 0 379 8 1 1184 401 355 61 68 chr5 78513189 78513515 -74023744 + ORR1E LTR MaLR 25 348 -11 2 1184 1249 252 60 3 chr5 78513909 78514259 -74023000 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 1184 3443 25 2 0 chr5 78515807 78516202 -74021057 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1184 9520 19 2 0 chr5 78516202 78517298 -74019961 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1184 2907 31 3 0 chr5 78517298 78517653 -74019606 + MTA_Mm LTR MaLR 1 356 -40 2 1184 10510 11 38 0 chr5 78517653 78519567 -74017692 - MERVL-int LTR ERVL -3499 1986 1 3 1184 4202 14 12 12 chr5 78519567 78520060 -74017199 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1184 3709 192 78 24 chr5 78528520 78529574 -74007685 - RMER12 LTR ERVK -5 1317 1 3 1184 292 355 19 9 chr5 78533282 78533390 -74003869 - MLT1N2 LTR MaLR -346 216 108 4 1184 642 322 80 18 chr5 78550297 78550635 -73986624 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 1184 324 369 40 47 chr5 78550732 78550880 -73986379 - MLT2D LTR ERVL -150 264 118 6 1184 329 245 0 48 chr5 78551610 78551713 -73985546 - MLT2D LTR ERVL -314 100 3 6 1184 2241 205 146 14 chr5 78553280 78553634 -73983625 - RMER17B LTR ERVK -247 711 307 7 1184 2241 205 146 14 chr5 78553662 78553881 -73983378 - RMER17B LTR ERVK -652 306 63 7 1184 438 213 0 0 chr5 78554089 78554164 -73983095 - RMER17B LTR ERVK -883 75 1 7 1184 1319 255 95 138 chr5 78556303 78556623 -73980636 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -401 2441 2106 8 1184 1897 193 62 48 chr5 78556698 78557333 -73979926 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -737 2105 1067 8 1184 2885 196 74 25 chr5 78563881 78564723 -73972536 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1449 1393 1 8 1184 579 225 62 45 chr5 78566440 78566617 -73970642 - RLTR20A2 LTR ERVK -2 576 397 8 1184 619 225 126 29 chr5 78566612 78566818 -73970441 - RLTR20A2 LTR ERVK -352 226 1 8 1184 232 293 92 96 chr5 78567909 78568158 -73969101 - ORR1D1 LTR MaLR -42 332 85 8 1184 4494 153 20 34 chr5 78568412 78569218 -73968041 - RMER13B LTR ERVK -111 797 3 8 1184 245 357 129 18 chr5 78569406 78569577 -73967682 + ORR1E LTR MaLR 4 193 -166 9 1184 4423 16 0 0 chr5 78569993 78570486 -73966773 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 9 1184 45518 17 0 0 chr5 78570486 78575844 -73961415 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 9 1184 373 179 46 35 chr5 78575844 78575931 -73961328 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 9 1184 302 0 0 0 chr5 78575931 78575969 -73961290 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 9 1184 4423 16 0 0 chr5 78575969 78576462 -73960797 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 9 1184 1109 271 157 14 chr5 78581584 78581940 -73955319 - MTD LTR MaLR -12 407 1 1 1184 584 319 71 15 chr5 78594322 78594639 -73942620 - MLT2D LTR ERVL -58 339 1 1 1184 299 261 129 41 chr5 78595152 78595322 -73941937 - MTEa LTR MaLR 0 379 182 1 1184 2994 47 42 13 chr5 78601122 78601507 -73935752 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1184 540 210 429 44 chr5 78604228 78604503 -73932756 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 1 1184 365 354 107 57 chr5 78605498 78605938 -73931321 + LTR40b LTR ERVL 1 462 0 1 1184 590 161 26 184 chr5 78609956 78610108 -73927151 + MTE2b LTR MaLR 3 130 -249 1 1184 618 341 26 17 chr5 78610710 78610943 -73926316 + MTE2b LTR MaLR 139 373 -6 1 1184 4128 300 39 31 chr5 78610943 78612508 -73924751 + MTE2b-int LTR MaLR 2 1579 -1 1 1184 1013 288 32 75 chr5 78612510 78612855 -73924404 + MTE2b LTR MaLR 22 351 -28 1 1184 1920 161 3 3 chr5 78616142 78616453 -73920806 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 1 1184 1393 98 122 24 chr5 78616453 78616725 -73920534 + RLTR10-int LTR ERVK 1 337 -7244 1 1184 596 156 33 0 chr5 78616725 78616847 -73920412 + RLTR10-int LTR ERVK 747 872 -6709 1 1184 1217 165 148 12 chr5 78616819 78617076 -73920183 + IAPEY3-int LTR ERVK 312 603 -4803 1 1184 267 325 17 8 chr5 78617242 78617360 -73919899 + IAPEY3-int LTR ERVK 822 940 -5602 1 1184 276 259 61 18 chr5 78617375 78617489 -73919770 + IAPEY3-int LTR ERVK 1448 1566 -6015 1 1184 263 218 36 0 chr5 78617506 78617561 -73919698 + IAP-d-int LTR ERVK 447 503 -6039 1 1184 1403 128 102 0 chr5 78617561 78617787 -73919472 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5255 -1287 1 1184 4225 112 8 3 chr5 78617787 78618470 -73918789 + IAPEY3-int LTR ERVK 6965 7680 0 1 1184 1919 164 3 3 chr5 78618470 78618781 -73918478 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 1 1184 1754 188 15 42 chr5 78638759 78639092 -73898167 - ORR1B1 LTR MaLR -68 326 3 1 1185 277 291 103 31 chr5 78643650 78643902 -73893357 + MTEa LTR MaLR 67 379 0 1 1185 2071 148 3 3 chr5 78645596 78645922 -73891337 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1185 360 341 70 54 chr5 78648867 78649109 -73888150 - MLT1B LTR MaLR -134 256 11 1 1185 2623 189 24 17 chr5 78651451 78652026 -73885233 - RMER6C LTR ERVK 0 690 112 1 1185 2144 76 3 0 chr5 78661676 78661966 -73875293 + ORR1A1 LTR MaLR 1 291 -55 2 1185 915 56 0 0 chr5 78663192 78663317 -73873942 + ORR1A1 LTR MaLR 1 125 -221 2 1185 431 69 0 0 chr5 78664217 78664275 -73872984 + ORR1A1 LTR MaLR 281 338 -8 2 1185 624 314 35 39 chr5 78667516 78667774 -73869485 - ORR1D2 LTR MaLR -113 257 1 2 1185 673 331 60 45 chr5 78673147 78673591 -73863668 - MLT1C LTR MaLR -9 618 8 2 1185 403 279 26 52 chr5 78675624 78675830 -73861429 + RMER12B LTR ERVK 597 1008 -396 2 1185 1772 199 45 68 chr5 78679148 78679574 -73857685 + RMER10A LTR ERVL 7 422 -20 2 1185 362 209 11 44 chr5 78681274 78681364 -73855895 - RLTR15 LTR ERVK -14 345 259 2 1185 1170 192 12 20 chr5 78681432 78681682 -73855577 - RLTR15 LTR ERVK -109 250 3 2 1185 3001 39 7 72 chr5 78683963 78684378 -73852881 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 2 1185 16986 20 3 1 chr5 78684390 78686330 -73850929 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1984 -3 2 1185 3023 39 7 72 chr5 78686332 78686749 -73850510 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 1185 4301 143 24 12 chr5 78689376 78690120 -73847139 - RMER6A LTR ERVK -3 753 1 2 1185 246 343 181 17 chr5 78693330 78693689 -73843570 - MLT1F LTR MaLR 0 548 131 2 1185 388 299 189 67 chr5 78697121 78697523 -73839736 + MLT1C LTR MaLR 1 451 -16 2 1185 302 288 120 39 chr5 78697942 78698091 -73839168 - LTR48 LTR ERV1 -12 632 484 2 1185 302 299 132 18 chr5 78698113 78698142 -73839117 - LTR48 LTR ERV1 -161 483 448 2 1185 567 308 128 32 chr5 78698227 78698572 -73838687 - LTR48 LTR ERV1 -344 443 66 2 1185 229 296 53 74 chr5 78698670 78698860 -73838399 + RLTR15 LTR ERVK 33 218 -141 2 1185 310 311 43 22 chr5 78698864 78699048 -73838211 + RLTR15 LTR ERVK 158 345 -14 2 1185 657 303 54 61 chr5 78700911 78701224 -73836035 + MER67D LTR ERV1 1 311 -203 2 1185 503 300 101 65 chr5 78703646 78703957 -73833302 - MER92B LTR ERV1 -164 390 12 2 1185 332 382 31 25 chr5 78704057 78704218 -73833041 - LTR33C LTR ERVL -467 162 1 2 1185 644 109 114 30 chr5 78714892 78714980 -73822279 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 100 -457 2 1185 644 109 114 30 chr5 78715017 78715060 -73822199 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 101 143 -414 2 1185 1954 144 9 6 chr5 78715889 78716210 -73821049 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 150 471 -86 2 1185 353 374 48 26 chr5 78718824 78718902 -73818357 + RMER15 LTR ERVL 296 370 -205 3 1185 353 374 48 26 chr5 78718926 78719119 -73818140 + RMER15 LTR ERVL 371 572 -3 3 1185 1750 143 57 7 chr5 78723340 78723636 -73813623 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 1185 852 299 27 8 chr5 78733569 78733829 -73803430 - MTD LTR MaLR -39 380 116 3 1185 265 326 22 28 chr5 78733913 78734036 -73803223 - MTD LTR MaLR -286 133 9 3 1185 421 307 164 67 chr5 78734070 78734412 -73802847 - MTEa LTR MaLR 0 379 5 3 1185 376 362 82 45 chr5 78736991 78737234 -73800025 - MLT1F2 LTR MaLR -4 556 305 3 1185 814 300 68 57 chr5 78737629 78737982 -73799277 - MTEa LTR MaLR -20 359 3 3 1185 545 350 70 51 chr5 78753766 78754121 -73783138 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 9 3 1185 470 294 152 18 chr5 78754587 78754958 -73782301 + LTR80B LTR ERVL 144 579 -4 3 1185 2312 99 9 0 chr5 78757568 78757892 -73779367 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1185 4336 20 2 0 chr5 78759766 78760258 -73777001 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1185 314 0 0 0 chr5 78760258 78760296 -73776963 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 1185 392 167 46 35 chr5 78760296 78760383 -73776876 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 3 1185 47223 16 6 0 chr5 78760383 78765709 -73771550 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 3 1185 2978 26 3 0 chr5 78765709 78766054 -73771205 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1185 4119 185 33 60 chr5 78767356 78768193 -73769066 + RMER12 LTR ERVK 1 836 -486 3 1185 4119 185 33 60 chr5 78768244 78768321 -73768938 + RMER12 LTR ERVK 837 890 -432 3 1186 315 314 28 19 chr5 78779412 78779519 -73757740 + MLT1J1 LTR MaLR 1 108 -336 3 1186 2753 173 55 48 chr5 78790580 78791145 -73746114 - RMER4B LTR ERVK 0 585 17 3 1186 234 341 81 7 chr5 78792142 78792278 -73744981 - LTR52 LTR ERVL -265 156 11 4 1186 2955 37 3 8 chr5 78798794 78799150 -73738109 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 4 1186 2879 24 3 0 chr5 78812090 78812424 -73724835 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 4 1186 4854 52 24 39 chr5 78812424 78813091 -73724168 + IAPEz-int LTR ERVK 6 662 -5819 4 1186 442 66 0 32 chr5 78813091 78813154 -73724105 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 4 1186 1846 111 4 4 chr5 78813143 78813405 -73723854 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 4 1186 932 73 24 0 chr5 78813402 78813525 -73723734 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 4 1186 21205 11 2 0 chr5 78813527 78815880 -73721379 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 4 1186 2857 27 3 0 chr5 78815880 78816214 -73721045 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 4 1186 1435 205 81 182 chr5 78826123 78826743 -73710516 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 1 4 1186 551 293 80 65 chr5 78828944 78829283 -73707976 - RLTR15 LTR ERVK -15 344 1 4 1186 332 180 16 0 chr5 78829625 78829686 -73707573 - RLTR15 LTR ERVK -297 62 1 4 1186 600 272 120 112 chr5 78832122 78832498 -73704761 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1186 2104 244 24 10 chr5 78833860 78834352 -73702907 - RMER20A LTR ERVK -7 509 11 4 1186 1124 154 0 89 chr5 78839486 78839700 -73697559 + MTC LTR MaLR 219 413 -8 4 1186 2972 81 2 0 chr5 78849703 78850098 -73687161 - MTB LTR MaLR 0 400 5 4 1186 1928 225 10 15 chr5 78850469 78850760 -73686499 - MTC LTR MaLR -13 408 115 4 1186 1928 225 10 15 chr5 78851089 78851206 -73686053 - MTC LTR MaLR -307 114 2 4 1186 391 354 26 10 chr5 78853490 78853684 -73683575 - LTR82A LTR ERVL -511 361 165 4 1186 3415 30 2 0 chr5 78855956 78856351 -73680908 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1186 964 286 102 13 chr5 78857353 78857725 -73679534 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1186 2229 120 3 6 chr5 78859127 78859453 -73677806 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 4 1186 958 286 78 18 chr5 78862969 78863304 -73673955 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 8 4 1186 1136 247 77 35 chr5 78864457 78864859 -73672400 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1186 233 243 84 14 chr5 78873353 78873424 -73663835 + RMER5 LTR ERV1 28 103 -431 4 1186 354 318 46 97 chr5 78879634 78879850 -73657409 + MLT1K LTR MaLR 378 582 -13 5 1186 919 208 72 17 chr5 78883617 78883852 -73653407 - RMER16 LTR ERVK 0 533 286 5 1186 310 250 219 7 chr5 78883840 78883977 -73653282 - RMER16 LTR ERVK -154 379 214 5 1186 235 225 26 66 chr5 78883947 78884023 -73653236 - RMER16 LTR ERVK -460 73 1 5 1186 1843 210 101 36 chr5 78889864 78890083 -73647176 + RLTR11A LTR ERVK 3 256 -272 5 1186 1843 210 101 36 chr5 78890177 78890451 -73646808 + RLTR11A LTR ERVK 257 528 0 5 1186 561 316 123 47 chr5 78891732 78892126 -73645133 + MLT2B3 LTR ERVL 163 673 -43 5 1186 555 287 98 25 chr5 78892280 78892345 -73644914 + MLT2B3 LTR ERVL 644 710 -7 5 1186 231 183 46 77 chr5 78894482 78894547 -73642712 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 5 1186 334 250 122 22 chr5 78899801 78899940 -73637319 - MLT2D LTR ERVL -250 164 12 5 1186 600 293 40 59 chr5 78901447 78901719 -73635540 - RMER21B LTR ERV1 -442 400 134 5 1187 1079 158 78 20 chr5 78916900 78917146 -73620113 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 65 5 1187 293 346 73 12 chr5 78917148 78917312 -73619947 + RMER15-int LTR ERVL 378 551 -4448 5 1187 1241 258 188 5 chr5 78917406 78917841 -73619418 + RMER15-int LTR ERVL 769 1283 -3716 5 1187 3071 276 49 21 chr5 78918287 78919182 -73618077 + RMER15-int LTR ERVL 1467 2386 -2613 5 1187 1730 259 106 31 chr5 78919199 78919745 -73617514 + RMER15-int LTR ERVL 4051 4637 -362 5 1187 1305 271 44 53 chr5 78920248 78920704 -73616555 + RLTR19C LTR ERVK 18 469 -37 5 1187 2320 171 158 39 chr5 78925302 78926106 -73611153 + RMER19B LTR ERVK 3 902 0 5 1187 365 119 0 17 chr5 78929150 78929210 -73608049 + ORR1B1 LTR MaLR 184 242 -152 5 1187 1577 188 65 3 chr5 78930678 78930987 -73606272 + ORR1B1 LTR MaLR 59 386 -8 5 1187 285 343 28 19 chr5 78936244 78936351 -73600908 + RMER15 LTR ERVL 336 443 -132 5 1187 1071 316 32 17 chr5 78936497 78936842 -73600417 + MTE2b LTR MaLR 24 373 -6 5 1187 882 147 0 0 chr5 78936874 78937010 -73600249 + RLTR11B LTR ERVK 313 448 -5 5 1187 455 169 0 119 chr5 78937005 78937106 -73600153 - ORR1C2 LTR MaLR -295 89 1 5 1187 2149 247 51 85 chr5 78941304 78942043 -73595216 - RMER6D LTR ERVK -6 714 1 5 1187 2273 153 24 10 chr5 78942051 78942466 -73594793 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 2 5 1187 1486 188 117 76 chr5 78943246 78943295 -73593964 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 344 5 1187 1486 188 117 76 chr5 78943811 78944130 -73593129 - ORR1C2 LTR MaLR -41 343 1 5 1187 279 312 65 76 chr5 78950225 78950409 -73586850 + MLT1A1 LTR MaLR 28 209 -199 6 1187 281 370 50 40 chr5 78951812 78952012 -73585247 - MLT1E1 LTR MaLR -66 588 387 6 1187 1523 237 8 43 chr5 78952553 78952885 -73584374 + ORR1C1 LTR MaLR 1 320 -58 6 1187 1523 237 8 43 chr5 78952962 78953021 -73584238 + ORR1C1 LTR MaLR 321 378 0 6 1187 807 191 0 26 chr5 78962147 78962303 -73574956 + RLTR20A LTR ERVK 2 153 -388 6 1187 473 257 27 20 chr5 78970513 78970660 -73566599 - RLTR11B LTR ERVK -22 431 284 6 1187 939 273 12 47 chr5 78971430 78971728 -73565531 - RLTR11B LTR ERVK -162 283 1 6 1187 1513 166 106 41 chr5 78974143 78974483 -73562776 + ORR1B2 LTR MaLR 3 364 -3 6 1187 303 343 50 55 chr5 78974557 78974776 -73562483 + MLT1B LTR MaLR 2 219 -171 6 1187 698 329 125 18 chr5 78974777 78975281 -73561978 - MER67C LTR ERV1 0 711 154 6 1187 4666 60 0 0 chr5 78976428 78977013 -73560246 - IAPEz-int LTR ERVK -4715 1766 1182 6 1187 667 218 15 36 chr5 78980762 78980923 -73556336 - ORR1C2 LTR MaLR -164 220 61 6 1187 464 204 123 5 chr5 78994103 78994270 -73542989 - RMER6A LTR ERVK -521 235 1 6 1187 779 278 43 40 chr5 78994640 78994940 -73542319 - MER34 LTR ERV1 -53 489 189 6 1187 1935 103 83 45 chr5 79011635 79011971 -73525288 + RLTR10B2 LTR ERVK 17 365 0 2 1187 1336 266 91 33 chr5 79015047 79015443 -73521816 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1187 971 193 84 5 chr5 79022448 79022712 -73514547 - RMER19A LTR ERVK -144 593 256 3 1187 1548 165 15 0 chr5 79026591 79026857 -73510402 - RMER19A LTR ERVK -467 270 1 3 1187 281 188 109 0 chr5 79035017 79035081 -73502178 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 459 4 1187 363 244 122 0 chr5 79035375 79035498 -73501761 + RLTR24 LTR ERV1 392 529 0 4 148 1273 279 51 8 chr5 79036389 79036744 -73500515 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 5 1188 295 283 125 54 chr5 79036812 79037036 -73500223 + RMER15 LTR ERVL 303 542 -33 5 1188 228 361 65 65 chr5 79037883 79038037 -73499222 - ORR1D2 LTR MaLR -131 239 86 5 1188 825 302 132 21 chr5 79038465 79038887 -73498372 + RMER15 LTR ERVL 45 575 0 5 1188 266 380 48 53 chr5 79048963 79049169 -73488090 - LTR16E1 LTR ERVL -9 529 325 6 1188 1336 264 88 49 chr5 79054420 79054502 -73482757 + ORR1D2-int LTR MaLR 961 1042 -328 7 1188 1336 264 88 49 chr5 79054690 79054993 -73482266 + ORR1D2-int LTR MaLR 1043 1361 -9 7 1188 1043 305 42 20 chr5 79055003 79055357 -73481902 + ORR1D2 LTR MaLR 3 364 -6 7 1188 792 299 118 31 chr5 79057253 79057602 -73479657 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 7 1188 899 336 47 15 chr5 79057625 79057966 -73479293 + MTE2b-int LTR MaLR 26 377 -1203 7 1188 536 269 32 6 chr5 79058957 79059114 -73478145 - MER67D LTR ERV1 -353 161 1 8 1188 2675 142 6 19 chr5 79063429 79063901 -73473358 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 466 -91 9 1188 1583 249 46 19 chr5 79064096 79064506 -73472753 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1188 2799 47 6 3 chr5 79077500 79077845 -73459414 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1188 661 233 27 0 chr5 79096169 79096315 -73440944 - ORR1B2 LTR MaLR -217 150 1 1 1188 229 321 24 12 chr5 79096387 79096472 -73440787 + MLT1C LTR MaLR 335 420 -47 1 1188 1288 209 39 100 chr5 79106036 79106425 -73430834 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 1 1188 1506 284 75 68 chr5 79116587 79117224 -73420035 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 1 1188 593 247 33 33 chr5 79117493 79117673 -73419586 + MTD LTR MaLR 234 413 -6 1 1188 304 299 11 33 chr5 79117754 79117844 -73419415 + MLT1B LTR MaLR 303 390 0 1 1188 1237 269 68 20 chr5 79126537 79126931 -73410328 - BGLII_B LTR ERVK -23 418 6 1 1188 3824 161 96 64 chr5 79128556 79129434 -73407825 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 1 1188 2479 73 12 0 chr5 79131444 79131771 -73405488 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 1 1188 244 285 79 21 chr5 79134094 79134234 -73403025 - LTR48 LTR ERV1 -54 733 586 2 1188 227 364 50 0 chr5 79137234 79137355 -73399904 + LTR16A LTR ERVL 140 266 -185 2 1188 620 332 31 45 chr5 79143070 79143452 -73393807 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 2 1188 237 340 87 68 chr5 79149216 79149468 -73387791 + MER31B LTR ERV1 77 333 -133 2 1188 1055 224 25 121 chr5 79165298 79165624 -73371635 - RMER19C LTR ERVK -406 496 1 2 1188 594 254 43 81 chr5 79166686 79166896 -73370363 + ORR1D1 LTR MaLR 135 336 -38 2 1189 344 325 84 18 chr5 79170658 79170824 -73366435 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 384 2 1189 787 236 115 32 chr5 79170838 79171235 -73366024 + RMER19C LTR ERVK 308 664 -238 2 1189 522 305 90 38 chr5 79178684 79178950 -73358309 - LTR48 LTR ERV1 -20 767 488 2 1189 290 324 47 81 chr5 79179101 79179334 -73357925 - LTR48 LTR ERV1 -523 264 3 2 1189 474 259 103 14 chr5 79185325 79185470 -73351789 + MLT2B4 LTR ERVL 1 158 -398 2 1189 594 242 204 52 chr5 79187336 79187698 -73349561 - MTD LTR MaLR 0 419 3 2 1189 444 208 260 7 chr5 79194689 79194839 -73342420 - MTD LTR MaLR -25 394 207 2 1189 838 243 62 58 chr5 79196310 79196781 -73340478 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 1189 663 266 149 27 chr5 79199215 79199543 -73337716 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 5 3 1189 4363 184 99 29 chr5 79210468 79211429 -73325830 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 3 1189 897 193 343 0 chr5 79213585 79213853 -73323406 + ORR1B2 LTR MaLR 6 365 -2 3 1189 303 127 62 16 chr5 79213854 79213918 -73323341 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 67 -1442 3 1189 619 199 7 60 chr5 79213960 79214110 -73323149 + ORR1B2-int LTR MaLR 431 572 -937 3 1189 565 245 150 35 chr5 79214110 79214397 -73322862 + RLTR15 LTR ERVK 1 320 -39 3 1189 1736 249 82 0 chr5 79214430 79214920 -73322339 + ORR1B2-int LTR MaLR 568 1097 -412 3 1189 1415 192 171 3 chr5 79215584 79215876 -73321383 - ORR1B2 LTR MaLR -24 343 3 3 1189 1450 164 183 14 chr5 79215879 79216247 -73321012 - ORR1B2-int LTR MaLR -203 1589 1099 3 1189 290 380 30 40 chr5 79219613 79219813 -73317446 + MLT2F LTR ERVL 461 658 -5 3 1189 305 384 89 15 chr5 79219815 79220285 -73316974 + ERVL-E-int LTR ERVL 1322 1826 -3841 3 1189 239 346 13 0 chr5 79221184 79221262 -73315997 - MER67B LTR ERV1 -452 209 131 3 1189 1529 265 5 53 chr5 79221323 79221738 -73315521 - MTD LTR MaLR -24 395 1 3 1189 3999 164 5 1 chr5 79222227 79222899 -73314360 - RLTR33 LTR ERVK -4 674 1 3 1189 3303 206 42 20 chr5 79223341 79223582 -73313677 - RMER6A LTR ERVK 0 756 505 3 1189 3303 206 42 20 chr5 79223702 79224198 -73313061 - RMER6A LTR ERVK -252 504 5 3 1189 663 351 47 8 chr5 79225695 79225752 -73311507 + MT2A LTR ERVL 198 256 -277 3 1189 663 316 189 7 chr5 79226139 79226372 -73310887 + MT2A LTR ERVL 257 533 0 3 1189 1764 173 106 17 chr5 79231127 79231486 -73305773 + MTC LTR MaLR 23 413 -8 3 1189 308 236 305 43 chr5 79233587 79233751 -73303508 - MLT1A1 LTR MaLR -16 349 143 3 1189 3487 142 64 0 chr5 79235142 79235707 -73301552 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 3 1189 325 299 49 56 chr5 79236659 79236801 -73300458 - MLT1A1 LTR MaLR -267 141 1 3 1189 850 224 40 0 chr5 79275602 79275776 -73261483 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 185 4 1189 888 253 2 178 chr5 79278066 79278527 -73258732 + ORR1C2 LTR MaLR 1 380 -4 4 1189 292 222 0 45 chr5 79281716 79281782 -73255477 + RMER20B LTR ERVK 258 320 -307 4 1189 1207 227 217 6 chr5 79282838 79283184 -73254075 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1189 2388 98 185 0 chr5 79283640 79284007 -73253252 + RLTR10C LTR ERVK 1 435 -1 4 1189 659 78 11 0 chr5 79284007 79284097 -73253162 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3 93 -7488 4 1189 229 255 0 19 chr5 79284097 79284149 -73253110 + RLTR27 LTR ERVK 222 272 -37 4 1189 988 127 0 7 chr5 79284151 79284302 -73252957 + MMERVK10C-int LTR ERVK 224 373 -7208 4 1189 53381 71 7 19 chr5 79284301 79291402 -73245857 + MMERVK10C-int LTR ERVK 571 7581 0 4 1189 2925 114 9 27 chr5 79291402 79291843 -73245416 + RLTR10C LTR ERVK 1 433 -3 4 1190 490 223 43 69 chr5 79309317 79309562 -73227697 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 507 276 4 1190 1186 321 27 16 chr5 79317683 79318052 -73219207 + MTEb LTR MaLR 1 373 -6 4 1190 1330 330 53 35 chr5 79318052 79318652 -73218607 + MTEb-int LTR MaLR 3 613 -967 4 1190 225 161 143 16 chr5 79318654 79318717 -73218542 - MLT2B2 LTR ERVL 0 562 492 4 1190 229 355 43 61 chr5 79322536 79322767 -73214492 + MLT1A LTR MaLR 7 233 -141 4 1190 250 282 25 68 chr5 79322815 79322911 -73214348 + RLTR15 LTR ERVK 1 96 -263 4 1190 250 282 25 68 chr5 79322952 79322973 -73214286 + RLTR15 LTR ERVK 97 113 -246 4 1190 956 246 52 45 chr5 79330169 79330459 -73206800 + MLT1F LTR MaLR 1 292 -256 5 1190 1824 169 5 90 chr5 79332832 79333226 -73204033 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 5 1190 2759 108 5 0 chr5 79334622 79335020 -73202239 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1190 425 250 177 0 chr5 79348344 79348517 -73188742 + MTD LTR MaLR 3 206 -213 5 1190 275 262 0 0 chr5 79350242 79350303 -73186956 + MTD LTR MaLR 359 419 0 5 1190 243 204 20 20 chr5 79354827 79354877 -73182382 + MER76 LTR ERVL 64 113 -578 5 1190 349 344 145 31 chr5 79356296 79356565 -73180694 + MLT2B3 LTR ERVL 400 671 -46 5 1190 547 393 33 0 chr5 79359083 79359327 -73177932 - MLT1A LTR MaLR -119 255 4 5 1190 291 324 43 18 chr5 79360734 79360897 -73176362 - MLT1C LTR MaLR -9 496 291 5 1190 11682 82 21 69 chr5 79361148 79363041 -73174218 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 1802 -6 5 1190 622 349 31 24 chr5 79368074 79368365 -73168894 + MTEb LTR MaLR 36 328 -51 5 1190 250 400 47 53 chr5 79370843 79371033 -73166226 - MER21B LTR ERV1 -589 274 86 5 1190 2104 111 167 0 chr5 79372360 79372701 -73164558 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 5 1190 291 396 34 20 chr5 79380159 79380306 -73156953 - LTR16A LTR ERVL -286 165 17 5 1190 769 377 133 36 chr5 79381494 79382270 -73154989 + MLT1A1-int LTR MaLR 882 1732 -3 5 1190 498 325 78 78 chr5 79382277 79382575 -73154684 + MLT1A1 LTR MaLR 13 305 -103 5 1190 498 325 78 78 chr5 79382610 79382695 -73154564 + MLT1A1 LTR MaLR 306 396 -12 5 1190 1196 154 20 10 chr5 79384256 79384459 -73152800 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 117 5 1190 243 331 164 8 chr5 79386839 79386973 -73150286 - MLT2B4 LTR ERVL -10 546 392 6 1190 2844 202 82 24 chr5 79389263 79389943 -73147316 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 6 1190 6781 68 14 13 chr5 79394025 79394953 -73142306 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 6 1190 2876 184 36 27 chr5 79397677 79398235 -73139024 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 2 6 1190 1316 220 62 135 chr5 79403226 79403803 -73133456 + RLTR40 LTR ERVK 219 753 -64 6 1190 2388 91 12 0 chr5 79407649 79407991 -73129268 - MTB LTR MaLR -54 346 1 6 1190 331 289 12 24 chr5 79410752 79410828 -73126431 - RLTR20B1 LTR ERVK -15 548 474 6 1190 1216 218 30 29 chr5 79411608 79411981 -73125278 - RLTR20B1 LTR ERVK -85 478 2 6 1190 644 184 83 30 chr5 79411983 79412151 -73125108 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1 2325 2149 6 1190 261 224 69 0 chr5 79418951 79419009 -73118250 + LTR88c LTR Genie? 1 62 -800 6 1190 3423 36 43 9 chr5 79419341 79419763 -73117496 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1191 1989 127 26 3 chr5 79430952 79431261 -73105998 - IAPLTR2b LTR ERVK -11 316 1 6 1191 473 283 43 68 chr5 79435693 79435823 -73101436 + ORR1D2 LTR MaLR 209 335 -35 6 1191 2931 91 2 5 chr5 79435823 79436223 -73101036 + MTB LTR MaLR 1 399 -1 6 1191 473 283 43 68 chr5 79436223 79436255 -73101004 + ORR1D2 LTR MaLR 336 367 -3 6 1191 939 280 39 48 chr5 79436291 79436647 -73100612 + ORR1D2-int LTR MaLR 157 509 -861 6 1191 831 329 8 4 chr5 79442259 79442512 -73094747 + ORR1D2-int LTR MaLR 879 1132 -238 6 1191 263 250 44 0 chr5 79442551 79442619 -73094640 + ORR1D2-int LTR MaLR 1300 1370 0 6 1191 2053 103 11 68 chr5 79448802 79449157 -73088102 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 7 1191 3390 63 4 27 chr5 79449169 79449889 -73087370 + IAPEz-int LTR ERVK 35 662 -5819 7 1191 433 82 0 32 chr5 79449889 79449952 -73087307 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 7 1191 1828 115 4 4 chr5 79449941 79450203 -73087056 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 7 1191 894 89 24 0 chr5 79450200 79450323 -73086936 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 7 1191 26371 13 3 0 chr5 79450323 79453270 -73083989 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 7 1191 2053 103 11 68 chr5 79453270 79453625 -73083634 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 7 1191 2878 180 40 75 chr5 79456146 79456789 -73080470 + RLTR26 LTR ERVK 19 639 -3 7 1191 1210 277 11 19 chr5 79460528 79460903 -73076356 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 7 1191 352 188 175 19 chr5 79472197 79472300 -73064959 + RLTR9A LTR ERVK 1 119 -249 7 1191 537 180 0 32 chr5 79472305 79472431 -73064828 + RLTR9A LTR ERVK 247 368 0 7 1191 227 167 0 0 chr5 79475719 79475755 -73061504 + RMER6C LTR ERVK 1 36 -684 7 1191 417 228 0 25 chr5 79475769 79475850 -73061409 + MT2B LTR ERVL 181 259 -342 7 1191 3019 21 2 120 chr5 79475874 79476316 -73060943 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 7 1191 11202 107 41 37 chr5 79476318 79478255 -73059004 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 7 1191 3019 21 2 120 chr5 79478268 79478710 -73058549 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 7 1191 1446 176 25 75 chr5 79478785 79479186 -73058073 + RMER6C LTR ERVK 346 693 -63 7 1191 3114 12 0 0 chr5 79479722 79480068 -73057191 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 1191 1536 202 42 21 chr5 79481280 79481721 -73055538 - RLTR20A LTR ERVK -53 488 4 7 1191 674 273 85 50 chr5 79484822 79485154 -73052105 + MTD LTR MaLR 25 419 0 7 1191 572 284 47 28 chr5 79489198 79489412 -73047847 + RLTR45 LTR ERVK 265 482 0 7 1191 556 252 24 61 chr5 79493613 79493778 -73043481 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 205 7 1191 785 249 52 0 chr5 79494105 79494298 -73042961 + RLTR18B LTR ERVK 1 203 -309 7 1191 909 248 28 18 chr5 79494345 79494563 -73042696 + RLTR18B LTR ERVK 289 508 -4 7 1191 1349 286 51 8 chr5 79494647 79495038 -73042221 + MTD LTR MaLR 5 412 -7 7 1191 340 368 77 39 chr5 79496446 79496627 -73040632 - LTR16C LTR ERVL -62 427 240 7 1191 313 346 102 44 chr5 79497104 79497397 -73039862 + ORR1E LTR MaLR 39 348 -11 7 1191 324 379 108 21 chr5 79510059 79510299 -73026960 - MTD LTR MaLR -140 281 21 1 1191 737 364 67 35 chr5 79522606 79523144 -73014115 + LTR80A LTR ERVL 4 558 -25 3 1191 1417 253 148 33 chr5 79533659 79534140 -73003119 + RMER19B LTR ERVK 35 797 -105 5 1191 1601 109 212 7 chr5 79536745 79537032 -73000227 + RLTR44B LTR ERVK 1 346 -103 5 1191 2870 87 13 3 chr5 79549366 79549747 -72987512 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 6 1191 1572 275 24 4 chr5 79554266 79554777 -72982482 + MYSERV6-int LTR ERVK 633 1153 -7806 7 148 4040 169 112 15 chr5 79560424 79561294 -72975965 + RMER17B LTR ERVK 1 954 -4 8 1192 287 313 51 51 chr5 79561841 79561999 -72975260 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 213 8 1192 287 284 20 31 chr5 79567161 79567259 -72970000 - ORR1D2 LTR MaLR -287 97 1 8 1192 989 181 36 134 chr5 79579194 79579551 -72957708 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 9 1192 547 320 101 44 chr5 79580848 79581145 -72956114 + MTE-int LTR MaLR 1145 1458 -122 1 1192 1510 258 22 3 chr5 79586813 79587175 -72950084 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 6 1 1192 296 123 0 186 chr5 79588766 79588836 -72948423 + ORR1B2 LTR MaLR 311 367 0 1 1192 1073 286 37 131 chr5 79594302 79594706 -72942553 - MTC-int LTR MaLR -473 785 412 1 1192 1073 286 37 131 chr5 79594903 79594985 -72942274 - MTC-int LTR MaLR -847 411 345 1 1192 788 288 53 45 chr5 79596261 79596617 -72940642 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 1 1192 5346 111 6 2 chr5 79608088 79608895 -72928364 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 810 -998 1 1192 1505 169 44 87 chr5 79609074 79609442 -72927817 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1591 1848 0 1 1192 631 300 115 27 chr5 79609490 79609785 -72927474 + RMER5 LTR ERV1 95 415 -119 1 1192 2588 134 40 37 chr5 79610788 79611269 -72925990 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1192 974 250 59 20 chr5 79613687 79613993 -72923266 - RMER6C LTR ERVK -2 688 371 1 1192 1687 180 0 10 chr5 79614002 79614300 -72922959 + RMER6C LTR ERVK 1 295 -425 1 1192 2318 121 138 30 chr5 79614719 79615154 -72922105 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1192 1699 171 14 39 chr5 79615423 79615787 -72921472 + RMER6C LTR ERVK 314 668 -22 1 1192 5415 68 25 16 chr5 79615794 79616554 -72920705 - RLTR13D1 LTR ERVK -39 767 1 1 1192 1611 190 19 64 chr5 79616585 79616961 -72920298 - RMER6C LTR ERVK -331 359 1 1 1192 332 197 0 0 chr5 79616974 79617035 -72920224 + RMER6C LTR ERVK 16 76 -614 1 1192 1441 239 44 115 chr5 79619529 79619615 -72917644 - RMER6A LTR ERVK 0 756 668 1 1192 1441 239 44 115 chr5 79619660 79620234 -72917025 - RMER6A LTR ERVK -89 667 145 1 1192 408 307 27 41 chr5 79625806 79625952 -72911307 - MT2A LTR ERVL -160 373 230 1 1192 1830 207 37 5 chr5 79627742 79628150 -72909109 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1192 423 307 40 99 chr5 79628574 79628827 -72908432 + MTC-int LTR MaLR 821 1058 -200 1 1192 559 310 58 5 chr5 79628852 79629040 -72908219 + MTD LTR MaLR 214 411 -8 1 1192 6851 83 3 0 chr5 79635261 79636151 -72901108 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 1 1192 2161 222 72 95 chr5 79638074 79638330 -72898929 - RMER6C LTR ERVK 0 690 446 1 1192 2161 222 72 95 chr5 79638486 79638934 -72898325 - RMER6C LTR ERVK -245 445 2 1 1192 1107 140 0 6 chr5 79640921 79641101 -72896158 - RMER6C LTR ERVK -12 678 500 1 1192 718 202 207 0 chr5 79641184 79641372 -72895887 - RMER6C LTR ERVK -460 230 4 1 1192 243 250 20 59 chr5 79642546 79642648 -72894611 + MLT1B LTR MaLR 28 125 -265 1 1192 554 292 74 120 chr5 79643389 79643542 -72893717 - RMER16 LTR ERVK -1 532 378 1 1192 554 292 74 120 chr5 79643722 79643823 -72893436 - RMER16 LTR ERVK -156 377 281 1 1192 554 268 42 106 chr5 79644817 79644980 -72892279 - RMER16 LTR ERVK -253 280 1 1 1192 2602 62 24 0 chr5 79648423 79648761 -72888498 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1192 13854 57 6 1 chr5 79648761 79650543 -72886716 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 1 1192 2440 74 27 0 chr5 79650543 79650880 -72886379 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1192 2786 82 15 0 chr5 79653356 79653745 -72883514 + MTB LTR MaLR 6 400 0 2 1192 1444 288 23 29 chr5 79667729 79668208 -72869051 - MT2A LTR ERVL -57 476 1 2 1192 339 175 0 0 chr5 79668833 79668896 -72868363 + MT2B LTR ERVL 1 63 -538 2 1192 275 245 156 83 chr5 79670473 79670724 -72866535 + MT2B LTR ERVL 95 456 -145 2 1192 748 199 49 20 chr5 79689974 79690163 -72847096 + MT2B LTR ERVL 241 558 -43 2 18 751 327 70 17 chr5 79691596 79691954 -72845305 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 2 1193 974 324 75 3 chr5 79692028 79692403 -72844856 + MTD LTR MaLR 18 419 0 2 1193 664 265 227 30 chr5 79692426 79692726 -72844533 + MTD-int LTR MaLR 22 380 -878 2 1193 498 344 77 23 chr5 79692917 79693434 -72843825 + MTD-int LTR MaLR 392 1058 -200 2 1193 295 322 98 26 chr5 79693569 79693841 -72843418 + MTD LTR MaLR 60 387 -32 2 1193 322 319 45 85 chr5 79693848 79693971 -72843288 + MTD LTR MaLR 208 329 -92 2 1193 322 319 45 85 chr5 79694422 79694521 -72842738 + MTD LTR MaLR 330 421 0 2 1193 1542 365 102 31 chr5 79694523 79695436 -72841823 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 550 2 1193 734 342 42 11 chr5 79695454 79695741 -72841518 - MTE-int LTR MaLR -1186 394 99 2 1193 658 288 38 5 chr5 79696673 79696886 -72840373 + RLTR45 LTR ERVK 263 482 0 2 1193 437 330 16 62 chr5 79697280 79697456 -72839803 - MTE2b LTR MaLR -32 347 180 2 1193 437 330 16 62 chr5 79697632 79697649 -72839610 - MTE2b LTR MaLR -200 179 163 2 1193 2230 107 3 6 chr5 79699236 79699556 -72837703 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1193 1719 246 12 26 chr5 79700006 79700431 -72836828 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 2 1193 1290 124 69 16 chr5 79700443 79700689 -72836570 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 806 548 2 1193 1412 146 20 16 chr5 79700684 79700935 -72836324 - RLTR13B1 LTR ERVK -641 252 1 2 1193 1604 199 22 57 chr5 79704427 79704795 -72832464 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 40 2 1193 302 271 141 14 chr5 79705002 79705144 -72832115 + MLT2D LTR ERVL 70 229 -185 2 1193 3733 170 12 6 chr5 79712321 79712961 -72824298 + RLTR21 LTR ERVK 3 646 -926 2 1193 1706 249 24 54 chr5 79713149 79713192 -72824067 + RLTR21 LTR ERVK 1084 1125 -447 2 1193 1706 249 24 54 chr5 79713235 79713695 -72823564 + RLTR21 LTR ERVK 1126 1571 -1 2 1193 646 232 45 26 chr5 79720906 79721061 -72816198 + MTE2a LTR MaLR 199 356 -23 2 1193 483 266 14 14 chr5 79730876 79731017 -72806242 + MLT2B1 LTR ERVL 3 143 -377 3 1193 763 315 20 65 chr5 79735077 79735474 -72801785 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 3 1193 4340 157 39 62 chr5 79738278 79738579 -72798680 + RMER12 LTR ERVK 1 317 -1005 3 1193 4340 157 39 62 chr5 79739204 79739812 -72797447 + RMER12 LTR ERVK 318 888 -434 3 1193 330 289 119 109 chr5 79739912 79740122 -72797137 + RMER12 LTR ERVK 1001 1212 -110 3 1193 394 250 96 102 chr5 79743127 79743430 -72793829 + MTC-int LTR MaLR 951 1251 -7 3 1193 800 355 53 9 chr5 79749871 79750209 -72787050 + MTD LTR MaLR 55 407 -12 3 1193 916 284 146 41 chr5 79754505 79754993 -72782266 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 2 3 1193 1188 246 50 75 chr5 79762487 79762926 -72774333 + RMER6C LTR ERVK 114 541 -149 3 1193 2983 63 13 5 chr5 79774956 79775353 -72761906 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1193 2089 152 84 0 chr5 79785260 79785629 -72751630 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1193 854 349 67 66 chr5 79787239 79787951 -72749308 + RMER15-int LTR ERVL 61 773 -4226 3 1193 677 250 29 18 chr5 79791773 79791944 -72745315 + MTD LTR MaLR 14 186 -233 4 1193 787 287 76 37 chr5 79798406 79798760 -72738499 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 4 1193 255 186 16 48 chr5 79816075 79816137 -72721122 + ORR1B2 LTR MaLR 1 60 -324 4 1193 735 191 13 19 chr5 79816132 79816287 -72720972 + ORR1B2 LTR MaLR 214 367 0 4 1194 4485 105 7 3 chr5 79825456 79826214 -72711045 - MT-int LTR MaLR -488 770 1 4 1194 3436 64 49 0 chr5 79826214 79826386 -72710873 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 304 4 1194 3436 64 49 0 chr5 79826485 79826765 -72710494 - MT2C_Mm LTR ERVL -172 303 2 4 1194 4354 158 12 6 chr5 79827043 79827764 -72709495 + RLTR21 LTR ERVK 1 726 -846 4 1194 2278 159 120 37 chr5 79828567 79829110 -72708149 + RLTR21 LTR ERVK 718 1305 -267 4 1194 2069 212 23 120 chr5 79829165 79829604 -72707655 + RLTR21 LTR ERVK 1132 1568 -4 4 1194 238 393 62 28 chr5 79850236 79850414 -72686845 + MLT1E1A LTR MaLR 374 557 -123 4 1194 423 379 39 10 chr5 79862548 79862753 -72674506 - LTR40a LTR ERVL -33 486 276 4 1194 793 328 104 7 chr5 79865932 79866266 -72670993 + MTD LTR MaLR 27 382 -37 5 1194 2295 110 171 52 chr5 79879791 79880212 -72657047 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 5 5 1194 850 177 25 25 chr5 79886064 79886226 -72651033 + ORR1A3 LTR MaLR 3 164 -162 5 1194 1156 186 8 17 chr5 79887419 79887654 -72649605 + RLTR11B LTR ERVK 219 451 -2 5 1194 376 274 27 10 chr5 79892412 79892570 -72644689 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 214 5 1194 1337 276 87 22 chr5 79892586 79893079 -72644180 - ORR1D1-int LTR MaLR -29 1341 817 5 1194 735 315 22 50 chr5 79893773 79894094 -72643165 + MTD LTR MaLR 2 313 -106 5 1194 798 342 30 61 chr5 79896894 79897289 -72639970 - LTR40b LTR ERVL 0 462 80 5 1194 613 312 48 57 chr5 79897640 79897973 -72639286 + RLTR14 LTR ERV1 4 333 -49 5 1194 1228 294 38 94 chr5 79898489 79899010 -72638249 - RMER15 LTR ERVL -66 509 18 5 1194 686 309 70 54 chr5 79899393 79899691 -72637568 - RMER15 LTR ERVL -44 531 229 5 1194 282 196 0 0 chr5 79900540 79900591 -72636668 + MTC LTR MaLR 1 51 -370 5 1194 3077 63 2 8 chr5 79908903 79909301 -72627958 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1194 6992 98 11 69 chr5 79909301 79910466 -72626793 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1194 1262 57 6 6 chr5 79910467 79910642 -72626617 - MTA_Mm LTR MaLR -1 399 225 5 1194 268 71 0 106 chr5 79910625 79910672 -72626587 + MTB LTR MaLR 359 400 0 5 1194 434 335 112 63 chr5 79917482 79917849 -72619410 + MTEa LTR MaLR 1 375 -4 5 1194 1359 228 20 10 chr5 79919551 79919852 -72617407 + MT2A LTR ERVL 3 306 -227 5 1194 1746 197 80 0 chr5 79920183 79920548 -72616711 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1194 940 245 56 82 chr5 79922143 79922415 -72614844 + ORR1C2 LTR MaLR 63 332 -52 5 1194 940 236 58 83 chr5 79922561 79922602 -72614657 + ORR1C2 LTR MaLR 333 370 -14 5 1194 1911 266 115 55 chr5 79926328 79927091 -72610168 - ORR1B2-int LTR MaLR -561 809 1 5 1194 957 239 78 50 chr5 79927091 79927448 -72609811 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1194 761 284 124 53 chr5 79933804 79933950 -72603309 + ORR1D2 LTR MaLR 1 142 -228 6 1194 761 284 124 53 chr5 79934026 79934218 -72603041 + ORR1D2 LTR MaLR 143 362 -8 6 1194 550 259 42 0 chr5 79934945 79935088 -72602171 + MLT1C LTR MaLR 316 464 -3 6 1194 1491 224 86 43 chr5 79935297 79935806 -72601453 + RMER6C LTR ERVK 21 551 -139 6 1195 2345 187 122 13 chr5 79953979 79954576 -72582683 + RMER6C LTR ERVK 3 664 -26 6 1195 296 357 94 94 chr5 79954851 79955203 -72582056 - ORR1E LTR MaLR -4 355 4 6 1195 1468 238 146 99 chr5 79965056 79965640 -72571619 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 1195 4356 51 12 2 chr5 79965919 79966490 -72570769 + MT-int LTR MaLR 403 979 -119 6 1195 1252 249 102 21 chr5 79982430 79982894 -72554365 - RMER6C LTR ERVK -2 688 227 7 1195 1252 274 60 67 chr5 79982920 79983275 -72553984 - RMER6C LTR ERVK -337 353 1 7 1195 225 330 75 0 chr5 79990011 79990117 -72547142 - MLT2B2 LTR ERVL -34 528 415 7 1195 2073 232 37 26 chr5 80002829 80003320 -72533939 - RMER15 LTR ERVL -78 497 2 9 1195 2909 53 3 0 chr5 80006011 80006367 -72530892 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 1 1195 739 152 50 50 chr5 80006367 80006526 -72530733 + IAPLTR4_I LTR ERVK 22 180 -1290 1 1195 4758 169 6 37 chr5 80006525 80007418 -72529841 + IAPLTR4_I LTR ERVK 546 1410 -60 1 1195 3083 80 5 0 chr5 80007412 80007813 -72529446 + IAPEY3-int LTR ERVK 1580 1982 -5698 1 1195 3466 76 9 0 chr5 80007790 80008238 -72529021 + IAPEY3-int LTR ERVK 2238 2689 -4991 1 1195 2876 172 24 73 chr5 80008394 80009022 -72528237 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6985 7581 0 2 1195 2998 50 0 0 chr5 80009022 80009379 -72527880 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 2 1195 2166 130 9 0 chr5 80011336 80011660 -72525599 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1195 429 250 25 44 chr5 80013271 80013430 -72523829 + RLTR43A LTR ERVK 209 364 0 2 1195 528 246 177 72 chr5 80014309 80014642 -72522617 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 3 1195 437 213 147 45 chr5 80017849 80018006 -72519253 + MER76 LTR ERVL 519 691 0 3 1195 1567 184 4 8 chr5 80023256 80023594 -72513665 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -75 2251 1957 4 1195 3323 157 26 8 chr5 80023623 80024265 -72512994 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -585 1741 1088 4 1195 696 291 5 16 chr5 80024389 80024581 -72512678 - ORR1E LTR MaLR -168 191 2 4 1195 6117 69 14 12 chr5 80029851 80030658 -72506601 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 5 1195 282 308 62 172 chr5 80034668 80035005 -72502254 + RMER20B LTR ERVK 258 557 -70 5 1195 1026 252 73 115 chr5 80046419 80046827 -72490432 + MTD LTR MaLR 15 405 -14 7 1195 808 128 84 39 chr5 80047549 80047704 -72489555 - MTC LTR MaLR -250 171 10 7 1195 960 205 179 4 chr5 80057268 80057508 -72479751 - RMER6D LTR ERVK -159 561 280 9 1195 259 291 157 34 chr5 80060145 80060323 -72476936 + LTR80A LTR ERVL 40 239 -344 1 1195 618 267 86 8 chr5 80060342 80060503 -72476756 + ORR1C2 LTR MaLR 162 339 -55 1 1195 618 248 84 7 chr5 80060549 80060592 -72476667 + ORR1C2 LTR MaLR 330 372 -12 1 1195 408 392 41 68 chr5 80061657 80062026 -72475233 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1195 1123 355 85 2 chr5 80062026 80062437 -72474822 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1081 1 1195 901 318 109 45 chr5 80063190 80063983 -72473276 - ORR1E-int LTR MaLR -642 938 5 1 1195 385 211 0 13 chr5 80063989 80064066 -72473193 - ORR1E LTR MaLR -6 373 298 1 1195 399 342 0 14 chr5 80070942 80071090 -72466169 - MER67D LTR ERV1 -100 414 269 1 1195 558 323 66 53 chr5 80073368 80073669 -72463590 + MTE2a LTR MaLR 60 364 -15 1 1195 4326 145 36 39 chr5 80076370 80077182 -72460077 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 1 1195 309 315 28 51 chr5 80077477 80077654 -72459605 - RLTR25A LTR ERVK -930 173 1 1 1195 2047 171 46 23 chr5 80078445 80078876 -72458383 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 1 1196 2506 188 26 16 chr5 80086743 80087307 -72449952 + ORR1A3-int LTR MaLR 334 1190 -773 1 1196 915 267 75 7 chr5 80087356 80087423 -72449836 + ORR1A3-int LTR MaLR 556 631 -627 1 1196 234 215 154 0 chr5 80093688 80093753 -72443506 - MTEb LTR MaLR -165 214 140 1 1196 319 383 31 6 chr5 80094112 80094275 -72442984 + MTEa LTR MaLR 10 176 -203 1 1196 916 318 52 25 chr5 80094419 80094861 -72442398 + MTE-int LTR MaLR 23 476 -1104 1 1196 287 262 25 12 chr5 80094903 80094984 -72442275 + MTE-int LTR MaLR 548 629 -951 1 1196 2378 94 122 5 chr5 80108148 80108524 -72428735 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 1 1196 3048 88 2 9 chr5 80109613 80110037 -72427222 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 1196 334 275 167 56 chr5 80112558 80112774 -72424485 - MTD LTR MaLR -14 405 166 2 1196 258 205 20 102 chr5 80119637 80119735 -72417524 + MLT1A1 LTR MaLR 307 396 -12 2 1196 1813 236 12 42 chr5 80121114 80121538 -72415721 - MTD LTR MaLR -8 411 1 2 1196 2983 83 2 5 chr5 80122873 80123270 -72413989 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1196 1132 251 127 42 chr5 80127922 80128156 -72409103 - RMER6B LTR ERVK -1 460 225 2 1196 1132 251 127 42 chr5 80128754 80128943 -72408316 - RMER6B LTR ERVK -237 224 2 2 1196 1369 135 125 30 chr5 80134525 80134830 -72402429 + RLTR9E LTR ERVK 76 409 0 2 1196 335 198 67 36 chr5 80136725 80136761 -72400498 + ORR1B1 LTR MaLR 309 369 -52 2 1196 392 60 0 0 chr5 80137514 80137564 -72399695 + ORR1B1 LTR MaLR 344 393 -1 2 1196 552 309 101 57 chr5 80144229 80144634 -72392625 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 8 2 1196 1144 257 112 87 chr5 80146089 80146686 -72390573 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 1 2 1196 337 289 43 17 chr5 80147386 80147502 -72389757 + ORR1E LTR MaLR 241 359 0 2 1196 782 277 53 106 chr5 80148876 80149312 -72387947 + RLTR12B LTR ERVK 74 486 -42 2 1196 305 218 0 25 chr5 80158767 80158847 -72378412 + RMER12 LTR ERVK 712 789 -615 2 1196 392 291 25 121 chr5 80158844 80159125 -72378134 + RLTR22_Mur LTR ERVK 549 802 -1046 2 1196 689 277 52 48 chr5 80159427 80159685 -72377574 + RMER12 LTR ERVK 994 1304 -18 2 1196 580 351 25 90 chr5 80174414 80174561 -72362698 + MTE2a LTR MaLR 1 145 -234 3 1196 580 351 25 90 chr5 80175372 80175434 -72361825 + MTE2a LTR MaLR 146 186 -193 3 1196 580 351 25 90 chr5 80175503 80175658 -72361601 + MTE2a LTR MaLR 187 341 -38 3 1196 3080 26 32 0 chr5 80180013 80180391 -72356868 - MTA_Mm LTR MaLR -6 390 1 3 1196 327 336 0 82 chr5 80186074 80186220 -72351039 - BGLII_B LTR ERVK -21 420 287 3 1196 429 267 148 48 chr5 80186342 80186531 -72350728 + MTEb LTR MaLR 172 379 0 3 1196 1002 207 14 178 chr5 80189696 80190060 -72347199 - RMER19B LTR ERVK -273 338 3 3 1196 307 332 118 89 chr5 80192513 80192817 -72344442 - MTEa LTR MaLR -47 332 20 3 1196 745 211 133 10 chr5 80194864 80195060 -72342199 - RMER6D LTR ERVK 0 720 501 3 1196 534 330 62 0 chr5 80196663 80196842 -72340417 + ORR1E LTR MaLR 1 190 -169 3 1196 1823 234 105 39 chr5 80199693 80200253 -72337006 - RMER20B LTR ERVK -21 606 10 3 1196 532 271 42 52 chr5 80200874 80201065 -72336194 - MTE2a LTR MaLR -18 361 173 3 1196 938 206 89 66 chr5 80210310 80210743 -72326516 - RMER19B LTR ERVK 0 902 317 3 1196 2313 122 16 6 chr5 80215040 80215404 -72321855 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 3 1197 2587 97 19 0 chr5 80217451 80217821 -72319438 + MTB LTR MaLR 3 379 -21 3 1197 322 314 41 16 chr5 80224032 80224155 -72313104 - RLTR25B LTR ERVK -4 1099 974 3 1197 1656 223 176 61 chr5 80224140 80224857 -72312402 - RLTR25B LTR ERVK -224 804 6 3 1197 2095 196 84 64 chr5 80228224 80228267 -72308992 - RLTR20B3 LTR ERVK -54 523 481 3 1197 2095 196 84 64 chr5 80228363 80228831 -72308428 - RLTR20B3 LTR ERVK -97 480 2 3 1197 357 217 24 0 chr5 80232553 80232636 -72304623 + MTD LTR MaLR 1 85 -334 3 1197 1246 292 92 84 chr5 80232647 80233313 -72303946 + MTD-int LTR MaLR 586 1256 -2 3 1197 1023 272 21 14 chr5 80233313 80233589 -72303670 + MTD LTR MaLR 18 295 -124 3 1197 9233 136 29 60 chr5 80236810 80237818 -72299441 + RLTR22_Mur LTR ERVK 200 1158 -690 3 1197 9233 136 29 60 chr5 80237872 80238565 -72298694 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1159 1848 0 3 1197 283 182 136 0 chr5 80239044 80239110 -72298149 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 510 4 1197 2306 184 26 78 chr5 80239084 80239625 -72297634 - RLTR5_Mm LTR ERV1 -115 513 1 4 1197 21698 196 18 17 chr5 80239625 80244994 -72292265 - MURVY-int LTR ERV1 0 7778 2229 4 1197 920 164 0 0 chr5 80251940 80252092 -72285167 - MURVY-int LTR ERV1 -5217 2235 2084 4 1197 4202 160 1 11 chr5 80252090 80252824 -72284435 - MURVY-int LTR ERV1 -6725 727 1 4 1197 2818 169 57 66 chr5 80252824 80253458 -72283801 - RLTR5_Mm LTR ERV1 0 628 1 4 1197 587 248 97 81 chr5 80255533 80255792 -72281467 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 106 4 1197 716 229 62 36 chr5 80258918 80259113 -72278146 + LTRIS4 LTR ERV1 308 507 0 4 1197 307 375 42 17 chr5 80260018 80260254 -72277005 + ERVL-int LTR ERVL 4112 4353 -1404 4 1197 2378 68 64 3 chr5 80265025 80265351 -72271908 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1197 589 267 107 130 chr5 80267178 80267664 -72269595 - RLTR12B LTR ERVK -7 521 47 4 1197 2730 196 4 101 chr5 80287840 80288516 -72248743 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 1197 2568 199 182 31 chr5 80289067 80289848 -72247411 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 4 1197 1150 229 131 33 chr5 80306771 80307046 -72230213 + MTEa LTR MaLR 36 337 -42 4 1197 373 311 37 7 chr5 80312255 80312391 -72224868 - MTD LTR MaLR -56 363 224 4 1197 829 214 147 77 chr5 80313488 80313680 -72223579 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 165 4 1197 829 214 147 77 chr5 80313749 80313855 -72223404 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 54 4 1197 268 222 40 40 chr5 80316961 80317036 -72220223 + RLTR25B LTR ERVK 423 497 -531 4 1197 272 216 0 98 chr5 80316969 80317051 -72220208 + MT2B LTR ERVL 191 264 -337 4 1197 1297 163 82 0 chr5 80326075 80326320 -72210939 - RMER6C LTR ERVK -1 689 425 5 1197 304 191 14 56 chr5 80326440 80326512 -72210747 - MYSERV6-int LTR ERVK -63 3114 3046 5 1197 521 221 10 0 chr5 80326505 80326609 -72210650 - MYSERV6-int LTR ERVK -70 3107 3003 5 1197 1370 222 68 6 chr5 80326656 80327152 -72210107 - MYSERV6-int LTR ERVK -4348 4611 4156 5 1197 1464 140 4 0 chr5 80327163 80327399 -72209860 - RMER6C LTR ERVK 0 690 454 5 1197 523 309 62 73 chr5 80336213 80336639 -72200620 + MT2A LTR ERVL 1 553 -48 5 1197 421 187 19 31 chr5 80346414 80346602 -72190657 + MYSERV6-int LTR ERVK 1033 1202 -1124 5 149 3704 209 42 30 chr5 80346773 80347743 -72189516 + MYSERV6-int LTR ERVK 7926 8907 -52 5 1198 457 211 80 16 chr5 80354016 80354141 -72183118 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 393 5 1198 2772 122 34 32 chr5 80354259 80354733 -72182526 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 475 -347 5 1198 6250 93 23 5 chr5 80361850 80362727 -72174532 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 5 1198 1846 175 13 84 chr5 80363374 80363755 -72173504 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1198 283 196 0 0 chr5 80363762 80363808 -72173451 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 1918 5 1198 323 216 45 73 chr5 80363833 80363943 -72173316 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 107 -1856 5 1198 2617 234 19 19 chr5 80363913 80364540 -72172719 + ORR1A3-int LTR MaLR 14 640 -1323 5 1198 421 192 0 0 chr5 80364576 80364649 -72172610 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 73 -402 5 1198 324 339 23 30 chr5 80367825 80367956 -72169303 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 279 5 1198 1480 214 130 33 chr5 80370686 80371058 -72166201 + RLTR16 LTR ERVK 1 419 -86 5 1198 1480 214 130 33 chr5 80371113 80371200 -72166059 + RLTR16 LTR ERVK 420 505 0 5 1198 292 349 88 39 chr5 80376917 80377099 -72160160 + MLT1A0 LTR MaLR 166 356 -9 5 1198 355 122 39 39 chr5 80380101 80380178 -72157081 - RLTR25B LTR ERVK -522 506 430 6 1198 639 182 14 49 chr5 80392578 80392722 -72144537 + RLTR11A LTR ERVK 390 528 0 6 1198 3355 44 49 76 chr5 80398690 80399178 -72138081 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 1198 2173 197 146 20 chr5 80403680 80404340 -72132919 - RMER6A LTR ERVK -7 749 2 6 1198 784 121 0 0 chr5 80409907 80410023 -72127236 + ORR1A3 LTR MaLR 211 326 0 6 1198 234 412 47 7 chr5 80418751 80418900 -72118359 - MLT1F2 LTR MaLR -274 286 132 6 1198 240 290 16 0 chr5 80419038 80419100 -72118159 - MLT1F2-int LTR MaLR -95 1394 1332 6 1198 815 268 56 134 chr5 80420207 80420565 -72116694 + MTD LTR MaLR 82 411 -8 6 1198 4660 163 76 34 chr5 80429760 80430239 -72107020 + RMER17B LTR ERVK 1 526 -432 6 1198 4660 163 76 34 chr5 80430496 80430935 -72106324 + RMER17B LTR ERVK 527 958 0 6 1198 941 284 168 6 chr5 80432758 80433091 -72104168 + ORR1B1 LTR MaLR 6 392 -2 6 1198 380 349 36 80 chr5 80443761 80444035 -72093224 + MLT2F LTR ERVL 402 663 0 6 1198 307 320 116 34 chr5 80444128 80444422 -72092837 + ERVL-E-int LTR ERVL 68 385 -5282 6 1198 263 357 30 10 chr5 80445347 80445446 -72091813 + MLT2F LTR ERVL 189 289 -374 6 1198 2014 188 6 43 chr5 80445915 80446381 -72090878 + RLTR11B LTR ERVK 1 449 -4 6 1198 1840 228 12 21 chr5 80446849 80447274 -72089985 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1198 1303 199 15 19 chr5 80450349 80450615 -72086644 + RMER10B LTR ERVL 1 265 -133 6 1198 297 280 12 96 chr5 80450641 80450807 -72086452 + RMER10B LTR ERVL 195 346 -52 6 1198 1723 147 64 23 chr5 80454108 80454534 -72082725 + RMER17C LTR ERVK 19 439 -519 7 1198 1172 253 79 42 chr5 80454759 80455114 -72082145 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 7 1198 948 265 65 13 chr5 80455127 80455423 -72081836 + ORR1D2-int LTR MaLR 5 316 -1054 7 1198 2419 135 64 38 chr5 80459632 80460102 -72077157 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 7 1198 410 259 42 35 chr5 80465272 80465416 -72071843 + RLTR23 LTR ERV1 286 430 0 7 1198 1767 190 31 20 chr5 80466998 80467353 -72069906 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 7 1198 252 237 26 26 chr5 80467945 80468023 -72069236 - RMER15-int LTR ERVL -3683 1316 1239 7 1198 764 329 63 57 chr5 80468042 80468641 -72068618 - RMER15-int LTR ERVL -3936 1063 461 7 1198 240 325 39 0 chr5 80468852 80468929 -72068330 - RMER15 LTR ERVL -43 532 453 7 1198 1459 200 162 11 chr5 80469791 80470150 -72067109 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 7 1198 233 250 0 98 chr5 80476194 80476296 -72060963 - MLT2B2 LTR ERVL -8 554 463 7 1199 3116 3 43 0 chr5 80487239 80487591 -72049668 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 1199 21299 33 40 4 chr5 80487591 80490165 -72047094 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2674 -3807 7 1199 9334 28 3 0 chr5 80490143 80491219 -72046040 + IAPEz-int LTR ERVK 5403 6481 0 7 1199 3116 3 43 0 chr5 80491219 80491571 -72045688 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 7 1199 631 332 71 30 chr5 80496232 80496499 -72040760 + MTEb LTR MaLR 92 369 -10 7 1199 2231 117 9 12 chr5 80512819 80513147 -72024112 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1199 812 296 121 37 chr5 80520182 80520548 -72016711 - MTD LTR MaLR 0 400 14 2 1199 562 302 118 79 chr5 80522230 80522921 -72014338 - MTC-int LTR MaLR -118 1140 323 2 1199 441 245 0 11 chr5 80523385 80523480 -72013779 - MTC-int LTR MaLR -922 336 243 2 1199 731 319 41 22 chr5 80525488 80525805 -72011454 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 43 3 1199 390 271 107 52 chr5 80526845 80527053 -72010206 - ORR1C2 LTR MaLR -128 256 9 3 1199 672 189 8 32 chr5 80529254 80529380 -72007879 - RLTR20C LTR ERVK -409 125 3 4 1199 308 338 35 21 chr5 80543798 80543940 -71993319 + ORR1D1 LTR MaLR 231 374 0 5 1199 361 205 0 20 chr5 80544113 80544195 -71993064 + ORR1D1 LTR MaLR 310 384 0 5 1199 1391 309 28 26 chr5 80546052 80546560 -71990699 - RLTR11A2 LTR ERVK -14 513 5 6 1199 769 289 41 72 chr5 80546906 80547268 -71989991 + RLTR40 LTR ERVK 457 807 -10 6 1199 310 329 34 26 chr5 80550690 80550848 -71986411 + ORR1E LTR MaLR 26 179 -191 7 1199 1106 300 20 7 chr5 80559687 80559992 -71977267 + ORR1D2 LTR MaLR 11 319 -51 8 1199 680 295 45 33 chr5 80561383 80561556 -71975703 - MTD LTR MaLR 0 419 243 9 1199 1698 198 235 14 chr5 80561556 80562121 -71975138 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 9 1199 680 295 45 33 chr5 80562121 80562189 -71975070 - MTD LTR MaLR -177 242 175 9 1199 525 305 40 128 chr5 80562294 80562692 -71974567 - RMER20B LTR ERVK -31 596 234 9 1199 1118 256 10 75 chr5 80575360 80575758 -71961501 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 1 1199 326 374 43 27 chr5 80587306 80587493 -71949766 + MTE-int LTR MaLR 65 254 -1326 1 1199 236 380 78 0 chr5 80587827 80587969 -71949290 + MTE-int LTR MaLR 766 918 -662 1 1199 522 299 82 165 chr5 80589352 80589765 -71947494 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1199 298 353 69 35 chr5 80591305 80591478 -71945781 + MLT1E1 LTR MaLR 472 650 -4 1 1199 298 385 37 31 chr5 80595027 80595188 -71942071 - MLT1H LTR MaLR -347 202 41 1 1199 372 333 85 78 chr5 80599456 80599775 -71937484 + ORR1E LTR MaLR 11 331 -28 1 1200 1878 161 50 116 chr5 80613491 80613816 -71923443 + ORR1B1 LTR MaLR 1 337 -57 1 1200 1878 161 50 116 chr5 80613987 80614083 -71923176 + ORR1B1 LTR MaLR 338 394 0 1 1200 3328 86 11 9 chr5 80619567 80620034 -71917225 + MT2C_Mm LTR ERVL 8 475 0 1 1200 2367 194 168 67 chr5 80620309 80620977 -71916282 - RMER19A LTR ERVK -2 735 1 1 1200 341 187 13 0 chr5 80625084 80625159 -71912100 + MER57D LTR ERV1 336 411 0 1 1200 3815 136 7 10 chr5 80633058 80633659 -71903600 - MT2B LTR ERVL 0 601 3 1 1200 526 165 67 19 chr5 80635274 80635379 -71901880 + RMER6B LTR ERVK 3 112 -349 2 1200 1385 179 282 3 chr5 80635379 80635737 -71901522 + RMER6B LTR ERVK 1 458 -3 2 1200 530 269 151 23 chr5 80637840 80638098 -71899161 + ORR1D-int LTR MaLR 504 794 -576 2 1200 1848 291 31 24 chr5 80639916 80640236 -71897023 + ORR1D-int LTR MaLR 790 1109 -261 2 1200 1848 291 31 24 chr5 80640375 80640631 -71896628 + ORR1D-int LTR MaLR 1110 1370 0 2 1200 365 330 50 0 chr5 80645037 80645178 -71892081 + MLT2B4 LTR ERVL 1 150 -404 2 1200 1544 206 69 11 chr5 80645498 80645847 -71891412 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 3 2 1200 3811 92 23 31 chr5 80645858 80646430 -71890829 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 2 1200 384 329 57 7 chr5 80647386 80647527 -71889732 + MLT1A0 LTR MaLR 218 365 0 2 1200 535 291 191 13 chr5 80662486 80662716 -71874543 - MTEb LTR MaLR -3 376 106 2 1200 1557 198 10 13 chr5 80676034 80676341 -71860918 - RMER6C LTR ERVK -384 306 1 2 1200 2345 127 50 25 chr5 80690087 80690484 -71846775 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1200 852 310 75 41 chr5 80692483 80692974 -71844285 - RMER5 LTR ERV1 -12 522 15 2 1200 1836 161 15 58 chr5 80697889 80698231 -71839028 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1200 1138 318 47 19 chr5 80703097 80703459 -71833800 + MTEa LTR MaLR 3 374 -5 3 1200 319 268 130 27 chr5 80706674 80706820 -71830439 - MLT1C LTR MaLR -289 178 18 3 1200 1003 158 16 11 chr5 80720723 80720909 -71816350 + RMER6C LTR ERVK 500 686 -4 3 1200 298 330 130 36 chr5 80731428 80731651 -71805608 + MLT1A0 LTR MaLR 119 362 -3 3 1200 782 249 117 4 chr5 80732497 80732727 -71804532 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1593 3 1200 1521 121 169 0 chr5 80735571 80735861 -71801398 - RLTR22_Mur LTR ERVK -869 979 641 3 1200 1452 246 71 60 chr5 80735890 80736003 -71801256 + RMER12 LTR ERVK 32 133 -1189 3 1200 1452 246 71 60 chr5 80736604 80737001 -71800258 + RMER12 LTR ERVK 134 555 -767 3 1201 241 247 56 131 chr5 80748525 80748632 -71788627 - MTEb LTR MaLR -280 99 1 3 1201 2381 253 65 23 chr5 80752691 80753169 -71784090 - ORR1D-int LTR MaLR -535 974 361 3 1201 2381 250 67 23 chr5 80753659 80753891 -71783368 - ORR1D-int LTR MaLR -1010 360 101 3 1201 600 310 90 78 chr5 80754046 80754392 -71782867 + ORR1E LTR MaLR 5 354 -5 3 1201 254 301 81 40 chr5 80759613 80759762 -71777497 + MTD LTR MaLR 8 162 -257 3 1201 236 331 83 23 chr5 80759897 80760030 -71777229 + MTD LTR MaLR 204 344 -15 3 1201 376 342 65 20 chr5 80761558 80761758 -71775501 - MLT2B1 LTR ERVL -40 527 319 3 1201 270 272 149 0 chr5 80762085 80762199 -71775060 - MLT2B1 LTR ERVL -357 199 69 3 1201 818 307 106 21 chr5 80770163 80770502 -71766757 + MTEb LTR MaLR 2 369 -10 3 1201 317 263 69 12 chr5 80771149 80771266 -71765993 + ORR1E LTR MaLR 1 126 -244 3 1201 1904 161 24 0 chr5 80775062 80775403 -71761856 + RLTR20A2 LTR ERVK 85 433 -145 3 1201 276 294 18 81 chr5 80775601 80775712 -71761547 + RLTR20A2 LTR ERVK 433 536 -42 3 1201 435 248 27 54 chr5 80775745 80775856 -71761403 + RLTR20A1 LTR ERVK 444 551 0 3 1201 849 280 103 25 chr5 80805936 80806271 -71730988 + ORR1D2 LTR MaLR 2 373 -11 4 1201 1405 144 30 52 chr5 80808850 80809121 -71728138 + RLTR26 LTR ERVK 1 265 -377 4 1201 612 316 239 20 chr5 80810994 80811282 -71725977 + ORR1D2 LTR MaLR 18 368 -2 4 1201 2504 181 240 81 chr5 80811763 80812538 -71724721 + RMER19B LTR ERVK 5 902 0 4 1201 1049 172 55 17 chr5 80814406 80814642 -71722617 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 238 4 1201 1474 119 26 49 chr5 80816805 80817069 -71720190 - RLTR45 LTR ERVK -224 258 1 4 1201 1208 179 25 10 chr5 80836888 80837197 -71700062 - RLTR25A LTR ERVK -41 1062 641 4 1201 2159 201 31 2 chr5 80837200 80837625 -71699634 - RLTR25A LTR ERVK -623 480 44 4 1201 1979 157 145 24 chr5 80837729 80838191 -71699068 - RMER6C LTR ERVK -77 613 96 4 1201 994 272 11 8 chr5 80846780 80847047 -71690212 - RMER15 LTR ERVL -22 553 286 4 1201 318 339 90 84 chr5 80847967 80848266 -71688993 - MLT1B LTR MaLR -77 313 13 4 1201 1470 230 18 20 chr5 80851933 80852275 -71684984 - ORR1C1 LTR MaLR -5 373 33 4 1201 516 391 105 32 chr5 80856761 80857265 -71679994 + MTE-int LTR MaLR 892 1432 -148 5 1201 529 333 59 22 chr5 80858931 80859292 -71677967 + MTD LTR MaLR 6 406 -13 5 1201 546 330 61 32 chr5 80859310 80859589 -71677670 + MTD-int LTR MaLR 11 297 -961 5 1201 752 307 141 57 chr5 80859620 80860229 -71677030 + MTD-int LTR MaLR 495 1165 -93 5 1201 414 275 99 19 chr5 80860227 80860503 -71676756 + MTD LTR MaLR 50 385 -34 5 1202 586 219 138 74 chr5 80874412 80874629 -71662630 - RMER12 LTR ERVK -104 1218 988 5 1202 245 221 54 75 chr5 80874694 80874787 -71662472 - RMER12 LTR ERVK -533 789 699 5 1202 1133 256 199 17 chr5 80874881 80875596 -71661663 - RMER12 LTR ERVK -395 1009 1 5 1202 261 436 16 40 chr5 80889572 80889825 -71647434 - MLT2C2 LTR ERVL -63 351 105 5 1202 284 318 18 18 chr5 80891143 80891255 -71646004 - MLT2C2 LTR ERVL -352 112 1 5 1202 609 231 105 126 chr5 80896746 80897118 -71640141 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 5 5 1202 284 245 36 48 chr5 80925072 80925196 -71612063 + MER34 LTR ERV1 459 585 -2 5 1202 383 323 59 93 chr5 80930030 80930354 -71606905 - MER89 LTR ERV1 -26 533 221 5 1202 314 301 7 56 chr5 80941644 80941788 -71595471 - MLT2B4 LTR ERVL -346 210 74 6 1202 233 367 40 30 chr5 80942339 80942440 -71594819 + MLT1H LTR MaLR 359 460 -89 6 1202 638 324 131 53 chr5 80950768 80951371 -71585888 - MLT1E1 LTR MaLR 0 654 5 6 1202 339 133 50 0 chr5 80958491 80958551 -71578708 + MT2A LTR ERVL 3 65 -468 6 1202 1327 283 47 7 chr5 80959661 80960091 -71577168 + MT2A LTR ERVL 77 523 -10 6 1202 1057 314 21 35 chr5 80962371 80962747 -71574512 - MTEb LTR MaLR 0 379 9 6 1202 353 320 60 7 chr5 80962756 80962907 -71574352 - MTEb-int LTR MaLR -1 1579 1421 6 1202 1354 326 53 75 chr5 80962899 80963563 -71573696 - MTEb-int LTR MaLR -931 649 1 6 1202 301 296 146 30 chr5 80963563 80963727 -71573532 - MTEb LTR MaLR 0 379 197 6 1202 263 315 70 53 chr5 80964323 80964437 -71572822 - MTEb LTR MaLR -258 121 6 6 1202 229 254 90 0 chr5 80964448 80964515 -71572744 + MLT1A1 LTR MaLR 4 76 -332 6 1202 335 354 74 36 chr5 80964731 80964993 -71572266 + MLT1A1 LTR MaLR 77 381 -27 6 1202 362 345 34 27 chr5 80967642 80967788 -71569471 - MTEa LTR MaLR -43 336 190 6 1202 282 279 44 70 chr5 80969009 80969167 -71568092 + RLTR43A LTR ERVK 211 364 0 6 1202 1385 220 0 54 chr5 80973888 80974224 -71563035 - RMER6C LTR ERVK -2 688 371 6 1202 293 213 118 146 chr5 80974308 80974418 -71562841 - MT2B LTR ERVL -315 286 180 6 1202 285 157 39 0 chr5 80974411 80974462 -71562797 - RMER6C LTR ERVK -667 53 1 6 1202 1244 205 51 31 chr5 80980897 80981249 -71556010 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 6 1202 1057 229 61 2 chr5 80985109 80985378 -71551881 - ORR1D1 LTR MaLR -50 309 1 6 1202 752 288 70 91 chr5 80997791 80998165 -71539094 + MTE2a LTR MaLR 1 366 -13 6 1202 564 358 37 16 chr5 80998205 80998449 -71538810 + MLT1B LTR MaLR 142 390 0 6 1203 1981 210 76 20 chr5 81003986 81004610 -71532649 - RMER6A LTR ERVK -105 651 1 4 1203 378 359 31 47 chr5 81024552 81024809 -71512450 + MLT1A0 LTR MaLR 48 300 -65 3 1203 427 311 7 13 chr5 81032501 81032651 -71504608 - RMER15 LTR ERVL -46 529 381 4 1203 6019 43 3 19 chr5 81035132 81035888 -71501371 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 5 1203 2173 75 0 0 chr5 81035887 81036165 -71501094 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 5 1203 3929 87 45 26 chr5 81036165 81036885 -71500374 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 3 5 1203 2362 120 135 7 chr5 81036887 81037308 -71499951 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1203 1758 215 22 78 chr5 81039430 81039890 -71497369 + RMER10A LTR ERVL 3 436 -6 5 1203 532 318 137 4 chr5 81060134 81060390 -71476869 - LTR50 LTR ERVL 0 795 506 8 1203 249 304 84 28 chr5 81068006 81068148 -71469111 + MLT1C LTR MaLR 318 467 0 1 1203 3685 35 7 0 chr5 81096690 81097123 -71440136 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1203 820 276 54 78 chr5 81113074 81113541 -71423718 - RMER15 LTR ERVL -17 558 1 1 1203 969 280 113 6 chr5 81116758 81117085 -71420174 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 6 1 1203 237 366 36 62 chr5 81117726 81117921 -71419338 - MLT1F-int LTR MaLR -34 1455 1266 1 1203 225 385 29 40 chr5 81118300 81118473 -71418786 - MLT1F-int LTR MaLR -575 834 664 1 1203 2765 104 5 2 chr5 81121889 81122286 -71414973 - MTB LTR MaLR 0 400 3 1 1203 790 309 20 4 chr5 81131726 81131970 -71405289 + MTD LTR MaLR 4 251 -168 1 1203 296 279 310 14 chr5 81131996 81132197 -71405062 + MTC-int LTR MaLR 45 306 -952 1 1203 1112 274 21 14 chr5 81132395 81132676 -71404583 + MTC-int LTR MaLR 296 578 -680 1 1204 250 261 0 0 chr5 81137291 81137337 -71399922 - MER50 LTR ERV1 -58 676 631 1 1204 311 243 14 0 chr5 81145698 81145768 -71391491 + MLT2B4 LTR ERVL 10 80 -476 1 1204 564 221 21 168 chr5 81151059 81151249 -71386010 - MTC LTR MaLR -8 413 252 2 1204 957 229 130 15 chr5 81157242 81157504 -71379755 - MTC LTR MaLR -129 292 1 2 1204 240 253 141 11 chr5 81160136 81160228 -71377031 - MLT1C LTR MaLR -53 414 311 2 1204 229 200 22 0 chr5 81164740 81164785 -71372474 - MLT2D LTR ERVL -368 46 1 2 1204 1254 263 108 14 chr5 81165103 81165465 -71371794 - MTD LTR MaLR -21 398 3 2 1204 3953 190 80 10 chr5 81168789 81169529 -71367730 + RMER12 LTR ERVK 1 785 -537 2 1204 3953 190 80 10 chr5 81169622 81169744 -71367515 + RMER12 LTR ERVK 786 923 -399 2 1204 542 342 63 42 chr5 81171410 81171857 -71365402 + MLT1E LTR MaLR 17 479 -201 2 1204 915 318 55 44 chr5 81172424 81172502 -71364757 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 295 2 1204 915 318 55 44 chr5 81172557 81172840 -71364419 - ORR1D2 LTR MaLR -76 294 3 2 1204 913 242 110 62 chr5 81173177 81173580 -71363679 - RMER13A LTR ERVK -75 552 113 2 1204 2630 71 87 0 chr5 81197123 81197491 -71339768 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1204 697 67 0 0 chr5 81203333 81203422 -71333837 + RLTR10 LTR ERVK 300 388 -2 2 1204 7966 35 7 7 chr5 81203424 81204384 -71332875 + RLTR10-int LTR ERVK 1 988 -999 2 1204 8888 15 0 0 chr5 81204461 81205456 -71331803 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 2 1204 2955 34 7 104 chr5 81205458 81205890 -71331369 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 1204 475 301 152 36 chr5 81208412 81208688 -71328571 - MLT1A LTR MaLR -66 308 1 2 1204 246 338 161 34 chr5 81213850 81214055 -71323204 - RMER15 LTR ERVL 0 575 345 2 1204 726 293 104 68 chr5 81214610 81214976 -71322283 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 1204 258 304 88 9 chr5 81223127 81223240 -71314019 - MTEb LTR MaLR -2 377 256 3 1204 1105 157 21 5 chr5 81223944 81224130 -71313129 + ORR1B1 LTR MaLR 206 394 0 3 1204 274 333 85 48 chr5 81225386 81225514 -71311745 - RMER15 LTR ERVL -3 572 438 3 1204 1422 195 102 3 chr5 81225514 81225848 -71311411 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1204 274 333 85 48 chr5 81225848 81225908 -71311351 - RMER15 LTR ERVL -138 437 377 3 1204 2599 269 80 40 chr5 81228860 81229676 -71307583 - ORR1D2-int LTR MaLR -522 848 1 3 1204 1017 289 39 17 chr5 81229676 81230038 -71307221 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1204 1491 148 35 25 chr5 81235499 81235783 -71301476 + ORR1A4 LTR MaLR 32 318 -11 3 1204 1847 172 58 28 chr5 81237601 81237996 -71299263 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1204 304 370 16 52 chr5 81239877 81240071 -71297188 + LTR41B LTR ERVL 482 668 -90 3 1204 3443 28 2 0 chr5 81250783 81251178 -71286081 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1204 256 359 98 79 chr5 81252985 81253363 -71283896 + MLT1K LTR MaLR 194 578 -17 3 1204 1942 146 3 68 chr5 81258681 81259033 -71278226 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1204 3364 91 124 11 chr5 81259623 81260148 -71277111 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 3 1204 279 339 102 53 chr5 81260730 81260917 -71276342 - LTR88c LTR Genie? -650 212 17 3 1204 2047 172 3 39 chr5 81261652 81262033 -71275226 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1204 1173 208 147 59 chr5 81262386 81262536 -71274723 - RMER19C LTR ERVK -278 333 198 3 1204 1173 208 147 59 chr5 81262781 81262936 -71274323 - RMER19C LTR ERVK -414 197 1 3 1204 786 194 7 0 chr5 81263425 81263569 -71273690 + RLTR11A LTR ERVK 4 148 -380 3 1204 1338 146 83 4 chr5 81263555 81263795 -71273464 + RLTR11A LTR ERVK 270 528 0 3 1205 253 277 15 0 chr5 81265653 81265718 -71271541 - MLT2D LTR ERVL 0 560 495 3 1205 553 335 71 34 chr5 81266956 81267225 -71270034 - MT2A LTR ERVL -254 279 1 3 1205 232 197 81 16 chr5 81271758 81271820 -71265439 + MLT2B4 LTR ERVL 231 296 -260 3 1205 2148 121 12 0 chr5 81291620 81291943 -71245316 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1205 317 269 28 46 chr5 81292896 81293005 -71244254 + MLT1D LTR MaLR 27 133 -372 3 1205 247 261 30 30 chr5 81297880 81297947 -71239312 + MTEa LTR MaLR 278 344 -35 4 1205 2682 192 32 87 chr5 81301373 81302064 -71235195 + RMER6C LTR ERVK 1 653 -37 4 1205 371 361 44 122 chr5 81307018 81307362 -71229897 - MLT1J1 LTR MaLR -127 317 1 4 1205 1185 204 48 0 chr5 81307528 81307734 -71229525 - MTC LTR MaLR -52 369 154 4 1205 228 372 112 36 chr5 81309214 81309518 -71227741 - MLT1J1-int LTR MaLR -358 1029 703 4 1205 465 342 149 33 chr5 81310262 81310537 -71226722 - MLT1J1-int LTR MaLR -979 408 102 4 1205 843 278 39 66 chr5 81349943 81350278 -71186981 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 291 4 1205 249 227 0 0 chr5 81350576 81350620 -71186639 - RLTR18 LTR ERVK -564 52 9 4 1205 396 327 74 89 chr5 81355345 81355681 -71181578 - ORR1E LTR MaLR -20 339 9 4 1205 955 262 137 37 chr5 81371778 81372158 -71165101 + MTD LTR MaLR 2 419 0 5 1205 1835 261 74 72 chr5 81373232 81374006 -71163253 - RLTR40 LTR ERVK -40 777 3 5 1205 375 315 184 5 chr5 81375681 81375882 -71161377 + RMER15 LTR ERVL 336 572 -3 5 1205 2143 141 0 3 chr5 81377741 81378061 -71159198 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 1205 10074 158 52 7 chr5 81378061 81379940 -71157319 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 5 1205 2047 87 83 0 chr5 81379944 81380233 -71157026 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 7 5 1205 416 353 39 86 chr5 81390050 81390310 -71146949 + MLT1E2 LTR MaLR 190 438 -189 5 1206 294 339 98 29 chr5 81400595 81400768 -71136491 + MLT1C LTR MaLR 283 467 0 5 1206 501 320 54 45 chr5 81410005 81410339 -71126920 + LTR37A LTR ERV1 46 382 -44 5 1206 2230 173 149 9 chr5 81412761 81413217 -71124042 + RMER15 LTR ERVL 22 541 -34 5 1206 837 287 84 57 chr5 81414716 81415085 -71122174 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 5 1206 3493 18 2 0 chr5 81417657 81418052 -71119207 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1206 9144 20 20 1 chr5 81418052 81419129 -71118130 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1206 3527 13 2 0 chr5 81419129 81419524 -71117735 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1206 294 333 65 18 chr5 81426117 81426285 -71110974 + MTEb LTR MaLR 200 375 -4 5 1206 1139 299 59 34 chr5 81429768 81430131 -71107128 + MTE2b LTR MaLR 3 357 -2 5 1206 478 312 61 28 chr5 81430351 81430746 -71106513 + MLT1C LTR MaLR 45 448 -19 6 1206 447 264 47 63 chr5 81439728 81439918 -71097341 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 244 6 1206 310 308 53 59 chr5 81441525 81441677 -71095582 + MTEb LTR MaLR 1 151 -228 6 1206 341 188 16 0 chr5 81441790 81441854 -71095405 + MTEb LTR MaLR 315 379 0 6 1206 737 243 130 32 chr5 81445353 81445569 -71091690 + RMER15 LTR ERVL 303 532 -43 6 1206 737 243 130 32 chr5 81445606 81445636 -71091623 + RMER15 LTR ERVL 533 572 -3 6 1206 306 234 31 41 chr5 81447073 81447171 -71090088 - MTEa LTR MaLR -4 375 279 6 1206 1852 197 59 8 chr5 81461918 81462292 -71074967 - MTC LTR MaLR 0 421 29 6 1206 1033 223 253 3 chr5 81465742 81466034 -71071225 + MTD LTR MaLR 16 380 -39 6 1206 2479 64 103 22 chr5 81469720 81470089 -71067170 + MTB LTR MaLR 2 400 0 6 1206 1043 300 56 85 chr5 81477190 81477448 -71059811 + MTD LTR MaLR 18 264 -155 6 1206 1043 300 56 85 chr5 81477502 81477655 -71059604 + MTD LTR MaLR 265 417 -2 6 1206 527 227 6 30 chr5 81491091 81491223 -71046036 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 260 6 1206 262 174 26 186 chr5 81494028 81494141 -71043118 - RLTR25B LTR ERVK -493 535 441 6 1206 303 377 83 53 chr5 81501686 81502081 -71035178 - MLT1J LTR MaLR -34 478 72 2 1206 566 336 78 80 chr5 81502794 81503295 -71033964 - MLT1G3 LTR MaLR -16 579 80 4 1206 277 315 88 51 chr5 81522813 81522950 -71014309 - MTEa LTR MaLR 0 379 238 2 1206 3748 233 31 61 chr5 81525491 81526396 -71010863 - RMER13B LTR ERVK 0 908 31 3 1206 561 216 92 0 chr5 81526423 81526626 -71010633 + RMER15 LTR ERVL 285 572 -3 3 1207 896 292 46 27 chr5 81533059 81533428 -71003831 - MTEb LTR MaLR 0 379 4 4 1207 882 257 111 23 chr5 81562131 81562474 -70974785 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 8 1207 1018 226 120 106 chr5 81566181 81566557 -70970702 - MTD LTR MaLR -21 398 18 8 1207 518 374 75 29 chr5 81577255 81577671 -70959588 + MLT2B2 LTR ERVL 1 435 -80 1 1207 280 311 8 78 chr5 81582889 81583018 -70954241 - RMER5 LTR ERV1 -18 516 397 1 1207 360 304 171 70 chr5 81584050 81584365 -70952894 - RMER5 LTR ERV1 -131 403 57 1 1207 846 303 60 54 chr5 81588190 81588637 -70948622 - RLTR17 LTR ERVK -126 566 117 1 1207 442 267 60 50 chr5 81601204 81601433 -70935826 - MTE2a LTR MaLR 0 379 85 1 1207 2924 159 12 45 chr5 81605422 81606002 -70931257 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 1 1207 406 331 75 82 chr5 81607001 81607320 -70929939 - ORR1E LTR MaLR -34 325 9 1 1207 458 293 86 62 chr5 81650464 81650708 -70886551 - MLT1B LTR MaLR -20 370 121 2 1207 572 405 27 33 chr5 81650726 81651091 -70886168 + MER21B LTR ERV1 22 384 -479 2 1208 269 150 77 77 chr5 81661825 81661890 -70875369 + RLTR25A LTR ERVK 518 582 -521 2 1208 1653 196 34 40 chr5 81685671 81686049 -70851210 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 2 1208 1361 208 65 9 chr5 81689685 81690095 -70847164 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 2 1208 2323 194 73 6 chr5 81690144 81690638 -70846621 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 1208 1135 268 70 6 chr5 81693305 81693636 -70843623 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 12 2 1208 306 298 58 50 chr5 81697747 81697867 -70839392 - LTR86C LTR ERVL -65 556 436 2 1208 262 350 121 28 chr5 81705408 81705590 -70831669 - RMER15 LTR ERVL -17 558 360 2 1208 2619 147 41 36 chr5 81709025 81709492 -70827767 - MT2B LTR ERVL 0 601 133 2 1208 2783 167 15 11 chr5 81712517 81713037 -70824222 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 1 2 1208 2006 200 185 2 chr5 81717725 81718085 -70819174 - RMER15 LTR ERVL 0 575 147 3 1208 2006 200 185 2 chr5 81718138 81718259 -70819000 - RMER15 LTR ERVL -429 146 6 3 1208 1762 190 85 3 chr5 81766768 81767132 -70770127 - RMER6D LTR ERVK -13 707 314 3 1208 1661 170 44 48 chr5 81778589 81779039 -70758220 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 3 1208 561 261 146 75 chr5 81779254 81779589 -70757670 - MTEb LTR MaLR -20 359 1 3 1208 1050 315 36 48 chr5 81779591 81780011 -70757248 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 1164 3 1209 458 239 147 53 chr5 81796077 81796267 -70740992 - MLT1B LTR MaLR -174 216 9 3 1209 412 293 92 11 chr5 81797568 81797736 -70739523 + MLT1A0 LTR MaLR 199 382 -8 3 1209 228 322 104 113 chr5 81805041 81805387 -70731872 - MLT1F2 LTR MaLR -38 522 180 4 1209 2093 108 12 12 chr5 81806724 81807061 -70730198 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1209 55074 29 9 2 chr5 81807061 81813486 -70723773 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6478 -3 4 1209 2093 108 12 12 chr5 81813490 81813827 -70723432 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1209 430 233 43 73 chr5 81827512 81827712 -70709547 - RLTR11B LTR ERVK -35 493 284 4 1209 833 236 38 30 chr5 81831983 81832245 -70705014 - RLTR11B LTR ERVK -189 264 1 4 1209 2909 90 18 5 chr5 81843366 81843767 -70693492 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 1 4 1209 513 282 99 181 chr5 81861160 81861575 -70675684 + RMER20B LTR ERVK 219 599 -28 4 1209 812 234 207 19 chr5 81867789 81868103 -70669156 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 4 1209 238 326 44 58 chr5 81877031 81877168 -70660091 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 274 5 1209 338 313 146 77 chr5 81883646 81884000 -70653259 - MLT1C LTR MaLR -12 378 1 5 1209 1565 247 80 8 chr5 81898480 81898867 -70638392 - MTD LTR MaLR 0 419 5 5 1209 231 309 143 0 chr5 81909568 81909652 -70627607 - MLT1D LTR MaLR -397 108 13 5 1209 328 368 46 96 chr5 81911853 81912334 -70624925 - MTE-int LTR MaLR -1082 498 42 5 1209 304 374 65 14 chr5 81912863 81913080 -70624179 - ORR1E LTR MaLR -131 228 1 5 1209 1356 185 91 19 chr5 81916249 81916568 -70620691 - ORR1B1 LTR MaLR -12 382 41 5 1209 328 241 38 121 chr5 81918646 81918671 -70618588 - MT2B LTR ERVL -345 256 136 5 1210 1459 201 206 3 chr5 81930141 81930491 -70606768 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1210 265 220 14 246 chr5 81942762 81942833 -70594426 + MT2B LTR ERVL 103 221 -363 6 1210 265 196 13 296 chr5 81943097 81943137 -70594122 + MT2B LTR ERVL 222 257 -344 6 1210 3187 63 2 0 chr5 81956215 81956614 -70580645 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1210 2136 186 50 0 chr5 81959836 81960235 -70577024 - MTC LTR MaLR -2 419 1 6 1210 793 159 14 0 chr5 81960857 81960995 -70576264 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 245 6 1210 301 304 39 0 chr5 81961061 81961163 -70576096 - ORR1C2 LTR MaLR -268 106 1 6 1210 790 317 11 96 chr5 81967856 81968199 -70569060 - MTE2b LTR MaLR -60 319 1 6 1210 227 333 202 0 chr5 81968469 81968583 -70568676 + ORR1E LTR MaLR 76 212 -147 6 1210 285 344 11 0 chr5 81968876 81968966 -70568293 - RMER15 LTR ERVL -54 521 431 6 1210 281 364 45 23 chr5 81969588 81969765 -70567494 - ORR1E LTR MaLR -178 181 1 6 1210 940 251 24 76 chr5 81970866 81971156 -70566103 - ORR1E LTR MaLR -96 274 1 6 1210 1786 187 49 19 chr5 81977645 81978010 -70559249 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 1 6 1210 447 250 68 8 chr5 81983770 81983887 -70553372 - MER34A LTR ERV1 -428 143 20 6 1210 3403 157 62 12 chr5 81984638 81985297 -70551962 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 6 1210 612 262 12 47 chr5 81991729 81991901 -70545358 + MLT1A1 LTR MaLR 243 408 0 6 1210 269 333 0 12 chr5 81992390 81992475 -70544784 - MLT1H2 LTR MaLR -338 151 68 6 1210 1553 187 28 90 chr5 81999510 81999909 -70537350 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1210 1838 161 64 61 chr5 82015937 82016314 -70520945 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1210 1670 186 36 36 chr5 82016636 82016999 -70520260 - RMER6B LTR ERVK -2 459 97 1 1210 1215 275 52 10 chr5 82018215 82018523 -70518736 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 42 1 1210 931 148 321 32 chr5 82020162 82020357 -70516902 - RMER10B LTR ERVL -1 397 154 2 1210 931 148 321 32 chr5 82020394 82020506 -70516753 - RMER10B LTR ERVL -245 153 1 2 1210 1254 180 42 30 chr5 82022299 82022618 -70514641 - RMER17C LTR ERVK -14 396 1 3 1210 972 247 116 62 chr5 82024694 82025201 -70512058 - RMER17C LTR ERVK -520 438 2 3 1210 464 294 75 52 chr5 82026288 82026500 -70510759 - MLT1C LTR MaLR -225 242 26 3 1210 1177 122 226 46 chr5 82031921 82032204 -70505055 - ORR1B1 LTR MaLR -20 374 41 4 1210 247 351 101 36 chr5 82032477 82032616 -70504643 - MER21B LTR ERV1 -202 661 514 4 1210 273 376 28 28 chr5 82032763 82032908 -70504351 - MER21B LTR ERV1 -621 242 98 4 1210 1266 291 64 10 chr5 82033646 82034035 -70503224 - MTD LTR MaLR -9 410 1 5 1210 1343 271 13 140 chr5 82034102 82034573 -70502686 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 5 1210 1331 205 23 37 chr5 82035969 82036268 -70500991 - MTC LTR MaLR -24 397 103 5 1210 908 286 93 60 chr5 82037355 82037561 -70499698 + MTD LTR MaLR 1 206 -213 5 1210 908 286 93 60 chr5 82037593 82037772 -70499487 + MTD LTR MaLR 207 398 -21 5 1210 709 279 19 83 chr5 82045982 82046076 -70491183 + ORR1E LTR MaLR 10 102 -257 7 1210 2052 118 11 72 chr5 82046076 82046423 -70490836 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 7 1210 709 279 19 83 chr5 82046423 82046594 -70490665 + ORR1E LTR MaLR 103 258 -101 7 1210 1419 189 108 5 chr5 82049447 82049626 -70487633 - RMER17C LTR ERVK 0 410 206 7 1210 1419 189 108 5 chr5 82049678 82049870 -70487389 - RMER17C LTR ERVK -205 205 2 7 1211 295 320 144 55 chr5 82051199 82051470 -70485789 - MLT1E1 LTR MaLR -38 616 322 8 1211 234 352 68 54 chr5 82053343 82053622 -70483637 - MLT1E1 LTR MaLR -21 353 71 8 1211 2927 61 200 9 chr5 82054653 82055083 -70482176 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 8 1211 61615 18 0 0 chr5 82055083 82062637 -70474622 - MMERGLN-int LTR ERV1 0 7556 1 8 1211 2927 61 200 9 chr5 82062637 82063067 -70474192 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 8 1211 736 219 40 30 chr5 82063307 82063509 -70473750 - ORR1C2 LTR MaLR -6 378 175 8 1211 610 304 40 17 chr5 82063483 82063730 -70473529 - ORR1C2 LTR MaLR -109 261 1 8 1211 355 312 88 79 chr5 82065041 82065359 -70471900 - ORR1D1 LTR MaLR -26 353 1 8 1211 309 275 12 12 chr5 82080055 82080136 -70457123 - MLT1A0 LTR MaLR -73 292 212 1 1211 272 176 77 66 chr5 82080154 82080245 -70457014 - MLT1A0 LTR MaLR -217 148 57 1 1211 755 307 65 91 chr5 82081706 82082225 -70455034 - MT2A LTR ERVL 0 533 28 1 1211 461 284 161 93 chr5 82085630 82085941 -70451318 - ORR1D2 LTR MaLR -11 359 28 1 1211 1750 136 78 56 chr5 82095797 82096156 -70441103 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1211 249 331 21 63 chr5 82102070 82102212 -70435047 - RMER12 LTR ERVK -437 885 750 1 1211 2195 161 56 21 chr5 82109926 82110356 -70426903 - RLTR11B LTR ERVK -8 445 1 1 1211 2129 111 19 66 chr5 82110425 82110802 -70426457 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1211 379 346 22 0 chr5 82111418 82111554 -70425705 + MLT1A0 LTR MaLR 225 363 -2 1 1211 1947 130 3 10 chr5 82138265 82138575 -70398684 - RLTR10E LTR ERVK -3 308 1 1 1211 253 200 119 48 chr5 82156444 82156528 -70380731 + MT2B LTR ERVL 168 257 -344 2 1211 778 217 62 11 chr5 82176481 82176658 -70360601 - ORR1D1 LTR MaLR -188 186 1 2 1212 408 302 132 66 chr5 82190821 82191094 -70346165 - MLT1J1 LTR MaLR -149 295 5 2 1212 411 279 116 74 chr5 82191957 82192289 -70344970 - MLT1A LTR MaLR 0 365 1 2 1212 955 286 37 48 chr5 82193733 82194108 -70343151 - MTEb LTR MaLR 0 379 9 2 1212 287 298 194 36 chr5 82248371 82248618 -70288641 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 275 3 1212 485 338 76 21 chr5 82263744 82263980 -70273279 - MLT1D LTR MaLR -2 503 255 3 1212 4133 171 182 11 chr5 82264847 82265725 -70271534 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 3 1212 2552 141 58 7 chr5 82269058 82269493 -70267766 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 457 -104 3 1212 300 253 75 32 chr5 82270051 82270145 -70267114 - MER77 LTR ERVL -7 600 503 3 1212 367 280 7 101 chr5 82271446 82271585 -70265674 + MTE2b LTR MaLR 58 183 -196 3 1212 280 262 40 45 chr5 82271570 82271770 -70265489 - RMER17D LTR ERVK -471 418 220 3 1212 873 252 40 0 chr5 82271699 82271901 -70265358 + MTE2b LTR MaLR 169 378 -1 3 1212 6528 51 10 1 chr5 82276692 82277493 -70259766 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 3 1212 791 313 45 61 chr5 82280478 82280810 -70256449 - MTE2a LTR MaLR -53 366 37 3 1212 6838 86 33 21 chr5 82281510 82282481 -70254778 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 1 3 1212 3022 37 167 2 chr5 82287863 82288271 -70248988 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1212 1693 191 36 42 chr5 82291727 82292087 -70245172 + ORR1B2 LTR MaLR 2 359 -8 3 1212 1590 168 64 6 chr5 82293267 82293578 -70243681 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1212 1009 255 70 65 chr5 82294668 82295080 -70242179 + RMER13B LTR ERVK 317 730 -178 3 1212 1164 314 59 3 chr5 82299542 82299896 -70237363 + MTE2b LTR MaLR 1 374 -5 3 1212 281 156 0 0 chr5 82306284 82306329 -70230930 + RMER6A LTR ERVK 1 45 -675 3 1212 438 177 186 10 chr5 82306395 82306492 -70230767 + RMER19B LTR ERVK 316 429 -473 3 1212 355 287 18 39 chr5 82306505 82306649 -70230610 + RMER19B LTR ERVK 545 630 -272 3 1212 3194 159 57 8 chr5 82307403 82308005 -70229254 + RMER6A LTR ERVK 126 756 0 3 1212 1205 181 54 102 chr5 82310120 82310452 -70226807 - ORR1B2 LTR MaLR -51 316 1 3 1213 1561 233 231 12 chr5 82317569 82318072 -70219187 + RMER20B LTR ERVK 1 613 -14 4 1213 1648 99 12 87 chr5 82318253 82318575 -70218684 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 114 4 1213 2386 100 121 25 chr5 82326328 82326768 -70210491 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1213 232 323 20 20 chr5 82331986 82332084 -70205175 - MTEa LTR MaLR -3 418 321 4 1213 249 352 102 34 chr5 82332630 82332777 -70204482 - MTEa LTR MaLR -201 178 22 4 1213 469 318 75 5 chr5 82335020 82335219 -70202040 + RMER15 LTR ERVL 363 575 0 4 1213 4168 73 29 7 chr5 82347984 82348532 -70188727 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 4 1213 586 303 235 49 chr5 82350824 82351232 -70186027 + RMER5 LTR ERV1 49 532 -2 4 1213 237 283 68 126 chr5 82365721 82365905 -70171354 - LTR85c LTR Gypsy? -207 616 445 4 1213 1864 251 39 46 chr5 82366148 82366450 -70170809 - RLTR17 LTR ERVK -73 619 309 4 1213 1864 251 39 46 chr5 82367014 82367230 -70170029 - RLTR17 LTR ERVK -384 308 105 4 1213 306 244 40 24 chr5 82367324 82367435 -70169824 - MTD LTR MaLR -58 361 242 4 1213 510 255 0 19 chr5 82375144 82375248 -70162011 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 440 4 1213 1666 156 102 0 chr5 82375335 82375649 -70161610 - RMER6C LTR ERVK -344 346 1 4 1213 1598 227 41 15 chr5 82375975 82376119 -70161140 + RLTR20A LTR ERVK 31 179 -362 4 1213 1598 227 41 15 chr5 82376252 82376501 -70160758 + RLTR20A LTR ERVK 180 433 -108 4 1213 1282 184 25 1 chr5 82376570 82376850 -70160409 + RMER6C LTR ERVK 345 690 0 4 1213 1336 133 298 12 chr5 82377316 82377473 -70159786 - RMER17C LTR ERVK 0 410 181 5 1213 1336 133 298 12 chr5 82377630 82377791 -70159468 - RMER17C LTR ERVK -230 180 1 5 1213 1102 225 16 16 chr5 82380072 82380329 -70156930 + ORR1D1 LTR MaLR 1 257 -117 5 1213 261 348 40 73 chr5 82383431 82383555 -70153704 - MTEa LTR MaLR -220 159 40 5 1213 2258 91 0 59 chr5 82384257 82384596 -70152663 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 1213 1811 201 47 3 chr5 82385731 82386096 -70151163 + ORR1C2 LTR MaLR 4 384 0 5 1213 1610 204 75 11 chr5 82389857 82390218 -70147041 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 1213 344 317 24 24 chr5 82390311 82390434 -70146825 + MLT1F2 LTR MaLR 1 123 -437 5 1213 1253 205 60 32 chr5 82390964 82391246 -70146013 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 95 5 1213 1846 168 19 0 chr5 82393689 82394010 -70143249 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 5 1213 430 304 81 73 chr5 82401365 82401613 -70135646 + LTR40a LTR ERVL 268 517 -2 5 1213 349 331 225 36 chr5 82404841 82405170 -70132089 - MLT2B1 LTR ERVL -69 451 61 5 1213 552 342 25 0 chr5 82405182 82405384 -70131875 + MTE2a LTR MaLR 169 375 -4 5 1213 1782 301 81 15 chr5 82405392 82406062 -70131197 + MTE2a-int LTR MaLR 5 718 -862 5 1213 442 371 44 27 chr5 82406102 82406285 -70130974 - MTEa-int LTR MaLR -432 1148 963 5 1213 887 355 84 36 chr5 82406349 82406779 -70130480 - MTEa-int LTR MaLR -971 609 160 5 1213 887 355 84 36 chr5 82407237 82407387 -70129872 - MTEa-int LTR MaLR -1421 159 1 5 1213 900 288 46 79 chr5 82407387 82407779 -70129480 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 1213 451 341 97 18 chr5 82409270 82409477 -70127782 - MLT1B LTR MaLR 0 390 166 5 1213 451 341 97 18 chr5 82409587 82409657 -70127602 - MLT1B LTR MaLR -225 165 91 5 1213 1163 310 51 44 chr5 82414088 82414499 -70122760 - MTD LTR MaLR -5 414 1 5 1213 574 352 16 89 chr5 82416975 82417290 -70119969 + MLT1E3 LTR MaLR 300 591 -33 5 1213 2463 190 64 16 chr5 82418590 82419151 -70118108 + RMER6D LTR ERVK 129 716 -4 5 1213 277 324 45 50 chr5 82421701 82421922 -70115337 - MER31A LTR ERV1 -21 464 245 5 1213 530 262 97 44 chr5 82430402 82430650 -70106609 + MER92B LTR ERV1 177 437 -199 5 1213 490 32 0 0 chr5 82441089 82441152 -70096107 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 258 6 1214 2771 55 0 3 chr5 82445608 82445955 -70091304 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 1214 479 302 163 5 chr5 82448624 82448820 -70088439 + MLT1D LTR MaLR 279 505 0 6 1214 431 302 152 30 chr5 82459428 82459626 -70077633 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1101 6 1214 1161 129 9 65 chr5 82459821 82460036 -70077223 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 603 6 1214 266 311 47 37 chr5 82461429 82461536 -70075723 - ORR1E LTR MaLR -232 127 20 6 1214 770 239 145 60 chr5 82462672 82463037 -70074222 - MT2B LTR ERVL -54 547 3 6 1214 232 235 146 12 chr5 82463152 82463234 -70074025 - RMER15 LTR ERVL -76 499 407 6 1214 410 255 142 47 chr5 82472527 82472675 -70064584 - MLT1K LTR MaLR -22 573 412 6 1214 3016 48 0 0 chr5 82483174 82483531 -70053728 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 6 1214 321 250 183 37 chr5 82485164 82485355 -70051904 + LTR80B LTR ERVL 75 293 -291 6 1214 476 250 207 83 chr5 82487712 82487978 -70049281 - MLT2D LTR ERVL -115 299 1 6 1214 2844 95 5 2 chr5 82489947 82490346 -70046913 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1214 1642 162 106 36 chr5 82500957 82501315 -70035944 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 2 1214 1461 210 65 20 chr5 82510918 82511272 -70025987 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 1 1214 2769 52 3 9 chr5 82514737 82515085 -70022174 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1214 12632 66 50 1 chr5 82515085 82516794 -70020465 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 2 1214 2490 58 55 0 chr5 82516794 82517122 -70020137 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1214 805 143 424 0 chr5 82534586 82534817 -70002442 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1214 248 304 82 82 chr5 82535147 82535305 -70001954 + MLT1A1 LTR MaLR 8 165 -243 5 1214 290 262 38 0 chr5 82535317 82535397 -70001862 + MLT1A1 LTR MaLR 297 379 -29 5 1214 523 325 12 0 chr5 82536159 82536319 -70000940 + MTEa LTR MaLR 210 371 -8 5 1214 234 341 54 16 chr5 82539925 82540110 -69997149 + RLTR21 LTR ERVK 1071 1262 -310 6 1214 341 300 22 51 chr5 82540893 82541030 -69996229 - RMER15 LTR ERVL -414 161 29 6 1214 2066 139 72 8 chr5 82545591 82545954 -69991305 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 7 1214 315 350 111 0 chr5 82546876 82547126 -69990133 + MLT2D LTR ERVL 111 540 -19 7 1214 405 340 114 29 chr5 82560225 82560498 -69976761 - MER92B LTR ERV1 -314 322 27 9 1214 341 298 16 16 chr5 82565613 82565739 -69971520 + MLT1D LTR MaLR 72 197 -308 1 1214 466 369 39 22 chr5 82567025 82567255 -69970004 - MLT1D LTR MaLR 0 505 272 1 1214 399 266 83 0 chr5 82567347 82567456 -69969803 - MLT1D LTR MaLR -359 146 29 1 1214 1367 244 9 19 chr5 82568175 82568496 -69968763 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 61 1 1214 3069 295 38 23 chr5 82568487 82569444 -69967815 - ORR1C1-int LTR MaLR -392 978 8 1 1214 1593 181 44 80 chr5 82569451 82569841 -69967418 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 1 1214 4427 132 173 75 chr5 82570177 82571117 -69966142 - RLTR13D4 LTR ERVK 0 1033 1 1 1214 859 230 135 63 chr5 82571550 82571793 -69965466 + ORR1D1 LTR MaLR 1 273 -101 1 1214 859 230 135 63 chr5 82571838 82571942 -69965317 + ORR1D1 LTR MaLR 274 372 -2 1 1215 229 233 0 0 chr5 82575889 82575932 -69961327 - MLT1H-int LTR MaLR -548 861 819 1 1215 897 253 139 6 chr5 82576083 82576413 -69960846 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1215 2151 177 13 5 chr5 82577148 82577539 -69959720 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1215 5472 215 65 39 chr5 82577539 82579010 -69958249 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1509 0 1 1215 2021 176 38 19 chr5 82579010 82579381 -69957878 + ORR1B1 LTR MaLR 1 378 -16 1 1215 2144 165 26 16 chr5 82579419 82579800 -69957459 + ORR1B1 LTR MaLR 1 385 -9 1 1215 2399 180 229 7 chr5 82583535 82584099 -69953160 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 1215 263 290 13 70 chr5 82585308 82585407 -69951852 - MLT1F2 LTR MaLR -1 548 454 1 1215 238 317 0 19 chr5 82589009 82589115 -69948144 + MLT1A1 LTR MaLR 300 403 -5 1 1215 1521 186 30 77 chr5 82589748 82590086 -69947173 - RLTR41 LTR ERV1 -63 383 62 1 1215 409 326 41 14 chr5 82590245 82590466 -69946793 - MuRRS4-int LTR ERV1 -174 4889 4663 1 1215 316 359 98 29 chr5 82590881 82591125 -69946134 - MLT1G1 LTR MaLR -8 571 311 1 1215 385 319 87 68 chr5 82593117 82593383 -69943876 - MLT1E1A LTR MaLR -2 678 408 1 1215 392 326 144 40 chr5 82593750 82594153 -69943106 + LTR68 LTR ERV1 25 469 -271 1 1215 489 325 10 96 chr5 82594348 82594556 -69942703 + MTD LTR MaLR 29 218 -201 1 1215 393 288 87 68 chr5 82597475 82597819 -69939440 - MTE2a LTR MaLR 0 421 3 1 1215 532 337 37 26 chr5 82597958 82598227 -69939032 + MLT1A0 LTR MaLR 92 367 -7 1 1215 1102 230 134 57 chr5 82599082 82599433 -69937826 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1215 4345 249 50 37 chr5 82599433 82600783 -69936476 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 1367 -3 1 1215 1000 192 29 54 chr5 82618929 82619205 -69918054 + RMER17C LTR ERVK 1 269 -141 1 1215 1035 268 134 18 chr5 82620448 82620790 -69916469 + MER89 LTR ERV1 178 559 0 1 1215 425 212 12 0 chr5 82638507 82638592 -69898667 + RMER20B LTR ERVK 1 86 -541 2 1215 666 253 40 99 chr5 82638593 82638795 -69898464 + RMER20B LTR ERVK 378 567 -60 2 1215 894 293 58 19 chr5 82640607 82640972 -69896287 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 2 1215 238 345 103 5 chr5 82646034 82646229 -69891030 + MLT1H-int LTR MaLR 641 854 -555 2 1215 227 312 97 21 chr5 82654519 82654663 -69882596 + MLT2B4 LTR ERVL 372 526 -30 2 1215 282 301 200 29 chr5 82667622 82667827 -69869432 + MLT1A0 LTR MaLR 108 347 -18 2 1215 414 360 109 33 chr5 82672184 82672604 -69864655 + MLT1C LTR MaLR 2 453 -14 2 1215 6294 98 25 3 chr5 82682492 82683375 -69853884 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 2 1215 1219 240 105 15 chr5 82687311 82687654 -69849605 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1215 921 224 57 133 chr5 82687654 82687969 -69849290 - ORR1D1-int LTR MaLR -6 1364 1074 2 1215 814 262 34 24 chr5 82688029 82688236 -69849023 - RMER15-int LTR ERVL -2867 2132 1924 2 1215 1544 218 54 17 chr5 82693231 82693535 -69843724 + ORR1B2 LTR MaLR 1 301 -66 2 1215 1544 218 54 17 chr5 82693605 82693654 -69843605 + ORR1B2 LTR MaLR 302 366 -1 2 1216 376 271 138 23 chr5 82710250 82710424 -69826835 + MLT1A1 LTR MaLR 173 366 -42 2 1216 664 287 45 35 chr5 82710839 82711041 -69826218 + MTE2b LTR MaLR 2 205 -174 2 1216 1695 140 0 8 chr5 82712210 82712470 -69824789 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1591 2 1216 5350 107 19 11 chr5 82712680 82713503 -69823756 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1018 830 1 2 1216 1297 193 154 12 chr5 82713758 82714089 -69823170 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 1216 1778 162 97 8 chr5 82728541 82728901 -69808358 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 3 1216 2491 194 58 88 chr5 82737111 82737823 -69799436 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 3 1216 565 344 42 61 chr5 82747615 82747974 -69789285 - LTR16B1 LTR ERVL -124 356 5 3 1216 449 312 243 19 chr5 82748979 82749296 -69787963 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 3 1216 289 305 0 28 chr5 82763566 82763674 -69773585 - MLT1A LTR MaLR -23 351 247 3 1216 2069 224 50 58 chr5 82763845 82764353 -69772906 + RMER19C LTR ERVK 1 569 -42 3 1216 2069 223 52 58 chr5 82764558 82764602 -69772657 + RMER19C LTR ERVK 570 610 -1 3 1216 256 272 54 75 chr5 82769565 82769712 -69767547 - ORR1D2 LTR MaLR -226 144 1 3 1216 980 266 35 66 chr5 82782045 82782468 -69754791 + MT2B LTR ERVL 1 536 -65 4 1216 347 262 53 45 chr5 82783270 82783402 -69753857 - MLT1E1A LTR MaLR -366 314 182 4 1216 2097 239 108 11 chr5 82786314 82786834 -69750425 - RMER15 LTR ERVL -5 570 1 4 1216 419 283 58 8 chr5 82789023 82789144 -69748115 + MTE2a LTR MaLR 1 127 -252 4 1216 1898 157 273 14 chr5 82790669 82791186 -69746073 + RMER6C LTR ERVK 3 653 -37 4 1216 509 286 11 45 chr5 82791362 82791538 -69745721 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 284 4 1216 404 261 46 80 chr5 82791656 82791831 -69745428 - RLTR11B LTR ERVK -191 262 94 4 1216 746 293 35 39 chr5 82797189 82797448 -69739811 - MTD LTR MaLR -161 258 1 4 1216 727 349 58 28 chr5 82802019 82802381 -69734878 + MTE2b LTR MaLR 1 373 -6 4 1216 231 287 42 21 chr5 82802387 82802483 -69734776 + MTE2b-int LTR MaLR 2 99 -1481 4 1216 277 229 82 24 chr5 82802492 82802577 -69734682 + MTE2b-int LTR MaLR 283 372 -1208 4 1216 697 300 122 23 chr5 82803106 82803451 -69733808 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1216 294 246 85 53 chr5 82804791 82804980 -69732279 - RMER17C LTR ERVK -138 272 78 4 1216 1363 207 134 12 chr5 82805482 82805824 -69731435 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1216 468 288 21 28 chr5 82809660 82809803 -69727456 - RMER15-int LTR ERVL -246 4753 4612 4 1216 342 232 73 0 chr5 82809809 82809891 -69727368 - MTEb LTR MaLR -2 377 290 4 1216 285 305 8 71 chr5 82811055 82811066 -69726193 + MT2B LTR ERVL 156 200 -401 4 1216 285 305 8 71 chr5 82811167 82811182 -69726077 + MT2B LTR ERVL 201 274 -327 4 1216 313 340 29 0 chr5 82812553 82812656 -69724603 + MLT1L LTR MaLR 415 520 -90 4 1216 334 347 54 54 chr5 82814175 82814229 -69723030 - MLT1B LTR MaLR -9 458 412 4 1216 346 335 34 80 chr5 82814918 82815266 -69721993 - MLT1B LTR MaLR -56 411 28 4 1216 6107 129 21 5 chr5 82817497 82818440 -69718819 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 4 1216 247 233 80 65 chr5 82823643 82823696 -69713563 + RMER17D LTR ERVK 233 283 -606 4 1216 247 233 80 65 chr5 82823761 82823845 -69713414 + RMER17D LTR ERVK 284 372 -517 4 1216 388 250 64 9 chr5 82830091 82830200 -69707059 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2248 3466 3352 4 1216 336 380 49 35 chr5 82831122 82831608 -69705651 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3445 2222 1730 4 1216 294 268 73 73 chr5 82836086 82836223 -69701036 - MLT1A0 LTR MaLR -15 350 214 4 1216 344 321 82 0 chr5 82836424 82836558 -69700701 + MTE2b LTR MaLR 6 150 -229 4 1216 790 292 64 11 chr5 82836567 82836834 -69700425 - RMER15 LTR ERVL -16 559 279 4 1217 1365 233 27 37 chr5 82847533 82847907 -69689352 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 5 1217 294 399 42 38 chr5 82852554 82852791 -69684468 - MTE2b LTR MaLR -141 238 1 5 1217 2168 212 49 68 chr5 82854826 82855382 -69681877 - RMER15 LTR ERVL -2 573 29 5 1217 487 318 36 10 chr5 82866549 82866743 -69670516 + MLT2B4 LTR ERVL 2 200 -356 5 1217 698 163 121 0 chr5 82869333 82869474 -69667785 + MTC LTR MaLR 1 158 -263 5 1217 868 244 80 0 chr5 82869617 82869842 -69667417 + MTC LTR MaLR 179 421 0 5 1217 7045 69 5 0 chr5 82876435 82877324 -69659935 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 5 1217 548 213 0 0 chr5 82887264 82887372 -69649887 + MTD LTR MaLR 13 120 -301 5 1217 865 286 116 18 chr5 82887513 82887848 -69649411 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 5 1217 3211 47 3 0 chr5 82887945 82888329 -69648930 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 5 1217 616 279 37 0 chr5 82888333 82888494 -69648765 + MTD LTR MaLR 108 274 -145 5 1217 1384 295 45 15 chr5 82902946 82903348 -69633911 - MTD LTR MaLR 0 419 6 5 1217 478 277 0 18 chr5 82903823 82903937 -69633322 + ORR1D2 LTR MaLR 10 121 -249 5 1217 227 274 71 62 chr5 82904297 82904410 -69632849 + ORR1D2 LTR MaLR 122 235 -139 5 1217 567 210 86 14 chr5 82904465 82904605 -69632654 - RMER15 LTR ERVL -41 534 385 5 1217 468 364 22 56 chr5 82904681 82905009 -69632250 - RMER15 LTR ERVL -199 376 27 5 1217 291 257 72 1 chr5 82905108 82905193 -69632066 - ORR1D1 LTR MaLR -276 98 9 5 1217 1951 231 88 12 chr5 82906888 82907375 -69629884 - RLTR11A2 LTR ERVK -3 524 1 5 1217 2075 176 31 15 chr5 82914528 82914920 -69622339 + RMER6B LTR ERVK 1 398 -63 5 1217 640 253 65 60 chr5 82917586 82917922 -69619337 - RLTR15 LTR ERVK -21 338 1 5 1217 489 286 41 51 chr5 82925403 82925591 -69611668 + MT2A LTR ERVL 21 206 -327 6 1217 326 235 204 0 chr5 82925591 82925689 -69611570 + ORR1B2 LTR MaLR 3 120 -247 6 1217 933 121 0 0 chr5 82925689 82925821 -69611438 + ORR1B2 LTR MaLR 236 367 0 6 1217 423 242 40 13 chr5 82926600 82926751 -69610508 + MERVL_2A-int LTR ERVL 220 374 -5387 6 1217 1134 266 58 58 chr5 82930591 82930636 -69606623 - MTD LTR MaLR -15 404 371 6 1217 1134 266 58 58 chr5 82930679 82931012 -69606247 - MTD LTR MaLR -49 370 26 6 1217 352 330 122 5 chr5 82943115 82943304 -69593955 + MTE-int LTR MaLR 1311 1521 -59 6 1217 1951 159 14 25 chr5 82943625 82943993 -69593266 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 5 6 1217 3238 51 2 2 chr5 82956524 82956920 -69580339 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1217 448 274 0 42 chr5 82959197 82959315 -69577944 - ORR1B1 LTR MaLR -169 225 113 6 1218 2766 233 92 22 chr5 82972079 82972891 -69564368 - ORR1B1-int LTR MaLR -257 1252 384 6 1218 1462 247 37 32 chr5 82973448 82973466 -69563793 - ORR1B1-int LTR MaLR -1103 406 395 6 1218 1462 247 37 32 chr5 82973507 82973889 -69563370 - ORR1B1-int LTR MaLR -1115 394 4 6 1218 678 195 129 51 chr5 82973912 82974090 -69563169 - ORR1B1 LTR MaLR -202 192 1 6 1218 2085 162 6 3 chr5 82976555 82976896 -69560363 + ORR1A1 LTR MaLR 1 342 -4 6 1218 315 351 80 11 chr5 82978580 82978756 -69558503 - MLT1B LTR MaLR 0 467 280 6 1218 406 332 24 19 chr5 82978787 82979016 -69558243 - MLT1B LTR MaLR -229 238 3 6 1218 969 272 32 36 chr5 82980102 82980411 -69556848 - MTD-int LTR MaLR -806 452 145 6 1218 253 296 25 0 chr5 82981724 82981805 -69555454 - MTD-int LTR MaLR -1174 84 2 6 1218 1384 296 22 10 chr5 82981808 82982208 -69555051 - MTD LTR MaLR -2 417 13 6 1218 830 306 33 111 chr5 82989010 82989378 -69547881 - MTE2a LTR MaLR -40 339 1 7 1218 1755 189 36 6 chr5 82990896 82991226 -69546033 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 47 7 1218 744 280 10 58 chr5 82991289 82991494 -69545765 - ORR1C2 LTR MaLR -173 211 17 7 1218 1072 185 112 3 chr5 82992856 82993091 -69544168 + ORR1C2 LTR MaLR 39 313 -71 7 1218 5964 144 70 58 chr5 82993091 82993970 -69543289 + RMER17C-int LTR ERVK 1649 2578 -660 7 1218 5964 144 70 58 chr5 82994025 82994325 -69542934 + RMER17C-int LTR ERVK 2579 2897 -341 7 1218 723 228 83 26 chr5 82994344 82994373 -69542886 + RMER17C LTR ERVK 166 205 -205 7 1218 723 228 83 26 chr5 82994468 82994668 -69542591 + RMER17C LTR ERVK 206 408 -2 7 1218 285 157 20 0 chr5 82995428 82995479 -69541780 + ORR1C2 LTR MaLR 330 381 -3 7 1218 1480 164 177 128 chr5 82997319 82997850 -69539409 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 557 0 7 1218 757 250 87 0 chr5 83013262 83013446 -69523813 + ORR1B2 LTR MaLR 160 359 -8 2 1218 704 252 139 0 chr5 83013450 83013647 -69523612 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 225 -1284 2 1218 343 115 0 37 chr5 83013647 83013701 -69523558 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 340 2 1218 1511 259 25 42 chr5 83014470 83014873 -69522386 - ORR1A3-int LTR MaLR -1567 396 1 2 1218 229 323 106 64 chr5 83020821 83021056 -69516203 - MLT1E1 LTR MaLR -12 642 398 3 1218 339 348 75 33 chr5 83021456 83021670 -69515589 - MLT1E1-int LTR MaLR -191 1298 1076 3 1218 1645 235 11 37 chr5 83031830 83032210 -69505049 - MTC LTR MaLR -2 419 50 4 1218 241 344 108 0 chr5 83033709 83033802 -69503457 - LTR40a LTR ERVL -77 442 340 4 1218 489 148 11 0 chr5 83055003 83055091 -69482168 + RMER6-int LTR ERVK 700 788 -2389 5 1218 5703 206 64 88 chr5 83055078 83055659 -69481600 + RMER6-int LTR ERVK 1478 2126 -1051 5 1218 5703 200 42 60 chr5 83055836 83056969 -69480290 + RMER6-int LTR ERVK 2127 3152 -25 5 1218 890 234 56 50 chr5 83056970 83057445 -69479814 + RMER6A LTR ERVK 386 706 -14 5 1218 1318 287 37 42 chr5 83080095 83080284 -69456975 + BGLII_B LTR ERVK 1 184 -257 7 1218 1318 287 37 42 chr5 83080388 83080631 -69456628 + BGLII_B LTR ERVK 185 431 -10 7 1218 1296 232 43 17 chr5 83080673 83081020 -69456239 + MYSERV6-int LTR ERVK 3698 4053 -4906 7 1218 1180 293 56 58 chr5 83081436 83082004 -69455255 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 526 1092 -1234 7 1218 1764 203 43 25 chr5 83093188 83093587 -69443672 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 2 9 1218 1452 296 25 9 chr5 83097806 83098243 -69439016 - MT2A LTR ERVL -88 445 2 1 1218 2631 57 30 0 chr5 83098563 83098899 -69438360 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1219 675 185 89 0 chr5 83108755 83108901 -69428358 + RLTR11A LTR ERVK 1 159 -369 1 1219 1875 190 51 3 chr5 83109662 83109963 -69427296 + RLTR11A LTR ERVK 141 449 -79 1 1219 1875 190 51 3 chr5 83110019 83110087 -69427172 + RLTR11A LTR ERVK 450 527 -1 1 1219 341 330 34 46 chr5 83111524 83111762 -69425497 - MLT1B LTR MaLR -107 283 49 1 1219 258 309 52 96 chr5 83116452 83116588 -69420671 - RMER15 LTR ERVL -40 535 406 1 1219 562 297 25 94 chr5 83117938 83118224 -69419035 - RMER15-int LTR ERVL -73 4926 4661 1 1219 497 304 71 40 chr5 83119335 83119588 -69417671 - RMER15-int LTR ERVL -3878 1121 861 1 1219 241 327 90 68 chr5 83125154 83125429 -69411830 - MER67C LTR ERV1 -342 369 59 1 1219 2121 193 126 129 chr5 83128383 83128667 -69408592 - RMER17A2 LTR ERVK -15 794 446 1 1219 2121 144 102 144 chr5 83128732 83129221 -69408038 - RMER17A2 LTR ERVK -457 449 2 1 1219 2521 63 147 3 chr5 83132105 83132473 -69404786 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1219 818 307 41 22 chr5 83134475 83134838 -69402421 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1219 2187 185 40 21 chr5 83148176 83148657 -69388602 + RLTR16 LTR ERVK 3 492 -13 2 1219 2457 185 222 22 chr5 83151909 83152328 -69384931 - RMER6A LTR ERVK 0 756 326 2 1219 2457 185 222 22 chr5 83152485 83152644 -69384615 - RMER6A LTR ERVK -431 325 57 2 1219 2457 185 222 22 chr5 83152667 83152717 -69384542 - RMER6A LTR ERVK -700 56 3 2 1219 2681 113 0 21 chr5 83153200 83153581 -69383678 + IAPEy-int LTR ERVK 5270 5642 -1939 2 1219 3420 91 2 2 chr5 83153564 83154027 -69383232 + IAPEy-int LTR ERVK 5752 6214 -1367 2 1219 5349 108 5 8 chr5 83154017 83154798 -69382461 + IAPEy-int LTR ERVK 6735 7513 0 2 1219 2229 104 32 3 chr5 83154799 83155145 -69382114 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 2 357 0 2 1219 1071 283 105 67 chr5 83156344 83156809 -69380450 - RLTR19 LTR ERVK -7 492 10 2 1219 978 258 35 72 chr5 83156848 83157166 -69380093 - RMER20B LTR ERVK -22 605 300 2 1219 2974 76 2 5 chr5 83161381 83161778 -69375481 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1219 1037 254 125 70 chr5 83164268 83164836 -69372423 - RLTR40 LTR ERVK -44 773 175 2 1219 1737 159 8 92 chr5 83168240 83168599 -69368660 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1219 2484 296 74 31 chr5 83174500 83175121 -69362138 - ORR1D1-int LTR MaLR -145 1225 563 2 1219 4275 19 12 0 chr5 83175121 83175608 -69361651 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 1219 2484 296 74 31 chr5 83175608 83175890 -69361369 - ORR1D1-int LTR MaLR -808 562 283 2 1219 399 227 0 0 chr5 83175898 83175986 -69361273 - ORR1D1-int LTR MaLR -1192 178 91 2 1219 370 213 62 21 chr5 83178286 83178382 -69358877 - ORR1D1-int LTR MaLR -1408 101 2 2 1219 684 285 30 0 chr5 83178383 83178583 -69358676 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 169 2 1219 3384 30 2 0 chr5 83179020 83179415 -69357844 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1219 1346 221 143 26 chr5 83182806 83183183 -69354076 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1219 1765 150 9 58 chr5 83183255 83183580 -69353679 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 21 2 1219 729 283 80 112 chr5 83183696 83184186 -69353073 + RLTR12B LTR ERVK 35 508 -20 2 1219 1476 234 77 17 chr5 83184835 83185630 -69351629 + RMER6C LTR ERVK 1 686 -4 2 1219 507 278 22 51 chr5 83187899 83188077 -69349182 - MTEb LTR MaLR -4 375 203 2 1219 294 187 92 13 chr5 83188964 83189040 -69348219 + RLTR11B LTR ERVK 233 314 -139 2 1219 379 263 60 17 chr5 83189031 83189147 -69348112 - MTE-int LTR MaLR -252 1328 1208 2 1219 230 354 10 20 chr5 83194663 83194761 -69342498 - RMER20B LTR ERVK -494 133 37 2 1219 746 343 44 36 chr5 83195262 83195673 -69341586 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -2472 5129 4830 2 1219 2654 203 105 23 chr5 83208235 83208900 -69328359 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 2 1219 2881 92 17 15 chr5 83211819 83212225 -69325034 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1219 3200 114 4 12 chr5 83213499 83213978 -69323281 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 1219 11721 127 34 16 chr5 83213978 83215853 -69321406 + MERVL-int LTR ERVL 1 1908 -3577 3 1219 6544 98 24 1 chr5 83215841 83216757 -69320502 + MERVL-int LTR ERVL 3115 4051 -1434 3 1219 1118 131 6 0 chr5 83217709 83217869 -69319390 + MERVL-int LTR ERVL 4049 4209 -1276 3 1219 668 311 56 96 chr5 83223826 83224181 -69313078 - ORR1E LTR MaLR -18 341 1 3 1219 507 286 40 87 chr5 83226263 83226562 -69310697 + RLTR11B LTR ERVK 1 285 -168 3 1220 2458 105 36 3 chr5 83238377 83238741 -69298518 + MTB LTR MaLR 25 400 0 3 1220 283 299 141 13 chr5 83241670 83241819 -69295440 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4557 4724 -1037 3 1220 1064 122 12 0 chr5 83242170 83242334 -69294925 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 257 3 1220 358 223 105 33 chr5 83242407 83242560 -69294699 + RMER3D-int LTR ERVK 680 843 -1999 3 1220 5016 191 91 50 chr5 83245593 83247097 -69290162 + RMER3D-int LTR ERVK 489 2375 -467 3 1220 543 209 32 32 chr5 83247103 83247261 -69289998 - RMER3D-int LTR ERVK -978 1864 1707 3 1220 3130 57 3 0 chr5 83248767 83249151 -69288108 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 3 1220 764 296 63 44 chr5 83250271 83250688 -69286571 - MT2B LTR ERVL 0 601 5 3 1220 642 343 88 24 chr5 83253265 83253561 -69283698 + ORR1D2 LTR MaLR 1 315 -55 3 1220 1461 207 61 8 chr5 83261809 83262170 -69275089 - RMER17C LTR ERVK -30 380 1 3 1220 531 272 172 19 chr5 83262216 83262478 -69274781 - RLTR40 LTR ERVK -55 762 461 3 1220 1225 200 29 40 chr5 83267299 83267575 -69269684 + RLTR46 LTR ERVK 42 314 -6 3 1220 1703 246 102 56 chr5 83288549 83289088 -69248171 + RMER2 LTR ERV1 1 564 -3 4 1220 3274 48 2 0 chr5 83291345 83291738 -69245521 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 4 1220 391 255 25 82 chr5 83293669 83293827 -69243432 + RLTR43A LTR ERVK 216 364 0 4 1220 1942 106 26 36 chr5 83295775 83296153 -69241106 - RLTR10A LTR ERVK 0 359 1 4 1220 1523 159 6 75 chr5 83299498 83299844 -69237415 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 1220 3124 40 25 15 chr5 83299911 83300318 -69236941 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 4 1220 5820 50 15 8 chr5 83300320 83301059 -69236200 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 4 1220 2218 65 0 0 chr5 83301058 83301336 -69235923 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 4 1220 3524 82 20 39 chr5 83301336 83301989 -69235270 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 4 1220 248 302 0 0 chr5 83301989 83302042 -69235217 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 4 1220 1052 90 50 119 chr5 83302042 83302243 -69235016 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 9 4 1220 3146 35 25 15 chr5 83302244 83302651 -69234608 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 4 1220 2914 23 42 3 chr5 83304962 83305315 -69231944 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1220 55376 22 12 13 chr5 83305315 83311796 -69225463 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 4 1220 2914 23 42 3 chr5 83311796 83312149 -69225110 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1220 826 210 0 0 chr5 83312776 83312933 -69224326 + RMER6D LTR ERVK 564 720 0 4 1220 1551 180 97 24 chr5 83314979 83315069 -69222190 + RMER17C LTR ERVK 1 90 -320 4 1220 1551 180 97 24 chr5 83315123 83315414 -69221845 + RMER17C LTR ERVK 91 409 -1 4 1220 235 399 49 21 chr5 83326537 83326780 -69210479 - MLT-int LTR MaLR -1482 253 4 4 1220 465 263 79 25 chr5 83334104 83334307 -69202952 - RLTR15 LTR ERVK -104 255 42 4 1220 540 288 7 52 chr5 83345319 83345473 -69191786 + MTC LTR MaLR 275 421 0 4 1220 229 271 32 48 chr5 83347799 83347828 -69189431 + MT2B2 LTR ERVL 232 259 -325 4 1220 3725 112 13 141 chr5 83349839 83350156 -69187103 - RMER17A LTR ERVK -6 745 426 4 1220 3725 119 17 135 chr5 83350871 83351418 -69185841 - RMER17A LTR ERVK -326 425 1 4 1221 591 293 47 50 chr5 83371643 83371963 -69165296 - MYSERV-int LTR ERVK -1767 4783 4465 5 1221 866 242 90 29 chr5 83372000 83372250 -69165009 - MYSERV6-int LTR ERVK -7068 1891 1631 5 1221 866 242 90 29 chr5 83372271 83372331 -69164928 - MYSERV6-int LTR ERVK -7329 1630 1562 5 1221 626 167 81 29 chr5 83372342 83372478 -69164781 - RMER17C-int LTR ERVK -3093 145 3 5 1221 405 161 11 44 chr5 83372481 83372572 -69164687 - RMER17C LTR ERVK 0 410 323 5 1221 1318 147 60 142 chr5 83373345 83373780 -69163479 - RMER17C LTR ERVK -11 399 1 5 1221 587 194 39 31 chr5 83373840 83373968 -69163291 - MYSERV6-int LTR ERVK -7637 1322 1194 5 1221 401 317 10 0 chr5 83375010 83375111 -69162148 + LTR33 LTR ERVL 1 102 -413 5 1221 715 181 178 15 chr5 83376228 83376430 -69160829 - RMER4B LTR ERVK -338 247 13 5 1221 270 376 114 28 chr5 83382909 83383338 -69153921 - MT2A LTR ERVL -5 528 63 5 1221 1636 244 75 26 chr5 83383509 83383933 -69153326 + RLTR25B LTR ERVK 2 446 -582 5 1221 518 335 59 15 chr5 83388905 83389178 -69148081 - RMER15 LTR ERVL -17 558 274 5 1221 435 150 0 12 chr5 83393886 83393967 -69143292 + RLTR9C LTR ERVK 1 80 -313 5 1221 1689 246 47 25 chr5 83396812 83397220 -69140039 + MTC LTR MaLR 5 421 0 5 1221 1209 218 67 17 chr5 83397219 83397518 -69139741 + MTC-int LTR MaLR 2 315 -943 5 1221 527 260 44 92 chr5 83401922 83402179 -69135080 - RMER12 LTR ERVK -175 1397 1003 5 1221 508 265 0 0 chr5 83402232 83402334 -69134925 - RMER12 LTR ERVK -434 888 787 5 1221 1366 153 23 46 chr5 83409604 83409712 -69127547 - RMER19B LTR ERVK -130 772 672 5 1221 1366 153 23 46 chr5 83409956 83410106 -69127153 - RMER19B LTR ERVK -231 671 520 5 1221 668 164 49 0 chr5 83410099 83410221 -69127038 + RMER19B LTR ERVK 764 891 -11 5 1221 749 84 48 14 chr5 83412454 83412599 -69124660 + RMER17B LTR ERVK 311 460 -498 5 1221 490 343 11 33 chr5 83412987 83413168 -69124091 + ORR1E LTR MaLR 1 177 -182 5 1221 1743 127 110 72 chr5 83415197 83415486 -69121773 + RLTR9C LTR ERVK 6 304 -89 5 1221 1743 127 110 72 chr5 83415555 83415639 -69121620 + RLTR9C LTR ERVK 305 392 -1 5 1221 1545 219 21 48 chr5 83415846 83416240 -69121019 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 148 5 1221 616 245 117 24 chr5 83416383 83416516 -69120743 - RLTR24 LTR ERV1 -320 209 63 5 1221 3353 38 0 0 chr5 83416918 83417314 -69119945 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1221 2341 189 145 26 chr5 83420930 83421545 -69115714 - RMER6C LTR ERVK 0 690 3 6 1221 547 325 122 4 chr5 83425850 83426088 -69111171 - MTD LTR MaLR -136 283 18 6 1221 991 297 87 82 chr5 83430563 83430729 -69106530 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 453 6 1221 991 297 87 82 chr5 83430765 83431211 -69106048 - RLTR18 LTR ERVK -164 452 2 6 1221 3181 194 60 12 chr5 83432142 83432491 -69104768 - RMER6D LTR ERVK -4 716 364 6 1221 3181 194 60 12 chr5 83432546 83432879 -69104380 - RMER6D LTR ERVK -357 363 2 6 1221 324 290 108 20 chr5 83440351 83440382 -69096877 + MTE-int LTR MaLR 1197 1226 -354 6 1221 324 290 108 20 chr5 83440426 83440542 -69096717 + MTE-int LTR MaLR 1227 1357 -223 6 1221 228 247 82 0 chr5 83440763 83440836 -69096423 + ORR1D-int LTR MaLR 1188 1266 -104 6 1221 1009 274 77 41 chr5 83442631 83442987 -69094272 + MTE2a LTR MaLR 36 410 -9 6 1221 2066 139 40 3 chr5 83446473 83446797 -69090462 + MTB_Mm LTR MaLR 72 407 0 6 1221 626 319 124 12 chr5 83446797 83447025 -69090234 - MTD LTR MaLR -113 306 50 6 1221 2166 87 60 17 chr5 83450184 83450536 -69086723 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 1221 55061 29 9 4 chr5 83450536 83456977 -69080282 + IAPEz-int LTR ERVK 4 6475 -6 6 1221 2166 87 60 17 chr5 83456979 83457331 -69079928 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 1221 1550 158 26 113 chr5 83458662 83459041 -69078218 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 6 1221 1073 219 76 33 chr5 83470092 83470460 -69066799 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1221 3420 35 0 0 chr5 83473118 83473514 -69063745 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1221 277 292 71 78 chr5 83475884 83476025 -69061234 + MLT1B LTR MaLR 236 375 -15 6 1221 531 290 196 10 chr5 83476923 83477215 -69060044 + MTD LTR MaLR 50 388 -12 6 1221 896 203 0 17 chr5 83479296 83479476 -69057783 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 191 6 1221 683 351 11 36 chr5 83479631 83479738 -69057521 - MTE-int LTR MaLR -1207 373 269 6 1221 1934 217 67 19 chr5 83479738 83480273 -69056986 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 7 1221 683 275 70 70 chr5 83480273 83480466 -69056793 - MTE-int LTR MaLR -1312 268 47 6 1221 648 311 142 24 chr5 83480521 83480860 -69056399 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 7 1221 315 320 62 0 chr5 83480952 83481080 -69056179 + MLT1D LTR MaLR 46 181 -324 7 1221 1819 174 16 9 chr5 83483093 83483412 -69053847 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 7 1221 1482 182 21 25 chr5 83490784 83491110 -69046149 + ORR1A4 LTR MaLR 1 325 -4 7 1222 300 386 40 20 chr5 83493240 83493388 -69043871 - ORR1E LTR MaLR -193 166 16 7 1222 608 220 68 14 chr5 83494781 83494943 -69042316 - MTD LTR MaLR 0 419 250 7 1222 1199 267 54 18 chr5 83495283 83495615 -69041644 + MTD LTR MaLR 76 419 0 7 1222 293 307 37 56 chr5 83498996 83499158 -69038101 - ERVL-E-int LTR ERVL -295 5372 5214 7 1222 1130 192 26 39 chr5 83499345 83499524 -69037735 + ORR1B1 LTR MaLR 12 188 -206 7 1222 3171 33 125 2 chr5 83499524 83499947 -69037312 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 7 1222 1130 192 26 39 chr5 83499947 83500000 -69037259 + ORR1B1 LTR MaLR 189 241 -153 7 1222 647 157 0 0 chr5 83500000 83500102 -69037157 + ORR1A4 LTR MaLR 242 343 -51 1 1222 298 170 0 0 chr5 83500292 83500339 -69036920 + ORR1A4 LTR MaLR 324 370 -8 1 1222 4271 232 106 85 chr5 83500352 83501795 -69035464 + ORR1A4-int LTR MaLR 37 1509 0 1 1222 941 211 115 74 chr5 83501796 83502132 -69035127 + ORR1A4 LTR MaLR 2 361 -13 1 1222 320 405 43 0 chr5 83502223 83502477 -69034782 - ERVL-int LTR ERVL -3577 2180 1916 3 1222 1300 143 143 0 chr5 83504081 83504333 -69032926 + RLTR33 LTR ERVK 348 635 -43 5 1222 263 368 110 19 chr5 83505045 83505200 -69032059 - MLT1D LTR MaLR -109 396 228 6 1222 529 350 14 73 chr5 83505235 83505608 -69031651 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1777 3937 3587 7 1222 298 372 13 20 chr5 83506222 83506373 -69030886 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2436 3321 3172 7 1222 509 340 49 21 chr5 83507208 83507496 -69029763 - ERVL-B4-int LTR ERVL -5206 508 213 9 1222 1090 191 49 165 chr5 83510133 83510503 -69026756 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 1 1222 308 396 71 17 chr5 83513464 83513703 -69023556 - MLT1G LTR MaLR -332 259 8 1 1222 1243 278 22 7 chr5 83515239 83515652 -69021607 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1222 440 255 60 40 chr5 83515664 83515864 -69021395 - MTD-int LTR MaLR -12 1246 1043 2 1222 1995 297 53 60 chr5 83516549 83517345 -69019914 - MTD-int LTR MaLR -165 1093 304 2 1222 806 305 63 13 chr5 83518543 83518842 -69018417 - MTD LTR MaLR -59 360 47 3 1222 316 351 102 57 chr5 83520506 83520820 -69016439 + MLT1A LTR MaLR 34 361 -13 3 1222 1044 84 7 0 chr5 83527471 83527613 -69009646 + MTA_Mm LTR MaLR 254 396 0 4 1222 337 361 28 0 chr5 83529146 83529290 -69007969 - MER70A LTR ERVL -1 471 324 5 1222 533 151 325 8 chr5 83545173 83545266 -68991993 - MT2C_Mm LTR ERVL -364 220 95 7 1222 520 318 79 4 chr5 83554025 83554263 -68982996 + MTC-int LTR MaLR 312 567 -691 8 1222 1530 193 40 82 chr5 83554263 83554641 -68982618 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 31 8 1222 764 292 118 128 chr5 83554626 83554788 -68982471 + MTC-int LTR MaLR 547 821 -437 8 1222 964 179 349 69 chr5 83554788 83554895 -68982364 + RLTR23 LTR ERV1 2 192 -238 8 1222 964 179 349 69 chr5 83554937 83555164 -68982095 + RLTR23 LTR ERV1 193 430 0 8 1222 764 292 118 128 chr5 83555164 83555550 -68981709 + MTC-int LTR MaLR 728 1090 -8 8 1222 415 304 87 29 chr5 83555560 83555867 -68981392 + MTD LTR MaLR 2 319 -81 8 1222 2895 82 8 8 chr5 83557800 83558194 -68979065 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 8 1222 487 370 4 9 chr5 83558796 83559025 -68978234 + MLT2C1 LTR ERVL 4 231 -166 9 1222 496 279 86 24 chr5 83559759 83559968 -68977291 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 261 9 1222 1872 196 23 21 chr5 83562233 83562610 -68974649 + ORR1B2 LTR MaLR 1 379 0 1 1222 1031 94 12 181 chr5 83566998 83567246 -68970013 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 183 388 -2 1 1222 21558 43 33 21 chr5 83567246 83569981 -68967278 + IAPEz-int LTR ERVK 6 2774 -3707 1 1222 2449 18 0 0 chr5 83570004 83570286 -68966973 + IAPEz-int LTR ERVK 4076 4357 -2124 1 1222 5880 59 13 18 chr5 83570277 83571052 -68966207 + IAPEz-int LTR ERVK 5709 6479 -2 1 1222 2323 113 14 24 chr5 83571054 83571425 -68965834 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 1222 306 85 64 0 chr5 83579738 83579785 -68957474 - RLTR44C LTR ERVK -137 365 316 1 1222 6453 98 6 0 chr5 83582380 83583268 -68953991 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 1 1222 12308 104 31 17 chr5 83583273 83584982 -68952277 - RLTR45-int LTR ERVK -1173 6071 4762 1 1222 12308 95 39 19 chr5 83585014 83585672 -68951587 - RLTR45-int LTR ERVK -2483 4761 4100 1 1222 1762 114 128 0 chr5 83591069 83591359 -68945900 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1222 482 341 58 36 chr5 83594923 83595148 -68942111 - MLT1E1A LTR MaLR -178 502 273 1 1222 1832 231 38 10 chr5 83597325 83597722 -68939537 - MTC LTR MaLR -11 410 3 1 1222 1329 231 25 50 chr5 83602194 83602432 -68934827 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 131 1 1222 1329 231 25 50 chr5 83602937 83603017 -68934242 - ORR1D1 LTR MaLR -244 130 61 1 1222 230 314 70 0 chr5 83603082 83603168 -68934091 - ORR1D1-int LTR MaLR -1417 92 1 1 1222 736 265 56 95 chr5 83603168 83603417 -68933842 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 140 1 1222 736 265 56 95 chr5 83603462 83603516 -68933743 - ORR1D1 LTR MaLR -235 139 83 1 1222 297 347 24 16 chr5 83604457 83604583 -68932676 + MLT1A0 LTR MaLR 145 271 -94 1 1222 6581 85 7 2 chr5 83605970 83606859 -68930400 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 1 1222 277 359 35 7 chr5 83606877 83607020 -68930239 + MER31A LTR ERV1 110 256 -229 1 1222 2401 240 41 25 chr5 83618714 83619320 -68917939 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 1 1222 626 311 117 39 chr5 83619718 83620092 -68917167 + MTC LTR MaLR 1 408 -13 1 1222 394 362 35 44 chr5 83620583 83620907 -68916352 + ORR1E LTR MaLR 1 338 -41 1 1222 255 178 0 0 chr5 83620917 83620962 -68916297 + RMER6C LTR ERVK 1 45 -675 1 1222 2284 198 56 38 chr5 83620956 83621477 -68915782 + RMER6C LTR ERVK 161 690 0 1 1222 698 249 0 40 chr5 83622072 83622248 -68915011 + RLTR30 LTR ERV1 49 217 -162 1 1222 917 149 60 0 chr5 83622283 83622451 -68914808 + RLTR30 LTR ERV1 202 379 0 1 1222 378 200 0 153 chr5 83622772 83622896 -68914363 + MT2B LTR ERVL 155 259 -342 1 1222 566 348 82 44 chr5 83623038 83623381 -68913878 - MTE-int LTR MaLR -1216 364 9 1 1222 895 335 19 19 chr5 83623583 83623905 -68913354 - MTEb LTR MaLR -57 322 1 1 1223 366 304 49 0 chr5 83641261 83641363 -68895896 + ORR1D1 LTR MaLR 102 208 -166 2 1223 297 276 141 59 chr5 83641452 83641587 -68895672 + ORR1D1 LTR MaLR 229 374 0 2 1223 594 292 82 0 chr5 83650504 83650699 -68886560 + MTD LTR MaLR 1 211 -208 2 1223 553 266 8 0 chr5 83651984 83652108 -68885151 + MTD LTR MaLR 196 320 -99 2 1223 347 280 37 18 chr5 83655344 83655453 -68881806 + ORR1B1 LTR MaLR 266 376 -18 2 1223 1736 186 114 100 chr5 83655455 83656208 -68881051 - RMER6D LTR ERVK 0 720 6 2 1223 1191 222 35 21 chr5 83676402 83676692 -68860567 + RLTR40 LTR ERVK 4 297 -520 2 1223 1627 279 57 96 chr5 83677075 83677917 -68859342 - RLTR40 LTR ERVK -8 809 1 2 1223 231 382 84 42 chr5 83682403 83682545 -68854714 + MLT1A1 LTR MaLR 81 228 -180 2 1223 1903 189 20 15 chr5 83685601 83685993 -68851266 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1223 758 227 155 0 chr5 83690963 83691170 -68846089 + ORR1C2 LTR MaLR 2 240 -144 3 1223 1250 191 53 45 chr5 83691171 83691527 -68845732 - RMER6C LTR ERVK 0 690 332 3 1223 837 228 46 10 chr5 83691523 83691718 -68845541 - RMER6C LTR ERVK -481 209 8 3 1223 568 211 17 9 chr5 83691727 83691842 -68845417 + ORR1C2 LTR MaLR 269 384 0 3 1223 464 365 49 13 chr5 83695901 83696126 -68841133 - ORR1E LTR MaLR -112 247 15 3 1223 480 266 18 43 chr5 83696744 83696882 -68840377 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 386 3 1223 995 247 56 59 chr5 83706246 83706586 -68830673 + RLTR40 LTR ERVK 468 806 -11 3 1223 5241 163 93 9 chr5 83710751 83711778 -68825481 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 3 1223 415 343 53 29 chr5 83712420 83712666 -68824593 + RMER15 LTR ERVL 306 557 -18 3 1223 340 347 11 69 chr5 83713637 83713826 -68823433 + MTE-int LTR MaLR 373 550 -1030 3 1223 475 267 129 12 chr5 83723192 83723355 -68813904 + MTD LTR MaLR 20 201 -218 3 1223 360 358 28 33 chr5 83730783 83730965 -68806294 + MTD LTR MaLR 10 190 -229 3 1223 1204 296 33 5 chr5 83754295 83754622 -68782637 + MTD LTR MaLR 13 346 -73 3 1223 1204 296 33 5 chr5 83754642 83754681 -68782578 + MTD LTR MaLR 347 389 -30 3 1224 344 341 90 13 chr5 83756540 83756721 -68780538 + MLT2B2 LTR ERVL 94 290 -230 3 1224 1130 296 13 7 chr5 83759819 83760128 -68777131 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 56 4 1224 1704 179 55 12 chr5 83762991 83763239 -68774020 + ORR1B2 LTR MaLR 1 248 -119 4 1224 1704 179 55 12 chr5 83763306 83763401 -68773858 + ORR1B2 LTR MaLR 249 357 -10 4 1224 551 146 21 10 chr5 83763762 83763859 -68773400 + ORR1B1 LTR MaLR 289 386 -8 4 1224 1159 229 39 13 chr5 83764564 83764885 -68772374 + ORR1B1 LTR MaLR 1 252 -142 4 1224 888 274 152 87 chr5 83774690 83775188 -68762071 + MTC-int LTR MaLR 22 553 -705 4 1224 3208 46 5 0 chr5 83775758 83776151 -68761108 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 4 1224 8550 48 3 40 chr5 83776151 83777290 -68759969 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1224 3258 41 8 0 chr5 83777290 83777683 -68759576 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1224 1130 280 49 24 chr5 83798656 83798985 -68738274 + RMER15 LTR ERVL 1 337 -238 4 1224 1747 281 48 109 chr5 83799069 83799873 -68737386 - MTB-int LTR MaLR -360 1010 1 4 1224 2758 72 72 3 chr5 83799873 83800247 -68737012 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1224 873 194 17 23 chr5 83802623 83802797 -68734462 - RLTR24 LTR ERV1 -356 173 1 4 1224 1831 207 28 20 chr5 83805771 83806171 -68731088 + MTB_Mm LTR MaLR 5 407 0 4 1224 4426 219 26 4 chr5 83806171 83807089 -68730170 + MTB_Mm-int LTR MaLR 3 940 -318 4 1224 887 307 50 45 chr5 83820316 83820718 -68716541 - MLT2D LTR ERVL -10 404 1 5 1224 2280 72 119 11 chr5 83821651 83822003 -68715256 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 5 1224 14671 28 1 0 chr5 83822005 83823687 -68713572 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 302 5 1224 2179 87 129 11 chr5 83823687 83824036 -68713223 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 5 1224 1528 220 42 81 chr5 83825818 83826137 -68711122 - RMER6A LTR ERVK 0 756 458 5 1224 1528 220 42 81 chr5 83826286 83826460 -68710799 - RMER6A LTR ERVK -299 457 282 5 1224 1176 210 58 0 chr5 83826492 83826821 -68710438 - RMER6A LTR ERVK -317 439 92 5 1224 280 261 84 74 chr5 83842024 83842119 -68695140 + MTE-int LTR MaLR 558 653 -927 5 1224 484 263 58 167 chr5 83842255 83842734 -68694525 + RLTR23 LTR ERV1 4 430 0 5 1224 2507 193 64 5 chr5 83843039 83843618 -68693641 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 1224 252 310 79 72 chr5 83843913 83844052 -68693207 - MLT1J-int LTR MaLR -1130 257 118 5 1224 792 240 84 31 chr5 83855762 83856038 -68681221 + BGLII_B LTR ERVK 10 241 -264 5 1224 1210 171 9 0 chr5 83861555 83861766 -68675493 + ORR1A4 LTR MaLR 109 321 -8 5 1224 3722 251 118 90 chr5 83861770 83863680 -68673579 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1963 0 5 1224 1783 163 31 12 chr5 83863680 83864003 -68673256 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1224 480 318 43 167 chr5 83866083 83866412 -68670847 + MTD LTR MaLR 96 383 -38 5 1224 2784 174 153 12 chr5 83874379 83874973 -68662286 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 5 1224 1590 260 100 31 chr5 83875986 83876628 -68660631 - RMER6C LTR ERVK -4 686 1 5 1225 2476 121 27 17 chr5 83894044 83894447 -68642812 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1225 226 379 31 31 chr5 83898659 83898787 -68638472 - MLT1G3 LTR MaLR -244 351 224 6 1225 2662 104 42 0 chr5 83903690 83904074 -68633185 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1225 1385 198 80 159 chr5 83905422 83905957 -68631302 + RMER17B LTR ERVK 1 493 -465 6 1225 421 304 47 37 chr5 83925033 83925197 -68612062 + ORR1E LTR MaLR 31 181 -193 6 1225 2259 181 2 28 chr5 83926296 83926728 -68610531 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1225 481 229 25 25 chr5 83929088 83929209 -68608050 + MTC LTR MaLR 295 415 -6 6 1225 1653 254 52 81 chr5 83929213 83929380 -68607879 + MTC-int LTR MaLR 2 164 -1094 6 1225 3012 186 78 22 chr5 83929380 83929726 -68607533 + RMER6D LTR ERVK 1 368 -352 6 1225 3012 186 78 22 chr5 83929748 83930079 -68607180 + RMER6D LTR ERVK 369 716 -4 6 1225 1653 254 52 81 chr5 83930079 83930454 -68606805 + MTC-int LTR MaLR 165 528 -730 6 1225 472 301 85 16 chr5 83937889 83938078 -68599181 + MLT1D LTR MaLR 2 203 -302 6 1225 1682 201 19 65 chr5 83939683 83940051 -68597208 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 42 6 1225 3035 26 0 0 chr5 83942706 83943052 -68594207 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1225 268 344 25 50 chr5 83943745 83943904 -68593355 + MTE-int LTR MaLR 101 255 -1325 6 1225 427 279 121 76 chr5 83944208 83944392 -68592867 - RLTR25B LTR ERVK -11 1092 829 6 1225 382 279 121 76 chr5 83944417 83944496 -68592763 - RLTR25B LTR ERVK -200 828 742 6 1225 2553 176 67 4 chr5 83944609 83945104 -68592155 - RLTR25B LTR ERVK -253 775 250 6 1225 2631 64 0 62 chr5 83951852 83952221 -68585038 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 1225 310 351 38 73 chr5 83954017 83954278 -68582981 + MLT1B LTR MaLR 3 254 -136 7 1225 276 355 52 82 chr5 83955060 83955195 -68582064 - LTR69 LTR ERVL -7 581 451 7 1225 256 337 11 0 chr5 83965201 83965293 -68571966 - ERVL-int LTR ERVL -5209 548 456 7 1225 7380 17 0 0 chr5 83965800 83966622 -68570637 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 7 1225 2123 123 15 6 chr5 83978028 83978362 -68558897 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 7 1225 20248 60 25 21 chr5 83978362 83981017 -68556242 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2674 -3807 7 1225 8580 50 9 13 chr5 83980995 83982076 -68555183 + IAPEz-int LTR ERVK 5403 6479 -2 7 1225 2123 123 15 6 chr5 83982078 83982412 -68554847 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 7 1225 2688 31 0 35 chr5 83987794 83988133 -68549126 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 7 1225 6328 66 12 11 chr5 83988135 83988961 -68548298 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5653 7 1225 2714 64 0 3 chr5 83988956 83989299 -68547960 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1359 7 1225 3440 77 0 14 chr5 83989299 83989953 -68547306 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 7 1225 250 302 0 0 chr5 83989953 83990006 -68547253 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 7 1225 996 88 99 12 chr5 83990006 83990178 -68547081 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 9 7 1225 785 106 29 2 chr5 83990179 83990326 -68546933 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 411 173 7 1225 577 0 0 0 chr5 83990310 83990378 -68546881 - IAPLTR2b LTR ERVK -343 68 1 7 1225 2770 22 5 131 chr5 84015150 84015570 -68521689 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 153 29012 17 1 2 chr5 84015570 84018846 -68518413 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 2 1226 8177 68 78 16 chr5 84018845 84020071 -68517188 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 67 2 1226 1027 85 152 0 chr5 84020042 84020206 -68517053 - IAPEz-int LTR ERVK -6285 196 8 2 1226 2770 22 5 131 chr5 84020206 84020626 -68516633 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1226 623 355 29 8 chr5 84027565 84027804 -68509455 - ORR1E LTR MaLR -110 249 6 3 1226 2671 54 60 18 chr5 84048646 84049026 -68488233 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1226 1109 240 79 37 chr5 84053525 84053879 -68483380 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 2 6 1226 2496 302 129 38 chr5 84053896 84054973 -68482286 - ORR1D1-int LTR MaLR -31 1339 165 6 1226 402 281 142 35 chr5 84058577 84058910 -68478349 - RMER15 LTR ERVL -140 435 1 7 1226 564 344 99 89 chr5 84063782 84063913 -68473346 - MTE-int LTR MaLR -54 1526 1401 7 1226 564 344 99 89 chr5 84063941 84064336 -68472923 - MTE-int LTR MaLR -180 1400 995 7 1226 609 328 191 18 chr5 84064595 84065083 -68472176 - MTE-int LTR MaLR -948 632 61 7 1226 1410 147 0 4 chr5 84066606 84066831 -68470428 - MT2B LTR ERVL -28 573 350 8 1226 373 233 22 0 chr5 84066832 84066922 -68470337 - ORR1A3-int LTR MaLR -1226 737 646 8 1226 336 234 117 31 chr5 84066922 84066954 -68470305 - MT2B LTR ERVL -462 121 1 8 1226 2732 138 39 99 chr5 84076980 84077656 -68459603 - RMER17D2 LTR ERVK -149 660 26 1 1226 1953 67 72 20 chr5 84083914 84084206 -68453053 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 307 -20 1 1226 430 298 50 65 chr5 84094191 84094392 -68442867 + RMER15 LTR ERVL 311 508 -67 1 1226 486 332 73 52 chr5 84098693 84099019 -68438240 - MLT1A0 LTR MaLR -19 346 14 1 1226 1157 307 53 46 chr5 84099019 84099435 -68437824 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1226 718 248 103 60 chr5 84099606 84100053 -68437206 - RLTR20C LTR ERVK -9 569 3 1 1226 703 277 95 36 chr5 84102369 84102706 -68434553 + RLTR10D LTR ERVK 3 359 0 1 1226 332 360 54 14 chr5 84119533 84119809 -68417450 - MLT1H-int LTR MaLR -900 509 223 1 1226 593 384 62 13 chr5 84126075 84126610 -68410649 + RMER15-int LTR ERVL 162 722 -4277 1 1226 825 330 60 32 chr5 84126755 84127252 -68410007 + RMER15-int LTR ERVL 1326 1836 -3163 1 1226 935 354 70 60 chr5 84127427 84128142 -68409117 + RMER15-int LTR ERVL 4275 4996 -3 1 1226 230 183 31 146 chr5 84128151 84128202 -68409057 + RMER15 LTR ERVL 14 60 -515 1 1226 230 183 31 146 chr5 84128771 84128815 -68408444 + RMER15 LTR ERVL 61 98 -477 1 1226 242 209 0 0 chr5 84140629 84140672 -68396587 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 43 -1071 2 1226 342 234 114 46 chr5 84141416 84141570 -68395689 + RLTR13D3 LTR ERVK 981 1114 0 2 1226 1567 170 119 19 chr5 84147495 84147872 -68389387 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 1 2 1227 2646 113 27 5 chr5 84161685 84162095 -68375164 - BGLII LTR ERVK -2 419 1 2 1227 2767 201 143 85 chr5 84162281 84163120 -68374139 - RMER19B LTR ERVK -12 890 3 2 1227 2496 61 12 3 chr5 84164754 84165082 -68372177 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 2 1227 274 293 7 109 chr5 84165912 84166050 -68371209 - MT2B LTR ERVL -337 264 141 2 1227 647 329 28 20 chr5 84166115 84166369 -68370890 + MTD LTR MaLR 3 258 -161 2 1227 1657 275 27 31 chr5 84181552 84181925 -68355334 - RMER19C LTR ERVK 0 611 238 2 1227 2630 117 38 2 chr5 84181925 84182318 -68354941 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1227 1657 275 27 31 chr5 84182318 84182432 -68354827 - RMER19C LTR ERVK -374 237 126 2 1227 281 319 66 53 chr5 84182545 84182697 -68354562 - RLTR14 LTR ERV1 -3 379 226 2 1227 325 288 0 43 chr5 84183149 84183265 -68353994 + MTD LTR MaLR 6 116 -303 2 1227 1633 239 82 15 chr5 84194123 84194210 -68343049 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 88 -496 2 1227 1633 239 82 15 chr5 84194280 84194656 -68342603 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 89 494 -90 2 1227 659 117 0 43 chr5 84194651 84194767 -68342492 - MTB LTR MaLR -296 111 1 2 1227 6284 109 43 68 chr5 84194767 84195893 -68341366 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1227 2802 103 5 2 chr5 84195893 84196292 -68340967 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1227 714 281 76 23 chr5 84209506 84209768 -68327491 - MTEb LTR MaLR 0 379 104 2 1227 3298 188 68 18 chr5 84227593 84228274 -68308985 + RMER6D LTR ERVK 6 720 0 3 1227 1917 212 16 25 chr5 84236179 84236614 -68300645 - BGLII_B LTR ERVK -10 431 1 3 1227 269 310 34 78 chr5 84239547 84239750 -68297509 - MTEa LTR MaLR 0 379 179 3 1227 275 289 31 171 chr5 84254675 84255018 -68282241 - MTEa LTR MaLR -30 349 64 3 1227 505 286 61 69 chr5 84255036 84255382 -68281877 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 3 1227 235 231 0 55 chr5 84255400 84255455 -68281804 - MLT2B2 LTR ERVL -463 52 1 3 1227 345 353 62 77 chr5 84256023 84256376 -68280883 - MLT1D LTR MaLR -25 480 133 3 1227 710 295 117 27 chr5 84266989 84267289 -68269970 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 44 3 1227 379 279 66 48 chr5 84269458 84269638 -68267621 + BGLII_B LTR ERVK 5 178 -350 3 1227 1744 144 6 86 chr5 84270035 84270385 -68266874 + RLTR23 LTR ERV1 107 428 -2 3 1227 499 264 66 53 chr5 84270405 84270651 -68266608 + BGLII_B LTR ERVK 169 414 -27 3 1227 927 226 148 109 chr5 84272327 84272739 -68264520 - RMER6B LTR ERVK -33 428 1 3 1227 295 355 83 79 chr5 84273731 84274139 -68263120 - MLT1H-int LTR MaLR -442 1047 564 3 1228 310 311 81 48 chr5 84283067 84283253 -68254006 + ORR1E LTR MaLR 5 196 -163 4 1228 1080 277 54 124 chr5 84287889 84288446 -68248813 - RLTR20B3 LTR ERVK -47 530 13 4 1228 1352 122 0 5 chr5 84290097 84290303 -68246956 + ORR1A3 LTR MaLR 122 326 0 4 1228 9519 153 66 27 chr5 84290303 84292188 -68245071 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 1959 -4 4 1228 1665 80 13 0 chr5 84292932 84293158 -68244101 + ORR1A3 LTR MaLR 43 271 -55 4 1228 2453 193 142 7 chr5 84294845 84295450 -68241809 + RMER6C LTR ERVK 3 689 -1 4 1228 781 264 62 42 chr5 84295797 84296038 -68241221 + ORR1E LTR MaLR 4 249 -110 4 1228 853 317 9 45 chr5 84307303 84307637 -68229622 - MurERV4-int LTR ERVK -396 4864 4543 4 1228 1008 224 47 47 chr5 84308845 84309187 -68228072 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 4 1228 2685 45 3 0 chr5 84312411 84312742 -68224517 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 4 1228 411 383 36 94 chr5 84314807 84315167 -68222092 - ORR1E LTR MaLR 0 359 21 4 1228 1588 155 18 0 chr5 84316459 84316736 -68220523 - RMER6C LTR ERVK 0 690 409 4 1228 5984 79 2 12 chr5 84317675 84318491 -68218768 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 4 1228 1391 190 17 64 chr5 84327821 84328119 -68209140 + RLTR20A LTR ERVK 258 541 0 4 1228 937 274 55 142 chr5 84328294 84328753 -68208506 - RLTR23 LTR ERV1 -4 426 8 4 1228 2293 178 2 12 chr5 84335646 84336047 -68201212 + ORR1B1 LTR MaLR 1 387 -7 4 1228 890 68 90 0 chr5 84338873 84339006 -68198253 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 285 4 1228 549 154 170 27 chr5 84339001 84339148 -68198111 - RLTR23 LTR ERV1 -262 168 1 4 1228 2210 196 8 45 chr5 84339296 84339782 -68197477 + RLTR18-int LTR ERVK 4890 5357 -4 4 1228 459 340 65 116 chr5 84339799 84340394 -68196865 + RLTR18 LTR ERVK 25 589 -27 4 1228 1300 189 71 4 chr5 84340427 84340682 -68196577 + ORR1C1 LTR MaLR 105 376 -2 4 1228 1308 182 19 0 chr5 84341603 84341861 -68195398 + RMER10B LTR ERVL 1 263 -135 4 1228 828 230 32 68 chr5 84341878 84342097 -68195162 + RMER10B LTR ERVL 188 398 0 4 1228 1048 286 46 41 chr5 84344159 84344527 -68192732 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1228 730 244 28 6 chr5 84349129 84349310 -68187949 + ORR1D1-int LTR MaLR 1181 1365 -5 4 1228 489 265 0 8 chr5 84349314 84349432 -68187827 + ORR1D1 LTR MaLR 3 119 -255 4 1228 274 235 36 24 chr5 84349419 84349502 -68187757 + ORR1D1 LTR MaLR 299 382 -2 4 1228 255 365 13 105 chr5 84355129 84355282 -68181977 - MTEb LTR MaLR -118 261 123 5 1228 397 333 24 0 chr5 84356830 84356953 -68180306 + RMER15 LTR ERVL 436 561 -14 5 1228 505 314 171 43 chr5 84358056 84358408 -68178851 - LTR40a LTR ERVL -37 482 86 5 1228 818 213 22 12 chr5 84361945 84362132 -68175127 - ORR1B1 LTR MaLR -220 174 1 5 1228 503 266 137 0 chr5 84362784 84362923 -68174336 + MT2A LTR ERVL 376 533 0 5 1228 2579 171 112 25 chr5 84363703 84364338 -68172921 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 1228 792 319 149 3 chr5 84364628 84364949 -68172310 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 5 1228 1298 229 105 12 chr5 84372891 84373214 -68164045 + ORR1D1 LTR MaLR 3 355 -19 5 1228 2332 96 3 88 chr5 84388693 84389080 -68148179 - RLTR10D LTR ERVK -5 354 1 5 1228 252 338 68 18 chr5 84389087 84389250 -68148009 + RMER15 LTR ERVL 389 559 -16 5 1228 1512 225 20 26 chr5 84390053 84390396 -68146863 - ORR1C2 LTR MaLR -43 341 1 5 1228 551 238 60 35 chr5 84390399 84390599 -68146660 + RMER15-int LTR ERVL 584 788 -4211 5 1228 340 297 29 19 chr5 84390922 84391025 -68146234 + RMER15 LTR ERVL 355 458 -117 5 1228 1851 152 42 76 chr5 84398178 84398584 -68138675 + RLTR9C LTR ERVK 2 393 0 5 1228 2919 174 45 35 chr5 84401294 84401870 -68135389 - RMER4B LTR ERVK 0 585 4 5 1228 739 329 48 15 chr5 84403054 84403384 -68133875 + LTR83 LTR ERVL 58 398 -382 5 1228 550 380 88 12 chr5 84406254 84406685 -68130574 - MLT2B4 LTR ERVL -89 467 4 5 1228 1286 346 50 7 chr5 84407948 84408486 -68128773 - LTR69 LTR ERVL -27 561 1 5 153 460 313 72 55 chr5 84410144 84410520 -68126739 + MLT1D LTR MaLR 21 415 -52 5 1229 665 307 164 16 chr5 84412799 84413110 -68124149 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 5 1229 582 241 75 7 chr5 84413290 84413436 -68123823 + MTD LTR MaLR 1 156 -263 5 1229 631 245 36 7 chr5 84413442 84413582 -68123677 + MTD LTR MaLR 273 416 -3 5 1229 1901 203 28 47 chr5 84414906 84415125 -68122134 - MTC LTR MaLR 0 421 207 5 1229 1901 203 28 47 chr5 84415828 84416032 -68121227 - MTC LTR MaLR -215 206 1 5 1229 509 176 22 0 chr5 84417642 84417733 -68119526 - RMER6C LTR ERVK -3 687 595 5 1229 1656 179 45 3 chr5 84417794 84418125 -68119134 - RMER6C LTR ERVK -345 345 1 5 1229 3286 212 33 42 chr5 84418126 84419298 -68117961 - MurERV4-int LTR ERVK -106 5154 4312 5 1229 2179 192 20 124 chr5 84421899 84422488 -68114771 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 5 1229 877 310 69 39 chr5 84427010 84427399 -68109860 - MTD LTR MaLR -15 404 4 6 1229 290 211 14 40 chr5 84447048 84447119 -68090140 - RMER19C LTR ERVK 0 902 834 6 1229 3630 102 6 30 chr5 84447119 84447358 -68089901 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 1033 690 6 1229 3630 161 66 47 chr5 84448083 84448750 -68088509 - RLTR13C1 LTR ERVK -294 689 1 6 1229 2365 181 44 161 chr5 84448751 84449368 -68087891 - RMER19C LTR ERVK -63 548 4 6 1229 685 305 19 5 chr5 84449480 84449694 -68087565 + MLT2D LTR ERVL 8 224 -190 6 1229 2255 334 109 40 chr5 84449920 84451839 -68085420 + ERVL-int LTR ERVL 3363 5415 -342 6 1229 312 339 119 25 chr5 84451897 84452133 -68085126 + MLT2D LTR ERVL 5 262 -152 6 1229 398 204 248 28 chr5 84461653 84461792 -68075467 - RMER6D LTR ERVK -3 717 548 6 1229 1260 274 69 74 chr5 84461792 84462592 -68074667 + RMER12 LTR ERVK 1 777 -1071 6 1229 1681 227 164 36 chr5 84462842 84463423 -68073836 - RMER6C LTR ERVK -35 655 1 6 1229 854 283 113 18 chr5 84464540 84464875 -68072384 + MTD LTR MaLR 3 369 -50 6 1229 2779 61 0 3 chr5 84468263 84468609 -68068650 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 6 1229 360 237 126 8 chr5 84470729 84470848 -68066411 + MLT1B LTR MaLR 29 161 -229 6 1229 326 365 73 10 chr5 84473387 84473592 -68063667 + MLT1B LTR MaLR 170 387 -3 6 1229 903 329 81 3 chr5 84475531 84475863 -68061396 - MTE2b LTR MaLR -21 358 1 6 1229 2771 268 90 74 chr5 84479397 84479884 -68057375 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4162 4651 -1110 6 1229 2771 268 90 74 chr5 84479931 84480557 -68056702 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4652 5293 -468 6 1229 949 234 116 35 chr5 84502237 84502583 -68034676 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1229 1960 254 37 76 chr5 84502583 84503256 -68034003 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 647 -723 3 1229 1322 313 61 46 chr5 84503707 84504229 -68033030 + ORR1D1-int LTR MaLR 669 1198 -172 3 1229 761 277 11 0 chr5 84504282 84504466 -68032793 + ORR1D1 LTR MaLR 179 364 -6 3 1229 1361 238 82 27 chr5 84506192 84506568 -68030691 - MTD LTR MaLR -12 407 11 6 1229 1950 190 26 69 chr5 84513044 84513462 -68023797 - MTC LTR MaLR -9 412 13 1 1229 652 271 158 19 chr5 84516233 84516500 -68020759 - MTD LTR MaLR 0 419 105 3 1229 652 271 158 19 chr5 84516562 84516662 -68020597 - MTD LTR MaLR -315 104 2 3 1229 278 365 99 37 chr5 84517715 84517877 -68019382 + MLT2B3 LTR ERVL 373 544 -10 3 1230 1006 279 70 22 chr5 84551630 84552030 -67985229 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1230 752 348 65 31 chr5 84553717 84554132 -67983127 + BGLII_B LTR ERVK 5 433 -8 7 1230 2340 121 60 118 chr5 84555319 84555870 -67981389 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 7 1230 1072 296 25 17 chr5 84556447 84556853 -67980406 + MYSERV6-int LTR ERVK 453 861 -8098 7 1230 2291 273 98 26 chr5 84556853 84557742 -67979517 + MYSERV6-int LTR ERVK 974 1926 -7033 7 1230 423 333 0 0 chr5 84557753 84557873 -67979386 + BGLII_B LTR ERVK 295 414 -27 7 1230 1147 241 62 129 chr5 84568811 84569041 -67968218 + MTC LTR MaLR 10 216 -205 9 1230 1147 241 62 129 chr5 84569482 84569683 -67967576 + MTC LTR MaLR 217 412 -9 9 1230 706 238 113 113 chr5 84574377 84574523 -67962736 + ORR1D1 LTR MaLR 1 156 -218 9 1230 706 238 113 113 chr5 84574622 84574801 -67962458 + ORR1D1 LTR MaLR 157 326 -48 9 1230 287 239 157 11 chr5 84574799 84574811 -67962448 + ORR1D1-int LTR MaLR 41 61 -1309 9 1230 287 239 157 11 chr5 84574859 84574935 -67962324 + ORR1D1-int LTR MaLR 62 142 -1228 9 1230 427 273 45 28 chr5 84574948 84575125 -67962134 + ORR1D1-int LTR MaLR 393 572 -798 9 1230 616 253 140 16 chr5 84576930 84577234 -67960025 + ORR1D1 LTR MaLR 25 370 0 9 1230 2892 47 14 14 chr5 84600583 84600951 -67936308 + ETnERV-int LTR ERVK 2947 3314 0 1 1230 1791 115 28 25 chr5 84600951 84601272 -67935987 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 1230 355 348 64 68 chr5 84612641 84612946 -67924313 + MLT1A LTR MaLR 30 333 -41 1 1230 3639 174 46 8 chr5 84626116 84626838 -67910421 + RMER6A LTR ERVK 1 749 -7 1 1230 503 347 79 62 chr5 84642570 84642874 -67894385 + ORR1E LTR MaLR 1 309 -50 2 1230 474 151 58 87 chr5 84651910 84652048 -67885211 + RLTR15 LTR ERVK 187 320 -39 2 1230 880 321 29 4 chr5 84653180 84653458 -67883801 + MYSERV-int LTR ERVK 4843 5127 -1423 2 1230 373 341 30 20 chr5 84653459 84653642 -67883617 + RMER4A LTR ERVK 254 542 -43 2 1230 3820 211 75 31 chr5 84653649 84654824 -67882435 + MYSERV6-int LTR ERVK 7813 8890 -69 2 1230 2298 255 81 75 chr5 84655010 84655119 -67882140 + MYSERV6-int LTR ERVK 6465 6546 -4 2 1230 1258 218 27 24 chr5 84655122 84655460 -67881799 + RLTR15 LTR ERVK 3 341 -18 2 1231 991 239 35 155 chr5 84677251 84677465 -67859794 + ORR1D1 LTR MaLR 5 179 -195 2 1231 991 239 35 155 chr5 84677490 84677681 -67859578 + ORR1D1 LTR MaLR 180 361 -13 2 1231 237 333 90 30 chr5 84678250 84678383 -67858876 + MLT1G1 LTR MaLR 1 141 -233 2 1231 267 357 70 76 chr5 84680590 84680775 -67856484 + MLT1G1 LTR MaLR 348 531 -48 2 1231 2475 182 157 5 chr5 84680769 84681067 -67856192 - RMER6D LTR ERVK -52 668 351 2 1231 2475 182 157 5 chr5 84681109 84681390 -67855869 - RMER6D LTR ERVK -370 350 1 2 1231 436 338 102 11 chr5 84683634 84683918 -67853341 + MLT2B1 LTR ERVL 10 319 -201 2 1231 229 219 0 0 chr5 84703645 84703686 -67833573 - LTR90B LTR LTR -751 45 5 3 1231 232 167 34 85 chr5 84717936 84717995 -67819264 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1312 1367 -481 3 1231 1223 292 46 34 chr5 84723231 84723645 -67813614 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1231 879 172 59 54 chr5 84725684 84725887 -67811372 + RMER20B LTR ERVK 234 437 -190 3 1231 573 181 6 127 chr5 84729897 84730055 -67807204 - ORR1C2 LTR MaLR -245 139 1 3 1231 3644 44 5 0 chr5 84731804 84732238 -67805021 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 1231 2134 204 131 35 chr5 84736657 84737398 -67799861 - RMER6C LTR ERVK -11 709 1 3 1231 485 319 65 46 chr5 84738910 84739127 -67798132 + MER34A1 LTR ERV1 14 234 -353 3 1231 243 322 10 72 chr5 84743967 84744064 -67793195 - RMER15 LTR ERVL -114 461 371 3 1231 243 253 171 51 chr5 84744645 84744803 -67792456 + MT2B2 LTR ERVL 64 240 -344 3 1231 1424 213 35 16 chr5 84744870 84745185 -67792074 + RMER6C LTR ERVK 370 690 0 3 1231 1448 158 89 77 chr5 84748037 84748441 -67788818 + RMER17C LTR ERVK 2 410 0 3 1231 1608 218 47 34 chr5 84756793 84757201 -67780058 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1231 2021 142 19 29 chr5 84761337 84761749 -67775510 + RMER17C LTR ERVK 3 410 0 4 1231 1900 218 37 2 chr5 84770019 84770424 -67766835 - MTC LTR MaLR 0 421 3 4 1231 1730 154 46 14 chr5 84778574 84778922 -67758337 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 4 1231 1799 178 138 8 chr5 84782116 84782507 -67754752 + RLTR41 LTR ERV1 3 444 -2 4 1231 1190 260 44 22 chr5 84789599 84789961 -67747298 + ORR1D1 LTR MaLR 2 371 -3 4 1232 1305 249 96 13 chr5 84813444 84813831 -67723428 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1232 367 262 37 16 chr5 84818905 84819018 -67718241 + MTD LTR MaLR 206 327 -73 4 1232 1041 265 165 91 chr5 84825301 84825732 -67711527 + MT2A LTR ERVL 1 463 -70 5 1232 1700 185 95 6 chr5 84828294 84828631 -67708628 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1232 5860 198 83 6 chr5 84828631 84830032 -67707227 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 1509 0 5 1232 465 231 157 0 chr5 84830032 84830166 -67707093 + ORR1B2 LTR MaLR 1 155 -212 5 1232 294 221 0 0 chr5 84830164 84830232 -67707027 + ORR1B2 LTR MaLR 327 394 0 5 1232 812 289 43 8 chr5 84830234 84830468 -67706791 + MTEb LTR MaLR 1 242 -137 5 1232 2515 163 122 8 chr5 84852590 84853091 -67684168 + RMER2 LTR ERV1 10 567 0 5 1232 2390 101 3 0 chr5 84853350 84853676 -67683583 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1232 2236 176 76 47 chr5 84859848 84860315 -67676944 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 45 5 1232 3624 199 152 4 chr5 84860315 84861103 -67676156 - RMER13B LTR ERVK -3 905 1 5 1232 2236 176 76 47 chr5 84861103 84861147 -67676112 - RLTR11A2 LTR ERVK -483 44 1 5 1232 2020 171 20 3 chr5 84876185 84876531 -67660728 + ORR1B1 LTR MaLR 1 352 -42 5 1232 1034 291 96 43 chr5 84876531 84877174 -67660085 - RMER19B LTR ERVK 0 902 32 5 1232 1376 235 48 39 chr5 84879248 84879584 -67657675 - RMER19C LTR ERVK -2 609 271 5 1232 815 202 130 2 chr5 84880603 84880818 -67656441 - RMER19C LTR ERVK -332 279 1 5 1232 2865 84 16 3 chr5 84881941 84882321 -67654938 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 5 1232 823 309 38 105 chr5 84888082 84888473 -67648786 + MTE2a LTR MaLR 1 365 -14 5 1232 2714 109 0 20 chr5 84888622 84889016 -67648243 - MTB LTR MaLR -14 386 1 6 1232 303 371 71 81 chr5 84889515 84889823 -67647436 + MLT2B3 LTR ERVL 250 554 0 6 1232 6128 78 75 2 chr5 84892651 84893517 -67643742 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 6 1232 226 183 46 77 chr5 84897685 84897750 -67639509 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 6 1232 415 162 0 0 chr5 84903636 84903704 -67633555 + ORR1C2 LTR MaLR 1 68 -316 6 1232 2558 184 157 35 chr5 84908821 84909433 -67627826 - RMER6C LTR ERVK -4 686 1 6 1232 324 327 92 89 chr5 84909933 84910259 -67627000 + ORR1E LTR MaLR 1 327 -32 6 1232 359 91 0 0 chr5 84912293 84912348 -67624911 + ORR1A2 LTR MaLR 1 55 -272 6 1232 599 83 0 0 chr5 84912345 84912429 -67624830 + ORR1A2 LTR MaLR 244 327 0 6 1232 5371 207 115 33 chr5 84912429 84912775 -67624484 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 392 -1400 6 1232 5371 207 115 33 chr5 84912812 84912855 -67624404 + ORR1A2-int LTR MaLR 393 410 -1382 6 1232 5371 207 115 33 chr5 84913710 84914689 -67622570 + ORR1A2-int LTR MaLR 411 1483 -309 6 1232 1555 325 91 29 chr5 84916185 84917118 -67620141 - MER70-int LTR ERVL -2412 2611 1621 6 1232 376 268 55 84 chr5 84917426 84917699 -67619560 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 77 6 1232 340 333 14 69 chr5 84919066 84919211 -67618048 + MLT2B3 LTR ERVL 8 144 -410 6 1232 4493 111 12 87 chr5 84921932 84922744 -67614515 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 6 1233 1445 197 66 0 chr5 84939512 84939816 -67597443 - RLTR12A LTR ERVK -244 324 1 6 1233 361 169 0 0 chr5 84948429 84948494 -67588765 - ORR1B1 LTR MaLR -329 65 1 6 1233 678 304 39 30 chr5 84948896 84949174 -67588085 + MLT1E1A LTR MaLR 240 636 -44 7 1233 247 366 121 8 chr5 84955070 84955202 -67582057 - MER74A LTR ERVL -206 352 206 7 1233 766 258 120 84 chr5 84957678 84958037 -67579222 - RMER20B LTR ERVK -22 605 234 7 1233 338 294 41 25 chr5 84960955 84961077 -67576182 - MTEa LTR MaLR 0 379 256 7 1233 230 362 38 9 chr5 84961181 84961287 -67575972 - MLT2B3 LTR ERVL -445 109 1 7 1233 1035 247 183 8 chr5 84962536 84962891 -67574368 - MTD LTR MaLR 0 419 3 7 1233 1710 237 11 0 chr5 84963042 84963409 -67573850 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 3 7 1233 1344 163 39 90 chr5 84963461 84963643 -67573616 - RMER17C LTR ERVK 0 410 232 7 1233 1344 163 39 90 chr5 84963670 84963831 -67573428 - RMER17C LTR ERVK -179 231 86 7 1233 1344 163 39 90 chr5 84963930 84964017 -67573242 - RMER17C LTR ERVK -325 85 1 7 1233 1397 180 35 62 chr5 84968580 84968918 -67568341 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1233 1746 177 62 15 chr5 84968951 84969289 -67567970 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 7 1233 1287 279 45 30 chr5 84978787 84979190 -67558069 + MTC LTR MaLR 13 421 0 7 1233 439 260 132 0 chr5 84980837 84981022 -67556237 - ERVL-E-int LTR ERVL -2315 3399 3118 7 1233 1179 279 59 18 chr5 84988450 84988840 -67548419 - MTD LTR MaLR 0 419 14 7 1233 507 333 106 66 chr5 84989683 84989956 -67547303 + MTD LTR MaLR 106 389 -30 7 1233 548 176 49 0 chr5 84990930 84991032 -67546227 + RMER6B LTR ERVK 3 109 -352 7 1233 1371 182 92 4 chr5 84991035 84991307 -67545952 + RMER6B LTR ERVK 1 297 -164 7 1233 950 182 0 0 chr5 84991307 84991477 -67545782 + RLTR12A LTR ERVK 1 170 -398 7 1233 308 302 137 8 chr5 85000487 85000604 -67536655 - MLT1A0 LTR MaLR -224 141 10 4 1233 748 133 232 27 chr5 85003821 85004006 -67533253 + RMER17C LTR ERVK 188 410 0 1 1233 369 115 0 0 chr5 85007662 85007714 -67529545 + RMER6C LTR ERVK 4 55 -665 1 1233 398 145 193 0 chr5 85007714 85007797 -67529462 + RMER6-int LTR ERVK 573 671 -2506 1 1233 1118 177 23 23 chr5 85007793 85008013 -67529246 + RMER6-int LTR ERVK 1523 1742 -1435 1 1233 288 149 0 0 chr5 85008011 85008058 -67529201 + RMER6-int LTR ERVK 2470 2516 -661 1 1233 751 129 7 35 chr5 85008120 85008264 -67528995 + RMER6-int LTR ERVK 2579 2718 -459 1 1233 1224 176 107 27 chr5 85008996 85009258 -67528001 + RMER6-int LTR ERVK 2738 3020 -157 1 1233 1251 109 21 40 chr5 85012594 85012856 -67524403 - RLTR9D LTR ERVK 0 415 145 2 1233 1093 152 44 39 chr5 85012836 85013042 -67524217 + MTA_Mm LTR MaLR 190 396 0 2 1233 3878 129 24 9 chr5 85013042 85013677 -67523582 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 644 -454 2 1233 2705 163 126 15 chr5 85013840 85014362 -67522897 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 5 2 1233 2340 205 21 131 chr5 85014539 85015003 -67522256 + RMER6C LTR ERVK 1 376 -314 1 1233 2340 205 21 131 chr5 85015233 85015539 -67521720 + RMER6C LTR ERVK 377 690 0 1 1233 865 288 50 86 chr5 85020776 85021160 -67516099 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1233 1428 288 35 18 chr5 85023945 85024344 -67512915 + MTD LTR MaLR 6 411 -8 4 1233 1314 286 79 38 chr5 85038430 85038961 -67498298 - RLTR20B3 LTR ERVK -4 573 21 6 1233 2908 99 0 10 chr5 85049127 85049536 -67487723 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 7 1233 1954 199 40 154 chr5 85053638 85053799 -67483460 + RMER6C LTR ERVK 1 142 -548 7 1233 1954 199 40 154 chr5 85054505 85054647 -67482612 + RMER6C LTR ERVK 143 210 -480 7 1233 1954 199 40 154 chr5 85054697 85055171 -67482088 + RMER6C LTR ERVK 211 690 0 7 154 760 267 211 31 chr5 85065498 85065792 -67471467 - MTD LTR MaLR -58 361 3 9 1234 1985 179 15 16 chr5 85065788 85066244 -67471015 + RMER6C LTR ERVK 1 439 -281 1 1234 415 132 59 0 chr5 85074971 85075039 -67462220 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 72 -285 1 1234 1181 184 248 0 chr5 85078300 85078594 -67458665 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1234 459 346 82 64 chr5 85082404 85082858 -67454401 + MT2A LTR ERVL 1 462 -71 1 1234 3465 103 112 0 chr5 85083471 85083996 -67453263 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 1 1234 2446 23 134 0 chr5 85092231 85092536 -67444723 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1234 3078 76 0 2 chr5 85093008 85093403 -67443856 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 1 1234 337 286 60 35 chr5 85105910 85106026 -67431233 - RMER15 LTR ERVL -154 421 303 1 1234 1356 194 65 35 chr5 85110001 85110589 -67426670 + RMER6A LTR ERVK 109 754 -2 1 1234 863 340 26 29 chr5 85115261 85115612 -67421647 + MTE2a LTR MaLR 26 375 -4 1 1234 301 186 85 0 chr5 85124337 85124396 -67412863 + RMER6D LTR ERVK 1 64 -656 1 1234 1290 221 21 62 chr5 85126082 85126420 -67410839 + RMER6A LTR ERVK 433 756 0 1 1234 409 236 11 0 chr5 85139127 85139216 -67398043 + MTEb LTR MaLR 268 357 -22 2 1234 837 296 53 23 chr5 85139202 85139503 -67397756 - MTEa LTR MaLR -69 310 1 2 1234 1074 320 37 30 chr5 85156043 85156445 -67380814 - MTD LTR MaLR -1 418 14 2 1234 411 269 150 18 chr5 85166413 85166640 -67370619 - RMER20B LTR ERVK -217 410 154 2 1234 264 329 125 6 chr5 85180129 85180297 -67356962 + MLT-int LTR MaLR 377 564 -1171 2 1235 2295 33 62 7 chr5 85197588 85197897 -67339362 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 357 0 2 1235 2771 41 9 3 chr5 85205549 85205893 -67331366 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1235 1383 229 47 0 chr5 85222151 85222426 -67314833 + RLTR25B LTR ERVK 3 290 -738 3 1235 322 335 90 31 chr5 85222699 85222955 -67314304 + LTR40a LTR ERVL 25 295 -224 3 1235 478 245 0 0 chr5 85228490 85228592 -67308667 + ORR1B2 LTR MaLR 258 359 -8 3 1235 587 171 38 0 chr5 85234379 85234484 -67302775 + RMER6C LTR ERVK 3 111 -579 3 1235 274 152 0 21 chr5 85234469 85234516 -67302743 + MT2B LTR ERVL 182 227 -374 3 1235 1504 195 60 18 chr5 85234578 85234923 -67302336 + RMER6C LTR ERVK 326 690 0 3 1235 2056 243 65 45 chr5 85244590 85245189 -67292070 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1235 1682 239 11 8 chr5 85260393 85260752 -67276507 - ORR1B2 LTR MaLR -7 360 1 3 1235 475 268 142 161 chr5 85261610 85261983 -67275276 - MTE2a LTR MaLR 0 379 14 3 1235 492 78 89 16 chr5 85264486 85264576 -67272683 - RMER19B LTR ERVK -11 891 805 3 1235 635 209 60 0 chr5 85264578 85264736 -67272523 - RMER19B LTR ERVK -571 166 1 3 1235 294 337 102 19 chr5 85264992 85265198 -67272061 + MTE-int LTR MaLR 1345 1567 -13 3 1235 376 376 58 5 chr5 85267822 85268028 -67269231 - MTE2b LTR MaLR 0 379 163 3 1235 1101 181 106 6 chr5 85268865 85269185 -67268074 - MYSERV-int LTR ERVK -18 6532 6181 3 1235 357 304 134 110 chr5 85269274 85269729 -67267530 - RMER13A LTR ERVK -60 567 95 3 1235 867 306 90 56 chr5 85269828 85270240 -67267019 + RMER15 LTR ERVL 150 575 0 3 1235 895 273 116 18 chr5 85271633 85271969 -67265290 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 2 3 1235 595 266 41 82 chr5 85275517 85275832 -67261427 - RLTR15 LTR ERVK -57 302 1 3 1235 1519 175 30 62 chr5 85285642 85285978 -67251281 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 4 1235 7501 122 25 21 chr5 85291239 85291681 -67245578 - MERVK26-int LTR ERVK -3516 3403 2951 4 1235 7501 122 25 21 chr5 85291702 85292416 -67244843 - MERVK26-int LTR ERVK -3969 2950 2244 4 1235 13473 108 31 17 chr5 85292570 85294557 -67242702 - MERVK26-int LTR ERVK -4675 2244 230 4 1235 2112 137 23 11 chr5 85294553 85294907 -67242352 - MERVK26-int LTR ERVK -5804 1115 758 4 1235 731 245 85 35 chr5 85294907 85295214 -67242045 - RLTR26 LTR ERVK -606 300 1 4 1235 485 354 63 49 chr5 85297907 85298119 -67239140 - RLTR20D LTR ERVK -19 549 323 4 1235 485 354 63 49 chr5 85298179 85298316 -67238943 - RLTR20D LTR ERVK -246 322 196 4 1235 3140 43 5 25 chr5 85303061 85303462 -67233797 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 4 4 1235 795 340 38 9 chr5 85304612 85304930 -67232329 + MTE2b LTR MaLR 1 327 -52 4 1235 3769 160 22 28 chr5 85306351 85307092 -67230167 + RMER17A LTR ERVK 1 736 -15 4 1236 544 303 66 22 chr5 85328857 85329151 -67208108 - MTD LTR MaLR -69 350 12 4 1236 350 248 57 9 chr5 85329165 85329271 -67207988 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 1148 4 1236 1070 241 33 22 chr5 85330950 85331222 -67206037 - RMER19C LTR ERVK -336 275 1 4 1236 594 292 60 98 chr5 85331945 85332189 -67205070 + MTD LTR MaLR 9 258 -161 4 1236 594 292 60 98 chr5 85332218 85332288 -67204971 + MTD LTR MaLR 259 311 -108 4 1236 342 220 125 105 chr5 85332331 85332511 -67204748 + MTC LTR MaLR 235 414 -7 4 1236 290 57 0 0 chr5 85334641 85334676 -67202583 + MurERV4_19-int LTR ERVK 2958 2992 -2788 4 1236 931 184 0 135 chr5 85334801 85334923 -67202336 - MurERV4_19-int LTR ERVK -2817 2963 2856 4 1236 931 184 0 135 chr5 85335105 85335227 -67202032 - MurERV4_19-int LTR ERVK -2925 2855 2752 4 1236 2454 165 29 16 chr5 85335509 85335649 -67201610 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3021 2759 2609 4 1236 2454 165 29 16 chr5 85335687 85335995 -67201264 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3172 2608 2306 4 1236 1067 260 12 28 chr5 85335995 85336305 -67200954 - RMER19C LTR ERVK -240 371 1 4 1236 271 394 71 25 chr5 85348679 85348877 -67188382 - LTR16A LTR ERVL -221 230 24 5 1236 2063 201 208 21 chr5 85356999 85357513 -67179746 - RMER19C LTR ERVK 0 611 2 5 1236 272 231 15 23 chr5 85357828 85357854 -67179405 + ORR1B1-int LTR MaLR 623 647 -862 5 1236 1674 230 110 42 chr5 85383237 85383718 -67153541 + RLTR12B LTR ERVK 1 514 -14 5 1236 1799 212 53 23 chr5 85394708 85395143 -67142116 - RMER6C LTR ERVK 0 690 243 5 1236 316 307 19 19 chr5 85395707 85395810 -67141449 - RLTR11A LTR ERVK -231 297 195 5 1236 311 226 55 36 chr5 85397943 85398090 -67139169 + MLT1A0 LTR MaLR 218 393 -15 5 1236 4957 169 43 20 chr5 85401045 85401976 -67135283 - RMER17B LTR ERVK -6 952 1 5 1236 989 267 97 60 chr5 85410671 85411073 -67126186 + MTD LTR MaLR 3 419 0 5 1236 2911 66 32 7 chr5 85425552 85425963 -67111296 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 1236 251 348 42 42 chr5 85436393 85436545 -67100714 - RMER12 LTR ERVK -388 934 782 6 1236 251 348 42 42 chr5 85436570 85436606 -67100653 - RMER12 LTR ERVK -541 781 746 6 1236 232 307 69 49 chr5 85437749 85437893 -67099366 + MLT2B1 LTR ERVL 381 527 -40 6 1236 387 388 61 66 chr5 85438123 85438485 -67098774 + MLT2F LTR ERVL 237 596 -67 6 1237 2882 145 132 11 chr5 85459636 85460172 -67077087 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 1237 2670 206 19 83 chr5 85460417 85461149 -67076110 - RMER6C LTR ERVK 0 690 6 6 1237 528 177 46 8 chr5 85461154 85461285 -67075974 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 3042 6 1237 2930 77 9 5 chr5 85462677 85463096 -67074163 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 6 1237 538 300 60 24 chr5 85469486 85469817 -67067442 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 6 1237 522 311 98 37 chr5 85478250 85478547 -67058712 - ORR1E LTR MaLR -9 350 36 7 1237 2729 186 92 23 chr5 85482972 85483540 -67053719 + RMER19C LTR ERVK 5 611 0 7 1237 295 244 154 0 chr5 85487138 85487216 -67050043 + MTD LTR MaLR 228 317 -102 7 1237 306 359 5 47 chr5 85489385 85489578 -67047681 + MLT2B1 LTR ERVL 2 186 -334 7 1237 1194 162 5 5 chr5 85489816 85490014 -67047245 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 198 -704 7 1237 3267 146 97 28 chr5 85496268 85496938 -67040321 + RLTR13D6 LTR ERVK 187 902 0 7 1237 247 239 159 0 chr5 85502616 85502704 -67034555 + MLT1B LTR MaLR 1 102 -288 2 1237 3050 19 0 44 chr5 85502899 85503283 -67033976 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 3 1237 1014 86 159 0 chr5 85503283 85503446 -67033813 + IAPEz-int LTR ERVK 8 196 -6285 3 1237 54813 23 15 4 chr5 85503417 85509815 -67027444 + IAPEz-int LTR ERVK 67 6481 0 3 1237 3050 19 0 44 chr5 85509815 85510199 -67027060 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 3 1237 245 271 0 0 chr5 85511790 85511849 -67025410 - RLTR20A2 LTR ERVK -12 566 508 6 1237 1966 188 30 59 chr5 85511859 85512351 -67024908 + RMER6C LTR ERVK 213 690 0 7 1237 2805 48 0 0 chr5 85517118 85517449 -67019810 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 331 -1 1 1237 1364 221 89 33 chr5 85520083 85520420 -67016839 - ORR1C1 LTR MaLR -17 361 6 2 1237 438 351 36 0 chr5 85523815 85523983 -67013276 + MTEb LTR MaLR 192 365 -14 3 1237 253 264 70 57 chr5 85534350 85534507 -67002752 - RMER10A LTR ERVL -162 280 122 4 1237 2781 74 5 34 chr5 85543927 85544144 -66993115 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 188 5 1237 2781 74 5 34 chr5 85544579 85544769 -66992490 - MTA_Mm LTR MaLR -209 187 1 5 1237 514 240 78 45 chr5 85545059 85545229 -66992030 - MTB_Mm LTR MaLR -53 354 178 6 1237 514 271 84 443 chr5 85545656 85545695 -66991564 - MTB_Mm LTR MaLR -229 192 155 6 1237 604 257 55 9 chr5 85548309 85548524 -66988735 - MTC LTR MaLR -138 283 1 7 1237 2912 277 90 31 chr5 85548524 85549577 -66987682 - MTC-int LTR MaLR -7 1251 18 7 1237 252 210 65 0 chr5 85549606 85549668 -66987591 - ORR1E LTR MaLR -11 348 283 7 1237 272 368 34 0 chr5 85551635 85551752 -66985507 + MER70B LTR ERVL 61 181 -397 7 1237 1281 337 86 37 chr5 85557086 85557681 -66979578 + RMER15-int LTR ERVL 4147 4770 -229 9 1237 412 388 74 14 chr5 85558879 85559164 -66978095 + RMER15 LTR ERVL 274 575 0 9 1237 837 180 85 0 chr5 85583684 85583873 -66953386 - RMER6B LTR ERVK -256 205 1 1 1237 664 324 49 69 chr5 85584106 85584454 -66952805 + ORR1E LTR MaLR 19 359 0 1 1237 746 329 82 65 chr5 85584931 85585380 -66951879 + MT2A LTR ERVL 75 531 -2 1 1237 1897 88 261 3 chr5 85586953 85587271 -66949988 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1237 896 210 156 0 chr5 85588787 85589011 -66948248 - MT2B LTR ERVL -342 259 1 1 1237 2892 209 37 13 chr5 85589051 85589676 -66947583 - ORR1B1-int LTR MaLR -1323 640 1 1 1237 1863 199 11 20 chr5 85589678 85589921 -66947338 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 154 1 154 1863 198 29 24 chr5 85589945 85590065 -66947194 - ORR1B1 LTR MaLR -241 153 1 1 1238 1288 38 11 21 chr5 85602798 85602985 -66934274 - RLTR44C LTR ERVK -85 417 233 1 1238 433 317 72 44 chr5 85603055 85603306 -66933953 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 258 -269 1 1238 261 385 57 71 chr5 85603491 85603701 -66933558 + MTEa LTR MaLR 55 261 -118 1 1238 256 295 91 77 chr5 85603773 85603916 -66933343 - MLT1A1 LTR MaLR -239 169 25 1 1238 416 343 94 74 chr5 85604157 85604456 -66932803 - MLT1E2 LTR MaLR -11 616 312 1 1238 2839 93 5 2 chr5 85627148 85627545 -66909714 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 1 1238 6605 105 58 6 chr5 85627547 85628591 -66908668 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1238 2430 112 58 8 chr5 85628591 85628968 -66908291 + MTB LTR MaLR 1 396 0 1 1238 318 226 8 102 chr5 85631509 85631627 -66905632 + RLTR25B LTR ERVK 415 521 -507 1 1238 226 358 81 12 chr5 85636151 85636312 -66900947 + MLT1A0 LTR MaLR 23 194 -171 2 1238 1528 230 38 6 chr5 85636552 85636871 -66900388 - MTC LTR MaLR -2 419 91 2 1238 501 198 0 21 chr5 85638289 85638396 -66898863 - MTC LTR MaLR -297 110 6 2 1238 905 228 56 63 chr5 85650024 85650309 -66886950 - RLTR40 LTR ERVK -514 303 21 2 1238 870 84 107 0 chr5 85655855 85655986 -66881273 + MTB LTR MaLR 256 400 0 2 1238 529 81 0 0 chr5 85655986 85656060 -66881199 + MTB-int LTR MaLR 1 74 -1024 2 1238 2393 126 32 78 chr5 85656030 85656503 -66880756 + MTB-int LTR MaLR 648 1098 0 2 1238 2965 88 2 0 chr5 85656503 85656902 -66880357 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1238 389 351 44 68 chr5 85661468 85661764 -66875495 + ERVL-B4-int LTR ERVL 292 580 -5134 2 1238 362 268 129 14 chr5 85662532 85662672 -66874587 + MLT2B4 LTR ERVL 6 161 -395 2 1238 453 326 92 103 chr5 85674943 85675292 -66861967 + ORR1E LTR MaLR 4 348 -11 2 1238 358 211 26 13 chr5 85690385 85690462 -66846797 + MTC LTR MaLR 129 206 -215 2 1238 2953 96 7 2 chr5 85691598 85692017 -66845242 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 1238 1061 111 11 32 chr5 85705346 85705532 -66831727 - MTB_Mm LTR MaLR -229 192 1 3 1238 1139 254 56 17 chr5 85707974 85708330 -66828929 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1238 1247 209 4 8 chr5 85713149 85713386 -66823873 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 94 3 1238 257 294 53 21 chr5 85713619 85713713 -66823546 - RLTR25B LTR ERVK -488 540 444 3 1238 1127 209 7 77 chr5 85713656 85713930 -66823329 - MT2B LTR ERVL -346 255 1 3 1238 296 250 27 63 chr5 85713839 85713950 -66823309 - ORR1A4-int LTR MaLR -1259 704 598 3 1238 281 305 60 38 chr5 85716996 85717180 -66820079 - MER34 LTR ERV1 -39 503 316 3 1239 256 399 109 19 chr5 85721483 85721795 -66815464 + LTR16B1 LTR ERVL 120 459 -21 3 1239 341 279 9 9 chr5 85723012 85723117 -66814142 + MLT1A1 LTR MaLR 299 403 -5 3 1239 329 266 68 42 chr5 85726931 85727049 -66810210 + MT2B LTR ERVL 138 258 -343 3 1239 991 218 233 36 chr5 85730341 85730844 -66806415 + RMER20B LTR ERVK 1 602 -25 3 1239 303 189 63 13 chr5 85734432 85734524 -66802735 - MLT1A1 LTR MaLR -42 366 245 3 1239 277 346 0 0 chr5 85734867 85734948 -66802311 + LTR16A LTR ERVL 5 85 -366 3 1239 3314 145 24 125 chr5 85738378 85739196 -66798063 + RMER17A LTR ERVK 1 736 -15 3 1239 352 299 63 14 chr5 85749244 85749370 -66787889 - RMER4B LTR ERVK -4 581 343 3 1239 807 255 88 48 chr5 85749554 85749826 -66787433 - RMER4B LTR ERVK -286 299 17 3 1239 4914 271 32 32 chr5 85751097 85752570 -66784689 + MurERV4-int LTR ERVK 561 2033 -3227 3 1239 262 332 73 61 chr5 85752878 85753205 -66784054 - RMER5 LTR ERV1 -79 455 125 3 1239 347 365 32 23 chr5 85758449 85758665 -66778594 - MLT1D LTR MaLR -5 500 283 3 1239 2248 132 93 38 chr5 85769557 85769975 -66767284 + MT2C_Mm LTR ERVL 3 443 -32 4 1239 937 214 24 179 chr5 85777197 85777483 -66759776 - RMER19C LTR ERVK -332 279 45 4 1239 937 214 24 179 chr5 85777517 85777560 -66759699 - RMER19C LTR ERVK -567 44 2 4 1239 243 273 25 38 chr5 85793577 85793657 -66743602 + LTR52 LTR ERVL 11 89 -332 4 1239 852 272 131 3 chr5 85796821 85797127 -66740132 + RLTR18B LTR ERVK 168 512 0 4 1239 1739 178 25 0 chr5 85797708 85798029 -66739230 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1239 5430 200 29 93 chr5 85798029 85799360 -66737899 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 718 4 1239 1224 166 62 62 chr5 85799316 85799573 -66737686 - MT2B LTR ERVL -310 291 35 4 1239 3284 191 21 77 chr5 85799387 85800188 -66737071 - ORR1A4-int LTR MaLR -1157 806 50 4 1239 1718 156 63 0 chr5 85801080 85801382 -66735877 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 4 1239 1858 230 30 5 chr5 85803616 85803988 -66733271 + ORR1B1 LTR MaLR 6 386 -8 4 1239 2411 108 82 170 chr5 85810756 85811315 -66725944 + RLTR1B LTR ERV1 3 512 0 4 1239 398 229 45 119 chr5 85819518 85819652 -66717607 + MT2B LTR ERVL 155 278 -323 4 1239 258 308 190 24 chr5 85821672 85821925 -66715334 + RMER5 LTR ERV1 202 496 -38 4 1239 258 308 190 24 chr5 85823475 85823728 -66713531 + RMER5 LTR ERV1 202 496 -38 4 1239 1674 163 22 22 chr5 85830654 85830967 -66706292 + ORR1B2 LTR MaLR 55 367 0 4 1239 1387 84 133 2 chr5 85831098 85831328 -66705931 - LTRIS5 LTR ERV1 -14 489 224 4 1239 2713 89 44 3 chr5 85831955 85832339 -66704920 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1239 4348 113 14 55 chr5 85840754 85841537 -66695722 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 4 1239 753 268 77 130 chr5 85841833 85842224 -66695035 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 1240 2920 227 78 49 chr5 85854253 85855041 -66682218 + RLTR25B LTR ERVK 16 961 -142 5 1240 540 277 118 47 chr5 85855253 85855356 -66681903 + RLTR25B LTR ERVK 757 869 -159 5 1240 540 277 118 47 chr5 85855471 85855621 -66681638 + RLTR25B LTR ERVK 870 1027 -1 5 1240 262 337 39 19 chr5 85856263 85856366 -66680893 + MTD LTR MaLR 7 111 -308 5 1240 238 320 84 37 chr5 85856966 85857073 -66680186 + MTD LTR MaLR 85 196 -183 5 1240 636 293 54 15 chr5 85857785 85858008 -66679251 - MLT2B3 LTR ERVL -208 346 116 5 1240 2879 195 11 35 chr5 85858595 85859169 -66678090 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 1 5 1240 312 217 0 14 chr5 85859169 85859235 -66678024 - MLT2B3 LTR ERVL -478 76 12 5 1240 421 407 53 47 chr5 85860641 85860919 -66676340 + MLT1H1 LTR MaLR 2 284 -307 5 1240 1314 225 53 37 chr5 85870541 85870919 -66666340 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1240 1992 122 48 0 chr5 85875968 85876280 -66660979 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1240 496 320 64 24 chr5 85884202 85884532 -66652727 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 5 1240 1909 174 42 8 chr5 85885676 85886030 -66651229 + MTC LTR MaLR 1 366 -55 5 1240 784 269 39 76 chr5 85898025 85898515 -66638744 - RLTR11A2 LTR ERVK -65 388 1 5 1240 3040 12 0 0 chr5 85906120 85906457 -66630802 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 1240 53070 24 11 7 chr5 85906457 85912906 -66624353 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 5 1240 3040 12 0 0 chr5 85912906 85913243 -66624016 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 1240 1180 247 36 92 chr5 85914139 85914531 -66622728 - MTE2a LTR MaLR -9 370 1 5 1240 1179 311 141 35 chr5 85914537 85915317 -66621942 - MTE2a-int LTR MaLR -23 1347 342 5 1240 554 168 149 16 chr5 85915353 85915474 -66621785 - RMER6D LTR ERVK 0 720 584 5 1240 635 332 51 132 chr5 85915945 85916363 -66620896 + MLT1E2 LTR MaLR 70 449 -175 5 1240 405 300 22 51 chr5 85917919 85918056 -66619203 - RMER20B LTR ERVK -34 593 461 5 1240 568 317 131 19 chr5 85921619 85921886 -66615373 + RMER15 LTR ERVL 276 572 -3 6 1240 302 237 73 73 chr5 85922249 85922331 -66614928 - RMER15 LTR ERVL 0 575 494 6 1240 2285 104 91 18 chr5 85943024 85943407 -66593852 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 6 1240 3063 42 10 33 chr5 85943478 85943877 -66593382 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1240 15134 35 5 30 chr5 85943879 85945874 -66591385 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 6 1240 3000 52 10 33 chr5 85945884 85946283 -66590976 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1240 2468 205 40 83 chr5 85963360 85964079 -66573180 - RMER6C LTR ERVK -2 688 1 6 1240 680 279 78 37 chr5 85967601 85967895 -66569364 - MTEb LTR MaLR 0 379 74 6 1240 331 217 0 0 chr5 85977491 85977551 -66559708 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 6 1241 228 183 46 77 chr5 85993724 85993789 -66543470 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 6 1241 511 300 42 87 chr5 86017913 86018223 -66519036 + MLT1G LTR MaLR 22 275 -316 2 1241 502 272 121 27 chr5 86028550 86028810 -66508449 + MLT2B4 LTR ERVL 14 291 -229 4 1241 434 323 41 67 chr5 86028989 86029607 -66507652 + MLT1A-int LTR MaLR 22 769 -966 4 1241 246 360 105 33 chr5 86030170 86030380 -66506879 + MLT1A LTR MaLR 85 309 -65 4 1241 2968 29 0 0 chr5 86034825 86035171 -66502088 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1241 367 223 20 69 chr5 86035481 86035582 -66501677 + MTEa LTR MaLR 284 379 0 5 1241 1845 234 77 45 chr5 86044573 86045256 -66492003 + RMER13A LTR ERVK 1 748 -160 6 1241 241 317 83 45 chr5 86047107 86047239 -66490020 - MER89 LTR ERV1 -40 519 383 6 1241 2451 94 46 3 chr5 86054068 86054441 -66482818 - MTB LTR MaLR -2 398 10 7 1241 286 331 40 101 chr5 86068082 86068280 -66468979 - MLT1B LTR MaLR 0 390 205 9 1241 448 314 136 84 chr5 86073963 86074450 -66462809 - MLT2B1 LTR ERVL -8 512 1 1 1241 1900 167 31 3 chr5 86074580 86074905 -66462354 + ORR1A1 LTR MaLR 5 338 -8 1 1241 3895 196 30 41 chr5 86076724 86077582 -66459677 - RMER13B LTR ERVK -59 849 1 1 1241 499 346 61 51 chr5 86082889 86083358 -66453901 - LTR33C LTR ERVL -162 501 1 1 1241 459 343 90 33 chr5 86084199 86084779 -66452480 - MERVL-int LTR ERVL -782 4703 4178 1 1241 289 306 48 62 chr5 86084810 86085019 -66452240 - MERVL-int LTR ERVL -1729 3938 3733 1 1241 1311 235 186 46 chr5 86087604 86088082 -66449177 + RMER2 LTR ERV1 1 545 -22 1 1241 726 348 88 55 chr5 86096987 86097359 -66439900 - MER92B LTR ERV1 -47 589 208 1 1241 726 348 88 55 chr5 86098085 86098272 -66438987 - MER92B LTR ERV1 -429 207 12 1 1241 437 240 108 77 chr5 86098879 86098928 -66438331 - MER89 LTR ERV1 0 559 516 1 1241 437 240 108 77 chr5 86098948 86099092 -66438167 - MER89 LTR ERV1 -44 515 360 1 1241 1223 115 0 0 chr5 86099329 86099511 -66437748 + RMER4B LTR ERVK 1 182 -403 1 1241 984 164 0 0 chr5 86099510 86099662 -66437597 + RLTR25B LTR ERVK 77 228 -800 1 1241 524 161 125 67 chr5 86099647 86099767 -66437492 + RLTR25B LTR ERVK 638 764 -264 1 1241 923 227 98 58 chr5 86100314 86100590 -66436669 + RLTR25B LTR ERVK 742 1028 0 1 1241 918 164 200 9 chr5 86100590 86100804 -66436455 + RMER4B LTR ERVK 323 577 -8 1 1241 256 341 94 43 chr5 86101046 86101184 -66436075 - MER110A LTR ERV1 -169 299 155 1 1241 1127 311 98 42 chr5 86103071 86103866 -66433393 - MER54A LTR ERVL 0 901 4 1 1242 894 286 71 34 chr5 86115796 86116147 -66421112 + MTEb LTR MaLR 6 369 -10 1 1242 265 358 124 10 chr5 86119474 86119683 -66417576 - HERV16-int LTR ERVL -3415 1581 1349 1 1242 584 305 51 19 chr5 86124370 86124584 -66412675 - LTR53 LTR ERVL -109 410 190 1 1242 356 362 80 74 chr5 86127088 86127440 -66409819 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 1 1242 362 351 18 60 chr5 86127540 86127758 -66409501 - MLT1C LTR MaLR -3 464 256 1 1242 236 244 67 79 chr5 86131382 86131471 -66405788 - LTR84a LTR ERVL -81 676 589 1 1242 623 331 81 62 chr5 86131565 86131997 -66405262 - LTR84a LTR ERVL -312 445 6 1 1242 764 260 86 30 chr5 86150448 86150682 -66386577 + ORR1E LTR MaLR 4 250 -109 2 1242 523 326 119 10 chr5 86151309 86151619 -66385640 + MLT1A0 LTR MaLR 10 353 -12 2 1242 282 273 23 0 chr5 86154244 86154270 -66382989 + ORR1E-int LTR MaLR 620 648 -861 2 1242 404 337 100 64 chr5 86156323 86156713 -66380546 + RLTR11A2 LTR ERVK 99 502 -25 2 1242 639 333 61 45 chr5 86157431 86157695 -66379564 + MLT1A0 LTR MaLR 86 353 -12 2 1242 247 296 143 71 chr5 86159915 86160097 -66377162 - MLT1H LTR MaLR -258 291 97 2 1242 481 314 42 80 chr5 86160866 86161105 -66376154 - MLT1A LTR MaLR 0 374 145 2 1242 404 292 87 33 chr5 86162199 86162383 -66374876 - MLT1A LTR MaLR -4 370 177 2 1242 2870 94 10 0 chr5 86164047 86164450 -66372809 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1242 323 247 22 0 chr5 86165902 86165991 -66371268 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 91 -462 2 1242 989 100 33 16 chr5 86166114 86166284 -66370975 + RLTR9E LTR ERVK 1 169 -251 2 1242 1819 82 29 32 chr5 86167545 86167824 -66369435 + RLTR9E LTR ERVK 132 409 0 2 1242 255 191 0 0 chr5 86173789 86173836 -66363423 - MER4B-int LTR ERV1 -5567 1191 1145 2 1242 242 250 105 111 chr5 86175688 86175850 -66361409 + RMER15 LTR ERVL 1 161 -414 2 1242 285 349 25 84 chr5 86175868 86176071 -66361188 + RMER15 LTR ERVL 299 489 -86 2 1242 1386 296 66 11 chr5 86179162 86179616 -66357643 - RMER5 LTR ERV1 -3 531 53 2 1242 1171 268 131 13 chr5 86189812 86190187 -66347072 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1242 3206 179 93 12 chr5 86193584 86194250 -66343009 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 2 1242 287 307 75 65 chr5 86198085 86198339 -66338920 + MLT2B3 LTR ERVL 228 509 -45 2 1242 576 263 70 6 chr5 86201317 86201474 -66335785 + ORR1D2 LTR MaLR 1 167 -203 3 1242 880 201 251 28 chr5 86203913 86204164 -66333095 + ORR1C2 LTR MaLR 1 307 -77 3 1242 1620 244 87 37 chr5 86207201 86207395 -66329864 + RMER19C LTR ERVK 107 333 -278 3 1242 1620 244 87 37 chr5 86207441 86207727 -66329532 + RMER19C LTR ERVK 334 610 -1 3 1242 1180 131 16 76 chr5 86216160 86216409 -66320850 + RMER10B LTR ERVL 7 240 -158 3 1242 246 256 67 44 chr5 86218505 86218595 -66318664 - RLTR24 LTR ERV1 -409 120 29 3 1242 456 255 16 147 chr5 86219094 86219278 -66317981 + MTEa LTR MaLR 208 367 -12 3 1242 3422 302 122 43 chr5 86219310 86220741 -66316518 + MTEa-int LTR MaLR 11 1554 -26 3 1242 459 272 74 92 chr5 86220719 86221027 -66316232 + ORR1E LTR MaLR 42 371 -8 3 1242 1221 294 28 33 chr5 86225641 86226000 -66311259 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 3 1242 268 312 17 92 chr5 86226000 86226084 -66311175 - MER31B LTR ERV1 -348 118 44 3 1242 1143 136 97 113 chr5 86229643 86229891 -66307368 + ORR1A3 LTR MaLR 99 394 0 3 1242 374 323 142 92 chr5 86232917 86233414 -66303845 + MLT1F2 LTR MaLR 14 643 -37 3 1242 2544 189 136 23 chr5 86238052 86238566 -66298693 + RMER19C LTR ERVK 1 572 -39 3 1242 232 275 58 104 chr5 86239025 86239049 -66298210 + MT2A LTR ERVL 3 30 -503 3 1242 232 275 58 104 chr5 86239613 86239742 -66297517 + MT2A LTR ERVL 31 148 -385 3 1242 362 306 96 15 chr5 86239626 86239763 -66297496 + MTE2b LTR MaLR 32 213 -206 3 1242 576 163 10 0 chr5 86239845 86239943 -66297316 + MTE2b LTR MaLR 279 377 -2 3 1242 2367 69 92 0 chr5 86242439 86242756 -66294503 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1242 495 290 34 45 chr5 86244553 86244752 -66292507 - RLTR18 LTR ERVK -3 613 305 3 1242 396 312 83 93 chr5 86244903 86245076 -66292183 - RLTR18 LTR ERVK -208 304 132 3 155 527 299 82 33 chr5 86245226 86245409 -66291850 - RLTR18B LTR ERVK -311 201 10 3 1243 1864 178 32 11 chr5 86249604 86249951 -66287308 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 3 1243 374 295 85 24 chr5 86274134 86274346 -66262913 + ORR1E LTR MaLR 4 228 -131 4 1243 1978 183 259 14 chr5 86277408 86277935 -66259324 + RLTR25A LTR ERVK 446 1028 0 4 1243 1256 87 60 0 chr5 86277945 86278128 -66259131 + MTB LTR MaLR 1 194 -206 4 1243 1632 46 5 9 chr5 86279740 86279960 -66257299 + MTB LTR MaLR 182 400 0 4 1243 454 345 57 68 chr5 86280914 86281299 -66255960 - MLT2B4 LTR ERVL -175 381 1 4 1243 614 295 168 30 chr5 86283678 86283975 -66253284 + MLT2D LTR ERVL 1 338 -76 4 1243 775 311 84 26 chr5 86286273 86286370 -66250889 + MER90a LTR ERV1 70 167 -447 4 1243 3084 61 5 8 chr5 86286370 86286767 -66250492 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1243 775 311 84 26 chr5 86286767 86287049 -66250210 + MER90a LTR ERV1 168 470 -144 4 1243 333 280 20 0 chr5 86315731 86315831 -66221428 + MER110A LTR ERV1 74 175 -293 4 1243 891 278 100 24 chr5 86317746 86318037 -66219222 + MLT1A0 LTR MaLR 34 346 -19 4 1243 721 301 59 0 chr5 86326367 86326570 -66210689 + MTE2b LTR MaLR 113 327 -52 4 1243 359 335 64 35 chr5 86328608 86328781 -66208478 + MLT1B LTR MaLR 2 179 -211 4 1243 315 228 51 0 chr5 86328865 86328944 -66208315 + MLT1B LTR MaLR 308 390 0 4 1243 577 349 60 92 chr5 86329912 86330196 -66207063 - MLT1A LTR MaLR -94 280 6 4 1243 1930 201 94 12 chr5 86330621 86331048 -66206211 + RMER20A LTR ERVK 55 516 0 4 1243 305 250 37 12 chr5 86331790 86331871 -66205388 - MLT1C LTR MaLR 0 467 385 4 1243 2106 153 42 3 chr5 86332135 86332488 -66204771 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 4 1243 1239 132 98 7 chr5 86333175 86333431 -66203828 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 4 4 1243 260 387 51 78 chr5 86342477 86342771 -66194488 - ORR1E LTR MaLR -20 339 54 5 1243 247 297 27 0 chr5 86342995 86343069 -66194190 - MLT1J LTR MaLR -337 175 100 5 1243 380 290 53 15 chr5 86344674 86344807 -66192452 + MLT1A1 LTR MaLR 33 170 -238 5 1243 271 264 91 11 chr5 86345530 86345618 -66191641 + MLT1A1 LTR MaLR 241 335 -73 5 1243 238 241 0 0 chr5 86346833 86346891 -66190368 - MLT1D LTR MaLR -1 504 447 5 1243 372 311 178 34 chr5 86347027 86347296 -66189963 + MLT1A1 LTR MaLR 98 405 -3 5 1243 246 324 97 51 chr5 86351506 86351763 -66185496 - LTR90A LTR LTR -402 574 306 5 1243 285 337 52 10 chr5 86353557 86353653 -66183606 + MLT1I LTR MaLR 238 337 -74 5 1243 232 341 60 60 chr5 86358415 86358649 -66178610 - MLT1K LTR MaLR -30 565 332 5 1243 493 328 15 79 chr5 86360293 86360495 -66176764 + MLT2B2 LTR ERVL 364 552 -10 5 1243 1690 200 96 19 chr5 86361959 86362336 -66174923 - MTD LTR MaLR -13 406 1 5 1243 510 283 52 47 chr5 86367984 86368177 -66169082 + MLT1A0 LTR MaLR 1 194 -171 5 1243 585 293 83 0 chr5 86370601 86370756 -66166503 + MTE2b LTR MaLR 171 329 -50 5 1243 585 293 83 0 chr5 86370804 86370829 -66166430 + MTE2b LTR MaLR 330 364 -15 5 1243 401 382 33 9 chr5 86371428 86371642 -66165617 - MLT1B LTR MaLR -45 345 127 5 1243 1086 129 18 21 chr5 86371663 86371862 -66165397 - LTRIS3 LTR ERV1 0 587 339 5 1243 348 257 57 0 chr5 86372254 86372359 -66164900 - MLT1B LTR MaLR -275 115 5 5 1243 320 277 172 25 chr5 86376320 86376442 -66160817 - MER34A LTR ERV1 -431 140 1 5 1244 3470 23 2 0 chr5 86380040 86380435 -66156824 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1244 9136 34 4 1 chr5 86380435 86381530 -66155729 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1244 3470 23 2 0 chr5 86381530 86381925 -66155334 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1244 690 290 131 78 chr5 86383003 86383362 -66153897 - MLT2D LTR ERVL -34 380 3 5 1244 320 381 86 37 chr5 86389418 86389745 -66147514 - MLT1J2 LTR MaLR -104 344 2 6 1244 508 159 0 33 chr5 86390569 86390660 -66146599 + ORR1D1 LTR MaLR 1 88 -286 6 1244 509 236 72 7 chr5 86390731 86390888 -66146371 + ORR1D1 LTR MaLR 239 405 -14 6 1244 3111 43 0 6 chr5 86390890 86391238 -66146021 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 1244 3254 163 95 14 chr5 86391940 86392573 -66144686 + RLTR17 LTR ERVK 6 689 -3 6 1244 894 324 104 32 chr5 86394204 86394644 -66142615 - MLT2B1 LTR ERVL -48 472 1 6 1244 317 318 0 45 chr5 86396502 86396591 -66140668 - RMER20A LTR ERVK -24 492 408 6 1244 1532 204 99 19 chr5 86404077 86404451 -66132808 - MTD LTR MaLR -11 408 5 6 1244 3288 63 10 0 chr5 86406097 86406493 -66130766 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1244 808 255 89 74 chr5 86408487 86408918 -66128341 + RMER13A LTR ERVK 96 586 -41 6 1244 2355 170 127 2 chr5 86414730 86415196 -66122063 + RLTR24 LTR ERV1 6 529 0 6 1244 482 312 151 26 chr5 86417854 86418174 -66119085 - MLT1A0 LTR MaLR 0 374 3 6 1244 239 289 179 37 chr5 86424725 86424887 -66112372 - MLT1H LTR MaLR -81 468 284 6 1244 835 150 186 24 chr5 86426421 86426685 -66110574 - ORR1A4 LTR MaLR -8 338 1 6 1244 254 257 124 35 chr5 86426734 86426847 -66110412 - MLT1A1 LTR MaLR -282 126 4 6 1244 1581 236 37 39 chr5 86426933 86427290 -66109969 + MTD LTR MaLR 1 356 -63 6 1244 3972 35 28 13 chr5 86427290 86427758 -66109501 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 1244 1581 236 37 39 chr5 86427758 86427806 -66109453 + MTD LTR MaLR 357 405 -14 6 1244 229 312 26 0 chr5 86433282 86433359 -66103900 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1262 1340 -468 6 1244 901 158 116 6 chr5 86434256 86434428 -66102831 - MTC LTR MaLR -1 420 230 6 1244 297 325 120 49 chr5 86442610 86442788 -66094471 + MLT1E1A LTR MaLR 5 215 -412 6 1244 277 338 159 90 chr5 86442846 86442916 -66094343 + MLT1E1A LTR MaLR 216 273 -354 6 1244 299 329 158 36 chr5 86443199 86443528 -66093731 + MLT1E1A LTR MaLR 274 676 -4 6 1244 418 194 14 0 chr5 86445003 86445075 -66092184 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 488 6 1244 1531 134 113 50 chr5 86446400 86446737 -66090522 + ORR1C2 LTR MaLR 5 362 -22 6 1244 1393 201 80 53 chr5 86455184 86455558 -66081701 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1244 274 267 25 74 chr5 86462243 86462324 -66074935 + MLT1F1 LTR MaLR 155 231 -338 7 1244 751 267 160 38 chr5 86463804 86464092 -66073167 + MTE2a LTR MaLR 47 369 -10 7 1244 429 292 96 144 chr5 86465251 86465607 -66071652 + MLT1D LTR MaLR 69 434 -71 7 1244 429 292 96 144 chr5 86465784 86465863 -66071396 + MLT1D LTR MaLR 435 483 -22 7 1244 1412 247 42 67 chr5 86467897 86468217 -66069042 + MTD LTR MaLR 18 338 -81 7 1244 1412 247 42 67 chr5 86468356 86468439 -66068820 + MTD LTR MaLR 339 411 -8 7 1244 2371 232 148 153 chr5 86468443 86468841 -66068418 + MTD-int LTR MaLR 1 242 -1016 7 1244 2371 232 148 153 chr5 86469076 86469937 -66067322 + MTD-int LTR MaLR 243 1254 -4 7 1244 1265 223 179 9 chr5 86470002 86470342 -66066917 + MTD LTR MaLR 22 419 0 7 1244 2147 74 3 0 chr5 86470971 86471255 -66066004 + ORR1A2 LTR MaLR 1 285 -42 7 1244 234 329 142 14 chr5 86477164 86477312 -66059947 + MER68 LTR ERVL 172 338 -225 7 1244 1886 134 20 3 chr5 86493029 86493321 -66043938 + RLTR13D6 LTR ERVK 36 332 -570 7 1244 1471 144 98 23 chr5 86493318 86493623 -66043636 + RLTR13D6 LTR ERVK 442 769 -133 7 1244 342 254 245 40 chr5 86498031 86498327 -66038932 - MTEb LTR MaLR -4 366 13 7 1244 1173 115 0 77 chr5 86504092 86504299 -66032960 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1382 8 1244 768 142 17 0 chr5 86504295 86504415 -66032844 - RLTR21 LTR ERVK -1312 260 139 8 1245 3271 46 5 0 chr5 86510372 86510766 -66026493 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1245 1556 172 77 61 chr5 86511266 86511643 -66025616 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 2 1245 366 271 141 34 chr5 86528696 86528845 -66008414 - MLT1H LTR MaLR -2 547 383 5 1245 318 173 91 26 chr5 86533802 86533879 -66003380 + RLTR25B LTR ERVK 428 509 -519 6 1245 1403 183 84 38 chr5 86536074 86536430 -66000829 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 15 7 1245 272 256 46 77 chr5 86568048 86568243 -65969016 + RMER17A2 LTR ERVK 344 532 -374 1 1245 3132 56 0 10 chr5 86572008 86572408 -65964851 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1245 294 269 175 36 chr5 86584172 86584338 -65952921 + LTR40c LTR ERVL 125 313 -152 1 1245 634 308 126 61 chr5 86592389 86592731 -65944528 + MLT1F2 LTR MaLR 197 560 0 1 1245 302 272 62 0 chr5 86597182 86597263 -65939996 - ORR1E LTR MaLR -273 86 1 1 1245 983 276 154 30 chr5 86597273 86597739 -65939520 - MTE-int LTR MaLR -123 1457 934 1 1245 633 273 74 11 chr5 86597750 86597939 -65939320 - ERVL-int LTR ERVL -4275 1482 1282 1 1245 3190 46 13 0 chr5 86598323 86598714 -65938545 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1245 279 286 54 21 chr5 86598860 86598953 -65938306 - MTEa LTR MaLR 0 379 284 1 1245 265 310 74 97 chr5 86599004 86599179 -65938080 - MTEa LTR MaLR -194 180 10 1 1245 2838 72 5 3 chr5 86599757 86600146 -65937113 + MTB LTR MaLR 1 390 -10 1 1245 245 314 62 64 chr5 86604236 86604453 -65932806 + MLT1A LTR MaLR 1 266 -99 1 1245 1072 295 82 36 chr5 86607118 86607558 -65929701 + RMER5 LTR ERV1 70 529 -5 2 1245 1199 87 6 6 chr5 86608029 86608202 -65929057 + RLTR11A LTR ERVK 284 456 -72 2 1245 454 141 0 0 chr5 86608439 86608510 -65928749 + RLTR11A LTR ERVK 458 528 0 2 1245 1524 138 166 17 chr5 86609173 86609528 -65927731 - RMER17C LTR ERVK -2 408 1 2 1245 2316 162 7 19 chr5 86613533 86613943 -65923316 - MTB_Mm LTR MaLR -2 405 1 2 1245 643 319 104 70 chr5 86616155 86616624 -65920635 + MLT2B3 LTR ERVL 1 485 -69 2 1245 1193 214 58 102 chr5 86616624 86616967 -65920292 + RLTR18B LTR ERVK 1 328 -184 2 1245 1775 28 0 0 chr5 86616968 86617179 -65920080 - MT2_Mm LTR ERVL -282 211 1 2 1245 302 0 0 0 chr5 86617179 86617217 -65920042 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 1245 347 125 26 53 chr5 86617217 86617293 -65919966 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 2 1245 2906 28 0 0 chr5 86617293 86617650 -65919609 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 5015 2 1245 574 264 87 29 chr5 86617650 86617822 -65919437 + RLTR18B LTR ERVK 331 512 0 2 1245 1178 248 99 14 chr5 86619393 86619737 -65917522 + ORR1C2 LTR MaLR 1 373 -11 2 1245 1454 234 60 13 chr5 86627972 86628208 -65909051 - RMER5 LTR ERV1 -127 407 165 2 1245 1454 234 60 13 chr5 86628303 86628452 -65908807 - RMER5 LTR ERV1 -370 164 5 2 1245 267 368 0 0 chr5 86629581 86629695 -65907564 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -2012 5589 5476 2 1245 2381 44 6 284 chr5 86635518 86636056 -65901203 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 2 1245 1594 306 39 51 chr5 86636743 86638014 -65899245 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2375 5231 3547 2 1245 450 321 55 44 chr5 86638025 86638499 -65898760 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5146 2460 2014 2 155 591 318 66 30 chr5 86638513 86638983 -65898276 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5715 2063 1577 2 1246 2861 42 0 0 chr5 86641254 86641586 -65895673 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 2 1246 55349 61 9 6 chr5 86641586 86648966 -65888293 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 7376 -304 2 1246 6175 75 8 18 chr5 86648966 86649852 -65887407 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 1 2 1246 1990 47 8 0 chr5 86649852 86650106 -65887153 + IAPEY3-int LTR ERVK 7425 7680 0 2 1246 2676 44 34 0 chr5 86650106 86650427 -65886832 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 2 1246 2650 153 128 13 chr5 86653571 86654094 -65883165 - RMER4B LTR ERVK -2 583 1 2 1246 464 252 0 83 chr5 86654568 86654689 -65882570 + RMER5 LTR ERV1 222 332 -202 2 1246 820 297 95 42 chr5 86655547 86655948 -65881311 + RMER5 LTR ERV1 113 534 0 2 1246 241 313 140 10 chr5 86678924 86679024 -65858235 + MLT1A0 LTR MaLR 174 286 -79 3 1246 523 301 116 44 chr5 86680953 86681273 -65855986 - MLT1C LTR MaLR -54 413 71 3 1246 1017 182 68 0 chr5 86681486 86681678 -65855581 + RLTR18B LTR ERVK 1 205 -307 3 1246 1351 272 31 44 chr5 86681683 86682067 -65855192 + RLTR18B LTR ERVK 123 501 -11 3 1246 1522 241 46 29 chr5 86682689 86683039 -65854220 + MTD LTR MaLR 51 406 -13 3 1246 777 311 14 93 chr5 86692105 86692459 -65844800 + MTE2a LTR MaLR 34 359 -20 3 1246 314 360 7 41 chr5 86704102 86704247 -65833012 + MLT1J LTR MaLR 233 372 -140 3 1246 301 350 92 63 chr5 86707264 86707535 -65829724 - LTR78 LTR ERV1 -906 398 120 3 1246 695 332 92 11 chr5 86714930 86715289 -65821970 - MLT1B LTR MaLR -2 388 1 3 1246 2729 119 53 2 chr5 86722845 86723257 -65814002 + RLTR10C LTR ERVK 1 433 -3 3 1246 1802 183 96 73 chr5 86737403 86737893 -65799366 + RLTR28 LTR ERVL 1 501 -23 4 1246 2436 133 38 40 chr5 86747297 86747773 -65789486 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 1246 723 90 0 9 chr5 86754265 86754377 -65782882 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 187 297 -287 4 1246 2121 199 24 3 chr5 86761353 86761736 -65775523 + MTC LTR MaLR 1 391 -30 4 1246 563 343 54 30 chr5 86763804 86764099 -65773160 + MER74A LTR ERVL 1 302 -256 4 1247 362 233 112 58 chr5 86774726 86774896 -65762363 + MLT1A0 LTR MaLR 184 376 -14 4 1247 912 264 90 68 chr5 86806604 86806970 -65730289 + MTEa LTR MaLR 2 375 -4 4 1247 3048 308 45 48 chr5 86806970 86807487 -65729772 + MTEa-int LTR MaLR 19 685 -895 4 1247 3048 300 42 51 chr5 86807973 86808007 -65729252 + MTEa-int LTR MaLR 686 691 -889 4 1247 3048 300 42 51 chr5 86808092 86808826 -65728433 + MTEa-int LTR MaLR 692 1448 -132 4 1247 1318 216 34 14 chr5 86814091 86814387 -65722872 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 58 5 1247 265 192 0 55 chr5 86815074 86815129 -65722130 - RLTR15 LTR ERVK -297 62 11 5 1247 1087 241 36 72 chr5 86817924 86818259 -65719000 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 41 5 1247 281 358 0 16 chr5 86819252 86819374 -65717885 + MTE-int LTR MaLR 1454 1573 -7 5 1247 233 243 28 28 chr5 86823329 86823401 -65713858 - MLT1E1A LTR MaLR -497 183 112 5 1247 389 309 167 65 chr5 86824181 86824227 -65713032 - MLT2B4 LTR ERVL 0 414 357 5 1247 389 309 167 65 chr5 86824384 86824582 -65712677 - MLT2B4 LTR ERVL -58 356 145 5 1247 515 312 97 74 chr5 86824611 86824961 -65712298 + MLT1A LTR MaLR 17 374 0 5 1247 409 273 27 54 chr5 86824961 86825072 -65712187 - MLT2B4 LTR ERVL -449 107 1 5 1247 1425 70 0 0 chr5 86828379 86828565 -65708694 - MTB LTR MaLR -214 186 1 5 1247 2191 108 82 11 chr5 86836188 86836564 -65700695 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 5 1247 1047 198 36 44 chr5 86841668 86841943 -65695316 + BGLII_B LTR ERVK 1 273 -168 5 1247 315 287 0 11 chr5 86844901 86844989 -65692270 + MLT1E1 LTR MaLR 169 255 -399 5 1247 764 211 0 100 chr5 86845161 86845236 -65692023 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 460 5 1247 764 211 0 100 chr5 86845265 86845389 -65691870 - RLTR11A LTR ERVK -69 459 349 5 1247 894 151 216 0 chr5 86845388 86845573 -65691686 - RLTR11A LTR ERVK -303 225 1 5 1247 4937 184 20 37 chr5 86845623 86846441 -65690818 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -83 2243 1446 5 1247 4937 184 20 37 chr5 86846530 86846883 -65690376 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -881 1445 1091 5 1247 304 301 103 103 chr5 86848705 86848938 -65688321 + MLT1E1 LTR MaLR 359 591 -4 5 1247 1449 230 50 11 chr5 86853542 86853705 -65683554 + ORR1D1 LTR MaLR 1 163 -211 5 1247 1449 230 50 11 chr5 86853767 86853963 -65683296 + ORR1D1 LTR MaLR 164 373 -1 5 1247 387 309 31 93 chr5 86869566 86869791 -65667468 - MTEa LTR MaLR -2 377 167 5 1247 253 364 65 18 chr5 86869673 86869841 -65667418 + ORR1E LTR MaLR 79 254 -105 6 1247 426 298 110 37 chr5 86869826 86870098 -65667161 + ORR1E LTR MaLR 56 347 -12 6 1247 597 285 18 18 chr5 86870128 86870296 -65666963 + MLT1A0 LTR MaLR 198 365 0 6 1247 265 324 66 9 chr5 86888836 86888942 -65648317 - MLT1E3 LTR MaLR -143 537 426 6 1247 469 305 45 28 chr5 86888983 86889162 -65648097 - MLT1E3 LTR MaLR -442 182 1 6 1247 2197 184 30 15 chr5 86889906 86890313 -65646946 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 1247 796 163 20 0 chr5 86890313 86890466 -65646793 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1103 6 1247 4959 206 32 4 chr5 86891048 86892014 -65645245 - MTC-int LTR MaLR -265 993 1 6 1247 1152 196 12 3 chr5 86892014 86892347 -65644912 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1248 950 279 71 34 chr5 86903408 86903705 -65633554 + MTE2a LTR MaLR 4 311 -68 6 1248 768 302 64 18 chr5 86903897 86904111 -65633148 + MTE2b-int LTR MaLR 133 351 -1229 6 1248 768 302 64 18 chr5 86904174 86904239 -65633020 + MTE2b-int LTR MaLR 352 424 -1156 6 1248 496 291 59 26 chr5 86904218 86904370 -65632889 + MTE2b-int LTR MaLR 539 695 -885 6 1248 1687 189 121 14 chr5 86904700 86905071 -65632188 - MTD LTR MaLR -8 411 1 6 1248 1570 291 131 34 chr5 86905821 86906081 -65631178 + MTE2b-int LTR MaLR 718 1133 -447 6 1248 2449 140 55 2 chr5 86906081 86906481 -65630778 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1248 1570 285 132 22 chr5 86906481 86906861 -65630398 + MTE2b-int LTR MaLR 1134 1569 -11 6 1248 670 308 116 17 chr5 86906872 86907216 -65630043 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 6 1248 553 299 61 81 chr5 86908242 86908602 -65628657 + ORR1E LTR MaLR 5 357 -2 6 1248 1400 282 57 16 chr5 86912524 86912964 -65624295 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 73 6 1248 1582 257 75 52 chr5 86922118 86922719 -65614540 - RLTR22_Mur LTR ERVK -596 808 1 6 1248 6205 115 50 8 chr5 86931189 86932108 -65605151 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 6 1248 240 273 84 74 chr5 86940067 86940162 -65597097 + MT2B LTR ERVL 155 250 -351 6 1248 1474 185 99 20 chr5 86948523 86948672 -65588587 + ORR1D1 LTR MaLR 5 180 -194 7 1248 1474 185 99 20 chr5 86948731 86948924 -65588335 + ORR1D1 LTR MaLR 181 374 0 7 1248 381 256 121 24 chr5 86965075 86965199 -65572060 - LTR48 LTR ERV1 -641 146 11 7 1248 428 259 81 7 chr5 86967352 86967488 -65569771 + MLT1J1 LTR MaLR 1 146 -298 7 1248 274 270 33 22 chr5 86973026 86973117 -65564142 + MLT1C LTR MaLR 373 464 -3 7 1248 7928 34 5 32 chr5 86976004 86977009 -65560250 + RLTR13A3 LTR ERVK 1 978 0 7 1248 307 271 199 0 chr5 86983965 86984116 -65553143 - MLT1D LTR MaLR -51 454 274 7 1248 445 298 121 11 chr5 86984143 86984333 -65552926 - MLT1D LTR MaLR -292 213 3 7 1248 1694 125 46 126 chr5 86987831 86988045 -65549214 + ORR1A4 LTR MaLR 1 179 -150 7 1248 1694 125 46 126 chr5 86988072 86988206 -65549053 + ORR1A4 LTR MaLR 180 321 -8 7 1248 264 348 75 87 chr5 86990965 86991286 -65545973 + ORR1D1 LTR MaLR 45 361 -13 7 1248 285 77 0 0 chr5 86998407 86998446 -65538813 + MTB_Mm LTR MaLR 1 39 -368 7 1248 2456 109 139 19 chr5 86998446 86998876 -65538383 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 7 1248 3471 108 42 11 chr5 86998876 86999398 -65537861 + RLTR45-int LTR ERVK 1 538 -6706 7 1248 2831 63 0 47 chr5 86999615 87000000 -65537259 + RLTR45-int LTR ERVK 1176 1542 -5702 7 1248 774 75 0 0 chr5 87000000 87000106 -65537153 + RLTR45-int LTR ERVK 1543 1648 -5596 1 1248 7269 143 11 13 chr5 87000195 87001602 -65535657 + RLTR45-int LTR ERVK 6331 7761 -456 1 1248 2530 123 22 123 chr5 87001602 87002138 -65535121 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1248 2718 55 8 21 chr5 87002138 87002510 -65534749 + MTB LTR MaLR 34 400 0 2 1248 2764 81 2 20 chr5 87004943 87005347 -65531912 + MMVL30-int LTR ERV1 25 421 -7135 8 1248 371 274 40 40 chr5 87005336 87005488 -65531771 + MMVL30-int LTR ERV1 382 533 -7023 8 1248 4422 98 25 12 chr5 87005835 87006141 -65531118 + MMVL30-int LTR ERV1 772 1071 -2627 8 1248 4422 98 25 12 chr5 87006286 87006652 -65530607 + MMVL30-int LTR ERV1 1072 1452 -2246 8 1248 431 168 10 10 chr5 87006737 87006839 -65530420 + MMVL30-int LTR ERV1 1029 1130 -2169 1 1248 377 70 0 0 chr5 87006832 87006889 -65530370 + MMVL30-int LTR ERV1 1455 1511 -2187 1 1248 15287 76 26 7 chr5 87007214 87009372 -65527887 + MMVL30-int LTR ERV1 1501 3698 0 1 1248 2892 121 110 36 chr5 87009372 87009911 -65527348 + RLTR1D LTR ERV1 1 589 -16 1 1248 2685 180 60 51 chr5 87010320 87011226 -65526033 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 855 0 1 1249 1752 228 78 3 chr5 87041351 87041738 -65495521 + MTD LTR MaLR 4 419 0 4 1249 259 293 12 47 chr5 87055784 87055870 -65481389 + MTEb LTR MaLR 280 362 -17 6 1249 459 394 127 44 chr5 87064487 87065119 -65472140 - LTR81B LTR ERV1? -402 991 308 7 1249 1841 212 8 13 chr5 87069454 87069827 -65467432 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 12 8 1249 399 191 0 125 chr5 87075121 87075241 -65462018 - MT2B LTR ERVL -337 264 160 9 1249 491 287 56 108 chr5 87083237 87083432 -65453827 - MTE2a LTR MaLR -128 251 67 1 1249 1730 178 26 6 chr5 87097165 87097476 -65439783 + ORR1A1 LTR MaLR 1 317 -29 1 1249 330 146 0 0 chr5 87098235 87098290 -65438969 + ORR1A1 LTR MaLR 272 326 0 1 1249 514 188 32 47 chr5 87101778 87101968 -65435291 + RMER17C LTR ERVK 89 275 -135 1 1249 289 340 10 31 chr5 87108572 87108669 -65428590 + LTR33B LTR ERVL 32 126 -377 1 1249 2009 111 45 79 chr5 87121241 87121647 -65415612 - RLTR9F LTR ERVK -45 370 1 1 1249 3024 17 0 6 chr5 87141417 87141765 -65395494 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1249 250 333 32 97 chr5 87151029 87151215 -65386044 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 184 2 1249 252 298 47 19 chr5 87152066 87152172 -65385087 + MLT1A LTR MaLR 65 173 -201 2 1249 1915 164 128 13 chr5 87162373 87162749 -65374510 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 2 1250 2042 154 71 22 chr5 87166517 87166883 -65370376 + ORR1B1 LTR MaLR 3 386 -8 2 1250 253 390 68 19 chr5 87167032 87167194 -65370065 + MLT1J LTR MaLR 254 423 -89 2 1250 1429 143 12 20 chr5 87182296 87182545 -65354714 + MTC LTR MaLR 170 416 -5 2 1250 3459 138 7 166 chr5 87183601 87184433 -65352826 - RMER12 LTR ERVK -622 700 1 2 1250 1624 238 62 0 chr5 87185695 87186036 -65351223 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 7 2 1250 4620 170 83 25 chr5 87190291 87190464 -65346795 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 824 2 1250 4620 170 83 25 chr5 87190545 87191319 -65345940 - RLTR25B LTR ERVK -205 823 27 2 1250 2009 116 31 50 chr5 87191716 87192134 -65345125 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 1250 260 265 123 82 chr5 87192907 87193200 -65344059 - RLTR11A LTR ERVK -73 495 176 2 1250 228 281 217 23 chr5 87193215 87193390 -65343869 - RLTR12B LTR ERVK -257 271 63 2 1250 296 330 0 0 chr5 87201045 87201136 -65336123 - RMER15 LTR ERVL -105 470 380 3 1250 1187 267 127 88 chr5 87201489 87202002 -65335257 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 1 3 1250 459 277 196 64 chr5 87204868 87205134 -65332125 + ORR1D2 LTR MaLR 1 301 -69 3 1250 887 289 100 26 chr5 87206822 87207173 -65330086 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 3 1250 1756 172 61 20 chr5 87211556 87211948 -65325311 - RMER10A LTR ERVL -30 412 5 3 1250 774 153 116 40 chr5 87212486 87212684 -65324575 - RMER10B LTR ERVL 0 398 186 3 1250 1231 169 66 31 chr5 87212719 87212975 -65324284 - RMER10B LTR ERVL -133 265 1 3 1250 1461 183 122 85 chr5 87216676 87217074 -65320185 + RMER10A LTR ERVL 1 418 -24 3 1250 1461 183 122 85 chr5 87217239 87217265 -65319994 + RMER10A LTR ERVL 419 441 -1 3 1250 304 250 40 0 chr5 87218438 87218514 -65318745 - RLTR23 LTR ERV1 -3 427 349 3 1250 2002 126 117 70 chr5 87220350 87220804 -65316455 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1250 255 114 0 141 chr5 87221332 87221424 -65315835 - RMER4B LTR ERVK -9 576 498 3 1250 381 178 27 0 chr5 87221407 87221480 -65315779 + MTC LTR MaLR 285 359 -8 3 1250 5646 168 86 25 chr5 87221484 87222669 -65314590 + MTC-int LTR MaLR 1 1258 0 3 1250 2057 186 53 8 chr5 87222669 87223064 -65314195 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 1250 312 245 24 113 chr5 87223279 87223403 -65313856 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 3 1250 342 103 0 17 chr5 87223967 87224026 -65313233 - ORR1B1 LTR MaLR -336 58 1 3 1250 2626 94 152 0 chr5 87224100 87224559 -65312700 - RLTR47_MM LTR ERV1 -3 529 1 3 1250 1132 202 117 4 chr5 87224569 87224817 -65312442 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 97 3 1250 430 218 0 33 chr5 87224862 87224952 -65312307 + ORR1D1 LTR MaLR 1 87 -287 3 1250 2930 154 199 14 chr5 87225656 87226288 -65310971 + RMER6A LTR ERVK 1 749 -7 3 1250 670 298 40 34 chr5 87226630 87226807 -65310452 - MTEa LTR MaLR -201 178 1 3 1250 292 289 47 85 chr5 87227784 87227890 -65309369 - MT2B LTR ERVL -361 240 139 3 1250 1903 54 254 0 chr5 87228261 87228537 -65308722 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1250 377 285 106 37 chr5 87228697 87228970 -65308289 - MTEb LTR MaLR -13 366 75 3 1250 2373 137 175 22 chr5 87228970 87229462 -65307797 - RMER15 LTR ERVL 0 575 9 3 1250 2711 158 70 4 chr5 87230126 87230608 -65306651 + RLTR28 LTR ERVL 1 514 -10 3 1250 404 208 41 124 chr5 87235591 87235712 -65301547 + MT2B LTR ERVL 148 258 -343 3 1250 3027 57 34 3 chr5 87239902 87240286 -65296973 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1250 1075 271 61 17 chr5 87269309 87269606 -65267653 - ORR1D2 LTR MaLR -60 310 1 4 1250 2866 157 169 38 chr5 87280106 87280762 -65256497 - RMER12 LTR ERVK -107 1215 474 4 1250 1672 148 134 18 chr5 87280762 87281105 -65256154 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 4 1250 11853 137 87 77 chr5 87281497 87282457 -65254802 + ETnERV2-int LTR ERVK 1066 1995 -5411 4 1250 11853 137 87 77 chr5 87282600 87283592 -65253667 + ETnERV2-int LTR ERVK 1996 3026 -4380 4 1250 11853 137 87 77 chr5 87283786 87284661 -65252598 + ETnERV2-int LTR ERVK 3027 3921 -3485 4 1250 2077 134 47 26 chr5 87284814 87285122 -65252137 + RMER16-int LTR ERVK 2991 3311 -2095 4 1250 2077 134 47 26 chr5 87285156 87285229 -65252030 + RMER16-int LTR ERVK 3312 3380 -2026 4 1250 328 136 0 17 chr5 87285424 87285484 -65251775 + RMER16-int LTR ERVK 3370 3428 -1978 4 1250 1605 275 73 33 chr5 87285490 87286062 -65251197 + RLTR1 LTR ERV1 30 624 0 4 1250 3012 164 99 33 chr5 87286063 87286768 -65250491 + RMER16-int LTR ERVK 3425 4176 -1230 4 1250 271 222 24 36 chr5 87286779 87286863 -65250396 + ETnERV2-int LTR ERVK 6119 6201 -1205 4 1250 469 219 107 33 chr5 87286877 87287125 -65250134 + ETnERV2-int LTR ERVK 6223 6425 -981 4 1250 281 208 28 0 chr5 87287336 87287408 -65249851 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7404 -2 4 1250 2179 173 3 20 chr5 87287409 87287799 -65249460 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 4 1250 2213 148 79 12 chr5 87287799 87288203 -65249056 - RMER12 LTR ERVK -843 479 49 4 1250 571 154 5 0 chr5 87288584 87288683 -65248576 + ORR1C2 LTR MaLR 3 105 -273 4 1250 2254 65 39 3 chr5 87291124 87291437 -65245822 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 310 -17 4 1251 3384 33 8 0 chr5 87294183 87294576 -65242683 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1251 2048 177 86 166 chr5 87322874 87323167 -65214092 + RMER6C LTR ERVK 9 328 -362 4 1251 2048 177 86 166 chr5 87323258 87323701 -65213558 + RMER6C LTR ERVK 329 686 -4 4 1251 2728 175 45 24 chr5 87325284 87325833 -65211426 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 4 1251 4501 155 30 19 chr5 87328952 87329798 -65207461 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 5 1251 307 310 84 15 chr5 87330535 87330666 -65206593 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 240 5 1251 1259 271 64 14 chr5 87331238 87331582 -65205677 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 9 5 1251 2464 175 65 4 chr5 87337919 87338412 -65198847 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 523 -4 5 1251 311 296 55 70 chr5 87345355 87345555 -65191704 - MTC LTR MaLR -218 203 7 5 1251 2483 163 81 32 chr5 87360221 87360728 -65176531 + RMER16 LTR ERVK 2 533 0 5 1251 964 306 141 0 chr5 87363321 87363684 -65173575 - MTD LTR MaLR 0 419 6 5 1251 465 242 51 25 chr5 87363716 87363873 -65173386 + RMER15 LTR ERVL 337 497 -78 5 1251 261 341 61 39 chr5 87364153 87364219 -65173040 + RMER15-int LTR ERVL 479 552 -4447 5 1251 261 341 61 39 chr5 87364262 87364375 -65172884 + RMER15-int LTR ERVL 553 662 -4337 5 1251 1416 192 7 41 chr5 87364665 87364958 -65172301 + ORR1C1 LTR MaLR 1 283 -95 5 1251 344 292 19 49 chr5 87365077 87365239 -65172020 + RLTR6-int LTR ERV1 1222 1378 -6178 5 1251 1020 319 92 76 chr5 87365300 87366059 -65171200 + RLTR6-int LTR ERV1 1556 2326 -5452 5 1251 316 345 33 57 chr5 87366954 87367320 -65169939 + MuRRS4-int LTR ERV1 4663 5019 -44 5 1251 2150 113 136 0 chr5 87367323 87367712 -65169547 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 442 -90 5 1251 661 149 19 0 chr5 87374427 87374534 -65162725 + ORR1C2 LTR MaLR 276 384 0 5 1251 1061 146 5 31 chr5 87374534 87374719 -65162540 + RMER15 LTR ERVL 285 464 -111 5 1251 2064 109 7 13 chr5 87379253 87379667 -65157592 - RLTR13D2 LTR ERVK -185 838 521 5 1251 5292 173 1 9 chr5 87379681 87380615 -65156644 - ETnERV3-int LTR ERVK -30 5778 4852 5 1251 611 245 145 21 chr5 87388503 87388745 -65148514 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 140 5 1251 5170 77 28 48 chr5 87391652 87392239 -65145020 + RLTR22_Mus LTR ERVK 30 618 -1190 5 1251 5170 77 28 48 chr5 87392588 87392814 -65144445 + RLTR22_Mus LTR ERVK 619 827 -981 5 1251 283 328 17 26 chr5 87393086 87393202 -65144057 + RMER12 LTR ERVK 1090 1204 -118 5 1251 2133 170 12 32 chr5 87394682 87395084 -65142175 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1251 2034 184 40 12 chr5 87402974 87403376 -65133883 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 1251 1551 222 35 24 chr5 87403542 87403916 -65133343 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1251 365 279 58 14 chr5 87404630 87404768 -65132491 - RMER15 LTR ERVL -76 499 356 6 1251 1132 267 116 16 chr5 87404813 87405194 -65132065 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1251 2301 91 29 3 chr5 87406859 87407201 -65130058 - BGLII LTR ERVK 0 421 71 6 1251 3527 87 4 4 chr5 87414741 87415228 -65122031 + RLTR1C LTR ERV1 1 487 -16 6 1251 5743 137 34 29 chr5 87416740 87417757 -65119502 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1023 0 6 1251 1266 280 81 59 chr5 87421250 87421892 -65115367 - RLTR40 LTR ERVK -83 734 79 6 1251 241 215 31 0 chr5 87423162 87423227 -65114032 - RLTR40 LTR ERVK -732 85 19 6 1252 270 242 16 0 chr5 87427611 87427673 -65109586 - RMER6B LTR ERVK 0 461 399 6 1252 1273 168 30 4 chr5 87427679 87427912 -65109347 - RMER6B LTR ERVK -219 242 4 6 1252 280 351 53 0 chr5 87428401 87428495 -65108764 + MTEa LTR MaLR 3 101 -278 6 1252 1571 213 28 9 chr5 87428913 87429235 -65108024 + ORR1B1 LTR MaLR 41 368 -26 6 1252 305 195 21 26 chr5 87443117 87443204 -65094055 + ORR1B1 LTR MaLR 1 89 -285 6 1252 465 302 24 24 chr5 87444337 87444503 -65092756 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 477 6 1252 1606 186 62 21 chr5 87456753 87457093 -65080166 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 46 6 1252 2845 12 0 0 chr5 87465834 87466156 -65071103 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1252 40945 27 4 6 chr5 87466156 87471012 -65066247 + MMETn-int LTR ERVK 1 4844 0 6 1252 2831 16 0 0 chr5 87471012 87471334 -65065925 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1252 2914 176 31 7 chr5 87479406 87479422 -65057837 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 538 7 1252 2914 176 31 7 chr5 87479469 87479991 -65057268 - RLTR31_Mur LTR ERVK -16 537 3 7 1252 2957 210 17 48 chr5 87480012 87480766 -65056493 - RMER3D-int LTR ERVK -24 2818 2088 7 1252 376 194 0 0 chr5 87480922 87480994 -65056265 - RMER3D-int LTR ERVK -1464 1378 1307 7 1252 594 248 74 46 chr5 87485033 87485249 -65052010 + RLTR45 LTR ERVK 261 482 0 7 1252 1205 350 94 38 chr5 87487226 87487511 -65049748 - MTE-int LTR MaLR -516 1064 755 7 1252 1205 350 94 38 chr5 87487788 87488127 -65049132 - MTE-int LTR MaLR -826 754 394 7 1252 295 379 9 0 chr5 87488251 87488367 -65048892 - MER95 LTR ERV -300 131 15 7 1252 275 386 26 0 chr5 87490000 87490114 -65047145 + MER95 LTR ERV 15 131 -300 7 1252 558 303 67 6 chr5 87491287 87491466 -65045793 + MTE-int LTR MaLR 1389 1578 -2 7 1252 701 299 147 29 chr5 87494038 87494317 -65042942 + ORR1E LTR MaLR 59 370 0 7 1252 257 273 0 0 chr5 87514554 87514620 -65022639 + RLTR18-int LTR ERVK 4191 4256 -1105 1 1252 296 297 63 63 chr5 87517126 87517252 -65020007 + MT2B LTR ERVL 139 264 -337 1 1252 1774 176 43 17 chr5 87540602 87540948 -64996311 - RMER17D2 LTR ERVK -1 808 454 3 1252 6143 83 26 6 chr5 87541019 87541902 -64995357 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 78 3 1252 1432 166 27 27 chr5 87541880 87542001 -64995258 - RMER17D2 LTR ERVK -461 445 326 3 1252 3188 48 5 2 chr5 87542001 87542396 -64994863 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1252 1432 166 27 27 chr5 87542396 87542609 -64994650 - RMER17D2 LTR ERVK -581 325 112 3 1252 560 252 47 8 chr5 87542642 87542770 -64994489 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 3 1252 4014 199 34 44 chr5 87549569 87549797 -64987462 + RMER19B LTR ERVK 1 230 -672 4 1252 4014 199 34 44 chr5 87549830 87550512 -64986747 + RMER19B LTR ERVK 231 902 0 4 1253 255 276 0 13 chr5 87560482 87560559 -64976700 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4123 3458 3383 5 1253 1251 123 25 5 chr5 87569702 87569898 -64967361 + RMER16-int LTR ERVK 4085 4284 -1122 7 1253 715 256 0 27 chr5 87569892 87570077 -64967182 + RMER16-int LTR ERVK 5362 5541 -267 7 1253 1159 192 121 8 chr5 87570083 87570340 -64966919 + RMER16-int LTR ERVK 5494 5779 -29 7 1253 1516 134 17 4 chr5 87570348 87570581 -64966678 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 236 -787 7 1253 566 230 14 22 chr5 87578425 87578563 -64958696 - RMER13B LTR ERVK -2 906 770 8 1253 1001 309 36 50 chr5 87579504 87579862 -64957397 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 8 1253 1833 223 106 19 chr5 87580457 87580529 -64956730 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 457 8 1253 1833 223 106 19 chr5 87580570 87580977 -64956282 - RLTR11A LTR ERVK -72 456 7 8 1253 677 254 38 55 chr5 87581293 87581530 -64955729 - RMER16 LTR ERVK 0 533 301 8 1253 3049 27 3 8 chr5 87581587 87581956 -64955303 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 9 1253 3416 77 15 13 chr5 87581956 87582685 -64954574 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 9 1253 442 66 0 32 chr5 87582685 87582748 -64954511 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 9 1253 1763 123 4 15 chr5 87582737 87583002 -64954257 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 9 1253 914 81 24 0 chr5 87582999 87583122 -64954137 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 9 1253 26192 17 1 2 chr5 87583122 87586082 -64951177 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 9 1253 3049 27 3 8 chr5 87586082 87586451 -64950808 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 9 1253 357 165 79 33 chr5 87586465 87586587 -64950672 - RMER16 LTR ERVK -455 78 1 8 1253 3791 147 102 46 chr5 87604753 87605583 -64931676 + RLTR13A3 LTR ERVK 1 978 0 1 1253 1771 185 38 6 chr5 87605797 87606140 -64931119 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 1253 1188 165 31 9 chr5 87607237 87607463 -64929796 + RMER6B LTR ERVK 5 235 -226 1 1253 297 203 31 15 chr5 87607465 87607530 -64929729 + RMER6B LTR ERVK 396 461 0 1 1253 348 230 23 11 chr5 87607537 87607625 -64929634 - MTC LTR MaLR -14 407 319 1 1253 763 292 31 67 chr5 87607627 87607983 -64929276 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 1 1253 1288 245 115 70 chr5 87610576 87611178 -64926081 + RLTR40 LTR ERVK 82 710 -107 1 1253 2265 191 129 57 chr5 87613912 87614428 -64922831 - RLTR40 LTR ERVK -15 802 246 1 1253 2265 191 129 57 chr5 87614619 87614751 -64922508 - RLTR40 LTR ERVK -572 245 107 1 1253 4212 167 23 27 chr5 87633647 87634459 -64902800 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 1 1253 732 285 57 48 chr5 87635054 87635389 -64901870 + RLTR10D LTR ERVK 1 338 -21 1 1253 794 207 62 0 chr5 87651470 87651649 -64885610 + RMER19B LTR ERVK 1 190 -712 1 1253 2689 66 0 0 chr5 87653744 87654076 -64883183 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 1 1253 15066 82 36 6 chr5 87654076 87657027 -64880232 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 3040 -4640 1 1253 29304 50 17 1 chr5 87657024 87661053 -64876206 + IAPEY3-int LTR ERVK 3587 7680 0 1 1253 2888 39 0 0 chr5 87661053 87661385 -64875874 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 1 1253 639 260 26 8 chr5 87665285 87665464 -64871795 + RMER19B LTR ERVK 161 409 -202 1 1253 1340 104 26 0 chr5 87684170 87684362 -64852897 + ETnERV3-int LTR ERVK 4088 4284 -1122 1 1253 1730 233 29 12 chr5 87684356 87684764 -64852495 + ETnERV3-int LTR ERVK 5362 5776 -32 1 1253 6529 123 22 20 chr5 87684776 87685796 -64851463 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1023 0 1 1253 1601 229 43 95 chr5 87686299 87686570 -64850689 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 257 1 1253 1601 229 43 95 chr5 87686723 87687007 -64850252 - RLTR11A2 LTR ERVK -271 256 1 1 1254 2936 15 9 0 chr5 87697110 87697444 -64839815 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1254 4717 59 44 14 chr5 87697444 87698080 -64839179 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 1 1254 442 66 0 32 chr5 87698080 87698143 -64839116 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 1 1254 1836 111 4 4 chr5 87698132 87698394 -64838865 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 1 1254 890 98 24 0 chr5 87698391 87698514 -64838745 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 1 1254 467 66 0 0 chr5 87698514 87698575 -64838684 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 3585 -2896 1 1254 21264 12 1 0 chr5 87698567 87700929 -64836330 + IAPEz-int LTR ERVK 4117 6481 0 1 1254 2961 15 3 0 chr5 87700929 87701265 -64835994 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1254 912 213 34 119 chr5 87704561 87704913 -64832346 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1254 595 193 49 14 chr5 87704913 87705055 -64832204 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 4698 2 1254 330 238 241 8 chr5 87705055 87705275 -64831984 - RLTR13B1 LTR ERVK -462 440 155 2 1254 6239 151 20 7 chr5 87705277 87706242 -64831017 - ETnERV2-int LTR ERVK -203 7203 6227 2 1254 5424 152 28 20 chr5 87706347 87707726 -64829533 - MMETn-int LTR ERVK -3321 4085 2348 2 1254 590 171 61 15 chr5 87707727 87707858 -64829401 - MMETn-int LTR ERVK -3828 3578 3442 2 1254 2683 122 42 50 chr5 87708341 87708997 -64828262 - MMETn-int LTR ERVK -2657 2187 1730 2 1254 6124 111 24 71 chr5 87709021 87710119 -64827140 - MMETn-int LTR ERVK -3714 1130 85 2 1254 2497 92 34 22 chr5 87712321 87712730 -64824529 - MTA_Mm-int LTR MaLR -684 414 1 2 1254 2749 107 5 2 chr5 87712730 87713125 -64824134 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1254 515 224 43 8 chr5 87715274 87715391 -64821868 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 908 2 1254 3558 234 42 2 chr5 87715412 87716223 -64821036 - RLTR25A LTR ERVK -260 843 1 2 1254 1980 202 8 3 chr5 87716924 87717316 -64819943 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1254 419 115 0 0 chr5 87734366 87734427 -64802832 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 260 2 1254 673 114 9 9 chr5 87734434 87734540 -64802719 - RLTR46 LTR ERVK -214 106 1 2 1254 23074 114 6 6 chr5 87734540 87738004 -64799255 - MMERVK10C-int LTR ERVK -354 7227 4125 2 1254 7976 92 21 1 chr5 87738003 87739088 -64798171 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3662 3919 2813 2 1254 3607 78 92 10 chr5 87739108 87739628 -64797631 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5134 2447 1885 2 1254 362 172 0 0 chr5 87739630 87739688 -64797571 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5142 995 938 2 1254 1448 212 173 34 chr5 87739693 87740184 -64797075 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4587 819 113 2 1254 458 157 10 10 chr5 87740119 87740222 -64797037 + MMERVK10C-int LTR ERVK 759 861 -6720 2 1254 269 250 41 57 chr5 87740249 87740372 -64796887 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7557 123 3 2 1254 2032 120 13 3 chr5 87740375 87740692 -64796567 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 2 1254 598 247 13 46 chr5 87744311 87744464 -64792795 - RMER13B LTR ERVK 0 908 761 2 1254 932 310 57 34 chr5 87745485 87745836 -64791423 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 2 1254 1758 213 90 22 chr5 87746021 87746510 -64790749 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 7 2 1254 1048 253 62 137 chr5 87760479 87760596 -64776663 + MTD LTR MaLR 6 104 -315 2 1254 1048 253 62 137 chr5 87760831 87761056 -64776203 + MTD LTR MaLR 105 315 -104 2 1254 1048 253 62 137 chr5 87761095 87761173 -64776086 + MTD LTR MaLR 316 395 -24 2 1254 2669 102 45 0 chr5 87762957 87763339 -64773920 + MTB LTR MaLR 2 400 0 2 1254 2519 109 14 7 chr5 87774167 87774610 -64762649 - MTA_Mm-int LTR MaLR -817 441 1 2 1254 2652 98 5 3 chr5 87774610 87774989 -64762270 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 17 2 1254 475 277 30 8 chr5 87776823 87776954 -64760305 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 970 2 1254 3681 224 43 2 chr5 87776962 87777772 -64759487 - RLTR25A LTR ERVK -260 843 1 2 1254 2014 199 8 3 chr5 87778475 87778867 -64758392 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1254 289 311 75 40 chr5 87799658 87800133 -64737126 + RMER16-int LTR ERVK 1513 1910 -3496 3 1255 3041 67 18 5 chr5 87841989 87842379 -64694880 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 3 1255 989 96 0 0 chr5 87853577 87853712 -64683547 + RMER16-int LTR ERVK 4088 4222 -1184 3 1255 477 218 111 15 chr5 87854470 87854605 -64682654 + ETnERV3-int LTR ERVK 5633 5780 -28 3 1255 6911 103 26 12 chr5 87854612 87855621 -64681638 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1023 0 3 1255 1665 214 40 129 chr5 87856118 87856383 -64680876 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 256 3 1255 1665 214 40 129 chr5 87856472 87856785 -64680474 - RLTR11A2 LTR ERVK -272 255 1 3 1255 545 156 171 8 chr5 87877945 87878068 -64659191 + ORR1D1 LTR MaLR 3 145 -229 3 1255 3071 55 182 5 chr5 87878084 87878519 -64658740 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 3 1255 555 340 47 36 chr5 87879484 87879759 -64657500 + MTEa LTR MaLR 91 368 -11 3 1255 5108 102 26 21 chr5 87879851 87880653 -64656606 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 1 3 1255 1846 194 60 2 chr5 87880994 87881392 -64655867 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1255 2692 108 12 2 chr5 87881651 87881885 -64655374 + RLTR9D LTR ERVK 1 235 -168 3 1255 2692 108 12 2 chr5 87881915 87882079 -64655180 + RLTR9D LTR ERVK 236 401 -2 3 1255 515 246 30 8 chr5 87885311 87885442 -64651817 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 970 3 1255 3821 216 46 5 chr5 87885450 87886260 -64650999 - RLTR25A LTR ERVK -260 843 1 3 1255 2001 202 8 3 chr5 87886955 87887347 -64649912 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1255 2351 68 63 30 chr5 87904370 87904705 -64632554 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1255 12815 69 27 6 chr5 87904705 87906460 -64630799 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 4 1255 2391 62 63 24 chr5 87906460 87906793 -64630466 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1255 985 208 127 46 chr5 87922815 87923122 -64614137 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 4 1255 260 343 82 60 chr5 87926225 87926507 -64610752 - MT2A LTR ERVL -186 347 60 4 1255 286 233 81 0 chr5 87929302 87929388 -64607871 - RMER5 LTR ERV1 -114 420 328 4 1255 710 344 21 21 chr5 87929573 87929858 -64607401 - RMER5 LTR ERV1 -185 349 65 4 1255 1548 250 110 24 chr5 87934043 87934506 -64602753 - MT2A LTR ERVL -30 503 1 4 1255 263 144 319 11 chr5 87934512 87934603 -64602656 - MERVL_2A-int LTR ERVL -7 5754 5636 4 1255 494 254 0 9 chr5 87941819 87941934 -64595325 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 419 4 1255 3255 165 13 6 chr5 87947230 87947783 -64589476 - RMER17B LTR ERVK -5 953 399 4 1255 2131 175 50 10 chr5 87947930 87948360 -64588899 - RMER17B LTR ERVK -458 431 1 4 1256 343 264 83 77 chr5 87950864 87951007 -64586252 - MTD LTR MaLR -51 370 197 4 1256 610 364 59 11 chr5 87983168 87983526 -64553733 - MERVL_2A-int LTR ERVL -839 4922 4548 5 1256 395 347 132 29 chr5 87987742 87988094 -64549165 + MLT1B LTR MaLR 1 388 -2 5 1256 551 157 0 36 chr5 87996417 87996529 -64540730 + ORR1B1 LTR MaLR 41 148 -246 5 1256 832 121 99 0 chr5 87996525 87996666 -64540593 + ORR1B1-int LTR MaLR 1223 1377 -586 5 1256 976 266 63 4 chr5 87999691 87999944 -64537315 - MTC LTR MaLR -8 413 146 5 1256 1782 146 58 9 chr5 88006297 88006623 -64530636 - BGLII_Mus LTR ERVK -10 412 71 9 1256 733 245 30 6 chr5 88017464 88017628 -64519631 + RMER20A LTR ERVK 1 168 -348 3 1256 569 222 190 55 chr5 88017621 88017950 -64519309 + RMER13A LTR ERVK 165 531 -377 3 1256 275 309 44 7 chr5 88023039 88023176 -64514083 - ERVL-B4-int LTR ERVL -5386 328 187 4 1256 2053 88 112 0 chr5 88023349 88023643 -64513616 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1256 1367 183 143 60 chr5 88025294 88025495 -64511764 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 142 4 1256 1367 183 143 60 chr5 88025710 88025856 -64511403 - ORR1C1 LTR MaLR -237 141 2 4 1256 385 229 66 153 chr5 88034953 88035149 -64502110 + RLTR12B LTR ERVK 118 296 -232 6 1256 366 261 62 140 chr5 88035172 88035444 -64501815 + RLTR12B LTR ERVK 246 496 -32 6 1256 3273 101 7 13 chr5 88046984 88047447 -64489812 + RLTR13C2 LTR ERVK 350 808 0 7 1256 4890 129 57 16 chr5 88048300 88049167 -64488092 - RMER17A2 LTR ERVK -4 902 1 8 1256 1326 217 24 38 chr5 88057986 88058215 -64479044 - MTC LTR MaLR -133 288 58 9 1256 3430 85 6 11 chr5 88058215 88058692 -64478567 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 9 1256 1326 217 24 38 chr5 88058692 88058754 -64478505 - MTC LTR MaLR -364 57 1 9 1256 1997 221 57 88 chr5 88074421 88074456 -64462803 - RLTR40 LTR ERVK -218 599 570 1 1256 1997 221 57 88 chr5 88074538 88074707 -64462552 - RLTR40 LTR ERVK -248 569 399 1 1256 1997 221 57 88 chr5 88074758 88075161 -64462098 - RLTR40 LTR ERVK -419 398 10 1 1256 5355 97 7 66 chr5 88075734 88076587 -64460672 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 1 1256 238 238 0 0 chr5 88076654 88076696 -64460563 + RLTR28B LTR ERVL 1 42 -439 1 1256 226 237 18 134 chr5 88077554 88077666 -64459593 - RMER12B LTR ERVK -1030 374 276 1 1256 241 251 79 69 chr5 88077825 88077983 -64459276 + MTC LTR MaLR 9 197 -222 1 1257 1932 146 51 17 chr5 88083868 88084224 -64453035 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 1 1257 3103 58 179 5 chr5 88112751 88113187 -64424072 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 1257 2198 126 22 79 chr5 88114133 88114537 -64422722 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 13 1 1257 1523 100 8 38 chr5 88114465 88114726 -64422533 - MTB_Mm LTR MaLR -154 253 1 1 1257 1156 225 44 85 chr5 88115535 88115965 -64421294 - RLTR21 LTR ERVK -118 1454 1076 1 1257 1619 157 32 84 chr5 88116251 88116598 -64420661 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1257 9384 156 57 58 chr5 88116598 88118563 -64418696 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1 1 1257 1903 143 3 60 chr5 88118563 88118912 -64418347 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1257 4544 106 27 31 chr5 88140804 88141335 -64395924 - RLTR22_Mus LTR ERVK 0 1808 1292 2 1257 4544 106 27 31 chr5 88141390 88141569 -64395690 - RLTR22_Mus LTR ERVK -517 1291 1102 2 1257 608 164 146 15 chr5 88142416 88142546 -64394713 - RLTR12B LTR ERVK -381 147 1 2 1257 620 328 56 67 chr5 88144965 88145324 -64391935 + MTEa LTR MaLR 25 379 0 2 1257 1493 233 79 19 chr5 88145753 88146121 -64391138 + ORR1B1 LTR MaLR 1 390 -4 2 1257 791 217 28 56 chr5 88160003 88160218 -64377041 - RMER5 LTR ERV1 -325 209 1 2 1257 1234 117 0 0 chr5 88168230 88168409 -64368850 + RLTR9B2 LTR ERVK 241 419 -1 2 1257 825 199 176 4 chr5 88172187 88172449 -64364810 + RMER12 LTR ERVK 1 307 -1015 2 1257 507 287 179 47 chr5 88173142 88173677 -64363582 + RMER12 LTR ERVK 491 1288 -116 2 1257 999 219 87 21 chr5 88173946 88174309 -64362950 + RMER12 LTR ERVK 988 1322 0 2 1257 401 285 171 52 chr5 88181244 88181625 -64355634 + RLTR40 LTR ERVK 145 570 -247 2 1257 2840 169 24 63 chr5 88186806 88187437 -64349822 + RMER6C LTR ERVK 85 690 0 2 1257 3019 199 35 8 chr5 88188953 88189555 -64347704 - RLTR17 LTR ERVK -74 618 1 2 1257 791 217 28 56 chr5 88194723 88194938 -64342321 + RMER5 LTR ERV1 1 209 -325 2 1257 2514 119 20 32 chr5 88201129 88201537 -64335722 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 3 1258 5815 90 11 16 chr5 88222789 88223659 -64313600 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 866 -942 3 1258 338 321 43 82 chr5 88223895 88224126 -64313133 + RMER12 LTR ERVK 1101 1322 0 3 1258 524 286 84 57 chr5 88227411 88227858 -64309401 + RLTR12B LTR ERVK 5 339 -20 3 1258 314 161 36 0 chr5 88231219 88231275 -64305984 + RMER6D LTR ERVK 1 58 -662 3 1258 3184 156 61 41 chr5 88232273 88232902 -64304357 + RMER6D LTR ERVK 71 712 -8 3 1258 792 286 137 12 chr5 88241022 88241351 -64295908 + ORR1D1 LTR MaLR 3 372 -2 3 1258 684 208 165 17 chr5 88248778 88248954 -64288305 + MTC LTR MaLR 1 202 -219 3 1258 3179 58 17 5 chr5 88252049 88252465 -64284794 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 1258 1756 130 147 125 chr5 88255125 88255415 -64281844 + RMER21B LTR ERV1 1 317 -525 3 1258 1756 130 147 125 chr5 88255448 88255580 -64281679 + RMER21B LTR ERV1 318 432 -410 3 1258 2529 125 55 7 chr5 88256128 88256311 -64280948 + RMER21B LTR ERV1 418 619 -223 3 1258 2529 125 55 7 chr5 88256331 88256551 -64280708 + RMER21B LTR ERV1 620 839 -3 3 1258 1603 134 124 0 chr5 88268646 88268937 -64268322 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 4 1258 285 330 81 95 chr5 88275986 88276197 -64261062 - MLT1D LTR MaLR -10 495 288 4 1258 2002 108 69 41 chr5 88277397 88277715 -64259544 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1258 271 315 75 71 chr5 88282570 88282782 -64254477 - ERVL-E-int LTR ERVL -1596 4071 3859 4 1258 926 171 90 6 chr5 88289509 88289686 -64247573 - RLTR19 LTR ERVK -4 495 304 4 1258 297 284 30 0 chr5 88302776 88302843 -64234416 - MLT1I LTR MaLR -238 173 105 4 1258 637 256 224 30 chr5 88311078 88311384 -64225875 - MTC LTR MaLR -52 369 12 4 1258 1556 248 48 20 chr5 88339984 88340379 -64196880 - MTD LTR MaLR -13 406 1 5 1259 1507 201 89 20 chr5 88344302 88344652 -64192607 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1259 243 302 58 77 chr5 88367001 88367105 -64170154 + MT2B LTR ERVL 138 239 -362 5 1259 822 126 0 0 chr5 88367847 88367974 -64169285 - RMER15 LTR ERVL -162 413 287 5 1259 544 222 17 0 chr5 88367985 88368102 -64169157 - RMER15 LTR ERVL -456 119 1 5 1259 282 281 0 33 chr5 88370745 88370837 -64166422 + RMER12 LTR ERVK 749 837 -485 5 1259 255 273 0 96 chr5 88374186 88374259 -64163000 - MT2B LTR ERVL -361 240 175 5 1259 323 311 50 84 chr5 88376520 88376699 -64160560 + MTE-int LTR MaLR 71 243 -1337 5 1259 614 289 113 76 chr5 88379190 88379624 -64157635 + MTE-int LTR MaLR 237 686 -894 5 1259 305 237 54 85 chr5 88381073 88381202 -64156057 + MTE-int LTR MaLR 560 684 -896 5 1259 3089 39 7 42 chr5 88395496 88395900 -64141359 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1259 1247 256 114 42 chr5 88426736 88426765 -64110494 - RLTR20B3 LTR ERVK -67 510 482 6 1259 1247 256 114 42 chr5 88426819 88427246 -64110013 - RLTR20B3 LTR ERVK -96 481 22 6 1259 3268 61 0 0 chr5 88453071 88453467 -64083792 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1259 8272 59 16 3 chr5 88453467 88454551 -64082708 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1259 3365 48 0 0 chr5 88454551 88454947 -64082312 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1259 262 214 113 14 chr5 88457424 88457495 -64079764 + RMER19B LTR ERVK 814 891 -11 6 1259 1941 143 19 9 chr5 88459936 88460260 -64076999 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1259 257 284 54 0 chr5 88470525 88470599 -64066660 + RMER19B LTR ERVK 814 891 -11 6 1260 1205 194 4 25 chr5 88480930 88481168 -64056091 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 162 6 1260 4766 124 6 70 chr5 88498466 88499326 -64037933 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 2 6 1260 1866 26 4 0 chr5 88500680 88500909 -64036350 + MT2C_Mm LTR ERVL 17 246 -229 2 1260 465 228 10 0 chr5 88505751 88505852 -64031407 + RLTR16 LTR ERVK 299 400 -105 9 1260 273 273 45 0 chr5 88540547 88540613 -63996646 + RMER19B LTR ERVK 815 883 -19 4 1260 993 180 6 11 chr5 88548819 88548999 -63988260 - ORR1B1 LTR MaLR -46 348 170 5 1260 3604 177 57 37 chr5 88552514 88552966 -63984293 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 453 -353 6 1260 3604 177 57 37 chr5 88553636 88553973 -63983286 + RLTR13D1 LTR ERVK 454 806 0 6 1260 558 158 10 0 chr5 88555642 88555743 -63981516 + RLTR16 LTR ERVK 299 400 -105 6 1260 962 169 22 43 chr5 88585891 88586076 -63951183 + RMER17A2 LTR ERVK 1 181 -725 9 1260 2686 162 52 48 chr5 88587545 88588253 -63949006 + RMER17A2 LTR ERVK 156 906 0 9 1260 2018 83 31 16 chr5 88591483 88591800 -63945459 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 9 1260 24087 30 11 11 chr5 88591800 88596384 -63940875 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 180 9 1260 2831 34 0 0 chr5 88596355 88596709 -63940550 - ETnERV-int LTR ERVK -2960 354 1 9 1260 2018 83 31 16 chr5 88596709 88597026 -63940233 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 9 1261 1263 103 0 0 chr5 88612180 88612364 -63924895 + MT2C_Mm LTR ERVL 2 185 -290 1 1261 512 198 10 0 chr5 88616113 88616214 -63921045 + RLTR16 LTR ERVK 299 400 -105 1 1261 1104 206 17 9 chr5 88654025 88654255 -63883004 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 163 1 1261 2326 218 103 65 chr5 88654720 88655587 -63881672 - RLTR13D6 LTR ERVK -56 846 1 1 1261 316 252 28 59 chr5 88663722 88663975 -63873284 - RMER17D2 LTR ERVK -328 481 237 1 1261 1450 120 4 43 chr5 88672918 88673153 -63864106 - IAPEY_LTR LTR ERVK -69 316 91 1 1261 398 180 9 33 chr5 88677233 88677326 -63859933 - IAPEY_LTR LTR ERVK -281 104 1 1 1261 694 184 22 7 chr5 88677326 88677452 -63859807 - MTC-int LTR MaLR -1128 130 3 1 1261 1257 204 188 25 chr5 88677452 88677814 -63859445 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1261 878 113 157 0 chr5 88680955 88681114 -63856145 + MT2C_Mm LTR ERVL 2 185 -290 1 1261 4904 147 12 70 chr5 88684499 88685456 -63851803 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 1 1261 455 211 21 0 chr5 88685873 88685968 -63851291 + RLTR16 LTR ERVK 299 395 -110 1 1261 887 149 40 7 chr5 88701955 88702104 -63835155 - RMER17D LTR ERVK -4 885 732 1 1261 2224 156 12 31 chr5 88720263 88720680 -63816579 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 2 1261 4703 138 42 11 chr5 88720748 88721661 -63815598 - ETnERV2-int LTR ERVK -3353 4053 3055 2 1261 615 165 26 0 chr5 88722301 88722416 -63814843 - RLTR19-int LTR ERVK -5082 1055 938 2 1261 4848 46 5 0 chr5 88722732 88723316 -63813943 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 2 1261 315 230 0 13 chr5 88723559 88723634 -63813625 - ETnERV2-int LTR ERVK -5080 2164 2091 2 1261 748 174 6 62 chr5 88723779 88723957 -63813302 - MMETn-int LTR ERVK -4676 168 1 2 1261 2081 161 14 51 chr5 88723962 88724375 -63812884 - RLTR9E LTR ERVK -11 398 1 2 1262 538 103 11 22 chr5 88740093 88740182 -63797077 + RLTR45 LTR ERVK 395 482 0 2 1262 2127 204 86 55 chr5 88740260 88740304 -63796955 - RMER19B LTR ERVK -12 890 848 2 1262 2374 125 52 8 chr5 88740304 88740690 -63796569 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 2 1262 2127 216 83 67 chr5 88740690 88741290 -63795969 - RMER19B LTR ERVK -55 847 1 2 1262 241 336 62 35 chr5 88741389 88741534 -63795725 - MLT1E3 LTR MaLR -31 593 445 2 1262 1104 187 22 27 chr5 88754705 88754930 -63782329 - ORR1D1 LTR MaLR -150 224 1 2 1262 872 175 26 26 chr5 88755183 88755377 -63781882 - RLTR11A LTR ERVK -118 409 216 2 1262 1124 201 7 70 chr5 88755497 88755770 -63781489 - RLTR11A LTR ERVK -270 258 3 2 1262 524 201 19 65 chr5 88758497 88758651 -63778608 - RLTR43A LTR ERVK -2 362 216 2 1262 2295 196 2 77 chr5 88759528 88760074 -63777185 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 2 1262 1270 196 29 36 chr5 88762846 88763122 -63774137 - RLTR46 LTR ERVK -5 315 42 2 1262 3208 134 28 15 chr5 88775805 88776342 -63760917 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 62 2 1262 2163 187 75 27 chr5 88777457 88777513 -63759746 - RMER19B LTR ERVK -1 901 854 2 1262 2310 141 52 8 chr5 88777513 88777899 -63759360 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 2 1262 2163 218 74 61 chr5 88777899 88778498 -63758761 - RMER19B LTR ERVK -49 853 1 2 1262 307 321 34 43 chr5 88778790 88778907 -63758352 - MLT1E3 LTR MaLR -69 555 440 2 1262 8334 145 37 58 chr5 88799987 88800248 -63737011 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1304 3 1262 8334 145 37 58 chr5 88800297 88801066 -63736193 - RLTR21 LTR ERVK -269 1303 563 3 1262 8334 145 37 58 chr5 88801238 88801811 -63735448 - RLTR21 LTR ERVK -1010 562 1 3 1262 2310 83 52 29 chr5 88817607 88817953 -63719306 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 3 1262 584 323 115 25 chr5 88822782 88823103 -63714156 + ORR1E LTR MaLR 6 355 -4 3 1262 656 307 74 22 chr5 88849112 88849342 -63687917 + MLT2B4 LTR ERVL 1 242 -314 3 1262 2531 188 112 4 chr5 88850361 88850878 -63686381 - RMER15 LTR ERVL -2 573 1 3 1262 296 255 27 45 chr5 88863102 88863116 -63674143 + MT2B LTR ERVL 152 163 -438 3 1262 234 276 37 173 chr5 88864695 88864967 -63672292 + RLTR13B2 LTR ERVK 98 332 -490 3 1262 2204 19 114 0 chr5 88865234 88865496 -63671763 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 1 3 1262 1798 68 0 0 chr5 88865496 88865731 -63671528 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 7347 3 1262 967 47 23 0 chr5 88865731 88865859 -63671400 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2015 5566 5436 3 1262 1894 76 30 9 chr5 88865845 88866576 -63670683 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7305 276 1 3 157 2182 23 115 0 chr5 88866576 88866837 -63670422 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 2 3 1263 910 143 84 0 chr5 88868701 88868855 -63668404 - RLTR17 LTR ERVK -324 368 202 3 1263 257 281 37 59 chr5 88876486 88876622 -63660637 - MER72B LTR ERV1 -356 412 280 3 1263 3050 69 8 2 chr5 88937292 88937686 -63599573 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1263 788 253 0 0 chr5 88942747 88942901 -63594358 - MTC LTR MaLR -8 413 260 5 1263 2009 181 254 10 chr5 88943316 88943796 -63593463 - MTC-int LTR MaLR -309 949 353 5 1263 403 129 58 29 chr5 88943805 88943909 -63593350 - MTC-int LTR MaLR -1150 108 2 5 1263 1652 194 22 3 chr5 88943908 88944228 -63593031 - MTC LTR MaLR 0 421 96 5 1263 573 133 0 30 chr5 88944395 88944494 -63592765 - MTC LTR MaLR -325 96 1 5 1263 1568 108 66 11 chr5 88944552 88944824 -63592435 + ORR1A4 LTR MaLR 1 287 -42 5 1263 3977 268 68 50 chr5 88945787 88946314 -63590945 - MTE-int LTR MaLR -224 1356 819 5 1263 3977 268 68 50 chr5 88946461 88946799 -63590460 - MTE-int LTR MaLR -762 818 458 5 1263 3977 268 68 50 chr5 88946986 88947298 -63589961 - MTE-int LTR MaLR -1123 457 157 5 1263 1470 155 126 14 chr5 88947298 88947592 -63589667 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 5 1263 3977 268 68 50 chr5 88947592 88947743 -63589516 - MTE-int LTR MaLR -1424 156 2 5 1263 475 214 19 19 chr5 88947840 88947945 -63589314 - MTEb LTR MaLR -151 228 124 5 1263 250 304 101 0 chr5 88948177 88948256 -63589003 - MTEb LTR MaLR -45 334 248 5 1263 354 301 18 9 chr5 88962073 88962187 -63575072 - MLT1E2 LTR MaLR -163 464 350 5 1263 1260 162 24 40 chr5 88965919 88966144 -63571115 - RMER3D-int LTR ERVK -1386 1456 1231 5 1263 3162 63 2 5 chr5 88966144 88966541 -63570718 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1263 1260 162 24 40 chr5 88966541 88966565 -63570694 - RMER3D-int LTR ERVK -1612 1230 1211 5 1263 1229 210 110 39 chr5 88966684 88967028 -63570231 + RLTR20A LTR ERVK 74 450 -91 5 1263 1229 210 110 39 chr5 88967120 88967211 -63570048 + RLTR20A LTR ERVK 451 539 -2 5 1264 652 270 96 50 chr5 88998648 88998991 -63538268 + MTE2a LTR MaLR 5 363 -16 6 1264 1755 134 89 51 chr5 88999653 88999967 -63537292 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 6 1264 3077 71 10 0 chr5 89006011 89006407 -63530852 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1264 7851 74 10 70 chr5 89006407 89007575 -63529684 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1264 2669 73 31 18 chr5 89007575 89007750 -63529509 - MTB LTR MaLR 0 396 223 2 1264 2669 73 31 18 chr5 89007839 89007859 -63529400 - MTB LTR MaLR -174 222 194 2 1264 2669 73 31 18 chr5 89007995 89008189 -63529070 - MTB LTR MaLR -203 193 2 2 1264 1136 271 76 13 chr5 89025055 89025436 -63511823 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1264 372 252 36 27 chr5 89031814 89031924 -63505335 - MTEb LTR MaLR -55 324 214 7 1264 1553 197 79 8 chr5 89043123 89043516 -63493743 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1264 3251 157 84 17 chr5 89062755 89063398 -63473861 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 7 1 1264 1449 161 291 0 chr5 89066631 89066954 -63470305 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 1264 729 156 14 7 chr5 89075466 89075608 -63461651 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -434 150 8 1 1264 1565 186 148 19 chr5 89081678 89082051 -63455208 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1264 1919 167 105 39 chr5 89091042 89091479 -63445780 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 1 1264 867 325 94 72 chr5 89117514 89118339 -63418920 + MTE-int LTR MaLR 609 1452 -128 2 1264 368 136 0 15 chr5 89120342 89120409 -63416850 + ORR1A2 LTR MaLR 2 67 -260 2 1264 442 149 0 0 chr5 89121462 89121536 -63415723 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 295 2 1264 1023 224 177 29 chr5 89121634 89122079 -63415180 + RLTR20A1 LTR ERVK 1 563 0 2 1264 225 256 0 0 chr5 89125129 89125172 -63412087 - RLTR18 LTR ERVK -337 175 133 2 1264 526 272 0 64 chr5 89125279 89125452 -63411807 - RLTR18 LTR ERVK -454 162 1 2 1264 348 253 46 10 chr5 89128638 89128753 -63408506 + MLT1A1 LTR MaLR 1 124 -284 3 19 285 266 43 52 chr5 89128847 89128962 -63408297 + MLT1A1 LTR MaLR 246 359 -6 3 1265 296 293 231 36 chr5 89130256 89130554 -63406705 - ORR1E LTR MaLR -4 375 20 3 1265 346 246 124 83 chr5 89131285 89131502 -63405757 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 192 3 1265 2390 130 14 2 chr5 89133009 89133405 -63403854 + MTC LTR MaLR 1 392 -29 3 1265 508 171 161 8 chr5 89133972 89134096 -63403163 - MTC LTR MaLR 0 421 279 3 1265 883 127 7 13 chr5 89134092 89134244 -63403015 - MTC LTR MaLR -270 151 1 3 1265 3301 58 46 0 chr5 89137241 89137658 -63399601 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 1265 4860 48 3 2 chr5 89138142 89138728 -63398531 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 3 1265 925 217 39 58 chr5 89139611 89140077 -63397182 + RMER17C LTR ERVK 6 410 0 3 1265 4808 117 26 11 chr5 89142501 89143243 -63394016 + RMER6A LTR ERVK 1 753 -3 3 1265 309 183 159 28 chr5 89145103 89145210 -63392049 + RLTR15 LTR ERVK 1 121 -238 3 1265 425 254 36 71 chr5 89145317 89145542 -63391717 + RLTR15 LTR ERVK 143 359 0 3 1265 757 243 42 79 chr5 89157805 89158158 -63379101 - RLTR15 LTR ERVK -19 340 1 3 1265 5596 227 89 70 chr5 89158163 89160208 -63377051 - MYSERV-int LTR ERVK -6 6544 4452 3 1265 2040 153 94 3 chr5 89166235 89166595 -63370664 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 4 1265 292 212 7 169 chr5 89196407 89196543 -63340716 - MT2B LTR ERVL -338 263 150 4 1265 1138 151 333 37 chr5 89199616 89199940 -63337319 - MTC LTR MaLR 0 421 2 4 1265 323 220 18 83 chr5 89201233 89201342 -63335917 - MT2B LTR ERVL -356 245 144 4 1265 714 189 53 13 chr5 89214191 89214341 -63322918 - MTE2b LTR MaLR -5 374 219 5 1265 332 216 11 54 chr5 89214824 89214917 -63322342 - MT2B LTR ERVL -354 247 159 5 1265 418 292 219 5 chr5 89219858 89220054 -63317205 + ORR1D2 LTR MaLR 108 345 -25 5 1265 361 299 77 35 chr5 89220841 89221011 -63316248 + MTEa LTR MaLR 85 261 -118 5 1265 254 339 0 0 chr5 89221184 89221249 -63316010 + LTR84b LTR ERVL 113 177 -584 5 1265 270 300 80 26 chr5 89227096 89227209 -63310050 - MLT1I LTR MaLR -253 158 40 5 1265 425 119 0 0 chr5 89232318 89232385 -63304874 + RMER10B LTR ERVL 1 67 -331 5 1265 643 306 139 20 chr5 89247423 89247717 -63289542 - MTEb LTR MaLR -43 336 8 5 1265 3182 70 2 0 chr5 89251130 89251529 -63285730 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1265 854 131 92 29 chr5 89255495 89255668 -63281591 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 211 6 1265 1245 176 9 5 chr5 89256017 89256239 -63281020 - ORR1B1 LTR MaLR -171 223 1 6 1266 237 272 11 80 chr5 89260921 89261009 -63276250 - MLT1G LTR MaLR -296 295 214 6 1266 1592 127 14 28 chr5 89266527 89266810 -63270449 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 43 6 1266 1287 219 132 54 chr5 89275550 89275723 -63261536 - MTD LTR MaLR 0 419 225 6 1266 1287 219 132 54 chr5 89275743 89275888 -63261371 - MTD LTR MaLR -195 224 66 6 1266 1287 219 132 54 chr5 89276556 89276623 -63260636 - MTD LTR MaLR -354 65 4 6 1266 255 274 48 0 chr5 89276628 89276712 -63260547 - MTD-int LTR MaLR -3 1255 1168 6 1266 868 213 243 18 chr5 89276847 89277114 -63260145 - MTD-int LTR MaLR -889 369 43 6 1266 1450 207 68 21 chr5 89277130 89277466 -63259793 - MTD LTR MaLR 0 419 68 6 1266 392 210 108 20 chr5 89279875 89279977 -63257282 - MTD LTR MaLR -308 111 1 6 1266 648 297 164 25 chr5 89289655 89290087 -63247172 - MLT1G LTR MaLR -55 536 45 6 1266 591 99 69 0 chr5 89290384 89290485 -63246774 + MTD LTR MaLR 2 109 -310 6 1266 1255 194 72 28 chr5 89292078 89292155 -63245104 + MTD LTR MaLR 101 197 -222 6 1266 1255 194 72 28 chr5 89292525 89292738 -63244521 + MTD LTR MaLR 198 404 -15 6 1266 3021 165 48 18 chr5 89293053 89293610 -63243649 - RMER15 LTR ERVL -1 574 1 6 1266 370 256 90 30 chr5 89296185 89296318 -63240941 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 268 6 1266 935 286 61 3 chr5 89306227 89306357 -63230902 - MTE2b LTR MaLR -67 312 179 6 1266 935 286 61 3 chr5 89306380 89306544 -63230715 - MTE2b LTR MaLR -201 178 2 6 1266 1868 150 105 34 chr5 89312462 89312842 -63224417 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1266 2061 219 35 60 chr5 89323590 89323678 -63213581 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 446 7 1266 2061 219 35 60 chr5 89323727 89324186 -63213073 - RLTR20C LTR ERVK -89 445 3 7 1266 1729 184 83 28 chr5 89330669 89331066 -63206193 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1266 676 238 81 189 chr5 89335802 89335922 -63201337 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 260 7 1266 676 238 81 189 chr5 89335978 89336276 -63200983 - ORR1D1 LTR MaLR -115 259 3 7 1266 388 257 76 83 chr5 89339151 89339459 -63197800 - BGLII_B LTR ERVK -189 338 1 7 1266 2340 102 12 0 chr5 89340828 89341151 -63196108 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1266 330 332 68 32 chr5 89343551 89343772 -63193487 + MLT1A LTR MaLR 133 361 -13 7 1267 807 272 151 25 chr5 89401460 89401777 -63135482 - MTD LTR MaLR -10 409 53 8 1267 2405 151 5 17 chr5 89411741 89412153 -63125106 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1267 3004 24 0 0 chr5 89429934 89430271 -63106988 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 8 1267 56075 23 20 7 chr5 89430271 89436662 -63100597 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 8 1267 3052 15 0 0 chr5 89436662 89436999 -63100260 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 8 1267 241 281 52 10 chr5 89443675 89443772 -63093487 - MLT1A1 LTR MaLR -30 378 278 8 1267 330 331 141 33 chr5 89443794 89443978 -63093281 - MLT1A1 LTR MaLR -204 204 1 8 1267 236 236 120 33 chr5 89446310 89446402 -63090857 + LTR88b LTR Gypsy? 661 760 -77 8 1267 440 352 158 57 chr5 89446843 89447262 -63089997 - MLT1K LTR MaLR -110 485 25 8 1267 226 262 0 71 chr5 89458824 89458894 -63078365 - MT2B2 LTR ERVL -323 261 197 8 1267 527 290 21 8 chr5 89463489 89463655 -63073604 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 223 8 1267 1237 251 19 106 chr5 89468954 89469369 -63067890 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 8 1267 233 263 98 29 chr5 89473695 89473797 -63063462 + MLT1J-int LTR MaLR 1243 1351 -36 8 1267 836 192 0 0 chr5 89479913 89480059 -63057200 - RMER10B LTR ERVL -52 346 201 9 1267 539 257 138 19 chr5 89497025 89497235 -63040024 + MLT1I LTR MaLR 1 235 -176 9 1267 1113 170 229 32 chr5 89508248 89508527 -63028732 - MTB LTR MaLR -51 349 16 1 1267 1692 185 39 14 chr5 89509066 89509501 -63027758 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 1 1267 225 55 53 53 chr5 89512818 89512856 -63024403 - LTR65 LTR ERV1 -250 419 382 2 1267 979 202 197 104 chr5 89521003 89521466 -63015793 - MT2A LTR ERVL 0 533 28 3 1268 1442 231 36 91 chr5 89560407 89560792 -62976467 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 7 1268 375 230 167 45 chr5 89566010 89566142 -62971117 - MLT1G LTR MaLR -198 393 246 7 1268 2507 154 47 7 chr5 89567679 89568084 -62969175 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1268 1467 47 62 0 chr5 89575070 89575263 -62961996 - BGLII LTR ERVK 0 421 217 9 1268 225 325 45 67 chr5 89578703 89578792 -62958467 + LTR33 LTR ERVL 55 141 -374 1 1268 743 261 167 50 chr5 89579550 89579885 -62957374 - ORR1E LTR MaLR 0 379 6 1 1268 381 305 126 0 chr5 89582489 89582663 -62954596 - MLT2B4 LTR ERVL -356 200 5 1 1268 564 267 38 104 chr5 89587408 89587726 -62949533 - MT2B LTR ERVL -2 599 146 1 1268 1926 160 104 3 chr5 89588850 89589195 -62948064 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 1 1268 2370 124 76 19 chr5 89597825 89598194 -62939065 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 1 1268 516 304 122 47 chr5 89606663 89606918 -62930341 - LTR16A1 LTR ERVL -19 437 164 1 1268 290 354 86 134 chr5 89615565 89615871 -62921388 - LTR33 LTR ERVL -6 509 206 1 1268 290 354 86 134 chr5 89615899 89616048 -62921211 - LTR33 LTR ERVL -310 205 77 1 1268 1200 57 0 0 chr5 89620110 89620267 -62916992 + MTB_Mm LTR MaLR 1 157 -250 1 1268 519 302 96 34 chr5 89621248 89621457 -62915802 - MLT1D LTR MaLR -83 422 201 1 1268 228 294 29 0 chr5 89623858 89623926 -62913333 - MTEa LTR MaLR -51 328 259 1 1268 251 167 101 43 chr5 89625180 89625249 -62912010 - ORR1A3-int LTR MaLR -1454 509 437 1 1268 556 218 2 47 chr5 89625936 89626071 -62911188 + ORR1C2 LTR MaLR 1 117 -267 1 1268 1496 172 70 11 chr5 89626071 89626382 -62910877 + ORR1C2 LTR MaLR 37 384 0 1 1268 238 274 70 87 chr5 89631831 89632003 -62905256 - RLTR21 LTR ERVK -370 1202 1034 1 1268 2828 12 3 0 chr5 89632801 89633122 -62904137 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1268 24147 29 11 12 chr5 89633122 89637712 -62899547 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 180 1 1268 2868 31 0 0 chr5 89637683 89638037 -62899222 - ETnERV-int LTR ERVK -2960 354 1 1 1268 2091 77 28 16 chr5 89638037 89638355 -62898904 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1269 2829 161 63 7 chr5 89655651 89656190 -62881069 - RMER15 LTR ERVL -2 573 5 1 1269 865 262 78 54 chr5 89671103 89671490 -62865769 - RLTR28B LTR ERVL -38 443 48 2 1269 2210 155 34 16 chr5 89672103 89672490 -62864769 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1269 1158 183 117 28 chr5 89673448 89674003 -62863256 + RMER6C LTR ERVK 1 656 -34 2 1269 3310 41 4 122 chr5 89674020 89674514 -62862745 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 1269 583 259 327 8 chr5 89679275 89679525 -62857734 + MTE2b LTR MaLR 50 379 0 2 1269 391 335 64 26 chr5 89682088 89682244 -62855015 + MLT1A0 LTR MaLR 149 310 -55 2 1269 2185 96 96 35 chr5 89692176 89692542 -62844717 + ORR1B1 LTR MaLR 2 389 -5 2 1269 1405 192 134 9 chr5 89693600 89693921 -62843338 + MTC LTR MaLR 59 419 -2 2 1269 769 289 117 23 chr5 89696793 89697059 -62840200 + MTEb LTR MaLR 13 303 -76 2 1269 895 239 115 4 chr5 89697056 89697300 -62839959 + ORR1D2 LTR MaLR 90 360 -10 2 1269 1789 152 7 0 chr5 89698835 89699112 -62838147 + RLTR27 LTR ERVK 31 309 0 2 1269 3148 140 74 0 chr5 89701793 89702322 -62834937 + RLTR20D LTR ERVK 1 568 0 2 1269 1106 326 135 41 chr5 89707474 89708150 -62829109 + MER21B LTR ERV1 20 758 -105 2 1269 232 231 80 27 chr5 89708644 89708759 -62828500 - RMER17D LTR ERVK -496 393 269 2 1269 232 231 80 27 chr5 89708938 89709009 -62828250 - RMER17D LTR ERVK -621 268 198 2 1269 244 291 142 33 chr5 89709339 89709512 -62827747 + ORR1D1 LTR MaLR 1 197 -162 2 1269 2091 170 0 75 chr5 89710847 89711272 -62825987 + MTB_Mm LTR MaLR 4 396 -11 2 1269 1890 136 53 9 chr5 89712295 89712636 -62824623 + RLTR15 LTR ERVK 1 356 -3 2 1269 3425 30 2 0 chr5 89714620 89715015 -62822244 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1269 677 258 115 63 chr5 89718886 89719234 -62818025 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 3 3 1269 2375 176 78 20 chr5 89726441 89726940 -62810319 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 1269 248 336 134 48 chr5 89730015 89730284 -62806975 + LTR16E2 LTR ERVL 246 537 -31 3 1269 1254 236 139 59 chr5 89730501 89730561 -62806698 + MTD LTR MaLR 3 60 -359 3 1269 1254 238 136 58 chr5 89730738 89731057 -62806202 + MTD LTR MaLR 61 404 -15 3 1269 2247 150 92 9 chr5 89734152 89734576 -62802683 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 3 1269 2894 71 46 5 chr5 89737898 89738293 -62798966 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 3 1269 641 178 58 15 chr5 89771100 89771237 -62766022 + MER57D LTR ERV1 3 145 -266 3 1269 840 206 44 16 chr5 89772397 89772580 -62764679 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1135 3 1269 1186 144 44 135 chr5 89772607 89772904 -62764355 - RMER12 LTR ERVK -420 902 633 3 1269 2906 86 13 0 chr5 89773074 89773469 -62763790 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1269 840 229 182 32 chr5 89775228 89775556 -62761703 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 1269 298 143 0 35 chr5 89779066 89779118 -62758141 + ORR1B2 LTR MaLR 2 51 -316 3 1269 1645 229 81 64 chr5 89779118 89779588 -62757671 - RMER19C LTR ERVK 0 611 134 3 1269 1948 156 15 33 chr5 89779621 89779952 -62757307 + ORR1B2 LTR MaLR 43 367 0 3 1269 634 167 52 9 chr5 89780306 89780421 -62756838 + ORR1D1 LTR MaLR 3 122 -252 3 158 3170 84 14 2 chr5 89784048 89784464 -62752795 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 1270 396 262 16 16 chr5 89785971 89786095 -62751164 - RMER15 LTR ERVL -14 561 438 3 1270 299 244 25 14 chr5 89787164 89787263 -62749996 - MTEb LTR MaLR -1 378 279 3 1270 2385 99 3 58 chr5 89787576 89787920 -62749339 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 3 1270 1376 239 86 3 chr5 89791856 89792192 -62745067 + ORR1D2 LTR MaLR 7 370 0 3 1270 1145 280 91 34 chr5 89795429 89795682 -62741577 - MLT1C LTR MaLR 0 467 209 3 1270 1145 280 91 34 chr5 89795720 89795906 -62741353 - MLT1C LTR MaLR -259 208 4 3 1270 1104 149 77 0 chr5 89800866 89801047 -62736212 - MTD LTR MaLR -29 390 196 3 1270 430 237 49 33 chr5 89807014 89807136 -62730123 - RMER15 LTR ERVL -104 471 348 3 1270 1045 231 181 22 chr5 89808277 89808592 -62728667 - MTE2b LTR MaLR -12 367 3 3 1270 855 219 26 46 chr5 89814688 89814968 -62722291 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 534 5 4 1270 775 223 78 0 chr5 89817489 89817655 -62719604 + RLTR40 LTR ERVK 632 810 -7 4 1270 343 232 0 24 chr5 89817662 89817746 -62719513 + MTE-int LTR MaLR 328 409 -1171 4 1270 891 221 42 19 chr5 89817746 89817958 -62719301 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 158 4 1270 241 359 56 45 chr5 89822231 89822409 -62714850 - RMER4B LTR ERVK -396 189 10 4 1270 6423 93 9 32 chr5 89822800 89823728 -62713531 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 4 1270 235 247 49 31 chr5 89831614 89831777 -62705482 + RMER17A LTR ERVK 308 473 -278 4 1270 2533 171 67 12 chr5 89836423 89836904 -62700355 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 22 4 1270 1850 171 56 25 chr5 89836872 89837227 -62700032 + RMER20A LTR ERVK 151 516 0 4 1270 2986 112 76 51 chr5 89837227 89837305 -62699954 - RMER12 LTR ERVK -791 531 460 4 1270 2986 112 76 51 chr5 89837529 89837968 -62699291 - RMER12 LTR ERVK -863 459 1 4 1270 257 197 0 76 chr5 89841372 89841438 -62695821 + LTR23-int LTR ERV1 115 175 -4948 4 1270 573 289 128 15 chr5 89842204 89842440 -62694819 + MLT2C1 LTR ERVL 93 515 -44 4 1270 2432 195 12 2 chr5 89847022 89847439 -62689820 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1270 817 249 60 28 chr5 89863508 89863793 -62673466 - RLTR15 LTR ERVK -65 294 1 4 1270 2197 132 59 39 chr5 89874651 89875007 -62662252 + ORR1B2 LTR MaLR 1 363 -4 4 1270 228 210 48 16 chr5 89891781 89891844 -62645415 - RLTR18 LTR ERVK -48 568 504 5 1270 660 111 0 29 chr5 89895510 89895594 -62641665 + RMER17C LTR ERVK 1 84 -326 5 1270 660 111 0 29 chr5 89895673 89895690 -62641569 + RMER17C LTR ERVK 85 99 -311 5 1270 1219 82 11 11 chr5 89895676 89895861 -62641398 + RMER17C LTR ERVK 226 410 0 5 1270 984 283 123 32 chr5 89896514 89896978 -62640281 - MER67C LTR ERV1 -125 586 81 5 1270 587 329 85 34 chr5 89905428 89905780 -62631479 + MLT1A LTR MaLR 4 373 -1 5 1270 1655 283 46 57 chr5 89910830 89911706 -62625553 - MYSERV-int LTR ERVK -1412 5138 4273 5 1270 352 333 14 66 chr5 89912392 89912604 -62624655 + MLT1A LTR MaLR 172 372 -2 5 1270 713 246 72 40 chr5 89913984 89914186 -62623073 - RLTR15 LTR ERVK -45 314 106 5 1270 713 246 72 40 chr5 89914276 89914377 -62622882 - RLTR15 LTR ERVK -254 105 1 5 1271 1187 282 49 35 chr5 89919413 89919840 -62617419 + BGLII_B LTR ERVK 1 433 -8 5 1271 594 221 17 77 chr5 89921010 89921177 -62616082 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 222 5 1271 343 324 10 118 chr5 89924919 89925122 -62612137 - RMER4A LTR ERVK -253 213 33 5 1271 490 323 72 28 chr5 89934089 89934379 -62602880 + MER90 LTR ERV1 27 329 -246 5 1271 603 369 85 40 chr5 89934432 89934912 -62602347 - LTR83 LTR ERVL -225 555 54 5 1271 6038 105 16 8 chr5 89940273 89941225 -62596034 + IAPEy-int LTR ERVK 100 1058 -6455 6 1271 20715 48 2 6 chr5 89941225 89943946 -62593313 + IAPEy-int LTR ERVK 4804 7513 0 6 1271 3137 53 13 0 chr5 89943946 89944326 -62592933 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 6 1271 508 266 35 85 chr5 89944585 89944703 -62592556 + ORR1E LTR MaLR 6 118 -241 6 1271 5840 89 116 77 chr5 89944703 89945697 -62591562 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 1033 0 6 1271 508 266 35 85 chr5 89945697 89945779 -62591480 + ORR1E LTR MaLR 119 196 -163 6 1271 289 255 182 32 chr5 89945849 89946003 -62591256 + ORR1E LTR MaLR 201 377 -2 6 1271 462 286 50 28 chr5 89960077 89960257 -62577002 + MER57C2 LTR ERV1 246 429 -5 6 1271 4900 223 145 44 chr5 89967799 89969443 -62567816 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1672 -176 6 1271 226 341 83 67 chr5 89972576 89972937 -62564322 - MLT1C LTR MaLR -36 431 65 6 1271 417 363 75 71 chr5 89977839 89978361 -62558898 + LTR33C LTR ERVL 19 542 -87 6 1271 1017 297 52 30 chr5 89979333 89979638 -62557621 - MTEb LTR MaLR -4 375 64 6 1271 953 261 108 54 chr5 89981757 89982089 -62555170 - ORR1E LTR MaLR -9 350 1 6 1271 287 280 56 69 chr5 89985285 89985421 -62551838 - ORR1E LTR MaLR -14 365 239 6 1271 3458 28 2 0 chr5 89985712 89986107 -62551152 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1271 9559 21 1 0 chr5 89986107 89987204 -62550055 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1271 3471 25 2 0 chr5 89987204 89987599 -62549660 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1271 2466 95 50 28 chr5 89988072 89988472 -62548787 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 6 1271 465 319 59 27 chr5 89990729 89990916 -62546343 - MLT1A0 LTR MaLR -172 193 1 6 1271 836 241 78 35 chr5 89993794 89994052 -62543207 - RMER5 LTR ERV1 0 534 266 6 1271 1256 233 120 49 chr5 90008212 90008578 -62528681 + MTD LTR MaLR 1 392 -27 3 1271 265 281 8 116 chr5 90008624 90008753 -62528506 - MT2B LTR ERVL -338 263 149 5 1271 233 184 41 0 chr5 90008726 90008775 -62528484 + MTD LTR MaLR 369 419 0 3 1271 2010 195 43 25 chr5 90008779 90009358 -62527901 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 557 1 6 1271 316 320 177 15 chr5 90010881 90011084 -62526175 - MLT1H2 LTR MaLR -60 429 194 8 1271 832 86 7 19 chr5 90013660 90013814 -62523445 - RMER17B LTR ERVK -501 457 306 1 1271 661 298 55 118 chr5 90017527 90017908 -62519351 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 1 1271 610 171 9 0 chr5 90017911 90018016 -62519243 + ORR1E-int LTR MaLR 3 108 -1472 1 1271 775 363 31 122 chr5 90018432 90019249 -62518010 + ORR1E-int LTR MaLR 101 842 -738 1 1271 511 217 19 0 chr5 90019248 90019354 -62517905 - ORR1D1 LTR MaLR -265 109 2 1 1271 459 323 53 12 chr5 90019354 90019523 -62517736 + MLT1D LTR MaLR 321 496 -9 1 1271 515 260 117 38 chr5 90019547 90019787 -62517472 + MLT1D-int LTR MaLR 185 443 -928 1 1271 252 385 17 0 chr5 90023077 90023194 -62514065 + MLT1F2 LTR MaLR 17 135 -425 2 1271 3919 202 46 40 chr5 90024779 90025670 -62511589 + RMER13B LTR ERVK 4 899 -9 2 1271 289 283 80 10 chr5 90027131 90027231 -62510028 - MLT1K LTR MaLR -118 477 371 3 1271 2321 93 132 11 chr5 90031491 90031839 -62505420 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 3 1271 2546 259 25 114 chr5 90037484 90038447 -62498812 - RMER17B LTR ERVK -77 881 5 3 1271 3920 115 27 11 chr5 90038828 90039383 -62497876 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 3 1271 1051 295 62 46 chr5 90039535 90039905 -62497354 - MTEa LTR MaLR -1 378 3 4 1271 530 233 148 66 chr5 90042333 90042650 -62494609 + RMER10A LTR ERVL 84 426 -16 4 1271 4020 136 62 30 chr5 90044369 90045092 -62492167 + RMER6A LTR ERVK 8 753 -3 4 1271 391 260 52 37 chr5 90045298 90045434 -62491825 + MER73 LTR ERVL 108 245 -399 5 1271 282 322 127 32 chr5 90045590 90045747 -62491512 + MER73 LTR ERVL 437 608 -36 5 1272 521 243 28 0 chr5 90051430 90051574 -62485685 + MER67C LTR ERV1 359 506 -205 5 1272 351 365 105 8 chr5 90051717 90051974 -62485285 - LTR80B LTR ERVL -118 466 185 5 1272 917 244 161 24 chr5 90064613 90064911 -62472348 + MTD LTR MaLR 80 418 -1 6 1272 2998 76 13 8 chr5 90065303 90065701 -62471558 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1272 5637 85 11 17 chr5 90068257 90069068 -62468191 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 1 7 1272 562 154 0 0 chr5 90069078 90069169 -62468090 - RMER16-int LTR ERVK -30 5778 5688 7 1272 4329 153 44 29 chr5 90069167 90070676 -62466583 - RMER16-int LTR ERVK -692 5116 2870 7 1272 5034 113 37 36 chr5 90070798 90071166 -62466093 - ETnERV2-int LTR ERVK -3488 3918 3567 7 1272 5034 113 37 36 chr5 90071314 90071888 -62465371 - ETnERV2-int LTR ERVK -3840 3566 2975 7 1272 2496 133 45 52 chr5 90072295 90072780 -62464479 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 7 1272 253 401 0 29 chr5 90077670 90077806 -62459453 + MLT1A0 LTR MaLR 1 132 -233 8 1272 272 295 84 25 chr5 90077819 90077964 -62459295 + ORR1B2 LTR MaLR 47 192 -167 8 1272 603 170 60 20 chr5 90095027 90095161 -62442098 - RMER5 LTR ERV1 -65 469 330 1 1272 537 250 172 48 chr5 90095342 90095615 -62441644 - RMER5 LTR ERV1 -195 339 33 1 1272 842 287 101 89 chr5 90099601 90100075 -62437184 - RMER13B LTR ERVK -227 681 202 1 1272 892 174 18 23 chr5 90100063 90100234 -62437025 - RMER20A LTR ERVK -346 170 1 1 1272 1651 185 57 6 chr5 90110287 90110640 -62426619 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 371 -206 1 1272 322 198 70 140 chr5 90110706 90110806 -62426453 + RLTR20B3 LTR ERVK 485 577 0 1 1272 646 258 61 140 chr5 90119363 90119864 -62417395 + RLTR11B LTR ERVK 1 493 -35 1 1272 295 143 17 35 chr5 90128632 90128690 -62408569 + MLT1A0 LTR MaLR 300 356 -9 1 1272 385 328 66 58 chr5 90133687 90133945 -62403314 + MLT1D LTR MaLR 12 257 -370 1 1272 2050 176 73 13 chr5 90146101 90146498 -62390761 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1272 825 274 158 22 chr5 90147710 90148027 -62389232 + ORR1D2 LTR MaLR 5 364 -6 1 1272 266 311 121 38 chr5 90158012 90158169 -62379090 - MLT1L LTR MaLR -57 553 384 1 1272 233 321 102 19 chr5 90160137 90160245 -62377014 + ORR1E LTR MaLR 4 120 -239 1 1272 359 318 88 105 chr5 90160739 90161034 -62376225 + MLT1E2 LTR MaLR 255 568 -112 1 1272 315 327 78 22 chr5 90161186 90161330 -62375929 + MLT1E2 LTR MaLR 457 606 -18 1 1272 294 353 46 0 chr5 90163787 90163825 -62373434 + MLT1N2 LTR MaLR 403 562 0 1 1272 377 301 9 17 chr5 90163825 90163940 -62373319 + LTR33B LTR ERVL 390 503 0 1 1272 2271 179 96 17 chr5 90168804 90169345 -62367914 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 2 1272 304 275 22 130 chr5 90173226 90173261 -62363998 + MT2B LTR ERVL 136 155 -446 2 1273 354 337 85 37 chr5 90178693 90178881 -62358378 - MLT1A LTR MaLR -9 365 169 2 1273 1798 165 81 51 chr5 90179930 90180301 -62356958 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 2 1273 237 297 0 129 chr5 90180590 90180706 -62356553 - MTD LTR MaLR 0 419 319 2 1273 430 238 9 38 chr5 90180694 90180799 -62356460 - MTD LTR MaLR -300 119 18 2 1273 633 294 159 38 chr5 90181665 90182085 -62355174 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 210 2 1273 243 232 36 0 chr5 90182105 90182161 -62355098 - MLT1E1A LTR MaLR -586 68 11 2 1273 1568 180 184 58 chr5 90189079 90189475 -62347784 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 2 1273 1123 277 113 67 chr5 90194955 90195496 -62341763 + RMER13A LTR ERVK 1 566 -294 2 1273 325 203 0 0 chr5 90195500 90195559 -62341700 + MTEa LTR MaLR 321 379 0 2 1273 593 241 95 58 chr5 90197457 90197677 -62339582 - MTE2b LTR MaLR -13 406 208 2 1273 2091 200 79 50 chr5 90201867 90202300 -62334959 + RLTR20A LTR ERVK 6 441 -100 2 1273 2091 200 79 50 chr5 90202332 90202418 -62334841 + RLTR20A LTR ERVK 442 539 -2 2 1273 2386 205 9 18 chr5 90203153 90203764 -62333495 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2 486 -1840 2 1273 226 244 33 55 chr5 90206687 90206778 -62330481 + MLT1A1 LTR MaLR 307 395 -13 2 1273 264 354 31 10 chr5 90207835 90207932 -62329327 - MLT1J2 LTR MaLR -329 119 21 2 1273 229 267 17 0 chr5 90213870 90213930 -62323329 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 567 2 1273 235 248 94 16 chr5 90218455 90218554 -62318705 + MLT2B4 LTR ERVL 466 588 -13 2 1273 642 313 50 54 chr5 90219563 90219843 -62317416 + MT2A LTR ERVL 189 467 -66 2 1273 6123 35 1 3 chr5 90230708 90231448 -62305811 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 191 3 1273 1762 10 0 0 chr5 90232985 90233188 -62304071 - RLTR13B3 LTR ERVK -726 203 1 3 1273 298 282 164 40 chr5 90237061 90237286 -62299973 - ORR1E LTR MaLR -106 253 1 3 1273 243 257 13 63 chr5 90238901 90238980 -62298279 + MLT1A0 LTR MaLR 1 75 -290 3 1273 1965 202 116 5 chr5 90240566 90240945 -62296314 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1273 1716 202 62 32 chr5 90250701 90251106 -62286153 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 3 1273 3298 45 133 7 chr5 90259746 90260168 -62277091 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1273 235 146 42 0 chr5 90268806 90268854 -62268405 + ORR1E LTR MaLR 27 76 -283 3 1273 2570 121 16 13 chr5 90274357 90274744 -62262515 + ORR1B1 LTR MaLR 1 388 -6 3 1273 731 259 151 81 chr5 90278153 90278355 -62258904 + MT2B LTR ERVL 16 313 -288 3 1273 731 235 128 89 chr5 90278401 90278679 -62258580 + MT2B LTR ERVL 314 601 0 3 1273 860 297 57 16 chr5 90285713 90286079 -62251180 - MLT1B LTR MaLR -9 381 1 3 1273 399 323 131 94 chr5 90301599 90302005 -62235254 - MLT1D LTR MaLR -84 421 1 3 1274 1381 222 48 43 chr5 90309158 90309400 -62227859 + ORR1D1 LTR MaLR 1 243 -131 4 1274 1381 222 48 43 chr5 90309509 90309638 -62227621 + ORR1D1 LTR MaLR 244 373 -1 4 1274 398 192 7 172 chr5 90315846 90315991 -62221268 + MTE2a LTR MaLR 2 122 -257 4 1274 1543 201 12 39 chr5 90323546 90323877 -62213382 - MTC LTR MaLR -79 342 21 4 1274 330 333 31 25 chr5 90330440 90330603 -62206656 - MLT1K LTR MaLR -416 179 16 4 1274 493 336 76 89 chr5 90333827 90333857 -62203402 + LTR33A_ LTR ERVL 27 56 -475 4 1274 493 336 76 89 chr5 90334066 90334339 -62202920 + LTR33A_ LTR ERVL 57 326 -205 4 1274 414 244 0 0 chr5 90338222 90338308 -62198951 - MLT2B2 LTR ERVL -427 88 3 4 1274 589 315 38 11 chr5 90343080 90343263 -62193996 + ORR1D1 LTR MaLR 116 303 -71 4 1274 777 218 29 29 chr5 90343526 90343702 -62193557 - RMER21B LTR ERV1 -350 492 317 4 1274 577 306 133 46 chr5 90345809 90346223 -62191036 + MLT1C LTR MaLR 18 467 0 4 1274 2648 78 3 0 chr5 90348947 90349269 -62187990 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 4 1274 430 252 143 7 chr5 90351391 90351531 -62185728 - MLT2B1 LTR ERVL -361 159 1 4 1274 724 308 47 89 chr5 90356912 90357294 -62179965 - MTEb LTR MaLR -13 366 1 4 1274 1057 181 42 111 chr5 90368966 90369423 -62167836 - RMER6C LTR ERVK 0 756 345 5 1274 1911 145 185 5 chr5 90369579 90369994 -62167265 + RMER12 LTR ERVK 448 911 -411 5 1274 2566 162 206 9 chr5 90376760 90377046 -62160213 - RMER6D LTR ERVK 0 720 386 5 1274 2566 147 43 13 chr5 90377109 90377366 -62159893 - RMER6D LTR ERVK -335 385 113 5 1274 395 220 52 132 chr5 90377375 90377511 -62159748 - MTD LTR MaLR -101 320 196 5 1274 440 279 102 97 chr5 90379045 90379251 -62158008 - MTD LTR MaLR -208 211 5 5 1274 455 253 0 0 chr5 90383158 90383253 -62154006 + ORR1D2 LTR MaLR 1 95 -275 5 1274 1985 164 31 66 chr5 90393393 90393785 -62143474 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 1274 416 203 208 26 chr5 90396015 90396207 -62141052 + RMER5 LTR ERV1 153 379 -155 5 1274 243 238 32 0 chr5 90405219 90405282 -62131977 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 301 5 1274 782 255 122 45 chr5 90406949 90407285 -62129974 + MLT1A LTR MaLR 1 362 -12 5 1274 963 153 6 0 chr5 90409979 90410136 -62127123 + ORR1A4 LTR MaLR 1 158 -171 5 1274 484 277 41 28 chr5 90410383 90410528 -62126731 + MLT1A0 LTR MaLR 3 149 -216 5 1274 421 290 53 88 chr5 90410551 90410721 -62126538 + MLT1A0 LTR MaLR 244 407 -1 5 1274 1807 145 162 10 chr5 90413555 90413869 -62123390 - ORR1B2 LTR MaLR -3 364 3 5 1274 2984 79 44 19 chr5 90416258 90416669 -62120590 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 1274 2106 174 76 13 chr5 90427910 90428385 -62108874 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 553 1 5 1274 366 293 126 48 chr5 90429285 90429544 -62107715 + RMER20A LTR ERVK 73 355 -272 5 1274 292 95 0 0 chr5 90430542 90430584 -62106675 + MT2A LTR ERVL 492 533 0 5 1274 3561 30 5 10 chr5 90431845 90432243 -62105016 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1274 342 289 78 64 chr5 90433691 90433909 -62103350 + MLT1D LTR MaLR 25 245 -260 6 1274 260 206 107 27 chr5 90434009 90434084 -62103175 + MLT1D LTR MaLR 303 383 -7 6 1275 551 348 107 0 chr5 90440796 90441049 -62096210 + MLT1F LTR MaLR 3 282 -266 6 1275 374 362 22 17 chr5 90441090 90441270 -62095989 + MLT1F LTR MaLR 366 546 -2 6 1275 3050 133 75 32 chr5 90444227 90444830 -62092429 + MTB-int LTR MaLR 549 1578 -2 6 1275 2582 80 108 0 chr5 90444830 90445191 -62092068 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1275 838 294 41 14 chr5 90445194 90445415 -62091844 - ORR1D2 LTR MaLR -143 227 1 6 1275 673 347 92 63 chr5 90447533 90447958 -62089301 + MER74B LTR ERVL 85 521 -101 6 1275 439 358 62 77 chr5 90449784 90450123 -62087136 + ORR1E LTR MaLR 3 336 -23 6 1275 302 274 73 63 chr5 90459579 90459770 -62077489 + RLTR15 LTR ERVK 99 291 -68 6 1275 1816 155 95 6 chr5 90464483 90464820 -62072439 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1275 351 368 0 0 chr5 90468147 90468272 -62068987 - MTE-int LTR MaLR -34 1546 1422 6 1275 701 315 19 5 chr5 90468275 90468489 -62068770 - MTE-int LTR MaLR -1230 350 134 6 1275 284 278 11 32 chr5 90468618 90468711 -62068548 - RLTR17 LTR ERVK -3 689 599 6 1275 2268 182 35 50 chr5 90469537 90470081 -62067178 - RLTR31_Mm LTR ERVK -25 536 1 6 1275 320 328 109 0 chr5 90470110 90470238 -62067021 - MTE-int LTR MaLR -1438 142 1 6 1275 569 195 50 104 chr5 90470648 90470930 -62066329 - RMER10A LTR ERVL -25 417 1 6 1275 1857 106 9 109 chr5 90472674 90473022 -62064237 + ORR1A4 LTR MaLR 9 321 -8 6 1275 930 255 21 58 chr5 90475330 90475621 -62061638 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 280 -247 6 1275 385 261 34 25 chr5 90475708 90475826 -62061433 + RLTR11A2 LTR ERVK 286 404 -49 6 1275 4445 14 0 0 chr5 90477369 90477862 -62059397 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1275 1751 82 84 93 chr5 90483918 90484239 -62053020 + ORR1A4 LTR MaLR 1 318 -11 6 1275 2031 101 6 100 chr5 90486003 90486305 -62050954 + ORR1A3 LTR MaLR 1 273 -53 6 1275 2031 101 6 100 chr5 90486715 90486763 -62050496 + ORR1A3 LTR MaLR 274 318 -8 6 1275 381 278 49 88 chr5 90487235 90487440 -62049819 - MT2B LTR ERVL -97 504 308 6 1275 240 286 0 67 chr5 90488495 90488555 -62048704 - ORR1D1 LTR MaLR -314 60 5 6 1275 360 271 0 0 chr5 90489133 90489203 -62048056 + MT2A LTR ERVL 397 466 -67 6 1275 2657 62 56 16 chr5 90491128 90491505 -62045754 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 5 6 1275 253 203 26 92 chr5 90492277 90492353 -62044906 - RMER15 LTR ERVL -89 486 416 7 1275 337 312 53 35 chr5 90501521 90501634 -62035625 + MLT1H LTR MaLR 136 250 -299 2 1275 331 269 63 84 chr5 90501730 90501872 -62035387 + MLT1H LTR MaLR 411 549 0 2 1275 1827 185 35 23 chr5 90502214 90502562 -62034697 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 27 4 1275 323 300 160 21 chr5 90507754 90507948 -62029311 + LTR79 LTR ERVL 257 477 -50 1 1275 238 307 29 169 chr5 90513782 90514060 -62023199 - ORR1E LTR MaLR -120 239 1 2 1275 1109 282 89 14 chr5 90520754 90521103 -62016156 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 3 1275 274 354 177 18 chr5 90532357 90532521 -62004738 + MLT1A1 LTR MaLR 181 370 -38 5 1275 1103 251 88 60 chr5 90533036 90533387 -62003872 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 1 5 1275 1002 206 0 0 chr5 90536745 90536915 -62000344 - RLTR17 LTR ERVK -324 368 199 5 1275 763 241 133 3 chr5 90537394 90537724 -61999535 - MTE2b LTR MaLR -6 373 1 6 1275 2047 152 72 14 chr5 90537805 90538164 -61999095 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 6 1275 880 339 74 18 chr5 90541107 90541564 -61995695 - LTR79 LTR ERVL -13 514 32 7 1275 254 296 49 39 chr5 90542117 90542219 -61995040 + MTEb LTR MaLR 249 351 -28 7 1275 557 290 123 59 chr5 90551495 90551881 -61985378 - RMER20B LTR ERVK -31 596 205 9 1275 277 381 46 15 chr5 90554011 90554208 -61983051 + LTR82A LTR ERVL 571 773 -99 1 1275 849 265 109 40 chr5 90556636 90557013 -61980246 + MLT2D LTR ERVL 8 410 -4 1 1275 341 272 80 104 chr5 90557264 90557514 -61979745 - ORR1E LTR MaLR -78 281 38 1 1275 1183 265 17 78 chr5 90559598 90559942 -61977317 + MTE2b LTR MaLR 16 338 -41 1 1275 1950 111 14 59 chr5 90565930 90566284 -61970975 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 1 1275 380 309 100 25 chr5 90566428 90566731 -61970528 + MLT1A1 LTR MaLR 21 403 -5 1 1275 1900 77 75 164 chr5 90566875 90567234 -61970025 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1275 1089 256 67 26 chr5 90568712 90569057 -61968202 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1275 3238 56 2 12 chr5 90569188 90569588 -61967671 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1275 278 340 169 15 chr5 90570337 90570597 -61966662 - LTR16C LTR ERVL -48 441 142 1 1276 472 250 43 136 chr5 90571191 90571353 -61965906 + MTE2a LTR MaLR 1 147 -232 1 1276 602 247 42 16 chr5 90571700 90571889 -61965370 + MTE2a LTR MaLR 186 379 0 1 1276 337 178 10 118 chr5 90574055 90574070 -61963189 + MT2B LTR ERVL 154 157 -444 1 1276 3378 35 5 0 chr5 90577935 90578329 -61958930 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1276 282 234 26 86 chr5 90580647 90580764 -61956495 + RMER15-int LTR ERVL 4708 4817 -182 1 1276 502 281 119 77 chr5 90583311 90583623 -61953636 + MLT1C LTR MaLR 1 325 -142 1 1276 366 71 37 44 chr5 90585239 90585333 -61951926 - ORR1A3 LTR MaLR -269 125 2 1 1276 941 226 208 26 chr5 90588409 90588579 -61948680 - MTD LTR MaLR 0 419 205 1 1276 2030 111 38 118 chr5 90588579 90588978 -61948281 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1276 941 226 208 26 chr5 90588978 90589120 -61948139 - MTD LTR MaLR -215 204 50 1 1276 505 236 148 142 chr5 90589417 90589783 -61947476 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 1 1276 2490 117 45 2 chr5 90590266 90590662 -61946597 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1276 1301 230 96 6 chr5 90597195 90597528 -61939731 + ORR1D2 LTR MaLR 8 370 0 2 1276 908 265 86 65 chr5 90605898 90606164 -61931095 - MTEa LTR MaLR 0 379 111 2 1276 908 265 86 65 chr5 90606191 90606295 -61930964 - MTEa LTR MaLR -269 110 1 2 1276 837 252 80 0 chr5 90606534 90606760 -61930499 - MT2A LTR ERVL -11 522 279 2 1276 533 291 0 0 chr5 90606762 90606903 -61930356 - MT2A LTR ERVL -380 153 13 2 1276 1081 221 90 48 chr5 90609764 90610121 -61927138 - RMER13A LTR ERVK -394 466 95 2 1276 521 114 114 0 chr5 90617758 90617863 -61919396 + ORR1B1 LTR MaLR 4 120 -274 2 1276 3578 38 55 0 chr5 90617849 90618319 -61918940 - RLTR1C LTR ERV1 -7 496 1 2 1276 1504 122 76 12 chr5 90618319 90618568 -61918691 + ORR1B1 LTR MaLR 117 381 -13 2 1276 290 233 33 55 chr5 90619767 90619783 -61917476 + MT2B LTR ERVL 152 240 -361 2 1276 3105 63 10 2 chr5 90619858 90620255 -61917004 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1276 845 149 143 5 chr5 90622985 90623174 -61914085 + MTD LTR MaLR 1 215 -204 2 1276 520 226 52 9 chr5 90623390 90623506 -61913753 + MTD LTR MaLR 295 415 -6 2 1276 2074 186 124 31 chr5 90624161 90624677 -61912582 - RMER2 LTR ERV1 0 567 4 2 1276 1492 283 25 20 chr5 90625342 90625782 -61911477 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1067 3996 3555 2 1276 432 377 5 5 chr5 90626459 90626675 -61910584 - RLTR6-int LTR ERV1 -3221 4557 4342 2 1276 1299 29 103 0 chr5 90627179 90627353 -61909906 - MTB LTR MaLR 0 400 209 2 1276 981 76 7 7 chr5 90627336 90627481 -61909778 + MTA_Mm LTR MaLR 256 400 0 2 1276 8438 63 19 3 chr5 90627481 90628561 -61908698 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1276 2830 59 70 11 chr5 90628561 90628935 -61908324 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1276 1677 114 17 110 chr5 90629080 90629435 -61907824 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1276 464 165 41 124 chr5 90638223 90638252 -61899007 - MT2B LTR ERVL -453 148 132 3 1276 679 195 102 18 chr5 90641389 90641556 -61895703 + RLTR33 LTR ERVK 1 181 -497 3 1276 1714 136 35 0 chr5 90641691 90642001 -61895258 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 3 1276 388 136 198 0 chr5 90642116 90642197 -61895062 - RLTR33 LTR ERVK -34 644 548 3 1276 232 214 0 35 chr5 90647830 90647888 -61889371 + RLTR25A LTR ERVK 6 61 -1042 3 1276 325 207 0 139 chr5 90650486 90650587 -61886672 + MT2B LTR ERVL 169 255 -346 3 1276 549 254 251 9 chr5 90651417 90651632 -61885627 + MTD LTR MaLR 6 272 -147 3 1276 539 252 38 38 chr5 90664622 90664779 -61872480 + ORR1D1 LTR MaLR 1 157 -217 3 1276 658 210 84 38 chr5 90664933 90665140 -61872119 + ORR1D1 LTR MaLR 143 359 -15 3 1276 1787 247 108 52 chr5 90665140 90665906 -61871353 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 963 -546 3 1276 766 174 90 53 chr5 90665874 90666166 -61871093 + ORR1D1-int LTR MaLR 1171 1365 -5 3 1276 1235 221 71 40 chr5 90666172 90666525 -61870734 + ORR1D1 LTR MaLR 5 368 -6 3 1276 1960 103 48 13 chr5 90675708 90676023 -61861236 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 4 1276 6860 150 94 190 chr5 90676023 90677349 -61859910 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1032 -931 4 1276 6860 150 94 190 chr5 90677427 90678270 -61858989 + ORR1A2-int LTR MaLR 1033 1963 0 4 1276 424 178 58 29 chr5 90678270 90678346 -61858913 + ORR1A2 LTR MaLR 1 76 -270 4 1276 424 178 58 29 chr5 90678496 90678511 -61858748 + ORR1A2 LTR MaLR 77 95 -251 4 1276 1692 102 19 8 chr5 90678570 90678828 -61858431 + ORR1A2 LTR MaLR 67 327 0 4 1276 481 125 0 12 chr5 90679850 90679931 -61857328 + ORR1A3-int LTR MaLR 1834 1913 -50 4 1276 895 176 190 13 chr5 90681061 90681342 -61855917 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 1276 523 128 14 23 chr5 90682073 90682184 -61855075 + MERVL-int LTR ERVL 5259 5477 -284 4 1276 239 349 0 99 chr5 90684191 90684312 -61852947 - MT2B LTR ERVL -340 261 153 4 1276 1123 201 175 30 chr5 90685912 90686209 -61851050 + RMER10A LTR ERVL 1 340 -102 4 1276 2995 125 63 4 chr5 90686666 90687157 -61850102 + ORR1A3-int LTR MaLR 976 1495 -468 4 1276 237 237 25 62 chr5 90693542 90693623 -61843636 + MTEb LTR MaLR 294 371 -8 4 1276 1043 174 236 13 chr5 90696470 90696779 -61840480 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1276 225 208 113 0 chr5 90700025 90700078 -61837181 - MT2B LTR ERVL -361 240 182 4 1277 255 318 38 53 chr5 90705780 90705913 -61831346 + RMER12 LTR ERVK 746 876 -446 5 1277 371 386 118 51 chr5 90730213 90730647 -61806612 + MLT1E3 LTR MaLR 159 621 -3 5 1277 1606 91 140 8 chr5 90736514 90736779 -61800480 + ORR1A2 LTR MaLR 28 327 0 5 1277 6910 160 166 20 chr5 90736779 90738341 -61798918 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1790 -2 5 1277 1835 78 46 36 chr5 90738341 90738622 -61798637 + ORR1A2 LTR MaLR 36 319 -8 5 1277 1037 149 46 0 chr5 90775336 90775510 -61761749 + ORR1C2 LTR MaLR 202 383 -1 6 1277 266 222 36 116 chr5 90784584 90784696 -61752563 + MLT1J LTR MaLR 142 244 -268 6 1277 744 271 118 46 chr5 90784707 90785012 -61752247 - MLT1B LTR MaLR -2 388 62 6 1277 438 247 61 37 chr5 90786164 90786328 -61750931 + MLT1E3 LTR MaLR 53 220 -404 6 1277 246 188 0 0 chr5 90786570 90786618 -61750641 + MLT2F LTR ERVL 512 559 -4 6 1277 2160 136 113 3 chr5 90798835 90799205 -61738054 + MTC LTR MaLR 1 411 -10 6 1277 6573 160 67 58 chr5 90799933 90800946 -61736313 + MTC-int LTR MaLR 1 1047 -211 6 1277 6573 160 67 58 chr5 90801114 90801345 -61735914 + MTC-int LTR MaLR 1048 1257 -1 6 1277 2270 156 29 29 chr5 90801349 90801551 -61735708 + MTC LTR MaLR 5 210 -211 6 1277 2656 22 139 9 chr5 90801551 90801867 -61735392 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 7 1277 2270 156 29 29 chr5 90801867 90802081 -61735178 + MTC LTR MaLR 211 421 0 6 1277 259 229 57 57 chr5 90808617 90808705 -61728554 - MTEb LTR MaLR 0 379 292 7 1277 290 285 45 95 chr5 90816934 90817168 -61720091 + MTEb LTR MaLR 118 371 -8 7 1277 3404 55 2 15 chr5 90822472 90822877 -61714382 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1277 862 193 53 0 chr5 90824292 90824463 -61712796 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 191 7 1277 1556 168 11 16 chr5 90825277 90825606 -61711653 + ORR1B1 LTR MaLR 1 385 -9 7 1277 279 146 42 0 chr5 90827242 90827290 -61709969 - ORR1B2 LTR MaLR -317 50 1 7 1277 286 125 42 0 chr5 90829593 90829641 -61707618 - ORR1B2 LTR MaLR -317 50 1 7 1277 276 264 14 0 chr5 90830266 90830338 -61706921 + MLT1I LTR MaLR 94 166 -245 7 1277 2146 139 102 11 chr5 90830844 90831215 -61706044 + MTC LTR MaLR 9 413 -8 7 1278 510 308 93 15 chr5 90835900 90836240 -61701019 - MLT2B4 LTR ERVL -14 542 117 7 1278 2715 130 217 20 chr5 90838473 90839068 -61698191 - RMER6A LTR ERVK -44 712 1 7 1278 312 306 61 27 chr5 90841408 90841556 -61695703 + RLTR40 LTR ERVK 50 202 -615 7 1278 240 309 84 113 chr5 90849000 90849053 -61688206 + LTR81B LTR ERV1? 173 233 -1160 8 1278 240 309 84 113 chr5 90849075 90849163 -61688096 + LTR81B LTR ERV1? 