607 4880 111 4 1 chr15 3000000 3000679 -100494295 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6057 1524 844 1 607 3560 192 55 43 chr15 3000675 3001598 -100493376 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6657 924 1 1 607 1934 174 3 13 chr15 3001598 3001912 -100493062 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 2 607 286 169 143 22 chr15 3001912 3001924 -100493050 - IAPLTR4_I LTR ERVK -1449 21 6 1 607 2531 133 48 93 chr15 3004821 3005326 -100489648 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 8 607 2251 172 36 8 chr15 3007915 3008307 -100486667 - MTC LTR MaLR -10 411 9 1 607 4304 146 22 38 chr15 3008315 3009070 -100485904 + RLTR14-int LTR ERV1 3797 4539 -778 1 607 2886 109 12 0 chr15 3009069 3009472 -100485502 + MurERV4_19-int LTR ERVK 1852 2259 -3521 1 607 308 317 28 42 chr15 3009671 3009885 -100485089 + RMER5 LTR ERV1 273 483 -51 1 607 415 318 40 0 chr15 3009891 3010017 -100484957 + ORR1E LTR MaLR 3 133 -226 1 607 1007 207 5 18 chr15 3010078 3010295 -100484679 + RLTR14-int LTR ERV1 5101 5314 -3 1 607 1936 214 16 3 chr15 3010318 3010693 -100484281 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 1 607 245 210 16 0 chr15 3012026 3012088 -100482886 + ORR1E LTR MaLR 329 391 -28 1 607 644 142 38 0 chr15 3013288 3013394 -100481580 + RLTR11A LTR ERVK 3 112 -416 2 607 609 205 6 58 chr15 3013650 3013821 -100481153 + RNLTR23 LTR ERVK 481 642 0 2 607 2259 150 26 10 chr15 3013821 3014236 -100480738 + RLTR11A LTR ERVK 107 528 0 2 608 1039 212 139 16 chr15 3018273 3018518 -100476456 + MTEa LTR MaLR 1 275 -104 3 608 2798 184 2 2 chr15 3018528 3019008 -100475966 + RMER15 LTR ERVL 6 485 -90 4 608 236 299 184 24 chr15 3019302 3019470 -100475504 + RLTR9A LTR ERVK 1 195 -173 4 608 476 191 32 73 chr15 3019789 3019913 -100475061 + RLTR9A LTR ERVK 250 368 0 4 608 450 288 70 127 chr15 3019943 3020204 -100474770 + MLT1E2 LTR MaLR 50 361 -293 4 608 2704 123 19 42 chr15 3020736 3021249 -100473725 + RLTR1D LTR ERV1 1 589 -16 4 608 1381 191 58 13 chr15 3021420 3021728 -100473246 + RLTR11A2 LTR ERVK 206 527 0 4 608 6797 83 26 3 chr15 3035533 3036406 -100458568 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 6 608 454 324 36 36 chr15 3057890 3058327 -100436647 + RLTR15 LTR ERVK 10 317 -42 9 608 251 308 58 33 chr15 3060027 3060148 -100434826 - MTEb LTR MaLR -4 375 252 9 608 801 243 150 40 chr15 3060209 3060483 -100434491 - MTEa-int LTR MaLR -34 1546 1243 9 608 1480 322 111 71 chr15 3060486 3061500 -100433474 - MTEa-int LTR MaLR -524 1056 2 9 608 392 273 62 19 chr15 3061500 3061663 -100433311 - MTEa LTR MaLR -16 403 243 9 608 2867 45 0 0 chr15 3068983 3069315 -100425659 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 9 608 58951 65 13 5 chr15 3069315 3076936 -100418038 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 1 9 608 2900 42 0 0 chr15 3076936 3077268 -100417706 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 9 608 1291 201 111 6 chr15 3097114 3097429 -100397545 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 277 1 608 263 275 11 11 chr15 3112359 3112451 -100382523 - MMTV-int LTR ERVK -4749 2504 2413 1 608 1136 58 0 0 chr15 3112851 3112989 -100381985 - RLTR45-int LTR ERVK -6426 818 681 1 608 4695 54 84 11 chr15 3113287 3113906 -100381068 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 29 1 608 2493 119 76 81 chr15 3113911 3114395 -100380579 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 608 340 119 33 17 chr15 3115848 3115908 -100379066 + RMER17C LTR ERVK 1 61 -349 1 608 2215 116 18 3 chr15 3115909 3116239 -100378735 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 1 608 11198 98 92 28 chr15 3116239 3118843 -100376131 + IAPEz-int LTR ERVK 6 2774 -3707 1 608 3170 20 0 0 chr15 3118841 3119198 -100375776 + IAPEz-int LTR ERVK 4001 4357 -2124 1 608 5617 76 33 12 chr15 3119189 3119944 -100375030 + IAPEz-int LTR ERVK 5709 6479 -2 1 608 2215 116 18 3 chr15 3119946 3120276 -100374698 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 1 608 1189 171 37 68 chr15 3120278 3120630 -100374344 + RMER17C LTR ERVK 57 397 -13 1 608 1057 198 94 53 chr15 3123500 3123909 -100371065 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 1 608 521 270 18 83 chr15 3125927 3126159 -100368815 + ORR1D1 LTR MaLR 2 284 -90 1 608 3915 166 92 33 chr15 3126234 3126307 -100368667 - MTC-int LTR MaLR -118 1140 1068 1 608 3915 166 92 33 chr15 3126507 3127322 -100367652 - MTC-int LTR MaLR -191 1067 199 1 608 404 275 42 48 chr15 3132522 3132690 -100362284 + MTEa LTR MaLR 17 183 -196 1 608 418 305 56 88 chr15 3132847 3133063 -100361911 + MTEa LTR MaLR 168 376 -3 1 608 1431 208 128 19 chr15 3133145 3133512 -100361462 - MTD LTR MaLR 0 419 13 1 608 1954 169 42 17 chr15 3133618 3133974 -100361000 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 1 608 445 213 164 102 chr15 3136086 3136311 -100358663 + MT2A LTR ERVL 28 266 -267 1 608 371 214 158 4 chr15 3136306 3136408 -100358566 + MT2A LTR ERVL 359 552 -49 1 608 263 152 38 0 chr15 3136463 3136542 -100358432 + MT2A LTR ERVL 452 533 0 1 608 946 259 48 67 chr15 3137066 3137457 -100357517 - MTEb LTR MaLR -2 377 4 1 608 2519 141 2 0 chr15 3137453 3137871 -100357103 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 166 1 608 1907 124 42 0 chr15 3137964 3138270 -100356704 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 608 10063 142 65 27 chr15 3138274 3140165 -100354809 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 1 608 1541 132 0 4 chr15 3140165 3140416 -100354558 + ORR1A2 LTR MaLR 1 250 -77 1 608 604 91 0 0 chr15 3140420 3140508 -100354466 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 238 1 608 1017 208 53 65 chr15 3140814 3141223 -100353751 - RMER2 LTR ERV1 -69 498 1 1 608 1146 239 74 59 chr15 3141701 3142092 -100352882 + RMER10A LTR ERVL 5 401 -41 1 608 3133 144 161 21 chr15 3144746 3145400 -100349574 - RMER6A LTR ERVK -11 745 1 2 609 2996 57 35 42 chr15 3146445 3146848 -100348126 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 609 1979 184 16 16 chr15 3146850 3147232 -100347742 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 2 609 7021 59 25 8 chr15 3149161 3150039 -100344935 