234 310 -1083 8 1278 241 353 114 33 chr5 90850933 90851144 -61686115 + MLT1C LTR MaLR 240 467 0 8 1278 338 327 36 9 chr5 90910450 90910561 -61626698 + MLT1A1 LTR MaLR 1 114 -294 8 1278 323 259 42 59 chr5 90941750 90941869 -61595390 - MTEa LTR MaLR -23 356 240 9 1278 228 302 0 0 chr5 90942963 90943016 -61594243 - MTEa LTR MaLR -297 73 21 9 1278 4550 119 13 100 chr5 90943353 90944181 -61593078 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 9 1278 266 309 10 30 chr5 90945614 90945714 -61591545 + RMER5 LTR ERV1 220 317 -217 9 1278 605 275 24 0 chr5 90945801 90945968 -61591291 + RMER5 LTR ERV1 351 521 -13 9 1278 430 213 45 45 chr5 90952312 90952445 -61584814 - RLTR42-int LTR ERVK -4162 1360 1228 9 1279 368 285 112 7 chr5 90974836 90974988 -61562271 - MLT1D LTR MaLR 0 505 338 9 1279 1372 242 68 15 chr5 90982648 90983046 -61554213 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1279 784 260 206 29 chr5 90992632 90992977 -61544282 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 3 1 1279 369 288 26 46 chr5 90997505 90997658 -61539601 + MER76 LTR ERVL 542 691 0 1 1279 244 333 138 8 chr5 90997772 90997902 -61539357 - MLT1J1 LTR MaLR -277 167 21 1 1279 448 355 73 29 chr5 90998820 90999308 -61537951 - MLT1G LTR MaLR -2 553 41 1 1279 405 127 0 0 chr5 91000905 91000968 -61536291 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 267 1 1279 1311 156 201 24 chr5 91009728 91010056 -61527203 + MTC LTR MaLR 1 386 -35 1 1279 626 276 144 89 chr5 91012271 91012832 -61524427 - MER67C LTR ERV1 -81 630 39 2 1279 2602 148 86 10 chr5 91015530 91016021 -61521238 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 2 1279 267 216 0 0 chr5 91016053 91016104 -61521155 + RLTR11A LTR ERVK 478 528 0 2 1279 859 299 27 73 chr5 91016150 91016267 -61520992 - RLTR11B LTR ERVK -172 356 242 3 1279 859 227 28 76 chr5 91016355 91016610 -61520649 - RLTR11B LTR ERVK -211 242 2 3 1279 269 351 101 7 chr5 91029447 91029596 -61507663 - MLT1F2 LTR MaLR -1 559 397 5 1279 357 227 75 8 chr5 91030984 91031104 -61506155 + LTR41B LTR ERVL 628 755 -3 5 1279 302 227 48 76 chr5 91039644 91039749 -61497510 + ORR1E LTR MaLR 176 277 -82 6 1279 392 207 58 1 chr5 91039843 91039948 -61497311 + ORR1E LTR MaLR 248 358 -12 6 1279 509 267 119 99 chr5 91042185 91042531 -61494728 + ORR1E LTR MaLR 1 372 -7 7 1279 788 235 52 97 chr5 91058413 91058701 -61478558 + RLTR11B LTR ERVK 1 275 -178 9 1279 647 213 23 40 chr5 91058755 91058931 -61478328 + RLTR11B LTR ERVK 259 431 -22 9 1279 952 199 53 14 chr5 91066326 91066535 -61470724 - MTD LTR MaLR 0 419 203 9 1279 665 187 18 49 chr5 91066807 91066970 -61470289 - MTD LTR MaLR -261 158 1 9 1279 617 219 319 0 chr5 91072956 91073232 -61464027 + ORR1D2 LTR MaLR 1 364 -6 1 1279 328 318 56 11 chr5 91074028 91074206 -61463053 + MLT1H LTR MaLR 345 530 -19 1 1279 473 273 106 59 chr5 91076293 91076768 -61460491 - RMER20A LTR ERVK -61 566 14 1 1279 1542 184 159 14 chr5 91077311 91077663 -61459596 - MTD LTR MaLR -11 408 6 1 1279 2058 146 40 27 chr5 91080448 91080850 -61456409 + RMER17C LTR ERVK 1 407 -3 1 1279 439 327 115 7 chr5 91088021 91088326 -61448933 + MER90a LTR ERV1 106 443 -171 1 1280 1150 243 109 18 chr5 91100552 91100891 -61436368 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1280 3839 159 111 10 chr5 91113210 91113897 -61423362 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 1 1280 512 349 45 33 chr5 91121897 91122229 -61415030 - MER21-int LTR ERV1 -3294 897 562 1 1280 358 234 0 157 chr5 91124018 91124165 -61413094 - MT2B LTR ERVL -323 278 155 1 1280 2538 215 88 104 chr5 91126875 91127650 -61409609 - RMER13A LTR ERVK -1 859 98 1 1280 447 182 23 0 chr5 91128233 91128321 -61408938 - RMER17A-int LTR ERVK -650 1078 989 1 1280 1198 158 41 12 chr5 91141687 91141994 -61395265 - RMER17B LTR ERVK -519 439 16 2 1280 1305 151 18 5 chr5 91141997 91142217 -61395042 - RMER17C-int LTR ERVK -1 3237 3015 2 1280 468 196 269 82 chr5 91143427 91143683 -61393576 + ORR1E LTR MaLR 52 355 -4 2 1280 922 331 81 18 chr5 91153839 91154223 -61383036 - LTR16B2 LTR ERVL 0 462 55 2 1280 748 127 0 0 chr5 91156680 91156790 -61380469 + RLTR22_Mus LTR ERVK 2 111 -1697 2 1280 3030 76 12 5 chr5 91156788 91157210 -61380049 + RLTR22_Mus LTR ERVK 395 819 -989 2 1280 2156 148 25 69 chr5 91159681 91160175 -61377084 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 449 -26 2 1280 1044 236 123 113 chr5 91172705 91172790 -61364469 - MTD LTR MaLR -14 405 358 2 1280 1044 236 123 113 chr5 91173006 91173317 -61363942 - MTD LTR MaLR -62 357 5 2 1280 2585 79 29 21 chr5 91176932 91177306 -61359953 + MTB_Mm LTR MaLR 1 377 -30 2 1280 3365 60 8 10 chr5 91180396 91180797 -61356462 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1280 359 399 139 25 chr5 91181893 91182230 -61355029 - MLT1G1 LTR MaLR -162 417 1 2 1280 370 304 130 34 chr5 91203187 91203364 -61333895 - MLT1D LTR MaLR -308 197 4 3 1280 305 264 101 17 chr5 91205873 91206007 -61331252 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 209 3 1280 432 255 0 0 chr5 91220387 91220481 -61316778 + MLT1B LTR MaLR 11 104 -286 3 1280 3043 71 18 15 chr5 91221206 91221605 -61315654 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1280 334 262 93 23 chr5 91222766 91222895 -61314364 + MLT1B LTR MaLR 310 447 -20 3 1280 316 289 9 19 chr5 91225765 91225871 -61311388 + RMER12 LTR ERVK 744 848 -474 3 1280 275 189 133 62 chr5 91225911 91226024 -61311235 - MLT1E2 LTR MaLR -4 620 500 3 1281 360 270 131 65 chr5 91226131 91226238 -61311021 - MLT1E2 LTR MaLR -121 532 386 3 1281 3508 45 8 0 chr5 91227208 91227605 -61309654 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1281 1553 217 48 3 chr5 91228148 91228458 -61308801 - MTD LTR MaLR -95 324 1 3 1281 1088 150 43 21 chr5 91230462 91230676 -61306583 + RLTR13B4 LTR ERVK 3 239 -583 3 1281 372 346 58 75 chr5 91234362 91234709 -61302550 - ORR1E LTR MaLR 0 359 19 3 1281 2650 181 63 63 chr5 91238612 91239120 -61298139 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 5 3 1281 1739 225 36 4 chr5 91262059 91262465 -61274794 - MTD LTR MaLR -25 394 1 3 1281 878 323 134 36 chr5 91262682 91263160 -61274099 - MTE-int LTR MaLR -898 682 158 3 1281 692 291 62 91 chr5 91263216 91263590 -61273669 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 7 3 1281 541 339 79 71 chr5 91267498 91267892 -61269367 + MER31A LTR ERV1 3 399 -86 3 1281 3007 84 32 10 chr5 91273327 91273737 -61263522 + BGLII LTR ERVK 1 419 -2 4 1281 1156 175 207 26 chr5 91274152 91274457 -61262802 + RMER3D-int LTR ERVK 489 848 -1994 4 1281 2007 200 103 38 chr5 91274490 91275338 -61261921 + RMER3D-int LTR ERVK 354 1533 -1309 4 1281 1431 171 64 57 chr5 91275379 91275874 -61261385 + RMER3D-int LTR ERVK 1542 2267 -575 4 1281 1407 206 98 10 chr5 91275878 91276295 -61260964 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1873 2326 0 4 1281 3221 86 2 9 chr5 91276295 91276719 -61260540 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1281 1278 203 19 105 chr5 91276869 91277183 -61260076 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 98 4 1281 2549 53 3 3 chr5 91277193 91277516 -61259743 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 354 -3 4 1281 15568 108 10 17 chr5 91277520 91279855 -61257404 + IAPEY3-int LTR ERVK 21 2689 -4991 4 1281 1642 46 0 0 chr5 91279848 91280042 -61257217 + IAPEY3-int LTR ERVK 4852 5045 -2635 4 1281 704 119 10 0 chr5 91280034 91280135 -61257124 + IAPEY3-int LTR ERVK 3186 3287 -4393 4 1281 3673 67 56 0 chr5 91280135 91280867 -61256392 + IAPEY3-int LTR ERVK 6908 7680 0 4 1281 2581 50 0 3 chr5 91280877 91281201 -61256058 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 354 -3 4 1281 495 168 0 50 chr5 91281206 91281306 -61255953 - ORR1C2 LTR MaLR -283 95 1 4 1281 228 397 0 14 chr5 91286905 91286979 -61250280 - MamGypLTR2c LTR Gypsy -782 286 214 4 1281 226 358 102 67 chr5 91290383 91290757 -61246502 + LTR16E1 LTR ERVL 136 522 -16 4 1281 731 252 127 23 chr5 91292655 91292915 -61244344 - RMER20B LTR ERVK -214 413 127 4 1281 3030 38 117 0 chr5 91294203 91294571 -61242688 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1281 505 324 27 72 chr5 91302266 91302529 -61234730 - MLT1B LTR MaLR -2 388 138 4 1281 768 214 24 42 chr5 91302696 91302862 -61234397 + ORR1D1 LTR MaLR 1 163 -211 4 1281 787 231 25 20 chr5 91302990 91303193 -61234066 + RLTR22_Mur LTR ERVK 152 355 -1493 4 1281 468 225 29 86 chr5 91303219 91303360 -61233899 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1194 1322 -526 4 1281 468 238 34 90 chr5 91303425 91303482 -61233777 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1276 1357 -491 4 1281 526 248 58 7 chr5 91306612 91306766 -61230493 - MTD LTR MaLR 0 419 258 4 1281 324 296 45 0 chr5 91312612 91312700 -61224559 + MT2B LTR ERVL 181 272 -329 4 1281 1100 182 316 50 chr5 91312630 91312855 -61224404 + RLTR25B LTR ERVK 521 808 -220 4 1281 1100 208 78 87 chr5 91312929 91313151 -61224108 + RLTR25B LTR ERVK 809 1028 0 4 1281 366 286 13 74 chr5 91315026 91315167 -61222092 - MLT1A LTR MaLR -17 450 262 4 1281 245 288 103 8 chr5 91315300 91315426 -61221833 - MLT1A LTR MaLR -270 138 1 4 1281 308 246 67 0 chr5 91322895 91323029 -61214230 + ORR1B1-int LTR MaLR 612 754 -755 4 1281 493 266 73 56 chr5 91336934 91337113 -61200146 - MTEb LTR MaLR -197 182 1 5 1281 3850 162 46 56 chr5 91345640 91346118 -61191141 + RMER12 LTR ERVK 1 469 -853 5 1281 3850 162 46 56 chr5 91346303 91346630 -61190629 + RMER12 LTR ERVK 470 798 -524 5 1281 1172 236 109 14 chr5 91346601 91346949 -61190310 + RMER12 LTR ERVK 940 1320 -2 5 1281 1623 170 88 31 chr5 91347681 91347867 -61189392 - RMER17C LTR ERVK 0 410 225 5 1281 1623 170 88 31 chr5 91348046 91348238 -61189021 - RMER17C LTR ERVK -194 216 3 5 1281 324 310 50 10 chr5 91348578 91348679 -61188580 - ORR1E LTR MaLR -249 110 6 5 1281 1880 193 90 54 chr5 91351616 91352272 -61184987 + BGLII_B LTR ERVK 1 528 -33 5 1281 2178 112 15 21 chr5 91352992 91353321 -61183938 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1281 2887 9 0 0 chr5 91353948 91354270 -61182989 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 160 39462 23 3 10 chr5 91354270 91359145 -61178114 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 1 5 1282 2887 9 0 0 chr5 91359145 91359467 -61177792 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1282 270 276 156 25 chr5 91359705 91359865 -61177394 - LTR65 LTR ERV1 -433 236 56 5 1282 323 280 229 11 chr5 91367710 91367898 -61169361 - MLT1B LTR MaLR -158 232 4 5 1282 3732 113 29 127 chr5 91369369 91370202 -61167057 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 5 1282 859 275 35 137 chr5 91373341 91373708 -61163551 + RLTR18 LTR ERVK 1 324 -292 5 1282 1138 204 5 0 chr5 91373708 91373909 -61163350 - RLTR20A LTR ERVK -1 540 339 5 1282 1606 231 44 21 chr5 91374602 91374991 -61162268 - RLTR20A2 LTR ERVK -180 398 1 5 1282 1374 246 0 24 chr5 91375004 91375300 -61161959 + RLTR18B LTR ERVK 224 512 0 5 1282 260 283 43 21 chr5 91375303 91375397 -61161862 - MLT1A LTR MaLR -276 98 3 5 1282 3041 73 5 2 chr5 91376053 91376453 -61160806 + MTB_Mm LTR MaLR 4 404 -3 5 1282 726 252 66 51 chr5 91390490 91390791 -61146468 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 2 5 1282 1785 240 22 187 chr5 91391011 91391480 -61145779 + RMER19C LTR ERVK 1 379 -232 5 1282 1785 240 22 187 chr5 91391500 91391762 -61145497 + RMER19C LTR ERVK 380 610 -1 5 1282 1225 189 158 32 chr5 91394236 91394547 -61142712 - MTB_Mm LTR MaLR -35 372 23 5 1282 2542 161 5 3 chr5 91399418 91399810 -61137449 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 5 1282 270 290 21 12 chr5 91400927 91401032 -61136227 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 261 5 1282 260 214 136 45 chr5 91401165 91401253 -61136006 - MLT1A1 LTR MaLR -290 118 23 5 1282 232 324 161 56 chr5 91404981 91405161 -61132098 + LTR33A LTR ERVL 5 203 -317 5 1282 780 250 354 5 chr5 91411372 91411745 -61125514 - RMER15 LTR ERVL -45 530 27 6 1282 532 91 11 11 chr5 91412165 91412254 -61125005 - RMER17B LTR ERVK -495 463 375 6 1282 277 252 49 29 chr5 91413480 91413582 -61123677 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 301 6 1282 2575 95 0 15 chr5 91415088 91415419 -61121840 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 1282 444 248 107 7 chr5 91416220 91416370 -61120889 + ORR1E LTR MaLR 33 197 -162 6 1282 269 220 17 17 chr5 91417463 91417523 -61119736 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 6 1282 711 349 68 0 chr5 91417734 91418015 -61119244 + RMER15 LTR ERVL 276 575 0 6 1282 427 301 153 47 chr5 91420057 91420357 -61116902 - MLT1H LTR MaLR -10 539 208 6 1282 761 220 60 13 chr5 91427445 91427853 -61109406 - RMER17C LTR ERVK 0 410 77 6 1282 688 216 60 8 chr5 91427942 91428037 -61109222 - RMER17C LTR ERVK -315 95 1 6 1282 226 333 71 18 chr5 91428562 91428675 -61108584 + MLT1H LTR MaLR 115 233 -316 6 1282 303 196 52 65 chr5 91429948 91430101 -61107158 - RMER17A2 LTR ERVK -524 382 232 6 1282 941 155 6 12 chr5 91437461 91437624 -61099635 + RMER5 LTR ERV1 3 164 -370 6 1282 2303 179 74 56 chr5 91437725 91438276 -61098983 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 6 1282 322 355 9 27 chr5 91445347 91445457 -61091802 + MLT1H2 LTR MaLR 73 180 -309 6 1282 576 332 97 37 chr5 91451555 91451986 -61085273 - MER31B LTR ERV1 -5 461 5 6 1282 1807 206 29 40 chr5 91454000 91454420 -61082839 - MTD LTR MaLR -3 416 2 6 1282 614 326 125 81 chr5 91462436 91462867 -61074392 - LTR16A1 LTR ERVL -6 450 1 6 1282 315 383 35 89 chr5 91469558 91469816 -61067443 + MLT1K LTR MaLR 162 405 -190 6 1282 404 303 99 83 chr5 91469815 91470139 -61067120 - ORR1E LTR MaLR -25 334 6 6 1282 896 315 38 26 chr5 91473336 91473598 -61063661 + MTEa-int LTR MaLR 1310 1574 -6 6 1282 262 315 10 82 chr5 91473598 91473695 -61063564 + MTEa LTR MaLR 1 90 -289 6 1282 225 250 83 48 chr5 91474468 91474552 -61062707 - MER50B LTR ERV1 -129 568 482 6 1282 861 236 12 8 chr5 91476414 91476606 -61060653 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 165 6 1282 709 249 55 55 chr5 91478694 91478894 -61058365 + MER21B LTR ERV1 649 848 -15 7 1282 1598 245 39 17 chr5 91483992 91484399 -61052860 + MTD LTR MaLR 2 417 -2 7 1283 1685 167 138 30 chr5 91494166 91494536 -61042723 + MTD LTR MaLR 3 412 -7 7 1283 1032 125 59 12 chr5 91499092 91499262 -61037997 - RMER4B LTR ERVK 0 585 408 7 1283 6184 74 16 5 chr5 91507584 91508442 -61028817 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 111 9 1283 421 283 20 145 chr5 91524678 91524800 -61012459 + MLT1D LTR MaLR 267 382 -123 3 1283 421 283 20 145 chr5 91524856 91524981 -61012278 + MLT1D LTR MaLR 383 483 -22 3 1283 527 206 92 39 chr5 91530275 91530512 -61006747 - MT2A LTR ERVL -41 492 194 4 1283 1615 165 172 15 chr5 91534736 91535068 -61002191 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1283 1145 162 111 0 chr5 91537901 91538135 -60999124 + RMER12 LTR ERVK 484 743 -579 5 1283 269 110 130 52 chr5 91538216 91538293 -60998966 - RMER12 LTR ERVK -574 748 666 5 1283 2016 208 121 61 chr5 91548821 91549344 -60987915 - RMER15 LTR ERVL 0 575 22 7 1283 730 313 112 40 chr5 91550364 91550937 -60986322 - RMER15-int LTR ERVL -225 4774 4161 7 1283 309 374 8 8 chr5 91550963 91551095 -60986164 - RMER15-int LTR ERVL -2447 2552 2421 7 1283 647 239 15 7 chr5 91551141 91551276 -60985983 - RMER15-int LTR ERVL -2682 2317 2182 7 1283 449 278 68 6 chr5 91552135 91552298 -60984961 - RMER15-int LTR ERVL -3598 1401 1229 7 1283 530 384 14 4 chr5 91552485 91552762 -60984497 - RMER15-int LTR ERVL -4463 536 257 7 1283 727 317 103 2 chr5 91554031 91554430 -60982829 + MER90a LTR ERV1 66 498 -116 7 1283 243 331 99 88 chr5 91554846 91555028 -60982231 - MLT1J LTR MaLR -298 214 31 7 1283 2129 95 49 0 chr5 91555417 91555722 -60981537 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 8 7 1283 9271 137 152 12 chr5 91555723 91557445 -60979814 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 7 1283 1967 103 44 88 chr5 91557446 91557787 -60979472 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 7 1283 1130 130 6 0 chr5 91558402 91558579 -60978680 - ORR1A3-int LTR MaLR -379 1584 1407 8 1283 1358 279 169 75 chr5 91561443 91562556 -60974703 - RMER12 LTR ERVK -104 1218 1 8 1283 1594 176 7 80 chr5 91565290 91565768 -60971491 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 9 1283 2779 133 33 13 chr5 91580113 91580562 -60956697 + ORR1A3-int LTR MaLR 215 672 -1291 1 1283 478 251 88 186 chr5 91584154 91584472 -60952787 + RMER20B LTR ERVK 318 604 -23 1 1283 1867 151 19 22 chr5 91592219 91592579 -60944680 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1283 631 316 119 68 chr5 91602417 91602753 -60934506 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 1 1283 357 277 42 11 chr5 91603888 91603983 -60933276 - MTE-int LTR MaLR -696 884 787 1 1283 1273 332 151 38 chr5 91604565 91604666 -60932593 + ORR1E-int LTR MaLR 391 489 -1091 1 1283 1273 332 151 38 chr5 91604843 91605406 -60931853 + ORR1E-int LTR MaLR 490 1112 -468 1 1283 1273 241 54 70 chr5 91605500 91605744 -60931515 + ORR1E-int LTR MaLR 1113 1370 0 1 1283 1125 259 84 54 chr5 91605744 91606079 -60931180 + ORR1E LTR MaLR 4 348 -11 1 1283 1722 245 43 3 chr5 91607970 91608343 -60928916 + MTD LTR MaLR 1 388 -31 1 1283 262 354 102 46 chr5 91608960 91609176 -60928083 + ORR1E LTR MaLR 26 253 -106 1 1283 231 300 32 43 chr5 91609729 91609823 -60927436 - MLT1A0 LTR MaLR -243 122 30 1 1283 274 264 54 54 chr5 91612616 91612708 -60924551 + MTD LTR MaLR 13 104 -315 1 1283 241 384 28 73 chr5 91616157 91616334 -60920925 - LTR16C LTR ERVL -60 429 261 1 1284 1993 190 14 19 chr5 91620263 91620633 -60916626 - MTC LTR MaLR -53 368 1 1 1284 283 218 0 0 chr5 91620807 91620862 -60916397 + MTC LTR MaLR 359 413 -8 1 1284 287 304 0 0 chr5 91622291 91622360 -60914899 - MLT1J2 LTR MaLR -38 410 342 1 1284 487 380 99 33 chr5 91622653 91623075 -60914184 - MLT1J2-int LTR MaLR -105 1282 833 1 1284 300 26 0 0 chr5 91636996 91637034 -60900225 + BGLII LTR ERVK 1 38 -383 2 1284 259 140 0 66 chr5 91637017 91637078 -60900181 + BGLII LTR ERVK 365 421 0 2 1284 412 359 74 30 chr5 91647030 91647366 -60889893 - ORR1E LTR MaLR -8 351 1 2 1284 693 320 157 0 chr5 91647366 91647624 -60889635 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1226 2 1284 1259 315 64 42 chr5 91647680 91648183 -60889076 - ORR1E-int LTR MaLR -1032 548 35 2 1284 362 299 125 65 chr5 91648218 91648386 -60888873 + MTE-int LTR MaLR 589 766 -814 2 1284 539 339 37 59 chr5 91648349 91648672 -60888587 - ORR1E LTR MaLR -42 317 2 2 1284 228 311 196 54 chr5 91648676 91648992 -60888267 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 9 2 1284 3108 11 0 78 chr5 91655798 91656196 -60881063 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1284 52844 25 14 3 chr5 91656196 91662659 -60874600 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3 2 1284 3108 11 0 78 chr5 91662661 91663059 -60874200 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1284 709 264 160 40 chr5 91664714 91665163 -60872096 - MLT1D LTR MaLR 0 505 3 2 1284 228 319 29 0 chr5 91665612 91665681 -60871578 - RLTR20C LTR ERVK -381 153 83 2 1284 934 192 290 24 chr5 91666437 91666768 -60870491 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1284 744 321 90 34 chr5 91667344 91667821 -60869438 + MER90a LTR ERV1 111 614 0 2 1284 458 220 12 1 chr5 91668062 91668165 -60869094 + ORR1D2 LTR MaLR 1 104 -280 2 1284 1522 143 4 16 chr5 91668251 91668493 -60868766 - ORR1A4 LTR MaLR -90 239 1 2 1284 1153 314 112 52 chr5 91674387 91675046 -60862213 + MTEb-int LTR MaLR 843 1578 -2 2 1284 633 229 161 65 chr5 91675050 91675391 -60861868 + MTEb LTR MaLR 3 376 -3 2 1284 449 276 86 68 chr5 91675820 91675983 -60861276 + MTE-int LTR MaLR 176 341 -1239 2 1284 680 333 106 72 chr5 91676140 91676583 -60860676 - MLT1C LTR MaLR 0 467 10 2 1284 1457 246 95 55 chr5 91684488 91684575 -60852684 - RLTR20A LTR ERVK -2 539 454 2 1284 1457 251 94 60 chr5 91684612 91684980 -60852279 - RLTR20A LTR ERVK -85 493 102 2 1284 813 300 82 114 chr5 91685330 91685468 -60851791 - RLTR20A2 LTR ERVK -405 173 2 2 1284 274 286 84 19 chr5 91686572 91686679 -60850580 + MLT1K LTR MaLR 482 595 0 2 1284 1729 178 133 22 chr5 91689452 91689769 -60847490 + MTC LTR MaLR 1 351 -68 2 1284 326 162 27 13 chr5 91689789 91689852 -60847407 + MTC LTR MaLR 352 416 -3 2 1284 1035 226 96 101 chr5 91692381 91692726 -60844533 - MTE2a LTR MaLR -16 363 21 2 1284 241 371 120 0 chr5 91749090 91749265 -60787994 + MLT1D-int LTR MaLR 669 864 -523 3 1285 227 322 148 40 chr5 91751138 91751287 -60785972 + MLT1D LTR MaLR 339 503 -2 3 1285 404 161 67 22 chr5 91752624 91752713 -60784546 + ORR1D2 LTR MaLR 278 370 0 3 1285 2609 159 11 42 chr5 91755102 91755626 -60781633 - RLTR28 LTR ERVL -16 508 1 3 1285 1528 191 139 3 chr5 91756401 91756560 -60780699 + ORR1C2 LTR MaLR 1 173 -211 3 1285 1528 191 139 3 chr5 91756651 91756828 -60780431 + ORR1C2 LTR MaLR 174 383 -1 3 1285 2018 126 3 61 chr5 91757205 91757535 -60779724 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 1285 4973 133 40 43 chr5 91758679 91759588 -60777671 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 3 1285 369 217 0 52 chr5 91759720 91759817 -60777442 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 317 3 1285 259 333 37 67 chr5 91759984 91760119 -60777140 - MLT1A1 LTR MaLR -253 155 25 3 1285 319 363 64 68 chr5 91760219 91760485 -60776774 - MLT1A1-int LTR MaLR -1 1408 1144 3 1285 550 327 131 26 chr5 91761162 91761579 -60775680 - MLT1A1-int LTR MaLR -315 1094 633 3 1285 1646 216 59 5 chr5 91761579 91761969 -60775290 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 3 1285 299 324 83 61 chr5 91762275 91762505 -60774754 - MLT1A1-int LTR MaLR -1161 248 14 3 1285 597 258 20 44 chr5 91763149 91763352 -60773907 + RMER15 LTR ERVL 22 219 -356 3 1285 849 197 25 55 chr5 91763341 91763540 -60773719 + RMER15 LTR ERVL 383 575 0 3 1285 1458 157 15 112 chr5 91772484 91772822 -60764437 + ORR1A4 LTR MaLR 1 305 -24 3 1285 770 331 119 35 chr5 91800837 91801232 -60736027 - MER70B LTR ERVL -145 433 6 4 1285 1179 264 30 22 chr5 91805182 91805553 -60731706 + MTEa LTR MaLR 5 378 -1 4 1285 5299 112 10 39 chr5 91806188 91807076 -60730183 + RMER17D LTR ERVK 26 887 -2 4 1285 903 336 90 72 chr5 91835276 91836201 -60701058 - MLT1I-int LTR MaLR -639 1096 57 4 1285 1149 248 100 6 chr5 91836505 91836834 -60700425 + MTE2b LTR MaLR 3 362 -17 4 1285 271 262 114 61 chr5 91837594 91837708 -60699551 + MTEa LTR MaLR 3 122 -257 4 1285 373 307 112 15 chr5 91837859 91838064 -60699195 + MT2A LTR ERVL 307 531 -2 4 1285 225 312 12 0 chr5 91838674 91838754 -60698505 - MLT1I LTR MaLR -30 381 301 4 1285 438 304 86 120 chr5 91844301 91844653 -60692606 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 4 1285 576 257 85 32 chr5 91858794 91858983 -60678276 + MLT2B4 LTR ERVL 3 201 -355 4 1285 528 274 61 122 chr5 91859376 91859621 -60677638 + MLT2B4 LTR ERVL 337 566 -1 4 1285 478 115 7 14 chr5 91860721 91860826 -60676433 + ORR1B1 LTR MaLR 282 394 0 4 1285 733 147 58 117 chr5 91862633 91862856 -60674403 + RMER17D2 LTR ERVK 598 807 -2 4 1285 358 275 101 0 chr5 91866195 91866304 -60670955 - MLT1K LTR MaLR -306 289 170 5 1285 462 315 179 13 chr5 91868647 91868965 -60668294 + MLT1A LTR MaLR 4 374 0 5 1285 918 288 34 48 chr5 91869555 91869909 -60667350 - MER90a LTR ERV1 -1 613 265 5 1285 1235 275 47 3 chr5 91870407 91870750 -60666509 + ORR1D2 LTR MaLR 1 358 -12 5 1285 245 321 57 21 chr5 91870882 91871022 -60666237 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 260 5 1285 1622 244 50 11 chr5 91871778 91872179 -60665080 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 5 1285 354 200 12 12 chr5 91872506 91872587 -60664672 + MTC LTR MaLR 5 85 -336 5 1285 439 230 87 8 chr5 91875464 91875591 -60661668 - MTD LTR MaLR 0 419 283 5 1286 848 148 36 24 chr5 91883259 91883425 -60653834 + RMER17A2 LTR ERVK 1 168 -738 5 1286 1150 320 29 32 chr5 91895379 91895756 -60641503 - MLT1B LTR MaLR -3 387 12 5 1286 6982 63 8 1 chr5 91899118 91900005 -60637254 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 5 1286 253 132 0 0 chr5 91905447 91905485 -60631774 - RMER15 LTR ERVL -537 38 1 5 1286 240 328 134 0 chr5 91906106 91906240 -60631019 + LTR88b LTR Gypsy? 4 155 -682 5 1286 243 364 107 24 chr5 91906780 91906949 -60630310 + MLT1K LTR MaLR 63 245 -350 5 1286 257 333 37 31 chr5 91907478 91907639 -60629620 + LTR37B LTR ERV1 280 441 -27 5 1286 289 414 56 24 chr5 91908298 91908548 -60628711 + LTR78 LTR ERV1 420 677 -627 5 1286 2165 123 13 4 chr5 91911427 91911764 -60625495 + MTC LTR MaLR 53 384 -37 5 1286 241 363 90 68 chr5 91916974 91917240 -60620019 + LTR85b LTR Gypsy? 513 784 0 5 1286 1934 147 59 70 chr5 91918009 91918061 -60619198 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 312 5 1286 1934 150 59 67 chr5 91918102 91918435 -60618824 - ORR1C1 LTR MaLR -67 311 2 5 1286 270 296 106 0 chr5 91919565 91919697 -60617562 - MER89 LTR ERV1 -259 300 155 5 1286 248 346 36 29 chr5 91920042 91920182 -60617077 + ORR1E LTR MaLR 1 141 -218 5 1286 1952 300 33 15 chr5 91920441 91921163 -60616096 - MER89-int LTR ERV1 -321 6480 5746 5 1286 1614 204 108 26 chr5 91929075 91929453 -60607806 - MTD LTR MaLR -10 409 1 6 1286 319 316 114 70 chr5 91929461 91929662 -60607597 - MLT1J2 LTR MaLR 0 448 235 6 1286 486 252 28 14 chr5 91935604 91935749 -60601510 + ORR1E LTR MaLR 8 154 -205 6 1286 366 81 127 16 chr5 91936174 91936237 -60601022 - MTC LTR MaLR 0 421 352 6 1286 1995 164 13 66 chr5 91936398 91936777 -60600482 - MTC LTR MaLR -62 359 1 6 1286 1969 127 23 23 chr5 91938272 91938618 -60598641 + RMER6C LTR ERVK 1 346 -344 6 1286 567 281 111 4 chr5 91939390 91939615 -60597644 + MLT1B-int LTR MaLR 1121 1369 -2 6 1286 561 304 91 75 chr5 91939618 91939938 -60597321 + MLT1B LTR MaLR 3 327 -63 6 1286 1305 216 54 65 chr5 91940160 91940546 -60596713 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 6 1286 423 332 117 87 chr5 91941368 91941932 -60595327 - MER34A1 LTR ERV1 -2 585 5 6 1286 257 238 56 56 chr5 91942173 91942262 -60594997 + MLT1I LTR MaLR 32 120 -291 6 1286 2146 166 228 29 chr5 91943068 91943578 -60593681 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 1286 424 330 60 14 chr5 91953970 91954185 -60583074 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 139 6 1286 2809 52 24 0 chr5 91956508 91956890 -60580369 - RLTR10A LTR ERVK -20 391 1 6 1286 2194 76 75 56 chr5 91959612 91959933 -60577326 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1286 427 221 17 42 chr5 91962964 91963082 -60574177 - MLT1C LTR MaLR 0 467 353 6 1286 416 192 90 10 chr5 91968544 91968644 -60568615 - MTD LTR MaLR -11 410 303 6 1286 616 213 8 8 chr5 91969704 91969827 -60567432 - MTD LTR MaLR -146 273 151 6 1286 303 210 0 0 chr5 91969838 91969900 -60567359 - MTD LTR MaLR -342 79 18 6 1286 1006 295 87 19 chr5 91975692 91976162 -60561097 + RMER5 LTR ERV1 33 534 0 6 1286 451 239 34 8 chr5 91981978 91982096 -60555163 - MT2A LTR ERVL -326 207 87 6 1286 585 180 0 111 chr5 91982088 91982232 -60555027 - MT2A LTR ERVL -405 128 1 6 1286 1884 259 39 2 chr5 91982512 91983026 -60554233 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 6 1286 2523 129 12 35 chr5 91983134 91983537 -60553722 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1286 734 224 9 86 chr5 91987587 91987797 -60549462 - MTEa LTR MaLR -181 198 5 6 1286 795 329 13 60 chr5 91987802 91988200 -60549059 - MER31B LTR ERV1 -87 379 1 6 1286 913 167 23 47 chr5 91990545 91990759 -60546500 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 166 6 1286 812 161 81 29 chr5 91990889 91991062 -60546197 - ORR1D1 LTR MaLR -192 182 1 6 1286 404 266 177 35 chr5 91991173 91991399 -60545860 - ORR1E LTR MaLR -5 354 97 6 1286 2136 136 66 29 chr5 91992406 91992786 -60544473 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1286 762 297 60 38 chr5 91995673 91995991 -60541268 - RMER15 LTR ERVL 0 575 251 7 1286 1822 127 87 6 chr5 91996416 91996748 -60540511 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 7 1286 2708 147 47 54 chr5 91997448 91997981 -60539278 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 7 1286 1746 214 38 35 chr5 92001441 92001641 -60535618 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 177 2 1286 1746 214 38 35 chr5 92001680 92001852 -60535407 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 2 2 1286 1841 289 111 49 chr5 92001940 92002740 -60534519 - MER21B LTR ERV1 -12 851 2 4 1286 319 289 35 17 chr5 92008989 92009105 -60528154 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 248 1 1286 914 297 17 107 chr5 92010630 92011033 -60526226 + MTEa LTR MaLR 1 367 -12 1 1287 1365 200 67 55 chr5 92013507 92013970 -60523289 + RLTR20B3 LTR ERVK 35 509 -68 1 1287 1868 173 30 112 chr5 92017335 92018165 -60519094 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 1287 374 298 8 24 chr5 92018410 92018534 -60518725 + MLT1A LTR MaLR 39 160 -214 2 1287 383 252 110 14 chr5 92018696 92018862 -60518397 + MLT1A LTR MaLR 195 374 -16 2 1287 1900 148 48 6 chr5 92035240 92035574 -60501685 + ORR1B1 LTR MaLR 47 394 0 4 1287 238 331 89 56 chr5 92058603 92058782 -60478477 - LTR88c LTR Genie? -83 779 595 7 1287 414 284 159 37 chr5 92059525 92059674 -60477585 - MLT1A LTR MaLR -24 350 175 7 1287 414 284 159 37 chr5 92059718 92059813 -60477446 - MLT1A LTR MaLR -200 174 77 7 1287 244 312 34 51 chr5 92066558 92066676 -60470583 + ORR1E LTR MaLR 79 194 -165 7 1287 2927 54 89 21 chr5 92068891 92069272 -60467987 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1287 425 331 80 34 chr5 92073091 92073266 -60463993 - MLT1E3 LTR MaLR -4 620 374 8 1287 389 318 92 52 chr5 92074161 92074390 -60462869 + MLT1J LTR MaLR 237 474 -38 8 1287 1950 172 29 6 chr5 92074499 92074850 -60462409 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 9 1287 703 295 83 23 chr5 92076232 92076496 -60460763 + MLT1A0 LTR MaLR 85 364 -1 9 1287 292 333 76 7 chr5 92079287 92079432 -60457827 + LTR33C LTR ERVL 116 270 -359 9 1287 244 270 59 129 chr5 92079402 92079657 -60457602 + MLT2E LTR ERVL 369 605 -23 9 1287 2229 143 60 0 chr5 92083670 92084034 -60453225 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 1287 863 291 145 35 chr5 92084083 92084511 -60452748 - LTR53 LTR ERVL -37 482 8 1 1287 239 372 21 11 chr5 92086738 92086833 -60450426 - LTR33 LTR ERVL -380 135 40 1 1287 244 331 62 16 chr5 92091300 92091429 -60445830 + MLT1A0 LTR MaLR 72 206 -159 1 1287 3058 110 112 41 chr5 92091872 92092335 -60444924 + RLTR19A LTR ERVK 1 496 0 1 1287 3424 64 2 5 chr5 92095404 92095812 -60441447 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1287 871 277 115 52 chr5 92096830 92097208 -60440051 + MLT2C2 LTR ERVL 20 414 -50 1 1287 871 277 115 52 chr5 92097251 92097291 -60439968 + MLT2C2 LTR ERVL 415 464 0 1 1287 264 278 129 26 chr5 92097475 92097630 -60439629 + LTR78 LTR ERV1 940 1110 -194 1 1287 279 339 50 17 chr5 92100611 92100731 -60436528 + ORR1E LTR MaLR 1 124 -235 1 1287 309 378 36 32 chr5 92100818 92101033 -60436226 - MT2A LTR ERVL -85 448 231 1 1287 309 378 36 32 chr5 92101063 92101096 -60436163 - MT2A LTR ERVL -303 230 199 1 1287 267 295 98 0 chr5 92101166 92101278 -60435981 - MLT2B3 LTR ERVL -431 123 1 1 1287 4386 113 82 13 chr5 92102486 92103120 -60434139 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 1 1287 1453 160 47 0 chr5 92103320 92103576 -60433683 - RMER6C LTR ERVK 0 690 423 1 1287 365 100 0 0 chr5 92103579 92103629 -60433630 - RMER6C LTR ERVK -670 50 1 1 1287 313 245 94 21 chr5 92107044 92107140 -60430119 + MTEb LTR MaLR 277 379 0 1 1287 1294 215 151 42 chr5 92116586 92116964 -60420295 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1287 557 151 31 63 chr5 92117424 92117551 -60419708 - MTC LTR MaLR -30 389 267 1 1287 660 309 28 38 chr5 92117564 92117873 -60419386 - MTC LTR MaLR -116 303 5 1 1287 1202 268 181 32 chr5 92117880 92118515 -60418744 - MTC-int LTR MaLR -299 1281 625 1 1287 530 364 68 12 chr5 92121881 92122131 -60415128 + MLT1G3 LTR MaLR 37 300 -295 1 1287 1908 112 17 78 chr5 92129160 92129507 -60407752 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1287 2465 69 31 0 chr5 92133285 92133602 -60403657 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1287 1875 146 37 65 chr5 92133779 92134161 -60403098 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1287 907 242 50 29 chr5 92134631 92134873 -60402386 + ORR1E LTR MaLR 1 247 -112 1 1287 826 316 133 50 chr5 92134897 92135340 -60401919 + MLT1G3 LTR MaLR 116 595 0 1 1287 490 357 93 63 chr5 92139318 92139773 -60397486 - LTR83 LTR ERVL -85 695 212 1 1287 490 357 93 63 chr5 92139893 92140038 -60397221 - LTR83 LTR ERVL -569 211 77 1 1288 2893 39 0 0 chr5 92143691 92144023 -60393236 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 1 1288 747 212 136 5 chr5 92147596 92147875 -60389384 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 1 2 1288 2156 186 84 37 chr5 92148396 92148494 -60388765 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 465 2 1288 2156 186 84 37 chr5 92148528 92148775 -60388484 - RLTR20B2 LTR ERVK -96 464 186 2 1288 2156 186 84 37 chr5 92148842 92149030 -60388229 - RLTR20B2 LTR ERVK -375 185 4 2 1288 231 250 0 0 chr5 92150729 92150789 -60386470 + LTR50 LTR ERVL 613 672 -123 2 1288 911 245 46 38 chr5 92153790 92154238 -60383021 - RMER2 LTR ERV1 -14 553 3 2 1288 376 281 145 22 chr5 92156433 92156702 -60380557 + RMER5 LTR ERV1 85 386 -148 2 1288 3511 25 2 0 chr5 92157648 92158043 -60379216 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1288 1653 141 54 43 chr5 92160710 92161081 -60376178 + RMER10A LTR ERVL 68 442 0 2 1288 562 284 214 13 chr5 92161131 92161434 -60375825 + MLT1J LTR MaLR 33 396 -116 2 1288 583 306 54 62 chr5 92161870 92162128 -60375131 - ORR1E LTR MaLR -103 256 1 2 1288 2505 189 44 0 chr5 92167722 92168198 -60369061 + RLTR18B LTR ERVK 8 504 -8 2 1288 794 244 66 41 chr5 92171781 92172143 -60365116 + RMER15 LTR ERVL 45 539 -36 2 1288 307 161 16 16 chr5 92173918 92173981 -60363278 - ORR1B1 LTR MaLR -331 63 1 2 1288 812 308 72 14 chr5 92174273 92174632 -60362627 + MLT1B LTR MaLR 11 390 0 2 1288 2286 88 20 3 chr5 92181993 92182334 -60354925 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 347 -38 2 1288 1333 327 98 28 chr5 92187674 92188269 -60348990 + MTE-int LTR MaLR 890 1527 -53 2 1288 389 314 35 61 chr5 92188269 92188466 -60348793 + ORR1E LTR MaLR 1 192 -167 2 1288 591 314 93 49 chr5 92191397 92191806 -60345453 + LTR68 LTR ERV1 11 437 -303 2 1288 417 300 51 66 chr5 92196562 92196897 -60340362 - LTR85a LTR Gypsy? -370 332 3 2 1288 1547 143 99 36 chr5 92201318 92201651 -60335608 - ORR1B2 LTR MaLR -13 354 1 2 1288 268 307 20 0 chr5 92209949 92210050 -60327209 + LTR33 LTR ERVL 3 105 -410 3 1288 402 237 52 94 chr5 92212392 92212647 -60324612 - RLTR5_Mm LTR ERV1 -121 507 238 3 1288 2282 158 128 21 chr5 92213678 92214155 -60323104 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 1 3 1288 257 242 0 0 chr5 92224585 92224647 -60312612 + MLT1A1 LTR MaLR 333 394 -14 3 1288 319 343 66 79 chr5 92226196 92226500 -60310759 - MLT1L LTR MaLR -60 550 251 3 1288 3313 48 8 0 chr5 92229401 92229798 -60307461 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1288 1444 213 209 7 chr5 92231680 92232125 -60305134 - RMER15 LTR ERVL -14 561 27 3 1288 1531 173 85 35 chr5 92234303 92234644 -60302615 + RLTR15 LTR ERVK 2 359 0 3 1288 263 365 24 0 chr5 92236431 92236557 -60300702 + MLT1K LTR MaLR 460 588 -7 3 1288 784 301 89 33 chr5 92247022 92247414 -60289845 + MER70B LTR ERVL 12 425 -153 3 1288 2111 126 11 6 chr5 92252993 92253345 -60283914 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 3 1288 243 277 71 12 chr5 92254540 92254624 -60282635 - MER34A LTR ERV1 -22 549 461 3 1288 3149 70 8 0 chr5 92258453 92258850 -60278409 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1288 2304 144 35 5 chr5 92260556 92260955 -60276304 - MTC LTR MaLR 0 421 11 3 1288 546 153 68 8 chr5 92260993 92261125 -60276134 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1119 3 1288 4909 147 114 29 chr5 92267374 92268418 -60268841 - MTC-int LTR MaLR -124 1134 2 3 1288 2188 158 40 10 chr5 92268417 92268820 -60268439 - MTC LTR MaLR 0 421 7 3 1288 1421 207 20 60 chr5 92270127 92270476 -60266783 + MTD LTR MaLR 1 335 -84 3 1288 1328 238 32 93 chr5 92270649 92271080 -60266179 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 1289 443 251 25 84 chr5 92278132 92278327 -60258932 - MTC LTR MaLR -229 190 1 3 1289 543 242 142 6 chr5 92278330 92278492 -60258767 + MTD LTR MaLR 223 406 -13 4 1289 3461 33 2 0 chr5 92279866 92280261 -60256998 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1289 1959 207 58 24 chr5 92281361 92281862 -60255397 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 1 4 1289 2020 165 40 15 chr5 92288492 92289007 -60248252 + RMER4B LTR ERVK 17 585 0 4 1289 613 250 129 17 chr5 92289763 92290003 -60247256 - MLT1C LTR MaLR -18 449 183 4 1289 1737 217 7 63 chr5 92292157 92292585 -60244674 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 4 1289 1541 219 35 29 chr5 92294167 92294544 -60242715 - MTD LTR MaLR -40 379 1 4 1289 835 217 22 17 chr5 92295632 92295810 -60241449 + ORR1D1 LTR MaLR 3 181 -193 4 1289 312 174 0 14 chr5 92295986 92296056 -60241203 + ORR1D1 LTR MaLR 175 243 -131 4 1289 322 283 26 17 chr5 92296043 92296158 -60241101 + LTR16D LTR ERVL 534 649 -2 4 1289 381 244 0 0 chr5 92296272 92296354 -60240905 + MTC LTR MaLR 1 82 -339 4 1289 1587 156 99 6 chr5 92296632 92296954 -60240305 + MTC LTR MaLR 70 421 0 4 1289 997 224 149 45 chr5 92299961 92300317 -60236942 + MTD LTR MaLR 18 410 -9 4 1289 285 339 105 65 chr5 92300454 92300760 -60236499 - MLT2B3 LTR ERVL -213 341 24 4 1289 3311 151 17 14 chr5 92300910 92301494 -60235765 + RLTR17 LTR ERVK 101 686 -6 4 1289 530 343 36 45 chr5 92301794 92302155 -60235104 + MLT1A0 LTR MaLR 1 374 0 4 1289 262 337 12 0 chr5 92307025 92307108 -60230151 - MLT1A LTR MaLR -243 131 48 4 1289 259 216 75 64 chr5 92307687 92307781 -60229478 - ORR1E LTR MaLR -5 354 260 4 1289 1764 123 15 28 chr5 92309346 92309671 -60227588 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 1289 1662 147 6 126 chr5 92311528 92311893 -60225366 - ORR1A3 LTR MaLR -5 321 1 4 1289 5732 105 42 90 chr5 92311893 92312980 -60224279 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 929 4 1289 3315 46 10 0 chr5 92313111 92313504 -60223755 + MTB LTR MaLR 4 400 0 4 1289 3533 23 2 0 chr5 92314386 92314781 -60222478 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1289 888 191 71 40 chr5 92317889 92318113 -60219146 + RMER13B LTR ERVK 535 765 -143 4 1289 2444 65 12 58 chr5 92318707 92319050 -60218209 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1289 1819 181 15 54 chr5 92325524 92325916 -60211343 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 1 4 1289 336 217 76 34 chr5 92325916 92326030 -60211229 + LTR81C LTR ERV1? 874 992 -161 4 1289 309 349 83 8 chr5 92327050 92327316 -60209943 + LTR16C LTR ERVL 148 433 -56 4 1289 767 308 55 22 chr5 92328735 92329007 -60208252 - MLT1A0 LTR MaLR -79 286 6 4 1289 472 324 54 25 chr5 92329152 92329393 -60207866 + MLT1I LTR MaLR 129 376 -35 4 1289 3506 162 53 15 chr5 92330318 92330976 -60206283 + RLTR17 LTR ERVK 10 692 0 4 1289 338 285 69 130 chr5 92331441 92331687 -60205572 + MLT1I LTR MaLR 416 646 -8 4 1289 273 259 0 90 chr5 92332804 92332893 -60204366 - MLT1J LTR MaLR -9 503 423 4 1289 373 377 50 17 chr5 92333265 92333505 -60203754 + MLT1J LTR MaLR 3 250 -262 4 1289 1924 152 3 47 chr5 92333855 92334199 -60203060 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1289 854 216 41 0 chr5 92334535 92334729 -60202530 - MLT2B2 LTR ERVL -307 208 7 5 1289 249 322 66 8 chr5 92334759 92334881 -60202378 + MLT1L LTR MaLR 6 134 -476 5 1289 1122 140 38 0 chr5 92334932 92335118 -60202141 - RLTR20B3 LTR ERVK -384 193 1 5 1289 259 330 105 48 chr5 92337463 92337673 -60199586 + LTR16E1 LTR ERVL 307 528 -10 5 1289 362 269 155 20 chr5 92337733 92337881 -60199378 - MLT1B LTR MaLR -19 371 204 5 1289 303 305 50 8 chr5 92342567 92342686 -60194573 - LTR16A1 LTR ERVL 0 456 333 5 1289 1110 201 265 13 chr5 92343298 92343401 -60193858 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 244 5 1289 1110 201 265 13 chr5 92343434 92343628 -60193631 - ORR1D1 LTR MaLR -131 243 1 5 1289 878 314 96 40 chr5 92343762 92344157 -60193102 + MTD LTR MaLR 3 419 0 5 1289 1160 232 128 15 chr5 92344948 92345285 -60191974 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 5 1289 662 261 159 41 chr5 92345695 92345990 -60191269 + MLT1A LTR MaLR 13 351 -23 5 1289 400 322 75 30 chr5 92347701 92347967 -60189292 - MER21B LTR ERV1 -364 499 222 5 1289 1518 113 25 12 chr5 92347978 92348219 -60189040 + ORR1A4 LTR MaLR 86 329 0 5 1289 375 252 42 38 chr5 92350207 92350346 -60186913 - MLT1A0 LTR MaLR -1 407 216 5 1289 4393 14 2 24 chr5 92353848 92354352 -60182907 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1289 28497 10 16 0 chr5 92354352 92357479 -60179780 + MERVL-int LTR ERVL 1 3177 -2308 5 1289 18353 23 1 0 chr5 92357475 92359519 -60177740 + MERVL-int LTR ERVL 3327 5371 -114 5 1289 374 123 13 40 chr5 92359519 92359595 -60177664 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 5 1289 321 0 0 0 chr5 92359595 92359633 -60177626 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 1289 4393 14 2 24 chr5 92359633 92360137 -60177122 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1289 480 294 179 23 chr5 92360452 92360723 -60176536 - MLT1A0 LTR MaLR -32 333 21 5 1289 3812 149 100 94 chr5 92363662 92363767 -60173492 - RMER19B LTR ERVK 0 902 797 5 1289 3812 149 100 94 chr5 92363951 92364741 -60172518 - RMER19B LTR ERVK -106 796 1 5 1289 316 301 84 67 chr5 92366194 92366372 -60170887 + MTEa LTR MaLR 100 280 -99 5 1289 784 244 118 0 chr5 92371813 92372042 -60165217 + ORR1D1 LTR MaLR 1 256 -118 5 1289 1657 81 88 66 chr5 92374849 92375154 -60162105 + ORR1A2 LTR MaLR 8 319 -8 5 1289 260 291 153 23 chr5 92375382 92375558 -60161701 - RLTR12B LTR ERVK -31 497 299 5 1289 322 275 137 41 chr5 92375842 92376039 -60161220 - RLTR12B LTR ERVK -265 263 48 5 1289 1993 176 87 10 chr5 92376329 92376720 -60160539 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1289 1920 196 50 46 chr5 92383904 92384321 -60152938 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 5 1289 1231 202 109 12 chr5 92386181 92386501 -60150758 + ORR1D2 LTR MaLR 1 351 -19 6 1289 3032 92 2 7 chr5 92387464 92387914 -60149345 + MT-int LTR MaLR 199 646 -452 6 1289 594 69 0 11 chr5 92387916 92388004 -60149255 + ORR1D2 LTR MaLR 321 407 0 6 1289 2025 186 48 20 chr5 92388150 92388544 -60148715 + MTB_Mm LTR MaLR 1 405 -2 6 1289 755 208 43 48 chr5 92389475 92389694 -60147565 + MTD LTR MaLR 196 398 -21 6 1289 3558 13 5 0 chr5 92401911 92402305 -60134954 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1289 3196 70 0 17 chr5 92403599 92404006 -60133253 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1289 375 226 19 47 chr5 92404012 92404119 -60133140 + MLT1A1 LTR MaLR 303 406 -2 6 1290 993 287 35 56 chr5 92405996 92406359 -60130900 - MTD LTR MaLR 0 419 61 6 1290 1879 148 115 0 chr5 92406359 92406697 -60130562 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 6 1290 993 287 35 56 chr5 92406697 92406761 -60130498 - MTD LTR MaLR -359 60 1 6 1290 582 332 25 50 chr5 92409853 92410170 -60127089 - MLT2D LTR ERVL -15 399 91 6 1290 4099 138 86 75 chr5 92410190 92411070 -60126189 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 6 1290 232 318 34 0 chr5 92411070 92411157 -60126102 - MLT2D LTR ERVL -465 91 2 6 1290 393 321 71 96 chr5 92413835 92413859 -60123400 + ORR1E LTR MaLR 4 27 -332 6 1290 3418 33 0 8 chr5 92413859 92414258 -60123001 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1290 393 321 71 96 chr5 92414258 92414598 -60122661 + ORR1E LTR MaLR 28 359 0 6 1290 2055 159 52 11 chr5 92414938 92415307 -60121952 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1290 1399 168 105 10 chr5 92415607 92415902 -60121357 + ORR1D1 LTR MaLR 1 323 -51 6 1290 287 153 0 92 chr5 92416121 92416186 -60121073 + ORR1D1 LTR MaLR 316 374 0 6 1290 2466 58 169 3 chr5 92422627 92422970 -60114289 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1290 3167 119 0 30 chr5 92427714 92428174 -60109085 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 6 1290 1581 165 89 0 chr5 92442147 92442462 -60094797 - ORR1C1 LTR MaLR -35 343 1 7 1290 309 302 57 25 chr5 92449805 92449927 -60087332 + RMER12 LTR ERVK 725 850 -472 7 1290 556 319 112 50 chr5 92450176 92450632 -60086627 + RMER5 LTR ERV1 24 507 -27 7 1290 3617 23 21 0 chr5 92453505 92453893 -60083366 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1290 1919 150 37 34 chr5 92454988 92455312 -60081947 + ORR1A4 LTR MaLR 1 325 -4 7 1290 1353 246 94 17 chr5 92457956 92458308 -60078951 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 7 1290 1520 216 67 28 chr5 92464491 92464852 -60072407 + MTEb LTR MaLR 1 375 -4 7 1290 473 168 98 74 chr5 92465750 92465872 -60071387 + MT2B LTR ERVL 152 276 -325 7 1290 318 298 118 64 chr5 92477189 92477393 -60059866 + MLT1J1 LTR MaLR 102 316 -128 8 1290 4022 121 77 29 chr5 92497852 92498477 -60038782 - RMER6A LTR ERVK 0 756 80 8 1290 3565 35 5 0 chr5 92498477 92498871 -60038388 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1290 4022 121 77 29 chr5 92498871 92498962 -60038297 - RMER6A LTR ERVK -677 79 6 8 1290 275 192 138 25 chr5 92507556 92507636 -60029623 + RLTR25B LTR ERVK 421 509 -519 2 1290 725 219 113 9 chr5 92516426 92516638 -60020621 + ORR1D2 LTR MaLR 137 370 0 5 1290 369 133 22 140 chr5 92520236 92520336 -60016923 + ORR1C2 LTR MaLR 272 362 -22 6 1290 2871 61 0 10 chr5 92524060 92524460 -60012799 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1290 1903 213 45 58 chr5 92530648 92531187 -60006072 + RMER5 LTR ERV1 1 532 -2 1 1290 674 215 21 0 chr5 92535508 92535652 -60001607 + MLT1D LTR MaLR 249 395 -110 1 1291 824 284 127 34 chr5 92546503 92546848 -59990411 + MTD LTR MaLR 11 361 -46 1 1291 1165 174 225 58 chr5 92557550 92557879 -59979380 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1291 435 305 92 44 chr5 92560539 92560745 -59976514 + MTEa LTR MaLR 1 216 -163 2 1291 2245 83 42 60 chr5 92561943 92562276 -59974983 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1291 2212 150 42 2 chr5 92575501 92575901 -59961358 - MTC LTR MaLR -5 416 1 2 1291 291 229 70 40 chr5 92582259 92582359 -59954900 - MT2B LTR ERVL -344 257 155 2 1291 260 283 97 32 chr5 92583439 92583684 -59953575 - MLT1F1 LTR MaLR -269 300 2 2 1291 465 294 76 5 chr5 92584125 92584310 -59952949 + MLT1D LTR MaLR 5 202 -303 2 1291 1434 225 47 27 chr5 92592028 92592233 -59945026 + MTD LTR MaLR 6 211 -208 2 1291 1434 225 47 27 chr5 92592385 92592585 -59944674 + MTD LTR MaLR 212 419 0 2 1291 809 226 133 25 chr5 92593780 92594021 -59943238 - MTD LTR MaLR -15 404 138 2 1291 1010 222 69 135 chr5 92594010 92594431 -59942828 - MTC-int LTR MaLR -623 635 243 2 1291 426 264 142 78 chr5 92594596 92594814 -59942445 - MTC-int LTR MaLR -1025 233 2 2 1291 1461 201 133 25 chr5 92617505 92618214 -59919045 + RMER6C LTR ERVK 1 716 -4 3 1291 2921 146 20 6 chr5 92625600 92626109 -59911150 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 3 1291 407 303 141 0 chr5 92627824 92628009 -59909250 - MLT1-int LTR MaLR -711 660 450 3 1291 240 348 92 22 chr5 92628241 92628426 -59908833 - MLT1-int LTR MaLR -1133 238 41 3 1291 1109 199 164 9 chr5 92631918 92632102 -59905157 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 185 3 1291 1109 199 164 9 chr5 92632166 92632305 -59904954 - ORR1C2 LTR MaLR -200 184 8 3 1291 875 180 0 0 chr5 92632684 92632845 -59904414 + ORR1C1 LTR MaLR 218 378 0 3 1291 1636 164 34 14 chr5 92636455 92636746 -59900513 - MTB_Mm LTR MaLR -63 344 48 3 1291 574 156 0 0 chr5 92636989 92637085 -59900174 - MTC LTR MaLR -323 98 3 3 1291 411 243 155 22 chr5 92637089 92637134 -59900125 - MTC-int LTR MaLR -258 1000 943 3 1291 411 243 155 22 chr5 92637176 92637311 -59899948 - MTC-int LTR MaLR -316 942 797 3 1291 753 195 137 64 chr5 92638103 92638281 -59898978 - MTD LTR MaLR -21 398 206 3 1291 753 204 113 113 chr5 92638465 92638652 -59898607 - MTD LTR MaLR -214 205 47 3 1291 306 254 114 97 chr5 92645963 92646365 -59890894 - RMER10A LTR ERVL -13 429 21 4 1291 627 253 77 25 chr5 92650404 92650639 -59886620 - MER57F LTR ERV1 -189 247 1 4 1291 2684 107 25 63 chr5 92650722 92651169 -59886090 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 4 1291 1635 156 43 3 chr5 92652529 92652877 -59884382 - RLTR31_Mm LTR ERVK -199 362 1 4 1291 776 213 40 6 chr5 92652899 92653074 -59884185 - MTC LTR MaLR -55 366 186 4 1291 481 272 51 26 chr5 92653076 92653193 -59884066 + ETnERV2-int LTR ERVK 7083 7202 -204 4 1291 429 141 0 37 chr5 92653582 92653663 -59883596 - MTC LTR MaLR -215 204 127 4 1291 240 155 79 66 chr5 92657784 92657860 -59879399 + RMER10B LTR ERVL 235 311 -87 4 1291 231 267 144 0 chr5 92666313 92666403 -59870856 - LTR48 LTR ERV1 -633 154 52 4 1291 256 225 144 11 chr5 92666441 92666531 -59870728 - MTD LTR MaLR 0 419 318 4 1291 1842 236 12 2 chr5 92666957 92667370 -59869889 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 4 1292 347 267 149 52 chr5 92671027 92671181 -59866078 + MLT1J-int LTR MaLR 1128 1296 -91 4 1292 700 295 70 39 chr5 92671332 92671561 -59865698 + MLT1J LTR MaLR 73 308 -204 4 1292 3133 49 30 51 chr5 92672675 92673107 -59864152 + RLTR10C LTR ERVK 1 423 -13 4 1292 1795 137 117 90 chr5 92680195 92680597 -59856662 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 1292 386 221 0 0 chr5 92685792 92685878 -59851381 + RMER4B LTR ERVK 1 86 -499 5 1292 938 131 7 42 chr5 92685890 92686084 -59851175 + RMER17C LTR ERVK 9 321 -89 5 1292 370 203 148 25 chr5 92686153 92686238 -59851021 + RMER17C LTR ERVK 322 405 -5 5 1292 1650 144 190 41 chr5 92686219 92686619 -59850640 + RMER4B LTR ERVK 61 462 -4 5 1292 3663 122 47 28 chr5 92686619 92686710 -59850549 - RLTR5_Mm LTR ERV1 0 628 535 5 1292 3663 122 47 28 chr5 92686740 92687264 -59849995 - RLTR5_Mm LTR ERV1 -94 534 3 5 1292 541 319 17 67 chr5 92693770 92693948 -59843311 + MER67A LTR ERV1 363 531 -12 5 1292 1728 212 59 11 chr5 92704812 92705170 -59832089 - RLTR33 LTR ERVK -16 662 288 5 1292 1426 132 8 60 chr5 92705278 92705527 -59831732 - RLTR33 LTR ERVK -442 236 1 5 1292 1063 219 178 33 chr5 92707354 92707685 -59829574 + RLTR18 LTR ERVK 102 480 -136 5 1292 1157 154 50 27 chr5 92707719 92707939 -59829320 + MTB_Mm LTR MaLR 1 225 -182 5 1292 2338 211 129 85 chr5 92710734 92711455 -59825804 - RMER13A LTR ERVK -107 753 1 5 1292 403 275 81 50 chr5 92711719 92711998 -59825261 + MTEb LTR MaLR 56 378 -1 5 1292 255 319 31 101 chr5 92715271 92715302 -59821957 - MT2B LTR ERVL -445 156 135 5 1292 563 237 24 19 chr5 92732367 92732529 -59804730 - MTD LTR MaLR -244 163 4 6 1292 2039 173 119 37 chr5 92743949 92744436 -59792823 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1292 2180 92 75 3 chr5 92744577 92744882 -59792377 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1292 231 288 133 17 chr5 92744898 92745018 -59792241 - LTR16B LTR ERVL 0 463 330 6 1292 385 190 0 77 chr5 92746154 92746245 -59791014 - MT2B LTR ERVL -351 250 167 6 1292 621 225 249 9 chr5 92747304 92747533 -59789726 + ORR1D2 LTR MaLR 81 364 -6 6 1292 391 368 164 17 chr5 92747593 92748119 -59789140 - LTR33C LTR ERVL -15 614 12 6 1292 1567 195 114 16 chr5 92749772 92750148 -59787111 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 1292 1223 221 171 117 chr5 92764609 92765146 -59772113 - RMER2 LTR ERV1 0 567 2 7 1292 367 256 16 47 chr5 92765403 92765530 -59771729 + MLT1B LTR MaLR 1 123 -267 7 1292 401 237 129 17 chr5 92766435 92766551 -59770708 + MT2A LTR ERVL 1 129 -404 7 1292 937 208 236 28 chr5 92766584 92766940 -59770319 + MT2A LTR ERVL 94 523 -10 7 1292 2213 69 6 59 chr5 92771935 92772275 -59764984 - ORR1A2 LTR MaLR -5 322 1 7 1292 768 228 174 58 chr5 92775105 92775468 -59761791 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1292 6785 110 8 31 chr5 92781003 92781605 -59755654 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 431 7 1292 6785 110 8 31 chr5 92781812 92782251 -59755008 - RLTR13D2 LTR ERVK -593 430 6 7 1292 4058 128 111 85 chr5 92786541 92787398 -59749861 - RMER21A LTR ERV1 -2 945 67 7 1292 309 209 209 0 chr5 92793400 92793529 -59743730 - RMER17A LTR ERVK -250 501 346 7 1292 1344 214 125 27 chr5 92796896 92797265 -59739994 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1293 277 238 29 116 chr5 92806327 92806465 -59730794 - MLT1F2 LTR MaLR -63 497 372 7 1293 1808 191 45 6 chr5 92814073 92814426 -59722833 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 8 8 1293 860 178 276 9 chr5 92814681 92814891 -59722368 - MTC LTR MaLR -27 394 129 8 1293 472 167 0 0 chr5 92815165 92815243 -59722016 - MTC LTR MaLR -339 80 3 8 1293 3069 115 121 30 chr5 92818433 92818969 -59718290 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 8 1293 296 282 113 15 chr5 92825083 92825216 -59712043 - LTR87 LTR ERVL? -6 618 473 8 1293 414 305 65 24 chr5 92827841 92828009 -59709250 - LTR87 LTR ERVL? -4 620 446 8 1293 1043 240 232 16 chr5 92829755 92830104 -59707155 - MTE2b LTR MaLR -3 376 3 8 1293 3392 20 8 5 chr5 92866429 92866824 -59670435 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1293 342 288 91 7 chr5 92867305 92867459 -59669800 - RMER20B LTR ERVK -281 346 180 9 1293 959 225 75 157 chr5 92868394 92868795 -59668464 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 3 9 1293 2975 82 10 10 chr5 92884778 92885174 -59652085 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1293 575 336 37 15 chr5 92885266 92885535 -59651724 + MLT1A0 LTR MaLR 91 365 0 9 1293 2521 87 0 0 chr5 92899962 92900285 -59636974 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 1 1293 3171 54 31 3 chr5 92904276 92904665 -59632594 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1293 3043 17 36 8 chr5 92905131 92905488 -59631771 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 1293 31762 28 25 1 chr5 92905488 92909123 -59628136 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3729 -2752 1 1293 14774 25 1 3 chr5 92909106 92910767 -59626492 + IAPEz-int LTR ERVK 4824 6481 0 1 1293 3043 17 36 8 chr5 92910767 92911124 -59626135 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 1293 557 274 65 129 chr5 92915535 92915891 -59621368 + MLT1B LTR MaLR 1 333 -57 1 1293 415 258 98 62 chr5 92917528 92917772 -59619487 - MER92B LTR ERV1 -9 627 375 1 1293 375 315 139 16 chr5 92924475 92924596 -59612663 + MLT1A0 LTR MaLR 1 137 -228 1 1293 879 280 66 75 chr5 92924596 92924943 -59612316 + MTEa LTR MaLR 1 344 -35 1 1293 342 257 158 9 chr5 92924934 92925048 -59612211 + MLT1A0 LTR MaLR 231 361 -4 1 1294 828 274 60 18 chr5 92930349 92930637 -59606622 - MTD LTR MaLR 0 419 31 1 1294 645 297 86 57 chr5 92935387 92935701 -59601558 - LTR16B2 LTR ERVL -137 325 3 1 1294 4015 51 9 51 chr5 92939101 92939635 -59597624 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 1294 415 219 123 9 chr5 92939635 92939741 -59597518 + MLT1H2 LTR MaLR 207 324 -165 1 1294 265 293 84 25 chr5 92939722 92939841 -59597418 + MLT1H2 LTR MaLR 430 555 -24 1 1294 1636 147 16 95 chr5 92940329 92940667 -59596592 + ORR1A3 LTR MaLR 1 277 -49 1 1294 2297 146 12 31 chr5 92941172 92941589 -59595670 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 1294 3865 28 5 0 chr5 92941638 92942072 -59595187 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 1294 1430 60 5 1 chr5 92942072 92942266 -59594993 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 201 -1786 1 1294 232 255 0 0 chr5 92942266 92942313 -59594946 + RLTR27 LTR ERVK 222 268 -41 1 1294 463 68 0 0 chr5 92942316 92942375 -59594884 + MMERVK10C-int LTR ERVK 224 282 -7299 1 1294 543 168 150 0 chr5 92942583 92942696 -59594563 + MMERVK10C-int LTR ERVK 270 399 -7182 1 1294 43037 37 0 1 chr5 92942694 92947638 -59589621 + MMERVK10C-int LTR ERVK 870 5810 -1771 1 1294 8042 32 15 0 chr5 92947629 92948546 -59588713 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6651 7581 0 1 1294 3838 30 5 0 chr5 92948546 92948980 -59588279 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 1294 5432 67 133 39 chr5 92949036 92949952 -59587307 - RLTR22_Mus LTR ERVK 0 1808 807 1 1294 292 225 62 15 chr5 92949987 92950105 -59587154 - RLTR13D3 LTR ERVK -42 1072 981 1 1294 4528 89 36 91 chr5 92950899 92951457 -59585802 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1042 806 278 1 1294 4528 89 36 91 chr5 92951603 92951897 -59585362 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1571 277 1 1 1294 2481 110 94 3 chr5 92951905 92952287 -59584972 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 417 -3 1 1294 228 273 53 74 chr5 92952871 92952882 -59584377 + MT2B2 LTR ERVL 152 160 -424 1 1294 995 265 26 92 chr5 92954786 92954830 -59582429 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 327 1 1294 995 265 26 92 chr5 92955000 92955336 -59581923 - MLT1A0 LTR MaLR -39 326 2 1 1294 2460 85 5 32 chr5 92955579 92955981 -59581278 + MT2B2 LTR ERVL 1 362 -222 1 1294 323 0 0 0 chr5 92955964 92956003 -59581256 + MT2B2 LTR ERVL 546 584 0 1 1294 510 162 25 56 chr5 92958336 92958532 -59578727 - RMER17C LTR ERVK -136 274 85 1 1294 554 161 26 6 chr5 92959233 92959343 -59577916 + ORR1C1 LTR MaLR 2 119 -240 1 1294 1114 201 128 9 chr5 92959404 92959725 -59577534 + RMER16 LTR ERVK 175 533 0 1 1294 717 238 46 41 chr5 92959725 92959922 -59577337 + RMER16-int LTR ERVK 1 198 -5208 1 1294 344 328 7 4 chr5 92959937 92960127 -59577132 + RMER16-int LTR ERVK 194 466 -7751 1 1294 3039 61 24 3 chr5 92960685 92961062 -59576197 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 1 1294 412 329 61 53 chr5 92961105 92961639 -59575620 + RMER16-int LTR ERVK 945 1590 -1724 1 1294 821 281 68 26 chr5 92961689 92962051 -59575208 + RMER16-int LTR ERVK 1685 2036 -5545 1 1294 4922 220 56 32 chr5 92962028 92963650 -59573609 + RMER16-int LTR ERVK 1513 3971 -4246 1 1294 3930 87 17 0 chr5 92963628 92964156 -59573103 + RMER16-int LTR ERVK 2389 2925 -2481 1 1294 3390 171 25 25 chr5 92964306 92964974 -59572285 + RMER16-int LTR ERVK 3205 3872 -1534 1 1294 6300 141 18 11 chr5 92965367 92966412 -59570847 + RMER16-int LTR ERVK 4025 5076 -330 1 1294 2544 80 3 6 chr5 92966555 92966883 -59570376 + RMER16-int LTR ERVK 5080 5406 0 1 1294 1598 146 57 50 chr5 92966883 92967283 -59569976 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 1 1294 1216 173 6 155 chr5 92967283 92967618 -59569641 + ORR1B2 LTR MaLR 83 367 0 1 1294 717 258 131 25 chr5 92967859 92968088 -59569171 + MER67C LTR ERV1 110 368 -343 1 1294 717 258 131 25 chr5 92968108 92968160 -59569099 + MER67C LTR ERV1 369 420 -291 1 1294 370 230 40 10 chr5 92968218 92968319 -59568940 + MER67C LTR ERV1 541 644 -67 1 1294 2073 114 235 43 chr5 92971979 92972439 -59564820 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 37 1 1294 68824 14 14 0 chr5 92972548 92980221 -59557038 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 1 1 1294 2227 108 224 44 chr5 92980221 92980703 -59556556 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -49 605 37 1 1294 320 182 45 0 chr5 92982904 92982970 -59554289 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 336 1 1294 286 262 132 28 chr5 92985203 92985309 -59551950 - MTEa LTR MaLR -1 378 262 1 1294 959 215 26 58 chr5 92986930 92987241 -59550018 - RLTR11B LTR ERVK -152 301 1 1 1294 428 238 24 32 chr5 92989228 92989354 -59547905 + RMER20B LTR ERVK 1 125 -502 1 1294 756 272 115 19 chr5 92989764 92990034 -59547225 - MTEa LTR MaLR -83 296 1 1 1294 1948 158 73 5 chr5 92990137 92990428 -59546831 + RMER4B LTR ERVK 13 332 -253 1 1294 1948 142 344 14 chr5 92990638 92990817 -59546442 + RMER4B LTR ERVK 339 570 -15 1 1294 273 333 62 57 chr5 92993586 92993796 -59543463 - MLT1K LTR MaLR -190 405 195 1 1294 576 288 90 57 chr5 92997115 92997450 -59539809 - MLT1D LTR MaLR -157 348 3 1 1294 561 250 91 120 chr5 92997642 92997983 -59539276 - ORR1E LTR MaLR -3 356 26 1 1294 1230 224 67 29 chr5 92999336 92999681 -59537578 + ORR1C1 LTR MaLR 1 358 -20 1 1294 2142 96 83 6 chr5 93012449 93012817 -59524442 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 3 1294 1364 148 128 30 chr5 93018349 93018672 -59518587 - RMER16 LTR ERVK 0 533 2 4 1294 1169 55 104 6 chr5 93022089 93022253 -59515006 - MTB_Mm LTR MaLR 0 400 221 5 1294 1863 71 0 0 chr5 93022519 93022757 -59514502 - MTB_Mm LTR MaLR -169 238 1 5 1294 1823 207 38 25 chr5 93022773 93023170 -59514089 - RLTR40 LTR ERVK -274 543 142 5 1294 838 161 53 7 chr5 93023318 93023468 -59513791 - RLTR40 LTR ERVK -660 157 1 5 1294 708 299 66 33 chr5 93025782 93026055 -59511204 + MER21B LTR ERV1 562 843 -20 6 1294 569 280 128 43 chr5 93028800 93029035 -59508224 - MER21B LTR ERV1 -108 755 501 6 1294 572 332 130 53 chr5 93041787 93042293 -59494966 + MLT2B3 LTR ERVL 1 545 -9 8 1294 977 191 15 31 chr5 93043402 93043569 -59493690 + MTD LTR MaLR 10 179 -240 9 1294 2222 87 60 17 chr5 93043569 93043921 -59493338 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 9 1294 977 191 15 31 chr5 93043921 93043948 -59493311 + MTD LTR MaLR 180 201 -218 9 1294 972 101 14 0 chr5 93043948 93044086 -59493173 + IAPEz-int LTR ERVK 57 196 -6285 9 1294 54521 29 21 8 chr5 93044057 93050445 -59486814 + IAPEz-int LTR ERVK 67 6479 -2 9 1294 2222 87 60 17 chr5 93050447 93050799 -59486460 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 9 1294 855 219 160 5 chr5 93050803 93051009 -59486250 + MTD LTR MaLR 179 416 -3 9 1294 2692 133 15 0 chr5 93055021 93055433 -59481826 - MTC LTR MaLR -3 418 1 1 1294 1688 143 84 23 chr5 93055730 93056152 -59481107 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 1 1294 1199 213 100 7 chr5 93057383 93057672 -59479587 - MTD LTR MaLR -103 316 1 1 1294 533 167 157 9 chr5 93060854 93060969 -59476290 + RLTR20D LTR ERVK 178 309 -259 1 161 399 283 19 0 chr5 93061028 93061134 -59476125 + RLTR20D LTR ERVK 461 568 0 1 1295 2302 107 11 38 chr5 93064143 93064512 -59472747 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 1295 3378 20 13 3 chr5 93069590 93069982 -59467277 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1295 408 345 58 64 chr5 93074846 93075190 -59462069 - ORR1D2 LTR MaLR -23 347 6 1 1295 625 290 109 22 chr5 93075730 93076005 -59461254 + MER68 LTR ERVL 56 354 -209 1 1295 228 362 70 16 chr5 93076101 93076162 -59461097 + ORR1D2 LTR MaLR 25 86 -284 1 1295 228 362 70 16 chr5 93076444 93076510 -59460749 + ORR1D2 LTR MaLR 87 159 -211 1 1295 603 291 57 53 chr5 93087930 93088177 -59449082 + RLTR18 LTR ERVK 63 310 -306 1 1295 772 297 80 7 chr5 93088220 93088522 -59448737 + RLTR18B LTR ERVK 186 509 -3 1 1295 2132 101 6 0 chr5 93088959 93089275 -59447984 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 1 1295 571 221 61 6 chr5 93090256 93090420 -59446839 + MER31B LTR ERV1 280 452 -14 1 1295 290 131 243 14 chr5 93093703 93093773 -59443486 + RMER20A LTR ERVK 1 86 -430 1 1295 736 70 28 14 chr5 93093816 93093960 -59443299 - RMER17B LTR ERVK -505 453 308 2 1295 1475 199 71 62 chr5 93093957 93094396 -59442863 + RMER20A LTR ERVK 74 516 0 1 1295 424 327 66 6 chr5 93105687 93105853 -59431406 + MT2A LTR ERVL 245 420 -113 2 1295 241 366 59 101 chr5 93114300 93114537 -59422722 - LTR86B2 LTR ERVL -72 415 189 2 1295 345 346 77 94 chr5 93114397 93114848 -59422411 - MLT1L LTR MaLR -65 447 5 2 1295 520 278 126 96 chr5 93115156 93115490 -59421769 - ORR1E LTR MaLR -15 344 1 2 1295 644 312 99 78 chr5 93116349 93116967 -59420292 - MLT1D LTR MaLR 0 627 1 2 1295 450 266 32 8 chr5 93118014 93118139 -59419120 - RMER5 LTR ERV1 0 534 407 2 1295 565 303 213 18 chr5 93124329 93124662 -59412597 + LTR16C LTR ERVL 69 466 -23 2 1295 2312 167 26 97 chr5 93124663 93125490 -59411769 + RMER6A LTR ERVK 47 755 -1 2 1295 1804 130 32 0 chr5 93126070 93126347 -59410912 + ORR1A3 LTR MaLR 1 286 -40 2 1295 349 257 57 9 chr5 93129130 93129226 -59408033 - MTEa LTR MaLR -14 365 264 2 1295 420 295 36 0 chr5 93129344 93129456 -59407803 - MLT1B LTR MaLR -236 154 39 2 1295 349 312 9 44 chr5 93146219 93146333 -59390926 - RMER15 LTR ERVL -108 467 358 3 1295 355 107 0 35 chr5 93146565 93146623 -59390636 - MTA_Mm LTR MaLR -301 95 40 3 1295 311 338 176 5 chr5 93148387 93148586 -59388673 + LTR16A1 LTR ERVL 218 450 -6 3 1295 236 258 14 155 chr5 93150256 93150398 -59386861 - RMER20B LTR ERVK -99 528 407 3 1295 855 275 24 45 chr5 93150380 93150669 -59386590 - RMER13A LTR ERVK -564 296 14 3 1295 320 318 58 11 chr5 93156654 93156800 -59380459 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 212 3 1295 236 281 47 35 chr5 93159292 93159377 -59377882 + MT2B LTR ERVL 170 255 -346 3 1295 246 236 13 77 chr5 93162222 93162300 -59374959 - RLTR25B LTR ERVK -533 495 423 3 1295 1320 266 36 22 chr5 93163900 93164257 -59373002 - MTEa LTR MaLR 0 379 18 3 1295 1535 182 36 133 chr5 93168252 93168665 -59368594 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 4 1295 2335 140 35 5 chr5 93168687 93169088 -59368171 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1295 3072 72 13 3 chr5 93170150 93170542 -59366717 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1295 1829 193 16 34 chr5 93174350 93174731 -59362528 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1295 462 297 43 24 chr5 93176678 93176885 -59360374 - MamGypLTR2c LTR Gypsy -4 1064 854 4 1295 2665 90 85 0 chr5 93184005 93184393 -59352866 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1295 1376 216 76 31 chr5 93185657 93185815 -59351444 + ORR1D2 LTR MaLR 1 178 -192 4 1295 1376 216 76 31 chr5 93185916 93186111 -59351148 + ORR1D2 LTR MaLR 179 370 0 4 1295 1659 184 10 103 chr5 93186335 93186398 -59350861 - MTC LTR MaLR -49 372 313 4 1295 2094 93 81 19 chr5 93186398 93186706 -59350553 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1295 1659 184 10 103 chr5 93186706 93186816 -59350443 - MTC LTR MaLR -109 312 211 4 1295 1659 184 10 103 chr5 93186884 93186912 -59350347 - MTC LTR MaLR -211 210 210 4 1295 1659 184 10 103 chr5 93187096 93187298 -59349961 - MTC LTR MaLR -211 210 5 4 1295 1497 172 19 62 chr5 93188141 93188464 -59348795 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 70 4 1295 1326 200 225 20 chr5 93191677 93192024 -59345235 - MTD LTR MaLR -1 418 1 4 1296 2106 140 26 3 chr5 93195761 93196111 -59341148 - RLTR15 LTR ERVK -1 358 1 4 1296 3807 136 103 137 chr5 93197248 93198185 -59339074 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 4 1296 1564 201 68 58 chr5 93198414 93198794 -59338465 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1296 826 258 140 45 chr5 93199385 93199721 -59337538 - ORR1E LTR MaLR -8 371 4 4 1296 1869 134 73 3 chr5 93204039 93204369 -59332890 + ORR1B1 LTR MaLR 1 353 -41 4 1296 1932 97 3 109 chr5 93208542 93208901 -59328358 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 4 1296 226 260 40 14 chr5 93215546 93215620 -59321639 - MTEa LTR MaLR -14 365 290 5 1296 2194 127 12 3 chr5 93223045 93223369 -59313890 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1296 2345 101 45 3 chr5 93223780 93224138 -59313121 - ORR1B1 LTR MaLR -21 373 1 5 1296 293 198 59 47 chr5 93229253 93229338 -59307921 + ORR1E LTR MaLR 3 88 -271 5 1296 246 321 54 103 chr5 93229401 93229585 -59307674 + ORR1E LTR MaLR 87 261 -109 5 1296 263 301 69 99 chr5 93246552 93246814 -59290445 - RMER21A LTR ERV1 -3 944 691 5 1296 243 298 132 55 chr5 93255516 93255736 -59281523 + LTR78 LTR ERV1 644 880 -424 6 1296 233 329 38 12 chr5 93256218 93256298 -59280961 + MT2B LTR ERVL 168 249 -352 6 1296 413 296 0 44 chr5 93291587 93291700 -59245559 - MER21B LTR ERV1 -107 756 649 6 1296 268 314 80 8 chr5 93291700 93291825 -59245434 + ORR1E LTR MaLR 1 134 -225 6 1296 420 258 183 6 chr5 93294702 93294866 -59242393 - MLT1B LTR MaLR 0 390 198 7 1296 1650 191 148 6 chr5 93300052 93300404 -59236855 - MTD LTR MaLR 0 419 18 7 1296 659 344 71 15 chr5 93304314 93304580 -59232679 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 347 7 1296 1682 169 96 67 chr5 93310652 93311026 -59226233 - MTD LTR MaLR -32 387 3 7 1297 1162 186 50 57 chr5 93333843 93334123 -59203136 - MTD LTR MaLR -141 278 1 7 1297 283 243 35 7 chr5 93339111 93339165 -59198094 - RMER17C LTR ERVK -136 274 222 7 1297 283 243 35 7 chr5 93339218 93339308 -59197951 - RMER17C LTR ERVK -189 221 127 7 1297 624 150 0 34 chr5 93342020 93342137 -59195122 + ORR1B1 LTR MaLR 41 153 -241 7 1297 911 133 170 6 chr5 93342367 93342549 -59194710 + ORR1B1 LTR MaLR 183 394 0 7 1297 3202 58 5 12 chr5 93345750 93346149 -59191110 - MTB LTR MaLR -4 396 1 7 1297 317 283 106 106 chr5 93346741 93347073 -59190186 - MLT1A1 LTR MaLR -17 391 74 8 1297 1825 113 197 0 chr5 93348938 93349238 -59188021 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 8 1297 1100 288 22 74 chr5 93351419 93351786 -59185473 - MTEa LTR MaLR -19 360 13 8 1297 1842 145 11 114 chr5 93359389 93359756 -59177503 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1297 521 262 124 80 chr5 93360871 93361156 -59176103 - ORR1E LTR MaLR 0 374 75 8 1297 272 351 38 28 chr5 93363571 93363689 -59173570 - MLT2E LTR ERVL -1 628 456 8 1297 2264 87 19 3 chr5 93375287 93375576 -59161683 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 36 8 1297 2264 87 19 3 chr5 93375658 93375689 -59161570 - ORR1A2 LTR MaLR -292 35 2 8 1297 1742 190 53 11 chr5 93397425 93397782 -59139477 + RMER10B LTR ERVL 25 396 -2 8 1297 382 323 219 65 chr5 93398895 93399395 -59137864 - LTR41B LTR ERVL -51 707 176 8 1297 382 323 219 65 chr5 93399716 93399828 -59137431 - LTR41B LTR ERVL -583 175 2 8 1297 2405 95 6 0 chr5 93403332 93403657 -59133602 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1297 365 275 15 98 chr5 93403696 93403715 -59133544 + MT2B LTR ERVL 143 150 -451 9 1297 361 333 61 0 chr5 93404297 93404429 -59132830 + MER34 LTR ERV1 336 475 -67 9 1297 310 333 68 42 chr5 93410871 93411062 -59126197 + ORR1E LTR MaLR 158 353 -6 9 1297 253 287 44 33 chr5 93411903 93411993 -59125266 - LTR77 LTR ERV1 -139 483 393 9 1297 2471 61 6 0 chr5 93413304 93413617 -59123642 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 9 9 1297 1392 235 42 27 chr5 93415254 93415586 -59121673 - MTD LTR MaLR -14 405 69 9 1297 1670 158 68 19 chr5 93415595 93415611 -59121648 - ORR1C1 LTR MaLR -39 339 322 9 1297 1670 158 68 19 chr5 93415638 93415944 -59121315 - ORR1C1 LTR MaLR -57 321 2 9 1297 310 111 22 0 chr5 93415944 93415989 -59121270 - MTD LTR MaLR -375 46 1 9 1297 825 277 133 34 chr5 93419075 93419397 -59117862 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 9 1297 511 254 35 28 chr5 93421170 93421312 -59115947 + MLT1A0 LTR MaLR 222 364 -1 9 1297 2282 168 66 56 chr5 93421711 93422016 -59115243 + RLTR16 LTR ERVK 3 320 -185 9 1297 2282 168 66 56 chr5 93422214 93422406 -59114853 + RLTR16 LTR ERVK 321 505 0 9 1297 307 256 20 109 chr5 93422540 93422641 -59114618 + MLT1H2 LTR MaLR 5 96 -393 9 1297 265 280 134 111 chr5 93422749 93422966 -59114293 - MLT1J LTR MaLR -199 313 92 9 1297 228 281 118 86 chr5 93423962 93424114 -59113145 - MLT1H LTR MaLR -260 289 133 9 1297 340 333 0 0 chr5 93424342 93424426 -59112833 - MLT1H LTR MaLR -399 150 67 9 1297 243 315 55 105 chr5 93425346 93425527 -59111732 - ORR1E LTR MaLR -53 306 135 9 1297 400 279 123 38 chr5 93431432 93431644 -59105615 - RMER15 LTR ERVL -24 551 322 9 1297 429 254 0 112 chr5 93435774 93435934 -59101325 + MT2B LTR ERVL 167 308 -293 1 1297 398 325 144 64 chr5 93438785 93438853 -59098406 + LTR82A LTR ERVL 13 84 -788 1 1297 3212 61 2 8 chr5 93438853 93439251 -59098008 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1297 398 325 144 64 chr5 93439251 93439458 -59097801 + LTR82A LTR ERVL 85 317 -555 1 1297 351 115 32 16 chr5 93440071 93440133 -59097126 + MTA_Mm LTR MaLR 130 192 -204 1 1297 2165 108 65 0 chr5 93442982 93443289 -59093970 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1297 1919 170 19 37 chr5 93443851 93444229 -59093030 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 2 1 1297 2660 70 53 0 chr5 93445822 93446163 -59091096 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 1 1297 365 276 87 39 chr5 93447101 93447288 -59089971 + MLT1A0 LTR MaLR 6 236 -129 1 1297 623 224 29 29 chr5 93447464 93447602 -59089657 + MTE2b LTR MaLR 1 138 -241 1 1297 278 298 113 9 chr5 93447977 93448092 -59089167 + MLT1M LTR MaLR 88 214 -458 1 1297 1005 220 25 133 chr5 93448332 93448572 -59088687 - MTE2b LTR MaLR -4 375 187 1 1297 2485 83 3 0 chr5 93448572 93448898 -59088361 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1297 1005 198 26 64 chr5 93448898 93449083 -59088176 - MTE2b LTR MaLR -193 186 11 1 1297 287 250 325 0 chr5 93451293 93451413 -59085846 - LTR16B LTR ERVL -304 159 1 1 1298 1201 237 128 3 chr5 93455039 93455407 -59081852 + MTD LTR MaLR 5 418 -1 1 1298 581 252 42 36 chr5 93458489 93458654 -59078605 - ORR1E LTR MaLR -193 166 1 1 1298 942 269 140 52 chr5 93462420 93462941 -59074318 + MLT1F1 LTR MaLR 1 567 -2 1 1298 390 284 46 0 chr5 93466030 93466139 -59071120 - RMER15 LTR ERVL -65 510 397 1 1298 302 242 32 75 chr5 93480934 93481037 -59056222 - MTEa LTR MaLR -1 378 279 1 1298 360 370 126 19 chr5 93481873 93482135 -59055124 - MLT1J LTR MaLR 0 512 223 1 1298 454 327 6 39 chr5 93482602 93482758 -59054501 - MLT1J LTR MaLR -314 198 48 1 1298 1449 135 79 66 chr5 93485643 93485961 -59051298 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1298 281 239 104 0 chr5 93489642 93489709 -59047550 - ORR1E LTR MaLR -3 376 303 1 1298 4075 130 119 152 chr5 93489760 93490511 -59046748 - RMER19B LTR ERVK 0 902 245 1 1298 4075 130 119 152 chr5 93490546 93490727 -59046532 - RMER19B LTR ERVK -658 244 2 1 1298 400 327 78 34 chr5 93490729 93490935 -59046324 - ORR1E LTR MaLR -144 215 1 1 1298 1216 218 134 96 chr5 93491061 93491574 -59045685 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 1 1298 309 209 48 117 chr5 93491873 93491976 -59045283 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 414 1 1298 2985 20 2 176 chr5 93495830 93496302 -59040957 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1298 17499 21 0 4 chr5 93496312 93498263 -59038996 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1984 -3 1 1298 2985 20 2 176 chr5 93498265 93498737 -59038522 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1298 2265 34 0 0 chr5 93498747 93499010 -59038249 + RLTR10-int LTR ERVK 41 303 -1684 1 1298 501 240 16 31 chr5 93499753 93499882 -59037377 - RLTR22_Mur LTR ERVK -134 1714 1588 1 1298 287 216 0 0 chr5 93499947 93499998 -59037261 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1045 803 753 1 1298 1203 167 8 31 chr5 93500000 93500260 -59036999 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1098 750 497 1 1298 409 177 71 20 chr5 93500373 93500471 -59036788 + RLTR23 LTR ERV1 328 430 0 2 1298 1774 194 108 32 chr5 93500988 93501368 -59035891 + RLTR12A LTR ERVK 6 429 -139 7 1298 1774 194 108 32 chr5 93501557 93501650 -59035609 + RLTR12A LTR ERVK 430 515 -53 7 1298 1681 184 6 31 chr5 93503274 93503627 -59033632 + ORR1C2 LTR MaLR 1 344 -40 1 1298 504 152 141 0 chr5 93504972 93505071 -59032188 - MTE2a LTR MaLR -1 378 266 1 1298 314 272 42 37 chr5 93505084 93505275 -59031984 - RLTR15 LTR ERVK -3 356 165 1 1298 448 205 92 43 chr5 93505330 93505493 -59031766 - RLTR15 LTR ERVK -188 171 1 1 1298 294 306 35 104 chr5 93505542 93505585 -59031674 - MTE2a LTR MaLR -174 233 190 1 1298 3448 33 2 0 chr5 93505585 93505980 -59031279 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1298 447 291 139 19 chr5 93505980 93506176 -59031083 - MTE2a LTR MaLR -206 213 1 1 1298 723 320 123 28 chr5 93506381 93506780 -59030479 + MLT1F LTR MaLR 6 442 -106 2 1298 501 220 340 65 chr5 93509282 93509526 -59027733 - RMER13A LTR ERVK 0 860 550 2 1298 1442 107 0 9 chr5 93509568 93509786 -59027473 - RMER13A LTR ERVK -644 216 1 2 1298 2003 135 56 6 chr5 93510850 93511192 -59026067 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 2 1298 2088 150 74 64 chr5 93511215 93511699 -59025560 - RLTR12B LTR ERVK -39 489 1 3 1298 1057 239 97 30 chr5 93512988 93513358 -59023901 - MTE2a LTR MaLR -2 417 23 3 1298 2162 184 106 15 chr5 93515057 93515538 -59021721 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 525 -2 3 1298 262 291 83 28 chr5 93520056 93520201 -59017058 - RMER15 LTR ERVL -12 563 411 5 1298 288 102 34 0 chr5 93528568 93528627 -59008632 - RLTR11B LTR ERVK -165 288 228 6 1298 474 273 177 49 chr5 93529497 93529763 -59007496 - ORR1E LTR MaLR -11 348 49 6 1298 981 305 122 47 chr5 93557615 93558189 -58979070 + MLT1E3 LTR MaLR 8 624 0 1 1298 2266 128 152 57 chr5 93567829 93568303 -58968956 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 1 1298 234 302 109 36 chr5 93570765 93570875 -58966384 - MLT1D LTR MaLR -147 358 241 1 1299 2138 85 12 68 chr5 93587194 93587534 -58949725 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 1 1299 315 250 19 103 chr5 93587933 93588040 -58949219 + MT2B LTR ERVL 160 257 -344 1 1299 1587 148 149 33 chr5 93596037 93596170 -58941089 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 246 1 1299 1587 148 149 33 chr5 93596227 93596428 -58940831 - ORR1C1 LTR MaLR -133 245 3 1 1299 446 209 56 98 chr5 93608074 93608217 -58929042 + MT2B LTR ERVL 128 264 -337 1 1299 354 288 197 21 chr5 93617830 93618018 -58919241 + RMER21B LTR ERV1 347 567 -275 2 1299 322 398 8 0 chr5 93623123 93623241 -58914018 - ORR1E LTR MaLR -240 119 1 2 1299 1092 205 126 89 chr5 93628614 93628940 -58908319 + RMER15 LTR ERVL 238 575 0 2 1299 1854 177 62 24 chr5 93644182 93644552 -58892707 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1299 542 303 47 26 chr5 93644792 93644985 -58892274 + MLT1A0 LTR MaLR 21 217 -148 2 1299 301 312 114 34 chr5 93645570 93645746 -58891513 - MLT1J LTR MaLR -92 420 231 2 1299 2057 82 10 64 chr5 93646900 93647213 -58890046 + ORR1A2 LTR MaLR 32 327 0 2 1299 276 321 0 0 chr5 93649184 93649265 -58887994 - MER57A-int LTR ERV1 -301 5886 5806 2 1299 2840 127 177 16 chr5 93649272 93649776 -58887483 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 2 1299 746 366 55 62 chr5 93651880 93652351 -58884908 - LTR33 LTR ERVL 0 515 48 2 1299 380 297 144 0 chr5 93654281 93654392 -58882867 + LTR33 LTR ERVL 256 382 -133 2 1299 1780 192 145 54 chr5 93655474 93655615 -58881644 + RLTR12A LTR ERVK 1 143 -425 2 1299 1780 192 145 54 chr5 93655750 93656125 -58881134 + RLTR12A LTR ERVK 144 563 -5 2 1299 379 258 0 20 chr5 93661728 93661816 -58875443 + MLT1A LTR MaLR 1 87 -287 3 1299 272 296 239 22 chr5 93662208 93662346 -58874913 + MLT1A LTR MaLR 71 238 -127 3 1299 667 272 53 62 chr5 93663397 93663605 -58873654 + MLT1B LTR MaLR 1 206 -184 3 1299 267 241 22 78 chr5 93664704 93664794 -58872465 - MLT1J1 LTR MaLR -287 157 73 3 1299 2589 161 90 6 chr5 93668757 93669226 -58868033 - RLTR18B LTR ERVK -3 509 2 3 1299 1603 203 42 28 chr5 93672076 93672436 -58864823 + MTC LTR MaLR 1 365 -56 3 1299 228 300 0 0 chr5 93672766 93672826 -58864433 + RMER15 LTR ERVL 403 462 -113 3 1299 254 310 66 46 chr5 93673085 93673237 -58864022 - LTR50 LTR ERVL -638 157 3 3 1299 286 296 59 2 chr5 93673807 93673938 -58863321 - ERVL-B4-int LTR ERVL -894 4820 4621 3 1299 274 323 105 0 chr5 93673974 93674098 -58863161 - ERVL-B4-int LTR ERVL -858 4627 4491 3 1299 1621 163 46 13 chr5 93674101 93674405 -58862854 + ORR1B1 LTR MaLR 71 384 -10 3 1299 706 234 228 5 chr5 93674556 93674766 -58862493 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 113 3 1299 431 137 0 0 chr5 93674766 93674839 -58862420 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 306 3 1299 1754 138 26 105 chr5 93674834 93675112 -58862147 - ORR1C1-int LTR MaLR -1159 350 97 3 1299 1754 138 26 105 chr5 93675771 93675872 -58861387 - ORR1C1-int LTR MaLR -1413 96 1 3 1299 1920 149 38 35 chr5 93675874 93676242 -58861017 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 8 3 1299 412 217 94 0 chr5 93676242 93676348 -58860911 - ORR1D2 LTR MaLR -252 118 3 3 1299 567 315 46 83 chr5 93677324 93677649 -58859610 - ORR1E LTR MaLR -26 333 21 3 1299 462 284 153 41 chr5 93677716 93678010 -58859249 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2180 3305 2979 3 1299 561 330 90 57 chr5 93678097 93678855 -58858404 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2728 2986 2204 3 1299 492 227 22 16 chr5 93681704 93681854 -58855405 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 237 3 1299 1959 193 125 149 chr5 93685882 93686504 -58850755 + RMER19C LTR ERVK 1 607 -4 3 1299 325 267 111 45 chr5 93690260 93690449 -58846810 + MLT1F LTR MaLR 342 489 0 3 1299 1651 163 69 3 chr5 93705980 93706300 -58830959 - ORR1C1 LTR MaLR -35 343 3 3 1299 257 259 111 0 chr5 93708387 93708468 -58828791 + MLT1H2 LTR MaLR 400 489 0 3 1299 230 377 19 12 chr5 93715065 93715226 -58822033 - LTR16B1 LTR ERVL -2 478 317 3 1300 1844 132 73 318 chr5 93721381 93721685 -58815574 - RMER6C LTR ERVK 0 690 424 4 1300 1844 132 73 318 chr5 93721841 93722134 -58815125 - RMER6C LTR ERVK -267 423 321 4 1300 2065 132 73 318 chr5 93722163 93722478 -58814781 - RMER6C LTR ERVK -370 320 1 4 1300 480 278 123 34 chr5 93722678 93722857 -58814402 + MLT1A0 LTR MaLR 2 196 -169 4 1300 608 263 137 77 chr5 93722876 93723347 -58813912 - RMER2 LTR ERV1 -26 541 2 4 1300 416 280 17 17 chr5 93723601 93723721 -58813538 + MLT1A0 LTR MaLR 287 406 -2 4 1300 1143 216 100 4 chr5 93724836 93725105 -58812154 - MTE2b LTR MaLR -9 370 76 4 1300 2092 181 58 2 chr5 93727082 93727481 -58809778 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1300 479 256 132 42 chr5 93730061 93730355 -58806904 + RLTR15 LTR ERVK 48 337 -22 4 1300 329 182 193 0 chr5 93732616 93732704 -58804555 - MTE2b LTR MaLR 0 379 275 4 1300 949 236 107 110 chr5 93733377 93733844 -58803415 - MT2B LTR ERVL -14 587 1 4 1300 6284 159 44 59 chr5 93733844 93735044 -58802215 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 4580 4 1300 225 183 46 77 chr5 93743277 93743342 -58793917 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 4 1300 260 289 12 50 chr5 93753257 93753337 -58783922 - RMER20B LTR ERVK -38 589 513 4 1300 759 232 60 28 chr5 93753425 93753677 -58783582 - RMER20B LTR ERVK -288 339 96 4 1300 1875 164 136 9 chr5 93754375 93754720 -58782539 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 5 4 1300 2334 153 108 0 chr5 93755475 93755855 -58781404 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1300 246 376 70 30 chr5 93759042 93759242 -58778017 - ORR1E LTR MaLR -132 227 20 4 1300 1663 238 32 27 chr5 93760052 93760424 -58776835 + MTE2b LTR MaLR 1 374 -5 4 1300 1106 146 50 25 chr5 93769120 93769346 -58767913 + ORR1B1 LTR MaLR 1 203 -191 4 1300 1331 59 24 0 chr5 93770254 93770422 -58766837 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 175 4 1300 12855 73 17 2 chr5 93770422 93772211 -58765048 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 3 4 1300 874 194 164 3 chr5 93773852 93774175 -58763084 + RMER6B LTR ERVK 1 375 -86 4 1300 1578 194 36 24 chr5 93774175 93774512 -58762747 + MYSERV6-int LTR ERVK 2045 2385 -6574 4 1300 2087 154 30 15 chr5 93781297 93781699 -58755560 + MYSERV6-int LTR ERVK 2370 2777 -6182 4 1300 2508 112 73 8 chr5 93782259 93782655 -58754604 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 4 1300 4520 67 32 49 chr5 93783705 93784302 -58752957 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 4 1300 1026 327 80 0 chr5 93786007 93786604 -58750655 + MYSERV6-int LTR ERVK 452 1096 -7863 4 1300 3186 74 5 8 chr5 93786615 93787012 -58750247 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1300 2335 295 100 13 chr5 93787733 93788649 -58748610 + MYSERV6-int LTR ERVK 1085 2080 -6879 4 1300 2050 225 45 28 chr5 93788660 93788773 -58748486 + MYSERV6-int LTR ERVK 4114 4218 -4741 4 1300 2050 225 45 28 chr5 93789689 93790069 -58747190 + MYSERV6-int LTR ERVK 4219 4615 -4344 4 1300 4132 199 94 40 chr5 93790190 93791943 -58745316 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 319 2235 -91 4 1300 2551 128 18 55 chr5 93792009 93792447 -58744812 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 4 1300 1808 228 95 40 chr5 93793990 93794410 -58742849 + RLTR41 LTR ERV1 1 443 -3 4 1300 326 289 44 88 chr5 93799541 93799723 -58737536 - RMER10B LTR ERVL -12 386 213 4 1300 5090 43 16 2 chr5 93825601 93826180 -58711079 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 5 1300 246 377 75 59 chr5 93826777 93826963 -58710296 + MTEa LTR MaLR 32 220 -159 5 1300 3747 170 38 4 chr5 93846598 93847277 -58689982 - ETnERV2-int LTR ERVK -210 7196 6495 5 162 847 279 10 7 chr5 93847306 93847661 -58689598 - ETnERV3-int LTR ERVK -391 7826 7506 5 1301 790 175 112 10 chr5 93847650 93847846 -58689413 - ETnERV3-int LTR ERVK -420 5388 5173 5 1301 3178 16 0 0 chr5 93847893 93848270 -58688989 + MERVL-int LTR ERVL 992 1368 -4117 5 1301 3497 167 22 25 chr5 93848284 93849073 -58688186 - ETnERV3-int LTR ERVK -719 5089 3577 5 1301 1745 219 95 40 chr5 93856842 93857265 -58679994 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 1301 359 199 81 74 chr5 93858770 93858917 -58678342 + RLTR13D3 LTR ERVK 889 1114 0 5 1301 3163 78 33 7 chr5 93859206 93859631 -58677628 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 5 1301 1269 64 0 6 chr5 93859631 93859804 -58677455 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 172 -7409 5 1301 245 302 0 0 chr5 93859804 93859857 -58677402 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 5 1301 628 135 72 0 chr5 93859857 93859968 -58677291 + MMERVK10C-int LTR ERVK 225 343 -7238 5 1301 618 175 21 0 chr5 93859967 93860110 -58677149 + MMERVK10C-int LTR ERVK 747 892 -6689 5 1301 31195 49 6 9 chr5 93860105 93864445 -58672814 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3319 7581 0 5 1301 3255 76 28 7 chr5 93864446 93864872 -58672387 + RLTR10C LTR ERVK 2 436 0 5 1301 1363 242 86 57 chr5 93866400 93866934 -58670325 + MYSERV6-int LTR ERVK 8429 8905 -54 5 1301 469 252 28 14 chr5 93866956 93867101 -58670158 + RLTR12B LTR ERVK 41 187 -341 5 1301 348 114 0 10 chr5 93867088 93867158 -58670101 + ORR1A4 LTR MaLR 274 370 -14 5 1301 260 125 0 97 chr5 93867162 93867186 -58670073 + MYSERV6-int LTR ERVK 7301 7324 -1635 5 1301 1265 175 177 20 chr5 93867376 93867710 -58669549 + MYSERV6-int LTR ERVK 7325 7709 -1250 5 1301 2002 234 28 5 chr5 93868008 93868441 -58668818 + RLTR21 LTR ERVK 6 448 -1124 5 1301 1227 188 89 1 chr5 93876981 93877230 -58660029 + ORR1A1 LTR MaLR 1 278 -68 5 1301 505 274 192 50 chr5 93877296 93877618 -58659641 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 5 1301 1467 232 76 17 chr5 93889596 93889801 -58647458 - RMER16 LTR ERVK 0 533 328 5 1301 1467 232 76 17 chr5 93890211 93890412 -58646847 - RMER16 LTR ERVK -206 327 104 5 1301 227 350 115 10 chr5 93891448 93891552 -58645707 + LTR41 LTR ERVL 98 212 -556 5 1301 2569 138 38 40 chr5 93891666 93892142 -58645117 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 1301 769 189 27 80 chr5 93909258 93909482 -58627777 - RMER3D-int LTR ERVK -633 2209 1998 6 1301 306 255 10 48 chr5 93910032 93910135 -58627124 - RMER10B LTR ERVL -84 314 216 6 1301 3244 91 48 4 chr5 93914686 93915148 -58622111 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 6 1301 1493 232 73 17 chr5 93920503 93920708 -58616551 - RMER16 LTR ERVK 0 533 328 6 1301 1493 232 73 17 chr5 93921103 93921305 -58615954 - RMER16 LTR ERVK -206 327 104 6 1301 2600 136 38 40 chr5 93922558 93923034 -58614225 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1301 230 202 59 84 chr5 93939221 93939340 -58597919 - RLTR25B LTR ERVK -516 512 397 6 1301 760 195 32 64 chr5 93939920 93940139 -58597120 - RMER3D-int LTR ERVK -633 2209 1998 6 1301 348 271 39 39 chr5 93940665 93940792 -58596467 - RMER10B LTR ERVL -56 342 216 6 1301 362 244 67 73 chr5 93950624 93950778 -58586481 + RLTR13D3 LTR ERVK 981 1114 0 6 1301 1293 248 46 68 chr5 93952900 93953464 -58583795 + MYSERV6-int LTR ERVK 8426 8903 -56 6 1301 439 259 28 14 chr5 93953486 93953631 -58583628 + RLTR12B LTR ERVK 41 187 -341 6 1301 338 149 15 15 chr5 93953618 93953686 -58583573 + ORR1A4 LTR MaLR 254 321 -8 6 1301 1202 181 61 10 chr5 93953942 93954238 -58583021 + MYSERV6-int LTR ERVK 7399 7709 -1250 6 1301 2036 232 28 2 chr5 93954532 93954964 -58582295 + RLTR21 LTR ERVK 6 448 -1124 6 1301 738 194 103 7 chr5 93955525 93955670 -58581589 + ORR1A2 LTR MaLR 101 259 -68 7 1301 415 251 214 71 chr5 93955744 93956066 -58581193 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 7 1301 2405 242 97 62 chr5 93963256 93964183 -58573076 - MT-int LTR MaLR -135 963 4 7 1301 962 146 79 0 chr5 93964216 93964380 -58572879 - MTC LTR MaLR -233 188 12 7 1301 597 231 41 46 chr5 93965935 93966130 -58571129 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 331 7 1301 665 321 32 92 chr5 93967021 93967391 -58569868 - RMER5 LTR ERV1 -174 360 13 7 1301 743 345 61 23 chr5 93969119 93969463 -58567796 - MTEa LTR MaLR -20 359 3 7 1301 3881 57 0 0 chr5 93969999 93970474 -58566785 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 7 1301 696 252 130 50 chr5 93970482 93970625 -58566634 + MTEb LTR MaLR 2 166 -213 7 1301 2599 97 79 0 chr5 93970625 93971006 -58566253 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 7 1301 696 252 130 50 chr5 93971006 93971163 -58566096 + MTEb LTR MaLR 167 326 -53 7 1302 396 307 50 28 chr5 93986558 93986699 -58550560 + ORR1D2 LTR MaLR 3 146 -224 7 1302 1339 263 60 27 chr5 93986803 93987205 -58550054 - MTD LTR MaLR 0 419 5 7 1302 1659 226 24 13 chr5 93987318 93987695 -58549564 + MTC-int LTR MaLR 427 807 -451 7 1302 547 172 10 0 chr5 93987685 93987779 -58549480 + MTC LTR MaLR 224 318 -103 7 1302 591 223 23 8 chr5 93987779 93987910 -58549349 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 277 7 1302 1904 132 9 51 chr5 94002132 94002468 -58534791 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1302 9913 103 21 27 chr5 94002468 94003980 -58533279 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 3342 2 1302 3470 141 24 54 chr5 94005007 94005766 -58531493 + RMER17A LTR ERVK 1 736 -15 3 1302 1647 226 98 41 chr5 94011515 94011934 -58525325 + RLTR41 LTR ERV1 4 446 0 1 1302 2109 111 232 43 chr5 94022035 94022496 -58514763 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 37 2 1302 68330 18 13 1 chr5 94022605 94030294 -58506965 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 1 2 1302 2212 113 221 43 chr5 94030294 94030777 -58506482 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -49 605 37 2 1302 1704 138 254 33 chr5 94032085 94032534 -58504725 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 37 2 1302 248 209 209 0 chr5 94032574 94032641 -58504618 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -573 81 1 2 1302 65235 35 17 6 chr5 94032641 94040344 -58496915 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 1 2 1302 1760 134 251 33 chr5 94040344 94040798 -58496461 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -65 589 37 2 1302 268 194 209 0 chr5 94040838 94040905 -58496354 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -573 81 1 2 1302 225 167 0 0 chr5 94044752 94044788 -58492471 + RMER10A LTR ERVL 12 47 -395 3 1302 1105 353 43 59 chr5 94046486 94047350 -58489909 - RodERV21-int LTR ERV1 -1273 3718 2869 3 1302 306 186 16 53 chr5 94047836 94047943 -58489316 - RodERV21-int LTR ERV1 -2657 4949 4830 3 1302 461 344 30 45 chr5 94049441 94049882 -58487377 - RodERV21-int LTR ERV1 -3020 4071 3638 3 1302 3973 299 19 43 chr5 94050050 94051392 -58485867 - RodERV21-int LTR ERV1 -2273 2718 1410 3 1302 813 307 45 111 chr5 94052690 94053430 -58483829 - RodERV21-int LTR ERV1 -3571 1420 730 3 1302 263 294 19 95 chr5 94053409 94053567 -58483692 - RMER17C-int LTR ERVK -2714 524 379 3 1302 335 298 8 42 chr5 94063827 94063946 -58473313 - RMER10B LTR ERVL -57 341 227 4 1302 1505 230 54 38 chr5 94079936 94080150 -58457109 - RMER16 LTR ERVK 0 533 320 6 1302 1505 225 31 84 chr5 94080544 94080778 -58456481 - RMER16 LTR ERVK -214 319 1 6 1302 4698 78 15 14 chr5 94083707 94084440 -58452819 + IAPLTR4_I LTR ERVK 129 952 -6629 7 1302 1548 203 159 58 chr5 94084551 94085068 -58452191 + RMER16-int LTR ERVK 251 819 -4587 7 1302 291 279 107 9 chr5 94085073 94085185 -58452074 + RMER16-int LTR ERVK 938 1060 -5077 7 1302 295 267 0 55 chr5 94085198 94085289 -58451970 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2539 -4867 7 1302 557 229 0 0 chr5 94085301 94085419 -58451840 + ETnERV2-int LTR ERVK 2635 2752 -4654 7 1302 1910 148 120 5 chr5 94085446 94086031 -58451228 + ETnERV2-int LTR ERVK 3567 4271 -3135 7 1302 401 204 22 2 chr5 94086036 94086157 -58451102 + RMER16-int LTR ERVK 2367 2464 -2380 7 1302 795 76 17 8 chr5 94086168 94086287 -58450972 + IAPEY3-int LTR ERVK 4530 4649 -2932 7 1302 3115 89 0 18 chr5 94086564 94087012 -58450247 + IAPEY3-int LTR ERVK 5203 5642 -1939 7 1302 3074 98 7 7 chr5 94087003 94087457 -58449802 + IAPEY3-int LTR ERVK 5761 6214 -1367 7 1302 3815 105 28 2 chr5 94087447 94088028 -58449231 + IAPEY3-int LTR ERVK 6743 7338 -342 7 1302 1273 185 61 20 chr5 94088045 94088388 -58448871 + IAPEz-int LTR ERVK 6125 6481 0 7 1302 1430 181 92 0 chr5 94088388 94088681 -58448578 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 320 -12 7 1302 3468 158 54 35 chr5 94088688 94089423 -58447836 + RMER17D LTR ERVK 141 889 0 7 1302 803 145 7 0 chr5 94089423 94089561 -58447698 + RMER16-int LTR ERVK 4200 4338 -1068 7 1302 420 280 16 6 chr5 94089556 94089739 -58447520 + RLTR6-int LTR ERV1 7387 7571 -207 7 1302 1188 180 131 21 chr5 94092947 94093237 -58444022 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 8 1302 2601 237 87 69 chr5 94098365 94099308 -58437951 - MT-int LTR MaLR -135 963 4 8 1302 1186 138 6 0 chr5 94099338 94099519 -58437740 - MTC LTR MaLR -229 192 11 8 1302 1212 288 34 89 chr5 94100938 94101490 -58435769 - RMER5 LTR ERV1 -5 529 8 9 1303 383 290 9 0 chr5 94112310 94112417 -58424842 + ORR1D1 LTR MaLR 39 146 -228 1 1303 627 208 38 19 chr5 94112518 94112675 -58424584 - MTD LTR MaLR 0 419 260 1 1303 1676 195 12 6 chr5 94112677 94113008 -58424251 + MTC-int LTR MaLR 475 807 -451 1 1303 539 177 10 0 chr5 94112998 94113094 -58424165 + MTC LTR MaLR 224 320 -101 1 1303 1730 195 77 13 chr5 94113098 94113473 -58423786 - RLTR9E LTR ERVK -5 404 6 1 1303 341 134 134 0 chr5 94113619 94113686 -58423573 + MTC LTR MaLR 346 421 0 1 1303 448 216 10 0 chr5 94115075 94115172 -58422087 - MTC-int LTR MaLR -252 1006 909 1 1303 1457 242 140 44 chr5 94119903 94120310 -58416949 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 1 1303 354 298 33 77 chr5 94123407 94123589 -58413670 - RMER10B LTR ERVL -12 386 213 1 1303 1543 244 72 5 chr5 94137205 94137592 -58399667 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1303 432 254 66 66 chr5 94137597 94137795 -58399464 - MTC-int LTR MaLR -6 1252 1055 1 1303 501 293 31 31 chr5 94155394 94155651 -58381608 - RLTR6-int LTR ERV1 -135 7643 7387 1 1303 847 159 7 0 chr5 94155646 94155784 -58381475 - RMER16-int LTR ERVK -1068 4338 4200 1 1303 3850 169 28 33 chr5 94155784 94156581 -58380678 - RMER17D LTR ERVK 0 889 97 1 1303 227 189 0 0 chr5 94158272 94158309 -58378950 - RMER10A LTR ERVL -394 48 12 1 1303 1436 225 32 83 chr5 94160384 94160615 -58376644 + RMER16 LTR ERVK 1 322 -211 1 1303 1436 243 57 33 chr5 94161010 94161224 -58376035 + RMER16 LTR ERVK 323 533 0 1 1303 288 314 10 19 chr5 94171048 94171152 -58366107 + RMER10B LTR ERVL 213 315 -83 1 1303 2730 133 8 171 chr5 94179298 94179924 -58357335 + RMER2 LTR ERV1 44 567 0 1 1303 333 276 30 30 chr5 94181749 94181880 -58355379 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1432 -3631 2 1303 480 322 61 11 chr5 94182591 94182921 -58354338 + MURVY-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 2 1303 1293 293 62 5 chr5 94183198 94183634 -58353625 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 2 1303 3377 145 16 18 chr5 94184066 94184629 -58352630 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 2 1303 2786 152 80 12 chr5 94184736 94185237 -58352022 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 2 1303 3953 135 29 77 chr5 94190443 94191232 -58346027 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 2 1303 9923 103 21 27 chr5 94192257 94193769 -58343490 + MMETn-int LTR ERVK 3342 4844 0 2 1303 2024 132 9 51 chr5 94193769 94194105 -58343154 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1303 580 231 23 8 chr5 94208315 94208446 -58328813 + RLTR9E LTR ERVK 277 409 0 2 1303 555 170 9 28 chr5 94208446 94208550 -58328709 - MTC LTR MaLR -103 318 217 2 1303 1626 228 41 13 chr5 94208530 94208921 -58328338 - MTC-int LTR MaLR -451 807 406 2 1303 1270 263 60 27 chr5 94209020 94209422 -58327837 + MTD LTR MaLR 5 419 0 2 1303 381 292 37 30 chr5 94209530 94209664 -58327595 - MTC LTR MaLR -233 137 3 2 1303 678 255 130 50 chr5 94218205 94218362 -58318897 - MTEb LTR MaLR -53 326 167 2 1303 2773 97 79 0 chr5 94218362 94218743 -58318516 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 1303 678 255 130 50 chr5 94218743 94218886 -58318373 - MTEb LTR MaLR -213 166 2 2 1303 4139 57 0 0 chr5 94218894 94219369 -58317890 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1303 727 345 61 23 chr5 94219905 94220249 -58317010 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 2 1303 635 321 32 92 chr5 94221620 94221990 -58315269 + RMER5 LTR ERV1 13 360 -174 2 1303 586 236 41 46 chr5 94222881 94223076 -58314183 + RMER5 LTR ERV1 331 524 -10 2 1303 962 146 79 0 chr5 94224594 94224758 -58312501 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 2 1303 2470 237 97 62 chr5 94224791 94225718 -58311541 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 2 1303 401 254 214 71 chr5 94232907 94233229 -58304030 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 1303 738 194 103 7 chr5 94239789 94239934 -58297325 - ORR1A2 LTR MaLR -68 259 101 2 162 2036 232 28 2 chr5 94240495 94240927 -58296332 - RLTR21 LTR ERVK -1124 448 6 2 1304 1202 181 61 10 chr5 94241221 94241517 -58295742 - MYSERV6-int LTR ERVK -1250 7709 7399 2 1304 338 149 15 15 chr5 94241773 94241841 -58295418 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 254 2 1304 439 259 28 14 chr5 94241828 94241973 -58295286 - RLTR12B LTR ERVK -341 187 41 2 1304 1296 246 46 71 chr5 94241995 94242561 -58294698 - MYSERV6-int LTR ERVK -56 8903 8426 2 1304 367 243 67 73 chr5 94244678 94244832 -58292427 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 981 2 1304 348 271 39 39 chr5 94254705 94254832 -58282427 + RMER10B LTR ERVL 216 342 -56 2 1304 760 195 32 64 chr5 94255358 94255577 -58281682 + RMER3D-int LTR ERVK 1998 2209 -633 2 1304 230 202 59 84 chr5 94256163 94256282 -58280977 + RLTR25B LTR ERVK 397 512 -516 2 1304 2613 133 38 40 chr5 94272482 94272958 -58264301 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 1304 1450 235 76 17 chr5 94274212 94274413 -58262846 + RMER16 LTR ERVK 103 326 -207 3 1304 1450 235 76 17 chr5 94274809 94275014 -58262245 + RMER16 LTR ERVK 327 532 -1 3 1304 3497 89 45 4 chr5 94280365 94280828 -58256431 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1304 857 216 39 162 chr5 94286845 94287204 -58250055 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 8 3 1304 225 218 93 65 chr5 94289775 94289883 -58247376 + MURVY-LTR LTR ERV1 351 461 -58 3 1304 1347 331 46 45 chr5 94290004 94290672 -58246587 + RodERV21-int LTR ERV1 4120 4788 -203 3 1304 716 176 7 7 chr5 94291739 94291876 -58245383 + MTC-int LTR MaLR 909 1045 -213 3 1304 378 164 82 0 chr5 94292592 94292665 -58244594 - MTC LTR MaLR 0 421 343 3 1304 868 256 46 95 chr5 94292797 94293164 -58244095 + RMER5 LTR ERV1 186 534 0 3 1304 2833 189 12 41 chr5 94293999 94294566 -58242693 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 551 -2 3 1304 1863 215 34 38 chr5 94294567 94295433 -58241826 + RMER3D-int LTR ERVK 1 1382 -1460 3 1304 5137 207 83 53 chr5 94295491 94296966 -58240293 + RMER3D-int LTR ERVK 388 2841 -1 3 1304 605 162 7 117 chr5 94296967 94297121 -58240138 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 137 -416 3 1304 918 241 113 51 chr5 94298633 94298823 -58238436 - MTEb LTR MaLR -21 358 168 3 1304 2969 86 43 0 chr5 94298823 94299217 -58238042 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 3 1304 918 241 113 51 chr5 94299217 94299362 -58237897 - MTEb LTR MaLR -212 167 2 3 1304 3629 43 30 11 chr5 94299370 94299719 -58237540 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 363 -112 3 1304 4565 19 0 0 chr5 94299719 94300201 -58237058 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 3 1304 3629 43 30 11 chr5 94300201 94300317 -58236942 + MT2C_Mm LTR ERVL 364 475 0 3 1304 711 306 82 44 chr5 94300857 94301199 -58236060 + MTEa LTR MaLR 5 359 -20 3 1304 581 251 54 11 chr5 94302628 94302813 -58234446 + RMER5 LTR ERV1 331 523 -11 3 1304 2982 68 52 0 chr5 94303544 94303913 -58233346 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 3 1304 1022 137 74 6 chr5 94304644 94304814 -58232445 + MTC LTR MaLR 6 188 -233 3 1304 2726 226 91 75 chr5 94304847 94305792 -58231467 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 3 1304 2569 18 2 253 chr5 94310150 94310574 -58226685 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 97 4 1304 2569 18 2 253 chr5 94311012 94311108 -58226151 - RLTR10 LTR ERVK -294 96 1 4 1304 2652 139 8 171 chr5 94314364 94314990 -58222269 + RMER2 LTR ERV1 44 567 0 4 1304 693 215 35 61 chr5 94316141 94316339 -58220920 - RMER13A LTR ERVK -570 290 98 4 1304 356 179 0 15 chr5 94316964 94317032 -58220227 - RMER17A-int LTR ERVK -518 1210 1144 4 1304 314 283 30 38 chr5 94324157 94324289 -58212970 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1432 -3631 4 1304 444 322 65 14 chr5 94324999 94325329 -58211930 + MURVY-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 4 1304 1241 298 34 5 chr5 94325606 94326042 -58211217 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 4 1304 3391 143 16 18 chr5 94326474 94327037 -58210222 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 4 1304 2797 148 80 12 chr5 94327144 94327645 -58209614 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 4 1304 1937 174 41 41 chr5 94332880 94333342 -58203917 - RMER17D2 LTR ERVK -15 794 333 4 1304 463 222 65 75 chr5 94348017 94348217 -58189042 + MTC-int LTR MaLR 1055 1252 -6 4 1304 1541 233 92 5 chr5 94348222 94348602 -58188657 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1304 620 207 35 11 chr5 94350066 94350208 -58187051 - RLTR21 LTR ERVK -136 1436 1281 4 1304 1010 223 82 43 chr5 94350383 94350711 -58186548 - RLTR21 LTR ERVK -426 1146 806 4 1304 367 279 29 99 chr5 94368947 94369118 -58168141 + RMER10B LTR ERVL 228 386 -12 4 1304 1363 242 150 52 chr5 94371103 94371509 -58165750 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 4 1305 418 237 10 0 chr5 94376123 94376220 -58161039 + MTC-int LTR MaLR 909 1006 -252 4 1305 407 151 114 0 chr5 94377606 94377698 -58159561 - MTC LTR MaLR 0 421 268 4 1305 1995 177 70 13 chr5 94377828 94378211 -58159048 + RLTR9E LTR ERVK 5 409 0 4 1305 566 147 29 29 chr5 94378215 94378320 -58158939 - MTC LTR MaLR -107 314 210 4 1305 1617 229 24 13 chr5 94378295 94378672 -58158587 - MTC-int LTR MaLR -451 807 427 4 1305 1334 253 59 35 chr5 94378785 94379190 -58158069 + MTD LTR MaLR 5 419 0 4 1305 388 283 42 28 chr5 94379290 94379432 -58157827 - MTC LTR MaLR -228 146 3 4 1305 1183 288 36 93 chr5 94390175 94390734 -58146525 + RMER5 LTR ERV1 3 529 -5 5 1305 1165 144 6 0 chr5 94392148 94392329 -58144930 + MTC LTR MaLR 11 192 -229 5 1305 2630 230 90 75 chr5 94392359 94393104 -58144155 + MT-int LTR MaLR 4 801 -297 5 1305 4386 8 0 0 chr5 94393104 94393586 -58143673 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 5 1305 2630 230 90 75 chr5 94393586 94393795 -58143464 + MT-int LTR MaLR 802 972 -126 5 1305 1337 164 55 73 chr5 94398871 94399199 -58138060 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1305 235 234 30 30 chr5 94401825 94401891 -58135368 - RLTR9A LTR ERVK -296 72 7 5 1305 394 286 16 6 chr5 94402434 94402617 -58134642 - RLTR6-int LTR ERV1 -207 7571 7387 5 1305 779 152 7 0 chr5 94402612 94402750 -58134509 - RMER16-int LTR ERVK -1068 4338 4200 5 1305 3637 147 44 40 chr5 94402750 94403496 -58133763 - RMER17D LTR ERVK 0 889 141 5 1305 1483 174 92 0 chr5 94403503 94403796 -58133463 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 5 1305 1258 181 61 20 chr5 94403796 94404139 -58133120 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6125 5 1305 3647 111 29 25 chr5 94404156 94404422 -58132837 - IAPEY3-int LTR ERVK -342 7338 7071 5 1305 3647 111 29 25 chr5 94404918 94405245 -58132014 - IAPEY3-int LTR ERVK -610 7070 6743 5 1305 3101 102 4 4 chr5 94405235 94405689 -58131570 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 5 1305 3114 96 0 16 chr5 94405680 94406127 -58131132 - IAPEY3-int LTR ERVK -1939 5642 5203 5 1305 795 76 17 8 chr5 94406404 94406523 -58130736 - IAPEY3-int LTR ERVK -2932 4649 4530 5 1305 428 188 19 34 chr5 94406539 94406662 -58130597 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 5 1305 1896 140 111 5 chr5 94406671 94407255 -58130004 - ETnERV2-int LTR ERVK -3142 4264 3567 5 1305 577 219 0 0 chr5 94407281 94407400 -58129859 - ETnERV2-int LTR ERVK -4653 2753 2635 5 1305 291 267 0 55 chr5 94407412 94407503 -58129756 - ETnERV2-int LTR ERVK -4867 2539 2454 5 1305 280 310 88 0 chr5 94407516 94407629 -58129630 - RMER16-int LTR ERVK -5077 1060 938 5 1305 1441 198 93 68 chr5 94407634 94408148 -58129111 - RMER16-int LTR ERVK -4760 646 251 5 1305 335 144 0 103 chr5 94408259 94408375 -58128884 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 849 5 1305 5124 67 14 15 chr5 94408356 94409086 -58128173 - IAPLTR4_I LTR ERVK -704 766 38 5 1305 1409 187 73 41 chr5 94409087 94409404 -58127855 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -1 366 1 5 1305 411 57 0 0 chr5 94409404 94409457 -58127802 - RMER17D2 LTR ERVK -659 150 98 5 1305 725 152 0 9 chr5 94413132 94413245 -58124014 - RMER17D2 LTR ERVK -697 112 1 5 1305 706 100 8 62 chr5 94413245 94413373 -58123886 - RMER16-int LTR ERVK -1207 4199 4079 5 1305 3651 124 55 72 chr5 94413373 94414060 -58123199 - RMER16-int LTR ERVK -3017 2389 1677 5 1305 3651 124 55 72 chr5 94414219 94414241 -58123018 - RMER16-int LTR ERVK -3730 1676 1676 5 1305 3651 124 55 72 chr5 94414264 94414319 -58122940 - RMER16-int LTR ERVK -3730 1676 1637 5 1305 228 260 125 77 chr5 94414319 94414423 -58122836 + MTA_Mm LTR MaLR 196 304 -92 5 1305 278 291 15 30 chr5 94414442 94414573 -58122686 - ETnERV2-int LTR ERVK -3812 2355 2227 5 1305 552 242 28 131 chr5 94414682 94414934 -58122325 - ETnERV2-int LTR ERVK -4859 2547 2322 5 1305 298 294 6 150 chr5 94414953 94415113 -58122146 - ETnERV2-int LTR ERVK -5075 2331 2195 5 1305 252 208 0 0 chr5 94415085 94415133 -58122126 - ETnERV2-int LTR ERVK -1730 1584 1537 5 1305 467 230 8 16 chr5 94415318 94415446 -58121813 - ETnERV2-int LTR ERVK -3822 1584 1458 5 1305 240 162 0 0 chr5 94417133 94417170 -58120089 - RMER10A LTR ERVL -394 48 12 5 1305 1525 217 33 83 chr5 94419245 94419474 -58117785 + RMER16 LTR ERVK 1 320 -213 5 1305 1525 222 62 33 chr5 94419870 94420084 -58117175 + RMER16 LTR ERVK 321 533 0 5 1305 313 301 23 47 chr5 94429442 94429571 -58107688 + RMER10B LTR ERVL 216 341 -57 5 1305 2698 141 9 168 chr5 94437841 94438479 -58098780 + RMER2 LTR ERV1 31 567 0 5 1305 302 264 31 31 chr5 94440282 94440411 -58096848 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1430 -3633 5 1305 369 326 61 11 chr5 94441123 94441453 -58095806 + MURVY-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 5 1305 1067 301 68 5 chr5 94441730 94442164 -58095095 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 5 1305 3421 136 18 18 chr5 94442595 94443157 -58094102 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 5 1305 2855 145 78 14 chr5 94443264 94443767 -58093492 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 5 1305 3638 136 25 48 chr5 94448988 94449744 -58087515 - RMER17A LTR ERVK -12 739 1 5 1305 9614 114 21 26 chr5 94450772 94452280 -58084979 + MMETn-int LTR ERVK 3344 4844 0 5 1305 1883 138 9 51 chr5 94452280 94452616 -58084643 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 1305 3513 23 2 0 chr5 94459224 94459619 -58077640 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1305 9603 23 2 0 chr5 94459619 94460715 -58076544 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1305 3513 23 2 0 chr5 94460715 94461110 -58076149 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1305 441 219 67 78 chr5 94487562 94487755 -58049504 + MTC-int LTR MaLR 1062 1252 -6 6 1305 1545 229 72 5 chr5 94487760 94488147 -58049112 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 1305 565 217 35 11 chr5 94489611 94489753 -58047506 - RLTR21 LTR ERVK -136 1436 1281 6 1305 969 214 82 42 chr5 94489994 94490325 -58046934 - RLTR21 LTR ERVK -426 1146 803 6 1305 3380 43 2 0 chr5 94490942 94491337 -58045922 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1305 9690 17 3 0 chr5 94491337 94492432 -58044827 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1305 904 26 9 0 chr5 94492432 94492548 -58044711 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 280 6 1305 1479 31 5 0 chr5 94492537 94492728 -58044531 + MTA_Mm LTR MaLR 205 396 0 6 1306 351 279 29 99 chr5 94510396 94510567 -58026692 + RMER10B LTR ERVL 228 386 -12 1 1306 1538 210 150 54 chr5 94512550 94512957 -58024302 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 1306 401 237 10 0 chr5 94567708 94567805 -57969454 + MTC-int LTR MaLR 909 1006 -252 3 1306 411 155 114 0 chr5 94569193 94569285 -57967974 - MTC LTR MaLR 0 421 268 3 1306 1875 166 76 18 chr5 94569416 94569797 -57967462 + RLTR9E LTR ERVK 7 409 0 3 1306 538 182 10 0 chr5 94569797 94569891 -57967368 - MTC LTR MaLR -103 318 224 3 1306 1614 198 15 6 chr5 94569881 94570211 -57967048 - MTC-int LTR MaLR -451 807 475 4 1306 654 195 38 19 chr5 94570213 94570370 -57966889 + MTD LTR MaLR 260 419 0 4 1306 399 299 9 0 chr5 94570471 94570578 -57966681 - MTC LTR MaLR -228 146 39 3 1306 765 260 99 54 chr5 94583622 94583811 -57953448 - MTEb LTR MaLR -21 358 163 5 1306 2777 100 51 0 chr5 94583811 94584202 -57953057 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 5 1306 765 260 99 54 chr5 94584202 94584325 -57952934 - MTEb LTR MaLR -217 162 32 5 1306 3933 53 0 0 chr5 94584353 94584828 -57952431 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 1306 667 351 61 26 chr5 94585364 94585709 -57951550 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 6 1306 612 330 32 92 chr5 94587425 94587795 -57949464 + RMER5 LTR ERV1 13 360 -174 6 1306 611 231 41 46 chr5 94588680 94588875 -57948384 + RMER5 LTR ERV1 331 524 -10 6 1306 908 153 86 0 chr5 94590415 94590578 -57946681 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 7 1306 2601 233 105 59 chr5 94590611 94591529 -57945730 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 7 1306 506 257 202 59 chr5 94598658 94598980 -57938279 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 8 1306 1196 192 89 0 chr5 94599054 94599278 -57937981 - ORR1A1 LTR MaLR -68 278 35 8 1306 561 200 15 23 chr5 94600675 94600808 -57936451 - MYSERV-int LTR ERVK -1429 7530 7399 8 1306 346 83 0 0 chr5 94601064 94601112 -57936147 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 274 8 1306 381 273 27 40 chr5 94601121 94601270 -57935989 - RLTR12B LTR ERVK -341 187 41 8 1306 1417 247 43 64 chr5 94601292 94601854 -57935405 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6001 8 1306 362 244 67 73 chr5 94603998 94604152 -57933107 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 981 9 1306 322 271 39 39 chr5 94614007 94614134 -57923125 + RMER10B LTR ERVL 216 342 -56 9 1306 878 190 32 64 chr5 94614660 94614879 -57922380 + RMER3D-int LTR ERVK 1998 2209 -633 9 1306 226 202 57 107 chr5 94615447 94615569 -57921690 + RLTR25B LTR ERVK 397 512 -516 1 1307 2870 131 38 40 chr5 94638391 94638867 -57898392 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1307 1462 228 76 17 chr5 94640121 94640322 -57896937 + RMER16 LTR ERVK 103 326 -207 1 1307 1462 228 76 17 chr5 94640718 94640923 -57896336 + RMER16 LTR ERVK 327 532 -1 1 1307 3439 91 48 7 chr5 94646288 94646751 -57890508 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1307 273 255 20 30 chr5 94651344 94651445 -57885814 + RMER10B LTR ERVL 216 315 -83 1 1307 895 195 48 151 chr5 94652743 94653094 -57884165 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 8 1 1307 225 218 93 65 chr5 94655727 94655835 -57881424 + MURVY-LTR LTR ERV1 351 461 -58 1 1307 1333 331 46 45 chr5 94655956 94656624 -57880635 + RodERV21-int LTR ERV1 4120 4788 -203 1 1307 736 169 7 7 chr5 94657703 94657840 -57879419 + MTC-int LTR MaLR 909 1045 -213 1 1307 378 164 82 0 chr5 94665445 94665518 -57871741 - MTC LTR MaLR 0 421 343 1 1307 868 256 46 95 chr5 94665648 94666015 -57871244 + RMER5 LTR ERV1 186 534 0 1 1307 2808 191 12 41 chr5 94666854 94667421 -57869838 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 551 -2 1 1307 1825 215 34 38 chr5 94667422 94668288 -57868971 + RMER3D-int LTR ERVK 1 1382 -1460 1 1307 5138 210 83 52 chr5 94668346 94669821 -57867438 + RMER3D-int LTR ERVK 388 2841 -1 1 1307 615 154 7 117 chr5 94669822 94669976 -57867283 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 137 -416 1 1307 872 242 116 54 chr5 94671487 94671677 -57865582 - MTEb LTR MaLR -21 358 168 1 1307 3029 86 43 0 chr5 94671677 94672071 -57865188 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 1 1307 872 242 116 54 chr5 94672071 94672216 -57865043 - MTEb LTR MaLR -212 167 2 1 1307 3643 41 30 11 chr5 94672224 94672573 -57864686 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 363 -112 1 1307 4525 25 0 0 chr5 94672573 94673055 -57864204 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 1 1307 3643 41 30 11 chr5 94673055 94673171 -57864088 + MT2C_Mm LTR ERVL 364 475 0 1 1307 711 309 82 44 chr5 94673704 94674046 -57863213 + MTEa LTR MaLR 5 359 -20 1 1307 597 246 54 11 chr5 94675475 94675660 -57861599 + RMER5 LTR ERV1 331 523 -11 2 1307 3037 73 8 35 chr5 94676392 94676791 -57860468 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 2 1307 989 154 74 0 chr5 94677525 94677695 -57859564 + MTC LTR MaLR 1 183 -238 2 1307 2655 226 93 76 chr5 94677728 94678672 -57858587 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 2 1307 2652 141 8 171 chr5 94686477 94687103 -57850156 + RMER2 LTR ERV1 44 567 0 2 1307 693 215 35 61 chr5 94688289 94688487 -57848772 - RMER13A LTR ERVK -570 290 98 2 1307 356 179 0 15 chr5 94689112 94689180 -57848079 - RMER17A-int LTR ERVK -518 1210 1144 2 1307 333 276 30 30 chr5 94696117 94696248 -57841011 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1432 -3631 2 1307 444 322 65 14 chr5 94696958 94697288 -57839971 + MuRRS4-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 2 1307 1205 309 55 11 chr5 94697562 94698001 -57839258 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 2 1307 3398 143 16 18 chr5 94698433 94698996 -57838263 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 2 1307 2796 149 80 12 chr5 94699103 94699604 -57837655 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 2 1307 3885 143 24 36 chr5 94704842 94705587 -57831672 - RMER17A LTR ERVK -15 736 1 2 1307 9620 113 21 26 chr5 94706615 94708126 -57829133 + MMETn-int LTR ERVK 3342 4844 0 2 1307 2021 135 9 51 chr5 94708126 94708462 -57828797 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1307 451 211 97 84 chr5 94725697 94725924 -57811335 + MTC-int LTR MaLR 1023 1252 -6 2 1307 1588 228 92 5 chr5 94725929 94726309 -57810950 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1307 1235 235 59 79 chr5 94727773 94727955 -57809304 - RLTR21 LTR ERVK -136 1436 1225 2 1307 1235 240 148 65 chr5 94727995 94728454 -57808805 - RLTR21 LTR ERVK -266 1306 806 2 1307 367 279 29 99 chr5 94746661 94746832 -57790427 + RMER10B LTR ERVL 228 386 -12 2 1307 1388 236 150 52 chr5 94748816 94749222 -57788037 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 1307 418 237 10 0 chr5 94753833 94753930 -57783329 + MTC-int LTR MaLR 909 1006 -252 3 1307 407 151 114 0 chr5 94755132 94755224 -57782035 - MTC LTR MaLR 0 421 268 3 1307 1999 183 70 13 chr5 94755354 94755737 -57781522 + RLTR9E LTR ERVK 5 409 0 3 1307 566 147 29 29 chr5 94755741 94755846 -57781413 - MTC LTR MaLR -107 314 210 3 1307 1617 229 24 13 chr5 94755821 94756198 -57781061 - MTC-int LTR MaLR -451 807 427 3 1307 1247 264 59 39 chr5 94756311 94756718 -57780541 + MTD LTR MaLR 5 419 0 3 1307 413 275 42 28 chr5 94756818 94756960 -57780299 - MTC LTR MaLR -228 146 3 3 1308 1156 286 36 90 chr5 94767716 94768273 -57768986 + RMER5 LTR ERV1 3 529 -5 3 1308 1176 138 6 0 chr5 94769682 94769863 -57767396 + MTC LTR MaLR 11 192 -229 3 1308 2612 230 90 75 chr5 94769893 94770638 -57766621 + MT-int LTR MaLR 4 801 -297 3 1308 4647 8 0 0 chr5 94770638 94771120 -57766139 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 3 1308 2612 230 90 75 chr5 94771120 94771329 -57765930 + MT-int LTR MaLR 802 972 -126 3 1308 261 210 198 58 chr5 94773448 94773534 -57763725 - MT2B LTR ERVL -337 264 167 3 1308 1293 174 55 73 chr5 94776386 94776714 -57760545 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1308 4641 14 2 12 chr5 94776937 94777435 -57759824 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1308 235 234 30 30 chr5 94779847 94779913 -57757346 - RLTR9A LTR ERVK -296 72 7 3 1308 464 280 50 41 chr5 94780393 94780635 -57756624 - RLTR6-int LTR ERV1 -148 7630 7387 3 1308 847 152 7 0 chr5 94780630 94780768 -57756491 - RMER16-int LTR ERVK -1068 4338 4200 3 1308 3680 149 44 39 chr5 94780768 94781513 -57755746 - RMER17D LTR ERVK 0 889 141 3 1308 1480 178 92 0 chr5 94781520 94781813 -57755446 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 3 1308 1356 182 64 20 chr5 94781813 94782155 -57755104 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6125 3 1308 3950 107 29 30 chr5 94782172 94782438 -57754821 - IAPEY3-int LTR ERVK -342 7338 7073 3 1308 3950 107 29 30 chr5 94782934 94783264 -57753995 - IAPEY3-int LTR ERVK -608 7072 6743 3 1308 3262 106 4 7 chr5 94783254 94783709 -57753550 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 3 1308 3385 92 0 16 chr5 94783697 94784147 -57753112 - IAPEY3-int LTR ERVK -1936 5645 5203 3 1308 875 81 35 49 chr5 94784400 94784543 -57752716 - IAPEY3-int LTR ERVK -2911 4670 4530 3 1308 478 183 22 36 chr5 94784555 94784679 -57752580 - IAPEY3-int LTR ERVK -2380 2464 2357 3 1308 2048 144 108 7 chr5 94784691 94785275 -57751984 - ETnERV2-int LTR ERVK -3142 4264 3567 3 1308 635 242 374 25 chr5 94785301 94785523 -57751736 - ETnERV2-int LTR ERVK -4653 2753 2454 3 1308 327 310 88 0 chr5 94785536 94785649 -57751610 - RMER16-int LTR ERVK -5077 1060 938 3 1308 1781 206 159 54 chr5 94785635 94786169 -57751090 - RMER16-int LTR ERVK -4587 819 251 3 1308 5521 80 19 21 chr5 94786280 94787107 -57750152 - IAPLTR4_I LTR ERVK -6629 952 38 3 1308 1430 184 88 10 chr5 94787108 94787425 -57749834 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -1 366 1 3 1308 401 41 0 0 chr5 94787429 94787478 -57749781 - RMER17D2 LTR ERVK -663 146 98 3 1308 716 161 0 9 chr5 94791153 94791266 -57745993 - RMER17D2 LTR ERVK -697 112 1 3 1308 762 100 8 62 chr5 94791266 94791394 -57745865 - RMER16-int LTR ERVK -1207 4199 4079 3 1308 4253 133 50 92 chr5 94791394 94792081 -57745178 - RMER16-int LTR ERVK -3017 2389 1675 3 1308 4253 133 50 92 chr5 94792242 94792414 -57744845 - RMER16-int LTR ERVK -3732 1674 1566 3 1308 322 259 71 71 chr5 94792467 94792650 -57744609 - SRV_MM-int LTR ERVK -3812 2355 2173 3 1308 815 261 48 150 chr5 94792707 94793043 -57744216 - ETnERV2-int LTR ERVK -4859 2547 2250 3 1308 815 261 48 150 chr5 94793100 94793156 -57744103 - ETnERV2-int LTR ERVK -5157 2249 2196 3 1308 275 208 0 0 chr5 94793128 94793176 -57744083 - ETnERV2-int LTR ERVK -1730 1584 1537 3 1308 527 228 8 16 chr5 94793361 94793490 -57743769 - ETnERV2-int LTR ERVK -3822 1584 1457 3 1308 240 162 0 0 chr5 94795178 94795215 -57742044 - RMER10A LTR ERVL -394 48 12 3 1308 3627 35 104 5 chr5 94795310 94795742 -57741517 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 1308 1523 217 33 83 chr5 94797734 94797963 -57739296 + RMER16 LTR ERVK 1 320 -213 3 1308 1523 222 62 33 chr5 94798359 94798573 -57738686 + RMER16 LTR ERVK 321 533 0 3 1308 4680 20 0 0 chr5 94800120 94800613 -57736646 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1308 48253 16 8 0 chr5 94800613 94805944 -57731315 + MERVL-int LTR ERVL 1 5371 -114 3 1308 372 137 13 40 chr5 94805944 94806020 -57731239 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 3 1308 322 0 0 0 chr5 94806020 94806058 -57731201 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 1308 4713 16 0 0 chr5 94806058 94806551 -57730708 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1308 309 331 16 16 chr5 94814349 94814478 -57722781 + RMER10B LTR ERVL 213 341 -57 3 1308 2732 133 8 171 chr5 94822724 94823350 -57713909 + RMER2 LTR ERV1 44 567 0 3 1308 333 276 30 30 chr5 94825152 94825283 -57711976 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1432 -3631 3 1308 438 330 61 11 chr5 94825993 94826323 -57710936 + MURVY-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 3 1308 1268 300 51 7 chr5 94826600 94827036 -57710223 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 3 1308 3413 136 18 18 chr5 94827467 94828029 -57709230 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 4 1308 2834 147 78 14 chr5 94828136 94828639 -57708620 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 4 1308 4100 138 23 54 chr5 94833833 94834608 -57702651 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 4 1308 9720 111 22 26 chr5 94835637 94837144 -57700115 + MMETn-int LTR ERVK 3344 4844 0 4 1308 2003 138 9 51 chr5 94837144 94837480 -57699779 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 1308 3706 20 2 0 chr5 94843958 94844353 -57692906 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1308 466 230 67 78 chr5 94855159 94855352 -57681907 + MTC-int LTR MaLR 1062 1252 -6 4 1308 1683 229 72 5 chr5 94855357 94855744 -57681515 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1308 696 261 33 95 chr5 94857208 94857390 -57679869 - RMER12B LTR ERVK -2 1402 1234 4 1308 696 261 33 95 chr5 94857451 94857485 -57679774 - RMER12B LTR ERVK -171 1233 1198 4 1308 696 261 33 95 chr5 94857613 94857634 -57679625 - RMER12B LTR ERVK -207 1197 1177 4 1308 1057 214 82 42 chr5 94857621 94857952 -57679307 - RLTR21 LTR ERVK -426 1146 803 4 1308 3547 43 2 0 chr5 94858569 94858964 -57678295 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1308 9970 21 4 2 chr5 94858964 94860060 -57677199 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1308 932 35 9 0 chr5 94860060 94860176 -57677083 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 280 4 1308 1581 26 5 0 chr5 94860165 94860356 -57676903 + MTA_Mm LTR MaLR 205 396 0 4 1308 351 279 29 99 chr5 94878012 94878183 -57659076 + RMER10B LTR ERVL 228 386 -12 4 1308 1538 210 150 54 chr5 94880167 94880574 -57656685 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 4 1308 390 237 10 0 chr5 94885316 94885413 -57651846 + MTC-int LTR MaLR 909 1006 -252 4 1308 407 155 114 0 chr5 94886802 94886894 -57650365 - MTC LTR MaLR 0 421 268 4 1308 1844 171 76 18 chr5 94887025 94887406 -57649853 + RLTR9E LTR ERVK 7 409 0 4 1308 543 182 10 0 chr5 94887406 94887500 -57649759 - MTC LTR MaLR -103 318 224 4 1308 1604 198 15 6 chr5 94887490 94887820 -57649439 - MTC-int LTR MaLR -451 807 475 4 1308 657 195 38 19 chr5 94887822 94887979 -57649280 + MTD LTR MaLR 260 419 0 4 1308 383 308 9 0 chr5 94888080 94888187 -57649072 - MTC LTR MaLR -228 146 39 4 1309 693 271 131 46 chr5 94901222 94901407 -57635852 - MTEb LTR MaLR -21 358 167 5 1309 2576 100 79 0 chr5 94901407 94901788 -57635471 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 5 1309 693 271 131 46 chr5 94901788 94901931 -57635328 - MTEb LTR MaLR -213 166 2 5 1309 3927 50 0 0 chr5 94901939 94902414 -57634845 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 1309 723 348 61 23 chr5 94902950 94903294 -57633965 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 5 1309 655 316 22 106 chr5 94905024 94905392 -57631867 + RMER5 LTR ERV1 13 349 -185 5 1309 571 246 54 11 chr5 94906284 94906469 -57630790 + RMER5 LTR ERV1 331 523 -11 5 1309 962 146 79 0 chr5 94907987 94908151 -57629108 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 5 1309 2467 237 101 71 chr5 94908184 94909116 -57628143 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 5 1309 402 248 217 75 chr5 94916311 94916633 -57620626 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 1309 729 201 103 7 chr5 94916707 94916852 -57620407 - ORR1A2 LTR MaLR -68 259 101 5 1309 2014 234 28 2 chr5 94917415 94917847 -57619412 - RLTR21 LTR ERVK -1124 448 6 5 1309 1216 178 61 10 chr5 94918141 94918437 -57618822 - MYSERV6-int LTR ERVK -1250 7709 7399 5 1309 338 149 15 15 chr5 94918693 94918761 -57618498 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 254 5 1309 446 262 27 14 chr5 94918748 94918895 -57618364 - RLTR12B LTR ERVK -341 187 39 5 1309 1256 250 46 76 chr5 94918915 94919484 -57617775 - MYSERV6-int LTR ERVK -56 8903 8426 5 1309 343 251 67 73 chr5 94921646 94921800 -57615459 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 981 5 1309 348 271 39 39 chr5 94931645 94931772 -57605487 + RMER10B LTR ERVL 216 342 -56 5 1309 801 194 27 64 chr5 94932298 94932518 -57604741 + RMER3D-int LTR ERVK 1998 2209 -633 5 1309 3946 24 32 140 chr5 94945108 94945785 -57591474 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 604 -50 5 1309 6587 20 54 18 chr5 94945786 94946586 -57590673 + RLTR6-int LTR ERV1 1 829 -6949 5 1309 403 301 0 59 chr5 94946580 94946732 -57590527 + MMVL30-int LTR ERV1 391 533 -7023 5 1309 9122 34 61 15 chr5 94947080 94949879 -57587380 + MMVL30-int LTR ERV1 772 3698 0 5 1309 3783 25 34 145 chr5 94949879 94950536 -57586723 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 584 -70 5 1309 2663 136 38 40 chr5 94955021 94955497 -57581762 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 1309 1323 232 76 17 chr5 94956751 94956952 -57580307 + RMER16 LTR ERVK 103 326 -207 5 1309 1323 232 76 17 chr5 94957346 94957551 -57579708 + RMER16 LTR ERVK 327 532 -1 5 1309 3229 93 48 7 chr5 94963111 94963574 -57573685 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 6 1309 307 263 17 26 chr5 94968188 94968305 -57568954 + RMER10B LTR ERVL 227 342 -56 6 1309 794 203 43 145 chr5 94969578 94969929 -57567330 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 8 6 1309 1292 328 49 46 chr5 94972719 94973388 -57563871 + RodERV21-int LTR ERV1 4118 4788 -203 6 1309 661 184 7 7 chr5 94974435 94974572 -57562687 + MTC-int LTR MaLR 909 1045 -213 6 1309 355 164 82 0 chr5 94975288 94975361 -57561898 - MTEb LTR MaLR 0 421 343 6 1309 773 256 46 95 chr5 94975487 94975854 -57561405 + RMER5 LTR ERV1 186 534 0 6 1309 2639 189 12 41 chr5 94976681 94977248 -57560011 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 551 -2 6 1309 1867 212 34 38 chr5 94977249 94978115 -57559144 + RMER3D-int LTR ERVK 1 1382 -1460 6 1309 5069 207 80 55 chr5 94978173 94979646 -57557613 + RMER3D-int LTR ERVK 388 2841 -1 6 1309 568 154 7 117 chr5 94979647 94979801 -57557458 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 137 -416 6 1309 769 251 89 54 chr5 94981312 94981502 -57555757 - MTEb LTR MaLR -21 358 168 6 1309 2869 86 43 0 chr5 94981502 94981896 -57555363 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 6 1309 769 251 89 54 chr5 94981896 94982021 -57555238 - MTEb LTR MaLR -212 167 32 6 1309 3450 41 30 11 chr5 94982049 94982398 -57554861 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 363 -112 6 1309 4336 23 0 0 chr5 94982398 94982880 -57554379 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 6 1309 3450 41 30 11 chr5 94982880 94982996 -57554263 + MT2C_Mm LTR ERVL 364 475 0 6 1309 610 309 82 44 chr5 94983536 94983878 -57553381 + MTEa LTR MaLR 5 359 -20 6 1309 548 246 54 11 chr5 94985307 94985492 -57551767 + RMER5 LTR ERV1 331 523 -11 6 1309 2945 78 10 0 chr5 94986223 94986607 -57550652 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 6 1309 961 128 79 0 chr5 94987341 94987505 -57549754 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 6 1309 2449 227 93 77 chr5 94987538 94988483 -57548776 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 6 1309 2434 141 8 171 chr5 94996331 94996957 -57540302 + RMER2 LTR ERV1 44 567 0 6 1309 624 215 35 61 chr5 94998094 94998292 -57538967 - RMER13A LTR ERVK -570 290 98 6 1309 357 179 0 15 chr5 94998918 94998986 -57538273 - RMER17A-int LTR ERVK -518 1210 1144 6 1309 320 283 30 30 chr5 95006118 95006249 -57531010 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1432 -3631 3 1309 452 326 63 14 chr5 95006960 95007290 -57529969 + MuRRS4-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 4 1309 1241 304 55 11 chr5 95007564 95008003 -57529256 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 4 1309 3393 146 14 16 chr5 95008435 95008998 -57528261 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 5 1309 2806 149 80 12 chr5 95009105 95009606 -57527653 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 6 1309 3866 146 26 32 chr5 95014849 95015590 -57521669 - RMER17A LTR ERVK -15 736 1 2 1309 9787 109 21 27 chr5 95016613 95018125 -57519134 + MMETn-int LTR ERVK 3342 4844 0 2 1309 1955 144 9 51 chr5 95018125 95018461 -57518798 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1310 455 227 65 75 chr5 95035322 95035522 -57501737 + MTC-int LTR MaLR 1055 1252 -6 3 1310 1535 235 92 3 chr5 95035527 95035906 -57501353 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 1310 620 206 74 13 chr5 95037371 95037530 -57499729 - RLTR21 LTR ERVK -136 1436 1281 3 1310 984 232 79 40 chr5 95037682 95038010 -57499249 - RLTR21 LTR ERVK -426 1146 806 3 1310 384 273 29 99 chr5 95056206 95056377 -57480882 + RMER10B LTR ERVL 228 386 -12 6 1310 1272 220 158 57 chr5 95058562 95058967 -57478292 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 6 1310 429 237 10 0 chr5 95062278 95062375 -57474884 + MTC-int LTR MaLR 909 1006 -252 6 1310 411 151 114 0 chr5 95063757 95063849 -57473410 - MTC LTR MaLR 0 421 268 7 1310 1851 183 70 13 chr5 95063978 95064361 -57472898 + RLTR9E LTR ERVK 5 409 0 7 1310 556 141 29 28 chr5 95064361 95064470 -57472789 - MTC LTR MaLR -113 308 209 7 1310 1637 229 24 13 chr5 95064445 95064822 -57472437 - MTC-int LTR MaLR -451 807 427 7 1310 1326 254 58 38 chr5 95064935 95065328 -57471931 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 7 1310 417 275 42 28 chr5 95065441 95065583 -57471676 - MTC LTR MaLR -228 146 3 7 1310 1141 294 34 94 chr5 95076372 95076927 -57460332 + RMER5 LTR ERV1 8 529 -5 8 1310 1155 144 6 0 chr5 95078337 95078518 -57458741 + MTC LTR MaLR 11 192 -229 9 1310 2691 224 90 75 chr5 95078548 95079293 -57457966 + MT-int LTR MaLR 4 801 -297 9 1310 4330 17 0 0 chr5 95079293 95079775 -57457484 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 9 1310 2691 224 90 75 chr5 95079775 95079984 -57457275 + MT-int LTR MaLR 802 972 -126 9 1310 1349 164 55 73 chr5 95085031 95085359 -57451900 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 9 1310 226 234 30 30 chr5 95087988 95088054 -57449205 - RLTR9A LTR ERVK -296 72 7 1 1310 399 277 44 33 chr5 95088595 95088778 -57448481 - RLTR6-int LTR ERV1 -207 7571 7387 1 1310 779 152 7 0 chr5 95088773 95088911 -57448348 - RMER16-int LTR ERVK -1068 4338 4200 1 1310 3655 148 44 39 chr5 95088911 95089656 -57447603 - RMER17D LTR ERVK 0 889 141 1 1310 1454 184 92 0 chr5 95089663 95089956 -57447303 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 1 1310 1278 181 61 20 chr5 95089956 95090299 -57446960 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6125 1 1310 3694 105 29 25 chr5 95090316 95090582 -57446677 - IAPEY3-int LTR ERVK -342 7338 7071 1 1310 3694 105 29 25 chr5 95091078 95091405 -57445854 - IAPEY3-int LTR ERVK -610 7070 6743 1 1310 3053 102 7 4 chr5 95091395 95091848 -57445411 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 1 1310 3157 89 0 16 chr5 95091839 95092286 -57444973 - IAPEY3-int LTR ERVK -1939 5642 5203 1 1310 795 76 17 8 chr5 95092563 95092682 -57444577 - IAPEY3-int LTR ERVK -2932 4649 4530 1 1310 428 188 19 34 chr5 95092698 95092821 -57444438 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 1 1310 1880 144 111 7 chr5 95092830 95093415 -57443844 - ETnERV2-int LTR ERVK -3142 4264 3567 1 1310 577 219 0 0 chr5 95093441 95093560 -57443699 - ETnERV2-int LTR ERVK -4653 2753 2635 1 1310 291 267 0 55 chr5 95093572 95093663 -57443596 - ETnERV2-int LTR ERVK -4867 2539 2454 1 1310 280 310 88 0 chr5 95093676 95093789 -57443470 - RLTR19-int LTR ERVK -5077 1060 938 1 1310 289 241 140 33 chr5 95093775 95093925 -57443334 - RLTR19-int LTR ERVK -5448 689 524 1 1310 1493 181 96 40 chr5 95093934 95094309 -57442950 - RMER16-int LTR ERVK -4760 646 251 1 1310 335 144 0 103 chr5 95094420 95094536 -57442723 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 849 1 1310 5139 71 12 15 chr5 95094517 95095249 -57442010 - IAPLTR4_I LTR ERVK -704 766 37 1 1310 1437 178 88 10 chr5 95095249 95095566 -57441693 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -1 366 1 1 1310 384 75 0 0 chr5 95095566 95095619 -57441640 - RMER17D2 LTR ERVK -659 150 98 1 1310 714 161 0 9 chr5 95099296 95099409 -57437850 - RMER17D2 LTR ERVK -697 112 1 1 1310 698 100 8 62 chr5 95099409 95099537 -57437722 - RMER16-int LTR ERVK -1207 4199 4079 1 1310 3729 136 51 98 chr5 95099537 95100225 -57437034 - RMER16-int LTR ERVK -3017 2389 1677 1 1310 3729 136 51 98 chr5 95100386 95100562 -57436697 - RMER16-int LTR ERVK -3730 1676 1566 1 1310 278 291 15 30 chr5 95100615 95100746 -57436513 - ETnERV2-int LTR ERVK -3812 2355 2227 1 1310 528 242 28 131 chr5 95100855 95101107 -57436152 - ETnERV2-int LTR ERVK -4859 2547 2322 1 1310 482 227 8 15 chr5 95101511 95101641 -57435618 - ETnERV2-int LTR ERVK -3822 1584 1456 1 1310 240 162 0 0 chr5 95103337 95103374 -57433885 - RMER10A LTR ERVL -394 48 12 1 1310 1503 223 33 83 chr5 95105448 95105677 -57431582 + RMER16 LTR ERVK 1 320 -213 1 1310 1503 225 62 33 chr5 95106073 95106287 -57430972 + RMER16 LTR ERVK 321 533 0 1 1310 289 298 8 42 chr5 95115644 95115763 -57421496 + RMER10B LTR ERVL 227 341 -57 1 1310 269 291 21 147 chr5 95119838 95120076 -57417183 + RMER17C-int LTR ERVK 379 586 -2652 1 1310 651 301 45 117 chr5 95119953 95120679 -57416580 + RodERV21-int LTR ERV1 745 1418 -3573 1 1310 2508 296 8 20 chr5 95121985 95122734 -57414525 + RodERV21-int LTR ERV1 1410 2149 -2842 1 1310 1761 218 95 40 chr5 95128583 95129004 -57408255 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 3 1 1310 1173 295 41 84 chr5 95132402 95132916 -57404343 + RodERV21-int LTR ERV1 2227 2718 -2273 1 1310 513 340 30 45 chr5 95133084 95133525 -57403734 + RodERV21-int LTR ERV1 3638 4071 -3020 1 1310 306 186 16 53 chr5 95135000 95135107 -57402152 + RodERV21-int LTR ERV1 4830 4949 -2657 1 1310 1086 355 43 59 chr5 95135593 95136457 -57400802 + RodERV21-int LTR ERV1 2869 3718 -1273 1 1310 225 167 0 0 chr5 95138159 95138195 -57399064 - RMER10A LTR ERVL -395 47 12 1 1310 268 194 209 0 chr5 95142049 95142116 -57395143 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 81 -573 1 1310 1766 125 269 51 chr5 95142156 95142610 -57394649 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 589 -65 1 1310 66137 28 17 7 chr5 95142610 95150321 -57386938 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7778 0 1 1310 243 182 227 0 chr5 95150321 95150387 -57386872 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 81 -573 1 1310 1727 124 272 51 chr5 95150427 95150876 -57386383 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 1 1310 2174 112 221 45 chr5 95152184 95152668 -57384591 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 605 -49 1 163 68135 19 12 2 chr5 95152668 95160368 -57376891 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7778 0 1 1311 2092 111 232 45 chr5 95160477 95160939 -57376320 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 1 1311 1690 224 98 41 chr5 95171041 95171460 -57365799 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 4 1 1311 440 172 43 11 chr5 95175038 95175132 -57362127 + MTC-int LTR MaLR 910 1006 -252 1 1311 249 182 0 0 chr5 95175767 95175811 -57361448 - MTEb LTR MaLR 0 419 376 1 1311 450 232 69 42 chr5 95176143 95176287 -57360972 + MTD LTR MaLR 272 419 0 1 1311 3918 145 67 13 chr5 95176781 95177320 -57359939 - RMER17D LTR ERVK 0 889 321 1 1311 3918 145 67 13 chr5 95177420 95177661 -57359598 - RMER17D LTR ERVK -569 320 68 1 1311 783 265 139 31 chr5 95178984 95179307 -57357952 - MTEb LTR MaLR -21 358 1 1 1311 572 382 40 23 chr5 95179849 95180200 -57357059 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 1 1311 391 304 78 34 chr5 95180904 95181108 -57356151 + RMER5 LTR ERV1 13 225 -309 1 1311 456 258 47 78 chr5 95181269 95181462 -57355797 + RMER5 LTR ERV1 331 517 -17 1 1311 1003 194 15 2 chr5 95182750 95182969 -57354290 + MTC LTR MaLR 6 222 -197 2 1311 2314 247 100 53 chr5 95182970 95183807 -57353452 + MT-int LTR MaLR 4 880 -218 2 1311 298 186 135 19 chr5 95185256 95185360 -57351899 + MT-int LTR MaLR 996 1111 -147 2 1311 233 266 29 86 chr5 95199679 95199749 -57337510 - RLTR19A LTR ERVK -360 136 71 2 1311 352 277 30 103 chr5 95211264 95211429 -57325830 + RMER10B LTR ERVL 234 386 -12 2 1311 1628 204 104 52 chr5 95213417 95213841 -57323418 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 1311 400 240 10 0 chr5 95219308 95219404 -57317855 + MTC-int LTR MaLR 910 1006 -252 2 1311 347 147 118 13 chr5 95220776 95220852 -57316407 - MTC LTR MaLR 0 421 338 2 1311 1239 155 94 20 chr5 95221010 95221254 -57316005 + RLTR9E LTR ERVK 6 267 -142 2 1311 571 231 23 8 chr5 95222421 95222552 -57314707 + RLTR9E LTR ERVK 277 409 0 2 1311 550 172 10 0 chr5 95222552 95222646 -57314613 - MTC LTR MaLR -103 318 224 2 1311 1647 226 35 5 chr5 95222636 95223006 -57314253 - MTC-int LTR MaLR -451 807 427 2 1311 1247 266 60 27 chr5 95223119 95223521 -57313738 + MTD LTR MaLR 5 419 0 2 1311 394 286 28 28 chr5 95223621 95223765 -57313494 - MTC LTR MaLR -228 146 3 2 1311 3484 8 0 3 chr5 95226883 95227251 -57310008 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1311 56730 22 15 1 chr5 95227251 95233632 -57303627 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 1311 3256 8 42 3 chr5 95233632 95233985 -57303274 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1311 677 246 101 85 chr5 95239418 95239603 -57297656 - MTEb LTR MaLR -21 358 167 2 1311 2782 94 79 0 chr5 95239603 95239984 -57297275 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 1311 677 255 130 50 chr5 95239984 95240127 -57297132 - MTEb LTR MaLR -213 166 2 2 1311 4181 53 0 0 chr5 95240135 95240610 -57296649 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1311 670 342 60 37 chr5 95241147 95241496 -57295763 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 2 1311 635 321 32 92 chr5 95243224 95243594 -57293665 + RMER5 LTR ERV1 13 360 -174 2 1311 559 240 54 11 chr5 95244485 95244670 -57292589 + RMER5 LTR ERV1 331 523 -11 2 1311 971 146 79 0 chr5 95246241 95246405 -57290854 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 2 1311 2470 234 102 71 chr5 95246438 95247369 -57289890 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 2 1311 522 233 224 81 chr5 95254572 95254894 -57282365 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 1311 732 181 113 0 chr5 95254968 95255101 -57282158 - ORR1A2 LTR MaLR -68 259 112 2 1311 1970 237 28 2 chr5 95255676 95256108 -57281151 - RLTR21 LTR ERVK -1124 448 6 2 1311 1350 178 61 10 chr5 95256402 95256698 -57280561 - MYSERV6-int LTR ERVK -1250 7709 7399 2 1311 333 149 15 15 chr5 95256955 95257023 -57280236 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 254 2 1311 432 259 28 14 chr5 95257010 95257155 -57280104 - RLTR12B LTR ERVK -341 187 41 2 1311 1528 244 46 64 chr5 95257177 95257739 -57279520 - MYSERV6-int LTR ERVK -56 8903 8426 2 1311 361 242 68 70 chr5 95259873 95260027 -57277232 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 981 2 1311 333 262 39 39 chr5 95269879 95270006 -57267253 + RMER10B LTR ERVL 216 342 -56 2 1311 807 197 42 65 chr5 95270532 95270749 -57266510 + RMER3D-int LTR ERVK 1998 2209 -633 2 1311 4628 22 0 0 chr5 95276146 95276639 -57260620 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1311 48650 12 0 0 chr5 95276639 95281998 -57255261 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 3 1311 387 167 46 35 chr5 95281998 95282085 -57255174 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 1311 311 26 0 0 chr5 95282085 95282123 -57255136 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 1311 4628 22 0 0 chr5 95282123 95282616 -57254643 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1312 272 256 138 56 chr5 95290612 95290699 -57246560 - RMER17A2 LTR ERVK -490 416 321 3 1312 272 256 138 56 chr5 95290873 95291015 -57246244 - RMER17A2 LTR ERVK -586 320 166 3 1312 2870 131 38 40 chr5 95294233 95294709 -57242550 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 1312 1455 232 76 17 chr5 95295963 95296164 -57241095 + RMER16 LTR ERVK 103 326 -207 3 1312 1455 232 76 17 chr5 95296560 95296765 -57240494 + RMER16 LTR ERVK 327 532 -1 3 1312 3445 87 47 15 chr5 95302118 95302585 -57234674 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 3 1312 332 274 24 24 chr5 95307208 95307335 -57229924 + RMER10B LTR ERVL 216 342 -56 3 1312 845 199 51 151 chr5 95308606 95308956 -57228303 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 8 3 1312 225 218 93 65 chr5 95311499 95311607 -57225652 + MURVY-LTR LTR ERV1 351 461 -58 3 1312 1371 329 46 45 chr5 95311728 95312396 -57224863 + RodERV21-int LTR ERV1 4120 4788 -203 3 1312 716 176 7 7 chr5 95313465 95313602 -57223657 + MTC-int LTR MaLR 909 1045 -213 3 1312 378 164 82 0 chr5 95314316 95314389 -57222870 - MTC LTR MaLR 0 421 343 3 1312 868 256 46 95 chr5 95314508 95314875 -57222384 + RMER5 LTR ERV1 186 534 0 3 1312 2808 191 12 41 chr5 95315714 95316281 -57220978 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 551 -2 3 1312 1825 215 34 38 chr5 95316282 95317148 -57220111 + RMER3D-int LTR ERVK 1 1382 -1460 3 1312 5159 208 83 51 chr5 95317206 95318679 -57218580 + RMER3D-int LTR ERVK 388 2841 -1 3 1312 615 154 7 117 chr5 95318680 95318834 -57218425 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 137 -416 3 1312 883 239 116 54 chr5 95320345 95320535 -57216724 - MTEb LTR MaLR -21 358 163 3 1312 3009 86 43 0 chr5 95320535 95320929 -57216330 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 3 1312 883 239 116 54 chr5 95320929 95321074 -57216185 - MTEb LTR MaLR -217 162 2 3 1312 3643 41 30 11 chr5 95321082 95321431 -57215828 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 363 -112 3 1312 4568 15 0 4 chr5 95321431 95321915 -57215344 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 3 1312 3643 41 30 11 chr5 95321915 95322031 -57215228 + MT2C_Mm LTR ERVL 364 475 0 3 1312 711 309 82 44 chr5 95322571 95322913 -57214346 + MTEa LTR MaLR 5 359 -20 3 1312 597 246 54 11 chr5 95324342 95324527 -57212732 + RMER5 LTR ERV1 331 523 -11 4 1312 3100 75 10 0 chr5 95325258 95325642 -57211617 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 4 1312 1026 128 79 0 chr5 95326375 95326539 -57210720 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 4 1312 2744 226 93 77 chr5 95326572 95327517 -57209742 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 4 1312 2657 137 8 171 chr5 95335332 95335958 -57201301 + RMER2 LTR ERV1 44 567 0 4 1312 693 215 35 61 chr5 95337096 95337294 -57199965 - RMER13A LTR ERVK -570 290 98 4 1312 356 179 0 15 chr5 95337921 95337989 -57199270 - RMER17A-int LTR ERVK -518 1210 1144 4 1312 320 283 30 30 chr5 95345121 95345252 -57192007 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1432 -3631 4 1312 475 323 63 14 chr5 95345962 95346292 -57190967 + MuRRS4-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 4 1312 1241 304 55 11 chr5 95346566 95347005 -57190254 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 4 1312 3380 148 14 16 chr5 95347437 95348000 -57189259 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 4 1312 2807 149 80 12 chr5 95348107 95348608 -57188651 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 4 1312 3851 151 25 32 chr5 95353838 95354590 -57182669 - RMER17A LTR ERVK -4 747 1 4 1312 9741 111 21 28 chr5 95355613 95357126 -57180133 + MMETn-int LTR ERVK 3342 4844 0 4 1312 1950 144 9 51 chr5 95357126 95357462 -57179797 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 1312 455 227 65 75 chr5 95374321 95374521 -57162738 + MTC-int LTR MaLR 1055 1252 -6 4 1312 1535 235 92 3 chr5 95374526 95374905 -57162354 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1312 620 206 74 13 chr5 95376369 95376528 -57160731 - RLTR21 LTR ERVK -136 1436 1281 4 1312 976 235 79 40 chr5 95376686 95377014 -57160245 - RLTR21 LTR ERVK -426 1146 806 4 1312 394 266 29 99 chr5 95395220 95395391 -57141868 + RMER10B LTR ERVL 228 386 -12 4 1312 1259 222 158 57 chr5 95397584 95397989 -57139270 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 4 1312 429 237 10 0 chr5 95402605 95402702 -57134557 + MTC-int LTR MaLR 909 1006 -252 5 1312 411 151 114 0 chr5 95404084 95404176 -57133083 - MTC LTR MaLR 0 421 268 5 1312 1851 183 70 13 chr5 95404306 95404689 -57132570 + RLTR9E LTR ERVK 5 409 0 5 1312 565 147 29 29 chr5 95404693 95404798 -57132461 - MTC LTR MaLR -107 314 210 5 1312 1637 229 24 13 chr5 95404773 95405150 -57132109 - MTC-int LTR MaLR -451 807 427 5 1312 1331 254 59 36 chr5 95405263 95405655 -57131604 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 5 1312 399 283 42 28 chr5 95405768 95405910 -57131349 - MTC LTR MaLR -228 146 3 5 1312 1131 294 34 97 chr5 95416681 95417238 -57120021 + RMER5 LTR ERV1 8 529 -5 5 1312 1155 144 6 0 chr5 95418634 95418815 -57118444 + MTC LTR MaLR 11 192 -229 5 1312 2710 223 90 75 chr5 95418845 95419590 -57117669 + MT-int LTR MaLR 4 801 -297 5 1312 4343 14 0 0 chr5 95419590 95420072 -57117187 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 5 1312 2710 223 90 75 chr5 95420072 95420281 -57116978 + MT-int LTR MaLR 802 972 -126 5 1313 1349 164 55 73 chr5 95425342 95425670 -57111589 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1313 226 234 30 30 chr5 95428299 95428365 -57108894 - RLTR9A LTR ERVK -296 72 7 5 1313 399 277 44 33 chr5 95428907 95429090 -57108169 - RLTR6-int LTR ERV1 -207 7571 7387 5 1313 779 152 7 0 chr5 95429085 95429223 -57108036 - RMER16-int LTR ERVK -1068 4338 4200 5 1313 3655 148 44 39 chr5 95429223 95429968 -57107291 - RMER17D LTR ERVK 0 889 141 5 1313 1454 184 92 0 chr5 95429975 95430268 -57106991 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 5 1313 1278 181 61 20 chr5 95430268 95430611 -57106648 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6125 5 1313 3681 87 7 27 chr5 95430665 95430894 -57106365 - IAPEY3-int LTR ERVK -392 7288 7071 5 1313 3681 87 7 27 chr5 95431390 95431717 -57105542 - IAPEY3-int LTR ERVK -610 7070 6743 5 1313 3053 102 7 4 chr5 95431707 95432160 -57105099 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 5 1313 3140 91 0 16 chr5 95432151 95432598 -57104661 - IAPEY3-int LTR ERVK -1939 5642 5203 5 1313 795 76 17 8 chr5 95432875 95432994 -57104265 - IAPEY3-int LTR ERVK -2932 4649 4530 5 1313 428 188 19 34 chr5 95433010 95433133 -57104126 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 5 1313 1880 144 111 7 chr5 95433142 95433727 -57103532 - ETnERV2-int LTR ERVK -3142 4264 3567 5 1313 577 219 0 0 chr5 95433753 95433872 -57103387 - ETnERV2-int LTR ERVK -4653 2753 2635 5 1313 291 267 0 55 chr5 95433884 95433975 -57103284 - ETnERV2-int LTR ERVK -4867 2539 2454 5 1313 280 310 88 0 chr5 95433988 95434101 -57103158 - RLTR19-int LTR ERVK -5077 1060 938 5 1313 289 241 140 33 chr5 95434087 95434237 -57103022 - RLTR19-int LTR ERVK -5448 689 524 5 1313 1480 178 96 43 chr5 95434246 95434622 -57102637 - RMER16-int LTR ERVK -4760 646 251 5 1313 335 144 0 103 chr5 95434733 95434849 -57102410 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 849 5 1313 5150 69 12 15 chr5 95434830 95435562 -57101697 - IAPLTR4_I LTR ERVK -704 766 37 5 1313 1437 178 88 10 chr5 95435562 95435879 -57101380 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -1 366 1 5 1313 384 75 0 0 chr5 95435879 95435932 -57101327 - RMER17D2 LTR ERVK -659 150 98 5 1313 748 143 0 9 chr5 95439607 95439720 -57097539 - RMER17D2 LTR ERVK -697 112 1 5 1313 698 100 8 62 chr5 95439720 95439848 -57097411 - RMER16-int LTR ERVK -1207 4199 4079 5 1313 3964 135 53 60 chr5 95439848 95440536 -57096723 - RMER16-int LTR ERVK -3017 2389 1677 5 1313 3964 135 53 60 chr5 95440697 95440711 -57096548 - RMER16-int LTR ERVK -3730 1676 1676 5 1313 3964 135 53 60 chr5 95440745 95440871 -57096388 - RMER16-int LTR ERVK -3730 1676 1566 5 1313 255 299 15 30 chr5 95440924 95441055 -57096204 - ETnERV2-int LTR ERVK -3812 2355 2227 5 1313 528 251 25 131 chr5 95441164 95441449 -57095810 - ETnERV2-int LTR ERVK -4859 2547 2322 5 1313 482 227 8 15 chr5 95441820 95441950 -57095309 - ETnERV2-int LTR ERVK -3822 1584 1456 5 1313 240 162 0 0 chr5 95443644 95443681 -57093578 - RMER10A LTR ERVL -394 48 12 5 1313 1353 207 42 70 chr5 95445682 95445911 -57091348 + RMER16 LTR ERVK 1 320 -213 5 1313 1353 225 62 33 chr5 95446307 95446521 -57090738 + RMER16 LTR ERVK 321 533 0 5 1313 289 298 8 42 chr5 95455908 95456027 -57081232 + RMER10B LTR ERVL 227 341 -57 5 1313 269 291 21 147 chr5 95460104 95460342 -57076917 + RMER17C-int LTR ERVK 379 586 -2652 5 1313 651 301 45 117 chr5 95460219 95460945 -57076314 + RodERV21-int LTR ERV1 745 1418 -3573 5 1313 2508 296 8 20 chr5 95462242 95462991 -57074268 + RodERV21-int LTR ERV1 1410 2149 -2842 5 1313 1721 223 95 40 chr5 95468840 95469261 -57067998 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 3 5 1313 1151 297 41 84 chr5 95472660 95473174 -57064085 + RodERV21-int LTR ERV1 2227 2718 -2273 5 1313 513 340 30 45 chr5 95473342 95473783 -57063476 + RodERV21-int LTR ERV1 3638 4071 -3020 5 1313 306 186 16 53 chr5 95475258 95475365 -57061894 + RodERV21-int LTR ERV1 4830 4949 -2657 5 1313 1086 355 43 59 chr5 95475851 95476715 -57060544 + RodERV21-int LTR ERV1 2869 3718 -1273 5 1313 225 167 0 0 chr5 95478423 95478459 -57058800 - RMER10A LTR ERVL -395 47 12 6 1313 268 194 209 0 chr5 95482312 95482379 -57054880 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 81 -573 6 1313 1785 121 269 51 chr5 95482419 95482873 -57054386 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 589 -65 6 1313 66630 25 17 7 chr5 95482873 95490587 -57046672 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7778 0 6 1313 2094 113 232 43 chr5 95490696 95491157 -57046102 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 6 1313 1690 224 98 41 chr5 95501259 95501678 -57035581 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 4 2 1313 440 172 43 11 chr5 95505256 95505350 -57031909 + MTC-int LTR MaLR 910 1006 -252 5 1313 249 182 0 0 chr5 95505985 95506029 -57031230 - MTEb LTR MaLR 0 419 376 6 1313 450 232 69 42 chr5 95506361 95506505 -57030754 + MTD LTR MaLR 272 419 0 8 1313 3971 126 36 53 chr5 95506999 95507836 -57029423 - RMER17D LTR ERVK 0 889 67 9 1313 783 265 139 31 chr5 95509160 95509483 -57027776 - MTEb LTR MaLR -21 358 1 6 1313 572 382 40 23 chr5 95510025 95510376 -57026883 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 1 1313 391 304 78 34 chr5 95511080 95511284 -57025975 + RMER5 LTR ERV1 13 225 -309 1 1313 457 264 47 68 chr5 95511445 95511636 -57025623 + RMER5 LTR ERV1 331 517 -17 1 1313 1003 182 16 0 chr5 95512922 95513114 -57024145 + MTC LTR MaLR 6 200 -221 2 1313 2314 247 100 53 chr5 95513144 95513981 -57023278 + MT-int LTR MaLR 4 880 -218 2 1313 298 186 135 19 chr5 95515430 95515534 -57021725 + MT-int LTR MaLR 996 1111 -147 2 1313 233 266 29 86 chr5 95529853 95529923 -57007336 - RLTR19A LTR ERVK -360 136 71 3 1313 352 277 30 103 chr5 95541435 95541600 -56995659 + RMER10B LTR ERVL 234 386 -12 4 1313 1602 206 104 52 chr5 95543587 95544011 -56993248 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 1313 400 240 10 0 chr5 95549473 95549569 -56987690 + MTC-int LTR MaLR 910 1006 -252 5 1313 359 133 118 13 chr5 95550937 95551013 -56986246 - MTC LTR MaLR 0 421 338 6 1313 1239 155 94 20 chr5 95551170 95551414 -56985845 + RLTR9E LTR ERVK 6 267 -142 6 1314 574 231 23 8 chr5 95552575 95552706 -56984553 + RLTR9E LTR ERVK 277 409 0 6 1314 547 172 10 0 chr5 95552706 95552800 -56984459 - MTC LTR MaLR -103 318 224 6 1314 1647 228 35 5 chr5 95552790 95553160 -56984099 - MTC-int LTR MaLR -451 807 427 6 1314 1318 266 60 27 chr5 95553273 95553675 -56983584 + MTD LTR MaLR 5 419 0 6 1314 416 286 28 28 chr5 95553775 95553919 -56983340 - MTC LTR MaLR -228 146 3 6 1314 677 246 101 85 chr5 95562455 95562640 -56974619 - MTEb LTR MaLR -21 358 167 7 1314 2801 92 79 0 chr5 95562640 95563021 -56974238 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 7 1314 677 255 130 50 chr5 95563021 95563164 -56974095 - MTEb LTR MaLR -213 166 2 7 1314 4165 55 0 0 chr5 95563172 95563647 -56973612 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 7 1314 684 339 60 37 chr5 95564184 95564533 -56972726 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 7 1314 635 321 32 92 chr5 95566262 95566632 -56970627 + RMER5 LTR ERV1 13 360 -174 7 1314 558 236 41 46 chr5 95567523 95567718 -56969541 + RMER5 LTR ERV1 331 524 -10 7 1314 971 146 79 0 chr5 95569269 95569433 -56967826 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 8 1314 2470 234 102 71 chr5 95569466 95570397 -56966862 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 8 1314 522 233 224 81 chr5 95577597 95577919 -56959340 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 9 1314 732 181 113 0 chr5 95577993 95578126 -56959133 - ORR1A2 LTR MaLR -68 259 112 9 1314 1970 237 28 2 chr5 95578700 95579132 -56958127 - RLTR21 LTR ERVK -1124 448 6 9 1314 1364 174 61 10 chr5 95579426 95579722 -56957537 - MYSERV6-int LTR ERVK -1250 7709 7399 9 1314 333 149 15 15 chr5 95579979 95580047 -56957212 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 254 1 1314 432 259 28 14 chr5 95580034 95580179 -56957080 - RLTR12B LTR ERVK -341 187 41 1 1314 1528 244 46 64 chr5 95580201 95580763 -56956496 - MYSERV6-int LTR ERVK -56 8903 8426 9 1314 361 242 68 70 chr5 95582902 95583056 -56954203 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 981 1 1314 333 262 39 39 chr5 95592884 95593011 -56944248 + RMER10B LTR ERVL 216 342 -56 1 1314 794 202 42 65 chr5 95593537 95593754 -56943505 + RMER3D-int LTR ERVK 1998 2209 -633 1 1314 4648 20 0 0 chr5 95599208 95599701 -56937558 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1314 48877 15 0 0 chr5 95599701 95605060 -56932199 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 1 1314 387 167 46 35 chr5 95605060 95605147 -56932112 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 1 1314 311 26 0 0 chr5 95605147 95605185 -56932074 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1314 1459 28 0 0 chr5 95605185 95605361 -56931898 + MT2_Mm LTR ERVL 1 176 -317 1 1314 2870 131 38 40 chr5 95611335 95611811 -56925448 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1314 1455 232 76 17 chr5 95613065 95613266 -56923993 + RMER16 LTR ERVK 103 326 -207 1 1314 1455 232 76 17 chr5 95613662 95613867 -56923392 + RMER16 LTR ERVK 327 532 -1 1 1314 3498 87 48 4 chr5 95619221 95619683 -56917576 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1314 332 274 24 24 chr5 95624293 95624420 -56912839 + RMER10B LTR ERVL 216 342 -56 1 1314 895 195 48 151 chr5 95625691 95626042 -56911217 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 8 1 1314 225 218 93 65 chr5 95628670 95628778 -56908481 + MURVY-LTR LTR ERV1 351 461 -58 1 1314 1343 331 46 45 chr5 95628899 95629567 -56907692 + RodERV21-int LTR ERV1 4120 4788 -203 1 1314 716 176 7 7 chr5 95630649 95630786 -56906473 + MTC-int LTR MaLR 909 1045 -213 1 1314 378 164 82 0 chr5 95631500 95631573 -56905686 - MTC LTR MaLR 0 421 343 1 1314 857 259 46 95 chr5 95631691 95632058 -56905201 + RMER5 LTR ERV1 186 534 0 1 1314 2808 191 12 41 chr5 95632903 95633470 -56903789 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 551 -2 1 1314 1868 213 34 39 chr5 95633471 95634342 -56902917 + RMER3D-int LTR ERVK 1 1386 -1456 1 1314 5151 209 83 52 chr5 95634395 95635870 -56901389 + RMER3D-int LTR ERVK 388 2841 -1 1 1314 615 154 7 117 chr5 95635871 95636025 -56901234 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 137 -416 1 1314 849 241 126 54 chr5 95637537 95637724 -56899535 - MTEb LTR MaLR -21 358 168 1 1314 3004 84 43 0 chr5 95637724 95638118 -56899141 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 1 1314 849 241 126 54 chr5 95638118 95638263 -56898996 - MTEb LTR MaLR -212 167 2 1 1314 3621 46 30 11 chr5 95638271 95638620 -56898639 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 363 -112 2 1314 4541 23 0 0 chr5 95638620 95639102 -56898157 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 2 1314 3621 46 30 11 chr5 95639102 95639218 -56898041 + MT2C_Mm LTR ERVL 364 475 0 2 1314 711 309 82 44 chr5 95639751 95640093 -56897166 + MTEa LTR MaLR 5 359 -20 2 1314 597 246 54 11 chr5 95641522 95641707 -56895552 + RMER5 LTR ERV1 331 523 -11 2 1314 3075 68 8 35 chr5 95642439 95642838 -56894421 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 2 1314 1001 140 79 0 chr5 95643572 95643736 -56893523 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 2 1314 2685 225 93 76 chr5 95643769 95644713 -56892546 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 2 1314 2660 139 8 171 chr5 95652481 95653107 -56884152 + RMER2 LTR ERV1 44 567 0 2 1314 671 221 35 61 chr5 95654322 95654520 -56882739 - RMER13A LTR ERVK -570 290 98 2 1314 356 179 0 15 chr5 95655143 95655211 -56882048 - RMER17A-int LTR ERVK -518 1210 1144 2 1314 333 276 30 30 chr5 95662127 95662258 -56875001 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1432 -3631 2 1314 455 325 63 14 chr5 95662968 95663298 -56873961 + MURVY-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 2 1314 1241 286 58 14 chr5 95663575 95664011 -56873248 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 2 1314 3086 142 65 19 chr5 95664442 95664979 -56872280 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 2 1314 2779 146 82 14 chr5 95665086 95665587 -56871672 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 2 1314 3872 144 26 35 chr5 95670827 95671570 -56865689 - RMER17A LTR ERVK -15 736 1 2 1314 9642 115 20 26 chr5 95672594 95674106 -56863153 + MMETn-int LTR ERVK 3342 4844 0 2 1314 2008 138 9 51 chr5 95674106 95674442 -56862817 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1315 442 227 65 75 chr5 95691688 95691888 -56845371 + MTC-int LTR MaLR 1055 1252 -6 2 1315 1588 228 92 5 chr5 95691893 95692273 -56844986 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1315 1269 231 120 76 chr5 95693737 95693919 -56843340 - RLTR21 LTR ERVK -136 1436 1225 2 1315 1269 228 150 75 chr5 95693959 95694422 -56842837 - RLTR21 LTR ERVK -266 1306 806 2 1315 367 279 29 99 chr5 95712648 95712819 -56824440 + RMER10B LTR ERVL 228 386 -12 2 1315 1388 236 150 52 chr5 95714803 95715209 -56822050 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 3 1315 408 247 10 0 chr5 95719825 95719922 -56817337 + MTC-int LTR MaLR 909 1006 -252 3 1315 407 151 114 0 chr5 95721308 95721400 -56815859 - MTC LTR MaLR 0 421 268 3 1315 2039 177 70 13 chr5 95721530 95721913 -56815346 + RLTR9E LTR ERVK 5 409 0 3 1315 566 147 29 29 chr5 95721917 95722022 -56815237 - MTC LTR MaLR -107 314 210 3 1315 1630 229 24 13 chr5 95721997 95722374 -56814885 - MTC-int LTR MaLR -451 807 427 3 1315 1352 261 60 27 chr5 95722487 95722889 -56814370 + MTD LTR MaLR 5 419 0 3 1315 417 275 42 28 chr5 95722989 95723131 -56814128 - MTC LTR MaLR -228 146 3 3 1315 1205 286 36 93 chr5 95733925 95734484 -56802775 + RMER5 LTR ERV1 3 529 -5 3 1315 1165 144 6 0 chr5 95735897 95736078 -56801181 + MTC LTR MaLR 11 192 -229 3 1315 2693 225 90 75 chr5 95736108 95736853 -56800406 + MT-int LTR MaLR 4 801 -297 3 1315 4386 8 0 0 chr5 95736853 95737335 -56799924 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 3 1315 2693 225 90 75 chr5 95737335 95737544 -56799715 + MT-int LTR MaLR 802 972 -126 3 1315 1319 171 55 73 chr5 95742607 95742935 -56794324 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1315 235 234 30 30 chr5 95745562 95745628 -56791631 - RLTR9A LTR ERVK -296 72 7 3 1315 394 286 16 6 chr5 95746171 95746354 -56790905 - RLTR6-int LTR ERV1 -207 7571 7387 3 1315 779 152 7 0 chr5 95746349 95746487 -56790772 - RMER16-int LTR ERVK -1068 4338 4200 3 1315 3642 148 44 39 chr5 95746487 95747232 -56790027 - RMER17D LTR ERVK 0 889 141 3 1315 1493 174 92 0 chr5 95747239 95747532 -56789727 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 3 1315 1248 182 61 20 chr5 95747533 95747875 -56789384 - IAPEz-int LTR ERVK -1 6480 6125 3 1315 3658 109 29 25 chr5 95747892 95748158 -56789101 - IAPEY3-int LTR ERVK -342 7338 7071 3 1315 3658 109 29 25 chr5 95748654 95748981 -56788278 - IAPEY3-int LTR ERVK -610 7070 6743 3 1315 3041 102 4 9 chr5 95748971 95749427 -56787832 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 3 1315 3126 93 0 16 chr5 95749418 95749865 -56787394 - IAPEY3-int LTR ERVK -1939 5642 5203 3 1315 795 76 17 8 chr5 95750142 95750261 -56786998 - IAPEY3-int LTR ERVK -2932 4649 4530 3 1315 428 188 19 34 chr5 95750277 95750400 -56786859 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 3 1315 1912 137 111 5 chr5 95750409 95750993 -56786266 - ETnERV2-int LTR ERVK -3142 4264 3567 3 1315 577 219 0 0 chr5 95751019 95751138 -56786121 - ETnERV2-int LTR ERVK -4653 2753 2635 3 1315 291 267 0 55 chr5 95751150 95751241 -56786018 - ETnERV2-int LTR ERVK -4867 2539 2454 3 1315 280 310 88 0 chr5 95751254 95751367 -56785892 - RMER16-int LTR ERVK -5077 1060 938 3 1315 1464 195 93 68 chr5 95751372 95751886 -56785373 - RMER16-int LTR ERVK -4760 646 251 3 1315 335 144 0 103 chr5 95751997 95752113 -56785146 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 849 3 1315 5276 68 16 15 chr5 95752094 95752849 -56784410 - IAPLTR4_I LTR ERVK -704 766 11 3 1315 1440 178 92 0 chr5 95752849 95753142 -56784117 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 3 1315 411 57 0 0 chr5 95753142 95753195 -56784064 - RMER17D2 LTR ERVK -659 150 98 3 1315 714 161 0 9 chr5 95756870 95756983 -56780276 - RMER17D2 LTR ERVK -697 112 1 3 1315 676 108 8 62 chr5 95756983 95757111 -56780148 - RMER16-int LTR ERVK -1207 4199 4079 3 1315 3910 131 50 92 chr5 95757111 95757798 -56779461 - RMER16-int LTR ERVK -3017 2389 1677 3 1315 3910 141 47 85 chr5 95757959 95758144 -56779115 - RMER16-int LTR ERVK -3730 1676 1566 3 1315 278 291 15 30 chr5 95758184 95758315 -56778944 - RMER16-int LTR ERVK -3812 2355 2227 3 1315 552 242 28 131 chr5 95758424 95758676 -56778583 - ETnERV2-int LTR ERVK -4859 2547 2322 3 1315 298 294 6 150 chr5 95758695 95758855 -56778404 - ETnERV2-int LTR ERVK -5075 2331 2195 3 1315 252 208 0 0 chr5 95758827 95758875 -56778384 - ETnERV2-int LTR ERVK -1730 1584 1537 3 1315 482 227 8 15 chr5 95759060 95759190 -56778069 - ETnERV2-int LTR ERVK -3822 1584 1456 3 1315 240 162 0 0 chr5 95760883 95760920 -56776339 - RMER10A LTR ERVL -394 48 12 3 1315 1504 189 51 69 chr5 95762995 95763220 -56774039 + RMER16 LTR ERVK 1 320 -213 3 1315 1504 210 75 36 chr5 95763616 95763830 -56773429 + RMER16 LTR ERVK 321 533 0 3 1315 335 298 8 42 chr5 95773202 95773321 -56763938 + RMER10B LTR ERVL 227 341 -57 3 1315 433 311 39 49 chr5 95777517 95777801 -56759458 + RodERV21-int LTR ERV1 745 1025 -3966 3 1315 276 267 40 0 chr5 95778074 95778149 -56759110 + RodERV21-int LTR ERV1 1252 1329 -3662 3 1315 627 256 18 35 chr5 95778194 95778364 -56758895 + RodERV21-int LTR ERV1 1252 1418 -3573 3 1315 2495 297 8 20 chr5 95779683 95780432 -56756827 + RodERV21-int LTR ERV1 1410 2149 -2842 3 1315 1750 223 95 40 chr5 95786296 95786717 -56750542 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 3 3 1315 1198 291 41 84 chr5 95790117 95790631 -56746628 + RodERV21-int LTR ERV1 2227 2718 -2273 3 1315 530 337 30 45 chr5 95790799 95791240 -56746019 + RodERV21-int LTR ERV1 3638 4071 -3020 3 1315 306 186 16 53 chr5 95792738 95792845 -56744414 + RodERV21-int LTR ERV1 4830 4949 -2657 3 1315 1097 355 43 59 chr5 95793331 95794195 -56743064 + RodERV21-int LTR ERV1 2869 3718 -1273 3 1315 233 162 0 0 chr5 95795901 95795938 -56741321 - RMER10A LTR ERVL -394 48 12 4 1315 241 194 206 15 chr5 95799795 95799863 -56737396 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 81 -573 4 1315 1678 138 259 33 chr5 95799903 95800354 -56736905 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 589 -65 4 1315 66690 26 17 6 chr5 95800354 95808055 -56729204 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7778 0 4 1315 2096 109 236 48 chr5 95808164 95808625 -56728634 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 4 1316 1677 221 98 41 chr5 95818734 95819153 -56718106 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 4 4 1316 405 172 43 11 chr5 95822734 95822828 -56714431 + MTC-int LTR MaLR 910 1006 -252 4 1316 230 182 0 0 chr5 95823463 95823507 -56713752 - MTEb LTR MaLR 0 419 376 4 1316 403 255 49 21 chr5 95823842 95823986 -56713273 + MTD LTR MaLR 272 419 0 4 1316 3691 131 37 65 chr5 95824480 95825327 -56711932 - RMER17D LTR ERVK 0 889 67 4 1316 670 268 139 31 chr5 95826652 95826975 -56710284 - MTEb LTR MaLR -21 358 1 4 1316 453 340 94 77 chr5 95827517 95827868 -56709391 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 4 1316 330 296 60 38 chr5 95828572 95828755 -56708504 + RMER5 LTR ERV1 13 199 -335 4 1316 396 264 48 48 chr5 95828937 95829124 -56708135 + RMER5 LTR ERV1 331 517 -17 4 1316 944 171 16 0 chr5 95830417 95830604 -56706655 + MTC LTR MaLR 11 200 -221 4 1316 2022 246 102 54 chr5 95830632 95831469 -56705790 + MT-int LTR MaLR 4 880 -218 4 1316 271 196 135 19 chr5 95832916 95833020 -56704239 + MT-int LTR MaLR 996 1111 -147 4 1316 229 266 29 86 chr5 95847322 95847392 -56689867 - RLTR19A LTR ERVK -360 136 71 4 1316 345 277 30 103 chr5 95858914 95859079 -56678180 + RMER10B LTR ERVL 234 386 -12 4 1316 1799 204 104 52 chr5 95861066 95861490 -56675769 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 4 1316 388 240 10 0 chr5 95866951 95867047 -56670212 + MTC-int LTR MaLR 910 1006 -252 4 1316 356 133 118 13 chr5 95868385 95868461 -56668798 - MTC LTR MaLR 0 421 338 4 1316 1236 160 95 21 chr5 95868619 95868862 -56668397 + RLTR9E LTR ERVK 7 267 -142 4 1316 573 231 23 8 chr5 95870017 95870148 -56667111 + RLTR9E LTR ERVK 277 409 0 4 1316 550 172 10 0 chr5 95870148 95870242 -56667017 - MTC LTR MaLR -103 318 224 4 1316 1609 234 35 5 chr5 95870232 95870602 -56666657 - MTC-int LTR MaLR -451 807 427 4 1316 379 204 51 85 chr5 95870715 95870833 -56666426 + MTD LTR MaLR 5 118 -301 4 1316 363 227 41 10 chr5 95870834 95870932 -56666327 + MTD LTR MaLR 319 419 0 4 1316 383 322 7 14 chr5 95871031 95871176 -56666083 - MTC LTR MaLR -228 146 3 4 1316 839 237 120 51 chr5 95880036 95880226 -56657033 - MTEb LTR MaLR -21 358 167 4 1316 2854 103 54 0 chr5 95880226 95880616 -56656643 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 4 1316 839 237 120 51 chr5 95880616 95880759 -56656500 - MTEb LTR MaLR -213 166 2 4 1316 4246 44 0 0 chr5 95880767 95881242 -56656017 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 1316 685 346 51 24 chr5 95881791 95882123 -56655136 + MTEa LTR MaLR 19 359 -20 4 1316 544 325 22 106 chr5 95883849 95884217 -56653042 + RMER5 LTR ERV1 13 349 -185 5 1316 582 242 41 46 chr5 95885109 95885304 -56651955 + RMER5 LTR ERV1 331 524 -10 5 1316 949 141 86 0 chr5 95886833 95886996 -56650263 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 5 1316 2587 231 94 57 chr5 95887029 95887955 -56649304 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 5 1316 495 261 202 59 chr5 95895103 95895425 -56641834 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 1316 1196 192 89 0 chr5 95895499 95895723 -56641536 - ORR1A1 LTR MaLR -68 278 35 5 1316 561 200 15 23 chr5 95897115 95897248 -56640011 - MYSERV-int LTR ERVK -1429 7530 7399 5 1316 346 83 0 0 chr5 95897504 95897552 -56639707 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 274 5 1316 404 266 27 40 chr5 95897561 95897710 -56639549 - RLTR12B LTR ERVK -341 187 41 5 1316 1408 247 43 64 chr5 95897732 95898294 -56638965 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6001 5 1316 370 200 91 77 chr5 95900054 95900201 -56637058 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 889 5 1316 2435 148 47 40 chr5 95902256 95902728 -56634531 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 1316 1202 188 22 102 chr5 95903789 95903885 -56633374 + RMER16 LTR ERVK 1 130 -403 5 1316 1202 244 113 79 chr5 95904020 95904206 -56633053 + RMER16 LTR ERVK 131 322 -211 5 1316 1202 244 113 79 chr5 95904617 95904816 -56632443 + RMER16 LTR ERVK 323 532 -1 5 1316 326 279 39 39 chr5 95915858 95915985 -56621274 + RMER10B LTR ERVL 216 342 -56 5 1316 797 194 27 64 chr5 95916511 95916731 -56620528 + RMER3D-int LTR ERVK 1998 2209 -633 5 1316 2634 140 36 34 chr5 95939457 95939931 -56597328 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 1316 1317 233 126 18 chr5 95941181 95941351 -56595908 + RMER16 LTR ERVK 103 287 -246 5 1316 1317 233 126 18 chr5 95941378 95941390 -56595869 + RMER16 LTR ERVK 288 314 -219 5 1316 1317 233 126 18 chr5 95941778 95941983 -56595276 + RMER16 LTR ERVK 315 531 -2 5 1317 351 277 18 18 chr5 95952227 95952341 -56584918 + RMER10B LTR ERVL 229 342 -56 6 1317 877 216 39 152 chr5 95952666 95953021 -56584238 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 8 6 1317 225 218 93 65 chr5 95955613 95955721 -56581538 + MURVY-LTR LTR ERV1 351 461 -58 6 1317 1347 331 46 45 chr5 95955842 95956510 -56580749 + RodERV21-int LTR ERV1 4120 4788 -203 6 1317 716 176 7 7 chr5 95957579 95957716 -56579543 + MTC-int LTR MaLR 909 1045 -213 6 1317 378 164 82 0 chr5 95958432 95958505 -56578754 - MTC LTR MaLR 0 421 343 6 1317 868 256 46 95 chr5 95958637 95959004 -56578255 + RMER5 LTR ERV1 186 534 0 6 1317 2833 189 12 41 chr5 95959837 95960404 -56576855 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 551 -2 6 1317 1863 215 34 38 chr5 95960405 95961271 -56575988 + RMER3D-int LTR ERVK 1 1382 -1460 6 1317 5137 207 83 53 chr5 95961329 95962804 -56574455 + RMER3D-int LTR ERVK 388 2841 -1 6 1317 605 162 7 117 chr5 95962805 95962959 -56574300 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 137 -416 6 1317 918 241 113 51 chr5 95964471 95964661 -56572598 - MTEb LTR MaLR -21 358 168 6 1317 2969 86 43 0 chr5 95964661 95965055 -56572204 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 6 1317 918 241 113 51 chr5 95965055 95965200 -56572059 - MTEb LTR MaLR -212 167 2 6 1317 3629 43 30 11 chr5 95965208 95965557 -56571702 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 363 -112 6 1317 4565 19 0 0 chr5 95965557 95966039 -56571220 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 6 1317 3629 43 30 11 chr5 95966039 95966155 -56571104 + MT2C_Mm LTR ERVL 364 475 0 6 1317 711 306 82 44 chr5 95966695 95967037 -56570222 + MTEa LTR MaLR 5 359 -20 6 1317 581 251 54 11 chr5 95968466 95968651 -56568608 + RMER5 LTR ERV1 331 523 -11 6 1317 2982 68 52 0 chr5 95969382 95969751 -56567508 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 6 1317 1022 137 74 6 chr5 95970482 95970652 -56566607 + MTC LTR MaLR 6 188 -233 6 1317 2726 226 91 75 chr5 95970685 95971630 -56565629 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 6 1317 2465 18 14 256 chr5 95975989 95976407 -56560852 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 97 6 1317 2465 18 14 256 chr5 95976845 95976941 -56560318 - RLTR10 LTR ERVK -294 96 1 6 1317 2652 139 8 171 chr5 95980197 95980823 -56556436 + RMER2 LTR ERV1 44 567 0 6 1317 693 215 35 61 chr5 95981956 95982154 -56555105 - RMER13A LTR ERVK -570 290 98 6 1317 356 179 0 15 chr5 95982777 95982845 -56554414 - RMER17A-int LTR ERVK -518 1210 1144 6 1317 314 283 30 38 chr5 95989974 95990106 -56547153 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1432 -3631 6 1317 444 322 65 14 chr5 95990816 95991146 -56546113 + MURVY-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 6 1317 1241 298 34 5 chr5 95991423 95991859 -56545400 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 6 1317 3391 143 16 18 chr5 95992291 95992854 -56544405 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 6 1317 2797 148 80 12 chr5 95992961 95993462 -56543797 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 6 1317 1937 174 41 41 chr5 95998697 95999159 -56538100 - RMER17D2 LTR ERVK -15 794 333 7 1317 463 222 65 75 chr5 96013838 96014038 -56523221 + MTC-int LTR MaLR 1055 1252 -6 1 1317 1541 233 92 5 chr5 96014043 96014423 -56522836 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1317 620 207 35 11 chr5 96015887 96016029 -56521230 - RLTR21 LTR ERVK -136 1436 1281 1 1317 1010 223 82 43 chr5 96016198 96016526 -56520733 - RLTR21 LTR ERVK -426 1146 806 1 1317 367 279 29 99 chr5 96034763 96034934 -56502325 + RMER10B LTR ERVL 228 386 -12 4 1317 1363 242 150 52 chr5 96036919 96037325 -56499934 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 1317 418 237 10 0 chr5 96041939 96042036 -56495223 + MTC-int LTR MaLR 909 1006 -252 5 1317 407 151 114 0 chr5 96043422 96043514 -56493745 - MTC LTR MaLR 0 421 268 6 1317 1995 177 70 13 chr5 96043644 96044027 -56493232 + RLTR9E LTR ERVK 5 409 0 6 1317 566 147 29 29 chr5 96044031 96044136 -56493123 - MTC LTR MaLR -107 314 210 6 1317 1617 229 24 13 chr5 96044111 96044488 -56492771 - MTC-int LTR MaLR -451 807 427 6 1317 1334 253 59 35 chr5 96044601 96045006 -56492253 + MTD LTR MaLR 5 419 0 6 1317 388 283 42 28 chr5 96045106 96045248 -56492011 - MTC LTR MaLR -228 146 3 6 1317 1183 288 36 93 chr5 96055993 96056552 -56480707 + RMER5 LTR ERV1 3 529 -5 7 1317 1165 144 6 0 chr5 96057960 96058141 -56479118 + MTC LTR MaLR 11 192 -229 8 1317 2630 230 90 75 chr5 96058171 96058916 -56478343 + MT-int LTR MaLR 4 801 -297 8 1317 4386 8 0 0 chr5 96058916 96059398 -56477861 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 8 1317 2630 230 90 75 chr5 96059398 96059607 -56477652 + MT-int LTR MaLR 802 972 -126 8 1317 1337 164 55 73 chr5 96064689 96065017 -56472242 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 8 1317 235 234 30 30 chr5 96067643 96067709 -56469550 - RLTR9A LTR ERVK -296 72 7 9 1317 394 286 16 6 chr5 96068252 96068435 -56468824 - RLTR6-int LTR ERV1 -207 7571 7387 9 1317 779 152 7 0 chr5 96068430 96068568 -56468691 - RMER16-int LTR ERVK -1068 4338 4200 9 1317 3637 147 44 40 chr5 96068568 96069314 -56467945 - RMER17D LTR ERVK 0 889 141 9 1317 1483 174 92 0 chr5 96069321 96069614 -56467645 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -12 320 1 9 1317 1258 181 61 20 chr5 96069614 96069957 -56467302 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6125 9 1317 3633 112 29 25 chr5 96069974 96070240 -56467019 - IAPEY3-int LTR ERVK -342 7338 7071 9 1317 3633 112 29 25 chr5 96070736 96071063 -56466196 - IAPEY3-int LTR ERVK -610 7070 6743 9 1317 3101 102 4 4 chr5 96071053 96071507 -56465752 - IAPEY3-int LTR ERVK -1367 6214 5761 9 1317 3114 96 0 16 chr5 96071498 96071945 -56465314 - IAPEY3-int LTR ERVK -1939 5642 5203 9 1317 795 76 17 8 chr5 96072222 96072341 -56464918 - IAPEY3-int LTR ERVK -2932 4649 4530 9 1317 428 188 19 34 chr5 96072357 96072480 -56464779 - MMETn-int LTR ERVK -2380 2464 2357 9 1317 1896 140 111 5 chr5 96072489 96073073 -56464186 - ETnERV2-int LTR ERVK -3142 4264 3567 1 1317 577 219 0 0 chr5 96073099 96073218 -56464041 - ETnERV2-int LTR ERVK -4653 2753 2635 1 1317 291 267 0 55 chr5 96073230 96073321 -56463938 - ETnERV2-int LTR ERVK -4867 2539 2454 1 1317 280 310 88 0 chr5 96073334 96073447 -56463812 - RMER16-int LTR ERVK -5077 1060 938 1 1317 1441 198 93 68 chr5 96073452 96073966 -56463293 - RMER16-int LTR ERVK -4760 646 251 1 1317 335 144 0 103 chr5 96074077 96074193 -56463066 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 849 1 1317 5124 67 14 15 chr5 96074174 96074904 -56462355 - IAPLTR4_I LTR ERVK -704 766 38 1 1317 1409 187 73 41 chr5 96074905 96075222 -56462037 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -1 366 1 1 1317 411 57 0 0 chr5 96075222 96075275 -56461984 - RMER17D2 LTR ERVK -659 150 98 1 1318 725 152 0 9 chr5 96078950 96079063 -56458196 - RMER17D2 LTR ERVK -697 112 1 1 1318 706 100 8 62 chr5 96079063 96079191 -56458068 - RMER16-int LTR ERVK -1207 4199 4079 1 1318 3645 124 55 73 chr5 96079191 96079878 -56457381 - RMER16-int LTR ERVK -3017 2389 1677 1 1318 3645 124 55 73 chr5 96080037 96080060 -56457199 - RMER16-int LTR ERVK -3730 1676 1676 1 1318 3645 124 55 73 chr5 96080083 96080138 -56457121 - RMER16-int LTR ERVK -3730 1676 1637 1 1318 228 260 125 77 chr5 96080138 96080242 -56457017 + MTA_Mm LTR MaLR 196 304 -92 1 1318 278 291 15 30 chr5 96080261 96080392 -56456867 - ETnERV2-int LTR ERVK -3812 2355 2227 1 1318 552 242 28 131 chr5 96080501 96080753 -56456506 - ETnERV2-int LTR ERVK -4859 2547 2322 1 1318 298 294 6 150 chr5 96080772 96080932 -56456327 - ETnERV2-int LTR ERVK -5075 2331 2195 1 1318 252 208 0 0 chr5 96080904 96080952 -56456307 - ETnERV2-int LTR ERVK -1730 1584 1537 1 1318 467 230 8 16 chr5 96081137 96081265 -56455994 - ETnERV2-int LTR ERVK -3822 1584 1458 1 1318 240 162 0 0 chr5 96082952 96082989 -56454270 - RMER10A LTR ERVL -394 48 12 1 1318 1525 217 33 83 chr5 96085064 96085293 -56451966 + RMER16 LTR ERVK 1 320 -213 1 1318 1525 222 62 33 chr5 96085689 96085903 -56451356 + RMER16 LTR ERVK 321 533 0 1 1318 313 301 23 47 chr5 96095259 96095388 -56441871 + RMER10B LTR ERVL 216 341 -57 1 1318 2698 141 9 168 chr5 96103659 96104297 -56432962 + RMER2 LTR ERV1 31 567 0 1 1318 302 264 31 31 chr5 96106100 96106229 -56431030 + MuRRS4-int LTR ERV1 1302 1430 -3633 1 1318 369 326 61 11 chr5 96106941 96107271 -56429988 + MURVY-int LTR ERV1 4019 4360 -3241 1 1318 1067 301 68 5 chr5 96107548 96107982 -56429277 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 3954 -1109 1 1318 3421 136 18 18 chr5 96108413 96108975 -56428284 + RMER2 LTR ERV1 1 562 -5 1 1318 2855 145 78 14 chr5 96109082 96109585 -56427674 - RLTR33 LTR ERVK -143 535 1 1 1318 3620 129 22 55 chr5 96114807 96115571 -56421688 - RMER17A LTR ERVK -12 739 1 1 1318 9666 113 21 26 chr5 96116599 96118107 -56419152 + MMETn-int LTR ERVK 3344 4844 0 1 1318 1883 138 9 51 chr5 96118107 96118443 -56418816 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 1 1318 3494 25 2 0 chr5 96125051 96125446 -56411813 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1318 9603 23 2 0 chr5 96125446 96126542 -56410717 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1318 3513 23 2 0 chr5 96126542 96126937 -56410322 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1318 441 219 67 78 chr5 96153175 96153368 -56383891 + MTC-int LTR MaLR 1062 1252 -6 1 1318 1545 229 72 5 chr5 96153373 96153760 -56383499 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1318 565 217 35 11 chr5 96155224 96155366 -56381893 - RLTR21 LTR ERVK -136 1436 1281 1 1318 969 214 82 42 chr5 96155625 96155956 -56381303 - RLTR21 LTR ERVK -426 1146 803 1 1318 3380 43 2 0 chr5 96156573 96156968 -56380291 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1318 9690 17 3 0 chr5 96156968 96158063 -56379196 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1318 904 26 9 0 chr5 96158063 96158179 -56379080 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 280 1 1318 1479 31 5 0 chr5 96158168 96158359 -56378900 + MTA_Mm LTR MaLR 205 396 0 1 1318 352 291 33 93 chr5 96175998 96176180 -56361079 + RMER10B LTR ERVL 216 386 -12 2 1318 1376 210 150 54 chr5 96178163 96178570 -56358689 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 1318 401 237 10 0 chr5 96183315 96183412 -56353847 + MTC-int LTR MaLR 909 1006 -252 2 1318 411 155 114 0 chr5 96184800 96184892 -56352367 - MTC LTR MaLR 0 421 268 2 1318 1875 166 76 18 chr5 96185023 96185404 -56351855 + RLTR9E LTR ERVK 7 409 0 2 1318 538 182 10 0 chr5 96185404 96185498 -56351761 - MTC LTR MaLR -103 318 224 2 1318 1614 198 15 6 chr5 96185488 96185818 -56351441 - MTC-int LTR MaLR -451 807 475 2 1318 654 195 38 19 chr5 96185820 96185977 -56351282 + MTD LTR MaLR 260 419 0 2 1318 399 299 9 0 chr5 96186078 96186185 -56351074 - MTC LTR MaLR -228 146 39 2 1318 765 260 99 54 chr5 96199221 96199410 -56337849 - MTEb LTR MaLR -21 358 163 2 1318 2777 100 51 0 chr5 96199410 96199801 -56337458 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 1318 765 260 99 54 chr5 96199801 96199924 -56337335 - MTEb LTR MaLR -217 162 32 2 1318 3933 53 0 0 chr5 96199952 96200427 -56336832 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1318 667 351 61 26 chr5 96200963 96201308 -56335951 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 2 1318 612 330 32 92 chr5 96203025 96203395 -56333864 + RMER5 LTR ERV1 13 360 -174 2 1318 611 231 41 46 chr5 96204280 96204475 -56332784 + RMER5 LTR ERV1 331 524 -10 2 1318 908 153 86 0 chr5 96206017 96206180 -56331079 + MTC LTR MaLR 12 188 -233 2 164 2601 233 105 59 chr5 96206213 96207131 -56330128 + MT-int LTR MaLR 4 963 -135 2 1319 477 271 192 50 chr5 96214263 96214585 -56322674 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 1319 1117 184 67 22 chr5 96214651 96214874 -56322385 - ORR1A2 LTR MaLR -60 267 35 2 1319 561 200 15 23 chr5 96216270 96216403 -56320856 - MYSERV-int LTR ERVK -1429 7530 7399 2 1319 346 83 0 0 chr5 96216659 96216707 -56320552 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 274 2 1319 404 266 27 40 chr5 96216716 96216865 -56320394 - RLTR12B LTR ERVK -341 187 41 2 1319 1370 243 45 62 chr5 96216887 96217422 -56319837 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6025 2 1319 375 196 91 77 chr5 96219156 96219303 -56317956 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 889 2 1319 2435 148 47 40 chr5 96221354 96221826 -56315433 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1319 1337 241 71 80 chr5 96222913 96222984 -56314275 + RMER16 LTR ERVK 60 129 -404 2 1319 1337 241 71 80 chr5 96223119 96223307 -56313952 + RMER16 LTR ERVK 130 323 -210 2 1319 1337 241 71 80 chr5 96223718 96223935 -56313324 + RMER16 LTR ERVK 324 533 0 2 1319 351 277 18 18 chr5 96234060 96234174 -56303085 + RMER10B LTR ERVL 229 342 -56 3 1319 847 216 39 166 chr5 96234499 96234860 -56302399 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 8 3 1319 1348 331 46 45 chr5 96237652 96238320 -56298939 + RodERV21-int LTR ERV1 4120 4788 -203 3 1319 716 176 7 7 chr5 96239391 96239528 -56297731 + MTC-int LTR MaLR 909 1045 -213 3 1319 378 164 82 0 chr5 96240246 96240319 -56296940 - MTC LTR MaLR 0 421 343 3 1319 972 277 32 129 chr5 96240332 96240796 -56296463 + RMER5 LTR ERV1 116 534 0 3 1319 2830 186 12 41 chr5 96241630 96242197 -56295062 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 551 -2 3 1319 1990 202 32 39 chr5 96242198 96243067 -56294192 + RMER3D-int LTR ERVK 1 1382 -1460 3 1319 5596 201 60 51 chr5 96243169 96244628 -56292631 + RMER3D-int LTR ERVK 422 2841 -1 3 1319 640 132 7 117 chr5 96244629 96244783 -56292476 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 137 -416 3 1319 4471 157 27 27 chr5 96246352 96247198 -56290061 + RLTR13A LTR ERVK 10 855 0 3 1319 1448 167 12 4 chr5 96257924 96258182 -56279077 + RLTR31_Mur LTR ERVK 117 376 -177 3 1319 374 183 0 0 chr5 96263370 96263441 -56273818 + RLTR19 LTR ERVK 1 71 -428 3 1319 417 250 187 13 chr5 96263569 96263719 -56273540 + RLTR19 LTR ERVK 115 290 -209 3 1319 394 309 39 7 chr5 96263741 96263894 -56273365 + RLTR19 LTR ERVK 339 496 -3 3 1319 588 255 127 8 chr5 96269135 96269372 -56267887 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 147 3 1319 1291 124 38 0 chr5 96269705 96269914 -56267345 + RMER2 LTR ERV1 31 247 -320 3 1319 326 264 45 84 chr5 96274296 96274474 -56262785 + RMER10B LTR ERVL 216 386 -12 3 1319 3710 158 49 18 chr5 96279258 96279969 -56257290 - MYSERV6-int LTR ERVK -6180 2779 2047 3 1319 933 189 156 15 chr5 96279981 96280307 -56256952 - RMER6B LTR ERVK -89 372 1 3 1319 4593 118 49 78 chr5 96280349 96281182 -56256077 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 3 1319 2289 169 40 0 chr5 96285209 96285588 -56251671 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1319 2472 87 6 58 chr5 96295309 96295652 -56241607 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 3 1319 1667 229 32 27 chr5 96295831 96296203 -56241056 - MTE2b LTR MaLR -5 374 1 3 1319 542 208 9 0 chr5 96303474 96303580 -56233679 + MTD LTR MaLR 1 107 -312 4 1319 4382 114 106 20 chr5 96303580 96304325 -56232934 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 4 1319 1389 197 58 51 chr5 96305705 96306016 -56231243 + MTD LTR MaLR 107 419 0 4 1319 241 301 159 58 chr5 96308842 96309050 -56228209 - MLT1A LTR MaLR -77 297 69 4 1319 411 281 303 76 chr5 96312068 96312381 -56224878 + MLT1A0 LTR MaLR 1 384 -6 4 1319 229 329 84 14 chr5 96319175 96319246 -56218013 + LTR16A1 LTR ERVL 1 76 -404 4 1319 891 297 105 56 chr5 96319485 96319934 -56217325 - RMER5 LTR ERV1 -31 503 33 4 1319 255 342 42 8 chr5 96320552 96320670 -56216589 + HERV16-int LTR ERVL 1248 1369 -3627 4 1319 487 338 62 66 chr5 96321289 96321593 -56215666 - ORR1E LTR MaLR -36 323 21 4 1319 2523 182 30 17 chr5 96322665 96323135 -56214124 - RMER19B LTR ERVK -426 476 1 4 1319 401 319 135 81 chr5 96323135 96323481 -56213778 + LTR16A1 LTR ERVL 91 455 -1 4 1319 452 254 75 0 chr5 96336806 96336940 -56200319 + RMER15 LTR ERVL 432 575 0 4 1320 237 265 73 0 chr5 96339187 96339255 -56198004 + LTR33 LTR ERVL 100 172 -343 4 1320 3083 146 45 87 chr5 96340185 96340831 -56196428 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 24 4 1320 2976 57 57 5 chr5 96342527 96342914 -56194345 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1320 541 313 36 18 chr5 96353186 96353407 -56183852 - HERV16-int LTR ERVL -3853 1143 919 4 1320 274 378 55 25 chr5 96355747 96355948 -56181311 + LTR16C LTR ERVL 187 393 -96 4 1320 1132 192 131 32 chr5 96369916 96370297 -56166962 - RMER17C LTR ERVK 0 410 16 4 1320 2613 148 34 16 chr5 96371088 96371589 -56165670 + RLTR28 LTR ERVL 2 511 -13 4 1320 1806 133 11 138 chr5 96373376 96373846 -56163413 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1320 230 225 108 40 chr5 96394221 96394295 -56142964 - MTEa LTR MaLR -23 356 278 5 1320 234 316 66 0 chr5 96396240 96396316 -56140943 - MLT1H LTR MaLR -468 81 1 5 1320 496 216 103 8 chr5 96406008 96406125 -56131134 - ORR1D1 LTR MaLR -245 129 2 5 1320 402 390 52 11 chr5 96407309 96407657 -56129602 + HERV16-int LTR ERVL 1095 1456 -3540 5 1320 1970 171 66 33 chr5 96407803 96408004 -56129255 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 161 5 1320 1970 171 66 33 chr5 96408076 96408236 -56129023 - ORR1D1 LTR MaLR -214 160 1 5 1320 1488 168 34 14 chr5 96408236 96408532 -56128727 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1069 5 1320 321 338 46 46 chr5 96410264 96410416 -56126843 - MLT2B1 LTR ERVL -48 519 368 5 1320 427 342 43 5 chr5 96411012 96411197 -56126062 - RMER15 LTR ERVL -13 562 371 5 1320 495 252 88 75 chr5 96411370 96411597 -56125662 + MLT2C1 LTR ERVL 83 312 -85 5 1320 272 238 81 23 chr5 96424493 96424579 -56112680 - MLT1F2-int LTR MaLR -1198 173 83 5 1320 1061 324 67 78 chr5 96425814 96426369 -56110890 - MLT1F2 LTR MaLR -8 552 4 5 1320 1862 139 40 108 chr5 96427356 96427736 -56109523 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1320 341 291 145 29 chr5 96429535 96429822 -56107437 - RLTR22_Mur LTR ERVK -37 1811 1595 5 1320 677 222 26 110 chr5 96429894 96430122 -56107137 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1006 802 594 5 1320 1503 236 66 98 chr5 96430175 96430777 -56106482 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1265 583 1 5 1320 1536 229 88 3 chr5 96436498 96436839 -56100420 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1320 2123 161 155 36 chr5 96437267 96437340 -56099919 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 450 5 1320 2123 161 155 36 chr5 96437388 96437785 -56099474 - RLTR11A LTR ERVK -79 449 2 5 1320 1811 110 0 4 chr5 96451250 96451514 -56085745 + RLTR31_Mur LTR ERVK 179 441 -112 6 1321 351 405 63 24 chr5 96470487 96470740 -56066519 + LTR33A_ LTR ERVL 264 526 -5 6 1321 2653 53 81 0 chr5 96471367 96471687 -56065572 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 1321 5011 79 16 114 chr5 96479933 96480766 -56056493 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 6 1321 390 331 135 0 chr5 96484317 96484495 -56052764 + LTR33A LTR ERVL 1 202 -318 6 1321 3708 30 0 128 chr5 96485443 96485943 -56051316 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1321 2714 90 53 3 chr5 96485943 96486323 -56050936 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 399 -7182 6 1321 43085 36 0 1 chr5 96486321 96491265 -56045994 + MMERVK10C-int LTR ERVK 870 5810 -1771 6 1321 7561 38 7 62 chr5 96491251 96491301 -56045958 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6646 6692 -889 6 1321 7561 38 7 62 chr5 96491330 96492269 -56044990 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6693 7581 0 6 1321 3645 39 0 128 chr5 96492269 96492769 -56044490 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1321 661 201 221 32 chr5 96495242 96495545 -56041714 + ORR1B1 LTR MaLR 1 372 -6 6 1321 336 339 70 100 chr5 96496565 96496765 -56040494 + LTR16E2 LTR ERVL 351 544 -24 6 1321 227 331 100 44 chr5 96501197 96501377 -56035882 - RLTR13A2 LTR ERVK -678 280 91 1 1321 601 357 71 35 chr5 96511354 96511665 -56025594 + LTR33 LTR ERVL 40 361 -154 1 1321 919 206 141 33 chr5 96516051 96516392 -56020867 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1321 586 293 161 40 chr5 96539817 96540190 -55997069 + RMER5 LTR ERV1 25 442 -92 6 1321 313 296 84 73 chr5 96569363 96569701 -55967558 + MTEb LTR MaLR 15 379 0 1 1321 2232 181 88 23 chr5 96569848 96570181 -55967078 + RLTR12B LTR ERVK 23 387 -141 1 1321 2232 181 88 23 chr5 96570357 96570498 -55966761 + RLTR12B LTR ERVK 388 528 0 1 1321 360 258 60 136 chr5 96575133 96575317 -55961942 + MT2B LTR ERVL 96 265 -336 1 1321 313 170 0 0 chr5 96576313 96576366 -55960893 + RLTR31_Mur LTR ERVK 501 553 0 1 1321 2862 143 77 38 chr5 96577072 96577594 -55959665 + RLTR31_Mur LTR ERVK 12 553 0 1 1321 4280 155 124 11 chr5 96579385 96580194 -55957065 + RMER19B LTR ERVK 3 902 0 1 1321 1075 152 44 28 chr5 96583007 96583207 -55954052 + ORR1D1 LTR MaLR 1 200 -178 1 1321 895 221 102 84 chr5 96583234 96583404 -55953855 + ORR1D1 LTR MaLR 201 378 0 1 1321 227 309 85 12 chr5 96583477 96583559 -55953700 + MTEb LTR MaLR 1 88 -271 1 1321 311 319 104 30 chr5 96583634 96583889 -55953370 + MTEb LTR MaLR 79 374 -5 1 1321 1049 116 26 0 chr5 96587193 96587348 -55949911 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6850 7008 -573 1 1321 1347 184 130 22 chr5 96595828 96596151 -55941108 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 1 1321 2328 121 11 6 chr5 96596902 96597259 -55940000 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 1322 901 271 132 35 chr5 96601547 96601888 -55935371 + MTEa LTR MaLR 1 374 -5 2 1322 413 316 71 51 chr5 96602216 96602566 -55934693 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 2 1322 236 371 75 8 chr5 96605876 96606009 -55931250 + ORR1E LTR MaLR 4 145 -214 2 1322 280 340 129 19 chr5 96606730 96606855 -55930404 + MLT1A LTR MaLR 65 198 -176 2 1322 280 260 110 65 chr5 96606908 96607063 -55930196 + MLT1A LTR MaLR 199 407 -1 2 1322 925 234 159 30 chr5 96612198 96612532 -55924727 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 2 1322 249 226 214 10 chr5 96617408 96617511 -55919748 + RLTR15 LTR ERVK 2 125 -234 2 1322 304 202 128 23 chr5 96617509 96617595 -55919664 - RLTR15 LTR ERVK -262 97 3 2 1322 2552 137 24 22 chr5 96619026 96619438 -55917821 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 1322 342 224 46 114 chr5 96622377 96622508 -55914751 + MT2B LTR ERVL 155 276 -325 2 1322 271 353 51 17 chr5 96626770 96626946 -55910313 - LTR33A_ LTR ERVL -322 209 28 2 1322 1411 242 48 40 chr5 96629019 96629393 -55907866 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 2 1322 294 229 56 14 chr5 96629470 96629541 -55907718 - MTEa LTR MaLR -17 362 289 2 1322 1125 215 42 0 chr5 96630037 96630274 -55906985 - MTD LTR MaLR -1 418 172 2 1322 363 367 82 44 chr5 96634104 96634446 -55902813 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 33 2 1322 1011 273 56 85 chr5 96636552 96636928 -55900331 - MTEa LTR MaLR -1 378 14 2 1322 703 250 105 83 chr5 96643161 96643523 -55893736 - MTE2a LTR MaLR -7 372 3 2 1322 741 300 99 62 chr5 96649882 96650305 -55886954 - MLT1D LTR MaLR -2 503 65 3 1322 835 287 44 87 chr5 96650326 96650692 -55886567 - ORR1E LTR MaLR -6 353 4 3 1322 429 294 76 124 chr5 96650920 96651211 -55886048 - MLT1H LTR MaLR -143 406 130 3 1322 508 271 73 60 chr5 96657821 96658053 -55879206 - RMER5 LTR ERV1 -21 513 279 3 1322 335 337 101 48 chr5 96667381 96667748 -55869511 - MLT1F2 LTR MaLR -158 469 1 3 1322 457 87 29 0 chr5 96691806 96691875 -55845384 - ORR1A4 LTR MaLR 0 394 324 3 1322 1532 161 11 46 chr5 96692373 96692653 -55844606 - ORR1A4 LTR MaLR -59 270 1 3 1322 3190 177 56 17 chr5 96697534 96698126 -55839133 + RLTR18 LTR ERVK 1 615 -1 3 1322 3444 23 43 10 chr5 96701760 96702158 -55835101 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 1322 961 137 25 85 chr5 96702159 96702358 -55834901 + IAPEz-int LTR ERVK 9 195 -6286 3 1322 231 321 0 0 chr5 96702358 96702411 -55834848 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 3 1322 932 60 8 0 chr5 96702411 96702528 -55834731 + IAPEz-int LTR ERVK 168 285 -6196 3 1322 10995 61 41 33 chr5 96702528 96704007 -55833252 + IAPEz-int LTR ERVK 211 1700 -4781 3 1322 6340 68 13 17 chr5 96704000 96704832 -55832427 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 3 1322 3441 23 43 10 chr5 96704834 96705232 -55832027 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 1322 2262 145 67 21 chr5 96709841 96710215 -55827044 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 3 1322 247 355 9 18 chr5 96725400 96725512 -55811747 + MLT1A1 LTR MaLR 1 111 -297 4 1322 717 214 22 52 chr5 96725517 96725766 -55811493 + RMER19B LTR ERVK 1 203 -699 4 1322 2277 127 87 38 chr5 96725766 96726217 -55811042 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 473 -2 4 1322 2443 44 3 3 chr5 96726223 96726519 -55810740 - RLTR10-int LTR ERVK -1390 597 302 4 1322 2663 63 25 52 chr5 96726519 96726920 -55810339 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 4 1322 9001 18 0 0 chr5 96726922 96727917 -55809342 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 4 1322 369 261 51 19 chr5 96727999 96728155 -55809104 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1434 4 1322 6137 25 1 0 chr5 96728198 96728888 -55808371 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 302 4 1322 1598 90 35 14 chr5 96728888 96729171 -55808088 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 102 4 1322 1915 193 133 94 chr5 96729141 96729833 -55807426 + RMER19B LTR ERVK 168 886 -16 4 1322 326 210 37 0 chr5 96730275 96730356 -55806903 + MTEa LTR MaLR 275 358 -21 4 1323 991 302 39 33 chr5 96731557 96731889 -55805370 - MTE2b LTR MaLR -45 334 1 4 1323 490 306 116 42 chr5 96738586 96738947 -55798312 - MER21B LTR ERV1 -113 750 363 4 1323 465 300 159 78 chr5 96738970 96739241 -55798018 - MER21B LTR ERV1 -551 312 20 4 1323 279 333 79 23 chr5 96744213 96744428 -55792831 + MTEa LTR MaLR 38 264 -115 4 1323 515 315 83 65 chr5 96744306 96744683 -55792576 + MT2A LTR ERVL 135 562 0 4 1323 399 318 0 15 chr5 96746501 96746632 -55790627 - MTE-int LTR MaLR -1413 167 39 4 1323 438 333 73 30 chr5 96746688 96747033 -55790226 - MTEb LTR MaLR 0 379 6 4 1323 401 249 10 2 chr5 96747475 96747589 -55789670 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 261 4 1323 552 257 104 26 chr5 96750614 96750806 -55786453 + MLT2B2 LTR ERVL 1 207 -313 4 1323 930 275 29 4 chr5 96751286 96751563 -55785696 + MLT2B2 LTR ERVL 224 507 -8 4 1323 1983 174 60 25 chr5 96763911 96764313 -55772946 + MTC LTR MaLR 6 421 0 4 1323 393 292 180 38 chr5 96765662 96765929 -55771330 - MTEa LTR MaLR 0 379 75 4 1323 3406 35 5 0 chr5 96765962 96766356 -55770903 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1323 396 365 59 0 chr5 96774107 96774277 -55762982 + HERV16-int LTR ERVL 1406 1585 -3411 5 1323 817 316 24 45 chr5 96774596 96774928 -55762331 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 82 5 1323 612 260 25 20 chr5 96775158 96775354 -55761905 - RMER15 LTR ERVL -34 541 345 5 1323 239 275 74 12 chr5 96775760 96775841 -55761418 - MLT1A1 LTR MaLR -322 86 1 5 1323 392 300 48 78 chr5 96776196 96776402 -55760857 + MLT1D LTR MaLR 298 497 -8 5 1323 312 329 20 27 chr5 96776424 96776574 -55760685 + HERV16-int LTR ERVL 2357 2505 -2980 5 1323 1932 135 176 8 chr5 96779979 96780338 -55756921 + MTC LTR MaLR 3 421 0 5 1323 509 315 70 82 chr5 96782537 96782925 -55754334 + MLT1D LTR MaLR 121 503 -2 5 1323 577 311 10 118 chr5 96783529 96783926 -55753333 + MLT1D-int LTR MaLR 315 668 -703 5 1323 351 378 17 12 chr5 96784339 96784594 -55752665 + MLT1D-int LTR MaLR 722 1019 -470 5 1323 2229 153 186 4 chr5 96784644 96785122 -55752137 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 4 5 1323 453 311 112 39 chr5 96785306 96785611 -55751648 + MLT1D-int LTR MaLR 915 1241 -130 5 1323 433 282 113 7 chr5 96785726 96785876 -55751383 + ERVL-E-int LTR ERVL 702 867 -4800 5 1323 291 307 170 29 chr5 96785971 96786212 -55751047 - ERVL-E-int LTR ERVL -3834 1833 1559 5 1323 2135 70 36 45 chr5 96788693 96789023 -55748236 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 5 1323 276 319 73 12 chr5 96795709 96795874 -55741385 - MLT1I LTR MaLR -8 403 229 5 1323 405 302 47 58 chr5 96798352 96798609 -55738650 - ORR1E LTR MaLR -105 254 1 5 1323 476 326 113 21 chr5 96798785 96799067 -55738192 - MTE-int LTR MaLR -102 1478 1171 5 1323 1539 111 386 19 chr5 96807819 96808127 -55729132 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1323 603 144 26 51 chr5 96808191 96808308 -55728951 - RMER15 LTR ERVL 0 575 462 5 1323 706 203 19 105 chr5 96808309 96808518 -55728741 - RMER15 LTR ERVL -382 193 3 5 1323 1502 199 149 3 chr5 96822927 96823270 -55713989 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 5 1323 606 252 141 75 chr5 96832806 96833111 -55704148 + MTE2a LTR MaLR 41 365 -14 5 1323 1620 186 3 7 chr5 96839698 96840007 -55697252 - MTD LTR MaLR -8 411 104 6 1323 278 200 14 54 chr5 96841161 96841235 -55696024 + LTR48 LTR ERV1 1 71 -716 6 1323 1314 228 70 32 chr5 96841238 96841641 -55695618 + BGLII_B LTR ERVK 6 423 -18 6 1323 648 319 76 3 chr5 96849354 96849643 -55687616 + MLT1B LTR MaLR 1 310 -80 6 1323 537 339 53 9 chr5 96852230 96852456 -55684803 + MLT1A0 LTR MaLR 3 238 -127 6 1323 1995 157 6 3 chr5 96852452 96852790 -55684469 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 47 6 1323 271 361 9 9 chr5 96852802 96852911 -55684348 + MLT1A0 LTR MaLR 238 346 -19 6 1323 776 244 164 18 chr5 96859408 96859633 -55677626 - MTEb LTR MaLR -121 258 1 6 1324 333 217 0 0 chr5 96862934 96863003 -55674256 + MTEb LTR MaLR 3 71 -308 6 1324 649 268 147 11 chr5 96863223 96863502 -55673757 + MTEb LTR MaLR 63 379 0 6 1324 2801 61 3 0 chr5 96869444 96869789 -55667470 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 1324 486 145 0 12 chr5 96873213 96873297 -55663962 - RLTR20A LTR ERVK -458 83 1 6 1324 1196 297 8 42 chr5 96875318 96875704 -55661555 - MTEa LTR MaLR -2 377 5 6 1324 369 295 173 0 chr5 96895895 96896034 -55641225 - MLT1H LTR MaLR -382 167 5 6 1324 378 385 37 34 chr5 96898798 96899094 -55638165 + MLT1J1 LTR MaLR 73 369 -75 6 1324 257 197 0 116 chr5 96900701 96900770 -55636489 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 512 7 1324 231 327 19 19 chr5 96904071 96904174 -55633085 + MTC LTR MaLR 3 105 -254 7 1324 551 180 26 35 chr5 96904178 96904293 -55632966 + MTC LTR MaLR 300 413 -8 7 1324 555 311 88 36 chr5 96909205 96909455 -55627804 - LTR33 LTR ERVL -7 508 246 7 1324 528 237 125 0 chr5 96913906 96914058 -55623201 - MLT1E3 LTR MaLR -406 218 48 7 1324 2884 19 5 83 chr5 96914517 96914915 -55622344 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 1324 29415 20 1 1 chr5 96914915 96918187 -55619072 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 7 1324 7424 81 165 7 chr5 96918186 96919314 -55617945 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 7 1324 2554 19 5 84 chr5 96919314 96919707 -55617552 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 6 7 1324 298 339 49 49 chr5 96923879 96924084 -55613175 + LTR16E1 LTR ERVL 326 530 -8 7 1324 1325 251 59 31 chr5 96934460 96934847 -55602412 + MTD LTR MaLR 6 403 -16 7 1324 291 382 37 26 chr5 96935640 96935831 -55601428 - LTR16A LTR ERVL -142 309 117 7 1324 245 221 52 0 chr5 96939724 96939801 -55597458 - MLT2B2 LTR ERVL 0 562 482 7 1324 1410 238 66 59 chr5 96954680 96955122 -55582137 - RLTR11B LTR ERVK -8 445 1 7 1324 774 209 29 68 chr5 96955122 96955327 -55581932 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6354 7 1324 392 362 60 0 chr5 96955386 96955571 -55581688 - MLT2C2 LTR ERVL -173 291 96 7 1324 1651 199 68 32 chr5 96958464 96958864 -55578395 - MTD LTR MaLR -5 414 1 7 1324 1169 246 105 26 chr5 96971139 96971490 -55565769 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 7 1324 2633 90 3 0 chr5 96971556 96971878 -55565381 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 7 1324 477 269 45 23 chr5 96971915 96972048 -55565211 - MTE2b LTR MaLR -234 145 10 7 1324 225 224 116 12 chr5 96983155 96983241 -55554018 - MLT1L LTR MaLR -18 592 498 8 1325 2301 115 3 0 chr5 97001373 97001695 -55535564 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 4 1325 716 204 79 21 chr5 97002205 97002395 -55534864 - MTD LTR MaLR 0 419 219 5 1325 1278 197 93 19 chr5 97005469 97005779 -55531480 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 42 1 1325 1235 198 17 100 chr5 97014008 97014206 -55523053 - MTD LTR MaLR -11 408 208 2 1325 1235 198 17 100 chr5 97014258 97014285 -55522974 - MTD LTR MaLR -212 207 199 2 1325 1235 198 17 100 chr5 97014557 97014679 -55522580 - MTD LTR MaLR -221 198 89 2 1325 450 336 44 36 chr5 97015894 97016119 -55521140 + LTR90A LTR LTR 14 240 -736 3 1325 267 281 37 0 chr5 97016655 97016737 -55520522 + LTR90A LTR LTR 827 911 -65 3 1325 377 293 84 18 chr5 97018006 97018173 -55519086 + MLT1D LTR MaLR 308 485 -20 3 1325 1020 238 168 64 chr5 97031314 97031795 -55505464 - RMER15 LTR ERVL 0 575 45 5 1325 4374 16 14 0 chr5 97034930 97035416 -55501843 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1325 511 301 58 6 chr5 97041016 97041190 -55496069 - MER74A LTR ERVL -371 187 5 6 1325 506 227 102 16 chr5 97047801 97048057 -55489202 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 7 1325 497 233 51 29 chr5 97050699 97050836 -55486423 - MLT1B LTR MaLR -2 388 249 7 1325 914 263 63 118 chr5 97062794 97063129 -55474130 - MTEa LTR MaLR -2 377 77 8 1325 914 263 63 118 chr5 97063332 97063393 -55473866 - MTEa LTR MaLR -303 76 3 8 1325 683 309 93 57 chr5 97063679 97064012 -55473247 - ORR1E LTR MaLR 0 359 15 9 1325 967 272 50 4 chr5 97065440 97065698 -55471561 - MTE2b LTR MaLR -109 270 1 9 1325 995 269 52 49 chr5 97067018 97067362 -55469897 - ORR1E LTR MaLR -9 350 6 9 1325 1062 173 102 22 chr5 97093116 97093205 -55444054 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 268 1 1325 1502 166 78 197 chr5 97093205 97093641 -55443618 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 1325 1062 173 102 22 chr5 97093641 97093776 -55443483 - ORR1D1 LTR MaLR -107 267 132 1 1325 2413 60 119 11 chr5 97101166 97101518 -55435741 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 1325 2527 163 27 45 chr5 97119814 97120329 -55416930 - RMER20A LTR ERVK -7 509 4 1 1326 4282 164 86 54 chr5 97134287 97135161 -55402098 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 1326 364 341 22 0 chr5 97139585 97139723 -55397536 - ORR1E LTR MaLR -218 141 1 1 1326 285 317 50 25 chr5 97140548 97140737 -55396522 - LTR40c LTR ERVL -164 298 105 1 1326 279 278 0 53 chr5 97149986 97150081 -55387178 - MLT1A0 LTR MaLR -257 108 19 1 1326 1321 261 69 11 chr5 97150100 97150479 -55386780 + MTD LTR MaLR 19 419 0 1 1326 659 298 81 78 chr5 97150886 97151269 -55385990 - MLT1B LTR MaLR -3 387 4 1 1326 393 317 84 30 chr5 97161124 97161361 -55375898 - MLT1J LTR MaLR -243 269 20 1 1326 1033 171 55 125 chr5 97179233 97179593 -55357666 - MTC-int LTR MaLR -827 431 6 2 1326 292 224 0 76 chr5 97184908 97185000 -55352259 - MT2B LTR ERVL -337 264 180 2 1326 2548 122 66 2 chr5 97185941 97186337 -55350922 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1326 2339 106 83 35 chr5 97196636 97197067 -55340192 - RLTR20B2 LTR ERVK -108 452 1 2 1326 1926 157 47 0 chr5 97217061 97217405 -55319854 + ORR1D1 LTR MaLR 15 374 0 2 1326 1254 184 116 24 chr5 97217532 97217861 -55319398 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 2 1326 679 265 0 29 chr5 97218805 97218980 -55318279 - MTEa-int LTR MaLR -232 1348 1179 2 1326 536 236 86 0 chr5 97218993 97219133 -55318126 - MTEa-int LTR MaLR -1422 158 7 2 1326 558 285 262 36 chr5 97219138 97219447 -55317812 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 1326 1332 230 72 41 chr5 97221454 97221844 -55315415 - MTD LTR MaLR -12 407 6 2 1326 232 239 14 29 chr5 97224070 97224139 -55313120 - MTEa LTR MaLR -24 355 288 2 1326 773 277 61 36 chr5 97233370 97233647 -55303612 - MER21B LTR ERV1 -578 285 2 3 1326 844 226 113 13 chr5 97234804 97235100 -55302159 - MTD LTR MaLR -14 365 52 3 1326 321 303 23 8 chr5 97235102 97235235 -55302024 - MLT1C LTR MaLR -301 166 32 3 1326 495 309 78 65 chr5 97246791 97247178 -55290081 - MLT2C1 LTR ERVL -5 392 1 3 1326 431 90 15 0 chr5 97248022 97248089 -55289170 - RMER17C LTR ERVK -342 68 1 3 1326 567 274 6 43 chr5 97248231 97248395 -55288864 - RLTR20D LTR ERVK -5 573 416 3 1326 900 246 59 66 chr5 97248375 97248662 -55288597 - RLTR20D LTR ERVK -281 287 3 3 1326 253 179 0 67 chr5 97249626 97249686 -55287573 - IAPEY3-int LTR ERVK -4153 3527 3472 3 1326 275 359 70 20 chr5 97250014 97250213 -55287046 - MER21B LTR ERV1 -264 599 391 3 1326 259 225 0 101 chr5 97250794 97250883 -55286376 - LTR50 LTR ERVL 0 795 716 3 1326 280 294 62 23 chr5 97253384 97253513 -55283746 - MLT1J LTR MaLR -251 261 128 3 1327 623 250 53 26 chr5 97256294 97256483 -55280776 - RLTR42-int LTR ERVK -4140 1382 1189 3 1327 334 226 30 3 chr5 97260700 97260775 -55276484 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 551 460 3 1327 351 119 0 0 chr5 97260864 97260923 -55276336 - RLTR20A2 LTR ERVK -171 407 349 3 1327 2909 56 2 15 chr5 97260926 97261326 -55275933 - MTB LTR MaLR -5 395 1 3 1327 1949 146 42 0 chr5 97261334 97261664 -55275595 - RLTR20A2 LTR ERVK -234 344 1 3 1327 300 317 113 21 chr5 97261752 97261894 -55275365 - MER92A LTR ERV1 -255 157 3 3 1327 1444 202 81 26 chr5 97262603 97262949 -55274310 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 3 1327 356 253 22 122 chr5 97272507 97272687 -55264572 - ORR1E LTR MaLR -48 311 150 3 1327 2568 115 28 34 chr5 97272718 97273214 -55264045 + BGLII_B LTR ERVK 1 436 -5 3 1327 1050 133 33 0 chr5 97273752 97273933 -55263326 - RMER15 LTR ERVL -385 190 4 3 1327 384 281 51 63 chr5 97278950 97279125 -55258134 + MERVK26-int LTR ERVK 284 456 -6463 3 1327 3195 323 60 37 chr5 97279155 97279682 -55257577 + MERVK26-int LTR ERVK 1547 2059 -4860 3 1327 3195 323 60 37 chr5 97279862 97280792 -55256467 + MERVK26-int LTR ERVK 2060 3038 -3881 3 1327 1534 219 122 11 chr5 97280793 97281021 -55256238 + RLTR12B LTR ERVK 1 257 -271 4 1327 1534 222 106 13 chr5 97281077 97281339 -55255920 + RLTR12B LTR ERVK 258 551 -17 4 1327 459 266 68 36 chr5 97286658 97286880 -55250379 + RLTR12B LTR ERVK 3 231 -297 4 1327 319 256 36 66 chr5 97286962 97287129 -55250130 + RLTR15 LTR ERVK 172 333 -26 4 1327 1564 142 90 10 chr5 97289040 97289339 -55247920 + ORR1B2 LTR MaLR 1 323 -44 4 1327 323 179 0 18 chr5 97293414 97293471 -55243788 + ORR1B2 LTR MaLR 312 367 0 4 1327 3062 77 13 3 chr5 97295752 97296144 -55241115 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1327 1232 172 299 71 chr5 97296239 97296701 -55240558 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 4 1327 424 295 77 90 chr5 97302922 97303258 -55234001 + RLTR17 LTR ERVK 60 426 -266 4 1327 275 288 101 43 chr5 97308255 97308393 -55228866 - LTR16C LTR ERVL -63 426 281 4 1327 374 321 104 82 chr5 97309067 97309566 -55227693 + MTE-int LTR MaLR 354 863 -717 4 1327 1246 279 61 76 chr5 97310091 97310565 -55226694 + MTE-int LTR MaLR 891 1357 -223 4 1327 254 261 196 0 chr5 97310900 97310992 -55226267 + MTE-int LTR MaLR 1351 1460 -120 4 1327 1392 201 87 15 chr5 97311782 97312116 -55225143 - MTD LTR MaLR -30 389 32 4 1327 1836 146 72 6 chr5 97312847 97313179 -55224080 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1327 1156 216 149 74 chr5 97314223 97314613 -55222646 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1327 1602 131 97 0 chr5 97317347 97317637 -55219622 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 4 1327 2015 152 35 20 chr5 97321586 97321805 -55215454 + RMER4B LTR ERVK 2 223 -362 4 1327 1215 220 47 115 chr5 97321805 97322232 -55215027 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 4 1327 2015 152 35 20 chr5 97322232 97322408 -55214851 + RMER4B LTR ERVK 224 403 -182 4 1327 894 193 62 31 chr5 97329047 97329304 -55207955 + RMER10A LTR ERVL 176 440 -2 4 1327 1154 222 40 0 chr5 97338118 97338391 -55198868 + MTD LTR MaLR 13 296 -123 5 1327 3223 167 21 70 chr5 97338391 97339066 -55198193 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 5 1327 301 131 149 35 chr5 97339066 97339137 -55198122 + MTD LTR MaLR 307 387 -32 5 1327 2078 177 154 18 chr5 97339224 97339244 -55198015 + RMER4B LTR ERVK 17 39 -546 5 1327 2078 177 154 18 chr5 97339281 97339485 -55197774 + RMER4B LTR ERVK 40 257 -328 5 1327 2078 177 154 18 chr5 97339531 97339806 -55197453 + RMER4B LTR ERVK 258 583 -2 5 1327 2385 91 25 0 chr5 97345425 97345744 -55191515 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1327 661 287 133 16 chr5 97352670 97352985 -55184274 + ORR1E LTR MaLR 6 357 -2 5 1327 1045 332 33 16 chr5 97352985 97353435 -55183824 + ORR1E-int LTR MaLR 1 458 -1122 5 1327 227 239 15 15 chr5 97353489 97353557 -55183702 + ORR1D1 LTR MaLR 1 68 -306 5 1327 437 247 67 103 chr5 97354200 97354394 -55182865 - RLTR19-int LTR ERVK -3068 3069 2883 5 1327 1264 268 70 31 chr5 97354507 97354992 -55182267 - RLTR19-int LTR ERVK -3281 2856 2353 5 1327 498 165 45 9 chr5 97355515 97355625 -55181634 - RLTR19-int LTR ERVK -3395 2127 2014 5 1327 1069 236 273 20 chr5 97356270 97356783 -55180476 - MTC-int LTR MaLR -163 1095 474 5 1327 288 169 345 12 chr5 97356903 97356987 -55180272 - RLTR19-int LTR ERVK -3658 1864 1753 5 1327 2503 55 39 0 chr5 97357156 97357467 -55179792 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 5 1327 794 257 65 85 chr5 97358215 97358602 -55178657 + RLTR42-int LTR ERVK 1694 2072 -3450 5 1327 989 189 62 10 chr5 97359291 97359499 -55177760 - RLTR19-int LTR ERVK -4179 1343 1125 5 1327 255 276 0 54 chr5 97359616 97359708 -55177551 - RLTR19-int LTR ERVK -5252 885 799 5 1327 449 315 39 91 chr5 97360995 97361281 -55175978 + ORR1E LTR MaLR 70 340 -19 5 1327 425 292 41 0 chr5 97367946 97368093 -55169166 + MLT2B3 LTR ERVL 28 180 -374 5 1327 275 297 31 52 chr5 97368560 97368656 -55168603 + MLT2B3 LTR ERVL 395 488 -66 5 1327 2764 28 28 0 chr5 97376373 97376696 -55160563 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 5 1328 1468 159 106 111 chr5 97388626 97388702 -55148557 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 350 6 1328 1468 159 106 111 chr5 97388847 97389158 -55148101 - ORR1B1 LTR MaLR -45 349 1 6 1328 1279 230 115 93 chr5 97399397 97399805 -55137454 - MTD LTR MaLR -2 417 1 6 1328 919 289 50 23 chr5 97401074 97401417 -55135842 - MLT1A0 LTR MaLR -13 352 1 6 1328 1085 157 399 0 chr5 97401751 97402012 -55135247 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 6 1328 1603 167 56 42 chr5 97404711 97405068 -55132191 + ORR1D1 LTR MaLR 1 362 -12 6 1328 637 291 79 36 chr5 97405088 97405366 -55131893 + MTE2a LTR MaLR 90 379 0 6 1328 3164 134 54 27 chr5 97422864 97423495 -55113764 - RMER6A LTR ERVK 0 756 109 6 1328 359 250 21 42 chr5 97433646 97433724 -55103535 + MLT1A0 LTR MaLR 238 313 -52 7 1328 682 260 52 74 chr5 97438702 97439044 -55098215 - ORR1E LTR MaLR -60 334 1 7 1328 244 258 72 39 chr5 97441574 97441660 -55095599 + ORR1E LTR MaLR 279 375 -4 7 1328 2535 134 24 10 chr5 97454320 97454735 -55082524 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1328 367 228 21 42 chr5 97458730 97458872 -55078387 - RLTR15 LTR ERVK -188 171 33 7 1328 1507 190 67 9 chr5 97473301 97473631 -55063628 - MTD LTR MaLR -5 414 66 7 1328 864 94 0 0 chr5 97481745 97481873 -55055386 - MTB_Mm LTR MaLR -257 150 23 7 1328 4307 159 71 5 chr5 97488239 97488966 -55048293 + RMER12 LTR ERVK 8 764 -558 7 1328 4307 159 71 5 chr5 97489009 97489056 -55048203 + RMER12 LTR ERVK 765 831 -491 7 1328 4307 201 64 58 chr5 97489093 97489372 -55047887 + RMER12 LTR ERVK 832 1156 -166 7 1328 1426 209 39 39 chr5 97492043 97492427 -55044832 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 8 1329 2803 45 6 0 chr5 97530003 97530333 -55006926 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 2 1329 2079 205 29 68 chr5 97542597 97542890 -54994369 + RMER16 LTR ERVK 1 291 -242 4 1329 2079 205 29 68 chr5 97543279 97543540 -54993719 + RMER16 LTR ERVK 292 533 0 4 1329 315 220 23 30 chr5 97547220 97547266 -54989993 - RMER17A LTR ERVK -291 460 414 5 1329 315 220 23 30 chr5 97547455 97547539 -54989720 - RMER17A LTR ERVK -338 413 331 5 1329 550 341 115 7 chr5 97561196 97561474 -54975785 + MLT1C LTR MaLR 65 372 -95 7 1329 633 359 61 23 chr5 97564943 97565261 -54971998 + LTR16D LTR ERVL 263 593 -82 7 1329 456 312 29 29 chr5 97565205 97565380 -54971879 + MTC LTR MaLR 246 420 -1 8 1329 551 284 116 25 chr5 97567181 97567535 -54969724 - MLT1B LTR MaLR 0 390 5 8 1329 1810 155 49 17 chr5 97570735 97571083 -54966176 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 9 1329 717 324 59 18 chr5 97572368 97572707 -54964552 + MLT1D LTR MaLR 5 357 -148 9 1329 1690 163 85 58 chr5 97573735 97574036 -54963223 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 63 9 1329 3213 50 0 20 chr5 97574036 97574444 -54962815 - MTB LTR MaLR 0 400 1 9 1329 1690 163 85 58 chr5 97574444 97574506 -54962753 - ORR1D1 LTR MaLR -312 62 1 9 1329 3410 83 8 21 chr5 97579790 97580271 -54956988 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 1329 1203 251 117 11 chr5 97580939 97581297 -54955962 + MTD LTR MaLR 1 396 -23 1 1329 461 298 138 5 chr5 97593227 97593340 -54943919 - MTEb LTR MaLR -23 356 223 1 1329 461 240 280 19 chr5 97593415 97593595 -54943664 - MTEb LTR MaLR -157 222 1 1 1329 1887 159 82 9 chr5 97598996 97599326 -54937933 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 1329 318 227 54 68 chr5 97607696 97607872 -54929387 + MTC LTR MaLR 243 419 -2 1 1329 1044 329 22 25 chr5 97608363 97608684 -54928575 + MTE2b LTR MaLR 1 320 -59 1 1329 2320 154 40 12 chr5 97608934 97609336 -54927923 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1329 601 245 40 58 chr5 97632537 97632568 -54904691 + MTD LTR MaLR 18 48 -371 1 1329 1849 171 16 63 chr5 97632568 97632949 -54904310 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 1 1329 601 245 40 58 chr5 97632949 97633090 -54904169 + MTD LTR MaLR 49 187 -232 1 1329 797 227 113 0 chr5 97633328 97633531 -54903728 + MTD LTR MaLR 194 419 0 1 1329 1161 228 31 24 chr5 97635912 97636262 -54900997 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 1 1329 762 275 63 138 chr5 97640143 97640540 -54896719 - MTE2a LTR MaLR -1 378 12 2 1330 1578 239 26 62 chr5 97654043 97654439 -54882820 - MTD LTR MaLR -9 410 20 2 1330 1578 239 26 62 chr5 97654464 97654490 -54882769 - MTD LTR MaLR -400 19 3 2 1330 266 256 42 62 chr5 97660477 97660573 -54876686 + MLT1I LTR MaLR 22 115 -296 2 1330 1951 218 39 22 chr5 97661989 97662401 -54874858 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1330 2275 133 17 6 chr5 97669936 97670291 -54866968 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 2 1330 869 250 101 50 chr5 97671704 97672196 -54865063 - RMER4B LTR ERVK -14 571 17 2 1330 615 292 58 61 chr5 97673362 97673639 -54863620 - MLT1E1A LTR MaLR -24 656 381 2 1330 550 247 122 128 chr5 97674493 97674869 -54862390 + MTE2a LTR MaLR 6 379 0 2 1330 282 369 50 28 chr5 97689587 97689768 -54847491 - ORR1E LTR MaLR -169 190 6 2 1330 3292 47 28 10 chr5 97690043 97690432 -54846827 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1330 1749 183 49 35 chr5 97700779 97701124 -54836135 + ORR1B1 LTR MaLR 1 350 -44 2 1330 280 114 68 0 chr5 97702372 97702416 -54834843 + ORR1B1 LTR MaLR 340 386 -8 2 1330 8224 170 105 75 chr5 97702420 97704326 -54832933 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1963 0 2 1330 2372 120 63 39 chr5 97704326 97704709 -54832550 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 2 1330 473 106 0 0 chr5 97710260 97710326 -54826933 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 264 2 1330 1696 129 6 95 chr5 97710645 97710982 -54826277 - ORR1A4 LTR MaLR -57 327 1 2 1330 367 329 114 55 chr5 97713971 97714190 -54823069 + MLT1D LTR MaLR 238 469 -36 3 1330 448 300 127 31 chr5 97724640 97724932 -54812327 + MLT1B LTR MaLR 69 388 -2 3 1330 1401 227 152 77 chr5 97732215 97732688 -54804571 - MT2B LTR ERVL -1 600 87 3 1330 1401 227 152 77 chr5 97732715 97732799 -54804460 - MT2B LTR ERVL -515 86 1 3 1330 416 331 44 50 chr5 97734231 97734335 -54802924 + MER70B LTR ERVL 270 372 -206 3 1330 1962 183 35 23 chr5 97734335 97734732 -54802527 + MTB_Mm LTR MaLR 4 405 -2 3 1330 416 331 44 50 chr5 97734732 97734786 -54802473 + MER70B LTR ERVL 373 427 -151 3 1330 264 234 35 47 chr5 97741739 97741824 -54795435 + MTEa LTR MaLR 278 361 -18 3 1330 325 292 66 0 chr5 97741992 97742098 -54795161 + RMER15 LTR ERVL 258 370 -205 3 1330 530 270 83 35 chr5 97742100 97742269 -54794990 + ORR1C2 LTR MaLR 3 179 -205 3 1330 510 298 59 64 chr5 97744102 97744306 -54792953 - MLT1J-int LTR MaLR -845 542 340 3 1330 3084 80 2 0 chr5 97744496 97744895 -54792364 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1330 1271 177 98 20 chr5 97745043 97745318 -54791941 - ORR1A4 LTR MaLR -36 342 1 3 1330 1201 217 131 45 chr5 97746056 97746369 -54790890 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 31 3 1330 1780 191 50 14 chr5 97747110 97747471 -54789788 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1330 232 356 0 0 chr5 97756245 97756318 -54780941 - LTR16D LTR ERVL -4 647 575 3 1330 2289 88 28 16 chr5 97756742 97757065 -54780194 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1330 351 326 87 15 chr5 97757842 97758038 -54779221 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4198 4407 -1307 3 1330 275 279 29 0 chr5 97758621 97758689 -54778570 + ERVL-B4-int LTR ERVL 5174 5243 -471 3 1330 499 376 39 9 chr5 97759122 97759353 -54777906 + LTR41B LTR ERVL 22 259 -499 3 1330 468 414 40 36 chr5 97760001 97760279 -54776980 + LTR41B LTR ERVL 345 623 -135 3 1330 307 309 85 42 chr5 97766231 97766420 -54770839 + ORR1E LTR MaLR 1 197 -162 3 1330 2108 189 118 21 chr5 97768073 97768555 -54768704 + MT2A LTR ERVL 5 533 0 4 1330 2132 142 87 3 chr5 97769184 97769564 -54767695 + RMER4B LTR ERVK 1 412 -173 4 1330 286 376 0 19 chr5 97774456 97774559 -54762700 + RMER12 LTR ERVK 750 850 -472 4 1330 252 253 116 35 chr5 97774726 97774812 -54762447 + MTEb LTR MaLR 273 365 -14 4 166 3060 49 0 0 chr5 97779553 97779899 -54757360 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1331 15148 48 7 3 chr5 97779900 97781685 -54755574 - ORR1A1-int LTR MaLR -1 1791 1 4 1331 1938 65 0 12 chr5 97781685 97781936 -54755323 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 99 4 1331 1618 246 11 27 chr5 97782758 97783134 -54754125 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1331 890 271 208 20 chr5 97784854 97785221 -54752038 + RLTR16 LTR ERVK 1 437 -68 4 1331 232 298 25 50 chr5 97785277 97785301 -54751958 + RLTR16 LTR ERVK 438 460 -45 4 1331 467 294 149 71 chr5 97801000 97801296 -54735963 - MLT1B LTR MaLR -71 319 1 4 1331 1211 244 158 36 chr5 97806764 97807041 -54730218 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 181 4 1331 1211 244 158 36 chr5 97807521 97807710 -54729549 - RMER5 LTR ERV1 -354 180 1 4 1331 277 306 53 18 chr5 97817752 97817865 -54719394 + MLT1J1 LTR MaLR 1 117 -327 4 1331 278 357 0 35 chr5 97825732 97825848 -54711411 - RMER15 LTR ERVL -105 470 359 4 1331 2284 129 54 3 chr5 97826565 97826938 -54710321 - RLTR19 LTR ERVK -2 497 106 4 1331 5363 146 125 6 chr5 97829355 97830332 -54706927 + RLTR25A LTR ERVK 11 1103 0 4 1331 384 222 83 53 chr5 97831620 97831753 -54705506 + LTR33A LTR ERVL 369 505 -15 5 1331 2879 108 86 0 chr5 97832763 97833172 -54704087 - BGLII_A LTR ERVK -1 444 1 5 1331 402 351 90 36 chr5 97835393 97835646 -54701613 - MLT1E1 LTR MaLR 0 654 387 5 1331 1125 260 54 20 chr5 97835646 97836000 -54701259 - MTE2b LTR MaLR 0 379 5 5 1331 1874 185 56 30 chr5 97836110 97836588 -54700671 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 5 1331 250 307 195 26 chr5 97836606 97836837 -54700422 - MLT1E1 LTR MaLR -378 275 6 5 1331 734 249 55 20 chr5 97836926 97837127 -54700132 + ORR1D2 LTR MaLR 29 236 -134 5 1331 284 234 171 5 chr5 97846379 97846555 -54690704 + LTR40b LTR ERVL 308 519 0 5 1331 334 318 57 50 chr5 97870020 97870185 -54667074 - MLT1C LTR MaLR -39 428 225 5 1331 681 239 251 87 chr5 97872078 97872437 -54664822 - MTD LTR MaLR 0 419 2 5 1331 2443 199 77 74 chr5 97875845 97876533 -54660726 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 1331 5732 62 3 11 chr5 97878707 97879483 -54657776 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 961 -17 5 1331 1047 233 88 82 chr5 97881293 97881714 -54655545 + MT2A LTR ERVL 4 559 -42 5 1331 1625 152 104 27 chr5 97890945 97891283 -54645976 + ORR1B1 LTR MaLR 2 365 -29 5 1331 355 293 58 68 chr5 97892266 97892471 -54644788 - RLTR41 LTR ERV1 -45 401 199 5 1331 997 227 90 18 chr5 97898731 97899063 -54638196 + ORR1E LTR MaLR 4 359 0 5 1331 1837 221 45 25 chr5 97900285 97900515 -54636744 - MTD LTR MaLR -8 411 168 5 1331 2142 174 32 7 chr5 97900515 97900926 -54636333 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1331 1837 221 45 25 chr5 97900926 97901098 -54636161 - MTD LTR MaLR -252 167 1 5 1331 806 219 104 30 chr5 97901494 97901696 -54635563 - MTD LTR MaLR -6 413 197 5 1331 314 192 37 49 chr5 97902243 97902325 -54634934 - MTD LTR MaLR -224 195 115 5 1331 574 256 44 38 chr5 97902367 97902525 -54634734 + MTD LTR MaLR 42 200 -219 5 1331 412 261 99 8 chr5 97902552 97902683 -54634576 + MTD LTR MaLR 277 419 0 5 1331 537 279 69 17 chr5 97904315 97904490 -54632769 - MTD LTR MaLR -218 201 18 6 1331 1850 166 88 6 chr5 97904546 97904897 -54632362 - MTC LTR MaLR -24 397 18 6 1331 1659 194 60 6 chr5 97906648 97906980 -54630279 - MTC LTR MaLR -71 350 1 6 1331 1480 185 33 130 chr5 97908342 97908765 -54628494 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 6 1331 374 234 106 0 chr5 97910227 97910321 -54626938 - MTE2a LTR MaLR -99 280 177 6 1332 1496 212 81 0 chr5 97912071 97912415 -54624844 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 6 1332 1031 274 161 3 chr5 97914242 97914583 -54622676 + MTD LTR MaLR 25 419 0 6 1332 1048 241 132 52 chr5 97916126 97916490 -54620769 + MTD LTR MaLR 5 397 -22 6 1332 2858 39 7 132 chr5 97917127 97917573 -54619686 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 1332 7552 47 0 2 chr5 97917583 97918543 -54618716 + RLTR10-int LTR ERVK 41 998 -989 6 1332 318 232 62 39 chr5 97918607 97918737 -54618522 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 6 1332 8388 22 0 0 chr5 97918819 97919814 -54617445 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 6 1332 2855 39 7 132 chr5 97919816 97920262 -54616997 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 1332 1612 145 187 25 chr5 97923555 97923908 -54613351 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 1332 418 289 106 108 chr5 97926251 97926620 -54610639 + MLT2B4 LTR ERVL 1 368 -188 6 1332 552 250 75 28 chr5 97926890 97927304 -54609955 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 -4 6 1332 649 157 24 7 chr5 97933943 97934033 -54603226 + RMER17C LTR ERVK 1 82 -328 6 1332 1104 115 19 69 chr5 97934054 97934272 -54602987 + RMER17C LTR ERVK 83 410 0 6 1332 1030 199 72 180 chr5 97936801 97937218 -54600041 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 6 1332 2234 160 15 10 chr5 97939996 97940388 -54596871 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1332 322 318 51 62 chr5 97944355 97944603 -54592656 - MLT1E1A LTR MaLR -3 677 387 6 1332 1547 248 65 52 chr5 97945895 97946363 -54590896 + RLTR20B3 LTR ERVK 31 506 -71 6 1332 1547 248 65 52 chr5 97946397 97946447 -54590812 + RLTR20B3 LTR ERVK 507 556 -21 6 1332 272 333 20 0 chr5 97965071 97965170 -54572089 + MER34A1 LTR ERV1 477 577 -10 6 1332 1536 181 43 46 chr5 97965312 97965637 -54571622 + ORR1C1 LTR MaLR 6 329 -49 6 1332 1297 205 148 99 chr5 97965650 97966223 -54571036 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 1332 535 176 78 10 chr5 97968045 97968148 -54569111 + ORR1D1 LTR MaLR 263 372 -2 6 1332 840 154 305 10 chr5 97968196 97968271 -54568988 - ORR1D1 LTR MaLR -100 274 200 6 1332 840 154 305 10 chr5 97968338 97968465 -54568794 - ORR1D1 LTR MaLR -175 199 12 6 1332 1131 179 74 0 chr5 97968472 97968701 -54568558 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1125 6 1332 1669 207 80 115 chr5 97968719 97968810 -54568449 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 425 6 1332 1669 207 80 115 chr5 97968867 97969298 -54567961 - RLTR16 LTR ERVK -81 424 1 6 1332 4176 211 116 26 chr5 97969313 97970324 -54566935 - ORR1D1-int LTR MaLR -267 1103 2 6 1332 659 176 0 0 chr5 97970323 97970431 -54566828 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 267 6 1332 663 247 19 25 chr5 97970424 97970582 -54566677 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 8 6 1332 2116 269 23 23 chr5 97971004 97971526 -54565733 + MTE-int LTR MaLR 934 1455 -125 6 1332 487 275 58 95 chr5 97981415 97981804 -54555455 + RLTR11B LTR ERVK 90 474 -53 7 1332 1047 206 91 30 chr5 97981823 97982053 -54555206 + MTD LTR MaLR 161 404 -15 7 1332 619 306 92 44 chr5 97990874 97991189 -54546070 - MLT1A LTR MaLR 0 374 45 7 1332 319 304 103 7 chr5 98002387 98002533 -54534726 + MLT1J1 LTR MaLR 283 442 -2 7 1332 3066 50 16 0 chr5 98008597 98008979 -54528280 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 1332 1670 239 15 51 chr5 98010017 98010425 -54526834 - MT2A LTR ERVL -81 520 3 1 1332 458 250 60 42 chr5 98010452 98010619 -54526640 + RMER5 LTR ERV1 349 518 -16 1 1332 1735 231 183 58 chr5 98012446 98013169 -54524090 + RLTR40 LTR ERVK 1 813 -4 2 1332 1566 186 114 3 chr5 98020884 98021261 -54515998 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1332 2875 41 3 3 chr5 98032514 98032860 -54504399 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1332 1262 254 57 43 chr5 98040076 98040425 -54496834 - MTD LTR MaLR -65 354 1 5 1333 4111 42 0 12 chr5 98044363 98044486 -54492773 + RLTR1C LTR ERV1 1 123 -380 6 1333 4425 16 0 0 chr5 98044486 98044979 -54492280 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 1333 4111 42 0 12 chr5 98044979 98045364 -54491895 + RLTR1C LTR ERV1 124 503 0 6 1333 4048 158 83 81 chr5 98047300 98047892 -54489367 - RMER19B LTR ERVK -12 890 245 6 1333 4048 158 83 81 chr5 98047989 98048283 -54488976 - RMER19B LTR ERVK -658 244 2 6 1333 1515 170 108 44 chr5 98051220 98051373 -54485886 + ORR1C2 LTR MaLR 19 171 -213 6 1333 1515 170 108 44 chr5 98051446 98051636 -54485623 + ORR1C2 LTR MaLR 172 383 -1 6 1333 1171 267 34 68 chr5 98059725 98060107 -54477152 - MTE2b LTR MaLR 0 379 11 7 1333 3982 111 34 14 chr5 98066382 98066967 -54470292 - MT2B LTR ERVL -4 597 1 8 1333 295 290 79 92 chr5 98069540 98069768 -54467491 + ORR1E LTR MaLR 135 359 0 9 1333 2366 190 15 21 chr5 98072630 98073103 -54464156 + RMER5 LTR ERV1 1 470 -64 1 1333 2271 112 16 0 chr5 98090219 98090541 -54446718 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1333 743 305 98 47 chr5 98113471 98113746 -54423513 + ORR1D2 LTR MaLR 80 368 -2 1 1333 358 281 16 88 chr5 98114959 98115084 -54422175 - MLT1H2 LTR MaLR -26 463 348 1 1333 448 290 109 57 chr5 98119400 98119719 -54417540 - ORR1E LTR MaLR -24 355 1 1 1333 327 314 79 75 chr5 98120197 98120462 -54416797 + MTEa LTR MaLR 1 266 -113 1 1333 379 364 32 19 chr5 98120478 98120635 -54416624 + MT2A LTR ERVL 270 428 -105 1 1333 481 328 62 51 chr5 98125583 98125859 -54411400 + MER74A LTR ERVL 127 405 -153 1 1333 1263 229 66 73 chr5 98128062 98128486 -54408773 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1333 1338 137 259 3 chr5 98130974 98131260 -54405999 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 1333 1225 38 13 6 chr5 98135394 98135552 -54401707 - MTB LTR MaLR 0 400 242 1 1333 1030 54 20 0 chr5 98135552 98135701 -54401558 - MT-int LTR MaLR -946 152 1 1 1333 3398 46 94 0 chr5 98135703 98136137 -54401122 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 1333 2551 105 42 0 chr5 98138762 98139142 -54398117 - MTB LTR MaLR -4 396 1 1 1333 1616 199 65 8 chr5 98139709 98140063 -54397196 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1333 2342 254 97 102 chr5 98140440 98141304 -54395955 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 1 1333 4114 138 57 10 chr5 98141577 98142299 -54394960 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 2 1333 3664 117 87 23 chr5 98148382 98149073 -54388186 + RMER17A LTR ERVK 1 735 -16 2 1333 2940 69 51 0 chr5 98155911 98156302 -54380957 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 1333 233 333 78 107 chr5 98157055 98157297 -54379962 + ORR1D2 LTR MaLR 87 321 -49 2 1333 428 255 42 36 chr5 98161304 98161471 -54375788 - RMER15 LTR ERVL -77 498 331 2 1333 2220 171 102 73 chr5 98162838 98163387 -54373872 - RMER2 LTR ERV1 -2 565 1 2 1334 1033 219 10 19 chr5 98184034 98184243 -54353016 + ORR1B2 LTR MaLR 70 276 -91 2 1334 948 112 0 15 chr5 98184224 98184360 -54352899 - ORR1A1 LTR MaLR -72 274 141 2 1334 1262 311 22 34 chr5 98185532 98185942 -54351317 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1334 400 241 0 12 chr5 98193324 98193408 -54343851 - ORR1D1 LTR MaLR -268 106 24 2 1334 1662 173 24 3 chr5 98193397 98193687 -54343572 - MT2A LTR ERVL -74 459 164 2 1334 1184 275 4 11 chr5 98193681 98193953 -54343306 - ORR1D1 LTR MaLR -101 273 4 2 1334 3024 163 94 38 chr5 98201997 98202971 -54334288 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 1 2 1334 1237 223 77 49 chr5 98203443 98203824 -54333435 + RMER10A LTR ERVL 22 413 -29 2 1334 2437 117 55 81 chr5 98204021 98204516 -54332743 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1334 518 349 115 57 chr5 98215586 98216109 -54321150 - MLT2B3 LTR ERVL 0 554 2 3 1334 1760 233 26 33 chr5 98232649 98233071 -54304188 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1334 3269 37 25 0 chr5 98234338 98234739 -54302520 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 3 1334 484 312 149 8 chr5 98236225 98236467 -54300792 + MLT1B LTR MaLR 50 325 -65 3 1334 7571 147 64 6 chr5 98247358 98248732 -54288527 - ORR1A2-int LTR MaLR -527 1436 1 3 1334 2261 106 6 15 chr5 98248735 98249062 -54288197 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 3 1334 612 298 55 75 chr5 98252039 98252347 -54284912 - LTR86A1 LTR ERVL -16 497 196 3 1334 351 335 131 61 chr5 98252338 98252650 -54284609 + MLT1D LTR MaLR 8 341 -164 3 1334 2168 86 86 0 chr5 98252907 98253208 -54284051 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1334 401 357 84 80 chr5 98267317 98267569 -54269690 + MLT1G3 LTR MaLR 70 357 -238 3 1334 3337 135 147 5 chr5 98267953 98268558 -54268701 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 1 3 1334 1259 117 297 71 chr5 98269050 98269316 -54267943 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 3 1334 266 274 55 77 chr5 98269483 98269574 -54267685 + MTEb LTR MaLR 9 97 -262 3 1334 394 301 44 76 chr5 98269626 98269784 -54267475 + MTEb LTR MaLR 219 371 -8 3 1334 764 279 125 95 chr5 98272841 98272885 -54264374 - ORR1E LTR MaLR -6 353 317 3 1334 764 279 125 95 chr5 98272912 98273204 -54264055 - ORR1E LTR MaLR -43 316 8 3 1334 325 330 11 0 chr5 98275439 98275533 -54261726 + MTE2b LTR MaLR 8 102 -277 3 1334 837 284 64 40 chr5 98275544 98275841 -54261418 + MTE2b LTR MaLR 75 378 -1 3 1334 791 243 89 9 chr5 98282121 98282345 -54254914 - ORR1D1 LTR MaLR -91 283 42 4 1334 249 206 52 52 chr5 98285442 98285519 -54251740 - MTE2a LTR MaLR -30 349 273 4 1334 3758 169 30 10 chr5 98300937 98301626 -54235633 + RMER6D LTR ERVK 18 720 0 4 1335 518 335 26 11 chr5 98340606 98340733 -54196526 - MLT1A0 LTR MaLR -16 374 217 4 1335 518 360 67 17 chr5 98340962 98341165 -54196094 - MLT1A0 LTR MaLR -149 216 3 4 1335 561 63 1 4 chr5 98369234 98369313 -54167946 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 298 5 1335 3168 76 2 0 chr5 98384664 98385070 -54152189 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1335 503 256 117 112 chr5 98386480 98386732 -54150527 - MLT1D LTR MaLR -8 497 204 5 1335 364 293 189 21 chr5 98388609 98388967 -54148292 + MLT1E2 LTR MaLR 1 403 -102 5 1335 1366 188 24 133 chr5 98395763 98396223 -54141036 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 1335 770 273 134 46 chr5 98407396 98407791 -54129468 - MER57F LTR ERV1 -6 430 1 5 1335 268 196 39 158 chr5 98415064 98415191 -54122068 + MT2A LTR ERVL 165 276 -257 5 1335 628 198 9 0 chr5 98425943 98426059 -54111200 - MTD LTR MaLR -302 117 1 5 166 316 175 48 0 chr5 98435035 98435098 -54102161 - RLTR21 LTR ERVK -155 1417 1352 6 1336 1326 41 12 6 chr5 98435094 98435267 -54101992 + LTRIS2 LTR ERV1 391 564 0 6 1336 225 0 0 0 chr5 98435260 98435287 -54101972 + RLTR6_Mm LTR ERV1 613 639 -15 6 1336 619 95 0 2 chr5 98435482 98435586 -54101673 + MuRRS4-int LTR ERV1 139 288 -3011 6 1336 881 157 61 17 chr5 98435938 98436119 -54101140 + RMER16-int LTR ERVK 142 330 -5076 6 1336 3813 138 90 18 chr5 98436104 98436815 -54100444 + RMER16-int LTR ERVK 683 1444 -3962 6 1336 960 213 127 22 chr5 98436806 98437269 -54099990 + MuRRS4-int LTR ERV1 760 1271 -3792 6 1336 5738 136 78 51 chr5 98442370 98443451 -54093808 - RMER12 LTR ERVK -201 1121 12 6 1336 226 340 144 0 chr5 98464483 98464580 -54072679 - LTR16A LTR ERVL -98 353 243 6 1336 510 352 39 60 chr5 98465684 98465968 -54071291 - MLT1A0 LTR MaLR -82 283 6 6 1336 1303 185 140 0 chr5 98466116 98466381 -54070878 - MTC LTR MaLR -22 399 98 6 1336 1603 218 138 41 chr5 98466382 98466846 -54070413 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 19 6 1336 626 129 10 0 chr5 98466860 98466961 -54070298 - MTC LTR MaLR -319 102 1 6 1336 227 233 0 0 chr5 98469391 98469434 -54067825 + ORR1C2 LTR MaLR 3 45 -339 6 1336 2798 172 23 26 chr5 98469434 98470102 -54067157 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 559 -2 6 1336 1547 219 72 44 chr5 98470240 98470307 -54066952 + RMER3D-int LTR ERVK 1 65 -2777 6 1336 4736 194 56 99 chr5 98470536 98472232 -54065027 + RMER3D-int LTR ERVK 66 2029 -813 6 1336 278 305 29 41 chr5 98478488 98478659 -54058600 + RMER17D LTR ERVK 378 546 -343 6 1336 1007 172 65 15 chr5 98478554 98478755 -54058504 + ORR1C2 LTR MaLR 174 384 0 6 1336 1235 281 68 13 chr5 98479626 98480023 -54057236 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1336 3436 55 2 2 chr5 98487671 98488071 -54049188 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1336 1148 95 0 34 chr5 98490147 98490322 -54046937 - MTB LTR MaLR 0 400 232 6 1336 1939 100 25 4 chr5 98491570 98491851 -54045408 + ORR1A2 LTR MaLR 1 287 -40 7 1336 425 86 0 0 chr5 98493343 98493401 -54043858 + ORR1A2 LTR MaLR 269 326 0 7 1336 555 191 112 47 chr5 98498378 98498532 -54038727 - RMER20B LTR ERVK -357 159 1 7 1336 448 246 70 63 chr5 98503098 98503213 -54034046 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 252 1 1336 4629 16 0 12 chr5 98503213 98503712 -54033547 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1336 448 257 70 63 chr5 98503712 98503755 -54033504 - MLT1A0 LTR MaLR -114 294 220 1 1336 265 339 39 23 chr5 98510326 98510456 -54026803 + MLT1L LTR MaLR 344 475 -135 1 1336 2563 133 190 124 chr5 98510947 98511520 -54025739 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1336 328 266 20 41 chr5 98514686 98514784 -54022475 - LTR16E1 LTR ERVL -19 519 424 2 1336 240 267 110 9 chr5 98537411 98537522 -53999737 + MLT1A1 LTR MaLR 4 126 -239 5 1336 876 241 36 16 chr5 98538033 98538227 -53999032 + RLTR18B LTR ERVK 5 202 -310 5 1336 1375 270 55 14 chr5 98538321 98538685 -53998574 + RLTR18B LTR ERVK 134 512 0 5 1336 398 255 63 14 chr5 98538685 98538809 -53998450 + MLT1A1 LTR MaLR 278 408 0 5 1336 1201 287 6 65 chr5 98541404 98541758 -53995501 + MTE2a LTR MaLR 46 378 -1 5 1336 3470 39 23 0 chr5 98548005 98548392 -53988867 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1336 286 336 106 30 chr5 98551908 98552190 -53985069 - MLT1H1 LTR MaLR -16 544 238 7 1336 274 347 0 10 chr5 98554739 98554838 -53982421 + HERV16-int LTR ERVL 1660 1757 -3239 7 1336 430 361 50 36 chr5 98555433 98555654 -53981605 + LTR16C LTR ERVL 1 224 -265 8 1336 729 240 191 4 chr5 98556555 98556806 -53980453 - RLTR11A2 LTR ERVK -229 298 1 8 1336 1986 185 26 23 chr5 98556808 98557235 -53980024 - MYSERV-int LTR ERVK -2 6548 6121 8 1336 1138 272 80 19 chr5 98560672 98561036 -53976223 - RLTR18B LTR ERVK -6 506 121 9 1336 782 262 0 16 chr5 98561041 98561227 -53976032 - RLTR18B LTR ERVK -321 191 9 9 1336 376 303 92 61 chr5 98565259 98565586 -53971673 - LTR84a LTR ERVL -407 350 14 9 20 737 282 120 37 chr5 98566140 98566490 -53970769 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 9 1337 571 324 72 51 chr5 98570731 98571313 -53965946 - MLT1-int LTR MaLR -592 779 66 1 1337 589 286 96 11 chr5 98571313 98571500 -53965759 + LTR55 LTR ERV 1 203 -345 1 1337 1201 234 74 31 chr5 98575941 98576267 -53960992 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 31 1 1337 278 248 73 123 chr5 98579357 98579536 -53957723 + MTEb LTR MaLR 202 371 -8 1 1337 1007 315 113 51 chr5 98579544 98580189 -53957070 + MTEb-int LTR MaLR 1 685 -895 1 1337 387 318 113 53 chr5 98580462 98580764 -53956495 + MTEa LTR MaLR 55 374 -5 1 1337 288 234 11 19 chr5 98584255 98584335 -53952924 - MTD LTR MaLR -259 162 86 1 1337 1539 209 79 3 chr5 98584451 98584806 -53952453 - MTD LTR MaLR -18 401 20 1 1337 398 167 0 119 chr5 98590234 98590343 -53946916 - RMER20B LTR ERVK 0 627 532 1 1337 493 254 8 0 chr5 98590320 98590438 -53946821 - RMER20B LTR ERVK -507 120 2 1 1337 1140 249 28 14 chr5 98591139 98591424 -53945835 + MTE2b LTR MaLR 63 351 -28 1 1337 260 136 0 0 chr5 98591592 98591636 -53945623 + MTE2b LTR MaLR 335 378 -1 1 1337 253 316 92 25 chr5 98591761 98591881 -53945378 - MLT1A1 LTR MaLR -278 130 3 1 1337 2869 72 3 0 chr5 98593906 98594297 -53942962 - MTB LTR MaLR -8 392 1 1 1337 580 306 56 39 chr5 98626657 98627017 -53910242 + MLT1B LTR MaLR 18 383 -7 1 1337 3081 80 8 2 chr5 98629469 98629871 -53907388 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 4 1 1337 2125 122 41 41 chr5 98633739 98634106 -53903153 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1337 57611 18 7 10 chr5 98634106 98640594 -53896665 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 1337 2125 122 41 41 chr5 98640594 98640961 -53896298 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1337 2289 137 105 0 chr5 98648770 98649151 -53888108 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1337 3545 47 62 5 chr5 98657125 98657574 -53879685 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1337 1210 220 134 33 chr5 98664117 98664483 -53872776 + RMER20B LTR ERVK 10 412 -215 2 1337 399 234 150 14 chr5 98664721 98664868 -53872391 + RMER20B LTR ERVK 401 567 -60 2 1337 262 167 147 29 chr5 98664870 98664926 -53872333 + RMER20B LTR ERVK 528 582 -45 2 1337 262 167 147 29 chr5 98664950 98664961 -53872298 + RMER20B LTR ERVK 583 601 -26 2 1337 1736 214 5 44 chr5 98666035 98666425 -53870834 + MTD LTR MaLR 31 405 -14 2 1337 297 239 31 42 chr5 98679159 98679255 -53858004 - MLT1A LTR MaLR -17 357 263 2 1337 272 301 83 70 chr5 98679267 98679424 -53857835 - MLT1A LTR MaLR -166 199 41 2 1338 273 271 40 67 chr5 98711743 98711893 -53825366 - RMER17C LTR ERVK -103 307 162 3 1338 1532 58 5 5 chr5 98713805 98714013 -53823246 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 199 3 1338 853 175 60 53 chr5 98728065 98728330 -53808929 - RMER17C LTR ERVK -55 355 89 3 1338 1039 285 79 77 chr5 98728787 98729319 -53807940 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 3 1338 4995 167 29 29 chr5 98731191 98732099 -53805160 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 3 1338 1311 213 106 0 chr5 98741365 98741666 -53795593 + ORR1D1 LTR MaLR 42 374 0 3 1338 2277 130 0 6 chr5 98742496 98742836 -53794423 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 3 1338 8791 167 78 38 chr5 98742836 98744093 -53793166 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 466 3 1338 8791 167 78 38 chr5 98744282 98744746 -53792513 - ORR1A1-int LTR MaLR -1327 465 1 3 1338 2038 131 16 0 chr5 98744750 98745064 -53792195 - ORR1A1 LTR MaLR -8 319 1 3 1338 2904 71 5 5 chr5 98747461 98747857 -53789402 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1338 4382 85 3 5 chr5 98747857 98748460 -53788799 - MTB-int LTR MaLR -496 602 1 3 1338 3004 70 41 15 chr5 98748460 98748850 -53788409 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1338 1267 85 6 6 chr5 98751377 98751555 -53785704 - MTA_Mm LTR MaLR -218 178 1 3 1338 2780 67 0 0 chr5 98752869 98753196 -53784063 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1338 3269 80 2 0 chr5 98754065 98754464 -53782795 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1338 1584 201 84 77 chr5 98760148 98760474 -53776785 - RLTR20A LTR ERVK -97 444 117 3 1338 1584 201 84 77 chr5 98760622 98760736 -53776523 - RLTR20A LTR ERVK -425 116 2 3 1338 838 234 87 49 chr5 98772778 98773124 -53764135 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 4 1338 360 371 81 20 chr5 98776888 98777086 -53760173 - MLT1E3 LTR MaLR -125 499 290 4 1338 322 256 11 44 chr5 98777105 98777195 -53760064 - MLT1E3 LTR MaLR -416 211 125 4 1338 446 279 8 5 chr5 98778679 98778828 -53758431 + ORR1D2 LTR MaLR 25 171 -207 4 1338 763 211 172 0 chr5 98779424 98779628 -53757631 + ORR1D2 LTR MaLR 132 370 0 4 1338 2397 189 71 43 chr5 98780842 98781352 -53755907 - RLTR11A LTR ERVK -4 524 1 4 1338 1998 97 94 63 chr5 98785131 98785450 -53751809 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1338 4219 178 72 46 chr5 98785450 98786940 -53750319 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1792 1 4 1338 2145 123 40 40 chr5 98786940 98787269 -53749990 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1338 2033 149 62 0 chr5 98806340 98806398 -53730861 - MTC LTR MaLR -44 377 315 4 1338 2033 149 62 0 chr5 98806459 98806755 -53730504 - MTC LTR MaLR -107 314 3 4 1338 2537 71 12 9 chr5 98808485 98808811 -53728448 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1338 1752 339 74 89 chr5 98815754 98817079 -53720180 + MLT1J-int LTR MaLR 11 1315 -72 4 1338 292 321 0 0 chr5 98821555 98821639 -53715620 - LTR40b LTR ERVL -4 458 375 4 1338 357 250 30 30 chr5 98823477 98823609 -53713650 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 299 4 1338 3148 144 133 59 chr5 98823890 98824515 -53712744 - RLTR19-int LTR ERVK -4931 1206 527 4 1338 3148 144 133 59 chr5 98824557 98824644 -53712615 - RLTR19-int LTR ERVK -5611 526 441 4 1339 330 308 79 25 chr5 98829752 98829955 -53707304 + LTR86B2 LTR ERVL 269 482 -5 4 1339 2431 133 36 49 chr5 98833508 98833958 -53703301 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 444 -140 5 1339 713 223 59 45 chr5 98834128 98834349 -53702910 + RMER3D-int LTR ERVK 149 372 -2470 5 1339 872 291 45 11 chr5 98836686 98836954 -53700305 - RMER15 LTR ERVL -5 570 294 5 1339 404 306 183 19 chr5 98837757 98838010 -53699249 - MLT1B LTR MaLR -18 372 78 5 1339 2526 138 98 18 chr5 98840899 98841348 -53695911 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 485 -42 5 1339 6163 125 39 23 chr5 98841521 98842464 -53694795 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 5 1339 1599 132 41 4 chr5 98842763 98843029 -53694230 + RMER6C LTR ERVK 415 690 0 5 1339 400 203 250 0 chr5 98847938 98847981 -53689278 - MT2B LTR ERVL 0 601 545 5 1339 400 203 250 0 chr5 98848059 98848143 -53689116 - MT2B LTR ERVL -57 544 443 5 1339 1373 254 99 10 chr5 98855860 98856245 -53681014 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1339 694 276 119 37 chr5 98857040 98857334 -53679925 - MER57F LTR ERV1 -16 420 103 5 1339 1965 168 76 3 chr5 98860572 98860913 -53676346 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 5 1339 328 261 83 16 chr5 98861364 98861485 -53675774 + ORR1E LTR MaLR 9 137 -222 5 1339 1130 283 55 19 chr5 98872696 98873060 -53664199 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 5 1339 1017 233 42 113 chr5 98883591 98883997 -53653262 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 5 1339 1943 199 9 65 chr5 98891807 98892253 -53645006 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1339 660 127 82 0 chr5 98892253 98892363 -53644896 + MTC-int LTR MaLR 1 119 -1139 5 1339 853 283 156 20 chr5 98892362 98892715 -53644544 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 5 1339 662 320 81 3 chr5 98892729 98893014 -53644245 + MTD-int LTR MaLR 3 309 -1271 5 1339 905 312 98 65 chr5 98893006 98893258 -53644001 + MTD-int LTR MaLR 780 933 -647 5 1339 946 283 70 48 chr5 98893287 98893628 -53643631 + MTC-int LTR MaLR 676 1290 -290 5 1339 946 281 69 50 chr5 98893651 98893766 -53643493 + MTC-int LTR MaLR 985 1106 -152 5 1339 598 316 85 139 chr5 98893789 98893875 -53643384 + MTD-int LTR MaLR 991 1092 -6 5 1339 1229 247 96 22 chr5 98893882 98894217 -53643042 + MTD LTR MaLR 2 358 -63 5 1339 1229 235 97 19 chr5 98894246 98894294 -53642965 + MTD LTR MaLR 356 404 -15 5 1339 1326 201 171 112 chr5 98895131 98895569 -53641690 + MT2A LTR ERVL 2 465 -68 5 1339 248 276 81 121 chr5 98904009 98904207 -53633052 - MLT1F1 LTR MaLR -154 415 226 6 1339 547 285 32 55 chr5 98910632 98910851 -53626408 + RLTR26 LTR ERVK 124 337 -305 6 1339 2883 170 2 19 chr5 98912130 98912664 -53624595 + RLTR12B LTR ERVK 1 525 -3 6 1339 2011 174 18 50 chr5 98915712 98916111 -53621148 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 1339 2663 63 3 0 chr5 98925517 98925848 -53611411 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 6 1339 1011 210 48 16 chr5 98931263 98931492 -53605767 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 149 6 1339 864 168 65 0 chr5 98931574 98931729 -53605530 - ORR1C2 LTR MaLR -190 194 30 6 1339 254 302 57 23 chr5 98931842 98931930 -53605329 + ORR1E LTR MaLR 269 359 0 6 1339 491 271 135 27 chr5 98935729 98936030 -53601229 + MTEb LTR MaLR 4 376 -3 6 1339 2131 183 114 37 chr5 98941894 98942383 -53594876 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1339 1436 135 199 21 chr5 98942537 98942863 -53594396 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 185 6 1339 306 351 103 7 chr5 98943988 98944143 -53593116 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 839 1008 -60 6 1339 895 92 0 26 chr5 98949500 98949656 -53587603 + RMER17B LTR ERVK 312 463 -495 6 1339 334 297 33 17 chr5 98951168 98951288 -53585971 - MTEa LTR MaLR -2 377 256 6 1340 1495 221 69 18 chr5 98969254 98969586 -53567673 - MTD LTR MaLR -70 349 1 6 1340 2154 245 97 48 chr5 98969586 98970276 -53566983 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 535 6 1340 1284 229 64 3 chr5 98971948 98972310 -53564949 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 6 1340 2200 169 21 5 chr5 98974456 98974836 -53562423 + ORR1B1 LTR MaLR 1 388 -6 6 1340 2767 141 10 40 chr5 98979981 98980461 -53556798 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 6 1340 326 301 218 16 chr5 98981078 98981388 -53555871 - MLT1A0 LTR MaLR 0 374 1 6 1340 4442 168 43 82 chr5 98997737 98998674 -53538585 + RMER19B LTR ERVK 3 902 0 7 1340 353 322 118 55 chr5 99013481 99013770 -53523489 - MLT1J1 LTR MaLR -127 317 11 1 1340 396 372 21 38 chr5 99029333 99029568 -53507691 - RMER15 LTR ERVL -70 505 275 3 1340 544 327 150 44 chr5 99030419 99030811 -53506448 - MLT1E3 LTR MaLR 0 624 196 3 1340 939 242 67 111 chr5 99031862 99032178 -53505081 + MT2A LTR ERVL 1 302 -231 4 1340 1386 274 51 0 chr5 99033804 99034154 -53503105 - MTEa LTR MaLR -8 371 4 4 1340 352 353 83 14 chr5 99044880 99045102 -53492157 + MLT1F2 LTR MaLR 1 224 -324 5 1340 399 303 111 43 chr5 99045130 99045337 -53491922 + MLT1F2 LTR MaLR 340 560 0 5 1340 329 380 26 62 chr5 99049336 99049563 -53487696 - MTEa LTR MaLR -157 222 4 5 1340 609 277 54 6 chr5 99054846 99055013 -53482246 + ORR1D1 LTR MaLR 1 175 -199 6 1340 359 325 8 8 chr5 99061492 99061610 -53475649 + MLT1D LTR MaLR 364 481 -24 7 1340 1468 213 82 3 chr5 99064342 99064671 -53472588 - MTD LTR MaLR 0 419 65 8 1340 279 175 35 0 chr5 99070878 99070935 -53466324 - MTD LTR MaLR -342 77 19 8 1340 503 327 60 124 chr5 99080161 99080541 -53456718 - MLT1E3 LTR MaLR -10 643 288 9 1340 251 337 47 0 chr5 99080614 99080700 -53456559 - MLT1E3 LTR MaLR -570 110 21 9 1340 1129 314 103 14 chr5 99080720 99081224 -53456035 - MLT1E3-int LTR MaLR -40 1449 901 9 1340 239 320 50 10 chr5 99081505 99081606 -53455653 + ORR1E LTR MaLR 253 357 -2 9 1340 305 352 40 85 chr5 99081724 99081901 -53455358 - MLT1E3-int LTR MaLR -585 904 736 9 1340 250 331 18 74 chr5 99082178 99082341 -53454918 - MLT1E3-int LTR MaLR -1110 379 226 9 1340 733 206 78 218 chr5 99082829 99083264 -53453995 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1340 245 315 0 0 chr5 99083268 99083322 -53453937 + ORR1D1-int LTR MaLR 5 58 -1312 1 1340 5849 220 25 40 chr5 99083365 99084437 -53452822 + ORR1D1-int LTR MaLR 47 1083 -287 1 1340 5849 220 25 40 chr5 99084462 99084734 -53452525 + ORR1D1-int LTR MaLR 1084 1370 0 1 1340 892 200 126 3 chr5 99084736 99084964 -53452295 + ORR1D1 LTR MaLR 3 367 0 1 1340 2977 64 20 18 chr5 99089486 99089885 -53447374 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1341 888 301 30 134 chr5 99093942 99094510 -53442749 + RLTR18B LTR ERVK 3 511 -1 1 1341 2759 52 9 0 chr5 99095897 99096240 -53441019 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1341 1504 217 86 9 chr5 99103473 99103821 -53433438 + ORR1C1 LTR MaLR 1 375 -3 1 1341 4818 216 52 31 chr5 99110305 99111436 -53425823 + ORR1D1-int LTR MaLR 216 1370 0 1 1341 1133 216 58 116 chr5 99111436 99111833 -53425426 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1341 245 279 0 34 chr5 99117029 99117118 -53420141 - MTEb LTR MaLR -20 359 274 1 1341 3469 23 2 0 chr5 99117659 99118054 -53419205 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1341 765 321 87 46 chr5 99120947 99121336 -53415923 + MLT1C LTR MaLR 61 465 -2 1 1341 622 327 110 48 chr5 99126741 99126818 -53410441 + LTR16A LTR ERVL 89 176 -275 1 1341 622 327 110 48 chr5 99126850 99127109 -53410150 + LTR16A LTR ERVL 177 446 -5 1 1341 467 301 41 74 chr5 99130373 99130617 -53406642 - ORR1E LTR MaLR -123 236 1 1 1341 2348 160 68 67 chr5 99149329 99149885 -53387374 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 1 1 1341 307 219 31 0 chr5 99150909 99150973 -53386286 - ORR1C1 LTR MaLR -310 68 3 1 1341 541 392 34 50 chr5 99153879 99154319 -53382940 + MLT1D LTR MaLR 65 497 -8 1 1341 2519 149 10 0 chr5 99176706 99177096 -53360163 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1341 236 239 60 0 chr5 99177969 99178036 -53359223 - MTE2a LTR MaLR -14 365 295 2 1341 544 246 56 40 chr5 99178130 99178336 -53358923 - MTE2a LTR MaLR -136 283 58 2 1341 851 298 54 17 chr5 99199429 99199723 -53337536 - ORR1E LTR MaLR -42 317 13 2 1341 1460 168 95 70 chr5 99211854 99212212 -53325047 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1342 565 311 78 51 chr5 99221760 99222213 -53315046 + RMER20B LTR ERVK 1 477 -39 2 1342 478 258 11 119 chr5 99226389 99226530 -53310729 - MER31-int LTR ERV1 -834 4102 3978 3 1342 478 258 11 119 chr5 99226716 99226759 -53310500 - MER31-int LTR ERV1 -959 3977 3938 3 1342 375 273 122 28 chr5 99229525 99229706 -53307553 - LTR37A LTR ERV1 -2 424 227 3 1342 689 288 172 56 chr5 99231924 99232091 -53305168 + MTEb LTR MaLR 2 156 -223 3 1342 689 288 172 56 chr5 99232168 99232337 -53304922 + MTEb LTR MaLR 157 377 -2 3 1342 2988 63 65 5 chr5 99232343 99232727 -53304532 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1342 3610 140 44 10 chr5 99233453 99234038 -53303221 + RLTR17 LTR ERVK 88 692 0 3 1342 304 226 65 53 chr5 99235325 99235498 -53301761 - MLT1B LTR MaLR -14 376 172 3 1342 1472 172 22 74 chr5 99241919 99242185 -53295074 + ORR1C2 LTR MaLR 1 245 -149 3 1342 3194 51 0 0 chr5 99242215 99242567 -53294692 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 3 354 -3 3 1342 1472 155 20 57 chr5 99242567 99242725 -53294534 + ORR1C2 LTR MaLR 235 383 -1 3 1342 1161 279 24 10 chr5 99243724 99244017 -53293242 - MTD LTR MaLR -122 297 1 3 1342 929 236 19 158 chr5 99244017 99244480 -53292779 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 860 3 1342 2310 189 77 70 chr5 99245273 99246037 -53291222 + RMER19B LTR ERVK 10 890 -12 3 1342 1285 191 63 40 chr5 99247164 99247415 -53289844 + RMER17C LTR ERVK 1 385 -424 3 1342 1285 173 75 25 chr5 99247464 99247620 -53289639 + RMER17C LTR ERVK 219 378 -32 3 1342 278 282 0 56 chr5 99254938 99255028 -53282231 + MT2B LTR ERVL 173 257 -344 3 1342 286 295 27 54 chr5 99260714 99260825 -53276434 - MLT1B LTR MaLR -35 355 248 3 1342 418 303 96 112 chr5 99269536 99269848 -53267411 + MLT2C2 LTR ERVL 22 328 -136 3 1342 721 287 102 94 chr5 99278277 99278377 -53258882 + MLT1E3 LTR MaLR 140 214 -410 3 1342 721 287 102 94 chr5 99278416 99278795 -53258464 + MLT1E3 LTR MaLR 215 623 -1 3 1342 288 282 116 34 chr5 99279739 99279886 -53257373 - RMER15 LTR ERVL -46 529 371 3 1342 1979 170 61 82 chr5 99294296 99294626 -53242633 - MTC LTR MaLR 0 421 99 4 1342 1979 170 61 82 chr5 99294772 99294869 -53242390 - MTC LTR MaLR -323 98 4 4 1342 3409 38 3 0 chr5 99314745 99315137 -53222122 + MTA_Mm LTR MaLR 1 393 -3 4 1342 8928 46 10 1 chr5 99315139 99316224 -53221035 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1095 -3 4 1342 2189 55 3 0 chr5 99316224 99316514 -53220745 + MTA_Mm LTR MaLR 106 396 0 4 1342 677 202 144 46 chr5 99321675 99322004 -53215255 - RMER6B LTR ERVK 0 461 23 4 1342 1817 146 23 61 chr5 99324878 99325220 -53212039 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1342 1104 268 123 5 chr5 99337857 99338228 -53199031 - MTD LTR MaLR -14 405 1 4 1342 663 288 60 19 chr5 99345597 99345813 -53191446 + ORR1E LTR MaLR 11 235 -124 4 1342 2175 213 61 16 chr5 99346211 99346702 -53190557 + RMER5 LTR ERV1 1 513 -21 4 1342 1402 330 162 50 chr5 99346888 99347317 -53189942 + MTE-int LTR MaLR 5 487 -1093 4 1342 1402 330 162 50 chr5 99347341 99347824 -53189435 + MTE-int LTR MaLR 488 1018 -562 4 1342 4139 144 46 37 chr5 99347825 99348200 -53189059 + RLTR25B LTR ERVK 1 386 -642 4 1342 4139 144 46 37 chr5 99348243 99348633 -53188626 + RLTR25B LTR ERVK 387 773 -255 4 1342 1727 165 84 78 chr5 99348650 99349032 -53188227 + RLTR41 LTR ERV1 62 445 -1 4 1342 827 211 26 143 chr5 99349374 99349640 -53187619 + RLTR25B LTR ERVK 792 1026 -2 4 1342 2889 63 39 5 chr5 99349637 99350022 -53187237 + MTB LTR MaLR 3 400 0 4 1342 903 269 125 61 chr5 99350034 99350331 -53186928 + MTE-int LTR MaLR 909 1322 -258 4 1343 437 313 70 39 chr5 99357366 99357601 -53179658 + MLT1G-int LTR MaLR 1163 1457 -32 4 1343 592 337 62 8 chr5 99357602 99357859 -53179400 + MLT1G LTR MaLR 3 273 -318 4 1343 815 227 72 11 chr5 99370840 99371117 -53166142 + MTD LTR MaLR 3 419 0 5 1343 296 241 143 50 chr5 99373366 99373506 -53163753 + MLT1A LTR MaLR 218 370 -4 5 1343 260 351 88 61 chr5 99373682 99373979 -53163280 + ORR1E LTR MaLR 54 358 -1 5 1343 1429 254 35 19 chr5 99385046 99385419 -53151840 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 1343 1503 208 109 9 chr5 99387371 99387711 -53149548 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1343 1605 204 51 15 chr5 99387711 99388044 -53149215 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 345 -1025 5 1343 3164 191 70 93 chr5 99388038 99388625 -53148634 + ORR1D1-int LTR MaLR 553 1115 -255 5 1343 3164 191 70 93 chr5 99388773 99389022 -53148237 + ORR1D1-int LTR MaLR 1116 1370 0 5 1343 1223 194 147 14 chr5 99389023 99389316 -53147943 + ORR1D1 LTR MaLR 5 336 -38 5 1343 2208 133 3 6 chr5 99396949 99397274 -53139985 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 5 1343 585 344 61 69 chr5 99411595 99412057 -53125202 - MLT1E3 LTR MaLR 0 624 167 5 1343 331 329 146 33 chr5 99412528 99412679 -53124580 + MLT1J1 LTR MaLR 233 400 -44 5 1343 345 276 77 62 chr5 99414889 99415098 -53122161 - RMER10A LTR ERVL -16 426 215 5 1343 2094 198 28 2 chr5 99430414 99430810 -53106449 - MTD LTR MaLR -13 406 1 5 1343 392 263 22 14 chr5 99437550 99437689 -53099570 - MER70-int LTR ERVL -482 4541 4402 5 1343 626 280 112 80 chr5 99442729 99442939 -53094320 + MLT1E1A LTR MaLR 283 496 -184 6 1343 626 280 112 80 chr5 99443141 99443295 -53093964 + MLT1E1A LTR MaLR 497 659 -21 6 1343 1809 142 4 181 chr5 99443315 99443813 -53093446 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 1343 419 351 109 28 chr5 99468048 99468470 -53068789 - MLT1L LTR MaLR -23 587 132 6 1343 341 327 85 85 chr5 99470826 99471180 -53066079 + ORR1E LTR MaLR 5 358 -1 6 1343 394 340 126 28 chr5 99471584 99471974 -53065285 + LTR16D LTR ERVL 222 649 -2 6 1343 307 364 100 40 chr5 99482050 99482299 -53054960 - MLT1C LTR MaLR -4 463 200 6 1344 536 232 159 13 chr5 99490058 99490215 -53047044 - MTE2a LTR MaLR 0 379 200 6 1344 307 352 150 5 chr5 99490764 99490964 -53046295 + MLT1H LTR MaLR 71 299 -250 6 1344 441 309 22 87 chr5 99491421 99491697 -53045562 - MLT1B LTR MaLR -132 258 1 6 1344 2400 100 158 2 chr5 99494430 99494841 -53042418 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1344 2081 114 9 12 chr5 99498995 99499332 -53037927 + ORR1A1 LTR MaLR 3 338 -8 6 1344 771 287 74 36 chr5 99499565 99499930 -53037329 + MLT1B LTR MaLR 1 379 -11 6 1344 3571 96 65 74 chr5 99504922 99505493 -53031766 + RMER2 LTR ERV1 1 566 -1 5 1344 401 243 133 4 chr5 99511306 99511420 -53025839 + MLT1F1 LTR MaLR 191 346 -233 1 1344 693 266 54 45 chr5 99513874 99514205 -53023054 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 10 1 1344 272 316 58 50 chr5 99514907 99515027 -53022232 - LTR16C LTR ERVL -8 481 361 1 1344 608 301 89 35 chr5 99516570 99516843 -53020416 + MTE2a LTR MaLR 51 320 -59 2 1344 600 287 19 34 chr5 99519140 99519349 -53017910 + MLT1B LTR MaLR 185 390 0 2 1344 371 82 0 0 chr5 99529923 99529972 -53007287 + ORR1A3 LTR MaLR 278 326 0 4 1344 3354 51 18 0 chr5 99532211 99532604 -53004655 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1344 590 314 129 31 chr5 99534788 99535231 -53002028 + MLT1G LTR MaLR 119 595 0 5 1344 2963 165 40 21 chr5 99549100 99549745 -52987514 + RMER19A LTR ERVK 1 700 -37 7 1344 3299 61 5 8 chr5 99549745 99550142 -52987117 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1344 1833 145 24 30 chr5 99550142 99550183 -52987076 + RMER19A LTR ERVK 701 737 0 7 1344 1943 227 145 22 chr5 99550772 99551316 -52985943 - ORR1C2-int LTR MaLR -898 611 1 7 1344 1358 219 91 36 chr5 99551316 99551506 -52985753 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 173 7 1344 1358 219 91 36 chr5 99551585 99551758 -52985501 - ORR1C2 LTR MaLR -212 172 2 7 1344 2091 198 74 6 chr5 99556538 99557011 -52980248 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 8 1344 315 236 32 53 chr5 99557022 99557116 -52980143 - MER68 LTR ERVL -469 94 3 8 1344 883 316 50 16 chr5 99559299 99559682 -52977577 - MER68 LTR ERVL -11 552 157 8 1344 1727 134 44 79 chr5 99559804 99560145 -52977114 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 8 1344 390 354 92 65 chr5 99564199 99564308 -52972951 - MLT2B3 LTR ERVL -53 501 376 9 1344 390 354 92 65 chr5 99564515 99564882 -52972377 - MLT2B3 LTR ERVL -179 375 13 9 1344 1141 183 56 18 chr5 99566344 99566654 -52970605 + ORR1C2 LTR MaLR 2 339 -35 9 1344 270 239 98 74 chr5 99570497 99570588 -52966671 - MTEa LTR MaLR 0 379 286 1 1344 2950 156 58 8 chr5 99570588 99571087 -52966172 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 1 1344 270 239 98 74 chr5 99571087 99571117 -52966142 - MTEa LTR MaLR -94 285 255 1 1344 348 350 54 65 chr5 99572026 99572380 -52964879 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 17 1 1344 1923 213 46 31 chr5 99577300 99577776 -52959483 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -101 483 1 1 1344 302 296 107 43 chr5 99577776 99577960 -52959299 - RMER20B LTR ERVK -233 394 199 1 1344 329 328 175 15 chr5 99581777 99582040 -52955219 - LTR16C LTR ERVL -9 480 176 1 1344 530 265 46 7 chr5 99588485 99588637 -52948622 - MLT1B LTR MaLR -11 379 222 1 1344 2019 192 30 59 chr5 99596462 99596970 -52940289 + RLTR16 LTR ERVK 1 493 -12 1 1344 387 346 66 13 chr5 99600215 99600423 -52936836 + MLT2B1 LTR ERVL 264 491 -76 1 1344 2032 146 48 5 chr5 99600433 99600826 -52936433 + MTC LTR MaLR 12 421 0 1 1344 375 302 113 29 chr5 99602279 99602518 -52934741 + ORR1E LTR MaLR 96 354 -5 1 1344 2152 173 104 68 chr5 99606820 99607360 -52929899 + RMER15 LTR ERVL 1 559 -16 1 1344 1613 148 59 92 chr5 99607448 99607806 -52929453 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 1 1344 1784 117 36 80 chr5 99609664 99610000 -52927259 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 1 1344 3248 65 0 2 chr5 99613530 99613929 -52923330 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 1 1344 2067 112 13 0 chr5 99614114 99614428 -52922831 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 1 1345 2210 134 57 45 chr5 99618103 99618533 -52918726 - RLTR1D LTR ERV1 -16 589 144 1 1345 2187 171 110 2 chr5 99623316 99623780 -52913479 + RLTR28 LTR ERVL 1 514 -10 1 1345 568 274 0 32 chr5 99624420 99624578 -52912681 + MTC LTR MaLR 1 153 -254 1 1345 550 246 74 51 chr5 99624613 99624909 -52912350 - RLTR15 LTR ERVK -53 306 4 1 1345 1519 146 0 12 chr5 99624915 99625172 -52912087 + MTC LTR MaLR 165 418 -3 1 1345 2469 90 3 3 chr5 99625776 99626099 -52911160 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 1 1345 1119 41 0 0 chr5 99628054 99628200 -52909059 + BGLII LTR ERVK 276 421 0 2 1345 664 201 71 0 chr5 99628451 99628605 -52908654 - MTC LTR MaLR 0 421 257 2 1345 1571 232 163 19 chr5 99628616 99628893 -52908366 - RMER20B LTR ERVK 0 627 334 2 1345 1571 232 163 19 chr5 99628937 99629199 -52908060 - RMER20B LTR ERVK -294 333 11 2 1345 385 113 0 31 chr5 99629195 99629259 -52908000 - MTC LTR MaLR -151 270 209 2 1345 936 221 40 36 chr5 99629882 99630135 -52907124 - RLTR28B LTR ERVL -227 254 1 2 1345 3203 46 20 3 chr5 99633772 99634164 -52903095 + MTB LTR MaLR 2 400 0 2 1345 683 170 30 0 chr5 99634271 99634406 -52902853 + ORR1C1 LTR MaLR 18 156 -222 2 1345 248 307 57 0 chr5 99635360 99635448 -52901811 + LTR16A1 LTR ERVL 244 336 -120 2 1345 446 345 65 22 chr5 99637760 99638127 -52899132 - MLT1I LTR MaLR -3 408 26 2 1345 1477 219 58 29 chr5 99638978 99639354 -52897905 + MTD LTR MaLR 33 419 0 2 1345 2470 130 20 15 chr5 99639487 99639879 -52897380 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1345 356 261 61 8 chr5 99639977 99640108 -52897151 - MER34-int LTR ERV1 -6889 1318 1181 2 1345 418 153 41 0 chr5 99640815 99640827 -52896432 - ORR1B1 LTR MaLR -263 131 120 2 1345 418 153 41 0 chr5 99640857 99640942 -52896317 - ORR1B1 LTR MaLR -275 119 31 2 1345 408 138 11 0 chr5 99645777 99645864 -52891395 + ORR1B1 LTR MaLR 50 137 -257 2 1345 1883 130 34 12 chr5 99645865 99646192 -52891067 + ORR1B1 LTR MaLR 61 394 0 2 1345 590 203 0 8 chr5 99648159 99648278 -52888981 - MTC LTR MaLR -8 413 296 2 1345 2468 152 59 3 chr5 99649758 99650260 -52886999 + RMER19C LTR ERVK 1 593 -18 2 1345 346 226 75 156 chr5 99661571 99661744 -52875515 + MTE2a LTR MaLR 3 161 -218 2 1345 612 217 90 6 chr5 99661931 99662098 -52875161 + MTE2a LTR MaLR 185 365 -14 2 1345 902 182 183 19 chr5 99675308 99675576 -52861683 + RLTR20C LTR ERVK 1 312 -222 2 1345 320 162 0 29 chr5 99675574 99675644 -52861615 + RLTR20C LTR ERVK 424 491 -87 2 1345 754 288 76 57 chr5 99692095 99692478 -52844781 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 135 2 1345 250 246 16 0 chr5 99707252 99707313 -52829946 - MLT1A0 LTR MaLR -224 141 80 3 1345 247 319 22 11 chr5 99709182 99709274 -52827985 + LTR16B1 LTR ERVL 179 271 -209 3 1345 270 283 41 74 chr5 99714889 99715011 -52822248 + RLTR25B LTR ERVK 5 122 -906 3 1345 297 294 130 54 chr5 99717664 99717926 -52819333 + MLT1A0 LTR MaLR 80 361 -4 3 1345 513 326 51 36 chr5 99731623 99731897 -52805362 + RMER15-int LTR ERVL 1944 2221 -2778 3 1345 534 323 327 18 chr5 99737512 99737898 -52799361 - LTR33 LTR ERVL -4 511 7 3 1346 676 221 54 24 chr5 99753907 99754074 -52783185 + ORR1E LTR MaLR 2 173 -186 3 1346 385 196 175 0 chr5 99755475 99755572 -52781687 - MTD LTR MaLR -14 405 292 3 1346 731 304 73 15 chr5 99755664 99755925 -52781334 - MTD LTR MaLR -143 276 1 3 1346 786 303 23 49 chr5 99757373 99757678 -52779581 - MTE2a LTR MaLR -14 365 69 3 1346 2281 70 19 0 chr5 99767341 99767657 -52769602 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 4 1346 1775 117 80 87 chr5 99770300 99770525 -52766734 + RMER17C LTR ERVK 1 211 -199 4 1346 1775 117 80 87 chr5 99770606 99770793 -52766466 + RMER17C LTR ERVK 212 410 0 4 1346 617 137 17 0 chr5 99771654 99771771 -52765488 + ORR1B1 LTR MaLR 3 121 -273 4 1346 543 200 205 7 chr5 99771777 99771928 -52765331 - MTD LTR MaLR -43 376 196 4 1346 1318 166 51 0 chr5 99771930 99772165 -52765094 + ORR1B1 LTR MaLR 148 394 0 4 1346 1765 174 75 28 chr5 99782248 99782454 -52754805 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 164 4 1346 1765 174 75 28 chr5 99782478 99782632 -52754627 - ORR1C1 LTR MaLR -215 163 2 4 1346 246 226 106 31 chr5 99797589 99797661 -52739598 - RMER17C LTR ERVK -138 272 192 4 1346 246 226 106 31 chr5 99797748 99797835 -52739424 - RMER17C LTR ERVK -219 191 101 4 1346 271 361 59 0 chr5 99802037 99802156 -52735103 - MLT1J LTR MaLR -315 197 72 4 1346 2300 137 48 10 chr5 99818247 99818644 -52718615 - MTC LTR MaLR 0 421 10 4 1346 275 179 104 104 chr5 99818836 99818849 -52718410 + MT2B LTR ERVL 152 164 -437 4 1346 675 289 91 76 chr5 99821619 99822147 -52715112 + MLT1E3 LTR MaLR 64 599 -25 4 1346 649 237 90 48 chr5 99824549 99824859 -52712400 + RLTR15 LTR ERVK 1 323 -36 4 1346 338 247 0 118 chr5 99825854 99825964 -52711295 + MYSERV6-int LTR ERVK 3989 4085 -4874 5 1346 938 249 35 38 chr5 99841519 99841866 -52695393 + RLTR15 LTR ERVK 1 346 -13 5 1346 1520 165 100 108 chr5 99845104 99845504 -52691755 + RMER10B LTR ERVL 1 397 -1 5 1346 582 326 96 0 chr5 99876209 99876396 -52660863 + MLT1I LTR MaLR 89 293 -118 5 1347 384 348 92 23 chr5 99877713 99878255 -52659004 + MLT1G3 LTR MaLR 13 591 0 5 1347 386 307 121 5 chr5 99878706 99878896 -52658363 + MLT1B LTR MaLR 6 217 -173 5 1347 1415 219 90 19 chr5 99882267 99882643 -52654616 - MTD LTR MaLR -16 403 1 5 1347 2139 163 49 17 chr5 99884549 99884955 -52652304 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 5 1347 1025 178 82 13 chr5 99884961 99885194 -52652065 + MTC-int LTR MaLR 22 270 -988 5 1347 3820 183 60 10 chr5 99885198 99885977 -52651282 + RMER19B LTR ERVK 73 890 -12 5 1347 3790 134 34 6 chr5 99885990 99886634 -52650625 + MTC-int LTR MaLR 253 914 -344 5 1347 1632 181 60 85 chr5 99886646 99887044 -52650215 + MTC LTR MaLR 34 421 0 5 1347 666 261 61 0 chr5 99890545 99890577 -52646682 + ORR1E LTR MaLR 2 34 -325 5 1347 666 285 61 22 chr5 99890602 99890820 -52646439 + ORR1E LTR MaLR 35 249 -121 5 1347 357 208 83 60 chr5 99894662 99894795 -52642464 - RLTR42-int LTR ERVK -4126 1396 1261 5 1347 939 187 21 51 chr5 99896777 99897228 -52640031 - RMER17C LTR ERVK -22 388 1 5 1347 524 309 47 6 chr5 99898061 99898230 -52639029 - ORR1E LTR MaLR -181 178 3 5 1347 314 303 99 62 chr5 99899777 99899939 -52637320 + LTR16A LTR ERVL 122 289 -162 6 1347 445 310 78 10 chr5 99913606 99913861 -52623398 - LTR48 LTR ERV1 -115 672 211 6 1347 387 364 122 23 chr5 99915906 99916210 -52621049 - LTR33A LTR ERVL -148 372 39 6 1347 1127 221 44 103 chr5 99917482 99917781 -52619478 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 78 6 1347 1140 256 66 29 chr5 99917781 99918131 -52619128 + ORR1D2 LTR MaLR 5 367 -3 6 1347 1127 221 44 103 chr5 99918131 99918149 -52619110 - ORR1D2 LTR MaLR -293 77 75 6 1347 2988 136 84 39 chr5 99918149 99918709 -52618550 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 6 1347 1127 221 44 103 chr5 99918709 99918778 -52618481 - ORR1D2 LTR MaLR -296 74 3 6 1347 256 279 68 81 chr5 99932349 99932497 -52604762 - MLT1A0 LTR MaLR -11 354 209 6 1347 401 332 29 30 chr5 99937767 99937986 -52599273 - MTD LTR MaLR -214 205 11 6 1347 1114 207 194 23 chr5 99945296 99945642 -52591617 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1347 266 304 90 36 chr5 99953267 99953434 -52583825 - MLT2D LTR ERVL -190 224 49 6 1347 365 274 71 106 chr5 99962655 99962915 -52574344 - MLT1J LTR MaLR -142 302 50 6 1347 2277 107 0 69 chr5 99966647 99966997 -52570262 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 6 1347 341 373 131 32 chr5 99972533 99972907 -52564352 + MLT1K LTR MaLR 163 573 -22 6 1347 2162 94 3 3 chr5 99977860 99978179 -52559080 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1347 3633 13 0 0 chr5 99979255 99979651 -52557608 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1347 747 238 166 13 chr5 99982447 99982733 -52554526 - MTD LTR MaLR 0 419 58 7 1347 234 259 53 121 chr5 99982734 99982866 -52554393 - MTD LTR MaLR -283 138 16 7 1347 301 320 89 8 chr5 99991202 99991325 -52545934 - LTR16A LTR ERVL -65 386 254 7 1347 538 338 51 92 chr5 99991909 99992245 -52545014 - MLT2B3 LTR ERVL -13 541 220 7 1347 345 267 56 0 chr5 99992318 99992408 -52544851 - MLT2B3 LTR ERVL -322 232 138 7 1347 268 241 254 7 chr5 99998055 99998197 -52539062 + MLT1C LTR MaLR 291 467 0 7 1347 427 223 89 16 chr5 100002359 100002482 -52534777 + MT2B LTR ERVL 1 132 -401 8 1347 727 242 21 99 chr5 100002966 100003209 -52534050 + MT2B LTR ERVL 317 540 -61 8 1347 610 189 0 0 chr5 100004142 100004253 -52533006 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 249 1 1348 2063 158 95 9 chr5 100011616 100012039 -52525220 - RMER4A LTR ERVK 0 466 8 2 1348 411 272 42 58 chr5 100021023 100021232 -52516027 - MLT1A1 LTR MaLR -155 210 3 4 1348 3360 208 45 49 chr5 100025598 100026499 -52510760 - RMER17B LTR ERVK -60 898 1 5 1348 2629 224 31 67 chr5 100033441 100034441 -52502818 + RMER17B LTR ERVK 1 907 -1 6 1348 1485 159 48 74 chr5 100045710 100046130 -52491129 + RMER17C LTR ERVK 1 409 -1 7 1348 797 181 84 76 chr5 100046967 100047230 -52490029 + RMER10B LTR ERVL 1 265 -133 8 1348 813 170 46 110 chr5 100047272 100047490 -52489769 + RMER10B LTR ERVL 195 398 0 8 1348 392 241 28 55 chr5 100050757 100050902 -52486357 + RLTR23 LTR ERV1 286 426 -4 8 1348 399 291 148 51 chr5 100051050 100051401 -52485858 + MLT1A1 LTR MaLR 24 408 0 9 1348 471 296 188 12 chr5 100054886 100055136 -52482123 - MLT1D LTR MaLR -123 382 89 9 1348 2182 202 7 17 chr5 100062656 100063073 -52474186 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1348 295 232 14 14 chr5 100066944 100067014 -52470245 + MLT1B LTR MaLR 147 216 -174 1 1348 229 351 61 9 chr5 100067154 100067269 -52469990 + MLT1B LTR MaLR 288 408 0 1 1348 268 226 52 78 chr5 100067496 100067585 -52469674 - MTE2a LTR MaLR -2 377 290 1 1348 345 295 29 79 chr5 100068125 100068265 -52468994 - MLT1A1 LTR MaLR -275 133 1 1 1348 1944 157 138 3 chr5 100069640 100070011 -52467248 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1348 2248 206 30 66 chr5 100074707 100075210 -52462049 + RMER15 LTR ERVL 1 485 -90 1 1348 258 140 39 20 chr5 100075662 100075713 -52461546 + RMER15 LTR ERVL 524 575 0 1 1348 1103 244 168 8 chr5 100079984 100080336 -52456923 - MTD LTR MaLR 0 419 12 1 1348 1575 193 83 131 chr5 100080923 100081194 -52456065 + RLTR20A1 LTR ERVK 1 271 -280 1 1348 1575 193 83 131 chr5 100081346 100081630 -52455629 + RLTR20A1 LTR ERVK 272 529 -22 1 1348 2004 117 13 67 chr5 100083481 100083931 -52453328 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1348 702 333 68 35 chr5 100087256 100087714 -52449545 + MER110-int LTR ERV1 4168 4640 -7 1 1348 469 336 157 14 chr5 100090393 100090680 -52446579 + LTR33 LTR ERVL 37 364 -151 1 1348 259 246 45 15 chr5 100098597 100098663 -52438596 - LTR86A2 LTR ERVL -415 93 26 1 1348 619 196 0 0 chr5 100100441 100100548 -52436711 + MT2A LTR ERVL 1 107 -426 1 1348 244 103 34 17 chr5 100100722 100100781 -52436478 + MT2A LTR ERVL 466 525 -8 1 1348 1436 224 114 3 chr5 100101171 100101521 -52435738 - MTD LTR MaLR -13 406 18 1 1348 1371 207 171 9 chr5 100101894 100102216 -52435043 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1348 324 259 23 12 chr5 100109746 100109832 -52427427 - MTEb LTR MaLR -14 365 279 1 1348 264 268 42 14 chr5 100110078 100110150 -52427109 - MLT1A1 LTR MaLR -298 110 37 1 1348 964 245 97 27 chr5 100120374 100120705 -52416554 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 1 1348 688 265 122 11 chr5 100121729 100122015 -52415244 + MLT1D LTR MaLR 188 505 0 1 1348 725 321 96 92 chr5 100122045 100122629 -52414630 - MER34A1 LTR ERV1 -1 586 1 2 1348 2270 87 14 61 chr5 100125108 100125453 -52411806 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1348 2490 86 6 0 chr5 100125914 100126239 -52411020 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1348 1328 98 0 24 chr5 100130376 100130586 -52406673 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 123 2 1349 264 331 55 55 chr5 100139529 100139711 -52397548 + MLT1A0 LTR MaLR 7 188 -177 2 1349 253 312 110 44 chr5 100139962 100140190 -52397069 - LTR33 LTR ERVL -31 484 242 2 1349 321 300 20 0 chr5 100140266 100140366 -52396893 + RMER12 LTR ERVK 750 851 -471 2 1349 2604 71 3 0 chr5 100151648 100151974 -52385285 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1349 1739 231 80 23 chr5 100153445 100153969 -52383290 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 554 -9 2 1349 825 255 115 90 chr5 100154176 100154542 -52382717 - MTEa LTR MaLR -4 375 1 2 1349 4821 15 2 0 chr5 100159264 100159801 -52377458 + MERVL-int LTR ERVL 23 560 -4925 2 1349 230 261 68 0 chr5 100159959 100160047 -52377212 - MLT1E2 LTR MaLR -308 319 226 2 1349 248 282 28 14 chr5 100168114 100168186 -52369073 - LTR16C LTR ERVL -2 487 415 2 1349 855 132 37 0 chr5 100168404 100168540 -52368719 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 238 2 1349 3188 312 38 25 chr5 100169281 100170540 -52366719 - RodERV21-int LTR ERV1 -198 4793 3518 2 1349 2587 68 9 0 chr5 100178991 100179315 -52357944 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1349 741 189 18 16 chr5 100179395 100179554 -52357705 - MTC LTR MaLR -2 419 216 2 1349 1541 143 94 0 chr5 100179795 100180081 -52357178 + MTC LTR MaLR 1 313 -108 2 1349 1789 156 146 9 chr5 100186571 100186900 -52350359 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1349 2810 179 113 20 chr5 100190297 100190854 -52346405 + RMER19C LTR ERVK 1 609 -2 3 1349 1823 187 22 3 chr5 100191088 100191447 -52345812 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 3 1349 361 344 154 45 chr5 100192010 100192150 -52345109 + ORR1E LTR MaLR 8 169 -190 3 1349 4034 135 113 0 chr5 100192150 100192811 -52344448 - RMER19A LTR ERVK 0 737 2 3 1349 361 344 154 45 chr5 100192811 100192981 -52344278 + ORR1E LTR MaLR 170 352 -7 3 1349 1410 199 50 14 chr5 100197577 100197934 -52339325 - ORR1C2-int LTR MaLR -1000 370 1 3 1349 1651 169 101 22 chr5 100197934 100198290 -52338969 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1349 3650 93 63 17 chr5 100201317 100201428 -52335831 + RMER2 LTR ERV1 1 111 -456 3 1349 3650 93 63 17 chr5 100201457 100201883 -52335376 + RMER2 LTR ERV1 112 563 -4 3 1349 2226 127 28 2 chr5 100208809 100209304 -52327955 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 3 3 1349 416 280 47 111 chr5 100210244 100210497 -52326762 + RLTR26 LTR ERVK 199 435 -207 3 1349 3466 23 8 0 chr5 100212642 100213035 -52324224 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1349 8745 55 13 5 chr5 100213035 100214124 -52323135 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1349 3426 40 2 0 chr5 100214124 100214519 -52322740 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1349 2281 137 35 5 chr5 100220268 100220803 -52316456 - RMER19A LTR ERVK 0 737 143 3 1349 1712 131 104 3 chr5 100225081 100225379 -52311880 + ORR1C1 LTR MaLR 51 378 0 3 1349 1526 157 138 0 chr5 100232249 100232510 -52304749 - MTC LTR MaLR 0 421 125 3 1349 508 145 36 0 chr5 100234378 100234461 -52302798 - MTC LTR MaLR -331 90 5 3 1349 251 219 96 0 chr5 100234681 100234754 -52302505 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 329 3 1349 327 287 132 13 chr5 100234912 100235064 -52302195 - MLT1A1 LTR MaLR -238 170 1 3 1349 314 309 9 28 chr5 100235230 100235351 -52301908 + MLT1A1 LTR MaLR 36 150 -215 3 1349 381 257 91 151 chr5 100236732 100237025 -52300234 + ORR1E LTR MaLR 72 354 -5 4 1349 4746 141 65 78 chr5 100237037 100237951 -52299308 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 4 1349 243 337 117 6 chr5 100239538 100239717 -52297542 + MLT1A1 LTR MaLR 73 271 -218 3 1349 2388 106 110 47 chr5 100240672 100241119 -52296140 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 1349 6074 45 4 19 chr5 100241124 100241876 -52295383 - IAPEz-int LTR ERVK -5 6476 5736 4 1349 2255 75 0 0 chr5 100241875 100242153 -52295106 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 4 1349 3391 69 25 16 chr5 100242153 100242719 -52294540 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 4 1349 242 327 0 0 chr5 100242719 100242774 -52294485 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 4 1349 1065 100 25 82 chr5 100242774 100242970 -52294289 - IAPEz-int LTR ERVK -6288 193 9 4 1349 2429 112 87 33 chr5 100242971 100243422 -52293837 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 1349 885 324 58 12 chr5 100243730 100244055 -52293204 - MTE2b LTR MaLR 0 379 40 4 1349 450 239 0 0 chr5 100244083 100244175 -52293084 - MT2A LTR ERVL -441 92 1 4 1349 2153 92 5 149 chr5 100255975 100256357 -52280902 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1349 2362 70 129 11 chr5 100256613 100256962 -52280297 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 4 1349 884 309 118 3 chr5 100257578 100257900 -52279359 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 1349 1961 315 152 20 chr5 100258827 100258906 -52278353 + MTEb-int LTR MaLR 172 256 -1324 4 1349 1961 315 152 20 chr5 100259248 100260073 -52277186 + MTEb-int LTR MaLR 257 1196 -384 4 1349 1328 266 55 45 chr5 100261241 100261501 -52275758 + MTEb-int LTR MaLR 1147 1417 -163 4 1349 1328 266 55 45 chr5 100262074 100262103 -52275156 + MTEb-int LTR MaLR 1418 1436 -144 4 1349 1328 266 55 45 chr5 100262718 100262804 -52274455 + MTEb-int LTR MaLR 1437 1527 -53 4 1349 355 233 87 34 chr5 100262804 100262917 -52274342 + MTEb LTR MaLR 1 128 -242 4 1349 470 280 25 17 chr5 100262919 100263039 -52274220 + MTEb LTR MaLR 259 379 0 4 1349 451 344 40 47 chr5 100264478 100264731 -52272528 + LTR16A LTR ERVL 1 251 -200 4 1349 591 274 23 123 chr5 100264800 100265100 -52272159 - MT2A LTR ERVL -206 327 58 4 1349 1340 227 48 43 chr5 100267376 100267791 -52269468 - MTD LTR MaLR -2 417 1 4 1350 2325 192 37 44 chr5 100270714 100271232 -52266027 - RLTR40 LTR ERVK 0 817 304 4 1350 1268 200 92 11 chr5 100271510 100271629 -52265630 - RLTR40 LTR ERVK -520 297 162 4 1350 1268 200 92 11 chr5 100271756 100271907 -52265352 - RLTR40 LTR ERVK -656 161 5 4 1350 3574 15 2 0 chr5 100272253 100272647 -52264612 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 4 1350 8872 43 1 66 chr5 100272648 100273822 -52263437 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1350 2896 29 6 0 chr5 100273822 100274163 -52263096 + MTA_Mm LTR MaLR 1 343 -53 4 1350 1439 115 65 112 chr5 100274154 100274448 -52262811 - RMER15 LTR ERVL -293 282 3 4 1350 669 164 175 3 chr5 100275947 100276105 -52261154 + MTD LTR MaLR 237 405 -14 4 1350 934 171 97 10 chr5 100282642 100282733 -52254526 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 466 4 1350 1658 135 78 34 chr5 100282771 100283133 -52254126 - RLTR20D LTR ERVK -103 465 31 4 1350 1658 131 76 36 chr5 100283346 100283376 -52253883 - RLTR20D LTR ERVK -538 30 1 4 1350 719 282 70 102 chr5 100292628 100293011 -52244248 + MTEa LTR MaLR 1 371 -8 5 1350 327 284 39 33 chr5 100293404 100293671 -52243588 + RLTR15 LTR ERVK 48 278 -81 5 1350 535 315 65 91 chr5 100299739 100300137 -52237122 + MLT1B LTR MaLR 1 388 -2 5 1350 387 318 148 0 chr5 100303988 100304177 -52233082 - MLT1L LTR MaLR -31 579 363 5 1350 3161 149 65 2 chr5 100308378 100308917 -52228342 - RMER15 LTR ERVL 0 575 3 5 1350 262 230 122 0 chr5 100309813 100309887 -52227372 - RMER15-int LTR ERVL -895 4104 4022 5 1350 4240 244 55 21 chr5 100309875 100310959 -52226300 - RMER15-int LTR ERVL -2610 2389 1269 5 1350 2267 138 26 19 chr5 100310959 100311379 -52225880 + RLTR28 LTR ERVL 1 423 -101 5 1350 3070 222 97 12 chr5 100311379 100311892 -52225367 - RMER15-int LTR ERVL -4156 843 306 5 1350 3070 222 97 12 chr5 100311986 100312226 -52225033 - RMER15-int LTR ERVL -4694 305 26 5 1350 3490 141 14 11 chr5 100312238 100312811 -52224448 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 5 1350 824 336 34 47 chr5 100312936 100313401 -52223858 - MT2A LTR ERVL -74 459 1 5 1350 1019 300 92 45 chr5 100314709 100315595 -52221664 + RMER15-int LTR ERVL 1205 2132 -2867 5 1350 313 250 118 12 chr5 100315675 100315760 -52221499 + RMER15-int LTR ERVL 2296 2389 -2610 5 1350 1845 272 70 56 chr5 100315852 100316568 -52220691 + RMER15-int LTR ERVL 4271 4996 -3 5 1350 542 201 30 118 chr5 100321642 100321811 -52215448 - ORR1D1 LTR MaLR -212 162 9 5 1350 2443 125 22 6 chr5 100322244 100322605 -52214654 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1350 1600 186 62 9 chr5 100329652 100329993 -52207266 - MTC LTR MaLR 0 421 63 5 1350 871 241 10 0 chr5 100331327 100331530 -52205729 + MTD LTR MaLR 5 209 -210 5 1350 276 280 0 0 chr5 100331530 100331605 -52205654 + RLTR24 LTR ERV1 1 75 -454 5 1350 260 268 205 13 chr5 100331797 100331948 -52205311 + RLTR24 LTR ERV1 350 529 0 5 1350 929 188 44 5 chr5 100331948 100332147 -52205112 + MTD LTR MaLR 205 411 -8 5 1350 609 275 73 16 chr5 100332334 100332526 -52204733 + MTD LTR MaLR 18 220 -199 5 1350 3575 51 9 0 chr5 100336062 100336494 -52200765 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1350 46399 9 0 0 chr5 100336494 100341522 -52195737 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 2552 6 1350 362 111 0 0 chr5 100341528 100341591 -52195668 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5634 1947 1885 6 1350 313 175 0 0 chr5 100341596 100341653 -52195606 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4261 1145 1089 6 1350 692 242 154 70 chr5 100341640 100342028 -52195231 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4819 2425 2075 6 1350 933 148 4 177 chr5 100342116 100342387 -52194872 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 729 6 1350 2897 47 0 0 chr5 100342385 100342728 -52194531 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7238 343 1 6 1350 3671 46 5 0 chr5 100342728 100343162 -52194097 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1350 3084 52 49 0 chr5 100350807 100351194 -52186065 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 1 6 1350 248 23 45 0 chr5 100354760 100354804 -52182455 + BGLII_B LTR ERVK 4 49 -392 6 1350 1682 147 127 0 chr5 100354804 100355150 -52182109 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1937 2326 0 6 1350 2814 96 52 14 chr5 100355152 100355575 -52181684 + BGLII_B LTR ERVK 3 441 0 6 1350 1048 265 106 12 chr5 100363007 100363336 -52173923 + MTE2a LTR MaLR 19 378 -1 6 1350 3554 15 2 2 chr5 100365111 100365507 -52171752 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1350 9865 16 0 0 chr5 100365507 100366605 -52170654 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1350 3598 20 0 0 chr5 100366605 100367001 -52170258 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1350 298 316 51 34 chr5 100378786 100378904 -52158355 - ORR1E LTR MaLR -239 120 1 6 1350 1773 106 55 46 chr5 100379127 100379453 -52157806 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1350 241 302 33 44 chr5 100381356 100381369 -52155890 + MT2B LTR ERVL 152 163 -438 6 1351 1184 192 150 18 chr5 100409454 100409793 -52127466 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 7 1351 2541 86 3 0 chr5 100413365 100413689 -52123570 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 7 1351 3751 39 5 0 chr5 100415544 100415978 -52121281 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 1351 8229 33 0 0 chr5 100415978 100416907 -52120352 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2 7579 6651 7 1351 42615 41 1 1 chr5 100416898 100421839 -52115420 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 7 1351 2743 87 53 3 chr5 100421837 100422217 -52115042 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 7 1351 3341 39 9 0 chr5 100422217 100422649 -52114610 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 1351 436 264 45 23 chr5 100423025 100423157 -52114102 - ORR1C1 LTR MaLR 0 370 236 7 1351 345 322 0 0 chr5 100423781 100423902 -52113357 - RLTR6-int LTR ERV1 -315 7463 7343 7 1351 239 143 0 23 chr5 100424295 100424338 -52112921 - ORR1C1-int LTR MaLR -16 1493 1452 7 1351 798 123 0 49 chr5 100424506 100424669 -52112590 - ORR1C1-int LTR MaLR -44 1465 1311 7 1351 2820 236 118 24 chr5 100424659 100425568 -52111691 - ORR1C1-int LTR MaLR -374 996 3 7 1351 1354 183 125 75 chr5 100425570 100425930 -52111329 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1351 2226 155 40 2 chr5 100426967 100427122 -52110137 - RMER15 LTR ERVL -133 442 286 7 1351 2226 155 40 2 chr5 100427148 100427418 -52109841 - RMER15 LTR ERVL -290 285 2 7 1351 2413 102 9 0 chr5 100431100 100431424 -52105835 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1351 1184 187 48 31 chr5 100431616 100432012 -52105247 + RMER6B LTR ERVK 1 450 -11 7 1351 1465 192 40 37 chr5 100432752 100433104 -52104155 - ORR1C1 LTR MaLR -25 353 1 7 1351 1128 127 80 13 chr5 100433577 100433853 -52103406 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 7 1351 773 182 39 45 chr5 100434170 100434207 -52103052 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 354 7 1351 2497 89 6 0 chr5 100434207 100434532 -52102727 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1351 773 177 50 37 chr5 100434532 100434736 -52102523 - ORR1C2 LTR MaLR -31 353 4 7 1351 658 251 48 19 chr5 100437342 100437549 -52099710 - ORR1D2 LTR MaLR -157 213 1 7 1351 469 200 0 0 chr5 100437673 100437753 -52099506 + RMER12B LTR ERVK 1 80 -1324 7 1351 487 174 20 0 chr5 100437755 100437853 -52099406 - RLTR16 LTR ERVK -2 503 404 7 1351 769 131 23 0 chr5 100437857 100437987 -52099272 - RLTR16 LTR ERVK -372 133 1 7 1351 6271 158 23 83 chr5 100437987 100439146 -52098113 + RMER12B LTR ERVK 75 1253 -151 7 1351 6271 158 23 83 chr5 100439190 100439236 -52098023 + RMER12B LTR ERVK 1254 1263 -141 7 1351 6271 158 23 83 chr5 100439275 100439484 -52097775 + RMER12B LTR ERVK 1264 1404 0 7 1351 235 170 0 78 chr5 100440049 100440100 -52097159 - RMER10A LTR ERVL -395 47 1 7 1351 373 320 85 24 chr5 100440688 100440899 -52096360 + ERVL-E-int LTR ERVL 384 607 -5060 7 1351 273 276 66 0 chr5 100441264 100441340 -52095919 + MLT1D LTR MaLR 415 495 -10 7 1351 317 284 28 47 chr5 100441400 100441507 -52095752 + ERVL-E-int LTR ERVL 770 874 -4840 7 1351 3108 20 0 0 chr5 100442209 100442555 -52094704 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 1351 1539 100 11 282 chr5 100443846 100443914 -52093345 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 281 7 1351 1539 100 11 282 chr5 100444104 100444482 -52092777 - ORR1A4 LTR MaLR -49 280 1 7 1351 1418 201 208 53 chr5 100449665 100449922 -52087337 - RMER6C LTR ERVK 0 720 367 7 1351 1418 168 214 48 chr5 100449951 100450247 -52087012 - RMER6C LTR ERVK -323 367 2 7 1351 412 282 45 78 chr5 100450610 100450764 -52086495 - ORR1E LTR MaLR -210 149 1 8 1351 352 250 0 94 chr5 100451098 100451204 -52086055 - MT2B LTR ERVL -341 260 165 8 1351 565 303 84 70 chr5 100451203 100451476 -52085783 - RMER15 LTR ERVL -49 526 250 8 1351 2500 66 3 0 chr5 100452697 100453015 -52084244 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 1351 2292 98 31 9 chr5 100454080 100454398 -52082861 + MTB LTR MaLR 3 327 0 8 1351 6346 137 81 33 chr5 100454399 100455597 -52081662 + MTB-int LTR MaLR 2 1256 -2 8 1351 3304 55 2 2 chr5 100455599 100455999 -52081260 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1351 245 346 83 41 chr5 100456103 100456272 -52080987 - MLT1N2 LTR MaLR -278 284 109 8 1351 808 253 51 10 chr5 100456561 100456832 -52080427 + MTEb LTR MaLR 1 329 -50 8 1351 814 288 94 13 chr5 100457218 100457517 -52079742 + MTE-int LTR MaLR 1 323 -1257 8 1351 280 267 36 98 chr5 100471246 100471260 -52065999 + MT2B LTR ERVL 153 159 -442 8 1351 3557 24 48 96 chr5 100480277 100480776 -52056483 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 8 1351 611 230 45 126 chr5 100480838 100480913 -52056346 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 319 8 1351 611 230 45 126 chr5 100481100 100481223 -52056036 - ORR1C2 LTR MaLR -66 318 202 8 1351 351 142 160 35 chr5 100481439 100481535 -52055724 - ORR1C2 LTR MaLR -220 164 48 8 1351 5082 42 19 0 chr5 100482517 100483111 -52054148 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 1 8 1351 859 196 208 18 chr5 100484604 100484874 -52052385 - MTB_Mm LTR MaLR 0 421 3 8 1351 414 252 3 2 chr5 100484874 100484966 -52052293 + MTE2b LTR MaLR 286 412 -7 8 1351 278 192 102 0 chr5 100485123 100485189 -52052070 + MTE2b LTR MaLR 280 362 -17 8 1351 617 252 107 15 chr5 100491320 100491525 -52045734 - MTC LTR MaLR -14 407 184 8 1351 1770 133 46 33 chr5 100502703 100503006 -52034253 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 13 6 1351 3309 46 8 0 chr5 100505729 100506120 -52031139 + MTB LTR MaLR 3 396 -4 1 1351 278 293 83 76 chr5 100506482 100506626 -52030633 + MER21B LTR ERV1 19 163 -700 2 1351 232 253 27 100 chr5 100506675 100506785 -52030474 + MER21B LTR ERV1 366 467 -396 2 1351 2081 153 106 8 chr5 100510147 100510523 -52026736 + MTC LTR MaLR 9 421 0 2 1351 1398 251 25 60 chr5 100511028 100511381 -52025878 + ORR1E LTR MaLR 2 403 -4 2 1351 350 254 20 98 chr5 100515632 100515785 -52021474 - MT2B LTR ERVL -337 264 124 3 1351 396 264 68 27 chr5 100516573 100516721 -52020538 + RNLTR23 LTR ERVK 489 642 0 4 1351 1425 169 189 13 chr5 100523250 100523568 -52013691 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1351 1122 262 42 117 chr5 100525265 100525675 -52011584 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1351 3093 160 18 0 chr5 100525710 100525780 -52011479 - RMER20A LTR ERVK -1 515 446 5 1351 3093 160 18 0 chr5 100525836 100526271 -52010988 - RMER20A LTR ERVK -71 445 2 5 1351 540 244 52 29 chr5 100528855 100529028 -52008231 - RLTR42-int LTR ERVK -4147 1375 1199 6 1351 356 222 28 0 chr5 100530501 100530573 -52006686 + MTE2b LTR MaLR 69 142 -237 6 1351 235 288 59 59 chr5 100530574 100530659 -52006600 + MT2B LTR ERVL 173 257 -344 6 1352 1761 179 122 19 chr5 100536647 100537017 -52000242 + MTC LTR MaLR 6 413 -8 8 1352 356 329 0 0 chr5 100537297 100537382 -51999877 - RMER12 LTR ERVK -471 851 767 9 1352 348 394 36 32 chr5 100540342 100540594 -51996665 + MLT1L LTR MaLR 220 472 -138 9 1352 997 247 112 24 chr5 100541166 100541460 -51995799 + ORR1E LTR MaLR 38 357 -2 9 1352 245 309 150 38 chr5 100542486 100542656 -51994603 + MLT1J LTR MaLR 2 179 -333 1 1352 1401 235 62 57 chr5 100545569 100545971 -51991288 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 1 1352 794 329 130 3 chr5 100545974 100546328 -51990931 + MLT2B2 LTR ERVL 116 514 -1 1 1352 1673 224 59 49 chr5 100548475 100548969 -51988290 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 499 -28 1 1352 4401 69 30 2 chr5 100551576 100552143 -51985116 - MT2B2 LTR ERVL -1 583 1 1 1352 945 254 130 27 chr5 100552475 100552767 -51984492 - MTEb LTR MaLR -18 361 40 1 1352 501 265 72 22 chr5 100552815 100552864 -51984395 - MER31A LTR ERV1 -338 147 92 1 1352 501 265 72 22 chr5 100553032 100553120 -51984139 - MER31A LTR ERV1 -394 91 3 1 1352 2028 95 60 0 chr5 100555203 100555518 -51981741 - ORR1B1 LTR MaLR -60 334 1 1 1352 1150 325 33 111 chr5 100556216 100556935 -51980324 + MLT2F LTR ERVL 1 663 0 1 1352 489 139 14 0 chr5 100565851 100565923 -51971336 + MT2B LTR ERVL 185 257 -344 1 1352 353 215 74 116 chr5 100567010 100567131 -51970128 + LTR37A LTR ERV1 111 226 -200 1 1352 285 283 29 39 chr5 100567418 100567521 -51969738 + LTR37A LTR ERV1 325 426 0 1 1352 429 281 100 43 chr5 100569009 100569240 -51968019 - RLTR21 LTR ERVK -266 1306 1063 1 1352 285 247 0 115 chr5 100571437 100571451 -51965808 + MT2B LTR ERVL 156 158 -443 1 1352 1065 270 86 26 chr5 100573290 100573629 -51963630 + MTE2b LTR MaLR 16 374 -5 1 1352 634 272 173 44 chr5 100574280 100574671 -51962588 + MLT1C LTR MaLR 21 467 0 1 1352 3208 60 8 2 chr5 100575413 100575811 -51961448 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1352 2887 24 3 0 chr5 100576280 100576620 -51960639 + ORR1A0 LTR MaLR 6 346 0 1 1352 4923 84 19 46 chr5 100581585 100582373 -51954886 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 1 1352 931 297 80 36 chr5 100590581 100590944 -51946315 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 1 1352 467 225 59 44 chr5 100591020 100591155 -51946104 - RMER15 LTR ERVL -103 472 336 1 1352 304 287 100 18 chr5 100591285 100591395 -51945864 + LTR28 LTR ERV1 89 207 -813 1 1352 248 209 108 147 chr5 100591744 100591873 -51945386 + LTR77 LTR ERV1 459 582 -40 1 1352 1730 201 57 16 chr5 100598301 100598687 -51938572 + MTD LTR MaLR 3 380 -39 2 1352 864 324 48 13 chr5 100607444 100607816 -51929443 - MLT1B LTR MaLR -5 385 1 2 1352 392 314 148 45 chr5 100610587 100610924 -51926335 + LTR16A1 LTR ERVL 85 456 0 2 1352 241 298 102 39 chr5 100616365 100616571 -51920688 - RLTR21 LTR ERVK -268 1304 1086 2 1352 388 253 169 86 chr5 100617067 100617334 -51919925 + MLT1A LTR MaLR 73 408 0 2 1352 326 329 87 55 chr5 100618260 100618561 -51918698 + MLT1G1 LTR MaLR 188 565 -14 2 1352 280 296 92 31 chr5 100623101 100623211 -51914048 + MLT1F1 LTR MaLR 416 550 -19 2 1352 402 321 102 102 chr5 100626382 100626756 -51910503 + MLT1C LTR MaLR 94 467 0 2 1352 312 246 99 58 chr5 100628851 100628972 -51908287 - RLTR25B LTR ERVK -507 521 396 2 1352 436 382 82 28 chr5 100633516 100633807 -51903452 + LTR16B1 LTR ERVL 169 475 -5 2 1352 429 239 340 38 chr5 100639229 100639458 -51897801 - MLT1B LTR MaLR -32 358 61 2 1352 3484 174 41 26 chr5 100639492 100640163 -51897096 + RMER19B LTR ERVK 1 896 -6 2 1352 641 358 71 57 chr5 100642544 100643053 -51894206 + MTE-int LTR MaLR 1 516 -1064 3 1352 695 188 58 27 chr5 100643153 100643341 -51893918 - RMER17C LTR ERVK -562 344 1 3 1352 234 246 114 99 chr5 100646898 100647029 -51890230 + ORR1E LTR MaLR 83 215 -144 3 1352 1286 231 94 21 chr5 100657087 100657427 -51879832 - MTD LTR MaLR -44 375 11 3 1352 230 317 24 24 chr5 100658000 100658084 -51879175 + LTR16A LTR ERVL 7 90 -361 3 1352 2559 124 118 29 chr5 100658124 100658605 -51878654 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 3 1352 229 413 14 14 chr5 100658657 100658802 -51878457 + LTR16A LTR ERVL 269 413 -38 3 1352 3132 151 86 11 chr5 100658809 100659344 -51877915 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 3 1352 243 274 18 97 chr5 100662813 100662926 -51874333 + MT2B2 LTR ERVL 155 258 -326 3 1353 2626 130 70 5 chr5 100663368 100663809 -51873450 - RLTR44D LTR ERVK -16 470 1 3 1353 21973 37 52 1 chr5 100663809 100666478 -51870781 - RLTR44-int LTR ERVK 0 2812 8 3 1353 2821 110 69 2 chr5 100666488 100666936 -51870323 - RLTR44D LTR ERVK -8 478 1 3 1353 330 268 120 36 chr5 100666936 100667130 -51870129 - MLT2B1 LTR ERVL -21 546 280 3 1353 231 284 0 82 chr5 100683541 100683614 -51853645 + MLT1J LTR MaLR 392 458 -54 3 1353 1345 149 189 31 chr5 100688977 100689331 -51847928 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 1353 370 208 90 40 chr5 100690714 100690814 -51846445 + MT2B LTR ERVL 174 278 -323 3 1353 945 214 261 0 chr5 100691624 100691919 -51845340 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 3 1353 1962 187 49 96 chr5 100697340 100697808 -51839451 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 3 1353 1157 242 38 139 chr5 100698318 100698368 -51838891 + MTE2a LTR MaLR 4 47 -332 3 1353 1157 242 38 139 chr5 100698515 100698882 -51838377 + MTE2a LTR MaLR 48 379 0 3 1353 4428 45 3 24 chr5 100700627 100700854 -51836405 + LTRIS2 LTR ERV1 3 224 -340 4 1353 3005 82 16 131 chr5 100700854 100701398 -51835861 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1353 4428 45 3 24 chr5 100701398 100701744 -51835515 + LTRIS2 LTR ERV1 225 564 0 4 1353 343 306 182 61 chr5 100702127 100702457 -51834802 + MER21B LTR ERV1 223 592 -271 4 1353 2332 98 3 3 chr5 100707980 100708306 -51828953 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 1353 3293 38 8 5 chr5 100711854 100712249 -51825010 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1353 282 217 158 32 chr5 100714619 100714714 -51822545 - RMER15 LTR ERVL -368 207 101 4 1353 2338 144 86 0 chr5 100716114 100716511 -51820748 + ORR1B1-int LTR MaLR 1079 1509 0 4 1353 1387 117 143 16 chr5 100716511 100716648 -51820611 + ORR1B1 LTR MaLR 1 160 -234 4 1353 1387 139 116 24 chr5 100716684 100716838 -51820421 + ORR1B1 LTR MaLR 98 284 -110 4 1353 1084 202 53 80 chr5 100717066 100717440 -51819819 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 4 1353 7017 154 75 29 chr5 100717442 100718789 -51818470 + RMER16-int LTR ERVK 2 1410 -3996 4 1353 2048 139 70 76 chr5 100718789 100719186 -51818073 + RMER16-int LTR ERVK 3579 3973 -1433 4 1353 6297 125 55 32 chr5 100719359 100720414 -51816845 + RMER16-int LTR ERVK 4328 5406 0 4 1353 740 225 80 87 chr5 100720414 100720591 -51816668 + RMER16 LTR ERVK 1 314 -219 4 1353 2448 98 6 0 chr5 100720591 100720916 -51816343 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1353 740 255 106 87 chr5 100720916 100721133 -51816126 + RMER16 LTR ERVK 315 532 -1 4 1353 970 83 15 0 chr5 100721198 100721331 -51815928 + ORR1B1 LTR MaLR 260 394 0 4 1353 962 204 154 37 chr5 100727306 100727631 -51809628 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 666 4 1353 2409 186 92 16 chr5 100727626 100728117 -51809142 - RLTR25A LTR ERVK -575 528 1 4 1353 569 241 160 93 chr5 100728155 100728483 -51808776 + MLT1F1 LTR MaLR 218 569 0 4 1353 629 211 58 47 chr5 100728690 100728899 -51808360 + RMER20B LTR ERVK 1 212 -304 4 1353 2098 114 3 7 chr5 100730204 100730504 -51806755 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 29 4 1353 469 148 0 0 chr5 100730522 100730610 -51806649 - ORR1A2 LTR MaLR -239 88 1 4 1353 5581 137 39 9 chr5 100730974 100731850 -51805409 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 4 1353 681 253 14 0 chr5 100734852 100734998 -51802261 + MTEa LTR MaLR 1 148 -231 4 1353 289 302 159 13 chr5 100735064 100735215 -51802044 + MT2A LTR ERVL 286 458 -75 4 1353 324 316 102 92 chr5 100737104 100737397 -51799862 + ORR1E LTR MaLR 30 325 -34 4 1353 243 286 16 0 chr5 100743284 100743347 -51793912 + MER34A1 LTR ERV1 225 288 -299 4 1353 2479 74 0 58 chr5 100743449 100743795 -51793464 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 1353 1871 78 134 0 chr5 100752430 100752714 -51784545 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 6 5 1353 253 327 0 119 chr5 100755381 100755499 -51781760 - MT2B LTR ERVL -338 263 160 5 1353 268 362 137 52 chr5 100763322 100763483 -51773776 + MLT1C LTR MaLR 4 191 -276 5 1353 268 362 137 52 chr5 100763655 100763915 -51773344 + MLT1C LTR MaLR 192 461 -6 5 1353 228 360 35 0 chr5 100765865 100765951 -51771308 - MLT1A1 LTR MaLR -296 112 24 5 1353 877 237 30 25 chr5 100767040 100767243 -51770016 + RLTR25B LTR ERVK 1 204 -824 5 1353 615 309 102 56 chr5 100767762 100768154 -51769105 + MLT1D LTR MaLR 1 475 -30 5 1353 3025 77 38 2 chr5 100770428 100770821 -51766438 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1353 242 279 44 103 chr5 100773122 100773258 -51764001 - MTEa LTR MaLR 0 379 252 5 1353 565 338 119 20 chr5 100773594 100773887 -51763372 + MLT1A0 LTR MaLR 4 325 -40 5 1353 2399 73 18 57 chr5 100774517 100774853 -51762406 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 5 1353 543 145 7 74 chr5 100778983 100779103 -51758156 + RMER17C LTR ERVK 1 89 -321 5 1353 1348 212 58 26 chr5 100786055 100786365 -51750894 - RMER2 LTR ERV1 0 567 248 5 1354 2248 112 50 39 chr5 100814510 100814871 -51722388 + RLTR8 LTR ERVK 1 365 0 6 1354 659 197 64 36 chr5 100827032 100827214 -51710045 + ORR1D1 LTR MaLR 1 142 -184 6 1354 322 169 34 0 chr5 100827208 100827267 -51709992 + ORR1D1 LTR MaLR 310 370 -4 6 1354 3932 175 87 114 chr5 100828815 100829833 -51707426 + RLTR25B LTR ERVK 5 995 -33 6 1354 313 222 199 14 chr5 100831410 100831556 -51705703 + MTC LTR MaLR 1 173 -248 6 1354 227 277 46 0 chr5 100831613 100831678 -51705581 + MTC LTR MaLR 288 355 -4 6 1354 339 186 315 8 chr5 100851863 100851993 -51685266 + MT2A LTR ERVL 46 215 -318 7 1354 353 161 63 99 chr5 100852038 100852192 -51685067 + MT2A LTR ERVL 413 599 -2 7 1354 1995 151 70 40 chr5 100852211 100852579 -51684680 + RMER17A2 LTR ERVK 1 389 -517 7 1354 1995 151 70 40 chr5 100852619 100852706 -51684553 + RMER17A2 LTR ERVK 390 470 -436 7 1354 865 173 54 5 chr5 100852718 100852904 -51684355 + RMER17A2 LTR ERVK 712 906 0 7 1354 3004 64 20 20 chr5 100853960 100854356 -51682903 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1354 4338 73 30 6 chr5 100854356 100855069 -51682190 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 736 -522 7 1354 2445 36 45 6 chr5 100855040 100855372 -51681887 + MTA_Mm LTR MaLR 52 396 0 7 1354 457 213 222 89 chr5 100856331 100856646 -51680613 + ORR1C1 LTR MaLR 1 357 -21 7 1354 1896 181 55 27 chr5 100860225 100860628 -51676631 + MTC LTR MaLR 1 414 -7 7 1354 1482 188 164 29 chr5 100863140 100863584 -51673675 + RLTR12B LTR ERVK 1 504 -24 7 1354 883 199 257 25 chr5 100867598 100867913 -51669346 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 7 1354 1626 166 23 13 chr5 100878614 100878920 -51658339 + ORR1B1 LTR MaLR 84 392 -2 7 1354 1639 155 140 20 chr5 100887314 100887656 -51649603 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 7 1354 2323 60 3 9 chr5 100893309 100893629 -51643630 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 2 8 1354 943 200 18 18 chr5 100893957 100894181 -51643078 - MTD LTR MaLR 0 419 196 8 1354 433 169 146 10 chr5 100895202 100895298 -51641961 - MTD LTR MaLR -209 210 102 8 1354 382 252 35 9 chr5 100895408 100895524 -51641735 - MTD LTR MaLR -300 119 1 8 1354 236 270 40 13 chr5 100896039 100896114 -51641145 + MLT1J1 LTR MaLR 35 111 -333 8 1354 971 202 299 105 chr5 100901548 100901797 -51635462 - RMER2 LTR ERV1 0 567 320 8 1354 971 202 299 105 chr5 100901987 100902212 -51635047 - RMER2 LTR ERV1 -248 319 1 8 1354 911 291 83 24 chr5 100917786 100918124 -51619135 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 8 1354 325 155 11 45 chr5 100922292 100922380 -51614879 + MTEb LTR MaLR 206 290 -89 8 1354 249 345 23 0 chr5 100922508 100922595 -51614664 + MTE2a LTR MaLR 222 310 -69 8 1355 1531 178 127 27 chr5 100934132 100934502 -51602757 + MTC LTR MaLR 15 421 0 9 1355 3057 64 28 0 chr5 100934717 100935105 -51602154 + MTB LTR MaLR 2 400 0 9 1355 516 293 116 12 chr5 100935168 100935427 -51601832 + RMER15 LTR ERVL 275 560 -15 9 1355 2105 110 3 0 chr5 100944218 100944536 -51592723 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 9 1355 2156 168 52 107 chr5 100946464 100947024 -51590235 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 9 1355 350 266 105 27 chr5 100949243 100949437 -51587822 - MLT1H1 LTR MaLR -308 241 37 9 1355 516 250 167 10 chr5 100952519 100952717 -51584542 - MLT1H LTR MaLR -307 242 14 9 1355 362 272 35 92 chr5 100955820 100955874 -51581385 + MT2B LTR ERVL 115 158 -443 9 1355 1152 209 55 113 chr5 100956582 100956964 -51580295 - MTE2a LTR MaLR -15 364 5 9 1355 1644 203 63 18 chr5 100964630 100965026 -51572233 - MTD LTR MaLR -5 414 1 9 1355 687 168 63 0 chr5 100970041 100970184 -51567075 - MTEb LTR MaLR -187 192 41 1 1355 1332 113 129 4 chr5 100977302 100977550 -51559709 - RMER6A LTR ERVK -477 279 1 1 1355 427 55 0 0 chr5 100978794 100978849 -51558410 + ORR1B1 LTR MaLR 340 394 0 1 1355 1674 153 27 7 chr5 100979189 100979485 -51557774 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 24 1 1355 579 270 10 46 chr5 100987257 100987451 -51549808 + MLT2D LTR ERVL 1 187 -227 1 1355 346 196 18 110 chr5 101005274 101005383 -51531876 - MT2B LTR ERVL -337 264 166 1 1355 332 238 0 45 chr5 101007068 101007156 -51530103 - MT2B LTR ERVL -344 257 174 2 1355 417 253 160 21 chr5 101013141 101013335 -51523924 + MTEb LTR MaLR 159 379 0 4 1355 270 336 315 10 chr5 101014045 101014341 -51522918 + MLT1G LTR MaLR 11 397 -182 4 1355 269 139 0 0 chr5 101019981 101020024 -51517235 - ORR1C2 LTR MaLR -341 43 1 5 1355 1424 160 82 10 chr5 101022092 101022383 -51514876 + MTC LTR MaLR 1 312 -109 6 1355 917 219 101 141 chr5 101022383 101022876 -51514383 + RMER4B LTR ERVK 1 573 -12 6 1355 641 123 12 10 chr5 101022891 101023006 -51514253 + MTC LTR MaLR 254 413 -8 6 1355 1215 155 235 16 chr5 101023455 101023770 -51513489 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1355 932 196 50 35 chr5 101024280 101024777 -51512482 + RMER17B LTR ERVK 85 439 -519 6 1355 2466 178 86 29 chr5 101026206 101026786 -51510473 - RMER20B LTR ERVK -5 622 10 7 1355 2516 140 203 65 chr5 101027906 101028442 -51508817 - RMER19C LTR ERVK 0 611 2 7 1355 651 24 0 0 chr5 101032330 101032414 -51504845 + RLTR1B LTR ERV1 1 84 -428 8 1355 766 94 34 0 chr5 101032415 101032532 -51504727 + RLTR1B LTR ERV1 392 512 0 8 1355 412 199 110 97 chr5 101032540 101032685 -51504574 - ORR1D1 LTR MaLR -227 147 1 8 1355 874 181 96 40 chr5 101037473 101037882 -51499377 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 522 -46 9 1355 545 158 0 6 chr5 101039052 101039150 -51498109 + MT2B LTR ERVL 1 92 -441 1 1355 1266 118 191 76 chr5 101042477 101042781 -51494478 + MT2B LTR ERVL 74 412 -189 1 1355 312 262 146 80 chr5 101042848 101043047 -51494212 + ORR1D2 LTR MaLR 24 235 -135 1 1355 355 280 70 134 chr5 101043486 101043932 -51493327 + RMER10A LTR ERVL 12 428 -14 1 1355 3393 41 5 0 chr5 101046603 101046997 -51490262 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1355 704 306 53 64 chr5 101048629 101048870 -51488389 - MTEb LTR MaLR -23 356 107 1 1355 1386 213 43 48 chr5 101048870 101049245 -51488014 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 1 1355 704 306 53 64 chr5 101049245 101049363 -51487896 - MTEb LTR MaLR -273 106 1 1 1355 482 282 44 78 chr5 101052090 101052294 -51484965 + MTEa LTR MaLR 20 216 -163 1 1355 687 325 57 42 chr5 101052890 101053244 -51484015 + MER21B LTR ERV1 487 845 -18 1 1355 1101 223 212 102 chr5 101054529 101054874 -51482385 - MT2A LTR ERVL 0 533 119 1 1355 1101 223 212 102 chr5 101055487 101055621 -51481638 - MT2A LTR ERVL -415 118 1 1 1356 1595 211 94 34 chr5 101062366 101062779 -51474480 - RMER10A LTR ERVL -4 438 1 1 1356 419 242 97 38 chr5 101062897 101063196 -51474063 + RMER10A LTR ERVL 80 429 -13 1 1356 1038 140 103 15 chr5 101065159 101065362 -51471897 + MTC LTR MaLR 1 221 -200 1 1356 1822 122 7 125 chr5 101066237 101066677 -51470582 + RMER17C LTR ERVK 23 410 0 1 1356 696 322 101 50 chr5 101068208 101068545 -51468714 + MER57F LTR ERV1 83 436 0 1 1356 273 309 0 0 chr5 101069622 101069690 -51467569 - MLT1A LTR MaLR -305 69 2 1 1356 373 294 62 27 chr5 101069837 101069949 -51467310 + MLT1F1 LTR MaLR 1 116 -453 1 1356 266 244 133 0 chr5 101074566 101074656 -51462603 + MLT2F LTR ERVL 1 102 -561 1 1356 276 305 84 8 chr5 101074738 101074857 -51462402 - ERVL-E-int LTR ERVL -4021 1646 1519 1 1356 636 289 146 23 chr5 101075676 101075977 -51461282 - LTR41B LTR ERVL -27 731 394 1 1356 364 349 54 0 chr5 101080518 101080667 -51456592 - MLT1D LTR MaLR -22 483 327 2 1356 236 337 61 77 chr5 101080682 101080878 -51456381 - MLT1D LTR MaLR -266 239 47 2 1356 250 262 55 55 chr5 101081238 101081250 -51456009 - MT2B2 LTR ERVL -319 263 157 2 1356 357 307 25 42 chr5 101081291 101081410 -51455849 - MLT1B LTR MaLR -273 117 1 2 1356 428 158 481 11 chr5 101097242 101097423 -51439836 - MTD LTR MaLR -149 270 4 2 1356 259 341 52 44 chr5 101098541 101098676 -51438583 - MT2B2 LTR ERVL -252 332 197 2 1356 231 225 48 112 chr5 101099197 101099322 -51437937 - LTR40c LTR ERVL -234 231 115 2 1356 459 277 82 44 chr5 101099908 101100156 -51437103 + ORR1D2 LTR MaLR 67 362 -8 2 1356 506 242 65 0 chr5 101106304 101106428 -51430831 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 401 2 1356 536 263 59 49 chr5 101106477 101106580 -51430679 - RMER5 LTR ERV1 -306 228 121 2 1356 3444 42 0 0 chr5 101106580 101106980 -51430279 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1356 536 263 59 49 chr5 101106980 101107080 -51430179 - RMER5 LTR ERV1 -414 120 23 2 1356 310 358 168 38 chr5 101108721 101109066 -51428193 + MLT1L LTR MaLR 77 466 -144 2 1356 3426 35 5 0 chr5 101116438 101116832 -51420427 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1356 2989 68 21 2 chr5 101116832 101117397 -51419862 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 2 3 1356 3472 28 5 0 chr5 101117397 101117791 -51419468 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1356 250 316 95 0 chr5 101130016 101130111 -51407148 + RLTR11A2 LTR ERVK 4 107 -346 3 1356 338 242 55 0 chr5 101130152 101130243 -51407016 + RLTR11A2 LTR ERVK 119 214 -313 3 1356 3918 94 217 7 chr5 101131095 101131704 -51405555 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 3 1356 1213 273 88 11 chr5 101140954 101141306 -51395953 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 3 1356 277 290 19 48 chr5 101144497 101144532 -51392727 + ORR1D2 LTR MaLR 3 36 -334 3 1356 2523 119 50 23 chr5 101144532 101144928 -51392331 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1356 622 249 146 60 chr5 101144928 101145129 -51392130 + ORR1D2 LTR MaLR 37 308 -62 3 1356 622 243 162 62 chr5 101145319 101145381 -51391878 + ORR1D2 LTR MaLR 309 368 -2 3 1356 2428 124 48 18 chr5 101151605 101152000 -51385259 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1356 6968 125 76 9 chr5 101152000 101153178 -51384081 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1258 2 3 1356 233 146 0 47 chr5 101153178 101153221 -51384038 + MTB LTR MaLR 352 392 -8 4 1356 357 216 33 22 chr5 101154579 101154669 -51382590 + MLT1A1 LTR MaLR 315 405 -3 4 1356 2662 59 56 0 chr5 101155824 101156162 -51381097 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 3 4 1356 862 272 45 15 chr5 101157792 101158061 -51379198 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 92 4 1356 432 377 41 60 chr5 101163971 101164287 -51372972 + MLT1A0 LTR MaLR 56 365 0 4 1356 787 221 137 27 chr5 101164375 101164405 -51372854 + ORR1C2 LTR MaLR 142 171 -213 4 1356 787 221 137 27 chr5 101164448 101164636 -51372623 + ORR1C2 LTR MaLR 172 383 -1 4 1356 798 234 119 73 chr5 101165301 101165697 -51371562 + RMER10A LTR ERVL 29 442 0 4 1356 599 234 83 6 chr5 101167422 101167590 -51369669 - RMER5 LTR ERV1 -56 478 298 4 1356 294 344 10 10 chr5 101167894 101167991 -51369268 - MLT1A LTR MaLR -15 359 263 4 1356 2044 165 50 3 chr5 101168466 101168824 -51368435 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 4 4 1356 2896 30 3 3 chr5 101169641 101169978 -51367281 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1356 56398 23 17 7 chr5 101169978 101176385 -51360874 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 4 1356 2908 27 3 3 chr5 101176385 101176722 -51360537 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1356 263 312 0 6 chr5 101177972 101178048 -51359211 - MLT1A LTR MaLR -295 79 5 4 1356 265 239 67 86 chr5 101178098 101178203 -51359056 - MER34 LTR ERV1 -65 477 375 4 1356 555 292 51 40 chr5 101178957 101179210 -51358049 - LTR29 LTR ERV1 -245 377 122 4 1356 346 309 159 50 chr5 101181100 101181301 -51355958 + MER67B LTR ERV1 7 229 -314 4 1356 1149 231 78 21 chr5 101183066 101183412 -51353847 + ORR1D-int LTR MaLR 693 1139 -441 4 1356 1442 191 124 3 chr5 101184469 101184799 -51352460 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 4 1356 2467 204 162 34 chr5 101186595 101187309 -51349950 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 1 4 1357 1756 183 82 39 chr5 101188253 101188715 -51348544 + RMER15 LTR ERVL 1 573 -2 4 1357 2385 137 93 33 chr5 101188770 101189230 -51348029 + RLTR28 LTR ERVL 37 524 0 4 1357 1603 197 121 11 chr5 101192866 101193245 -51344014 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1357 274 331 107 40 chr5 101195046 101195373 -51341886 - RLTR15 LTR ERVK -10 349 1 5 1357 245 263 61 74 chr5 101195373 101195515 -51341744 + MT2A LTR ERVL 198 337 -196 5 1357 1324 232 44 0 chr5 101197926 101198350 -51338909 + RLTR18B LTR ERVK 3 485 -27 5 1357 1182 202 125 18 chr5 101204415 101204742 -51332517 + ORR1D2 LTR MaLR 3 364 -6 5 1357 377 198 15 165 chr5 101205718 101205851 -51331408 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 5 1357 1627 122 162 21 chr5 101210667 101211001 -51326258 + ORR1B1 LTR MaLR 14 394 0 5 1357 2860 41 3 17 chr5 101211238 101211583 -51325676 - ORR1A1 LTR MaLR -4 342 3 5 1357 2662 106 35 5 chr5 101217189 101217586 -51319673 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 1357 246 277 8 137 chr5 101217774 101217891 -51319368 + MT2B LTR ERVL 157 258 -343 5 1357 263 297 54 74 chr5 101223055 101223204 -51314055 + MT2B LTR ERVL 110 255 -346 5 1357 242 262 16 0 chr5 101237383 101237444 -51299815 + LTR16B2 LTR ERVL 113 174 -288 6 1357 1506 199 75 20 chr5 101251345 101251694 -51285565 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 6 1357 391 260 67 67 chr5 101252236 101252401 -51284858 + MER21-int LTR ERV1 3869 4033 -158 6 1357 233 170 0 21 chr5 101254710 101254758 -51282501 - MTD LTR MaLR -98 321 275 6 1357 530 172 0 47 chr5 101256405 101256499 -51280760 + RLTR11A2 LTR ERVK 136 224 -303 6 1357 530 172 0 47 chr5 101256609 101256642 -51280617 + RLTR11A2 LTR ERVK 225 256 -271 6 1357 530 222 47 8 chr5 101257862 101257989 -51279270 - MTC LTR MaLR -8 411 280 6 1357 803 117 7 14 chr5 101257966 101258105 -51279154 - MTC LTR MaLR -283 138 1 6 1357 638 227 193 30 chr5 101261840 101262101 -51275158 + RLTR28B LTR ERVL 3 314 -167 6 1357 638 227 193 30 chr5 101262139 101262177 -51275082 + RLTR28B LTR ERVL 315 350 -131 6 1357 1948 146 85 0 chr5 101262973 101263315 -51273944 + ORR1D1 LTR MaLR 2 372 -2 6 1357 906 276 74 63 chr5 101265243 101265606 -51271653 - MTEa LTR MaLR -12 367 1 6 1357 536 244 15 30 chr5 101266941 101267076 -51270183 - MTE2b LTR MaLR -246 133 1 6 1357 1801 231 42 57 chr5 101267076 101267303 -51269956 - MTE2b-int LTR MaLR 0 1580 1356 6 1357 1801 231 42 57 chr5 101267499 101267767 -51269492 - MTE2b-int LTR MaLR -225 1355 1092 6 1357 282 226 11 87 chr5 101269049 101269141 -51268118 - MLT-int LTR MaLR -1401 334 250 7 1357 410 300 34 50 chr5 101270002 101270181 -51267078 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1355 1530 -4184 7 1357 937 300 122 45 chr5 101270292 101270735 -51266524 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1720 2196 -3518 7 1357 1071 119 15 20 chr5 101271024 101271221 -51266038 - RMER6C LTR ERVK -11 679 484 7 1357 2025 130 34 17 chr5 101271269 101271622 -51265637 - RMER6C LTR ERVK -331 359 1 7 1357 2754 72 8 8 chr5 101271683 101272048 -51265211 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 7 1357 356 307 0 34 chr5 101283665 101283783 -51253476 - MLT1B LTR MaLR -17 373 260 7 1357 2499 127 193 79 chr5 101288400 101289018 -51248241 - RMER6C LTR ERVK -2 688 1 7 1357 1651 191 76 15 chr5 101293497 101293906 -51243353 - RLTR16 LTR ERVK -71 434 1 7 1357 369 196 19 38 chr5 101294315 101294421 -51242838 - ORR1D2 LTR MaLR -55 315 212 7 1357 432 272 0 0 chr5 101294464 101294556 -51242703 - ORR1D2 LTR MaLR -277 93 2 7 1357 458 332 132 30 chr5 101294574 101294975 -51242284 + MER21B LTR ERV1 248 689 -174 7 1357 1720 135 11 43 chr5 101316114 101316502 -51220757 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 3 8 1357 1596 163 153 11 chr5 101317479 101317851 -51219408 + RMER4A LTR ERVK 42 466 0 8 1357 237 344 71 19 chr5 101317944 101318094 -51219165 - MLT1A1 LTR MaLR -250 158 1 8 1358 261 294 140 70 chr5 101322711 101322996 -51214263 - MLT1J LTR MaLR -185 327 23 8 1358 312 315 97 7 chr5 101323301 101323445 -51213814 - MLT1A LTR MaLR -183 191 35 8 1358 403 326 15 83 chr5 101323744 101324008 -51213251 - LTR82A LTR ERVL -457 415 170 8 1358 1688 198 47 39 chr5 101328201 101328607 -51208652 + MTC LTR MaLR 12 420 -1 8 1358 2349 185 61 108 chr5 101329782 101330423 -51206836 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 8 1358 1767 118 47 50 chr5 101332133 101332453 -51204806 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 1358 2379 66 6 3 chr5 101334517 101334851 -51202408 + IAPEY_LTR LTR ERVK 37 371 -14 8 1358 606 271 65 10 chr5 101335879 101336080 -51201179 - MTEa LTR MaLR -8 371 160 8 1358 2010 161 86 20 chr5 101336120 101336514 -51200745 - MTC LTR MaLR -1 420 1 8 1358 414 348 0 21 chr5 101336519 101336663 -51200596 - MTEa LTR MaLR -223 156 16 8 1358 629 211 77 18 chr5 101340249 101340525 -51196734 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 8 1358 283 306 190 6 chr5 101341517 101341691 -51195568 + MLT1F2 LTR MaLR 349 554 -6 8 1358 640 240 71 22 chr5 101354214 101354440 -51182819 - RMER20B LTR ERVK -263 364 128 9 1358 230 289 35 80 chr5 101356093 101356206 -51181053 - RMER12 LTR ERVK -466 856 749 9 1358 296 258 0 43 chr5 101357536 101357629 -51179630 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 318 9 1358 288 310 43 37 chr5 101358042 101358206 -51179053 - LTR16A LTR ERVL -274 177 13 9 1358 1042 203 209 114 chr5 101360890 101361303 -51175956 + MT2A LTR ERVL 2 463 -70 9 1358 1042 203 209 114 chr5 101361366 101361436 -51175823 + MT2A LTR ERVL 464 531 -2 9 1358 538 168 0 0 chr5 101362390 101362485 -51174774 + MTC LTR MaLR 10 104 -317 9 1358 4014 147 143 48 chr5 101367176 101367393 -51169866 + RLTR25B LTR ERVK 5 223 -805 9 1358 4014 147 143 48 chr5 101367921 101368458 -51168801 + RLTR25B LTR ERVK 224 774 -254 9 1358 4014 147 143 48 chr5 101368490 101368542 -51168717 + RLTR25B LTR ERVK 775 863 -165 9 1358 4014 147 143 48 chr5 101368614 101368740 -51168519 + RLTR25B LTR ERVK 864 1026 -2 9 1358 260 256 112 34 chr5 101369399 101369488 -51167771 - ORR1E LTR MaLR -263 96 1 9 1358 254 333 28 83 chr5 101371675 101371819 -51165440 - MER21B LTR ERV1 -169 694 559 9 1358 288 313 122 39 chr5 101389427 101389583 -51147676 - MLT1F2 LTR MaLR -91 469 301 9 1358 335 354 40 62 chr5 101392196 101392323 -51144936 + LTR78 LTR ERV1 126 247 -1057 9 1358 335 354 40 62 chr5 101392540 101392686 -51144573 + LTR78 LTR ERV1 248 393 -911 9 1358 1067 267 110 63 chr5 101396006 101396514 -51140745 + RMER5 LTR ERV1 1 532 -2 9 1358 2979 52 46 28 chr5 101397866 101398259 -51139000 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1358 1866 241 112 48 chr5 101399039 101399620 -51137639 - RMER20B LTR ERVK 0 627 10 9 1358 2206 178 262 41 chr5 101403954 101404558 -51132701 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 1 1358 520 207 84 13 chr5 101409187 101409326 -51127933 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 224 1 1358 437 202 12 0 chr5 101409332 101409416 -51127843 - ORR1D2 LTR MaLR -284 86 2 1 1358 298 350 7 28 chr5 101416034 101416175 -51121084 + MER67C LTR ERV1 258 395 -316 1 1358 395 267 66 40 chr5 101420334 101420486 -51116773 + MLT1-int LTR MaLR 957 1112 -259 1 1358 307 281 70 55 chr5 101420653 101420781 -51116478 + MLT2B3 LTR ERVL 398 527 -27 1 1358 1030 246 68 71 chr5 101420782 101421149 -51116110 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 1 1358 2721 92 37 3 chr5 101422404 101422783 -51114476 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 1 1358 2031 165 30 67 chr5 101423131 101423652 -51113607 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -1 560 1 1 1358 586 261 25 6 chr5 101425992 101426150 -51111109 - MTEa LTR MaLR -202 177 17 1 1358 2250 94 45 0 chr5 101427180 101427489 -51109770 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 1 1358 249 310 12 12 chr5 101429312 101429397 -51107862 + MTEa LTR MaLR 295 379 0 1 1358 1574 347 106 69 chr5 101429463 101429734 -51107525 + MTE-int LTR MaLR 66 335 -1245 1 1358 1574 347 106 69 chr5 101429924 101431086 -51106173 + MTE-int LTR MaLR 336 1552 -28 1 1358 1797 216 54 32 chr5 101431392 101431579 -51105680 - RMER19C LTR ERVK 0 611 416 1 1358 1797 216 54 32 chr5 101431627 101431904 -51105355 - RMER19C LTR ERVK -196 415 138 1 1358 362 231 119 40 chr5 101432306 101432432 -51104827 + ORR1D1 LTR MaLR 239 374 0 1 1358 911 104 0 0 chr5 101433024 101433158 -51104101 + ORR1C2 LTR MaLR 251 384 0 1 1358 1560 196 93 79 chr5 101436168 101436600 -51100659 - RLTR18B LTR ERVK -74 438 1 1 1358 2622 71 30 0 chr5 101437426 101437762 -51099497 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1358 4846 66 15 6 chr5 101437762 101438494 -51098765 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 739 -1053 1 1358 6815 59 6 1 chr5 101438500 101439434 -51097825 - ORR1A2-int LTR MaLR -134 1658 720 1 1358 1072 97 137 0 chr5 101439540 101439715 -51097544 - ORR1A2 LTR MaLR -128 199 1 1 1358 885 218 8 89 chr5 101439720 101439967 -51097292 + RLTR20C LTR ERVK 308 534 0 1 1358 276 291 78 43 chr5 101439972 101440087 -51097172 - ORR1D1 LTR MaLR -250 124 6 1 1358 3244 41 26 3 chr5 101448482 101448873 -51088386 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1359 265 234 51 41 chr5 101452922 101453020 -51084239 - MLT1F2 LTR MaLR -316 244 146 1 1359 253 313 138 42 chr5 101454001 101454241 -51083018 - MLT1L LTR MaLR 0 610 348 1 1359 1736 141 8 111 chr5 101464879 101465231 -51072028 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 3 1 1359 1160 271 37 29 chr5 101465354 101465730 -51071529 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1359 336 252 65 40 chr5 101470031 101470155 -51067104 - ORR1E LTR MaLR -195 164 38 1 1359 411 372 16 90 chr5 101481638 101481960 -51055299 - MLT1A LTR MaLR -45 329 32 1 1359 2884 39 0 3 chr5 101482346 101482684 -51054575 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1359 26191 31 30 12 chr5 101482684 101485786 -51051473 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3165 -3316 1 1359 10032 29 2 4 chr5 101485775 101486915 -51050344 + IAPEz-int LTR ERVK 5345 6481 0 1 1359 2884 39 0 3 chr5 101486915 101487253 -51050006 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1359 226 248 0 158 chr5 101491710 101491830 -51045429 + MT2B LTR ERVL 157 257 -344 1 1359 460 288 113 67 chr5 101493915 101494198 -51043061 + MLT1A LTR MaLR 23 318 -56 1 1359 439 239 0 0 chr5 101504502 101504594 -51032665 + MTD LTR MaLR 327 418 -1 1 1359 449 174 23 0 chr5 101505318 101505404 -51031855 - MTD LTR MaLR 0 419 332 1 1359 1445 207 87 32 chr5 101505544 101505854 -51031405 - MTD LTR MaLR -85 334 8 1 1359 3733 20 2 0 chr5 101507512 101507907 -51029352 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1359 2106 87 132 3 chr5 101509745 101510034 -51027225 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1359 2116 217 52 31 chr5 101514709 101515231 -51022028 + RMER15 LTR ERVL 1 533 -42 2 1359 281 253 40 0 chr5 101522770 101522845 -51014414 - MLT1A LTR MaLR -206 168 91 3 1359 510 346 81 37 chr5 101523201 101523474 -51013785 - MLT1C LTR MaLR 0 467 183 4 1359 415 247 99 61 chr5 101524027 101524208 -51013051 - MLT1C LTR MaLR -219 248 61 4 1359 2251 113 0 0 chr5 101526148 101526466 -51010793 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 5 1359 564 229 7 48 chr5 101526688 101526835 -51010424 + RLTR11B LTR ERVK 2 142 -311 5 1359 426 200 58 124 chr5 101529246 101529365 -51007894 - ORR1D1 LTR MaLR -4 366 256 5 1359 841 213 16 48 chr5 101529400 101529576 -51007683 - ORR1D1 LTR MaLR -115 255 21 5 1359 1815 201 46 48 chr5 101529869 101530281 -51006978 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 6 1359 1645 145 162 19 chr5 101556712 101556897 -50980362 - RMER17C LTR ERVK 0 410 203 8 1359 1645 145 162 19 chr5 101556930 101557103 -50980156 - RMER17C LTR ERVK -208 202 1 8 1359 241 220 17 0 chr5 101560493 101560552 -50976707 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 296 9 1359 242 273 76 25 chr5 101560797 101560876 -50976383 - MLT1A0 LTR MaLR -52 313 231 9 1359 504 354 66 43 chr5 101566927 101567275 -50969984 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 1 1359 722 93 111 0 chr5 101567999 101568107 -50969152 + MTC LTR MaLR 1 120 -301 1 1359 1468 150 89 32 chr5 101569026 101569308 -50967951 + MTC LTR MaLR 124 421 0 1 1359 1440 194 36 73 chr5 101569308 101569916 -50967343 + MTC-int LTR MaLR 835 1254 -4 1 1359 2034 164 69 41 chr5 101569912 101570301 -50966958 + MTC LTR MaLR 7 406 -15 1 1359 294 292 63 94 chr5 101570648 101570807 -50966452 - MTEb LTR MaLR -221 158 5 1 1359 1359 251 41 8 chr5 101575428 101575793 -50961466 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 1 1359 2120 198 15 5 chr5 101578175 101578572 -50958687 + MTC LTR MaLR 21 421 0 1 1360 1612 190 18 195 chr5 101582416 101582867 -50954392 + ORR1D1 LTR MaLR 1 371 -3 1 1360 455 301 86 62 chr5 101590108 101590352 -50946907 + ORR1E LTR MaLR 1 250 -109 1 1360 677 161 39 35 chr5 101616312 101616500 -50920759 - RMER17C LTR ERVK -247 163 1 1 1360 1819 146 48 53 chr5 101617895 101618069 -50919190 + RMER17C LTR ERVK 11 187 -223 1 1360 1819 146 48 53 chr5 101618186 101618412 -50918847 + RMER17C LTR ERVK 188 410 0 1 1360 227 208 0 0 chr5 101618498 101618546 -50918713 - MLT1C LTR MaLR -343 124 77 1 1360 281 290 121 61 chr5 101621235 101621400 -50915859 + MLT1I LTR MaLR 274 448 0 1 1360 289 385 66 22 chr5 101629360 101629586 -50907673 + LTR33 LTR ERVL 45 280 -235 1 1360 2015 145 81 26 chr5 101633185 101633532 -50903727 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 2 1360 1716 162 110 81 chr5 101640859 101641268 -50895991 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1360 4390 211 106 11 chr5 101641268 101642402 -50894857 + MTC-int LTR MaLR 1 1241 -17 2 1360 1686 184 150 62 chr5 101642414 101642801 -50894458 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1360 2312 185 131 8 chr5 101645454 101645929 -50891330 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 2 1360 2470 91 39 22 chr5 101649485 101649892 -50887367 + RLTR44E LTR ERVK 1 414 -38 2 1360 1149 224 145 22 chr5 101652535 101652859 -50884400 - MTEb LTR MaLR -8 371 8 2 1360 3128 278 107 17 chr5 101652861 101653978 -50883281 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 361 2 1360 1182 285 3 31 chr5 101655151 101655506 -50881753 - MTEb-int LTR MaLR -1235 345 1 2 1360 872 305 57 49 chr5 101655510 101655876 -50881383 - MTEb LTR MaLR -8 371 3 2 1360 1407 209 158 82 chr5 101659736 101660185 -50877074 + RMER19C LTR ERVK 1 483 -128 2 1360 742 171 14 21 chr5 101661264 101661407 -50875852 + RMER19C LTR ERVK 469 610 -1 2 1360 1390 224 105 50 chr5 101667887 101668362 -50868897 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 521 -56 2 1360 635 290 35 133 chr5 101676398 101676804 -50860455 - MTE2a LTR MaLR -1 378 13 2 1360 2210 146 69 21 chr5 101681393 101681827 -50855432 + RMER6B LTR ERVK 1 455 -6 2 1360 1430 209 42 42 chr5 101682906 101683310 -50853949 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 2 1360 1518 186 178 20 chr5 101690272 101690672 -50846587 - RMER19B LTR ERVK -132 770 308 2 1360 489 279 105 0 chr5 101690703 101690875 -50846384 - MTEa LTR MaLR -7 372 183 2 1360 367 288 9 18 chr5 101690895 101691008 -50846251 - MTEa LTR MaLR -253 126 15 2 1360 2347 82 31 3 chr5 101691959 101692276 -50844983 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 2 1360 258 319 34 50 chr5 101695148 101695267 -50841992 + MLT1J LTR MaLR 52 168 -344 2 1360 329 311 52 29 chr5 101696492 101696628 -50840631 + MLT1A0 LTR MaLR 4 142 -223 2 1360 1215 234 94 27 chr5 101701102 101701216 -50836043 + MTD LTR MaLR 13 140 -279 2 1360 1937 99 28 28 chr5 101701216 101701538 -50835721 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1360 1215 234 94 27 chr5 101701538 101701797 -50835462 + MTD LTR MaLR 141 411 -8 2 21 1078 227 48 96 chr5 101711632 101711987 -50825272 - MTE2a LTR MaLR -41 338 1 2 1361 2233 110 3 9 chr5 101713850 101714179 -50823080 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1361 239 222 220 11 chr5 101716463 101716554 -50820705 + MLT1B LTR MaLR 6 115 -275 3 1361 1126 111 42 0 chr5 101723544 101723733 -50813526 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 330 3 1361 1648 176 40 29 chr5 101723817 101724163 -50813096 - RLTR11A LTR ERVK -178 350 1 3 1361 549 240 145 94 chr5 101728160 101728296 -50808963 - RMER10A LTR ERVL -51 391 272 3 1361 549 240 145 94 chr5 101728445 101728680 -50808579 - RMER10A LTR ERVL -171 271 1 3 1361 903 320 117 36 chr5 101731767 101732315 -50804944 - MLT1J-int LTR MaLR -260 1127 536 3 1361 869 249 21 8 chr5 101739312 101739592 -50797667 - RMER19A LTR ERVK -1 736 357 3 1361 1314 261 81 11 chr5 101739835 101739950 -50797309 - RMER19A LTR ERVK -352 385 265 3 1361 1314 261 81 11 chr5 101739994 101740067 -50797192 - RMER19A LTR ERVK -473 264 174 3 1361 1314 261 81 11 chr5 101740152 101740321 -50796938 - RMER19A LTR ERVK -564 173 4 3 1361 2124 69 18 7 chr5 101763042 101763362 -50773897 + ORR1A2 LTR MaLR 1 363 -11 3 1361 225 185 93 0 chr5 101766361 101766415 -50770844 + LTR85a LTR Gypsy? 