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 2 609 1790 116 39 0 chr15 3150481 3150765 -100344209 + RLTR44A LTR ERVK 1 295 -110 2 609 263 192 36 60 chr15 3152147 3152230 -100342744 + RMER5 LTR ERV1 454 534 0 2 609 1909 134 44 0 chr15 3154223 3154521 -100340453 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 2 609 2846 25 0 0 chr15 3155952 3156274 -100338700 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 609 2765 89 47 3 chr15 3156365 3156748 -100338226 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 609 575 188 26 32 chr15 3157260 3157414 -100337560 - RLTR15 LTR ERVK -15 344 192 2 609 458 283 78 6 chr15 3157408 3157635 -100337339 + ORR1D2 LTR MaLR 126 372 -2 2 609 1352 223 71 20 chr15 3158294 3158646 -100336328 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 609 1809 170 40 0 chr15 3158970 3159299 -100335675 - ORR1C1 LTR MaLR -16 362 21 2 609 1895 156 80 8 chr15 3160175 3160562 -100334412 + RLTR9F LTR ERVK 1 415 0 2 609 3120 73 2 10 chr15 3161102 3161505 -100333469 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 609 459 308 32 70 chr15 3161816 3162001 -100332973 - MTEa LTR MaLR -197 182 5 2 609 942 263 79 73 chr15 3165053 3165558 -100329416 - MER67C LTR ERV1 -47 664 157 2 609 2449 87 3 0 chr15 3166437 3166759 -100328215 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 2 609 1180 235 97 61 chr15 3169824 3170268 -100324706 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 73 2 609 336 210 0 47 chr15 3170375 3170460 -100324514 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 481 2 609 1010 176 61 34 chr15 3170468 3170732 -100324242 - RLTR31_Mm LTR ERVK -290 271 1 2 609 279 211 32 128 chr15 3175882 3176007 -100318967 - MLT1A LTR MaLR -249 125 13 2 609 235 321 36 0 chr15 3179482 3179594 -100315380 + LTR16A1 LTR ERVL 276 391 -65 2 609 346 307 124 64 chr15 3180440 3180673 -100314301 - LTR33 LTR ERVL -168 347 101 2 609 1604 206 47 84 chr15 3183453 3183883 -100311091 - RLTR18B LTR ERVK -61 451 33 2 609 1774 137 69 94 chr15 3183883 3184024 -100310950 - RMER10B LTR ERVL 0 398 261 2 609 1774 137 69 94 chr15 3184051 3184313 -100310661 - RMER10B LTR ERVL -138 260 5 2 609 1604 206 47 84 chr15 3184313 3184332 -100310642 - RLTR18B LTR ERVK -480 32 19 2 609 899 324 78 60 chr15 3184439 3184861 -100310113 - MER34A1 LTR ERV1 -22 565 133 2 609 899 324 78 60 chr15 3185023 3185154 -100309820 - MER34A1 LTR ERV1 -455 132 2 2 609 255 217 47 35 chr15 3189382 3189468 -100305506 - MTEa LTR MaLR 0 379 293 3 609 1501 148 33 66 chr15 3195110 3195443 -100299531 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 609 396 329 88 71 chr15 3201488 3201727 -100293247 + MER68 LTR ERVL 27 269 -294 3 609 1477 235 21 49 chr15 3204823 3205208 -100289766 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 609 313 263 109 20 chr15 3206338 3206439 -100288535 - MLT1B LTR MaLR -278 112 3 3 609 2400 128 32 27 chr15 3209233 3209634 -100285340 - MTB_Mm LTR MaLR -4 403 1 3 609 994 277 90 6 chr15 3212938 3213294 -100281680 + MLT1B LTR MaLR 1 386 -4 3 609 3739 203 26 49 chr15 3213732 3214643 -100280331 + RMER13B LTR ERVK 15 904 -4 3 609 783 312 49 21 chr15 3214854 3215056 -100279918 + MTEb LTR MaLR 1 199 -180 3 609 783 312 49 21 chr15 3215076 3215161 -100279813 + MTEb LTR MaLR 200 295 -84 3 609 373 315 147 47 chr15 3232259 3232812 -100262162 + LTR84b LTR ERVL 131 761 0 3 609 1073 282 40 34 chr15 3233198 3233547 -100261427 - ORR1E LTR MaLR 0 359 9 3 609 363 293 85 88 chr15 3233764 3233880 -100261094 + ORR1C2 LTR MaLR 5 116 -278 3 609 565 260 111 23 chr15 3233940 3234130 -100260844 + ORR1C2 LTR MaLR 117 310 -84 3 609 1027 196 237 26 chr15 3235610 3235691 -100259283 + ORR1D2 LTR MaLR 1 96 -274 3 609 1027 196 237 26 chr15 3235851 3236073 -100258901 + ORR1D2 LTR MaLR 97 367 -3 3 609 1838 273 136 69 chr15 3236082 3237178 -100257796 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 1109 -471 3 609 973 186 27 103 chr15 3237176 3237439 -100257535 - ORR1E-int LTR MaLR -87 1283 1041 3 609 2901 60 34 8 chr15 3239563 3239949 -100255025 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 609 1285 276 20 3 chr15 3240532 3240877 -100254097 + ORR1E LTR MaLR 3 353 -6 3 609 1231 137 68 10 chr15 3244071 3244278 -100250696 - MTC LTR MaLR -138 283 65 4 609 360 180 0 0 chr15 3245258 3245319 -100249655 - MTC LTR MaLR -360 61 1 4 609 248 289 194 84 chr15 3245397 3245681 -100249293 + LTR88c LTR Genie? 4 318 -544 4 609 376 316 52 9 chr15 3246497 3246612 -100248362 + ORR1E LTR MaLR 10 129 -230 4 609 671 174 16 8 chr15 3254416 3254538 -100240436 + RLTR17 LTR ERVK 244 366 -326 4 609 549 325 78 57 chr15 3263113 3263394 -100231580 + LTR87 LTR ERVL? 122 408 -216 4 609 290 300 174 22 chr15 3265875 3266059 -100228915 + LTR87 LTR ERVL? 375 586 -38 4 609 629 311 60 35 chr15 3266982 3267336 -100227638 + ORR1E LTR MaLR 4 373 -6 4 609 242 277 94 47 chr15 3272730 3272836 -100222138 - MER66A LTR ERV1 -153 325 215 4 610 387 316 103 32 chr15 3278913 3279194 -100215780 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 4 610 2002 228 27 103 chr15 3287083 3287744 -100207230 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 610 334 299 58 75 chr15 3291428 3291616 -100203358 + ORR1E LTR MaLR 64 248 -111 4 610 227 284 30 0 chr15 3291685 3291752 -100203222 + ORR1E LTR MaLR 311 379 0 4 610 3071 85 0 10 chr15 3298264 3298668 -100196306 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 610 865 159 0 37 chr15 3298668 3298831 -100196143 + MTB-int LTR MaLR 1 157 -941 5 610 1030 257 63 104 chr15 3300366 3300761 -100194213 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 610 407 308 71 109 chr15 3307940 3308360 -100186614 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 1 5 610 3064 44 10 37 chr15 3310646 3311047 -100183927 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 5 610 7359 28 9 49 chr15 3311057 3312049 -100182925 + RLTR10-int LTR ERVK 41 992 -995 5 610 285 281 39 15 chr15 3312120 3312250 -100182724 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 5 610 8349 17 2 1 chr15 3312333 3313325 -100181649 + RLTR10-int LTR ERVK 992 1984 -3 5 610 3035 44 10 38 chr15 3313327 3313726 -100181248 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 5 610 2980 178 