523 581 -121 3 1361 3418 38 2 0 chr5 101769290 101769685 -50767574 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1361 7410 178 51 65 chr5 101771540 101773462 -50763797 - RMER3D-int LTR ERVK -140 2702 287 3 1361 1560 131 216 3 chr5 101773462 101773651 -50763608 - RMER17C LTR ERVK 0 410 179 3 1361 1560 131 216 3 chr5 101773718 101773866 -50763393 - RMER17C LTR ERVK -232 178 3 3 1361 2054 190 81 58 chr5 101773866 101774131 -50763128 - RMER3D-int LTR ERVK -2556 286 10 3 1361 1697 204 144 44 chr5 101774194 101774713 -50762546 - RLTR17 LTR ERVK -121 571 1 3 1361 611 261 48 11 chr5 101776600 101776786 -50760473 - MTD LTR MaLR -209 210 18 3 1361 2339 86 17 0 chr5 101776961 101777309 -50759950 - RMER17A LTR ERVK -397 354 1 3 1361 296 222 33 100 chr5 101777527 101777647 -50759612 + RMER15 LTR ERVL 15 126 -449 3 1361 690 260 107 28 chr5 101777688 101777941 -50759318 + RMER15 LTR ERVL 294 566 -9 3 1361 1117 208 7 66 chr5 101781146 101781419 -50755840 - ORR1D-int LTR MaLR -133 1237 981 3 1361 569 251 113 11 chr5 101781546 101781731 -50755528 + ORR1D2 LTR MaLR 155 358 -12 3 1361 642 338 27 45 chr5 101799605 101799924 -50737335 + MLT2B1 LTR ERVL 218 507 -8 4 1361 768 239 33 48 chr5 101800188 101800490 -50736769 + MLT1B LTR MaLR 5 300 -167 4 1361 1349 192 102 45 chr5 101808766 101809120 -50728139 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1361 328 219 0 0 chr5 101819633 101819706 -50717553 + MLT1G3 LTR MaLR 499 571 -24 4 1361 331 356 34 14 chr5 101819731 101819879 -50717380 - LTR16C LTR ERVL -14 475 325 4 1361 230 355 84 0 chr5 101822626 101822733 -50714526 + MLT1A1 LTR MaLR 3 118 -290 4 1361 563 294 8 99 chr5 101822895 101822964 -50714295 - MTEa LTR MaLR -157 222 167 4 1361 563 294 8 99 chr5 101823167 101823339 -50713920 - MTEa LTR MaLR -213 166 3 4 1361 3466 121 31 5 chr5 101824661 101825244 -50712015 + ORR1A2-int LTR MaLR 950 1547 -416 4 1361 2002 130 51 6 chr5 101826210 101826576 -50710683 + ORR1A2-int LTR MaLR 1207 1887 -76 4 1361 1909 92 11 0 chr5 101826576 101826849 -50710410 + ORR1A2 LTR MaLR 1 276 -51 4 1361 264 250 0 0 chr5 101836126 101836186 -50701073 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 470 4 1361 536 350 78 35 chr5 101837121 101837518 -50699741 + MLT1H LTR MaLR 16 478 -71 4 1361 260 277 0 0 chr5 101837733 101837798 -50699461 - MTE-int LTR MaLR -320 1260 1196 4 1361 1702 322 142 37 chr5 101837814 101838914 -50698345 - MTE-int LTR MaLR -361 1219 5 4 1361 240 316 80 36 chr5 101839044 101839182 -50698077 - ORR1E LTR MaLR -163 196 53 4 1361 572 262 176 35 chr5 101842031 101842292 -50694967 - RMER15 LTR ERVL -1 574 277 4 1361 289 156 61 61 chr5 101842400 101842482 -50694777 - RMER15 LTR ERVL -480 95 14 4 1362 348 330 43 39 chr5 101843844 101844052 -50693207 - MLT1D LTR MaLR -17 488 280 4 1362 289 286 91 10 chr5 101844097 101844196 -50693063 - MLT1D LTR MaLR -364 141 35 4 1362 1500 133 51 0 chr5 101847385 101847641 -50689618 - ORR1A3 LTR MaLR -55 271 3 4 1362 7416 94 18 5 chr5 101847643 101848749 -50688510 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 844 4 1362 400 318 27 7 chr5 101849619 101849768 -50687491 - MLT1A0 LTR MaLR -198 167 16 4 1362 773 273 164 68 chr5 101851365 101851686 -50685573 - MT2A LTR ERVL -16 517 190 4 1362 3114 57 10 27 chr5 101851686 101852100 -50685159 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1362 773 273 164 68 chr5 101852100 101852249 -50685010 - MT2A LTR ERVL -344 189 2 4 1362 499 344 73 4 chr5 101865873 101866121 -50671138 - LTR16E2 LTR ERVL -72 496 232 4 1362 600 325 107 32 chr5 101875659 101875822 -50661437 + MTEa LTR MaLR 3 157 -222 5 1362 600 325 107 32 chr5 101875909 101876091 -50661168 + MTEa LTR MaLR 158 373 -6 5 1362 524 254 56 0 chr5 101878365 101878507 -50658752 + RMER10B LTR ERVL 249 398 0 5 1362 1075 194 128 36 chr5 101878577 101878881 -50658378 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 5 1362 1309 176 63 137 chr5 101881066 101881295 -50655964 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 174 5 1362 1309 176 63 137 chr5 101881467 101881652 -50655607 - ORR1C2 LTR MaLR -211 173 1 5 1362 331 223 50 50 chr5 101882633 101882732 -50654527 - ORR1E LTR MaLR -17 362 264 5 1362 538 274 68 84 chr5 101882724 101883035 -50654224 - ORR1E LTR MaLR -52 307 2 5 1362 1710 57 0 0 chr5 101884139 101884366 -50652893 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 181 5 1362 1331 49 60 0 chr5 101885388 101885572 -50651687 - MTB_Mm LTR MaLR -212 195 1 5 1362 3269 143 47 15 chr5 101888035 101888583 -50648676 - RLTR12A LTR ERVK -2 566 1 5 1362 1230 250 19 113 chr5 101889111 101889576 -50647683 + MTD LTR MaLR 6 419 0 5 1362 1032 209 248 3 chr5 101895212 101895535 -50641724 - MTD LTR MaLR 0 419 18 5 1362 1572 221 40 0 chr5 101897008 101897361 -50639898 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 5 1362 9139 31 4 0 chr5 101898943 101900156 -50637103 - MERVL-int LTR ERVL -3722 2039 686 5 1362 269 180 0 0 chr5 101904848 101904898 -50632361 + MTEb LTR MaLR 329 378 -1 5 1362 706 232 8 115 chr5 101910343 101910562 -50626697 - MLT1B LTR MaLR 0 390 198 5 1362 706 232 8 115 chr5 101910742 101910775 -50626484 - MLT1B LTR MaLR -193 197 165 5 1362 1057 234 187 33 chr5 101920193 101920556 -50616703 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1362 277 332 59 82 chr5 101921034 101921262 -50615997 - MLT2B3 LTR ERVL -186 484 262 5 1362 308 343 76 76 chr5 101921667 101921907 -50615352 - ORR1E LTR MaLR 0 359 133 5 1362 2116 162 73 15 chr5 101921907 101922302 -50614957 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 5 1362 308 343 76 76 chr5 101922302 101922417 -50614842 - ORR1E LTR MaLR -227 132 5 5 1362 1691 212 57 12 chr5 101933144 101933545 -50603714 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1362 265 327 113 30 chr5 101936919 101937149 -50600110 + MER76 LTR ERVL 25 273 -418 5 1362 1824 189 89 5 chr5 101941170 101941552 -50595707 - MTD LTR MaLR -4 415 2 5 1362 1802 17 0 75 chr5 101941670 101941925 -50595334 + IAPLTR2b LTR ERVK 92 327 0 5 1362 2891 78 2 40 chr5 101943348 101943815 -50593444 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 5 1362 242 228 0 17 chr5 101945036 101945094 -50592165 - MTC LTR MaLR 0 421 365 5 1362 1647 168 73 0 chr5 101945731 101946046 -50591213 - MTC LTR MaLR -83 338 1 5 1362 293 287 23 11 chr5 101946721 101946809 -50590450 - ORR1E LTR MaLR -115 244 156 6 1362 297 301 12 123 chr5 101952124 101952287 -50584972 + MLT1B LTR MaLR 217 361 -29 6 1362 1058 83 6 0 chr5 101960855 101961011 -50576248 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 173 6 1363 2385 103 18 0 chr5 101977037 101977377 -50559882 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 1363 420 318 39 33 chr5 101979717 101979899 -50557360 - RMER15 LTR ERVL -106 469 287 6 1363 1532 111 0 0 chr5 101981981 101982207 -50555052 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 182 6 1363 446 144 92 46 chr5 101982244 101982397 -50554862 - RMER17C LTR ERVK -135 275 116 6 1363 1074 77 92 29 chr5 101982405 101982579 -50554680 - MTB_Mm LTR MaLR -222 185 1 6 1363 1372 157 78 69 chr5 101990427 101990841 -50546418 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1363 938 221 213 22 chr5 101992147 101992461 -50544798 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 1 6 1363 2404 70 48 0 chr5 101995870 101996182 -50541077 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1363 225 390 19 52 chr5 102009460 102009671 -50527588 + MLT1J LTR MaLR 112 315 -197 1 1363 1732 140 60 35 chr5 102014095 102014413 -50522846 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 1363 857 183 25 64 chr5 102023016 102023220 -50514039 + RLTR19-int LTR ERVK 2580 2775 -3362 4 1363 2957 103 5 0 chr5 102033983 102034381 -50502878 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1363 3050 112 19 11 chr5 102044501 102044972 -50492287 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 8 1363 3694 65 19 16 chr5 102044973 102045698 -50491561 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 8 1363 952 67 0 0 chr5 102045698 102045817 -50491442 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 8 1363 1894 93 0 0 chr5 102045818 102046064 -50491195 + IAPEz-int LTR ERVK 2252 2497 -5183 8 1363 15049 41 5 3 chr5 102046091 102047861 -50489398 + IAPEz-int LTR ERVK 4708 6479 -2 8 1363 3055 112 19 11 chr5 102047863 102048334 -50488925 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 8 1363 1559 182 73 67 chr5 102055075 102055447 -50481812 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 1363 5423 192 104 18 chr5 102055465 102056676 -50480583 + ORR1D1-int LTR MaLR 56 1370 0 9 1363 1659 180 66 55 chr5 102056664 102057029 -50480230 + ORR1D1 LTR MaLR 3 371 -3 9 1363 309 203 50 17 chr5 102058435 102058495 -50478764 + RLTR40 LTR ERVK 3 64 -753 9 1363 440 328 103 27 chr5 102058504 102058689 -50478570 - MLT1E3 LTR MaLR -18 606 408 9 1363 359 350 89 10 chr5 102061235 102061437 -50475822 - MLT1E3 LTR MaLR -15 429 212 9 1363 278 306 0 0 chr5 102061459 102061531 -50475728 - MLT1E3 LTR MaLR -335 177 106 9 1363 2227 169 51 13 chr5 102066174 102066569 -50470690 - MTC LTR MaLR -9 412 3 1 1363 520 201 216 63 chr5 102081012 102081240 -50456019 - MLT1F1 LTR MaLR -4 565 312 1 1363 501 250 29 139 chr5 102099133 102099407 -50437852 + RLTR15 LTR ERVK 18 261 -98 1 1364 2549 77 27 0 chr5 102110097 102110434 -50426825 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1364 1142 132 23 0 chr5 102112840 102113014 -50424245 + ORR1A2 LTR MaLR 1 178 -149 1 1364 3648 81 126 11 chr5 102113034 102113558 -50423701 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 1 1364 765 263 146 68 chr5 102118973 102119203 -50418056 - MTEa LTR MaLR -15 364 107 1 1364 1228 212 142 9 chr5 102119203 102119526 -50417733 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 1 1364 765 263 146 68 chr5 102119526 102119617 -50417642 - MTEa LTR MaLR -273 106 18 1 1364 1049 280 80 30 chr5 102121614 102121957 -50415302 - MTE2b LTR MaLR -13 408 6 1 1364 2287 89 6 61 chr5 102123379 102123725 -50413534 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1364 1699 173 136 3 chr5 102127421 102127775 -50409484 + MTD LTR MaLR 11 411 -8 2 1364 3149 58 8 5 chr5 102128350 102128749 -50408510 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1364 619 250 36 103 chr5 102130940 102131157 -50406102 + ORR1E LTR MaLR 3 187 -187 2 1364 333 240 209 20 chr5 102131402 102131555 -50405704 + ORR1E LTR MaLR 169 350 -9 2 1364 795 53 19 16 chr5 102136117 102136250 -50401009 - RMER17B LTR ERVK -287 464 344 2 1364 2767 127 183 6 chr5 102136241 102136334 -50400925 - RMER6A LTR ERVK -113 643 542 2 1364 2767 127 183 6 chr5 102136447 102136899 -50400360 - RMER6A LTR ERVK -215 541 3 2 1364 1813 90 111 7 chr5 102137402 102137672 -50399587 + RMER2 LTR ERV1 1 298 -269 2 1364 2566 212 168 63 chr5 102138881 102139736 -50397523 + RMER17B LTR ERVK 1 945 -13 2 1364 1383 170 119 46 chr5 102139813 102139983 -50397276 + ORR1D1 LTR MaLR 3 165 -209 2 1364 1383 170 119 46 chr5 102140149 102140192 -50397067 + ORR1D1 LTR MaLR 166 224 -150 2 1364 1383 170 119 46 chr5 102140220 102140350 -50396909 + ORR1D1 LTR MaLR 225 372 -2 2 1364 1100 225 136 10 chr5 102143356 102143659 -50393600 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 2 1364 464 337 44 80 chr5 102145678 102145952 -50391307 + LTR48B LTR ERV1 381 644 0 2 1364 244 277 117 0 chr5 102148907 102149001 -50388258 + MLT2D LTR ERVL 1 105 -309 2 1364 621 283 179 17 chr5 102150400 102150634 -50386625 + MLT2D LTR ERVL 81 352 -62 2 1364 287 351 58 35 chr5 102156604 102156778 -50380481 - ORR1E LTR MaLR -174 185 8 2 1364 1269 142 24 5 chr5 102157394 102157607 -50379652 + MTC LTR MaLR 203 419 -2 2 1364 3140 55 17 17 chr5 102159639 102160046 -50377213 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1364 1229 244 65 10 chr5 102160192 102160498 -50376761 + MTE2b LTR MaLR 48 370 -9 2 1364 537 302 78 12 chr5 102164051 102164249 -50373010 - MLT1A0 LTR MaLR -3 405 156 3 1364 411 322 91 101 chr5 102164854 102165062 -50372197 - MLT1A0 LTR MaLR -207 201 3 3 1364 1329 245 62 18 chr5 102166837 102167212 -50370047 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 1364 1427 147 31 80 chr5 102169645 102169933 -50367326 + ORR1C1 LTR MaLR 15 288 -90 3 1364 1771 256 46 42 chr5 102170139 102170657 -50366602 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 13 3 1364 429 310 67 39 chr5 102173583 102173791 -50363468 + MLT1B LTR MaLR 98 311 -79 3 1364 2747 57 8 3 chr5 102174369 102174723 -50362536 + MTB_Mm LTR MaLR 1 356 -51 3 1364 306 218 7 57 chr5 102178067 102178208 -50359051 + ORR1B1-int LTR MaLR 621 754 -755 3 1364 421 182 51 117 chr5 102178083 102178100 -50359159 + MT2B LTR ERVL 151 158 -443 3 1364 3606 147 78 43 chr5 102184154 102184846 -50352413 + RMER6D LTR ERVK 1 716 -4 3 1364 3617 18 0 0 chr5 102185772 102186168 -50351091 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1364 359 320 62 17 chr5 102186564 102186742 -50350517 - ORR1E LTR MaLR -167 192 7 3 1364 2007 161 30 35 chr5 102190230 102190602 -50346657 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 9 3 1364 231 164 73 110 chr5 102191379 102191461 -50345798 + LTR88b LTR Gypsy? 242 320 -517 3 1364 265 214 0 0 chr5 102191704 102191760 -50345499 - MT2A LTR ERVL 0 601 546 3 1364 1645 180 227 18 chr5 102191873 102192257 -50345002 - MT2A LTR ERVL -69 464 1 3 1364 692 276 98 11 chr5 102202467 102202731 -50334528 - MLT1D LTR MaLR -8 497 211 3 1364 245 265 176 0 chr5 102203043 102203111 -50334148 - MLT1A LTR MaLR -7 367 288 3 1364 703 281 131 46 chr5 102207712 102207838 -50329421 - MTD LTR MaLR -14 405 270 3 1364 703 281 131 46 chr5 102207886 102207964 -50329295 - MTD LTR MaLR -150 269 182 3 1364 1737 179 61 19 chr5 102207964 102208323 -50328936 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1364 703 281 131 46 chr5 102208323 102208490 -50328769 - MTD LTR MaLR -238 181 1 3 1364 571 234 101 20 chr5 102214067 102214215 -50323044 + MLT1A1 LTR MaLR 248 407 -1 3 1364 440 321 32 47 chr5 102219619 102219897 -50317362 + MTEb LTR MaLR 1 274 -105 4 1364 370 197 0 27 chr5 102231415 102231488 -50305771 - ORR1C2 LTR MaLR -283 101 31 4 1364 977 235 176 34 chr5 102233143 102233495 -50303764 - MTD LTR MaLR -14 405 4 4 1364 1358 179 127 29 chr5 102233515 102233831 -50303428 - ORR1C2 LTR MaLR -14 370 24 4 1365 240 250 0 45 chr5 102238957 102239024 -50298235 - LTR48 LTR ERV1 -559 228 165 4 1365 409 284 102 54 chr5 102254725 102255078 -50282181 + RMER15-int LTR ERVL 232 601 -4398 4 1365 272 211 193 0 chr5 102255187 102255296 -50281963 + RMER15-int LTR ERVL 652 781 -4218 4 1365 912 209 146 146 chr5 102255487 102255891 -50281368 + MTD LTR MaLR 14 417 -2 4 1365 1772 170 3 25 chr5 102256512 102256837 -50280422 + MTC LTR MaLR 3 320 -101 4 1365 3315 37 40 0 chr5 102266276 102266681 -50270578 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1365 591 189 134 51 chr5 102266729 102267151 -50270108 + RMER3D-int LTR ERVK 489 1093 -6313 4 1365 1719 169 134 13 chr5 102267178 102267660 -50269599 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1533 -1309 4 1365 651 149 36 29 chr5 102267696 102267834 -50269425 + RMER3D-int LTR ERVK 1541 1679 -1163 4 1365 3318 202 50 37 chr5 102268011 102268934 -50268325 + RMER3D-int LTR ERVK 1907 2841 -1 4 1365 2847 41 89 13 chr5 102268935 102269326 -50267933 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1365 250 318 92 23 chr5 102271013 102271100 -50266159 + MTD LTR MaLR 9 101 -318 4 1365 1286 173 32 154 chr5 102276438 102276807 -50260452 + ORR1D1 LTR MaLR 47 370 -4 4 1365 1963 147 69 83 chr5 102282360 102282783 -50254476 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 4 1365 824 278 89 86 chr5 102283750 102284109 -50253150 + MTE2a LTR MaLR 3 362 -17 4 1365 1370 136 91 33 chr5 102297890 102298164 -50239095 + ORR1A4 LTR MaLR 32 321 -8 4 1365 777 242 119 14 chr5 102298353 102298689 -50238570 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 4 1365 231 342 45 27 chr5 102312490 102312601 -50224658 + LTR16A LTR ERVL 339 451 0 5 1365 2069 221 56 14 chr5 102320103 102320604 -50216655 + RLTR11A2 LTR ERVK 6 527 0 5 1365 466 163 356 15 chr5 102321228 102321409 -50215850 - MTD LTR MaLR -176 245 6 5 1365 236 283 17 0 chr5 102324919 102324979 -50212280 + LTR40c LTR ERVL 365 425 -40 5 1365 719 242 80 25 chr5 102332218 102332417 -50204842 + RMER5 LTR ERV1 323 532 -2 5 1365 3520 30 2 2 chr5 102334105 102334512 -50202747 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1365 589 307 171 18 chr5 102343604 102343932 -50193327 + MTD LTR MaLR 18 395 -24 5 1366 1259 209 121 68 chr5 102371209 102371699 -50165560 + RLTR20C LTR ERVK 33 534 0 5 1366 4310 117 40 28 chr5 102375186 102375933 -50161326 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 5 1366 2344 147 128 13 chr5 102381021 102381491 -50155768 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 5 1366 280 321 58 23 chr5 102396593 102396765 -50140494 + MLT1A LTR MaLR 73 250 -124 6 1366 1287 214 117 71 chr5 102397078 102397471 -50139788 - MTD LTR MaLR -8 411 1 6 1366 1881 14 120 0 chr5 102405015 102405290 -50131969 + MERVL-int LTR ERVL 511 818 -4667 6 1366 457 36 0 0 chr5 102405291 102405347 -50131912 + MT2_Mm LTR ERVL 438 493 0 6 1366 6370 9 0 0 chr5 102405347 102406040 -50131219 + MERVL-int LTR ERVL 1 693 -4792 6 1366 372 37 0 53 chr5 102406040 102406097 -50131162 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1019 829 776 6 1366 3627 10 0 14 chr5 102406095 102406518 -50130741 - MT2_Mm LTR ERVL -76 417 1 6 1366 314 26 0 0 chr5 102406518 102406556 -50130703 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 6 1366 376 179 46 35 chr5 102406556 102406643 -50130616 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 6 1366 2549 20 3 0 chr5 102406643 102406935 -50130324 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 5068 6 1366 366 228 153 8 chr5 102407116 102407240 -50130019 + MTC LTR MaLR 1 142 -279 6 1366 701 289 183 4 chr5 102408258 102408526 -50128733 + MTEa LTR MaLR 59 374 -5 6 1366 404 117 17 0 chr5 102412810 102412870 -50124389 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 324 6 1366 580 196 39 77 chr5 102413250 102413405 -50123854 - ORR1D1 LTR MaLR -60 314 166 6 1366 709 203 66 88 chr5 102413390 102413638 -50123621 - ORR1D1 LTR MaLR -136 242 1 6 1366 2244 89 19 19 chr5 102415355 102415674 -50121585 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1366 234 247 47 105 chr5 102417247 102417259 -50120000 + MT2B LTR ERVL 152 158 -443 6 1366 2484 116 130 11 chr5 102420577 102421015 -50116244 + MTC-int LTR MaLR 593 1082 -176 6 1366 333 122 0 20 chr5 102422496 102422546 -50114713 + RMER5 LTR ERV1 440 488 -46 6 1366 267 267 76 65 chr5 102424472 102424564 -50112695 + MLT1D LTR MaLR 12 104 -401 6 1366 340 293 89 77 chr5 102424900 102425148 -50112111 + MLT1D LTR MaLR 255 505 0 6 1366 286 311 71 32 chr5 102435252 102435343 -50101916 + MT2B2 LTR ERVL 162 257 -327 7 1366 474 256 251 0 chr5 102435748 102435959 -50101300 + MTD LTR MaLR 156 419 0 7 1366 334 258 57 47 chr5 102438042 102438148 -50099111 + MT2B LTR ERVL 158 264 -337 7 1366 995 198 53 53 chr5 102440942 102441204 -50096055 + RMER10B LTR ERVL 1 262 -136 7 1366 836 137 11 97 chr5 102441875 102442061 -50095198 + RMER10B LTR ERVL 228 397 -1 7 1366 368 292 125 51 chr5 102443383 102443659 -50093600 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 286 -167 7 1366 287 318 58 70 chr5 102443678 102443935 -50093324 + RLTR12B LTR ERVK 241 494 -34 7 1366 3440 97 19 74 chr5 102444441 102445009 -50092250 - MT2B LTR ERVL -64 537 1 7 1366 693 266 115 91 chr5 102446874 102447238 -50090021 + MTE2a LTR MaLR 1 373 -6 7 1366 1016 282 103 20 chr5 102448371 102448872 -50088387 + MLT1F1 LTR MaLR 1 560 0 7 1366 2216 84 35 10 chr5 102449628 102449942 -50087317 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 5 7 1366 2772 61 3 0 chr5 102455906 102456251 -50081008 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 1366 2398 105 9 0 chr5 102457523 102457847 -50079412 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1366 356 252 36 71 chr5 102457954 102458067 -50079192 + ORR1E LTR MaLR 1 109 -265 7 1366 1546 189 70 53 chr5 102460261 102460635 -50076624 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 7 1366 353 332 106 66 chr5 102460748 102461050 -50076209 + MER34 LTR ERV1 124 437 -105 7 1366 524 267 117 33 chr5 102461078 102461318 -50075941 + ORR1E LTR MaLR 1 260 -99 7 1366 261 224 99 62 chr5 102461426 102461507 -50075752 + MER34 LTR ERV1 459 542 0 7 1366 1674 146 22 96 chr5 102472368 102472723 -50064536 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1366 2727 111 15 18 chr5 102477561 102477956 -50059303 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1366 1009 261 200 27 chr5 102479422 102479871 -50057388 + MTEb-int LTR MaLR 1053 1579 -1 7 1366 1273 239 24 30 chr5 102479872 102480170 -50057089 + MTEb LTR MaLR 1 296 -83 7 1366 685 282 50 25 chr5 102484328 102484528 -50052731 - MTD LTR MaLR -118 301 97 7 1366 232 105 0 26 chr5 102490256 102490295 -50046964 + RLTR11A2 LTR ERVK 490 527 0 8 1367 304 284 13 10 chr5 102505836 102505956 -50031303 + MLT2B4 LTR ERVL 1 122 -432 1 1367 1692 142 107 15 chr5 102507870 102507902 -50029357 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 328 1 1367 1692 142 107 15 chr5 102508071 102508366 -50028893 - ORR1B2 LTR MaLR -40 327 2 1 1367 680 265 128 21 chr5 102508898 102509257 -50028002 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 1 1367 1473 238 74 0 chr5 102510940 102511293 -50025966 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 2 1367 513 197 17 0 chr5 102511296 102511413 -50025846 + ORR1D2 LTR MaLR 1 119 -251 2 1367 541 167 127 0 chr5 102511440 102511566 -50025693 + ORR1D2 LTR MaLR 229 370 0 2 1367 1238 253 14 4 chr5 102512220 102512498 -50024761 - MTE2b LTR MaLR -84 295 15 2 1367 366 320 96 32 chr5 102514334 102514615 -50022644 + MT2A LTR ERVL 142 440 -93 3 1367 1548 193 150 5 chr5 102517140 102517548 -50019711 + RLTR18B LTR ERVK 41 507 -5 4 1367 461 297 119 70 chr5 102518959 102519245 -50018014 + MLT1A0 LTR MaLR 66 365 0 4 1367 1302 221 163 18 chr5 102519576 102520031 -50017228 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 7 4 1367 3435 40 0 2 chr5 102526191 102526592 -50010667 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1367 471 380 50 40 chr5 102530130 102530429 -50006830 + LTR16B LTR ERVL 5 306 -156 6 1367 5475 88 36 10 chr5 102530524 102531403 -50005856 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 1023 1 6 1367 538 295 122 36 chr5 102533673 102533926 -50003333 - MTD LTR MaLR -144 275 1 7 1367 847 202 85 5 chr5 102534161 102534350 -50002909 - MTD LTR MaLR -52 367 164 7 1367 229 374 20 39 chr5 102534351 102534504 -50002755 + MLT1G1 LTR MaLR 158 307 -365 7 1367 255 287 68 60 chr5 102535114 102535296 -50001963 + MLT1G1 LTR MaLR 300 523 -56 7 1367 282 278 14 0 chr5 102540170 102540242 -49997017 - MLT2D LTR ERVL -232 182 110 9 1367 304 254 78 84 chr5 102545760 102545902 -49991357 - MT2B LTR ERVL -337 264 124 1 1367 630 317 39 10 chr5 102548115 102548322 -49988937 + RMER15 LTR ERVL 346 558 -17 1 1367 1727 237 61 16 chr5 102550058 102550551 -49986708 + RMER20A LTR ERVK 2 516 0 1 1367 450 288 15 29 chr5 102551068 102551204 -49986055 - MTEb LTR MaLR 0 379 246 1 1367 387 386 32 27 chr5 102551216 102551437 -49985822 - MTEb LTR MaLR -127 232 11 1 1367 443 404 36 33 chr5 102551532 102551806 -49985453 + LTR33 LTR ERVL 1 275 -240 1 1367 2285 173 41 24 chr5 102558327 102558426 -49978833 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 413 1 1367 2285 173 41 24 chr5 102558479 102558872 -49978387 - RLTR16 LTR ERVK -93 412 7 1 1367 1368 189 119 35 chr5 102559578 102559682 -49977577 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 271 1 1367 2927 35 6 0 chr5 102559682 102560026 -49977233 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1367 1368 189 119 35 chr5 102560026 102560116 -49977143 - ORR1D1 LTR MaLR -104 270 168 1 1367 1368 189 119 35 chr5 102560172 102560321 -49976938 - ORR1D1 LTR MaLR -207 167 2 1 1367 1579 135 57 108 chr5 102560494 102560954 -49976305 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 1 1367 2326 138 42 9 chr5 102562288 102562718 -49974541 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 7 450 -107 1 1367 3066 74 5 12 chr5 102563576 102563985 -49973274 + MTB_Mm LTR MaLR 1 406 -1 1 1367 2618 85 3 5 chr5 102566712 102567092 -49970167 - MTB LTR MaLR 0 400 22 1 1367 662 24 0 0 chr5 102567082 102567165 -49970094 + MTB_Mm LTR MaLR 325 407 0 1 1367 238 61 0 0 chr5 102567183 102567216 -49970043 - MTC-int LTR MaLR -1155 103 71 1 1367 790 70 20 47 chr5 102567222 102567371 -49969888 + MTB_Mm-int LTR MaLR 954 1098 0 1 1367 643 83 0 0 chr5 102567371 102567467 -49969792 + MTB_Mm LTR MaLR 1 96 -311 1 1367 1740 103 0 0 chr5 102567462 102567715 -49969544 - MTB LTR MaLR -147 253 1 1 1367 1071 209 43 20 chr5 102569880 102570134 -49967125 - MERVL_2A-int LTR ERVL -309 5452 5193 1 1367 664 292 75 65 chr5 102570428 102570746 -49966513 - MTD LTR MaLR -71 348 9 1 1367 2306 155 63 2 chr5 102571313 102571708 -49965551 + MTC LTR MaLR 3 421 0 1 1367 4480 100 9 86 chr5 102574464 102575274 -49961985 - RMER17A LTR ERVK -4 747 1 1 1367 351 298 32 42 chr5 102575721 102575914 -49961345 + MLT1A LTR MaLR 186 363 -27 1 1367 1628 200 92 19 chr5 102577136 102577639 -49959620 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 559 -4 1 1367 380 144 21 24 chr5 102579309 102579401 -49957858 + MTD LTR MaLR 306 419 0 1 1367 3118 64 20 2 chr5 102579409 102579802 -49957457 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1367 1587 145 48 57 chr5 102585656 102585701 -49951558 - MT2B LTR ERVL 0 601 559 1 1367 1587 157 89 48 chr5 102585777 102586161 -49951098 - MT2B LTR ERVL -43 558 2 1 1367 261 385 9 0 chr5 102590282 102590391 -49946868 - MTEb LTR MaLR -34 345 236 1 1367 352 151 46 81 chr5 102595128 102595259 -49942000 + ORR1B1 LTR MaLR 1 144 -250 1 1367 1844 160 52 31 chr5 102595270 102595656 -49941603 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1367 3173 29 65 3 chr5 102602309 102602692 -49934567 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1367 345 346 18 55 chr5 102608037 102608202 -49929057 - MTEa LTR MaLR -220 159 1 2 1367 598 245 87 45 chr5 102608969 102609281 -49927978 + MLT1A1 LTR MaLR 21 408 0 2 1367 369 317 0 0 chr5 102609565 102609685 -49927574 + MLT1A1-int LTR MaLR 29 148 -1587 2 1367 272 286 116 23 chr5 102610112 102610241 -49927018 + MLT1A1-int LTR MaLR 1247 1387 -348 2 1367 799 111 0 0 chr5 102610514 102610631 -49926628 + RLTR23 LTR ERV1 314 430 0 2 1367 455 287 161 21 chr5 102610656 102610898 -49926361 + MLT1A1-int LTR MaLR 1373 1648 -87 2 1367 226 322 106 28 chr5 102614001 102614180 -49923079 - MLT1L LTR MaLR -291 319 127 2 1367 3000 88 28 17 chr5 102615731 102616202 -49921057 - LTRIS2 LTR ERV1 -88 476 1 2 1367 824 207 125 0 chr5 102616203 102616411 -49920848 - MuRRS4-int LTR ERV1 -42 5021 4788 2 1367 2964 236 25 25 chr5 102616402 102617111 -49920148 - MuRRS4-int LTR ERV1 -792 4271 3563 2 1367 8880 108 43 29 chr5 102617436 102618863 -49918396 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2030 3033 1640 2 1367 1389 219 107 25 chr5 102618842 102619484 -49917775 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3619 1444 750 2 1367 2185 125 27 9 chr5 102619472 102619803 -49917456 - RMER16-int LTR ERVK -3963 1443 1107 2 1367 3213 102 9 2 chr5 102626454 102626898 -49910361 - RMER16-int LTR ERVK -4283 1123 677 2 1367 615 113 147 9 chr5 102626919 102627035 -49910224 - RMER16-int LTR ERVK -5134 272 141 2 1367 259 200 30 104 chr5 102627492 102627626 -49909633 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3574 124 1 2 1367 987 105 49 12 chr5 102627626 102627790 -49909469 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 395 2 1367 470 295 46 57 chr5 102628358 102628552 -49908707 - MTE2a LTR MaLR -17 362 171 2 1368 3142 147 30 11 chr5 102632310 102632875 -49904384 - RMER12 LTR ERVK -746 576 1 2 1368 710 209 66 35 chr5 102639225 102639423 -49897836 - RMER10B LTR ERVL 0 398 195 2 1368 391 245 10 10 chr5 102645876 102645979 -49891280 + MTD LTR MaLR 18 120 -299 2 1368 503 222 43 15 chr5 102652163 102652358 -49884901 + MTD LTR MaLR 104 416 -3 2 1368 379 301 97 8 chr5 102653744 102653868 -49883391 - LTR16B1 LTR ERVL -5 475 341 2 1368 2308 82 0 0 chr5 102653904 102654222 -49883037 - ORR1A2 LTR MaLR -9 318 1 2 1368 289 124 30 44 chr5 102657844 102657919 -49879340 - MTE2b LTR MaLR -1 378 291 2 1368 439 260 57 43 chr5 102658283 102658526 -49878733 - MTE2b LTR MaLR -166 253 1 2 1368 3713 231 146 57 chr5 102659958 102661620 -49875639 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1810 -38 2 1368 439 349 80 65 chr5 102668717 102669054 -49868205 + MER74A LTR ERVL 16 357 -201 2 1368 258 322 34 11 chr5 102669033 102669121 -49868138 - MTEb LTR MaLR -11 368 279 2 1368 2555 49 31 0 chr5 102672595 102672886 -49864373 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 95 2 1368 2555 49 31 0 chr5 102673490 102673522 -49863737 - IAPEY_LTR LTR ERVK -291 94 53 2 1368 776 148 5 23 chr5 102680192 102680355 -49856904 + RMER17D LTR ERVK 751 887 -19 3 1368 303 317 66 36 chr5 102682315 102682482 -49854777 - MLT1B LTR MaLR -38 352 181 3 1368 302 317 108 0 chr5 102682612 102682732 -49854527 - MLT1B LTR MaLR -241 133 1 3 1368 225 148 93 0 chr5 102689162 102689216 -49848043 - ORR1E LTR MaLR -248 111 53 3 1368 1969 197 191 20 chr5 102689736 102690243 -49847016 + RMER19B LTR ERVK 309 902 0 3 1368 1991 145 19 12 chr5 102691951 102692273 -49844986 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 6 3 1368 3562 35 2 2 chr5 102693132 102693528 -49843731 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1368 1207 262 63 11 chr5 102701440 102701787 -49835472 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 3 1368 4327 154 36 6 chr5 102704246 102704918 -49832341 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 3 1368 479 125 0 53 chr5 102704918 102704994 -49832265 + RMER3D-int LTR ERVK 1 72 -2770 3 1368 1047 269 65 54 chr5 102712775 102713003 -49824256 + MTD LTR MaLR 1 218 -201 3 1368 1047 269 65 54 chr5 102713034 102713158 -49824101 + MTD LTR MaLR 219 356 -63 3 1368 756 205 65 133 chr5 102717116 102717364 -49819895 + ORR1D1 LTR MaLR 1 231 -143 3 1368 789 216 19 31 chr5 102717783 102717991 -49819268 + ORR1C2 LTR MaLR 159 382 -2 3 1368 811 241 4 0 chr5 102718954 102719121 -49818138 - MTE2b LTR MaLR -204 175 3 3 1368 267 337 42 0 chr5 102719455 102719550 -49817709 - LTR85b LTR Gypsy? -230 554 456 3 1368 386 284 0 10 chr5 102721915 102722018 -49815241 + MTE2b LTR MaLR 18 119 -260 3 1368 1265 255 125 11 chr5 102722036 102722405 -49814854 - MTC LTR MaLR -10 411 1 3 1368 389 315 7 14 chr5 102722405 102722549 -49814710 + MTE2b LTR MaLR 179 321 -58 3 1368 2065 130 3 58 chr5 102726345 102726689 -49810570 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 3 1368 847 314 65 29 chr5 102734672 102735081 -49802178 + MLT2B4 LTR ERVL 63 494 -26 3 1368 7600 41 37 2 chr5 102739109 102740035 -49797224 + RLTR13A2 LTR ERVK 1 958 0 4 1368 1501 241 38 2 chr5 102744199 102744560 -49792699 - MTD LTR MaLR 0 419 20 4 1368 373 149 15 15 chr5 102746721 102746789 -49790470 - MTEa LTR MaLR 0 379 312 4 1368 344 286 26 71 chr5 102746834 102746947 -49790312 - MTEa LTR MaLR -159 220 113 4 1368 596 240 35 176 chr5 102747241 102747610 -49789649 - RLTR15 LTR ERVK -8 351 35 4 1368 277 292 126 56 chr5 102751607 102751821 -49785438 + MLT1J1 LTR MaLR 27 255 -189 4 1368 303 299 195 42 chr5 102756017 102756224 -49781035 + MLT1A0 LTR MaLR 2 243 -122 4 1368 303 299 96 73 chr5 102756402 102756460 -49780799 + MLT1A0 LTR MaLR 244 301 -64 4 1368 306 263 8 99 chr5 102758546 102758570 -49778689 - MT2B LTR ERVL -329 246 154 4 1369 2156 94 65 0 chr5 102764358 102764665 -49772594 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1369 2107 138 90 14 chr5 102775366 102775732 -49761527 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1369 2315 93 3 55 chr5 102789133 102789476 -49747783 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 4 1369 2045 129 123 0 chr5 102791403 102791744 -49745515 + ORR1C2 LTR MaLR 2 384 0 4 1369 1308 207 80 31 chr5 102791765 102792114 -49745145 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 4 1369 1221 205 290 10 chr5 102796942 102797356 -49739903 + RMER15 LTR ERVL 27 556 -19 4 1369 3213 67 5 2 chr5 102798915 102799319 -49737940 + MTB_Mm LTR MaLR 1 405 -2 4 1369 3088 85 48 5 chr5 102800411 102800823 -49736436 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 4 1369 269 269 0 15 chr5 102802861 102802929 -49734330 - MLT1J LTR MaLR -344 168 102 4 1369 257 176 26 117 chr5 102802862 102802939 -49734320 - LTR33B LTR ERVL -359 144 75 4 1369 1404 214 136 78 chr5 102805305 102805857 -49731402 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 5 1369 287 263 39 13 chr5 102807164 102807241 -49730018 - ORR1E LTR MaLR -280 79 1 5 1369 3283 58 2 0 chr5 102809448 102809847 -49727412 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1369 1153 296 33 17 chr5 102809856 102810217 -49727042 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 5 1369 1234 143 25 33 chr5 102810983 102811228 -49726031 - RMER6B LTR ERVK -81 380 138 5 1369 804 115 86 0 chr5 102817621 102817760 -49719499 - RMER6B LTR ERVK -310 151 1 5 1369 681 302 72 38 chr5 102818768 102819060 -49718199 - MTE-int LTR MaLR -460 1120 819 5 1369 301 302 112 15 chr5 102819066 102819271 -49717988 + MLT1C LTR MaLR 86 310 -157 5 1369 2835 116 5 15 chr5 102821226 102821637 -49715622 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1369 602 324 85 12 chr5 102822099 102822418 -49714841 + MLT1B LTR MaLR 49 390 0 5 1369 1828 201 91 5 chr5 102826250 102826636 -49710623 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1369 234 323 21 0 chr5 102829110 102829206 -49708053 - MLT1C LTR MaLR 0 467 370 5 1369 4207 83 21 39 chr5 102830391 102831003 -49706256 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 5 1369 556 271 147 110 chr5 102835019 102835338 -49701921 + MLT1A1 LTR MaLR 75 405 -3 5 1369 245 307 88 111 chr5 102836535 102836671 -49700588 - ORR1D1 LTR MaLR -53 306 183 5 1369 245 307 88 111 chr5 102836723 102836802 -49700457 - ORR1D1 LTR MaLR -177 182 96 5 1369 288 188 31 15 chr5 102836873 102836938 -49700321 - ORR1D1 LTR MaLR -308 66 1 5 1369 312 339 8 25 chr5 102850078 102850199 -49687060 - MTE2a LTR MaLR -204 175 57 5 1369 1107 214 140 30 chr5 102851546 102851874 -49685385 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 11 5 1369 670 289 78 175 chr5 102853376 102853553 -49683706 - MTE-int LTR MaLR -34 1546 1357 5 1369 670 289 78 175 chr5 102853577 102854040 -49683219 - MTE-int LTR MaLR -224 1356 969 5 1369 332 326 69 58 chr5 102858149 102858338 -49678921 - ORR1D2 LTR MaLR -172 198 8 5 1369 395 333 110 83 chr5 102862664 102863156 -49674103 - MLT1D LTR MaLR 0 505 1 5 1369 2290 102 6 50 chr5 102882318 102882660 -49654599 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1369 271 211 103 21 chr5 102883258 102883355 -49653904 - LTR16A1 LTR ERVL -151 305 201 6 1369 2029 167 39 3 chr5 102888173 102888534 -49648725 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1370 265 305 0 12 chr5 102893932 102894015 -49643244 - MTEb LTR MaLR -11 368 287 6 1370 241 280 32 33 chr5 102894273 102894399 -49642860 - MTEb LTR MaLR -284 124 1 6 1370 1242 251 28 85 chr5 102897927 102898327 -49638932 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 6 1370 4332 130 87 3 chr5 102901910 102902590 -49634669 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 6 1370 341 159 95 24 chr5 102907694 102907778 -49629481 + RMER10A LTR ERVL 322 411 -31 6 1370 2450 151 78 60 chr5 102916889 102917440 -49619819 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 6 1370 2436 101 0 0 chr5 102917471 102917797 -49619462 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 1370 725 279 65 17 chr5 102934536 102934766 -49602493 - RMER15 LTR ERVL -59 516 276 6 1370 1210 257 94 11 chr5 102934973 102935347 -49601912 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 1370 705 330 106 27 chr5 102939198 102939612 -49597647 - MLT1C LTR MaLR 0 467 21 6 1370 411 282 0 30 chr5 102940149 102940284 -49596975 + RMER15 LTR ERVL 433 563 -12 6 1370 1163 233 29 7 chr5 102942439 102942716 -49594543 + MTD LTR MaLR 137 419 0 6 1370 774 214 34 23 chr5 102948175 102948352 -49588907 + ORR1C2 LTR MaLR 1 179 -195 6 1370 1751 119 105 63 chr5 102948379 102948711 -49588548 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 6 1370 775 231 70 16 chr5 102948710 102948895 -49588364 + ORR1C2 LTR MaLR 186 380 -4 6 1370 241 262 43 106 chr5 102952725 102952819 -49584440 - MT2B LTR ERVL -350 251 164 6 1370 3652 32 0 2 chr5 102957443 102957844 -49579415 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1370 3313 56 10 0 chr5 102958935 102959327 -49577932 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1370 8378 70 9 68 chr5 102959327 102960495 -49576764 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1370 261 262 35 23 chr5 102967510 102967596 -49569663 - MTEa LTR MaLR -14 365 279 7 1370 308 345 102 25 chr5 102983143 102983339 -49553920 - ORR1E LTR MaLR -122 237 27 7 1370 386 300 29 70 chr5 102986313 102986485 -49550774 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 201 7 1370 383 220 44 35 chr5 102999887 103000000 -49537259 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 255 7 1370 715 223 167 35 chr5 103000001 103000229 -49537030 - ORR1D2 LTR MaLR -112 258 1 1 1371 1642 198 35 32 chr5 103023607 103023951 -49513308 + ORR1D1 LTR MaLR 14 358 -16 3 1371 486 364 96 54 chr5 103026355 103026802 -49510457 + MER74A LTR ERVL 93 558 0 3 1371 308 319 127 32 chr5 103038987 103039207 -49498052 - MLT1B LTR MaLR -149 241 1 4 1371 3329 48 2 60 chr5 103053482 103053594 -49483665 + MTA_Mm LTR MaLR 1 106 -290 6 1371 3329 48 2 60 chr5 103053785 103054091 -49483168 + MTA_Mm LTR MaLR 107 395 -1 6 1371 280 337 84 20 chr5 103060432 103060635 -49476624 - MLT1H1 LTR MaLR -8 547 332 6 1371 2655 169 77 26 chr5 103060827 103061362 -49475897 + RLTR12A LTR ERVK 3 564 -4 7 1371 517 360 55 28 chr5 103066500 103066826 -49470433 - MLT1A LTR MaLR -24 350 16 7 1371 357 301 12 73 chr5 103071507 103071672 -49465587 + MLT1A0 LTR MaLR 20 174 -191 8 1371 441 256 44 55 chr5 103088770 103088884 -49448375 - MLT1D LTR MaLR -314 191 77 1 1371 441 256 44 55 chr5 103089113 103089180 -49448079 - MLT1D LTR MaLR -429 76 12 1 1371 369 219 47 19 chr5 103089469 103089576 -49447683 + RMER13A LTR ERVK 32 141 -719 1 1371 2812 91 36 23 chr5 103089846 103090238 -49447021 - MTB LTR MaLR -3 397 1 1 1371 483 224 0 25 chr5 103092415 103092534 -49444725 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 291 1 1371 295 339 136 18 chr5 103098273 103098501 -49438758 - LTR16A LTR ERVL -15 436 182 1 1371 307 306 55 14 chr5 103105285 103105431 -49431828 - MLT1B LTR MaLR 0 390 239 1 1371 380 267 57 70 chr5 103105574 103105731 -49431528 - MLT1B LTR MaLR -116 274 120 1 1371 1928 146 55 0 chr5 103114439 103114748 -49422511 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1371 670 283 13 186 chr5 103123975 103124422 -49412837 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1371 731 186 31 25 chr5 103125607 103125767 -49411492 - ORR1C2 LTR MaLR -7 377 217 1 1371 3512 25 2 0 chr5 103128254 103128649 -49408610 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1371 9875 15 0 0 chr5 103128649 103129747 -49407512 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1371 3512 25 2 0 chr5 103129747 103130142 -49407117 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1371 9854 16 0 0 chr5 103130142 103131240 -49406019 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1371 3512 25 2 0 chr5 103131240 103131635 -49405624 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1371 652 339 112 26 chr5 103144823 103145286 -49391973 - MLT2B1 LTR ERVL -8 512 10 1 1372 322 339 115 69 chr5 103166592 103166896 -49370363 + MTEa LTR MaLR 4 321 -58 2 1372 845 284 141 27 chr5 103173561 103173966 -49363293 - LTR41 LTR ERVL -1 767 317 2 1372 332 313 55 15 chr5 103174765 103174966 -49362293 - LTR41 LTR ERVL -537 231 23 2 1372 267 268 17 59 chr5 103206223 103206342 -49330917 - MLT1B LTR MaLR -138 252 139 2 1372 318 257 9 56 chr5 103208140 103208247 -49329012 - MLT1B LTR MaLR -138 252 151 2 1372 858 298 39 61 chr5 103208499 103208860 -49328399 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 5 2 1372 568 289 296 10 chr5 103211358 103211659 -49325600 - MTD LTR MaLR -14 405 19 2 1372 964 271 60 47 chr5 103223758 103224075 -49313184 - ORR1E LTR MaLR -31 328 8 2 1372 1546 176 59 78 chr5 103245736 103246144 -49291115 - RMER17C LTR ERVK -8 402 3 3 1372 1093 148 0 0 chr5 103246312 103246481 -49290778 + RMER13B LTR ERVK 226 394 -514 3 1372 883 218 42 87 chr5 103261218 103261570 -49275689 - RMER13A LTR ERVK -453 407 30 3 1372 274 294 39 0 chr5 103266513 103266615 -49270644 - ORR1E LTR MaLR -235 124 19 3 1372 343 287 43 14 chr5 103280866 103281004 -49256255 + RMER15 LTR ERVL 303 444 -131 3 1373 2487 83 6 0 chr5 103290310 103290635 -49246624 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1373 2438 162 26 42 chr5 103291355 103291857 -49245402 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 494 -33 3 1373 730 293 98 45 chr5 103293347 103293633 -49243626 + MTEa LTR MaLR 7 307 -72 3 1373 247 239 83 14 chr5 103293633 103293705 -49243554 + MTEa LTR MaLR 281 357 -22 3 1373 1686 246 40 12 chr5 103295262 103295689 -49241570 - MT2A LTR ERVL -92 441 3 3 1373 254 304 56 28 chr5 103300751 103300893 -49236366 - MLT1B LTR MaLR -63 327 182 4 1373 706 258 109 79 chr5 103310199 103310629 -49226630 - RLTR12B LTR ERVK -34 494 52 4 1373 306 304 33 42 chr5 103316808 103316928 -49220331 + MTE2a LTR MaLR 35 153 -266 4 1373 577 271 44 63 chr5 103316939 103317144 -49220115 + MTE2a LTR MaLR 179 379 0 4 1373 548 335 44 4 chr5 103327172 103327445 -49209814 - RMER15 LTR ERVL -16 559 276 4 1373 252 266 68 68 chr5 103327444 103327577 -49209682 - RMER15 LTR ERVL -416 159 27 4 1373 922 245 50 65 chr5 103331852 103332236 -49205023 - RMER2 LTR ERV1 0 567 190 4 1373 287 130 0 0 chr5 103332244 103332290 -49204969 - RMER2 LTR ERV1 -521 46 1 4 1373 669 260 103 40 chr5 103347496 103347769 -49189490 + MTEa LTR MaLR 3 292 -87 4 1373 295 305 94 9 chr5 103347808 103347914 -49189345 + MTEa LTR MaLR 256 370 -9 4 1373 560 307 24 19 chr5 103351469 103351675 -49185584 + MTEa-int LTR MaLR 1357 1563 -17 4 1373 522 306 97 44 chr5 103351692 103352013 -49185246 + MTEa LTR MaLR 1 338 -41 4 1373 2192 107 0 0 chr5 103352574 103352893 -49184366 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1373 962 276 82 49 chr5 103360046 103360412 -49176847 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 4 1373 3458 140 18 38 chr5 103368941 103369602 -49167657 + RMER6A LTR ERVK 109 756 0 4 1373 407 174 0 25 chr5 103369988 103370121 -49167138 + ORR1B1 LTR MaLR 26 143 -251 4 1373 956 264 119 12 chr5 103370539 103370876 -49166383 + MTEb LTR MaLR 6 378 -1 4 1373 680 252 15 0 chr5 103373221 103373356 -49163903 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7206 -200 4 1373 1561 171 155 11 chr5 103374693 103375055 -49162204 + MTC LTR MaLR 3 407 -14 4 1373 2301 154 47 10 chr5 103383322 103383728 -49153531 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1373 1745 167 108 16 chr5 103383729 103384119 -49153140 + MTC-int LTR MaLR 4 428 -830 4 1373 620 179 6 70 chr5 103384731 103384747 -49152512 + MTC-int LTR MaLR 1079 1095 -868 4 1373 3763 191 47 16 chr5 103385560 103386377 -49150882 + MTC-int LTR MaLR 417 1258 0 4 1373 2269 118 97 25 chr5 103386377 103386770 -49150489 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1373 435 240 341 46 chr5 103389656 103389910 -49147349 - MTD LTR MaLR 0 419 91 4 1373 487 187 9 1 chr5 103395171 103395267 -49141992 + ORR1C1 LTR MaLR 1 101 -258 4 1373 2618 58 156 0 chr5 103413028 103413374 -49123885 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1374 640 226 117 19 chr5 103422436 103422680 -49114579 + RMER20B LTR ERVK 160 425 -91 5 1374 900 238 9 50 chr5 103426716 103427009 -49110250 + RLTR11B LTR ERVK 1 279 -162 5 1374 1070 197 46 8 chr5 103431251 103431492 -49105767 + MT2A LTR ERVL 1 250 -283 5 1374 737 224 0 6 chr5 103431508 103431665 -49105594 + MT2A LTR ERVL 309 464 -69 5 1374 260 355 85 0 chr5 103431760 103431949 -49105310 - MLT1A0 LTR MaLR -105 260 56 5 1374 2303 92 6 15 chr5 103432462 103432792 -49104467 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1374 3273 46 5 2 chr5 103433762 103434157 -49103102 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1374 2186 159 108 14 chr5 103437752 103438242 -49099017 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 974 5 1374 645 292 81 60 chr5 103438227 103438693 -49098566 - ORR1B1-int LTR MaLR -769 601 121 5 1374 1625 169 0 7 chr5 103440743 103441035 -49096224 - RLTR11A2 LTR ERVK -12 515 226 5 1374 1197 267 28 46 chr5 103441071 103441149 -49096110 - RLTR11A2 LTR ERVK -164 289 211 5 1374 1197 204 16 4 chr5 103441184 103441406 -49095853 - RLTR11A2 LTR ERVK -302 225 2 5 1374 2276 64 21 60 chr5 103445365 103445697 -49091562 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 1374 1560 184 116 6 chr5 103445978 103446291 -49090968 - MTC LTR MaLR 0 421 73 5 1374 1200 204 28 63 chr5 103446322 103446356 -49090903 - MTC LTR MaLR -333 74 35 5 1374 534 127 0 0 chr5 103446442 103446521 -49090738 - MTC LTR MaLR -342 79 1 5 1374 319 302 73 0 chr5 103446599 103446695 -49090564 - MLT1E2 LTR MaLR -198 429 327 5 1374 333 297 40 48 chr5 103451969 103452093 -49085166 + MLT1J1 LTR MaLR 75 197 -247 5 1374 1427 242 61 39 chr5 103453164 103453525 -49083734 + MTD LTR MaLR 47 415 -4 5 1374 527 212 176 19 chr5 103456279 103456454 -49080805 + MTEb LTR MaLR 155 379 0 5 1374 1531 224 62 3 chr5 103456753 103457111 -49080148 + MT2A LTR ERVL 1 379 -154 5 1374 228 143 24 0 chr5 103457705 103457747 -49079512 + MT2A LTR ERVL 488 530 -3 5 1374 620 308 206 35 chr5 103464205 103464716 -49072543 - MLT1E2 LTR MaLR -13 614 17 5 1374 3168 146 6 8 chr5 103464939 103465451 -49071808 - RLTR17 LTR ERVK -84 608 98 5 1374 1928 202 32 20 chr5 103466778 103467186 -49070073 - MTD LTR MaLR -4 415 3 5 1374 1660 201 190 24 chr5 103473606 103474059 -49063200 + RMER19B LTR ERVK 375 902 0 6 1374 945 276 45 48 chr5 103478192 103478402 -49058857 + MTEb LTR MaLR 1 208 -171 6 1374 945 276 45 48 chr5 103478448 103478546 -49058713 + MTEb LTR MaLR 209 307 -72 6 1374 1889 300 138 27 chr5 103478527 103479415 -49057844 + MTE-int LTR MaLR 131 1116 -464 6 1374 416 305 56 43 chr5 103479405 103479566 -49057693 - MTE-int LTR MaLR -302 1278 1116 6 1374 3476 36 8 8 chr5 103480084 103480478 -49056781 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 6 1374 3697 18 5 0 chr5 103481528 103481922 -49055337 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1374 4473 196 30 24 chr5 103487624 103488587 -49048672 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 969 -879 6 1374 1216 189 19 30 chr5 103488908 103489170 -49048089 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1590 1848 0 6 1374 826 357 65 25 chr5 103490960 103491440 -49045819 + LTR40a LTR ERVL 11 509 -10 6 1374 365 270 84 13 chr5 103492905 103493059 -49044200 + RMER15 LTR ERVL 382 546 -29 6 1374 229 355 56 91 chr5 103495955 103496187 -49041072 - RMER21B LTR ERV1 -19 823 600 6 1374 1696 192 80 0 chr5 103497331 103497680 -49039579 - ORR1C2 LTR MaLR -7 377 1 6 1374 1185 206 90 27 chr5 103500169 103500468 -49036791 - MTD LTR MaLR 0 419 102 1 1374 861 320 113 17 chr5 103506039 103506545 -49030714 + MER68 LTR ERVL 1 607 0 1 1374 455 397 65 26 chr5 103508741 103509051 -49028208 - MER74B LTR ERVL -90 532 211 1 1374 2914 143 106 54 chr5 103509202 103509242 -49028017 + RMER4B LTR ERVK 1 44 -541 1 1374 2914 143 106 54 chr5 103509389 103509904 -49027355 + RMER4B LTR ERVK 45 585 0 1 1374 813 329 39 81 chr5 103517581 103518090 -49019169 - MLT1D LTR MaLR -15 490 3 3 1374 2218 156 15 53 chr5 103519078 103519471 -49017788 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 1374 465 301 96 10 chr5 103531093 103531301 -49005958 - LTR87 LTR ERVL? -3 621 396 4 1374 258 333 172 65 chr5 103531909 103532124 -49005135 + LTR33 LTR ERVL 27 264 -251 4 1374 1672 170 102 21 chr5 103532727 103533077 -49004182 + MTD LTR MaLR 42 405 -14 5 1374 351 198 32 24 chr5 103540996 103541120 -48996139 - RMER17A LTR ERVK -287 464 340 6 1374 1033 266 104 32 chr5 103544659 103544997 -48992262 + MTEb LTR MaLR 5 366 -13 6 1375 2911 24 24 0 chr5 103560654 103560992 -48976267 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 1375 320 353 16 21 chr5 103561192 103561386 -48975873 + MER67C LTR ERV1 89 281 -430 8 1375 514 307 72 28 chr5 103563781 103564032 -48973227 - MLT2B1 LTR ERVL -61 459 198 8 1375 1766 197 147 45 chr5 103586047 103586558 -48950701 + RMER2 LTR ERV1 1 563 -4 1 1375 457 311 94 25 chr5 103587356 103587600 -48949659 + MLT1A0 LTR MaLR 103 363 -2 1 1375 1448 167 10 28 chr5 103597229 103597518 -48939741 - MTD LTR MaLR -4 415 132 1 1375 407 219 35 17 chr5 103599706 103599822 -48937437 - MTD LTR MaLR -299 120 3 1 1375 1003 267 105 0 chr5 103604458 103604791 -48932468 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 1 1375 440 342 105 33 chr5 103612107 103612442 -48924817 + MLT1A0 LTR MaLR 6 365 0 1 1375 1852 157 25 14 chr5 103616238 103616593 -48920666 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 1 1375 2142 118 204 21 chr5 103619721 103620252 -48917007 + RMER17C-int LTR ERVK 2611 3238 0 1 1375 756 189 26 71 chr5 103620252 103620515 -48916744 + RMER17C LTR ERVK 1 454 -355 1 1375 396 265 44 71 chr5 103627178 103627300 -48909959 - MLT1A0 LTR MaLR -173 192 70 1 1375 3282 133 146 134 chr5 103627300 103628195 -48909064 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 1 1375 396 265 44 71 chr5 103628195 103628247 -48909012 - MLT1A0 LTR MaLR -296 69 23 1 1375 4022 128 66 6 chr5 103644077 103644380 -48892879 - RMER6C LTR ERVK 0 690 370 1 1375 4022 128 66 6 chr5 103644503 103644850 -48892409 - RMER6C LTR ERVK -321 369 1 1 1375 487 258 66 7 chr5 103644910 103645062 -48892197 + RLTR18B LTR ERVK 1 161 -351 1 1375 1419 167 18 36 chr5 103645077 103645351 -48891908 + MT2B LTR ERVL 1 269 -332 1 1375 7276 126 30 25 chr5 103645155 103646448 -48890811 + ORR1A3-int LTR MaLR 659 1963 0 1 1375 2529 80 6 0 chr5 103646454 103646779 -48890480 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1375 574 266 232 50 chr5 103646779 103647155 -48890104 + RLTR18B LTR ERVK 167 613 -3 1 1375 1054 182 136 26 chr5 103653777 103654042 -48883217 + RMER19A LTR ERVK 1 294 -443 1 1375 505 317 65 41 chr5 103654249 103654600 -48882659 - RLTR26 LTR ERVK -242 400 12 1 1375 1155 218 23 56 chr5 103654612 103655018 -48882241 + RMER19A LTR ERVK 242 737 0 1 1375 707 257 5 32 chr5 103659375 103659564 -48877695 - MTE2b LTR MaLR -37 342 159 1 1375 2422 167 32 34 chr5 103659564 103660059 -48877200 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 6 1 1375 448 238 97 14 chr5 103660056 103660201 -48877058 - MTE2b LTR MaLR -208 171 15 1 1375 1038 173 0 0 chr5 103661101 103661286 -48875973 + ORR1B1 LTR MaLR 3 187 -207 1 1375 230 386 44 0 chr5 103662343 103662457 -48874802 + LTR33A LTR ERVL 102 220 -300 2 1375 3172 62 12 0 chr5 103670605 103671021 -48866238 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1375 600 288 245 13 chr5 103671459 103671769 -48865490 - MTD LTR MaLR -25 394 13 2 1375 288 247 10 40 chr5 103671754 103671855 -48865404 - MER34 LTR ERV1 -75 467 370 2 1375 723 303 97 20 chr5 103672481 103672831 -48864428 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 2 1375 598 280 85 43 chr5 103673668 103673903 -48863356 + MLT1B LTR MaLR 125 369 -21 2 171 2355 125 3 42 chr5 103677670 103678053 -48859206 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 1376 522 182 30 10 chr5 103678991 103679091 -48858168 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 440 2 1376 3152 66 5 2 chr5 103681064 103681459 -48855800 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1376 7826 66 16 70 chr5 103681459 103682619 -48854640 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1376 3073 76 5 5 chr5 103682619 103683015 -48854244 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1376 6738 112 41 5 chr5 103686792 103687078 -48850181 - RLTR13D4 LTR ERVK 0 1033 744 2 1376 6738 112 41 5 chr5 103687108 103687818 -48849441 - RLTR13D4 LTR ERVK -290 743 3 2 1376 4920 51 2 2 chr5 103688283 103688870 -48848389 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 2 1376 4962 97 20 16 chr5 103691379 103692189 -48845070 + RLTR22_Mur LTR ERVK 20 832 -1016 2 1376 359 326 64 45 chr5 103692386 103692588 -48844671 + RMER12 LTR ERVK 1117 1322 0 2 1376 361 330 139 67 chr5 103698997 103699400 -48837859 - LTR16B2 LTR ERVL 0 462 31 2 1376 1927 169 49 30 chr5 103701577 103701944 -48835315 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1376 3783 117 72 32 chr5 103705213 103705935 -48831324 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 2 1376 256 305 44 106 chr5 103708017 103708244 -48829015 + MLT1C LTR MaLR 86 298 -92 2 1376 254 296 158 36 chr5 103708268 103708464 -48828795 - ORR1E LTR MaLR -43 316 97 2 1376 348 187 27 0 chr5 103708709 103708784 -48828475 + MLT1C LTR MaLR 374 450 -17 2 1376 2359 119 41 5 chr5 103708991 103709379 -48827880 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 40 2 1376 1948 132 103 21 chr5 103711702 103712080 -48825179 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 1376 2297 106 16 0 chr5 103712105 103712427 -48824832 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1376 307 346 30 23 chr5 103727339 103727472 -48809787 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3587 3720 -1947 2 1376 396 241 54 27 chr5 103728263 103728374 -48808885 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4608 4721 -1040 2 1376 3113 143 48 9 chr5 103728452 103729010 -48808249 + RMER21B LTR ERV1 49 628 -214 2 1376 3163 84 2 0 chr5 103730851 103731257 -48806002 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1376 3706 74 6 2 chr5 103732903 103733376 -48803883 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1376 232 318 0 0 chr5 103733904 103733967 -48803292 - LTR16B LTR ERVL -2 461 399 2 1376 2153 144 68 0 chr5 103734253 103734620 -48802639 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 3 1376 1882 109 28 28 chr5 103735282 103735604 -48801655 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 1376 1254 168 67 41 chr5 103750457 103750724 -48786535 - RLTR11A LTR ERVK -26 502 229 3 1376 1275 119 17 22 chr5 103751388 103751620 -48785639 + RLTR11B LTR ERVK 223 453 0 3 1376 2540 171 7 81 chr5 103755956 103756502 -48780757 - RLTR19C LTR ERVK 0 506 1 3 1376 2528 74 12 0 chr5 103756631 103756954 -48780305 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1376 1509 176 79 25 chr5 103763206 103763572 -48773687 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 122 3 1376 1654 148 131 19 chr5 103764170 103764353 -48772906 - RMER17C LTR ERVK -3 407 214 3 1376 1654 148 131 19 chr5 103764390 103764572 -48772687 - RMER17C LTR ERVK -197 213 1 3 1376 1070 182 5 19 chr5 103767303 103767510 -48769749 + MT2B LTR ERVL 398 601 0 3 1376 1967 100 0 124 chr5 103768158 103768464 -48768795 + ORR1A2 LTR MaLR 1 272 -55 3 1376 1967 100 0 124 chr5 103768611 103768668 -48768591 + ORR1A2 LTR MaLR 273 319 -8 3 1376 809 233 46 28 chr5 103770804 103771020 -48766239 + MT2A LTR ERVL 1 220 -313 3 1376 926 137 6 221 chr5 103771203 103771295 -48765964 + RMER17C LTR ERVK 2 90 -320 3 1376 926 137 6 221 chr5 103771339 103771603 -48765656 + RMER17C LTR ERVK 91 281 -129 3 1376 296 211 28 0 chr5 103772301 103772372 -48764887 + MTD LTR MaLR 339 411 -8 3 1376 2878 64 15 2 chr5 103774066 103774460 -48762799 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 3 1376 260 208 75 38 chr5 103775781 103775861 -48761398 + RLTR19-int LTR ERVK 2050 2132 -4005 3 1376 465 276 26 57 chr5 103777044 103777236 -48760023 + MT2A LTR ERVL 191 376 -157 3 1376 799 238 170 28 chr5 103777470 103777522 -48759737 + ORR1D2 LTR MaLR 1 59 -311 3 1376 2061 104 6 122 chr5 103777522 103777874 -48759385 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 3 1376 799 238 170 28 chr5 103777874 103778145 -48759114 + ORR1D2 LTR MaLR 60 370 0 3 1376 328 248 35 57 chr5 103780507 103780648 -48756611 + RNLTR23 LTR ERVK 479 616 -26 3 1376 240 333 11 44 chr5 103784812 103784903 -48752356 + MTEb LTR MaLR 3 90 -269 3 1376 309 270 80 9 chr5 103784952 103785064 -48752195 + MTEb LTR MaLR 252 371 -8 3 1376 1492 143 65 98 chr5 103785481 103785837 -48751422 - ORR1B1 LTR MaLR -14 380 37 3 1376 3397 181 40 31 chr5 103788252 103788924 -48748335 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 3 1376 1619 148 93 93 chr5 103790925 103791312 -48745947 + ORR1B1 LTR MaLR 8 394 0 4 1376 745 188 41 69 chr5 103795678 103796157 -48741102 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1376 1600 148 50 7 chr5 103800650 103800929 -48736330 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 29 4 1376 464 111 3 53 chr5 103800977 103801095 -48736164 - ORR1A4 LTR MaLR -248 146 1 4 1376 2174 75 3 67 chr5 103808011 103808354 -48728905 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 4 1377 395 361 97 22 chr5 103810470 103810790 -48726469 + MLT1J-int LTR MaLR 628 971 -416 4 1377 1326 84 11 0 chr5 103810833 103811023 -48726236 + RMER6A LTR ERVK 2 193 -563 4 1377 1348 182 53 112 chr5 103813751 103814371 -48722888 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 561 0 4 1377 2263 58 64 0 chr5 103814375 103814688 -48722571 + IAPEY_LTR LTR ERVK 53 385 0 4 1377 402 374 72 9 chr5 103815112 103815333 -48721926 + MLT1J LTR MaLR 50 284 -228 4 1377 333 198 49 0 chr5 103815517 103815598 -48721661 - MTEa LTR MaLR -2 377 293 4 1377 978 211 206 25 chr5 103815923 103816243 -48721016 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1377 759 335 73 14 chr5 103816961 103817397 -48719862 - LTR40a LTR ERVL -53 466 5 4 1377 3014 46 0 3 chr5 103832077 103832469 -48704790 + MTA_Mm LTR MaLR 1 391 -5 4 1377 389 327 192 11 chr5 103834855 103835214 -48702045 + MLT2B2 LTR ERVL 1 424 -91 4 1377 2463 87 77 28 chr5 103835710 103836102 -48701157 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 5 1377 6352 31 3 19 chr5 103836104 103836860 -48700399 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 5 1377 2316 54 0 0 chr5 103836859 103837137 -48700122 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 5 1377 3634 60 1 16 chr5 103837137 103837715 -48699544 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 5 1377 240 244 0 0 chr5 103837715 103837760 -48699499 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 5 1377 532 86 78 186 chr5 103837760 103837889 -48699370 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 9 5 1377 2494 87 77 28 chr5 103837890 103838282 -48698977 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 5 1377 3558 106 98 27 chr5 103842109 103842670 -48694589 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 5 1377 2523 165 63 32 chr5 103848719 103849277 -48687982 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 5 1377 838 235 84 62 chr5 103858889 103859197 -48678062 + ORR1D2 LTR MaLR 56 370 0 5 1377 878 181 298 0 chr5 103859986 103860275 -48676984 - MTD LTR MaLR -42 379 1 5 1377 1091 222 167 9 chr5 103866872 103867208 -48670051 + MTC LTR MaLR 33 421 0 5 1377 1292 213 147 106 chr5 103872542 103873052 -48664207 - MT2A LTR ERVL 0 533 3 5 1377 503 293 166 49 chr5 103874399 103874683 -48662576 - MER68 LTR ERVL -187 376 60 5 1377 1136 211 201 6 chr5 103878505 103878843 -48658416 + MTD LTR MaLR 4 407 -12 5 1377 2471 118 50 32 chr5 103880133 103880572 -48656687 + RMER15 LTR ERVL 39 485 -90 5 1377 358 197 0 0 chr5 103880577 103880648 -48656611 - ORR1C2 LTR MaLR -23 361 291 5 1377 286 282 90 59 chr5 103887351 103887573 -48649686 - LTR78 LTR ERV1 -84 1220 992 6 1377 269 345 84 21 chr5 103888305 103888447 -48648812 - LTR78 LTR ERV1 -954 350 200 6 1377 950 255 132 75 chr5 103897932 103898233 -48639026 - MTD LTR MaLR 0 419 74 6 1377 950 255 132 75 chr5 103898422 103898506 -48638753 - MTD LTR MaLR -346 73 12 6 1377 2019 117 93 8 chr5 103909434 103909789 -48627470 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 1 6 1377 6692 171 90 11 chr5 103909789 103910004 -48627255 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1292 6 1377 6692 171 90 11 chr5 103910028 103911209 -48626050 - ORR1B1-int LTR MaLR -218 1291 4 6 1377 1900 138 101 20 chr5 103911218 103911574 -48625685 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 1 6 1377 525 99 287 0 chr5 103912145 103912246 -48625013 + RMER19B LTR ERVK 1 130 -772 6 1377 2838 74 5 5 chr5 103912246 103912642 -48624617 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1377 3541 165 88 3 chr5 103912642 103913298 -48623961 + RMER19B LTR ERVK 126 837 -65 6 1378 2309 138 33 83 chr5 103945506 103945989 -48591270 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 6 1378 1913 164 103 3 chr5 103949287 103949665 -48587594 + MTC LTR MaLR 2 417 -4 6 1378 1403 257 68 75 chr5 103960262 103961071 -48576188 + RMER12 LTR ERVK 1 773 -1075 7 1378 308 198 72 113 chr5 103961375 103961472 -48575787 + RMER12 LTR ERVK 990 1082 -240 7 1378 405 141 77 0 chr5 103961748 103961826 -48575433 + RMER12 LTR ERVK 1104 1187 -135 7 1378 3794 125 151 2 chr5 103982110 103982751 -48554508 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 7 1378 251 233 70 104 chr5 103987042 103987157 -48550102 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 7 1378 261 303 0 0 chr5 104000118 104000184 -48537075 - MLT1D LTR MaLR -23 572 507 1 1378 727 279 159 31 chr5 104001006 104001358 -48535901 - MLT1D LTR MaLR -1 504 108 1 1378 227 253 0 112 chr5 104001663 104001752 -48535507 - LTR36 LTR ERV1 -507 104 26 4 1378 227 159 116 74 chr5 104010965 104011060 -48526199 - MLT1B LTR MaLR -162 228 130 1 1378 1477 185 107 25 chr5 104011207 104011534 -48525725 + RMER4A LTR ERVK 113 466 0 2 1378 232 284 100 54 chr5 104012871 104012907 -48524352 + RLTR25A LTR ERVK 445 580 -523 2 1378 2216 142 34 3 chr5 104017314 104017668 -48519591 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 3 1378 1079 166 35 110 chr5 104028661 104028792 -48508467 + RMER17C LTR ERVK 92 187 -223 5 1378 1079 166 35 110 chr5 104028877 104029090 -48508169 + RMER17C LTR ERVK 188 410 0 5 1378 8375 26 0 0 chr5 104029986 104030915 -48506344 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 6 1378 1180 238 161 25 chr5 104032118 104032484 -48504775 - MTC LTR MaLR -2 419 4 6 1378 227 286 146 31 chr5 104036907 104037025 -48500234 + RLTR47_MM LTR ERV1 139 271 -261 8 1378 1104 231 25 138 chr5 104037025 104037432 -48499827 + ORR1D2 LTR MaLR 1 361 -9 8 1378 2140 161 25 62 chr5 104040409 104040501 -48496758 + MTC LTR MaLR 1 76 -345 8 1378 2140 161 25 62 chr5 104040693 104041037 -48496222 + MTC LTR MaLR 77 421 0 8 1378 792 195 150 20 chr5 104041962 104042164 -48495095 - MTD LTR MaLR -14 405 196 9 1378 768 277 29 19 chr5 104042699 104042905 -48494354 - MTD LTR MaLR -207 212 5 9 1378 313 367 76 68 chr5 104044417 104044771 -48492488 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 1 1378 347 231 55 55 chr5 104050409 104050510 -48486749 + ORR1E LTR MaLR 10 110 -249 1 1378 485 307 101 62 chr5 104050697 104050954 -48486305 + ORR1E LTR MaLR 87 353 -6 1 1378 442 360 92 18 chr5 104053063 104053281 -48483978 + MLT1H LTR MaLR 9 242 -307 1 1378 4476 16 2 0 chr5 104059613 104060105 -48477154 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1378 321 0 0 0 chr5 104060105 104060143 -48477116 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 1 1378 342 179 46 35 chr5 104060143 104060230 -48477029 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 1 1378 41395 16 14 0 chr5 104060230 104065518 -48471741 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 1 1378 4476 16 2 0 chr5 104065518 104066010 -48471249 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1379 1770 174 70 50 chr5 104071314 104071643 -48465616 + MTC LTR MaLR 6 347 -74 1 1379 1770 174 70 50 chr5 104071829 104071899 -48465360 + MTC LTR MaLR 348 413 -8 1 1379 4845 154 204 26 chr5 104071902 104072968 -48464291 + MTC-int LTR MaLR 2 1256 -2 1 1379 812 182 30 18 chr5 104072970 104073138 -48464121 + MTC LTR MaLR 1 170 -251 1 1379 1289 101 67 0 chr5 104073291 104073499 -48463760 + MTC LTR MaLR 200 421 0 1 1379 250 216 12 129 chr5 104076402 104076487 -48460772 + MT2B LTR ERVL 163 237 -364 1 1379 519 229 218 62 chr5 104083022 104083329 -48453930 + MTD LTR MaLR 10 364 -55 1 1379 279 263 26 0 chr5 104086005 104086081 -48451178 + MLT1F1 LTR MaLR 410 487 -82 1 1379 287 250 26 0 chr5 104087949 104088025 -48449234 - MLT1F1 LTR MaLR -82 487 410 2 1379 226 308 18 71 chr5 104095606 104095718 -48441541 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 2 1379 311 296 60 93 chr5 104097072 104097340 -48439919 + MLT1L LTR MaLR 172 430 -180 2 1379 1365 222 55 17 chr5 104097968 104098312 -48438947 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 2 1379 4586 108 21 63 chr5 104100962 104101751 -48435508 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 2 1379 2262 134 130 43 chr5 104102012 104102412 -48434847 - RMER4A LTR ERVK -3 463 45 2 1379 2262 134 130 43 chr5 104102596 104102617 -48434642 - RMER4A LTR ERVK -422 44 6 2 1379 786 312 51 68 chr5 104105741 104106124 -48431135 + MLT1C LTR MaLR 46 413 -54 2 1379 786 312 51 68 chr5 104106177 104106222 -48431037 + MLT1C LTR MaLR 414 467 0 2 1379 381 300 95 0 chr5 104106453 104106633 -48430626 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4206 4342 -1419 2 1379 324 297 37 64 chr5 104106645 104106832 -48430427 - MLT1A0 LTR MaLR -164 201 20 2 1379 1230 217 112 0 chr5 104108079 104108393 -48428866 + ORR1D2 LTR MaLR 1 349 -21 2 1379 308 263 43 8 chr5 104109522 104109619 -48427640 + LTR41 LTR ERVL 91 182 -576 2 1379 2336 92 3 58 chr5 104114303 104114649 -48422610 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1379 227 200 0 141 chr5 104118289 104118336 -48418923 + RLTR25A LTR ERVK 525 570 -533 3 1379 227 200 0 141 chr5 104118478 104118494 -48418765 + RLTR25A LTR ERVK 571 579 -524 3 1379 807 274 189 42 chr5 104128929 104129379 -48407880 - LTR40a LTR ERVL -1 518 3 3 1379 1929 140 35 32 chr5 104129618 104129843 -48407416 - RMER17C LTR ERVK -3 407 177 3 1379 1929 140 35 32 chr5 104129880 104129971 -48407288 - RMER17C LTR ERVK -234 176 90 3 1379 1929 140 35 32 chr5 104130132 104130220 -48407039 - RMER17C LTR ERVK -321 89 2 3 1379 669 201 342 0 chr5 104130816 104131015 -48406244 + ORR1D2 LTR MaLR 104 370 0 3 1379 247 192 51 64 chr5 104131025 104131058 -48406201 - MT2A LTR ERVL -312 289 215 3 1379 527 175 29 10 chr5 104131311 104131415 -48405844 - MT2A LTR ERVL -427 106 1 3 1379 1530 146 425 30 chr5 104131564 104131995 -48405264 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 3 1379 344 103 0 218 chr5 104132189 104132276 -48404983 - MT2B LTR ERVL -361 240 173 3 1379 1611 123 42 148 chr5 104133083 104133541 -48403718 - RMER17C LTR ERVK 0 410 2 3 1379 239 158 0 0 chr5 104134708 104134746 -48402513 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 357 3 1379 700 111 0 9 chr5 104135018 104135127 -48402132 - ORR1A2 LTR MaLR -219 108 1 3 1379 2122 192 43 97 chr5 104136169 104136197 -48401062 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 541 3 1379 2602 153 56 27 chr5 104136197 104136681 -48400578 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 1 4 1379 2122 192 43 97 chr5 104136681 104137252 -48400007 - RLTR12A LTR ERVK -28 540 2 3 1379 1003 261 52 95 chr5 104139409 104139632 -48397627 - MTE2a LTR MaLR -4 375 155 4 1379 1003 261 52 95 chr5 104139816 104139907 -48397352 - MTE2a LTR MaLR -225 154 74 4 1379 596 186 31 31 chr5 104140040 104140168 -48397091 + RMER10B LTR ERVL 223 350 -48 4 1379 231 319 20 50 chr5 104141843 104141942 -48395317 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -826 96 1 4 1379 383 214 45 62 chr5 104141942 104142081 -48395178 - RMER17C LTR ERVK -175 235 100 4 1379 231 304 42 32 chr5 104150531 104150626 -48386633 - RLTR13C1 LTR ERVK -491 492 397 4 1379 2159 189 138 38 chr5 104162727 104163287 -48373972 - RMER17C-int LTR ERVK -34 3204 2589 4 1379 524 195 15 96 chr5 104163343 104163479 -48373780 - RMER17C-int LTR ERVK -707 2531 2407 4 1379 228 310 101 25 chr5 104165175 104165294 -48371965 - LTR84b LTR ERVL -76 685 558 4 1379 3334 113 136 0 chr5 104171886 104172415 -48364844 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 5 1379 1147 241 144 32 chr5 104175159 104175498 -48361761 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 5 1379 1662 164 44 44 chr5 104177123 104177442 -48359817 - RLTR14 LTR ERV1 -45 337 19 5 1379 262 270 46 83 chr5 104180296 104180405 -48356854 - MT2B LTR ERVL -338 263 159 5 1379 233 303 0 13 chr5 104185160 104185237 -48352022 + LTR84a LTR ERVL 274 349 -408 5 1380 226 244 43 75 chr5 104215755 104215848 -48321411 - MER87 LTR ERV1 -275 266 177 6 1380 239 263 125 48 chr5 104219688 104219719 -48317540 + LTR84a LTR ERVL 644 673 -84 6 1380 239 263 125 48 chr5 104219882 104219954 -48317305 + LTR84a LTR ERVL 674 755 -2 6 1380 1558 113 55 4 chr5 104242305 104242562 -48294697 - RLTR9D LTR ERVK -133 270 1 6 1380 1371 215 99 62 chr5 104246033 104246435 -48290824 + MTD LTR MaLR 3 419 0 6 1380 453 269 89 140 chr5 104264973 104265401 -48271858 + RMER10A LTR ERVL 12 417 -25 7 1380 255 302 39 85 chr5 104290030 104290160 -48247099 + RLTR42-int LTR ERVK 1198 1321 -4201 7 1380 762 92 140 16 chr5 104301704 104301843 -48235416 + MT2B LTR ERVL 1 150 -383 7 1380 998 199 60 94 chr5 104305781 104306164 -48231095 + ORR1D1 LTR MaLR 2 371 -3 7 1380 244 279 103 92 chr5 104308238 104308412 -48228847 + MLT2B4 LTR ERVL 93 268 -288 7 1380 792 275 62 27 chr5 104308437 104308695 -48228564 + MLT1A1 LTR MaLR 77 343 -65 7 1380 326 206 100 30 chr5 104316439 104316626 -48220633 + MLT1E1A LTR MaLR 360 675 -5 7 1380 740 235 92 25 chr5 104320712 104320953 -48216306 + MTD LTR MaLR 3 254 -153 8 1380 326 220 46 47 chr5 104332279 104332385 -48204874 - MTEa LTR MaLR -2 377 264 8 1381 2384 182 27 42 chr5 104342215 104342741 -48194518 + RLTR28 LTR ERVL 7 524 0 8 1381 484 291 89 97 chr5 104345547 104345965 -48191294 + MER21B LTR ERV1 345 716 -147 8 1381 3278 48 5 15 chr5 104347514 104347918 -48189341 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1381 272 326 105 33 chr5 104348049 104348230 -48189029 - LTR33 LTR ERVL -299 216 23 8 1381 875 274 87 37 chr5 104350532 104350854 -48186405 + MTE2b LTR MaLR 2 339 -40 8 1381 2065 188 44 29 chr5 104352194 104352644 -48184615 - MT2A LTR ERVL -76 457 1 8 1381 234 116 23 23 chr5 104353639 104353683 -48183576 + LTRIS2 LTR ERV1 455 498 -66 8 1381 1484 224 82 8 chr5 104358164 104358529 -48178730 + MTD LTR MaLR 28 419 0 8 1381 2109 187 167 36 chr5 104358696 104359223 -48178036 - RMER12 LTR ERVK -528 794 196 8 1381 3032 52 52 5 chr5 104359223 104359625 -48177634 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 8 1381 2109 197 165 33 chr5 104359625 104359749 -48177510 - RMER12 LTR ERVK -1127 195 59 8 1381 4420 131 54 74 chr5 104360650 104361570 -48175689 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 8 1381 1731 223 16 58 chr5 104362186 104362470 -48174789 - MTD LTR MaLR -9 410 125 8 1381 1731 223 16 58 chr5 104363315 104363343 -48173916 - MTD LTR MaLR -295 124 115 8 1381 1731 223 16 58 chr5 104363386 104363500 -48173759 - MTD LTR MaLR -305 114 1 8 1381 3453 179 111 25 chr5 104363608 104364163 -48173096 + RMER12 LTR ERVK 205 767 -555 9 1381 3453 195 117 26 chr5 104364218 104364727 -48172532 + RMER12 LTR ERVK 768 1122 -200 9 1381 2460 59 23 3 chr5 104364842 104365184 -48172075 + IAPEY_LTR LTR ERVK 37 385 0 9 1381 3237 128 29 6 chr5 104366652 104367164 -48170095 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 9 1381 494 288 86 14 chr5 104368577 104368799 -48168460 + MTEb-int LTR MaLR 1339 1576 -4 9 1381 243 259 0 0 chr5 104368801 104368855 -48168404 + MTEb LTR MaLR 1 54 -325 9 1381 421 312 146 31 chr5 104369251 104369539 -48167720 + MTEb LTR MaLR 52 372 -7 9 1381 2914 179 88 76 chr5 104369598 104370392 -48166867 + RLTR40 LTR ERVK 1 804 -13 9 1381 452 173 0 0 chr5 104371592 104371673 -48165586 + RLTR40 LTR ERVK 724 804 -13 9 1381 412 202 0 0 chr5 104371786 104371865 -48165394 + RLTR40 LTR ERVK 721 799 -18 9 1381 2568 58 3 3 chr5 104375457 104375806 -48161453 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 37 9 1381 21605 60 3 7 chr5 104375816 104378537 -48158722 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 4804 9 1381 7052 115 8 15 chr5 104378537 104379603 -48157656 - IAPEy-int LTR ERVK -6455 1058 1 9 1381 2994 66 16 3 chr5 104379603 104379983 -48157276 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 9 1381 3601 106 69 15 chr5 104380599 104381137 -48156122 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 9 1381 366 280 9 9 chr5 104381262 104381370 -48155889 + MLT1A0 LTR MaLR 31 138 -227 9 1381 4234 160 61 73 chr5 104383411 104384310 -48152949 - RMER19B LTR ERVK -12 890 3 9 1381 2503 98 0 0 chr5 104384407 104384734 -48152525 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1381 288 158 105 0 chr5 104385934 104385991 -48151268 + RLTR14-int LTR ERV1 4270 4332 -985 9 1381 4002 156 84 8 chr5 104386184 104386896 -48150363 + RLTR14-int LTR ERV1 4407 5172 -145 9 1381 365 118 0 0 chr5 104386907 104386958 -48150301 + RLTR14-int LTR ERV1 5267 5317 0 9 1381 2317 145 44 0 chr5 104386958 104387324 -48149935 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 9 1381 273 233 81 0 chr5 104407509 104407595 -48129664 - MLT1A0 LTR MaLR -254 111 19 9 1381 231 272 64 64 chr5 104408105 104408278 -48128981 + RMER2 LTR ERV1 395 567 0 9 1381 2461 75 16 3 chr5 104409597 104409917 -48127342 + ORR1A2 LTR MaLR 3 326 -1 9 1381 1152 265 63 9 chr5 104424144 104424494 -48112765 - RLTR18B LTR ERVK -5 507 139 1 1381 299 199 15 26 chr5 104424821 104424898 -48112361 - RLTR18B LTR ERVK -433 79 1 1 1381 2614 171 145 56 chr5 104435540 104436272 -48100987 - RLTR40 LTR ERVK -16 801 5 1 1381 235 118 0 0 chr5 104444545 104444579 -48092680 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 351 1 1381 2411 94 96 6 chr5 104444833 104445214 -48092045 + MTC LTR MaLR 1 409 -12 1 1381 2082 147 22 53 chr5 104452238 104452649 -48084610 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 1 1381 882 310 95 33 chr5 104457227 104457678 -48079581 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 47 1 1381 413 256 178 25 chr5 104459478 104459711 -48077548 - RMER20B LTR ERVK -124 392 133 1 1381 2873 25 0 0 chr5 104460611 104460933 -48076326 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1381 3527 41 84 5 chr5 104462488 104462928 -48074331 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1381 301 211 99 21 chr5 104463521 104463615 -48073644 - MTD LTR MaLR -1 418 284 1 1381 334 398 15 5 chr5 104464128 104464330 -48072929 - HERV16-int LTR ERVL -2098 2898 2695 1 1382 316 363 49 33 chr5 104466504 104466749 -48070510 + LTR41 LTR ERVL 513 761 -7 1 1382 240 258 109 33 chr5 104467788 104467880 -48069379 - LTR16E2 LTR ERVL -198 370 272 1 1382 456 314 90 74 chr5 104470927 104471163 -48066096 + MLT1D LTR MaLR 219 498 -7 1 1382 404 284 163 72 chr5 104471526 104471887 -48065372 + LTR81A LTR ERV1? 5 398 -995 1 1382 358 169 39 13 chr5 104473834 104473912 -48063347 + RMER5 LTR ERV1 33 112 -422 1 1382 733 237 181 32 chr5 104473933 104474243 -48063016 + RMER5 LTR ERV1 179 534 0 1 1382 291 271 70 12 chr5 104474555 104474641 -48062618 - MER67A LTR ERV1 -20 523 433 1 1382 955 78 22 10 chr5 104494474 104494618 -48042641 - RLTR10 LTR ERVK 0 411 259 1 1382 232 70 47 0 chr5 104494603 104494646 -48042613 - RLTR10 LTR ERVK -85 305 261 1 1382 2294 65 18 15 chr5 104494720 104495050 -48042209 - RLTR10 LTR ERVK -59 331 1 1 1382 9063 17 0 0 chr5 104495052 104496047 -48041212 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 1 1382 379 259 54 16 chr5 104496129 104496278 -48040981 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 1 1382 8165 30 1 27 chr5 104496323 104497307 -48039952 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 41 1 1382 2497 41 6 253 chr5 104497317 104497835 -48039424 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 1382 1347 202 170 22 chr5 104510024 104510388 -48026871 + MTD LTR MaLR 2 419 0 1 1382 1511 148 58 63 chr5 104523046 104523263 -48013996 + RMER17C LTR ERVK 1 221 -189 3 1382 1511 148 58 63 chr5 104523333 104523513 -48013746 + RMER17C LTR ERVK 222 396 -14 3 1382 1243 88 0 3 chr5 104530210 104530505 -48006754 + MTB_Mm LTR MaLR 1 391 -5 4 1382 227 293 77 39 chr5 104531725 104531803 -48005456 + LTR33 LTR ERVL 94 174 -341 4 1382 1447 149 58 111 chr5 104533255 104533686 -48003573 + RMER17C LTR ERVK 3 410 0 4 1382 3059 78 18 0 chr5 104534151 104534551 -48002708 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1382 225 255 130 56 chr5 104535753 104535861 -48001398 + LTR84a LTR ERVL 14 129 -628 5 1382 873 182 142 34 chr5 104545557 104545790 -47991469 + RMER13A LTR ERVK 212 469 -391 6 1382 395 215 160 62 chr5 104546594 104546616 -47990643 - MLT1B LTR MaLR -3 387 371 6 1382 1454 122 67 193 chr5 104546616 104547082 -47990177 + RMER17C LTR ERVK 1 407 -3 6 1382 395 215 160 62 chr5 104547082 104547203 -47990056 - MLT1B LTR MaLR -20 370 230 6 1382 368 325 26 0 chr5 104548671 104548788 -47988471 - MLT1B LTR MaLR -211 200 81 6 1382 436 325 73 29 chr5 104548871 104549213 -47988046 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 7 1382 674 320 78 39 chr5 104551549 104551984 -47985275 - MLT1B LTR MaLR -6 461 10 7 1382 452 302 84 11 chr5 104552421 104552612 -47984647 - MLT1B-int LTR MaLR -214 1157 953 7 1382 690 246 207 7 chr5 104552667 104552937 -47984322 - MLT1B LTR MaLR -9 381 58 7 1382 1324 294 137 14 chr5 104553057 104553686 -47983573 - MLT1B-int LTR MaLR -510 861 156 7 1382 358 160 0 107 chr5 104553689 104553773 -47983486 + RMER10A LTR ERVL 1 75 -367 8 1382 328 267 71 18 chr5 104554140 104554308 -47982951 + RMER10A LTR ERVL 122 298 -144 8 1382 816 255 189 13 chr5 104555488 104555806 -47981453 - MTEb LTR MaLR -3 376 3 8 1382 243 223 101 50 chr5 104559254 104559353 -47977906 - MTEb LTR MaLR -53 326 223 9 1382 242 252 125 66 chr5 104562607 104562743 -47974516 - MT2B LTR ERVL -344 257 114 9 1382 380 184 8 114 chr5 104564734 104564857 -47972402 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 1 1382 261 270 0 26 chr5 104564739 104564895 -47972364 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 603 1 1382 785 93 78 0 chr5 104566294 104566423 -47970836 - MTB LTR MaLR -261 139 1 1 1382 2408 156 88 66 chr5 104580241 104580798 -47956461 + RMER4B LTR ERVK 17 585 0 1 1382 2523 70 8 6 chr5 104583151 104583513 -47953746 - MTB LTR MaLR 0 400 38 1 1382 287 332 93 47 chr5 104585846 104586108 -47951151 - RMER13B LTR ERVK -45 863 556 1 1382 404 228 15 54 chr5 104586342 104586472 -47950787 - RMER13A LTR ERVK -638 222 98 1 1382 353 356 145 26 chr5 104589609 104589920 -47947339 + MLT1J2 LTR MaLR 72 419 -29 1 1382 2790 171 119 29 chr5 104593855 104594771 -47942488 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 1022 -1 1 172 237 284 157 0 chr5 104595399 104595501 -47941758 + MLT1E1A LTR MaLR 57 174 -506 1 1383 1484 159 41 39 chr5 104597265 104597614 -47939645 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 1383 844 137 186 11 chr5 104609607 104609784 -47927475 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 177 1 1383 637 263 83 65 chr5 104609790 104610204 -47927055 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 423 -18 1 1383 1262 293 31 80 chr5 104611091 104611707 -47925552 + MYSERV6-int LTR ERVK 4538 5123 -1427 1 1383 407 261 46 52 chr5 104611711 104611885 -47925374 + RMER4A LTR ERVK 251 423 -43 1 1383 1826 179 122 33 chr5 104611886 104612421 -47924838 + MYSERV6-int LTR ERVK 7808 8324 -635 1 1383 1853 211 45 11 chr5 104612769 104613214 -47924045 + MYSERV6-int LTR ERVK 8328 8787 -172 1 1383 880 214 56 19 chr5 104613305 104613519 -47923740 + MYSERV-int LTR ERVK 6329 6550 0 1 1383 900 273 24 45 chr5 104613519 104613944 -47923315 + BGLII_B LTR ERVK 1 416 -25 1 1383 700 86 94 0 chr5 104613987 104614104 -47923155 - ORR1C1 LTR MaLR -250 128 1 1 1383 2271 82 27 59 chr5 104614763 104615101 -47922158 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1383 322 177 65 0 chr5 104616526 104616588 -47920671 + MLT1A0 LTR MaLR 300 365 0 1 1383 2818 22 22 0 chr5 104617331 104617651 -47919608 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 1 1383 14130 73 12 6 chr5 104617653 104619465 -47917794 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 4656 1 1383 1904 83 0 0 chr5 104619464 104619704 -47917555 - IAPEY3-int LTR ERVK -5183 2497 2258 1 1383 4927 104 69 65 chr5 104619766 104621071 -47916188 - IAPEz-int LTR ERVK -5486 995 3 1 1383 2827 22 22 0 chr5 104621073 104621392 -47915867 - IAPLTR2b LTR ERVK -1 326 1 1 1383 5026 141 50 42 chr5 104626219 104627114 -47910145 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 1383 245 246 16 0 chr5 104627147 104627204 -47910055 + MTEa LTR MaLR 322 379 0 1 1383 2899 152 37 14 chr5 104628862 104629377 -47907882 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 2 1383 1769 199 76 7 chr5 104644603 104645013 -47892246 + BGLII_B LTR ERVK 4 441 0 2 1383 274 224 105 0 chr5 104648586 104648662 -47888597 + MER34 LTR ERV1 97 180 -362 2 1383 324 278 439 0 chr5 104648703 104648908 -47888351 + MER34 LTR ERV1 248 542 0 2 1383 3102 69 13 0 chr5 104650117 104650510 -47886749 + MTB LTR MaLR 3 400 0 2 1383 623 237 60 25 chr5 104652399 104652598 -47884661 + RMER5 LTR ERV1 217 422 -112 2 1383 514 294 36 45 chr5 104653287 104653511 -47883748 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1101 2 1383 4323 117 62 14 chr5 104653685 104654425 -47882834 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1072 776 1 2 1383 1509 221 49 61 chr5 104661072 104661578 -47875681 - RMER4B LTR ERVK -6 579 16 2 1383 289 352 43 7 chr5 104661866 104662006 -47875253 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -56 747 603 2 1383 1790 143 46 67 chr5 104667602 104667947 -47869312 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 41 2 1383 1872 197 139 68 chr5 104670261 104670806 -47866453 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 2 1383 366 325 148 47 chr5 104671203 104671562 -47865697 - LTR16C LTR ERVL -17 472 78 2 1383 324 365 98 86 chr5 104672622 104672921 -47864338 - MER21B LTR ERV1 -58 805 503 2 1383 281 140 123 0 chr5 104672921 104672948 -47864311 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 348 2 1383 281 140 123 0 chr5 104672968 104672997 -47864262 - ORR1D2 LTR MaLR -27 347 312 2 1383 3462 197 29 21 chr5 104673023 104673775 -47863484 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 758 -1090 2 1383 280 147 12 128 chr5 104673816 104673902 -47863357 + RLTR22_Mur LTR ERVK 932 1007 -841 2 1383 357 168 165 19 chr5 104674158 104674261 -47862998 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1731 1848 0 2 1383 831 266 72 17 chr5 104674261 104674486 -47862773 - ORR1D2 LTR MaLR -132 238 1 2 1383 399 129 53 14 chr5 104674601 104674693 -47862566 - MTEb LTR MaLR -13 366 275 2 1383 399 255 51 0 chr5 104675737 104675835 -47861424 - MTE2b LTR MaLR -80 299 197 2 1383 878 278 140 24 chr5 104678896 104679309 -47857950 + MLT1C LTR MaLR 4 464 -3 2 1383 264 309 94 89 chr5 104681141 104681354 -47855905 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -79 724 511 2 1383 3449 61 0 0 chr5 104687668 104688064 -47849195 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1383 8037 73 16 70 chr5 104688064 104688480 -47848779 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 417 -681 2 1383 8037 73 16 70 chr5 104688511 104689254 -47848005 + MTA_Mm-int LTR MaLR 418 1097 -1 2 1383 3501 51 2 0 chr5 104689254 104689649 -47847610 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1383 3105 96 30 0 chr5 104689720 104690115 -47847144 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1383 5227 160 55 17 chr5 104695158 104696133 -47841126 + MTC-int LTR MaLR 230 1241 -17 3 1383 2499 172 12 37 chr5 104696134 104696562 -47840697 + MTC LTR MaLR 5 421 0 3 1383 549 313 54 31 chr5 104702844 104703068 -47834191 + RMER15 LTR ERVL 347 575 0 3 1383 1676 218 93 8 chr5 104705184 104705540 -47831719 + MTD LTR MaLR 13 398 -21 3 1383 985 288 95 40 chr5 104718091 104718143 -47819116 - MTD LTR MaLR -14 405 360 3 1383 985 288 95 40 chr5 104718282 104718609 -47818650 - MTD LTR MaLR -60 359 5 3 1383 879 231 97 73 chr5 104718980 104719269 -47817990 + MT2B2 LTR ERVL 4 299 -285 3 1383 996 130 15 111 chr5 104719135 104719334 -47817925 - ORR1A4 LTR MaLR -149 180 1 3 1383 5941 129 4 148 chr5 104719334 104720636 -47816623 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 849 3 1383 1349 228 88 15 chr5 104722467 104722809 -47814450 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 3 1383 514 269 50 16 chr5 104726386 104726507 -47810752 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7078 3 1384 249 247 0 110 chr5 104738549 104738649 -47798610 - RMER12 LTR ERVK -501 821 733 3 1384 1125 199 31 16 chr5 104742710 104743032 -47794227 - RMER17C LTR ERVK 0 410 84 3 1384 647 252 59 25 chr5 104743048 104743284 -47793975 - RMER17C LTR ERVK -166 244 1 3 1384 455 304 67 109 chr5 104753266 104753687 -47783572 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 4 3 1384 1060 259 57 9 chr5 104779511 104779827 -47757432 - MTD LTR MaLR -88 331 1 4 1384 680 279 126 4 chr5 104780021 104780251 -47757008 + MLT2B2 LTR ERVL 258 515 0 4 1384 837 275 169 3 chr5 104785685 104786010 -47751249 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 4 1384 3097 58 24 0 chr5 104790397 104790773 -47746486 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 4 1384 59451 67 3 7 chr5 104790773 104798318 -47738941 + IAPEy-int LTR ERVK 1 7513 0 4 1384 2530 43 12 0 chr5 104798318 104798645 -47738614 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 4 1384 1446 154 37 120 chr5 104807540 104807865 -47729394 - RMER19B LTR ERVK -602 300 3 4 1384 2936 6 0 0 chr5 104810491 104810813 -47726446 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 1384 892 204 34 37 chr5 104811133 104811584 -47725675 - RMER17C LTR ERVK -2 408 10 4 1384 3281 64 5 2 chr5 104811992 104812398 -47724861 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1384 416 301 258 17 chr5 104816418 104816710 -47720549 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 6 4 1384 2343 69 3 0 chr5 104819653 104819971 -47717288 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 9 4 1384 2429 135 59 9 chr5 104820576 104821032 -47716227 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 164 4 1384 240 155 67 33 chr5 104823565 104823617 -47713642 - MLT1B LTR MaLR -295 95 40 4 1384 387 268 167 89 chr5 104824822 104825356 -47711903 - MER34A LTR ERV1 -6 565 1 4 1384 239 299 109 68 chr5 104826333 104826480 -47710779 - MLT1D LTR MaLR 0 505 353 4 1384 346 313 216 5 chr5 104826517 104826716 -47710543 - MLT1D LTR MaLR -257 248 8 4 1384 242 29 29 0 chr5 104834468 104834502 -47702757 - MTC LTR MaLR -375 46 12 5 1384 502 364 40 77 chr5 104839170 104839548 -47697711 - LTR16A LTR ERVL -54 397 34 5 1384 3530 58 5 16 chr5 104839640 104840078 -47697181 + RLTR10C LTR ERVK 1 433 -3 5 1384 625 301 47 49 chr5 104844336 104844676 -47692583 - MLT1A0 LTR MaLR -30 344 1 5 1385 6128 90 26 30 chr5 104871626 104872531 -47664728 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 5 1385 3116 84 33 88 chr5 104872975 104873485 -47663774 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 5 1385 425 302 102 53 chr5 104874997 104875263 -47661996 - LTR41 LTR ERVL -20 738 460 5 1385 437 273 83 22 chr5 104875377 104875557 -47661702 - LTR41 LTR ERVL -573 195 5 5 1385 3089 91 25 105 chr5 104877224 104877788 -47659471 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 5 1385 319 288 109 90 chr5 104878558 104878732 -47658527 + MLT1C LTR MaLR 106 364 -103 5 1385 2608 106 112 94 chr5 104878732 104879242 -47658017 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 5 1385 319 318 49 76 chr5 104879242 104879345 -47657914 + MLT1C LTR MaLR 365 467 0 5 1385 3286 53 8 0 chr5 104880038 104880435 -47656824 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1385 257 385 35 66 chr5 104882211 104882439 -47654820 - MLT1K LTR MaLR -347 248 28 5 1385 287 191 79 26 chr5 104885391 104885495 -47651764 - MTEa LTR MaLR 0 379 256 5 1385 384 314 83 33 chr5 104885782 104885963 -47651296 + MLT1A0 LTR MaLR 164 353 -12 5 1385 2494 65 9 24 chr5 104886022 104886354 -47650905 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 1385 688 276 107 66 chr5 104887063 104887428 -47649831 + MLT1B LTR MaLR 11 390 0 5 1385 255 306 35 0 chr5 104890886 104890971 -47646288 + MER21B LTR ERV1 351 438 -425 6 1385 346 85 0 0 chr5 104898621 104898668 -47638591 - ORR1A2 LTR MaLR -8 318 272 6 1385 1889 89 10 38 chr5 104899622 104899915 -47637344 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 6 1385 557 222 163 6 chr5 104901010 104901182 -47636077 + MTD LTR MaLR 207 405 -14 6 1385 2941 26 6 175 chr5 104902643 104903112 -47634147 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1385 8860 22 2 0 chr5 104903114 104904107 -47633152 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 6 1385 373 271 31 8 chr5 104904189 104904319 -47632940 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 6 1385 8241 35 2 2 chr5 104904383 104905341 -47631918 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 41 6 1385 2514 29 7 177 chr5 104905361 104905824 -47631435 - RLTR10 LTR ERVK -6 384 1 6 1385 3069 61 41 3 chr5 104910262 104910654 -47626605 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1385 811 208 57 10 chr5 104923508 104923702 -47613557 - MTD LTR MaLR -203 216 14 6 1385 818 205 91 58 chr5 104925843 104926117 -47611142 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 90 6 1385 717 43 0 0 chr5 104926126 104926218 -47611041 + MTA_Mm LTR MaLR 1 92 -304 6 1385 438 36 0 0 chr5 104926212 104926268 -47610991 + MTB LTR MaLR 345 400 0 6 1385 309 235 0 14 chr5 104926275 104926344 -47610915 - ORR1D1 LTR MaLR -299 75 8 6 1385 821 209 29 49 chr5 104931723 104931969 -47605290 - RMER16 LTR ERVK 0 533 293 6 1385 313 222 74 37 chr5 104932001 104932167 -47605092 - RMER16 LTR ERVK -187 346 214 6 1385 1253 207 62 13 chr5 104935135 104935223 -47602036 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 276 6 1385 4889 41 9 0 chr5 104935223 104935805 -47601454 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 6 1385 1253 207 62 13 chr5 104935805 104936024 -47601235 - ORR1D1 LTR MaLR -99 275 52 6 1385 232 295 12 25 chr5 104942483 104942563 -47594696 - RLTR20A2 LTR ERVK -418 160 82 6 1385 285 175 0 0 chr5 104942590 104942647 -47594612 - RLTR12A LTR ERVK -498 70 14 6 1385 376 339 88 22 chr5 104943027 104943253 -47594006 - MLT1E2 LTR MaLR -137 490 250 6 1385 282 336 51 7 chr5 104943283 104943421 -47593838 - MLT1E2 LTR MaLR -419 205 62 6 1385 437 250 9 9 chr5 104954067 104954176 -47583083 - MTE-int LTR MaLR -45 1535 1427 6 1385 1140 166 204 0 chr5 104954215 104954450 -47582809 + ORR1B1 LTR MaLR 1 283 -111 6 1385 1251 237 118 3 chr5 104978836 104979175 -47558084 + RLTR14 LTR ERV1 5 382 0 7 1385 411 338 110 10 chr5 104982126 104982335 -47554924 - LTR16C LTR ERVL -15 474 245 7 1385 1852 171 63 9 chr5 104984290 104984638 -47552621 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1386 314 186 75 75 chr5 104988748 104988841 -47548418 + RLTR23 LTR ERV1 15 107 -323 7 1386 698 128 89 57 chr5 104988845 104989002 -47548257 + RLTR22_Mus LTR ERVK 550 711 -1097 7 1386 1972 180 24 129 chr5 104989971 104990586 -47546673 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 557 0 7 1386 2424 202 41 38 chr5 104996679 104997129 -47540130 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 479 -98 7 1386 2424 202 41 38 chr5 104997242 104997345 -47539914 + RLTR20B3 LTR ERVK 480 576 -1 7 1386 265 180 0 0 chr5 104998541 104998591 -47538668 + MTC LTR MaLR 1 50 -371 7 1386 913 158 111 0 chr5 104999827 104999998 -47537261 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 137 7 1386 332 87 0 0 chr5 105000001 105000047 -47537212 - ORR1A3 LTR MaLR -193 133 88 1 1386 750 273 33 78 chr5 105000283 105000589 -47536670 + RMER13A LTR ERVK 569 860 0 2 1386 2146 240 24 101 chr5 105005658 105006284 -47530975 + RLTR25B LTR ERVK 1 578 -450 8 1386 2146 240 24 101 chr5 105006483 105006566 -47530693 + RLTR25B LTR ERVK 579 655 -373 8 1386 1498 186 34 3 chr5 105015051 105015343 -47521916 + ORR1A2 LTR MaLR 27 327 0 2 1386 1140 22 0 0 chr5 105017774 105017912 -47519347 + RLTR1B LTR ERV1 1 138 -374 2 1386 982 145 6 0 chr5 105017915 105018074 -47519185 + RLTR1B LTR ERV1 353 512 0 2 1386 2999 248 20 145 chr5 105018753 105019928 -47517331 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 2 1386 1738 243 75 70 chr5 105021307 105021918 -47515341 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 3 3 1386 301 286 82 67 chr5 105022910 105023125 -47514134 + MT2A LTR ERVL 336 528 -73 3 1386 2128 136 9 0 chr5 105031803 105032127 -47505132 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1386 6861 183 62 66 chr5 105032127 105032815 -47504444 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1305 5 1386 6861 183 62 66 chr5 105032962 105033931 -47503328 - ORR1A2-int LTR MaLR -659 1304 313 5 1386 1569 205 33 24 chr5 105033940 105034170 -47503089 + RLTR20B3 LTR ERVK 245 483 -94 5 1386 1569 205 33 24 chr5 105034195 105034294 -47502965 + RLTR20B3 LTR ERVK 484 576 -1 5 1386 3261 67 83 2 chr5 105035326 105035772 -47501487 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 6 1386 1352 181 4 0 chr5 105037591 105037829 -47499430 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 88 5 1386 802 266 28 67 chr5 105038064 105038346 -47498913 + RMER13A LTR ERVK 569 839 -21 6 1386 2547 256 58 91 chr5 105050438 105051438 -47485821 + RLTR25B LTR ERVK 1 967 -61 7 1386 3051 75 0 17 chr5 105051656 105052074 -47485185 + LTRIS2 LTR ERV1 1 411 -153 7 1386 2940 27 0 0 chr5 105057184 105057516 -47479743 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 8 1386 2806 55 6 0 chr5 105063676 105064020 -47473239 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 9 1386 265 310 147 78 chr5 105071437 105071598 -47465661 - RMER10A LTR ERVL -8 434 290 9 1386 3161 58 22 212 chr5 105071598 105072230 -47465029 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 1386 265 310 147 78 chr5 105072230 105072464 -47464795 - RMER10A LTR ERVL -153 289 12 9 1386 2035 138 28 0 chr5 105077426 105077744 -47459515 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1386 8499 182 56 31 chr5 105077744 105079659 -47457600 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 1 1386 1967 172 3 0 chr5 105079659 105079985 -47457274 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1386 1765 175 58 63 chr5 105081005 105081223 -47456036 - MTC LTR MaLR -8 413 200 1 1386 1765 175 58 63 chr5 105081415 105081611 -47455648 - MTC LTR MaLR -222 199 1 1 1386 1477 238 20 80 chr5 105081855 105082257 -47455002 + RLTR1B LTR ERV1 135 512 0 1 1386 278 211 73 96 chr5 105082396 105082532 -47454727 - RLTR25B LTR ERVK -524 504 372 1 1386 1208 214 48 19 chr5 105082977 105083291 -47453968 + ORR1A3 LTR MaLR 3 325 -1 1 1386 1216 201 21 28 chr5 105086941 105087223 -47450036 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 280 -1568 1 1386 2445 160 11 2 chr5 105087366 105087817 -47449442 + RLTR22_Mur LTR ERVK 261 715 -1133 1 1386 1655 214 27 94 chr5 105089192 105089850 -47447409 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 555 -2 1 1386 878 278 22 90 chr5 105090974 105091286 -47445973 + RMER13A LTR ERVK 570 860 0 1 1386 2547 256 58 91 chr5 105103364 105104364 -47432895 + RLTR25B LTR ERVK 1 967 -61 1 1386 3075 73 0 17 chr5 105104582 105105000 -47432259 + LTRIS2 LTR ERV1 1 411 -153 1 1386 2940 27 0 0 chr5 105110110 105110442 -47426817 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 1 1386 2989 55 6 0 chr5 105116600 105116944 -47420315 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1387 2942 16 2 231 chr5 105122319 105122825 -47414434 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1387 6197 45 64 136 chr5 105122825 105123861 -47413398 + RLTR10-int LTR ERVK 1 991 -996 1 1387 756 320 64 10 chr5 105123918 105124310 -47412949 + RLTR10-int LTR ERVK 738 1150 -5392 1 1387 8877 21 1 0 chr5 105124392 105125386 -47411873 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 1 1387 2800 23 2 233 chr5 105125388 105125890 -47411369 + RLTR10 LTR ERVK 1 386 -4 1 1387 245 310 147 78 chr5 105127944 105128105 -47409154 - RMER10A LTR ERVL -8 434 290 1 1387 3420 58 22 212 chr5 105128105 105128737 -47408522 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 1387 245 310 147 78 chr5 105128737 105128971 -47408288 - RMER10A LTR ERVL -153 289 12 1 1387 5085 44 25 13 chr5 105132388 105133058 -47404201 + ORR1A1-int LTR MaLR 1115 1792 0 1 1387 2690 61 58 9 chr5 105133058 105133388 -47403871 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1387 2319 130 9 0 chr5 105137046 105137370 -47399889 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1387 9276 187 50 19 chr5 105137370 105139274 -47397985 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 1 1387 2038 162 19 0 chr5 105139275 105139595 -47397664 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 1 1387 872 214 114 0 chr5 105140002 105140192 -47397067 - MTC LTR MaLR -208 213 1 1 1387 1411 187 68 13 chr5 105141392 105141701 -47395558 + ORR1A4 LTR MaLR 3 328 -1 1 1387 2919 106 30 11 chr5 105143875 105144368 -47392891 - RLTR13C2 LTR ERVK -11 811 325 1 1387 1958 251 52 79 chr5 105144516 105144642 -47392617 - RLTR13C2 LTR ERVK -470 459 294 1 1387 2104 241 4 9 chr5 105144642 105145102 -47392157 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2553 2510 2053 1 1387 4691 214 37 62 chr5 105145091 105146583 -47390676 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2839 1851 367 1 1387 4691 182 18 23 chr5 105146622 105147027 -47390232 - MuRRS4-int LTR ERV1 -4697 366 2 1 1387 2559 102 6 3 chr5 105147032 105147397 -47389862 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 222 1 1387 2273 212 34 43 chr5 105148621 105149063 -47388196 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 471 -106 1 1387 2273 212 34 43 chr5 105149153 105149271 -47387988 + RLTR20B3 LTR ERVK 472 576 -1 1 1387 1341 181 4 0 chr5 105151033 105151271 -47385988 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 88 2 1387 830 282 34 61 chr5 105151506 105151801 -47385458 + RMER13A LTR ERVK 569 855 -5 2 1387 3252 236 109 67 chr5 105157090 105157953 -47379306 + RLTR25A LTR ERVK 1 882 -221 2 1387 3252 236 109 67 chr5 105158024 105158218 -47379041 + RLTR25A LTR ERVK 883 1102 -1 2 1387 1746 253 78 77 chr5 105159562 105160175 -47377084 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 3 2 1387 302 265 98 69 chr5 105161176 105161350 -47375909 + MT2A LTR ERVL 336 514 -19 2 1387 2415 109 134 56 chr5 105163905 105164352 -47372907 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1387 7640 37 26 2 chr5 105164352 105165243 -47372016 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 6333 2 1387 2858 71 8 0 chr5 105165243 105165621 -47371638 - RLTR13B1 LTR ERVK -385 508 128 2 1387 1730 104 0 0 chr5 105165621 105165851 -47371408 - RLTR45-int LTR ERVK -50 5758 5529 2 1387 8113 39 26 7 chr5 105165864 105166854 -47370405 - RLTR45-int LTR ERVK -1172 6072 5064 2 1387 17342 40 18 11 chr5 105166846 105169168 -47368091 - RLTR45-int LTR ERVK -3258 3986 1649 2 1387 724 67 0 6 chr5 105169245 105169357 -47367902 - RLTR13B1 LTR ERVK -277 652 435 2 1387 624 311 43 56 chr5 105169369 105169852 -47367407 - RNERVK23-int LTR ERVK -612 7605 7129 2 1387 4614 78 78 24 chr5 105169944 105170650 -47366609 - RLTR45-int LTR ERVK -5599 1645 902 2 1387 1727 41 0 9 chr5 105170757 105170978 -47366281 - RLTR45-int LTR ERVK -6334 910 692 2 1387 4789 62 29 22 chr5 105171297 105171984 -47365275 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 1 2 1387 2752 115 26 51 chr5 105171984 105172478 -47364781 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 1387 2786 49 6 0 chr5 105183490 105183834 -47353425 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1387 2068 142 9 0 chr5 105187032 105187356 -47349903 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1387 8065 175 83 32 chr5 105187356 105189224 -47348035 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 2 1387 1854 186 3 0 chr5 105189232 105189549 -47347710 - ORR1A2 LTR MaLR -9 318 1 2 1387 1802 169 55 62 chr5 105190545 105190763 -47346496 - MTC LTR MaLR -8 413 214 2 1387 1802 169 55 62 chr5 105190955 105191152 -47346107 - MTC LTR MaLR -208 213 1 2 1387 693 147 8 8 chr5 105191533 105191663 -47345596 + RLTR22_Mur LTR ERVK 586 715 -1133 2 1387 1458 231 18 149 chr5 105191854 105192412 -47344847 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 98 582 -2 2 1387 2640 82 141 139 chr5 105192715 105193226 -47344033 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 2 1387 255 200 0 0 chr5 105197189 105197239 -47340020 + MTC LTR MaLR 1 50 -371 2 1387 1369 154 21 0 chr5 105198575 105198809 -47338450 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 88 2 1387 793 275 40 73 chr5 105199044 105199346 -47337913 + RMER13A LTR ERVK 569 860 0 2 1387 243 170 38 0 chr5 105199876 105199929 -47337330 - RMER4A LTR ERVK -401 65 11 2 1387 551 72 0 12 chr5 105203716 105203800 -47333459 - RLTR45-int LTR ERVK -2326 4918 4836 2 1387 23671 98 22 36 chr5 105213680 105213765 -47323494 - ETnERV3-int LTR ERVK -1712 4096 4010 3 1387 23671 128 26 36 chr5 105213798 105218249 -47319010 - ETnERV3-int LTR ERVK -1799 4009 188 3 1387 1111 109 5 27 chr5 105218665 105218853 -47318406 - ETnERV3-int LTR ERVK -5622 186 3 3 1387 6935 35 0 21 chr5 105218855 105219695 -47317564 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 3 1387 1274 164 8 45 chr5 105219789 105220031 -47317228 + ORR1A3 LTR MaLR 88 320 -6 3 1387 2314 222 12 61 chr5 105221941 105222511 -47314748 - RLTR25B LTR ERVK -475 553 12 3 1387 752 264 26 75 chr5 105227984 105228291 -47308968 - RMER13A LTR ERVK 0 860 569 3 1387 1205 166 9 0 chr5 105229642 105229865 -47307394 + ORR1A3 LTR MaLR 86 310 -16 3 1387 273 133 22 0 chr5 105234695 105234740 -47302519 + RNERVK23-int LTR ERVK 6811 6856 -1361 3 1387 381 270 45 30 chr5 105235991 105236191 -47301068 - RLTR6-int LTR ERV1 -6310 1468 1159 3 1387 297 338 47 43 chr5 105236767 105236999 -47300260 - RLTR6-int LTR ERV1 -6741 815 583 3 1387 2830 50 7 103 chr5 105238672 105239100 -47298159 + RLTR10 LTR ERVK 1 387 -3 3 1387 15458 38 13 65 chr5 105239100 105241170 -47296089 + RLTR10-int LTR ERVK 17 1986 -1 3 1387 2816 52 7 103 chr5 105241170 105241598 -47295661 + RLTR10 LTR ERVK 1 387 -3 3 1388 2186 35 3 0 chr5 105251146 105251428 -47285831 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 56 3 1388 8404 141 114 52 chr5 105252485 105254980 -47282279 - RLTR1B-int LTR ERV1 -1067 3996 761 3 1388 4266 135 92 16 chr5 105254972 105255678 -47281581 - RMER16-int LTR ERVK -3962 1444 685 3 1388 975 157 61 11 chr5 105255659 105255839 -47281420 - RMER16-int LTR ERVK -5075 331 143 3 1388 1096 144 69 17 chr5 105256159 105256392 -47280867 - RLTR1B-int LTR ERV1 -2992 307 63 3 1388 3763 67 82 37 chr5 105256541 105257081 -47280178 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 3 1388 782 259 29 64 chr5 105258176 105258457 -47278802 - RMER13A LTR ERVK -21 839 569 3 1388 1279 162 4 16 chr5 105258690 105258934 -47278325 + ORR1A3 LTR MaLR 86 326 0 3 1388 247 180 0 0 chr5 105260187 105260237 -47277022 - MTC LTR MaLR -371 50 1 3 1388 2026 214 50 54 chr5 105261296 105261415 -47275844 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 473 3 1388 2026 214 50 54 chr5 105261493 105261931 -47275328 - RLTR20B3 LTR ERVK -105 472 22 3 1388 3915 84 3 38 chr5 105263203 105263258 -47274001 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 534 3 1388 5743 95 77 4 chr5 105263258 105264090 -47273169 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 3 1388 3915 84 3 38 chr5 105264090 105264642 -47272617 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -54 533 1 3 1388 5830 86 12 42 chr5 105264977 105265372 -47271887 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 395 -413 3 1388 5830 86 12 42 chr5 105265511 105265948 -47271311 + RLTR13C2 LTR ERVK 396 808 0 3 1388 1651 227 30 111 chr5 105268225 105268858 -47268401 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -2 582 1 3 1388 2093 173 16 2 chr5 105269978 105270424 -47266835 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1133 715 264 3 1388 1107 209 11 35 chr5 105270601 105270884 -47266375 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1572 276 1 3 1388 1331 190 51 13 chr5 105274501 105274815 -47262444 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 3 3 1388 2399 57 88 6 chr5 105275544 105275864 -47261395 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1388 1608 177 55 62 chr5 105276348 105276545 -47260714 + MTC LTR MaLR 1 213 -208 3 1388 1608 177 55 62 chr5 105276736 105276954 -47260305 + MTC LTR MaLR 214 413 -8 3 1388 2023 153 45 0 chr5 105277991 105278304 -47258955 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1388 5190 198 60 30 chr5 105278304 105279541 -47257718 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1274 -689 3 1388 4335 86 9 23 chr5 105283310 105283882 -47253377 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 3 1388 3106 231 112 80 chr5 105284017 105285060 -47252199 - RLTR25A LTR ERVK -26 1077 1 3 1388 757 272 29 81 chr5 105289158 105289466 -47247793 - RMER13A LTR ERVK 0 860 569 4 1388 1419 165 0 4 chr5 105289700 105289938 -47247321 + ORR1A2 LTR MaLR 86 322 -4 3 1388 251 200 0 0 chr5 105291325 105291375 -47245884 - MTC LTR MaLR -371 50 1 4 1388 6747 57 10 3 chr5 105291987 105292885 -47244374 + RLTR13A3 LTR ERVK 75 978 0 4 1388 2856 80 141 139 chr5 105294944 105295455 -47241804 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1388 1367 236 18 149 chr5 105297723 105298281 -47238978 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -2 582 98 4 1388 753 117 16 8 chr5 105298474 105298603 -47238656 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1133 715 586 4 1388 1769 174 53 60 chr5 105298995 105299192 -47238067 + MTC LTR MaLR 1 213 -208 4 1388 1769 174 53 60 chr5 105299383 105299601 -47237658 + MTC LTR MaLR 214 412 -9 4 1388 1989 170 31 0 chr5 105300606 105300923 -47236336 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1388 9546 173 54 31 chr5 105300923 105302841 -47234418 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 4 1388 2163 151 9 0 chr5 105302841 105303165 -47234094 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1388 2967 49 6 0 chr5 105306363 105306707 -47230552 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1388 9784 63 2 7 chr5 105306707 105307657 -47229602 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 951 -841 4 1388 4862 57 19 7 chr5 105307657 105308237 -47229022 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 4 1388 9784 63 2 7 chr5 105308237 105308625 -47228634 + ORR1A1-int LTR MaLR 952 1333 -459 4 1388 2987 64 143 139 chr5 105309402 105309912 -47227347 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1388 3083 54 2 65 chr5 105316490 105316903 -47220356 - RLTR10 LTR ERVK -3 387 1 4 1388 257 285 86 14 chr5 105331795 105331934 -47205325 - MT2A LTR ERVL -19 514 366 4 1388 1829 253 77 77 chr5 105332979 105333592 -47203667 + RLTR18 LTR ERVK 4 616 0 4 1388 2558 256 46 54 chr5 105335005 105335199 -47202060 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 814 4 1388 2558 256 46 54 chr5 105335286 105335458 -47201801 - RLTR25B LTR ERVK -215 813 646 4 1388 2558 254 102 88 chr5 105335603 105336322 -47200937 - RLTR25B LTR ERVK -384 719 2 4 1388 2822 74 16 245 chr5 105336935 105337560 -47199699 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1388 33782 66 71 72 chr5 105337560 105340094 -47197165 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 4749 4 1388 33782 66 71 72 chr5 105340116 105342977 -47194282 - RLTR45-int LTR ERVK -2496 4748 1858 4 1388 6576 67 40 19 chr5 105342968 105344330 -47192929 - RLTR45-int LTR ERVK -5826 1418 1 4 1388 3043 74 17 186 chr5 105344330 105344910 -47192349 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 1388 283 208 12 72 chr5 105349737 105349820 -47187439 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 500 4 1388 3591 124 48 32 chr5 105349822 105350347 -47186912 + RLTR5_Mm LTR ERV1 1 516 -112 4 1388 3591 124 48 32 chr5 105350371 105350463 -47186796 + RLTR5_Mm LTR ERV1 517 627 -1 4 1388 50094 110 19 20 chr5 105350463 105357921 -47179338 + MURVY-int LTR ERV1 1 7452 0 4 1388 3888 128 14 28 chr5 105357921 105358558 -47178701 + RLTR5_Mm LTR ERV1 1 628 0 4 1388 1707 219 39 27 chr5 105358608 105359050 -47178209 - RLTR20B3 LTR ERVK -110 467 21 4 1388 4748 60 2 10 chr5 105361003 105361595 -47175664 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 4 1388 6696 158 21 44 chr5 105361595 105363114 -47174145 - MuRRS-int LTR ERV1 0 4690 3089 4 1388 331 317 48 18 chr5 105363390 105363557 -47173702 - RMER13A LTR ERVK 0 860 689 4 1388 1870 215 30 0 chr5 105368796 105369200 -47168059 + MTC LTR MaLR 6 421 0 4 1388 3127 85 2 0 chr5 105369318 105369717 -47167542 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1388 235 146 0 0 chr5 105370045 105370086 -47167173 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 334 4 1388 2822 94 22 0 chr5 105370419 105370832 -47166427 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 5 1388 361 266 67 47 chr5 105371177 105371327 -47165932 - RLTR42-int LTR ERVK -2998 2524 2372 5 1388 1358 242 40 23 chr5 105372365 105372716 -47164543 - MTD LTR MaLR -5 414 58 5 1388 1052 189 6 172 chr5 105374275 105374588 -47162671 + RMER19B LTR ERVK 1 261 -641 5 1388 776 299 31 18 chr5 105376136 105376422 -47160837 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 81 5 1388 303 260 26 0 chr5 105378100 105378177 -47159082 + MTD LTR MaLR 1 79 -342 5 1388 302 203 16 0 chr5 105378510 105378574 -47158685 + MTD LTR MaLR 137 201 -220 5 1388 506 120 76 0 chr5 105378695 105378787 -47158472 + MTD LTR MaLR 209 307 -112 5 1389 2421 84 74 25 chr5 105382464 105382856 -47154403 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 1389 2230 199 9 7 chr5 105383350 105383770 -47153489 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1389 398 296 94 30 chr5 105383992 105384194 -47153065 + MLT1A LTR MaLR 3 217 -157 5 1389 1704 222 25 5 chr5 105386919 105387313 -47149946 - MTD LTR MaLR 0 419 18 5 1389 3906 92 99 0 chr5 105393112 105393656 -47143603 + MT2B LTR ERVL 4 601 0 5 1389 636 165 26 0 chr5 105395290 105395405 -47141854 - MTC LTR MaLR -288 133 16 5 1389 1547 117 4 0 chr5 105397627 105397857 -47139402 + ORR1A2 LTR MaLR 3 233 -94 5 1389 228 271 150 39 chr5 105397879 105398006 -47139253 + MLT1B LTR MaLR 213 353 -37 5 1389 1585 124 124 0 chr5 105400118 105400409 -47136850 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 5 1389 882 287 32 99 chr5 105401840 105402243 -47135016 - MTE2a LTR MaLR 0 379 4 5 1389 1819 102 10 10 chr5 105417192 105417488 -47119771 + RMER6A LTR ERVK 461 756 0 5 1389 420 352 18 18 chr5 105419140 105419305 -47117954 - MTE2b LTR MaLR -140 239 75 6 1389 249 226 154 5 chr5 105425508 105425616 -47111643 - MTE2b LTR MaLR -299 120 1 6 1389 1366 184 34 54 chr5 105429082 105429491 -47107768 - RMER17C LTR ERVK 0 410 10 6 1389 321 253 63 0 chr5 105431044 105431139 -47106120 - MTEb LTR MaLR -46 333 233 6 1389 262 349 48 12 chr5 105436058 105436226 -47101033 + MLT1A0 LTR MaLR 168 341 -24 6 1389 1511 150 117 26 chr5 105437272 105437615 -47099644 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1389 2001 135 0 0 chr5 105438056 105438375 -47098884 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1389 640 245 114 26 chr5 105443359 105443631 -47093628 - MTE2b LTR MaLR -11 368 73 6 1389 6206 65 25 8 chr5 105460800 105461594 -47075665 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 6 1389 1297 147 13 13 chr5 105465179 105465414 -47071845 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 444 6 1389 1640 180 19 6 chr5 105465411 105465735 -47071524 + RMER20B LTR ERVK 44 371 -256 6 1389 788 239 91 22 chr5 105465778 105466009 -47071250 + RMER20B LTR ERVK 360 606 -21 6 1389 3296 136 125 57 chr5 105466114 105466908 -47070351 + RMER17D LTR ERVK 26 873 -16 6 1389 690 253 131 12 chr5 105468710 105468962 -47068297 + MTEa LTR MaLR 3 284 -95 6 1389 323 271 58 29 chr5 105468982 105469119 -47068140 + RLTR15 LTR ERVK 33 173 -186 6 1389 358 276 48 43 chr5 105469155 105469363 -47067896 + RLTR15 LTR ERVK 133 341 -18 6 1389 388 318 55 33 chr5 105471028 105471210 -47066049 + ORR1E LTR MaLR 12 197 -162 6 1389 269 319 71 27 chr5 105481166 105481350 -47055909 - MER57F LTR ERV1 -217 219 28 6 1389 1328 209 82 28 chr5 105483057 105483446 -47053813 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 1389 925 238 61 39 chr5 105486010 105486442 -47050817 - RMER17C LTR ERVK 0 410 76 6 1389 301 244 77 11 chr5 105487755 105487846 -47049413 - MTE2b LTR MaLR -47 332 236 6 1389 1936 156 21 86 chr5 105492184 105492604 -47044655 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 6 1389 426 355 33 15 chr5 105493618 105493890 -47043369 + MLT1A0 LTR MaLR 72 348 -17 6 1389 1375 191 82 23 chr5 105494943 105495296 -47041963 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1389 1876 143 13 0 chr5 105495961 105496276 -47040983 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1389 6792 119 56 9 chr5 105505378 105506439 -47030820 - RLTR13D3 LTR ERVK -4 1110 1 2 1389 685 282 66 83 chr5 105508500 105508848 -47028411 - MTE2b LTR MaLR -11 368 27 6 1390 3388 141 19 26 chr5 105526158 105526484 -47010775 - RLTR33 LTR ERVK -68 610 296 2 1390 5612 112 18 48 chr5 105526484 105527418 -47009841 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 2 1390 3388 141 19 26 chr5 105527418 105527705 -47009554 - RLTR33 LTR ERVK -383 295 1 2 1390 712 195 58 5 chr5 105529451 105529642 -47007617 + RMER17B LTR ERVK 183 383 -575 2 1390 723 273 95 4 chr5 105530967 105531210 -47006049 + MTEa LTR MaLR 3 267 -112 2 1390 339 347 23 0 chr5 105537873 105538046 -46999213 - MER57F LTR ERV1 -247 189 13 4 1390 1237 185 35 79 chr5 105539746 105540175 -46997084 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 1390 1919 120 9 51 chr5 105541061 105541394 -46995865 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1390 2687 28 31 0 chr5 105542350 105542667 -46994592 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 4 1390 646 316 84 28 chr5 105546714 105547077 -46990182 - MTE2b LTR MaLR -2 377 21 5 1390 1049 220 13 13 chr5 105558647 105558882 -46978377 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 444 6 1390 1665 179 12 6 chr5 105558879 105559205 -46978054 + RMER20B LTR ERVK 44 371 -256 6 1390 852 202 67 89 chr5 105559222 105559504 -46977755 + RMER20B LTR ERVK 352 627 0 6 1390 660 293 90 4 chr5 105561734 105561967 -46975292 + MTEa LTR MaLR 3 255 -124 7 1390 380 243 58 22 chr5 105562006 105562145 -46975114 + RLTR15 LTR ERVK 33 176 -183 7 1390 383 241 68 49 chr5 105562178 105562383 -46974876 + RLTR15 LTR ERVK 133 341 -18 7 1390 241 337 72 0 chr5 105563237 105563320 -46973939 + LTR16A LTR ERVL 3 91 -360 7 1390 258 357 37 11 chr5 105567148 105567335 -46969924 - MER57F LTR ERV1 -217 219 28 8 1390 990 224 18 48 chr5 105569059 105569396 -46967863 + RMER17C LTR ERVK 84 410 0 8 1390 294 169 143 12 chr5 105570976 105571060 -46966199 - RMER17C LTR ERVK 0 410 316 9 1390 1277 225 40 33 chr5 105571079 105571478 -46965781 - RMER17C LTR ERVK 0 410 9 9 1390 2692 113 2 17 chr5 105575543 105575956 -46961303 + RLTR9E LTR ERVK 3 409 0 1 1390 466 338 43 14 chr5 105577241 105577520 -46959739 + MLT1A0 LTR MaLR 72 358 -7 1 1390 1445 199 32 15 chr5 105578554 105578896 -46958363 + ORR1D1 LTR MaLR 27 374 0 1 1390 2047 117 9 0 chr5 105579536 105579852 -46957407 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1390 6522 112 36 14 chr5 105582845 105583932 -46953327 - RLTR13D3 LTR ERVK -3 1111 1 1 1390 652 291 72 80 chr5 105586280 105586642 -46950617 - MTE2b LTR MaLR -12 367 9 1 1390 3364 149 18 21 chr5 105604980 105605311 -46931948 - RLTR33 LTR ERVK -64 614 296 1 1390 4939 123 60 48 chr5 105605311 105606206 -46931053 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 1 1390 3364 149 18 21 chr5 105606206 105606490 -46930769 - RLTR33 LTR ERVK -383 295 1 1 1390 2994 153 9 24 chr5 105608276 105608824 -46928435 + RLTR1D LTR ERV1 50 589 -16 1 1390 571 170 106 12 chr5 105608835 105608996 -46928263 + RMER17B LTR ERVK 208 383 -575 1 1390 374 318 22 60 chr5 105611337 105611521 -46925738 + ORR1E LTR MaLR 12 188 -171 1 1390 1721 55 0 17 chr5 105611875 105612115 -46925144 - LTRIS2 LTR ERV1 -324 240 5 1 1390 1593 151 12 81 chr5 105612198 105612544 -46924715 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1390 892 139 19 12 chr5 105612927 105613087 -46924172 + RMER17C-int LTR ERVK 1346 1506 -1732 1 1390 3526 331 30 39 chr5 105616876 105618326 -46918933 - RodERV21-int LTR ERV1 -204 4787 3331 1 1390 3097 86 58 19 chr5 105618326 105618790 -46918469 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1390 3526 331 30 39 chr5 105618790 105619232 -46918027 - RodERV21-int LTR ERV1 -1661 3330 2911 1 1390 295 202 21 56 chr5 105619782 105619895 -46917364 - MER52-int LTR ERV1 -1319 5772 5671 1 1390 330 308 57 45 chr5 105620268 105620594 -46916665 - RodERV21-int LTR ERV1 -3339 4868 4664 1 1390 637 299 48 71 chr5 105621329 105621851 -46915408 - RodERV21-int LTR ERV1 -2986 4105 3596 1 1390 5912 272 23 36 chr5 105621980 105623611 -46913648 - RodERV21-int LTR ERV1 -2273 2718 1110 1 1390 793 286 35 53 chr5 105623692 105624032 -46913227 - RodERV21-int LTR ERV1 -3913 1078 745 1 1390 4215 148 61 30 chr5 105624032 105624911 -46912348 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 883 -19 1 1390 312 332 29 63 chr5 105624911 105625117 -46912142 - RMER17C-int LTR ERVK -2714 524 326 1 1390 320 24 0 0 chr5 105625740 105625782 -46911477 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 42 -250 1 1390 1927 78 84 39 chr5 105625818 105626151 -46911108 + RLTR10B2 LTR ERVK 18 365 0 1 1390 1292 205 89 41 chr5 105626702 105627093 -46910166 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 1390 417 343 67 51 chr5 105628668 105629058 -46908201 + MER57F LTR ERV1 17 412 -24 1 1390 2272 62 56 0 chr5 105631800 105632124 -46905135 + LTRIS2 LTR ERV1 223 564 0 1 1390 1567 158 38 35 chr5 105639575 105639922 -46897337 + ORR1D1 LTR MaLR 27 374 0 1 1390 380 189 11 0 chr5 105640368 105640458 -46896801 + ORR1A2 LTR MaLR 1 91 -236 1 1390 1668 132 4 2 chr5 105640485 105640792 -46896467 + ORR1A2 LTR MaLR 28 332 -14 1 1391 644 289 67 66 chr5 105645809 105646184 -46891075 - MTE2b LTR MaLR -2 368 6 1 1391 891 177 146 10 chr5 105660009 105660214 -46877045 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 446 2 1391 2117 194 19 113 chr5 105660248 105660883 -46876376 + RMER20B LTR ERVK 52 626 -1 2 1391 376 343 30 10 chr5 105667134 105667337 -46869922 - MER57F LTR ERV1 -217 219 13 2 1391 1305 202 87 43 chr5 105669040 105669433 -46867826 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 1391 342 326 29 63 chr5 105670605 105670811 -46866448 + RMER17C-int LTR ERVK 326 524 -2714 2 1391 4396 133 61 30 chr5 105670811 105671689 -46865570 - RLTR13D6 LTR ERVK -19 883 1 2 1391 838 279 35 53 chr5 105671689 105672029 -46865230 + RodERV21-int LTR ERV1 745 1078 -3913 2 1391 5887 266 25 38 chr5 105672110 105673741 -46863518 + RodERV21-int LTR ERV1 1110 2718 -2273 2 1391 418 299 54 99 chr5 105673870 105674404 -46862855 + RodERV21-int LTR ERV1 3596 4105 -2986 2 1391 335 322 28 28 chr5 105675137 105675466 -46861793 + RodERV21-int LTR ERV1 4664 4836 -3371 2 1391 295 202 21 56 chr5 105675839 105675952 -46861307 + RodERV21-int LTR ERV1 5671 5772 -1319 2 1391 3645 334 30 38 chr5 105676503 105676945 -46860314 + RodERV21-int LTR ERV1 2911 3330 -1661 2 1391 2996 92 59 40 chr5 105676945 105677418 -46859841 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1391 3645 334 30 38 chr5 105677418 105678868 -46858391 + RodERV21-int LTR ERV1 3331 4788 -203 2 1391 911 139 19 12 chr5 105682711 105682871 -46854388 - RMER17C-int LTR ERVK -1732 1506 1346 2 1391 265 342 37 26 chr5 105694183 105694372 -46842887 + MLT1A0 LTR MaLR 168 358 -7 2 1391 1495 170 38 35 chr5 105695395 105695742 -46841517 + ORR1D1 LTR MaLR 27 374 0 2 1391 350 200 11 0 chr5 105696187 105696277 -46840982 + ORR1A2 LTR MaLR 1 91 -236 2 1391 1654 140 4 2 chr5 105696304 105696611 -46840648 + ORR1A2 LTR MaLR 28 332 -14 2 1391 653 282 67 66 chr5 105701606 105701981 -46835278 - MTE2b LTR MaLR -2 368 6 2 1391 891 163 146 10 chr5 105714993 105715198 -46822061 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 446 2 1391 2167 192 19 113 chr5 105715232 105715867 -46821392 + RMER20B LTR ERVK 52 626 -1 2 1391 374 335 22 39 chr5 105718102 105718282 -46818977 + ORR1E LTR MaLR 12 188 -171 2 1391 249 350 32 16 chr5 105721291 105721480 -46815779 - MER57F LTR ERV1 -217 219 28 2 1391 1208 174 127 33 chr5 105723207 105723539 -46813720 + RMER17C LTR ERVK 1 363 -47 2 1391 2657 35 0 3 chr5 105723548 105723888 -46813371 + ORR1A1 LTR MaLR 8 346 0 2 1391 259 338 7 42 chr5 105726559 105726701 -46810558 - RMER12 LTR ERVK -490 832 696 2 1391 1002 215 45 131 chr5 105729103 105729374 -46807885 - RMER17C LTR ERVK 0 410 169 2 1391 1002 215 45 131 chr5 105729452 105729629 -46807630 - RMER17C LTR ERVK -242 168 1 2 1391 2259 140 76 6 chr5 105729629 105730311 -46806948 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2509 2 1391 1907 270 106 75 chr5 105730306 105731589 -46805670 - RMER17C-int LTR ERVK -1915 1323 1 2 1391 520 97 0 0 chr5 105735244 105735316 -46801943 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 72 -961 2 1391 3157 167 16 131 chr5 105735729 105736569 -46800690 + RLTR13C2 LTR ERVK 66 808 0 2 1391 301 321 50 0 chr5 105738399 105738539 -46798720 + MLT1A0 LTR MaLR 168 314 -51 2 1391 5057 106 93 11 chr5 105738986 105739806 -46797453 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 3 1391 1347 181 82 24 chr5 105740421 105740750 -46796509 + ORR1D1 LTR MaLR 27 374 0 3 1391 2125 110 3 0 chr5 105741188 105741506 -46795753 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 3 1391 617 296 66 72 chr5 105752220 105752583 -46784676 - MTE2b LTR MaLR -2 368 21 3 1391 1263 179 4 13 chr5 105764431 105764668 -46772591 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 444 3 1391 2277 192 24 87 chr5 105764666 105765288 -46771971 + RMER20B LTR ERVK 45 627 0 3 1391 614 275 161 0 chr5 105768844 105769062 -46768197 + MTEa LTR MaLR 3 255 -124 3 1391 370 237 65 29 chr5 105769101 105769240 -46768019 + RLTR15 LTR ERVK 33 176 -183 3 1391 411 231 68 49 chr5 105769273 105769478 -46767781 + RLTR15 LTR ERVK 133 341 -18 3 1391 281 349 40 10 chr5 105774063 105774263 -46762996 - MER57F LTR ERV1 -214 222 17 3 1392 565 168 15 60 chr5 105775935 105776068 -46761191 + RMER17C LTR ERVK 2 128 -282 3 1392 939 210 49 35 chr5 105778868 105779154 -46758105 + RMER17C LTR ERVK 121 410 0 3 1392 331 348 37 16 chr5 105785677 105785864 -46751395 + MLT1A0 LTR MaLR 168 358 -7 3 1392 1708 171 64 22 chr5 105786865 105787224 -46750035 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1392 2313 103 0 0 chr5 105787660 105787979 -46749280 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 3 1392 528 279 99 14 chr5 105788594 105788805 -46748454 + MYSERV-int LTR ERVK 1096 1324 -5226 3 1392 498 224 74 7 chr5 105788871 105789006 -46748253 + MYSERV-int LTR ERVK 4258 4401 -2149 3 1392 6236 69 4 19 chr5 105789096 105789964 -46747295 + RLTR13A2 LTR ERVK 1 958 0 3 1392 48215 32 11 12 chr5 105789964 105793979 -46743280 + ETnERV3-int LTR ERVK 1 3978 -1830 3 1392 48215 32 11 12 chr5 105794014 105795800 -46741459 + ETnERV3-int LTR ERVK 3979 5793 -15 3 1392 6246 72 7 22 chr5 105795801 105796676 -46740583 + RLTR13A2 LTR ERVK 97 958 0 3 1392 567 273 34 17 chr5 105796763 105796938 -46740321 + MYSERV-int LTR ERVK 4459 4636 -1914 3 1392 441 262 0 18 chr5 105797116 105797225 -46740034 + MYSERV-int LTR ERVK 4661 4767 -1783 3 1392 682 265 12 78 chr5 105797332 105797590 -46739669 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 500 740 -1586 3 1392 365 235 60 87 chr5 105809123 105809272 -46727987 + MYSERV-int LTR ERVK 4979 5123 -1427 3 1392 404 272 31 100 chr5 105809279 105809502 -46727757 + RMER4A LTR ERVK 252 567 -18 3 1392 1639 233 64 69 chr5 105809660 105810194 -46727065 + MYSERV-int LTR ERVK 5344 5874 -676 3 1392 731 182 46 59 chr5 105819835 105819987 -46717272 + MTC LTR MaLR 220 369 -52 3 1392 1544 223 71 14 chr5 105820758 105821122 -46716137 - RMER19C LTR ERVK 0 611 227 3 1392 2209 118 3 21 chr5 105821122 105821460 -46715799 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 34 3 1392 1070 194 30 50 chr5 105821469 105821778 -46715481 - RMER19C LTR ERVK -341 270 1 3 1392 6380 131 95 29 chr5 105821912 105822179 -46715080 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 851 3 1392 6380 131 95 29 chr5 105822326 105822608 -46714651 - RLTR13D3 LTR ERVK -264 850 532 3 1392 6380 131 95 29 chr5 105822755 105823249 -46714010 - RLTR13D3 LTR ERVK -583 531 1 3 1392 2612 142 20 2 chr5 105823779 105824183 -46713076 - MTC LTR MaLR -8 413 3 3 1392 299 303 45 92 chr5 105824701 105824924 -46712335 + MLT1F2 LTR MaLR 292 525 -44 3 1392 266 183 67 0 chr5 105829126 105829186 -46708073 - ORR1D1 LTR MaLR -306 68 5 4 1392 1107 221 207 6 chr5 105830248 105830581 -46706678 + MTD LTR MaLR 5 404 -15 4 1392 501 298 94 21 chr5 105831580 105831772 -46705487 - ORR1E LTR MaLR -153 206 1 4 1392 246 339 104 28 chr5 105836214 105836263 -46700996 + RMER17A LTR ERVK 364 412 -339 4 1392 246 339 104 28 chr5 105836305 105836437 -46700822 + RMER17A LTR ERVK 413 559 -192 4 1392 1838 154 67 12 chr5 105838252 105838580 -46698679 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 4 1392 579 315 136 30 chr5 105840648 105840979 -46696280 + MTEa LTR MaLR 13 378 -1 4 1392 3123 14 5 47 chr5 105848354 105848737 -46688522 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1392 29377 22 1 1 chr5 105848737 105852011 -46685248 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 4 1392 7384 71 122 36 chr5 105852010 105853208 -46684051 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 67 4 1392 1049 86 159 0 chr5 105853179 105853342 -46683917 - IAPEz-int LTR ERVK -6285 196 8 4 1392 3123 14 5 47 chr5 105853342 105853725 -46683534 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 1392 1662 132 58 7 chr5 105853725 105853999 -46683260 + ORR1B2 LTR MaLR 80 367 0 4 1392 1453 187 101 15 chr5 105859896 105860222 -46677037 - MTD LTR MaLR 0 419 66 4 1392 340 245 9 93 chr5 105862221 105862329 -46674930 - MT2B LTR ERVL -343 258 160 4 1392 477 256 205 66 chr5 105862617 105862905 -46674354 + MTEa LTR MaLR 1 328 -51 4 1392 297 322 139 33 chr5 105864068 105864248 -46673011 + MLT1A0 LTR MaLR 1 199 -166 4 1392 2443 115 25 54 chr5 105867124 105867530 -46669729 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1392 1429 258 43 37 chr5 105891109 105891427 -46645832 + ORR1D2 LTR MaLR 3 322 -48 5 1392 510 86 0 14 chr5 105891427 105891498 -46645761 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 257 5 1392 339 95 0 23 chr5 105893059 105893116 -46644143 - ORR1A3 LTR MaLR -48 298 226 5 1392 1797 135 0 50 chr5 105893115 105893418 -46643841 - ORR1A1 LTR MaLR -57 289 2 5 1392 411 319 138 55 chr5 105900591 105900953 -46636306 + MLT1H-int LTR MaLR 1 392 -1017 5 1392 414 301 28 49 chr5 105901383 105901471 -46635788 + MLT1H-int LTR MaLR 1265 1351 -58 5 1392 2118 152 86 0 chr5 105901471 105901833 -46635426 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 5 1392 414 301 28 49 chr5 105901833 105901887 -46635372 + MLT1H-int LTR MaLR 1352 1403 -6 5 1392 347 244 244 0 chr5 105905816 105905935 -46631324 - RMER15 LTR ERVL -14 561 414 5 1393 1272 253 87 50 chr5 105925040 105925398 -46611861 + MTE2a LTR MaLR 2 372 -7 5 1393 230 217 31 62 chr5 105927230 105927294 -46609965 + MLT1A0 LTR MaLR 242 303 -62 5 1393 310 296 91 10 chr5 105928017 105928116 -46609143 - MTEb LTR MaLR -201 178 72 5 1393 931 135 21 2 chr5 105928235 105928382 -46608877 + ORR1B2-int LTR MaLR 1363 1530 -50 5 1393 614 148 0 17 chr5 105928382 105928499 -46608760 + ORR1B2 LTR MaLR 4 118 -249 5 1393 1912 154 3 25 chr5 105928517 105928843 -46608416 + ORR1B2 LTR MaLR 41 359 -8 5 1393 306 367 58 71 chr5 105929708 105929934 -46607325 - MER21B LTR ERV1 -147 716 494 5 1393 254 354 96 46 chr5 105931688 105931907 -46605352 - MER21B LTR ERV1 -553 310 81 5 1393 794 206 29 35 chr5 105932267 105932419 -46604840 + ORR1E LTR MaLR 1 144 -215 5 1393 827 280 234 50 chr5 105932419 105933129 -46604130 - RMER13A LTR ERVK 0 860 21 5 1393 290 297 97 26 chr5 105933320 105933434 -46603825 + ORR1E LTR MaLR 257 378 -1 5 1393 284 267 9 114 chr5 105934600 105934714 -46602545 - MTEb LTR MaLR -274 105 4 5 1393 626 235 72 36 chr5 105934719 105934940 -46602319 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 1350 5 1393 1286 158 62 41 chr5 105935104 105935348 -46601911 + MTC LTR MaLR 171 419 -2 5 1393 6216 156 109 12 chr5 105935350 105936495 -46600764 + MTC-int LTR MaLR 3 1258 0 5 1393 2482 142 9 50 chr5 105936501 105936593 -46600666 + MTC LTR MaLR 8 95 -326 5 1393 2482 142 9 50 chr5 105936738 105937068 -46600191 + MTC LTR MaLR 96 413 -8 5 1393 908 269 144 40 chr5 105937447 105937795 -46599464 - MTC LTR MaLR -20 401 18 5 1393 2210 118 6 18 chr5 105939525 105939863 -46597396 + ORR1A1 LTR MaLR 5 338 -8 5 1393 416 341 37 60 chr5 105939912 105940093 -46597166 - LTR40b LTR ERVL -10 452 269 5 1393 416 341 37 60 chr5 105940318 105940391 -46596868 - LTR40b LTR ERVL -194 268 204 5 1393 1849 126 90 26 chr5 105940733 105941076 -46596183 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 5 1393 747 274 67 110 chr5 105941940 105942285 -46594974 - MER21B LTR ERV1 -105 758 429 5 1393 714 208 42 64 chr5 105942925 105943143 -46594116 + ORR1D2 LTR MaLR 164 371 -8 5 1393 2060 101 34 16 chr5 105964175 105964498 -46572761 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1393 3177 139 27 27 chr5 105964499 105965302 -46571957 - ORR1A4-int LTR MaLR -191 1772 1001 6 1393 715 156 166 12 chr5 105965304 105965473 -46571786 - ORR1A4 LTR MaLR -159 235 41 6 1393 287 285 98 57 chr5 105966764 105966915 -46570344 - LTR37B LTR ERV1 -2 466 313 6 1393 287 285 98 57 chr5 105967095 105967207 -46570052 - LTR37B LTR ERV1 -156 312 192 6 1393 1517 225 63 5 chr5 105968696 105969076 -46568183 - MTD LTR MaLR -14 405 4 6 1393 428 204 26 17 chr5 105969288 105969403 -46567856 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 291 6 1393 2375 89 6 50 chr5 105969428 105969770 -46567489 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1393 346 284 72 23 chr5 105971282 105971476 -46565783 - MLT1A1 LTR MaLR -233 279 33 6 1393 308 219 8 130 chr5 105972808 105972846 -46564413 - MT2B LTR ERVL -447 154 133 6 1393 2569 149 5 7 chr5 105973833 105974272 -46562987 - RLTR17 LTR ERVK -152 540 103 6 1393 280 140 17 17 chr5 105974284 105974342 -46562917 - RLTR17 LTR ERVK -634 58 1 6 1393 4221 82 35 2 chr5 105981563 105982128 -46555131 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 6 1393 1690 180 74 23 chr5 105985287 105985639 -46551620 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 6 1393 590 232 256 0 chr5 105986355 105986634 -46550625 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 17 6 1393 272 207 22 109 chr5 105990586 105990678 -46546581 - MT2B LTR ERVL -363 238 155 6 1393 947 221 75 30 chr5 105991530 105991796 -46545463 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 103 6 1393 528 178 20 0 chr5 105992334 105992435 -46544824 - ORR1C2 LTR MaLR -270 104 2 6 1393 608 156 11 33 chr5 105992582 105992717 -46544542 + ORR1D1 LTR MaLR 1 130 -264 6 1393 255 211 19 37 chr5 106002899 106002953 -46534306 - RMER15-int LTR ERVL -55 4944 4892 8 1393 287 309 160 55 chr5 106003106 106003325 -46533934 - RMER15-int LTR ERVL -229 4770 4529 8 1393 803 260 78 41 chr5 106003915 106004208 -46533051 - RMER15-int LTR ERVL -549 4450 4147 8 1393 1302 305 45 47 chr5 106004240 106004451 -46532808 - RMER15-int LTR ERVL -2462 2537 2325 8 1393 1302 305 45 47 chr5 106004649 106004884 -46532375 - RMER15-int LTR ERVL -2675 2324 2092 8 1393 1412 259 61 15 chr5 106006023 106006416 -46530843 + MTD LTR MaLR 5 415 -4 1 1393 241 368 60 77 chr5 106007414 106007767 -46529492 - ORR1E LTR MaLR -5 354 8 2 1393 372 300 33 16 chr5 106011516 106011638 -46525621 - LTR87 LTR ERVL? -70 554 431 3 1393 2850 117 22 2 chr5 106018393 106018837 -46518422 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 4 1393 297 327 9 35 chr5 106019702 106019816 -46517443 - MLT1A1 LTR MaLR -294 114 4 4 1393 2333 98 19 6 chr5 106027283 106027602 -46509657 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 5 1393 256 326 11 23 chr5 106032090 106032107 -46505152 + MT2B2 LTR ERVL 152 167 -417 6 1394 1228 302 16 25 chr5 106043101 106043464 -46493795 + MTEa LTR MaLR 20 379 0 8 1394 318 296 96 29 chr5 106045834 106045970 -46491289 - MLT1C LTR MaLR -178 289 145 9 1394 741 285 27 47 chr5 106046347 106046634 -46490625 - MTE2a LTR MaLR -119 260 10 9 1394 610 347 88 58 chr5 106047355 106047835 -46489424 - MLT1G LTR MaLR -9 546 48 9 1394 688 267 122 114 chr5 106047904 106048045 -46489214 - MTE2a LTR MaLR 0 379 206 1 1394 688 267 122 114 chr5 106048099 106048333 -46488926 - MTE2a LTR MaLR -174 205 1 1 1394 283 359 132 34 chr5 106049899 106050254 -46487005 - LTR85b LTR Gypsy? -10 774 385 1 1394 1977 163 0 168 chr5 106050468 106050926 -46486333 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 2 1 1394 2577 149 2 51 chr5 106051636 106052068 -46485191 + MTC LTR MaLR 3 413 -8 1 1394 242 386 26 17 chr5 106055138 106055254 -46482005 + LTR16D LTR ERVL 154 270 -381 1 1394 997 238 32 18 chr5 106058186 106058404 -46478855 - MTEb LTR MaLR -48 331 111 1 1394 3311 50 8 2 chr5 106060716 106061114 -46476145 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1394 2905 95 48 12 chr5 106062964 106063379 -46473880 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 1 1394 675 239 129 144 chr5 106063891 106063973 -46473286 + MTEb LTR MaLR 106 175 -204 1 1394 675 239 129 144 chr5 106064133 106064328 -46472931 + MTEb LTR MaLR 176 379 0 1 1394 2596 115 46 74 chr5 106069959 106070420 -46466839 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 6 1 1394 2168 141 101 8 chr5 106073953 106074338 -46462921 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1394 238 346 62 16 chr5 106074463 106074592 -46462667 + MLT1B LTR MaLR 7 141 -249 1 1394 480 280 77 12 chr5 106081771 106081941 -46455318 + MLT1A0 LTR MaLR 185 365 0 1 1394 296 291 12 12 chr5 106086934 106087014 -46450245 + MLT1B LTR MaLR 261 340 -50 1 1394 2585 195 52 2 chr5 106087564 106088047 -46449212 - RLTR18B LTR ERVK -5 507 1 1 1394 501 281 75 16 chr5 106088743 106088931 -46448328 - RLTR20B3 LTR ERVK -364 213 15 1 1394 279 277 75 72 chr5 106095518 106095837 -46441422 + ORR1B1-int LTR MaLR 435 754 -755 2 1394 2211 219 47 132 chr5 106096291 106096913 -46440346 + MTC-int LTR MaLR 363 1063 -195 2 1394 2211 220 38 81 chr5 106097091 106097159 -46440100 + MTC-int LTR MaLR 1064 1133 -125 2 1394 553 227 42 7 chr5 106097328 106097470 -46439789 + MTC-int LTR MaLR 1112 1258 0 2 1394 2084 140 111 19 chr5 106097470 106097848 -46439411 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1394 381 328 151 26 chr5 106098069 106098301 -46438958 - MER21B LTR ERV1 -81 782 522 2 1394 698 318 150 3 chr5 106098407 106098694 -46438565 - MER21B LTR ERV1 -534 329 1 2 1394 335 345 81 52 chr5 106098833 106099044 -46438215 - LTR16A1 LTR ERVL -229 227 11 2 1394 1475 132 192 23 chr5 106100631 106100979 -46436280 - RMER17C LTR ERVK -3 407 1 2 1394 2325 129 83 0 chr5 106101954 106102302 -46434957 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 2 1394 278 253 75 12 chr5 106105737 106105817 -46431442 + MLT1G3 LTR MaLR 150 234 -361 2 1394 760 80 0 0 chr5 106107759 106107859 -46429400 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 929 830 2 1394 2243 19 0 4 chr5 106107857 106108119 -46429140 - RLTR13B4 LTR ERVK -229 574 314 2 1394 1395 57 0 6 chr5 106108109 106108284 -46428975 - RLTR13B4 LTR ERVK -755 174 1 2 1394 578 271 149 37 chr5 106112899 106113229 -46424030 - MTEb LTR MaLR -5 374 8 2 1394 693 340 62 21 chr5 106116583 106116922 -46420337 + MLT1A LTR MaLR 10 362 -12 2 1394 806 316 146 14 chr5 106121445 106121869 -46415390 - MER21B LTR ERV1 -14 849 370 3 1394 273 354 74 68 chr5 106122013 106122189 -46415070 - MER21B LTR ERV1 -668 195 19 3 1394 276 317 58 19 chr5 106122511 106122614 -46414645 - MLT2B2 LTR ERVL -72 490 384 3 1394 2565 193 71 7 chr5 106122620 106123157 -46414102 - RMER15 LTR ERVL -4 571 1 3 1394 236 189 117 0 chr5 106123421 106123489 -46413770 - ORR1E LTR MaLR -19 360 271 3 1394 552 294 37 40 chr5 106123572 106123842 -46413417 - ORR1E LTR MaLR -106 268 1 3 1394 229 307 98 80 chr5 106134071 106134102 -46403157 - MT2B2 LTR ERVL -251 333 302 3 1394 229 307 98 80 chr5 106134135 106134266 -46402993 - MT2B2 LTR ERVL -283 301 168 3 1394 967 160 111 16 chr5 106137690 106137880 -46399379 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 177 3 1394 246 132 283 0 chr5 106137939 106137992 -46399267 - ORR1C2 LTR MaLR -316 68 1 3 1394 2214 206 44 23 chr5 106150612 106150693 -46386566 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 417 3 1394 2214 206 44 23 chr5 106150732 106151131 -46386128 - RLTR16 LTR ERVK -89 416 3 3 1394 2972 11 54 6 chr5 106153172 106153522 -46383737 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 1394 28015 21 1 1 chr5 106153522 106156793 -46380466 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 3 1394 5806 109 118 91 chr5 106156792 106158064 -46379195 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 3 1394 2948 14 54 6 chr5 106158064 106158414 -46378845 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 1395 2227 82 6 67 chr5 106173138 106173480 -46363779 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 7 4 1395 1505 145 152 50 chr5 106174995 106175336 -46361923 + ORR1C2 LTR MaLR 7 382 -2 4 1395 226 188 98 24 chr5 106179594 106179676 -46357583 + MLT1F-int LTR MaLR 369 456 -1033 4 1395 608 279 81 48 chr5 106187972 106188271 -46348988 - MTEa LTR MaLR 0 379 73 4 1395 1321 178 46 23 chr5 106193585 106193844 -46343415 - MTC LTR MaLR -155 266 2 4 1395 2625 68 29 6 chr5 106195915 106196269 -46340990 - MTB LTR MaLR -23 377 28 4 1395 1757 150 67 52 chr5 106196679 106197081 -46340178 - RMER17C LTR ERVK 0 410 3 4 1395 953 255 93 90 chr5 106201603 106201926 -46335333 - MTE2b LTR MaLR -52 327 4 4 1395 3375 38 2 5 chr5 106204996 106205393 -46331866 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1395 291 281 424 12 chr5 106211611 106211774 -46325485 + MLT1B LTR MaLR 146 375 -15 5 1395 517 95 0 0 chr5 106217323 106217397 -46319862 - ORR1A2 LTR MaLR -253 74 1 5 1395 278 221 56 42 chr5 106231351 106231422 -46305837 + MER92C LTR ERV1 483 554 0 5 1395 2468 79 28 0 chr5 106234402 106234719 -46302540 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1395 421 250 134 15 chr5 106251137 106251271 -46285988 + RMER5 LTR ERV1 126 275 -259 5 1395 462 290 21 92 chr5 106251594 106251833 -46285426 + RMER5 LTR ERV1 296 517 -17 5 1395 445 260 44 62 chr5 106256271 106256431 -46280828 - MLT1B LTR MaLR -37 353 197 5 1395 2319 81 18 64 chr5 106262211 106262554 -46274705 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1395 516 262 119 25 chr5 106263624 106264022 -46273237 - RLTR15 LTR ERVK -19 340 1 6 1395 859 247 182 23 chr5 106266658 106266965 -46270294 + MTD LTR MaLR 64 419 0 6 1395 864 252 142 17 chr5 106266970 106267265 -46269994 - MTEa LTR MaLR 0 379 48 6 1395 1391 219 29 53 chr5 106268881 106269258 -46268001 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 6 1395 571 363 37 29 chr5 106269418 106269662 -46267597 - MER21B LTR ERV1 -178 685 440 6 1395 551 285 188 5 chr5 106272494 106272702 -46264557 - MER21B LTR ERV1 -423 440 195 6 1395 290 271 142 33 chr5 106273031 106273214 -46264045 - MER21-int LTR ERV1 -64 4127 3925 6 1395 352 287 36 153 chr5 106276135 106276357 -46260902 + MLT1F LTR MaLR 302 497 -51 6 1395 226 300 104 18 chr5 106277875 106278038 -46259221 + RMER15 LTR ERVL 347 523 -52 6 1395 9050 97 26 72 chr5 106282558 106282808 -46254451 - RLTR21 LTR ERVK -26 1546 1289 6 1395 9050 97 26 72 chr5 106282830 106282998 -46254261 - RLTR21 LTR ERVK -284 1288 1150 6 1395 9050 97 26 72 chr5 106283177 106283201 -46254058 - RLTR21 LTR ERVK -423 1149 1133 6 1395 9050 97 26 72 chr5 106283255 106284430 -46252829 - RLTR21 LTR ERVK -440 1132 1 6 1395 231 269 110 9 chr5 106284441 106284550 -46252709 + MLT1B LTR MaLR 259 378 -12 6 1395 1213 203 168 10 chr5 106294275 106294584 -46242675 - MTD LTR MaLR -44 375 18 6 1395 292 247 144 0 chr5 106295288 106295385 -46241874 + MTE-int LTR MaLR 790 900 -680 6 174 3131 107 103 38 chr5 106299225 106299757 -46237502 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 6 1396 2712 49 0 12 chr5 106300850 106301179 -46236080 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 6 1396 1156 221 56 78 chr5 106301925 106302283 -46234976 + ORR1D1 LTR MaLR 25 374 0 6 1396 615 194 75 18 chr5 106303486 106303654 -46233605 + RMER19B LTR ERVK 1 176 -435 6 1396 939 116 85 37 chr5 106303657 106303845 -46233414 + RMER19B LTR ERVK 657 853 -49 6 1396 506 269 118 48 chr5 106338418 106338684 -46198575 - ORR1D2 LTR MaLR -89 281 1 7 1396 2560 121 86 99 chr5 106345461 106346087 -46191172 - RMER6A LTR ERVK -138 618 1 7 1396 325 184 204 53 chr5 106348609 106348741 -46188518 - RMER15 LTR ERVL -151 424 273 7 1396 2169 96 57 3 chr5 106350488 106350823 -46186436 + MTB_Mm LTR MaLR 55 407 0 7 1396 3592 142 48 40 chr5 106361107 106361412 -46175847 - RMER6C LTR ERVK -1 689 367 7 1396 3592 142 48 40 chr5 106361865 106362219 -46175040 - RMER6C LTR ERVK -328 362 1 7 1396 1913 183 30 5 chr5 106369803 106370203 -46167056 + MTC LTR MaLR 2 411 -10 8 1396 3133 74 2 5 chr5 106370205 106370613 -46166646 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1396 2424 191 108 53 chr5 106370626 106371655 -46165604 + MTC-int LTR MaLR 1 1258 0 8 1396 1640 147 189 6 chr5 106371655 106372004 -46165255 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 8 1396 2265 76 6 3 chr5 106372203 106372521 -46164738 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 1396 626 289 6 40 chr5 106380404 106380577 -46156682 + MTEa LTR MaLR 3 169 -210 8 1396 1887 191 34 88 chr5 106385350 106385791 -46151468 + MTD LTR MaLR 3 419 0 8 1396 4498 104 50 22 chr5 106385839 106386574 -46150685 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 8 1396 618 267 145 28 chr5 106388485 106388774 -46148485 + RMER20B LTR ERVK 69 391 -236 8 1396 1126 225 144 24 chr5 106392174 106392548 -46144711 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1396 2145 99 38 13 chr5 106394724 106395042 -46142217 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 8 1396 367 363 89 8 chr5 106398326 106398553 -46138706 + LTR16C LTR ERVL 1 246 -243 8 1396 647 273 90 88 chr5 106398553 106398930 -46138329 + MTEa LTR MaLR 1 378 -1 8 1396 392 300 83 74 chr5 106398941 106399104 -46138155 + LTR16C LTR ERVL 271 439 -50 8 1396 392 300 83 74 chr5 106399245 106399297 -46137962 + LTR16C LTR ERVL 440 488 -1 8 1396 944 51 14 0 chr5 106401912 106402050 -46135209 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 283 8 1396 509 88 12 24 chr5 106402050 106402132 -46135127 - RMER3D-int LTR ERVK -1072 1770 1690 8 1396 3222 29 42 0 chr5 106412582 106412962 -46124297 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 174 1394 245 66 0 chr5 106430423 106430770 -46106489 - MTEb LTR MaLR -5 374 5 9 1397 887 153 375 46 chr5 106436390 106436670 -46100589 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 9 1397 1108 243 157 6 chr5 106437434 106437790 -46099469 + MTD LTR MaLR 5 414 -5 9 1397 228 268 113 26 chr5 106437881 106437996 -46099263 + MLT1C LTR MaLR 138 262 -205 9 1397 530 313 77 72 chr5 106443030 106443433 -46093826 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 126 9 1397 266 240 80 0 chr5 106462327 106462402 -46074857 - MLT1A LTR MaLR -287 87 7 9 1397 290 316 60 43 chr5 106471561 106471746 -46065513 - MLT1J2 LTR MaLR -23 425 238 9 1397 696 235 299 63 chr5 106477630 106477921 -46059338 + ORR1E LTR MaLR 1 360 -19 9 1397 987 257 50 58 chr5 106481478 106481858 -46055401 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 9 1397 716 282 74 70 chr5 106482225 106482639 -46054620 - MLT2C2 LTR ERVL -1 396 1 9 1397 2378 72 15 58 chr5 106487683 106488025 -46049234 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1397 4450 171 24 63 chr5 106493216 106494148 -46043111 - RMER19B LTR ERVK -7 895 1 1 1397 2041 95 70 26 chr5 106495651 106495964 -46041295 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1397 2821 62 8 0 chr5 106500000 106500386 -46036873 + MTA_Mm LTR MaLR 8 396 0 1 1397 564 257 202 27 chr5 106504034 106504366 -46032893 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 1 1397 2998 151 35 10 chr5 106511177 106511490 -46025769 + RLTR12B LTR ERVK 1 329 -199 1 1397 2998 151 35 10 chr5 106511531 106511732 -46025527 + RLTR12B LTR ERVK 330 528 0 1 1397 284 348 75 43 chr5 106512717 106512999 -46024260 + MLT1J LTR MaLR 71 361 -151 2 1397 2782 149 102 33 chr5 106513468 106514015 -46023244 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 2 1397 2872 156 73 49 chr5 106516310 106516984 -46020275 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 2 1397 396 250 97 0 chr5 106518495 106518619 -46018640 - LTR33 LTR ERVL -7 508 373 3 1397 271 122 0 0 chr5 106525356 106525397 -46011862 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 334 4 1397 758 181 7 34 chr5 106525676 106525825 -46011434 - ORR1D1 LTR MaLR -64 310 166 4 1397 751 208 5 38 chr5 106525861 106526046 -46011213 - ORR1D1 LTR MaLR -191 183 5 4 1397 804 228 120 35 chr5 106528004 106528263 -46008996 - MTE2b LTR MaLR -97 282 2 5 1397 979 262 60 25 chr5 106536412 106536694 -46000565 + MTEa LTR MaLR 1 292 -87 5 1397 320 194 0 15 chr5 106536873 106536941 -46000318 + MTEa LTR MaLR 313 379 0 5 1397 761 304 111 56 chr5 106543461 106543820 -45993439 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 1398 311 276 98 84 chr5 106563571 106563791 -45973468 - MLT1B LTR MaLR -4 501 167 9 1398 2016 144 12 95 chr5 106566085 106566478 -45970781 + ORR1B1 LTR MaLR 31 386 -8 9 1398 3497 20 10 0 chr5 106569910 106570302 -45966957 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1398 9395 30 2 5 chr5 106570302 106571403 -45965856 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1398 3497 20 10 0 chr5 106571403 106571795 -45965464 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1398 1158 256 50 28 chr5 106573028 106573386 -45963873 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 1 1398 1625 189 62 52 chr5 106574507 106574875 -45962384 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 1 1398 4472 12 0 12 chr5 106580584 106581083 -45956176 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1398 242 323 30 15 chr5 106585955 106585984 -45951275 + MT2B LTR ERVL 229 258 -343 1 1398 1155 162 43 19 chr5 106588883 106589091 -45948168 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 166 1 1398 1099 155 0 36 chr5 106589168 106589362 -45947897 - ORR1C1 LTR MaLR -191 187 1 1 1398 581 275 105 29 chr5 106590672 106590882 -45946377 + MLT1F1 LTR MaLR 171 396 -173 1 1398 492 293 71 71 chr5 106595353 106595647 -45941612 - MLT1A LTR MaLR -30 344 51 1 1398 1415 172 69 41 chr5 106595852 106596245 -45941014 - RMER17C LTR ERVK 0 410 7 1 1398 729 178 35 92 chr5 106598035 106598524 -45938735 - RMER17C LTR ERVK -84 326 1 1 1398 422 309 78 64 chr5 106608700 106608918 -45928341 + MTE2b LTR MaLR 1 221 -158 1 1398 837 286 64 4 chr5 106612181 106612448 -45924811 + MTE2a LTR MaLR 96 378 -1 1 1398 260 279 51 0 chr5 106613257 106613336 -45923923 + MLT1A1 LTR MaLR 9 91 -317 1 1398 2831 124 164 37 chr5 106613786 106614328 -45922931 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1398 2134 115 41 3 chr5 106614589 106614904 -45922355 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1398 294 327 18 0 chr5 106618719 106618829 -45918430 - MLT1D LTR MaLR 0 505 394 1 1398 1134 266 105 14 chr5 106618853 106619215 -45918044 + MTD LTR MaLR 25 419 0 1 1398 300 302 30 38 chr5 106619694 106619825 -45917434 + MLT1D LTR MaLR 376 505 0 1 1398 838 248 176 39 chr5 106625698 106626006 -45911253 + ORR1E LTR MaLR 1 375 -4 2 1398 236 246 0 17 chr5 106646781 106646839 -45890420 + MLT2B1 LTR ERVL 412 468 -99 2 1398 4258 69 56 0 chr5 106653996 106654549 -45882710 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 2 1398 236 264 27 14 chr5 106658294 106658367 -45878892 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -351 571 498 2 1398 393 175 38 85 chr5 106659147 106659253 -45878006 - MT2B LTR ERVL -346 255 155 2 1398 740 275 124 0 chr5 106662593 106662811 -45874448 + MTE2b LTR MaLR 1 245 -134 2 1398 231 250 238 0 chr5 106662880 106662960 -45874299 + MTE2b LTR MaLR 215 313 -66 2 1398 723 272 140 26 chr5 106666308 106666572 -45870687 - MTE2b LTR MaLR -85 294 1 2 1398 943 268 61 0 chr5 106671025 106671286 -45865973 + ORR1D2 LTR MaLR 17 293 -77 2 1398 1538 138 124 0 chr5 106676218 106676509 -45860750 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 2 1398 2720 138 82 30 chr5 106686699 106687201 -45850058 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 1398 3550 25 0 0 chr5 106687799 106688195 -45849064 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 174 2483 158 7 9 chr5 106692416 106692838 -45844421 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1399 2307 91 16 6 chr5 106697674 106697995 -45839264 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 3 3 1399 2170 182 25 14 chr5 106698452 106698892 -45838367 + RMER19B LTR ERVK 1 445 -457 3 1399 479 316 111 51 chr5 106703369 106703702 -45833557 - MLT1B LTR MaLR -16 374 22 3 1399 871 212 256 43 chr5 106703710 106704011 -45833248 + ORR1D2 LTR MaLR 6 370 0 3 1399 1487 240 61 5 chr5 106706754 106707148 -45830111 - MTD LTR MaLR -3 416 1 3 1399 1976 174 66 87 chr5 106707723 106707939 -45829320 + RLTR16 LTR ERVK 1 199 -306 3 1399 1976 174 66 87 chr5 106708085 106708384 -45828875 + RLTR16 LTR ERVK 200 505 0 3 1399 1183 148 0 5 chr5 106718013 106718216 -45819043 - ORR1A0 LTR MaLR -99 247 46 3 1399 775 299 78 53 chr5 106734143 106734503 -45802756 - MTE2a LTR MaLR -9 370 2 3 1399 643 179 68 20 chr5 106734504 106734652 -45802607 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5607 3 1399 376 271 41 0 chr5 106763737 106763859 -45773400 - MTEb LTR MaLR -184 195 69 4 1399 348 222 43 22 chr5 106784763 106784855 -45752404 + RLTR23 LTR ERV1 333 426 -4 4 1399 976 220 125 58 chr5 106785518 106785861 -45751398 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 4 1399 817 179 54 49 chr5 106786925 106787130 -45750129 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 172 4 1399 248 195 260 0 chr5 106787147 106787224 -45750035 - ORR1C1 LTR MaLR -263 111 15 4 1399 3808 110 101 12 chr5 106787802 106788484 -45748775 - RMER6A LTR ERVK -13 743 1 4 1399 3281 164 33 7 chr5 106788485 106789057 -45748202 - RMER6-int LTR ERVK -2 3175 2589 4 1399 3330 141 76 33 chr5 106789121 106789723 -45747536 - RMER6-int LTR ERVK -2543 634 7 4 1399 4633 115 36 16 chr5 106789750 106790491 -45746768 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 4 1399 767 258 25 94 chr5 106790952 106791354 -45745905 - RLTR26 LTR ERVK -212 430 21 4 1399 1373 125 74 155 chr5 106796106 106796295 -45740964 - RMER17C LTR ERVK 0 410 225 4 1399 1373 125 74 155 chr5 106796334 106796590 -45740669 - RMER17C LTR ERVK -186 224 1 4 1399 252 91 22 43 chr5 106798903 106798949 -45738310 + RMER15 LTR ERVL 28 72 -503 4 1399 884 175 58 0 chr5 106798949 106799120 -45738139 + RLTR27 LTR ERVK 1 181 -128 4 1399 479 253 125 10 chr5 106799257 106799449 -45737810 + RMER15 LTR ERVL 361 574 -1 4 1399 2999 40 0 24 chr5 106800037 106800399 -45736860 + MTB LTR MaLR 1 359 -41 4 1399 3629 38 28 0 chr5 106800399 106800823 -45736436 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1399 2999 40 0 24 chr5 106800823 106800870 -45736389 + MTB LTR MaLR 360 400 0 4 1399 641 273 129 10 chr5 106802425 106802743 -45734516 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 4 1399 1817 53 4 0 chr5 106803295 106803541 -45733718 + MTB LTR MaLR 1 247 -153 4 1399 478 294 85 30 chr5 106804586 106804821 -45732438 + MTEa LTR MaLR 127 374 -5 4 1399 273 324 74 0 chr5 106806549 106806657 -45730602 + ORR1E LTR MaLR 2 117 -242 4 1399 646 288 55 36 chr5 106808169 106808443 -45728816 + MTD LTR MaLR 5 283 -136 4 1399 881 265 36 55 chr5 106818277 106818585 -45718674 + MT2A LTR ERVL 147 448 -85 5 1399 948 222 191 14 chr5 106819426 106819714 -45717545 + ORR1D2 LTR MaLR 32 370 0 5 1399 591 335 136 21 chr5 106820561 106820669 -45716590 - LTR16E1 LTR ERVL -2 536 419 5 1399 591 335 136 21 chr5 106820696 106820711 -45716548 - LTR16E1 LTR ERVL -120 418 406 5 1399 591 335 136 21 chr5 106821076 106821421 -45715838 - LTR16E1 LTR ERVL -133 405 11 5 1400 1301 209 22 54 chr5 106823789 106824078 -45713181 - MTD LTR MaLR -116 303 19 5 1400 1301 209 22 54 chr5 106824108 106824131 -45713128 - MTD LTR MaLR -401 18 1 5 1400 4713 106 36 11 chr5 106824337 106825084 -45712175 + ORR1A2-int LTR MaLR 1198 1963 0 5 1400 2521 89 0 0 chr5 106825084 106825409 -45711850 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 5 1400 2005 160 60 14 chr5 106828768 106829135 -45708124 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1400 1221 228 152 11 chr5 106833455 106833715 -45703544 - MTC LTR MaLR 0 421 147 5 1400 1221 228 152 11 chr5 106833753 106833860 -45703399 - MTC LTR MaLR -275 146 3 5 1400 240 268 179 0 chr5 106837131 106837243 -45700016 - MLT1E1 LTR MaLR -383 271 140 5 1400 3121 35 61 3 chr5 106838062 106838438 -45698821 + MTB LTR MaLR 3 400 0 5 1400 3736 42 5 2 chr5 106847734 106848169 -45689090 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 5 1400 266 308 45 55 chr5 106856213 106856323 -45680936 + LTR16A LTR ERVL 122 230 -221 5 1400 471 302 41 116 chr5 106858993 106859382 -45677877 - LTR40a LTR ERVL -9 510 151 5 1400 401 299 81 13 chr5 106859668 106859817 -45677442 - MLT1F LTR MaLR -1 547 389 6 1400 251 250 47 59 chr5 106859891 106859976 -45677283 - MLT1F LTR MaLR -287 282 199 6 1400 3327 45 2 15 chr5 106913495 106913898 -45623361 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 6 1400 291 294 12 128 chr5 106916438 106916602 -45620657 - MLT1A1 LTR MaLR -263 145 1 6 1400 1754 156 82 9 chr5 106917298 106917386 -45619873 - ORR1D1 LTR MaLR -34 340 230 6 1400 1754 156 82 9 chr5 106917420 106917648 -45619611 - ORR1D1 LTR MaLR -145 229 2 6 1400 344 325 17 42 chr5 106917648 106917741 -45619518 - MTEa LTR MaLR -289 90 1 6 1400 236 222 95 0 chr5 106919718 106919781 -45617478 + ORR1E LTR MaLR 1 69 -290 6 1400 302 287 63 84 chr5 106919855 106920022 -45617237 + ORR1E LTR MaLR 76 241 -118 6 1400 3334 55 2 0 chr5 106920022 106920421 -45616838 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1400 302 247 149 45 chr5 106920421 106920553 -45616706 + ORR1E LTR MaLR 238 379 0 6 1400 518 309 55 6 chr5 106943497 106943660 -45593599 + RMER15 LTR ERVL 396 566 -9 7 1400 1035 238 147 51 chr5 106945800 106946154 -45591105 - MTD LTR MaLR -14 405 18 7 1400 323 282 189 26 chr5 106947567 106947720 -45589539 - MLT1H LTR MaLR -322 227 50 7 1401 344 194 15 0 chr5 106959736 106959803 -45577456 - MER73 LTR ERVL -481 163 96 7 1401 1478 210 57 6 chr5 106962777 106963093 -45574166 + ORR1D2 LTR MaLR 8 339 -31 7 1401 486 209 12 0 chr5 106964058 106964144 -45573115 + MTD LTR MaLR 203 289 -130 7 1401 397 298 33 16 chr5 106964545 106964725 -45572534 - MLT1H LTR MaLR -304 185 39 7 1401 2544 130 52 5 chr5 106964725 106965127 -45572132 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1401 2713 142 71 8 chr5 106968763 106969240 -45568019 + RMER20A LTR ERVK 6 512 -4 7 1401 1000 275 64 53 chr5 106972873 106973215 -45564044 - MLT2B1 LTR ERVL -165 355 10 7 1401 1136 197 29 16 chr5 106974486 106974619 -45562640 - MTC LTR MaLR 0 421 287 7 1401 3386 47 5 15 chr5 106974619 106975030 -45562229 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 8 1401 1136 197 29 16 chr5 106975030 106975139 -45562120 - MTC LTR MaLR -135 286 176 7 1401 262 182 18 35 chr5 106975192 106975249 -45562010 - MTC LTR MaLR -365 56 1 7 1401 1384 246 89 72 chr5 106978770 106979295 -45557964 + RLTR20C LTR ERVK 1 534 0 8 1401 3028 59 49 3 chr5 106980339 106980728 -45556531 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1401 1302 181 21 146 chr5 107000285 107000456 -45536803 + ORR1D1 LTR MaLR 41 186 -188 1 1401 1302 181 21 146 chr5 107000496 107000700 -45536559 + ORR1D1 LTR MaLR 187 369 -5 1 1401 245 248 55 73 chr5 107001447 107001556 -45535703 - MT2B LTR ERVL -343 258 152 5 1401 2432 88 22 0 chr5 107007974 107008294 -45528965 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1401 998 240 179 0 chr5 107008515 107008828 -45528431 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 1 1401 2044 143 78 113 chr5 107016181 107016669 -45520590 - RMER4B LTR ERVK -1 584 114 2 1401 550 215 107 7 chr5 107018675 107018825 -45518434 - MTE2b LTR MaLR -6 373 209 3 1401 752 201 184 40 chr5 107018934 107019157 -45518102 - MTE2b LTR MaLR -124 255 1 3 1401 302 304 97 84 chr5 107019157 107019358 -45517901 + MLT1G1-int LTR MaLR 985 1188 -301 3 1401 697 313 127 26 chr5 107019596 107020022 -45517237 + MLT1G1 LTR MaLR 111 579 0 3 1401 949 288 114 36 chr5 107020928 107021292 -45515967 + MTE2a LTR MaLR 25 405 -14 3 1401 421 221 28 28 chr5 107022843 107022950 -45514309 + MTEa LTR MaLR 258 364 -15 4 1401 840 217 32 41 chr5 107024840 107025061 -45512198 + MTD LTR MaLR 1 219 -200 4 1401 2110 143 92 13 chr5 107033171 107033561 -45503698 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1401 349 200 225 11 chr5 107034162 107034344 -45502915 + RLTR15 LTR ERVK 4 224 -135 6 1401 288 273 50 85 chr5 107034438 107034638 -45502621 + RLTR15 LTR ERVK 165 357 -2 6 1401 2449 82 25 0 chr5 107037112 107037429 -45499830 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 1 7 1401 431 143 34 103 chr5 107038157 107038170 -45499089 + MT2B LTR ERVL 168 271 -330 7 1401 1776 129 7 4 chr5 107040036 107040316 -45496943 - ORR1B1 LTR MaLR -113 281 1 7 1401 3512 138 103 35 chr5 107040308 107041057 -45496202 - ORR1B1-int LTR MaLR -2 1507 708 7 1401 239 139 23 0 chr5 107041101 107041144 -45496115 - ORR1B1-int LTR MaLR -1465 44 1 7 1401 1865 144 84 6 chr5 107041156 107041511 -45495748 - ORR1B1 LTR MaLR -11 383 1 7 1401 617 153 43 21 chr5 107042188 107042328 -45494931 + ORR1D1 LTR MaLR 5 147 -227 8 1401 423 221 94 71 chr5 107042559 107042729 -45494530 + ORR1D1 LTR MaLR 211 384 0 8 1401 940 236 179 38 chr5 107043908 107044272 -45492987 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 1401 329 246 35 43 chr5 107052037 107052152 -45485107 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 252 9 1401 518 306 88 16 chr5 107053248 107053608 -45483651 - MLT1A0-int LTR MaLR -960 411 5 9 1401 983 191 180 8 chr5 107055934 107056281 -45480978 - MTD LTR MaLR -8 411 5 1 1401 314 355 121 13 chr5 107075123 107075354 -45461905 + MER90 LTR ERV1 315 570 -5 1 1401 345 304 44 18 chr5 107075605 107075719 -45461540 + MLT1A1 LTR MaLR 292 408 0 1 1401 571 352 28 12 chr5 107079152 107079399 -45457860 - MLT1B LTR MaLR -139 251 1 1 1401 963 156 304 30 chr5 107079910 107080271 -45456988 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1867 2326 0 1 1401 1579 205 156 70 chr5 107080275 107080763 -45456496 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 550 -27 1 1401 571 311 90 32 chr5 107082523 107082802 -45454457 + MLT1B LTR MaLR 17 311 -79 1 1401 2105 114 6 53 chr5 107083951 107084292 -45452967 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 1 175 1616 180 170 89 chr5 107085710 107086203 -45451056 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 1 1402 3242 108 51 12 chr5 107087890 107088429 -45448830 + MT2B LTR ERVL 2 593 -8 1 1402 283 315 159 19 chr5 107088789 107088996 -45448263 - RMER13B LTR ERVK -227 681 446 1 1402 1254 211 102 95 chr5 107089178 107089649 -45447610 + RMER4B LTR ERVK 1 586 -25 1 1402 1183 164 40 15 chr5 107089939 107090237 -45447022 - ORR1C1 LTR MaLR -5 379 3 1 1402 1471 168 164 6 chr5 107093644 107093967 -45443292 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1402 230 322 43 11 chr5 107098908 107099002 -45438257 + MLT1D LTR MaLR 1 97 -408 1 1402 556 283 12 30 chr5 107102801 107102965 -45434294 + ORR1E LTR MaLR 1 161 -198 1 1402 2146 160 8 60 chr5 107129567 107129966 -45407293 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1402 2404 155 34 12 chr5 107131419 107131830 -45405429 - MTC LTR MaLR 0 421 2 2 1402 4273 171 128 76 chr5 107131831 107131920 -45405339 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1177 2 1402 4273 171 128 76 chr5 107132109 107132360 -45404899 - MTC-int LTR MaLR -82 1176 946 2 1402 4273 171 128 76 chr5 107132507 107133212 -45404047 - MTC-int LTR MaLR -313 945 154 2 1402 4273 171 128 76 chr5 107133412 107133556 -45403703 - MTC-int LTR MaLR -1105 153 5 2 1402 783 215 23 1 chr5 107133640 107133851 -45403408 - MT2B LTR ERVL -49 552 237 2 1402 321 303 79 70 chr5 107135738 107135965 -45401294 + ORR1E LTR MaLR 79 307 -52 2 1402 2127 108 70 34 chr5 107138824 107139207 -45398052 + RMER10B LTR ERVL 1 397 -1 2 1402 324 181 0 0 chr5 107144017 107144089 -45393170 + RMER4B LTR ERVK 513 584 -1 2 1402 3604 72 13 15 chr5 107148142 107148618 -45388641 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 2 1402 2525 158 21 11 chr5 107150460 107150934 -45386325 - ORR1A4-int LTR MaLR -1484 479 1 2 1402 1956 142 31 0 chr5 107150936 107151253 -45386006 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 2 1402 960 280 44 14 chr5 107152019 107152312 -45384947 + MTEb LTR MaLR 8 309 -70 2 1402 2944 110 57 0 chr5 107157318 107157808 -45379451 + RLTR28 LTR ERVL 1 518 -6 3 1402 2510 176 2 0 chr5 107159345 107159765 -45377494 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1402 400 324 144 39 chr5 107160586 107161017 -45376242 + MLT1D LTR MaLR 1 476 -29 3 1402 263 104 20 40 chr5 107164175 107164225 -45373034 + ORR1C2 LTR MaLR 1 49 -318 3 1402 1614 141 54 48 chr5 107164299 107164612 -45372647 + ORR1C2 LTR MaLR 70 384 0 3 1402 318 239 185 17 chr5 107165016 107165135 -45372124 - RMER15 LTR ERVL -90 485 347 3 1402 365 206 248 61 chr5 107166516 107166689 -45370570 - MTE2a LTR MaLR -9 370 166 3 1402 312 325 28 28 chr5 107167782 107167928 -45369331 - MTE2a LTR MaLR -242 179 43 3 1402 403 285 19 77 chr5 107169221 107169377 -45367882 + MLT1B LTR MaLR 244 390 0 3 1402 2050 286 97 21 chr5 107170956 107171609 -45365650 + MER21B LTR ERV1 9 710 -153 3 1402 1807 188 24 0 chr5 107174460 107174790 -45362469 - MTC LTR MaLR 0 421 84 3 1402 739 214 6 54 chr5 107174994 107175092 -45362167 - MTC LTR MaLR -331 90 1 3 1402 310 296 255 52 chr5 107175442 107175791 -45361468 - LTR40a LTR ERVL 0 519 100 3 1402 1945 168 32 50 chr5 107175864 107176241 -45361018 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 3 1402 3373 55 2 0 chr5 107181154 107181557 -45355702 - MTB_Mm LTR MaLR -3 404 1 3 1402 2015 105 74 30 chr5 107186034 107186427 -45350832 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 3 1402 2505 123 60 12 chr5 107189975 107190377 -45346882 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1402 332 172 0 0 chr5 107190378 107190442 -45346817 - MTC-int LTR MaLR -1 1257 1194 3 1402 2444 175 181 31 chr5 107190431 107191006 -45346253 + MTC-int LTR MaLR 471 1143 -115 3 1402 2444 175 181 31 chr5 107191180 107191216 -45346043 + MTC-int LTR MaLR 1144 1174 -84 3 1402 278 295 50 59 chr5 107191258 107191359 -45345900 - ORR1E LTR MaLR -218 141 42 3 1402 238 216 20 0 chr5 107191779 107191830 -45345429 - RMER15 LTR ERVL -20 555 504 3 1402 1681 184 78 23 chr5 107191844 107192239 -45345020 + RMER10A LTR ERVL 1 417 -25 3 1402 471 271 117 86 chr5 107192194 107192241 -45345018 - RMER15 LTR ERVL -31 544 502 3 1402 471 271 117 86 chr5 107192279 107192522 -45344737 - RMER15 LTR ERVL -74 501 245 3 1402 327 320 79 49 chr5 107199643 107199807 -45337452 + ORR1E LTR MaLR 8 176 -183 3 1402 1176 238 172 11 chr5 107200165 107200514 -45336745 + MTD LTR MaLR 8 412 -7 3 1402 317 304 26 18 chr5 107200519 107200633 -45336626 + ORR1E LTR MaLR 262 376 -3 3 1402 838 232 81 29 chr5 107203090 107203518 -45333741 + MT2B LTR ERVL 1 553 -48 3 1402 230 212 81 154 chr5 107206358 107206481 -45330778 + MT2B LTR ERVL 124 237 -364 4 1402 339 316 108 60 chr5 107209947 107210098 -45327161 + ORR1E LTR MaLR 2 159 -200 4 1402 3447 35 2 5 chr5 107210098 107210506 -45326753 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1402 339 316 108 60 chr5 107210506 107210539 -45326720 + ORR1E LTR MaLR 160 195 -164 4 1402 576 257 27 48 chr5 107212342 107212367 -45324892 - MTEa LTR MaLR -235 144 125 4 1402 1403 143 88 251 chr5 107212367 107212842 -45324417 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 1402 576 257 27 48 chr5 107212842 107212963 -45324296 - MTEa LTR MaLR -255 124 1 4 1402 2888 152 92 20 chr5 107214831 107215340 -45321919 + RMER15 LTR ERVL 29 574 -1 4 1402 716 161 97 0 chr5 107215713 107215837 -45321422 - MTC LTR MaLR -285 136 1 4 1403 3718 99 36 28 chr5 107219869 107220448 -45316811 + RMER17B LTR ERVK 2 585 -373 4 1403 297 209 277 34 chr5 107221466 107221585 -45315674 + MTD LTR MaLR 211 375 -44 4 1403 642 367 90 33 chr5 107222325 107222812 -45314447 - LTR16E2 LTR ERVL -30 538 24 4 1403 400 285 60 109 chr5 107226803 107227051 -45310208 - MLT1B LTR MaLR -22 368 133 4 1403 241 317 48 12 chr5 107227174 107227257 -45310002 + MLT1E2 LTR MaLR 80 165 -462 4 1403 395 182 88 33 chr5 107227388 107227479 -45309780 + MLT1D LTR MaLR 408 503 -2 4 1403 2082 107 58 10 chr5 107227909 107228221 -45309038 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1403 240 235 29 14 chr5 107228548 107228617 -45308642 + MLT2B4 LTR ERVL 315 384 -172 4 1403 396 291 36 43 chr5 107233029 107233169 -45304090 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 244 4 1403 1747 216 119 78 chr5 107239199 107239887 -45297372 - ORR1D-int LTR MaLR -333 1037 7 4 1403 2956 73 8 2 chr5 107241866 107242263 -45294996 + MTB_Mm LTR MaLR 4 402 -5 4 1403 253 279 60 85 chr5 107242290 107242525 -45294734 + RMER10A LTR ERVL 185 413 -29 4 1403 487 184 29 101 chr5 107248143 107248282 -45288977 + MT2B LTR ERVL 150 278 -323 5 1403 1894 146 134 27 chr5 107255822 107256194 -45281065 - MTC LTR MaLR -9 412 1 5 1403 578 205 22 59 chr5 107257951 107258086 -45279173 - ORR1C2 LTR MaLR -83 301 172 5 1403 1239 125 5 0 chr5 107258190 107258374 -45278885 - ORR1C2 LTR MaLR -199 185 1 5 1403 1393 171 150 29 chr5 107264813 107265192 -45272067 + RMER10A LTR ERVL 18 442 0 5 1403 1728 206 80 5 chr5 107274771 107275161 -45262098 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1403 627 284 77 44 chr5 107279264 107279537 -45257722 + MLT1K LTR MaLR 286 567 -28 5 1403 1444 219 100 3 chr5 107284254 107284584 -45252675 + ORR1D2 LTR MaLR 9 370 0 5 1403 2235 68 61 13 chr5 107284909 107285221 -45252038 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1403 225 182 179 18 chr5 107287871 107287927 -45249332 + ORR1D2 LTR MaLR 6 70 -300 5 1403 250 182 0 0 chr5 107288273 107288317 -45248942 - ORR1C2 LTR MaLR 0 379 336 5 1403 407 169 0 144 chr5 107288469 107288566 -45248693 - MTEa LTR MaLR -296 83 1 5 1403 430 312 69 69 chr5 107288602 107288819 -45248440 + MER90 LTR ERV1 41 257 -318 5 1403 250 268 77 135 chr5 107290169 107290428 -45246831 + RLTR12B LTR ERVK 11 254 -274 5 1403 399 184 26 8 chr5 107290432 107290526 -45246733 + ORR1A2 LTR MaLR 1 93 -236 5 1403 972 178 45 134 chr5 107295073 107295365 -45241894 - ORR1C2 LTR MaLR -118 266 1 5 1403 1918 106 28 0 chr5 107296562 107296578 -45240681 + ORR1A2 LTR MaLR 28 43 -284 6 1403 1918 106 28 0 chr5 107297528 107297795 -45239464 + ORR1A2 LTR MaLR 44 318 -9 6 1403 1346 242 64 34 chr5 107298231 107298638 -45238621 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1403 247 139 0 0 chr5 107305880 107305916 -45231343 + MTEb LTR MaLR 1 36 -343 6 1403 310 281 16 40 chr5 107306736 107306862 -45230397 + RLTR17 LTR ERVK 116 238 -454 6 1403 586 235 80 60 chr5 107306903 107307102 -45230157 + RLTR17 LTR ERVK 319 521 -171 6 1403 339 129 48 0 chr5 107307145 107307207 -45230052 + RLTR31_Mur LTR ERVK 489 553 0 6 1403 302 385 57 43 chr5 107313201 107313500 -45223759 + LTR16B2 LTR ERVL 9 311 -151 6 1403 561 262 142 18 chr5 107321027 107321275 -45215984 + MLT1F1 LTR MaLR 357 680 0 6 1403 1853 130 71 22 chr5 107323216 107323539 -45213720 + MTC LTR MaLR 83 421 0 6 1403 578 187 9 9 chr5 107328330 107328438 -45208821 + RLTR18 LTR ERVK 463 570 -46 6 1403 409 305 46 13 chr5 107328434 107328587 -45208672 - RLTR18B LTR ERVK -169 343 186 6 1403 735 292 53 66 chr5 107328642 107328946 -45208313 - RLTR18 LTR ERVK -311 305 6 6 1403 2814 110 39 16 chr5 107329555 107329974 -45207285 - RMER6A LTR ERVK -8 748 328 6 1403 2814 110 39 16 chr5 107330013 107330082 -45207177 - RMER6A LTR ERVK -429 327 250 6 1403 3128 9 0 0 chr5 107330284 107330630 -45206629 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1403 659 206 36 52 chr5 107336958 107337152 -45200107 + RLTR15 LTR ERVK 1 191 -168 6 1403 777 262 78 36 chr5 107337391 107337473 -45199786 + RLTR15 LTR ERVK 22 103 -256 6 1403 777 262 78 36 chr5 107337516 107337742 -45199517 + RLTR15 LTR ERVK 104 342 -17 6 1403 1534 169 73 38 chr5 107339268 107339581 -45197678 + ORR1D1 LTR MaLR 51 374 0 6 1403 534 307 75 122 chr5 107340805 107341377 -45195882 + MLT1F LTR MaLR 1 545 -3 6 1403 2221 95 38 0 chr5 107344993 107345308 -45191951 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1404 1352 262 52 12 chr5 107348356 107348700 -45188559 - MER68 LTR ERVL -175 388 31 7 1404 327 361 33 33 chr5 107348954 107349169 -45188090 - MTD LTR MaLR -204 215 1 7 1404 3376 41 0 130 chr5 107349619 107350120 -45187139 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 1404 674 183 84 13 chr5 107357900 107358055 -45179204 + ORR1D1 LTR MaLR 1 166 -208 7 1404 999 227 49 69 chr5 107358055 107358405 -45178854 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 7 1404 1027 197 72 57 chr5 107358369 107358633 -45178626 + ORR1C2 LTR MaLR 107 374 -10 7 1404 2744 135 5 19 chr5 107360469 107360794 -45176465 + MTC LTR MaLR 3 326 -95 7 1404 3477 25 0 133 chr5 107360794 107361297 -45175962 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 1404 2744 135 5 19 chr5 107361297 107361395 -45175864 + MTC LTR MaLR 327 420 -1 7 1404 2276 112 6 0 chr5 107376602 107376922 -45160337 - ORR1A2 LTR MaLR -5 322 1 7 1404 1386 40 0 0 chr5 107377298 107377472 -45159787 + RLTR10-int LTR ERVK 1813 1986 -1 7 1404 2345 72 119 11 chr5 107377472 107377824 -45159435 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 7 1404 339 328 63 58 chr5 107380669 107380900 -45156359 + MLT1A1 LTR MaLR 26 297 -111 7 1404 311 117 0 0 chr5 107382268 107382321 -45154938 + MT2A LTR ERVL 488 533 0 7 1404 3584 155 128 39 chr5 107382850 107383741 -45153518 - RLTR25A LTR ERVK -3 1025 1 7 1404 628 309 131 27 chr5 107386420 107386862 -45150397 + MLT1D LTR MaLR 2 489 -16 7 1404 1174 222 125 153 chr5 107388614 107389236 -45148023 + RMER19B LTR ERVK 298 902 0 7 1404 1928 190 76 112 chr5 107391675 107392226 -45145033 + MT2A LTR ERVL 1 531 -2 7 1404 729 205 161 150 chr5 107399630 107399908 -45137351 + MTE2a LTR MaLR 1 289 -90 8 1404 2672 60 88 26 chr5 107399908 107400285 -45136974 - MTB LTR MaLR 0 400 1 8 1404 729 205 161 150 chr5 107400285 107400373 -45136886 + MTE2a LTR MaLR 290 370 -9 8 1404 1555 210 124 143 chr5 107434435 107435169 -45102090 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 8 1404 296 308 0 37 chr5 107449984 107450065 -45087194 + MTEa LTR MaLR 1 78 -301 8 1404 273 262 66 51 chr5 107451407 107451544 -45085715 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 268 9 1404 798 256 30 93 chr5 107456467 107456799 -45080460 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 33 9 1404 538 185 73 32 chr5 107457274 107457397 -45079862 - MTC LTR MaLR -3 418 291 9 1404 1622 222 171 70 chr5 107459422 107459936 -45077323 + RMER2 LTR ERV1 1 566 -1 9 1404 229 317 60 42 chr5 107460968 107461105 -45076154 - ORR1E LTR MaLR -261 147 1 9 1404 3184 53 13 5 chr5 107466908 107467305 -45069954 - MTB LTR MaLR 0 400 1 9 1404 273 289 104 9 chr5 107469056 107469171 -45068088 - MLT1L LTR MaLR -290 320 195 9 1404 267 335 58 34 chr5 107473859 107474066 -45063193 + MLT2F LTR ERVL 442 653 -10 9 1404 1637 225 55 10 chr5 107476358 107476757 -45060502 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 9 1405 2142 169 39 42 chr5 107481516 107481849 -45055410 - MTC LTR MaLR 0 421 89 9 1405 2142 169 39 42 chr5 107481998 107482071 -45055188 - MTC LTR MaLR -333 88 17 9 1405 403 294 25 8 chr5 107482108 107482228 -45055031 + RLTR18B LTR ERVK 391 512 0 9 1405 256 257 185 50 chr5 107483196 107483315 -45053944 + MLT1A0 LTR MaLR 1 135 -273 9 1405 649 207 26 14 chr5 107483326 107483477 -45053782 + MLT1A0 LTR MaLR 245 467 0 9 1405 1416 229 150 45 chr5 107485560 107486026 -45051233 + RMER15 LTR ERVL 2 516 -59 9 1405 1543 191 231 34 chr5 107489522 107489998 -45047261 - RMER4B LTR ERVK -15 570 1 9 1405 1854 132 180 9 chr5 107490082 107490410 -45046849 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 9 1405 628 230 58 53 chr5 107492192 107492399 -45044860 + ORR1E LTR MaLR 1 208 -151 9 1405 2503 71 6 6 chr5 107493000 107493327 -45043932 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1405 332 319 49 21 chr5 107498846 107498990 -45038269 + MLT1L LTR MaLR 349 496 -114 9 1405 2705 87 48 38 chr5 107502107 107502503 -45034756 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1405 512 298 104 83 chr5 107514128 107514454 -45022805 - MLT1A0 LTR MaLR -32 333 1 3 1405 410 236 0 98 chr5 107514692 107514814 -45022445 - MT2B LTR ERVL -344 257 148 3 1405 250 305 0 0 chr5 107521614 107521673 -45015586 - HERV16-int LTR ERVL -3954 1042 984 4 1405 389 328 76 110 chr5 107521894 107522195 -45015064 + MLT1E2 LTR MaLR 272 562 -65 4 1405 273 242 62 62 chr5 107522550 107522647 -45014612 - LTR16B LTR ERVL -45 418 322 5 1405 997 169 113 146 chr5 107523430 107523854 -45013405 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1405 232 278 91 100 chr5 107525010 107525350 -45011909 - RMER17C LTR ERVK -59 351 15 5 1405 1369 217 159 49 chr5 107525372 107525683 -45011576 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2898 5 1405 1369 217 159 49 chr5 107525714 107525930 -45011329 - RMER17C-int LTR ERVK -341 2897 2653 5 1405 388 209 7 29 chr5 107526176 107526287 -45010972 - RMER17C-int LTR ERVK -2467 3670 3605 5 1405 315 200 43 0 chr5 107526278 107526348 -45010911 - MYSERV6-int LTR ERVK -183 8776 8704 6 1405 878 291 61 61 chr5 107528985 107529344 -45007915 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 1405 583 267 74 86 chr5 107530209 107530533 -45006726 + ORR1E LTR MaLR 29 348 -11 6 1405 3115 29 0 0 chr5 107543814 107544160 -44993099 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 9 1405 733 310 67 66 chr5 107552740 107553122 -44984137 + MTE2a LTR MaLR 26 419 0 1 1405 349 317 45 68 chr5 107588081 107588213 -44949046 - MER21B LTR ERV1 -729 134 6 1 1405 282 354 20 0 chr5 107593746 107593845 -44943414 + MLT2C2 LTR ERVL 459 559 0 1 1405 249 0 0 0 chr5 107600953 107600985 -44936274 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 32 -290 1 1405 2230 100 13 6 chr5 107602664 107602975 -44934284 + ORR1A2 LTR MaLR 15 327 0 1 1405 2053 120 87 128 chr5 107604536 107604733 -44932526 + MTC LTR MaLR 1 210 -211 1 1405 2053 120 87 128 chr5 107605184 107605425 -44931834 + MTC LTR MaLR 211 421 0 1 1406 1428 119 160 8 chr5 107614771 107615034 -44922225 - MTC LTR MaLR -8 413 111 2 1406 391 242 55 0 chr5 107615318 107615409 -44921850 - MTC LTR MaLR -302 119 24 2 1406 778 261 269 24 chr5 107615413 107615706 -44921553 + ORR1E LTR MaLR 13 377 -2 2 1406 1029 300 113 14 chr5 107618784 107619139 -44918120 - MLT2B2 LTR ERVL -41 474 85 2 1406 3364 55 51 0 chr5 107627042 107627246 -44910013 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 233 2 1406 3364 55 51 0 chr5 107627272 107627482 -44909777 - RLTR10C LTR ERVK -204 232 2 2 1406 611 290 98 56 chr5 107628128 107628549 -44908710 - MLT1D LTR MaLR -17 488 13 2 1406 516 288 138 52 chr5 107630073 107630362 -44906897 + ORR1E LTR MaLR 42 355 -4 2 1406 1146 252 66 24 chr5 107634040 107634373 -44902886 - MTE2b LTR MaLR -24 355 9 2 1406 337 313 138 81 chr5 107645712 107646230 -44891029 + LTR48B LTR ERV1 1 588 -56 2 1406 481 293 67 82 chr5 107648976 107649184 -44888075 + MLT1J LTR MaLR 81 285 -227 2 1406 1298 259 30 24 chr5 107657808 107658137 -44879122 + MTE2b LTR MaLR 5 335 -44 2 1406 253 299 93 90 chr5 107667617 107667896 -44869363 + RMER10B LTR ERVL 12 291 -107 3 1406 434 318 108 49 chr5 107673273 107673561 -44863698 + ORR1E LTR MaLR 9 313 -46 3 1406 2844 34 6 177 chr5 107684360 107684830 -44852429 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 3 1406 1534 62 10 0 chr5 107684889 107685084 -44852175 + RLTR10-int LTR ERVK 11 207 -1780 3 1406 704 72 10 10 chr5 107685084 107685182 -44852077 + RLTR10 LTR ERVK 314 411 0 3 1406 6017 29 9 3 chr5 107685182 107685875 -44851384 + RLTR10-int LTR ERVK 302 998 -989 3 1406 376 271 31 8 chr5 107685939 107686069 -44851190 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 3 1406 9051 18 2 0 chr5 107686151 107687147 -44850112 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1987 0 3 1406 2844 34 6 177 chr5 107687147 107687617 -44849642 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 3 1406 270 130 185 0 chr5 107688023 107688077 -44849182 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 311 3 1406 1219 172 39 0 chr5 107688095 107688298 -44848961 - ORR1D1 LTR MaLR -161 213 3 3 1406 254 270 0 42 chr5 107692101 107692244 -44845015 + ORR1B1-int LTR MaLR 618 754 -755 3 1406 344 283 89 38 chr5 107702323 107702481 -44834778 - MTE2a LTR MaLR -114 265 100 3 1406 379 239 82 35 chr5 107704091 107704271 -44832988 - MTD LTR MaLR -11 408 196 4 1406 438 286 24 0 chr5 107704479 107704594 -44832665 - MTD LTR MaLR -205 214 97 4 1406 936 191 326 62 chr5 107704604 107704908 -44832351 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1406 261 323 10 40 chr5 107709188 107709288 -44827971 + MTEa LTR MaLR 269 365 -14 4 1406 1879 84 133 7 chr5 107709412 107709698 -44827561 + ORR1A3 LTR MaLR 1 322 -4 4 1406 4723 128 65 58 chr5 107710066 107710903 -44826356 + RMER21B LTR ERV1 1 842 0 4 1406 4403 162 57 66 chr5 107719765 107720675 -44816584 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 4 1406 1008 239 57 98 chr5 107722003 107722389 -44814870 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1407 1604 106 39 0 chr5 107742291 107742546 -44794713 + ORR1A2 LTR MaLR 54 318 -9 4 1407 2098 164 76 10 chr5 107743317 107743712 -44793547 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1407 294 329 26 32 chr5 107745869 107746023 -44791236 - RMER15 LTR ERVL -76 499 347 4 1407 466 277 32 0 chr5 107746615 107746770 -44790489 - MTD LTR MaLR -14 405 246 5 1407 665 236 219 9 chr5 107746950 107747159 -44790100 - MTD LTR MaLR -166 253 1 5 1407 484 234 144 21 chr5 107754219 107754455 -44782804 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 147 5 1407 296 229 0 121 chr5 107780173 107780297 -44756962 + MT2B LTR ERVL 156 264 -337 5 1407 1057 128 202 11 chr5 107792820 107793167 -44744092 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 1407 977 161 101 30 chr5 107793167 107793435 -44743824 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 972 6 1407 1590 209 12 9 chr5 107793506 107793835 -44743424 - MTC LTR MaLR -90 331 2 6 1407 265 253 9 95 chr5 107807657 107807762 -44729497 - RMER15 LTR ERVL -76 499 404 6 1407 1954 215 158 26 chr5 107811813 107812343 -44724916 + RMER19B LTR ERVK 303 902 0 6 1407 230 265 0 146 chr5 107815773 107815910 -44721349 + MT2B LTR ERVL 148 264 -337 6 1407 3373 131 108 8 chr5 107817525 107818170 -44719089 - RMER6D LTR ERVK -10 710 1 6 1407 805 258 176 12 chr5 107824504 107824845 -44712414 - RMER5 LTR ERV1 0 534 138 6 1407 2147 155 83 19 chr5 107826334 107826754 -44710505 - RMER12B LTR ERVK -957 447 1 6 1407 1646 113 255 28 chr5 107826851 107827169 -44710090 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 6 1407 1415 142 32 0 chr5 107829192 107829439 -44707820 - ORR1D1 LTR MaLR -119 255 1 6 1407 324 275 91 9 chr5 107829444 107829554 -44707705 - MLT1J2 LTR MaLR -263 185 67 6 1407 236 128 0 0 chr5 107835301 107835340 -44701919 - MLT1A1 LTR MaLR -70 338 300 6 1407 1709 123 207 6 chr5 107835677 107836005 -44701254 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1407 447 180 25 10 chr5 107836175 107836283 -44700976 + MTD LTR MaLR 248 395 -24 6 1407 973 222 44 107 chr5 107838040 107838378 -44698881 + RMER12 LTR ERVK 785 1101 -221 7 1407 1845 156 65 16 chr5 107838616 107838988 -44698271 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 140 7 1407 3137 64 20 0 chr5 107839929 107840321 -44696938 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1407 1813 145 40 51 chr5 107849012 107849064 -44688195 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 328 7 1407 2490 136 91 16 chr5 107849064 107849491 -44687768 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 7 1407 1813 145 40 51 chr5 107849491 107849809 -44687450 - ORR1D1 LTR MaLR -47 327 5 7 1407 410 219 59 42 chr5 107857585 107857704 -44679555 - MTE2a LTR MaLR 0 379 259 7 1407 1299 236 81 0 chr5 107863542 107863839 -44673420 - MTD LTR MaLR -98 321 1 7 1407 2044 132 61 79 chr5 107865950 107866379 -44670880 + RLTR23 LTR ERV1 10 430 0 7 1407 1891 152 140 5 chr5 107869185 107869556 -44667703 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1408 2385 114 48 8 chr5 107874317 107874714 -44662545 - MTC LTR MaLR -8 413 1 7 1408 4227 122 53 27 chr5 107876448 107876784 -44660475 + RMER6D LTR ERVK 3 359 -361 7 1408 4227 122 53 27 chr5 107876875 107877234 -44660025 + RMER6D LTR ERVK 360 717 -3 7 1408 962 267 108 63 chr5 107879227 107879626 -44657633 + MER74A LTR ERVL 26 442 -116 7 1408 233 300 73 24 chr5 107884604 107884686 -44652573 - MER21B LTR ERV1 -765 98 13 8 1408 292 232 0 12 chr5 107887641 107887724 -44649535 - MER57D LTR ERV1 0 434 353 8 1408 807 231 186 114 chr5 107888132 107888465 -44648794 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 8 1408 509 276 173 10 chr5 107888532 107888752 -44648507 - MER57D LTR ERV1 -142 269 7 8 1408 1347 120 72 11 chr5 107898313 107898575 -44638684 + RMER12B LTR ERVK 919 1196 -208 8 1408 1048 171 30 252 chr5 107903425 107903854 -44633405 + ORR1C2 LTR MaLR 2 335 -49 8 1408 765 191 95 0 chr5 107905460 107905628 -44631631 - MT2A LTR ERVL 0 533 350 8 1408 262 268 0 18 chr5 107905649 107905706 -44631553 - MT2A LTR ERVL -400 133 78 8 1408 788 190 62 47 chr5 107909666 107909859 -44627400 - ORR1D1 LTR MaLR -178 196 1 8 1408 251 239 63 32 chr5 107915519 107915614 -44621645 - RLTR22_Mur LTR ERVK -694 1154 1057 8 1408 880 223 96 23 chr5 107920075 107920295 -44616964 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 381 8 1408 254 268 18 0 chr5 107920287 107920343 -44616916 - RLTR18 LTR ERVK -454 58 2 8 1408 1762 279 70 30 chr5 107920940 107921599 -44615660 + ERVL-int LTR ERVL 4288 4972 -785 8 1408 1072 201 173 37 chr5 107922198 107922493 -44614766 - MTD LTR MaLR -37 382 48 8 1408 839 207 94 6 chr5 107923200 107923380 -44613879 - MTD LTR MaLR -212 207 12 8 1408 232 325 157 13 chr5 107924643 107924796 -44612463 - MLT1H2 LTR MaLR -11 478 304 8 1408 769 163 22 34 chr5 107944508 107944673 -44592586 + RMER20A LTR ERVK 1 161 -355 9 1408 801 275 125 15 chr5 107944804 107945133 -44592126 + RMER20A LTR ERVK 152 516 0 9 1408 563 277 181 15 chr5 107946586 107946846 -44590413 - RMER15 LTR ERVL 0 575 273 9 1408 345 240 57 152 chr5 107946956 107947133 -44590126 - RMER15-int LTR ERVL -5 4994 4835 9 1408 419 280 79 8 chr5 107947194 107947320 -44589939 - RMER15-int LTR ERVL -696 4303 4169 9 1408 1593 313 94 24 chr5 107947495 107948247 -44589012 - RMER15-int LTR ERVL -2807 2192 1388 9 1408 6444 83 74 5 chr5 107948516 107949473 -44587786 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 9 1408 933 252 164 9 chr5 107950962 107951335 -44585924 + MER57C2 LTR ERV1 1 409 -25 9 1408 1052 191 62 48 chr5 107952233 107952611 -44584648 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 39 9 1408 511 254 0 0 chr5 107952895 107953005 -44584254 - MTEb LTR MaLR -269 110 1 9 1408 1127 232 11 45 chr5 107955876 107956232 -44581027 - RLTR15 LTR ERVK -15 344 1 9 1408 2485 112 72 24 chr5 107956624 107957000 -44580259 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 9 1408 942 151 99 20 chr5 107957000 107957260 -44579999 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 9 1408 1849 176 31 70 chr5 107957490 107957905 -44579354 + RLTR18B LTR ERVK 4 402 -110 9 1408 1698 261 44 65 chr5 107958444 107959013 -44578246 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 56 9 1408 2089 150 11 132 chr5 107960843 107960888 -44576371 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 353 9 1408 2089 150 11 132 chr5 107961078 107961471 -44575788 - ORR1B1 LTR MaLR -42 352 1 9 1408 578 301 94 77 chr5 107961640 107961786 -44575473 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 211 9 1408 578 301 94 77 chr5 107961995 107962200 -44575059 - MLT1A0 LTR MaLR -155 210 4 9 1408 1041 203 62 132 chr5 107965985 107966429 -44570830 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 1408 240 278 87 22 chr5 107967873 107967965 -44569294 + LTR40a LTR ERVL 422 519 0 9 1408 380 317 110 7 chr5 107974197 107974343 -44562916 + MER21B LTR ERV1 332 492 -371 9 1408 2750 177 44 65 chr5 107984549 107985118 -44552141 + RLTR31_Mm LTR ERVK 5 561 0 9 1408 234 253 80 11 chr5 107989786 107989874 -44547385 + MTEb LTR MaLR 281 374 -5 9 1408 368 258 124 13 chr5 107991982 107992134 -44545125 + MLT1B LTR MaLR 11 179 -211 1 1408 728 268 103 105 chr5 107992344 107992954 -44544305 + RMER20B LTR ERVK 30 707 -201 1 1408 282 280 172 37 chr5 107993152 107993206 -44544053 + MLT1B LTR MaLR 270 332 -135 1 1408 1298 231 104 62 chr5 107993206 107993608 -44543651 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1408 282 280 172 37 chr5 107993608 107993716 -44543543 + MLT1B LTR MaLR 333 454 -13 1 1408 3335 67 12 0 chr5 107996904 107997335 -44539924 + LTRIS5 LTR ERV1 12 447 0 1 1408 599 278 41 41 chr5 107999392 107999499 -44537760 + MLT1E LTR MaLR 49 152 -501 1 1408 2299 154 41 0 chr5 107999499 107999862 -44537397 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1408 599 278 41 41 chr5 107999862 107999949 -44537310 + MLT1E LTR MaLR 153 243 -410 1 1408 350 245 0 109 chr5 108000340 108000450 -44536809 + MT2B LTR ERVL 161 258 -343 3 21 440 223 228 21 chr5 108003105 108003352 -44533907 + MTEa LTR MaLR 82 379 0 1 1409 300 318 39 82 chr5 108022149 108022382 -44514877 + MT2A LTR ERVL 143 365 -168 3 1409 236 257 37 65 chr5 108022481 108022589 -44514670 + ORR1D1 LTR MaLR 268 372 -2 3 1409 3353 28 10 10 chr5 108023021 108023417 -44513842 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1409 9412 32 3 1 chr5 108023417 108024513 -44512746 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1409 3328 26 21 0 chr5 108024513 108024901 -44512358 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1409 1502 179 46 54 chr5 108028655 108028927 -44508332 - MTC LTR MaLR -75 346 68 4 1409 1502 179 46 54 chr5 108029149 108029225 -44508034 - MTC LTR MaLR -354 67 1 4 1409 1544 144 3 58 chr5 108031053 108031348 -44505911 + MTC LTR MaLR 139 417 -4 4 1409 4476 130 106 8 chr5 108031359 108032191 -44505068 + MTC-int LTR MaLR 2 914 -344 4 1409 1023 168 86 0 chr5 108032199 108032396 -44504863 - MTC LTR MaLR -58 363 150 4 1409 599 213 65 137 chr5 108043416 108043693 -44493566 + MTE2a LTR MaLR 123 379 0 6 1409 1693 178 86 23 chr5 108044104 108044490 -44492769 - MTC LTR MaLR -7 414 5 7 1409 2305 156 112 25 chr5 108045709 108046229 -44491030 - RMER15 LTR ERVL -5 570 6 7 1409 297 287 102 70 chr5 108056445 108056632 -44480627 + MT2B LTR ERVL 86 278 -323 8 1409 1786 186 43 3 chr5 108058628 108058979 -44478280 + ORR1D1 LTR MaLR 5 369 -5 9 1409 313 214 10 92 chr5 108061608 108061706 -44475553 - MT2B LTR ERVL -361 240 151 1 1409 299 291 128 37 chr5 108067619 108067783 -44469476 + ORR1E LTR MaLR 14 192 -167 1 1409 258 252 74 50 chr5 108067816 108067937 -44469322 + ORR1E LTR MaLR 256 379 0 1 1409 904 310 124 80 chr5 108067936 108068563 -44468696 + ORR1E-int LTR MaLR 2 656 -924 1 1409 364 262 12 0 chr5 108068754 108068838 -44468421 + ORR1E-int LTR MaLR 960 1044 -536 1 1409 841 261 58 5 chr5 108069538 108069761 -44467498 + ORR1E-int LTR MaLR 1148 1382 -198 1 1409 1550 208 190 106 chr5 108074599 108075089 -44462170 + MT2A LTR ERVL 3 533 0 1 1409 3688 33 0 0 chr5 108076190 108076586 -44460673 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1409 1274 214 244 57 chr5 108077294 108077769 -44459490 - RMER2 LTR ERV1 0 567 4 1 1409 487 254 51 0 chr5 108096291 108096409 -44440850 + RMER20B LTR ERVK 1 124 -503 1 1409 256 268 28 14 chr5 108112423 108112495 -44424764 - MTE2a LTR MaLR -17 362 290 1 1409 2355 46 6 90 chr5 108114626 108114678 -44422581 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 288 1 1409 2355 46 6 90 chr5 108115182 108115486 -44421773 - ORR1A2 LTR MaLR -40 287 1 1 1409 237 143 165 0 chr5 108124810 108124857 -44412402 - MTE2a LTR MaLR -39 340 287 1 1409 3241 130 95 2 chr5 108126669 108127193 -44410066 + RMER15 LTR ERVL 1 573 -2 2 1409 325 342 8 33 chr5 108127431 108127552 -44409707 - RMER12 LTR ERVK -466 856 739 2 1409 930 231 73 49 chr5 108133776 108134103 -44403156 + RLTR15 LTR ERVK 1 335 -24 2 1410 673 331 99 53 chr5 108134644 108135056 -44402203 + MLT1J2 LTR MaLR 17 447 -1 2 1410 706 294 53 43 chr5 108135075 108135426 -44401833 + MLT2B4 LTR ERVL 3 356 -58 2 1410 259 95 47 23 chr5 108136001 108136044 -44401215 + MT2B2 LTR ERVL 244 287 -297 2 1410 369 301 196 36 chr5 108136458 108136682 -44400577 + RMER15 LTR ERVL 302 561 -14 2 1410 228 329 78 71 chr5 108138868 108139022 -44398237 - RMER15 LTR ERVL -7 568 414 2 1410 1419 238 96 10 chr5 108140197 108140583 -44396676 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1410 1538 120 117 19 chr5 108143529 108143793 -44393466 + MTC LTR MaLR 1 290 -131 2 1410 2517 138 39 12 chr5 108164520 108164930 -44372329 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1410 921 204 198 13 chr5 108165204 108165522 -44371737 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 2 1410 1638 184 56 8 chr5 108168793 108169150 -44368109 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1410 814 252 27 54 chr5 108169348 108169679 -44367580 + RLTR15 LTR ERVK 22 343 -16 2 1410 294 239 14 14 chr5 108170060 108170132 -44367127 - ORR1E LTR MaLR -285 74 3 2 1410 264 295 154 0 chr5 108170132 108170202 -44367057 - ORR1E-int LTR MaLR -51 1529 1448 2 1410 576 251 104 26 chr5 108170356 108170537 -44366722 - ORR1E-int LTR MaLR -118 1462 1267 2 1410 942 287 142 33 chr5 108170723 108171796 -44365463 - ORR1E-int LTR MaLR -320 1260 8 2 1410 354 262 233 36 chr5 108171807 108172056 -44365203 - ORR1E LTR MaLR -6 353 56 2 1410 281 227 20 137 chr5 108188679 108188698 -44348561 + MT2B LTR ERVL 151 157 -444 3 1410 421 196 0 125 chr5 108197689 108197817 -44339442 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 3 1410 450 309 134 27 chr5 108199713 108199936 -44337323 + MLT1K LTR MaLR 339 585 -10 3 1410 1268 189 134 41 chr5 108214620 108214962 -44322297 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1410 1085 238 104 23 chr5 108215213 108215509 -44321750 + MTD LTR MaLR 3 299 -101 3 1410 1146 114 6 0 chr5 108231746 108231913 -44305346 + ORR1C2 LTR MaLR 1 168 -216 4 1410 235 170 62 21 chr5 108233264 108233312 -44303947 + RMER21B LTR ERV1 188 237 -605 4 1410 1622 214 64 14 chr5 108234703 108235124 -44302135 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 4 1410 2557 137 10 7 chr5 108237498 108237911 -44299348 + MTC LTR MaLR 8 421 0 4 1410 561 293 69 29 chr5 108263930 108264134 -44273125 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 144 4 1410 298 269 221 8 chr5 108264620 108264751 -44272508 - MLT1A0 LTR MaLR -206 159 1 4 1411 612 193 84 26 chr5 108267038 108267192 -44270067 - ORR1D1 LTR MaLR -211 163 1 4 1411 314 200 250 0 chr5 108276296 108276376 -44260883 - MLT1C LTR MaLR 0 467 368 5 1411 308 337 69 21 chr5 108276534 108276722 -44260537 + MLT1G3 LTR MaLR 398 594 -1 5 1411 2378 132 59 0 chr5 108276941 108277313 -44259946 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1411 883 254 171 3 chr5 108279014 108279306 -44257953 - RMER15 LTR ERVL -26 549 209 5 1411 245 93 47 0 chr5 108279357 108279400 -44257859 - RMER15 LTR ERVL -458 117 73 5 1411 1589 173 88 83 chr5 108280398 108280783 -44256476 + MTC LTR MaLR 28 414 -7 5 1411 855 203 35 15 chr5 108281839 108282039 -44255220 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 167 5 1411 1445 204 20 47 chr5 108282136 108282480 -44254779 + ORR1C2 LTR MaLR 36 370 -14 5 1411 468 174 0 11 chr5 108282488 108282575 -44254684 - ORR1D1 LTR MaLR -288 86 1 5 1411 3569 228 81 70 chr5 108282575 108283926 -44253333 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 6 5 1411 706 113 17 0 chr5 108284844 108284959 -44252300 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 210 5 1411 360 237 386 58 chr5 108285435 108285719 -44251540 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 5 1411 3085 85 57 53 chr5 108294303 108294776 -44242483 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 1411 232 218 125 22 chr5 108296406 108296542 -44240717 + ORR1B1-int LTR MaLR 605 754 -755 5 1411 300 294 152 32 chr5 108307555 108307713 -44229546 + MLT1F LTR MaLR 32 208 -340 6 1411 275 271 9 86 chr5 108308118 108308223 -44229036 + MLT1F LTR MaLR 285 381 -167 6 1411 294 185 15 30 chr5 108308778 108308845 -44228414 + ORR1E LTR MaLR 1 66 -293 6 1411 251 304 97 45 chr5 108312786 108312962 -44224297 - MTEb LTR MaLR 0 379 195 6 1411 594 255 112 24 chr5 108313549 108313754 -44223505 + MTD LTR MaLR 197 419 0 6 1411 2729 83 3 3 chr5 108314922 108315310 -44221949 + MTA_Mm LTR MaLR 1 388 -8 6 1411 1008 97 474 0 chr5 108315612 108315825 -44221434 + ORR1A2 LTR MaLR 1 314 -12 6 1411 944 132 275 8 chr5 108316695 108316946 -44220313 - RMER15 LTR ERVL -5 570 254 6 1411 1827 106 36 27 chr5 108316948 108317267 -44219992 + RMER6A LTR ERVK 2 323 -433 6 1411 1756 132 51 6 chr5 108317267 108317603 -44219656 + RLTR15 LTR ERVK 1 351 -8 6 1411 1704 134 8 65 chr5 108317600 108317952 -44219307 + RMER6A LTR ERVK 391 722 -34 6 1411 940 203 78 43 chr5 108317962 108318219 -44219040 - RMER15 LTR ERVL -309 266 1 6 1411 2350 151 117 11 chr5 108318491 108318669 -44218590 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 285 6 1411 2350 151 117 11 chr5 108318887 108319141 -44218118 - RLTR28B LTR ERVL -197 284 3 6 1411 614 238 103 70 chr5 108319386 108319548 -44217711 + RMER15 LTR ERVL 207 377 -198 6 1411 614 238 103 70 chr5 108319667 108319785 -44217474 + RMER15 LTR ERVL 378 497 -78 6 1411 1803 169 71 11 chr5 108319785 108320149 -44217110 - MTC LTR MaLR -2 419 34 6 1411 258 268 24 24 chr5 108320162 108320246 -44217013 + RMER15 LTR ERVL 492 575 0 6 1411 626 244 98 58 chr5 108321940 108322266 -44214993 - RLTR15 LTR ERVK -20 339 1 6 1411 1185 199 7 56 chr5 108322266 108322515 -44214744 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6311 6 1411 1185 199 7 56 chr5 108322745 108322798 -44214461 - MYSERV-int LTR ERVK -240 6310 6263 6 1411 885 106 512 0 chr5 108322800 108323046 -44214213 + RMER21A LTR ERV1 1 372 -470 6 1411 2213 139 57 68 chr5 108323372 108323843 -44213416 + RMER21A LTR ERV1 482 947 0 6 1411 685 180 7 36 chr5 108323852 108323990 -44213269 + RMER21B LTR ERV1 708 841 -1 6 1411 1907 133 191 11 chr5 108327228 108327585 -44209674 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1411 346 200 0 14 chr5 108327802 108327873 -44209386 + MTB_Mm LTR MaLR 40 109 -298 6 1411 319 216 86 129 chr5 108334546 108334732 -44202527 + MT2B LTR ERVL 87 264 -337 7 1411 1050 166 160 108 chr5 108347872 108348121 -44189138 + ORR1D1 LTR MaLR 31 317 -57 7 1411 1050 166 160 108 chr5 108348266 108348284 -44188975 + ORR1D1 LTR MaLR 318 324 -50 7 1411 1050 166 160 108 chr5 108348472 108348528 -44188731 + ORR1D1 LTR MaLR 325 372 -2 7 1411 410 198 16 98 chr5 108354060 108354081 -44183178 + MT2B LTR ERVL 142 152 -449 7 1411 3212 131 53 9 chr5 108356904 108357468 -44179791 + RLTR21 LTR ERVK 1 589 -983 7 1411 2166 112 32 21 chr5 108357993 108358368 -44178891 + RLTR21 LTR ERVK 574 952 -620 7 1411 1035 262 51 152 chr5 108360973 108361111 -44176148 + RLTR21 LTR ERVK 937 1100 -472 7 1411 1035 262 51 152 chr5 108361159 108361728 -44175531 + RLTR21 LTR ERVK 1101 1571 -1 7 1411 2633 150 37 70 chr5 108367594 108367795 -44169464 + RLTR19 LTR ERVK 1 181 -318 7 1411 2633 150 37 70 chr5 108367982 108368296 -44168963 + RLTR19 LTR ERVK 182 499 0 7 1411 2044 170 41 48 chr5 108368452 108369121 -44168138 + RMER6A LTR ERVK 140 750 -6 7 1411 1653 257 133 18 chr5 108372683 108373366 -44163893 + RMER13A LTR ERVK 1 762 -98 8 1411 431 338 145 30 chr5 108373425 108373660 -44163599 + MLT1A1 LTR MaLR 80 341 -67 8 1411 392 279 129 90 chr5 108378852 108379108 -44158151 - MTE2a LTR MaLR -108 271 6 8 1411 1419 202 42 18 chr5 108389758 108390090 -44147169 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 31 8 1411 294 301 103 37 chr5 108392497 108392711 -44144548 + ORR1E LTR MaLR 3 230 -129 8 1411 477 178 0 11 chr5 108393792 108393883 -44143376 - RMER19B LTR ERVK 0 902 813 8 1411 1895 146 31 27 chr5 108393890 108394347 -44142912 + MurERV4_19-int LTR ERVK 4326 5205 -575 8 1411 1257 180 87 72 chr5 108394348 108394683 -44142576 + RMER19B LTR ERVK 421 760 -142 8 1411 318 67 89 0 chr5 108394848 108394893 -44142366 - MurERV4_19-int LTR ERVK -1049 4731 4683 8 1412 731 221 45 39 chr5 108398356 108398535 -44138724 + ORR1D1 LTR MaLR 1 180 -194 8 1412 387 184 9 75 chr5 108398592 108398698 -44138561 + ORR1D1 LTR MaLR 164 262 -112 8 1412 1066 163 82 26 chr5 108398831 108399064 -44138195 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 129 8 1412 675 193 22 0 chr5 108399402 108399537 -44137722 - ORR1D1 LTR MaLR -232 142 5 8 1412 912 265 61 4 chr5 108402344 108402624 -44134635 + MTD LTR MaLR 18 313 -106 8 1412 1126 126 70 0 chr5 108402654 108402799 -44134460 - RMER6A LTR ERVK -278 478 328 8 1412 1126 126 70 0 chr5 108402852 108402921 -44134338 - RMER6A LTR ERVK -429 327 250 8 1412 2871 49 3 3 chr5 108403123 108403469 -44133790 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 8 1412 248 261 105 32 chr5 108406257 108406352 -44130907 - LTR84b LTR ERVL -536 225 124 9 1412 1800 146 83 9 chr5 108406619 108406944 -44130315 + ORR1B2 LTR MaLR 3 351 -16 9 1412 3240 46 13 3 chr5 108411826 108412218 -44125041 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1412 1520 154 89 29 chr5 108422656 108422970 -44114289 - MTC LTR MaLR -8 413 81 9 1412 2747 31 65 0 chr5 108427483 108427808 -44109451 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 9 1412 237 173 48 107 chr5 108430301 108430385 -44106874 + RLTR42 LTR ERVK 136 214 -25 9 1412 439 321 58 31 chr5 108432859 108433084 -44104175 + LTR84b LTR ERVL 216 446 -315 9 1412 3032 81 2 10 chr5 108435652 108436062 -44101197 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1412 1459 225 50 20 chr5 108437159 108437470 -44099789 + ORR1D2 LTR MaLR 1 329 -41 1 1412 2565 204 45 70 chr5 108437470 108438097 -44099162 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1412 1459 225 50 20 chr5 108438097 108438143 -44099116 + ORR1D2 LTR MaLR 330 369 -1 1 1412 1605 175 194 114 chr5 108438702 108439244 -44098015 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 1 1412 779 151 22 0 chr5 108442129 108442268 -44094991 + RMER12 LTR ERVK 1 142 -1180 1 1412 262 167 100 0 chr5 108442274 108442334 -44094925 + RLTR22_Mus LTR ERVK 518 583 -1225 1 1412 406 287 29 26 chr5 108442738 108442911 -44094348 + RMER12B LTR ERVK 886 1008 -396 1 1412 877 172 90 63 chr5 108443236 108443459 -44093800 + RMER12 LTR ERVK 989 1217 -105 1 1412 653 144 59 102 chr5 108450102 108450288 -44086971 - RMER10A LTR ERVL -29 413 236 1 1412 366 200 116 31 chr5 108450997 108451126 -44086133 + RLTR15 LTR ERVK 1 140 -219 1 1412 498 188 0 35 chr5 108451227 108451343 -44085916 + RLTR15 LTR ERVK 33 144 -215 1 1412 2101 144 93 21 chr5 108451546 108451966 -44085293 + RLTR12A LTR ERVK 2 451 -117 1 1412 652 128 0 0 chr5 108452057 108452166 -44085093 + RLTR12A LTR ERVK 454 562 -6 1 1412 2633 37 27 144 chr5 108457759 108458169 -44079090 + RLTR10B2 LTR ERVK 4 365 0 1 1412 1856 161 87 3 chr5 108459751 108460106 -44077153 + MTC LTR MaLR 1 385 -36 1 1412 1094 226 125 55 chr5 108460320 108460704 -44076555 - MTD LTR MaLR 0 419 9 1 1412 2862 93 50 14 chr5 108462424 108462928 -44074331 + RMER6A LTR ERVK 140 661 -95 1 1412 1005 253 107 67 chr5 108469077 108469201 -44068058 - RMER5 LTR ERV1 -34 500 387 1 1412 1005 253 107 67 chr5 108469349 108469673 -44067586 - RMER5 LTR ERV1 -148 386 34 1 1412 538 269 85 22 chr5 108469828 108470052 -44067207 - MLT1B LTR MaLR 0 390 153 1 1412 290 242 112 8 chr5 108470391 108470516 -44066743 - MLT1B LTR MaLR -252 138 1 1 1412 1036 238 62 94 chr5 108470534 108470850 -44066409 - RMER5 LTR ERV1 -24 510 212 1 1412 1036 238 62 94 chr5 108471028 108471147 -44066112 - RMER5 LTR ERV1 -323 211 89 1 1412 245 265 0 14 chr5 108471954 108472023 -44065236 + RMER5 LTR ERV1 437 504 -30 1 1412 662 310 150 5 chr5 108475289 108475595 -44061664 - ORR1E LTR MaLR -2 377 1 1 1412 900 116 7 0 chr5 108482124 108482262 -44054997 + RLTR33 LTR ERVK 405 543 -135 1 1412 3905 161 109 10 chr5 108482491 108483288 -44053971 + RMER19B LTR ERVK 1 876 -26 1 1412 1543 147 0 4 chr5 108483950 108484202 -44053057 + MTC LTR MaLR 171 421 0 1 1412 1283 179 4 16 chr5 108485137 108485376 -44051883 + ORR1D1 LTR MaLR 1 236 -138 1 1412 799 134 145 5 chr5 108485376 108485595 -44051664 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 57 1 1412 329 164 14 29 chr5 108485584 108485653 -44051606 + ORR1D1 LTR MaLR 279 346 -28 1 1412 1148 258 94 6 chr5 108485903 108486231 -44051028 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 14 1 1412 645 325 7 77 chr5 108487791 108488088 -44049171 - MT2A LTR ERVL -71 462 187 1 1412 2740 100 136 6 chr5 108489452 108489923 -44047336 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 532 0 1 1412 1506 210 45 211 chr5 108490422 108491133 -44046126 + RMER19C LTR ERVK 19 611 0 1 1412 1392 146 19 56 chr5 108491604 108491873 -44045386 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 457 1 1412 680 62 0 0 chr5 108491873 108491970 -44045289 - RLTR19B LTR ERVK -618 97 1 1 1412 1610 146 48 85 chr5 108491977 108492375 -44044884 - RMER10B LTR ERVL -15 383 1 1 1412 1812 175 49 16 chr5 108498094 108498460 -44038799 + MTEb LTR MaLR 2 379 0 1 1412 899 148 426 4 chr5 108505358 108505635 -44031624 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1412 8149 142 83 111 chr5 108505637 108507656 -44029603 + ORR1B1-int LTR MaLR 2 1963 0 2 1412 485 137 264 35 chr5 108507658 108507802 -44029457 + ORR1B1 LTR MaLR 3 179 -215 2 1412 229 346 89 41 chr5 108512313 108512393 -44024866 - RMER12 LTR ERVK -30 1292 1190 4 1412 229 346 89 41 chr5 108512427 108512482 -44024777 - RMER12 LTR ERVK -30 1189 1116 4 1412 227 36 0 0 chr5 108515076 108515104 -44022155 - MT2C_Mm LTR ERVL -240 235 208 5 1412 1377 166 169 22 chr5 108515437 108515757 -44021502 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1412 2210 108 21 74 chr5 108521711 108522090 -44015169 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 7 1413 272 331 117 41 chr5 108533748 108533893 -44003366 - RMER15 LTR ERVL -153 422 267 9 1413 346 290 44 30 chr5 108543349 108543484 -43993775 + MTE-int LTR MaLR 66 202 -1378 1 1413 364 234 16 98 chr5 108555459 108555480 -43981779 + MT2B LTR ERVL 145 155 -446 1 1413 1583 157 130 21 chr5 108557306 108557637 -43979622 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1413 2151 175 34 122 chr5 108565484 108565638 -43971621 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1732 1 1413 2151 175 34 122 chr5 108565785 108566197 -43971062 - RLTR22_Mur LTR ERVK -117 1731 1332 1 1413 1322 172 40 25 chr5 108566196 108566470 -43970789 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1570 278 1 1 1413 498 152 62 52 chr5 108571583 108571722 -43965537 - RLTR21 LTR ERVK -130 1442 1253 2 1413 2130 166 29 42 chr5 108571753 108572230 -43965029 - RLTR21 LTR ERVK -485 1087 617 2 1413 3204 174 46 48 chr5 108572422 108573048 -43964211 - RLTR21 LTR ERVK -941 631 7 2 1413 1682 127 7 18 chr5 108573054 108573334 -43963925 + RMER10B LTR ERVL 1 277 -121 2 1413 315 122 0 0 chr5 108573465 108573514 -43963745 - RMER10B LTR ERVL -349 49 1 2 1413 361 136 15 15 chr5 108586521 108586588 -43950671 - ORR1A2 LTR MaLR -260 67 1 2 1413 961 196 136 20 chr5 108586633 108586879 -43950380 - ORR1D1 LTR MaLR -76 298 6 2 1413 254 294 61 45 chr5 108598028 108598067 -43939192 - MT2B LTR ERVL -275 326 229 2 1413 254 294 61 45 chr5 108598148 108598160 -43939099 - MT2B LTR ERVL -275 228 193 2 1413 359 226 0 23 chr5 108603733 108603819 -43933440 - MT2B2 LTR ERVL -64 520 437 2 1413 4538 109 44 1 chr5 108605122 108605808 -43931451 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 1 3 1413 1694 185 64 3 chr5 108618762 108619104 -43918155 - ORR1D1 LTR MaLR -11 363 1 3 1413 1611 183 18 172 chr5 108625284 108625638 -43911621 + ORR1C1 LTR MaLR 5 321 -57 3 1413 1611 183 18 172 chr5 108625811 108625835 -43911424 + ORR1C1 LTR MaLR 322 322 -56 3 1413 1611 183 18 172 chr5 108625982 108626044 -43911215 + ORR1C1 LTR MaLR 322 378 0 3 1413 4799 51 2 3 chr5 108633704 108634292 -43902967 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 3 1413 4755 50 3 3 chr5 108636217 108636804 -43900455 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 3 1413 870 277 253 18 chr5 108640624 108640951 -43896308 - RLTR16 LTR ERVK -79 426 23 4 1413 1737 138 32 70 chr5 108641688 108642030 -43895229 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1413 269 303 9 9 chr5 108643200 108643310 -43893949 + RMER21B LTR ERV1 86 195 -647 4 1413 449 230 107 93 chr5 108643327 108643543 -43893716 + RMER21B LTR ERV1 347 565 -277 4 1413 342 229 171 9 chr5 108647745 108647879 -43889380 + ORR1C1 LTR MaLR 18 206 -172 4 1413 1409 227 109 9 chr5 108654942 108655280 -43881979 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 4 1413 4923 188 145 30 chr5 108655280 108656507 -43880752 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1368 -2 4 1413 1815 196 19 21 chr5 108656509 108656884 -43880375 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1413 2828 85 19 27 chr5 108658328 108658529 -43878730 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 211 4 176 3368 35 2 0 chr5 108658529 108658924 -43878335 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1414 2828 85 19 27 chr5 108658924 108659132 -43878127 - MTB_Mm LTR MaLR -197 210 1 4 1414 350 276 18 71 chr5 108660475 108660588 -43876671 + MT2B LTR ERVL 152 258 -343 4 1414 799 281 13 69 chr5 108664358 108664591 -43872668 + MLT1A0 LTR MaLR 146 365 0 4 1414 1635 201 64 3 chr5 108665904 108666249 -43871010 + ORR1D2 LTR MaLR 3 368 -2 4 1414 1469 174 71 166 chr5 108667486 108667921 -43869338 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1414 913 245 66 121 chr5 108668626 108669042 -43868217 - MTE2a LTR MaLR -36 383 6 4 1414 304 200 0 151 chr5 108669658 108669764 -43867495 + MT2B2 LTR ERVL 183 272 -312 4 1414 1909 157 9 3 chr5 108671115 108671442 -43865817 - RMER6D LTR ERVK -4 716 388 4 1414 289 226 24 12 chr5 108674291 108674376 -43862883 - MurERV4_19-int LTR ERVK -1993 5260 5175 4 1414 8827 101 48 1 chr5 108675823 108676043 -43861216 - MurERV4_19-int LTR ERVK -1178 4602 4359 4 1414 8827 101 48 1 chr5 108676068 108677249 -43860010 - MurERV4_19-int LTR ERVK -1422 4358 3137 4 1414 3769 113 25 0 chr5 108678688 108679288 -43857971 - MurERV4_19-int LTR ERVK -2640 3140 2526 4 1414 6436 155 43 10 chr5 108679280 108680822 -43856437 - MurERV4_19-int LTR ERVK -4186 1594 1 4 1414 1377 219 34 104 chr5 108680822 108681178 -43856081 - RMER19C LTR ERVK 0 611 281 4 1414 232 91 0 0 chr5 108681175 108681208 -43856051 - RLTR19B LTR ERVK -651 64 32 5 1414 354 197 0 0 chr5 108681249 108681315 -43855944 - RLTR19-int LTR ERVK -1 6136 6071 5 1414 2014 180 121 13 chr5 108681730 108682202 -43855057 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5196 565 43 5 1414 328 74 0 0 chr5 108682235 108682289 -43854970 - MT2A LTR ERVL -2 531 478 5 1414 1066 207 86 121 chr5 108682626 108682939 -43854320 - MT2A LTR ERVL -231 302 1 5 1414 288 200 36 0 chr5 108682939 108682993 -43854266 - RMER15 LTR ERVL -519 56 1 5 1414 288 333 157 0 chr5 108682996 108683098 -43854161 - MER70B LTR ERVL -285 293 176 5 1414 341 312 86 0 chr5 108683204 108683297 -43853962 - MER70B LTR ERVL -388 190 90 5 1414 1861 164 149 63 chr5 108687708 108688171 -43849088 - RMER5 LTR ERV1 -14 520 18 5 1414 279 270 32 0 chr5 108690922 108690985 -43846274 + MLT1H LTR MaLR 331 395 -154 5 1414 714 173 211 71 chr5 108692171 108692450 -43844809 - RMER17C-int LTR ERVK -2919 319 2 5 1414 1381 154 131 23 chr5 108692462 108692814 -43844445 - RMER17C LTR ERVK -19 391 2 5 1414 1424 138 8 12 chr5 108702885 108703127 -43834132 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 213 5 1414 1824 188 49 18 chr5 108703321 108703812 -43833447 + MYSERV-int LTR ERVK 6037 6488 -62 5 1414 1726 142 65 0 chr5 108703815 108704138 -43833121 + RLTR15 LTR ERVK 3 346 -13 5 1414 470 279 182 23 chr5 108706284 108706548 -43830711 + LTR50 LTR ERVL 401 706 -89 5 1414 339 264 16 98 chr5 108707018 108707140 -43830119 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 5 1414 279 330 53 0 chr5 108710579 108710673 -43826586 - MLT1D LTR MaLR -69 436 338 5 1414 459 244 85 16 chr5 108710797 108710926 -43826333 - MLT1D LTR MaLR -365 140 3 5 1414 460 213 45 90 chr5 108711587 108711721 -43825538 + MT2B LTR ERVL 137 264 -337 5 1414 278 220 34 0 chr5 108712072 108712131 -43825128 - RLTR13B1 LTR ERVK -832 61 1 5 1414 3761 138 56 70 chr5 108712544 108713103 -43824156 - RMER6A LTR ERVK 0 756 168 5 1414 3583 26 33 2 chr5 108713103 108713526 -43823733 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1414 3761 138 56 70 chr5 108713526 108713733 -43823526 - RMER6A LTR ERVK -589 167 1 5 1414 1464 142 19 71 chr5 108714490 108714800 -43822459 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 29 5 1414 4205 240 66 39 chr5 108714843 108715670 -43821589 - MYSERV6-int LTR ERVK -6864 2095 1227 5 1414 4205 240 66 39 chr5 108715840 108716355 -43820904 - MYSERV6-int LTR ERVK -7733 1226 716 5 1414 674 206 226 6 chr5 108716460 108716641 -43820618 + RMER21B LTR ERV1 347 567 -275 5 1414 830 228 28 46 chr5 108718879 108719095 -43818164 + MTEa LTR MaLR 168 379 0 6 1414 257 224 0 0 chr5 108722400 108722458 -43814801 + ORR1C1 LTR MaLR 180 237 -141 6 1414 807 198 11 50 chr5 108722718 108722899 -43814360 - ORR1D1 LTR MaLR -200 174 1 6 1414 2177 134 60 15 chr5 108722944 108723346 -43813913 - RMER6B LTR ERVK -7 454 35 6 1414 262 191 0 0 chr5 108729574 108729621 -43807638 - RMER6B LTR ERVK -414 47 1 6 1414 1117 213 270 32 chr5 108730723 108730958 -43806301 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1305 6 1414 1117 213 270 32 chr5 108730988 108731025 -43806234 - RLTR21 LTR ERVK -268 1304 1255 6 1414 1117 213 270 32 chr5 108731063 108731197 -43806062 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1070 6 1414 360 156 13 0 chr5 108731171 108731248 -43806011 - RLTR21 LTR ERVK -610 962 885 6 1414 3338 150 41 7 chr5 108731632 108732215 -43805044 - RLTR21 LTR ERVK -969 603 1 6 1414 279 250 0 84 chr5 108735028 108735111 -43802148 - RMER5 LTR ERV1 -50 484 409 6 1414 306 216 50 75 chr5 108735135 108735255 -43802004 - RMER4B LTR ERVK -16 569 453 6 1414 2523 153 6 32 chr5 108735284 108735750 -43801509 + RMER6B LTR ERVK 1 454 -7 6 1414 285 217 90 60 chr5 108736222 108736389 -43800870 - RMER19C LTR ERVK -143 468 297 6 1414 645 187 216 5 chr5 108736380 108736584 -43800675 - RMER4B LTR ERVK -338 247 1 6 1414 576 216 117 7 chr5 108736706 108736860 -43800399 - MTD LTR MaLR -15 404 234 6 1414 374 267 112 34 chr5 108736899 108737077 -43800182 - RMER5 LTR ERV1 -254 280 89 6 1414 1509 229 74 8 chr5 108737077 108737429 -43799830 + MTD LTR MaLR 14 388 -31 6 1414 1887 153 23 23 chr5 108737435 108737789 -43799470 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 6 1414 236 86 0 0 chr5 108737789 108737824 -43799435 + MTD LTR MaLR 383 417 -2 6 1414 2362 215 47 45 chr5 108737827 108738471 -43798788 + MTD-int LTR MaLR 3 647 -611 6 1414 371 340 64 31 chr5 108738762 108739071 -43798188 + RMER20B LTR ERVK 169 471 -171 6 1414 848 227 202 20 chr5 108739349 108739617 -43797642 + MTD-int LTR MaLR 797 1106 -152 6 1414 848 227 202 20 chr5 108739786 108739908 -43797351 + MTD-int LTR MaLR 1107 1258 0 6 1414 244 28 0 100 chr5 108739940 108739980 -43797279 + MTD LTR MaLR 20 55 -366 6 1414 739 54 45 9 chr5 108739976 108740088 -43797171 + ORR1C1 LTR MaLR 263 378 0 6 1414 485 149 21 11 chr5 108740088 108740179 -43797080 + MTD LTR MaLR 320 411 -8 6 1414 638 292 52 48 chr5 108753185 108753433 -43783826 - ORR1E LTR MaLR -110 249 1 6 1414 735 283 61 5 chr5 108753507 108753720 -43783539 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 184 6 1414 225 284 12 12 chr5 108753797 108753879 -43783380 - MLT1A1 LTR MaLR -278 87 6 6 1414 1506 179 67 55 chr5 108757034 108757395 -43779864 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 10 6 1414 405 261 25 36 chr5 108760249 108760387 -43776872 - RMER20B LTR ERVK -273 354 221 6 1414 1690 105 34 4 chr5 108762945 108763213 -43774046 - ORR1A2 LTR MaLR -51 276 1 6 1414 7230 102 21 3 chr5 108763213 108764347 -43772912 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 809 6 1414 367 227 11 64 chr5 108764390 108764484 -43772775 - MTEb LTR MaLR -12 367 279 6 1414 2306 107 3 0 chr5 108771158 108771484 -43765775 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1414 353 271 146 58 chr5 108783536 108783673 -43753586 + MLT1A1 LTR MaLR 226 408 0 7 1414 506 253 142 7 chr5 108783701 108783856 -43753403 + ORR1D2 LTR MaLR 1 176 -194 7 1414 500 243 58 45 chr5 108783972 108784127 -43753132 + ORR1D2 LTR MaLR 163 319 -40 7 1414 267 177 0 139 chr5 108784190 108784262 -43752997 + ORR1D2 LTR MaLR 309 370 0 7 1414 293 308 120 76 chr5 108784612 108784976 -43752283 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 1 7 1414 832 274 46 30 chr5 108785555 108785792 -43751467 - MER21B LTR ERV1 -49 814 574 7 1414 1452 138 317 3 chr5 108787009 108787299 -43749960 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 1 7 1414 1902 142 38 43 chr5 108787303 108787649 -43749610 + ORR1D1 LTR MaLR 30 373 -1 7 1415 235 297 110 0 chr5 108791704 108791795 -43745464 + RMER15 LTR ERVL 417 517 -58 7 1415 259 258 95 81 chr5 108800490 108800648 -43736611 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 204 7 1415 984 206 28 203 chr5 108805343 108805801 -43731458 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1415 2270 96 14 64 chr5 108809666 108810010 -43727249 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1415 1286 255 65 29 chr5 108810131 108810529 -43726730 + MTE2a LTR MaLR 1 419 0 7 1415 1909 150 34 62 chr5 108810846 108811231 -43726028 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 1415 454 356 52 18 chr5 108820646 108820932 -43716327 - MER65D LTR ERV1 0 473 178 7 1415 319 340 70 12 chr5 108823999 108824240 -43713019 - MER65-int LTR ERV1 -1210 3726 3472 7 1415 270 219 48 24 chr5 108825173 108825257 -43712002 - MER65-int LTR ERV1 -2549 2574 2489 7 1415 303 271 56 6 chr5 108825867 108826027 -43711232 - MER65-int LTR ERV1 -2377 2494 2327 7 1415 506 248 57 11 chr5 108826461 108826653 -43710606 - MER65-int LTR ERV1 -2822 2049 1915 7 1415 249 321 36 36 chr5 108828629 108828739 -43708520 - LTR75_1 LTR ERV1 -224 322 213 7 1415 2008 153 3 3 chr5 108830142 108830451 -43706808 + RLTR10E LTR ERVK 3 311 0 7 1415 1824 137 177 3 chr5 108834331 108834653 -43702606 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1415 3710 158 73 31 chr5 108837375 108838060 -43699199 - RMER6D LTR ERVK -4 716 3 7 1415 871 255 49 5 chr5 108841983 108842188 -43695071 - MER21B LTR ERV1 -77 786 573 8 1415 309 269 86 9 chr5 108842196 108842301 -43694958 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 292 8 1415 764 223 21 98 chr5 108844516 108844592 -43692667 - ORR1D1 LTR MaLR -141 233 167 8 1415 764 250 19 110 chr5 108844639 108844819 -43692440 - ORR1D1 LTR MaLR -204 180 13 8 1415 455 221 48 27 chr5 108845242 108845428 -43691831 - RMER17C LTR ERVK -136 274 85 8 1415 840 166 421 34 chr5 108861523 108861823 -43675436 - MTD LTR MaLR -2 417 2 8 1415 251 198 0 129 chr5 108867976 108868069 -43669190 - MT2B LTR ERVL -354 247 167 8 1415 270 311 64 24 chr5 108882955 108883080 -43654179 - LTR40a LTR ERVL -4 515 386 8 1415 769 144 133 32 chr5 108884690 108884848 -43652411 + MT2A LTR ERVL 360 533 0 8 1415 1855 142 7 7 chr5 108885625 108885916 -43651343 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 39 8 1415 1072 209 177 128 chr5 108902354 108902777 -43634482 - MT2A LTR ERVL -89 444 1 9 1415 1385 223 113 16 chr5 108906237 108906619 -43630640 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1415 341 215 41 123 chr5 108913830 108913847 -43623412 + MT2B LTR ERVL 152 158 -443 9 1415 1389 238 104 6 chr5 108918628 108918992 -43618267 - MTD LTR MaLR -14 405 6 9 1415 2806 259 39 84 chr5 108919002 108920062 -43617197 - MTD-int LTR MaLR -4 1254 243 9 176 3588 8 5 0 chr5 108920669 108921063 -43616196 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1416 9485 25 5 0 chr5 108921063 108922156 -43615103 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 9 1416 3588 8 5 0 chr5 108922156 108922550 -43614709 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1416 259 207 121 44 chr5 108923588 108923679 -43613580 - RLTR11B LTR ERVK -72 381 284 9 1416 725 270 0 113 chr5 108923752 108924044 -43613215 - RLTR11B LTR ERVK -188 265 7 9 1416 227 372 23 0 chr5 108926442 108926528 -43610731 + MLT1A0 LTR MaLR 20 107 -258 9 1416 1914 156 83 30 chr5 108934703 108935175 -43602084 - RMER4B LTR ERVK 0 466 17 9 1416 385 242 20 135 chr5 108935823 108935859 -43601400 - MT2B LTR ERVL -449 152 134 9 1416 1071 137 84 64 chr5 108945927 108946130 -43591129 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 207 -377 9 1416 1107 125 79 42 chr5 108946596 108946866 -43590393 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 193 584 0 9 1416 2059 141 11 86 chr5 108950383 108950825 -43586434 + RMER17C LTR ERVK 1 409 -1 9 1416 377 229 74 61 chr5 108961785 108961948 -43575311 + RLTR15 LTR ERVK 179 343 -16 9 1416 1655 210 54 6 chr5 108965592 108965941 -43571318 + ORR1D1 LTR MaLR 5 370 -4 9 1416 1725 230 62 35 chr5 108970296 108970702 -43566557 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 1 1416 965 246 138 24 chr5 108982016 108982399 -43554860 + RLTR28B LTR ERVL 1 427 -54 1 1416 244 287 42 21 chr5 108986473 108986552 -43550707 - MT2B LTR ERVL -333 268 188 1 1416 2134 143 61 8 chr5 108986552 108986911 -43550348 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1416 244 287 42 21 chr5 108986911 108986927 -43550332 - MT2B LTR ERVL -414 187 172 1 1416 1980 92 195 8 chr5 108988745 108989079 -43548180 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 1416 316 294 25 119 chr5 108999775 108999878 -43537381 + MT2B2 LTR ERVL 76 159 -425 1 1416 813 262 35 116 chr5 109001526 109001613 -43535646 + MTE2a LTR MaLR 1 88 -291 1 1416 813 264 35 110 chr5 109001714 109001921 -43535338 + MTE2a LTR MaLR 89 262 -117 1 1416 230 328 133 55 chr5 109018613 109018884 -43518375 - MLT1A LTR MaLR 0 374 83 3 1416 580 204 0 129 chr5 109030543 109030729 -43506530 + MT2A LTR ERVL 365 526 -7 5 1416 269 217 22 67 chr5 109031371 109031386 -43505873 + MTD LTR MaLR 10 20 -387 5 1416 976 235 64 22 chr5 109031412 109031719 -43505540 + MTD LTR MaLR 20 419 0 5 1416 500 312 135 12 chr5 109037122 109037381 -43499878 + MER21B LTR ERV1 149 439 -424 6 1416 577 315 66 71 chr5 109037505 109037871 -43499388 + MER21B LTR ERV1 473 836 -27 6 1416 237 276 54 54 chr5 109040815 109040907 -43496352 - MLT1A LTR MaLR -212 162 71 6 1416 1778 165 58 78 chr5 109044294 109044676 -43492583 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1416 1602 194 144 5 chr5 109048256 109048624 -43488635 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1417 266 347 73 85 chr5 109062545 109062668 -43474591 + MT2B2 LTR ERVL 31 268 -311 1 1417 462 226 0 11 chr5 109064069 109064163 -43473096 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 290 1 1417 3323 146 90 34 chr5 109090722 109091366 -43445893 - RMER6A LTR ERVK -76 680 1 1 1417 287 157 67 78 chr5 109091456 109091480 -43445779 - RLTR25B LTR ERVK -499 529 510 1 1417 287 157 67 78 chr5 109091545 109091610 -43445649 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 441 1 1417 415 260 15 82 chr5 109091547 109091681 -43445578 - MT2B LTR ERVL -344 257 133 1 1417 308 281 183 46 chr5 109092235 109092388 -43444871 - MER74A LTR ERVL -384 174 1 1 1417 3642 14 16 2 chr5 109092421 109092846 -43444413 + MT2_Mm LTR ERVL 1 431 -62 1 1417 482 302 42 120 chr5 109092957 109093062 -43444197 + RLTR12B LTR ERVK 9 104 -424 1 1417 482 297 56 92 chr5 109093259 109093586 -43443673 + RLTR12B LTR ERVK 47 292 -236 1 1417 373 263 73 29 chr5 109094207 109094344 -43442915 - MLT1D LTR MaLR -290 215 73 1 1417 1460 178 183 31 chr5 109094922 109094940 -43442319 + MTD LTR MaLR 3 19 -400 1 1417 1460 178 183 31 chr5 109094963 109095304 -43441955 + MTD LTR MaLR 20 417 -2 1 1417 802 305 93 22 chr5 109112843 109112879 -43424380 - MTE-int LTR MaLR -145 1435 1400 1 1417 802 305 93 22 chr5 109112912 109113187 -43424072 - MTE-int LTR MaLR -181 1399 1102 1 1417 1405 214 130 25 chr5 109113191 109113559 -43423700 - MTC LTR MaLR -8 413 7 1 1417 438 326 60 65 chr5 109113555 109113755 -43423504 - MTE-int LTR MaLR -615 965 767 1 1417 345 352 15 15 chr5 109113826 109113956 -43423303 - ORR1E LTR MaLR -177 182 53 1 1417 252 327 92 29 chr5 109114433 109114606 -43422653 - ERVL-E-int LTR ERVL -2813 2854 2671 1 1417 2825 30 0 0 chr5 109115395 109115727 -43421532 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 1 1417 1324 199 4 0 chr5 109115901 109116142 -43421117 - MTD LTR MaLR -171 248 7 1 1417 605 286 79 47 chr5 109116918 109117259 -43420000 + RMER10A LTR ERVL 73 424 -18 1 1417 1416 246 45 11 chr5 109117270 109117628 -43419631 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1417 1684 238 57 121 chr5 109117628 109117812 -43419447 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 1178 1 1417 1684 238 57 121 chr5 109117837 109118012 -43419247 - ORR1D2-int LTR MaLR -193 1177 1045 1 1417 1684 238 57 121 chr5 109118160 109118396 -43418863 - ORR1D2-int LTR MaLR -326 1044 812 1 1417 289 274 42 25 chr5 109163513 109163633 -43373626 + MYSERV-int LTR ERVK 4682 4803 -1747 2 1417 3323 28 2 0 chr5 109164203 109164598 -43372661 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1417 9149 24 2 0 chr5 109164598 109165694 -43371565 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1417 3323 28 2 0 chr5 109165694 109166089 -43371170 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1417 2955 126 52 0 chr5 109168200 109168684 -43368575 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 16 2 1417 274 272 31 52 chr5 109169132 109169229 -43368030 + RMER10B LTR ERVL 263 357 -41 2 1417 1350 221 95 55 chr5 109171517 109171994 -43365265 + RMER4B LTR ERVK 17 560 -25 2 1417 545 318 63 5 chr5 109172860 109173050 -43364209 - MER54B LTR ERVL -109 684 484 2 1417 2743 82 99 47 chr5 109174137 109174560 -43362699 + BGLII_A LTR ERVK 1 445 0 2 1417 656 344 64 8 chr5 109177450 109177699 -43359560 + MER54A LTR ERVL 132 394 -507 2 1417 1221 242 127 15 chr5 109182473 109182812 -43354447 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 2 177 5252 247 123 32 chr5 109182814 109184260 -43352999 + MTE2b-int LTR MaLR 1 1578 -2 2 1418 1487 255 27 12 chr5 109184263 109184597 -43352662 + MTE2b LTR MaLR 2 340 -39 2 1418 430 72 27 55 chr5 109190117 109190190 -43347069 + ORR1B1-int LTR MaLR 125 195 -1314 2 1418 1028 143 120 0 chr5 109192371 109192546 -43344713 + ORR1B1 LTR MaLR 5 200 -194 2 1418 1262 163 14 1 chr5 109192848 109193090 -43344169 + ORR1B1 LTR MaLR 119 394 0 2 1418 1629 223 58 6 chr5 109193446 109193775 -43343484 + MT2A LTR ERVL 81 426 -107 2 1418 2106 159 71 5 chr5 109197330 109197708 -43339551 - MTC LTR MaLR -18 403 1 2 1418 1858 141 130 59 chr5 109205121 109205476 -43331783 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 2 1418 576 212 40 27 chr5 109205857 109206007 -43331252 - RMER10B LTR ERVL -53 345 194 2 1418 368 197 146 49 chr5 109213330 109213474 -43323785 + RLTR15 LTR ERVK 4 161 -198 3 1418 390 307 20 0 chr5 109214084 109214185 -43323074 + MTD LTR MaLR 18 120 -299 3 1418 4489 140 96 17 chr5 109216803 109217616 -43319643 + RMER12 LTR ERVK 1 877 -445 3 1418 497 207 24 32 chr5 109217769 109217894 -43319365 + RMER12 LTR ERVK 1199 1322 0 3 1418 243 301 14 14 chr5 109220188 109220262 -43316997 + LTR16A1 LTR ERVL 372 445 -11 3 1418 578 257 127 33 chr5 109225850 109226063 -43311196 - MTD LTR MaLR -15 404 172 3 1418 344 261 83 21 chr5 109232968 109233110 -43304149 + RLTR9E LTR ERVK 164 397 -12 3 1418 614 291 15 15 chr5 109233381 109233583 -43303676 + ETnERV-int LTR ERVK 350 551 -2763 3 1418 4109 174 117 87 chr5 109233778 109234574 -43302685 + RMER16-int LTR ERVK 240 1079 -4327 3 1418 4109 174 117 87 chr5 109235610 109235824 -43301435 + RMER16-int LTR ERVK 1080 1316 -4090 3 1418 1555 204 19 9 chr5 109246481 109246802 -43290457 - MERVL_2A-int LTR ERVL -275 5486 5163 3 1418 5649 195 41 11 chr5 109246811 109247997 -43289262 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1338 4423 3202 3 1418 1325 246 71 117 chr5 109249342 109250137 -43287122 + RMER12 LTR ERVK 1 782 -1066 3 1418 523 305 96 46 chr5 109271600 109271861 -43265398 - MTD LTR MaLR -15 404 131 3 1418 314 266 118 10 chr5 109278772 109278908 -43258351 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 164 397 -12 3 1418 447 303 35 15 chr5 109279180 109279378 -43257881 + ETnERV-int LTR ERVK 350 551 -2763 3 1418 4053 171 72 22 chr5 109279584 109280578 -43256681 + RMER16-int LTR ERVK 192 1165 -4972 3 1418 904 314 88 6 chr5 109301631 109301996 -43235263 - MTD LTR MaLR -15 404 10 3 1418 3412 37 0 128 chr5 109312154 109312654 -43224605 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 1418 7300 31 2 52 chr5 109312654 109313639 -43223620 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 3 177 8400 31 2 0 chr5 109313625 109314644 -43222615 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 4790 3 1419 1623 55 0 0 chr5 109314637 109314857 -43222402 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3838 3743 3524 3 1419 1853 18 0 4 chr5 109314845 109315072 -43222187 - RLTR10-int LTR ERVK -1110 877 652 4 1419 339 67 0 0 chr5 109315075 109315120 -43222139 - RLTR10-int LTR ERVK -6405 137 93 4 1419 402 0 0 0 chr5 109315292 109315338 -43221921 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7314 267 222 4 1419 245 191 0 0 chr5 109315338 109315380 -43221879 - RLTR27 LTR ERVK -37 272 231 4 1419 1392 50 0 0 chr5 109315380 109315560 -43221699 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7401 180 1 4 1419 3467 28 2 128 chr5 109315560 109316059 -43221200 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 1419 376 290 37 30 chr5 109321942 109322077 -43215182 + RLTR9A LTR ERVK 231 366 -2 4 1419 2986 39 21 3 chr5 109322242 109322626 -43214633 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 6 4 1419 2253 169 69 36 chr5 109324326 109324848 -43212411 - RLTR13D6 LTR ERVK -19 883 345 4 1419 368 222 0 40 chr5 109333639 109333714 -43203545 + RLTR17 LTR ERVK 562 633 -59 4 1419 4221 89 7 2 chr5 109341272 109341849 -43195410 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 314 4 1419 2572 82 0 14 chr5 109346157 109346504 -43190755 + ORR1A1 LTR MaLR 1 342 -4 4 1419 1842 213 10 23 chr5 109349804 109350193 -43187066 + RMER12 LTR ERVK 506 889 -433 4 1419 711 196 18 167 chr5 109350463 109350684 -43186575 + RMER12 LTR ERVK 1135 1322 0 4 1419 235 227 71 107 chr5 109350684 109350753 -43186506 + MT2B2 LTR ERVL 241 306 -278 4 1419 3102 135 68 84 chr5 109352685 109353132 -43184127 - RMER17A LTR ERVK -15 736 337 4 1419 3102 144 77 78 chr5 109353225 109353538 -43183721 - RMER17A LTR ERVK -415 336 1 4 1419 1920 34 291 0 chr5 109353786 109354054 -43183205 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1419 13228 59 29 11 chr5 109354054 109355815 -43181444 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 4 1419 2935 38 3 0 chr5 109355815 109356160 -43181099 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1419 255 274 48 0 chr5 109356308 109356370 -43180889 + LTR16C LTR ERVL 409 473 -16 4 1419 950 327 67 3 chr5 109370697 109371068 -43166191 - MTD LTR MaLR -15 404 10 4 1419 6672 57 9 6 chr5 109371815 109372667 -43164592 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 4 1419 844 199 108 16 chr5 109378204 109378398 -43158861 - RMER13A LTR ERVK -648 212 1 4 1419 1734 181 58 8 chr5 109378403 109378781 -43158478 - MERVL_2A-int LTR ERVL -202 5559 5163 4 1419 5236 203 34 11 chr5 109378789 109379984 -43157275 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1337 4424 3202 4 1419 1291 256 74 113 chr5 109381324 109382097 -43155162 + RMER12 LTR ERVK 1 769 -1079 4 1419 4114 97 44 9 chr5 109383342 109384135 -43153124 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 855 1 4 1419 1967 130 138 28 chr5 109384525 109384953 -43152306 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 1419 1988 230 17 2 chr5 109394585 109394994 -43142265 + RLTR17 LTR ERVK 219 633 -59 4 1419 280 345 56 23 chr5 109395293 109395599 -43141660 + RMER16-int LTR ERVK 4324 4639 -767 4 1419 3929 195 93 18 chr5 109396149 109397083 -43140176 + RLTR19-int LTR ERVK 3399 4402 -1735 4 1419 280 237 73 44 chr5 109397769 109397906 -43139353 + RLTR19-int LTR ERVK 5241 5381 -25 4 1419 4633 72 2 2 chr5 109399458 109400045 -43137214 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 4 1419 4560 106 10 155 chr5 109406022 109406343 -43130916 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 514 4 1419 4560 106 10 155 chr5 109406551 109407201 -43130058 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1335 513 2 4 1419 2373 81 27 12 chr5 109408434 109408770 -43128489 + ORR1A1 LTR MaLR 1 341 -5 4 1419 1816 212 30 0 chr5 109412071 109412334 -43124925 + RMER12 LTR ERVK 506 777 -545 4 1419 1816 212 30 0 chr5 109412395 109412504 -43124755 + RMER12 LTR ERVK 778 888 -434 4 1419 699 207 198 56 chr5 109416454 109416812 -43120447 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 1419 473 80 25 74 chr5 109416814 109416895 -43120364 - ETnERV2-int LTR ERVK -3 7403 7327 4 1419 712 203 307 47 chr5 109416899 109417199 -43120060 - RLTR13D6 LTR ERVK -371 531 154 4 1419 6634 136 10 8 chr5 109417199 109418182 -43119077 - ETnERV2-int LTR ERVK -200 7206 6222 4 1419 4678 201 66 59 chr5 109418231 109420884 -43116375 - ETnERV2-int LTR ERVK -3321 4085 1565 4 1419 6169 120 12 99 chr5 109420907 109421645 -43115614 - ETnERV2-int LTR ERVK -3714 1130 444 4 1419 6169 120 12 99 chr5 109421832 109422330 -43114929 - ETnERV2-int LTR ERVK -4401 443 2 4 1419 805 207 184 36 chr5 109422334 109422670 -43114589 - RLTR9E LTR ERVK -18 391 6 4 1419 813 301 93 23 chr5 109424010 109424353 -43112906 - MTD LTR MaLR -8 411 45 4 1419 570 268 47 16 chr5 109429632 109429761 -43107498 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 5 1419 413 283 92 28 chr5 109433127 109433269 -43103990 + RLTR9E LTR ERVK 256 406 -3 5 1419 2273 227 31 4 chr5 109440253 109440736 -43096523 + RLTR17 LTR ERVK 197 692 0 5 1419 1423 218 57 64 chr5 109440736 109441298 -43095961 + RMER3D-int LTR ERVK 1 935 -1907 5 1419 2066 108 30 18 chr5 109441310 109441640 -43095619 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 690 5 1419 4163 88 19 3 chr5 109442536 109443116 -43094143 - RLTR13D5 LTR ERVK -317 706 118 5 1420 3409 169 29 8 chr5 109448338 109448965 -43088294 - RMER12 LTR ERVK -682 640 1 5 1420 225 281 94 0 chr5 109449822 109449886 -43087373 - MTC LTR MaLR -338 83 14 5 1420 835 268 126 9 chr5 109450288 109450605 -43086654 - MTD LTR MaLR -53 366 13 5 1420 4890 179 80 60 chr5 109451915 109452673 -43084586 + ETnERV3-int LTR ERVK 3572 5049 -759 5 1420 4890 179 78 63 chr5 109453175 109453870 -43083389 + ETnERV3-int LTR ERVK 5050 5779 -29 5 1420 4942 57 16 31 chr5 109453881 109454555 -43082704 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 664 -144 5 1420 228 183 46 77 chr5 109459106 109459171 -43078088 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 5 1420 587 164 73 0 chr5 109460839 109460949 -43076310 + RLTR13C2 LTR ERVK 691 808 0 5 1420 257 301 14 14 chr5 109462385 109462459 -43074800 + LTR16A1 LTR ERVL 372 445 -11 5 1420 966 315 66 3 chr5 109474347 109474680 -43062579 - MTD LTR MaLR -15 404 51 5 1420 691 196 14 21 chr5 109474680 109474821 -43062438 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 5 1420 442 286 68 52 chr5 109474865 109475057 -43062202 + RLTR46 LTR ERVK 126 320 0 5 1420 244 108 0 0 chr5 109478788 109478825 -43058434 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 37 -300 5 1420 9940 19 4 0 chr5 109478825 109480006 -43057253 + IAPEz-int LTR ERVK 5296 6481 0 5 1420 2444 98 59 59 chr5 109480006 109480481 -43056778 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1420 344 229 34 115 chr5 109484612 109484760 -43052499 + RLTR9A2 LTR ERVK 243 378 -5 5 1420 482 342 0 0 chr5 109485030 109485232 -43052027 + ETnERV-int LTR ERVK 350 551 -2763 5 1420 4705 169 71 28 chr5 109485438 109486471 -43050788 + RMER16-int LTR ERVK 240 1316 -4090 5 1420 2694 89 168 14 chr5 109489574 109490009 -43047250 + RLTR44C LTR ERVK 1 502 0 5 1420 1296 182 9 0 chr5 109492632 109492852 -43044407 + RMER12 LTR ERVK 6 227 -1095 5 1420 667 181 135 23 chr5 109492886 109493107 -43044152 + RMER12 LTR ERVK 1130 1322 0 5 1420 231 188 42 0 chr5 109493107 109493150 -43044109 + MT2B2 LTR ERVL 152 196 -388 5 1420 4466 10 0 0 chr5 109493611 109494104 -43043155 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1420 45634 16 0 0 chr5 109494104 109499462 -43037797 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 5 1420 369 191 46 35 chr5 109499462 109499549 -43037710 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 5 1420 257 216 95 95 chr5 109499531 109499587 -43037672 + ORR1A3-int LTR MaLR 558 613 -1350 5 1420 3546 12 0 0 chr5 109499587 109500000 -43037259 + MT2_Mm LTR ERVL 1 413 -80 5 1420 684 0 0 0 chr5 109500000 109500080 -43037179 + MT2_Mm LTR ERVL 414 493 0 1 1420 267 312 13 13 chr5 109501858 109501936 -43035323 + LTR16C LTR ERVL 409 486 -3 4 1420 507 268 47 8 chr5 109510794 109510922 -43026337 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 7 1420 945 308 87 3 chr5 109514289 109514621 -43022638 - MTD LTR MaLR -15 404 45 1 1420 394 293 36 29 chr5 109522624 109522761 -43014498 + RLTR9A LTR ERVK 231 368 0 2 1420 3160 41 21 0 chr5 109522924 109523312 -43013947 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1420 5612 114 24 6 chr5 109525219 109526086 -43011173 - RLTR13D6 LTR ERVK -19 883 1 2 1420 2050 231 34 17 chr5 109531860 109532332 -43004927 + RLTR17 LTR ERVK 167 646 -46 3 1420 2375 229 25 8 chr5 109532943 109533538 -43003721 + RLTR19-int LTR ERVK 3799 4403 -1734 3 1420 261 309 0 0 chr5 109533833 109533930 -43003329 + RLTR19-int LTR ERVK 4444 4540 -866 3 1420 1850 95 40 7 chr5 109534298 109534574 -43002685 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 81 3 1420 36514 60 14 0 chr5 109534574 109539340 -42997919 - MMERVK10C-int LTR ERVK -865 6716 1885 3 1420 373 198 123 0 chr5 109539331 109539412 -42997847 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5109 1028 938 3 1420 298 242 118 29 chr5 109539412 109539548 -42997711 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5466 671 524 3 1420 1012 147 55 44 chr5 109539567 109539805 -42997454 - RMER16-int LTR ERVK -4881 525 312 4 1420 923 182 10 0 chr5 109539897 109540100 -42997159 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 748 4 1420 708 91 0 0 chr5 109540104 109540203 -42997056 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7261 320 222 4 1420 228 255 0 19 chr5 109540203 109540255 -42997004 - RLTR27 LTR ERVK -37 272 222 4 1420 650 76 11 0 chr5 109540255 109540347 -42996912 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7488 93 1 4 1420 2196 74 28 175 chr5 109540347 109540775 -42996484 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 4 1420 2348 42 87 0 chr5 109541449 109541761 -42995498 + ORR1A1 LTR MaLR 8 346 0 4 1420 4990 76 4 1 chr5 109542848 109543523 -42993736 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1131 677 1 4 1420 4948 165 24 7 chr5 109546145 109547019 -42990240 + RMER12 LTR ERVK 1 889 -433 5 1420 274 278 0 14 chr5 109547101 109547174 -42990085 + RMER12 LTR ERVK 1185 1256 -66 5 1420 477 145 265 8 chr5 109547148 109547280 -42989979 + RMER12 LTR ERVK 1128 1293 -29 5 1420 257 200 117 0 chr5 109547293 109547353 -42989906 + MT2B2 LTR ERVL 221 287 -297 5 1420 2188 246 31 23 chr5 109558535 109559050 -42978209 + RLTR17 LTR ERVK 172 690 -2 6 1420 669 209 97 46 chr5 109559056 109559252 -42978007 + RMER3D-int LTR ERVK 1 206 -2636 6 1420 4327 82 17 1 chr5 109559529 109560128 -42977131 - RLTR13D5 LTR ERVK -249 784 118 6 1420 3466 169 29 6 chr5 109563306 109563932 -42973327 - RMER12 LTR ERVK -682 640 1 7 1420 820 277 126 9 chr5 109565275 109565592 -42971667 - MTD LTR MaLR -53 366 13 7 1420 4399 160 52 27 chr5 109566725 109568167 -42969092 + ETnERV3-int LTR ERVK 3572 5780 -28 8 1420 3803 44 4 82 chr5 109568178 109568727 -42968532 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 506 -302 8 1421 4120 89 22 48 chr5 109582517 109583120 -42954139 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 9 1421 1033 299 77 6 chr5 109584500 109584850 -42952409 - MTD LTR MaLR -17 402 28 9 1421 613 279 68 10 chr5 109588069 109588275 -42948984 + RLTR45 LTR ERVK 265 482 0 9 1421 1420 269 36 17 chr5 109588276 109588799 -42948460 + RLTR45-int LTR ERVK 2 534 -6710 9 1421 622 194 0 0 chr5 109595971 109596095 -42941164 + RLTR45-int LTR ERVK 569 692 -6552 9 1421 463 238 57 0 chr5 109596453 109596575 -42940684 + RLTR45-int LTR ERVK 693 821 -6423 9 1421 307 242 0 118 chr5 109596785 109596921 -42940338 + RLTR45-int LTR ERVK 912 1031 -6213 9 1421 3026 320 55 43 chr5 109597255 109600256 -42937003 + RNERVK23-int LTR ERVK 2671 5707 -2510 9 1421 312 261 24 31 chr5 109604794 109604903 -42932356 + RLTR9A2 LTR ERVK 243 407 -30 1 1421 3208 55 0 2 chr5 109626055 109626452 -42910807 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1421 2086 239 5 5 chr5 109627917 109628359 -42908900 + RLTR17 LTR ERVK 192 633 -59 1 1421 3667 208 92 23 chr5 109629777 109630726 -42906533 + RLTR19-int LTR ERVK 3397 4410 -1727 1 1421 292 309 0 0 chr5 109631012 109631109 -42906150 + RLTR19-int LTR ERVK 4444 4540 -866 1 1421 322 231 71 43 chr5 109631396 109631536 -42905723 + RLTR19-int LTR ERVK 5234 5377 -29 1 1421 2641 48 36 0 chr5 109632143 109632477 -42904782 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1421 1381 91 64 37 chr5 109633109 109633327 -42903932 + IAPEY3-int LTR ERVK 7120 7343 -337 1 1421 1350 202 61 18 chr5 109633339 109633681 -42903578 + RLTR19-int LTR ERVK 6125 6481 0 1 1421 1097 204 122 36 chr5 109633681 109633983 -42903276 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 388 -2 1 1421 1334 65 6 0 chr5 109633985 109634153 -42903106 + RLTR19-int LTR ERVK 1 169 -7412 1 1421 237 327 0 0 chr5 109634154 109634209 -42903050 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 1 1421 489 371 24 12 chr5 109643522 109643770 -42893489 - MTD LTR MaLR -124 295 45 1 1421 404 345 0 0 chr5 109644198 109644317 -42892942 - MTD LTR MaLR -252 167 49 1 1421 318 273 82 54 chr5 109651095 109651242 -42886017 + RLTR9E LTR ERVK 256 406 -3 1 1421 705 211 38 46 chr5 109656235 109656513 -42880746 + RMER3D-int LTR ERVK 210 477 -2365 1 1421 519 164 51 17 chr5 109656636 109656754 -42880505 + RMER3D-int LTR ERVK 489 610 -2232 1 1421 6022 213 58 60 chr5 109656770 109658610 -42878649 + RMER3D-int LTR ERVK 485 2842 0 1 1421 1980 173 28 6 chr5 109658610 109658970 -42878289 + RLTR17 LTR ERVK 1 368 -324 1 1421 2152 126 133 0 chr5 109660204 109660601 -42876658 - RLTR47_MM LTR ERV1 -82 450 1 1 1421 353 312 29 38 chr5 109660745 109660955 -42876304 - MURVY-int LTR ERV1 -109 7343 7136 1 1421 2035 138 12 168 chr5 109661552 109662039 -42875220 - RLTR9F LTR ERVK -4 411 1 1 1421 4474 112 94 7 chr5 109663298 109664042 -42873217 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 1 1421 3146 117 40 6 chr5 109669497 109669994 -42867265 - RMER17B LTR ERVK -369 589 76 1 1421 4226 168 57 19 chr5 109672942 109673803 -42863456 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 856 -46 1 1421 5231 116 17 42 chr5 109683089 109683990 -42853269 + RLTR13A3 LTR ERVK 1 978 0 1 1421 2595 79 3 8 chr5 109684456 109684812 -42852447 + MTA_Mm LTR MaLR 1 354 -42 1 1421 475 35 0 0 chr5 109684999 109685056 -42852203 + MTA_Mm LTR MaLR 344 400 0 1 1421 702 139 57 8 chr5 109687710 109687833 -42849426 + RMER16-int LTR ERVK 3849 3977 -1429 1 1421 1624 261 56 43 chr5 109688074 109688722 -42848537 + RMER16-int LTR ERVK 3980 4635 -771 1 1421 4232 181 89 21 chr5 109689277 109690219 -42847040 + RLTR19-int LTR ERVK 3397 4402 -1735 1 1422 528 367 81 9 chr5 109714754 109715076 -42822183 - MTD LTR MaLR -30 389 45 1 1422 389 244 80 73 chr5 109723994 109724131 -42813128 + RLTR9A LTR ERVK 231 368 0 2 1422 3465 23 2 0 chr5 109732585 109732980 -42804279 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1422 371 359 46 59 chr5 109738166 109738403 -42798856 + RLTR25A LTR ERVK 1 234 -869 2 1422 1963 155 3 3 chr5 109740408 109740719 -42796540 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 2 1422 3370 50 72 5 chr5 109757172 109757446 -42779813 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 304 -171 2 1422 3370 50 72 5 chr5 109757495 109757665 -42779594 + MT2C_Mm LTR ERVL 305 475 0 2 1422 12802 65 31 22 chr5 109760686 109761985 -42775274 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 1307 -501 2 1422 12802 65 31 22 chr5 109762017 109762508 -42774751 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1308 1808 0 2 1422 1387 198 58 18 chr5 109763193 109763522 -42773737 + ORR1A1 LTR MaLR 3 344 -2 2 1422 1903 145 81 0 chr5 109763524 109763744 -42773515 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 238 -1725 2 1422 1903 145 81 0 chr5 109763813 109763924 -42773335 + ORR1A1-int LTR MaLR 239 358 -1605 2 1422 1831 60 22 8 chr5 109764257 109764524 -42772735 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 562 2 1422 5256 82 11 1 chr5 109765788 109766513 -42770746 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1076 732 1 2 1422 1317 219 74 53 chr5 109766513 109766893 -42770366 + ORR1A1-int LTR MaLR 357 744 -1219 2 1422 1106 203 51 64 chr5 109766750 109767083 -42770176 + MT2B LTR ERVL 24 287 -314 2 1422 4272 157 26 1 chr5 109767092 109767830 -42769429 + ORR1A1-int LTR MaLR 851 1606 -357 2 1422 753 286 219 12 chr5 109793667 109793992 -42743267 + MTD LTR MaLR 19 406 -13 2 1422 292 356 114 53 chr5 109796394 109796658 -42740601 - RMER13A LTR ERVK -37 823 544 2 1422 800 271 106 70 chr5 109796771 109797112 -42740147 - RMER13A LTR ERVK -505 355 3 2 1422 1365 227 58 3 chr5 109797431 109797775 -42739484 - MERVL-int LTR ERVL -255 5506 5144 2 1422 1988 240 112 28 chr5 109797768 109798350 -42738909 - MERVL-int LTR ERVL -956 4529 3899 2 1422 934 232 201 4 chr5 109798487 109798760 -42738499 + MTD LTR MaLR 93 419 0 2 1422 1108 243 45 5 chr5 109809766 109809989 -42727270 - ETnERV2-int LTR ERVK -210 7196 6965 2 1422 898 158 123 0 chr5 109822375 109822546 -42714713 - ORR1A2 LTR MaLR -135 192 1 2 1422 1704 169 7 0 chr5 109824305 109824578 -42712681 + ORR1A3 LTR MaLR 1 275 -51 2 1422 1469 191 30 65 chr5 109827384 109827720 -42709539 + ORR1A3 LTR MaLR 3 326 0 2 1422 6238 175 86 89 chr5 109827720 109827945 -42709314 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 242 -1721 2 1422 6238 175 86 89 chr5 109827968 109829343 -42707916 + ORR1A3-int LTR MaLR 243 1596 -367 2 1422 296 251 112 69 chr5 109835765 109835929 -42701330 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 983 2 1423 2928 21 2 173 chr5 109838729 109839197 -42698062 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 3 1423 1442 129 4 13 chr5 109843781 109844009 -42693250 - RLTR13B1 LTR ERVK -667 226 1 3 1423 405 156 15 131 chr5 109849569 109849775 -42687484 + RMER17C LTR ERVK 91 272 -138 3 1423 1818 152 9 58 chr5 109853801 109854143 -42683116 + ORR1A3 LTR MaLR 2 326 0 3 1423 7028 170 65 75 chr5 109854143 109855765 -42681494 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 1606 -357 3 1423 558 235 17 69 chr5 109861130 109861304 -42675955 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 478 3 1423 981 310 76 6 chr5 109882592 109882946 -42654313 + MTD LTR MaLR 28 406 -13 3 1423 1848 245 32 9 chr5 109884763 109885229 -42652030 - MERVL_2A-int LTR ERVL -120 5641 5165 3 1423 1667 196 11 46 chr5 109885247 109885594 -42651665 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1134 4627 4293 3 1423 473 235 25 0 chr5 109885677 109885796 -42651463 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1599 4162 4041 3 1423 330 310 221 14 chr5 109885799 109886025 -42651234 + MTD LTR MaLR 118 421 0 3 1423 508 228 99 45 chr5 109891029 109891231 -42646028 + RMER3D-int LTR ERVK 630 842 -2000 3 1423 395 205 22 36 chr5 109891264 109891401 -42645858 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1148 -1694 3 1423 297 154 31 71 chr5 109891412 109891510 -42645749 + RMER3D-int LTR ERVK 680 773 -2069 3 1423 496 189 36 9 chr5 109891558 109891670 -42645589 + RMER3D-int LTR ERVK 490 604 -2238 3 1423 346 102 0 0 chr5 109891710 109891759 -42645500 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 490 538 -2304 3 1423 1849 212 113 8 chr5 109891758 109892396 -42644863 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1602 2304 -22 3 1423 1849 212 113 8 chr5 109892426 109892443 -42644816 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2305 2325 -1 3 1423 1791 227 39 84 chr5 109892443 109892981 -42644278 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 514 -70 3 1423 568 281 56 56 chr5 109895035 109895143 -42642116 + MT2A LTR ERVL 107 218 -315 3 1423 568 249 29 29 chr5 109895169 109895333 -42641926 + MT2A LTR ERVL 219 426 -107 3 1423 225 174 109 0 chr5 109897177 109897223 -42640036 - LTR86C LTR ERVL -235 386 336 3 1423 667 137 153 61 chr5 109897811 109897974 -42639285 - RMER4A LTR ERVK -8 458 281 3 1423 1891 140 17 0 chr5 109897974 109898267 -42638992 + ORR1A2 LTR MaLR 30 327 0 3 1423 3709 142 66 15 chr5 109899852 109900569 -42636690 + RMER6A LTR ERVK 1 753 -3 3 1423 1820 273 92 35 chr5 109901342 109902002 -42635257 + ORR1E-int LTR MaLR 666 1363 -7 3 1423 450 323 68 14 chr5 109903577 109903797 -42633462 + ORR1E LTR MaLR 24 255 -104 3 1423 2253 82 32 3 chr5 109903821 109904134 -42633125 + RMER17A LTR ERVK 1 417 -334 3 1423 2253 139 21 8 chr5 109904256 109904586 -42632673 + RMER17A LTR ERVK 418 750 -1 3 1423 1153 126 324 16 chr5 109908391 109908641 -42628618 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 3 1423 227 395 0 0 chr5 109909608 109909684 -42627575 - RLTR33 LTR ERVK -85 593 518 3 1423 1394 258 35 78 chr5 109911896 109912321 -42624938 - MTD LTR MaLR 0 419 13 3 1423 257 211 104 13 chr5 109912471 109912548 -42624711 + LTR48 LTR ERV1 702 785 -2 3 1423 313 325 83 47 chr5 109917336 109917598 -42619661 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 104 4 1423 2112 142 60 11 chr5 109919692 109920042 -42617217 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 1423 1229 231 24 71 chr5 109920415 109920797 -42616462 - RLTR9A LTR ERVK -2 366 3 4 1423 3386 28 5 2 chr5 109920990 109921385 -42615874 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1423 508 319 58 51 chr5 109923101 109923375 -42613884 + MLT1A0 LTR MaLR 1 276 -89 4 1423 3183 102 133 24 chr5 109925798 109926309 -42610950 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 4 1423 495 196 52 8 chr5 109928021 109928155 -42609104 + RLTR19-int LTR ERVK 1197 1336 -4801 4 1423 1885 198 54 76 chr5 109928157 109928738 -42608521 + RLTR19-int LTR ERVK 2461 3007 -3130 4 1423 261 179 0 0 chr5 109929205 109929261 -42607998 + RLTR19-int LTR ERVK 8727 8782 -177 4 1423 1653 178 24 3 chr5 109929398 109929692 -42607567 + RLTR20C LTR ERVK 1 300 -234 4 1423 1468 157 13 0 chr5 109929687 109929923 -42607336 - RMER13B LTR ERVK -467 441 203 4 1423 237 139 0 0 chr5 109929927 109929963 -42607296 + RMER13B LTR ERVK 10 45 -863 4 1423 674 214 20 0 chr5 109930013 109930155 -42607104 + RLTR20C LTR ERVK 336 536 -42 4 1423 329 250 92 33 chr5 109930201 109930354 -42606905 - RLTR43A LTR ERVK -2 362 201 4 1423 362 308 30 48 chr5 109931681 109931848 -42605411 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 479 4 1423 932 232 74 86 chr5 109933009 109933452 -42603807 - RMER2 LTR ERV1 -26 541 1 4 1423 401 279 35 28 chr5 109938641 109938785 -42598474 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 286 4 1423 1367 182 222 45 chr5 109939244 109939640 -42597619 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 4 1423 803 221 69 23 chr5 109942811 109943029 -42594230 + RLTR11A LTR ERVK 301 528 0 4 1423 2667 171 76 85 chr5 109943988 109944590 -42592669 - RLTR33 LTR ERVK -81 597 1 4 1423 1831 276 141 62 chr5 109945854 109946303 -42590956 - RMER19B LTR ERVK 0 902 398 4 1423 1831 276 141 62 chr5 109946347 109946422 -42590837 - RMER19B LTR ERVK -505 397 329 4 1423 1831 276 131 50 chr5 109946569 109946898 -42590361 - RMER19B LTR ERVK -574 328 43 4 1423 963 281 53 39 chr5 109947069 109947425 -42589834 + RodERV21-int LTR ERV1 728 1088 -3903 4 1423 1648 273 35 47 chr5 109947504 109948019 -42589240 + RodERV21-int LTR ERV1 1107 1615 -3376 4 1423 2024 250 92 26 chr5 109948018 109948564 -42588695 + RodERV21-int LTR ERV1 2137 2718 -2273 4 1423 404 330 52 22 chr5 109948640 109948869 -42588390 + RodERV21-int LTR ERV1 3839 4074 -3017 4 1423 267 203 0 48 chr5 109950351 109950413 -42586846 + RodERV21-int LTR ERV1 4891 4949 -2657 4 1423 875 334 66 70 chr5 109950976 109951674 -42585585 + RodERV21-int LTR ERV1 3060 3754 -1237 4 1423 300 276 26 0 chr5 109951667 109951743 -42585516 + RodERV21-int LTR ERV1 4135 4212 -779 4 1423 1113 288 25 28 chr5 109951883 109952280 -42584979 + RodERV21-int LTR ERV1 4449 4844 -147 4 1423 589 219 23 0 chr5 109952758 109952886 -42584373 + MTC LTR MaLR 1 131 -290 4 1423 3876 126 41 45 chr5 109953202 109953956 -42583303 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 4 1423 477 282 195 6 chr5 109954080 109954244 -42583015 + MTC LTR MaLR 125 319 -102 4 1423 1185 181 19 0 chr5 109954508 109954724 -42582535 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 405 4 1423 2653 224 19 9 chr5 109954758 109955325 -42581934 - MMERGLN-int LTR ERV1 -6660 896 324 4 1423 466 193 16 81 chr5 109955298 109955422 -42581837 - MMERGLN-int LTR ERV1 -7117 439 324 4 1423 1070 174 184 134 chr5 109955395 109955813 -42581446 - MMERGLN-int LTR ERV1 -7117 439 1 4 1423 1532 232 102 25 chr5 109955813 109956305 -42580954 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 82 4 1423 522 250 65 0 chr5 109958571 109958695 -42578564 + MTC LTR MaLR 288 419 0 4 1424 2472 165 80 10 chr5 109969417 109969907 -42567352 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 5 4 1424 5197 194 63 45 chr5 109969950 109970202 -42567057 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -729 1597 1318 5 1424 5197 194 63 45 chr5 109970376 109970709 -42566550 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1009 1317 983 5 1424 5197 194 63 45 chr5 109971000 109971537 -42565722 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1344 982 429 5 1424 5197 194 63 45 chr5 109971731 109971957 -42565302 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1898 428 218 5 1424 1478 137 80 0 chr5 109975517 109975743 -42561516 + RLTR21 LTR ERVK 1 244 -1328 5 1424 3593 21 139 0 chr5 109978267 109978700 -42558559 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1424 385 143 24 61 chr5 109988228 109988310 -42548949 + RLTR11A LTR ERVK 400 478 -50 5 1424 503 333 6 6 chr5 109988671 109988831 -42548428 + MTD LTR MaLR 27 186 -233 5 1424 5099 127 24 96 chr5 109989099 109989271 -42547988 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 745 5 1424 5099 127 24 96 chr5 109989420 109990219 -42547040 - RLTR13D6 LTR ERVK -158 744 1 5 1424 337 298 138 6 chr5 109992358 109992529 -42544730 - MTC LTR MaLR -213 194 1 5 1424 722 210 0 0 chr5 109992640 109992783 -42544476 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4000 4142 -1619 5 1424 279 265 0 0 chr5 109992797 109992865 -42544394 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4455 4522 -963 5 1424 590 215 6 18 chr5 109992925 109993091 -42544168 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5481 5644 -117 5 1424 891 290 62 75 chr5 109994672 109995056 -42542203 - MTD LTR MaLR -13 406 28 5 1424 6827 183 39 71 chr5 109998409 109999996 -42537263 - ORR1A3-int LTR MaLR -367 1596 72 5 1424 319 122 0 0 chr5 110000001 110000050 -42537209 - ORR1A3-int LTR MaLR -1460 49 1 1 1424 830 157 23 1 chr5 110000050 110000206 -42537053 - ORR1A3 LTR MaLR 0 394 186 1 1424 282 276 68 11 chr5 110010139 110010227 -42527032 - MTA_Mm LTR MaLR -290 106 14 2 1424 3318 38 2 10 chr5 110010307 110010706 -42526553 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1424 527 128 0 60 chr5 110017740 110017840 -42519419 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 229 3 1424 993 247 32 72 chr5 110017887 110018232 -42519027 - RLTR9C LTR ERVK -62 331 1 3 1424 2905 71 16 5 chr5 110021340 110021721 -42515538 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 3 1424 833 263 116 20 chr5 110021977 110022427 -42514832 - ORR1A3-int LTR MaLR -1065 898 406 3 1424 2049 174 82 19 chr5 110022787 110023202 -42514057 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 4 1424 335 293 34 17 chr5 110024598 110024716 -42512543 + RLTR23 LTR ERV1 311 430 0 4 1424 256 305 54 8 chr5 110025441 110025570 -42511689 + MURVY-int LTR ERV1 599 733 -6868 4 1424 344 219 0 8 chr5 110025993 110026076 -42511183 + MURVY-int LTR ERV1 1222 1286 -6166 4 1424 372 359 78 36 chr5 110026501 110027163 -42510096 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 3683 4372 -3229 4 1424 759 264 41 19 chr5 110027279 110027549 -42509710 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4924 5199 -2402 4 1424 4246 199 62 12 chr5 110030247 110031088 -42506171 - RMER13B LTR ERVK -21 887 5 5 1424 1595 213 140 26 chr5 110031093 110031585 -42505674 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1298 1845 -3 5 1424 3022 74 5 2 chr5 110035365 110035760 -42501499 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1424 730 238 78 155 chr5 110038517 110038865 -42498394 - RLTR11A LTR ERVK -188 340 20 7 1424 4948 165 62 3 chr5 110038972 110039727 -42497532 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -130 2196 1416 7 1424 919 226 119 49 chr5 110039727 110040071 -42497188 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 7 1424 4948 165 62 3 chr5 110040071 110040285 -42496974 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -911 1415 1187 7 1424 4948 165 62 3 chr5 110040334 110040419 -42496840 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1140 1186 1080 7 1424 2608 84 179 59 chr5 110040547 110041004 -42496255 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 8 1424 2821 58 9 0 chr5 110041882 110042225 -42495034 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 8 1424 244 299 62 38 chr5 110042570 110042702 -42494557 - RMER4B LTR ERVK -34 551 311 8 1424 3322 181 15 32 chr5 110042708 110043426 -42493833 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1406 920 215 8 1424 944 219 20 8 chr5 110043776 110044020 -42493239 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2099 227 1 8 1424 1961 136 113 8 chr5 110055601 110055956 -42481303 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 9 1424 2617 79 48 24 chr5 110056074 110056448 -42480811 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 9 1424 236 135 0 0 chr5 110057592 110057629 -42479630 + RMER2 LTR ERV1 529 565 -2 9 1424 326 167 0 0 chr5 110057992 110058046 -42479213 + RLTR23 LTR ERV1 1 54 -376 1 1424 328 206 59 0 chr5 110058122 110058190 -42479069 + RLTR23 LTR ERV1 226 297 -133 1 1424 902 155 20 0 chr5 110064164 110064312 -42472947 + RLTR23 LTR ERV1 280 430 0 1 1424 312 302 44 69 chr5 110065405 110065608 -42471651 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1253 1450 -6151 1 1424 811 135 123 37 chr5 110065637 110065799 -42471460 - RMER2 LTR ERV1 -391 176 1 1 1424 1977 238 40 28 chr5 110065803 