108 12 chr15 3316645 3317238 -100177736 + RLTR25B LTR ERVK 1 650 -378 5 610 2341 111 3 3 chr15 3319879 3320205 -100174769 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 357 0 5 610 544 207 57 45 chr15 3320205 3320362 -100174612 + IAPLTR4_I LTR ERVK 22 180 -1290 5 610 13030 150 8 27 chr15 3320361 3322563 -100172411 + IAPEY3-int LTR ERVK 524 2684 -4996 5 610 3034 66 91 0 chr15 3322566 3323157 -100171817 + IAPEY3-int LTR ERVK 4857 5501 -2179 5 610 4204 76 71 0 chr15 3323153 3323748 -100171226 + IAPEY3-int LTR ERVK 7044 7680 0 5 610 2475 60 3 3 chr15 3323758 3324076 -100170898 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 349 -8 5 610 245 345 55 92 chr15 3335805 3335968 -100159006 + MTEa LTR MaLR 22 178 -201 5 610 378 314 179 68 chr15 3335846 3336226 -100158748 + MLT2B5 LTR ERVL 81 502 -99 5 610 349 310 0 0 chr15 3336373 3336460 -100158514 + MTE2b LTR MaLR 1 87 -292 5 610 913 358 36 17 chr15 3339395 3339756 -100155218 + MER21B LTR ERV1 1 368 -495 5 610 311 290 72 133 chr15 3339783 3340156 -100154818 + MTEb LTR MaLR 1 361 -18 5 610 390 257 69 26 chr15 3340178 3340294 -100154680 + MER21B LTR ERV1 447 567 -296 5 610 427 258 76 23 chr15 3340363 3340494 -100154480 + MER21B LTR ERV1 587 724 -139 5 610 273 364 17 0 chr15 3355624 3355742 -100139232 + MLT1K LTR MaLR 451 570 -25 5 610 2214 175 30 2 chr15 3357270 3357666 -100137308 - MTC LTR MaLR -12 409 3 5 610 234 250 14 14 chr15 3359220 3359293 -100135681 - MamGypLTR1a LTR Gypsy -711 73 1 5 610 445 356 73 103 chr15 3367194 3367670 -100127304 + LTR16B2 LTR ERVL 1 462 0 6 610 308 234 95 61 chr15 3368150 3368294 -100126680 + MLT1A1 LTR MaLR 194 392 -16 6 610 6018 167 15 22 chr15 3368944 3370057 -100124917 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3715 4820 -941 6 610 418 355 7 14 chr15 3370654 3370794 -100124180 + LTR33 LTR ERVL 16 154 -361 6 610 280 302 93 21 chr15 3375852 3376065 -100118909 + LTR16A LTR ERVL 174 450 -1 6 610 363 293 109 54 chr15 3405057 3405099 -100089875 - MT2B2 LTR ERVL -221 363 170 6 610 333 185 43 65 chr15 3405139 3405278 -100089696 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 619 6 611 806 313 124 51 chr15 3419176 3419701 -100075273 + MLT1E3 LTR MaLR 62 624 0 6 611 3335 64 77 0 chr15 3424015 3424455 -100070519 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 474 -1 6 611 1883 279 90 12 chr15 3441849 3442427 -100052547 + MTE-int LTR MaLR 30 652 -928 7 611 523 296 24 80 chr15 3442562 3442775 -100052199 + MTE-int LTR MaLR 662 862 -718 7 611 590 274 121 73 chr15 3442749 3443079 -100051895 + ORR1E LTR MaLR 12 357 -2 7 611 226 291 0 0 chr15 3449462 3449517 -100045457 + LTR33A_ LTR ERVL 316 370 -161 7 611 2421 146 10 0 chr15 3457279 3457669 -100037305 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 611 273 362 138 0 chr15 3459849 3459965 -100035009 + MLT1L LTR MaLR 306 437 -173 7 611 623 211 148 100 chr15 3483782 3483958 -100011016 + RMER17C-int LTR ERVK 2627 2802 -436 7 611 623 243 340 69 chr15 3484092 3484381 -100010593 + RMER17C-int LTR ERVK 2803 3179 -59 7 611 1496 217 36 84 chr15 3484407 3484824 -100010150 + RMER10B LTR ERVL 2 398 0 7 611 264 303 22 11 chr15 3487735 3487825 -100007149 + MTD LTR MaLR 239 329 -90 7 611 346 195 107 7 chr15 3490278 3490390 -100004584 + MTD LTR MaLR 255 419 0 7 611 558 248 28 35 chr15 3490390 3490524 -100004450 - MTD LTR MaLR -95 324 192 7 611 520 271 47 90 chr15 3490602 3490622 -100004352 - MTD LTR MaLR -186 214 196 7 611 884 225 53 6 chr15 3490770 3490960 -100004014 - MTD LTR MaLR -210 209 13 7 611 1317 249 92 3 chr15 3496541 3496879 -99998095 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 7 611 2602 36 2 230 chr15 3497928 3498428 -99996546 + RLTR10 LTR ERVK 1 386 -4 7 611 3833 40 26 0 chr15 3498444 3499298 -99995676 + RLTR10-int LTR ERVK 41 992 -995 7 611 294 276 31 43 chr15 3499342 3499505 -99995469 + RLTR10-int LTR ERVK 1434 1594 -5987 7 611 3359 29 5 0 chr15 3499587 3500000 -99994974 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1404 -583 7 611 4886 17 0 7 chr15 3500000 3500584 -99994390 + RLTR10-int LTR ERVK 1405 1984 -3 1 611 2602 36 2 230 chr15 3500586 3501086 -99993888 + RLTR10 LTR ERVK 1 386 -4 1 611 2231 158 18 8 chr15 3509841 3510231 -99984743 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 611 356 352 50 105 chr15 3512073 3512155 -99982819 + ORR1E LTR MaLR 1 72 -287 1 611 356 352 50 105 chr15 3512254 3512514 -99982460 + ORR1E LTR MaLR 73 324 -35 1 611 233 287 12 117 chr15 3512607 3512769 -99982205 - MT2_Mm LTR ERVL -120 373 229 1 611 397 372 92 98 chr15 3519969 3520176 -99974798 - MLT1F1 LTR MaLR -2 567 346 2 611 1385 222 73 60 chr15 3520176 3520545 -99974429 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 611 397 372 92 98 chr15 3520545 3520868 -99974106 - MLT1F1 LTR MaLR -224 345 40 2 611 390 219 138 32 chr15 3523721 3523910 -99971064 + LTR37A LTR ERV1 216 424 -2 3 611 265 281 33 177 chr15 3524984 3525190 -99969784 + MLT1A LTR MaLR 1 189 -201 3 611 774 311 102 8 chr15 3535672 3535938 -99959036 + MTEa LTR MaLR 24 314 -65 5 611 596 252 9 66 chr15 3538086 3538114 -99956860 + MLT2D LTR ERVL 3 27 -387 5 611 1810 125 167 12 chr15 3538114 3538455 -99956519 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 611 596 252 9 66 chr15 3538455 3538638 -99956336 + MLT2D LTR ERVL 28 202 -212 5 612 256 326 109 30 chr15 3557024 3557125 -99937849 + LTR33 LTR ERVL 183 291 -224 9 612 1436 149 12 122 chr15 3562545 3562889 -99932085 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 125 1 612 2295 119 0 0 chr15 3575038 3575365 -99919609 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 612 1204 300 27 24 chr15 3582061 3582477 -99912497 - MTE2b LTR MaLR -14 405 1 1 612 244 369 84 60 chr15 3583361 3583528 -99911446 + MLT1H LTR MaLR 97 267 -282 1 612 911 272 141 13 chr15 3586218 3586524 -99908450 - ORR1D2 LTR MaLR -25 345 1 1 612 2152 131 3 30 chr15 3592242 3592580 -99902394 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 612 2307 175 60 52 chr15 3596788 3596997 -99897977 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 294 1 612 2307 175 60 52 chr15 3597237 3597479 -99897495 - RLTR28 LTR ERVL -231 293 64 1 612 2870 64 35 0 chr15 3597479 3597854 -99897120 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 1 612 2307 175 60 52 chr15 3597854 3597919 -99897055 - RLTR28 LTR ERVL -461 63 1 1 612 237 276 29 67 chr15 3598179 3598284 -99896690 - RMER4A LTR ERVK -358 108 8 1 612 1870 184 48 6 chr15 3600043 3600398 -99894576 + ORR1C1 LTR MaLR 9 378 0 1 612 274 317 70 0 chr15 3608879 3609030 -99885944 + LTR16B LTR ERVL 288 459 -3 1 612 284 282 11 86 chr15 3613918 3614011 -99880963 - ORR1E LTR MaLR -273 86 1 1 612 6781 61 43 2 chr15 3615783 3616676 -99878298 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 1 612 1515 329 64 46 chr15 3618335 3619010 -99875964 + MER21B LTR ERV1 58 744 -119 1 612 400 356 53 7 chr15 3623334 3623484 -99871490 + LTR40c LTR ERVL 18 174 -291 1 612 390 356 92 18 chr15 3623514 3623677 -99871297 + LTR40c LTR ERVL 207 381 -81 1 612 734 268 144 8 chr15 3624172 3624435 -99870539 + RMER15 LTR ERVL 275 573 -2 2 612 2922 131 98 45 chr15 3626944 3627861 -99867113 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 956 -2 2 612 1178 240 91 37 chr15 3628011 3628362 -99866612 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 612 604 374 68 56 chr15 3643281 3643695 -99851279 - MLT1G3 LTR MaLR -168 427 9 2 612 451 282 96 32 chr15 3644591 3644771 -99850203 + ORR1B1 LTR MaLR 65 240 -127 2 612 1889 146 48 0 chr15 3645020 3645355 -99849619 - RLTR15 LTR ERVK -8 351 1 2 612 300 269 19 7 chr15 3649890 3650004 -99844970 + MLT1A0 LTR MaLR 4 114 -294 2 612 1790 124 84 13 chr15 3650669 3650979 -99843995 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 2 612 576 271 60 101 chr15 3655135 3655402 -99839572 - MTE2a LTR MaLR -122 257 2 2 612 921 312 44 18 chr15 3659930 3660272 -99834702 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 15 2 612 419 205 107 35 chr15 3660960 3661157 -99833817 - RMER17C LTR ERVK -138 272 62 2 612 1441 267 14 20 chr15 3665118 3665578 -99829396 + MTEb-int LTR MaLR 971 1577 -3 2 612 277 254 14 27 chr15 3665577 3665628 -99829346 + MTEb LTR MaLR 2 51 -328 2 612 871 259 23 145 chr15 3665888 3666150 -99828824 + MTEb LTR MaLR 84 315 -64 2 612 871 259 23 145 chr15 3666232 3666272 -99828702 + MTEb LTR MaLR 316 349 -30 2 613 7122 102 7 33 chr15 3672036 3672439 -99822535 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 639 2 613 7122 102 7 33 chr15 3672680 3673325 -99821649 - RLTR13D5 LTR ERVK -385 638 4 2 613 975 269 33 103 chr15 3673494 3673892 -99821082 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 613 247 264 0 19 chr15 3674130 3674184 -99820790 + MLT1A1 LTR MaLR 82 134 -240 2 613 415 292 83 15 chr15 3674580 3674712 -99820262 + MLT1A1 LTR MaLR 268 408 0 2 613 1439 240 215 22 chr15 3684601 3685057 -99809917 + RMER15 LTR ERVL 27 570 -5 2 613 269 308 0 45 chr15 3692785 3692897 -99802077 + MLT1A1 LTR MaLR 294 400 -8 3 613 2344 145 20 25 chr15 3698018 3698415 -99796559 - RLTR9D LTR ERVK -4 399 5 3 613 1777 299 59 15 chr15 3698568 3699108 -99795866 - MTE-int LTR MaLR -244 1336 773 3 613 499 299 104 88 chr15 3703061 3703504 -99791470 + MLT1D LTR MaLR 1 450 -55 3 613 754 251 202 15 chr15 3703827 3704170 -99790804 