110066304 -42470955 - RMER19C LTR ERVK -2 609 103 1 1424 530 336 47 66 chr5 110066365 110066684 -42470575 + RLTR25B LTR ERVK 1 313 -715 1 1424 2513 193 7 7 chr5 110072438 110072892 -42464367 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 75 1 1424 352 326 58 77 chr5 110073812 110074138 -42463121 + RLTR46 LTR ERVK 1 320 0 1 1424 260 240 13 13 chr5 110074415 110074491 -42462768 + IAPLTR3-int LTR ERVK 371 446 -6375 1 1424 36624 182 16 5 chr5 110074476 110081807 -42455452 + IAPEY3-int LTR ERVK 246 7680 0 1 1424 352 326 58 77 chr5 110081807 110082133 -42455126 + RLTR46 LTR ERVK 1 320 0 1 1424 765 240 71 157 chr5 110083003 110083481 -42453778 + RMER2 LTR ERV1 5 540 -27 1 1424 284 299 41 10 chr5 110083764 110083862 -42453397 + MTC LTR MaLR 13 113 -308 1 1424 6092 83 5 1 chr5 110095049 110095895 -42441364 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 849 -959 1 1424 285 299 112 84 chr5 110096135 110096350 -42440909 + RMER12 LTR ERVK 1102 1322 0 1 1424 1940 160 63 20 chr5 110099655 110100006 -42437253 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 2 1 1425 1621 201 61 0 chr5 110103512 110103840 -42433419 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 47 1 1425 1039 242 48 134 chr5 110109462 110109925 -42427334 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 1 1425 231 330 8 59 chr5 110109925 110110015 -42427244 - ORR1D2 LTR MaLR -286 84 1 1 1425 1015 241 48 24 chr5 110110015 110110125 -42427134 - ORR1D2-int LTR MaLR -24 1346 1244 1 1425 1015 241 48 24 chr5 110110318 110110500 -42426759 - ORR1D2-int LTR MaLR -127 1243 1048 1 1425 4169 164 77 22 chr5 110111709 110112564 -42424695 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 1 1425 2683 172 30 36 chr5 110112951 110113632 -42423627 - RMER6A LTR ERVK -32 724 3 1 1425 849 239 58 19 chr5 110114421 110114775 -42422484 + RMER16 LTR ERVK 114 513 -20 1 1425 325 204 63 187 chr5 110117038 110117276 -42419983 + RMER16 LTR ERVK 1 377 -156 1 1425 565 157 72 124 chr5 110117640 110117793 -42419466 + RMER4A LTR ERVK 322 466 0 1 1425 360 232 22 106 chr5 110120442 110120610 -42416649 - RLTR9E LTR ERVK -34 375 204 1 1425 723 205 72 14 chr5 110120773 110120996 -42416263 + RMER10A LTR ERVL 63 298 -144 1 1425 227 283 54 108 chr5 110121029 110121215 -42416044 + RMER10B LTR ERVL 202 377 -21 1 1425 450 216 82 11 chr5 110121368 110121514 -42415745 - MT2A LTR ERVL 0 562 410 1 1425 227 239 42 14 chr5 110121672 110121744 -42415515 + MT2A LTR ERVL 21 94 -439 1 1425 701 266 143 32 chr5 110121774 110121972 -42415287 + MT2A LTR ERVL 72 279 -254 1 1425 701 266 143 32 chr5 110122283 110122494 -42414765 + MT2A LTR ERVL 280 527 -6 1 1425 2680 95 128 0 chr5 110123358 110124077 -42413182 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 811 -997 1 1425 261 308 51 91 chr5 110124383 110124558 -42412701 + RMER12 LTR ERVK 1155 1322 0 1 1425 344 281 83 69 chr5 110126236 110126381 -42410878 + RLTR33 LTR ERVK 447 593 -85 2 1425 3477 46 77 16 chr5 110127300 110127807 -42409452 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 27 2 1425 1148 173 8 27 chr5 110130930 110131186 -42406073 + RLTR21 LTR ERVK 715 965 -607 2 1425 421 112 12 12 chr5 110131469 110131550 -42405709 + RLTR21 LTR ERVK 970 1050 -522 2 1425 435 248 151 27 chr5 110132389 110132702 -42404557 + RLTR12B LTR ERVK 11 335 -192 2 1425 329 279 64 35 chr5 110134094 110134235 -42403024 - RodERV21-int LTR ERV1 -4381 610 466 2 1425 311 311 73 15 chr5 110134231 110134368 -42402891 - RodERV21-int LTR ERV1 -4784 207 63 2 1425 2198 108 38 0 chr5 110135393 110135708 -42401551 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1425 518 171 0 43 chr5 110135708 110135824 -42401435 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1853 2 1425 954 172 0 6 chr5 110135816 110135997 -42401262 - ORR1A2-int LTR MaLR -347 1616 1437 2 1425 561 206 76 28 chr5 110137167 110137312 -42399947 - RMER10B LTR ERVL -52 346 195 2 1425 738 221 87 66 chr5 110138461 110138518 -42398741 + MTC LTR MaLR 1 55 -366 2 1425 738 221 87 66 chr5 110138708 110138737 -42398522 + MTC LTR MaLR 56 77 -344 2 1425 738 221 87 66 chr5 110138930 110139084 -42398175 + MTC LTR MaLR 78 247 -174 2 1425 4060 143 40 57 chr5 110146053 110146928 -42390331 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 119 2 1425 1709 188 51 37 chr5 110146946 110147376 -42389883 - BGLII_B LTR ERVK -2 439 4 2 1425 464 294 77 69 chr5 110148802 110149076 -42388183 - MLT1A0 LTR MaLR -89 276 1 2 1425 4610 121 18 63 chr5 110149796 110150705 -42386554 + RLTR13A3 LTR ERVK 111 978 0 2 1425 678 252 15 0 chr5 110151956 110152087 -42385172 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 2 1425 249 278 0 20 chr5 110152278 110152304 -42384955 + ORR1B1-int LTR MaLR 611 749 -755 2 1425 332 255 0 121 chr5 110152304 110152420 -42384839 + MT2B LTR ERVL 156 257 -344 2 1425 2832 120 14 39 chr5 110154174 110154661 -42382598 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1425 3022 64 17 19 chr5 110154662 110155322 -42381937 + IAPEz-int LTR ERVK 9 591 -5890 2 1425 787 29 155 0 chr5 110155354 110155457 -42381802 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 2 1425 1828 110 0 0 chr5 110155458 110155704 -42381555 + IAPEz-int LTR ERVK 2252 2497 -5183 2 1425 953 80 24 0 chr5 110155699 110155824 -42381435 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 2 1425 26985 12 5 0 chr5 110155824 110158767 -42378492 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 2 1425 2902 115 12 39 chr5 110158767 110159255 -42378004 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1425 2700 79 44 30 chr5 110160652 110161057 -42376202 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 1425 4994 74 32 12 chr5 110161057 110161742 -42375517 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 1288 2 1425 1468 103 23 5 chr5 110161743 110161957 -42375302 - IAP-d-int LTR ERVK -658 5884 5667 2 1425 3585 69 86 14 chr5 110161961 110162448 -42374811 - IAP-d-int LTR ERVK -1015 5527 5006 2 1425 686 174 26 53 chr5 110162455 110162607 -42374652 - IAP-d-int LTR ERVK -6048 494 347 2 1425 2014 77 28 19 chr5 110162601 110162921 -42374338 - IAP-d-int LTR ERVK -1385 602 121 2 1425 2723 75 56 10 chr5 110162921 110163314 -42373945 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 1425 1210 232 62 24 chr5 110164536 110164876 -42372383 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 41 2 1425 985 237 59 141 chr5 110169886 110170347 -42366912 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 2 1425 263 331 8 62 chr5 110170347 110170438 -42366821 - ORR1D2 LTR MaLR -286 84 1 2 1425 331 259 17 61 chr5 110170448 110170549 -42366710 - ORR1D2-int LTR MaLR -28 1342 1246 2 1425 244 216 25 90 chr5 110170742 110170769 -42366490 - ORR1D2-int LTR MaLR -155 1637 1612 2 1425 4164 160 78 72 chr5 110172561 110173458 -42363801 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 2 1425 3110 193 54 20 chr5 110173843 110174541 -42362718 - RMER6A LTR ERVK -32 724 3 2 1425 994 233 68 51 chr5 110175261 110175623 -42361636 + RMER16 LTR ERVK 155 513 -20 2 1425 357 213 63 187 chr5 110177891 110178129 -42359130 + RMER16 LTR ERVK 1 377 -156 2 1425 567 164 73 113 chr5 110178493 110178644 -42358615 + RMER4A LTR ERVK 322 466 0 2 1425 247 207 0 33 chr5 110181243 110181301 -42355958 + RMER10A LTR ERVL 1 56 -342 3 1425 443 255 29 82 chr5 110181301 110181472 -42355787 - RLTR9A LTR ERVK -3 365 204 3 1425 637 263 65 63 chr5 110181635 110182063 -42355196 + RMER10A LTR ERVL 63 364 -78 3 1425 484 211 69 22 chr5 110182230 110182375 -42354884 - MT2A LTR ERVL 0 533 343 3 1425 286 292 28 19 chr5 110182538 110182646 -42354613 + MT2A LTR ERVL 21 129 -404 3 1425 590 230 6 88 chr5 110182621 110182802 -42354457 + MT2A LTR ERVL 72 237 -296 3 1425 487 252 131 74 chr5 110183016 110183260 -42353999 + MT2A LTR ERVL 322 597 -4 3 1425 1529 117 34 0 chr5 110185014 110185253 -42352006 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 247 -1561 3 1425 3095 66 168 0 chr5 110187176 110187670 -42349589 + RLTR22_Mus LTR ERVK 235 811 -997 3 1425 350 294 38 81 chr5 110188164 110188349 -42348910 + RMER12 LTR ERVK 1146 1322 0 3 1425 3631 25 5 0 chr5 110188550 110188944 -42348315 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1425 8918 66 6 1 chr5 110188944 110190036 -42347223 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1425 3368 42 37 0 chr5 110190036 110190418 -42346841 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1425 449 276 98 58 chr5 110191903 110192076 -42345183 + RLTR33 LTR ERVK 447 626 -52 3 1425 614 221 57 192 chr5 110204621 110204991 -42332268 + RLTR46 LTR ERVK 1 320 0 3 1425 1554 208 17 62 chr5 110205575 110205929 -42331330 + RLTR21 LTR ERVK 289 626 -946 3 1425 412 208 14 0 chr5 110205929 110206001 -42331258 - ETnERV2-int LTR ERVK -264 7142 7070 3 1425 1813 249 33 91 chr5 110206085 110206689 -42330570 + RLTR1D LTR ERV1 37 605 0 3 1425 1661 191 53 18 chr5 110211198 110211539 -42325720 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 41 3 1425 257 348 5 130 chr5 110214740 110214833 -42322426 - ORR1D2 LTR MaLR -208 162 92 3 1425 1036 230 56 142 chr5 110214833 110215299 -42321960 + RLTR23 LTR ERV1 5 430 0 3 1425 257 348 5 130 chr5 110215299 110215390 -42321869 - ORR1D2 LTR MaLR -279 91 1 3 1425 250 304 16 74 chr5 110215390 110215511 -42321748 - ORR1D2-int LTR MaLR -24 1346 1233 3 1425 236 262 24 144 chr5 110215696 110215709 -42321550 - ORR1B1-int LTR MaLR -125 1384 1372 3 1425 537 312 46 65 chr5 110217160 110217376 -42319883 - MTD LTR MaLR -155 264 53 3 1425 1152 158 0 5 chr5 110219663 110219847 -42317412 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 183 -719 3 1425 635 137 12 2 chr5 110219847 110219980 -42317279 + RLTR13B1 LTR ERVK 132 337 -641 3 1425 363 242 101 144 chr5 110222495 110222683 -42314576 + RMER16 LTR ERVK 198 377 -156 3 1425 581 157 73 113 chr5 110223069 110223220 -42314039 + RMER4A LTR ERVK 322 466 0 3 1425 479 229 29 82 chr5 110225883 110226054 -42311205 - RLTR9A LTR ERVK -3 365 204 3 1425 767 215 77 9 chr5 110226209 110226430 -42310829 + RMER10A LTR ERVL 63 298 -144 3 1425 299 286 64 123 chr5 110226463 110226650 -42310609 + RMER10B LTR ERVL 202 377 -21 3 1425 495 223 63 28 chr5 110226803 110226978 -42310281 - MT2A LTR ERVL 0 533 310 3 1425 234 277 76 38 chr5 110227131 110227198 -42310061 + MT2A LTR ERVL 21 92 -441 3 1425 234 277 76 38 chr5 110227232 110227269 -42309990 + MT2A LTR ERVL 93 129 -404 3 1425 622 293 79 125 chr5 110227244 110227499 -42309760 + MT2A LTR ERVL 72 276 -257 3 1425 622 293 79 125 chr5 110227643 110227656 -42309603 + MT2A LTR ERVL 277 286 -247 3 1425 622 293 79 125 chr5 110227727 110227937 -42309322 + MT2A LTR ERVL 287 529 -4 3 1425 2059 103 6 33 chr5 110230114 110230275 -42306984 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 161 -1647 3 1425 2331 204 118 95 chr5 110230275 110231108 -42306151 + RLTR13A LTR ERVK 4 855 0 3 178 2675 114 10 18 chr5 110231108 110231677 -42305582 + RLTR22_Mus LTR ERVK 162 810 -998 3 1426 414 264 80 67 chr5 110233222 110233372 -42303887 + RLTR33 LTR ERVK 447 598 -80 3 1426 1970 84 14 4 chr5 110234292 110234563 -42302696 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 291 3 1426 2039 81 23 23 chr5 110234742 110235046 -42302213 - LTRIS2 LTR ERV1 -260 304 1 3 1426 4613 12 0 0 chr5 110236871 110237353 -42299906 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 3 1426 3035 47 15 68 chr5 110239448 110239858 -42297401 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 3 1426 2203 205 11 222 chr5 110245777 110246379 -42290880 + RLTR21 LTR ERVK 291 729 -843 4 1426 2203 205 11 222 chr5 110246553 110246791 -42290468 + RLTR21 LTR ERVK 730 953 -619 4 1426 474 181 96 15 chr5 110247236 110247371 -42289888 + RLTR21 LTR ERVK 970 1115 -457 4 1426 236 204 88 53 chr5 110247624 110247681 -42289578 + RMER12B LTR ERVK 1346 1404 0 4 1426 524 212 168 119 chr5 110248141 110248451 -42288808 + RLTR12B LTR ERVK 11 335 -193 4 1426 621 189 74 34 chr5 110249794 110249942 -42287317 - RMER10B LTR ERVL -52 346 193 4 1426 281 136 0 0 chr5 110251064 110251108 -42286151 + MTD LTR MaLR 1 44 -375 4 1426 1712 205 64 31 chr5 110254428 110254850 -42282409 - BGLII_B LTR ERVK -2 439 4 4 1426 570 305 62 51 chr5 110256255 110256528 -42280731 - MLT1A0 LTR MaLR -89 276 1 4 1426 716 229 15 0 chr5 110258483 110258614 -42278645 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 4 1426 927 191 188 87 chr5 110262640 110262938 -42274321 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 4 1426 297 344 55 78 chr5 110267442 110267627 -42269632 - ORR1E LTR MaLR -89 270 89 4 1426 975 230 65 145 chr5 110267627 110268090 -42269169 + RLTR23 LTR ERV1 5 430 0 4 1426 297 344 55 78 chr5 110268090 110268175 -42269084 - ORR1E LTR MaLR -271 88 6 4 1426 349 262 83 76 chr5 110268181 110268291 -42268968 - ORR1E-int LTR MaLR -24 1346 1246 4 1426 349 262 83 76 chr5 110268484 110268530 -42268729 - ORR1E-int LTR MaLR -125 1245 1189 4 1426 450 323 43 62 chr5 110268758 110268969 -42268290 - MTD LTR MaLR -161 258 52 4 1426 3707 159 78 21 chr5 110271221 110271942 -42265317 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 762 -140 4 1426 4855 120 87 7 chr5 110275912 110276661 -42260598 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 4 1426 1843 305 83 86 chr5 110277053 110278104 -42259155 - MTD-int LTR MaLR -125 1245 198 4 1426 2282 69 0 23 chr5 110278109 110278419 -42258840 + LTRIS2 LTR ERV1 2 304 -260 4 1426 1723 78 89 4 chr5 110278583 110278835 -42258424 + LTRIS2 LTR ERV1 291 564 0 4 1426 291 347 34 17 chr5 110278838 110279017 -42258242 - MTD-int LTR MaLR -1176 194 13 4 1426 649 310 86 44 chr5 110279053 110279391 -42257868 - MTD LTR MaLR -16 403 52 4 1426 3700 89 87 25 chr5 110280308 110280839 -42256420 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 4 1426 1351 214 7 13 chr5 110281955 110282253 -42255006 - RMER6A LTR ERVK -29 727 432 4 1426 1441 228 78 56 chr5 110283449 110283695 -42253564 - MTD LTR MaLR -13 406 147 4 1426 1441 228 78 56 chr5 110283842 110283990 -42253269 - MTD LTR MaLR -273 146 3 4 1426 341 276 54 0 chr5 110284097 110284209 -42253050 + LTR48 LTR ERV1 685 785 -2 4 1426 388 322 99 63 chr5 110287710 110287962 -42249297 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 100 5 1426 12795 69 11 41 chr5 110293271 110295135 -42242124 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 1808 0 5 1426 1684 168 118 41 chr5 110298526 110298916 -42238343 - RMER16 LTR ERVK -1 532 113 5 1426 3106 177 83 48 chr5 110299663 110300365 -42236894 + RMER6A LTR ERVK 2 727 -29 5 1426 3059 68 36 18 chr5 110300907 110301296 -42235963 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1426 601 344 48 59 chr5 110303427 110303764 -42233495 + MTD LTR MaLR 71 403 -16 5 1426 1417 343 59 51 chr5 110303808 110304142 -42233117 + MTD-int LTR MaLR 24 363 -1007 5 1426 1417 343 59 51 chr5 110304226 110304818 -42232441 + MTD-int LTR MaLR 364 958 -412 5 1426 307 265 78 10 chr5 110304996 110305099 -42232160 + MTD-int LTR MaLR 1395 1504 -76 5 1426 240 315 17 59 chr5 110305105 110305194 -42232065 + ORR1D2 LTR MaLR 1 84 -286 5 1426 1058 230 55 153 chr5 110305194 110305671 -42231588 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 5 1426 3145 78 2 12 chr5 110307062 110307462 -42229797 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1426 8066 88 34 3 chr5 110307462 110308527 -42228732 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1426 3369 58 2 5 chr5 110308527 110308924 -42228335 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1426 1668 207 47 9 chr5 110312361 110312702 -42224557 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 5 1426 452 318 56 52 chr5 110317850 110318099 -42219160 + MLT1A0 LTR MaLR 1 250 -115 5 1426 3634 42 96 9 chr5 110320393 110320830 -42216429 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1426 3441 68 22 13 chr5 110320832 110321296 -42215963 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 6012 5 1426 2485 74 225 41 chr5 110321405 110321868 -42215391 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 584 -70 5 1426 2277 57 0 31 chr5 110321868 110322157 -42215102 - IAPEz-int LTR ERVK -466 6015 5736 5 1426 2272 61 0 0 chr5 110322156 110322434 -42214825 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 5 1426 3483 79 2 14 chr5 110322434 110323012 -42214247 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 5 1426 231 267 0 0 chr5 110323012 110323057 -42214202 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 5 1426 492 131 162 0 chr5 110323057 110323156 -42214103 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 9 5 1426 3669 39 96 9 chr5 110323157 110323594 -42213665 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1426 1154 129 0 6 chr5 110324546 110324725 -42212534 + ORR1A2-int LTR MaLR 1439 1616 -347 5 1426 608 180 0 18 chr5 110324717 110324830 -42212429 + ORR1A2-int LTR MaLR 1853 1963 0 5 1426 2250 112 38 0 chr5 110324830 110325143 -42212116 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 5 1426 2262 118 12 3 chr5 110325740 110326079 -42211180 - RLTR9E LTR ERVK -62 347 6 5 1426 17354 173 42 52 chr5 110326096 110327249 -42210010 + ETnERV2-int LTR ERVK 970 3166 -4240 5 1426 17354 126 19 24 chr5 110327396 110327809 -42209450 + ETnERV2-int LTR ERVK 3167 3563 -3843 5 1426 17354 126 19 24 chr5 110327956 110328325 -42208934 + ETnERV2-int LTR ERVK 3564 3930 -3476 5 1426 17354 126 19 24 chr5 110328345 110329567 -42207692 + ETnERV2-int LTR ERVK 3931 5159 -2247 5 1426 7005 18 1 0 chr5 110329567 110330308 -42206951 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 1 5 1426 2093 34 0 0 chr5 110330308 110330546 -42206713 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 0 7601 7364 5 1426 38297 17 2 2 chr5 110330544 110336292 -42200967 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -1849 5752 1 5 1426 6693 18 1 0 chr5 110336292 110337033 -42200226 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 1 5 1426 8946 95 13 13 chr5 110337033 110338298 -42198961 + ETnERV2-int LTR ERVK 5157 6421 -985 5 1426 420 160 0 0 chr5 110338517 110338592 -42198667 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7405 -1 5 1426 2708 121 10 7 chr5 110338592 110339000 -42198259 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 1426 352 200 0 123 chr5 110340003 110340117 -42197142 - MT2B LTR ERVL -337 264 165 5 1426 277 305 89 70 chr5 110342295 110342561 -42194698 - MLT1A0 LTR MaLR 0 374 104 5 1426 1905 161 67 9 chr5 110344528 110344872 -42192387 + ORR1B2 LTR MaLR 1 364 -3 5 1426 4478 86 18 6 chr5 110350943 110351617 -42185642 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 682 -1126 5 1426 938 90 8 0 chr5 110351617 110351751 -42185508 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 175 6 1426 1688 49 0 0 chr5 110351735 110351960 -42185299 - RLTR10A LTR ERVK -150 261 37 6 1426 1025 104 6 0 chr5 110351968 110352131 -42185128 + RLTR22_Mus LTR ERVK 674 837 -971 5 1426 617 134 73 107 chr5 110354767 110354917 -42182342 - RMER4A LTR ERVK 0 466 322 6 1426 343 238 91 103 chr5 110355283 110355531 -42181728 - RMER16 LTR ERVK -156 377 1 6 1426 474 191 35 0 chr5 110357801 110357916 -42179343 - RMER16 LTR ERVK 0 533 415 6 1426 522 219 110 18 chr5 110358111 110358274 -42178985 - RMER16 LTR ERVK -253 280 103 6 1426 2537 194 83 47 chr5 110358999 110359165 -42178094 + RMER6A LTR ERVK 1 178 -578 6 1426 2537 194 83 47 chr5 110359354 110359889 -42177370 + RMER6A LTR ERVK 179 727 -29 6 1426 302 118 78 0 chr5 110362511 110362562 -42174697 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 273 6 1427 2527 124 7 12 chr5 110362635 110363050 -42174209 - RMER19A LTR ERVK 0 737 325 6 1427 1565 130 138 33 chr5 110363046 110363443 -42173816 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK -36 439 1 6 1427 6457 68 12 2 chr5 110363443 110364264 -42172995 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5653 6 1427 7583 150 76 76 chr5 110364259 110365920 -42171339 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 3 6 1427 1976 133 101 59 chr5 110365922 110366378 -42170881 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1427 300 296 87 120 chr5 110366459 110366609 -42170650 + MTD LTR MaLR 187 331 -88 6 1427 448 302 35 30 chr5 110366690 110366784 -42170475 + ORR1D-int LTR MaLR 1141 1237 -133 6 1427 448 302 35 30 chr5 110366977 110367083 -42170176 + ORR1D-int LTR MaLR 1238 1341 -29 6 1427 847 238 50 162 chr5 110367361 110367837 -42169422 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 8 6 1427 1386 152 81 59 chr5 110372684 110373006 -42164253 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1427 1708 176 91 9 chr5 110379442 110379781 -42157478 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 1427 669 167 8 31 chr5 110380823 110380953 -42156306 - MTC LTR MaLR -294 127 1 6 1427 398 210 0 112 chr5 110381382 110381516 -42155743 + RMER10B LTR ERVL 228 346 -52 6 1427 1406 307 59 50 chr5 110381801 110382480 -42154779 + ORR1D-int LTR MaLR 562 1246 -124 6 1427 4673 84 18 82 chr5 110382484 110383284 -42153975 - RMER17A LTR ERVK -3 748 1 6 1427 301 252 77 10 chr5 110383475 110383579 -42153680 + ORR1D-int LTR MaLR 1394 1504 -76 6 1427 851 242 49 143 chr5 110383674 110384141 -42153118 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 8 6 1427 2383 82 3 11 chr5 110385626 110385973 -42151286 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 53 6 1427 375 318 56 52 chr5 110387830 110388079 -42149180 + MLT1A0 LTR MaLR 1 250 -115 6 1427 1085 145 6 6 chr5 110391590 110391770 -42145489 + ORR1A2-int LTR MaLR 1439 1618 -345 6 1427 616 171 0 18 chr5 110391761 110391874 -42145385 + ORR1A2-int LTR MaLR 1853 1963 0 6 1427 1994 118 41 13 chr5 110391874 110392192 -42145067 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1427 2295 113 9 3 chr5 110392778 110393115 -42144144 - RLTR9E LTR ERVK -62 347 9 6 1427 10456 172 39 34 chr5 110393129 110394280 -42142979 + ETnERV2-int LTR ERVK 971 3166 -4240 6 1427 10456 122 21 11 chr5 110394425 110395488 -42141771 + ETnERV2-int LTR ERVK 3167 4244 -3162 6 1427 1523 42 0 5 chr5 110395488 110395677 -42141582 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 249 6 1427 32137 41 1 4 chr5 110395680 110396980 -42140279 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1024 6557 5270 6 1427 32137 41 1 4 chr5 110397161 110399880 -42137379 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2312 5269 2552 6 1427 365 65 16 0 chr5 110399886 110399948 -42137311 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5634 1947 1885 6 1427 303 238 125 0 chr5 110399940 110400020 -42137239 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5110 1027 938 6 1427 717 167 241 36 chr5 110400131 110400375 -42136884 - RMER16-int LTR ERVK -4854 552 312 6 1427 869 163 4 97 chr5 110400462 110400700 -42136559 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 737 6 1427 1212 95 5 32 chr5 110400707 110400977 -42136282 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7238 343 1 6 1427 3442 47 31 2 chr5 110400977 110401401 -42135858 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1427 10538 97 9 1 chr5 110401401 110402882 -42134377 + ETnERV2-int LTR ERVK 4239 5731 -1675 6 1427 316 70 0 0 chr5 110403055 110403098 -42134161 + ETnERV2-int LTR ERVK 5717 5759 -1647 6 1427 3861 86 43 105 chr5 110409450 110410167 -42127092 + ETnERV2-int LTR ERVK 5757 6429 -977 6 1427 379 160 0 0 chr5 110410378 110410453 -42126806 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7405 -1 6 1427 2440 149 15 7 chr5 110410453 110410859 -42126400 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 6 1427 389 307 90 67 chr5 110414386 110414641 -42122618 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 100 7 1427 1901 159 67 9 chr5 110417548 110417891 -42119368 + ORR1B2 LTR MaLR 1 363 -4 7 1427 4907 84 4 0 chr5 110423800 110424479 -42112780 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 682 -1126 7 1427 987 90 8 0 chr5 110424479 110424613 -42112646 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 175 7 1427 1582 59 22 31 chr5 110424597 110424824 -42112435 - RLTR10A LTR ERVK -150 261 37 7 1427 1065 112 0 0 chr5 110424832 110424993 -42112266 + RLTR22_Mus LTR ERVK 674 834 -974 7 1427 260 83 21 0 chr5 110427655 110427703 -42109556 - RMER4A LTR ERVK 0 466 418 7 1427 821 170 16 186 chr5 110428532 110428687 -42108572 - RMER16 LTR ERVK 0 533 408 7 1427 821 170 16 186 chr5 110428832 110428929 -42108330 - RMER16 LTR ERVK -126 407 324 7 1427 584 219 110 18 chr5 110429183 110429346 -42107913 - RMER16 LTR ERVK -253 280 103 7 1427 324 178 9 211 chr5 110430071 110430185 -42107074 + RMER6A LTR ERVK 1 91 -665 7 1427 607 222 16 8 chr5 110430181 110430308 -42106951 + RMER6A LTR ERVK 600 727 -29 7 1427 564 308 142 24 chr5 110432866 110433162 -42104097 + MTD LTR MaLR 1 331 -88 7 1427 437 311 29 67 chr5 110433241 110433335 -42103924 + ORR1D-int LTR MaLR 1141 1235 -135 7 1427 437 311 29 67 chr5 110433517 110433632 -42103627 + ORR1D-int LTR MaLR 1236 1342 -28 7 1427 988 229 51 152 chr5 110433942 110434370 -42102889 - RLTR23 LTR ERV1 -38 392 8 7 1427 1468 159 84 59 chr5 110439156 110439477 -42097782 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1427 1796 181 91 9 chr5 110443526 110443865 -42093394 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1427 415 270 50 66 chr5 110444678 110444876 -42092383 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 126 7 1427 285 319 14 48 chr5 110444920 110445065 -42092194 - RLTR46 LTR ERVK -180 140 1 7 1427 37135 185 37 22 chr5 110445065 110448491 -42088768 - IAPEY3-int LTR ERVK -351 7329 3947 7 1427 37135 185 37 22 chr5 110448588 110452334 -42084925 - IAPEY3-int LTR ERVK -351 3946 247 7 1427 456 249 50 66 chr5 110452643 110452841 -42084418 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 126 7 1427 278 345 7 41 chr5 110452885 110453030 -42084229 - RLTR46 LTR ERVK -180 140 1 7 1427 761 135 8 31 chr5 110453229 110453359 -42083900 - MTC LTR MaLR -294 127 1 7 1427 4477 187 89 73 chr5 110457420 110457586 -42079673 - RLTR21 LTR ERVK -453 1119 948 7 1427 4477 187 89 73 chr5 110457609 110457710 -42079549 - RLTR21 LTR ERVK -625 947 856 7 1427 4477 187 89 73 chr5 110457858 110458691 -42078568 - RLTR21 LTR ERVK -717 855 1 7 1427 3069 172 9 9 chr5 110460235 110460861 -42076398 + RMER6A LTR ERVK 57 727 -29 7 1427 2045 109 31 25 chr5 110463136 110463456 -42073803 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 7 1427 1694 201 47 9 chr5 110466363 110466704 -42070555 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 8 1427 769 202 31 0 chr5 110470618 110470747 -42066512 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 8 1427 1606 204 46 31 chr5 110474506 110474642 -42062617 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 257 8 1427 1606 204 46 31 chr5 110474831 110475043 -42062216 - ORR1B1 LTR MaLR -138 256 41 8 1427 780 222 161 146 chr5 110480064 110480481 -42056778 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 8 1427 237 298 35 12 chr5 110480577 110480662 -42056597 - MTE-int LTR MaLR -76 1504 1418 8 1427 1519 205 155 31 chr5 110481551 110481897 -42055362 + RMER16 LTR ERVK 70 467 -66 8 1427 1519 205 155 31 chr5 110482097 110482163 -42055096 + RMER16 LTR ERVK 468 533 0 8 1427 356 207 179 8 chr5 110484609 110484726 -42052533 + RMER16 LTR ERVK 241 377 -156 8 1427 569 179 73 107 chr5 110485079 110485229 -42052030 + RMER4A LTR ERVK 322 466 0 8 1427 9789 115 53 92 chr5 110487677 110488803 -42048456 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 690 8 1427 9789 115 53 92 chr5 110488954 110489026 -42048233 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1159 689 682 8 1427 9789 115 53 92 chr5 110489289 110490011 -42047248 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1167 681 1 8 1427 3856 28 31 0 chr5 110490281 110490704 -42046555 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 8 1427 412 179 138 28 chr5 110492683 110492790 -42044469 - RLTR44B LTR ERVK 0 449 316 8 1428 1443 228 74 74 chr5 110498283 110498418 -42038841 + MTD LTR MaLR 13 146 -273 8 1428 1443 228 74 74 chr5 110498557 110498828 -42038431 + MTD LTR MaLR 147 419 0 8 1428 1506 89 47 0 chr5 110503578 110503814 -42033445 + ORR1A2-int LTR MaLR 1717 1963 0 1 1428 2037 77 27 63 chr5 110503814 110504145 -42033114 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1428 2541 83 26 64 chr5 110504277 110504653 -42032606 + MTB_Mm LTR MaLR 1 367 -40 1 1428 1007 197 162 36 chr5 110504653 110505016 -42032243 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 1428 2541 83 26 64 chr5 110505016 110505062 -42032197 + MTB_Mm LTR MaLR 368 407 0 1 1428 4893 94 36 10 chr5 110505262 110506046 -42031213 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1042 806 3 1 1428 1365 173 94 29 chr5 110506508 110506817 -42030442 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1428 1067 216 64 134 chr5 110512018 110512473 -42024786 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 3 1428 1716 287 78 45 chr5 110512570 110513375 -42023884 - ORR1D-int LTR MaLR -7 1363 532 3 1428 6424 89 34 39 chr5 110515976 110516512 -42020747 - RLTR22_Mus LTR ERVK 0 1808 1270 3 1428 6424 89 34 39 chr5 110516542 110517076 -42020183 - RLTR22_Mus LTR ERVK -539 1269 745 3 1428 1957 91 0 0 chr5 110517237 110517524 -42019735 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1521 287 1 3 1428 637 123 71 104 chr5 110521272 110521426 -42015833 + RMER4A LTR ERVK 316 464 -2 5 1428 272 164 77 64 chr5 110522455 110522533 -42014726 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 431 5 1428 778 239 70 26 chr5 110523966 110524237 -42013022 + RMER10A LTR ERVL 16 298 -144 5 1428 438 221 139 42 chr5 110524265 110524430 -42012829 + RMER10B LTR ERVL 186 366 -32 5 1428 352 213 7 130 chr5 110524593 110524663 -42012596 - MT2A LTR ERVL 0 533 476 5 1428 352 213 7 130 chr5 110524809 110524884 -42012375 - MT2A LTR ERVL -58 475 406 5 1428 3905 65 103 62 chr5 110524931 110525187 -42012072 + RLTR22_Mur LTR ERVK 126 387 -1461 6 1428 3905 65 103 62 chr5 110525360 110525791 -42011468 + RLTR22_Mur LTR ERVK 388 841 -1007 6 1428 2201 108 36 79 chr5 110526548 110526874 -42010385 + RLTR22_Mur LTR ERVK 806 1099 -749 6 1428 2201 108 36 79 chr5 110526993 110527108 -42010151 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1100 1227 -621 6 1428 2478 116 54 25 chr5 110527911 110528319 -42008940 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 6 1428 402 94 0 15 chr5 110528926 110528991 -42008268 + RMER19A LTR ERVK 674 737 0 6 1428 2858 101 28 16 chr5 110534631 110535063 -42002196 + RLTR9B LTR ERVK 1 437 0 7 1428 240 339 84 22 chr5 110539714 110539892 -41997367 + MER92B LTR ERV1 22 210 -426 7 1428 589 298 133 37 chr5 110541688 110542012 -41995247 - MER76 LTR ERVL -12 679 325 8 1428 1826 128 9 19 chr5 110543031 110543349 -41993910 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 45 9 1428 375 89 0 0 chr5 110543517 110543573 -41993686 - RLTR15 LTR ERVK -298 61 6 9 1428 2981 204 48 18 chr5 110543579 110544304 -41992955 - MYSERV-int LTR ERVK -5 6545 5799 9 1428 1734 240 27 23 chr5 110544305 110544744 -41992515 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 9 1428 3269 210 93 58 chr5 110544744 110545708 -41991551 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -743 1583 586 9 1428 1664 241 59 28 chr5 110545797 110546305 -41990954 - MYSERV-int LTR ERVK -1832 4718 4195 9 1428 481 182 114 48 chr5 110546583 110546750 -41990509 - MYSERV6-int LTR ERVK -2285 6674 6497 9 1428 715 154 0 0 chr5 110549399 110549521 -41987738 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 238 1 1428 1961 160 138 49 chr5 110549521 110549727 -41987532 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 347 1 1428 3176 58 10 2 chr5 110549727 110550124 -41987135 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1428 1961 160 138 49 chr5 110550124 110550431 -41986828 - RLTR20B2 LTR ERVK -214 346 1 1 1428 1376 119 8 25 chr5 110550431 110550671 -41986588 - RLTR15 LTR ERVK -118 241 6 1 1428 1770 130 3 3 chr5 110550683 110550969 -41986290 + ORR1B1 LTR MaLR 8 293 -101 1 1428 3662 139 79 25 chr5 110550969 110551926 -41985333 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 1 1 1428 563 100 77 39 chr5 110551926 110552030 -41985229 + ORR1A4 LTR MaLR 222 329 0 1 1428 313 339 106 25 chr5 110552253 110552537 -41984722 - MLT1F2 LTR MaLR -2 558 252 1 1428 2009 135 8 35 chr5 110560775 110561143 -41976116 + RLTR9D LTR ERVK 46 403 0 1 1428 2779 114 56 34 chr5 110561659 110562124 -41975135 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1428 731 240 96 0 chr5 110562565 110562773 -41974486 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4324 4551 -1163 1 1428 2675 128 150 25 chr5 110563336 110563856 -41973403 + RLTR33 LTR ERVK 7 591 -87 1 1428 279 255 62 21 chr5 110563935 110564031 -41973228 + RLTR23 LTR ERV1 331 430 0 1 1428 2705 136 176 14 chr5 110568140 110568641 -41968618 + RMER4B LTR ERVK 4 585 0 1 1428 295 268 178 15 chr5 110571084 110571240 -41966019 - MLT1D LTR MaLR -18 487 197 1 1428 608 229 105 56 chr5 110577102 110577426 -41959833 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 4 1 1428 1936 191 101 57 chr5 110581588 110582094 -41955165 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1428 1066 100 100 2 chr5 110598763 110598949 -41938310 - ORR1A2 LTR MaLR 0 384 137 2 1428 964 248 101 7 chr5 110601959 110602247 -41935012 - MTEa LTR MaLR -59 320 6 2 1428 760 271 32 46 chr5 110603517 110603862 -41933397 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 4 2 1428 298 139 95 27 chr5 110617577 110617651 -41919608 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 431 2 1428 2212 127 131 2 chr5 110619157 110619661 -41917598 - RMER4B LTR ERVK 0 585 17 2 1428 546 100 0 0 chr5 110620401 110620481 -41916778 - MTC LTR MaLR 0 421 342 2 1428 1057 184 43 14 chr5 110620474 110620684 -41916575 - MTC LTR MaLR -203 218 3 2 1428 2731 48 30 6 chr5 110622967 110623305 -41913954 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1428 2486 100 49 46 chr5 110623912 110624322 -41912937 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 178 26885 15 2 0 chr5 110624322 110627272 -41909987 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 2 1429 1022 78 0 0 chr5 110627272 110627400 -41909859 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 2 1429 1852 102 0 0 chr5 110627395 110627641 -41909618 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2252 2 1429 988 59 0 0 chr5 110627642 110627761 -41909498 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 1359 2 1429 5019 60 4 55 chr5 110627761 110628450 -41908809 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 9 2 1429 2439 109 36 53 chr5 110628451 110628869 -41908390 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 1429 1625 176 89 3 chr5 110632339 110632675 -41904584 - RMER19A LTR ERVK -152 585 221 2 1429 2591 165 84 26 chr5 110639403 110639975 -41897284 - MTC-int LTR MaLR -637 621 17 3 1429 1569 147 83 27 chr5 110640355 110640656 -41896603 - MTB_Mm LTR MaLR -89 318 1 3 1429 2262 187 45 35 chr5 110642585 110642906 -41894353 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 186 3 1429 2262 187 45 35 chr5 110643101 110643271 -41893988 - RLTR19 LTR ERVK -314 185 5 3 1429 2718 128 17 19 chr5 110651315 110651777 -41885482 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 3 1429 1187 180 157 52 chr5 110656377 110656664 -41880595 - ORR1B2 LTR MaLR -50 317 1 3 1429 267 222 28 0 chr5 110656870 110656942 -41880317 - RMER15 LTR ERVL -96 479 406 3 1429 1712 171 67 15 chr5 110667302 110667627 -41869632 - RMER15 LTR ERVL 0 575 234 3 1429 246 137 96 19 chr5 110667627 110667679 -41869580 - ORR1C1 LTR MaLR 0 367 312 3 1429 1883 132 216 43 chr5 110669169 110669408 -41867851 + RMER6A LTR ERVK 2 309 -447 3 1429 1883 132 216 43 chr5 110669596 110669823 -41867436 + RMER6A LTR ERVK 310 549 -207 3 1429 1771 175 38 30 chr5 110674145 110674516 -41862743 - RLTR14 LTR ERV1 -8 374 1 3 1429 1986 99 53 25 chr5 110674839 110675159 -41862100 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1429 3107 20 0 0 chr5 110691035 110691381 -41845878 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1429 13892 53 16 6 chr5 110691381 110693155 -41844104 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 4 1429 3001 35 0 3 chr5 110693155 110693502 -41843757 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 1429 473 232 0 113 chr5 110711783 110711806 -41825453 + MT2B LTR ERVL 166 287 -314 4 1429 950 253 87 60 chr5 110713496 110713862 -41823397 - MTE2b LTR MaLR -3 376 1 4 1429 282 276 0 33 chr5 110718029 110718044 -41819215 + MT2B LTR ERVL 154 165 -436 5 1429 906 205 77 50 chr5 110734019 110734342 -41802917 - RLTR15 LTR ERVK -27 332 1 5 1429 248 218 0 52 chr5 110734517 110734575 -41802684 - MLT1F1 LTR MaLR -514 55 1 5 1429 253 332 120 7 chr5 110739182 110739333 -41797926 + MLT1G LTR MaLR 32 207 -372 5 1429 227 293 10 146 chr5 110743593 110743689 -41793570 - MT2B2 LTR ERVL -346 238 156 5 1429 2507 218 63 110 chr5 110744766 110745290 -41791969 - RLTR40 LTR ERVK -5 812 329 5 1429 2507 218 63 110 chr5 110745433 110745732 -41791527 - RLTR40 LTR ERVK -489 328 28 5 1429 2995 57 39 5 chr5 110748968 110749355 -41787904 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1430 436 311 40 0 chr5 110756127 110756275 -41780984 - MER54B LTR ERVL -209 584 431 5 1430 300 269 75 28 chr5 110772888 110772995 -41764264 + MER57D LTR ERV1 54 165 -246 6 1430 276 243 12 75 chr5 110776391 110776471 -41760788 + MT2B LTR ERVL 190 264 -337 6 1430 339 277 94 47 chr5 110777049 110777155 -41760104 + MLT1C LTR MaLR 309 419 -48 6 1430 252 314 35 11 chr5 110777601 110777688 -41759571 - MER57C2 LTR ERV1 -4 430 342 6 1430 595 245 38 6 chr5 110778891 110779051 -41758208 - MTD LTR MaLR 0 419 255 6 1430 275 252 9 88 chr5 110785731 110785844 -41751415 + RLTR20B3 LTR ERVK 2 105 -472 6 1430 233 200 127 0 chr5 110785973 110786028 -41751231 + BGLII_B LTR ERVK 56 117 -324 6 1430 422 216 52 0 chr5 110787488 110787585 -41749674 - MT2A LTR ERVL -431 102 1 6 1430 307 274 191 24 chr5 110790000 110790168 -41747091 + RMER15 LTR ERVL 324 519 -56 6 1430 317 235 128 12 chr5 110795230 110795316 -41741943 + RLTR42-int LTR ERVK 1701 1796 -3726 7 1430 1944 160 240 21 chr5 110795409 110795843 -41741416 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 7 1430 936 203 126 33 chr5 110795977 110796252 -41741007 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 7 1430 4330 227 131 28 chr5 110796252 110796686 -41740573 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 506 -864 7 1430 4330 227 131 28 chr5 110796824 110797628 -41739631 + ORR1C2-int LTR MaLR 507 1366 -4 7 1430 1038 182 128 16 chr5 110797673 110797924 -41739335 + ORR1C2 LTR MaLR 98 376 -8 7 1430 889 230 93 39 chr5 110799288 110799546 -41737713 + RLTR42-int LTR ERVK 4361 4632 -890 7 1430 344 291 174 33 chr5 110802751 110802964 -41734295 + MER68 LTR ERVL 40 282 -281 7 1430 421 270 90 53 chr5 110811507 110811695 -41725564 + MLT1A0 LTR MaLR 121 315 -50 7 1430 292 235 43 58 chr5 110813175 110813286 -41723973 + MLT1A0 LTR MaLR 229 358 -50 7 1430 1367 216 137 52 chr5 110821251 110821274 -41715985 + MTD LTR MaLR 1 21 -398 7 1430 1367 216 137 52 chr5 110821302 110821664 -41715595 + MTD LTR MaLR 22 419 0 7 1430 2345 80 82 11 chr5 110826717 110827084 -41710175 + MTB LTR MaLR 1 393 -7 7 1430 261 275 109 9 chr5 110828057 110828167 -41709092 - RMER12 LTR ERVK -459 863 743 7 1430 1228 241 71 20 chr5 110828233 110828585 -41708674 + MTEb LTR MaLR 3 372 -7 7 1430 2257 252 55 5 chr5 110828613 110829175 -41708084 + MTEb-int LTR MaLR 1 590 -990 7 1430 229 227 13 120 chr5 110829598 110829673 -41707586 + MT2B LTR ERVL 181 247 -354 7 1430 2406 279 132 21 chr5 110829681 110829842 -41707417 + MTEb-int LTR MaLR 579 737 -843 7 1430 2406 279 132 21 chr5 110830057 110830718 -41706541 + MTEb-int LTR MaLR 738 1493 -87 7 1430 680 257 43 78 chr5 110830785 110831017 -41706242 + MTEa LTR MaLR 75 298 -81 7 1430 256 317 107 8 chr5 110854037 110854158 -41683101 - ORR1E LTR MaLR -225 134 2 7 1430 617 238 224 30 chr5 110855788 110856056 -41681203 + MTD LTR MaLR 1 320 -99 7 1430 1644 94 61 64 chr5 110866353 110866683 -41670576 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 125 7 1430 572 130 130 0 chr5 110866812 110866927 -41670332 - RLTR11B LTR ERVK -318 135 6 7 1430 3181 47 42 0 chr5 110878966 110879346 -41657913 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1430 2808 124 45 51 chr5 110881151 110881619 -41655640 - RMER4A LTR ERVK -1 465 1 8 1431 328 337 34 57 chr5 110891619 110891795 -41645464 + MTE2b LTR MaLR 13 184 -195 8 1431 3412 38 5 0 chr5 110893444 110893838 -41643421 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1431 2072 25 26 8 chr5 110894612 110894894 -41642365 + MT-int LTR MaLR 783 1194 -64 8 1431 236 308 161 21 chr5 110895569 110895755 -41641504 - MLT1F LTR MaLR -244 304 93 8 1431 343 257 87 34 chr5 110897853 110898002 -41639257 + ORR1E LTR MaLR 66 222 -137 8 1431 1659 156 103 16 chr5 110899052 110899429 -41637830 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 8 1431 2011 167 83 17 chr5 110900138 110900547 -41636712 - RMER10A LTR ERVL -5 437 2 8 1431 227 94 0 0 chr5 110908542 110908574 -41628685 + LTR33A_ LTR ERVL 500 531 0 8 1431 284 268 24 24 chr5 110908748 110908874 -41628385 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 629 8 1431 475 165 128 0 chr5 110909444 110909553 -41627706 + RLTR19-int LTR ERVK 1209 1331 -4806 8 1431 1267 70 37 21 chr5 110911384 110911575 -41625684 - RMER6A LTR ERVK -55 701 508 8 1431 1727 179 99 208 chr5 110911656 110912374 -41624885 - RMER21A LTR ERV1 -63 884 245 8 1431 429 197 0 0 chr5 110912428 110912504 -41624755 - RMER21A LTR ERV1 -871 76 1 8 1431 1984 93 55 88 chr5 110914607 110914682 -41622577 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 266 8 1431 1984 93 55 88 chr5 110914832 110915086 -41622173 - ORR1A2 LTR MaLR -62 265 1 8 1431 246 250 44 0 chr5 110916690 110916758 -41620501 + MLT1G3 LTR MaLR 483 553 -42 9 1431 317 164 56 25 chr5 110919333 110919413 -41617846 + MTE2b LTR MaLR 287 368 -11 9 1431 283 326 129 0 chr5 110919871 110920049 -41617210 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 165 9 1431 381 144 97 108 chr5 110922125 110922218 -41615041 - MT2B LTR ERVL -356 245 154 9 1431 603 131 0 70 chr5 110922185 110922300 -41614959 - MT2B LTR ERVL -314 287 181 9 1431 745 165 27 48 chr5 110922252 110922329 -41614930 - RMER6C LTR ERVK -547 143 64 9 1431 1983 129 55 20 chr5 110922329 110922676 -41614583 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 9 1431 745 165 27 48 chr5 110922676 110922744 -41614515 - RMER6C LTR ERVK -627 63 1 9 1431 240 221 143 0 chr5 110924807 110924884 -41612375 + MLT1C LTR MaLR 34 121 -346 9 1431 321 276 61 0 chr5 110924905 110925003 -41612256 + MLT1C LTR MaLR 178 281 -186 9 1431 250 311 55 39 chr5 110927885 110928012 -41609247 - MLT1E1 LTR MaLR -15 639 511 9 1431 2112 153 128 5 chr5 110931098 110931473 -41605786 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1431 2534 81 3 12 chr5 110933769 110934096 -41603163 + ORR1A2 LTR MaLR 3 326 -1 9 1431 2448 131 89 30 chr5 110935531 110935971 -41601288 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 9 1431 256 299 0 0 chr5 110938927 110938994 -41598265 - MLT2D LTR ERVL -107 453 387 9 1431 3469 25 2 8 chr5 110942389 110942787 -41594472 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1431 329 211 31 72 chr5 110942804 110942901 -41594358 + MTEb LTR MaLR 279 371 -8 9 1431 290 311 209 41 chr5 110942918 110943186 -41594073 + MLT1K LTR MaLR 283 595 0 9 1431 237 305 63 0 chr5 110946984 110947079 -41590180 - MLT1K LTR MaLR -86 509 409 9 1431 251 168 112 56 chr5 110953440 110953547 -41583712 + RLTR25B LTR ERVK 397 509 -519 9 1431 250 226 80 45 chr5 110954498 110954586 -41582673 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 318 9 1431 264 319 52 0 chr5 110954773 110954889 -41582370 + RMER4B LTR ERVK 13 134 -451 9 1431 235 305 138 38 chr5 110956379 110956539 -41580720 - MLT1A1 LTR MaLR -348 247 72 9 1431 566 182 111 0 chr5 110958432 110958558 -41578701 - MTD LTR MaLR -279 140 1 1 1431 3707 50 125 12 chr5 110958888 110959393 -41577866 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 3 1 1431 243 358 65 33 chr5 110965625 110965778 -41571481 - MLT1K LTR MaLR -4 591 434 1 1431 503 244 75 75 chr5 110967526 110967826 -41569433 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2150 2449 -3265 1 1431 577 308 187 20 chr5 110967962 110968357 -41568902 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4655 5115 -646 1 1431 294 198 34 0 chr5 110968973 110969039 -41568220 + MTEb LTR MaLR 57 124 -255 1 1431 839 220 79 44 chr5 110969225 110969453 -41567806 + MTEb LTR MaLR 144 379 0 1 1431 240 314 32 63 chr5 110977465 110977591 -41559668 - MT2B2 LTR ERVL -326 258 137 1 1431 453 331 114 53 chr5 110980643 110980804 -41556455 + MLT1C LTR MaLR 1 182 -285 1 1431 453 331 114 53 chr5 110980985 110981199 -41556060 + MLT1C LTR MaLR 183 399 -68 1 1431 2295 96 12 6 chr5 110983326 110983651 -41553608 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1431 2862 110 69 119 chr5 110986427 110987034 -41550225 + MT2B2 LTR ERVL 1 577 -7 1 1431 430 304 130 12 chr5 111000075 111000321 -41536938 - MLT1C LTR MaLR -95 372 98 1 1431 1078 258 164 6 chr5 111001284 111001596 -41535663 + MTEa LTR MaLR 19 379 0 2 1431 255 352 86 0 chr5 111014801 111014906 -41522353 + MLT1C LTR MaLR 1 114 -353 2 1431 277 155 13 90 chr5 111016058 111016136 -41521123 - MTC LTR MaLR -24 395 324 3 1431 810 203 36 62 chr5 111016125 111016319 -41520940 - MTC LTR MaLR -232 189 1 3 178 1050 227 62 0 chr5 111017742 111018013 -41519246 - MTEb LTR MaLR 0 379 75 3 1432 2074 73 3 89 chr5 111020214 111020497 -41516762 + ORR1A2 LTR MaLR 10 286 -41 3 1432 2074 73 3 89 chr5 111020645 111020709 -41516550 + ORR1A2 LTR MaLR 287 327 0 3 1432 9959 133 86 15 chr5 111020709 111022542 -41514717 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1962 -1 3 1432 2099 80 90 0 chr5 111022543 111022843 -41514416 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1432 1128 238 132 29 chr5 111036137 111036448 -41500811 - MTEa LTR MaLR -33 346 4 5 1432 311 298 132 0 chr5 111041923 111042037 -41495222 + ORR1E LTR MaLR 1 129 -230 6 1432 354 355 36 79 chr5 111042326 111042656 -41494603 - ORR1D2 LTR MaLR -12 358 43 6 1432 602 249 180 63 chr5 111048394 111048711 -41488548 - MTEb LTR MaLR -22 357 4 7 1432 345 356 132 16 chr5 111054083 111054462 -41482797 - MLT1C LTR MaLR 0 467 45 8 1432 2663 123 14 67 chr5 111058085 111058530 -41478729 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1432 2343 148 128 18 chr5 111058530 111058984 -41478275 + MTC-int LTR MaLR 3 506 -752 9 1432 2334 194 58 22 chr5 111058986 111059371 -41477888 + MTC-int LTR MaLR 665 1068 -190 9 1432 2334 194 58 22 chr5 111059522 111059670 -41477589 + MTC-int LTR MaLR 1069 1217 -41 9 1432 1561 226 66 61 chr5 111059916 111060091 -41477168 + MTC LTR MaLR 24 208 -213 9 1432 1561 226 66 61 chr5 111060283 111060503 -41476756 + MTC LTR MaLR 209 421 0 9 1432 237 143 0 0 chr5 111060742 111060784 -41476475 - MT2A LTR ERVL -8 525 484 1 1432 1389 224 20 10 chr5 111061074 111061372 -41475887 - MT2A LTR ERVL -44 489 189 1 1432 499 161 0 12 chr5 111061419 111061501 -41475758 - MT2A LTR ERVL -452 81 1 1 1432 230 311 164 24 chr5 111061875 111062040 -41475219 + MLT1D LTR MaLR 242 429 -76 1 1432 2363 173 86 38 chr5 111064163 111064661 -41472598 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 7 1 1432 1295 190 82 40 chr5 111067771 111068099 -41469160 + BGLII_B LTR ERVK 21 362 -79 1 1432 6364 264 58 55 chr5 111069677 111070276 -41466983 + MYSERV6-int LTR ERVK 694 1299 -7660 1 1432 6364 264 58 55 chr5 111070424 111071085 -41466174 + MYSERV6-int LTR ERVK 1300 1988 -6971 1 1432 6364 264 58 55 chr5 111071231 111071349 -41465910 + MYSERV6-int LTR ERVK 1989 2088 -6871 1 1432 4473 71 20 30 chr5 111071349 111071942 -41465317 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 1 1432 6364 264 58 55 chr5 111071942 111072982 -41464277 + MYSERV6-int LTR ERVK 2089 3121 -5838 1 1432 248 139 0 0 chr5 111073676 111073712 -41463547 - MTC LTR MaLR -85 336 301 1 1432 982 113 33 17 chr5 111075299 111075479 -41461780 + MTC-int LTR MaLR 1076 1258 0 1 1432 1379 153 0 0 chr5 111075479 111075688 -41461571 + MTC LTR MaLR 1 209 -212 1 1432 751 180 129 43 chr5 111075740 111075949 -41461310 + MTC LTR MaLR 186 412 -9 1 1432 1116 287 75 79 chr5 111075953 111076622 -41460637 + RMER15-int LTR ERVL 3085 3750 -1249 1 1432 357 280 7 114 chr5 111089775 111089825 -41447434 + MT2B LTR ERVL 125 158 -443 1 1432 383 148 48 36 chr5 111092861 111092945 -41444314 - RMER19B LTR ERVK -789 113 29 1 1432 270 164 146 0 chr5 111096034 111096089 -41441170 - RLTR47_MM LTR ERV1 -84 448 386 1 1432 524 211 97 0 chr5 111098412 111098526 -41438733 + MTEa LTR MaLR 7 131 -248 1 1432 255 271 46 11 chr5 111098549 111098655 -41438604 + MTEa LTR MaLR 180 279 -100 1 1432 1939 151 103 3 chr5 111135571 111135929 -41401330 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1432 1624 107 38 91 chr5 111136386 111136725 -41400534 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 2 1432 244 243 135 0 chr5 111138364 111138438 -41398821 + MLT1A1 LTR MaLR 2 85 -323 2 1432 264 331 97 87 chr5 111138506 111138701 -41398558 + MLT1A1 LTR MaLR 212 408 0 2 1433 598 210 47 34 chr5 111165547 111165695 -41371564 + MTEa LTR MaLR 181 330 -49 2 1433 231 0 0 0 chr5 111166937 111166965 -41370294 + MT2_Mm LTR ERVL 466 493 0 2 1433 2291 158 36 6 chr5 111172741 111173138 -41364121 + MTC LTR MaLR 3 398 -23 2 1433 312 279 29 109 chr5 111189253 111189390 -41347869 + MT2B LTR ERVL 131 256 -345 3 1433 1633 249 148 52 chr5 111192733 111192878 -41344381 + MTE-int LTR MaLR 1 135 -1445 3 1433 1633 249 148 52 chr5 111193025 111193459 -41343800 + MTE-int LTR MaLR 136 636 -944 3 1433 924 228 91 83 chr5 111193708 111194160 -41343099 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 3 1433 898 244 188 51 chr5 111194478 111194814 -41342445 + MTE-int LTR MaLR 825 1206 -374 3 1433 1238 275 46 15 chr5 111195124 111195275 -41341984 + MTE-int LTR MaLR 1195 1349 -231 3 1433 1238 275 46 15 chr5 111195452 111195628 -41341631 + MTE-int LTR MaLR 1350 1532 -48 3 1433 301 355 30 97 chr5 111195632 111195766 -41341493 + ORR1D1 LTR MaLR 14 138 -236 3 1433 1639 232 90 98 chr5 111211171 111211683 -41325576 + RLTR18B LTR ERVK 1 508 -4 4 1433 459 211 352 32 chr5 111234121 111234371 -41302888 + ORR1E LTR MaLR 2 331 -28 4 1433 1605 149 14 167 chr5 111240739 111241223 -41296036 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1433 2499 89 9 0 chr5 111243470 111243794 -41293465 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1433 3391 176 191 11 chr5 111243794 111244140 -41293119 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 351 -1612 4 1433 3391 176 191 11 chr5 111244287 111244814 -41292445 + ORR1A2-int LTR MaLR 352 1030 -933 4 1433 420 59 0 139 chr5 111244977 111245056 -41292203 + ORR1A1-int LTR MaLR 843 910 -882 4 1433 604 175 57 23 chr5 111245309 111245484 -41291775 - RMER17C LTR ERVK -132 278 98 4 1433 1002 188 220 40 chr5 111245668 111245972 -41291287 - ORR1C1 LTR MaLR -15 363 5 4 1433 227 229 42 0 chr5 111246029 111246077 -41291182 + MTC LTR MaLR 372 421 0 4 1433 353 78 0 18 chr5 111246077 111246118 -41291141 - ORR1A2 LTR MaLR -147 179 143 4 1433 1077 121 0 0 chr5 111246282 111246439 -41290820 - ORR1A2 LTR MaLR -170 157 1 4 1433 4127 133 72 9 chr5 111246779 111247447 -41289812 + RMER19A LTR ERVK 38 737 0 4 1433 2741 111 10 8 chr5 111247798 111248189 -41289070 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 4 1433 1969 143 9 135 chr5 111248733 111248800 -41288459 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 353 4 1433 1969 143 9 135 chr5 111248944 111249297 -41287962 - ORR1B1 LTR MaLR -42 352 27 4 1433 602 296 34 23 chr5 111251309 111251485 -41285774 + MTD LTR MaLR 24 201 -218 4 1433 420 225 73 86 chr5 111251867 111252018 -41285241 + MTC-int LTR MaLR 624 772 -486 4 1433 655 257 77 114 chr5 111252357 111252637 -41284622 + MTC-int LTR MaLR 796 1066 -192 4 1433 655 257 77 114 chr5 111252875 111252892 -41284367 + MTC-int LTR MaLR 1067 1082 -176 4 1433 250 314 47 74 chr5 111254109 111254257 -41283002 + RMER15 LTR ERVL 425 568 -7 5 1433 302 369 13 6 chr5 111254416 111254574 -41282685 + RMER15-int LTR ERVL 257 415 -4584 5 1433 1254 237 115 109 chr5 111254713 111254851 -41282408 - RMER15-int LTR ERVL -3350 1649 1550 5 1433 1254 237 115 109 chr5 111255044 111255436 -41281823 - RMER15-int LTR ERVL -3450 1549 1116 5 1433 1461 245 144 32 chr5 111256003 111256476 -41280783 + RMER5 LTR ERV1 1 526 -8 5 1433 236 132 151 0 chr5 111256864 111256917 -41280342 - RMER15 LTR ERVL -92 483 423 5 1433 1139 196 304 15 chr5 111256989 111257387 -41279872 - RLTR11A2 LTR ERVK -7 520 8 5 1433 1002 196 141 187 chr5 111261162 111261271 -41275988 + MTD LTR MaLR 1 90 -329 5 1433 1002 196 141 187 chr5 111261443 111261703 -41275556 + MTD LTR MaLR 91 356 -63 5 1433 1002 196 141 187 chr5 111261879 111261946 -41275313 + MTD LTR MaLR 357 418 -1 5 1433 1371 176 231 8 chr5 111271186 111271398 -41265861 - MT2A LTR ERVL 0 533 259 5 1433 1371 176 231 8 chr5 111271574 111271721 -41265538 - MT2A LTR ERVL -275 258 94 5 1433 1071 276 133 49 chr5 111271877 111272304 -41264955 - MT2A LTR ERVL -68 465 3 5 1433 616 187 0 147 chr5 111272389 111272552 -41264707 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 430 5 1433 421 265 6 137 chr5 111273925 111273979 -41263280 - MT2B LTR ERVL -446 155 125 5 1433 256 194 62 31 chr5 111274186 111274250 -41263009 - RMER15 LTR ERVL 0 575 510 5 1433 2189 116 3 42 chr5 111274250 111274419 -41262840 + ORR1A2 LTR MaLR 1 168 -159 5 1433 2189 116 3 42 chr5 111274563 111274725 -41262534 + ORR1A2 LTR MaLR 169 319 -8 5 1433 1673 191 139 64 chr5 111274718 111275187 -41262072 - RMER15 LTR ERVL -50 525 22 5 1433 290 250 0 53 chr5 111275250 111275326 -41261933 - RMER15 LTR ERVL -503 72 1 5 179 1346 35 6 0 chr5 111280011 111280185 -41257074 - MTB LTR MaLR 0 400 226 5 1434 676 244 67 10 chr5 111280317 111280675 -41256584 - MTC LTR MaLR -14 407 6 5 1434 280 265 84 0 chr5 111280717 111280800 -41256459 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1169 5 1434 1509 244 148 163 chr5 111281005 111281078 -41256181 - MTC-int LTR MaLR -86 1172 1096 5 1434 1509 244 148 163 chr5 111281276 111282136 -41255123 - MTC-int LTR MaLR -163 1095 257 5 1434 1509 244 148 163 chr5 111282325 111282535 -41254724 - MTC-int LTR MaLR -1002 256 47 5 1434 508 225 136 21 chr5 111282568 111282885 -41254374 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1434 255 257 78 109 chr5 111291156 111291449 -41245810 - RMER10A LTR ERVL -37 405 122 6 1434 2457 77 0 0 chr5 111307410 111307748 -41229511 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 6 1434 1554 118 129 58 chr5 111314423 111314748 -41222511 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 31 6 1434 617 225 154 84 chr5 111315632 111315918 -41221341 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3546 2211 1906 7 1434 3486 228 110 43 chr5 111316291 111316708 -41220551 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3782 1979 1538 7 1434 1967 119 198 15 chr5 111316708 111317041 -41220218 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1434 3486 228 110 43 chr5 111317041 111317615 -41219644 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4224 1537 922 7 1434 2314 210 84 10 chr5 111317779 111318279 -41218980 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2339 2875 -2886 7 1434 2224 94 51 6 chr5 111318422 111318733 -41218526 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 1 7 1434 1411 194 105 10 chr5 111319125 111319438 -41217821 + ORR1C1 LTR MaLR 5 347 -31 7 1434 1771 177 124 16 chr5 111319438 111319877 -41217382 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2849 3337 -2420 7 1434 1719 181 98 4 chr5 111319874 111320391 -41216868 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3862 4427 -1334 7 1434 801 249 132 10 chr5 111320822 111321126 -41216133 - ORR1D1 LTR MaLR -32 342 2 7 1434 665 232 99 10 chr5 111321127 111321319 -41215940 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1162 7 1434 1951 93 3 146 chr5 111322732 111322798 -41214461 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 270 7 1434 1951 93 3 146 chr5 111322939 111323249 -41214010 - ORR1A2 LTR MaLR -58 269 1 7 1434 467 154 34 111 chr5 111325350 111325467 -41211792 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 262 7 1434 415 154 48 1 chr5 111325884 111325983 -41211276 - ORR1D1 LTR MaLR -99 279 176 7 1434 256 192 0 0 chr5 111325978 111326030 -41211229 - ORR1D1 LTR MaLR -332 52 1 7 1434 1255 244 203 99 chr5 111326103 111327059 -41210200 - MTC-int LTR MaLR -198 1060 6 7 1434 2550 128 52 0 chr5 111327883 111328283 -41208976 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1434 1094 163 16 0 chr5 111336260 111336450 -41200809 - MERVL_2A-int LTR ERVL -86 5675 5483 7 1434 611 103 0 0 chr5 111339056 111339143 -41198116 - MERVL_2A-int LTR ERVL -313 5448 5362 7 1434 397 48 15 31 chr5 111339143 111339208 -41198051 - ORR1B1-int LTR MaLR -1445 64 1 7 1434 1553 181 62 14 chr5 111339398 111339756 -41197503 - ORR1C2 LTR MaLR -9 375 1 7 1434 631 262 65 28 chr5 111341464 111341680 -41195579 - MTEb LTR MaLR -119 260 37 7 1434 3150 148 36 22 chr5 111343140 111343814 -41193445 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -485 2357 1069 7 1434 844 185 24 91 chr5 111343819 111344027 -41193232 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1393 933 740 7 1434 2974 171 68 61 chr5 111344044 111344383 -41192876 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1649 677 337 7 1434 2974 198 69 53 chr5 111344532 111344946 -41192313 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1990 336 1 7 1434 966 238 40 16 chr5 111350348 111350596 -41186663 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 121 7 1434 407 243 111 39 chr5 111350713 111350893 -41186366 - RLTR15 LTR ERVK -153 206 14 7 1434 374 269 26 0 chr5 111350907 111351009 -41186250 - ORR1D1 LTR MaLR -253 125 7 7 1434 273 258 75 15 chr5 111351951 111352085 -41185174 - LTR41B LTR ERVL -37 721 580 7 1434 302 254 149 25 chr5 111352572 111352693 -41184566 - LTR41B LTR ERVL -617 141 6 7 1434 341 259 176 39 chr5 111360753 111360907 -41176352 - ORR1E LTR MaLR -4 375 202 7 1434 1962 160 64 26 chr5 111361666 111362057 -41175202 + MTC LTR MaLR 1 406 -15 8 1434 2863 52 0 3 chr5 111362099 111362446 -41174813 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 8 1434 9827 68 105 11 chr5 111362446 111363999 -41173260 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1699 -93 8 1434 434 167 0 0 chr5 111363992 111364070 -41173189 + MT2A LTR ERVL 155 232 -301 8 1434 741 258 11 22 chr5 111364072 111364254 -41173005 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4790 4969 -792 8 1434 1053 194 199 7 chr5 111367105 111367406 -41169853 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 8 1434 349 223 176 13 chr5 111373604 111373763 -41163496 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 182 8 1434 368 235 40 40 chr5 111373858 111373982 -41163277 - ORR1D1 LTR MaLR -249 125 2 8 1434 421 317 232 0 chr5 111373982 111374238 -41163021 - MTE2b LTR MaLR -64 315 1 8 1434 1924 169 87 11 chr5 111382156 111382522 -41154737 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 8 1434 303 154 0 0 chr5 111384636 111384688 -41152571 - MT2B LTR ERVL 0 601 550 8 1434 657 124 80 0 chr5 111384674 111384787 -41152472 - MT2B LTR ERVL -463 138 17 8 1434 251 244 24 0 chr5 111386836 111386918 -41150341 - MLT1D LTR MaLR -1 504 421 8 1434 227 242 130 11 chr5 111388007 111388099 -41149160 - MER34A LTR ERV1 -1 570 468 8 1434 2044 51 116 0 chr5 111395544 111395836 -41141423 - MTB LTR MaLR 0 400 75 8 1434 2066 173 68 2 chr5 111397595 111397989 -41139270 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 8 1435 1660 182 34 3 chr5 111412544 111412897 -41124362 + ORR1B1 LTR MaLR 9 372 -22 9 1435 3263 21 29 3 chr5 111414977 111415363 -41121896 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1435 1411 162 150 43 chr5 111420833 111421206 -41116053 - MTC LTR MaLR -8 413 1 9 1435 1572 98 132 123 chr5 111421306 111421631 -41115628 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 9 1435 2113 153 89 13 chr5 111423364 111423755 -41113504 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1435 1059 143 84 235 chr5 111427746 111428027 -41109232 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 158 9 1435 1059 143 84 235 chr5 111428050 111428197 -41109062 - ORR1D1 LTR MaLR -217 157 11 9 1435 274 352 0 0 chr5 111431168 111431259 -41106000 - RMER15 LTR ERVL -113 462 372 9 1435 1151 252 36 36 chr5 111433604 111433962 -41103297 + MTD LTR MaLR 28 385 -34 9 1435 2409 179 0 5 chr5 111449396 111449806 -41087453 + MTC LTR MaLR 14 421 0 9 1435 385 252 77 10 chr5 111459775 111459879 -41077380 + RMER15 LTR ERVL 369 479 -96 9 1435 2251 95 36 60 chr5 111462804 111463139 -41074120 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1435 1063 161 16 16 chr5 111472407 111472596 -41064663 + RMER5 LTR ERV1 18 206 -328 1 1435 2307 72 66 0 chr5 111480867 111481172 -41056087 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 1 1435 680 237 126 31 chr5 111492167 111492389 -41044870 + RMER5 LTR ERV1 40 282 -252 1 1435 546 277 45 11 chr5 111492419 111492598 -41044661 + RMER5 LTR ERV1 350 534 0 1 1435 2263 141 27 61 chr5 111498209 111498617 -41038642 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1435 655 253 146 26 chr5 111513083 111513426 -41023833 + MTD LTR MaLR 15 405 -14 2 1435 1312 266 32 53 chr5 111514532 111515001 -41022258 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 74 2 1435 275 221 9 120 chr5 111515641 111515656 -41021603 - RLTR25B LTR ERVK -491 537 524 2 1435 275 221 9 120 chr5 111515701 111515793 -41021466 - RLTR25B LTR ERVK -505 523 442 2 1435 3657 46 5 2 chr5 111516601 111517036 -41020223 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 1435 45872 12 7 1 chr5 111517036 111522106 -41015153 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 1885 3 1435 327 155 17 0 chr5 111522113 111522171 -41015088 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5627 1779 1721 3 1435 779 198 231 45 chr5 111522155 111522541 -41014718 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4795 611 312 3 1435 864 151 4 180 chr5 111522629 111522896 -41014363 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6633 948 729 3 1435 2876 55 0 0 chr5 111522894 111523237 -41014022 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7238 343 1 3 1435 3657 46 5 2 chr5 111523237 111523672 -41013587 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 1435 1068 275 148 21 chr5 111528775 111529248 -41008011 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 1 3 1435 302 191 32 0 chr5 111540087 111540150 -40997109 - ORR1B2 LTR MaLR 0 384 320 5 1435 3698 247 51 26 chr5 111540162 111541160 -40996099 - ORR1B2-int LTR MaLR -345 1025 3 5 1435 1952 156 31 37 chr5 111541162 111541361 -40995898 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 166 5 1435 1952 156 31 37 chr5 111541414 111541567 -40995692 - ORR1B2 LTR MaLR -202 165 17 5 1436 4215 65 40 9 chr5 111556403 111556946 -40980313 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 7 1436 273 238 172 86 chr5 111558864 111559108 -40978151 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 245 7 1436 354 271 177 27 chr5 111560447 111560633 -40976626 - MLT1I LTR MaLR 0 411 198 8 1436 1397 220 93 6 chr5 111564548 111564859 -40972400 + MTD LTR MaLR 82 419 0 8 1436 532 282 77 0 chr5 111574722 111574903 -40962356 + ORR1E LTR MaLR 1 195 -164 1 1436 878 213 119 0 chr5 111576351 111576553 -40960706 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 147 1 1436 597 160 139 46 chr5 111576608 111576759 -40960500 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 17 1 1436 689 255 103 73 chr5 111576867 111577219 -40960040 - ORR1E LTR MaLR 0 379 1 1 1436 283 244 60 24 chr5 111580384 111580468 -40956791 - MLT2E LTR ERVL -20 543 457 1 1436 408 347 85 70 chr5 111583062 111583393 -40953866 - MLT1M LTR MaLR -336 336 1 1 1436 297 259 156 9 chr5 111587536 111587645 -40949614 - MTE2b LTR MaLR -17 362 238 1 1436 618 279 112 43 chr5 111588519 111588796 -40948463 + MLT1E1A LTR MaLR 385 680 0 1 1436 395 323 140 9 chr5 111606408 111606630 -40930629 - MLT1I LTR MaLR -1 410 160 1 1436 646 212 211 25 chr5 111607658 111607900 -40929359 + ORR1E LTR MaLR 68 354 -5 1 1436 5659 110 91 12 chr5 111615516 111616402 -40920857 - RMER17B LTR ERVK -2 956 1 1 1436 741 203 119 0 chr5 111619601 111619778 -40917481 - MTD LTR MaLR 0 419 222 1 1436 335 299 95 22 chr5 111627546 111627683 -40909576 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 214 1 1436 928 278 122 21 chr5 111635494 111635872 -40901387 - BGLII_B LTR ERVK -25 416 1 1 1436 1608 73 319 0 chr5 111639039 111639287 -40897972 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1436 460 305 50 28 chr5 111661121 111661370 -40875889 - MTEb LTR MaLR -30 349 13 2 1436 506 246 73 53 chr5 111665209 111665415 -40871844 - RMER15 LTR ERVL -6 569 360 2 1436 299 294 21 11 chr5 111668790 111668883 -40868376 - RMER15 LTR ERVL -155 420 327 2 179 945 240 168 29 chr5 111673100 111673409 -40863850 + ORR1E LTR MaLR 3 354 -5 2 1437 1130 247 161 0 chr5 111682269 111682605 -40854654 + MTD LTR MaLR 30 419 0 2 1437 2043 149 58 80 chr5 111689209 111689609 -40847650 + ORR1B1 LTR MaLR 3 393 -1 2 1437 2748 73 70 5 chr5 111690297 111690668 -40846591 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 2 1437 1557 183 151 3 chr5 111727655 111727671 -40809588 - MTD LTR MaLR -17 402 387 2 1437 1557 183 151 3 chr5 111727704 111728037 -40809222 - MTD LTR MaLR -33 386 3 2 1437 568 140 29 39 chr5 111728445 111728549 -40808710 - RMER4A LTR ERVK 0 466 364 2 1437 2414 131 26 152 chr5 111728567 111729100 -40808159 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 2 1437 1308 197 109 109 chr5 111729100 111729267 -40807992 + ORR1C2 LTR MaLR 26 186 -198 2 1437 1308 197 109 109 chr5 111729374 111729565 -40807694 + ORR1C2 LTR MaLR 187 384 0 2 1437 1469 214 137 116 chr5 111730710 111731229 -40806030 + MT2A LTR ERVL 1 530 -3 2 1437 1797 163 54 43 chr5 111734355 111734462 -40802797 + ORR1C2 LTR MaLR 1 109 -275 2 1437 1797 163 54 43 chr5 111734642 111734886 -40802373 + ORR1C2 LTR MaLR 110 356 -28 2 1437 933 253 142 7 chr5 111734884 111735159 -40802100 + MTD LTR MaLR 104 415 -4 2 1437 263 248 210 25 chr5 111735698 111735848 -40801411 - ORR1E LTR MaLR -1 358 180 3 1437 546 174 70 55 chr5 111735848 111736149 -40801110 + ORR1B2 LTR MaLR 1 382 -2 3 1437 2319 167 93 16 chr5 111737578 111738021 -40799238 + MT2A LTR ERVL 5 481 -52 3 1437 381 78 0 0 chr5 111738382 111738433 -40798826 + MT2A LTR ERVL 412 462 -71 3 1437 233 319 14 0 chr5 111740997 111741069 -40796190 + RLTR19C LTR ERVK 25 97 -409 3 1437 2012 158 71 6 chr5 111741452 111741803 -40795456 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 3 1437 624 223 36 7 chr5 111742025 111742165 -40795094 - MTD LTR MaLR 0 419 276 3 1437 641 217 28 14 chr5 111742165 111742310 -40794949 - MTD-int LTR MaLR -1111 147 1 3 1437 337 140 35 0 chr5 111742310 111742367 -40794892 - MTD LTR MaLR 0 419 361 3 1437 962 227 138 52 chr5 111742365 111742702 -40794557 - ORR1D1 LTR MaLR -6 373 1 3 1437 507 275 15 8 chr5 111742702 111742822 -40794437 - MTD LTR MaLR -56 363 243 3 1437 1110 190 68 107 chr5 111742822 111743187 -40794072 + RMER19C LTR ERVK 1 336 -401 3 1437 2411 64 10 3 chr5 111743193 111743506 -40793753 + ORR1A2 LTR MaLR 5 319 -8 3 1437 1449 225 6 75 chr5 111743505 111743851 -40793408 + RMER19C LTR ERVK 288 609 -2 3 1437 1164 224 34 45 chr5 111743887 111744153 -40793106 - MTD LTR MaLR -156 263 1 3 1437 622 306 106 55 chr5 111746564 111747037 -40790222 - RLTR11A2 LTR ERVK -24 503 7 3 1437 2830 139 76 18 chr5 111747037 111747290 -40789969 + RLTR11A LTR ERVK 1 287 -241 3 1437 3042 61 12 15 chr5 111747290 111747691 -40789568 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1437 2830 139 76 18 chr5 111747691 111747936 -40789323 + RLTR11A LTR ERVK 288 528 0 3 1437 477 225 0 90 chr5 111749038 111749160 -40788099 + MurERV4-int LTR ERVK 4543 4653 -607 3 1437 229 250 75 100 chr5 111749165 111749285 -40787974 - RLTR22_Mus LTR ERVK -1655 153 37 3 1437 1128 145 36 10 chr5 111749266 111749461 -40787798 - RLTR12B LTR ERVK -328 200 1 3 1437 2124 77 84 62 chr5 111749613 111749933 -40787326 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1437 240 111 0 0 chr5 111753224 111753260 -40783999 + MT2B LTR ERVL 3 38 -563 3 1437 8489 163 35 10 chr5 111753260 111754701 -40782558 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3136 4612 -1149 3 1437 652 186 19 26 chr5 111754703 111754846 -40782413 + ORR1A4 LTR MaLR 208 348 -11 3 1437 800 187 183 20 chr5 111754875 111755077 -40782182 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4856 5090 -671 3 1437 1569 141 52 59 chr5 111755095 111755213 -40782046 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5440 5563 -198 3 1437 1513 153 261 28 chr5 111755213 111755569 -40781690 + RMER10A LTR ERVL 3 441 -1 3 1437 1569 141 52 59 chr5 111755569 111755774 -40781485 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5564 5761 0 3 1437 292 233 0 0 chr5 111755778 111755838 -40781421 + MT2A LTR ERVL 5 64 -469 3 1437 1580 249 75 31 chr5 111755863 111756315 -40780944 + RMER19C LTR ERVK 126 597 -14 3 1437 795 215 50 19 chr5 111756310 111756557 -40780702 + MT2A LTR ERVL 48 463 -138 3 1437 317 278 0 126 chr5 111762853 111762964 -40774295 - MT2B LTR ERVL -343 258 162 3 1437 2884 71 33 12 chr5 111763592 111763991 -40773268 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1437 1393 223 79 46 chr5 111769255 111769650 -40767609 - MTD LTR MaLR -13 406 7 3 1437 238 221 59 162 chr5 111774642 111774680 -40762579 - MT2B LTR ERVL -314 287 262 3 1437 238 221 59 162 chr5 111774816 111774889 -40762370 - MT2B LTR ERVL -340 261 89 3 1437 690 182 19 43 chr5 111792498 111792764 -40744495 - RMER10A LTR ERVL -2 440 3 4 1438 225 330 59 0 chr5 111828490 111828608 -40708651 + LTR16C LTR ERVL 178 302 -187 4 1438 746 289 95 95 chr5 111832700 111832890 -40704369 + MLT1D LTR MaLR 1 203 -302 4 1438 623 276 125 125 chr5 111833013 111833327 -40703932 + MLT1D LTR MaLR 178 505 0 4 1438 400 280 0 92 chr5 111836450 111836580 -40700679 - MT2B LTR ERVL -337 264 147 4 1438 1055 321 59 0 chr5 111876704 111877043 -40660216 - MTE2b LTR MaLR 0 379 21 5 1438 286 315 17 104 chr5 111877869 111878110 -40659149 - RLTR21 LTR ERVK -266 1306 1087 5 1438 964 237 116 7 chr5 111888148 111888437 -40648822 + MTD LTR MaLR 2 322 -97 5 1438 834 176 64 6 chr5 111888437 111888608 -40648651 + ORR1D1 LTR MaLR 1 181 -193 5 1438 919 168 75 25 chr5 111888729 111888930 -40648329 + ORR1D1 LTR MaLR 164 374 0 5 1438 411 229 41 10 chr5 111888933 111889030 -40648229 + MTE2a LTR MaLR 280 379 0 5 1438 3598 23 0 0 chr5 111891680 111892076 -40645183 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1438 9616 30 1 0 chr5 111892076 111893173 -40644086 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1438 3598 23 0 0 chr5 111893173 111893569 -40643690 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1438 891 188 50 15 chr5 111894259 111894459 -40642800 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 173 5 1438 839 199 26 84 chr5 111894512 111894776 -40642483 - ORR1D1 LTR MaLR -111 259 2 5 1438 821 109 107 13 chr5 111894778 111894927 -40642332 - ORR1D1-int LTR MaLR -1 1369 1207 5 1438 362 256 121 55 chr5 111897306 111897471 -40639788 - RMER15 LTR ERVL -7 568 393 5 1438 279 280 76 8 chr5 111898524 111898643 -40638616 + MLT1H LTR MaLR 125 251 -298 5 1438 504 278 42 0 chr5 111899366 111899524 -40637735 + MTEa LTR MaLR 1 165 -214 5 1438 812 210 123 46 chr5 111899591 111899638 -40637621 - RMER4B LTR ERVK -291 294 256 5 1438 812 210 123 46 chr5 111899690 111899902 -40637357 - RMER4B LTR ERVK -330 255 15 5 1438 233 191 21 0 chr5 111907258 111907305 -40629954 - MLT1I LTR MaLR 0 411 364 5 1438 235 296 39 48 chr5 111907396 111907499 -40629760 - MLT1I LTR MaLR 0 411 310 5 1438 227 257 54 0 chr5 111907784 111907858 -40629401 + MLT1A1 LTR MaLR 62 139 -269 5 1438 1239 176 77 70 chr5 111908072 111908372 -40628887 + MTC LTR MaLR 1 302 -119 5 1438 1576 174 49 37 chr5 111915784 111916194 -40621065 + MT2A LTR ERVL 4 538 -63 5 1438 385 323 32 80 chr5 111918033 111918282 -40618977 - MLT1J2 LTR MaLR -153 295 59 6 1438 2610 54 26 0 chr5 111922198 111922547 -40614712 - MT2C_Mm LTR ERVL -117 358 1 6 1438 3477 28 5 0 chr5 111923955 111924349 -40612910 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1438 3793 113 84 10 chr5 111928093 111928787 -40608472 - RMER17B LTR ERVK -15 943 199 6 1438 1064 256 122 12 chr5 111932060 111932388 -40604871 - MTEb LTR MaLR -15 364 1 6 1438 588 257 17 125 chr5 111932390 111932630 -40604629 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 1365 6 1438 380 262 136 65 chr5 111932635 111932819 -40604440 - RMER15 LTR ERVL -12 563 367 6 1438 555 299 151 33 chr5 111933082 111933386 -40603873 - MTEb-int LTR MaLR -214 1366 1027 6 1438 724 308 54 82 chr5 111933678 111934029 -40603230 + MTE2a LTR MaLR 1 351 -68 6 1439 261 288 72 70 chr5 111945732 111945891 -40591368 + ORR1E LTR MaLR 30 194 -165 6 1439 2445 79 6 3 chr5 111946567 111946908 -40590351 - MTC LTR MaLR -8 413 72 6 1439 228 300 109 67 chr5 111947018 111947101 -40590158 - MT2B LTR ERVL -337 264 112 6 1439 415 212 0 12 chr5 111947101 111947187 -40590072 - MTC LTR MaLR -336 85 1 6 1439 228 300 109 67 chr5 111947187 111947211 -40590048 - MT2B LTR ERVL -337 111 64 6 1439 1572 246 22 11 chr5 111947278 111947640 -40589619 + MTE2b LTR MaLR 1 366 -13 6 1439 1316 140 89 0 chr5 111947856 111948092 -40589167 + MTC LTR MaLR 139 395 -26 6 1439 1850 104 19 12 chr5 111970911 111971223 -40566036 - ORR1A2 LTR MaLR -24 343 25 6 1439 400 163 21 32 chr5 111971267 111971362 -40565897 - ORR1B1 LTR MaLR -253 141 48 6 1439 492 221 7 84 chr5 111979180 111979323 -40557936 + MTD LTR MaLR 3 134 -287 7 1439 1954 193 49 15 chr5 111979417 111979822 -40557437 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1439 3237 60 7 2 chr5 111993520 111993924 -40543335 + MTB_Mm LTR MaLR 1 406 -1 7 1439 3256 127 23 9 chr5 111993925 111994489 -40542770 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 572 -526 7 1439 2172 231 90 50 chr5 111994498 111995309 -40541950 + RMER17B LTR ERVK 2 775 -183 7 1439 2338 111 54 19 chr5 111995380 111995930 -40541329 + MTB_Mm-int LTR MaLR 524 1535 -428 7 1439 1892 43 28 4 chr5 111995937 111996191 -40541068 + MTB LTR MaLR 139 398 -2 7 1439 267 350 130 46 chr5 111996212 111996428 -40540831 + MLT1K LTR MaLR 48 281 -314 7 1439 353 366 29 12 chr5 111997277 111997496 -40539763 - RMER12 LTR ERVK -334 988 766 7 1439 344 282 50 99 chr5 112004620 112004821 -40532438 + MLT1A LTR MaLR 9 199 -175 7 1439 260 265 14 14 chr5 112005291 112005360 -40531899 + MLT1A LTR MaLR 340 408 0 7 1439 510 325 27 50 chr5 112005368 112005569 -40531690 + MTEb LTR MaLR 1 199 -180 9 1439 510 325 27 50 chr5 112005598 112005616 -40531643 + MTEb LTR MaLR 200 215 -164 9 1439 279 297 9 84 chr5 112011190 112011322 -40525937 - MLT1F LTR MaLR 0 560 442 2 1439 831 284 92 56 chr5 112016921 112017279 -40519980 - MTEa LTR MaLR -8 371 1 2 1439 980 249 102 21 chr5 112020521 112020804 -40516455 - MTEb LTR MaLR -54 325 20 3 1439 2494 124 5 74 chr5 112020846 112021290 -40515969 + MTC LTR MaLR 4 416 -5 3 1439 232 301 128 40 chr5 112022063 112022212 -40515047 - MLT2B3 LTR ERVL -352 202 41 4 1439 272 321 45 40 chr5 112032529 112032753 -40504506 + RMER12 LTR ERVK 736 960 -362 5 1439 228 262 69 78 chr5 112034641 112034757 -40502502 + ORR1D2 LTR MaLR 1 115 -255 6 1439 375 277 124 14 chr5 112035491 112035700 -40501559 + ORR1D2 LTR MaLR 86 317 -53 6 1439 2156 109 0 58 chr5 112036370 112036729 -40500530 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 6 1439 296 299 235 58 chr5 112038337 112038647 -40498612 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 44 6 1439 984 260 117 23 chr5 112040133 112040646 -40496613 + RMER19A LTR ERVK 1 719 -18 7 1439 326 290 134 22 chr5 112045658 112045792 -40491467 - MTE-int LTR MaLR -1428 152 4 8 1439 1035 248 81 18 chr5 112045884 112046167 -40491092 - MTE2b LTR MaLR -76 303 3 8 1439 229 280 13 51 chr5 112051083 112051162 -40486097 + MT2A LTR ERVL 54 129 -404 8 1439 479 279 13 45 chr5 112051100 112051254 -40486005 + MTEa LTR MaLR 67 215 -164 8 1439 237 302 52 83 chr5 112051276 112051444 -40485815 + MTEa LTR MaLR 202 371 -8 8 1439 478 250 35 28 chr5 112059258 112059402 -40477857 - MTEb LTR MaLR -17 362 218 9 1439 1458 188 45 36 chr5 112062178 112062510 -40474749 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 40 1 1439 267 220 4 8 chr5 112062508 112062594 -40474665 - MTEb LTR MaLR -248 146 58 9 1439 301 195 0 88 chr5 112062578 112062741 -40474518 - ORR1D1 LTR MaLR -253 141 40 1 1439 582 201 0 65 chr5 112062712 112062850 -40474409 - ORR1D1 LTR MaLR -245 129 1 1 1440 265 264 83 0 chr5 112067769 112067841 -40469418 + MTEb LTR MaLR 287 364 -15 1 1440 1982 214 9 19 chr5 112072015 112072435 -40464824 - MTD LTR MaLR 0 419 4 1 1440 2068 82 7 10 chr5 112078976 112079273 -40457986 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 29 1 1440 372 166 53 46 chr5 112079277 112079364 -40457895 - ORR1A2 LTR MaLR -295 99 1 1 1440 479 245 109 6 chr5 112082228 112082384 -40454875 - MTC LTR MaLR 0 419 248 1 1440 684 236 34 16 chr5 112082639 112082842 -40454417 - MTC LTR MaLR -180 241 14 1 1440 1407 220 77 3 chr5 112084100 112084438 -40452821 - ORR1D1 LTR MaLR -9 365 3 1 1440 780 286 24 190 chr5 112097379 112097880 -40439379 + MTE-int LTR MaLR 110 527 -1053 1 1440 452 182 19 0 chr5 112098161 112098267 -40438992 + ORR1B1 LTR MaLR 1 139 -255 1 1440 268 208 0 25 chr5 112098270 112098349 -40438910 + ORR1A1 LTR MaLR 32 108 -238 1 1440 2022 94 3 10 chr5 112098426 112098727 -40438532 + ORR1A2 LTR MaLR 28 326 -1 1 1440 1417 208 76 24 chr5 112099552 112099882 -40437377 - MTD LTR MaLR -72 347 1 1 1440 261 293 154 8 chr5 112113492 112113609 -40423650 - MLT1G3 LTR MaLR -191 404 271 1 1440 1022 252 67 4 chr5 112115938 112116205 -40421054 - MTE2b LTR MaLR -95 284 1 1 1440 1542 172 183 112 chr5 112119642 112120114 -40417145 + MT2A LTR ERVL 1 512 -21 2 1440 1542 172 183 112 chr5 112120323 112120348 -40416911 + MT2A LTR ERVL 513 533 0 2 1440 249 278 57 50 chr5 112120619 112120759 -40416500 + RMER15 LTR ERVL 404 544 -31 2 1440 1902 237 71 81 chr5 112124001 112124913 -40412346 + RMER17B LTR ERVK 8 872 -36 2 1440 291 236 35 83 chr5 112133713 112133776 -40403483 - RMER17D LTR ERVK -373 516 466 2 1440 291 236 35 83 chr5 112133815 112134005 -40403254 - RMER17D LTR ERVK -424 465 275 2 1440 235 305 183 0 chr5 112137984 112138115 -40399144 + MLT1B LTR MaLR 210 364 -26 2 1440 1961 189 51 23 chr5 112144399 112144788 -40392471 - MTD LTR MaLR -8 411 12 2 1440 1251 172 114 15 chr5 112145644 112145915 -40391344 - MTD LTR MaLR -12 407 110 2 1440 360 330 38 19 chr5 112156415 112156625 -40380634 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1041 2 1440 1098 196 156 36 chr5 112162120 112162454 -40374805 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1440 239 319 14 0 chr5 112164032 112164104 -40373155 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 324 2 1440 1078 211 14 51 chr5 112164804 112165098 -40372161 + RMER10A LTR ERVL 3 285 -157 2 1440 473 234 32 16 chr5 112165493 112165619 -40371640 + RMER10A LTR ERVL 315 442 0 2 1440 226 277 130 92 chr5 112166094 112166136 -40371123 + RMER12 LTR ERVK 719 758 -564 2 1440 1022 184 302 0 chr5 112166136 112166457 -40370802 - MTD LTR MaLR -1 418 1 2 1440 226 277 130 92 chr5 112166457 112166676 -40370583 + RMER12 LTR ERVK 759 990 -332 2 1440 903 134 72 5 chr5 112169178 112169368 -40367891 + MTC LTR MaLR 102 305 -95 2 1440 385 309 65 14 chr5 112169582 112169720 -40367539 - MLT1C LTR MaLR -273 194 50 2 1440 2074 92 30 0 chr5 112173466 112173770 -40363489 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 15 2 1440 1238 211 102 148 chr5 112175444 112175553 -40361706 + ORR1C2 LTR MaLR 3 109 -275 3 1440 1238 211 102 148 chr5 112175731 112175858 -40361401 + ORR1C2 LTR MaLR 110 191 -193 3 1440 1238 211 102 148 chr5 112175893 112176055 -40361204 + ORR1C2 LTR MaLR 192 384 0 3 1440 888 270 55 24 chr5 112176055 112176309 -40360950 + ORR1D2 LTR MaLR 21 282 -88 3 1440 384 228 0 12 chr5 112176586 112176666 -40360593 + ORR1D2 LTR MaLR 288 366 -4 3 1440 238 353 22 22 chr5 112184245 112184381 -40352878 - MLT1K LTR MaLR 0 595 460 3 1440 1702 153 108 29 chr5 112185668 112185831 -40351428 + ORR1C2 LTR MaLR 12 166 -218 3 1440 1702 153 108 29 chr5 112185914 112186094 -40351165 + ORR1C2 LTR MaLR 167 380 -4 3 1440 391 221 28 46 chr5 112186499 112186608 -40350651 - MTEa LTR MaLR -14 365 259 3 1440 934 313 14 37 chr5 112187030 112187325 -40349934 - MTEa LTR MaLR -89 290 3 3 1440 245 279 43 80 chr5 112188267 112188454 -40348805 - MLT2B5 LTR ERVL -300 301 122 3 1440 961 243 62 0 chr5 112188300 112188543 -40348716 - MTEb LTR MaLR -121 258 1 3 1440 1938 141 8 83 chr5 112193939 112194311 -40342948 + ORR1B1 LTR MaLR 51 394 0 3 1440 267 286 0 42 chr5 112197120 112197215 -40340044 + MLT1A1 LTR MaLR 317 407 -1 3 1441 296 333 70 7 chr5 112207306 112207448 -40329811 + MLT1F2 LTR MaLR 1 151 -409 3 1441 3164 53 2 32 chr5 112212858 112213266 -40323993 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1441 649 290 172 47 chr5 112213269 112213566 -40323693 - MTEa LTR MaLR -36 343 10 3 1441 225 291 33 55 chr5 112213777 112213868 -40323391 + MTEa LTR MaLR 47 135 -244 3 1441 2983 185 173 14 chr5 112216167 112216803 -40320456 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 3 1441 1112 245 104 15 chr5 112230525 112230853 -40306406 - MTE2b LTR MaLR -4 375 19 3 1441 359 326 101 47 chr5 112237925 112238182 -40299077 + RMER12 LTR ERVK 690 960 -362 4 1441 2437 108 12 3 chr5 112243365 112243708 -40293551 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1441 1112 270 60 17 chr5 112244342 112244692 -40292567 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 5 4 1441 230 381 33 33 chr5 112246243 112246425 -40290834 - LTR37A LTR ERV1 0 426 245 4 1441 851 251 156 31 chr5 112251337 112251400 -40285859 + MTEa LTR MaLR 5 61 -318 4 1441 851 251 156 31 chr5 112251445 112251669 -40285590 + MTEa LTR MaLR 62 328 -51 4 1441 3867 35 49 0 chr5 112254422 112254875 -40282384 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 1441 337 256 57 79 chr5 112255607 112255747 -40281512 - LTR33B LTR ERVL -332 171 35 4 1441 3210 83 0 2 chr5 112256443 112256843 -40280416 - MTB LTR MaLR -1 399 1 4 1441 258 321 85 72 chr5 112257097 112257412 -40279847 - ORR1E LTR MaLR -5 354 23 4 1441 3827 141 7 74 chr5 112257883 112258836 -40278423 + RMER17A2 LTR ERVK 31 865 -24 4 1441 2912 97 12 17 chr5 112260939 112261348 -40275911 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1441 1691 232 72 8 chr5 112262614 112263005 -40274254 - MTD LTR MaLR -3 416 1 4 1441 2273 257 86 143 chr5 112263005 112264339 -40272920 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 2 4 1441 1594 211 67 76 chr5 112264340 112264746 -40272513 - MTD LTR MaLR 0 421 20 4 1441 244 287 25 92 chr5 112271855 112271974 -40265285 - MLT1B LTR MaLR -279 111 1 4 1441 237 269 25 141 chr5 112274211 112274332 -40262927 + MLT1A1 LTR MaLR 12 118 -247 4 1441 306 241 0 139 chr5 112274401 112274502 -40262757 + MLT1A1 LTR MaLR 315 401 -7 4 1441 1911 189 65 3 chr5 112275177 112275564 -40261695 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 4 1441 575 258 103 42 chr5 112277920 112278092 -40259167 - ORR1E LTR MaLR -111 267 98 4 1441 575 252 102 36 chr5 112278162 112278247 -40259012 - ORR1E LTR MaLR -251 108 1 4 1441 2304 222 100 40 chr5 112279081 112279843 -40257416 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 4 1441 2951 104 10 17 chr5 112280465 112280875 -40256384 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1441 999 227 127 22 chr5 112283152 112283397 -40253862 + MTD LTR MaLR 1 274 -145 4 1441 468 176 22 0 chr5 112283397 112283488 -40253771 - MTD LTR MaLR -1 418 326 4 1441 270 282 0 56 chr5 112287638 112287685 -40249574 + ORR1C2 LTR MaLR 33 79 -295 4 1441 270 282 0 56 chr5 112287907 112287949 -40249310 + ORR1C2 LTR MaLR 80 117 -257 4 1441 665 204 86 0 chr5 112288134 112288296 -40248963 + ORR1C2 LTR MaLR 209 384 0 4 1441 920 251 40 71 chr5 112288296 112288646 -40248613 - ORR1D1 LTR MaLR -31 343 5 4 1441 1251 260 69 6 chr5 112288650 112288983 -40248276 - MTD LTR MaLR -63 356 3 4 1441 264 318 45 27 chr5 112290321 112290431 -40246828 + MLT1A LTR MaLR 20 131 -243 4 1441 359 197 19 7 chr5 112291440 112291546 -40245713 + MTD LTR MaLR 12 141 -253 4 1441 1218 145 0 10 chr5 112291572 112291774 -40245485 + ORR1A1 LTR MaLR 44 243 -103 4 1441 1130 220 60 21 chr5 112291758 112292041 -40245218 + MTD LTR MaLR 118 411 -8 4 1441 236 299 0 0 chr5 112296130 112296197 -40241062 - MTEa LTR MaLR 0 379 313 4 1441 1285 250 42 0 chr5 112296524 112296836 -40240423 - MTEa LTR MaLR -54 325 1 4 1441 1848 100 224 58 chr5 112302138 112302499 -40234760 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1441 295 272 257 0 chr5 112304467 112304603 -40232656 - MTEa LTR MaLR -203 176 6 5 1441 437 156 0 0 chr5 112307598 112307655 -40229604 + ORR1A3 LTR MaLR 1 57 -272 5 1441 722 202 13 56 chr5 112307655 112307862 -40229397 + ORR1A3 LTR MaLR 1 228 -166 5 1441 1735 173 32 30 chr5 112307858 112308390 -40228869 - ORR1A4 LTR MaLR -8 386 1 5 1442 1333 189 156 9 chr5 112333922 112334242 -40203017 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 1 5 1442 920 146 109 0 chr5 112334243 112334435 -40202824 - ORR1D1-int LTR MaLR -16 1354 1142 5 1442 467 246 39 16 chr5 112334436 112334564 -40202695 + MTC LTR MaLR 1 131 -290 5 1442 780 160 0 0 chr5 112334495 112334620 -40202639 - MTC LTR MaLR -296 125 1 5 1442 5334 202 44 18 chr5 112334624 112334877 -40202382 - MTC-int LTR MaLR -4 1254 1011 5 1442 5334 202 44 18 chr5 112334901 112335852 -40201407 - MTC-int LTR MaLR -248 1010 20 5 1442 1274 186 9 4 chr5 112335856 112336088 -40201171 + MTC LTR MaLR 60 292 -129 5 1442 1298 237 62 23 chr5 112340496 112340850 -40196409 - MTEa LTR MaLR -11 368 1 5 1442 2943 80 15 2 chr5 112357437 112357839 -40179420 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1442 362 269 241 10 chr5 112361637 112361840 -40175419 - RMER15 LTR ERVL -2 573 324 5 1442 307 255 111 41 chr5 112361831 112362003 -40175256 - RMER15 LTR ERVL -386 189 6 5 1442 2226 83 3 60 chr5 112365194 112365541 -40171718 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1442 2796 170 70 44 chr5 112366052 112366818 -40170441 - RMER13B LTR ERVK -1 907 1 5 1442 2847 64 17 53 chr5 112368774 112369189 -40168070 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1442 1106 139 51 5 chr5 112369632 112369827 -40167432 - MTC LTR MaLR -8 413 210 6 1442 551 257 21 98 chr5 112369801 112369995 -40167264 + MT2B LTR ERVL 349 527 -74 6 1442 235 179 18 18 chr5 112370354 112370411 -40166848 + MLT2B1 LTR ERVL 511 567 0 6 1442 484 287 22 0 chr5 112376301 112376437 -40160822 + ORR1D2 LTR MaLR 1 139 -231 6 1442 1973 58 0 0 chr5 112376548 112376809 -40160450 + RLTR10A LTR ERVK 1 261 -150 6 1442 950 77 0 0 chr5 112376796 112376926 -40160333 + RLTR27 LTR ERVK 179 308 -1 6 1442 352 78 39 0 chr5 112376951 112377002 -40160257 + MMERVK10C-int LTR ERVK 210 262 -7319 6 1442 562 106 0 23 chr5 112377583 112377670 -40159589 + IAP-d-int LTR ERVK 93 177 -6365 6 1442 728 206 13 0 chr5 112377664 112377819 -40159440 + IAP-d-int LTR ERVK 347 503 -6039 6 1442 3242 52 128 19 chr5 112377819 112378289 -40158970 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5527 -1015 6 1442 4741 84 25 16 chr5 112378335 112379028 -40158231 + RLTR10-int LTR ERVK 1288 1986 -1 6 1442 2114 80 134 35 chr5 112379028 112379402 -40157857 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 6 1442 908 155 42 0 chr5 112380184 112380352 -40156907 + ORR1D2 LTR MaLR 195 369 -1 6 1442 777 231 190 23 chr5 112383469 112383774 -40153485 - MTD LTR MaLR -58 361 6 6 1442 1451 310 77 74 chr5 112383855 112384772 -40152487 - MT-int LTR MaLR -134 964 45 6 1442 697 181 32 5 chr5 112393484 112393660 -40143599 - MT2A LTR ERVL -61 540 347 6 1442 3085 176 34 19 chr5 112393675 112394266 -40142993 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3210 2551 1952 6 1442 551 245 67 25 chr5 112395170 112395462 -40141797 + RMER15 LTR ERVL 7 428 -147 6 1442 239 303 54 43 chr5 112399392 112399485 -40137774 + MLT1C LTR MaLR 358 451 -16 6 1442 371 286 159 45 chr5 112401359 112401579 -40135680 + MTEa LTR MaLR 1 245 -134 6 1442 2883 31 2 169 chr5 112405281 112405747 -40131512 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 6 1442 14333 20 58 71 chr5 112405749 112407757 -40129502 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 3 6 1442 2789 39 2 199 chr5 112407761 112408244 -40129015 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 6 1442 555 127 0 0 chr5 112409821 112409929 -40127330 + ORR1A2 LTR MaLR 1 108 -238 6 1442 1872 118 42 21 chr5 112409929 112410318 -40126941 + ORR1A2 LTR MaLR 1 392 -2 6 1442 1794 122 68 20 chr5 112412417 112412711 -40124548 + MTC LTR MaLR 1 308 -113 6 1442 440 222 20 20 chr5 112413065 112413166 -40124093 + MTC LTR MaLR 316 416 -3 6 1442 703 324 37 12 chr5 112413666 112413907 -40123352 - MLT1J1 LTR MaLR -146 298 52 7 1442 427 0 0 19 chr5 112418741 112418793 -40118466 + MTA_Mm LTR MaLR 1 51 -345 7 1442 1873 47 4 0 chr5 112418772 112419005 -40118254 + MTA_Mm LTR MaLR 163 396 0 7 1442 1321 214 150 25 chr5 112419421 112419780 -40117479 - MTD LTR MaLR -15 404 1 7 1442 250 300 133 0 chr5 112422133 112422223 -40115036 - MLT1J LTR MaLR -309 203 102 7 1442 769 296 106 32 chr5 112422304 112422615 -40114644 + MTEa LTR MaLR 1 334 -45 7 1442 370 269 112 9 chr5 112422641 112422757 -40114502 + MTE-int LTR MaLR 1 128 -1452 7 1442 256 275 49 69 chr5 112423060 112423190 -40114069 - MLT1J LTR MaLR -351 161 4 7 1442 388 250 10 29 chr5 112427587 112427690 -40109569 + MTC-int LTR MaLR 1158 1258 0 7 1442 1856 129 52 112 chr5 112427704 112428071 -40109188 - ORR1A1 LTR MaLR -1 345 1 7 1442 1751 173 100 54 chr5 112428074 112428465 -40108794 + MTD LTR MaLR 11 419 0 7 1442 308 248 39 93 chr5 112428573 112428702 -40108557 - RMER15 LTR ERVL -43 532 411 7 1442 314 313 23 63 chr5 112428931 112429105 -40108154 + MTEb LTR MaLR 212 378 -1 7 1442 381 155 14 14 chr5 112434220 112434292 -40102967 + MTD LTR MaLR 1 72 -347 7 1442 1022 162 322 10 chr5 112434564 112434843 -40102416 + MTD LTR MaLR 47 421 0 7 1442 256 372 11 0 chr5 112440545 112440639 -40096620 - MLT1D LTR MaLR -9 496 402 7 1442 328 252 168 15 chr5 112441157 112441294 -40095965 + ORR1C1 LTR MaLR 24 181 -197 7 1442 958 91 0 0 chr5 112446194 112446326 -40090933 + ORR1A3 LTR MaLR 194 325 -1 7 1442 1724 185 100 5 chr5 112447010 112447379 -40089880 + MTC LTR MaLR 5 408 -13 7 1442 5267 180 70 22 chr5 112447384 112448585 -40088674 + MTC-int LTR MaLR 1 1258 0 7 1442 2211 147 23 16 chr5 112448585 112448973 -40088286 + MTC LTR MaLR 1 391 -30 7 1442 5278 112 88 7 chr5 112453562 112454448 -40082811 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 7 180 284 290 0 115 chr5 112459666 112459779 -40077480 - MT2B LTR ERVL -360 241 142 7 1443 487 121 0 62 chr5 112460886 112460983 -40076276 + ORR1A2 LTR MaLR 1 91 -236 7 1443 279 181 0 48 chr5 112460996 112461093 -40076166 + ORR1A2 LTR MaLR 41 122 -272 7 1443 308 198 0 34 chr5 112461073 112461162 -40076097 + ORR1A2 LTR MaLR 65 150 -244 7 1443 287 186 0 19 chr5 112461162 112461266 -40075993 + ORR1B1 LTR MaLR 41 141 -253 7 1443 233 169 0 17 chr5 112461242 112461302 -40075957 + ORR1B1 LTR MaLR 82 140 -254 7 1443 320 105 55 74 chr5 112461302 112461436 -40075823 + ORR1B2 LTR MaLR 1 117 -277 7 1443 1953 101 3 13 chr5 112461440 112461742 -40075517 + ORR1A2 LTR MaLR 29 327 0 7 1443 408 302 32 91 chr5 112465014 112465323 -40071936 + ORR1E LTR MaLR 22 312 -47 7 1443 1711 165 32 59 chr5 112472764 112473138 -40064121 + MTC LTR MaLR 58 421 0 8 1443 287 220 193 83 chr5 112477263 112477372 -40059887 + MTE2b LTR MaLR 258 378 -1 8 1443 275 349 123 65 chr5 112478344 112478564 -40058695 - MER74B LTR ERVL -95 527 299 8 1443 1970 193 17 19 chr5 112478564 112478981 -40058278 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 8 1443 275 349 123 65 chr5 112478981 112479192 -40058067 - MER74B LTR ERVL -324 298 71 8 1443 454 221 226 21 chr5 112483164 112483354 -40053905 + MTEb LTR MaLR 127 355 -24 8 1443 410 314 103 39 chr5 112487283 112487510 -40049749 + MLT1A LTR MaLR 86 328 -46 8 1443 1290 139 153 40 chr5 112487696 112488050 -40049209 + ORR1A3 LTR MaLR 1 327 0 8 1443 455 97 0 0 chr5 112488848 112488910 -40048349 + ORR1A3 LTR MaLR 218 279 -47 8 1443 312 313 16 73 chr5 112497624 112497748 -40039511 + ORR1D2 LTR MaLR 50 166 -204 8 1443 1177 192 58 143 chr5 112501546 112501923 -40035336 + ORR1A1 LTR MaLR 1 345 -1 7 1443 810 302 88 0 chr5 112506801 112507106 -40030153 - ORR1E LTR MaLR -2 357 26 1 1443 384 278 49 68 chr5 112507837 112507999 -40029260 + MTEb LTR MaLR 20 178 -201 1 1443 428 250 56 67 chr5 112508149 112508329 -40028930 + RMER15 LTR ERVL 33 210 -365 1 1443 3168 75 5 2 chr5 112508617 112509016 -40028243 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1443 1891 126 11 2 chr5 112513993 112514409 -40022850 - ORR1A2 LTR MaLR -1 393 1 2 1443 1825 115 32 27 chr5 112515445 112515834 -40021425 - ORR1A4 LTR MaLR -8 386 1 2 1443 779 196 15 82 chr5 112516962 112517157 -40020102 + ORR1D1 LTR MaLR 1 182 -192 3 1443 281 158 0 95 chr5 112517219 112517271 -40019988 + ORR1C2 LTR MaLR 120 166 -212 3 1443 878 181 87 10 chr5 112517368 112517563 -40019696 + ORR1C2 LTR MaLR 175 384 0 3 1443 249 182 325 0 chr5 112520955 112521032 -40016227 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 307 4 1443 245 299 58 0 chr5 112521894 112521981 -40015278 - MLT1A1 LTR MaLR -349 118 27 4 1443 1025 223 28 0 chr5 112523688 112523899 -40013360 - MTD LTR MaLR -190 229 13 4 1443 560 142 160 0 chr5 112524693 112524799 -40012460 - RMER15 LTR ERVL -5 570 448 5 1443 659 184 25 56 chr5 112525082 112525243 -40012016 + RMER15 LTR ERVL 51 206 -369 5 1443 1237 186 37 50 chr5 112525321 112525652 -40011607 - RMER15 LTR ERVL -154 421 51 5 1443 325 310 0 81 chr5 112526240 112526363 -40010896 + MLT1D LTR MaLR 273 385 -120 5 1443 3102 134 16 40 chr5 112528900 112529445 -40007814 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 3 5 1443 795 135 106 30 chr5 112529447 112529645 -40007614 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 2114 5 1443 2838 65 55 47 chr5 112529930 112530333 -40006926 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 1 6 1443 3033 142 24 16 chr5 112533064 112533565 -40003694 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 6 1443 912 218 138 106 chr5 112534190 112534413 -40002846 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 153 6 1443 912 218 138 106 chr5 112534581 112534706 -40002553 - ORR1D1 LTR MaLR -222 152 15 6 1443 244 319 33 49 chr5 112537972 112538094 -39999165 - MLT1E2 LTR MaLR -488 139 20 7 1443 1365 160 140 56 chr5 112538869 112539247 -39998012 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 7 1443 631 187 266 6 chr5 112540884 112541061 -39996198 - RMER4A LTR ERVK -19 566 344 8 1443 1263 172 39 8 chr5 112541246 112541503 -39995756 - RMER4A LTR ERVK -201 265 1 8 1443 249 336 91 21 chr5 112544425 112544568 -39992691 - MLT1J2 LTR MaLR -119 329 177 8 1443 229 373 23 40 chr5 112545195 112545371 -39991888 + RLTR21 LTR ERVK 1084 1256 -316 8 1443 451 228 150 0 chr5 112549695 112549833 -39987426 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 233 9 1443 499 319 103 39 chr5 112550089 112550399 -39986860 - ORR1E LTR MaLR -20 339 10 9 1443 2442 116 33 50 chr5 112551541 112551960 -39985299 - MTC LTR MaLR 0 421 10 9 1443 253 304 63 94 chr5 112553889 112554016 -39983243 - MLT1B LTR MaLR -68 322 200 9 1443 489 219 14 53 chr5 112555891 112556108 -39981151 - ORR1A1 LTR MaLR -234 160 8 1 1443 514 173 13 8 chr5 112556244 112556378 -39980881 + ORR1A4 LTR MaLR 1 151 -243 1 1443 2532 92 30 0 chr5 112556870 112557206 -39980053 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1443 422 332 80 68 chr5 112558843 112559179 -39978080 - ORR1E LTR MaLR -10 349 10 1 1443 3097 45 39 8 chr5 112559318 112559702 -39977557 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1443 481 334 87 119 chr5 112564514 112564908 -39972351 - MLT1H LTR MaLR 0 549 157 1 1443 481 334 87 119 chr5 112565206 112565341 -39971918 - MLT1H LTR MaLR -393 156 37 1 1443 1126 188 67 64 chr5 112565419 112565731 -39971528 - RMER13B LTR ERVK -1 907 595 1 1443 482 185 0 0 chr5 112567345 112567458 -39969801 + ORR1A2 LTR MaLR 1 113 -233 1 1443 1890 117 14 8 chr5 112567493 112567819 -39969440 + ORR1A2 LTR MaLR 11 338 -8 1 1443 2935 106 2 48 chr5 112568385 112568821 -39968438 - MTC LTR MaLR -1 420 5 1 1443 6563 159 60 24 chr5 112568825 112570039 -39967220 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1 1 1443 2352 154 72 3 chr5 112570043 112570434 -39966825 - MTC LTR MaLR -3 418 1 1 1443 424 246 257 49 chr5 112570917 112571230 -39966029 + MT-int LTR MaLR 678 955 -143 1 1443 1354 230 41 9 chr5 112573771 112574113 -39963146 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 1 1443 1621 127 62 163 chr5 112584147 112584360 -39952899 + MTC LTR MaLR 34 210 -211 1 1443 1621 127 62 163 chr5 112584551 112584760 -39952499 + MTC LTR MaLR 211 413 -8 1 1443 256 291 11 34 chr5 112586132 112586221 -39951038 - MLT1K LTR MaLR -345 250 164 1 1443 242 294 100 65 chr5 112588381 112588581 -39948678 + RMER12 LTR ERVK 741 947 -375 1 1443 352 316 60 38 chr5 112588581 112588765 -39948494 + RMER12 LTR ERVK 771 958 -364 1 1443 281 176 0 0 chr5 112590181 112590230 -39947029 - ORR1E LTR MaLR -8 371 323 1 1443 846 274 95 0 chr5 112590568 112590842 -39946417 - ORR1E LTR MaLR -42 317 18 1 1444 657 280 105 63 chr5 112591718 112592069 -39945190 + MTEa LTR MaLR 1 366 -13 1 1444 997 302 122 22 chr5 112592085 112592573 -39944686 + MTEa-int LTR MaLR 30 520 -989 1 1444 1099 305 134 13 chr5 112592931 112593393 -39943866 + MTEa-int LTR MaLR 1008 1525 -55 1 1444 812 183 433 8 chr5 112598775 112599128 -39938131 - RMER15 LTR ERVL -43 532 30 1 1444 2065 169 39 42 chr5 112601053 112601460 -39935799 + RMER19B LTR ERVK 497 902 0 1 1444 1276 295 12 92 chr5 112601600 112602011 -39935248 + MTE2b LTR MaLR 1 378 -1 1 1444 314 349 117 23 chr5 112602774 112603073 -39934186 - MLT2B3 LTR ERVL -65 489 163 2 1444 898 253 103 40 chr5 112605195 112605516 -39931743 - MTD LTR MaLR -78 341 1 2 1444 439 178 17 86 chr5 112605530 112605635 -39931624 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 430 2 1444 2137 74 3 7 chr5 112605635 112605935 -39931324 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 29 2 1444 462 185 0 0 chr5 112605950 112606042 -39931217 - ORR1A0 LTR MaLR -254 92 1 2 1444 1667 243 33 31 chr5 112606042 112606466 -39930793 - RLTR11A LTR ERVK -97 431 7 2 1444 1042 266 114 27 chr5 112606474 112606807 -39930452 + MTE2a LTR MaLR 16 377 -2 2 1444 265 254 12 78 chr5 112607470 112607713 -39929546 + RMER17D LTR ERVK 234 460 -429 2 1444 559 275 45 35 chr5 112609058 112609258 -39928001 + ORR1E LTR MaLR 8 209 -150 2 1444 306 347 64 91 chr5 112610265 112610309 -39926950 - ORR1E LTR MaLR -18 341 296 2 1444 306 347 64 91 chr5 112610329 112610626 -39926633 - ORR1E LTR MaLR -64 295 9 2 1444 1122 334 167 38 chr5 112610632 112611295 -39925964 - MTE-int LTR MaLR -51 1529 781 2 1444 225 222 127 0 chr5 112611342 112611405 -39925854 - MTE-int LTR MaLR -965 615 545 2 1444 1366 279 52 10 chr5 112611406 112611808 -39925451 - MTE-int LTR MaLR -1137 443 25 2 1444 479 259 149 70 chr5 112611797 112612038 -39925221 - ORR1E LTR MaLR -49 310 51 2 1444 282 283 54 11 chr5 112614494 112614587 -39922672 - MLT1A LTR MaLR -10 364 268 2 1444 4457 14 2 12 chr5 112616034 112616532 -39920727 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1444 297 0 0 0 chr5 112616532 112616570 -39920689 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 1444 370 167 46 35 chr5 112616570 112616657 -39920602 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 2 1444 45850 16 6 0 chr5 112616657 112621983 -39915276 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 2 1444 4457 14 2 12 chr5 112621983 112622481 -39914778 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1444 494 237 65 135 chr5 112622490 112622690 -39914569 + MTE2a LTR MaLR 9 194 -185 2 1444 1330 234 40 119 chr5 112622704 112622880 -39914379 + RMER4B LTR ERVK 35 212 -373 2 1444 2400 86 185 3 chr5 112622880 112623253 -39914006 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 2 1444 1330 234 40 119 chr5 112623253 112623427 -39913832 + RMER4B LTR ERVK 213 337 -248 2 1444 1330 234 40 119 chr5 112623561 112623804 -39913455 + RMER4B LTR ERVK 338 584 -1 2 1444 705 213 106 10 chr5 112624196 112624395 -39912864 - MTEa LTR MaLR -159 220 3 2 1444 2400 64 3 112 chr5 112626320 112626396 -39910863 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 287 2 1444 2400 64 3 112 chr5 112626543 112626833 -39910426 - ORR1A2 LTR MaLR -41 286 1 2 1444 382 266 175 63 chr5 112627151 112627340 -39909919 - MTD LTR MaLR -98 321 112 2 1444 4617 133 4 39 chr5 112628757 112629474 -39907785 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 2 1444 885 283 81 33 chr5 112631311 112631644 -39905615 + MTE2b LTR MaLR 1 349 -30 2 1444 824 247 233 3 chr5 112632225 112632526 -39904733 + MTE2b LTR MaLR 1 370 -9 2 1444 282 310 0 11 chr5 112635847 112635935 -39901324 - MTEa LTR MaLR -1 378 292 2 1444 242 286 36 45 chr5 112635969 112636079 -39901180 + RMER15 LTR ERVL 48 156 -419 2 1444 415 292 181 23 chr5 112636110 112636331 -39900928 + RMER15 LTR ERVL 306 561 -14 2 1444 3286 60 2 2 chr5 112636574 112636974 -39900285 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1444 3161 49 0 117 chr5 112651162 112651413 -39885846 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 198 2 1444 3161 49 0 117 chr5 112651563 112651772 -39885487 - MTB_Mm LTR MaLR -210 197 1 2 1444 257 244 19 126 chr5 112651968 112651989 -39885270 + MT2B2 LTR ERVL 149 158 -426 2 1444 1770 218 61 19 chr5 112659515 112659875 -39877384 - MTEa LTR MaLR -2 377 3 3 1444 2970 87 10 17 chr5 112664737 112665147 -39872112 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1444 944 251 135 111 chr5 112670835 112671242 -39866017 + MT2A LTR ERVL 3 419 -114 3 1444 235 234 0 0 chr5 112671265 112671312 -39865947 + MT2A LTR ERVL 538 584 0 3 1444 225 254 17 17 chr5 112671636 112671696 -39865563 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 3 1444 1470 176 269 3 chr5 112671772 112672159 -39865100 + RMER15 LTR ERVL 83 572 -3 3 1444 1468 250 85 45 chr5 112674148 112674725 -39862534 - RMER13A LTR ERVK -214 646 1 3 1444 347 250 0 13 chr5 112676569 112676646 -39860613 + MLT1K LTR MaLR 163 238 -357 3 1444 368 268 49 44 chr5 112681044 112681247 -39856012 - RMER12 LTR ERVK -348 974 771 3 1444 852 259 157 13 chr5 112714105 112714418 -39822841 - MTEa LTR MaLR 0 379 22 4 1445 407 307 76 84 chr5 112745045 112745308 -39791951 - MTEa LTR MaLR -116 263 3 4 1445 274 328 0 0 chr5 112747393 112747460 -39789799 + MTE2a LTR MaLR 75 141 -238 4 1445 467 310 106 12 chr5 112747560 112747815 -39789444 + MT2A LTR ERVL 248 526 -7 4 1445 255 254 70 0 chr5 112748081 112748152 -39789107 + MT2A LTR ERVL 248 323 -210 4 1445 2073 83 10 15 chr5 112748252 112748587 -39788672 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1445 491 151 0 0 chr5 112748588 112748674 -39788585 - ORR1A2 LTR MaLR -240 87 2 4 1445 294 330 42 25 chr5 112749044 112749162 -39788097 - MLT1G LTR MaLR -287 304 185 4 1445 1849 179 178 50 chr5 112751235 112751736 -39785523 + MT2B LTR ERVL 1 565 -36 4 1445 264 274 97 46 chr5 112752133 112752271 -39784988 + MTD LTR MaLR 1 124 -295 4 1445 408 255 8 94 chr5 112752423 112752540 -39784719 - RLTR33 LTR ERVK -85 593 487 4 1445 412 177 0 0 chr5 112752640 112752719 -39784540 - RLTR19C LTR ERVK -409 97 19 4 1445 354 244 201 49 chr5 112752713 112752877 -39784382 + MTD LTR MaLR 96 284 -135 4 1445 1053 209 244 9 chr5 112754217 112754541 -39782718 - MTD LTR MaLR -2 417 18 5 1445 1173 120 393 0 chr5 112765209 112765443 -39771816 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 1445 235 361 0 0 chr5 112767375 112767458 -39769801 + RMER20B LTR ERVK 351 433 -194 5 1445 3996 111 12 87 chr5 112777344 112778101 -39759158 - RMER6A LTR ERVK 0 756 57 5 1445 2450 148 27 2 chr5 112788837 112789243 -39748016 - MTC LTR MaLR -5 416 1 5 1445 589 219 0 8 chr5 112789245 112789365 -39747894 - RMER15 LTR ERVL -42 533 415 5 1445 1024 191 73 28 chr5 112789375 112789623 -39747636 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1590 5 1445 2955 150 69 61 chr5 112789699 112789942 -39747317 - RLTR22_Mur LTR ERVK -965 883 662 5 1445 2955 150 69 61 chr5 112790089 112790582 -39746677 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1187 661 141 5 1445 602 207 40 46 chr5 112790949 112791101 -39746158 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1697 151 1 5 1445 1385 151 214 24 chr5 112791105 112791437 -39745822 - RMER15 LTR ERVL -154 421 27 5 1445 3116 53 10 53 chr5 112794481 112794899 -39742360 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1445 798 73 66 7 chr5 112794899 112794956 -39742303 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1042 5 1445 798 73 66 7 chr5 112795091 112795170 -39742089 - MTB-int LTR MaLR -57 1041 955 5 1445 638 35 0 23 chr5 112795170 112795258 -39742001 - MTA_Mm LTR MaLR -310 86 1 5 1445 1541 202 76 60 chr5 112800427 112800969 -39736290 - RMER4A LTR ERVK 0 585 6 5 1445 257 241 89 0 chr5 112808902 112808981 -39728278 + MLT1F1 LTR MaLR 308 393 -176 5 1445 264 325 16 16 chr5 112812198 112812320 -39724939 - MLT1K LTR MaLR -7 588 467 5 1445 463 82 31 21 chr5 112815040 112815137 -39722122 + ORR1A2 LTR MaLR 3 117 -277 5 1445 336 203 0 5 chr5 112815129 112815220 -39722039 + ORR1A2 LTR MaLR 28 141 -253 5 1445 259 179 0 29 chr5 112815201 112815270 -39721989 + ORR1A2 LTR MaLR 44 110 -257 5 1445 936 172 1 40 chr5 112815241 112815490 -39721769 + ORR1A2 LTR MaLR 17 212 -134 5 1445 2194 122 109 45 chr5 112816111 112816507 -39720752 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1445 361 353 100 33 chr5 112824806 112825105 -39712154 - ORR1E LTR MaLR -12 347 29 6 1445 424 241 46 0 chr5 112828074 112828182 -39709077 + MTEa LTR MaLR 1 113 -266 6 1445 296 194 44 15 chr5 112828705 112828773 -39708486 + ORR1E LTR MaLR 50 119 -240 6 1445 293 317 50 8 chr5 112829313 112829434 -39707825 + MLT1A1 LTR MaLR 278 403 -5 6 1445 662 259 46 0 chr5 112830504 112830678 -39706581 - MTE2a LTR MaLR 0 379 198 6 1445 649 251 126 0 chr5 112830877 112831060 -39706199 - MTE2a LTR MaLR -173 206 1 6 1445 718 227 133 34 chr5 112833049 112833282 -39703977 - MTD LTR MaLR -3 416 161 6 1445 247 234 98 63 chr5 112836703 112836812 -39700447 - MTE2b LTR MaLR -18 361 243 6 1445 351 243 96 41 chr5 112837240 112837386 -39699873 - MTD LTR MaLR 0 419 266 6 1445 825 194 223 9 chr5 112837534 112837758 -39699501 - MTD LTR MaLR -147 272 1 6 1445 2055 94 13 7 chr5 112841985 112842284 -39694975 + ORR1A2 LTR MaLR 27 327 0 6 1445 283 162 0 0 chr5 112844964 112845032 -39692227 - MT2A LTR ERVL 0 533 466 6 1445 375 186 0 0 chr5 112845277 112845347 -39691912 - MT2A LTR ERVL -400 133 64 6 1445 248 291 0 34 chr5 112845281 112845370 -39691889 - MTE2b LTR MaLR -250 129 44 6 1445 2383 125 16 8 chr5 112846374 112846762 -39690497 + ORR1B1 LTR MaLR 1 391 -3 6 1446 301 279 13 0 chr5 112855369 112855448 -39681811 + MTEa LTR MaLR 296 375 -4 6 1446 314 222 60 24 chr5 112856879 112856962 -39680297 + MLT1A1 LTR MaLR 321 406 -2 6 1446 957 264 107 15 chr5 112860163 112860490 -39676769 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 6 1446 513 226 67 15 chr5 112862416 112862551 -39674708 - MTEa LTR MaLR -207 172 31 6 1446 294 313 60 17 chr5 112866445 112866562 -39670697 - RMER12 LTR ERVK -451 871 750 6 1446 2228 130 45 3 chr5 112869241 112869619 -39667640 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1446 5148 119 70 2 chr5 112871276 112872167 -39665092 + RMER17B LTR ERVK 1 951 -7 7 1446 797 228 32 46 chr5 112881776 112881992 -39655267 + MTC LTR MaLR 206 418 -3 7 1446 868 289 57 69 chr5 112883639 112883988 -39653271 - ORR1E LTR MaLR -13 346 2 7 1446 1266 266 70 19 chr5 112883988 112884404 -39652855 - MTE-int LTR MaLR -52 1528 1038 7 1446 341 336 0 23 chr5 112884568 112884696 -39652563 - MTE-int LTR MaLR -1226 354 230 7 1446 2454 111 18 98 chr5 112884696 112885145 -39652114 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 7 1446 3566 158 160 10 chr5 112885149 112885937 -39651322 + MTC-int LTR MaLR 1 906 -352 7 1446 254 325 31 50 chr5 112894243 112894402 -39642857 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1306 1461 -387 7 1446 238 302 132 77 chr5 112894578 112894851 -39642408 + RMER12 LTR ERVK 778 1065 -257 7 1446 1929 102 27 10 chr5 112897863 112898213 -39639046 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 11 7 1446 274 174 0 48 chr5 112898209 112898292 -39638967 - ORR1A0 LTR MaLR -249 118 44 7 1446 430 191 69 15 chr5 112898290 112898421 -39638838 - ORR1A0 LTR MaLR -253 141 5 7 1446 855 224 200 82 chr5 112898706 112898862 -39638397 + ORR1C2 LTR MaLR 4 173 -211 7 1446 855 224 200 82 chr5 112898976 112899159 -39638100 + ORR1C2 LTR MaLR 174 382 -2 7 1446 1438 132 98 33 chr5 112906755 112907029 -39630230 - MTC LTR MaLR -125 296 5 7 1446 773 299 78 48 chr5 112909239 112909612 -39627647 + MTD LTR MaLR 22 405 -14 7 1446 2326 157 117 14 chr5 112912269 112912774 -39624485 + RLTR31_Mm LTR ERVK 5 561 0 7 1446 330 307 169 38 chr5 112916301 112916514 -39620745 + MER77 LTR ERVL 104 344 -263 7 1446 4764 130 153 9 chr5 112917811 112918161 -39619098 + RMER17B LTR ERVK 1 398 -560 7 1446 4764 130 153 9 chr5 112918186 112918673 -39618586 + RMER17B LTR ERVK 399 957 -1 7 1446 576 284 156 62 chr5 112924868 112925285 -39611974 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 75 7 1446 346 280 0 61 chr5 112927088 112927202 -39610057 + MLT1A1 LTR MaLR 294 400 -8 7 1446 230 240 39 26 chr5 112927510 112927587 -39609672 + ORR1E LTR MaLR 2 79 -280 8 1446 454 306 87 5 chr5 112927767 112927951 -39609308 + ORR1E LTR MaLR 52 250 -109 8 1446 816 261 56 5 chr5 112944487 112944683 -39592576 + MTE2b LTR MaLR 1 206 -173 8 1446 692 230 132 50 chr5 112944762 112944982 -39592277 + ORR1E LTR MaLR 122 359 0 8 1446 285 194 81 0 chr5 112944987 112945049 -39592210 + MTE2b LTR MaLR 294 360 -19 8 1446 2088 152 64 44 chr5 112945132 112945537 -39591722 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 8 1446 1578 201 93 11 chr5 112946140 112946507 -39590752 - MTD LTR MaLR -16 403 7 8 1446 506 173 9 52 chr5 112952888 112953004 -39584255 + ORR1A2 LTR MaLR 1 111 -235 8 1446 1788 126 57 29 chr5 112952981 112953338 -39583921 + ORR1A2 LTR MaLR 28 356 -14 8 1446 406 319 88 44 chr5 112965965 112966214 -39571045 + MLT1J2 LTR MaLR 1 260 -188 8 1446 3038 46 18 5 chr5 112974532 112974923 -39562336 + MTB LTR MaLR 5 400 0 8 1446 430 303 213 40 chr5 112979963 112980259 -39557000 + MLT1A1 LTR MaLR 1 390 -18 8 1447 2464 74 3 0 chr5 112986891 112987216 -39550043 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 9 1447 228 214 30 110 chr5 112987456 112987556 -39549703 + RLTR23 LTR ERV1 142 233 -197 9 1447 296 260 114 64 chr5 112990019 112990159 -39547100 + MLT1G1 LTR MaLR 401 547 -32 9 1447 940 315 45 36 chr5 112991145 112991501 -39545758 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 9 1447 2172 162 47 20 chr5 112999492 112999894 -39537365 - MTC LTR MaLR -8 413 1 9 1447 2052 133 8 7 chr5 113001150 113001555 -39535704 - ORR1A2 LTR MaLR -1 366 1 6 1447 2376 118 86 21 chr5 113013649 113014031 -39523228 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 1447 459 301 142 9 chr5 113014896 113015121 -39522138 - MT2A LTR ERVL -22 511 257 1 1447 1984 112 11 28 chr5 113020581 113021037 -39516222 - ORR1A2 LTR MaLR -12 382 1 3 1447 2208 148 14 31 chr5 113023263 113023680 -39513579 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 1447 417 308 56 7 chr5 113023783 113023927 -39513332 + ORR1E LTR MaLR 11 161 -198 4 1447 1668 218 109 41 chr5 113031362 113031875 -39505384 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 548 -15 6 1447 277 254 23 170 chr5 113033138 113033309 -39503950 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 235 6 1447 4490 151 41 19 chr5 113039976 113040800 -39496459 - RMER13A LTR ERVK -18 842 1 7 1447 701 228 34 0 chr5 113042650 113042799 -39494460 + MTEa LTR MaLR 11 164 -215 8 1447 2360 121 12 62 chr5 113042958 113043380 -39493879 + MTC LTR MaLR 13 413 -8 8 1447 457 242 202 32 chr5 113045372 113045560 -39491699 + MLT2D LTR ERVL 67 286 -128 8 1447 2198 102 6 103 chr5 113048257 113048617 -39488642 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 9 1447 864 254 176 15 chr5 113048719 113049043 -39488216 + MTEa LTR MaLR 4 379 0 9 1447 229 243 13 51 chr5 113049406 113049484 -39487775 + ORR1A0 LTR MaLR 9 83 -263 9 1447 230 325 102 8 chr5 113050130 113050248 -39487011 - MLT1G3 LTR MaLR -18 577 449 1 1447 685 264 145 46 chr5 113052531 113052793 -39484466 - MTE2a LTR MaLR -29 350 63 1 1447 655 133 97 0 chr5 113059702 113059815 -39477444 + MTC LTR MaLR 1 124 -297 1 1447 1873 96 3 11 chr5 113059897 113060180 -39477079 + MTC LTR MaLR 134 414 -7 1 1447 1023 265 67 75 chr5 113060309 113060684 -39476575 + MTE2a LTR MaLR 8 379 0 1 1447 305 242 78 39 chr5 113061701 113061804 -39475455 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 324 1 1447 1608 182 209 29 chr5 113061893 113062271 -39474988 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 1 1447 1483 188 56 3 chr5 113063812 113064117 -39473142 + MTD LTR MaLR 42 362 -57 1 1447 1003 266 103 26 chr5 113064148 113064537 -39472722 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1447 1440 225 74 20 chr5 113066794 113067198 -39470061 + RLTR11A2 LTR ERVK 2 427 -100 1 1447 1636 153 39 62 chr5 113074189 113074645 -39462614 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 1 1447 476 163 29 23 chr5 113074648 113074821 -39462438 - RMER17B LTR ERVK -673 285 181 1 1447 1900 136 61 50 chr5 113074881 113074938 -39462321 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 325 1 1447 1900 136 61 50 chr5 113075125 113075430 -39461829 - ORR1B2 LTR MaLR -43 324 1 1 1447 829 250 169 42 chr5 113075572 113075927 -39461332 + RLTR11A LTR ERVK 10 409 -119 1 1447 564 178 0 0 chr5 113075908 113076015 -39461244 + ORR1A0 LTR MaLR 5 111 -235 1 1447 263 217 36 45 chr5 113075982 113076098 -39461161 + ORR1A0 LTR MaLR 9 114 -232 1 1447 619 193 22 39 chr5 113076161 113076324 -39460935 + RLTR11A LTR ERVK 372 528 0 1 1447 1884 91 50 4 chr5 113076963 113077355 -39459904 + ORR1A2 LTR MaLR 1 394 0 1 1447 486 148 0 111 chr5 113079016 113079115 -39458144 + BGLII_B LTR ERVK 1 88 -353 1 1447 1246 149 7 18 chr5 113079634 113079936 -39457323 + BGLII_B LTR ERVK 87 441 0 1 1447 4343 75 0 14 chr5 113080146 113080738 -39456521 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 1 1447 2306 143 11 0 chr5 113081014 113081392 -39455867 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 1 1447 356 143 8 183 chr5 113082299 113082419 -39454840 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1005 1 1447 1122 179 154 66 chr5 113082716 113082969 -39454290 + RMER17C LTR ERVK 1 276 -134 1 1447 2774 110 13 52 chr5 113082969 113083430 -39453829 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 4 1 1447 1122 179 154 66 chr5 113083430 113083553 -39453706 + RMER17C LTR ERVK 277 410 0 1 1447 1589 168 25 81 chr5 113083775 113084209 -39453050 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 1447 731 182 110 11 chr5 113084679 113084975 -39452284 + RMER17C LTR ERVK 13 410 0 1 1447 1801 127 7 127 chr5 113085980 113086523 -39450736 + RMER17C LTR ERVK 1 439 -519 1 1447 324 321 33 18 chr5 113087519 113087652 -39449607 - MTE2a LTR MaLR -239 180 48 1 1447 3088 71 0 5 chr5 113091477 113091886 -39445373 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 1447 1320 186 179 20 chr5 113097657 113098008 -39439251 - MTD LTR MaLR -12 407 1 1 1447 2403 86 3 3 chr5 113098485 113098812 -39438447 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1447 9587 140 69 23 chr5 113098812 113100688 -39436571 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 1 1447 1772 99 3 76 chr5 113100692 113100747 -39436512 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 273 1 1447 1772 99 3 76 chr5 113100921 113101181 -39436078 - ORR1A2 LTR MaLR -55 272 27 1 1447 616 194 0 51 chr5 113109122 113109283 -39427976 + ORR1D1 LTR MaLR 1 143 -241 2 1447 1281 188 60 7 chr5 113109348 113109655 -39427604 + ORR1D1 LTR MaLR 40 374 0 2 1447 7558 7 4 0 chr5 113111561 113112380 -39424879 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 2 1447 1921 106 39 60 chr5 113113990 113114321 -39422938 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 1 2 1447 252 346 73 86 chr5 113114618 113115013 -39422246 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 2 1448 236 300 108 77 chr5 113115594 113115724 -39421535 + MLT1B LTR MaLR 1 134 -256 2 1448 922 276 140 21 chr5 113117093 113117422 -39419837 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 2 1448 569 231 145 17 chr5 113123957 113124129 -39413130 + MLT1A0 LTR MaLR 149 342 -23 2 1448 568 274 106 12 chr5 113139248 113139418 -39397841 + MTE2b LTR MaLR 22 207 -172 2 1448 2336 91 28 12 chr5 113141590 113141912 -39395347 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1448 226 232 0 104 chr5 113144103 113144180 -39393079 + RMER6C LTR ERVK 345 413 -277 2 1448 1765 184 16 0 chr5 113149742 113150057 -39387202 + MTC LTR MaLR 1 320 -101 2 1448 2146 100 28 19 chr5 113150056 113150373 -39386886 + ORR1A2 LTR MaLR 8 327 0 2 1448 535 208 19 0 chr5 113150373 113150477 -39386782 + MTC LTR MaLR 314 419 0 2 1448 229 268 78 84 chr5 113151995 113152069 -39385190 + MTEb LTR MaLR 205 281 -89 2 1448 278 217 65 0 chr5 113152111 113152203 -39385056 + MTEb LTR MaLR 282 379 0 2 1448 2242 60 21 142 chr5 113152253 113152625 -39384634 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1448 598 233 113 0 chr5 113153441 113153591 -39383668 + ORR1B1 LTR MaLR 226 392 -2 2 1448 299 277 0 46 chr5 113158832 113158919 -39378340 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 324 2 1448 394 324 61 65 chr5 113159847 113160108 -39377151 + ORR1E LTR MaLR 23 282 -77 3 1448 2526 129 8 13 chr5 113160329 113160715 -39376544 + ORR1B1 LTR MaLR 3 386 -8 3 1448 1396 225 80 69 chr5 113160719 113161096 -39376163 + MTD LTR MaLR 25 405 -14 3 1448 2832 239 201 34 chr5 113161105 113162167 -39375092 + MTD-int LTR MaLR 19 1258 0 3 1448 1182 239 141 11 chr5 113162167 113162535 -39374724 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 3 1448 526 328 29 6 chr5 113164593 113164765 -39372494 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 394 3 1448 3083 59 8 2 chr5 113164786 113165179 -39372080 + MTB LTR MaLR 1 395 -5 3 1448 505 291 121 39 chr5 113168632 113168734 -39368525 - MTE2a LTR MaLR -45 334 218 3 1448 505 291 121 39 chr5 113168793 113168947 -39368312 - MTE2a LTR MaLR -162 217 57 3 1448 1632 143 152 7 chr5 113168972 113169281 -39367978 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 3 1448 274 253 141 24 chr5 113169281 113169332 -39367927 - MTE2a LTR MaLR -299 80 20 3 1448 289 298 0 12 chr5 113180553 113180638 -39356621 + MLT1C LTR MaLR 350 433 -34 3 1448 539 312 60 82 chr5 113183390 113183757 -39353502 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 3 1448 1025 230 128 16 chr5 113191157 113191237 -39346022 + ORR1C1 LTR MaLR 33 184 -194 3 1448 1025 161 61 20 chr5 113191288 113191471 -39345788 + ORR1C1 LTR MaLR 185 378 0 3 1448 1244 246 142 3 chr5 113192205 113192543 -39344716 + MTD LTR MaLR 27 411 -8 3 1448 267 352 49 32 chr5 113196083 113196391 -39340868 + RMER12 LTR ERVK 770 1082 -240 3 1448 1392 212 47 107 chr5 113209385 113209833 -39327426 + RLTR11A LTR ERVK 97 517 -11 3 1448 301 218 86 52 chr5 113209970 113210003 -39327256 - MTD LTR MaLR 0 370 340 3 1448 1098 266 104 19 chr5 113210054 113210406 -39326853 - MTD LTR MaLR -32 387 1 3 1448 393 295 25 131 chr5 113212506 113212705 -39324554 + MLT1A LTR MaLR 48 225 -149 3 1448 2413 76 38 0 chr5 113213699 113214014 -39323245 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1448 431 159 0 64 chr5 113216832 113216942 -39320317 + ORR1A4 LTR MaLR 1 141 -253 3 1448 331 171 0 14 chr5 113216942 113217013 -39320246 + ORR1B1 LTR MaLR 82 151 -243 3 1448 1074 148 82 14 chr5 113217134 113217354 -39319905 + ORR1A4 LTR MaLR 95 329 0 3 1448 282 109 22 0 chr5 113221500 113221546 -39315713 + ORR1A4-int LTR MaLR 1917 1963 0 4 1448 1530 149 17 115 chr5 113221546 113221902 -39315357 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 1448 1801 163 46 22 chr5 113227170 113227539 -39309720 + ORR1C2 LTR MaLR 6 383 -1 4 1448 344 341 30 8 chr5 113231754 113231887 -39305372 + MLT1A1 LTR MaLR 269 404 -4 4 1448 750 313 69 19 chr5 113233998 113234376 -39302883 + RMER5 LTR ERV1 98 494 -40 4 1448 3264 48 40 5 chr5 113239492 113239913 -39297346 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1448 852 258 138 25 chr5 113245795 113246077 -39291182 + ORR1E LTR MaLR 6 319 -40 4 1449 899 263 132 37 chr5 113251900 113252248 -39285011 + MTD LTR MaLR 25 405 -14 4 1449 1966 150 32 27 chr5 113265020 113265396 -39271863 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1449 1066 234 88 37 chr5 113290415 113290843 -39246416 + RMER13A LTR ERVK 102 672 -236 5 1449 3064 75 20 3 chr5 113304746 113305136 -39232123 + MTB LTR MaLR 4 400 0 5 1449 2958 85 17 34 chr5 113309032 113309446 -39227813 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1449 5206 151 15 92 chr5 113309501 113310485 -39226774 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 5 1449 2089 144 18 0 chr5 113312990 113313323 -39223936 + ORR1B1 LTR MaLR 47 385 -9 5 1449 547 197 0 101 chr5 113320233 113320391 -39216868 + MTC LTR MaLR 38 179 -242 5 1449 1431 150 54 18 chr5 113320400 113320678 -39216581 + MTC LTR MaLR 134 421 0 5 1449 2285 67 37 113 chr5 113326262 113326615 -39210644 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 5 1449 1928 134 55 60 chr5 113327086 113327468 -39209791 - MTC LTR MaLR -8 413 34 5 1449 2762 181 185 34 chr5 113327475 113328216 -39209043 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 406 5 1449 848 299 55 8 chr5 113330441 113330694 -39206565 - MTD LTR MaLR -150 269 5 5 1449 372 264 77 21 chr5 113330967 113331110 -39206149 - LTR16A LTR ERVL -295 156 6 5 1449 1126 148 0 11 chr5 113331618 113331809 -39205450 - RMER19C LTR ERVK 0 611 423 5 1449 3119 34 0 3 chr5 113331812 113332167 -39205092 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 5 1449 3210 122 29 30 chr5 113332167 113332878 -39204381 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7581 6907 5 1449 455 35 0 0 chr5 113332878 113332935 -39204324 - IAPEY3-int LTR ERVK -2770 4910 4854 5 1449 3340 74 9 2 chr5 113332930 113333379 -39203880 - IAPEY3-int LTR ERVK -4991 2689 2238 5 1449 9262 121 11 35 chr5 113333356 113334850 -39202409 - IAPEY3-int LTR ERVK -5698 1982 524 5 1449 684 159 37 15 chr5 113334850 113334984 -39202275 - IAPEY3-int LTR ERVK -7518 162 26 5 1449 2792 45 3 11 chr5 113334997 113335354 -39201905 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 5 1449 952 173 199 129 chr5 113335358 113335702 -39201557 - RMER19C LTR ERVK -198 413 50 5 1449 952 173 199 129 chr5 113335849 113335890 -39201369 - RMER19C LTR ERVK -562 49 2 5 1449 1928 196 30 5 chr5 113335922 113336327 -39200932 + MTD LTR MaLR 4 418 -1 5 1449 350 208 37 56 chr5 113338236 113338251 -39199008 + ORR1A3-int LTR MaLR 601 613 -1350 6 1449 3005 73 36 97 chr5 113338251 113338410 -39198849 + MT2B2 LTR ERVL 1 118 -466 6 1449 3005 73 36 97 chr5 113338575 113338941 -39198318 + MT2B2 LTR ERVL 119 494 -90 6 1449 289 295 82 17 chr5 113357306 113357439 -39179820 + ORR1E LTR MaLR 37 186 -184 6 1449 414 282 46 37 chr5 113360177 113360394 -39176865 - RMER12 LTR ERVK -334 988 770 6 1449 2111 126 3 23 chr5 113363753 113364095 -39173164 - ORR1A1 LTR MaLR -11 335 1 6 1449 1111 259 52 70 chr5 113368715 113369101 -39168158 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 6 1449 2649 142 70 8 chr5 113372227 113372724 -39164535 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 6 1449 2125 159 38 5 chr5 113372823 113373214 -39164045 + MTC LTR MaLR 18 421 0 6 1450 1016 208 146 74 chr5 113378470 113378971 -39158288 - RMER4B LTR ERVK -9 576 1 6 1450 2233 152 52 5 chr5 113379561 113379963 -39157296 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1450 226 342 88 92 chr5 113380621 113380882 -39156377 + MER67A LTR ERV1 12 271 -272 6 1450 245 304 0 28 chr5 113391752 113391823 -39145436 + MTEb LTR MaLR 13 81 -298 6 1450 305 291 183 33 chr5 113391859 113392012 -39145247 + MTEb LTR MaLR 186 361 -18 6 1450 1312 136 228 24 chr5 113393508 113393846 -39143413 + RMER17C LTR ERVK 4 410 0 6 1450 805 219 0 38 chr5 113401002 113401187 -39136072 - BGLII_B LTR ERVK -10 431 254 7 1450 1951 150 115 0 chr5 113406425 113406791 -39130468 - MTC LTR MaLR -8 413 6 7 1450 1765 82 71 32 chr5 113407340 113407706 -39129553 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 1 7 1450 1180 242 91 3 chr5 113407889 113408208 -39129051 + MTE2b LTR MaLR 31 377 -2 7 1450 239 324 45 9 chr5 113414902 113415014 -39122245 + MTE2b LTR MaLR 23 138 -221 7 1450 391 225 67 11 chr5 113415107 113415196 -39122063 - MTC LTR MaLR -3 418 325 7 1450 1952 138 55 30 chr5 113415196 113415561 -39121698 + ORR1C1 LTR MaLR 1 374 -4 7 1450 1730 97 118 0 chr5 113415560 113415848 -39121411 - MTC LTR MaLR -99 322 1 7 1450 312 301 53 9 chr5 113416133 113416247 -39121012 + MTE2b LTR MaLR 247 365 -14 7 1450 3331 114 12 31 chr5 113419072 113419905 -39117354 + RMER19A LTR ERVK 1 732 -5 7 1450 728 284 118 40 chr5 113421643 113421984 -39115275 + MTE2a LTR MaLR 40 405 -14 7 1450 1329 164 122 10 chr5 113425294 113425590 -39111669 + ORR1D1 LTR MaLR 35 363 -11 7 1450 2049 150 63 48 chr5 113439218 113439371 -39097888 - MTC LTR MaLR -2 419 250 7 1450 2049 150 63 48 chr5 113439402 113439661 -39097598 - MTC LTR MaLR -172 249 2 7 1450 2217 110 19 12 chr5 113448731 113449053 -39088206 + ORR1A3 LTR MaLR 3 326 0 7 1450 265 354 55 8 chr5 113454107 113454236 -39083023 - MLT1E1A LTR MaLR -93 587 470 8 1450 265 368 49 49 chr5 113454426 113454560 -39082699 - MLT1E1A LTR MaLR -211 469 342 8 1450 228 364 39 47 chr5 113456157 113456284 -39080975 + MT2A LTR ERVL 5 130 -403 8 1450 683 327 45 114 chr5 113456173 113456572 -39080687 + MTE2b LTR MaLR 9 419 -2 8 1450 287 285 58 76 chr5 113461462 113461633 -39075626 + MTD LTR MaLR 239 406 -13 8 1450 2132 181 31 35 chr5 113462393 113462874 -39074385 + RLTR16 LTR ERVK 1 479 -26 8 1450 902 284 22 95 chr5 113463479 113463848 -39073411 - MTE2a LTR MaLR -15 364 23 8 1450 1742 189 68 3 chr5 113466331 113466696 -39070563 + RLTR40 LTR ERVK 14 402 -415 8 1450 2337 85 61 32 chr5 113466699 113467074 -39070185 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 8 1450 1471 202 60 56 chr5 113467075 113467489 -39069770 + RLTR40 LTR ERVK 398 813 -4 8 1450 2193 141 69 5 chr5 113468859 113469191 -39068068 - MTC LTR MaLR -2 419 71 8 1450 2193 141 69 5 chr5 113469244 113469304 -39067955 - MTC LTR MaLR -351 70 2 8 1450 243 288 0 14 chr5 113472061 113472135 -39065124 + MLT1K LTR MaLR 412 484 -111 8 1450 925 267 108 47 chr5 113474619 113474961 -39062298 - MTEb LTR MaLR -4 375 13 8 1450 454 238 134 0 chr5 113475521 113475658 -39061601 - MLT1F LTR MaLR -254 315 151 8 1450 431 286 140 66 chr5 113476238 113476481 -39060778 + MLT1H LTR MaLR 90 350 -199 8 1450 1065 241 87 12 chr5 113477660 113477970 -39059289 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 31 8 1450 340 258 43 86 chr5 113478016 113478156 -39059103 - ORR1D2 LTR MaLR -236 134 1 8 1450 359 255 108 0 chr5 113481975 113482077 -39055182 + RMER5 LTR ERV1 191 303 -231 8 1450 2420 124 63 10 chr5 113482114 113482513 -39054746 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 8 1450 1010 308 67 17 chr5 113482513 113482904 -39054355 + RMER5 LTR ERV1 44 454 -80 8 1450 384 324 74 37 chr5 113484355 113484679 -39052580 - MT2A LTR ERVL -7 526 191 8 1450 299 278 98 0 chr5 113484721 113484854 -39052405 - MTEa LTR MaLR -233 146 1 8 1450 403 241 139 82 chr5 113484854 113485060 -39052199 - MLT1C LTR MaLR -249 218 1 8 1450 283 320 113 69 chr5 113490059 113490334 -39046925 + RMER12 LTR ERVK 701 987 -335 8 1450 2729 115 30 64 chr5 113499082 113499518 -39037741 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1450 845 262 164 30 chr5 113501271 113501309 -39035950 + MTD LTR MaLR 5 40 -379 5 1450 845 262 164 30 chr5 113501500 113501827 -39035432 + MTD LTR MaLR 41 419 0 5 1451 367 328 62 106 chr5 113511454 113511795 -39025464 - ORR1E LTR MaLR -16 343 18 2 1451 1116 124 6 6 chr5 113512369 113512547 -39024712 + MTC LTR MaLR 33 210 -211 3 1451 1289 149 19 5 chr5 113512913 113513128 -39024131 + MTC LTR MaLR 196 413 -8 3 1451 520 271 15 15 chr5 113513162 113513280 -39023979 + MTE2b LTR MaLR 1 118 -261 3 1451 264 311 8 109 chr5 113513280 113513395 -39023864 + MTE2b LTR MaLR 1 103 -276 3 1451 1792 168 36 51 chr5 113513395 113513843 -39023416 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 3 1451 731 231 106 55 chr5 113513843 113514094 -39023165 + MTE2a LTR MaLR 115 378 -1 3 1451 725 289 86 29 chr5 113514114 113514456 -39022803 + MT2A LTR ERVL 184 546 -8 3 1451 660 282 162 28 chr5 113514585 113514942 -39022317 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 1451 1403 32 27 5 chr5 113516762 113516950 -39020309 - MTB LTR MaLR 0 400 209 4 1451 882 122 29 0 chr5 113516935 113517074 -39020185 + MTA_Mm LTR MaLR 254 396 0 4 1451 1415 118 147 12 chr5 113530074 113530415 -39006844 + MTC LTR MaLR 1 388 -12 6 1451 306 208 36 90 chr5 113533722 113533833 -39003426 + MT2B LTR ERVL 153 257 -344 6 1451 750 176 157 4 chr5 113534646 113534899 -39002360 + MTEa LTR MaLR 18 379 0 7 1451 796 239 69 0 chr5 113538146 113538334 -38998925 - MTE2a LTR MaLR -56 323 123 8 1451 2421 122 10 60 chr5 113543908 113544325 -38992934 + MTB_Mm LTR MaLR 12 407 0 9 1451 485 182 68 11 chr5 113544992 113545142 -38992117 - MTC LTR MaLR -147 232 72 9 1451 294 316 0 13 chr5 113547911 113547988 -38989271 + MLT1I LTR MaLR 92 167 -244 1 1451 303 225 14 14 chr5 113548088 113548160 -38989099 + MLT1I LTR MaLR 340 411 0 1 1451 280 313 132 55 chr5 113554869 113555104 -38982155 - MTEb LTR MaLR 0 379 124 1 1451 280 313 132 55 chr5 113555131 113555152 -38982107 - MTEb LTR MaLR -256 123 103 1 1451 553 285 105 14 chr5 113558609 113558891 -38978368 + MTEb LTR MaLR 1 364 -15 1 1451 606 312 139 18 chr5 113560280 113560619 -38976640 - MLT1F1 LTR MaLR 0 560 179 1 1451 459 254 118 15 chr5 113561091 113561227 -38976032 - ORR1E LTR MaLR -179 180 31 1 1451 340 321 64 15 chr5 113578702 113578868 -38958391 + MTD LTR MaLR 207 403 -16 1 1451 243 250 60 48 chr5 113582897 113582981 -38954278 + MLT1B LTR MaLR 61 145 -245 1 1451 266 303 159 29 chr5 113595069 113595300 -38941959 + MLT1A0 LTR MaLR 77 361 -13 1 1451 239 342 102 34 chr5 113595337 113595543 -38941716 + MLT1C LTR MaLR 215 434 -33 1 1451 631 200 8 16 chr5 113599935 113600057 -38937202 + MT2A LTR ERVL 1 121 -412 2 1451 674 219 27 51 chr5 113600033 113600314 -38936945 + MT2A LTR ERVL 323 567 -34 2 1451 3483 57 0 0 chr5 113600325 113600732 -38936527 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1451 1908 192 85 85 chr5 113603028 113603556 -38933703 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 2 1451 226 336 70 31 chr5 113610042 113610171 -38927088 + LTR16C LTR ERVL 208 341 -148 2 1451 292 215 0 15 chr5 113614010 113614076 -38923183 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 344 2 1451 1755 193 146 62 chr5 113614277 113614764 -38922495 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 2 1451 4114 147 218 58 chr5 113630826 113631421 -38905838 - MTC-int LTR MaLR -6 1252 534 2 1451 4114 147 218 58 chr5 113631568 113632049 -38905210 - MTC-int LTR MaLR -725 533 3 2 1451 2452 157 11 63 chr5 113632051 113632494 -38904765 - MTC LTR MaLR 0 421 2 2 1451 1394 228 109 28 chr5 113635566 113636045 -38901214 + RMER4B LTR ERVK 18 466 0 2 1451 2384 102 70 5 chr5 113636561 113636945 -38900314 + MTC LTR MaLR 5 413 -8 2 1452 927 270 56 53 chr5 113653981 113654084 -38883175 + ORR1E LTR MaLR 2 102 -257 2 1452 927 270 56 53 chr5 113654301 113654534 -38882725 + ORR1E LTR MaLR 103 339 -20 2 1452 265 333 46 20 chr5 113655564 113655717 -38881542 - LTR16D LTR ERVL -6 645 489 3 1452 2461 50 27 59 chr5 113657955 113658293 -38878966 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1452 344 252 26 80 chr5 113660009 113660160 -38877099 + MLT1A1 LTR MaLR 19 161 -213 3 1452 462 273 25 68 chr5 113660623 113660784 -38876475 + MLT1A1 LTR MaLR 255 408 0 3 1452 1414 268 35 146 chr5 113660809 113662047 -38875212 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1441 -407 3 1452 1088 248 90 108 chr5 113662110 113662405 -38874854 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1338 1611 -237 3 1452 636 294 38 72 chr5 113662952 113663216 -38874043 - MTEa LTR MaLR -8 371 117 3 1452 2891 157 58 20 chr5 113664287 113664839 -38872420 + RMER4B LTR ERVK 1 573 -12 3 1452 372 276 157 10 chr5 113666519 113666717 -38870542 + RMER12 LTR ERVK 767 993 -329 3 1452 1082 252 57 10 chr5 113667689 113667989 -38869270 + MTE2b LTR MaLR 2 315 -64 3 1452 1347 249 82 3 chr5 113668007 113668337 -38868922 + MTE2a LTR MaLR 24 379 0 3 1452 302 172 0 30 chr5 113669151 113669217 -38868042 + ORR1B1 LTR MaLR 1 64 -265 3 1452 2472 35 3 0 chr5 113669217 113669710 -38867549 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 10 3 1452 1573 109 27 98 chr5 113669707 113670002 -38867257 + ORR1B1 LTR MaLR 113 386 -8 3 1452 2556 128 55 15 chr5 113677447 113677851 -38859408 + MTC LTR MaLR 2 421 0 3 1452 658 249 79 17 chr5 113685312 113685523 -38851736 - MTC-int LTR MaLR -674 584 386 3 1452 2203 63 3 112 chr5 113686449 113686807 -38850452 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 1452 397 279 74 50 chr5 113688635 113688860 -38848399 + MTE2a LTR MaLR 1 256 -163 3 1452 526 152 0 11 chr5 113688827 113688920 -38848339 + RLTR11A LTR ERVK 271 362 -166 3 1452 226 335 72 43 chr5 113691400 113691609 -38845650 + MLT1H LTR MaLR 169 383 -166 3 1452 2028 130 19 108 chr5 113693813 113694237 -38843022 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 4 1452 1962 124 25 9 chr5 113696528 113696845 -38840414 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 1452 243 307 0 39 chr5 113697950 113698028 -38839231 + MLT1E2 LTR MaLR 23 97 -277 4 1452 262 255 28 47 chr5 113698148 113698255 -38839004 + MLT1E2 LTR MaLR 523 627 0 4 1452 411 248 51 42 chr5 113700252 113700370 -38836889 + MLT1K LTR MaLR 47 165 -279 4 1452 416 234 227 0 chr5 113701517 113701658 -38835601 + MTE2b LTR MaLR 201 373 -6 4 1452 640 341 50 13 chr5 113703629 113703932 -38833327 + MLT1K LTR MaLR 225 538 -57 4 1452 231 241 125 12 chr5 113709647 113709727 -38827532 + MLT1K LTR MaLR 148 236 -359 4 1452 1926 135 23 9 chr5 113716856 113717249 -38820010 + MTC LTR MaLR 1 418 -1 4 1452 3312 39 31 0 chr5 113718325 113718709 -38818550 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1452 454 292 142 14 chr5 113720819 113721031 -38816228 + MLT1B LTR MaLR 20 258 -132 4 1452 237 376 0 0 chr5 113721032 113721125 -38816134 + MLT1B LTR MaLR 371 463 -4 4 1452 314 248 57 38 chr5 113723375 113723480 -38813779 + RLTR14 LTR ERV1 274 380 -2 4 1452 229 270 48 39 chr5 113723793 113723897 -38813362 + ORR1D2 LTR MaLR 190 294 -76 4 1452 343 223 57 19 chr5 113730898 113731003 -38806256 + MLT1A0 LTR MaLR 24 132 -233 4 1452 244 227 67 15 chr5 113733951 113734085 -38803174 - RMER17A2 LTR ERVK -506 400 260 4 1452 1363 257 106 30 chr5 113741405 113741903 -38795356 - ORR1A3-int LTR MaLR -1233 730 195 5 1452 2269 123 22 0 chr5 113742122 113742440 -38794819 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 1 5 1452 1293 173 256 84 chr5 113742500 113742547 -38794712 - MTC LTR MaLR 0 421 378 5 1452 1293 173 256 84 chr5 113742731 113742952 -38794307 - MTC LTR MaLR -44 377 83 5 1452 1293 173 256 84 chr5 113742997 113743076 -38794183 - MTC LTR MaLR -339 82 2 5 1452 361 318 128 41 chr5 113743523 113743769 -38793490 + MLT2B1 LTR ERVL 36 327 -390 5 1452 361 340 134 45 chr5 113743916 113744059 -38793200 + MLT2B1 LTR ERVL 263 424 -96 5 1452 694 171 124 7 chr5 113746727 113746880 -38790379 + RLTR19-int LTR ERVK 289 459 -5678 5 1452 3451 196 140 96 chr5 113747161 113747506 -38789753 + RLTR19-int LTR ERVK 418 772 -5365 5 1452 3451 196 140 96 chr5 113747541 113747642 -38789617 + RLTR19-int LTR ERVK 773 857 -5280 5 1452 3451 196 140 96 chr5 113747701 113748224 -38789035 + RLTR19-int LTR ERVK 858 1372 -4765 5 1452 3451 196 140 96 chr5 113748282 113748582 -38788677 + RLTR19-int LTR ERVK 1373 1744 -4393 5 1452 232 304 42 42 chr5 113748738 113748882 -38788377 + RLTR25B LTR ERVK 397 540 -488 5 1452 2528 216 155 55 chr5 113748909 113750138 -38787121 + RLTR19-int LTR ERVK 1750 3189 -2948 5 1452 709 259 65 135 chr5 113750307 113750766 -38786493 + RLTR23 LTR ERV1 4 430 0 5 1452 519 168 8 108 chr5 113751616 113751736 -38785523 - MTC LTR MaLR -310 111 4 5 1452 401 333 95 13 chr5 113752527 113752758 -38784501 - MLT1D LTR MaLR -2 503 254 5 1452 607 333 108 50 chr5 113753933 113754091 -38783168 + MTEa LTR MaLR 1 154 -225 5 1452 607 333 108 50 chr5 113754295 113754477 -38782782 + MTEa LTR MaLR 155 361 -18 5 1452 1856 108 177 13 chr5 113755102 113755413 -38781846 + RLTR9A LTR ERVK 5 366 -2 5 1452 1799 224 48 12 chr5 113755550 113755966 -38781293 + RLTR19C LTR ERVK 1 431 -75 5 1452 415 347 91 65 chr5 113756146 113756411 -38780848 - ORR1E LTR MaLR -96 274 3 5 1452 514 242 12 64 chr5 113757277 113757449 -38779810 + RNLTR23 LTR ERVK 480 642 0 5 1452 671 169 312 76 chr5 113759132 113759356 -38777903 + MT2B LTR ERVL 11 287 -314 5 1452 1566 157 75 21 chr5 113759315 113759687 -38777572 + ORR1B1-int LTR MaLR 718 1109 -854 5 1452 1039 146 103 20 chr5 113759705 113759908 -38777351 + ORR1B1 LTR MaLR 175 394 0 5 1452 262 244 21 53 chr5 113760551 113760646 -38776613 + MTEa LTR MaLR 262 353 -26 5 1452 1183 218 58 111 chr5 113762150 113762527 -38774732 + ORR1D1 LTR MaLR 2 358 -16 5 1452 490 274 53 44 chr5 113765297 113765503 -38771756 - MTE2a LTR MaLR -2 377 170 5 1452 301 218 183 43 chr5 113765514 113765629 -38771630 - MTE2a LTR MaLR -286 133 3 5 1452 902 267 163 25 chr5 113766000 113766326 -38770933 - MTEb LTR MaLR -7 372 2 5 1452 284 252 173 0 chr5 113767427 113767554 -38769705 - RMER15 LTR ERVL -85 490 342 5 1453 1159 176 169 57 chr5 113774570 113775089 -38762170 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 1 5 1453 333 268 35 112 chr5 113777956 113778099 -38759160 - RMER15 LTR ERVL -97 478 347 5 1453 1704 136 156 36 chr5 113778771 113779136 -38758123 - RMER19A LTR ERVK -9 728 320 5 1453 13406 157 50 22 chr5 113779153 113781712 -38755547 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3058 2722 92 5 1453 228 255 93 93 chr5 113788215 113788323 -38748936 + MLT1A1 LTR MaLR 299 406 -2 5 1453 3441 219 80 84 chr5 113789676 113789972 -38747287 - MurERV4-int LTR ERVK -2814 2446 2125 5 1453 3441 219 80 84 chr5 113790044 113790961 -38746298 - MurERV4-int LTR ERVK -2814 2124 1126 5 1453 256 256 0 47 chr5 113790934 113791020 -38746239 - MurERV4-int LTR ERVK -5002 258 177 5 1453 377 187 0 62 chr5 113796850 113796947 -38740312 + ORR1A2 LTR MaLR 1 91 -236 6 1453 1954 69 7 7 chr5 113796955 113797233 -38740026 + ORR1A2 LTR MaLR 28 305 -22 6 1453 1320 174 59 39 chr5 113797650 113797936 -38739323 - ORR1C2 LTR MaLR -85 299 8 6 1453 390 281 19 52 chr5 113799417 113799571 -38737688 + ORR1E LTR MaLR 1 149 -210 6 1453 379 235 73 63 chr5 113804925 113805100 -38732159 + ORR1E LTR MaLR 10 183 -191 6 1453 1427 176 132 3 chr5 113805345 113805664 -38731595 - MTD LTR MaLR -55 364 5 6 1453 810 268 86 103 chr5 113807347 113807743 -38729516 - MTD LTR MaLR -14 405 17 6 1453 1414 169 143 87 chr5 113810187 113810631 -38726628 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 6 1453 486 200 192 6 chr5 113810791 113810947 -38726312 - MTC LTR MaLR -14 407 223 6 1453 4250 16 0 0 chr5 113812872 113813362 -38723897 - MT2_Mm LTR ERVL -3 490 1 6 1453 301 0 0 0 chr5 113813362 113813400 -38723859 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 6 1453 379 167 46 35 chr5 113813400 113813487 -38723772 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 6 1453 45989 16 6 0 chr5 113813487 113818813 -38718446 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 6 1453 4279 16 0 0 chr5 113818813 113819306 -38717953 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1453 542 280 127 91 chr5 113820391 113820753 -38716506 - MTE2a LTR MaLR 0 379 5 6 1453 334 184 150 50 chr5 113824738 113824818 -38712441 + MTEb LTR MaLR 3 90 -289 6 1453 778 285 153 38 chr5 113831023 113831421 -38705838 - MLT1H LTR MaLR 0 549 106 6 1453 2586 70 9 3 chr5 113834852 113835196 -38702063 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 1453 1763 124 52 61 chr5 113842470 113842797 -38694462 + ORR1A4 LTR MaLR 1 324 -5 6 1453 1691 150 110 14 chr5 113843867 113844212 -38693047 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1453 434 252 50 10 chr5 113844437 113844537 -38692722 + ETnERV2-int LTR ERVK 7097 7200 -206 6 1453 892 113 19 12 chr5 113844658 113844819 -38692440 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 227 6 1453 239 82 0 39 chr5 113844824 113844875 -38692384 - RLTR10 LTR ERVK -83 307 259 6 1453 233 200 0 0 chr5 113844877 113844937 -38692322 - RLTR10 LTR ERVK -72 318 259 6 1453 2262 63 9 0 chr5 113844941 113845256 -38692003 - RLTR10 LTR ERVK -72 318 1 6 1453 878 256 86 4 chr5 113850276 113850543 -38686716 + MTEa LTR MaLR 13 301 -78 6 1453 259 250 0 12 chr5 113851960 113852045 -38685214 - ORR1D1 LTR MaLR -141 233 150 6 1453 821 210 5 84 chr5 113852470 113852495 -38684764 - ORR1D1 LTR MaLR -187 187 164 6 1453 821 210 5 84 chr5 113852594 113852770 -38684489 - ORR1D1 LTR MaLR -211 163 2 6 1453 855 202 155 59 chr5 113853621 113853965 -38683294 + RLTR20C LTR ERVK 1 490 -88 7 1453 417 209 203 28 chr5 113854019 113854093 -38683166 + RLTR20C LTR ERVK 491 577 -1 7 1453 2064 189 16 16 chr5 113855079 113855467 -38681792 - MTB_Mm LTR MaLR -10 397 10 7 1453 1083 294 99 24 chr5 113857049 113857422 -38679837 - MER70B LTR ERVL -102 476 76 7 1453 450 259 106 78 chr5 113858576 113858794 -38678465 + MTEb LTR MaLR 94 317 -62 7 1453 3123 53 2 5 chr5 113862089 113862490 -38674769 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1453 1272 217 118 7 chr5 113862545 113862884 -38674375 + ORR1D1 LTR MaLR 1 394 0 7 1453 577 200 39 23 chr5 113865357 113865528 -38671731 - MTD LTR MaLR 0 419 205 7 1453 295 302 84 95 chr5 113869445 113869624 -38667635 + MTEa LTR MaLR 5 181 -198 7 1453 321 201 183 68 chr5 113869929 113870240 -38667019 + MTD LTR MaLR 1 353 -26 7 1453 352 352 35 0 chr5 113870604 113870749 -38666510 - MLT1B LTR MaLR -206 184 35 7 1453 3063 124 20 58 chr5 113871910 113872459 -38664800 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 7 1453 1134 182 50 78 chr5 113878266 113878588 -38658671 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 62 7 1453 680 120 8 50 chr5 113878642 113878802 -38658457 - ORR1D1 LTR MaLR -248 146 1 7 1453 2943 175 0 24 chr5 113878797 113879336 -38657923 - ORR1D1-int LTR MaLR -2 1368 843 7 1453 1378 248 92 6 chr5 113879871 113880228 -38657031 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 7 1453 251 288 17 47 chr5 113885674 113885816 -38651443 + MLT1A1 LTR MaLR 259 444 -23 7 1453 461 305 85 10 chr5 113885818 113886017 -38651242 + MLT1J LTR MaLR 204 417 -95 7 1453 4910 105 29 14 chr5 113886896 113887622 -38649637 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 7 1453 267 318 45 23 chr5 113889390 113889522 -38647737 - ORR1E LTR MaLR -224 135 1 7 1453 503 309 94 31 chr5 113889713 113889967 -38647292 - MLT1K LTR MaLR -72 523 254 7 1453 240 182 0 0 chr5 113890840 113890884 -38646375 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 341 7 1453 636 202 8 0 chr5 113894675 113894794 -38642465 + MTC LTR MaLR 1 120 -301 7 1453 2139 107 6 3 chr5 113894996 113895311 -38641948 + MTC LTR MaLR 106 421 0 7 1453 284 209 60 0 chr5 113898428 113898495 -38638764 + MLT1L LTR MaLR 160 230 -380 7 1453 3128 80 2 5 chr5 113900138 113900539 -38636720 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1454 977 253 103 73 chr5 113901898 113902256 -38635003 + MTEa LTR MaLR 1 369 -10 8 1454 398 326 41 144 chr5 113903222 113903638 -38633621 + MTEb LTR MaLR 6 378 -1 8 1454 401 335 96 23 chr5 113904054 113904314 -38632945 + MLT1H LTR MaLR 12 290 -259 8 1454 4291 113 128 3 chr5 113912581 113913236 -38624023 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 8 1454 529 250 179 26 chr5 113915678 113915972 -38621287 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 8 1454 491 265 33 39 chr5 113917626 113917722 -38619537 + MTEa LTR MaLR 5 104 -275 8 1454 2738 115 52 2 chr5 113917722 113918123 -38619136 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1454 491 289 93 40 chr5 113918123 113918220 -38619039 + MTEa LTR MaLR 105 224 -155 8 1454 945 207 97 55 chr5 113929732 113930191 -38607068 - RLTR20C LTR ERVK 0 551 1 8 1454 239 182 73 29 chr5 113935120 113935188 -38602071 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1261 1331 -477 8 1454 342 313 147 31 chr5 113941361 113941654 -38595605 - MLT1D LTR MaLR -93 412 86 8 1454 1293 146 78 87 chr5 113943734 113944136 -38593123 + MTD LTR MaLR 13 394 -6 8 1454 228 284 101 16 chr5 113947699 113947828 -38589431 + MLT1C LTR MaLR 42 181 -286 9 1454 264 276 131 46 chr5 113950604 113950779 -38586480 - MLT1K LTR MaLR -4 591 402 9 1454 606 261 90 5 chr5 113986291 113986491 -38550768 - MTE2b LTR MaLR -161 218 2 9 1454 260 321 119 22 chr5 114016401 114016535 -38520724 - LTR16C LTR ERVL -184 305 159 2 1454 2162 202 24 43 chr5 114019493 114019830 -38517429 - MT2A LTR ERVL -71 462 129 2 1454 2590 114 4 125 chr5 114019830 114020293 -38516966 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1454 2162 202 24 43 chr5 114020293 114020421 -38516838 - MT2A LTR ERVL -405 128 6 2 1454 1064 237 175 14 chr5 114022941 114023301 -38513958 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 3 1455 1303 185 108 21 chr5 114035508 114035737 -38501522 - RMER5 LTR ERV1 0 534 281 5 1455 2890 61 237 10 chr5 114035737 114036154 -38501105 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 5 1455 1303 185 108 21 chr5 114036154 114036211 -38501048 - RMER5 LTR ERV1 -254 280 223 5 1455 1647 209 111 95 chr5 114036795 114037362 -38499897 - RMER4B LTR ERVK -8 577 2 6 1455 476 174 156 0 chr5 114037363 114037472 -38499787 - RMER5 LTR ERV1 -387 147 22 5 1455 2183 78 52 55 chr5 114043999 114044384 -38492875 + ORR1A2 LTR MaLR 1 384 0 6 1455 648 267 127 10 chr5 114046002 114046199 -38491060 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 147 7 1455 1592 189 83 58 chr5 114046202 114046612 -38490647 - MTC LTR MaLR -1 420 1 7 1455 481 240 16 8 chr5 114046624 114046750 -38490509 - ORR1D2 LTR MaLR -239 131 5 7 1455 1642 109 0 131 chr5 114049019 114049342 -38487917 - ORR1A3 LTR MaLR -41 285 5 8 1455 460 242 108 104 chr5 114050015 114050255 -38487004 - ORR1E LTR MaLR -73 286 46 8 1455 636 169 8 0 chr5 114050261 114050385 -38486874 + ORR1B1 LTR MaLR 6 130 -264 8 1455 1809 158 20 73 chr5 114050385 114050794 -38486465 + ORR1B1 LTR MaLR 8 394 0 8 1455 693 146 128 28 chr5 114051504 114051645 -38485614 + RLTR24 LTR ERV1 369 523 -6 8 1455 1918 164 16 80 chr5 114051821 114052259 -38485000 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 8 1455 312 286 26 26 chr5 114054666 114054781 -38482478 - MTEa LTR MaLR 0 379 265 9 1455 753 273 32 3 chr5 114055172 114055381 -38481878 - MTE2b LTR MaLR 0 379 172 9 1455 735 249 209 42 chr5 114055658 114055830 -38481429 + MTEa LTR MaLR 1 194 -185 9 1455 2034 115 39 51 chr5 114055830 114056161 -38481098 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1455 735 249 209 42 chr5 114056161 114056294 -38480965 + MTEa LTR MaLR 195 357 -22 9 1455 1226 180 234 30 chr5 114065718 114066022 -38471237 + ORR1D1 LTR MaLR 5 370 -4 1 1455 2067 157 52 47 chr5 114071700 114072023 -38465236 + ORR1C2 LTR MaLR 1 340 -44 1 1455 2067 157 52 47 chr5 114072214 114072272 -38464987 + ORR1C2 LTR MaLR 341 384 0 1 1455 296 240 65 27 chr5 114074764 114074851 -38462408 + MTEa LTR MaLR 248 336 -43 1 1455 628 270 136 86 chr5 114082341 114082817 -38454442 + RLTR18B LTR ERVK 9 616 0 1 1455 367 309 31 8 chr5 114092793 114092920 -38444339 + MLT1H LTR MaLR 56 185 -364 1 1455 539 228 101 6 chr5 114094112 114094271 -38442988 + MTE2a LTR MaLR 201 374 -5 1 1455 319 196 56 93 chr5 114099601 114099708 -38437551 - MT2B LTR ERVL -337 264 162 1 1455 230 175 17 34 chr5 114102830 114102889 -38434370 - ORR1D1-int LTR MaLR -159 1211 1154 1 1455 1250 164 205 29 chr5 114102889 114103294 -38433965 - ORR1D1-int LTR MaLR -188 1321 821 1 1455 2121 220 46 58 chr5 114103284 114103622 -38433637 - ORR1D1-int LTR MaLR -774 596 272 1 1455 2121 220 46 58 chr5 114103811 114104075 -38433184 - ORR1D1-int LTR MaLR -1099 271 1 1 1455 478 198 0 1 chr5 114104076 114104163 -38433096 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 288 1 1455 403 259 78 51 chr5 114104183 114104250 -38433009 - ORR1D1 LTR MaLR -101 318 253 1 1455 396 245 0 78 chr5 114104544 114104562 -38432697 + MT2B LTR ERVL 152 160 -441 1 1455 582 336 41 24 chr5 114105637 114105927 -38431332 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 70 1 1455 2115 152 92 0 chr5 114106504 114106885 -38430374 + MTC LTR MaLR 6 421 0 1 1455 1930 205 42 16 chr5 114113210 114113665 -38423594 + RLTR11A LTR ERVK 17 528 0 2 1455 441 225 65 40 chr5 114116351 114116518 -38420741 - MTE2a LTR MaLR -213 206 40 2 1455 414 307 7 28 chr5 114118404 114118545 -38418714 + MLT1A0 LTR MaLR 222 359 -6 2 1455 558 337 49 55 chr5 114123095 114123443 -38413816 - ORR1E LTR MaLR -13 346 1 2 1455 2096 75 3 16 chr5 114126713 114127063 -38410196 + ORR1A2 LTR MaLR 4 333 -13 2 1455 273 111 75 3 chr5 114127232 114127298 -38409961 - MTD LTR MaLR 0 421 344 2 1455 956 292 25 79 chr5 114128053 114128495 -38408764 + RMER5 LTR ERV1 61 478 -56 2 1455 2939 60 2 57 chr5 114129064 114129487 -38407772 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1455 283 303 20 101 chr5 114129952 114130051 -38407208 - MLT1A1 LTR MaLR -49 359 227 2 1455 1445 199 97 12 chr5 114130146 114130327 -38406932 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 188 2 1455 1445 199 97 12 chr5 114130372 114130521 -38406738 - ORR1C2 LTR MaLR -197 187 26 2 1455 2040 113 93 98 chr5 114130521 114130917 -38406342 + RMER6A LTR ERVK 1 374 -382 2 1455 2040 113 93 98 chr5 114130958 114131012 -38406247 + RMER6A LTR ERVK 375 448 -308 2 1455 225 267 67 25 chr5 114133270 114133389 -38403870 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 269 2 1455 1019 274 58 17 chr5 114133601 114133961 -38403298 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 2 1455 1406 160 0 141 chr5 114135189 114135510 -38401749 - MTC LTR MaLR -128 293 19 2 1455 657 316 168 21 chr5 114135543 114136008 -38401251 + MLT1F-int LTR MaLR 394 926 -563 2 1455 411 335 99 55 chr5 114136372 114136625 -38400634 + MLT1F-int LTR MaLR 914 1177 -312 2 1455 1433 150 70 175 chr5 114136731 114137160 -38400099 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 1455 508 240 0 0 chr5 114137625 114137746 -38399513 + ORR1A2 LTR MaLR 1 121 -225 2 1455 2018 101 7 10 chr5 114137730 114138031 -38399228 + ORR1A2 LTR MaLR 28 327 0 2 1455 332 320 53 76 chr5 114141950 114142214 -38395045 - MLT1D LTR MaLR -189 316 59 2 1455 1597 323 119 76 chr5 114143736 114144087 -38393172 + RMER15-int LTR ERVL 2024 2376 -2623 2 1455 1597 323 119 76 chr5 114144350 114145824 -38391435 + RMER15-int LTR ERVL 2377 3927 -1072 2 1455 1964 85 18 161 chr5 114145879 114146259 -38391000 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 2 1455 569 262 27 7 chr5 114146259 114146409 -38390850 + RMER15-int LTR ERVL 4179 4331 -668 2 1455 439 288 25 0 chr5 114149811 114149928 -38387331 - MT2A LTR ERVL -119 414 295 3 1455 2267 166 88 15 chr5 114149928 114150405 -38386854 - RMER5 LTR ERV1 0 534 23 3 1455 305 301 91 81 chr5 114150424 114150634 -38386625 - MT2A LTR ERVL -235 298 87 3 1455 1013 208 24 5 chr5 114151343 114151551 -38385708 + MTD LTR MaLR 5 216 -203 3 1455 275 194 16 0 chr5 114151577 114151639 -38385620 + MTD LTR MaLR 328 390 -31 3 1455 269 301 69 83 chr5 114152520 114152737 -38384522 + MLT1C LTR MaLR 51 264 -203 3 1455 260 321 35 62 chr5 114156437 114156534 -38380725 - MLT1K LTR MaLR -354 241 148 3 1455 264 95 0 0 chr5 114159846 114159888 -38377371 - MamGypLTR1b LTR Gypsy -740 42 1 3 1455 1904 110 7 3 chr5 114162409 114162701 -38374558 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 111 3 1455 1396 104 169 14 chr5 114162790 114163077 -38374182 - ORR1A2 LTR MaLR 0 329 8 3 1455 475 185 0 0 chr5 114163105 114163213 -38374046 - ORR1A1 LTR MaLR -238 108 1 3 1456 1727 135 42 55 chr5 114167211 114167415 -38369844 + RMER17C LTR ERVK 1 195 -215 3 1456 1727 135 42 55 chr5 114167437 114167616 -38369643 + RMER17C LTR ERVK 196 379 -31 3 1456 1195 194 191 3 chr5 114168334 114168649 -38368610 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1456 241 320 184 11 chr5 114176504 114176678 -38360581 - MLT1H LTR MaLR -13 536 333 3 1456 278 361 60 0 chr5 114178197 114178363 -38358896 + LTR33A_ LTR ERVL 286 461 -70 3 1456 1218 103 10 15 chr5 114179724 114179910 -38357349 - MTC LTR MaLR -125 296 110 3 1456 666 160 8 25 chr5 114180126 114180248 -38357011 - MTC LTR MaLR -301 120 1 3 1456 4266 76 27 36 chr5 114183219 114183382 -38353877 + MT2B2 LTR ERVL 2 166 -418 4 1456 4266 76 27 36 chr5 114183851 114184268 -38352991 + MT2B2 LTR ERVL 167 584 0 4 1456 948 75 98 24 chr5 114184448 114184612 -38352647 + MTC LTR MaLR 35 210 -211 4 1456 583 253 92 6 chr5 114194152 114194315 -38342944 + MTB LTR MaLR 181 357 -43 4 1456 579 266 105 28 chr5 114196985 114197233 -38340026 - MTE2a LTR MaLR -17 362 96 4 1456 235 133 133 0 chr5 114197200 114197245 -38340014 - MT2A LTR ERVL -405 128 78 4 1456 485 272 123 4 chr5 114202801 114203033 -38334226 + MTE2b LTR MaLR 16 379 0 4 1456 368 290 147 61 chr5 114204430 114204757 -38332502 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 4 1456 1751 164 107 28 chr5 114217555 114217996 -38319263 + RMER4B LTR ERVK 30 464 -2 4 1456 738 231 131 111 chr5 114218095 114218446 -38318813 + MTE2a LTR MaLR 20 377 -2 4 1456 252 178 98 10 chr5 114224801 114224903 -38312356 - RLTR1B-int LTR ERV1 -2049 1250 1140 4 1456 308 274 94 46 chr5 114231479 114231777 -38305482 + MLT1A LTR MaLR 42 363 -11 4 1456 1792 135 104 108 chr5 114231813 114232124 -38305135 - MTC LTR MaLR -8 413 97 4 1456 1792 135 104 108 chr5 114232274 114232377 -38304882 - MTC LTR MaLR -325 96 1 4 1456 282 360 34 22 chr5 114232511 114232690 -38304569 - LTR16A LTR ERVL -14 437 257 4 1456 2121 132 47 84 chr5 114234137 114234566 -38302693 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1456 341 319 115 37 chr5 114255311 114255555 -38281704 - ORR1E LTR MaLR 0 359 97 5 1456 413 285 136 19 chr5 114255743 114255897 -38281362 - MTD LTR MaLR -138 281 110 5 1456 352 275 40 40 chr5 114259941 114260089 -38277170 + RLTR9B LTR ERVK 290 437 0 5 1456 1842 184 100 50 chr5 114260192 114260691 -38276568 - RMER17B LTR ERVK -434 524 1 5 1456 2923 124 63 65 chr5 114262089 114262674 -38274585 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 1 5 1456 300 326 189 46 chr5 114262818 114263063 -38274196 + MTEb LTR MaLR 46 288 -91 5 1456 554 274 91 24 chr5 114282880 114283089 -38254170 + MER57F LTR ERV1 1 223 -213 6 1456 279 177 0 151 chr5 114287634 114287727 -38249532 + MTD-int LTR MaLR 180 258 -1000 6 1456 1931 198 216 40 chr5 114288262 114288856 -38248403 + MTD-int LTR MaLR 406 1103 -155 6 1456 269 315 48 14 chr5 114289483 114289623 -38247636 + MTD-int LTR MaLR 1096 1240 -18 6 1456 589 249 80 17 chr5 114289623 114289858 -38247401 + MTD LTR MaLR 2 263 -133 6 1456 1321 205 65 46 chr5 114289858 114290264 -38246995 + MT2A LTR ERVL 1 544 -57 6 1456 399 242 80 72 chr5 114290225 114290363 -38246896 + MTD LTR MaLR 252 390 -29 6 1457 848 235 126 18 chr5 114295629 114295907 -38241352 + MTD LTR MaLR 3 273 -146 6 1457 301 290 89 26 chr5 114297018 114297209 -38240050 + RMER17C LTR ERVK 144 346 -64 6 1457 936 259 30 54 chr5 114312054 114312388 -38224871 + RLTR15 LTR ERVK 1 326 -33 6 1457 1290 177 227 0 chr5 114313648 114313970 -38223289 - MTD LTR MaLR -8 411 17 6 1457 2169 89 9 22 chr5 114313971 114314129 -38223130 + ORR1A2 LTR MaLR 1 161 -166 6 1457 2453 104 174 3 chr5 114314129 114314515 -38222744 + RLTR44E LTR ERVK 1 452 0 6 1457 2169 89 9 22 chr5 114314515 114314679 -38222580 + ORR1A2 LTR MaLR 162 319 -8 6 1457 1207 261 102 41 chr5 114318014 114318425 -38218834 + RLTR18B LTR ERVK 50 485 -27 7 1457 798 199 0 37 chr5 114325273 114325461 -38211798 + RMER19C LTR ERVK 1 181 -556 7 1457 921 215 50 77 chr5 114325443 114325740 -38211519 + RMER19C LTR ERVK 47 335 -276 7 1457 704 245 130 0 chr5 114327556 114327756 -38209503 - ORR1D1 LTR MaLR -147 227 2 7 1457 2036 148 146 11 chr5 114328229 114328599 -38208660 - MTC LTR MaLR 0 421 2 7 1457 2082 141 80 13 chr5 114338289 114338677 -38198582 + MTC LTR MaLR 3 416 -5 7 1457 369 214 92 55 chr5 114345237 114345248 -38192011 + MT2B LTR ERVL 152 166 -435 7 1457 2653 133 17 12 chr5 114356887 114357306 -38179953 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1457 2285 110 98 3 chr5 114361699 114362054 -38175205 + RMER15 LTR ERVL 1 389 -186 8 1457 2833 54 53 5 chr5 114362054 114362428 -38174831 + MTB LTR MaLR 1 392 -8 8 1457 1190 98 43 5 chr5 114362432 114362616 -38174643 + RMER15 LTR ERVL 385 575 0 8 1457 502 325 88 105 chr5 114363651 114363803 -38173456 - MLT2B1 LTR ERVL -75 445 274 8 1457 502 325 88 105 chr5 114363994 114364053 -38173206 - MLT2B1 LTR ERVL -247 273 227 8 1457 502 325 88 105 chr5 114364172 114364310 -38172949 - MLT2B1 LTR ERVL -294 226 101 8 1457 313 269 10 70 chr5 114364543 114364643 -38172616 - MLT2B1 LTR ERVL -409 106 13 8 1457 302 240 213 8 chr5 114367936 114367957 -38169302 + MT2B LTR ERVL 132 177 -424 8 1457 230 226 101 101 chr5 114369107 114369245 -38168014 - MLT1A LTR MaLR -119 450 313 8 1457 537 292 74 28 chr5 114369534 114369749 -38167510 - MLT1A LTR MaLR -130 244 20 8 1457 399 242 0 104 chr5 114370274 114370306 -38166953 + MT2B LTR ERVL 138 155 -446 8 1457 1850 120 21 18 chr5 114370569 114370887 -38166372 - MTC LTR MaLR -43 378 3 8 1457 1885 134 16 82 chr5 114372142 114372581 -38164678 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 8 1457 252 243 65 39 chr5 114374821 114374898 -38162361 + MLT1A1 LTR MaLR 314 392 -16 8 1457 655 211 85 104 chr5 114376109 114376368 -38160891 + RMER13B LTR ERVK 427 680 -228 8 1457 1749 114 33 89 chr5 114378378 114378715 -38158544 - MTC LTR MaLR 0 421 104 8 1457 459 215 11 11 chr5 114378848 114378942 -38158317 - MTC LTR MaLR -324 97 4 8 1457 227 253 38 95 chr5 114382762 114382867 -38154392 - RLTR25B LTR ERVK -481 547 449 8 1457 3223 60 10 15 chr5 114385021 114385430 -38151829 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 8 1457 2793 77 4 117 chr5 114423305 114423760 -38113499 + MTB_Mm LTR MaLR 4 407 0 9 1458 1281 194 125 43 chr5 114437445 114437790 -38099469 + BGLII_B LTR ERVK 1 373 -68 1 1458 229 257 86 95 chr5 114439444 114439560 -38097699 - MT2B LTR ERVL -324 277 163 1 1458 2020 121 40 9 chr5 114445578 114445899 -38091360 + MTC LTR MaLR 1 331 -90 1 1458 924 259 82 26 chr5 114445899 114446240 -38091019 + RLTR9A LTR ERVK 1 360 -8 1 1458 611 140 10 10 chr5 114446246 114446347 -38090912 + MTC LTR MaLR 321 421 0 1 1458 270 232 59 69 chr5 114448255 114448357 -38088902 - MT2B LTR ERVL -357 244 144 1 1458 3073 56 2 0 chr5 114450422 114450817 -38086442 + MTB LTR MaLR 1 396 -4 1 1458 967 200 26 31 chr5 114464033 114464373 -38072886 - RMER10A LTR ERVL -8 434 1 1 1458 934 264 91 26 chr5 114466026 114466463 -38070796 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 1 1458 2042 100 7 9 chr5 114471208 114471559 -38065700 - ORR1A2 LTR MaLR -8 359 1 1 1458 522 148 0 0 chr5 114471559 114471647 -38065612 - ORR1A1 LTR MaLR -258 88 1 1 1458 4318 137 40 28 chr5 114472666 114473465 -38063794 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 1 1458 249 216 152 43 chr5 114478575 114478667 -38058592 + MT2B2 LTR ERVL 155 256 -328 1 1458 847 182 159 8 chr5 114482277 114482465 -38054794 + ORR1C1 LTR MaLR 8 229 -149 1 1458 847 168 153 5 chr5 114482493 114482562 -38054697 + ORR1C1 LTR MaLR 230 315 -63 1 1458 257 339 70 14 chr5 114484433 114484613 -38052646 + LTR40a LTR ERVL 22 210 -252 1 1458 266 235 44 0 chr5 114484788 114484856 -38052403 + MLT1A1 LTR MaLR 322 392 -16 1 1458 317 303 16 32 chr5 114489817 114489943 -38047316 + RMER5 LTR ERV1 119 242 -292 1 1458 457 258 111 48 chr5 114493687 114494021 -38043238 + RLTR15 LTR ERVK 1 355 -4 1 1458 3195 248 83 40 chr5 114499018 114499997 -38037262 + RMER15-int LTR ERVL 1337 2357 -2642 1 1458 3057 228 75 37 chr5 114500023 114500932 -38036327 + RMER15-int LTR ERVL 4030 4973 -26 1 1458 2705 147 65 63 chr5 114500932 114501425 -38035834 + RMER15 LTR ERVL 1 485 -90 1 1458 2649 127 90 7 chr5 114501425 114501869 -38035390 + RLTR28B LTR ERVL 1 481 0 2 1458 2705 147 65 63 chr5 114501869 114501949 -38035310 + RMER15 LTR ERVL 486 575 0 1 1458 238 256 57 23 chr5 114505290 114505378 -38031881 + MTEb LTR MaLR 269 359 -20 1 1458 2356 66 23 86 chr5 114508006 114508285 -38028974 + ORR1A2 LTR MaLR 1 286 -41 2 1458 2356 66 23 86 chr5 114508431 114508500 -38028759 + ORR1A2 LTR MaLR 287 327 0 2 1458 1380 159 62 8 chr5 114508670 114508930 -38028329 + ORR1D1 LTR MaLR 1 274 -100 2 1458 666 165 0 0 chr5 114511902 114512011 -38025248 + MTD LTR MaLR 1 109 -310 3 1458 1214 230 35 35 chr5 114512612 114512927 -38024332 + MTD LTR MaLR 105 419 0 3 1458 233 59 0 0 chr5 114522608 114522642 -38014617 - MTB_Mm LTR MaLR -53 354 321 6 1458 934 249 99 83 chr5 114523886 114524258 -38013001 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 7 1458 450 257 37 30 chr5 114529905 114530122 -38007137 - MTEa LTR MaLR -14 365 69 8 1458 235 321 0 62 chr5 114530318 114530366 -38006893 - MTEa LTR MaLR -299 68 23 8 1458 515 282 16 33 chr5 114530425 114530608 -38006651 - ORR1E-int LTR MaLR -1400 180 1 9 1458 690 287 112 41 chr5 114530608 114530922 -38006337 - ORR1E LTR MaLR -17 342 6 9 1458 3278 38 10 2 chr5 114534021 114534414 -38002845 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1458 818 292 58 116 chr5 114537011 114537444 -37999815 + MTD LTR MaLR 12 419 0 1 1458 4382 128 50 20 chr5 114542866 114543598 -37993661 - RMER6A LTR ERVK 0 756 3 1 1458 2052 123 11 90 chr5 114545108 114545389 -37991870 + ORR1A4 LTR MaLR 1 270 -59 1 1458 2052 123 11 90 chr5 114545571 114545646 -37991613 + ORR1A4 LTR MaLR 271 329 0 1 1458 345 275 56 55 chr5 114547709 114547861 -37989398 + MTE2a LTR MaLR 65 240 -179 1 1458 604 287 21 27 chr5 114547923 114548109 -37989150 + MTE2a LTR MaLR 195 379 0 1 1459 1600 160 119 0 chr5 114557091 114557428 -37979831 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 65 1 1459 1258 108 53 199 chr5 114557432 114557688 -37979571 - MTC LTR MaLR -133 288 81 1 1459 1258 108 53 199 chr5 114557830 114557910 -37979349 - MTC LTR MaLR -341 80 1 1 1459 2010 154 16 25 chr5 114558605 114558971 -37978288 + ORR1B1 LTR MaLR 24 386 -8 1 1459 295 80 80 0 chr5 114558992 114559042 -37978217 - ORR1A3-int LTR MaLR -386 1577 1524 1 1459 347 137 99 37 chr5 114559986 114560086 -37977173 - ORR1A4 LTR MaLR -254 120 1 1 1459 760 233 188 61 chr5 114574421 114574579 -37962680 + ORR1D1 LTR MaLR 1 160 -214 1 1459 760 233 188 61 chr5 114574611 114574781 -37962478 + ORR1D1 LTR MaLR 161 370 -4 1 1459 1621 152 129 67 chr5 114576416 114576789 -37960470 - RMER10B LTR ERVL 0 398 3 1 1459 1049 155 31 1 chr5 114589672 114589879 -37947380 - RLTR11A LTR ERVK -30 497 287 2 1459 233 228 70 0 chr5 114589988 114590045 -37947214 - RLTR11A LTR ERVK -368 159 99 2 1459 741 164 69 46 chr5 114590234 114590407 -37946852 - MTC LTR MaLR -244 177 1 2 1459 4215 94 35 2 chr5 114592758 114593323 -37943936 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 2 1459 947 261 86 35 chr5 114594193 114594531 -37942728 - RLTR11A LTR ERVK -167 361 7 2 1459 3952 120 64 65 chr5 114598468 114599223 -37938036 + RMER6A LTR ERVK 1 754 -2 2 1459 251 263 91 25 chr5 114612060 114612181 -37925078 - RMER2 LTR ERV1 0 567 439 2 1459 816 205 43 0 chr5 114612234 114612486 -37924773 - RMER2 LTR ERV1 -207 360 1 2 1459 1749 234 52 86 chr5 114618827 114618894 -37918365 - RMER16 LTR ERVK -1 532 468 3 1459 1749 234 52 86 chr5 114619218 114619679 -37917580 - RMER16 LTR ERVK -66 467 18 3 1459 273 235 120 93 chr5 114620003 114620111 -37917148 - MLT1A LTR MaLR 0 408 298 3 1459 364 264 17 126 chr5 114620130 114620365 -37916894 - MLT1A LTR MaLR -193 215 15 3 1459 252 256 10 104 chr5 114623089 114623185 -37914074 + MT2B2 LTR ERVL 152 238 -346 3 1459 255 191 9 152 chr5 114629070 114629175 -37908084 - MT2B LTR ERVL -360 241 152 3 1459 3119 118 88 11 chr5 114635100 114635786 -37901473 - RLTR13D4 LTR ERVK 0 1033 2 3 1459 1525 102 55 0 chr5 114637473 114637708 -37899551 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 79 3 1459 2521 144 170 14 chr5 114642380 114642886 -37894373 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 3 1459 1870 103 9 51 chr5 114643679 114644083 -37893176 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 1 3 1459 477 209 8 73 chr5 114651537 114651564 -37885695 - MT2B LTR ERVL -349 252 137 4 1459 838 260 14 23 chr5 114652475 114652695 -37884564 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 140 4 1459 1808 72 58 7 chr5 114656063 114656341 -37880918 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 28 4 1459 424 184 10 0 chr5 114656367 114656465 -37880794 - ORR1A1 LTR MaLR -247 99 1 4 1459 1444 246 18 0 chr5 114664375 114664713 -37872546 - MTEa LTR MaLR -25 354 11 4 1459 3947 115 132 32 chr5 114669727 114670411 -37866848 - RMER6A LTR ERVK -4 752 1 4 1459 296 266 0 102 chr5 114672146 114672234 -37865025 - MTEb LTR MaLR -299 80 2 4 1459 399 0 0 0 chr5 114674404 114674451 -37862808 - ORR1A2 LTR MaLR -8 318 272 4 1459 1856 86 12 71 chr5 114674484 114674505 -37862754 - ORR1A2 LTR MaLR -22 305 286 4 1459 1856 86 12 71 chr5 114674694 114674996 -37862263 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 4 1459 1956 103 6 46 chr5 114678804 114679193 -37858066 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 2 4 1460 1607 161 55 9 chr5 114688799 114689124 -37848135 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 28 4 1460 818 123 31 10 chr5 114694934 114695072 -37842187 - MTC LTR MaLR 0 421 190 5 1460 227 246 16 16 chr5 114701305 114701367 -37835892 + MLT1K LTR MaLR 425 486 -109 5 1460 3595 25 0 0 chr5 114703109 114703505 -37833754 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1460 558 40 0 0 chr5 114703505 114703581 -37833678 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 76 -1022 5 1460 482 260 43 60 chr5 114732237 114732421 -37804838 - RLTR42-int LTR ERVK -4106 1416 1236 5 1460 1193 247 84 35 chr5 114738211 114738580 -37798679 + MTD LTR MaLR 18 404 -15 5 1460 272 217 47 24 chr5 114751642 114751727 -37785532 + MT2B LTR ERVL 194 280 -321 5 1460 1426 190 84 19 chr5 114755950 114756309 -37780950 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 6 1460 793 261 175 48 chr5 114762910 114763264 -37773995 + MTD LTR MaLR 2 400 -19 6 1460 707 235 209 46 chr5 114768908 114769234 -37768025 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 1460 411 191 0 118 chr5 114778361 114778480 -37758779 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 6 1460 3366 43 2 8 chr5 114780486 114780884 -37756375 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1460 272 316 0 25 chr5 114781583 114781664 -37755595 - MLT1A0 LTR MaLR -17 348 270 6 1460 234 211 110 73 chr5 114781775 114781857 -37755402 - MLT1A0 LTR MaLR -288 102 18 6 1460 2970 124 136 17 chr5 114784479 114784769 -37752490 + RMER4B LTR ERVK 1 330 -255 6 1460 2970 124 136 17 chr5 114784959 114785191 -37752068 + RMER4B LTR ERVK 331 585 0 6 1460 1660 140 155 31 chr5 114789950 114790304 -37746955 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 7 1460 276 143 33 82 chr5 114794579 114794640 -37742619 + RMER2 LTR ERV1 200 257 -310 7 1460 2270 84 14 101 chr5 114795464 114795822 -37741437 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1460 236 316 75 50 chr5 114797905 114798025 -37739234 - ORR1E LTR MaLR -172 187 65 7 1460 2478 174 12 30 chr5 114802574 114803044 -37734215 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 44 7 1460 2478 174 12 30 chr5 114803231 114803268 -37733991 - RLTR16 LTR ERVK -462 43 7 7 1460 231 307 62 134 chr5 114803453 114803758 -37733501 - MLT1B LTR MaLR -53 337 55 7 1461 275 241 249 17 chr5 114825903 114826076 -37711183 + MER90 LTR ERV1 2 214 -361 7 1461 442 292 113 19 chr5 114841807 114842020 -37695239 - ORR1D2 LTR MaLR -131 239 7 8 1461 536 281 59 56 chr5 114845719 114845971 -37691288 - ORR1D2 LTR MaLR -75 284 22 8 1461 295 284 135 49 chr5 114846005 114846168 -37691091 + MTE2a LTR MaLR 63 239 -140 8 1461 980 204 122 30 chr5 114860034 114860374 -37676885 - MTC LTR MaLR 0 421 20 8 1461 543 143 11 0 chr5 114867892 114867983 -37669276 - RMER4A LTR ERVK 0 466 375 8 1461 247 93 91 23 chr5 114877597 114877641 -37659618 + ORR1C2 LTR MaLR 338 384 0 8 1461 874 293 106 57 chr5 114883575 114884017 -37653242 + RMER4A LTR ERVK 1 464 -2 8 1461 2807 180 31 15 chr5 114888677 114889196 -37648063 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 8 1461 279 328 76 71 chr5 114889674 114889871 -37647388 + MER90 LTR ERV1 194 391 -184 8 1461 793 232 266 7 chr5 114896668 114896942 -37640317 - MTEa LTR MaLR -2 377 33 8 1461 3088 74 26 3 chr5 114910702 114911093 -37626166 - MTB LTR MaLR 0 400 1 8 1461 2685 32 0 0 chr5 114918322 114918660 -37618599 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 9 1461 2619 137 40 45 chr5 114920170 114920590 -37616669 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 9 1461 4863 165 133 27 chr5 114920594 114921517 -37615742 + MTC-int LTR MaLR 26 1039 -219 9 1461 4863 165 133 27 chr5 114921672 114921863 -37615396 + MTC-int LTR MaLR 1040 1257 -1 9 1461 2324 147 32 12 chr5 114921868 114922268 -37614991 + MTC LTR MaLR 3 410 -11 9 1461 423 259 7 86 chr5 114923498 114923530 -37613729 - MT2B LTR ERVL -330 249 132 9 1461 3692 130 36 10 chr5 114929977 114930590 -37606669 - RMER19A LTR ERVK -108 629 1 9 1461 2096 117 40 68 chr5 114930625 114930790 -37606469 + MTC LTR MaLR 36 197 -224 9 1461 2096 117 40 68 chr5 114930976 114931206 -37606053 + MTC LTR MaLR 198 420 -1 9 1461 1940 173 86 2 chr5 114934335 114934676 -37602583 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 70 9 1461 1940 173 86 2 chr5 114934710 114934763 -37602496 - BGLII_B LTR ERVK -372 69 16 9 1461 2370 171 46 35 chr5 114935146 114935665 -37601594 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 29 9 1461 657 240 40 118 chr5 114941371 114941668 -37595591 - MTE2a LTR MaLR -9 370 103 9 1461 829 269 35 59 chr5 114941668 114941956 -37595303 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 166 9 1461 275 258 0 15 chr5 114941981 114942048 -37595211 - MTE2a LTR MaLR -273 146 81 9 1461 3131 23 0 0 chr5 114942405 114942751 -37594508 + MTA_Mm LTR MaLR 1 346 0 9 1461 9425 23 3 29 chr5 114942753 114943729 -37593530 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 963 -135 9 1461 8887 23 3 29 chr5 114943916 114944066 -37593193 + MTA_Mm-int LTR MaLR 964 1098 0 9 1461 3254 45 0 0 chr5 114944066 114944462 -37592797 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1461 470 189 22 0 chr5 114944464 114944554 -37592705 + MTC LTR MaLR 1 92 -329 9 1461 1961 123 14 60 chr5 114944559 114944912 -37592347 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 2 9 1461 939 126 31 98 chr5 114944912 114945104 -37592155 + MTC LTR MaLR 88 266 -155 9 1461 4134 156 251 20 chr5 114945104 114945429 -37591830 + MTC-int LTR MaLR 2 439 -819 9 1461 4134 156 251 20 chr5 114945459 114946154 -37591105 + MTC-int LTR MaLR 440 1258 0 9 1461 2542 148 0 26 chr5 114946154 114946583 -37590676 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 9 1461 2062 120 73 6 chr5 114948065 114948408 -37588851 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 9 1462 1399 251 75 3 chr5 114951057 114951433 -37585826 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 9 1462 2454 118 7 92 chr5 114952134 114952247 -37585012 - MTC LTR MaLR 0 421 343 9 1462 2454 118 7 92 chr5 114952393 114952736 -37584523 - MTC LTR MaLR -79 342 4 9 1462 594 314 66 35 chr5 114954078 114954335 -37582924 - MLT1A1 LTR MaLR -73 335 71 1 1462 551 287 71 5 chr5 114955449 114955659 -37581600 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 141 1 1462 1998 72 14 0 chr5 114956392 114956668 -37580591 - MTB LTR MaLR -120 280 1 1 1462 246 179 161 0 chr5 114965807 114965863 -37571396 + MTE2a LTR MaLR 4 68 -311 1 1462 498 302 38 107 chr5 114965876 114966057 -37571202 + MTE2a LTR MaLR 135 314 -65 1 1462 498 302 38 107 chr5 114966095 114966118 -37571141 + MTE2a LTR MaLR 315 334 -45 1 1462 893 203 19 260 chr5 114966118 114966364 -37570895 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 152 1 1462 893 203 19 260 chr5 114966528 114966766 -37570493 - ORR1D2 LTR MaLR -219 151 1 1 1462 498 302 38 107 chr5 114966766 114966823 -37570436 + MTE2a LTR MaLR 335 379 0 1 1462 1623 146 119 59 chr5 114966828 114966997 -37570262 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 231 1 1462 1623 146 119 59 chr5 114967146 114967347 -37569912 - ORR1B1 LTR MaLR -164 230 2 1 1462 1648 128 0 130 chr5 114968099 114968430 -37568829 + ORR1A2 LTR MaLR 1 288 -39 1 1462 493 0 0 0 chr5 114968479 114968537 -37568722 + ORR1A2 LTR MaLR 269 326 0 1 1462 1673 117 37 95 chr5 114968876 114968929 -37568330 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 286 1 1462 1673 117 37 95 chr5 114969120 114969415 -37567844 - ORR1A4 LTR MaLR -44 285 1 1 1462 979 122 126 16 chr5 114969460 114969643 -37567616 - ORR1B1 LTR MaLR -151 243 41 1 1462 2286 160 28 94 chr5 114970022 114970079 -37567180 + RLTR24 LTR ERV1 1 58 -471 1 1462 2286 160 28 94 chr5 114970278 114970619 -37566640 + RLTR24 LTR ERV1 59 363 -166 1 1462 2286 160 28 94 chr5 114970809 114970973 -37566286 + RLTR24 LTR ERV1 364 527 -2 1 1462 2071 92 4 7 chr5 114977614 114977947 -37559312 - ORR1A2 LTR MaLR -2 344 12 1 1462 399 306 62 14 chr5 114980881 114981027 -37556232 + MLT1G1 LTR MaLR 166 318 -261 1 1462 270 263 91 138 chr5 114984461 114984696 -37552563 + MTEb LTR MaLR 100 297 -82 1 1462 1245 196 111 82 chr5 114994256 114994661 -37542598 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 1 1462 268 309 89 48 chr5 115009724 115009752 -37527507 - MTE2a LTR MaLR -140 239 201 2 1462 268 322 84 54 chr5 115009797 115009980 -37527279 - MTE2a LTR MaLR -179 200 27 2 1462 2995 72 36 0 chr5 115009981 115010367 -37526892 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1462 5171 123 60 78 chr5 115012273 115012861 -37524398 - RMER17B LTR ERVK 0 958 345 3 1462 5171 123 60 78 chr5 115013008 115013394 -37523865 - RMER17B LTR ERVK -614 344 1 3 1462 2385 207 168 49 chr5 115013702 115014494 -37522765 + RMER19B LTR ERVK 1 886 -16 3 1462 769 191 189 32 chr5 115038509 115038822 -37498437 - MTD LTR MaLR -8 411 1 7 1462 1933 117 17 3 chr5 115049897 115050198 -37487061 + ORR1A1 LTR MaLR 1 305 -41 8 1462 344 273 58 39 chr5 115053679 115053782 -37483477 + MT2B LTR ERVL 153 257 -344 9 1462 1467 139 109 13 chr5 115066550 115066883 -37470376 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 5 1 1462 236 270 120 33 chr5 115068348 115068440 -37468819 + MLT1K LTR MaLR 164 263 -332 1 1462 290 172 34 17 chr5 115068544 115068603 -37468656 + MLT1K LTR MaLR 459 518 -77 1 1463 328 203 41 129 chr5 115093629 115093672 -37443587 + MT2B LTR ERVL 124 153 -448 1 1463 2033 131 267 28 chr5 115111523 115111883 -37425376 + RMER15 LTR ERVL 1 430 -145 2 1463 2029 131 267 28 chr5 115112075 115112178 -37425081 + RMER15 LTR ERVL 431 575 0 2 1463 288 305 79 58 chr5 115118999 115119138 -37418121 - MTD LTR MaLR 0 419 278 2 1463 482 269 6 48 chr5 115119155 115119323 -37417936 - MTD LTR MaLR -213 206 46 2 1463 227 242 0 16 chr5 115124714 115124777 -37412482 + ORR1E LTR MaLR 72 133 -226 2 1463 400 198 25 109 chr5 115135747 115135866 -37401393 + MT2B LTR ERVL 156 264 -337 2 1463 2030 121 12 5 chr5 115137786 115138155 -37399104 - ORR1A2 LTR MaLR -8 386 1 2 1463 230 347 70 55 chr5 115143039 115143167 -37394092 + RMER10B LTR ERVL 269 398 0 3 1463 457 316 133 75 chr5 115145498 115145863 -37391396 - MLT1D LTR MaLR -7 498 102 3 1463 470 316 112 88 chr5 115146826 115146918 -37390341 + MTE2a LTR MaLR 10 88 -331 3 1463 901 235 132 49 chr5 115147064 115147371 -37389888 + MTE2a LTR MaLR 70 402 -17 3 1463 832 254 224 0 chr5 115147872 115148175 -37389084 + MTEb LTR MaLR 1 371 -8 3 1463 545 360 54 102 chr5 115149083 115149484 -37387775 - MER54A LTR ERVL -135 766 374 3 1463 2059 121 117 66 chr5 115149484 115149936 -37387323 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 1463 545 360 54 102 chr5 115149936 115150299 -37386960 - MER54A LTR ERVL -528 373 39 3 1463 777 219 0 0 chr5 115151420 115151566 -37385693 + RMER12B LTR ERVK 1 146 -1258 3 1463 727 108 87 7 chr5 115151763 115151912 -37385347 + RMER12 LTR ERVK 574 734 -588 3 1463 682 226 38 11 chr5 115152160 115152417 -37384842 + RMER12 LTR ERVK 701 887 -435 3 1463 464 308 123 46 chr5 115152444 115152555 -37384704 + RMER12 LTR ERVK 1306 1416 -156 3 1463 230 364 33 17 chr5 115152824 115152944 -37384315 - MLT1L LTR MaLR -354 256 135 3 1463 396 250 25 33 chr5 115153397 115153517 -37383742 + MLT1D LTR MaLR 3 121 -384 3 1463 2988 63 5 112 chr5 115154766 115154963 -37382296 + MTB LTR MaLR 1 196 -204 3 1463 2988 63 5 112 chr5 115155108 115155358 -37381901 + MTB LTR MaLR 197 400 0 3 1463 252 252 87 70 chr5 115159687 115159802 -37377457 - MTEa LTR MaLR -55 324 208 3 1463 310 206 24 144 chr5 115159966 115160091 -37377168 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 3 1463 754 275 0 6 chr5 115160197 115160380 -37376879 - MT2A LTR ERVL -88 445 264 3 1463 754 267 34 62 chr5 115160398 115160750 -37376509 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 3 1463 309 261 43 11 chr5 115160760 115160853 -37376406 - MT2A LTR ERVL -291 242 147 3 1463 717 286 31 51 chr5 115169127 115169415 -37367844 - MTD LTR MaLR -64 355 1 3 1463 2017 138 137 26 chr5 115173300 115173711 -37363548 - RMER4A LTR ERVK -4 462 4 3 1463 1654 146 60 4 chr5 115174157 115174438 -37362821 + MTC LTR MaLR 125 421 0 3 1463 1436 110 15 143 chr5 115174437 115174707 -37362552 + MTC-int LTR MaLR 2 242 -1016 3 1463 1436 110 15 143 chr5 115174852 115174910 -37362349 + MTC-int LTR MaLR 243 288 -970 3 1463 2409 193 46 44 chr5 115176689 115176900 -37360359 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 332 3 1463 2409 193 46 44 chr5 115177049 115177363 -37359896 - RLTR11A LTR ERVK -197 331 2 3 1464 653 254 149 4 chr5 115231521 115231797 -37305462 + ORR1E LTR MaLR 44 359 0 4 1464 1058 260 15 131 chr5 115233429 115233841 -37303418 + MTE2a LTR MaLR 14 377 -2 4 1464 1608 148 0 15 chr5 115262758 115263019 -37274240 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 55 5 1464 2510 97 3 0 chr5 115263032 115263382 -37273877 - MMERVK10C-int LTR ERVK -503 7078 6728 5 1464 1852 167 16 16 chr5 115263388 115263699 -37273560 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 1464 4999 178 61 34 chr5 115265539 115266644 -37270615 + MYSERV6-int LTR ERVK 1694 2828 -6131 5 1464 442 213 53 99 chr5 115266651 115266802 -37270457 - RLTR25B LTR ERVK -645 383 240 5 1464 1838 180 0 25 chr5 115271313 115271632 -37265627 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 1464 1847 172 78 26 chr5 115271708 115271863 -37265396 - MMERVK10C-int LTR ERVK -258 7422 7273 5 1464 4315 55 44 13 chr5 115271863 115272410 -37264849 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 5 1464 3383 104 47 0 chr5 115272410 115272903 -37264356 - MMERVK10C-int LTR ERVK -408 7272 6728 5 1464 1567 176 48 63 chr5 115272909 115273225 -37264034 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 1464 229 271 69 28 chr5 115274790 115274862 -37262397 + MLT1K LTR MaLR 142 216 -379 5 1464 354 236 8 117 chr5 115276724 115276740 -37260519 + MT2B LTR ERVL 152 154 -447 5 1464 791 204 74 74 chr5 115279790 115280033 -37257226 + ORR1D1 LTR MaLR 1 243 -131 5 1464 3442 18 16 0 chr5 115281476 115281863 -37255396 + MTA_Mm LTR MaLR 4 396 0 5 1464 2168 282 102 118 chr5 115283067 115283236 -37254023 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -566 1760 1580 5 1464 2168 282 102 118 chr5 115283384 115283705 -37253554 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -747 1579 1317 5 1464 2168 278 101 112 chr5 115283897 115285102 -37252157 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1010 1316 100 5 1464 2168 256 52 6 chr5 115285140 115285247 -37252012 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2227 99 4 5 1464 491 193 40 73 chr5 115285909 115286060 -37251199 - MYSERV6-int LTR ERVK -2285 6674 6529 5 1464 1952 155 228 25 chr5 115287341 115287779 -37249480 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1464 758 195 12 43 chr5 115288374 115288535 -37248724 + RMER6B LTR ERVK 268 423 -38 6 1464 13356 161 52 35 chr5 115288574 115291354 -37245905 + MYSERV6-int LTR ERVK 2 2828 -6131 6 1464 1503 185 70 91 chr5 115291361 115291735 -37245524 - RLTR25A LTR ERVK -717 386 21 6 1464 284 286 116 37 chr5 115303867 115304056 -37233203 + MER68 LTR ERVL 360 563 0 6 1464 2389 95 0 57 chr5 115304979 115305349 -37231910 - MTB LTR MaLR 0 400 52 6 1464 1827 132 99 55 chr5 115318768 115319112 -37218147 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 6 1464 853 203 17 86 chr5 115321097 115321193 -37216066 - RLTR22_Mur LTR ERVK -40 1808 1720 6 1464 853 203 17 86 chr5 115321342 115321477 -37215782 - RLTR22_Mur LTR ERVK -129 1719 1593 6 1464 3586 185 73 40 chr5 115321573 115322439 -37214820 - RLTR22_Mur LTR ERVK -954 894 1 6 1464 2440 72 118 0 chr5 115329793 115330142 -37207117 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1464 8613 18 0 0 chr5 115330144 115331139 -37206120 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 6 1464 298 256 62 39 chr5 115331221 115331351 -37205908 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 6 1464 5675 37 1 4 chr5 115331415 115332114 -37205145 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 302 6 1464 2402 75 119 11 chr5 115332114 115332466 -37204793 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1464 3631 137 12 77 chr5 115333596 115333765 -37203494 + RLTR21 LTR ERVK 323 470 -1102 6 1464 3631 137 12 77 chr5 115333913 115334409 -37202850 + RLTR21 LTR ERVK 471 945 -627 6 1464 637 227 52 96 chr5 115335451 115335700 -37201559 - MTD LTR MaLR -176 243 6 6 1464 6228 68 16 5 chr5 115336063 115336862 -37200397 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 6 1464 2462 155 21 17 chr5 115337646 115337696 -37199563 - RMER4A LTR ERVK -11 455 410 6 1464 5065 44 2 0 chr5 115337696 115338282 -37198977 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 6 1464 2462 155 21 17 chr5 115338282 115338652 -37198607 - RMER4A LTR ERVK -57 409 33 6 1464 362 22 0 0 chr5 115338822 115338868 -37198391 - RMER4A LTR ERVK -420 46 1 6 1464 3621 87 48 73 chr5 115339933 115340552 -37196707 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 604 -50 6 1464 6290 28 46 17 chr5 115340553 115341359 -37195900 + RLTR6-int LTR ERV1 1 829 -6949 6 1464 409 287 0 59 chr5 115341353 115341505 -37195754 + MMVL30-int LTR ERV1 391 533 -7023 6 22 7455 32 95 4 chr5 115341853 115344534 -37192725 + MMVL30-int LTR ERV1 772 3698 0 6 1465 3473 87 50 75 chr5 115344534 115345133 -37192126 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 584 -70 6 1465 1188 208 69 176 chr5 115346029 115346107 -37191152 + MTC LTR MaLR 20 90 -331 6 1465 1188 208 69 176 chr5 115346276 115346555 -37190704 + MTC LTR MaLR 91 365 -56 6 1465 1188 208 69 176 chr5 115346701 115346788 -37190471 + MTC LTR MaLR 366 421 0 6 1465 840 247 62 54 chr5 115355465 115355702 -37181557 + LTRIS4 LTR ERV1 285 512 -116 6 1465 3414 38 5 0 chr5 115357664 115358058 -37179201 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1465 1787 139 71 76 chr5 115358524 115358891 -37178368 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 7 1465 4481 80 16 0 chr5 115362535 115363110 -37174149 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 7 1465 233 171 89 65 chr5 115364392 115364465 -37172794 + RMER21A LTR ERV1 623 682 -265 7 1465 1487 165 127 19 chr5 115364539 115364909 -37172350 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 7 1465 447 262 58 39 chr5 115365950 115366105 -37171154 + MLT1J LTR MaLR 8 165 -347 7 1465 241 279 12 60 chr5 115366032 115366116 -37171143 + LTR33B LTR ERVL 74 153 -350 7 1465 560 186 88 25 chr5 115367278 115367438 -37169821 - MT2A LTR ERVL -2 531 362 7 1465 907 243 102 102 chr5 115367576 115367624 -37169635 - MT2A LTR ERVL -227 306 275 7 1465 907 243 102 102 chr5 115367785 115368039 -37169220 - MT2A LTR ERVL -259 274 4 7 1465 293 224 0 84 chr5 115368293 115368376 -37168883 + MT2B2 LTR ERVL 165 240 -344 7 1465 423 303 69 58 chr5 115368635 115368824 -37168435 - MLT2B2 LTR ERVL -2 560 370 7 1465 1099 181 21 0 chr5 115369192 115369380 -37167879 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 191 7 1465 241 238 95 0 chr5 115369628 115369691 -37167568 - MLT2B2 LTR ERVL -484 72 4 7 1465 1440 142 189 17 chr5 115379376 115379726 -37157533 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 7 1465 2688 114 40 56 chr5 115381518 115381946 -37155313 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1465 2217 111 26 68 chr5 115384332 115384717 -37152542 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 39 7 1465 582 281 124 12 chr5 115387707 115387948 -37149311 + MER89 LTR ERV1 292 559 0 7 1465 376 311 155 53 chr5 115388600 115388914 -37148345 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 2 7 1465 2347 61 219 0 chr5 115394780 115395108 -37142151 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1465 251 376 22 22 chr5 115408095 115408231 -37129028 + MLT1K LTR MaLR 283 418 -177 8 1465 1628 196 110 24 chr5 115411173 115411367 -37125892 + MTD LTR MaLR 3 209 -210 8 1465 1628 196 110 24 chr5 115411559 115411746 -37125513 + MTD LTR MaLR 210 417 -2 8 1465 1759 186 118 8 chr5 115424012 115424376 -37112883 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 8 1465 467 250 94 89 chr5 115425678 115425858 -37111401 + MTEb LTR MaLR 195 375 -4 9 1465 577 217 255 16 chr5 115426783 115426975 -37110284 - ORR1D2 LTR MaLR -132 238 1 9 1465 865 212 127 0 chr5 115431779 115432024 -37105235 - ORR1D1 LTR MaLR -58 316 41 9 1465 449 250 45 96 chr5 115434017 115434093 -37103166 + MT2B LTR ERVL 97 175 -426 9 1465 449 250 45 96 chr5 115434146 115434246 -37103013 + MT2B LTR ERVL 176 263 -338 9 1465 271 304 191 0 chr5 115437337 115437452 -37099807 - MLT1A LTR MaLR -2 372 236 9 1465 4614 119 70 129 chr5 115437505 115437938 -37099321 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 569 9 1465 4614 119 70 129 chr5 115437961 115438490 -37098769 - RMER17A2 LTR ERVK -338 568 1 9 1465 260 237 28 102 chr5 115438895 115439003 -37098256 + MT2B LTR ERVL 151 250 -351 9 1465 287 316 72 84 chr5 115450822 115450875 -37086384 + MT2B2 LTR ERVL 112 162 -422 1 1465 395 231 0 133 chr5 115453836 115453956 -37083303 + MT2B LTR ERVL 154 257 -344 1 1466 314 115 24 49 chr5 115475537 115475619 -37061640 - RMER17C LTR ERVK -135 275 196 1 1466 899 187 306 34 chr5 115478546 115478840 -37058419 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1466 585 217 71 13 chr5 115480163 115480288 -37056971 + RLTR12A LTR ERVK 1 134 -434 1 1466 1786 196 138 52 chr5 115480288 115480773 -37056486 + RLTR11A LTR ERVK 2 528 0 1 1466 1582 182 93 43 chr5 115480773 115481199 -37056060 + RLTR12A LTR ERVK 121 568 0 1 1466 232 200 63 51 chr5 115482784 115482863 -37054396 + MLT2B2 LTR ERVL 5 84 -431 1 1466 298 295 95 114 chr5 115494150 115494414 -37042845 - ORR1E LTR MaLR -37 322 64 1 1466 3489 20 8 0 chr5 115495975 115496368 -37040891 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1466 2583 143 30 7 chr5 115500599 115501034 -37036225 - RLTR17 LTR ERVK -150 542 98 2 1466 693 205 37 0 chr5 115501327 115501489 -37035770 + ORR1D1 LTR MaLR 1 187 -197 3 1466 230 222 222 0 chr5 115501487 115501550 -37035709 + ORR1D1 LTR MaLR 297 373 -1 3 1466 592 182 71 0 chr5 115501614 115501740 -37035519 + MT2A LTR ERVL 399 533 0 4 1466 1760 111 34 179 chr5 115506118 115506217 -37031042 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 263 1 1466 1760 111 34 179 chr5 115506358 115506643 -37030616 - ORR1A4 LTR MaLR -67 262 1 1 1466 229 128 26 0 chr5 115507442 115507481 -37029778 - MER57E1 LTR ERV1 -218 154 115 1 1466 953 244 130 45 chr5 115513294 115513672 -37023587 + MTD LTR MaLR 10 419 0 3 1466 432 284 46 144 chr5 115519163 115519379 -37017880 - MLT1B LTR MaLR -72 318 144 5 1466 432 284 46 144 chr5 115519495 115519624 -37017635 - MLT1B LTR MaLR -247 143 7 5 1466 293 239 102 61 chr5 115522931 115523029 -37014230 - MLT1A LTR MaLR -5 369 268 6 1466 4068 100 32 26 chr5 115523039 115523663 -37013596 - RLTR5_Mm LTR ERV1 0 628 1 6 1466 702 266 39 92 chr5 115529445 115529751 -37007508 + RLTR15 LTR ERVK 31 320 -39 8 1466 332 158 36 136 chr5 115537933 115538043 -36999216 - MT2B LTR ERVL -350 251 153 1 1466 761 181 390 41 chr5 115539967 115540231 -36997028 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 12 1 1466 607 327 62 15 chr5 115541777 115542115 -36995144 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 1 1466 376 154 77 0 chr5 115544523 115544601 -36992658 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 485 1 1466 1233 149 33 19 chr5 115544576 115544788 -36992471 - RLTR12A LTR ERVK -353 215 1 1 1466 361 271 53 94 chr5 115552865 115553036 -36984223 + MT2B LTR ERVL 101 264 -337 1 1466 1078 205 195 8 chr5 115554563 115554824 -36982435 + RMER12 LTR ERVK 1 310 -1012 1 1466 400 249 69 27 chr5 115554824 115555073 -36982186 + RMER12 LTR ERVK 447 694 -710 1 1466 1222 187 174 24 chr5 115580969 115581117 -36956142 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 231 2 1466 1222 187 174 24 chr5 115581338 115581523 -36955736 - ORR1C2 LTR MaLR -154 230 1 2 1466 1704 155 5 114 chr5 115582915 115583345 -36953914 + RMER17C LTR ERVK 28 410 0 2 1466 1596 203 44 31 chr5 115586027 115586387 -36950872 + ORR1D1 LTR MaLR 2 366 -8 2 1466 3903 143 152 21 chr5 115587417 115588215 -36949044 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 2 1466 1100 197 30 130 chr5 115588697 115588738 -36948521 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 354 2 1466 1100 197 30 130 chr5 115588924 115589059 -36948200 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 215 2 1466 1100 176 23 72 chr5 115589272 115589451 -36947808 - ORR1B1 LTR MaLR -182 212 11 2 1467 301 326 76 49 chr5 115613216 115613400 -36923859 - ORR1E LTR MaLR -169 190 2 2 1467 398 313 88 15 chr5 115656197 115656401 -36880858 + LTR33 LTR ERVL 297 515 0 4 1467 237 240 105 48 chr5 115658494 115658599 -36878660 + MT2B2 LTR ERVL 134 244 -340 4 1467 273 296 109 18 chr5 115668639 115668749 -36868510 + MTD LTR MaLR 5 124 -295 4 1467 233 278 77 11 chr5 115669036 115669127 -36868132 + MLT1F LTR MaLR 33 129 -419 4 1467 227 260 125 78 chr5 115676391 115676583 -36860676 - MLT1A0 LTR MaLR -11 354 154 5 1467 1626 202 143 6 chr5 115676593 115676957 -36860302 - MTD LTR MaLR -5 414 1 5 1467 265 286 93 19 chr5 115679713 115679820 -36857439 + MLT1G1 LTR MaLR 246 360 -219 5 1467 734 319 29 21 chr5 115682028 115682268 -36854991 - MLT1A LTR MaLR -132 242 1 5 1467 263 241 134 3 chr5 115689918 115690048 -36847211 + RLTR13D3 LTR ERVK 983 1066 -48 5 1467 226 193 325 0 chr5 115691345 115691428 -36845831 + ORR1C1 LTR MaLR 6 115 -263 5 1467 613 231 13 70 chr5 115695148 115695306 -36841953 + MTC LTR MaLR 1 149 -272 5 1467 517 200 255 13 chr5 115701642 115701799 -36835460 + ORR1D1 LTR MaLR 54 248 -126 5 1467 3227 33 5 20 chr5 115701884 115701961 -36835298 + MTA_Mm LTR MaLR 1 77 -319 5 1467 3528 20 5 0 chr5 115701961 115702355 -36834904 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1467 9801 15 3 0 chr5 115702355 115703450 -36833809 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1467 3553 18 5 0 chr5 115703450 115703844 -36833415 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1467 3227 33 5 20 chr5 115703844 115704166 -36833093 + MTA_Mm LTR MaLR 78 394 -2 5 1467 1809 63 20 4 chr5 115704167 115704420 -36832839 + MTA_Mm-int LTR MaLR 2 258 -840 5 1467 1448 48 19 5 chr5 115704411 115704618 -36832641 + MTA_Mm-int LTR MaLR 889 1098 0 5 1467 3319 41 5 2 chr5 115704618 115705013 -36832246 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1467 271 253 38 25 chr5 115709027 115709185 -36828074 + ORR1B1-int LTR MaLR 595 754 -755 5 1467 312 218 73 113 chr5 115710602 115710631 -36826628 + MT2B LTR ERVL 139 162 -439 5 1467 1744 175 60 0 chr5 115714087 115714419 -36822840 + RMER19B LTR ERVK 522 873 -29 6 1467 229 284 11 90 chr5 115714643 115714732 -36822527 + MT2B LTR ERVL 162 243 -358 6 1467 2884 123 10 132 chr5 115724862 115725224 -36812035 + RLTR28 LTR ERVL 1 304 -220 6 1467 2884 123 10 132 chr5 115725370 115725604 -36811655 + RLTR28 LTR ERVL 305 524 0 6 1467 2827 58 40 8 chr5 115727112 115727492 -36809767 + MTB_Mm LTR MaLR 13 404 -3 6 1467 415 192 0 126 chr5 115733886 115734005 -36803254 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 6 1468 233 221 58 141 chr5 115743048 115743071 -36794188 + MT2B LTR ERVL 196 281 -320 7 1468 2130 148 105 3 chr5 115743146 115743526 -36793733 + RMER4B LTR ERVK 1 419 -166 7 1468 395 345 21 48 chr5 115754515 115754701 -36782558 + MTEa LTR MaLR 1 181 -198 7 1468 1081 184 240 31 chr5 115756501 115756895 -36780364 + RMER4B LTR ERVK 54 452 -14 7 1468 409 275 60 138 chr5 115760463 115760575 -36776684 - MTE2a LTR MaLR -88 291 183 7 1468 4113 123 52 21 chr5 115760575 115761303 -36775956 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 7 1468 409 275 60 138 chr5 115761303 115761422 -36775837 - MTE2a LTR MaLR -197 182 78 7 1468 1154 254 150 69 chr5 115764321 115764430 -36772829 + RMER15 LTR ERVL 27 159 -416 8 1468 1154 254 150 69 chr5 115764583 115764981 -36772278 + RMER15 LTR ERVL 160 575 0 8 1468 611 251 19 70 chr5 115765154 115765245 -36772014 - MTD LTR MaLR -119 302 213 8 1468 611 255 19 70 chr5 115765383 115765483 -36771776 - MTD LTR MaLR -209 212 117 8 1468 2202 130 0 12 chr5 115770409 115770751 -36766508 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 8 1468 3321 26 13 13 chr5 115770874 115771270 -36765989 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1468 9722 16 4 0 chr5 115771270 115772364 -36764895 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 8 1468 3156 30 7 94 chr5 115772364 115772487 -36764772 + MTA_Mm LTR MaLR 1 115 -281 8 1468 3156 30 7 94 chr5 115772674 115772984 -36764275 + MTA_Mm LTR MaLR 116 396 0 8 1468 1765 159 92 42 chr5 115776322 115776703 -36760556 + RMER10A LTR ERVL 1 400 -42 8 1468 288 259 11 86 chr5 115779080 115779173 -36758086 - MT2B LTR ERVL -353 248 163 8 1468 1081 219 180 34 chr5 115794267 115794589 -36742670 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 5 8 1468 3510 23 8 0 chr5 115799912 115800305 -36736954 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1468 388 191 180 51 chr5 115802517 115802668 -36734591 + RMER19C LTR ERVK 25 231 -380 9 1468 2096 159 50 24 chr5 115802800 115803181 -36734078 + RMER19C LTR ERVK 219 609 -2 9 1468 2549 134 7 65 chr5 115814600 115814682 -36722577 + MTC LTR MaLR 1 77 -344 9 1468 2549 134 7 65 chr5 115814872 115815236 -36722023 + MTC LTR MaLR 78 421 0 9 1468 5303 136 196 39 chr5 115815237 115815388 -36721871 + MTC-int LTR MaLR 2 165 -1093 9 1468 5303 136 196 39 chr5 115815532 115816466 -36720793 + MTC-int LTR MaLR 166 1258 0 9 1468 1390 134 22 0 chr5 115816466 115816689 -36720570 + MTC LTR MaLR 1 228 -193 9 1468 1643 187 3 0 chr5 115816962 115817246 -36720013 - MT2A LTR ERVL -71 462 178 9 1468 519 191 60 17 chr5 115817338 115817455 -36719804 - MT2A LTR ERVL -328 205 84 9 1468 525 143 12 12 chr5 115817485 115817570 -36719689 - MT2A LTR ERVL -444 89 5 9 1468 911 292 95 29 chr5 115826081 115826427 -36710832 + MER68 LTR ERVL 97 465 -98 1 1468 373 203 81 50 chr5 115827935 115828096 -36709163 - RMER17C LTR ERVK -137 273 108 1 1468 3199 51 8 8 chr5 115828694 115829090 -36708169 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1468 243 258 50 70 chr5 115835416 115835516 -36701743 + MT2B LTR ERVL 175 272 -329 1 1468 259 201 43 105 chr5 115837211 115837312 -36699947 + RLTR11A2 LTR ERVK 105 208 -320 1 1468 631 262 19 19 chr5 115837284 115837485 -36699774 + RLTR15 LTR ERVK 138 338 -21 1 1468 347 211 32 135 chr5 115838687 115838813 -36698446 + MT2B LTR ERVL 145 257 -344 1 1468 2886 56 23 3 chr5 115845992 115846384 -36690875 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1468 393 141 0 90 chr5 115847260 115847338 -36689921 - MTD LTR MaLR 0 419 349 1 1468 367 125 41 148 chr5 115853005 115853127 -36684132 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 1 1468 2110 104 3 63 chr5 115863961 115864311 -36672948 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1468 1908 82 27 134 chr5 115864413 115864779 -36672480 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1468 236 333 14 79 chr5 115866978 115867247 -36670012 + RMER12 LTR ERVK 770 1021 -301 1 1469 236 304 28 38 chr5 115890993 115891099 -36646160 + MT2B LTR ERVL 152 256 -345 1 1469 877 65 0 31 chr5 115911442 115911570 -36625689 + ORR1A1 LTR MaLR 223 346 0 1 1469 348 330 112 39 chr5 115911793 115911998 -36625261 + RMER15 LTR ERVL 339 558 -17 1 1469 1316 179 137 129 chr5 115913061 115913471 -36623788 + RMER19B LTR ERVK 2 414 -488 1 1469 1784 162 188 21 chr5 115914943 115915373 -36621886 + RLTR11A LTR ERVK 1 502 -26 1 1469 385 155 0 134 chr5 115916675 115916772 -36620487 + MT2B LTR ERVL 174 257 -344 1 1469 314 208 18 73 chr5 115921446 115921555 -36615704 + RLTR25B LTR ERVK 419 521 -507 1 1469 1151 235 120 16 chr5 115922989 115923356 -36613903 - RLTR12B LTR ERVK -16 512 108 1 1469 612 198 58 0 chr5 115923548 115923668 -36613591 - RLTR12B LTR ERVK -434 134 8 1 1469 1064 254 149 0 chr5 115926427 115926770 -36610489 + MTD LTR MaLR 25 418 -1 1 1469 242 179 0 0 chr5 115927575 115927611 -36609648 + MT2B LTR ERVL 175 210 -391 1 1469 294 167 52 65 chr5 115928437 115928514 -36608745 + MT2B LTR ERVL 189 264 -337 1 1469 450 135 0 0 chr5 115945042 115945116 -36592143 + RLTR18B LTR ERVK 1 74 -438 1 1469 1638 156 24 92 chr5 115945270 115945569 -36591690 - RMER17C LTR ERVK 0 410 123 1 1469 1638 163 20 129 chr5 115945713 115945923 -36591336 - RMER17C LTR ERVK -614 344 16 1 1469 2098 212 15 34 chr5 115945903 115946368 -36590891 + RLTR18B LTR ERVK 53 508 -4 1 1469 2200 82 0 73 chr5 115949637 115949907 -36587352 + ORR1A2 LTR MaLR 1 269 -58 1 1469 2200 82 0 73 chr5 115950088 115950115 -36587144 + ORR1A2 LTR MaLR 270 287 -40 1 1469 2200 82 0 73 chr5 115950283 115950327 -36586932 + ORR1A2 LTR MaLR 288 318 -9 1 1469 1682 201 30 24 chr5 115954296 115954668 -36582591 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1469 391 233 36 126 chr5 115966939 115967106 -36570153 - MT2B LTR ERVL -337 264 113 1 1469 868 183 22 22 chr5 115972909 115973093 -36564166 - RLTR11A2 LTR ERVK -25 502 319 1 1469 474 258 41 62 chr5 115973111 115973305 -36563954 - RLTR11A2 LTR ERVK -304 223 34 1 1469 293 279 0 0 chr5 115978835 115978903 -36558356 - RMER15 LTR ERVL -105 470 403 1 1469 510 235 5 135 chr5 115986293 115986500 -36550759 - MT2A LTR ERVL -7 526 347 1 1469 1395 197 59 73 chr5 115986568 115986924 -36550335 - RLTR18 LTR ERVK -265 351 1 1 1469 299 300 156 62 chr5 115986924 115986967 -36550292 - MT2A LTR ERVL -189 412 357 1 1469 383 214 16 85 chr5 115987050 115987151 -36550108 - MT2A LTR ERVL -353 180 98 1 1469 410 162 119 20 chr5 115987630 115987731 -36549528 - MT2A LTR ERVL -416 117 7 1 1470 3237 56 20 197 chr5 116006759 116006910 -36530349 + MT2_Mm LTR ERVL 1 130 -363 3 1470 3237 56 20 197 chr5 116007056 116007503 -36529756 + MT2_Mm LTR ERVL 131 493 0 3 1470 573 230 41 143 chr5 116034057 116034113 -36503146 - MTE2a LTR MaLR 0 379 326 5 1470 573 230 41 143 chr5 116034259 116034446 -36502813 - MTE2a LTR MaLR -54 325 161 5 1470 290 245 117 0 chr5 116035096 116035190 -36502069 - MTE2a LTR MaLR -229 130 26 5 1470 1186 249 86 42 chr5 116045683 116046019 -36491240 - MTE2a LTR MaLR -8 371 21 7 1470 2276 138 73 0 chr5 116047890 116048274 -36488985 - MTC LTR MaLR -9 412 1 8 1470 877 199 160 0 chr5 116054526 116054757 -36482502 - MTD LTR MaLR 0 419 152 9 1470 235 231 24 49 chr5 116055832 116055914 -36481345 - RLTR25B LTR ERVK -522 506 427 1 1470 2511 151 50 0 chr5 116068194 116068591 -36468668 - MTC LTR MaLR -4 417 1 1 1470 1888 167 60 33 chr5 116076810 116077176 -36460083 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 1 1470 1218 159 0 38 chr5 116077477 116077739 -36459520 + RMER17C LTR ERVK 117 368 -42 1 1470 231 277 67 29 chr5 116086722 116086826 -36450433 + RLTR25B LTR ERVK 441 548 -480 1 1470 322 167 0 0 chr5 116088360 116088414 -36448845 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 331 1 1470 1499 176 154 9 chr5 116088540 116088872 -36448387 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 3 1 1470 320 259 8 136 chr5 116113141 116113266 -36423993 - MT2B LTR ERVL -351 250 142 2 1470 249 241 23 81 chr5 116115556 116115642 -36421617 + RMER13B LTR ERVK 104 184 -724 2 1470 454 219 130 97 chr5 116115624 116115831 -36421428 + RLTR26 LTR ERVK 241 454 -188 2 1470 370 211 0 0 chr5 116126256 116126321 -36410938 + ORR1D1 LTR MaLR 9 73 -301 2 1470 542 95 0 0 chr5 116126321 116126395 -36410864 - RMER19B LTR ERVK 0 902 829 2 1470 704 255 198 22 chr5 116128954 116129267 -36407992 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 2 1471 623 249 139 49 chr5 116131888 116132133 -36405126 - ORR1D1 LTR MaLR -107 267 1 2 1471 670 85 271 0 chr5 116137992 116138110 -36399149 - BGLII_B LTR ERVK -3 438 289 2 1471 410 281 68 56 chr5 116139199 116139361 -36397898 + MLT1A LTR MaLR 11 174 -200 2 1471 2270 147 58 12 chr5 116141786 116142213 -36395046 - RMER6A LTR ERVK 0 756 310 2 1471 1530 119 157 61 chr5 116142610 116142904 -36394355 - RMER6A LTR ERVK -434 322 1 2 1471 332 235 125 19 chr5 116144511 116144615 -36392644 + MLT1A LTR MaLR 267 381 -27 2 1471 881 73 28 48 chr5 116147557 116147734 -36389525 + RMER17B LTR ERVK 310 506 -383 2 1471 314 294 130 48 chr5 116150340 116150547 -36386712 + MLT1E1 LTR MaLR 297 520 -134 2 1471 2754 168 81 122 chr5 116154031 116154859 -36382400 + RMER17D2 LTR ERVK 1 794 -15 2 1471 965 211 181 25 chr5 116156540 116156822 -36380437 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 39 2 1471 317 281 77 58 chr5 116163238 116163393 -36373866 + MLT1J1 LTR MaLR 38 195 -249 3 1471 238 222 73 100 chr5 116163473 116163583 -36373676 + RLTR19B LTR ERVK 50 156 -559 3 1471 706 201 238 9 chr5 116166695 116166926 -36370333 - MTD LTR MaLR -34 385 102 3 1471 376 291 94 50 chr5 116168620 116168718 -36368541 + MLT1C LTR MaLR 5 114 -353 3 1471 376 291 94 50 chr5 116168920 116168980 -36368279 + MLT1C LTR MaLR 115 170 -297 3 1471 269 288 0 22 chr5 116173939 116173968 -36363291 - ORR1B1-int LTR MaLR -861 648 623 3 1471 698 324 140 53 chr5 116183562 116184032 -36353227 - LTR84a LTR ERVL -29 728 218 3 1471 233 302 0 59 chr5 116186045 116186147 -36351112 + MLT1A1 LTR MaLR 1 96 -312 3 1471 2162 182 49 78 chr5 116186986 116187521 -36349738 + RLTR11A LTR ERVK 7 525 -3 3 1471 3099 40 42 5 chr5 116190745 116191127 -36346132 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1471 797 157 317 11 chr5 116196896 116197076 -36340183 + RMER19B LTR ERVK 1 235 -667 3 1471 2211 151 97 21 chr5 116197090 116197524 -36339735 - RLTR16 LTR ERVK -38 467 1 3 1471 1722 157 80 16 chr5 116197534 116197844 -36339415 + RMER19B LTR ERVK 227 556 -346 3 1471 1239 235 46 106 chr5 116197844 116198325 -36338934 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 75 4 1471 2279 126 23 0 chr5 116198403 116198745 -36338514 + RMER19B LTR ERVK 553 902 0 3 1471 368 340 81 81 chr5 116199955 116200339 -36336920 + MLT2B3 LTR ERVL 1 384 -170 4 1471 2258 154 13 3 chr5 116200481 116200858 -36336401 - RMER4A LTR ERVK -85 381 1 4 1471 442 246 9 52 chr5 116201894 116201950 -36335309 + RMER13B LTR ERVK 798 852 -56 4 1471 1740 158 203 8 chr5 116201950 116202314 -36334945 - RLTR10C LTR ERVK -1 435 1 4 1471 442 246 9 52 chr5 116202314 116202373 -36334886 + RMER13B LTR ERVK 853 908 0 4 1471 227 167 0 0 chr5 116205203 116205245 -36332014 + BGLII_A LTR ERVK 1 42 -403 4 1471 2334 152 41 7 chr5 116205250 116205668 -36331591 + RLTR11A LTR ERVK 97 528 0 4 1471 2819 126 52 27 chr5 116206160 116206640 -36330619 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 8 4 1471 1374 221 74 20 chr5 116207447 116207797 -36329462 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 4 1471 780 251 18 120 chr5 116211000 116211276 -36325983 + RMER15 LTR ERVL 299 546 -29 4 1471 498 280 201 10 chr5 116211848 116212057 -36325202 - MT2A LTR ERVL -13 520 272 4 1471 1820 83 186 7 chr5 116213803 116214082 -36323177 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1471 1505 197 122 15 chr5 116220177 116220512 -36316747 + ORR1C1 LTR MaLR 5 375 -3 4 1471 250 211 0 55 chr5 116220609 116220664 -36316595 + MTEb LTR MaLR 87 138 -221 4 1471 1400 272 104 18 chr5 116220780 116221271 -36315988 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 46 4 1471 285 310 0 12 chr5 116221302 116221387 -36315872 + MTEb LTR MaLR 280 363 -16 4 1471 227 260 20 0 chr5 116221400 116221450 -36315809 - LTR16C LTR ERVL -259 230 180 4 1471 2678 179 54 30 chr5 116223089 116223648 -36313611 - RMER15 LTR ERVL 0 575 4 4 1471 519 255 80 80 chr5 116223712 116223887 -36313372 + MTEa LTR MaLR 5 179 -200 4 1471 1798 127 158 45 chr5 116224206 116224560 -36312699 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1471 431 260 31 10 chr5 116224716 116224813 -36312446 - RLTR20D LTR ERVK -4 564 466 5 1471 510 289 128 85 chr5 116226052 116226404 -36310855 - MTE2a LTR MaLR 0 379 13 5 1471 255 273 114 0 chr5 116228487 116228575 -36308684 - MLT1A1 LTR MaLR -29 379 282 5 1471 4263 135 92 0 chr5 116229868 116230543 -36306716 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 1471 420 177 115 0 chr5 116230547 116230643 -36306616 - MT2A LTR ERVL 0 533 427 5 1471 847 237 132 0 chr5 116230642 116230861 -36306398 - MT2A LTR ERVL -283 250 3 5 1471 1956 134 143 3 chr5 116230902 116231245 -36306014 - MTC LTR MaLR 0 421 31 5 1471 246 146 40 40 chr5 116231373 116231423 -36305836 - ORR1E LTR MaLR -9 350 301 5 1471 5570 114 6 37 chr5 116231636 116232310 -36304949 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 661 -1187 5 1471 5570 114 6 37 chr5 116232963 116233171 -36304088 + RLTR22_Mur LTR ERVK 662 855 -993 5 1471 625 294 36 45 chr5 116233349 116233573 -36303686 + RMER12 LTR ERVK 1101 1322 0 5 1471 392 310 20 65 chr5 116233829 116234029 -36303230 - ORR1E LTR MaLR -147 212 22 5 1471 261 122 0 24 chr5 116234276 116234318 -36302941 - MTEb LTR MaLR -61 318 278 5 1471 1748 120 125 7 chr5 116234925 116235230 -36302029 + ORR1B2 LTR MaLR 1 306 -61 5 1471 382 222 0 40 chr5 116235356 116235370 -36301889 + ORR1B2 LTR MaLR 258 269 -60 5 1471 382 222 0 40 chr5 116235394 116235454 -36301805 + ORR1B2 LTR MaLR 270 329 0 5 1471 2386 131 43 0 chr5 116235454 116235829 -36301430 + MTC LTR MaLR 30 420 -1 5 1471 21103 45 46 34 chr5 116235992 116238115 -36299144 + RLTR44-int LTR ERVK 1 2149 -663 5 1471 21103 45 46 34 chr5 116238311 116238966 -36298293 + RLTR44-int LTR ERVK 2150 2812 0 5 1471 2712 86 91 0 chr5 116238966 116239362 -36297897 + RLTR44E LTR ERVK 1 432 -20 5 1471 2169 118 82 3 chr5 116241814 116242154 -36295105 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1471 1252 170 46 0 chr5 116242547 116242765 -36294494 + RMER6C LTR ERVK 1 228 -462 5 1471 1298 127 10 10 chr5 116242810 116243017 -36294242 + RMER6C LTR ERVK 484 690 0 5 1471 2466 112 3 75 chr5 116243342 116243729 -36293530 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 5 1471 2994 121 64 135 chr5 116245171 116245860 -36291399 + MT-int LTR MaLR 384 1023 -75 5 1471 2375 138 166 5 chr5 116246274 116246709 -36290550 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 5 1471 457 324 45 84 chr5 116246795 116246997 -36290262 + MTEb LTR MaLR 3 196 -183 5 1471 906 241 33 203 chr5 116246998 116247451 -36289808 + MTE2a LTR MaLR 4 379 0 5 1471 471 237 181 23 chr5 116247451 116247607 -36289652 + MTEb LTR MaLR 192 375 -4 5 1471 5016 82 65 4 chr5 116252779 116253474 -36283785 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 1471 1551 240 80 37 chr5 116254977 116255379 -36281880 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1471 793 206 140 5 chr5 116257777 116257977 -36279282 - MTD LTR MaLR -14 405 179 6 1471 269 301 27 75 chr5 116258902 116259049 -36278210 + LTR16A LTR ERVL 27 166 -285 6 1471 260 312 0 79 chr5 116259119 116259258 -36278001 + LTR16A LTR ERVL 324 451 0 6 1471 226 221 69 59 chr5 116259407 116259508 -36277751 - RLTR25B LTR ERVK -530 498 397 6 1472 481 220 0 114 chr5 116260879 116261002 -36276257 - MTD LTR MaLR -248 111 3 6 1472 1945 138 58 111 chr5 116263111 116263527 -36273732 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1472 285 301 118 15 chr5 116265239 116265374 -36271885 + MLT1H2 LTR MaLR 313 461 -28 6 1472 278 233 61 23 chr5 116268332 116268357 -36268902 + ORR1B1-int LTR MaLR 617 646 -863 6 1472 1616 145 41 105 chr5 116268747 116269185 -36268074 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 1472 2005 159 14 8 chr5 116271828 116272184 -36265075 - RLTR15 LTR ERVK -1 358 1 6 1472 1694 135 0 8 chr5 116274367 116274629 -36262630 - ORR1A4 LTR MaLR -42 287 28 6 1472 413 182 0 83 chr5 116274657 116274777 -36262482 - ORR1B1 LTR MaLR -253 141 2 6 1472 274 83 0 0 chr5 116276827 116276863 -36260396 - RMER19B LTR ERVK -866 36 1 6 1472 1816 135 66 148 chr5 116277248 116277674 -36259585 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 6 1472 2560 139 16 106 chr5 116278261 116278839 -36258420 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 1 6 1472 264 218 51 13 chr5 116278947 116279026 -36258233 + MLT1F2 LTR MaLR 32 113 -447 6 1472 456 221 13 99 chr5 116280709 116280753 -36256506 - MT2B LTR ERVL -445 156 126 6 1472 484 236 244 61 chr5 116281633 116281783 -36255476 + ORR1D2 LTR MaLR 3 177 -193 6 1472 484 236 244 61 chr5 116281963 116282123 -36255136 + ORR1D2 LTR MaLR 178 370 0 6 1472 1981 70 11 146 chr5 116283953 116284276 -36252983 + ORR1A2 LTR MaLR 1 286 -41 6 1472 1981 70 11 146 chr5 116284469 116284514 -36252745 + ORR1A2 LTR MaLR 287 319 -8 6 1472 562 242 43 65 chr5 116290612 116290779 -36246480 - RMER17C LTR ERVK 0 410 242 7 1472 562 180 21 60 chr5 116290896 116291048 -36246211 - RMER17C LTR ERVK -169 241 4 7 1472 797 255 53 110 chr5 116291097 116291397 -36245862 + ORR1D2 LTR MaLR 17 288 -82 7 1472 2656 116 94 33 chr5 116291397 116291886 -36245373 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 7 1472 797 259 63 147 chr5 116291886 116291966 -36245293 + ORR1D2 LTR MaLR 289 364 -6 7 1472 2937 128 79 37 chr5 116291998 116292542 -36244717 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 7 1472 245 185 359 0 chr5 116296078 116296170 -36241089 - MT2A LTR ERVL 0 533 409 7 1472 457 254 75 0 chr5 116297440 116297574 -36239685 + MTD LTR MaLR 276 419 0 7 1472 410 144 59 109 chr5 116298776 116298877 -36238382 + MT2B LTR ERVL 162 257 -344 7 1472 343 206 227 0 chr5 116301704 116301801 -36235458 - MLT1K LTR MaLR -26 569 451 7 1472 289 324 109 23 chr5 116302622 116302796 -36234463 - MLT1K LTR MaLR -23 466 278 7 1472 765 246 101 37 chr5 116304055 116304381 -36232878 - ORR1E LTR MaLR -12 367 1 7 1472 672 249 93 116 chr5 116304619 116304887 -36232372 + MTE2a LTR MaLR 105 366 -13 7 1472 227 188 17 39 chr5 116310944 116311013 -36226246 - ORR1E LTR MaLR -36 343 270 7 1472 311 174 32 95 chr5 116313391 116313486 -36223773 - MT2B LTR ERVL -344 257 169 7 1472 234 333 0 35 chr5 116315747 116315834 -36221425 - MTEa LTR MaLR -221 158 75 7 1472 390 256 125 22 chr5 116321893 116322029 -36215230 - MTEb LTR MaLR -216 163 14 7 1472 839 272 34 28 chr5 116324610 116324935 -36212324 - RLTR15 LTR ERVK -32 327 1 8 1472 817 243 163 4 chr5 116337853 116337972 -36199287 - MTE2a LTR MaLR -55 324 182 8 1472 817 243 163 4 chr5 116338031 116338175 -36199084 - MTE2a LTR MaLR -198 181 21 8 1472 248 328 35 88 chr5 116338307 116338631 -36198628 - MTE2a LTR MaLR -15 364 42 8 1472 3319 25 5 0 chr5 116348380 116348774 -36188485 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1472 263 253 21 65 chr5 116348989 116349000 -36188259 + MT2B LTR ERVL 153 159 -442 8 1472 621 261 95 103 chr5 116353902 116354261 -36182998 - MTE2a LTR MaLR -7 372 17 8 1472 268 292 123 0 chr5 116374062 116374214 -36163045 - MLT1D LTR MaLR -21 659 424 8 1472 447 312 106 26 chr5 116374435 116374662 -36162597 - MLT1D LTR MaLR -237 268 24 8 1472 1416 208 177 28 chr5 116380224 116380733 -36156526 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 9 1472 567 220 52 52 chr5 116385452 116385663 -36151596 - RMER3D-int LTR ERVK -795 2047 1837 9 1473 462 144 0 43 chr5 116406661 116406755 -36130504 - RLTR11A LTR ERVK -184 344 255 9 1473 1197 176 99 35 chr5 116408445 116408727 -36128532 + MTD LTR MaLR 12 311 -108 9 1473 299 282 13 0 chr5 116408816 116408894 -36128365 - RMER15 LTR ERVL -72 503 425 9 1473 246 336 44 0 chr5 116410516 116410629 -36126630 - ORR1E LTR MaLR -236 123 6 9 1473 454 198 112 32 chr5 116421771 116421896 -36115363 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 269 9 1473 407 301 25 50 chr5 116421929 116422090 -36115169 - MLT1A1 LTR MaLR -217 157 1 9 1473 352 264 54 77 chr5 116427787 116427955 -36109304 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 201 9 1473 234 256 221 0 chr5 116432274 116432360 -36104899 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 292 9 1473 302 286 12 23 chr5 116438813 116438899 -36098360 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 305 9 1473 525 243 169 84 chr5 116441587 116441748 -36095511 - MTEa LTR MaLR -96 283 104 1 1473 666 271 130 65 chr5 116441748 116442103 -36095156 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 1 1473 525 243 169 84 chr5 116442103 116442202 -36095057 - MTEa LTR MaLR -276 103 1 1 1473 2349 80 9 12 chr5 116449328 116449656 -36087603 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1473 9307 137 65 5 chr5 116449656 116450525 -36086734 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1792 888 1 1473 9307 137 65 5 chr5 116450706 116451526 -36085733 - ORR1A2-int LTR MaLR -905 887 3 1 1473 2204 69 74 16 chr5 116451526 116451835 -36085424 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1473 2872 57 33 13 chr5 116452070 116452462 -36084797 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1473 796 272 52 25 chr5 116461035 116461321 -36075938 - MLT1A1 LTR MaLR -15 393 100 1 1473 574 258 31 12 chr5 116466568 116466729 -36070530 + MTE2a LTR MaLR 216 379 0 1 1473 251 252 75 37 chr5 116467533 116467640 -36069619 + MLT1A0 LTR MaLR 17 127 -238 1 1473 490 230 115 39 chr5 116477703 116477739 -36059520 + RLTR15 LTR ERVK 1 47 -312 1 1473 490 230 115 39 chr5 116477763 116477934 -36059325 + RLTR15 LTR ERVK 48 223 -136 1 1473 264 212 62 12 chr5 116481086 116481167 -36056092 + RMER15 LTR ERVL 405 489 -86 1 1473 2683 123 17 12 chr5 116481963 116482382 -36054877 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1473 2967 63 2 2 chr5 116482404 116482804 -36054455 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1473 5052 174 85 30 chr5 116482804 116483921 -36053338 + MTC-int LTR MaLR 19 1197 -61 1 1473 813 119 0 83 chr5 116484181 116484218 -36053041 + MTC LTR MaLR 1 36 -385 1 1473 3831 49 38 10 chr5 116484218 116484716 -36052543 + LTRIS3 LTR ERV1 1 512 0 1 1473 813 119 0 83 chr5 116484716 116484834 -36052425 + MTC LTR MaLR 37 143 -278 1 1473 239 358 12 0 chr5 116485263 116485344 -36051915 + MLT1D LTR MaLR 342 423 -82 1 1473 318 256 103 116 chr5 116485552 116485707 -36051552 - MTEa LTR MaLR -222 157 5 1 1473 292 315 52 77 chr5 116487108 116487263 -36049996 + MLT1K LTR MaLR 5 155 -440 1 1473 503 264 70 23 chr5 116487846 116488017 -36049242 - MTE2b LTR MaLR -7 372 194 1 1473 376 255 134 134 chr5 116488158 116488344 -36048915 - MTE2b LTR MaLR -189 190 5 1 1473 324 145 76 38 chr5 116491129 116491208 -36046051 + RLTR25B LTR ERVK 428 509 -519 1 1473 258 399 56 0 chr5 116492343 116492486 -36044773 + MER21B LTR ERV1 20 170 -693 1 1473 291 289 147 17 chr5 116492927 116493043 -36044216 + MER21B LTR ERV1 210 340 -523 1 1473 239 309 92 38 chr5 116493296 116493427 -36043832 + MER21B LTR ERV1 721 858 -5 1 1473 2200 95 13 0 chr5 116497147 116497462 -36039797 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1473 283 308 21 27 chr5 116499375 116499562 -36037697 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1069 1 1473 341 273 0 54 chr5 116501205 116501298 -36035961 - MT2B LTR ERVL -337 264 177 3 1473 300 233 75 32 chr5 116504227 116504320 -36032939 - MTEa LTR MaLR 0 379 283 1 1473 263 200 0 39 chr5 116507249 116507301 -36029958 - MT2B2 LTR ERVL -291 293 244 1 1473 586 304 107 69 chr5 116515678 116515968 -36021291 - ORR1E LTR MaLR -53 306 6 4 1473 836 236 180 24 chr5 116517311 116517668 -36019591 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 5 1473 3509 18 8 0 chr5 116519318 116519711 -36017548 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 184 532 330 59 76 chr5 116522728 116523069 -36014190 - ORR1E LTR MaLR 0 359 25 7 1474 886 281 82 43 chr5 116524755 116524847 -36012412 + MTE2b LTR MaLR 19 107 -272 7 1474 2222 136 52 113 chr5 116524847 116525234 -36012025 + RMER4A LTR ERVK 1 369 -97 7 1474 2222 136 52 113 chr5 116525257 116525365 -36011894 + RMER4A LTR ERVK 370 466 0 7 1474 886 281 82 43 chr5 116525365 116525554 -36011705 + MTE2b LTR MaLR 108 311 -68 7 1474 282 200 0 48 chr5 116527884 116527947 -36009312 + RMER15 LTR ERVL 368 427 -148 8 1474 552 239 83 14 chr5 116527947 116528091 -36009168 + RMER15 LTR ERVL 389 542 -33 8 1474 1115 219 193 6 chr5 116528737 116529063 -36008196 + MTD LTR MaLR 19 405 -14 8 1474 357 241 12 24 chr5 116529110 116529195 -36008064 + MTD LTR MaLR 336 419 0 8 1474 268 327 115 0 chr5 116529495 116529608 -36007651 + MLT1A0 LTR MaLR 4 129 -279 8 1474 709 296 25 5 chr5 116538555 116538759 -35998500 + MTD LTR MaLR 18 225 -194 1 1474 1102 252 25 47 chr5 116538754 116539141 -35998118 + RLTR11A LTR ERVK 144 528 0 1 1474 489 184 120 26 chr5 116540508 116540625 -35996634 + MTD LTR MaLR 18 145 -274 1 1474 2030 174 26 54 chr5 116540605 116540993 -35996266 + ORR1C2 LTR MaLR 6 382 -2 1 1474 1150 233 73 22 chr5 116540993 116541256 -35996003 + MTD LTR MaLR 129 405 -14 1 1474 2582 132 59 144 chr5 116546430 116547007 -35990252 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1474 2098 128 22 12 chr5 116547059 116547484 -35989775 + ORR1A3 LTR MaLR 1 394 0 1 1474 1566 208 152 14 chr5 116548690 116549046 -35988213 + MTD LTR MaLR 15 419 0 1 1474 267 318 23 12 chr5 116549416 116549502 -35987757 + ORR1E LTR MaLR 268 354 -5 1 1474 892 236 162 60 chr5 116550233 116550585 -35986674 + MLT1B LTR MaLR 3 390 0 1 1474 1192 221 117 28 chr5 116556033 116556358 -35980901 + BGLII_B LTR ERVK 87 440 -1 1 1474 305 300 77 87 chr5 116558304 116558586 -35978673 - MTEb LTR MaLR -1 378 83 1 1474 1061 242 103 15 chr5 116566750 116567063 -35970196 + ORR1E LTR MaLR 8 373 -6 1 1474 234 346 50 0 chr5 116567841 116567942 -35969317 - MLT1K LTR MaLR 0 595 490 1 1474 252 300 62 0 chr5 116568191 116568271 -35968988 - MLT1K LTR MaLR -373 222 138 1 1474 1857 229 129 15 chr5 116568518 116568992 -35968267 + MT2A LTR ERVL 2 529 -4 1 1474 363 229 83 99 chr5 116572974 116573095 -35964164 + MT2B LTR ERVL 143 261 -340 1 1474 1020 269 159 15 chr5 116574293 116574633 -35962626 + MTD LTR MaLR 3 391 -28 1 1474 225 213 79 32 chr5 116574672 116574735 -35962524 - MT2B LTR ERVL -369 232 167 1 1474 767 282 181 61 chr5 116577240 116577716 -35959543 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 1474 1206 216 38 35 chr5 116587541 116587952 -35949307 + MT2A LTR ERVL 9 466 -67 2 1474 915 152 77 36 chr5 116589093 116589485 -35947774 + RMER17C LTR ERVK 1 474 -335 2 1474 518 216 20 51 chr5 116589522 116589636 -35947623 + RMER17C LTR ERVK 220 329 -81 2 1474 1776 195 67 23 chr5 116592660 116593048 -35944211 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1474 229 275 29 137 chr5 116594519 116594658 -35942601 - MT2B2 LTR ERVL -292 292 169 2 1474 253 262 69 35 chr5 116595020 116595107 -35942152 - RLTR16 LTR ERVK -58 447 358 2 1474 618 243 14 7 chr5 116595137 116595282 -35941977 - RLTR16 LTR ERVK -358 147 2 2 1474 3034 43 25 102 chr5 116596377 116596816 -35940443 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 2 1474 4444 16 2 0 chr5 116597058 116597550 -35939709 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1474 305 0 0 0 chr5 116597550 116597588 -35939671 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 1474 399 167 46 35 chr5 116597588 116597675 -35939584 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 2 1474 46011 16 6 0 chr5 116597675 116603001 -35934258 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 2 1474 4444 16 2 0 chr5 116603001 116603493 -35933766 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1474 303 286 155 63 chr5 116604425 116604567 -35932692 + MLT1C LTR MaLR 7 161 -229 2 1474 3566 23 0 2 chr5 116611161 116611558 -35925701 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1474 9519 26 3 1 chr5 116611558 116612654 -35924605 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1474 3348 30 0 0 chr5 116612654 116613050 -35924209 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1474 2083 115 38 6 chr5 116619194 116619534 -35917725 - MTC LTR MaLR -15 406 56 2 1474 698 238 143 37 chr5 116619537 116619914 -35917345 - MT2A LTR ERVL -193 340 1 2 1474 227 356 25 25 chr5 116621650 116621771 -35915488 + MLT2B3 LTR ERVL 6 126 -428 2 1474 513 280 108 44 chr5 116625751 116626001 -35911258 + MLT1B LTR MaLR 4 269 -121 2 1474 261 275 65 21 chr5 116627335 116627428 -35909831 + MTEa LTR MaLR 1 97 -262 2 1474 338 290 22 30 chr5 116627487 116627622 -35909637 + MTEa LTR MaLR 207 340 -39 2 1474 457 346 40 26 chr5 116628740 116629013 -35908246 + MLT1H LTR MaLR 19 295 -254 3 1474 481 348 0 54 chr5 116631281 116631448 -35905811 - MTEa LTR MaLR -219 160 3 3 1474 2552 87 62 3 chr5 116634439 116634807 -35902452 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 3 1474 6522 166 80 25 chr5 116634808 116636238 -35901021 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 1 3 1474 2330 109 70 3 chr5 116636238 116636607 -35900652 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1474 278 270 19 21 chr5 116637269 116637386 -35899873 + ORR1E LTR MaLR 1 112 -262 3 1474 852 276 28 35 chr5 116637421 116637676 -35899583 + ORR1E LTR MaLR 98 350 -9 3 1474 331 284 84 105 chr5 116640394 116640747 -35896512 + ORR1D2 LTR MaLR 14 356 -14 3 1474 401 239 207 7 chr5 116642779 116642914 -35894345 - ORR1E LTR MaLR -183 176 15 3 1474 1099 205 20 20 chr5 116643929 116644173 -35893086 + RMER17B LTR ERVK 524 767 -191 3 1474 288 227 35 92 chr5 116644234 116644375 -35892884 + RMER17B LTR ERVK 761 893 -13 3 1474 813 288 40 51 chr5 116644394 116644668 -35892591 + MTE2a LTR MaLR 107 377 -2 3 1474 258 327 9 37 chr5 116646737 116646845 -35890414 + MTEa LTR MaLR 256 360 -19 3 1474 390 288 32 105 chr5 116651947 116652137 -35885122 + ORR1E LTR MaLR 1 176 -183 3 1475 372 252 62 132 chr5 116656893 116657135 -35880124 + MTEb LTR MaLR 148 372 -7 3 1475 392 350 55 10 chr5 116665976 116666175 -35871084 + LTR16A LTR ERVL 118 325 -126 3 1475 252 219 81 58 chr5 116666520 116666607 -35870652 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 421 3 1475 338 298 129 31 chr5 116670940 116671165 -35866094 + MLT1H LTR MaLR 43 289 -260 3 1475 430 212 73 30 chr5 116671303 116671468 -35865791 + RLTR15 LTR ERVK 178 349 -10 3 1475 479 309 74 33 chr5 116671601 116671943 -35865316 + MTD LTR MaLR 1 347 -60 3 1475 380 152 10 52 chr5 116671943 116672010 -35865249 + ORR1A4 LTR MaLR 1 63 -266 3 1475 1776 130 6 41 chr5 116672010 116672422 -35864837 + ORR1A4 LTR MaLR 1 394 0 3 1475 409 281 88 59 chr5 116672523 116672693 -35864566 + MTEa LTR MaLR 6 180 -199 3 1475 938 284 125 3 chr5 116673965 116674276 -35862983 - ORR1E LTR MaLR -6 353 5 3 1475 297 284 104 21 chr5 116674298 116674442 -35862817 - MLT1B LTR MaLR -193 197 42 3 1475 372 231 72 32 chr5 116674591 116674605 -35862654 - MTE2a LTR MaLR -56 323 311 4 1475 372 280 178 36 chr5 116674635 116674871 -35862388 - MTE2a LTR MaLR -69 310 39 4 1475 236 295 34 11 chr5 116679003 116679092 -35858167 - MTD LTR MaLR 0 379 289 4 1475 726 236 0 131 chr5 116680466 116680695 -35856564 - MTD LTR MaLR -218 201 3 4 1475 244 250 0 0 chr5 116682672 116682728 -35854531 + MTE2b LTR MaLR 287 342 -37 4 1475 682 303 133 22 chr5 116684727 116685230 -35852029 + MLT1F2 LTR MaLR 1 559 -1 4 1475 296 232 109 59 chr5 116691815 116691934 -35845325 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 439 4 1475 412 154 38 13 chr5 116691953 116692032 -35845227 - RMER2 LTR ERV1 -486 81 1 4 1475 619 232 154 30 chr5 116694072 116694362 -35842897 - MTEb LTR MaLR -8 371 3 4 1475 397 318 73 53 chr5 116694479 116694685 -35842574 + MLT1C LTR MaLR 258 467 0 4 1475 1410 221 21 78 chr5 116695441 116695651 -35841608 - ORR1D1 LTR MaLR -17 357 165 4 1475 1410 221 21 78 chr5 116695700 116695862 -35841397 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 6 4 1475 1408 262 10 46 chr5 116711510 116711902 -35825357 - MTD LTR MaLR -1 418 41 4 1475 896 214 101 39 chr5 116720224 116720481 -35816778 + MTD LTR MaLR 4 276 -143 4 1475 302 299 9 36 chr5 116720571 116720682 -35816577 + ORR1E LTR MaLR 83 190 -169 4 1475 272 287 51 58 chr5 116723314 116723451 -35813808 + ORR1E LTR MaLR 179 314 -45 4 1475 286 206 27 68 chr5 116723617 116723690 -35813569 + ORR1E LTR MaLR 310 379 0 4 1475 2194 150 0 22 chr5 116725525 116725886 -35811373 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 26 4 1475 383 255 84 9 chr5 116727345 116727452 -35809807 + MTEa LTR MaLR 47 161 -218 5 1475 397 326 28 90 chr5 116727616 116727828 -35809431 + MT2A LTR ERVL 269 467 -66 5 1475 1119 287 83 6 chr5 116729009 116729345 -35807914 + MTE2b LTR MaLR 18 379 0 5 1475 788 167 160 6 chr5 116730322 116730503 -35806756 + RMER4B LTR ERVK 17 225 -360 5 1475 513 238 50 72 chr5 116730800 116731056 -35806203 + RMER4B LTR ERVK 286 569 -16 5 1475 297 277 104 23 chr5 116734076 116734207 -35803052 + MLT1J LTR MaLR 399 609 -1 5 1475 307 232 62 51 chr5 116741698 116741875 -35795384 - RMER17A LTR ERVK -283 468 290 5 1475 1490 94 104 25 chr5 116742405 116742646 -35794613 + ORR1A2 LTR MaLR 68 327 0 5 1475 393 267 157 38 chr5 116745232 116745442 -35791817 - ORR1E LTR MaLR -99 260 26 5 1475 1284 242 73 89 chr5 116745885 116746311 -35790948 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1475 272 366 93 86 chr5 116748987 116749265 -35787994 - LTR33 LTR ERVL -185 330 51 5 1475 971 196 82 56 chr5 116749903 116750173 -35787086 - RMER15 LTR ERVL 0 575 299 5 1475 332 231 92 113 chr5 116750171 116750366 -35786893 - RMER15 LTR ERVL -382 193 3 5 1475 236 328 16 0 chr5 116750395 116750456 -35786803 + RMER15 LTR ERVL 499 560 -15 5 1475 2051 134 8 77 chr5 116752098 116752461 -35784798 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 5 1475 331 266 10 31 chr5 116753337 116753434 -35783825 + MLT1A1 LTR MaLR 307 401 -7 5 1475 243 304 87 16 chr5 116753981 116754108 -35783151 + LTR85a LTR Gypsy? 1 136 -566 5 1475 539 309 285 57 chr5 116754296 116754717 -35782542 - MLT1K LTR MaLR -4 591 75 5 1475 2052 99 10 27 chr5 116754945 116755284 -35781975 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 5 1475 286 169 27 40 chr5 116755284 116755327 -35781932 - ORR1B2 LTR MaLR -278 68 27 5 1475 349 172 24 57 chr5 116755294 116755420 -35781839 - ORR1B2 LTR MaLR -244 123 28 5 1475 521 128 19 0 chr5 116755415 116755523 -35781736 - ORR1B1 LTR MaLR -253 141 1 5 1475 387 346 26 0 chr5 116757830 116757983 -35779276 - MLT2D LTR ERVL -43 371 215 5 1475 308 299 58 25 chr5 116758223 116758343 -35778916 - MLT2D LTR ERVL -407 149 26 5 1475 286 324 35 18 chr5 116760163 116760276 -35776983 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 294 5 1475 324 227 70 30 chr5 116760680 116760780 -35776479 - MLT2B4 LTR ERVL -448 108 5 5 1475 689 227 135 0 chr5 116760945 116761108 -35776151 - MTD LTR MaLR -220 199 15 5 1475 461 242 58 0 chr5 116761274 116761394 -35775865 - MTEb LTR MaLR 0 379 253 5 1475 538 336 13 71 chr5 116761651 116761875 -35775384 + MLT1K LTR MaLR 41 251 -344 5 1475 1193 103 23 11 chr5 116763480 116763642 -35773617 + MTC LTR MaLR 258 421 0 5 1475 303 132 37 19 chr5 116765853 116765907 -35771352 - RLTR18 LTR ERVK -200 416 362 5 1475 271 301 51 57 chr5 116766207 116766383 -35770876 + RLTR21 LTR ERVK 1081 1255 -317 5 1475 274 324 83 14 chr5 116770983 116771127 -35766132 - LTR78 LTR ERV1 -861 443 290 6 1475 299 286 11 0 chr5 116771540 116771631 -35765628 + LTR16C LTR ERVL 168 259 -230 6 1475 1054 335 75 55 chr5 116773796 116774170 -35763089 + MLT1F2 LTR MaLR 3 384 -176 6 1475 3699 94 68 4 chr5 116774170 116774703 -35762556 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 6 1475 1054 335 75 55 chr5 116774703 116774872 -35762387 + MLT1F2 LTR MaLR 385 557 -3 6 1475 462 167 0 0 chr5 116778976 116779085 -35758174 + ORR1A2 LTR MaLR 1 109 -237 6 1475 2259 113 9 17 chr5 116779085 116779483 -35757776 + ORR1A2 LTR MaLR 2 394 0 6 1475 942 241 86 53 chr5 116782795 116783087 -35754172 + MTEa LTR MaLR 2 304 -75 6 1475 306 296 12 167 chr5 116782871 116783195 -35754064 + MLT2B5 LTR ERVL 125 398 -203 6 1475 392 257 18 54 chr5 116783228 116783339 -35753920 + MTEa LTR MaLR 273 379 0 6 1475 2149 106 66 0 chr5 116784219 116784522 -35752737 + ORR1A3 LTR MaLR 1 323 -3 6 1475 269 247 13 52 chr5 116784905 116784982 -35752277 + MTEa LTR MaLR 262 335 -44 6 1476 738 226 46 50 chr5 116786337 116786556 -35750703 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1105 6 1476 481 268 34 112 chr5 116786585 116786791 -35750468 - RMER12 LTR ERVK -137 1185 996 6 1476 3846 151 83 37 chr5 116786909 116787478 -35749781 - RMER12 LTR ERVK -531 791 197 6 1476 3477 28 2 0 chr5 116787478 116787873 -35749386 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1476 3846 151 83 37 chr5 116787873 116788059 -35749200 - RMER12 LTR ERVK -1126 196 1 6 1476 448 332 134 40 chr5 116788810 116789108 -35748151 + LTR89 LTR ERVL? 492 817 -62 6 1476 245 306 148 96 chr5 116789620 116789891 -35747368 - ORR1E LTR MaLR -1 358 74 6 1476 246 325 16 70 chr5 116789922 116790051 -35747208 - MLT1A1 LTR MaLR -281 127 6 6 1476 2162 88 52 3 chr5 116791538 116791847 -35745412 + ORR1A3 LTR MaLR 3 326 0 6 1476 230 328 17 0 chr5 116794686 116794744 -35742515 + MLT1J LTR MaLR 257 315 -197 6 1476 2769 43 0 47 chr5 116796725 116796782 -35740477 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 306 6 1476 2769 43 0 47 chr5 116797273 116797578 -35739681 - ORR1A0 LTR MaLR -41 305 1 6 1476 1743 198 122 5 chr5 116797782 116798152 -35739107 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 1476 2404 126 10 39 chr5 116798869 116799258 -35738001 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1476 548 201 87 40 chr5 116800776 116800926 -35736333 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 205 6 1476 660 249 63 107 chr5 116800978 116801087 -35736172 - ORR1D2 LTR MaLR -108 262 177 6 1476 660 249 63 107 chr5 116801136 116801296 -35735963 - ORR1D2 LTR MaLR -194 176 5 6 1476 594 311 61 128 chr5 116802343 116802489 -35734770 + MLT1A0 LTR MaLR 1 138 -227 6 1476 2263 74 52 61 chr5 116802489 116802819 -35734440 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1476 594 311 61 128 chr5 116802819 116802994 -35734265 + MLT1A0 LTR MaLR 139 295 -70 6 1476 594 311 61 128 chr5 116803105 116803173 -35734086 + MLT1A0 LTR MaLR 296 365 0 6 1476 246 336 9 63 chr5 116803776 116803800 -35733459 - MTE2b LTR MaLR -274 105 1 6 1476 304 268 23 11 chr5 116803800 116803887 -35733372 - MT2B LTR ERVL -513 88 1 6 1476 238 304 21 21 chr5 116804718 116804812 -35732447 - MLT1A1 LTR MaLR -314 94 1 6 1476 1218 227 44 151 chr5 116805862 116806252 -35731007 - MTE2a LTR MaLR -22 357 10 6 1476 1297 184 287 54 chr5 116806308 116806768 -35730491 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 6 1476 2787 60 42 12 chr5 116808669 116809057 -35728202 - MTB LTR MaLR -12 388 1 6 1476 332 250 109 10 chr5 116813074 116813175 -35724084 + MTEb LTR MaLR 3 113 -266 7 1476 316 261 225 41 chr5 116813320 116813564 -35723695 + LTR16B LTR ERVL 175 463 0 7 1476 603 312 113 52 chr5 116814766 116815148 -35722111 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1476 3565 115 47 4 chr5 116816303 116816389 -35720870 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 87 -470 7 1476 3565 115 47 4 chr5 116816437 116816884 -35720375 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 88 556 -1 7 1476 376 272 126 74 chr5 116818407 116818440 -35718819 - MTD LTR MaLR -43 336 308 7 1476 1695 167 18 10 chr5 116818484 116818795 -35718464 - MTD LTR MaLR -72 307 10 7 1476 1788 142 106 26 chr5 116820533 116820722 -35716537 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 173 7 1476 1788 142 106 26 chr5 116820754 116820903 -35716356 - ORR1C1 LTR MaLR -206 172 15 7 1476 364 316 115 55 chr5 116821346 116821744 -35715515 - MLT1J1 LTR MaLR 0 444 55 7 1476 672 289 90 5 chr5 116823678 116823890 -35713369 + MTEa LTR MaLR 149 378 -1 7 1476 905 88 10 46 chr5 116825257 116825410 -35711849 - ORR1A2 LTR MaLR 0 407 277 7 1476 2389 92 3 58 chr5 116825413 116825758 -35711501 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 7 1476 348 276 66 66 chr5 116827143 116827279 -35709980 - MLT1A0 LTR MaLR -221 144 9 7 1476 3167 141 37 79 chr5 116830873 116831491 -35705768 + RLTR26 LTR ERVK 51 642 0 7 1476 265 222 154 100 chr5 116831505 116831615 -35705644 + ORR1E LTR MaLR 244 359 0 7 1476 415 284 92 75 chr5 116831635 116831875 -35705384 + MLT1B LTR MaLR 114 357 -33 7 1476 4733 120 181 69 chr5 116832593 116833522 -35703737 - RLTR13D4 LTR ERVK 0 1033 1 7 1476 1397 191 112 44 chr5 116843406 116843741 -35693518 + MTD LTR MaLR 49 405 -14 7 1476 753 321 40 34 chr5 116845694 116846045 -35691214 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 13 7 1476 588 270 83 40 chr5 116846602 116846897 -35690362 + MLT1F LTR MaLR 138 495 -74 7 1476 776 308 95 36 chr5 116850348 116850650 -35686609 + MLT1A0 LTR MaLR 9 330 -35 7 1476 776 308 95 36 chr5 116850688 116850722 -35686537 + MLT1A0 LTR MaLR 331 364 -1 7 1476 1000 271 91 82 chr5 116851330 116851700 -35685559 + MTE2a LTR MaLR 6 370 -49 7 1476 1000 285 87 77 chr5 116851720 116851758 -35685501 + MTE2a LTR MaLR 332 363 -16 7 1476 842 301 77 72 chr5 116852067 116852511 -35684748 - MER74A LTR ERVL -55 503 58 7 1476 2562 123 33 45 chr5 116852553 116852979 -35684280 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1476 791 237 103 26 chr5 116853979 116854174 -35683085 + MTEa LTR MaLR 94 303 -76 7 1476 555 208 0 0 chr5 116857961 116858062 -35679197 + MTE2b LTR MaLR 279 379 0 8 1476 363 274 44 80 chr5 116864817 116865043 -35672216 - RMER12 LTR ERVK -334 988 771 8 1476 241 270 0 0 chr5 116871785 116871848 -35665411 + LTR50 LTR ERVL 718 780 -15 8 1476 981 291 120 34 chr5 116873356 116873797 -35663462 - MER31A LTR ERV1 -6 479 1 8 1476 1697 191 99 22 chr5 116878734 116879098 -35658161 - MTD LTR MaLR -14 405 14 8 1476 633 261 83 86 chr5 116879935 116880003 -35657256 - ORR1E LTR MaLR -11 348 280 8 1476 936 229 35 99 chr5 116880003 116880347 -35656912 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 8 1476 633 261 83 86 chr5 116880347 116880626 -35656633 - ORR1E LTR MaLR -80 279 3 8 1476 506 342 78 58 chr5 116881360 116881742 -35655517 - MLT1J LTR MaLR -60 452 63 8 1476 2676 122 76 27 chr5 116888529 116888598 -35648661 + RLTR11A LTR ERVK 18 106 -422 8 1476 2676 122 76 27 chr5 116888621 116889038 -35648221 + RLTR11A LTR ERVK 107 528 0 8 1476 475 298 112 173 chr5 116898521 116899093 -35638166 + MLT1H LTR MaLR 12 548 -1 8 1476 3180 81 2 0 chr5 116902274 116902670 -35634589 + MTB LTR MaLR 4 400 0 9 1476 477 366 101 18 chr5 116909903 116910189 -35627070 - LTR16C LTR ERVL -79 410 101 9 1477 234 329 17 116 chr5 116924895 116925067 -35612192 + MLT1M LTR MaLR 518 672 0 9 1477 230 352 68 54 chr5 116926832 116926864 -35610395 - MT2B2 LTR ERVL -423 161 128 9 1477 328 315 174 13 chr5 116932903 116933161 -35604098 + MLT1F LTR MaLR 162 422 -126 9 1477 3903 176 73 16 chr5 116942747 116943137 -35594122 + RMER17B LTR ERVK 2 435 -523 9 1477 3903 220 70 57 chr5 116943194 116943763 -35593496 + RMER17B LTR ERVK 359 894 -12 9 1477 388 354 33 17 chr5 116947961 116948142 -35589117 - LTR16C LTR ERVL -154 335 152 9 1477 232 321 65 51 chr5 116948727 116948865 -35588394 - ORR1E LTR MaLR -211 148 9 9 1477 239 152 20 80 chr5 116958430 116958480 -35578779 + RMER15 LTR ERVL 4 50 -525 1 1477 2032 207 114 9 chr5 116958480 116958928 -35578331 + RMER15 LTR ERVL 15 509 -66 1 1477 704 300 54 78 chr5 116962742 116963168 -35574091 + MTE2a LTR MaLR 1 417 -2 1 1477 573 348 138 3 chr5 116966581 116966907 -35570352 + MLT1I LTR MaLR 42 411 0 1 1477 449 346 178 9 chr5 116974231 116974563 -35562696 + MLT1K LTR MaLR 98 485 -110 1 1477 255 320 287 8 chr5 116978830 116978959 -35558300 + MLT1B LTR MaLR 1 165 -225 1 1477 699 340 99 53 chr5 116979113 116979566 -35557693 + MLT2B3 LTR ERVL 18 491 -63 1 1477 3711 44 5 9 chr5 116984494 116984932 -35552327 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1477 2986 73 30 2 chr5 116985072 116985468 -35551791 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1477 990 252 76 36 chr5 116992261 116992590 -35544669 - ORR1E LTR MaLR -15 344 3 1 1477 346 303 193 29 chr5 116992698 116992936 -35544323 + LTR16A LTR ERVL 158 434 -17 1 1477 494 293 74 125 chr5 116994342 116994650 -35542609 + MLT1F2 LTR MaLR 206 585 -42 1 1477 1015 206 272 3 chr5 116997517 116997829 -35539430 + MTD LTR MaLR 1 396 -23 1 1477 351 377 33 0 chr5 117000000 117000183 -35537076 - MLT1L LTR MaLR -119 491 303 1 1477 338 311 106 20 chr5 117000916 117001067 -35536192 + LTR16B2 LTR ERVL 1 164 -298 4 1477 262 331 93 40 chr5 117004612 117004763 -35532496 + MLT1L LTR MaLR 51 209 -401 1 1477 313 285 105 8 chr5 117004916 117005040 -35532219 + MLT1L LTR MaLR 469 604 -6 1 1477 356 279 110 41 chr5 117007678 117007824 -35529435 + ORR1E LTR MaLR 40 195 -164 1 1477 606 271 53 107 chr5 117008077 117008574 -35528685 + RMER15 LTR ERVL 14 575 0 1 1477 2161 110 6 87 chr5 117008653 117009011 -35528248 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1477 561 234 91 77 chr5 117009873 117010081 -35527178 + ORR1E LTR MaLR 1 211 -148 2 1477 388 259 71 37 chr5 117011871 117012049 -35525210 - MLT1C LTR MaLR -15 534 352 2 1477 260 303 88 29 chr5 117012309 117012445 -35524814 + LTR45C LTR ERV1 382 525 -14 2 1477 489 315 74 12 chr5 117012449 117012693 -35524566 - MLT1C LTR MaLR -156 311 53 2 1477 2291 143 31 21 chr5 117018003 117018389 -35518870 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 4 1477 3417 86 42 2 chr5 117025267 117025724 -35511535 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 1477 531 321 182 20 chr5 117028744 117029046 -35508213 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 1 351 -452 6 1477 891 263 118 35 chr5 117037892 117038208 -35499051 + MTE2b LTR MaLR 1 337 -42 8 1477 891 263 118 35 chr5 117038242 117038272 -35498987 + MTE2b LTR MaLR 338 376 -3 8 1477 736 243 47 38 chr5 117043746 117043981 -35493278 - MTEa LTR MaLR 0 379 143 9 1477 1121 256 102 62 chr5 117044270 117044755 -35492504 - RMER13A LTR ERVK -123 504 1 9 1477 487 224 83 33 chr5 117044755 117044857 -35492402 - MTEa LTR MaLR -259 120 13 9 1477 582 270 7 13 chr5 117046560 117046714 -35490545 + MTD LTR MaLR 26 178 -241 9 1477 786 250 99 57 chr5 117046742 117047005 -35490254 + MTD LTR MaLR 146 419 0 9 1477 254 260 26 13 chr5 117047106 117047184 -35490075 - MTEb LTR MaLR -23 356 278 9 1478 2341 163 24 33 chr5 117052034 117052459 -35484800 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1478 447 286 112 36 chr5 117052467 117052744 -35484515 - MTE2a LTR MaLR -43 336 39 1 1478 265 331 74 47 chr5 117062891 117063040 -35474219 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 256 1 1478 335 297 59 88 chr5 117066160 117066330 -35470929 - MTEb LTR MaLR -3 376 212 1 1478 757 294 66 99 chr5 117067018 117067259 -35470000 + ORR1E LTR MaLR 39 270 -89 1 1478 757 287 65 101 chr5 117067529 117067611 -35469648 + ORR1E LTR MaLR 277 358 -1 1 1478 777 256 81 19 chr5 117070620 117070831 -35466428 - RMER21A LTR ERV1 -258 689 466 1 1478 278 314 0 28 chr5 117070863 117070971 -35466288 - RMER21A LTR ERV1 -661 181 77 1 1478 271 294 82 101 chr5 117071009 117071228 -35466031 - ORR1E LTR MaLR -37 322 108 1 1478 236 239 53 118 chr5 117071325 117071401 -35465858 - ORR1E LTR MaLR -290 89 19 1 1478 621 338 89 20 chr5 117075258 117075551 -35461708 + MLT1F2 LTR MaLR 199 511 -49 1 1478 228 224 85 17 chr5 117077599 117077658 -35459601 + RMER17A LTR ERVK 480 542 -209 1 1478 754 275 173 29 chr5 117078695 117079002 -35458257 + MLT2B5 LTR ERVL 4 354 -363 1 1478 739 287 93 75 chr5 117079134 117079466 -35457793 + MLT1B LTR MaLR 28 365 -25 1 1478 614 208 0 0 chr5 117079471 117079577 -35457682 + MTC LTR MaLR 3 108 -313 1 1478 267 143 18 0 chr5 117079583 117079639 -35457620 - RMER19A LTR ERVK -6 731 675 1 1478 2029 83 3 18 chr5 117079642 117079924 -35457335 - MTB_Mm LTR MaLR -129 278 1 1 1478 966 292 97 18 chr5 117083951 117084282 -35452977 + MTE2b LTR MaLR 21 377 -2 1 1478 503 321 143 24 chr5 117090335 117090622 -35446637 + MLT1F LTR MaLR 222 542 -6 1 1478 2412 139 7 67 chr5 117091781 117092198 -35445061 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 2 1478 989 193 155 59 chr5 117093538 117093818 -35443441 + ORR1D1 LTR MaLR 1 310 -64 2 1478 989 193 155 59 chr5 117093869 117093929 -35443330 + ORR1D1 LTR MaLR 311 373 -1 2 1478 254 274 18 72 chr5 117094157 117094267 -35442992 - MLT1N2 LTR MaLR -2 670 462 2 1478 1947 225 35 12 chr5 117096953 117097354 -35439905 + MTC LTR MaLR 1 410 -11 2 1478 344 329 153 51 chr5 117098601 117098992 -35438267 - LTR16A LTR ERVL -6 445 15 2 1478 283 279 0 0 chr5 117102196 117102264 -35434995 - MLT1K LTR MaLR -358 237 170 2 1478 3357 53 2 0 chr5 117103260 117103659 -35433600 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1478 941 280 56 91 chr5 117104284 117104657 -35432602 + MTEa LTR MaLR 1 360 -19 2 1478 2185 110 31 3 chr5 117106411 117106729 -35430530 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1478 319 331 38 30 chr5 117108011 117108142 -35429117 - MLT1A1 LTR MaLR -197 211 80 2 1478 1406 243 46 9 chr5 117110044 117110368 -35426891 + MTD LTR MaLR 7 342 -77 2 1478 568 296 184 77 chr5 117111315 117111821 -35425438 + RMER15 LTR ERVL 16 575 0 2 1478 2733 46 3 12 chr5 117116404 117116734 -35420525 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1478 259 294 82 0 chr5 117117923 117118008 -35419251 - ORR1D2 LTR MaLR -255 115 24 2 1478 1345 197 164 27 chr5 117120012 117120178 -35417081 + MTD LTR MaLR 5 198 -221 2 1478 1345 206 157 28 chr5 117120269 117120462 -35416797 + MTD LTR MaLR 199 421 0 2 1478 12647 81 19 44 chr5 117120905 117122760 -35414499 - RLTR22_Mus LTR ERVK 0 1808 1 2 1478 507 319 74 22 chr5 117123744 117124055 -35413204 - MLT1E LTR MaLR 0 654 330 2 1478 263 385 0 0 chr5 117124117 117124195 -35413064 - MLT1E LTR MaLR -471 89 12 2 1478 2991 147 9 46 chr5 117128216 117128764 -35408495 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 2 1478 1073 267 64 52 chr5 117128880 117128956 -35408303 - ORR1E LTR MaLR -10 349 274 2 1478 1073 267 64 52 chr5 117129032 117129298 -35407961 - ORR1E LTR MaLR -86 273 3 2 1478 685 324 152 97 chr5 117131024 117131530 -35405729 + MLT1H LTR MaLR 1 534 -15 2 1478 493 356 129 43 chr5 117136499 117136919 -35400340 + LTR83 LTR ERVL 252 707 -73 2 1478 340 312 88 84 chr5 117138829 117139102 -35398157 - ORR1E LTR MaLR -4 355 82 2 1478 1108 232 91 55 chr5 117146579 117146887 -35390372 - MTEa LTR MaLR -5 374 61 3 1478 1108 232 91 55 chr5 117146944 117146996 -35390263 - MTEa LTR MaLR -319 60 3 3 1478 294 248 102 95 chr5 117153443 117153590 -35383669 + LTR16E1 LTR ERVL 364 511 -27 3 1478 2367 88 22 0 chr5 117153722 117154040 -35383219 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 3 1478 660 308 199 48 chr5 117154282 117154654 -35382605 - MLT2F LTR ERVL -235 428 1 3 1478 2483 125 49 0 chr5 117155636 117155684 -35381575 - MTC LTR MaLR -17 404 355 3 1478 2483 125 49 0 chr5 117155706 117156042 -35381217 - MTC LTR MaLR -67 354 2 3 1478 521 291 155 26 chr5 117156209 117156513 -35380746 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 3 1478 954 269 29 84 chr5 117163139 117163528 -35373731 + MTE2a LTR MaLR 16 391 -30 3 1478 758 229 23 92 chr5 117163677 117163935 -35373324 + MTEa LTR MaLR 106 377 -2 3 1478 229 282 11 96 chr5 117165974 117166068 -35371191 - MT2B2 LTR ERVL -342 242 157 3 1478 1397 229 31 44 chr5 117166529 117166844 -35370415 - MTE2b LTR MaLR 0 379 72 3 1478 1397 229 31 44 chr5 117166934 117167001 -35370258 - MTE2b LTR MaLR -308 71 2 3 1478 636 251 65 23 chr5 117170677 117170893 -35366366 + RMER15 LTR ERVL 220 444 -131 3 1478 2284 87 22 0 chr5 117170893 117171204 -35366055 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 3 1478 422 184 39 48 chr5 117171208 117171311 -35365948 + RMER15 LTR ERVL 440 541 -34 3 1478 333 385 60 48 chr5 117176166 117176501 -35360758 - LTR85c LTR Gypsy? -1 822 459 3 1478 3518 23 5 0 chr5 117176501 117176895 -35360364 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1478 8854 43 24 1 chr5 117176895 117177968 -35359291 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1478 3379 30 8 0 chr5 117177968 117178361 -35358898 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 184 251 408 55 66 chr5 117178361 117178510 -35358749 - LTR85c LTR Gypsy? -326 458 313 3 1479 1866 106 156 0 chr5 117180535 117180818 -35356441 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1479 1305 239 73 18 chr5 117183332 117183673 -35353586 - MTE2b LTR MaLR -2 377 18 3 1479 434 356 86 18 chr5 117184223 117184443 -35352816 + LTR16A LTR ERVL 121 355 -96 3 1479 523 179 35 9 chr5 117184454 117184567 -35352692 + ORR1A2 LTR MaLR 1 116 -211 3 1479 1942 115 3 17 chr5 117184560 117184853 -35352406 + ORR1A2 LTR MaLR 29 317 -10 3 1479 1183 276 84 17 chr5 117185935 117186003 -35351256 - MTE2b LTR MaLR -10 369 302 3 1479 1183 276 84 17 chr5 117186213 117186490 -35350769 - MTE2b LTR MaLR -78 301 2 3 1479 3790 179 26 33 chr5 117187459 117188458 -35348801 - RMER17B LTR ERVK 0 958 12 3 1479 692 334 75 21 chr5 117191876 117192249 -35345010 - MLT1C LTR MaLR -33 434 42 3 1479 920 242 67 162 chr5 117192298 117192717 -35344542 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 1479 943 305 85 59 chr5 117193310 117193732 -35343527 + MLT1F2 LTR MaLR 27 459 -101 4 1479 288 252 81 81 chr5 117199483 117199521 -35337738 - MTD LTR MaLR 0 379 342 4 1479 3381 36 5 8 chr5 117199521 117199918 -35337341 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1479 391 188 86 68 chr5 117199918 117199985 -35337274 - MTD LTR MaLR -59 360 270 4 1479 2047 135 3 58 chr5 117199985 117200330 -35336929 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 1479 391 199 85 70 chr5 117200330 117200383 -35336876 - MTD LTR MaLR -111 308 221 4 1479 624 307 58 31 chr5 117200420 117200679 -35336580 - MTD LTR MaLR -149 270 5 4 1479 946 237 68 145 chr5 117205141 117205535 -35331724 + MTE2a LTR MaLR 3 366 -13 4 1479 334 247 40 40 chr5 117207779 117207880 -35329379 + MTEa LTR MaLR 274 374 -5 4 1479 425 325 64 35 chr5 117210274 117210446 -35326813 + MLT1A0 LTR MaLR 1 177 -188 4 1479 2598 74 3 0 chr5 117214105 117214431 -35322828 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1479 2226 127 0 29 chr5 117217223 117217571 -35319688 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 4 1479 3528 15 8 0 chr5 117218103 117218496 -35318763 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1479 9267 33 5 1 chr5 117218496 117219590 -35317669 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1479 3528 15 8 0 chr5 117219590 117219983 -35317276 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1479 255 221 250 8 chr5 117220878 117221006 -35316253 - ORR1E LTR MaLR -37 342 184 4 1479 313 317 74 16 chr5 117221046 117221168 -35316091 - ORR1E LTR MaLR -228 131 3 4 1479 3507 28 2 0 chr5 117226753 117227148 -35310111 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1479 242 275 174 24 chr5 117234710 117234922 -35302337 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1207 1450 -398 4 1479 393 301 54 80 chr5 117235063 117235287 -35301972 + RMER12 LTR ERVK 771 988 -334 5 1479 1059 287 50 98 chr5 117240414 117240812 -35296447 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 5 1479 238 231 30 30 chr5 117241543 117241610 -35295649 + RMER15 LTR ERVL 494 560 -15 5 1479 294 299 50 17 chr5 117241665 117241784 -35295475 + LTR33 LTR ERVL 385 507 -8 5 1479 1202 263 46 81 chr5 117242089 117242482 -35294777 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1479 402 338 73 34 chr5 117242521 117242726 -35294533 - MER74A LTR ERVL 0 558 346 5 1479 296 336 19 9 chr5 117242821 117242926 -35294333 - MER74A LTR ERVL -405 153 48 5 1479 2261 117 41 57 chr5 117243141 117243530 -35293729 + ORR1B1 LTR MaLR 4 386 -8 5 1479 320 231 61 71 chr5 117243889 117243987 -35293272 + MLT1K LTR MaLR 143 239 -356 5 1479 251 221 100 2 chr5 117245301 117245371 -35291888 + MLT1K LTR MaLR 339 444 -4 5 1479 3429 25 2 8 chr5 117245941 117246339 -35290920 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1479 2043 108 75 0 chr5 117247712 117248018 -35289241 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1479 9610 142 39 120 chr5 117248018 117250155 -35287104 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1963 0 5 1479 2278 72 65 0 chr5 117250155 117250462 -35286797 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 5 1479 311 317 222 24 chr5 117252743 117252995 -35284264 - MLT1C LTR MaLR -160 307 6 5 1479 344 287 100 44 chr5 117256179 117256402 -35280857 - RMER15 LTR ERVL -17 558 303 5 1479 913 200 18 29 chr5 117257073 117257243 -35280016 + ORR1B2 LTR MaLR 5 172 -195 5 1479 1178 158 24 19 chr5 117257468 117257675 -35279584 + ORR1B2 LTR MaLR 160 367 0 5 1479 257 328 122 20 chr5 117260868 117261064 -35276195 - MLT1C LTR MaLR 0 467 252 5 1479 280 267 40 13 chr5 117261131 117261207 -35276052 - MLT1C LTR MaLR -331 136 59 5 1479 995 260 109 43 chr5 117261360 117261689 -35275570 - MTEa LTR MaLR -25 354 4 5 1479 229 283 156 16 chr5 117262529 117262651 -35274608 - MLT1E2 LTR MaLR -474 153 15 5 1479 303 301 71 24 chr5 117264686 117264812 -35272447 + LTR16E1 LTR ERVL 369 500 -38 5 1479 1338 187 212 17 chr5 117267425 117267774 -35269485 - MTD LTR MaLR 0 419 3 5 1479 4136 118 141 0 chr5 117267951 117268578 -35268681 - RMER19A LTR ERVK 0 737 27 5 1479 4136 118 141 0 chr5 117268598 117268616 -35268643 - RMER19A LTR ERVK -711 26 2 5 1479 342 231 239 9 chr5 117274732 117274841 -35262418 - MTEa LTR MaLR -8 371 238 5 1479 1000 249 42 124 chr5 117274837 117275223 -35262036 + MTE2a LTR MaLR 11 364 -15 5 1479 252 277 57 38 chr5 117275171 117275276 -35261983 - LTR86A2 LTR ERVL -42 466 360 5 1479 285 270 134 70 chr5 117275246 117275433 -35261826 - MTEa LTR MaLR -109 250 52 5 1479 2587 193 25 102 chr5 117276089 117276739 -35260520 - RMER19C LTR ERVK -2 609 10 5 1479 1004 286 13 122 chr5 117276817 117277211 -35260048 + MTE2a LTR MaLR 11 361 -18 5 1479 450 278 128 33 chr5 117277491 117277807 -35259452 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 5 1479 6579 148 45 51 chr5 117283404 117283839 -35253420 - MTC-int LTR MaLR -29 1229 794 6 1479 6579 148 45 51 chr5 117283933 117284734 -35252525 - MTC-int LTR MaLR -465 793 3 6 1479 2467 165 46 0 chr5 117284738 117285133 -35252126 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 1479 334 341 35 75 chr5 117285482 117285710 -35251549 - ORR1E LTR MaLR -140 219 1 6 1479 702 237 9 24 chr5 117286886 117287056 -35250203 - MTD LTR MaLR -14 405 223 6 1479 868 295 38 41 chr5 117287072 117287346 -35249913 - MTD LTR MaLR -123 296 18 6 1479 1796 114 293 9 chr5 117287346 117287674 -35249585 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1479 868 295 38 41 chr5 117287674 117287692 -35249567 - MTD LTR MaLR -402 17 5 6 1479 898 122 0 8 chr5 117287847 117287979 -35249280 + MTC LTR MaLR 272 402 -19 6 1479 305 219 53 27 chr5 117287977 117288052 -35249207 + MTE2a LTR MaLR 68 144 -235 6 1479 538 84 6 3 chr5 117290846 117290949 -35246310 + RMER17D2 LTR ERVK 379 525 -284 6 1479 583 177 219 65 chr5 117291151 117291320 -35245939 + MTEa LTR MaLR 16 210 -169 6 1479 300 280 24 56 chr5 117291404 117291529 -35245730 - RMER15 LTR ERVL -391 184 64 6 1479 505 274 111 103 chr5 117291803 117292303 -35244956 - RMER13A LTR ERVK -25 602 30 6 1479 320 203 0 33 chr5 117292664 117292725 -35244534 + MTEa LTR MaLR 311 369 -10 6 1479 309 193 124 74 chr5 117297011 117297126 -35240133 - RMER10A LTR ERVL -279 119 1 6 1479 1330 235 121 12 chr5 117297382 117297714 -35239545 - MTD LTR MaLR -34 385 18 6 1479 2950 30 78 8 chr5 117300875 117301245 -35236014 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1479 288 304 124 9 chr5 117304943 117305056 -35232203 - MLT1J2 LTR MaLR -322 126 1 6 1479 497 138 0 153 chr5 117305511 117305648 -35231611 + ORR1A1 LTR MaLR 1 116 -230 6 1479 2137 72 16 162 chr5 117308404 117308787 -35228472 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1479 374 350 190 21 chr5 117308806 117309095 -35228164 + RMER15 LTR ERVL 238 575 0 6 1479 318 230 75 58 chr5 117309215 117309335 -35227924 - MER74C LTR ERVL -55 405 284 6 184 467 368 67 0 chr5 117309371 117309564 -35227695 - MER74C LTR ERVL -244 216 11 6 1480 242 274 0 0 chr5 117309987 117310038 -35227221 + LTR16C LTR ERVL 435 485 -4 6 1480 272 227 121 0 chr5 117310360 117310426 -35226833 - MLT1M LTR MaLR -6 666 593 6 1480 2084 105 14 69 chr5 117313113 117313462 -35223797 - MTC LTR MaLR -6 415 86 6 1480 470 256 70 93 chr5 117313870 117314042 -35223217 + MLT1F-int LTR MaLR 1057 1224 -265 6 1480 992 269 71 7 chr5 117314194 117314490 -35222769 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 56 6 1480 1365 238 90 42 chr5 117317457 117317857 -35219402 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1480 2440 68 3 0 chr5 117320052 117320360 -35216899 + ORR1A2 LTR MaLR 19 327 0 7 1480 311 230 327 51 chr5 117320705 117320861 -35216398 + MLT1C LTR MaLR 270 468 -37 7 1480 253 338 111 38 chr5 117320843 117321173 -35216086 - MLT2B3 LTR ERVL -237 480 124 7 1480 3062 69 15 2 chr5 117321173 117321568 -35215691 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1480 2090 111 28 41 chr5 117324048 117324455 -35212804 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 1 7 1480 1484 229 51 34 chr5 117325102 117325455 -35211804 - MTE2b LTR MaLR -3 376 18 7 1480 387 182 97 54 chr5 117329208 117329301 -35207958 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 306 7 1480 431 204 152 0 chr5 117329726 117329761 -35207498 + ORR1B1 LTR MaLR 1 35 -359 7 1480 431 204 152 0 chr5 117329809 117329897 -35207362 + ORR1B1 LTR MaLR 36 143 -251 7 1480 1920 160 46 48 chr5 117329897 117330292 -35206967 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1480 1321 232 178 3 chr5 117332953 117333308 -35203951 - MTD LTR MaLR 0 419 3 7 1480 266 219 104 31 chr5 117333673 117333835 -35203424 + MLT1B LTR MaLR 149 341 -49 7 1480 291 308 131 14 chr5 117336322 117336467 -35200792 - LTR16A LTR ERVL -282 169 8 7 1480 2345 77 45 0 chr5 117338428 117338741 -35198518 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1480 2094 94 7 20 chr5 117339884 117340187 -35197072 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 29 7 1480 506 196 4 0 chr5 117340176 117340293 -35196966 - ORR1A2 LTR MaLR -227 119 1 7 1480 451 291 9 0 chr5 117341731 117341841 -35195418 + MLT2B2 LTR ERVL 4 114 -401 7 1480 1906 191 87 14 chr5 117347045 117347431 -35189828 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 7 1480 494 117 1 55 chr5 117348723 117348831 -35188428 + ORR1A2 LTR MaLR 1 109 -237 7 1480 1636 141 86 7 chr5 117348867 117349145 -35188114 + ORR1A2 LTR MaLR 28 327 0 7 1480 318 218 152 83 chr5 117350024 117350169 -35187090 - RLTR22_Mur LTR ERVK -387 1461 1307 7 1480 2622 145 108 12 chr5 117351968 117352450 -35184809 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 7 1480 1180 199 79 139 chr5 117352733 117353136 -35184123 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 7 1480 1469 126 24 11 chr5 117355037 117355338 -35181921 - MTC LTR MaLR -2 419 1 7 1480 3276 48 8 0 chr5 117356778 117357171 -35180088 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1480 7392 75 45 72 chr5 117357171 117358298 -35178961 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1097 -1 7 1480 3385 26 8 0 chr5 117358299 117358689 -35178570 + MTA_Mm LTR MaLR 1 393 -3 7 1480 683 296 82 25 chr5 117359974 117360255 -35177004 + RMER15 LTR ERVL 279 575 0 7 1480 226 398 9 0 chr5 117360593 117360701 -35176558 - MLT1G1 LTR MaLR -37 542 434 7 1480 335 264 174 12 chr5 117360739 117360900 -35176359 - MLT1G1 LTR MaLR -224 355 169 7 1480 1570 174 39 60 chr5 117361012 117361398 -35175861 - RMER17C LTR ERVK -32 378 1 7 1480 2474 72 19 0 chr5 117363385 117363706 -35173553 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1480 1861 185 66 38 chr5 117366907 117367273 -35169986 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 8 1480 1319 184 29 40 chr5 117370126 117370403 -35166856 + RLTR46 LTR ERVK 42 315 -5 8 1480 245 268 76 59 chr5 117372866 117372985 -35164274 - LTR16C LTR ERVL -356 133 13 8 1480 2989 110 24 38 chr5 117373509 117374010 -35163249 - RLTR28 LTR ERVL -30 494 1 8 1480 2796 246 114 99 chr5 117376488 117377790 -35159469 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1 8 1480 300 230 21 75 chr5 117378962 117379056 -35158203 - MTE2a LTR MaLR -7 372 284 8 1480 781 236 6 42 chr5 117379064 117379232 -35158027 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 407 8 1480 362 268 88 18 chr5 117379221 117379335 -35157924 - RLTR20D LTR ERVK -285 283 162 8 1480 1938 132 8 112 chr5 117385158 117385525 -35151734 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1480 340 216 47 8 chr5 117387526 117387624 -35149635 - MLT1J LTR MaLR -261 183 79 8 1480 379 114 0 136 chr5 117389896 117389956 -35147303 + ORR1B1 LTR MaLR 43 91 -303 8 1480 3203 195 36 28 chr5 117389956 117390595 -35146664 - RMER13B LTR ERVK -1 907 264 8 1480 1086 112 101 0 chr5 117390590 117390768 -35146491 + ORR1B1 LTR MaLR 199 394 0 8 1480 2225 69 41 29 chr5 117392244 117392559 -35144700 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 1480 1936 110 33 51 chr5 117394283 117394618 -35142641 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 8 1480 240 215 11 112 chr5 117396655 117396713 -35140546 - MTEa LTR MaLR -18 361 313 8 1480 262 319 14 138 chr5 117397478 117397616 -35139643 - MTEa LTR MaLR -258 121 1 8 1480 234 229 194 0 chr5 117401899 117402043 -35135216 + RLTR21 LTR ERVK 1081 1252 -320 9 1480 406 204 42 21 chr5 117409641 117409736 -35127523 - MTE2b LTR MaLR -43 336 240 9 1480 296 340 65 37 chr5 117410063 117410277 -35126982 - LTR16A LTR ERVL -211 240 21 9 1480 304 239 182 9 chr5 117410755 117410865 -35126394 + MT2A LTR ERVL 2 130 -403 9 1480 522 235 73 40 chr5 117410769 117411054 -35126205 + MTE2b LTR MaLR 20 379 0 9 1480 1699 174 251 17 chr5 117412042 117412504 -35124755 + RMER15 LTR ERVL 6 575 0 9 1480 444 217 80 40 chr5 117415127 117415252 -35122007 - RMER15 LTR ERVL 0 575 446 9 1480 1072 260 177 40 chr5 117415347 117415828 -35121431 - RMER15 LTR ERVL -2 573 27 9 1480 3510 86 17 4 chr5 117418921 117419390 -35117869 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 9 1480 1848 142 119 8 chr5 117419694 117419872 -35117387 + RMER17C LTR ERVK 1 212 -198 9 1480 1848 142 119 8 chr5 117419930 117420120 -35117139 + RMER17C LTR ERVK 213 409 -1 9 1480 1386 165 183 0 chr5 117420133 117420406 -35116853 + ORR1C2 LTR MaLR 62 384 0 9 1480 646 321 52 82 chr5 117422117 117422309 -35114950 + MLT1A1 LTR MaLR 4 179 -229 9 1480 646 321 52 82 chr5 117422347 117422554 -35114705 + MLT1A1 LTR MaLR 180 391 -17 9 1480 912 257 41 144 chr5 117422623 117423186 -35114073 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 9 1480 972 237 132 47 chr5 117424094 117424413 -35112846 + MTEb LTR MaLR 1 341 -38 9 1480 972 237 132 47 chr5 117424448 117424469 -35112790 + MTEb LTR MaLR 342 369 -10 9 1480 1153 319 91 11 chr5 117424505 117424951 -35112308 + ORR1E-int LTR MaLR 99 548 -822 9 1480 530 308 44 64 chr5 117424996 117425246 -35112013 - RMER15 LTR ERVL -2 573 329 9 1480 444 238 96 20 chr5 117425234 117425380 -35111879 - RMER15 LTR ERVL -402 173 17 9 1480 1752 159 79 20 chr5 117425869 117426184 -35111075 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 51 9 1480 1752 159 79 20 chr5 117426225 117426262 -35110997 - ORR1D1 LTR MaLR -324 50 1 9 1480 898 211 10 61 chr5 117428404 117428555 -35108704 + ORR1E LTR MaLR 3 151 -208 9 1480 2304 85 31 6 chr5 117428555 117428874 -35108385 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1480 898 211 10 61 chr5 117428874 117428919 -35108340 + ORR1E LTR MaLR 152 189 -170 9 1480 327 263 113 101 chr5 117429003 117429204 -35108055 + ORR1E LTR MaLR 171 366 -13 9 1480 2713 136 17 15 chr5 117430580 117430992 -35106267 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 1480 658 179 51 8 chr5 117431138 117431256 -35106003 + MTC LTR MaLR 291 413 -8 9 1480 2436 207 12 122 chr5 117431476 117432163 -35105096 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 9 1480 1330 207 83 12 chr5 117432698 117433025 -35104234 + ORR1D1 LTR MaLR 25 374 0 9 1480 308 299 75 79 chr5 117435180 117435420 -35101839 - RMER12 LTR ERVK -334 988 750 9 1480 643 71 0 0 chr5 117436721 117436805 -35100454 - ORR1A2 LTR MaLR -147 180 97 9 1480 3039 23 0 6 chr5 117437415 117437763 -35099496 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 9 1480 11532 52 125 0 chr5 117437763 117439356 -35097903 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 9 1480 3123 17 0 3 chr5 117439356 117439703 -35097556 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 9 1481 676 283 136 23 chr5 117442416 117442680 -35094579 - MTE2a LTR MaLR -4 375 82 9 1481 780 218 86 0 chr5 117442681 117442855 -35094404 - MTE2b LTR MaLR -190 189 1 1 1481 309 279 215 17 chr5 117444412 117444654 -35092605 - MLT1H-int LTR MaLR -863 546 258 1 1481 1464 212 103 14 chr5 117445164 117445513 -35091746 - MTD LTR MaLR -16 403 24 1 1481 622 269 11 23 chr5 117445506 117445681 -35091578 - MTD LTR MaLR -242 177 5 1 1481 3118 81 10 2 chr5 117445816 117446213 -35091046 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1481 2883 49 6 0 chr5 117446622 117446966 -35090293 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1481 788 341 131 21 chr5 117447015 117447497 -35089762 + MLT1K LTR MaLR 43 577 -18 1 1481 999 225 29 5 chr5 117447554 117447764 -35089495 + MTE2b LTR MaLR 1 215 -164 1 1481 621 267 16 54 chr5 117447881 117447988 -35089271 + MTE2b LTR MaLR 201 304 -75 1 1481 621 267 16 54 chr5 117448174 117448252 -35089007 + MTE2b LTR MaLR 305 379 0 1 1481 360 318 31 43 chr5 117449803 117449964 -35087295 + MLT1K LTR MaLR 160 318 -277 1 1481 270 310 17 34 chr5 117454875 117454992 -35082267 + ORR1A4 LTR MaLR 25 139 -190 1 1481 1489 241 91 57 chr5 117455424 117456141 -35081118 - RMER20A LTR ERVK -190 670 1 1 1481 4284 44 0 10 chr5 117456610 117457118 -35080141 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 1 1481 2637 24 204 0 chr5 117458259 117458588 -35078671 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1481 9638 22 2 1 chr5 117458588 117459685 -35077574 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1481 3450 35 2 0 chr5 117459685 117460080 -35077179 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1481 231 257 143 38 chr5 117463027 117463237 -35074022 + RLTR21 LTR ERVK 1075 1306 -266 1 1481 277 253 56 78 chr5 117463756 117463846 -35073413 + LTR16E1 LTR ERVL 440 527 -11 1 1481 535 338 33 65 chr5 117464045 117464381 -35072878 + LTR16A LTR ERVL 98 422 -29 1 1481 300 187 0 128 chr5 117466542 117466681 -35070578 + ORR1B1 LTR MaLR 1 150 -244 1 1481 1631 153 75 8 chr5 117466681 117466997 -35070262 + ORR1A3 LTR MaLR 1 338 -8 1 1481 229 303 0 57 chr5 117467024 117467094 -35070165 - MLT1D LTR MaLR -439 66 1 1 1481 1276 142 4 117 chr5 117468690 117468954 -35068305 - ORR1B1 LTR MaLR -99 295 62 1 1481 475 155 0 11 chr5 117468963 117469080 -35068179 - ORR1B1 LTR MaLR -235 111 1 1 1481 2329 74 11 63 chr5 117470782 117471129 -35066130 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1481 1257 282 94 12 chr5 117472523 117472864 -35064395 + MTEb LTR MaLR 11 379 0 1 1481 268 320 252 15 chr5 117474433 117474639 -35062620 + LTR16C LTR ERVL 42 296 -193 1 1481 4451 22 0 0 chr5 117477955 117478448 -35058811 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1481 900 200 80 10 chr5 117479241 117479515 -35057744 - ORR1D1 LTR MaLR -1 369 1 1 1481 741 310 71 65 chr5 117480078 117480585 -35056674 - RLTR33 LTR ERVK -27 651 142 1 1481 2816 172 63 17 chr5 117480643 117481170 -35056089 - RMER19B LTR ERVK -12 890 340 1 1481 1024 176 0 204 chr5 117481192 117481477 -35055782 - RMER19B LTR ERVK -675 227 1 1 1481 520 269 68 7 chr5 117483101 117483247 -35054012 - MTEb LTR MaLR 0 379 225 1 1481 410 206 82 0 chr5 117484521 117484618 -35052641 + MTD LTR MaLR 315 419 0 1 1481 509 239 403 26 chr5 117487768 117488036 -35049223 - MTEa LTR MaLR -6 373 5 1 1481 1409 202 155 16 chr5 117488318 117488635 -35048624 - MTE2a LTR MaLR 0 379 19 1 1481 248 300 115 16 chr5 117489825 117489947 -35047312 + LTR78 LTR ERV1 173 306 -998 1 1481 420 322 50 79 chr5 117490575 117490855 -35046404 - ORR1E LTR MaLR -3 356 85 1 1481 1518 127 27 27 chr5 117492781 117493041 -35044218 - MTC LTR MaLR -161 260 1 1 1481 436 202 17 96 chr5 117494679 117494691 -35042568 + MT2B LTR ERVL 152 154 -447 1 1481 244 282 23 34 chr5 117498776 117498864 -35038395 - MLT1H LTR MaLR -6 543 457 1 1481 1913 155 7 42 chr5 117499287 117499685 -35037574 - ORR1A3 LTR MaLR -8 386 1 1 1481 2371 74 7 0 chr5 117499690 117500000 -35037259 - MTB LTR MaLR 0 400 89 1 1481 587 125 0 0 chr5 117500000 117500088 -35037171 - MTB_Mm LTR MaLR -319 88 1 1 1481 258 192 12 110 chr5 117500913 117500995 -35036264 + MER90a LTR ERV1 296 369 -245 3 1481 305 227 45 24 chr5 117504409 117504506 -35032753 - MTEa LTR MaLR -12 367 277 1 1481 2061 104 26 111 chr5 117505140 117505518 -35031741 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1481 444 360 111 20 chr5 117506314 117506566 -35030693 + MER34A LTR ERV1 1 275 -296 1 1481 3247 62 5 15 chr5 117508257 117508668 -35028591 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1481 992 100 43 0 chr5 117516730 117516770 -35020489 - ORR1A4 LTR MaLR -19 310 278 4 1481 992 88 43 0 chr5 117516961 117517076 -35020183 - ORR1A4 LTR MaLR -51 333 166 4 1481 454 319 133 9 chr5 117517340 117517558 -35019701 - MLT2B1 LTR ERVL -275 245 1 5 1481 1575 160 214 20 chr5 117519917 117520267 -35016992 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 5 1481 349 310 98 55 chr5 117520983 117521147 -35016112 + LTR16C LTR ERVL 351 568 0 6 1481 1574 183 111 9 chr5 117528672 117529014 -35008245 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 8 1481 274 314 64 37 chr5 117529074 117529183 -35008076 - MLT1F1 LTR MaLR 0 653 542 8 1481 1228 227 77 103 chr5 117529184 117529572 -35007687 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 9 1481 449 317 91 55 chr5 117529661 117529881 -35007378 - MLT1F1 LTR MaLR -98 471 244 8 1481 2016 150 12 11 chr5 117530765 117531151 -35006108 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 17 9 1481 437 178 0 66 chr5 117531141 117531299 -35005960 - ORR1A1 LTR MaLR -249 118 1 9 1481 253 300 91 87 chr5 117532985 117533226 -35004033 - ORR1E LTR MaLR 0 359 118 9 1481 1406 201 25 7 chr5 117533288 117533563 -35003696 - RMER15 LTR ERVL 0 575 296 9 1481 598 218 49 49 chr5 117533554 117533718 -35003541 - RMER15 LTR ERVL -390 185 22 9 1481 3598 106 97 35 chr5 117534366 117534932 -35002327 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 1 1481 1464 209 121 35 chr5 117536671 117537043 -35000216 - MTD LTR MaLR -14 405 2 1 1481 1348 207 101 100 chr5 117557089 117557540 -34979719 + MT2A LTR ERVL 2 586 -15 1 1481 3994 128 64 33 chr5 117563891 117564568 -34972691 - RMER6A LTR ERVK 0 756 61 1 1481 3994 128 64 33 chr5 117564588 117564643 -34972616 - RMER6A LTR ERVK -696 60 3 1 1482 229 276 118 0 chr5 117572621 117572697 -34964562 - MER90a LTR ERV1 -450 164 80 1 1482 1993 94 8 158 chr5 117573956 117574347 -34962912 + ORR1A2 LTR MaLR 5 319 -8 1 1482 3371 31 15 0 chr5 117577426 117577816 -34959443 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1482 229 308 0 150 chr5 117594197 117594350 -34942909 + MT2B2 LTR ERVL 185 314 -270 2 1482 2781 104 68 46 chr5 117596065 117596567 -34940692 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 16 2 1482 1972 187 62 5 chr5 117601130 117601517 -34935742 + MTD LTR MaLR 10 418 -1 2 1482 367 259 23 101 chr5 117607303 117607432 -34929827 - MT2B LTR ERVL -338 263 145 2 1482 865 239 158 49 chr5 117607919 117608272 -34928987 - MTD LTR MaLR -16 403 1 2 1482 1096 262 79 79 chr5 117610127 117610496 -34926763 + MTE2b LTR MaLR 3 371 -8 2 1482 652 291 219 4 chr5 117614545 117614787 -34922472 + MTE2a LTR MaLR 85 378 -1 2 1482 286 295 179 22 chr5 117625327 117625556 -34911703 - MLT1B LTR MaLR -82 308 44 3 1482 808 236 39 39 chr5 117627656 117627859 -34909400 - ORR1D1 LTR MaLR -171 203 1 3 1482 2890 82 4 68 chr5 117637362 117637846 -34899413 - RLTR19-int LTR ERVK -4125 2012 1560 3 1482 866 217 64 43 chr5 117638494 117638804 -34898455 - MTE2b LTR MaLR -17 362 2 3 1482 321 303 37 96 chr5 117652467 117652602 -34884657 - MT2B LTR ERVL -300 301 175 3 1482 1571 198 23 89 chr5 117658655 117658726 -34878533 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 314 4 1482 1571 198 23 89 chr5 117658905 117659227 -34878032 - ORR1D1 LTR MaLR -61 313 4 4 1482 684 196 12 84 chr5 117663325 117663492 -34873767 - ORR1E LTR MaLR -204 155 1 4 1482 1002 211 104 15 chr5 117668739 117669009 -34868250 - RMER15 LTR ERVL -3 572 279 4 1482 299 235 193 34 chr5 117669017 117669136 -34868123 - RMER15 LTR ERVL -416 159 22 4 1482 2691 132 67 7 chr5 117669287 117669723 -34867536 - RMER4A LTR ERVK 0 466 5 4 1482 1416 191 226 3 chr5 117679491 117679832 -34857427 - MTD LTR MaLR 0 419 3 4 1483 258 229 55 78 chr5 117726752 117726880 -34810379 + RLTR25B LTR ERVK 397 521 -507 5 1483 1084 236 100 57 chr5 117729616 117729917 -34807342 + MTE2b LTR MaLR 28 341 -38 6 1483 1022 134 10 46 chr5 117738917 117739113 -34798146 + RMER17C-int LTR ERVK 2627 2815 -423 6 1483 227 191 61 45 chr5 117741705 117741771 -34795488 - ORR1E LTR MaLR 0 359 293 6 1483 351 316 29 35 chr5 117741758 117741932 -34795327 - RMER17C LTR ERVK -62 348 176 6 1483 484 268 8 31 chr5 117743463 117743590 -34793669 + MLT1E1A LTR MaLR 541 664 -16 6 1483 3676 46 5 2 chr5 117745461 117745896 -34791363 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1483 43696 12 7 1 chr5 117745896 117750966 -34786293 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 1885 6 1483 312 155 17 0 chr5 117750973 117751031 -34786228 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5627 1779 1721 6 1483 703 200 231 43 chr5 117751031 117751401 -34785858 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4795 611 312 6 1483 813 151 4 180 chr5 117751489 117751756 -34785503 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6633 948 729 6 1483 787 126 0 0 chr5 117751754 117751873 -34785386 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7238 343 225 6 1483 225 225 0 0 chr5 117751873 117751913 -34785346 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 236 6 1483 1567 16 0 0 chr5 117751913 117752097 -34785162 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7397 184 1 6 1483 3662 48 5 2 chr5 117752097 117752532 -34784727 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1483 323 149 70 56 chr5 117752599 117752670 -34784589 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 438 6 1483 403 225 162 0 chr5 117753582 117753693 -34783566 + MER21B LTR ERV1 114 242 -621 6 1483 225 89 31 125 chr5 117754375 117754439 -34782820 + MT2B LTR ERVL 207 264 -337 6 1483 558 263 68 11 chr5 117755297 117755474 -34781785 + MTD LTR MaLR 3 189 -230 6 1483 333 270 122 40 chr5 117755498 117755637 -34781622 + MTD LTR MaLR 257 419 0 6 1483 2855 192 100 68 chr5 117759558 117760475 -34776784 - RLTR42-int LTR ERVK -568 4954 4008 6 1483 2805 198 73 32 chr5 117760550 117761211 -34776048 - RLTR42-int LTR ERVK -2547 2975 2288 6 1483 1492 228 56 21 chr5 117763030 117763456 -34773803 - RLTR42-int LTR ERVK -4124 1398 958 6 1483 997 42 0 0 chr5 117766334 117766454 -34770805 + MTB_Mm LTR MaLR 288 407 0 7 1483 2077 150 14 16 chr5 117766454 117766819 -34770440 - RMER15 LTR ERVL -206 369 6 7 1483 268 279 25 157 chr5 117773929 117774133 -34763126 - MLT1H LTR MaLR -170 379 203 7 1483 1078 248 112 60 chr5 117774179 117774510 -34762749 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 7 1483 295 256 4 92 chr5 117776076 117776199 -34761060 - MT2B LTR ERVL -345 239 125 7 1483 334 341 87 26 chr5 117786193 117786473 -34750786 - ORR1E LTR MaLR -9 370 56 7 1483 350 280 66 95 chr5 117789078 117789302 -34747957 - MLT1F LTR MaLR -204 344 132 7 1483 1959 157 74 40 chr5 117790033 117790357 -34746902 - MTC LTR MaLR 0 421 95 7 1483 3086 64 17 25 chr5 117790357 117790551 -34746708 + MTB LTR MaLR 1 195 -205 7 1483 3086 64 17 25 chr5 117790747 117790954 -34746305 + MTB LTR MaLR 196 399 -1 7 1483 1959 157 74 40 chr5 117790954 117791034 -34746225 - MTC LTR MaLR -327 94 3 7 1483 419 283 83 0 chr5 117791868 117792013 -34745246 - RMER15 LTR ERVL -16 559 403 7 1483 289 310 35 9 chr5 117792229 117792343 -34744916 + MLT1D LTR MaLR 131 247 -258 7 1483 2086 167 112 32 chr5 117794314 117794777 -34742482 - RLTR1C LTR ERV1 -3 500 1 7 1483 572 325 62 52 chr5 117797234 117797562 -34739697 - RLTR26 LTR ERVK -75 552 168 8 1483 2361 106 16 0 chr5 117797632 117797954 -34739305 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1483 1800 143 85 35 chr5 117800436 117800812 -34736447 + RMER10B LTR ERVL 4 398 0 8 1483 1800 130 166 48 chr5 117811990 117812346 -34724913 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 8 1483 288 255 96 19 chr5 117815224 117815328 -34721931 + MER21B LTR ERV1 32 143 -720 8 1483 310 216 116 88 chr5 117818534 117818681 -34718578 - MT2B LTR ERVL -336 265 115 8 1483 357 247 70 51 chr5 117822571 117822729 -34714530 - MLT1A0 LTR MaLR -204 161 1 8 1484 271 287 34 22 chr5 117836086 117836175 -34701084 - LTR33 LTR ERVL -2 513 424 8 1484 256 300 114 15 chr5 117837293 117837425 -34699834 + ORR1E LTR MaLR 95 239 -120 8 1484 398 144 40 91 chr5 117840574 117840673 -34696586 - MT2B LTR ERVL -361 240 147 8 1484 439 311 30 24 chr5 117840719 117840887 -34696372 + RMER15 LTR ERVL 405 573 -2 8 1484 656 160 0 0 chr5 117841484 117841582 -34695677 + ORR1D1 LTR MaLR 1 98 -276 8 1484 363 248 8 66 chr5 117841582 117841661 -34695598 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 303 8 1484 655 222 56 77 chr5 117841750 117841945 -34695314 - ORR1D1 LTR MaLR -57 317 127 9 1484 2049 131 58 67 chr5 117841949 117842169 -34695090 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 211 9 1484 2049 131 58 67 chr5 117842312 117842451 -34694808 - RLTR41 LTR ERV1 -236 210 90 9 1484 4724 101 23 61 chr5 117842505 117843047 -34694212 + RMER19A LTR ERVK 1 508 -229 9 1484 3242 131 11 54 chr5 117843047 117843582 -34693677 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 9 1484 4724 101 23 61 chr5 117843582 117843788 -34693471 + RMER19A LTR ERVK 509 720 -17 9 1484 662 194 110 14 chr5 117844001 117844147 -34693112 + ORR1D1 LTR MaLR 215 374 0 8 1484 1228 274 114 9 chr5 117845988 117846331 -34690928 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 9 1484 1734 155 73 73 chr5 117849044 117849239 -34688020 - RMER17C LTR ERVK 0 410 214 9 1484 1734 155 73 73 chr5 117849299 117849513 -34687746 - RMER17C LTR ERVK -197 213 2 9 1484 719 253 37 6 chr5 117850208 117850371 -34686888 + MTEa LTR MaLR 1 168 -211 9 1484 1131 114 18 0 chr5 117850445 117850612 -34686647 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 343 9 1484 434 71 0 0 chr5 117850616 117850672 -34686587 - RLTR1B LTR ERV1 -102 410 355 9 1484 2746 138 0 21 chr5 117850882 117851312 -34685947 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1484 1815 125 29 156 chr5 117853321 117853494 -34683765 - RLTR9A LTR ERVK -2 366 238 9 1484 1815 125 29 156 chr5 117853639 117853874 -34683385 - RLTR9A LTR ERVK -131 237 10 9 1484 300 279 125 47 chr5 117854049 117854177 -34683082 + MLT1D LTR MaLR 111 248 -257 9 1484 2428 71 3 94 chr5 117854774 117855134 -34682125 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1484 755 227 69 170 chr5 117856444 117856779 -34680480 - RMER2 LTR ERV1 -266 301 1 9 1484 2933 69 39 16 chr5 117857489 117857874 -34679385 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 9 1484 1396 143 13 5 chr5 117867069 117867293 -34669966 - MTC LTR MaLR 0 421 196 9 1484 1063 143 74 30 chr5 117867431 117867632 -34669627 - MTC LTR MaLR -211 210 1 9 1484 926 279 62 79 chr5 117869937 117869975 -34667284 - ORR1E LTR MaLR -60 299 264 9 1484 926 279 62 79 chr5 117870099 117870254 -34667005 - ORR1E LTR MaLR -96 263 101 9 1484 926 279 62 79 chr5 117870463 117870572 -34666687 - ORR1E LTR MaLR -259 100 1 9 1484 373 296 110 61 chr5 117872675 117872938 -34664321 - MLT1H2 LTR MaLR -139 350 75 9 1484 1832 151 129 3 chr5 117878026 117878211 -34659048 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 170 1 1484 1832 151 129 3 chr5 117878287 117878433 -34658826 - ORR1C1 LTR MaLR -209 169 6 1 1484 255 103 26 0 chr5 117878772 117878811 -34658448 + MT2A LTR ERVL 1 40 -493 1 1484 821 245 378 7 chr5 117878811 117879077 -34658182 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 1 1484 667 309 48 35 chr5 117884180 117884551 -34652708 - RLTR12B LTR ERVK -205 323 1 1 1484 2130 142 96 13 chr5 117886469 117886854 -34650405 + MTC LTR MaLR 5 421 0 1 1484 2208 113 3 6 chr5 117888911 117889231 -34648028 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1484 3175 43 48 10 chr5 117889721 117890117 -34647142 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 1 1484 267 249 146 77 chr5 117890745 117891006 -34646253 - RMER10A LTR ERVL -163 279 1 1 1484 307 224 45 16 chr5 117895080 117895178 -34642081 - MTEa LTR MaLR 0 419 310 1 1484 257 261 23 16 chr5 117898385 117898479 -34638780 - ORR1E LTR MaLR -10 369 270 1 1484 327 271 63 63 chr5 117908285 117908411 -34628848 + RMER15 LTR ERVL 435 560 -15 1 1484 595 314 19 10 chr5 117911960 117912169 -34625090 + MLT1A0 LTR MaLR 136 346 -19 1 1484 642 261 130 100 chr5 117913749 117914119 -34623140 - MLT1C LTR MaLR -21 446 66 1 1484 2256 161 110 7 chr5 117919270 117919689 -34617570 - MT2A LTR ERVL -71 462 1 1 1484 1053 248 39 10 chr5 117920343 117920652 -34616607 - MERVL_2A-int LTR ERVL -288 5473 5156 1 1484 3379 25 28 0 chr5 117922643 117923043 -34614216 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 1 1484 2317 113 0 58 chr5 117924651 117924998 -34612261 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1484 387 310 44 44 chr5 117928116 117928298 -34608961 - MLT1E1A LTR MaLR -40 640 459 1 1484 921 271 75 27 chr5 117928714 117928737 -34608522 + ORR1E LTR MaLR 1 23 -336 1 1484 921 271 75 27 chr5 117928776 117929044 -34608215 + ORR1E LTR MaLR 24 305 -54 1 1484 265 340 19 32 chr5 117929217 117929241 -34608018 + ORR1E LTR MaLR 325 348 -31 1 1484 351 228 7 14 chr5 117942799 117942937 -34594322 - RMER17A LTR ERVK -302 449 313 1 1484 305 323 0 39 chr5 117950231 117950334 -34586925 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 308 1 1484 857 280 78 111 chr5 117951992 117952378 -34584881 - MTE2a LTR MaLR -1 378 6 1 1484 508 288 332 35 chr5 117954061 117954371 -34582888 + MTD LTR MaLR 18 419 0 1 1485 2709 134 9 50 chr5 117965788 117966227 -34571032 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1485 299 235 14 20 chr5 117985108 117985196 -34552063 - MLT1J1 LTR MaLR -339 109 25 1 1485 352 311 188 4 chr5 117992540 117992769 -34544490 - RMER15 LTR ERVL -44 531 261 1 1485 352 352 72 23 chr5 117993306 117993527 -34543732 + MLT1D LTR MaLR 274 505 0 1 1485 1484 171 68 86 chr5 118000422 118000761 -34536498 + MTD LTR MaLR 74 406 -13 3 1485 740 299 60 32 chr5 118017005 118017229 -34520030 - MTEb LTR MaLR -9 370 139 5 1485 740 299 60 32 chr5 118017414 118017441 -34519818 - MTEb LTR MaLR -241 138 112 5 1485 974 281 75 30 chr5 118020329 118020690 -34516569 - MTE2a LTR MaLR -16 403 21 6 1485 332 300 45 96 chr5 118022777 118022954 -34514305 - MLT1C LTR MaLR -270 197 30 6 1485 1789 202 87 19 chr5 118023892 118024271 -34512988 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1485 1500 218 84 19 chr5 118025439 118025818 -34511441 + MTD LTR MaLR 5 408 -11 7 1485 2405 139 79 31 chr5 118029240 118029685 -34507574 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 8 1485 800 265 95 117 chr5 118030092 118030502 -34506757 - MTD LTR MaLR -14 405 5 8 1485 246 264 54 11 chr5 118030962 118031054 -34506205 - MLT1K LTR MaLR -111 484 389 8 1485 516 181 386 18 chr5 118034141 118034304 -34502955 - MTD LTR MaLR 0 419 197 9 1485 863 185 114 21 chr5 118034758 118034950 -34502309 - MTD LTR MaLR -209 210 1 9 1485 226 276 35 0 chr5 118036873 118036931 -34500328 - ORR1D2 LTR MaLR -310 60 1 1 1485 2443 150 30 10 chr5 118037198 118037603 -34499656 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1485 239 335 116 0 chr5 118039702 118039875 -34497384 + RMER15 LTR ERVL 360 552 -23 1 1485 810 278 47 19 chr5 118040751 118041075 -34496184 - MTD LTR MaLR 0 419 49 1 1485 276 252 106 32 chr5 118041866 118041989 -34495270 - MLT1D LTR MaLR -25 365 234 1 1485 291 310 48 79 chr5 118042063 118042252 -34495007 - MLT1D LTR MaLR -274 231 49 1 1485 1076 268 138 12 chr5 118046595 118046928 -34490331 - MTEa LTR MaLR 0 379 5 1 1485 1048 257 60 133 chr5 118051077 118051512 -34485747 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 1 1485 323 352 8 54 chr5 118052694 118052823 -34484436 + RMER10B LTR ERVL 269 391 -7 1 1485 386 266 22 88 chr5 118053484 118053620 -34483639 - MT2B LTR ERVL -343 258 132 1 1485 1993 199 111 12 chr5 118053956 118054387 -34482872 + RMER13A LTR ERVK 1 474 -386 1 1485 477 250 5 125 chr5 118054360 118054552 -34482707 + RMER13A LTR ERVK 692 860 0 1 1485 3009 60 8 2 chr5 118058516 118058914 -34478345 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1485 1982 157 73 16 chr5 118066169 118066555 -34470704 - MTD LTR MaLR -15 404 12 1 1485 2002 119 11 19 chr5 118070820 118071204 -34466055 + ORR1A2 LTR MaLR 1 394 0 1 1485 422 239 6 127 chr5 118075190 118075348 -34461911 - MT2B LTR ERVL -345 256 118 1 1485 309 232 63 0 chr5 118078522 118078617 -34458642 + ORR1E LTR MaLR 20 120 -239 1 1485 840 281 130 18 chr5 118078833 118079163 -34458096 - MTEa LTR MaLR 0 379 13 2 1485 1334 246 30 38 chr5 118079826 118080197 -34457062 - MTEa LTR MaLR 0 379 12 2 1485 2147 71 3 155 chr5 118080998 118081384 -34455875 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1485 2257 83 6 55 chr5 118082964 118083308 -34453951 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1485 499 327 66 18 chr5 118088364 118088638 -34448621 - MLT1F LTR MaLR -50 498 212 2 1485 910 227 108 16 chr5 118090890 118091141 -34446118 + MTEa LTR MaLR 96 369 -10 2 1485 570 294 123 34 chr5 118091514 118092055 -34445204 - LTR16D LTR ERVL 0 651 25 2 1486 243 278 13 89 chr5 118100044 118100123 -34437136 - MLT1K LTR MaLR -323 272 200 2 1486 420 238 0 135 chr5 118100362 118100532 -34436727 - MTEb LTR MaLR 0 379 233 2 1486 317 252 21 27 chr5 118100553 118100661 -34436598 - MTEb LTR MaLR -276 108 4 2 1486 364 328 78 94 chr5 118102921 118103122 -34434137 + ORR1E LTR MaLR 43 239 -120 2 1486 2469 138 39 5 chr5 118103122 118103529 -34433730 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1486 364 328 78 94 chr5 118103529 118103647 -34433612 + ORR1E LTR MaLR 240 357 -2 2 1486 1357 238 43 48 chr5 118105055 118105190 -34432069 + ORR1C2 LTR MaLR 1 128 -256 2 1486 1919 190 78 32 chr5 118105190 118105691 -34431568 + RLTR11A LTR ERVK 1 524 -4 2 1486 1357 238 40 45 chr5 118105691 118105942 -34431317 + ORR1C2 LTR MaLR 129 421 0 2 1486 430 271 0 37 chr5 118110336 118110470 -34426789 + ORR1E LTR MaLR 56 184 -175 2 1486 1493 227 29 26 chr5 118110752 118110907 -34426352 - MTEb LTR MaLR -16 363 211 2 1486 1493 227 29 26 chr5 118110969 118111161 -34426098 - MTEb LTR MaLR -169 210 16 2 1486 373 289 8 55 chr5 118113243 118113371 -34423888 - MLT1D LTR MaLR 0 505 384 2 1486 461 309 86 35 chr5 118121800 118122055 -34415204 + ORR1E LTR MaLR 3 270 -89 3 1486 1116 243 125 6 chr5 118125377 118125696 -34411563 + MTEa LTR MaLR 21 377 -2 3 1486 990 266 101 16 chr5 118134236 118134583 -34402676 + MTEa LTR MaLR 2 377 -2 3 1486 445 354 11 48 chr5 118141131 118141257 -34396002 - MLT1G LTR MaLR -2 589 467 3 1486 445 354 11 48 chr5 118141301 118141361 -34395898 - MLT1G LTR MaLR -125 466 410 3 1486 293 288 213 24 chr5 118141538 118141702 -34395557 - MLT1G LTR MaLR -210 381 187 3 1486 594 326 80 71 chr5 118150156 118150595 -34386664 - MLT1D LTR MaLR 0 505 63 3 1486 825 147 126 0 chr5 118155566 118155756 -34381503 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 174 3 1486 1310 183 29 18 chr5 118155825 118156098 -34381161 - MTD LTR MaLR -122 297 22 3 1486 262 400 77 16 chr5 118163040 118163223 -34374036 - MLT1J2 LTR MaLR -239 209 16 3 1486 1929 141 9 12 chr5 118163470 118163801 -34373458 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 17 3 1486 415 157 0 0 chr5 118163787 118163876 -34373383 - ORR1A1 LTR MaLR -238 89 1 3 1486 449 342 35 88 chr5 118164619 118164936 -34372323 - ORR1E LTR MaLR -56 303 4 3 1486 1008 251 43 50 chr5 118173577 118173858 -34363401 - MTE2a LTR MaLR -31 348 70 4 1486 588 317 94 85 chr5 118177936 118178288 -34358971 + ORR1E LTR MaLR 3 357 -2 4 1486 368 283 196 12 chr5 118178405 118178573 -34358686 - ORR1D2 LTR MaLR -171 199 1 4 1486 277 206 0 60 chr5 118182564 118182631 -34354628 - MTE2b LTR MaLR -11 368 306 4 1486 471 174 12 22 chr5 118182650 118182752 -34354507 - MTE2b LTR MaLR -265 114 13 4 1486 921 300 92 80 chr5 118183643 118184056 -34353203 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 4 1486 356 286 175 72 chr5 118187642 118187962 -34349297 - MLT1A0 LTR MaLR -12 353 1 4 1486 754 245 202 91 chr5 118190968 118191309 -34345950 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1486 464 292 76 42 chr5 118193648 118193912 -34343347 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 93 4 1486 2289 138 93 53 chr5 118193996 118194462 -34342797 - RMER4B LTR ERVK -14 452 17 4 1486 313 126 30 0 chr5 118196994 118197052 -34340207 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 311 4 1486 228 89 222 0 chr5 118197028 118197073 -34340186 - ORR1C2 LTR MaLR -320 58 4 4 1486 403 279 92 29 chr5 118197815 118197988 -34339271 - ORR1E LTR MaLR -166 193 2 4 1486 570 322 61 80 chr5 118200295 118200656 -34336603 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 4 1486 2593 116 59 25 chr5 118201525 118201932 -34335327 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1486 2231 191 144 10 chr5 118201933 118202452 -34334807 - ORR1A2-int LTR MaLR -908 601 13 4 1486 789 112 149 0 chr5 118202453 118202587 -34334672 + ORR1B1 LTR MaLR 1 154 -240 4 1486 2175 107 55 0 chr5 118204318 118204628 -34332631 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1486 255 306 79 36 chr5 118209144 118209336 -34327923 - MER74B LTR ERVL -332 226 20 4 1486 282 328 103 15 chr5 118220354 118220490 -34316769 - MLT1C LTR MaLR -178 289 142 5 1486 434 309 73 153 chr5 118220495 118220907 -34316352 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 5 1487 909 191 169 19 chr5 118234828 118235095 -34302164 - MTD LTR MaLR 0 419 113 5 1487 422 286 7 50 chr5 118235466 118235606 -34301653 - MTD LTR MaLR -287 134 1 5 1487 2179 117 66 92 chr5 118242453 118242876 -34294383 - MTC LTR MaLR -9 412 1 5 1487 225 329 14 14 chr5 118250805 118250879 -34286380 - MLT1A0 LTR MaLR -269 96 23 5 1487 2667 127 122 28 chr5 118252749 118253284 -34283975 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 5 1487 300 305 66 77 chr5 118258452 118258633 -34278626 - MLT1H LTR MaLR 0 549 371 5 1487 937 233 33 58 chr5 118262353 118262772 -34274487 - RLTR18B LTR ERVK -134 378 2 5 1487 362 321 175 38 chr5 118264160 118264480 -34272779 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 5 1487 251 275 43 0 chr5 118266751 118266820 -34270439 - MLT1F2 LTR MaLR -414 146 75 5 1487 351 348 15 77 chr5 118267619 118267815 -34269444 + ORR1E LTR MaLR 4 187 -172 6 1487 294 332 66 62 chr5 118271463 118271752 -34265507 - RMER12 LTR ERVK -260 1062 773 6 1487 285 277 24 24 chr5 118273986 118274071 -34263188 - MLT1K LTR MaLR -329 266 182 6 1487 246 232 89 0 chr5 118276293 118276349 -34260910 + MTE2b LTR MaLR 43 103 -276 6 1487 672 296 0 5 chr5 118276374 118276561 -34260698 + MTE2b LTR MaLR 90 275 -104 6 1487 871 209 9 59 chr5 118277777 118277952 -34259307 - MTD LTR MaLR -211 208 35 6 1487 871 209 9 59 chr5 118278169 118278212 -34259047 - MTD LTR MaLR -385 34 1 6 1487 343 295 199 8 chr5 118280870 118281116 -34256143 - LTR40b LTR ERVL 0 462 170 6 1487 2114 165 45 5 chr5 118283696 118284097 -34253162 + MTC LTR MaLR 5 421 0 6 1487 911 288 117 32 chr5 118312065 118312500 -34224759 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 53 6 1487 1452 143 169 45 chr5 118327025 118327333 -34209926 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 1487 987 299 72 24 chr5 118328015 118328380 -34208879 - MTE2b LTR MaLR -2 357 2 7 1487 2278 127 62 18 chr5 118330332 118330733 -34206526 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1487 1061 151 43 0 chr5 118332210 118332396 -34204863 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 190 7 1487 1529 159 16 96 chr5 118332397 118332773 -34204486 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 1487 1079 124 27 11 chr5 118332773 118332960 -34204299 - ORR1C2 LTR MaLR -194 190 1 7 1487 473 282 77 93 chr5 118334530 118334894 -34202365 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 7 1487 955 204 105 25 chr5 118340155 118340432 -34196827 - MTEb LTR MaLR 0 379 77 7 1487 404 210 64 89 chr5 118340497 118340654 -34196605 - MT2B LTR ERVL -344 257 105 7 1487 274 320 144 0 chr5 118341538 118341635 -34195624 - MLT1A LTR MaLR -240 134 24 7 1487 906 158 0 111 chr5 118343154 118343361 -34193898 + ORR1A1 LTR MaLR 1 184 -162 7 1487 494 361 94 34 chr5 118344490 118344788 -34192471 - MLT1H LTR MaLR -208 341 26 7 1487 260 330 78 41 chr5 118346090 118346333 -34190926 - RMER12 LTR ERVK -278 1044 793 7 1487 372 291 66 16 chr5 118346339 118346521 -34190738 - RMER12 LTR ERVK -365 957 767 7 1488 1626 124 0 74 chr5 118359388 118359685 -34177574 - ORR1A1 LTR MaLR -64 282 8 7 1488 252 328 43 0 chr5 118366080 118366196 -34171063 + RMER12 LTR ERVK 736 856 -466 7 1488 1885 150 18 76 chr5 118368561 118368581 -34168678 - ORR1B1 LTR MaLR -31 363 353 8 1488 1885 150 18 76 chr5 118368725 118368758 -34168501 - ORR1B1 LTR MaLR -42 352 334 8 1488 1885 150 18 76 chr5 118368905 118369232 -34168027 - ORR1B1 LTR MaLR -61 333 4 8 1488 301 263 116 0 chr5 118373069 118373164 -34164095 - MLT1B LTR MaLR -280 110 5 8 1488 474 277 34 58 chr5 118390428 118390635 -34146624 - LTR16B2 LTR ERVL -69 393 192 8 1488 762 298 72 30 chr5 118391053 118391129 -34146130 + ORR1E LTR MaLR 9 83 -276 8 1488 762 298 72 30 chr5 118391310 118391565 -34145694 + ORR1E LTR MaLR 84 353 -6 8 1488 436 346 104 4 chr5 118392361 118392602 -34144657 + MLT1A0 LTR MaLR 72 336 -29 8 1488 1113 247 43 78 chr5 118392626 118392973 -34144286 - ORR1E LTR MaLR -23 336 2 8 1488 290 314 27 62 chr5 118396445 118396478 -34140781 + MT2B LTR ERVL 138 165 -436 8 1488 924 210 210 46 chr5 118397673 118397997 -34139262 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 9 1488 1199 293 25 41 chr5 118398926 118399293 -34137966 - MTEa LTR MaLR -1 378 18 9 1488 349 330 87 22 chr5 118399342 118399525 -34137734 + LTR16E2 LTR ERVL 336 530 -38 9 1488 329 344 18 41 chr5 118401773 118401943 -34135316 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 265 9 1488 322 260 211 0 chr5 118413391 118413514 -34123745 - MTE2b LTR MaLR -3 376 228 9 1488 551 320 0 7 chr5 118413536 118413687 -34123572 - MTE2b LTR MaLR -223 156 7 9 1488 308 309 56 49 chr5 118414349 118414492 -34122767 + MLT1D LTR MaLR 289 432 -73 9 1488 255 373 55 55 chr5 118414886 118415212 -34122047 - MLT1D LTR MaLR -179 326 1 9 1488 402 320 19 68 chr5 118418567 118418728 -34118531 + LTR31 LTR ERV1 224 376 -243 9 1488 291 291 0 95 chr5 118421390 118421485 -34115774 + MT2B LTR ERVL 155 240 -361 9 1488 634 307 65 9 chr5 118421740 118421957 -34115302 + MER67C LTR ERV1 154 382 -329 9 1488 495 246 30 15 chr5 118422926 118423058 -34114201 - MTE2a LTR MaLR -6 373 240 9 1488 453 288 13 46 chr5 118423235 118423262 -34113997 - MTE2a LTR MaLR -137 282 258 9 1488 473 266 109 85 chr5 118423390 118423673 -34113586 - MTE2a LTR MaLR -160 259 1 9 1488 1834 142 37 88 chr5 118424481 118425096 -34112163 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 9 1488 344 256 7 117 chr5 118425275 118425289 -34111970 + MT2B LTR ERVL 153 221 -380 9 1488 254 260 232 16 chr5 118461404 118461529 -34075730 - MLT1J1 LTR MaLR -26 418 267 1 1488 432 211 78 106 chr5 118472784 118472964 -34064295 - MT2B LTR ERVL -344 257 83 1 1488 2938 35 3 11 chr5 118482643 118482992 -34054267 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1488 1912 128 210 23 chr5 118485865 118486218 -34051041 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 1 1489 3054 59 200 9 chr5 118489927 118490357 -34046902 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 1489 2195 121 28 83 chr5 118490895 118491268 -34045991 + RMER6C LTR ERVK 3 345 -345 1 1489 2195 121 28 83 chr5 118491302 118491361 -34045898 + RMER6C LTR ERVK 346 410 -280 1 1489 1442 77 47 8 chr5 118491327 118491588 -34045671 + ORR1A2 LTR MaLR 41 305 -41 1 1489 371 125 0 0 chr5 118491774 118491830 -34045429 + ORR1A2 LTR MaLR 274 329 0 1 1489 1547 119 15 37 chr5 118491831 118492102 -34045157 + RMER6C LTR ERVK 426 690 0 1 1489 1014 201 28 99 chr5 118493525 118493554 -34043705 - RLTR15 LTR ERVK -30 329 303 1 1489 1014 201 28 99 chr5 118493725 118494049 -34043210 - RLTR15 LTR ERVK -57 302 1 1 1489 226 351 64 64 chr5 118494528 118494601 -34042658 + MT2B LTR ERVL 56 254 -347 1 1489 2292 55 26 0 chr5 118498143 118498452 -34038807 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 3 1 1489 447 173 16 134 chr5 118506129 118506256 -34031003 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 1 1489 262 280 108 17 chr5 118510426 118510546 -34026713 + MT2B2 LTR ERVL 125 255 -329 1 1489 271 309 60 0 chr5 118521113 118521197 -34016062 + MTEb LTR MaLR 174 262 -117 2 1489 472 224 278 28 chr5 118548164 118548467 -33988792 + MTD LTR MaLR 11 405 -14 5 1489 2836 213 96 88 chr5 118551360 118551761 -33985498 - RLTR21 LTR ERVK -564 1008 635 5 1489 2836 213 96 88 chr5 118551949 118552494 -33984765 - RLTR21 LTR ERVK -938 634 54 5 1489 679 292 68 89 chr5 118553089 118553130 -33984129 + MTD LTR MaLR 22 62 -357 6 1489 679 292 68 89 chr5 118553361 118553688 -33983571 + MTD LTR MaLR 63 381 -38 6 1489 4958 140 80 25 chr5 118561242 118562097 -33975162 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 7 1489 439 251 264 26 chr5 118586916 118587177 -33950082 + MTEa LTR MaLR 53 375 -4 1 1489 445 314 109 5 chr5 118591887 118592089 -33945170 + RMER15 LTR ERVL 353 575 0 1 1489 238 327 204 71 chr5 118599283 118599606 -33937653 + MLT1K LTR MaLR 203 568 -27 1 1489 1404 174 144 59 chr5 118601318 118601672 -33935587 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 1489 1798 188 138 39 chr5 118603290 118603673 -33933586 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1489 293 192 73 49 chr5 118605956 118606038 -33931221 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 426 1 1489 896 259 81 142 chr5 118606536 118606978 -33930281 + RMER5 LTR ERV1 40 454 -80 1 1489 291 167 49 16 chr5 118607747 118607808 -33929451 + RMER5 LTR ERV1 472 534 0 1 1489 367 340 152 8 chr5 118612170 118612573 -33924686 + MLT2B5 LTR ERVL 77 526 -7 1 1490 333 283 65 26 chr5 118630235 118630439 -33906820 - ORR1E LTR MaLR -290 69 1 2 1490 654 314 142 58 chr5 118644873 118645336 -33891923 + MLT1F2 LTR MaLR 59 560 0 2 1490 364 286 25 31 chr5 118648548 118648707 -33888552 + RLTR21 LTR ERVK 1097 1254 -318 2 1490 636 219 271 3 chr5 118650579 118650881 -33886378 + RMER10B LTR ERVL 6 387 -11 2 1490 232 309 36 0 chr5 118659342 118659426 -33877833 + MLT1A LTR MaLR 67 153 -212 2 1490 239 312 0 3 chr5 118659883 118659966 -33877293 + MLT1A LTR MaLR 213 305 -69 2 1490 317 322 61 66 chr5 118662179 118662375 -33874884 - MLT1K LTR MaLR -21 574 380 3 1490 2375 159 121 30 chr5 118662433 118662964 -33874295 + RMER4B LTR ERVK 1 579 -6 3 1490 241 208 60 72 chr5 118663320 118663403 -33873856 + RLTR28B LTR ERVL 148 229 -252 3 1490 1777 169 169 0 chr5 118668409 118668728 -33868531 + ORR1C1 LTR MaLR 2 374 -4 3 1490 396 291 94 68 chr5 118670290 118670596 -33866663 + MLT2C1 LTR ERVL 154 562 -1 3 1490 290 179 72 29 chr5 118671193 118671262 -33865997 + ORR1E LTR MaLR 38 109 -250 3 1490 558 256 95 0 chr5 118672268 118672436 -33864823 - MTEa LTR MaLR 0 379 196 3 1490 2567 143 52 47 chr5 118682837 118683301 -33853958 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 3 1490 2317 100 49 51 chr5 118690414 118690825 -33846434 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 3 1490 302 231 45 55 chr5 118691738 118691848 -33845411 + RMER15 LTR ERVL 313 421 -154 3 1490 296 214 106 12 chr5 118691865 118691950 -33845309 + MLT1A0 LTR MaLR 189 281 -84 3 1490 247 330 21 21 chr5 118692238 118692334 -33844925 + MLT1A0 LTR MaLR 292 387 -21 3 1490 2062 79 10 0 chr5 118696833 118697123 -33840136 + ORR1A2 LTR MaLR 35 327 0 3 1490 763 147 0 119 chr5 118701822 118701999 -33835260 - ORR1D1 LTR MaLR -218 156 1 3 1490 361 181 31 21 chr5 118713639 118713735 -33823524 - RMER10A LTR ERVL -25 417 321 4 1490 252 256 174 22 chr5 118720270 118720362 -33816897 + MLT1B LTR MaLR 1 106 -284 4 1490 2833 137 73 6 chr5 118730863 118731355 -33805904 + RLTR11A LTR ERVK 1 525 -3 4 1490 784 240 99 148 chr5 118736870 118737202 -33800057 + MTE2a LTR MaLR 52 367 -12 4 1490 353 95 159 0 chr5 118738268 118738331 -33798928 + MTC LTR MaLR 5 77 -344 4 1490 558 159 7 187 chr5 118738712 118738762 -33798497 + MTC LTR MaLR 44 73 -348 4 1490 558 159 7 187 chr5 118738902 118739006 -33798253 + MTC LTR MaLR 74 170 -251 4 1490 242 305 67 17 chr5 118745293 118745538 -33791721 + RLTR11A LTR ERVK 43 292 -67 4 1490 304 288 62 9 chr5 118746486 118746598 -33790661 + MLT1A1 LTR MaLR 291 408 0 4 1491 2039 89 45 63 chr5 118764755 118765089 -33772170 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 5 1491 328 275 0 68 chr5 118771543 118771660 -33765599 + MLT1D LTR MaLR 389 497 -8 5 1491 1903 135 98 12 chr5 118775332 118775670 -33761589 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1491 1969 141 30 11 chr5 118783959 118784376 -33752883 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 5 6 1491 330 333 68 36 chr5 118788882 118789103 -33748156 + MER74A LTR ERVL 41 268 -290 6 1491 392 335 12 30 chr5 118790641 118790810 -33746449 - MLT1K LTR MaLR -5 590 425 6 1491 3836 180 53 53 chr5 118797435 118798332 -33738927 + RMER13B LTR ERVK 12 908 0 6 1491 2786 122 7 0 chr5 118800421 118800839 -33736420 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1491 681 260 172 28 chr5 118801224 118801544 -33735715 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 3 6 1491 871 171 53 0 chr5 118801547 118801717 -33735542 + ORR1C1 LTR MaLR 2 180 -198 6 1491 406 119 0 0 chr5 118802037 118802096 -33735163 + ORR1C1 LTR MaLR 326 384 0 6 1491 1553 141 206 69 chr5 118803151 118803530 -33733729 + RMER10A LTR ERVL 1 434 -8 6 1491 2453 154 5 7 chr5 118806717 118807130 -33730129 + MTC LTR MaLR 2 413 -8 6 1491 682 311 103 10 chr5 118813535 118813837 -33723422 - MT2A LTR ERVL -4 529 200 6 1491 240 294 41 32 chr5 118816831 118816954 -33720305 + MLT1C LTR MaLR 336 459 -8 6 1491 891 230 4 74 chr5 118821117 118821361 -33715898 - MTD LTR MaLR -192 227 1 7 1491 1896 142 119 5 chr5 118822102 118822471 -33714788 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 7 1491 246 327 8 34 chr5 118825912 118826029 -33711230 + MLT1K LTR MaLR 369 482 -113 7 1491 830 190 94 9 chr5 118837453 118837666 -33699593 - RMER4B LTR ERVK -338 247 17 7 1491 1175 176 9 0 chr5 118838893 118839103 -33698156 + ORR1B1 LTR MaLR 174 385 -9 7 1491 2539 128 14 33 chr5 118843738 118843934 -33693325 - MTC LTR MaLR 0 421 226 7 1491 2170 73 0 153 chr5 118843934 118844320 -33692939 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1491 2539 128 14 33 chr5 118844320 118844552 -33692707 - MTC LTR MaLR -196 225 1 7 1491 560 225 163 31 chr5 118847379 118847625 -33689634 + MTD LTR MaLR 139 418 -1 7 1491 3244 172 51 80 chr5 118850313 118851098 -33686161 - RMER13B LTR ERVK -146 762 1 7 1491 1744 198 19 48 chr5 118852761 118853138 -33684121 - MTE2a LTR MaLR -13 366 1 7 1491 293 330 119 50 chr5 118854456 118854657 -33682602 + MLT1F1 LTR MaLR 68 282 -287 7 1491 1795 171 62 14 chr5 118854705 118855062 -33682197 + MTC LTR MaLR 11 384 -37 7 1491 4412 152 147 11 chr5 118855458 118856005 -33681254 + RLTR25B LTR ERVK 1 591 -437 7 1491 4412 152 147 11 chr5 118856120 118856132 -33681127 + RLTR25B LTR ERVK 592 623 -405 7 1491 4412 152 147 11 chr5 118856274 118856618 -33680641 + RLTR25B LTR ERVK 624 1027 -1 7 1491 660 311 102 55 chr5 118858491 118858525 -33678734 + MLT1F1 LTR MaLR 161 194 -375 7 1491 3062 51 15 2 chr5 118858525 118858920 -33678339 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1491 660 311 102 55 chr5 118858920 118859269 -33677990 + MLT1F1 LTR MaLR 195 562 -7 7 1491 418 284 19 81 chr5 118863525 118863686 -33673573 + MLT1J1 LTR MaLR 40 190 -254 8 1491 334 302 0 36 chr5 118863784 118863894 -33673365 + MLT1J1 LTR MaLR 337 442 -2 8 1491 2031 103 106 6 chr5 118864727 118865067 -33672192 + MTC LTR MaLR 3 376 -45 8 1491 253 293 0 116 chr5 118866291 118866354 -33670905 - MLT1D LTR MaLR -5 500 447 8 1491 253 293 0 116 chr5 118866529 118866576 -33670683 - MLT1D LTR MaLR -59 446 403 8 1491 1539 104 0 13 chr5 118866596 118866829 -33670430 - ORR1A2 LTR MaLR -97 230 1 8 1491 330 256 24 38 chr5 118876886 118877011 -33660248 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 229 8 1491 1653 153 43 107 chr5 118880587 118881025 -33656234 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 8 1492 2051 162 42 22 chr5 118886147 118886552 -33650707 - MTC LTR MaLR -8 413 1 8 1492 319 282 7 82 chr5 118888533 118888571 -33648688 + MT2B LTR ERVL 133 160 -441 8 1492 270 265 136 10 chr5 118888870 118888973 -33648286 + MLT1A0 LTR MaLR 219 334 -31 8 1492 373 281 222 18 chr5 118889348 118889569 -33647690 + RMER15 LTR ERVL 296 561 -14 8 1492 1024 236 140 70 chr5 118889673 118890015 -33647244 - MTE2b LTR MaLR -13 366 1 8 1492 339 340 92 47 chr5 118890236 118890417 -33646842 + MLT1D LTR MaLR 40 340 -165 8 1492 909 99 152 0 chr5 118890417 118890568 -33646691 + MT2B LTR ERVL 75 248 -353 8 1492 339 340 92 47 chr5 118890568 118890638 -33646621 + MLT1D LTR MaLR 341 459 -46 8 1492 300 292 94 34 chr5 118890687 118890804 -33646455 + MLT1N2 LTR MaLR 111 234 -328 8 1492 1821 149 12 30 chr5 118890950 118891304 -33645955 + ORR1A2 LTR MaLR 47 394 0 8 1492 2434 49 16 22 chr5 118891306 118891621 -33645638 - ORR1A2 LTR MaLR -14 313 1 8 1492 856 247 89 39 chr5 118892550 118892832 -33644427 - MTE2a LTR MaLR 0 379 84 9 1492 351 267 51 17 chr5 118893411 118893529 -33643730 - MTE2a LTR MaLR -295 124 3 9 1492 267 355 57 57 chr5 118897435 118897629 -33639630 + MLT1A1 LTR MaLR 5 198 -210 9 1492 423 242 0 0 chr5 118899360 118899451 -33637808 + MLT2C1 LTR ERVL 6 96 -301 9 1492 243 320 0 0 chr5 118899399 118899454 -33637805 + MLT1E3 LTR MaLR 66 120 -504 9 1492 3505 28 2 2 chr5 118900787 118901183 -33636076 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1492 363 335 92 87 chr5 118906598 118906944 -33630315 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 9 1492 263 269 25 51 chr5 118909268 118909464 -33627795 + RMER17C LTR ERVK 54 244 -166 9 1492 294 188 202 45 chr5 118913659 118913748 -33623511 + ORR1E LTR MaLR 6 138 -221 9 1492 384 269 87 28 chr5 118916903 118917051 -33620208 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 268 9 1492 264 224 27 82 chr5 118918012 118918085 -33619174 - MLT1A1 LTR MaLR -316 92 24 9 1492 336 298 8 34 chr5 118918699 118918817 -33618442 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 291 9 1492 286 247 24 61 chr5 118919230 118919312 -33617947 - MLT1A1 LTR MaLR -242 132 54 9 1492 649 256 152 30 chr5 118920537 118920868 -33616391 + MTEb LTR MaLR 1 372 -7 9 1492 248 365 80 13 chr5 118927435 118927585 -33609674 - MLT1K LTR MaLR -30 565 406 1 1492 294 339 28 139 chr5 118930319 118930535 -33606724 + MLT2B1 LTR ERVL 319 510 -57 1 1492 1561 176 21 100 chr5 118930928 118931277 -33605982 - RMER17C LTR ERVK 0 410 95 1 1492 1561 189 17 101 chr5 118931406 118931534 -33605725 - RMER17C LTR ERVK -316 94 16 1 1492 275 233 50 91 chr5 118931655 118931754 -33605505 + MT2B LTR ERVL 163 257 -344 1 1492 1504 196 149 14 chr5 118936098 118936460 -33600799 + MTD LTR MaLR 6 416 -3 1 1492 1984 86 60 46 chr5 118942469 118942873 -33594386 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 2 1 1492 305 254 140 43 chr5 118942873 118942997 -33594262 - MTEb LTR MaLR -21 358 219 1 1492 291 257 237 9 chr5 118945980 118946094 -33591165 - MLT1K LTR MaLR -160 435 296 1 1492 293 406 74 55 chr5 118950895 118951166 -33586093 + MLT1K LTR MaLR 24 299 -296 1 1492 1951 179 45 38 chr5 118958394 118958762 -33578497 - RMER6B LTR ERVK -33 428 57 1 1492 1951 179 45 38 chr5 118958783 118958839 -33578420 - RMER6B LTR ERVK -405 56 1 1 1492 227 245 20 0 chr5 118960038 118960087 -33577172 - MLT1A1 LTR MaLR -283 125 76 1 1492 384 345 65 76 chr5 118966989 118967462 -33569797 - MLT1D LTR MaLR 0 505 38 1 1492 2217 131 19 3 chr5 118969576 118969898 -33567361 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1492 3599 15 2 0 chr5 118970065 118970460 -33566799 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1492 233 329 14 0 chr5 118973553 118973626 -33563633 + MLT1L LTR MaLR 437 510 -100 1 1492 650 257 55 15 chr5 118977079 118977391 -33559868 - MTEb LTR MaLR 0 379 14 1 1492 1423 158 4 4 chr5 118992870 118993104 -33544155 - MTD LTR MaLR -45 374 141 1 1492 1801 231 117 18 chr5 118993104 118993521 -33543738 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 465 -95 1 1492 1801 231 117 18 chr5 118993566 118993651 -33543608 + RLTR20B2 LTR ERVK 466 552 -8 1 1492 527 194 102 0 chr5 118993655 118993763 -33543496 - MTD LTR MaLR -280 139 21 1 1492 570 278 105 33 chr5 118994356 118994661 -33542598 + RLTR15 LTR ERVK 1 327 -32 1 1492 2647 276 39 46 chr5 118995784 118996219 -33541040 + MYSERV-int LTR ERVK 3775 4194 -2356 1 1492 3214 156 136 31 chr5 118996219 118996886 -33540373 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 1492 2647 268 53 65 chr5 118996886 118997889 -33539370 + MYSERV-int LTR ERVK 4195 5391 -389 1 1492 485 260 38 48 chr5 118997913 118997929 -33539330 + MYSERV-int LTR ERVK 5392 5407 -373 1 1492 410 278 35 9 chr5 118997966 118998082 -33539177 + RMER4A LTR ERVK 321 439 -27 1 1492 1445 186 12 24 chr5 118998089 118998420 -33538839 + MYSERV-int LTR ERVK 5315 5641 -909 1 1492 2849 191 94 14 chr5 118998696 118999356 -33537903 + MYSERV6-int LTR ERVK 8092 8804 -155 1 1492 1380 270 8 34 chr5 118999370 118999757 -33537502 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 1 1492 1491 129 4 4 chr5 119002300 119002526 -33534733 - MTC LTR MaLR 0 421 196 8 1492 993 155 8 158 chr5 119002735 119002883 -33534376 - MTC LTR MaLR -212 209 97 8 1492 993 155 8 158 chr5 119003057 119003154 -33534105 - MTC LTR MaLR -325 96 1 8 1492 477 320 138 42 chr5 119008167 119008500 -33528759 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 2 1493 1781 126 109 0 chr5 119023540 119023834 -33513425 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 1493 319 253 12 25 chr5 119025938 119026019 -33511240 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 493 6 1493 1155 190 229 16 chr5 119035775 119035921 -33501338 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 183 9 1493 1155 190 229 16 chr5 119035949 119036112 -33501147 - ORR1C1 LTR MaLR -196 182 4 9 1493 514 309 88 28 chr5 119055881 119056097 -33481162 + MTE2a LTR MaLR 151 379 0 1 1493 228 255 84 143 chr5 119062373 119062492 -33474767 - MT2B LTR ERVL -338 263 152 1 1493 441 252 65 0 chr5 119069943 119070050 -33467209 - RMER19A LTR ERVK -446 291 178 1 1493 2017 189 249 46 chr5 119070325 119070936 -33466323 + RMER19A LTR ERVK 2 736 -1 1 1493 1018 262 70 44 chr5 119072066 119072472 -33464787 + MTC LTR MaLR 2 407 -14 1 1493 343 369 74 20 chr5 119109026 119109228 -33428031 - MLT1G LTR MaLR -15 576 364 2 1493 324 369 133 17 chr5 119110048 119110288 -33426971 - MLT1G LTR MaLR -325 270 3 2 1493 3028 153 169 40 chr5 119115001 119115647 -33421612 - RMER19B LTR ERVK -12 890 162 2 1493 281 338 69 53 chr5 119125280 119125527 -33411732 - MLT1I LTR MaLR -89 322 72 2 1493 3397 33 8 0 chr5 119133025 119133418 -33403841 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1493 8122 77 23 2 chr5 119133418 119134493 -33402766 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1493 3123 40 45 0 chr5 119134493 119134872 -33402387 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1493 2013 167 254 2 chr5 119136877 119137298 -33399961 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 1 2 1493 757 214 283 11 chr5 119140347 119140630 -33396629 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 2 2 1493 1861 179 27 49 chr5 119141140 119141545 -33395714 + RMER10B LTR ERVL 1 396 -2 2 1493 964 201 204 3 chr5 119143194 119143498 -33393761 + ORR1D1 LTR MaLR 2 366 -8 2 1494 2175 186 113 20 chr5 119150586 119151074 -33386185 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 1494 2145 145 107 23 chr5 119162612 119163042 -33374217 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 2 1494 233 346 39 29 chr5 119164660 119164764 -33372495 + MLT1A0 LTR MaLR 157 261 -104 2 1494 244 224 175 50 chr5 119172578 119172658 -33364601 - MTEa LTR MaLR -287 92 3 2 1494 802 207 169 35 chr5 119196696 119197016 -33340243 - MTD LTR MaLR -11 408 1 2 1494 331 225 0 53 chr5 119220727 119220821 -33316438 - ORR1D2 LTR MaLR -228 142 54 3 1494 1058 269 86 3 chr5 119229023 119229314 -33307945 - MTE2b LTR MaLR -60 319 5 3 1494 342 238 9 56 chr5 119230497 119230604 -33306655 - RLTR25B LTR ERVK -485 543 442 3 1494 1715 133 81 3 chr5 119236001 119236311 -33300948 - ORR1C1 LTR MaLR -44 334 1 3 1494 473 281 128 30 chr5 119236323 119236558 -33300701 - MT2A LTR ERVL -97 436 179 3 1494 314 264 64 11 chr5 119238250 119238380 -33298879 - ORR1E LTR MaLR -18 361 236 3 1494 415 274 34 8 chr5 119238427 119238545 -33298714 + ORR1E LTR MaLR 1 121 -238 3 1494 2271 143 43 0 chr5 119238612 119239003 -33298256 + MTC LTR MaLR 14 421 0 3 1494 386 307 51 51 chr5 119240378 119240507 -33296752 + ORR1D2 LTR MaLR 1 127 -243 3 1494 386 307 51 51 chr5 119240696 119240741 -33296518 + ORR1D2 LTR MaLR 128 174 -196 3 1494 774 219 101 38 chr5 119240786 119240995 -33296264 + ORR1D2 LTR MaLR 149 370 0 3 1494 1698 220 67 20 chr5 119242125 119242515 -33294744 + MT2A LTR ERVL 1 408 -125 3 1494 254 347 47 34 chr5 119246889 119247038 -33290221 + MER74A LTR ERVL 387 537 -21 3 1494 2230 92 3 84 chr5 119247150 119247505 -33289754 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 3 1494 2226 111 108 3 chr5 119249997 119250357 -33286902 + MTC LTR MaLR 24 421 0 3 1494 249 310 64 83 chr5 119250638 119250747 -33286512 - MT2B LTR ERVL -344 257 151 3 1494 2145 85 7 3 chr5 119252507 119252814 -33284445 - MTC LTR MaLR 0 421 114 3 1494 379 175 0 0 chr5 119253058 119253121 -33284138 - MTC LTR MaLR -358 63 1 3 1494 2102 174 56 25 chr5 119255529 119255924 -33281335 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1494 370 296 9 9 chr5 119267992 119268101 -33269158 - ORR1E LTR MaLR -248 111 3 4 1494 590 205 0 9 chr5 119272110 119272223 -33265036 - MTEb LTR MaLR 0 379 268 4 1494 257 246 0 17 chr5 119272310 119272368 -33264891 - MTEb LTR MaLR -59 320 264 4 1494 262 279 50 47 chr5 119272404 119272536 -33264723 - MTEa LTR MaLR -56 323 182 4 1494 253 204 18 36 chr5 119272510 119272566 -33264693 - MTE2b LTR MaLR -60 319 265 4 1494 1589 215 15 15 chr5 119272554 119272880 -33264379 - MTE2b LTR MaLR -53 326 1 4 1494 2206 250 136 23 chr5 119273252 119273916 -33263343 - RMER13A LTR ERVK -119 741 3 4 1494 231 337 21 21 chr5 119273947 119274044 -33263215 - MTEa LTR MaLR -282 97 1 4 1495 384 292 71 0 chr5 119276887 119277000 -33260259 - MLT2D LTR ERVL -123 291 171 4 1495 348 343 27 27 chr5 119278836 119278983 -33258276 - MLT1C LTR MaLR -314 153 7 4 1495 981 257 132 19 chr5 119284244 119284554 -33252705 + ORR1E LTR MaLR 10 354 -5 4 1495 1255 198 70 194 chr5 119286116 119286331 -33250928 - MTC LTR MaLR -68 353 209 4 1495 1255 198 70 194 chr5 119286476 119286661 -33250598 - MTC LTR MaLR -213 208 3 4 1495 306 302 110 32 chr5 119286753 119286907 -33250352 - MLT1C LTR MaLR -38 429 264 4 1495 647 327 33 72 chr5 119286908 119287270 -33249989 - ORR1D2 LTR MaLR -18 352 5 4 1495 785 232 115 74 chr5 119289894 119290206 -33247053 - ORR1E LTR MaLR -19 340 16 4 1495 2051 84 104 0 chr5 119295361 119295659 -33241600 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1495 272 338 52 84 chr5 119299617 119299772 -33237487 - MLT1B LTR MaLR -25 365 216 4 1495 323 201 108 30 chr5 119302435 119302540 -33234719 + MLT1A1 LTR MaLR 257 408 0 5 1495 1582 69 0 5 chr5 119302937 119303141 -33234118 - MTC LTR MaLR -18 403 201 5 1495 1459 118 23 5 chr5 119303744 119303962 -33233297 - MTC LTR MaLR -199 222 1 5 1495 240 302 10 50 chr5 119305708 119305809 -33231450 + MLT1K LTR MaLR 416 512 -83 5 1495 274 353 78 59 chr5 119306104 119306375 -33230884 + ORR1C2 LTR MaLR 104 379 -5 5 1495 464 277 203 36 chr5 119313004 119313285 -33223974 + ORR1E LTR MaLR 9 336 -23 5 1495 700 136 134 17 chr5 119315178 119315347 -33221912 + MTC LTR MaLR 1 175 -221 5 1495 897 243 170 11 chr5 119317337 119317607 -33219652 - MTD LTR MaLR -88 331 19 5 1495 310 294 204 24 chr5 119318163 119318369 -33218890 + LTR16E1 LTR ERVL 290 532 -6 5 1495 410 203 25 1 chr5 119318859 119318940 -33218319 - MT2A LTR ERVL -364 169 93 5 1495 677 191 0 9 chr5 119318950 119319066 -33218193 - MT2A LTR ERVL -416 117 3 5 1495 2688 76 9 141 chr5 119333378 119333583 -33203676 + MTB LTR MaLR 1 193 -207 5 1495 2688 76 9 141 chr5 119333968 119334223 -33203036 + MTB LTR MaLR 194 400 0 5 1495 482 282 57 74 chr5 119334506 119334736 -33202523 - MTE2a LTR MaLR 0 379 154 5 1495 4417 8 0 2 chr5 119337437 119337919 -33199340 - LTRIS_Mm LTR ERV1 -1 481 1 5 1495 275 344 76 90 chr5 119339029 119339240 -33198019 + MLT1H1 LTR MaLR 256 463 -92 5 1495 616 215 60 30 chr5 119342461 119342595 -33194664 - MTE2a LTR MaLR 0 379 242 5 1495 766 295 89 73 chr5 119342669 119343038 -33194221 + MTE2a LTR MaLR 1 375 -4 5 1495 904 217 105 30 chr5 119344571 119344858 -33192401 - BGLII_B LTR ERVK -61 380 60 6 1495 313 275 134 65 chr5 119344898 119344935 -33192324 - BGLII_B LTR ERVK -394 59 20 6 1495 367 295 43 43 chr5 119345457 119345666 -33191593 - RMER12 LTR ERVK -344 978 770 6 1495 2208 157 48 25 chr5 119345797 119346195 -33191064 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1495 571 265 145 0 chr5 119350289 119350455 -33186804 - MTEb LTR MaLR -13 366 177 6 1495 506 204 8 110 chr5 119351062 119351189 -33186070 - MTEb LTR MaLR -194 185 72 6 1495 2078 173 87 5 chr5 119351261 119351650 -33185609 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1495 660 305 68 65 chr5 119352404 119352667 -33184592 + MTD LTR MaLR 1 264 -155 6 1495 817 223 139 10 chr5 119353651 119353859 -33183400 - ORR1E LTR MaLR -122 237 3 6 1495 2685 77 8 55 chr5 119354235 119354618 -33182641 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 6 1495 413 356 95 45 chr5 119354761 119355120 -33182139 - LTR16B1 LTR ERVL -100 380 4 6 1495 612 241 104 38 chr5 119357245 119357510 -33179749 + MTD LTR MaLR 1 270 -151 6 1495 994 245 24 181 chr5 119359203 119359712 -33177547 - RLTR11B LTR ERVK -14 439 11 6 1495 353 259 181 13 chr5 119362754 119362903 -33174356 - MLT1H LTR MaLR 0 549 376 6 1495 336 301 9 72 chr5 119373284 119373395 -33163864 + MLT1M LTR MaLR 94 197 -475 6 1495 1397 246 89 14 chr5 119373539 119373897 -33163362 - RLTR18B LTR ERVK -5 507 123 6 1495 567 241 116 144 chr5 119374303 119374691 -33162568 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 6 1495 506 275 91 28 chr5 119375256 119375432 -33161827 - ORR1E LTR MaLR -2 357 171 6 1495 734 265 5 21 chr5 119375508 119375701 -33161558 - ORR1E LTR MaLR -169 190 1 6 1495 511 250 168 77 chr5 119375701 119375909 -33161350 + MTEa LTR MaLR 16 242 -137 6 1495 258 200 99 12 chr5 119382922 119383003 -33154256 - ORR1E LTR MaLR -56 323 236 7 1495 1240 196 225 6 chr5 119384890 119385219 -33152040 + MTD LTR MaLR 19 419 0 7 1495 278 330 60 0 chr5 119385313 119385413 -33151846 - ORR1E LTR MaLR -248 111 6 7 1495 298 269 252 31 chr5 119386111 119386337 -33150922 + MLT1C LTR MaLR 191 466 -1 7 1495 1820 197 53 11 chr5 119388134 119388489 -33148770 - MTD LTR MaLR -40 379 10 7 1495 304 364 150 41 chr5 119390095 119390341 -33146918 + LTR16A LTR ERVL 3 275 -176 7 1495 312 296 107 41 chr5 119390365 119390562 -33146697 + ORR1E LTR MaLR 1 210 -149 7 1495 445 279 152 9 chr5 119390869 119391079 -33146180 - MLT1J LTR MaLR -136 376 137 7 1495 1657 225 40 9 chr5 119392482 119392831 -33144428 + MTE2b LTR MaLR 18 377 -2 7 1495 480 272 361 11 chr5 119395594 119395863 -33141396 + ORR1D2 LTR MaLR 1 363 -7 7 1495 266 405 93 5 chr5 119398492 119398708 -33138551 - LTR16C LTR ERVL -114 375 141 7 1495 1961 180 56 33 chr5 119403846 119404195 -33133064 - MTC LTR MaLR -14 407 50 7 1495 1877 135 62 3 chr5 119404195 119404515 -33132744 + RMER4B LTR ERVK 1 339 -246 7 1495 1077 130 228 36 chr5 119404638 119404661 -33132598 + RMER4B LTR ERVK 319 339 -246 7 1495 1077 130 228 36 chr5 119404839 119405039 -33132220 + RMER4B LTR ERVK 340 585 0 7 1496 325 312 18 44 chr5 119407852 119407966 -33129293 + MTE2b LTR MaLR 265 375 -4 7 1496 853 321 97 38 chr5 119411772 119412216 -33125043 + MLT1J LTR MaLR 29 498 -14 7 1496 716 318 96 44 chr5 119413682 119414162 -33123097 + LTR33A LTR ERVL 7 511 -9 7 1496 475 271 16 24 chr5 119414839 119414964 -33122295 - MTD LTR MaLR -166 253 130 7 1496 302 285 23 61 chr5 119417114 119417245 -33120014 - MTE2b LTR MaLR -4 375 250 7 1496 991 236 102 86 chr5 119420798 119421147 -33116112 - ORR1D2 LTR MaLR -10 384 11 8 1496 2486 148 37 12 chr5 119424177 119424586 -33112673 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 8 1496 226 288 41 95 chr5 119426053 119426180 -33111079 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1306 1431 -417 8 1496 226 288 41 95 chr5 119426219 119426260 -33110999 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1432 1465 -383 8 1496 249 354 171 9 chr5 119426626 119426837 -33110422 + LTR16C LTR ERVL 79 323 -166 8 1496 562 315 66 29 chr5 119426864 119427106 -33110153 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 310 8 1496 1764 249 38 3 chr5 119429445 119429836 -33107423 - MTD LTR MaLR -14 405 1 8 1496 1419 255 47 28 chr5 119430090 119430167 -33107092 + MTE2b LTR MaLR 5 76 -303 8 1496 1419 255 47 28 chr5 119430195 119430480 -33106779 + MTE2b LTR MaLR 77 374 -5 8 1496 566 285 58 16 chr5 119434338 119434527 -33102732 + MLT2C1 LTR ERVL 160 356 -41 8 1496 483 286 14 35 chr5 119441541 119441686 -33095573 - MLT1D LTR MaLR -39 466 325 8 1496 1270 301 88 37 chr5 119445184 119445698 -33091561 + MLT1F LTR MaLR 1 540 -8 8 1496 493 283 136 94 chr5 119459124 119459455 -33077804 - LTR16B2 LTR ERVL -13 449 105 8 1496 259 143 20 39 chr5 119460468 119460519 -33076740 - MLT1H1 LTR MaLR -11 544 495 8 1496 519 234 42 7 chr5 119460786 119460928 -33076331 - ORR1E LTR MaLR -212 147 1 9 1496 241 217 0 170 chr5 119462206 119462306 -33074953 - MLT1H1 LTR MaLR -357 270 188 8 1496 629 263 48 59 chr5 119470866 119471052 -33066207 + MTEa LTR MaLR 1 184 -195 9 1496 716 220 106 7 chr5 119472456 119472671 -33064588 - MTEb LTR MaLR -29 350 115 9 1496 260 294 121 121 chr5 119474453 119474817 -33062442 + MLT1M LTR MaLR 90 453 -219 9 1496 289 318 27 9 chr5 119476875 119476986 -33060273 - ORR1E LTR MaLR 0 359 247 9 1496 240 246 0 16 chr5 119481063 119481125 -33056134 + ORR1E LTR MaLR 268 328 -31 9 1496 2480 132 26 17 chr5 119484674 119485091 -33052168 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1496 5336 174 96 69 chr5 119485091 119485330 -33051929 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1009 9 1496 5336 174 96 69 chr5 119485500 119486484 -33050775 - MTC-int LTR MaLR -250 1008 2 9 1496 234 274 11 16 chr5 119486485 119486562 -33050697 - MTC LTR MaLR 0 421 344 9 1496 298 342 57 98 chr5 119489833 119490079 -33047180 + MLT1L LTR MaLR 168 403 -207 9 1496 1057 209 147 0 chr5 119493783 119494042 -33043217 + MTD LTR MaLR 27 323 -96 9 1496 2309 78 25 21 chr5 119495822 119496148 -33041111 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 9 1496 540 184 29 0 chr5 119496558 119496661 -33040598 + RMER15 LTR ERVL 441 546 -29 9 1496 229 265 35 46 chr5 119498443 119498530 -33038729 + MLT2B2 LTR ERVL 22 107 -408 9 1496 1557 244 45 0 chr5 119498454 119498790 -33038469 + MTEb LTR MaLR 21 371 -8 1 1496 380 318 117 68 chr5 119499052 119499376 -33037883 - ORR1E LTR MaLR -19 340 1 1 1496 260 147 171 29 chr5 119500045 119500115 -33037144 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 282 1 1496 264 252 102 39 chr5 119515187 119515315 -33021944 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1306 1441 -407 2 1496 439 300 181 55 chr5 119521625 119521918 -33015341 - MLT1D LTR MaLR -173 332 3 4 1496 3260 62 0 24 chr5 119525276 119525693 -33011566 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1496 313 149 59 129 chr5 119530462 119530547 -33006712 - MTEa LTR MaLR -22 357 279 6 1497 434 229 335 45 chr5 119538140 119538364 -32998895 + MTEb LTR MaLR 91 379 0 8 1497 460 335 17 95 chr5 119540093 119540442 -32996817 - MLT1B LTR MaLR -17 373 52 8 1497 989 233 48 122 chr5 119541479 119541871 -32995388 - MTE2a LTR MaLR -10 369 7 9 1497 2426 122 27 49 chr5 119547988 119548395 -32988864 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 1 1497 395 293 79 48 chr5 119550554 119550719 -32986540 - MLT1D LTR MaLR -308 197 28 1 1497 1960 252 12 0 chr5 119551476 119551876 -32985383 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1497 3324 127 26 15 chr5 119554646 119555175 -32982084 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 535 -22 1 1497 380 272 103 8 chr5 119564723 119564849 -32972410 - RMER5 LTR ERV1 0 534 397 1 1497 833 252 12 41 chr5 119564830 119565074 -32972185 - RMER5 LTR ERV1 -265 269 33 1 1497 524 274 81 20 chr5 119566418 119566698 -32970561 - MTE2b LTR MaLR -39 340 3 1 1497 982 212 118 70 chr5 119570585 119570915 -32966344 + MTE2a LTR MaLR 23 368 -11 1 1497 452 334 37 107 chr5 119571808 119572123 -32965136 + MLT1E1 LTR MaLR 223 590 -64 1 1497 915 255 58 144 chr5 119573445 119573890 -32963369 - MTC LTR MaLR -14 407 1 1 1497 258 285 108 38 chr5 119602081 119602238 -32935021 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1233 2 1497 1717 162 81 42 chr5 119603612 119603972 -32933287 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1497 230 303 91 0 chr5 119605468 119605534 -32931725 + MTE2b LTR MaLR 260 331 -48 2 1497 1335 300 155 52 chr5 119605561 119606269 -32930990 + MTE-int LTR MaLR 1 781 -799 2 1497 299 336 26 26 chr5 119606293 119606409 -32930850 + MTE-int LTR MaLR 1229 1344 -236 2 1497 259 345 50 16 chr5 119607007 119607128 -32930131 + MLT1I LTR MaLR 1 125 -286 2 1497 1251 135 354 8 chr5 119612669 119612923 -32924336 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 5 2 1497 1673 214 44 52 chr5 119613705 119614113 -32923146 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1497 431 299 136 56 chr5 119616821 119617034 -32920225 + MLT1F2 LTR MaLR 296 525 -35 2 1497 583 291 172 24 chr5 119617380 119617676 -32919583 - ORR1E LTR MaLR -13 346 7 2 1497 2480 129 102 0 chr5 119620815 119621196 -32916063 + MTC LTR MaLR 2 421 0 2 1497 2184 144 0 62 chr5 119624164 119624565 -32912694 - RLTR14 LTR ERV1 -4 378 3 2 1497 236 301 70 35 chr5 119627930 119628016 -32909243 - MT2B LTR ERVL -333 268 180 3 1497 247 290 43 70 chr5 119633260 119633375 -32903884 + LTR16B2 LTR ERVL 241 352 -110 3 1497 365 287 93 18 chr5 119639861 119640034 -32897225 + MLT1J LTR MaLR 229 366 -146 3 1497 396 289 8 34 chr5 119640678 119640796 -32896463 + MLT1J1 LTR MaLR 45 159 -285 3 1497 1164 258 47 120 chr5 119641096 119641505 -32895754 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 1497 424 240 100 38 chr5 119642735 119642895 -32894364 + ORR1E LTR MaLR 23 192 -167 3 1497 1151 275 88 17 chr5 119644385 119644737 -32892522 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 3 1497 333 338 64 96 chr5 119644926 119644971 -32892288 - MLT1D LTR MaLR -12 493 458 3 1497 333 338 64 96 chr5 119645207 119645495 -32891764 - MLT1D LTR MaLR -48 457 167 3 1497 333 338 64 96 chr5 119645774 119645858 -32891401 - MLT1D LTR MaLR -339 166 88 3 1497 252 259 37 12 chr5 119659958 119660038 -32877221 - MTEa LTR MaLR -37 342 266 3 1497 1728 211 83 11 chr5 119660049 119660422 -32876837 - MTD LTR MaLR -14 405 6 3 1497 904 288 87 0 chr5 119660398 119660662 -32876597 - MTEa LTR MaLR -80 299 13 3 1497 323 316 74 37 chr5 119663153 119663396 -32873863 - MLT2D LTR ERVL -56 358 107 3 1497 315 375 38 43 chr5 119664049 119664258 -32873001 + MLT1L LTR MaLR 40 247 -363 3 1497 440 241 25 17 chr5 119664623 119664741 -32872518 - MTEa LTR MaLR 0 379 261 3 1497 457 312 142 38 chr5 119666099 119666339 -32870920 - LTR33A LTR ERVL -252 268 4 4 1498 809 232 41 10 chr5 119669853 119670049 -32867210 - MLT1B LTR MaLR -166 224 23 4 1498 608 191 38 15 chr5 119673715 119673848 -32863411 + RLTR11A LTR ERVK 1 136 -392 4 1498 1238 165 61 30 chr5 119673805 119674052 -32863207 - RLTR11A LTR ERVK -252 276 3 4 1498 1323 240 101 9 chr5 119675670 119676006 -32861253 - MTEa LTR MaLR 0 379 13 4 1498 446 339 71 94 chr5 119678917 119679269 -32857990 + ORR1E LTR MaLR 6 349 -10 4 1498 491 246 38 23 chr5 119679583 119679612 -32857647 + MTD LTR MaLR 1 27 -392 4 1498 2655 43 6 36 chr5 119679612 119679949 -32857310 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 4 1498 916 204 109 15 chr5 119679949 119680249 -32857010 + MTD LTR MaLR 28 419 0 4 1498 803 151 229 28 chr5 119681851 119682123 -32855136 - ORR1C1 LTR MaLR 0 327 1 4 1498 273 379 40 20 chr5 119683967 119684115 -32853144 - MLT1H1 LTR MaLR -360 195 45 4 1498 393 385 22 72 chr5 119687004 119687323 -32849936 - MT2A LTR ERVL -138 395 93 4 1498 254 151 148 19 chr5 119687465 119687519 -32849740 - MTE2b LTR MaLR 0 379 319 4 1498 503 301 82 10 chr5 119687807 119688002 -32849257 - RMER15 LTR ERVL 0 575 367 4 1498 1446 146 123 6 chr5 119689961 119690235 -32847024 + ORR1C2 LTR MaLR 1 280 -104 4 1498 420 314 152 56 chr5 119694310 119694580 -32842679 + ORR1E LTR MaLR 56 351 -8 4 1498 931 328 119 13 chr5 119703039 119703502 -32833757 - MLT1H LTR MaLR 0 549 38 4 1498 1025 174 304 14 chr5 119703569 119703695 -32833564 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 224 4 1498 1025 174 304 14 chr5 119703771 119703930 -32833329 - ORR1D1 LTR MaLR -151 223 7 4 1498 1592 228 94 25 chr5 119717199 119717591 -32819668 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1498 327 380 68 64 chr5 119717591 119717899 -32819360 + MLT1I LTR MaLR 103 411 0 5 1498 344 191 0 16 chr5 119724002 119724066 -32813193 + RMER15 LTR ERVL 403 465 -110 5 1498 410 357 16 78 chr5 119726827 119727070 -32810189 + ORR1E LTR MaLR 5 232 -138 5 1498 1235 202 177 18 chr5 119728541 119728837 -32808422 + RMER15 LTR ERVL 196 543 -32 5 1498 1235 202 177 18 chr5 119728867 119728898 -32808361 + RMER15 LTR ERVL 544 575 0 5 1498 1285 194 117 60 chr5 119729612 119729963 -32807296 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 5 1498 1974 161 25 56 chr5 119729963 119730151 -32807108 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1181 5 1498 1974 161 25 56 chr5 119730187 119730393 -32806866 - ORR1D1-int LTR MaLR -190 1180 988 5 1498 1004 272 88 44 chr5 119731724 119732020 -32805239 + ORR1D2 LTR MaLR 45 353 -17 5 1498 364 292 37 30 chr5 119734284 119734418 -32802841 - RMER15 LTR ERVL -87 488 354 5 1498 1702 178 57 25 chr5 119739315 119739632 -32797627 + MTC LTR MaLR 81 407 -14 5 1498 3080 111 0 33 chr5 119744291 119744740 -32792519 + RLTR10C LTR ERVK 1 434 -2 5 1498 370 351 33 26 chr5 119745383 119745535 -32791724 - LTR33 LTR ERVL -326 189 37 5 1498 2052 174 117 8 chr5 119759494 119759870 -32777389 - MTC LTR MaLR 0 421 5 6 1498 549 333 63 67 chr5 119766303 119766534 -32770725 - MTE2a LTR MaLR -39 340 111 6 1498 1234 225 153 0 chr5 119766534 119766854 -32770405 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 6 1498 554 284 63 29 chr5 119766799 119766973 -32770286 - MTE2a LTR MaLR -199 180 1 6 1498 376 300 94 99 chr5 119767145 119767378 -32769881 - RMER15 LTR ERVL -7 568 337 6 1498 327 280 107 106 chr5 119768105 119768447 -32768812 + MLT1C LTR MaLR 23 385 -5 6 1498 256 264 0 0 chr5 119771105 119771158 -32766101 + MLT1C LTR MaLR 359 411 0 6 1498 552 299 54 127 chr5 119771815 119772202 -32765057 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 6 1498 2654 103 57 3 chr5 119794201 119794590 -32742669 - MTC LTR MaLR -8 413 4 7 1498 3434 175 128 85 chr5 119796392 119797215 -32740044 - RMER19B LTR ERVK -44 858 1 7 1498 1241 308 32 54 chr5 119799295 119799738 -32737521 - MLT1G3 LTR MaLR -45 550 118 7 1499 407 269 141 18 chr5 119803601 119803764 -32733495 + MTEa LTR MaLR 197 379 0 7 1499 228 355 71 18 chr5 119812692 119812804 -32724455 + ORR1E LTR MaLR 32 149 -210 7 1499 420 280 67 48 chr5 119819649 119819859 -32717400 - RMER15 LTR ERVL -5 570 357 7 1499 2120 125 0 10 chr5 119820092 119820406 -32716853 + MTC LTR MaLR 103 413 -8 7 1499 267 273 71 134 chr5 119824936 119825063 -32712196 - MLT1H LTR MaLR 0 549 431 7 1499 895 255 64 4 chr5 119827031 119827267 -32709992 - MTEb LTR MaLR -129 250 1 8 1499 943 288 93 12 chr5 119831951 119832274 -32704985 + MTEa LTR MaLR 1 349 -30 8 1499 236 365 82 20 chr5 119833206 119833304 -32703955 + MLT1K LTR MaLR 290 393 -202 8 1499 929 277 61 4 chr5 119835629 119835908 -32701351 + ORR1E LTR MaLR 5 299 -60 8 1499 227 289 56 67 chr5 119836845 119836934 -32700325 + MT2B2 LTR ERVL 154 241 -343 8 1499 549 339 52 43 chr5 119840863 119841187 -32696072 - ORR1E LTR MaLR -15 344 18 8 1499 346 291 79 159 chr5 119842523 119842813 -32694446 + MLT1A0 LTR MaLR 79 345 -20 8 1499 706 328 60 42 chr5 119844867 119845150 -32692109 + MLT1G LTR MaLR 40 327 -264 8 1499 271 343 34 29 chr5 119845171 119845302 -32691957 + MLT1G LTR MaLR 417 538 -57 8 1499 769 302 75 43 chr5 119845302 119845648 -32691611 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 8 1499 296 229 14 0 chr5 119845895 119845965 -32691294 + MLT1A0 LTR MaLR 1 71 -294 8 1499 1101 100 126 11 chr5 119847439 119847621 -32689638 + ORR1B2 LTR MaLR 1 203 -164 8 1499 507 275 103 147 chr5 119848209 119848605 -32688654 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 8 1499 310 269 23 78 chr5 119853966 119854095 -32683164 + MLT1A1 LTR MaLR 1 122 -286 8 1499 1173 234 73 102 chr5 119857870 119858251 -32679008 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 8 1499 514 265 5 103 chr5 119862818 119863038 -32674221 - MTE2a LTR MaLR -183 196 1 8 1499 722 324 119 28 chr5 119867007 119867394 -32669865 - MLT1F LTR MaLR -84 464 43 9 1499 647 260 17 75 chr5 119867453 119867748 -32669511 + BGLII_B LTR ERVK 1 278 -163 9 1499 762 292 7 35 chr5 119867859 119868114 -32669145 + BGLII_B LTR ERVK 165 418 -27 9 1499 299 333 23 23 chr5 119868504 119868636 -32668623 + MLT1N2 LTR MaLR 430 561 -1 9 1499 269 416 49 13 chr5 119873447 119873671 -32663588 + MLT1I LTR MaLR 35 266 -145 9 1499 472 206 5 236 chr5 119874177 119874368 -32662891 + MTEa LTR MaLR 5 151 -228 9 1499 293 291 39 10 chr5 119876466 119876570 -32660689 + MLT1J LTR MaLR 59 165 -347 9 1499 284 330 182 82 chr5 119878604 119878895 -32658364 + MLT1A0 LTR MaLR 18 337 -28 9 1499 853 258 66 112 chr5 119879389 119879826 -32657433 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 9 1499 865 296 75 0 chr5 119880020 119880300 -32656959 - RMER15 LTR ERVL 0 575 275 9 1499 1500 226 64 61 chr5 119882797 119883174 -32654085 + MTD LTR MaLR 42 419 0 9 1499 2453 203 18 108 chr5 119887423 119888092 -32649167 + RMER19C LTR ERVK 3 611 0 9 1499 809 204 32 87 chr5 119888120 119888372 -32648887 - MTE2a LTR MaLR -138 241 4 9 1499 522 286 61 7 chr5 119892811 119892959 -32644300 + MLT1H1 LTR MaLR 400 555 0 9 1499 1747 180 151 0 chr5 119893447 119893797 -32643462 - MTD LTR MaLR -16 403 1 9 1499 831 289 68 18 chr5 119893809 119894122 -32643137 + ORR1E LTR MaLR 26 379 0 9 1499 371 229 36 122 chr5 119899884 119900023 -32637236 + MT2B LTR ERVL 138 264 -337 9 1499 237 385 74 7 chr5 119900800 119900949 -32636310 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 207 9 1499 300 220 137 20 chr5 119900964 119901066 -32636193 - MLT1A0 LTR MaLR -222 143 30 9 1499 2269 163 185 10 chr5 119901332 119901829 -32635430 + RMER4B LTR ERVK 2 585 0 9 1499 1827 149 43 28 chr5 119908386 119908711 -32628548 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 65 9 1499 812 211 21 67 chr5 119908710 119908903 -32628356 - RLTR11A LTR ERVK -237 291 108 1 1499 515 58 14 0 chr5 119908902 119908971 -32628288 - RLTR11A LTR ERVK -351 177 108 1 1499 1166 162 21 26 chr5 119908978 119909212 -32628047 + RLTR11A LTR ERVK 279 511 -17 1 1499 541 309 42 36 chr5 119909648 119910032 -32627227 + MLT1F LTR MaLR 40 555 -14 1 1499 404 302 39 109 chr5 119915709 119915992 -32621267 - ORR1E LTR MaLR -13 346 84 1 1499 544 202 47 89 chr5 119917754 119917944 -32619315 + ORR1E LTR MaLR 11 192 -167 1 1499 1315 183 32 29 chr5 119917888 119918169 -32619090 + MT2B LTR ERVL 320 601 0 1 1499 412 314 73 144 chr5 119918951 119919416 -32617843 + MLT1K LTR MaLR 4 435 -160 1 1499 250 226 126 97 chr5 119924630 119924733 -32612526 + MLT1A0 LTR MaLR 180 285 -80 1 1499 411 309 146 24 chr5 119925379 119925591 -32611668 + MLT1J LTR MaLR 45 282 -230 1 1499 293 279 202 34 chr5 119927713 119927891 -32609368 + LTR33A LTR ERVL 309 516 -4 1 1500 231 327 51 102 chr5 119932147 119932184 -32605075 + MT2B2 LTR ERVL 181 322 -262 1 1500 323 277 92 47 chr5 119932749 119933010 -32604249 - MLT1F LTR MaLR -234 345 22 1 1500 331 273 26 43 chr5 119935636 119935751 -32601508 + MLT1A1 LTR MaLR 296 408 0 1 1500 1536 251 21 13 chr5 119936058 119936434 -32600825 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1500 273 327 111 56 chr5 119939582 119939906 -32597353 - ORR1E LTR MaLR -7 367 26 1 1500 1126 235 66 78 chr5 119958751 119958938 -32578321 - MTE2a LTR MaLR 0 379 194 1 1500 1126 269 74 68 chr5 119958989 119959193 -32578066 - MTE2a LTR MaLR -178 243 15 1 1500 1005 235 151 20 chr5 119977355 119977659 -32559600 - MTEa LTR MaLR -31 348 5 1 1500 570 176 109 34 chr5 119978683 119978830 -32558429 + RMER21B LTR ERV1 307 464 -378 1 1500 371 289 0 20 chr5 119982983 119983082 -32554177 - MLT1K LTR MaLR -326 269 173 1 1500 1638 21 5 0 chr5 119984659 119984851 -32552408 + MTA_Mm LTR MaLR 204 396 0 1 1500 549 301 80 57 chr5 119985165 119985479 -32551780 + ORR1E LTR MaLR 38 358 -1 1 1500 488 313 22 67 chr5 119986226 119986468 -32550791 + MTD LTR MaLR 6 222 -197 1 1500 285 306 57 75 chr5 119987069 119987334 -32549925 + RMER12 LTR ERVK 733 992 -330 1 1500 925 326 108 11 chr5 119987578 119988040 -32549219 - MT2A LTR ERVL 0 533 27 1 1500 306 352 95 0 chr5 119987948 119988053 -32549206 - MTEa LTR MaLR -259 120 6 1 1500 386 297 88 31 chr5 119990177 119990337 -32546922 + MLT1B LTR MaLR 16 184 -206 1 1500 2082 124 3 41 chr5 119993822 119994208 -32543051 + ORR1A2 LTR MaLR 1 346 0 1 1500 4283 138 92 87 chr5 120001688 120002554 -32534705 - RMER19B LTR ERVK -12 890 20 7 1500 230 289 0 0 chr5 120007984 120008036 -32529223 + MTEb LTR MaLR 1 52 -327 2 1500 639 247 221 7 chr5 120011371 120011653 -32525606 - MTE2b LTR MaLR -13 366 25 3 1500 235 262 70 23 chr5 120021980 120022066 -32515193 - LTR58 LTR ERV1 -565 114 25 8 1500 238 213 111 32 chr5 120022511 120022574 -32514685 - MT2B LTR ERVL -360 241 174 8 1500 277 241 103 69 chr5 120022912 120023028 -32514231 - MLT1D LTR MaLR -359 146 27 8 1500 572 276 63 26 chr5 120040285 120040553 -32496706 - RMER17C LTR ERVK -22 388 111 1 1500 235 184 20 0 chr5 120040650 120040699 -32496560 - RLTR25A LTR ERVK -532 571 522 1 1500 423 171 11 109 chr5 120040746 120040838 -32496421 - RMER17C LTR ERVK -327 83 1 1 1500 231 314 96 85 chr5 120042469 120042546 -32494713 + MT2B2 LTR ERVL 53 241 -343 1 1500 273 298 43 9 chr5 120043564 120043677 -32493582 - MLT1C LTR MaLR -290 177 61 1 1500 227 314 77 98 chr5 120053121 120053145 -32484114 + MT2B2 LTR ERVL 97 172 -412 2 1500 277 344 93 64 chr5 120056954 120057265 -32479994 + MLT1G LTR MaLR 67 427 -168 2 1501 375 233 0 97 chr5 120081666 120081780 -32455479 - MT2B LTR ERVL -344 257 155 2 1501 2133 107 28 3 chr5 120081997 120082315 -32454944 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 1501 238 315 86 94 chr5 120082315 120082560 -32454699 + MLT1F LTR MaLR 305 547 -1 3 1501 329 272 120 82 chr5 120084482 120084690 -32452569 + MLT1B LTR MaLR 1 216 -174 3 1501 1055 211 134 18 chr5 120084925 120085209 -32452050 + MTD LTR MaLR 103 419 0 3 1501 996 238 145 31 chr5 120085589 120085966 -32451293 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 3 1501 234 369 49 0 chr5 120086421 120086543 -32450716 + LTR33 LTR ERVL 47 174 -341 3 1501 304 366 18 1 chr5 120087154 120087283 -32449976 - MLT1H LTR MaLR -418 177 47 3 1501 283 372 23 15 chr5 120090468 120090599 -32446660 - MLT1H LTR MaLR -295 254 123 3 1501 315 224 16 144 chr5 120093334 120093459 -32443800 + MT2B LTR ERVL 155 263 -338 3 1501 701 177 116 0 chr5 120149301 120149370 -32387889 + ORR1B2 LTR MaLR 1 82 -296 4 1501 3505 28 2 0 chr5 120149370 120149765 -32387494 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1501 701 177 116 0 chr5 120149765 120149842 -32387417 + ORR1B2 LTR MaLR 83 163 -215 4 1501 1206 155 31 0 chr5 120150152 120150345 -32386914 + ORR1B2 LTR MaLR 161 359 -8 4 1501 1200 256 98 20 chr5 120150387 120150785 -32386474 + BGLII_B LTR ERVK 5 433 -8 4 1501 259 245 47 122 chr5 120169407 120169514 -32367745 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 142 5 1501 508 276 89 59 chr5 120172327 120172597 -32364662 - ORR1E LTR MaLR -9 350 73 5 1501 534 241 129 14 chr5 120172646 120172785 -32364474 + MTEb LTR MaLR 1 155 -224 5 1501 2234 139 157 28 chr5 120173054 120173519 -32363740 + RLTR11A LTR ERVK 4 528 0 5 1501 1558 162 22 113 chr5 120173781 120174232 -32363027 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1501 3619 18 0 0 chr5 120175222 120175618 -32361641 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1501 9203 37 4 4 chr5 120175618 120176716 -32360543 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1501 3619 18 0 0 chr5 120176716 120177112 -32360147 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1501 321 216 118 81 chr5 120179403 120179539 -32357720 + MT2B LTR ERVL 123 263 -338 5 1501 287 260 103 145 chr5 120183846 120184080 -32353179 - MTEa LTR MaLR -31 348 108 5 1501 915 189 152 27 chr5 120184269 120184492 -32352767 + MTD LTR MaLR 2 252 -167 5 1501 1680 236 110 14 chr5 120184529 120184958 -32352301 + RMER19C LTR ERVK 138 607 -4 5 1501 243 271 51 29 chr5 120185011 120185129 -32352130 - MTEa-int LTR MaLR -755 754 633 5 1501 243 271 51 29 chr5 120185264 120185282 -32351977 - MTEa-int LTR MaLR -877 632 615 5 1501 346 157 261 42 chr5 120185499 120185625 -32351634 + MTD LTR MaLR 240 404 -15 5 1501 399 203 83 113 chr5 120185630 120185763 -32351496 - MTEa LTR MaLR -250 129 1 5 1501 2779 18 18 0 chr5 120186351 120186683 -32350576 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 1 5 1502 442 224 293 79 chr5 120194935 120195209 -32342050 - RMER16 LTR ERVK 0 533 201 6 1502 231 193 52 17 chr5 120195178 120195236 -32342023 - RMER16 LTR ERVK -473 60 1 6 1502 1939 191 30 3 chr5 120200612 120200975 -32336284 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 10 6 1502 320 283 109 61 chr5 120201172 120201522 -32335737 - ORR1D1 LTR MaLR 0 379 1 6 1502 1314 198 120 65 chr5 120207102 120207453 -32329806 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 1502 1318 214 142 15 chr5 120210418 120210750 -32326509 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1502 465 281 50 35 chr5 120232790 120232971 -32304288 + ORR1E LTR MaLR 46 223 -147 7 1502 311 311 119 64 chr5 120233588 120233866 -32303393 - MLT1G LTR MaLR -169 386 106 7 1502 958 308 83 21 chr5 120238721 120239059 -32298200 + MTEb LTR MaLR 6 364 -15 7 1502 314 354 46 62 chr5 120241227 120241486 -32295773 + ORR1E LTR MaLR 99 353 -6 7 1502 393 225 247 19 chr5 120242226 120242380 -32294879 + ORR1E LTR MaLR 1 189 -170 7 1502 297 247 136 57 chr5 120261884 120262060 -32275199 - MT2B LTR ERVL -323 278 89 7 1502 287 280 99 86 chr5 120267338 120267662 -32269597 + RMER12 LTR ERVK 690 1017 -305 8 1502 325 302 71 104 chr5 120270754 120270965 -32266294 + MLT1C LTR MaLR 65 268 -199 8 1502 240 340 28 28 chr5 120284423 120284529 -32252730 - LTR78 LTR ERV1 -345 959 854 8 1502 412 194 48 97 chr5 120311073 120311176 -32226083 + MT2B LTR ERVL 160 257 -344 8 1503 290 252 104 89 chr5 120335739 120335874 -32201385 - ORR1E LTR MaLR -222 137 1 9 1503 1748 148 132 6 chr5 120336107 120336433 -32200826 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 9 1503 887 172 13 7 chr5 120337390 120337542 -32199717 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 490 9 1503 2694 158 35 12 chr5 120337530 120338019 -32199240 - RLTR26 LTR ERVK -98 544 1 9 1503 2634 58 0 58 chr5 120338205 120338552 -32198707 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1503 1910 161 3 16 chr5 120339008 120339330 -32197929 + ORR1C1 LTR MaLR 59 376 -2 9 1503 360 280 107 24 chr5 120340999 120341204 -32196055 + RMER12 LTR ERVK 767 988 -334 9 1503 308 312 65 92 chr5 120343758 120343987 -32193272 + MLT1G3 LTR MaLR 350 572 -23 9 1503 233 354 79 58 chr5 120346177 120346507 -32190752 - MER31A LTR ERV1 -48 437 101 9 1503 2136 98 3 69 chr5 120348480 120348830 -32188429 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -10 327 1 9 1503 56280 10 7 1 chr5 120348830 120355288 -32181971 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3 9 1503 2137 108 3 67 chr5 120355289 120355647 -32181612 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -2 335 1 9 1503 428 295 102 23 chr5 120356247 120356420 -32180839 - LTR16A LTR ERVL 0 451 265 9 1503 441 334 104 98 chr5 120356420 120356839 -32180420 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 117 9 1503 437 333 104 104 chr5 120357126 120357225 -32180034 - MLT1E1A LTR MaLR -444 116 23 9 1503 501 354 60 48 chr5 120357234 120357486 -32179773 - LTR16A LTR ERVL -164 287 33 9 1503 1450 179 39 70 chr5 120360489 120360820 -32176439 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 208 9 1503 1136 207 63 15 chr5 120360826 120361114 -32176145 - RLTR11A2 LTR ERVK -160 293 1 9 1503 2614 56 16 3 chr5 120361926 120362249 -32175010 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1503 364 307 7 66 chr5 120362438 120362574 -32174685 + MLT1K LTR MaLR 181 308 -287 1 1503 2579 106 67 3 chr5 120364739 120365126 -32172133 + MTC LTR MaLR 10 421 0 1 1503 1201 127 127 64 chr5 120367654 120367890 -32169369 + MTC LTR MaLR 171 421 0 1 1503 612 307 62 10 chr5 120370066 120370260 -32166999 + MLT1J LTR MaLR 140 343 -169 1 1503 260 301 0 14 chr5 120374782 120374856 -32162403 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 336 1 1503 521 310 86 53 chr5 120375892 120376203 -32161056 - MLT1F LTR MaLR -1 547 149 1 1503 2810 57 84 3 chr5 120378423 120378790 -32158469 - MTB LTR MaLR 0 400 4 1 1503 231 224 61 0 chr5 120379417 120379466 -32157793 - MTE2b LTR MaLR -39 340 289 1 1503 273 254 63 55 chr5 120380081 120380318 -32156941 - RMER17A2 LTR ERVK -424 482 244 1 1503 1098 223 153 53 chr5 120380525 120380885 -32156374 + MTD LTR MaLR 10 405 -14 1 1503 570 328 31 11 chr5 120381699 120381890 -32155369 + MTE2a LTR MaLR 177 371 -8 1 1503 266 290 60 86 chr5 120383573 120383690 -32153569 + MLT1K LTR MaLR 171 284 -311 1 1503 413 273 91 80 chr5 120383849 120383872 -32153387 - MT2A LTR ERVL 0 533 518 1 1503 413 286 63 65 chr5 120384068 120384288 -32152971 - MT2A LTR ERVL -16 517 268 1 1503 2648 77 7 101 chr5 120384360 120384800 -32152459 + RLTR11B LTR ERVK 55 453 0 1 1503 691 291 16 58 chr5 120388405 120388595 -32148664 + MTE2a LTR MaLR 1 182 -197 1 1503 371 312 0 52 chr5 120390137 120390272 -32146987 + MTA_Mm LTR MaLR 2 129 -267 1 1503 1731 139 138 10 chr5 120390457 120390769 -32146490 + MTC LTR MaLR 63 414 -7 1 1503 891 232 70 59 chr5 120392035 120392291 -32144968 + MTEb LTR MaLR 1 259 -120 1 1503 542 243 40 46 chr5 120392339 120392490 -32144769 + MTEb LTR MaLR 226 375 -4 1 1503 240 316 48 88 chr5 120396153 120396202 -32141057 - MT2B2 LTR ERVL -350 234 115 1 1503 425 256 11 0 chr5 120398631 120398721 -32138538 - MLT1J LTR MaLR -339 173 83 1 1503 1080 214 122 53 chr5 120400747 120401067 -32136192 - ORR1E LTR MaLR -5 354 13 1 1503 1911 262 38 8 chr5 120402388 120402889 -32134370 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 1 1503 388 268 98 0 chr5 120403339 120403451 -32133808 + MLT1J LTR MaLR 77 199 -313 1 1503 271 244 92 58 chr5 120404779 120404866 -32132393 - LTR33 LTR ERVL -9 506 417 1 1503 357 215 25 0 chr5 120406780 120406859 -32130400 + MTE2b LTR MaLR 33 113 -266 1 1503 346 341 42 6 chr5 120408425 120408590 -32128669 + LTR33 LTR ERVL 332 502 -13 1 1503 237 242 28 83 chr5 120409931 120410003 -32127256 + MLT1G LTR MaLR 38 105 -464 1 1503 283 304 53 129 chr5 120410099 120410231 -32127028 + MLT1G LTR MaLR 334 455 -136 1 1503 408 377 62 51 chr5 120410250 120410602 -32126657 + ORR1E LTR MaLR 1 356 -3 1 1503 235 321 11 35 chr5 120415318 120415405 -32121854 - ORR1E LTR MaLR -7 372 288 1 1503 375 299 17 103 chr5 120415602 120415747 -32121512 - ORR1E LTR MaLR -161 198 69 1 1503 290 346 64 74 chr5 120421185 120421388 -32115871 + MLT1E LTR MaLR 452 652 -1 1 1503 556 251 250 25 chr5 120434253 120434534 -32102725 + ORR1E LTR MaLR 22 379 0 1 1503 285 289 91 70 chr5 120436378 120436564 -32100695 + LTR33A LTR ERVL 83 272 -248 1 1503 1415 187 129 93 chr5 120436922 120437287 -32099972 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1503 324 347 16 16 chr5 120445891 120446017 -32091242 - MTD LTR MaLR -16 403 278 1 1503 307 240 27 0 chr5 120446040 120446115 -32091144 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5544 217 141 1 1503 1506 224 37 124 chr5 120446296 120446786 -32090473 - MT2A LTR ERVL -85 448 2 1 1503 3302 50 5 2 chr5 120448761 120449160 -32088099 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1503 1291 63 45 51 chr5 120452924 120453194 -32084065 + MTB LTR MaLR 3 382 -18 1 1503 296 312 170 36 chr5 120454113 120454336 -32082923 - MLT1E2 LTR MaLR -139 488 236 1 187 1175 237 128 17 chr5 120454838 120455190 -32082069 - RMER19C LTR ERVK -219 392 2 1 1504 231 322 110 14 chr5 120455884 120456029 -32081230 - RMER15 LTR ERVL -36 539 381 1 1504 1474 228 158 62 chr5 120456029 120456548 -32080711 - RMER4B LTR ERVK 0 585 17 1 1504 1782 144 28 101 chr5 120457706 120458061 -32079198 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1504 1709 158 31 51 chr5 120459503 120459856 -32077403 - MTC LTR MaLR 0 421 76 1 1504 267 140 100 0 chr5 120460241 120460291 -32076968 - MTC LTR MaLR -352 69 15 1 1504 1907 156 22 55 chr5 120460409 120460775 -32076484 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 1504 402 255 58 43 chr5 120461897 120462119 -32075140 - ORR1B1 LTR MaLR -157 170 1 1 1504 307 241 35 24 chr5 120464108 120464193 -32073066 - MLT1M LTR MaLR -487 185 100 1 1504 841 239 139 29 chr5 120464426 120464746 -32072513 - MTD LTR MaLR -19 360 18 1 1504 735 321 172 28 chr5 120467539 120467998 -32069261 + MT2A LTR ERVL 1 525 -8 1 1504 323 241 102 91 chr5 120469908 120470095 -32067164 + RMER15 LTR ERVL 380 568 -7 1 1504 2440 141 27 15 chr5 120472871 120473281 -32063978 - MTC LTR MaLR -2 419 5 1 1504 633 173 0 93 chr5 120475575 120475715 -32061544 - MTC LTR MaLR 0 421 295 1 1504 451 332 97 21 chr5 120476032 120476269 -32060990 - MT2A LTR ERVL -152 381 127 1 1504 533 238 68 15 chr5 120476265 120476397 -32060862 - MTC LTR MaLR -280 139 1 1 1504 1800 169 104 38 chr5 120476751 120476794 -32060465 - MTC LTR MaLR -1 420 376 1 1504 1800 169 104 38 chr5 120476875 120477225 -32060034 - MTC LTR MaLR -46 375 2 1 1504 231 320 53 0 chr5 120480478 120480553 -32056706 - MLT1J LTR MaLR -201 311 233 1 1504 2292 117 6 0 chr5 120482712 120483036 -32054223 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1504 2079 108 120 0 chr5 120485841 120486166 -32051093 - RMER19A LTR ERVK -373 364 1 1 1504 1958 106 4 4 chr5 120487612 120487886 -32049373 - RMER19B LTR ERVK 0 902 629 1 1504 869 235 72 13 chr5 120488634 120488871 -32048388 - MTD LTR MaLR 0 419 169 1 1504 453 301 54 27 chr5 120489831 120489978 -32047281 - MTEb LTR MaLR -1 378 228 1 1504 1246 304 198 42 chr5 120489982 120490931 -32046328 - MTE-int LTR MaLR -483 1097 1 1 1504 550 298 98 84 chr5 120493915 120494274 -32042985 - MTE-int LTR MaLR -1104 476 113 1 1504 1995 100 60 19 chr5 120496912 120497227 -32040032 - RLTR33 LTR ERVK -349 329 2 1 1504 1082 103 0 0 chr5 120497364 120497520 -32039739 - MT2B LTR ERVL -16 585 430 1 1504 1523 212 25 69 chr5 120497529 120498096 -32039163 - RLTR11A LTR ERVK -6 522 1 1 1504 2543 214 38 36 chr5 120498098 120498712 -32038547 - MYSERV-int LTR ERVK -2 6548 5934 1 1504 1252 159 26 78 chr5 120498712 120498944 -32038315 - MT2B LTR ERVL -191 410 191 1 1504 345 206 0 42 chr5 120498887 120498958 -32038301 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 505 1 1504 365 293 90 8 chr5 120499615 120499749 -32037510 - MTD LTR MaLR 0 419 275 1 1504 703 162 0 0 chr5 120501870 120501987 -32035272 - MTC LTR MaLR -304 117 1 2 1504 860 252 103 69 chr5 120504136 120504455 -32032804 + MTD LTR MaLR 65 394 -25 5 1504 290 331 35 35 chr5 120506894 120507033 -32030226 + MLT1A0 LTR MaLR 20 158 -207 6 1504 2680 89 12 21 chr5 120508320 120508745 -32028514 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1504 1509 232 18 193 chr5 120509558 120510299 -32026960 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1504 321 282 27 124 chr5 120510334 120510520 -32026739 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 241 1 1504 531 322 153 5 chr5 120511295 120511586 -32025673 - ORR1E LTR MaLR -17 342 1 1 1504 239 316 117 7 chr5 120522846 120522983 -32014276 + RMER15 LTR ERVL 411 562 -13 4 1504 1789 152 79 6 chr5 120525993 120526323 -32010936 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1504 258 299 166 7 chr5 120528448 120528593 -32008666 + MLT1H2 LTR MaLR 225 392 -97 5 1504 1173 131 0 5 chr5 120543690 120543874 -31993385 + MTB_Mm LTR MaLR 221 403 -4 8 1504 434 295 50 82 chr5 120544747 120545129 -31992130 + ORR1E LTR MaLR 7 360 -10 9 1504 395 307 83 39 chr5 120548423 120548579 -31988680 + ORR1E LTR MaLR 1 163 -196 1 1504 313 283 38 30 chr5 120553109 120553240 -31984019 - MLT1B LTR MaLR -191 199 68 1 1504 1230 153 101 0 chr5 120557260 120557341 -31979918 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 447 1 1504 1230 153 101 0 chr5 120557380 120557526 -31979733 - RLTR11A2 LTR ERVK -81 446 278 1 1504 1341 155 34 46 chr5 120557979 120558242 -31979017 - RLTR11A2 LTR ERVK -267 260 1 1 1504 1030 279 117 30 chr5 120560339 120560672 -31976587 - MTEa LTR MaLR 0 379 18 1 1504 302 269 31 31 chr5 120562101 120562197 -31975062 + MLT1B LTR MaLR 30 125 -265 1 1504 2509 82 55 8 chr5 120562324 120562704 -31974555 - MTB_Mm LTR MaLR -7 400 3 1 1504 1458 181 97 125 chr5 120562947 120563338 -31973921 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 1 1504 273 286 12 23 chr5 120565691 120565777 -31971482 - RLTR25A LTR ERVK -498 605 521 1 1504 229 264 8 8 chr5 120565710 120565836 -31971423 - ORR1B1-int LTR MaLR -750 759 634 1 1504 623 273 257 7 chr5 120566845 120567149 -31970110 + MTD LTR MaLR 1 380 -41 1 1504 4070 139 127 107 chr5 120570449 120571454 -31965805 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 3 1 1504 5284 165 40 15 chr5 120578982 120579867 -31957392 - RMER13B LTR ERVK 0 908 2 1 1504 799 218 129 26 chr5 120580175 120580465 -31956794 - ORR1D1 LTR MaLR -73 321 1 1 1504 571 200 31 23 chr5 120580465 120580593 -31956666 - ORR1D1 LTR MaLR -245 129 1 1 1504 256 302 89 51 chr5 120584880 120585037 -31952222 - MLT1G3 LTR MaLR -202 393 231 1 1505 1780 154 100 54 chr5 120587786 120588137 -31949122 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1505 248 294 113 53 chr5 120591504 120591637 -31945622 - MamGypLTR1b LTR Gypsy -502 280 140 1 1505 226 307 0 116 chr5 120600572 120600701 -31936558 + RLTR11B LTR ERVK 83 196 -257 2 1505 1063 261 72 22 chr5 120610197 120610558 -31926701 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 1505 1714 142 126 59 chr5 120630732 120631090 -31906169 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 2 1505 314 308 122 39 chr5 120634659 120634872 -31902387 - MLT1B LTR MaLR -235 232 1 2 1505 2503 145 26 19 chr5 120652130 120652546 -31884713 - MTC LTR MaLR -2 419 1 2 1505 829 271 97 65 chr5 120654083 120654391 -31882868 - ORR1E LTR MaLR -1 358 41 2 1505 2482 138 32 5 chr5 120664596 120664997 -31872262 + MTC LTR MaLR 8 419 -2 2 1505 671 139 0 18 chr5 120665851 120665961 -31871298 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 270 2 1505 991 170 18 0 chr5 120666411 120666582 -31870677 - ORR1C1 LTR MaLR -204 174 1 2 1505 230 333 23 11 chr5 120671153 120671241 -31866018 - MLT1H LTR MaLR -337 212 124 3 1505 301 203 31 15 chr5 120671336 120671401 -31865858 - MLT1H LTR MaLR -413 136 71 3 1505 261 292 28 0 chr5 120684932 120685004 -31852255 + LTR16E1 LTR ERVL 463 536 -2 3 1505 694 252 128 28 chr5 120686262 120686544 -31850715 - MLT1D LTR MaLR -15 490 181 3 1505 471 286 19 52 chr5 120686849 120687004 -31850255 - MLT1D LTR MaLR -300 205 56 3 1505 4905 151 57 59 chr5 120690512 120691125 -31846134 + RMER17B LTR ERVK 1 620 -338 3 1505 4905 151 57 59 chr5 120691320 120691666 -31845593 + RMER17B LTR ERVK 621 958 0 3 1505 3844 98 27 25 chr5 120691899 120692538 -31844721 - RMER17B LTR ERVK 0 958 319 3 1505 2326 88 8 34 chr5 120692719 120693074 -31844185 - RMER17B LTR ERVK -612 346 1 3 1505 260 275 29 0 chr5 120716793 120716862 -31820397 - MLT1K LTR MaLR -319 276 206 4 1506 645 175 67 67 chr5 120718398 120718563 -31818696 - MTD LTR MaLR -11 408 244 4 1506 965 162 26 73 chr5 120718531 120718764 -31818495 + MTD LTR MaLR 198 419 0 4 1506 379 273 83 64 chr5 120727050 120727316 -31809943 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 71 4 1506 298 253 123 49 chr5 120727288 120727450 -31809809 - RLTR15 LTR ERVK -185 174 1 4 1506 255 295 72 60 chr5 120727794 120727877 -31809382 + MTEb LTR MaLR 282 365 -14 4 1506 346 204 0 150 chr5 120733181 120733203 -31804056 - MT2B LTR ERVL -342 233 147 4 1506 293 299 68 61 chr5 120739048 120739107 -31798152 + RMER17C LTR ERVK 70 130 -280 4 1506 293 299 68 61 chr5 120739154 120739372 -31797887 + RMER17C LTR ERVK 131 348 -62 4 1506 326 226 36 0 chr5 120740556 120740640 -31796619 + MLT1I LTR MaLR 325 411 0 4 1506 621 157 0 55 chr5 120749256 120749292 -31787967 - RMER4A LTR ERVK 0 466 431 4 1506 621 157 0 55 chr5 120749371 120749462 -31787797 - RMER4A LTR ERVK -36 430 347 4 1506 1595 183 42 45 chr5 120749459 120749814 -31787445 - RMER4A LTR ERVK -75 391 38 4 1506 250 298 59 74 chr5 120757228 120757431 -31779828 + RLTR25B LTR ERVK 307 506 -522 5 1506 1886 202 77 13 chr5 120766651 120767043 -31770216 - MTD LTR MaLR 0 419 3 5 1506 391 267 24 48 chr5 120773813 120773939 -31763320 + MTEa LTR MaLR 251 373 -6 5 1506 868 159 8 84 chr5 120774277 120774519 -31762740 + ORR1A2 LTR MaLR 23 218 -128 5 1506 1924 80 3 143 chr5 120776138 120776502 -31760757 + ORR1A2 LTR MaLR 1 313 -14 5 1506 2063 98 20 63 chr5 120781621 120781969 -31755290 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 6 5 1506 357 204 10 30 chr5 120799226 120799327 -31737932 + RLTR15 LTR ERVK 33 131 -228 6 1506 1127 134 62 0 chr5 120799646 120799840 -31737419 - RMER19C LTR ERVK -12 599 394 6 1506 700 345 90 53 chr5 120819005 120819524 -31717735 + MLT1F2 LTR MaLR 24 678 -2 6 1506 1252 110 349 0 chr5 120819982 120820200 -31717059 - RMER6A LTR ERVK -460 296 3 6 1506 277 209 14 56 chr5 120820247 120820318 -31716941 + MLT1G LTR MaLR 219 286 -305 6 1506 262 184 0 0 chr5 120824189 120824238 -31713021 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 512 6 1506 2595 49 6 6 chr5 120837506 120837852 -31699407 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 1507 413 317 158 29 chr5 120852871 120853150 -31684109 - MLT1D LTR MaLR -124 381 67 7 1507 2018 90 93 10 chr5 120856968 120857270 -31679989 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 2 7 1507 290 292 62 6 chr5 120857500 120857679 -31679580 - RLTR21 LTR ERVK -311 1261 1073 7 1507 262 348 26 9 chr5 120863399 120863515 -31673744 - RMER15 LTR ERVL -3 572 455 7 1507 3249 58 0 10 chr5 120901631 120902031 -31635228 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1507 890 194 48 5 chr5 120915462 120915649 -31621610 + MTC LTR MaLR 1 195 -226 8 1507 284 314 74 8 chr5 120931136 120931258 -31606001 - LTR16C LTR ERVL -159 330 201 9 1507 348 306 119 23 chr5 120931858 120932035 -31605224 - MLT1J LTR MaLR -115 397 204 9 1507 331 243 0 0 chr5 120932374 120932448 -31604811 - MLT1J LTR MaLR -306 142 69 9 1507 321 304 0 0 chr5 120932576 120932655 -31604604 + MLT1J LTR MaLR 230 308 -204 9 1507 254 231 29 125 chr5 120945293 120945397 -31591862 + MLT1H LTR MaLR 252 345 -204 9 1507 2427 144 44 69 chr5 120946418 120946894 -31590365 + RMER4A LTR ERVK 3 466 0 9 1507 310 278 109 80 chr5 120956551 120956584 -31580675 - MT2B LTR ERVL -448 153 117 1 1507 230 324 73 40 chr5 120957756 120957907 -31579352 - RLTR25A LTR ERVK -515 588 433 1 1507 4527 98 0 2 chr5 120957983 120958568 -31578691 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 1 1507 383 288 57 74 chr5 120959245 120959489 -31577770 + MLT1F1 LTR MaLR 330 569 0 1 1507 349 236 68 75 chr5 120962322 120962455 -31574804 + MT2B2 LTR ERVL 156 287 -297 1 1507 236 327 140 0 chr5 120965824 120965931 -31571328 - MLT1D LTR MaLR -284 221 100 1 1507 2238 86 3 124 chr5 120974424 120974504 -31562755 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 252 1 1507 2238 86 3 124 chr5 120974697 120974988 -31562271 - ORR1A2 LTR MaLR -76 251 1 1 1508 3046 84 20 3 chr5 120991085 120991477 -31545782 + MTB LTR MaLR 2 400 0 1 1508 908 292 138 17 chr5 121001848 121002210 -31535049 + RMER5 LTR ERV1 58 463 -71 6 1508 517 202 36 14 chr5 121010371 121010527 -31526732 + ORR1B1 LTR MaLR 31 213 -181 2 1508 2370 136 103 60 chr5 121023774 121023808 -31513451 + RMER4A LTR ERVK 1 34 -432 5 1508 2370 136 103 60 chr5 121023861 121024273 -31512986 + RMER4A LTR ERVK 35 466 0 5 1508 1521 170 67 131 chr5 121032579 121032675 -31504584 + MTC LTR MaLR 16 109 -312 6 1508 1521 170 67 131 chr5 121032699 121032712 -31504547 + MTC LTR MaLR 110 110 -311 6 1508 1521 170 67 131 chr5 121032852 121032880 -31504379 + MTC LTR MaLR 110 110 -311 6 1508 1521 170 67 131 chr5 121032907 121033201 -31504058 + MTC LTR MaLR 110 421 0 6 1508 294 279 34 67 chr5 121036127 121036246 -31501013 + MT2B2 LTR ERVL 127 241 -343 7 1508 2029 66 17 208 chr5 121040111 121040355 -31496904 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 108 8 1508 2029 66 17 208 chr5 121040501 121040660 -31496599 - ORR1A2 LTR MaLR -220 107 1 8 1508 2012 144 90 14 chr5 121043032 121043181 -31494078 + ORR1B1 LTR MaLR 1 149 -245 9 1508 2012 144 90 14 chr5 121043219 121043435 -31493824 + ORR1B1 LTR MaLR 150 393 -1 9 1508 4675 88 36 62 chr5 121043512 121044283 -31492976 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 9 1508 244 261 14 14 chr5 121055910 121055980 -31481279 - ORR1E LTR MaLR -283 76 7 1 1508 278 235 0 0 chr5 121060995 121061046 -31476213 + MTE2a LTR MaLR 3 53 -326 1 1508 441 282 133 7 chr5 121061207 121061350 -31475909 + MTE2a LTR MaLR 219 379 0 1 1508 233 269 107 36 chr5 121072458 121072570 -31464689 + MT2B LTR ERVL 194 313 -288 1 1508 2596 145 11 48 chr5 121085666 121086101 -31451158 + MTC LTR MaLR 3 421 0 1 1508 777 167 115 6 chr5 121088185 121088342 -31448917 + MTD LTR MaLR 6 179 -240 1 1508 232 221 97 56 chr5 121088350 121088422 -31448837 + MTD LTR MaLR 285 359 -60 1 1508 303 266 66 59 chr5 121107390 121107526 -31429733 - MT2B LTR ERVL -297 304 168 2 1508 630 265 40 46 chr5 121108204 121108438 -31428821 - MTE2a LTR MaLR -157 222 29 2 1508 371 176 35 121 chr5 121110268 121110384 -31426875 - MT2B LTR ERVL -338 263 158 2 1509 1368 196 14 106 chr5 121118587 121118904 -31418355 - MTD LTR MaLR -81 338 22 2 1509 678 283 72 22 chr5 121126332 121126623 -31410636 - MTD LTR MaLR -15 404 21 3 1509 947 178 189 36 chr5 121127374 121127656 -31409603 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 41 3 1509 251 216 0 26 chr5 121127697 121127773 -31409486 - ORR1D1 LTR MaLR -259 135 62 3 1509 270 214 14 0 chr5 121127819 121127889 -31409370 - ORR1B1 LTR MaLR -248 146 76 3 1509 958 256 4 34 chr5 121146280 121146519 -31390740 + MTEa LTR MaLR 6 237 -142 3 1509 294 278 159 0 chr5 121146559 121146692 -31390567 + MTEa LTR MaLR 221 377 -2 3 1509 246 298 0 78 chr5 121152576 121152678 -31384581 - MT2B LTR ERVL -339 262 169 3 1509 362 353 70 102 chr5 121164835 121165207 -31372052 + MTEa LTR MaLR 17 376 -3 3 1509 947 243 54 25 chr5 121166355 121166666 -31370593 - MLT2D LTR ERVL -69 328 5 3 1509 265 327 82 19 chr5 121168164 121168323 -31368936 - MLT1D LTR MaLR -213 292 124 4 1509 694 275 65 53 chr5 121168339 121168593 -31368666 + RLTR26 LTR ERVK 5 308 -334 4 1509 694 282 110 50 chr5 121168622 121168729 -31368530 + RLTR26 LTR ERVK 309 411 -231 4 1509 382 310 42 22 chr5 121169349 121169474 -31367785 + ORR1D2 LTR MaLR 39 145 -214 4 1509 382 324 120 39 chr5 121169778 121169998 -31367261 + ORR1D2 LTR MaLR 122 366 -4 4 1509 1818 198 73 5 chr5 121171007 121171388 -31365871 - MTD LTR MaLR 0 419 13 4 1509 281 372 42 82 chr5 121172087 121172418 -31364841 - MLT1L LTR MaLR -55 555 238 4 1509 1312 232 19 44 chr5 121174389 121174705 -31362554 - MTE2b LTR MaLR -55 324 17 4 1509 415 296 0 90 chr5 121174565 121174721 -31362538 - MT2A LTR ERVL -387 146 5 4 1509 402 329 111 58 chr5 121180136 121180226 -31357033 - MER21B LTR ERV1 -293 570 477 4 1509 402 329 111 58 chr5 121180355 121180680 -31356579 - MER21B LTR ERV1 -387 476 134 4 1509 539 301 120 24 chr5 121187259 121187467 -31349792 + MTD LTR MaLR 156 383 -36 4 1509 1612 237 78 26 chr5 121189295 121189720 -31347539 + RMER19C LTR ERVK 165 611 0 4 1509 248 304 51 0 chr5 121190432 121190511 -31346748 + MLT1D LTR MaLR 8 90 -377 4 1509 2059 79 30 59 chr5 121190586 121190923 -31346336 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1509 333 264 16 97 chr5 121190947 121191103 -31346156 + MLT1D LTR MaLR 316 505 0 4 1509 267 87 0 42 chr5 121195602 121195650 -31341609 + RLTR10C LTR ERVK 345 390 -46 4 1509 672 244 126 36 chr5 121196904 121197181 -31340078 - ORR1E LTR MaLR -55 304 3 4 1509 948 211 226 35 chr5 121198118 121198432 -31338827 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1509 528 322 64 17 chr5 121202638 121202872 -31334387 - RMER15 LTR ERVL -4 571 327 4 1509 3266 61 10 0 chr5 121203054 121203450 -31333809 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1509 695 170 0 111 chr5 121207861 121208015 -31329244 + ORR1C2 LTR MaLR 29 165 -209 5 1509 695 170 0 111 chr5 121208038 121208055 -31329204 + ORR1C2 LTR MaLR 166 181 -193 5 1509 708 184 161 6 chr5 121208308 121208488 -31328771 + ORR1C2 LTR MaLR 175 382 -2 5 1509 287 193 0 17 chr5 121210650 121210708 -31326551 + MLT1A1 LTR MaLR 349 405 -3 5 1509 4233 216 93 75 chr5 121212273 121213531 -31323728 - RMER12 LTR ERVK -41 1281 1 5 1509 368 257 44 35 chr5 121213546 121213659 -31323600 + RMER5 LTR ERV1 196 309 -225 5 1509 340 203 163 0 chr5 121213904 121214057 -31323202 + RMER5 LTR ERV1 350 527 -7 5 1509 4302 150 112 41 chr5 121217896 121218744 -31318515 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 5 1509 1755 144 34 61 chr5 121220180 121220531 -31316728 + ORR1D1 LTR MaLR 3 348 -31 5 1509 266 259 35 135 chr5 121220601 121220617 -31316642 + ORR1D1 LTR MaLR 349 364 -15 5 1509 2577 146 15 1 chr5 121225730 121226166 -31311093 + RLTR11A LTR ERVK 51 528 0 5 1509 650 292 103 19 chr5 121230004 121230325 -31306934 + RMER5 LTR ERV1 33 380 -154 5 1509 2464 147 24 137 chr5 121232597 121233230 -31304029 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 5 1509 296 304 11 21 chr5 121235070 121235164 -31302095 + MTEb LTR MaLR 5 97 -282 5 1509 1037 216 135 38 chr5 121240014 121240384 -31296875 + MTD LTR MaLR 14 419 0 5 1509 995 273 112 39 chr5 121240384 121241361 -31295898 + MTD-int LTR MaLR 1 1255 -3 5 188 751 230 144 28 chr5 121241361 121241718 -31295541 + MTD LTR MaLR 15 415 -4 5 1510 2104 127 8 80 chr5 121246632 121246984 -31290275 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1510 331 244 22 11 chr5 121248016 121248107 -31289152 + MTC LTR MaLR 1 92 -329 5 1510 370 246 89 7 chr5 121248356 121248491 -31288768 - RMER5 LTR ERV1 -356 178 33 5 1510 818 255 74 16 chr5 121254006 121254249 -31283010 - RLTR16 LTR ERVK -234 271 15 6 1510 1106 227 133 22 chr5 121254679 121255048 -31282211 + MTD LTR MaLR 6 415 -4 6 1510 609 247 193 18 chr5 121255116 121255339 -31281920 + MTD LTR MaLR 154 415 -4 6 1510 2694 130 8 32 chr5 121265529 121265999 -31271260 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 6 1510 995 268 99 18 chr5 121267879 121268263 -31268996 - MTD LTR MaLR -4 415 1 6 1510 1837 251 162 15 chr5 121268263 121268936 -31268323 - MTD-int LTR MaLR -5 1575 635 6 1510 1773 157 40 149 chr5 121268915 121269385 -31267874 - RLTR23 LTR ERV1 -4 426 8 6 1510 947 258 32 36 chr5 121269462 121269771 -31267488 - MTD-int LTR MaLR -950 308 1 6 1510 1236 217 129 11 chr5 121269771 121270134 -31267125 - MTD LTR MaLR 0 419 14 6 1510 2142 92 16 3 chr5 121273900 121274215 -31263044 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1510 1013 243 48 0 chr5 121274768 121275019 -31262240 - RLTR42-int LTR ERVK -4123 1399 1137 6 1510 2935 33 0 3 chr5 121275653 121275991 -31261268 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 6 1510 7037 29 2 7 chr5 121275991 121276847 -31260412 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5630 6 1510 23994 33 35 12 chr5 121276833 121279834 -31257425 - IAPEz-int LTR ERVK -3405 3076 8 6 1510 2931 33 0 3 chr5 121279834 121280172 -31257087 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 6 1510 2255 135 45 13 chr5 121280376 121280758 -31256501 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1510 1093 181 38 61 chr5 121281037 121281333 -31255926 - ORR1A4 LTR MaLR -76 298 1 6 1510 317 356 71 43 chr5 121281405 121281616 -31255643 - RMER15 LTR ERVL -7 568 352 6 1510 2001 123 4 31 chr5 121281992 121282365 -31254894 + ORR1A2 LTR MaLR 1 346 0 6 1510 3911 178 17 45 chr5 121285247 121285505 -31251754 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1055 793 535 6 1510 3911 178 17 45 chr5 121285640 121286197 -31251062 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1314 534 1 6 1510 2201 175 21 0 chr5 121291643 121292021 -31245238 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 1510 447 287 31 0 chr5 121295157 121295286 -31241973 + RLTR18-int LTR ERVK 2529 2661 -2700 6 1510 342 241 36 36 chr5 121295350 121295462 -31241797 + RLTR18-int LTR ERVK 2877 2988 -2373 6 1510 1297 250 34 21 chr5 121295942 121296330 -31240929 + RLTR18-int LTR ERVK 3177 3569 -1792 6 1510 987 230 30 25 chr5 121296755 121297043 -31240216 - RMER6A LTR ERVK 0 756 501 6 1510 696 236 176 23 chr5 121301750 121301971 -31235288 - MTD LTR MaLR -4 415 161 6 1510 1176 219 96 88 chr5 121301942 121302177 -31235082 - BGLII_B LTR ERVK -63 378 124 6 1510 1176 219 96 88 chr5 121302315 121302454 -31234805 - BGLII_B LTR ERVK -318 123 1 6 1510 229 108 27 0 chr5 121302454 121302489 -31234770 - MTD LTR MaLR -376 45 10 6 1510 996 251 160 33 chr5 121302498 121302848 -31234411 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 802 6 1510 7070 56 41 0 chr5 121302848 121303706 -31233553 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 6 1510 996 265 116 28 chr5 121303706 121304012 -31233247 - MTD-int LTR MaLR -457 801 381 6 1510 846 295 73 33 chr5 121304205 121304370 -31232889 - MTD-int LTR MaLR -878 380 314 6 1510 918 268 173 31 chr5 121317259 121317617 -31219642 - MTD LTR MaLR 0 419 11 7 1510 1559 262 290 19 chr5 121317629 121318593 -31218666 - MTD-int LTR MaLR -149 1109 1 7 1510 1225 219 123 22 chr5 121318593 121318958 -31218301 - MTD LTR MaLR 0 419 18 7 1510 5313 139 75 19 chr5 121319630 121320537 -31216722 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 7 1510 282 244 36 24 chr5 121330421 121330505 -31206754 + MTD LTR MaLR 14 98 -321 7 1510 1626 258 179 36 chr5 121330487 121331436 -31205823 + MTD-int LTR MaLR 41 1258 0 7 1510 909 280 95 16 chr5 121331436 121331824 -31205435 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1510 2097 136 65 86 chr5 121338500 121339003 -31198256 + BGLII_B LTR ERVK 5 436 -5 7 1510 292 254 50 83 chr5 121341620 121341740 -31195519 - MTC LTR MaLR -305 116 1 7 1510 1698 91 24 28 chr5 121342753 121342937 -31194322 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 142 7 1510 2771 66 143 139 chr5 121342937 121343447 -31193812 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 7 1510 1698 91 24 28 chr5 121343447 121343512 -31193747 - ORR1A2 LTR MaLR -186 141 79 7 1510 6159 79 11 103 chr5 121344372 121345355 -31191904 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 7 1510 345 217 24 24 chr5 121350396 121350481 -31186778 + MTD LTR MaLR 14 98 -321 7 1510 1454 252 160 40 chr5 121350466 121351420 -31185839 + MTC-int LTR MaLR 46 1098 0 7 1510 1022 298 93 13 chr5 121351420 121351808 -31185451 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1510 2067 163 51 62 chr5 121358587 121359080 -31178179 + BGLII_B LTR ERVK 5 436 -5 7 1510 3483 61 28 2 chr5 121360112 121360537 -31176722 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 1510 237 305 143 31 chr5 121360617 121360715 -31176544 - MLT2B1 LTR ERVL -234 286 178 7 1510 364 246 89 7 chr5 121361858 121361993 -31175266 + RMER5 LTR ERV1 33 178 -356 7 1510 341 240 18 88 chr5 121362219 121362333 -31174926 - MTC LTR MaLR -315 106 1 7 1510 2494 68 12 6 chr5 121363366 121363691 -31173568 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1510 682 242 193 18 chr5 121367117 121367340 -31169919 - MTD LTR MaLR -4 415 154 8 1510 1136 216 131 25 chr5 121367408 121367768 -31169491 - MTD LTR MaLR -4 415 18 8 1510 663 271 6 46 chr5 121372492 121372666 -31164593 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 418 8 188 865 209 27 6 chr5 121372669 121372852 -31164407 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1053 4708 4522 8 1511 2280 152 12 56 chr5 121373070 121373173 -31164086 + MTC LTR MaLR 26 120 -301 8 1511 2280 152 12 56 chr5 121373363 121373671 -31163588 + MTC LTR MaLR 121 419 -2 8 1511 2235 138 45 13 chr5 121374624 121375006 -31162253 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 1511 945 249 43 4 chr5 121375616 121375870 -31161389 + RLTR42-int LTR ERVK 1137 1400 -4122 8 1511 1320 199 124 30 chr5 121380016 121380388 -31156871 + MTD LTR MaLR 13 419 0 8 1511 1911 244 147 35 chr5 121380388 121381260 -31155999 + MTD-int LTR MaLR 1 1083 -175 8 1511 1911 261 96 25 chr5 121381453 121381614 -31155645 + MTD-int LTR MaLR 1084 1257 -1 8 1511 909 264 160 3 chr5 121381614 121381919 -31155340 + MTD LTR MaLR 14 367 -52 8 1511 12444 84 25 41 chr5 121382535 121384410 -31152849 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1844 -4 8 1511 1450 151 243 12 chr5 121403118 121403460 -31133799 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1511 490 202 20 0 chr5 121408261 121408360 -31128899 + ORR1E LTR MaLR 18 118 -241 8 1511 654 299 46 62 chr5 121415522 121415683 -31121576 - MTC-int LTR MaLR -939 319 172 8 1511 654 299 46 62 chr5 121415750 121415912 -31121347 - MTC-int LTR MaLR -1087 171 1 8 1511 1095 188 45 45 chr5 121415927 121416172 -31121087 - MTD LTR MaLR -174 245 1 8 1511 537 301 33 75 chr5 121420393 121420684 -31116575 + MLT1H1 LTR MaLR 216 552 -3 9 1511 484 315 96 60 chr5 121425514 121425846 -31111413 - MTE2b LTR MaLR -1 378 7 9 1511 412 359 43 14 chr5 121438416 121438625 -31098634 + MLT1K LTR MaLR 54 268 -327 9 1511 310 302 87 74 chr5 121440940 121441169 -31096090 + LTR33 LTR ERVL 3 234 -281 9 1511 3392 20 0 2 chr5 121443131 121443528 -31093731 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1511 272 322 34 11 chr5 121450549 121450637 -31086622 + ORR1E LTR MaLR 269 358 -1 9 1511 1520 189 200 27 chr5 121451761 121452207 -31085052 + MT2A LTR ERVL 1 523 -10 9 1511 1208 218 83 34 chr5 121463114 121463441 -31073818 - MTD LTR MaLR -45 374 32 9 1511 249 304 25 0 chr5 121463841 121463920 -31073339 + MLT1D LTR MaLR 408 488 -17 9 1511 301 317 0 82 chr5 121467455 121467613 -31069646 - MLT1B LTR MaLR -187 203 59 1 1511 253 264 79 35 chr5 121467974 121468088 -31069171 + LTR16B2 LTR ERVL 190 308 -154 1 1511 284 309 223 6 chr5 121468789 121468955 -31068304 + MLT1K LTR MaLR 281 482 -113 1 1511 425 260 135 52 chr5 121470689 121470977 -31066282 + MLT1H LTR MaLR 38 349 -200 1 1511 254 301 182 28 chr5 121473971 121474152 -31063107 + RLTR24 LTR ERV1 321 529 0 1 1511 276 299 180 73 chr5 121476372 121476700 -31060559 - ORR1E LTR MaLR 0 370 8 1 1511 2627 28 28 0 chr5 121485614 121485932 -31051327 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 1 1511 620 168 113 0 chr5 121490930 121491078 -31046181 + ORR1D1 LTR MaLR 214 394 0 1 1511 272 394 15 8 chr5 121491734 121491867 -31045392 + LTR85c LTR Gypsy? 685 818 -5 1 1511 324 335 55 77 chr5 121492699 121492880 -31044379 - LTR33A_ LTR ERVL -16 515 339 1 1511 495 293 101 73 chr5 121497189 121497436 -31039823 - MLT1J LTR MaLR -12 500 247 1 1511 2946 108 91 26 chr5 121502434 121502928 -31034331 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 1 6 1511 424 249 153 17 chr5 121503426 121503602 -31033657 + RMER15 LTR ERVL 374 573 -2 8 1512 293 259 83 89 chr5 121503759 121503786 -31033473 + MT2B2 LTR ERVL 199 323 -261 1 1512 474 315 49 40 chr5 121508451 121508676 -31028583 - ORR1E LTR MaLR -122 237 11 2 1512 1397 191 132 66 chr5 121508805 121509198 -31028061 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1512 232 368 0 0 chr5 121510444 121510512 -31026747 - LTR16C LTR ERVL -259 230 163 2 1512 954 198 54 36 chr5 121511573 121511648 -31025611 - ORR1D1 LTR MaLR -164 210 171 3 1512 954 164 73 53 chr5 121511704 121511858 -31025401 - ORR1D1 LTR MaLR -204 170 2 3 1512 520 328 38 32 chr5 121511858 121512040 -31025219 + MLT1J LTR MaLR 86 268 -244 3 1512 347 323 12 83 chr5 121514857 121515026 -31022233 - LTR90B LTR LTR -484 312 156 3 1512 2355 64 0 153 chr5 121519916 121520302 -31016957 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1512 1158 268 87 32 chr5 121521048 121521395 -31015864 - MTE2a LTR MaLR 0 379 14 5 1512 810 237 152 27 chr5 121522205 121522461 -31014798 - MTD LTR MaLR -109 310 23 6 1512 3149 47 42 0 chr5 121523561 121523941 -31013318 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1512 8449 38 21 9 chr5 121523941 121524675 -31012584 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 351 6 1512 1680 125 30 63 chr5 121524675 121525008 -31012251 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1512 8449 38 21 9 chr5 121525008 121525358 -31011901 - MTA_Mm-int LTR MaLR -748 350 1 6 1512 389 41 0 0 chr5 121525366 121525415 -31011844 - MTD LTR MaLR -347 49 1 6 1512 312 342 70 26 chr5 121528399 121528555 -31008704 - LTR16E1 LTR ERVL -17 521 359 7 1512 663 344 87 23 chr5 121531167 121531512 -31005747 + MLT1G1 LTR MaLR 173 539 -40 7 1512 704 261 147 39 chr5 121533368 121533672 -31003587 - ORR1E LTR MaLR -4 375 20 8 1512 1284 235 32 47 chr5 121533662 121534041 -31003218 + MTE2a LTR MaLR 36 405 -14 8 1512 1897 139 140 17 chr5 121536802 121537152 -31000107 - MTC LTR MaLR -28 393 1 9 1512 401 228 101 95 chr5 121538727 121538804 -30998455 + MT2B2 LTR ERVL 78 155 -429 9 1512 840 301 44 83 chr5 121540358 121540802 -30996457 + MTD LTR MaLR 1 421 0 1 1512 251 261 156 22 chr5 121541404 121541494 -30995765 - MTEb LTR MaLR 0 379 278 1 1512 1615 209 24 14 chr5 121541572 121541889 -30995370 - MTEb LTR MaLR -74 305 1 1 1512 408 299 86 5 chr5 121541895 121542093 -30995166 - MLT1D LTR MaLR -289 216 3 1 1512 232 225 104 104 chr5 121545284 121545436 -30991823 + RMER15 LTR ERVL 309 460 -115 1 1512 1031 254 82 52 chr5 121546888 121547254 -30990005 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 1 1512 2640 158 9 14 chr5 121548576 121548999 -30988260 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1512 315 214 26 88 chr5 121549517 121549630 -30987629 + MT2B LTR ERVL 167 272 -329 1 1512 1897 152 15 38 chr5 121556994 121557335 -30979924 + RLTR14 LTR ERV1 1 333 -49 1 1512 320 155 0 49 chr5 121557418 121557479 -30979780 + RLTR14 LTR ERV1 317 374 -8 1 1512 3282 30 5 0 chr5 121557709 121558103 -30979156 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1512 2157 134 88 13 chr5 121560757 121561142 -30976117 - MTC LTR MaLR -7 414 1 1 1512 387 291 31 52 chr5 121567850 121568033 -30969226 - MTEa LTR MaLR -10 369 186 1 1512 865 264 179 6 chr5 121568391 121568738 -30968521 - MTD LTR MaLR -10 409 3 1 1512 738 259 205 30 chr5 121578710 121579012 -30958247 + MTD LTR MaLR 45 399 -20 2 1512 227 311 159 12 chr5 121579403 121579566 -30957693 + RMER15 LTR ERVL 324 510 -65 2 1512 494 184 0 39 chr5 121588666 121588768 -30948491 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 98 -377 2 1512 341 220 8 128 chr5 121597713 121597730 -30939529 + MT2B LTR ERVL 156 157 -444 2 1512 2219 206 27 0 chr5 121615743 121616150 -30921109 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 2 1512 257 221 77 87 chr5 121626494 121626518 -30910741 + MT2B LTR ERVL 209 311 -290 3 1513 274 364 5 80 chr5 121636301 121636429 -30900830 - MT2B2 LTR ERVL -427 157 46 3 1513 2881 115 73 32 chr5 121636549 121636799 -30900460 + RLTR28 LTR ERVL 1 258 -266 3 1513 2881 115 73 32 chr5 121636927 121637170 -30900089 + RLTR28 LTR ERVL 259 514 -10 3 1513 532 144 31 113 chr5 121645907 121646102 -30891157 + RMER17C LTR ERVK 97 275 -135 4 1513 1482 201 194 97 chr5 121649409 121649848 -30887411 + MT2A LTR ERVL 3 489 -44 4 1513 1482 201 194 97 chr5 121649877 121649921 -30887338 + MT2A LTR ERVL 490 533 0 4 1513 1111 0 0 0 chr5 121651310 121651434 -30885825 + MT2_Mm LTR ERVL 192 315 -178 4 1513 412 185 37 0 chr5 121658276 121658357 -30878902 - MT2B LTR ERVL -361 240 157 4 1513 471 202 149 0 chr5 121659214 121659328 -30877931 - RLTR14 LTR ERV1 -41 341 211 4 1513 649 123 19 9 chr5 121662875 121662982 -30874277 - ORR1D1 LTR MaLR -266 108 1 4 1513 2192 66 39 2 chr5 121664970 121665286 -30871973 - RLTR13C2 LTR ERVK -167 866 501 4 1513 1041 78 0 21 chr5 121673396 121673541 -30863718 + ETnERV3-int LTR ERVK 4801 4942 -866 5 1513 1913 124 21 39 chr5 121673744 121674014 -30863245 + ETnERV3-int LTR ERVK 4928 5187 -621 5 1513 1913 124 21 39 chr5 121674206 121674270 -30862989 + ETnERV3-int LTR ERVK 5188 5256 -552 5 1513 3968 43 8 4 chr5 121675230 121675718 -30861541 - RLTR13C2 LTR ERVK -107 701 212 5 1513 360 235 47 59 chr5 121677449 121677702 -30859557 + RMER17D LTR ERVK 210 459 -430 5 1513 229 213 78 47 chr5 121678221 121678285 -30858974 + RLTR9A2 LTR ERVK 232 297 -86 5 1513 767 184 179 0 chr5 121682660 121682837 -30854422 + MTD LTR MaLR 1 209 -210 5 1513 244 266 57 92 chr5 121687973 121688114 -30849145 + MER74B LTR ERVL 13 148 -474 5 1513 278 256 77 0 chr5 121706047 121706125 -30831134 - RMER15 LTR ERVL -121 454 371 6 1513 2004 165 102 16 chr5 121717915 121717956 -30819303 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 336 6 1513 2004 165 102 16 chr5 121718102 121718423 -30818836 - ORR1B1 LTR MaLR -59 335 2 6 1513 228 333 31 94 chr5 121718515 121718582 -30818677 - MT2B LTR ERVL -356 245 97 6 1513 793 163 258 0 chr5 121719224 121719402 -30817857 - MTD LTR MaLR 0 419 196 6 1513 2527 23 13 0 chr5 121721459 121721762 -30815497 - ORR1A0 LTR MaLR -39 307 1 6 1513 3167 29 0 0 chr5 121721762 121722136 -30815123 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1419 6 1513 590 195 92 15 chr5 121727883 121728013 -30809246 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 231 7 1513 624 256 88 12 chr5 121728425 121728593 -30808666 - ORR1D2 LTR MaLR -161 209 29 7 1513 1561 208 206 6 chr5 121730177 121730526 -30806733 - MTC LTR MaLR -2 419 1 7 1513 2072 81 84 39 chr5 121733308 121733641 -30803618 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 18 7 1513 287 28 0 0 chr5 121733655 121733691 -30803568 - RLTR10B2 LTR ERVK -256 36 1 7 1513 235 352 29 66 chr5 121737883 121738020 -30799239 - MLT1E1 LTR MaLR -331 323 192 7 1513 794 250 183 35 chr5 121741318 121741629 -30795630 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 7 1513 228 230 117 39 chr5 121753693 121753770 -30783489 - RNLTR23 LTR ERVK -356 286 204 7 1514 2644 87 43 60 chr5 121780127 121780545 -30756714 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 8 1514 979 204 117 4 chr5 121813326 121813557 -30723702 - ORR1C2 LTR MaLR -15 369 113 8 1514 420 247 22 135 chr5 121836838 121836893 -30700366 + MT2B LTR ERVL 107 141 -460 9 1514 1432 181 192 14 chr5 121840429 121840777 -30696482 + MTD LTR MaLR 10 419 0 9 1514 358 222 71 71 chr5 121844744 121844870 -30692389 + RLTR20C LTR ERVK 72 197 -337 9 1514 2016 180 133 99 chr5 121852840 121853507 -30683752 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 1 1514 2045 186 24 91 chr5 121855139 121855690 -30681569 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 514 -70 1 1514 333 284 107 107 chr5 121865979 121866176 -30671083 - MT2B LTR ERVL -316 285 89 1 1514 258 313 80 31 chr5 121887433 121887578 -30649681 - MT2B LTR ERVL -328 256 104 1 1515 1418 189 137 38 chr5 121903647 121904020 -30633239 + RMER10A LTR ERVL 1 410 -32 1 1515 440 280 43 50 chr5 121904038 121904177 -30633082 + MER54A LTR ERVL 156 293 -608 1 1515 377 291 47 54 chr5 121904690 121904830 -30632429 + MLT1B LTR MaLR 42 180 -210 1 1515 896 251 114 122 chr5 121906601 121906977 -30630282 + MTD LTR MaLR 47 419 0 1 1515 334 271 11 76 chr5 121907677 121907769 -30629490 - MT2B LTR ERVL -360 241 156 1 1515 1609 210 218 31 chr5 121909998 121910513 -30626746 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1515 323 274 57 102 chr5 121911404 121911668 -30625591 - RMER12 LTR ERVK -334 988 737 1 1515 1827 180 21 63 chr5 121919940 121920319 -30616940 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 16 1 1515 1609 132 217 0 chr5 121922425 121922706 -30614553 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 26 1 1515 1033 285 95 56 chr5 121925990 121926473 -30610786 - RLTR18B LTR ERVK -7 505 4 1 1515 5830 12 4 1 chr5 121930610 121931287 -30605972 - MERVL-int LTR ERVL -1368 4117 3439 1 1515 799 200 126 29 chr5 121931666 121931772 -30605487 - RMER20B LTR ERVK -170 457 334 1 1515 936 214 216 14 chr5 121931855 121932130 -30605129 - RMER20B LTR ERVK -294 333 10 1 1515 292 214 84 14 chr5 121933496 121933567 -30603692 - RMER10A LTR ERVL -45 397 322 1 1515 1868 187 165 13 chr5 121935052 121935512 -30601747 - RLTR40 LTR ERVK -16 801 272 1 1515 3330 108 24 28 chr5 121940143 121940415 -30596844 - RLTR19C LTR ERVK -3 503 223 1 1515 3330 108 24 28 chr5 121940595 121940826 -30596433 - RLTR19C LTR ERVK -284 222 2 1 1515 447 214 0 0 chr5 121940876 121940960 -30596299 + MTC LTR MaLR 52 135 -286 1 1515 2516 203 88 23 chr5 121941870 121942470 -30594789 - RMER12 LTR ERVK -683 639 1 1 1515 2045 194 316 14 chr5 121954149 121954804 -30582455 + RMER21A LTR ERV1 3 834 -8 1 1515 363 206 15 0 chr5 121957913 121957981 -30579278 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 302 1 1515 360 243 15 116 chr5 121958127 121958262 -30578997 - ORR1D2 LTR MaLR -55 339 217 1 1515 238 331 73 67 chr5 121958426 121958468 -30578791 - ORR1D2 LTR MaLR -116 278 242 1 1515 530 288 167 17 chr5 121958573 121958766 -30578493 - ORR1D2 LTR MaLR -153 241 5 1 1515 3297 98 38 29 chr5 121959707 121960232 -30577027 - RMER6A LTR ERVK -225 531 2 1 1515 2871 91 206 8 chr5 121960793 121961278 -30575981 - MT2B LTR ERVL -20 581 1 1 1515 307 137 76 76 chr5 121965567 121965646 -30571613 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 431 1 1515 237 179 33 82 chr5 121968250 121968311 -30568948 - LTR65 LTR ERV1 -350 319 262 1 1515 321 245 28 75 chr5 121972302 121972408 -30564851 + MT2B LTR ERVL 163 263 -338 1 1515 440 219 207 18 chr5 121983762 121983923 -30553336 - RLTR11A LTR ERVK -303 225 24 1 1515 233 284 16 121 chr5 121984469 121984483 -30552776 + MT2B2 LTR ERVL 142 199 -385 1 1515 226 208 37 111 chr5 121985439 121985520 -30551739 + MT2B LTR ERVL 164 238 -363 1 1515 2059 107 17 0 chr5 121991008 121991308 -30545951 + ORR1A4 LTR MaLR 17 321 -8 1 1515 258 292 8 138 chr5 121993240 121993363 -30543896 - MT2B LTR ERVL -326 275 169 1 1515 1480 208 21 9 chr5 121996822 121997147 -30540112 - RLTR42-int LTR ERVK -4689 833 505 1 1515 2955 115 33 50 chr5 121997837 121998320 -30538939 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 1515 491 274 7 20 chr5 121998403 121998552 -30538707 - RLTR42-int LTR ERVK -5222 300 154 1 1515 1012 158 75 19 chr5 121999779 121999992 -30537267 - RMER12 LTR ERVK -29 1293 1069 1 1515 332 174 48 124 chr5 122000000 122000105 -30537154 - RMER12 LTR ERVK -268 1054 958 1 1515 1502 265 68 85 chr5 122000099 122000965 -30536294 - RMER12 LTR ERVK -390 1014 1 2 1515 302 227 0 129 chr5 122000986 122001087 -30536172 - MT2B LTR ERVL -361 240 153 4 1515 2209 91 25 9 chr5 122002751 122003072 -30534187 + ORR1A4 LTR MaLR 1 326 -3 5 1515 2165 129 3 0 chr5 122006277 122006603 -30530656 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1515 2521 162 102 10 chr5 122008227 122008737 -30528522 - MTC-int LTR MaLR -325 933 377 1 1515 514 193 209 29 chr5 122008895 122008981 -30528278 - MTC-int LTR MaLR -862 396 303 1 1515 2087 130 77 21 chr5 122008981 122009358 -30527901 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 2 1515 514 193 209 29 chr5 122009358 122009400 -30527859 - MTC-int LTR MaLR -956 302 243 1 1515 803 178 87 73 chr5 122009861 122010067 -30527192 - MTC-int LTR MaLR -1044 214 6 1 1515 479 194 10 20 chr5 122010067 122010167 -30527092 - MTC LTR MaLR -21 398 300 1 1515 1743 132 39 29 chr5 122010546 122010857 -30526402 - MTC LTR MaLR -106 315 2 1 1515 2365 117 35 2 chr5 122010886 122011282 -30525977 - RMER6A LTR ERVK -10 746 338 2 1515 1163 132 122 9 chr5 122011375 122011605 -30525654 + RLTR11A LTR ERVK 1 256 -272 3 1515 821 165 18 12 chr5 122011606 122011772 -30525487 - RMER17B LTR ERVK 0 958 792 3 1515 570 95 32 0 chr5 122011793 122011888 -30525371 + RLTR11A LTR ERVK 245 342 -186 3 1515 423 286 64 23 chr5 122012183 122012355 -30524904 + RLTR41 LTR ERV1 268 446 0 3 1515 1043 154 11 11 chr5 122012357 122012547 -30524712 + RLTR11A LTR ERVK 339 528 0 3 1515 2299 57 0 86 chr5 122012805 122013090 -30524169 + ORR1A2 LTR MaLR 1 271 -56 3 1515 2299 57 0 86 chr5 122013226 122013240 -30524019 + ORR1A2 LTR MaLR 272 272 -55 3 1515 2299 57 0 86 chr5 122013430 122013478 -30523781 + ORR1A2 LTR MaLR 272 319 -8 3 1515 482 265 79 12 chr5 122024307 122024471 -30512788 + ORR1E LTR MaLR 1 175 -184 5 1516 261 196 18 0 chr5 122030953 122031009 -30506250 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 433 6 1516 245 336 62 55 chr5 122031190 122031281 -30505978 - MLT1H1 LTR MaLR -362 193 104 6 1516 1833 147 31 11 chr5 122031281 122031633 -30505626 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 6 1516 245 336 62 55 chr5 122031633 122031686 -30505573 - MLT1H1 LTR MaLR -452 103 48 6 1516 4182 14 2 12 chr5 122033034 122033532 -30503727 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 1516 1207 184 130 22 chr5 122040336 122040697 -30496562 + RLTR16 LTR ERVK 102 501 -4 8 1516 2781 77 28 3 chr5 122046729 122047119 -30490140 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1516 661 272 100 30 chr5 122050228 122050491 -30486768 + RMER5 LTR ERV1 11 292 -242 1 1516 2769 219 107 57 chr5 122050491 122051035 -30486224 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 540 -483 1 1516 2769 123 82 27 chr5 122051210 122051641 -30485618 + RLTR13D1 LTR ERVK 351 806 0 1 1516 1735 184 47 59 chr5 122052325 122052831 -30484428 + RLTR45-int LTR ERVK 3140 3460 -3946 1 1516 1980 165 25 61 chr5 122053024 122053469 -30483790 + RLTR45-int LTR ERVK 4596 5024 -2220 1 1516 624 227 113 5 chr5 122053575 122053761 -30483498 + RLTR18B LTR ERVK 301 506 -6 1 1516 311 292 24 89 chr5 122058221 122058263 -30478996 + MT2B LTR ERVL 125 158 -443 1 1516 282 289 45 123 chr5 122059042 122059297 -30477962 + MTEa LTR MaLR 56 285 -94 1 1516 736 234 46 31 chr5 122061406 122061666 -30475593 + MTD LTR MaLR 126 407 -14 1 1516 1698 214 52 46 chr5 122063168 122063644 -30473615 + RLTR1C LTR ERV1 25 503 0 1 1516 426 298 92 74 chr5 122064932 122065215 -30472044 - ORR1E LTR MaLR 0 359 72 1 1516 785 268 142 31 chr5 122073018 122073369 -30463890 + RMER5 LTR ERV1 11 400 -134 1 1516 929 218 61 171 chr5 122074978 122075147 -30462112 + RLTR18B LTR ERVK 128 284 -228 1 1516 929 218 61 171 chr5 122075297 122075553 -30461706 + RLTR18B LTR ERVK 285 506 -6 1 1516 1547 214 65 37 chr5 122104917 122105300 -30431959 + MTD LTR MaLR 12 405 -14 2 1516 375 305 92 74 chr5 122106889 122107172 -30430087 - ORR1E LTR MaLR 0 359 72 2 1516 302 236 0 147 chr5 122118123 122118232 -30419027 - MT2B2 LTR ERVL -330 254 162 3 1516 681 231 259 67 chr5 122118608 122118984 -30418275 - RMER4B LTR ERVK -137 448 1 3 1516 3749 9 128 0 chr5 122126248 122126685 -30410574 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1516 1781 129 46 109 chr5 122148775 122148849 -30388410 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 281 4 1516 1781 129 46 109 chr5 122148998 122149271 -30387988 - ORR1A3 LTR MaLR -46 280 1 4 1516 283 276 8 0 chr5 122154047 122154171 -30383088 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 630 4 1516 262 320 121 16 chr5 122158499 122158623 -30378636 - MLT1F1 LTR MaLR -106 463 327 4 1517 239 200 76 51 chr5 122160446 122160525 -30376734 - MT2B LTR ERVL -369 232 152 4 1517 266 302 92 0 chr5 122166292 122166324 -30370935 + MT2B2 LTR ERVL 161 287 -297 5 1517 248 283 37 83 chr5 122172282 122172390 -30364869 - MT2B LTR ERVL -345 256 154 5 1517 3257 31 26 8 chr5 122198244 122198633 -30338626 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1517 1812 123 3 3 chr5 122203615 122203900 -30333359 + ORR1A2 LTR MaLR 1 285 -42 6 1517 388 58 0 0 chr5 122204119 122204171 -30333088 + ORR1A2 LTR MaLR 272 323 -3 6 1517 328 358 60 30 chr5 122210624 122210791 -30326468 - RMER15 LTR ERVL -102 473 302 6 1517 1197 162 22 22 chr5 122210908 122211135 -30326124 - ORR1C1 LTR MaLR -5 373 147 6 1517 529 299 31 62 chr5 122212223 122212483 -30324776 + MTD LTR MaLR 45 296 -123 6 1517 1755 172 88 11 chr5 122220005 122220369 -30316890 - RLTR17 LTR ERVK -98 594 203 6 1517 402 67 0 0 chr5 122220369 122220429 -30316830 - BGLII_B LTR ERVK -381 60 1 6 1517 244 309 29 67 chr5 122223257 122223361 -30313898 + MT2B LTR ERVL 152 251 -350 7 1517 3312 158 107 10 chr5 122225799 122226417 -30310842 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 7 1517 259 299 0 93 chr5 122227145 122227252 -30310007 - MT2B2 LTR ERVL -334 250 154 7 1517 330 281 16 55 chr5 122228400 122228528 -30308731 + RLTR25B LTR ERVK 399 521 -507 7 1517 3954 36 19 8 chr5 122243410 122243880 -30293379 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 7 1518 233 162 0 0 chr5 122291865 122291902 -30245357 + MLT1H LTR MaLR 513 549 0 8 1518 535 261 0 9 chr5 122294165 122294281 -30242978 - MTC LTR MaLR 0 421 307 8 1518 3419 38 2 5 chr5 122297007 122297404 -30239855 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1518 512 322 99 2 chr5 122311997 122312298 -30224961 + MTD LTR MaLR 46 405 -14 8 1518 227 345 72 0 chr5 122315304 122315435 -30221824 + ORR1E LTR MaLR 1 141 -218 9 1518 227 250 14 130 chr5 122318723 122318861 -30218398 - RLTR47_MM LTR ERV1 -386 146 25 9 1518 227 301 56 66 chr5 122324260 122324331 -30212928 - RMER17D LTR ERVK -357 532 458 9 1518 227 301 56 66 chr5 122324352 122324476 -30212783 - RMER17D LTR ERVK -432 457 339 9 1518 229 318 67 11 chr5 122325569 122325658 -30211601 + RLTR24 LTR ERV1 28 121 -408 9 1518 1544 187 88 29 chr5 122326259 122326622 -30210637 + MTD LTR MaLR 1 365 -14 9 1518 2354 149 161 12 chr5 122331579 122332075 -30205184 + RMER4B LTR ERVK 1 570 -15 9 1518 2415 149 44 19 chr5 122336114 122336525 -30200734 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1518 276 211 77 26 chr5 122337140 122337218 -30200041 + RMER10A LTR ERVL 318 399 -43 9 1518 1092 187 19 126 chr5 122338002 122338205 -30199054 + ORR1D1 LTR MaLR 1 172 -202 9 1518 1092 187 19 126 chr5 122338374 122338486 -30198773 + ORR1D1 LTR MaLR 173 284 -90 9 1518 284 274 67 71 chr5 122347400 122347655 -30189604 + RLTR21 LTR ERVK 1062 1315 -257 9 1518 3532 70 31 40 chr5 122364896 122365375 -30171884 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 1518 297 336 115 0 chr5 122417359 122417481 -30119778 + MLT1B LTR MaLR 1 136 -254 1 1519 296 224 64 22 chr5 122421673 122421765 -30115494 - MLT1B LTR MaLR -243 224 129 1 1519 379 257 0 71 chr5 122428989 122429031 -30108228 + MT2B LTR ERVL 129 249 -352 1 1519 260 347 82 24 chr5 122429349 122429556 -30107703 + ERVL-int LTR ERVL 1331 1549 -4208 1 1519 384 252 12 107 chr5 122432916 122432976 -30104283 + MT2B LTR ERVL 112 155 -446 1 1519 3345 43 0 8 chr5 122436438 122436837 -30100422 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1519 2015 97 3 70 chr5 122455965 122456321 -30080938 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 1 1519 2368 149 121 25 chr5 122461473 122461883 -30075376 + RLTR11A LTR ERVK 2 456 -72 1 1519 2368 149 121 25 chr5 122461932 122462002 -30075257 + RLTR11A LTR ERVK 457 528 0 1 1519 424 251 15 8 chr5 122471338 122471476 -30065783 - MTD LTR MaLR -207 193 50 1 1519 344 290 73 37 chr5 122475215 122475351 -30061908 - MLT1K LTR MaLR -252 343 203 1 1519 709 260 93 57 chr5 122476745 122477079 -30060180 - ORR1E LTR MaLR -5 354 9 1 1519 2075 112 11 103 chr5 122479404 122479763 -30057496 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1519 292 269 57 19 chr5 122484203 122484309 -30052950 + MLT1G3 LTR MaLR 15 124 -471 1 1519 296 296 70 24 chr5 122486296 122486474 -30050785 - MTEa LTR MaLR -4 375 169 1 1519 530 303 87 55 chr5 122488717 122489028 -30048231 - ORR1E LTR MaLR -32 327 7 1 1519 440 283 70 20 chr5 122504549 122504733 -30032526 + LTR33 LTR ERVL 13 214 -301 1 1519 336 197 26 26 chr5 122514626 122514704 -30022555 + MTEa LTR MaLR 302 379 0 3 1519 268 306 0 27 chr5 122514734 122514808 -30022451 - MLT1L LTR MaLR -338 272 201 3 1519 345 302 0 40 chr5 122522148 122522248 -30015011 - MLT1K LTR MaLR -335 260 165 5 1519 403 235 19 38 chr5 122525766 122525872 -30011387 - MTC LTR MaLR -180 241 138 6 1519 569 301 62 29 chr5 122527163 122527435 -30009824 + RMER20B LTR ERVK 140 419 -208 7 1519 2675 131 0 14 chr5 122528514 122528931 -30008328 + MTC LTR MaLR 11 421 0 7 1519 540 298 27 94 chr5 122534033 122534212 -30003047 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 174 9 1519 540 298 27 94 chr5 122534568 122534759 -30002500 - ORR1A0 LTR MaLR -173 173 1 9 1519 2582 189 126 25 chr5 122536496 122536562 -30000697 + RMER19C LTR ERVK 1 65 -546 1 1519 2582 189 126 25 chr5 122536748 122537236 -30000023 + RMER19C LTR ERVK 66 610 -1 1 1519 444 123 0 40 chr5 122537236 122537312 -29999947 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1 73 -5707 1 1519 3417 50 2 0 chr5 122537703 122538102 -29999157 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1519 1194 184 37 11 chr5 122538385 122538548 -29998711 + ORR1D1 LTR MaLR 1 162 -212 1 1519 1194 205 41 17 chr5 122538590 122538733 -29998526 + ORR1D1 LTR MaLR 163 312 -58 1 1519 781 223 290 10 chr5 122541543 122541846 -29995413 - MTD LTR MaLR -14 405 18 1 1519 2101 114 42 6 chr5 122541864 122542217 -29995042 + RMER6A LTR ERVK 11 376 -380 1 1519 355 256 22 104 chr5 122545144 122545160 -29992099 + MT2B LTR ERVL 153 157 -444 1 1519 328 290 9 108 chr5 122547398 122547581 -29989678 - MLT1A LTR MaLR -245 163 1 1 1519 285 287 43 0 chr5 122548302 122548396 -29988863 + MLT1D LTR MaLR 272 369 -136 1 1520 2181 96 4 6 chr5 122569352 122569670 -29967589 + ORR1A2 LTR MaLR 1 368 -11 2 1520 1288 239 61 0 chr5 122570561 122570858 -29966401 - RLTR12A LTR ERVK -253 315 1 2 1520 4687 144 70 5 chr5 122571678 122572525 -29964734 + RMER13B LTR ERVK 7 908 0 2 1520 2916 52 3 0 chr5 122573177 122573522 -29963737 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1520 264 202 148 20 chr5 122576868 122576969 -29960290 - MTE-int LTR MaLR -231 1349 1236 2 1520 234 308 16 70 chr5 122584679 122584808 -29952451 - MT2B LTR ERVL -330 271 150 2 1520 493 217 19 19 chr5 122587449 122587557 -29949702 - MER77 LTR ERVL -497 110 3 2 1520 291 293 134 51 chr5 122587706 122587922 -29949337 + MLT1H2 LTR MaLR 212 445 -44 2 1520 320 277 220 0 chr5 122587959 122588136 -29949123 + MLT1L LTR MaLR 307 522 -88 2 1520 1694 190 163 32 chr5 122590700 122591136 -29946123 - MT2A LTR ERVL -40 493 1 2 1520 246 339 29 72 chr5 122594235 122594442 -29942817 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 67 2 1520 584 135 9 55 chr5 122595036 122595146 -29942113 - RLTR28 LTR ERVL -419 105 1 2 1520 226 316 86 43 chr5 122597093 122597195 -29940064 + ORR1E LTR MaLR 6 111 -248 2 1520 226 316 86 43 chr5 122597374 122597433 -29939826 + ORR1E LTR MaLR 112 173 -186 2 1520 297 111 0 0 chr5 122597690 122597735 -29939524 - RMER10B LTR ERVL -6 392 348 2 1520 1658 148 32 82 chr5 122598028 122598404 -29938855 - RMER10B LTR ERVL -41 357 1 2 1520 1927 148 57 39 chr5 122599408 122599794 -29937465 + RMER10B LTR ERVL 2 394 -4 3 1520 1483 192 68 141 chr5 122600740 122601236 -29936023 + RMER4A LTR ERVK 1 460 -6 3 1520 235 282 0 66 chr5 122612445 122612536 -29924723 + MT2B2 LTR ERVL 155 239 -345 3 1520 1330 228 179 38 chr5 122630525 122631027 -29906232 - RMER4B LTR ERVK -12 573 1 3 1520 1027 179 137 0 chr5 122636663 122636897 -29900362 - MTD LTR MaLR 0 419 154 4 1520 1602 161 210 0 chr5 122641918 122642266 -29894993 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1520 6201 30 1 0 chr5 122642855 122643596 -29893663 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 4 1520 49389 15 1 0 chr5 122643596 122649291 -29887968 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1 5702 -1899 4 1520 1778 15 0 0 chr5 122649272 122649476 -29887783 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 7398 7601 0 4 1520 6201 30 1 0 chr5 122649476 122650217 -29887042 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 4 1520 4663 119 71 26 chr5 122650839 122651695 -29885564 + RMER17A2 LTR ERVK 1 895 -11 4 1520 803 87 8 38 chr5 122656237 122656369 -29880890 - RLTR15 LTR ERVK -11 348 221 4 1520 1223 158 9 0 chr5 122656551 122656766 -29880493 - RLTR15 LTR ERVK -124 235 19 4 1520 660 252 197 85 chr5 122658077 122658407 -29878852 - MTE2a LTR MaLR 0 379 13 4 1520 353 284 67 52 chr5 122670459 122670652 -29866607 - MER68 LTR ERVL -118 445 250 4 1520 1966 197 67 23 chr5 122678020 122678558 -29858701 - RMER6A LTR ERVK -12 744 60 5 1520 822 134 215 0 chr5 122678582 122678629 -29858630 - RMER6A LTR ERVK -402 59 3 5 1520 1825 221 122 70 chr5 122682104 122682717 -29854542 - RLTR40 LTR ERVK -15 802 158 5 1521 2551 152 118 15 chr5 122694811 122695286 -29841973 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 5 1521 1067 163 57 26 chr5 122705081 122705308 -29831951 + RMER15 LTR ERVL 1 234 -341 5 1521 312 136 0 57 chr5 122717936 122718006 -29819253 + ORR1B1 LTR MaLR 49 114 -280 6 1521 704 123 107 8 chr5 122719578 122719709 -29817550 - RMER15 LTR ERVL -48 527 384 6 1521 389 256 36 94 chr5 122723602 122723740 -29813519 - MT2B LTR ERVL -345 256 127 6 1521 369 361 64 23 chr5 122725167 122725385 -29811874 - MLT1K LTR MaLR -218 377 151 6 1521 312 262 24 132 chr5 122726334 122726376 -29810883 - MT2B LTR ERVL -318 282 135 6 1521 366 182 320 120 chr5 122726455 122726693 -29810566 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 287 -281 6 1521 386 261 83 21 chr5 122726668 122726738 -29810521 + RLTR20A2 LTR ERVK 411 480 -98 6 1521 386 261 83 21 chr5 122726797 122726871 -29810388 + RLTR20A2 LTR ERVK 481 564 -14 6 1521 2495 153 145 17 chr5 122727189 122727707 -29809552 - RMER4B LTR ERVK 0 585 2 6 1521 629 164 9 42 chr5 122727911 122728062 -29809197 - MTE2b LTR MaLR -32 347 198 6 1521 455 236 17 119 chr5 122728138 122728323 -29808936 - MTE2b LTR MaLR -97 282 102 6 1521 1736 119 52 87 chr5 122746703 122747070 -29790189 - MTC LTR MaLR 0 421 68 6 1521 344 194 68 120 chr5 122758371 122758488 -29778771 - MT2B LTR ERVL -344 257 147 7 1521 2885 199 102 69 chr5 122768766 122769634 -29767625 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 1033 1 7 1521 1269 184 165 6 chr5 122782131 122782453 -29754806 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 7 1521 267 337 71 66 chr5 122784936 122785133 -29752126 + MLT1H2 LTR MaLR 285 482 -7 7 1521 902 221 219 18 chr5 122790205 122790517 -29746742 + ORR1D1 LTR MaLR 1 400 0 8 1521 262 220 34 0 chr5 122790771 122790830 -29746429 + ORR1D2 LTR MaLR 307 367 -3 8 1521 2807 52 91 3 chr5 122792173 122792537 -29744722 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1521 353 331 81 0 chr5 122792636 122792796 -29744463 + MLT1F2 LTR MaLR 26 198 -362 8 1521 364 298 171 9 chr5 122792859 122793069 -29744190 + MLT1F2 LTR MaLR 316 559 -1 8 1521 270 304 216 73 chr5 122795549 122795884 -29741375 - MLT1F1 LTR MaLR -8 561 140 8 1521 253 303 223 73 chr5 122796084 122796154 -29741105 - MLT1F1 LTR MaLR -410 139 79 8 1521 327 265 0 143 chr5 122814071 122814190 -29723069 - MT2B LTR ERVL -347 254 153 8 1522 1666 213 109 46 chr5 122817772 122818249 -29719010 + RLTR18B LTR ERVK 2 508 -4 8 1522 2945 34 6 0 chr5 122827868 122828220 -29709039 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 43 9 1522 4404 16 0 35 chr5 122833286 122833797 -29703462 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 9 1522 305 0 0 0 chr5 122833797 122833835 -29703424 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 9 1522 385 151 13 40 chr5 122833835 122833911 -29703348 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 9 1522 46299 15 6 0 chr5 122833911 122839249 -29698010 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 1 9 1522 4404 16 0 35 chr5 122839249 122839760 -29697499 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 9 1522 318 227 23 141 chr5 122840732 122840860 -29696399 + MT2B LTR ERVL 152 264 -337 9 1522 3302 56 5 0 chr5 122845762 122846156 -29691103 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1522 345 240 122 15 chr5 122860565 122860696 -29676563 - RMER17C LTR ERVK -30 380 236 1 1522 267 327 0 106 chr5 122863400 122863513 -29673746 + MT2B LTR ERVL 177 277 -324 1 1522 258 268 80 30 chr5 122863558 122863658 -29673601 - RMER5 LTR ERV1 -410 124 20 1 1522 5077 101 31 30 chr5 122864978 122865786 -29671473 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 1 1522 2470 134 10 41 chr5 122868044 122868456 -29668803 - RLTR1D LTR ERV1 -16 589 191 1 1522 2334 58 58 0 chr5 122868440 122868750 -29668509 + RLTR10C LTR ERVK 109 436 0 1 1522 3490 72 50 6 chr5 122868750 122869253 -29668006 - RLTR10-int LTR ERVK -175 1812 1288 1 1522 1415 96 5 5 chr5 122869256 122869465 -29667794 - IAP-d-int LTR ERVK -667 5875 5667 1 1522 3374 59 95 17 chr5 122869469 122869952 -29667307 - IAP-d-int LTR ERVK -1015 5527 5007 1 1522 688 209 26 0 chr5 122869952 122870105 -29667154 - IAP-d-int LTR ERVK -6039 503 347 1 1522 2243 78 3 20 chr5 122870099 122870478 -29666781 - IAP-d-int LTR ERVK -1381 606 54 1 1522 2977 66 43 15 chr5 122870478 122870877 -29666382 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 2 1 1522 3327 38 2 10 chr5 122874633 122875032 -29662227 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1522 298 242 0 16 chr5 122879258 122879380 -29657879 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 635 1 1522 1533 148 148 0 chr5 122880035 122880313 -29656946 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 76 1 1522 509 114 0 83 chr5 122880456 122880552 -29656707 - ORR1B1 LTR MaLR -305 89 2 1 1522 464 147 88 105 chr5 122884920 122885034 -29652225 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 1 1522 732 174 241 140 chr5 122895551 122895858 -29641401 - ORR1C2 LTR MaLR -16 368 31 1 1522 299 283 180 79 chr5 122913947 122914263 -29622996 - MTE2b LTR MaLR 0 379 6 1 1522 1449 139 260 43 chr5 122920783 122921083 -29616176 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 1 1522 1332 125 274 12 chr5 122923489 122923814 -29613445 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 1522 320 257 85 111 chr5 122931072 122931225 -29606034 + MT2B2 LTR ERVL 167 315 -269 1 1522 229 266 28 138 chr5 122935250 122935359 -29601900 + MT2B LTR ERVL 155 251 -350 1 1522 295 246 24 134 chr5 122941298 122941425 -29595834 - MT2B LTR ERVL -343 258 146 1 1523 357 85 0 0 chr5 122957149 122957196 -29580063 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 340 1 1523 2125 130 62 1 chr5 122957397 122957738 -29579521 - ORR1B1 LTR MaLR -42 352 1 1 1523 1906 132 65 16 chr5 122958117 122958304 -29578955 - ORR1B1 LTR MaLR -22 372 186 1 1523 1906 132 65 16 chr5 122958374 122958508 -29578751 - ORR1B1 LTR MaLR -209 185 35 1 1523 412 272 91 8 chr5 122978913 122979113 -29558146 + MLT1C LTR MaLR 267 467 0 1 1523 599 227 31 43 chr5 122981129 122981290 -29555969 + RMER15 LTR ERVL 1 159 -416 1 1523 571 244 189 5 chr5 122981404 122981589 -29555670 + RMER15 LTR ERVL 341 559 -16 1 1523 1360 225 107 11 chr5 123007398 123007762 -29529497 + MTD LTR MaLR 14 412 -7 2 1523 310 258 9 102 chr5 123009495 123009603 -29527656 + MT2B LTR ERVL 161 258 -343 2 1523 1989 101 52 0 chr5 123013943 123014249 -29523010 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 4 1523 632 143 0 0 chr5 123028937 123029042 -29508217 + ORR1C2 LTR MaLR 1 105 -279 8 1523 3956 154 79 70 chr5 123030809 123031691 -29505568 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 9 1523 326 178 70 122 chr5 123045184 123045299 -29491960 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 1 1523 2350 168 103 32 chr5 123046739 123046920 -29490339 + RMER15 LTR ERVL 1 177 -398 1 1523 1234 211 168 141 chr5 123046920 123047439 -29489820 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 1 1523 2350 168 103 32 chr5 123047439 123047793 -29489466 + RMER15 LTR ERVL 178 574 -1 1 1523 1128 210 129 25 chr5 123065818 123066096 -29471163 + MTD LTR MaLR 113 419 0 1 1523 284 343 68 62 chr5 123068743 123068920 -29468339 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 355 532 -252 1 1523 2007 136 29 27 chr5 123072114 123072563 -29464696 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 1 1523 592 207 267 8 chr5 123073373 123073594 -29463665 - ORR1E LTR MaLR -2 377 75 2 1523 229 292 45 15 chr5 123073938 123073978 -29463281 + ORR1B1-int LTR MaLR 604 647 -862 2 1523 241 314 135 82 chr5 123075098 123075268 -29461991 - MLT1K LTR MaLR -229 366 188 2 1523 333 281 32 35 chr5 123075968 123076094 -29461165 + MLT1L LTR MaLR 98 245 -365 2 1524 482 326 55 72 chr5 123077761 123077996 -29459263 + MTE2b LTR MaLR 1 231 -148 2 1524 542 267 6 68 chr5 123078149 123078256 -29459003 + MTE2b LTR MaLR 195 297 -82 2 1524 6593 109 12 26 chr5 123078256 123079224 -29458035 - RMER17B LTR ERVK -3 955 1 2 1524 542 267 6 68 chr5 123079224 123079277 -29457982 + MTE2b LTR MaLR 298 345 -34 2 1524 4498 129 76 97 chr5 123079736 123080657 -29456602 + RMER17A2 LTR ERVK 1 902 -4 2 1524 933 148 136 0 chr5 123081249 123081418 -29455841 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 192 2 1524 773 125 59 4 chr5 123081442 123081526 -29455733 - ORR1C2 LTR MaLR -190 184 171 2 1524 2598 83 0 0 chr5 123082171 123082497 -29454762 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1524 3080 29 0 6 chr5 123083818 123084166 -29453093 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1524 261 164 210 16 chr5 123088460 123088522 -29448737 - LTR65 LTR ERV1 -546 123 50 2 1524 307 328 16 101 chr5 123090412 123090541 -29446718 + MLT1I LTR MaLR 6 123 -288 2 1524 372 219 113 10 chr5 123090647 123090744 -29446515 + MLT1I LTR MaLR 303 409 -2 2 1524 1502 129 185 122 chr5 123091017 123091369 -29445890 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 2 1524 253 218 114 13 chr5 123092659 123092738 -29444521 + LTR65 LTR ERV1 240 326 -343 2 1524 375 298 124 0 chr5 123093091 123093252 -29444007 + LTR65 LTR ERV1 487 667 -2 2 1524 296 301 65 93 chr5 123099848 123099944 -29437315 + MT2B2 LTR ERVL 69 158 -426 2 1524 338 289 103 28 chr5 123108932 123109039 -29428220 - RMER20B LTR ERVK -20 607 493 2 1524 686 249 127 35 chr5 123109494 123109723 -29427536 - RMER20B LTR ERVK -142 485 236 2 1524 726 305 171 59 chr5 123113695 123114099 -29423160 - MLT1F LTR MaLR -7 541 93 3 1524 554 297 38 61 chr5 123114888 123114954 -29422305 - MLT1D LTR MaLR 0 505 439 3 1524 554 280 33 45 chr5 123115145 123115349 -29421910 - MLT1D LTR MaLR -67 438 250 3 1524 583 252 187 108 chr5 123119729 123120156 -29417103 - MLT1C LTR MaLR -2 465 5 3 1524 641 336 102 75 chr5 123122204 123122751 -29414508 - MLT1K LTR MaLR -29 566 5 3 1524 315 256 44 117 chr5 123124546 123124582 -29412677 + MT2B2 LTR ERVL 128 251 -330 3 1524 333 338 46 26 chr5 123128173 123128325 -29408934 - MLT1C LTR MaLR -2 465 311 3 1524 259 297 118 25 chr5 123131705 123131948 -29405311 + MLT1G LTR MaLR 3 273 -318 3 1524 243 279 0 47 chr5 123132097 123132161 -29405098 + MLT1G LTR MaLR 519 579 0 3 1524 416 280 77 39 chr5 123134673 123134855 -29402404 + MT2B LTR ERVL 90 278 -323 3 1524 896 245 12 55 chr5 123135563 123135818 -29401441 + MTD LTR MaLR 18 261 -158 3 1524 309 134 6 23 chr5 123135846 123135906 -29401353 + MTD LTR MaLR 319 405 -14 3 1524 483 239 9 44 chr5 123135954 123136068 -29401191 + LTR53 LTR ERVL 340 449 -70 3 1524 821 168 26 78 chr5 123137004 123137232 -29400027 - ORR1B1 LTR MaLR -156 211 1 3 1524 5807 122 42 67 chr5 123137232 123138248 -29399011 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1792 851 3 1524 5807 109 43 50 chr5 123138395 123138637 -29398622 - ORR1B1-int LTR MaLR -937 1026 795 3 1524 270 188 0 72 chr5 123138640 123138709 -29398550 - ORR1A4 LTR MaLR -263 66 3 4 1524 620 257 192 40 chr5 123138818 123139094 -29398165 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 318 -157 4 1524 1959 176 38 27 chr5 123142410 123142790 -29394469 - ORR1B1 LTR MaLR -1 378 9 4 1524 313 255 85 14 chr5 123150887 123151033 -29386226 - MLT1M LTR MaLR -289 306 85 4 1524 2585 199 17 32 chr5 123155004 123155533 -29381726 + RLTR12B LTR ERVK 1 521 -7 4 1524 4583 52 13 2 chr5 123163203 123163757 -29373502 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 4 1524 229 394 15 30 chr5 123170699 123170830 -29366429 - MLT1K LTR MaLR -425 170 42 5 1524 378 318 221 33 chr5 123175674 123176067 -29361192 - MLT1C LTR MaLR 0 467 1 5 1524 404 285 171 55 chr5 123180041 123180334 -29356925 + MLT1A1 LTR MaLR 22 348 -17 5 1524 1497 67 17 30 chr5 123196876 123196898 -29340361 + MTB LTR MaLR 174 193 -207 5 1524 1497 67 17 30 chr5 123197081 123197287 -29339972 + MTB LTR MaLR 194 399 -1 5 1524 1005 233 189 0 chr5 123205952 123206270 -29330989 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 5 1525 748 128 72 0 chr5 123207888 123208013 -29329246 - RMER6A LTR ERVK 0 756 623 5 1525 356 152 36 48 chr5 123208009 123208092 -29329167 - RMER6A LTR ERVK -379 82 1 5 1525 311 292 17 94 chr5 123208371 123208488 -29328771 + MT2B LTR ERVL 151 258 -343 5 1525 2712 117 25 13 chr5 123210013 123210462 -29326797 + RMER12B LTR ERVK 1 454 -950 5 1525 259 198 43 75 chr5 123214994 123215087 -29322172 + RLTR25B LTR ERVK 441 530 -498 6 1525 250 252 226 8 chr5 123223534 123223658 -29313601 + MLT1K LTR MaLR 369 519 -76 6 1525 526 198 90 0 chr5 123230420 123230531 -29306728 - RMER15 LTR ERVL -18 557 437 6 1525 3189 129 115 7 chr5 123231706 123232252 -29305007 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 1 6 1525 240 159 23 0 chr5 123232520 123232564 -29304695 + RMER15 LTR ERVL 422 466 -109 6 1525 353 250 0 102 chr5 123240471 123240491 -29296768 + MT2B LTR ERVL 149 236 -365 6 1525 2273 207 37 23 chr5 123263776 123264290 -29272969 + RLTR20C LTR ERVK 3 523 -11 7 1525 248 317 114 46 chr5 123267561 123267736 -29269523 - LTR33 LTR ERVL -275 240 54 7 1525 2113 69 3 92 chr5 123273637 123273972 -29263287 + ORR1A2 LTR MaLR 8 312 -15 8 1525 257 234 15 15 chr5 123283083 123283148 -29254111 - MLT1K LTR MaLR -338 257 193 8 1525 3087 59 13 10 chr5 123283764 123284158 -29253101 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 8 1525 1248 150 68 11 chr5 123287684 123287947 -29249312 - RMER6C LTR ERVK -13 677 400 8 1525 2121 100 30 3 chr5 123288115 123288416 -29248843 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 8 1525 1654 110 101 14 chr5 123288460 123288756 -29248503 - RMER6C LTR ERVK -368 322 1 8 1525 1493 237 63 12 chr5 123291110 123291589 -29245670 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 8 1525 886 286 258 27 chr5 123292720 123293238 -29244021 + RMER13A LTR ERVK 191 827 -33 8 1525 399 141 0 0 chr5 123293642 123293706 -29243553 + RLTR23 LTR ERV1 5 68 -362 8 1525 319 250 55 46 chr5 123293818 123293927 -29243332 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 8 1525 433 253 52 73 chr5 123294120 123294312 -29242947 + RLTR23 LTR ERV1 239 426 -4 8 1525 2035 135 52 28 chr5 123296184 123296572 -29240687 + RMER6B LTR ERVK 6 402 -59 9 1525 1489 154 183 31 chr5 123302646 123303029 -29234230 - RMER10A LTR ERVL 0 442 2 9 1525 1946 157 106 14 chr5 123307126 123307476 -29229783 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 9 1525 1570 127 220 33 chr5 123310563 123310986 -29226273 - RMER6A LTR ERVK -254 502 1 9 1525 387 202 7 131 chr5 123311351 123311453 -29225806 - MT2B LTR ERVL -344 257 167 9 1525 387 202 7 131 chr5 123311656 123311690 -29225569 - MT2B LTR ERVL -435 166 138 9 1525 329 232 0 112 chr5 123312043 123312150 -29225109 - MT2B LTR ERVL -343 258 164 9 1525 340 241 55 87 chr5 123334862 123334876 -29202383 + MT2B LTR ERVL 157 218 -383 1 1525 340 241 55 87 chr5 123334978 123334989 -29202270 + MT2B LTR ERVL 219 279 -322 1 1526 366 311 98 30 chr5 123338882 123339117 -29198142 + MLT1C LTR MaLR 57 307 -160 1 1526 235 299 85 61 chr5 123358030 123358100 -29179159 - MT2B LTR ERVL -360 241 169 1 1526 235 299 85 61 chr5 123358270 123358281 -29178978 - MT2B LTR ERVL -433 168 158 1 1526 391 371 58 17 chr5 123360673 123360846 -29176413 - LTR33 LTR ERVL -244 271 92 1 1526 230 253 158 13 chr5 123361073 123361149 -29176110 + MLT1B LTR MaLR 302 388 -2 1 1526 930 114 8 0 chr5 123363140 123363191 -29174068 + MT2B2 LTR ERVL 209 260 -324 1 1526 651 210 0 0 chr5 123363321 123363445 -29173814 + RMER15-int LTR ERVL 2617 2740 -2259 1 1526 2001 72 15 4 chr5 123363457 123363724 -29173535 - MT2C_Mm LTR ERVL -205 270 1 1 1526 301 261 47 68 chr5 123363724 123363753 -29173506 - ORR1A3-int LTR MaLR -1347 616 591 1 1526 4982 232 93 51 chr5 123363758 123365355 -29171904 + RMER15-int LTR ERVL 2748 4412 -587 1 1526 290 238 0 16 chr5 123366408 123366425 -29170834 + ORR1B1-int LTR MaLR 633 647 -862 1 1526 271 240 35 130 chr5 123369511 123369626 -29167633 + MT2B LTR ERVL 176 279 -322 1 1526 612 351 75 40 chr5 123374156 123374503 -29162756 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1526 269 224 0 106 chr5 123382293 123382378 -29154881 + ORR1D-int LTR MaLR 519 594 -776 1 1526 442 286 99 74 chr5 123392040 123392282 -29144977 + MT2B LTR ERVL 31 278 -323 1 1526 2022 113 3 3 chr5 123392811 123393095 -29144164 + ORR1A2 LTR MaLR 1 284 -43 1 1526 272 231 140 47 chr5 123405662 123405812 -29131447 + RLTR21 LTR ERVK 1084 1247 -325 1 1526 431 256 233 60 chr5 123406128 123406461 -29130798 + MLT1F1 LTR MaLR 65 490 -79 1 1526 615 189 18 9 chr5 123411740 123411850 -29125409 + MTC LTR MaLR 1 111 -310 1 1526 1430 165 71 34 chr5 123412008 123412332 -29124927 + MTC LTR MaLR 84 380 -41 1 1526 1430 158 80 29 chr5 123412520 123412563 -29124696 + MTC LTR MaLR 381 421 0 1 1526 1647 254 13 63 chr5 123414459 123414934 -29122325 + RLTR16 LTR ERVK 1 451 -54 1 1526 238 312 25 82 chr5 123422749 123422766 -29114493 + MT2B LTR ERVL 149 158 -443 1 1526 409 234 63 115 chr5 123426911 123426978 -29110281 - MT2B LTR ERVL -451 150 93 1 1526 266 270 93 86 chr5 123429203 123429365 -29107894 + MLT1K LTR MaLR 406 568 -27 1 1526 359 268 17 67 chr5 123430505 123430625 -29106634 + MLT1A0 LTR MaLR 15 128 -237 1 1526 321 220 25 49 chr5 123430770 123430877 -29106382 + MTEb LTR MaLR 267 375 -4 1 1526 268 232 0 79 chr5 123448349 123448438 -29088821 + MT2B2 LTR ERVL 155 236 -348 1 1526 5187 71 10 4 chr5 123449835 123450531 -29086728 - MTA_Mm-int LTR MaLR -398 700 1 1 1526 3437 38 2 0 chr5 123450531 123450926 -29086333 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1526 1092 295 33 27 chr5 123452578 123452909 -29084350 + MER21B LTR ERV1 1 333 -530 1 1526 396 250 15 138 chr5 123453783 123453913 -29083346 + MER21B LTR ERV1 695 808 -55 1 1526 343 287 35 0 chr5 123457781 123457868 -29079391 - MLT1A LTR MaLR -109 265 176 1 1526 630 279 91 63 chr5 123457996 123458371 -29078888 + MLT1D LTR MaLR 82 501 -4 1 1526 324 298 121 8 chr5 123459567 123459699 -29077560 + LTR33A_ LTR ERVL 3 149 -382 1 1526 257 279 104 98 chr5 123460446 123460629 -29076630 - MLT1D LTR MaLR -60 445 262 1 1526 1397 187 163 37 chr5 123462761 123463099 -29074160 - MTD LTR MaLR -19 400 18 1 1526 1397 187 163 37 chr5 123463132 123463148 -29074111 - MTD LTR MaLR -402 17 1 1 1526 353 134 21 128 chr5 123463582 123463676 -29073583 - MT2B LTR ERVL -365 236 153 1 1526 250 192 35 124 chr5 123464190 123464303 -29072956 + MT2B LTR ERVL 163 265 -336 1 1527 2004 76 46 122 chr5 123471719 123471926 -29065333 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 98 1 1527 2004 76 46 122 chr5 123472294 123472410 -29064849 - ORR1A2 LTR MaLR -230 97 1 1 1527 411 302 75 138 chr5 123483546 123483907 -29053352 - MTEa LTR MaLR -40 339 2 1 1527 1145 176 66 155 chr5 123493025 123493203 -29044056 + MTD LTR MaLR 23 208 -211 1 1527 1145 176 66 155 chr5 123493351 123493475 -29043784 + MTD LTR MaLR 209 298 -121 1 1527 459 200 91 53 chr5 123493594 123493610 -29043649 + MTD LTR MaLR 240 257 -122 1 1527 560 200 89 53 chr5 123493787 123493909 -29043350 + MTD LTR MaLR 258 419 0 1 1527 1922 151 59 6 chr5 123507162 123507502 -29029757 + RLTR15 LTR ERVK 2 359 0 3 1527 311 225 54 43 chr5 123509761 123509854 -29027405 - MLT1A0 LTR MaLR -271 94 1 4 1527 357 161 0 0 chr5 123520977 123521033 -29016226 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 312 9 1527 460 212 16 32 chr5 123521544 123521643 -29015616 + RMER17C LTR ERVK 89 186 -224 1 1527 460 212 16 32 chr5 123521754 123521844 -29015415 + RMER17C LTR ERVK 187 275 -135 1 1527 682 298 54 25 chr5 123522117 123522396 -29014863 - RMER15 LTR ERVL -16 559 273 1 1527 280 208 0 122 chr5 123522393 123522475 -29014784 - RMER15 LTR ERVL -418 157 86 1 1527 940 281 60 16 chr5 123523920 123524235 -29013024 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 197 1 1527 261 338 165 25 chr5 123525042 123525279 -29011980 + MLT1C LTR MaLR 198 467 0 1 1527 303 280 65 113 chr5 123536844 123537154 -29000105 + RMER10A LTR ERVL 122 416 -26 1 1527 318 330 74 58 chr5 123538758 123538948 -28998311 - MLT1K LTR MaLR -331 264 72 1 1527 487 220 149 26 chr5 123539070 123539213 -28998046 + ORR1E LTR MaLR 1 163 -196 1 1527 2588 113 62 3 chr5 123539213 123539585 -28997674 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1527 281 218 139 13 chr5 123539585 123539648 -28997611 - ORR1B2 LTR MaLR -293 74 2 1 1527 2425 241 43 26 chr5 123539800 123540443 -28996816 + ORR1E-int LTR MaLR 203 856 -514 1 1527 361 309 77 59 chr5 123540445 123540665 -28996594 - MT2B LTR ERVL -211 390 167 1 1527 542 331 19 13 chr5 123541071 123541230 -28996029 - MLT1G LTR MaLR -381 210 51 1 1527 377 361 99 27 chr5 123546704 123546907 -28990352 - MLT1K LTR MaLR -292 303 84 1 1527 377 361 99 27 chr5 123547109 123547127 -28990132 - MLT1K LTR MaLR -512 83 67 1 1527 590 266 55 28 chr5 123548515 123548697 -28988562 - MLT1K LTR MaLR -27 568 382 2 1527 442 347 77 69 chr5 123550845 123551195 -28986064 - MLT1K LTR MaLR 0 595 243 2 1527 246 300 14 0 chr5 123551330 123551400 -28985859 - MLT1K LTR MaLR -343 169 99 2 1527 237 346 99 50 chr5 123554012 123554173 -28983086 - MLT1C LTR MaLR -6 461 293 2 1527 631 270 191 64 chr5 123554642 123555030 -28982229 - MLT1K LTR MaLR -5 590 154 2 1527 466 197 75 43 chr5 123556651 123556885 -28980374 - RMER13B LTR ERVK -444 514 310 2 1527 324 287 10 21 chr5 123559581 123559677 -28977582 - MLT1K LTR MaLR -302 293 199 2 1527 451 311 69 20 chr5 123563489 123563692 -28973567 - MLT1B LTR MaLR -27 363 151 2 1527 373 200 9 130 chr5 123572025 123572039 -28965220 - MT2B LTR ERVL -346 255 155 2 1527 256 345 13 82 chr5 123574158 123574180 -28963079 + RLTR25B LTR ERVK 428 477 -551 2 1527 256 345 13 82 chr5 123574276 123574316 -28962943 + RLTR25B LTR ERVK 478 574 -454 2 1527 784 255 117 21 chr5 123577172 123577412 -28959847 + MTD LTR MaLR 18 280 -139 2 1527 352 244 143 24 chr5 123577602 123577728 -28959531 + MTD LTR MaLR 279 419 0 2 1528 285 279 16 126 chr5 123604826 123604953 -28932306 + MT2B LTR ERVL 153 265 -336 3 1528 2652 148 5 2 chr5 123625007 123625426 -28911833 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 3 1528 3152 66 5 2 chr5 123637772 123638167 -28899092 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1528 2176 215 29 150 chr5 123641195 123641890 -28895369 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 1528 520 213 121 44 chr5 123646082 123646264 -28890995 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 229 -348 4 1528 727 101 18 0 chr5 123646264 123646373 -28890886 + ORR1A2 LTR MaLR 1 111 -216 4 1528 593 42 0 0 chr5 123646383 123646454 -28890805 + ORR1A2 LTR MaLR 256 326 0 4 1528 520 245 86 137 chr5 123647748 123647923 -28889336 + MTEa LTR MaLR 242 419 0 4 1528 440 233 91 91 chr5 123648163 123648361 -28888898 - MT2B LTR ERVL -343 258 61 4 1528 2296 143 14 36 chr5 123649221 123649642 -28887617 - RLTR11A2 LTR ERVK -77 450 39 4 1528 263 211 51 90 chr5 123653438 123653516 -28883743 - MT2B2 LTR ERVL -346 238 164 4 1528 480 292 29 32 chr5 123654264 123654428 -28882831 + MTEa LTR MaLR 242 402 -17 4 1528 409 238 88 98 chr5 123654633 123654838 -28882421 - MT2B LTR ERVL -338 263 61 4 1528 2330 101 187 5 chr5 123655254 123655623 -28881636 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 1528 10424 62 36 6 chr5 123655623 123657733 -28879526 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7680 5482 4 1528 4457 10 2 12 chr5 123657733 123658231 -28879028 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1528 305 0 0 0 chr5 123658231 123658269 -28878990 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 4 1528 379 179 46 35 chr5 123658269 123658356 -28878903 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 5 1528 46074 16 6 0 chr5 123658356 123663682 -28873577 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 4 1528 4457 10 2 12 chr5 123663682 123664180 -28873079 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 4 1528 23034 56 30 20 chr5 123664180 123664493 -28872766 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2095 5486 5188 5 1528 23034 56 30 20 chr5 123664690 123665882 -28871377 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2394 5187 3933 5 1528 23034 56 30 20 chr5 123666073 123666151 -28871108 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3649 3932 3868 5 1528 24964 53 7 7 chr5 123666476 123669600 -28867659 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3714 3867 733 5 1528 614 130 0 0 chr5 123669599 123669691 -28867568 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7265 316 225 5 1528 236 278 0 18 chr5 123669691 123669746 -28867513 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 222 5 1528 325 89 0 0 chr5 123669747 123669792 -28867467 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7489 92 48 5 1528 2349 98 188 5 chr5 123669837 123670205 -28867054 - RLTR10C LTR ERVK -1 435 1 5 1528 2193 160 26 34 chr5 123670731 123671146 -28866113 - RLTR11A2 LTR ERVK -77 450 39 5 1528 263 216 49 86 chr5 123674344 123674425 -28862834 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 164 5 1528 462 159 23 124 chr5 123675017 123675146 -28862113 - MT2B LTR ERVL -337 264 149 5 1528 2040 163 102 26 chr5 123675611 123675959 -28861300 + MTC LTR MaLR 1 381 -40 5 1528 2887 87 15 3 chr5 123675959 123676350 -28860909 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1528 2040 163 102 26 chr5 123676350 123676392 -28860867 + MTC LTR MaLR 382 421 0 5 1528 2123 176 13 3 chr5 123676660 123677036 -28860223 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 1 5 1528 2061 169 202 34 chr5 123681706 123681747 -28855512 + RMER4B LTR ERVK 1 52 -533 5 1528 2061 169 202 34 chr5 123681925 123682384 -28854875 + RMER4B LTR ERVK 53 585 0 5 1528 283 348 29 52 chr5 123682892 123683065 -28854194 + ORR1E LTR MaLR 1 169 -190 5 1528 699 282 112 35 chr5 123685794 123686132 -28851127 - MLT1D LTR MaLR -50 455 92 5 1528 445 327 96 90 chr5 123688946 123689001 -28848258 - MTEa LTR MaLR 0 379 324 5 1528 475 325 64 55 chr5 123689146 123689467 -28847792 - MTEa LTR MaLR -56 323 1 5 1528 309 292 26 116 chr5 123692081 123692236 -28845023 - MLT1A0 LTR MaLR -223 142 2 5 1528 369 306 119 0 chr5 123693617 123693751 -28843508 - MLT1F1 LTR MaLR -416 153 4 5 1528 281 273 65 0 chr5 123695960 123696037 -28841222 - ORR1D2 LTR MaLR -288 82 1 5 1528 1102 226 49 115 chr5 123708250 123708659 -28828600 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 2 6 1528 1283 236 138 5 chr5 123725294 123725392 -28811867 + MTD LTR MaLR 1 116 -303 6 1528 1283 236 138 5 chr5 123725420 123725691 -28811568 + MTD LTR MaLR 117 418 -1 6 1528 287 275 14 7 chr5 123730172 123730311 -28806948 + ORR1B1-int LTR MaLR 615 754 -755 7 1528 456 167 24 129 chr5 123730192 123730316 -28806943 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 7 1528 517 185 142 18 chr5 123731830 123731961 -28805298 + MTD LTR MaLR 43 174 -226 7 1529 906 166 156 2 chr5 123732193 123732393 -28804866 + MTD LTR MaLR 196 411 -8 7 1529 790 218 324 12 chr5 123739048 123739292 -28797967 - MTD LTR MaLR -95 324 5 7 1529 2622 196 189 48 chr5 123743387 123744163 -28793096 - RMER19B LTR ERVK -16 886 1 7 1529 2868 69 23 8 chr5 123749212 123749589 -28787670 - MTB LTR MaLR 0 400 24 7 1529 2868 69 23 8 chr5 123749625 123749641 -28787618 - MTB LTR MaLR -377 23 1 7 1529 2281 110 0 0 chr5 123755645 123755963 -28781296 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 7 1529 3443 133 7 46 chr5 123755967 123756552 -28780707 + RMER4B LTR ERVK 24 585 0 7 1529 296 331 16 103 chr5 123771931 123772030 -28765229 - MLT1C LTR MaLR -296 171 81 8 1529 296 331 16 103 chr5 123772223 123772308 -28764951 - MLT1C LTR MaLR -387 80 3 8 1529 256 259 11 105 chr5 123775120 123775215 -28762044 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 8 1529 235 274 105 9 chr5 123775951 123776065 -28761194 - MLT1F1 LTR MaLR -137 432 308 8 1529 1420 198 68 28 chr5 123779725 123780185 -28757074 - RMER15 LTR ERVL 0 575 39 8 1529 3682 137 154 47 chr5 123782558 123783345 -28753914 + RMER19B LTR ERVK 1 871 -31 8 1529 962 177 178 42 chr5 123789136 123789562 -28747697 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 8 1529 3288 38 0 0 chr5 123790362 123790756 -28746503 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 9 1529 1798 148 166 11 chr5 123808243 123808605 -28728654 - MTC LTR MaLR -3 418 1 9 1529 1564 169 163 0 chr5 123813363 123813713 -28723546 - MTD LTR MaLR -12 407 1 9 1529 1556 116 255 75 chr5 123825976 123826360 -28710899 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 1 1529 300 275 0 24 chr5 123827744 123827826 -28709433 + MLT1K LTR MaLR 189 268 -327 1 1529 608 176 89 13 chr5 123832858 123833082 -28704177 + RMER17C LTR ERVK 13 253 -157 1 1529 1025 224 71 13 chr5 123833058 123833366 -28703893 + RMER17C LTR ERVK 85 410 0 1 1529 1128 251 69 25 chr5 123834076 123834395 -28702864 + MTEa LTR MaLR 1 333 -46 1 1529 4152 130 87 16 chr5 123835704 123836409 -28700850 - RMER6A LTR ERVK -1 755 1 1 1529 1266 213 158 15 chr5 123836945 123837274 -28699985 + MTD LTR MaLR 44 419 0 1 1529 979 299 66 113 chr5 123837274 123837525 -28699734 + MTD-int LTR MaLR 1 236 -1022 1 1529 979 299 66 113 chr5 123837663 123837786 -28699473 + MTD-int LTR MaLR 237 367 -891 1 1529 1245 254 33 87 chr5 123837978 123838434 -28698825 + MTD-int LTR MaLR 292 792 -466 1 1529 285 264 31 192 chr5 123838450 123838741 -28698518 - RMER10A LTR ERVL -27 415 172 1 1529 860 239 84 32 chr5 123838935 123839229 -28698030 + MTD-int LTR MaLR 784 1363 -217 1 1529 327 240 112 20 chr5 123839440 123839538 -28697721 + MTA_Mm LTR MaLR 1 107 -289 1 1529 475 298 6 69 chr5 123841267 123841361 -28695898 - RLTR20D LTR ERVK 0 578 492 1 1529 475 298 6 69 chr5 123841441 123841518 -28695741 - RLTR20D LTR ERVK -87 491 418 1 1529 807 219 83 61 chr5 123841502 123841779 -28695480 - RLTR20D LTR ERVK -285 283 1 1 1529 2151 182 24 34 chr5 123842250 123842361 -28694898 + MTD LTR MaLR 1 103 -316 1 1529 2151 182 24 34 chr5 123842553 123842856 -28694403 + MTD LTR MaLR 104 411 -8 1 1529 414 170 8 145 chr5 123842939 123843056 -28694203 - MT2B LTR ERVL -344 257 157 1 1529 971 240 248 32 chr5 123852815 123853094 -28684165 - RMER4B LTR ERVK -42 543 179 1 1529 971 240 248 32 chr5 123853284 123853383 -28683876 - RMER4B LTR ERVK -407 178 83 1 1529 1075 300 89 32 chr5 123853737 123854140 -28683119 + MLT1D LTR MaLR 27 452 -53 1 1529 3405 98 115 9 chr5 123855399 123855722 -28681537 + RMER6A LTR ERVK 3 376 -380 1 1529 3405 98 115 9 chr5 123855768 123856018 -28681241 + RMER6A LTR ERVK 377 635 -121 1 1530 379 231 45 90 chr5 123865933 123866066 -28671193 + MT2B LTR ERVL 152 278 -323 1 1530 1996 132 60 63 chr5 123868544 123868582 -28668677 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 351 1 1530 1996 133 63 64 chr5 123868767 123869121 -28668138 - ORR1C2 LTR MaLR -34 350 6 1 1530 326 78 78 0 chr5 123871176 123871227 -28666032 - ORR1A4 LTR MaLR 0 394 340 1 1530 429 112 212 0 chr5 123871326 123871406 -28665853 - ORR1A4 LTR MaLR -45 284 188 1 1530 247 309 75 54 chr5 123873930 123873986 -28663273 - MT2B LTR ERVL -435 166 108 1 1530 819 258 109 93 chr5 123874201 123874415 -28662844 - MT2B LTR ERVL 0 601 383 1 1530 819 258 109 93 chr5 123874579 123874681 -28662578 - MT2B LTR ERVL -219 382 279 1 1530 634 114 0 0 chr5 123875061 123875149 -28662110 - MT2B LTR ERVL -445 88 1 1 1530 384 127 0 0 chr5 123876390 123876445 -28660814 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 330 1 1530 1699 165 67 40 chr5 123876805 123876966 -28660293 - ORR1C1 LTR MaLR -41 337 177 1 1530 1699 165 67 40 chr5 123876990 123877156 -28660103 - ORR1C1 LTR MaLR -202 176 2 1 1530 322 325 43 37 chr5 123878826 123878989 -28658270 - MER77 LTR ERVL 0 607 444 1 1530 305 338 103 7 chr5 123879115 123879261 -28657998 - MER77 LTR ERVL -369 238 79 1 1530 922 98 8 8 chr5 123883958 123884091 -28653168 + ORR1B2 LTR MaLR 235 367 0 1 1530 265 294 35 12 chr5 123884815 123884901 -28652358 - LTR79 LTR ERVL -56 471 384 1 1530 337 200 67 95 chr5 123889669 123889774 -28647485 - MT2B2 LTR ERVL -332 252 151 1 1530 4588 72 24 3 chr5 123916998 123917573 -28619686 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 1 1530 1059 274 21 121 chr5 123918164 123918237 -28619022 + MTE2a LTR MaLR 1 52 -327 1 1530 1059 274 21 121 chr5 123918369 123918668 -28618591 + MTE2a LTR MaLR 53 336 -43 1 1530 673 344 45 4 chr5 123920492 123920734 -28616525 + LTR16B2 LTR ERVL 1 252 -210 1 1530 245 301 55 31 chr5 123920924 123921051 -28616208 + LTR16B2 LTR ERVL 283 412 -50 1 1530 1998 200 11 19 chr5 123923041 123923418 -28613841 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1530 544 294 58 86 chr5 123923638 123923951 -28613308 + ORR1E LTR MaLR 4 307 -52 1 1530 411 298 99 7 chr5 123923957 123924099 -28613160 - RMER5 LTR ERV1 -20 514 360 1 1530 276 192 0 103 chr5 123924528 123924586 -28612673 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 333 1 1530 1227 209 117 25 chr5 123925342 123925666 -28611593 - ORR1D1 LTR MaLR -18 356 3 1 1530 256 290 7 108 chr5 123928226 123928238 -28609021 + MT2B LTR ERVL 202 280 -321 1 1530 257 232 18 0 chr5 123929067 123929123 -28608136 - LTR37B LTR ERV1 -405 63 7 1 1530 572 114 0 0 chr5 123933771 123933859 -28603400 + RMER19B LTR ERVK 1 88 -814 1 1530 1801 181 154 126 chr5 123941605 123942123 -28595136 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 1 1530 665 222 272 43 chr5 123943819 123944120 -28593139 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1530 915 280 82 141 chr5 123952367 123953111 -28584148 - RMER13A LTR ERVK -159 701 2 1 1530 237 359 7 97 chr5 123967303 123967319 -28569940 + MT2B LTR ERVL 150 152 -449 1 1530 264 153 48 48 chr5 123969263 123969325 -28567934 + MT2B LTR ERVL 208 269 -332 1 1530 437 258 159 82 chr5 123983236 123983468 -28553791 + MTE2a LTR MaLR 57 306 -73 1 1530 289 308 0 133 chr5 123986285 123986313 -28550946 + MT2B LTR ERVL 142 149 -452 1 1530 8520 23 1 7 chr5 123988737 123989701 -28547558 + RLTR13A2 LTR ERVK 1 958 0 1 191 48587 12 1 7 chr5 123989701 123995543 -28541716 + ETnERV3-int LTR ERVK 1 5808 0 1 1531 8615 21 1 0 chr5 123995548 123996505 -28540754 + RLTR13A2 LTR ERVK 1 958 0 1 1531 4506 14 0 0 chr5 123997633 123998126 -28539133 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1531 6246 8 0 0 chr5 123998126 123998840 -28538419 + MERVL-int LTR ERVL 1 714 -4771 1 1531 8101 33 0 3 chr5 123998840 124000000 -28537259 + MERVL-int LTR ERVL 748 2045 -3716 1 1531 30956 20 0 0 chr5 124000000 124003416 -28533843 + MERVL-int LTR ERVL 1944 5360 -125 1 1531 403 167 46 35 chr5 124003416 124003503 -28533756 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 2 1531 319 0 0 0 chr5 124003503 124003541 -28533718 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1531 4524 12 0 0 chr5 124003541 124004034 -28533225 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1531 1655 142 34 116 chr5 124023722 124024169 -28513090 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 7 1531 1524 230 92 18 chr5 124055013 124055394 -28481865 + MTD LTR MaLR 9 417 -2 1 1531 3092 36 19 98 chr5 124070959 124071196 -28466063 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 173 1 1531 3092 36 19 98 chr5 124071383 124071575 -28465684 - MTA_Mm LTR MaLR -224 172 1 1 1531 1108 205 156 38 chr5 124079156 124079470 -28457789 + ORR1D1 LTR MaLR 1 351 -23 2 1531 273 341 68 77 chr5 124086984 124087206 -28450053 - MT2B2 LTR ERVL -309 275 56 2 1531 237 333 0 15 chr5 124100745 124100812 -28436447 + MLT1A1 LTR MaLR 30 95 -313 2 1531 226 300 66 44 chr5 124100978 124101114 -28436145 + MLT1A1 LTR MaLR 268 406 -2 2 1531 3315 53 0 2 chr5 124101858 124102255 -28435004 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1531 256 103 0 0 chr5 124105371 124105410 -28431849 + MLT1A1 LTR MaLR 323 361 -47 2 1531 385 155 14 27 chr5 124113108 124113181 -28424078 + RLTR11B LTR ERVK 360 431 -22 3 1531 353 308 143 17 chr5 124118476 124118714 -28418545 + MLT1J1 LTR MaLR 6 273 -171 3 1531 1315 202 113 125 chr5 124123771 124124051 -28413208 - MTD LTR MaLR 0 419 112 3 1531 1315 202 113 125 chr5 124124198 124124222 -28413037 - MTD LTR MaLR -308 111 111 3 1531 1315 202 113 125 chr5 124124386 124124504 -28412755 - MTD LTR MaLR -308 111 1 3 1531 233 227 23 148 chr5 124124619 124124707 -28412552 - MT2B LTR ERVL -371 230 154 3 1532 1170 181 205 10 chr5 124129120 124129422 -28407837 + ORR1D2 LTR MaLR 3 363 -7 3 1532 226 195 0 0 chr5 124140764 124140805 -28396454 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1218 4 1532 250 321 24 0 chr5 124144003 124144087 -28393172 + MTD LTR MaLR 313 398 -21 4 1532 834 184 132 161 chr5 124171736 124172145 -28365114 - RLTR21 LTR ERVK -492 1080 684 5 1532 2146 229 95 58 chr5 124172341 124172628 -28364631 - RLTR21 LTR ERVK -908 664 390 5 1532 2146 229 95 58 chr5 124172808 124173145 -28364114 - RLTR21 LTR ERVK -1183 389 17 5 1532 2843 60 84 3 chr5 124174419 124174789 -28362470 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1532 756 136 0 64 chr5 124174789 124174928 -28362331 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 968 5 1532 756 136 0 64 chr5 124175117 124175150 -28362109 - MTB-int LTR MaLR -131 967 937 5 1532 844 79 21 14 chr5 124175608 124175749 -28361510 - MTB-int LTR MaLR -135 963 822 5 1532 1150 152 38 67 chr5 124175741 124175766 -28361493 - RMER6B LTR ERVK -224 237 218 5 1532 1150 152 38 67 chr5 124176075 124176287 -28360972 - RMER6B LTR ERVK -244 217 7 5 1532 1924 140 220 48 chr5 124176469 124176651 -28360608 + RMER6A LTR ERVK 150 344 -412 5 1532 1924 140 220 48 chr5 124176787 124177122 -28360137 + RMER6A LTR ERVK 345 756 0 5 1532 1277 201 199 100 chr5 124187394 124187815 -28349444 + RLTR18B LTR ERVK 1 463 -49 5 1532 294 180 113 16 chr5 124196601 124196663 -28340596 - MT2B LTR ERVL -361 240 173 5 1532 806 84 17 8 chr5 124201700 124201820 -28335439 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 248 6 1532 683 241 59 86 chr5 124204478 124204939 -28332320 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 534 -43 6 1532 241 219 122 103 chr5 124212589 124212696 -28324563 - RLTR25A LTR ERVK -453 650 542 6 1532 307 262 25 93 chr5 124220478 124220501 -28316758 - MT2B LTR ERVL -349 252 143 6 1532 293 310 10 39 chr5 124235068 124235172 -28302087 - MLT1A1 LTR MaLR -40 368 268 7 1532 1391 147 60 82 chr5 124237996 124238314 -28298945 - RMER4B LTR ERVK -274 311 1 7 1532 1142 214 115 12 chr5 124239394 124239715 -28297544 - ORR1E LTR MaLR -1 358 5 7 1532 235 220 122 108 chr5 124242605 124242753 -28294506 - RLTR25B LTR ERVK -674 354 205 7 1532 243 220 71 35 chr5 124249615 124249700 -28287559 - IAPLTR3 LTR ERVK -59 267 180 7 1533 370 186 0 148 chr5 124267610 124267711 -28269548 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 8 1533 466 222 44 68 chr5 124272684 124272891 -28264368 - RMER4B LTR ERVK -4 581 343 8 1533 601 168 101 7 chr5 124272911 124273049 -28264210 - RMER4B LTR ERVK -388 197 47 8 1533 234 314 0 113 chr5 124275515 124275612 -28261647 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 8 1533 1115 114 34 6 chr5 124276222 124276253 -28261006 - ORR1A2 LTR MaLR -25 302 271 8 1533 1115 124 41 5 chr5 124276301 124276463 -28260796 - ORR1A2 LTR MaLR -62 316 123 8 1533 1521 154 30 129 chr5 124279097 124279462 -28257797 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1533 252 238 32 116 chr5 124283052 124283063 -28254196 + MT2B LTR ERVL 152 238 -363 8 1533 268 328 32 84 chr5 124283103 124283293 -28253966 + ORR1D2 LTR MaLR 79 258 -112 8 1533 494 272 31 54 chr5 124283326 124283465 -28253794 + ORR1D2 LTR MaLR 208 344 -35 8 1533 494 265 28 49 chr5 124283487 124283508 -28253751 + ORR1D2 LTR MaLR 338 354 -16 8 1533 253 103 26 0 chr5 124283518 124283557 -28253702 + ORR1D2 LTR MaLR 330 369 -1 8 1533 367 291 132 76 chr5 124284123 124284333 -28252926 + ORR1E LTR MaLR 66 291 -68 8 1533 2297 129 82 37 chr5 124284333 124284734 -28252525 + MTC LTR MaLR 2 420 -1 8 1533 367 250 19 128 chr5 124284734 124284803 -28252456 + ORR1E LTR MaLR 292 379 0 8 1533 240 281 92 50 chr5 124286103 124286217 -28251042 - MLT1C LTR MaLR -289 178 60 8 1533 474 174 8 121 chr5 124293451 124293575 -28243684 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 9 1533 342 275 12 0 chr5 124295088 124295168 -28242091 + ORR1E LTR MaLR 3 83 -276 9 1533 1245 231 76 53 chr5 124295356 124295713 -28241546 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 6 9 1533 240 324 14 0 chr5 124301426 124301497 -28235762 - MLT1B LTR MaLR -12 378 307 9 1533 547 250 75 32 chr5 124301499 124301685 -28235574 + ORR1E LTR MaLR 1 194 -165 9 1533 3257 216 73 46 chr5 124306141 124307003 -28230256 - RMER19B LTR ERVK -17 885 1 9 1533 475 295 164 30 chr5 124309010 124309241 -28228018 - RMER15 LTR ERVL -40 535 274 9 1533 289 194 0 31 chr5 124311523 124311587 -28225672 + MLT1C LTR MaLR 402 463 -4 9 1533 405 318 46 8 chr5 124317885 124318015 -28219244 + ORR1E LTR MaLR 1 135 -224 1 1533 1137 260 36 137 chr5 124318804 124319219 -28218040 + MTE2a LTR MaLR 7 379 0 1 1533 317 242 47 75 chr5 124319413 124319520 -28217739 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 1 1533 239 279 93 55 chr5 124321216 124321398 -28215861 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 301 1 1533 924 209 156 19 chr5 124321422 124321685 -28215574 - MTEb LTR MaLR -3 376 78 1 1533 343 210 12 24 chr5 124324552 124324635 -28212624 + RLTR11A LTR ERVK 90 171 -357 1 1533 904 194 15 25 chr5 124324651 124324847 -28212412 + RLTR11A LTR ERVK 308 501 -27 1 1533 1740 169 55 79 chr5 124338218 124338597 -28198662 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 1 1533 518 220 164 23 chr5 124341920 124342097 -28195162 - RMER17C-int LTR ERVK -1495 5055 4965 1 1533 1095 223 21 76 chr5 124342095 124342386 -28194873 - RMER17C-int LTR ERVK -351 2887 2613 1 1533 481 181 33 115 chr5 124342849 124343036 -28194223 - RMER17C-int LTR ERVK -714 2524 2265 1 1533 378 179 57 209 chr5 124343599 124343776 -28193483 - RMER17C-int LTR ERVK -3679 1843 1694 1 1533 370 297 113 71 chr5 124344874 124345113 -28192146 - RodERV21-int LTR ERV1 -4277 714 466 1 1533 255 325 38 19 chr5 124345109 124345144 -28192115 - RodERV21-int LTR ERV1 -4784 207 174 1 1533 255 325 38 19 chr5 124345353 124345474 -28191785 - RodERV21-int LTR ERV1 -4818 173 48 1 1533 732 238 251 43 chr5 124345872 124346332 -28190927 + RMER4B LTR ERVK 1 571 -14 1 1533 341 309 101 108 chr5 124349503 124349909 -28187350 + RMER17C LTR ERVK 8 410 0 1 1533 1515 101 108 8 chr5 124350038 124350288 -28186971 - MTC LTR MaLR 0 421 147 1 1533 1864 93 81 101 chr5 124350677 124351066 -28186193 + RMER17C LTR ERVK 1 376 -34 1 1533 1864 93 81 101 chr5 124351241 124351267 -28185992 + RMER17C LTR ERVK 377 410 0 1 1533 2890 151 20 50 chr5 124351724 124352268 -28184991 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1533 243 302 57 32 chr5 124354429 124354552 -28182707 - LTR33 LTR ERVL -357 158 33 1 1533 229 247 29 136 chr5 124368742 124368845 -28168414 + MT2B2 LTR ERVL 179 270 -314 1 1533 321 253 13 0 chr5 124371056 124371135 -28166124 - RLTR42-int LTR ERVK -1183 4339 4260 1 1533 502 203 27 107 chr5 124382308 124382352 -28154907 + MT2B LTR ERVL 122 153 -448 1 1534 1924 109 31 22 chr5 124389289 124389608 -28147651 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1534 28392 18 3 3 chr5 124389608 124392924 -28144335 - ETnERV-int LTR ERVK 0 3314 1 1 1534 1931 106 31 22 chr5 124392924 124393243 -28144016 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1534 419 311 59 49 chr5 124395675 124395878 -28141381 - MER21B LTR ERV1 -165 698 494 1 1534 269 216 78 84 chr5 124403214 124403381 -28133878 + RMER17D LTR ERVK 189 354 -535 1 1534 244 254 33 91 chr5 124405176 124405297 -28131962 + MTC LTR MaLR 226 339 -82 1 1534 683 256 149 73 chr5 124408950 124409292 -28127967 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 1 1534 360 252 34 59 chr5 124426896 124427014 -28110245 + MLT1D LTR MaLR 391 505 0 1 1534 1070 151 0 17 chr5 124432506 124432681 -28104578 - RMER17B LTR ERVK -183 775 604 1 1534 296 167 19 0 chr5 124432689 124432743 -28104516 - RMER17A-int LTR ERVK -1672 56 2 1 1534 6743 87 24 12 chr5 124432744 124433690 -28103569 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 1 1534 452 280 93 0 chr5 124436521 124436639 -28100620 + RLTR18B LTR ERVK 380 508 -4 1 1534 262 250 19 115 chr5 124469578 124469599 -28067660 + MT2B LTR ERVL 147 157 -444 1 1534 235 350 0 88 chr5 124492963 124493068 -28044191 - MT2B LTR ERVL -344 257 163 1 1534 3210 68 0 5 chr5 124494248 124494646 -28042613 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1534 298 224 0 126 chr5 124501453 124501540 -28035719 + MT2B LTR ERVL 164 239 -362 5 1534 528 337 144 19 chr5 124510293 124510605 -28026654 + MLT1D LTR MaLR 1 351 -154 4 1534 417 202 28 30 chr5 124510950 124511063 -28026196 + MTD LTR MaLR 1 120 -259 4 1534 373 355 83 5 chr5 124514165 124514383 -28022876 + MER67B LTR ERV1 125 359 -302 4 1534 548 224 50 121 chr5 124514862 124515060 -28022199 + RMER5 LTR ERV1 13 196 -338 5 1534 396 148 145 24 chr5 124515116 124515199 -28022060 + RMER5 LTR ERV1 401 493 -41 5 1534 249 212 42 105 chr5 124515581 124515676 -28021583 - MT2B LTR ERVL -360 241 153 5 1535 1263 230 74 25 chr5 124520939 124521305 -28015954 + RMER5 LTR ERV1 151 534 0 7 1535 273 225 24 36 chr5 124527847 124527930 -28009329 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 183 9 1535 787 288 60 14 chr5 124533842 124534127 -28003132 + MTE2b LTR MaLR 18 315 -64 1 1535 3462 173 20 75 chr5 124546738 124546877 -27990382 + RMER19B LTR ERVK 1 138 -764 1 1535 3462 173 20 75 chr5 124547044 124547611 -27989648 + RMER19B LTR ERVK 139 668 -234 1 1535 1360 186 4 8 chr5 124547796 124548039 -27989220 + RMER19B LTR ERVK 656 897 -5 1 1535 1362 188 131 6 chr5 124548045 124548366 -27988893 + MTD LTR MaLR 8 368 -51 1 1535 1530 200 137 38 chr5 124549371 124549818 -27987441 + RMER15 LTR ERVL 7 497 -78 1 1535 3661 170 136 14 chr5 124552104 124552867 -27984392 - RMER19B LTR ERVK 0 902 47 1 1535 631 153 27 0 chr5 124553100 124553211 -27984048 - RMER19B LTR ERVK -788 114 1 1 1535 1268 243 54 18 chr5 124553661 124553977 -27983282 - MTC LTR MaLR -8 413 85 1 1535 1268 243 54 18 chr5 124554032 124554050 -27983209 - MTC LTR MaLR -337 84 68 1 1535 416 125 26 172 chr5 124554115 124554231 -27983028 - MTC LTR MaLR -319 102 4 1 1535 3041 17 48 3 chr5 124554503 124554854 -27982405 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1535 38599 14 0 0 chr5 124554864 124559766 -27977493 - IAPEz-int LTR ERVK -10 6471 1566 1 1535 6235 51 52 11 chr5 124559772 124560606 -27976653 - IAPEz-int LTR ERVK -5606 875 8 1 1535 3041 17 48 3 chr5 124560606 124560957 -27976302 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1535 1750 199 218 38 chr5 124589970 124590371 -27946888 + MT2A LTR ERVL 3 489 -44 1 1535 1750 199 218 38 chr5 124590403 124590451 -27946808 + MT2A LTR ERVL 490 533 0 1 1535 1822 165 84 20 chr5 124592275 124592622 -27944637 + ORR1D1 LTR MaLR 4 372 -2 1 1535 1001 139 54 67 chr5 124596243 124596482 -27940777 - RLTR42 LTR ERVK 0 239 4 2 1535 314 200 0 16 chr5 124597021 124597082 -27940177 + MTE2a LTR MaLR 3 62 -317 2 1535 350 356 45 0 chr5 124602001 124602133 -27935126 + MLT1A LTR MaLR 19 156 -218 2 1535 492 195 135 37 chr5 124607619 124607896 -27929363 + MT2A LTR ERVL 1 462 -71 2 1535 451 319 0 54 chr5 124618235 124618384 -27918875 - MLT1C LTR MaLR 0 467 327 2 1535 232 352 76 30 chr5 124618568 124618700 -27918559 + MLT1K LTR MaLR 458 595 0 2 1535 322 293 78 20 chr5 124626430 124626583 -27910676 + MLT1C LTR MaLR 104 265 -202 2 1535 3292 138 32 21 chr5 124629403 124630033 -27907226 + RMER6A LTR ERVK 1 637 -119 2 1535 258 264 32 21 chr5 124642108 124642201 -27895058 - MT2B LTR ERVL -350 251 158 2 1535 498 158 1 12 chr5 124646083 124646184 -27891075 - ORR1D1 LTR MaLR -259 100 1 2 1535 1052 305 79 48 chr5 124648276 124648696 -27888563 - MLT1F LTR MaLR -97 451 19 2 1536 3490 30 2 2 chr5 124653600 124653996 -27883263 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1536 3402 16 39 0 chr5 124662587 124662968 -27874291 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1536 319 252 29 29 chr5 124662982 124663084 -27874175 + MTEa LTR MaLR 278 379 0 3 1536 347 319 84 118 chr5 124681349 124681463 -27855796 + MLT1C LTR MaLR 78 180 -287 3 1536 347 319 84 118 chr5 124681540 124681565 -27855694 + MLT1C LTR MaLR 181 199 -268 3 1536 347 319 84 118 chr5 124681760 124682009 -27855250 + MLT1C LTR MaLR 200 454 -13 3 1536 316 169 34 0 chr5 124688992 124689051 -27848208 - MTD LTR MaLR 0 419 359 3 1536 711 196 330 28 chr5 124689051 124689336 -27847923 + ORR1C2 LTR MaLR 1 371 -13 3 1536 1527 230 67 14 chr5 124689346 124689690 -27847569 - MTD LTR MaLR -53 366 5 3 1536 3646 202 73 41 chr5 124693071 124693984 -27843275 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 3 1536 327 275 10 17 chr5 124695545 124695648 -27841611 + MTEb LTR MaLR 233 329 -50 3 1536 1348 212 99 14 chr5 124708531 124708876 -27828383 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1536 706 111 198 0 chr5 124709243 124709369 -27827890 + ORR1C1 LTR MaLR 1 151 -227 3 1536 1358 163 18 0 chr5 124709488 124709715 -27827544 + ORR1C1 LTR MaLR 143 373 -5 3 1536 728 231 26 42 chr5 124718568 124718758 -27818501 - MTD LTR MaLR -113 306 120 4 1536 3259 42 69 40 chr5 124721352 124721802 -27815457 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 463 -12 4 1536 564 115 15 144 chr5 124721803 124721935 -27815324 + IAPEz-int LTR ERVK 9 123 -6358 4 1536 234 267 0 0 chr5 124721935 124721980 -27815279 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 4 1536 11116 66 47 92 chr5 124721982 124723656 -27813603 + IAPEz-int LTR ERVK 94 1700 -4781 4 1536 6521 62 12 11 chr5 124723649 124724477 -27812782 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 4 1536 3446 36 80 56 chr5 124724479 124724943 -27812316 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1536 529 302 66 19 chr5 124727807 124728028 -27809231 + ORR1E LTR MaLR 1 245 -125 4 1536 466 262 390 17 chr5 124740587 124740828 -27796431 + ORR1D2 LTR MaLR 6 336 -43 4 1536 281 310 32 76 chr5 124746740 124746897 -27790362 + RLTR14 LTR ERV1 233 382 0 5 1536 1230 202 66 96 chr5 124747787 124748164 -27789095 + MTEa LTR MaLR 14 379 0 5 1536 369 356 30 0 chr5 124750242 124750374 -27786885 + ORR1E LTR MaLR 3 138 -221 5 1536 1901 178 135 17 chr5 124751343 124751685 -27785574 + RLTR20D LTR ERVK 6 436 -132 5 1536 1901 169 139 16 chr5 124751836 124751966 -27785293 + RLTR20D LTR ERVK 437 567 -1 5 1536 3564 23 0 0 chr5 124754381 124754777 -27782482 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1536 437 191 25 118 chr5 124768451 124768570 -27768689 - MT2B LTR ERVL -337 264 157 5 1537 369 204 45 80 chr5 124785992 124786104 -27751155 - MT2B LTR ERVL -345 256 149 6 1537 1172 42 0 0 chr5 124791549 124791693 -27745566 + ORR1A1-int LTR MaLR 846 989 -803 6 1537 555 212 66 29 chr5 124794049 124794185 -27743074 + MTE2a LTR MaLR 225 365 -14 6 1537 2122 113 28 16 chr5 124811394 124811717 -27725542 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1537 333 201 32 25 chr5 124811746 124811826 -27725433 - RLTR41 LTR ERV1 -63 383 294 7 1537 2375 129 134 159 chr5 124812882 124813481 -27723778 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 7 1537 422 209 30 122 chr5 124817289 124817420 -27719839 - MT2B LTR ERVL -337 264 146 7 1537 607 184 38 38 chr5 124832898 124833056 -27704203 - RMER10B LTR ERVL -45 353 196 7 1537 541 233 263 15 chr5 124877132 124877406 -27659853 - MTD LTR MaLR -67 352 11 9 1537 2414 122 60 33 chr5 124878747 124879196 -27658063 + RMER4A LTR ERVK 6 466 0 9 1537 1010 254 52 11 chr5 124879468 124879739 -27657520 + MTEa LTR MaLR 94 375 -4 9 1537 2308 163 40 29 chr5 124892610 124893090 -27644169 - RMER6A LTR ERVK -71 685 201 9 1537 3204 63 2 8 chr5 124905282 124905684 -27631575 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1537 1224 199 111 83 chr5 124908454 124908884 -27628375 - RMER13A LTR ERVK 0 860 286 1 1537 361 183 0 66 chr5 124908867 124908943 -27628316 - RMER13A LTR ERVK -789 71 1 1 1538 252 229 93 0 chr5 124914373 124914404 -27622855 - ORR1B1-int LTR MaLR -863 646 605 1 1538 778 220 130 57 chr5 124916433 124916491 -27620768 + MTC LTR MaLR 21 76 -331 1 1538 919 140 147 12 chr5 124916661 124916848 -27620411 + MTC LTR MaLR 77 299 -122 1 1538 2890 121 88 33 chr5 124916852 124917366 -27619893 + RMER15 LTR ERVL 34 575 0 1 1538 473 271 8 8 chr5 124917366 124917485 -27619774 + MTC LTR MaLR 300 418 -3 1 1538 2107 106 18 33 chr5 124923551 124923883 -27613376 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 1 1538 1058 132 66 36 chr5 124931194 124931390 -27605869 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 158 1 1538 1013 140 28 23 chr5 124931553 124931729 -27605530 - RLTR15 LTR ERVK -182 177 1 1 1538 356 355 53 27 chr5 124934441 124934744 -27602515 + RLTR6-int LTR ERV1 4028 4518 -3260 1 1538 428 279 90 59 chr5 124935185 124935511 -27601748 + RLTR6-int LTR ERV1 4934 5267 -2511 1 1538 4220 88 10 12 chr5 124937211 124937796 -27599463 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 1 1538 294 345 5 73 chr5 124938170 124938242 -27599017 + RLTR6-int LTR ERV1 7116 7180 -426 1 1538 345 300 9 2 chr5 124938433 124938551 -27598708 + RLTR6-int LTR ERV1 7170 7293 -313 1 1538 306 229 54 115 chr5 124941564 124941614 -27595645 + RLTR25B LTR ERVK 402 521 -507 1 1538 306 247 42 96 chr5 124946452 124946618 -27590641 + MLT1C LTR MaLR 122 278 -189 1 1538 2015 159 55 8 chr5 124955583 124955645 -27581614 + MTC LTR MaLR 22 83 -338 1 1538 2015 159 55 8 chr5 124956042 124956360 -27580899 + MTC LTR MaLR 84 419 -2 1 1538 371 294 49 18 chr5 124961356 124961519 -27575740 + MLT1K LTR MaLR 365 532 -63 1 1538 2161 122 87 31 chr5 124964047 124964460 -27572799 - RMER4A LTR ERVK -8 458 23 1 1538 594 256 107 40 chr5 124975610 124975834 -27561425 + MLT1D LTR MaLR 148 386 -119 1 1538 2698 38 0 0 chr5 124986210 124986550 -27550709 - ORR1A1 LTR MaLR -1 345 6 1 1538 985 157 110 57 chr5 125000698 125001028 -27536231 + RMER4B LTR ERVK 48 369 -97 3 1538 947 202 142 113 chr5 125001220 125001296 -27535963 + RMER4B LTR ERVK 370 466 0 3 1538 1353 219 75 20 chr5 125005615 125005964 -27531295 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 1 1538 252 259 130 57 chr5 125012823 125012946 -27524313 - MT2B LTR ERVL -361 240 109 4 1538 1342 175 137 14 chr5 125019218 125019496 -27517763 + ORR1B1 LTR MaLR 41 352 -42 5 1538 406 89 0 0 chr5 125020365 125020421 -27516838 + ORR1B1 LTR MaLR 339 394 0 5 1538 1673 183 67 28 chr5 125037320 125037679 -27499580 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 1 1539 294 255 144 9 chr5 125049345 125049386 -27487873 + MT2B LTR ERVL 115 170 -431 1 1539 2268 117 169 6 chr5 125049872 125050234 -27487025 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1539 2046 221 55 33 chr5 125055613 125056123 -27481136 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 7 1 1539 430 162 96 42 chr5 125063152 125063319 -27473940 - RMER17C LTR ERVK -140 270 95 1 1539 274 205 118 24 chr5 125066205 125066290 -27470969 - MT2B LTR ERVL -342 259 167 2 1539 268 279 34 68 chr5 125066746 125066892 -27470367 - RLTR25B LTR ERVK -507 521 381 2 1539 1904 119 28 12 chr5 125068674 125068996 -27468263 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 2 1539 878 270 63 140 chr5 125076240 125076513 -27460746 - RLTR18 LTR ERVK -3 613 354 2 1539 878 270 63 140 chr5 125076703 125077093 -27460166 - RLTR18 LTR ERVK -263 353 1 2 1539 690 268 31 5 chr5 125078784 125078979 -27458280 - MTD LTR MaLR -208 211 12 2 1539 2181 111 0 15 chr5 125093436 125093767 -27443492 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1539 5034 120 84 91 chr5 125093767 125095079 -27442180 - ORR1A3-int LTR MaLR 0 1963 64 2 1539 878 127 6 25 chr5 125095050 125095211 -27442048 - ORR1A3 LTR MaLR -171 158 1 2 1540 448 247 69 62 chr5 125197433 125197474 -27339785 - MT2B LTR ERVL -442 159 118 3 1540 1170 212 180 17 chr5 125204944 125205299 -27331960 - MTD LTR MaLR 0 419 7 3 1540 1031 160 96 34 chr5 125215154 125215340 -27321919 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 178 3 1540 1031 160 96 34 chr5 125215378 125215430 -27321829 - ORR1C2 LTR MaLR -207 177 131 3 1540 480 184 0 0 chr5 125215703 125215790 -27321469 - ORR1C2 LTR MaLR -289 89 3 3 1540 1956 166 84 5 chr5 125215945 125216326 -27320933 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 3 1540 2480 159 31 56 chr5 125218837 125218946 -27318313 - RLTR11A2 LTR ERVK -1 526 432 3 1540 2480 159 31 56 chr5 125219698 125220127 -27317132 - RLTR11A2 LTR ERVK -96 431 1 3 1540 366 189 241 9 chr5 125220559 125220671 -27316588 + ORR1E LTR MaLR 1 138 -221 3 1540 523 341 9 45 chr5 125221561 125221782 -27315477 - MTD LTR MaLR -206 213 1 3 1540 267 186 300 44 chr5 125225565 125225655 -27311604 + MTD LTR MaLR 196 308 -111 3 1540 1207 162 186 7 chr5 125228337 125228616 -27308643 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1540 243 252 8 32 chr5 125232999 125233015 -27304244 + ORR1B1-int LTR MaLR 635 647 -862 4 1540 307 206 10 80 chr5 125233055 125233155 -27304104 + RLTR25B LTR ERVK 442 534 -494 4 1540 1997 183 108 41 chr5 125237908 125238398 -27298861 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 6 4 1540 949 232 40 140 chr5 125241840 125242261 -27294998 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 1540 360 291 33 29 chr5 125242702 125242876 -27294383 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 212 4 1540 2162 131 41 18 chr5 125246343 125246733 -27290526 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 4 1540 314 208 98 10 chr5 125247688 125247790 -27289469 + ORR1E LTR MaLR 1 111 -248 4 1540 1430 216 44 44 chr5 125249969 125250308 -27286951 - MTE2b LTR MaLR 0 379 41 4 1540 278 289 167 0 chr5 125257322 125257436 -27279823 - MLT2B3 LTR ERVL -414 140 8 4 1540 395 221 150 139 chr5 125258366 125258639 -27278620 - MTEb LTR MaLR -88 291 16 4 1540 327 267 98 36 chr5 125262012 125262206 -27275053 - RMER20B LTR ERVK 0 516 311 5 1540 477 236 16 47 chr5 125262317 125262446 -27274813 - RMER20B LTR ERVK -502 125 1 5 1540 568 279 55 74 chr5 125265769 125266025 -27271234 - MTEa LTR MaLR -7 372 122 5 1540 3342 15 8 0 chr5 125267156 125267549 -27269710 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1540 783 125 2 3 chr5 125271307 125271433 -27265826 - RLTR16 LTR ERVK -404 174 1 5 1540 906 235 162 0 chr5 125278434 125278711 -27258548 - MLT1F LTR MaLR 0 548 227 5 1540 289 279 0 12 chr5 125278719 125278799 -27258460 - MLT1A1 LTR MaLR -33 375 297 5 1540 836 320 45 40 chr5 125288295 125288672 -27248587 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1540 1944 84 53 7 chr5 125292087 125292388 -27244871 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 5 5 1540 268 255 146 10 chr5 125293386 125293489 -27243770 - MLT1C LTR MaLR -291 176 60 5 1540 1996 114 164 30 chr5 125300742 125301113 -27236146 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 5 1540 349 301 96 24 chr5 125301236 125301403 -27235856 - MLT1K LTR MaLR -34 561 383 5 1541 327 286 21 45 chr5 125306523 125306651 -27230608 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 247 6 1541 243 238 0 143 chr5 125311535 125311633 -27225626 - MT2B LTR ERVL -350 251 168 6 1541 1995 165 35 90 chr5 125327713 125328193 -27209066 + RMER4A LTR ERVK 1 454 -12 6 1541 8265 170 86 19 chr5 125328374 125329765 -27207494 + MurERV4-int LTR ERVK 31 1494 -3766 6 1541 8265 170 86 19 chr5 125329951 125330229 -27207030 + MurERV4-int LTR ERVK 1495 1811 -3449 6 1541 786 188 45 0 chr5 125330212 125330366 -27206893 + MurERV4-int LTR ERVK 5099 5259 -1 6 1541 2498 140 59 46 chr5 125330369 125330826 -27206433 + RMER4A LTR ERVK 4 466 0 6 1541 2406 147 27 24 chr5 125339379 125339791 -27197468 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 1541 265 236 159 19 chr5 125350926 125351023 -27186236 - ORR1E LTR MaLR -4 375 275 6 1541 451 273 159 12 chr5 125351034 125351197 -27186062 - ORR1E LTR MaLR -172 187 1 6 1541 229 271 68 41 chr5 125351416 125351489 -27185770 + LTR88c LTR Genie? 79 153 -709 6 1541 268 221 39 0 chr5 125353081 125353158 -27184101 + RMER17C LTR ERVK 195 274 -136 6 1541 3089 95 32 19 chr5 125355490 125355921 -27181338 - RLTR9B LTR ERVK 0 437 1 6 1541 950 191 107 8 chr5 125359039 125359359 -27177900 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 168 6 1541 1254 164 18 116 chr5 125363808 125364084 -27173175 - ORR1A3 LTR MaLR -77 249 1 6 1541 251 280 98 98 chr5 125384129 125384343 -27152916 - MLT1C LTR MaLR -186 281 68 7 1541 2191 168 55 91 chr5 125384348 125384873 -27152386 + RMER20A LTR ERVK 11 516 0 7 1541 1934 122 69 89 chr5 125385880 125386241 -27151018 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 7 1541 604 323 46 30 chr5 125388342 125388687 -27148572 + ORR1E LTR MaLR 6 377 -2 7 1541 645 215 34 127 chr5 125389865 125390220 -27147039 - ORR1C2 LTR MaLR -39 355 34 7 1541 3602 134 131 89 chr5 125399126 125399955 -27137304 + RMER19B LTR ERVK 1 873 -29 7 1541 3602 134 131 89 chr5 125400139 125400163 -27137096 + RMER19B LTR ERVK 874 890 -12 7 1541 360 117 0 2 chr5 125406323 125406392 -27130867 + RLTR26 LTR ERVK 1 68 -821 7 1541 265 234 0 144 chr5 125409281 125409406 -27127853 - MT2B2 LTR ERVL -299 285 179 7 1541 292 284 22 22 chr5 125409702 125409792 -27127467 - ORR1E LTR MaLR 0 379 290 7 1541 774 262 65 38 chr5 125409817 125410107 -27127152 - ORR1E LTR MaLR -60 299 2 7 1541 1651 156 279 27 chr5 125418461 125418479 -27118780 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 544 8 1541 1651 156 279 27 chr5 125418504 125418933 -27118326 - RLTR31_Mm LTR ERVK -18 543 3 8 1541 253 108 11 43 chr5 125425035 125425091 -27112168 - ORR1D2 LTR MaLR -2 372 316 8 1541 344 268 10 20 chr5 125426391 125426490 -27110769 + MLT1L LTR MaLR 193 290 -320 8 1541 1356 226 49 99 chr5 125426788 125427344 -27109915 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 8 1541 458 260 117 0 chr5 125427982 125428136 -27109123 - MTD LTR MaLR 0 379 208 8 1541 535 262 28 62 chr5 125430100 125430279 -27106980 - MTD LTR MaLR -240 179 7 8 192 323 329 67 75 chr5 125435779 125436051 -27101208 + MT2A LTR ERVL 169 436 -97 8 1542 298 317 129 18 chr5 125436027 125436197 -27101062 - MTE2a LTR MaLR -110 269 81 8 1542 339 300 60 117 chr5 125442782 125443065 -27094194 - ORR1E LTR MaLR -17 342 76 8 1542 1869 207 16 5 chr5 125455843 125456217 -27081042 - MTEb LTR MaLR 0 379 2 8 1542 1340 219 61 3 chr5 125458729 125459040 -27078219 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 54 8 1542 5093 131 42 97 chr5 125463571 125463782 -27073477 + RMER19B LTR ERVK 1 157 -745 9 1542 5093 131 42 97 chr5 125463925 125464668 -27072591 + RMER19B LTR ERVK 158 902 0 9 1542 830 322 64 20 chr5 125467249 125467591 -27069668 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 9 1542 3085 72 31 0 chr5 125468995 125469381 -27067878 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 9 1542 246 283 59 75 chr5 125472331 125472518 -27064741 - RLTR21 LTR ERVK -313 1259 1076 9 1542 1882 156 83 16 chr5 125479106 125479478 -27057781 + MTD LTR MaLR 22 418 -1 9 1542 1030 179 60 32 chr5 125479712 125479992 -27057267 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1542 822 198 53 61 chr5 125486921 125487269 -27049990 - RMER17C LTR ERVK 0 410 14 9 1542 271 232 0 18 chr5 125496062 125496119 -27041140 + MT2A LTR ERVL 291 346 -187 9 1542 254 314 69 0 chr5 125527508 125527610 -27009649 + MLT1C LTR MaLR 156 264 -203 2 1542 1175 184 155 54 chr5 125527844 125528160 -27009099 + ORR1C2 LTR MaLR 37 384 0 2 1542 230 301 122 34 chr5 125542920 125543157 -26994102 + MLT1C LTR MaLR 171 428 -39 3 1542 1639 158 73 21 chr5 125551823 125552152 -26985107 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 5 1542 689 184 44 0 chr5 125553354 125553490 -26983769 + MTD LTR MaLR 1 142 -277 5 1542 1067 264 85 17 chr5 125557245 125557538 -26979721 + ORR1D2 LTR MaLR 58 370 0 6 1543 769 255 178 48 chr5 125580802 125581175 -26956084 + MTD LTR MaLR 18 406 -15 8 1543 2368 143 14 26 chr5 125593816 125594238 -26943021 + MTC LTR MaLR 5 421 0 1 1543 5190 174 129 35 chr5 125594238 125594285 -26942974 + MTC-int LTR MaLR 1 47 -1211 1 1543 5190 174 129 35 chr5 125594317 125595309 -26941950 + MTC-int LTR MaLR 48 1116 -142 1 1543 5190 174 129 35 chr5 125595491 125595600 -26941659 + MTC-int LTR MaLR 1117 1257 -1 1 1543 1552 118 328 37 chr5 125595600 125595926 -26941333 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1543 289 335 100 50 chr5 125614456 125614755 -26922504 - MLT1B LTR MaLR -19 371 58 1 1543 286 280 29 39 chr5 125616722 125616826 -26920433 + MLT1A0 LTR MaLR 12 114 -251 1 1543 438 243 130 65 chr5 125617350 125617628 -26919631 + ORR1E LTR MaLR 7 355 -24 1 1543 1364 234 46 33 chr5 125617700 125618066 -26919193 + MTD LTR MaLR 5 346 -73 1 1543 2792 59 53 60 chr5 125625340 125625512 -26911747 + MTA_Mm LTR MaLR 1 190 -206 1 1543 2792 59 53 60 chr5 125625679 125625896 -26911363 + MTA_Mm LTR MaLR 191 396 0 1 1543 1322 280 50 16 chr5 125636516 125636897 -26900362 + MTD LTR MaLR 12 405 -14 1 1543 284 194 0 0 chr5 125642966 125643028 -26894231 + ORR1A2 LTR MaLR 1 62 -265 1 1543 1577 116 38 11 chr5 125643181 125643437 -26893822 + ORR1A2 LTR MaLR 24 291 -36 1 1543 294 339 108 29 chr5 125649700 125649990 -26887269 - MLT1C LTR MaLR -70 320 6 2 1543 1235 240 71 44 chr5 125652785 125653151 -26884108 + ORR1C1 LTR MaLR 1 376 -2 2 1543 1535 237 24 27 chr5 125666973 125667013 -26870246 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 338 2 1543 2254 106 16 119 chr5 125667013 125667156 -26870103 + ORR1A1 LTR MaLR 1 111 -235 2 1543 2254 106 16 119 chr5 125667295 125667537 -26869722 + ORR1A1 LTR MaLR 112 346 0 2 1543 1522 237 24 27 chr5 125667537 125667869 -26869390 - ORR1D1 LTR MaLR -37 337 1 2 1543 1531 206 48 66 chr5 125668557 125668952 -26868307 + ORR1B1 LTR MaLR 7 394 0 2 1543 481 315 128 32 chr5 125669147 125669546 -26867713 - MLT2B4 LTR ERVL -72 443 35 2 1543 246 243 99 122 chr5 125669728 125669747 -26867512 + MT2B LTR ERVL 151 166 -435 2 1543 301 367 41 85 chr5 125669940 125670211 -26867048 - ORR1E LTR MaLR -44 315 57 2 1543 225 182 0 0 chr5 125670285 125670329 -26866930 + MLT1F LTR MaLR 67 110 -438 2 1543 3315 53 2 2 chr5 125678355 125678751 -26858508 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1543 643 310 104 81 chr5 125694073 125694554 -26842705 + MER77 LTR ERVL 10 501 -106 3 1544 404 226 139 12 chr5 125700390 125700543 -26836716 + MTEb LTR MaLR 191 354 -25 3 1544 3265 68 2 0 chr5 125700601 125701000 -26836259 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1544 814 334 60 0 chr5 125701751 125702053 -26835206 - MLT1C LTR MaLR 0 467 148 3 1544 307 134 224 35 chr5 125711173 125711258 -26826001 - MTD LTR MaLR -90 329 229 3 1544 1067 214 4 70 chr5 125711331 125711439 -26825820 - MTD LTR MaLR -194 225 119 3 1544 1067 214 4 70 chr5 125712329 125712461 -26824798 - MTD LTR MaLR -301 118 1 3 1544 231 224 0 162 chr5 125712920 125712939 -26824320 - MT2B LTR ERVL -385 201 150 3 1544 246 214 72 72 chr5 125717168 125717279 -26819980 - RLTR25B LTR ERVK -521 507 397 3 1544 1294 198 46 95 chr5 125719405 125719795 -26817464 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 158 3 1544 300 195 169 0 chr5 125719795 125719872 -26817387 + RLTR11A LTR ERVK 63 152 -376 3 1544 3409 121 11 35 chr5 125720334 125720874 -26816385 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 3 1544 305 321 40 60 chr5 125727992 125728141 -26809118 - ORR1E LTR MaLR -213 146 1 4 1544 478 166 51 51 chr5 125730227 125730405 -26806854 + RMER17C LTR ERVK 97 274 -136 4 1544 239 361 43 25 chr5 125744817 125744979 -26792280 + MLT1I LTR MaLR 247 411 0 4 1544 245 211 113 26 chr5 125750771 125750922 -26786337 - RMER17C LTR ERVK -133 277 114 4 1544 874 217 107 145 chr5 125753020 125753414 -26783845 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 1544 267 265 15 0 chr5 125764533 125764601 -26772658 + MLT1J2 LTR MaLR 66 134 -314 5 1544 403 330 95 47 chr5 125769065 125769339 -26767920 + MER68 LTR ERVL 82 368 -195 5 1544 350 275 107 0 chr5 125774003 125774152 -26763107 + MLT1D LTR MaLR 252 416 -89 5 1544 869 229 69 82 chr5 125776057 125776362 -26760897 + MTE2a LTR MaLR 3 303 -76 5 1544 259 264 0 0 chr5 125777422 125777475 -26759784 + MTE2a LTR MaLR 327 379 0 5 1544 355 250 62 10 chr5 125780567 125780664 -26756595 + MLT1K LTR MaLR 460 561 -34 5 1544 532 222 27 21 chr5 125784840 125785003 -26752256 + ORR1C2 LTR MaLR 1 146 -248 5 1544 1204 217 3 98 chr5 125785030 125785347 -26751912 + ORR1C2 LTR MaLR 95 381 -3 5 1544 641 231 67 24 chr5 125793741 125793990 -26743269 - MTEb LTR MaLR -39 340 20 5 1544 563 237 97 70 chr5 125799218 125799445 -26737814 + MTD LTR MaLR 7 239 -180 5 1544 284 222 0 16 chr5 125803122 125803186 -26734073 - RMER15 LTR ERVL -154 421 359 6 1544 226 214 88 18 chr5 125808097 125808154 -26729105 + MLT1K LTR MaLR 195 255 -340 6 1544 1787 172 73 45 chr5 125812127 125812552 -26724707 + RMER10A LTR ERVL 1 437 -5 6 1544 1916 166 3 21 chr5 125815455 125815544 -26721715 + MTC LTR MaLR 1 86 -335 6 1544 1916 166 3 21 chr5 125815756 125816004 -26721255 + MTC LTR MaLR 87 332 -89 6 1544 1935 190 73 13 chr5 125825084 125825479 -26711780 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1545 531 316 158 16 chr5 125830668 125830922 -26706337 + MTE2b LTR MaLR 39 328 -51 6 1545 246 207 0 65 chr5 125831210 125831272 -26705987 + MTE2b LTR MaLR 313 370 -9 6 1545 309 295 54 27 chr5 125832455 125832605 -26704654 + MLT1L LTR MaLR 90 248 -362 7 1545 373 235 53 120 chr5 125833718 125833868 -26703391 - MT2B LTR ERVL -323 278 139 7 1545 2587 149 12 12 chr5 125833851 125834264 -26702995 - MTC LTR MaLR -8 413 1 7 1545 351 235 131 52 chr5 125837564 125837725 -26699534 + MT2B LTR ERVL 158 287 -314 7 1545 333 235 26 121 chr5 125839825 125839941 -26697318 + MT2B LTR ERVL 160 264 -337 7 1545 279 297 78 151 chr5 125841296 125841641 -26695618 + MTEa LTR MaLR 24 343 -36 7 1545 1255 231 164 15 chr5 125844671 125845021 -26692238 - MTD LTR MaLR -15 404 18 7 1545 417 169 0 110 chr5 125848947 125849047 -26688212 - MT2B LTR ERVL -344 257 169 7 1545 2134 103 45 10 chr5 125850591 125850905 -26686354 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 7 1545 704 232 157 73 chr5 125853535 125853809 -26683450 + MTEa LTR MaLR 58 354 -25 7 1545 2337 182 118 63 chr5 125854286 125854537 -26682722 + RLTR17 LTR ERVK 1 248 -444 7 1545 4254 35 91 2 chr5 125854537 125855055 -26682204 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 7 1545 2337 182 118 63 chr5 125855055 125855389 -26681870 + RLTR17 LTR ERVK 249 618 -74 7 1545 281 75 56 18 chr5 125855848 125855904 -26681355 + MTEa LTR MaLR 317 379 0 7 1545 3375 33 5 10 chr5 125856521 125856919 -26680340 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1545 1167 228 91 22 chr5 125858841 125859205 -26678054 - RMER17C LTR ERVK -21 389 1 8 1545 1915 226 60 15 chr5 125859559 125860039 -26677220 + RMER20A LTR ERVK 3 504 -12 8 1545 235 242 152 81 chr5 125861202 125861301 -26675958 - MT2B LTR ERVL -341 260 155 8 1545 395 316 56 42 chr5 125862402 125862617 -26674642 - RMER15 LTR ERVL -7 568 351 8 1545 300 278 30 30 chr5 125872913 125872974 -26664285 - ORR1B1-int LTR MaLR -861 648 588 8 1545 1750 170 106 24 chr5 125874716 125874917 -26662342 + RMER17C LTR ERVK 1 195 -215 8 1545 1750 170 106 24 chr5 125874960 125875137 -26662122 + RMER17C LTR ERVK 196 409 -1 8 1545 1886 138 7 3 chr5 125876601 125876885 -26660374 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 8 1545 5436 99 92 19 chr5 125876885 125877757 -26659502 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1029 8 1545 679 136 0 127 chr5 125879127 125879253 -26658006 + MT2B LTR ERVL 175 284 -317 8 1545 1169 167 113 23 chr5 125879215 125879516 -26657743 + ORR1A3-int LTR MaLR 718 1045 -918 8 1545 639 68 0 0 chr5 125879700 125879788 -26657471 - RLTR31_Mur LTR ERVK -465 88 1 8 1545 1457 147 45 0 chr5 125879788 125880039 -26657220 - ORR1A2-int LTR MaLR -1700 263 1 8 1545 1743 99 34 87 chr5 125880037 125880101 -26657158 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 267 8 1545 1743 99 34 87 chr5 125880247 125880480 -26656779 - ORR1A2 LTR MaLR -61 266 44 8 1545 1294 238 107 56 chr5 125882511 125882753 -26654506 - RLTR19C LTR ERVK -49 457 201 8 1545 1294 238 107 56 chr5 125882773 125882961 -26654298 - RLTR19C LTR ERVK -306 200 6 8 1545 399 236 41 47 chr5 125883162 125883269 -26653990 + RMER13B LTR ERVK 1 103 -805 8 1545 374 252 60 43 chr5 125883287 125883403 -26653856 + RMER13B LTR ERVK 524 641 -1 8 1545 239 209 35 201 chr5 125883932 125883945 -26653314 + MT2B2 LTR ERVL 152 184 -400 8 1545 239 209 35 201 chr5 125884045 125884076 -26653183 + MT2B2 LTR ERVL 185 271 -313 8 1545 1373 218 85 11 chr5 125892854 125892870 -26644389 + RMER19A LTR ERVK 225 240 -497 9 1545 1733 144 45 16 chr5 125893017 125893457 -26643802 + RMER19A LTR ERVK 241 737 0 9 1545 438 206 24 81 chr5 125915148 125915300 -26621959 + MT2B LTR ERVL 105 257 -327 9 1545 226 280 13 53 chr5 125917329 125917480 -26619779 + RLTR40 LTR ERVK 570 714 -103 9 1545 556 223 18 110 chr5 125924182 125924409 -26612850 - RMER17C LTR ERVK -204 206 1 9 1545 1595 174 141 50 chr5 125924420 125924784 -26612475 - RMER4B LTR ERVK -143 442 44 9 1545 1595 174 141 50 chr5 125924947 125924983 -26612276 - RMER4B LTR ERVK -542 43 2 9 1545 576 202 92 0 chr5 125929186 125929305 -26607954 + RLTR18B LTR ERVK 10 139 -373 1 1545 356 244 0 12 chr5 125929431 125929514 -26607745 + RLTR18B LTR ERVK 123 204 -308 1 1545 861 248 28 139 chr5 125929617 125929940 -26607319 + RLTR18B LTR ERVK 223 509 -3 1 1545 257 200 99 121 chr5 125930790 125930881 -26606378 - MT2B LTR ERVL -362 239 151 1 1545 1805 132 100 12 chr5 125931141 125931472 -26605787 - MTC LTR MaLR -59 362 3 1 1545 310 216 17 128 chr5 125932328 125932445 -26604814 + MT2B LTR ERVL 155 258 -343 1 1545 3414 149 65 22 chr5 125948990 125949779 -26587480 + RMER12 LTR ERVK 9 781 -541 1 1545 388 294 69 96 chr5 125949821 125949964 -26587295 + RMER12 LTR ERVK 1014 1143 -179 1 1545 788 180 44 16 chr5 125950101 125950270 -26586989 + RMER12 LTR ERVK 1100 1266 -56 1 1545 518 233 144 43 chr5 125953047 125953091 -26584168 + MTD LTR MaLR 198 247 -172 1 1545 518 233 144 43 chr5 125953325 125953466 -26583793 + MTD LTR MaLR 248 402 -17 1 1545 285 282 71 64 chr5 125953591 125953731 -26583528 + MLT1A1 LTR MaLR 10 150 -258 1 1545 241 299 48 88 chr5 125959675 125959822 -26577437 - MT2B LTR ERVL -314 287 147 1 1546 5631 59 16 2 chr5 125973890 125974688 -26562571 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 983 1 1 1546 292 245 72 30 chr5 125987333 125987465 -26549794 - ORR1E LTR MaLR -11 408 254 1 1546 485 200 38 0 chr5 125988103 125988208 -26549051 - ORR1E LTR MaLR -250 109 1 1 1546 1364 102 25 20 chr5 125992562 125992791 -26544468 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 101 1 1546 227 280 40 0 chr5 126002928 126003003 -26534256 + MLT1H2 LTR MaLR 70 147 -342 6 1546 1912 137 79 11 chr5 126003661 126004015 -26533244 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1546 2421 50 3 0 chr5 126008350 126008668 -26528591 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1546 3086 46 5 8 chr5 126021095 126021492 -26515767 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1546 287 333 29 29 chr5 126023834 126023970 -26513289 - MLT1K LTR MaLR -115 480 345 6 1546 773 302 66 84 chr5 126027395 126027704 -26509555 + MTE2a LTR MaLR 8 316 -63 7 1546 1604 181 89 11 chr5 126027704 126028073 -26509186 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 7 1546 773 302 66 84 chr5 126028073 126028142 -26509117 + MTE2a LTR MaLR 317 379 0 7 1546 1476 175 55 0 chr5 126034996 126035288 -26501971 + MTD LTR MaLR 112 419 0 9 1546 1776 219 28 3 chr5 126037488 126037845 -26499414 - MTEb LTR MaLR 0 379 14 9 1546 286 331 98 44 chr5 126040381 126040559 -26496700 - MLT1K LTR MaLR -76 519 332 1 1546 963 258 7 175 chr5 126040559 126041015 -26496244 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1546 794 272 182 22 chr5 126042060 126042385 -26494874 + ORR1E LTR MaLR 1 377 -2 1 1546 281 167 50 0 chr5 126043440 126043500 -26493759 + RLTR25A LTR ERVK 120 182 -921 1 1546 382 286 74 74 chr5 126044601 126044831 -26492428 - ORR1E LTR MaLR -15 344 115 1 1546 2948 37 56 0 chr5 126049877 126050252 -26487007 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1546 460 301 205 7 chr5 126051439 126051727 -26485532 - MLT1G LTR MaLR -8 583 239 1 1546 1500 188 169 6 chr5 126051869 126052217 -26485042 + MTB_Mm LTR MaLR 2 406 -1 1 1546 1784 151 47 0 chr5 126053767 126054066 -26483193 - MTC LTR MaLR -101 320 8 1 1546 1034 242 111 38 chr5 126060995 126061352 -26475907 + MTD LTR MaLR 11 403 -16 1 1546 951 235 121 53 chr5 126061353 126061708 -26475551 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1546 640 254 35 6 chr5 126061773 126061940 -26475319 + ORR1E LTR MaLR 1 172 -187 1 1546 581 159 0 0 chr5 126061940 126062028 -26475231 + RLTR26 LTR ERVK 1 88 -554 1 1546 697 259 33 18 chr5 126062018 126062263 -26474996 + RMER17B LTR ERVK 499 784 -174 1 1546 523 252 65 71 chr5 126062245 126062478 -26474781 + RMER13B LTR ERVK 593 899 -9 1 1546 290 222 15 45 chr5 126062496 126062562 -26474697 + ORR1E LTR MaLR 240 303 -76 1 1546 2196 102 18 56 chr5 126065302 126065644 -26471615 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1546 315 343 36 73 chr5 126067886 126068078 -26469181 + MLT1C LTR MaLR 216 400 -67 1 1546 1970 147 11 138 chr5 126068448 126068890 -26468369 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 1546 4768 84 123 73 chr5 126075697 126076075 -26461184 + RMER17D LTR ERVK 1 347 -542 1 1546 4768 84 123 73 chr5 126076255 126076721 -26460538 + RMER17D LTR ERVK 348 887 -2 1 1546 1039 217 186 26 chr5 126081876 126082183 -26455076 + MTE2a LTR MaLR 1 356 -23 2 1546 3678 39 18 98 chr5 126083713 126084224 -26453035 - MT2C_Mm LTR ERVL -2 473 4 2 1546 346 364 58 41 chr5 126086892 126087184 -26450075 - MT2A LTR ERVL -73 460 164 2 1546 1673 205 74 34 chr5 126090249 126090602 -26446657 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 2 193 1135 218 65 48 chr5 126091239 126091533 -26445726 + MTE2a LTR MaLR 81 379 0 2 1547 848 210 33 71 chr5 126098431 126098641 -26438618 - MTEb LTR MaLR -7 372 171 2 1547 749 263 17 6 chr5 126099178 126099348 -26437911 - MTEb LTR MaLR -207 172 1 2 1547 971 312 33 9 chr5 126100006 126100336 -26436923 - MLT1B LTR MaLR -8 382 45 2 1547 260 259 0 0 chr5 126101880 126101934 -26435325 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 350 2 1547 837 304 121 6 chr5 126103847 126104161 -26433098 - MER67B LTR ERV1 -25 636 287 2 1547 367 333 60 13 chr5 126104225 126104374 -26432885 - MER67B LTR ERV1 -499 162 7 2 1547 2423 129 51 18 chr5 126104873 126105267 -26431992 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1547 1979 221 89 11 chr5 126106967 126107425 -26429834 - MT2A LTR ERVL -2 531 38 2 1547 630 227 139 25 chr5 126109700 126109858 -26427401 - MTE2a LTR MaLR -10 369 194 2 1547 440 337 19 45 chr5 126110440 126110683 -26426576 - ORR1E LTR MaLR -115 244 3 2 1547 750 194 57 25 chr5 126110766 126110925 -26426334 - MTE2a LTR MaLR 0 379 216 2 1547 2478 137 28 59 chr5 126112798 126113224 -26424035 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 1547 1375 254 68 0 chr5 126114187 126114542 -26422717 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 2 1547 1598 184 52 118 chr5 126117940 126118126 -26419133 - ORR1B1 LTR MaLR -20 374 219 2 1547 1598 184 52 118 chr5 126118270 126118483 -26418776 - ORR1B1 LTR MaLR -176 218 1 2 1547 304 292 82 20 chr5 126122958 126123056 -26414203 - RMER20B LTR ERVK -31 596 493 2 1547 646 262 41 108 chr5 126123117 126123500 -26413759 - RMER20B LTR ERVK -22 605 169 2 1547 1413 161 87 135 chr5 126124806 126125207 -26412052 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 2 1547 2510 118 120 193 chr5 126125444 126126075 -26411184 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 2 1547 2063 148 3 0 chr5 126127309 126127627 -26409632 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1547 2321 198 10 5 chr5 126133250 126133661 -26403598 - MTC LTR MaLR -8 413 1 3 1547 318 237 37 13 chr5 126136755 126136858 -26400401 - MTE2b LTR MaLR -8 371 266 3 1547 1949 123 81 3 chr5 126151570 126151903 -26385356 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 3 1547 389 202 26 103 chr5 126153046 126153162 -26384097 - MT2B LTR ERVL -337 264 158 3 1547 251 298 44 80 chr5 126155961 126156074 -26381185 - MLT1J1 LTR MaLR -1 443 335 3 1547 2308 105 59 31 chr5 126157290 126157645 -26379614 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 3 1547 2054 50 51 2 chr5 126158321 126158606 -26378653 + MTA_Mm LTR MaLR 1 398 -2 3 1547 414 289 120 8 chr5 126158999 126159196 -26378063 + MLT1F1 LTR MaLR 90 351 -228 3 1547 902 308 86 56 chr5 126159859 126160323 -26376936 + MTE-int LTR MaLR 948 1425 -155 3 1547 1512 173 77 11 chr5 126160406 126160692 -26376567 + MTD LTR MaLR 115 419 0 3 1547 679 277 77 66 chr5 126160817 126161091 -26376168 + MTEa LTR MaLR 6 282 -97 3 1547 254 219 146 0 chr5 126163435 126163517 -26373742 - RLTR26 LTR ERVK -4 638 545 3 1547 1215 221 143 13 chr5 126163542 126163849 -26373410 - RLTR26 LTR ERVK -295 347 1 3 1547 439 323 77 18 chr5 126175544 126175714 -26361545 + MTE2a LTR MaLR 198 377 -2 4 1547 730 200 313 10 chr5 126178424 126178719 -26358540 + MTD LTR MaLR 22 405 -14 4 1547 555 254 38 8 chr5 126181675 126181798 -26355461 + ORR1E LTR MaLR 7 133 -226 4 1547 432 300 54 70 chr5 126181840 126182108 -26355151 + ORR1E LTR MaLR 93 373 -6 4 1547 429 278 59 15 chr5 126182128 126182263 -26354996 - RMER15 LTR ERVL 0 575 435 4 1547 1296 229 7 11 chr5 126182199 126182477 -26354782 - ORR1C2-int LTR MaLR -1093 277 1 4 1547 990 203 65 19 chr5 126182477 126182703 -26354556 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 149 4 1547 940 174 0 42 chr5 126182822 126183014 -26354245 - ORR1C2 LTR MaLR -188 186 3 4 1547 679 318 43 0 chr5 126183017 126183228 -26354031 - RMER15 LTR ERVL -110 465 246 4 1547 420 359 48 61 chr5 126183631 126184008 -26353251 + MLT1L LTR MaLR 7 378 -232 4 1547 464 252 86 26 chr5 126186391 126186542 -26350717 - MLT1D LTR MaLR -2 503 344 4 1547 237 181 38 100 chr5 126191181 126191261 -26345998 + MLT-int LTR MaLR 1534 1608 -127 4 1547 1653 232 10 23 chr5 126191385 126191769 -26345490 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 4 1547 2887 39 0 3 chr5 126195751 126196089 -26341170 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1547 56911 20 15 6 chr5 126196089 126202506 -26334753 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 4 1547 2901 36 0 3 chr5 126202506 126202844 -26334415 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1547 272 306 58 116 chr5 126202983 126203208 -26334051 - ORR1E LTR MaLR -33 337 126 4 1547 468 243 83 28 chr5 126203723 126203867 -26333392 - ORR1E LTR MaLR -206 153 2 4 1547 1741 134 110 21 chr5 126204618 126204954 -26332305 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 6 4 1547 513 241 51 66 chr5 126205830 126206075 -26331184 + LTRIS_Mm LTR ERV1 276 507 0 4 1547 417 332 57 28 chr5 126207450 126207741 -26329518 + LTR41B LTR ERVL 448 712 -56 4 1547 2798 129 106 34 chr5 126209782 126210280 -26326979 + RLTR20C LTR ERVK 1 534 0 4 1547 2036 180 61 10 chr5 126210640 126211033 -26326226 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1547 420 235 0 0 chr5 126215603 126215688 -26321571 - RMER15-int LTR ERVL -342 4657 4573 4 1547 517 304 0 60 chr5 126217855 126218023 -26319236 - MLT1A LTR MaLR -25 349 192 4 1547 620 300 129 46 chr5 126219126 126219451 -26317808 + MLT1C LTR MaLR 110 461 -6 5 1548 1057 264 31 24 chr5 126223228 126223515 -26313744 - MTD LTR MaLR 0 419 131 5 1548 370 250 18 46 chr5 126223587 126223696 -26313563 - MTD LTR MaLR -309 112 7 5 1548 557 217 0 24 chr5 126226223 126226346 -26310913 + ORR1D2 LTR MaLR 1 120 -250 5 1548 477 258 84 75 chr5 126234837 126235129 -26302130 - MLT1D LTR MaLR -39 428 154 5 1548 2434 169 47 41 chr5 126235142 126235649 -26301610 + RMER15 LTR ERVL 33 542 -33 5 1548 269 330 127 44 chr5 126235837 126236065 -26301194 - MLT1C LTR MaLR -197 270 24 5 1548 1632 213 25 47 chr5 126236305 126236670 -26300589 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 5 1548 517 266 110 54 chr5 126238371 126238622 -26298637 + MTD LTR MaLR 1 265 -154 5 1548 414 254 24 56 chr5 126242371 126242496 -26294763 - RMER5 LTR ERV1 0 534 414 5 1548 1091 273 48 78 chr5 126249897 126250270 -26286989 + MTE2a LTR MaLR 1 362 -17 5 1548 259 245 60 128 chr5 126255371 126255488 -26281771 + RMER12 LTR ERVK 749 857 -465 5 1548 1109 232 40 132 chr5 126259864 126260236 -26277023 + ORR1E LTR MaLR 18 355 -4 5 1548 883 308 127 48 chr5 126260241 126260745 -26276514 + MLT1E3 LTR MaLR 73 616 -8 5 1548 459 320 96 86 chr5 126260755 126261279 -26275980 + MLT1E3-int LTR MaLR 1 638 -733 5 1548 258 246 128 60 chr5 126261508 126261625 -26275634 + ORR1E-int LTR MaLR 1442 1566 -397 5 1548 369 302 148 21 chr5 126262387 126262634 -26274625 - MTEb LTR MaLR -2 377 71 5 1548 980 248 60 32 chr5 126274983 126275233 -26262026 - MTE2a LTR MaLR 0 379 123 6 1548 697 244 77 88 chr5 126275232 126275509 -26261750 - MT2A LTR ERVL -226 267 1 6 1548 1202 195 158 151 chr5 126275631 126276173 -26261086 - MT2B LTR ERVL -15 569 1 6 1548 1519 222 73 27 chr5 126277593 126278001 -26259258 + BGLII_B LTR ERVK 12 438 -3 6 1548 316 310 42 42 chr5 126282453 126282571 -26254688 - MER74C LTR ERVL 0 460 343 6 1548 296 307 148 32 chr5 126282643 126282798 -26254461 - MER74C LTR ERVL -192 268 96 6 1548 2005 121 15 33 chr5 126287181 126287515 -26249744 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 6 1548 2018 230 25 78 chr5 126289103 126289155 -26248104 - MT2A LTR ERVL 0 533 483 6 1548 2206 176 10 5 chr5 126289155 126289543 -26247716 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 5 6 1548 2018 230 25 78 chr5 126289543 126290051 -26247208 - MT2A LTR ERVL -51 482 3 6 1548 373 289 132 0 chr5 126290287 126290408 -26246851 - MLT1A LTR MaLR -83 291 155 6 1548 350 281 63 56 chr5 126290630 126290773 -26246486 - MLT1A LTR MaLR -221 144 1 6 1548 2569 58 3 69 chr5 126291169 126291519 -26245740 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1548 2153 202 23 88 chr5 126292939 126293459 -26243800 - RMER19C LTR ERVK 0 611 126 6 1548 2858 121 177 0 chr5 126293725 126294222 -26243037 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 6 1548 391 305 85 97 chr5 126294273 126294531 -26242728 + MLT1L LTR MaLR 128 382 -228 6 1548 1940 197 16 8 chr5 126295657 126296021 -26241238 - MTD LTR MaLR 0 419 53 6 1548 1517 246 49 140 chr5 126296027 126296621 -26240638 - RLTR20B3 LTR ERVK -17 560 21 6 1548 2697 179 25 34 chr5 126298817 126299344 -26237915 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 3 6 1548 394 342 19 25 chr5 126299346 126299508 -26237751 + ORR1E LTR MaLR 32 192 -167 6 1548 276 284 0 0 chr5 126299536 126299603 -26237656 + ORR1E LTR MaLR 283 349 -30 6 1548 3550 112 37 9 chr5 126300417 126300875 -26236384 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 86 6 1548 3550 112 37 9 chr5 126300895 126300976 -26236283 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -472 85 4 6 1548 294 231 13 0 chr5 126301837 126301915 -26235344 + RMER15 LTR ERVL 296 374 -201 6 1548 1187 272 89 35 chr5 126303224 126303593 -26233666 + MTD LTR MaLR 1 389 -30 6 1548 590 222 0 17 chr5 126308803 126308922 -26228337 - MTD LTR MaLR -216 203 87 6 1548 932 296 113 6 chr5 126309375 126309711 -26227548 - MTD LTR MaLR 0 419 48 6 1548 315 325 169 45 chr5 126309689 126309956 -26227303 + MLT-int LTR MaLR 1407 1706 -29 6 1548 666 231 110 72 chr5 126313009 126313355 -26223904 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 6 1548 1976 127 58 90 chr5 126314713 126315078 -26222181 + ORR1B1 LTR MaLR 42 394 0 6 1548 454 259 160 59 chr5 126315841 126316181 -26221078 + ORR1E LTR MaLR 3 365 -5 6 1548 2367 77 3 61 chr5 126319858 126320203 -26217056 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 7 1548 1848 193 39 47 chr5 126320228 126320656 -26216603 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1548 442 117 10 50 chr5 126320656 126320734 -26216525 - ORR1B1 LTR MaLR -265 102 29 7 1548 1394 204 97 6 chr5 126320837 126321019 -26216240 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 172 7 1548 1394 204 97 6 chr5 126321104 126321262 -26215997 - ORR1D1 LTR MaLR -203 171 4 7 1548 3628 135 49 54 chr5 126323770 126324382 -26212877 + RMER19C LTR ERVK 3 611 0 7 1548 1074 264 116 86 chr5 126324705 126324909 -26212350 + MTD LTR MaLR 1 195 -224 7 1548 1074 264 116 86 chr5 126325078 126325119 -26212140 + MTD LTR MaLR 196 224 -195 7 1548 1651 156 130 23 chr5 126325119 126325302 -26211957 + ORR1C2 LTR MaLR 1 189 -195 7 1548 1651 156 130 23 chr5 126325337 126325500 -26211759 + ORR1C2 LTR MaLR 190 383 -1 7 1548 1074 264 116 86 chr5 126325500 126325659 -26211600 + MTD LTR MaLR 225 418 -1 7 1548 2377 151 47 15 chr5 126325785 126326181 -26211078 - MTC LTR MaLR -2 419 9 7 1548 1915 126 8 97 chr5 126326181 126326542 -26210717 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1548 1439 250 65 22 chr5 126331706 126332074 -26205185 - MTD LTR MaLR -34 385 2 7 1548 230 306 106 111 chr5 126332799 126333016 -26204243 + MLT1A1 LTR MaLR 3 218 -190 7 1548 668 255 229 16 chr5 126338059 126338370 -26198889 + MTD LTR MaLR 43 419 0 7 1548 2164 212 17 167 chr5 126339298 126340017 -26197242 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 7 1548 653 213 0 34 chr5 126341751 126341897 -26195362 + MTEb LTR MaLR 227 367 -12 7 1548 413 278 51 87 chr5 126344637 126344775 -26192484 + MLT1C LTR MaLR 42 174 -216 7 1548 292 271 89 41 chr5 126348030 126348153 -26189106 + RMER5 LTR ERV1 344 472 -62 7 1548 3156 66 36 0 chr5 126349992 126350385 -26186874 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 1548 2181 142 18 18 chr5 126351723 126352109 -26185150 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 7 193 288 319 89 42 chr5 126353278 126353537 -26183722 - ORR1E LTR MaLR -10 349 79 7 1549 330 333 0 0 chr5 126355419 126355500 -26181759 + MER77 LTR ERVL 1 81 -526 7 1549 249 398 44 10 chr5 126355567 126355770 -26181489 + MER77 LTR ERVL 281 490 -117 7 1549 632 234 92 44 chr5 126357304 126357510 -26179749 + RMER15 LTR ERVL 246 461 -114 7 1549 402 285 8 24 chr5 126357713 126357839 -26179420 + RMER15 LTR ERVL 452 575 0 7 1549 505 274 0 38 chr5 126364648 126364781 -26172478 - MTEb LTR MaLR -145 234 107 7 1549 1950 102 16 14 chr5 126366215 126366544 -26170715 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 357 1 7 1549 433 310 19 39 chr5 126367383 126367588 -26169671 - MER90a LTR ERV1 -39 575 375 7 1549 542 267 0 0 chr5 126368589 126368720 -26168539 - MTE2b LTR MaLR -10 369 239 7 1549 1498 212 14 131 chr5 126370080 126370509 -26166750 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 8 1549 2085 125 48 3 chr5 126372835 126373148 -26164111 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1549 3411 162 57 13 chr5 126375603 126376292 -26160967 - MTC-int LTR MaLR -538 720 2 8 1549 1495 169 223 12 chr5 126376295 126376636 -26160623 - MTC LTR MaLR -8 413 1 8 1549 443 222 59 17 chr5 126377093 126377212 -26160047 - ORR1E LTR MaLR -235 124 1 8 1549 2466 139 41 24 chr5 126381651 126382065 -26155194 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1549 291 181 151 14 chr5 126382097 126382137 -26155122 + RMER15 LTR ERVL 492 531 -44 8 1549 291 181 151 14 chr5 126382185 126382217 -26155042 + RMER15 LTR ERVL 532 574 -1 8 1549 614 287 80 76 chr5 126382554 126382979 -26154280 - MT2A LTR ERVL -77 485 1 8 1549 241 207 49 20 chr5 126383869 126383967 -26153292 - MTC-int LTR MaLR -95 1163 1091 8 1549 882 257 198 12 chr5 126391481 126391819 -26145440 - MTD LTR MaLR -18 401 1 8 1549 333 266 103 26 chr5 126392245 126392361 -26144898 - MLT1B LTR MaLR -265 125 1 8 1549 1821 212 103 0 chr5 126393250 126393628 -26143631 - MTD LTR MaLR 0 419 3 8 1549 1395 149 182 3 chr5 126394034 126394270 -26142989 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 88 8 1549 1395 149 182 3 chr5 126394416 126394481 -26142778 - RLTR15 LTR ERVK -272 87 5 8 1549 229 325 17 25 chr5 126395457 126395577 -26141682 + MLT1I LTR MaLR 96 214 -197 8 1549 2075 156 74 65 chr5 126396757 126397174 -26140085 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1549 1795 213 55 5 chr5 126397417 126397814 -26139445 + MTD LTR MaLR 3 419 0 8 1549 2061 179 136 42 chr5 126398251 126398824 -26138435 + RMER20B LTR ERVK 1 627 0 8 1549 366 229 70 85 chr5 126398839 126398968 -26138291 + MT2B LTR ERVL 138 264 -337 8 1549 1967 171 138 0 chr5 126402428 126402797 -26134462 + MTC LTR MaLR 2 421 0 8 1549 259 215 91 15 chr5 126406938 126407004 -26130255 - ORR1E LTR MaLR -9 350 280 8 1549 633 287 0 6 chr5 126412387 126412555 -26124704 - MTEa LTR MaLR -7 372 206 8 1549 1552 203 80 3 chr5 126412539 126412890 -26124369 + MTD LTR MaLR 42 419 0 8 1549 269 270 0 63 chr5 126412890 126412978 -26124281 - MTEa LTR MaLR -297 82 1 8 1549 2935 102 0 12 chr5 126415493 126415901 -26121358 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 4 8 1549 1817 188 38 35 chr5 126417707 126418105 -26119154 - MTD LTR MaLR -2 417 19 9 1549 792 237 8 0 chr5 126418413 126418614 -26118645 + MLT2B2 LTR ERVL 363 567 0 9 1549 334 291 78 0 chr5 126422329 126422432 -26114827 - MTD LTR MaLR -241 178 68 9 1549 1282 191 191 17 chr5 126425734 126426114 -26111145 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 1549 732 266 16 0 chr5 126428305 126428489 -26108770 + MTEa LTR MaLR 193 379 0 9 1549 963 228 190 6 chr5 126428642 126428969 -26108290 + MTD LTR MaLR 19 405 -14 9 1549 2046 228 7 5 chr5 126430447 126430865 -26106394 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 1549 709 199 41 73 chr5 126434267 126434515 -26102744 + ORR1E LTR MaLR 4 251 -119 9 1549 2606 77 0 0 chr5 126435226 126435553 -26101706 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1549 772 293 80 29 chr5 126439978 126440450 -26096809 - RMER15 LTR ERVL 0 575 16 9 1549 2105 165 84 18 chr5 126442494 126442876 -26094383 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 9 1549 244 231 128 46 chr5 126450416 126450525 -26086734 + MER67C LTR ERV1 3 120 -591 9 1549 976 268 94 82 chr5 126450598 126450817 -26086442 + MER67C LTR ERV1 143 386 -325 9 1549 976 268 94 82 chr5 126450860 126450873 -26086386 + MER67C LTR ERV1 387 388 -323 9 1549 976 268 94 82 chr5 126451084 126451341 -26085918 + MER67C LTR ERV1 389 639 -72 9 1549 273 349 65 9 chr5 126457126 126457340 -26079919 - LTR33 LTR ERVL 0 515 290 9 1549 2244 117 0 21 chr5 126457665 126457998 -26079261 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 9 1549 1988 99 85 18 chr5 126462629 126462959 -26074300 - RMER19A LTR ERVK 0 737 386 9 1549 638 139 0 39 chr5 126462942 126463069 -26074190 - RMER19A LTR ERVK -615 122 1 9 1549 1323 240 10 60 chr5 126464770 126465156 -26072103 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 9 1549 3127 53 18 15 chr5 126466548 126466947 -26070312 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1549 1359 228 110 11 chr5 126471125 126471238 -26066021 + MTD LTR MaLR 1 114 -305 1 1549 1359 229 111 11 chr5 126471294 126471562 -26065697 + MTD LTR MaLR 115 398 -21 1 1549 371 209 56 28 chr5 126479869 126479977 -26057282 - MTC LTR MaLR -39 382 272 1 1549 696 253 99 85 chr5 126480263 126480626 -26056633 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 1 1549 1416 239 68 20 chr5 126481186 126481562 -26055697 + MTD LTR MaLR 25 403 -16 1 1549 277 254 140 0 chr5 126483716 126483830 -26053429 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 241 1 1550 1936 183 66 37 chr5 126492065 126492548 -26044711 + RMER20A LTR ERVK 11 507 -9 1 1550 4108 153 95 60 chr5 126496661 126497532 -26039727 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 1550 1131 151 172 87 chr5 126500571 126500926 -26036333 + RMER17B LTR ERVK 2 386 -572 2 1550 2056 173 35 12 chr5 126501176 126501580 -26035679 - MTC LTR MaLR -8 413 1 3 1550 458 331 73 38 chr5 126504323 126504694 -26032565 + MT2A LTR ERVL 146 529 -4 7 1550 311 251 231 16 chr5 126507173 126507359 -26029900 - MLT2B5 LTR ERVL -66 489 264 1 1550 1357 241 94 8 chr5 126507376 126507750 -26029509 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 1 1550 306 161 15 46 chr5 126507751 126507816 -26029443 - MLT2B5 LTR ERVL -246 308 246 1 1550 246 311 14 50 chr5 126507879 126508018 -26029241 - RLTR41 LTR ERV1 -62 384 251 1 1550 726 262 146 10 chr5 126508481 126508789 -26028470 - MLT2B5 LTR ERVL -365 352 3 1 1550 1182 129 100 0 chr5 126509943 126510153 -26027106 + RMER4B LTR ERVK 18 248 -337 1 1550 635 214 43 21 chr5 126510242 126510502 -26026757 + RMER4B LTR ERVK 272 576 -9 1 1550 2455 141 139 16 chr5 126512651 126513148 -26024111 - RMER4B LTR ERVK -12 573 16 2 1550 422 161 361 0 chr5 126513497 126513627 -26023632 - MTD LTR MaLR -58 361 185 2 1550 2443 87 12 3 chr5 126519102 126519426 -26017833 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1550 309 229 120 28 chr5 126519881 126519989 -26017270 - MTEa LTR MaLR -15 364 247 3 1550 262 269 51 0 chr5 126520117 126520195 -26017064 - MTEa LTR MaLR -277 82 1 3 1550 1585 206 77 77 chr5 126524539 126525060 -26012199 - RLTR11A LTR ERVK -6 522 2 5 1550 2258 7 4 0 chr5 126527757 126528032 -26009227 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 71 5 1550 2828 31 3 3 chr5 126528032 126528359 -26008900 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 5 1550 5815 59 15 8 chr5 126528361 126529100 -26008159 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 5 1550 10400 68 63 78 chr5 126529099 126530840 -26006419 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 10 5 1550 2798 37 3 3 chr5 126530845 126531172 -26006087 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 5 1550 569 49 0 0 chr5 126531172 126531248 -26006011 - ORR1A0 LTR MaLR -269 77 2 5 1550 2873 16 0 0 chr5 126532020 126532342 -26004917 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1550 271 70 0 23 chr5 126533126 126533170 -26004089 + RLTR10 LTR ERVK 348 390 0 6 1550 8116 41 2 2 chr5 126533180 126534138 -26003121 + RLTR10-int LTR ERVK 41 998 -989 6 1550 393 224 62 39 chr5 126534202 126534332 -26002927 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 6 1550 8992 12 4 2 chr5 126534414 126535409 -26001850 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 6 1550 2941 41 2 128 chr5 126535409 126535855 -26001404 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 1550 3176 79 77 2 chr5 126537207 126537370 -25999889 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 289 6 1550 3176 79 77 2 chr5 126537416 126537694 -25999565 - MT2C_Mm LTR ERVL -187 288 2 6 1550 1109 150 105 0 chr5 126539995 126540266 -25996993 + ORR1A2 LTR MaLR 13 394 0 7 1550 2511 131 2 10 chr5 126540913 126541321 -25995938 + MTC LTR MaLR 15 419 -2 7 1550 394 283 13 131 chr5 126542429 126542463 -25994796 - MTEa LTR MaLR -169 210 144 7 1550 396 293 38 0 chr5 126542463 126542596 -25994663 - MLT2B5 LTR ERVL -391 210 73 7 1550 394 283 13 131 chr5 126542596 126542665 -25994594 - MTEa LTR MaLR -169 143 3 7 1550 687 289 10 24 chr5 126545541 126545750 -25991509 + MER110 LTR ERV1 70 275 -216 8 1550 2548 169 14 32 chr5 126546557 126547053 -25990206 - RMER19C LTR ERVK -17 594 108 8 1550 2133 125 0 0 chr5 126547200 126547519 -25989740 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 1550 1403 215 66 88 chr5 126548207 126548425 -25988834 - MTD LTR MaLR -16 391 181 8 1550 1403 198 65 102 chr5 126548618 126548821 -25988438 - MTD LTR MaLR -214 205 1 8 1550 1350 234 72 93 chr5 126550116 126550503 -25986756 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 8 1550 840 61 7 26 chr5 126553810 126553962 -25983297 - RMER17B LTR ERVK -498 460 312 9 1550 1830 183 103 3 chr5 126555582 126555961 -25981298 - MTD LTR MaLR -2 417 1 9 1550 1584 131 14 32 chr5 126556934 126557218 -25980041 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 43 1 1550 1542 160 45 7 chr5 126557734 126558043 -25979216 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 1 1550 1555 64 5 18 chr5 126560993 126561216 -25976043 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 345 1 1550 305 82 0 0 chr5 126562629 126562690 -25974569 - MT2A LTR ERVL 0 533 473 1 1550 1286 202 83 23 chr5 126563535 126563920 -25973339 - MT2A LTR ERVL -48 553 14 1 1550 297 195 69 58 chr5 126564736 126564823 -25972436 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 422 1 1550 303 276 19 75 chr5 126565425 126565531 -25971728 + MTEa LTR MaLR 88 187 -192 1 1550 1314 217 95 12 chr5 126565562 126565889 -25971370 + MTD LTR MaLR 20 373 -46 1 1550 514 233 18 150 chr5 126565897 126566124 -25971135 + MTEa LTR MaLR 174 370 -9 1 1550 4105 47 99 2 chr5 126566187 126566701 -25970558 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 1 1550 561 296 81 0 chr5 126567676 126567862 -25969397 - MT2A LTR ERVL -87 446 246 1 1550 230 329 0 0 chr5 126567916 126567992 -25969267 + MLT1D LTR MaLR 357 432 -73 1 1550 555 80 0 0 chr5 126571395 126571469 -25965790 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 315 1 1550 2121 67 26 20 chr5 126571469 126571774 -25965485 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 307 -20 1 1550 2142 55 10 0 chr5 126571801 126572092 -25965167 - RLTR10 LTR ERVK -96 294 1 1 1550 963 237 120 26 chr5 126573515 126573823 -25963436 - ORR1E LTR MaLR 0 359 23 1 1550 1701 207 60 8 chr5 126574998 126575363 -25961896 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 1550 1797 212 57 22 chr5 126582167 126582572 -25954687 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1550 4059 173 85 62 chr5 126582885 126583062 -25954197 + RMER19B LTR ERVK 1 134 -768 1 1550 4059 173 85 62 chr5 126583252 126583956 -25953303 + RMER19B LTR ERVK 135 902 0 1 1550 6084 54 124 1 chr5 126584058 126584853 -25952406 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 1 1550 269 297 106 72 chr5 126585451 126585687 -25951572 + MER67C LTR ERV1 86 329 -382 1 1550 2196 131 62 26 chr5 126586080 126586284 -25950975 + RMER10B LTR ERVL 1 203 -195 1 1550 2196 131 62 26 chr5 126586353 126586532 -25950727 + RMER10B LTR ERVL 204 398 0 1 1550 1058 232 138 35 chr5 126586723 126586896 -25950363 + ORR1C2 LTR MaLR 1 188 -196 1 1550 1058 232 138 35 chr5 126586938 126587112 -25950147 + ORR1C2 LTR MaLR 189 384 0 1 1550 3240 99 9 93 chr5 126587348 126587915 -25949344 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 1 1550 229 287 129 0 chr5 126588337 126588438 -25948821 + RMER5 LTR ERV1 421 534 0 1 1550 2799 102 45 24 chr5 126589572 126589993 -25947266 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 1 1550 2098 122 242 3 chr5 126592439 126592799 -25944460 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 1 1550 449 282 83 6 chr5 126593821 126593978 -25943281 - MLT1D LTR MaLR -3 502 334 1 1550 2525 128 19 62 chr5 126594428 126594913 -25942346 - RMER16 LTR ERVK 0 533 70 1 1550 2075 101 167 47 chr5 126596014 126596397 -25940862 + RLTR23 LTR ERV1 1 429 -1 1 1550 454 175 0 20 chr5 126596926 126597031 -25940228 - MTC LTR MaLR -50 371 257 1 1550 273 132 19 22 chr5 126597107 126597170 -25940089 - RLTR11A LTR ERVK -18 509 448 1 1550 861 202 60 5 chr5 126597382 126597581 -25939678 - RLTR11A LTR ERVK -79 449 240 1 1550 750 244 111 39 chr5 126597660 126597984 -25939275 - RLTR11A LTR ERVK -256 321 1 1 1550 266 297 106 19 chr5 126602792 126602953 -25934306 - RLTR42-int LTR ERVK -4126 1396 1222 1 1550 1530 223 36 11 chr5 126604332 126604690 -25932569 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 1 1550 294 325 60 17 chr5 126604930 126605046 -25932213 + ORR1E LTR MaLR 23 143 -216 1 1550 1261 263 73 18 chr5 126605056 126605440 -25931819 - MTD LTR MaLR -13 406 2 1 1550 2598 169 43 2 chr5 126605867 126606358 -25930901 + RLTR24 LTR ERV1 19 529 0 1 1550 497 343 33 5 chr5 126607417 126607631 -25929628 + RMER15 LTR ERVL 349 568 -7 1 1550 368 306 26 53 chr5 126609213 126609365 -25927894 - MLT1A0 LTR MaLR -1 407 260 1 1550 844 311 39 21 chr5 126612926 126613209 -25924050 - MLT1A0 LTR MaLR -61 304 17 1 1550 1051 282 82 14 chr5 126614872 126615239 -25922020 + MTD LTR MaLR 14 405 -14 2 1551 524 188 107 14 chr5 126617227 126617367 -25919892 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 218 2 1551 1061 252 69 91 chr5 126617489 126617864 -25919395 - MTE2b LTR MaLR 0 379 13 2 1551 356 323 83 77 chr5 126617889 126618201 -25919058 + LTR55 LTR ERV 19 332 -216 2 1551 689 283 204 32 chr5 126622092 126622517 -25914742 + MT2A LTR ERVL 36 533 0 2 1551 1061 272 26 138 chr5 126622946 126623373 -25913886 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1551 390 279 104 179 chr5 126623468 126623870 -25913389 + MTEa LTR MaLR 5 376 -3 2 1551 2908 81 47 0 chr5 126627891 126628273 -25908986 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1551 927 323 2 96 chr5 126629881 126630092 -25907167 - MTEa LTR MaLR -19 360 169 2 1551 927 323 2 96 chr5 126630296 126630481 -25906778 - MTEa LTR MaLR -211 168 1 2 1551 1481 234 11 8 chr5 126642005 126642283 -25894976 + MTEa LTR MaLR 25 302 -77 2 1551 1481 234 11 8 chr5 126642313 126642388 -25894871 + MTEa LTR MaLR 303 378 -1 2 1551 1584 229 40 16 chr5 126642399 126642776 -25894483 + MTD LTR MaLR 26 411 -8 2 1551 2004 197 19 38 chr5 126653881 126654308 -25882951 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1551 1156 248 97 43 chr5 126654911 126655261 -25881998 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 2 1551 1512 234 30 24 chr5 126656026 126656398 -25880861 + MTEa LTR MaLR 6 379 0 2 1551 730 300 127 0 chr5 126657147 126657414 -25879845 - RMER15 LTR ERVL 0 575 275 2 1551 561 168 24 40 chr5 126657447 126657571 -25879688 - RMER15 LTR ERVL -444 131 10 2 1551 1864 226 66 8 chr5 126657877 126658273 -25878986 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1551 883 246 73 94 chr5 126658978 126659319 -25877940 - MTEa LTR MaLR -33 346 13 2 1551 252 218 71 71 chr5 126661806 126661890 -25875369 - RMER3D-int LTR ERVK -1731 1111 1028 2 1551 3215 63 0 2 chr5 126662410 126662805 -25874454 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 2 1551 7689 81 9 69 chr5 126662805 126663974 -25873285 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1551 3301 51 0 5 chr5 126663974 126664372 -25872887 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1551 1394 209 105 35 chr5 126673048 126673420 -25863839 + MTD LTR MaLR 19 416 -3 3 1551 374 216 96 78 chr5 126679996 126680149 -25857110 + MTD LTR MaLR 232 419 0 3 1551 1842 194 12 130 chr5 126680727 126681226 -25856033 + MT2A LTR ERVL 3 442 -91 3 1551 611 292 71 31 chr5 126681905 126682160 -25855099 + LTR41 LTR ERVL 1 265 -503 3 1551 2004 155 101 43 chr5 126691468 126691866 -25845393 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1551 1473 187 87 19 chr5 126691964 126692231 -25845028 + MTD LTR MaLR 1 287 -132 3 1551 1315 178 179 49 chr5 126692231 126692556 -25844703 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1551 1473 187 87 19 chr5 126692556 126692658 -25844601 + MTD LTR MaLR 288 395 -24 3 1551 373 305 26 7 chr5 126696622 126696774 -25840485 - RMER15 LTR ERVL -65 510 356 3 1551 572 297 91 27 chr5 126698104 126698416 -25838843 - MTE2a LTR MaLR -43 376 47 3 1551 1037 220 104 36 chr5 126699160 126699467 -25837792 + MTD LTR MaLR 84 411 -8 3 1551 368 275 9 56 chr5 126699463 126699571 -25837688 - MTE2a LTR MaLR -220 159 57 3 1551 1274 252 82 6 chr5 126704961 126705333 -25831926 - MTD LTR MaLR -20 399 20 3 1551 980 252 77 31 chr5 126706067 126706456 -25830803 + RMER5 LTR ERV1 128 534 0 3 1551 3824 64 19 0 chr5 126717073 126717539 -25819720 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 4 1551 668 288 22 67 chr5 126717635 126717993 -25819266 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 4 1551 357 341 110 48 chr5 126721481 126721627 -25815632 + MLT1F2 LTR MaLR 83 241 -319 4 1551 3072 28 3 64 chr5 126721627 126722016 -25815243 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 4 1551 357 341 110 48 chr5 126722016 126722097 -25815162 + MLT1F2 LTR MaLR 242 324 -236 4 1551 1976 212 101 2 chr5 126724893 126725370 -25811889 + MT2A LTR ERVL 1 524 -9 4 1551 430 281 76 141 chr5 126730674 126731056 -25806203 + MTEa LTR MaLR 2 358 -21 4 1551 808 283 43 68 chr5 126731625 126731993 -25805266 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 4 1551 301 316 130 14 chr5 126732584 126732722 -25804537 - MLT1J2 LTR MaLR -129 319 166 4 1551 1478 182 142 8 chr5 126737268 126737633 -25799626 - MTD LTR MaLR 0 419 6 4 1552 1480 222 96 37 chr5 126747809 126748268 -25788991 + RLTR11A2 LTR ERVK 11 496 -31 4 1552 2343 151 5 3 chr5 126748656 126749035 -25788224 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 4 1552 349 266 0 52 chr5 126752285 126752400 -25784859 - ORR1E LTR MaLR 0 379 271 4 1552 462 324 22 22 chr5 126752947 126753127 -25784132 - ORR1E LTR MaLR -177 182 3 4 1552 260 240 23 200 chr5 126755473 126755517 -25781742 - MT2B LTR ERVL -448 153 133 4 1552 238 353 51 37 chr5 126756937 126757152 -25780107 - MT2A LTR ERVL -70 463 246 4 1552 650 231 21 42 chr5 126760713 126760903 -25776356 + MTEa LTR MaLR 14 199 -180 4 1552 848 213 90 25 chr5 126764646 126764968 -25772291 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 4 1552 439 277 95 19 chr5 126765140 126765350 -25771909 + ORR1E LTR MaLR 11 236 -123 4 1552 246 284 77 33 chr5 126765366 126765457 -25771802 + ORR1E LTR MaLR 238 332 -47 4 1552 1039 254 20 8 chr5 126765921 126766171 -25771088 + MTE2b LTR MaLR 125 377 -2 4 1552 4263 204 70 128 chr5 126767880 126769456 -25767803 - RLTR21 LTR ERVK -106 1466 18 4 1552 550 338 20 31 chr5 126770734 126771027 -25766232 + MT2A LTR ERVL 132 421 -112 4 1552 256 216 0 0 chr5 126771225 126771276 -25765983 + MLT2B3 LTR ERVL 504 554 0 5 1552 1714 124 143 12 chr5 126771934 126772276 -25764983 + ORR1B1 LTR MaLR 8 394 0 5 1552 326 147 55 68 chr5 126775412 126775485 -25761774 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -219 365 294 5 1552 2047 84 16 3 chr5 126776468 126776779 -25760480 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -269 315 1 5 1552 430 246 122 34 chr5 126781602 126781749 -25755510 - RMER15 LTR ERVL -415 160 1 5 1552 586 294 64 10 chr5 126784388 126784591 -25752668 + RMER15 LTR ERVL 360 573 -2 5 1552 405 164 0 14 chr5 126786215 126786289 -25750970 - ORR1E LTR MaLR -13 366 294 5 1552 1370 169 130 28 chr5 126786289 126786611 -25750648 - MTC LTR MaLR 0 421 67 5 1552 656 199 7 7 chr5 126790365 126790502 -25746757 - ORR1E LTR MaLR -205 154 18 5 1552 368 288 3 0 chr5 126791599 126791706 -25745553 - MTE2b LTR MaLR -16 363 256 5 1552 1373 212 117 0 chr5 126791724 126792050 -25745209 + MTD LTR MaLR 1 364 -55 5 1552 322 321 45 22 chr5 126792097 126792231 -25745028 - MTE2b LTR MaLR -217 142 6 5 1552 803 257 115 55 chr5 126792234 126792611 -25744648 + MTE2a LTR MaLR 6 417 -2 5 1552 637 166 130 19 chr5 126797139 126797293 -25739966 + MTD LTR MaLR 233 403 -16 5 1552 3271 61 50 92 chr5 126797877 126798419 -25738840 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 5 1552 300 323 125 39 chr5 126799249 126799481 -25737778 + MLT1A LTR MaLR 75 326 -48 5 1552 267 308 60 0 chr5 126802230 126802347 -25734912 - RMER15 LTR ERVL -49 526 403 5 1552 2898 152 27 8 chr5 126802507 126803025 -25734234 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 5 1552 266 331 60 71 chr5 126809689 126809956 -25727303 + RMER12 LTR ERVK 725 988 -334 5 1552 252 237 101 106 chr5 126811440 126811629 -25725630 - ORR1E LTR MaLR -166 193 6 5 1552 401 283 55 42 chr5 126815281 126815517 -25721742 + RLTR42-int LTR ERVK 1161 1399 -4123 5 1552 260 305 40 158 chr5 126816712 126816965 -25720294 - RMER15 LTR ERVL -16 559 337 5 1552 2599 60 116 6 chr5 126817683 126818036 -25719223 + MTA_Mm LTR MaLR 5 396 0 6 1552 1824 211 72 0 chr5 126826323 126826712 -25710547 + MTD LTR MaLR 3 419 0 6 1552 227 366 16 24 chr5 126830816 126830942 -25706317 + ORR1D2 LTR MaLR 238 362 -8 6 1552 2108 142 24 101 chr5 126830942 126831366 -25705893 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 6 1552 793 200 67 89 chr5 126832849 126832988 -25704271 + MTD LTR MaLR 1 143 -276 6 1552 2818 180 77 66 chr5 126832988 126833596 -25703663 + RLTR18 LTR ERVK 1 615 -1 6 1552 793 200 67 89 chr5 126833596 126833681 -25703578 + MTD LTR MaLR 144 220 -199 6 1552 661 263 129 70 chr5 126833679 126833965 -25703294 + MTE2a LTR MaLR 63 365 -14 6 1552 469 297 46 79 chr5 126833975 126834216 -25703043 + MER89 LTR ERV1 325 557 -2 6 1552 635 277 216 30 chr5 126834531 126834933 -25702326 - RMER5 LTR ERV1 -18 516 40 6 1552 2520 74 3 9 chr5 126840092 126840419 -25696840 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 6 1552 3344 36 3 0 chr5 126847007 126847391 -25689868 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 6 1552 910 232 21 12 chr5 126855790 126856035 -25681224 + ORR1E LTR MaLR 1 271 -108 6 1552 1658 229 6 16 chr5 126860590 126860954 -25676305 - MTEa LTR MaLR 0 379 20 6 1552 2303 149 11 0 chr5 126860985 126861367 -25675892 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 1552 2107 101 3 58 chr5 126862502 126862848 -25674411 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1552 764 317 41 26 chr5 126865867 126865955 -25671304 + RMER15 LTR ERVL 226 315 -260 6 1552 764 317 41 26 chr5 126866032 126866286 -25670973 + RMER15 LTR ERVL 316 572 -3 6 24 648 272 71 185 chr5 126877285 126877735 -25659524 - MTD LTR MaLR -14 407 22 6 1553 1550 200 92 14 chr5 126879326 126879686 -25657573 - MTD LTR MaLR -14 405 18 6 1553 1415 235 78 8 chr5 126882267 126882628 -25654631 - MTD LTR MaLR -15 404 19 7 1553 888 252 45 37 chr5 126885224 126885492 -25651767 + MTEa LTR MaLR 107 376 -3 7 1553 270 327 79 18 chr5 126886382 126886547 -25650712 + MER68 LTR ERVL 148 322 -241 7 1553 1346 224 87 42 chr5 126891780 126892181 -25645078 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1553 618 274 97 91 chr5 126899691 126900020 -25637239 + ORR1E LTR MaLR 14 344 -15 7 1553 3093 61 8 5 chr5 126900135 126900530 -25636729 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1553 292 241 0 60 chr5 126904401 126904485 -25632774 + MTEa-int LTR MaLR 1500 1578 -2 7 1553 401 248 0 38 chr5 126904487 126904592 -25632667 + MTEa LTR MaLR 1 101 -278 7 1553 1461 39 84 162 chr5 126907796 126908104 -25629155 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 9 7 1553 320 24 0 0 chr5 126908140 126908182 -25629077 - RLTR10B LTR ERVK -250 42 1 7 1553 314 275 205 13 chr5 126908525 126908676 -25628583 + MLT1A0 LTR MaLR 145 324 -41 7 1553 1153 254 26 43 chr5 126911551 126911940 -25625319 + MTE2a LTR MaLR 27 404 -15 7 1553 564 244 48 58 chr5 126916634 126916857 -25620402 + MTE2a LTR MaLR 29 217 -162 7 1553 2118 154 89 65 chr5 126916990 126917498 -25619761 + RLTR11A LTR ERVK 9 528 0 7 1553 478 243 117 7 chr5 126917500 126917645 -25619614 + MTE2a LTR MaLR 213 373 -6 7 1553 862 246 56 66 chr5 126917924 126918341 -25618918 - MTE2a LTR MaLR -14 405 1 7 1553 3377 46 2 0 chr5 126922402 126922797 -25614462 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1553 8141 73 18 3 chr5 126922797 126923879 -25613380 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 7 1553 2708 53 3 0 chr5 126923879 126924234 -25613025 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 41 7 1553 338 229 19 103 chr5 126924614 126924628 -25612631 - MTEb LTR MaLR -40 339 328 7 1553 3169 75 2 0 chr5 126924628 126925027 -25612232 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1553 338 229 19 103 chr5 126925027 126925119 -25612140 - MTEb LTR MaLR -52 327 242 7 1553 449 359 21 8 chr5 126926137 126926376 -25610883 - MER68 LTR ERVL -321 242 1 7 1553 225 340 20 54 chr5 126927908 126928057 -25609202 + RMER5 LTR ERV1 228 371 -163 7 1553 2503 89 3 0 chr5 126929816 126930142 -25607117 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1553 4560 10 0 0 chr5 126933726 126934219 -25603040 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 8 1553 3020 15 3 3 chr5 126938149 126938491 -25598768 + ORR1A0 LTR MaLR 5 346 0 8 1553 252 355 9 0 chr5 126942394 126942501 -25594758 + RMER15 LTR ERVL 372 479 -96 8 1553 503 251 114 49 chr5 126943504 126943688 -25593571 - MTE2a LTR MaLR 0 379 184 8 1553 431 296 161 36 chr5 126944077 126944351 -25592908 + RMER5 LTR ERV1 115 422 -112 8 1553 2328 177 93 55 chr5 126945906 126946425 -25590834 + RMER15 LTR ERVL 6 545 -30 8 1553 2328 177 93 55 chr5 126946500 126946529 -25590730 + RMER15 LTR ERVL 546 574 -1 8 1553 471 117 117 0 chr5 126948916 126948993 -25588266 + RLTR28B LTR ERVL 1 86 -395 8 1553 608 150 8 62 chr5 126948997 126949125 -25588134 + RMER4A LTR ERVK 346 466 0 8 1553 2441 155 16 21 chr5 126949497 126949920 -25587339 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1553 2369 183 43 93 chr5 126950195 126950751 -25586508 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 8 1553 2106 178 28 8 chr5 126952319 126952639 -25584620 - RMER4B LTR ERVK 0 585 217 8 1553 2106 176 40 12 chr5 126952715 126952918 -25584341 - RMER4B LTR ERVK -369 216 13 8 1553 1026 258 4 0 chr5 126953213 126953457 -25583802 - MTEb LTR MaLR -12 367 123 8 1553 371 238 179 14 chr5 126953466 126953611 -25583648 - MTEb LTR MaLR -210 169 1 8 1553 701 186 50 0 chr5 126955876 126956016 -25581243 + ORR1D1 LTR MaLR 6 152 -222 8 1553 1004 202 36 9 chr5 126956248 126956468 -25580791 + ORR1D1 LTR MaLR 143 368 -6 8 1553 264 261 43 11 chr5 126960834 126960922 -25576337 - MTD LTR MaLR -253 166 55 8 1553 576 209 97 7 chr5 126971153 126971307 -25565952 - RMER15 LTR ERVL 0 575 408 8 1553 5424 108 27 58 chr5 126971381 126972316 -25564943 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 8 1553 501 285 68 154 chr5 126972364 126972733 -25564526 - RMER20B LTR ERVK -48 579 243 8 1553 1014 201 233 14 chr5 126972920 126973208 -25564051 - RMER15 LTR ERVL -191 384 34 8 1553 1287 235 52 54 chr5 126976032 126976401 -25560858 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 8 1553 2200 131 19 0 chr5 126978490 126978811 -25558448 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1553 262 247 22 90 chr5 126981167 126981188 -25556071 + MTD LTR MaLR 13 35 -384 8 1553 2154 98 37 19 chr5 126981188 126981511 -25555748 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1553 262 247 22 90 chr5 126981511 126981578 -25555681 + MTD LTR MaLR 36 95 -324 8 1553 957 271 30 95 chr5 126981784 126982183 -25555076 + MTE2a LTR MaLR 3 375 -4 8 1553 1311 214 142 12 chr5 126983930 126984127 -25553132 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 8 1553 1311 214 142 12 chr5 126984149 126984282 -25552977 + ORR1D1 LTR MaLR 229 374 0 8 1553 232 200 0 0 chr5 126984291 126984336 -25552923 + ORR1D1 LTR MaLR 330 374 0 8 1553 232 200 0 0 chr5 126984345 126984390 -25552869 + ORR1D1 LTR MaLR 330 374 0 8 1553 396 342 56 94 chr5 126984476 126984815 -25552444 + MLT2B1 LTR ERVL 1 326 -194 8 1553 1515 186 81 25 chr5 126985969 126986327 -25550932 + MTC LTR MaLR 1 378 -43 8 1553 227 294 0 52 chr5 126987385 126987482 -25549777 + RMER5 LTR ERV1 219 310 -224 8 1553 285 312 79 61 chr5 126987793 126987862 -25549397 - MLT1D LTR MaLR -78 427 359 8 1553 285 312 79 61 chr5 126987882 126988041 -25549218 - MLT1D LTR MaLR -147 358 195 8 1553 1648 240 5 8 chr5 126996329 126996699 -25540560 - MTEa LTR MaLR -4 375 7 9 1553 1721 208 96 10 chr5 126999362 126999746 -25537513 + MTC LTR MaLR 5 421 0 9 1553 1554 253 53 77 chr5 127001384 127001890 -25535369 - RMER5 LTR ERV1 0 534 41 4 1553 273 227 14 70 chr5 127001894 127001965 -25535294 - RMER5 LTR ERV1 -467 67 1 4 1553 588 297 110 127 chr5 127005595 127005874 -25531385 - MT2A LTR ERVL -4 516 231 1 1553 432 329 7 32 chr5 127006179 127006333 -25530926 - MT2A LTR ERVL -383 150 1 1 1554 1285 216 70 106 chr5 127012223 127012651 -25524608 - MTD LTR MaLR -14 405 4 2 1554 225 310 16 72 chr5 127014212 127014337 -25522922 - MT2B LTR ERVL -338 263 146 3 1554 534 158 167 0 chr5 127015239 127015353 -25521906 - MTD LTR MaLR -14 405 273 3 1554 1089 244 75 18 chr5 127020792 127021068 -25516191 + MTD LTR MaLR 97 416 -3 4 1554 1755 205 83 31 chr5 127023984 127024371 -25512888 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 4 1554 628 266 129 87 chr5 127032300 127032633 -25504626 + ORR1E LTR MaLR 9 355 -4 6 1554 3710 28 0 0 chr5 127034505 127034901 -25502358 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1554 1582 218 134 76 chr5 127034929 127035400 -25501859 - RLTR18B LTR ERVK -14 498 1 7 1554 237 318 27 0 chr5 127035552 127035662 -25501597 - RMER12 LTR ERVK -466 856 744 7 1554 1707 173 66 68 chr5 127038730 127039140 -25498119 - MTD LTR MaLR -10 409 1 8 1554 995 220 137 105 chr5 127044742 127044855 -25492404 + MTD LTR MaLR 95 182 -237 9 1554 995 220 137 105 chr5 127045137 127045338 -25491921 + MTD LTR MaLR 183 419 0 9 1554 244 206 128 64 chr5 127046613 127046722 -25490537 + MER110 LTR ERV1 359 474 -17 1 1554 2485 154 164 47 chr5 127049189 127049760 -25487499 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 1554 1206 253 86 31 chr5 127051825 127052176 -25485083 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1554 728 231 50 21 chr5 127053090 127053371 -25483888 + ORR1D1 LTR MaLR 1 362 -12 1 1554 2587 42 27 130 chr5 127057860 127058267 -25478992 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 1 1554 2848 67 0 56 chr5 127060505 127060806 -25476453 + BGLII LTR ERVK 1 287 -134 1 1554 2848 67 0 56 chr5 127061154 127061298 -25475961 + BGLII LTR ERVK 288 421 0 1 1554 2048 116 24 62 chr5 127062749 127063088 -25474171 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1554 1597 175 119 3 chr5 127063221 127063565 -25473694 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1554 305 280 96 20 chr5 127066718 127066864 -25470395 - RMER15 LTR ERVL -5 570 414 1 1554 236 208 221 0 chr5 127067840 127067917 -25469342 + MTE2b LTR MaLR 5 98 -281 1 1554 1293 196 100 0 chr5 127067986 127068225 -25469034 + MTE2b LTR MaLR 58 312 -67 1 1554 1293 196 100 0 chr5 127068285 127068336 -25468923 + MTE2b LTR MaLR 313 376 -3 1 1554 1921 106 3 70 chr5 127070041 127070397 -25466862 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 1 1554 13818 26 6 3 chr5 127070397 127071958 -25465301 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4916 1 1554 39080 7 5 7 chr5 127071955 127076237 -25461022 - IAPEz-int LTR ERVK -2208 4273 1 1 1554 1870 105 3 77 chr5 127076238 127076590 -25460669 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 1 1554 2228 94 3 0 chr5 127076775 127077093 -25460166 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1554 452 250 25 16 chr5 127078430 127078552 -25458707 + RMER5 LTR ERV1 1 123 -411 1 1554 386 226 58 19 chr5 127080507 127080611 -25456648 - MTD LTR MaLR -44 375 268 1 1554 367 143 0 0 chr5 127080617 127080673 -25456586 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4556 4611 -1150 1 1554 708 273 46 42 chr5 127080676 127080936 -25456323 - MTD LTR MaLR -158 261 1 1 1554 1218 254 42 27 chr5 127082599 127083008 -25454251 + RMER5 LTR ERV1 115 529 -5 1 1554 895 257 39 131 chr5 127095010 127095422 -25441837 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 1 1554 271 284 37 0 chr5 127099734 127099815 -25437444 - MLT1B LTR MaLR -234 156 73 1 1554 611 167 7 77 chr5 127100077 127100220 -25437039 + MTD LTR MaLR 273 405 -14 1 1554 844 283 140 48 chr5 127101174 127101545 -25435714 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1554 357 375 43 19 chr5 127103941 127104135 -25433124 - LTR55 LTR ERV -231 317 118 2 1554 357 375 43 19 chr5 127104193 127104256 -25433003 - LTR55 LTR ERV -431 117 55 2 1554 3395 33 2 8 chr5 127107316 127107714 -25429545 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1554 297 243 23 0 chr5 127109379 127109459 -25427800 + MLT1E3 LTR MaLR 482 573 -80 2 1554 1696 155 205 3 chr5 127110348 127110490 -25426769 + RMER10B LTR ERVL 1 192 -206 2 1554 1696 155 205 3 chr5 127110665 127110853 -25426406 + RMER10B LTR ERVL 193 398 0 2 1554 3420 129 61 9 chr5 127112157 127112679 -25424580 - RMER4B LTR ERVK 0 585 46 2 1554 3420 129 61 9 chr5 127112703 127112736 -25424523 - RMER4B LTR ERVK -540 45 1 2 1554 747 264 131 15 chr5 127114607 127114935 -25422324 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1554 519 295 128 28 chr5 127119053 127119304 -25417955 + RMER15 LTR ERVL 284 559 -16 2 1554 274 242 78 39 chr5 127123024 127123127 -25414132 - MLT2B4 LTR ERVL -3 553 447 2 1554 1287 233 157 44 chr5 127123911 127124133 -25413126 + RMER4B LTR ERVK 17 263 -322 2 1554 1287 233 157 44 chr5 127124174 127124454 -25412805 + RMER4B LTR ERVK 264 576 -9 2 1554 907 214 37 23 chr5 127124462 127124677 -25412582 + MurERV4-int LTR ERVK 9 226 -5034 2 1554 284 186 39 48 chr5 127126394 127126499 -25410760 + MTEb LTR MaLR 275 379 0 2 1554 1193 196 35 0 chr5 127129879 127130109 -25407150 + MTD LTR MaLR 165 402 -17 2 1554 1276 201 159 9 chr5 127132460 127132786 -25404473 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 2 1554 817 181 147 14 chr5 127133348 127133566 -25403693 + RMER4B LTR ERVK 1 247 -338 2 1554 454 241 69 37 chr5 127133817 127134020 -25403239 + RMER4B LTR ERVK 332 568 -17 2 1554 432 156 16 114 chr5 127135241 127135364 -25401895 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 2 1554 482 259 199 38 chr5 127138907 127139224 -25398035 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 1555 1239 177 146 0 chr5 127140284 127140572 -25396687 + MTD LTR MaLR 76 405 -14 2 1555 1341 229 101 6 chr5 127142346 127142684 -25394575 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 1555 1144 218 138 14 chr5 127144969 127145332 -25391927 + MTD LTR MaLR 12 419 0 2 1555 991 286 90 24 chr5 127148650 127148983 -25388276 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 2 1555 811 209 9 71 chr5 127149556 127149767 -25387492 - MTE2b LTR MaLR -11 368 171 2 1555 1890 116 14 109 chr5 127150369 127150737 -25386522 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 6 3 1555 289 270 0 65 chr5 127154052 127154159 -25383100 - MT2B LTR ERVL -345 256 157 3 1555 2640 91 121 18 chr5 127157224 127157614 -25379645 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 3 1555 845 257 107 44 chr5 127158000 127158318 -25378941 - MTD LTR MaLR -64 355 18 3 1555 251 277 34 51 chr5 127164438 127164556 -25372703 + MLT1A0 LTR MaLR 47 162 -203 3 1555 760 279 34 129 chr5 127166586 127166819 -25370440 - MTD LTR MaLR -14 405 202 3 1555 912 268 38 134 chr5 127166883 127167097 -25370162 - MTD LTR MaLR -219 200 1 3 1555 5032 78 15 50 chr5 127167741 127168519 -25368740 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 3 1555 1522 194 149 82 chr5 127169205 127169549 -25367710 - RLTR20B3 LTR ERVK -91 486 119 3 1555 1522 194 149 82 chr5 127169884 127169988 -25367271 - RLTR20B3 LTR ERVK -459 118 9 3 1555 1360 267 79 21 chr5 127170318 127170697 -25366562 - MTD LTR MaLR -15 404 4 3 1555 399 307 60 12 chr5 127172488 127172656 -25364603 + MLT1L LTR MaLR 306 481 -129 3 1555 583 262 20 7 chr5 127172892 127173038 -25364221 - RMER5 LTR ERV1 0 534 387 3 1555 239 308 120 67 chr5 127173753 127174094 -25363165 - RMER17C LTR ERVK -17 393 35 3 1555 1020 269 70 15 chr5 127174166 127174494 -25362765 - RMER5 LTR ERV1 -156 378 33 3 1555 651 225 117 40 chr5 127180557 127180828 -25356431 - RMER15 LTR ERVL -174 401 1 3 1555 257 183 117 0 chr5 127181725 127181785 -25355474 + MTEb LTR MaLR 295 361 -18 3 1555 453 340 86 30 chr5 127182397 127182594 -25354665 + MTEb LTR MaLR 1 208 -171 3 1555 1706 197 105 65 chr5 127183242 127183746 -25353513 + RLTR11A LTR ERVK 1 524 -4 3 1555 1723 228 37 9 chr5 127184891 127185240 -25352019 + ORR1D2 LTR MaLR 11 369 -1 3 1555 229 338 52 15 chr5 127189357 127189492 -25347767 - MLT1L LTR MaLR -125 485 346 3 1555 1501 204 88 7 chr5 127190252 127190558 -25346701 + MTD LTR MaLR 1 331 -88 3 1555 448 327 92 35 chr5 127191752 127191944 -25345315 + MLT1A LTR MaLR 134 341 -33 3 1555 1444 197 154 42 chr5 127191944 127192321 -25344938 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1555 448 327 92 35 chr5 127192321 127192356 -25344903 + MLT1A LTR MaLR 342 374 0 3 1555 3171 63 5 2 chr5 127193570 127193969 -25343290 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1555 1708 239 60 43 chr5 127195458 127195589 -25341670 + RLTR20B1 LTR ERVK 89 218 -345 3 1555 1708 239 60 43 chr5 127195687 127196022 -25341237 + RLTR20B1 LTR ERVK 219 563 0 3 1555 2070 174 11 18 chr5 127196872 127197253 -25340006 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 3 1555 1715 126 118 14 chr5 127201836 127202125 -25335134 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1555 563 248 19 45 chr5 127202968 127203124 -25334135 - MTEb LTR MaLR -30 349 198 4 1555 1185 179 9 23 chr5 127203505 127203722 -25333537 - MTEb LTR MaLR -164 215 2 4 1555 471 132 0 0 chr5 127204127 127204195 -25333064 - RLTR28 LTR ERVL -456 68 1 4 1555 245 360 40 60 chr5 127204270 127204471 -25332788 + MER57C2 LTR ERV1 182 378 -56 4 1555 457 287 169 17 chr5 127205578 127205755 -25331504 - RMER15 LTR ERVL -93 482 279 4 1555 342 321 0 84 chr5 127207570 127207689 -25329570 + MTEa LTR MaLR 1 109 -270 4 1555 1923 216 37 10 chr5 127207890 127208292 -25328967 + MTD LTR MaLR 6 418 -1 4 1555 2231 143 20 58 chr5 127209477 127209870 -25327389 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1555 372 342 8 0 chr5 127209903 127210020 -25327239 - RMER15 LTR ERVL -55 520 403 4 1555 408 325 24 30 chr5 127217429 127217594 -25319665 - LTR75 LTR ERVL -62 500 337 4 1555 266 328 69 83 chr5 127219243 127219459 -25317800 + MER68 LTR ERVL 53 265 -298 4 1555 262 208 206 10 chr5 127222434 127222531 -25314728 - MTEb LTR MaLR 0 379 264 4 1555 238 329 97 13 chr5 127223025 127223179 -25314080 - MLT1E LTR MaLR -380 273 107 4 1555 419 216 149 39 chr5 127224408 127224615 -25312644 + MTD LTR MaLR 127 404 -15 4 1555 1326 175 163 34 chr5 127225335 127225661 -25311598 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 4 1555 4136 120 89 42 chr5 127231549 127232271 -25304988 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 4 1555 411 333 25 0 chr5 127233753 127233912 -25303347 + RMER5 LTR ERV1 361 523 -11 4 1555 572 283 65 22 chr5 127235567 127235882 -25301377 - MER67D LTR ERV1 -375 336 3 4 1555 1395 173 72 91 chr5 127236492 127236855 -25300404 + RLTR41 LTR ERV1 91 446 0 4 1555 819 238 149 13 chr5 127236995 127237233 -25300026 - RMER17C LTR ERVK -51 359 80 4 1555 819 238 149 13 chr5 127237290 127237353 -25299906 - RMER17C LTR ERVK -331 79 17 4 1555 944 148 22 51 chr5 127237353 127237531 -25299728 - RMER17C-int LTR ERVK -8 3230 3058 4 1555 2048 175 49 5 chr5 127238246 127238636 -25298623 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1555 5674 126 66 10 chr5 127243083 127243481 -25293778 + RMER17B LTR ERVK 1 399 -559 4 1555 5674 126 66 10 chr5 127243538 127244046 -25293213 + RMER17B LTR ERVK 400 957 -1 4 1555 387 321 32 6 chr5 127247734 127247891 -25289368 - MT2A LTR ERVL -71 462 302 4 1555 1232 212 122 15 chr5 127248688 127249081 -25288178 - RMER10A LTR ERVL 0 442 8 5 1555 2740 117 15 15 chr5 127250825 127251301 -25285958 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 35 5 1555 402 275 49 16 chr5 127252605 127252727 -25284532 + RMER15 LTR ERVL 296 421 -154 5 1555 1096 199 11 225 chr5 127255008 127255474 -25281785 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 5 1555 359 339 106 13 chr5 127255728 127255955 -25281304 + MLT1C LTR MaLR 204 451 -16 5 1555 402 246 61 8 chr5 127256868 127256999 -25280260 - MLT1B LTR MaLR -71 319 182 5 1555 354 221 71 32 chr5 127257819 127257945 -25279314 - MLT1B LTR MaLR -195 195 65 5 1555 259 239 42 14 chr5 127263128 127263200 -25274059 + LTR33C LTR ERVL 10 83 -546 5 1555 1862 203 32 45 chr5 127264363 127264806 -25272453 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 5 5 1555 299 280 211 21 chr5 127266827 127267017 -25270242 - MLT1D LTR MaLR -7 498 273 5 1555 2168 216 96 33 chr5 127267218 127267759 -25269500 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 5 1556 296 159 0 45 chr5 127271160 127271226 -25266033 - MTE2b LTR MaLR -10 369 307 5 1556 980 288 56 10 chr5 127271654 127271956 -25265303 - MTE2b LTR MaLR -60 319 4 5 1556 1128 279 46 32 chr5 127274340 127274774 -25262485 - BGLII_B LTR ERVK -1 440 1 5 1556 1415 223 43 69 chr5 127275203 127275282 -25261977 + MTD LTR MaLR 8 80 -339 5 1556 1415 223 43 69 chr5 127275450 127275792 -25261467 + MTD LTR MaLR 81 418 -1 5 1556 909 65 3 1 chr5 127277400 127277536 -25259723 - ORR1A3 LTR MaLR -8 386 198 5 1556 741 249 8 23 chr5 127279247 127279554 -25257705 + ORR1D1 LTR MaLR 1 368 -6 5 1556 907 284 65 63 chr5 127281211 127281670 -25255589 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 59 5 1556 1935 131 24 42 chr5 127289572 127289907 -25247352 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1556 1242 246 27 91 chr5 127292030 127292405 -25244854 + ORR1E LTR MaLR 9 359 0 5 1556 3445 160 40 82 chr5 127293141 127293857 -25243402 + RMER19B LTR ERVK 1 686 -216 5 1556 1516 208 46 89 chr5 127295695 127296133 -25241126 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1556 269 377 0 9 chr5 127298640 127298755 -25238504 - MT2A LTR ERVL -114 419 306 5 1556 4446 16 0 12 chr5 127299810 127300309 -25236950 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1556 41438 16 14 0 chr5 127300309 127305596 -25231663 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 5 1556 354 167 46 35 chr5 127305596 127305683 -25231576 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 5 1556 321 0 0 0 chr5 127305683 127305721 -25231538 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 1556 4446 16 0 12 chr5 127305721 127306220 -25231039 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1556 1508 226 28 43 chr5 127306348 127306700 -25230559 + MTE2b LTR MaLR 18 364 -15 5 1556 1240 128 16 47 chr5 127308899 127309153 -25228106 + RLTR9A LTR ERVK 1 246 -122 6 1556 389 271 0 0 chr5 127309552 127309648 -25227611 + MTEb LTR MaLR 2 97 -282 6 1556 1235 179 76 31 chr5 127309651 127309968 -25227291 - RMER19C LTR ERVK -3 608 278 6 1556 503 282 119 80 chr5 127317132 127317459 -25219800 + MTEa LTR MaLR 4 343 -36 6 1556 283 339 101 40 chr5 127318349 127318576 -25218683 + MLT2B1 LTR ERVL 327 567 0 6 1556 291 347 34 87 chr5 127319507 127319603 -25217656 + MTEa LTR MaLR 1 96 -283 6 1556 1690 162 132 35 chr5 127319603 127319974 -25217285 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1556 291 347 34 87 chr5 127319974 127320085 -25217174 + MTEa LTR MaLR 97 197 -182 6 1556 1555 191 113 6 chr5 127320828 127321191 -25216068 + MTD LTR MaLR 18 419 0 6 1556 1059 269 59 53 chr5 127321784 127321837 -25215422 + MTE2b LTR MaLR 20 58 -321 6 1556 1059 269 59 53 chr5 127321897 127322200 -25215059 + MTE2b LTR MaLR 59 378 -1 6 1556 315 267 0 0 chr5 127330657 127330732 -25206527 - RLTR24 LTR ERV1 -454 75 1 6 1556 1017 226 128 49 chr5 127334898 127334976 -25202283 - MTEa LTR MaLR 0 379 286 6 1556 2433 149 10 34 chr5 127334976 127335393 -25201866 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1556 1017 226 128 49 chr5 127335393 127335659 -25201600 - MTEa LTR MaLR -94 285 8 6 1556 1591 170 125 0 chr5 127335874 127336162 -25201097 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 1 6 1556 2617 131 36 22 chr5 127339735 127340148 -25197111 - MTC LTR MaLR -2 419 1 6 1556 718 256 32 76 chr5 127341263 127341512 -25195747 - ORR1E LTR MaLR -5 354 117 6 1556 2686 136 26 30 chr5 127343309 127343816 -25193443 + RMER6A LTR ERVK 1 505 -251 6 1556 1417 180 54 18 chr5 127343792 127344237 -25193022 + RMER6A LTR ERVK 321 756 0 6 1556 4150 38 6 33 chr5 127346952 127347469 -25189790 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 6 1556 773 291 43 49 chr5 127348048 127348395 -25188864 + RMER15 LTR ERVL 226 570 -5 6 1556 681 309 13 39 chr5 127350232 127350461 -25186798 - MTE2b LTR MaLR -116 263 41 6 1556 836 278 104 30 chr5 127352891 127353285 -25183974 - MER67C LTR ERV1 -286 425 3 6 1556 1809 207 64 35 chr5 127355476 127355687 -25181572 + MTD LTR MaLR 3 205 -214 6 1556 1809 207 64 35 chr5 127355930 127356121 -25181138 + MTD LTR MaLR 206 419 0 6 1556 5100 171 36 8 chr5 127356159 127357036 -25180223 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 6 1556 375 302 99 15 chr5 127360032 127360163 -25177096 + ORR1E LTR MaLR 6 147 -212 7 1556 234 349 0 76 chr5 127365430 127365548 -25171711 + ORR1E LTR MaLR 88 196 -163 7 1556 1245 261 30 19 chr5 127369277 127369626 -25167633 - ORR1E LTR MaLR -2 417 6 7 1556 1197 244 5 92 chr5 127381082 127381471 -25155788 + ORR1E LTR MaLR 5 359 0 7 1556 296 315 92 33 chr5 127386388 127386572 -25150687 + RMER15 LTR ERVL 354 548 -27 7 1556 405 340 47 14 chr5 127387816 127388028 -25149231 + MLT1D LTR MaLR 23 241 -264 7 1556 329 271 109 71 chr5 127388064 127388247 -25149012 + MLT1D LTR MaLR 310 499 -6 7 1556 2000 169 96 35 chr5 127388482 127388971 -25148288 - RLTR11A LTR ERVK -9 519 1 7 1556 477 265 126 50 chr5 127390460 127390595 -25146664 + ORR1E LTR MaLR 9 162 -197 7 1556 1259 226 81 53 chr5 127390595 127390955 -25146304 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1556 477 272 97 77 chr5 127390955 127391092 -25146167 + ORR1E LTR MaLR 149 284 -86 7 1556 1557 235 44 25 chr5 127393177 127393583 -25143676 - MTD LTR MaLR 0 419 6 7 1556 278 356 17 0 chr5 127395975 127396093 -25141166 - MLT1A0 LTR MaLR -39 326 207 7 1556 458 179 8 17 chr5 127396577 127396696 -25140563 + ORR1B2 LTR MaLR 1 118 -249 7 1556 1581 127 51 37 chr5 127396694 127396989 -25140270 + ORR1B2 LTR MaLR 59 357 -10 7 1556 855 285 95 15 chr5 127397537 127397811 -25139448 - ORR1E LTR MaLR -4 355 60 7 1556 369 251 76 22 chr5 127397800 127397943 -25139316 - ORR1D2 LTR MaLR -221 138 1 7 1557 2983 65 42 0 chr5 127401999 127402383 -25134876 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1557 301 300 64 0 chr5 127405069 127405179 -25132080 + MTEa LTR MaLR 259 375 -4 7 1557 1850 232 86 12 chr5 127408286 127408787 -25128472 + RMER15 LTR ERVL 38 575 0 7 1557 820 241 107 33 chr5 127412998 127413320 -25123939 - MTD LTR MaLR -42 377 6 8 1557 339 282 93 42 chr5 127413335 127413559 -25123700 - ORR1E LTR MaLR -32 347 98 8 1557 653 281 226 4 chr5 127415127 127415197 -25122062 - MTD LTR MaLR 0 419 331 8 1557 2342 203 57 92 chr5 127415197 127415830 -25121429 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 8 1557 653 282 198 14 chr5 127415830 127416090 -25121169 - MTD LTR MaLR -89 330 1 8 1557 232 340 84 32 chr5 127416330 127416485 -25120774 - LTR16B2 LTR ERVL -226 236 74 8 1557 2267 38 3 74 chr5 127417268 127417607 -25119652 + RLTR10B2 LTR ERVK 50 364 -1 8 1557 270 366 79 18 chr5 127418621 127418849 -25118410 - LTR33A LTR ERVL -255 265 24 8 1557 1341 243 80 31 chr5 127420469 127420818 -25116441 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 8 1557 1775 159 22 0 chr5 127420943 127421258 -25116001 + ORR1A2 LTR MaLR 1 322 -5 8 1557 4427 164 80 46 chr5 127421382 127422259 -25115000 - RMER13B LTR ERVK 0 908 2 8 1557 505 264 37 50 chr5 127423317 127423588 -25113671 - ORR1E LTR MaLR -105 265 3 8 1557 1479 190 83 24 chr5 127424592 127424964 -25112295 - MTD LTR MaLR -14 405 12 8 1557 322 257 26 71 chr5 127435468 127435581 -25101678 - MT2B LTR ERVL -344 257 150 8 1557 1146 295 60 15 chr5 127437240 127437639 -25099620 - MTD LTR MaLR 0 419 3 8 1557 335 357 52 42 chr5 127438007 127438317 -25098942 - LTR53 LTR ERVL -9 510 198 8 1557 1498 264 24 21 chr5 127438685 127439103 -25098156 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1557 2045 139 45 3 chr5 127440234 127440566 -25096693 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 8 1557 3423 76 6 37 chr5 127441000 127441490 -25095769 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 8 1557 4084 94 27 41 chr5 127441500 127442220 -25095039 + IAPEz-int LTR ERVK 35 662 -5819 8 1557 964 67 0 0 chr5 127442220 127442339 -25094920 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 8 1557 1929 82 4 0 chr5 127442340 127442585 -25094674 + IAPEz-int LTR ERVK 2252 2497 -5183 8 1557 15500 36 3 7 chr5 127442603 127444415 -25092844 + IAPEz-int LTR ERVK 4678 6481 0 8 1557 3413 78 6 37 chr5 127444415 127444905 -25092354 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 8 1557 1191 229 3 14 chr5 127444933 127445212 -25092047 - ORR1E LTR MaLR -99 271 1 8 1557 233 290 213 21 chr5 127447840 127447981 -25089278 + MLT1I LTR MaLR 205 372 -39 8 1557 877 202 139 3 chr5 127448098 127448467 -25088792 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1557 832 249 13 18 chr5 127450355 127450580 -25086679 - RMER15 LTR ERVL -54 521 298 8 1557 623 312 72 57 chr5 127453816 127454234 -25083025 - MER67D LTR ERV1 -31 483 60 8 1557 1630 219 30 65 chr5 127456926 127457435 -25079824 + RMER5 LTR ERV1 44 534 0 8 1557 260 321 49 58 chr5 127458725 127458930 -25078329 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 168 8 1557 1456 212 83 17 chr5 127460069 127460420 -25076839 - MTEa LTR MaLR -2 377 4 8 1557 2394 157 73 60 chr5 127460433 127460498 -25076761 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 464 8 1557 2394 157 73 60 chr5 127460523 127460978 -25076281 - RLTR11A LTR ERVK -65 463 1 8 1557 1124 250 76 34 chr5 127462064 127462449 -25074810 - BGLII_B LTR ERVK -21 420 22 9 1557 300 234 78 136 chr5 127463371 127463577 -25073682 + MTE2a LTR MaLR 178 352 -27 9 1557 400 286 42 21 chr5 127463634 127463777 -25073482 + RMER15 LTR ERVL 337 482 -93 9 1557 1372 214 45 39 chr5 127463792 127464071 -25073188 - RLTR12B LTR ERVK -3 525 244 9 1557 3091 14 0 9 chr5 127464071 127464420 -25072839 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 9 1557 14282 44 23 1 chr5 127464420 127466172 -25071087 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 9 1557 3085 26 0 0 chr5 127466172 127466518 -25070741 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 9 1557 1372 214 45 39 chr5 127466518 127466592 -25070667 - RLTR12B LTR ERVK -285 243 170 9 1557 1131 266 87 11 chr5 127466791 127467160 -25070099 - MTD LTR MaLR 0 419 23 9 1557 1386 198 53 130 chr5 127468111 127468565 -25068694 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 1557 1992 188 49 16 chr5 127469478 127469905 -25067354 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 9 1557 1081 156 279 16 chr5 127470271 127470590 -25066669 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 9 1557 2907 186 13 7 chr5 127471615 127472156 -25065103 + RMER15 LTR ERVL 1 544 -31 9 1557 1089 265 43 16 chr5 127473989 127474292 -25062967 - MTEb LTR MaLR 0 379 69 9 1557 307 246 145 16 chr5 127475752 127475876 -25061383 - ORR1E LTR MaLR -67 303 164 9 1557 668 229 26 32 chr5 127476021 127476210 -25061049 - ORR1E LTR MaLR -169 190 3 9 1557 652 286 20 55 chr5 127476300 127476648 -25060611 + RLTR15 LTR ERVK 3 338 -21 9 1557 516 162 8 10 chr5 127476936 127477058 -25060201 - ORR1B1 LTR MaLR -240 154 1 9 1557 1137 165 4 34 chr5 127477058 127477295 -25059964 + RLTR28 LTR ERVL 265 494 -30 9 1557 563 335 33 133 chr5 127480477 127480928 -25056331 + MTC LTR MaLR 2 407 -14 9 1557 369 303 22 22 chr5 127482363 127482498 -25054761 + RLTR11A LTR ERVK 388 522 -6 9 1557 481 301 75 42 chr5 127483177 127483416 -25053843 - MER110 LTR ERV1 -244 247 1 9 1557 844 258 37 138 chr5 127484684 127485062 -25052197 - MTE2b LTR MaLR -31 348 9 9 1557 2296 84 12 64 chr5 127485095 127485440 -25051819 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1557 288 202 0 62 chr5 127487812 127487877 -25049382 - ORR1D1 LTR MaLR -288 82 21 9 1557 3195 143 105 40 chr5 127498841 127499060 -25038199 - RMER6C LTR ERVK 0 690 462 9 1557 3195 143 105 40 chr5 127499289 127499713 -25037546 - RMER6C LTR ERVK -229 461 1 9 1557 1219 255 69 13 chr5 127500438 127500815 -25036444 - MTD LTR MaLR 0 419 22 1 1557 1975 166 52 81 chr5 127506338 127506744 -25030515 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1557 538 198 0 62 chr5 127506966 127507079 -25030180 + MTD LTR MaLR 178 283 -136 1 1557 271 349 44 28 chr5 127507165 127507345 -25029914 - MER57D LTR ERV1 -47 364 182 1 1557 930 259 14 25 chr5 127517483 127517526 -25019733 - RMER15 LTR ERVL 0 575 532 2 1557 930 259 14 25 chr5 127517574 127517807 -25019452 - RMER15 LTR ERVL -44 531 302 2 1557 1950 167 137 11 chr5 127519404 127519870 -25017389 + RMER15 LTR ERVL 27 551 -24 3 1557 1440 258 22 8 chr5 127522687 127523051 -25014208 + MTE2b LTR MaLR 1 369 -10 3 1557 1253 206 188 18 chr5 127528017 127528357 -25008902 + MTD LTR MaLR 18 415 -4 4 1558 577 277 112 39 chr5 127540127 127540412 -24996847 - MER74A LTR ERVL -251 307 2 6 1558 910 256 44 18 chr5 127543388 127543662 -24993597 - ORR1E LTR MaLR -78 281 1 7 1558 1444 234 56 17 chr5 127549767 127549937 -24987322 + ORR1D1 LTR MaLR 1 169 -205 8 1558 1444 234 56 17 chr5 127550027 127550216 -24987043 + ORR1D1 LTR MaLR 170 374 0 8 1558 359 217 0 0 chr5 127551680 127551749 -24985510 - MTEa LTR MaLR -305 74 6 9 1558 378 196 35 105 chr5 127552438 127552552 -24984707 + MTEa LTR MaLR 164 269 -110 9 1558 577 265 47 8 chr5 127552530 127552721 -24984538 + MTEa LTR MaLR 159 378 -1 9 1558 499 221 0 34 chr5 127561032 127561149 -24976110 + MTEa LTR MaLR 265 377 -2 1 1558 1629 205 95 11 chr5 127561579 127561958 -24975301 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 1 1558 1565 190 76 27 chr5 127562666 127563034 -24974225 - MTD LTR MaLR -33 386 1 1 1558 1592 190 99 3 chr5 127564392 127564746 -24972513 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 1 1558 338 274 9 0 chr5 127564876 127564982 -24972277 + MLT1D LTR MaLR 135 241 -264 1 1558 2259 165 31 13 chr5 127568071 127568542 -24968717 + RLTR11A LTR ERVK 8 513 -15 1 1558 2460 110 96 5 chr5 127568618 127569003 -24968256 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 1 1558 260 320 52 0 chr5 127583852 127583949 -24953310 - MLT1D LTR MaLR -367 138 37 1 1558 318 307 20 0 chr5 127584175 127584276 -24952983 - ORR1E LTR MaLR -256 103 1 1 1558 383 301 45 52 chr5 127586773 127586917 -24950342 + ORR1D2 LTR MaLR 4 149 -210 1 1558 436 132 0 0 chr5 127587006 127587074 -24950185 + ORR1D2 LTR MaLR 295 362 -8 1 1558 828 230 80 1 chr5 127588327 127588575 -24948684 + MTD LTR MaLR 1 308 -113 1 1558 428 245 76 14 chr5 127589524 127589669 -24947590 - RMER15 LTR ERVL -70 505 352 1 1558 358 303 138 49 chr5 127590979 127591008 -24946251 - MT2A LTR ERVL -8 593 565 1 1558 893 219 213 121 chr5 127591129 127591556 -24945703 - MT2A LTR ERVL -37 564 1 1 1558 1369 237 73 13 chr5 127592478 127592868 -24944391 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 1 1558 2253 147 68 15 chr5 127595596 127595996 -24941263 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1558 1340 222 158 3 chr5 127596773 127597134 -24940125 - MTD LTR MaLR 0 419 3 1 1558 303 216 8 211 chr5 127598078 127598201 -24939058 + MTEa LTR MaLR 218 315 -64 1 1558 1479 228 32 6 chr5 127600715 127601059 -24936200 + MTEa LTR MaLR 27 379 0 1 1558 1542 184 2 136 chr5 127603316 127603743 -24933516 - ORR1C1 LTR MaLR -4 374 5 1 1558 356 356 22 6 chr5 127604715 127604893 -24932366 - MER34 LTR ERV1 -39 503 323 1 1558 920 305 67 31 chr5 127605934 127606320 -24930939 + MTD LTR MaLR 1 400 -19 1 1558 2218 176 16 30 chr5 127606392 127606819 -24930440 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1558 1079 245 50 107 chr5 127613637 127614039 -24923220 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1558 791 194 30 18 chr5 127614237 127614405 -24922854 - MTE2b LTR MaLR -6 373 204 2 1558 1703 188 57 14 chr5 127615677 127616027 -24921232 - MTC LTR MaLR 0 421 57 2 1558 586 176 9 0 chr5 127616181 127616289 -24920970 - MTE2b LTR MaLR -312 109 1 2 1558 2017 176 107 33 chr5 127617475 127617963 -24919296 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 2 1558 1657 156 53 28 chr5 127618445 127618897 -24918362 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 2 1558 433 333 7 11 chr5 127623307 127623490 -24913769 + MLT1E2 LTR MaLR 340 521 -103 2 1558 267 174 0 0 chr5 127624162 127624208 -24913051 + ORR1D2 LTR MaLR 1 46 -324 2 1558 496 306 74 64 chr5 127625210 127625507 -24911752 + LTR16A LTR ERVL 33 332 -119 2 1558 575 326 37 31 chr5 127626479 127626802 -24910457 - MER68 LTR ERVL -5 558 234 2 1558 1173 183 6 70 chr5 127627978 127628290 -24908969 + RMER16 LTR ERVK 242 533 0 2 1558 1014 181 133 24 chr5 127628696 127628906 -24908353 - RLTR20D LTR ERVK -335 233 1 2 1558 1942 143 56 46 chr5 127629106 127629159 -24908100 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 335 2 1558 1942 143 56 46 chr5 127629275 127629594 -24907665 - ORR1C1 LTR MaLR -44 334 1 2 1558 247 304 43 9 chr5 127629603 127629719 -24907540 - RMER15 LTR ERVL -119 456 337 2 1558 1701 180 58 14 chr5 127632538 127632882 -24904377 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 2 1558 3465 23 5 0 chr5 127633516 127633910 -24903349 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1558 9086 42 4 1 chr5 127633910 127635005 -24902254 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1558 3465 23 5 0 chr5 127635005 127635399 -24901860 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1558 282 293 151 54 chr5 127638852 127639130 -24898129 + MLT1C LTR MaLR 99 403 -64 2 1558 666 262 85 41 chr5 127642188 127642506 -24894753 - MT2A LTR ERVL -3 530 199 2 1558 1420 246 26 11 chr5 127642775 127643124 -24894135 + ORR1E LTR MaLR 3 356 -3 2 1558 2774 155 31 27 chr5 127648651 127649047 -24888212 + RLTR11A LTR ERVK 4 398 -130 2 1558 3146 14 0 3 chr5 127649047 127649394 -24887865 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1558 2774 155 31 27 chr5 127649394 127649450 -24887809 + RLTR11A LTR ERVK 399 458 -70 2 1558 2774 155 31 27 chr5 127649505 127649574 -24887685 + RLTR11A LTR ERVK 459 528 0 2 1558 1573 201 41 6 chr5 127649793 127650108 -24887151 + MTD LTR MaLR 6 331 -88 2 1558 338 277 44 63 chr5 127650136 127650294 -24886965 + RMER15 LTR ERVL 329 483 -92 2 1558 400 333 41 26 chr5 127651122 127651316 -24885943 + RMER15 LTR ERVL 337 533 -42 2 1558 1379 194 300 31 chr5 127651521 127651974 -24885285 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 2 1558 1222 259 92 3 chr5 127652980 127653297 -24883962 + MTEa LTR MaLR 29 373 -6 2 1558 2253 102 3 61 chr5 127653473 127653819 -24883440 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 1558 316 332 94 5 chr5 127653824 127654027 -24883232 + MER89 LTR ERV1 337 557 -2 2 1558 7052 139 25 13 chr5 127655307 127656546 -24880713 + RLTR21 LTR ERVK 1 1254 -318 2 1558 2620 193 37 12 chr5 127656830 127657348 -24879911 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 185 2 1558 258 280 13 156 chr5 127657626 127657653 -24879606 + RLTR21 LTR ERVK 1202 1223 -181 2 1558 258 280 13 156 chr5 127657698 127657741 -24879518 + RLTR21 LTR ERVK 1224 1260 -144 2 1558 330 228 14 155 chr5 127657783 127657948 -24879311 + RLTR21 LTR ERVK 1261 1572 0 2 1558 228 316 25 0 chr5 127658579 127658658 -24878601 - MLT1J2 LTR MaLR -306 142 62 2 1558 947 197 81 36 chr5 127658815 127658842 -24878417 + ORR1D1 LTR MaLR 1 27 -347 2 1558 1730 155 91 87 chr5 127658842 127659281 -24877978 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 2 1558 947 235 113 28 chr5 127659281 127659568 -24877691 + ORR1D1 LTR MaLR 25 357 -2 2 1558 1658 176 47 16 chr5 127662154 127662519 -24874740 + MTD LTR MaLR 44 419 0 2 1558 1128 192 27 0 chr5 127663679 127663903 -24873356 - MTEb LTR MaLR -6 373 144 2 1559 745 281 73 18 chr5 127665030 127665065 -24872194 - RMER5 LTR ERV1 -12 522 488 2 1559 1912 168 61 66 chr5 127665065 127665461 -24871798 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1559 745 281 73 18 chr5 127665461 127665697 -24871562 - RMER5 LTR ERV1 -47 487 236 2 1559 659 196 184 55 chr5 127665727 127665974 -24871285 - RMER4B LTR ERVK -23 588 343 2 1559 913 206 85 1 chr5 127666231 127666469 -24870790 - RMER4B LTR ERVK -198 268 1 2 1559 733 228 56 77 chr5 127666472 127666705 -24870554 - RMER5 LTR ERV1 -306 228 1 2 1559 1040 298 72 9 chr5 127667840 127668185 -24869074 - MTE2b LTR MaLR -10 369 3 3 1559 318 287 39 29 chr5 127670751 127670855 -24866404 - MLT1C LTR MaLR -298 169 65 3 1559 2538 198 68 2 chr5 127673436 127673936 -24863323 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 3 1559 330 356 75 7 chr5 127674484 127674631 -24862628 + MLT1E2 LTR MaLR 308 464 -163 3 1559 327 241 176 22 chr5 127676184 127676320 -24860939 + MTEb LTR MaLR 55 211 -168 3 1559 293 242 5 23 chr5 127676365 127676454 -24860805 + MTEb LTR MaLR 269 361 -18 3 1559 332 257 29 10 chr5 127682636 127682738 -24854521 - MLT1D LTR MaLR 0 505 402 3 1559 2062 211 143 20 chr5 127685019 127685570 -24851689 - RLTR17 LTR ERVK -73 619 1 3 1559 692 228 118 18 chr5 127686875 127687045 -24850214 - ORR1B1 LTR MaLR -26 368 182 3 1559 2132 76 4 0 chr5 127687047 127687324 -24849935 + ORR1A2 LTR MaLR 5 282 -45 3 1559 464 36 0 0 chr5 127688858 127688913 -24848346 + ORR1A2 LTR MaLR 272 326 0 3 1559 690 157 150 44 chr5 127688913 127689070 -24848189 - ORR1B1 LTR MaLR -180 214 41 3 1559 461 264 61 77 chr5 127689390 127689571 -24847688 - MER74B LTR ERVL -372 250 73 3 1559 265 299 60 78 chr5 127690986 127691102 -24846157 - MLT1D LTR MaLR -133 372 259 3 1559 2126 142 93 40 chr5 127691625 127692022 -24845237 - MTC LTR MaLR -2 419 2 3 1559 1077 203 127 107 chr5 127693199 127693624 -24843635 - MT2A LTR ERVL -44 557 1 3 1559 1542 234 104 30 chr5 127694654 127695126 -24842133 - RMER5 LTR ERV1 -22 512 6 3 1559 305 285 34 81 chr5 127698141 127698152 -24839107 - ORR1E LTR MaLR -2 377 368 3 1559 538 269 36 51 chr5 127698407 127698694 -24838565 - ORR1E LTR MaLR -12 367 7 3 1559 2281 61 2 175 chr5 127699373 127699768 -24837491 + ORR1A3 LTR MaLR 1 327 0 3 1559 11358 114 108 5 chr5 127699768 127701479 -24835780 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 1885 -78 3 1559 11358 114 108 5 chr5 127701522 127701590 -24835669 + ORR1A3-int LTR MaLR 1886 1962 -1 3 1559 2363 98 3 0 chr5 127701590 127701907 -24835352 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 3 1559 621 309 45 81 chr5 127702054 127702413 -24834846 - ORR1E LTR MaLR -8 351 6 3 1559 987 287 56 78 chr5 127702449 127702857 -24834402 - MTD LTR MaLR -20 399 1 3 1559 1928 209 60 8 chr5 127704608 127705018 -24832241 + RMER19C LTR ERVK 220 611 0 3 1559 413 250 33 8 chr5 127706323 127706444 -24830815 - RMER15 LTR ERVL -154 421 298 3 1559 333 309 119 31 chr5 127707917 127708111 -24829148 - RMER15 LTR ERVL -106 469 259 3 1559 330 262 49 24 chr5 127709443 127709493 -24827766 + ORR1B1-int LTR MaLR 594 655 -854 3 1559 2239 92 19 19 chr5 127709503 127709826 -24827433 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 3 1559 519 129 20 88 chr5 127709826 127709917 -24827342 + MT2B LTR ERVL 173 256 -345 3 1559 330 262 49 24 chr5 127709917 127709929 -24827330 + ORR1B1-int LTR MaLR 656 760 -749 3 1559 228 405 45 13 chr5 127716958 127717113 -24820146 - MLT1I LTR MaLR -13 398 239 4 1559 1996 188 8 22 chr5 127719368 127719733 -24817526 - MTEa LTR MaLR -17 362 3 4 1559 269 316 113 88 chr5 127729050 127729289 -24807970 - MLT1C LTR MaLR -10 457 213 4 1559 279 330 186 24 chr5 127731104 127731442 -24805817 - MLT1K LTR MaLR -113 482 90 4 1559 480 326 46 46 chr5 127732908 127733146 -24804113 + MLT2D LTR ERVL 14 251 -163 4 1559 1550 212 35 19 chr5 127734033 127734403 -24802856 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 4 1559 1155 273 94 14 chr5 127735150 127735521 -24801738 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 4 1559 979 233 87 42 chr5 127737884 127738249 -24799010 - MTD LTR MaLR -14 405 7 4 1559 2600 155 93 86 chr5 127738370 127738929 -24798330 - RMER19B LTR ERVK -336 566 4 4 1559 276 328 119 85 chr5 127739661 127740131 -24797128 + LTR33A LTR ERVL 14 499 -21 4 1559 884 310 63 52 chr5 127748817 127749184 -24788075 - MTE2a LTR MaLR -2 377 7 4 1559 536 287 28 14 chr5 127751015 127751160 -24786099 + MTE2a LTR MaLR 15 161 -218 4 1559 269 135 18 71 chr5 127759054 127759110 -24778149 - MTE2b LTR MaLR 0 379 327 4 1559 272 280 135 8 chr5 127760404 127760530 -24776729 - MLT1K LTR MaLR 0 595 454 4 1559 748 244 155 59 chr5 127760551 127760938 -24776321 + MLT1C LTR MaLR 3 426 -41 4 1559 2996 63 44 3 chr5 127762375 127762759 -24774500 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1559 328 208 117 0 chr5 127770216 127770293 -24766966 + MLT1G1 LTR MaLR 471 556 -23 4 1559 4246 174 89 64 chr5 127773267 127774136 -24763123 + RMER19B LTR ERVK 13 902 0 4 1559 1140 257 22 114 chr5 127774889 127775293 -24761966 + MTE2a LTR MaLR 11 377 -2 5 1559 1272 248 14 102 chr5 127784005 127784418 -24752841 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 5 1559 1288 233 76 45 chr5 127792026 127792420 -24744839 - MTD LTR MaLR -14 405 1 5 1559 266 252 117 138 chr5 127792986 127793225 -24744034 - ORR1C2 LTR MaLR -73 311 63 5 1559 288 347 97 7 chr5 127793352 127793497 -24743762 + MLT1J LTR MaLR 161 318 -194 5 1559 269 287 53 53 chr5 127793530 127793644 -24743615 + MLT1J LTR MaLR 360 473 -39 5 1560 1350 246 14 118 chr5 127795242 127795657 -24741602 - MTE2a LTR MaLR -5 374 3 5 1560 1144 249 40 34 chr5 127802938 127803266 -24733993 - MTE2b LTR MaLR -3 376 47 5 1560 1335 223 39 75 chr5 127807304 127807663 -24729596 + MTE2a LTR MaLR 2 347 -32 5 1560 255 278 27 14 chr5 127812039 127812112 -24725147 - MLT1C LTR MaLR -371 96 23 5 1560 3659 57 35 2 chr5 127813150 127813610 -24723649 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 1560 698 307 60 54 chr5 127814949 127815280 -24721979 - ORR1E LTR MaLR -4 355 23 5 1560 980 256 118 17 chr5 127818154 127818457 -24718802 + ORR1E LTR MaLR 1 351 -28 6 1560 275 272 111 99 chr5 127818606 127818956 -24718303 + RLTR21 LTR ERVK 671 1311 -261 6 1560 543 229 80 62 chr5 127820018 127820186 -24717073 - MTD LTR MaLR -14 405 238 6 1560 457 234 0 11 chr5 127820923 127821018 -24716241 - RMER17C LTR ERVK -315 95 2 6 1560 260 254 17 0 chr5 127823695 127823754 -24713505 - MLT1F1 LTR MaLR -319 250 191 6 1560 608 341 139 39 chr5 127829140 127829579 -24707680 + MLT1D LTR MaLR 21 503 -2 6 1560 1303 221 61 52 chr5 127848822 127849174 -24688085 - MTE2a LTR MaLR -14 405 39 6 1560 956 268 72 111 chr5 127849375 127849445 -24687814 - MTE2a LTR MaLR -365 54 7 6 1560 292 333 0 10 chr5 127849900 127850003 -24687256 - MLT1K LTR MaLR -18 449 348 6 1560 304 378 99 49 chr5 127853422 127853706 -24683553 - MLT1K LTR MaLR -294 301 4 6 1560 315 238 154 91 chr5 127855104 127855312 -24681947 + MER57F LTR ERV1 208 428 -8 6 1560 1434 240 84 6 chr5 127856749 127857105 -24680154 - MTD LTR MaLR -14 405 22 6 1560 1976 161 109 21 chr5 127860492 127860517 -24676742 + MTC LTR MaLR 5 40 -381 7 1560 1976 161 109 21 chr5 127860569 127860918 -24676341 + MTC LTR MaLR 41 412 -9 7 1560 313 320 77 23 chr5 127862252 127862407 -24674852 - MLT1H LTR MaLR -6 549 382 7 1560 267 280 27 0 chr5 127862550 127862625 -24674634 - MLT1H LTR MaLR -410 139 63 7 1560 1288 174 168 54 chr5 127865081 127865415 -24671844 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 7 1560 1378 108 81 0 chr5 127865513 127865736 -24671523 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 89 7 1560 622 67 31 43 chr5 127867173 127867298 -24669961 - ORR1A4 LTR MaLR -249 145 1 7 1560 821 312 42 42 chr5 127867517 127867801 -24669458 + MTEb LTR MaLR 10 293 -86 7 1560 1754 135 49 49 chr5 127867963 127868290 -24668969 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 7 1560 385 316 83 50 chr5 127869862 127870102 -24667157 - MLT1F LTR MaLR -104 444 197 7 1560 1500 188 90 24 chr5 127876268 127876601 -24660658 + MTD LTR MaLR 65 419 0 7 1560 387 313 37 7 chr5 127876822 127876957 -24660302 - RMER15 LTR ERVL -15 560 422 7 1560 226 289 133 38 chr5 127877735 127877893 -24659366 - MLT1K LTR MaLR -6 589 417 7 1560 757 271 218 37 chr5 127880993 127881276 -24655983 - MTD LTR MaLR -34 385 36 7 1560 757 271 218 37 chr5 127881501 127881543 -24655716 - MTD LTR MaLR -384 35 1 7 1560 3548 158 192 74 chr5 127882948 127883755 -24653504 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 7 1560 1136 263 84 89 chr5 127884886 127885057 -24652202 + MTE2b LTR MaLR 1 194 -185 7 1560 837 290 73 43 chr5 127885057 127885425 -24651834 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 7 1560 1136 263 84 89 chr5 127885425 127885633 -24651626 + MTE2b LTR MaLR 195 378 -1 7 1560 1155 242 77 21 chr5 127886382 127886707 -24650552 + ORR1E LTR MaLR 2 344 -15 7 1560 1720 205 33 39 chr5 127889498 127889858 -24647401 - MTE2b LTR MaLR -13 366 9 7 1560 368 335 67 24 chr5 127892871 127893079 -24644180 - RMER15 LTR ERVL -23 552 336 7 1560 707 336 49 89 chr5 127893430 127893799 -24643460 + ORR1E LTR MaLR 2 355 -4 7 1560 267 273 14 70 chr5 127894273 127894344 -24642915 + MLT1H LTR MaLR 483 549 0 7 1560 1900 164 29 45 chr5 127895265 127895642 -24641617 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 7 1560 305 319 52 40 chr5 127897363 127897536 -24639723 - RMER15 LTR ERVL -62 513 339 7 1560 3154 70 5 0 chr5 127899067 127899465 -24637794 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1560 1956 208 11 11 chr5 127900860 127901229 -24636030 + MTEa LTR MaLR 1 369 -10 7 1560 1297 191 130 8 chr5 127906915 127907217 -24630042 - MTD LTR MaLR -15 404 82 8 1560 656 311 88 91 chr5 127911177 127911595 -24625664 + MTD LTR MaLR 3 419 0 8 1560 410 252 160 7 chr5 127913296 127913440 -24623819 - MLT1B LTR MaLR -34 356 191 8 1560 295 136 152 0 chr5 127913530 127913589 -24623670 - RMER19C LTR ERVK -543 68 1 8 1560 266 405 66 40 chr5 127925667 127925873 -24611386 - MLT1L LTR MaLR -206 404 198 8 1560 266 405 66 40 chr5 127925942 127926085 -24611174 - MLT1L LTR MaLR -413 197 46 8 1561 1718 248 14 25 chr5 127926794 127927154 -24610105 + ORR1D2 LTR MaLR 9 364 -6 8 1561 291 252 123 28 chr5 127927825 127927931 -24609328 - MLT1K LTR MaLR -62 533 418 8 1561 1604 132 92 66 chr5 127929613 127929932 -24607327 - ORR1A3 LTR MaLR 0 419 1 8 1561 862 304 45 14 chr5 127930001 127930318 -24606941 - MLT1A0 LTR MaLR 0 467 43 8 1561 1000 176 11 21 chr5 127931603 127931794 -24605465 - MTEa LTR MaLR -8 371 183 8 1561 772 252 125 9 chr5 127936771 127936987 -24600272 + MTEa LTR MaLR 1 241 -138 8 1561 3284 34 2 193 chr5 127937291 127937830 -24599429 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 8 1561 1079 248 73 118 chr5 127941938 127942377 -24594882 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1561 2041 175 57 22 chr5 127944262 127944665 -24592594 - MTD LTR MaLR -2 417 1 8 1561 442 198 10 77 chr5 127947822 127947926 -24589333 + MTC LTR MaLR 18 114 -307 8 1561 320 284 136 103 chr5 127947973 127948342 -24588917 - MLT1B LTR MaLR -1 504 124 8 1561 356 269 100 8 chr5 127949657 127949777 -24587482 - MLT1B LTR MaLR -230 160 30 8 1561 324 331 58 84 chr5 127949972 127950233 -24587026 + LTR16A1 LTR ERVL 202 455 -1 8 1561 225 284 95 133 chr5 127953983 127954194 -24583065 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 27 229 -555 9 1561 290 253 48 135 chr5 127954318 127954366 -24582893 + RMER17C LTR ERVK 38 85 -325 9 1561 290 253 48 135 chr5 127954519 127954804 -24582455 + RMER17C LTR ERVK 86 342 -68 9 1561 348 339 43 39 chr5 127955323 127955781 -24581478 + MLT1F1 LTR MaLR 42 568 -1 9 1561 276 326 66 81 chr5 127956343 127956540 -24580719 - ORR1E LTR MaLR -104 255 62 9 1561 447 331 132 47 chr5 127958619 127958936 -24578323 - MLT1J LTR MaLR -128 384 41 9 1561 614 249 183 103 chr5 127959804 127960039 -24577220 - MTEb LTR MaLR -1 378 167 9 1561 614 249 183 103 chr5 127960065 127960179 -24577080 - MTEb LTR MaLR -213 166 3 9 1561 434 322 128 36 chr5 127961362 127961746 -24575513 + MLT1F2 LTR MaLR 22 440 -120 9 1561 326 333 35 80 chr5 127965877 127966076 -24571183 - MLT1J LTR MaLR -45 467 278 9 1561 306 266 113 17 chr5 127967819 127967934 -24569325 - LTR37A LTR ERV1 -111 315 190 9 1561 1096 250 130 14 chr5 127968066 127968358 -24568901 - MTEa LTR MaLR -12 367 42 9 1561 2226 166 76 10 chr5 127972238 127972633 -24564626 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1561 358 286 164 5 chr5 127975143 127975350 -24561909 - MLT1A0 LTR MaLR -93 272 33 9 1561 769 288 33 69 chr5 127979185 127979491 -24557768 - ORR1E LTR MaLR -64 295 1 9 1561 2193 104 21 59 chr5 127980684 127981022 -24556237 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 9 1561 628 279 89 0 chr5 127981188 127981346 -24555913 + MTEb LTR MaLR 1 172 -207 9 1561 904 244 73 155 chr5 127985787 127986199 -24551060 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 9 1561 256 317 203 15 chr5 127987100 127987302 -24549957 - MLT1K LTR MaLR -347 248 9 9 1561 258 279 23 133 chr5 127987572 127987618 -24549641 - MT2B2 LTR ERVL -426 158 127 9 1561 627 210 126 15 chr5 127991474 127991672 -24545587 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 149 9 1561 328 280 32 0 chr5 127991831 127991849 -24545410 - ORR1D2 LTR MaLR -185 185 167 9 1561 328 280 32 0 chr5 127991906 127991980 -24545279 - ORR1D2 LTR MaLR -204 166 91 9 1561 619 158 0 29 chr5 127992189 127992293 -24544966 - ORR1D2 LTR MaLR -258 101 1 9 1561 2005 110 117 18 chr5 127993911 127994245 -24543014 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1561 229 234 65 122 chr5 127994432 127994479 -24542780 + ORR1E LTR MaLR 53 101 -258 1 1561 229 234 65 122 chr5 127994679 127994738 -24542521 + ORR1E LTR MaLR 102 153 -206 1 1561 350 238 58 29 chr5 127998052 127998156 -24539103 - MT2B LTR ERVL -344 257 151 1 1561 279 315 117 47 chr5 127999281 127999659 -24537600 + MLT1D LTR MaLR 34 466 -39 1 1561 364 257 0 121 chr5 128004537 128004661 -24532598 + MT2B LTR ERVL 149 257 -344 1 1561 1476 222 21 36 chr5 128004712 128005044 -24532215 - MTD LTR MaLR -92 327 1 1 1561 354 320 55 92 chr5 128007762 128008055 -24529204 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 87 2 1561 272 323 196 20 chr5 128015707 128016013 -24521246 - MLT1D LTR MaLR -69 436 77 3 1561 1469 201 150 22 chr5 128016025 128016386 -24520873 - MTD LTR MaLR -11 408 2 3 1561 303 356 156 33 chr5 128017948 128018218 -24519041 - LTR40b LTR ERVL 0 462 160 3 1561 4474 12 0 12 chr5 128018329 128018828 -24518431 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1561 21170 9 1 0 chr5 128018828 128021249 -24516010 + MERVL-int LTR ERVL 1 2424 -3061 3 1561 2705 40 3 14 chr5 128021216 128021570 -24515689 + MERVL-int LTR ERVL 5011 5360 -125 3 1561 382 179 46 35 chr5 128021570 128021657 -24515602 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 1561 305 0 0 0 chr5 128021657 128021695 -24515564 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 1561 4474 12 0 12 chr5 128021695 128022194 -24515065 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1561 422 209 270 0 chr5 128024295 128024410 -24512849 - ORR1E LTR MaLR -212 147 2 4 1561 2114 132 6 18 chr5 128026331 128026662 -24510597 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1561 2793 53 24 0 chr5 128036544 128036882 -24500377 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 1561 271 343 95 43 chr5 128037163 128037373 -24499886 - MLT1E3 LTR MaLR -146 478 258 6 1561 2494 219 48 0 chr5 128042214 128042717 -24494542 - MT2A LTR ERVL -6 527 1 7 1561 1351 199 56 28 chr5 128046326 128046610 -24490649 - MTEa LTR MaLR -82 297 6 7 1561 277 326 10 30 chr5 128050771 128050872 -24486387 - MLT1C LTR MaLR -316 151 53 8 1561 511 265 7 29 chr5 128051056 128051196 -24486063 - MTEa LTR MaLR -4 375 239 8 1561 799 289 39 66 chr5 128052008 128052342 -24484917 - MTD LTR MaLR -94 325 1 9 195 2089 117 38 3 chr5 128057040 128057382 -24479877 + RLTR15 LTR ERVK 1 354 -5 9 1562 487 193 131 25 chr5 128059779 128059901 -24477358 - MTEb LTR MaLR 0 379 245 1 1562 257 293 19 48 chr5 128061290 128061394 -24475865 - MLT1H LTR MaLR -445 104 4 1 1562 282 299 126 51 chr5 128061756 128061971 -24475288 + MLT1B LTR MaLR 135 365 -25 1 1562 2277 111 84 14 chr5 128062736 128063093 -24474166 - MTC LTR MaLR -39 382 1 1 1562 272 272 40 88 chr5 128064410 128064436 -24472823 - RLTR25B LTR ERVK -465 563 445 1 1562 689 263 106 0 chr5 128065937 128066116 -24471143 - MTE2a LTR MaLR 0 379 182 1 1562 538 193 119 0 chr5 128066344 128066453 -24470806 - MTE2a LTR MaLR -200 179 58 1 1562 413 269 88 59 chr5 128066576 128066746 -24470513 - ORR1E LTR MaLR -184 175 1 1 1562 674 102 78 0 chr5 128068932 128069060 -24468199 - RMER17B LTR ERVK -495 463 326 1 1562 423 212 89 19 chr5 128094793 128094911 -24442348 - MTE2b LTR MaLR -5 374 249 1 1562 344 189 53 53 chr5 128094933 128095028 -24442231 - MTE2b LTR MaLR -279 95 1 1 1562 1544 189 143 20 chr5 128099366 128099722 -24437537 + MTD LTR MaLR 8 407 -12 1 1562 1987 111 175 0 chr5 128100140 128100465 -24436794 + ORR1B1 LTR MaLR 5 386 -8 1 1562 691 294 39 0 chr5 128101411 128101615 -24435644 + RMER15 LTR ERVL 347 558 -17 1 1562 2531 153 21 19 chr5 128105649 128105753 -24431506 + MTC LTR MaLR 1 99 -322 2 1562 3170 126 48 2 chr5 128105753 128106254 -24431005 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 2 1562 2531 153 21 19 chr5 128106254 128106569 -24430690 + MTC LTR MaLR 100 421 0 2 1562 1675 171 76 6 chr5 128106751 128107081 -24430178 - MTD LTR MaLR -54 365 13 2 1562 594 223 78 162 chr5 128107435 128107658 -24429601 - ORR1E LTR MaLR -99 275 67 2 1562 594 220 65 174 chr5 128107804 128107889 -24429370 - ORR1E LTR MaLR -283 76 1 2 1562 270 284 26 105 chr5 128110842 128110956 -24426303 + MLT1J LTR MaLR 190 294 -218 2 1562 247 341 121 42 chr5 128114231 128114470 -24422789 - LTR48 LTR ERV1 -39 748 491 2 1562 266 307 47 157 chr5 128118471 128118556 -24418703 + MT2B2 LTR ERVL 47 132 -452 2 1562 266 307 47 157 chr5 128118775 128118822 -24418437 + MT2B2 LTR ERVL 133 152 -432 2 1562 1780 150 75 31 chr5 128119324 128119709 -24417550 - RMER10A LTR ERVL -6 436 35 2 1562 896 282 80 117 chr5 128119732 128120293 -24416966 + RMER13A LTR ERVK 14 604 -23 2 1562 245 111 0 0 chr5 128120397 128120433 -24416826 - RMER10A LTR ERVL -406 36 1 2 1562 238 244 0 122 chr5 128122883 128122981 -24414278 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 318 2 1562 1715 143 45 48 chr5 128124043 128124249 -24413010 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 116 2 1562 1715 143 45 48 chr5 128124439 128124562 -24412697 - ORR1A4 LTR MaLR -214 115 1 2 1562 1012 223 120 38 chr5 128125221 128125591 -24411668 - MTE2a LTR MaLR 0 419 18 2 1562 2232 137 70 16 chr5 128133825 128134212 -24403047 - MTC LTR MaLR 0 421 14 3 1562 310 196 0 0 chr5 128134230 128134281 -24402978 - MTEa LTR MaLR -2 377 327 3 1562 880 277 81 72 chr5 128134590 128134897 -24402362 - MTEa LTR MaLR -69 310 1 3 1562 2542 68 3 33 chr5 128147835 128148171 -24389088 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 3 1562 524 232 123 38 chr5 128148261 128148414 -24388845 - RMER20B LTR ERVK -355 161 1 3 1562 1227 234 48 32 chr5 128149200 128149514 -24387745 - MTE2a LTR MaLR -9 370 52 3 1562 2474 175 87 24 chr5 128150609 128151106 -24386153 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 3 1562 2298 92 35 0 chr5 128155212 128155528 -24381731 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1562 617 331 48 52 chr5 128160852 128161120 -24376139 + MLT1A0 LTR MaLR 15 281 -84 4 1562 330 229 298 50 chr5 128161338 128161499 -24375760 - RMER15 LTR ERVL -96 479 279 4 1562 862 272 130 62 chr5 128162122 128162605 -24374654 - MTC-int LTR MaLR -103 1155 640 4 1562 584 239 139 60 chr5 128163015 128163282 -24373977 - MTC-int LTR MaLR -567 691 404 4 1562 554 244 54 116 chr5 128163284 128163543 -24373716 - MTC-int LTR MaLR -958 300 58 4 1562 1415 164 109 11 chr5 128163661 128163945 -24373314 - MTD LTR MaLR -34 385 74 4 1562 1444 192 130 6 chr5 128176551 128176881 -24360378 - MTD LTR MaLR -8 411 41 4 1562 1402 219 52 44 chr5 128180375 128180738 -24356521 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 4 1562 230 254 103 27 chr5 128181280 128181426 -24355833 + ORR1B1-int LTR MaLR 598 754 -755 4 1562 2304 135 27 144 chr5 128184527 128185013 -24352246 + RLTR23 LTR ERV1 2 430 0 4 1562 243 262 65 87 chr5 128185795 128185887 -24351372 - MTD LTR MaLR -96 323 234 4 1562 713 192 132 144 chr5 128186070 128186320 -24350939 - MTD LTR MaLR -172 247 1 4 1563 2562 93 2 55 chr5 128189384 128189804 -24347455 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 1563 525 332 88 40 chr5 128191737 128192066 -24345193 - ORR1E LTR MaLR -5 354 10 4 1563 626 184 172 35 chr5 128192680 128192849 -24344410 - RMER15 LTR ERVL 0 575 384 4 1563 514 218 48 16 chr5 128192924 128193050 -24344209 - RMER15 LTR ERVL -444 131 2 4 1563 351 287 95 43 chr5 128193329 128193540 -24343719 - MLT1J LTR MaLR -34 478 257 4 1563 260 272 158 32 chr5 128193596 128193691 -24343568 - MLT1J LTR MaLR -365 147 41 4 1563 513 206 197 7 chr5 128196149 128196291 -24340968 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 199 4 1563 242 296 0 27 chr5 128197339 128197412 -24339847 + MLT1J LTR MaLR 243 313 -199 5 1563 1645 235 55 71 chr5 128197906 128197945 -24339314 - RLTR20B3 LTR ERVK -56 521 483 5 1563 1645 235 55 71 chr5 128197987 128198456 -24338803 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 23 5 1563 314 280 188 41 chr5 128198796 128198993 -24338266 - MLT1C LTR MaLR -198 269 44 5 1563 2263 50 30 20 chr5 128202766 128203070 -24334189 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 307 -20 5 1563 520 161 149 74 chr5 128204097 128204140 -24333119 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 342 5 1563 520 161 149 74 chr5 128204329 128204406 -24332853 - ORR1C2 LTR MaLR -43 341 247 5 1563 323 266 93 86 chr5 128204445 128204463 -24332796 - ORR1C2 LTR MaLR -130 229 214 5 1563 3407 129 53 78 chr5 128204882 128205481 -24331778 + RMER4B LTR ERVK 1 584 -1 5 1563 1646 232 21 9 chr5 128206316 128206651 -24330608 + MTEa LTR MaLR 41 379 0 5 1563 455 299 45 35 chr5 128206680 128206878 -24330381 + MLT1J LTR MaLR 117 316 -196 5 1563 727 260 170 43 chr5 128208958 128209110 -24328149 - MTD LTR MaLR -25 394 211 5 1563 727 260 170 43 chr5 128209295 128209419 -24327840 - MTD LTR MaLR -209 210 83 5 1563 236 273 62 93 chr5 128209403 128209500 -24327759 - MLT1A1 LTR MaLR -152 256 163 5 1563 3360 43 8 0 chr5 128209782 128210179 -24327080 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1563 1194 239 114 44 chr5 128210180 128210478 -24326781 - MTEa LTR MaLR -18 361 43 5 1563 754 165 54 81 chr5 128212473 128212658 -24324601 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 200 -377 5 1563 784 190 34 171 chr5 128212681 128212943 -24324316 + RLTR20B3 LTR ERVK 308 528 0 5 1563 268 311 194 51 chr5 128213175 128213412 -24323847 + MLT1F LTR MaLR 150 420 -128 5 1563 289 367 18 0 chr5 128222697 128222806 -24314453 - MER77 LTR ERVL -11 596 486 5 1563 2867 16 5 131 chr5 128222817 128223237 -24314022 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1563 51927 29 23 15 chr5 128223237 128229660 -24307599 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6478 -3 5 1563 277 304 40 88 chr5 128234709 128234857 -24302402 - RMER15 LTR ERVL -1 574 434 5 1563 1805 171 56 92 chr5 128234881 128235273 -24301986 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 1563 1463 165 133 125 chr5 128239960 128240024 -24297235 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 277 5 1563 1463 165 133 125 chr5 128240052 128240362 -24296897 - ORR1C1 LTR MaLR -102 276 2 5 1563 2766 124 128 2 chr5 128243210 128243678 -24293581 + RLTR11A LTR ERVK 2 528 0 5 1563 2085 156 31 54 chr5 128244343 128244730 -24292529 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 5 1563 1815 223 30 0 chr5 128244788 128245156 -24292103 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 5 1563 1461 212 96 28 chr5 128245225 128245588 -24291671 - MTD LTR MaLR -14 405 18 5 1563 485 378 126 20 chr5 128247602 128248040 -24289219 - MLT1H LTR MaLR 0 549 66 6 1563 247 253 0 132 chr5 128249850 128249941 -24287318 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 163 6 1563 299 279 132 31 chr5 128250779 128250938 -24286321 + MLT1J LTR MaLR 5 179 -333 6 1563 982 358 32 36 chr5 128253490 128253959 -24283300 + MLT1F LTR MaLR 2 468 -80 6 1563 237 226 74 19 chr5 128257855 128257909 -24279350 + MLT1C LTR MaLR 6 62 -405 6 1563 2010 127 14 64 chr5 128257956 128258302 -24278957 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1563 293 301 116 30 chr5 128259026 128259259 -24278000 + MLT1C LTR MaLR 5 257 -210 6 1563 347 331 159 20 chr5 128259326 128259477 -24277782 + MLT1C LTR MaLR 259 430 -37 6 1563 1723 203 53 117 chr5 128268457 128268892 -24268367 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 6 1563 2945 139 39 31 chr5 128269444 128269962 -24267297 + RLTR11A LTR ERVK 7 528 0 6 1563 2313 101 6 0 chr5 128271654 128271970 -24265289 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 6 1563 316 234 0 0 chr5 128273461 128273525 -24263734 - RMER15 LTR ERVL -106 469 406 6 1563 2531 186 54 43 chr5 128273665 128274122 -24263137 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 462 -98 6 1563 2531 186 54 43 chr5 128274173 128274267 -24262992 + RLTR20B2 LTR ERVK 463 558 -2 6 1563 706 284 137 81 chr5 128274741 128275113 -24262146 - MTB_Mm LTR MaLR -14 393 1 6 1563 583 264 55 22 chr5 128281418 128281600 -24255659 + ORR1E LTR MaLR 4 191 -168 6 1563 263 299 120 92 chr5 128282421 128282605 -24254654 + MLT1B LTR MaLR 98 286 -104 6 1563 250 228 24 71 chr5 128282828 128282913 -24254346 + MLT1B LTR MaLR 310 390 0 6 1563 484 232 63 132 chr5 128283376 128283550 -24253709 + MTE2b LTR MaLR 83 244 -135 6 1563 321 299 45 45 chr5 128284786 128284940 -24252319 + MLT1G3 LTR MaLR 7 160 -435 6 1563 1682 195 87 6 chr5 128286532 128286867 -24250392 + ORR1D1 LTR MaLR 13 374 0 6 1563 287 250 82 32 chr5 128288644 128288780 -24248479 - MTEa LTR MaLR 0 379 221 6 1563 440 295 55 45 chr5 128295040 128295242 -24242017 + RMER15 LTR ERVL 347 550 -25 6 1563 270 325 68 79 chr5 128297519 128297750 -24239509 + MLT1L LTR MaLR 229 474 -136 7 1563 1207 251 31 80 chr5 128303767 128304117 -24233142 - MTE2b LTR MaLR 0 379 47 7 1563 488 238 99 62 chr5 128305432 128305593 -24231666 - ORR1E LTR MaLR -16 363 197 7 1563 848 223 0 54 chr5 128306013 128306217 -24231042 - ORR1E LTR MaLR -164 195 3 7 1563 318 270 45 0 chr5 128310025 128310114 -24227145 - MTE2b LTR MaLR 0 379 287 7 1563 1253 235 38 66 chr5 128310211 128310576 -24226683 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 7 1563 1120 226 84 47 chr5 128311390 128311407 -24225852 - MTE2b LTR MaLR -46 333 318 7 1563 2218 111 105 0 chr5 128311407 128311739 -24225520 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1563 1120 226 84 47 chr5 128311739 128312042 -24225217 - MTE2b LTR MaLR -62 317 1 7 1563 1057 267 54 89 chr5 128312753 128313144 -24224115 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 7 1563 289 275 128 113 chr5 128313189 128313484 -24223775 + MLT1A0 LTR MaLR 86 372 -18 7 1563 285 382 88 28 chr5 128313552 128313835 -24223424 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 525 824 -15 7 1563 424 329 45 45 chr5 128313951 128314171 -24223088 + LTR33 LTR ERVL 4 223 -292 7 1563 1684 196 87 6 chr5 128317504 128317859 -24219400 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 7 1563 1069 284 101 20 chr5 128318718 128319073 -24218186 - MTD LTR MaLR -31 388 5 7 1564 755 266 63 63 chr5 128321680 128321965 -24215294 + RLTR11B LTR ERVK 10 294 -159 7 1564 584 261 13 19 chr5 128322076 128322232 -24215027 + RLTR11B LTR ERVK 284 438 -15 7 1564 259 306 139 35 chr5 128322245 128322360 -24214899 - MLT2B4 LTR ERVL -428 128 2 7 1564 244 224 131 10 chr5 128322811 128322910 -24214349 - MLT1H2 LTR MaLR -233 256 146 7 1564 2612 191 69 19 chr5 128324709 128325289 -24211970 + RLTR17 LTR ERVK 1 609 -83 7 1564 508 252 52 0 chr5 128327927 128328042 -24209217 + MTEa LTR MaLR 259 379 0 7 1564 788 273 151 19 chr5 128328249 128328619 -24208640 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1564 702 257 134 51 chr5 128328754 128329029 -24208230 - MTE2a LTR MaLR -9 370 73 7 1564 344 345 20 33 chr5 128329220 128329350 -24207909 - MTC LTR MaLR -293 128 1 7 1564 2232 183 20 14 chr5 128331115 128331553 -24205706 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 7 1564 2226 102 13 0 chr5 128331595 128331910 -24205349 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1564 1440 176 227 3 chr5 128334218 128334549 -24202710 + MTD LTR MaLR 15 419 0 7 1564 679 312 0 50 chr5 128334932 128335134 -24202125 - MTEa LTR MaLR -27 352 161 7 1564 578 282 13 19 chr5 128335341 128335500 -24201759 - MTEa LTR MaLR -201 158 1 7 1564 959 269 127 54 chr5 128339976 128340291 -24196968 + MTEa LTR MaLR 19 356 -23 8 1564 2966 79 18 13 chr5 128346095 128346493 -24190766 - MTB LTR MaLR 0 400 1 8 1564 253 358 9 27 chr5 128346916 128347028 -24190231 + MLT1I LTR MaLR 173 282 -313 8 1564 2184 196 105 7 chr5 128347071 128347517 -24189742 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 203 8 1564 258 341 72 29 chr5 128350714 128350853 -24186406 + MLT1I LTR MaLR 267 411 0 8 1564 949 260 101 103 chr5 128351767 128351930 -24185329 - MTE2a LTR MaLR -2 377 200 8 1564 949 260 101 103 chr5 128352011 128352225 -24185034 - MTE2a LTR MaLR -180 199 2 8 1564 290 331 14 57 chr5 128352740 128352881 -24184378 + MLT1G3 LTR MaLR 163 297 -298 8 1564 2142 165 52 22 chr5 128364760 128365163 -24172096 - MTD LTR MaLR -2 417 3 8 1564 621 206 244 23 chr5 128366880 128367179 -24170080 + ORR1D2 LTR MaLR 6 370 0 8 1564 2412 83 16 0 chr5 128369015 128369329 -24167930 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 1564 1461 171 129 31 chr5 128374890 128375240 -24162019 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 8 1564 2018 119 15 62 chr5 128376478 128376818 -24160441 + ORR1A2 LTR MaLR 4 327 0 8 1564 2187 113 15 18 chr5 128377383 128377725 -24159534 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 6 8 1564 1903 144 36 52 chr5 128378272 128378602 -24158657 + ORR1A3 LTR MaLR 2 326 0 8 1564 2003 151 46 17 chr5 128379343 128379693 -24157566 + ORR1B2 LTR MaLR 1 360 -7 8 1564 1177 285 76 20 chr5 128390473 128390715 -24146544 + MTD LTR MaLR 3 258 -161 8 1564 1177 285 76 20 chr5 128390738 128390889 -24146370 + MTD LTR MaLR 259 417 -2 8 1564 349 311 109 65 chr5 128391427 128391670 -24145589 + MLT1J LTR MaLR 46 306 -142 8 1564 283 353 50 33 chr5 128392114 128392368 -24144891 + MamGypLTR1d LTR Gypsy 543 813 0 8 1564 346 206 48 23 chr5 128392581 128392669 -24144590 - MTEa LTR MaLR -5 374 286 8 1564 465 305 188 68 chr5 128394220 128394544 -24142715 + MLT1K LTR MaLR 153 515 -80 8 1564 2252 114 0 6 chr5 128395993 128396319 -24140940 + ORR1A4 LTR MaLR 1 324 -5 8 1564 421 352 64 53 chr5 128400953 128401217 -24136042 + RMER15 LTR ERVL 309 575 0 9 1564 1135 192 17 97 chr5 128403250 128403539 -24133720 + MTD LTR MaLR 154 419 0 9 1564 1740 204 66 25 chr5 128411035 128411051 -24126208 + MTEa LTR MaLR 1 16 -363 9 1564 909 219 138 42 chr5 128411051 128411385 -24125874 + RLTR9A LTR ERVK 1 366 -2 9 1564 1740 204 66 25 chr5 128411385 128411730 -24125529 + MTEa LTR MaLR 17 377 -2 9 1564 445 260 221 60 chr5 128412542 128412759 -24124500 - RMER15 LTR ERVL -43 532 281 9 1564 2199 133 9 0 chr5 128412840 128413163 -24124096 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 9 1564 318 266 62 40 chr5 128423128 128423304 -24113955 - RLTR21 LTR ERVK -319 1253 1074 9 1564 333 216 44 22 chr5 128426378 128426468 -24110791 + RMER10A LTR ERVL 323 414 -28 9 1564 227 299 16 93 chr5 128432455 128432584 -24104675 - LTR16D2 LTR ERVL -3 569 451 9 1564 785 164 36 9 chr5 128444038 128444181 -24093078 - ORR1B2 LTR MaLR -15 364 222 9 1564 1768 131 39 63 chr5 128447961 128448296 -24088963 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 9 1564 439 281 106 78 chr5 128449209 128449502 -24087757 + ORR1E LTR MaLR 54 354 -5 9 1564 1193 263 61 6 chr5 128450213 128450542 -24086717 + ORR1E LTR MaLR 4 350 -9 9 1565 716 228 32 5 chr5 128453079 128453264 -24083995 + RMER15 LTR ERVL 372 561 -14 1 1565 1427 192 157 22 chr5 128453949 128454306 -24082953 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1565 1711 193 75 28 chr5 128463001 128463098 -24074161 + MTD LTR MaLR 9 105 -314 1 1565 3163 162 37 90 chr5 128463098 128463743 -24073516 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1565 1711 193 75 28 chr5 128463743 128464036 -24073223 + MTD LTR MaLR 106 418 -1 1 1565 836 153 0 71 chr5 128469503 128469686 -24067573 - RMER10B LTR ERVL 0 398 229 1 1565 567 62 12 0 chr5 128469683 128469763 -24067496 - RMER10B LTR ERVL -298 100 20 1 1565 1527 175 115 14 chr5 128469778 128470125 -24067134 - MTD LTR MaLR -20 399 18 1 1565 781 311 70 27 chr5 128470467 128470495 -24066764 - MTD LTR MaLR -33 386 364 1 1565 2449 137 12 27 chr5 128470495 128470908 -24066351 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1565 781 311 70 27 chr5 128470908 128471249 -24066010 - MTD LTR MaLR -56 363 1 1 1565 237 246 14 14 chr5 128471849 128471919 -24065340 + ORR1E LTR MaLR 39 108 -251 1 1565 1784 179 84 5 chr5 128472378 128472759 -24064500 + MTD LTR MaLR 9 419 0 1 1565 230 306 48 58 chr5 128476302 128476406 -24060853 + RMER15 LTR ERVL 344 446 -129 1 1565 315 290 29 58 chr5 128476407 128476579 -24060680 + RMER15 LTR ERVL 396 562 -13 1 1565 1369 219 19 138 chr5 128478902 128479331 -24057928 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 1 1565 421 220 117 28 chr5 128479863 128480008 -24057251 + MLT1D LTR MaLR 8 165 -340 1 1565 307 298 0 21 chr5 128481520 128481616 -24055643 + MER57F LTR ERV1 2 95 -341 1 1565 1202 241 107 9 chr5 128481635 128481962 -24055297 + MTD LTR MaLR 25 383 -36 1 1565 604 272 58 73 chr5 128481979 128482253 -24055006 + MER57F LTR ERV1 92 361 -75 1 1565 996 236 93 12 chr5 128482477 128482734 -24054525 - MTD LTR MaLR -136 283 6 1 1565 2863 140 34 19 chr5 128483376 128483909 -24053350 + MTC-int LTR MaLR 10 550 -708 1 1565 2019 163 89 18 chr5 128483911 128484304 -24052955 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1565 1416 186 166 21 chr5 128488392 128488717 -24048542 + MTEa LTR MaLR 4 375 -4 1 1565 1608 194 74 5 chr5 128489873 128490239 -24047020 + MTD LTR MaLR 18 406 -13 1 1565 417 286 30 15 chr5 128490533 128490668 -24046591 + MTEa LTR MaLR 5 141 -238 1 1565 370 345 144 14 chr5 128490734 128490875 -24046384 + MT2A LTR ERVL 149 325 -208 1 1565 539 313 82 24 chr5 128491090 128491296 -24045963 + MT2A LTR ERVL 310 527 -6 1 1565 1060 238 37 80 chr5 128494938 128495312 -24041947 - ORR1D2 LTR MaLR -12 358 1 1 1565 2284 93 9 58 chr5 128496751 128497094 -24040165 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1565 1022 284 62 9 chr5 128500499 128500836 -24036423 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 2 1565 1610 160 11 3 chr5 128505169 128505452 -24031807 + RLTR15 LTR ERVK 73 357 -2 8 1565 1137 236 119 26 chr5 128506289 128506667 -24030592 - BGLII_B LTR ERVK -3 438 26 1 1565 375 377 51 29 chr5 128508915 128509188 -24028071 - MLT1A LTR MaLR -20 354 76 1 1565 1506 151 53 0 chr5 128510798 128511082 -24026177 + ORR1B1 LTR MaLR 1 299 -95 2 1565 943 219 114 102 chr5 128511082 128511407 -24025852 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1565 574 322 82 71 chr5 128511426 128511793 -24025466 + MTE2a LTR MaLR 1 371 -8 2 1565 1798 178 16 3 chr5 128514138 128514460 -24022799 + MTD LTR MaLR 1 326 -93 2 1565 1052 188 71 104 chr5 128519240 128519646 -24017613 + MT2A LTR ERVL 1 531 -70 3 1565 545 257 69 23 chr5 128523159 128523334 -24013925 + MTEb LTR MaLR 1 183 -196 4 1565 1625 192 58 3 chr5 128526037 128526402 -24010857 + MTD LTR MaLR 21 405 -14 5 1565 3093 56 12 17 chr5 128528556 128528958 -24008301 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1565 974 250 62 61 chr5 128536494 128536718 -24000541 - MTD LTR MaLR -14 405 195 7 1565 974 267 95 85 chr5 128537264 128537449 -23999810 - MTD LTR MaLR -225 194 1 7 1565 1102 248 26 95 chr5 128538220 128538650 -23998609 + MTE2a LTR MaLR 1 405 -14 7 1565 283 389 113 17 chr5 128543769 128544122 -23993137 + LTR16A LTR ERVL 11 397 -54 8 1565 1576 178 34 0 chr5 128549686 128549979 -23987280 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 24 9 1565 2226 46 0 62 chr5 128551476 128551800 -23985459 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 24 9 1565 265 319 0 0 chr5 128554428 128554497 -23982762 - MT2B LTR ERVL -361 240 172 1 1565 713 292 54 78 chr5 128561012 128561421 -23975838 - MTC LTR MaLR -17 404 6 1 1565 1191 237 94 18 chr5 128562814 128563013 -23974246 + MTEb LTR MaLR 1 200 -179 1 1565 1191 237 94 18 chr5 128563036 128563175 -23974084 + MTEb LTR MaLR 201 364 -15 1 1565 709 103 33 33 chr5 128565898 128566049 -23971210 - RMER17B LTR ERVK -498 460 310 1 1565 713 278 82 120 chr5 128566619 128567011 -23970248 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 1 1565 280 322 38 82 chr5 128567961 128568120 -23969139 + MTEa LTR MaLR 32 183 -196 1 1565 2400 161 47 9 chr5 128568459 128568941 -23968318 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 1 1 1565 891 211 84 51 chr5 128568941 128569216 -23968043 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6267 1 1565 1632 189 16 6 chr5 128569219 128569539 -23967720 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -339 1987 1665 1 1565 1197 249 71 58 chr5 128576105 128576570 -23960689 - RLTR20B3 LTR ERVK -106 471 1 1 1565 1325 226 50 24 chr5 128578153 128578533 -23958726 + MTD LTR MaLR 1 390 -29 1 1566 1615 185 59 35 chr5 128584119 128584545 -23952714 + RLTR11A LTR ERVK 10 445 -83 1 1566 818 187 118 65 chr5 128588950 128589179 -23948080 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 144 1 1566 2147 183 0 13 chr5 128590460 128590836 -23946423 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 1 1566 1627 180 13 7 chr5 128598763 128599070 -23938189 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 73 2 1566 1606 187 87 0 chr5 128606728 128607059 -23930200 + MTD LTR MaLR 56 402 -5 2 1566 2006 143 6 20 chr5 128607699 128608055 -23929204 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 17 2 1566 1670 58 4 0 chr5 128608056 128608282 -23928977 - MTB LTR MaLR -52 348 122 2 1566 1242 262 49 23 chr5 128612653 128613043 -23924216 + MTD LTR MaLR 5 404 -15 2 1566 888 292 110 42 chr5 128615438 128615566 -23921693 - ORR1E LTR MaLR 0 359 229 2 1566 888 292 110 42 chr5 128615740 128615947 -23921312 - ORR1E LTR MaLR -131 228 1 2 1566 2821 129 69 35 chr5 128618486 128618993 -23918266 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 2 1566 2311 125 9 20 chr5 128619686 128619757 -23917502 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 281 2 1566 2311 125 9 20 chr5 128619941 128620219 -23917040 - ORR1A1 LTR MaLR -66 280 1 2 1566 339 282 118 20 chr5 128620363 128620515 -23916744 + MER68 LTR ERVL 101 267 -296 2 1566 1810 150 19 82 chr5 128620540 128620918 -23916341 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 1566 254 363 60 38 chr5 128620941 128621176 -23916083 + MER77 LTR ERVL 357 596 -11 2 1566 502 256 34 129 chr5 128621177 128621441 -23915818 + RLTR42 LTR ERVK 1 239 0 2 1566 2976 159 58 4 chr5 128621514 128621589 -23915670 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 466 2 1566 2976 159 58 4 chr5 128621626 128622086 -23915173 - RLTR20D LTR ERVK -103 465 5 2 1566 2073 124 90 3 chr5 128624042 128624397 -23912862 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 2 1566 292 328 35 55 chr5 128625078 128625223 -23912036 - MLT1J1 LTR MaLR -116 328 187 2 1566 3163 30 0 27 chr5 128626124 128626499 -23910760 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 2 1566 579 278 204 30 chr5 128626980 128627284 -23909975 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 2 1566 316 225 50 0 chr5 128630680 128630760 -23906499 + MTD LTR MaLR 65 148 -231 2 1566 283 234 0 0 chr5 128630815 128630879 -23906380 - MERVL-int LTR ERVL -968 4517 4454 2 1566 617 244 40 40 chr5 128630885 128631037 -23906222 + MTD LTR MaLR 233 405 -14 2 1566 499 264 122 11 chr5 128631473 128631653 -23905606 - ORR1E LTR MaLR 0 370 171 2 1566 766 162 0 7 chr5 128631917 128632060 -23905199 - ORR1E LTR MaLR -178 181 40 2 1566 1272 218 169 22 chr5 128633491 128633852 -23903407 - MTD LTR MaLR -2 417 4 2 1566 1345 171 181 56 chr5 128636644 128637003 -23900256 - MTD LTR MaLR -4 415 12 2 1566 2227 142 7 75 chr5 128638267 128638694 -23898565 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 2 1566 399 266 51 45 chr5 128638807 128638945 -23898314 + MTEb LTR MaLR 243 379 0 2 1566 646 247 121 53 chr5 128639731 128640086 -23897173 + RMER13A LTR ERVK 88 466 -394 2 1566 702 259 60 0 chr5 128640187 128640353 -23896906 + MTEa LTR MaLR 204 379 0 2 1566 1597 212 39 3 chr5 128641988 128642352 -23894907 + MTD LTR MaLR 42 418 -1 2 1566 230 333 54 0 chr5 128643557 128643650 -23893609 - MLT1I LTR MaLR -6 405 308 2 1566 1390 229 62 17 chr5 128643958 128644253 -23893006 - MTEa LTR MaLR -7 372 78 2 1566 1390 229 62 17 chr5 128644315 128644375 -23892884 - MTEa LTR MaLR -302 77 3 2 1566 991 236 52 125 chr5 128644642 128645049 -23892210 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 2 1566 303 299 25 96 chr5 128651471 128651723 -23885536 + MTD LTR MaLR 1 205 -174 2 1566 3487 111 38 25 chr5 128658768 128659434 -23877825 - RMER17A LTR ERVK -263 695 1 3 1566 750 231 82 146 chr5 128662803 128663208 -23874051 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 1566 261 311 9 28 chr5 128663443 128663549 -23873710 + MTEb LTR MaLR 276 379 0 3 1566 1283 218 78 10 chr5 128663887 128664193 -23873066 - MTEa LTR MaLR -2 377 51 3 1566 1443 214 87 51 chr5 128664876 128665266 -23871993 - MTC LTR MaLR -17 404 1 3 1566 303 215 24 37 chr5 128667504 128667586 -23869673 - MLT1J LTR MaLR -3 509 429 3 1566 1121 255 91 31 chr5 128668177 128668497 -23868762 + ORR1E LTR MaLR 15 353 -6 3 1566 955 256 45 108 chr5 128668583 128668816 -23868443 - MTD LTR MaLR 0 419 211 3 1566 955 256 45 108 chr5 128669027 128669236 -23868023 - MTD LTR MaLR -209 210 5 3 1566 1198 162 131 8 chr5 128669741 128669977 -23867282 - MTD LTR MaLR -2 417 153 3 1566 766 239 125 81 chr5 128670111 128670306 -23866953 - MTEa LTR MaLR 0 379 197 3 1566 766 239 125 81 chr5 128670390 128670554 -23866705 - MTEa LTR MaLR -183 196 4 3 1566 1006 244 159 24 chr5 128671323 128671666 -23865593 - MTD LTR MaLR -6 373 5 3 1566 1162 233 70 18 chr5 128671646 128671930 -23865329 - ORR1E LTR MaLR -23 336 38 3 1566 2534 77 12 9 chr5 128676824 128677150 -23860109 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1566 307 323 70 47 chr5 128677451 128677623 -23859636 + MLT1K LTR MaLR 390 565 -30 3 1566 1209 169 35 5 chr5 128679541 128679743 -23857516 + MTC LTR MaLR 1 208 -213 3 1566 1090 142 6 40 chr5 128681092 128681300 -23855959 + MTC LTR MaLR 202 401 -18 3 1566 337 369 104 21 chr5 128683523 128683764 -23853495 - MER77 LTR ERVL -27 580 320 3 1566 662 300 46 43 chr5 128684343 128684625 -23852634 - MER77 LTR ERVL -324 283 1 3 1566 654 259 49 178 chr5 128687814 128688204 -23849055 - MTE2a LTR MaLR -35 372 1 3 1566 1688 91 136 71 chr5 128688443 128688752 -23848507 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1566 2506 173 33 25 chr5 128689488 128689999 -23847260 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 10 3 1566 280 309 32 0 chr5 128691078 128691172 -23846087 - MLT1A0-int LTR MaLR -1290 97 1 3 1566 1031 258 70 42 chr5 128692686 128692998 -23844261 + ORR1D2 LTR MaLR 1 321 -49 3 1566 364 314 77 60 chr5 128693112 128693463 -23843796 + ORR1E LTR MaLR 1 378 -1 3 1566 541 309 98 26 chr5 128693484 128693750 -23843509 - MLT1A0 LTR MaLR -78 287 3 3 1566 476 282 11 144 chr5 128697963 128698239 -23839020 + MTD LTR MaLR 3 212 -207 3 1566 492 190 0 0 chr5 128700975 128701054 -23836205 + MTEa LTR MaLR 4 82 -297 3 1566 660 207 59 8 chr5 128701609 128701805 -23835454 + MTEa LTR MaLR 124 354 -5 3 1566 247 303 58 39 chr5 128702537 128702640 -23834619 + MLT2B3 LTR ERVL 1 105 -449 3 1566 1285 203 154 28 chr5 128702856 128702895 -23834364 + MTD LTR MaLR 10 44 -375 3 1566 2281 117 0 58 chr5 128702895 128703241 -23834018 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 3 1566 1285 203 154 28 chr5 128703241 128703565 -23833694 + MTD LTR MaLR 45 419 0 3 1566 261 289 138 15 chr5 128704427 128704557 -23832702 + ORR1E LTR MaLR 208 353 -6 3 1566 1518 157 93 10 chr5 128705549 128705735 -23831524 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 189 3 1566 1518 157 93 10 chr5 128705840 128705955 -23831304 - ORR1C2 LTR MaLR -196 188 59 3 1566 1593 122 172 0 chr5 128712133 128712412 -23824847 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1567 1136 264 49 3 chr5 128712978 128713282 -23823977 + RMER5 LTR ERV1 202 519 -15 4 1567 487 278 155 39 chr5 128713610 128713842 -23823417 + MER67C LTR ERV1 147 405 -306 4 1567 742 232 92 16 chr5 128714286 128714470 -23822789 + RLTR24 LTR ERV1 332 529 0 4 1567 307 349 82 24 chr5 128720501 128720671 -23816588 + ORR1E LTR MaLR 12 191 -168 4 1567 1656 159 34 120 chr5 128721313 128721664 -23815595 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 1567 2408 89 0 58 chr5 128722950 128723296 -23813963 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1567 3185 139 21 30 chr5 128725295 128725860 -23811399 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 4 1567 254 204 41 65 chr5 128728751 128728857 -23808402 - MLT1L LTR MaLR -147 463 331 4 1567 3093 147 116 30 chr5 128729276 128729839 -23807420 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 1567 295 295 112 156 chr5 128730513 128730782 -23806477 + LTR84b LTR ERVL 492 748 -13 4 1567 274 152 169 51 chr5 128731858 128731976 -23805283 - RMER17B LTR ERVK -499 459 328 4 1567 1060 205 75 25 chr5 128731987 128732227 -23805032 + MTD LTR MaLR 127 378 -41 4 1567 471 275 107 117 chr5 128735087 128735396 -23801863 + ORR1E LTR MaLR 8 313 -46 4 1567 2978 152 39 10 chr5 128739213 128739726 -23797533 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 4 1567 331 362 87 35 chr5 128740156 128740385 -23796874 - MLT1H1 LTR MaLR -312 243 3 4 1567 2166 97 29 10 chr5 128742032 128742343 -23794916 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 10 4 1567 1713 188 134 113 chr5 128743098 128743619 -23793640 + MT2A LTR ERVL 2 533 0 4 1567 339 318 200 17 chr5 128750611 128750835 -23786424 + RMER15 LTR ERVL 296 560 -15 4 1567 1229 210 65 101 chr5 128752502 128752857 -23784402 + MTEb LTR MaLR 18 359 -20 4 1567 1450 201 133 9 chr5 128754057 128754379 -23782880 - MTD LTR MaLR -57 362 1 4 1567 1042 221 101 92 chr5 128755851 128755997 -23781262 - MTD LTR MaLR -88 331 168 5 1567 2415 98 12 9 chr5 128755997 128756338 -23780921 - ORR1A1 LTR MaLR -1 345 4 5 1567 1042 221 101 92 chr5 128756338 128756519 -23780740 - MTD LTR MaLR -252 167 1 5 1567 607 325 107 3 chr5 128759732 128760041 -23777218 + RMER5 LTR ERV1 98 438 -96 5 1567 1306 234 168 6 chr5 128760207 128760547 -23776712 - MTD LTR MaLR -24 395 1 5 1567 422 267 16 70 chr5 128760547 128760633 -23776626 + RMER5 LTR ERV1 442 520 -14 5 1567 477 209 131 16 chr5 128761973 128762133 -23775126 + MTD LTR MaLR 1 170 -249 5 1567 352 301 19 10 chr5 128762417 128762521 -23774738 + MTD LTR MaLR 242 346 -33 5 1567 1667 212 33 25 chr5 128762829 128763196 -23774063 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1567 508 328 73 89 chr5 128763719 128764090 -23773169 + ORR1D2 LTR MaLR 6 370 0 5 1567 1330 142 286 62 chr5 128768630 128769004 -23768255 - RMER6B LTR ERVK -3 458 1 5 1567 477 285 151 72 chr5 128772184 128772502 -23764757 + ORR1E LTR MaLR 2 344 -15 5 1567 1524 222 66 30 chr5 128774599 128774933 -23762326 + MTEa LTR MaLR 34 379 0 5 1567 1164 251 96 83 chr5 128775814 128776188 -23761071 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1567 3946 175 17 16 chr5 128776224 128776914 -23760345 + RLTR17 LTR ERVK 2 692 0 5 1567 1252 228 206 6 chr5 128777611 128777960 -23759299 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1567 606 199 11 80 chr5 128783191 128783453 -23753806 - RMER17C LTR ERVK -166 244 1 5 1567 561 245 43 12 chr5 128784901 128785056 -23752203 - MTD LTR MaLR 0 419 260 5 1567 501 300 35 55 chr5 128785202 128785403 -23751856 - MTD LTR MaLR -149 270 74 5 1567 940 160 118 6 chr5 128785703 128785873 -23751386 - MTEa LTR MaLR -160 219 31 5 1567 247 330 29 67 chr5 128789246 128789350 -23747909 + RMER15 LTR ERVL 32 131 -444 5 1567 513 282 28 14 chr5 128789381 128789525 -23747734 + RMER15 LTR ERVL 276 421 -154 5 1567 1120 278 67 20 chr5 128790543 128790884 -23746375 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 5 1567 4560 62 14 10 chr5 128791182 128791764 -23745495 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 5 1567 245 320 31 0 chr5 128797256 128797353 -23739906 + LTR37B LTR ERV1 5 104 -364 5 1567 1747 220 13 27 chr5 128802476 128802850 -23734409 + MTEb LTR MaLR 3 371 -8 5 1567 2255 69 8 91 chr5 128810549 128810675 -23726584 + ORR1A2 LTR MaLR 1 101 -226 5 1567 2888 91 15 8 chr5 128810675 128811075 -23726184 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 5 1567 2255 69 8 91 chr5 128811075 128811300 -23725959 + ORR1A2 LTR MaLR 102 323 -4 5 1567 1859 182 8 65 chr5 128811778 128812165 -23725094 + ORR1D1 LTR MaLR 2 366 -8 5 1567 1784 199 15 71 chr5 128819726 128819909 -23717350 + MTEb LTR MaLR 4 185 -194 6 1567 1784 199 15 71 chr5 128820037 128820248 -23717011 + MTEb LTR MaLR 186 376 -3 6 1567 1268 144 171 31 chr5 128822661 128822919 -23714340 + MTB_Mm LTR MaLR 1 294 -113 6 1567 630 180 41 15 chr5 128823056 128823200 -23714059 + MTD LTR MaLR 190 418 -1 6 1567 4545 156 72 28 chr5 128825588 128826452 -23710807 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 6 1567 1471 250 41 29 chr5 128833893 128834235 -23703024 - ORR1E LTR MaLR -4 355 10 6 1567 2319 141 64 11 chr5 128837840 128838214 -23699045 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1567 1072 285 25 96 chr5 128839633 128840071 -23697188 - MTD LTR MaLR 0 419 13 6 1568 479 67 0 3 chr5 128847187 128847253 -23690006 - ORR1A4 LTR MaLR -13 357 263 6 1568 1861 129 130 19 chr5 128847303 128847627 -23689632 + ORR1C2 LTR MaLR 24 383 -1 6 1568 2400 192 41 117 chr5 128847934 128848595 -23688664 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 1568 746 281 96 36 chr5 128850811 128851062 -23686197 - MTE2b LTR MaLR -8 371 106 6 1568 297 302 33 49 chr5 128851914 128852036 -23685223 - MTE2b LTR MaLR -258 121 2 6 1568 267 224 0 56 chr5 128852516 128852587 -23684672 + RMER5 LTR ERV1 47 113 -421 6 1568 1548 216 97 29 chr5 128852624 128853005 -23684254 + MTD LTR MaLR 13 419 0 6 1568 970 256 85 16 chr5 128853005 128853311 -23683948 + RMER5 LTR ERV1 168 494 -40 6 1568 673 252 46 63 chr5 128854557 128854794 -23682465 - MLT2C1 LTR ERVL -108 289 57 6 1568 1833 170 196 16 chr5 128855663 128856111 -23681148 - MT2A LTR ERVL 0 533 5 6 1568 302 276 26 13 chr5 128858732 128858809 -23678450 - MTEb LTR MaLR -55 324 247 7 1568 2201 143 90 8 chr5 128858810 128859207 -23678052 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 7 1568 2151 133 11 14 chr5 128859732 128860084 -23677175 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 41 7 1568 1073 253 63 97 chr5 128861544 128861925 -23675334 + MTE2a LTR MaLR 1 368 -11 7 1568 2068 210 50 74 chr5 128861953 128862439 -23674820 + RLTR20B3 LTR ERVK 22 483 -94 7 1568 2068 210 50 74 chr5 128862471 128862540 -23674719 + RLTR20B3 LTR ERVK 484 563 -14 7 1568 351 260 112 16 chr5 128862915 128863040 -23674219 - RMER15 LTR ERVL -92 483 347 7 1568 653 287 124 105 chr5 128863346 128863716 -23673543 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 7 1568 1978 129 145 40 chr5 128865128 128865397 -23671862 - MTC LTR MaLR 0 421 105 7 1568 1978 129 145 40 chr5 128865619 128865728 -23671531 - MTC LTR MaLR -317 104 3 7 1568 1370 227 99 3 chr5 128869613 128869958 -23667301 + MTE2b LTR MaLR 1 378 -1 7 1568 1337 283 51 28 chr5 128879665 128880094 -23657165 + BGLII_B LTR ERVK 1 439 -2 7 1568 298 379 77 6 chr5 128880429 128880612 -23656647 - MER68 LTR ERVL -314 249 54 7 1568 2323 106 12 42 chr5 128880721 128881089 -23656170 + ORR1A3 LTR MaLR 1 346 -13 7 1568 252 271 128 65 chr5 128882075 128882210 -23655049 + MLT1A0 LTR MaLR 91 230 -144 7 1568 1261 199 123 28 chr5 128884180 128884505 -23652754 + ORR1E LTR MaLR 4 359 0 7 1568 946 274 109 9 chr5 128884881 128885202 -23652057 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 7 1568 243 306 69 46 chr5 128890767 128890897 -23646362 + RMER15 LTR ERVL 1 133 -442 7 1568 620 271 31 67 chr5 128890921 128891115 -23646144 + RMER15 LTR ERVL 261 447 -128 7 1568 601 253 29 40 chr5 128891176 128891349 -23645910 + RMER15 LTR ERVL 405 575 0 7 1568 1055 248 38 107 chr5 128896773 128897138 -23640121 - MTE2a LTR MaLR 0 379 40 7 1568 495 290 18 57 chr5 128897139 128897457 -23639802 + MTEa LTR MaLR 86 379 0 7 1568 306 380 17 17 chr5 128899997 128900171 -23637088 - ORR1E LTR MaLR -168 191 18 7 1568 250 313 73 84 chr5 128900850 128901028 -23636231 + MTEb LTR MaLR 203 378 -1 7 1568 2884 124 2 28 chr5 128901131 128901596 -23635663 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 7 1568 305 250 183 11 chr5 128901598 128901691 -23635568 + RLTR11A2 LTR ERVK 419 527 0 7 1568 297 260 27 27 chr5 128903959 128904034 -23633225 - ORR1E LTR MaLR -188 171 97 7 1568 243 286 32 0 chr5 128904028 128904091 -23633168 + MLT1A0 LTR MaLR 228 292 -73 7 1568 1774 215 48 0 chr5 128904819 128905177 -23632082 + MTEb LTR MaLR 5 379 0 7 1568 2464 158 2 19 chr5 128905249 128905663 -23631596 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1568 314 360 55 16 chr5 128913528 128913655 -23623604 - MLT1K LTR MaLR -4 591 460 8 1568 227 306 59 0 chr5 128913994 128914079 -23623180 - MLT1K LTR MaLR -320 275 186 8 1568 225 347 40 0 chr5 128915685 128915809 -23621450 + LTR33A LTR ERVL 306 434 -86 8 1568 1129 247 128 37 chr5 128919791 128920153 -23617106 + MTD LTR MaLR 1 379 -40 8 1568 252 395 6 48 chr5 128922121 128922286 -23614973 + RMER15 LTR ERVL 314 471 -104 8 1568 266 254 0 0 chr5 128925156 128925223 -23612036 - RMER15 LTR ERVL -106 469 403 8 1568 414 253 6 21 chr5 128925463 128925575 -23611684 + MLT1A1 LTR MaLR 5 114 -294 8 1568 241 289 48 0 chr5 128925812 128925895 -23611364 + MTEa LTR MaLR 287 373 -6 8 1568 245 288 0 0 chr5 128933024 128933090 -23604169 + MLT1D LTR MaLR 439 504 -1 8 1568 321 287 11 11 chr5 128934584 128934672 -23602587 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 154 8 1568 439 202 0 12 chr5 128939626 128939706 -23597553 - MTEb LTR MaLR -4 375 297 8 1568 1561 218 79 8 chr5 128939714 128940080 -23597179 + MTD LTR MaLR 6 397 -22 8 1568 854 219 93 28 chr5 128940078 128940294 -23596965 - MTEb LTR MaLR -115 264 35 8 1568 238 307 179 36 chr5 128945252 128945475 -23591784 - RMER15 LTR ERVL -15 560 306 8 1568 335 293 99 62 chr5 128947059 128947270 -23589989 - MLT1A0 LTR MaLR -146 219 1 8 1568 1501 185 66 53 chr5 128952546 128953011 -23584248 - RMER17C LTR ERVK -464 425 1 8 1568 1145 314 43 39 chr5 128953722 128954239 -23583020 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 1 8 1568 813 246 58 41 chr5 128955738 128955980 -23581279 + RLTR40 LTR ERVK 1 246 -571 8 1568 300 182 24 61 chr5 128959332 128959414 -23577845 - MLT2B5 LTR ERVL -4 551 473 8 1568 481 181 141 8 chr5 128963074 128963202 -23574057 - ORR1D2 LTR MaLR -228 146 9 9 1568 697 307 59 89 chr5 128963786 128964090 -23573169 - MTD LTR MaLR 0 419 125 9 1568 288 239 236 9 chr5 128964004 128964114 -23573145 + MTEb LTR MaLR 237 371 -8 9 1568 3249 109 4 24 chr5 128964415 128964867 -23572392 - RLTR41 LTR ERV1 -3 443 1 9 1568 228 244 10 148 chr5 128967747 128967763 -23569496 + MT2B2 LTR ERVL 155 156 -428 9 1568 253 309 26 26 chr5 128967966 128968079 -23569180 + MLT1K LTR MaLR 430 542 -53 9 1568 304 250 148 0 chr5 128970697 128970768 -23566491 - RLTR16 LTR ERVK -13 492 415 9 1568 304 250 148 0 chr5 128970809 128970845 -23566414 - RLTR16 LTR ERVK -91 414 370 9 1568 1448 259 76 35 chr5 128972463 128972576 -23564683 - MTD LTR MaLR -1 418 301 9 1568 1448 259 76 35 chr5 128972748 128973030 -23564229 - MTD LTR MaLR -119 300 7 9 1569 255 235 0 38 chr5 128976817 128976870 -23560389 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 317 9 1569 498 138 20 13 chr5 128976855 128976955 -23560304 - ORR1B2 LTR MaLR -274 93 2 9 1569 428 208 152 65 chr5 128977850 128978040 -23559219 + MTD LTR MaLR 10 204 -196 9 1569 984 236 128 98 chr5 128979129 128979388 -23557871 + MTE2b LTR MaLR 42 310 -69 9 1569 2202 175 107 19 chr5 128979388 128979900 -23557359 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 557 0 9 1569 984 236 128 98 chr5 128979900 128979968 -23557291 + MTE2b LTR MaLR 311 379 0 9 1569 236 229 200 0 chr5 128982044 128982114 -23555145 - ORR1E LTR MaLR -3 376 293 9 1569 399 279 23 62 chr5 128982282 128982403 -23554856 - ORR1E LTR MaLR -193 166 50 9 1569 2010 117 9 47 chr5 128983036 128983378 -23553881 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 9 1569 4230 122 85 18 chr5 128984943 128985652 -23551607 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 9 1569 470 245 26 80 chr5 128986637 128986686 -23550573 + MT2B LTR ERVL 116 156 -445 9 1569 912 280 147 50 chr5 128990518 128990838 -23546421 + MTE2a LTR MaLR 1 351 -28 9 1569 2074 147 51 56 chr5 128995109 128995504 -23541755 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 9 1569 1802 148 24 14 chr5 129000171 129000562 -23536697 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 22 2 1569 268 315 22 73 chr5 129000766 129000903 -23536356 - MLT1J2 LTR MaLR -212 236 107 3 1569 477 67 0 3 chr5 129002532 129002598 -23534661 - ORR1A4 LTR MaLR -13 357 263 6 1569 1868 129 130 19 chr5 129002648 129002972 -23534287 + ORR1C2 LTR MaLR 24 383 -1 7 1569 2456 192 41 117 chr5 129003279 129003940 -23533319 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 8 1569 761 281 96 36 chr5 129006156 129006407 -23530852 - MTE2b LTR MaLR -8 371 106 1 1569 299 302 33 49 chr5 129007258 129007380 -23529879 - MTE2b LTR MaLR -258 121 2 1 1569 265 224 0 56 chr5 129007860 129007931 -23529328 + RMER5 LTR ERV1 47 113 -421 1 1569 1555 216 97 29 chr5 129007968 129008349 -23528910 + MTD LTR MaLR 13 419 0 1 1569 963 256 85 16 chr5 129008349 129008655 -23528604 + RMER5 LTR ERV1 168 494 -40 1 1569 674 252 46 63 chr5 129009901 129010138 -23527121 - MLT2C1 LTR ERVL -108 289 57 2 1569 1867 170 196 16 chr5 129011007 129011455 -23525804 - MT2A LTR ERVL 0 533 5 2 1569 298 276 26 13 chr5 129014076 129014153 -23523106 - MTEb LTR MaLR -55 324 247 3 1569 2207 143 90 6 chr5 129014154 129014546 -23522713 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 1569 2166 133 11 14 chr5 129015076 129015428 -23521831 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 41 4 1569 1067 253 63 97 chr5 129016888 129017269 -23519990 + MTE2a LTR MaLR 1 368 -11 4 1569 2078 210 50 74 chr5 129017297 129017783 -23519476 + RLTR20B3 LTR ERVK 22 483 -94 4 1569 2078 210 50 74 chr5 129017815 129017884 -23519375 + RLTR20B3 LTR ERVK 484 563 -14 4 1569 357 260 112 16 chr5 129018259 129018384 -23518875 - RMER15 LTR ERVL -92 483 347 4 1569 658 287 124 105 chr5 129018690 129019060 -23518199 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 4 1569 2008 129 145 40 chr5 129020472 129020741 -23516518 - MTC LTR MaLR 0 421 105 5 1569 2008 129 145 40 chr5 129020963 129021072 -23516187 - MTC LTR MaLR -317 104 3 5 1569 2257 122 24 48 chr5 129023550 129023726 -23513533 + RMER17C LTR ERVK 1 179 -231 5 1569 2257 122 24 48 chr5 129023781 129024024 -23513235 + RMER17C LTR ERVK 180 410 0 5 1569 329 339 32 0 chr5 129030085 129030209 -23507050 + MLT1B LTR MaLR 40 167 -223 7 1569 367 317 56 33 chr5 129031588 129031803 -23505456 + RMER15 LTR ERVL 351 570 -5 7 1569 295 279 94 87 chr5 129032023 129032310 -23504949 - RLTR21 LTR ERVK -266 1306 1018 7 1569 456 322 40 53 chr5 129037314 129037536 -23499723 - MLT1F1 LTR MaLR -291 278 69 8 1569 1983 120 61 29 chr5 129037723 129038067 -23499192 + RLTR15 LTR ERVK 1 355 -4 8 1569 653 290 8 104 chr5 129039130 129039380 -23497879 + MTE2a LTR MaLR 1 226 -153 9 1569 230 371 32 63 chr5 129041119 129041309 -23495950 + MLT1G LTR MaLR 30 213 -378 9 1569 293 341 119 58 chr5 129045018 129045295 -23491964 + MLT1J1 LTR MaLR 1 294 -150 1 1569 2290 170 27 10 chr5 129048779 129049188 -23488071 + MTD LTR MaLR 4 419 0 1 1569 449 324 122 18 chr5 129051088 129051374 -23485885 - MLT1B LTR MaLR -25 365 50 1 1569 990 266 88 30 chr5 129053000 129053365 -23483894 + RMER15 LTR ERVL 188 573 -2 1 1569 2113 242 24 55 chr5 129053472 129054014 -23483245 - RMER19C LTR ERVK 0 611 87 1 1569 238 226 19 0 chr5 129054827 129054876 -23482383 + MTEb LTR MaLR 234 283 -96 1 1569 1124 87 21 104 chr5 129054876 129055069 -23482190 + ORR1A3 LTR MaLR 1 177 -149 1 1569 277 325 53 98 chr5 129057169 129057394 -23479865 + ORR1E LTR MaLR 103 317 -42 1 1569 1991 175 56 37 chr5 129059744 129060154 -23477105 + MTC LTR MaLR 4 421 0 1 1569 1686 169 32 115 chr5 129061110 129061353 -23475906 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 137 1 1569 1686 169 32 115 chr5 129061545 129061622 -23475637 - ORR1C2 LTR MaLR -248 136 79 1 1569 1686 169 32 115 chr5 129061775 129061861 -23475398 - ORR1C2 LTR MaLR -306 78 11 1 1569 858 240 202 42 chr5 129061895 129062223 -23475036 - MTEa LTR MaLR -3 416 1 1 1569 486 228 144 56 chr5 129064822 129064933 -23472326 + MTE2a LTR MaLR 159 285 -94 1 1569 2273 131 44 40 chr5 129064933 129065338 -23471921 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1569 486 228 144 56 chr5 129065338 129065421 -23471838 + MTE2a LTR MaLR 286 370 -9 1 1569 288 369 47 16 chr5 129066689 129066723 -23470536 + MLT1H1 LTR MaLR 70 103 -452 1 1569 2907 152 48 80 chr5 129066723 129067436 -23469823 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 1569 288 369 47 16 chr5 129067436 129067591 -23469668 + MLT1H1 LTR MaLR 104 265 -290 1 1569 226 364 50 8 chr5 129067686 129067805 -23469454 + MLT1H1 LTR MaLR 424 547 -32 1 1569 2235 85 0 30 chr5 129070459 129070788 -23466471 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1569 309 298 115 0 chr5 129075381 129075485 -23461774 + MLT1D LTR MaLR 25 140 -365 1 1569 714 262 220 11 chr5 129076908 129077190 -23460069 + MTEb LTR MaLR 1 341 -38 1 1569 1221 202 99 7 chr5 129077936 129078230 -23459029 - MTEb LTR MaLR 0 379 59 1 1569 1486 218 124 8 chr5 129078838 129079194 -23458065 + MTD LTR MaLR 3 399 -20 1 1569 557 274 90 82 chr5 129080651 129081005 -23456254 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 1 1569 296 328 150 19 chr5 129081041 129081308 -23455951 - MLT1K LTR MaLR -123 472 171 1 1569 1527 219 68 8 chr5 129089204 129089558 -23447701 - MTEa LTR MaLR -1 378 4 1 1569 401 156 0 150 chr5 129092036 129092149 -23445110 + MT2B LTR ERVL 162 257 -344 2 1569 287 272 24 12 chr5 129096747 129096829 -23440430 + MTD LTR MaLR 322 404 -15 2 1569 345 263 44 56 chr5 129096896 129097014 -23440245 - MTEa LTR MaLR 0 419 269 2 1569 599 257 86 0 chr5 129097342 129097517 -23439742 + MTE2b LTR MaLR 182 371 -8 2 1569 1313 243 124 11 chr5 129098837 129099008 -23438251 + MTD LTR MaLR 1 180 -239 2 1569 1313 244 118 14 chr5 129099141 129099342 -23437917 + MTD LTR MaLR 181 403 -16 2 1569 1234 242 58 35 chr5 129101321 129101667 -23435592 - MTEa LTR MaLR -20 359 6 2 1570 923 197 45 14 chr5 129114440 129114640 -23422619 - MTE2a LTR MaLR -2 377 171 2 1570 6811 162 47 12 chr5 129114640 129114710 -23422549 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2099 3662 3579 2 1570 6811 162 47 12 chr5 129114737 129115901 -23421358 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2183 3578 2387 2 1570 1075 294 54 56 chr5 129115901 129116401 -23420858 + ERVL-int LTR ERVL 5259 5757 0 2 1570 519 264 40 8 chr5 129116403 129116529 -23420730 + MT2A LTR ERVL 13 142 -391 2 1570 277 284 370 24 chr5 129116598 129116759 -23420500 + MT2A LTR ERVL 268 488 -45 2 1570 277 306 184 9 chr5 129116797 129116827 -23420432 + MT2A LTR ERVL 489 518 -15 2 1570 255 321 118 15 chr5 129116809 129116945 -23420314 + MLT1L LTR MaLR 270 419 -191 2 1570 2253 82 12 60 chr5 129119220 129119555 -23417704 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1570 398 296 247 58 chr5 129128613 129129069 -23408190 - RMER20B LTR ERVK -31 596 55 2 1570 1897 149 21 26 chr5 129129560 129129957 -23407302 - ORR1B2 LTR MaLR 0 378 3 2 1570 2184 168 64 7 chr5 129135753 129136258 -23401001 - RMER4B LTR ERVK 0 585 17 2 1570 288 286 61 10 chr5 129136542 129136641 -23400618 - RMER15 LTR ERVL -50 525 422 2 1570 4740 64 5 0 chr5 129139796 129140377 -23396882 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 2 1570 2039 160 62 23 chr5 129145569 129145959 -23391300 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 3 1570 633 262 178 0 chr5 129149341 129149532 -23387727 + MTEb LTR MaLR 1 225 -154 3 1570 2421 98 60 3 chr5 129149538 129149885 -23387374 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 28 3 1570 687 338 78 43 chr5 129150545 129150891 -23386368 + ORR1E LTR MaLR 1 358 -1 3 1570 396 293 93 44 chr5 129151040 129151222 -23386037 - MLT1C LTR MaLR -203 264 74 3 1570 351 310 142 17 chr5 129152223 129152525 -23384734 + MLT1D LTR MaLR 24 363 -142 3 1570 2081 172 25 40 chr5 129158622 129159021 -23378238 + MTD LTR MaLR 11 403 -16 3 1570 2380 80 3 109 chr5 129159326 129159692 -23377567 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1570 660 278 39 58 chr5 129160411 129160615 -23376644 - RMER5 LTR ERV1 0 534 335 3 1570 1779 181 71 20 chr5 129160615 129160965 -23376294 + ORR1D1 LTR MaLR 1 368 -6 3 1570 3033 188 12 44 chr5 129160990 129161584 -23375675 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 3 1570 227 85 356 0 chr5 129161634 129161693 -23375566 - RMER5 LTR ERV1 -260 274 195 3 1570 1050 109 156 11 chr5 129161924 129162110 -23375149 - RLTR44E LTR ERVK -2 447 235 3 1570 2689 101 48 13 chr5 129163762 129164155 -23373104 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1570 2068 171 8 66 chr5 129164293 129164687 -23372572 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 3 1570 1081 238 266 31 chr5 129166658 129167082 -23370177 - RLTR11A LTR ERVK -4 524 1 3 1570 907 265 44 81 chr5 129167597 129167956 -23369303 - MTD LTR MaLR -41 359 2 3 1570 2269 104 66 6 chr5 129169482 129169829 -23367430 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 3 1570 523 206 55 18 chr5 129169856 129169965 -23367294 + ORR1E LTR MaLR 179 291 -68 3 1570 1710 138 141 57 chr5 129171228 129171582 -23365677 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1570 1108 213 62 27 chr5 129174219 129174479 -23362780 + MTEb LTR MaLR 107 375 -4 3 1570 2145 162 62 22 chr5 129174925 129175329 -23361930 + MTC LTR MaLR 2 421 0 3 1570 1042 251 85 27 chr5 129176926 129177273 -23359986 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 3 1570 415 339 60 6 chr5 129177435 129177601 -23359658 - MLT1C LTR MaLR 0 467 293 3 1570 2451 141 34 27 chr5 129178278 129178687 -23358572 + MTC LTR MaLR 3 414 -7 3 1570 3342 16 39 3 chr5 129178729 129179111 -23358148 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1570 1380 236 70 14 chr5 129185128 129185485 -23351774 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 4 1570 2199 119 0 49 chr5 129186010 129186354 -23350905 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1570 1558 166 196 11 chr5 129189559 129189573 -23347686 + MTD LTR MaLR 1 14 -405 4 1570 1558 166 196 11 chr5 129189607 129189945 -23347314 + MTD LTR MaLR 15 418 -1 4 1570 1319 269 3 29 chr5 129192083 129192393 -23344866 + MTE2b LTR MaLR 4 305 -74 4 1570 2877 153 114 64 chr5 129193503 129194083 -23343176 + RMER19C LTR ERVK 1 609 -2 4 1570 2799 126 92 14 chr5 129194789 129194858 -23342401 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 459 4 1570 2799 126 92 14 chr5 129194879 129195299 -23341960 - RLTR11A LTR ERVK -70 458 2 4 1570 1856 141 48 63 chr5 129198432 129198766 -23338493 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1570 1651 229 34 17 chr5 129204404 129204755 -23332504 + ORR1D2 LTR MaLR 6 362 -8 4 1570 1412 191 118 92 chr5 129208118 129208509 -23328750 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 4 1570 280 353 62 37 chr5 129214993 129215237 -23322022 + RMER15 LTR ERVL 311 560 -15 4 1570 952 175 33 26 chr5 129222520 129222721 -23314538 - ORR1A4 LTR MaLR -31 348 176 4 1570 331 368 105 43 chr5 129223021 129223325 -23313934 - LTR41B LTR ERVL -198 560 238 4 1570 609 299 88 88 chr5 129224411 129224598 -23312661 - MLT1C LTR MaLR -107 360 169 4 1570 609 299 88 88 chr5 129224794 129224958 -23312301 - MLT1C LTR MaLR -299 168 9 4 1570 2537 170 169 57 chr5 129225498 129226047 -23311212 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 1570 2193 117 7 3 chr5 129226277 129226587 -23310672 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 4 1570 253 257 13 26 chr5 129235686 129235762 -23301497 + MTE2a LTR MaLR 39 113 -266 5 1570 490 157 104 0 chr5 129236047 129236162 -23301097 + ORR1A2 LTR MaLR 1 127 -219 5 1570 1764 94 0 13 chr5 129236284 129236522 -23300737 + ORR1A2 LTR MaLR 93 327 0 5 1571 3242 61 0 5 chr5 129237959 129238357 -23298902 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1571 1111 246 15 112 chr5 129238647 129238986 -23298273 + ORR1E LTR MaLR 54 359 0 5 1571 228 276 122 19 chr5 129262502 129262609 -23274650 + MTEb LTR MaLR 5 122 -257 5 1571 251 239 38 114 chr5 129278015 129278147 -23259112 + RMER15 LTR ERVL 9 130 -445 5 1571 1110 253 101 31 chr5 129278277 129278691 -23258568 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1510 2012 -3749 5 1571 1031 206 190 32 chr5 129278691 129279007 -23258252 + MTD LTR MaLR 46 411 -8 5 1571 2367 179 175 21 chr5 129283209 129283724 -23253535 + RMER19C LTR ERVK 18 611 0 5 1571 385 284 57 89 chr5 129285756 129286003 -23251256 + MTEb LTR MaLR 52 290 -89 5 1571 1824 106 67 24 chr5 129294931 129295282 -23241977 + ORR1A4 LTR MaLR 1 394 0 5 1571 883 277 65 20 chr5 129301390 129301763 -23235496 - MTD LTR MaLR -1 378 1 6 1571 406 324 52 19 chr5 129304371 129304582 -23232677 + RMER12 LTR ERVK 771 988 -334 6 1571 2211 91 45 17 chr5 129307546 129307904 -23229355 + ORR1B1 LTR MaLR 27 394 0 6 1571 360 288 59 0 chr5 129310883 129311001 -23226258 + MER68 LTR ERVL 170 294 -269 6 1571 270 274 92 61 chr5 129320325 129320488 -23216771 + MLT1K LTR MaLR 259 426 -169 6 1571 2598 58 63 0 chr5 129327502 129327884 -23209375 + RLTR10A LTR ERVK 1 406 -5 6 1571 569 313 99 54 chr5 129329923 129330217 -23207042 - ORR1E LTR MaLR -48 311 5 6 1571 1671 203 167 72 chr5 129331139 129331623 -23205636 - MT2A LTR ERVL -3 530 1 6 1571 2329 93 9 64 chr5 129332841 129333186 -23204073 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 1571 590 266 41 14 chr5 129334861 129335006 -23202253 + MTEa LTR MaLR 5 153 -226 6 1571 589 257 22 100 chr5 129335438 129335667 -23201592 + MTEa LTR MaLR 169 379 0 6 1571 752 234 247 16 chr5 129335932 129336236 -23201023 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1571 909 276 166 3 chr5 129339810 129340159 -23197100 + MTD LTR MaLR 13 418 -1 6 1571 426 322 127 25 chr5 129344019 129344255 -23193004 + MLT1K LTR MaLR 285 544 -51 6 1571 821 250 120 131 chr5 129349451 129349810 -23187449 + MTE2a LTR MaLR 15 369 -10 6 1571 1130 260 89 62 chr5 129354996 129355611 -23181648 + RMER13A LTR ERVK 4 681 -227 6 1571 696 167 14 21 chr5 129359349 129359490 -23177769 + RLTR46 LTR ERVK 1 140 -180 6 1571 391 290 46 41 chr5 129359534 129359728 -23177531 + RLTR46 LTR ERVK 126 320 0 6 1571 3437 164 186 12 chr5 129361294 129362045 -23175214 + RMER19B LTR ERVK 1 882 -20 6 1571 290 296 18 57 chr5 129363134 129363283 -23173976 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 224 7 1572 297 254 81 8 chr5 129373282 129373405 -23163854 - LTR33 LTR ERVL -1 514 383 7 1572 476 336 61 20 chr5 129374099 129374345 -23162914 + MLT1C LTR MaLR 5 260 -207 7 1572 1478 233 67 21 chr5 129377046 129377467 -23159792 + BGLII_B LTR ERVK 2 441 0 7 1572 2277 140 105 20 chr5 129377711 129378007 -23159252 + RLTR16 LTR ERVK 6 344 -161 7 1572 3282 43 0 2 chr5 129378007 129378404 -23158855 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1572 2277 140 105 20 chr5 129378404 129378566 -23158693 + RLTR16 LTR ERVK 345 503 -2 7 1572 637 187 107 86 chr5 129379910 129380223 -23157036 + RMER10A LTR ERVL 2 382 -60 7 1572 537 213 156 124 chr5 129380364 129380417 -23156842 + RMER10A LTR ERVL 383 426 -16 7 1572 4987 92 111 29 chr5 129385735 129386572 -23150687 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 7 1572 1227 193 0 9 chr5 129396423 129396635 -23140624 + MTC LTR MaLR 210 420 -1 7 1572 1335 161 5 9 chr5 129398677 129398897 -23138362 + MTC LTR MaLR 200 418 -3 7 1572 1914 138 42 18 chr5 129401525 129401787 -23135472 + RLTR11A LTR ERVK 189 457 -71 7 1572 1914 138 42 18 chr5 129401808 129401877 -23135382 + RLTR11A LTR ERVK 458 527 -1 7 1572 291 252 68 39 chr5 129404109 129404212 -23133047 - MTD LTR MaLR -4 415 310 7 1572 2117 172 19 14 chr5 129404201 129404566 -23132693 + ORR1D1 LTR MaLR 8 374 0 7 1572 1003 258 101 17 chr5 129404571 129404859 -23132400 - MTD LTR MaLR -104 315 4 7 1572 408 277 0 40 chr5 129405105 129405229 -23132030 + RMER5 LTR ERV1 42 160 -374 7 1572 815 281 69 22 chr5 129405260 129405537 -23131722 + RMER5 LTR ERV1 233 522 -12 7 1572 422 216 18 89 chr5 129406912 129407024 -23130235 - MT2B LTR ERVL -345 256 153 7 1572 2247 70 33 62 chr5 129411297 129411633 -23125626 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 8 1572 272 304 60 17 chr5 129417027 129417080 -23120179 - MT2B2 LTR ERVL -310 274 178 8 1572 272 304 60 17 chr5 129417132 129417144 -23120115 - MT2B2 LTR ERVL -310 177 153 8 1572 319 157 0 0 chr5 129419310 129419361 -23117898 + MTEa LTR MaLR 25 75 -304 8 1572 423 345 52 99 chr5 129421030 129421413 -23115846 - MLT1B LTR MaLR -12 378 14 8 1572 659 240 52 58 chr5 129421764 129421972 -23115287 - MTE2a LTR MaLR 0 379 154 8 1572 823 240 14 43 chr5 129422172 129422454 -23114805 - ORR1E LTR MaLR -108 262 1 8 1572 286 203 188 0 chr5 129422639 129422703 -23114556 + MTE2a LTR MaLR 8 83 -296 8 1572 563 214 27 20 chr5 129422794 129422931 -23114328 + MTE2a LTR MaLR 254 403 -16 8 1572 309 199 42 100 chr5 129426280 129426369 -23110890 + RMER17D LTR ERVK 288 383 -506 8 1572 309 199 42 100 chr5 129426392 129426542 -23110717 + RMER17D LTR ERVK 384 513 -376 8 1572 663 192 8 23 chr5 129427451 129427579 -23109680 + MTEa LTR MaLR 19 144 -235 8 1572 736 283 21 11 chr5 129427811 129428000 -23109259 + MTEa LTR MaLR 181 371 -8 8 1572 1385 179 108 66 chr5 129432677 129433011 -23104248 + MTD LTR MaLR 64 411 -8 8 1572 1940 141 25 3 chr5 129433514 129433828 -23103431 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 8 1572 1841 161 39 71 chr5 129437460 129437842 -23099417 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 8 1572 1057 235 81 40 chr5 129442513 129442829 -23094430 - MTD LTR MaLR -72 307 1 8 1572 368 192 12 82 chr5 129442878 129442963 -23094296 + MT2B LTR ERVL 162 240 -361 8 1572 1789 146 29 100 chr5 129449525 129449812 -23087447 + ORR1B1 LTR MaLR 41 299 -95 9 1572 3427 18 0 0 chr5 129449812 129450208 -23087051 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1572 8958 19 19 1 chr5 129450208 129451287 -23085972 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 9 1572 3427 18 0 0 chr5 129451287 129451683 -23085576 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1572 1789 146 29 100 chr5 129451683 129451774 -23085485 + ORR1B1 LTR MaLR 300 392 -2 9 1572 1484 127 51 12 chr5 129452015 129452271 -23084988 + ORR1B2 LTR MaLR 1 266 -101 9 1572 2339 110 6 3 chr5 129455834 129456179 -23081080 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 9 1572 1221 132 36 12 chr5 129464198 129464429 -23072830 + ORR1B1 LTR MaLR 94 386 -8 9 1572 1505 214 42 21 chr5 129465038 129465417 -23071842 + MTD LTR MaLR 6 389 -30 9 1572 1438 185 87 17 chr5 129465766 129466112 -23071147 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 9 1572 268 175 143 0 chr5 129466505 129466568 -23070691 + ORR1D2 LTR MaLR 1 72 -298 9 1572 2603 25 41 0 chr5 129468715 129469029 -23068230 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 9 1572 5595 164 40 49 chr5 129472043 129472429 -23064830 + RMER12 LTR ERVK 1 387 -935 9 1572 5595 164 40 49 chr5 129472608 129473422 -23063837 + RMER12 LTR ERVK 388 1190 -132 9 1572 1887 90 48 114 chr5 129476112 129476192 -23061067 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 288 9 1572 1887 90 48 114 chr5 129476340 129476611 -23060648 - ORR1A4 LTR MaLR -42 287 1 9 1572 341 135 62 0 chr5 129481116 129481212 -23056047 - IAPEz-int LTR ERVK -5546 935 834 1 1572 285 75 57 0 chr5 129481186 129481239 -23056020 - IAPEz-int LTR ERVK -5546 935 880 1 1572 967 225 208 23 chr5 129482590 129482932 -23054327 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1572 1763 163 105 3 chr5 129486722 129487087 -23050172 - MTD LTR MaLR -14 405 13 1 1572 244 270 123 19 chr5 129487218 129487373 -23049886 + MTEa LTR MaLR 197 367 -12 1 1572 228 314 23 11 chr5 129489945 129490032 -23047227 - RMER15 LTR ERVL -36 539 452 1 1572 298 224 79 0 chr5 129490294 129490370 -23046889 + RMER15 LTR ERVL 492 573 -2 1 1572 1825 155 64 3 chr5 129497221 129497564 -23039695 + ORR1B2 LTR MaLR 1 364 -3 1 1572 261 288 21 120 chr5 129498274 129498416 -23038843 + MT2B LTR ERVL 138 265 -336 1 1573 234 290 109 27 chr5 129503005 129503115 -23034144 + MLT1E2 LTR MaLR 45 163 -464 6 1573 2046 106 98 9 chr5 129503290 129503615 -23033644 + ORR1B2 LTR MaLR 1 354 -13 7 1573 228 297 16 105 chr5 129506090 129506214 -23031045 + MT2B LTR ERVL 151 263 -338 1 1573 329 223 61 50 chr5 129507917 129508016 -23029243 + MT2B LTR ERVL 158 257 -344 1 1573 721 287 26 102 chr5 129514895 129515279 -23021980 - ORR1E LTR MaLR -3 356 2 3 1573 1152 257 45 0 chr5 129515404 129515669 -23021590 + MTE2b LTR MaLR 43 319 -60 3 1573 240 239 44 15 chr5 129518897 129518965 -23018294 - MLT1A LTR MaLR -272 102 33 5 1573 577 277 96 80 chr5 129520738 129521245 -23016014 + RMER4B LTR ERVK 1 579 -6 6 1573 473 289 230 12 chr5 129523419 129523460 -23013799 - MT2A LTR ERVL 0 533 493 7 1573 473 342 225 26 chr5 129523507 129523731 -23013528 - MT2A LTR ERVL -41 492 6 7 1573 477 297 69 52 chr5 129523731 129523905 -23013354 - MTEa LTR MaLR -197 182 6 7 1573 385 274 70 17 chr5 129523969 129524084 -23013175 - MTEa LTR MaLR -1 378 258 7 1573 773 224 304 34 chr5 129524282 129524578 -23012681 - MTEa LTR MaLR -3 376 1 7 1573 2057 157 120 32 chr5 129531696 129532137 -23005122 + RMER15 LTR ERVL 96 575 0 8 1573 2518 86 3 0 chr5 129533131 129533457 -23003802 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1573 9063 118 70 38 chr5 129533457 129534406 -23002853 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1043 8 1573 9063 118 70 38 chr5 129534533 129535201 -23002058 - ORR1A2-int LTR MaLR -921 1042 294 8 1573 327 294 141 88 chr5 129538386 129538534 -22998725 - MLT1B LTR MaLR -17 373 242 1 1573 1573 154 119 106 chr5 129538534 129538912 -22998347 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 1 1573 327 294 141 88 chr5 129538912 129539117 -22998142 - MLT1B LTR MaLR -149 241 1 1 1573 1605 219 22 25 chr5 129544926 129545249 -22992010 - MTEa LTR MaLR -57 322 1 1 1573 1663 215 45 17 chr5 129547158 129547513 -22989746 + MTEa LTR MaLR 13 377 -2 1 1573 649 228 187 42 chr5 129550174 129550408 -22986851 - RMER4B LTR ERVK 0 585 343 1 1573 1052 168 76 45 chr5 129550897 129551121 -22986138 - RMER4B LTR ERVK -338 247 17 1 1573 3010 113 124 8 chr5 129553623 129554130 -22983129 + RMER4B LTR ERVK 20 585 0 1 1573 638 217 97 13 chr5 129560057 129560211 -22977048 - MTE2b LTR MaLR -11 368 202 1 1573 489 179 56 19 chr5 129560291 129560507 -22976752 - RMER17D LTR ERVK -420 469 246 1 1573 755 245 31 0 chr5 129560462 129560621 -22976638 - MTE2b LTR MaLR -170 209 46 1 1573 231 259 10 115 chr5 129561785 129561881 -22975378 - MT2B LTR ERVL -363 238 153 1 1573 230 354 24 12 chr5 129564983 129565066 -22972193 - ORR1E LTR MaLR -11 408 325 2 1573 295 255 94 125 chr5 129565181 129565405 -22971854 - ORR1E LTR MaLR -112 247 31 2 1573 1403 237 137 6 chr5 129565455 129565812 -22971447 + MTD LTR MaLR 16 419 0 2 1573 318 291 201 35 chr5 129566734 129567022 -22970237 - MLT1D LTR MaLR -62 443 108 2 1573 333 288 194 17 chr5 129574064 129574244 -22963015 + MLT1A0 LTR MaLR 1 212 -153 2 1573 458 261 35 31 chr5 129574253 129574422 -22962837 - MTEa LTR MaLR -10 369 181 2 1573 397 291 31 16 chr5 129574565 129574694 -22962565 + MLT1A0 LTR MaLR 235 365 0 2 1573 273 350 30 61 chr5 129578782 129578980 -22958279 - RMER15 LTR ERVL -59 516 325 2 1573 928 167 31 6 chr5 129582320 129582483 -22954776 + MTC LTR MaLR 1 167 -240 2 1573 972 99 7 121 chr5 129582775 129583068 -22954191 + MTC LTR MaLR 166 400 0 2 1573 225 324 0 40 chr5 129584278 129584352 -22952907 - MLT2B2 LTR ERVL -222 293 223 2 1573 2523 97 20 8 chr5 129588934 129589289 -22947970 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 2 1573 2045 105 32 79 chr5 129590500 129590841 -22946418 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 1 2 1573 1136 242 38 144 chr5 129597305 129597390 -22939869 - MTEa LTR MaLR 0 379 329 2 1573 1136 242 38 144 chr5 129597416 129597754 -22939505 - MTEa LTR MaLR -51 328 1 2 1573 467 264 40 0 chr5 129609270 129609395 -22927864 + MTE2b LTR MaLR 1 130 -249 3 1573 911 258 67 159 chr5 129609391 129609824 -22927435 - MTD LTR MaLR -9 410 18 3 1573 559 262 180 11 chr5 129609825 129610014 -22927245 + MTE2b LTR MaLR 158 378 -1 3 1573 2906 163 22 28 chr5 129613613 129613713 -22923546 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 437 3 1573 2906 163 22 28 chr5 129613762 129614205 -22923054 - RLTR20A LTR ERVK -105 436 1 3 1573 1063 262 45 65 chr5 129627157 129627212 -22910047 - MTE2a LTR MaLR -13 406 315 3 1573 1063 263 46 65 chr5 129627249 129627598 -22909661 - MTE2a LTR MaLR -76 343 1 3 1574 1221 109 178 4 chr5 129632339 129632569 -22904690 + MTC LTR MaLR 11 280 -141 3 1574 547 294 107 44 chr5 129636727 129637065 -22900194 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 1574 231 206 31 31 chr5 129637862 129637927 -22899332 - MLT1A1 LTR MaLR -266 142 78 3 1574 252 280 0 47 chr5 129637908 129637994 -22899265 - ORR1B1 LTR MaLR -311 83 2 3 1574 239 291 173 25 chr5 129648994 129649156 -22888103 - MLT1K LTR MaLR -35 560 375 3 1574 572 256 111 37 chr5 129650588 129650850 -22886409 - RMER20B LTR ERVK -91 425 139 3 1574 1021 224 172 16 chr5 129653636 129653944 -22883315 - MTD LTR MaLR -14 405 50 3 1574 433 318 142 34 chr5 129657654 129657950 -22879309 - MLT1D LTR MaLR -6 499 172 4 1574 720 198 35 12 chr5 129663065 129663234 -22874025 - RLTR11A LTR ERVK -349 179 7 4 1574 232 318 94 38 chr5 129666037 129666197 -22871062 - LTR84a LTR ERVL -427 330 162 4 1574 1440 231 114 31 chr5 129670903 129671288 -22865971 - MTD LTR MaLR -2 417 1 4 1574 245 352 0 77 chr5 129674637 129674668 -22862591 - MT2B2 LTR ERVL -430 154 133 4 1574 2267 147 68 8 chr5 129690108 129690289 -22846970 - MTC LTR MaLR 0 421 243 4 1574 2267 147 68 8 chr5 129690335 129690550 -22846709 - MTC LTR MaLR -179 242 3 4 1574 277 295 121 14 chr5 129693107 129693248 -22844011 - MLT1K LTR MaLR -23 572 417 4 1574 260 286 95 89 chr5 129693385 129693554 -22843705 - MLT1K LTR MaLR -377 233 64 4 1574 280 330 58 0 chr5 129699033 129699136 -22838123 - MLT1B LTR MaLR -9 381 273 4 1574 862 273 109 57 chr5 129699631 129700054 -22837205 - RMER13A LTR ERVK -394 466 22 4 1574 404 332 108 80 chr5 129703050 129703364 -22833895 - MER76 LTR ERVL -62 629 307 4 1574 690 249 86 113 chr5 129712545 129712871 -22824388 + RMER13A LTR ERVK 511 827 -33 4 1574 2090 196 55 39 chr5 129713073 129713530 -22823729 - RMER4A LTR ERVK 0 466 3 4 1574 1019 198 93 32 chr5 129721350 129721596 -22815663 - MTD LTR MaLR -14 405 145 5 1574 696 277 37 5 chr5 129721703 129721892 -22815367 - MTD LTR MaLR -224 195 1 5 1574 240 284 91 9 chr5 129722998 129723108 -22814151 + MLT1E2 LTR MaLR 1 119 -386 5 1574 272 333 119 22 chr5 129723205 129723432 -22813827 + MLT1E2 LTR MaLR 275 523 -104 5 1574 2397 82 12 59 chr5 129727200 129727537 -22809722 + ORR1A2 LTR MaLR 3 323 -4 5 1574 970 240 78 109 chr5 129734481 129734699 -22802560 - RLTR18B LTR ERVK 0 616 275 5 1574 3367 43 5 2 chr5 129734699 129735095 -22802164 - MTB LTR MaLR 0 400 4 5 1574 970 231 66 126 chr5 129735095 129735289 -22801970 - RLTR18B LTR ERVK -238 274 105 5 1574 573 241 158 57 chr5 129739881 129739993 -22797266 + RMER21A LTR ERV1 414 536 -411 5 1574 573 241 158 57 chr5 129740018 129740151 -22797108 + RMER21A LTR ERV1 537 684 -263 5 1574 4392 98 11 28 chr5 129740951 129741590 -22795669 + RLTR5_Mm LTR ERV1 1 628 0 5 1574 258 200 140 79 chr5 129741638 129741752 -22795507 + MLT1J1 LTR MaLR 32 152 -292 5 1574 442 299 50 58 chr5 129744468 129744727 -22792532 + ORR1E LTR MaLR 41 297 -62 5 1574 3596 20 0 2 chr5 129747219 129747616 -22789643 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1574 268 226 24 35 chr5 129755055 129755152 -22782107 - MLT1J LTR MaLR -346 166 45 5 1574 303 315 11 0 chr5 129755738 129755827 -22781432 - MLT1J2 LTR MaLR -285 163 74 5 1574 258 277 110 63 chr5 129755826 129755953 -22781306 - MLT1J LTR MaLR -367 145 13 5 1574 353 193 0 120 chr5 129760965 129761065 -22776194 + MT2B LTR ERVL 153 240 -361 5 196 577 292 146 48 chr5 129761211 129761527 -22775732 + RMER10A LTR ERVL 71 417 -25 5 1575 1092 195 73 159 chr5 129763065 129763473 -22773786 - ORR1C2 LTR MaLR -11 373 1 5 1575 688 197 187 31 chr5 129771586 129771811 -22765448 - RMER4B LTR ERVK -8 577 318 5 1575 772 192 156 23 chr5 129772032 129772250 -22765009 - RMER4B LTR ERVK -338 247 1 5 1575 290 336 72 40 chr5 129773472 129773624 -22763635 + MLT1A1 LTR MaLR 1 157 -251 5 1575 921 301 50 29 chr5 129776875 129777250 -22760009 - MTE2a LTR MaLR -2 417 19 5 1575 1778 151 3 27 chr5 129781111 129781411 -22755848 + ORR1D1 LTR MaLR 1 293 -81 5 1575 402 211 22 11 chr5 129781610 129781701 -22755558 + ORR1D1 LTR MaLR 282 373 -1 5 1575 1282 137 103 16 chr5 129785853 129786106 -22751153 - MTB_Mm LTR MaLR -132 275 1 5 1575 465 284 66 38 chr5 129788447 129788630 -22748629 - MER34A LTR ERV1 0 571 384 5 1575 505 203 134 8 chr5 129788830 129788949 -22748310 - MTE2b LTR MaLR -241 138 5 5 1575 1650 163 86 47 chr5 129790724 129790767 -22746492 + RLTR20D LTR ERVK 1 39 -529 5 1575 1650 163 85 45 chr5 129791639 129791993 -22745266 + RLTR20D LTR ERVK 40 464 -104 5 1575 939 163 80 24 chr5 129792035 129792126 -22745133 + RLTR20D LTR ERVK 465 567 -1 5 1575 244 283 130 23 chr5 129793626 129793803 -22743456 + RMER15 LTR ERVL 6 201 -374 5 1575 5032 123 22 22 chr5 129796453 129796483 -22740776 - RMER19A LTR ERVK 0 737 721 6 1575 5032 123 22 22 chr5 129796663 129797369 -22739890 - RMER19A LTR ERVK -17 720 1 6 1575 767 233 16 11 chr5 129797732 129797914 -22739345 - MTC LTR MaLR -223 198 16 6 1575 859 260 39 123 chr5 129807454 129807867 -22729392 + MTD LTR MaLR 3 380 -39 6 1575 583 333 63 11 chr5 129808895 129809180 -22728079 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 58 6 1575 1578 201 94 6 chr5 129819163 129819493 -22717766 + MTEa LTR MaLR 13 371 -8 6 1575 511 223 31 0 chr5 129821347 129821477 -22715782 + ORR1E LTR MaLR 12 145 -214 6 1575 3064 23 23 0 chr5 129823438 129823784 -22713475 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 6 1575 856 196 170 55 chr5 129834676 129835006 -22702253 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 6 1575 1906 243 87 18 chr5 129837373 129837413 -22699846 - MT2A LTR ERVL -4 529 490 6 1575 1906 243 87 18 chr5 129837514 129837968 -22699291 - MT2A LTR ERVL -44 489 1 6 1575 577 357 87 36 chr5 129838419 129838808 -22698451 + MER70B LTR ERVL 164 572 -6 6 1575 860 249 174 49 chr5 129838919 129839286 -22697973 - MTD LTR MaLR -1 418 6 6 1575 991 287 63 15 chr5 129842413 129842746 -22694513 + MTE2b LTR MaLR 1 349 -30 6 1575 2062 149 34 17 chr5 129842908 129843262 -22693997 + ORR1B2 LTR MaLR 8 367 0 6 1575 298 283 77 35 chr5 129845013 129845156 -22692103 + MLT1J LTR MaLR 13 161 -351 6 1575 2106 114 126 0 chr5 129851741 129852091 -22685168 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1575 444 332 87 29 chr5 129855145 129855353 -22681906 + MT2A LTR ERVL 245 464 -69 6 1575 1218 212 202 46 chr5 129857015 129857471 -22679788 + RMER4B LTR ERVK 35 561 -24 6 1575 1225 198 167 3 chr5 129858430 129858759 -22678500 + MTD LTR MaLR 35 417 -2 6 1575 1949 148 62 19 chr5 129861457 129861830 -22675429 + ORR1B1 LTR MaLR 1 389 -5 7 1575 288 205 96 16 chr5 129862491 129862592 -22674667 - MLT1J LTR MaLR -323 189 44 7 1575 337 150 11 101 chr5 129867053 129867119 -22670140 - MTEb LTR MaLR 0 379 320 7 1575 2220 128 31 16 chr5 129867119 129867507 -22669752 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1575 337 150 11 101 chr5 129867507 129867529 -22669730 - MTEb LTR MaLR -60 319 299 7 1575 500 337 178 31 chr5 129873486 129873748 -22663511 + MLT2B3 LTR ERVL 71 373 -181 7 1575 1405 245 57 15 chr5 129873748 129874150 -22663109 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1575 500 337 178 31 chr5 129874150 129874268 -22662991 + MLT2B3 LTR ERVL 374 512 -42 7 1575 500 337 178 31 chr5 129874321 129874361 -22662898 + MLT2B3 LTR ERVL 513 553 -1 7 1575 244 276 117 62 chr5 129875162 129875324 -22661935 - MTE2b LTR MaLR -114 245 75 7 1575 574 246 12 83 chr5 129875380 129875602 -22661657 + MTE2a LTR MaLR 1 230 -189 7 1575 1151 259 49 18 chr5 129875631 129875957 -22661302 + ORR1E LTR MaLR 24 359 0 7 1575 2251 240 110 30 chr5 129876537 129877228 -22660031 - RMER13A LTR ERVK -114 746 1 7 1575 610 227 194 9 chr5 129877228 129877448 -22659811 + RMER21B LTR ERV1 307 567 -275 7 1575 1478 253 34 19 chr5 129877662 129878072 -22659187 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 7 1575 469 290 244 20 chr5 129878705 129879025 -22658234 - MLT1A0 LTR MaLR -2 406 1 7 1575 1434 202 71 74 chr5 129879271 129879651 -22657608 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 7 1575 369 228 86 8 chr5 129879660 129879788 -22657471 - MLT1C LTR MaLR -24 443 306 7 1575 392 211 0 0 chr5 129879776 129879852 -22657407 - MTE2b LTR MaLR -303 76 1 7 1575 264 247 39 13 chr5 129879955 129880033 -22657226 - MLT1A LTR MaLR -151 223 144 7 1575 428 289 19 57 chr5 129880102 129880260 -22656999 - ORR1E LTR MaLR -207 152 1 7 1575 340 198 20 71 chr5 129881343 129881441 -22655818 + ORR1E LTR MaLR 42 134 -225 7 1575 742 196 104 16 chr5 129881461 129881643 -22655616 + RLTR11A LTR ERVK 4 201 -327 7 1575 3910 144 92 84 chr5 129882287 129883230 -22654029 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 1 7 1575 350 309 121 8 chr5 129883230 129883408 -22653851 - MLT1E2 LTR MaLR -137 487 285 7 1575 1334 244 105 56 chr5 129883944 129884447 -22652812 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 7 1575 247 289 179 36 chr5 129885387 129885527 -22651732 - MLT1E2 LTR MaLR -260 252 93 7 1575 1871 120 39 72 chr5 129888298 129888631 -22648628 + ORR1A3 LTR MaLR 5 326 0 7 1575 2313 66 83 0 chr5 129891259 129891561 -22645698 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1576 2007 182 16 29 chr5 129893298 129893682 -22643577 + RMER20B LTR ERVK 1 379 -248 7 1576 253 229 31 62 chr5 129893695 129893760 -22643499 + RMER20B LTR ERVK 544 606 -21 7 1576 1567 112 72 32 chr5 129903316 129903593 -22633666 + ORR1A2 LTR MaLR 32 319 -8 7 1576 4688 174 26 59 chr5 129905000 129905988 -22631271 - RMER17B LTR ERVK 0 958 3 7 1576 2246 90 0 0 chr5 129906414 129906714 -22630545 + ORR1A3 LTR MaLR 27 326 0 7 1576 323 276 134 31 chr5 129907157 129907218 -22630041 - RLTR20A2 LTR ERVK -28 550 492 7 1576 323 276 134 31 chr5 129907247 129907282 -22629977 - RLTR20A2 LTR ERVK -87 491 444 7 1576 2386 84 0 0 chr5 129908275 129908584 -22628675 + ORR1A2 LTR MaLR 11 319 -8 7 1576 2200 175 61 5 chr5 129909639 129910030 -22627229 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 7 1576 1202 289 58 14 chr5 129913027 129913388 -22623871 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 7 1576 1479 237 43 41 chr5 129914214 129914583 -22622676 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1576 502 162 167 28 chr5 129914973 129915081 -22622178 - MTD LTR MaLR -1 418 296 7 1576 2528 124 12 10 chr5 129916679 129917093 -22620166 + BGLII LTR ERVK 7 421 0 7 1576 502 269 44 25 chr5 129919855 129920015 -22617244 + MTE2a LTR MaLR 6 168 -211 8 1576 2289 139 3 17 chr5 129925420 129925779 -22611480 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 8 1576 2372 190 0 44 chr5 129930475 129930910 -22606349 + MTC LTR MaLR 2 417 -4 8 1576 246 226 10 65 chr5 129937304 129937412 -22599847 - ORR1A2 LTR MaLR -140 238 138 8 1576 1176 231 67 87 chr5 129937389 129937711 -22599548 + MT2B LTR ERVL 253 546 -55 8 1576 1176 231 67 87 chr5 129937745 129937778 -22599481 + MT2B LTR ERVL 547 601 0 8 1576 2077 125 1 72 chr5 129937819 129938172 -22599087 - ORR1A3 LTR MaLR 0 379 1 8 1576 302 145 63 16 chr5 129939863 129939926 -22597333 - MTEb LTR MaLR -14 365 300 8 1576 2199 136 16 33 chr5 129939927 129940292 -22596967 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 8 1576 280 284 32 54 chr5 129940401 129940494 -22596765 - MTEb LTR MaLR -269 110 20 8 1576 484 301 62 31 chr5 129940517 129940678 -22596581 + MLT1A0 LTR MaLR 86 251 -114 8 1576 1240 279 22 85 chr5 129941163 129941563 -22595696 + MTE2a LTR MaLR 1 375 -4 8 1576 2890 14 5 157 chr5 129943315 129943748 -22593511 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 8 1576 8381 80 66 13 chr5 129943750 129945042 -22592217 + IAPEz-int LTR ERVK 3 1313 -5168 8 1576 28168 17 1 1 chr5 129945041 129948315 -22588944 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6481 0 8 1576 2715 14 5 157 chr5 129948315 129948748 -22588511 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 8 1576 2411 137 31 17 chr5 129949207 129949622 -22587637 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1576 457 238 10 0 chr5 129950618 129950719 -22586540 + MTEb LTR MaLR 1 102 -277 8 1576 1711 161 42 33 chr5 129950721 129951010 -22586249 + ORR1A1 LTR MaLR 3 305 -41 8 1576 1711 161 42 33 chr5 129951197 129951241 -22586018 + ORR1A1 LTR MaLR 306 339 -7 8 1576 854 229 109 0 chr5 129951245 129951455 -22585804 + MTEb LTR MaLR 147 379 0 8 1576 230 235 22 90 chr5 129951990 129952079 -22585180 + MT2B2 LTR ERVL 173 255 -329 8 1576 2289 93 84 3 chr5 129959344 129959700 -22577559 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 2 8 1576 1569 207 149 98 chr5 129962953 129963516 -22573743 + RMER20B LTR ERVK 11 602 -25 8 1576 994 286 28 83 chr5 129969131 129969528 -22567731 - MTE2a LTR MaLR 0 379 5 8 1576 1613 134 105 64 chr5 129971887 129972074 -22565185 + RMER17C LTR ERVK 1 188 -222 8 1576 1613 134 105 64 chr5 129972136 129972337 -22564922 + RMER17C LTR ERVK 189 405 -5 8 1576 1327 196 114 13 chr5 129975080 129975446 -22561813 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1576 1162 253 100 14 chr5 129980894 129981243 -22556016 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 9 1576 407 256 82 8 chr5 129981424 129981546 -22555713 + MER34A LTR ERV1 436 566 -5 9 1576 271 191 0 0 chr5 129983335 129983382 -22553877 - MLT1I LTR MaLR 0 411 365 9 1576 1591 199 86 72 chr5 129984643 129985099 -22552160 + MT2B LTR ERVL 2 556 -45 9 1576 1591 197 34 43 chr5 129985143 129985186 -22552073 + MT2B LTR ERVL 557 599 -2 9 1576 297 224 15 15 chr5 129989947 129990015 -22547244 - MTD LTR MaLR -148 271 204 9 1576 2056 191 122 74 chr5 129991624 129992205 -22545054 - RMER19C LTR ERVK 0 611 3 9 1576 1472 214 49 17 chr5 129996542 129996889 -22540370 + MTD LTR MaLR 45 402 -17 9 1576 533 289 68 128 chr5 130000004 130000254 -22537005 + MTD LTR MaLR 76 310 -109 1 1576 261 365 88 67 chr5 130000414 130000699 -22536560 + ORR1E LTR MaLR 58 348 -11 2 1576 723 234 116 26 chr5 130002654 130002843 -22534416 + MTE2b LTR MaLR 2 207 -172 1 1576 1052 247 114 86 chr5 130002893 130003323 -22533936 + RLTR28B LTR ERVL 2 443 -38 1 1576 476 337 39 85 chr5 130005064 130005223 -22532036 - MER70A LTR ERVL -9 463 312 1 1576 476 337 39 85 chr5 130005366 130005537 -22531722 - MER70A LTR ERVL -161 311 148 1 1576 1549 194 49 55 chr5 130011196 130011544 -22525715 - ORR1C2 LTR MaLR -38 346 1 2 1576 2235 86 3 107 chr5 130015447 130015812 -22521447 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1576 263 229 90 15 chr5 130016602 130016622 -22520637 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 750 612 4 1576 1579 201 57 22 chr5 130017285 130017651 -22519608 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 1576 289 245 9 133 chr5 130023137 130023158 -22514101 + MT2B LTR ERVL 148 154 -447 5 1577 654 281 11 50 chr5 130031482 130031662 -22505597 - MTE2a LTR MaLR -3 376 204 7 1577 369 332 112 53 chr5 130036605 130036655 -22500604 - MT2A LTR ERVL -16 517 470 8 1577 369 332 112 53 chr5 130036839 130037085 -22500174 - MT2A LTR ERVL -68 465 195 8 1577 369 332 112 53 chr5 130037268 130037285 -22499974 - MT2A LTR ERVL -339 194 178 8 1577 306 298 36 0 chr5 130037338 130037422 -22499837 - MTEa LTR MaLR -232 147 61 9 1577 2162 234 132 99 chr5 130037472 130037751 -22499508 - MERVL_2A-int LTR ERVL -190 5567 5255 9 1577 2162 234 132 99 chr5 130037828 130038400 -22498859 - MERVL_2A-int LTR ERVL -190 5254 4609 9 1577 3176 250 84 49 chr5 130038399 130038757 -22498502 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1495 4266 3890 9 1577 3176 250 84 49 chr5 130038915 130039569 -22497690 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1872 3889 3219 9 1577 353 368 53 49 chr5 130039790 130040056 -22497203 - MT2A LTR ERVL -202 331 65 9 1577 403 365 108 51 chr5 130039870 130040084 -22497175 - MTEa LTR MaLR -117 262 37 9 1577 518 219 10 0 chr5 130045300 130045396 -22491863 - ORR1E LTR MaLR -243 116 20 1 1577 260 233 43 65 chr5 130053274 130053366 -22483893 + MT2B2 LTR ERVL 190 279 -305 1 1577 227 241 139 49 chr5 130054397 130054519 -22482740 - MT2A LTR ERVL -287 246 114 1 1577 962 150 50 2 chr5 130057437 130057683 -22479576 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1577 237 327 87 17 chr5 130067470 130067585 -22469674 - ORR1E LTR MaLR -217 142 20 1 1577 3308 48 0 8 chr5 130078323 130078719 -22458540 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 4 1 1577 301 312 41 10 chr5 130088573 130088670 -22448589 + MTEa LTR MaLR 1 100 -279 1 1577 482 257 0 60 chr5 130088650 130088766 -22448493 + MTE2b LTR MaLR 42 150 -229 1 1577 475 279 175 22 chr5 130093932 130094232 -22443027 - ORR1D1 LTR MaLR -10 349 1 1 1577 255 273 71 77 chr5 130107254 130107409 -22429850 - RMER15 LTR ERVL -421 154 1 2 1577 769 228 135 135 chr5 130109254 130109625 -22427634 - MTE2b LTR MaLR -1 378 5 2 1577 2248 165 94 102 chr5 130109747 130109849 -22427410 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 449 2 1577 2248 165 94 102 chr5 130109996 130110425 -22426834 - RLTR11A LTR ERVK -80 448 1 2 1577 288 292 75 23 chr5 130118168 130118301 -22418958 - RMER15 LTR ERVL -90 485 346 2 1577 2881 58 81 5 chr5 130122162 130122544 -22414715 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 1577 3215 163 96 83 chr5 130123850 130124640 -22412619 + RLTR14-int LTR ERV1 488 1287 -4030 2 1577 2338 140 20 56 chr5 130124733 130124978 -22412281 + RLTR14-int LTR ERV1 1295 1535 -3782 2 1577 2338 197 29 65 chr5 130125161 130125386 -22411873 + RLTR14-int LTR ERV1 1536 1688 -3629 2 1577 11436 203 47 66 chr5 130125591 130126658 -22410601 + RLTR14-int LTR ERV1 1746 2593 -2724 2 1577 1336 211 25 16 chr5 130126658 130126975 -22410284 + RLTR46 LTR ERVK 1 320 0 2 1577 11436 147 51 56 chr5 130126975 130127608 -22409651 + RLTR14-int LTR ERV1 2594 3177 -2140 2 1577 11436 147 51 56 chr5 130127800 130128813 -22408446 + RLTR14-int LTR ERV1 3178 4236 -1081 2 1577 6312 140 28 42 chr5 130129785 130130879 -22406380 + RLTR14-int LTR ERV1 4231 5309 -8 2 1577 2217 151 19 8 chr5 130130887 130131260 -22405999 + RLTR14 LTR ERV1 1 377 -5 2 1577 2890 68 39 3 chr5 130131260 130131646 -22405613 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1577 6141 110 111 52 chr5 130132199 130132978 -22404281 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 847 -267 2 1577 6141 110 111 52 chr5 130133162 130133434 -22403825 + RLTR13D3 LTR ERVK 848 1114 0 2 1577 1810 188 50 45 chr5 130135922 130136042 -22401217 + MTC LTR MaLR 1 114 -307 2 1577 1810 188 50 45 chr5 130136230 130136528 -22400731 + MTC LTR MaLR 115 421 0 2 1577 553 233 78 24 chr5 130137516 130137683 -22399576 + ORR1D2 LTR MaLR 139 314 -56 2 1577 1597 121 258 6 chr5 130139635 130139965 -22397294 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 1577 671 188 25 56 chr5 130139966 130140163 -22397096 - MTC-int LTR MaLR -1 1257 1067 2 1577 3265 91 32 17 chr5 130142698 130143166 -22394093 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 2 1577 258 154 191 71 chr5 130146762 130146775 -22390484 + MT2B LTR ERVL 155 177 -424 2 1577 3076 119 88 18 chr5 130147573 130148060 -22389199 - MTC-int LTR MaLR -157 1101 587 2 1577 3641 35 28 0 chr5 130148060 130148484 -22388775 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 1577 3076 150 150 23 chr5 130148484 130148656 -22388603 - MTC-int LTR MaLR -672 586 509 2 1577 314 131 65 16 chr5 130148637 130148699 -22388560 - MTC-int LTR MaLR -1188 70 6 2 1577 2220 152 56 8 chr5 130148714 130149104 -22388155 - MTC LTR MaLR -12 409 1 2 1577 738 214 35 97 chr5 130149219 130149303 -22387956 + MTC LTR MaLR 154 231 -165 2 1577 1086 133 7 2 chr5 130149519 130149691 -22387568 + MTC LTR MaLR 232 421 0 2 1577 2936 9 0 0 chr5 130150138 130150460 -22386799 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 197 43344 14 1 3 chr5 130150460 130155315 -22381944 + MMETn-int LTR ERVK 1 4844 0 2 1578 2919 16 0 0 chr5 130155315 130155637 -22381622 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1578 2118 110 63 15 chr5 130157107 130157439 -22379820 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 39 3 1578 801 306 91 102 chr5 130157994 130158500 -22378759 + MTE-int LTR MaLR 22 569 -1011 3 1578 600 306 91 102 chr5 130158695 130158899 -22378360 + MTE-int LTR MaLR 498 724 -646 3 1578 1183 186 174 6 chr5 130158909 130159235 -22378024 + RLTR40 LTR ERVK 1 381 -436 3 1578 1022 204 146 21 chr5 130159265 130159505 -22377754 - MTD LTR MaLR -148 271 2 3 1578 598 256 36 12 chr5 130159514 130159680 -22377579 - RMER15-int LTR ERVL -4620 379 210 3 1578 258 267 97 19 chr5 130159919 130160022 -22377237 - RMER15 LTR ERVL -57 518 408 3 1578 1895 110 32 78 chr5 130164622 130164967 -22372292 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1578 847 191 13 0 chr5 130168019 130168176 -22369083 - MTD LTR MaLR -248 171 13 3 1578 334 166 99 62 chr5 130169924 130170024 -22367235 + RLTR13D3 LTR ERVK 889 1072 -42 3 1578 2148 152 52 17 chr5 130173189 130173591 -22363668 - MTC LTR MaLR -5 416 1 3 1578 1346 273 20 73 chr5 130173602 130174056 -22363203 - MT2A LTR ERVL -103 430 1 3 1578 1242 91 21 0 chr5 130176914 130177101 -22360158 - MTC LTR MaLR -8 413 223 3 1578 389 352 40 36 chr5 130177690 130177914 -22359345 + RMER15 LTR ERVL 337 561 -14 3 1578 2216 92 3 43 chr5 130179324 130179626 -22357633 + ORR1A1 LTR MaLR 1 301 -45 3 1578 2216 92 3 43 chr5 130179796 130179844 -22357415 + ORR1A1 LTR MaLR 302 337 -9 3 1578 1866 54 4 0 chr5 130180495 130180756 -22356503 + RLTR22_Mus LTR ERVK 551 812 -996 3 1578 906 320 81 33 chr5 130181259 130181297 -22355962 + MTE-int LTR MaLR 1042 1077 -503 3 1578 906 320 81 33 chr5 130181364 130181807 -22355452 + MTE-int LTR MaLR 1078 1546 -34 3 1578 440 353 133 13 chr5 130181793 130182109 -22355150 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 3 1578 2515 161 26 18 chr5 130182622 130183077 -22354182 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 3 1578 1253 164 33 115 chr5 130183080 130183384 -22353875 + MYSERV6-int LTR ERVK 10 288 -8671 3 1578 235 170 43 0 chr5 130183400 130183447 -22353812 + RMER6B LTR ERVK 1 49 -412 3 1578 19047 130 31 20 chr5 130183517 130184894 -22352365 + MYSERV6-int LTR ERVK 337 1697 -7262 3 1578 19047 124 45 15 chr5 130185092 130187538 -22349721 + MYSERV6-int LTR ERVK 1698 4250 -4709 3 1578 2915 127 124 111 chr5 130187532 130187930 -22349329 + MYSERV6-int LTR ERVK 5880 6325 -2634 3 1578 2915 127 124 111 chr5 130188002 130188265 -22348994 + MYSERV6-int LTR ERVK 6326 6622 -2337 3 1578 685 199 0 29 chr5 130188289 130188429 -22348830 + RMER12B LTR ERVK 1 136 -1268 3 1578 2028 121 16 10 chr5 130188429 130188737 -22348522 + MYSERV6-int LTR ERVK 7455 7764 -1195 3 1578 2055 169 85 12 chr5 130188740 130189164 -22348095 + RMER6B LTR ERVK 1 455 -6 3 1578 261 322 124 32 chr5 130190332 130190550 -22346709 + MLT-int LTR MaLR 423 660 -1075 3 1578 441 337 186 39 chr5 130190691 130190946 -22346313 + MLT-int LTR MaLR 867 1169 -566 3 1578 1587 138 86 128 chr5 130190946 130191013 -22346246 + ORR1B2 LTR MaLR 1 59 -308 3 1578 1587 138 86 128 chr5 130191157 130191472 -22345787 + ORR1B2 LTR MaLR 60 367 0 3 1578 441 337 186 39 chr5 130191472 130191528 -22345731 + MLT-int LTR MaLR 1170 1224 -511 3 1578 2739 97 270 5 chr5 130194078 130194523 -22342736 + RMER2 LTR ERV1 4 566 -1 3 1578 597 199 14 68 chr5 130195873 130196048 -22341211 + MTD LTR MaLR 1 194 -225 3 1578 769 179 211 15 chr5 130202720 130202924 -22334335 + MTD LTR MaLR 176 419 0 4 1578 250 363 35 0 chr5 130202964 130203077 -22334182 + MLT1C LTR MaLR 333 449 -18 4 1578 663 137 8 17 chr5 130203880 130203999 -22333260 + ORR1C1 LTR MaLR 61 178 -200 4 1578 1310 146 0 5 chr5 130204170 130204384 -22332875 + ORR1C1 LTR MaLR 166 378 0 4 1578 2403 142 35 18 chr5 130206453 130206905 -22330354 + RLTR20D LTR ERVK 1 460 -108 4 1578 3486 25 2 0 chr5 130211389 130211784 -22325475 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1578 9506 26 2 1 chr5 130211784 130212881 -22324378 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1578 3486 25 2 0 chr5 130212881 130213276 -22323983 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1578 2081 104 82 27 chr5 130213279 130213645 -22323614 - MTC LTR MaLR -35 386 1 4 1578 4002 124 77 165 chr5 130213645 130213971 -22323288 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1058 4 1578 4002 124 77 165 chr5 130213995 130214728 -22322531 - MTC-int LTR MaLR -201 1057 292 4 1578 1420 188 124 27 chr5 130214724 130215062 -22322197 - MTB_Mm LTR MaLR -35 372 2 4 1578 265 288 0 48 chr5 130216849 130216933 -22320326 + MTE2b LTR MaLR 19 98 -281 4 1578 535 298 173 4 chr5 130216990 130217216 -22320043 + MTE2b LTR MaLR 99 362 -17 4 1578 676 290 89 12 chr5 130217233 130217491 -22319768 + MTE2b-int LTR MaLR 1 278 -1302 4 1578 367 272 361 65 chr5 130217488 130217774 -22319485 - RMER21B LTR ERV1 -124 718 348 4 1578 872 293 96 14 chr5 130217792 130218155 -22319104 + MTE2b-int LTR MaLR 260 652 -928 4 1578 2264 75 3 0 chr5 130219792 130220110 -22317149 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1578 235 270 104 73 chr5 130223406 130223502 -22313757 - MT2B LTR ERVL -337 264 166 4 1578 4361 107 66 0 chr5 130225177 130225811 -22311448 - RLTR33 LTR ERVK -2 676 1 4 1578 388 236 53 59 chr5 130228312 130228498 -22308761 + RLTR13D3 LTR ERVK 793 1072 -42 4 1578 255 276 35 87 chr5 130240756 130240871 -22296388 - MT2B2 LTR ERVL -321 263 155 5 1578 1452 196 83 32 chr5 130246659 130246893 -22290366 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 127 5 1578 1452 196 83 32 chr5 130246935 130247048 -22290211 - ORR1D1 LTR MaLR -248 126 10 5 1578 2617 153 160 8 chr5 130248251 130248758 -22288501 - RMER4B LTR ERVK 0 585 2 5 1578 2608 68 3 0 chr5 130265372 130265698 -22271561 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1578 868 173 117 48 chr5 130271879 130271965 -22265294 + ORR1C2 LTR MaLR 141 234 -150 6 1578 868 181 99 21 chr5 130271992 130272126 -22265133 + ORR1C2 LTR MaLR 235 383 -1 6 1578 1145 225 91 74 chr5 130281419 130281770 -22255489 + RMER4B LTR ERVK 16 372 -213 6 1579 414 187 68 37 chr5 130287831 130287992 -22249267 + RMER17C LTR ERVK 112 277 -133 7 1579 296 286 11 35 chr5 130299799 130299886 -22237373 - RMER15 LTR ERVL -114 461 377 7 1579 225 286 0 125 chr5 130300109 130300197 -22237062 - MT2B LTR ERVL -367 234 158 7 1579 302 255 0 113 chr5 130326278 130326384 -22210875 - MT2B LTR ERVL -344 257 164 7 1579 2911 19 3 0 chr5 130326386 130326711 -22210548 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 7 1579 628 257 92 54 chr5 130331015 130331254 -22206005 + RMER21B LTR ERV1 320 567 -275 8 1579 3303 193 90 87 chr5 130331286 130332110 -22205149 - RMER13A LTR ERVK -34 826 1 8 1579 1054 121 24 6 chr5 130332591 130332758 -22204501 - MTB LTR MaLR -55 345 176 8 1579 419 212 0 83 chr5 130335200 130335211 -22202048 + MT2B2 LTR ERVL 153 154 -430 8 1579 1252 249 71 71 chr5 130336738 130336984 -22200275 - MT2B LTR ERVL -1 600 372 8 1579 4109 89 34 9 chr5 130336984 130337552 -22199707 - MT2B2 LTR ERVL -2 582 1 8 1579 1252 249 71 71 chr5 130337552 130337645 -22199614 - MT2B LTR ERVL -230 371 257 8 1579 1252 221 141 54 chr5 130337836 130337953 -22199306 - MT2B LTR ERVL -345 256 191 8 1579 1653 167 129 18 chr5 130338108 130338450 -22198809 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 1 8 1579 982 235 237 11 chr5 130341034 130341307 -22195952 + MTE2b LTR MaLR 2 336 -43 8 1579 674 129 8 87 chr5 130346240 130346272 -22190987 - MTC LTR MaLR -303 118 97 8 1579 674 129 8 87 chr5 130346464 130346558 -22190701 - MTC LTR MaLR -325 96 2 8 1579 474 148 67 11 chr5 130352059 130352148 -22185111 - RLTR1B LTR ERV1 -76 436 343 8 1579 415 74 0 0 chr5 130352152 130352206 -22185053 - RLTR1B LTR ERV1 -102 410 357 8 1579 437 57 0 0 chr5 130355315 130355368 -22181891 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 272 8 1579 352 75 0 0 chr5 130355391 130355444 -22181815 - ORR1A3 LTR MaLR -274 53 1 8 1579 475 190 0 0 chr5 130356793 130356872 -22180387 - MT2B LTR ERVL -391 210 132 9 1579 287 232 137 0 chr5 130356796 130356891 -22180368 - ORR1A3-int LTR MaLR -1185 778 671 9 1579 304 148 147 74 chr5 130360893 130360988 -22176271 + RLTR25B LTR ERVK 408 509 -519 9 1579 976 146 11 50 chr5 130364867 130365047 -22172212 + LTRIS5 LTR ERV1 208 380 -67 9 1579 761 161 32 204 chr5 130365197 130365300 -22171959 + LTRIS3 LTR ERV1 445 512 0 9 1579 2943 69 183 27 chr5 130365576 130366023 -22171236 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 517 -2 9 1579 2417 230 9 98 chr5 130366981 130367288 -22169971 - RMER19C LTR ERVK 0 611 316 9 1579 2417 230 9 98 chr5 130367475 130367513 -22169746 - RMER19C LTR ERVK -296 315 294 9 1579 2847 50 6 0 chr5 130367513 130367855 -22169404 + ORR1A1 LTR MaLR 3 346 0 9 1579 2417 230 9 98 chr5 130367855 130368179 -22169080 - RMER19C LTR ERVK -318 293 1 9 1579 1005 265 48 11 chr5 130370266 130370617 -22166642 + RLTR18-int LTR ERVK 4911 5274 -87 9 1579 364 241 16 107 chr5 130376824 130376945 -22160314 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 9 1579 380 135 293 30 chr5 130380195 130380294 -22156965 - MTC LTR MaLR -296 125 1 9 1579 985 199 104 16 chr5 130381080 130381354 -22155905 - ORR1D2 LTR MaLR 0 394 102 9 1579 3520 87 77 2 chr5 130382912 130383395 -22153864 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 9 1579 713 318 46 99 chr5 130383656 130384001 -22153258 + MTEa LTR MaLR 45 371 -8 1 1579 826 210 268 47 chr5 130385493 130385833 -22151426 - MTD LTR MaLR -2 417 3 1 1579 285 270 76 53 chr5 130388975 130389182 -22148077 + MTD LTR MaLR 5 209 -210 1 1579 402 211 148 25 chr5 130389335 130389502 -22147757 + MTD LTR MaLR 231 379 0 1 1579 690 199 169 35 chr5 130392654 130392697 -22144562 - RMER16 LTR ERVK -41 492 447 1 1579 3269 35 186 11 chr5 130392697 130393133 -22144126 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 1579 690 195 116 56 chr5 130393133 130393383 -22143876 - RMER16 LTR ERVK -87 446 1 1 1579 1107 239 76 3 chr5 130398959 130399249 -22138010 - MTEb LTR MaLR -2 377 67 1 1579 397 259 0 0 chr5 130399540 130399625 -22137634 - MTEb LTR MaLR -293 86 2 1 1579 338 245 213 14 chr5 130401914 130402055 -22135204 - MTC LTR MaLR 0 421 253 1 1579 1457 186 158 60 chr5 130402055 130402131 -22135128 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 457 1 1579 1457 186 158 60 chr5 130402180 130402584 -22134675 - RLTR11A LTR ERVK -72 456 3 1 1579 278 239 0 129 chr5 130406562 130406663 -22130596 - MT2B LTR ERVL -347 254 167 1 1579 298 232 16 118 chr5 130407090 130407217 -22130042 - MT2B LTR ERVL -337 264 151 1 1579 2202 124 81 81 chr5 130408601 130408904 -22128355 - MTC LTR MaLR -1 420 108 1 1579 2202 124 81 81 chr5 130409052 130409168 -22128091 - MTC LTR MaLR -314 107 1 1 1579 374 128 35 25 chr5 130409362 130409452 -22127807 - MTEa LTR MaLR -10 349 256 1 1579 4146 124 102 16 chr5 130410217 130410896 -22126363 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 197 279 322 28 134 chr5 130416364 130416647 -22120612 + MLT1F2 LTR MaLR 305 557 -3 1 1580 1089 182 109 39 chr5 130436753 130437010 -22100249 - MTD LTR MaLR -46 373 99 1 1580 851 203 36 18 chr5 130437014 130437235 -22100024 - MTC-int LTR MaLR -797 461 237 1 1580 641 274 190 12 chr5 130441323 130441631 -22095628 - MTE2b LTR MaLR 0 421 21 1 1580 728 322 43 29 chr5 130447604 130447882 -22089377 - MT2A LTR ERVL -105 428 147 1 1580 255 234 47 58 chr5 130448191 130448277 -22088982 + RLTR25A LTR ERVK 497 581 -522 1 1580 360 240 88 62 chr5 130481258 130481418 -22055841 - RLTR43A LTR ERVK 0 364 249 1 1580 283 164 0 52 chr5 130483154 130483212 -22054047 + RLTR42-int LTR ERVK 1032 1086 -4436 1 1580 311 192 96 0 chr5 130483533 130483606 -22053653 + RLTR42-int LTR ERVK 2049 2128 -3394 1 1580 347 186 53 142 chr5 130488163 130488276 -22048983 + MT2B LTR ERVL 162 264 -337 1 1580 911 169 139 7 chr5 130490125 130490435 -22046824 + RLTR18B LTR ERVK 13 363 -149 1 1580 806 200 78 10 chr5 130505812 130506004 -22031255 - MTD LTR MaLR 0 419 215 2 1580 556 288 6 53 chr5 130506181 130506332 -22030927 - MTD LTR MaLR -272 147 5 2 1580 751 330 30 39 chr5 130515674 130516005 -22021254 - MT2A LTR ERVL -105 428 101 5 1580 330 197 30 0 chr5 130523375 130523441 -22013818 - MTE2b LTR MaLR 0 379 312 7 1580 438 256 0 83 chr5 130523436 130523568 -22013691 - MTE2b LTR MaLR -258 121 1 7 1580 237 220 16 33 chr5 130523608 130523669 -22013590 + RLTR25A LTR ERVK 541 600 -503 7 1580 267 250 66 94 chr5 130524294 130524400 -22012859 - MT2B LTR ERVL -362 239 137 7 1580 535 310 121 31 chr5 130534482 130534805 -22002454 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 1 1580 1188 210 158 35 chr5 130537461 130537772 -21999487 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 20 1 1580 268 299 95 130 chr5 130538077 130538308 -21998951 + ORR1E LTR MaLR 116 338 -21 1 1580 1398 209 165 43 chr5 130538599 130538757 -21998502 - MTC LTR MaLR 0 421 209 1 1580 2394 93 12 15 chr5 130538757 130539041 -21998218 + ORR1A2 LTR MaLR 1 287 -40 1 1580 2394 93 12 15 chr5 130539177 130539220 -21998039 + ORR1A2 LTR MaLR 288 327 0 1 1580 1398 209 165 43 chr5 130539220 130539436 -21997823 - MTC LTR MaLR -213 208 1 1 1580 267 276 53 68 chr5 130539581 130539713 -21997546 - MLT2B4 LTR ERVL -74 482 353 1 1580 3047 60 16 5 chr5 130543548 130543936 -21993323 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 3 1 1580 884 264 140 18 chr5 130545555 130545891 -21991368 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 1 1580 650 296 89 5 chr5 130546126 130546316 -21990943 - MTEa LTR MaLR -173 206 1 1 1581 428 298 118 45 chr5 130548977 130549193 -21988066 - MTD LTR MaLR -29 390 177 1 1581 1282 140 14 0 chr5 130549185 130549392 -21987867 + ORR1B1 LTR MaLR 185 394 0 1 1581 2170 160 21 29 chr5 130561627 130561819 -21975440 - ORR1C2 LTR MaLR -13 371 175 2 1581 2170 160 21 29 chr5 130561869 130562050 -21975209 - ORR1C2 LTR MaLR -210 174 1 2 1581 237 159 116 0 chr5 130576757 130576826 -21960433 - MLT2D LTR ERVL -53 507 431 2 1581 253 309 23 23 chr5 130580574 130580660 -21956599 - MER34 LTR ERV1 -384 158 73 2 1581 667 247 38 152 chr5 130582610 130582873 -21954386 + MTE2b LTR MaLR 5 237 -142 2 1581 1375 198 252 48 chr5 130583688 130584187 -21953072 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 2 1581 734 265 159 30 chr5 130586281 130586369 -21950890 + MTD LTR MaLR 1 92 -304 2 1581 1032 181 124 11 chr5 130586570 130586828 -21950431 + MTD LTR MaLR 93 404 -15 2 1581 429 194 44 44 chr5 130587630 130587743 -21949516 - MTC LTR MaLR 0 421 309 2 1581 426 181 35 32 chr5 130587739 130587837 -21949422 - MTC LTR MaLR -299 108 1 2 1581 368 323 122 47 chr5 130588111 130588407 -21948852 + MT2A LTR ERVL 100 417 -116 2 1581 371 68 4 0 chr5 130589933 130589989 -21947270 + ORR1A3 LTR MaLR 284 326 0 2 1581 1314 211 61 69 chr5 130602845 130603045 -21934214 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 167 3 1581 1314 211 61 69 chr5 130603098 130603274 -21933985 - ORR1D1 LTR MaLR -208 166 1 3 1581 228 244 50 25 chr5 130609174 130609254 -21928005 - MER77 LTR ERVL -120 487 406 3 1581 320 231 214 14 chr5 130613081 130613226 -21924033 - MTEa LTR MaLR 0 379 206 3 1581 2114 81 40 3 chr5 130613237 130613534 -21923725 - RMER2 LTR ERV1 -5 562 255 3 1581 227 294 33 76 chr5 130622190 130622282 -21914977 - RLTR9A2 LTR ERVK -238 145 58 3 1581 2216 94 0 75 chr5 130633760 130634047 -21903212 + ORR1A2 LTR MaLR 1 272 -55 4 1581 2216 94 0 75 chr5 130634231 130634284 -21902975 + ORR1A2 LTR MaLR 273 319 -8 4 1581 2289 87 51 0 chr5 130638293 130638604 -21898655 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1581 336 295 123 39 chr5 130639739 130639894 -21897365 - LTR41 LTR ERVL -594 174 7 4 1581 4368 72 26 5 chr5 130639898 130640470 -21896789 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 4 1581 236 349 0 44 chr5 130641408 130641510 -21895749 - MLT2B4 LTR ERVL -356 200 104 4 1581 4090 101 89 30 chr5 130641589 130642060 -21895199 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 170 4 1581 4090 101 89 30 chr5 130642095 130642263 -21894996 - RLTR33 LTR ERVK -509 169 1 4 1581 319 238 108 10 chr5 130642366 130642468 -21894791 - MLT2B4 LTR ERVL -442 114 3 4 1581 3610 145 64 29 chr5 130642600 130643587 -21893672 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 1 4 1581 595 167 10 0 chr5 130644007 130644103 -21893156 - ERVL-B4-int LTR ERVL -814 4900 4804 4 1581 316 286 108 23 chr5 130644413 130644542 -21892717 + RMER15 LTR ERVL 422 561 -14 4 1581 816 304 73 21 chr5 130645016 130645345 -21891914 - RMER5 LTR ERV1 -121 413 68 4 1581 272 237 90 30 chr5 130653272 130653372 -21883887 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 4 1581 425 224 8 128 chr5 130656962 130657095 -21880164 + MT2B LTR ERVL 148 264 -337 5 1581 429 338 37 19 chr5 130660028 130660242 -21877017 - LTR40a LTR ERVL 0 519 302 5 1581 1023 281 86 25 chr5 130661367 130661728 -21875531 - RLTR18B LTR ERVK -19 493 111 5 1581 380 258 82 10 chr5 130661722 130661820 -21875439 - RLTR18B LTR ERVK -316 196 92 5 1581 3306 21 39 0 chr5 130661830 130662211 -21875048 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1581 317 272 85 43 chr5 130662395 130662442 -21874817 - MT2B LTR ERVL -298 286 178 5 1581 317 272 85 43 chr5 130662528 130662541 -21874718 - MT2B LTR ERVL -298 177 143 5 1581 950 83 26 70 chr5 130663773 130663837 -21873422 + RMER6A LTR ERVK 1 59 -697 5 1581 950 83 26 70 chr5 130664173 130664263 -21872996 + RMER6A LTR ERVK 60 148 -608 5 1581 1192 212 84 84 chr5 130664759 130665014 -21872245 + RMER6A LTR ERVK 283 512 -244 5 1581 1192 212 84 84 chr5 130665061 130665279 -21871980 + RMER6A LTR ERVK 513 756 0 5 1581 2401 135 5 19 chr5 130670841 130671219 -21866040 - RLTR16 LTR ERVK -120 385 13 5 1581 314 116 39 8 chr5 130671642 130671693 -21865566 - ORR1A4 LTR MaLR -8 366 274 5 1582 582 273 29 35 chr5 130685067 130685238 -21852021 - MTEa LTR MaLR 0 379 210 6 1582 615 277 73 6 chr5 130685551 130685729 -21851530 - MTEa LTR MaLR -189 190 1 6 1582 247 295 148 105 chr5 130692804 130693062 -21844197 - ORR1E LTR MaLR -14 405 148 6 1582 323 318 82 34 chr5 130693518 130693726 -21843533 - RMER15 LTR ERVL -18 557 340 6 1582 233 302 111 53 chr5 130694954 130695125 -21842134 + MTE-int LTR MaLR 786 966 -614 6 1582 1932 162 57 27 chr5 130696271 130696640 -21840619 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 6 1582 354 308 30 15 chr5 130697042 130697177 -21840082 + RMER15 LTR ERVL 347 483 -92 6 1582 1765 171 138 21 chr5 130704106 130704483 -21832776 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1582 1167 174 242 9 chr5 130709471 130709786 -21827473 - RMER10B LTR ERVL 0 398 12 6 1582 1645 188 112 16 chr5 130710367 130710465 -21826794 + MTC LTR MaLR 1 122 -299 6 1582 1645 188 112 16 chr5 130710497 130710782 -21826477 + MTC LTR MaLR 123 421 0 6 1582 698 195 164 22 chr5 130711323 130711548 -21825711 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 118 6 1582 633 171 15 37 chr5 130711680 130711802 -21825457 - ORR1D1 LTR MaLR -255 119 1 6 1582 322 177 24 71 chr5 130721164 130721249 -21816010 - MT2B LTR ERVL -344 257 177 7 1582 560 237 201 29 chr5 130721353 130721557 -21815702 + MTEb LTR MaLR 141 379 0 7 1582 2070 112 76 0 chr5 130722528 130722832 -21814427 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1582 333 333 82 33 chr5 130723684 130723867 -21813392 + ORR1E LTR MaLR 1 192 -167 7 1582 2913 66 52 5 chr5 130735857 130736238 -21801021 - MTB LTR MaLR 0 400 2 7 1582 264 352 164 7 chr5 130740643 130740789 -21796470 - MER21B LTR ERV1 -691 172 4 7 1582 2045 191 58 115 chr5 130741378 130741892 -21795367 + RLTR18B LTR ERVK 25 509 -3 7 1582 1828 165 53 17 chr5 130755501 130755859 -21781400 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 8 1582 255 179 9 215 chr5 130755859 130755905 -21781354 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1343 8 1582 255 179 9 215 chr5 130756089 130756149 -21781110 - ORR1D1-int LTR MaLR -28 1342 1286 8 1582 247 139 0 0 chr5 130756542 130756578 -21780681 - ORR1D2 LTR MaLR -332 38 3 8 1582 1003 258 142 21 chr5 130756626 130756968 -21780291 + MTD LTR MaLR 18 391 -16 8 1582 765 193 142 138 chr5 130763393 130763646 -21773613 - ORR1B1 LTR MaLR -140 254 1 8 1582 2021 108 146 0 chr5 130765022 130765338 -21771921 - RMER19A LTR ERVK -355 382 21 8 1582 2337 198 38 8 chr5 130765337 130765812 -21771447 - RLTR18B LTR ERVK -23 489 1 8 1582 5015 156 81 1 chr5 130774544 130775379 -21761880 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 9 1582 486 179 104 74 chr5 130782469 130782632 -21754627 + MTD LTR MaLR 250 417 -2 9 1582 5072 72 21 49 chr5 130785034 130785245 -21752014 - RMER17A LTR ERVK 0 751 555 9 1582 5072 72 21 49 chr5 130785271 130785832 -21751427 - RMER17A LTR ERVK -197 554 1 9 1582 995 271 102 16 chr5 130787293 130787597 -21749662 + MTE2b LTR MaLR 45 374 -5 9 1582 359 266 248 52 chr5 130792276 130792546 -21744713 - MTE2b LTR MaLR -37 342 20 9 1582 1437 228 30 60 chr5 130793331 130793700 -21743559 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 9 9 1582 1358 189 79 11 chr5 130794324 130794591 -21742668 + MTD LTR MaLR 5 289 -130 9 1582 2685 141 56 64 chr5 130794607 130794977 -21742282 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 161 9 1582 2685 141 56 64 chr5 130795290 130795441 -21741818 - RLTR11A LTR ERVK -368 160 1 9 1582 371 185 37 28 chr5 130795441 130795524 -21741735 + MTD LTR MaLR 296 405 -14 9 1582 240 347 40 30 chr5 130808279 130808380 -21728879 - RMER4A LTR ERVK -343 123 22 1 1582 418 255 20 20 chr5 130808612 130808712 -21728547 - MTEb LTR MaLR -263 116 17 1 1583 1420 193 143 12 chr5 130810721 130811056 -21726203 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1583 2435 166 40 0 chr5 130816006 130816409 -21720850 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1583 537 236 362 5 chr5 130819781 130820002 -21717257 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 69 1 1583 231 211 19 19 chr5 130820046 130820099 -21717160 - ORR1D2 LTR MaLR -283 87 35 1 1583 334 295 72 86 chr5 130822606 130822890 -21714369 - MTEa LTR MaLR 0 379 111 1 1583 308 308 104 121 chr5 130823113 130823186 -21714073 - MTEa LTR MaLR -274 110 32 1 1583 694 241 140 100 chr5 130823372 130823722 -21713537 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 5 1 1583 2585 169 44 26 chr5 130825967 130826465 -21710794 - RMER20A LTR ERVK 0 516 10 1 1583 1123 221 23 0 chr5 130833452 130833669 -21703590 + MTEb LTR MaLR 1 222 -157 1 1583 398 271 50 8 chr5 130835214 130835333 -21701926 - ORR1E LTR MaLR 0 359 236 1 1583 413 285 59 29 chr5 130835847 130836017 -21701242 - RLTR42-int LTR ERVK -4117 1405 1231 1 1583 234 378 37 37 chr5 130836138 130836300 -21700959 - ORR1E LTR MaLR -125 234 73 1 1583 2630 154 53 37 chr5 130837188 130837648 -21699611 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 456 -107 1 1583 2630 154 53 37 chr5 130837701 130837732 -21699527 + RLTR20B1 LTR ERVK 457 498 -65 1 1583 2166 205 88 22 chr5 130838691 130839181 -21698078 - RLTR11A LTR ERVK -5 523 2 1 1583 1529 208 92 17 chr5 130839909 130840257 -21697002 + MTE2b LTR MaLR 6 379 0 1 1583 301 292 30 30 chr5 130842329 130842428 -21694831 - MTEa LTR MaLR -280 99 1 1 1583 709 251 147 0 chr5 130843971 130844182 -21693077 - ORR1E LTR MaLR -103 256 15 1 1583 958 116 116 6 chr5 130846295 130846441 -21690818 - MTD LTR MaLR -13 406 253 1 1583 958 226 448 56 chr5 130846479 130846624 -21690635 - MTD LTR MaLR -167 252 44 1 1583 324 333 39 8 chr5 130846848 130846975 -21690284 + RMER15 LTR ERVL 402 532 -43 1 1583 229 275 56 28 chr5 130848375 130848441 -21688818 - MTEa LTR MaLR -39 340 273 1 1583 1020 246 194 16 chr5 130848657 130849008 -21688251 - MTD LTR MaLR -15 404 6 1 1583 585 306 148 25 chr5 130849358 130849636 -21687623 + ORR1E LTR MaLR 43 354 -5 1 1583 374 221 65 123 chr5 130849973 130850143 -21687116 + RMER15 LTR ERVL 325 484 -91 1 1583 1525 185 7 18 chr5 130850939 130851219 -21686040 - MTEb LTR MaLR -2 377 101 1 1583 328 271 84 66 chr5 130852049 130852215 -21685044 + RMER15 LTR ERVL 342 510 -65 1 1583 390 333 76 117 chr5 130854742 130855269 -21681990 - MLT2B3 LTR ERVL -41 526 20 1 1583 341 245 52 25 chr5 130855395 130855532 -21681727 + MLT1A1 LTR MaLR 306 450 -17 1 1583 376 211 47 19 chr5 130856923 130857029 -21680230 - LTR33A LTR ERVL -13 507 399 1 1583 323 265 71 0 chr5 130865706 130865804 -21671455 + RMER15 LTR ERVL 406 510 -65 1 1583 398 327 51 0 chr5 130866087 130866243 -21671016 + RMER15 LTR ERVL 407 570 -5 1 1583 612 271 54 57 chr5 130866370 130866718 -21670541 + MTD LTR MaLR 1 379 0 1 1583 1897 107 2 177 chr5 130867853 130868249 -21669010 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 1 1583 1415 230 80 25 chr5 130874242 130874567 -21662692 - MTE2b LTR MaLR -36 343 1 1 1583 571 344 52 4 chr5 130875422 130875673 -21661586 - RMER5 LTR ERV1 -19 515 253 1 1583 1077 118 68 69 chr5 130879156 130879377 -21657882 - LTRIS5 LTR ERV1 0 512 228 1 1583 401 119 60 0 chr5 130879407 130879474 -21657785 - LTRIS5 LTR ERV1 -376 71 1 1 1583 1445 231 6 48 chr5 130885678 130886010 -21651249 + ORR1E LTR MaLR 1 318 -41 1 1583 584 248 255 22 chr5 130888053 130888284 -21648975 - RMER15 LTR ERVL -43 532 248 1 1583 809 311 84 87 chr5 130888320 130888376 -21648883 - MTE2a LTR MaLR -8 371 319 1 1583 2651 71 3 0 chr5 130888376 130888702 -21648557 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1583 809 311 84 87 chr5 130888702 130889012 -21648247 - MTE2a LTR MaLR -61 318 6 1 1583 467 208 40 32 chr5 130889012 130889136 -21648123 - RMER15 LTR ERVL -450 125 1 1 1583 351 320 16 31 chr5 130889139 130889268 -21647991 + MLT1A1 LTR MaLR 1 127 -281 1 1583 388 285 24 123 chr5 130889266 130889566 -21647693 + ORR1E LTR MaLR 37 306 -53 1 1583 683 336 76 11 chr5 130894820 130895082 -21642177 - MTEa LTR MaLR -4 375 97 1 1583 1088 221 97 91 chr5 130895377 130895750 -21641509 - MTE2a LTR MaLR -2 377 3 1 1583 330 337 2 0 chr5 130897312 130897399 -21639860 - MTE2a LTR MaLR -229 150 63 1 1583 289 314 128 0 chr5 130897389 130897491 -21639768 - MTEa LTR MaLR -264 115 1 1 1583 1986 149 32 76 chr5 130898080 130898450 -21638809 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 1583 2482 139 33 93 chr5 130903282 130903767 -21633492 + RMER6B LTR ERVK 6 461 0 1 1583 3430 35 5 0 chr5 130904654 130905048 -21632211 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1583 886 241 103 25 chr5 130906066 130906233 -21631026 + MTEa LTR MaLR 1 173 -206 1 1583 1542 152 182 56 chr5 130906233 130906421 -21630838 + ORR1C2 LTR MaLR 1 171 -213 1 1583 1542 152 182 56 chr5 130906512 130906663 -21630596 + ORR1C2 LTR MaLR 172 382 -2 1 1583 886 241 103 25 chr5 130906663 130906737 -21630522 + MTEa LTR MaLR 174 261 -118 1 1583 660 206 73 0 chr5 130906963 130907099 -21630160 + MTEa LTR MaLR 8 153 -226 1 1583 239 201 11 0 chr5 130907338 130907394 -21629865 - MTEb LTR MaLR -2 377 316 1 1583 2123 161 77 0 chr5 130909372 130909738 -21627521 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1583 1360 192 14 78 chr5 130910127 130910409 -21626850 + ORR1C2 LTR MaLR 9 272 -112 1 1583 1487 238 43 91 chr5 130911189 130911587 -21625672 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 1 1583 356 301 29 19 chr5 130912725 130912830 -21624429 - MER21B LTR ERV1 -276 587 482 1 1583 930 288 9 113 chr5 130912830 130913253 -21624006 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1583 573 279 46 82 chr5 130913477 130913696 -21623563 - MTEb LTR MaLR 0 379 169 1 1583 869 250 100 128 chr5 130914207 130914597 -21622662 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1583 242 247 0 165 chr5 130916065 130916162 -21621097 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 161 1 1583 264 247 21 53 chr5 130917015 130917109 -21620150 + MTEa LTR MaLR 289 379 0 1 1583 350 247 48 131 chr5 130920219 130920311 -21616948 - RMER10A LTR ERVL -28 414 321 1 1583 350 247 48 131 chr5 130920375 130920450 -21616809 - RMER10A LTR ERVL -122 320 261 1 1583 1100 257 40 117 chr5 130937047 130937501 -21599758 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1583 1043 290 104 0 chr5 130937920 130937983 -21599276 + MTD LTR MaLR 50 116 -303 1 1583 1043 290 104 0 chr5 130938221 130938490 -21598769 + MTD LTR MaLR 117 416 -3 1 1583 900 205 19 49 chr5 130938533 130938854 -21598405 - MTEb LTR MaLR -12 367 2 1 1584 2363 96 16 0 chr5 130942200 130942522 -21594737 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1584 620 248 7 0 chr5 130944423 130944568 -21592691 - ORR1D2-int LTR MaLR -1224 146 1 1 1584 473 190 89 173 chr5 130944568 130944759 -21592500 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 196 1 1584 2039 132 21 21 chr5 130949367 130949693 -21587566 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 1 1 1584 385 311 48 48 chr5 130953988 130954238 -21583021 + MLT1A LTR MaLR 109 358 -16 1 1584 1115 231 24 142 chr5 130959428 130959837 -21577422 - MTE2a LTR MaLR 0 379 19 1 1584 1694 190 43 11 chr5 130964720 130965072 -21572187 + MTEa LTR MaLR 5 367 -12 1 1584 328 250 72 10 chr5 130965555 130965652 -21571607 + MLT1F2 LTR MaLR 456 558 -2 1 1584 1024 257 124 12 chr5 130970177 130970500 -21566759 - MTE2a LTR MaLR -6 373 15 1 1584 607 266 22 6 chr5 130971147 130971325 -21565934 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 228 1 1584 1292 269 56 3 chr5 130975359 130975717 -21561542 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 1 1584 520 296 44 20 chr5 130977508 130977711 -21559548 - RMER15 LTR ERVL 0 575 368 1 1584 283 244 10 113 chr5 130980259 130980356 -21556903 + MT2B2 LTR ERVL 155 241 -343 1 1584 361 0 0 0 chr5 130982902 130982945 -21554314 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 284 1 1584 1922 108 33 0 chr5 130983047 130983354 -21553905 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 2 1 1584 462 261 9 0 chr5 130984600 130984711 -21552548 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 254 1 1584 2701 164 42 45 chr5 130985901 130986431 -21550828 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1584 252 311 69 40 chr5 130986492 130986666 -21550593 + ORR1E LTR MaLR 56 234 -125 1 1584 292 318 101 45 chr5 130988030 130988289 -21548970 - ORR1E LTR MaLR -7 372 80 1 1584 725 217 59 171 chr5 130988290 130988629 -21548630 + MTE2a LTR MaLR 1 301 -78 1 1584 1886 116 25 118 chr5 130989476 130989839 -21547420 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1584 1171 212 66 0 chr5 130990834 130991075 -21546184 + MTD LTR MaLR 148 404 -15 1 1584 2337 162 34 2 chr5 130993879 130994287 -21542972 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1584 3062 26 0 0 chr5 130999051 130999397 -21537862 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1584 326 269 102 0 chr5 130999768 130999876 -21537383 + MTE2a LTR MaLR 3 121 -258 1 1584 251 283 23 152 chr5 130999829 131000000 -21537259 + MT2A LTR ERVL 75 223 -310 1 1584 340 333 36 7 chr5 131000057 131000196 -21537063 + MT2A LTR ERVL 246 388 -145 2 1584 229 341 158 0 chr5 131000202 131000366 -21536893 + MT2A LTR ERVL 343 532 -1 2 1584 3563 105 24 110 chr5 131000920 131001411 -21535848 + RMER6A LTR ERVK 74 489 -267 3 1584 3563 105 24 110 chr5 131001477 131001732 -21535527 + RMER6A LTR ERVK 490 755 -1 3 1584 923 301 47 9 chr5 131001742 131002214 -21535045 + MERVL_2A-int LTR ERVL 100 652 -5109 5 1584 1537 211 50 86 chr5 131002227 131002646 -21534613 + MTD LTR MaLR 8 411 -8 6 1584 3671 224 75 19 chr5 131002650 131003662 -21533597 + MERVL_2A-int LTR ERVL 648 1781 -3980 5 1584 402 257 0 58 chr5 131003684 131003716 -21533543 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1782 1809 -3952 5 1584 3069 256 34 7 chr5 131003720 131004427 -21532832 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2462 3187 -2574 5 1584 277 209 63 98 chr5 131004592 131004735 -21532524 - RLTR12B LTR ERVK -243 285 148 8 1584 489 181 12 0 chr5 131004764 131004847 -21532412 + MERVL-int LTR ERVL 3076 3159 -2326 9 1584 1672 184 90 0 chr5 131006497 131006840 -21530419 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1584 428 250 14 69 chr5 131007365 131007528 -21529731 + MTE2a LTR MaLR 3 137 -222 1 1584 431 224 15 108 chr5 131009616 131009746 -21527513 - MTE2b LTR MaLR -261 118 1 2 1584 1951 95 42 7 chr5 131010089 131010397 -21526862 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1584 968 216 66 93 chr5 131010444 131010776 -21526483 + MTE2a LTR MaLR 57 379 0 1 1584 1357 176 165 32 chr5 131011899 131012245 -21525014 + MTB LTR MaLR 1 392 -8 3 1584 706 194 77 1 chr5 131012662 131012841 -21524418 - MTD LTR MaLR -14 405 229 3 1584 438 267 43 0 chr5 131012858 131012974 -21524285 - MTD LTR MaLR -298 121 1 3 1584 404 246 64 0 chr5 131014187 131014294 -21522965 + ORR1E LTR MaLR 13 126 -233 4 1584 227 175 67 101 chr5 131014294 131014383 -21522876 - MTD LTR MaLR -1 418 333 4 1584 759 291 30 107 chr5 131014911 131015350 -21521909 - MTD LTR MaLR -14 405 1 4 1584 3955 164 69 68 chr5 131016050 131016931 -21520328 + RMER19B LTR ERVK 1 882 -20 5 1584 712 173 45 26 chr5 131018095 131018249 -21519010 + MTD LTR MaLR 1 157 -262 5 1584 1564 197 176 3 chr5 131018325 131018502 -21518757 + MTD LTR MaLR 1 201 -218 5 1584 1564 197 176 3 chr5 131018559 131018738 -21518521 + MTD LTR MaLR 202 418 -1 5 1584 716 263 163 16 chr5 131027175 131027488 -21509771 + MTE2b LTR MaLR 17 375 -4 8 1584 230 229 15 62 chr5 131027555 131027620 -21509639 + MLT1E2 LTR MaLR 1 62 -565 8 1584 247 286 0 0 chr5 131028173 131028229 -21509030 + LTR16D2 LTR ERVL 517 572 0 8 1584 309 295 62 62 chr5 131028528 131028705 -21508554 - MTEb LTR MaLR -2 377 201 8 1584 698 286 27 19 chr5 131028763 131028972 -21508287 - MTEb LTR MaLR -164 215 6 8 1584 644 246 89 87 chr5 131029612 131029932 -21507327 + MTE2a LTR MaLR 82 419 0 9 1584 2533 171 60 125 chr5 131031861 131032515 -21504744 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 9 1584 786 254 173 26 chr5 131040269 131040621 -21496638 - MTD LTR MaLR -15 404 1 1 1584 527 303 10 51 chr5 131040621 131040804 -21496455 - RMER15 LTR ERVL -89 486 312 1 1584 431 314 16 39 chr5 131040987 131041169 -21496090 + MLT1D LTR MaLR 284 461 -44 1 1584 466 217 101 0 chr5 131051482 131051611 -21485648 - MTE2b LTR MaLR -37 342 201 1 1584 265 292 14 0 chr5 131051766 131051838 -21485421 - MTE2b LTR MaLR -302 77 5 1 1584 2155 120 100 3 chr5 131051988 131052347 -21484912 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1584 854 309 45 59 chr5 131057939 131058293 -21478966 - MTE2b LTR MaLR -30 349 1 1 1584 1177 258 25 55 chr5 131059607 131060026 -21477233 + MTE2a LTR MaLR 5 419 0 1 1584 936 266 73 29 chr5 131060919 131061263 -21475996 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1584 286 312 36 0 chr5 131061426 131061538 -21475721 - RMER15 LTR ERVL -50 525 410 1 1584 845 242 49 143 chr5 131061558 131061949 -21475310 - MTE2a LTR MaLR -6 373 20 1 1584 359 198 43 94 chr5 131062524 131062641 -21474618 + MLT1A1 LTR MaLR 291 401 -7 1 1584 828 295 67 44 chr5 131063989 131064098 -21473161 - ORR1E LTR MaLR 0 359 240 2 1584 828 295 67 44 chr5 131064140 131064374 -21472885 - ORR1E LTR MaLR -120 239 8 2 1584 1362 209 61 66 chr5 131066434 131066797 -21470462 + MTE2a LTR MaLR 19 379 0 2 1584 1490 164 22 8 chr5 131066996 131067312 -21469947 - MTC LTR MaLR -3 418 1 2 1584 2051 185 60 5 chr5 131067632 131068029 -21469230 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1584 2485 188 32 28 chr5 131070012 131070544 -21466715 - RMER5 LTR ERV1 0 534 1 2 1584 1210 224 94 100 chr5 131070628 131071009 -21466250 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1585 308 257 92 68 chr5 131075933 131075987 -21461272 + MT2B LTR ERVL 97 154 -447 2 1585 1471 230 57 30 chr5 131077339 131077743 -21459516 + MTD LTR MaLR 5 419 0 2 1585 1244 246 92 14 chr5 131081260 131081607 -21455652 - MTD LTR MaLR -21 398 25 2 1585 745 302 62 55 chr5 131082305 131082686 -21454573 + MTE2a LTR MaLR 1 391 -28 2 1585 617 304 93 58 chr5 131082709 131082725 -21454534 + MTE2a LTR MaLR 392 411 -8 2 1585 233 260 45 99 chr5 131085074 131085185 -21452074 - MER87 LTR ERV1 -39 502 398 2 1585 1113 244 38 96 chr5 131085224 131085376 -21451883 - MTE2a LTR MaLR -8 371 210 2 1585 1113 244 38 96 chr5 131085429 131085670 -21451589 - MTE2a LTR MaLR -170 209 1 2 1585 1079 251 19 127 chr5 131086626 131087051 -21450208 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1585 366 271 0 0 chr5 131088419 131088504 -21448755 + ORR1E LTR MaLR 57 141 -218 2 1585 1717 229 44 3 chr5 131088752 131089116 -21448143 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 1585 1196 233 67 62 chr5 131089355 131089551 -21447708 + MTD LTR MaLR 2 197 -222 2 1585 1196 233 67 62 chr5 131089609 131089828 -21447431 + MTD LTR MaLR 198 419 0 2 1585 490 234 195 72 chr5 131091329 131091689 -21445570 + MTE2a LTR MaLR 9 405 -14 2 1585 266 292 91 42 chr5 131091802 131091945 -21445314 + MLT1D LTR MaLR 39 188 -317 2 1585 242 281 0 0 chr5 131093584 131093641 -21443618 + MTEa LTR MaLR 312 368 -11 2 1585 1315 229 57 49 chr5 131095393 131095742 -21441517 + ORR1D2 LTR MaLR 1 352 -18 2 1585 519 254 0 86 chr5 131095749 131095900 -21441359 + MTD LTR MaLR 268 405 -14 2 1585 475 163 23 0 chr5 131096639 131096725 -21440534 - MTE2a LTR MaLR -125 254 167 2 1585 701 243 71 121 chr5 131100139 131100462 -21436797 + MTEa LTR MaLR 55 361 -18 3 1585 515 269 16 74 chr5 131102082 131102271 -21434988 - MTEa LTR MaLR 0 379 202 3 1585 1771 117 45 13 chr5 131102721 131103032 -21434227 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 1585 360 210 49 12 chr5 131104425 131104507 -21432752 - MTEa LTR MaLR -274 85 1 3 1585 898 266 47 18 chr5 131104797 131105076 -21432183 - RMER15 LTR ERVL -14 561 275 3 1585 327 203 0 0 chr5 131105058 131105122 -21432137 + MTD LTR MaLR 342 405 -14 3 1585 1044 290 40 40 chr5 131105501 131105530 -21431729 + ORR1E LTR MaLR 1 26 -333 3 1585 1507 201 53 69 chr5 131105530 131105905 -21431354 + ORR1D1 LTR MaLR 4 372 -2 3 1585 1044 289 51 26 chr5 131105905 131106219 -21431040 + ORR1E LTR MaLR 27 374 -5 3 1585 281 311 57 8 chr5 131106313 131106436 -21430823 + MLT1D LTR MaLR 1 129 -376 3 1585 509 283 68 68 chr5 131106614 131106819 -21430440 - MTEa LTR MaLR -174 205 1 3 1585 330 221 11 0 chr5 131119438 131119518 -21417741 + ORR1D1 LTR MaLR 295 378 -6 3 1585 317 374 0 8 chr5 131120921 131121053 -21416206 - MT2A LTR ERVL -74 459 329 3 1585 2823 93 28 0 chr5 131121903 131122291 -21414968 - MTB LTR MaLR 0 400 2 3 1585 1425 216 194 20 chr5 131122919 131123410 -21413849 + RMER4B LTR ERVK 1 576 -9 3 1585 353 250 233 0 chr5 131123642 131123762 -21413497 - RMER15 LTR ERVL -9 566 419 3 1585 2116 171 35 8 chr5 131125568 131125964 -21411295 + MTC LTR MaLR 15 421 0 3 1585 248 295 0 62 chr5 131130954 131131019 -21406240 - MLT1-int LTR MaLR -384 987 927 3 1585 278 248 165 81 chr5 131133442 131133739 -21403520 + ORR1E LTR MaLR 1 324 -50 3 1585 3113 145 19 30 chr5 131135233 131135766 -21401493 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 3 1585 901 209 189 168 chr5 131138882 131139405 -21397854 - RMER4B LTR ERVK -6 579 46 3 1585 2665 161 69 21 chr5 131139405 131139503 -21397756 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 453 3 1585 2665 161 69 21 chr5 131139541 131139976 -21397283 - RLTR20B2 LTR ERVK -108 452 2 3 1585 1830 143 48 3 chr5 131139976 131140313 -21396946 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1975 3 1585 915 157 20 44 chr5 131140293 131140497 -21396762 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2157 169 5 3 1585 329 252 0 64 chr5 131140554 131140664 -21396595 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1629 1213 1111 3 1585 584 277 164 8 chr5 131142001 131142245 -21395014 - RMER15 LTR ERVL -14 561 280 4 1585 628 281 15 30 chr5 131142592 131142794 -21394465 - RMER15 LTR ERVL -17 558 360 4 1585 1271 202 134 3 chr5 131144454 131144782 -21392477 - MTD LTR MaLR -8 411 41 4 1585 519 277 111 102 chr5 131147383 131147725 -21389534 - ORR1E LTR MaLR -7 352 8 4 1585 566 259 52 30 chr5 131149099 131149343 -21387916 - MLT1F LTR MaLR -72 488 252 4 1585 1419 148 128 87 chr5 131150929 131151321 -21385938 - RMER17C LTR ERVK 0 410 3 4 1585 640 284 9 38 chr5 131151779 131151991 -21385268 - RMER15 LTR ERVL -95 480 275 4 1585 395 268 16 79 chr5 131152643 131152825 -21384434 - ORR1E LTR MaLR -185 174 1 4 1585 2199 153 133 11 chr5 131156700 131157150 -21380109 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 4 1585 232 265 46 64 chr5 131157879 131157988 -21379271 + MER57C2 LTR ERV1 203 309 -125 4 1585 2206 121 44 10 chr5 131158305 131158689 -21378570 + RLTR28 LTR ERVL 1 397 -127 4 1585 4600 78 13 7 chr5 131161102 131161699 -21375560 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 4 1585 289 232 94 10 chr5 131163482 131163578 -21373681 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 257 4 1585 553 220 123 25 chr5 131166915 131167078 -21370181 - MTEb LTR MaLR 0 379 201 4 1585 384 257 69 62 chr5 131168647 131168792 -21368467 + MTEa LTR MaLR 1 146 -233 4 1585 2405 80 6 58 chr5 131169259 131169603 -21367656 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 4 1585 278 351 37 71 chr5 131169622 131169919 -21367340 - MTEa LTR MaLR -16 363 77 4 1585 822 273 126 19 chr5 131174401 131174774 -21362485 + MTE2a LTR MaLR 1 419 0 4 1585 454 279 125 0 chr5 131176157 131176293 -21360966 - MTE2a LTR MaLR 0 379 227 5 1585 232 309 0 85 chr5 131180430 131180536 -21356723 - MT2B LTR ERVL -350 251 155 5 1585 342 274 39 0 chr5 131182927 131183029 -21354230 - LTR40b LTR ERVL -4 458 353 5 1585 577 182 124 0 chr5 131183132 131183269 -21353990 - MTEa LTR MaLR -78 301 148 5 1585 770 282 86 35 chr5 131183357 131183697 -21353562 - MTE2a LTR MaLR -22 397 55 5 1585 636 241 151 14 chr5 131185989 131186385 -21350874 - RMER15 LTR ERVL 0 575 27 5 1585 230 234 15 45 chr5 131186480 131186547 -21350712 - RMER15 LTR ERVL -510 65 1 5 1585 619 285 26 16 chr5 131187027 131187216 -21350043 + MTD LTR MaLR 10 200 -219 5 1585 351 252 54 23 chr5 131187403 131187547 -21349712 + MTD LTR MaLR 240 397 -22 5 1585 2037 130 22 78 chr5 131188288 131188688 -21348571 + ORR1B1 LTR MaLR 17 394 0 5 1585 816 318 38 28 chr5 131192407 131192727 -21344532 + MTEa LTR MaLR 52 374 -5 5 1585 840 258 45 45 chr5 131194386 131194699 -21342560 + ORR1E LTR MaLR 37 349 -10 5 1585 668 304 26 64 chr5 131197165 131197478 -21339781 + MTEa LTR MaLR 1 301 -78 5 1585 3502 28 2 0 chr5 131198360 131198755 -21338504 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1585 1184 234 71 38 chr5 131200106 131200497 -21336762 - MTD LTR MaLR -14 405 5 5 1585 1245 225 73 67 chr5 131201041 131201099 -21336160 - MTEa LTR MaLR -3 376 338 5 1585 1245 225 73 67 chr5 131201291 131201604 -21335655 - MTEa LTR MaLR -42 337 3 5 1586 876 220 71 35 chr5 131203088 131203314 -21333945 + MTE2a LTR MaLR 129 362 -17 5 1586 535 234 89 19 chr5 131204469 131204518 -21332741 - ORR1E LTR MaLR -6 373 326 5 1586 1183 232 33 62 chr5 131204570 131204874 -21332385 - ORR1E LTR MaLR -64 295 1 5 1586 1108 226 93 21 chr5 131205910 131206270 -21330989 + MTD LTR MaLR 6 404 -15 5 1586 687 297 73 23 chr5 131206708 131207008 -21330251 + ORR1E LTR MaLR 3 317 -42 5 1586 1955 154 0 0 chr5 131210880 131211198 -21326061 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 6 1586 238 327 26 17 chr5 131213508 131213623 -21323636 - RMER15 LTR ERVL -91 484 369 6 1586 280 243 14 0 chr5 131214260 131214330 -21322929 + MTEa LTR MaLR 296 366 -13 6 1586 605 256 6 13 chr5 131214360 131214518 -21322741 + MTE2b LTR MaLR 19 175 -204 6 1586 1229 185 58 0 chr5 131214511 131214754 -21322505 + MTEb LTR MaLR 123 379 0 6 1586 738 272 163 13 chr5 131216775 131217081 -21320178 - ORR1E LTR MaLR -5 354 3 6 1586 403 174 47 35 chr5 131217500 131217634 -21319625 + MTD LTR MaLR 215 386 -33 6 1586 287 221 0 14 chr5 131218792 131218861 -21318398 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 336 6 1586 322 217 169 0 chr5 131219241 131219324 -21317935 - MTEb LTR MaLR -232 147 51 6 1586 881 280 24 122 chr5 131221263 131221399 -21315860 + MTD LTR MaLR 5 131 -288 6 1586 881 280 24 122 chr5 131221627 131221950 -21315309 + MTD LTR MaLR 132 419 0 6 1586 601 269 53 16 chr5 131222721 131222910 -21314349 - MTE2a LTR MaLR -3 376 181 6 1586 624 256 57 172 chr5 131225423 131225824 -21311435 - MTE2a LTR MaLR -24 355 1 6 1586 1212 233 52 0 chr5 131226463 131226750 -21310509 + MTEb LTR MaLR 1 302 -77 6 1586 979 270 128 17 chr5 131230831 131231189 -21306070 + MTD LTR MaLR 2 399 -20 6 1586 1082 254 96 3 chr5 131231742 131232086 -21305173 + MTEb LTR MaLR 4 379 0 6 1586 1566 225 116 11 chr5 131233923 131234301 -21302958 - MTD LTR MaLR -1 418 1 6 1586 3262 236 106 90 chr5 131234301 131235484 -21301775 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 58 6 1586 962 208 14 5 chr5 131235477 131235685 -21301574 - MTD LTR MaLR -194 227 18 6 1586 633 255 158 54 chr5 131235704 131236022 -21301237 - MTD LTR MaLR -5 374 40 6 1586 1448 201 54 12 chr5 131236343 131236675 -21300584 - ORR1E LTR MaLR -12 347 2 6 1586 247 297 67 17 chr5 131238122 131238239 -21299020 - ORR1D2 LTR MaLR -186 184 62 6 1586 234 331 52 29 chr5 131238239 131238413 -21298846 - RMER15 LTR ERVL 0 575 398 6 1586 2188 133 24 104 chr5 131243439 131243971 -21293288 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 2 7 1586 1067 242 38 63 chr5 131244216 131244533 -21292726 + ORR1E LTR MaLR 18 326 -33 7 1586 298 284 9 18 chr5 131245896 131246007 -21291252 - RMER15 LTR ERVL -43 532 423 7 1586 842 230 99 137 chr5 131247198 131247632 -21289627 - MTD LTR MaLR -15 404 1 7 1586 1440 148 16 16 chr5 131249192 131249446 -21287813 - ORR1A3 LTR MaLR -72 254 1 7 1586 347 236 112 16 chr5 131251200 131251325 -21285934 - MTEb LTR MaLR -241 138 2 7 1586 1061 253 71 53 chr5 131252068 131252162 -21285097 - MTD LTR MaLR -15 404 303 7 1586 1061 253 71 53 chr5 131252476 131252774 -21284485 - MTD LTR MaLR -117 302 6 7 1586 577 294 11 46 chr5 131253042 131253302 -21283957 - BGLII_B LTR ERVK -12 429 179 7 1586 1079 246 81 37 chr5 131255158 131255542 -21281717 + MTD LTR MaLR 16 404 -15 7 1586 905 260 77 31 chr5 131256962 131257248 -21280011 - RMER15 LTR ERVL -4 571 273 7 1586 678 259 183 27 chr5 131257641 131257942 -21279317 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 7 1586 1518 211 55 9 chr5 131258039 131258364 -21278895 - MTE2b LTR MaLR -39 340 1 7 1586 239 364 14 64 chr5 131261200 131261341 -21275918 + MTE2b LTR MaLR 81 214 -165 7 1586 444 245 60 40 chr5 131262056 131262229 -21275030 + MTE2a LTR MaLR 151 344 -35 7 1586 752 269 67 15 chr5 131265074 131265331 -21271928 + ORR1E LTR MaLR 64 340 -19 7 1586 976 287 31 48 chr5 131266145 131266540 -21270719 - MTE2a LTR MaLR -13 406 11 7 1586 262 250 0 0 chr5 131267178 131267230 -21270029 - MTEa LTR MaLR -5 374 323 7 1586 347 250 29 88 chr5 131267214 131267350 -21269909 + MT2B LTR ERVL 151 278 -323 7 1586 1077 188 8 25 chr5 131267384 131267619 -21269640 - MTEa LTR MaLR -42 337 107 7 1586 329 336 47 57 chr5 131267651 131267826 -21269433 - MT2A LTR ERVL -232 301 5 7 1586 358 312 96 0 chr5 131267826 131267951 -21269308 - MTEa LTR MaLR -238 141 5 7 1586 533 284 60 66 chr5 131268378 131268677 -21268582 - ORR1E LTR MaLR -77 297 1 7 1586 963 209 15 0 chr5 131269999 131270205 -21267054 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 166 7 1586 250 302 0 0 chr5 131270280 131270343 -21266916 - ORR1D1 LTR MaLR -311 63 1 7 1586 2263 95 3 58 chr5 131270516 131270862 -21266397 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1586 859 282 121 16 chr5 131272433 131272746 -21264513 - ORR1E LTR MaLR -10 349 4 7 1586 868 303 61 30 chr5 131275835 131276196 -21261063 - MTEa LTR MaLR -4 375 4 7 1586 919 291 38 46 chr5 131282469 131282795 -21254464 - MTE2a LTR MaLR -44 377 50 8 1586 424 246 178 50 chr5 131283145 131283325 -21253934 - MTE2a LTR MaLR -6 373 171 8 1586 1401 205 186 0 chr5 131284311 131284628 -21252631 - MTEa LTR MaLR -3 376 1 8 1586 1186 262 80 13 chr5 131284776 131285089 -21252170 + ORR1E LTR MaLR 4 337 -22 8 1586 1024 241 82 43 chr5 131285533 131285837 -21251422 - RMER15 LTR ERVL -12 563 248 8 1586 2196 132 3 9 chr5 131292654 131292982 -21244277 + ORR1A4 LTR MaLR 1 326 -3 8 1586 1101 282 55 55 chr5 131293725 131293896 -21243363 - MTD LTR MaLR 0 419 241 8 1586 1101 282 55 55 chr5 131293973 131294203 -21243056 - MTD LTR MaLR -179 240 18 8 1586 250 198 112 56 chr5 131295661 131295768 -21241491 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 8 1586 1075 273 91 40 chr5 131296171 131296545 -21240714 - MTD LTR MaLR -18 401 9 8 1586 1228 224 121 12 chr5 131296941 131297280 -21239979 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 8 1586 226 191 94 160 chr5 131301269 131301375 -21235884 - MT2B LTR ERVL -337 264 166 8 1586 918 257 48 103 chr5 131302872 131303271 -21233988 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 8 1586 256 321 81 60 chr5 131303533 131303778 -21233481 + ORR1E LTR MaLR 104 354 -25 8 1586 1584 229 89 0 chr5 131303778 131304115 -21233144 - MTE2b LTR MaLR 0 379 13 8 1586 1085 258 59 76 chr5 131306077 131306433 -21230826 - ORR1E LTR MaLR -6 353 4 8 1586 601 295 92 54 chr5 131311433 131311727 -21225532 - ORR1E LTR MaLR 0 359 55 9 1586 606 173 79 85 chr5 131323741 131323930 -21213329 + RLTR15 LTR ERVK 1 188 -171 9 1586 411 256 59 35 chr5 131323952 131324122 -21213137 + RLTR15 LTR ERVK 161 334 -25 9 1586 337 246 59 128 chr5 131324587 131324816 -21212443 - MTEb LTR MaLR 0 379 157 9 1586 2286 153 103 10 chr5 131333002 131333410 -21203849 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 9 1586 255 275 27 68 chr5 131333430 131333504 -21203755 + LTR16C LTR ERVL 420 538 0 9 1587 236 312 51 71 chr5 131335326 131335576 -21201683 - ORR1E LTR MaLR -29 350 94 9 1587 324 267 11 22 chr5 131335749 131335841 -21201418 - ORR1E LTR MaLR -260 99 9 9 1587 247 206 62 16 chr5 131337763 131337827 -21199432 - RMER5 LTR ERV1 -434 100 34 9 1587 1848 138 94 9 chr5 131337896 131338226 -21199033 + ORR1B1 LTR MaLR 37 394 0 9 1587 567 300 90 5 chr5 131339036 131339237 -21198022 + RMER5 LTR ERV1 173 390 -144 9 1587 735 137 193 47 chr5 131339454 131339646 -21197613 - MTD LTR MaLR 0 419 200 9 1587 749 261 114 16 chr5 131339818 131340063 -21197196 - MTD LTR MaLR -142 277 9 9 1587 517 301 75 135 chr5 131344351 131344735 -21192524 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 2 9 1587 2097 185 11 3 chr5 131345090 131345464 -21191795 + MTEb LTR MaLR 3 379 0 1 1587 637 250 0 79 chr5 131348383 131348561 -21188698 - MTEb LTR MaLR -12 367 204 1 1587 600 188 6 138 chr5 131348904 131349071 -21188188 - MTEb LTR MaLR -210 149 5 1 1587 1280 215 21 126 chr5 131350221 131350594 -21186665 + MTE2a LTR MaLR 3 336 -43 1 1587 2051 162 79 14 chr5 131354610 131354978 -21182281 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 1 1587 1152 278 80 12 chr5 131355734 131356073 -21181186 + MTE2b LTR MaLR 13 374 -5 1 1587 1361 228 90 21 chr5 131356705 131357081 -21180178 - MTD LTR MaLR 0 419 18 1 1587 2116 125 124 9 chr5 131357087 131357433 -21179826 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 1587 425 326 38 0 chr5 131357558 131357684 -21179575 + ORR1E LTR MaLR 1 131 -228 1 1587 391 110 315 0 chr5 131357684 131357757 -21179502 + RLTR28 LTR ERVL 1 96 -385 1 1587 2461 183 5 2 chr5 131357989 131358421 -21178838 + RLTR28 LTR ERVL 92 524 0 1 1587 353 305 17 17 chr5 131358548 131358668 -21178591 + ORR1E LTR MaLR 259 378 -1 1 1587 522 249 183 26 chr5 131359241 131359635 -21177624 + RMER15 LTR ERVL 4 554 -21 1 1587 1016 232 46 60 chr5 131363766 131364114 -21173145 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 1 1587 244 257 154 34 chr5 131366246 131366363 -21170896 + MTEa LTR MaLR 246 376 -3 1 1587 227 269 42 31 chr5 131368331 131368427 -21168832 + RMER12 LTR ERVK 731 827 -495 1 1587 290 175 70 0 chr5 131370702 131370759 -21166500 + MTEa LTR MaLR 319 379 0 1 1587 421 131 0 14 chr5 131374595 131374665 -21162594 + ORR1D1 LTR MaLR 306 374 0 1 1587 1069 274 53 60 chr5 131376716 131377096 -21160163 - MTE2a LTR MaLR -1 378 2 1 1587 1901 150 160 32 chr5 131379286 131379693 -21157566 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 1 1587 1708 199 68 0 chr5 131380066 131380418 -21156841 + MTEb LTR MaLR 2 377 -2 1 1587 1342 244 49 32 chr5 131382734 131383102 -21154157 - MTD LTR MaLR -14 405 8 1 1587 1580 230 71 3 chr5 131383102 131383438 -21153821 + MTEa LTR MaLR 1 359 -20 1 1587 335 247 12 36 chr5 131386467 131386551 -21150708 + MTE2a LTR MaLR 1 82 -297 1 1587 836 299 117 10 chr5 131386799 131387090 -21150169 + MTE2a LTR MaLR 52 373 -6 1 1587 1200 203 76 0 chr5 131388124 131388360 -21148899 + MTEa LTR MaLR 1 254 -125 1 1587 838 226 37 175 chr5 131388734 131389163 -21148096 - MTE2a LTR MaLR -2 377 8 1 1587 2419 206 33 13 chr5 131391137 131391232 -21146027 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 465 1 1587 2419 206 33 13 chr5 131391365 131391815 -21145444 - RLTR20B2 LTR ERVK -96 464 6 1 1587 336 244 24 12 chr5 131394399 131394482 -21142777 + MTD LTR MaLR 101 184 -235 1 1587 292 292 123 7 chr5 131394499 131394654 -21142605 + MTD LTR MaLR 207 379 0 1 1587 518 240 197 22 chr5 131394953 131395136 -21142123 - MT2A LTR ERVL -171 362 148 1 1587 320 240 115 0 chr5 131395201 131395297 -21141962 - MTD LTR MaLR -312 107 1 1 1587 469 165 98 11 chr5 131397055 131397147 -21140112 - MTEa LTR MaLR -31 348 249 1 1587 474 250 92 53 chr5 131397631 131397783 -21139476 - MTEa LTR MaLR -163 216 59 1 1587 848 228 133 62 chr5 131399689 131399998 -21137261 - MTD LTR MaLR -14 405 86 1 1587 1249 261 89 18 chr5 131400987 131401141 -21136118 - RMER5 LTR ERV1 -21 513 342 1 1587 1249 261 89 18 chr5 131401188 131401482 -21135777 - RMER5 LTR ERV1 -193 341 34 1 1587 511 229 123 37 chr5 131401993 131402156 -21135103 + ORR1E LTR MaLR 18 194 -165 1 1587 793 259 46 156 chr5 131402180 131402597 -21134662 + MTE2a LTR MaLR 1 371 -8 1 1587 2231 81 3 6 chr5 131402602 131402924 -21134335 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 1 1587 336 292 9 19 chr5 131402941 131403049 -21134210 + ORR1E LTR MaLR 264 370 -9 1 1587 486 298 166 44 chr5 131403376 131403671 -21133588 + MTEa LTR MaLR 49 379 0 1 1587 254 313 35 52 chr5 131404806 131404978 -21132281 - MLT1B LTR MaLR -115 275 107 1 1587 1022 268 77 32 chr5 131406157 131406558 -21130701 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1587 5776 186 36 46 chr5 131406827 131407395 -21129864 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 769 1 1587 5776 186 36 46 chr5 131407446 131408213 -21129046 - RMER12 LTR ERVK -554 768 2 1 1587 1336 226 128 8 chr5 131409332 131409698 -21127561 - MTD LTR MaLR 0 419 10 1 1587 249 185 0 53 chr5 131412433 131412490 -21124769 - MTC LTR MaLR -347 74 21 1 1587 236 177 58 92 chr5 131412864 131412942 -21124317 + MTEa LTR MaLR 263 337 -42 1 1587 1726 104 35 97 chr5 131413068 131413410 -21123849 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 1 1587 267 298 31 47 chr5 131415887 131416014 -21121245 + RMER15 LTR ERVL 440 564 -11 1 1587 1135 281 13 62 chr5 131416092 131416464 -21120795 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 1 1587 589 209 51 63 chr5 131418163 131418321 -21118938 - MTD LTR MaLR -14 405 219 1 1587 287 224 35 0 chr5 131418321 131418379 -21118880 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4466 4525 -1189 1 1587 328 289 84 46 chr5 131418404 131418616 -21118643 - MTD LTR MaLR -202 217 18 1 1587 480 275 32 53 chr5 131419164 131419352 -21117907 + RLTR42-int LTR ERVK 1222 1405 -4117 1 1587 1234 224 96 6 chr5 131421288 131421620 -21115639 - MTEa LTR MaLR -17 362 1 1 1587 1000 282 65 83 chr5 131421838 131422406 -21114853 + RMER13A LTR ERVK 106 663 -197 1 1587 901 263 40 103 chr5 131424055 131424454 -21112805 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 1 1587 377 269 46 9 chr5 131424455 131424564 -21112695 - MTE2a-int LTR MaLR -2 1578 1466 1 1587 595 274 54 147 chr5 131424898 131425305 -21111954 - MTC LTR MaLR -44 377 1 1 1587 864 143 212 0 chr5 131427352 131427541 -21109718 + RMER6A LTR ERVK 109 337 -419 1 1587 578 218 14 33 chr5 131427605 131427742 -21109517 - ORR1E LTR MaLR -229 141 1 1 1587 3302 41 5 5 chr5 131429999 131430395 -21106864 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1587 1031 276 58 71 chr5 131432565 131433044 -21104215 + RLTR12B LTR ERVK 47 519 -9 1 1587 1919 128 152 0 chr5 131433286 131433614 -21103645 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1587 230 256 102 23 chr5 131435218 131435306 -21101953 + ORR1E LTR MaLR 6 100 -259 1 1587 1155 194 44 80 chr5 131437617 131438036 -21099223 + RLTR20D LTR ERVK 28 505 0 1 1587 1000 225 34 137 chr5 131439112 131439529 -21097730 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 1 1587 1162 206 171 19 chr5 131440598 131440920 -21096339 + MTEb LTR MaLR 2 372 -7 1 1587 247 245 78 39 chr5 131442549 131442651 -21094608 + MTE2a LTR MaLR 87 192 -167 1 1587 957 244 198 22 chr5 131442776 131443095 -21094164 + MTEb LTR MaLR 5 379 0 1 1587 1083 152 10 16 chr5 131444527 131444721 -21092538 + MTD LTR MaLR 18 210 -209 1 1587 805 230 85 5 chr5 131445085 131445286 -21091973 + MTD LTR MaLR 200 416 -3 1 1587 315 232 36 12 chr5 131446326 131446409 -21090850 + MTE2a LTR MaLR 291 375 -4 1 1587 1173 251 14 17 chr5 131448148 131448440 -21088819 + MTD LTR MaLR 1 291 -128 1 1587 384 276 122 0 chr5 131448472 131448595 -21088664 + MTD LTR MaLR 267 404 -15 1 1587 258 293 25 81 chr5 131449618 131449778 -21087481 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 863 1013 -55 1 1587 1075 232 65 99 chr5 131451048 131451460 -21085799 - MTD LTR MaLR -14 405 21 1 1587 771 276 105 71 chr5 131452428 131452713 -21084546 + RMER5 LTR ERV1 56 348 -186 1 1587 771 276 105 71 chr5 131452919 131453081 -21084178 + RMER5 LTR ERV1 349 518 -16 1 1587 1076 246 55 52 chr5 131456004 131456352 -21080907 - ORR1E LTR MaLR -9 350 2 1 1587 226 339 98 0 chr5 131456576 131456688 -21080571 - ORR1E LTR MaLR -217 142 20 1 1587 1716 224 81 18 chr5 131456996 131457442 -21079817 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 1 1587 699 306 55 67 chr5 131458334 131458677 -21078582 + MT2A LTR ERVL 1 339 -194 1 1587 2378 170 32 5 chr5 131461249 131461657 -21075602 + MTC LTR MaLR 3 421 0 1 1587 614 310 28 73 chr5 131461752 131462069 -21075190 + MTEa LTR MaLR 75 377 -2 1 1587 1770 158 49 12 chr5 131462844 131463190 -21074069 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 1 198 673 233 203 71 chr5 131465001 131465297 -21071962 + MTD LTR MaLR 85 419 0 1 1588 892 230 71 167 chr5 131466299 131466737 -21070522 - MTD LTR MaLR -14 405 10 1 1588 301 272 84 100 chr5 131467794 131468041 -21069218 + MTD LTR MaLR 1 317 -102 1 1588 284 218 3 3 chr5 131468762 131468831 -21068428 + MTD LTR MaLR 311 405 -14 1 1588 3132 145 21 4 chr5 131468881 131469399 -21067860 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 1 1 1588 288 235 28 93 chr5 131469717 131469825 -21067434 + LTR50 LTR ERVL 7 107 -688 1 1588 1164 271 54 12 chr5 131469863 131470219 -21067040 - MTE2b LTR MaLR -8 362 1 1 1588 945 239 71 109 chr5 131470349 131470743 -21066516 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1588 915 265 124 40 chr5 131474194 131474462 -21062797 + MTD LTR MaLR 36 335 -84 1 1588 915 265 124 40 chr5 131474661 131474746 -21062513 + MTD LTR MaLR 336 419 0 1 1588 732 284 75 69 chr5 131477819 131478233 -21059026 - MTE2a LTR MaLR 0 419 1 1 1588 825 271 48 32 chr5 131479555 131479807 -21057452 + MTD LTR MaLR 21 276 -143 1 1588 583 256 91 27 chr5 131480506 131480812 -21056447 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 1 1588 2464 80 0 60 chr5 131481029 131481377 -21055882 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1588 644 306 75 45 chr5 131485533 131485841 -21051418 + ORR1E LTR MaLR 32 348 -11 1 1588 263 268 18 0 chr5 131487389 131487445 -21049814 + MTE2b LTR MaLR 253 309 -70 1 1588 352 257 14 0 chr5 131488324 131488398 -21048861 + MTE2b LTR MaLR 238 312 -67 1 1588 1693 174 78 21 chr5 131488992 131489379 -21047880 + MTC LTR MaLR 5 413 -8 1 1588 279 323 23 16 chr5 131491735 131491864 -21045395 + MTD LTR MaLR 1 130 -289 1 1588 1520 224 42 117 chr5 131492392 131492938 -21044321 - RLTR11A LTR ERVK -17 511 7 1 1588 789 302 90 21 chr5 131494100 131494489 -21042770 - RMER5 LTR ERV1 -46 488 73 1 1588 1359 197 24 20 chr5 131497563 131497857 -21039402 - MTEa LTR MaLR -83 296 2 1 1588 378 341 7 7 chr5 131500638 131500777 -21036482 + MLT1B LTR MaLR 1 139 -251 3 1588 301 329 28 61 chr5 131501482 131501663 -21035596 + MLT1B LTR MaLR 182 356 -34 3 1588 466 130 140 11 chr5 131501697 131501790 -21035469 - RLTR24 LTR ERV1 -220 309 205 7 1588 762 85 45 23 chr5 131501799 131501931 -21035328 - ORR1C2 LTR MaLR -249 135 1 8 1588 1127 235 48 26 chr5 131502086 131502357 -21034902 + MTEa LTR MaLR 103 379 0 9 1588 727 93 45 23 chr5 131503752 131503884 -21033375 + ORR1C2 LTR MaLR 1 135 -249 1 1588 1321 137 164 14 chr5 131503893 131504174 -21033085 + RLTR24 LTR ERV1 205 527 -2 1 1588 1809 141 31 87 chr5 131505886 131506073 -21031186 + ORR1C2 LTR MaLR 18 182 -202 2 1588 1809 141 31 87 chr5 131506252 131506453 -21030806 + ORR1C2 LTR MaLR 183 384 0 2 1588 592 300 66 57 chr5 131506675 131506919 -21030340 - MLT2F LTR ERVL -104 559 314 2 1588 361 279 10 0 chr5 131506974 131507078 -21030181 - MLT2F LTR ERVL -532 131 27 2 1588 589 301 11 32 chr5 131507587 131507776 -21029483 + MTEa LTR MaLR 1 185 -194 2 1588 521 136 240 0 chr5 131507854 131507979 -21029280 + ORR1C1 LTR MaLR 1 155 -223 3 1588 587 180 0 35 chr5 131509594 131509709 -21027550 + MTEa LTR MaLR 71 181 -198 3 1588 665 204 82 13 chr5 131509897 131510056 -21027203 + MTEa LTR MaLR 172 341 -38 3 1588 648 304 49 33 chr5 131511466 131511711 -21025548 - MTE2a LTR MaLR -8 371 123 4 1588 564 264 55 25 chr5 131511699 131511862 -21025397 + MTEb LTR MaLR 42 209 -170 4 1588 628 233 39 11 chr5 131511967 131512145 -21025114 + MTEb LTR MaLR 197 379 0 4 1588 952 240 69 16 chr5 131512532 131512850 -21024409 + RLTR11A LTR ERVK 164 498 -30 4 1588 293 237 74 21 chr5 131513497 131513592 -21023667 - RMER10A LTR ERVL -25 417 318 5 1588 1971 140 100 0 chr5 131513688 131514039 -21023220 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 5 1588 254 249 106 126 chr5 131514090 131514297 -21022962 - RMER10A LTR ERVL -236 206 4 5 1588 1361 219 69 34 chr5 131515835 131516234 -21021025 + MTD LTR MaLR 2 405 -14 5 1588 962 249 66 66 chr5 131516436 131516623 -21020636 - MTE2a LTR MaLR -5 374 184 5 1588 962 262 73 67 chr5 131516644 131516862 -21020397 - MTE2a LTR MaLR -177 242 1 5 1588 275 389 24 24 chr5 131517812 131517978 -21019281 - MLT1A0 LTR MaLR -86 279 114 6 1588 587 281 21 51 chr5 131518582 131518815 -21018444 + MTD LTR MaLR 4 259 -160 6 1588 523 280 13 20 chr5 131518876 131519029 -21018230 + MTD LTR MaLR 266 417 -2 6 1588 933 240 73 85 chr5 131519837 131520178 -21017081 - MTE2a LTR MaLR -42 337 1 6 1588 932 264 86 21 chr5 131520748 131521083 -21016176 + RMER5 LTR ERV1 4 360 -174 6 1588 714 231 75 0 chr5 131521083 131521269 -21015990 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 171 6 1588 806 239 57 6 chr5 131521406 131521583 -21015676 - ORR1D2 LTR MaLR -184 186 1 6 1588 996 255 34 113 chr5 131521822 131522229 -21015030 + MTE2a LTR MaLR 5 379 0 7 1588 1448 236 40 9 chr5 131522821 131523180 -21014079 - MTE2a LTR MaLR 0 407 18 7 1588 2420 117 27 2 chr5 131535363 131535766 -21001493 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 1588 597 303 59 50 chr5 131535841 131536161 -21001098 + MER21B LTR ERV1 417 739 -124 9 1588 1999 114 71 10 chr5 131543700 131544009 -20993250 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 1 1588 9709 117 53 116 chr5 131544010 131546080 -20991179 + ORR1A4-int LTR MaLR 24 1963 0 1 1588 1941 117 68 44 chr5 131546080 131546401 -20990858 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1588 669 291 60 22 chr5 131546633 131546865 -20990394 + MTD LTR MaLR 11 251 -168 1 1588 387 149 0 15 chr5 131551010 131551078 -20986181 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 293 1 1588 2271 119 13 37 chr5 131551291 131551667 -20985592 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1588 1100 254 68 15 chr5 131555449 131555817 -20981442 - MTD LTR MaLR -25 396 12 1 1588 572 260 38 65 chr5 131555896 131556081 -20981178 + MTEa LTR MaLR 4 183 -196 1 1588 290 105 1 5 chr5 131561023 131561094 -20976165 - MTB_Mm LTR MaLR -179 240 176 1 1588 1321 207 108 41 chr5 131561238 131561581 -20975678 + MTEa LTR MaLR 5 370 -9 1 1588 1437 222 96 3 chr5 131562388 131562731 -20974528 + MTEa LTR MaLR 4 378 -1 1 1588 1774 138 15 57 chr5 131563356 131563687 -20973572 + ORR1A3 LTR MaLR 1 317 -9 1 1588 548 226 52 8 chr5 131566954 131567088 -20970171 - MTC LTR MaLR -15 406 267 1 1588 2487 159 62 14 chr5 131567207 131567710 -20969549 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 1 1588 741 152 0 0 chr5 131567710 131567835 -20969424 - RLTR11B LTR ERVK -328 125 1 1 1588 539 256 42 48 chr5 131567835 131568024 -20969235 - MTC LTR MaLR -222 197 10 1 1588 368 316 24 55 chr5 131568642 131568784 -20968475 + MTEa LTR MaLR 6 143 -236 1 1588 526 284 80 109 chr5 131568865 131569177 -20968082 + RMER15 LTR ERVL 181 483 -92 1 1588 588 276 116 34 chr5 131570972 131571205 -20966054 + MLT1A0 LTR MaLR 112 363 -2 1 1588 1053 233 31 86 chr5 131571471 131571795 -20965464 - MTE2a LTR MaLR 0 379 74 1 1588 1078 217 92 65 chr5 131572519 131572888 -20964371 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1588 858 283 128 13 chr5 131578389 131578765 -20958494 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1588 1458 189 169 14 chr5 131579994 131580338 -20956921 - MTD LTR MaLR -5 414 18 2 1588 296 269 100 42 chr5 131583794 131583914 -20953345 - MTE2a LTR MaLR -168 211 85 2 1588 2001 144 56 28 chr5 131583925 131584282 -20952977 + MTC LTR MaLR 1 367 -54 2 1588 531 212 28 61 chr5 131584287 131584447 -20952812 + RMER20B LTR ERVK 4 161 -355 2 1588 298 175 0 17 chr5 131584718 131584776 -20952483 + MTC LTR MaLR 351 407 0 2 1588 1044 237 50 94 chr5 131587007 131587389 -20949870 - MTE2a LTR MaLR -6 373 9 2 1588 237 267 0 0 chr5 131590664 131590724 -20946535 + MTEa LTR MaLR 6 65 -314 2 1588 679 317 103 44 chr5 131590721 131591110 -20946149 + MT2A LTR ERVL 106 517 -16 2 1588 906 305 101 24 chr5 131591502 131591878 -20945381 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 1588 1103 231 86 64 chr5 131592287 131592647 -20944612 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 2 1588 531 275 74 42 chr5 131594823 131595013 -20942246 - MTEa LTR MaLR 0 379 184 2 1588 999 245 57 102 chr5 131595105 131595459 -20941800 + MTE2a LTR MaLR 1 338 -41 2 1589 416 262 66 13 chr5 131599702 131599853 -20937406 - ORR1E LTR MaLR -200 159 1 2 1589 992 244 90 26 chr5 131603305 131603650 -20933609 + MTD LTR MaLR 51 405 -14 2 1589 1854 168 102 0 chr5 131609647 131609980 -20927279 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1589 772 249 151 61 chr5 131610207 131610519 -20926740 + MTE2a LTR MaLR 40 379 0 3 1589 613 283 28 48 chr5 131611250 131611459 -20925800 + MTD LTR MaLR 5 189 -230 3 1589 583 286 78 6 chr5 131611893 131612072 -20925187 + MTD LTR MaLR 228 419 0 3 1589 583 294 45 66 chr5 131612329 131612573 -20924686 - RMER15 LTR ERVL 0 575 337 3 1589 411 267 29 29 chr5 131612650 131612789 -20924470 - RMER15 LTR ERVL -436 139 1 3 1589 651 291 16 22 chr5 131612962 131613145 -20924114 - MTEb LTR MaLR -163 216 35 3 1589 1332 285 8 21 chr5 131614460 131614833 -20922426 + MTE2b LTR MaLR 6 373 -6 3 1589 1430 206 49 114 chr5 131618537 131618985 -20918274 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1589 1288 266 32 42 chr5 131620262 131620670 -20916589 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 3 1589 526 224 32 0 chr5 131621157 131621282 -20915977 + RMER15 LTR ERVL 430 558 -17 3 1589 782 310 35 46 chr5 131621342 131621762 -20915497 + MTE2a LTR MaLR 5 404 -15 3 1589 1323 247 59 50 chr5 131622502 131622860 -20914399 + MTEa LTR MaLR 4 364 -15 3 1589 1113 209 183 25 chr5 131630740 131631063 -20906196 - MTEa LTR MaLR -3 376 3 3 1589 251 303 112 60 chr5 131632764 131633031 -20904228 + ORR1E LTR MaLR 44 324 -35 3 1589 245 237 0 48 chr5 131638645 131638707 -20898552 - RMER21B LTR ERV1 -112 835 777 3 1589 609 254 199 5 chr5 131638734 131638940 -20898319 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 322 3 1589 1003 225 192 15 chr5 131639053 131639387 -20897872 - MTD LTR MaLR -14 405 13 3 1589 1309 240 75 0 chr5 131639700 131640021 -20897238 + MTEa LTR MaLR 20 364 -15 3 1589 1402 243 91 82 chr5 131640408 131640747 -20896512 - RMER15 LTR ERVL 0 575 221 3 1589 1402 243 91 82 chr5 131640985 131641170 -20896089 - RMER15 LTR ERVL -355 220 46 3 1589 395 285 184 31 chr5 131641353 131641614 -20895645 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 4 1589 1273 232 48 36 chr5 131644125 131644460 -20892799 + ORR1D2 LTR MaLR 20 358 -12 4 1589 546 256 115 101 chr5 131644662 131644958 -20892301 + RMER15 LTR ERVL 273 572 -3 4 1589 1346 219 83 44 chr5 131647751 131648114 -20889145 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 4 1589 771 274 119 88 chr5 131648333 131648653 -20888606 - ORR1E LTR MaLR -9 350 21 4 1589 2372 113 3 0 chr5 131649109 131649435 -20887824 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1589 333 256 120 0 chr5 131654442 131654559 -20882700 - MTEa LTR MaLR 0 379 249 4 1589 432 298 63 34 chr5 131654895 131655100 -20882159 + RMER15 LTR ERVL 275 485 -90 4 1589 2354 208 25 23 chr5 131655839 131655913 -20881346 + RLTR28 LTR ERVL 5 85 -439 4 1589 2354 208 25 23 chr5 131655948 131656391 -20880868 + RLTR28 LTR ERVL 86 523 -1 4 1589 422 335 26 21 chr5 131656744 131656933 -20880326 + MLT2B3 LTR ERVL 12 201 -353 4 1589 1233 211 77 42 chr5 131661526 131661707 -20875552 + MTEa LTR MaLR 11 202 -177 4 1589 1233 211 77 42 chr5 131661758 131661912 -20875347 + MTEa LTR MaLR 203 357 -22 4 1589 341 263 115 46 chr5 131667481 131667734 -20869525 + ORR1E LTR MaLR 83 379 0 4 1589 1252 291 32 40 chr5 131668765 131669144 -20868115 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 4 1589 260 353 67 126 chr5 131670226 131670495 -20866764 - ORR1E LTR MaLR -13 346 94 4 1589 1224 224 124 34 chr5 131670674 131671029 -20866230 + MTD LTR MaLR 20 406 -13 4 1589 255 291 169 0 chr5 131672618 131672766 -20864493 + ORR1E LTR MaLR 175 347 -12 4 1589 727 277 62 99 chr5 131673977 131674350 -20862909 + MTE2a LTR MaLR 3 361 -18 4 1589 746 313 42 59 chr5 131674644 131675000 -20862259 - ORR1E LTR MaLR -3 356 7 4 1589 1451 230 61 11 chr5 131676315 131676675 -20860584 + MTEa LTR MaLR 1 378 -1 4 1589 801 250 31 90 chr5 131677403 131677693 -20859566 + MTEb LTR MaLR 3 275 -104 4 1589 620 268 117 106 chr5 131677689 131678039 -20859220 + MTE2a LTR MaLR 8 361 -18 5 1589 407 204 59 30 chr5 131678057 131678158 -20859101 + MTEb LTR MaLR 269 372 -7 4 1589 866 217 45 87 chr5 131679445 131679733 -20857526 - MTE2a LTR MaLR -39 340 65 5 1589 417 279 38 81 chr5 131681187 131681347 -20855912 - MTEa LTR MaLR -226 153 1 5 1589 1114 285 13 47 chr5 131687670 131688050 -20849209 - MTEa LTR MaLR 0 379 13 5 1589 237 333 0 12 chr5 131688091 131688173 -20849086 - MLT1B LTR MaLR -290 100 20 5 1589 1807 145 89 6 chr5 131693167 131693494 -20843765 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 5 1589 1442 221 56 11 chr5 131694490 131694847 -20842412 + MTEb LTR MaLR 3 375 -4 5 1589 260 280 98 77 chr5 131695681 131695824 -20841435 + RMER15 LTR ERVL 416 561 -14 5 1589 369 360 22 58 chr5 131697396 131697620 -20839639 + MTEb LTR MaLR 1 216 -163 5 1589 2150 160 50 5 chr5 131697844 131698221 -20839038 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1589 1232 145 48 17 chr5 131698343 131698574 -20838685 - ORR1A3 LTR MaLR -88 238 1 5 1589 252 200 126 29 chr5 131700618 131700721 -20836538 - MTD LTR MaLR 0 419 307 5 1589 685 171 1 47 chr5 131707308 131707458 -20829801 + MTC LTR MaLR 276 407 -14 5 1589 486 257 90 70 chr5 131711530 131711731 -20825528 + ORR1E LTR MaLR 6 210 -149 5 1589 244 284 45 11 chr5 131711770 131711859 -20825400 + ORR1E LTR MaLR 288 379 0 5 1589 438 311 49 20 chr5 131712157 131712360 -20824899 + MLT1D LTR MaLR 263 471 -34 5 1589 619 302 72 57 chr5 131713644 131713978 -20823281 - ORR1E LTR MaLR -2 357 19 5 1589 307 254 94 58 chr5 131714304 131714442 -20822817 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 254 5 1589 677 256 26 31 chr5 131714488 131714714 -20822545 - RMER15 LTR ERVL -15 560 336 5 1589 246 337 24 12 chr5 131715021 131715105 -20822154 - MLT1A1 LTR MaLR -323 85 1 5 1589 809 227 162 153 chr5 131716544 131716987 -20820272 + MT2A LTR ERVL 1 447 -86 6 1589 429 222 85 31 chr5 131718367 131718497 -20818762 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 268 6 1589 562 318 85 93 chr5 131718725 131719231 -20818028 + RLTR18 LTR ERVK 31 532 -84 6 1589 1379 137 4 252 chr5 131719340 131719800 -20817459 + RLTR24 LTR ERV1 26 371 -158 6 1589 624 137 17 17 chr5 131719987 131720106 -20817153 + RLTR24 LTR ERV1 411 529 0 6 1589 1175 245 93 44 chr5 131720862 131720891 -20816368 - MTD LTR MaLR -15 404 380 6 1589 1175 245 93 44 chr5 131721108 131721463 -20815796 - MTD LTR MaLR -40 379 1 6 1589 293 252 113 30 chr5 131721463 131721622 -20815637 - MTD LTR MaLR -203 193 1 6 1589 779 200 344 28 chr5 131725866 131726148 -20811111 + MTEb LTR MaLR 1 371 -8 6 1590 495 260 43 70 chr5 131728517 131728703 -20808556 + ORR1E LTR MaLR 3 183 -176 6 1590 504 267 40 20 chr5 131729041 131729190 -20808069 + MTEa LTR MaLR 1 152 -227 6 1590 610 237 7 0 chr5 131729809 131729948 -20807311 + MTEa LTR MaLR 240 379 0 6 1590 263 180 0 0 chr5 131739705 131739755 -20797504 - MTEb LTR MaLR -3 376 327 6 1590 321 307 75 10 chr5 131740654 131740855 -20796404 - RMER15 LTR ERVL -15 560 347 6 1590 1761 209 67 0 chr5 131740885 131741273 -20795986 - MTD LTR MaLR -5 414 1 6 1590 2241 81 14 69 chr5 131741656 131742002 -20795257 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1590 298 220 27 99 chr5 131748333 131748444 -20788815 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 103 -1011 7 1590 259 329 62 34 chr5 131748775 131748951 -20788308 + RLTR3_Mm LTR ERVK 627 807 -521 7 1590 461 228 35 17 chr5 131749341 131749457 -20787802 + RLTR13D3 LTR ERVK 997 1114 0 7 1590 858 268 30 50 chr5 131750241 131750540 -20786719 - ORR1E LTR MaLR -45 314 22 7 1590 570 287 86 96 chr5 131750654 131750955 -20786304 - ORR1E LTR MaLR -80 298 1 7 1590 1169 268 86 14 chr5 131751555 131751903 -20785356 - MTEa LTR MaLR -4 375 3 7 1590 3290 33 15 3 chr5 131752076 131752467 -20784792 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1590 227 365 24 0 chr5 131758985 131759070 -20778189 + MTEb LTR MaLR 5 91 -288 7 1590 310 227 29 49 chr5 131759542 131759644 -20777615 + MTEb LTR MaLR 251 350 -29 7 1590 427 141 0 0 chr5 131761833 131761904 -20775355 - ORR1B2 LTR MaLR -279 88 18 7 1590 367 292 53 0 chr5 131762951 131763064 -20774195 - ORR1E LTR MaLR -231 128 10 7 1590 426 206 132 72 chr5 131763491 131763643 -20773616 - MLT1F1 LTR MaLR -6 573 413 7 1590 427 370 1 18 chr5 131763856 131764088 -20773171 - MLT1F1 LTR MaLR -324 231 9 7 1590 2538 98 41 2 chr5 131764308 131764719 -20772540 - RLTR44C LTR ERVK -25 477 51 7 1590 819 252 45 165 chr5 131765884 131766283 -20770976 - MTE2a LTR MaLR -8 371 21 7 1590 1671 220 37 32 chr5 131766283 131766691 -20770568 + MTD LTR MaLR 1 410 -9 7 1590 4852 158 64 21 chr5 131767991 131768861 -20768398 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 7 1590 694 209 94 30 chr5 131770601 131770803 -20766456 + ORR1E LTR MaLR 23 237 -122 7 1590 1255 93 31 0 chr5 131785073 131785267 -20751992 - RMER4B LTR ERVK -370 215 16 8 1590 814 250 53 69 chr5 131786927 131787245 -20750014 + ORR1E LTR MaLR 11 323 -36 8 1590 1121 222 32 138 chr5 131791131 131791508 -20745751 + MTEb LTR MaLR 32 368 -11 8 1590 2031 123 97 43 chr5 131793166 131793558 -20743701 - MTC LTR MaLR -8 413 1 8 1590 287 250 12 62 chr5 131794684 131794765 -20742494 - ORR1D2 LTR MaLR -292 78 2 8 1590 502 272 51 23 chr5 131796351 131796566 -20740693 + ORR1E LTR MaLR 11 216 -154 8 1590 321 182 52 0 chr5 131796589 131796666 -20740593 - RMER17C LTR ERVK 0 410 330 8 1590 722 265 132 16 chr5 131798709 131798958 -20738301 + MTE2a LTR MaLR 18 295 -84 8 1590 1649 117 13 147 chr5 131799859 131799930 -20737329 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 286 8 1590 1649 117 13 147 chr5 131800442 131800750 -20736509 - ORR1A4 LTR MaLR -44 285 1 8 1590 1207 220 112 9 chr5 131801284 131801614 -20735645 - MTE2b LTR MaLR -13 366 3 8 1590 1506 195 70 12 chr5 131802480 131802807 -20734452 + ORR1D1 LTR MaLR 29 374 0 8 1590 929 166 151 5 chr5 131808111 131808317 -20728942 + MTEa LTR MaLR 144 379 0 8 1590 546 266 58 109 chr5 131809602 131810039 -20727220 - MTD LTR MaLR -17 402 1 8 1590 2091 129 98 6 chr5 131812673 131813009 -20724250 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 8 1590 988 262 212 50 chr5 131815352 131815994 -20721265 + RMER13A LTR ERVK 115 860 0 9 1590 823 208 28 50 chr5 131825249 131825286 -20711973 - MTD LTR MaLR -239 180 144 9 1590 823 208 28 50 chr5 131825515 131825659 -20711600 - MTD LTR MaLR -276 143 3 9 1590 511 280 41 36 chr5 131834090 131834286 -20702973 - RMER15 LTR ERVL -65 510 314 9 1590 276 311 144 29 chr5 131835296 131835435 -20701824 + MLT1N2 LTR MaLR 4 158 -404 9 1590 821 234 60 72 chr5 131835668 131835917 -20701342 - MTEa LTR MaLR -2 377 132 9 1590 309 293 13 0 chr5 131835962 131836037 -20701222 - MTEa LTR MaLR -230 149 74 9 1590 312 236 0 14 chr5 131836615 131836688 -20700571 - MTEa LTR MaLR -306 73 2 9 1590 531 171 26 26 chr5 131836848 131836962 -20700297 + MLT1A1 LTR MaLR 1 114 -294 9 1590 489 295 97 17 chr5 131837002 131837178 -20700081 + MLT1A1 LTR MaLR 219 408 0 9 1590 273 282 35 0 chr5 131837447 131837532 -20699727 - MLT1D LTR MaLR 0 505 418 9 1590 1813 137 68 85 chr5 131840290 131840642 -20696617 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 9 1590 305 292 62 10 chr5 131843790 131843887 -20693372 - MTE2a LTR MaLR -14 365 264 9 1590 859 235 14 156 chr5 131845659 131845941 -20691318 - MTE2a LTR MaLR -128 251 10 9 1590 541 330 71 58 chr5 131848503 131848812 -20688447 - ORR1E LTR MaLR -4 355 43 9 1590 1760 202 53 3 chr5 131852681 131853019 -20684240 + MTEa LTR MaLR 13 367 -12 9 1590 312 266 54 61 chr5 131857382 131857530 -20679729 - LTR77 LTR ERV1 -103 519 373 1 198 630 278 141 31 chr5 131858391 131858647 -20678612 - RMER15 LTR ERVL -18 557 274 1 1591 244 238 136 71 chr5 131858654 131858794 -20678465 - RMER15 LTR ERVL -426 149 1 1 1591 393 216 193 0 chr5 131860112 131860200 -20677059 - MTEa LTR MaLR -274 105 1 1 1591 379 248 115 39 chr5 131861432 131861562 -20675697 - RMER10A LTR ERVL -30 412 273 1 1591 1285 254 35 11 chr5 131861939 131862225 -20675034 + ORR1E LTR MaLR 4 296 -63 1 1591 2501 162 19 12 chr5 131862397 131862815 -20674444 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1591 1127 288 62 22 chr5 131864638 131864958 -20672301 - MTEa LTR MaLR -45 334 2 1 1591 1072 256 64 78 chr5 131865208 131865568 -20671691 + MTE2a LTR MaLR 19 373 -6 1 1591 1398 249 30 65 chr5 131867421 131867791 -20669468 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 1 1591 342 306 194 76 chr5 131867846 131868150 -20669109 + ORR1E LTR MaLR 20 359 0 1 1591 1515 222 105 3 chr5 131868290 131868479 -20668780 + MTD LTR MaLR 1 207 -212 1 1591 1515 222 105 3 chr5 131868525 131868715 -20668544 + MTD LTR MaLR 208 419 0 1 1591 369 323 127 86 chr5 131872949 131873240 -20664019 - ORR1E LTR MaLR -34 325 23 1 1591 758 187 56 58 chr5 131873271 131873492 -20663767 - MTE2a LTR MaLR 0 379 162 1 1591 594 282 11 45 chr5 131873716 131873916 -20663343 - MTE2a LTR MaLR -244 175 2 1 1591 248 369 85 24 chr5 131876518 131876682 -20660577 - MLT1K LTR MaLR -3 592 419 1 1591 1174 246 115 41 chr5 131876746 131877085 -20660174 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 1 1591 905 245 159 65 chr5 131877088 131877421 -20659838 + MTE2a LTR MaLR 52 405 -14 1 1591 1044 271 83 45 chr5 131880260 131880596 -20656663 + MTEa LTR MaLR 1 349 -30 1 1591 4455 179 49 32 chr5 131880624 131881543 -20655716 - RMER19B LTR ERVK -12 890 20 1 1591 311 116 0 0 chr5 131884989 131885032 -20652227 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1248 4466 4424 1 1591 355 253 0 0 chr5 131885393 131885480 -20651779 + ERVL-B4-int LTR ERVL 962 1048 -4666 1 1591 2476 147 47 7 chr5 131886702 131887106 -20650153 - MTC LTR MaLR -1 420 1 1 1591 5993 149 72 38 chr5 131887106 131887344 -20649915 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1013 1 1591 5993 149 72 38 chr5 131887374 131888350 -20648909 - MTC-int LTR MaLR -246 1012 3 1 1591 2891 123 2 5 chr5 131888356 131888771 -20648488 - MTC LTR MaLR -7 414 1 1 1591 275 292 127 131 chr5 131889516 131889918 -20647341 + MLT1A1 LTR MaLR 12 400 -8 1 1591 333 279 125 0 chr5 131890283 131890387 -20646872 + MTEa LTR MaLR 1 117 -262 1 1591 1155 265 0 4 chr5 131890574 131890813 -20646446 + MTD LTR MaLR 13 250 -169 1 1591 842 190 49 0 chr5 131890918 131891081 -20646178 + MTD LTR MaLR 235 405 -14 1 1591 266 303 68 16 chr5 131891325 131891480 -20645779 + MLT1A1-int LTR MaLR 44 194 -1176 1 1591 1697 271 151 82 chr5 131891502 131892322 -20644937 + MLT1A1-int LTR MaLR 353 1231 -27 1 1591 1205 224 44 113 chr5 131892399 131892761 -20644498 + MTD LTR MaLR 46 382 -37 1 1591 1897 198 54 62 chr5 131896628 131897161 -20640098 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 1 1591 321 189 60 86 chr5 131899270 131899386 -20637873 + MT2B LTR ERVL 145 257 -344 1 1591 304 218 0 0 chr5 131899939 131899994 -20637265 - MTE2a LTR MaLR -72 349 295 1 1591 2009 149 99 25 chr5 131900832 131901224 -20636035 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1591 256 248 66 69 chr5 131901723 131901827 -20635432 - MT2A LTR ERVL -1 600 474 1 1591 903 315 68 20 chr5 131901848 131902143 -20635116 - MT2A LTR ERVL -162 371 63 1 1591 338 241 30 121 chr5 131902062 131902161 -20635098 - MTE2a LTR MaLR -233 146 57 1 1591 674 281 5 43 chr5 131903378 131903564 -20633695 + MLT1A0 LTR MaLR 44 222 -143 1 1591 1576 150 279 86 chr5 131904290 131904734 -20632525 + MT2A LTR ERVL 1 530 -3 1 1591 2339 78 56 0 chr5 131907493 131907799 -20629460 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 1 1591 2357 156 72 70 chr5 131908548 131909046 -20628213 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 1 1591 406 255 61 124 chr5 131909166 131909295 -20627964 - MT2B LTR ERVL -438 146 26 1 1591 740 242 114 15 chr5 131922415 131922616 -20614643 + MTE2b LTR MaLR 1 221 -158 1 1591 1435 210 111 18 chr5 131923004 131923338 -20613921 + MTD LTR MaLR 41 405 -14 1 1591 1055 226 85 150 chr5 131926890 131927291 -20609968 + MTE2a LTR MaLR 5 379 0 1 1591 715 275 6 36 chr5 131928811 131928834 -20608425 + MTD LTR MaLR 22 44 -375 1 1591 3453 45 0 0 chr5 131928834 131929230 -20608029 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1591 715 230 353 21 chr5 131929230 131929510 -20607749 + MTD LTR MaLR 45 417 -2 1 1591 1079 265 121 15 chr5 131934719 131935069 -20602190 + MTE2b LTR MaLR 38 421 0 1 1591 2242 152 33 40 chr5 131946613 131947037 -20590222 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1591 782 181 6 119 chr5 131951439 131951615 -20585644 + MTEb LTR MaLR 224 379 0 1 1591 826 249 118 146 chr5 131954593 131954661 -20582598 + MTEb LTR MaLR 1 68 -311 1 1591 826 249 118 146 chr5 131954687 131955008 -20582251 + MTEb LTR MaLR 69 378 -1 1 1591 262 191 0 0 chr5 131955835 131955882 -20581377 - MTEb LTR MaLR -328 51 5 1 1591 1064 231 129 24 chr5 131956991 131957332 -20579927 + MTEb LTR MaLR 1 377 -2 1 1591 481 228 10 63 chr5 131959213 131959419 -20577840 - RMER17C LTR ERVK -135 275 81 1 1591 2435 144 12 37 chr5 131961728 131962132 -20575127 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1591 375 333 0 72 chr5 131964494 131964645 -20572614 + MTE2b LTR MaLR 72 211 -168 1 1591 1585 213 27 9 chr5 131988027 131988358 -20548901 + MTEa LTR MaLR 29 365 -14 1 1592 1130 214 84 117 chr5 131994183 131994575 -20542684 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1592 449 271 0 0 chr5 131997835 131997931 -20539328 + MTEa LTR MaLR 1 96 -283 1 1592 263 320 94 23 chr5 131997931 131997963 -20539296 + MLT2B3 LTR ERVL 1 137 -417 1 1592 740 189 19 25 chr5 131998346 131998503 -20538756 + MTEa LTR MaLR 168 323 -56 1 1592 1474 197 135 42 chr5 131998531 131998886 -20538373 + MTB_Mm LTR MaLR 1 388 -19 1 1592 1298 244 72 9 chr5 132003806 132004154 -20533105 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1592 779 283 35 39 chr5 132004826 132005080 -20532179 + RMER15 LTR ERVL 310 562 -13 1 1592 1099 282 71 24 chr5 132020189 132020570 -20516689 + MTD LTR MaLR 5 403 -16 4 1592 232 350 67 43 chr5 132021518 132021682 -20515577 + MLT1G1 LTR MaLR 371 538 -41 4 1592 2293 93 48 0 chr5 132030288 132030600 -20506659 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1592 1449 147 67 98 chr5 132032748 132033094 -20504165 + RMER15 LTR ERVL 2 336 -239 9 1592 353 154 0 97 chr5 132033100 132033172 -20504087 + RMER15 LTR ERVL 511 575 0 9 1592 231 362 97 39 chr5 132036423 132036702 -20500557 - RMER12 LTR ERVK -364 958 664 1 1592 237 333 64 11 chr5 132041259 132041353 -20495906 + MLT1J LTR MaLR 100 198 -314 1 1592 1576 131 17 136 chr5 132046990 132047351 -20489908 + ORR1A4 LTR MaLR 1 318 -11 1 1592 1019 239 177 8 chr5 132053241 132053507 -20483752 + ORR1E LTR MaLR 4 314 -45 1 1592 810 271 105 74 chr5 132065302 132065625 -20471634 - MTE2a LTR MaLR -46 333 1 1 1592 566 197 197 0 chr5 132069736 132069863 -20467396 + MTEb LTR MaLR 223 374 -5 1 1592 379 286 12 0 chr5 132070133 132070217 -20467042 + ORR1E LTR MaLR 1 85 -274 1 1592 387 222 92 17 chr5 132074386 132074505 -20462754 - MTD LTR MaLR -26 393 266 2 1592 313 337 0 44 chr5 132074516 132074606 -20462653 - MTD LTR MaLR -206 213 128 2 1592 438 320 94 7 chr5 132080200 132080382 -20456877 - MLT1J LTR MaLR 0 512 256 2 1592 231 186 23 0 chr5 132085487 132085530 -20451729 + RMER15 LTR ERVL 532 575 0 2 1592 420 307 43 38 chr5 132087348 132087534 -20449725 + ORR1E LTR MaLR 1 187 -172 2 1592 228 391 120 39 chr5 132087645 132087879 -20449380 + LTR16A LTR ERVL 194 446 -5 2 1592 567 279 97 52 chr5 132093689 132093931 -20443328 - MTD LTR MaLR -136 283 9 2 1592 1378 237 86 14 chr5 132103282 132103633 -20433626 + MTE2b LTR MaLR 1 376 -3 2 1592 2137 141 83 11 chr5 132103807 132104167 -20433092 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 2 1592 1176 249 106 48 chr5 132104649 132105045 -20432214 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1592 1334 125 21 17 chr5 132112691 132112917 -20424342 - MTC LTR MaLR 0 421 143 2 1592 439 198 0 0 chr5 132116574 132116655 -20420604 + MTC LTR MaLR 1 81 -340 3 1592 994 296 81 0 chr5 132116874 132117134 -20420125 - MTE2b LTR MaLR -98 281 1 3 1593 877 239 108 36 chr5 132125830 132126108 -20411151 + ORR1E LTR MaLR 45 342 -17 3 1593 265 337 11 0 chr5 132128412 132128507 -20408752 + RMER15 LTR ERVL 371 466 -109 3 1593 802 97 1 13 chr5 132133299 132133423 -20403836 + ORR1B2 LTR MaLR 249 383 -1 3 1593 470 316 61 25 chr5 132135580 132135778 -20401481 + MTD LTR MaLR 1 205 -214 3 1593 886 292 40 80 chr5 132136571 132136731 -20400528 + MTD LTR MaLR 15 211 -208 3 1593 886 290 27 76 chr5 132136944 132137155 -20400104 + MTD LTR MaLR 212 413 -6 3 1593 1854 158 113 14 chr5 132139708 132140079 -20397180 + MTD LTR MaLR 12 419 0 3 1593 283 161 62 31 chr5 132143080 132143144 -20394115 - MTEa LTR MaLR -112 267 202 3 1593 309 207 244 0 chr5 132143216 132143298 -20393961 - MTEa LTR MaLR -258 121 20 3 1593 935 250 239 3 chr5 132146309 132146614 -20390645 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 3 1593 4219 88 41 12 chr5 132150187 132150771 -20386488 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 3 1593 1764 163 73 12 chr5 132152489 132152830 -20384429 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 3 3 1593 2020 103 23 75 chr5 132155301 132155648 -20381611 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1593 530 179 10 10 chr5 132158168 132158264 -20378995 + MTC LTR MaLR 326 421 0 4 1593 3194 128 23 26 chr5 132159176 132159705 -20377554 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 4 1593 909 210 89 136 chr5 132159868 132160250 -20377009 + ORR1E LTR MaLR 4 377 -2 4 1593 244 182 0 22 chr5 132163787 132163832 -20373427 + ORR1E LTR MaLR 312 355 -4 4 1593 1435 207 117 29 chr5 132170605 132170948 -20366311 - MTE2b LTR MaLR -4 375 3 4 1593 978 268 40 148 chr5 132175430 132175855 -20361404 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 1593 1363 181 121 32 chr5 132181081 132181395 -20355864 + MTD LTR MaLR 1 342 -77 4 1593 253 204 19 0 chr5 132181690 132181744 -20355515 - MTD LTR MaLR -60 359 305 4 1593 3180 122 26 38 chr5 132182345 132182873 -20354386 + RLTR28 LTR ERVL 1 522 -2 4 1593 2768 149 66 98 chr5 132184274 132184867 -20352392 + RMER15 LTR ERVL 1 574 -1 4 1593 922 263 138 9 chr5 132185797 132186131 -20351128 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 4 1593 501 294 69 25 chr5 132201006 132201208 -20336051 + RMER15 LTR ERVL 352 562 -13 5 1593 2589 157 62 14 chr5 132206016 132206519 -20330740 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 5 1593 569 107 541 18 chr5 132206701 132206871 -20330388 - ORR1A3 LTR MaLR -67 259 1 5 1593 1246 249 77 20 chr5 132209973 132210325 -20326934 + MTEa LTR MaLR 4 375 -4 5 1593 431 293 55 59 chr5 132220309 132220545 -20316714 + RMER15 LTR ERVL 341 575 0 5 1593 237 211 115 0 chr5 132222528 132222580 -20314679 + RLTR19 LTR ERVK 326 383 -116 5 1593 1446 231 62 8 chr5 132222787 132223145 -20314114 + MTEb LTR MaLR 1 377 -2 5 1593 369 304 36 61 chr5 132229104 132229300 -20307959 - MTEa LTR MaLR -21 358 168 5 1593 856 214 45 75 chr5 132236632 132237037 -20300222 + ORR1E LTR MaLR 30 383 -1 6 1593 752 282 72 5 chr5 132247144 132247351 -20289908 + MTEb LTR MaLR 16 236 -143 6 1593 1829 156 85 17 chr5 132247351 132247703 -20289556 + ORR1C2 LTR MaLR 1 376 -8 6 1593 527 281 37 7 chr5 132247703 132247839 -20289420 + MTEb LTR MaLR 232 371 -8 6 1594 2389 179 5 17 chr5 132253356 132253772 -20283487 + MTC LTR MaLR 11 421 0 6 1594 904 322 62 46 chr5 132262823 132263194 -20274065 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 6 1594 1136 284 59 14 chr5 132267660 132268014 -20269245 - MTD LTR MaLR -37 382 13 6 1594 310 265 29 58 chr5 132272738 132272842 -20264417 + RMER15 LTR ERVL 422 522 -53 6 1594 700 242 130 31 chr5 132280803 132280995 -20256264 + MTD LTR MaLR 103 313 -106 6 1594 313 250 36 99 chr5 132294246 132294357 -20242902 + RMER15 LTR ERVL 359 462 -113 7 1594 2304 71 45 10 chr5 132294590 132294902 -20242357 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 7 1594 484 264 216 82 chr5 132298617 132298885 -20238374 + MTE2a LTR MaLR 52 355 -24 7 1594 1001 246 114 57 chr5 132299184 132299516 -20237743 - MTEa LTR MaLR -5 374 24 7 1594 1322 239 108 46 chr5 132304324 132304741 -20232518 + RMER5 LTR ERV1 92 534 0 7 1594 1111 271 113 27 chr5 132307940 132308312 -20228947 + MTD LTR MaLR 4 407 -12 7 1594 1913 148 13 12 chr5 132310300 132310703 -20226556 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 1 7 1594 1417 263 50 3 chr5 132316610 132316972 -20220287 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 7 1594 586 240 123 29 chr5 132317777 132318036 -20219223 + MTD LTR MaLR 89 405 -14 7 1594 569 236 160 50 chr5 132322951 132323170 -20214089 - MTD LTR MaLR -12 407 165 7 1594 665 265 28 6 chr5 132333102 132333284 -20203975 + MTE2b LTR MaLR 3 188 -191 8 1594 372 264 146 23 chr5 132333651 132333822 -20203437 + MTE2b LTR MaLR 174 365 -14 8 1594 980 264 71 76 chr5 132352395 132352776 -20184483 - MTD LTR MaLR -31 388 10 8 1594 540 336 26 113 chr5 132353270 132353651 -20183608 + MTE2a LTR MaLR 17 376 -43 8 1594 597 272 81 64 chr5 132355638 132355954 -20181305 - MTD LTR MaLR 0 379 24 8 1594 935 265 59 125 chr5 132359245 132359693 -20177566 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 8 1594 794 235 91 75 chr5 132360275 132360583 -20176676 + MTE2b LTR MaLR 67 379 0 8 1594 5717 180 163 8 chr5 132361829 132363132 -20174127 + ORR1B1-int LTR MaLR 5 1509 0 8 1594 1976 155 112 8 chr5 132363132 132363489 -20173770 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 1594 349 269 19 28 chr5 132364627 132364734 -20172525 - MTD LTR MaLR -27 392 287 8 1594 288 263 254 0 chr5 132364754 132364868 -20172391 - MTD LTR MaLR -230 189 47 8 1594 719 236 101 6 chr5 132371645 132371824 -20165435 + MTE2a LTR MaLR 92 287 -92 8 1595 1391 208 91 20 chr5 132383245 132383598 -20153661 + MTD LTR MaLR 40 417 -2 9 1595 1472 214 132 5 chr5 132383794 132384166 -20153093 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1595 610 264 16 36 chr5 132387399 132387592 -20149667 + RLTR14 LTR ERV1 1 189 -193 9 1595 361 285 0 58 chr5 132387741 132387879 -20149380 + MLT1A0 LTR MaLR 34 163 -202 9 1595 270 361 16 0 chr5 132387905 132388027 -20149232 + MLT1A0 LTR MaLR 232 355 -10 9 1595 1303 191 238 26 chr5 132398038 132398382 -20138877 - MTC LTR MaLR -4 417 1 9 1595 846 308 81 25 chr5 132407742 132408138 -20129121 - MTD LTR MaLR 0 419 2 9 1595 3213 52 32 0 chr5 132410419 132410823 -20126436 + BGLII LTR ERVK 5 421 0 9 1595 237 247 255 11 chr5 132412827 132412921 -20124338 + MTEa LTR MaLR 1 117 -262 9 1595 831 257 196 8 chr5 132416632 132416989 -20120270 + MTD LTR MaLR 1 398 -21 9 1595 928 258 49 35 chr5 132425987 132426352 -20110907 - MTD LTR MaLR -23 396 35 1 1595 2100 89 79 0 chr5 132428615 132428918 -20108341 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1595 1293 144 66 35 chr5 132429683 132429941 -20107318 + MTC LTR MaLR 1 266 -155 1 1595 2242 230 9 25 chr5 132429937 132430494 -20106765 + MTC-int LTR MaLR 711 1258 0 1 1595 2105 188 50 0 chr5 132430494 132430893 -20106366 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 1 1595 470 294 48 28 chr5 132432056 132432308 -20104951 + RMER5 LTR ERV1 3 259 -275 1 1595 307 253 21 21 chr5 132432607 132432700 -20104559 + RMER5 LTR ERV1 393 485 -49 1 1595 525 226 0 25 chr5 132433610 132433728 -20103531 + RMER5 LTR ERV1 410 524 -10 1 1595 240 233 0 0 chr5 132434081 132434124 -20103135 + ORR1E LTR MaLR 56 98 -261 1 1595 227 253 67 0 chr5 132434125 132434200 -20103059 + ORR1E LTR MaLR 218 297 -62 1 1595 2359 179 7 12 chr5 132437006 132437429 -20099830 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1595 475 282 170 44 chr5 132437610 132437881 -20099378 - MTD LTR MaLR -80 339 35 1 1595 1033 184 256 10 chr5 132442222 132442519 -20094740 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 1 1595 1023 295 43 58 chr5 132444954 132445181 -20092078 + RLTR12B LTR ERVK 47 261 -267 1 1595 1023 295 43 58 chr5 132445291 132445509 -20091750 + RLTR12B LTR ERVK 262 485 -43 1 1595 247 270 70 26 chr5 132445511 132445625 -20091634 + RLTR12B LTR ERVK 367 485 -43 1 1595 2163 151 89 3 chr5 132446459 132446818 -20090441 + ORR1B1 LTR MaLR 1 390 -4 1 1595 977 298 40 30 chr5 132452680 132453081 -20084178 + MTE2a LTR MaLR 7 419 0 1 1595 791 283 40 69 chr5 132456336 132456613 -20080646 - MTE2a LTR MaLR -15 364 96 1 1595 457 281 144 25 chr5 132457077 132457278 -20079981 + RMER15 LTR ERVL 336 560 -15 1 1595 225 218 138 106 chr5 132458615 132458738 -20078521 - MER72B LTR ERV1 -36 732 606 1 1595 814 272 17 122 chr5 132460495 132460855 -20076404 - MTEa LTR MaLR -54 325 4 1 1595 307 258 96 73 chr5 132464770 132464902 -20072357 + MER34A1 LTR ERV1 440 584 -3 1 1595 2415 151 75 18 chr5 132465585 132465983 -20071276 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1595 817 237 105 102 chr5 132472550 132472903 -20064356 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 31 1 1595 1088 237 88 86 chr5 132482265 132482662 -20054597 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 1 1595 415 229 110 17 chr5 132483132 132483336 -20053923 - RMER17C LTR ERVK -47 363 1 1 1595 734 310 138 26 chr5 132485436 132485784 -20051475 + MTD LTR MaLR 13 399 -20 1 1595 847 287 27 145 chr5 132491977 132492384 -20044875 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1595 371 322 17 104 chr5 132500225 132500571 -20036688 - ORR1E LTR MaLR -42 317 2 2 1595 488 305 66 0 chr5 132508655 132508806 -20028453 - ORR1E LTR MaLR -7 372 212 1 1595 496 229 9 0 chr5 132508842 132508951 -20028308 - ORR1E LTR MaLR -243 116 7 1 1595 738 315 103 27 chr5 132511647 132512094 -20025165 + RMER5 LTR ERV1 54 534 0 2 1596 955 225 259 14 chr5 132514692 132514989 -20022270 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1596 1157 208 177 37 chr5 132520165 132520515 -20016744 + MTD LTR MaLR 7 405 -14 4 1596 1264 199 87 68 chr5 132522694 132523060 -20014199 + ORR1C2 LTR MaLR 12 384 0 5 1596 696 247 51 6 chr5 132529350 132529525 -20007734 + MTEa LTR MaLR 1 183 -196 7 1596 1989 194 64 4 chr5 132529814 132530264 -20006995 + RLTR11A LTR ERVK 50 526 -2 7 1596 867 257 107 16 chr5 132530619 132531062 -20006197 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 48 7 1596 878 321 58 17 chr5 132532326 132532671 -20004588 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 7 1596 615 322 28 28 chr5 132541491 132541740 -19995519 - MTD LTR MaLR -145 274 26 9 1596 4664 98 45 31 chr5 132541842 132541978 -19995281 + RMER17A LTR ERVK 1 136 -615 9 1596 4664 98 45 31 chr5 132541998 132542602 -19994657 + RMER17A LTR ERVK 137 750 -1 9 1596 265 169 25 25 chr5 132545210 132545289 -19991970 + MTEa LTR MaLR 301 379 0 1 1596 666 285 119 63 chr5 132546080 132546365 -19990894 + MTE2a LTR MaLR 79 379 0 1 1596 391 282 121 47 chr5 132546561 132546897 -19990362 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 1 1596 818 251 197 13 chr5 132559070 132559385 -19977874 - MTEa LTR MaLR -3 376 4 1 1596 583 147 36 9 chr5 132563724 132563834 -19973425 + MTE2a LTR MaLR 267 379 0 1 1596 1303 285 8 23 chr5 132576802 132577187 -19960072 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1596 281 256 238 8 chr5 132583607 132583729 -19953530 + MTEa LTR MaLR 16 165 -214 1 1596 1083 210 88 27 chr5 132592464 132592758 -19944501 + MT2A LTR ERVL 3 314 -219 1 1596 1017 234 126 31 chr5 132611224 132611582 -19925677 + MTD LTR MaLR 15 406 -13 2 1596 275 148 91 80 chr5 132613408 132613496 -19923763 - MTD LTR MaLR -2 377 289 2 1596 383 204 124 160 chr5 132613715 132613884 -19923375 - MTD LTR MaLR -205 214 27 2 1596 225 218 209 38 chr5 132614036 132614141 -19923118 + RMER15 LTR ERVL 439 561 -14 2 1596 317 283 46 51 chr5 132616876 132617051 -19920208 + MTEa LTR MaLR 206 379 0 2 1596 1106 261 100 21 chr5 132624017 132624448 -19912811 - RMER5 LTR ERV1 0 534 70 2 1596 360 284 138 45 chr5 132624798 132625045 -19912214 + MT2A LTR ERVL 253 522 -11 2 1596 878 277 93 25 chr5 132626132 132626487 -19910772 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1596 497 269 77 113 chr5 132628380 132628707 -19908552 + MTE2a LTR MaLR 8 322 -57 2 1596 4516 166 106 17 chr5 132629132 132629966 -19907293 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 2 1596 414 369 0 0 chr5 132632531 132632699 -19904560 + MTE2b LTR MaLR 30 197 -182 2 1596 1153 243 88 12 chr5 132635376 132635717 -19901542 + MTEa LTR MaLR 11 377 -2 2 1596 911 248 101 140 chr5 132639730 132640166 -19897093 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1596 1376 219 170 80 chr5 132640166 132640372 -19896887 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 1022 2 1596 1376 219 170 80 chr5 132640413 132640830 -19896429 - MTD-int LTR MaLR -237 1021 579 2 1596 641 253 139 78 chr5 132642491 132642810 -19894449 + ORR1E LTR MaLR 5 370 0 2 199 572 253 59 94 chr5 132644635 132645030 -19892229 - MTE2a LTR MaLR -26 393 1 2 1597 932 296 34 8 chr5 132647452 132647717 -19889542 + MTE2b LTR MaLR 3 274 -105 2 1597 337 214 329 0 chr5 132647712 132647839 -19889420 + MTE2b LTR MaLR 211 378 -1 2 1597 4459 10 2 12 chr5 132651015 132651513 -19885746 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 1597 48404 15 6 1 chr5 132651513 132656844 -19880415 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 2 1597 362 167 46 35 chr5 132656844 132656931 -19880328 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 2 1597 321 0 0 0 chr5 132656931 132656969 -19880290 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 2 1597 4459 10 2 12 chr5 132656969 132657467 -19879792 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 1597 2053 173 58 2 chr5 132657600 132657995 -19879264 - MTC LTR MaLR -4 417 1 2 1597 1089 238 127 9 chr5 132664402 132664733 -19872526 + MTEa LTR MaLR 9 378 -1 3 1597 534 287 64 121 chr5 132666148 132666276 -19870983 + MTE2a LTR MaLR 45 183 -196 3 1597 1827 178 78 16 chr5 132666276 132666659 -19870600 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1597 534 287 64 121 chr5 132666659 132666827 -19870432 + MTE2a LTR MaLR 184 324 -55 3 1597 815 306 51 16 chr5 132672079 132672454 -19864805 - MTD LTR MaLR 0 419 32 3 1597 963 258 78 19 chr5 132672920 132673173 -19864086 - ORR1E LTR MaLR 0 359 87 3 1597 963 258 78 19 chr5 132673227 132673293 -19863966 - ORR1E LTR MaLR -273 86 21 3 1597 544 320 116 39 chr5 132675348 132675729 -19861530 - MTD LTR MaLR 0 419 10 3 1597 643 246 148 33 chr5 132681108 132681405 -19855854 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 3 1597 382 283 166 4 chr5 132688282 132688574 -19848685 - RMER15-int LTR ERVL -3344 1655 1317 3 1597 279 308 0 0 chr5 132688606 132688697 -19848562 - RMER15-int LTR ERVL -3750 1249 1159 3 1597 1172 316 168 16 chr5 132688809 132689506 -19847753 - RMER15-int LTR ERVL -3996 1003 201 3 1597 314 338 61 0 chr5 132689698 132689846 -19847413 - RMER15 LTR ERVL -15 560 404 3 1597 258 258 109 40 chr5 132702426 132702527 -19834732 + MTE2a LTR MaLR 3 110 -269 3 1597 707 293 43 130 chr5 132713439 132713831 -19823428 + MTE2a LTR MaLR 1 358 -21 4 1597 471 304 29 13 chr5 132715609 132715857 -19821402 + MTE2a LTR MaLR 63 365 -14 4 1597 444 282 49 49 chr5 132720524 132720707 -19816552 - RMER15 LTR ERVL -46 529 347 4 1597 412 326 159 9 chr5 132737011 132737293 -19799966 + MLT1A0 LTR MaLR 6 341 -33 4 1597 1470 220 177 82 chr5 132739130 132739571 -19797688 + MT2A LTR ERVL 1 488 -45 4 1597 1470 220 177 82 chr5 132739601 132739644 -19797615 + MT2A LTR ERVL 489 531 -2 4 1597 446 230 10 0 chr5 132740080 132740180 -19797079 + MER34A LTR ERV1 11 111 -460 4 1597 428 191 86 0 chr5 132740614 132740719 -19796540 + MER34A LTR ERV1 428 541 -1 4 1597 824 284 160 9 chr5 132741415 132741752 -19795507 - MTD LTR MaLR -14 405 18 4 1597 945 289 75 17 chr5 132745393 132745738 -19791521 - MTEa LTR MaLR -14 365 1 4 1597 273 301 64 48 chr5 132757721 132757940 -19779319 + MTE2a LTR MaLR 18 239 -180 4 1597 346 223 199 25 chr5 132758011 132758172 -19779087 + MTE2a LTR MaLR 189 377 -2 4 1597 313 172 47 0 chr5 132760251 132760315 -19776944 - MTE2a LTR MaLR 0 379 313 4 1597 378 305 30 6 chr5 132773780 132773945 -19763314 + RMER15 LTR ERVL 336 504 -71 5 1598 448 350 10 24 chr5 132779950 132780171 -19757088 + MTE2a LTR MaLR 3 194 -185 5 1598 514 271 53 0 chr5 132780601 132780752 -19756507 + MTE2a LTR MaLR 216 374 -5 5 1598 490 248 15 8 chr5 132782733 132782867 -19754392 - ORR1E LTR MaLR -224 135 1 5 1598 2526 170 40 9 chr5 132784498 132784949 -19752310 + RMER4A LTR ERVK 1 465 -1 5 1598 1263 270 12 32 chr5 132790874 132791211 -19746048 + ORR1E LTR MaLR 3 351 -28 5 1598 393 231 92 25 chr5 132795523 132795643 -19741616 + MTE2a LTR MaLR 160 287 -92 5 1598 236 331 118 41 chr5 132796009 132796204 -19741055 + RMER15 LTR ERVL 349 558 -17 5 1598 1501 169 111 15 chr5 132796631 132796956 -19740303 + ORR1B1 LTR MaLR 39 394 0 5 1598 812 219 113 105 chr5 132803867 132804239 -19733020 - MTE2a LTR MaLR 0 379 5 5 1598 1835 167 96 33 chr5 132804301 132804697 -19732562 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1598 1099 259 56 38 chr5 132813308 132813682 -19723577 + MTD LTR MaLR 10 405 -14 5 1598 226 241 244 25 chr5 132816311 132816430 -19720829 - MTC LTR MaLR -12 407 263 5 1598 261 163 20 0 chr5 132816432 132816481 -19720778 + MERVL-int LTR ERVL 4454 4503 -982 5 1598 277 351 29 15 chr5 132816489 132816625 -19720634 - MTC LTR MaLR -161 260 123 5 1598 338 272 71 8 chr5 132818426 132818552 -19718707 + MLT1F1 LTR MaLR 4 137 -432 5 1598 1175 245 103 29 chr5 132820127 132820468 -19716791 - MTE2b LTR MaLR -13 366 1 5 1598 722 262 53 135 chr5 132821450 132821843 -19715416 - MTE2a LTR MaLR -14 365 5 5 1598 468 301 38 7 chr5 132822574 132822742 -19714517 - MTE2a LTR MaLR -8 388 195 5 1598 1414 244 92 5 chr5 132824439 132824809 -19712450 + MTD LTR MaLR 18 419 0 6 1598 472 316 35 25 chr5 132839230 132839431 -19697828 + MTD LTR MaLR 3 205 -214 6 1598 5189 122 91 29 chr5 132839570 132840472 -19696787 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 6 1598 874 236 41 16 chr5 132842065 132842368 -19694891 - MTD LTR MaLR -1 373 57 6 1598 255 246 49 0 chr5 132842403 132842464 -19694795 + ORR1D2 LTR MaLR 26 89 -270 6 1598 675 207 292 17 chr5 132842555 132842791 -19694468 + ORR1D2 LTR MaLR 70 370 0 6 1598 350 305 67 79 chr5 132845894 132846058 -19691201 - MTE2a LTR MaLR -89 290 129 6 1598 938 158 194 33 chr5 132878770 132879012 -19658247 + RMER10B LTR ERVL 5 285 -113 6 1598 1588 162 98 53 chr5 132884045 132884422 -19652837 - RMER10B LTR ERVL 0 398 5 7 1598 435 281 68 7 chr5 132894617 132894764 -19642495 - RMER15 LTR ERVL -77 498 343 7 1598 502 261 152 98 chr5 132899385 132899776 -19637483 - MTC LTR MaLR -17 404 6 7 1598 938 243 14 36 chr5 132901826 132902048 -19635211 + ORR1E LTR MaLR 6 222 -137 7 1599 2316 129 33 11 chr5 132908987 132909346 -19627913 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 1599 226 278 87 94 chr5 132909705 132909832 -19627427 + ORR1D-int LTR MaLR 1017 1142 -228 7 1599 2176 152 61 3 chr5 132912295 132912657 -19624602 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 3 7 1599 1372 225 130 17 chr5 132913438 132913799 -19623460 + MTD LTR MaLR 18 419 0 7 1599 330 293 37 74 chr5 132917080 132917242 -19620017 + MLT1B LTR MaLR 4 159 -231 7 1599 3730 23 0 0 chr5 132923369 132923763 -19613496 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 7 1599 540 279 65 153 chr5 132925164 132925742 -19611517 + RMER20B LTR ERVK 30 601 -259 7 1599 239 307 0 83 chr5 132926007 132926103 -19611156 + MTE2b LTR MaLR 238 325 -54 7 1599 947 267 34 79 chr5 132940615 132940969 -19596290 - MTE2a LTR MaLR -41 338 1 8 1599 770 264 50 131 chr5 132944093 132944489 -19592770 + MTE2a LTR MaLR 2 365 -14 8 1599 1138 272 105 8 chr5 132944753 132945105 -19592154 + MTD LTR MaLR 20 405 -14 8 1599 515 280 88 86 chr5 132964453 132964930 -19572329 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 478 -49 8 1599 254 303 144 11 chr5 132971862 132972049 -19565210 - RMER15 LTR ERVL -17 558 347 8 1599 2126 157 42 32 chr5 132972457 132972866 -19564393 - MTC LTR MaLR -8 413 1 8 1599 515 314 47 19 chr5 132974482 132974696 -19562563 + RMER15 LTR ERVL 356 575 0 8 1599 1039 280 89 11 chr5 132974757 132975115 -19562144 - MTD LTR MaLR -33 386 1 8 1599 372 284 117 36 chr5 132975251 132975474 -19561785 + MLT1C LTR MaLR 227 467 0 8 1599 1022 253 33 81 chr5 132978627 132979007 -19558252 - MLT1A LTR MaLR -14 453 1 8 1599 675 247 100 62 chr5 132980768 132981069 -19556190 - MTD LTR MaLR -15 404 113 8 1599 675 251 119 81 chr5 132981147 132981246 -19556013 - MTD LTR MaLR -307 112 6 8 1599 1587 219 72 18 chr5 132986483 132986873 -19550386 - MTD LTR MaLR -8 411 1 8 1599 602 279 26 103 chr5 133006095 133006327 -19530932 + MTE2a LTR MaLR 123 336 -43 1 1599 322 184 40 44 chr5 133006306 133006437 -19530822 + MTE2a LTR MaLR 286 419 0 1 1599 274 163 0 144 chr5 133014187 133014402 -19522857 - RMER17C LTR ERVK -136 274 91 2 1599 1151 226 115 38 chr5 133021580 133021953 -19515306 - MTD LTR MaLR 0 419 18 3 1599 1659 210 112 18 chr5 133023341 133023724 -19513535 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1599 247 236 20 101 chr5 133027665 133027764 -19509495 - MT2B LTR ERVL -354 247 157 5 1599 1722 143 84 3 chr5 133036070 133036392 -19500867 + ORR1B1 LTR MaLR 39 386 -8 8 1600 650 279 27 32 chr5 133039108 133039289 -19497970 + MTEb LTR MaLR 1 180 -199 9 1600 1308 186 128 119 chr5 133039402 133040005 -19497254 + RMER6D LTR ERVK 113 720 0 9 1600 907 209 23 28 chr5 133040202 133040418 -19496841 + MTEb LTR MaLR 162 376 -3 9 1600 1009 249 37 140 chr5 133041907 133042308 -19494951 - MTE2a LTR MaLR -9 370 11 1 1600 3019 70 39 0 chr5 133048641 133049026 -19488233 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1600 399 204 0 215 chr5 133049186 133049330 -19487929 + MTE2a LTR MaLR 1 113 -266 1 1600 1949 106 16 86 chr5 133049337 133049709 -19487550 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 1 1600 870 212 23 80 chr5 133049723 133049985 -19487274 + MTE2a LTR MaLR 133 379 0 1 1600 304 289 28 19 chr5 133051367 133051473 -19485786 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 324 1 1600 2342 77 6 110 chr5 133054103 133054468 -19482791 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1600 2205 72 3 62 chr5 133056726 133057065 -19480194 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1600 788 262 82 49 chr5 133057411 133057656 -19479603 + ORR1D2 LTR MaLR 5 257 -113 1 1600 399 294 42 0 chr5 133058604 133058723 -19478536 + ORR1D2 LTR MaLR 243 366 -4 1 1600 757 185 13 7 chr5 133063553 133063705 -19473554 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 490 1 1600 2142 158 19 28 chr5 133063730 133064159 -19473100 - RLTR26 LTR ERVK -217 425 1 1 1600 592 266 0 0 chr5 133071961 133072089 -19465170 + MTEa LTR MaLR 3 130 -249 1 1600 764 289 55 58 chr5 133072259 133072589 -19464670 - ORR1E LTR MaLR -2 357 29 1 1600 4045 102 33 41 chr5 133073767 133074373 -19462886 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 2 1600 433 247 0 0 chr5 133075030 133075127 -19462132 - MTE2b LTR MaLR -265 114 18 2 1600 361 239 0 89 chr5 133075219 133075320 -19461939 + MTEa LTR MaLR 1 92 -287 2 1600 276 253 128 61 chr5 133075410 133075574 -19461685 + MTEa LTR MaLR 116 290 -69 2 1600 3588 20 0 0 chr5 133081316 133081712 -19455547 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1600 820 284 64 60 chr5 133084389 133084764 -19452495 + MTD LTR MaLR 10 405 -14 2 1600 604 277 101 53 chr5 133091408 133091857 -19445402 + RMER13A LTR ERVK 95 622 -286 2 1600 1782 154 103 29 chr5 133092535 133092883 -19444376 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1600 774 282 67 56 chr5 133093673 133094048 -19443211 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 2 1600 2396 164 27 10 chr5 133094298 133094710 -19442549 - MTC LTR MaLR -2 419 1 2 1600 300 227 133 10 chr5 133100097 133100195 -19437064 + MER34 LTR ERV1 433 542 0 2 1600 1167 236 52 82 chr5 133100247 133100276 -19436983 + MTE2a LTR MaLR 4 31 -348 2 1600 2504 151 7 15 chr5 133100276 133100686 -19436573 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1600 1167 236 52 82 chr5 133100686 133100720 -19436539 + MTE2a LTR MaLR 32 60 -319 2 1600 2177 138 10 69 chr5 133100720 133101109 -19436150 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 2 1600 1167 236 52 82 chr5 133101109 133101432 -19435827 + MTE2a LTR MaLR 61 378 -1 2 1600 1921 210 16 0 chr5 133104925 133105296 -19431963 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 3 1600 2099 127 57 27 chr5 133105678 133106049 -19431210 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 5 3 1600 1765 150 71 29 chr5 133106526 133106877 -19430382 + ORR1C1 LTR MaLR 1 366 -12 3 1600 506 280 227 23 chr5 133106895 133107155 -19430104 + MTD LTR MaLR 5 317 -102 3 1600 1471 236 34 45 chr5 133108096 133108291 -19428968 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 169 3 1600 1471 236 34 45 chr5 133108422 133108508 -19428751 - ORR1D1 LTR MaLR -206 168 87 3 1600 1471 236 34 45 chr5 133108712 133108807 -19428452 - ORR1D1 LTR MaLR -288 86 1 3 1600 2329 111 46 3 chr5 133110219 133110589 -19426670 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 1600 302 280 190 0 chr5 133110715 133110815 -19426444 + MTEa LTR MaLR 51 169 -210 3 1600 456 227 25 8 chr5 133111469 133111589 -19425670 - MTD LTR MaLR 0 419 298 3 1600 734 254 15 15 chr5 133111609 133111817 -19425442 - MTD LTR MaLR -190 189 13 3 1600 905 233 121 40 chr5 133111836 133112207 -19425052 - MTD-int LTR MaLR -7 1251 851 3 1600 349 268 208 73 chr5 133113323 133113476 -19423783 + ORR1E LTR MaLR 8 204 -155 3 1600 2142 209 95 59 chr5 133113476 133114066 -19423193 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 1600 349 268 208 73 chr5 133114066 133114186 -19423073 + ORR1E LTR MaLR 205 317 -42 3 1600 490 373 38 66 chr5 133116668 133117139 -19420120 - MT2A LTR ERVL -74 459 2 3 1600 424 340 47 0 chr5 133117838 133117988 -19419271 - MTEb LTR MaLR -2 377 221 3 1600 309 206 112 61 chr5 133118716 133118814 -19418445 - MT2B LTR ERVL -323 278 176 3 1600 729 304 3 97 chr5 133120465 133120753 -19416506 - ORR1E LTR MaLR -38 321 61 3 1600 1832 205 16 5 chr5 133128753 133129125 -19408134 + MTEb LTR MaLR 4 379 0 3 1600 498 293 56 77 chr5 133131749 133131982 -19405277 - RMER15 LTR ERVL 0 575 348 3 1600 311 268 10 0 chr5 133132388 133132485 -19404774 + MLT2B3 LTR ERVL 3 100 -454 3 1600 347 311 49 128 chr5 133132764 133133070 -19404189 + ORR1E LTR MaLR 72 353 -6 3 1600 448 260 11 66 chr5 133133585 133133766 -19403493 + RMER15 LTR ERVL 336 506 -69 3 1600 1869 130 19 82 chr5 133133837 133134215 -19403044 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 3 1600 1613 228 22 17 chr5 133134215 133134576 -19402683 - MTD LTR MaLR -56 363 1 3 1600 671 234 12 127 chr5 133140533 133140792 -19396467 - RMER15 LTR ERVL -11 564 336 4 1600 320 272 30 36 chr5 133143990 133144130 -19393129 - MLT1A0 LTR MaLR -17 348 228 4 1600 791 280 59 44 chr5 133144120 133144393 -19392866 + MTEb LTR MaLR 100 376 -3 4 1600 490 245 66 33 chr5 133144961 133145188 -19392071 + ORR1E LTR MaLR 1 242 -128 4 1600 225 264 0 130 chr5 133147260 133147360 -19389899 + MLT1A1 LTR MaLR 16 102 -272 4 1600 299 264 0 103 chr5 133148046 133148143 -19389116 - MTEa LTR MaLR -289 90 4 4 1600 236 290 42 31 chr5 133148237 133148333 -19388926 + MLT1A1 LTR MaLR 311 407 -1 4 1600 365 331 38 38 chr5 133148466 133148733 -19388526 + RLTR42-int LTR ERVK 1139 1405 -4117 4 1600 881 256 55 8 chr5 133151895 133152131 -19385128 + MT2A LTR ERVL 268 514 -19 4 1600 298 315 47 40 chr5 133152825 133152974 -19384285 - MTEa LTR MaLR -118 261 112 4 1600 2215 204 18 8 chr5 133155482 133155980 -19381279 + RLTR11A2 LTR ERVK 4 506 -21 4 1600 1344 217 70 50 chr5 133163722 133164081 -19373178 - MTEa LTR MaLR -13 366 1 4 1600 388 354 91 49 chr5 133164954 133165340 -19371919 - LTR33A_ LTR ERVL -65 466 65 4 1600 1724 137 24 7 chr5 133165471 133165766 -19371493 + ORR1B1 LTR MaLR 1 300 -94 4 1600 2619 123 43 20 chr5 133165847 133166245 -19371014 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1600 597 272 139 77 chr5 133168350 133168673 -19368586 + ORR1E LTR MaLR 1 343 -16 4 1600 1676 186 96 26 chr5 133168680 133169023 -19368236 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 4 1601 934 227 285 0 chr5 133170103 133170398 -19366861 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 4 1601 2379 152 6 147 chr5 133170624 133171140 -19366119 - RLTR41 LTR ERV1 -3 443 1 4 1601 3217 61 5 0 chr5 133171251 133171647 -19365612 - MTB LTR MaLR -2 398 1 4 1601 2262 130 47 3 chr5 133176790 133177152 -19360107 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 5 1601 2267 156 220 7 chr5 133177197 133177754 -19359505 - RLTR17 LTR ERVK -16 676 1 5 1601 1036 235 52 10 chr5 133177798 133178086 -19359173 + RMER15 LTR ERVL 276 575 0 5 1601 834 266 90 31 chr5 133180865 133181121 -19356138 - MTD LTR MaLR -146 273 3 5 1601 1114 259 48 60 chr5 133181378 133181797 -19355462 - BGLII_B LTR ERVK -27 414 1 5 1601 316 200 316 17 chr5 133185556 133185673 -19351586 - MTEb LTR MaLR 0 379 228 5 1601 334 295 26 103 chr5 133185930 133186085 -19351174 + MTD LTR MaLR 37 179 -242 5 1601 471 234 46 46 chr5 133186098 133186269 -19350990 + MTD LTR MaLR 199 419 0 5 1601 752 302 60 23 chr5 133187163 133187465 -19349794 - RMER15 LTR ERVL -18 557 245 5 1601 320 256 32 71 chr5 133187504 133187630 -19349629 - RMER15 LTR ERVL -454 121 1 5 1601 580 283 93 48 chr5 133187633 133187945 -19349314 - ORR1E LTR MaLR -19 340 15 5 1601 950 265 119 10 chr5 133189797 133190091 -19347168 + MTD LTR MaLR 4 329 -90 5 1601 389 311 87 67 chr5 133195155 133195600 -19341659 + MLT1F LTR MaLR 11 496 -52 5 1601 232 304 61 61 chr5 133196329 133196427 -19340832 + MLT1A1 LTR MaLR 24 121 -287 5 1601 387 306 8 32 chr5 133197882 133198007 -19339252 - RMER20B LTR ERVK -24 603 482 5 1601 269 281 12 24 chr5 133198295 133198379 -19338880 - RLTR26 LTR ERVK -368 274 192 5 1601 1102 255 35 10 chr5 133199701 133199990 -19337269 + MTEb LTR MaLR 84 379 0 5 1601 382 222 212 0 chr5 133201703 133201802 -19335457 + MER57D LTR ERV1 6 125 -286 5 1601 914 265 55 110 chr5 133201835 133202234 -19335025 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 5 1601 391 319 43 16 chr5 133203357 133203545 -19333714 - ORR1E LTR MaLR -166 193 1 6 1601 1671 178 124 165 chr5 133212717 133212902 -19324357 - RMER20B LTR ERVK -24 603 461 6 1601 1671 178 124 165 chr5 133213079 133213101 -19324158 - RMER20B LTR ERVK -167 460 460 6 1601 1671 178 124 165 chr5 133213281 133213691 -19323568 - RMER20B LTR ERVK -167 460 10 6 1601 1875 120 32 3 chr5 133213808 133214117 -19323142 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 6 1601 917 254 61 97 chr5 133215466 133215859 -19321400 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 6 1601 906 240 60 71 chr5 133219604 133219947 -19317312 - MTE2a LTR MaLR -44 375 25 6 1601 1256 226 84 18 chr5 133219951 133220294 -19316965 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 6 1601 1061 258 110 27 chr5 133221317 133221691 -19315568 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1601 916 246 60 148 chr5 133228987 133229387 -19307872 - MTE2a LTR MaLR -14 365 1 6 1601 4913 107 52 24 chr5 133229903 133230243 -19307016 + RMER17D2 LTR ERVK 1 353 -456 6 1601 4913 107 52 24 chr5 133230509 133230954 -19306305 + RMER17D2 LTR ERVK 354 808 -1 6 1601 526 251 79 35 chr5 133236563 133236765 -19300494 + RLTR42-int LTR ERVK 1190 1400 -4122 6 1601 269 262 82 12 chr5 133238327 133238412 -19298847 + ORR1E LTR MaLR 1 91 -288 6 1601 378 256 112 37 chr5 133238502 133238750 -19298509 + ORR1E LTR MaLR 97 379 0 6 1601 988 289 30 60 chr5 133240923 133241291 -19295968 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 6 1601 385 293 128 29 chr5 133245304 133245550 -19291709 - MLT2B4 LTR ERVL -74 482 157 6 1601 313 259 40 112 chr5 133245566 133245825 -19291434 - MTEb LTR MaLR -15 364 95 6 1601 4323 97 0 48 chr5 133245976 133246607 -19290652 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 1601 278 238 23 35 chr5 133247367 133247454 -19289805 - MLT2B4 LTR ERVL -422 134 49 6 1601 1069 253 189 5 chr5 133247607 133247993 -19289266 + MTE2b-int LTR MaLR 1124 1580 0 7 1601 1072 255 102 33 chr5 133247993 133248297 -19288962 + MTE2b LTR MaLR 1 325 -54 7 1601 2202 203 22 174 chr5 133248429 133249149 -19288110 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 7 1601 342 349 57 60 chr5 133251686 133251914 -19285345 - MLT1D LTR MaLR -170 335 107 7 1601 342 349 57 60 chr5 133252133 133252169 -19285090 - MLT1D LTR MaLR -399 106 72 7 1601 237 276 24 106 chr5 133255656 133255741 -19281518 - MTEa LTR MaLR -280 99 22 7 1601 1410 254 54 25 chr5 133255935 133256260 -19280999 - MTE2b LTR MaLR 0 379 43 7 1601 1410 254 54 25 chr5 133256488 133256530 -19280729 - MTE2b LTR MaLR -337 42 1 7 1601 1099 280 78 23 chr5 133257684 133258028 -19279231 + MTEb LTR MaLR 15 377 -2 7 1601 306 247 20 51 chr5 133259113 133259211 -19278048 - MLT1A LTR MaLR -27 338 244 7 1601 335 280 11 0 chr5 133259984 133260075 -19277184 - MLT1A LTR MaLR -296 112 21 7 1601 935 241 123 38 chr5 133262411 133262752 -19274507 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 7 1601 532 361 0 28 chr5 133264330 133264541 -19272718 - RMER15 LTR ERVL -47 528 324 7 1601 625 254 65 202 chr5 133267685 133268100 -19269159 + MTE2b LTR MaLR 4 361 -18 7 1601 792 228 130 61 chr5 133272421 133272683 -19264576 - MTC LTR MaLR 0 419 149 7 1601 1922 138 86 3 chr5 133272697 133273047 -19264212 + ORR1B1 LTR MaLR 16 394 0 7 1601 1257 230 95 7 chr5 133273366 133273672 -19263587 - MTEa LTR MaLR -11 368 36 7 1601 1240 255 8 60 chr5 133274864 133275244 -19262015 + MTE2a LTR MaLR 5 364 -15 7 1601 286 302 85 17 chr5 133277811 133277929 -19259330 - MTD LTR MaLR -1 418 293 7 1601 282 266 49 99 chr5 133277914 133278056 -19259203 - MTD LTR MaLR -40 339 205 7 1601 735 288 25 50 chr5 133278050 133278331 -19258928 - ORR1E LTR MaLR -85 274 1 7 1601 356 277 29 53 chr5 133279213 133279433 -19257826 - MTEa LTR MaLR -2 377 155 7 1601 246 320 92 46 chr5 133279452 133279583 -19257676 + MTE2a LTR MaLR 1 137 -242 7 1601 701 320 51 55 chr5 133279554 133279689 -19257570 + MT2A LTR ERVL 108 243 -290 7 1601 701 320 51 55 chr5 133279727 133279902 -19257357 + MT2A LTR ERVL 244 417 -116 7 1601 284 300 44 11 chr5 133279921 133280012 -19257247 + MT2A LTR ERVL 348 441 -92 7 1601 804 282 105 56 chr5 133286245 133286615 -19250644 - MTE2a LTR MaLR -16 403 30 8 1601 820 220 206 16 chr5 133286615 133286925 -19250334 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 8 1601 509 308 113 53 chr5 133286925 133286952 -19250307 - MTE2a LTR MaLR -390 29 1 8 1601 955 236 83 114 chr5 133287705 133288190 -19249069 + RMER13A LTR ERVK 1 519 -389 8 1601 265 122 0 0 chr5 133289930 133289971 -19247288 + MER21B LTR ERV1 276 316 -547 8 1601 340 317 50 8 chr5 133290422 133290543 -19246716 + ORR1E LTR MaLR 1 126 -233 8 1601 1056 300 43 26 chr5 133290542 133290960 -19246299 + MER21B LTR ERV1 375 799 -64 8 1601 1392 254 39 14 chr5 133291801 133292160 -19245099 - MTE2a LTR MaLR -11 368 1 8 1601 705 272 113 37 chr5 133292569 133292924 -19244335 + MTD LTR MaLR 10 391 -28 8 1601 1075 247 94 60 chr5 133293945 133294328 -19242931 + MTD LTR MaLR 10 405 -14 8 1601 854 248 60 170 chr5 133295958 133295996 -19241263 + RMER5 LTR ERV1 33 64 -470 8 1601 854 248 60 170 chr5 133296143 133296658 -19240601 + RMER5 LTR ERV1 65 525 -9 8 1601 255 298 71 12 chr5 133298981 133299066 -19238193 + MLT1A LTR MaLR 6 95 -279 8 1601 1684 192 78 19 chr5 133299486 133299858 -19237401 + MTD LTR MaLR 18 411 -8 8 1602 2286 119 14 3 chr5 133300594 133300949 -19236310 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 8 1602 732 221 112 26 chr5 133304317 133304650 -19232609 - MT2A LTR ERVL -7 594 92 8 1602 225 265 0 0 chr5 133304650 133304699 -19232560 - MT2A LTR ERVL -407 126 78 8 1602 276 259 0 133 chr5 133304690 133304788 -19232471 + MT2B LTR ERVL 154 238 -363 8 1602 512 167 0 0 chr5 133304872 133304956 -19232303 - MT2A LTR ERVL -449 84 1 8 1602 1061 204 245 47 chr5 133305004 133305473 -19231786 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 2 8 1602 1736 177 11 81 chr5 133306343 133306724 -19230535 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 8 1602 482 194 0 30 chr5 133310138 133310239 -19227020 - MTEb LTR MaLR -20 359 262 8 1602 3510 18 5 0 chr5 133316252 133316646 -19220613 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1602 1127 264 51 51 chr5 133316725 133317076 -19220183 - ORR1E LTR MaLR -8 351 1 9 1602 1605 165 148 15 chr5 133319925 133320091 -19217168 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 209 9 1602 1605 165 148 15 chr5 133320183 133320344 -19216915 - ORR1C2 LTR MaLR -193 191 4 9 1602 1191 215 27 145 chr5 133320614 133321027 -19216232 - MTE2a LTR MaLR -15 364 1 9 1602 676 254 72 5 chr5 133321610 133321804 -19215455 - MLT1G3 LTR MaLR 0 595 389 9 1602 1002 237 141 24 chr5 133327413 133327522 -19209737 - ORR1D1 LTR MaLR -89 285 181 9 1602 1002 237 141 24 chr5 133327688 133327833 -19209426 - ORR1D1 LTR MaLR -194 180 1 9 1602 1242 227 158 45 chr5 133328621 133328753 -19208506 + ORR1D1 LTR MaLR 1 177 -197 9 1602 1242 227 158 45 chr5 133328821 133329024 -19208235 + ORR1D1 LTR MaLR 178 374 0 9 1602 2172 133 15 12 chr5 133329543 133329869 -19207390 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1602 1207 251 58 39 chr5 133330351 133330712 -19206547 - MTEa LTR MaLR -11 368 1 9 1602 820 274 13 24 chr5 133332687 133332956 -19204303 + MTD LTR MaLR 36 287 -120 9 1602 1566 244 94 73 chr5 133333022 133333291 -19203968 + RMER15 LTR ERVL 27 330 -245 9 1602 1566 244 94 73 chr5 133333441 133333480 -19203779 + RMER15 LTR ERVL 331 343 -232 9 1602 1566 244 94 73 chr5 133333529 133333741 -19203518 + RMER15 LTR ERVL 344 559 -16 9 1602 1343 249 94 33 chr5 133333808 133334202 -19203057 - MTD LTR MaLR 0 419 2 9 1602 669 292 37 32 chr5 133334284 133334547 -19202712 - ORR1E LTR MaLR -111 259 3 9 1602 413 364 62 12 chr5 133336880 133337136 -19200123 + RMER15 LTR ERVL 302 570 -5 9 1602 278 305 46 28 chr5 133341273 133341381 -19195878 + MLT1A1 LTR MaLR 21 130 -278 9 1602 1215 221 130 86 chr5 133341466 133341828 -19195431 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 9 1602 1963 121 22 81 chr5 133343875 133344245 -19193014 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 47 9 1602 633 290 75 81 chr5 133344260 133344594 -19192665 + ORR1E LTR MaLR 28 359 0 9 1602 2448 172 51 25 chr5 133347134 133347648 -19189611 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 9 1602 864 269 91 21 chr5 133348639 133348924 -19188335 - ORR1E LTR MaLR -52 307 3 9 1602 1196 243 81 20 chr5 133353306 133353651 -19183608 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 1 1602 255 274 11 77 chr5 133355517 133355608 -19181651 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 157 1 1602 323 253 10 44 chr5 133363424 133363550 -19173709 - MTEa LTR MaLR -7 372 253 1 1602 354 194 48 48 chr5 133364049 133364152 -19173107 + MTEb LTR MaLR 277 379 0 1 1602 1660 255 60 20 chr5 133365901 133366397 -19170862 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 1 1602 945 257 125 6 chr5 133367400 133367737 -19169522 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 1 1602 1389 127 244 13 chr5 133369401 133369713 -19167546 + ORR1B1 LTR MaLR 1 384 -10 1 1602 280 81 0 0 chr5 133370220 133370257 -19167002 - RLTR23 LTR ERV1 -393 37 1 1 1602 1453 192 42 13 chr5 133372103 133372409 -19164850 - MTD LTR MaLR -104 315 1 1 1602 2000 92 140 6 chr5 133376902 133377251 -19160008 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1602 2720 15 0 17 chr5 133377251 133377554 -19159705 - ORR1A0 LTR MaLR -49 297 1 1 1602 445 66 0 0 chr5 133377554 133377615 -19159644 + MTB LTR MaLR 347 407 0 1 1602 8245 63 14 20 chr5 133377615 133378720 -19158539 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1602 2814 64 72 5 chr5 133378720 133379095 -19158164 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1602 806 290 66 77 chr5 133385647 133386030 -19151229 + MTE2a LTR MaLR 6 401 -18 1 1602 1153 273 18 0 chr5 133386315 133386601 -19150658 - MTE2b LTR MaLR -88 291 1 1 1602 1113 212 74 18 chr5 133388652 133388935 -19148324 + MTE2b LTR MaLR 80 378 -1 1 1602 1002 234 113 90 chr5 133389462 133389825 -19147434 - MTE2b LTR MaLR -15 364 1 1 1602 902 213 147 59 chr5 133389920 133390099 -19147160 - RMER20B LTR ERVK -102 525 307 1 1602 902 213 147 59 chr5 133390429 133390569 -19146690 - RMER20B LTR ERVK -321 306 178 1 1602 723 245 199 29 chr5 133391326 133391633 -19145626 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 8 1 1602 290 265 12 35 chr5 133391690 133391776 -19145483 - MTEb LTR MaLR -1 378 295 1 1602 379 234 0 83 chr5 133392295 133392416 -19144843 - MLT1A1 LTR MaLR -278 130 20 1 1602 397 308 108 0 chr5 133392520 133392650 -19144609 - MTEb LTR MaLR -22 357 214 1 1602 666 249 47 114 chr5 133392672 133393180 -19144079 - RLTR11B LTR ERVK -22 431 1 1 1602 636 195 104 25 chr5 133393193 133393356 -19143903 - MTEb LTR MaLR -201 178 3 1 1602 1568 162 45 84 chr5 133393659 133394016 -19143243 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 52 1 1602 408 223 19 0 chr5 133399323 133399426 -19137833 - LTR33 LTR ERVL 0 515 411 1 1602 1923 132 3 6 chr5 133400049 133400361 -19136898 + ORR1B2 LTR MaLR 55 365 -2 1 1602 583 275 51 17 chr5 133405077 133405336 -19131923 - MTEa LTR MaLR -3 376 79 1 1602 765 19 87 0 chr5 133405331 133405435 -19131824 + MTA_Mm LTR MaLR 284 396 0 1 1602 576 294 37 45 chr5 133407491 133407733 -19129526 - RMER15 LTR ERVL 0 575 336 1 1602 427 271 9 0 chr5 133408295 133408402 -19128857 - ORR1E LTR MaLR -251 108 1 1 1602 2928 31 16 3 chr5 133408518 133408904 -19128355 + MTA_Mm LTR MaLR 1 391 -5 1 1602 400 248 17 34 chr5 133409831 133409948 -19127311 - MTEa LTR MaLR -16 363 249 1 1602 269 221 0 105 chr5 133411891 133411977 -19125282 - MTD LTR MaLR -8 371 295 1 1602 356 368 37 27 chr5 133412378 133412565 -19124694 - MTD LTR MaLR -226 193 5 1 1602 828 253 143 11 chr5 133414595 133414875 -19122384 + RMER15 LTR ERVL 259 575 0 1 1602 512 289 63 84 chr5 133416075 133416427 -19120832 + ORR1E LTR MaLR 7 368 -11 1 1602 973 192 39 5 chr5 133416915 133417119 -19120140 - MTEb LTR MaLR 0 379 169 1 1602 414 345 36 0 chr5 133421031 133421196 -19116063 + MLT2B3 LTR ERVL 372 542 -12 1 1602 488 242 83 26 chr5 133421207 133421443 -19115816 - MTEb LTR MaLR 0 379 123 1 1602 1124 245 119 30 chr5 133421764 133422126 -19115133 + MTD LTR MaLR 20 413 -6 1 1602 669 262 12 50 chr5 133422558 133422808 -19114451 - MTEa LTR MaLR 0 379 114 1 1602 394 237 10 0 chr5 133423009 133423106 -19114153 - MTEa LTR MaLR -261 98 1 1 1602 615 253 68 64 chr5 133423157 133423423 -19113836 + LTR37B LTR ERV1 198 464 -4 1 1602 752 318 72 58 chr5 133425800 133425936 -19111323 + MT2A LTR ERVL 10 142 -391 1 1602 752 318 72 58 chr5 133426097 133426407 -19110852 + MT2A LTR ERVL 143 462 -71 1 1602 437 284 0 0 chr5 133427963 133428069 -19109190 + MTEa LTR MaLR 10 115 -264 1 1602 280 275 146 76 chr5 133428069 133428254 -19109005 + RLTR25A LTR ERVK 1 198 -905 1 1602 1177 201 43 4 chr5 133429342 133429597 -19107662 + MTEa LTR MaLR 113 377 -2 1 1603 499 250 74 60 chr5 133432997 133433196 -19104063 - MTEb LTR MaLR 0 379 205 1 1603 256 308 13 0 chr5 133433522 133433600 -19103659 - MER21B LTR ERV1 -144 719 641 1 1603 922 325 51 18 chr5 133433742 133434131 -19103128 - MER21B LTR ERV1 -301 562 161 1 1603 601 237 12 160 chr5 133434397 133434653 -19102606 + MTE2a LTR MaLR 1 218 -161 1 1603 465 292 91 0 chr5 133434834 133434988 -19102271 + MTE2a LTR MaLR 198 365 -14 1 1603 532 250 181 25 chr5 133436534 133436772 -19100487 - RMER15 LTR ERVL 0 575 301 1 1603 230 248 75 120 chr5 133436831 133436964 -19100295 - RMER15 LTR ERVL -445 130 4 1 1603 568 359 45 61 chr5 133437019 133437378 -19099881 + ORR1E LTR MaLR 7 359 0 1 1603 229 221 60 83 chr5 133438259 133438343 -19098916 - MTEa LTR MaLR -13 366 285 1 1603 1398 201 17 32 chr5 133438508 133438786 -19098473 + RLTR20B2 LTR ERVK 180 455 -105 1 1603 1398 201 17 32 chr5 133439007 133439062 -19098197 + RLTR20B2 LTR ERVK 465 519 -41 1 1603 312 281 67 20 chr5 133446653 133446802 -19090457 + RMER15 LTR ERVL 403 558 -17 1 1603 326 219 186 10 chr5 133447935 133448032 -19089227 + MTD LTR MaLR 20 133 -226 1 1603 1938 182 29 22 chr5 133448900 133449310 -19087949 + MTD LTR MaLR 7 419 0 1 1603 433 168 86 12 chr5 133449316 133449422 -19087837 + MTD LTR MaLR 267 405 -14 1 1603 603 175 40 53 chr5 133451529 133451680 -19085579 + ORR1E LTR MaLR 2 150 -209 1 1603 289 248 94 68 chr5 133453047 133453164 -19084095 + ORR1E LTR MaLR 236 355 -24 1 1603 234 299 70 65 chr5 133453781 133454010 -19083249 - RMER17C LTR ERVK -44 366 137 1 1603 231 294 90 48 chr5 133455704 133455972 -19081287 + RMER17C LTR ERVK 67 345 -65 1 1603 1208 235 121 18 chr5 133456078 133456389 -19080870 - MTEa LTR MaLR 0 379 34 1 1603 1046 255 117 9 chr5 133456389 133456678 -19080581 + MTE2b LTR MaLR 1 318 -61 1 1603 1046 255 117 9 chr5 133456737 133456780 -19080479 + MTE2b LTR MaLR 319 368 -11 1 1603 315 193 0 0 chr5 133458583 133458640 -19078619 + MTC LTR MaLR 5 61 -360 1 1603 1598 207 160 15 chr5 133458642 133459098 -19078161 - RMER19C LTR ERVK -2 609 88 1 1603 1872 134 91 6 chr5 133459126 133459455 -19077804 + MTC LTR MaLR 57 413 -8 1 1603 247 384 62 22 chr5 133459982 133460206 -19077053 + MLT1L LTR MaLR 176 408 -202 1 1603 340 273 30 10 chr5 133463502 133463602 -19073657 + MTE2a LTR MaLR 15 116 -263 1 1603 1564 223 27 16 chr5 133463874 133464247 -19073012 - MTEb LTR MaLR -2 377 1 1 1603 274 333 16 16 chr5 133464326 133464451 -19072808 - ORR1E LTR MaLR 0 379 255 1 1603 1391 215 17 46 chr5 133464553 133464904 -19072355 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 39 1 1603 413 222 68 83 chr5 133465022 133465214 -19072045 - ORR1E LTR MaLR -168 191 3 1 1603 1319 221 108 0 chr5 133466731 133467047 -19070212 + MTEa LTR MaLR 4 353 -26 1 1603 924 278 52 39 chr5 133469666 133469973 -19067286 + ORR1E LTR MaLR 45 355 -4 1 1603 798 237 112 99 chr5 133470607 133470756 -19066503 - MTE2a LTR MaLR 0 379 219 1 1603 798 237 112 99 chr5 133470888 133471112 -19066147 - MTE2a LTR MaLR -161 218 1 1 1603 407 342 32 19 chr5 133472038 133472193 -19065066 - LTR16B LTR ERVL -8 455 299 1 1603 279 239 0 92 chr5 133472453 133472573 -19064686 + ORR1D1 LTR MaLR 6 114 -260 1 1603 478 360 65 40 chr5 133476067 133476345 -19060914 - MLT1E2 LTR MaLR -26 601 317 1 1603 251 319 90 94 chr5 133476385 133476586 -19060673 - MLT1E2 LTR MaLR -329 295 96 1 1603 227 317 33 0 chr5 133476658 133476718 -19060541 + MLT1M LTR MaLR 124 185 -487 1 1603 521 287 66 77 chr5 133477374 133477570 -19059689 - MTEa LTR MaLR -185 194 1 1 1603 480 136 0 47 chr5 133478813 133478898 -19058361 + ETnERV2-int LTR ERVK 1883 1963 -5443 1 1603 1402 204 115 109 chr5 133490892 133490946 -19046313 - MTE2b LTR MaLR 0 379 327 1 1603 1402 204 115 109 chr5 133491006 133491326 -19045933 - MTE2b LTR MaLR -53 326 4 1 1603 1289 157 5 0 chr5 133492766 133492989 -19044270 - RMER4B LTR ERVK -345 240 17 1 1603 2483 98 3 0 chr5 133494521 133494847 -19042412 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1603 2128 164 39 8 chr5 133497992 133498379 -19038880 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 1 1603 1525 223 48 43 chr5 133501926 133502301 -19034958 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 3 1603 538 253 5 76 chr5 133502667 133502851 -19034408 + MTEa LTR MaLR 5 175 -204 5 1603 323 252 92 74 chr5 133503049 133503212 -19034047 + MTEa LTR MaLR 193 358 -21 5 1603 1723 152 50 74 chr5 133504437 133504800 -19032459 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 1603 873 171 0 86 chr5 133508279 133508477 -19028782 + ORR1C1 LTR MaLR 1 181 -197 2 1603 1075 176 10 15 chr5 133508799 133509001 -19028258 + ORR1C1 LTR MaLR 166 366 -12 2 1603 1024 247 33 147 chr5 133510524 133510952 -19026307 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 2 1603 856 242 100 13 chr5 133511085 133511315 -19025944 - MTEa LTR MaLR -120 259 10 2 1603 416 242 85 18 chr5 133516406 133516570 -19020689 - RMER15 LTR ERVL -65 510 336 4 1603 2909 70 55 0 chr5 133518492 133518891 -19018368 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 1603 266 316 62 10 chr5 133519763 133519859 -19017400 + RMER12 LTR ERVK 750 850 -472 5 1603 533 229 8 16 chr5 133523002 133523126 -19014133 + ORR1E LTR MaLR 1 123 -236 6 1603 492 256 57 7 chr5 133523138 133523292 -19013967 + ORR1E LTR MaLR 164 348 -31 6 1603 271 388 51 46 chr5 133523587 133523784 -19013475 + MLT1G LTR MaLR 7 204 -387 7 1603 1279 279 31 3 chr5 133523792 133524141 -19013118 - MTEa LTR MaLR -2 377 19 7 1603 733 295 73 91 chr5 133526529 133526913 -19010346 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 7 1603 663 213 255 25 chr5 133529135 133529412 -19007847 - MTD LTR MaLR 0 419 79 8 1603 2258 158 128 9 chr5 133530247 133530714 -19006545 - RMER4B LTR ERVK 0 585 63 8 1603 307 210 269 75 chr5 133531503 133531637 -19005622 - ORR1E LTR MaLR -6 373 214 9 1603 461 315 9 62 chr5 133531918 133532128 -19005131 + MTD LTR MaLR 5 203 -216 9 1603 406 275 58 0 chr5 133532424 133532544 -19004715 + MTD LTR MaLR 293 419 0 9 1603 1075 245 54 74 chr5 133533183 133533536 -19003723 - ORR1E LTR MaLR -10 349 4 9 1603 374 262 82 116 chr5 133534699 133534906 -19002353 - ORR1E LTR MaLR -159 200 1 9 1603 1371 247 94 6 chr5 133536291 133536633 -19000626 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 1 1603 471 261 84 45 chr5 133541555 133541816 -18995443 - MTEa LTR MaLR 0 379 86 1 1603 238 247 47 58 chr5 133543637 133543723 -18993536 - MTE2a LTR MaLR -23 356 272 1 1603 507 207 68 74 chr5 133544334 133544496 -18992763 - MTE2a LTR MaLR -213 166 6 1 1603 960 259 50 69 chr5 133544706 133545083 -18992176 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1603 1105 243 36 36 chr5 133548693 133549026 -18988233 - MTE2b LTR MaLR -41 338 6 1 1603 2156 155 35 5 chr5 133550803 133551172 -18986087 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 1 1603 1008 238 179 13 chr5 133551229 133551531 -18985728 - MTEa LTR MaLR -8 371 20 1 1603 906 255 144 15 chr5 133552428 133552755 -18984504 - MTE2a LTR MaLR -10 369 1 1 1603 273 320 55 60 chr5 133558004 133558187 -18979072 + MTEa LTR MaLR 184 365 -14 1 1603 229 227 67 22 chr5 133559953 133560043 -18977216 - ORR1C2 LTR MaLR -285 99 6 1 1603 1345 146 5 5 chr5 133561971 133562185 -18975074 - MTEa LTR MaLR -6 373 160 1 200 913 212 3 47 chr5 133562184 133562397 -18974862 - MTEa LTR MaLR -141 238 35 1 1604 1853 182 62 34 chr5 133563159 133563598 -18973661 + RLTR17 LTR ERVK 105 555 -137 1 1604 778 223 129 61 chr5 133563815 133564126 -18973133 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 352 -225 1 1604 1089 243 93 29 chr5 133564189 133564533 -18972726 - MTD LTR MaLR -36 383 18 1 1604 299 244 58 11 chr5 133566568 133566655 -18970604 - MTD LTR MaLR -15 404 314 1 1604 305 205 24 17 chr5 133567046 133567128 -18970131 - MTD LTR MaLR -78 343 260 1 1604 703 313 56 12 chr5 133567157 133567406 -18969853 - MTD LTR MaLR -136 283 24 1 1604 1760 203 66 38 chr5 133567968 133568452 -18968807 + RMER4B LTR ERVK 17 451 -15 1 1604 934 240 45 19 chr5 133570276 133570561 -18966698 + ORR1E LTR MaLR 5 327 -52 1 1604 460 248 181 9 chr5 133570928 133571220 -18966039 - MTEa LTR MaLR -5 374 16 1 1604 441 333 46 92 chr5 133571220 133571262 -18965997 - MTE2a LTR MaLR -5 374 337 1 1604 1873 131 141 28 chr5 133571262 133571616 -18965643 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1604 441 333 46 92 chr5 133571616 133571963 -18965296 - MTE2a LTR MaLR -43 336 3 1 1604 1326 158 22 106 chr5 133575550 133575861 -18961398 + ORR1B1 LTR MaLR 102 386 -8 2 1604 1251 238 52 10 chr5 133577525 133577835 -18959424 + ORR1E LTR MaLR 1 323 -36 2 1604 293 281 62 20 chr5 133580121 133580234 -18957025 - MTEa LTR MaLR 0 379 262 2 1604 297 287 31 170 chr5 133584341 133584635 -18952624 - ORR1E LTR MaLR -5 354 102 2 1604 1043 231 82 112 chr5 133590348 133590739 -18946520 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1604 1087 241 151 19 chr5 133594393 133594757 -18942502 + MTD LTR MaLR 3 414 -5 2 1604 664 303 130 10 chr5 133598108 133598401 -18938858 + MTD LTR MaLR 36 363 -56 2 1604 2408 137 58 11 chr5 133598411 133598787 -18938472 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1604 1511 248 32 8 chr5 133599435 133599805 -18937454 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 2 1604 1137 257 95 6 chr5 133601307 133601655 -18935604 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 2 1604 1562 227 148 20 chr5 133609233 133609687 -18927572 + RMER15 LTR ERVL 64 575 0 2 1604 1085 267 37 72 chr5 133610847 133611222 -18926037 - MTEa LTR MaLR 0 379 18 2 1604 250 316 0 26 chr5 133612912 133612990 -18924269 + MTE2a LTR MaLR 1 76 -303 2 1604 1132 248 35 35 chr5 133613071 133613385 -18923874 + MTE2a LTR MaLR 57 370 -9 2 1604 407 344 37 46 chr5 133613401 133613642 -18923617 + ORR1E LTR MaLR 121 359 0 3 1604 548 280 5 131 chr5 133614905 133615127 -18922132 + MTE2a LTR MaLR 3 196 -183 3 1604 428 299 17 0 chr5 133615179 133615296 -18921963 + MTE2a LTR MaLR 196 314 -65 3 1604 448 303 32 63 chr5 133615710 133615900 -18921359 + ORR1E LTR MaLR 6 189 -170 3 1604 241 220 0 39 chr5 133615922 133615974 -18921285 + ORR1E LTR MaLR 255 304 -75 3 1604 232 333 63 21 chr5 133620713 133620808 -18916451 + MLT1H LTR MaLR 63 161 -388 3 1604 1099 246 53 98 chr5 133621803 133622054 -18915205 - MTD LTR MaLR -14 405 157 3 1604 1363 150 367 13 chr5 133622054 133622365 -18914894 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1604 1099 246 53 98 chr5 133622365 133622509 -18914750 - MTD LTR MaLR -263 156 28 3 1604 390 346 72 52 chr5 133622637 133622708 -18914551 + MTEa LTR MaLR 1 70 -300 3 1604 431 294 47 53 chr5 133622747 133623038 -18914221 + MTEa LTR MaLR 71 379 0 3 1604 2270 98 3 79 chr5 133625420 133625600 -18911659 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 156 3 1604 2270 98 3 79 chr5 133625783 133625956 -18911303 - ORR1A2 LTR MaLR -172 155 1 3 1604 2309 98 3 6 chr5 133626321 133626648 -18910611 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 3 1604 1199 261 0 26 chr5 133627596 133627690 -18909569 + MTE2b LTR MaLR 11 104 -275 3 1604 2378 146 6 3 chr5 133627690 133628055 -18909204 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 3 1604 1199 261 0 26 chr5 133628055 133628228 -18909031 + MTE2b LTR MaLR 105 271 -108 3 1604 348 266 32 16 chr5 133636819 133636945 -18900314 + RMER15 LTR ERVL 2 129 -446 3 1604 894 273 64 46 chr5 133636973 133637091 -18900168 + RMER15 LTR ERVL 244 355 -220 3 1604 1176 264 49 41 chr5 133637091 133637458 -18899801 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1604 894 273 64 46 chr5 133637458 133637665 -18899594 + RMER15 LTR ERVL 356 575 0 3 1604 296 261 44 26 chr5 133638527 133638641 -18898618 + RMER15 LTR ERVL 2 117 -458 3 1604 5067 135 78 30 chr5 133638846 133639426 -18897833 - RMER17B LTR ERVK -3 955 351 3 1604 5067 135 78 30 chr5 133639480 133639810 -18897449 - RMER17B LTR ERVK -608 350 2 3 1604 2150 203 11 59 chr5 133644341 133644881 -18892378 + RLTR24 LTR ERV1 1 514 -15 3 1604 520 317 66 44 chr5 133645292 133645566 -18891693 + MT2A LTR ERVL 183 462 -71 3 1604 812 248 29 34 chr5 133646258 133646496 -18890763 - RMER15 LTR ERVL -43 532 296 3 1604 779 325 59 38 chr5 133647619 133648124 -18889135 - MT2A LTR ERVL -17 516 1 3 1604 2525 177 58 6 chr5 133648161 133648662 -18888597 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 3 1604 1811 148 152 27 chr5 133648836 133649210 -18888049 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1604 726 251 28 52 chr5 133657188 133657440 -18879819 - RMER15 LTR ERVL -54 521 276 4 1604 851 274 46 46 chr5 133658813 133659115 -18878144 + ORR1E LTR MaLR 1 302 -57 4 1604 931 231 19 5 chr5 133659588 133659797 -18877462 - MTD LTR MaLR -206 213 2 4 1604 924 264 26 136 chr5 133660029 133660449 -18876810 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 4 1604 997 274 133 21 chr5 133665320 133665696 -18871563 + MTD LTR MaLR 2 419 0 4 1604 477 252 33 117 chr5 133667191 133667371 -18869888 + MTE2a LTR MaLR 78 242 -137 4 1604 856 323 20 73 chr5 133669290 133669647 -18867612 - ORR1E LTR MaLR 0 359 22 4 1604 1117 243 13 75 chr5 133670323 133670630 -18866629 - MTE2a LTR MaLR -2 377 90 4 1604 1434 200 132 9 chr5 133672347 133672680 -18864579 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1604 349 304 8 0 chr5 133674244 133674369 -18862890 - SRV_MM-int LTR ERVK -2566 3601 3476 4 1604 237 194 0 0 chr5 133676185 133676233 -18861026 - MTD LTR MaLR 0 421 372 4 1604 233 220 20 0 chr5 133678243 133678293 -18858966 - MTE2a LTR MaLR 0 379 329 4 1604 441 286 9 18 chr5 133678433 133678547 -18858712 - MTE2a LTR MaLR -183 196 84 4 1604 804 310 83 25 chr5 133680417 133680731 -18856528 - RMER15 LTR ERVL 0 575 244 4 1604 630 191 55 37 chr5 133681358 133681521 -18855738 - RMER15 LTR ERVL -19 556 391 4 1604 1298 232 98 19 chr5 133681898 133682223 -18855036 - MTEa LTR MaLR -28 351 1 4 1604 2091 151 32 104 chr5 133682712 133683214 -18854045 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 4 1604 1111 266 29 33 chr5 133687261 133687533 -18849726 + MTEa LTR MaLR 39 309 -70 4 1605 359 417 42 21 chr5 133698594 133698834 -18838425 - MLT1I LTR MaLR -76 335 91 5 1605 1498 270 62 18 chr5 133699152 133699604 -18837655 + RMER5 LTR ERV1 52 523 -11 5 1605 807 231 10 7 chr5 133699920 133700116 -18837143 + ORR1D1-int LTR MaLR 1187 1353 -17 5 1605 1631 211 22 0 chr5 133700132 133700445 -18836814 + ORR1D1 LTR MaLR 1 320 -54 5 1605 692 293 0 6 chr5 133702102 133702277 -18834982 - MTEa LTR MaLR 0 379 206 5 1605 660 301 5 30 chr5 133702646 133702837 -18834422 - MTEa LTR MaLR -193 186 1 5 1605 339 303 58 67 chr5 133711903 133712104 -18825155 + MTEb LTR MaLR 196 381 -38 5 1605 301 280 11 0 chr5 133713020 133713113 -18824146 - MER31-int LTR ERV1 -97 4839 4746 5 1605 326 335 20 13 chr5 133714446 133714597 -18822662 + LTR37B LTR ERV1 317 468 0 5 1605 1229 284 22 9 chr5 133715041 133715365 -18821894 - MTE2b LTR MaLR 0 379 52 5 1605 546 276 16 0 chr5 133715368 133715491 -18821768 - MTE2b LTR MaLR -254 125 1 5 1605 919 233 34 4 chr5 133716974 133717207 -18820052 - RMER15 LTR ERVL 0 575 336 5 1605 901 252 151 40 chr5 133717810 133718108 -18819151 - RMER15 LTR ERVL -244 331 1 5 1605 843 286 67 91 chr5 133721526 133721941 -18815318 - MTE2a LTR MaLR 0 419 1 5 1605 473 253 25 29 chr5 133723188 133723332 -18813927 - MTE2a LTR MaLR 0 379 196 5 1605 680 255 56 183 chr5 133724052 133724517 -18812742 + MTC LTR MaLR 1 406 -15 5 1605 1727 201 86 3 chr5 133726887 133727261 -18809998 - MTD LTR MaLR -14 405 1 5 1605 1764 235 58 33 chr5 133727352 133727871 -18809388 + RMER19C LTR ERVK 80 611 0 5 1605 579 285 78 96 chr5 133730189 133730534 -18806725 + MTE2a LTR MaLR 31 369 -10 5 1605 386 295 25 25 chr5 133739832 133739992 -18797267 - MTD LTR MaLR -259 160 1 5 1605 250 360 45 11 chr5 133741118 133741295 -18795964 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2508 2690 -3024 5 1605 364 281 14 136 chr5 133744954 133745170 -18792089 + MTE2a LTR MaLR 1 188 -191 6 1605 544 266 62 43 chr5 133745291 133745334 -18791925 + MTE2a LTR MaLR 167 211 -168 6 1605 544 266 62 43 chr5 133745396 133745560 -18791699 + MTE2a LTR MaLR 212 378 -1 6 1605 294 211 14 0 chr5 133746039 133746110 -18791149 - MLT1A1 LTR MaLR -36 372 301 6 1605 1568 197 89 14 chr5 133746321 133746738 -18790521 - RMER15 LTR ERVL -21 554 107 6 1605 268 161 32 16 chr5 133746893 133746956 -18790303 - RMER15 LTR ERVL -485 90 27 6 1605 280 246 0 15 chr5 133747305 133747371 -18789888 - MLT1A1 LTR MaLR -309 99 35 6 1605 612 314 60 82 chr5 133749670 133750035 -18787224 + MTEa LTR MaLR 3 359 -20 6 1605 1761 135 5 139 chr5 133754767 133755147 -18782112 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1605 1352 247 10 58 chr5 133755842 133756238 -18781021 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 6 1605 2232 161 31 8 chr5 133759809 133760192 -18777067 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 6 1605 432 280 29 43 chr5 133761352 133761490 -18775769 - MT2A LTR ERVL -71 462 327 6 1605 471 235 90 84 chr5 133761747 133761914 -18775345 + MTEa LTR MaLR 3 170 -209 6 1605 328 300 118 26 chr5 133762080 133762123 -18775136 - RMER20B LTR ERVK -235 392 340 6 1605 3543 30 0 0 chr5 133762123 133762519 -18774740 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1605 328 300 118 26 chr5 133762519 133762670 -18774589 - RMER20B LTR ERVK -288 339 180 6 1605 1024 338 28 31 chr5 133763776 133764234 -18773025 - MT2A LTR ERVL -71 462 6 6 1605 2948 64 22 5 chr5 133766445 133766855 -18770404 + MT2C_Mm LTR ERVL 59 475 0 6 1605 1213 190 15 33 chr5 133767700 133767972 -18769287 - RMER10B LTR ERVL -131 267 1 6 1605 801 171 20 0 chr5 133767976 133768128 -18769131 + RLTR15 LTR ERVK 164 318 -41 6 1605 3139 94 38 51 chr5 133768128 133768654 -18768605 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 6 1605 4858 279 65 46 chr5 133768654 133771266 -18765993 + MuRRS4-int LTR ERV1 3 2816 -4740 6 1605 3044 276 0 4 chr5 133771269 133772006 -18765253 + MuRRS4-int LTR ERV1 2152 2885 -2178 6 1605 2084 128 8 150 chr5 133772034 133772566 -18764693 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 456 -63 6 1605 498 230 62 53 chr5 133772711 133772955 -18764304 + LTRIS4 LTR ERV1 276 507 0 6 1605 466 61 15 0 chr5 133772955 133773021 -18764238 + MURVY-LTR LTR ERV1 453 519 0 6 1605 281 49 73 0 chr5 133773022 133773063 -18764196 + RLTR15 LTR ERVK 316 359 0 6 1605 727 261 135 42 chr5 133773848 133774136 -18763123 - RMER15 LTR ERVL 0 575 261 6 1605 724 259 118 26 chr5 133775739 133776093 -18761166 + RMER15 LTR ERVL 61 533 -42 6 1605 604 320 0 6 chr5 133777004 133777180 -18760079 - MLT1D LTR MaLR -330 175 1 6 1605 237 250 0 18 chr5 133778982 133779039 -18758220 + MTEb LTR MaLR 170 225 -154 6 1605 922 271 110 44 chr5 133779127 133779396 -18757863 - MTD LTR MaLR -15 404 112 6 1605 922 271 110 44 chr5 133779623 133779716 -18757543 - MTD LTR MaLR -308 111 18 6 1605 356 221 0 13 chr5 133779736 133779814 -18757445 + MTEb LTR MaLR 299 375 -4 6 1605 375 302 21 7 chr5 133780393 133780533 -18756726 - MLT1B LTR MaLR -42 348 207 7 1605 237 268 24 150 chr5 133780614 133780781 -18756478 + RMER15 LTR ERVL 1 146 -429 7 1605 298 307 56 65 chr5 133780822 133780930 -18756329 + RMER15 LTR ERVL 347 453 -122 7 1605 1057 258 129 0 chr5 133781421 133781723 -18755536 + MTEa LTR MaLR 38 378 -1 7 1605 1007 250 176 55 chr5 133784646 133785158 -18752101 + RMER15 LTR ERVL 2 575 0 7 1605 311 186 155 26 chr5 133785683 133785799 -18751460 + RLTR15 LTR ERVK 1 131 -228 7 1605 283 281 49 89 chr5 133786069 133786315 -18750944 + RLTR15 LTR ERVK 116 351 -8 7 1605 1372 249 17 36 chr5 133788801 133789163 -18748096 + MTEa LTR MaLR 25 379 0 7 1605 1587 259 47 63 chr5 133790816 133791353 -18745906 - RMER15 LTR ERVL -18 557 30 7 1605 498 275 102 31 chr5 133791550 133791783 -18745476 - MLT2B2 LTR ERVL -80 482 132 7 1605 284 312 78 31 chr5 133792047 133792176 -18745083 + ORR1E LTR MaLR 3 137 -222 7 1605 442 201 165 61 chr5 133793651 133793815 -18743444 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 190 7 1605 2072 167 174 13 chr5 133793821 133793855 -18743404 + RMER19A LTR ERVK 1 35 -702 7 1605 3344 85 14 33 chr5 133793855 133794339 -18742920 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 7 1605 2072 138 124 8 chr5 133794339 133794915 -18742344 + RMER19A LTR ERVK 36 736 -1 7 1605 279 230 276 0 chr5 133794919 133795006 -18742253 - ORR1D2 LTR MaLR -244 126 16 7 1605 2219 154 23 10 chr5 133805725 133806113 -18731146 + MTC LTR MaLR 1 393 -28 7 1605 759 216 92 50 chr5 133806196 133806537 -18730722 - RMER19B LTR ERVK -359 543 1 7 1605 4441 143 30 36 chr5 133809938 133810680 -18726579 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 7 1605 252 235 67 58 chr5 133813167 133813271 -18723988 - MTEb LTR MaLR 0 379 275 7 1605 768 236 23 104 chr5 133815573 133815833 -18721426 + MTEa LTR MaLR 2 240 -139 7 1605 434 269 162 8 chr5 133818593 133818757 -18718502 + MTEa LTR MaLR 65 254 -125 7 1605 1038 301 22 25 chr5 133819006 133819320 -18717939 + MTEb LTR MaLR 1 313 -66 7 1605 283 290 54 0 chr5 133820836 133820929 -18716330 - MTEa LTR MaLR -281 98 1 7 1605 1437 224 96 21 chr5 133821751 133822138 -18715121 - MTC LTR MaLR -3 418 3 8 1605 1084 281 47 42 chr5 133822194 133822595 -18714664 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 8 1605 692 312 12 17 chr5 133824120 133824361 -18712898 - MT2A LTR ERVL -71 462 223 8 1606 970 254 102 50 chr5 133827139 133827500 -18709759 - MTD LTR MaLR -30 389 10 8 1606 281 336 89 71 chr5 133827506 133827762 -18709497 - MLT1D LTR MaLR -10 495 198 8 1606 1109 217 24 130 chr5 133827978 133828402 -18708857 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 8 1606 1078 247 26 76 chr5 133837238 133837580 -18699679 + ORR1E LTR MaLR 4 328 -31 8 1606 1207 255 26 128 chr5 133837895 133838317 -18698942 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 8 1606 1282 218 125 41 chr5 133840998 133841342 -18695917 + MTE2b LTR MaLR 7 379 0 8 1606 487 343 27 54 chr5 133842807 133843029 -18694230 + MTEa LTR MaLR 1 216 -163 8 1606 302 265 115 19 chr5 133843202 133843306 -18693953 + MTEa LTR MaLR 197 310 -69 8 1606 515 227 111 44 chr5 133843959 133844207 -18693052 - MTEb LTR MaLR 0 379 97 8 1606 509 273 31 0 chr5 133844223 133844351 -18692908 + MTD LTR MaLR 15 146 -273 8 1606 262 329 11 66 chr5 133844346 133844437 -18692822 - MTEb LTR MaLR -273 86 1 8 1606 1202 250 62 43 chr5 133845624 133845823 -18691436 - MTE2b LTR MaLR 0 379 179 8 1606 1202 250 62 43 chr5 133845856 133846028 -18691231 - MTE2b LTR MaLR -201 178 1 8 1606 469 136 12 12 chr5 133846194 133846276 -18690983 - MTE2a LTR MaLR -2 377 296 8 1606 839 256 25 136 chr5 133846509 133846825 -18690434 - MTE2a LTR MaLR -86 293 13 8 1606 3259 69 5 2 chr5 133848406 133848801 -18688458 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1606 816 299 91 39 chr5 133849708 133849918 -18687341 + MT2A LTR ERVL 3 232 -301 8 1606 816 299 91 39 chr5 133849961 133850188 -18687071 + MT2A LTR ERVL 233 462 -71 8 1606 1088 277 52 67 chr5 133852739 133853236 -18684023 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 8 1606 564 263 174 9 chr5 133856410 133856629 -18680630 - ORR1E LTR MaLR -5 354 100 8 1606 515 221 0 0 chr5 133856805 133856900 -18680359 - ORR1E LTR MaLR -264 95 1 8 1606 611 339 55 38 chr5 133857565 133857930 -18679329 - ERVL-E-int LTR ERVL -1091 4576 4206 8 1606 245 326 32 32 chr5 133860715 133860810 -18676449 - ORR1E LTR MaLR -210 149 55 8 1606 297 320 9 28 chr5 133860843 133860949 -18676310 - MLT1A1 LTR MaLR -295 113 10 8 1606 910 263 59 17 chr5 133862541 133862777 -18674482 + MTD LTR MaLR 3 248 -171 8 1606 470 231 57 6 chr5 133863074 133863258 -18674001 + MTD LTR MaLR 197 416 -3 8 1606 2103 176 65 28 chr5 133863258 133863656 -18673603 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 8 1606 442 296 7 52 chr5 133863832 133863985 -18673274 - RMER5 LTR ERV1 0 534 389 8 1606 1396 240 55 3 chr5 133863963 133864272 -18672987 - MTD LTR MaLR -94 325 1 8 1606 236 311 54 32 chr5 133867603 133867696 -18669563 - ORR1E LTR MaLR -64 306 212 9 1606 513 287 10 50 chr5 133867790 133867988 -18669271 - ORR1E LTR MaLR -169 190 1 9 1606 475 280 87 21 chr5 133868042 133868248 -18669011 - MTD LTR MaLR -14 405 157 9 1606 1156 258 49 65 chr5 133868539 133868908 -18668351 - MTE2a LTR MaLR -16 363 1 9 1606 289 286 79 50 chr5 133891538 133891740 -18645519 + RMER15 LTR ERVL 347 554 -21 9 1606 475 339 40 63 chr5 133894878 133895177 -18642082 + ORR1E LTR MaLR 3 294 -65 9 1606 486 332 10 30 chr5 133895187 133895389 -18641870 + MTD LTR MaLR 1 198 -221 9 1606 1621 221 125 11 chr5 133895548 133896005 -18641254 + RMER15 LTR ERVL 27 535 -40 9 1606 456 248 176 8 chr5 133896018 133896206 -18641053 + MTD LTR MaLR 181 403 -16 9 1606 1294 259 77 24 chr5 133896864 133897243 -18640016 + MTD LTR MaLR 13 411 -8 9 1606 492 298 36 108 chr5 133897508 133897929 -18639330 + MTE2a LTR MaLR 1 351 -68 9 1606 1497 260 19 5 chr5 133899851 133900219 -18637040 + MTEa LTR MaLR 1 373 -6 9 1606 275 352 48 59 chr5 133901137 133901324 -18635935 + ORR1E LTR MaLR 11 195 -164 9 1606 367 212 169 0 chr5 133902470 133902588 -18634671 - MTD LTR MaLR -9 370 233 9 1606 273 233 0 0 chr5 133902591 133902651 -18634608 + MERVL-int LTR ERVL 4454 4513 -972 9 1606 691 305 28 24 chr5 133902651 133902903 -18634356 - MTD LTR MaLR -159 260 8 9 1606 1070 264 70 27 chr5 133903589 133903963 -18633296 + MTD LTR MaLR 10 399 -20 9 1606 2019 171 10 41 chr5 133905565 133905981 -18631278 - RLTR11A LTR ERVK -125 403 1 9 1606 1645 218 43 162 chr5 133906133 133906714 -18630545 + RLTR18B LTR ERVK 1 512 0 9 1606 1564 244 50 6 chr5 133917659 133918022 -18619237 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 1 1606 226 156 43 72 chr5 133919455 133919524 -18617735 - RMER15 LTR ERVL -453 122 56 1 1606 351 329 80 61 chr5 133919560 133919888 -18617371 + MLT1A LTR MaLR 49 383 -7 1 1606 683 269 52 84 chr5 133920827 133921136 -18616123 - RMER15 LTR ERVL 0 575 277 1 1606 317 174 40 128 chr5 133921138 133921263 -18615996 - RMER15 LTR ERVL -417 158 45 1 1606 830 281 32 103 chr5 133922462 133922842 -18614417 - MTE2a LTR MaLR -26 353 1 1 1606 803 284 119 24 chr5 133928282 133928433 -18608826 + ORR1E LTR MaLR 1 156 -203 1 1606 803 284 119 24 chr5 133928525 133928700 -18608559 + ORR1E LTR MaLR 157 358 -1 1 1606 245 247 36 36 chr5 133931436 133931520 -18605739 - MTEb LTR MaLR -18 361 278 1 1606 571 272 37 65 chr5 133933119 133933335 -18603924 - MTEb LTR MaLR 0 379 170 1 1606 331 312 149 0 chr5 133933523 133933664 -18603595 - MTEb LTR MaLR -200 179 18 1 1606 1135 211 73 15 chr5 133935483 133935743 -18601516 + MTD LTR MaLR 20 294 -125 1 1606 233 266 15 45 chr5 133935756 133935823 -18601436 + RMER15 LTR ERVL 1 65 -510 1 1606 2051 229 65 17 chr5 133935904 133936428 -18600831 + RMER15 LTR ERVL 27 575 0 1 1606 1888 84 84 42 chr5 133936626 133936960 -18600299 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 18 1 1606 290 71 0 0 chr5 133936982 133937024 -18600235 - RLTR10B2 LTR ERVK -250 42 1 1 1606 7695 52 0 28 chr5 133937024 133937982 -18599277 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6651 1 1606 42721 40 1 1 chr5 133937973 133942910 -18594349 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 1 1606 2828 102 23 10 chr5 133942908 133943302 -18593957 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 1 1606 1912 81 84 39 chr5 133943302 133943635 -18593624 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 18 1 1606 275 410 20 14 chr5 133952352 133952498 -18584761 - LTR16A LTR ERVL -121 330 184 1 1606 226 379 59 56 chr5 133952651 133952989 -18584270 + ORR1E LTR MaLR 20 358 -1 1 1606 265 250 59 0 chr5 133952989 133953040 -18584219 - LTR16A LTR ERVL -358 93 39 1 1606 4112 160 26 26 chr5 133953130 133953886 -18583373 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 1 1606 645 282 18 40 chr5 133954382 133954607 -18582652 + RMER15 LTR ERVL 339 558 -17 1 1607 1915 171 82 23 chr5 133956900 133957289 -18579970 - MTC LTR MaLR -8 413 2 1 1607 301 111 0 0 chr5 133957537 133957582 -18579677 + MTC LTR MaLR 1 45 -376 1 1607 2388 146 116 8 chr5 133959955 133960431 -18576828 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 1 1607 1230 229 90 59 chr5 133962964 133963353 -18573906 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 1 1607 1019 234 26 39 chr5 133964962 133965269 -18571990 - RMER15 LTR ERVL 0 575 273 1 1607 293 292 21 97 chr5 133965263 133965407 -18571852 - RMER15 LTR ERVL -415 160 28 1 1607 409 360 12 12 chr5 133968178 133968341 -18568918 + MLT1I LTR MaLR 239 401 -10 1 1607 2210 154 109 9 chr5 133969675 133970084 -18567175 - RLTR28 LTR ERVL -11 513 91 1 1607 2210 154 109 9 chr5 133970120 133970176 -18567083 - RLTR28 LTR ERVL -434 90 3 1 1607 1519 143 86 0 chr5 133970397 133970676 -18566583 - MTC LTR MaLR -118 303 1 1 1607 1334 238 49 20 chr5 133970676 133971024 -18566235 - ORR1D1 LTR MaLR -16 358 1 1 1607 796 271 33 139 chr5 133973757 133973962 -18563297 - MTE2a LTR MaLR 0 379 193 1 1607 796 271 33 139 chr5 133973988 133974206 -18563053 - MTE2a LTR MaLR -187 192 1 1 1607 748 208 69 6 chr5 133975321 133975495 -18561764 + MTE2a LTR MaLR 1 185 -194 1 1607 651 319 75 61 chr5 133977123 133977483 -18559776 + MTD LTR MaLR 1 365 -54 1 1607 802 255 10 14 chr5 133979575 133979782 -18557477 - ORR1E LTR MaLR -146 213 8 1 1607 1064 272 85 31 chr5 133980174 133980527 -18556732 + MTE2a LTR MaLR 2 373 -6 1 1607 233 232 42 28 chr5 133980791 133980862 -18556397 + MTEa LTR MaLR 302 373 -6 1 1607 509 361 51 115 chr5 133980853 133981263 -18555996 + MLT2B2 LTR ERVL 132 515 0 1 1607 1625 211 54 10 chr5 133982242 133982630 -18554629 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1607 1085 274 37 20 chr5 133984338 133984691 -18552568 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1607 1345 231 60 81 chr5 133989547 133989966 -18547293 + RMER15 LTR ERVL 165 574 -1 1 1607 838 254 22 18 chr5 133989966 133990194 -18547065 - ERVL-int LTR ERVL -961 4796 4568 1 1607 1379 259 29 24 chr5 133990396 133990772 -18546487 - ERVL-int LTR ERVL -2411 3346 2969 1 1607 1200 251 45 42 chr5 133990819 133991177 -18546082 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1607 530 261 31 0 chr5 133993841 133993971 -18543288 - MTD LTR MaLR -14 405 272 1 1607 522 290 42 26 chr5 133994088 133994279 -18542980 - MTD LTR MaLR -208 211 18 1 1607 5276 129 91 6 chr5 133997582 133998465 -18538794 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 1 1607 596 243 75 6 chr5 134004640 134004814 -18532445 - RMER15 LTR ERVL -110 465 280 1 1607 234 299 50 81 chr5 134004820 134004980 -18532279 - RMER15 LTR ERVL -418 157 3 1 1607 262 289 26 0 chr5 134005259 134005335 -18531924 - MTE2a LTR MaLR -62 317 240 1 1607 445 326 15 58 chr5 134005686 134005946 -18531313 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 169 1 1607 382 256 86 0 chr5 134007325 134007442 -18529817 + RMER15 LTR ERVL 1 127 -448 2 1607 246 320 8 31 chr5 134007474 134007603 -18529656 + RMER15 LTR ERVL 274 399 -176 2 1607 729 293 44 24 chr5 134009313 134009607 -18527652 - RMER15 LTR ERVL 0 575 276 2 1607 258 261 22 11 chr5 134010088 134010177 -18527082 + MTEa LTR MaLR 290 379 0 2 1607 1204 246 85 24 chr5 134011243 134011636 -18525623 - MTD LTR MaLR -15 404 1 2 1607 283 176 87 14 chr5 134012053 134012122 -18525137 - MTE2a LTR MaLR -130 249 176 2 1607 1913 123 24 83 chr5 134017056 134017428 -18519831 + ORR1B1 LTR MaLR 41 390 -4 4 1607 272 292 30 37 chr5 134017639 134017774 -18519485 + RMER15 LTR ERVL 347 480 -95 4 1607 233 350 10 0 chr5 134017944 134018047 -18519212 + RMER15 LTR ERVL 467 570 -5 4 1607 1775 108 65 95 chr5 134018052 134018389 -18518870 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 4 1607 430 283 0 9 chr5 134019686 134019793 -18517466 - MTEa LTR MaLR -37 342 237 5 1607 576 326 71 39 chr5 134020982 134021350 -18515909 - MTE2a LTR MaLR -14 405 21 5 1607 1978 244 54 36 chr5 134021812 134022390 -18514869 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 105 6 1607 1153 237 114 15 chr5 134022476 134022819 -18514440 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 6 1607 258 279 99 15 chr5 134022829 134022960 -18514299 - MLT1G3 LTR MaLR -300 295 154 6 1607 583 310 64 27 chr5 134023365 134023659 -18513600 + ORR1E LTR MaLR 1 337 -42 6 1607 1855 180 20 3 chr5 134025401 134025757 -18511502 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 6 7 1607 709 201 117 5 chr5 134032511 134032710 -18504549 - ORR1D2 LTR MaLR -158 216 1 8 1607 689 289 98 18 chr5 134043058 134043505 -18493754 + RMER15 LTR ERVL 3 575 0 9 1607 911 235 278 28 chr5 134045209 134045669 -18491590 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 1 1607 576 337 51 25 chr5 134048677 134049033 -18488226 - RMER5 LTR ERV1 -14 520 156 1 1607 1078 289 53 58 chr5 134049624 134050003 -18487256 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 1 1607 614 244 172 18 chr5 134051710 134051931 -18485328 + MTE2a LTR MaLR 123 377 -2 1 1607 721 249 165 14 chr5 134053923 134054135 -18483124 + ORR1E LTR MaLR 6 249 -110 1 1607 277 264 43 78 chr5 134055112 134055227 -18482032 + RMER15 LTR ERVL 425 535 -40 1 1607 2023 161 45 52 chr5 134056842 134057223 -18480036 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1607 231 298 54 125 chr5 134057342 134057526 -18479733 - MTEb LTR MaLR -8 371 201 1 1607 710 260 140 113 chr5 134057558 134057922 -18479337 + MTD LTR MaLR 6 379 0 1 1607 4410 166 61 22 chr5 134059914 134060771 -18476488 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 1 1607 1003 245 189 12 chr5 134064039 134064361 -18472898 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1607 2109 124 17 22 chr5 134067032 134067388 -18469871 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 1607 275 312 53 46 chr5 134067402 134067533 -18469726 + MLT1A LTR MaLR 16 147 -227 1 1607 1006 95 77 0 chr5 134069143 134069311 -18467948 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 185 1 1607 1025 159 36 16 chr5 134069495 134069687 -18467572 - ORR1B2 LTR MaLR -171 196 1 1 1607 964 192 231 29 chr5 134071553 134071864 -18465395 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1607 4227 131 28 6 chr5 134071975 134072699 -18464560 - RMER6A LTR ERVK -16 740 1 1 1607 1730 199 34 44 chr5 134072949 134073332 -18463927 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 1 1607 1221 191 79 138 chr5 134073954 134074360 -18462899 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 1 1607 1064 210 177 12 chr5 134074611 134074944 -18462315 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 1 1607 1395 205 19 16 chr5 134074981 134075298 -18461961 + ORR1B2 LTR MaLR 1 318 -49 1 1607 1023 274 109 30 chr5 134079803 134080297 -18456962 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 1607 519 317 76 53 chr5 134082578 134082930 -18454329 + ORR1E LTR MaLR 8 379 0 2 1607 1219 228 17 124 chr5 134082959 134083379 -18453880 + MTE2a LTR MaLR 1 375 -4 2 1607 1160 168 5 5 chr5 134084865 134085074 -18452185 + MTC LTR MaLR 99 307 -114 2 1607 2187 87 22 0 chr5 134085153 134085465 -18451794 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1608 487 271 55 14 chr5 134091522 134091663 -18445596 + ORR1E LTR MaLR 168 314 -45 2 1608 268 237 0 0 chr5 134091663 134091722 -18445537 + RMER15 LTR ERVL 1 59 -516 2 1608 674 177 42 7 chr5 134091776 134091918 -18445341 + RMER15 LTR ERVL 429 575 0 2 1608 967 293 99 27 chr5 134093828 134094270 -18442989 - MT2A LTR ERVL -3 530 57 2 1608 297 255 43 0 chr5 134094269 134094363 -18442896 - MTE2b LTR MaLR -281 98 1 2 1608 227 316 40 57 chr5 134094698 134094822 -18442437 + MLT1D LTR MaLR 363 484 -21 2 1608 269 250 105 32 chr5 134096531 134096655 -18440604 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 269 2 1608 1408 243 29 52 chr5 134096691 134097077 -18440182 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 2 1608 3432 25 8 0 chr5 134098091 134098484 -18438775 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1608 786 302 22 15 chr5 134100699 134100971 -18436288 - RMER15 LTR ERVL -18 557 284 2 1608 226 256 79 71 chr5 134101021 134101147 -18436112 - RMER15 LTR ERVL -448 127 1 2 1608 297 259 107 12 chr5 134101157 134101286 -18435973 + MT2A LTR ERVL 406 564 -3 2 1608 531 211 16 0 chr5 134101589 134101712 -18435547 + ORR1E LTR MaLR 11 135 -224 2 1608 289 248 115 23 chr5 134101903 134102033 -18435226 + ORR1E LTR MaLR 250 379 0 2 1608 2380 152 84 16 chr5 134104338 134104827 -18432432 + RLTR11A LTR ERVK 7 528 0 2 1608 1748 168 94 0 chr5 134107799 134108150 -18429109 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1608 3056 20 3 0 chr5 134108947 134109292 -18427967 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1608 1274 235 78 27 chr5 134109647 134110089 -18427170 + RMER19C LTR ERVK 138 901 -1 2 1608 304 309 66 12 chr5 134117901 134118068 -18419191 + MLT2B4 LTR ERVL 8 183 -373 2 1608 545 275 33 57 chr5 134120016 134120228 -18417031 - RMER15 LTR ERVL -24 551 345 3 1608 869 272 115 29 chr5 134128122 134128477 -18408782 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 3 1608 1068 220 102 4 chr5 134129981 134130242 -18407017 + ORR1D2 LTR MaLR 1 287 -83 3 1608 542 176 0 0 chr5 134130447 134130538 -18406721 + ORR1D2 LTR MaLR 280 370 0 3 1608 1868 194 24 53 chr5 134130934 134131442 -18405817 + RLTR26 LTR ERVK 2 535 -107 3 1608 655 171 14 35 chr5 134131449 134131594 -18405665 + RLTR26 LTR ERVK 501 642 0 3 1608 239 307 47 56 chr5 134131952 134132059 -18405200 - MLT1G1 LTR MaLR -407 172 67 3 1608 235 357 17 25 chr5 134133022 134133140 -18404119 - MLT1A0 LTR MaLR -221 144 28 3 1608 416 245 39 30 chr5 134142420 134142585 -18394674 - ORR1E LTR MaLR -154 216 51 3 1608 1745 188 38 89 chr5 134142585 134143092 -18394167 + RLTR28B LTR ERVL 1 481 0 3 1608 2148 121 10 71 chr5 134145654 134146063 -18391196 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 2 3 1608 862 274 86 25 chr5 134146748 134147073 -18390186 - MTE2a LTR MaLR -16 363 19 3 1608 1229 224 20 75 chr5 134148294 134148641 -18388618 + MT2B LTR ERVL 274 601 0 3 1608 1950 161 75 70 chr5 134148837 134149067 -18388192 + MTC LTR MaLR 5 243 -178 3 1608 1950 161 75 70 chr5 134149416 134149598 -18387661 + MTC LTR MaLR 244 421 0 3 1608 496 228 31 16 chr5 134154461 134154590 -18382669 + MTE2a LTR MaLR 249 379 0 3 1608 1244 251 24 39 chr5 134155686 134156018 -18381241 + MTE2b LTR MaLR 38 364 -15 3 1608 734 270 61 109 chr5 134157926 134157987 -18379272 - MTE2a LTR MaLR 0 379 320 3 1608 3040 20 6 3 chr5 134157987 134158332 -18378927 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1608 734 270 61 109 chr5 134158332 134158582 -18378677 - MTE2a LTR MaLR -60 319 83 3 1608 296 222 21 62 chr5 134158713 134158809 -18378450 - MTE2a LTR MaLR -327 92 1 3 1608 732 251 17 0 chr5 134159606 134159781 -18377478 + MTE2a LTR MaLR 2 179 -200 4 1608 2097 125 42 18 chr5 134160149 134160532 -18376727 + RMER6A LTR ERVK 365 756 0 4 1608 282 278 10 67 chr5 134163599 134163652 -18373607 + MTD LTR MaLR 302 350 -69 4 1608 4122 101 170 86 chr5 134163652 134164488 -18372771 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 4 1608 282 278 10 67 chr5 134164488 134164538 -18372721 + MTD LTR MaLR 351 399 -20 4 1608 893 293 134 13 chr5 134165478 134165852 -18371407 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1608 2866 95 120 0 chr5 134166136 134166611 -18370648 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 532 0 4 1608 1267 230 116 12 chr5 134167107 134167442 -18369817 + MTD LTR MaLR 12 381 -38 4 1608 561 291 16 38 chr5 134167838 134168024 -18369235 + MTD LTR MaLR 6 187 -232 4 1608 277 312 38 60 chr5 134168107 134168240 -18369019 + MTD LTR MaLR 250 379 0 4 1608 649 291 119 30 chr5 134171236 134171572 -18365687 - MT2A LTR ERVL -160 373 8 4 1608 667 270 128 50 chr5 134171618 134171882 -18365377 - RMER5 LTR ERV1 -144 390 120 4 1608 3978 84 70 2 chr5 134171882 134172429 -18364830 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 4 1608 667 270 128 50 chr5 134172429 134172484 -18364775 - RMER5 LTR ERV1 -415 119 46 4 1608 1488 193 90 28 chr5 134172903 134173260 -18363999 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 4 4 1608 1835 154 28 52 chr5 134181891 134182046 -18355213 + ORR1B1 LTR MaLR 41 183 -211 4 1608 1835 154 28 52 chr5 134182115 134182322 -18354937 + ORR1B1 LTR MaLR 184 394 0 4 1608 1298 173 38 4 chr5 134182979 134183217 -18354042 - MTEa LTR MaLR -1 378 133 4 1608 2705 39 39 3 chr5 134183214 134183577 -18353682 - MTB LTR MaLR -24 376 1 4 1608 1077 258 57 20 chr5 134184211 134184512 -18352747 - MTD LTR MaLR -15 404 93 4 1608 3353 126 32 94 chr5 134185999 134186683 -18350576 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 4 1608 980 173 142 26 chr5 134186706 134186938 -18350321 + MTEa LTR MaLR 121 379 0 4 1608 335 196 34 0 chr5 134192012 134192096 -18345163 + MTE2b LTR MaLR 2 90 -289 4 1608 1207 264 61 37 chr5 134192359 134192820 -18344439 - RMER5 LTR ERV1 -30 504 33 4 1608 1205 127 127 0 chr5 134193136 134193364 -18343895 + ORR1B1 LTR MaLR 1 257 -137 4 1608 754 159 0 8 chr5 134193472 134193599 -18343660 + ORR1B1 LTR MaLR 236 361 -6 4 1608 406 272 74 51 chr5 134195112 134195329 -18341930 + RMER15 LTR ERVL 336 557 -18 4 1608 3851 121 20 50 chr5 134195713 134196472 -18340787 + RMER17A LTR ERVK 1 736 -15 4 1608 261 299 68 11 chr5 134198478 134198566 -18338693 - MTC LTR MaLR -40 379 287 4 1608 427 344 84 13 chr5 134198878 134199105 -18338154 - MTC LTR MaLR -161 260 18 4 1608 1488 266 50 12 chr5 134200902 134201306 -18335953 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1608 370 245 161 12 chr5 134205084 134205245 -18332014 - ORR1E LTR MaLR -21 338 154 5 1608 244 367 14 41 chr5 134205426 134205571 -18331688 + LTR16E2 LTR ERVL 352 492 -76 5 1608 363 288 49 76 chr5 134209988 134210172 -18327087 + MTEb LTR MaLR 5 183 -196 5 1608 1974 150 8 22 chr5 134210310 134210665 -18326594 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 18 5 1608 248 245 0 0 chr5 134212236 134212285 -18324974 + RMER13B LTR ERVK 624 672 -236 5 1608 3738 195 26 16 chr5 134212553 134213408 -18323851 - RMER13B LTR ERVK -5 903 1 5 1608 2815 156 50 18 chr5 134214375 134214819 -18322440 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 462 -98 5 1608 2815 156 50 18 chr5 134214896 134214994 -18322265 + RLTR20B2 LTR ERVK 463 559 -1 5 1609 321 250 12 23 chr5 134218830 134218916 -18318343 - MLT1A1 LTR MaLR -279 129 45 5 1609 1648 127 70 70 chr5 134219404 134219597 -18317662 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 138 5 1609 2800 72 164 2 chr5 134219597 134220055 -18317204 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 532 0 5 1609 1648 127 70 70 chr5 134220055 134220190 -18317069 - ORR1A4 LTR MaLR -192 137 2 5 1609 311 167 0 3 chr5 134220258 134220322 -18316937 + MTC LTR MaLR 1 64 -343 5 1609 1346 216 119 66 chr5 134220328 134220825 -18316434 - RLTR11A LTR ERVK -5 523 1 5 1609 1791 153 67 17 chr5 134220825 134221171 -18316088 + MTC LTR MaLR 57 419 -2 5 1609 853 268 137 15 chr5 134225477 134225877 -18311382 - RMER15 LTR ERVL -21 554 38 5 1609 1195 264 110 11 chr5 134227500 134227936 -18309323 - RMER5 LTR ERV1 -12 522 44 5 1609 1891 141 94 19 chr5 134231887 134232249 -18305010 + ORR1B1 LTR MaLR 6 394 0 5 1609 268 259 106 0 chr5 134232986 134233071 -18304188 - RMER15 LTR ERVL -18 557 464 5 1609 1988 161 50 21 chr5 134233039 134233073 -18304186 - MTC LTR MaLR -28 393 366 5 1609 1890 123 38 68 chr5 134233073 134233412 -18303847 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1609 1988 161 50 21 chr5 134233412 134233759 -18303500 - MTC LTR MaLR -56 365 1 5 1609 831 234 56 9 chr5 134233759 134233967 -18303292 - RMER15 LTR ERVL -74 501 284 5 1609 940 273 151 30 chr5 134233999 134234331 -18302928 - MTD LTR MaLR 0 419 48 5 1609 358 171 42 74 chr5 134234355 134234450 -18302809 - RMER15 LTR ERVL -439 136 45 5 1609 350 387 0 34 chr5 134234732 134234911 -18302348 + LTR84b LTR ERVL 515 687 -74 5 1609 263 313 10 0 chr5 134238008 134238107 -18299152 - MTEb LTR MaLR -13 366 267 5 1609 298 326 11 0 chr5 134238803 134238895 -18298364 - MLT2B3 LTR ERVL -460 94 2 5 1609 1352 245 65 23 chr5 134239880 134240231 -18297028 + MTEa LTR MaLR 14 379 0 5 1609 512 335 57 12 chr5 134240263 134240511 -18296748 - MLT1C LTR MaLR -5 462 204 5 1609 375 181 150 0 chr5 134240563 134240679 -18296580 + MER34B-int LTR ERV1 1610 1713 -3643 5 1609 297 257 84 19 chr5 134242356 134242463 -18294796 - ORR1E LTR MaLR -7 372 259 5 1609 964 233 96 146 chr5 134242504 134242921 -18294338 - MTD LTR MaLR -14 405 10 5 1609 627 259 123 0 chr5 134242931 134243101 -18294158 - ORR1E LTR MaLR -168 191 1 5 1609 339 312 127 30 chr5 134243188 134243353 -18293906 - MLT1L LTR MaLR -3 607 427 5 1609 844 282 41 11 chr5 134243407 134243676 -18293583 - MT2A LTR ERVL -12 521 245 5 1609 536 321 57 37 chr5 134246530 134246776 -18290483 + RMER15 LTR ERVL 325 575 0 6 1609 231 354 147 36 chr5 134247280 134247532 -18289727 - MER31A LTR ERV1 -114 371 92 6 1609 342 259 82 18 chr5 134247562 134247672 -18289587 + MLT1A1 LTR MaLR 271 387 -21 6 1609 361 336 98 47 chr5 134247920 134248023 -18289236 + MLT1A1 LTR MaLR 63 162 -212 6 1609 374 311 36 33 chr5 134248050 134248243 -18289016 + MLT1A1 LTR MaLR 163 408 0 6 1609 253 230 101 22 chr5 134249031 134249120 -18288139 - MTEa LTR MaLR -11 368 273 6 1609 1001 215 160 162 chr5 134249640 134250078 -18287181 - MT2A LTR ERVL -96 437 1 6 1609 704 287 101 16 chr5 134250168 134250416 -18286843 + MTD LTR MaLR 1 269 -150 6 1609 843 283 40 40 chr5 134251952 134252250 -18285009 + RMER15 LTR ERVL 278 575 0 6 1609 1799 235 7 17 chr5 134254422 134254838 -18282421 - MTD LTR MaLR -6 413 2 6 1609 2021 136 63 9 chr5 134255172 134255520 -18281739 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1609 434 319 60 16 chr5 134256980 134257165 -18280094 + RMER15 LTR ERVL 383 575 0 6 1609 741 331 38 66 chr5 134257250 134257485 -18279774 + MT2A LTR ERVL 1 230 -303 6 1609 741 331 38 66 chr5 134257577 134257794 -18279465 + MT2A LTR ERVL 231 440 -93 6 1609 298 233 91 80 chr5 134257779 134257921 -18279338 + MT2A LTR ERVL 344 489 -44 6 1609 298 233 91 80 chr5 134257978 134258021 -18279238 + MT2A LTR ERVL 490 531 -2 6 1609 5621 150 14 18 chr5 134260990 134261952 -18275307 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 6 1609 261 197 155 0 chr5 134262817 134262888 -18274371 + RMER15 LTR ERVL 1 82 -493 6 1609 859 253 100 11 chr5 134263002 134263262 -18273997 + RMER15 LTR ERVL 258 540 -35 6 1609 376 275 108 7 chr5 134264489 134264628 -18272631 - MLT1B LTR MaLR -204 186 34 6 1609 653 164 79 100 chr5 134264629 134264819 -18272440 + ORR1C2 LTR MaLR 1 186 -198 6 1609 1077 176 19 28 chr5 134265049 134265260 -18271999 + ORR1C2 LTR MaLR 174 382 -2 6 1609 869 276 150 0 chr5 134268382 134268704 -18268555 - MTD LTR MaLR -14 405 25 6 1609 320 200 23 12 chr5 134269128 134269214 -18268045 - MTE2b LTR MaLR 0 379 293 6 1609 504 198 23 69 chr5 134269218 134269348 -18267911 + MTEa LTR MaLR 251 374 -5 6 1609 1671 210 66 0 chr5 134272309 134272656 -18264603 + MTE2b LTR MaLR 2 371 -8 6 1609 1146 259 219 12 chr5 134272841 134273272 -18263987 - RMER15 LTR ERVL 0 575 56 6 1609 369 301 70 107 chr5 134274409 134274861 -18262398 - RMER15 LTR ERVL -12 563 1 6 1609 1723 172 243 8 chr5 134275788 134276269 -18260990 + RMER19B LTR ERVK 309 902 0 6 1609 1292 152 189 3 chr5 134276582 134276878 -18260381 - ORR1B2 LTR MaLR -16 351 1 6 1609 305 267 130 130 chr5 134277524 134277778 -18259481 - ORR1E LTR MaLR -42 317 64 6 1609 1156 218 103 22 chr5 134277781 134278100 -18259159 + ORR1E LTR MaLR 15 359 0 6 1609 286 307 13 0 chr5 134278100 134278171 -18259088 - ORR1E LTR MaLR -287 72 1 6 1609 3074 19 0 81 chr5 134279862 134280259 -18257000 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 6 1609 317 279 99 0 chr5 134280728 134280839 -18256420 - MTE2b LTR MaLR -257 122 1 6 1609 395 245 94 0 chr5 134280845 134280951 -18256308 - MTE2b-int LTR MaLR -3 1577 1462 6 1609 1212 303 19 36 chr5 134284129 134284244 -18253015 - MT2A LTR ERVL -119 414 296 6 1609 3034 137 38 33 chr5 134284244 134284765 -18252494 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 6 1609 1212 303 19 36 chr5 134284765 134285070 -18252189 - MT2A LTR ERVL -238 295 1 6 1609 823 268 53 94 chr5 134286409 134286876 -18250383 + RMER15 LTR ERVL 1 538 -37 6 1609 841 252 66 44 chr5 134289255 134289529 -18247730 - RMER15 LTR ERVL 0 575 296 7 1609 279 210 48 36 chr5 134289711 134289787 -18247472 - RMER15 LTR ERVL -453 122 46 7 1609 542 344 54 57 chr5 134291023 134291377 -18245882 + ORR1E LTR MaLR 3 355 -4 7 1609 939 247 101 63 chr5 134291471 134291787 -18245472 + ORR1E LTR MaLR 4 331 -28 7 1609 1099 243 125 0 chr5 134294440 134294777 -18242482 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 7 1609 1004 232 52 105 chr5 134295181 134295362 -18241897 - MTE2a LTR MaLR 0 379 189 7 1609 1004 232 52 105 chr5 134295405 134295623 -18241636 - MTE2a LTR MaLR -191 188 1 7 1609 346 142 2 18 chr5 134295711 134295787 -18241472 - MTEb LTR MaLR -15 364 290 7 1609 373 247 20 51 chr5 134296197 134296295 -18240964 - MTEa LTR MaLR -283 96 2 7 1609 1524 185 76 12 chr5 134300872 134301200 -18236059 + ORR1D1 LTR MaLR 1 349 -25 7 1609 1824 209 45 10 chr5 134302593 134302994 -18234265 + MTD LTR MaLR 4 418 -1 7 1609 521 278 185 22 chr5 134303050 134303282 -18233977 + MTD LTR MaLR 136 405 -14 7 1609 2062 151 34 42 chr5 134305871 134305903 -18231356 + ORR1C1 LTR MaLR 1 20 -358 7 1609 2062 151 34 42 chr5 134306200 134306548 -18230711 + ORR1C1 LTR MaLR 21 378 0 7 1609 575 293 170 22 chr5 134307147 134307458 -18229801 + MTD LTR MaLR 1 357 -62 7 1609 362 283 76 12 chr5 134311537 134311672 -18225587 + MLT1A1 LTR MaLR 1 144 -264 7 1609 3828 170 16 6 chr5 134312236 134312921 -18224338 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 7 1609 1894 144 113 3 chr5 134313605 134313933 -18223326 + ORR1B2 LTR MaLR 4 367 0 7 1609 289 68 0 0 chr5 134315050 134315094 -18222165 + RLTR16 LTR ERVK 5 48 -457 7 1609 2097 178 47 9 chr5 134318533 134318894 -18218365 + RLTR16 LTR ERVK 34 413 -92 7 1609 2097 178 47 9 chr5 134318948 134319029 -18218230 + RLTR16 LTR ERVK 414 492 -13 7 1609 345 189 26 26 chr5 134319026 134319102 -18218157 + RLTR16 LTR ERVK 430 505 0 7 1609 879 232 19 19 chr5 134319432 134319639 -18217620 - ORR1D2 LTR MaLR -163 207 1 7 1609 955 236 112 26 chr5 134321922 134322227 -18215032 + RMER15 LTR ERVL 245 575 0 8 1609 596 305 77 82 chr5 134322685 134323088 -18214171 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 8 1609 265 308 25 17 chr5 134323904 134324023 -18213236 - RMER15 LTR ERVL -5 570 451 8 1609 327 316 10 0 chr5 134324853 134324951 -18212308 + MLT2B3 LTR ERVL 2 100 -454 8 1609 2475 146 37 15 chr5 134325342 134325752 -18211507 - MTC LTR MaLR -2 419 1 8 1609 432 288 29 29 chr5 134327747 134327883 -18209376 + RMER20B LTR ERVK 1 136 -491 8 1609 1539 188 24 94 chr5 134330010 134330235 -18207024 - MTD LTR MaLR 0 419 207 8 1609 1539 199 34 86 chr5 134330801 134330976 -18206283 - MTD LTR MaLR -213 206 6 8 1609 1780 180 92 9 chr5 134333717 134334054 -18203205 + MTEa LTR MaLR 6 370 -9 8 1609 352 245 108 81 chr5 134334073 134334184 -18203075 + MLT1A LTR MaLR 34 147 -227 8 1609 345 299 147 32 chr5 134334723 134334941 -18202318 - MLT1J LTR MaLR -2 510 268 8 1609 966 260 48 124 chr5 134335074 134335535 -18201724 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 5 8 1609 285 381 19 71 chr5 134338384 134338692 -18198567 - MT2A LTR ERVL -137 396 105 8 1609 930 263 34 111 chr5 134340006 134340331 -18196928 - RMER15 LTR ERVL -3 572 273 8 1609 298 364 84 40 chr5 134341390 134341513 -18195746 + MLT1C LTR MaLR 181 310 -157 8 1609 1083 270 72 3 chr5 134341513 134341844 -18195415 - ORR1E LTR MaLR -2 357 4 8 1609 298 364 84 40 chr5 134341844 134341995 -18195264 + MLT1C LTR MaLR 311 467 0 8 1609 363 256 46 79 chr5 134343666 134343864 -18193395 - MTE2a LTR MaLR -17 362 158 8 1609 1148 281 100 18 chr5 134344919 134345300 -18191959 + MTD LTR MaLR 8 419 0 8 1609 279 221 45 71 chr5 134345957 134346069 -18191190 + RMER15 LTR ERVL 61 169 -406 8 1609 492 296 164 45 chr5 134346055 134346324 -18190935 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 8 1609 1298 260 141 79 chr5 134347794 134348290 -18188969 - RMER15 LTR ERVL -14 561 35 8 201 1119 232 106 35 chr5 134348461 134348876 -18188383 + RMER15 LTR ERVL 39 574 -1 8 1610 6075 112 55 7 chr5 134349162 134350074 -18187185 + RMER17B LTR ERVK 1 956 -2 8 1610 2247 206 41 39 chr5 134357580 134358032 -18179227 + RMER15 LTR ERVL 27 486 -89 8 1610 2044 138 12 3 chr5 134358032 134358351 -18178908 + ORR1A3 LTR MaLR 5 326 0 8 1610 2247 206 41 39 chr5 134358351 134358387 -18178872 + RMER15 LTR ERVL 487 516 -59 8 1610 268 273 0 0 chr5 134359613 134359668 -18177591 + RMER15 LTR ERVL 5 59 -516 8 1610 2192 209 81 81 chr5 134359702 134360243 -18177016 + RMER15 LTR ERVL 34 574 -1 8 1610 907 263 47 60 chr5 134363551 134363600 -18173659 + ORR1E LTR MaLR 1 47 -312 8 1610 907 263 47 60 chr5 134363808 134364122 -18173137 + ORR1E LTR MaLR 48 359 0 8 1610 709 253 6 24 chr5 134364759 134364929 -18172330 - MTC-int LTR MaLR -715 543 377 9 1610 233 222 18 18 chr5 134365434 134365489 -18171770 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 342 9 1610 3091 129 45 10 chr5 134367721 134368230 -18169029 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 9 1610 2882 217 74 81 chr5 134368500 134369470 -18167789 - RMER17B LTR ERVK -44 864 1 9 1610 679 262 9 40 chr5 134369891 134370109 -18167150 + MTEa LTR MaLR 1 187 -234 9 1610 914 221 80 10 chr5 134370391 134370611 -18166648 + MTEa LTR MaLR 168 418 -1 9 1610 2315 100 12 39 chr5 134373357 134373690 -18163569 + ORR1A3 LTR MaLR 3 326 0 9 1610 1011 271 48 84 chr5 134375050 134375473 -18161786 + MTE2a LTR MaLR 10 406 -13 9 1610 3313 178 30 24 chr5 134377374 134378012 -18159247 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 9 1610 523 341 71 0 chr5 134378387 134378557 -18158702 + ORR1E LTR MaLR 1 182 -177 9 1610 1976 127 16 10 chr5 134378564 134378874 -18158385 + ORR1A4 LTR MaLR 18 329 0 9 1610 351 146 19 7 chr5 134380419 134380490 -18156769 - MTE2a LTR MaLR -11 368 282 9 1610 4296 141 26 38 chr5 134380545 134380595 -18156664 - RMER6A LTR ERVK 0 756 714 9 1610 4296 141 26 38 chr5 134380756 134381099 -18156160 - RMER6A LTR ERVK -43 713 386 9 1610 4296 141 26 38 chr5 134381145 134381515 -18155744 - RMER6A LTR ERVK -371 385 2 9 1610 716 330 64 7 chr5 134382050 134382331 -18154928 - RMER15 LTR ERVL 0 575 279 9 1610 555 264 171 96 chr5 134382588 134382827 -18154432 + MTE2b LTR MaLR 1 257 -122 9 1610 684 221 0 0 chr5 134383093 134383215 -18154044 + MTE2b LTR MaLR 255 376 -3 9 1610 357 253 76 103 chr5 134384003 134384188 -18153071 - MTEa LTR MaLR -22 357 178 9 1610 754 303 78 15 chr5 134385791 134386059 -18151200 - ORR1E LTR MaLR -10 349 65 9 1610 689 329 66 23 chr5 134386185 134386443 -18150816 + RMER15 LTR ERVL 262 530 -45 9 1610 418 239 0 0 chr5 134386622 134386710 -18150549 - ORR1E LTR MaLR -270 89 2 9 1610 327 134 0 107 chr5 134391617 134391692 -18145567 + ORR1A4 LTR MaLR 92 158 -171 9 1610 1651 134 50 96 chr5 134392155 134392518 -18144741 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 9 1610 344 204 22 22 chr5 134393836 134393926 -18143333 - RMER15 LTR ERVL -62 513 424 9 1610 259 282 70 35 chr5 134394051 134394165 -18143094 - RMER15 LTR ERVL -445 130 13 9 1610 372 292 50 38 chr5 134394227 134394387 -18142872 - RMER15 LTR ERVL -115 460 299 9 1610 3003 145 41 18 chr5 134395964 134396476 -18140783 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 9 1610 1470 238 12 15 chr5 134398388 134398717 -18138542 - MTEa LTR MaLR 0 379 52 9 1610 384 127 0 0 chr5 134398908 134398971 -18138288 - MTEa LTR MaLR -316 63 1 9 1610 371 314 50 28 chr5 134399903 134400083 -18137176 + ORR1E LTR MaLR 1 184 -175 1 1610 1222 198 132 39 chr5 134405438 134405801 -18131458 + MTD LTR MaLR 8 404 -15 1 1610 1410 176 111 48 chr5 134406750 134407203 -18130056 + RMER17B LTR ERVK 1 439 -519 1 1610 2138 213 45 44 chr5 134407189 134407782 -18129477 + RMER13B LTR ERVK 311 904 -4 1 1610 252 323 10 20 chr5 134408735 134408836 -18128423 + MTEa LTR MaLR 278 377 -2 1 1610 2543 135 42 2 chr5 134410300 134410700 -18126559 - MTC LTR MaLR -4 417 2 1 1610 478 279 72 38 chr5 134411336 134411545 -18125714 + MLT1B LTR MaLR 22 237 -153 1 1610 407 186 35 0 chr5 134411897 134411983 -18125276 - MTE2b LTR MaLR -290 89 1 1 1610 541 165 10 0 chr5 134412312 134412409 -18124850 + MTE2b LTR MaLR 9 106 -273 1 1610 609 349 28 34 chr5 134412411 134412737 -18124522 + MTD LTR MaLR 1 324 -95 1 1610 558 304 97 21 chr5 134412760 134413049 -18124210 - MTD LTR MaLR -107 312 2 1 1610 262 204 56 22 chr5 134413063 134413153 -18124106 + ORR1E LTR MaLR 261 353 -6 1 1610 672 283 106 59 chr5 134414153 134414330 -18122929 + MTD LTR MaLR 1 183 -236 1 1610 3331 200 130 56 chr5 134414330 134415175 -18122084 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 1 1610 672 250 65 61 chr5 134415175 134415397 -18121862 + MTD LTR MaLR 184 405 -14 1 1610 920 246 112 19 chr5 134417193 134417540 -18119719 - MTD LTR MaLR -14 405 6 1 1610 778 272 60 24 chr5 134417787 134418036 -18119223 - RMER15 LTR ERVL 0 575 318 1 1610 237 275 45 84 chr5 134418072 134418227 -18119032 - RMER15 LTR ERVL -414 161 13 1 1610 398 252 52 9 chr5 134419660 134419776 -18117483 + MTEa LTR MaLR 1 121 -258 1 1610 256 233 17 0 chr5 134421407 134421467 -18115792 + ORR1B2 LTR MaLR 1 61 -306 1 1610 1621 189 78 6 chr5 134421524 134421859 -18115400 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 1 1610 785 264 234 24 chr5 134422312 134422693 -18114566 - RMER20B LTR ERVK -39 588 128 1 1610 307 270 291 9 chr5 134423470 134423683 -18113576 - RMER15 LTR ERVL -2 573 301 1 1610 1969 197 5 22 chr5 134424107 134424507 -18112752 - MTD LTR MaLR -8 411 19 1 1610 2880 22 5 88 chr5 134425311 134425711 -18111548 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1610 29242 25 1 1 chr5 134425711 134428982 -18108277 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 1 1610 7402 96 75 67 chr5 134428981 134430277 -18106982 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 1 1610 2855 25 5 88 chr5 134430277 134430677 -18106582 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 1 1610 496 290 13 13 chr5 134431416 134431573 -18105686 - MTD LTR MaLR -262 157 1 1 1610 553 223 35 35 chr5 134436972 134437144 -18100115 - RMER15 LTR ERVL -12 563 392 1 1610 629 265 37 11 chr5 134438263 134438450 -18098809 - MTE2a LTR MaLR 0 379 188 1 1610 266 310 44 52 chr5 134439764 134439900 -18097359 - RMER15 LTR ERVL -15 560 426 1 1610 3531 152 177 1 chr5 134440119 134440831 -18096428 - RMER21B LTR ERV1 -5 837 1 1 1610 2397 151 9 57 chr5 134441082 134441524 -18095735 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1610 799 268 32 28 chr5 134441750 134442000 -18095259 - MTE2a LTR MaLR 0 379 129 1 1610 2337 127 67 11 chr5 134442147 134442520 -18094739 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1610 716 206 15 0 chr5 134442887 134443023 -18094236 - MTE2a LTR MaLR -241 138 1 1 1610 273 245 29 58 chr5 134443293 134443397 -18093862 + RMER15 LTR ERVL 62 162 -413 1 1610 839 270 42 9 chr5 134443452 134443669 -18093590 + RMER15 LTR ERVL 352 575 0 1 1610 292 349 34 122 chr5 134443704 134443998 -18093261 + ORR1E LTR MaLR 92 359 0 1 1610 352 221 0 0 chr5 134447690 134447758 -18089501 + RMER15 LTR ERVL 403 470 -105 1 1610 413 236 87 92 chr5 134447854 134448010 -18089249 + ORR1E LTR MaLR 142 293 -66 1 1610 413 236 87 92 chr5 134448040 134448056 -18089203 + ORR1E LTR MaLR 294 312 -47 1 1610 779 275 5 11 chr5 134448079 134448270 -18088989 + MTD LTR MaLR 4 193 -228 1 1610 954 243 48 13 chr5 134448439 134448668 -18088591 + MTD LTR MaLR 169 405 -14 1 1610 515 292 91 25 chr5 134448979 134449221 -18088038 - RMER15 LTR ERVL 0 575 318 1 1610 234 282 27 40 chr5 134449286 134449360 -18087899 - RMER15 LTR ERVL -459 116 44 1 1610 321 251 165 97 chr5 134450381 134450647 -18086612 - ORR1D1 LTR MaLR -44 330 58 1 1610 229 253 163 35 chr5 134450853 134450866 -18086393 + MT2B2 LTR ERVL 244 267 -317 1 1610 1149 262 0 24 chr5 134451155 134451405 -18085854 - MTEa LTR MaLR -115 264 21 1 1610 586 207 113 7 chr5 134452202 134452323 -18084936 + MTC LTR MaLR 2 137 -284 1 1610 1139 253 87 83 chr5 134452323 134452870 -18084389 + RMER13A LTR ERVK 1 556 -71 1 1610 1856 116 51 0 chr5 134453074 134453350 -18083909 + MTC LTR MaLR 132 421 0 1 1610 233 293 0 16 chr5 134453621 134453746 -18083513 + ORR1B1-int LTR MaLR 632 754 -755 1 1610 2362 199 78 14 chr5 134456992 134457477 -18079782 + MT2A LTR ERVL 18 533 0 1 1610 891 269 125 72 chr5 134457900 134458261 -18078998 - MTD LTR MaLR 0 419 40 1 1610 230 254 0 63 chr5 134461756 134461785 -18075474 - MT2B LTR ERVL -343 258 234 1 1610 1280 236 18 43 chr5 134463144 134463472 -18073787 + MTD LTR MaLR 42 361 -58 1 1610 258 308 0 103 chr5 134463590 134463677 -18073582 - RMER21B LTR ERV1 -111 836 759 1 1610 1099 208 96 26 chr5 134463680 134463952 -18073307 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 277 1 1610 226 213 35 128 chr5 134463997 134464083 -18073176 + ORR1D2 LTR MaLR 292 369 -1 1 1610 949 258 55 42 chr5 134464086 134464397 -18072862 - RMER15 LTR ERVL -39 536 222 1 1610 231 242 104 15 chr5 134465121 134465188 -18072071 + MLT1A0 LTR MaLR 293 365 0 1 1610 521 205 133 90 chr5 134465972 134466160 -18071099 - MLT1C LTR MaLR -270 197 2 1 1610 1628 163 72 13 chr5 134466740 134467045 -18070214 + MTD LTR MaLR 1 323 -96 1 1610 458 235 66 36 chr5 134468245 134468382 -18068877 + RMER15 LTR ERVL 1 141 -434 1 1610 457 176 58 10 chr5 134469922 134470025 -18067234 + MTD LTR MaLR 312 419 0 1 1610 415 314 39 0 chr5 134470648 134470750 -18066509 - ORR1E LTR MaLR -253 106 1 1 1610 848 206 210 89 chr5 134471785 134472146 -18065113 - MTD LTR MaLR 0 419 21 1 1610 247 351 45 8 chr5 134473143 134473275 -18063984 - RMER15 LTR ERVL -5 570 434 1 1610 649 325 110 96 chr5 134474225 134474508 -18062751 + ORR1E LTR MaLR 1 307 -52 1 1610 649 325 110 96 chr5 134474721 134474791 -18062468 + ORR1E LTR MaLR 308 359 0 1 1610 2897 190 26 17 chr5 134477619 134478155 -18059104 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 1 1610 1800 192 82 40 chr5 134478626 134479028 -18058231 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1611 315 243 0 28 chr5 134479942 134480014 -18057245 - ORR1E LTR MaLR -287 72 3 1 1611 233 358 112 9 chr5 134480584 134480691 -18056568 + ORR1D2 LTR MaLR 122 239 -131 1 1611 279 335 76 9 chr5 134486406 134486537 -18050722 - MLT1A0 LTR MaLR -239 169 21 1 1611 817 238 232 24 chr5 134488539 134488836 -18048423 + MLT1A0 LTR MaLR 4 362 -3 1 1611 516 307 105 87 chr5 134489031 134489363 -18047896 - ORR1E LTR MaLR -15 344 7 1 1611 686 315 42 51 chr5 134493492 134493803 -18043456 - ORR1E LTR MaLR -46 313 6 1 1611 1351 241 133 27 chr5 134493945 134494312 -18042947 - MTD LTR MaLR -13 406 1 1 1611 1310 180 164 141 chr5 134496791 134497218 -18040041 - MT2A LTR ERVL -96 437 1 1 1611 1775 184 30 14 chr5 134497614 134497977 -18039282 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 1 1611 476 312 112 78 chr5 134498440 134498788 -18038471 - MTEa LTR MaLR -14 365 6 1 1611 586 229 275 17 chr5 134499026 134499266 -18037993 - MTD LTR MaLR 0 419 118 1 1611 2772 31 28 0 chr5 134512015 134512333 -18024926 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 2 1611 261 218 18 0 chr5 134512350 134512405 -18024854 - MLT1A0 LTR MaLR -54 311 256 2 1611 340 252 47 137 chr5 134512463 134512633 -18024626 - MTEb LTR MaLR -2 377 201 2 1611 461 240 48 40 chr5 134512720 134512846 -18024413 - MTEb LTR MaLR 0 379 253 2 1611 435 275 63 24 chr5 134512967 134513157 -18024102 - MTEb LTR MaLR -184 194 1 2 1611 1959 193 78 13 chr5 134513361 134513744 -18023515 + MTC LTR MaLR 1 408 -13 3 1611 456 301 41 27 chr5 134513723 134513870 -18023389 - MTEa LTR MaLR -15 364 216 3 1611 256 154 0 0 chr5 134513868 134513907 -18023352 - MTEa LTR MaLR -340 39 1 3 1611 351 314 46 146 chr5 134514543 134514823 -18022436 - ORR1E LTR MaLR -5 354 103 3 1611 263 250 100 40 chr5 134514865 134514965 -18022294 - MLT1A1 LTR MaLR -279 129 24 3 1611 272 335 102 87 chr5 134516331 134516527 -18020732 + MER21B LTR ERV1 101 299 -564 4 1611 494 289 161 76 chr5 134517233 134517469 -18019790 + ORR1E LTR MaLR 44 299 -60 4 1611 251 277 111 134 chr5 134517588 134517625 -18019634 + ORR1E LTR MaLR 318 371 -8 4 1611 889 283 52 77 chr5 134517719 134518044 -18019215 + MTE2a LTR MaLR 40 356 -23 4 1611 256 268 68 23 chr5 134519792 134519880 -18017379 + MLT1A1 LTR MaLR 259 350 -58 5 1611 1537 208 76 22 chr5 134522889 134523244 -18014015 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1611 327 328 90 52 chr5 134525172 134525461 -18011798 - ORR1D2 LTR MaLR -70 300 1 6 1611 275 281 71 0 chr5 134525570 134525671 -18011588 + MTD LTR MaLR 4 107 -312 6 1611 1255 259 63 24 chr5 134525675 134526008 -18011251 - ORR1E LTR MaLR -5 354 9 6 1611 757 241 36 39 chr5 134527531 134527826 -18009433 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 37 7 1611 505 195 16 74 chr5 134528309 134528395 -18008864 + MTE2b LTR MaLR 2 87 -292 7 1611 505 195 16 74 chr5 134528571 134528605 -18008654 + MTE2b LTR MaLR 88 115 -264 7 1611 268 336 98 8 chr5 134528882 134529014 -18008245 + MTE2b LTR MaLR 197 340 -39 7 1611 554 179 109 132 chr5 134530812 134530986 -18006273 + MTE2a LTR MaLR 21 190 -189 8 1611 610 199 163 13 chr5 134531590 134531743 -18005516 - ORR1E LTR MaLR 0 359 184 8 1611 425 217 269 21 chr5 134532260 134532401 -18004858 + MTE2a LTR MaLR 202 377 -2 8 1611 235 327 77 43 chr5 134535967 134536175 -18001084 - RLTR21 LTR ERVK -271 1301 1087 1 1611 818 306 81 19 chr5 134542817 134543124 -17994135 - MLT1D LTR MaLR -2 503 178 1 1611 426 311 30 0 chr5 134543608 134543743 -17993516 - MLT1D LTR MaLR -342 163 25 1 1611 1935 156 25 0 chr5 134544334 134544649 -17992610 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 7 1 1611 273 310 2 31 chr5 134544731 134544827 -17992432 + MTEb LTR MaLR 289 379 0 1 1611 930 280 44 61 chr5 134545837 134546130 -17991129 + RMER15 LTR ERVL 275 562 -13 1 1611 2054 148 28 34 chr5 134546543 134546899 -17990360 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 1611 226 229 295 0 chr5 134547789 134547850 -17989409 + ORR1E LTR MaLR 281 359 0 1 1611 574 281 75 68 chr5 134548530 134548887 -17988372 + ORR1E LTR MaLR 12 371 -3 1 1611 509 235 182 7 chr5 134551270 134551424 -17985835 + RMER15 LTR ERVL 395 575 0 1 1611 437 264 47 0 chr5 134552016 134552122 -17985137 + MTEa LTR MaLR 137 247 -132 1 1611 699 246 47 26 chr5 134552486 134552720 -17984539 - RLTR15 LTR ERVK -119 240 2 1 1611 265 345 93 7 chr5 134553570 134553710 -17983549 + MLT2B2 LTR ERVL 331 482 -80 1 1611 602 255 94 113 chr5 134554189 134554442 -17982817 + ORR1E LTR MaLR 22 246 -121 1 1611 1074 223 173 36 chr5 134554451 134554758 -17982501 + ORR1E LTR MaLR 7 355 -4 1 1611 261 317 19 19 chr5 134554763 134554869 -17982390 + ORR1E LTR MaLR 269 374 -5 1 1611 256 284 0 0 chr5 134556559 134556626 -17980633 + MLT1D LTR MaLR 439 505 0 1 1611 1614 155 102 9 chr5 134558619 134558952 -17978307 - ORR1B2 LTR MaLR -3 364 1 1 1611 260 363 26 0 chr5 134558971 134559084 -17978175 + MLT1A0 LTR MaLR 197 312 -53 1 1611 257 264 14 27 chr5 134560370 134560444 -17976815 - RLTR25B LTR ERVK -529 499 427 1 1611 1225 241 82 34 chr5 134561217 134561570 -17975689 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 1611 247 311 77 53 chr5 134561570 134561667 -17975592 - MLT2B1 LTR ERVL -52 515 411 2 1611 484 335 17 94 chr5 134561708 134561942 -17975317 - MT2A LTR ERVL -183 350 135 2 1611 309 343 0 29 chr5 134561940 134562045 -17975214 - MTEa LTR MaLR -265 114 13 2 1611 289 300 0 29 chr5 134564006 134564109 -17973150 + MLT1A1 LTR MaLR 293 392 -16 2 1611 331 331 28 121 chr5 134565209 134565498 -17971761 + ORR1E LTR MaLR 98 359 0 2 1611 1639 173 134 8 chr5 134566303 134566675 -17970584 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1611 828 163 7 0 chr5 134567498 134567639 -17969620 - ORR1D2 LTR MaLR -228 142 1 2 1611 2091 125 6 12 chr5 134567957 134568288 -17968971 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1611 2218 137 198 5 chr5 134569505 134569944 -17967315 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 2 1611 630 202 98 27 chr5 134570377 134570643 -17966616 + RMER19C LTR ERVK 153 611 0 2 1611 2216 107 3 3 chr5 134572676 134573003 -17964256 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1611 898 242 60 123 chr5 134581708 134581822 -17955437 - ORR1E LTR MaLR 0 359 243 2 1611 898 242 60 123 chr5 134581850 134582116 -17955143 - ORR1E LTR MaLR -117 242 3 2 1611 2157 136 5 62 chr5 134587557 134587958 -17949301 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1611 258 305 91 55 chr5 134588062 134588338 -17948921 - ORR1D2 LTR MaLR -9 370 81 2 1611 351 280 11 0 chr5 134589044 134589137 -17948122 + MLT1F LTR MaLR 143 236 -312 3 1611 500 278 79 6 chr5 134592188 134592405 -17944854 + MLT2B3 LTR ERVL 197 428 -87 3 1611 340 248 25 107 chr5 134603734 134603856 -17933403 + MT2B LTR ERVL 154 265 -336 3 1611 2082 273 109 99 chr5 134604432 134605703 -17931556 - RMER12 LTR ERVK -38 1284 1 3 1611 530 241 229 47 chr5 134608521 134608774 -17928485 - RMER15 LTR ERVL -2 573 275 3 1612 332 286 23 105 chr5 134616711 134616844 -17920415 - MT2B LTR ERVL -337 264 143 3 1612 228 255 68 37 chr5 134616716 134616879 -17920380 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 587 3 1612 895 243 116 73 chr5 134618336 134618638 -17918621 - MTEa LTR MaLR -37 342 28 3 1612 258 315 43 0 chr5 134620352 134620444 -17916815 - MLT1D LTR MaLR 0 505 410 3 1612 346 321 28 40 chr5 134622768 134622918 -17914341 + MTE2b LTR MaLR 3 141 -229 4 1612 351 291 44 44 chr5 134622988 134623146 -17914113 + MTE2b LTR MaLR 191 348 -31 4 1612 2708 129 24 17 chr5 134626134 134626318 -17910941 + MTC LTR MaLR 1 186 -235 4 1612 2708 129 24 17 chr5 134626389 134626622 -17910637 + MTC LTR MaLR 187 421 0 4 1612 353 255 30 10 chr5 134635137 134635236 -17902023 + ORR1E LTR MaLR 66 166 -193 4 1612 416 339 109 67 chr5 134636160 134636609 -17900650 + MLT1F2 LTR MaLR 8 475 -85 4 1612 232 164 143 32 chr5 134639903 134639966 -17897293 + MT2B LTR ERVL 218 287 -314 4 1612 585 158 0 77 chr5 134641883 134642013 -17895246 + MTC LTR MaLR 1 120 -301 4 1612 1447 155 90 4 chr5 134642163 134642442 -17894817 + MTC LTR MaLR 111 413 -8 4 1612 278 189 14 42 chr5 134643675 134643747 -17893512 + RLTR25B LTR ERVK 438 507 -521 4 1612 1239 19 6 0 chr5 134655194 134655350 -17881909 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 182 5 1612 315 289 31 69 chr5 134655328 134655458 -17881801 + MT2B LTR ERVL 139 263 -338 5 1612 286 262 26 104 chr5 134656477 134656592 -17880667 - MT2B LTR ERVL -337 264 159 5 1612 347 286 100 50 chr5 134657955 134658135 -17879124 + ORR1E LTR MaLR 1 189 -170 5 1612 361 272 7 81 chr5 134668870 134669006 -17868253 - MT2B2 LTR ERVL -322 262 137 5 1612 254 312 36 79 chr5 134669787 134669926 -17867333 - ORR1D2 LTR MaLR -202 168 36 6 1612 1928 200 114 10 chr5 134671600 134672013 -17865246 - MT2A LTR ERVL -77 456 1 6 1612 237 265 39 10 chr5 134672013 134672116 -17865143 - ORR1D2 LTR MaLR -87 283 178 6 1612 380 308 7 65 chr5 134674900 134675039 -17862220 + MT2B LTR ERVL 127 257 -344 6 1612 1388 205 99 58 chr5 134679722 134680055 -17857204 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 31 6 1612 1388 205 99 58 chr5 134680243 134680272 -17856987 - ORR1C1 LTR MaLR -348 30 2 6 1612 2344 148 32 10 chr5 134681076 134681480 -17855779 - MTC LTR MaLR -8 413 1 6 1612 1899 164 52 0 chr5 134684943 134685290 -17851969 + ORR1D1 LTR MaLR 10 374 0 6 1612 1011 203 105 4 chr5 134686660 134686907 -17850352 - MTEa LTR MaLR -46 333 62 6 1612 308 228 20 89 chr5 134694897 134694998 -17842261 + MT2B LTR ERVL 164 257 -344 7 1612 2145 106 89 137 chr5 134696078 134696455 -17840804 - MTC LTR MaLR -4 417 63 7 1612 2145 106 89 137 chr5 134696616 134696675 -17840584 - MTC LTR MaLR -359 62 2 7 1612 1403 202 97 37 chr5 134699887 134700267 -17836992 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 7 1612 622 283 61 32 chr5 134721444 134721711 -17815548 + RLTR12B LTR ERVK 47 304 -224 7 1612 1594 177 45 84 chr5 134723418 134723800 -17813459 + ORR1C2 LTR MaLR 11 377 -7 7 1612 2159 228 92 16 chr5 134723800 134724374 -17812885 + ORR1C2-int LTR MaLR 2 619 -890 7 1612 2134 165 209 16 chr5 134724375 134724929 -17812330 + ORR1C2-int LTR MaLR 849 1509 0 7 1612 960 222 203 45 chr5 134724930 134725260 -17811999 + ORR1C2 LTR MaLR 2 383 -1 7 1612 2577 140 11 33 chr5 134726494 134726951 -17810308 + RMER6A LTR ERVK 310 756 0 7 1612 267 337 11 11 chr5 134728536 134728629 -17808630 + RMER15-int LTR ERVL 4848 4940 -59 7 1612 470 203 194 7 chr5 134735537 134735681 -17801578 + ETnERV2-int LTR ERVK 6255 6425 -981 8 1612 352 94 0 36 chr5 134735893 134735948 -17801311 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7383 -23 8 1612 2900 107 22 2 chr5 134735968 134736380 -17800879 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 8 1612 767 271 174 20 chr5 134736955 134737287 -17799972 + MTD LTR MaLR 15 366 -13 8 1613 390 257 93 108 chr5 134747594 134747808 -17789451 + MT2B LTR ERVL 59 269 -332 8 1613 228 171 108 139 chr5 134748351 134748480 -17788779 - MER88 LTR ERVL -327 137 13 8 1613 1120 150 63 76 chr5 134760014 134760252 -17777007 - RMER4A LTR ERVK 0 466 232 8 1613 702 247 6 34 chr5 134765440 134765616 -17771643 - MTD LTR MaLR -247 172 2 8 1613 1842 177 35 42 chr5 134772395 134772772 -17764487 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 1613 1801 148 115 12 chr5 134777890 134778212 -17759047 + ORR1B1 LTR MaLR 2 356 -38 9 1613 314 236 16 172 chr5 134779109 134779237 -17758022 + MT2B LTR ERVL 133 240 -361 9 1613 1374 171 53 84 chr5 134794545 134794611 -17742648 + RMER4B LTR ERVK 1 60 -525 9 1613 1374 171 53 84 chr5 134794801 134795092 -17742167 + RMER4B LTR ERVK 61 347 -238 9 1613 307 325 122 66 chr5 134797401 134797688 -17739571 + RMER5 LTR ERV1 65 367 -167 9 1613 846 234 92 238 chr5 134802218 134802454 -17734805 - MTD LTR MaLR 0 419 207 1 1613 846 234 92 238 chr5 134802589 134802632 -17734627 - MTD LTR MaLR -213 206 206 1 1613 846 234 92 238 chr5 134802812 134803018 -17734241 - MTD LTR MaLR -213 206 4 1 1613 279 139 89 89 chr5 134804237 134804316 -17732943 + RLTR25B LTR ERVK 431 509 -519 1 1613 277 238 16 0 chr5 134805273 134805336 -17731923 + RMER16 LTR ERVK 332 395 -138 1 1613 309 265 29 19 chr5 134805334 134805438 -17731821 - MTE2a LTR MaLR -167 212 108 1 1613 392 246 11 109 chr5 134805531 134805623 -17731636 - MTE2a LTR MaLR -280 99 18 1 1613 3424 90 5 0 chr5 134812809 134813244 -17724015 - RLTR9B LTR ERVK 0 437 1 1 1613 3013 29 40 6 chr5 134821956 134822309 -17714950 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 1 1613 494 235 33 8 chr5 134822555 134822675 -17714584 - RLTR11A2 LTR ERVK -329 198 76 1 1613 2293 122 12 0 chr5 134822679 134822999 -17714260 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 1 1613 336 195 380 8 chr5 134823179 134823308 -17713951 + MTEb LTR MaLR 1 177 -202 1 1613 980 194 62 10 chr5 134823760 134823968 -17713291 + MTEb LTR MaLR 161 379 0 1 1613 267 267 17 125 chr5 134823983 134824030 -17713229 + MT2B LTR ERVL 135 241 -360 1 1613 1750 176 165 18 chr5 134824103 134824549 -17712710 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 1613 416 294 80 29 chr5 134824549 134824721 -17712538 - RMER15 LTR ERVL -39 536 356 1 1613 953 253 211 19 chr5 134837151 134837469 -17699790 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1613 288 353 42 26 chr5 134838540 134838729 -17698530 + ORR1E LTR MaLR 2 193 -166 1 1613 939 266 195 22 chr5 134839379 134839702 -17697557 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1613 2117 179 143 21 chr5 134842766 134843285 -17693974 + RMER4B LTR ERVK 1 582 -3 1 1613 361 293 66 82 chr5 134844869 134845051 -17692208 + MT2B2 LTR ERVL 86 264 -320 1 1613 1080 229 128 10 chr5 134847859 134848172 -17689087 + MTD LTR MaLR 60 409 -10 1 1613 1358 143 42 56 chr5 134857269 134857557 -17679702 + RMER6B LTR ERVK 1 284 -177 1 1613 998 149 17 11 chr5 134857955 134858131 -17679128 + RMER6B LTR ERVK 283 459 -2 1 1613 721 276 87 56 chr5 134862460 134862824 -17674435 + MTE2a LTR MaLR 38 404 -15 1 1613 1358 255 46 16 chr5 134868429 134868796 -17668463 + MTEb LTR MaLR 2 379 0 1 1613 746 223 179 52 chr5 134869599 134869907 -17667352 + MTD LTR MaLR 50 396 -23 1 1614 3245 132 110 18 chr5 134873542 134874106 -17663153 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 1 1614 4199 121 79 13 chr5 134875732 134876017 -17661242 + RMER6A LTR ERVK 1 324 -432 1 1614 4199 121 79 13 chr5 134876161 134876584 -17660675 + RMER6A LTR ERVK 325 756 0 1 1614 1497 185 105 24 chr5 134876628 134876961 -17660298 + MTD LTR MaLR 46 405 -14 1 1614 479 348 62 9 chr5 134878895 134879121 -17658138 + MLT1F1 LTR MaLR 29 266 -303 1 1614 472 354 44 6 chr5 134879237 134879396 -17657863 + MTEa LTR MaLR 3 167 -212 1 1614 1767 173 76 32 chr5 134881313 134881683 -17655576 + ORR1B1 LTR MaLR 9 394 0 1 1614 9166 167 19 45 chr5 134881683 134884087 -17653172 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1792 0 1 1614 1278 249 15 111 chr5 134884577 134884984 -17652275 + MTE2a LTR MaLR 12 379 0 1 1614 445 299 182 18 chr5 134887358 134887583 -17649676 + MTE2a LTR MaLR 55 316 -63 1 1614 256 202 21 116 chr5 134888247 134888271 -17648988 + MT2A LTR ERVL 3 17 -584 1 1614 2011 126 95 20 chr5 134888271 134888619 -17648640 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 1 1614 326 239 0 0 chr5 134888619 134888690 -17648569 + MT2A LTR ERVL 18 88 -445 1 1614 1365 166 202 86 chr5 134888965 134889365 -17647894 + MT2A LTR ERVL 75 461 -72 1 1614 1365 161 161 101 chr5 134889435 134889474 -17647785 + MT2A LTR ERVL 462 487 -46 1 1614 1365 161 161 101 chr5 134889796 134889850 -17647409 + MT2A LTR ERVL 488 533 0 1 1614 320 316 140 72 chr5 134893371 134893467 -17643792 + RMER15 LTR ERVL 324 425 -150 1 1614 1224 191 117 86 chr5 134893467 134893827 -17643432 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 1 1614 320 316 140 72 chr5 134893827 134893952 -17643307 + RMER15 LTR ERVL 426 560 -15 1 1614 3834 135 58 6 chr5 134895204 134895888 -17641371 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 1 1614 291 249 9 97 chr5 134901267 134901468 -17635791 + MTEa LTR MaLR 63 250 -120 1 1614 332 191 35 35 chr5 134901540 134901627 -17635632 + MTEa LTR MaLR 293 379 0 1 1614 445 320 16 54 chr5 134905462 134905647 -17631612 - MTEb LTR MaLR -59 320 143 1 1614 2150 128 69 23 chr5 134912755 134913146 -17624113 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 1614 2486 103 48 18 chr5 134914978 134915375 -17621884 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 1614 3599 139 77 11 chr5 134919445 134920108 -17617151 - RMER6D LTR ERVK -5 715 9 1 1614 240 273 0 61 chr5 134925605 134925687 -17611572 - MT2B LTR ERVL -337 264 188 1 1614 3653 141 70 26 chr5 134927100 134927427 -17609832 + RMER6D LTR ERVK 1 359 -361 1 1614 3653 141 70 26 chr5 134927463 134927825 -17609434 + RMER6D LTR ERVK 360 720 0 1 1614 248 277 39 96 chr5 134929343 134929447 -17607812 + MT2B2 LTR ERVL 158 255 -329 1 1614 254 308 34 110 chr5 134937584 134937730 -17599529 - MT2B LTR ERVL -323 278 144 1 1614 285 239 10 115 chr5 134941204 134941308 -17595951 - MT2B LTR ERVL -357 244 152 1 1614 274 389 136 11 chr5 134948556 134948733 -17588526 + MLT1J LTR MaLR 115 313 -199 1 1614 1073 244 142 94 chr5 134948790 134948852 -17588407 - MT2A LTR ERVL -8 525 465 1 1614 1073 244 142 94 chr5 134948920 134949358 -17587901 - MT2A LTR ERVL -69 464 1 1 1614 259 225 39 128 chr5 134951368 134951403 -17585856 + MT2B LTR ERVL 132 222 -377 1 1614 2489 126 22 15 chr5 134951470 134951882 -17585377 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 1 1 1614 419 122 27 13 chr5 134951882 134951957 -17585302 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7331 1 1614 9561 151 34 27 chr5 134952169 134955015 -17582244 - ETnERV2-int LTR ERVK -981 6425 1565 1 1614 5864 128 65 30 chr5 134955302 134956559 -17580700 - ETnERV2-int LTR ERVK -5327 2079 14 1 1614 1057 170 22 26 chr5 134956564 134956794 -17580465 - RLTR9D LTR ERVK -1 402 174 1 1614 792 210 175 167 chr5 134960177 134960663 -17576596 - MT2A LTR ERVL -43 490 1 1 1614 1029 234 194 3 chr5 134961028 134961353 -17575906 - MTD LTR MaLR 0 419 33 1 1614 536 234 113 6 chr5 134962944 134963103 -17574156 + ORR1D1-int LTR MaLR 79 254 -1116 1 1614 628 190 49 93 chr5 134963613 134963679 -17573580 + ORR1D1-int LTR MaLR 250 319 -1051 1 1614 628 190 49 93 chr5 134963826 134963921 -17573338 + ORR1D1-int LTR MaLR 320 404 -966 1 1614 497 190 346 6 chr5 134964223 134964382 -17572877 + ORR1D1-int LTR MaLR 1158 1370 0 1 1614 1687 169 55 19 chr5 134964382 134964743 -17572516 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1614 248 30 0 0 chr5 134964763 134964796 -17572463 + MTD LTR MaLR 349 381 -38 1 1614 1058 282 74 15 chr5 134972876 134973214 -17564045 + MTD LTR MaLR 1 358 -61 1 1614 260 250 0 106 chr5 134979590 134979675 -17557584 - MT2B2 LTR ERVL -360 224 149 1 1614 229 214 35 140 chr5 134983586 134983622 -17553637 + MT2B2 LTR ERVL 168 269 -315 1 1614 2149 192 37 9 chr5 134988653 134989085 -17548174 + MT2A LTR ERVL 1 444 -89 1 1614 2030 108 34 37 chr5 134991053 134991328 -17545931 + ORR1A2 LTR MaLR 1 282 -45 1 1614 2030 108 34 37 chr5 134991517 134991569 -17545690 + ORR1A2 LTR MaLR 283 327 0 1 1614 643 269 263 8 chr5 134991646 134991901 -17545358 + RMER15 LTR ERVL 30 349 -226 1 1614 1054 282 47 47 chr5 134995489 134995894 -17541365 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1614 235 282 12 25 chr5 134997873 134997953 -17539306 + ORR1C1 LTR MaLR 85 163 -215 1 1615 1182 256 24 102 chr5 135008812 135009222 -17528037 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 3 1615 1250 268 56 11 chr5 135010164 135010522 -17526737 + MTE2a LTR MaLR 4 377 -2 3 1615 351 280 26 53 chr5 135010728 135010879 -17526380 + RMER15 LTR ERVL 404 550 -25 4 1615 1460 128 217 29 chr5 135013937 135014057 -17523202 + ORR1C2 LTR MaLR 13 133 -251 5 1615 4624 179 50 65 chr5 135014057 135014973 -17522286 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 1615 1460 128 217 29 chr5 135014973 135015165 -17522094 + ORR1C2 LTR MaLR 134 384 0 5 1615 2776 46 0 11 chr5 135032199 135032570 -17504689 + MTA_Mm LTR MaLR 1 367 -29 1 1615 311 98 0 73 chr5 135032609 135032621 -17504638 + MTA_Mm LTR MaLR 350 359 -41 1 1615 311 98 0 73 chr5 135032769 135032811 -17504448 + MTA_Mm LTR MaLR 360 400 0 1 1615 483 295 70 6 chr5 135033080 135033383 -17503876 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 16 1 1615 546 298 0 0 chr5 135034422 135034573 -17502686 - RodERV21-int LTR ERV1 -452 4539 4389 1 1615 2342 128 194 38 chr5 135036506 135036986 -17500273 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 2 556 -1 1 1615 401 229 0 110 chr5 135037926 135037942 -17499317 + MT2B LTR ERVL 153 155 -446 1 1615 1581 233 25 70 chr5 135041674 135042002 -17495257 + RMER5 LTR ERV1 33 348 -186 1 1615 1581 233 25 70 chr5 135042227 135042424 -17494835 + RMER5 LTR ERV1 349 534 0 1 1615 226 146 0 0 chr5 135044539 135044580 -17492679 - MTEa LTR MaLR -30 349 309 1 1615 431 252 67 0 chr5 135044639 135044758 -17492501 - MTEa LTR MaLR -241 138 12 1 1615 305 162 95 48 chr5 135052016 135052100 -17485159 + RLTR25B LTR ERVK 412 499 -529 1 1615 229 158 0 0 chr5 135062925 135062963 -17474296 - MTEb LTR MaLR -237 142 105 2 1615 1845 130 16 16 chr5 135069239 135069560 -17467699 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 87 2 1615 520 135 11 22 chr5 135069806 135069897 -17467362 - MTB_Mm LTR MaLR -323 98 9 2 1615 234 162 69 56 chr5 135071774 135071846 -17465413 - ORR1E LTR MaLR -248 111 39 2 1615 260 173 19 0 chr5 135088997 135089049 -17448210 + RMER15 LTR ERVL 417 469 -106 3 1615 647 277 124 41 chr5 135100408 135100675 -17436584 + MTD LTR MaLR 1 289 -130 3 1615 1669 144 185 8 chr5 135100763 135101114 -17436145 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 1615 430 195 31 92 chr5 135118222 135118352 -17418907 - MT2B LTR ERVL -323 278 157 4 1615 278 250 140 18 chr5 135119972 135120086 -17417173 + RMER15 LTR ERVL 298 425 -150 4 1615 439 232 71 9 chr5 135129824 135129937 -17407322 + MTC LTR MaLR 1 120 -301 4 1615 2038 124 60 17 chr5 135130831 135131184 -17406075 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 4 1615 323 263 28 75 chr5 135134960 135135067 -17402192 + MT2B LTR ERVL 156 257 -344 5 1616 330 303 10 10 chr5 135146037 135146137 -17391122 + MTEb LTR MaLR 280 379 0 5 1616 2490 146 85 19 chr5 135159703 135160186 -17377073 + RMER15 LTR ERVL 61 575 0 5 1616 1769 144 156 14 chr5 135166267 135166620 -17370639 - MTC LTR MaLR -18 403 1 6 1616 682 309 40 84 chr5 135169006 135169328 -17367931 - ORR1E LTR MaLR -51 308 1 6 1616 247 266 47 0 chr5 135171084 135171148 -17366111 - RMER15 LTR ERVL -136 439 373 6 1616 934 175 73 0 chr5 135171153 135171330 -17365929 + RLTR18B LTR ERVK 1 190 -322 6 1616 2780 151 22 10 chr5 135171330 135171838 -17365421 - RMER20A LTR ERVK 0 516 3 6 1616 1240 139 9 192 chr5 135171839 135171962 -17365297 + RLTR18B LTR ERVK 185 271 -241 6 1616 1240 139 9 192 chr5 135172107 135172322 -17364937 + RLTR18B LTR ERVK 272 461 -51 6 1616 1439 244 113 13 chr5 135172908 135173306 -17363953 - RMER15-int LTR ERVL -360 4639 4202 6 1616 634 261 190 14 chr5 135173323 135173607 -17363652 - ORR1E LTR MaLR 0 359 26 6 1616 1267 209 36 125 chr5 135174044 135174404 -17362855 - MTE2a LTR MaLR -42 337 10 6 1616 1434 288 42 12 chr5 135174417 135174912 -17362347 - RMER15-int LTR ERVL -4109 890 381 6 1616 514 318 71 52 chr5 135175690 135175959 -17361300 - RMER15-int LTR ERVL -4724 275 2 6 1616 406 314 156 20 chr5 135175960 135176204 -17361055 - RMER15 LTR ERVL 0 575 299 6 1616 253 271 57 86 chr5 135209887 135209898 -17327361 - MT2B LTR ERVL -348 253 152 7 1616 810 154 71 41 chr5 135250017 135250186 -17287073 - MTEa LTR MaLR -38 341 168 8 1616 638 311 68 20 chr5 135250351 135250553 -17286706 - MT2A LTR ERVL 0 533 178 8 1616 638 311 68 20 chr5 135250619 135250630 -17286629 - MT2A LTR ERVL 0 177 155 8 1617 792 312 65 82 chr5 135267356 135267658 -17269601 + ORR1E LTR MaLR 10 305 -54 9 1617 792 312 65 82 chr5 135267888 135267941 -17269318 + ORR1E LTR MaLR 306 358 -1 9 1617 664 282 89 138 chr5 135267969 135268360 -17268899 - MTE2b LTR MaLR -6 373 2 9 1617 1211 292 80 3 chr5 135269920 135270308 -17266951 - MTD LTR MaLR -1 418 1 9 1617 689 303 85 31 chr5 135274872 135275165 -17262094 - ORR1E LTR MaLR -47 312 4 9 1617 273 195 14 120 chr5 135275556 135275653 -17261606 + MTEb LTR MaLR 228 327 -52 9 1617 425 312 115 19 chr5 135276120 135276329 -17260930 - RMER15 LTR ERVL 0 575 347 9 1617 1382 230 157 35 chr5 135276905 135277243 -17260016 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 9 1617 747 240 66 0 chr5 135285897 135286080 -17251179 - MTEa LTR MaLR -23 356 162 9 1617 5342 129 76 24 chr5 135287354 135288232 -17249027 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 9 1617 708 122 156 4 chr5 135288249 135288397 -17248862 + ORR1B1 LTR MaLR 1 168 -191 9 1617 1108 231 82 38 chr5 135289061 135289079 -17248180 + MLT-int LTR MaLR 1407 1423 -312 9 1617 1108 231 82 38 chr5 135289210 135289483 -17247776 + MLT-int LTR MaLR 1424 1711 -24 9 1617 680 252 214 5 chr5 135292914 135293129 -17244130 - RMER15 LTR ERVL 0 575 316 9 1617 300 283 88 40 chr5 135293220 135293345 -17243914 - RMER15 LTR ERVL -444 131 1 9 1617 246 214 0 97 chr5 135294563 135294625 -17242634 + RMER15 LTR ERVL 5 60 -515 1 1617 1638 191 259 22 chr5 135294675 135295119 -17242140 + RMER15 LTR ERVL 27 575 0 1 1617 2768 31 65 0 chr5 135296949 135297274 -17239985 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1617 399 303 41 34 chr5 135306220 135306367 -17230892 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 261 1 1617 232 215 29 44 chr5 135307205 135307273 -17229986 + RLTR25B LTR ERVK 442 508 -520 1 1617 260 292 33 91 chr5 135310854 135311095 -17226164 - RLTR21 LTR ERVK -273 1299 1073 1 1617 313 258 75 11 chr5 135311370 135311464 -17225795 + MLT1K LTR MaLR 477 576 -19 1 1617 2129 106 43 28 chr5 135312227 135312487 -17224772 + ORR1A2 LTR MaLR 1 269 -58 1 1617 4119 128 44 21 chr5 135312487 135313163 -17224096 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 1 1617 2129 106 43 28 chr5 135313163 135313224 -17224035 + ORR1A2 LTR MaLR 270 327 0 1 1617 11377 124 62 14 chr5 135313224 135315097 -17222162 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 1 1617 2255 93 29 0 chr5 135315097 135315407 -17221852 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1617 633 230 0 22 chr5 135315409 135315547 -17221712 - MTD LTR MaLR -21 398 264 1 1617 694 282 79 51 chr5 135315541 135315852 -17221407 - MTD LTR MaLR -86 321 3 1 1617 343 138 15 44 chr5 135315874 135315942 -17221317 + MTEb LTR MaLR 310 375 -4 1 1617 498 316 79 47 chr5 135315988 135316305 -17220954 + ORR1E LTR MaLR 1 322 -72 1 1617 1484 258 18 42 chr5 135316340 135316725 -17220534 - MTE2a LTR MaLR -2 377 2 1 1617 539 304 26 35 chr5 135317195 135317427 -17219832 + RMER15 LTR ERVL 273 502 -73 1 1617 872 252 20 43 chr5 135317439 135317692 -17219567 + MTD LTR MaLR 21 267 -152 1 1617 676 211 25 44 chr5 135317737 135317896 -17219363 + MTD LTR MaLR 264 419 0 1 1617 273 242 163 64 chr5 135318630 135318771 -17218488 + MLT1A1 LTR MaLR 246 400 -8 1 1617 260 351 80 62 chr5 135325541 135325624 -17211635 - MER21B LTR ERV1 -403 460 378 1 1617 260 351 80 62 chr5 135325655 135325847 -17211412 - MER21B LTR ERV1 -486 377 180 1 1617 446 286 77 60 chr5 135325878 135326255 -17211004 - RMER15 LTR ERVL -51 524 24 1 1617 235 300 112 0 chr5 135326267 135326347 -17210912 - MER21B LTR ERV1 -679 184 96 1 1617 504 258 47 76 chr5 135328417 135328589 -17208670 + RMER15 LTR ERVL 3 169 -406 1 1617 1070 240 29 4 chr5 135328574 135328817 -17208442 + RMER15 LTR ERVL 275 523 -52 1 1617 2434 153 30 33 chr5 135330148 135330607 -17206652 - RLTR28 LTR ERVL -45 479 22 1 1617 845 259 87 117 chr5 135332211 135332578 -17204681 + MTE2a LTR MaLR 1 356 -23 1 1617 2223 145 85 32 chr5 135332780 135333180 -17204079 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1617 228 314 38 29 chr5 135333379 135333484 -17203775 - ORR1E LTR MaLR -253 106 1 1 1617 2822 124 162 35 chr5 135356674 135356863 -17180396 - RMER4B LTR ERVK -2 583 327 1 1617 2822 124 162 35 chr5 135356970 135357270 -17179989 - RMER4B LTR ERVK -259 326 43 1 1617 2822 124 162 35 chr5 135357315 135357341 -17179918 - RMER4B LTR ERVK -543 42 3 1 1617 1814 154 70 70 chr5 135360402 135360785 -17176474 + ORR1C2 LTR MaLR 2 384 0 1 1617 229 316 41 58 chr5 135374495 135374616 -17162643 - RMER15 LTR ERVL -76 499 381 1 1617 363 80 0 0 chr5 135386244 135386294 -17150965 + ORR1A4 LTR MaLR 272 321 -8 1 1617 771 169 81 7 chr5 135386593 135386742 -17150517 + MTC LTR MaLR 262 421 0 1 1617 304 256 79 33 chr5 135390057 135390254 -17147005 - RMER15 LTR ERVL -43 532 299 1 1617 896 264 140 13 chr5 135393054 135393368 -17143891 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 8 1 1617 1609 142 271 0 chr5 135393573 135393875 -17143384 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1617 226 250 82 148 chr5 135393948 135394070 -17143189 - MLT1J2 LTR MaLR -29 419 306 1 1617 3260 125 21 6 chr5 135396476 135396992 -17140267 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 1 1618 232 239 70 0 chr5 135397406 135397477 -17139782 + MTEb LTR MaLR 246 321 -58 1 1618 1704 208 30 0 chr5 135399035 135399396 -17137863 + MTEa LTR MaLR 8 379 0 1 1618 2621 170 27 25 chr5 135402366 135402880 -17134379 - RMER20A LTR ERVK -1 515 1 1 1618 670 259 136 105 chr5 135402983 135403146 -17134113 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 377 1 1618 670 259 136 105 chr5 135403284 135403326 -17133933 - RMER5 LTR ERV1 -158 376 343 1 1618 670 259 136 105 chr5 135403670 135403933 -17133326 - RMER5 LTR ERV1 -192 342 41 1 1618 227 242 48 0 chr5 135406832 135406894 -17130365 + RLTR19C LTR ERVK 33 97 -409 1 1618 334 329 30 42 chr5 135407191 135407356 -17129903 + RLTR33 LTR ERVK 469 631 -47 1 1618 714 205 73 0 chr5 135411472 135411623 -17125636 - MTE2b LTR MaLR -217 162 1 1 1618 2075 149 78 11 chr5 135413147 135413520 -17123739 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 1 1618 260 341 72 22 chr5 135417666 135417804 -17119455 - LTR31 LTR ERV1 -277 342 198 1 1618 506 216 18 103 chr5 135429993 135430057 -17107202 + MT2B LTR ERVL 107 156 -445 1 1618 314 170 67 105 chr5 135432801 135432906 -17104353 + MT2B LTR ERVL 155 255 -346 1 1618 525 232 60 75 chr5 135444708 135445143 -17092116 - RMER17C LTR ERVK -52 358 1 1 1618 443 250 27 0 chr5 135449751 135449863 -17087396 + MER31A LTR ERV1 355 469 -16 1 1618 425 302 8 23 chr5 135451838 135451967 -17085292 + MTEa LTR MaLR 5 131 -248 1 1618 2790 139 45 23 chr5 135453041 135453376 -17083883 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 180 1 1618 2790 139 45 23 chr5 135453422 135453601 -17083658 - RLTR11A LTR ERVK -349 179 1 1 1618 363 208 45 98 chr5 135457682 135457815 -17079444 - ORR1D2 LTR MaLR -53 317 192 1 1618 1025 206 92 58 chr5 135475088 135475381 -17061878 + MTEb LTR MaLR 37 339 -40 1 1618 372 281 146 39 chr5 135486221 135486454 -17050805 + RMER10A LTR ERVL 12 269 -173 1 1618 1605 165 33 5 chr5 135496945 135497266 -17039993 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 5 1 1618 249 257 83 28 chr5 135497292 135497400 -17039859 + RMER15 LTR ERVL 397 510 -65 1 1618 505 270 109 150 chr5 135509600 135509614 -17027645 + MTE2a LTR MaLR 2 13 -406 3 1618 586 260 113 96 chr5 135509739 135509878 -17027381 + MTE2a LTR MaLR 14 191 -228 3 1618 586 260 113 96 chr5 135509999 135510158 -17027101 + MTE2a LTR MaLR 192 397 -22 3 1618 582 240 93 147 chr5 135520769 135521109 -17016150 - MTD LTR MaLR -3 356 4 6 1619 2995 97 12 12 chr5 135559456 135559863 -16977396 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 1619 561 272 91 30 chr5 135560022 135560253 -16977006 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1156 1 1619 240 303 15 29 chr5 135571724 135571792 -16965467 + MER21B LTR ERV1 182 248 -615 2 1619 1836 162 9 32 chr5 135574046 135574391 -16962868 - RLTR19A LTR ERVK 0 496 160 2 1619 1336 247 28 12 chr5 135578878 135579202 -16958057 + MTE2b LTR MaLR 51 379 0 2 1619 241 308 97 58 chr5 135581623 135581778 -16955481 + MT2B2 LTR ERVL 179 339 -245 3 1619 270 221 0 112 chr5 135590282 135590389 -16946870 - MT2B LTR ERVL -361 240 146 3 1619 388 77 0 0 chr5 135590610 135590662 -16946597 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 278 3 1619 676 143 0 0 chr5 135591019 135591124 -16946135 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 249 3 1619 777 116 0 30 chr5 135591124 135591257 -16946002 - ORR1B1 LTR MaLR -265 129 1 3 1619 1891 135 23 20 chr5 135592388 135592736 -16944523 - RLTR11A LTR ERVK -7 521 173 3 1619 444 177 163 0 chr5 135600784 135600895 -16936364 - MTD LTR MaLR -14 405 244 3 1619 1549 162 192 25 chr5 135600912 135601266 -16935993 - MTC LTR MaLR -8 413 1 3 1619 250 382 7 22 chr5 135601274 135601413 -16935846 - MTD LTR MaLR -278 141 5 3 1619 240 238 90 54 chr5 135601418 135601431 -16935828 - MT2B2 LTR ERVL -301 283 170 3 1619 252 274 19 120 chr5 135604820 135604928 -16932331 - MT2B LTR ERVL -343 258 162 3 1619 1152 224 32 100 chr5 135605110 135605537 -16931722 - MTE2a LTR MaLR -14 405 1 3 1619 499 245 158 0 chr5 135606310 135606494 -16930765 - MTEa LTR MaLR -2 377 165 3 1619 572 258 11 63 chr5 135606953 135607127 -16930132 - MTEa LTR MaLR -214 165 1 3 1619 334 333 95 18 chr5 135611790 135611958 -16925301 - RMER17B LTR ERVK -91 867 687 4 1619 3318 176 65 78 chr5 135611950 135612744 -16924515 - RMER17B LTR ERVK -174 784 1 4 1619 2148 80 97 0 chr5 135612789 135613089 -16924170 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1619 873 224 38 5 chr5 135615493 135615677 -16921582 + ORR1D2 LTR MaLR 169 358 -12 4 1619 1570 185 97 29 chr5 135618853 135619203 -16918056 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1619 446 352 88 21 chr5 135619493 135619731 -16917528 - ORR1E LTR MaLR -17 342 89 4 1619 1191 263 77 65 chr5 135620984 135621073 -16916186 - MTD LTR MaLR 0 419 322 4 1619 1191 263 77 65 chr5 135621212 135621524 -16915735 - MTD LTR MaLR -98 321 13 4 1619 1944 182 167 9 chr5 135629135 135629590 -16907669 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 4 1619 505 329 61 19 chr5 135631043 135631257 -16906002 - RMER15 LTR ERVL -2 573 351 4 1619 339 272 38 75 chr5 135633976 135633994 -16903265 - MT2B LTR ERVL -286 315 166 4 1619 234 372 28 23 chr5 135639637 135639813 -16897446 + RLTR1 LTR ERV1 440 616 -8 5 1619 356 225 8 112 chr5 135643157 135643282 -16893977 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 5 1619 1945 138 65 42 chr5 135647233 135647619 -16889640 - RMER10B LTR ERVL 0 398 4 5 1619 832 175 174 34 chr5 135650967 135651203 -16886056 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 106 5 1619 764 204 236 29 chr5 135651209 135651547 -16885712 - MTD LTR MaLR -10 409 2 5 1619 587 188 16 82 chr5 135651547 135651626 -16885633 - ORR1D1 LTR MaLR -263 111 40 5 1619 587 188 16 82 chr5 135651798 135651837 -16885422 - ORR1D1 LTR MaLR -335 39 1 5 1619 290 277 122 102 chr5 135658402 135658492 -16878767 + MT2B2 LTR ERVL 62 155 -429 5 1620 344 181 209 45 chr5 135659996 135660106 -16877153 + MT2B LTR ERVL 152 279 -322 5 1620 790 195 37 30 chr5 135660480 135660644 -16876615 - RMER19B LTR ERVK -330 572 408 5 1620 1542 158 25 0 chr5 135660647 135660888 -16876371 - RMER19B LTR ERVK -655 247 1 5 1620 1359 193 89 50 chr5 135670200 135670560 -16866699 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 6 1620 284 250 67 22 chr5 135674405 135674495 -16862764 - MT2B LTR ERVL -350 251 158 6 1620 1880 163 119 3 chr5 135680403 135680587 -16856672 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 192 6 1620 1880 163 119 3 chr5 135680621 135680780 -16856479 - ORR1C2 LTR MaLR -193 191 3 6 1620 1913 148 137 22 chr5 135681910 135682275 -16854984 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1620 1185 250 11 22 chr5 135686935 135687205 -16850054 - MTD LTR MaLR -148 271 5 6 1620 243 196 16 157 chr5 135696113 135696234 -16841025 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 7 1620 668 266 191 33 chr5 135702868 135703230 -16834029 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 1620 1571 191 66 154 chr5 135710532 135710679 -16826580 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 371 7 1620 1571 191 66 154 chr5 135710779 135711170 -16826089 - RLTR18B LTR ERVK -142 370 15 7 1620 444 179 0 132 chr5 135719509 135719638 -16817621 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 7 1620 334 283 58 148 chr5 135731619 135731876 -16805383 + MT2B LTR ERVL 167 400 -201 8 1620 2034 117 33 47 chr5 135731968 135732327 -16804932 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 8 1620 2305 89 12 12 chr5 135735130 135735471 -16801788 - MTB_Mm LTR MaLR -66 341 1 8 1620 1355 159 44 69 chr5 135741630 135741657 -16795602 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 500 8 1620 1355 159 44 69 chr5 135741810 135741940 -16795319 - RLTR11A LTR ERVK -29 499 373 8 1620 1355 159 44 69 chr5 135742091 135742249 -16795010 - RLTR11A LTR ERVK -156 372 218 8 1620 1370 216 75 111 chr5 135742249 135742842 -16794417 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 563 6 8 1620 1320 135 14 0 chr5 135742852 135743059 -16794200 - RLTR11A LTR ERVK -315 213 4 8 1620 465 274 182 63 chr5 135744473 135744632 -16792627 - MTD LTR MaLR -14 405 210 8 1620 465 277 177 67 chr5 135744702 135744835 -16792424 - MTD LTR MaLR -212 209 88 8 1620 479 275 23 0 chr5 135749008 135749139 -16788120 - MTE2b LTR MaLR -189 190 57 8 1620 265 244 22 34 chr5 135755675 135755718 -16781541 - MLT1A1 LTR MaLR -320 88 48 9 1620 265 244 22 34 chr5 135755832 135755877 -16781382 - MLT1A1 LTR MaLR -361 47 2 9 1620 298 195 143 50 chr5 135756102 135756221 -16781038 + MLT1K LTR MaLR 146 275 -320 9 1620 1327 241 16 116 chr5 135759243 135759703 -16777556 - MTD LTR MaLR -14 405 5 9 1620 243 163 0 0 chr5 135765270 135765313 -16771946 - MTEa LTR MaLR -326 53 11 9 1620 1855 197 65 8 chr5 135769656 135770110 -16767149 + RMER20A LTR ERVK 4 516 0 9 1620 1331 253 35 51 chr5 135770579 135770897 -16766362 + ORR1D2 LTR MaLR 6 324 -46 9 1620 1331 253 35 51 chr5 135771076 135771128 -16766131 + ORR1D2 LTR MaLR 325 370 0 9 1620 2539 156 73 56 chr5 135771420 135771978 -16765281 - RMER4B LTR ERVK -1 584 17 9 1620 552 359 48 44 chr5 135774813 135775267 -16761992 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 3876 4291 -3265 9 1620 737 338 8 12 chr5 135775604 135775949 -16761310 + MURVY-int LTR ERV1 4727 5017 -2435 9 1620 962 190 110 110 chr5 135776191 135776279 -16760980 + RMER21A LTR ERV1 443 551 -396 9 1620 962 190 110 110 chr5 135776426 135776627 -16760632 + RMER21A LTR ERV1 552 732 -215 9 1620 652 297 37 31 chr5 135777263 135777590 -16759669 + RLTR15 LTR ERVK 1 329 -30 9 1620 266 234 31 0 chr5 135778185 135778249 -16759010 + RLTR19-int LTR ERVK 50 115 -8844 9 1620 3113 283 76 56 chr5 135778634 135778917 -16758342 + MYSERV-int LTR ERVK 3785 4067 -2483 9 1620 3113 283 76 56 chr5 135779086 135779865 -16757394 + MYSERV-int LTR ERVK 4068 4875 -1675 9 1620 3113 283 76 56 chr5 135780049 135780296 -16756963 + MYSERV-int LTR ERVK 4876 5121 -1429 9 1620 400 249 52 60 chr5 135780297 135780505 -16756754 + RMER4A LTR ERVK 246 561 -24 9 1620 1194 170 161 50 chr5 135780505 135780865 -16756394 + MYSERV-int LTR ERVK 5335 5734 -816 9 1620 1730 334 53 32 chr5 135780869 135781434 -16755825 + RodERV21-int LTR ERV1 3376 3949 -1042 9 1620 1730 334 53 32 chr5 135781489 135781971 -16755288 + RodERV21-int LTR ERV1 3950 4444 -547 9 1620 800 316 36 34 chr5 135781999 135782356 -16754903 + RodERV21-int LTR ERV1 4502 4859 -132 9 1620 341 83 47 62 chr5 135783592 135783656 -16753603 + RLTR19-int LTR ERVK 1342 1404 -1834 9 1620 3122 203 32 69 chr5 135783689 135784520 -16752739 + RLTR19-int LTR ERVK 1895 2996 -3141 9 1620 1235 161 22 31 chr5 135784582 135784807 -16752452 + RMER17C-int LTR ERVK 1965 2187 -1051 9 1620 2747 198 137 116 chr5 135784849 135785253 -16752006 + RMER17C-int LTR ERVK 2226 2793 -3344 9 1620 2747 198 137 116 chr5 135785305 135785931 -16751328 + RMER17C-int LTR ERVK 2794 3676 -2461 9 1620 284 288 29 94 chr5 135786273 135786411 -16750848 + RMER10B LTR ERVL 270 398 0 9 1620 333 167 30 0 chr5 135786787 135786853 -16750406 + RMER17C-int LTR ERVK 3757 3824 -2313 9 1621 601 279 72 123 chr5 135791428 135791972 -16745287 + RMER17C-int LTR ERVK 81 596 -2642 9 1621 4520 253 53 44 chr5 135791797 135792328 -16744931 + RodERV21-int LTR ERV1 682 1214 -3777 9 1621 4520 253 53 44 chr5 135792415 135793221 -16744038 + RodERV21-int LTR ERV1 1215 2022 -2969 9 1621 4520 253 53 44 chr5 135793282 135793376 -16743883 + RodERV21-int LTR ERV1 2023 2126 -2865 9 1621 783 195 356 36 chr5 135795099 135795416 -16741843 + RLTR33 LTR ERVK 175 592 -86 9 1621 646 233 20 13 chr5 135795998 135796150 -16741109 + RodERV21-int LTR ERV1 163 315 -4676 9 1621 356 223 53 23 chr5 135797358 135797491 -16739768 + MYSERV-int LTR ERVK 5339 5475 -1075 9 1621 317 243 123 41 chr5 135798249 135798395 -16738864 + RLTR19-int LTR ERVK 1177 1334 -1904 9 1621 347 169 31 0 chr5 135798463 135798528 -16738731 + RLTR19-int LTR ERVK 1358 1424 -1814 9 1621 4226 191 135 118 chr5 135798582 135798715 -16738544 + RLTR19-int LTR ERVK 2218 2301 -3836 9 1621 4226 186 129 113 chr5 135798856 135800221 -16737038 + RLTR19-int LTR ERVK 2302 3676 -2461 9 1621 2077 218 98 53 chr5 135800329 135800954 -16736305 + RLTR19-int LTR ERVK 2586 3238 0 9 1621 283 323 11 0 chr5 135804866 135804959 -16732300 + MER21-int LTR ERV1 1699 1792 -2399 1 1621 406 258 64 8 chr5 135805036 135805161 -16732098 + MER21-int LTR ERV1 2503 2634 -1557 1 1621 1239 189 46 150 chr5 135811293 135811521 -16725738 + ORR1D1 LTR MaLR 1 195 -179 1 1621 1239 191 59 137 chr5 135811677 135811842 -16725417 + ORR1D1 LTR MaLR 196 352 -7 1 1621 2071 107 0 16 chr5 135816162 135816484 -16720775 + ORR1A4 LTR MaLR 1 317 -12 1 1621 1370 210 53 39 chr5 135831337 135831645 -16705614 - MTEb LTR MaLR -37 342 21 1 1621 1370 210 53 39 chr5 135831832 135831860 -16705399 - MTEb LTR MaLR -359 20 1 1 1621 301 265 31 86 chr5 135836202 135836330 -16700929 - MT2B LTR ERVL -337 264 144 1 1621 531 62 0 111 chr5 135838279 135838328 -16698931 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 337 1 1621 531 95 40 112 chr5 135838524 135838589 -16698670 - ORR1C2 LTR MaLR -48 336 259 1 1621 288 271 19 68 chr5 135841451 135841554 -16695705 - ORR1D1 LTR MaLR 0 379 282 1 1621 315 263 48 9 chr5 135841633 135841742 -16695517 - ORR1D1 LTR MaLR -261 113 1 1 1621 247 302 75 53 chr5 135844061 135844288 -16692971 - RMER17C LTR ERVK -55 355 124 1 1621 245 255 29 48 chr5 135847970 135848073 -16689186 + MT2B LTR ERVL 158 258 -343 1 1621 1111 210 67 133 chr5 135863598 135864004 -16673255 - RLTR30 LTR ERV1 0 379 1 1 1621 879 251 155 51 chr5 135872625 135872819 -16664440 + MTD LTR MaLR 3 214 -205 1 1621 879 251 155 51 chr5 135872894 135873073 -16664186 + MTD LTR MaLR 215 415 -4 1 1621 425 187 17 101 chr5 135876630 135876749 -16660510 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 1 1621 244 219 45 79 chr5 135882076 135882165 -16655094 + RLTR25B LTR ERVK 423 508 -520 1 1621 360 260 41 0 chr5 135890310 135890433 -16646826 + ORR1E LTR MaLR 18 145 -214 1 1621 475 267 13 45 chr5 135890826 135890983 -16646276 + MTEa LTR MaLR 32 183 -196 1 1621 599 155 60 114 chr5 135891321 135891488 -16645771 + MTEa LTR MaLR 165 322 -57 1 1621 2440 143 128 41 chr5 135898607 135899168 -16638091 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 3 1 1621 784 219 78 142 chr5 135901321 135901721 -16635538 + MTE2a LTR MaLR 2 375 -4 1 1621 2392 135 97 8 chr5 135902528 135903013 -16634246 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 1621 379 301 66 5 chr5 135903077 135903274 -16633985 + RMER15 LTR ERVL 362 570 -5 1 1621 232 349 9 28 chr5 135905734 135905843 -16631416 + ORR1E LTR MaLR 97 203 -156 1 1621 534 217 26 59 chr5 135916819 135916971 -16620288 + MTEb LTR MaLR 4 150 -229 1 1621 624 200 99 7 chr5 135917162 135917303 -16619956 + MTEb LTR MaLR 210 363 -16 1 1621 237 286 23 45 chr5 135917760 135917848 -16619411 - MT2B LTR ERVL -336 265 180 1 1621 1205 209 74 79 chr5 135918786 135919166 -16618093 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 1 1621 359 85 51 0 chr5 135920169 135920228 -16617031 - ORR1A2 LTR MaLR -265 62 1 1 1622 636 283 11 39 chr5 135938968 135939226 -16598033 - MTEa LTR MaLR -56 323 3 1 1622 329 273 103 90 chr5 135943111 135943256 -16594003 - MTEa LTR MaLR -232 147 1 1 1622 844 273 90 63 chr5 135943346 135943696 -16593563 + ORR1E LTR MaLR 1 352 -22 1 1622 464 311 89 100 chr5 135943823 135943842 -16593417 + ORR1E LTR MaLR 353 370 -4 1 1622 584 309 41 37 chr5 135943900 135944145 -16593114 + ORR1E LTR MaLR 108 353 -6 1 1622 294 342 155 41 chr5 135946338 135946655 -16590604 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 1 1622 1076 217 115 122 chr5 135949555 135949670 -16587589 + MTD LTR MaLR 5 96 -323 1 1622 1076 217 115 122 chr5 135949856 135950150 -16587109 + MTD LTR MaLR 97 411 -8 1 1622 4466 219 71 48 chr5 135950154 135951374 -16585885 + MTD-int LTR MaLR 1 1248 -10 1 1622 1433 203 116 3 chr5 135951408 135951769 -16585490 + MTD LTR MaLR 18 419 0 1 1622 260 105 0 0 chr5 135953010 135953048 -16584211 + MTEa LTR MaLR 1 38 -341 1 1622 1209 185 153 16 chr5 135953499 135953807 -16583452 + MTEa LTR MaLR 30 379 0 1 1622 844 243 166 51 chr5 135953909 135954087 -16583172 + MTD LTR MaLR 4 216 -203 1 1622 844 243 166 51 chr5 135954296 135954490 -16582769 + MTD LTR MaLR 217 419 0 1 1622 691 332 59 59 chr5 135956172 135956495 -16580764 + MLT1A0 LTR MaLR 42 364 -1 1 1622 2626 128 12 2 chr5 135960290 135960697 -16576562 + MTC LTR MaLR 1 411 -10 1 1622 1758 145 54 68 chr5 135968319 135968763 -16568496 + RMER10A LTR ERVL 5 442 0 1 1622 480 222 10 0 chr5 135972836 135972935 -16564324 - MTEa LTR MaLR -201 178 79 1 1622 1905 170 36 60 chr5 135975376 135975485 -16561774 + MTC LTR MaLR 11 104 -317 1 1622 1905 170 36 60 chr5 135975621 135975924 -16561335 + MTC LTR MaLR 105 413 -8 1 1622 340 195 292 0 chr5 135981183 135981296 -16555963 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 367 1 1622 925 259 146 12 chr5 135982165 135982486 -16554773 - MTE2b LTR MaLR 0 379 16 1 1622 862 276 0 5 chr5 135990409 135990609 -16546650 + MTD LTR MaLR 15 213 -206 1 1622 865 200 104 5 chr5 135991050 135991251 -16546008 + MTD LTR MaLR 199 419 0 1 1622 1173 270 58 136 chr5 135991253 135991827 -16545432 + MTD-int LTR MaLR 3 531 -839 1 1622 3109 29 39 0 chr5 135993753 135994134 -16543125 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1622 2069 115 22 13 chr5 135995485 135995846 -16541413 + RMER16 LTR ERVK 3 533 0 1 1622 1210 251 30 54 chr5 135999539 135999872 -16537387 + MTE2b LTR MaLR 1 325 -54 1 1622 364 194 0 0 chr5 136000040 136000102 -16537157 + MTEb LTR MaLR 311 372 -7 1 1622 311 292 218 41 chr5 136005111 136005354 -16531905 - MLT1E2 LTR MaLR -54 573 288 1 1622 908 232 102 88 chr5 136008160 136008533 -16528726 - MTE2b LTR MaLR -1 378 1 3 1622 1569 200 48 21 chr5 136011317 136011649 -16525610 + MTEa LTR MaLR 30 370 -9 4 1622 995 227 54 137 chr5 136013572 136013944 -16523315 + MTEa LTR MaLR 4 344 -35 5 1622 2103 82 48 19 chr5 136016937 136017247 -16520012 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1622 2247 128 112 21 chr5 136023185 136023569 -16513690 - MTC LTR MaLR -2 419 1 9 1622 322 260 68 104 chr5 136025888 136025920 -16511339 - MT2B LTR ERVL -277 324 203 1 1622 478 298 98 62 chr5 136027389 136027664 -16509595 - MLT1A LTR MaLR 0 374 90 1 1622 249 115 151 19 chr5 136027664 136027717 -16509542 - MTEa LTR MaLR 0 379 320 1 1622 1769 224 84 32 chr5 136027725 136028199 -16509060 - RLTR11A2 LTR ERVK -28 499 1 1 1622 1074 203 246 95 chr5 136028203 136028261 -16508998 - MT2A LTR ERVL 0 533 491 1 1622 1074 203 246 95 chr5 136028298 136028702 -16508557 - MT2A LTR ERVL -43 490 1 1 1622 297 256 203 23 chr5 136028702 136028829 -16508430 - MTEa LTR MaLR -56 323 159 1 1622 666 111 0 79 chr5 136028859 136028986 -16508273 - RLTR15 LTR ERVK -9 350 234 1 1622 3253 228 37 86 chr5 136029006 136030095 -16507164 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1115 1211 227 1 1622 850 286 47 14 chr5 136030472 136030749 -16506510 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2070 4480 4195 1 1622 238 258 0 147 chr5 136030885 136030994 -16506265 - RLTR25A LTR ERVK -525 578 486 1 1622 1002 115 234 0 chr5 136031416 136031703 -16505556 - RLTR15 LTR ERVK -5 354 1 1 1622 321 200 52 62 chr5 136031927 136032023 -16505236 - MTEa LTR MaLR -200 179 85 1 1622 435 240 48 0 chr5 136033564 136033668 -16503591 - MTE2a LTR MaLR -2 377 269 1 1622 437 228 117 102 chr5 136033784 136034067 -16503192 - RMER10A LTR ERVL -34 408 122 1 1622 389 101 34 0 chr5 136034982 136035049 -16502210 + RLTR11A LTR ERVK 1 69 -458 1 1622 1446 118 38 14 chr5 136035053 136035367 -16501892 + RLTR11A LTR ERVK 229 528 0 1 1622 234 266 76 0 chr5 136035905 136035984 -16501275 + LTR16C LTR ERVL 344 428 -61 1 1622 263 227 92 13 chr5 136035998 136036074 -16501185 + RMER4B LTR ERVK 493 574 -11 1 1622 899 261 85 72 chr5 136038299 136038642 -16498617 + MTD LTR MaLR 1 330 -89 1 1622 1207 228 159 17 chr5 136038628 136038980 -16498279 + MTD LTR MaLR 18 419 0 1 1622 764 245 63 24 chr5 136039648 136039853 -16497406 - MTEb LTR MaLR -8 371 159 1 1622 279 364 0 20 chr5 136040813 136040914 -16496345 + MLT1A LTR MaLR 1 99 -275 1 1622 5097 132 32 20 chr5 136041239 136042071 -16495188 + RMER21B LTR ERV1 1 842 0 1 1622 347 375 6 42 chr5 136042078 136042245 -16495014 - MTEb LTR MaLR -165 194 34 1 1622 1824 136 86 0 chr5 136042986 136043287 -16493972 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 1 1622 1069 149 84 28 chr5 136043898 136044044 -16493215 - MTC LTR MaLR 0 421 279 1 1622 2936 118 12 7 chr5 136044044 136044472 -16492787 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 1 1622 1069 149 84 28 chr5 136044472 136044539 -16492720 - MTC LTR MaLR -143 278 196 1 1622 1306 169 55 31 chr5 136045630 136045902 -16491357 - ORR1B2 LTR MaLR 0 379 134 1 1623 505 208 271 55 chr5 136054007 136054316 -16482943 - ORR1E LTR MaLR 0 379 1 2 1623 314 271 11 23 chr5 136055569 136055656 -16481603 - MTEb LTR MaLR -44 335 250 2 1623 264 185 35 69 chr5 136056103 136056161 -16481098 + MLT1A1 LTR MaLR 74 129 -279 2 1623 3335 16 42 0 chr5 136062541 136062921 -16474338 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1623 2056 104 12 54 chr5 136066389 136066725 -16470534 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1623 3480 115 160 21 chr5 136066857 136067173 -16470086 + RMER6C LTR ERVK 1 323 -367 2 1623 3480 115 160 21 chr5 136067202 136067491 -16469768 + RMER6C LTR ERVK 324 689 -1 2 1623 737 178 110 93 chr5 136067974 136068285 -16468974 - RMER6A LTR ERVK -1 719 486 2 1623 490 258 0 55 chr5 136068281 136068408 -16468851 + ORR1E LTR MaLR 72 191 -168 2 1623 606 283 56 126 chr5 136071283 136071679 -16465580 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 1623 285 277 34 109 chr5 136071681 136071815 -16465444 + ETnERV2-int LTR ERVK 4 129 -3185 2 1623 2136 107 88 15 chr5 136071815 136072157 -16465102 - RLTR9A LTR ERVK -1 367 1 2 1623 285 277 34 109 chr5 136072157 136072261 -16464998 + ETnERV2-int LTR ERVK 130 224 -3090 2 1623 3462 309 63 57 chr5 136072295 136074594 -16462665 + ETnERV2-int LTR ERVK 328 2484 -3683 2 1623 256 33 0 0 chr5 136074597 136074627 -16462632 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -179 143 114 2 1623 605 122 33 0 chr5 136074638 136074728 -16462531 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -112 210 118 2 1623 10989 233 42 18 chr5 136074728 136077382 -16459877 + ETnERV2-int LTR ERVK 2512 5997 -1409 2 1623 10989 203 30 7 chr5 136077412 136077615 -16459644 + ETnERV2-int LTR ERVK 5998 6203 -1203 2 1623 302 278 21 83 chr5 136078633 136078778 -16458481 + ETnERV2-int LTR ERVK 6377 6512 -30 2 1623 581 284 59 116 chr5 136078914 136079301 -16457958 + RLTR9A LTR ERVK 4 368 0 2 1623 4538 159 48 75 chr5 136083673 136084684 -16452575 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 3 1623 394 184 51 120 chr5 136085298 136085415 -16451844 + MTEa LTR MaLR 3 111 -268 3 1623 3663 79 10 83 chr5 136085376 136086031 -16451228 - RMER17D LTR ERVK -316 573 1 3 1623 350 224 39 13 chr5 136086191 136086268 -16450991 + MT2B LTR ERVL 143 221 -380 3 1623 396 276 87 24 chr5 136086358 136086566 -16450693 - RLTR15 LTR ERVK -91 268 48 3 1623 830 202 31 84 chr5 136087125 136087352 -16449907 - MTD LTR MaLR -9 410 196 3 1623 796 197 108 62 chr5 136087584 136087779 -16449480 + MT2A LTR ERVL 12 215 -318 3 1623 3780 179 143 17 chr5 136096549 136097421 -16439838 + RMER19B LTR ERVK 1 885 -17 3 1623 271 262 115 53 chr5 136099384 136099495 -16437764 + MTEa LTR MaLR 13 130 -249 3 1623 3731 101 12 76 chr5 136099495 136100140 -16437119 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 604 -50 3 1623 3557 48 30 21 chr5 136100140 136100871 -16436388 + MMVL30-int LTR ERV1 1 829 -6949 3 1623 426 181 108 49 chr5 136100865 136101031 -16436228 + MMVL30-int LTR ERV1 280 533 -7023 3 1623 24018 36 35 15 chr5 136101302 136104228 -16433031 + MMVL30-int LTR ERV1 716 3698 0 3 1623 3635 106 14 88 chr5 136104228 136104888 -16432371 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 611 -43 3 1623 576 202 50 75 chr5 136104853 136105019 -16432240 + MTEa LTR MaLR 127 272 -107 3 1623 240 283 41 66 chr5 136114501 136114532 -16422727 - RMER12 LTR ERVK -460 862 834 4 1623 240 283 41 66 chr5 136114614 136114660 -16422599 - RMER12 LTR ERVK -489 833 745 4 1623 3197 44 18 3 chr5 136118002 136118178 -16419081 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 215 4 1623 3197 44 18 3 chr5 136118370 136118583 -16418676 - MTA_Mm LTR MaLR -182 214 2 4 1623 3930 47 17 0 chr5 136120685 136121152 -16416107 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 4 1623 3192 93 4 68 chr5 136124188 136124660 -16412599 - RLTR41 LTR ERV1 -4 442 1 4 1623 678 279 104 35 chr5 136130373 136130633 -16406626 + RMER5 LTR ERV1 84 361 -173 4 1623 1566 97 0 30 chr5 136130661 136130893 -16406366 + RMER4B LTR ERVK 1 225 -360 4 1623 2116 84 0 137 chr5 136130893 136131195 -16406064 + ORR1A2 LTR MaLR 1 272 -55 4 1623 2116 84 0 137 chr5 136131334 136131404 -16405855 + ORR1A2 LTR MaLR 273 322 -5 4 1623 1710 136 126 30 chr5 136131401 136131734 -16405525 + RMER4B LTR ERVK 221 585 0 4 1623 242 288 0 17 chr5 136131783 136131843 -16405416 + RMER5 LTR ERV1 465 523 -11 4 1623 911 250 30 43 chr5 136132465 136132699 -16404560 + MTE2b LTR MaLR 5 235 -144 4 1623 2505 147 41 16 chr5 136133191 136133632 -16403627 + RLTR11B LTR ERVK 1 452 -1 4 1623 1426 175 9 98 chr5 136134372 136134603 -16402656 + RLTR11A LTR ERVK 221 454 -106 4 1623 1426 153 0 104 chr5 136134918 136134976 -16402283 + RLTR11A LTR ERVK 451 489 -39 4 1623 868 147 212 18 chr5 136139522 136139744 -16397515 + RMER10B LTR ERVL 1 265 -133 4 1623 850 151 108 5 chr5 136139839 136140025 -16397234 + RMER10B LTR ERVL 194 398 0 4 1623 3482 154 124 2 chr5 136140561 136140849 -16396410 + RMER6D LTR ERVK 4 335 -385 5 1623 3482 154 124 2 chr5 136140873 136141223 -16396036 + RMER6D LTR ERVK 336 719 -1 5 1623 915 176 22 28 chr5 136141370 136141545 -16395714 - RLTR25B LTR ERVK -535 493 320 5 1623 1413 154 130 96 chr5 136141738 136142061 -16395198 - RLTR25B LTR ERVK -694 334 1 5 1623 262 231 156 32 chr5 136142280 136142374 -16394885 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 105 -797 5 1623 253 266 61 210 chr5 136152536 136152581 -16384678 - MTD LTR MaLR -4 366 328 5 1623 843 200 78 57 chr5 136152704 136152930 -16384329 - MTD LTR MaLR -31 390 196 5 1623 658 235 62 201 chr5 136153105 136153193 -16384066 - MTD LTR MaLR -218 203 129 5 1623 257 287 148 44 chr5 136153254 136153389 -16383870 - MTD LTR MaLR -266 153 5 5 1623 307 314 86 61 chr5 136155690 136155853 -16381406 - RMER15 LTR ERVL -4 571 405 5 1623 1013 219 212 31 chr5 136157106 136157427 -16379832 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1623 813 165 290 36 chr5 136160657 136160987 -16376272 + RMER10A LTR ERVL 1 415 -27 5 1623 479 250 154 0 chr5 136178995 136179151 -16358108 + MTE2a LTR MaLR 1 180 -199 6 1624 1164 260 101 32 chr5 136185750 136186127 -16351132 - MTD LTR MaLR -15 404 2 6 1624 227 263 12 62 chr5 136187448 136187529 -16349730 - MT2B2 LTR ERVL -345 239 163 6 1624 1256 219 83 9 chr5 136188049 136188385 -16348874 - MTEb LTR MaLR -1 378 18 6 1624 290 366 100 43 chr5 136189651 136189882 -16347377 - MER77 LTR ERVL -13 594 351 6 1624 2059 207 63 112 chr5 136190894 136191344 -16345915 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 98 6 1624 2059 207 63 112 chr5 136191380 136191467 -16345792 - RLTR18B LTR ERVK -415 97 3 6 1624 655 205 127 24 chr5 136199257 136199422 -16337837 - MTC LTR MaLR 0 421 240 7 1624 1661 186 76 52 chr5 136199432 136199813 -16337446 - RLTR18B LTR ERVK -16 496 107 7 1624 1249 145 74 17 chr5 136199817 136200048 -16337211 - MTC LTR MaLR -176 245 2 7 1624 1571 181 92 27 chr5 136214157 136214527 -16322732 - MTC LTR MaLR -22 399 6 7 1624 555 224 62 17 chr5 136214526 136214703 -16322556 - MTC-int LTR MaLR -4 1254 1070 7 1624 3709 206 142 15 chr5 136215001 136215032 -16322227 - MTC-int LTR MaLR -102 1156 1125 7 1624 3709 206 142 15 chr5 136215227 136215915 -16321344 - MTC-int LTR MaLR -134 1124 338 7 1624 3709 206 142 15 chr5 136216405 136216692 -16320567 - MTC-int LTR MaLR -950 308 4 7 1624 2164 129 98 23 chr5 136216694 136217083 -16320176 - MTC LTR MaLR -3 418 1 7 1624 456 238 24 59 chr5 136223221 136223391 -16313868 + RNLTR23 LTR ERVK 479 642 0 7 1624 2618 21 27 0 chr5 136227199 136227531 -16309728 + ORR1A1 LTR MaLR 1 341 -5 7 1624 1483 218 32 43 chr5 136228420 136228765 -16308494 + MTE2a LTR MaLR 36 376 -3 7 1624 358 228 16 168 chr5 136231393 136231583 -16305676 + RMER15 LTR ERVL 1 161 -414 7 1624 755 253 128 29 chr5 136231578 136231851 -16305408 + RMER15 LTR ERVL 276 575 0 7 1624 548 295 65 34 chr5 136233518 136233809 -16303450 - ORR1E LTR MaLR -52 307 8 7 1624 2410 83 6 0 chr5 136233892 136234217 -16303042 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1624 2990 60 14 43 chr5 136234222 136234446 -16302813 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 197 7 1624 2990 60 14 43 chr5 136234634 136234828 -16302431 - MTB_Mm LTR MaLR -211 196 1 7 1624 683 235 22 66 chr5 136236866 136237048 -16300211 + MTEa LTR MaLR 5 178 -201 7 1624 318 227 57 0 chr5 136237074 136237162 -16300097 + MTEa LTR MaLR 278 370 0 7 1624 260 308 63 36 chr5 136242058 136242092 -16295167 - MTEa LTR MaLR -21 358 324 8 1624 260 238 32 28 chr5 136242170 136242273 -16294986 - MTEa LTR MaLR -56 323 171 8 1624 593 267 48 0 chr5 136242436 136242601 -16294658 - MTEa LTR MaLR -204 175 3 8 1624 958 289 76 70 chr5 136242782 136243139 -16294120 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 8 1624 321 339 40 73 chr5 136249164 136249412 -16287847 - RLTR40 LTR ERVK -509 308 69 8 1624 981 208 131 6 chr5 136250435 136250747 -16286512 + MTD LTR MaLR 1 409 -10 8 1624 541 266 73 29 chr5 136260636 136260841 -16276418 - RLTR18-int LTR ERVK -5145 216 3 8 1624 2247 153 104 120 chr5 136260871 136261019 -16276240 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 469 8 1624 2247 153 104 120 chr5 136261170 136261629 -16275630 - RLTR18 LTR ERVK -148 468 15 8 1624 1686 112 90 23 chr5 136262942 136263243 -16274016 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 8 1624 254 277 0 30 chr5 136266761 136266828 -16270431 + MTC LTR MaLR 13 77 -344 8 1624 333 262 24 32 chr5 136267050 136267176 -16270083 - RLTR16 LTR ERVK -357 148 24 8 1624 499 325 41 5 chr5 136267139 136267319 -16269940 + MTD LTR MaLR 25 211 -208 8 1624 261 221 88 0 chr5 136267647 136267715 -16269544 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1128 4633 4560 8 1624 475 232 39 16 chr5 136267721 136267848 -16269411 + MTD LTR MaLR 276 405 -14 8 1624 2928 67 10 22 chr5 136271867 136272279 -16264980 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 9 1624 1114 281 98 3 chr5 136273199 136273545 -16263714 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 9 1624 966 262 121 47 chr5 136273639 136273782 -16263477 + RMER5 LTR ERV1 50 206 -328 9 1624 966 262 121 47 chr5 136274135 136274415 -16262844 + RMER5 LTR ERV1 207 510 -24 9 1624 1093 245 11 107 chr5 136307836 136307874 -16229385 - MTE2a LTR MaLR -9 370 337 1 1624 1093 251 17 91 chr5 136308009 136308414 -16228845 - MTE2a LTR MaLR -50 369 1 1 1625 261 288 55 61 chr5 136321244 136321407 -16215852 - ORR1E LTR MaLR -121 238 77 1 1625 291 242 0 87 chr5 136335732 136335836 -16201423 + MT2B LTR ERVL 170 264 -337 1 1625 1102 155 77 5 chr5 136352343 136352550 -16184709 - ORR1A0 LTR MaLR -121 225 4 1 1625 331 139 198 0 chr5 136355254 136355340 -16181919 - MER31A LTR ERV1 -369 116 14 1 1625 260 294 37 112 chr5 136361747 136361881 -16175378 + MT2B LTR ERVL 135 258 -343 1 1625 2857 58 13 121 chr5 136362086 136362342 -16174917 - MTB LTR MaLR 0 400 196 1 1625 2857 58 13 121 chr5 136362485 136362676 -16174583 - MTB LTR MaLR -205 195 1 1 1625 380 227 15 105 chr5 136373368 136373501 -16163758 - MT2B LTR ERVL -314 287 167 1 1625 410 211 164 0 chr5 136374030 136374134 -16163125 + ORR1E LTR MaLR 1 121 -238 1 1625 1275 168 190 0 chr5 136376935 136377203 -16160056 + MTC LTR MaLR 59 377 -44 1 1625 557 231 238 113 chr5 136388916 136388971 -16148288 - MTD LTR MaLR -3 416 364 1 1625 557 231 238 113 chr5 136389118 136389364 -16147895 - MTD LTR MaLR -56 363 77 1 1625 444 293 84 67 chr5 136392312 136392491 -16144768 + MER68 LTR ERVL 1 182 -381 1 1625 325 214 41 134 chr5 136402710 136402807 -16134452 + MT2B LTR ERVL 152 239 -362 1 1625 1031 151 171 105 chr5 136411731 136412006 -16125253 + RMER10A LTR ERVL 9 372 -70 1 1625 1031 120 142 132 chr5 136412155 136412229 -16125030 + RMER10A LTR ERVL 373 433 -9 1 1625 391 80 0 0 chr5 136420857 136420907 -16116352 - ORR1A2 LTR MaLR -5 321 272 1 1625 1825 99 55 4 chr5 136421066 136421337 -16115922 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 1 1625 225 362 75 58 chr5 136421513 136421686 -16115573 - ORR1D2 LTR MaLR -189 181 6 1 1625 300 236 120 33 chr5 136424531 136424623 -16112636 - MLT1A1 LTR MaLR -56 352 253 1 1626 1641 158 56 28 chr5 136452334 136452724 -16084535 + RMER17C LTR ERVK 10 410 0 1 1626 249 270 41 50 chr5 136456564 136456685 -16080574 - MT2B LTR ERVL -351 250 131 1 1626 309 252 49 90 chr5 136459063 136459108 -16078151 - MT2B LTR ERVL -440 161 123 1 1626 267 271 93 54 chr5 136473395 136473424 -16063835 + MT2B2 LTR ERVL 179 287 -297 1 1626 384 274 98 117 chr5 136474391 136474446 -16062813 - MT2B LTR ERVL -173 428 373 1 1626 384 274 98 117 chr5 136474641 136474698 -16062561 - MT2B LTR ERVL -229 372 325 1 1626 384 274 98 117 chr5 136474722 136474738 -16062521 - MT2B LTR ERVL -277 324 179 1 1626 333 216 67 76 chr5 136479297 136479402 -16057857 - MT2B LTR ERVL -337 264 161 1 1626 359 191 0 136 chr5 136484044 136484147 -16053112 - MT2B LTR ERVL -361 240 152 1 1626 588 264 60 11 chr5 136500494 136500678 -16036581 - MTEb LTR MaLR 0 379 187 2 1626 539 298 86 5 chr5 136501557 136501766 -16035493 - MTE2b LTR MaLR -134 245 20 3 1626 237 242 0 46 chr5 136510256 136510321 -16026938 - RLTR25B LTR ERVK -543 485 424 1 1626 789 201 190 5 chr5 136511257 136511595 -16025664 + MTC LTR MaLR 10 421 0 2 1626 1623 165 110 0 chr5 136512904 136513232 -16024027 + ORR1D1 LTR MaLR 6 369 -5 3 1626 2456 109 24 53 chr5 136524443 136524861 -16012398 + MTB_Mm LTR MaLR 2 407 0 6 1626 230 320 142 7 chr5 136529403 136529551 -16007708 + ORR1D2 LTR MaLR 3 170 -200 8 1626 244 222 74 67 chr5 136529712 136529847 -16007412 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 619 8 1626 667 232 142 5 chr5 136531156 136531368 -16005891 + ORR1E LTR MaLR 1 241 -118 9 1626 1277 171 134 34 chr5 136548069 136548390 -15988869 + ORR1C1 LTR MaLR 11 363 -15 1 1626 1456 226 47 32 chr5 136549453 136549860 -15987399 + MTD LTR MaLR 7 419 0 1 1626 526 307 127 30 chr5 136550405 136550762 -15986497 + MTE2a LTR MaLR 2 397 -22 1 1626 2426 118 33 62 chr5 136551210 136551575 -15985684 + MTC LTR MaLR 2 375 -46 1 1626 2426 118 33 62 chr5 136551767 136551824 -15985435 + MTC LTR MaLR 376 412 -9 1 1626 1024 238 19 19 chr5 136552008 136552269 -15984990 + ORR1D2 LTR MaLR 1 261 -109 1 1626 1359 181 125 0 chr5 136552245 136552549 -15984710 + MT2A LTR ERVL 192 533 0 1 1626 1107 116 11 6 chr5 136554595 136554764 -15982495 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 148 1 1626 1860 110 38 28 chr5 136555867 136556186 -15981073 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1626 839 216 312 72 chr5 136573791 136574087 -15963172 - MT2A LTR ERVL 0 533 147 2 1626 839 216 312 72 chr5 136574214 136574347 -15962912 - MT2A LTR ERVL -387 146 1 2 1627 1580 232 42 18 chr5 136581002 136581384 -15955875 - MTD LTR MaLR -9 410 20 2 1627 269 233 67 0 chr5 136591830 136591890 -15945369 - MTEb LTR MaLR -313 66 3 3 1627 284 345 116 41 chr5 136593550 136593792 -15943467 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 304 3 1627 375 283 95 54 chr5 136595514 136595527 -15941732 - MT2B LTR ERVL -325 276 245 3 1627 375 283 95 54 chr5 136595630 136595682 -15941577 - MT2B LTR ERVL -325 244 102 3 1627 272 221 302 31 chr5 136600205 136600364 -15936895 + RMER21B LTR ERV1 437 684 -263 3 1627 1278 173 99 14 chr5 136600547 136600829 -15936430 + RodERV21-int LTR ERV1 7 312 -4679 3 1627 350 229 71 30 chr5 136600825 136600924 -15936335 + RodERV21-int LTR ERV1 1754 1856 -3135 3 1627 356 239 208 21 chr5 136600944 136601136 -15936123 + RLTR15 LTR ERVK 1 228 -131 3 1627 235 282 170 26 chr5 136601225 136601378 -15935881 + RLTR15 LTR ERVK 167 341 -18 3 1627 2786 182 117 24 chr5 136601399 136602116 -15935143 + RodERV21-int LTR ERV1 1927 2710 -2281 3 1627 420 368 27 36 chr5 136602281 136602721 -15934538 + RodERV21-int LTR ERV1 3639 4074 -3017 3 1627 2961 184 56 20 chr5 136604342 136604877 -15932382 + RodERV21-int LTR ERV1 4191 4749 -242 3 1627 2961 184 56 20 chr5 136605017 136605085 -15932174 + RodERV21-int LTR ERV1 4750 4816 -175 3 1627 292 207 126 0 chr5 136605111 136605198 -15932061 + RMER4B LTR ERVK 356 453 -132 3 1627 526 207 99 0 chr5 136605238 136605359 -15931900 + RMER21B LTR ERV1 37 169 -673 3 1627 286 245 0 117 chr5 136612850 136612970 -15924289 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 3 1627 2789 144 147 47 chr5 136618410 136618710 -15918549 + RMER4B LTR ERVK 1 333 -252 3 1627 2789 144 147 47 chr5 136618877 136619108 -15918151 + RMER4B LTR ERVK 334 585 0 3 1627 604 279 34 34 chr5 136621337 136621537 -15915722 - RLTR26 LTR ERVK -226 416 217 3 1627 1804 225 51 63 chr5 136621537 136621692 -15915567 + RMER13A LTR ERVK 1 150 -710 3 1627 1804 225 51 63 chr5 136621838 136622170 -15915089 + RMER13A LTR ERVK 151 482 -378 3 1627 2061 73 21 0 chr5 136622502 136622781 -15914478 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 3 1627 322 230 104 60 chr5 136629055 136629088 -15908171 + MT2B2 LTR ERVL 177 313 -271 4 1627 2073 63 78 104 chr5 136629804 136629926 -15907333 + ORR1A3 LTR MaLR 1 107 -219 4 1627 2073 63 78 104 chr5 136630124 136630333 -15906926 + ORR1A3 LTR MaLR 108 326 0 4 1627 2247 121 15 9 chr5 136631548 136631883 -15905376 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1627 21699 74 32 18 chr5 136631883 136634911 -15902348 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 4 1627 6511 54 12 7 chr5 136634897 136635743 -15901516 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6479 -2 4 1627 2247 121 15 9 chr5 136635745 136636080 -15901179 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 1627 254 226 82 51 chr5 136648622 136648720 -15888539 - MLT1A0 LTR MaLR -214 151 51 4 1627 254 286 132 0 chr5 136650531 136650622 -15886637 + MTE2a LTR MaLR 18 120 -299 4 1627 1611 187 84 61 chr5 136650652 136650777 -15886482 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 249 4 1627 1611 187 84 61 chr5 136650817 136650953 -15886306 - ORR1D1 LTR MaLR -126 248 102 4 1627 1611 187 84 61 chr5 136651103 136651199 -15886060 - ORR1D1 LTR MaLR -273 101 5 4 1627 725 256 53 80 chr5 136651399 136651662 -15885597 + MTE2a LTR MaLR 96 351 -28 4 1627 801 239 150 43 chr5 136653966 136654306 -15882953 - MTD LTR MaLR -20 359 1 4 1627 1537 194 32 35 chr5 136660683 136661056 -15876203 - ORR1C2 LTR MaLR -12 372 1 5 1627 398 315 30 41 chr5 136668659 136668828 -15868431 + RMER15 LTR ERVL 333 499 -76 5 1627 277 277 75 115 chr5 136670466 136670573 -15866686 + MT2B LTR ERVL 59 157 -444 5 1627 410 256 24 66 chr5 136671170 136671337 -15865922 + RNLTR23 LTR ERVK 483 642 0 5 1627 2072 80 243 3 chr5 136672560 136672898 -15864361 + MTC LTR MaLR 3 421 0 5 1627 373 316 45 17 chr5 136677224 136677401 -15859858 + MER90a LTR ERV1 349 530 -84 5 1627 2349 149 68 57 chr5 136680089 136680559 -15856700 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1627 4183 65 68 23 chr5 136680582 136681200 -15856059 + IAPEz-int LTR ERVK 17 662 -5819 5 1627 445 66 0 32 chr5 136681200 136681263 -15855996 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 5 1627 1785 107 4 4 chr5 136681252 136681514 -15855745 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 5 1627 885 88 24 0 chr5 136681509 136681634 -15855625 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 5 1627 20220 17 2 0 chr5 136681636 136683991 -15853268 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 5 1627 2349 149 68 57 chr5 136683991 136684461 -15852798 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1627 315 276 23 0 chr5 136686098 136686185 -15851074 - LTR75 LTR ERVL -35 527 439 5 1627 364 187 0 142 chr5 136696010 136696116 -15841143 - MT2B LTR ERVL -343 258 168 6 1627 3631 73 106 19 chr5 136698594 136699112 -15838147 + RMER2 LTR ERV1 1 563 -4 6 1627 3448 118 188 34 chr5 136699120 136699775 -15837484 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 6 1628 226 360 76 33 chr5 136730569 136730779 -15806480 + ORR1E LTR MaLR 3 221 -138 7 1628 1001 208 46 12 chr5 136736229 136736550 -15800709 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 7 1628 234 283 73 124 chr5 136753978 136754115 -15783144 - MT2B LTR ERVL -302 299 170 7 1628 1331 229 50 6 chr5 136764044 136764364 -15772895 + MTEa LTR MaLR 39 372 -7 7 1628 244 231 28 104 chr5 136793528 136793634 -15743625 - MT2B2 LTR ERVL -333 251 154 8 1628 1326 234 64 24 chr5 136794312 136794640 -15742619 + MTEa LTR MaLR 37 377 -2 8 1628 268 214 21 116 chr5 136807360 136807375 -15729884 + MT2B2 LTR ERVL 154 159 -425 8 1628 874 240 129 8 chr5 136808094 136808358 -15728901 + MTE2b LTR MaLR 22 317 -62 8 1628 233 269 30 61 chr5 136810348 136810447 -15726812 - MLT1N2 LTR MaLR -402 160 65 8 1628 1395 164 222 14 chr5 136812122 136812469 -15724790 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1628 649 141 197 30 chr5 136815724 136815856 -15721403 + MTC LTR MaLR 170 323 -98 9 1628 3474 33 0 2 chr5 136817869 136818264 -15718995 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 9 1628 704 242 137 6 chr5 136818392 136818575 -15718684 + MTD LTR MaLR 1 207 -212 9 1628 294 183 26 177 chr5 136818546 136818659 -15718600 + MTD LTR MaLR 324 419 0 9 1628 396 267 20 0 chr5 136820218 136820319 -15716940 + MTE2b LTR MaLR 11 113 -266 9 1628 230 182 91 0 chr5 136820358 136820413 -15716846 + MTE2b LTR MaLR 312 371 -8 9 1628 1025 183 128 19 chr5 136821256 136821513 -15715746 + MTC LTR MaLR 137 421 0 9 1628 695 184 288 13 chr5 136829886 136830082 -15707177 - MTD LTR MaLR -35 384 158 9 1628 226 315 49 118 chr5 136837444 136837534 -15699725 + MER77 LTR ERVL 161 243 -364 9 1628 226 315 49 118 chr5 136837636 136837689 -15699570 + MER77 LTR ERVL 244 293 -314 9 1629 649 244 18 30 chr5 136843898 136844067 -15693192 + MTC LTR MaLR 2 168 -253 9 1629 430 298 80 8 chr5 136844092 136844217 -15693042 + MTC LTR MaLR 272 405 -14 9 1629 1555 179 148 3 chr5 136860050 136860381 -15676878 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 1 1629 598 147 0 21 chr5 136860719 136860816 -15676443 - MTC LTR MaLR -323 98 4 1 1629 1960 147 52 49 chr5 136862201 136862588 -15674671 + MTB_Mm LTR MaLR 20 407 0 1 1629 1344 197 146 11 chr5 136866591 136866960 -15670299 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1629 3041 42 11 3 chr5 136876204 136876586 -15660673 + MTA_Mm LTR MaLR 1 385 -11 1 1629 1371 232 148 3 chr5 136877281 136877639 -15659620 + MTD LTR MaLR 10 419 0 1 1629 421 171 43 95 chr5 136880129 136880245 -15657014 + MT2B LTR ERVL 155 264 -337 1 1629 859 193 45 26 chr5 136883603 136883802 -15653457 + MTEb LTR MaLR 208 419 0 1 1629 829 318 99 56 chr5 136884508 136884901 -15652358 + MLT1D LTR MaLR 48 457 -48 1 1629 1311 180 155 18 chr5 136895190 136895519 -15641740 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1629 300 264 33 33 chr5 136906705 136906795 -15630464 + RMER12 LTR ERVK 745 834 -488 1 1629 257 344 83 94 chr5 136912278 136912628 -15624631 + ORR1E LTR MaLR 1 346 -13 1 1629 682 249 31 109 chr5 136925628 136925885 -15611374 - ORR1E LTR MaLR -122 237 1 1 1629 682 218 180 5 chr5 136960718 136960907 -15576352 + MTEa LTR MaLR 156 377 -2 1 1629 230 261 73 42 chr5 136966972 136967068 -15570191 + RLTR21 LTR ERVK 1305 1403 -169 1 1630 765 290 97 13 chr5 136970868 136971095 -15566164 + MTE2a LTR MaLR 1 246 -133 1 1630 379 281 7 92 chr5 137022351 137022492 -15514767 + MLT1A1 LTR MaLR 276 404 -4 6 1630 536 192 12 77 chr5 137049807 137049976 -15487283 + RMER10B LTR ERVL 186 343 -55 1 1630 1758 232 11 47 chr5 137076775 137077155 -15460104 - MTD LTR MaLR -7 412 47 2 1630 290 180 0 103 chr5 137077334 137077402 -15459857 - MTD LTR MaLR -360 61 1 2 1630 774 122 33 33 chr5 137092569 137092721 -15444538 + RMER17B LTR ERVK 312 463 -495 3 1630 465 227 28 111 chr5 137092784 137092814 -15444445 + MT2B LTR ERVL 133 150 -451 3 1631 1924 203 62 7 chr5 137105554 137105640 -15431619 + MT2A LTR ERVL 74 177 -356 3 1631 1924 203 62 7 chr5 137105695 137106024 -15431235 + MT2A LTR ERVL 178 512 -21 3 1631 399 250 118 1 chr5 137106224 137106336 -15430923 + MTEa LTR MaLR 237 370 -9 3 1631 265 219 36 50 chr5 137107293 137107447 -15429812 - RMER17D LTR ERVK -373 516 365 3 1631 265 219 36 50 chr5 137107598 137107664 -15429595 - RMER17D LTR ERVK -525 364 299 3 1631 300 322 93 33 chr5 137111405 137111670 -15425589 + LTR85b LTR Gypsy? 194 559 -225 3 1631 2615 119 85 0 chr5 137116055 137116443 -15420816 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1631 2047 201 59 3 chr5 137126737 137127127 -15410132 - MTD LTR MaLR 0 419 8 4 1631 1524 192 144 17 chr5 137127912 137128272 -15408987 + MTD LTR MaLR 13 418 -1 4 1631 1867 210 33 31 chr5 137132285 137132674 -15404585 - MTD LTR MaLR -29 390 1 4 1631 352 330 32 80 chr5 137132692 137132880 -15404379 - ORR1E LTR MaLR -65 294 116 4 1631 2533 100 45 18 chr5 137133250 137133646 -15403613 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1631 685 235 65 158 chr5 137134544 137134822 -15402437 + MTE2a LTR MaLR 3 254 -125 4 1631 231 206 47 93 chr5 137141505 137141612 -15395647 - RLTR40 LTR ERVK -146 671 570 5 1631 308 303 48 72 chr5 137149119 137149417 -15387842 + MTEb LTR MaLR 59 363 -16 5 1631 330 344 71 45 chr5 137156590 137156809 -15380450 + MLT1G LTR MaLR 88 315 -240 5 1631 1092 219 50 0 chr5 137156837 137157056 -15380203 + MTE2b LTR MaLR 1 230 -149 5 1631 237 241 271 24 chr5 137158392 137158477 -15378782 + MTE2b LTR MaLR 274 379 0 5 1631 745 258 50 46 chr5 137158591 137158810 -15378449 + MTD LTR MaLR 6 225 -194 5 1631 705 208 15 0 chr5 137159028 137159158 -15378101 + MTD LTR MaLR 274 405 -14 5 1631 618 237 12 62 chr5 137160852 137160974 -15376285 - MTD LTR MaLR -185 234 120 5 1631 1984 184 144 11 chr5 137160974 137161046 -15376213 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 460 5 1631 1984 184 144 11 chr5 137161088 137161481 -15375778 - RLTR11A LTR ERVK -69 459 3 5 1631 618 237 12 62 chr5 137161481 137161520 -15375739 - MTD LTR MaLR -300 119 81 5 1631 235 274 33 87 chr5 137161509 137161601 -15375658 - MT2B LTR ERVL -360 241 155 5 1631 1040 199 43 0 chr5 137168827 137169038 -15368221 - MTEb LTR MaLR -142 237 18 5 1631 1617 208 47 50 chr5 137169329 137169709 -15367550 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 5 1631 409 186 95 95 chr5 137174848 137174996 -15362263 - MT2B LTR ERVL -337 264 117 6 1631 1267 205 48 185 chr5 137183920 137184357 -15352902 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 6 1631 355 295 13 76 chr5 137184747 137184905 -15352354 - ORR1E LTR MaLR -206 153 6 6 1631 248 237 86 78 chr5 137187358 137187399 -15349860 - MT2B2 LTR ERVL -427 157 116 6 1631 2732 58 26 3 chr5 137196112 137196458 -15340801 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 6 1631 1924 181 55 15 chr5 137198180 137198578 -15338681 + MTD LTR MaLR 4 417 -2 6 1631 458 316 77 82 chr5 137199602 137199968 -15337291 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 6 1631 321 255 136 36 chr5 137200867 137200977 -15336282 + MLT1A1 LTR MaLR 1 121 -287 6 1631 1402 207 133 40 chr5 137204198 137204479 -15332780 + MTEb LTR MaLR 1 316 -63 6 1631 1402 207 133 40 chr5 137204665 137204730 -15332529 + MTEb LTR MaLR 317 379 0 6 1631 320 267 39 62 chr5 137204889 137205017 -15332242 + RMER15 LTR ERVL 6 130 -445 6 1631 714 264 198 8 chr5 137205054 137205306 -15331953 + RMER15 LTR ERVL 273 572 -3 6 1631 302 329 56 43 chr5 137205306 137205466 -15331793 + MLT1B LTR MaLR 193 354 -20 7 1631 1432 194 105 55 chr5 137205660 137206021 -15331238 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 7 1631 4482 12 0 24 chr5 137206219 137206724 -15330535 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1631 297 0 0 0 chr5 137206724 137206762 -15330497 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 7 1631 374 167 46 35 chr5 137206762 137206849 -15330410 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 7 1631 45915 15 6 0 chr5 137206849 137212175 -15325084 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 7 1631 3723 16 117 26 chr5 137212175 137212627 -15324632 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1631 1863 77 53 141 chr5 137213431 137213792 -15323467 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1631 322 303 37 29 chr5 137213881 137214017 -15323242 + MER74B LTR ERVL 174 310 -312 7 1631 244 260 154 96 chr5 137215564 137215700 -15321559 + LTR84a LTR ERVL 429 572 -185 7 1631 1903 163 59 21 chr5 137220458 137220847 -15316412 + MTD LTR MaLR 12 405 -14 7 1631 1134 204 181 8 chr5 137225660 137225961 -15311298 + MTD LTR MaLR 67 404 -15 7 203 1038 270 125 25 chr5 137232346 137232714 -15304545 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 7 1632 1381 121 140 0 chr5 137240371 137240635 -15296624 + RMER15 LTR ERVL 272 572 -3 7 1632 238 335 44 89 chr5 137244773 137244953 -15292306 - MT2B2 LTR ERVL -326 258 87 7 1632 1136 262 49 46 chr5 137250390 137250718 -15286541 + MTE2a LTR MaLR 42 370 -9 7 1632 787 174 143 10 chr5 137252177 137252423 -15284836 + MTD LTR MaLR 127 419 0 8 1632 3058 108 9 14 chr5 137253050 137253473 -15283786 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1632 2374 103 19 3 chr5 137253519 137253840 -15283419 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 8 1632 1297 180 106 140 chr5 137255385 137255799 -15281460 - MTD LTR MaLR -2 417 18 8 1632 411 275 44 38 chr5 137257346 137257505 -15279754 + RMER15 LTR ERVL 1 160 -415 8 1632 417 240 0 20 chr5 137257518 137257616 -15279643 + RMER15 LTR ERVL 298 393 -182 8 1632 927 261 61 102 chr5 137261251 137261504 -15275755 - MTE2a LTR MaLR -2 377 118 8 1632 927 261 61 102 chr5 137261734 137261872 -15275387 - MTE2a LTR MaLR -262 117 2 8 1632 1203 209 105 23 chr5 137264346 137264689 -15272570 + MTD LTR MaLR 10 380 -39 8 1632 1298 218 146 15 chr5 137273591 137273926 -15263333 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 8 1632 1273 235 129 29 chr5 137274639 137275020 -15262239 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1632 1734 141 84 22 chr5 137276274 137276702 -15260557 + RMER17C LTR ERVK 20 439 -519 8 1632 250 213 0 0 chr5 137277245 137277292 -15259967 + RMER15 LTR ERVL 84 130 -445 8 1632 402 301 96 86 chr5 137282314 137282638 -15254621 - LTR37A LTR ERV1 -59 367 41 9 1632 232 240 0 65 chr5 137283558 137283665 -15253594 - ORR1B1-int LTR MaLR -776 733 634 9 1632 1705 127 144 74 chr5 137284096 137284463 -15252796 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 9 1632 325 290 86 0 chr5 137288068 137288161 -15249098 + MTEb LTR MaLR 3 103 -276 9 1632 678 170 131 0 chr5 137288442 137288595 -15248664 + MTEb LTR MaLR 164 336 -43 9 1632 2630 106 36 15 chr5 137288837 137289249 -15248010 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1632 1317 170 33 69 chr5 137291422 137291756 -15245503 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 9 1632 365 214 28 101 chr5 137292408 137292517 -15244742 + MT2B LTR ERVL 156 256 -345 9 1632 1615 178 155 3 chr5 137298006 137298367 -15238892 + MTD LTR MaLR 2 417 -2 9 1632 1609 140 8 105 chr5 137298695 137299065 -15238194 + ORR1B1 LTR MaLR 7 392 -2 9 1632 798 233 6 6 chr5 137299100 137299277 -15237982 - MTE2b LTR MaLR -200 179 3 9 1632 524 239 13 60 chr5 137306413 137306629 -15230630 - MTEa LTR MaLR -3 376 164 1 1632 410 321 44 57 chr5 137306838 137307066 -15230193 + RMER15 LTR ERVL 346 570 -5 1 1632 515 246 15 7 chr5 137307101 137307236 -15230023 - MTEa LTR MaLR -223 136 1 1 1632 2019 163 53 173 chr5 137307245 137307869 -15229390 + RMER19C LTR ERVK 2 550 -61 1 1632 1155 199 108 24 chr5 137307881 137308241 -15229018 + RLTR26 LTR ERVK 5 430 -212 1 1632 396 319 0 14 chr5 137308591 137308731 -15228528 + RLTR26 LTR ERVK 494 631 -11 1 1632 432 116 0 0 chr5 137308763 137308832 -15228427 + RMER19C LTR ERVK 543 611 0 1 1632 1973 117 8 71 chr5 137310836 137311187 -15226072 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1632 1530 148 64 1 chr5 137316685 137316957 -15220302 - MTC LTR MaLR -102 319 1 1 1632 612 244 19 13 chr5 137317986 137318140 -15219119 + MTD LTR MaLR 169 323 -96 1 1632 536 234 182 28 chr5 137320387 137320563 -15216696 - MTEa LTR MaLR -13 366 164 1 1632 2302 145 15 8 chr5 137320633 137321030 -15216229 - RMER20A LTR ERVK -106 410 11 1 1632 1152 239 115 53 chr5 137323564 137323599 -15213660 - MTE2b LTR MaLR -18 361 326 1 1632 1152 239 115 53 chr5 137323654 137323958 -15213301 - MTE2b LTR MaLR -54 325 2 1 1632 391 132 44 0 chr5 137323981 137324049 -15213210 + RLTR30 LTR ERV1 1 71 -308 1 1632 628 286 64 122 chr5 137324130 137324615 -15212644 + RLTR18 LTR ERVK 135 591 -25 1 1632 1155 112 185 142 chr5 137324643 137324868 -15212391 + RLTR30 LTR ERV1 65 335 -44 1 1632 1155 112 185 142 chr5 137324971 137324998 -15212261 + RLTR30 LTR ERV1 336 336 -43 1 1632 1155 112 185 142 chr5 137325141 137325189 -15212070 + RLTR30 LTR ERV1 336 379 0 1 1632 603 278 113 0 chr5 137325415 137325627 -15211632 + MTEb LTR MaLR 36 271 -108 1 1632 345 305 38 0 chr5 137325619 137325724 -15211535 - MTEa LTR MaLR -268 111 3 1 1632 437 339 122 14 chr5 137328695 137328916 -15208343 + ORR1E LTR MaLR 64 308 -51 1 1632 799 238 5 51 chr5 137330724 137330919 -15206340 - MTEa LTR MaLR -61 318 133 1 1632 3425 71 21 11 chr5 137332514 137332984 -15204275 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1632 556 276 134 15 chr5 137337894 137338096 -15199163 + RMER15 LTR ERVL 329 554 -21 1 1632 250 246 0 115 chr5 137347554 137347632 -15189627 + MT2B LTR ERVL 173 241 -360 1 1632 1023 238 90 28 chr5 137352360 137352757 -15184502 + RMER15 LTR ERVL 45 575 0 1 1633 1208 201 56 174 chr5 137365419 137365792 -15171467 + MTE2a LTR MaLR 1 329 -50 1 1633 2600 160 81 8 chr5 137373992 137374471 -15162788 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 15 1 1633 1500 152 170 25 chr5 137376368 137376583 -15160676 - RMER17C LTR ERVK 0 410 140 1 1633 1500 152 170 25 chr5 137376745 137376887 -15160372 - RMER17C LTR ERVK -271 139 1 1 1633 453 333 22 0 chr5 137379665 137379787 -15157472 + MTD LTR MaLR 6 130 -291 1 1633 952 176 210 26 chr5 137379787 137380098 -15157161 + RLTR20C LTR ERVK 1 476 -102 1 1633 579 211 106 26 chr5 137380144 137380234 -15157025 + RLTR20C LTR ERVK 477 577 -1 1 1633 966 271 91 11 chr5 137380234 137380503 -15156756 + MTD LTR MaLR 123 413 -6 1 1633 1248 252 95 0 chr5 137389602 137389939 -15147320 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 1 1633 350 284 10 31 chr5 137391308 137391406 -15145853 - MLT1D LTR MaLR -82 423 328 1 1633 347 330 102 68 chr5 137391786 137392108 -15145151 + ORR1E LTR MaLR 27 359 0 1 1633 2915 46 46 0 chr5 137393260 137393609 -15143650 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 1 1633 2552 50 85 0 chr5 137394126 137394445 -15142814 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1633 288 224 0 141 chr5 137402180 137402237 -15135022 - MTEb LTR MaLR -34 345 296 1 1633 288 243 3 136 chr5 137402454 137402518 -15134741 - MTEb LTR MaLR -84 295 220 1 1633 441 264 134 11 chr5 137408159 137408363 -15128896 - MTC LTR MaLR -14 407 174 1 1633 227 292 44 62 chr5 137413824 137413861 -15123398 - MT2B2 LTR ERVL -347 237 127 1 1633 2891 224 47 51 chr5 137415899 137416798 -15120461 + RMER3D-int LTR ERVK 1947 2841 -1 1 1633 3044 77 9 7 chr5 137416799 137417219 -15120040 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1633 306 261 34 11 chr5 137419467 137419556 -15117703 + MTE2a LTR MaLR 248 338 -41 1 1633 240 280 68 93 chr5 137419646 137419764 -15117495 - MT2B LTR ERVL -338 263 149 1 1633 1308 158 145 83 chr5 137423033 137423324 -15113935 + ORR1B2 LTR MaLR 1 321 -46 1 1633 1308 158 145 83 chr5 137423468 137423514 -15113745 + ORR1B2 LTR MaLR 322 359 -8 1 1633 1318 106 27 150 chr5 137423861 137424161 -15113098 + ORR1A4 LTR MaLR 1 263 -66 1 1633 393 72 81 54 chr5 137425066 137425140 -15112119 + ORR1A4 LTR MaLR 254 329 0 1 1633 411 248 18 44 chr5 137425377 137425491 -15111768 - MTE2a LTR MaLR -268 111 1 1 1633 1929 76 69 3 chr5 137425626 137425915 -15111344 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 308 -19 1 1633 2475 75 121 11 chr5 137428293 137428672 -15108587 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1633 1203 196 193 16 chr5 137431558 137431874 -15105385 + MTD LTR MaLR 1 372 -47 1 1633 306 210 24 36 chr5 137431951 137432035 -15105224 - RLTR11A LTR ERVK -445 83 1 1 1633 625 231 57 53 chr5 137432036 137432264 -15104995 - MYSERV-int LTR ERVK -2 6548 6320 1 1633 895 184 41 21 chr5 137432331 137432525 -15104734 - MYSERV6-int LTR ERVK -177 8782 8585 1 1633 264 264 239 8 chr5 137435017 137435147 -15102112 - MER21B LTR ERV1 -137 726 567 1 1633 416 271 30 37 chr5 137435350 137435484 -15101775 - MER21B LTR ERV1 -605 258 126 1 1633 293 188 0 0 chr5 137436175 137436223 -15101036 + ORR1B2 LTR MaLR 312 359 -8 1 1633 1024 126 114 16 chr5 137437210 137437400 -15099859 + MTC LTR MaLR 1 209 -212 1 1633 340 335 58 19 chr5 137447574 137447781 -15089478 + RMER15 LTR ERVL 343 557 -18 1 1633 396 174 31 20 chr5 137453274 137453360 -15083899 - MTD LTR MaLR -21 398 263 1 1633 441 261 41 32 chr5 137453409 137453532 -15083727 - MTD LTR MaLR -288 131 8 1 1633 2008 118 12 41 chr5 137454342 137454687 -15082572 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 51 1 1633 1923 123 14 74 chr5 137454756 137455106 -15082153 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1633 1504 215 62 25 chr5 137469289 137469642 -15067617 - MTE2b LTR MaLR -13 366 1 1 1633 1852 202 35 15 chr5 137471078 137471484 -15065775 - MTD LTR MaLR -5 414 1 1 1633 1076 250 124 21 chr5 137471530 137471861 -15065398 - MTEb LTR MaLR -14 365 1 1 1633 1178 254 126 6 chr5 137478086 137478427 -15058832 + MTD LTR MaLR 26 407 -12 1 1633 4606 127 47 11 chr5 137479733 137480463 -15056796 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 1 1633 1259 192 34 22 chr5 137484039 137484363 -15052896 - RLTR20B3 LTR ERVK -14 563 236 1 1633 295 341 36 43 chr5 137484575 137484713 -15052546 - LTR78 LTR ERV1 -33 1271 1135 1 1633 1041 285 95 3 chr5 137490557 137490884 -15046375 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 1 1633 267 328 33 33 chr5 137490906 137491026 -15046233 - ORR1E LTR MaLR -222 137 18 1 1633 554 204 0 9 chr5 137491379 137491481 -15045778 - MTEb LTR MaLR 0 379 279 1 1633 1258 240 85 35 chr5 137491481 137491822 -15045437 + MTEa LTR MaLR 3 360 -19 1 1633 414 199 40 5 chr5 137491856 137491959 -15045300 - MTEb LTR MaLR -271 103 2 1 1634 3304 121 259 5 chr5 137496308 137496896 -15040363 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 1634 584 233 51 104 chr5 137498146 137498465 -15038794 - MTE2a LTR MaLR -6 373 1 1 1634 1744 122 39 143 chr5 137515084 137515496 -15021763 + ORR1C2 LTR MaLR 16 384 0 2 1634 574 312 49 46 chr5 137524671 137525017 -15012242 - RMER17C LTR ERVK -63 347 1 6 1634 330 230 115 0 chr5 137528889 137528976 -15008283 + MLT1A1 LTR MaLR 1 97 -311 8 1634 273 391 81 8 chr5 137529212 137529282 -15007977 + ORR1D2 LTR MaLR 18 91 -279 8 1634 1548 239 80 3 chr5 137529282 137529634 -15007625 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 8 1634 273 391 81 8 chr5 137529634 137529823 -15007436 + ORR1D2 LTR MaLR 92 295 -75 8 1634 1368 261 38 35 chr5 137529832 137530205 -15007054 + MTEa LTR MaLR 4 377 -2 8 1634 249 307 78 17 chr5 137530345 137530461 -15006798 + MLT1A1 LTR MaLR 248 370 -38 8 1634 276 287 29 102 chr5 137544177 137544238 -14993021 - MT2B2 LTR ERVL -446 155 97 1 1634 1779 125 125 0 chr5 137557722 137558007 -14979252 + ORR1C2 LTR MaLR 6 319 -65 1 1634 1779 125 125 0 chr5 137558036 137558077 -14979182 + ORR1C2 LTR MaLR 320 371 -13 1 1634 287 247 18 126 chr5 137561318 137561429 -14975830 + MT2B2 LTR ERVL 153 251 -333 2 1634 2150 86 6 89 chr5 137561615 137561973 -14975286 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 2 1634 248 258 0 31 chr5 137565496 137565560 -14971699 + RMER5 LTR ERV1 141 202 -332 2 1634 1340 226 25 25 chr5 137571058 137571413 -14965846 - ORR1E LTR MaLR -2 377 5 2 1634 528 259 23 28 chr5 137571466 137571703 -14965556 + MTE2b LTR MaLR 10 351 -28 2 1634 2066 133 9 3 chr5 137572262 137572608 -14964651 - RLTR15 LTR ERVK -9 350 3 2 1634 607 246 112 9 chr5 137572610 137572830 -14964429 - MTD LTR MaLR -148 231 19 2 1634 267 257 54 174 chr5 137574478 137574602 -14962657 + MLT1A1 LTR MaLR 235 347 -61 2 1634 267 257 54 174 chr5 137574744 137574803 -14962456 + MLT1A1 LTR MaLR 348 396 -12 2 1634 558 258 0 92 chr5 137574840 137575024 -14962235 - RMER15 LTR ERVL -45 530 364 2 1634 247 174 22 0 chr5 137579937 137579983 -14957276 + ORR1E LTR MaLR 1 47 -312 2 1634 337 301 145 23 chr5 137580233 137580447 -14956812 + ORR1E LTR MaLR 88 327 -32 2 1634 784 224 61 30 chr5 137581008 137581206 -14956053 + MTD LTR MaLR 1 204 -215 2 1634 460 231 207 24 chr5 137581331 137581495 -14955764 + MTD LTR MaLR 223 416 -3 2 1634 303 239 17 21 chr5 137599795 137599896 -14937363 + MTEa LTR MaLR 24 123 -256 3 1634 506 198 26 18 chr5 137600430 137600543 -14936716 + MTEa LTR MaLR 50 163 -216 3 1634 249 300 0 53 chr5 137601628 137601723 -14935536 - MLT1C LTR MaLR 0 408 319 3 1634 1280 147 217 35 chr5 137603054 137603214 -14934045 - RMER17C LTR ERVK 0 410 180 3 1634 1280 147 217 35 chr5 137603332 137603516 -14933743 - RMER17C LTR ERVK -231 179 3 3 1634 708 241 50 28 chr5 137603629 137603847 -14933412 - BGLII LTR ERVK 0 421 199 3 1634 1425 184 146 0 chr5 137603838 137604153 -14933106 - MTE2a LTR MaLR -16 363 3 3 1634 369 290 56 37 chr5 137606100 137606261 -14930998 - MLT1C LTR MaLR -183 284 121 3 1634 2106 169 52 5 chr5 137609366 137609753 -14927506 + MTB_Mm LTR MaLR 3 407 0 3 1634 577 71 191 0 chr5 137610438 137610564 -14926695 + RMER17B LTR ERVK 311 460 -498 3 1634 672 269 41 116 chr5 137614819 137615113 -14922146 + ORR1E LTR MaLR 1 272 -87 3 1634 496 286 74 74 chr5 137617162 137617351 -14919908 + ORR1E LTR MaLR 5 193 -166 3 1634 298 222 161 77 chr5 137619086 137619251 -14918008 + MLT1B LTR MaLR 193 451 -16 3 1635 298 193 52 54 chr5 137634232 137634342 -14902917 + MTD LTR MaLR 203 326 -93 4 1635 1467 184 55 75 chr5 137634341 137634743 -14902516 + ORR1D1 LTR MaLR 8 401 -20 4 1635 1055 234 157 23 chr5 137636303 137636609 -14900650 + ORR1D-int LTR MaLR 639 985 -385 4 1635 2844 129 19 0 chr5 137637187 137637599 -14899660 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 4 1635 444 264 30 54 chr5 137638195 137638363 -14898896 + RNLTR23 LTR ERVK 479 642 0 4 1635 293 268 60 47 chr5 137642450 137642569 -14894690 + MLT1B LTR MaLR 243 382 -8 4 1635 296 259 56 11 chr5 137714174 137714264 -14822995 - MLT1I LTR MaLR 0 411 318 4 1635 968 241 34 86 chr5 137714365 137714692 -14822567 - MTE2a LTR MaLR 0 379 70 4 1635 757 186 8 0 chr5 137714703 137714821 -14822438 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7188 -218 4 1635 241 222 151 14 chr5 137715221 137715294 -14821965 - MTE2a LTR MaLR -292 87 5 4 1635 1057 223 32 144 chr5 137716453 137716856 -14820403 - MTE2a LTR MaLR -5 374 17 4 1635 1505 202 71 11 chr5 137719170 137719520 -14817739 - MTD LTR MaLR -12 407 37 4 1635 872 239 97 59 chr5 137720418 137720738 -14816521 + MTD LTR MaLR 13 344 -75 4 1635 1230 244 106 11 chr5 137723622 137723979 -14813280 - MTD LTR MaLR -25 394 4 5 1635 874 250 81 131 chr5 137724206 137724602 -14812657 + MTE2a LTR MaLR 4 379 0 5 1635 411 357 55 31 chr5 137727068 137727360 -14809899 + MLT1J LTR MaLR 67 365 -147 5 1635 2124 183 64 54 chr5 137740216 137740718 -14796541 + RLTR12B LTR ERVK 22 528 0 5 1635 231 286 44 79 chr5 137753485 137753599 -14783660 - MER77 LTR ERVL -445 162 53 5 1636 3189 63 10 0 chr5 137757779 137758175 -14779084 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1636 1142 209 64 50 chr5 137771133 137771467 -14765792 + MT2B LTR ERVL 205 547 -54 6 1636 964 239 53 8 chr5 137778685 137778930 -14758329 - MTEa LTR MaLR -121 258 3 6 1636 512 304 16 47 chr5 137782876 137783066 -14754193 - RMER15-int LTR ERVL -2596 2403 2220 6 1636 758 141 31 0 chr5 137783169 137783297 -14753962 - RMER10B LTR ERVL -266 132 1 6 1636 250 391 40 7 chr5 137784454 137784606 -14752653 - RMER15-int LTR ERVL -3346 1653 1497 6 1636 1057 244 42 150 chr5 137801838 137802224 -14735035 - MTE2a LTR MaLR -13 366 23 7 1636 933 234 107 22 chr5 137811560 137811865 -14725394 - MTE2b LTR MaLR 0 379 21 7 1636 292 226 132 88 chr5 137818746 137818882 -14718377 + RMER15 LTR ERVL 40 181 -394 7 1636 253 265 232 42 chr5 137818910 137819052 -14718207 + RMER15 LTR ERVL 289 457 -118 7 1636 3881 163 40 22 chr5 137825385 137826181 -14711078 + RMER12 LTR ERVK 4 1012 -310 8 1636 686 260 52 78 chr5 137826361 137826540 -14710719 + RMER12 LTR ERVK 1013 1187 -135 8 1636 883 294 63 29 chr5 137836214 137836600 -14700659 + MTE2a LTR MaLR 11 417 -2 8 1636 652 290 56 73 chr5 137843076 137843460 -14693799 + RLTR16 LTR ERVK 1 433 -259 8 1636 1177 232 55 114 chr5 137845693 137846109 -14691150 + RLTR20A LTR ERVK 52 450 -91 8 1636 1177 232 55 114 chr5 137846155 137846245 -14691014 + RLTR20A LTR ERVK 451 527 -14 8 1636 2400 145 32 30 chr5 137859424 137859830 -14677429 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 9 1636 1521 228 173 80 chr5 137868481 137868967 -14668292 + MT2A LTR ERVL 3 533 0 9 1636 1756 159 22 44 chr5 137873090 137873452 -14663807 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 9 1636 1290 245 74 52 chr5 137881583 137881975 -14655284 + RMER19B LTR ERVK 69 657 -245 9 1637 3339 46 5 2 chr5 137888171 137888566 -14648693 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1637 810 278 67 9 chr5 137888752 137888977 -14648282 - MTD LTR MaLR -172 247 10 1 1637 421 250 112 15 chr5 137889165 137889299 -14647960 + MTD LTR MaLR 273 419 0 1 1637 962 283 140 0 chr5 137891349 137891649 -14645610 - MTE2b LTR MaLR -11 368 27 1 1637 1812 123 14 3 chr5 137892153 137892438 -14644821 + ORR1A3 LTR MaLR 39 326 0 1 1637 975 261 22 142 chr5 137900666 137901081 -14636178 + MTE2a LTR MaLR 13 377 -2 1 1637 575 298 125 60 chr5 137907379 137907557 -14629702 + ORR1E LTR MaLR 3 205 -154 1 1637 2088 80 0 138 chr5 137907557 137907934 -14629325 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 1 1637 575 298 125 60 chr5 137907934 137908090 -14629169 + ORR1E LTR MaLR 206 358 -1 1 1637 1464 222 15 56 chr5 137909981 137910373 -14626886 + MTE2a LTR MaLR 4 379 0 1 1637 877 241 123 44 chr5 137920650 137920732 -14616527 - MT2A LTR ERVL -40 493 405 1 1637 2027 103 73 17 chr5 137920732 137921087 -14616172 + RLTR30 LTR ERV1 3 377 -2 1 1637 877 241 123 44 chr5 137921087 137921321 -14615938 - MT2A LTR ERVL -129 404 152 1 1637 877 226 41 5 chr5 137921538 137921734 -14615525 + MTEa LTR MaLR 167 369 -10 1 1637 256 217 0 77 chr5 137940864 137940929 -14596330 + RLTR25A LTR ERVK 514 573 -530 1 1637 530 252 141 32 chr5 137941598 137941754 -14595505 - MTEa LTR MaLR -201 178 6 1 1637 540 244 251 10 chr5 137947678 137947885 -14589374 + RMER15 LTR ERVL 306 562 -13 1 1637 1390 243 30 33 chr5 137976990 137977326 -14559933 - MTEa LTR MaLR -43 336 2 1 1637 256 333 12 88 chr5 137977832 137978003 -14559256 + RMER15 LTR ERVL 4 161 -414 1 1637 815 183 0 6 chr5 137983837 137984002 -14553257 + RMER19B LTR ERVK 2 149 -753 1 1637 1944 182 35 0 chr5 137984003 137984371 -14552888 + RMER19B LTR ERVK 56 436 -466 1 1637 272 244 118 34 chr5 137992259 137992378 -14544881 - ORR1D1 LTR MaLR -1 369 241 1 1637 286 248 45 45 chr5 137992396 137992506 -14544753 - ORR1D1 LTR MaLR -228 146 37 1 1638 296 265 35 24 chr5 138031321 138031335 -14505924 + MT2B LTR ERVL 154 168 -433 1 1638 1051 192 103 21 chr5 138031876 138032184 -14505075 + ORR1D1 LTR MaLR 1 363 -11 1 1638 1974 232 46 8 chr5 138035598 138036098 -14501161 - MT2A LTR ERVL -1 532 14 1 1638 1148 257 37 45 chr5 138036957 138037312 -14499947 - MTE2b LTR MaLR -13 366 15 1 1638 567 160 19 9 chr5 138056732 138056839 -14480420 + ORR1C2 LTR MaLR 1 108 -276 2 1638 435 160 240 0 chr5 138057356 138057456 -14479803 + ORR1C2 LTR MaLR 261 384 0 2 1638 473 256 126 153 chr5 138075520 138075797 -14461462 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 85 2 1638 473 256 126 153 chr5 138076361 138076448 -14460811 - MLT1A0 LTR MaLR -281 84 11 2 1638 341 157 28 14 chr5 138102814 138102881 -14434378 + MTD LTR MaLR 13 80 -339 3 1638 554 229 55 37 chr5 138103021 138103184 -14434075 + MTD LTR MaLR 68 233 -186 3 1638 666 217 77 6 chr5 138103234 138103415 -14433844 + MTD LTR MaLR 196 389 -30 3 1638 226 277 45 98 chr5 138103439 138103551 -14433708 + MT2B2 LTR ERVL 134 239 -345 3 1638 1646 197 55 67 chr5 138120042 138120359 -14416900 + MTD LTR MaLR 23 342 -77 3 1638 1646 197 55 67 chr5 138120546 138120630 -14416629 + MTD LTR MaLR 343 419 0 3 1638 270 279 47 19 chr5 138129201 138129307 -14407952 - ERVL-E-int LTR ERVL -1075 4592 4484 4 1638 226 305 32 90 chr5 138136647 138136682 -14400577 - MT2B2 LTR ERVL -269 315 286 4 1638 226 305 32 90 chr5 138136715 138136834 -14400425 - MT2B2 LTR ERVL -299 285 171 4 1638 365 245 0 131 chr5 138139064 138139186 -14398073 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 4 1638 364 234 83 21 chr5 138140073 138140169 -14397090 - ORR1E LTR MaLR -5 354 253 4 1638 1275 196 172 7 chr5 138144471 138144779 -14392480 - MTE2b LTR MaLR -20 359 1 4 1638 2995 91 31 37 chr5 138145304 138145762 -14391497 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 133 4 1638 521 270 82 0 chr5 138146620 138146779 -14390480 - MTE2b LTR MaLR 0 379 208 4 1638 612 268 19 31 chr5 138147323 138147468 -14389791 - MTE2b LTR MaLR -197 182 40 4 1638 962 286 54 51 chr5 138148078 138148450 -14388809 + MLT1F LTR MaLR 168 540 -8 4 1639 300 324 117 34 chr5 138156857 138157036 -14380223 + MLT1J2 LTR MaLR 252 445 -3 5 1639 1918 102 31 22 chr5 138162209 138162528 -14374731 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 1639 968 0 0 9 chr5 138163121 138163236 -14374023 - MT2_Mm LTR ERVL -83 410 297 5 1639 238 291 63 0 chr5 138183287 138183366 -14353893 + MLT1E2 LTR MaLR 14 97 -530 6 1639 2239 85 0 3 chr5 138216718 138217036 -14320223 + ORR1A2 LTR MaLR 1 317 -10 7 1639 681 283 130 23 chr5 138218549 138218896 -14318363 + RMER5 LTR ERV1 146 529 -5 7 1639 1565 154 204 3 chr5 138222531 138222875 -14314384 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 7 1639 315 235 151 56 chr5 138248952 138249038 -14288221 + MT2B2 LTR ERVL 155 251 -333 8 1639 3409 18 32 8 chr5 138253605 138254006 -14283253 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 8 1639 6503 63 11 17 chr5 138254008 138254842 -14282417 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 8 1639 11246 56 41 33 chr5 138254835 138256314 -14280945 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 211 8 1639 882 86 8 0 chr5 138256314 138256431 -14280828 - IAPEz-int LTR ERVK -6196 285 168 8 1639 240 309 0 0 chr5 138256431 138256486 -14280773 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 8 1639 253 0 0 0 chr5 138256486 138256513 -14280746 - IAPEz-int LTR ERVK -1787 200 174 8 1639 234 219 0 0 chr5 138256513 138256554 -14280705 - RLTR27 LTR ERVK -38 271 231 8 1639 613 115 16 124 chr5 138256554 138256683 -14280576 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 9 8 1639 3373 18 46 0 chr5 138256684 138257077 -14280182 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 8 1639 2102 88 39 16 chr5 138262240 138262552 -14274707 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 1639 1946 177 82 90 chr5 138266642 138267132 -14270127 + RLTR11A LTR ERVK 1 486 -42 8 1639 1074 238 126 30 chr5 138269693 138270026 -14267233 + ORR1D2 LTR MaLR 1 365 -5 8 1640 2632 66 0 97 chr5 138285576 138285980 -14251279 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 9 1640 1395 78 0 6 chr5 138285980 138286161 -14251098 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 180 -7401 9 1640 252 204 0 0 chr5 138286161 138286205 -14251054 + RLTR27 LTR ERVK 231 274 -35 9 1640 368 47 0 0 chr5 138286206 138286249 -14251010 + MMERVK10C-int LTR ERVK 225 267 -7314 9 1640 367 67 0 0 chr5 138286469 138286514 -14250745 + RLTR10-int LTR ERVK 93 137 -6405 9 1640 2955 32 9 0 chr5 138286517 138286855 -14250404 + RLTR10-int LTR ERVK 652 992 -995 9 1640 487 319 38 48 chr5 138286880 138287279 -14249980 + RLTR10-int LTR ERVK 1172 1566 -6015 9 1640 1525 101 119 0 chr5 138287289 138287516 -14249743 + IAP-d-int LTR ERVK 5002 5255 -1287 9 1640 4099 140 44 3 chr5 138287520 138288179 -14249080 + IAPEY3-int LTR ERVK 6995 7680 0 9 1640 2886 68 0 27 chr5 138288179 138288554 -14248705 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 9 1640 3513 25 2 0 chr5 138289770 138290165 -14247094 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1640 9295 31 6 2 chr5 138290165 138291259 -14246000 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 9 1640 3509 28 2 0 chr5 138291259 138291654 -14245605 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1640 362 329 25 0 chr5 138296839 138297000 -14240259 - RLTR21 LTR ERVK -243 1329 1165 9 1640 2740 60 0 99 chr5 138300917 138301322 -14235937 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 9 1640 1336 64 0 6 chr5 138301322 138301494 -14235765 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 171 -7410 9 1640 273 259 0 0 chr5 138301494 138301548 -14235711 + RLTR27 LTR ERVK 222 275 -34 9 1640 400 0 0 0 chr5 138301548 138301591 -14235668 + MMERVK10C-int LTR ERVK 225 267 -7314 9 1640 367 67 0 0 chr5 138302009 138302054 -14235205 + RLTR10-int LTR ERVK 93 137 -6405 9 1640 2952 41 0 0 chr5 138302057 138302398 -14234861 + RLTR10-int LTR ERVK 652 992 -995 9 1640 485 318 38 49 chr5 138302452 138302822 -14234437 + RLTR10-int LTR ERVK 1201 1566 -6015 9 1640 1600 100 100 0 chr5 138302832 138303063 -14234196 + IAP-d-int LTR ERVK 5002 5255 -1287 9 1640 4416 135 15 3 chr5 138303067 138303745 -14233514 + IAPEY3-int LTR ERVK 6995 7680 0 9 1640 2957 60 0 27 chr5 138303745 138304120 -14233139 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 9 1640 277 253 61 81 chr5 138310326 138310342 -14226917 + MT2B LTR ERVL 144 157 -444 9 1640 5143 109 85 4 chr5 138325277 138325620 -14211639 + RMER17D LTR ERVK 1 364 -525 9 1640 5143 109 85 4 chr5 138325766 138325778 -14211481 + RMER17D LTR ERVK 365 382 -507 9 1640 5143 109 85 4 chr5 138325955 138326418 -14210841 + RMER17D LTR ERVK 383 885 -4 9 1640 485 309 36 12 chr5 138334914 138335081 -14202178 + RMER15 LTR ERVL 391 561 -14 9 1640 716 259 16 74 chr5 138351514 138351756 -14185503 + MTE2a LTR MaLR 1 228 -151 1 1640 1420 227 87 9 chr5 138352396 138352729 -14184530 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1640 1242 232 31 182 chr5 138363119 138363147 -14174112 - MTD LTR MaLR 0 419 391 1 1640 1242 232 31 182 chr5 138363181 138363357 -14173902 - MTD LTR MaLR -29 390 206 1 1640 1242 232 31 182 chr5 138363424 138363708 -14173551 - MTD LTR MaLR -214 205 6 1 1640 1241 235 85 63 chr5 138368296 138368462 -14168797 + ORR1D1 LTR MaLR 1 164 -210 1 1640 1241 235 85 63 chr5 138368534 138368731 -14168528 + ORR1D1 LTR MaLR 165 372 -2 1 1640 1519 21 5 11 chr5 138369312 138369501 -14167758 + MTA_Mm LTR MaLR 1 188 -208 1 1640 1778 32 5 0 chr5 138370629 138370846 -14166413 + MTA_Mm LTR MaLR 179 396 0 1 1640 369 233 0 149 chr5 138370846 138370962 -14166297 + MTE-int LTR MaLR 588 685 -895 1 1640 612 294 21 32 chr5 138371007 138371197 -14166062 - RMER15 LTR ERVL 0 575 388 1 1640 365 267 40 65 chr5 138371281 138371405 -14165854 - RMER15 LTR ERVL -417 158 38 1 1640 546 308 123 54 chr5 138371468 138371801 -14165458 + MTE-int LTR MaLR 734 1089 -491 1 1640 3923 159 85 27 chr5 138374944 138375789 -14161470 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 856 -46 1 1640 374 278 78 0 chr5 138379527 138379642 -14157617 - RMER20B LTR ERVK -503 124 1 1 1640 934 236 75 59 chr5 138379772 138380069 -14157190 - MTD LTR MaLR -2 417 113 1 1640 934 236 75 59 chr5 138380187 138380209 -14157050 - MTD LTR MaLR -307 112 94 1 1640 251 312 98 110 chr5 138382726 138382971 -14154288 + ORR1E LTR MaLR 118 359 0 1 1640 478 315 136 18 chr5 138384967 138385164 -14152095 + RMER15 LTR ERVL 238 460 -115 1 1640 879 214 150 93 chr5 138393372 138393706 -14143553 + RLTR18B LTR ERVK 5 357 -155 1 1640 696 241 0 0 chr5 138393717 138393858 -14143401 - RLTR18B LTR ERVK -25 487 347 1 1640 300 288 12 0 chr5 138393855 138393935 -14143324 + ORR1D1 LTR MaLR 261 341 -33 1 1640 387 277 0 0 chr5 138397957 138398051 -14139208 + MTEa LTR MaLR 234 327 -52 1 1640 1016 260 22 86 chr5 138400429 138400574 -14136685 - MTE2a LTR MaLR -38 341 201 1 1640 1781 161 40 19 chr5 138400574 138400896 -14136363 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1640 1016 254 74 106 chr5 138400896 138401132 -14136127 - MTE2a LTR MaLR -174 245 10 1 1640 612 258 105 35 chr5 138402297 138402526 -14134733 + MLT1A0 LTR MaLR 119 363 -2 1 1640 563 245 68 37 chr5 138404429 138404620 -14132639 + RLTR42-int LTR ERVK 1184 1380 -4142 1 1640 2261 158 136 10 chr5 138409849 138410418 -14126841 + RLTR26 LTR ERVK 2 642 0 1 1641 266 200 18 0 chr5 138415213 138415268 -14121991 - LTR40c LTR ERVL -351 114 59 1 1641 300 257 8 110 chr5 138415667 138415785 -14121474 - MT2B LTR ERVL -350 251 146 1 1641 1501 265 65 105 chr5 138419138 138419902 -14117357 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1099 749 16 1 1641 1334 281 41 6 chr5 138421320 138421685 -14115574 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 1 1641 1523 175 118 35 chr5 138424223 138424530 -14112729 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 80 1 1641 1523 175 118 35 chr5 138424663 138424677 -14112582 - MTB_Mm LTR MaLR -328 79 55 1 1641 5321 130 84 12 chr5 138424677 138425571 -14111688 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 1 1641 1523 175 118 35 chr5 138425571 138425621 -14111638 - MTB_Mm LTR MaLR -353 54 5 1 1641 359 202 59 20 chr5 138431466 138431563 -14105696 - MTE2a LTR MaLR 0 379 279 1 1641 440 265 38 8 chr5 138431563 138431696 -14105563 - RMER15 LTR ERVL -2 573 437 1 1641 2519 70 6 0 chr5 138432055 138432398 -14104861 - MTA_Mm LTR MaLR -51 345 1 1 1641 402 240 82 18 chr5 138432398 138432550 -14104709 - RLTR12B LTR ERVK -390 178 23 1 1641 1595 219 58 22 chr5 138432547 138432962 -14104297 - RMER15 LTR ERVL -119 456 27 1 1641 1014 218 38 135 chr5 138433270 138433588 -14103671 - MTE2a LTR MaLR -90 289 3 1 1641 801 190 74 76 chr5 138437205 138437567 -14099692 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 409 0 1 1641 4129 152 17 129 chr5 138437568 138438572 -14098687 + MMETn-int LTR ERVK 1 891 -3953 1 1641 499 202 127 16 chr5 138438561 138438687 -14098572 + MMETn-int LTR ERVK 1949 2088 -5318 1 1641 2880 130 42 44 chr5 138438709 138439479 -14097780 + MMETn-int LTR ERVK 1721 3135 -4271 1 1641 3884 142 22 5 chr5 138439996 138440627 -14096632 + MMETn-int LTR ERVK 3443 4084 -3322 1 1641 3599 13 2 0 chr5 138440627 138441022 -14096237 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1641 9483 25 4 1 chr5 138441022 138442117 -14095142 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1641 3599 13 2 0 chr5 138442117 138442512 -14094747 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1641 4853 149 27 32 chr5 138442512 138443565 -14093694 + MMETn-int LTR ERVK 2356 3400 -2006 1 1641 265 117 45 90 chr5 138443595 138443662 -14093597 + RLTR10A LTR ERVK 291 398 -13 1 1641 1802 128 13 29 chr5 138443662 138443969 -14093290 + ETnERV2-int LTR ERVK 5774 6075 -1331 1 1641 872 127 8 16 chr5 138443981 138444109 -14093150 + ETnERV2-int LTR ERVK 6227 6353 -1053 1 1641 459 233 164 39 chr5 138444173 138444405 -14092854 - RLTR10A LTR ERVK -4 407 147 1 1641 6504 106 6 0 chr5 138446410 138447239 -14090020 + ETnERV2-int LTR ERVK 6370 7203 -203 1 1641 646 219 241 53 chr5 138447239 138447460 -14089799 + RLTR13D6 LTR ERVK 154 407 -495 1 1641 3730 44 5 0 chr5 138447460 138447894 -14089365 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1641 646 219 241 53 chr5 138447894 138447995 -14089264 + RLTR13D6 LTR ERVK 408 537 -365 1 1641 505 67 25 74 chr5 138447995 138448076 -14089183 + ETnERV2-int LTR ERVK 7329 7405 -1 1 1641 978 183 58 72 chr5 138448076 138448440 -14088819 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 409 0 1 1641 1191 230 42 149 chr5 138449051 138449475 -14087784 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 1641 2933 160 39 62 chr5 138450789 138451374 -14085885 - RMER15 LTR ERVL -3 572 1 1 1641 1343 142 135 68 chr5 138451942 138452326 -14084933 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 1641 1789 162 27 87 chr5 138452676 138453088 -14084171 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 60 1 1641 578 275 59 21 chr5 138453235 138453473 -14083786 - MURVY-int LTR ERV1 -70 7382 7136 1 1641 1031 324 62 18 chr5 138453762 138454265 -14082994 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2425 2638 2114 1 1641 257 241 0 0 chr5 138454283 138454337 -14082922 - MuLV-int LTR ERV1 -4345 3261 3208 1 1641 308 240 26 13 chr5 138454361 138454437 -14082822 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3783 1534 1458 1 1641 693 323 66 16 chr5 138454708 138454749 -14082510 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3321 1742 1699 1 1641 693 323 66 16 chr5 138454928 138455311 -14081948 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3365 1698 1297 1 1641 647 256 96 14 chr5 138455860 138456078 -14081181 - MTD LTR MaLR 0 419 184 1 1641 262 250 40 30 chr5 138458265 138458364 -14078895 - RMER15 LTR ERVL -96 479 380 1 1641 785 274 145 68 chr5 138461686 138462140 -14075119 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 10 1 1641 867 293 124 44 chr5 138477652 138478105 -14059154 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 10 1 1641 867 293 124 44 chr5 138493623 138494076 -14043183 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 10 1 1641 3831 7 121 0 chr5 138508739 138509179 -14028080 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1641 48838 16 0 0 chr5 138509179 138514538 -14022721 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 1 1641 351 179 46 35 chr5 138514538 138514625 -14022634 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 1 1641 321 0 0 0 chr5 138514625 138514663 -14022596 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1641 3831 7 121 0 chr5 138514663 138515103 -14022156 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1641 608 250 29 11 chr5 138516269 138516443 -14020816 + MT2A LTR ERVL 1 177 -356 1 1641 373 264 47 16 chr5 138517104 138517231 -14020028 + MTEb LTR MaLR 249 379 0 2 1641 2167 82 16 0 chr5 138519731 138520047 -14017212 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 1641 3059 62 26 0 chr5 138520978 138521368 -14015891 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1641 273 198 207 45 chr5 138522172 138522279 -14014980 - MTC LTR MaLR -44 375 251 4 1641 3278 142 238 3 chr5 138522279 138523012 -14014247 + RMER13B LTR ERVK 3 908 0 4 1641 323 225 38 0 chr5 138523087 138523167 -14014092 - MTC LTR MaLR -210 211 129 4 1641 293 279 0 0 chr5 138523347 138523426 -14013833 - MTC LTR MaLR -322 97 19 4 1641 2298 141 36 13 chr5 138525155 138525544 -14011715 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 5 1641 1782 171 206 7 chr5 138531067 138531527 -14005732 - RMER4B LTR ERVK -3 582 31 6 1641 276 67 44 0 chr5 138531823 138531868 -14005391 - RMER4B LTR ERVK -538 47 1 6 1642 552 296 96 43 chr5 138550802 138551032 -13986227 - MER21B LTR ERV1 -137 726 485 1 1642 445 189 130 20 chr5 138551539 138551675 -13985584 + RMER4B LTR ERVK 26 179 -287 1 1642 591 229 198 68 chr5 138551736 138551999 -13985260 + RMER4B LTR ERVK 285 581 -4 1 1642 1513 189 153 6 chr5 138552345 138552711 -13984548 - MTC LTR MaLR 0 421 2 1 1642 650 329 59 0 chr5 138554503 138554740 -13982519 + MTE2b LTR MaLR 1 251 -128 1 1642 402 99 19 10 chr5 138554943 138555019 -13982240 + MTE2b LTR MaLR 297 379 0 1 1642 1577 215 79 3 chr5 138555484 138555824 -13981435 + ORR1D2 LTR MaLR 2 367 -3 1 1642 2862 91 70 224 chr5 138556780 138557471 -13979788 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 1 1642 2632 31 78 0 chr5 138561890 138562211 -13975048 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1642 14412 47 7 1 chr5 138562211 138563991 -13973268 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 1 1642 2730 31 65 0 chr5 138563991 138564316 -13972943 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1642 1719 182 120 3 chr5 138565391 138565733 -13971526 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 1 1642 2086 146 229 33 chr5 138566991 138567472 -13969787 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 1 1642 237 385 80 66 chr5 138568036 138568295 -13968964 - LTR33 LTR ERVL -53 462 215 1 1642 237 385 80 66 chr5 138568442 138568621 -13968638 - LTR33 LTR ERVL -301 214 18 1 1642 1337 188 208 13 chr5 138570581 138570899 -13966360 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 1 1 1642 2156 124 57 69 chr5 138570969 138571358 -13965901 + ORR1B1 LTR MaLR 3 386 -8 1 1642 1789 85 36 15 chr5 138571585 138571859 -13965400 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 249 1 1642 1647 133 616 134 chr5 138577524 138577655 -13959604 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 168 -393 2 1642 1647 180 38 182 chr5 138577801 138578228 -13959031 + RLTR31_Mm LTR ERVK 169 561 0 2 1642 256 289 231 0 chr5 138580441 138580545 -13956714 + ORR1E LTR MaLR 1 128 -231 2 1642 246 258 93 41 chr5 138581404 138581501 -13955758 + ORR1E LTR MaLR 278 379 0 2 1642 811 164 88 6 chr5 138581724 138581883 -13955376 + ORR1C2 LTR MaLR 12 183 -195 2 1642 845 211 119 15 chr5 138581993 138582195 -13955064 + ORR1C2 LTR MaLR 162 384 0 2 1642 2812 69 88 0 chr5 138587236 138587600 -13949659 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1642 7654 65 22 81 chr5 138587600 138588703 -13948556 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1037 -61 2 1642 7654 65 22 81 chr5 138588896 138588958 -13948301 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1038 1098 0 2 1642 3541 23 2 0 chr5 138588958 138589353 -13947906 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1642 3260 53 2 8 chr5 138599812 138600209 -13937050 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 2 1642 468 36 0 0 chr5 138601430 138601485 -13935774 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 330 2 1642 252 244 77 0 chr5 138615044 138615122 -13922137 - RLTR19C LTR ERVK -410 96 13 2 1642 429 216 16 65 chr5 138622745 138622869 -13914390 + MT2B LTR ERVL 140 257 -344 3 1642 255 265 44 7 chr5 138626353 138626382 -13910877 - ORR1B1-int LTR MaLR -863 646 613 3 1642 3222 63 8 0 chr5 138638249 138638646 -13898613 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1642 500 272 48 8 chr5 138642347 138642473 -13894786 - ETnERV2-int LTR ERVK -206 7200 7070 3 1642 412 188 11 34 chr5 138643112 138643200 -13894059 + MTC LTR MaLR 1 86 -335 3 1642 1746 153 36 65 chr5 138643865 138643892 -13893367 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 302 3 1642 1746 153 36 65 chr5 138643925 138644233 -13893026 - ORR1A2 LTR MaLR -26 301 2 3 1642 2080 169 10 79 chr5 138644287 138644693 -13892566 + ORR1B1 LTR MaLR 4 381 -13 3 1642 387 271 14 104 chr5 138644788 138644932 -13892327 + MT2B LTR ERVL 127 257 -344 3 1642 2869 58 0 9 chr5 138645851 138646199 -13891060 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 3 1642 1667 254 7 71 chr5 138647332 138647925 -13889334 + RLTR6-int LTR ERV1 1782 2336 -5442 4 1642 3591 200 66 30 chr5 138649058 138649958 -13887301 + RLTR18-int LTR ERVK 2529 3460 -1901 4 1642 2443 80 47 26 chr5 138649958 138650343 -13886916 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 393 -29 4 1642 476 286 20 73 chr5 138650426 138650630 -13886629 - RMER10B LTR ERVL -12 386 194 4 1642 826 242 78 44 chr5 138650819 138651139 -13886120 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2908 4 1642 1803 132 82 7 chr5 138651203 138651507 -13885752 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 4 1642 51649 94 27 17 chr5 138651507 138657803 -13879456 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 1241 4 1642 231 261 90 80 chr5 138657803 138657903 -13879356 - LTR86C LTR ERVL -507 114 14 4 1642 51649 94 27 17 chr5 138657903 138659112 -13878147 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 1240 3 4 1642 1970 112 81 10 chr5 138659112 138659420 -13877839 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -1 331 2 4 1642 668 229 110 44 chr5 138659457 138659685 -13877574 - RMER17C-int LTR ERVK -369 2869 2627 4 1642 1608 210 87 59 chr5 138660116 138660354 -13876905 - RLTR20B3 LTR ERVK -68 509 270 4 1642 1608 210 87 59 chr5 138660524 138660610 -13876649 - RLTR20B3 LTR ERVK -308 269 178 4 1642 1608 210 87 59 chr5 138660650 138660819 -13876440 - RLTR20B3 LTR ERVK -400 177 3 4 1642 1452 262 38 92 chr5 138661454 138662119 -13875140 - MYSERV6-int LTR ERVK -277 8682 8054 4 1642 441 125 57 0 chr5 138662848 138662936 -13874323 - RLTR28B LTR ERVL -340 141 49 4 1642 345 129 0 91 chr5 138663062 138663139 -13874120 - RLTR28B LTR ERVL -402 79 10 4 1642 1351 225 41 94 chr5 138664581 138664881 -13872378 + MTD LTR MaLR 1 291 -128 4 1642 1351 225 41 94 chr5 138665027 138665065 -13872194 + MTD LTR MaLR 292 321 -98 4 1642 364 164 0 32 chr5 138665152 138665215 -13872044 + MTD LTR MaLR 351 411 -8 4 1642 499 179 53 0 chr5 138668013 138668108 -13869151 + ORR1C1 LTR MaLR 1 100 -278 4 1642 3782 62 19 0 chr5 138668128 138668594 -13868665 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 4 1642 425 172 115 0 chr5 138668783 138668870 -13868389 + ORR1C1 LTR MaLR 110 206 -178 4 1642 5897 84 17 16 chr5 138669863 138670670 -13866589 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 4 1642 307 362 42 26 chr5 138671457 138671647 -13865612 - RMER15 LTR ERVL -37 538 346 4 205 1989 168 29 34 chr5 138674117 138674499 -13862760 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 4 1643 283 176 0 0 chr5 138674516 138674567 -13862692 - RLTR14-int LTR ERV1 0 5317 5267 4 1643 3592 162 93 22 chr5 138674595 138675333 -13861926 - RLTR14-int LTR ERV1 -120 5197 4407 4 1643 304 93 0 0 chr5 138675352 138675395 -13861864 - RLTR14-int LTR ERV1 -998 4319 4277 4 1643 601 188 47 7 chr5 138675447 138675597 -13861662 - RLTR14-int LTR ERV1 -1091 4226 4071 4 1643 404 226 38 0 chr5 138675599 138675705 -13861554 - RLTR14-int LTR ERV1 -1193 4124 4015 4 1643 2925 170 41 55 chr5 138675711 138676365 -13860894 - RLTR14-int LTR ERV1 -2595 2722 2078 4 1643 926 201 75 16 chr5 138676366 138676619 -13860640 - RLTR14-int LTR ERV1 -4064 1253 986 4 1643 2777 216 82 42 chr5 138676783 138677131 -13860128 - RLTR14-int LTR ERV1 -4533 784 436 4 1643 2777 216 82 42 chr5 138677214 138677618 -13859641 - RLTR14-int LTR ERV1 -4882 435 2 4 1643 1972 196 19 3 chr5 138677624 138677993 -13859266 - RLTR14 LTR ERV1 -7 375 1 4 1643 262 100 200 0 chr5 138678044 138678094 -13859165 - ORR1A4 LTR MaLR -267 62 3 4 1643 2967 136 6 171 chr5 138678096 138678141 -13859118 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1924 4 1643 2967 136 6 171 chr5 138678286 138678912 -13858347 - ORR1A4-int LTR MaLR -40 1923 1403 4 1643 281 275 8 121 chr5 138684915 138685039 -13852220 - MT2B LTR ERVL -338 263 154 4 1643 2191 160 7 79 chr5 138686351 138686758 -13850501 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 4 4 1643 1233 198 11 33 chr5 138686781 138687048 -13850211 + ORR1A1 LTR MaLR 1 271 -123 5 1643 695 110 31 78 chr5 138689500 138689628 -13847631 + ORR1A1 LTR MaLR 199 320 -6 5 1643 2045 116 23 84 chr5 138691398 138691745 -13845514 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 1643 1139 181 23 46 chr5 138694674 138695000 -13842259 + RLTR28 LTR ERVL 159 524 0 5 1643 1699 156 21 96 chr5 138727930 138728306 -13808953 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 39 5 1643 282 340 53 40 chr5 138733364 138733634 -13803625 - MTEb LTR MaLR -14 365 87 5 1643 1757 149 145 9 chr5 138744145 138744483 -13792776 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 1643 316 269 0 25 chr5 138747642 138747722 -13789537 - RMER20B LTR ERVK -25 602 525 6 1643 1516 223 232 6 chr5 138747724 138748212 -13789047 - RMER20B LTR ERVK -29 598 1 6 1643 5940 76 20 8 chr5 138754499 138755295 -13781964 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 1 6 1643 1712 147 128 39 chr5 138755552 138755912 -13781347 - MTB LTR MaLR -8 392 1 6 1643 1040 191 270 27 chr5 138756232 138756528 -13780731 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 6 1643 2389 104 79 98 chr5 138759106 138759597 -13777662 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 6 1643 3769 39 5 0 chr5 138766025 138766459 -13770800 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1643 411 254 159 0 chr5 138770609 138770735 -13766524 - MTE-int LTR MaLR -253 1327 1182 6 1643 461 274 108 26 chr5 138770768 138770963 -13766296 - MTEa LTR MaLR 0 379 169 6 1643 469 264 154 32 chr5 138772766 138773013 -13764246 + RLTR10A LTR ERVK 135 411 0 6 1643 434 181 54 54 chr5 138773029 138773140 -13764119 + RLTR45-int LTR ERVK 318 428 -1559 6 1643 390 272 41 41 chr5 138773387 138773556 -13763703 + IAP-d-int LTR ERVK 2225 2393 -4149 6 1643 2170 325 60 48 chr5 138773559 138775518 -13761741 + IAP-d-int LTR ERVK 3224 5207 -1335 6 1643 1863 207 17 30 chr5 138775646 138776133 -13761126 + RLTR45-int LTR ERVK 6522 7042 -202 6 1643 495 262 162 29 chr5 138776173 138776413 -13760846 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 6 1643 1091 236 137 40 chr5 138780744 138781190 -13756069 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 31 6 1643 928 232 47 44 chr5 138785160 138785502 -13751757 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 6 1643 2952 151 81 42 chr5 138787172 138787775 -13749484 - RMER20B LTR ERVK 0 627 1 6 1643 3534 199 58 31 chr5 138787786 138788528 -13748731 - MERVK26-int LTR ERVK -1 6918 6157 6 1643 625 184 39 13 chr5 138795869 138796023 -13741236 + RMER4B LTR ERVK 17 174 -411 6 1643 446 236 71 42 chr5 138796146 138796229 -13741030 + RMER17C LTR ERVK 1 80 -330 6 1643 446 236 71 42 chr5 138796324 138796408 -13740851 + RMER17C LTR ERVK 81 173 -237 6 1643 299 249 45 42 chr5 138796542 138796733 -13740526 + RMER4B LTR ERVK 358 583 -2 6 1643 5372 85 22 66 chr5 138797975 138798915 -13738344 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 4 6 1644 1757 229 79 26 chr5 138807151 138807644 -13729615 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 10 7 1644 3291 56 0 5 chr5 138808677 138809075 -13728184 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1644 3388 207 88 46 chr5 138816252 138817468 -13719791 + RMER3D-int LTR ERVK 1574 2840 -2 7 1644 1783 176 32 44 chr5 138817470 138817731 -13719528 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 266 -295 7 1644 1783 191 22 88 chr5 138818310 138818564 -13718695 + RLTR31_Mm LTR ERVK 211 444 -140 7 1644 799 311 99 3 chr5 138820512 138820844 -13716415 + ORR1D1 LTR MaLR 9 372 -2 7 1644 669 253 213 3 chr5 138820846 138821150 -13716109 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 368 -2 7 1644 294 283 95 38 chr5 138823522 138823680 -13713579 - RLTR16 LTR ERVK -207 298 132 7 1644 806 247 85 21 chr5 138827229 138827510 -13709749 + RMER20B LTR ERVK 132 430 -197 7 1644 374 307 26 74 chr5 138831067 138831257 -13706002 + MTD LTR MaLR 81 261 -158 7 1644 425 250 25 16 chr5 138831323 138831445 -13705814 + MTD LTR MaLR 266 388 -31 7 1644 1188 247 72 31 chr5 138838093 138838454 -13698805 + BGLII_B LTR ERVK 11 435 -6 7 1644 4589 123 29 22 chr5 138838454 138839258 -13698001 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 7 1644 1154 271 51 128 chr5 138839258 138839502 -13697757 + BGLII_B LTR ERVK 322 552 -1 7 1644 3145 44 23 8 chr5 138840464 138840854 -13696405 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1644 1154 53 0 0 chr5 138841625 138841776 -13695483 + ORR1A1 LTR MaLR 1 151 -195 7 1644 13308 65 15 3 chr5 138841776 138843544 -13693715 + ORR1A1-int LTR MaLR 3 1792 0 7 1644 2854 52 0 6 chr5 138843544 138843892 -13693367 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 1644 368 216 64 50 chr5 138844802 138844943 -13692316 + MYSERV6-int LTR ERVK 6532 6674 -2285 7 1644 2794 215 115 28 chr5 138845141 138846140 -13691119 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 987 2072 -254 7 1644 2226 58 31 0 chr5 138846150 138846444 -13690815 - ORR1A1 LTR MaLR -43 303 1 7 1644 316 359 22 83 chr5 138854773 138855001 -13682258 + MTD LTR MaLR 48 261 -158 7 1644 603 222 29 7 chr5 138855063 138855199 -13682060 + MTD LTR MaLR 266 404 -15 7 1644 600 225 32 42 chr5 138859668 138859858 -13677401 + BGLII_B LTR ERVK 120 307 -134 7 1644 2836 210 49 12 chr5 138859867 138860441 -13676818 + RLTR17 LTR ERVK 98 692 0 7 1644 689 241 128 40 chr5 138860446 138860775 -13676484 + RLTR31_Mur LTR ERVK 184 541 -12 7 1644 248 204 0 0 chr5 138861323 138861367 -13675892 + MT2B LTR ERVL 197 240 -361 7 1644 351 164 225 14 chr5 138861509 138861651 -13675608 + MYSERV6-int LTR ERVK 6424 6595 -2364 7 1644 758 182 0 26 chr5 138861935 138862127 -13675132 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1051 1237 -1089 7 1644 2925 105 0 27 chr5 138862128 138862568 -13674691 - RLTR10C LTR ERVK -8 428 1 7 1644 1534 227 85 7 chr5 138862681 138863142 -13674117 + MYSERV-int LTR ERVK 5461 5957 -593 7 1644 364 159 14 0 chr5 138863142 138863211 -13674048 - RMER19B LTR ERVK -832 70 1 7 1644 708 147 15 15 chr5 138863211 138863341 -13673918 + RLTR11A2 LTR ERVK 398 527 0 7 1644 2380 93 22 0 chr5 138865129 138865451 -13671808 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 329 -479 7 1644 1143 96 24 19 chr5 138865451 138865663 -13671596 + ETnERV2-int LTR ERVK 2975 3187 -4219 7 1644 6081 106 23 21 chr5 138865655 138866661 -13670598 + RLTR45-int LTR ERVK 5064 6071 -1173 7 1644 1550 136 34 0 chr5 138866675 138866939 -13670320 + ETnERV3-int LTR ERVK 5529 5801 -7 7 1644 5835 62 66 0 chr5 138866949 138867707 -13669552 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 7 1644 1140 184 36 18 chr5 138878911 138879132 -13658127 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 154 7 1644 949 265 55 104 chr5 138879442 138879770 -13657489 + ORR1D2 LTR MaLR 59 370 0 8 1644 2122 143 18 72 chr5 138881222 138881622 -13655637 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 8 1644 1592 149 36 32 chr5 138885536 138885917 -13651342 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 165 8 1644 271 307 82 38 chr5 138899822 138899981 -13637278 + RMER15 LTR ERVL 403 568 -7 8 1644 256 269 78 69 chr5 138904395 138904511 -13632748 - MTEa LTR MaLR -2 377 261 8 1644 5300 106 100 8 chr5 138909267 138910114 -13627145 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 925 -189 8 1644 329 244 121 22 chr5 138910129 138910307 -13626952 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -2301 5305 5100 8 1644 686 312 32 28 chr5 138911998 138912471 -13624788 + RLTR6-int LTR ERV1 6925 7650 -128 8 1644 1148 237 111 66 chr5 138916512 138917054 -13620205 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 3 8 1644 246 106 106 0 chr5 138917261 138917308 -13619951 + MTD LTR MaLR 1 52 -367 8 1644 1427 237 65 3 chr5 138917388 138917739 -13619520 + MTD LTR MaLR 47 419 0 8 1644 2705 69 2 101 chr5 138923087 138923492 -13613767 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 8 1644 35588 88 5 18 chr5 138923492 138924447 -13612812 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6685 8 1644 35588 88 5 18 chr5 138924482 138926983 -13610276 - MMERVK10C-int LTR ERVK -897 6684 4196 8 1644 3589 42 50 28 chr5 138926983 138927448 -13609811 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 8 1644 35588 92 8 18 chr5 138927448 138929151 -13608108 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3386 4195 1885 8 1644 327 121 17 0 chr5 138929152 138929210 -13608049 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5624 1782 1724 8 1644 261 284 49 12 chr5 138929215 138929297 -13607962 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4587 819 735 8 1644 985 205 99 57 chr5 138929318 138929618 -13607641 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4803 603 312 8 1644 313 130 0 0 chr5 138929707 138929761 -13607498 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 899 8 1644 313 130 0 0 chr5 138929880 138929934 -13607325 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 899 8 1645 558 224 0 0 chr5 138936354 138936510 -13600749 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6678 903 748 8 1645 1182 110 8 13 chr5 138936513 138936755 -13600504 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7261 320 1 8 1645 2686 59 73 3 chr5 138936755 138937096 -13600163 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 8 1645 349 193 0 178 chr5 138938802 138938903 -13598356 + ORR1E LTR MaLR 49 131 -228 8 1645 298 125 36 0 chr5 138939087 138939143 -13598116 + RMER4B LTR ERVK 49 106 -479 8 1645 330 280 96 56 chr5 138957797 138957994 -13579265 - RLTR42-int LTR ERVK -1046 4476 4272 8 1645 513 266 61 0 chr5 138958332 138958546 -13578713 - RLTR42-int LTR ERVK -1283 4239 4013 8 1645 367 130 0 0 chr5 138978724 138978778 -13558481 - RLTR13D5 LTR ERVK -969 54 1 9 1645 989 286 37 43 chr5 138978778 138979234 -13558025 + MYSERV6-int LTR ERVK 886 1287 -7672 9 1645 1130 164 89 47 chr5 138979239 138979475 -13557784 - RLTR11A LTR ERVK -281 247 2 9 1645 1166 154 8 9 chr5 138987425 138987656 -13549603 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 242 -126 9 1645 748 147 14 14 chr5 138990374 138990512 -13546747 + RLTR9A2 LTR ERVK 231 368 0 9 1645 1984 154 39 11 chr5 138995324 138995685 -13541574 - RLTR14 LTR ERV1 -9 373 3 9 1645 702 268 104 50 chr5 138995727 138996138 -13541121 + RLTR20D LTR ERVK 1 578 0 9 1645 1206 211 106 6 chr5 138997876 138998320 -13538939 + MT2A LTR ERVL 1 488 -45 9 1645 1102 255 21 3 chr5 138998386 138998429 -13538830 + MT2A LTR ERVL 489 532 -1 9 1645 1530 218 32 32 chr5 138998655 138999029 -13538230 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 1645 428 310 102 15 chr5 138999544 138999750 -13537509 - RMER15 LTR ERVL -107 468 245 9 1645 1973 128 10 0 chr5 139000614 139000927 -13536332 + ORR1A2 LTR MaLR 5 320 -7 4 1645 1461 236 73 11 chr5 139001242 139001623 -13535636 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1645 1544 210 54 54 chr5 139008255 139008662 -13528597 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 1 1645 1989 241 55 38 chr5 139010987 139011588 -13525671 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1645 1743 158 61 12 chr5 139014479 139014824 -13522435 - RLTR14 LTR ERV1 -20 362 1 2 1645 586 257 84 40 chr5 139014889 139015140 -13522119 + RLTR20C LTR ERVK 51 312 -222 2 1645 486 206 109 64 chr5 139015132 139015288 -13521971 + RLTR20C LTR ERVK 416 578 0 2 1645 1089 197 148 14 chr5 139016301 139016727 -13520532 + MT2A LTR ERVL 1 487 -46 2 1645 907 248 85 4 chr5 139016781 139016818 -13520441 + MT2A LTR ERVL 488 525 -8 2 1645 1101 219 4 24 chr5 139017059 139017311 -13519948 + ORR1D1 LTR MaLR 1 247 -127 2 1645 3199 163 45 16 chr5 139017316 139017938 -13519321 + RLTR26 LTR ERVK 3 642 0 3 1645 12826 93 46 7 chr5 139017938 139019726 -13517533 + MERVK26-int LTR ERVK 1 1859 -5060 3 1645 435 271 36 67 chr5 139019744 139019938 -13517321 + RMER13B LTR ERVK 721 908 0 3 1645 874 189 23 0 chr5 139019963 139020138 -13517121 + RMER17A-int LTR ERVK 1355 1533 -195 3 1645 2270 120 30 70 chr5 139023029 139023393 -13513866 + MT2B LTR ERVL 180 551 -50 3 1645 2992 123 52 6 chr5 139023393 139023509 -13513750 + RLTR19C LTR ERVK 1 124 -382 3 1645 2992 123 52 6 chr5 139023538 139023905 -13513354 + RLTR19C LTR ERVK 125 506 0 3 1645 2270 120 30 70 chr5 139023905 139023980 -13513279 + MT2B LTR ERVL 552 601 0 3 1645 1789 172 99 8 chr5 139024810 139024966 -13512293 + ORR1C2 LTR MaLR 1 177 -207 4 1645 1789 172 99 8 chr5 139025116 139025311 -13511948 + ORR1C2 LTR MaLR 178 383 -1 4 1645 1134 271 74 8 chr5 139025715 139026095 -13511164 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1645 4501 96 8 32 chr5 139027891 139028645 -13508614 + RMER17A LTR ERVK 1 736 -15 4 1645 301 161 0 18 chr5 139028763 139028820 -13508439 + RLTR5_Mm LTR ERV1 1 56 -598 4 1645 742 198 61 70 chr5 139028931 139029186 -13508073 + RLTR5_Mm LTR ERV1 288 628 0 4 1645 309 261 70 26 chr5 139029310 139029424 -13507835 - RLTR25B LTR ERVK -3 1025 907 4 1645 2392 103 8 5 chr5 139029447 139029826 -13507433 - RLTR44B LTR ERVK -37 412 33 4 1645 637 176 11 140 chr5 139029839 139030017 -13507242 - RLTR25B LTR ERVK -253 775 621 4 1645 388 236 12 6 chr5 139030144 139030173 -13507086 - ORR1A3-int LTR MaLR -1094 869 707 4 1645 471 213 38 83 chr5 139030173 139030306 -13506953 - MT2B LTR ERVL -332 269 143 5 1645 1121 154 53 5 chr5 139030306 139030515 -13506744 - RLTR25B LTR ERVK -531 572 354 4 1645 1446 168 57 159 chr5 139030992 139031395 -13505864 - RLTR25B LTR ERVK -666 362 1 4 1645 1343 176 60 33 chr5 139043439 139043738 -13493521 + ORR1D1 LTR MaLR 5 311 -63 5 1645 1186 243 111 186 chr5 139043738 139044244 -13493015 + MT2B LTR ERVL 1 594 -7 6 1645 2213 103 16 0 chr5 139052602 139052922 -13484337 + ORR1A2 LTR MaLR 3 327 0 6 1645 1166 284 44 8 chr5 139054926 139055292 -13481967 - MTD LTR MaLR -39 380 2 7 1645 787 178 43 111 chr5 139061728 139061936 -13475323 - ORR1C2 LTR MaLR -32 352 159 7 1645 1477 130 17 35 chr5 139061954 139062185 -13475074 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4719 1042 816 7 1645 284 286 21 21 chr5 139062298 139062391 -13474868 + RLTR42-int LTR ERVK 1259 1351 -4171 8 1645 1374 156 112 0 chr5 139065976 139066252 -13471007 - ORR1B1 LTR MaLR -73 321 15 8 1646 247 248 165 0 chr5 139068921 139069030 -13468229 + RMER5 LTR ERV1 187 313 -221 9 1646 1246 220 67 56 chr5 139069038 139069380 -13467879 + ORR1E LTR MaLR 6 351 -8 9 1646 323 264 0 0 chr5 139069696 139069768 -13467491 - RMER10B LTR ERVL -57 341 270 9 1646 2048 144 45 48 chr5 139070959 139071338 -13465921 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 9 1646 1624 128 27 63 chr5 139071894 139072228 -13465031 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1646 227 307 0 13 chr5 139073929 139074005 -13463254 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 444 1 1646 312 318 9 26 chr5 139074054 139074167 -13463092 - RMER5 LTR ERV1 -186 348 238 1 1646 2032 169 80 0 chr5 139076498 139076888 -13460371 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1646 946 189 201 63 chr5 139078413 139078796 -13458463 - RMER17B LTR ERVK -522 436 1 1 1646 936 182 14 79 chr5 139078981 139079196 -13458063 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 166 1 1646 975 152 0 0 chr5 139079356 139079521 -13457738 - ORR1D1 LTR MaLR -209 165 1 1 1646 2341 89 9 50 chr5 139080025 139080366 -13456893 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1646 1447 208 12 3 chr5 139081698 139082017 -13455242 + MTD LTR MaLR 86 407 -12 1 1646 2506 90 46 25 chr5 139084058 139084490 -13452769 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 1 1646 2098 125 169 0 chr5 139090579 139090916 -13446343 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1646 719 110 76 0 chr5 139090940 139091013 -13446246 + ORR1B1 LTR MaLR 254 335 -59 1 1646 719 110 76 0 chr5 139091039 139091083 -13446176 + ORR1B1 LTR MaLR 336 379 -15 1 1646 820 241 145 8 chr5 139092114 139092348 -13444911 + MTE2b LTR MaLR 104 369 -10 1 1646 3362 159 97 19 chr5 139092714 139093356 -13443903 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 1 1646 1329 258 27 40 chr5 139094085 139094460 -13442799 + MTE2a LTR MaLR 10 379 0 1 1646 313 243 54 0 chr5 139162120 139162194 -13375065 - LTR52-int LTR ERVL -3243 313 236 1 1646 587 210 121 0 chr5 139165009 139165133 -13372126 + MTEb LTR MaLR 3 141 -238 1 1646 871 295 22 76 chr5 139165133 139165449 -13371810 + MTD LTR MaLR 1 299 -120 1 1646 624 236 25 25 chr5 139165460 139165621 -13371638 + MTD LTR MaLR 259 419 0 1 1646 647 199 223 11 chr5 139165622 139165810 -13371449 + MTEb LTR MaLR 151 378 -1 1 1646 492 169 2 12 chr5 139166540 139166632 -13370627 - MTC LTR MaLR -14 407 280 1 1646 1120 109 44 98 chr5 139169027 139169231 -13368028 - ORR1A3 LTR MaLR -133 193 1 1 1646 2436 126 15 26 chr5 139169319 139169709 -13367550 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 1646 247 223 104 26 chr5 139170905 139171020 -13366239 + MLT1A LTR MaLR 49 172 -202 1 1646 529 276 36 21 chr5 139171738 139171898 -13365361 - MTE2b LTR MaLR -213 166 10 2 1646 1266 192 104 109 chr5 139171965 139172388 -13364871 - MT2A LTR ERVL -54 547 6 2 1646 984 256 61 48 chr5 139173705 139173855 -13363404 - RMER17C LTR ERVK 0 410 214 2 1646 984 132 177 5 chr5 139173917 139174092 -13363167 - RMER17C LTR ERVK -197 213 4 2 1646 2805 44 11 20 chr5 139174948 139175297 -13361962 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1646 1236 295 29 24 chr5 139177789 139178171 -13359088 - RMER5 LTR ERV1 -24 510 127 2 1646 1704 145 112 3 chr5 139178215 139178526 -13358733 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 2 1646 395 259 8 101 chr5 139178594 139178615 -13358644 + MT2B LTR ERVL 147 155 -446 2 1646 507 284 105 38 chr5 139178759 139179026 -13358233 + RMER5 LTR ERV1 195 479 -55 2 1646 1834 172 50 28 chr5 139181797 139182156 -13355103 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 8 2 1646 1723 203 103 41 chr5 139183367 139183804 -13353455 + RMER15 LTR ERVL 22 485 -90 2 1646 2310 152 23 8 chr5 139183805 139184190 -13353069 + ORR1B1 LTR MaLR 1 391 -3 2 1646 271 219 149 58 chr5 139184190 139184273 -13352986 + RMER15 LTR ERVL 483 573 -2 2 1646 1752 128 74 64 chr5 139184848 139185174 -13352085 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1646 1333 278 59 0 chr5 139186458 139186814 -13350445 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 2 1646 1720 172 77 33 chr5 139188163 139188529 -13348730 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 2 1646 1597 231 38 19 chr5 139188529 139188884 -13348375 - MTEa LTR MaLR -12 367 3 2 1646 298 307 53 112 chr5 139189076 139189114 -13348145 + MT2B LTR ERVL 120 155 -446 2 1646 298 307 53 112 chr5 139189307 139189437 -13347822 + MT2B LTR ERVL 156 278 -323 2 1646 351 206 50 101 chr5 139190246 139190299 -13346960 + RMER15 LTR ERVL 19 67 -508 2 1646 351 206 50 101 chr5 139190446 139190511 -13346748 + RMER15 LTR ERVL 68 131 -444 2 1646 1024 240 72 8 chr5 139190541 139190805 -13346454 + RMER15 LTR ERVL 295 575 0 2 1646 3009 268 130 71 chr5 139192466 139193855 -13343404 - ORR1B1-int LTR MaLR -39 1470 1 2 1646 1024 197 224 26 chr5 139193901 139194213 -13343046 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1646 3077 66 18 13 chr5 139195348 139195746 -13341513 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1646 2904 100 20 0 chr5 139197869 139198268 -13338991 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 205 448 81 48 0 chr5 139198445 139198507 -13338752 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 343 2 1647 2322 132 82 3 chr5 139199807 139200172 -13337087 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1647 245 214 0 0 chr5 139202964 139203006 -13334253 - ORR1B2 LTR MaLR 0 378 337 2 1647 1678 148 51 119 chr5 139203270 139203428 -13333831 - ORR1B2 LTR MaLR -39 328 171 2 1647 1678 148 51 119 chr5 139203482 139203675 -13333584 - ORR1B2 LTR MaLR -197 170 3 2 1647 1328 199 44 25 chr5 139204629 139204949 -13332310 + RLTR15 LTR ERVK 1 326 -33 2 1647 285 327 67 0 chr5 139205290 139205394 -13331865 - RMER15 LTR ERVL -72 503 393 2 1647 1667 178 101 13 chr5 139205396 139205574 -13331685 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 198 2 1647 1667 178 101 13 chr5 139205660 139205799 -13331460 - ORR1D1 LTR MaLR -177 197 29 2 1647 2313 75 39 0 chr5 139205805 139206112 -13331147 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1647 669 268 106 18 chr5 139207562 139207779 -13329480 - RMER15 LTR ERVL -4 571 336 2 1647 1040 108 49 142 chr5 139207884 139208110 -13329149 + RMER6B LTR ERVK 1 205 -256 2 1647 631 163 148 0 chr5 139208128 139208263 -13328996 + RMER6B LTR ERVK 297 451 -10 2 1647 420 304 92 117 chr5 139208784 139209067 -13328192 + MTEa LTR MaLR 1 276 -103 2 1647 858 284 13 33 chr5 139209108 139209369 -13327890 + MT2A LTR ERVL 247 597 -4 2 1647 300 278 0 67 chr5 139211140 139211244 -13326015 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 145 2 1647 1294 175 45 46 chr5 139213629 139213890 -13323369 + MTD LTR MaLR 157 407 -12 2 1647 1723 205 35 8 chr5 139215618 139215987 -13321272 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 3 1647 1145 230 172 11 chr5 139216047 139216395 -13320864 - MTD LTR MaLR -13 406 3 3 1647 417 261 16 25 chr5 139241015 139241137 -13296122 - RMER15 LTR ERVL -155 420 300 3 1647 380 225 35 127 chr5 139241158 139241292 -13295967 - RMER15 LTR ERVL -416 159 40 3 1647 380 225 35 127 chr5 139241474 139241510 -13295749 - RMER15 LTR ERVL -536 39 3 3 1647 1408 215 96 35 chr5 139249953 139250329 -13286930 - MTD LTR MaLR -16 403 5 3 1647 244 337 37 69 chr5 139259719 139259907 -13277352 + MLT1D LTR MaLR 70 251 -254 3 1647 1718 203 3 7 chr5 139271178 139271486 -13265773 - MTEa LTR MaLR -72 307 1 3 1647 236 214 43 106 chr5 139278079 139278173 -13259086 - RLTR25B LTR ERVK -529 499 412 4 1647 1042 165 78 21 chr5 139282541 139282794 -13254465 - MTEb LTR MaLR -72 307 1 4 1647 283 276 119 119 chr5 139282794 139282821 -13254438 - MLT2B5 LTR ERVL -564 153 127 4 1647 339 314 0 90 chr5 139289704 139289837 -13247422 - MLT1B LTR MaLR -21 369 249 4 1647 289 220 65 11 chr5 139291739 139291831 -13245428 + RMER15 LTR ERVL 34 130 -445 4 1647 390 304 81 7 chr5 139291933 139292069 -13245190 + RMER15 LTR ERVL 427 572 -3 4 1647 302 266 70 52 chr5 139294296 139294411 -13242848 + MLT1G3 LTR MaLR 20 136 -459 4 1647 3087 130 52 23 chr5 139307744 139308304 -13228955 - RMER4B LTR ERVK -8 577 2 4 1647 941 241 44 22 chr5 139311803 139311996 -13225263 + MTD LTR MaLR 10 209 -210 4 1647 941 241 44 22 chr5 139312194 139312267 -13224992 + MTD LTR MaLR 210 284 -135 4 1647 1951 192 53 15 chr5 139312722 139313118 -13224141 + MTC LTR MaLR 3 413 -8 4 1647 305 305 42 8 chr5 139314201 139314320 -13222939 + MLT1A1 LTR MaLR 1 123 -285 4 1647 1581 229 72 25 chr5 139315564 139316035 -13221224 + RLTR26 LTR ERVK 1 493 -149 4 1647 615 251 81 68 chr5 139316124 139316359 -13220900 - RMER15 LTR ERVL -45 530 293 4 1647 700 238 24 0 chr5 139316470 139316634 -13220625 + MTEa LTR MaLR 10 177 -202 4 1647 1223 212 76 74 chr5 139316663 139317030 -13220229 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 3 4 1647 1022 179 15 10 chr5 139317033 139317231 -13220028 + MTEa LTR MaLR 181 379 0 4 1647 2547 33 0 163 chr5 139317600 139318036 -13219223 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 4 1647 386 313 35 9 chr5 139318526 139318642 -13218617 + RMER15 LTR ERVL 288 406 -169 4 1647 394 242 32 118 chr5 139320137 139320324 -13216935 + MTEb LTR MaLR 206 376 -3 4 1647 1705 164 17 97 chr5 139328273 139328631 -13208628 + ORR1D1 LTR MaLR 3 345 -29 5 1647 1705 164 17 97 chr5 139328827 139328872 -13208387 + ORR1D1 LTR MaLR 346 374 0 5 1648 492 299 63 36 chr5 139330766 139330988 -13206271 + RMER15 LTR ERVL 347 574 -1 5 1648 1988 150 88 13 chr5 139332313 139332697 -13204562 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 1648 286 378 104 19 chr5 139335209 139335468 -13201791 + MLT1K LTR MaLR 129 409 -186 5 1648 1276 240 102 6 chr5 139336048 139336371 -13200888 + MTD LTR MaLR 5 358 -61 5 1648 239 261 29 0 chr5 139338277 139338346 -13198913 - MLT1C LTR MaLR -351 116 46 5 1648 1166 230 120 56 chr5 139338522 139338914 -13198345 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 5 1648 2664 68 0 0 chr5 139342929 139343253 -13194006 + ORR1A2 LTR MaLR 4 327 0 5 1648 2674 57 45 0 chr5 139348731 139349062 -13188197 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1648 350 314 90 100 chr5 139352998 139353288 -13183971 + ORR1E LTR MaLR 23 309 -50 5 1648 347 349 95 12 chr5 139354103 139354271 -13182988 - RMER15 LTR ERVL -46 529 348 5 1648 1765 209 24 3 chr5 139355062 139355402 -13181857 + MTEa LTR MaLR 28 374 -5 5 1648 1337 231 63 13 chr5 139362585 139362884 -13174375 - MTE2b LTR MaLR -65 314 1 5 1648 396 303 131 75 chr5 139367522 139367804 -13169455 + ORR1D2 LTR MaLR 51 348 -22 5 1648 1306 194 204 13 chr5 139367981 139368294 -13168965 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 5 1648 1900 244 37 24 chr5 139378208 139378755 -13158504 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 24 6 1648 2069 155 28 82 chr5 139382163 139382509 -13154750 + ORR1C1 LTR MaLR 1 320 -58 6 1648 2069 155 28 82 chr5 139382694 139382747 -13154512 + ORR1C1 LTR MaLR 321 377 -1 6 1648 634 229 76 0 chr5 139383167 139383311 -13153948 - MTEb LTR MaLR 0 379 225 6 1648 1772 132 105 81 chr5 139383468 139383840 -13153419 + ORR1B1 LTR MaLR 14 394 0 6 1648 887 260 40 22 chr5 139383840 139384066 -13153193 - MTEb LTR MaLR -147 232 3 6 1648 686 223 28 113 chr5 139398293 139398652 -13138607 - MTD LTR MaLR -15 404 60 6 1648 382 267 137 29 chr5 139404785 139404924 -13132335 + MLT1K LTR MaLR 365 518 -77 6 1648 237 287 126 0 chr5 139412132 139412219 -13125040 + MER21B LTR ERV1 216 313 -550 6 1648 1679 212 121 45 chr5 139416242 139416730 -13120529 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 4 6 1648 3469 98 102 46 chr5 139417638 139418206 -13119053 + MT2B LTR ERVL 2 601 0 6 1648 302 311 174 19 chr5 139433714 139433927 -13103332 - MLT1C LTR MaLR -26 441 196 7 1648 254 372 35 0 chr5 139435592 139435705 -13101554 - MLT1L LTR MaLR -173 437 321 7 1648 270 278 139 29 chr5 139438018 139438252 -13099007 + MLT1C LTR MaLR 29 299 -91 7 1648 383 225 159 48 chr5 139449131 139449257 -13088002 + MTD LTR MaLR 34 173 -246 7 1648 538 163 85 47 chr5 139449251 139449380 -13087879 + MTD LTR MaLR 280 413 -6 7 1649 246 257 85 33 chr5 139461585 139461738 -13075521 + RMER15 LTR ERVL 1 161 -414 7 1649 399 223 245 13 chr5 139461801 139461960 -13075299 + RMER15 LTR ERVL 359 554 -21 7 1649 267 229 69 46 chr5 139478647 139478734 -13058525 + MT2B LTR ERVL 169 257 -344 7 1649 273 304 21 97 chr5 139485452 139485533 -13051726 - MT2B LTR ERVL -449 152 86 8 1649 323 267 59 10 chr5 139485708 139485810 -13051449 - MLT1F2 LTR MaLR -11 549 443 8 1649 1813 201 123 0 chr5 139488957 139489330 -13047929 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1649 1228 242 73 81 chr5 139514589 139514971 -13022288 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1649 1565 191 48 62 chr5 139515836 139516210 -13021049 + ORR1C1 LTR MaLR 1 369 -9 3 1649 701 255 31 63 chr5 139522707 139522929 -13014330 + MTEa LTR MaLR 1 215 -164 4 1649 655 243 42 32 chr5 139522982 139523185 -13014074 + MTEb LTR MaLR 151 379 0 4 1649 1346 247 37 66 chr5 139523864 139524245 -13013014 + MTE2b LTR MaLR 10 379 0 4 1649 255 221 110 55 chr5 139526320 139526411 -13010848 - MLT1J LTR MaLR -182 330 235 5 1649 231 371 0 0 chr5 139540889 139540959 -12996300 + RMER15 LTR ERVL 371 440 -135 7 1649 511 164 64 72 chr5 139546495 139546620 -12990639 + MT2B LTR ERVL 1 124 -409 9 1649 347 221 0 13 chr5 139546811 139546889 -12990370 + MT2B LTR ERVL 85 161 -372 9 1649 676 273 6 22 chr5 139546883 139547063 -12990196 + MT2B LTR ERVL 384 560 -41 9 1649 1203 201 149 89 chr5 139547396 139547745 -12989514 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 9 1649 1664 206 75 11 chr5 139555588 139555936 -12981323 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1649 798 253 114 106 chr5 139556227 139556425 -12980834 + MTE2a LTR MaLR 1 189 -190 1 1649 632 245 117 109 chr5 139556452 139556629 -12980630 + MTE2a LTR MaLR 190 378 -1 1 1649 461 297 199 10 chr5 139564569 139564962 -12972297 + RMER5 LTR ERV1 34 500 -34 1 1649 1071 222 19 16 chr5 139571707 139571963 -12965296 + RMER15 LTR ERVL 278 534 -41 1 1649 642 203 60 7 chr5 139572905 139573054 -12964205 - MTEa LTR MaLR 0 379 223 1 1649 307 209 33 44 chr5 139573054 139573144 -12964115 + RMER15 LTR ERVL 27 115 -460 1 1649 410 271 33 25 chr5 139573196 139573317 -12963942 + RMER15 LTR ERVL 275 396 -179 1 1649 1219 219 139 6 chr5 139573333 139573677 -12963582 + RMER10B LTR ERVL 9 398 0 1 1649 610 244 61 6 chr5 139573678 139573843 -12963416 + RMER15 LTR ERVL 402 575 0 1 1649 801 189 105 1 chr5 139573843 139574033 -12963226 - MTEa LTR MaLR -154 225 18 1 1649 2285 64 16 0 chr5 139580911 139581225 -12956034 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1649 690 328 34 43 chr5 139581997 139582319 -12954940 - ORR1E LTR MaLR -5 354 36 1 1650 231 310 45 22 chr5 139594626 139594715 -12942544 + RLTR47_MM LTR ERV1 74 164 -368 2 1650 233 277 17 122 chr5 139597537 139597652 -12939607 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 2 1650 302 257 95 26 chr5 139598790 139598906 -12938353 + MTD LTR MaLR 1 124 -295 2 1650 3076 134 224 28 chr5 139610548 139611164 -12926095 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 1650 257 299 0 0 chr5 139611489 139611556 -12925703 + MLT1E3 LTR MaLR 558 624 0 2 1650 1346 120 131 12 chr5 139615324 139615569 -12921690 + ORR1B2 LTR MaLR 1 274 -93 2 1650 2268 85 0 3 chr5 139615573 139615893 -12921366 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1650 556 152 0 0 chr5 139615893 139615992 -12921267 + ORR1B2 LTR MaLR 231 329 0 2 1650 557 312 98 25 chr5 139620064 139620389 -12916870 + ORR1E LTR MaLR 3 351 -8 3 1650 349 215 63 28 chr5 139620460 139620602 -12916657 + ORR1D2 LTR MaLR 1 189 -1181 3 1650 2496 258 47 61 chr5 139620602 139620948 -12916311 + ORR1D2-int LTR MaLR 297 653 -717 3 1650 2496 258 47 61 chr5 139621145 139621569 -12915690 + ORR1D2-int LTR MaLR 654 1056 -314 3 1650 1070 210 45 25 chr5 139621564 139621756 -12915503 + ORR1D2 LTR MaLR 122 322 -48 3 1650 2103 129 85 6 chr5 139621756 139622121 -12915138 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1650 1070 210 45 25 chr5 139622121 139622172 -12915087 + ORR1D2 LTR MaLR 323 370 0 3 1650 262 306 32 122 chr5 139622173 139622329 -12914930 - MLT1A LTR MaLR -213 161 20 3 1650 285 232 60 12 chr5 139624792 139624875 -12912384 - MLT1C LTR MaLR -351 116 30 3 1650 3647 108 40 35 chr5 139633869 139634464 -12902795 - MT2B LTR ERVL -3 598 1 3 1650 1881 163 40 11 chr5 139640045 139640399 -12896860 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 11 3 1650 748 252 115 67 chr5 139640988 139641345 -12895914 - RMER10A LTR ERVL 0 442 69 3 1650 259 205 60 0 chr5 139645346 139645463 -12891796 + ORR1B1-int LTR MaLR 631 754 -755 3 1650 1403 188 159 27 chr5 139651532 139651904 -12885355 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1650 438 233 65 0 chr5 139654209 139654366 -12882893 - MTE2a LTR MaLR 0 379 201 3 1650 1151 172 97 22 chr5 139656210 139656478 -12880781 + MTC LTR MaLR 1 288 -133 3 1650 326 224 43 86 chr5 139678966 139679059 -12858200 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 152 4 1650 225 254 158 35 chr5 139685116 139685230 -12852029 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -302 440 313 5 1650 2810 99 85 54 chr5 139687267 139687728 -12849531 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1650 3582 18 2 0 chr5 139693736 139694131 -12843128 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1650 9253 33 6 1 chr5 139694131 139695224 -12842035 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1650 3582 18 2 0 chr5 139695224 139695619 -12841640 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1650 657 179 0 0 chr5 139698174 139698286 -12838973 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 270 5 1650 580 185 28 0 chr5 139698275 139698383 -12838876 - ORR1C2 LTR MaLR -267 111 1 5 1650 237 260 79 85 chr5 139713738 139713902 -12823357 - RLTR30 LTR ERV1 -21 358 196 5 1650 318 330 0 89 chr5 139715677 139715694 -12821565 + MT2B LTR ERVL 146 151 -450 5 1650 249 278 69 0 chr5 139722474 139722546 -12814713 - MER21B LTR ERV1 -543 320 244 5 1651 1454 195 168 16 chr5 139731824 139732204 -12805055 - RMER15 LTR ERVL -133 442 5 5 1651 254 188 78 0 chr5 139732216 139732280 -12804979 - RMER15 LTR ERVL -506 69 1 5 1651 1574 297 136 24 chr5 139734725 139735468 -12801791 - RMER15-int LTR ERVL -7 4992 4167 5 1651 500 319 106 58 chr5 139735728 139736104 -12801155 - RMER15-int LTR ERVL -2792 2207 1814 5 1651 1401 275 121 22 chr5 139736177 139737045 -12800214 - RMER15-int LTR ERVL -3335 1664 711 5 1651 337 308 231 0 chr5 139737484 139737653 -12799606 - RMER15 LTR ERVL 0 575 368 5 1651 248 262 73 106 chr5 139737625 139737804 -12799455 - RMER15 LTR ERVL -354 221 49 5 1651 257 226 68 45 chr5 139766495 139766583 -12770676 + MLT1K LTR MaLR 389 478 -117 6 1651 1272 217 60 94 chr5 139767331 139767816 -12769443 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 1651 2293 118 11 14 chr5 139768216 139768584 -12768675 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 1651 488 301 118 84 chr5 139769487 139769784 -12767475 + MTE2a LTR MaLR 1 307 -72 6 1651 1570 125 134 17 chr5 139769784 139770076 -12767183 - MTC LTR MaLR 0 421 96 6 1651 323 116 42 28 chr5 139770129 139770200 -12767059 + MTE2a LTR MaLR 306 377 -2 6 1651 1483 205 76 20 chr5 139771528 139771882 -12765377 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1651 5103 204 71 106 chr5 139771882 139772805 -12764454 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 846 -524 6 1651 5103 204 71 106 chr5 139772825 139773319 -12763940 + ORR1D1-int LTR MaLR 847 1369 -1 6 1651 633 195 132 0 chr5 139773321 139773551 -12763708 + ORR1D1 LTR MaLR 2 370 -4 6 1651 275 293 73 6 chr5 139777906 139778071 -12759188 - RLTR21 LTR ERVK -319 1253 1078 6 1651 400 190 0 130 chr5 139779936 139779954 -12757305 + MT2B LTR ERVL 154 156 -445 6 1651 327 308 260 16 chr5 139805400 139805709 -12731550 + MLT1C LTR MaLR 1 384 -83 7 1651 319 320 98 49 chr5 139821695 139821941 -12715318 - MLT1C LTR MaLR -78 389 132 7 1651 1851 183 84 49 chr5 139825080 139825506 -12711753 + RMER10A LTR ERVL 1 441 -1 8 1651 271 254 0 8 chr5 139839217 139839344 -12697915 + ORR1B1-int LTR MaLR 629 754 -755 8 1651 825 180 5 70 chr5 139849112 139849297 -12687962 + MTD LTR MaLR 10 182 -237 8 1651 614 215 60 7 chr5 139849316 139849466 -12687793 + MTD LTR MaLR 262 419 0 8 1651 266 330 84 58 chr5 139850087 139850396 -12686863 + RMER17C LTR ERVK 46 362 -48 8 1651 1732 209 56 0 chr5 139851674 139852032 -12685227 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 8 1651 2213 146 99 3 chr5 139852162 139852546 -12684713 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1652 3264 37 37 3 chr5 139866347 139866730 -12670529 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1652 622 277 79 13 chr5 139875743 139876033 -12661226 + MTEa LTR MaLR 1 345 -14 8 1652 2043 189 61 36 chr5 139876283 139876694 -12660565 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1652 458 292 45 98 chr5 139877494 139877718 -12659541 + MT2B LTR ERVL 53 264 -337 8 1652 733 265 156 27 chr5 139889059 139889315 -12647944 - ORR1D2 LTR MaLR -70 289 1 9 1652 238 287 10 50 chr5 139913675 139913774 -12623485 + MTEa LTR MaLR 278 372 -7 9 1652 661 282 65 0 chr5 139917830 139918000 -12619259 + MTEa LTR MaLR 2 182 -197 9 1652 582 217 189 0 chr5 139918124 139918299 -12618960 + MTEa LTR MaLR 167 374 -5 9 1652 902 271 105 69 chr5 139919378 139919552 -12617707 + MTEa LTR MaLR 3 177 -202 9 1652 902 271 105 69 chr5 139920264 139920449 -12616810 + MTEa LTR MaLR 178 375 -4 9 1652 239 250 37 24 chr5 139933725 139933807 -12603452 - RLTR25B LTR ERVK -504 524 442 1 1652 2106 164 21 13 chr5 139937198 139937575 -12599684 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 1 1652 4648 95 69 6 chr5 139941200 139941838 -12595421 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 1 1652 361 161 0 129 chr5 139942189 139942282 -12594977 + MT2A LTR ERVL 1 81 -452 1 1652 2147 155 8 6 chr5 139942414 139942770 -12594489 + ORR1B1 LTR MaLR 38 394 0 1 1652 313 275 96 45 chr5 139957363 139957561 -12579698 + RLTR42-int LTR ERVK 1189 1396 -4126 1 1652 546 305 75 26 chr5 139961517 139961743 -12575516 + MTD LTR MaLR 6 242 -179 1 1652 560 187 214 25 chr5 139962228 139962387 -12574872 + MTD LTR MaLR 196 384 -35 1 1652 233 286 88 58 chr5 139962444 139962615 -12574644 - RLTR14 LTR ERV1 -53 329 154 1 1652 549 289 51 5 chr5 139963129 139963324 -12573935 - RMER5 LTR ERV1 0 534 331 1 1652 240 257 70 14 chr5 139963306 139963377 -12573882 - RMER5 LTR ERV1 -411 123 49 1 1652 4274 12 2 0 chr5 139963511 139964003 -12573256 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1652 488 221 44 37 chr5 139972047 139972183 -12565076 + ORR1E LTR MaLR 7 143 -216 1 1652 282 298 12 0 chr5 139973620 139973704 -12563555 + ORR1E LTR MaLR 288 372 -7 1 1652 1000 159 279 22 chr5 139973832 139974108 -12563151 - ORR1C2 LTR MaLR -33 351 5 1 1652 1606 192 113 13 chr5 139974737 139975116 -12562143 - MTD LTR MaLR -2 417 1 1 1652 360 143 0 0 chr5 139977049 139977105 -12560154 + MTE2b LTR MaLR 1 56 -323 1 1652 806 269 43 63 chr5 139979510 139979781 -12557478 + MT2B LTR ERVL 290 555 -46 1 1652 806 269 43 63 chr5 139979823 139979853 -12557406 + MT2B LTR ERVL 556 585 -16 1 1652 259 290 18 99 chr5 139983962 139983988 -12553271 - MT2B LTR ERVL -446 155 139 1 1652 2029 124 67 14 chr5 139984163 139984194 -12553065 + ORR1C1 LTR MaLR 1 31 -347 1 1652 2029 124 67 14 chr5 139984478 139984804 -12552455 + ORR1C1 LTR MaLR 32 377 -1 1 1653 1636 179 17 0 chr5 139988579 139988880 -12548379 - ORR1D1 LTR MaLR -29 345 40 1 1653 240 160 0 0 chr5 139994941 139994991 -12542268 - MT2A LTR ERVL 0 533 484 1 1653 1829 226 53 45 chr5 139995369 139995762 -12541497 - MT2A LTR ERVL -74 459 53 1 1653 1829 226 53 45 chr5 139995911 139995966 -12541293 - MT2A LTR ERVL -481 52 7 1 1653 258 394 10 0 chr5 140000368 140000467 -12536792 - RMER15 LTR ERVL -105 470 371 1 1653 364 279 5 125 chr5 140006529 140006713 -12530546 + MT2B LTR ERVL 103 264 -337 3 1653 248 224 0 33 chr5 140036743 140036803 -12500456 + MLT1B LTR MaLR 48 105 -285 9 1653 239 293 24 31 chr5 140044992 140045059 -12492200 + RMER17A LTR ERVK 344 413 -338 1 1653 239 293 24 31 chr5 140045242 140045301 -12491958 + RMER17A LTR ERVK 414 468 -283 1 1653 1187 231 90 36 chr5 140052510 140052811 -12484448 + MTEb LTR MaLR 61 377 -2 1 1653 387 312 35 14 chr5 140053435 140053578 -12483681 - RMER15 LTR ERVL -72 503 358 1 1653 270 264 31 52 chr5 140053599 140053695 -12483564 - RMER15 LTR ERVL -416 159 66 1 1653 333 289 8 66 chr5 140065342 140065464 -12471795 - MT2B LTR ERVL -334 267 153 1 1653 1869 134 118 14 chr5 140078313 140078670 -12458589 - MTD LTR MaLR -13 406 13 2 1653 257 236 56 0 chr5 140083962 140084034 -12453225 + MER74B LTR ERVL 233 308 -314 2 1653 1654 128 94 56 chr5 140084649 140084988 -12452271 + ORR1B1 LTR MaLR 41 392 -2 2 1653 323 309 0 21 chr5 140098959 140099055 -12438204 + RMER15 LTR ERVL 372 465 -110 2 1653 2267 158 80 8 chr5 140104087 140104476 -12432783 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 2 1653 525 240 155 92 chr5 140106803 140106854 -12430405 - MT2B2 LTR ERVL -2 531 481 2 1653 889 209 98 50 chr5 140106908 140107237 -12430022 - MT2B2 LTR ERVL -56 528 127 2 1653 4101 100 17 11 chr5 140107258 140107904 -12429355 - RMER6A LTR ERVK -106 650 1 2 1653 393 248 68 49 chr5 140107904 140108107 -12429152 + MTEa LTR MaLR 159 373 -6 2 1653 1311 211 86 67 chr5 140108788 140109072 -12428187 - MTD LTR MaLR 0 419 115 2 1653 1311 211 86 67 chr5 140109615 140109701 -12427558 - MTD LTR MaLR -305 114 42 2 1653 2877 145 67 10 chr5 140109745 140110252 -12427007 - RMER4B LTR ERVK 0 585 50 3 1653 376 271 177 5 chr5 140111682 140111897 -12425362 - RMER15 LTR ERVL -15 560 309 3 1653 235 284 65 119 chr5 140112842 140112906 -12424353 - MT2B LTR ERVL -441 160 106 3 1653 536 222 150 12 chr5 140112946 140113106 -12424153 + RMER15 LTR ERVL 389 570 -5 3 1653 1996 139 63 16 chr5 140113623 140113988 -12423271 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 5 3 1653 267 294 138 121 chr5 140114002 140114300 -12422959 - ORR1E LTR MaLR -36 323 21 3 1654 1732 172 166 18 chr5 140118547 140118890 -12418369 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1654 789 241 15 146 chr5 140121515 140121850 -12415409 + ORR1E LTR MaLR 1 291 -68 3 1654 2698 200 158 8 chr5 140130358 140130770 -12406489 + RMER19A LTR ERVK 1 451 -286 3 1654 2698 200 158 8 chr5 140130811 140131039 -12406220 + RMER19A LTR ERVK 452 736 -1 3 1654 3195 74 5 0 chr5 140132433 140132827 -12404432 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1654 334 303 113 38 chr5 140141521 140141706 -12395553 - MLT1G3 LTR MaLR -181 414 216 3 1654 226 185 17 85 chr5 140154390 140154449 -12382810 - MLT1E1A LTR MaLR -74 606 552 4 1654 1837 117 30 3 chr5 140169577 140169878 -12367381 + ORR1B2 LTR MaLR 59 367 0 4 1654 2339 77 51 6 chr5 140171749 140172062 -12365197 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1654 615 290 135 15 chr5 140172871 140173188 -12364071 - ORR1E LTR MaLR -1 369 1 4 1654 1639 149 51 3 chr5 140179175 140179469 -12357790 - MTC LTR MaLR -8 413 106 4 1654 491 136 0 36 chr5 140179672 140179756 -12357503 - MTC LTR MaLR -340 81 1 4 1654 5717 158 40 75 chr5 140179762 140180777 -12356482 - MTC-int LTR MaLR -13 1245 252 4 1654 5717 158 40 75 chr5 140180924 140181169 -12356090 - MTC-int LTR MaLR -1007 251 28 4 1654 1391 141 181 4 chr5 140181186 140181456 -12355803 - MTC LTR MaLR 0 421 104 4 1654 521 152 133 0 chr5 140181611 140181716 -12355543 - MTC LTR MaLR -302 119 1 4 1654 1019 281 33 110 chr5 140182010 140182187 -12355072 + MTE2a LTR MaLR 6 180 -199 4 1654 1019 281 33 110 chr5 140182330 140182544 -12354715 + MTE2a LTR MaLR 181 367 -12 4 1654 384 263 35 116 chr5 140190021 140190065 -12347194 + MT2B LTR ERVL 128 168 -433 4 1654 384 263 35 116 chr5 140190259 140190386 -12346873 + MT2B LTR ERVL 169 285 -316 4 1654 1773 189 66 44 chr5 140202650 140202813 -12334446 + MTD LTR MaLR 1 170 -249 4 1654 1773 189 66 44 chr5 140202856 140203038 -12334221 + MTD LTR MaLR 171 362 -57 4 1654 1848 171 57 25 chr5 140203038 140203404 -12333855 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1654 1773 189 66 44 chr5 140203404 140203467 -12333792 + MTD LTR MaLR 363 419 0 4 1654 410 282 91 17 chr5 140204238 140204450 -12332809 + RMER20B LTR ERVK 197 425 -91 4 1654 414 274 26 151 chr5 140205832 140206064 -12331195 + MLT1B LTR MaLR 51 253 -137 5 1654 2501 172 163 6 chr5 140215966 140216463 -12320796 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 5 1654 3385 28 23 0 chr5 140218845 140219232 -12318027 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1654 9240 41 4 1 chr5 140219232 140220327 -12316932 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1654 3431 46 2 0 chr5 140220327 140220722 -12316537 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1655 465 269 50 43 chr5 140254501 140254641 -12282618 + MT2B LTR ERVL 2 142 -391 5 1655 963 257 24 105 chr5 140255229 140255501 -12281758 + MT2B LTR ERVL 260 518 -83 5 1655 2224 96 63 0 chr5 140255501 140255804 -12281455 + ORR1A3 LTR MaLR 5 326 0 5 1655 963 257 24 105 chr5 140255804 140255901 -12281358 + MT2B LTR ERVL 519 599 -2 5 1655 609 234 42 118 chr5 140259786 140259931 -12277328 + MT2A LTR ERVL 1 207 -286 6 1655 609 234 42 118 chr5 140260048 140260100 -12277159 + MT2A LTR ERVL 208 284 -209 6 1655 792 294 68 56 chr5 140260808 140261235 -12276024 - RMER15 LTR ERVL -52 523 1 6 1655 2371 94 22 0 chr5 140266121 140266441 -12270818 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1655 1115 214 100 30 chr5 140306708 140307023 -12230236 + ORR1E LTR MaLR 21 374 0 7 1655 1299 315 59 25 chr5 140308616 140309128 -12228131 + MT2A LTR ERVL 5 533 0 7 1655 1070 220 101 55 chr5 140312164 140312491 -12224768 + MTE2b LTR MaLR 36 377 -2 7 1655 271 217 56 28 chr5 140315727 140315798 -12221461 - RLTR25B LTR ERVK -505 523 451 7 1655 2242 135 54 14 chr5 140319068 140319421 -12217838 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1655 263 198 11 129 chr5 140325113 140325206 -12212053 - RLTR25A LTR ERVK -512 591 510 7 1655 407 264 63 19 chr5 140328195 140328353 -12208906 + MLT1B LTR MaLR 16 180 -210 7 1655 1214 287 96 18 chr5 140330743 140331126 -12206133 + MTD LTR MaLR 1 397 -22 7 1655 911 264 39 121 chr5 140331361 140331774 -12205485 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 7 1655 572 181 102 8 chr5 140331938 140332066 -12205193 + RMER15 LTR ERVL 422 561 -14 7 1655 475 378 15 5 chr5 140339007 140339209 -12198050 - MLT1A0 LTR MaLR -7 358 155 8 1655 721 269 64 157 chr5 140341033 140341421 -12195838 - ORR1E LTR MaLR -2 357 6 8 1655 340 261 59 25 chr5 140341378 140341614 -12195645 - RMER17D LTR ERVK -358 531 288 8 1655 469 292 112 72 chr5 140341690 140341941 -12195318 + ORR1D2 LTR MaLR 6 266 -104 8 1655 387 248 0 68 chr5 140341954 140342071 -12195188 + ORR1D2 LTR MaLR 240 348 -31 8 1655 3672 15 0 0 chr5 140343940 140344336 -12192923 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1655 9382 36 2 1 chr5 140344336 140345433 -12191826 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 8 1655 3672 15 0 0 chr5 140345433 140345829 -12191430 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1655 665 241 34 6 chr5 140345870 140346041 -12191218 - MLT1B LTR MaLR -212 178 3 8 1655 1047 266 123 14 chr5 140350776 140351138 -12186121 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 8 1655 2038 248 152 86 chr5 140351138 140351992 -12185267 + MTD-int LTR MaLR 1 911 -347 8 1655 297 229 60 12 chr5 140354277 140354361 -12182898 - MTEb LTR MaLR -3 376 289 8 1655 257 411 75 19 chr5 140355160 140355321 -12181938 - MLT1G3 LTR MaLR -67 512 343 8 1655 931 268 127 65 chr5 140356038 140356393 -12180866 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 8 1655 293 352 16 0 chr5 140356524 140356652 -12180607 - MLT1G3 LTR MaLR -465 130 1 8 1655 2599 140 31 24 chr5 140357533 140357951 -12179308 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1655 435 233 178 41 chr5 140358602 140358799 -12178460 - RMER15 LTR ERVL -15 560 337 8 1655 493 302 54 139 chr5 140359261 140359521 -12177738 - MLT1F1 LTR MaLR -2 567 250 8 1655 1356 232 56 13 chr5 140360084 140360390 -12176869 - MTE2b LTR MaLR -39 340 22 8 1655 265 215 15 60 chr5 140360391 140360466 -12176793 - MTEb LTR MaLR -207 172 101 8 1655 1037 243 75 112 chr5 140360802 140361187 -12176072 + MTE2b LTR MaLR 9 379 0 8 1655 340 285 127 44 chr5 140372055 140372153 -12165106 - MLT1B LTR MaLR -54 336 239 9 1655 340 285 127 44 chr5 140372174 140372233 -12165026 - MLT1B LTR MaLR -152 238 167 9 1655 364 298 136 19 chr5 140372394 140372548 -12164711 - MLT1B LTR MaLR -212 178 7 9 1655 3267 55 2 17 chr5 140373362 140373768 -12163491 - MTB LTR MaLR 0 400 1 9 1655 418 247 28 66 chr5 140375027 140375209 -12162050 + MLT1B LTR MaLR 92 266 -124 9 1656 235 320 53 81 chr5 140396828 140396905 -12140354 - MT2B2 LTR ERVL -258 343 167 9 1656 354 165 49 108 chr5 140411750 140411852 -12125407 + MT2B LTR ERVL 162 257 -344 9 1656 448 340 23 28 chr5 140414586 140414801 -12122458 - RLTR42-int LTR ERVK -4134 1388 1175 1 1656 2496 61 3 84 chr5 140418126 140418177 -12119082 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 286 1 1656 2496 61 3 84 chr5 140418355 140418659 -12118600 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 1 1656 228 346 37 12 chr5 140426469 140426551 -12110708 - MLT1J LTR MaLR -203 309 226 1 1656 296 352 127 5 chr5 140430443 140430640 -12106619 + RMER12 LTR ERVK 737 957 -365 1 1656 869 172 340 48 chr5 140431812 140432066 -12105193 - MTC LTR MaLR -2 419 96 1 1656 869 143 26 98 chr5 140432230 140432316 -12104943 - MTC LTR MaLR -326 95 9 1 1656 377 312 86 11 chr5 140453791 140453966 -12083293 - RLTR42-int LTR ERVK -4179 1343 1156 1 1656 715 193 18 24 chr5 140456308 140456473 -12080786 - RLTR11A2 LTR ERVK -30 497 334 1 1656 1141 230 89 25 chr5 140456791 140457116 -12080143 - RLTR11A2 LTR ERVK -181 346 1 1 1656 334 233 66 28 chr5 140457240 140457342 -12079917 - MTC LTR MaLR -281 140 35 1 1656 1527 219 83 114 chr5 140459880 140460425 -12076834 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1656 704 245 52 71 chr5 140462338 140462549 -12074710 - MTE2a LTR MaLR 0 379 173 1 1656 240 350 12 0 chr5 140464725 140464805 -12072454 + MLT1K LTR MaLR 136 216 -379 1 1656 904 309 86 39 chr5 140465061 140465445 -12071814 - MTD LTR MaLR 0 419 18 1 1656 1257 265 196 33 chr5 140465468 140466408 -12070851 - MTD-int LTR MaLR -4 1254 48 1 1656 350 281 0 0 chr5 140466653 140466735 -12070524 + MTD LTR MaLR 4 85 -274 1 1656 616 234 44 0 chr5 140467692 140467829 -12069430 + MTD LTR MaLR 277 419 0 1 1656 1909 122 43 3 chr5 140470030 140470335 -12066924 + ORR1A2 LTR MaLR 3 319 -8 1 1656 1239 186 78 45 chr5 140479315 140479668 -12057591 + MTD LTR MaLR 1 392 -8 1 1656 526 254 87 50 chr5 140480824 140481045 -12056214 + RLTR12B LTR ERVK 108 323 -245 1 1656 254 208 97 0 chr5 140482157 140482229 -12055030 - MLT1B LTR MaLR -150 240 162 1 1656 261 355 89 15 chr5 140492131 140492334 -12044925 + MLT1F2 LTR MaLR 197 414 -146 1 1656 2446 98 3 3 chr5 140492616 140492943 -12044316 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1656 385 283 20 80 chr5 140493955 140494105 -12043154 - ORR1E LTR MaLR -170 189 49 1 1656 2918 150 67 8 chr5 140495704 140496195 -12041064 + RLTR28 LTR ERVL 1 520 -4 1 1656 252 269 50 100 chr5 140504350 140504400 -12032859 - MT2B2 LTR ERVL -433 168 125 9 1656 5990 113 61 13 chr5 140505480 140506394 -12030865 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 1 1657 304 330 89 6 chr5 140509939 140510119 -12027140 - MLT-int LTR MaLR -107 1628 1434 1 1657 1132 219 120 37 chr5 140525153 140525503 -12011756 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 2 1657 551 237 17 0 chr5 140534258 140534376 -12002883 + MTEb LTR MaLR 1 120 -239 3 1657 593 214 15 148 chr5 140534536 140534739 -12002520 + MTEb LTR MaLR 204 379 0 3 1657 896 254 86 11 chr5 140543612 140543879 -11993380 + RMER15 LTR ERVL 273 559 -16 5 1657 1002 295 114 13 chr5 140546241 140546619 -11990640 + MTD LTR MaLR 4 419 0 5 1657 1754 188 61 71 chr5 140547722 140548100 -11989159 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1657 392 294 50 38 chr5 140552869 140553028 -11984231 + RMER15 LTR ERVL 347 507 -68 6 1657 376 284 35 56 chr5 140555520 140555662 -11981597 + MTE-int LTR MaLR 359 497 -1083 6 1657 524 284 48 48 chr5 140555854 140556061 -11981198 + RMER15 LTR ERVL 326 532 -43 7 1657 866 263 212 0 chr5 140556616 140556961 -11980298 + MTD LTR MaLR 1 407 -14 7 1657 2751 154 40 85 chr5 140582535 140583138 -11954121 + RMER4B LTR ERVK 10 585 0 1 1657 1510 192 121 6 chr5 140590240 140590555 -11946704 + MTD LTR MaLR 69 419 0 1 1657 249 371 10 87 chr5 140595677 140595864 -11941395 + MLT2B1 LTR ERVL 373 556 0 1 1657 1320 243 30 102 chr5 140599915 140600318 -11936941 - MTEa LTR MaLR 0 379 6 1 1657 1243 150 332 14 chr5 140606443 140606762 -11930497 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1657 2562 129 11 64 chr5 140615258 140615729 -11921530 + RLTR11B LTR ERVK 8 453 0 1 1657 338 315 60 97 chr5 140623300 140623567 -11913692 - RMER15 LTR ERVL -43 532 276 1 1657 1061 292 33 6 chr5 140624317 140624654 -11912605 - ORR1E LTR MaLR -1 358 13 1 1657 1289 276 104 12 chr5 140627172 140627594 -11909665 + MT2A LTR ERVL 1 461 -72 1 1657 1896 153 13 0 chr5 140630745 140631059 -11906200 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 1 1657 259 324 39 74 chr5 140635518 140635748 -11901511 + ORR1E LTR MaLR 7 228 -131 1 1657 342 278 90 15 chr5 140638382 140638536 -11898723 + MTEb LTR MaLR 11 171 -208 2 1657 869 301 66 24 chr5 140638520 140638809 -11898450 + ORR1E LTR MaLR 5 305 -54 2 1657 472 295 103 80 chr5 140638987 140639289 -11897970 + ORR1E LTR MaLR 47 355 -4 2 1657 250 354 77 0 chr5 140639711 140639840 -11897419 - MTE2b LTR MaLR -1 378 241 2 1658 5260 111 48 68 chr5 140645534 140645609 -11891650 + RMER17B LTR ERVK 1 75 -883 2 1658 5260 111 48 68 chr5 140645755 140646657 -11890602 + RMER17B LTR ERVK 76 958 0 2 1658 559 317 109 19 chr5 140648229 140648550 -11888709 + MER67B LTR ERV1 279 628 -33 2 1658 359 266 109 29 chr5 140649111 140649285 -11887974 + RMER15 LTR ERVL 388 575 0 2 1658 2815 52 42 5 chr5 140664346 140664731 -11872528 + MTB LTR MaLR 1 399 -1 2 1658 339 256 69 49 chr5 140675770 140675914 -11861345 + RLTR42-int LTR ERVK 1165 1311 -4211 2 1658 251 233 88 55 chr5 140686187 140686278 -11850981 + MTEa LTR MaLR 21 114 -245 2 1658 312 308 8 48 chr5 140686349 140686475 -11850784 + MTEa LTR MaLR 252 372 -7 2 1658 1181 236 72 64 chr5 140700247 140700622 -11836637 + MTEa LTR MaLR 1 378 -1 3 1658 1381 212 119 39 chr5 140707553 140707941 -11829318 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1658 1143 212 110 40 chr5 140717519 140717873 -11819386 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 3 1658 979 245 102 48 chr5 140721958 140722292 -11814967 + ORR1E LTR MaLR 5 356 -3 3 1658 404 295 61 65 chr5 140728898 140729159 -11808100 + RMER15 LTR ERVL 299 558 -17 3 1658 357 299 115 57 chr5 140736081 140736290 -11800969 + MER21B LTR ERV1 17 237 -626 3 1658 1556 229 80 23 chr5 140747667 140748055 -11789204 + MTD LTR MaLR 10 419 0 3 1658 873 260 60 143 chr5 140748779 140749192 -11788067 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 1658 273 289 108 0 chr5 140755622 140755705 -11781554 + MTEa LTR MaLR 93 184 -195 3 1658 1853 186 98 13 chr5 140764998 140765384 -11771875 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1658 709 269 112 8 chr5 140765580 140765820 -11771439 + MER21B LTR ERV1 494 758 -105 4 1658 1284 222 146 12 chr5 140767663 140767991 -11769268 + MTEa LTR MaLR 1 372 -7 4 1659 303 200 33 125 chr5 140772580 140772700 -11764559 + MT2B LTR ERVL 155 263 -338 4 1659 773 276 27 18 chr5 140781889 140782114 -11755145 + MTD LTR MaLR 39 265 -154 4 1659 1459 232 52 3 chr5 140785061 140785402 -11751857 + MTEb LTR MaLR 2 360 -19 4 1659 1238 194 166 12 chr5 140786993 140787312 -11749947 + MTE2b LTR MaLR 12 379 0 4 1659 2441 117 45 14 chr5 140793700 140794118 -11743141 - RMER6B LTR ERVK -1 460 30 4 1659 294 85 21 0 chr5 140794289 140794336 -11742923 - RMER6B LTR ERVK -413 48 1 4 1659 3108 61 10 5 chr5 140795604 140796002 -11741257 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1659 501 296 84 71 chr5 140797990 140798250 -11739009 + RMER5 LTR ERV1 65 329 -205 4 1659 501 296 84 71 chr5 140798427 140798475 -11738784 + RMER5 LTR ERV1 330 377 -157 4 1659 682 191 63 6 chr5 140798850 140799008 -11738251 + RMER5 LTR ERV1 328 494 -40 4 1659 329 225 10 92 chr5 140800013 140800111 -11737148 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 151 5 1659 660 282 70 132 chr5 140800953 140801309 -11735950 + RMER5 LTR ERV1 13 346 -188 5 1659 234 272 59 89 chr5 140801531 140801632 -11735627 + RMER5 LTR ERV1 437 534 0 5 1659 1010 250 79 13 chr5 140803678 140803994 -11733265 - MTC LTR MaLR -44 377 41 5 1659 1141 143 26 116 chr5 140805963 140806231 -11731028 - MTC LTR MaLR -8 413 170 5 1659 317 250 0 103 chr5 140810661 140810768 -11726491 - MT2B LTR ERVL -352 249 154 5 1659 630 263 252 57 chr5 140813819 140814097 -11723162 + ORR1E LTR MaLR 2 333 -46 5 1659 882 262 69 113 chr5 140815411 140815790 -11721469 + MTE2a LTR MaLR 9 370 -9 5 1659 285 176 275 0 chr5 140815836 140815927 -11721332 - RMER15 LTR ERVL -113 462 347 5 1659 2739 99 5 86 chr5 140824911 140825151 -11712108 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 186 5 1659 2739 99 5 86 chr5 140825298 140825488 -11711771 - MTA_Mm LTR MaLR -211 185 1 5 1659 1105 219 49 19 chr5 140828519 140828784 -11708475 + MTEb LTR MaLR 91 363 -16 5 1659 1090 224 179 10 chr5 140833383 140833690 -11703569 + MTE2b LTR MaLR 3 361 -18 6 1659 2835 26 6 0 chr5 140838328 140838668 -11698591 - MTA_Mm LTR MaLR -54 342 1 6 1659 1588 87 164 37 chr5 140838668 140838966 -11698293 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 763 6 1659 2080 166 13 21 chr5 140839314 140839689 -11697570 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 6 1659 239 250 29 154 chr5 140839984 140840088 -11697171 + MT2B2 LTR ERVL 161 251 -333 6 1659 2152 145 65 3 chr5 140841427 140841794 -11695465 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 6 1659 345 217 12 24 chr5 140845042 140845127 -11692132 + RMER15 LTR ERVL 432 515 -60 6 1659 268 243 94 158 chr5 140847352 140847386 -11689873 + MT2B2 LTR ERVL 174 249 -335 6 1659 313 173 0 186 chr5 140852359 140852579 -11684680 + RMER17C LTR ERVK 96 274 -136 6 1659 927 199 192 34 chr5 140856098 140856218 -11681041 + ORR1D1 LTR MaLR 1 120 -254 6 1659 927 199 192 34 chr5 140856238 140856256 -11681003 + ORR1D1 LTR MaLR 121 146 -228 6 1659 927 199 192 34 chr5 140856278 140856320 -11680939 + ORR1D1 LTR MaLR 147 208 -166 6 1659 927 199 192 34 chr5 140856509 140856649 -11680610 + ORR1D1 LTR MaLR 209 372 -2 6 1659 362 304 65 61 chr5 140862595 140862840 -11674419 + MLT1E2 LTR MaLR 20 268 -237 7 1659 1991 145 106 9 chr5 140866904 140867252 -11670007 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 7 1659 455 231 58 0 chr5 140869736 140869840 -11667419 - MTD LTR MaLR -307 112 3 7 1659 3469 40 0 0 chr5 140874716 140875111 -11662148 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 7 1659 9833 14 1 0 chr5 140875111 140876208 -11661051 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 7 1659 3478 28 5 0 chr5 140876208 140876602 -11660657 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1659 705 168 189 26 chr5 140877387 140877540 -11659719 + MTC LTR MaLR 68 245 -176 7 1659 296 235 272 9 chr5 140877623 140877748 -11659511 - RMER13A LTR ERVK -531 377 183 7 1659 1371 211 171 0 chr5 140878380 140878726 -11658533 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1659 407 219 35 71 chr5 140879890 140880003 -11657256 + RMER15 LTR ERVL 22 130 -445 7 1659 422 181 16 173 chr5 140880023 140880150 -11657109 + RMER15 LTR ERVL 282 388 -187 7 1659 4083 163 107 68 chr5 140880659 140881510 -11655749 + RMER19B LTR ERVK 1 884 -18 7 1659 2667 106 5 11 chr5 140881981 140882363 -11654896 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 8 1659 336 164 32 16 chr5 140883461 140883523 -11653736 - ORR1D2 LTR MaLR -307 63 1 8 1659 451 289 32 32 chr5 140883523 140883671 -11653588 - MTE2a LTR MaLR -47 332 185 8 1659 387 294 88 38 chr5 140884358 140884517 -11652742 - MTD LTR MaLR -158 261 95 8 1659 2291 123 3 0 chr5 140886132 140886458 -11650801 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1659 356 294 107 99 chr5 140887918 140888160 -11649099 - MT2B LTR ERVL -332 269 26 8 1659 3248 112 38 63 chr5 140888657 140889256 -11648003 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 1 8 1659 1246 201 76 0 chr5 140898361 140898624 -11638635 - MTD LTR MaLR -135 284 2 8 1660 258 288 118 22 chr5 140906999 140907134 -11630125 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 214 8 1660 290 242 48 57 chr5 140909702 140909807 -11627452 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 9 1660 245 318 0 33 chr5 140926331 140926422 -11610837 - MT2B LTR ERVL -362 239 152 9 1660 1130 207 116 4 chr5 140930079 140930163 -11607096 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 269 9 1660 2274 128 75 22 chr5 140930163 140930563 -11606696 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1660 1130 214 129 6 chr5 140930563 140930782 -11606477 - ORR1D2 LTR MaLR -102 268 2 9 1660 361 221 19 87 chr5 140932513 140932617 -11604642 + MT2B LTR ERVL 163 259 -342 9 1660 247 259 0 33 chr5 140934002 140934062 -11603197 - MT2B LTR ERVL -347 254 197 9 1660 239 282 0 53 chr5 140934003 140934078 -11603181 - RLTR25B LTR ERVK -530 498 428 9 1660 1418 202 60 30 chr5 140938809 140939242 -11598017 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 135 9 1660 951 215 111 106 chr5 140947098 140947457 -11589802 - MTE2a LTR MaLR 0 379 19 1 1660 358 344 77 6 chr5 140953983 140954164 -11583095 - MER74A LTR ERVL -274 284 91 1 1660 1621 202 26 78 chr5 140954239 140954626 -11582633 - MTE2b LTR MaLR -3 376 10 1 1660 405 273 58 90 chr5 140960683 140960872 -11576387 - MT2B LTR ERVL -337 264 82 1 1660 610 235 62 58 chr5 140961745 140962020 -11575239 - MTE2a LTR MaLR -148 231 1 1 1660 401 247 102 71 chr5 140963858 140964054 -11573205 - MLT1A LTR MaLR 0 374 173 1 1660 654 349 32 0 chr5 140964873 140965091 -11572168 - MTE2b LTR MaLR -146 233 9 1 1660 1384 231 11 41 chr5 140966626 140966657 -11570602 - ORR1B1 LTR MaLR -11 356 327 1 1660 1761 158 63 1 chr5 140966759 140967092 -11570167 - ORR1B1 LTR MaLR -45 349 3 1 1660 664 211 139 11 chr5 140972033 140972260 -11564999 + MTD LTR MaLR 149 405 -14 1 1660 3107 121 206 13 chr5 140974005 140974608 -11562651 - RMER19A LTR ERVK -18 719 1 1 1660 390 236 147 33 chr5 140974758 140974942 -11562317 - MLT1A0 LTR MaLR -77 288 84 1 1660 1892 78 65 3 chr5 140974955 140975264 -11561995 - RLTR11B LTR ERVK -8 445 118 1 1660 864 126 0 0 chr5 140975437 140975572 -11561687 - RLTR11B LTR ERVK -318 135 1 1 1660 225 252 8 39 chr5 140976152 140976280 -11560979 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 631 1 1660 407 238 273 32 chr5 140978323 140978639 -11558620 + MTD LTR MaLR 28 419 0 1 1660 1406 174 33 72 chr5 140978826 140979161 -11558098 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1660 437 281 125 60 chr5 140980153 140980369 -11556890 + MLT1C LTR MaLR 2 231 -236 1 1660 1430 251 94 7 chr5 140992465 140992899 -11544360 + RMER5 LTR ERV1 63 534 0 1 1660 334 215 8 4 chr5 140992913 140992988 -11544271 - MLT2B4 LTR ERVL -325 89 13 1 1660 282 300 0 62 chr5 141003208 141003304 -11533955 - MTEb LTR MaLR -56 323 234 1 1660 3629 170 70 11 chr5 141004149 141004802 -11532457 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 1 1660 2685 125 42 36 chr5 141005773 141006245 -11531014 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1660 24440 8 21 0 chr5 141006245 141009141 -11528118 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 1 1660 870 96 24 0 chr5 141009141 141009266 -11527993 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 1 1660 1711 123 4 4 chr5 141009261 141009523 -11527736 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 1 1660 445 66 0 32 chr5 141009512 141009575 -11527684 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 1 1660 3304 95 17 42 chr5 141009575 141010389 -11526870 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 17 1 1660 260 83 0 0 chr5 141010389 141010425 -11526834 - IAPEz-int LTR ERVK -1949 38 3 1 1660 2689 125 42 36 chr5 141010427 141010899 -11526360 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1660 3314 53 5 2 chr5 141018374 141018773 -11518486 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1660 2310 61 109 0 chr5 141021183 141021477 -11515782 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 5 1660 1620 202 19 25 chr5 141027291 141027652 -11509607 - MTD LTR MaLR -16 403 45 7 1661 381 225 0 73 chr5 141034264 141034278 -11502981 + MT2B LTR ERVL 152 240 -361 9 1661 4453 20 2 0 chr5 141034360 141034852 -11502407 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 9 1661 354 179 46 35 chr5 141034890 141034977 -11502282 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 9 1661 21366 20 0 0 chr5 141034977 141037459 -11499800 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 2878 9 1661 4453 20 2 0 chr5 141037472 141037964 -11499295 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 9 1661 404 309 83 81 chr5 141039730 141040138 -11497121 + RMER17C LTR ERVK 1 409 -1 1 1661 930 221 173 76 chr5 141052394 141052437 -11484822 - MTD LTR MaLR 0 419 383 1 1661 930 221 173 76 chr5 141052624 141052962 -11484297 - MTD LTR MaLR -37 382 1 1 1661 329 186 67 34 chr5 141056907 141056996 -11480263 - MT2B LTR ERVL -344 257 166 1 1661 232 234 48 144 chr5 141058757 141058882 -11478377 + LTR87 LTR ERVL? 50 162 -462 1 1661 1910 122 60 14 chr5 141061556 141061676 -11475583 + ORR1B1 LTR MaLR 30 149 -245 1 1661 1910 122 60 14 chr5 141061721 141061949 -11475310 + ORR1B1 LTR MaLR 150 392 -2 1 1661 530 252 31 76 chr5 141063202 141063425 -11473834 - RLTR18-int LTR ERVK -5146 215 3 1 1661 2649 156 103 43 chr5 141063454 141063572 -11473687 - RLTR18 LTR ERVK -2 614 491 1 1661 2649 156 103 43 chr5 141063726 141064171 -11473088 - RLTR18 LTR ERVK -126 490 17 1 1661 1848 144 65 15 chr5 141064171 141064508 -11472751 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 1661 429 236 115 82 chr5 141079496 141079518 -11457741 - MT2B LTR ERVL -315 286 242 2 1661 429 236 115 82 chr5 141079626 141079704 -11457555 - MT2B LTR ERVL -315 241 72 2 1661 229 306 83 83 chr5 141102539 141102585 -11434674 - MT2B2 LTR ERVL -235 349 260 2 1661 229 306 83 83 chr5 141102706 141102781 -11434478 - MT2B2 LTR ERVL -235 259 108 2 1661 255 360 25 81 chr5 141108257 141108417 -11428842 - RMER12 LTR ERVK -423 899 749 2 1661 244 321 103 35 chr5 141112102 141112276 -11424983 - MT2A LTR ERVL -83 450 265 2 1661 290 248 37 157 chr5 141114813 141114947 -11422312 + MT2B LTR ERVL 137 254 -347 2 1661 2266 163 34 15 chr5 141116365 141116776 -11420483 - MTC LTR MaLR -2 419 1 2 1661 241 328 61 9 chr5 141120918 141121032 -11416227 + MLT1H-int LTR MaLR 831 950 -459 2 1661 1106 94 71 6 chr5 141131007 141131189 -11406070 + MTC LTR MaLR 2 195 -226 3 1661 1219 140 98 4 chr5 141131357 141131576 -11405683 + MTC LTR MaLR 181 421 0 3 1661 228 286 0 31 chr5 141138418 141138483 -11398776 + RMER4A LTR ERVK 362 424 -42 3 1661 1025 266 78 24 chr5 141154958 141155328 -11381931 + RMER5 LTR ERV1 47 436 -98 3 1661 2246 144 60 18 chr5 141161477 141161859 -11375400 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 3 1662 235 235 189 69 chr5 141164850 141165083 -11372176 - RLTR21 LTR ERVK -299 1273 1013 4 1662 1887 184 152 58 chr5 141173823 141174341 -11362918 + RMER15 LTR ERVL 9 575 0 4 1662 342 169 55 27 chr5 141179245 141179318 -11357941 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 354 4 1662 625 172 143 115 chr5 141179643 141179789 -11357470 - RLTR23 LTR ERV1 -63 367 210 4 1662 625 172 143 115 chr5 141179825 141179895 -11357364 - RLTR23 LTR ERV1 -221 209 145 4 1662 250 317 0 106 chr5 141187844 141187881 -11349378 + MT2B LTR ERVL 134 234 -367 4 1662 1490 240 108 28 chr5 141191642 141192105 -11345154 - RLTR11A LTR ERVK -28 500 1 4 1662 768 244 98 5 chr5 141193515 141193729 -11343530 - MTEa LTR MaLR 0 379 146 4 1662 1235 240 209 40 chr5 141195233 141196047 -11341212 - ORR1B2-int LTR MaLR -87 1011 1 4 1662 1105 139 377 8 chr5 141196084 141196352 -11340907 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 4 1662 851 241 65 19 chr5 141196729 141196991 -11340268 - MTEb LTR MaLR -46 333 60 4 1662 1616 252 25 0 chr5 141197397 141197762 -11339497 - MTC LTR MaLR -8 413 40 4 1662 243 302 46 11 chr5 141197885 141197972 -11339287 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 311 4 1662 311 321 44 98 chr5 141205288 141205414 -11331845 - MT2B LTR ERVL -319 282 168 5 1662 311 321 44 98 chr5 141205440 141205517 -11331742 - MT2B LTR ERVL -434 167 90 5 1662 967 303 41 64 chr5 141209347 141209735 -11327524 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1662 281 277 60 60 chr5 141229479 141229655 -11307604 - MTE2b LTR MaLR -7 372 206 5 1662 1008 228 190 13 chr5 141238762 141239073 -11298186 + MTD LTR MaLR 40 405 -14 6 1662 675 264 81 6 chr5 141261699 141262035 -11275224 + MTD LTR MaLR 27 419 0 6 1662 262 214 31 125 chr5 141265445 141265541 -11271718 + MT2B2 LTR ERVL 155 241 -343 6 1662 571 311 96 22 chr5 141272416 141272686 -11264573 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 68 6 1662 596 251 109 1 chr5 141274009 141274261 -11262998 + MLT2B1 LTR ERVL 266 562 -5 6 1662 251 266 0 15 chr5 141275595 141275660 -11261599 - RLTR15 LTR ERVK -295 64 1 7 1662 635 306 132 32 chr5 141277296 141277607 -11259652 + MER74A LTR ERVL 20 361 -197 7 1662 226 326 116 41 chr5 141286368 141286515 -11250744 - LTR33 LTR ERVL -334 181 24 7 1662 1870 164 15 39 chr5 141290219 141290626 -11246633 + RMER17C LTR ERVK 1 397 -13 7 1663 291 305 53 116 chr5 141297165 141297354 -11239905 + MT2B LTR ERVL 89 265 -336 7 1663 1357 217 127 16 chr5 141308793 141309143 -11228116 - MTD LTR MaLR -4 415 2 7 1663 1280 197 63 72 chr5 141311414 141311781 -11225478 + RLTR20C LTR ERVK 1 446 -105 8 1663 529 216 118 26 chr5 141311805 141311890 -11225369 + RLTR20C LTR ERVK 447 542 -9 8 1663 1520 177 110 7 chr5 141311905 141312195 -11225064 - ORR1B2 LTR MaLR -46 321 2 8 1663 1118 231 184 0 chr5 141312448 141312747 -11224512 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 8 1663 1109 266 90 26 chr5 141314470 141314531 -11222728 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 308 8 1663 1109 266 90 26 chr5 141314559 141314841 -11222418 - ORR1D2 LTR MaLR -63 307 1 8 1663 374 336 104 7 chr5 141314978 141315113 -11222146 - MLT1A1 LTR MaLR -196 212 65 8 1663 2990 100 4 24 chr5 141315782 141316232 -11221027 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 8 1663 391 192 29 29 chr5 141316865 141316967 -11220292 + MTEa LTR MaLR 278 379 0 8 1663 1078 293 32 52 chr5 141317022 141317425 -11219834 - MLT2D LTR ERVL -8 406 12 8 1663 265 184 293 10 chr5 141318874 141318973 -11218286 + RMER15 LTR ERVL 4 130 -445 8 1663 1023 282 43 27 chr5 141318998 141319297 -11217962 + RMER15 LTR ERVL 272 575 0 8 1663 1106 220 115 99 chr5 141320093 141320466 -11216793 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 8 1663 718 326 26 89 chr5 141325735 141326040 -11211219 + MT2A LTR ERVL 170 467 -66 8 1663 718 326 26 89 chr5 141326384 141326459 -11210800 + MT2A LTR ERVL 468 526 -7 8 1663 577 291 123 57 chr5 141326958 141327290 -11209969 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 8 1663 241 390 55 90 chr5 141327967 141328313 -11208946 - ORR1E LTR MaLR -25 334 1 8 1663 233 276 166 43 chr5 141329945 141330108 -11207151 - RMER15 LTR ERVL -15 560 378 8 1663 4458 24 0 0 chr5 141336843 141337336 -11199923 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 8 1663 39317 16 14 0 chr5 141337336 141342623 -11194636 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 8 1663 332 158 71 35 chr5 141342623 141342708 -11194551 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 8 1663 297 0 0 0 chr5 141342708 141342746 -11194513 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 8 1663 4458 24 0 0 chr5 141342746 141343239 -11194020 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 8 1663 2206 137 73 0 chr5 141344234 141344576 -11192683 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 8 1663 451 322 137 18 chr5 141355007 141355285 -11181974 + RMER15 LTR ERVL 250 560 -15 9 1663 3298 53 0 8 chr5 141369846 141370245 -11167014 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1663 1311 201 103 52 chr5 141382985 141383242 -11154017 + MTE2b LTR MaLR 19 293 -86 9 1663 1311 212 96 53 chr5 141383282 141383368 -11153891 + MTE2b LTR MaLR 283 370 0 9 1663 250 149 21 0 chr5 141384841 141384888 -11152371 - MTD LTR MaLR 0 419 372 9 1663 1088 228 188 9 chr5 141386058 141386377 -11150882 + ORR1E LTR MaLR 1 376 -3 9 1663 239 215 36 60 chr5 141386661 141386745 -11150514 + MLT1A1 LTR MaLR 327 408 0 9 1663 503 254 15 15 chr5 141388660 141388796 -11148463 + RMER15 LTR ERVL 305 440 -135 9 1663 1010 249 81 107 chr5 141391313 141391695 -11145564 - MTE2a LTR MaLR -7 372 1 9 1663 1540 217 54 12 chr5 141393767 141394098 -11143161 - ORR1E LTR MaLR -12 347 3 1 1663 1113 226 83 128 chr5 141399639 141399695 -11137564 + MTE2a LTR MaLR 1 54 -325 1 1663 1113 226 83 128 chr5 141399890 141400230 -11137029 + MTE2a LTR MaLR 55 379 0 1 1663 1035 242 196 0 chr5 141403321 141403627 -11133632 + MTE2b LTR MaLR 1 366 -13 1 1663 703 314 58 73 chr5 141405521 141405902 -11131357 + MTEb LTR MaLR 1 375 -4 1 1663 379 264 59 53 chr5 141409366 141409518 -11127741 + MLT1J LTR MaLR 2 154 -358 1 1663 729 243 18 12 chr5 141410369 141410540 -11126719 - MTEa LTR MaLR -18 361 190 1 1663 576 287 113 46 chr5 141410728 141410863 -11126396 - MTEa LTR MaLR -198 161 2 1 1663 427 291 80 0 chr5 141411472 141411625 -11125634 - MTE2b LTR MaLR -73 306 141 1 1663 282 274 70 23 chr5 141418084 141418170 -11119089 + MTE2a LTR MaLR 1 90 -289 1 1663 1198 274 30 20 chr5 141418462 141418760 -11118499 + MTE2a LTR MaLR 78 378 -1 1 1663 1180 208 105 58 chr5 141426138 141426480 -11110779 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 1 1663 277 206 63 0 chr5 141426515 141426578 -11110681 + MLT1C LTR MaLR 64 130 -337 1 1664 443 290 122 12 chr5 141428109 141428273 -11108986 + MLT2B2 LTR ERVL 3 184 -331 1 1664 1264 199 76 0 chr5 141428349 141428611 -11108648 + MTEb LTR MaLR 98 379 0 1 1664 382 262 184 0 chr5 141428617 141428775 -11108484 + MLT2B2 LTR ERVL 225 455 -107 1 1664 782 245 209 98 chr5 141431703 141431885 -11105374 - MTEa LTR MaLR -7 372 198 1 1664 782 245 209 98 chr5 141431906 141432058 -11105201 - MTEa LTR MaLR -182 197 1 1 1664 397 294 18 9 chr5 141449009 141449119 -11088140 + MLT1A1 LTR MaLR 1 111 -279 1 1664 832 260 44 96 chr5 141449848 141450127 -11087132 - MTE2a LTR MaLR -117 262 19 1 1664 606 207 49 8 chr5 141452051 141452173 -11085086 - MTD LTR MaLR -7 412 286 1 1664 910 264 105 19 chr5 141452179 141452492 -11084767 - MTD LTR MaLR -75 344 5 1 1664 525 259 47 9 chr5 141452535 141452694 -11084565 + MLT1A1 LTR MaLR 212 408 0 1 1664 734 297 43 77 chr5 141455145 141455495 -11081764 + ORR1E LTR MaLR 22 359 0 1 1664 483 252 48 0 chr5 141455903 141456006 -11081253 - MTEa LTR MaLR -269 110 3 1 1664 427 240 112 51 chr5 141456857 141457072 -11080187 + RLTR15 LTR ERVK 1 228 -131 1 1664 2252 134 123 10 chr5 141458633 141459047 -11078212 - RMER4A LTR ERVK 0 466 6 1 1664 633 329 5 32 chr5 141460502 141460568 -11076691 - MTEa LTR MaLR 0 379 313 1 1664 975 237 101 71 chr5 141460568 141460936 -11076323 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1664 633 329 5 32 chr5 141460936 141461089 -11076170 - MTEa LTR MaLR -67 312 166 1 1664 1057 257 158 14 chr5 141462370 141462717 -11074542 - MTD LTR MaLR -14 405 9 1 1664 423 230 124 15 chr5 141463237 141463374 -11073885 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 257 1 1664 288 188 0 184 chr5 141467416 141467514 -11069745 + MT2B LTR ERVL 179 258 -343 1 1664 1034 197 70 29 chr5 141467693 141467934 -11069325 - ORR1D1 LTR MaLR -122 252 2 1 1664 1074 253 37 14 chr5 141469716 141470013 -11067246 + RMER20A LTR ERVK 213 516 0 1 1664 1006 257 36 7 chr5 141481240 141481518 -11055741 - RMER15 LTR ERVL -3 572 287 1 1664 1742 189 36 12 chr5 141481814 141482010 -11055249 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 186 1 1664 1742 189 36 12 chr5 141482064 141482199 -11055060 - ORR1C2 LTR MaLR -199 185 45 1 1664 945 250 252 7 chr5 141484471 141484773 -11052486 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 1 1664 1762 214 52 25 chr5 141486505 141486908 -11050351 + MTD LTR MaLR 6 419 0 1 1664 1086 237 52 85 chr5 141491917 141492365 -11044894 - MTD LTR MaLR 0 379 5 1 1664 424 213 148 0 chr5 141496210 141496332 -11040927 + RMER15 LTR ERVL 422 561 -14 1 1664 294 234 39 169 chr5 141496346 141496500 -11040759 + MTEb LTR MaLR 202 335 -44 1 1664 742 261 64 170 chr5 141497016 141497440 -11039819 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1664 4868 157 36 61 chr5 141497554 141498458 -11038801 - RLTR25A LTR ERVK -2 1026 114 1 1664 4868 145 27 55 chr5 141498506 141498639 -11038620 - RLTR25A LTR ERVK -988 115 2 1 1664 723 253 335 8 chr5 141498856 141499156 -11038103 + MTD LTR MaLR 20 404 -15 1 1664 579 284 148 58 chr5 141500522 141500847 -11036412 + ORR1E LTR MaLR 2 355 -4 2 1664 1386 168 304 30 chr5 141500944 141501306 -11035953 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 3 1664 888 310 149 6 chr5 141501531 141501859 -11035400 + MTEa LTR MaLR 2 376 -3 5 1664 289 289 56 0 chr5 141501969 141502059 -11035200 + MLT1C LTR MaLR 302 396 -71 6 1664 719 250 11 14 chr5 141502224 141502442 -11034817 + MTD LTR MaLR 1 187 -192 7 1664 1139 265 96 7 chr5 141502440 141502766 -11034493 + MTD LTR MaLR 56 404 -15 8 1664 585 297 146 56 chr5 141503385 141503742 -11033517 + MLT1B LTR MaLR 2 390 0 1 1664 599 291 115 85 chr5 141507427 141507454 -11029805 + ORR1E LTR MaLR 2 27 -332 2 1664 2216 95 30 65 chr5 141507454 141507792 -11029467 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 2 1664 1014 254 158 21 chr5 141507801 141508131 -11029128 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 2 1664 599 291 115 85 chr5 141508131 141508240 -11029019 + ORR1E LTR MaLR 33 152 -207 2 1664 2587 132 21 40 chr5 141508240 141508666 -11028593 + MTC LTR MaLR 3 420 -1 2 1664 599 291 115 85 chr5 141508666 141508849 -11028410 + ORR1E LTR MaLR 153 342 -17 2 1664 679 329 46 25 chr5 141509120 141509404 -11027855 - MLT1H LTR MaLR -250 299 10 2 1664 303 268 71 99 chr5 141517872 141518083 -11019176 - ORR1D2 LTR MaLR -57 313 109 4 1664 305 247 21 105 chr5 141518295 141518390 -11018869 + MLT1C LTR MaLR 36 122 -345 4 1664 681 228 27 0 chr5 141518531 141518678 -11018581 + MTEa LTR MaLR 58 208 -171 4 1664 236 207 106 35 chr5 141518678 141518763 -11018496 + MTE2a LTR MaLR 1 91 -288 4 1664 495 287 108 42 chr5 141518810 141519050 -11018209 + MTE2a LTR MaLR 74 329 -50 4 1664 342 297 112 98 chr5 141519052 141519257 -11018002 + MLT1C LTR MaLR 253 460 -7 4 1664 1900 200 61 37 chr5 141521567 141522029 -11015230 + RLTR11A LTR ERVK 35 507 -21 5 1664 265 274 70 64 chr5 141522835 141522991 -11014268 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1281 1437 -411 5 1664 1286 265 96 63 chr5 141526554 141527065 -11010194 + RMER5 LTR ERV1 1 528 -6 7 1664 1764 186 59 25 chr5 141532636 141532994 -11004265 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 15 9 1664 1027 251 57 38 chr5 141533710 141534002 -11003257 + ORR1E LTR MaLR 1 320 -59 9 1664 357 293 101 60 chr5 141536958 141537176 -11000083 - RMER15 LTR ERVL -3 572 346 1 1664 712 348 68 22 chr5 141539831 141540198 -10997061 + MLT1F LTR MaLR 47 430 -118 1 1664 1203 198 67 160 chr5 141540210 141540655 -10996604 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 1 1664 571 312 61 58 chr5 141540913 141541223 -10996036 + MTE-int LTR MaLR 211 521 -1059 1 1664 565 330 101 64 chr5 141541233 141541579 -10995680 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1664 529 279 198 103 chr5 141541684 141542023 -10995236 - MTD LTR MaLR 0 379 9 1 1664 2147 114 30 39 chr5 141545077 141545407 -10991852 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1664 591 295 50 52 chr5 141546603 141546924 -10990335 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 1 1664 231 215 14 71 chr5 141548401 141548471 -10988788 - MLT1K LTR MaLR 0 595 530 1 1664 1149 241 37 30 chr5 141548882 141549102 -10988157 - MTD LTR MaLR -148 271 44 1 1664 4519 10 2 0 chr5 141549102 141549594 -10987665 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1664 1149 241 37 30 chr5 141549594 141549642 -10987617 - MTD LTR MaLR -376 43 1 1 1664 339 197 0 0 chr5 141555665 141555726 -10981533 - MTD LTR MaLR 0 419 359 1 1665 483 220 120 8 chr5 141559745 141559878 -10977381 + ORR1E LTR MaLR 22 169 -190 1 1665 668 268 134 68 chr5 141560181 141560517 -10976742 - ORR1E LTR MaLR -1 358 1 1 1665 239 271 43 0 chr5 141561886 141561956 -10975303 - MER74B LTR ERVL -197 425 353 1 1665 390 288 222 17 chr5 141562132 141562312 -10974947 - RMER15 LTR ERVL 0 575 359 1 1665 1016 251 114 19 chr5 141563076 141563393 -10973866 - ORR1E LTR MaLR -2 357 11 1 1665 2385 179 34 50 chr5 141566389 141566441 -10970818 - RLTR20B3 LTR ERVK -42 535 483 2 1665 2385 179 34 50 chr5 141566488 141566958 -10970301 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 23 2 1665 918 275 139 36 chr5 141573199 141573501 -10963758 - MTE2a LTR MaLR -46 333 1 2 1665 257 358 92 7 chr5 141579218 141579370 -10957889 + MER74A LTR ERVL 309 473 -85 2 1665 236 343 19 10 chr5 141579482 141579585 -10957674 - RMER15 LTR ERVL -129 446 343 2 1665 1774 137 21 71 chr5 141584409 141584748 -10952511 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1665 418 218 0 22 chr5 141586850 141586939 -10950320 - ORR1E LTR MaLR -4 375 289 2 1665 1012 209 77 133 chr5 141586961 141587336 -10949923 - ORR1D2 LTR MaLR -12 358 5 2 1665 695 250 178 24 chr5 141587335 141587548 -10949711 - ORR1E LTR MaLR -113 246 1 2 1665 1095 242 80 111 chr5 141587554 141587940 -10949319 - MTE2a LTR MaLR -1 378 5 2 1665 1253 279 60 55 chr5 141588921 141589338 -10947921 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1665 408 253 77 0 chr5 141597088 141597179 -10940080 + MTE2b LTR MaLR 1 98 -281 2 1665 929 232 27 11 chr5 141597179 141597366 -10939893 + MTE2b LTR MaLR 58 247 -132 2 1665 241 272 65 0 chr5 141599895 141599987 -10937272 - MLT1B LTR MaLR -288 102 5 2 1665 429 292 48 66 chr5 141604540 141604767 -10932492 + RMER12 LTR ERVK 770 992 -330 3 1665 326 305 56 19 chr5 141609013 141609120 -10928139 - ORR1E LTR MaLR -4 355 245 3 1665 337 323 65 92 chr5 141609712 141609896 -10927363 - ORR1E LTR MaLR -185 189 11 3 1665 333 294 57 25 chr5 141611343 141611500 -10925759 - MER92B LTR ERV1 -112 524 363 3 1665 1010 257 91 112 chr5 141617828 141618533 -10918726 - RMER13B LTR ERVK -10 898 276 3 1665 683 266 102 24 chr5 141627928 141628017 -10909242 - MTE2a LTR MaLR -49 351 231 3 1665 683 269 87 29 chr5 141628061 141628282 -10908977 - MTE2a LTR MaLR -186 235 26 3 1665 789 263 49 148 chr5 141631185 141631591 -10905668 + MTE2a LTR MaLR 14 379 0 3 1665 863 273 9 24 chr5 141638213 141638423 -10898836 - MTE2a LTR MaLR -154 225 19 3 1665 351 302 29 73 chr5 141638590 141638726 -10898533 - MTEa LTR MaLR -200 179 50 3 1665 1691 114 136 35 chr5 141640919 141641265 -10895994 + ORR1B1 LTR MaLR 6 386 -8 3 1665 357 271 117 50 chr5 141642345 141642524 -10894735 - MTEa LTR MaLR 0 379 189 4 1665 976 244 38 11 chr5 141644547 141644808 -10892451 + MTEb LTR MaLR 1 268 -111 4 1665 324 313 178 1 chr5 141647327 141647538 -10889721 + MLT1H1 LTR MaLR 24 272 -283 4 1665 429 318 36 21 chr5 141647810 141648003 -10889256 + MLT1H1 LTR MaLR 346 541 -14 4 1665 241 270 40 0 chr5 141652447 141652521 -10884738 + RMER15 LTR ERVL 434 510 -65 4 1665 1542 153 126 30 chr5 141653131 141653503 -10883756 - ORR1B2 LTR MaLR 0 370 2 4 1665 1119 252 41 19 chr5 141653743 141654058 -10883201 + MTE2b LTR MaLR 19 340 -39 4 1665 1669 198 123 3 chr5 141658016 141658390 -10878869 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1665 1801 195 46 19 chr5 141662945 141663317 -10873942 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 4 1665 845 205 112 54 chr5 141665349 141665591 -10871668 - MTE2a LTR MaLR -14 365 110 4 1665 437 233 6 175 chr5 141665833 141666010 -10871249 - MTE2a LTR MaLR -232 147 1 4 1665 1429 244 49 19 chr5 141666499 141666867 -10870392 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 4 1665 420 337 17 39 chr5 141670691 141670870 -10866389 + MLT1B LTR MaLR 177 351 -39 5 1665 487 273 206 29 chr5 141671093 141671365 -10865894 + ORR1E LTR MaLR 29 348 -11 5 1665 491 264 40 34 chr5 141671379 141671528 -10865731 - RMER15 LTR ERVL 0 575 426 5 1665 2485 154 10 5 chr5 141674989 141675407 -10861852 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 5 1665 3295 48 2 5 chr5 141677304 141677701 -10859558 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1665 225 327 0 81 chr5 141677821 141677944 -10859315 - RMER12 LTR ERVK -472 850 738 5 1665 564 304 223 10 chr5 141679799 141680095 -10857164 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 5 1665 1523 168 32 181 chr5 141681920 141682357 -10854902 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 5 1665 1193 225 56 43 chr5 141684213 141684539 -10852720 + MTD LTR MaLR 1 318 -82 5 1666 1681 209 55 8 chr5 141688892 141689253 -10848006 + MTE2b LTR MaLR 1 378 -1 5 1666 576 272 25 31 chr5 141692864 141693027 -10844232 + RMER15 LTR ERVL 277 438 -137 5 1666 419 288 17 52 chr5 141693036 141693208 -10844051 + RMER15 LTR ERVL 396 561 -14 5 1666 787 360 78 12 chr5 141693220 141693628 -10843631 + MER74A LTR ERVL 122 556 -2 5 1666 5739 209 30 12 chr5 141693803 141694915 -10842344 + ORR1D1-int LTR MaLR 239 1370 0 5 1666 1784 146 43 150 chr5 141694915 141695334 -10841925 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1666 1267 247 77 21 chr5 141697451 141697840 -10839419 + BGLII_B LTR ERVK 28 438 -3 5 1666 1120 263 81 24 chr5 141699829 141700164 -10837095 - MLT1B LTR MaLR -35 355 2 5 1666 1921 170 7 98 chr5 141700611 141701049 -10836210 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 5 1666 256 307 78 8 chr5 141701094 141701222 -10836037 - RMER17C-int LTR ERVK -75 3163 3027 5 1666 313 261 21 54 chr5 141701235 141701328 -10835931 - RMER17C-int LTR ERVK -264 2974 2885 5 1666 2521 185 46 36 chr5 141701340 141701839 -10835420 - RMER20A LTR ERVK 0 516 13 5 1666 839 210 48 85 chr5 141701846 141702117 -10835142 - RMER17C-int LTR ERVK -370 2868 2608 5 1666 278 278 36 36 chr5 141702323 141702435 -10834824 - RLTR19-int LTR ERVK -2829 3308 3197 5 1666 423 245 27 48 chr5 141702490 141702636 -10834623 - MYSERV6-int LTR ERVK -271 8688 8546 5 1666 367 319 100 56 chr5 141702729 141703048 -10834211 - ORR1E LTR MaLR -23 336 4 5 1666 2503 156 27 2 chr5 141706970 141707381 -10829878 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1666 6354 167 45 26 chr5 141707383 141708616 -10828643 - MTC-int LTR MaLR -2 1256 1 6 1666 2294 158 9 16 chr5 141708616 141709040 -10828219 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1666 299 152 0 0 chr5 141728724 141728770 -10808489 - MTC LTR MaLR -5 414 369 6 1666 629 121 20 0 chr5 141728769 141728868 -10808391 - MTC LTR MaLR -231 190 90 6 1666 2656 148 22 22 chr5 141738030 141738494 -10798765 - RMER4A LTR ERVK 0 466 3 6 1666 574 322 34 29 chr5 141745226 141745431 -10791828 - MLT1E2 LTR MaLR -179 448 243 6 1666 905 240 71 112 chr5 141745672 141746066 -10791193 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 6 1666 979 223 112 117 chr5 141749702 141750078 -10787181 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 6 1666 1344 222 77 28 chr5 141767050 141767403 -10769856 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1666 1194 256 76 22 chr5 141779869 141780225 -10757034 - MTEa LTR MaLR -4 375 1 7 1666 1872 166 91 43 chr5 141802191 141802402 -10734857 + ORR1B1 LTR MaLR 1 204 -190 7 1666 1872 158 90 48 chr5 141803067 141803254 -10734005 + ORR1B1 LTR MaLR 205 394 0 7 1666 1129 333 65 28 chr5 141817500 141817983 -10719276 + MLT1F LTR MaLR 1 521 -39 7 1667 1139 242 129 21 chr5 141825811 141826240 -10711019 - MTC-int LTR MaLR -462 796 245 8 1667 317 188 11 101 chr5 141826220 141826309 -10710950 + MTD-int LTR MaLR 387 467 -791 8 1667 1320 237 93 117 chr5 141826303 141826809 -10710450 + MTD-int LTR MaLR 765 1258 0 8 1667 1880 209 39 15 chr5 141826809 141827218 -10710041 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1667 383 314 64 62 chr5 141830001 141830436 -10706823 + MLT1C LTR MaLR 1 497 -8 8 1667 654 299 96 32 chr5 141830442 141830819 -10706440 + MLT1C-int LTR MaLR 6 406 -1083 8 1667 419 302 81 103 chr5 141831277 141831598 -10705661 + MLT1C LTR MaLR 61 374 -16 8 1667 358 312 8 16 chr5 141834377 141834504 -10702755 - MLT1H1 LTR MaLR -6 549 424 8 1667 635 262 317 24 chr5 141853016 141853309 -10683950 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 8 1667 2389 155 50 10 chr5 141868155 141868558 -10668701 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 8 1667 364 295 50 119 chr5 141873306 141873583 -10663676 - ORR1E LTR MaLR -6 353 96 8 1667 1252 223 112 12 chr5 141881791 141882131 -10655128 + MTEa LTR MaLR 4 377 -2 8 1667 1061 239 76 65 chr5 141885324 141885458 -10651801 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 223 8 1667 1061 239 76 65 chr5 141885515 141885747 -10651512 - ORR1D1 LTR MaLR -152 222 1 8 1667 244 274 16 0 chr5 141912537 141912599 -10624660 + MLT1D LTR MaLR 114 176 -329 9 1667 753 301 33 70 chr5 141914386 141914815 -10622444 - BGLII_B LTR ERVK -27 414 2 9 1667 380 279 21 104 chr5 141915024 141915168 -10622091 - ORR1E LTR MaLR -221 138 7 9 1667 449 279 126 52 chr5 141916575 141916946 -10620313 - MT2A LTR ERVL 0 554 93 9 1667 350 294 33 8 chr5 141917625 141917745 -10619514 - LTR33 LTR ERVL 0 515 393 9 1667 2481 107 96 0 chr5 141924940 141925324 -10611935 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1667 3568 10 5 0 chr5 141936935 141937329 -10599930 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1667 426 290 61 65 chr5 141947072 141947286 -10589973 - ORR1E LTR MaLR -6 353 141 9 1667 423 285 50 14 chr5 141948013 141948152 -10589107 - MTD LTR MaLR -2 417 274 9 1667 412 226 129 73 chr5 141948169 141948293 -10588966 - MTD LTR MaLR -244 175 19 9 1667 903 185 283 37 chr5 141950281 141950578 -10586681 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1668 1770 142 113 31 chr5 141953505 141953684 -10583575 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 185 1 1668 1770 142 113 31 chr5 141953760 141953935 -10583324 - ORR1C2 LTR MaLR -200 184 1 1 1668 515 309 122 23 chr5 141960184 141960712 -10576547 - MLT1E2 LTR MaLR -22 658 2 1 1668 325 242 104 45 chr5 141970024 141970158 -10567101 + MLT1D LTR MaLR 40 181 -324 1 1668 246 254 52 73 chr5 141970634 141970770 -10566489 - MLT1A1 LTR MaLR -275 133 1 1 1668 457 279 96 19 chr5 141970812 141970969 -10566290 + MLT1D LTR MaLR 337 505 0 1 1668 1011 229 147 20 chr5 141971318 141971666 -10565593 + MTD LTR MaLR 13 404 -15 1 1668 1521 227 119 26 chr5 141979904 141980289 -10556970 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1668 1704 161 122 19 chr5 141999122 141999484 -10537775 - MTC LTR MaLR -20 401 3 1 1668 345 299 94 19 chr5 142018040 142018200 -10519059 - MLT1A LTR MaLR 0 390 219 1 1668 423 241 17 8 chr5 142024985 142025102 -10512157 + LTR16D1 LTR ERVL 541 658 -17 2 1668 1074 258 68 18 chr5 142028116 142028455 -10508804 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 3 1668 1710 136 175 62 chr5 142053666 142054020 -10483239 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1668 2900 72 5 56 chr5 142055892 142056336 -10480923 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 7 1668 1963 209 10 20 chr5 142056388 142056794 -10480465 - MTD LTR MaLR 0 419 18 7 1668 873 268 117 3 chr5 142065039 142065340 -10471919 - MTE2b LTR MaLR -44 335 1 8 1668 1112 236 63 16 chr5 142068534 142068853 -10468406 - MTE2b LTR MaLR -4 375 72 9 1668 2492 178 15 16 chr5 142068853 142069356 -10467903 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 1 9 1668 277 320 0 10 chr5 142069356 142069443 -10467816 - MTE2b LTR MaLR -293 86 1 9 1669 2012 116 0 51 chr5 142084103 142084438 -10452821 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 1 1669 904 260 95 33 chr5 142085402 142085708 -10451551 - ORR1E LTR MaLR -34 325 1 1 1669 365 174 16 114 chr5 142093400 142093523 -10443736 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 1 1669 1487 110 62 115 chr5 142099282 142099621 -10437638 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 1 1669 1115 264 44 13 chr5 142099625 142099943 -10437316 + MTE2b LTR MaLR 1 328 -51 1 1669 1668 179 57 60 chr5 142100149 142100534 -10436725 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1669 1079 235 79 55 chr5 142105691 142106034 -10431225 - MTE2a LTR MaLR -13 366 16 1 1669 1072 162 193 180 chr5 142106039 142106490 -10430769 + MT2A LTR ERVL 3 459 -74 1 1669 257 113 0 16 chr5 142106570 142106633 -10430626 + MT2A LTR ERVL 465 526 -7 1 1669 249 270 0 0 chr5 142112092 142112155 -10425104 - MLT1A1 LTR MaLR -284 124 62 1 1669 524 256 14 14 chr5 142112804 142112943 -10424316 - ORR1E LTR MaLR -1 378 240 1 1669 634 281 44 22 chr5 142113106 142113335 -10423924 - ORR1E LTR MaLR -111 248 15 1 1669 2498 44 2 175 chr5 142115684 142116153 -10421106 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 1669 17433 24 0 0 chr5 142116165 142118109 -10419150 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1984 -3 1 1669 2751 32 25 148 chr5 142118111 142118556 -10418703 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1669 629 217 40 80 chr5 142127217 142127417 -10409842 - ORR1D1 LTR MaLR -175 199 8 1 1669 2046 174 161 8 chr5 142129353 142129868 -10407391 - MT2B LTR ERVL 0 601 8 1 1669 1926 200 44 20 chr5 142137047 142137543 -10399716 - RLTR11A LTR ERVK -4 524 1 1 1669 2196 137 26 0 chr5 142140044 142140423 -10396836 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 6 2 1669 432 149 14 0 chr5 142143997 142144071 -10393188 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 453 2 1669 2340 73 41 0 chr5 142151497 142151811 -10385448 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1669 1891 81 131 65 chr5 142162063 142162369 -10374890 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 1669 791 268 52 157 chr5 142164461 142164861 -10372398 + MTE2b LTR MaLR 1 357 -22 2 1669 791 268 52 157 chr5 142164997 142165017 -10372242 + MTE2b LTR MaLR 358 377 -2 2 1669 1092 241 127 14 chr5 142167014 142167344 -10369915 + ORR1D2 LTR MaLR 3 394 0 2 1669 264 174 0 0 chr5 142168896 142168942 -10368317 - MLT1H2 LTR MaLR -378 111 66 2 1669 333 156 62 0 chr5 142170340 142170404 -10366855 - MTE2a LTR MaLR 0 379 312 2 1669 2313 87 15 61 chr5 142172084 142172427 -10364832 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1669 3485 18 5 5 chr5 142173773 142174169 -10363090 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1669 398 362 78 68 chr5 142175958 142176358 -10360901 + MER34A LTR ERV1 56 459 -112 2 1669 309 277 52 26 chr5 142176610 142176725 -10360534 + MER34A LTR ERV1 454 571 0 2 1669 850 311 71 18 chr5 142177990 142178313 -10358946 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 190 2 1669 2492 149 12 26 chr5 142178313 142178740 -10358519 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1669 423 226 33 50 chr5 142178745 142178866 -10358393 - RMER5 LTR ERV1 -367 167 49 2 1669 1825 172 38 27 chr5 142182417 142182583 -10354676 + ORR1D1 LTR MaLR 1 167 -207 2 1669 1825 172 38 27 chr5 142182681 142182884 -10354375 + ORR1D1 LTR MaLR 168 374 0 2 1669 668 297 46 157 chr5 142184447 142184879 -10352380 - MTD LTR MaLR -17 402 19 2 1669 1060 274 29 23 chr5 142185557 142185863 -10351396 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 225 2 1669 339 264 22 161 chr5 142190225 142190482 -10346777 - MER31A LTR ERV1 -116 369 25 3 1669 496 294 94 97 chr5 142201074 142201413 -10335846 + ORR1E LTR MaLR 21 358 -1 3 1669 476 363 71 26 chr5 142201413 142201678 -10335581 - MER21B LTR ERV1 -478 385 109 3 1669 1229 248 37 111 chr5 142202866 142203270 -10333989 + MTE2a LTR MaLR 6 379 0 3 1669 1675 157 65 49 chr5 142203537 142203905 -10333354 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1670 246 263 123 90 chr5 142214971 142215272 -10321987 - RMER17C LTR ERVK -60 350 40 3 1670 1555 247 47 50 chr5 142215442 142215907 -10321352 - RMER5 LTR ERV1 0 534 71 3 1670 267 128 0 0 chr5 142215965 142216004 -10321255 - RMER5 LTR ERV1 -480 54 16 3 1670 1321 249 31 57 chr5 142217778 142218278 -10318981 + RMER20B LTR ERVK 2 516 0 3 1670 495 345 72 69 chr5 142218776 142219081 -10318178 - MLT1H LTR MaLR -128 421 116 3 1670 285 91 68 0 chr5 142226308 142226352 -10310907 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 340 3 1670 2005 104 57 71 chr5 142226443 142226795 -10310464 - ORR1B1 LTR MaLR -47 347 1 3 1670 581 248 21 21 chr5 142232113 142232253 -10305006 + RMER15 LTR ERVL 338 477 -98 3 1670 810 222 66 208 chr5 142235213 142235651 -10301608 - MTE2b LTR MaLR -3 376 1 4 1670 2822 72 40 25 chr5 142235688 142236085 -10301174 - MTB_Mm LTR MaLR -4 403 1 4 1670 1366 136 32 12 chr5 142242320 142242573 -10294686 + BGLII LTR ERVK 159 416 -5 4 1670 358 237 13 0 chr5 142249561 142249637 -10287622 - MTEa LTR MaLR -2 377 301 4 1670 1104 278 29 61 chr5 142249658 142249969 -10287290 - MTEa LTR MaLR -57 322 22 4 1670 634 318 78 43 chr5 142250195 142250540 -10286719 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 4 1670 323 321 136 52 chr5 142254923 142255173 -10282086 - ORR1E LTR MaLR -12 347 77 4 1670 2199 145 9 0 chr5 142255223 142255560 -10281699 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 53 4 1670 1263 245 3 49 chr5 142255590 142255895 -10281364 - MTD LTR MaLR -32 387 97 4 1670 1114 260 128 15 chr5 142262576 142262947 -10274312 - MTD LTR MaLR -31 388 1 4 1670 1805 209 16 11 chr5 142265944 142266321 -10270938 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1670 2008 120 199 16 chr5 142266868 142267250 -10270009 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 652 4 1670 378 243 0 0 chr5 142267246 142267316 -10269943 - RLTR25A LTR ERVK -1033 70 1 4 1670 2148 229 36 16 chr5 142267705 142268211 -10269048 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 4 1670 1425 209 80 45 chr5 142268231 142268410 -10268849 - ORR1D1 LTR MaLR -26 348 167 4 1670 1425 209 80 45 chr5 142268492 142268648 -10268611 - ORR1D1 LTR MaLR -208 166 1 4 1670 510 294 131 86 chr5 142275941 142276361 -10260898 - RLTR11A2 LTR ERVK -63 464 26 4 1670 1804 181 47 53 chr5 142278395 142278775 -10258484 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1670 1420 257 29 23 chr5 142281207 142281554 -10255705 - MTE2b LTR MaLR -15 364 16 4 1670 1787 257 66 33 chr5 142290855 142291370 -10245889 - RMER5 LTR ERV1 0 534 3 5 1670 914 304 169 15 chr5 142292739 142293200 -10244059 - MT2A LTR ERVL 0 533 2 5 1670 1061 196 35 102 chr5 142297098 142297354 -10239905 + MTEb LTR MaLR 141 379 0 5 1670 477 175 0 0 chr5 142298873 142298953 -10238306 - ORR1D1 LTR MaLR -279 95 16 5 1670 911 249 8 44 chr5 142302816 142303064 -10234195 - MTEb LTR MaLR 0 379 141 5 1670 294 296 36 88 chr5 142303071 142303208 -10234051 - RMER10B LTR ERVL 0 398 269 5 1670 627 273 40 0 chr5 142303471 142303621 -10233638 - MTEb LTR MaLR -223 156 1 5 1670 1391 192 150 29 chr5 142305857 142306216 -10231043 - MTD LTR MaLR -13 406 1 5 1670 1676 237 35 48 chr5 142309291 142309690 -10227569 - MTD LTR MaLR 0 419 26 5 1670 3754 14 128 0 chr5 142310365 142310802 -10226457 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1670 322 325 26 17 chr5 142313189 142313305 -10223954 + MTEa LTR MaLR 263 379 0 5 1670 302 289 82 10 chr5 142324023 142324121 -10213138 + MLT2B2 LTR ERVL 3 107 -408 6 1670 264 263 64 92 chr5 142324121 142324132 -10213127 + ORR1E LTR MaLR 3 108 -271 6 1670 281 328 90 101 chr5 142324172 142324450 -10212809 + ORR1E LTR MaLR 66 340 -19 6 1670 810 219 17 44 chr5 142325499 142325697 -10211562 - MTE2a LTR MaLR -9 370 180 6 1670 1259 204 28 37 chr5 142325730 142325993 -10211266 - MTE2a LTR MaLR -124 255 3 6 1670 280 231 31 156 chr5 142326497 142326625 -10210634 + MT2A LTR ERVL 1 112 -421 6 1670 1621 223 31 65 chr5 142326531 142326915 -10210344 + MTD LTR MaLR 49 419 0 6 1670 337 379 73 41 chr5 142339413 142339826 -10197433 - MLT1J-int LTR MaLR -292 1095 670 6 1670 365 332 147 23 chr5 142340261 142340526 -10196733 - MLT1J-int LTR MaLR -1089 298 1 6 1671 297 198 52 88 chr5 142347577 142347771 -10189488 + RMER17A LTR ERVK 291 477 -274 6 1671 320 85 21 0 chr5 142348654 142348701 -10188558 + MTE2b LTR MaLR 319 366 -13 6 1671 1314 237 34 55 chr5 142348724 142349050 -10188209 - MTE2b LTR MaLR -58 321 3 6 1671 347 286 40 10 chr5 142350118 142350217 -10187042 - MTEb LTR MaLR -1 378 277 6 1671 411 200 0 12 chr5 142350278 142350359 -10186900 - MTEa LTR MaLR -6 373 294 6 1671 309 217 0 0 chr5 142352997 142353057 -10184202 - MTEa LTR MaLR -319 60 1 6 1671 1224 251 165 11 chr5 142355827 142356190 -10181069 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1671 958 232 197 16 chr5 142359477 142359527 -10177732 - MTEb LTR MaLR -1 378 328 6 1671 958 232 197 16 chr5 142359647 142359916 -10177343 - MTEb LTR MaLR -52 327 2 6 1671 325 163 30 148 chr5 142364603 142364704 -10172555 + MT2B LTR ERVL 151 239 -362 7 1671 244 307 43 54 chr5 142365144 142365330 -10171929 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1071 7 1671 1376 227 156 12 chr5 142366194 142366520 -10170739 + MTE2b LTR MaLR 1 373 -6 7 1671 287 261 108 31 chr5 142367365 142367559 -10169700 - RLTR21 LTR ERVK -286 1286 1078 7 1671 1244 158 167 19 chr5 142368774 142369032 -10168227 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 79 7 1671 496 210 0 0 chr5 142369737 142369818 -10167441 - ORR1D1 LTR MaLR -293 81 1 7 1671 1588 245 66 0 chr5 142371599 142371946 -10165313 - MTEa LTR MaLR -9 370 1 7 1671 295 279 38 102 chr5 142373455 142373628 -10163631 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 199 7 1671 1604 210 26 106 chr5 142375450 142375838 -10161421 + MTE2b LTR MaLR 10 366 -13 7 1671 307 327 135 91 chr5 142376944 142377231 -10160028 - MT2A LTR ERVL -128 426 2 7 1671 246 327 25 58 chr5 142377231 142377351 -10159908 - MTEa LTR MaLR -262 117 2 7 1671 1465 222 106 10 chr5 142384565 142384970 -10152289 + RMER5 LTR ERV1 60 503 -31 7 1671 489 299 255 56 chr5 142390759 142391045 -10146214 + MTEa LTR MaLR 1 343 -36 7 1671 1616 147 194 10 chr5 142398312 142398622 -10138637 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 1671 1223 248 110 31 chr5 142407868 142408251 -10129008 - MTD LTR MaLR 0 419 7 8 1671 1338 220 105 6 chr5 142411296 142411639 -10125620 - MTEb LTR MaLR -2 377 1 8 1671 326 358 36 9 chr5 142414430 142414540 -10122719 - MTEb LTR MaLR -11 368 256 8 1671 841 248 36 129 chr5 142417942 142418220 -10119039 + MTE2a LTR MaLR 1 252 -127 8 1671 592 170 0 0 chr5 142418219 142418319 -10118940 - MTEb LTR MaLR -124 255 156 8 1671 672 225 7 35 chr5 142418300 142418443 -10118816 + MTE2a LTR MaLR 241 379 0 8 1671 1549 224 34 44 chr5 142418627 142419010 -10118249 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 8 1671 483 282 81 28 chr5 142419314 142419562 -10117697 - MLT1E2 LTR MaLR -366 261 1 8 1671 1723 201 21 42 chr5 142420712 142421092 -10116167 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 8 1671 416 301 75 27 chr5 142421551 142421698 -10115561 - RMER15 LTR ERVL -76 499 346 8 1671 1014 282 64 24 chr5 142424121 142424419 -10112840 - ORR1E LTR MaLR -49 310 1 8 1671 491 224 41 39 chr5 142428252 142428504 -10108755 - MTEb LTR MaLR 0 379 154 8 1671 379 177 97 97 chr5 142445523 142445667 -10091592 + RMER10B LTR ERVL 12 155 -243 8 1671 611 239 58 58 chr5 142445668 142446108 -10091151 - RMER17C LTR ERVK -32 378 1 8 1671 353 276 71 25 chr5 142446187 142446384 -10090875 + RMER10B LTR ERVL 218 423 -19 8 1671 250 352 47 75 chr5 142447611 142447823 -10089436 - MER21B LTR ERV1 -610 253 48 8 1671 344 182 82 94 chr5 142447916 142448001 -10089258 + MTE2a LTR MaLR 18 101 -278 8 1671 1378 246 38 98 chr5 142450592 142450992 -10086267 - MTE2a LTR MaLR -1 378 3 8 1671 986 238 338 23 chr5 142455207 142455642 -10081617 - RMER15 LTR ERVL -3 572 1 9 1671 533 294 65 54 chr5 142457601 142457878 -10079381 + LTR37A LTR ERV1 84 363 -63 9 1671 1041 244 91 66 chr5 142466931 142467295 -10069964 - MTE2b LTR MaLR 0 379 7 9 1671 307 218 12 25 chr5 142471130 142471210 -10066049 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 330 9 1671 1482 204 111 15 chr5 142471517 142471860 -10065399 - MTE2b LTR MaLR -2 377 2 9 208 1210 211 111 124 chr5 142475211 142475590 -10061669 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 9 1672 290 244 69 115 chr5 142479699 142479829 -10057430 - ORR1E LTR MaLR -164 195 72 9 1672 1673 232 51 59 chr5 142479915 142480409 -10056850 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 34 9 1672 1073 267 102 102 chr5 142482858 142483346 -10053913 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 39 9 1672 1220 161 59 40 chr5 142484933 142485186 -10052073 - MTC LTR MaLR 0 421 164 9 1672 787 211 100 23 chr5 142489980 142490200 -10047059 + MTD-int LTR MaLR 1055 1252 -6 9 1672 1464 255 54 39 chr5 142490211 142490409 -10046850 + MTD LTR MaLR 12 202 -217 9 1672 1464 255 54 39 chr5 142490608 142490797 -10046462 + MTD LTR MaLR 203 405 -14 9 1672 1315 222 107 73 chr5 142491130 142491514 -10045745 + MTD LTR MaLR 16 412 -7 9 1672 543 226 145 70 chr5 142494073 142494301 -10042958 - ORR1E LTR MaLR -6 353 109 9 1672 355 187 165 0 chr5 142495860 142495951 -10041308 - ORR1E LTR MaLR -264 106 1 9 1672 567 281 106 42 chr5 142496465 142496729 -10040530 - RMER15 LTR ERVL 0 575 295 9 1672 225 340 118 0 chr5 142499819 142499972 -10037287 - MLT2B3 LTR ERVL 0 554 384 9 1672 597 335 26 69 chr5 142500001 142500306 -10036953 - MT2A LTR ERVL -241 292 1 1 1672 269 289 31 10 chr5 142501678 142501776 -10035483 - MLT1H1 LTR MaLR 0 555 456 5 1672 1303 250 73 17 chr5 142502826 142503184 -10034075 - MTEa LTR MaLR 0 379 2 1 1672 391 225 128 30 chr5 142506157 142506290 -10030969 + MTD LTR MaLR 228 373 -46 1 1672 1250 215 149 24 chr5 142506795 142507148 -10030111 - MTD LTR MaLR -14 405 8 2 1672 946 244 95 9 chr5 142520276 142520507 -10016752 - MTE2b LTR MaLR -128 251 1 5 1672 1668 240 30 5 chr5 142527257 142527626 -10009633 - MTEa LTR MaLR 0 379 2 6 1672 414 331 144 26 chr5 142531602 142531949 -10005310 - MLT1E2 LTR MaLR -9 618 231 7 1672 3847 142 41 37 chr5 142532558 142533306 -10003953 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 7 1672 2116 115 231 16 chr5 142539004 142539385 -9997874 - RMER4A LTR ERVK -3 463 1 9 1672 3075 91 79 2 chr5 142541812 142542253 -9995006 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 9 1672 13892 50 9 3 chr5 142542255 142544010 -9993249 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 4714 9 1672 1826 82 4 0 chr5 142544043 142544288 -9992971 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2252 9 1672 901 76 0 0 chr5 142544289 142544408 -9992851 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 1359 9 1672 3753 59 2 18 chr5 142544408 142544911 -9992348 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 9 1672 231 327 0 0 chr5 142544911 142544966 -9992293 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 1 1672 963 107 100 12 chr5 142544966 142545136 -9992123 - IAPEz-int LTR ERVK -6288 193 9 9 1672 3025 86 99 0 chr5 142545137 142545569 -9991690 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 9 1672 436 256 59 2 chr5 142549089 142549233 -9988026 + MLT1A0 LTR MaLR 1 163 -211 1 1672 309 258 114 23 chr5 142552816 142552947 -9984312 + LTR37B LTR ERV1 297 439 -29 1 1672 1679 236 22 6 chr5 142559885 142560247 -9977012 - MTE2b LTR MaLR -9 370 3 1 1672 869 262 9 186 chr5 142561994 142562465 -9974794 - MTE2b LTR MaLR -13 366 2 1 1672 264 353 68 0 chr5 142562653 142562786 -9974473 - MLT1J2 LTR MaLR -18 430 289 1 1672 713 284 81 98 chr5 142564696 142565055 -9972204 - MTEa LTR MaLR -9 370 18 1 1672 673 276 46 18 chr5 142566365 142566583 -9970676 - RMER15 LTR ERVL -13 562 339 1 1672 2072 163 32 9 chr5 142566779 142567119 -9970140 + MTE2b LTR MaLR 18 365 -14 1 1672 1453 232 108 0 chr5 142573661 142574002 -9963257 - MTEa LTR MaLR 0 379 2 1 1672 1913 198 16 5 chr5 142574807 142575182 -9962077 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1672 1861 113 55 104 chr5 142577001 142577365 -9959894 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 1 1672 226 229 0 116 chr5 142578827 142578896 -9958363 - MLT1A1 LTR MaLR -23 385 325 1 1672 1870 162 59 9 chr5 142580877 142581214 -9956045 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 1672 1210 299 89 16 chr5 142581844 142582272 -9954987 - MT2A LTR ERVL -74 459 1 1 1672 2797 161 23 13 chr5 142585953 142586476 -9950783 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1672 1337 271 70 41 chr5 142586815 142587274 -9949985 - RMER5 LTR ERV1 0 534 63 1 1672 317 292 81 24 chr5 142593038 142593161 -9944098 - MTE2b LTR MaLR 0 379 250 1 1672 1177 133 6 0 chr5 142593225 142593398 -9943861 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 273 1 1672 922 277 128 27 chr5 142595968 142596305 -9940954 - MTE2b LTR MaLR -1 378 8 2 1672 1847 165 95 19 chr5 142597446 142597805 -9939454 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 2 1672 2185 124 17 11 chr5 142601632 142601984 -9935275 - ORR1B1 LTR MaLR -40 354 1 2 1672 1512 241 114 13 chr5 142602505 142602954 -9934305 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 33 2 1672 1502 248 61 45 chr5 142604670 142605142 -9932117 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 46 2 1673 1022 230 98 0 chr5 142609601 142609836 -9927423 - MTE2b LTR MaLR -119 260 3 2 1673 1179 231 86 3 chr5 142611961 142612252 -9925007 - MTEa LTR MaLR -4 375 61 2 1673 1144 256 136 0 chr5 142613720 142614052 -9923207 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 2 1673 1036 275 106 12 chr5 142615170 142615490 -9921769 + MTD LTR MaLR 56 405 -14 2 1673 435 292 169 16 chr5 142617614 142617868 -9919391 - MLT1C LTR MaLR -78 389 97 2 1673 2172 130 61 46 chr5 142617891 142618303 -9918956 - RLTR9B LTR ERVK -19 418 1 2 1673 2469 150 122 19 chr5 142618469 142618952 -9918307 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 2 1673 329 323 12 71 chr5 142620199 142620274 -9916985 + MT2B LTR ERVL 94 233 -368 2 1673 265 347 48 40 chr5 142622570 142622696 -9914563 - MTEa LTR MaLR -229 150 24 2 1673 1209 245 32 95 chr5 142622770 142623117 -9914142 - MTE2b LTR MaLR -39 340 16 2 1673 1806 198 23 55 chr5 142623308 142623692 -9913567 + MTE2b LTR MaLR 1 372 -7 2 1673 1724 196 56 8 chr5 142629675 142630035 -9907224 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 2 1673 658 317 182 20 chr5 142630242 142630593 -9906666 + MTD LTR MaLR 12 419 0 2 1673 1934 128 63 34 chr5 142632014 142632363 -9904896 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 2 1673 1252 241 60 35 chr5 142638515 142638863 -9898396 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 3 1673 520 312 132 69 chr5 142651337 142651671 -9885588 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 3 1673 3752 116 71 39 chr5 142660310 142661001 -9876258 - RMER6A LTR ERVK -6 750 38 3 1673 1090 268 71 40 chr5 142663067 142663267 -9873992 - MTE2a LTR MaLR 0 379 164 3 1673 1991 137 83 0 chr5 142663267 142663604 -9873655 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 3 1673 1090 268 71 40 chr5 142663604 142663757 -9873502 - MTE2a LTR MaLR -216 163 15 3 1673 437 293 0 0 chr5 142666833 142666932 -9870327 - MTE2b LTR MaLR -280 99 1 3 1673 411 355 87 33 chr5 142669367 142669734 -9867525 - LTR84b LTR ERVL -368 393 7 3 1673 225 233 58 11 chr5 142673994 142674081 -9863178 - RMER15 LTR ERVL -10 565 475 3 1673 1146 222 167 0 chr5 142674098 142674404 -9862855 - MTE2b LTR MaLR -14 365 9 3 1673 2073 155 5 53 chr5 142674928 142675323 -9861936 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 3 1673 228 351 39 50 chr5 142677542 142677722 -9859537 - RLTR22_Mur LTR ERVK -375 1473 1296 3 1673 538 288 205 13 chr5 142677827 142678066 -9859193 - RMER15 LTR ERVL -15 560 276 3 1673 412 264 31 49 chr5 142678069 142678232 -9859027 - RMER15 LTR ERVL -415 160 1 3 1673 1165 254 38 7 chr5 142681119 142681412 -9855847 - MTEa LTR MaLR -74 305 4 3 1673 327 277 139 0 chr5 142681524 142681625 -9855634 - ORR1E LTR MaLR -10 369 255 3 1673 490 312 26 16 chr5 142681652 142681841 -9855418 - ORR1E LTR MaLR -167 192 2 3 1673 763 105 0 0 chr5 142686359 142686473 -9850786 + MTB_Mm LTR MaLR 1 114 -293 4 1673 2878 64 23 3 chr5 142686787 142687179 -9850080 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1673 1287 187 129 44 chr5 142687254 142687448 -9849811 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 182 4 1673 1287 187 129 44 chr5 142687469 142687615 -9849644 - ORR1D2 LTR MaLR -189 181 1 4 1673 472 218 49 143 chr5 142693347 142693550 -9843709 - MTE2a LTR MaLR -45 334 151 4 1673 385 302 37 85 chr5 142696325 142696513 -9840746 + ORR1E LTR MaLR 176 354 -5 4 1673 1634 154 148 6 chr5 142696742 142697081 -9840178 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 1 4 1673 1347 214 52 52 chr5 142697881 142697983 -9839276 + MTE2b LTR MaLR 1 113 -266 4 1673 1347 214 52 52 chr5 142698052 142698313 -9838946 + MTE2b LTR MaLR 114 363 -16 4 1673 2469 158 7 5 chr5 142699703 142700123 -9837136 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1673 265 325 85 23 chr5 142702279 142702408 -9834851 + MLT1A1 LTR MaLR 269 405 -3 4 1673 2171 176 55 14 chr5 142702967 142703405 -9833854 + RMER6B LTR ERVK 1 456 -5 4 1673 516 304 118 22 chr5 142703806 142704035 -9833224 - ORR1E LTR MaLR -105 254 4 4 1673 1131 256 153 11 chr5 142705806 142706173 -9831086 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1673 1902 98 18 34 chr5 142706367 142706426 -9830833 - ORR1A4 LTR MaLR -6 323 267 4 1673 1902 98 18 34 chr5 142706556 142706824 -9830435 - ORR1A4 LTR MaLR -63 266 1 4 1673 971 153 171 0 chr5 142706824 142707036 -9830223 - MTD LTR MaLR -38 381 133 4 1673 2886 116 9 5 chr5 142710244 142710668 -9826591 + RLTR23 LTR ERV1 5 430 0 4 1673 1649 238 71 43 chr5 142712128 142712637 -9824622 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 3 4 1673 318 191 0 106 chr5 142713214 142713308 -9823951 + MT2B LTR ERVL 157 240 -361 4 1673 2158 181 215 4 chr5 142715669 142716163 -9821096 + RMER19B LTR ERVK 305 902 0 4 1673 543 288 60 9 chr5 142716335 142716535 -9820724 - ORR1E LTR MaLR -170 204 1 4 1673 487 328 84 55 chr5 142717370 142717755 -9819504 + MTE2a LTR MaLR 1 405 -14 4 1673 322 282 115 40 chr5 142718318 142718466 -9818793 + RMER15 LTR ERVL 403 561 -14 4 1673 342 220 10 52 chr5 142721261 142721357 -9815902 - MTEa LTR MaLR 0 379 288 4 1673 2003 168 16 0 chr5 142721369 142721733 -9815526 + ORR1C1 LTR MaLR 5 374 -4 4 1673 6341 176 120 28 chr5 142721737 142721940 -9815319 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 206 -1303 4 1673 6708 175 120 28 chr5 142722087 142723264 -9813995 + ORR1C1-int LTR MaLR 207 1509 0 4 1673 2263 160 11 13 chr5 142723264 142723643 -9813616 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1673 341 328 63 53 chr5 142723643 142723837 -9813422 - MTEa LTR MaLR -99 271 79 4 1673 257 314 0 0 chr5 142724981 142725051 -9812208 - MLT1I LTR MaLR -10 401 332 4 1673 1324 243 19 125 chr5 142725789 142726212 -9811047 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 5 1673 327 221 0 0 chr5 142727756 142727824 -9809435 + BGLII_B LTR ERVK 1 68 -373 5 1673 838 168 18 24 chr5 142728032 142728196 -9809063 + RLTR11A LTR ERVK 153 315 -213 5 1673 3287 20 5 15 chr5 142728196 142728420 -9808839 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 171 5 1673 1880 121 115 106 chr5 142728420 142728891 -9808368 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1673 3287 20 5 15 chr5 142728891 142729066 -9808193 - MTA_Mm LTR MaLR -226 170 1 5 1673 1527 97 5 0 chr5 142729066 142729283 -9807976 + RLTR11A LTR ERVK 311 528 0 5 1673 927 260 45 72 chr5 142729482 142729902 -9807357 - MTE2a LTR MaLR -44 375 12 5 1673 443 304 145 17 chr5 142731458 142731692 -9805567 + RMER15 LTR ERVL 311 574 -1 5 1673 393 259 26 40 chr5 142733002 142733155 -9804104 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 279 5 1673 272 333 0 0 chr5 142733590 142733668 -9803591 + MLT1H2 LTR MaLR 61 138 -351 5 1673 441 253 102 62 chr5 142733669 142733846 -9803413 + MTE2a LTR MaLR 12 195 -224 5 1673 657 278 32 134 chr5 142733832 142734115 -9803144 + MTE2a LTR MaLR 123 376 -3 5 1674 267 293 0 12 chr5 142737520 142737603 -9799656 - RMER15 LTR ERVL -489 86 5 5 1674 455 262 32 32 chr5 142737602 142737728 -9799531 + MTE2a LTR MaLR 243 368 -11 5 1674 1171 203 171 11 chr5 142740191 142740465 -9796794 - MTEb LTR MaLR -2 377 60 5 1674 1031 306 86 21 chr5 142740802 142741220 -9796039 - MT2A LTR ERVL -87 446 2 5 1674 418 136 0 0 chr5 142741221 142741280 -9795979 - MTEa LTR MaLR -320 59 1 5 1674 904 292 28 14 chr5 142741727 142742012 -9795247 - MER57F LTR ERV1 -147 289 1 5 1674 688 215 24 23 chr5 142745671 142745837 -9791422 - ORR1E LTR MaLR -226 168 1 5 1674 2352 132 59 37 chr5 142746772 142747180 -9790079 + MTC LTR MaLR 5 421 0 5 1674 280 296 69 62 chr5 142747339 142747483 -9789776 - MLT1A0 LTR MaLR -188 177 33 5 1674 301 298 83 93 chr5 142750066 142750423 -9786836 - MTEb LTR MaLR -4 375 16 5 1674 669 281 43 148 chr5 142750916 142751221 -9786038 - MLT2C1 LTR ERVL -108 289 17 5 1674 3561 113 181 3 chr5 142751900 142752476 -9784783 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 5 1674 1143 239 92 14 chr5 142752521 142752869 -9784390 - MTE2b LTR MaLR 0 379 5 5 1674 2088 144 63 73 chr5 142753655 142754053 -9783206 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1674 225 274 20 0 chr5 142756603 142756654 -9780605 + RMER15 LTR ERVL 507 558 -17 5 1674 487 301 15 84 chr5 142761129 142761341 -9775918 - MTEa LTR MaLR 0 379 155 5 1674 1499 188 154 60 chr5 142762130 142762605 -9774654 - RMER4B LTR ERVK -2 464 1 5 1674 404 235 50 10 chr5 142763080 142763179 -9774080 - ORR1E LTR MaLR 0 359 257 5 1674 1587 211 130 17 chr5 142763237 142763598 -9773661 + MTD LTR MaLR 18 419 0 5 1674 1987 138 53 88 chr5 142764706 142765102 -9772157 + ORR1B1 LTR MaLR 13 394 0 6 1674 249 230 31 106 chr5 142769793 142769933 -9767326 + ORR1D2 LTR MaLR 229 362 -12 6 1674 679 218 217 55 chr5 142771880 142772131 -9765128 - MTD LTR MaLR -30 389 116 6 1674 2136 118 15 15 chr5 142772131 142772458 -9764801 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 41 6 1674 262 95 0 0 chr5 142772460 142772502 -9764757 - MTD LTR MaLR -271 96 55 6 1674 648 104 0 57 chr5 142772506 142772628 -9764631 - ORR1B2 LTR MaLR -244 123 9 6 1674 247 296 22 22 chr5 142772683 142772773 -9764486 - MTD LTR MaLR -331 90 1 6 1674 239 306 23 186 chr5 142774747 142774924 -9762335 + MLT1N2 LTR MaLR 9 156 -406 6 1674 678 291 56 17 chr5 142774942 142775173 -9762086 - RMER15 LTR ERVL 0 575 336 6 1674 1338 250 88 11 chr5 142776455 142776807 -9760452 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 1674 238 293 133 0 chr5 142778493 142778568 -9758691 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 281 6 1674 368 271 42 8 chr5 142781523 142781642 -9755617 + MT2A LTR ERVL 1 123 -410 6 1674 997 203 138 40 chr5 142781537 142781864 -9755395 + MTE2b LTR MaLR 19 377 -2 6 1674 1861 152 73 3 chr5 142782222 142782538 -9754721 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 6 1674 1463 214 67 8 chr5 142782873 142783231 -9754028 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 6 1674 1003 277 62 117 chr5 142785723 142786124 -9751135 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1674 2318 105 69 17 chr5 142786558 142786907 -9750352 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 1674 896 259 118 52 chr5 142789590 142789895 -9747364 - MTEb LTR MaLR 0 379 55 6 1674 254 281 0 0 chr5 142789914 142789978 -9747281 - MTEb LTR MaLR -276 83 20 6 1674 633 279 182 55 chr5 142791355 142791811 -9745448 + MT2A LTR ERVL 12 525 -8 6 1674 411 267 87 118 chr5 142796263 142796371 -9740888 + ORR1D2 LTR MaLR 51 149 -221 7 1674 411 267 87 118 chr5 142796413 142796627 -9740632 + ORR1D2 LTR MaLR 150 363 -7 7 1674 298 47 47 0 chr5 142796901 142796944 -9740315 - MTE2b LTR MaLR 0 421 377 7 1674 714 285 57 109 chr5 142797947 142798404 -9738855 - BGLII_B LTR ERVK -6 435 3 7 1674 712 256 66 6 chr5 142798990 142799171 -9738088 - MTE2b LTR MaLR -183 196 5 7 1674 997 255 69 35 chr5 142801459 142801776 -9735483 - ORR1E LTR MaLR -28 331 4 7 1674 2075 185 43 38 chr5 142802675 142803118 -9734141 + RLTR41 LTR ERV1 2 446 0 7 1674 934 233 142 47 chr5 142804915 142804997 -9732262 - RMER15 LTR ERVL 0 575 490 7 1674 934 233 142 47 chr5 142805211 142805402 -9731857 - RMER15 LTR ERVL -86 489 276 7 1674 531 229 26 18 chr5 142806239 142806378 -9730881 - MTD LTR MaLR -15 404 232 7 1674 1250 246 93 13 chr5 142809005 142809318 -9727941 + ORR1D2 LTR MaLR 30 367 -3 7 1674 803 270 40 123 chr5 142809322 142809747 -9727512 + MTE2a LTR MaLR 19 404 -15 7 1674 353 241 175 18 chr5 142810487 142810601 -9726658 + ORR1E LTR MaLR 3 134 -225 7 1674 226 210 129 0 chr5 142811051 142811095 -9726164 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 319 7 1674 856 258 124 25 chr5 142811685 142811999 -9725260 - MTD LTR MaLR -64 355 11 7 1674 251 263 18 0 chr5 142812957 142813014 -9724245 + RMER15 LTR ERVL 363 420 -155 7 1674 1663 176 41 53 chr5 142817195 142817610 -9719649 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 7 1674 1049 174 226 31 chr5 142817948 142818393 -9718866 + RMER17C-int LTR ERVK 1485 2016 -1222 7 1674 881 161 30 0 chr5 142818393 142818561 -9718698 + RMER17C-int LTR ERVK 2170 2342 -896 7 1674 2251 124 154 29 chr5 142818559 142819186 -9718073 + RMER17C-int LTR ERVK 2533 3238 0 7 1674 1735 141 63 10 chr5 142819189 142819610 -9717649 + RMER17C LTR ERVK 16 441 -517 7 1674 1308 202 24 4 chr5 142820204 142820452 -9716807 - MTC LTR MaLR -63 358 106 7 1674 3362 21 23 5 chr5 142820573 142820962 -9716297 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1674 596 182 81 9 chr5 142821169 142821280 -9715979 - MTC LTR MaLR -301 120 2 7 1674 812 73 407 0 chr5 142821418 142821568 -9715691 - RMER19A LTR ERVK -526 211 1 7 1674 1613 130 64 83 chr5 142821776 142822214 -9715045 - MurERV4_19-int LTR ERVK -25 5755 5176 7 1674 1165 163 10 15 chr5 142823950 142824155 -9713104 + RMER10B LTR ERVL 195 398 0 7 1674 1928 119 69 10 chr5 142824361 142824667 -9712592 + ORR1A4 LTR MaLR 1 324 -5 7 1674 856 269 47 91 chr5 142824728 142824805 -9712454 + MTE2a LTR MaLR 40 112 -267 7 1674 856 269 47 91 chr5 142824983 142825245 -9712014 + MTE2a LTR MaLR 113 364 -15 7 1674 1623 182 148 40 chr5 142825289 142825531 -9711728 - RMER4B LTR ERVK 0 466 253 7 1674 1623 163 205 14 chr5 142825592 142825804 -9711455 - RMER4B LTR ERVK -333 252 22 7 1674 1341 175 174 3 chr5 142826113 142826400 -9710859 - MTE2b LTR MaLR -43 336 1 7 1674 335 267 0 0 chr5 142826703 142826778 -9710481 - ORR1E LTR MaLR -255 104 30 7 1674 2057 124 101 70 chr5 142827235 142827604 -9709655 + RLTR23 LTR ERV1 1 389 -41 8 1674 2225 122 40 18 chr5 142827604 142828005 -9709254 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 8 1674 2057 124 101 70 chr5 142828005 142828052 -9709207 + RLTR23 LTR ERV1 390 430 0 8 1674 711 225 27 27 chr5 142828419 142828602 -9708657 + RLTR12B LTR ERVK 47 229 -299 8 1674 277 266 114 9 chr5 142828604 142828718 -9708541 + MTE2b LTR MaLR 245 370 -9 8 1674 1823 159 77 26 chr5 142832021 142832370 -9704889 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 8 1674 1022 146 52 62 chr5 142833006 142833118 -9704141 - ORR1B2 LTR MaLR -9 358 241 8 1674 2117 151 6 3 chr5 142833118 142833476 -9703783 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 8 1674 1022 153 118 76 chr5 142833476 142833651 -9703608 - ORR1B2 LTR MaLR -127 240 2 8 1674 259 53 26 0 chr5 142834618 142834656 -9702603 - ORR1B2 LTR MaLR -207 160 122 8 1674 657 306 29 15 chr5 142835849 142836055 -9701204 + MTD LTR MaLR 1 209 -210 8 1674 702 228 59 45 chr5 142836301 142836522 -9700737 + MTD LTR MaLR 196 419 0 8 1674 2482 194 26 7 chr5 142840218 142840681 -9696578 + RLTR19A LTR ERVK 25 496 0 8 1674 613 236 28 14 chr5 142844595 142844703 -9692556 + RMER15 LTR ERVL 432 537 -38 8 1674 613 236 28 14 chr5 142844729 142844762 -9692497 + RMER15 LTR ERVL 538 574 -1 8 1674 339 225 159 18 chr5 142845084 142845197 -9692062 - MLT1B LTR MaLR -220 170 42 8 1674 1137 181 130 49 chr5 142845200 142845507 -9691752 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 8 1674 1946 142 31 0 chr5 142845976 142846299 -9690960 + MTC LTR MaLR 89 421 0 8 1674 409 274 87 22 chr5 142849540 142849678 -9687581 - MLT2B1 LTR ERVL -48 519 373 8 1674 811 229 77 7 chr5 142850367 142850666 -9686593 + ORR1D2 LTR MaLR 4 349 -21 8 1674 1650 151 75 3 chr5 142850992 142851298 -9685961 - ORR1C1 LTR MaLR -50 328 1 8 1674 344 242 95 0 chr5 142851598 142851693 -9685566 - MLT2B2 LTR ERVL -398 117 14 8 1674 638 247 36 6 chr5 142852847 142853014 -9684245 - MTE2b LTR MaLR -34 345 174 8 1674 622 236 146 20 chr5 142854920 142855119 -9682140 - RMER15 LTR ERVL -58 517 294 9 1674 1199 211 181 35 chr5 142855591 142855808 -9681451 - MTD LTR MaLR 0 419 155 9 1674 2247 91 19 12 chr5 142855808 142856129 -9681130 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 9 1674 1199 211 181 35 chr5 142856129 142856164 -9681095 - MTD LTR MaLR -265 154 110 9 1674 1199 211 181 35 chr5 142856308 142856397 -9680862 - MTD LTR MaLR -310 109 27 9 1674 271 264 124 26 chr5 142862793 142862906 -9674353 + MLT1N2 LTR MaLR 5 128 -467 9 1674 273 320 48 16 chr5 142863090 142863214 -9674045 + MLT1N2 LTR MaLR 417 544 -18 9 1674 399 266 124 55 chr5 142865419 142865652 -9671607 + MLT1F1 LTR MaLR 233 516 -53 9 1674 3134 139 26 73 chr5 142866860 142867474 -9669785 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 9 1674 299 376 14 7 chr5 142868242 142868384 -9668875 - RMER15 LTR ERVL -14 561 419 9 1675 2514 191 44 19 chr5 142898533 142899061 -9638198 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 1 1675 3488 143 67 74 chr5 142912259 142912443 -9624816 + MTB_Mm-int LTR MaLR 485 658 -600 1 1675 3488 143 67 74 chr5 142912641 142913236 -9624023 + MTB_Mm-int LTR MaLR 659 1258 0 1 1675 2168 164 73 11 chr5 142913236 142913618 -9623641 + MTB_Mm LTR MaLR 1 406 -1 1 1675 828 227 135 23 chr5 142913619 142913948 -9623311 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 1 1 1675 846 239 57 138 chr5 142931793 142932200 -9605059 - MTEb LTR MaLR -5 374 1 1 1675 779 236 46 30 chr5 142938226 142938511 -9598748 - ORR1D1 LTR MaLR -63 311 2 1 1675 1972 166 127 11 chr5 142947401 142947778 -9589481 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1675 2558 62 24 34 chr5 142957079 142957225 -9580034 - MTB LTR MaLR -22 378 230 1 1675 2558 62 24 34 chr5 142957431 142957665 -9579594 - MTB LTR MaLR -171 229 2 1 1675 240 250 0 17 chr5 142958083 142958201 -9579058 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 639 1 1675 229 303 68 76 chr5 142965986 142966118 -9571141 + RLTR26 LTR ERVK 440 570 -72 1 1675 1906 170 78 33 chr5 142967376 142967734 -9569525 + MTC LTR MaLR 1 382 -39 1 1675 3206 56 10 0 chr5 142967734 142968129 -9569130 + MTB LTR MaLR 1 399 -1 1 1675 1906 170 78 33 chr5 142968129 142968165 -9569094 + MTC LTR MaLR 383 413 -8 1 1675 234 330 98 10 chr5 142969824 142970017 -9567242 - MLT1D LTR MaLR -289 216 7 1 1675 235 337 63 0 chr5 142976320 142976415 -9560844 - LTR90B LTR LTR -551 245 145 1 1675 241 321 0 134 chr5 142989771 142989868 -9547391 + MT2B LTR ERVL 155 238 -363 1 1675 1348 188 182 31 chr5 142991790 142992114 -9545145 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 1 1675 534 357 180 9 chr5 142994972 142995512 -9541747 + MLT1F-int LTR MaLR 621 1252 -237 1 1675 5358 144 18 1 chr5 142997038 142997907 -9539352 + RMER19B LTR ERVK 1 884 -18 1 1675 499 261 259 22 chr5 142997905 142998159 -9539100 + MTEa LTR MaLR 15 333 -46 1 1675 371 320 102 21 chr5 142998159 142998468 -9538791 + MTE2a LTR MaLR 1 340 -39 1 1675 819 227 263 16 chr5 142999144 142999448 -9537811 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 1 1676 908 260 61 73 chr5 143006809 143007153 -9530106 - MTE2a LTR MaLR 0 379 40 6 1676 298 192 0 0 chr5 143007473 143007525 -9529734 - MTE2a LTR MaLR -327 52 1 6 1676 354 299 65 65 chr5 143008103 143008257 -9529002 - MT2B LTR ERVL -363 238 85 1 1676 365 248 7 104 chr5 143011682 143011708 -9525551 - MT2B LTR ERVL -337 264 143 2 1676 2358 117 92 3 chr5 143028129 143028488 -9508771 + ORR1B1 LTR MaLR 4 394 0 7 1676 281 247 81 12 chr5 143029731 143029817 -9507442 + ORR1E LTR MaLR 233 324 -35 7 1676 412 157 143 22 chr5 143029855 143029946 -9507313 - MLT1B LTR MaLR -283 107 6 7 1676 528 348 47 43 chr5 143030235 143030490 -9506769 + MLT1F LTR MaLR 9 264 -284 8 1676 2072 197 72 23 chr5 143031669 143032152 -9505107 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 18 8 1676 536 274 99 77 chr5 143033070 143033343 -9503916 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 168 8 1676 234 328 0 79 chr5 143034899 143034986 -9502273 - RMER12 LTR ERVK -472 850 774 9 1676 2408 79 6 3 chr5 143034986 143035304 -9501955 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 9 1676 2819 147 9 80 chr5 143037313 143037611 -9499648 + RLTR11A LTR ERVK 4 293 -235 1 1676 2819 147 9 80 chr5 143037807 143038034 -9499225 + RLTR11A LTR ERVK 294 492 -36 1 1676 739 258 74 20 chr5 143042875 143043077 -9494182 + MTE2a LTR MaLR 78 290 -89 1 1676 438 298 99 0 chr5 143048527 143048658 -9488601 + MTE2a LTR MaLR 1 144 -235 1 1676 387 237 32 0 chr5 143048668 143048761 -9488498 + MTE2a LTR MaLR 284 379 0 1 1676 559 255 38 13 chr5 143061728 143061887 -9475372 + MTE2a LTR MaLR 1 163 -216 1 1676 600 219 164 0 chr5 143062026 143062172 -9475087 + MTE2a LTR MaLR 210 379 0 1 1676 227 346 95 29 chr5 143062560 143062697 -9474562 - RMER12 LTR ERVK -476 846 701 2 1676 347 160 103 39 chr5 143063805 143063883 -9473376 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 445 2 1676 276 81 217 0 chr5 143063884 143063944 -9473315 - RLTR11A2 LTR ERVK -456 71 1 2 1676 269 331 41 0 chr5 143069600 143069721 -9467538 + RMER15 LTR ERVL 406 531 -44 2 1676 509 296 21 26 chr5 143069864 143070055 -9467204 + ORR1E LTR MaLR 3 192 -167 2 1676 458 292 144 60 chr5 143072698 143072982 -9464277 + MTD LTR MaLR 24 331 -88 2 1676 2725 128 45 65 chr5 143076589 143077125 -9460134 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 527 0 2 1676 2242 161 36 32 chr5 143078144 143078617 -9458642 + RMER6A LTR ERVK 282 756 0 2 1676 1271 170 71 15 chr5 143080844 143081112 -9456147 + RLTR17 LTR ERVK 333 615 -77 2 1676 652 275 35 15 chr5 143085771 143085974 -9451285 + MTE2b LTR MaLR 10 216 -163 2 1676 228 175 0 0 chr5 143086129 143086169 -9451090 + MTE2b LTR MaLR 203 242 -137 2 1676 274 292 133 0 chr5 143090635 143090748 -9446511 - MER67A LTR ERV1 -5 538 411 3 1676 264 245 68 48 chr5 143091809 143091912 -9445347 - MER67A LTR ERV1 -333 210 106 3 1676 783 318 21 28 chr5 143093674 143093956 -9443303 - RMER15 LTR ERVL 0 575 296 3 1676 308 228 48 88 chr5 143093999 143094124 -9443135 - RMER15 LTR ERVL -448 127 8 3 1676 404 271 49 0 chr5 143096824 143096946 -9440313 + MER89 LTR ERV1 328 455 -104 3 1676 1610 230 66 146 chr5 143115869 143116596 -9420663 - RMER17B LTR ERVK -32 926 258 3 1676 2545 178 147 10 chr5 143118510 143119033 -9418226 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 98 4 1676 6482 195 65 48 chr5 143119060 143120963 -9416296 - RMER3D-int LTR ERVK -5 2837 377 4 1676 691 254 91 99 chr5 143121052 143121467 -9415792 - RMER3D-int LTR ERVK -1692 1150 741 4 1676 691 254 91 99 chr5 143121663 143121810 -9415449 - RMER3D-int LTR ERVK -2102 740 593 4 1676 428 145 26 13 chr5 143121819 143121896 -9415363 - RMER3D-int LTR ERVK -2764 78 1 4 1676 588 129 20 10 chr5 143122007 143122109 -9415150 + RLTR17 LTR ERVK 98 200 -492 4 1676 928 162 7 0 chr5 143122131 143122285 -9414974 + RLTR17 LTR ERVK 308 462 -230 4 1676 1780 41 0 9 chr5 143122290 143122513 -9414746 - MT2C_Mm LTR ERVL -254 221 1 4 1676 328 207 33 83 chr5 143122513 143122542 -9414717 - ORR1A3-int LTR MaLR -1350 613 591 4 1676 305 152 49 37 chr5 143122537 143122619 -9414640 - ORR1A3-int LTR MaLR -1314 649 567 4 1676 1827 109 155 9 chr5 143122619 143122961 -9414298 - MERVL_2A-int LTR ERVL -132 5629 5238 4 1676 585 203 72 43 chr5 143122986 143123125 -9414134 + RLTR17 LTR ERVK 550 692 0 4 1677 238 270 234 16 chr5 143135817 143135945 -9401314 - ORR1E LTR MaLR -145 214 59 4 1677 2502 143 44 15 chr5 143150993 143151398 -9385861 + MTC LTR MaLR 5 421 0 4 1677 1293 218 28 122 chr5 143155323 143155683 -9381576 + MTEa LTR MaLR 54 379 0 4 1677 898 199 154 52 chr5 143159192 143159425 -9377834 + MTEb LTR MaLR 78 334 -45 5 1677 230 228 80 106 chr5 143162562 143162675 -9374584 - MamGypLTR1d LTR Gypsy -643 170 61 5 1677 276 247 12 38 chr5 143164112 143164192 -9373067 - MTEa LTR MaLR -9 370 293 5 1677 258 274 128 0 chr5 143183732 143183834 -9353425 - MLT1E3 LTR MaLR -426 198 84 5 1677 1111 256 111 15 chr5 143186571 143186912 -9350347 - MTEb LTR MaLR -4 375 2 5 1677 1351 209 27 70 chr5 143188247 143188618 -9348641 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 5 1677 414 277 7 47 chr5 143191458 143191606 -9345653 - RMER15 LTR ERVL -160 415 274 5 1677 763 245 92 98 chr5 143203346 143203735 -9333524 + MTE2a LTR MaLR 13 405 -14 6 1677 228 271 0 14 chr5 143204488 143204559 -9332700 + MTEb LTR MaLR 294 363 -16 6 1677 244 309 146 17 chr5 143206388 143206566 -9330693 - ORR1E LTR MaLR -122 237 37 6 1677 249 197 32 16 chr5 143207035 143207097 -9330162 + MLT1A LTR MaLR 1 63 -404 6 1677 263 314 76 0 chr5 143207213 143207331 -9329928 + MLT1A LTR MaLR 197 323 -51 6 1677 2336 146 78 99 chr5 143209770 143210357 -9326902 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 6 1677 308 327 83 19 chr5 143210533 143210689 -9326570 + MLT1A LTR MaLR 241 406 -2 6 1677 486 309 17 43 chr5 143217017 143217247 -9320012 + RLTR15 LTR ERVK 1 224 -135 6 1677 1950 177 13 20 chr5 143218988 143219385 -9317874 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1678 657 303 124 10 chr5 143271438 143271745 -9265514 - MLT1B LTR MaLR -3 387 46 6 1678 342 194 16 0 chr5 143271849 143271911 -9265348 - ORR1E LTR MaLR 0 379 317 6 1678 350 308 48 105 chr5 143272145 143272407 -9264852 - ORR1E LTR MaLR -46 300 70 6 1678 3754 293 87 50 chr5 143272436 143273915 -9263344 - ORR1E-int LTR MaLR -41 1539 6 6 1678 661 299 118 84 chr5 143273923 143274270 -9262989 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 1678 275 329 12 0 chr5 143276923 143277005 -9260254 - MTEb LTR MaLR 0 379 297 6 1678 488 307 89 94 chr5 143277511 143277914 -9259345 + LTR40b LTR ERVL 53 453 -9 6 1678 1972 189 117 21 chr5 143282230 143282761 -9254498 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 582 -2 6 1678 577 219 225 24 chr5 143283042 143283327 -9253932 + ORR1D2 LTR MaLR 1 364 -6 6 1678 362 264 0 15 chr5 143283323 143283412 -9253847 + MTE2b LTR MaLR 18 100 -279 6 1678 1759 181 45 24 chr5 143283412 143283792 -9253467 + ORR1B1 LTR MaLR 1 388 -6 6 1678 890 253 38 29 chr5 143283789 143284029 -9253230 + MTE2b LTR MaLR 138 379 0 6 1678 736 245 95 78 chr5 143285796 143286193 -9251066 + RMER2 LTR ERV1 1 538 -29 6 1678 1538 244 42 150 chr5 143292475 143293043 -9244216 + RLTR18B LTR ERVK 1 507 -5 6 1678 288 235 61 12 chr5 143293391 143293473 -9243786 + MLT1C LTR MaLR 17 102 -365 6 1678 959 255 86 74 chr5 143297546 143297721 -9239538 + MTE2a LTR MaLR 18 183 -196 6 1678 4536 125 53 86 chr5 143297721 143298658 -9238601 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 6 1678 959 255 86 74 chr5 143298658 143298833 -9238426 + MTE2a LTR MaLR 184 372 -7 6 1678 1427 219 94 12 chr5 143300185 143300527 -9236732 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 1678 1793 150 38 32 chr5 143303093 143303437 -9233822 + MTC LTR MaLR 1 346 -75 6 1678 309 274 39 10 chr5 143309960 143310063 -9227196 + MLT1C LTR MaLR 238 343 -124 7 1679 2238 146 37 40 chr5 143413570 143414026 -9123233 - RMER4A LTR ERVK -11 455 1 7 1679 2369 121 62 3 chr5 143414514 143414904 -9122355 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 7 1679 325 310 67 33 chr5 143417282 143417492 -9119767 + RMER15 LTR ERVL 352 568 -7 7 1679 275 366 82 0 chr5 143417727 143417861 -9119398 + MLT1A1 LTR MaLR 264 408 0 7 1679 1138 230 106 40 chr5 143428263 143428585 -9108674 - MTEb LTR MaLR -3 376 34 7 1679 3845 40 84 19 chr5 143433187 143433674 -9103585 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 7 1679 1505 244 83 30 chr5 143439449 143439509 -9097750 - MTD LTR MaLR 0 419 364 7 1679 3508 30 2 0 chr5 143439509 143439904 -9097355 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1679 1505 244 83 30 chr5 143439904 143440241 -9097018 - MTD LTR MaLR -56 363 1 7 1679 347 327 5 113 chr5 143440656 143440842 -9096417 - RMER4A LTR ERVK -279 187 22 7 1679 2589 75 3 0 chr5 143441979 143442301 -9094958 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 7 1679 2078 120 102 6 chr5 143448534 143448869 -9088390 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 1679 985 185 77 0 chr5 143451121 143451324 -9085935 - MTD LTR MaLR -21 398 196 7 1679 335 257 68 19 chr5 143451686 143451789 -9085470 - MTD LTR MaLR -304 115 8 7 1679 262 269 62 70 chr5 143453387 143453515 -9083744 - RLTR25B LTR ERVK -461 567 441 7 1679 781 238 175 43 chr5 143507170 143507527 -9029732 + MTE2a LTR MaLR 16 419 0 3 1679 1715 231 84 24 chr5 143510649 143511101 -9026158 + RLTR20D LTR ERVK 90 568 0 1 1680 238 305 49 0 chr5 143523916 143523998 -9013261 + LTR16D1 LTR ERVL 344 429 -246 4 1680 230 316 49 73 chr5 143541046 143541169 -8996090 - RMER12 LTR ERVK -487 835 716 8 1680 496 229 24 73 chr5 143541118 143541283 -8995976 + MTE2b LTR MaLR 169 325 -54 8 1680 2434 62 58 0 chr5 143550742 143551051 -8986208 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1680 277 295 29 109 chr5 143551371 143551508 -8985751 + MT2B LTR ERVL 132 257 -344 1 1680 305 209 22 203 chr5 143552936 143553074 -8984185 + MT2B LTR ERVL 139 251 -350 1 1680 229 193 235 24 chr5 143587296 143587381 -8949878 + RMER15 LTR ERVL 384 486 -89 2 1680 2619 90 62 3 chr5 143587946 143588314 -8948945 + ORR1B1 LTR MaLR 2 391 -3 2 1680 2397 139 35 141 chr5 143589956 143590259 -8947000 - RMER6B LTR ERVK -3 458 203 2 1680 2397 139 35 141 chr5 143590392 143590599 -8946660 - RMER6B LTR ERVK -259 202 2 2 1680 2224 117 6 41 chr5 143592712 143592767 -8944492 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 284 2 1680 2224 117 6 41 chr5 143592959 143593241 -8944018 - ORR1A3 LTR MaLR -43 283 1 2 1680 458 267 33 27 chr5 143595589 143595739 -8941520 - RMER15 LTR ERVL -420 155 5 2 1680 264 295 94 65 chr5 143596029 143596167 -8941092 + MTEb LTR MaLR 231 372 -7 2 1680 279 271 0 59 chr5 143599280 143599382 -8937877 - MT2B LTR ERVL -350 251 156 2 1680 498 262 83 84 chr5 143602472 143602799 -8934460 - RMER13A LTR ERVK -222 405 30 2 1680 703 43 0 0 chr5 143605906 143605999 -8931260 - RLTR44D LTR ERVK -393 93 1 3 1680 328 173 115 98 chr5 143606026 143606148 -8931111 + MT2B LTR ERVL 141 264 -337 3 1680 1214 123 27 9 chr5 143606572 143606870 -8930389 - RMER17A LTR ERVK 0 751 550 3 1680 1732 159 185 83 chr5 143612576 143612663 -8924596 - MT2A LTR ERVL 0 533 463 3 1680 1732 159 185 83 chr5 143612718 143613110 -8924149 - MT2A LTR ERVL -71 462 5 3 1680 395 284 69 14 chr5 143627410 143627599 -8909660 - MTE2a LTR MaLR -16 403 196 3 1680 327 314 31 39 chr5 143628322 143628451 -8908808 + MLT1G3 LTR MaLR 225 352 -243 3 1680 321 203 110 142 chr5 143643979 143644134 -8893125 + MTC LTR MaLR 34 183 -238 4 1680 268 250 0 0 chr5 143644118 143644178 -8893081 + MTC LTR MaLR 360 419 0 4 1681 643 238 165 27 chr5 143660036 143660291 -8876968 + RLTR28B LTR ERVL 17 309 -215 4 1681 1461 168 173 24 chr5 143679164 143679499 -8857760 + MTC-int LTR MaLR 673 1057 -201 5 1681 261 160 0 0 chr5 143680070 143680120 -8857139 - MTC-int LTR MaLR -540 718 669 5 1681 286 218 75 25 chr5 143680542 143680622 -8856637 + RLTR25B LTR ERVK 426 509 -519 5 1681 375 148 44 22 chr5 143680723 143680813 -8856446 + MTC-int LTR MaLR 1134 1225 -33 5 1681 1549 199 90 41 chr5 143680837 143681054 -8856205 + MTC LTR MaLR 1 210 -211 5 1681 1549 199 90 41 chr5 143681238 143681408 -8855851 + MTC LTR MaLR 211 407 -14 5 1681 335 214 10 110 chr5 143683471 143683571 -8853688 + MT2B LTR ERVL 168 257 -344 5 1681 340 250 41 89 chr5 143691484 143691607 -8845652 - RLTR25A LTR ERVK -525 578 462 6 1681 304 260 87 11 chr5 143697436 143697563 -8839696 - LTR33B LTR ERVL -641 154 15 6 1681 275 204 42 85 chr5 143716503 143716621 -8820638 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 7 1681 341 248 17 133 chr5 143723078 143723102 -8814157 - MT2B LTR ERVL -291 310 241 7 1681 341 248 17 133 chr5 143723231 143723259 -8814000 - MT2B LTR ERVL -291 240 151 7 1681 242 286 81 89 chr5 143728404 143728527 -8808732 + MT2B LTR ERVL 123 244 -357 7 1681 374 233 45 91 chr5 143730610 143730742 -8806517 - MT2B LTR ERVL -337 264 139 7 1681 256 311 14 168 chr5 143733255 143733475 -8803784 - MT2B LTR ERVL -356 245 60 8 1681 678 166 110 38 chr5 143735709 143735961 -8801298 - ORR1B1 LTR MaLR -8 321 41 8 1681 294 280 127 58 chr5 143738707 143738912 -8798347 + MT2B2 LTR ERVL 47 265 -319 8 1681 273 223 143 26 chr5 143760288 143760379 -8776880 + MTD LTR MaLR 1 101 -320 9 1681 264 246 14 55 chr5 143761381 143761454 -8775805 - MTD LTR MaLR -319 100 31 9 1681 2213 99 63 17 chr5 143766376 143766727 -8770532 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 9 1681 3990 90 18 89 chr5 143766727 143767432 -8769827 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 9 1681 445 66 0 32 chr5 143767432 143767495 -8769764 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 9 1681 1690 123 4 15 chr5 143767484 143767749 -8769510 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 9 1681 888 88 24 0 chr5 143767744 143767869 -8769390 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 9 1681 24850 19 10 0 chr5 143767869 143770796 -8766463 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6478 -3 9 1681 2213 99 63 17 chr5 143770800 143771151 -8766108 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 9 1681 320 225 0 82 chr5 143780022 143780119 -8757140 + MT2B LTR ERVL 169 257 -344 9 1681 1585 173 130 0 chr5 143780473 143780820 -8756439 + MTC LTR MaLR 13 404 -17 9 1682 531 254 67 36 chr5 143787774 143787969 -8749290 + ERVL-E-int LTR ERVL 2361 2652 -3109 9 1682 478 322 142 19 chr5 143788347 143788670 -8748589 - MLT1E2 LTR MaLR -179 448 86 9 1682 308 279 23 0 chr5 143802104 143802190 -8735069 + MLT1B LTR MaLR 10 97 -293 1 1682 1030 159 20 10 chr5 143804225 143804428 -8732831 + RMER17C LTR ERVK 206 410 0 1 1682 991 224 181 7 chr5 143809640 143809950 -8727309 + MTE2b LTR MaLR 7 370 -9 1 1682 8216 104 27 23 chr5 143831244 143832967 -8704292 + RLTR45-int LTR ERVK 4746 6070 -1174 1 1682 7413 49 17 0 chr5 143832977 143833855 -8703404 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 1 1682 287 328 59 17 chr5 143834928 143835046 -8702213 + MER21B LTR ERV1 458 580 -283 1 1682 1603 139 4 19 chr5 143839688 143839959 -8697300 + MTC LTR MaLR 102 368 -53 1 1682 1832 159 142 0 chr5 143851013 143851358 -8685901 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1682 2867 168 160 72 chr5 143855712 143856541 -8680718 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 1682 405 310 65 34 chr5 143863825 143864116 -8673143 + MLT1A LTR MaLR 12 311 -63 1 1682 379 220 43 130 chr5 143876391 143876553 -8660706 - MLT1A0 LTR MaLR -213 152 5 1 1682 3205 140 30 82 chr5 143876809 143877345 -8659914 - RMER15 LTR ERVL 0 575 71 1 1682 3205 140 30 82 chr5 143877483 143877553 -8659706 - RMER15 LTR ERVL -505 70 1 1 1682 626 267 113 49 chr5 143879115 143879399 -8657860 + MTE2b LTR MaLR 2 303 -76 1 1682 409 261 48 4 chr5 143880744 143880881 -8656378 + MTE2a LTR MaLR 56 206 -213 1 1682 589 215 43 110 chr5 143881243 143881320 -8655939 + MTE2a LTR MaLR 167 236 -143 1 1682 589 215 43 110 chr5 143881515 143881646 -8655613 + MTE2a LTR MaLR 237 361 -18 1 1682 397 315 54 18 chr5 143884029 143884197 -8653062 + MLT1H LTR MaLR 64 237 -358 1 1682 258 222 99 0 chr5 143885020 143885101 -8652158 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 286 1 1682 542 305 59 94 chr5 143885728 143886267 -8650992 - MT2A LTR ERVL -6 548 1 1 1682 410 211 0 133 chr5 143891977 143892097 -8645162 + MT2B LTR ERVL 155 258 -343 1 1682 661 302 93 103 chr5 143892782 143892904 -8644355 - RLTR18 LTR ERVK -51 565 448 1 1682 3056 52 203 9 chr5 143892904 143893333 -8643926 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 1682 661 302 93 103 chr5 143893333 143893705 -8643554 - RLTR18 LTR ERVK -169 447 76 1 1682 4210 63 40 9 chr5 143895517 143896060 -8641199 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 1 1682 343 210 0 110 chr5 143900110 143900201 -8637058 - MT2B LTR ERVL -344 257 177 1 1682 336 214 53 97 chr5 143904276 143904376 -8632883 + MT2B LTR ERVL 175 268 -333 1 1682 336 214 53 97 chr5 143904531 143904544 -8632715 + MT2B LTR ERVL 269 282 -319 1 1682 443 248 56 80 chr5 143909543 143909576 -8627683 + MT2B LTR ERVL 129 252 -349 1 1682 2618 86 0 0 chr5 143913030 143913357 -8623902 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1682 3261 95 5 2 chr5 143913836 143914269 -8622990 - RLTR10C LTR ERVK -2 434 1 1 1683 2548 174 144 30 chr5 143917129 143917662 -8619597 + RMER19B LTR ERVK 309 902 0 1 1683 450 242 65 82 chr5 143917828 143918030 -8619229 - RMER4B LTR ERVK -58 553 279 1 1683 981 160 87 28 chr5 143918514 143918732 -8618527 - RMER4B LTR ERVK -338 247 17 1 1683 407 235 0 121 chr5 143921527 143921614 -8615645 + MLT1A0 LTR MaLR 71 156 -209 1 1683 407 235 0 121 chr5 143921786 143921814 -8615445 + MLT1A0 LTR MaLR 157 172 -193 1 1683 238 221 143 0 chr5 143921834 143921911 -8615348 + MLT1A0 LTR MaLR 269 356 -9 1 1683 3087 51 15 0 chr5 143922220 143922609 -8614650 - MTB LTR MaLR -5 395 1 1 1683 615 219 36 36 chr5 143923169 143923319 -8613940 - MLT1A0 LTR MaLR -208 157 6 1 1683 2407 97 19 0 chr5 143923439 143923760 -8613499 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1683 1139 264 62 56 chr5 143923990 143924368 -8612891 + MTE2a LTR MaLR 29 405 -14 1 1683 1944 101 81 0 chr5 143925373 143925669 -8611590 + ORR1A2 LTR MaLR 1 320 -7 1 1683 2299 78 69 75 chr5 143926091 143926452 -8610807 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 1 1683 1614 94 249 110 chr5 143929483 143929829 -8607430 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1683 1670 192 39 41 chr5 143933489 143933853 -8603406 + ORR1C1 LTR MaLR 5 367 -11 1 1683 1289 219 39 81 chr5 143938478 143938835 -8598424 + MTE2a LTR MaLR 16 357 -22 1 1683 627 286 36 52 chr5 143939972 143940164 -8597095 + MTE2a LTR MaLR 3 191 -188 1 1683 505 238 48 68 chr5 143940552 143940735 -8596524 + MTE2a LTR MaLR 194 412 -7 1 1683 383 328 106 47 chr5 143943294 143943633 -8593626 - MER67C LTR ERV1 -202 509 151 1 1683 328 288 145 47 chr5 143944006 143944146 -8593113 - MER67C LTR ERV1 -408 303 155 1 1683 328 288 145 47 chr5 143944315 143944429 -8592830 - MER67C LTR ERV1 -557 154 26 1 1683 240 288 69 43 chr5 143945963 143946079 -8591180 - LTR41 LTR ERVL -621 147 29 1 1683 3486 62 41 71 chr5 143947364 143947872 -8589387 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1683 26290 38 22 7 chr5 143947872 143951160 -8586099 + MERVL-int LTR ERVL 1 3338 -2147 1 1683 5732 58 9 1 chr5 143951157 143951988 -8585271 + MERVL-int LTR ERVL 4647 5629 -132 1 1683 275 181 26 53 chr5 143951988 143952064 -8585195 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 1 1683 275 0 0 26 chr5 143952064 143952103 -8585156 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1683 3635 64 13 69 chr5 143952103 143952625 -8584634 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1683 2070 117 42 60 chr5 143958736 143959071 -8578188 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1683 2114 141 10 0 chr5 143960178 143960484 -8576775 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 1 1683 1473 161 0 22 chr5 143960484 143960751 -8576508 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 7321 1 1683 764 334 25 32 chr5 143960893 143961523 -8575736 - MMERVK10C-int LTR ERVK -520 7061 6436 1 1683 814 58 0 0 chr5 143962070 143962173 -8575086 - IAP-d-int LTR ERVK -6385 157 55 1 1683 2157 137 10 0 chr5 143962249 143962555 -8574704 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 1 1683 2079 151 96 3 chr5 143967645 143967998 -8569261 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 1683 3126 94 63 0 chr5 143968916 143969363 -8567896 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1683 337 239 30 0 chr5 143970457 143970524 -8566735 + MTE2b LTR MaLR 90 158 -221 1 1683 1298 207 13 25 chr5 143970714 143970971 -8566288 + MTE2b LTR MaLR 114 351 -8 1 1683 412 322 102 37 chr5 143970938 143971245 -8566014 - MLT2B3 LTR ERVL -4 563 224 1 1683 230 305 128 13 chr5 143971469 143971625 -8565634 - MLT2B3 LTR ERVL -303 251 78 1 1683 332 364 52 41 chr5 143971509 143971681 -8565578 - MTEa LTR MaLR -203 176 3 1 1683 327 263 84 114 chr5 143972456 143972658 -8564601 - MTE2a LTR MaLR -183 196 1 1 1683 1764 176 44 50 chr5 143975203 143975764 -8561495 - RLTR22_Mur LTR ERVK -815 993 406 1 1683 1418 129 18 0 chr5 143975927 143976152 -8561107 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1451 397 169 1 1683 783 249 9 43 chr5 143976290 143976500 -8560759 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1645 203 1 1 1683 1731 137 164 6 chr5 143981054 143981371 -8555888 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1683 237 284 0 15 chr5 143983812 143983880 -8553379 + MT2A LTR ERVL 398 464 -69 1 1683 638 284 61 63 chr5 143983985 143984418 -8552841 + MTD-int LTR MaLR 5 523 -735 1 1683 774 267 59 80 chr5 143985079 143985427 -8551832 + MTD-int LTR MaLR 623 1235 -345 1 1683 429 239 92 35 chr5 143985409 143985582 -8551677 + MTD-int LTR MaLR 1066 1248 -10 1 1683 1188 263 144 14 chr5 143985590 143985945 -8551314 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 1 1683 247 167 179 36 chr5 143988060 143988116 -8549143 - MT2B2 LTR ERVL -327 257 194 1 1683 1123 274 71 63 chr5 143989357 143989723 -8547536 - MTE2a LTR MaLR -8 371 3 1 1683 2214 113 9 12 chr5 143989799 143990129 -8547130 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1683 470 286 0 55 chr5 143990446 143990609 -8546650 - MTEb-int LTR MaLR -1081 499 346 1 1683 1062 282 34 34 chr5 143990638 143990932 -8546327 - MTE2a LTR MaLR -7 372 79 1 1683 835 329 32 4 chr5 143991460 143991741 -8545518 - MTEb-int LTR MaLR -1289 291 3 1 1683 505 258 65 0 chr5 143992038 143992162 -8545097 - MTEb LTR MaLR -21 358 227 1 1683 529 220 0 10 chr5 143992262 143992363 -8544896 + MTE2b LTR MaLR 1 100 -279 1 1683 272 196 0 0 chr5 143992447 143992498 -8544761 - MTEb LTR MaLR -324 55 5 1 1683 414 326 112 28 chr5 143995424 143995746 -8541513 + MER67C LTR ERV1 161 509 -202 1 1683 891 231 154 36 chr5 143998194 143998441 -8538818 + MTE2a LTR MaLR 16 291 -88 1 1683 566 243 204 4 chr5 144004403 144004634 -8532625 - ORR1D1 LTR MaLR -97 277 1 1 1683 1076 229 179 13 chr5 144029557 144029875 -8507384 + MTEa LTR MaLR 1 371 -8 5 1683 1368 222 160 6 chr5 144033879 144034242 -8503017 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1683 340 275 122 63 chr5 144036693 144036996 -8500263 + MER31B LTR ERV1 53 373 -93 6 1683 967 262 56 54 chr5 144038070 144038564 -8498695 + RMER4B LTR ERVK 46 574 -11 7 1683 1578 183 251 5 chr5 144038568 144038990 -8498269 + RMER15 LTR ERVL 50 575 0 7 1683 3949 235 41 24 chr5 144038991 144039933 -8497326 + RMER15-int LTR ERVL 2 959 -4040 7 1683 4961 257 58 26 chr5 144040517 144041924 -8495335 + RMER15-int LTR ERVL 948 2399 -2600 7 1683 2988 224 63 16 chr5 144041956 144042714 -8494545 + RMER15-int LTR ERVL 4147 4940 -59 7 1683 408 282 86 0 chr5 144042751 144042868 -8494391 + MurERV4-int LTR ERVK 1609 1735 -3525 8 1683 3873 208 55 98 chr5 144042997 144043136 -8494123 + MYSERV6-int LTR ERVK 7756 7922 -1037 8 1683 3873 208 55 98 chr5 144043186 144044304 -8492955 + MYSERV6-int LTR ERVK 7923 8959 0 8 1683 1084 237 88 60 chr5 144044312 144044754 -8492505 + RMER4B LTR ERVK 17 534 -77 8 1683 303 213 147 11 chr5 144044792 144044833 -8492426 + RMER4B LTR ERVK 535 588 -23 8 1683 2542 147 44 69 chr5 144044855 144045374 -8491885 + RMER15 LTR ERVL 70 575 0 7 1683 425 248 166 25 chr5 144046275 144046432 -8490827 + RMER20B LTR ERVK 133 311 -316 8 1684 581 294 57 30 chr5 144059066 144059312 -8477947 - ORR1E LTR MaLR -117 253 1 1 1684 874 243 30 26 chr5 144059763 144059995 -8477264 + MTE2a LTR MaLR 137 369 -10 1 1684 2347 104 90 5 chr5 144064051 144064438 -8472821 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 1 1684 1920 99 112 0 chr5 144072346 144072640 -8464619 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1684 778 304 73 76 chr5 144096191 144096456 -8440803 + MTEa LTR MaLR 10 283 -96 2 1684 778 304 73 76 chr5 144096711 144096815 -8440444 + MTEa LTR MaLR 284 378 -1 2 1684 2686 153 50 31 chr5 144097493 144098011 -8439248 + RLTR20C LTR ERVK 1 528 -6 2 1684 564 242 194 31 chr5 144098083 144098305 -8438954 + MTE2a LTR MaLR 121 378 -1 2 1684 302 167 32 71 chr5 144099979 144100055 -8437204 + MLT1J2 LTR MaLR 369 448 0 2 1684 2251 137 61 13 chr5 144100109 144100501 -8436758 - MTC LTR MaLR -10 411 1 2 1684 247 261 0 14 chr5 144101025 144101095 -8436164 - MLT1B LTR MaLR -3 387 319 2 1684 927 211 93 17 chr5 144101328 144101564 -8435695 + MTD LTR MaLR 5 258 -161 2 1684 600 208 1 0 chr5 144101564 144101694 -8435565 + ORR1D1 LTR MaLR 1 131 -239 2 1684 8800 143 42 31 chr5 144102177 144103846 -8433413 + RMER16-int LTR ERVK 2489 4176 -1230 2 1684 476 254 0 53 chr5 144103843 144103976 -8433283 + ETnERV2-int LTR ERVK 6086 6211 -1195 2 1684 389 260 176 14 chr5 144104067 144104215 -8433044 + ETnERV2-int LTR ERVK 6251 6422 -984 2 1684 346 111 0 36 chr5 144104428 144104484 -8432775 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7384 -22 2 1684 1197 75 78 19 chr5 144104506 144104711 -8432548 + RLTR9A LTR ERVK 1 217 -151 2 1684 4401 50 3 14 chr5 144105072 144105642 -8431617 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 2 1684 2369 35 64 0 chr5 144105729 144106041 -8431218 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 15 2 1684 550 281 51 28 chr5 144106393 144106569 -8430690 - MER21B LTR ERV1 -654 209 30 2 1684 2377 130 31 40 chr5 144106612 144107068 -8430191 - RMER4A LTR ERVK -10 456 5 2 1684 440 269 7 84 chr5 144107616 144107758 -8429501 + MLT1B LTR MaLR 244 374 -16 2 1684 246 296 28 0 chr5 144110027 144110098 -8427161 + ORR1E LTR MaLR 8 80 -279 2 1684 356 211 18 18 chr5 144110132 144110225 -8427034 - MTD LTR MaLR -23 396 280 2 1684 4193 22 0 2 chr5 144110750 144111244 -8426015 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 1684 778 228 147 11 chr5 144111640 144111982 -8425277 - MTD LTR MaLR -2 417 6 2 1684 2574 208 64 64 chr5 144112208 144112818 -8424441 + RMER19C LTR ERVK 2 611 0 2 1684 2884 104 115 5 chr5 144113048 144113482 -8423777 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1684 2966 96 8 2 chr5 144113559 144113957 -8423302 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1684 361 198 21 62 chr5 144114149 144114200 -8423059 - MTEb LTR MaLR -8 371 320 2 1684 1279 235 113 12 chr5 144114200 144114544 -8422715 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 2 1684 361 198 21 62 chr5 144114544 144114589 -8422670 - MTEb LTR MaLR -60 319 279 2 1684 2087 142 12 6 chr5 144116166 144116491 -8420768 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 2 1684 286 264 11 75 chr5 144116580 144116592 -8420667 - MT2B2 LTR ERVL -344 238 153 2 1684 301 215 45 97 chr5 144124948 144125082 -8412177 - MT2B LTR ERVL -337 264 138 3 1684 523 242 145 68 chr5 144139888 144139963 -8397296 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 483 3 1684 523 242 145 68 chr5 144140014 144140186 -8397073 - RLTR20D LTR ERVK -86 482 304 3 1684 930 318 67 50 chr5 144141144 144141667 -8395592 - MT2A LTR ERVL -1 532 1 3 1684 227 299 19 110 chr5 144151385 144151539 -8385720 - MT2B LTR ERVL -331 270 131 3 1684 362 351 21 70 chr5 144159070 144159257 -8378002 + MLT1K LTR MaLR 1 178 -417 4 1684 550 264 79 9 chr5 144160331 144160516 -8376743 - MTD LTR MaLR -14 405 171 4 1684 304 308 0 0 chr5 144160659 144160737 -8376522 - MTD LTR MaLR -154 267 190 4 1684 309 263 0 59 chr5 144160768 144160869 -8376390 - MLT1B LTR MaLR -281 109 15 4 1684 353 363 43 16 chr5 144160921 144161106 -8376153 - RMER15 LTR ERVL -34 541 352 4 1685 232 305 8 0 chr5 144185652 144185780 -8351479 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 626 5 1685 3914 91 89 4 chr5 144185891 144186443 -8350816 - MT2B LTR ERVL -2 599 1 5 1685 2558 148 89 9 chr5 144187107 144187569 -8349690 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 5 1685 3174 6 5 47 chr5 144188291 144188674 -8348585 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1685 4361 91 84 28 chr5 144188674 144189379 -8347880 + IAPEz-int LTR ERVK 8 751 -5730 5 1685 10582 16 2 6 chr5 144191019 144192211 -8345048 + IAPEz-int LTR ERVK 4368 5554 -927 5 1685 7040 31 2 6 chr5 144192204 144193018 -8344241 + IAPEz-int LTR ERVK 5671 6481 0 5 1685 3174 6 5 47 chr5 144193018 144193401 -8343858 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1685 825 233 148 130 chr5 144193841 144194005 -8343254 - MTE2a LTR MaLR -20 359 169 5 1685 825 233 148 130 chr5 144194188 144194368 -8342891 - MTE2a LTR MaLR -211 168 10 5 1685 4995 160 34 55 chr5 144195574 144196496 -8340763 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 5 1685 482 295 70 76 chr5 144196633 144197003 -8340256 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1816 2183 -2507 5 1685 649 320 99 25 chr5 144197195 144197628 -8339631 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 2633 3028 -4573 5 1685 3180 141 228 93 chr5 144198025 144198778 -8338481 + RMER19B LTR ERVK 1 867 -35 5 1685 3180 141 228 93 chr5 144199126 144199153 -8338106 + RMER19B LTR ERVK 868 886 -16 5 1685 516 290 71 28 chr5 144203154 144203440 -8333819 + IAPEY3-int LTR ERVK 3071 3499 -4181 5 1685 1615 139 14 28 chr5 144203472 144203756 -8333503 - RMER19B LTR ERVK 0 902 359 5 1685 525 224 198 139 chr5 144203763 144203783 -8333476 - RMER19B LTR ERVK -123 488 469 5 1685 707 162 266 59 chr5 144203974 144204195 -8333064 - RMER19B LTR ERVK -238 664 237 5 1685 4970 161 45 0 chr5 144204398 144205204 -8332055 - RMER19B LTR ERVK -11 891 50 5 1685 258 289 109 15 chr5 144206097 144206234 -8331025 + ETnERV2-int LTR ERVK 5390 5539 -1867 5 1685 1316 105 184 21 chr5 144207478 144207768 -8329491 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 24 5 1685 2906 112 31 14 chr5 144209381 144209826 -8327433 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 5 1685 4626 238 87 63 chr5 144209885 144211318 -8325941 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -73 2253 767 5 1685 4626 238 87 63 chr5 144211501 144211776 -8325483 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1560 766 505 5 1685 6777 206 39 31 chr5 144211808 144212921 -8324338 - MYSERV6-int LTR ERVK -4344 4615 2618 5 1685 6777 202 38 32 chr5 144213064 144213493 -8323766 - MYSERV6-int LTR ERVK -5445 3514 3110 5 1685 2266 74 3 119 chr5 144214738 144215107 -8322152 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1685 5673 227 54 47 chr5 144219864 144221372 -8315887 - MYSERV6-int LTR ERVK -5835 3124 1606 5 1685 1825 336 43 35 chr5 144221486 144222716 -8314543 - MYSERV6-int LTR ERVK -7402 1557 58 5 1685 2662 122 56 34 chr5 144223722 144224165 -8313094 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 5 1685 410 171 25 217 chr5 144229505 144229536 -8307723 + MT2B LTR ERVL 163 287 -314 5 1685 726 227 132 52 chr5 144240438 144240689 -8296570 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 104 6 1685 1738 221 136 82 chr5 144243126 144243544 -8293715 - RLTR40 LTR ERVK -47 770 288 6 1685 1738 221 136 82 chr5 144243567 144243624 -8293635 - RLTR40 LTR ERVK -530 287 240 6 1685 1738 221 136 82 chr5 144243748 144243976 -8293283 - RLTR40 LTR ERVK -578 239 28 6 1685 5013 214 88 63 chr5 144246364 144247373 -8289886 + RLTR21 LTR ERVK 1 1048 -524 6 1685 5013 214 88 63 chr5 144247410 144247934 -8289325 + RLTR21 LTR ERVK 1049 1572 0 6 1685 3270 131 64 138 chr5 144257829 144258643 -8278616 - RMER6A LTR ERVK 0 756 3 7 1685 237 278 0 93 chr5 144276208 144276315 -8260944 + MT2B2 LTR ERVL 169 265 -319 7 1685 3273 48 13 0 chr5 144276558 144276952 -8260307 + MTB LTR MaLR 2 400 0 7 1685 3405 43 2 0 chr5 144292755 144293150 -8244109 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1685 250 214 34 32 chr5 144294855 144294933 -8242326 - MLT1A0 LTR MaLR -2 372 286 8 1685 367 306 0 93 chr5 144297465 144297616 -8239643 + MT2B LTR ERVL 131 267 -334 8 1685 1169 269 63 19 chr5 144299299 144299652 -8237607 - RMER19C LTR ERVK -151 460 2 8 1685 1179 218 10 40 chr5 144299664 144299960 -8237299 - RodERV21-int LTR ERV1 -1976 3015 2729 8 1685 286 317 50 61 chr5 144302082 144302506 -8234753 - RodERV21-int LTR ERV1 -3034 4057 3639 8 1685 4100 200 96 32 chr5 144302825 144303839 -8233420 - RodERV21-int LTR ERV1 -2280 2711 1633 8 1685 936 220 73 16 chr5 144303848 144304093 -8233166 + RMER4B LTR ERVK 19 277 -308 8 1685 285 183 167 0 chr5 144304105 144304165 -8233094 + RMER4B LTR ERVK 343 412 -173 8 1685 1537 185 18 18 chr5 144304245 144304526 -8232733 - RodERV21-int LTR ERV1 -3351 1640 1360 8 1685 436 203 108 7 chr5 144304650 144304789 -8232470 - RodERV21-int LTR ERV1 -4578 413 261 8 1685 699 225 82 6 chr5 144304904 144305087 -8232172 - RodERV21-int LTR ERV1 -4782 209 13 8 1685 229 275 228 11 chr5 144305151 144305243 -8232016 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 456 8 1685 443 132 0 14 chr5 144305285 144305354 -8231905 + RMER4B LTR ERVK 99 166 -419 8 1685 1109 211 147 51 chr5 144305359 144305812 -8231447 - RMER4B LTR ERVK -37 548 17 8 1685 2810 150 80 13 chr5 144306313 144306839 -8230420 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 8 1685 846 310 51 27 chr5 144306893 144307188 -8230071 - RMER15 LTR ERVL -1 574 273 8 1685 247 259 30 145 chr5 144307215 144307346 -8229913 - RMER15 LTR ERVL -445 130 15 8 1685 1341 70 0 26 chr5 144307891 144308081 -8229178 - MTB_Mm LTR MaLR -222 185 1 8 1685 327 197 15 15 chr5 144308172 144308239 -8229020 - MTD LTR MaLR -12 409 343 8 1685 651 257 8 120 chr5 144308519 144308713 -8228546 - MTD LTR MaLR -211 208 35 8 1685 638 250 5 143 chr5 144308929 144308966 -8228293 - MTD LTR MaLR -387 34 3 8 1686 236 216 12 119 chr5 144315401 144315485 -8221774 + RLTR25B LTR ERVK 430 504 -524 8 1686 3509 23 0 29 chr5 144316910 144317318 -8219941 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1686 239 312 44 35 chr5 144325468 144325581 -8211678 + RMER4A LTR ERVK 274 387 -79 9 1686 2169 164 114 26 chr5 144334410 144334867 -8202392 - MT2A LTR ERVL -5 528 32 9 1686 774 278 101 8 chr5 144336603 144336850 -8200409 - MTE2b LTR MaLR -5 374 105 9 1686 390 269 0 0 chr5 144337205 144337288 -8199971 - MTE2b LTR MaLR -274 105 22 9 1686 482 272 48 30 chr5 144339103 144339290 -8197969 - MTE2a LTR MaLR -186 233 46 9 1686 230 182 91 0 chr5 144339404 144339448 -8197811 - MTE2a LTR MaLR -327 52 5 9 1686 2085 183 65 10 chr5 144339949 144340346 -8196913 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1686 268 253 0 74 chr5 144341158 144341217 -8196042 + MLT1A1 LTR MaLR 301 356 -52 9 1686 268 253 0 74 chr5 144341430 144341446 -8195813 + MLT1A1 LTR MaLR 357 370 -38 9 1686 241 197 111 14 chr5 144345770 144345842 -8191417 + MT2B LTR ERVL 162 240 -361 1 1686 3678 115 18 25 chr5 144348247 144348807 -8188452 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -1 556 1 1 1686 367 219 14 0 chr5 144349079 144349152 -8188107 - ORR1D2 LTR MaLR -296 74 1 1 1686 2436 131 13 10 chr5 144351311 144351704 -8185555 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1686 2408 127 64 11 chr5 144356649 144357023 -8180236 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1686 7110 163 71 13 chr5 144357025 144358449 -8178810 + ORR1B1-int LTR MaLR 3 1509 0 1 1686 2219 138 80 6 chr5 144358449 144358814 -8178445 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 1 1686 1120 251 39 55 chr5 144359064 144359462 -8177797 - MTE2a LTR MaLR -12 407 3 1 1686 423 200 0 0 chr5 144367424 144367504 -8169755 + MTD LTR MaLR 119 198 -221 1 1686 599 225 42 0 chr5 144367517 144367637 -8169622 + MTD LTR MaLR 251 375 -44 1 1686 333 301 50 65 chr5 144371030 144371229 -8166030 - RMER15 LTR ERVL -80 495 300 1 1686 320 235 81 23 chr5 144377689 144377776 -8159483 - RMER15 LTR ERVL -160 415 324 1 1686 552 283 100 35 chr5 144386903 144387371 -8149888 + LTR33A_ LTR ERVL 1 523 -8 1 1686 795 255 93 0 chr5 144406884 144407088 -8130171 - MTEa LTR MaLR -1 378 156 1 1686 1364 269 62 17 chr5 144407836 144408276 -8128983 - BGLII_B LTR ERVK -10 431 10 1 1686 1012 213 111 21 chr5 144411982 144412270 -8124989 + MLT1A0 LTR MaLR 45 358 -7 1 1686 303 415 0 0 chr5 144412822 144412957 -8124302 - MLT1N2 LTR MaLR 0 562 428 1 1686 244 200 55 0 chr5 144415075 144415130 -8122129 - RMER15 LTR ERVL -96 479 422 1 1686 248 248 82 82 chr5 144415216 144415326 -8121933 - RMER15 LTR ERVL -417 158 49 1 1686 261 206 0 81 chr5 144428966 144429030 -8108229 + RLTR25A LTR ERVK 515 572 -531 1 1686 254 260 65 0 chr5 144431734 144431811 -8105448 + ORR1D1 LTR MaLR 44 125 -234 1 1686 260 309 65 9 chr5 144431957 144432065 -8105194 + ORR1D1 LTR MaLR 257 370 -4 1 1686 508 284 82 87 chr5 144436055 144436410 -8100849 - MLT1H LTR MaLR -123 426 74 1 1687 899 238 108 108 chr5 144443998 144444370 -8092889 + MTE2a LTR MaLR 6 377 -2 1 1687 327 307 62 51 chr5 144448475 144448817 -8088442 - MLT1A LTR MaLR -25 365 3 1 1687 511 265 101 14 chr5 144450518 144450742 -8086517 - MLT1C LTR MaLR -18 449 222 1 1687 413 245 94 24 chr5 144455125 144455328 -8081931 - MTC LTR MaLR -15 404 196 1 1687 575 301 103 5 chr5 144455960 144456154 -8081105 - MTC LTR MaLR -208 213 1 1 1687 317 259 65 2 chr5 144458918 144459073 -8078186 - MTEb LTR MaLR -7 372 199 1 1687 630 215 54 27 chr5 144459282 144459430 -8077829 - MTEb LTR MaLR -227 152 1 1 1687 1763 103 114 0 chr5 144460015 144460288 -8076971 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 24 1 1687 2080 225 88 42 chr5 144460660 144461204 -8076055 - RMER4B LTR ERVK 0 585 17 1 1687 662 267 138 36 chr5 144462663 144462997 -8074262 - MTE2a LTR MaLR -9 370 3 1 1687 2448 73 6 0 chr5 144501125 144501442 -8035817 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 3 1687 11224 106 123 2 chr5 144501447 144503197 -8034062 + ORR1A2-int LTR MaLR 2 1963 0 3 1687 2587 80 3 3 chr5 144503197 144503524 -8033735 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1687 662 365 60 16 chr5 144524778 144525148 -8012111 + MER74B LTR ERVL 74 459 -163 6 1687 240 247 62 41 chr5 144525287 144525384 -8011875 + MER74B LTR ERVL 446 544 -78 6 1687 1846 143 66 32 chr5 144530514 144530861 -8006398 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 8 1687 2500 109 211 63 chr5 144534195 144534722 -8002537 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 605 -49 9 1687 65837 13 12 1 chr5 144534722 144542414 -7994845 + RLTR6-int LTR ERV1 1 7778 0 9 1687 2373 110 220 63 chr5 144542414 144542919 -7994340 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 584 -70 9 1687 1460 239 25 50 chr5 144544519 144544880 -7992379 - MT2A LTR ERVL -85 448 97 9 1687 4338 27 0 0 chr5 144546583 144547065 -7990194 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 9 1687 439 353 76 33 chr5 144547173 144547448 -7989811 + MER74B LTR ERVL 86 372 -250 1 1687 493 253 107 114 chr5 144547533 144547926 -7989333 + RLTR12B LTR ERVK 132 521 -7 1 1687 3010 18 3 0 chr5 144548263 144548599 -7988660 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1687 55628 15 5 0 chr5 144548614 144555024 -7982235 + IAPEz-int LTR ERVK 40 6481 0 1 1687 3010 18 3 0 chr5 144555024 144555360 -7981899 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1687 437 264 52 89 chr5 144555448 144555579 -7981680 + MTEa LTR MaLR 256 379 0 1 1687 1973 249 71 44 chr5 144555579 144556165 -7981094 + MTEa-int LTR MaLR 1 602 -978 1 1687 577 275 25 6 chr5 144556165 144556326 -7980933 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 267 1 1687 538 286 141 0 chr5 144556394 144556586 -7980673 + MTEb LTR MaLR 138 356 -23 1 1687 2680 26 2 251 chr5 144556586 144557105 -7980154 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 1687 15519 36 45 34 chr5 144557107 144559097 -7978162 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 4 1 1687 2585 26 2 273 chr5 144559319 144559851 -7977408 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 1 1687 615 200 53 40 chr5 144560318 144560469 -7976790 + MTD LTR MaLR 1 153 -266 1 1687 1281 186 52 25 chr5 144560551 144560838 -7976421 + MTD LTR MaLR 125 413 -6 1 1687 400 270 23 155 chr5 144562953 144563172 -7974087 + RMER15 LTR ERVL 4 193 -382 1 1687 857 203 198 0 chr5 144563192 144563389 -7973870 + RMER15 LTR ERVL 326 561 -14 1 1687 4398 80 10 7 chr5 144567100 144567682 -7969577 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 1 1687 249 295 121 102 chr5 144568486 144568652 -7968607 - MLT1A1 LTR MaLR -239 169 1 1 1687 1140 193 94 29 chr5 144571421 144571763 -7965496 + ORR1A4-int LTR MaLR 619 982 -981 1 1687 1387 107 19 0 chr5 144571759 144571965 -7965294 + ORR1A4 LTR MaLR 120 329 0 1 1687 685 247 28 88 chr5 144572066 144572246 -7965013 - MTE2b LTR MaLR -7 372 204 1 1688 687 260 44 105 chr5 144572576 144572804 -7964455 - MTE2b LTR MaLR -165 214 1 1 1688 2820 38 0 47 chr5 144573988 144574040 -7963219 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 304 1 1688 2820 38 0 47 chr5 144574230 144574540 -7962719 - ORR1A0 LTR MaLR -43 303 1 1 1688 427 250 8 49 chr5 144575050 144575172 -7962087 + MTD LTR MaLR 8 124 -295 1 1688 1810 107 131 13 chr5 144575389 144575702 -7961557 + MTC LTR MaLR 55 404 -17 1 1688 526 216 85 2 chr5 144575720 144575849 -7961410 + MTD LTR MaLR 238 405 -14 1 1688 461 215 7 136 chr5 144576225 144576265 -7960994 + MT2B LTR ERVL 136 157 -444 1 1688 2394 162 38 36 chr5 144640774 144641249 -7896010 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 6 2 1688 1024 198 61 0 chr5 144646899 144647096 -7890163 - ORR1D1 LTR MaLR -165 209 1 2 1688 447 154 88 25 chr5 144647924 144648004 -7889255 + MTE2a LTR MaLR 1 85 -294 2 1688 1078 265 100 7 chr5 144648119 144648419 -7888840 + MTE2a LTR MaLR 52 379 0 2 1688 772 204 75 65 chr5 144669013 144669361 -7867898 - RMER10A LTR ERVL -9 433 1 3 1688 285 205 73 49 chr5 144669372 144669454 -7867805 + RLTR25B LTR ERVK 426 509 -519 3 1688 874 249 27 22 chr5 144673255 144673477 -7863782 - RMER15 LTR ERVL -1 574 352 3 1688 405 231 22 0 chr5 144676185 144676276 -7860983 - MTD LTR MaLR -326 93 1 3 1688 1470 197 162 0 chr5 144678827 144679184 -7858075 - MTD LTR MaLR -14 405 6 3 1688 282 228 86 129 chr5 144685142 144685156 -7852103 + MT2B LTR ERVL 155 163 -438 3 1688 433 319 60 16 chr5 144693432 144693617 -7843642 + MLT1D LTR MaLR 1 193 -312 3 1688 373 252 9 104 chr5 144695356 144695471 -7841788 + MT2B LTR ERVL 155 258 -343 3 1688 665 48 0 0 chr5 144696997 144697081 -7840178 - BGLII LTR ERVK -337 84 1 3 1688 1122 251 186 12 chr5 144700954 144701293 -7835966 + MTD LTR MaLR 8 405 -14 4 1689 420 322 72 37 chr5 144705943 144706199 -7831060 - ORR1D2 LTR MaLR -37 342 63 4 1689 420 338 97 40 chr5 144706307 144706360 -7830899 - ORR1D2 LTR MaLR -308 62 9 4 1689 471 285 46 114 chr5 144707032 144707313 -7829946 + ORR1E LTR MaLR 96 357 -2 4 1689 1022 253 98 74 chr5 144709513 144709880 -7827379 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 4 1689 1943 190 30 11 chr5 144719986 144720359 -7816900 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 4 1689 2878 54 84 3 chr5 144725925 144726295 -7810964 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1689 336 297 108 66 chr5 144731905 144732071 -7805188 - MTEb LTR MaLR 0 379 207 4 1689 358 236 17 117 chr5 144732305 144732425 -7804834 - MT2B LTR ERVL -344 257 150 4 1689 2764 245 60 53 chr5 144733687 144734751 -7802508 - RMER12B LTR ERVK 0 1572 515 4 1689 2468 221 24 49 chr5 144734894 144735445 -7801814 - RMER12B LTR ERVK -867 537 1 4 1689 1994 88 62 36 chr5 144735608 144735650 -7801609 - ORR1A2 LTR MaLR -12 315 282 5 1689 1994 88 62 36 chr5 144735828 144736091 -7801168 - ORR1A2 LTR MaLR -46 281 2 5 1689 832 144 153 5 chr5 144743854 144744050 -7793209 - RMER17C LTR ERVK 0 410 186 5 1689 913 217 84 46 chr5 144745256 144745618 -7791641 - RMER17B LTR ERVK 0 410 1 5 1689 1715 128 14 126 chr5 144747988 144748345 -7788914 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 5 5 1689 328 243 326 17 chr5 144756636 144756720 -7780539 + MTB_Mm LTR MaLR 130 225 -182 5 1689 328 226 93 29 chr5 144756768 144756878 -7780381 + MTB_Mm LTR MaLR 226 391 -28 5 1689 271 195 1154 29 chr5 144756982 144756995 -7780264 + MTB_Mm LTR MaLR 371 377 -44 5 1689 272 120 0 1 chr5 144757172 144757215 -7780044 + MTB_Mm LTR MaLR 376 419 -2 5 1689 1555 196 39 75 chr5 144766121 144766508 -7770751 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 5 1689 1224 162 29 0 chr5 144766686 144766890 -7770369 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 169 5 1689 378 174 47 75 chr5 144767023 144767129 -7770130 - ORR1C1 LTR MaLR -215 163 61 5 1689 231 59 118 0 chr5 144767324 144767358 -7769901 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 289 5 1689 1279 94 6 0 chr5 144767958 144768128 -7769131 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 115 5 1689 3919 158 97 1 chr5 144768118 144768914 -7768345 - ORR1A2-int LTR MaLR -1091 872 1 5 1689 266 206 25 76 chr5 144768914 144768966 -7768293 - ORR1A2 LTR MaLR -336 48 1 5 1689 1505 249 44 60 chr5 144780086 144780414 -7756845 + MTE2b LTR MaLR 1 339 -40 6 1689 1505 249 44 60 chr5 144780605 144780661 -7756598 + MTE2b LTR MaLR 340 379 0 6 1689 472 228 7 124 chr5 144793138 144793283 -7743976 - MT2B LTR ERVL -337 264 137 6 1689 275 231 167 0 chr5 144794083 144794161 -7743098 + MTEa LTR MaLR 2 92 -287 6 1689 491 265 105 23 chr5 144794312 144794560 -7742699 + MTEa LTR MaLR 92 377 -2 6 1689 2148 196 12 12 chr5 144799973 144800377 -7736882 - MTD LTR MaLR -15 404 1 7 1689 1898 163 56 6 chr5 144800866 144801205 -7736054 + ORR1B1 LTR MaLR 39 394 0 7 1689 444 301 40 8 chr5 144803338 144803462 -7733797 - ORR1E LTR MaLR -231 128 1 7 1689 522 263 146 10 chr5 144807214 144807419 -7729840 + MLT2B2 LTR ERVL 217 450 -65 7 1689 4480 75 19 0 chr5 144811273 144811845 -7725414 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 2 7 1689 462 281 126 17 chr5 144812914 144813017 -7724242 + MLT1B LTR MaLR 8 129 -261 7 1689 462 281 126 17 chr5 144813173 144813243 -7724016 + MLT1B LTR MaLR 130 199 -191 7 1689 293 313 109 58 chr5 144813395 144813551 -7723708 + MLT1B LTR MaLR 194 357 -33 7 1689 278 273 54 43 chr5 144817622 144817714 -7719545 - MLT1B LTR MaLR -297 93 1 8 1689 3936 98 5 71 chr5 144818024 144818631 -7718628 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 8 1689 3301 16 2 56 chr5 144819982 144820392 -7716867 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 8 1689 3157 42 45 0 chr5 144820966 144821346 -7715913 + MTB LTR MaLR 4 400 0 8 1689 1061 231 151 13 chr5 144822572 144822884 -7714375 + ORR1D2 LTR MaLR 16 370 0 8 1689 359 253 149 77 chr5 144823984 144824246 -7713013 - MLT1C LTR MaLR -69 398 97 8 1689 3263 50 2 20 chr5 144824390 144824797 -7712462 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1689 397 296 65 72 chr5 144827750 144827903 -7709356 + MER89 LTR ERV1 199 350 -209 8 1689 2438 183 259 10 chr5 144828367 144828957 -7708302 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 8 1689 1399 210 166 99 chr5 144830130 144830495 -7706764 - MT2A LTR ERVL -71 462 64 8 1689 5617 133 39 50 chr5 144830495 144831463 -7705796 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 8 1689 1399 210 166 99 chr5 144831463 144831530 -7705729 - MT2A LTR ERVL -470 63 1 8 1689 351 66 0 0 chr5 144832587 144832648 -7704611 - MT2A LTR ERVL 0 533 473 8 1689 1711 175 159 95 chr5 144832884 144833325 -7703934 - MT2A LTR ERVL -64 469 1 8 1689 251 245 80 47 chr5 144833431 144833581 -7703678 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1306 1460 -388 8 211 511 196 20 49 chr5 144834551 144834653 -7702606 - MTE2b LTR MaLR 0 379 281 8 1690 1007 263 71 26 chr5 144834659 144834967 -7702292 + RLTR14 LTR ERV1 12 333 -49 8 1690 587 256 71 59 chr5 144835424 144835594 -7701665 - MTE2b LTR MaLR -127 252 81 8 1690 398 261 98 43 chr5 144835646 144835748 -7701511 - MTE2b LTR MaLR -309 112 3 8 1690 297 210 105 48 chr5 144837548 144837653 -7699606 - MTEb LTR MaLR -17 362 252 8 1690 373 250 51 43 chr5 144837590 144837601 -7699658 + MT2B LTR ERVL 154 201 -400 8 1690 267 257 91 66 chr5 144837642 144837763 -7699496 + RLTR25B LTR ERVK 451 574 -454 8 1690 373 250 51 43 chr5 144837694 144837707 -7699552 + MT2B LTR ERVL 202 271 -330 8 1690 444 309 79 83 chr5 144838417 144838671 -7698588 + MLT1J LTR MaLR 258 510 -2 8 1690 556 342 66 8 chr5 144838684 144838940 -7698319 - MLT1N2 LTR MaLR 0 562 292 8 1690 295 311 15 105 chr5 144839663 144839678 -7697581 + MT2B LTR ERVL 156 158 -443 8 1690 590 228 156 0 chr5 144841031 144841198 -7696061 - ORR1D1 LTR MaLR -174 200 8 8 1690 243 268 107 14 chr5 144841479 144841619 -7695640 - RLTR21 LTR ERVK -330 1242 1090 8 1690 1419 145 144 58 chr5 144845109 144845453 -7691806 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 13 9 1690 1337 102 4 41 chr5 144845468 144845713 -7691546 + RMER10B LTR ERVL 30 265 -133 9 1690 1131 148 9 47 chr5 144845710 144845922 -7691337 + RMER10B LTR ERVL 195 398 0 9 1690 2040 164 31 0 chr5 144848138 144848461 -7688798 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 167 9 1690 1361 67 6 16 chr5 144848767 144848950 -7688309 - RLTR19 LTR ERVK -318 181 1 9 1690 3058 16 2 140 chr5 144851559 144852009 -7685250 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 9 1690 8105 31 16 31 chr5 144852011 144853014 -7684245 + RLTR10-int LTR ERVK 1 988 -999 9 1690 9073 15 2 0 chr5 144853092 144854085 -7683174 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 9 1690 2953 18 2 171 chr5 144854087 144854554 -7682705 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 9 1690 280 207 0 79 chr5 144855441 144855530 -7681729 + RLTR25B LTR ERVK 432 513 -515 9 1690 3325 120 18 8 chr5 144857299 144857793 -7679466 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 9 1690 2258 137 59 16 chr5 144864070 144864457 -7672802 + MTB_Mm LTR MaLR 3 406 -1 9 1690 288 357 137 32 chr5 144878616 144878931 -7658328 - ORR1E LTR MaLR 0 359 12 1 1690 1762 117 94 76 chr5 144879268 144879500 -7657759 + ORR1B1 LTR MaLR 47 288 -106 1 1690 1762 117 94 76 chr5 144879691 144879797 -7657462 + ORR1B1 LTR MaLR 289 393 -1 1 1690 762 279 44 66 chr5 144883441 144883760 -7653499 + MLT1B LTR MaLR 54 365 -25 1 1690 436 239 35 26 chr5 144884448 144884564 -7652695 + MLT1B LTR MaLR 350 466 -1 1 1690 269 284 12 24 chr5 144886142 144886225 -7651034 + RMER15 LTR ERVL 454 535 -40 1 1690 239 267 45 34 chr5 144887693 144887708 -7649551 + MT2B LTR ERVL 152 167 -434 1 1690 1189 207 154 21 chr5 144896110 144896440 -7640819 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1690 3152 42 34 5 chr5 144901068 144901453 -7635806 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1690 262 184 41 0 chr5 144904645 144904694 -7632565 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 312 1 1690 572 239 137 11 chr5 144913008 144913245 -7624014 + ORR1D1 LTR MaLR 1 261 -109 1 1690 472 198 39 22 chr5 144929753 144929934 -7607325 + RMER17C LTR ERVK 91 274 -136 1 1690 227 259 17 33 chr5 144962922 144962982 -7574277 - MT2B2 LTR ERVL -340 244 186 1 1691 316 256 277 15 chr5 144969744 144969946 -7567313 + MTE2b LTR MaLR 119 373 -6 1 1691 385 234 78 25 chr5 144971955 144972090 -7565169 + MTD LTR MaLR 240 397 -22 1 1691 1710 175 178 29 chr5 144981617 144982000 -7555259 + RMER10A LTR ERVL 3 442 0 1 1691 325 243 0 0 chr5 144986244 144986314 -7550945 + MTE2b LTR MaLR 255 324 -55 1 1691 589 253 125 26 chr5 144986989 144987293 -7549966 - RMER17C LTR ERVK 0 410 77 1 1691 2294 112 25 3 chr5 144988029 144988351 -7548908 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1691 1841 149 69 9 chr5 144989189 144989521 -7547738 + ORR1B2 LTR MaLR 16 367 0 1 1691 2811 62 8 3 chr5 144989939 144990330 -7546929 + MTB LTR MaLR 1 393 -7 1 1691 1691 162 219 33 chr5 144991102 144991491 -7545768 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 1 1691 325 285 42 140 chr5 144993354 144993640 -7543619 + ORR1E LTR MaLR 97 354 -5 1 1691 294 256 102 91 chr5 144993797 144993958 -7543301 + RMER20B LTR ERVK 2 161 -355 1 1691 1547 178 58 77 chr5 144995177 144995555 -7541704 + MTE2a LTR MaLR 8 378 -1 1 1691 1406 175 141 16 chr5 144995844 144996163 -7541096 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 24 1 1691 379 305 94 22 chr5 145000142 145000321 -7536938 + LTR29 LTR ERV1 128 319 -303 1 1691 326 242 10 59 chr5 145000574 145000675 -7536584 + RMER10A LTR ERVL 1 96 -346 3 1691 1262 195 56 148 chr5 145001298 145001518 -7535741 - MTD LTR MaLR -14 405 211 6 1691 1262 195 56 148 chr5 145001664 145001678 -7535581 - MTD LTR MaLR -209 210 210 8 1691 1262 195 56 148 chr5 145001931 145002086 -7535173 - MTD LTR MaLR -209 210 51 6 1691 235 290 78 20 chr5 145002204 145002306 -7534953 - ORR1E LTR MaLR -172 187 80 1 1691 651 286 104 5 chr5 145002824 145003141 -7534118 + MTEb LTR MaLR 15 379 0 1 1691 1394 209 79 6 chr5 145005764 145006106 -7531153 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 2 1691 1975 184 74 30 chr5 145008159 145008618 -7528641 - RLTR11A2 LTR ERVK -48 479 1 3 1691 973 200 115 29 chr5 145012451 145012729 -7524530 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 68 4 1691 788 204 131 28 chr5 145012753 145013005 -7524254 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 97 4 1691 3401 15 2 0 chr5 145023407 145023802 -7513457 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1691 692 83 161 37 chr5 145028117 145028279 -7508980 - RMER17B LTR ERVK -500 458 277 8 1691 264 296 174 0 chr5 145059520 145059618 -7477641 + MTEa LTR MaLR 2 116 -263 1 1691 432 331 31 21 chr5 145067522 145067713 -7469546 + ORR1E LTR MaLR 1 193 -166 1 1691 412 338 94 61 chr5 145072471 145072730 -7464529 - MER21B LTR ERV1 -108 755 496 2 1691 412 316 93 52 chr5 145072874 145073229 -7464030 - MER21B LTR ERV1 -368 495 23 2 1691 1765 192 73 42 chr5 145077272 145077680 -7459579 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1691 1807 161 74 83 chr5 145090489 145090599 -7446660 + MTC LTR MaLR 1 111 -310 2 1691 1807 161 74 83 chr5 145090786 145090880 -7446379 + MTC LTR MaLR 112 197 -224 2 1691 1807 161 74 83 chr5 145091051 145091265 -7445994 + MTC LTR MaLR 198 416 -5 2 1692 270 253 187 29 chr5 145097817 145097988 -7439271 + MLT2C1 LTR ERVL 15 212 -185 2 1692 1472 217 69 13 chr5 145129504 145129821 -7407438 + MTE2b LTR MaLR 42 376 -3 3 1692 240 158 128 116 chr5 145130027 145130113 -7407146 - MTE2b LTR MaLR 0 379 293 3 1692 1518 234 86 8 chr5 145130115 145130486 -7406773 - MTD LTR MaLR -14 405 6 3 1692 381 296 0 0 chr5 145130504 145130592 -7406667 - MTE2b LTR MaLR -90 289 202 3 1692 522 159 0 0 chr5 145138037 145138105 -7399154 + ORR1A2 LTR MaLR 1 68 -261 4 1692 1910 123 22 15 chr5 145138105 145138479 -7398780 + ORR1A2 LTR MaLR 1 394 0 4 1692 1087 121 0 6 chr5 145138479 145138645 -7398614 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 165 -1798 4 1692 1115 127 0 0 chr5 145138636 145138802 -7398457 - ORR1A4 LTR MaLR -163 166 1 4 1692 2168 113 81 79 chr5 145140196 145140589 -7396670 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1692 2166 160 40 11 chr5 145146072 145146445 -7390814 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1692 942 182 326 7 chr5 145150370 145150661 -7386598 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1692 1289 132 19 10 chr5 145151070 145151277 -7385982 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 174 4 1692 260 230 54 66 chr5 145151190 145151432 -7385827 - RMER17D2 LTR ERVK -263 546 308 4 1692 495 259 20 114 chr5 145151959 145151974 -7385285 - ORR1C2 LTR MaLR -174 185 172 4 1692 942 137 2 64 chr5 145152026 145152211 -7385048 - ORR1C2 LTR MaLR -188 171 1 4 1692 957 280 78 11 chr5 145152211 145152481 -7384778 - MTEa LTR MaLR -64 315 28 4 1692 425 242 19 48 chr5 145153880 145153984 -7383275 - MTE2a LTR MaLR -221 158 58 4 1692 281 375 0 20 chr5 145153985 145154083 -7383176 - MTE2a LTR MaLR -283 96 1 4 1692 259 200 16 16 chr5 145155970 145156031 -7381228 + MLT1I LTR MaLR 351 411 0 4 1692 5054 133 88 34 chr5 145156266 145157122 -7380137 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 4 1692 409 168 37 112 chr5 145159478 145159585 -7377674 - MT2B LTR ERVL -337 264 166 4 1692 251 236 110 22 chr5 145163268 145163359 -7373900 - RMER15 LTR ERVL -29 546 448 5 1692 385 296 83 90 chr5 145163660 145163816 -7373443 - RMER15 LTR ERVL -128 447 293 5 1692 258 299 71 18 chr5 145166645 145166815 -7370444 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1076 5 1692 323 260 48 48 chr5 145171109 145171214 -7366045 - MTEa LTR MaLR 0 379 275 5 1692 670 219 235 10 chr5 145171826 145172077 -7365182 - MTD LTR MaLR -14 405 130 5 1692 545 271 77 22 chr5 145172172 145172353 -7364906 - MTD LTR MaLR -224 195 5 5 1692 599 172 20 0 chr5 145174934 145175033 -7362226 + ORR1D1 LTR MaLR 273 373 -1 5 1692 596 299 30 52 chr5 145175887 145176120 -7361139 + ORR1E LTR MaLR 6 233 -126 5 1692 1287 247 26 51 chr5 145176141 145176453 -7360806 + ORR1E LTR MaLR 18 321 -38 5 1692 320 279 46 37 chr5 145176871 145176979 -7360280 + ORR1E LTR MaLR 271 379 0 5 1692 1273 220 137 32 chr5 145179350 145179628 -7357631 + MTEb LTR MaLR 1 323 -56 5 1692 1273 220 137 32 chr5 145179781 145179845 -7357414 + MTEb LTR MaLR 324 379 0 5 1692 293 331 7 101 chr5 145182833 145182981 -7354278 + LTR81C LTR ERV1? 1020 1153 0 5 1692 3347 44 3 0 chr5 145183567 145183951 -7353308 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 5 1692 245 295 1 41 chr5 145186849 145186983 -7350276 - MER74B LTR ERVL -83 539 352 5 1692 360 322 52 28 chr5 145186988 145187199 -7350060 - LTR31 LTR ERV1 -32 587 372 5 1692 584 299 25 20 chr5 145187607 145187805 -7349454 - MER74B LTR ERVL -196 426 228 5 1692 983 316 119 43 chr5 145188472 145188961 -7348298 - MER21B LTR ERV1 -30 833 308 5 1692 1177 267 49 69 chr5 145189367 145189717 -7347542 - MTE2b LTR MaLR 0 379 37 5 1692 1379 146 45 38 chr5 145190011 145190028 -7347231 - RMER4B LTR ERVK -319 266 249 5 1692 1379 146 45 38 chr5 145190061 145190307 -7346952 - RMER4B LTR ERVK -337 248 1 5 1692 411 283 58 58 chr5 145190484 145190638 -7346621 - MLT1A LTR MaLR -189 185 32 6 1692 378 207 167 26 chr5 145190785 145190899 -7346360 + RMER15 LTR ERVL 2 131 -444 6 1692 396 331 0 15 chr5 145190943 145191069 -7346190 + RMER15 LTR ERVL 306 429 -146 6 1692 1078 239 28 128 chr5 145191069 145191545 -7345714 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 6 1692 319 120 0 0 chr5 145193835 145193885 -7343374 - MT2A LTR ERVL 0 584 535 6 1692 1212 203 301 20 chr5 145194296 145194652 -7342607 - MT2A LTR ERVL -76 457 2 6 1692 553 232 96 0 chr5 145198316 145198441 -7338818 - ORR1E LTR MaLR -222 137 1 6 1692 889 87 94 0 chr5 145198995 145199122 -7338137 - MT2B LTR ERVL -462 139 1 6 1692 401 318 9 0 chr5 145201535 145201645 -7335614 + MLT1C LTR MaLR 353 463 -4 6 1692 2142 130 6 58 chr5 145204355 145204698 -7332561 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 5 6 1692 561 167 18 18 chr5 145204712 145204822 -7332437 - ORR1A4 LTR MaLR -219 110 1 6 1692 1040 239 91 37 chr5 145205284 145205695 -7331564 + RMER15 LTR ERVL 48 575 0 6 1692 854 285 35 93 chr5 145208153 145208640 -7328619 + RMER15 LTR ERVL 1 573 -2 6 1692 256 241 160 96 chr5 145208883 145209039 -7328220 + MTEa LTR MaLR 207 372 -7 6 1692 953 210 116 58 chr5 145211530 145211788 -7325471 - MTE2a LTR MaLR 0 379 107 6 1692 2614 133 159 18 chr5 145211790 145211824 -7325435 - RMER15 LTR ERVL 0 575 542 6 1692 2614 133 159 18 chr5 145211866 145211963 -7325296 - RMER15 LTR ERVL -34 541 427 6 1692 3090 167 148 11 chr5 145211963 145212611 -7324648 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 6 1692 2614 133 159 18 chr5 145212611 145212982 -7324277 - RMER15 LTR ERVL -149 426 4 6 1692 1866 118 162 53 chr5 145213486 145213845 -7323414 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 6 1692 2316 89 35 0 chr5 145216365 145216681 -7320578 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1692 643 284 42 89 chr5 145220012 145220248 -7317011 + MTE2a LTR MaLR 1 225 -154 6 1692 2062 212 36 31 chr5 145220455 145220933 -7316326 + RMER20A LTR ERVK 15 494 -22 6 1692 3305 122 15 34 chr5 145220934 145221466 -7315793 + RLTR28 LTR ERVL 1 522 -2 6 1692 686 238 174 52 chr5 145221825 145222229 -7315030 + RMER15 LTR ERVL 9 537 -38 6 1692 761 260 58 25 chr5 145222229 145222470 -7314789 - RMER15 LTR ERVL -52 523 275 7 1692 1071 218 248 81 chr5 145222934 145223293 -7313966 - RLTR33 LTR ERVK -85 593 175 7 1692 1946 108 165 25 chr5 145224222 145224544 -7312715 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 1692 2686 34 0 42 chr5 145224823 145225159 -7312100 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 7 1692 1245 257 97 26 chr5 145226961 145227301 -7309958 + MTE2b LTR MaLR 3 366 -13 7 1693 2446 95 3 0 chr5 145229809 145230134 -7307125 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 7 1693 938 232 170 57 chr5 145230174 145230439 -7306820 - MTE2a LTR MaLR 0 379 85 7 1693 5342 147 36 14 chr5 145237431 145238313 -7298946 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 7 1693 951 249 65 118 chr5 145239418 145239641 -7297618 + MTE2a LTR MaLR 4 190 -189 7 1693 951 249 65 118 chr5 145239670 145239843 -7297416 + MTE2a LTR MaLR 191 379 0 7 1693 2631 77 0 9 chr5 145242096 145242426 -7294833 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1693 304 320 8 8 chr5 145243475 145243598 -7293661 - RLTR42-int LTR ERVK -4155 1367 1245 7 1693 326 305 73 37 chr5 145246531 145246667 -7290592 - RMER15 LTR ERVL 0 575 435 7 1693 304 345 107 6 chr5 145247823 145247992 -7289267 + MLT1A1 LTR MaLR 8 193 -215 7 1693 2819 128 122 15 chr5 145249985 145250183 -7287076 + RLTR11A LTR ERVK 1 229 -299 7 1693 2819 128 122 15 chr5 145250249 145250524 -7286735 + RLTR11A LTR ERVK 230 524 -4 7 1693 1301 251 61 10 chr5 145255009 145255319 -7281940 + MTEa LTR MaLR 51 376 -3 7 1693 1153 212 114 112 chr5 145255528 145255734 -7281525 - MTEa LTR MaLR 0 379 171 7 1693 1153 212 114 112 chr5 145255914 145256083 -7281176 - MTEa LTR MaLR -209 170 3 7 1693 542 307 79 38 chr5 145256086 145256377 -7280882 - ORR1E LTR MaLR -56 303 1 8 1693 983 268 52 116 chr5 145260105 145260325 -7276934 - MTE2a LTR MaLR 0 379 171 8 1693 983 268 52 116 chr5 145260369 145260553 -7276706 - MTE2a LTR MaLR -209 170 1 8 1693 2355 89 6 21 chr5 145261847 145262179 -7275080 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1693 613 311 99 87 chr5 145267063 145267397 -7269862 + ORR1E LTR MaLR 26 363 -7 8 1693 237 237 105 21 chr5 145272012 145272107 -7265152 - RMER15 LTR ERVL -92 483 381 8 1693 388 223 234 69 chr5 145276157 145276345 -7260914 - ORR1E LTR MaLR -4 355 137 8 1693 481 259 8 51 chr5 145278601 145278719 -7258540 - ORR1E LTR MaLR -235 124 12 8 1693 351 266 0 0 chr5 145279028 145279107 -7258152 - HERV16-int LTR ERVL -4558 438 360 8 1693 692 142 0 0 chr5 145280564 145280670 -7256589 + RLTR20D LTR ERVK 3 108 -460 8 1693 922 133 24 45 chr5 145280658 145280843 -7256416 - RLTR20D LTR ERVK -239 289 89 8 1693 233 267 33 0 chr5 145282503 145282563 -7254696 + MLT1A1 LTR MaLR 95 156 -252 8 1693 356 325 47 23 chr5 145282725 145282854 -7254405 + MLT1A1 LTR MaLR 272 403 -5 8 1693 290 246 46 0 chr5 145289518 145289583 -7247676 - MTEa LTR MaLR -2 377 310 9 1693 839 211 70 36 chr5 145289800 145290053 -7247206 - MTEa LTR MaLR -34 345 3 9 1693 258 343 68 10 chr5 145293973 145294076 -7243183 + RMER12 LTR ERVK 743 851 -471 9 1693 2155 139 87 5 chr5 145295563 145295952 -7241307 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1693 764 164 12 8 chr5 145297469 145297607 -7239652 - MTD LTR MaLR -14 405 269 9 1693 443 326 76 33 chr5 145297927 145298111 -7239148 - MTD LTR MaLR -218 201 10 9 1693 409 281 53 145 chr5 145299261 145299523 -7237736 - ORR1E LTR MaLR -121 238 1 9 1693 2368 127 11 8 chr5 145300779 145301137 -7236122 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 9 1693 285 278 6 189 chr5 145320766 145320814 -7216445 + MT2B LTR ERVL 179 295 -306 9 1693 1431 150 135 56 chr5 145320996 145321336 -7215923 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 3 9 1693 448 308 121 5 chr5 145322555 145322754 -7214505 - RMER20B LTR ERVK -280 347 126 9 1693 3467 247 25 26 chr5 145322913 145323819 -7213440 - MERVK26-int LTR ERVK -38 6881 5977 9 1693 1849 70 8 0 chr5 145324251 145324492 -7212767 + ORR1A2 LTR MaLR 85 327 0 9 1693 5004 91 21 50 chr5 145325431 145326205 -7211054 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 1 1693 288 241 30 170 chr5 145326998 145327133 -7210126 + MT2B LTR ERVL 143 258 -343 1 1693 273 297 111 49 chr5 145327382 145327626 -7209633 - LTR52-int LTR ERVL -3067 489 231 1 1693 2259 111 35 0 chr5 145330142 145330458 -7206801 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1693 870 251 20 81 chr5 145333477 145333511 -7203748 - MTE2b LTR MaLR -2 377 346 1 1693 870 251 20 81 chr5 145333569 145333781 -7203478 - MTE2b LTR MaLR -34 345 146 1 1693 309 267 13 26 chr5 145333812 145333889 -7203370 - RMER5 LTR ERV1 -388 146 71 1 1693 1027 264 8 47 chr5 145333938 145334192 -7203067 + MTE2a LTR MaLR 134 377 -2 1 1693 671 272 170 44 chr5 145334343 145334708 -7202551 + MLT1C LTR MaLR 42 452 -15 1 1693 329 336 25 17 chr5 145335330 145335448 -7201811 - LTR16B2 LTR ERVL -341 121 3 1 1693 2353 122 81 5 chr5 145335591 145335962 -7201297 - MTC LTR MaLR -18 403 5 1 1693 687 84 10 10 chr5 145336245 145336339 -7200920 - ORR1A4 LTR MaLR -55 274 181 1 1693 4410 150 83 68 chr5 145336591 145337479 -7199780 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 1693 964 248 103 56 chr5 145337479 145337775 -7199484 - MTEa LTR MaLR -66 313 3 1 1693 852 212 88 5 chr5 145337851 145338035 -7199224 - MTD LTR MaLR 0 419 220 1 1693 2979 28 3 6 chr5 145338035 145338397 -7198862 + MTB LTR MaLR 1 361 -39 1 1693 2499 117 20 0 chr5 145338397 145338749 -7198510 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 1 1693 11391 72 25 52 chr5 145338749 145340454 -7196805 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 4885 1 1693 35774 51 22 11 chr5 145340455 145342660 -7194599 - IAP-d-int LTR ERVK -1873 4669 2418 1 1693 35774 51 22 11 chr5 145342707 145345071 -7192188 - IAP-d-int LTR ERVK -1873 2417 1 1 1693 2538 99 17 22 chr5 145345071 145345432 -7191827 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 1 1693 410 0 0 0 chr5 145345432 145345478 -7191781 + MTB_Mm LTR MaLR 362 407 0 1 1693 993 242 18 9 chr5 145345478 145345699 -7191560 - MTD LTR MaLR -196 223 1 1 1693 967 225 67 20 chr5 145346642 145346883 -7190376 - MTD LTR MaLR -156 265 16 1 1693 1876 132 93 26 chr5 145349201 145349544 -7187715 + RLTR24 LTR ERV1 1 366 -163 1 1693 1850 150 22 28 chr5 145349554 145349863 -7187396 + ORR1B1 LTR MaLR 41 347 -47 1 1693 396 74 19 0 chr5 145350069 145350123 -7187136 + ORR1A3 LTR MaLR 272 326 0 1 1693 782 125 186 7 chr5 145350123 145350262 -7186997 + RLTR24 LTR ERV1 365 529 0 1 1693 2143 122 138 5 chr5 145350425 145350795 -7186464 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 12 1 1693 974 251 187 21 chr5 145350800 145351089 -7186170 - ORR1D2 LTR MaLR -33 337 1 1 1693 245 155 53 86 chr5 145351176 145351268 -7185991 + MTE2b LTR MaLR 287 421 0 1 1693 714 288 103 77 chr5 145351365 145351715 -7185544 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1693 429 263 71 0 chr5 145351784 145351883 -7185376 + MTE2b LTR MaLR 1 106 -273 1 1693 305 176 318 0 chr5 145351911 145351996 -7185263 + MTE2b LTR MaLR 238 349 -30 1 1693 344 224 0 117 chr5 145353558 145353669 -7183590 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 311 1 1693 1707 183 44 24 chr5 145355871 145356201 -7181058 + MTEb LTR MaLR 1 338 -41 1 1693 2077 136 25 22 chr5 145356278 145356650 -7180609 + ORR1B1 LTR MaLR 22 394 0 1 1693 285 232 58 0 chr5 145356863 145356932 -7180327 + MTEb LTR MaLR 307 379 0 1 1693 240 340 20 41 chr5 145357310 145357408 -7179851 - RMER15 LTR ERVL -117 458 363 1 1693 415 350 110 18 chr5 145357614 145357841 -7179418 - MLT1J LTR MaLR -145 367 120 1 1694 438 275 37 19 chr5 145359469 145359625 -7177634 + MTEa LTR MaLR 207 377 -2 1 1694 1502 207 98 19 chr5 145359631 145359956 -7177303 + MTEa LTR MaLR 1 351 -28 1 1694 2309 69 6 59 chr5 145359958 145360295 -7176964 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1694 740 173 60 7 chr5 145360503 145360654 -7176605 - RMER15 LTR ERVL -1 574 416 1 1694 1567 144 68 97 chr5 145361032 145361216 -7176043 + ORR1C1 LTR MaLR 16 166 -212 1 1694 1567 144 68 97 chr5 145361274 145361428 -7175831 + ORR1C1 LTR MaLR 167 343 -35 1 1694 298 284 45 0 chr5 145361521 145361609 -7175650 + MER89 LTR ERV1 437 528 -31 1 1694 583 148 9 47 chr5 145361810 145361916 -7175343 + MTD LTR MaLR 174 275 -144 1 1694 401 278 67 39 chr5 145362157 145362362 -7174897 - RLTR26 LTR ERVK -385 257 1 1 1694 429 185 29 4 chr5 145362366 145362447 -7174812 + MTD LTR MaLR 335 407 -12 1 1694 480 261 82 27 chr5 145362485 145362631 -7174628 + RMER15 LTR ERVL 276 429 -146 1 1694 715 220 176 24 chr5 145362799 145363004 -7174255 + RMER15 LTR ERVL 340 575 0 1 1694 931 216 108 22 chr5 145365677 145365909 -7171350 + RMER15 LTR ERVL 324 575 0 1 1694 1175 233 0 151 chr5 145366035 145366379 -7170880 + MTEa LTR MaLR 3 294 -85 1 1694 270 265 60 87 chr5 145368714 145368863 -7168396 - MLT1K LTR MaLR -131 464 320 1 1694 1852 141 90 0 chr5 145369536 145369835 -7167424 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1694 344 336 38 57 chr5 145371147 145371305 -7165954 + MLT1N2 LTR MaLR 113 267 -295 1 1694 2108 230 46 29 chr5 145373383 145373960 -7163299 + RMER19C LTR ERVK 86 664 -238 1 1694 228 280 91 120 chr5 145373977 145374253 -7163006 + ORR1B2 LTR MaLR 19 286 -81 1 1694 2397 148 291 17 chr5 145374401 145374978 -7162281 + RMER19A LTR ERVK 1 735 -2 1 1694 454 205 36 0 chr5 145377273 145377356 -7159903 - ORR1B2 LTR MaLR -58 320 235 1 1694 1233 163 65 81 chr5 145377455 145377715 -7159544 - ORR1B2 LTR MaLR -111 256 1 1 1694 1304 200 62 79 chr5 145378236 145378651 -7158608 - MT2A LTR ERVL -62 539 1 1 1694 392 317 71 12 chr5 145378838 145379007 -7158252 - LTR48B LTR ERV1 -331 313 135 1 1694 1112 223 157 74 chr5 145380760 145381123 -7156136 + MTD LTR MaLR 26 418 -1 1 1694 4149 123 143 6 chr5 145381372 145382020 -7155239 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 1 1694 422 284 140 11 chr5 145382175 145382353 -7154906 - ORR1E LTR MaLR -19 340 140 1 1694 376 240 8 92 chr5 145382643 145382773 -7154486 - ORR1E LTR MaLR -256 118 1 1 1694 597 240 15 30 chr5 145387511 145387644 -7149615 - MTE2a LTR MaLR -158 221 91 1 1694 569 298 107 91 chr5 145392543 145392861 -7144398 + MLT1F LTR MaLR 67 389 -159 1 1694 334 284 80 82 chr5 145395173 145395461 -7141798 - MTEb LTR MaLR -24 355 53 1 1694 878 226 25 15 chr5 145395867 145396065 -7141194 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 171 1 1694 475 275 12 75 chr5 145401522 145401683 -7135576 - MLT1C LTR MaLR 0 467 317 1 1694 274 292 161 32 chr5 145402393 145402517 -7134742 - MLT1C LTR MaLR -275 192 53 1 1694 384 232 49 0 chr5 145405491 145405573 -7131686 - MLT1C LTR MaLR -302 88 3 1 1694 442 216 9 38 chr5 145409162 145409265 -7127994 - MTD LTR MaLR 0 419 320 1 1694 2825 148 32 101 chr5 145409265 145409728 -7127531 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 452 -108 1 1694 2825 148 32 101 chr5 145409803 145409845 -7127414 + RLTR20B2 LTR ERVK 453 465 -95 1 1694 2825 148 32 101 chr5 145409868 145409963 -7127296 + RLTR20B2 LTR ERVK 466 559 -1 1 1694 847 276 147 18 chr5 145409963 145410233 -7127026 - MTD LTR MaLR -97 322 18 1 1694 1752 168 69 11 chr5 145411195 145411545 -7125714 - MTD LTR MaLR 0 419 50 1 1694 1800 121 27 66 chr5 145413804 145414139 -7123120 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1694 412 264 64 143 chr5 145414329 145414749 -7122510 + RMER10A LTR ERVL 29 415 -27 1 1694 299 322 64 32 chr5 145415230 145415355 -7121904 + MTE2a LTR MaLR 25 153 -206 1 1694 307 259 36 36 chr5 145415624 145415708 -7121551 + MTE2a LTR MaLR 278 365 -14 1 1694 4507 14 0 0 chr5 145415851 145416344 -7120915 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1694 229 291 0 0 chr5 145416557 145416574 -7120685 + MTE2a-int LTR MaLR 631 733 -776 1 1694 2559 101 173 7 chr5 145416653 145417074 -7120185 - RLTR44C LTR ERVK -11 491 1 1 1694 5397 30 0 0 chr5 145417074 145417718 -7119541 - RLTR44-int LTR ERVK 0 2812 2169 1 1694 4564 59 0 8 chr5 145417717 145418311 -7118948 - RLTR44-int LTR ERVK -1347 1465 877 1 1694 918 77 0 8 chr5 145418332 145418463 -7118796 - RLTR44-int LTR ERVK -1867 945 816 1 1694 1473 109 7 45 chr5 145418491 145418760 -7118499 - RLTR44-int LTR ERVK -2553 259 1 1 1694 3062 82 51 9 chr5 145418761 145419135 -7118124 - RLTR44C LTR ERVK -7 495 103 1 1694 1562 178 130 11 chr5 145419421 145419774 -7117485 + MTD LTR MaLR 25 419 0 1 1694 380 208 50 80 chr5 145421505 145421660 -7115599 - ORR1E LTR MaLR 0 379 217 1 1694 819 248 33 134 chr5 145421745 145422052 -7115207 - MTE2a LTR MaLR -84 295 20 1 1694 486 298 137 72 chr5 145423051 145423183 -7114076 + ORR1E LTR MaLR 29 177 -182 1 1694 3203 65 22 0 chr5 145423183 145423595 -7113664 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1694 486 298 137 72 chr5 145423595 145423737 -7113522 + ORR1E LTR MaLR 178 325 -34 1 1694 1452 224 15 63 chr5 145423737 145424133 -7113126 - MTEb LTR MaLR -2 377 1 1 1694 486 298 137 72 chr5 145424133 145424164 -7113095 + ORR1E LTR MaLR 326 355 -4 1 1694 1059 254 30 47 chr5 145425624 145425921 -7111338 + MTE2b LTR MaLR 49 340 -39 1 1694 1056 274 4 37 chr5 145426021 145426294 -7110965 - MTE2a LTR MaLR -43 336 73 1 1694 489 230 0 20 chr5 145426877 145426979 -7110280 + MLT1C LTR MaLR 360 459 -8 1 1694 598 200 172 0 chr5 145428019 145428164 -7109095 - RMER5 LTR ERV1 -21 513 344 1 1694 2328 208 94 142 chr5 145429740 145430545 -7106714 + RMER13A LTR ERVK 63 829 -31 1 1694 5739 45 65 0 chr5 145430707 145431404 -7105855 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 1 1694 66146 9 2 0 chr5 145431404 145438991 -7098268 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1 7601 0 1 1694 5739 45 65 0 chr5 145438991 145439688 -7097571 + RLTR4_Mm LTR ERV1 1 742 0 1 1694 3225 53 9 16 chr5 145439896 145440320 -7096939 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1694 307 256 21 75 chr5 145441943 145442036 -7095223 + MLT1A0 LTR MaLR 1 88 -277 1 1694 2001 161 124 19 chr5 145442684 145442787 -7094472 - MTD LTR MaLR 0 419 318 1 1694 3090 45 47 5 chr5 145442787 145443171 -7094088 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1694 2001 161 124 19 chr5 145443171 145443446 -7093813 - MTD LTR MaLR -102 317 1 1 1694 306 247 157 0 chr5 145450094 145450183 -7087076 - RMER20B LTR ERVK -391 236 134 1 1694 297 326 10 10 chr5 145450598 145450697 -7086562 - MLT1B LTR MaLR -72 318 220 1 1694 1873 210 28 20 chr5 145450717 145451115 -7086144 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 1 1694 226 167 143 143 chr5 145451706 145451783 -7085476 - MLT1B LTR MaLR -262 128 52 1 1694 240 295 62 47 chr5 145453471 145453671 -7083588 - RLTR20C LTR ERVK -146 213 22 1 1694 952 253 41 47 chr5 145454423 145454767 -7082492 + RLTR15 LTR ERVK 3 344 -15 1 1694 284 233 43 14 chr5 145460727 145460832 -7076427 + MTE2b LTR MaLR 250 362 -17 1 1694 306 303 47 31 chr5 145461168 145461367 -7075892 + MER34A LTR ERV1 285 492 -95 1 1694 437 276 108 34 chr5 145461355 145461531 -7075728 - MTEb LTR MaLR -4 375 187 1 1694 2392 188 73 27 chr5 145461920 145462400 -7074859 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 7 1 1694 474 221 301 6 chr5 145462618 145462791 -7074468 - RMER15 LTR ERVL -13 562 339 1 1694 240 218 0 0 chr5 145462908 145462963 -7074296 - MT2A LTR ERVL -2 558 488 1 1694 2547 170 40 11 chr5 145463113 145463558 -7073701 - MT2A LTR ERVL -73 460 3 1 1694 1640 275 80 59 chr5 145466932 145467495 -7069764 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 1 1694 3371 30 8 10 chr5 145469512 145469909 -7067350 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1694 1510 198 106 15 chr5 145469921 145470260 -7066999 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1694 250 219 158 0 chr5 145470260 145470342 -7066917 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 95 -1163 1 1694 244 246 32 32 chr5 145470959 145471022 -7066237 + ORR1E LTR MaLR 7 69 -290 1 1694 230 250 0 0 chr5 145473322 145473366 -7063893 - ORR1E LTR MaLR -42 317 274 1 1694 2256 209 22 16 chr5 145473427 145473874 -7063385 - MT2A LTR ERVL -78 455 6 1 1694 952 274 63 38 chr5 145474074 145474103 -7063156 - MTE2a LTR MaLR 0 379 345 1 1694 952 274 63 38 chr5 145474181 145474466 -7062793 - MTE2a LTR MaLR -35 344 58 1 1694 1246 223 103 66 chr5 145475639 145475989 -7061270 - MTE2a LTR MaLR 0 379 17 1 1694 1095 241 18 161 chr5 145478410 145478850 -7058409 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 1 1694 975 108 30 78 chr5 145487098 145487328 -7049931 - RMER17C LTR ERVK -191 219 1 1 1694 1252 142 352 110 chr5 145489455 145489647 -7047612 + RLTR24 LTR ERV1 1 265 -264 1 1694 1252 142 352 110 chr5 145489670 145489903 -7047356 + RLTR24 LTR ERV1 266 529 0 1 1695 233 298 43 147 chr5 145490019 145490104 -7047155 + MT2B LTR ERVL 90 244 -357 1 1695 233 298 43 147 chr5 145490248 145490298 -7046961 + MT2B LTR ERVL 245 339 -262 1 1695 1288 31 43 0 chr5 145490463 145490626 -7046633 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 395 1 1695 289 274 26 62 chr5 145490667 145490780 -7046479 - MER92B LTR ERV1 -411 225 117 1 1695 1572 143 60 206 chr5 145491555 145491968 -7045291 + ORR1C1 LTR MaLR 26 378 0 1 1695 346 204 92 51 chr5 145492149 145492213 -7045046 - MTD LTR MaLR 0 419 357 1 1695 3327 48 5 0 chr5 145492213 145492611 -7044648 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1695 346 204 92 51 chr5 145492611 145492642 -7044617 - MTD LTR MaLR -63 356 320 1 1695 795 272 19 107 chr5 145492642 145492707 -7044552 - MT2A LTR ERVL 0 533 468 1 1695 795 272 19 107 chr5 145492858 145493026 -7044233 - MT2A LTR ERVL -66 467 327 1 1695 795 272 19 107 chr5 145493250 145493332 -7043927 - MT2A LTR ERVL -207 326 245 1 1695 456 289 0 8 chr5 145493328 145493450 -7043809 - MT2A LTR ERVL -412 121 1 1 1695 501 274 78 94 chr5 145493450 145493722 -7043537 - MTD LTR MaLR -144 235 3 1 1695 2223 123 122 14 chr5 145495266 145495636 -7041623 + MTC LTR MaLR 12 421 0 1 1695 604 288 64 51 chr5 145500656 145500843 -7036416 + RMER10A LTR ERVL 65 260 -182 5 1695 3170 68 15 0 chr5 145500843 145501237 -7036022 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1695 604 288 64 51 chr5 145501237 145501422 -7035837 + RMER10A LTR ERVL 261 441 -1 5 1695 756 233 165 14 chr5 145502012 145502230 -7035029 + MTE2a LTR MaLR 120 370 -9 8 1695 914 285 66 19 chr5 145504800 145505058 -7032201 + MTE2b LTR MaLR 1 270 -109 2 1695 2628 170 44 20 chr5 145505066 145505564 -7031695 - RLTR11A2 LTR ERVK -17 510 1 2 1695 275 175 57 91 chr5 145505583 145505671 -7031588 - MYSERV-int LTR ERVK -8 6542 6458 2 1695 4070 196 85 19 chr5 145505951 145506830 -7030429 - MYSERV-int LTR ERVK -84 6466 5524 2 1695 4070 199 72 37 chr5 145507030 145507292 -7029967 - MYSERV-int LTR ERVK -1027 5523 5373 2 1695 3924 204 56 59 chr5 145507331 145507377 -7029882 - MYSERV-int LTR ERVK -1228 1098 1047 2 1695 296 261 6 118 chr5 145507378 145507565 -7029694 - RMER4B LTR ERVK -59 526 251 2 1695 943 202 11 87 chr5 145507710 145507976 -7029283 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 524 769 -1557 2 1695 720 155 57 63 chr5 145508401 145508559 -7028700 + RLTR11A2 LTR ERVK 10 166 -361 3 1695 1260 253 19 134 chr5 145509864 145510334 -7026925 + MTD LTR MaLR 4 419 0 3 1695 1776 163 29 43 chr5 145511095 145511545 -7025714 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 4 1695 471 208 47 70 chr5 145518941 145519070 -7018189 + MTEb LTR MaLR 224 349 -30 7 1695 260 167 0 0 chr5 145528288 145528330 -7008929 - RLTR25A LTR ERVK -537 566 525 1 1695 3522 28 2 0 chr5 145533166 145533561 -7003698 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1695 335 116 0 148 chr5 145536193 145536274 -7000985 - MT2B LTR ERVL -364 237 169 1 1695 1016 289 126 6 chr5 145549715 145550056 -6987203 + MTD LTR MaLR 37 418 -1 1 1695 876 246 220 7 chr5 145570219 145570501 -6966758 - MTD LTR MaLR -18 401 60 2 1695 970 190 156 4 chr5 145587687 145587930 -6949329 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 91 2 1695 3803 155 78 8 chr5 145590487 145591191 -6946068 - RMER6A LTR ERVK -3 753 1 2 1695 1562 172 40 3 chr5 145592639 145592937 -6944322 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 82 2 1695 995 224 129 55 chr5 145609482 145609861 -6927398 - RMER13A LTR ERVK -345 515 109 2 1696 2381 144 68 57 chr5 145622432 145622902 -6914357 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1696 4349 59 67 21 chr5 145622902 145623528 -6913731 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 2 1696 435 82 0 32 chr5 145623528 145623591 -6913668 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 2 1696 1739 119 4 4 chr5 145623580 145623842 -6913417 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 2 1696 900 80 24 0 chr5 145623837 145623962 -6913297 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 2 1696 20241 16 2 0 chr5 145623964 145626318 -6910941 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 2 1696 2393 142 68 59 chr5 145626318 145626789 -6910470 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 1696 1046 176 31 36 chr5 145628482 145628724 -6908535 - RMER15 LTR ERVL -353 222 1 3 1696 261 291 59 76 chr5 145634925 145635044 -6902215 - RLTR25B LTR ERVK -470 558 442 3 1696 413 198 0 131 chr5 145647704 145647826 -6889433 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 3 1696 801 197 219 153 chr5 145652547 145653045 -6884214 + MT2A LTR ERVL 3 533 0 3 1696 1553 202 117 14 chr5 145656834 145657028 -6880231 + MTD LTR MaLR 1 211 -208 3 1696 1553 202 117 14 chr5 145657169 145657341 -6879918 + MTD LTR MaLR 212 405 -14 3 1696 402 174 55 94 chr5 145660915 145661042 -6876217 + RMER15 LTR ERVL 38 159 -416 3 1696 277 276 269 6 chr5 145661042 145661224 -6876035 + RMER15 LTR ERVL 276 505 -70 3 1696 902 214 92 140 chr5 145669782 145670174 -6867085 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 3 1696 340 188 83 119 chr5 145676527 145676538 -6860721 + MT2B2 LTR ERVL 153 159 -425 3 1696 1933 196 50 8 chr5 145695538 145695940 -6841319 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1696 257 230 100 33 chr5 145698242 145698332 -6838927 + MTE2b LTR MaLR 264 359 -20 4 1696 267 246 66 0 chr5 145713762 145713823 -6823436 + MLT1L LTR MaLR 536 600 -10 5 1696 230 294 40 128 chr5 145716577 145716702 -6820557 + MT2B2 LTR ERVL 133 246 -338 5 1696 338 245 189 9 chr5 145719506 145719617 -6817642 - RMER15 LTR ERVL -89 486 356 5 1696 807 121 68 8 chr5 145731895 145732028 -6805231 + MTD LTR MaLR 119 259 -160 5 1696 1427 190 124 30 chr5 145732028 145732220 -6805039 + RMER6B LTR ERVK 1 230 -231 5 1696 1427 190 124 30 chr5 145732413 145732584 -6804675 + RMER6B LTR ERVK 231 398 -63 5 1696 748 199 39 32 chr5 145732622 145732778 -6804481 + MTD LTR MaLR 254 410 -9 5 1696 625 289 69 0 chr5 145733626 145733799 -6803460 + ORR1D2 LTR MaLR 43 227 -143 5 1696 1786 129 136 19 chr5 145733800 145734117 -6803142 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1696 640 180 108 8 chr5 145734122 145734251 -6803008 + ORR1D2 LTR MaLR 222 363 -7 5 1696 1005 244 151 19 chr5 145735214 145735522 -6801737 - MTEa LTR MaLR -8 371 1 5 1696 541 268 102 94 chr5 145736757 145737243 -6800016 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 509 -18 5 1696 263 309 146 94 chr5 145738593 145738868 -6798391 + MLT1A0 LTR MaLR 74 362 -3 5 1696 245 214 62 134 chr5 145740676 145740773 -6796486 - RLTR25B LTR ERVK -518 510 421 5 1696 1954 163 87 3 chr5 145742312 145742680 -6794579 + MTC LTR MaLR 22 420 -1 5 1696 363 272 43 101 chr5 145742985 145743016 -6794243 - MT2B LTR ERVL -446 155 133 5 1696 2099 76 48 26 chr5 145743030 145743287 -6793972 + ORR1A2 LTR MaLR 1 262 -65 5 1696 2099 76 48 26 chr5 145743477 145743531 -6793728 + ORR1A2 LTR MaLR 263 319 -8 5 1696 297 131 0 0 chr5 145749681 145749728 -6787531 + MTC LTR MaLR 35 81 -338 6 1696 1021 144 0 6 chr5 145750031 145750192 -6787067 + MTC LTR MaLR 262 421 0 6 1697 249 187 108 96 chr5 145762110 145762193 -6775066 + MT2B LTR ERVL 151 234 -367 6 1697 1138 238 34 19 chr5 145770320 145770586 -6766673 + RMER10B LTR ERVL 127 396 -2 7 1697 228 287 74 57 chr5 145775018 145775140 -6762119 - MURVY-LTR LTR ERV1 -53 466 343 7 1697 701 167 26 65 chr5 145798351 145798505 -6738754 - RLTR20D LTR ERVK 0 578 431 7 1697 726 234 96 46 chr5 145798513 145798773 -6738486 - RLTR20D LTR ERVK -295 273 1 7 1697 1454 152 72 26 chr5 145798813 145798857 -6738402 + RLTR14 LTR ERV1 6 44 -338 7 1697 3095 23 0 0 chr5 145798857 145799203 -6738056 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 1697 14663 46 2 1 chr5 145799203 145800992 -6736267 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 7 1697 2996 26 12 0 chr5 145800992 145801334 -6735925 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 1697 1454 152 72 26 chr5 145801334 145801510 -6735749 + RLTR14 LTR ERV1 45 231 -151 7 1697 1454 152 72 26 chr5 145801536 145801617 -6735642 + RLTR14 LTR ERV1 232 321 -61 7 1697 3045 71 20 0 chr5 145818011 145818403 -6718856 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1697 2076 109 105 11 chr5 145820138 145820501 -6716758 - RLTR9D LTR ERVK -6 397 1 7 1697 929 271 55 151 chr5 145823373 145823811 -6713448 + MTD LTR MaLR 9 404 -15 8 1697 1762 98 97 40 chr5 145824337 145824666 -6712593 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 18 8 1697 265 56 0 0 chr5 145824680 145824716 -6712543 - RLTR10B2 LTR ERVK -256 36 1 8 1697 1004 254 71 149 chr5 145833750 145834158 -6703101 + MTEa LTR MaLR 3 378 -1 8 1697 1038 217 37 12 chr5 145835944 145836124 -6701135 + ORR1E LTR MaLR 2 185 -174 8 1697 1038 222 41 37 chr5 145836175 145836267 -6700992 + ORR1E LTR MaLR 181 263 -107 8 1697 443 201 9 16 chr5 145836569 145836692 -6700567 + ORR1E LTR MaLR 219 385 -34 8 1697 405 207 8 90 chr5 145836784 145836906 -6700353 - MT2B LTR ERVL -344 257 146 8 1697 655 217 59 18 chr5 145839367 145839536 -6697723 - MLT2B4 LTR ERVL -367 189 14 8 1697 538 202 45 131 chr5 145839898 145840097 -6697162 + MTE2a LTR MaLR 1 182 -197 8 1697 362 196 10 107 chr5 145840158 145840261 -6696998 - RMER6A LTR ERVK -26 730 638 8 1697 239 245 107 48 chr5 145840250 145840353 -6696906 + RMER12 LTR ERVK 742 850 -472 8 1697 339 111 37 0 chr5 145841667 145841721 -6695538 + MTEb LTR MaLR 19 74 -305 8 1697 505 284 20 35 chr5 145841757 145841954 -6695305 + MTEb LTR MaLR 184 377 -2 8 1697 477 259 51 34 chr5 145843064 145843240 -6694019 + RMER5 LTR ERV1 218 396 -138 8 1697 307 200 129 113 chr5 145855842 145855966 -6681293 - MT2B LTR ERVL -337 264 139 9 1697 417 348 33 19 chr5 145862411 145862622 -6674637 - RMER15 LTR ERVL -15 560 347 9 1697 2621 47 0 6 chr5 145863023 145863363 -6673896 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 9 1697 2261 142 81 7 chr5 145866102 145866536 -6670723 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 9 1697 260 239 28 14 chr5 145876594 145876605 -6660654 - MT2B2 LTR ERVL -333 251 179 1 1697 289 194 109 64 chr5 145879980 145880090 -6657169 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 395 1 1697 375 259 26 43 chr5 145880171 145880288 -6656971 - MT2B LTR ERVL -337 264 150 1 1698 557 214 49 46 chr5 145904206 145904352 -6632907 - MTD LTR MaLR 0 419 235 1 1698 2913 97 32 14 chr5 145906402 145906839 -6630420 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 1 1 1698 1903 172 138 5 chr5 145914198 145914567 -6622692 + MTC LTR MaLR 3 420 -1 1 1698 3270 196 162 55 chr5 145916326 145916734 -6620525 + RMER12 LTR ERVK 8 443 -879 1 1698 3270 211 149 50 chr5 145916932 145917755 -6619504 + RMER12 LTR ERVK 444 1848 0 1 1698 1955 141 24 35 chr5 145918502 145918876 -6618383 + RLTR11A LTR ERVK 158 527 -1 1 1698 3237 46 15 5 chr5 145919175 145919571 -6617688 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1698 353 240 71 20 chr5 145921187 145921285 -6615974 + MT2B LTR ERVL 157 259 -342 1 1698 454 344 61 82 chr5 145923799 145924235 -6613024 + RLTR11A LTR ERVK 1 431 -97 1 1698 454 344 61 82 chr5 145924406 145924479 -6612780 + RLTR11A LTR ERVK 432 499 -29 1 1698 1825 158 139 23 chr5 145929407 145929840 -6607419 + RMER4B LTR ERVK 33 456 -10 1 1698 232 336 42 17 chr5 145931166 145931284 -6605975 - MT2B LTR ERVL -325 276 156 1 1698 1811 221 12 14 chr5 145931466 145931893 -6605366 + BGLII_B LTR ERVK 6 431 -10 1 1698 641 236 42 42 chr5 145943112 145943189 -6594070 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 528 457 1 1698 641 254 49 37 chr5 145943228 145943401 -6593858 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 295 1 1698 670 155 148 17 chr5 145943431 145943610 -6593649 - RLTR20B3 LTR ERVK -302 226 1 1 1698 2556 122 14 124 chr5 145945852 145945983 -6591276 + RLTR11B LTR ERVK 3 134 -319 1 1698 2556 122 14 124 chr5 145946128 145946503 -6590756 + RLTR11B LTR ERVK 135 453 0 1 1698 330 234 59 78 chr5 145950062 145950164 -6587095 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 141 1 1698 415 292 146 18 chr5 145958517 145958688 -6578571 + MTD LTR MaLR 18 210 -209 1 1698 262 261 54 158 chr5 145959075 145959304 -6577955 - ORR1E LTR MaLR 0 379 155 1 1698 350 239 185 113 chr5 145959251 145959498 -6577761 + MTD LTR MaLR 183 419 0 1 1698 599 292 260 3 chr5 145959833 145960118 -6577141 + MTEa LTR MaLR 12 369 -10 1 1698 1623 157 64 7 chr5 145960144 145960440 -6576819 - RLTR15 LTR ERVK -44 315 3 1 1698 2331 150 57 91 chr5 145969063 145969105 -6568154 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 42 -519 1 1698 2812 31 0 3 chr5 145969105 145969428 -6567831 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1698 2331 150 57 91 chr5 145969428 145969966 -6567293 + RLTR31_Mm LTR ERVK 43 561 0 1 1698 274 219 125 0 chr5 145970689 145970753 -6566506 - MTD-int LTR MaLR -1186 72 1 1 1698 1823 215 89 3 chr5 145970972 145971354 -6565905 - MTD LTR MaLR 0 419 5 1 1698 1024 251 48 117 chr5 145972760 145973169 -6564090 - MTE2b LTR MaLR 0 419 26 1 1698 1192 252 153 6 chr5 145975265 145975585 -6561674 - MTEa LTR MaLR 0 379 13 1 1698 959 218 126 80 chr5 145985529 145985918 -6551341 - RMER6A LTR ERVK 0 756 350 1 1698 511 116 11 95 chr5 145985936 145985968 -6551291 - RMER6B LTR ERVK -374 87 57 1 1698 511 116 11 95 chr5 145986157 145986219 -6551040 - RMER6B LTR ERVK -405 56 1 1 1698 3421 95 4 35 chr5 145987298 145987641 -6549618 - RLTR19C LTR ERVK 0 506 177 1 1698 4240 87 5 19 chr5 145987641 145988216 -6549043 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 1 1698 3421 95 4 35 chr5 145988216 145988394 -6548865 - RLTR19C LTR ERVK -330 176 1 1 1698 2338 148 28 20 chr5 145990331 145990730 -6546529 - RMER4A LTR ERVK -24 442 41 1 1698 281 95 0 0 chr5 145990773 145990815 -6546444 - RMER4A LTR ERVK -424 42 1 1 1698 1078 197 105 77 chr5 146009592 146009905 -6527354 - ORR1D1 LTR MaLR -48 326 5 2 1698 504 339 33 5 chr5 146013608 146013792 -6523467 - MLT2B1 LTR ERVL -331 189 1 3 1699 3443 73 2 26 chr5 146014492 146014959 -6522300 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 132 4 1699 2768 35 0 12 chr5 146014963 146015269 -6521990 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 4 1699 1188 87 35 11 chr5 146015269 146015305 -6521954 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -409 178 137 4 1699 13624 57 18 7 chr5 146015305 146017077 -6520182 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 4 1699 2587 51 31 51 chr5 146017077 146017426 -6519833 - ORR1A1 LTR MaLR -2 344 1 4 1699 1188 87 35 11 chr5 146017426 146017562 -6519697 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -451 136 2 4 1699 6593 115 8 18 chr5 146017562 146018515 -6518744 - MuRRS4-int LTR ERV1 0 4690 3747 4 1699 8792 268 46 39 chr5 146018559 146019319 -6517940 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2271 2792 2013 4 1699 8792 268 46 39 chr5 146019465 146021102 -6516157 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3051 2012 346 4 1699 8792 268 46 39 chr5 146021189 146021537 -6515722 - MuRRS4-int LTR ERV1 -4718 345 26 4 1699 3446 75 9 29 chr5 146021542 146022029 -6515230 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -51 603 132 4 1699 2526 39 0 7 chr5 146022029 146022338 -6514921 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 40 4 1699 296 285 115 83 chr5 146023981 146024138 -6513121 + MLT1K LTR MaLR 190 351 -244 5 1699 1433 222 77 68 chr5 146025387 146025825 -6511434 + ORR1C2 LTR MaLR 1 392 -2 6 1699 1619 180 128 6 chr5 146027246 146027581 -6509678 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 249 6 1699 1926 142 3 52 chr5 146029406 146029732 -6507527 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 166 7 1699 363 221 13 25 chr5 146029661 146029740 -6507519 - RLTR25A LTR ERVK -513 590 513 7 1699 1038 230 76 158 chr5 146029766 146029921 -6507338 + ORR1A2-int LTR MaLR 867 1143 -817 7 1699 5972 113 35 13 chr5 146030103 146031030 -6506229 + ORR1A2-int LTR MaLR 1029 1963 0 7 1699 1881 136 61 10 chr5 146031030 146031341 -6505918 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1699 2434 118 3 8 chr5 146031341 146031699 -6505560 - MERVL_2A-int LTR ERVL -275 5210 4855 7 1699 231 330 82 64 chr5 146031700 146031810 -6505449 - MLT2B5 LTR ERVL -301 300 189 7 1699 972 185 0 0 chr5 146031810 146031961 -6505298 - MERVL_2A-int LTR ERVL -916 4845 4695 7 1699 21891 125 16 8 chr5 146032144 146032758 -6504501 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1053 4708 4109 7 1699 2003 49 271 3 chr5 146032758 146033046 -6504213 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 8 1699 21891 125 16 8 chr5 146033046 146035592 -6501667 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1653 4108 1523 7 1699 3011 114 0 51 chr5 146035588 146036066 -6501193 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4549 936 507 7 1699 465 337 62 16 chr5 146036087 146036341 -6500918 - RLTR26 LTR ERVK -342 300 14 8 1699 963 205 80 56 chr5 146037207 146037662 -6499597 + RLTR20C LTR ERVK 1 578 0 8 1699 981 195 80 149 chr5 146040363 146040642 -6496617 - MTE2a LTR MaLR -45 334 81 9 1699 981 195 80 149 chr5 146040779 146040848 -6496411 - MTE2a LTR MaLR -299 80 10 9 1699 638 250 57 26 chr5 146043799 146043992 -6493267 - RMER15-int LTR ERVL -539 4460 4262 1 1699 3263 37 35 0 chr5 146053609 146054011 -6483248 - RLTR10C LTR ERVK -20 416 1 1 1699 447 277 25 25 chr5 146054723 146054845 -6482414 - MTE2a LTR MaLR -43 336 215 1 1699 2884 57 91 0 chr5 146060327 146060713 -6476546 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1699 1131 228 130 58 chr5 146060867 146061253 -6476006 + MTD LTR MaLR 5 403 -16 1 1699 2363 95 128 6 chr5 146062627 146062986 -6474273 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 1 1699 437 122 27 13 chr5 146062986 146063061 -6474198 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7331 1 1699 9134 156 71 35 chr5 146063271 146066211 -6471048 - ETnERV2-int LTR ERVK -1804 5440 1653 1 1699 649 113 19 0 chr5 146066236 146066342 -6470917 - ETnERV2-int LTR ERVK -5321 2085 1978 1 1699 2417 168 59 73 chr5 146066342 146067246 -6470013 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 855 10 1 1699 5274 103 85 14 chr5 146067254 146068094 -6469165 - ETnERV2-int LTR ERVK -5423 1983 1083 1 1699 1054 214 43 75 chr5 146068234 146068582 -6468677 - ETnERV2-int LTR ERVK -2975 339 3 1 1699 2833 99 23 5 chr5 146068584 146068980 -6468279 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 1 1699 799 161 29 35 chr5 146068980 146069154 -6468105 - ORR1D1 LTR MaLR -33 341 169 1 1699 1543 236 77 60 chr5 146069163 146069229 -6468030 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 451 1 1699 1543 236 77 60 chr5 146069293 146069758 -6467501 - RLTR20A LTR ERVK -91 450 1 1 1699 487 250 17 17 chr5 146069786 146069904 -6467355 - ORR1D1 LTR MaLR -225 145 28 1 1699 663 317 50 75 chr5 146073256 146073617 -6463642 + ORR1E LTR MaLR 1 352 -7 1 1699 2814 40 49 72 chr5 146075756 146076161 -6461098 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1699 2047 46 7 7 chr5 146076161 146076446 -6460813 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 285 -813 1 1699 3476 63 43 21 chr5 146076418 146076953 -6460306 + MTA_Mm-int LTR MaLR 552 1098 0 1 1699 3337 38 8 5 chr5 146076953 146077348 -6459911 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1699 575 289 33 62 chr5 146078101 146078377 -6458882 - MTE-int LTR MaLR -28 1552 1285 1 1699 470 355 71 49 chr5 146078832 146079282 -6457977 - MTE-int LTR MaLR -273 1307 848 1 1699 247 283 35 99 chr5 146079792 146079933 -6457326 - MT2B LTR ERVL -324 277 146 1 1699 2751 49 0 141 chr5 146084372 146084797 -6452462 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 2 1699 1277 83 0 6 chr5 146084797 146084967 -6452292 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 169 -7412 2 1699 269 250 0 0 chr5 146084967 146085023 -6452236 + RLTR27 LTR ERVK 220 275 -34 2 1699 873 127 0 0 chr5 146085023 146085149 -6452110 + MMERVK10C-int LTR ERVK 225 350 -7231 2 1699 1111 148 15 99 chr5 146085167 146085429 -6451830 + MMERVK10C-int LTR ERVK 713 952 -6629 2 1699 1293 183 126 7 chr5 146085491 146085793 -6451466 + MMERVK10C-int LTR ERVK 274 611 -4795 2 1699 330 232 154 47 chr5 146085789 146085938 -6451321 + MMERVK10C-int LTR ERVK 524 688 -5449 2 1699 436 148 123 0 chr5 146085925 146086006 -6451253 + MMERVK10C-int LTR ERVK 938 1028 -5109 2 1699 430 79 0 0 chr5 146085997 146086060 -6451199 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1885 1947 -5634 2 1699 9470 55 0 0 chr5 146086057 146087184 -6450075 + MMERVK10C-int LTR ERVK 2513 3639 -3942 2 1699 2502 55 0 36 chr5 146087184 146087541 -6449718 + RLTR10B2 LTR ERVK 22 365 0 2 1699 509 229 9 0 chr5 146090280 146090389 -6446870 + RLTR16 LTR ERVK 1 110 -395 2 1699 2634 145 16 41 chr5 146090389 146090900 -6446359 - RLTR13C1 LTR ERVK -296 687 190 2 1699 2214 87 60 17 chr5 146090900 146091252 -6446007 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 1699 55682 30 13 4 chr5 146091252 146097667 -6439592 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6479 -2 2 1699 2214 87 60 17 chr5 146097669 146098021 -6439238 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 1699 1358 106 0 0 chr5 146098021 146098219 -6439040 - RLTR13C1 LTR ERVK -916 198 1 2 1699 5102 211 62 48 chr5 146098220 146099620 -6437639 - ETnERV2-int LTR ERVK -3939 3467 1417 2 1699 643 218 7 14 chr5 146099641 146099785 -6437474 + RMER15 LTR ERVL 340 482 -93 2 1699 2133 173 42 12 chr5 146100914 146101323 -6435936 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1699 2276 156 59 5 chr5 146101382 146101756 -6435503 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1699 807 249 72 121 chr5 146106555 146106757 -6430502 + MTE2a LTR MaLR 1 160 -219 2 1699 807 249 72 121 chr5 146106817 146107002 -6430257 + MTE2a LTR MaLR 161 369 -10 2 1699 1648 181 94 37 chr5 146107214 146107597 -6429662 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 1699 1869 108 33 27 chr5 146107940 146108278 -6428981 + ORR1A2 LTR MaLR 1 338 -8 2 1699 1511 154 171 28 chr5 146109091 146109412 -6427847 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1699 1566 143 11 25 chr5 146111741 146112021 -6425238 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 178 2 1699 307 349 29 12 chr5 146112297 146112468 -6424791 + RLTR15 LTR ERVK 58 231 -128 2 1699 3061 169 60 5 chr5 146113082 146113168 -6424091 - MurERV4-int LTR ERVK -3137 2123 2038 2 1699 3061 169 60 5 chr5 146113220 146113686 -6423573 - MurERV4-int LTR ERVK -3223 2037 1543 2 1699 2352 272 73 33 chr5 146113692 146114597 -6422662 - MurERV4-int LTR ERVK -4159 1101 40 2 1699 2541 158 36 22 chr5 146123408 146123822 -6413437 + MTC LTR MaLR 2 421 0 2 1699 2939 198 75 26 chr5 146124369 146124981 -6412278 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 2 1699 2069 159 135 0 chr5 146126620 146126953 -6410306 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1699 931 251 137 39 chr5 146127393 146127700 -6409559 - MTD LTR MaLR -30 389 53 2 1699 3534 179 45 31 chr5 146130233 146130550 -6406709 + RMER6D LTR ERVK 3 318 -402 2 1699 2427 147 59 19 chr5 146130550 146130974 -6406285 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 2 1699 3534 179 45 31 chr5 146130974 146131023 -6406236 + RMER6D LTR ERVK 319 384 -336 2 1699 3534 179 45 31 chr5 146131138 146131476 -6405783 + RMER6D LTR ERVK 385 720 0 2 1699 786 215 73 6 chr5 146137043 146137207 -6400052 - MTEb LTR MaLR -97 282 108 2 1699 351 307 0 0 chr5 146137430 146137531 -6399728 - MTEb LTR MaLR -278 101 1 2 1699 3887 212 49 35 chr5 146138531 146139048 -6398211 - RMER17B LTR ERVK -1 957 440 2 1699 3887 212 49 35 chr5 146139115 146139541 -6397718 - RMER17B LTR ERVK -519 439 1 2 1699 2075 161 63 16 chr5 146142392 146142427 -6394832 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 350 2 1699 2007 195 22 65 chr5 146142427 146142839 -6394420 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1699 2075 161 63 16 chr5 146142839 146143170 -6394089 - ORR1C2 LTR MaLR -35 349 1 2 1699 3497 186 14 24 chr5 146143170 146143832 -6393427 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1509 855 2 1699 2313 214 108 18 chr5 146143831 146144398 -6392861 - ORR1C2-int LTR MaLR -891 618 1 2 1699 1947 169 62 27 chr5 146144398 146144608 -6392651 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 171 2 1699 1947 169 62 27 chr5 146144724 146144883 -6392376 - ORR1C2 LTR MaLR -214 170 2 2 1700 1018 193 255 33 chr5 146148078 146148216 -6389043 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 210 3 1700 1018 193 255 33 chr5 146148274 146148441 -6388818 - ORR1D1 LTR MaLR -165 209 1 3 1700 451 298 68 40 chr5 146149229 146149633 -6387626 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 3 3 1700 1791 191 112 9 chr5 146150010 146150358 -6386901 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1700 1418 237 78 17 chr5 146152118 146152466 -6384793 + MTE2b LTR MaLR 8 376 -3 3 1700 991 276 122 60 chr5 146152595 146153046 -6384213 - RMER19C LTR ERVK -48 563 85 3 1700 962 232 42 120 chr5 146165026 146165335 -6371924 - RLTR19 LTR ERVK -1 498 211 3 1700 1140 277 38 28 chr5 146170710 146171107 -6366152 + RLTR20B2 LTR ERVK 98 498 -62 3 1700 991 290 69 31 chr5 146175034 146175457 -6361802 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 55 3 1700 2906 64 3 0 chr5 146175758 146176102 -6361157 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 3 1700 1029 282 105 72 chr5 146176102 146176752 -6360507 + IAPLTR3-int LTR ERVK 1 671 -6150 3 1700 3628 215 12 15 chr5 146176735 146177709 -6359550 + IAPLTR3-int LTR ERVK 585 1519 -5302 3 1700 401 162 8 93 chr5 146177676 146177805 -6359454 + MMERVK10C-int LTR ERVK 835 952 -6629 3 1700 1472 201 108 44 chr5 146177917 146178396 -6358863 + RMER16-int LTR ERVK 251 819 -4587 3 1700 477 221 88 0 chr5 146178401 146178514 -6358745 + RMER16-int LTR ERVK 938 1060 -5077 3 1700 649 243 372 29 chr5 146178527 146178750 -6358509 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2753 -4653 3 1700 2140 136 107 3 chr5 146178776 146179365 -6357894 + ETnERV2-int LTR ERVK 3567 4271 -3135 3 1700 491 173 23 38 chr5 146179370 146179494 -6357765 + MMETn-int LTR ERVK 2357 2464 -2380 3 1700 837 96 35 49 chr5 146179506 146179649 -6357610 + IAPLTR3-int LTR ERVK 4530 4670 -2911 3 1700 5747 251 72 44 chr5 146179906 146182259 -6355000 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5176 7257 -423 3 1700 3034 44 3 0 chr5 146182259 146182601 -6354658 + IAPLTR4 LTR ERVK 3 345 0 3 1700 3370 168 133 40 chr5 146189891 146190720 -6346539 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 3 1700 530 183 86 17 chr5 146191152 146191269 -6345990 + MTC LTR MaLR 297 421 0 3 1700 814 292 25 40 chr5 146191468 146191743 -6345516 + MTEb LTR MaLR 101 371 -8 3 1700 4509 193 91 28 chr5 146217501 146218355 -6318904 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 4 1700 1491 236 52 28 chr5 146218679 146219118 -6318141 + RLTR20C LTR ERVK 4 444 -90 4 1700 1379 59 32 5 chr5 146220264 146220451 -6316808 + MTA_Mm LTR MaLR 1 192 -204 4 1700 1333 76 38 5 chr5 146223119 146223331 -6313928 + MTA_Mm LTR MaLR 182 400 0 4 1700 362 255 131 86 chr5 146228698 146229071 -6308188 + RLTR12B LTR ERVK 48 437 -91 4 1700 877 289 40 83 chr5 146229686 146230189 -6307070 + RLTR12B LTR ERVK 47 527 -1 4 1700 788 269 41 38 chr5 146235313 146235630 -6301629 - RLTR16 LTR ERVK -14 491 174 4 1700 694 288 0 20 chr5 146236063 146236258 -6301001 - RLTR16 LTR ERVK -314 191 1 4 1700 3463 165 47 56 chr5 146236314 146237370 -6299889 + RLTR13D1 LTR ERVK 10 1011 -12 4 1700 342 276 11 87 chr5 146241762 146241909 -6295350 + MTE2a LTR MaLR 235 374 -5 4 1700 2500 141 40 67 chr5 146253962 146254457 -6282802 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 1700 3736 113 26 23 chr5 146254457 146255026 -6282233 + RLTR45-int LTR ERVK 1 571 -6673 4 1700 1053 40 0 0 chr5 146255817 146255941 -6281318 + RLTR45-int LTR ERVK 569 692 -6552 4 1700 1008 163 62 0 chr5 146256041 146256250 -6281009 + RLTR45 LTR ERVK 261 482 0 4 1700 573 255 65 58 chr5 146256588 146256974 -6280285 - RLTR11A2 LTR ERVK -28 413 1 4 1700 3202 135 96 15 chr5 146257479 146258156 -6279103 - RMER17A LTR ERVK -19 732 1 4 1700 577 322 63 33 chr5 146259472 146259771 -6277488 - RodERV21-int LTR ERV1 -4677 314 7 4 1700 3504 30 2 128 chr5 146259804 146260303 -6276956 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 1700 7258 51 0 53 chr5 146260303 146261247 -6276012 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6688 4 1700 330 68 0 0 chr5 146261281 146261325 -6275934 - MMERVK10C-int LTR ERVK -887 6694 6651 4 1700 42531 41 0 1 chr5 146261316 146266262 -6270997 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 4 1700 2586 108 53 3 chr5 146266260 146266640 -6270619 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 4 1700 3456 32 4 127 chr5 146266640 146267137 -6270122 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 1700 1247 206 114 81 chr5 146274076 146274461 -6262798 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 1700 1390 233 51 41 chr5 146274496 146274846 -6262413 + RMER10B LTR ERVL 1 355 -43 4 1700 1390 233 51 41 chr5 146274911 146274954 -6262305 + RMER10B LTR ERVL 356 398 0 4 212 4124 148 44 25 chr5 146276210 146277004 -6260255 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 4 1701 1022 202 32 23 chr5 146293032 146293250 -6244009 - RMER19A LTR ERVK -517 220 1 5 1701 3518 33 10 0 chr5 146294380 146294772 -6242487 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1701 4727 10 2 0 chr5 146300289 146300781 -6236478 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1701 48269 15 7 0 chr5 146300781 146306103 -6231156 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 5 1701 387 167 46 35 chr5 146306103 146306190 -6231069 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 5 1701 301 26 0 0 chr5 146306190 146306228 -6231031 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 1701 4727 10 2 0 chr5 146306228 146306720 -6230539 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1701 1664 158 86 3 chr5 146311736 146312040 -6225219 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -3 329 1 5 1701 9782 117 37 13 chr5 146312040 146313553 -6223706 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 6132 5 1701 42201 81 10 4 chr5 146313553 146319010 -6218249 - IAPEY3-int LTR ERVK -2186 5494 3 5 1701 1734 146 86 0 chr5 146319017 146319318 -6217941 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 5 1701 2261 111 182 23 chr5 146320924 146321213 -6216046 + RMER17A2 LTR ERVK 11 337 -569 5 1701 2261 111 182 23 chr5 146321266 146321410 -6215849 + RMER17A2 LTR ERVK 338 512 -394 5 1701 2242 135 29 88 chr5 146321407 146321894 -6215365 - RMER17A2 LTR ERVK -448 458 1 5 1701 2907 58 9 3 chr5 146326867 146327210 -6210049 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 5 1701 294 123 42 102 chr5 146334918 146334992 -6202267 + RMER17D LTR ERVK 391 468 -421 5 1701 294 123 42 102 chr5 146335052 146335077 -6202182 + RMER17D LTR ERVK 469 483 -406 5 1701 4244 218 10 23 chr5 146335077 146335667 -6201592 + RMER13B LTR ERVK 1 582 -326 5 1701 4499 146 49 39 chr5 146335667 146336545 -6200714 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 5 1701 4244 218 10 23 chr5 146336545 146336867 -6200392 + RMER13B LTR ERVK 583 901 -7 5 1701 1295 262 72 24 chr5 146337199 146337634 -6199625 + RLTR20C LTR ERVK 7 444 -90 5 1701 2631 119 10 2 chr5 146337928 146338325 -6198934 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1701 401 273 115 72 chr5 146343750 146344140 -6193119 + RLTR12B LTR ERVK 48 454 -74 5 1701 744 271 56 96 chr5 146344687 146345188 -6192071 + RLTR12B LTR ERVK 47 527 -1 5 1701 565 279 29 34 chr5 146351612 146351816 -6185443 - RLTR16 LTR ERVK -133 372 170 5 1701 762 263 5 10 chr5 146352248 146352440 -6184819 - RLTR16 LTR ERVK -314 191 1 5 1701 2957 156 47 53 chr5 146352487 146353416 -6183843 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 846 -56 5 1701 230 309 37 60 chr5 146359725 146359859 -6177400 + RMER15 LTR ERVL 1 131 -444 6 1701 347 306 14 7 chr5 146359894 146360032 -6177227 + RMER15 LTR ERVL 275 413 -162 6 1701 261 310 39 70 chr5 146360359 146360579 -6176680 + RLTR25A LTR ERVK 813 1103 0 6 1701 303 268 29 109 chr5 146361393 146361531 -6175728 + MTE2a LTR MaLR 248 374 -5 6 1701 2244 143 145 19 chr5 146366609 146367037 -6170222 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 6 1701 3300 126 31 4 chr5 146367037 146367548 -6169711 + RLTR45-int LTR ERVK 1 525 -6719 6 1701 303 93 0 156 chr5 146368123 146368187 -6169072 + RLTR45-int LTR ERVK 521 574 -6670 6 1701 1141 42 0 40 chr5 146368945 146369095 -6168164 + RLTR45-int LTR ERVK 549 692 -6552 6 1701 250 261 34 0 chr5 146369306 146369394 -6167865 + RLTR45-int LTR ERVK 1535 1625 -6055 6 1701 1128 58 0 0 chr5 146369438 146369576 -6167683 + RLTR45-int LTR ERVK 681 818 -6426 6 1701 450 262 54 36 chr5 146369783 146369949 -6167310 + RNERVK23-int LTR ERVK 6195 6363 -1854 6 1701 2607 53 3 3 chr5 146370314 146370634 -6166625 + RLTR45-int LTR ERVK 1329 1648 -5596 6 1701 4082 185 17 15 chr5 146370723 146371694 -6165565 + RLTR45-int LTR ERVK 6331 7761 -456 6 1701 591 290 104 34 chr5 146371715 146372100 -6165159 - BGLII_B LTR ERVK -29 412 1 6 1701 2865 179 74 16 chr5 146372569 146373261 -6163998 - RMER17A LTR ERVK -19 732 1 6 1701 262 246 0 16 chr5 146373365 146373427 -6163832 - RodERV21-int LTR ERV1 -3348 1643 1583 6 1701 569 322 63 33 chr5 146374621 146374920 -6162339 - RodERV21-int LTR ERV1 -4677 314 7 6 1701 1085 201 163 84 chr5 146375495 146375864 -6161395 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 6 1701 952 266 46 33 chr5 146375899 146376292 -6160967 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 6 1701 2390 98 60 0 chr5 146377249 146377584 -6159675 - RLTR10D LTR ERVK -3 356 2 6 1701 2271 217 42 18 chr5 146377585 146378182 -6159077 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 5671 6 1701 5089 132 22 14 chr5 146378247 146379032 -6158227 - IAP-d-int LTR ERVK -358 6184 5394 6 1701 1890 228 3 0 chr5 146379071 146379426 -6157833 - IAP-d-int LTR ERVK -1148 5394 5039 6 1701 375 47 13 147 chr5 146379418 146379493 -6157766 - IAP-d-int LTR ERVK -6473 69 5 6 1701 818 125 111 0 chr5 146379494 146379638 -6157621 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 200 6 1701 3636 48 2 5 chr5 146379638 146380075 -6157184 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1701 2221 45 0 7 chr5 146380075 146380344 -6156915 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 267 -7314 6 1701 1618 138 62 4 chr5 146380474 146380750 -6156509 - RLTR10D LTR ERVK -67 292 1 6 1701 3538 160 121 11 chr5 146381384 146381715 -6155544 + RMER17D2 LTR ERVK 1 369 -440 6 1701 3538 160 121 11 chr5 146381858 146382255 -6155004 + RMER17D2 LTR ERVK 370 809 0 6 1701 1679 146 9 40 chr5 146386397 146386813 -6150446 + RMER17A2 LTR ERVK 1 513 -393 6 1701 2205 151 8 50 chr5 146386810 146387290 -6149969 - RMER17A2 LTR ERVK -446 460 1 6 1701 4205 225 18 12 chr5 146398278 146398854 -6138405 + RMER13B LTR ERVK 1 584 -324 6 1701 4858 131 14 64 chr5 146398854 146399790 -6137469 + RMER17D LTR ERVK 1 889 0 6 1701 4205 225 18 12 chr5 146399790 146400116 -6137143 + RMER13B LTR ERVK 585 908 0 6 1701 1258 260 68 27 chr5 146400440 146400866 -6136393 + RLTR20C LTR ERVK 4 446 -114 6 1701 2668 114 10 2 chr5 146401170 146401567 -6135692 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1701 381 293 48 57 chr5 146406900 146407110 -6130149 + RLTR12B LTR ERVK 48 255 -273 7 1702 726 293 54 97 chr5 146407865 146408368 -6128891 + RLTR12B LTR ERVK 47 527 -1 7 1702 2919 96 14 19 chr5 146412778 146413191 -6124068 + RLTR1B-int LTR ERV1 1671 2081 -1218 7 1702 2283 60 7 0 chr5 146413170 146413451 -6123808 + RLTR45-int LTR ERVK 6962 7244 0 7 1702 2557 148 32 68 chr5 146413451 146413951 -6123308 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 7 1702 4615 84 34 24 chr5 146413954 146414192 -6123067 + RLTR45-int LTR ERVK 18 278 -6966 7 1702 4615 84 34 24 chr5 146414212 146414641 -6122618 + RLTR45-int LTR ERVK 279 691 -6553 7 1702 1780 60 5 0 chr5 146414996 146415213 -6122046 + RLTR45-int LTR ERVK 692 909 -6335 7 1702 758 101 0 8 chr5 146415333 146415453 -6121806 + RLTR45-int LTR ERVK 913 1031 -6213 7 1702 291 278 22 22 chr5 146415748 146415840 -6121419 + MMTV-int LTR ERVK 2413 2504 -4749 7 1702 2664 59 0 0 chr5 146416204 146416524 -6120735 + RLTR45-int LTR ERVK 1329 1648 -5596 7 1702 7494 150 19 10 chr5 146416613 146418003 -6119256 + RLTR45-int LTR ERVK 6331 7761 -456 7 1702 2121 139 42 171 chr5 146418003 146418557 -6118702 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 7 1702 688 264 56 50 chr5 146419088 146419411 -6117848 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 169 7 1702 822 253 5 10 chr5 146419841 146420033 -6117226 - RLTR16 LTR ERVK -314 191 1 7 1702 2982 129 70 21 chr5 146420072 146421121 -6116138 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 978 0 7 1702 3147 147 93 23 chr5 146421920 146422609 -6114650 - RMER17A LTR ERVK -14 737 1 7 1702 1044 169 31 0 chr5 146474045 146474240 -6063019 - RMER19A LTR ERVK -536 201 1 7 1702 3196 53 8 0 chr5 146475481 146475874 -6061385 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1702 1129 200 98 37 chr5 146486294 146486590 -6050669 + RLTR46 LTR ERVK 1 314 -6 7 1702 519 236 30 110 chr5 146486600 146486800 -6050459 + IAPEY3-int LTR ERVK 3 186 -7494 7 1702 651 249 46 0 chr5 146486796 146487013 -6050246 + IAPEY3-int LTR ERVK 535 761 -6919 7 1702 539 101 0 63 chr5 146487128 146487223 -6050036 + IAPEz-int LTR ERVK 85 173 -6369 7 1702 753 213 29 6 chr5 146487220 146487390 -6049869 + IAPEz-int LTR ERVK 347 520 -6022 7 1702 1283 147 112 0 chr5 146487372 146487596 -6049663 + IAPEz-int LTR ERVK 5007 5255 -1287 7 1702 1749 163 73 6 chr5 146487593 146487921 -6049338 + IAPEY3-int LTR ERVK 6989 7338 -342 7 1702 1359 201 59 12 chr5 146487944 146488281 -6048978 + IAPEz-int LTR ERVK 6129 6481 0 7 1702 1192 192 94 34 chr5 146488281 146488578 -6048681 + RLTR46 LTR ERVK 1 315 -5 7 1702 1624 148 87 0 chr5 146490668 146490966 -6046293 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -8 324 1 7 1702 9201 89 30 15 chr5 146490966 146492259 -6045000 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 6368 7 1702 6002 187 20 8 chr5 146498840 146500000 -6037259 - IAPEY3-int LTR ERVK -1394 6286 5113 7 1702 39090 86 6 4 chr5 146500000 146505099 -6032160 - IAPEY3-int LTR ERVK -2568 5112 3 1 1702 1621 149 86 0 chr5 146505106 146505407 -6031852 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 1 1702 2094 111 182 23 chr5 146507015 146507304 -6029955 + RMER17A2 LTR ERVK 11 337 -569 3 1702 2094 111 182 23 chr5 146507357 146507501 -6029758 + RMER17A2 LTR ERVK 338 512 -394 3 1702 2053 122 28 99 chr5 146507498 146507991 -6029268 - RMER17A2 LTR ERVK -448 458 1 5 1702 2757 58 9 3 chr5 146512963 146513306 -6023953 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 1 1702 284 125 43 103 chr5 146521039 146521111 -6016148 + RMER17D LTR ERVK 393 468 -421 3 1702 284 125 43 103 chr5 146521175 146521200 -6016059 + RMER17D LTR ERVK 469 483 -406 3 1702 4248 221 10 23 chr5 146521200 146521790 -6015469 + RMER13B LTR ERVK 1 584 -324 3 1702 4539 137 55 48 chr5 146521790 146522671 -6014588 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 3 1702 4248 221 10 23 chr5 146522671 146522993 -6014266 + RMER13B LTR ERVK 585 901 -7 3 1702 1236 273 70 35 chr5 146523325 146523748 -6013511 + RLTR20C LTR ERVK 7 432 -102 3 1702 1236 273 68 35 chr5 146523783 146523810 -6013449 + RLTR20C LTR ERVK 433 455 -79 3 1702 2606 121 10 2 chr5 146524056 146524453 -6012806 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1702 378 283 48 57 chr5 146529867 146530077 -6007182 + RLTR12B LTR ERVK 48 255 -273 5 1702 763 269 56 96 chr5 146530804 146531305 -6005954 + RLTR12B LTR ERVK 47 527 -1 5 1702 594 270 30 30 chr5 146537737 146537939 -5999320 - RLTR16 LTR ERVK -133 372 171 7 212 762 263 5 10 chr5 146538374 146538566 -5998693 - RLTR16 LTR ERVK -314 191 1 7 1703 3038 163 70 20 chr5 146538613 146539543 -5997716 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 965 -58 7 1703 351 306 14 7 chr5 146550180 146550318 -5986941 + RMER15 LTR ERVL 275 413 -162 9 1703 344 294 27 87 chr5 146551720 146551869 -5985390 + MTE2a LTR MaLR 235 374 -5 9 1703 2279 141 145 19 chr5 146556983 146557411 -5979848 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1703 3459 114 29 4 chr5 146557411 146557923 -5979336 + RLTR45-int LTR ERVK 1 525 -6719 1 1703 282 127 0 167 chr5 146558500 146558566 -5978693 + RLTR45-int LTR ERVK 521 575 -6669 1 1703 1133 42 0 40 chr5 146559321 146559471 -5977788 + RLTR45-int LTR ERVK 549 692 -6552 1 1703 1122 58 0 0 chr5 146559814 146559952 -5977307 + RLTR45-int LTR ERVK 681 818 -6426 1 1703 478 250 54 36 chr5 146560159 146560325 -5976934 + RNERVK23-int LTR ERVK 6195 6363 -1854 1 1703 2443 72 6 3 chr5 146560688 146561007 -5976252 + RLTR45-int LTR ERVK 1329 1648 -5596 1 1703 7515 148 11 12 chr5 146561096 146562499 -5974760 + RLTR45-int LTR ERVK 6331 7761 -456 1 1703 2087 161 142 16 chr5 146562499 146562927 -5974332 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 1703 486 267 60 28 chr5 146566646 146566862 -5970397 - BGLII_B LTR ERVK -28 413 191 1 1703 486 275 71 51 chr5 146566854 146566904 -5970355 - RLTR11A2 LTR ERVK -269 258 209 1 1703 486 275 71 51 chr5 146567069 146567271 -5969988 - RLTR11A2 LTR ERVK -319 208 2 1 1703 2584 159 76 11 chr5 146567729 146568405 -5968854 - RMER17A LTR ERVK -22 787 1 1 1703 277 269 0 15 chr5 146568503 146568571 -5968688 - RodERV21-int LTR ERV1 -3342 1649 1583 1 1703 533 325 63 33 chr5 146569753 146570052 -5967207 - RodERV21-int LTR ERV1 -4677 314 7 1 1703 1052 207 163 84 chr5 146570628 146570997 -5966262 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 1 1703 961 266 49 31 chr5 146571032 146571423 -5965836 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 1 1703 2408 107 53 0 chr5 146572405 146572742 -5964517 - RLTR10D LTR ERVK -3 356 2 1 1703 2278 136 49 0 chr5 146572743 146573089 -5964170 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 6180 1 1703 6883 196 19 45 chr5 146573057 146574590 -5962669 - IAP-d-int LTR ERVK -727 6953 5039 1 1703 467 29 13 128 chr5 146574582 146574660 -5962599 - IAP-d-int LTR ERVK -6473 69 1 1 1703 2279 134 50 0 chr5 146574660 146575002 -5962257 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 1 1703 4087 152 49 14 chr5 146575675 146576457 -5960802 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 1 1703 1575 184 21 32 chr5 146586907 146587208 -5950051 + RMER17A2 LTR ERVK 1 295 -611 1 1703 1575 95 31 1 chr5 146587273 146587372 -5949887 + RMER17A2 LTR ERVK 296 372 -534 1 1703 2105 139 2 100 chr5 146587362 146587880 -5949379 - RMER17A2 LTR ERVK -439 467 1 1 1703 4221 221 26 19 chr5 146606972 146607582 -5929677 + RMER13B LTR ERVK 1 584 -324 1 1703 4888 147 19 40 chr5 146607582 146608488 -5928771 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 1 1703 4221 217 20 16 chr5 146608488 146608816 -5928443 + RMER13B LTR ERVK 585 908 0 1 1703 1213 229 61 26 chr5 146609140 146609566 -5927693 + RLTR20C LTR ERVK 4 432 -102 1 1703 491 283 0 14 chr5 146609608 146609625 -5927634 + RLTR20C LTR ERVK 447 463 -88 1 1703 2812 99 5 5 chr5 146609873 146610269 -5926990 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1703 341 303 48 57 chr5 146615611 146615821 -5921438 + RLTR12B LTR ERVK 48 255 -273 1 1703 672 289 37 91 chr5 146616615 146617045 -5920214 + RLTR12B LTR ERVK 121 527 -1 1 1703 2973 89 15 17 chr5 146621437 146621849 -5915410 + RLTR1B-int LTR ERV1 1671 2081 -1218 2 1703 2336 60 3 0 chr5 146621826 146622110 -5915149 + RLTR45-int LTR ERVK 6960 7244 0 2 1703 2551 142 34 66 chr5 146622110 146622608 -5914651 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1703 4579 91 35 19 chr5 146622611 146622849 -5914410 + RLTR45-int LTR ERVK 18 278 -6966 2 1703 4579 91 35 19 chr5 146622869 146623295 -5913964 + RLTR45-int LTR ERVK 279 691 -6553 2 1703 1823 59 0 0 chr5 146623650 146623869 -5913390 + RLTR45-int LTR ERVK 692 910 -6334 2 1703 745 77 17 25 chr5 146623990 146624110 -5913149 + RLTR45-int LTR ERVK 913 1031 -6213 2 1703 323 238 27 27 chr5 146624402 146624536 -5912723 + MMTV-int LTR ERVK 2388 2504 -4749 2 1703 2686 56 0 0 chr5 146624856 146625176 -5912083 + RLTR45-int LTR ERVK 1329 1648 -5596 2 1703 7494 150 19 10 chr5 146625265 146626655 -5910604 + RLTR45-int LTR ERVK 6331 7761 -456 2 1703 2154 139 42 170 chr5 146626655 146627208 -5910051 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1703 688 264 56 50 chr5 146627739 146628062 -5909197 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 169 2 1703 822 253 5 10 chr5 146628492 146628684 -5908575 - RLTR16 LTR ERVK -314 191 1 2 1703 2982 129 70 21 chr5 146628723 146629772 -5907487 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 978 0 2 1703 3147 147 93 23 chr5 146630570 146631259 -5906000 - RMER17A LTR ERVK -14 737 1 2 1703 252 267 0 109 chr5 146631929 146632030 -5905229 - RodERV21-int LTR ERV1 -3954 1037 948 2 1703 358 286 149 0 chr5 146632649 146632810 -5904449 - RodERV21-int LTR ERV1 -4188 803 619 2 1703 473 339 63 33 chr5 146632958 146633257 -5904002 - RodERV21-int LTR ERV1 -4677 314 7 2 1703 814 191 256 112 chr5 146633833 146634181 -5903078 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 2 1703 1347 228 30 45 chr5 146634216 146634620 -5902639 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 2 1703 2423 111 50 0 chr5 146635430 146635772 -5901487 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 2 1703 2538 147 26 16 chr5 146635772 146636232 -5901027 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 5812 2 1703 414 100 0 0 chr5 146636247 146636307 -5900952 - RLTR10D LTR ERVK -299 60 1 2 1703 4316 147 50 13 chr5 146636953 146637733 -5899526 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 2 1703 228 225 0 0 chr5 146639542 146639582 -5897677 - RMER13A LTR ERVK -214 646 607 2 1703 1056 159 31 0 chr5 146646330 146646525 -5890734 - RMER19A LTR ERVK -536 201 1 2 1703 3322 46 5 0 chr5 146647784 146648178 -5889081 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1703 265 56 0 0 chr5 146649517 146649553 -5887706 + RLTR10B LTR ERVK 1 36 -256 2 1703 1974 39 0 115 chr5 146649553 146649874 -5887385 + RLTR10B LTR ERVK 9 292 0 2 1703 1501 45 0 0 chr5 146649874 146650052 -5887207 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 178 -7403 2 1703 2471 35 117 0 chr5 146650207 146650540 -5886719 + MMERVK10C-int LTR ERVK 553 911 -1076 2 1703 399 314 32 32 chr5 146650540 146650760 -5886499 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1347 1566 -6015 2 1703 2842 100 8 3 chr5 146650744 146651174 -5886085 + MMERVK10C-int LTR ERVK 5001 5810 -1771 2 1703 7462 67 0 26 chr5 146651165 146652121 -5885138 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6651 7581 0 2 1703 315 48 0 0 chr5 146652121 146652163 -5885096 + RLTR10B LTR ERVK 1 42 -250 2 1703 1992 39 0 121 chr5 146652185 146652508 -5884751 + RLTR10B LTR ERVK 9 292 0 2 1703 1126 206 94 34 chr5 146661591 146661888 -5875371 + RLTR46 LTR ERVK 1 315 -5 2 1703 433 261 32 87 chr5 146661897 146662092 -5875167 + IAPEY3-int LTR ERVK 3 171 -7342 2 1703 651 242 47 0 chr5 146662095 146662310 -5874949 + IAPEY3-int LTR ERVK 537 761 -6919 2 1703 520 133 212 10 chr5 146662418 146662517 -5874742 + IAP-d-int LTR ERVK 55 173 -6369 2 1703 767 203 26 0 chr5 146662514 146662667 -5874592 + IAP-d-int LTR ERVK 347 503 -6039 2 1703 1310 138 112 0 chr5 146662667 146662891 -5874368 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5255 -1287 2 1703 1694 148 78 21 chr5 146662888 146663219 -5874040 + IAPEY3-int LTR ERVK 6989 7338 -342 2 1703 1242 186 94 21 chr5 146663242 146663571 -5873688 + IAP-d-int LTR ERVK 6129 6481 0 2 1703 1123 210 95 34 chr5 146663571 146663867 -5873392 + RLTR46 LTR ERVK 1 314 -6 2 1703 1872 179 21 49 chr5 146667580 146667887 -5869372 + RMER17A2 LTR ERVK 2 291 -615 2 1703 1872 130 51 14 chr5 146667951 146668096 -5869163 + RMER17A2 LTR ERVK 292 513 -393 2 1703 2376 114 18 84 chr5 146668095 146668585 -5868674 - RMER17A2 LTR ERVK -448 458 1 2 1704 4829 203 12 23 chr5 146681225 146681814 -5855445 + RMER13B LTR ERVK 1 584 -324 2 1704 5560 125 26 10 chr5 146681814 146682687 -5854572 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 2 1704 4829 203 12 23 chr5 146682687 146683015 -5854244 + RMER13B LTR ERVK 585 908 0 2 1704 1500 232 64 27 chr5 146683339 146683779 -5853480 + RLTR20C LTR ERVK 4 446 -88 2 1704 2793 119 2 5 chr5 146684080 146684477 -5852782 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1704 487 295 96 72 chr5 146689576 146689992 -5847267 + RLTR12B LTR ERVK 47 472 -56 3 1704 1149 281 36 72 chr5 146690533 146691032 -5846227 + RLTR12B LTR ERVK 47 527 -1 3 1704 791 253 48 19 chr5 146696255 146696525 -5840734 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 216 3 1704 3667 33 0 0 chr5 146699855 146700251 -5837008 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1704 9627 37 9 0 chr5 146700251 146701339 -5835920 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1704 3675 30 0 0 chr5 146701339 146701735 -5835524 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1704 2264 153 113 5 chr5 146708660 146709040 -5828219 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1704 275 287 22 54 chr5 146709318 146709410 -5827849 + MTE2b LTR MaLR 197 285 -94 3 1704 410 261 29 69 chr5 146711703 146711876 -5825383 + MTE2b LTR MaLR 205 370 -9 3 1704 575 340 105 49 chr5 146714045 146714539 -5822720 + MTE-int LTR MaLR 754 1275 -305 3 1704 446 300 74 84 chr5 146714766 146714807 -5822452 + MTE-int LTR MaLR 1247 1284 -296 3 1704 446 300 74 84 chr5 146714945 146715212 -5822047 + MTE-int LTR MaLR 1285 1552 -28 3 1704 639 323 53 72 chr5 146718035 146718286 -5818973 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 110 3 1704 6496 98 18 27 chr5 146718286 146719197 -5818062 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 3 1704 639 323 53 72 chr5 146719197 146719305 -5817954 - ORR1D2 LTR MaLR -261 109 18 3 1704 323 227 45 0 chr5 146719924 146719990 -5817269 + MER77 LTR ERVL 1 69 -538 3 1704 431 250 27 22 chr5 146720051 146720184 -5817075 + ORR1D1 LTR MaLR 39 164 -210 3 1704 1744 255 58 43 chr5 146720184 146720291 -5816968 + RLTR20A LTR ERVK 1 96 -445 3 1704 1744 255 58 43 chr5 146720318 146720655 -5816604 + RLTR20A LTR ERVK 97 449 -92 3 1704 1744 255 58 43 chr5 146720702 146720789 -5816470 + RLTR20A LTR ERVK 450 541 0 3 1704 994 194 25 10 chr5 146720797 146721000 -5816259 + ORR1D1 LTR MaLR 169 374 0 3 1704 1197 251 127 66 chr5 146722160 146722539 -5814720 - MTD LTR MaLR -13 406 5 3 1704 2523 215 44 31 chr5 146726418 146727004 -5810255 + RLTR17 LTR ERVK 98 691 -1 3 1704 418 138 0 0 chr5 146727007 146727065 -5810194 + RMER3D-int LTR ERVK 3 60 -2782 3 1704 3605 160 33 98 chr5 146727113 146728128 -5809131 + RMER17A2 LTR ERVK 1 958 0 3 1704 977 239 64 30 chr5 146728186 146728484 -5808775 + RMER3D-int LTR ERVK 165 472 -2370 3 1704 322 191 21 53 chr5 146728579 146728673 -5808586 + RMER3D-int LTR ERVK 1023 1113 -1729 3 1704 10817 85 13 16 chr5 146728672 146730134 -5807125 - MERVK26-int LTR ERVK -901 6018 4561 3 1704 2481 81 26 3 chr5 146730932 146731279 -5805980 - RLTR9F LTR ERVK -60 355 1 3 1704 403 102 42 28 chr5 146731284 146731355 -5805904 - ETnERV2-int LTR ERVK -4 7402 7331 3 1704 16112 160 47 30 chr5 146731565 146734503 -5802756 - ETnERV2-int LTR ERVK -977 6429 3441 3 1704 5394 182 51 42 chr5 146734726 146736387 -5800872 - ETnERV2-int LTR ERVK -3958 3448 814 3 1704 1983 122 125 19 chr5 146748804 146749164 -5788095 - ETnERV2-int LTR ERVK -5953 1453 1056 3 1704 788 246 89 23 chr5 146749146 146749404 -5787855 - ETnERV2-int LTR ERVK -2895 419 145 3 1704 2290 114 21 16 chr5 146749810 146750171 -5787088 - RLTR9F LTR ERVK -4 411 43 3 1704 602 321 73 53 chr5 146754574 146754905 -5782354 + MTE2a LTR MaLR 6 339 -80 4 1704 8650 241 82 83 chr5 146755474 146759107 -5778152 - ETnERV2-int LTR ERVK -213 7193 3567 4 1704 2846 152 53 16 chr5 146765168 146765731 -5771528 - ETnERV2-int LTR ERVK -3844 3562 2979 4 1704 828 243 80 28 chr5 146765710 146765922 -5771337 - ETnERV2-int LTR ERVK -4730 2676 2454 4 1704 495 113 255 10 chr5 146765935 146766033 -5771226 - RMER16-int LTR ERVK -4196 1210 1089 4 1704 2026 153 154 38 chr5 146766047 146766494 -5770765 - RMER16-int LTR ERVK -4595 811 313 4 1704 660 244 32 0 chr5 146767477 146767600 -5769659 - ETnERV2-int LTR ERVK -213 7193 7067 4 1704 557 283 73 22 chr5 146768435 146768805 -5768454 - RLTR11A2 LTR ERVK -27 414 1 4 1704 3053 25 0 3 chr5 146769178 146769505 -5767754 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 4 1704 60625 20 11 0 chr5 146769505 146776237 -5761022 + IAPLTR3-int LTR ERVK 1 6801 -20 4 1704 2887 25 28 0 chr5 146776237 146776554 -5760705 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 326 0 4 1704 370 206 0 0 chr5 146776860 146776923 -5760336 - RodERV21-int LTR ERV1 -3342 1649 1587 4 1704 785 266 73 0 chr5 146777642 146777875 -5759384 - RodERV21-int LTR ERV1 -4050 941 692 4 1704 876 272 57 37 chr5 146778089 146778387 -5758872 - RodERV21-int LTR ERV1 -4681 310 7 4 1704 1660 156 117 86 chr5 146778958 146779344 -5757915 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 1704 667 205 0 8 chr5 146779379 146779502 -5757757 + RMER10B LTR ERVL 1 122 -276 4 1704 1177 90 6 6 chr5 146779534 146779701 -5757558 - RMER19A LTR ERVK 0 737 571 4 1704 1062 167 58 10 chr5 146779698 146779904 -5757355 - RMER19A LTR ERVK -521 216 1 4 1704 1402 230 121 48 chr5 146787161 146787576 -5749683 + RMER19C LTR ERVK 121 565 -46 4 1704 1272 255 59 20 chr5 146787703 146788059 -5749200 - MTE2a LTR MaLR -2 377 8 4 1704 2630 118 35 30 chr5 146788167 146788568 -5748691 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 4 1704 1910 182 90 11 chr5 146790160 146790516 -5746743 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1704 421 328 85 39 chr5 146791195 146791455 -5745804 + RLTR12B LTR ERVK 17 288 -240 4 1704 849 182 16 74 chr5 146792400 146792590 -5744669 + ORR1D1 LTR MaLR 3 181 -193 4 1704 456 276 67 33 chr5 146792661 146792871 -5744388 + ORR1D1 LTR MaLR 158 374 0 4 1704 1577 206 25 76 chr5 146795982 146796349 -5740910 - ORR1B1 LTR MaLR -45 349 2 4 1704 284 262 25 12 chr5 146799132 146799213 -5738046 + MTEb LTR MaLR 6 87 -292 4 1704 788 219 73 6 chr5 146799503 146799668 -5737591 + MTEb LTR MaLR 108 283 -96 4 1705 3292 167 88 35 chr5 146804963 146805313 -5731946 - RMER6D LTR ERVK 0 720 362 4 1705 3292 167 88 35 chr5 146805377 146805426 -5731833 - RMER6D LTR ERVK -359 361 318 4 1705 2510 131 67 19 chr5 146805426 146805846 -5731413 + BGLII_B LTR ERVK 1 440 -1 4 1705 3292 167 88 35 chr5 146805846 146806127 -5731132 - RMER6D LTR ERVK -403 317 3 4 1705 1273 264 87 24 chr5 146808873 146809242 -5728017 + MTD LTR MaLR 1 392 -27 4 1705 1875 167 145 3 chr5 146809693 146810024 -5727235 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1705 2246 176 37 7 chr5 146812164 146812571 -5724688 - MTC LTR MaLR 0 421 3 4 1705 1541 205 102 9 chr5 146815494 146815829 -5721430 + ORR1B2 LTR MaLR 2 367 0 4 1705 287 211 0 0 chr5 146815830 146815882 -5721377 + ORR1B2-int LTR MaLR 2 53 -1456 4 1705 5856 187 126 15 chr5 146815882 146816700 -5720559 + ORR1B2-int LTR MaLR 8 917 -592 4 1705 3859 136 85 20 chr5 146816700 146817405 -5719854 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 4 1705 5856 187 126 15 chr5 146817405 146817717 -5719542 + ORR1B2-int LTR MaLR 918 1260 -249 4 1705 5856 187 126 15 chr5 146817741 146817961 -5719298 + ORR1B2-int LTR MaLR 1261 1508 -1 4 1705 1479 150 234 46 chr5 146817963 146818270 -5718989 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 4 1705 1668 110 18 37 chr5 146819118 146819391 -5717868 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 52 4 1705 281 128 0 0 chr5 146819471 146819518 -5717741 - ORR1A2 LTR MaLR -280 49 3 4 1705 1522 185 124 25 chr5 146819707 146820071 -5717188 + MTD LTR MaLR 13 404 -15 4 1705 745 265 161 55 chr5 146820258 146820454 -5716805 - MTD LTR MaLR 0 419 184 4 1705 745 265 161 55 chr5 146820594 146820776 -5716483 - MTD LTR MaLR -236 183 2 4 1705 600 229 17 0 chr5 146824771 146824889 -5712370 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 255 5 1705 1798 166 68 15 chr5 146824888 146825224 -5712035 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 5 1705 521 220 30 47 chr5 146825271 146825417 -5711842 - ORR1D1 LTR MaLR -162 208 67 5 1705 4156 107 71 84 chr5 146826116 146826936 -5710323 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 5 1705 369 241 12 11 chr5 146827911 146828063 -5709196 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 129 5 1705 225 231 246 0 chr5 146828243 146828308 -5708951 - ORR1D1 LTR MaLR -232 142 62 5 1705 330 164 0 0 chr5 146828316 146828371 -5708888 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 340 5 1705 1391 182 62 75 chr5 146829506 146829814 -5707445 - ORR1B1 LTR MaLR -44 350 47 5 1705 258 169 164 33 chr5 146829821 146829882 -5707377 - ORR1B1 LTR MaLR -301 69 1 5 1705 2167 188 8 3 chr5 146831220 146831604 -5705655 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 5 1705 915 251 28 125 chr5 146833659 146834082 -5703177 + MTD LTR MaLR 8 389 -30 5 1705 793 299 55 4 chr5 146836285 146836520 -5700739 - MTEa LTR MaLR -105 274 28 5 1705 307 222 48 36 chr5 146839787 146839871 -5697388 - MTE2b LTR MaLR 0 379 295 5 1705 1914 135 30 59 chr5 146840870 146841209 -5696050 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1705 682 260 22 11 chr5 146841519 146841702 -5695557 + RMER15 LTR ERVL 294 478 -97 5 1705 2090 163 50 12 chr5 146842854 146843257 -5694002 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 5 1705 2603 63 0 0 chr5 146855482 146855830 -5681429 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -7 350 3 5 1705 5558 76 56 0 chr5 146859320 146860053 -5677206 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 6907 5 1705 502 34 0 0 chr5 146860053 146860112 -5677147 - IAPEY3-int LTR ERVK -2770 4910 4852 5 1705 3647 72 23 0 chr5 146860079 146860550 -5676709 - IAPEY3-int LTR ERVK -4957 2723 2242 5 1705 9345 128 13 37 chr5 146860530 146862025 -5675234 - IAPEY3-int LTR ERVK -5698 1982 524 5 1705 822 128 49 49 chr5 146862024 146862188 -5675071 - IAPLTR4_I LTR ERVK -1290 180 17 5 1705 2747 51 0 0 chr5 146862188 146862541 -5674718 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 2 5 1705 1272 176 4 28 chr5 146866505 146866756 -5670503 + ORR1D1 LTR MaLR 3 247 -127 5 1705 2162 183 47 20 chr5 146866759 146867205 -5670054 + RLTR26 LTR ERVK 1 458 -184 5 1705 558 242 77 15 chr5 146867494 146867624 -5669635 + RLTR26 LTR ERVK 453 590 -52 5 1705 4811 141 17 1 chr5 146868014 146868712 -5668547 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 6494 5 1705 793 294 15 12 chr5 146868744 146869101 -5668158 - RLTR45-int LTR ERVK -389 7828 7506 5 1705 5250 136 83 106 chr5 146869103 146870287 -5666972 - RLTR45-int LTR ERVK -1173 6071 4916 5 1705 296 250 28 0 chr5 146877165 146877237 -5660022 - MTE2b LTR MaLR 0 379 306 5 1705 1977 133 20 58 chr5 146878253 146878595 -5658664 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1705 688 260 22 11 chr5 146878900 146879083 -5658176 + RMER15 LTR ERVL 294 478 -97 5 1705 2185 156 57 10 chr5 146880236 146880638 -5656621 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1705 353 191 0 29 chr5 146882007 146882077 -5655182 + ORR1B1 LTR MaLR 1 68 -306 5 1705 1226 189 62 75 chr5 146882084 146882392 -5654867 + ORR1B1 LTR MaLR 47 350 -44 5 1705 299 182 0 0 chr5 146883535 146883590 -5653669 + ORR1B1 LTR MaLR 340 394 0 5 1705 343 237 614 20 chr5 146883843 146883996 -5653263 + ORR1D1 LTR MaLR 129 372 -2 5 1705 3826 124 127 8 chr5 146884961 146885684 -5651575 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 5 1705 533 187 31 47 chr5 146886432 146886561 -5650698 + ORR1D1 LTR MaLR 87 213 -161 5 1705 1767 165 62 15 chr5 146886591 146886929 -5650330 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1705 597 212 17 0 chr5 146886928 146887046 -5650213 + ORR1D1 LTR MaLR 255 374 0 5 1705 226 302 91 23 chr5 146888661 146888793 -5648466 + MLT1A0 LTR MaLR 1 141 -224 5 1705 387 342 60 42 chr5 146891250 146891418 -5645841 + MTE2a LTR MaLR 1 171 -250 5 1705 493 292 106 16 chr5 146891501 146891689 -5645570 + MTE2a LTR MaLR 175 379 0 5 1705 1410 189 27 24 chr5 146891893 146892210 -5645049 - MTD LTR MaLR -14 405 13 5 1705 270 149 0 0 chr5 146892404 146892451 -5644808 + ORR1A2 LTR MaLR 3 49 -280 5 1705 1677 107 18 37 chr5 146892531 146892804 -5644455 + ORR1A2 LTR MaLR 52 319 -8 5 1705 1291 144 246 43 chr5 146893659 146893964 -5643295 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1705 6175 181 89 46 chr5 146893964 146894196 -5643063 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 1256 5 1705 6175 181 89 46 chr5 146894285 146894622 -5642637 - ORR1B2-int LTR MaLR -254 1255 918 5 1705 3745 138 78 17 chr5 146894622 146895330 -5641929 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 5 1705 6175 181 89 46 chr5 146895330 146896204 -5641055 - ORR1B2-int LTR MaLR -592 917 2 5 1705 1601 180 98 9 chr5 146896206 146896542 -5640717 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 2 5 1705 240 269 74 0 chr5 146897612 146897654 -5639605 - ORR1B2-int LTR MaLR -863 646 594 5 1705 2251 163 37 12 chr5 146899452 146899651 -5637608 + MTC LTR MaLR 3 200 -221 6 1705 2251 163 37 12 chr5 146900012 146900221 -5637038 + MTC LTR MaLR 201 420 -1 6 1705 1853 168 135 0 chr5 146902352 146902685 -5634574 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1705 1244 257 92 27 chr5 146903234 146903602 -5633657 - MTD LTR MaLR -27 392 1 6 1705 3498 172 51 54 chr5 146906347 146906659 -5630600 + RMER6D LTR ERVK 3 306 -414 6 1705 3498 172 51 54 chr5 146906806 146906838 -5630421 + RMER6D LTR ERVK 307 317 -403 6 1705 2406 133 37 25 chr5 146906838 146907271 -5629988 - BGLII_B LTR ERVK -1 440 3 6 1705 3498 172 51 54 chr5 146907271 146907319 -5629940 + RMER6D LTR ERVK 318 385 -335 6 1705 3498 172 51 54 chr5 146907478 146907801 -5629458 + RMER6D LTR ERVK 386 720 0 6 1705 764 232 73 6 chr5 146913282 146913447 -5623812 - MTEb LTR MaLR -96 283 108 6 1705 1868 194 29 68 chr5 146916572 146916981 -5620278 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 6 1705 841 192 39 34 chr5 146916981 146917158 -5620101 - ORR1C2 LTR MaLR -31 353 176 6 1705 2904 49 0 3 chr5 146918739 146919085 -5618174 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 6 1705 988 226 26 127 chr5 146920869 146921285 -5615974 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1705 483 298 64 39 chr5 146922070 146922476 -5614783 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 3 6 1705 1782 179 90 11 chr5 146923119 146923475 -5613784 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1705 2622 110 27 22 chr5 146925064 146925465 -5611794 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 6 1705 1174 248 61 19 chr5 146925567 146925929 -5611330 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 6 1705 1209 256 123 51 chr5 146926055 146926470 -5610789 - RMER19C LTR ERVK -46 565 121 6 1706 944 162 57 28 chr5 146939926 146940173 -5597086 - RLTR45-int LTR ERVK -2320 4924 4671 6 1706 3156 49 0 0 chr5 146940160 146940567 -5596692 - ETnERV2-int LTR ERVK -1644 5762 5356 6 1706 9686 145 38 24 chr5 146941858 146943869 -5593390 - ETnERV2-int LTR ERVK -2727 4679 2935 6 1706 498 94 268 10 chr5 146943884 146943981 -5593278 - RMER16-int LTR ERVK -4196 1210 1089 6 1706 2105 171 152 36 chr5 146943986 146944485 -5592774 - RMER16-int LTR ERVK -4587 819 263 6 1706 360 269 62 46 chr5 146944692 146944887 -5592372 - RMER16-int LTR ERVK -6878 366 169 6 1706 648 167 10 0 chr5 146945460 146945562 -5591697 - ETnERV2-int LTR ERVK -234 7172 7070 6 1706 422 53 0 0 chr5 146945564 146945621 -5591638 + RLTR26 LTR ERVK 586 642 0 6 1706 13117 88 50 7 chr5 146945621 146947423 -5589836 + MERVK26-int LTR ERVK 1 1880 -5039 6 1706 478 250 35 71 chr5 146947427 146947625 -5589634 + RMER13B LTR ERVK 718 908 0 6 1706 844 199 23 0 chr5 146947649 146947825 -5589434 + RMER17A-int LTR ERVK 1354 1533 -195 6 1706 2508 131 11 67 chr5 146950780 146951154 -5586105 + MT2B LTR ERVL 177 551 -50 6 1706 3173 128 14 10 chr5 146951154 146951658 -5585601 + RLTR19C LTR ERVK 1 506 0 6 1706 2508 131 11 67 chr5 146951658 146951732 -5585527 + MT2B LTR ERVL 552 600 -1 6 1706 1640 194 109 6 chr5 146952569 146952917 -5584342 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1706 1392 253 77 13 chr5 146953352 146953728 -5583531 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 6 1706 901 273 27 12 chr5 146957925 146958181 -5579078 + RMER5 LTR ERV1 235 494 -40 7 1706 2236 145 19 14 chr5 146960885 146961256 -5576003 - RLTR14 LTR ERV1 -9 373 1 7 1706 724 204 126 65 chr5 146961323 146961569 -5575690 + RLTR20C LTR ERVK 52 312 -222 7 1706 567 181 138 48 chr5 146961563 146961708 -5575551 + RLTR20C LTR ERVK 421 578 0 7 1706 1182 230 25 13 chr5 146962901 146963350 -5573909 + MT2A LTR ERVL 1 489 -44 7 1706 886 293 11 4 chr5 146963504 146963546 -5573713 + MT2A LTR ERVL 490 533 0 7 1706 1700 204 32 40 chr5 146963779 146964156 -5573103 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1706 3862 30 5 0 chr5 146964267 146964701 -5572558 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 1706 4486 12 0 12 chr5 146964734 146965233 -5572026 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 1706 422 336 102 12 chr5 146965572 146965816 -5571443 - RMER15 LTR ERVL -65 510 245 7 1706 1903 142 56 0 chr5 146966768 146967070 -5570189 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1706 1656 224 79 11 chr5 146967362 146967741 -5569518 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1706 384 184 11 33 chr5 146975843 146975933 -5561326 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 481 7 1706 870 293 23 0 chr5 146975931 146976146 -5561113 + MT2A LTR ERVL 246 465 -68 7 1706 1563 223 38 30 chr5 146976537 146976902 -5560357 + ORR1D1 LTR MaLR 1 368 -6 7 1706 291 239 68 68 chr5 146977133 146977281 -5559978 + RMER17A LTR ERVK 356 503 -248 7 1706 250 242 0 16 chr5 146977271 146977334 -5559925 - ORR1E LTR MaLR -297 62 1 7 1706 383 316 99 18 chr5 146977338 146977560 -5559699 - RMER15 LTR ERVL -91 484 245 7 1706 2129 108 3 22 chr5 146986014 146986336 -5550923 - IAPLTR2b LTR ERVK -11 316 1 7 1706 4747 97 15 22 chr5 146986336 146987010 -5550249 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5813 7 1706 24392 142 37 17 chr5 146987093 146992075 -5545184 - IAPEz-int LTR ERVK -1233 5588 1 7 1706 2109 108 6 19 chr5 146992087 146992407 -5544852 - IAPLTR2b LTR ERVK -11 316 1 7 1706 1316 231 103 55 chr5 146992426 146992967 -5544292 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 2 7 1706 699 232 28 102 chr5 146993170 146993386 -5543873 + MTD LTR MaLR 1 200 -219 7 1706 1330 252 65 75 chr5 147000713 147000835 -5536424 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 444 2 1706 1330 252 65 75 chr5 147000983 147001434 -5535825 - RLTR12A LTR ERVK -125 443 1 2 1706 1483 218 60 51 chr5 147001639 147002054 -5535205 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1706 1628 247 51 38 chr5 147003048 147003520 -5533739 - RMER19C LTR ERVK 0 611 134 6 1706 1083 229 87 15 chr5 147003541 147003873 -5533386 - RLTR20A2 LTR ERVK -222 356 1 7 1706 975 246 56 109 chr5 147005294 147005814 -5531445 - RLTR31_Mur LTR ERVK -60 493 96 9 1706 1073 191 0 45 chr5 147007982 147008202 -5529057 - MTB_Mm LTR MaLR -197 210 1 1 1706 2034 107 28 112 chr5 147012720 147013077 -5524182 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 2 1706 350 237 50 20 chr5 147015456 147015555 -5521704 - MTEb LTR MaLR -9 370 269 3 1706 249 172 108 15 chr5 147015951 147016016 -5521243 + MT2B LTR ERVL 62 132 -469 3 1706 831 221 116 66 chr5 147016046 147016306 -5520953 + MT2B LTR ERVL 100 545 -56 3 1706 831 219 114 70 chr5 147016327 147016387 -5520872 + MT2B LTR ERVL 546 594 -7 3 1706 1563 188 25 37 chr5 147017606 147017959 -5519300 - ORR1C2 LTR MaLR -35 349 1 3 1706 2580 113 35 43 chr5 147018115 147018538 -5518721 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 3 1706 2172 117 126 14 chr5 147031001 147031365 -5505894 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 6 1706 2374 119 58 29 chr5 147034140 147034521 -5502738 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 7 1706 396 307 113 41 chr5 147034728 147034949 -5502310 + RMER5 LTR ERV1 86 322 -212 7 1706 576 273 64 40 chr5 147035153 147035222 -5502037 + RMER5 LTR ERV1 326 392 -142 7 1706 576 273 64 40 chr5 147035372 147035504 -5501755 + RMER5 LTR ERV1 393 532 -2 7 1706 368 281 74 0 chr5 147037592 147037727 -5499532 - MTEb LTR MaLR 0 379 235 8 1706 1691 284 88 5 chr5 147037912 147037980 -5499279 - MTE2b-int LTR MaLR -924 656 589 8 1706 1920 133 68 0 chr5 147037980 147038288 -5498971 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 1706 1691 284 88 5 chr5 147038288 147038825 -5498434 - MTE2b-int LTR MaLR -992 588 1 8 1706 304 230 200 0 chr5 147038830 147038930 -5498329 - MTE2b LTR MaLR -5 374 255 8 1706 410 250 83 33 chr5 147038931 147039051 -5498208 + RMER20B LTR ERVK 1 126 -501 9 1706 3921 165 46 135 chr5 147039054 147040085 -5497174 + RMER21A LTR ERV1 1 939 -8 9 1706 329 252 40 163 chr5 147040345 147040743 -5496516 + RMER17C LTR ERVK 43 391 -19 9 1706 831 153 31 19 chr5 147040737 147040897 -5496362 + ORR1B2 LTR MaLR 66 227 -140 9 1706 452 221 67 0 chr5 147041963 147042067 -5495192 + MTD LTR MaLR 297 407 -12 1 1706 320 138 17 17 chr5 147047517 147047576 -5489683 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2517 3197 3139 1 1706 328 305 0 9 chr5 147053169 147053275 -5483984 + RMER15 LTR ERVL 428 532 -43 1 1706 692 277 68 29 chr5 147054737 147055016 -5482243 + RMER15-int LTR ERVL 1203 1492 -3507 1 1706 476 165 43 21 chr5 147055706 147055799 -5481460 + RMER15-int LTR ERVL 1514 1608 -3391 1 1706 283 158 215 38 chr5 147056177 147056256 -5481003 + RMER15-int LTR ERVL 1712 1804 -3195 1 1706 379 252 68 15 chr5 147061645 147061778 -5475481 - MTE2b LTR MaLR 0 379 240 1 1707 620 289 50 50 chr5 147063968 147064230 -5473029 - MT2A LTR ERVL -124 409 148 1 1707 3843 158 179 10 chr5 147064993 147065765 -5471494 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 1707 1092 216 129 7 chr5 147066436 147066841 -5470418 + RMER5 LTR ERV1 19 519 -15 1 1707 281 351 19 91 chr5 147068576 147068708 -5468551 + MTD LTR MaLR 50 168 -251 1 1707 281 351 19 91 chr5 147068890 147069020 -5468239 + MTD LTR MaLR 169 293 -126 1 1707 335 231 75 28 chr5 147069063 147069170 -5468089 + MTD LTR MaLR 287 398 -21 1 1707 2323 135 95 13 chr5 147070428 147070817 -5466442 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1707 380 303 87 54 chr5 147086131 147086407 -5450852 - MLT2D LTR ERVL 0 414 130 1 1707 519 232 16 8 chr5 147086723 147086849 -5450410 - MLT2D LTR ERVL -266 148 22 1 1707 534 260 31 8 chr5 147100419 147100547 -5436712 + RMER10B LTR ERVL 204 334 -64 2 1707 2005 88 29 13 chr5 147108924 147109235 -5428024 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 4 2 1707 381 318 96 81 chr5 147116875 147117210 -5420049 + ORR1E LTR MaLR 16 355 -4 2 1707 1298 144 120 11 chr5 147130379 147130645 -5406614 - RLTR28B LTR ERVL 0 524 230 2 1707 1466 161 12 0 chr5 147131418 147131660 -5405599 - RLTR28B LTR ERVL -236 245 1 2 1707 3411 28 13 0 chr5 147138493 147138888 -5398371 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1707 315 292 47 144 chr5 147139718 147139974 -5397285 + RLTR21 LTR ERVK 1057 1287 -285 2 1707 425 290 96 65 chr5 147141741 147141970 -5395289 - MLT1B LTR MaLR -153 237 2 2 1707 1673 177 56 35 chr5 147142862 147143201 -5394058 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 29 2 1707 2181 57 85 63 chr5 147146192 147146509 -5390750 + ORR1A2 LTR MaLR 3 326 -1 2 1707 1222 251 64 12 chr5 147146509 147146851 -5390408 + MTEa LTR MaLR 20 379 0 3 1707 243 264 43 54 chr5 147146857 147146949 -5390310 - MTE2b LTR MaLR -14 365 275 3 1707 2271 79 30 62 chr5 147151770 147152107 -5385152 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 3 1707 2485 129 211 23 chr5 147153402 147153523 -5383736 - RMER15 LTR ERVL 0 575 428 3 1707 2151 133 71 3 chr5 147153523 147153675 -5383584 + ORR1C1 LTR MaLR 1 162 -216 3 1707 2151 133 71 3 chr5 147153708 147153909 -5383350 + ORR1C1 LTR MaLR 163 376 -2 3 1707 2485 129 211 23 chr5 147153909 147154271 -5382988 - RMER15 LTR ERVL -148 427 1 3 1707 1294 117 0 16 chr5 147155257 147155448 -5381811 + RMER4B LTR ERVK 394 581 -4 3 1707 663 297 32 0 chr5 147155817 147156002 -5381257 + ORR1D2 LTR MaLR 1 191 -179 3 1707 2078 138 31 22 chr5 147156564 147156919 -5380340 + ORR1B1 LTR MaLR 1 358 -36 3 1707 2199 188 76 56 chr5 147159369 147159571 -5377688 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 220 -357 3 1707 2199 188 76 56 chr5 147159591 147159941 -5377318 + RLTR20B3 LTR ERVK 221 563 -14 3 1707 243 211 105 0 chr5 147159976 147160033 -5377226 - RMER10A LTR ERVL -62 380 318 3 1707 267 196 0 51 chr5 147160171 147160230 -5377029 + ORR1E-int LTR MaLR 584 639 -1324 3 1707 276 196 0 18 chr5 147160230 147160287 -5376972 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5706 5761 0 3 1707 849 241 65 60 chr5 147160300 147160702 -5376557 + MT2A LTR ERVL 26 561 -40 3 1707 849 223 0 10 chr5 147160766 147160812 -5376447 + MT2A LTR ERVL 484 529 -4 3 1707 1877 218 35 16 chr5 147161364 147161816 -5375443 - RLTR20B3 LTR ERVK -96 481 21 3 1707 1205 262 102 24 chr5 147163016 147163349 -5373910 - MTD LTR MaLR -15 404 46 3 1707 251 389 28 9 chr5 147164080 147164189 -5373070 + ORR1E LTR MaLR 1 111 -248 3 1707 260 280 81 36 chr5 147166438 147166549 -5370710 + RMER5 LTR ERV1 5 120 -414 3 1707 318 256 143 13 chr5 147168247 147168395 -5368864 - MTE2a LTR MaLR 0 419 253 3 1707 1263 178 151 189 chr5 147168821 147168998 -5368261 + MT2A LTR ERVL 3 131 -402 3 1707 4329 123 64 15 chr5 147168998 147169252 -5368007 - RMER6A LTR ERVK 0 756 484 3 1707 4329 123 64 15 chr5 147169313 147169779 -5367480 - RMER6A LTR ERVK -273 483 1 3 1707 1263 181 147 184 chr5 147169779 147170088 -5367171 + MT2A LTR ERVL 132 455 -78 3 1707 254 141 56 14 chr5 147170140 147170212 -5367047 + MT2A LTR ERVL 459 533 0 3 1707 1517 123 25 60 chr5 147171316 147171633 -5365626 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 409 1 3 1707 255 289 26 0 chr5 147174545 147174621 -5362638 + MLT2B4 LTR ERVL 18 95 -461 3 1707 1895 177 106 16 chr5 147174791 147175170 -5362089 + MTD LTR MaLR 6 418 -1 3 1707 552 290 58 32 chr5 147175829 147176018 -5361241 + ORR1E LTR MaLR 44 237 -122 3 1707 361 191 283 12 chr5 147176454 147176631 -5360628 - MTD LTR MaLR -21 400 177 3 1707 293 212 0 57 chr5 147177165 147177235 -5360024 - MTD LTR MaLR -286 73 8 3 1707 840 148 75 48 chr5 147179601 147179828 -5357431 + RMER17C LTR ERVK 1 233 -177 3 1707 981 245 34 28 chr5 147179899 147180226 -5357033 + RMER17C LTR ERVK 82 410 0 3 1707 2515 113 34 10 chr5 147182804 147183189 -5354070 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1707 2576 55 2 98 chr5 147186636 147187035 -5350224 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 5 3 1707 342 23 0 0 chr5 147187041 147187084 -5350175 - RLTR10B LTR ERVK -249 43 1 3 1707 1993 186 75 3 chr5 147187493 147187889 -5349370 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 1707 2060 192 184 34 chr5 147190065 147190599 -5346660 - RMER19A LTR ERVK 0 737 124 4 1708 1821 122 5 123 chr5 147195083 147195456 -5341803 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1708 1643 215 64 5 chr5 147201208 147201600 -5335659 + MTD LTR MaLR 5 419 0 4 1708 982 247 165 19 chr5 147203467 147203789 -5333470 + MTD LTR MaLR 51 419 0 4 1708 1797 195 97 13 chr5 147204959 147205339 -5331920 + MTD LTR MaLR 6 417 -2 4 1708 1892 99 49 7 chr5 147209922 147210207 -5327052 - MTC LTR MaLR 0 421 125 4 1708 712 199 22 0 chr5 147210738 147210874 -5326385 - MTC LTR MaLR -282 139 1 4 1708 3333 226 60 34 chr5 147211746 147212552 -5324707 + RMER19B LTR ERVK 14 705 -197 4 1708 1647 166 138 74 chr5 147212651 147213370 -5323889 - RMER19B LTR ERVK -80 822 3 4 1708 574 168 129 40 chr5 147215582 147215706 -5321553 - ORR1D2 LTR MaLR -234 136 2 4 1708 952 249 131 11 chr5 147221392 147221690 -5315569 - MTEa LTR MaLR -15 364 42 4 1708 4291 259 157 25 chr5 147221707 147223055 -5314204 - MTE-int LTR MaLR -6 1574 49 4 1708 2697 152 64 6 chr5 147229115 147229613 -5307646 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 4 1708 888 260 136 92 chr5 147231137 147231667 -5305592 - RMER4B LTR ERVK -24 587 1 4 1708 444 199 224 32 chr5 147231667 147231868 -5305391 - ORR1E LTR MaLR -61 309 49 4 1708 2016 113 12 51 chr5 147234097 147234432 -5302827 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 1708 1262 202 9 0 chr5 147236961 147237194 -5300065 + MTD LTR MaLR 11 245 -174 4 1708 715 277 112 28 chr5 147239158 147239444 -5297815 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 223 4 1708 259 336 93 17 chr5 147240885 147241003 -5296256 - ERVL-E-int LTR ERVL -2801 2866 2740 4 1708 725 236 24 39 chr5 147242178 147242385 -5294874 - RLTR15 LTR ERVK -155 204 1 4 1708 844 289 89 26 chr5 147243215 147243641 -5293618 - MER74A LTR ERVL -54 504 52 4 1708 412 297 99 36 chr5 147248781 147248973 -5288286 + MLT1D LTR MaLR 295 498 -7 5 1708 3742 44 5 0 chr5 147249018 147249452 -5287807 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1708 450 194 23 0 chr5 147249795 147249894 -5287365 - ORR1D2 LTR MaLR -257 102 1 5 1708 1297 207 89 56 chr5 147254284 147254661 -5282598 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 29 5 1708 3518 20 5 0 chr5 147276175 147276569 -5260690 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1708 439 267 148 57 chr5 147285213 147285443 -5251816 - RMER2 LTR ERV1 0 567 317 5 1708 294 338 24 53 chr5 147285765 147286012 -5251247 + MuRRS4-int LTR ERV1 3084 3323 -4283 5 1708 286 214 0 0 chr5 147286023 147286079 -5251180 + MuRRS4-int LTR ERV1 3508 3563 -4038 5 1708 323 242 7 101 chr5 147286084 147286230 -5251029 + MuRRS4-int LTR ERV1 3527 3642 -3810 5 1708 599 281 108 9 chr5 147287310 147287415 -5249844 + MuRRS4-int LTR ERV1 3722 3842 -1221 5 1708 599 288 106 16 chr5 147287471 147287651 -5249608 + MuRRS4-int LTR ERV1 3843 3954 -1109 5 1708 305 303 109 69 chr5 147287995 147288197 -5249062 - RMER2 LTR ERV1 -69 498 289 5 1708 1567 226 81 0 chr5 147297934 147298279 -5238980 + MTD LTR MaLR 46 418 -1 5 1708 1751 149 73 0 chr5 147298549 147298850 -5238409 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 5 1708 865 291 28 0 chr5 147298928 147299141 -5238118 - MT2A LTR ERVL -68 465 247 5 1708 428 172 11 22 chr5 147299139 147299228 -5238031 + RLTR12A LTR ERVK 481 568 0 5 1708 1140 231 75 15 chr5 147307328 147307596 -5229663 + MTD LTR MaLR 1 284 -135 5 1708 628 137 0 0 chr5 147307593 147307688 -5229571 - ORR1A2 LTR MaLR -231 96 2 5 1708 449 304 104 18 chr5 147308585 147308806 -5228453 + RMER15 LTR ERVL 245 484 -91 5 1708 236 229 16 32 chr5 147308810 147308873 -5228386 + ORR1E LTR MaLR 1 62 -297 5 1708 1546 224 53 28 chr5 147309223 147309582 -5227677 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 1 5 1708 997 281 21 18 chr5 147309815 147309861 -5227398 - MT2A LTR ERVL 0 533 487 5 1708 997 281 21 18 chr5 147309938 147310177 -5227082 - MT2A LTR ERVL -47 486 247 5 1708 393 195 11 11 chr5 147310175 147310263 -5226996 + RLTR12A LTR ERVK 481 568 0 5 1708 1437 257 82 11 chr5 147318383 147318761 -5218498 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 5 1708 1897 134 62 0 chr5 147319052 147319357 -5217902 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 2 5 1708 470 299 104 18 chr5 147320310 147320531 -5216728 + RMER15 LTR ERVL 245 484 -91 6 1708 236 229 16 32 chr5 147320535 147320598 -5216661 + ORR1E LTR MaLR 1 62 -297 6 1708 1467 220 52 41 chr5 147320939 147321308 -5215951 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 6 1708 997 281 21 18 chr5 147321541 147321587 -5215672 - MT2A LTR ERVL 0 533 487 6 1708 997 281 21 18 chr5 147321662 147321901 -5215358 - MT2A LTR ERVL -47 486 247 6 1708 393 195 11 11 chr5 147321899 147321987 -5215272 + RLTR12A LTR ERVK 481 568 0 6 1709 1610 232 79 11 chr5 147330110 147330489 -5206770 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 1709 1911 131 62 0 chr5 147330778 147331083 -5206176 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 2 6 1709 428 299 104 18 chr5 147331964 147332185 -5205074 + RMER15 LTR ERVL 245 484 -91 6 1709 238 226 0 127 chr5 147332189 147332260 -5204999 + ORR1E LTR MaLR 1 62 -297 6 1709 1502 227 32 35 chr5 147332618 147332992 -5204267 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 6 1709 960 286 25 14 chr5 147333225 147333271 -5203988 - MT2A LTR ERVL 0 533 487 6 1709 960 286 25 14 chr5 147333346 147333583 -5203676 - MT2A LTR ERVL -47 486 247 6 1709 380 190 12 23 chr5 147333583 147333669 -5203590 + RLTR12A LTR ERVK 484 568 0 6 1709 1543 233 82 11 chr5 147341756 147342134 -5195125 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 1709 1876 139 66 0 chr5 147342422 147342724 -5194535 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 5 6 1709 438 309 104 18 chr5 147343606 147343827 -5193432 + RMER15 LTR ERVL 245 484 -91 6 1709 261 242 0 16 chr5 147343831 147343894 -5193365 + ORR1E LTR MaLR 1 62 -297 6 1709 1525 227 39 33 chr5 147344304 147344664 -5192595 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 1 6 1709 310 146 0 0 chr5 147344806 147344854 -5192405 - ORR1C2 LTR MaLR -336 48 1 6 1709 862 294 23 0 chr5 147345215 147345429 -5191830 - MT2A LTR ERVL -68 465 247 6 1709 385 190 12 12 chr5 147345429 147345514 -5191745 + RLTR12A LTR ERVK 484 568 0 6 1709 2821 45 3 3 chr5 147353607 147353944 -5183315 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 1709 20829 31 67 46 chr5 147353944 147356171 -5181088 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2354 -4127 6 1709 20829 31 67 46 chr5 147356257 147356632 -5180627 + IAPEz-int LTR ERVK 2355 2751 -3730 6 1709 29389 16 2 0 chr5 147356624 147359856 -5177403 + IAPEz-int LTR ERVK 3244 6481 0 6 1709 2845 39 3 3 chr5 147359856 147360193 -5177066 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 1709 1543 233 82 11 chr5 147360225 147360603 -5176656 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 1709 1876 139 66 0 chr5 147360891 147361193 -5176066 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 5 6 1709 438 309 104 18 chr5 147362075 147362296 -5174963 + RMER15 LTR ERVL 245 484 -91 6 1709 261 242 0 16 chr5 147362300 147362363 -5174896 + ORR1E LTR MaLR 1 62 -297 6 1709 1509 230 39 33 chr5 147362795 147363155 -5174104 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 1 6 1709 310 146 0 0 chr5 147363297 147363345 -5173914 - ORR1C2 LTR MaLR -336 48 1 6 1709 973 282 25 14 chr5 147363578 147363624 -5173635 - MT2A LTR ERVL 0 533 487 6 1709 973 282 25 14 chr5 147363709 147363946 -5173313 - MT2A LTR ERVL -47 486 247 6 1709 385 190 12 12 chr5 147363946 147364031 -5173228 + RLTR12A LTR ERVK 484 568 0 6 1709 1548 245 77 10 chr5 147372118 147372510 -5164749 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 6 1709 1768 156 63 0 chr5 147372786 147373088 -5164171 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 5 6 1709 374 342 95 14 chr5 147373940 147374162 -5163097 + RMER15 LTR ERVL 245 484 -91 6 1709 280 182 36 0 chr5 147374171 147374226 -5163033 + ORR1E LTR MaLR 6 62 -297 6 1709 1675 209 30 27 chr5 147374850 147375223 -5162036 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1709 1070 228 107 30 chr5 147375457 147375952 -5161307 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 6 1709 645 163 138 33 chr5 147376834 147376986 -5160273 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 411 6 1709 717 203 114 63 chr5 147376966 147377247 -5160012 - RLTR20C LTR ERVK -222 312 1 6 1709 2256 148 19 14 chr5 147377287 147377658 -5159601 + RLTR14 LTR ERV1 1 373 -9 6 1709 891 271 31 12 chr5 147380749 147381007 -5156252 - RMER5 LTR ERV1 -37 497 235 7 1709 396 267 167 5 chr5 147385416 147385608 -5151651 - RLTR21 LTR ERVK -251 1321 1099 7 1709 497 212 41 34 chr5 147398636 147398778 -5138481 + ORR1D1 LTR MaLR 218 361 -13 7 1709 1145 229 67 53 chr5 147399839 147400195 -5137064 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 7 1709 250 279 22 44 chr5 147400447 147400537 -5136722 + MTEb LTR MaLR 290 377 -2 7 1709 2443 170 114 81 chr5 147404775 147405356 -5131903 - RMER19C LTR ERVK 0 611 12 7 1709 1488 167 40 196 chr5 147405614 147406069 -5131190 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 7 1709 380 350 38 24 chr5 147410887 147411098 -5126161 + RMER15 LTR ERVL 347 560 -15 7 1709 334 319 51 8 chr5 147412116 147412233 -5125026 - MLT1A1 LTR MaLR -267 141 20 7 1709 486 284 70 12 chr5 147412610 147412778 -5124481 - RMER15 LTR ERVL 0 575 398 7 1709 250 197 62 100 chr5 147412917 147413047 -5124212 + RLTR25B LTR ERVK 397 521 -507 7 1709 2012 146 41 77 chr5 147413235 147413627 -5123632 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1709 1055 238 127 47 chr5 147415946 147416285 -5120974 + RMER10B LTR ERVL 1 366 -32 7 1709 319 312 26 35 chr5 147416900 147417013 -5120246 + LTR48 LTR ERV1 5 116 -528 7 1709 511 264 92 11 chr5 147417342 147417526 -5119733 + LTR48 LTR ERV1 547 745 -42 7 1709 1573 173 176 0 chr5 147417835 147418165 -5119094 + MTD LTR MaLR 15 402 -17 7 1709 2977 70 39 3 chr5 147419017 147419403 -5117856 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1709 257 316 26 0 chr5 147421997 147422073 -5115186 - MLT1C LTR MaLR -379 88 11 7 1709 845 245 104 161 chr5 147425174 147425529 -5111730 - ORR1D2 LTR MaLR -35 335 1 8 1709 4706 113 33 8 chr5 147425713 147426447 -5110812 + RMER6A LTR ERVK 1 752 -4 8 1709 279 330 117 43 chr5 147428524 147428538 -5108721 + MT2A LTR ERVL 1 54 -479 8 1709 695 228 64 6 chr5 147428538 147428710 -5108549 + MTE2a LTR MaLR 19 200 -179 8 1709 279 330 117 43 chr5 147428710 147428755 -5108504 + MT2A LTR ERVL 55 248 -285 8 1709 927 265 192 74 chr5 147429522 147430023 -5107236 + RMER4B LTR ERVK 17 576 -9 8 1709 390 260 167 27 chr5 147430690 147430840 -5106419 + MER70A LTR ERVL 49 219 -359 8 1709 2239 189 25 15 chr5 147430880 147431277 -5105982 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 8 1709 300 263 31 31 chr5 147431530 147431628 -5105631 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 306 8 1709 491 281 163 6 chr5 147431969 147432141 -5105118 + MER70A LTR ERVL 269 467 -5 8 1709 363 273 67 101 chr5 147434241 147434420 -5102839 + ORR1E LTR MaLR 1 173 -186 8 1709 2273 202 52 93 chr5 147444219 147444791 -5092468 - RMER15 LTR ERVL 0 575 27 8 1709 2144 181 72 21 chr5 147446582 147447011 -5090248 - RMER20A LTR ERVK -55 461 11 8 1709 568 210 20 68 chr5 147447026 147447174 -5090085 - MERVK26-int LTR ERVK -7 6912 6772 8 1709 620 307 9 27 chr5 147447292 147447516 -5089743 - RMER17A-int LTR ERVK -239 1489 1270 8 1709 1336 232 77 70 chr5 147447662 147448237 -5089022 - RLTR20B3 LTR ERVK -27 550 24 8 1709 2548 190 38 38 chr5 147449214 147449718 -5087541 - RMER20A LTR ERVK 0 516 13 8 1709 279 221 111 40 chr5 147451815 147451914 -5085345 + MLT1A1 LTR MaLR 301 406 -2 8 1710 2549 92 3 0 chr5 147458325 147458651 -5078608 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1710 1977 229 22 2 chr5 147461810 147462212 -5075047 - MTD LTR MaLR -2 417 8 8 1710 737 248 165 92 chr5 147466521 147466849 -5070410 - ORR1E LTR MaLR -7 352 1 8 1710 2996 145 47 36 chr5 147467495 147467938 -5069321 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 443 -120 8 1710 2246 89 76 0 chr5 147467938 147468242 -5069017 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1710 2996 145 47 36 chr5 147468242 147468261 -5068998 + RLTR20B1 LTR ERVK 444 456 -107 8 1710 2996 145 47 36 chr5 147468310 147468403 -5068856 + RLTR20B1 LTR ERVK 457 561 -2 8 1710 929 234 190 28 chr5 147468500 147468732 -5068527 - MTD LTR MaLR 0 419 139 8 1710 2065 105 39 74 chr5 147468732 147469070 -5068189 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 8 1710 929 234 190 28 chr5 147469070 147469127 -5068132 - MTD LTR MaLR -281 138 83 8 1710 1481 218 101 6 chr5 147469486 147469814 -5067445 + ORR1D2 LTR MaLR 7 365 -5 8 1710 316 295 11 0 chr5 147470076 147470171 -5067088 + MLT1A0 LTR MaLR 69 164 -201 8 1710 528 283 60 7 chr5 147470485 147470663 -5066596 + MLT1A0 LTR MaLR 169 398 -10 8 1710 2462 65 3 0 chr5 147471547 147471856 -5065403 - MTB LTR MaLR -87 313 4 8 1710 3480 154 20 12 chr5 147473500 147474090 -5063169 + RLTR17 LTR ERVK 98 692 0 8 1710 350 306 152 69 chr5 147475905 147475998 -5061261 - LTR40b LTR ERVL -26 436 325 9 1710 350 306 152 69 chr5 147476191 147476373 -5060886 - LTR40b LTR ERVL -138 324 133 9 1710 350 306 152 69 chr5 147476400 147476484 -5060775 - LTR40b LTR ERVL -330 132 46 9 1710 1150 139 100 30 chr5 147482713 147482913 -5054346 - MTC LTR MaLR 0 421 208 9 1710 3769 91 255 79 chr5 147482915 147483683 -5053576 + RMER17A2 LTR ERVK 1 903 -3 9 1710 2940 131 101 75 chr5 147483990 147484586 -5052673 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 9 1710 235 260 77 13 chr5 147484875 147484953 -5052306 - LTR85a LTR Gypsy? -54 648 566 9 1710 246 264 32 75 chr5 147501529 147501623 -5035636 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 152 5 1710 611 303 75 36 chr5 147519924 147520177 -5017082 + MTEa LTR MaLR 58 320 -59 4 1710 1393 176 96 7 chr5 147520515 147520795 -5016464 - MTD LTR MaLR 0 419 115 4 1710 360 318 116 24 chr5 147522545 147522826 -5014433 + MLT1A0 LTR MaLR 27 373 -35 5 1710 1107 278 43 37 chr5 147523176 147523524 -5013735 - MER74A LTR ERVL 0 558 209 5 1710 275 333 46 28 chr5 147523547 147523655 -5013604 - MER74A LTR ERVL -440 118 9 5 1710 1051 178 42 0 chr5 147525872 147526063 -5011196 + MTC LTR MaLR 1 199 -222 5 1710 1015 146 122 20 chr5 147526267 147526463 -5010796 + MTC LTR MaLR 204 419 0 5 1710 4141 85 73 2 chr5 147527251 147527837 -5009422 + RLTR33 LTR ERVK 62 678 0 6 1710 293 266 63 0 chr5 147527964 147528043 -5009216 - MLT2B4 LTR ERVL -109 447 364 6 1710 1340 162 46 0 chr5 147530706 147531006 -5006253 - MTD LTR MaLR 0 419 13 7 1710 1405 209 157 99 chr5 147536857 147537323 -4999936 + MT2A LTR ERVL 1 493 -40 9 1710 309 193 18 0 chr5 147538665 147538722 -4998537 - RMER17C LTR ERVK -352 58 1 9 1710 889 166 121 6 chr5 147539045 147539227 -4998032 + ORR1D1 LTR MaLR 1 203 -171 9 1710 505 193 213 33 chr5 147539355 147539505 -4997754 + ORR1D1 LTR MaLR 196 372 -2 9 1710 249 214 71 0 chr5 147539838 147539894 -4997365 + ORR1D1 LTR MaLR 1 60 -324 9 1710 497 234 68 25 chr5 147540056 147540297 -4996962 + ORR1D1 LTR MaLR 43 374 0 9 1710 2894 163 41 19 chr5 147542649 147542674 -4994585 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 25 -535 1 1710 3477 35 2 0 chr5 147542674 147543073 -4994186 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1710 2894 163 41 19 chr5 147543073 147543561 -4993698 + RLTR20B2 LTR ERVK 26 524 -36 1 1710 623 236 191 12 chr5 147550235 147550515 -4986744 + ORR1D1 LTR MaLR 11 365 -13 1 1710 4550 10 0 0 chr5 147553309 147553802 -4983457 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1710 32853 12 6 0 chr5 147553802 147559128 -4978131 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 1 1710 399 167 46 35 chr5 147559128 147559215 -4978044 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 1 1710 305 0 0 0 chr5 147559215 147559253 -4978006 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1710 4450 10 12 0 chr5 147559253 147559740 -4977519 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1710 4386 116 42 60 chr5 147560522 147561292 -4975967 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 1 1710 445 284 158 18 chr5 147561959 147562215 -4975044 + MER68 LTR ERVL 184 507 -56 1 1710 1893 88 84 0 chr5 147565062 147565347 -4971912 + ORR1A2 LTR MaLR 1 309 -18 1 1710 273 178 112 56 chr5 147572943 147573050 -4964209 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 397 1 1710 2670 125 22 2 chr5 147576330 147576739 -4960520 - MTC LTR MaLR 0 421 5 1 1710 1719 120 92 54 chr5 147576916 147577233 -4960026 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1710 464 150 69 20 chr5 147585011 147585113 -4952146 + RMER19B LTR ERVK 1 107 -795 1 1710 2327 210 68 4 chr5 147585678 147586165 -4951094 + RLTR12B LTR ERVK 11 528 0 1 1711 437 246 98 15 chr5 147591345 147591477 -4945782 - MTEa LTR MaLR -236 143 1 1 1711 359 295 170 85 chr5 147596325 147596625 -4940634 + MLT1E2 LTR MaLR 2 322 -183 1 1711 301 295 170 85 chr5 147596645 147596674 -4940585 + MLT1E2 LTR MaLR 323 358 -147 1 1711 2006 115 70 18 chr5 147608629 147608956 -4928303 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 43 2 1711 233 291 24 163 chr5 147610448 147610571 -4926688 - LTR85c LTR Gypsy? -272 551 446 2 1711 2509 136 19 0 chr5 147612815 147613190 -4924069 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 2 1711 2162 108 41 0 chr5 147613202 147613518 -4923741 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1711 5038 164 46 19 chr5 147613518 147614490 -4922769 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 999 -964 2 1711 1105 247 125 57 chr5 147616094 147616429 -4920830 - MTE2b LTR MaLR -12 367 10 2 1711 341 297 34 8 chr5 147618666 147618785 -4918474 - ORR1E LTR MaLR -218 141 20 2 1711 487 276 59 99 chr5 147621361 147621735 -4915524 - RMER17C LTR ERVK -44 366 8 2 1711 2120 136 97 0 chr5 147626961 147627313 -4909946 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 2 1711 251 314 56 37 chr5 147630858 147631020 -4906239 + ERVL-E-int LTR ERVL 3502 3666 -2001 2 1711 536 280 42 57 chr5 147636125 147636318 -4900941 + MTEa LTR MaLR 183 372 -7 3 1711 297 205 101 13 chr5 147637670 147637749 -4899510 - MTEa LTR MaLR 0 379 294 3 1711 668 275 44 22 chr5 147637977 147638152 -4899107 - MTEa LTR MaLR -200 179 1 3 1711 316 254 45 0 chr5 147640722 147640789 -4896470 - RMER15 LTR ERVL 0 575 506 3 1711 596 337 20 36 chr5 147655046 147655298 -4881961 + MLT1H LTR MaLR 16 263 -286 3 1711 257 322 24 32 chr5 147664488 147664613 -4872646 + ORR1E LTR MaLR 1 124 -235 3 1711 501 184 0 0 chr5 147666868 147666955 -4870304 + MT2A LTR ERVL 2 88 -445 3 1711 415 296 182 36 chr5 147670713 147670993 -4866266 - MLT2D LTR ERVL -73 341 21 4 1711 423 230 9 83 chr5 147671460 147671569 -4865690 + MT2B LTR ERVL 158 258 -343 4 1711 277 280 83 9 chr5 147672053 147672161 -4865098 - MLT1D LTR MaLR -119 386 271 4 1711 513 259 66 47 chr5 147674568 147674779 -4862480 + LTR86A2 LTR ERVL 11 225 -283 4 1711 576 278 39 44 chr5 147674982 147675160 -4862099 + MLT1B LTR MaLR 1 177 -213 4 1711 576 278 39 44 chr5 147675306 147675330 -4861929 + MLT1B LTR MaLR 178 202 -188 4 1711 527 230 32 22 chr5 147675465 147675606 -4861653 + MLT1B LTR MaLR 195 339 -51 4 1711 1435 275 106 32 chr5 147677717 147678153 -4859106 - MT2A LTR ERVL -65 468 1 4 1711 413 284 50 25 chr5 147678163 147678322 -4858937 + MLT1A0 LTR MaLR 28 190 -184 4 1711 288 322 112 60 chr5 147678370 147678621 -4858638 - ORR1E LTR MaLR -3 356 93 4 1711 472 335 41 41 chr5 147678993 147679189 -4858070 + MLT1A0 LTR MaLR 170 365 0 4 1711 667 196 16 18 chr5 147681461 147681597 -4855662 + ORR1C2 LTR MaLR 248 382 -2 4 1711 1504 257 43 40 chr5 147681913 147682226 -4855033 - MTD LTR MaLR -22 397 83 4 1711 2810 110 67 35 chr5 147682226 147682717 -4854542 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 1 4 1711 1504 257 43 40 chr5 147682717 147682751 -4854508 - MTD LTR MaLR -337 82 49 4 1711 375 303 153 66 chr5 147683326 147683716 -4853543 - RLTR26 LTR ERVK -181 461 14 4 1711 699 269 100 17 chr5 147683915 147684146 -4853113 - RMER15 LTR ERVL -52 523 274 4 1711 245 302 39 68 chr5 147684192 147684295 -4852964 - RMER15 LTR ERVL -473 102 3 4 1711 1389 232 68 22 chr5 147685313 147685679 -4851580 + MTD LTR MaLR 23 405 -14 4 1711 241 314 17 87 chr5 147688428 147688462 -4848797 - MT2B LTR ERVL -442 159 134 4 1711 2823 189 24 25 chr5 147692017 147692566 -4844693 - RMER15 LTR ERVL 0 575 28 4 1711 241 246 132 66 chr5 147695059 147695211 -4842048 + ORR1D1 LTR MaLR 6 167 -207 4 1711 403 254 122 8 chr5 147696368 147696491 -4840768 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 268 4 1711 284 191 146 73 chr5 147697049 147697063 -4840196 + MT2B LTR ERVL 145 165 -436 4 1711 2772 49 0 0 chr5 147701524 147701849 -4835410 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 4 1711 1912 163 23 40 chr5 147704396 147704742 -4832517 - RLTR18 LTR ERVK -276 340 1 5 1711 1233 235 57 19 chr5 147706101 147706434 -4830825 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 201 5 1711 941 294 19 34 chr5 147706427 147706694 -4830565 + MTE2a LTR MaLR 115 377 -2 5 1711 567 179 19 0 chr5 147707308 147707414 -4829845 + MTD LTR MaLR 1 108 -311 5 1711 234 229 42 0 chr5 147707643 147707691 -4829568 + MTD LTR MaLR 74 123 -296 5 1711 297 199 27 18 chr5 147707727 147707808 -4829451 + MTD LTR MaLR 295 419 0 5 1711 455 179 0 152 chr5 147708058 147708183 -4829076 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 5 1711 1551 158 105 68 chr5 147710763 147711115 -4826144 - RMER21A LTR ERV1 -571 376 12 5 1711 309 330 30 0 chr5 147711170 147711270 -4825989 - RMER4B LTR ERVK -137 448 346 5 1711 1587 217 32 30 chr5 147711271 147711642 -4825617 - RodERV21-int LTR ERV1 -165 4826 4455 5 1711 1288 207 18 25 chr5 147711640 147711918 -4825341 - RodERV21-int LTR ERV1 -1213 3778 3503 5 1711 4886 211 39 25 chr5 147712264 147713362 -4823897 - RodERV21-int LTR ERV1 -2341 2650 1537 5 1711 285 281 115 29 chr5 147713354 147713493 -4823766 - RodERV21-int LTR ERV1 -3837 1154 1004 5 1711 526 200 84 21 chr5 147713828 147713971 -4823288 - RLTR42-int LTR ERVK -4173 1349 1198 5 1711 1954 191 132 56 chr5 147714290 147714458 -4822801 - RodERV21-int LTR ERV1 -3982 1009 842 5 1711 1954 191 132 56 chr5 147714642 147715115 -4822144 - RodERV21-int LTR ERV1 -4150 841 319 5 1711 1932 194 28 0 chr5 147715171 147715558 -4821701 - RodERV21-int LTR ERV1 -4538 453 56 5 1712 318 216 91 146 chr5 147724674 147724892 -4812367 - MT2B LTR ERVL -306 278 80 5 1712 1157 279 63 63 chr5 147728293 147728656 -4808603 + ORR1D2 LTR MaLR 8 370 0 5 1712 950 236 84 17 chr5 147737220 147737457 -4799802 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 111 6 1712 336 175 0 0 chr5 147756802 147756865 -4780394 - MLT1F2 LTR MaLR -64 616 554 6 1712 385 294 109 62 chr5 147757190 147757246 -4780013 - MLT1F2 LTR MaLR -111 449 393 6 1712 2664 111 68 2 chr5 147757246 147757660 -4779599 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 6 1712 385 291 90 94 chr5 147757660 147757810 -4779449 - MLT1F2 LTR MaLR -168 392 228 6 1712 1218 218 123 25 chr5 147773136 147773477 -4763782 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 6 1712 270 287 18 98 chr5 147774818 147774930 -4762329 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 6 1712 1850 118 7 17 chr5 147777152 147777446 -4759813 - ORR1A3 LTR MaLR -34 292 2 6 1712 674 179 54 52 chr5 147789433 147789665 -4747594 + RMER19C LTR ERVK 1 298 -313 7 1712 1146 172 9 28 chr5 147789919 147790134 -4747125 + RMER19C LTR ERVK 401 611 0 7 1712 521 75 0 25 chr5 147792213 147792301 -4744958 + ORR1B1 LTR MaLR 1 119 -275 7 1712 1862 183 6 21 chr5 147792301 147792630 -4744629 + ORR1B1 LTR MaLR 62 385 -9 7 1712 262 307 35 35 chr5 147795790 147795932 -4741327 + MLT1E2 LTR MaLR 41 182 -445 7 1712 435 314 42 36 chr5 147796763 147796955 -4740304 - MLT1D LTR MaLR -311 194 2 7 1712 241 220 116 42 chr5 147800613 147800708 -4736551 + MTEb LTR MaLR 278 379 0 7 1712 362 259 45 36 chr5 147808136 147808248 -4729011 - MLT2B3 LTR ERVL -436 118 6 7 1712 2114 110 0 114 chr5 147815441 147815809 -4721450 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 4 7 1712 2001 209 22 27 chr5 147816765 147816972 -4720287 - MTD LTR MaLR -8 411 210 7 1712 2001 209 22 27 chr5 147817141 147817340 -4719919 - MTD LTR MaLR -210 209 7 7 1712 2965 40 78 3 chr5 147819665 147820037 -4717222 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1712 2845 68 37 0 chr5 147823995 147824376 -4712883 - MTB LTR MaLR -5 395 1 8 1712 640 234 193 111 chr5 147833162 147833504 -4703755 + MTEa LTR MaLR 10 379 0 8 1712 922 284 83 45 chr5 147836762 147837161 -4700098 + BGLII_B LTR ERVK 1 414 -27 8 1712 289 252 98 104 chr5 147839085 147839161 -4698098 - MT2B LTR ERVL -439 162 88 8 1712 438 212 0 117 chr5 147843849 147843977 -4693282 + MT2B LTR ERVL 152 264 -337 8 1712 1295 224 186 6 chr5 147848120 147848475 -4688784 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1713 249 313 108 61 chr5 147876989 147877203 -4660056 - MLT1A1 LTR MaLR -10 398 165 8 1713 2628 175 88 4 chr5 147877728 147878233 -4659026 - RMER4B LTR ERVK -38 547 15 9 1713 726 295 66 75 chr5 147878516 147878601 -4658658 + MTE2b LTR MaLR 1 89 -290 9 1713 1533 202 56 61 chr5 147878601 147878976 -4658283 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 9 1713 726 295 66 75 chr5 147878976 147879224 -4658035 + MTE2b LTR MaLR 90 330 -49 9 1713 287 261 65 40 chr5 147890580 147890704 -4646555 + MLT1K LTR MaLR 461 587 -8 9 1713 1081 138 85 0 chr5 147897748 147897936 -4639323 + MTC LTR MaLR 5 208 -213 9 1713 840 172 108 66 chr5 147898181 147898393 -4638866 + MTC LTR MaLR 196 416 -3 9 1713 453 331 139 20 chr5 147898538 147898966 -4638293 - MLT1F2 LTR MaLR -1 559 1 9 1713 367 236 70 108 chr5 147907828 147907985 -4629274 + MT2B LTR ERVL 108 258 -343 9 1713 307 266 85 0 chr5 147908133 147908227 -4629032 + ORR1E LTR MaLR 19 120 -239 9 1713 675 310 70 33 chr5 147915607 147915937 -4621322 - MER77 LTR ERVL -9 598 257 9 1713 2329 129 104 5 chr5 147916391 147916774 -4620485 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1713 1490 236 62 11 chr5 147918297 147918670 -4618589 - MTC LTR MaLR -9 412 21 9 1713 405 299 18 65 chr5 147925194 147925362 -4611897 + MTEa LTR MaLR 32 191 -188 1 1713 320 356 88 7 chr5 147925445 147925592 -4611667 + MTE-int LTR MaLR 1351 1509 0 1 1713 580 309 119 65 chr5 147925640 147925976 -4611283 + MTEb LTR MaLR 12 365 -14 1 1713 984 294 40 65 chr5 147933479 147933909 -4603350 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 160 1 1713 233 196 52 35 chr5 147934856 147934914 -4602345 + MTEb LTR MaLR 300 358 -21 1 1713 1716 197 84 0 chr5 147937850 147938221 -4599038 + MTD LTR MaLR 3 404 -15 1 1713 1772 152 97 26 chr5 147938354 147938705 -4598554 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 19 1 1713 310 236 44 0 chr5 147939136 147939213 -4598046 + ORR1D1 LTR MaLR 251 333 -41 1 1713 1052 262 121 34 chr5 147939198 147939270 -4597989 - MTC-int LTR MaLR -175 923 846 1 1713 1492 206 34 18 chr5 147939296 147939602 -4597657 - MTC-int LTR MaLR -323 935 512 1 1713 2062 203 123 38 chr5 147940074 147940580 -4596679 - MTC-int LTR MaLR -694 886 1 1 1713 3058 114 2 2 chr5 147940580 147941001 -4596258 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1713 362 310 19 25 chr5 147941958 147942117 -4595142 + RLTR15 LTR ERVK 186 343 -16 1 1713 1160 299 99 8 chr5 147950412 147950766 -4586493 + MLT1B-int LTR MaLR 982 1367 -4 1 1713 259 188 0 59 chr5 147950831 147950899 -4586360 + MLT1B LTR MaLR 36 99 -291 1 1713 1889 164 57 75 chr5 147951515 147951916 -4585343 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1713 561 255 54 0 chr5 147953237 147953386 -4583873 + MLT1B LTR MaLR 164 320 -70 1 1713 1505 189 43 0 chr5 147955461 147955742 -4581517 - RLTR19C LTR ERVK -213 293 1 1 1713 482 116 33 55 chr5 147955742 147955833 -4581426 - RLTR19-int LTR ERVK 0 6137 6049 1 1713 6892 182 58 73 chr5 147955857 147957513 -4579746 - RLTR19-int LTR ERVK -51 6086 4456 1 1713 5532 154 82 88 chr5 147957524 147957820 -4579439 - RLTR19-int LTR ERVK -4672 1465 1205 1 1713 5532 154 82 88 chr5 147958011 147958276 -4578983 - RLTR19-int LTR ERVK -4933 1204 965 1 1713 5532 154 82 88 chr5 147958419 147958586 -4578673 - RLTR19-int LTR ERVK -5173 964 797 1 1713 5532 154 82 88 chr5 147958613 147959182 -4578077 - RLTR19-int LTR ERVK -5341 796 174 1 1713 431 195 62 39 chr5 147963250 147963378 -4573881 + RLTR12B LTR ERVK 181 311 -217 1 1713 805 239 56 80 chr5 147963424 147963711 -4573548 + RLTR12B LTR ERVK 240 519 -9 1 1713 471 305 58 35 chr5 147964240 147964413 -4572846 - MLT1A0 LTR MaLR -165 200 24 1 1713 820 168 68 20 chr5 147964787 147964965 -4572294 - ORR1D2 LTR MaLR -13 366 192 1 1713 641 199 63 42 chr5 147965244 147965272 -4571987 - ORR1D2 LTR MaLR -225 145 122 1 1713 2648 123 5 17 chr5 147965272 147965684 -4571575 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1713 641 199 63 42 chr5 147965684 147965797 -4571462 - ORR1D2 LTR MaLR -249 121 1 1 1713 892 261 118 60 chr5 147968787 147969134 -4568125 + ORR1D2 LTR MaLR 3 369 -1 1 1713 617 267 70 44 chr5 147969402 147969629 -4567630 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 294 1 1713 1241 222 19 15 chr5 147969824 147970080 -4567179 - RMER5 LTR ERV1 -277 257 1 1 1713 1268 264 75 52 chr5 147970080 147970391 -4566868 - RMER5 LTR ERV1 -24 510 187 1 1713 2884 124 5 2 chr5 147970391 147970810 -4566449 - MTC LTR MaLR 0 421 2 1 1713 1268 264 75 52 chr5 147970810 147970937 -4566322 - RMER5 LTR ERV1 -348 186 62 1 1713 607 306 30 21 chr5 147974828 147974842 -4562417 - RMER15 LTR ERVL -34 541 528 1 1713 607 306 30 21 chr5 147974872 147975091 -4562168 - RMER15 LTR ERVL -48 527 306 1 1713 246 219 69 59 chr5 147977718 147977820 -4559439 - RLTR25B LTR ERVK -529 499 397 1 1713 3572 20 2 0 chr5 147979064 147979459 -4557800 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 214 225 217 142 120 chr5 147980184 147980367 -4556892 + ORR1C2 LTR MaLR 5 191 -193 1 1714 325 191 0 16 chr5 147980493 147980557 -4556702 + MLT1A1 LTR MaLR 344 406 -2 1 1714 238 294 14 14 chr5 147983139 147983208 -4554051 - ORR1E LTR MaLR 0 379 311 1 1714 301 350 52 58 chr5 147983231 147983404 -4553855 - ORR1E LTR MaLR -173 186 15 1 1714 253 271 144 14 chr5 147984228 147984374 -4552885 - RLTR12B LTR ERVK -34 494 330 1 1714 2503 186 88 16 chr5 147985233 147985745 -4551514 + RMER15 LTR ERVL 27 575 0 1 1714 363 369 112 11 chr5 147985745 147985911 -4551348 - MLT1H LTR MaLR -259 290 107 1 1714 329 234 135 68 chr5 147987570 147987703 -4549556 - RLTR42-int LTR ERVK -4159 1363 1222 1 1714 2964 68 47 0 chr5 147990654 147991035 -4546224 - MTB LTR MaLR 0 400 2 1 1714 832 81 47 7 chr5 147992311 147992461 -4544798 - RMER17B LTR ERVK -491 467 312 1 1714 1809 176 55 42 chr5 147993301 147993495 -4543764 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 171 1 1714 1809 176 55 42 chr5 147993566 147993732 -4543527 - ORR1D1 LTR MaLR -204 170 9 1 1714 1938 110 93 3 chr5 147994418 147994720 -4542539 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1714 382 148 0 0 chr5 147994671 147994732 -4542527 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 334 1 1714 1314 141 15 0 chr5 147994731 147994930 -4542329 - ORR1A2 LTR MaLR -125 202 1 1 1714 525 116 0 65 chr5 147994930 147994997 -4542262 + ORR1A4 LTR MaLR 269 329 0 1 1714 779 224 211 39 chr5 147995168 147995424 -4541835 - RMER4B LTR ERVK -4 581 282 1 1714 925 150 116 16 chr5 147995466 147995656 -4541603 - RMER4B LTR ERVK -376 209 1 1 1714 458 250 80 45 chr5 148008373 148008549 -4528710 + MLT1B LTR MaLR 197 378 -12 1 1714 2145 129 108 39 chr5 148010184 148010646 -4526613 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 5 561 0 2 1714 236 254 14 43 chr5 148011892 148011904 -4525355 + MLT1B LTR MaLR 482 491 -71 1 1714 236 254 14 43 chr5 148012043 148012100 -4525159 + MLT1B LTR MaLR 492 549 -13 1 1714 278 152 11 160 chr5 148015077 148015171 -4522088 - RLTR25B LTR ERVK -533 495 416 3 1714 251 213 21 0 chr5 148017574 148017621 -4519638 - ORR1E LTR MaLR -40 319 272 4 1714 251 280 103 65 chr5 148021456 148021563 -4515696 + MLT1B LTR MaLR 156 266 -124 5 1714 2249 114 12 3 chr5 148023252 148023587 -4513672 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 6 1714 280 250 102 62 chr5 148025355 148025483 -4511776 - RMER15 LTR ERVL 0 575 443 7 1714 350 333 43 37 chr5 148025501 148025688 -4511571 - RMER15 LTR ERVL -101 474 287 7 1714 240 380 9 18 chr5 148030125 148030235 -4507024 - MER65D LTR ERV1 -347 126 18 8 1714 2323 177 39 65 chr5 148030550 148031093 -4506166 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 8 1714 2121 144 8 36 chr5 148031138 148031206 -4506053 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 341 8 1714 2805 181 59 11 chr5 148031206 148031497 -4505762 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 255 8 1714 2805 181 59 11 chr5 148031544 148031794 -4505465 - RLTR12A LTR ERVK -314 254 2 8 1714 2121 144 8 36 chr5 148031794 148032085 -4505174 - MTB_Mm LTR MaLR -67 340 58 8 1714 1080 264 115 81 chr5 148049609 148050177 -4487082 + MT2A LTR ERVL 4 517 -16 1 1714 267 298 36 44 chr5 148052283 148052420 -4484839 + RMER12 LTR ERVK 720 855 -467 1 1714 1979 120 10 7 chr5 148061653 148061946 -4475313 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 25 1 1714 1080 245 93 74 chr5 148062558 148062911 -4474348 + ORR1D2 LTR MaLR 10 369 -1 1 1714 1223 274 68 20 chr5 148065441 148065795 -4471464 - MTEb LTR MaLR -3 376 6 1 1714 281 247 69 23 chr5 148066079 148066166 -4471093 + MTEa LTR MaLR 289 379 0 1 1714 455 265 108 35 chr5 148066372 148066617 -4470642 + RMER10A LTR ERVL 12 269 -129 1 1714 1003 191 269 21 chr5 148078067 148078394 -4458865 + MTD LTR MaLR 3 411 -8 2 1714 3252 51 5 2 chr5 148093600 148093995 -4443264 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1714 296 282 13 0 chr5 148094546 148094624 -4442635 + MLT1E2 LTR MaLR 41 119 -508 2 1714 438 338 42 42 chr5 148099026 148099193 -4438066 + MLT1G LTR MaLR 413 579 -12 2 1714 375 256 37 67 chr5 148099839 148099973 -4437286 - MT2B LTR ERVL -337 264 135 2 1714 2403 116 3 0 chr5 148100902 148101238 -4436021 + ORR1A1 LTR MaLR 1 337 -9 2 1714 2375 214 72 3 chr5 148101752 148102324 -4434935 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 1714 287 256 85 113 chr5 148107981 148108122 -4429137 - MT2B LTR ERVL -337 264 128 2 1715 345 241 12 37 chr5 148131804 148131886 -4405373 + MTD LTR MaLR 4 83 -336 3 1715 576 222 62 16 chr5 148134738 148134866 -4402393 + MTD LTR MaLR 269 402 -17 3 1715 3072 38 7 102 chr5 148136398 148136645 -4400614 - MTB LTR MaLR 0 400 197 3 1715 3072 38 7 102 chr5 148136792 148136986 -4400273 - MTB LTR MaLR -204 196 1 3 1715 4198 149 122 9 chr5 148137982 148138555 -4398704 - RMER19B LTR ERVK -17 885 240 3 1715 4198 149 122 9 chr5 148138575 148138795 -4398464 - RMER19B LTR ERVK -663 239 3 3 1715 244 86 0 0 chr5 148140446 148140481 -4396778 + ORR1D2 LTR MaLR 336 370 0 3 1715 228 205 61 104 chr5 148144760 148144923 -4392336 + RMER17D LTR ERVK 227 382 -507 3 1715 293 242 0 133 chr5 148145074 148145179 -4392080 - MT2B LTR ERVL -356 245 155 3 1715 1245 201 80 22 chr5 148154600 148154962 -4382297 + MT2A LTR ERVL 58 553 -48 4 1715 243 127 15 45 chr5 148155251 148155317 -4381942 + MT2A LTR ERVL 470 533 0 4 1715 280 294 156 32 chr5 148155317 148155489 -4381770 + LTR48 LTR ERV1 551 745 -42 4 1715 336 294 88 0 chr5 148157514 148157616 -4379643 + MLT1A LTR MaLR 264 374 0 4 1715 1853 111 39 39 chr5 148161813 148162121 -4375138 + RLTR15 LTR ERVK 52 359 0 4 1715 261 301 64 50 chr5 148167284 148167424 -4369835 - MT2B2 LTR ERVL -333 251 110 4 1715 246 170 132 0 chr5 148179619 148179672 -4357587 + RMER20B LTR ERVK 66 125 -502 4 1715 237 316 81 22 chr5 148179897 148180033 -4357226 + RMER20A LTR ERVK 364 507 -9 4 1715 304 275 0 114 chr5 148180588 148180608 -4356651 + MT2B LTR ERVL 149 154 -447 4 1715 2367 121 34 6 chr5 148188724 148189081 -4348178 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1715 1513 231 82 61 chr5 148190179 148190392 -4346867 + RMER6A LTR ERVK 1 214 -542 5 1715 1795 132 100 28 chr5 148190571 148190983 -4346276 + RMER6A LTR ERVK 159 588 -168 5 1715 622 139 130 0 chr5 148191119 148191229 -4346030 + RLTR11B LTR ERVK 1 125 -328 5 1715 293 87 0 0 chr5 148191229 148191275 -4345984 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 46 -481 5 1715 256 103 0 0 chr5 148191274 148191313 -4345946 + RLTR11A2 LTR ERVK 7 45 -482 5 1715 2373 168 107 11 chr5 148191313 148191788 -4345471 + RLTR11A2 LTR ERVK 7 527 0 5 1715 3259 26 0 0 chr5 148195348 148195729 -4341530 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 16 5 1715 394 241 69 119 chr5 148197787 148197916 -4339343 - MT2B LTR ERVL -323 278 154 5 1715 394 241 69 119 chr5 148197953 148197983 -4339276 - MT2B LTR ERVL -448 153 127 5 1715 1907 166 87 16 chr5 148199574 148199942 -4337317 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1715 2716 164 99 11 chr5 148200141 148200667 -4336592 - RMER15 LTR ERVL -3 572 1 5 1715 229 235 171 24 chr5 148203569 148203739 -4333520 - RMER17C LTR ERVK -108 302 108 5 1715 1728 175 71 12 chr5 148208070 148208394 -4328865 + ORR1D1 LTR MaLR 32 374 0 5 1715 4720 206 69 104 chr5 148208394 148209025 -4328234 + ORR1D1-int LTR MaLR 47 653 -717 5 1715 4720 206 69 104 chr5 148209046 148209783 -4327476 + ORR1D1-int LTR MaLR 654 1367 -3 5 1715 1752 183 30 30 chr5 148209794 148210160 -4327099 + ORR1D1 LTR MaLR 9 374 0 5 1715 621 225 179 44 chr5 148213950 148214224 -4323035 + RLTR15 LTR ERVK 33 343 -16 5 1715 2584 117 65 10 chr5 148216076 148216474 -4320785 + MTC LTR MaLR 2 421 0 5 1715 256 253 182 11 chr5 148218419 148218507 -4318752 - ORR1E LTR MaLR -224 135 33 5 1715 235 287 35 40 chr5 148218741 148218861 -4318398 - MLT1F LTR MaLR -16 664 489 5 1715 1814 158 5 107 chr5 148222118 148222501 -4314758 - ORR1B1 LTR MaLR -10 384 41 6 1715 1839 141 62 3 chr5 148224436 148224727 -4312532 - RLTR10E LTR ERVK -3 308 1 6 1715 633 191 85 0 chr5 148228343 148228484 -4308775 - MTD LTR MaLR 0 419 267 6 1715 1251 237 104 11 chr5 148228468 148228843 -4308416 + RMER16 LTR ERVK 124 533 0 6 1715 983 219 104 55 chr5 148230040 148230349 -4306910 + ORR1E LTR MaLR 31 354 -5 6 1715 2379 84 19 0 chr5 148234353 148234673 -4302586 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 6 1715 1132 235 90 41 chr5 148234966 148235501 -4301758 + RLTR26 LTR ERVK 5 606 -36 6 1715 1789 133 115 0 chr5 148236519 148236841 -4300418 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 6 1715 917 228 161 16 chr5 148237228 148237544 -4299715 + MTD LTR MaLR 44 405 -14 6 1716 1130 241 159 8 chr5 148244120 148244484 -4292775 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1716 469 312 176 33 chr5 148246355 148246657 -4290602 - MLT-int LTR MaLR 0 1735 1391 6 1716 269 330 103 20 chr5 148248076 148248271 -4288988 - MLT-int LTR MaLR -1124 611 401 6 1716 776 271 84 24 chr5 148252050 148252300 -4284959 - MTE2b LTR MaLR -71 308 44 6 1716 697 284 35 31 chr5 148252780 148253036 -4284223 - MTE2b LTR MaLR -2 377 121 6 1716 444 259 210 25 chr5 148254315 148254334 -4282925 - MLT-int LTR MaLR -15 1720 1704 6 1716 444 259 210 25 chr5 148254363 148254581 -4282678 - MLT-int LTR MaLR -32 1703 1440 6 1716 357 378 183 26 chr5 148254627 148255055 -4282204 - MLT-int LTR MaLR -376 1359 865 6 1716 375 290 18 36 chr5 148255346 148255457 -4281802 - MLT-int LTR MaLR -932 803 695 6 1716 482 303 76 13 chr5 148255498 148255722 -4281537 - MLT-int LTR MaLR -1162 573 336 6 1716 363 268 10 0 chr5 148256476 148256573 -4280686 - MLT1A1 LTR MaLR -54 354 257 6 1716 347 289 14 62 chr5 148258647 148258791 -4278468 - MER21B LTR ERV1 -221 642 506 7 1716 2305 195 9 59 chr5 148258892 148259421 -4277838 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 6 7 1716 250 283 18 92 chr5 148267754 148267863 -4269396 - MT2B LTR ERVL -350 251 151 7 1716 423 300 94 84 chr5 148284761 148285070 -4252189 + RLTR25B LTR ERVK 1 312 -716 7 1716 343 286 88 54 chr5 148285828 148286021 -4251238 + RLTR25B LTR ERVK 859 1103 0 7 1716 1000 262 84 56 chr5 148286923 148287246 -4250013 - ORR1E LTR MaLR 0 359 28 7 1716 1531 211 82 70 chr5 148287498 148287910 -4249349 - ORR1E-int LTR MaLR -1 1369 953 7 1716 254 284 12 36 chr5 148288466 148288550 -4248709 + ORR1D-int LTR MaLR 363 444 -926 7 1716 669 269 100 123 chr5 148293025 148293180 -4244079 + MLT1B LTR MaLR 1 145 -245 7 1716 669 269 100 123 chr5 148293200 148293443 -4243816 + MLT1B LTR MaLR 146 390 0 7 1716 2259 133 90 2 chr5 148309418 148309818 -4227441 - BGLII_B LTR ERVK -4 437 3 8 1716 308 342 195 15 chr5 148318079 148318485 -4218774 + MER68 LTR ERVL 24 502 -61 8 1716 7098 162 88 42 chr5 148323982 148325040 -4212219 + MurERV4-int LTR ERVK 1607 2697 -2563 8 1716 7098 162 88 42 chr5 148325067 148325614 -4211645 + MurERV4-int LTR ERVK 2698 3286 -1974 8 1716 7616 184 66 13 chr5 148325613 148327292 -4209967 + MurERV4-int LTR ERVK 3491 5258 -2 8 1716 2492 159 15 44 chr5 148327308 148327783 -4209476 + RMER4A LTR ERVK 6 466 0 8 1716 235 277 57 97 chr5 148328193 148328317 -4208942 - MT2B LTR ERVL -344 257 139 8 1716 297 287 120 0 chr5 148362224 148362357 -4174902 - MLT1G3 LTR MaLR -38 557 403 9 1716 1652 171 28 86 chr5 148362893 148363242 -4174017 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 46 9 1716 1652 171 28 86 chr5 148363282 148363329 -4173930 - ORR1D1 LTR MaLR -329 45 1 9 1716 3529 25 2 0 chr5 148364675 148365070 -4172189 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1716 453 341 32 54 chr5 148366827 148367143 -4170116 + MT2A LTR ERVL 140 448 -85 9 1716 4291 25 0 2 chr5 148367211 148367694 -4169565 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 9 1716 33850 56 14 20 chr5 148367694 148372179 -4165080 - MuRRS-int LTR ERV1 0 4690 1 9 1716 4254 29 2 0 chr5 148372179 148372659 -4164600 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 2 9 1717 284 247 56 49 chr5 148388947 148389109 -4148150 + RMER17D2 LTR ERVK 389 551 -258 9 1717 1212 240 94 35 chr5 148399749 148400068 -4137191 + MTD LTR MaLR 5 342 -77 9 1717 422 310 42 138 chr5 148408442 148408753 -4128506 + ORR1E LTR MaLR 1 281 -78 9 1717 1234 136 143 8 chr5 148411622 148411867 -4125392 + ORR1C2 LTR MaLR 101 378 -6 1 1717 630 262 145 72 chr5 148420058 148420400 -4116859 + RMER13A LTR ERVK 100 497 -411 1 1717 234 361 127 44 chr5 148420579 148420831 -4116428 + RMER13A LTR ERVK 530 802 -58 1 1717 644 204 368 29 chr5 148431155 148431432 -4105827 + MTD LTR MaLR 48 419 0 1 1717 3126 143 46 13 chr5 148432548 148432984 -4104275 + RLTR20A LTR ERVK 1 439 -102 1 1717 3126 143 46 13 chr5 148433016 148433103 -4104156 + RLTR20A LTR ERVK 440 540 -1 1 1717 3045 72 10 5 chr5 148433914 148434306 -4102953 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1717 256 284 22 22 chr5 148461558 148461572 -4075687 + MT2B LTR ERVL 151 164 -437 1 1717 1390 219 89 23 chr5 148479415 148479789 -4057470 - MTD LTR MaLR -14 405 10 1 1717 464 198 25 117 chr5 148481829 148481949 -4055310 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 1 1717 1934 127 102 36 chr5 148488485 148488869 -4048390 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 1717 538 326 86 65 chr5 148502066 148502404 -4034855 - ORR1E LTR MaLR -5 354 10 7 1718 2137 125 93 11 chr5 148512197 148512561 -4024698 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1718 564 254 45 59 chr5 148513480 148513945 -4023314 - RMER17C LTR ERVK -32 378 1 3 1718 300 247 36 36 chr5 148524914 148524998 -4012261 + RLTR25A LTR ERVK 489 572 -531 5 1718 237 350 86 19 chr5 148528279 148528489 -4008770 + MLT1H LTR MaLR 75 298 -251 6 1718 2404 20 100 10 chr5 148543319 148543629 -3993630 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 9 1718 1669 155 40 20 chr5 148546163 148546660 -3990599 + RLTR20D LTR ERVK 6 564 -4 1 1718 425 239 66 101 chr5 148550891 148551053 -3986206 - ORR1E LTR MaLR -14 405 220 1 1718 1868 140 88 6 chr5 148551209 148551526 -3985733 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 25 1 1718 331 212 37 12 chr5 148554826 148554907 -3982352 - RLTR11A2 LTR ERVK -34 493 411 1 1718 1095 237 94 38 chr5 148555019 148555398 -3981861 + RMER13A LTR ERVK 118 669 -237 1 1718 292 342 87 48 chr5 148555375 148555581 -3981678 + RMER13A LTR ERVK 559 772 -136 1 1718 1420 236 16 71 chr5 148555699 148556123 -3981136 - RLTR11A2 LTR ERVK -120 407 7 1 1718 771 243 102 49 chr5 148556456 148556681 -3980578 + MTD LTR MaLR 183 419 0 1 1718 2505 84 37 20 chr5 148556732 148556825 -3980434 - RLTR10D LTR ERVK -1 358 271 1 1718 2505 84 37 20 chr5 148556861 148557119 -3980140 - RLTR10D LTR ERVK -89 270 1 1 1718 371 313 22 25 chr5 148557173 148557411 -3979848 + MLT1A LTR MaLR 16 368 -40 1 1718 1655 145 176 3 chr5 148565673 148565891 -3971368 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 1 1718 1655 145 176 3 chr5 148565919 148566019 -3971240 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 1 1718 2846 212 94 60 chr5 148576196 148577006 -3960253 + RMER19B LTR ERVK 1 837 -65 2 1718 230 270 0 73 chr5 148579104 148579172 -3958087 - MER57C2 LTR ERV1 -277 157 95 2 1718 378 302 93 26 chr5 148582010 148582258 -3955001 - MLT1A1 LTR MaLR -38 370 13 2 1718 345 287 59 0 chr5 148588796 148588897 -3948362 - MTE2a LTR MaLR -60 319 213 2 1718 286 225 80 53 chr5 148589038 148589113 -3948146 - MTEb LTR MaLR -116 263 187 2 1718 2167 102 12 58 chr5 148591113 148591457 -3945802 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 2 1718 806 247 38 52 chr5 148592470 148592816 -3944443 + RLTR15 LTR ERVK 2 342 -17 2 1718 270 269 0 15 chr5 148593320 148593388 -3943871 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 341 2 1718 228 267 23 98 chr5 148596603 148596736 -3940523 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1306 1428 -420 2 1718 2362 98 3 0 chr5 148597051 148597377 -3939882 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1718 1740 211 67 30 chr5 148600759 148601165 -3936094 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1718 237 218 112 56 chr5 148602055 148602162 -3935097 + RLTR25B LTR ERVK 397 509 -519 2 1718 314 237 76 67 chr5 148602568 148602688 -3934571 - MLT1A1 LTR MaLR -9 399 238 2 1718 266 244 40 142 chr5 148604898 148605151 -3932108 + ORR1E LTR MaLR 81 307 -52 2 1718 1677 212 128 33 chr5 148607673 148608102 -3929157 - MT2A LTR ERVL -4 529 60 2 1718 1031 232 117 78 chr5 148608835 148608854 -3928405 + MTD LTR MaLR 1 14 -405 2 1718 1031 232 117 78 chr5 148608882 148609203 -3928056 + MTD LTR MaLR 15 353 -66 2 1718 2332 97 34 74 chr5 148609203 148609583 -3927676 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 3 1718 1031 232 117 78 chr5 148609583 148609601 -3927658 + MTD LTR MaLR 354 373 -46 2 1718 22266 56 1 3 chr5 148609603 148613329 -3923930 - MMERVK10C-int LTR ERVK -22 7658 3920 3 1718 29389 54 2 1 chr5 148613329 148616870 -3920389 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3812 3769 225 3 1718 255 222 0 0 chr5 148616870 148616915 -3920344 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 3 1718 689 57 0 0 chr5 148616915 148617003 -3920256 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7478 103 16 3 1718 2273 65 33 79 chr5 148617003 148617371 -3919888 - RLTR10B2 LTR ERVK -14 351 1 3 1718 365 145 29 14 chr5 148617371 148617441 -3919818 + MTD LTR MaLR 349 419 0 2 1718 1846 134 67 99 chr5 148618729 148619134 -3918125 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 3 1718 2719 28 12 27 chr5 148619567 148619899 -3917360 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 327 1 3 1718 6372 65 14 17 chr5 148619901 148620732 -3916527 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5651 3 1718 11036 60 60 30 chr5 148620725 148622213 -3915046 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 168 3 1718 234 267 0 0 chr5 148622213 148622258 -3915001 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 3 1718 1014 121 25 99 chr5 148622266 148622468 -3914791 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 9 3 1718 3008 40 202 0 chr5 148622469 148622864 -3914395 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 1718 857 204 24 6 chr5 148627008 148627176 -3910083 + RMER10A LTR ERVL 1 171 -271 3 1719 1249 176 8 22 chr5 148638742 148639009 -3898250 + RMER10B LTR ERVL 3 265 -133 3 1719 1051 145 5 39 chr5 148639055 148639263 -3897996 + RMER10B LTR ERVL 197 397 -1 3 1719 2290 98 28 0 chr5 148640895 148641212 -3896047 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 3 1719 1553 177 122 6 chr5 148645272 148645624 -3891635 - MTD LTR MaLR -1 418 26 3 1719 829 201 19 118 chr5 148653704 148653982 -3883277 - MTE2a LTR MaLR -171 248 18 3 1719 237 305 303 7 chr5 148656846 148656998 -3880261 - LTR16C LTR ERVL -105 384 188 3 1719 246 271 23 23 chr5 148665062 148665149 -3872110 + ORR1D2 LTR MaLR 284 370 0 4 1719 2434 74 3 87 chr5 148669588 148669658 -3867601 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 268 4 1719 2434 74 3 87 chr5 148669842 148670127 -3867132 - ORR1A2 LTR MaLR -60 267 2 4 1719 792 257 70 74 chr5 148670804 148671060 -3866199 + MTEa LTR MaLR 49 303 -76 4 1719 2249 98 13 6 chr5 148677148 148677465 -3859794 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1719 9297 150 74 9 chr5 148677465 148679178 -3858081 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 141 4 1719 272 266 10 31 chr5 148684904 148685001 -3852258 - LTR40b LTR ERVL -29 433 339 4 1719 1915 159 17 14 chr5 148693674 148694019 -3843240 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 4 1719 2562 83 3 6 chr5 148698887 148699215 -3838044 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1719 1920 115 139 30 chr5 148701431 148701714 -3835545 + ORR1B2 LTR MaLR 1 323 -44 4 1719 1920 115 139 30 chr5 148701906 148701953 -3835306 + ORR1B2 LTR MaLR 324 367 0 4 1719 248 276 31 101 chr5 148702445 148702491 -3834768 - MT2B2 LTR ERVL -425 159 123 4 1719 1455 196 133 25 chr5 148702552 148702913 -3834346 + MTD LTR MaLR 18 417 -2 4 1719 388 297 64 13 chr5 148707287 148707444 -3829815 - MER90a LTR ERV1 -160 454 290 5 1719 586 331 99 8 chr5 148708345 148708607 -3828652 - MLT1I LTR MaLR -85 326 41 5 1719 548 224 80 9 chr5 148710011 148710201 -3827058 + RMER17C LTR ERVK 15 394 -512 5 1719 3383 38 5 2 chr5 148710203 148710602 -3826657 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1719 1578 186 155 3 chr5 148711825 148712186 -3825073 - MTD LTR MaLR 0 419 4 5 1719 462 221 9 46 chr5 148716751 148716860 -3820399 - RLTR20C LTR ERVK 0 551 447 5 1719 322 231 0 37 chr5 148716886 148716900 -3820359 - RLTR20C LTR ERVK -90 478 465 5 1719 1158 192 95 49 chr5 148717078 148717426 -3819833 - RLTR20C LTR ERVK -104 464 4 5 1719 2314 211 29 12 chr5 148720657 148721169 -3816090 - RLTR11A2 LTR ERVK -6 521 1 5 1719 226 295 61 76 chr5 148721802 148721934 -3815325 + MLT1J LTR MaLR 288 417 -95 5 1719 449 289 117 61 chr5 148723615 148723829 -3813430 - RMER15 LTR ERVL -14 561 336 5 1719 1622 161 79 66 chr5 148724046 148724277 -3812982 - RMER10B LTR ERVL 0 398 147 5 1719 1622 161 79 66 chr5 148724450 148724611 -3812648 - RMER10B LTR ERVL -252 146 1 5 1719 267 265 172 10 chr5 148725138 148725237 -3812022 - MLT1B LTR MaLR -80 310 196 5 1719 810 284 130 32 chr5 148733188 148733526 -3803733 - MER57E1 LTR ERV1 -1 371 1 5 1719 333 268 98 45 chr5 148733664 148733797 -3803462 + MLT1I LTR MaLR 7 146 -265 5 1719 328 401 44 20 chr5 148736238 148736490 -3800769 + LTR31 LTR ERV1 172 429 -190 5 1719 263 302 78 14 chr5 148736570 148736711 -3800548 - RMER17C LTR ERVK -59 351 202 5 1719 319 186 0 17 chr5 148736956 148737016 -3800243 + MER31B LTR ERV1 61 119 -366 5 1719 323 264 65 9 chr5 148737162 148737269 -3799990 + MER31B LTR ERV1 226 338 -128 5 1719 795 208 15 80 chr5 148738811 148738955 -3798304 - RLTR11A2 LTR ERVK -94 434 304 5 1719 1235 147 137 48 chr5 148739376 148739640 -3797619 - RLTR11A2 LTR ERVK -238 289 2 5 1719 1073 276 50 77 chr5 148745608 148746005 -3791254 + MTD LTR MaLR 1 385 -34 6 1719 1073 276 50 77 chr5 148746043 148746061 -3791198 + MTD LTR MaLR 386 404 -15 6 1719 793 264 43 16 chr5 148748385 148748570 -3788689 + MTD LTR MaLR 65 254 -165 6 1719 362 145 16 31 chr5 148748558 148748622 -3788637 + MTD LTR MaLR 356 418 -1 6 1719 417 249 76 66 chr5 148749279 148749477 -3787782 + RMER15 LTR ERVL 1 200 -375 6 1719 852 220 120 171 chr5 148750137 148750570 -3786689 - MTD LTR MaLR -4 415 5 6 1719 585 303 89 32 chr5 148750841 148751145 -3786114 - MLT1E LTR MaLR -15 638 219 6 1719 533 202 198 23 chr5 148751350 148751522 -3785737 - MLT1B LTR MaLR -121 269 68 6 1719 1821 125 22 123 chr5 148752294 148752489 -3784770 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 128 6 1719 1821 125 22 123 chr5 148752560 148752730 -3784529 - ORR1A4 LTR MaLR -202 127 1 6 1719 921 187 4 32 chr5 148752953 148753216 -3784043 + RMER19B LTR ERVK 1 220 -682 6 1719 1976 173 87 36 chr5 148754635 148755084 -3782175 - RLTR28B LTR ERVL -1 480 9 6 1719 1565 199 121 11 chr5 148758226 148758591 -3778668 + MTD LTR MaLR 14 418 -1 6 1719 3735 60 25 2 chr5 148764995 148765480 -3771779 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 6 1719 262 350 80 59 chr5 148765510 148765723 -3771536 + LTR16E1 LTR ERVL 207 424 -114 6 1719 892 163 224 15 chr5 148765723 148766008 -3771251 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 25 6 1719 2171 129 84 8 chr5 148766012 148766371 -3770888 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 1719 251 164 81 16 chr5 148766431 148766493 -3770766 + LTR16E1 LTR ERVL 449 514 -24 6 1720 788 262 40 84 chr5 148767073 148767348 -3769911 + MTEa LTR MaLR 1 263 -116 6 1720 759 274 63 70 chr5 148773583 148773870 -3763389 + MER67B LTR ERV1 208 492 -169 6 1720 338 253 109 98 chr5 148774019 148774212 -3763047 - MT2B LTR ERVL -344 257 63 6 1720 846 221 138 10 chr5 148782931 148783257 -3754002 + MTD LTR MaLR 18 377 -2 7 1720 584 231 39 34 chr5 148785463 148785642 -3751617 - RMER13B LTR ERVK -4 904 725 7 1720 2540 221 32 91 chr5 148785619 148786370 -3750889 - RMER17B LTR ERVK -251 707 1 7 1720 2182 191 19 19 chr5 148786514 148786926 -3750333 - MTC LTR MaLR -8 413 2 7 1720 1131 189 26 111 chr5 148787514 148787866 -3749393 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 7 1720 3519 30 2 0 chr5 148788513 148788912 -3748347 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1720 2511 175 22 171 chr5 148790099 148790388 -3746871 - RMER19C LTR ERVK 0 611 325 7 1720 2511 175 22 171 chr5 148790567 148790994 -3746265 - RMER19C LTR ERVK -287 324 2 7 1720 575 256 121 20 chr5 148791254 148791453 -3745806 - MTE2b LTR MaLR 0 379 161 7 1720 699 265 33 70 chr5 148791651 148791866 -3745393 - MTE2b LTR MaLR -172 207 1 7 1720 410 212 196 104 chr5 148793319 148793482 -3743777 + MTE2a LTR MaLR 146 323 -56 7 1720 1616 226 45 11 chr5 148794877 148795345 -3741914 - MT2A LTR ERVL -5 528 1 7 1720 346 283 29 137 chr5 148797217 148797356 -3739903 - RMER10B LTR ERVL -3 395 272 7 1720 1068 224 167 6 chr5 148797792 148798103 -3739156 + MTD LTR MaLR 47 399 -20 7 1720 2056 146 38 56 chr5 148798875 148799266 -3737993 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 7 1720 422 242 71 92 chr5 148799358 148799499 -3737760 - MT2B LTR ERVL -344 257 120 7 1720 252 303 59 29 chr5 148801578 148801748 -3735511 + LTR33A_ LTR ERVL 355 529 -2 7 1720 336 309 147 126 chr5 148802698 148803046 -3734213 + MLT1A LTR MaLR 15 369 -5 7 1720 923 169 196 5 chr5 148804177 148804397 -3732862 + ORR1D2 LTR MaLR 1 262 -108 7 1720 455 201 97 39 chr5 148804397 148804552 -3732707 + ORR1D2 LTR MaLR 176 339 -31 7 1720 2351 147 63 0 chr5 148806117 148806513 -3730746 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1720 3599 23 0 0 chr5 148806962 148807358 -3729901 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1720 1332 219 141 21 chr5 148812393 148812777 -3724482 - RMER13A LTR ERVK -239 669 242 7 1720 254 309 48 24 chr5 148815732 148815815 -3721444 + MLT1A1 LTR MaLR 292 376 -32 7 1720 1414 206 153 0 chr5 148817721 148818042 -3719217 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 7 1720 2930 48 40 3 chr5 148819348 148819727 -3717532 + MTB LTR MaLR 1 393 -7 7 1720 1659 196 38 13 chr5 148819730 148820046 -3717213 - MTD LTR MaLR -14 405 82 7 1720 1811 148 6 67 chr5 148823539 148823585 -3713674 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 326 8 1720 1811 153 9 66 chr5 148823731 148824078 -3713181 - ORR1B2 LTR MaLR -41 353 5 8 1720 603 164 17 0 chr5 148824062 148824178 -3713081 - ORR1B2 LTR MaLR -249 118 1 8 1720 227 330 69 20 chr5 148830391 148830493 -3706766 - MLT2C1 LTR ERVL -73 324 218 8 1720 1484 230 99 21 chr5 148832708 148833080 -3704179 + MTD LTR MaLR 1 372 -7 8 1720 268 213 225 14 chr5 148834083 148834221 -3703038 - RLTR21 LTR ERVK -321 1251 1085 8 1720 777 252 48 65 chr5 148836836 148837003 -3700256 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 196 8 1720 777 252 48 65 chr5 148837202 148837367 -3699892 - RLTR15 LTR ERVK -164 195 30 8 1720 963 245 227 0 chr5 148843136 148843475 -3693784 - MTD LTR MaLR 0 419 4 8 1720 990 296 85 28 chr5 148844527 148844917 -3692342 - MLT2D LTR ERVL 0 414 3 8 1720 3187 39 3 3 chr5 148847652 148848043 -3689216 - MTB LTR MaLR 0 400 10 8 1720 1200 278 108 5 chr5 148851811 148852191 -3685068 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 1720 3247 51 2 8 chr5 148856206 148856604 -3680655 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1720 490 246 148 67 chr5 148861576 148861851 -3675408 + MLT1E2 LTR MaLR 173 473 -151 8 1720 2180 116 13 0 chr5 148863903 148864221 -3673038 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 6 8 1720 950 261 99 27 chr5 148866461 148866795 -3670464 - ORR1E-int LTR MaLR -1208 372 15 8 1720 622 263 144 59 chr5 148867028 148867369 -3669890 - ORR1E LTR MaLR 0 379 1 8 1720 515 303 35 126 chr5 148868411 148868759 -3668500 + ORR1E LTR MaLR 44 359 0 8 1720 980 298 46 92 chr5 148868993 148869426 -3667833 + MLT2D LTR ERVL 2 414 0 8 1720 2008 121 63 6 chr5 148871746 148872080 -3665179 + RLTR15 LTR ERVK 1 353 -6 9 1720 383 200 0 146 chr5 148882822 148882851 -3654408 + MT2B LTR ERVL 143 153 -448 9 1720 867 207 155 0 chr5 148890813 148891026 -3646233 + MTD LTR MaLR 170 415 -4 9 1720 956 258 83 30 chr5 148896196 148896535 -3640724 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 3 9 1721 355 161 43 12 chr5 148900513 148900596 -3636663 - ORR1B2 LTR MaLR 0 421 312 9 1721 225 273 60 15 chr5 148903297 148903364 -3633895 - MLT2B1 LTR ERVL -4 550 481 9 1721 464 322 76 46 chr5 148903546 148903860 -3633399 - MLT2B1 LTR ERVL -90 477 7 9 1721 857 171 59 34 chr5 148908436 148908672 -3628587 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 100 9 1721 608 144 37 67 chr5 148908688 148908822 -3628437 - RLTR15 LTR ERVK -226 133 4 9 1721 395 310 108 42 chr5 148909036 148909317 -3627942 - MLT1B LTR MaLR -38 352 53 9 1721 248 324 106 34 chr5 148909754 148909933 -3627326 - MLT1F-int LTR MaLR -1297 192 1 9 1721 739 297 98 36 chr5 148909933 148910257 -3627002 - MLT1F LTR MaLR -15 533 183 9 1721 1250 249 92 6 chr5 148910556 148910891 -3626368 + ORR1D2 LTR MaLR 5 368 -2 9 1721 324 232 0 79 chr5 148913256 148913345 -3623914 + MT2B LTR ERVL 198 279 -322 9 1721 429 301 89 30 chr5 148916660 148916862 -3620397 - RMER15 LTR ERVL -2 573 360 9 1721 2308 182 22 2 chr5 148921270 148921676 -3615583 - MTD LTR MaLR -18 401 1 1 1721 1045 192 307 7 chr5 148924340 148924411 -3612848 + MTD LTR MaLR 37 106 -313 1 1721 1045 192 307 7 chr5 148924464 148924685 -3612574 + MTD LTR MaLR 107 417 -2 1 1721 3637 110 45 121 chr5 148925775 148926530 -3610729 + RMER6A LTR ERVK 57 754 -2 1 1721 2475 186 118 12 chr5 148932879 148933389 -3603870 - RMER19B LTR ERVK 0 902 339 1 1721 713 189 55 0 chr5 148933410 148933537 -3603722 - RMER19B LTR ERVK -675 227 94 1 1721 802 272 185 34 chr5 148933669 148934100 -3603159 - RLTR16 LTR ERVK -9 496 1 1 1721 684 184 38 5 chr5 148934100 148934252 -3603007 - RMER19B LTR ERVK -760 142 1 1 1721 1552 253 27 15 chr5 148934252 148934583 -3602676 - MTE2b LTR MaLR -44 335 1 1 1721 309 292 310 42 chr5 148934589 148934991 -3602268 - MLT2B2 LTR ERVL -2 558 5 1 1721 247 212 53 129 chr5 148940306 148940404 -3596855 - MLT1A1 LTR MaLR -312 96 1 1 1721 2091 150 87 15 chr5 148941630 148942023 -3595236 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1721 1532 203 115 52 chr5 148942235 148942619 -3594640 - MTD LTR MaLR 0 419 12 1 1721 1398 250 129 14 chr5 148944159 148944524 -3592735 - MTD LTR MaLR -5 414 8 1 1721 690 326 61 20 chr5 148946540 148946834 -3590425 - RMER15-int LTR ERVL -550 4449 4144 1 1721 438 255 29 0 chr5 148948486 148948588 -3588671 + MER21B LTR ERV1 119 223 -640 1 1721 547 316 105 21 chr5 148948589 148948828 -3588431 + MER21B LTR ERV1 375 633 -230 1 1721 373 232 72 72 chr5 148949309 148949476 -3587783 + RLTR15 LTR ERVK 1 167 -192 1 1721 354 301 55 34 chr5 148949467 148949704 -3587555 + RLTR15 LTR ERVK 100 341 -18 1 1721 285 346 70 8 chr5 148949960 148950088 -3587171 - ORR1E LTR MaLR -221 138 3 1 1721 358 317 56 102 chr5 148951614 148952086 -3585173 - MLT1E3 LTR MaLR -97 583 1 1 1721 822 110 8 0 chr5 148956314 148956441 -3580818 + ORR1A4 LTR MaLR 1 128 -201 1 1721 2653 63 30 50 chr5 148959799 148960197 -3577062 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1721 2759 28 3 5 chr5 148960197 148960548 -3576711 + RLTR10-int LTR ERVK 58 606 -1381 1 1721 3127 29 152 26 chr5 148960573 148960995 -3576264 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 1721 2752 44 0 3 chr5 148961317 148961656 -3575603 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 1 1721 287 347 46 20 chr5 148965554 148965707 -3571552 - MamGypLTR2c LTR Gypsy -59 1009 853 1 1721 297 293 0 42 chr5 148965972 148966068 -3571191 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 317 1 1721 321 270 0 0 chr5 148966085 148966159 -3571100 + MTD LTR MaLR 36 109 -310 1 1721 629 299 97 53 chr5 148970353 148970653 -3566606 + MLT1A LTR MaLR 5 317 -57 1 1721 4355 151 64 103 chr5 148974568 148974586 -3562673 - RMER19B LTR ERVK 0 902 884 1 1721 4355 151 64 103 chr5 148974730 148975328 -3561931 - RMER19B LTR ERVK -19 883 264 1 1721 4355 151 64 103 chr5 148975419 148975740 -3561519 - RMER19B LTR ERVK -639 263 1 1 1721 813 165 0 28 chr5 148976528 148976671 -3560588 + RMER19B LTR ERVK 642 780 -122 1 1721 235 240 0 0 chr5 148985072 148985122 -3552137 + MLT2B5 LTR ERVL 1 50 -667 1 1721 251 296 101 10 chr5 148985868 148985967 -3551292 + MTEb LTR MaLR 272 379 0 1 1721 1587 230 75 62 chr5 148987485 148988003 -3549256 + MT2A LTR ERVL 1 525 -8 1 1721 3944 62 87 17 chr5 148988043 148988570 -3548689 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 1 1721 2142 144 3 21 chr5 148989296 148989541 -3547718 + ORR1A2 LTR MaLR 1 245 -82 1 1721 2883 82 44 5 chr5 148989541 148989946 -3547313 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 1 1721 2142 144 3 21 chr5 148989946 148990033 -3547226 + ORR1A2 LTR MaLR 246 327 0 1 1721 262 248 265 52 chr5 148992100 148992236 -3545023 - MLT1E LTR MaLR -450 203 39 1 1721 380 60 20 0 chr5 148998639 148998689 -3538570 - RLTR23 LTR ERV1 -379 51 1 1 1721 3007 178 56 20 chr5 149000297 149000854 -3536405 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 1 2 1721 4092 144 112 19 chr5 149000854 149002016 -3535243 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1052 2 1721 3572 140 24 40 chr5 149002162 149002370 -3534889 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1275 1051 851 2 1721 3080 166 52 16 chr5 149002532 149003091 -3534168 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1586 740 162 2 1721 725 61 10 13 chr5 149003091 149003202 -3534057 - RLTR20B3 LTR ERVK -364 196 82 5 1721 1233 117 4 57 chr5 149003199 149003419 -3533840 - RLTR20B3 LTR ERVK -356 204 1 6 1721 373 292 60 34 chr5 149004373 149004490 -3532769 + MTEa-int LTR MaLR 1131 1250 -330 9 1721 446 305 79 39 chr5 149004757 149004986 -3532273 + MTEa-int LTR MaLR 1237 1474 -106 9 1721 228 280 0 0 chr5 149005213 149005263 -3531996 + MTEa-int LTR MaLR 1441 1490 -19 9 1721 317 299 99 66 chr5 149005283 149005598 -3531661 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 9 1721 352 333 82 38 chr5 149005912 149006096 -3531163 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 1 1721 396 295 110 48 chr5 149007230 149007458 -3529801 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 116 1 1721 239 253 70 50 chr5 149009050 149009150 -3528109 - MLT1J1 LTR MaLR -238 206 105 2 1721 345 205 102 102 chr5 149011260 149011358 -3525901 - MT2B LTR ERVL -344 257 160 3 1721 443 288 61 25 chr5 149014723 149014919 -3522340 - RMER20B LTR ERVK -208 419 217 4 1721 696 254 111 10 chr5 149016468 149016675 -3520584 + MTD LTR MaLR 3 230 -191 4 1721 936 194 45 20 chr5 149018087 149018287 -3518972 + MTD LTR MaLR 215 419 0 4 1721 2706 197 14 2 chr5 149018660 149019163 -3518096 - RLTR11A2 LTR ERVK -18 509 1 4 1721 2078 119 16 103 chr5 149020148 149020550 -3516709 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1721 341 235 36 73 chr5 149022183 149022293 -3514966 - MT2B LTR ERVL -342 259 154 5 1721 2184 231 41 12 chr5 149025841 149026328 -3510931 - RMER20A LTR ERVK -5 511 11 6 1721 1408 124 94 12 chr5 149027109 149027354 -3509905 - ORR1B1 LTR MaLR -89 305 41 6 1722 263 221 176 0 chr5 149029757 149029825 -3507434 + MTD LTR MaLR 18 97 -322 6 1722 1781 144 121 12 chr5 149031898 149032101 -3505158 - MTC LTR MaLR -6 415 203 7 1722 1781 144 121 12 chr5 149032155 149032281 -3504978 - MTC LTR MaLR -219 202 52 7 1722 394 177 0 0 chr5 149032712 149032774 -3504485 - MTC LTR MaLR -357 62 1 7 1722 1373 178 147 29 chr5 149032774 149033116 -3504143 - MTD LTR MaLR -36 383 1 7 1722 421 340 18 12 chr5 149034222 149034386 -3502873 - ORR1E LTR MaLR -194 165 1 7 1722 3325 48 5 0 chr5 149041274 149041668 -3495591 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1722 2141 161 104 2 chr5 149043575 149043987 -3493272 - RMER17B LTR ERVK -4 954 501 8 1722 1139 197 150 23 chr5 149044085 149044391 -3492868 - ORR1D2 LTR MaLR -21 349 5 8 1722 284 380 50 53 chr5 149044689 149044992 -3492267 - MER21B LTR ERV1 -355 508 207 8 1722 289 192 0 0 chr5 149045029 149045081 -3492178 - MTD LTR MaLR -321 98 47 8 1722 3228 22 3 3 chr5 149046373 149046738 -3490521 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 8 1722 1802 122 96 34 chr5 149051515 149051923 -3485336 + RMER17C LTR ERVK 19 439 -519 9 1722 1479 245 89 16 chr5 149054413 149054794 -3482465 + MTD LTR MaLR 11 419 0 9 1722 1480 135 20 98 chr5 149055612 149055895 -3481364 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 124 9 1722 1940 144 42 0 chr5 149056830 149057136 -3480123 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 76 1 1722 314 215 12 60 chr5 149057129 149057213 -3480046 - ORR1B1 LTR MaLR -248 119 40 1 1722 345 182 0 61 chr5 149057229 149057311 -3479948 - ORR1B2 LTR MaLR -250 117 41 1 1722 352 186 7 71 chr5 149057279 149057411 -3479848 - ORR1B2 LTR MaLR -250 117 17 1 1722 308 167 0 62 chr5 149057411 149057475 -3479784 - ORR1B2 LTR MaLR -269 98 39 1 1722 384 195 18 89 chr5 149057449 149057591 -3479668 - ORR1B2 LTR MaLR -253 141 9 1 1722 366 182 0 100 chr5 149057599 149057708 -3479551 - ORR1B2 LTR MaLR -250 117 29 1 1722 352 204 0 57 chr5 149057691 149057891 -3479368 - ORR1B2 LTR MaLR -275 119 12 1 1722 303 190 0 33 chr5 149057891 149057951 -3479308 - ORR1B2 LTR MaLR -269 98 41 1 1722 503 214 13 107 chr5 149057949 149058159 -3479100 - ORR1B1 LTR MaLR -249 145 1 1 1722 775 180 17 40 chr5 149060993 149061167 -3476092 - RMER10B LTR ERVL 0 398 229 1 1722 354 222 25 3 chr5 149062471 149062562 -3474697 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 267 1 1722 370 246 33 66 chr5 149062634 149062756 -3474503 - MLT1A1 LTR MaLR -290 118 1 1 1722 1676 165 142 27 chr5 149063159 149063533 -3473726 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 1722 3353 33 8 8 chr5 149065735 149066135 -3471124 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1722 639 284 270 37 chr5 149066735 149067113 -3470146 - MER31B LTR ERV1 0 466 1 1 1722 4201 169 117 23 chr5 149068471 149069301 -3467958 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 1 1722 1099 228 158 59 chr5 149070975 149071348 -3465911 - MTD LTR MaLR 0 419 10 1 1722 496 175 68 26 chr5 149072469 149072571 -3464688 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 264 1 1722 857 305 98 52 chr5 149073834 149074201 -3463058 - RMER5 LTR ERV1 -72 462 79 1 1722 1688 184 52 35 chr5 149074727 149075094 -3462165 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 1 1722 1569 217 30 75 chr5 149075374 149075812 -3461447 + RLTR28B LTR ERVL 64 481 0 1 1722 3260 55 2 2 chr5 149083073 149083473 -3453786 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1722 304 247 134 0 chr5 149086723 149086820 -3450439 - MLT1A0 LTR MaLR -59 306 197 1 1722 1149 253 188 8 chr5 149087517 149087757 -3449502 - MTD LTR MaLR 0 419 120 1 1722 1149 253 188 8 chr5 149087792 149087902 -3449357 - MTD LTR MaLR -300 119 7 1 1722 253 292 127 85 chr5 149087952 149088272 -3448987 - ORR1E LTR MaLR -19 346 4 1 1722 244 366 31 52 chr5 149089640 149089833 -3447426 - RMER4B LTR ERVK -372 213 25 1 1722 1020 190 356 16 chr5 149092553 149092859 -3444400 - MTD LTR MaLR -2 417 8 1 1722 1550 209 119 3 chr5 149095404 149095764 -3441495 - MTD LTR MaLR -3 416 15 1 1722 2147 77 0 0 chr5 149097317 149097590 -3439669 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 54 1 1722 386 281 29 10 chr5 149098982 149099086 -3438173 - ORR1E LTR MaLR -253 106 1 1 1722 1426 237 82 9 chr5 149102031 149102371 -3434888 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 3 1 1722 245 311 22 0 chr5 149104262 149104352 -3432907 + ORR1E LTR MaLR 1 92 -267 1 1722 404 278 136 93 chr5 149104720 149104978 -3432281 + ORR1E LTR MaLR 80 348 -11 1 1722 283 202 19 136 chr5 149111747 149111850 -3425409 + RLTR25B LTR ERVK 441 531 -497 2 1722 1089 203 265 6 chr5 149112400 149112580 -3424679 - MTD LTR MaLR -1 418 211 2 1722 1089 203 265 6 chr5 149112757 149112908 -3424351 - MTD LTR MaLR -209 210 1 2 1722 348 260 62 39 chr5 149115600 149115728 -3421531 - MLT1A0 LTR MaLR -234 131 1 2 1722 3469 35 2 0 chr5 149116880 149117275 -3419984 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1722 3851 69 24 4 chr5 149119033 149119566 -3417693 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -114 473 1 2 1722 6045 122 20 25 chr5 149119566 149120306 -3416953 - MuRRS-int LTR ERV1 0 4690 3971 2 1722 3217 28 0 3 chr5 149120306 149120664 -3416595 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 2 1722 6045 122 20 25 chr5 149120664 149120872 -3416387 - MuRRS-int LTR ERV1 -720 3970 3747 2 1722 3673 127 10 39 chr5 149120919 149121641 -3415618 - MuRRS-int LTR ERV1 -1021 3669 3121 2 1722 5201 255 88 38 chr5 149121630 149123079 -3414180 - MuRRS-int LTR ERV1 -3147 1916 356 2 1722 5201 255 88 38 chr5 149123117 149123488 -3413771 - MuRRS-int LTR ERV1 -4708 355 6 2 1722 4757 65 2 10 chr5 149123489 149124081 -3413178 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 2 1722 283 216 26 121 chr5 149127768 149127884 -3409375 - ORR1D1 LTR MaLR -269 105 1 2 1722 3189 42 0 10 chr5 149128018 149128403 -3408856 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 16 2 1722 1287 76 20 10 chr5 149128408 149128608 -3408651 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 897 2 1722 6228 54 78 2 chr5 149134673 149135524 -3401735 - MTA_Mm-int LTR MaLR -177 921 7 2 1722 3215 46 3 3 chr5 149135522 149135913 -3401346 - MTA_Mm LTR MaLR -5 391 1 2 1722 311 225 0 119 chr5 149137187 149137273 -3399986 - MT2B LTR ERVL -344 257 182 2 1722 311 225 0 119 chr5 149137302 149137316 -3399943 - MT2B LTR ERVL -420 181 169 2 1722 2541 112 259 6 chr5 149137451 149137918 -3399341 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 2 1722 3055 36 3 64 chr5 149138083 149138472 -3398787 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 2 1722 566 201 84 22 chr5 149155510 149155666 -3381593 + MTD LTR MaLR 206 385 -36 2 1723 2090 83 86 7 chr5 149162642 149162944 -3374315 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 2 1723 1699 221 64 5 chr5 149163068 149163460 -3373799 + MTD LTR MaLR 5 419 0 2 1723 292 182 18 0 chr5 149169295 149169350 -3367909 - MTEa LTR MaLR -25 354 299 2 1723 349 324 49 14 chr5 149178494 149178638 -3358621 + MTD LTR MaLR 1 149 -210 3 1723 604 204 223 11 chr5 149178763 149178951 -3358308 + MTD LTR MaLR 192 419 0 3 1723 2461 145 17 72 chr5 149183130 149183651 -3353608 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 2 557 0 3 1723 2311 153 50 60 chr5 149184025 149184435 -3352824 + RLTR28B LTR ERVL 4 412 -69 3 1723 2311 153 50 60 chr5 149184623 149184692 -3352567 + RLTR28B LTR ERVL 413 478 -3 3 1723 258 185 259 0 chr5 149187113 149187194 -3350065 + MTE2a LTR MaLR 278 379 0 3 1723 361 289 14 79 chr5 149189589 149189728 -3347531 + MT2B LTR ERVL 170 299 -302 3 1723 3352 53 2 0 chr5 149190020 149190419 -3346840 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1723 590 273 65 18 chr5 149191535 149191703 -3345556 - MTEb LTR MaLR 0 379 204 3 1723 492 247 99 35 chr5 149192066 149192150 -3345109 - MTEb LTR MaLR -196 183 98 3 1723 492 247 99 35 chr5 149192301 149192388 -3344871 - MTEb LTR MaLR -282 97 1 3 1723 909 179 81 10 chr5 149194769 149194966 -3342293 + RLTR11A LTR ERVK 1 211 -317 3 1723 565 215 22 29 chr5 149194958 149195097 -3342162 + RLTR11A LTR ERVK 385 522 -6 3 1723 1503 241 107 13 chr5 149198209 149198584 -3338675 + MTD LTR MaLR 1 410 -9 3 1723 3869 112 19 50 chr5 149206986 149207606 -3329653 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 3 1723 944 116 61 6 chr5 149214449 149214614 -3322645 + ORR1B2 LTR MaLR 4 177 -190 3 1723 682 161 106 144 chr5 149214819 149214950 -3322309 + ORR1B2 LTR MaLR 212 341 -53 3 1723 682 161 106 144 chr5 149215078 149215134 -3322125 + ORR1B2 LTR MaLR 342 392 -2 3 1723 486 279 38 3 chr5 149216198 149216366 -3320893 + ORR1D2 LTR MaLR 1 177 -207 3 1723 340 200 0 0 chr5 149216336 149216391 -3320868 + ORR1D2 LTR MaLR 316 370 -4 3 1723 2187 134 96 59 chr5 149216521 149216979 -3320280 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 1723 421 217 8 129 chr5 149218428 149218560 -3318699 + MT2B LTR ERVL 153 268 -333 4 1723 395 354 26 92 chr5 149220392 149220663 -3316596 + MLT1B LTR MaLR 126 378 -12 4 1723 1466 190 174 112 chr5 149222802 149222851 -3314408 - MT2A LTR ERVL -4 529 486 4 1723 1466 190 174 112 chr5 149222873 149223316 -3313943 - MT2A LTR ERVL -48 485 6 4 1723 1602 232 88 10 chr5 149223528 149223916 -3313343 + MTD LTR MaLR 2 419 0 4 1723 1379 134 123 58 chr5 149224103 149224412 -3312847 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1723 278 159 0 0 chr5 149226684 149226728 -3310531 - RMER21B LTR ERV1 -277 565 522 4 1723 708 221 5 102 chr5 149229800 149229916 -3307343 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 480 4 1723 1060 194 87 58 chr5 149229963 149230321 -3306938 - RLTR20C LTR ERVK -99 479 1 4 1723 1547 130 165 44 chr5 149231888 149231958 -3305301 + ORR1B1 LTR MaLR 1 100 -294 4 1723 2571 73 173 145 chr5 149231958 149232456 -3304803 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1723 1547 130 165 44 chr5 149232456 149232700 -3304559 + ORR1B1 LTR MaLR 101 352 -42 4 1723 286 125 0 127 chr5 149233552 149233564 -3303695 + ORR1A4 LTR MaLR 274 284 -45 4 1723 286 125 0 127 chr5 149233864 149233905 -3303354 + ORR1A4 LTR MaLR 285 320 -9 4 1723 304 316 149 13 chr5 149235264 149235418 -3301841 + MLT1I LTR MaLR 97 271 -140 4 1723 1968 149 14 65 chr5 149238838 149239255 -3298004 + RMER10B LTR ERVL 3 398 0 4 1723 302 301 133 20 chr5 149242182 149242385 -3294874 - MLT1B LTR MaLR -84 306 81 4 1723 1923 174 65 25 chr5 149244300 149244702 -3292557 - MTD LTR MaLR 0 419 2 4 1723 296 256 64 0 chr5 149245166 149245244 -3292015 - LTR33 LTR ERVL -91 424 342 4 1723 617 207 69 28 chr5 149246165 149246309 -3290950 + RMER19B LTR ERVK 1 150 -752 4 1723 1342 142 18 35 chr5 149246308 149246535 -3290724 + RMER19B LTR ERVK 680 902 0 4 1723 363 236 41 106 chr5 149251644 149251767 -3285492 + MT2B LTR ERVL 143 257 -344 4 1723 1426 183 127 67 chr5 149254247 149254663 -3282596 - RMER10A LTR ERVL 0 442 2 5 1723 1838 169 50 11 chr5 149257070 149257430 -3279829 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1723 566 310 129 63 chr5 149258423 149258611 -3278648 + MLT1C LTR MaLR 1 188 -279 5 1723 2079 175 19 3 chr5 149258611 149258983 -3278276 + RLTR14 LTR ERV1 5 382 0 5 1723 566 310 129 63 chr5 149258983 149259221 -3278038 + MLT1C LTR MaLR 189 455 -12 5 1723 291 238 35 35 chr5 149260248 149260335 -3276924 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 424 5 1723 2324 169 50 13 chr5 149260465 149260920 -3276339 + RLTR11A LTR ERVK 1 472 -56 5 1723 3485 115 18 93 chr5 149266817 149267522 -3269737 - RMER6A LTR ERVK -2 754 57 5 1723 925 81 0 0 chr5 149269109 149269233 -3268026 + ORR1A2 LTR MaLR 1 124 -203 5 1723 11205 113 107 3 chr5 149269246 149271024 -3266235 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 5 1723 2436 79 3 0 chr5 149271024 149271342 -3265917 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1723 2419 47 3 0 chr5 149271349 149271649 -3265610 - MTB LTR MaLR -99 301 1 5 1723 1221 204 133 9 chr5 149272393 149272709 -3264550 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 5 1723 2041 114 6 42 chr5 149272749 149273024 -3264235 + RLTR28 LTR ERVL 1 267 -257 5 1723 2057 98 21 59 chr5 149273024 149273362 -3263897 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 5 1723 2041 114 6 42 chr5 149273362 149273417 -3263842 + RLTR28 LTR ERVL 268 319 -205 5 1723 337 239 82 101 chr5 149277836 149278136 -3259123 + RLTR15 LTR ERVK 43 310 -49 5 1723 372 371 89 58 chr5 149279857 149280062 -3257197 + MLT1L LTR MaLR 191 412 -198 5 1723 372 371 89 58 chr5 149280089 149280175 -3257084 + MLT1L LTR MaLR 413 491 -119 5 1723 689 273 77 84 chr5 149280308 149280661 -3256598 - MLT1H2-int LTR MaLR -105 1384 1042 5 1723 785 335 132 57 chr5 149280637 149281163 -3256096 - MLT1H2-int LTR MaLR -477 932 356 5 1723 785 335 132 57 chr5 149281349 149281578 -3255681 - MLT1H2-int LTR MaLR -1054 355 120 5 1723 227 274 0 0 chr5 149281855 149281906 -3255353 - MLT1H2 LTR MaLR -10 479 429 5 1723 760 274 68 59 chr5 149285248 149285585 -3251674 + ORR1E LTR MaLR 18 357 -2 5 1723 2083 229 23 62 chr5 149286535 149286625 -3250634 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 447 5 1723 2083 229 23 62 chr5 149286700 149287172 -3250087 - RLTR20A LTR ERVK -95 446 1 5 1723 256 321 83 28 chr5 149288512 149288617 -3248642 + ORR1E LTR MaLR 1 111 -248 5 1723 1263 193 107 4 chr5 149288617 149288793 -3248466 - MTD LTR MaLR 0 419 225 5 1723 2405 74 55 0 chr5 149288793 149289103 -3248156 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1723 1263 180 538 9 chr5 149289103 149289248 -3248011 - MTD LTR MaLR -195 224 4 5 1723 1396 122 30 45 chr5 149289802 149290069 -3247190 + RMER10B LTR ERVL 3 265 -133 5 1723 935 161 58 68 chr5 149290089 149290295 -3246964 + RMER10B LTR ERVL 195 398 0 5 1724 3731 48 27 25 chr5 149291180 149291654 -3245605 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 1724 560 314 5 63 chr5 149293801 149294008 -3243251 + MTD LTR MaLR 17 211 -208 5 1724 2390 82 3 0 chr5 149294286 149294603 -3242656 + ORR1A2 LTR MaLR 1 318 -9 5 1724 738 184 207 0 chr5 149294750 149294924 -3242335 + MTD LTR MaLR 197 406 -13 5 1724 228 277 0 0 chr5 149299729 149299772 -3237487 + LTR80A LTR ERVL 231 273 -310 5 1724 1973 135 130 32 chr5 149299772 149300148 -3237111 - MTC LTR MaLR 0 421 9 5 1724 1065 245 75 69 chr5 149300973 149301319 -3235940 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 6 1724 958 274 161 22 chr5 149301332 149301735 -3235524 + MLT1C LTR MaLR 1 459 -8 6 1724 395 258 49 54 chr5 149303817 149304022 -3233237 - RLTR15 LTR ERVK -128 231 28 6 1724 1235 127 103 34 chr5 149304222 149304518 -3232741 - RMER16 LTR ERVK -5 528 1 6 1724 1797 159 51 63 chr5 149308188 149308538 -3228721 - RLTR19C LTR ERVK -20 486 141 6 1724 414 287 0 50 chr5 149309094 149309210 -3228049 - MLT2C1 LTR ERVL 0 563 454 6 1724 896 174 167 96 chr5 149309210 149309450 -3227809 + RMER4B LTR ERVK 1 255 -330 6 1724 896 221 124 124 chr5 149309496 149309722 -3227537 + RMER4B LTR ERVK 254 457 -9 6 1724 370 291 72 48 chr5 149309729 149309895 -3227364 - MLT2C1 LTR ERVL -167 389 220 6 1724 1226 205 57 50 chr5 149310172 149310432 -3226827 - MTE2b LTR MaLR -38 341 90 6 1724 1407 185 189 9 chr5 149310432 149310632 -3226627 + ORR1D1 LTR MaLR 1 204 -170 6 1724 1407 185 189 9 chr5 149310657 149310773 -3226486 + ORR1D1 LTR MaLR 205 373 -1 6 1724 1226 205 57 50 chr5 149310773 149310794 -3226465 - MTE2b LTR MaLR -290 89 59 6 1724 2278 153 19 0 chr5 149312855 149313228 -3224031 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 6 1724 1916 171 119 31 chr5 149333010 149333118 -3204141 + MTC LTR MaLR 1 104 -317 6 1724 1916 171 119 31 chr5 149333297 149333575 -3203684 + MTC LTR MaLR 105 421 0 6 1724 731 153 69 0 chr5 149336267 149336398 -3200861 + MTC LTR MaLR 1 140 -281 6 1724 256 239 118 9 chr5 149355961 149356071 -3181188 + MLT1A1 LTR MaLR 1 122 -286 6 1724 3086 121 38 18 chr5 149379326 149379875 -3157384 + RMER15 LTR ERVL 9 568 -7 7 1724 2007 137 144 24 chr5 149392187 149392562 -3144697 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 7 1724 461 333 161 45 chr5 149392582 149392805 -3144454 - MLT1J LTR MaLR -200 312 64 7 1724 1050 243 158 37 chr5 149394489 149394844 -3142415 + MTD LTR MaLR 22 419 0 7 1724 406 255 101 112 chr5 149395303 149395581 -3141678 + ORR1E LTR MaLR 65 339 -20 7 1724 2851 66 141 139 chr5 149395823 149396334 -3140925 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 7 1724 302 267 8 91 chr5 149396338 149396470 -3140789 - MT2B LTR ERVL -337 264 144 7 1724 265 198 320 10 chr5 149397408 149397505 -3139754 + ORR1E LTR MaLR 64 190 -169 7 1724 1332 252 96 52 chr5 149400392 149400849 -3136410 + RMER5 LTR ERV1 48 524 -10 7 1724 1641 144 47 80 chr5 149401123 149401547 -3135712 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 7 1724 557 192 55 29 chr5 149402518 149402681 -3134578 + RMER17C LTR ERVK 1 318 -588 7 1724 370 217 24 152 chr5 149404225 149404350 -3132909 - MT2B LTR ERVL -299 302 194 7 1724 378 288 113 109 chr5 149406591 149406848 -3130411 + MLT1N2 LTR MaLR 1 258 -304 7 1724 233 241 17 0 chr5 149406918 149406976 -3130283 + MLT1N2 LTR MaLR 463 521 -41 7 1724 2785 182 53 9 chr5 149409073 149409615 -3127644 + RLTR12A LTR ERVK 1 566 -2 7 1724 232 353 139 7 chr5 149412193 149412330 -3124929 + MER21B LTR ERV1 18 172 -691 7 1724 433 327 32 45 chr5 149412567 149412724 -3124535 + MER21B LTR ERV1 182 336 -527 7 1724 758 276 101 72 chr5 149414857 149415204 -3122055 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 8 1724 1826 295 152 38 chr5 149415204 149416038 -3121221 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 598 8 1724 1185 231 123 15 chr5 149416324 149416650 -3120609 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 2 8 1724 326 311 126 42 chr5 149416656 149416847 -3120412 - MTE-int LTR MaLR -1050 530 324 8 1724 310 314 46 103 chr5 149417038 149417120 -3120139 + ORR1E LTR MaLR 9 87 -272 8 1724 310 314 46 103 chr5 149417157 149417269 -3119990 + ORR1E LTR MaLR 88 192 -167 8 1724 2062 113 85 9 chr5 149418315 149418644 -3118615 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 8 1725 555 318 89 30 chr5 149423870 149424139 -3113120 - MLT1C LTR MaLR -112 355 71 8 1725 540 302 55 118 chr5 149424111 149424457 -3112802 - MTEa LTR MaLR -44 335 12 8 1725 2419 165 10 5 chr5 149429912 149430315 -3106944 + MTD LTR MaLR 12 416 -3 8 1725 645 277 122 53 chr5 149431963 149432266 -3104993 - MLT1A1 LTR MaLR -54 354 17 8 1725 2536 118 86 2 chr5 149433542 149433949 -3103310 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 8 1725 258 226 138 65 chr5 149434674 149434797 -3102462 + MLT1B LTR MaLR 254 385 -5 8 1725 457 263 32 38 chr5 149436210 149436341 -3100918 + MLT1D LTR MaLR 289 518 -109 8 1725 354 256 140 79 chr5 149440504 149440647 -3096612 - ORR1E LTR MaLR -169 190 32 8 1725 354 256 140 79 chr5 149440705 149440739 -3096520 - ORR1E LTR MaLR -328 31 2 8 1725 271 296 62 0 chr5 149448217 149448298 -3088961 - ORR1E LTR MaLR -260 99 14 8 1725 1117 292 100 15 chr5 149450894 149451120 -3086139 + ORR1D2 LTR MaLR 13 258 -112 8 1725 1117 292 100 15 chr5 149451159 149451262 -3085997 + ORR1D2 LTR MaLR 259 369 -1 8 1725 283 319 20 94 chr5 149451396 149451545 -3085714 - MLT1G1 LTR MaLR -327 252 115 8 1725 2712 62 9 0 chr5 149451675 149451999 -3085260 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 1725 1947 102 31 22 chr5 149452389 149452708 -3084551 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 8 1725 3367 52 16 11 chr5 149452708 149453153 -3084106 - ETnERV-int LTR ERVK 0 3314 2868 8 1725 1643 95 5 9 chr5 149453153 149453377 -3083882 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -99 223 1 8 1725 3321 24 39 0 chr5 149454300 149454681 -3082578 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1725 2097 146 46 16 chr5 149456940 149457308 -3079951 + RLTR14 LTR ERV1 1 379 -3 8 1725 689 304 118 92 chr5 149457733 149458081 -3079178 - MLT1A LTR MaLR -17 357 1 8 1725 229 275 90 84 chr5 149460870 149461025 -3076234 + MTEa LTR MaLR 206 361 -18 8 1725 2514 145 104 26 chr5 149468716 149468788 -3068471 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 457 8 1725 2514 145 104 26 chr5 149468839 149469256 -3068003 - RLTR11A LTR ERVK -72 456 1 8 1725 1334 168 39 4 chr5 149469258 149469515 -3067744 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1191 1456 -870 9 1725 1649 171 90 41 chr5 149472049 149472272 -3064987 + ORR1C2 LTR MaLR 1 237 -147 9 1725 1649 171 90 41 chr5 149472297 149472439 -3064820 + ORR1C2 LTR MaLR 238 383 -1 9 1725 1422 193 125 18 chr5 149476639 149476790 -3060469 + ORR1D1 LTR MaLR 13 163 -211 9 1725 1422 193 125 18 chr5 149476961 149477135 -3060124 + ORR1D1 LTR MaLR 164 373 -1 9 1725 3362 93 8 43 chr5 149479112 149479604 -3057655 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 9 1725 6255 100 26 81 chr5 149479604 149480912 -3056347 + MT-int LTR MaLR 1 1258 0 9 1725 3345 48 5 2 chr5 149480912 149481311 -3055948 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1725 3021 125 2 5 chr5 149483076 149483510 -3053749 - RLTR10C LTR ERVK -3 433 1 9 1725 230 221 40 81 chr5 149485707 149485781 -3051478 + RMER19C LTR ERVK 57 127 -484 9 1725 378 225 2 14 chr5 149485942 149486033 -3051226 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 289 9 1725 2875 36 2 123 chr5 149487356 149487771 -3049488 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 9 1725 4104 143 15 3 chr5 149487771 149488449 -3048810 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 6995 9 1725 1554 87 100 0 chr5 149488453 149488684 -3048575 - IAP-d-int LTR ERVK -1287 5255 5002 9 1725 460 298 25 24 chr5 149488697 149488967 -3048292 - IAP-d-int LTR ERVK -5520 1022 829 9 1725 2868 29 0 3 chr5 149489114 149489456 -3047803 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 652 9 1725 325 89 0 0 chr5 149489459 149489504 -3047755 - RLTR10-int LTR ERVK -6405 137 93 9 1725 1369 33 4 3 chr5 149489739 149489917 -3047342 - RLTR10-int LTR ERVK -7314 267 40 9 1725 2776 63 5 69 chr5 149489926 149490316 -3046943 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 9 1725 729 239 42 28 chr5 149490404 149490619 -3046640 + RLTR45 LTR ERVK 265 482 0 9 1725 513 253 98 12 chr5 149491846 149492010 -3045249 + MTD LTR MaLR 47 224 -195 9 1725 225 324 14 0 chr5 149492053 149492124 -3045135 + LTR48B LTR ERV1 436 507 -137 9 1725 387 206 127 27 chr5 149492166 149492276 -3044983 - RLTR15 LTR ERVK -238 121 1 9 1725 371 281 22 0 chr5 149492276 149492361 -3044898 + LTR48B LTR ERV1 557 643 -1 9 1725 1911 166 38 30 chr5 149492942 149493315 -3043944 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 9 1725 961 276 45 62 chr5 149493887 149494212 -3043047 + MTEa LTR MaLR 1 321 -58 9 1725 961 276 45 62 chr5 149494392 149494418 -3042841 + MTEa LTR MaLR 322 346 -33 9 1725 1370 256 26 115 chr5 149496514 149496796 -3040463 + MTE2a LTR MaLR 1 283 -96 9 1725 1093 210 236 15 chr5 149496796 149497139 -3040120 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 1725 1370 256 26 115 chr5 149497139 149497224 -3040035 + MTE2a LTR MaLR 284 348 -31 9 1725 1370 256 26 115 chr5 149497369 149497416 -3039843 + MTE2a LTR MaLR 349 379 0 9 1725 1131 115 16 6 chr5 149498637 149498820 -3038439 - ORR1A3 LTR MaLR -137 189 5 9 1725 284 253 25 25 chr5 149498822 149498903 -3038356 - RMER15 LTR ERVL -147 428 348 9 1725 2697 62 9 0 chr5 149498969 149499293 -3037966 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1725 2534 122 133 5 chr5 149506708 149507121 -3030138 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 1 1725 324 323 33 90 chr5 149507569 149507780 -3029479 + RMER15 LTR ERVL 319 517 -58 1 1725 547 269 130 134 chr5 149511268 149511430 -3025829 + RLTR16 LTR ERVK 1 181 -324 2 1725 547 269 130 134 chr5 149511485 149511738 -3025521 + RLTR16 LTR ERVK 182 413 -92 2 1725 547 269 130 134 chr5 149511813 149511903 -3025356 + RLTR16 LTR ERVK 414 504 -1 2 1725 3377 48 5 0 chr5 149514954 149515352 -3021907 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1725 525 312 44 55 chr5 149517234 149517505 -3019754 - ORR1E LTR MaLR -52 307 40 3 1725 380 283 54 61 chr5 149517932 149518079 -3019180 - MLT1K LTR MaLR -372 223 78 3 1725 374 285 142 24 chr5 149521591 149521760 -3015499 + RMER5 LTR ERV1 33 221 -313 4 1725 1318 188 99 18 chr5 149521773 149522055 -3015204 + MTD LTR MaLR 74 378 -41 4 1725 922 299 17 24 chr5 149522087 149522375 -3014884 + RMER5 LTR ERV1 232 517 -17 4 1725 2976 145 113 9 chr5 149524094 149524624 -3012635 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 1725 281 120 40 0 chr5 149525771 149525821 -3011438 - MTD LTR MaLR -366 53 2 5 1725 3021 54 33 10 chr5 149525821 149526212 -3011047 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1725 1704 171 82 24 chr5 149526320 149526661 -3010598 + MTD LTR MaLR 59 419 0 5 1725 345 347 60 77 chr5 149529065 149529348 -3007911 - LTR33A LTR ERVL -230 301 8 5 1725 2059 85 44 29 chr5 149529707 149530023 -3007236 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 6 1725 2084 214 54 36 chr5 149530898 149531401 -3005858 + RMER19C LTR ERVK 92 603 -8 6 1725 2087 206 67 12 chr5 149533135 149533567 -3003692 + MT2A LTR ERVL 2 457 -76 6 1725 294 268 87 26 chr5 149534929 149535044 -3002215 - MLT1A1 LTR MaLR -117 291 170 6 1725 2548 179 39 16 chr5 149536041 149536553 -3000706 - RLTR11A2 LTR ERVK -3 524 1 7 1725 3150 44 44 0 chr5 149537380 149537763 -2999496 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1725 230 228 98 98 chr5 149542598 149542710 -2994549 - RMER12 LTR ERVK -513 809 698 7 1725 226 128 0 161 chr5 149542756 149542812 -2994447 - RMER6B LTR ERVK -3 458 412 8 1725 1336 90 72 59 chr5 149542819 149543056 -2994203 - RMER6B LTR ERVK -221 240 1 8 1725 298 328 144 30 chr5 149544177 149544447 -2992812 - ORR1E LTR MaLR -53 306 6 8 1725 2594 55 15 3 chr5 149546437 149546764 -2990495 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 55 8 1725 232 293 0 0 chr5 149546895 149546953 -2990306 + MLT1F2 LTR MaLR 41 98 -462 8 1726 227 336 116 71 chr5 149554942 149555278 -2981981 - MLT1J LTR MaLR -55 457 107 1 1726 2250 81 39 0 chr5 149555942 149556249 -2981010 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1726 1314 261 69 11 chr5 149557257 149557632 -2979627 - MTD LTR MaLR 0 419 23 1 1726 2485 133 47 28 chr5 149558151 149558621 -2978638 - RLTR44D LTR ERVK -7 479 1 1 1726 486 348 95 81 chr5 149559932 149560342 -2976917 - RMER5 LTR ERV1 -41 493 78 1 1726 250 272 22 100 chr5 149560390 149560480 -2976779 - MER34 LTR ERV1 -84 458 376 1 1726 926 212 22 30 chr5 149562048 149562258 -2975001 + ORR1B1 LTR MaLR 1 223 -171 1 1726 1867 118 105 6 chr5 149563724 149564039 -2973220 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 1 1726 237 236 0 113 chr5 149571663 149571725 -2965534 - MLT1D LTR MaLR -449 56 2 1 1726 272 305 37 30 chr5 149572498 149572633 -2964626 - RMER15 LTR ERVL -90 485 350 1 1726 3443 35 8 0 chr5 149572659 149573056 -2964203 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1726 290 213 98 0 chr5 149576115 149576176 -2961083 - MLT1J LTR MaLR -338 174 108 1 1726 5361 127 73 8 chr5 149576245 149577144 -2960115 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 1 1726 940 265 89 91 chr5 149580568 149580824 -2956435 - MTE2a LTR MaLR -3 376 113 1 1726 940 265 89 91 chr5 149580998 149581101 -2956158 - MTE2a LTR MaLR -267 112 18 1 1726 712 353 28 19 chr5 149581331 149581654 -2955605 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 39 1 1726 633 280 36 67 chr5 149583282 149583336 -2953923 - MLT1C LTR MaLR -9 458 408 1 1726 633 280 36 67 chr5 149583411 149583551 -2953708 - MLT1C LTR MaLR -60 407 270 1 1726 1612 172 112 26 chr5 149583722 149584062 -2953197 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 1 1726 3210 112 55 85 chr5 149584140 149584371 -2952888 + RMER4B LTR ERVK 1 221 -364 1 1726 3210 112 55 85 chr5 149584446 149584749 -2952510 + RMER4B LTR ERVK 222 525 -60 1 1726 3210 112 55 85 chr5 149584939 149585006 -2952253 + RMER4B LTR ERVK 526 584 -1 1 1726 296 313 142 29 chr5 149589339 149589543 -2947716 - MLT1K LTR MaLR -3 592 366 1 1726 1533 217 45 22 chr5 149589920 149590278 -2946981 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 1 1726 3796 134 72 73 chr5 149592151 149593058 -2944201 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 1 1726 2052 106 32 13 chr5 149596959 149597274 -2939985 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 2 1726 1961 128 44 6 chr5 149601908 149602223 -2935036 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 2 1726 325 315 137 51 chr5 149603992 149604226 -2933033 - LTR33 LTR ERVL -4 511 258 2 1726 849 216 119 0 chr5 149606645 149606959 -2930300 - MTD LTR MaLR -3 416 42 2 1726 468 264 27 0 chr5 149609349 149609459 -2927800 + MLT1D LTR MaLR 278 390 -115 2 1726 584 196 374 9 chr5 149612111 149612233 -2925026 + MTD LTR MaLR 7 195 -224 2 1726 584 196 374 9 chr5 149612296 149612400 -2924859 + MTD LTR MaLR 196 315 -104 2 1726 3282 63 2 0 chr5 149612809 149613208 -2924051 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1726 1517 174 319 19 chr5 149617862 149618272 -2918987 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 1726 888 254 182 40 chr5 149621864 149622216 -2915043 + MTD LTR MaLR 18 419 0 2 1726 261 256 50 25 chr5 149622229 149622309 -2914950 + ORR1D2 LTR MaLR 289 370 0 2 1726 297 286 103 67 chr5 149623786 149623951 -2913308 + ORR1E LTR MaLR 21 191 -168 2 1726 246 299 53 70 chr5 149623968 149624155 -2913104 + ORR1E LTR MaLR 202 410 -9 2 1726 2482 75 3 0 chr5 149625246 149625565 -2911694 - ORR1A2 LTR MaLR -7 320 1 2 1726 434 336 63 93 chr5 149625879 149626276 -2910983 + MLT1A1 LTR MaLR 22 406 -2 2 1726 3236 60 2 0 chr5 149627324 149627723 -2909536 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1726 2663 126 45 56 chr5 149630059 149630574 -2906685 - RLTR28 LTR ERVL -15 509 1 2 1726 470 351 105 54 chr5 149631280 149631614 -2905645 + MLT1A0 LTR MaLR 3 353 -12 2 1726 225 312 95 21 chr5 149632907 149632997 -2904262 + MLT1C LTR MaLR 1 97 -370 2 1726 3010 53 2 111 chr5 149633530 149633729 -2903530 + MTB LTR MaLR 1 196 -204 2 1726 3010 53 2 111 chr5 149633875 149634124 -2903135 + MTB LTR MaLR 197 400 0 2 1726 433 321 50 30 chr5 149640166 149640221 -2897038 - MT2A LTR ERVL -328 205 3 2 1726 515 278 35 0 chr5 149640221 149640365 -2896894 - MTEb LTR MaLR -228 151 3 2 1726 1964 163 197 58 chr5 149640490 149640952 -2896307 - RMER19B LTR ERVK -376 526 1 2 1726 688 240 80 32 chr5 149641624 149641839 -2895420 + MTD LTR MaLR 186 405 -14 2 1726 412 200 60 100 chr5 149644329 149644426 -2892833 - MT2A LTR ERVL -107 494 327 2 1726 607 153 123 26 chr5 149644426 149644471 -2892788 - RMER10B LTR ERVL 0 398 354 2 1726 607 153 123 26 chr5 149644540 149644608 -2892651 - RMER10B LTR ERVL -45 353 276 2 1726 240 302 87 120 chr5 149646390 149646553 -2890706 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1428 1583 -265 2 1726 240 302 87 120 chr5 149646597 149646708 -2890551 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1584 1693 -155 2 1726 776 210 21 59 chr5 149648658 149648845 -2888414 + MTD LTR MaLR 1 180 -239 3 1726 243 149 43 0 chr5 149648947 149648994 -2888265 + MTD LTR MaLR 371 419 0 3 1726 1006 250 129 71 chr5 149649196 149649533 -2887726 + MTD LTR MaLR 19 381 -38 3 1726 2329 129 73 16 chr5 149649533 149649918 -2887341 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1726 1006 250 129 71 chr5 149649918 149649959 -2887300 + MTD LTR MaLR 382 419 0 3 1726 1742 209 54 60 chr5 149651803 149651846 -2885413 - RLTR11A LTR ERVK -27 501 460 3 1726 1742 209 54 60 chr5 149652091 149652328 -2884931 - RLTR11A LTR ERVK -78 450 220 3 1726 1742 209 54 60 chr5 149652388 149652593 -2884666 - RLTR11A LTR ERVK -309 219 7 3 1726 1945 224 22 37 chr5 149653679 149654142 -2883117 + RMER19C LTR ERVK 138 593 -18 3 1726 1567 233 51 3 chr5 149656401 149656754 -2880505 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1726 2353 141 26 16 chr5 149657616 149657998 -2879261 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 1726 334 273 0 134 chr5 149658195 149658216 -2879043 + MT2B LTR ERVL 150 153 -448 3 1726 580 255 186 68 chr5 149658749 149659060 -2878199 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 3 1726 3479 136 128 53 chr5 149660989 149661674 -2875585 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 3 1726 2187 128 0 24 chr5 149661720 149662055 -2875204 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1726 596 224 75 25 chr5 149662355 149662495 -2874764 + ORR1E LTR MaLR 3 150 -209 3 1726 2523 87 170 19 chr5 149662495 149662907 -2874352 + MT2B LTR ERVL 1 474 -127 3 1726 368 292 92 33 chr5 149663144 149663328 -2873931 + RMER2 LTR ERV1 373 567 0 3 1726 1133 158 36 22 chr5 149663328 149663499 -2873760 + MT2B LTR ERVL 352 601 0 3 1726 350 244 35 0 chr5 149663544 149663630 -2873629 + ORR1E LTR MaLR 284 372 -7 3 1726 1949 104 108 0 chr5 149667747 149668044 -2869215 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1726 2457 74 3 55 chr5 149668949 149669294 -2867965 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1726 345 250 29 98 chr5 149669797 149669899 -2867360 - MT2B LTR ERVL -337 264 170 3 1726 3349 48 2 0 chr5 149670521 149670916 -2866343 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1726 1461 146 11 17 chr5 149671410 149671669 -2865590 + ORR1B2 LTR MaLR 1 273 -86 3 1726 702 308 98 4 chr5 149672015 149672292 -2864967 + LTR84b LTR ERVL 22 324 -437 3 1726 2968 58 42 5 chr5 149672851 149673233 -2864026 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1726 1255 257 26 138 chr5 149679669 149680089 -2857170 - MTE2b LTR MaLR 0 379 7 3 1727 1547 239 91 46 chr5 149685833 149686272 -2850987 - RLTR28B LTR ERVL -1 480 22 3 1727 3022 21 0 0 chr5 149688073 149688405 -2848854 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 3 1727 304 264 0 14 chr5 149692703 149692776 -2844483 + MLT1B LTR MaLR 24 95 -295 3 1727 568 275 64 23 chr5 149693281 149693452 -2843807 + MLT1B LTR MaLR 116 293 -97 3 1727 238 200 38 143 chr5 149693526 149693631 -2843628 + RMER21A LTR ERV1 208 301 -646 3 1727 291 246 106 6 chr5 149694157 149694281 -2842978 + MLT1B LTR MaLR 205 360 -30 3 1727 286 291 108 16 chr5 149696154 149696283 -2840976 - MLT1F LTR MaLR -13 547 407 4 1727 390 319 17 46 chr5 149696448 149696622 -2840637 + MLT2D LTR ERVL 154 322 -92 4 1727 570 311 50 50 chr5 149696619 149696880 -2840379 - MTD LTR MaLR -158 261 1 4 1727 404 265 144 26 chr5 149696894 149697116 -2840143 - MLT1F LTR MaLR -219 360 162 4 1727 1624 163 128 18 chr5 149701632 149701969 -2835290 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1727 257 295 62 104 chr5 149706401 149706545 -2830714 - RLTR25A LTR ERVK -444 659 522 4 1727 2178 159 201 33 chr5 149710838 149711359 -2825900 + RMER19C LTR ERVK 3 611 0 4 1727 259 333 58 0 chr5 149713605 149713692 -2823567 + MLT1A0 LTR MaLR 4 95 -270 4 1727 310 271 75 30 chr5 149716293 149716426 -2820833 + RLTR25B LTR ERVK 371 509 -519 4 1727 722 293 119 63 chr5 149717912 149718247 -2819012 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 4 1727 225 171 81 47 chr5 149718933 149719019 -2818240 + RLTR25B LTR ERVK 397 485 -543 4 1727 3082 236 75 52 chr5 149722712 149723582 -2813677 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 4 1727 474 220 27 18 chr5 149725359 149725470 -2811789 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 295 4 1727 243 336 73 18 chr5 149726064 149726173 -2811086 - MLT1A1 LTR MaLR -250 115 1 4 1727 303 370 0 0 chr5 149734318 149734410 -2802849 + MTEb LTR MaLR 52 143 -236 4 1727 1669 152 178 0 chr5 149737046 149737359 -2799900 - RMER4B LTR ERVK 0 585 217 4 1727 1938 176 15 63 chr5 149737359 149737753 -2799506 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 20 4 1727 251 170 21 0 chr5 149737739 149737786 -2799473 - RMER4B LTR ERVK -365 220 173 4 1727 2122 136 95 36 chr5 149738687 149739075 -2798184 - RMER4B LTR ERVK -174 411 1 4 1727 344 314 72 11 chr5 149742352 149742529 -2794730 - LTR85b LTR Gypsy? -37 747 532 4 1727 1770 161 66 41 chr5 149743246 149743609 -2793650 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 4 1727 3274 46 13 2 chr5 149746457 149746853 -2790406 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1727 1277 152 174 114 chr5 149748393 149748660 -2788599 + ORR1B2 LTR MaLR 1 320 -47 4 1727 1277 114 179 43 chr5 149748837 149748908 -2788351 + ORR1B2 LTR MaLR 321 392 -2 4 1727 246 259 175 18 chr5 149749747 149749861 -2787398 + MTEb LTR MaLR 246 377 -2 5 1727 915 278 57 130 chr5 149749863 149750302 -2786957 + MTEb-int LTR MaLR 1 407 -1173 5 1727 229 280 38 51 chr5 149750462 149750541 -2786718 + RMER15 LTR ERVL 363 440 -135 5 1727 270 352 98 22 chr5 149750544 149750727 -2786532 + RMER15-int LTR ERVL 88 284 -4715 5 1727 1096 336 88 27 chr5 149751092 149751694 -2785565 + RMER15-int LTR ERVL 1976 2614 -2385 5 1727 290 321 36 18 chr5 149751994 149752105 -2785154 + RMER15-int LTR ERVL 2962 3074 -1925 5 1727 252 355 71 11 chr5 149753269 149753451 -2783808 - MLT1J LTR MaLR -38 474 282 5 1727 1149 251 104 9 chr5 149754477 149754803 -2782456 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 9 5 1727 1376 232 116 60 chr5 149755615 149756096 -2781163 + RLTR18B LTR ERVK 1 508 -4 5 1727 269 312 34 150 chr5 149756741 149756816 -2780443 - ORR1E LTR MaLR -6 353 281 5 1727 269 319 53 128 chr5 149757024 149757282 -2779977 - ORR1E LTR MaLR -82 292 36 5 1727 343 343 88 15 chr5 149758071 149758275 -2778984 - ORR1E LTR MaLR -133 226 8 5 1727 253 281 80 32 chr5 149760805 149760843 -2776416 + MT2B2 LTR ERVL 121 164 -420 5 1727 1844 149 102 9 chr5 149763490 149763814 -2773445 + ORR1B1 LTR MaLR 33 386 -8 5 1727 253 224 14 69 chr5 149764347 149764419 -2772840 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 197 5 1727 252 211 123 27 chr5 149764355 149764428 -2772831 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 430 5 1727 1228 256 107 46 chr5 149766754 149767023 -2770236 - MTD LTR MaLR 0 419 131 5 1727 1890 119 103 16 chr5 149767023 149767400 -2769859 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 1727 1228 256 107 46 chr5 149767400 149767523 -2769736 - MTD LTR MaLR -289 130 3 5 1727 1582 123 20 4 chr5 149767981 149768234 -2769025 - RMER6A LTR ERVK 0 756 500 5 1727 805 202 75 0 chr5 149769765 149769938 -2767321 - MTE2b LTR MaLR -190 189 4 5 1727 2346 68 26 0 chr5 149775390 149775701 -2761558 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 1727 933 199 57 56 chr5 149779153 149779643 -2757616 - RMER17C LTR ERVK -29 381 4 5 1727 1079 181 106 87 chr5 149782089 149782410 -2754849 + RLTR11A LTR ERVK 199 525 -3 5 1727 575 302 49 53 chr5 149782715 149783192 -2754067 + RLTR12B LTR ERVK 1 354 -5 5 1727 3306 110 2 8 chr5 149783198 149783676 -2753583 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 1727 1432 208 91 3 chr5 149783788 149784073 -2753186 - MTD LTR MaLR -97 322 13 5 1727 1645 130 57 70 chr5 149785840 149786155 -2751104 + ORR1B1 LTR MaLR 41 351 -43 5 1727 592 256 30 30 chr5 149786508 149786641 -2750618 + RMER20B LTR ERVK 1 133 -494 5 1727 358 319 41 14 chr5 149786779 149786925 -2750334 + RMER20B LTR ERVK 366 515 -1 5 1727 3396 40 2 0 chr5 149787370 149787767 -2749492 - MTB LTR MaLR -2 398 1 5 1727 2099 120 64 43 chr5 149792769 149793143 -2744116 + RLTR11A2 LTR ERVK 146 527 0 6 1727 228 360 8 51 chr5 149793462 149793579 -2743680 + RMER4B LTR ERVK 14 125 -460 6 1727 1216 202 27 142 chr5 149797699 149798149 -2739110 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 6 1727 1958 175 71 8 chr5 149805206 149805598 -2731661 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 6 1727 940 251 108 43 chr5 149808229 149808595 -2728664 + ORR1D2 LTR MaLR 1 378 0 6 1727 599 292 129 56 chr5 149809154 149809495 -2727764 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 6 1727 277 170 19 0 chr5 149810547 149810600 -2726659 + MTD LTR MaLR 238 291 -128 6 1728 335 307 70 0 chr5 149815923 149816037 -2721222 + MT2A LTR ERVL 1 122 -411 6 1728 634 245 73 0 chr5 149815936 149816087 -2721172 + MTE2b LTR MaLR 18 179 -200 6 1728 1057 256 41 73 chr5 149820438 149820685 -2716574 + ORR1D2 LTR MaLR 1 240 -130 6 1728 1057 256 41 73 chr5 149820734 149820827 -2716432 + ORR1D2 LTR MaLR 241 330 -40 6 1728 258 327 136 18 chr5 149821404 149821625 -2715634 - ORR1E LTR MaLR -112 247 1 6 1728 879 204 357 7 chr5 149822228 149822500 -2714759 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 6 1728 270 272 16 95 chr5 149822739 149822865 -2714394 - MT2B LTR ERVL -341 260 145 6 1728 311 336 38 9 chr5 149823968 149824073 -2713186 + MLT1A0 LTR MaLR 21 128 -237 7 1728 1772 160 104 13 chr5 149824084 149824401 -2712858 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 7 1728 2003 83 153 3 chr5 149829382 149829709 -2707550 + RLTR33 LTR ERVK 1 376 -302 7 1728 2101 111 16 9 chr5 149829713 149830032 -2707227 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 7 1728 1857 182 3 16 chr5 149830032 149830343 -2706916 + RLTR33 LTR ERVK 372 678 0 7 1728 2192 107 6 9 chr5 149830945 149831265 -2705994 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1728 1011 285 177 16 chr5 149833921 149834367 -2702892 + MT2A LTR ERVL 16 533 0 7 1728 233 282 118 0 chr5 149835328 149835413 -2701846 - MLT1E1A LTR MaLR -189 491 397 7 1728 235 282 125 18 chr5 149835830 149835942 -2701317 - MT2B2 LTR ERVL -306 278 155 7 1728 1072 237 150 125 chr5 149835970 149836490 -2700769 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 7 1728 342 241 98 57 chr5 149838644 149838692 -2698567 + MT2B LTR ERVL 113 165 -436 7 1728 1349 98 121 0 chr5 149838772 149838996 -2698263 + MTC LTR MaLR 1 251 -170 7 1728 3250 58 5 0 chr5 149840866 149841264 -2695995 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1728 1057 245 182 47 chr5 149846168 149846614 -2690645 - RMER13A LTR ERVK -354 506 1 7 1728 1320 203 104 14 chr5 149847248 149847603 -2689656 - MTD LTR MaLR -32 387 1 7 1728 252 264 154 44 chr5 149850507 149850598 -2686661 - MT2B LTR ERVL -344 257 157 7 1728 618 279 80 57 chr5 149851581 149851931 -2685328 + RLTR15 LTR ERVK 1 358 -1 8 1728 1135 229 59 88 chr5 149852387 149852741 -2684518 - MTEa LTR MaLR -5 374 31 8 1728 890 247 166 43 chr5 149852939 149852959 -2684300 + RMER5 LTR ERV1 1 21 -513 8 1728 890 247 166 43 chr5 149852983 149853241 -2684018 + RMER5 LTR ERV1 22 331 -203 8 1728 890 247 166 43 chr5 149853394 149853409 -2683850 + RMER5 LTR ERV1 332 346 -188 8 1728 890 247 166 43 chr5 149853548 149853649 -2683610 + RMER5 LTR ERV1 347 444 -90 8 1728 2098 143 99 16 chr5 149866203 149866586 -2670673 + MTC LTR MaLR 1 415 -6 8 1728 277 274 25 151 chr5 149866708 149866745 -2670514 + MT2B LTR ERVL 187 325 -276 8 1728 310 200 103 81 chr5 149868220 149868307 -2668952 - MT2B LTR ERVL -337 264 176 8 1728 1525 211 92 20 chr5 149887093 149887378 -2649881 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 78 9 1728 2514 63 22 6 chr5 149887378 149887699 -2649560 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 9 1728 1525 211 92 20 chr5 149887699 149887761 -2649498 - ORR1C2 LTR MaLR -307 77 12 9 1728 2002 88 22 46 chr5 149888284 149888657 -2648602 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 9 1728 778 245 6 0 chr5 149896165 149896324 -2640935 + MTE2b LTR MaLR 1 160 -219 9 1728 552 205 115 32 chr5 149896399 149896555 -2640704 + MTE2b LTR MaLR 157 325 -54 9 1728 320 180 0 32 chr5 149897154 149897217 -2640042 + MTE2b LTR MaLR 315 375 -4 9 1728 2226 87 18 58 chr5 149898536 149898879 -2638380 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 1728 1253 219 157 29 chr5 149900959 149901303 -2635956 - MTD LTR MaLR -14 405 18 9 1728 381 282 57 109 chr5 149901849 149902024 -2635235 + MT2B LTR ERVL 91 256 -345 9 1728 564 234 111 107 chr5 149903968 149904408 -2632851 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 1 1728 2658 104 35 2 chr5 149905491 149905887 -2631372 - MTC LTR MaLR -8 413 5 1 1728 3947 45 19 0 chr5 149908472 149908938 -2628321 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1728 236 281 94 87 chr5 149916624 149916863 -2620396 + MLT1E2 LTR MaLR 3 223 -404 1 1728 237 291 70 43 chr5 149918022 149918137 -2619122 + MLT1E2 LTR MaLR 312 429 -198 1 1728 4114 142 52 16 chr5 149923697 149924365 -2612894 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 1 1728 273 333 147 45 chr5 149925910 149926072 -2611187 - MLT1A LTR MaLR -4 370 179 1 1728 273 333 147 45 chr5 149926201 149926324 -2610935 - MLT1A LTR MaLR -196 178 56 1 1728 503 270 51 161 chr5 149927368 149927721 -2609538 + RMER20B LTR ERVK 234 547 -80 1 1728 2319 146 33 35 chr5 149927891 149928402 -2608857 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 561 1 1 1728 801 176 127 18 chr5 149932158 149932412 -2604847 - MTD LTR MaLR -115 304 5 1 1728 395 294 127 30 chr5 149935972 149936137 -2601122 + LTR84b LTR ERVL 100 280 -481 1 1728 1352 163 41 188 chr5 149936616 149936697 -2600562 + ORR1D1 LTR MaLR 1 82 -292 1 1728 3126 61 10 2 chr5 149936697 149937094 -2600165 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1728 1352 163 41 188 chr5 149937094 149937428 -2599831 + ORR1D1 LTR MaLR 83 355 -19 1 1728 5017 123 17 0 chr5 149939797 149940522 -2596737 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 1728 271 347 58 23 chr5 149941906 149942059 -2595200 + LTR16E2 LTR ERVL 268 426 -142 1 1728 271 347 58 23 chr5 149942082 149942099 -2595160 + LTR16E2 LTR ERVL 427 444 -124 1 1729 2204 98 6 66 chr5 149950509 149950858 -2586401 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 1 1729 241 296 11 54 chr5 149952050 149952143 -2585116 + MLT1K LTR MaLR 106 194 -401 1 1729 483 323 80 6 chr5 149953058 149953220 -2584039 + ORR1E LTR MaLR 1 174 -185 1 1729 263 294 39 10 chr5 149954015 149954118 -2583141 + MLT1C LTR MaLR 11 116 -351 1 1729 446 261 97 13 chr5 149962191 149962346 -2574913 + MLT1A LTR MaLR 5 172 -202 1 1729 553 296 157 47 chr5 149963713 149964032 -2573227 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 1 1729 252 356 59 44 chr5 149972272 149972407 -2564852 + MLT1J LTR MaLR 132 268 -244 1 1729 225 309 15 0 chr5 149972404 149972472 -2564787 + MLT1J LTR MaLR 436 504 -8 1 1729 2342 105 6 3 chr5 149973937 149974261 -2562998 + ORR1A3 LTR MaLR 2 326 0 1 1729 3162 46 22 27 chr5 149981375 149981777 -2555482 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1729 265 276 116 13 chr5 149982891 149983005 -2554254 + MLT1H1 LTR MaLR 109 251 -328 1 1729 696 331 35 55 chr5 149988444 149988792 -2548467 + MLT1F LTR MaLR 24 364 -184 1 1729 372 345 162 39 chr5 149989582 149989941 -2547318 + LTR79 LTR ERVL 94 496 -31 1 1729 805 221 23 6 chr5 149992347 149992520 -2544739 + MTE2a LTR MaLR 204 379 0 1 1729 296 270 144 0 chr5 150000856 150000967 -2536292 + MER21B LTR ERV1 107 233 -630 2 1729 3531 163 22 100 chr5 150001240 150002052 -2535207 + RMER6A LTR ERVK 8 756 0 3 1729 234 325 112 0 chr5 150002064 150002144 -2535115 + MER21B LTR ERV1 710 798 -65 2 1729 2478 152 60 35 chr5 150006304 150006817 -2530442 - RLTR11A2 LTR ERVK -1 526 1 1 1729 3475 28 0 10 chr5 150012176 150012574 -2524685 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 2 1729 506 301 82 47 chr5 150030229 150030735 -2506524 - RMER16-int LTR ERVK -1787 3619 3304 4 1729 506 270 108 47 chr5 150030755 150030820 -2506439 - RMER16-int LTR ERVK -2103 3303 3237 4 1729 992 145 13 103 chr5 150030840 150030939 -2506320 - RLTR9A LTR ERVK -251 186 92 5 1729 992 117 6 100 chr5 150031130 150031231 -2506028 - RLTR9A LTR ERVK -266 102 1 5 1729 353 266 29 57 chr5 150032293 150032516 -2504743 - IAP-d-int LTR ERVK -3495 3047 2906 5 1729 253 242 16 0 chr5 150033340 150033402 -2503857 - IAP-d-int LTR ERVK -5349 1904 1842 5 1729 2814 64 141 139 chr5 150034414 150034925 -2502334 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 5 1729 704 246 146 35 chr5 150035432 150035693 -2501566 + ORR1E LTR MaLR 36 325 -34 5 1729 1482 207 83 120 chr5 150035788 150036320 -2500939 + RLTR18B LTR ERVK 1 512 0 5 1729 2271 96 9 9 chr5 150037223 150037540 -2499719 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 5 5 1729 291 266 349 0 chr5 150038796 150038988 -2498271 - MLT1A LTR MaLR -104 270 1 6 1729 1248 115 120 26 chr5 150042387 150042547 -2494712 - RLTR15 LTR ERVK -104 255 75 7 1729 3498 36 35 9 chr5 150042547 150042972 -2494287 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 1729 1248 115 120 26 chr5 150042972 150043044 -2494215 - RLTR15 LTR ERVK -285 74 1 7 1729 285 213 0 47 chr5 150043044 150043099 -2494160 + MTEa LTR MaLR 328 379 0 7 1729 389 252 0 105 chr5 150046276 150046400 -2490859 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 8 1729 280 273 50 31 chr5 150046281 150046440 -2490819 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 593 8 1729 841 329 102 3 chr5 150046735 150047107 -2490152 + MLT1F LTR MaLR 88 496 -52 8 1729 351 309 10 10 chr5 150047365 150047463 -2489796 + MLT1H2 LTR MaLR 389 486 -3 9 1729 225 256 63 95 chr5 150048399 150048494 -2488765 - MLT1A1 LTR MaLR -66 342 251 9 1729 282 287 75 30 chr5 150049629 150049762 -2487497 + ORR1E LTR MaLR 59 197 -162 9 1729 253 330 8 113 chr5 150051173 150051306 -2485953 - MT2B LTR ERVL -326 275 157 1 1729 1120 201 228 7 chr5 150052822 150053098 -2484161 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 34 1 1729 2292 119 3 9 chr5 150053437 150053768 -2483491 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1729 528 359 57 64 chr5 150056677 150056975 -2480284 - MLT1C LTR MaLR -54 413 118 1 1729 3197 55 2 17 chr5 150061191 150061597 -2475662 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1729 247 170 57 19 chr5 150065991 150066052 -2471207 - ORR1E LTR MaLR 0 419 300 1 1729 1395 248 105 18 chr5 150066341 150066789 -2470470 - RMER5 LTR ERV1 -5 529 43 1 1729 377 296 18 36 chr5 150067824 150067989 -2469270 + ERVL-E-int LTR ERVL 2935 3096 -2571 1 1729 1775 137 78 36 chr5 150070075 150070462 -2466797 - RMER17C LTR ERVK 0 410 8 1 1729 690 299 130 50 chr5 150073457 150073884 -2463375 + MLT2B1 LTR ERVL 1 465 -55 1 1730 2704 110 35 7 chr5 150079440 150079844 -2457415 + MTC LTR MaLR 1 415 -6 1 1730 364 240 48 122 chr5 150086248 150086395 -2450864 - MT2B LTR ERVL -299 302 167 1 1730 694 284 57 28 chr5 150090114 150090397 -2446862 + MLT1D LTR MaLR 208 498 -7 1 1730 2118 126 25 16 chr5 150093948 150094271 -2442988 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 2 1730 900 280 75 38 chr5 150094327 150094620 -2442639 - MTE2a LTR MaLR -58 321 18 2 1730 2049 213 10 5 chr5 150096359 150096774 -2440485 + MTD LTR MaLR 3 419 0 2 1730 1568 171 101 16 chr5 150100434 150100847 -2436412 - MT2A LTR ERVL -40 493 9 2 1730 1189 218 23 8 chr5 150102546 150102809 -2434450 + ORR1D1 LTR MaLR 1 267 -107 2 1730 474 195 168 56 chr5 150102905 150103084 -2434175 - RMER21B LTR ERV1 -332 510 312 2 1730 260 323 10 29 chr5 150103109 150103211 -2434048 - RMER21B LTR ERV1 -649 193 94 2 1730 691 179 28 33 chr5 150103316 150103469 -2433790 + ORR1C2 LTR MaLR 188 384 0 2 1730 280 321 0 54 chr5 150104487 150104599 -2432660 - ORR1E LTR MaLR -77 302 197 2 1730 652 251 67 6 chr5 150104622 150104802 -2432457 - ORR1E LTR MaLR -168 191 1 2 1730 2445 137 160 63 chr5 150106146 150106670 -2430589 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 2 1730 239 239 0 66 chr5 150106808 150106884 -2430375 - ORR1E LTR MaLR -73 306 236 2 1730 1921 138 31 25 chr5 150107070 150107397 -2429862 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1730 419 311 68 53 chr5 150107471 150107661 -2429598 - ORR1E LTR MaLR -166 193 1 2 1730 924 249 47 130 chr5 150107766 150108105 -2429154 + MTD LTR MaLR 103 404 -15 2 1730 472 259 13 90 chr5 150109001 150109025 -2428234 + RMER17C LTR ERVK 183 203 -606 2 1730 1563 193 84 14 chr5 150109296 150109486 -2427773 + RMER17C LTR ERVK 1 213 -197 2 1730 1563 192 85 14 chr5 150109557 150109732 -2427527 + RMER17C LTR ERVK 214 390 -20 2 1730 1152 186 77 42 chr5 150117850 150118137 -2419122 - ORR1D1 LTR MaLR -67 307 11 2 1730 285 53 0 0 chr5 150119085 150119123 -2418136 + ORR1B1 LTR MaLR 351 388 -6 2 1730 1019 226 138 40 chr5 150119136 150119463 -2417796 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 1730 430 289 51 13 chr5 150121802 150121960 -2415299 - RMER15 LTR ERVL -7 568 405 2 1730 768 188 55 10 chr5 150121966 150122148 -2415111 + RMER17C LTR ERVK 1 192 -218 2 1730 768 188 55 10 chr5 150122184 150122200 -2415059 + RMER17C LTR ERVK 193 208 -202 2 1730 452 238 17 56 chr5 150123851 150123941 -2413318 + RMER17C LTR ERVK 1 84 -326 2 1730 452 238 17 56 chr5 150123991 150124035 -2413224 + RMER17C LTR ERVK 85 128 -282 2 1730 452 280 49 58 chr5 150124214 150124410 -2412849 + RMER17C LTR ERVK 129 376 -34 2 1730 638 243 166 13 chr5 150125420 150125649 -2411610 + RMER20B LTR ERVK 234 497 -130 2 1730 250 324 19 19 chr5 150125925 150126029 -2411230 + RMER20B LTR ERVK 499 602 -25 2 1730 239 259 0 17 chr5 150126462 150126521 -2410738 + MTEa LTR MaLR 13 70 -309 2 1730 621 243 107 23 chr5 150127006 150127221 -2410038 + MTEa LTR MaLR 147 379 0 2 1730 1819 132 71 51 chr5 150127845 150128196 -2409063 - MTC LTR MaLR -63 358 1 2 1730 480 205 143 0 chr5 150128209 150128321 -2408938 + MTEb LTR MaLR 4 131 -248 2 1730 3112 11 0 0 chr5 150129356 150129730 -2407529 - MT2_Mm LTR ERVL -119 374 1 2 1730 225 252 33 83 chr5 150129730 150129759 -2407500 - ORR1A3-int LTR MaLR -1350 613 591 2 1730 361 179 46 35 chr5 150129768 150129855 -2407404 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 2 1730 3326 22 0 0 chr5 150129855 150130255 -2407004 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 4961 2 1730 542 318 280 18 chr5 150130401 150130691 -2406568 - MLT1D LTR MaLR -117 388 23 2 1730 816 189 0 32 chr5 150136130 150136288 -2400971 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 294 2 1730 396 82 33 0 chr5 150136302 150136363 -2400896 - RLTR41 LTR ERV1 -383 63 1 2 1730 1225 142 64 0 chr5 150136617 150136835 -2400424 + ORR1B1 LTR MaLR 1 232 -162 2 1730 437 332 55 91 chr5 150143966 150144327 -2392932 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 2 1730 2162 130 76 5 chr5 150144596 150144966 -2392293 - MTC LTR MaLR -13 408 13 2 1730 317 282 88 104 chr5 150145032 150145214 -2392045 + MTE2a LTR MaLR 15 193 -186 2 1730 938 195 107 5 chr5 150145500 150145716 -2391543 - RMER20B LTR ERVK -212 415 178 2 1730 1577 214 61 92 chr5 150145832 150146054 -2391205 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 528 325 2 1730 1577 200 68 95 chr5 150146191 150146520 -2390739 - RLTR20B3 LTR ERVK -214 363 21 2 1730 655 211 0 45 chr5 150148099 150148233 -2389026 + MT2A LTR ERVL 1 128 -405 2 1730 2489 140 32 9 chr5 150148248 150148689 -2388570 - RMER13A LTR ERVK -407 453 3 3 1730 2054 72 113 0 chr5 150148920 150149212 -2388047 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 3 1730 2345 113 60 0 chr5 150153720 150154101 -2383158 - MTC LTR MaLR -7 414 11 3 1730 315 281 62 62 chr5 150154597 150154714 -2382545 + MTEb LTR MaLR 278 405 -14 3 1730 2566 47 44 3 chr5 150156531 150156892 -2380367 + MTB LTR MaLR 1 376 -24 3 1730 986 263 76 63 chr5 150158756 150159202 -2378057 - RMER13A LTR ERVK -407 453 2 3 1730 1869 174 23 51 chr5 150161466 150161660 -2375599 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 196 3 1730 1869 174 23 51 chr5 150162222 150162309 -2374950 - ORR1C2 LTR MaLR -195 189 101 3 1730 2099 137 3 55 chr5 150162309 150162673 -2374586 - ORR1A1 LTR MaLR -1 345 1 3 1730 1869 174 23 51 chr5 150162673 150162773 -2374486 - ORR1C2 LTR MaLR -284 100 1 3 1730 567 193 0 9 chr5 150163349 150163464 -2373795 - RMER20B LTR ERVK -46 581 468 3 1730 1526 199 112 99 chr5 150163508 150163964 -2373295 - RMER20B LTR ERVK -145 482 21 3 1730 922 58 0 0 chr5 150164195 150164315 -2372944 + ORR1A3 LTR MaLR 206 325 -1 3 1730 877 261 52 22 chr5 150164318 150164405 -2372854 + ORR1C2 LTR MaLR 98 185 -199 3 1730 877 261 52 22 chr5 150164434 150164577 -2372682 + ORR1C2 LTR MaLR 186 334 -50 3 1730 1553 226 40 63 chr5 150165015 150165480 -2371779 - RLTR11A LTR ERVK -16 512 17 3 1730 260 277 0 0 chr5 150170473 150170538 -2366721 + MTEa LTR MaLR 3 67 -312 3 1730 301 318 116 66 chr5 150170999 150171372 -2365887 - MLT1F2 LTR MaLR -1 568 201 3 1730 599 282 45 73 chr5 150172545 150172790 -2364469 + MER31B LTR ERV1 2 239 -227 3 1730 324 194 114 45 chr5 150173018 150173150 -2364109 + MTD LTR MaLR 6 195 -224 3 1730 324 274 0 0 chr5 150173155 150173228 -2364031 + MER31B LTR ERV1 393 465 -1 3 1730 381 277 83 15 chr5 150173692 150173824 -2363435 + MLT1A1 LTR MaLR 268 408 0 3 1730 232 295 142 61 chr5 150173907 150174055 -2363204 + LTR37B LTR ERV1 39 198 -270 3 1730 255 324 76 110 chr5 150175006 150175242 -2362017 + ORR1E LTR MaLR 96 323 -36 3 1730 232 222 44 0 chr5 150175846 150175891 -2361368 + MLT1M LTR MaLR 147 193 -479 3 1730 243 229 13 79 chr5 150176102 150176178 -2361081 + MER74A LTR ERVL 2 72 -486 3 1730 755 302 131 29 chr5 150176406 150176850 -2360409 + MER74A LTR ERVL 43 531 -27 3 1730 424 297 96 68 chr5 150185265 150185514 -2351745 - MLT1C LTR MaLR -14 453 198 3 1730 840 291 22 31 chr5 150185572 150185799 -2351460 + MTEa LTR MaLR 9 233 -146 3 1730 504 306 31 62 chr5 150185969 150186161 -2351098 + MTEa LTR MaLR 193 378 -1 3 1730 1166 140 11 0 chr5 150186772 150186950 -2350309 + ORR1C2 LTR MaLR 2 181 -193 3 1730 1219 153 39 15 chr5 150187040 150187246 -2350013 + ORR1C2 LTR MaLR 174 384 0 3 1730 504 237 88 37 chr5 150189895 150190031 -2347228 - MTD LTR MaLR -271 148 6 3 1730 3336 50 2 2 chr5 150190033 150190433 -2346826 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1730 2443 159 44 7 chr5 150190485 150190890 -2346369 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 3 1730 2133 148 27 24 chr5 150192726 150193135 -2344124 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 3 1730 258 221 10 173 chr5 150195584 150195688 -2341571 - MER57C2 LTR ERV1 -120 314 228 3 1730 2820 116 30 0 chr5 150195810 150196214 -2341045 + MTC LTR MaLR 6 421 0 3 1730 311 293 121 8 chr5 150196601 150196725 -2340534 - MER57C2 LTR ERV1 -264 170 33 3 1730 2517 69 25 0 chr5 150196797 150197116 -2340143 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1730 1500 247 107 18 chr5 150199109 150199493 -2337766 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 3 1730 2439 192 22 28 chr5 150199536 150200045 -2337214 + RMER20A LTR ERVK 11 516 0 3 1730 233 293 39 174 chr5 150200817 150200889 -2336370 + MER57D LTR ERV1 9 75 -336 3 1730 233 293 39 174 chr5 150201026 150201131 -2336128 + MER57D LTR ERV1 76 162 -249 3 1730 2527 113 8 11 chr5 150202485 150202853 -2334406 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 1730 1257 251 124 17 chr5 150203210 150203566 -2333693 - MTD LTR MaLR 0 419 26 3 1730 325 264 103 130 chr5 150204189 150204450 -2332809 + ORR1E LTR MaLR 1 254 -105 3 1730 542 240 16 0 chr5 150208273 150208394 -2328865 + ORR1D2 LTR MaLR 1 123 -247 4 216 301 331 25 75 chr5 150208382 150208581 -2328678 - MER74B LTR ERVL -75 547 359 4 1731 908 259 23 85 chr5 150208590 150208962 -2328297 + ORR1E LTR MaLR 1 314 -56 4 1731 984 284 70 90 chr5 150212335 150212485 -2324774 - MT2A LTR ERVL -136 397 244 4 1731 984 284 70 90 chr5 150212535 150212786 -2324473 - MT2A LTR ERVL -290 243 4 4 1731 413 275 49 14 chr5 150218634 150218778 -2318481 + RMER17C LTR ERVK 1 149 -261 4 1731 3145 123 141 40 chr5 150220958 150221699 -2315560 + RMER6A LTR ERVK 10 756 0 4 1731 1387 211 113 12 chr5 150223366 150223560 -2313699 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 173 4 1731 1387 211 113 12 chr5 150223611 150223762 -2313497 - ORR1C2 LTR MaLR -212 172 5 4 1731 2040 157 94 22 chr5 150225001 150225404 -2311855 - RLTR20C LTR ERVK -102 432 1 4 1731 332 195 157 12 chr5 150225952 150226035 -2311224 + RLTR20A LTR ERVK 447 541 0 4 1731 1840 159 202 25 chr5 150228451 150228554 -2308705 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 415 4 1731 2354 91 22 3 chr5 150228554 150228875 -2308384 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1731 1840 159 202 25 chr5 150228875 150229217 -2308042 - RLTR11A LTR ERVK -114 414 2 4 1731 3170 26 3 3 chr5 150234526 150234907 -2302352 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 16 4 1731 494 321 128 28 chr5 150235228 150235555 -2301704 + MLT2D LTR ERVL 1 360 -54 4 1731 501 304 138 13 chr5 150236125 150236450 -2300809 + MTEa LTR MaLR 4 379 0 4 1731 913 192 132 138 chr5 150236787 150237113 -2300146 + MTD LTR MaLR 22 345 -74 4 1731 1620 191 49 27 chr5 150246160 150246525 -2290734 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 4 1731 3347 106 12 6 chr5 150247277 150247781 -2289478 + RLTR28 LTR ERVL 4 510 -14 4 1731 760 266 80 55 chr5 150248959 150248979 -2288280 - ORR1D2 LTR MaLR -89 281 266 4 1731 760 266 80 55 chr5 150249163 150249412 -2287847 - ORR1D2 LTR MaLR -105 265 3 4 1731 1245 278 64 9 chr5 150255486 150255831 -2281428 + MTE2b LTR MaLR 15 378 -1 5 1731 417 289 295 44 chr5 150258761 150258992 -2278267 + MTEa LTR MaLR 68 356 -3 5 1731 2317 169 122 0 chr5 150259956 150260178 -2277081 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 229 -298 5 1731 2317 169 122 0 chr5 150260233 150260476 -2276783 + RLTR11A2 LTR ERVK 230 522 -5 5 1731 511 289 60 85 chr5 150261113 150261496 -2275763 + ORR1E LTR MaLR 10 370 -4 5 1731 3180 54 23 3 chr5 150270757 150271149 -2266110 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1731 820 276 119 55 chr5 150275101 150275462 -2261797 - RLTR12B LTR ERVK -134 394 11 5 1731 2094 82 7 4 chr5 150280614 150280895 -2256364 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 105 5 1731 393 378 53 45 chr5 150280932 150281289 -2255970 + LTR73 LTR ERV1 68 427 -145 5 1731 761 265 21 18 chr5 150283813 150284047 -2253212 + ORR1D2 LTR MaLR 5 245 -133 5 1731 615 171 63 34 chr5 150284374 150284530 -2252729 + ORR1D2 LTR MaLR 200 364 -3 5 1731 3164 68 0 12 chr5 150288512 150288917 -2248342 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1731 293 381 89 25 chr5 150288917 150289187 -2248072 - MLT1L LTR MaLR -300 310 20 5 1731 1686 214 71 6 chr5 150289560 150289899 -2247360 + ORR1D2 LTR MaLR 1 361 -9 5 1731 566 296 43 43 chr5 150290473 150290657 -2246602 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 370 5 1731 265 333 138 12 chr5 150291096 150291263 -2245996 - MLT1H LTR MaLR -337 212 25 5 1731 270 309 50 30 chr5 150295180 150295280 -2241979 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 306 5 1731 278 181 44 44 chr5 150297130 150297201 -2240058 - MTEa LTR MaLR -20 359 289 5 1731 2246 148 62 0 chr5 150301256 150301627 -2235632 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1731 1746 175 168 53 chr5 150302394 150302793 -2234466 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 2 6 1731 1462 207 83 81 chr5 150307992 150308412 -2228847 - RMER16 LTR ERVK 0 533 113 6 1731 252 256 23 58 chr5 150310407 150310494 -2226765 + MT2B2 LTR ERVL 156 239 -345 6 1731 327 299 61 102 chr5 150310750 150311121 -2226138 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 1 6 1731 433 260 23 68 chr5 150315445 150315577 -2221682 - MLT1A LTR MaLR -243 131 6 6 1731 1875 215 29 24 chr5 150317728 150318200 -2219059 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 692 0 6 1731 272 136 0 22 chr5 150318219 150318264 -2218995 - ORR1E LTR MaLR -47 323 280 6 1731 535 234 155 46 chr5 150318669 150318772 -2218487 - ORR1E LTR MaLR -106 253 125 6 1731 2063 124 58 23 chr5 150318772 150319118 -2218141 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 2 6 1731 535 234 155 46 chr5 150319118 150319233 -2218026 - ORR1E LTR MaLR -235 124 11 6 1731 272 300 25 0 chr5 150319932 150320012 -2217247 + MLT2B3 LTR ERVL 2 83 -471 6 1731 434 247 77 64 chr5 150320409 150320565 -2216694 + MTD LTR MaLR 241 398 -21 6 1731 1695 223 36 19 chr5 150323027 150323438 -2213821 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 6 1731 800 262 79 115 chr5 150324064 150324482 -2212777 - MTD LTR MaLR -15 404 2 6 1731 1693 125 74 33 chr5 150329932 150330196 -2207063 + RMER17C LTR ERVK 2 262 -148 6 1731 1693 125 74 33 chr5 150330247 150330345 -2206914 + RMER17C LTR ERVK 263 379 -31 6 1731 876 246 156 27 chr5 150331920 150332254 -2205005 - RMER17C LTR ERVK -32 378 2 6 1731 1649 150 3 100 chr5 150333607 150333926 -2203333 - ORR1B1 LTR MaLR -66 328 41 6 1731 1931 168 7 116 chr5 150336018 150336442 -2200817 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1731 486 239 7 51 chr5 150336650 150336787 -2200472 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 240 6 1731 378 319 107 48 chr5 150337086 150337396 -2199863 - ORR1E LTR MaLR -24 335 8 6 1731 1091 202 95 49 chr5 150337655 150338017 -2199242 + RLTR20C LTR ERVK 2 479 -99 6 1731 523 209 142 45 chr5 150338072 150338156 -2199103 + RLTR20C LTR ERVK 480 577 -1 6 1732 377 311 48 105 chr5 150341201 150341496 -2195763 - ORR1E LTR MaLR -81 278 1 6 1732 3742 102 73 23 chr5 150341753 150342325 -2194934 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 6 1732 3841 107 25 4 chr5 150342557 150343111 -2194148 - RMER2 LTR ERV1 -1 566 1 6 1732 499 228 73 40 chr5 150345101 150345192 -2192067 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 492 6 1732 499 228 73 40 chr5 150345219 150345278 -2191981 - RLTR20C LTR ERVK -87 491 425 6 1732 1046 204 156 22 chr5 150345274 150345550 -2191709 - RLTR20C LTR ERVK -221 313 1 6 1732 2460 107 50 5 chr5 150345962 150346185 -2191074 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 158 6 1732 2460 107 50 5 chr5 150346285 150346438 -2190821 - ORR1B1 LTR MaLR -237 157 1 6 1732 2417 120 30 28 chr5 150348566 150348959 -2188300 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1732 1761 149 48 31 chr5 150349506 150349859 -2187400 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 6 1732 3178 41 21 53 chr5 150350069 150350503 -2186756 - BGLII LTR ERVK 0 421 2 6 1732 3419 202 31 49 chr5 150350505 150351161 -2186098 - RMER3D-int LTR ERVK -1 2841 2185 6 1732 2131 115 183 35 chr5 150351161 150351538 -2185721 - RLTR10C LTR ERVK -3 433 1 6 1732 3419 202 31 49 chr5 150351538 150351802 -2185457 - RMER3D-int LTR ERVK -658 2184 1937 6 1732 1909 158 36 122 chr5 150351807 150352282 -2184977 - RMER3D-int LTR ERVK -1146 1696 1263 6 1732 673 124 38 0 chr5 150352707 150352799 -2184460 + RMER3D-int LTR ERVK 489 584 -2258 6 1732 673 124 38 0 chr5 150352918 150352930 -2184329 + RMER3D-int LTR ERVK 585 596 -2246 6 1732 600 133 29 2 chr5 150352936 150353047 -2184212 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1102 -1740 6 1732 2936 78 19 2 chr5 150353153 150353566 -2183693 - BGLII LTR ERVK -1 420 1 7 1732 1858 218 72 22 chr5 150356463 150356923 -2180336 - RLTR16 LTR ERVK -22 483 1 7 1732 692 295 63 41 chr5 150357230 150357577 -2179682 + RMER10A LTR ERVL 51 433 -9 7 1732 1485 180 59 28 chr5 150359370 150359696 -2177563 - MTD LTR MaLR -12 407 83 7 1732 265 268 123 18 chr5 150359722 150359836 -2177423 + MLT1A0 LTR MaLR 221 346 -19 7 1732 632 253 36 59 chr5 150360209 150360451 -2176808 - RLTR12B LTR ERVK -299 229 9 7 1732 1679 213 76 16 chr5 150361287 150361669 -2175590 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1732 627 270 120 37 chr5 150362191 150362536 -2174723 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 423 -18 7 1732 235 250 33 16 chr5 150364339 150364400 -2172859 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1446 402 341 7 1732 1889 143 100 72 chr5 150365081 150365484 -2171775 + RMER10A LTR ERVL 1 412 -30 7 1732 1889 143 100 72 chr5 150365648 150365674 -2171585 + RMER10A LTR ERVL 413 441 -1 7 1732 421 219 0 40 chr5 150367492 150367592 -2169667 + MTD LTR MaLR 1 96 -323 7 1732 582 158 10 19 chr5 150367569 150367672 -2169587 + MTD LTR MaLR 304 405 -14 7 1732 3386 72 47 21 chr5 150372175 150372645 -2164614 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 7 1732 397 261 25 50 chr5 150373427 150373548 -2163711 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 291 7 1732 1375 136 19 5 chr5 150373990 150374205 -2163054 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 177 7 1732 285 293 12 128 chr5 150374383 150374555 -2162704 + ORR1E LTR MaLR 161 312 -47 7 1732 469 325 71 87 chr5 150374594 150374812 -2162447 - MLT1B LTR MaLR -15 375 160 7 1732 469 325 71 87 chr5 150374864 150375026 -2162233 - MLT1B LTR MaLR -231 159 2 7 1732 2253 147 41 20 chr5 150381030 150381420 -2155839 - MTC LTR MaLR -23 398 1 7 1732 374 312 97 42 chr5 150382220 150382364 -2154895 - MTE2b LTR MaLR -17 362 211 7 1732 536 254 137 137 chr5 150382469 150382724 -2154535 - MTE2b LTR MaLR -124 255 1 7 1732 332 237 51 39 chr5 150382725 150382828 -2154431 + MLT1C LTR MaLR 274 414 -53 7 1732 306 326 77 66 chr5 150384482 150384741 -2152518 - ORR1E LTR MaLR 0 359 98 7 1732 2556 133 16 42 chr5 150387661 150388093 -2149166 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1732 544 300 137 96 chr5 150388762 150389048 -2148211 - MLT1A LTR MaLR -20 354 56 7 1732 544 300 137 96 chr5 150389215 150389263 -2147996 - MLT1A LTR MaLR -319 55 6 7 1732 2000 148 53 6 chr5 150389806 150390145 -2147114 - RLTR15 LTR ERVK -1 358 4 7 1732 241 268 18 0 chr5 150393248 150393304 -2143955 - MLT1A LTR MaLR -270 104 48 7 1732 1737 212 73 103 chr5 150393776 150393932 -2143327 + RMER20A LTR ERVK 11 155 -361 7 1732 1737 212 73 103 chr5 150393962 150394276 -2142983 + RMER20A LTR ERVK 156 466 -50 7 1732 1737 212 73 103 chr5 150394311 150394361 -2142898 + RMER20A LTR ERVK 467 515 -1 7 1732 3811 73 17 55 chr5 150394757 150395289 -2141970 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 8 1732 2016 149 92 6 chr5 150397259 150397584 -2139675 + RLTR41 LTR ERV1 93 445 -1 8 1732 421 298 116 82 chr5 150399154 150399446 -2137813 + RLTR11B LTR ERVK 99 460 -68 8 1732 276 304 138 66 chr5 150399615 150399642 -2137617 + RLTR11B LTR ERVK 461 482 -46 8 1732 558 312 129 35 chr5 150400234 150400576 -2136683 - MLT1A LTR MaLR 0 374 1 8 1732 954 204 37 7 chr5 150400876 150401104 -2136155 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 813 1006 -1320 8 1732 1257 237 49 38 chr5 150401104 150401472 -2135787 + RLTR11A LTR ERVK 188 528 0 8 1732 384 306 97 7 chr5 150403190 150403335 -2133924 - ORR1D2 LTR MaLR -83 287 130 8 1732 343 280 0 0 chr5 150403319 150403394 -2133865 - ORR1D2 LTR MaLR -179 191 117 8 1732 272 234 31 0 chr5 150403720 150403784 -2133475 - ORR1D2 LTR MaLR -250 120 55 8 1732 2780 117 0 26 chr5 150403790 150404210 -2133049 + MTC LTR MaLR 5 413 -8 8 1732 1577 150 254 29 chr5 150404213 150404486 -2132773 + MTC-int LTR MaLR 2 520 -738 8 1732 1577 175 214 58 chr5 150404676 150404910 -2132349 + MTC-int LTR MaLR 521 829 -429 8 1732 657 182 63 35 chr5 150404910 150405052 -2132207 - RMER19C LTR ERVK 0 611 466 8 1732 1507 160 108 129 chr5 150405052 150405136 -2132123 - RMER16 LTR ERVK 0 533 494 8 1732 1507 160 108 129 chr5 150405284 150405586 -2131673 - RMER16 LTR ERVK -40 493 155 8 1732 1329 255 39 57 chr5 150405605 150406012 -2131247 - RMER19C LTR ERVK -211 400 1 8 1732 1314 145 33 5 chr5 150406012 150406227 -2131032 + MTC-int LTR MaLR 824 1044 -214 8 1732 2018 123 79 6 chr5 150406221 150406549 -2130710 - RMER20A LTR ERVK -164 352 1 8 1732 582 186 7 85 chr5 150407176 150407329 -2129930 + MTC-int LTR MaLR 1118 1258 0 8 1732 1989 153 135 8 chr5 150407885 150408255 -2129004 + MTC LTR MaLR 5 421 0 8 1732 368 244 184 1 chr5 150415218 150415415 -2121844 + MLT1D LTR MaLR 268 467 0 8 1732 340 202 9 152 chr5 150435842 150435854 -2101405 + MT2B LTR ERVL 153 237 -359 8 1732 325 279 143 64 chr5 150441623 150441937 -2095322 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 21 8 1732 277 284 41 41 chr5 150444032 150444153 -2093106 + MLT1K LTR MaLR 154 274 -321 8 1732 670 204 102 32 chr5 150445317 150445386 -2091873 + RLTR20A2 LTR ERVK 411 479 -99 8 1732 670 204 102 32 chr5 150445433 150445520 -2091739 + RLTR20A2 LTR ERVK 480 577 -1 8 1732 1641 228 60 28 chr5 150447403 150447465 -2089794 - MTD LTR MaLR 0 419 359 8 1732 3117 44 39 3 chr5 150447465 150447849 -2089410 - MTB LTR MaLR -2 398 1 9 1732 1641 228 60 28 chr5 150447849 150448183 -2089076 - MTD LTR MaLR -61 358 10 8 1732 1845 158 148 11 chr5 150451112 150451490 -2085769 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 9 1732 1192 169 19 100 chr5 150453171 150453399 -2083860 - RLTR11B LTR ERVK -10 443 236 9 1732 1192 283 47 116 chr5 150453425 150453573 -2083686 - RLTR11B LTR ERVK -237 290 156 9 1732 895 109 2 44 chr5 150454153 150454305 -2082954 - RLTR11B LTR ERVK -372 155 2 9 1732 1436 189 135 77 chr5 150455148 150455497 -2081762 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 6 9 1732 4588 53 2 14 chr5 150455926 150456497 -2080762 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 9 1732 2245 111 50 186 chr5 150457213 150457735 -2079524 + RLTR11B LTR ERVK 3 453 0 9 1732 1129 272 130 0 chr5 150458252 150458575 -2078684 + ORR1D2 LTR MaLR 1 365 -5 9 1732 354 271 166 51 chr5 150459482 150459657 -2077602 + MTC LTR MaLR 1 195 -164 9 1732 339 197 0 0 chr5 150459679 150459740 -2077519 - MTD LTR MaLR 0 419 359 9 1732 3450 23 5 18 chr5 150459740 150460141 -2077118 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1732 2597 73 11 3 chr5 150460141 150460498 -2076761 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 360 -738 9 1732 391 97 113 0 chr5 150460475 150460537 -2076722 - MT-int LTR MaLR -704 394 326 9 1732 865 182 117 6 chr5 150460879 150461050 -2076209 + MTC LTR MaLR 232 421 0 9 1732 921 170 57 15 chr5 150461143 150461437 -2075822 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 9 1732 852 215 13 219 chr5 150461617 150462093 -2075166 + RMER17C LTR ERVK 1 378 -32 9 1732 603 296 48 14 chr5 150462168 150462377 -2074882 - LTR48B LTR ERV1 -280 364 149 9 1732 966 251 122 42 chr5 150466695 150467007 -2070252 + MER21B LTR ERV1 1 337 -526 9 1732 657 261 151 26 chr5 150467647 150467879 -2069380 + MER21B LTR ERV1 479 739 -124 9 1732 250 354 56 60 chr5 150468904 150469264 -2067995 - MTEb LTR MaLR 0 379 4 9 1733 266 215 15 30 chr5 150471115 150471182 -2066077 + MTE2b LTR MaLR 294 359 -20 9 1733 240 312 43 86 chr5 150471510 150471650 -2065609 - RLTR41 LTR ERV1 -62 384 251 9 1733 2320 223 26 54 chr5 150473039 150473230 -2064029 + RMER15 LTR ERVL 12 191 -384 9 1733 2320 223 26 54 chr5 150473483 150473868 -2063391 + RMER15 LTR ERVL 192 571 -4 9 1733 1047 198 107 100 chr5 150474652 150475024 -2062235 - MTE2a LTR MaLR -13 406 18 9 1733 3192 143 33 128 chr5 150476648 150477369 -2059890 - RMER6A LTR ERVK 0 756 104 9 1733 389 256 106 62 chr5 150484072 150484251 -2053008 + MLT1J LTR MaLR 242 428 -84 9 1733 312 340 0 11 chr5 150484385 150484480 -2052779 - LTR84a LTR ERVL -2 755 662 9 1733 2548 80 6 0 chr5 150485420 150485745 -2051514 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1733 1717 188 79 79 chr5 150489190 150489300 -2047959 + MTD LTR MaLR 5 116 -303 9 1733 1717 188 79 79 chr5 150489334 150489402 -2047857 + MTD LTR MaLR 117 208 -211 9 1733 1717 188 79 79 chr5 150489586 150489811 -2047448 + MTD LTR MaLR 209 408 -11 9 1733 1557 199 118 6 chr5 150490005 150490369 -2046890 - MTD LTR MaLR -14 405 1 9 1733 237 283 8 124 chr5 150493442 150493482 -2043777 - MT2B2 LTR ERVL -424 160 135 9 1733 1177 211 135 33 chr5 150497083 150497417 -2039842 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 1 1733 1712 87 0 9 chr5 150499336 150499568 -2037691 + ORR1A3 LTR MaLR 1 230 -96 1 1733 556 227 0 0 chr5 150503846 150503956 -2033303 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 299 1 1733 475 207 68 115 chr5 150504761 150504842 -2032417 - MT2B LTR ERVL -447 154 83 1 1733 1961 134 89 20 chr5 150504889 150505239 -2032020 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1733 248 284 169 11 chr5 150505264 150505353 -2031906 + LTRIS_Mm LTR ERV1 293 395 -87 1 1733 1663 229 72 16 chr5 150508158 150508544 -2028715 + MTD LTR MaLR 5 412 -7 2 1733 521 319 58 84 chr5 150510531 150510877 -2026382 - ORR1E LTR MaLR -20 339 3 2 1733 270 243 28 14 chr5 150510954 150511025 -2026234 + MTEb LTR MaLR 293 364 -15 2 1733 335 355 126 21 chr5 150511081 150511320 -2025939 - MLT1B LTR MaLR -125 265 2 3 1733 395 250 107 6 chr5 150520306 150520483 -2016776 - MTD LTR MaLR -65 354 129 5 1733 770 217 16 43 chr5 150520520 150520744 -2016515 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 158 5 1733 549 278 35 107 chr5 150521026 150521187 -2016072 - ORR1D2 LTR MaLR -187 183 20 5 1733 549 278 35 107 chr5 150521378 150521413 -2015846 - ORR1D2 LTR MaLR -351 19 1 5 1733 268 198 25 193 chr5 150522073 150522192 -2015067 - MT2B LTR ERVL -351 250 152 5 1733 1558 189 67 30 chr5 150525334 150525653 -2011606 + ORR1D1 LTR MaLR 1 337 -37 7 1733 1558 189 67 30 chr5 150525842 150525882 -2011377 + ORR1D1 LTR MaLR 338 373 -1 7 1733 290 206 44 0 chr5 150525933 150526001 -2011258 + ORR1D1 LTR MaLR 291 361 -13 7 1733 3915 83 54 4 chr5 150533021 150533555 -2003704 - LTRIS2 LTR ERV1 -3 561 1 8 1733 295 297 129 0 chr5 150534725 150534826 -2002433 + RLTR40 LTR ERVK 651 764 -53 9 1733 664 128 10 0 chr5 150536592 150536694 -2000565 - ORR1D1 LTR MaLR -266 108 6 9 1733 3280 163 132 92 chr5 150536906 150537779 -1999480 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 9 1733 1581 232 94 5 chr5 150540490 150540863 -1996396 - MTD LTR MaLR 0 419 14 1 1733 232 258 82 51 chr5 150540892 150540990 -1996269 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -903 286 186 1 1733 249 291 13 26 chr5 150548308 150548352 -1988907 - ORR1B1-int LTR MaLR -863 646 605 1 1733 495 99 56 0 chr5 150548850 150548921 -1988338 - MTD LTR MaLR -9 410 336 1 1733 315 211 89 59 chr5 150554288 150554389 -1982870 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 305 1 1733 1038 215 91 73 chr5 150556024 150556391 -1980868 - MTD LTR MaLR -14 405 8 1 1733 2019 148 58 0 chr5 150558704 150559069 -1978190 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 1733 1216 209 157 18 chr5 150569443 150569774 -1967485 + MTD LTR MaLR 12 388 -31 1 1733 358 235 0 12 chr5 150571854 150571936 -1965323 - MLT1D LTR MaLR -314 191 111 1 1733 235 65 0 0 chr5 150572682 150572713 -1964546 - RMER2 LTR ERV1 0 567 537 1 1733 3179 73 34 42 chr5 150572979 150573481 -1963778 - RMER2 LTR ERV1 -69 498 1 1 1733 717 272 87 138 chr5 150574028 150574420 -1962839 - MTE2b LTR MaLR 0 379 8 1 1733 2479 86 3 0 chr5 150575577 150575903 -1961356 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1733 1842 160 74 30 chr5 150577167 150577560 -1959699 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 1733 1454 212 7 14 chr5 150579604 150579998 -1957261 + MT2A LTR ERVL 1 438 -95 1 1733 1655 196 179 35 chr5 150582452 150582938 -1954321 + RMER19B LTR ERVK 347 902 0 1 1733 331 340 0 91 chr5 150583321 150583496 -1953763 + MLT1A0 LTR MaLR 5 163 -202 2 1733 577 245 113 89 chr5 150584614 150584896 -1952363 + MTD LTR MaLR 74 362 -57 2 1733 635 245 0 0 chr5 150585307 150585446 -1951813 - MTE-int LTR MaLR -313 1267 1129 2 1733 906 233 53 80 chr5 150585973 150586395 -1950864 - RMER2 LTR ERV1 -21 546 35 2 1733 1490 196 65 43 chr5 150587619 150587806 -1949453 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 177 2 1733 1490 196 65 43 chr5 150587831 150588012 -1949247 - ORR1C1 LTR MaLR -202 176 1 2 1733 2488 170 116 38 chr5 150592536 150593069 -1944190 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 2 1733 2346 102 29 24 chr5 150593130 150593510 -1943749 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 2 1733 402 317 24 89 chr5 150593512 150593758 -1943501 + MLT1F2 LTR MaLR 265 494 -66 2 1733 491 241 80 7 chr5 150595171 150595309 -1941950 + MLT1A0 LTR MaLR 218 365 0 2 1734 2015 179 134 25 chr5 150604618 150605075 -1932184 + RMER4B LTR ERVK 1 505 -80 2 1734 2015 179 134 25 chr5 150605104 150605168 -1932091 + RMER4B LTR ERVK 506 578 -7 2 1734 377 336 141 83 chr5 150605287 150605910 -1931349 + MLT2F LTR ERVL 3 661 -2 2 1734 6041 51 9 21 chr5 150612091 150612919 -1924340 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 20 2 1734 247 293 110 26 chr5 150619526 150619680 -1917579 - LTR86C LTR ERVL -39 582 416 2 1734 745 100 52 44 chr5 150626175 150626311 -1910948 + RMER10A LTR ERVL 6 142 -300 2 1734 2548 142 87 19 chr5 150629604 150630086 -1907173 - RLTR28 LTR ERVL -6 518 4 2 1734 1040 162 0 62 chr5 150630789 150630919 -1906340 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 258 2 1734 1040 162 0 62 chr5 150630964 150631043 -1906216 - ORR1C2 LTR MaLR -127 257 188 2 1734 1717 136 50 20 chr5 150631089 150631389 -1905870 - RLTR28 LTR ERVL -215 309 1 2 1734 601 183 164 56 chr5 150633372 150633560 -1903699 + ORR1D1 LTR MaLR 5 211 -156 2 1734 772 181 139 45 chr5 150633650 150633852 -1903407 + ORR1D1 LTR MaLR 154 374 0 2 1734 1790 171 97 33 chr5 150635736 150636128 -1901131 + MTD LTR MaLR 3 419 0 2 1734 3446 28 18 0 chr5 150636630 150637023 -1900236 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1734 4452 117 90 114 chr5 150637209 150638180 -1899079 + RMER21A LTR ERV1 1 947 0 2 1734 2361 122 66 3 chr5 150639395 150639757 -1897502 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 10 2 1734 277 321 32 46 chr5 150642754 150642907 -1894352 - LTR16D LTR ERVL -206 445 304 3 1734 1596 237 77 5 chr5 150645897 150646275 -1890984 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 1734 287 308 186 31 chr5 150646462 150646639 -1890620 + RMER20B LTR ERVK 197 419 -208 3 1734 4744 225 38 37 chr5 150646645 150647423 -1889836 - MERVK26-int LTR ERVK -5658 1261 475 3 1734 4744 225 38 37 chr5 150647461 150647887 -1889372 - MERVK26-int LTR ERVK -6445 474 57 3 1734 305 269 107 150 chr5 150648200 150648480 -1888779 - RLTR26 LTR ERVK -207 435 168 3 1734 641 255 56 6 chr5 150649058 150649220 -1888039 - MLT2C2 LTR ERVL -58 406 237 3 1734 438 273 34 101 chr5 150650120 150650299 -1886960 - MLT1B LTR MaLR -220 170 4 3 1734 1348 193 161 0 chr5 150650519 150650830 -1886429 + ORR1D1 LTR MaLR 1 361 -13 3 1734 2445 69 3 0 chr5 150652563 150652881 -1884378 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 1734 269 335 95 45 chr5 150655565 150655787 -1881472 + ORR1E LTR MaLR 32 264 -95 3 1734 1209 250 113 12 chr5 150656691 150657027 -1880232 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1734 2232 171 18 3 chr5 150658747 150659135 -1878124 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1734 2728 160 81 0 chr5 150660800 150661249 -1876010 + MT2A LTR ERVL 1 460 -73 3 1734 2728 160 81 0 chr5 150661295 150661338 -1875921 + MT2A LTR ERVL 461 531 -2 3 1734 226 349 68 78 chr5 150661543 150661748 -1875511 - ORR1C2 LTR MaLR -90 294 92 3 1734 1222 257 76 31 chr5 150662312 150662666 -1874593 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1734 231 326 0 32 chr5 150663466 150663561 -1873698 - MLT1A1 LTR MaLR -25 383 292 3 1734 384 298 55 20 chr5 150663821 150664044 -1873215 + MLT1D LTR MaLR 75 382 -123 3 1734 1751 139 117 5 chr5 150667212 150667581 -1869678 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 3 1734 252 208 0 182 chr5 150668096 150668184 -1869075 + MT2B LTR ERVL 167 238 -363 3 1734 924 215 156 30 chr5 150674211 150674548 -1862711 + RLTR11A LTR ERVK 10 386 -142 3 1734 924 215 156 30 chr5 150674584 150674611 -1862648 + RLTR11A LTR ERVK 387 419 -109 3 1734 1975 136 30 13 chr5 150674637 150675032 -1862227 + RMER17C LTR ERVK 1 402 -8 3 1734 251 224 65 76 chr5 150675025 150675117 -1862142 + RLTR11A LTR ERVK 432 522 -6 3 1734 1591 133 47 67 chr5 150675744 150675878 -1861381 - RMER17C LTR ERVK 0 410 279 3 1734 1591 136 38 61 chr5 150675929 150676284 -1860975 - RMER17C LTR ERVK -520 438 1 3 1734 649 236 56 9 chr5 150677319 150677522 -1859737 + ORR1C2 LTR MaLR 162 384 0 3 1734 3186 63 2 5 chr5 150677581 150677981 -1859278 + MTB LTR MaLR 2 400 0 3 1734 964 206 43 66 chr5 150678189 150678538 -1858721 + RLTR15 LTR ERVK 3 343 -16 3 1734 1172 245 46 79 chr5 150680228 150680492 -1856767 - ORR1D2 LTR MaLR -14 356 87 3 1734 1172 245 46 79 chr5 150680711 150680814 -1856445 - ORR1D2 LTR MaLR -284 86 1 3 1734 2133 155 171 11 chr5 150681092 150681756 -1855503 - RMER13A LTR ERVK -89 771 1 3 1734 466 236 109 99 chr5 150682917 150683138 -1854121 + MTC LTR MaLR 6 228 -193 3 1734 961 241 183 9 chr5 150689210 150689533 -1847726 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 3 1734 1454 198 76 48 chr5 150691070 150691467 -1845792 + MTD LTR MaLR 12 419 0 4 1734 2014 189 100 53 chr5 150691789 150692218 -1845041 + RMER15 LTR ERVL 1 452 -123 4 1734 2014 189 100 53 chr5 150692286 150692405 -1844854 + RMER15 LTR ERVL 453 574 -1 4 1734 2280 172 57 57 chr5 150695241 150695278 -1841981 + RLTR12A LTR ERVK 12 48 -520 4 1734 2280 172 57 57 chr5 150695465 150695975 -1841284 + RLTR12A LTR ERVK 49 559 -9 4 1734 259 221 169 0 chr5 150699667 150699744 -1837515 - MLT1J1 LTR MaLR -107 337 248 4 1734 3326 176 103 89 chr5 150700379 150701315 -1835944 + RMER19B LTR ERVK 1 896 -6 4 1734 2115 105 62 17 chr5 150701554 150701625 -1835634 + ORR1B1 LTR MaLR 1 67 -327 4 1734 2149 94 26 62 chr5 150701625 150701966 -1835293 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1734 2115 112 60 25 chr5 150701966 150702274 -1834985 + ORR1B1 LTR MaLR 68 377 -2 4 1734 1554 198 83 29 chr5 150703835 150704183 -1833076 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 4 1734 3173 141 21 23 chr5 150704746 150704989 -1832270 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 328 4 1734 3369 33 8 5 chr5 150704989 150705388 -1831871 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1734 3173 141 21 23 chr5 150705388 150705709 -1831550 - RLTR20D LTR ERVK -241 327 5 4 1734 470 217 167 0 chr5 150706770 150706908 -1830351 + ORR1D1 LTR MaLR 4 164 -210 4 1734 623 162 21 25 chr5 150708419 150708603 -1828656 - ORR1B2 LTR MaLR -178 168 7 4 1734 1461 150 6 192 chr5 150714052 150714366 -1822893 - RMER17C LTR ERVK 0 410 183 4 1734 1461 150 6 192 chr5 150714540 150714729 -1822530 - RMER17C LTR ERVK -228 182 1 4 1734 807 345 60 21 chr5 150718387 150718805 -1818454 + MLT1F LTR MaLR 97 530 -18 4 1734 3457 45 35 9 chr5 150724390 150724815 -1812444 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1734 1743 218 68 37 chr5 150725043 150725525 -1811734 + RLTR11A2 LTR ERVK 6 502 -25 4 1734 1512 200 68 26 chr5 150727837 150728388 -1808871 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 16 4 1734 2235 148 52 17 chr5 150728530 150728935 -1808324 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1734 463 290 51 1 chr5 150730294 150730459 -1806800 - MLT1B LTR MaLR -17 391 225 4 1734 535 273 8 0 chr5 150730459 150730587 -1806672 + MTE2b LTR MaLR 3 131 -248 4 1734 283 216 51 63 chr5 150730590 150730669 -1806590 + MTE2b LTR MaLR 293 370 -9 4 1734 269 304 34 17 chr5 150730679 150730796 -1806463 - MLT1B LTR MaLR -175 215 97 4 1734 377 277 9 26 chr5 150731119 150731234 -1806025 - MLT1B LTR MaLR -277 113 1 4 1735 705 148 70 19 chr5 150734882 150735040 -1802219 - MTD LTR MaLR 0 419 254 4 1735 783 271 24 108 chr5 150738160 150738569 -1798690 - MTEa LTR MaLR -4 375 1 4 1735 1746 210 94 43 chr5 150738693 150739192 -1798067 + RMER19C LTR ERVK 67 609 -2 4 1735 818 272 16 4 chr5 150740266 150740510 -1796749 + ORR1D2 LTR MaLR 122 368 -2 4 1735 871 259 70 103 chr5 150744248 150744618 -1792641 + MTE2a LTR MaLR 19 376 -3 4 1735 435 208 128 3 chr5 150745021 150745173 -1792086 - RLTR11A LTR ERVK -337 190 1 4 1735 800 318 111 25 chr5 150747576 150747973 -1789286 - MLT2B2 LTR ERVL -82 433 3 5 1735 289 309 37 9 chr5 150749916 150750024 -1787235 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2263 3451 3341 5 1735 552 287 68 54 chr5 150755834 150756153 -1781106 - MLT1B LTR MaLR -8 459 79 5 1735 520 318 103 26 chr5 150761272 150761650 -1775609 - MER57D LTR ERV1 0 411 5 5 1735 238 332 54 45 chr5 150764110 150764311 -1772948 - MLT2B1 LTR ERVL -207 347 151 5 1735 292 187 63 25 chr5 150764468 150764555 -1772704 + ORR1D2 LTR MaLR 159 250 -120 5 1735 1819 168 42 20 chr5 150765182 150765583 -1771676 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1735 643 244 88 42 chr5 150766063 150766163 -1771096 + RLTR15 LTR ERVK 1 111 -248 5 1735 643 244 88 42 chr5 150766197 150766404 -1770855 + RLTR15 LTR ERVK 112 322 -37 5 1735 3215 56 18 0 chr5 150766685 150767078 -1770181 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1735 1465 176 94 31 chr5 150769145 150769497 -1767762 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1735 366 224 41 0 chr5 150770762 150770860 -1766399 - RMER15 LTR ERVL -112 463 362 5 1735 367 320 90 0 chr5 150771040 150771140 -1766119 - RMER15-int LTR ERVL -3 4996 4888 5 1735 992 294 44 19 chr5 150771194 150771513 -1765746 - RMER15-int LTR ERVL -351 4648 4322 5 1735 1601 241 3 40 chr5 150772839 150773219 -1764040 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 5 1735 344 298 157 51 chr5 150773281 150773497 -1763762 + MTC LTR MaLR 137 375 -46 5 1735 317 202 38 12 chr5 150778324 150778404 -1758855 + MER89 LTR ERV1 1 82 -477 5 1735 3754 72 87 19 chr5 150778897 150779425 -1757834 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 5 1735 226 350 10 98 chr5 150779894 150780097 -1757162 - MLT1N2 LTR MaLR -280 282 98 5 1735 1668 151 148 0 chr5 150780521 150780852 -1756407 + ORR1B1 LTR MaLR 7 386 -8 5 1735 866 244 60 60 chr5 150782619 150782955 -1754304 + ERVL-B4-int LTR ERVL 5155 5490 -224 5 1735 535 288 214 55 chr5 150783164 150783528 -1753731 + MLT2B1 LTR ERVL 11 432 -88 5 1735 1054 249 132 5 chr5 150787070 150787441 -1749818 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 5 1735 236 329 142 7 chr5 150793982 150794123 -1743136 + RMER21B LTR ERV1 408 567 -275 5 1735 1180 219 132 9 chr5 150796031 150796371 -1740888 - MTD LTR MaLR 0 419 38 5 1735 1740 161 66 20 chr5 150797507 150797685 -1739574 - RMER17C LTR ERVK 0 410 226 5 1735 1740 161 66 20 chr5 150797741 150797954 -1739305 - RMER17C LTR ERVK -185 225 2 5 1735 1315 181 142 11 chr5 150800625 150800983 -1736276 - MTD LTR MaLR -14 405 1 5 1735 1164 225 61 24 chr5 150803597 150803893 -1733366 + MTD LTR MaLR 19 325 -94 5 1735 3011 41 3 0 chr5 150803990 150804381 -1732878 + MTB LTR MaLR 1 392 -8 5 1735 1501 97 267 18 chr5 150804937 150805089 -1732170 - RMER17C LTR ERVK -3 407 180 5 1735 1501 97 267 18 chr5 150805138 150805311 -1731948 - RMER17C LTR ERVK -231 179 1 5 1735 635 301 48 31 chr5 150808344 150808697 -1728562 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 6 1735 2102 112 51 0 chr5 150811152 150811464 -1725795 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 6 1735 422 97 0 0 chr5 150812943 150813005 -1724254 - MTEb LTR MaLR -3 376 315 6 1735 871 277 105 0 chr5 150813314 150813552 -1723707 - MTEa LTR MaLR -116 263 1 6 1735 1238 308 80 21 chr5 150813565 150814195 -1723064 - MTEa-int LTR MaLR -8 1572 1000 6 1735 917 162 0 0 chr5 150816715 150816882 -1720377 + ORR1C2 LTR MaLR 2 168 -216 6 1735 671 168 48 8 chr5 150816951 150817077 -1720182 + ORR1C2 LTR MaLR 249 379 -5 6 1735 1635 155 60 34 chr5 150828781 150828998 -1708261 + RMER17C LTR ERVK 19 413 -545 6 1735 1635 147 66 32 chr5 150829078 150829269 -1707990 + RMER17C LTR ERVK 213 409 -1 6 1735 1688 127 211 133 chr5 150834062 150834551 -1702708 - RLTR24 LTR ERV1 -2 527 1 6 1735 2145 120 38 46 chr5 150835954 150836346 -1700913 - RMER10B LTR ERVL 0 398 10 6 1735 931 202 120 18 chr5 150857913 150858205 -1679054 - ORR1D2 LTR MaLR -34 336 3 6 1735 225 276 0 38 chr5 150861006 150861085 -1676174 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 321 6 216 4240 36 32 0 chr5 150863744 150864247 -1673012 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 7 1736 1599 175 17 17 chr5 150864517 150864866 -1672393 - RLTR15 LTR ERVK -9 350 2 7 1736 1643 118 87 93 chr5 150873262 150873618 -1663641 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 7 1736 259 303 0 0 chr5 150875678 150875754 -1661505 - MLT1B LTR MaLR -261 129 54 7 1736 301 238 48 0 chr5 150882930 150883014 -1654245 - RMER17C LTR ERVK -29 381 294 7 1736 397 266 6 53 chr5 150883026 150883197 -1654062 - RMER17C LTR ERVK -247 163 1 7 1736 531 254 36 0 chr5 150885756 150885894 -1651365 + MTD LTR MaLR 6 148 -271 7 1736 727 196 26 84 chr5 150885909 150886182 -1651077 + RMER17B LTR ERVK 183 439 -519 7 1736 975 186 54 51 chr5 150886222 150886556 -1650703 + RMER17C LTR ERVK 76 410 0 7 1736 604 246 139 24 chr5 150886556 150886762 -1650497 + MTD LTR MaLR 162 391 -28 7 1736 970 244 148 19 chr5 150888180 150888498 -1648761 + MTD LTR MaLR 46 404 -15 7 1736 1498 208 75 36 chr5 150888934 150889294 -1647965 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1736 755 207 84 145 chr5 150897275 150897663 -1639596 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 7 1736 5153 132 73 44 chr5 150897663 150898571 -1638688 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 4473 7 1736 1991 56 3 21 chr5 150902767 150903058 -1634201 + MTB LTR MaLR 61 346 -54 7 1736 404 318 93 16 chr5 150905087 150905333 -1631926 + MLT1C LTR MaLR 4 268 -199 7 1736 3044 36 0 29 chr5 150907068 150907444 -1629815 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 7 1736 919 203 6 0 chr5 150911187 150911369 -1625890 - ORR1D1 LTR MaLR -19 355 173 7 1736 2772 137 83 8 chr5 150911369 150911812 -1625447 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 96 7 1736 1964 181 94 2 chr5 150911812 150912216 -1625043 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 7 1736 2772 137 83 8 chr5 150912216 150912300 -1624959 - RLTR12A LTR ERVK -473 95 2 7 1736 1017 128 12 6 chr5 150912302 150912475 -1624784 - ORR1D1 LTR MaLR -200 174 1 7 1736 232 253 11 57 chr5 150914549 150914637 -1622622 + MER77 LTR ERVL 523 606 -1 7 1736 889 249 75 82 chr5 150916463 150916682 -1620577 - MTD LTR MaLR 0 419 214 7 1736 889 249 75 82 chr5 150916891 150917086 -1620173 - MTD LTR MaLR -206 213 8 7 1736 368 212 12 12 chr5 150924718 150924799 -1612460 - MTD LTR MaLR 0 379 299 8 1736 1373 198 126 42 chr5 150924808 150925188 -1612071 + MTD LTR MaLR 8 419 0 8 1736 921 254 50 29 chr5 150925188 150925468 -1611791 - MTD LTR MaLR -88 331 46 8 1736 387 291 7 15 chr5 150925753 150925889 -1611370 - RMER15 LTR ERVL -13 562 428 8 1736 257 242 16 0 chr5 150928447 150928509 -1608750 - MER74B LTR ERVL -502 120 58 8 1736 870 219 67 118 chr5 150929085 150929368 -1607891 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 120 8 1736 870 219 67 118 chr5 150929411 150929532 -1607727 - ORR1C2 LTR MaLR -265 119 1 8 1736 253 256 121 57 chr5 150935826 150935967 -1601292 - MTD LTR MaLR -15 404 255 8 1736 1787 196 60 8 chr5 150937184 150937570 -1599689 - MTD LTR MaLR -13 406 1 8 1736 2551 114 45 5 chr5 150942170 150942549 -1594710 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 8 1736 2083 67 70 0 chr5 150950962 150951260 -1585999 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 1736 710 254 5 16 chr5 150952054 150952242 -1585017 - MTD LTR MaLR -38 381 196 8 1736 246 239 28 0 chr5 150953149 150953220 -1584039 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 298 8 1736 419 158 30 40 chr5 150956003 150956102 -1581157 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 333 8 1736 948 248 27 56 chr5 150958665 150959030 -1578229 + ORR1E LTR MaLR 1 338 -32 8 1736 405 282 27 9 chr5 150962507 150962618 -1574641 - MLT1D LTR MaLR -356 149 37 8 1736 364 141 0 14 chr5 150965869 150965941 -1571318 - RMER19B LTR ERVK -831 71 1 8 1736 1098 226 69 6 chr5 150968474 150968796 -1568463 + MTD LTR MaLR 7 411 -8 8 1736 2845 48 2 46 chr5 150981760 150982170 -1555089 + MTB LTR MaLR 1 392 -8 9 1737 1960 165 68 0 chr5 151000789 151001141 -1536118 + ORR1C1 LTR MaLR 1 376 -2 3 1737 2153 88 3 15 chr5 151012327 151012651 -1524608 + ORR1A3 LTR MaLR 7 326 0 2 1737 1406 177 147 7 chr5 151027226 151027533 -1509726 - MTD LTR MaLR -69 350 1 6 1737 2090 62 10 3 chr5 151028085 151028375 -1508884 + ORR1A2 LTR MaLR 36 327 0 6 1737 468 305 65 119 chr5 151033667 151034054 -1503205 - RMER20B LTR ERVK -28 599 234 8 1737 261 315 41 0 chr5 151034902 151034975 -1502284 - MLT1A LTR MaLR -135 492 417 8 1737 452 267 30 86 chr5 151035133 151035330 -1501929 - MLT1A LTR MaLR -151 223 38 8 1737 1186 176 84 84 chr5 151037390 151037761 -1499498 - RMER10B LTR ERVL -24 374 4 9 1737 2460 93 9 0 chr5 151041683 151042007 -1495252 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1737 3324 50 2 2 chr5 151043110 151043510 -1493749 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1737 385 200 19 57 chr5 151045527 151045633 -1491626 - MLT1B LTR MaLR -274 116 15 1 1737 373 253 53 67 chr5 151047061 151047269 -1489990 - RLTR15 LTR ERVK -154 205 1 1 1737 3509 34 0 132 chr5 151051549 151052051 -1485208 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1737 1013 236 80 4 chr5 151052373 151052637 -1484622 + MTD LTR MaLR 1 284 -135 1 1737 796 269 61 22 chr5 151055595 151055872 -1481387 - ORR1E LTR MaLR -38 321 34 1 1737 337 298 104 123 chr5 151067602 151068016 -1469243 + RMER10A LTR ERVL 12 417 -25 1 1737 2082 107 58 0 chr5 151071291 151071601 -1465658 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 1 1737 1537 204 91 28 chr5 151074780 151075142 -1462117 + MTD LTR MaLR 3 387 -32 1 1737 253 304 130 120 chr5 151080536 151080812 -1456447 - ORR1D2 LTR MaLR -67 303 25 1 1737 1111 219 151 76 chr5 151084349 151084719 -1452540 - MTD LTR MaLR -14 405 8 1 1737 1274 238 87 3 chr5 151084798 151085131 -1452128 + ORR1D2 LTR MaLR 8 368 -2 2 1737 476 223 142 17 chr5 151085153 151085373 -1451886 - MTEb LTR MaLR -3 376 96 2 1737 363 248 19 65 chr5 151085439 151085547 -1451712 - MTEb LTR MaLR -276 103 1 2 1737 1320 229 40 63 chr5 151087241 151087619 -1449640 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 3 2 1737 261 326 21 52 chr5 151087648 151087745 -1449514 - RMER20B LTR ERVK -38 589 496 2 1737 693 214 110 30 chr5 151087757 151087968 -1449291 - MTD LTR MaLR -177 230 14 2 1737 2705 34 3 60 chr5 151110944 151111291 -1425968 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 2 1737 1390 107 19 0 chr5 151111982 151112198 -1425061 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 175 2 1737 747 219 156 0 chr5 151113326 151113518 -1423741 - MTD LTR MaLR 0 419 198 2 1737 444 220 204 0 chr5 151116889 151117021 -1420238 + ORR1B1 LTR MaLR 235 393 -1 2 1737 885 224 168 43 chr5 151117135 151117415 -1419844 - ORR1D2 LTR MaLR -55 315 1 2 1738 2057 87 25 19 chr5 151127545 151127861 -1409398 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 3 1738 2067 203 52 55 chr5 151129371 151129950 -1407309 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 1 3 1738 246 324 66 7 chr5 151132104 151132241 -1405018 - LTR37A LTR ERV1 -194 232 88 3 1738 1222 229 170 0 chr5 151132917 151133275 -1403984 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1738 1783 136 12 36 chr5 151136915 151137244 -1400015 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 1738 1688 217 56 0 chr5 151140928 151141301 -1395958 - MTD LTR MaLR -14 405 12 3 1738 307 235 87 19 chr5 151153413 151153517 -1383742 - MLT1B LTR MaLR -16 374 264 3 1738 284 264 68 41 chr5 151153534 151153680 -1383579 - MLT1B LTR MaLR -176 214 65 3 1738 2728 158 33 10 chr5 151154906 151155422 -1381837 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 1738 2793 142 69 28 chr5 151159290 151159798 -1377461 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 3 1738 1557 204 103 29 chr5 151162953 151163332 -1373927 - MTD LTR MaLR 0 419 13 3 1738 3331 38 10 2 chr5 151165119 151165516 -1371743 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1738 899 250 55 143 chr5 151165593 151165931 -1371328 + MTC LTR MaLR 6 293 -128 3 1738 5282 97 155 18 chr5 151165931 151166770 -1370489 - RMER17B LTR ERVK -4 954 1 3 1738 899 250 55 143 chr5 151166770 151166884 -1370375 + MTC LTR MaLR 294 417 -4 3 1738 3384 35 2 2 chr5 151174338 151174737 -1362522 - MTB LTR MaLR -1 399 1 4 1738 2297 136 61 27 chr5 151176339 151176746 -1360513 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1738 2496 119 5 48 chr5 151190447 151190863 -1346396 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 4 1738 3478 28 8 0 chr5 151195583 151195980 -1341279 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1738 2466 106 70 13 chr5 151199840 151200213 -1337046 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1738 268 340 62 8 chr5 151203943 151204126 -1333133 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 169 4 1738 301 304 152 30 chr5 151205473 151205670 -1331589 - ORR1E LTR MaLR -130 229 9 4 1738 2718 35 45 3 chr5 151206939 151207317 -1329942 - MTB LTR MaLR 0 400 7 4 1738 229 181 206 14 chr5 151214158 151214231 -1323028 - MER101B LTR ERV1 -196 374 288 4 1738 226 181 206 14 chr5 151214489 151214562 -1322697 - MER101B LTR ERV1 -196 374 288 4 1738 1668 181 64 25 chr5 151218013 151218371 -1318888 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 4 1738 1147 228 58 68 chr5 151221484 151221898 -1315361 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 1738 232 219 15 45 chr5 151222273 151222340 -1314919 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 323 5 1738 346 242 32 174 chr5 151224896 151225086 -1312173 + MT2B LTR ERVL 102 264 -337 5 1738 2842 163 41 12 chr5 151226835 151227345 -1309914 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 1 5 1738 2293 127 83 19 chr5 151245155 151245546 -1291713 - RMER6A LTR ERVK 0 756 339 5 1738 2293 127 83 19 chr5 151245580 151245607 -1291652 - RMER6A LTR ERVK -418 338 311 5 1738 718 105 137 0 chr5 151245827 151245951 -1291308 - RLTR11B LTR ERVK -312 141 1 5 1738 276 283 43 26 chr5 151254488 151254604 -1282655 - ORR1E LTR MaLR -210 149 32 5 1738 398 209 27 16 chr5 151255512 151255558 -1281701 + MT2B LTR ERVL 122 165 -419 5 1738 2027 166 21 19 chr5 151256595 151256970 -1280289 + MTC LTR MaLR 41 416 -5 6 1739 498 250 235 55 chr5 151258731 151259032 -1278227 - RMER5 LTR ERV1 0 534 179 6 1739 307 221 69 11 chr5 151259227 151259314 -1277945 - RMER5 LTR ERV1 -401 133 42 6 1739 451 169 45 60 chr5 151265636 151265837 -1271422 + RMER17C LTR ERVK 77 274 -136 6 1739 2519 124 46 22 chr5 151267286 151267697 -1269562 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1739 508 245 70 46 chr5 151274963 151275131 -1262128 - MTD LTR MaLR -5 414 202 6 1739 2149 156 52 6 chr5 151275369 151275718 -1261541 - ORR1C1 LTR MaLR -13 365 1 6 1739 3407 25 8 0 chr5 151276316 151276709 -1260550 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1739 9301 31 6 1 chr5 151276709 151277802 -1259457 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1739 3396 25 8 0 chr5 151277802 151278195 -1259064 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1739 2310 122 88 0 chr5 151278535 151278897 -1258362 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1739 1458 236 84 11 chr5 151282057 151282438 -1254821 - MTD LTR MaLR -6 413 5 6 1739 1715 174 61 25 chr5 151286838 151287232 -1250027 - MTD LTR MaLR 0 419 12 6 1739 3395 55 0 0 chr5 151289099 151289499 -1247760 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1739 3826 146 52 21 chr5 151293869 151294540 -1242719 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 6 1739 3504 180 36 45 chr5 151294586 151295435 -1241824 - RMER3D-int LTR ERVK -21 2821 1980 6 1739 4092 182 14 67 chr5 151295443 151296532 -1240727 - RMER3D-int LTR ERVK -990 1852 377 6 1739 415 191 43 51 chr5 151296541 151296679 -1240580 - RMER3D-int LTR ERVK -1692 1150 1014 6 1739 1207 242 108 38 chr5 151296746 151297118 -1240141 - RMER3D-int LTR ERVK -2365 477 70 6 1739 1207 242 108 38 chr5 151297264 151297337 -1239922 - RMER3D-int LTR ERVK -2773 69 1 6 1739 602 186 69 35 chr5 151297337 151297482 -1239777 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 543 6 1739 1172 141 95 47 chr5 151301949 151302202 -1235057 - RLTR19 LTR ERVK -232 267 3 7 1739 250 225 183 53 chr5 151304160 151304329 -1232930 - MTE-int LTR MaLR -61 1519 1329 7 1739 681 296 105 30 chr5 151304911 151305337 -1231922 - MTE-int LTR MaLR -1192 543 41 7 1739 4569 67 3 28 chr5 151307234 151307836 -1229423 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 7 1739 442 172 23 108 chr5 151312520 151312650 -1224609 + MT2B LTR ERVL 146 264 -337 7 1739 1732 168 63 129 chr5 151318625 151319098 -1218161 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 7 1739 675 215 39 11 chr5 151322397 151322576 -1214683 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 340 7 1739 724 279 74 74 chr5 151322819 151323016 -1214243 - RMER5 LTR ERV1 -191 343 143 7 1739 724 279 74 74 chr5 151323164 151323291 -1213968 - RMER5 LTR ERV1 -392 142 19 7 1739 2991 23 6 3 chr5 151329428 151329773 -1207486 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 8 1739 13834 52 29 1 chr5 151329773 151331515 -1205744 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 8 1739 3045 20 3 3 chr5 151331515 151331861 -1205398 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 8 1739 4193 123 68 41 chr5 151364472 151365208 -1172051 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 8 1739 1319 183 3 101 chr5 151367616 151367858 -1169401 - RMER6C LTR ERVK -90 600 373 8 1739 1319 183 3 101 chr5 151367895 151368028 -1169231 - RMER6C LTR ERVK -318 372 262 8 1740 2171 151 39 31 chr5 151413576 151413992 -1123267 + MTC LTR MaLR 3 421 0 9 1740 643 249 186 19 chr5 151432154 151432412 -1104847 - MLT1-int LTR MaLR -55 1316 1016 9 1740 2192 92 6 0 chr5 151435208 151435525 -1101734 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 9 1740 696 237 78 14 chr5 151435857 151436075 -1101184 + RMER12 LTR ERVK 10 241 -1081 9 1740 3155 216 240 28 chr5 151436223 151437103 -1100156 + RLTR22_Mur LTR ERVK 225 1323 -525 9 1740 3155 216 240 28 chr5 151437140 151437567 -1099692 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1324 1809 -39 9 1740 790 315 70 26 chr5 151451735 151452048 -1085211 + ORR1E LTR MaLR 33 359 0 1 1740 294 240 185 49 chr5 151457660 151457822 -1079437 - MLT1D LTR MaLR -247 258 75 1 1740 285 236 156 99 chr5 151459264 151459405 -1077854 + LTR82A LTR ERVL 83 231 -641 1 1740 294 312 73 46 chr5 151459492 151459643 -1077616 + LTR82A LTR ERVL 424 578 -294 1 1740 2830 90 52 21 chr5 151466375 151466795 -1070464 - RLTR1D LTR ERV1 -16 589 157 1 1740 2912 104 25 51 chr5 151469690 151470178 -1067081 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1740 1239 200 190 145 chr5 151470396 151470864 -1066395 + MT2B LTR ERVL 1 567 -34 1 1740 293 135 0 71 chr5 151470898 151470954 -1066305 + MT2B LTR ERVL 531 582 -2 1 1740 647 324 103 53 chr5 151472526 151472993 -1064266 + MLT1D LTR MaLR 1 490 -15 1 1740 237 243 114 61 chr5 151475852 151475966 -1061293 + RLTR25B LTR ERVK 435 554 -474 1 1740 405 326 137 35 chr5 151489611 151489808 -1047451 + MLT1F LTR MaLR 4 220 -328 1 1740 355 292 19 9 chr5 151489810 151489917 -1047342 - LTR40a LTR ERVL -13 506 399 1 1740 703 275 141 1 chr5 151493371 151493670 -1043589 - ERVL-B4-int LTR ERVL -390 5324 5032 1 1740 424 294 88 14 chr5 151495266 151495414 -1041845 - MLT1H LTR MaLR -300 249 91 1 1740 242 302 0 44 chr5 151499540 151499630 -1037629 + MT2B LTR ERVL 155 240 -361 1 1740 558 142 203 8 chr5 151503971 151504099 -1033160 - RMER15 LTR ERVL -405 170 18 1 1740 2667 106 96 11 chr5 151505973 151506411 -1030848 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1740 27134 89 38 23 chr5 151506411 151506927 -1030332 + MERVL-int LTR ERVL 1 531 -4954 1 1740 27134 89 38 23 chr5 151506989 151510531 -1026728 + MERVL-int LTR ERVL 532 4180 -1305 1 1740 3339 41 5 0 chr5 151512085 151512479 -1024780 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1740 1493 141 0 17 chr5 151516660 151516898 -1020361 + ORR1A2 LTR MaLR 1 234 -93 3 1741 1440 221 82 18 chr5 151521334 151521674 -1015585 - MTEb LTR MaLR -17 362 1 4 1741 848 272 128 40 chr5 151522827 151523271 -1013988 - RMER5 LTR ERV1 -19 515 33 4 1741 408 301 151 50 chr5 151526227 151526591 -1010668 + RMER10A LTR ERVL 27 427 -15 5 1741 1001 114 135 122 chr5 151534838 151535068 -1002191 - ORR1B1 LTR MaLR -115 279 47 7 1741 1520 196 53 83 chr5 151535467 151535809 -1001450 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 54 7 1741 1520 196 53 83 chr5 151535846 151535899 -1001360 - ORR1C2 LTR MaLR -331 53 1 7 1741 864 280 28 77 chr5 151538181 151538506 -998753 - MLT2B2 LTR ERVL -8 507 199 7 1741 700 251 197 41 chr5 151540569 151540935 -996324 - BGLII_B LTR ERVK -1 440 18 8 1741 2232 171 104 13 chr5 151545715 151546178 -991081 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 9 1741 2024 157 74 62 chr5 151549618 151550066 -987193 - RMER4A LTR ERVK -12 454 2 1 1741 795 249 84 5 chr5 151550246 151550436 -986823 - MTEb LTR MaLR -174 205 1 1 1741 1286 210 81 31 chr5 151562575 151562934 -974325 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 1 1741 268 300 75 0 chr5 151568890 151568970 -968289 - MTEb LTR MaLR -15 364 279 1 1741 920 371 151 37 chr5 151569289 151570482 -966777 - ORR1D-int LTR MaLR -7 1502 48 1 1741 348 303 170 0 chr5 151574945 151575133 -962126 - RMER15 LTR ERVL -14 561 342 1 1741 1936 169 50 39 chr5 151575769 151576206 -961053 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 1 1741 323 340 78 37 chr5 151580190 151580434 -956825 - MLT1J2 LTR MaLR -189 259 6 1 1741 442 304 52 52 chr5 151585245 151585477 -951782 - MLT1A0 LTR MaLR -131 234 3 1 1741 545 204 22 22 chr5 151588222 151588402 -948857 - RMER17C LTR ERVK -136 274 95 1 1741 328 212 0 241 chr5 151597947 151597984 -939275 - MT2B LTR ERVL -316 285 259 1 1741 328 212 0 241 chr5 151598174 151598273 -938986 - MT2B LTR ERVL -343 258 182 1 1741 403 261 84 8 chr5 151601242 151601373 -935886 - MLT1A LTR MaLR -233 141 1 1 1741 3389 25 5 0 chr5 151604590 151604983 -932276 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 2 1741 9340 20 8 4 chr5 151604983 151606076 -931183 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 1741 3511 13 5 0 chr5 151606076 151606470 -930789 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1741 2186 78 165 6 chr5 151609061 151609424 -927835 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1741 456 282 84 33 chr5 151615815 151616127 -921132 - ORR1E LTR MaLR 0 379 28 2 1741 1448 268 168 14 chr5 151616129 151616766 -920493 - ORR1E-int LTR MaLR -42 1538 804 2 1741 795 295 164 16 chr5 151616817 151617178 -920081 - ORR1E-int LTR MaLR -924 656 241 2 1741 314 257 14 0 chr5 151617617 151617687 -919572 - ORR1E-int LTR MaLR -1505 75 5 2 1741 376 291 145 74 chr5 151617691 151618015 -919244 - ORR1E LTR MaLR 0 374 14 2 1741 1167 185 136 33 chr5 151619312 151619642 -917617 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 3 2 1741 334 169 0 30 chr5 151621454 151621521 -915738 - MTEa LTR MaLR -7 372 308 2 1741 892 247 202 36 chr5 151621728 151622169 -915090 - RMER13A LTR ERVK -312 548 35 2 1741 277 250 339 0 chr5 151622216 151622384 -914875 - MTEa LTR MaLR -115 264 40 2 1741 776 162 80 4 chr5 151622730 151622935 -914324 + ORR1B1 LTR MaLR 26 246 -121 2 1741 3431 28 5 0 chr5 151626227 151626621 -910638 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1741 498 112 90 29 chr5 151627664 151627779 -909480 - MTC LTR MaLR -13 406 272 2 1741 1974 104 131 3 chr5 151627779 151628116 -909143 + ORR1B1 LTR MaLR 1 380 -14 2 1741 805 261 23 107 chr5 151628130 151628439 -908820 - MTC LTR MaLR -137 284 2 2 1741 1341 214 52 22 chr5 151629106 151629469 -907790 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1741 1337 205 91 67 chr5 151630436 151630886 -906373 + RLTR11A LTR ERVK 15 475 -53 2 1741 572 274 106 63 chr5 151633942 151634292 -902967 - MT2A LTR ERVL -2 531 167 2 1741 719 289 151 0 chr5 151638015 151638320 -898939 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 13 2 1741 933 198 233 64 chr5 151638488 151638865 -898394 - RMER10A LTR ERVL -1 441 1 2 1741 559 201 63 28 chr5 151643815 151643958 -893301 + MTD LTR MaLR 13 160 -259 2 1741 393 337 92 16 chr5 151644044 151644228 -893031 + MLT1F2 LTR MaLR 363 560 0 2 1741 763 288 133 1 chr5 151645691 151645985 -891274 + MTE2b LTR MaLR 1 351 -28 2 1742 370 184 33 33 chr5 151650920 151651010 -886249 + MLT1A1 LTR MaLR 299 388 -20 2 1742 2146 170 16 11 chr5 151651034 151651408 -885851 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 2 1742 2525 153 15 72 chr5 151653452 151653995 -883264 + RMER20A LTR ERVK 5 516 0 3 1742 448 139 105 0 chr5 151654062 151654148 -883111 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 290 3 1742 2558 96 51 182 chr5 151654281 151654397 -882862 + RLTR47_MM LTR ERV1 2 115 -417 3 1742 2558 96 51 182 chr5 151654554 151654647 -882612 + RLTR47_MM LTR ERV1 116 126 -406 3 1742 2558 96 51 182 chr5 151654800 151655200 -882059 + RLTR47_MM LTR ERV1 127 532 0 3 1742 937 219 25 54 chr5 151658198 151658478 -878781 + RMER15 LTR ERVL 292 563 -12 3 1742 1940 135 87 8 chr5 151660437 151660795 -876464 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 1742 305 308 81 27 chr5 151662494 151662706 -874553 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1842 3919 3662 3 1742 254 320 30 30 chr5 151663064 151663164 -874095 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2543 3171 3072 3 1742 2376 167 27 10 chr5 151666710 151667121 -870138 + MTC LTR MaLR 4 421 0 3 1742 452 346 73 6 chr5 151667136 151667313 -869946 - MLT1I LTR MaLR -91 320 132 3 1742 241 272 103 52 chr5 151667836 151667933 -869326 - LTR40c LTR ERVL -83 382 281 3 1742 1817 125 25 60 chr5 151668924 151669239 -868020 + ORR1A3 LTR MaLR 23 326 0 3 1742 229 310 32 89 chr5 151669936 151670060 -867199 + MLT1C LTR MaLR 64 180 -287 3 1742 455 336 56 17 chr5 151670778 151671011 -866248 - RMER15 LTR ERVL 0 575 334 3 1742 2586 131 42 7 chr5 151673064 151673142 -864117 + RLTR28 LTR ERVL 1 86 -438 3 1742 2586 131 42 7 chr5 151673171 151673524 -863735 + RLTR28 LTR ERVL 87 446 -78 3 1742 1438 183 104 123 chr5 151673536 151674096 -863163 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 549 -4 3 1742 419 252 131 64 chr5 151675959 151676272 -860987 + RMER17C LTR ERVK 28 361 -49 3 1742 494 133 0 0 chr5 151676424 151676499 -860760 + RLTR16 LTR ERVK 1 75 -430 3 1742 274 125 39 59 chr5 151676652 151676703 -860556 + RLTR16 LTR ERVK 60 109 -396 3 1742 245 175 0 0 chr5 151676867 151676907 -860352 + RLTR16 LTR ERVK 96 135 -370 3 1742 1777 201 34 20 chr5 151677632 151678085 -859174 + RMER15 LTR ERVL 35 557 -18 3 1742 284 280 52 10 chr5 151678324 151678427 -858832 + MLT1J LTR MaLR 30 178 -334 3 1742 279 333 116 48 chr5 151678657 151678846 -858413 + MLT1J LTR MaLR 308 509 -101 3 1742 1646 183 45 117 chr5 151680070 151680473 -856786 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1742 347 295 83 8 chr5 151681286 151681419 -855840 + ORR1E LTR MaLR 1 143 -216 3 1742 259 256 23 68 chr5 151681638 151681726 -855533 + MLT1A1 LTR MaLR 320 403 -5 3 1742 2577 157 198 4 chr5 151682542 151683053 -854206 + RMER19C LTR ERVK 1 610 -1 3 1742 1077 279 18 82 chr5 151683096 151683424 -853835 + ORR1E LTR MaLR 1 307 -52 3 1742 292 246 0 0 chr5 151683467 151683532 -853727 + ORR1E LTR MaLR 315 379 0 3 1742 2784 168 44 10 chr5 151684920 151685424 -851835 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 7 3 1742 1397 232 113 49 chr5 151687102 151687588 -849671 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 2 3 1742 433 244 52 134 chr5 151687929 151688161 -849098 - ORR1E LTR MaLR -53 306 94 3 1742 2532 115 9 78 chr5 151688191 151688614 -848645 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1742 522 282 190 24 chr5 151688952 151689199 -848060 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 78 3 1742 868 254 79 20 chr5 151689209 151689470 -847789 + MTD LTR MaLR 1 272 -147 3 1742 2622 200 69 16 chr5 151689470 151689564 -847695 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 483 3 1742 2622 200 69 16 chr5 151689602 151690055 -847204 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 3 3 1742 701 203 35 7 chr5 151690055 151690190 -847069 + MTD LTR MaLR 281 419 0 3 1742 270 328 111 7 chr5 151690895 151691030 -846229 - ORR1E LTR MaLR -210 149 1 3 1742 1301 157 137 23 chr5 151692492 151692890 -844369 - RMER17C LTR ERVK -517 441 19 4 1742 460 247 25 139 chr5 151694287 151694334 -842925 + MER34A1 LTR ERV1 4 40 -547 4 1742 1813 152 75 18 chr5 151694334 151694722 -842537 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1742 460 247 25 139 chr5 151694722 151694876 -842383 + MER34A1 LTR ERV1 41 182 -405 4 1742 369 149 0 56 chr5 151694975 151695046 -842213 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 304 4 1742 972 238 27 31 chr5 151695557 151695864 -841395 + BGLII_B LTR ERVK 124 441 0 4 1742 1098 264 43 83 chr5 151695864 151696163 -841096 - ORR1D2 LTR MaLR -65 305 20 4 1742 526 241 149 16 chr5 151697449 151697558 -839701 + MT2A LTR ERVL 309 462 -71 4 1742 526 232 158 7 chr5 151697611 151697658 -839601 + MT2A LTR ERVL 463 530 -3 4 1742 732 236 116 15 chr5 151698375 151698660 -838599 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 24 4 1742 2867 49 90 3 chr5 151698662 151699028 -838231 - MTB LTR MaLR -2 398 1 4 1742 618 51 0 0 chr5 151699037 151699115 -838144 - ORR1D2 LTR MaLR -260 147 70 4 1742 1085 231 58 50 chr5 151699585 151699845 -837414 - MTE2b LTR MaLR -46 333 72 4 1742 272 188 159 34 chr5 151699883 151699971 -837288 - MLT1J LTR MaLR -181 331 233 4 1742 1401 198 18 18 chr5 151706583 151706856 -830403 + MTD LTR MaLR 14 286 -133 4 1742 1825 153 84 43 chr5 151706844 151707167 -830092 - RMER13B LTR ERVK -9 899 582 4 1742 1825 153 84 43 chr5 151707201 151707294 -829965 - RMER13B LTR ERVK -327 581 467 4 1742 641 264 36 57 chr5 151707298 151707584 -829675 + MTEb LTR MaLR 1 343 -36 4 1742 230 314 27 45 chr5 151707727 151707837 -829422 + MTEa LTR MaLR 272 379 0 4 1742 1099 229 205 7 chr5 151711872 151712175 -825084 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 7 4 1742 1625 207 84 20 chr5 151717585 151717979 -819280 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1742 363 315 73 12 chr5 151718023 151718187 -819072 - ERVL-E-int LTR ERVL -631 5036 4863 4 1742 267 331 71 19 chr5 151718722 151718876 -818383 - ERVL-E-int LTR ERVL -1378 4383 4222 4 1742 2034 133 46 46 chr5 151719322 151719732 -817527 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 1742 379 207 22 44 chr5 151726079 151726201 -811058 + MLT2D LTR ERVL 75 196 -268 4 1742 248 282 56 45 chr5 151726185 151726222 -811037 + MLT2D LTR ERVL 465 503 -57 4 1742 248 282 56 45 chr5 151726280 151726331 -810928 + MLT2D LTR ERVL 504 554 -6 4 1742 580 209 29 23 chr5 151726609 151726776 -810483 + ORR1D2 LTR MaLR 1 164 -206 4 1742 1918 184 41 63 chr5 151726747 151727141 -810118 + RLTR41 LTR ERV1 62 446 0 4 1742 947 228 135 4 chr5 151727141 151727369 -809890 + ORR1D2 LTR MaLR 113 370 0 4 1742 498 292 112 9 chr5 151727380 151727594 -809665 - LTR33 LTR ERVL -169 346 111 4 1742 1674 242 27 19 chr5 151728360 151728726 -808533 - MTEa LTR MaLR -8 371 3 4 1742 2859 74 154 0 chr5 151728991 151729452 -807807 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 4 1742 2119 156 151 0 chr5 151729606 151729971 -807288 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 4 1742 1302 107 112 28 chr5 151730454 151730703 -806556 + RLTR18 LTR ERVK 1 270 -346 4 1742 2164 125 7 87 chr5 151731068 151731514 -805745 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1742 996 248 63 13 chr5 151734828 151735065 -802194 - MTD LTR MaLR 0 419 171 5 1742 3380 21 26 0 chr5 151737131 151737517 -799742 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1742 315 263 137 127 chr5 151740601 151740964 -796295 + MLT1A0 LTR MaLR 11 405 -3 5 1742 346 242 78 39 chr5 151741561 151741664 -795595 - MLT1D LTR MaLR -292 213 107 5 1742 2960 136 65 14 chr5 151741679 151742170 -795089 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 5 1742 894 221 35 30 chr5 151742919 151743142 -794117 - MTD LTR MaLR -177 242 15 5 1742 2419 179 85 64 chr5 151743832 151744397 -792862 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 577 0 5 1742 4378 135 46 21 chr5 151745716 151745911 -791348 + RMER19A LTR ERVK 1 199 -538 5 1742 2697 202 199 40 chr5 151745911 151746690 -790569 + RMER13B LTR ERVK 2 904 -4 5 1742 4378 135 46 21 chr5 151746690 151747211 -790048 + RMER19A LTR ERVK 200 735 -2 5 1742 2158 183 35 25 chr5 151749504 151749907 -787352 - MTD LTR MaLR 0 419 13 5 1742 316 335 36 54 chr5 151751316 151751395 -785864 - RMER10B LTR ERVL 0 398 321 5 1742 2201 198 50 29 chr5 151751395 151751941 -785318 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 1 5 1742 316 335 36 54 chr5 151751941 151752028 -785231 - RMER10B LTR ERVL -78 320 235 5 1742 1911 170 107 36 chr5 151758605 151758989 -778270 - MTC LTR MaLR -8 413 3 5 1742 2321 71 26 0 chr5 151761920 151762229 -775030 - ORR1A2 LTR MaLR -10 317 1 5 1742 436 213 64 9 chr5 151762672 151762781 -774478 + MLT1A1 LTR MaLR 294 408 0 5 1742 1490 221 70 62 chr5 151764866 151765089 -772170 + MTD LTR MaLR 1 218 -201 5 1742 3070 149 7 44 chr5 151765089 151765637 -771622 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 5 1742 1490 221 70 62 chr5 151765637 151765829 -771430 + MTD LTR MaLR 219 419 0 5 1742 455 317 51 36 chr5 151765926 151766122 -771137 + MLT1H2 LTR MaLR 21 219 -270 5 1742 405 348 17 17 chr5 151766184 151766304 -770955 - LTR16B LTR ERVL -343 120 1 5 1742 1818 210 55 28 chr5 151775339 151775350 -761909 + MTD LTR MaLR 3 13 -406 5 1742 1818 210 55 28 chr5 151775384 151775769 -761490 + MTD LTR MaLR 14 410 -9 5 1742 548 248 9 32 chr5 151775835 151775992 -761267 + MTC LTR MaLR 256 407 0 5 1742 1759 226 47 69 chr5 151778660 151779047 -758212 + RMER19C LTR ERVK 88 477 -134 5 1742 1759 226 47 69 chr5 151779225 151779367 -757892 + RMER19C LTR ERVK 478 611 0 5 1742 1895 156 92 11 chr5 151779421 151779778 -757481 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 5 1742 818 243 218 31 chr5 151779943 151780296 -756963 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1742 6754 81 68 38 chr5 151780455 151780604 -756655 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1033 873 5 217 6754 57 15 36 chr5 151780749 151781615 -755644 - RLTR13D5 LTR ERVK -145 878 1 5 1743 332 327 46 35 chr5 151797086 151797260 -739999 - MLT1A LTR MaLR -177 197 22 6 1743 687 258 185 15 chr5 151797394 151797654 -739605 - ORR1E LTR MaLR -5 354 51 6 1743 349 298 1 1 chr5 151797666 151797768 -739491 - ORR1E-int LTR MaLR -36 1544 1454 6 1743 1440 204 37 133 chr5 151800549 151800687 -736572 + ORR1D2 LTR MaLR 3 135 -235 6 1743 1440 204 37 133 chr5 151800872 151801129 -736130 + ORR1D2 LTR MaLR 136 370 0 6 1743 2581 121 28 21 chr5 151801192 151801614 -735645 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 6 6 1743 1275 303 34 22 chr5 151802565 151803067 -734192 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1029 4034 3527 6 1743 300 352 0 0 chr5 151804127 151804249 -733010 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3134 4422 4301 6 1743 1101 333 44 39 chr5 151804235 151804695 -732564 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3310 4246 3805 6 1743 1101 326 57 50 chr5 151804762 151805345 -731914 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3752 3804 2982 6 1743 593 278 97 42 chr5 151805594 151806005 -731254 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5823 1733 1159 6 1743 2377 99 67 22 chr5 151806703 151807106 -730153 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 10 6 1743 1408 200 129 9 chr5 151812712 151813045 -724214 + MTD LTR MaLR 1 373 -46 6 1743 1015 281 75 15 chr5 151814174 151814507 -722752 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 6 1743 2251 199 42 44 chr5 151816225 151816676 -720583 + RLTR20A LTR ERVK 1 439 -102 6 1743 2251 199 42 44 chr5 151816706 151816796 -720463 + RLTR20A LTR ERVK 440 540 -1 6 1743 2990 84 19 84 chr5 151817198 151817719 -719540 - RLTR1C LTR ERV1 -16 487 1 6 1743 650 283 63 90 chr5 151819676 151819939 -717320 + ORR1E LTR MaLR 1 264 -95 6 1743 1705 164 139 57 chr5 151819939 151820121 -717138 - MTC LTR MaLR 0 421 236 6 1743 1705 164 139 57 chr5 151820267 151820460 -716799 - MTC LTR MaLR -186 235 13 6 1743 1705 164 139 57 chr5 151820637 151820649 -716610 - MTC LTR MaLR -409 12 1 6 1743 650 283 63 90 chr5 151820649 151820750 -716509 + ORR1E LTR MaLR 265 355 -4 6 1743 3021 142 50 97 chr5 151820803 151821404 -715855 + RMER15 LTR ERVL 1 573 -2 6 1743 1097 178 151 189 chr5 151824074 151824551 -712708 + RMER6B LTR ERVK 3 461 0 6 1743 1981 127 14 84 chr5 151826603 151827042 -710217 - RMER17C LTR ERVK -2 408 1 6 1743 244 258 76 33 chr5 151827217 151827309 -709950 + MLT2B3 LTR ERVL 6 101 -453 6 1743 3288 36 23 0 chr5 151827378 151827765 -709494 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1743 672 227 302 14 chr5 151828375 151828681 -708578 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 6 1743 345 207 98 0 chr5 151830288 151830370 -706889 + MTD LTR MaLR 20 109 -310 6 1743 1912 120 47 37 chr5 151830370 151830776 -706483 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 1743 954 222 152 15 chr5 151830780 151831050 -706209 + MTD LTR MaLR 108 414 -5 6 1743 504 272 199 23 chr5 151832727 151832997 -704262 - MLT2B2 LTR ERVL -77 438 123 6 1743 300 310 102 56 chr5 151833489 151833704 -703555 + ORR1D2 LTR MaLR 5 229 -141 6 1743 488 266 73 36 chr5 151836479 151836650 -700609 - RLTR41 LTR ERV1 -33 499 273 6 1743 433 281 177 76 chr5 151836798 151836959 -700300 - RLTR41 LTR ERV1 -202 330 152 6 1743 230 287 20 69 chr5 151845714 151845815 -691444 + MLT1A1 LTR MaLR 291 386 -22 7 1743 1742 120 55 7 chr5 151870254 151870650 -666609 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 7 1743 318 329 91 60 chr5 151876396 151876661 -660598 + MLT1A0 LTR MaLR 21 293 -72 7 1743 241 314 93 56 chr5 151878284 151878500 -658759 + RMER17C LTR ERVK 138 361 -49 7 1743 2191 138 176 41 chr5 151881355 151881748 -655511 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 7 1743 793 70 49 7 chr5 151884028 151884171 -653088 - RMER17B LTR ERVK -498 460 312 7 1743 1757 196 69 3 chr5 151897176 151897565 -639694 + MTD LTR MaLR 4 418 -1 7 1743 356 281 207 50 chr5 151900168 151900492 -636767 + ORR1E LTR MaLR 3 377 -2 7 1744 347 299 129 36 chr5 151932418 151932727 -604532 + LTR86A1 LTR ERVL 84 421 -92 8 1744 2407 170 58 41 chr5 151934182 151934698 -602561 + RLTR11A LTR ERVK 1 525 -3 8 1744 424 290 117 49 chr5 151934706 151934971 -602288 + LTR82A LTR ERVL 399 681 -191 8 1744 1594 226 111 3 chr5 151936996 151937374 -599885 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1744 281 282 13 0 chr5 151941409 151941487 -595772 - MLT1I LTR MaLR -8 403 325 8 1744 1560 186 85 27 chr5 151944250 151944660 -592599 + RMER10A LTR ERVL 1 434 -8 8 1744 1585 217 54 29 chr5 151953235 151953644 -583615 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1744 813 235 5 5 chr5 151954120 151954308 -582951 - ORR1E LTR MaLR -166 193 6 8 1744 1577 170 11 60 chr5 151957666 151958140 -579119 - RMER17C LTR ERVK -519 439 25 8 1744 2218 83 10 0 chr5 151960817 151961131 -576128 + ORR1A2 LTR MaLR 3 319 -8 8 1744 1140 237 106 35 chr5 151964827 151965168 -572091 + ORR1D2 LTR MaLR 2 366 -4 8 1744 1604 137 141 30 chr5 151966381 151966750 -570509 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 8 1744 1952 144 21 59 chr5 151972321 151972661 -564598 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 9 1744 343 320 32 8 chr5 151973240 151973363 -563896 + ORR1E LTR MaLR 10 135 -224 9 1744 1904 114 14 23 chr5 151973331 151973712 -563547 + RLTR11A LTR ERVK 155 526 -2 9 1744 296 93 652 43 chr5 151980299 151980391 -556868 + MTC LTR MaLR 115 262 -159 9 1744 2386 160 52 5 chr5 151980749 151981151 -556108 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1744 755 281 173 3 chr5 151982542 151982849 -554410 + MLT1B LTR MaLR 16 374 -16 9 1744 255 273 121 55 chr5 151996210 151996392 -540867 + RMER15 LTR ERVL 275 468 -107 9 1744 2178 153 53 5 chr5 151998822 151999216 -538043 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 1744 1794 128 32 32 chr5 152001400 152001747 -535512 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 13 4 1744 1437 232 47 22 chr5 152004320 152004681 -532578 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1744 1116 170 83 24 chr5 152008768 152009057 -528202 - RMER17C LTR ERVK -104 306 1 1 1744 1419 219 152 87 chr5 152024648 152025188 -512071 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 4 1744 947 187 182 59 chr5 152026504 152026958 -510301 + RLTR11A2 LTR ERVK 18 527 0 4 1744 503 236 330 21 chr5 152033393 152033727 -503532 + RMER10A LTR ERVL 6 442 0 5 1744 3906 156 95 63 chr5 152041165 152042027 -495232 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 6 1745 960 229 25 49 chr5 152044540 152044907 -492352 + RLTR15 LTR ERVK 1 358 -1 7 1745 280 293 87 107 chr5 152050751 152050957 -486302 - MLT1A1 LTR MaLR -204 204 3 7 1745 1957 150 27 0 chr5 152052875 152053209 -484050 + ORR1B2 LTR MaLR 1 343 -24 8 1745 905 234 32 86 chr5 152060702 152060982 -476277 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 99 9 1745 239 308 54 45 chr5 152067572 152067684 -469575 + RMER15 LTR ERVL 463 575 0 9 1745 660 317 122 47 chr5 152072594 152073021 -464238 + LTR40b LTR ERVL 4 462 0 1 1745 351 346 12 42 chr5 152073593 152073759 -463500 - MLT1A0 LTR MaLR -186 179 19 1 1745 595 332 55 37 chr5 152073877 152074205 -463054 + ORR1D2 LTR MaLR 37 370 0 1 1745 563 329 114 37 chr5 152074210 152074586 -462673 + LTR16B2 LTR ERVL 50 454 -8 1 1745 371 259 33 6 chr5 152078390 152078495 -458764 + MTD LTR MaLR 6 119 -302 1 1745 1102 234 116 14 chr5 152078975 152079269 -457990 + MTD LTR MaLR 96 419 0 1 1745 290 264 27 45 chr5 152085193 152085207 -452052 + MT2B LTR ERVL 152 163 -438 1 1745 3540 52 0 0 chr5 152092079 152092479 -444780 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1745 1782 185 34 36 chr5 152092929 152093352 -443907 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 1745 233 119 0 45 chr5 152093380 152093424 -443835 - ORR1B1 LTR MaLR -287 42 1 1 1745 3560 38 5 0 chr5 152095335 152095733 -441526 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1745 3347 135 119 71 chr5 152096082 152096663 -440596 + RMER19C LTR ERVK 1 609 -2 1 1745 255 301 60 40 chr5 152097149 152097298 -439961 + RMER15 LTR ERVL 417 568 -7 1 1745 248 146 20 20 chr5 152103163 152103212 -434047 - MLT1B LTR MaLR -12 378 330 1 1745 953 279 107 61 chr5 152105192 152105870 -431389 + RMER13A LTR ERVK 16 773 -135 1 1745 1070 213 69 99 chr5 152110193 152110509 -426750 - RMER12 LTR ERVK -2 1320 1014 1 1745 1070 213 69 99 chr5 152110628 152110644 -426615 - RMER12 LTR ERVK -309 1013 998 1 1745 398 311 105 85 chr5 152110781 152110832 -426427 - RLTR22_Mur LTR ERVK -135 1269 1224 1 1745 1527 263 70 111 chr5 152110878 152111824 -425435 - RLTR22_Mur LTR ERVK -181 1223 1 1 1745 2341 85 3 12 chr5 152115880 152116202 -421057 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1745 828 271 77 15 chr5 152116842 152117115 -420144 - MTE-int LTR MaLR 0 1580 1291 1 1745 238 333 118 0 chr5 152117159 152117303 -419956 + RMER15 LTR ERVL 403 563 -12 1 1745 2280 101 0 24 chr5 152117387 152117639 -419620 + ORR1A2 LTR MaLR 1 252 -75 1 1745 3030 152 79 21 chr5 152117639 152118169 -419090 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 1 1745 2280 101 0 24 chr5 152118169 152118251 -419008 + ORR1A2 LTR MaLR 253 327 0 1 1745 269 284 43 86 chr5 152124264 152124403 -412856 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 108 1 1745 869 184 18 34 chr5 152124634 152124884 -412375 + MTD LTR MaLR 141 419 0 1 1745 926 319 60 36 chr5 152134869 152135317 -401942 + MLT1C LTR MaLR 5 463 -4 2 1745 1659 159 122 37 chr5 152140396 152140638 -396621 - RMER17C LTR ERVK 0 410 135 2 1745 1659 159 122 37 chr5 152140737 152140872 -396387 - RMER17C LTR ERVK -276 134 1 2 1745 1713 194 86 66 chr5 152143127 152143453 -393806 - MTC LTR MaLR 0 421 85 2 1745 1713 194 86 66 chr5 152143605 152143687 -393572 - MTC LTR MaLR -337 84 5 2 1745 788 292 100 37 chr5 152144155 152144535 -392724 + MER31A LTR ERV1 1 404 -81 2 1745 2933 133 83 24 chr5 152148185 152148654 -388605 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 3 2 1745 1434 206 120 43 chr5 152149718 152150135 -387124 + RLTR20B3 LTR ERVK 23 471 -106 2 1745 231 300 75 23 chr5 152154822 152154996 -382263 + BGLII LTR ERVK 77 259 -162 2 1745 4646 45 21 2 chr5 152155612 152156191 -381068 + RLTR1D LTR ERV1 16 605 0 2 1745 3890 103 22 9 chr5 152165002 152165591 -371668 + ORR1A2-int LTR MaLR 1215 1782 -181 2 1745 2428 101 9 11 chr5 152165591 152165967 -371292 + ORR1A2 LTR MaLR 6 384 0 2 1745 1894 208 125 33 chr5 152169606 152170094 -367165 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 1 2 1745 228 220 0 48 chr5 152173170 152173232 -364027 + RMER4A LTR ERVK 317 375 -91 2 218 329 206 29 0 chr5 152174530 152174598 -362661 - MTD LTR MaLR -12 407 338 2 1746 2590 153 0 26 chr5 152178483 152178907 -358352 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1746 1295 147 13 35 chr5 152182953 152183185 -354074 + ORR1D1 LTR MaLR 148 374 0 2 1746 1049 251 184 8 chr5 152183260 152183613 -353646 - MTD LTR MaLR 0 419 5 2 1746 4748 179 50 30 chr5 152184815 152185658 -351601 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 2 1746 438 289 158 32 chr5 152187183 152187462 -349797 + RMER15 LTR ERVL 258 571 -4 2 1746 1149 232 145 3 chr5 152188194 152188518 -348741 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 1746 3153 34 14 0 chr5 152194176 152194528 -342731 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 2 1746 441 172 107 18 chr5 152197931 152198060 -339199 + MTD LTR MaLR 224 403 -16 2 1746 3221 71 5 10 chr5 152199273 152199671 -337588 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1746 864 200 83 16 chr5 152199920 152200113 -337146 - MTEa LTR MaLR -169 210 5 3 1746 3374 125 14 0 chr5 152200409 152200849 -336410 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 1746 268 140 80 0 chr5 152201718 152201768 -335491 - RLTR11B LTR ERVK -33 420 367 3 1746 1555 304 48 33 chr5 152201789 152201967 -335292 + RodERV21-int LTR ERV1 4235 4418 -573 3 1746 1555 304 48 33 chr5 152202022 152202485 -334774 + RodERV21-int LTR ERV1 4419 4885 -106 3 1746 2315 224 31 52 chr5 152204789 152205364 -331895 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 563 0 3 1746 2561 196 131 55 chr5 152210988 152211599 -325660 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 640 -383 3 1746 2561 116 91 35 chr5 152211620 152211950 -325309 + RLTR13D1 LTR ERVK 433 1023 0 3 1746 612 288 34 99 chr5 152213227 152213571 -323688 - MTD LTR MaLR -7 372 18 3 1746 378 306 39 39 chr5 152215123 152215276 -321983 + MLT1M LTR MaLR 128 280 -392 3 1746 1213 220 139 36 chr5 152220251 152220581 -316678 + MTD LTR MaLR 1 364 -55 3 1746 4889 118 26 28 chr5 152233223 152234034 -303225 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 3 1746 1818 203 67 51 chr5 152235201 152235694 -301565 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 521 -56 3 1746 257 350 106 75 chr5 152235836 152236129 -301130 - MLT1H1 LTR MaLR -77 478 177 3 1746 320 203 94 0 chr5 152237906 152237970 -299289 - MERVK26-int LTR ERVK -1410 5509 5440 3 1746 608 295 50 41 chr5 152240064 152240407 -296852 - RLTR15 LTR ERVK -13 346 1 3 1746 2286 192 61 45 chr5 152242179 152242752 -294507 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 614 1195 -1131 3 1746 3054 226 45 15 chr5 152245432 152245864 -291395 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1509 1953 -373 3 1746 4524 106 10 82 chr5 152245864 152246673 -290586 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 3 1746 3054 226 45 15 chr5 152246673 152247034 -290225 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1954 2326 0 3 1746 1836 241 34 22 chr5 152247048 152247556 -289703 + RLTR11A LTR ERVK 15 528 0 3 1746 2686 130 49 14 chr5 152249057 152249487 -287772 + BGLII_A LTR ERVK 1 445 0 3 1746 2839 91 8 12 chr5 152252462 152252861 -284398 + MTB LTR MaLR 3 399 -1 3 1746 3021 18 0 0 chr5 152253443 152253780 -283479 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 3 1746 57871 18 7 5 chr5 152253780 152260245 -277014 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 3 1746 3021 18 0 0 chr5 152260245 152260582 -276677 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 3 1746 2764 114 5 2 chr5 152265424 152265819 -271440 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1746 1648 138 7 0 chr5 152265819 152266108 -271151 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 291 -807 3 1746 3789 14 121 0 chr5 152266110 152266550 -270709 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1746 48494 16 3 0 chr5 152266550 152271894 -265365 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 3 1746 362 167 46 35 chr5 152271894 152271981 -265278 + MTA_Mm-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 1746 321 0 0 0 chr5 152271981 152272019 -265240 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 1746 3807 11 121 0 chr5 152272019 152272459 -264800 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 1746 955 113 13 0 chr5 152272459 152272610 -264649 + MT-int LTR MaLR 289 441 -657 3 1746 2516 126 17 21 chr5 152272604 152273097 -264162 + MT-int LTR MaLR 644 1538 -425 3 1746 2771 117 29 42 chr5 152273169 152273650 -263609 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1746 302 0 53 0 chr5 152273650 152273688 -263571 + IAPEz-int LTR ERVK 8 47 -6434 3 1746 3482 73 7 29 chr5 152273688 152274427 -262832 + IAPEz-int LTR ERVK 17 662 -5819 3 1746 454 94 0 30 chr5 152274427 152274493 -262766 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1422 -5059 3 1746 1839 119 4 4 chr5 152274479 152274741 -262518 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 3 1746 953 80 24 0 chr5 152274736 152274861 -262398 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 3 1746 26600 20 4 0 chr5 152274861 152277805 -259454 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 3 1746 2731 115 29 42 chr5 152277805 152278286 -258973 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1746 272 223 105 11 chr5 152282528 152282623 -254636 + RLTR19-int LTR ERVK 3735 3838 -2299 4 1746 2952 33 88 0 chr5 152285829 152286193 -251066 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1746 291 224 0 0 chr5 152292229 152292287 -244972 + RLTR11A LTR ERVK 471 528 0 4 1746 3665 79 0 32 chr5 152295125 152295623 -241636 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 4 1747 423 340 50 55 chr5 152307328 152307546 -229713 + RLTR25A LTR ERVK 1 217 -886 4 1747 2300 268 42 2 chr5 152308363 152308957 -228302 + MERVK26-int LTR ERVK 5681 6298 -621 4 1747 1456 140 92 4 chr5 152309067 152309339 -227920 + RMER6B LTR ERVK 1 296 -165 4 1747 2715 34 23 99 chr5 152310161 152310556 -226703 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 4 1747 646 251 55 11 chr5 152310991 152311172 -226087 + ORR1C1 LTR MaLR 1 189 -189 4 1747 614 258 18 1 chr5 152311782 152311951 -225308 + ORR1C1 LTR MaLR 98 327 -51 4 1747 281 304 54 36 chr5 152317316 152317483 -219776 - RLTR15 LTR ERVK -9 350 181 4 1747 2591 73 9 14 chr5 152318116 152318463 -218796 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 4 1747 477 196 9 35 chr5 152318466 152318582 -218677 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5 117 -6704 4 1747 393 168 18 61 chr5 152318582 152318696 -218563 + IAPLTR3-int LTR ERVK 834 942 -5879 4 1747 354 145 15 146 chr5 152318677 152318814 -218445 + IAPLTR3-int LTR ERVK 834 952 -6629 4 1747 1203 198 111 57 chr5 152318926 152319417 -217842 + ETnERV3-int LTR ERVK 251 668 -5469 4 1747 404 183 92 0 chr5 152319415 152319535 -217724 + ETnERV3-int LTR ERVK 1719 1849 -5557 4 1747 301 244 0 75 chr5 152319546 152319639 -217620 + ETnERV3-int LTR ERVK 2454 2539 -4867 4 1747 6244 111 20 12 chr5 152325894 152327206 -210053 + ETnERV3-int LTR ERVK 2779 4208 -3198 4 1747 2980 24 0 0 chr5 152327250 152327587 -209672 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1747 52987 22 17 6 chr5 152327587 152333996 -203263 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3 4 1747 2994 21 0 0 chr5 152333991 152334328 -202931 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1747 435 204 13 4 chr5 152334328 152334448 -202811 + IAPLTR3-int LTR ERVK 2362 2464 -2380 4 1747 777 85 17 8 chr5 152334463 152334582 -202677 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4530 4649 -2932 4 1747 5944 241 28 29 chr5 152334715 152337241 -200018 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5083 7240 -273 4 1747 2623 68 9 9 chr5 152337242 152337586 -199673 + IAPLTR4 LTR ERVK 2 345 0 4 1747 310 302 50 56 chr5 152343062 152343241 -194018 - RLTR15 LTR ERVK -181 178 1 4 1747 992 140 0 0 chr5 152343601 152343758 -193501 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 372 4 1747 1352 257 23 31 chr5 152343756 152344110 -193149 + RLTR11A LTR ERVK 178 528 0 4 1747 2725 132 7 14 chr5 152345316 152345762 -191497 + BGLII_A LTR ERVK 1 443 -2 4 1747 2608 85 47 13 chr5 152348518 152348900 -188359 + MTB LTR MaLR 1 395 -5 4 1747 581 295 71 50 chr5 152365878 152366217 -171042 - RLTR15 LTR ERVK -13 346 1 4 1747 2995 188 9 18 chr5 152370512 152371212 -166047 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 1353 -1489 4 1747 2679 147 7 9 chr5 152372589 152373035 -164224 + BGLII_A LTR ERVK 1 445 0 4 1747 2415 100 81 3 chr5 152378524 152378895 -158364 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1747 1882 152 90 22 chr5 152378895 152379368 -157891 + MTB-int LTR MaLR 697 1098 0 5 1747 2789 79 42 3 chr5 152379368 152379749 -157510 + MTB LTR MaLR 1 396 -4 5 1747 2621 134 0 8 chr5 152390592 152390991 -146268 + MTB LTR MaLR 1 396 0 5 1747 6396 110 27 65 chr5 152390991 152392132 -145127 + MTB-int LTR MaLR 1 1098 0 5 1747 2908 88 8 2 chr5 152392132 152392530 -144729 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1747 1588 264 73 31 chr5 152393073 152393272 -143987 + RMER5 LTR ERV1 5 203 -331 5 1747 1588 264 73 31 chr5 152393468 152393777 -143482 + RMER5 LTR ERV1 204 534 0 5 1747 280 125 0 0 chr5 152410996 152411036 -126223 - RLTR44B LTR ERVK -407 42 3 5 1747 1388 204 34 0 chr5 152433391 152433656 -103603 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 119 5 1747 2120 165 22 37 chr5 152433657 152434060 -103199 + RLTR11A LTR ERVK 5 401 -127 5 1748 481 347 62 72 chr5 152439023 152439330 -97929 + RLTR25A LTR ERVK 1 304 -799 5 1748 370 256 8 107 chr5 152442567 152442638 -94621 - RLTR20D LTR ERVK -38 540 478 5 1748 370 256 8 107 chr5 152442696 152442755 -94504 - RLTR20D LTR ERVK -101 477 423 5 1748 758 285 58 25 chr5 152442745 152443019 -94240 - RLTR20D LTR ERVK -285 283 1 5 1748 821 243 291 6 chr5 152443128 152443490 -93769 + RMER5 LTR ERV1 70 534 0 5 1748 2250 234 48 48 chr5 152444280 152445256 -92003 - RMER13B LTR ERVK -8 900 1 5 1748 255 307 13 13 chr5 152454692 152454768 -82491 + MTEb LTR MaLR 5 80 -299 5 1748 621 197 0 41 chr5 152454768 152454890 -82369 + RLTR14-int LTR ERV1 1933 2049 -3268 5 1748 1246 237 23 13 chr5 152454858 152455197 -82062 + RLTR14-int LTR ERV1 2039 2267 -3050 5 1748 1947 121 9 13 chr5 152455198 152455516 -81743 + ORR1A4 LTR MaLR 5 321 -8 5 1748 5403 177 65 32 chr5 152455519 152456588 -80671 + RLTR14-int LTR ERV1 2262 3365 -1952 5 1748 514 169 126 60 chr5 152456574 152456674 -80585 + RLTR14-int LTR ERV1 4083 4188 -1129 5 1748 514 169 126 60 chr5 152456702 152456723 -80536 + RLTR14-int LTR ERV1 4189 4218 -1099 5 1748 514 169 126 60 chr5 152457229 152457257 -80002 + RLTR14-int LTR ERV1 4219 4242 -1075 5 1748 670 179 51 0 chr5 152466062 152466179 -71080 - ETnERV2-int LTR ERVK -214 7192 7070 5 1748 2229 102 32 3 chr5 152469778 152470092 -67167 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 5 1748 6372 49 41 5 chr5 152471997 152472777 -64482 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 5 1748 1253 98 5 0 chr5 152472995 152473171 -64088 + MTB_Mm LTR MaLR 1 177 -230 5 1748 1562 100 25 4 chr5 152473171 152473411 -63848 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 268 5 1748 570 62 12 0 chr5 152473411 152473492 -63767 - LTRIS3 LTR ERV1 0 512 431 5 1748 1544 98 68 12 chr5 152473521 152473770 -63489 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3036 263 1 5 1748 2316 121 63 11 chr5 152473771 152474311 -62948 - RLTR1B LTR ERV1 -17 607 1 5 1748 887 123 0 153 chr5 152474326 152474528 -62731 - RLTR1B LTR ERV1 -207 305 135 5 1748 1650 86 0 0 chr5 152474610 152474842 -62417 + MTB LTR MaLR 169 400 0 5 1748 4505 12 2 0 chr5 152482165 152482657 -54602 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1748 41354 16 14 0 chr5 152482657 152487944 -49315 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 5 1748 351 179 46 35 chr5 152487944 152488031 -49228 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 5 1748 321 0 0 0 chr5 152488031 152488069 -49190 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 1748 4505 12 2 0 chr5 152488069 152488561 -48698 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1748 867 123 13 19 chr5 152491254 152491411 -45848 - RLTR31_Mur LTR ERVK -213 340 185 5 1748 1469 235 135 51 chr5 152491763 152492391 -44868 + RLTR40 LTR ERVK 88 768 -49 6 1748 4271 107 69 0 chr5 152493178 152493812 -43447 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 6 1748 606 244 183 19 chr5 152494934 152495147 -42112 + MTD LTR MaLR 172 419 0 6 1748 1832 57 176 19 chr5 152495153 152495420 -41839 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 6 1748 938 286 31 50 chr5 152495890 152496173 -41086 + ORR1E LTR MaLR 5 284 -75 6 1748 1971 96 0 182 chr5 152496173 152496553 -40706 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 6 1748 938 286 31 50 chr5 152496553 152496626 -40633 + ORR1E LTR MaLR 285 354 -5 6 1748 1353 210 68 0 chr5 152499480 152499761 -37498 + RMER12B LTR ERVK 1 300 -1104 6 1748 3631 15 0 0 chr5 152503226 152503620 -33639 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 5 1748 9680 18 3 0 chr5 152503620 152504715 -32544 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 1748 3613 18 0 0 chr5 152504717 152505111 -32148 - MTA_Mm LTR MaLR -2 394 1 5 1748 563 263 32 13 chr5 152505125 152505279 -31980 - RMER17B LTR ERVK 0 958 802 6 1748 512 302 44 59 chr5 152506901 152506943 -30316 + MLT1C LTR MaLR 200 243 -224 9 1748 2434 145 68 2 chr5 152506943 152507338 -29921 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1748 512 302 44 59 chr5 152507338 152507566 -29693 + MLT1C LTR MaLR 244 466 -1 9 1748 363 355 97 35 chr5 152510448 152510676 -26583 - MLT1E2 LTR MaLR -35 592 351 1 1748 1858 114 3 87 chr5 152510844 152511200 -26059 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 1 1748 2617 131 68 0 chr5 152511548 152511961 -25298 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 1 1748 605 92 71 0 chr5 152512552 152512650 -24609 + RMER19A LTR ERVK 1 105 -632 1 1748 3565 158 122 74 chr5 152512877 152513726 -23533 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 2 1748 1800 123 71 68 chr5 152513944 152514353 -22906 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 1748 628 275 26 16 chr5 152515051 152515243 -22016 - MTD LTR MaLR -122 297 104 2 1748 1859 133 41 12 chr5 152520066 152520113 -17146 + RLTR15 LTR ERVK 1 48 -311 3 1748 1859 133 41 12 chr5 152520280 152520575 -16684 + RLTR15 LTR ERVK 49 353 -6 3 1748 3389 74 48 4 chr5 152522324 152522786 -14473 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 1748 1464 232 59 0 chr5 152524290 152524630 -12629 - MTD LTR MaLR -14 405 46 4 1748 328 200 51 130 chr5 152525465 152525603 -11656 - MT2B LTR ERVL -305 296 170 4 1748 359 270 43 43 chr5 152525682 152525798 -11461 + MLT1A LTR MaLR 252 367 -7 4 1748 401 325 16 0 chr5 152526030 152526153 -11106 + MLT1D LTR MaLR 10 134 -371 4 1748 494 344 101 49 chr5 152526600 152527025 -10234 - MLT1E2 LTR MaLR -174 453 7 5 1748 3870 77 16 12 chr5 152527026 152527536 -9723 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 1748 4092 66 0 25 chr5 152529220 152529745 -7514 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 1748 2955 175 33 4 chr5 152530231 152530782 -6477 + RLTR25B LTR ERVK 1 567 -461 5 1748 377 210 121 62 chr5 152530782 152530961 -6298 + RLTR25B LTR ERVK 630 874 -229 5 1748 398 194 250 40 chr5 152531346 152531567 -5692 + RLTR25B LTR ERVK 742 1103 0 5 1748 421 100 0 0 chr5 152536481 152536541 -718 - ORR1A2 LTR MaLR -163 164 105 7 1748 267 200 0 16 chr5 152537020 152537081 -178 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 345 7