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 126 3 613 343 248 61 53 chr15 3705615 3705747 -99789227 - RMER5 LTR ERV1 -401 133 1 3 613 1280 201 189 86 chr15 3706477 3706989 -99787985 + RMER4B LTR ERVK 1 565 -20 3 613 4028 169 93 58 chr15 3713551 3714423 -99780551 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 3 613 1466 221 70 3 chr15 3714813 3715158 -99779816 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 3 613 2085 159 45 6 chr15 3715625 3715978 -99778996 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 613 2083 79 68 62 chr15 3717115 3717440 -99777534 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 613 367 293 105 23 chr15 3720546 3720717 -99774257 + LTR16A1 LTR ERVL 261 445 -11 3 613 377 278 201 17 chr15 3725382 3725561 -99769413 - MER67C LTR ERV1 -414 297 86 3 613 239 314 165 23 chr15 3726694 3726912 -99768062 + LTR37A LTR ERV1 77 325 -101 3 613 852 244 139 15 chr15 3728164 3728501 -99766473 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 3 613 3923 200 83 29 chr15 3735496 3736401 -99758573 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 3 613 476 317 41 127 chr15 3737372 3737741 -99757233 - ORR1E LTR MaLR -20 339 3 3 613 383 348 118 9 chr15 3741117 3741329 -99753645 + MLT1A LTR MaLR 137 371 -3 3 613 958 308 45 40 chr15 3742455 3742807 -99752167 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 3 613 297 157 0 0 chr15 3743211 3743262 -99751712 - RLTR22_Mus LTR ERVK -216 1592 1542 3 613 578 119 40 0 chr15 3743355 3743456 -99751518 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1094 754 650 3 613 1328 186 77 58 chr15 3745065 3745391 -99749583 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1187 661 330 3 613 510 156 11 0 chr15 3745766 3745856 -99749118 + RLTR12A LTR ERVK 18 108 -460 3 613 3837 193 85 38 chr15 3745856 3746690 -99748284 + RMER19B LTR ERVK 1 873 -29 3 613 952 212 76 14 chr15 3747133 3747543 -99747431 + RLTR12A LTR ERVK 103 568 0 3 613 780 192 38 122 chr15 3749991 3750271 -99744703 + ORR1C1 LTR MaLR 8 292 -102 3 613 1494 218 10 36 chr15 3756330 3756552 -99738422 - MTD LTR MaLR -14 405 191 3 613 3036 65 35 10 chr15 3756552 3756953 -99738021 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 4 613 1494 218 10 36 chr15 3756953 3757039 -99737935 - MTD LTR MaLR -229 190 105 3 613 568 194 10 0 chr15 3763848 3763946 -99731028 - MTD LTR MaLR -301 120 22 3 613 1244 166 109 4 chr15 3765065 3765313 -99729661 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 113 4 613 4204 118 24 70 chr15 3776403 3777190 -99717784 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 4 613 1495 221 29 223 chr15 3777385 3778143 -99716831 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 613 2229 116 60 37 chr15 3779090 3779492 -99715482 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 613 4810 134 19 54 chr15 3786087 3786978 -99707996 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 119 4 613 1851 243 88 8 chr15 3796379 3796857 -99698117 + RLTR11A LTR ERVK 1 516 -12 4 613 1054 268 36 40 chr15 3797568 3797871 -99697103 + MTD LTR MaLR 103 404 -15 4 613 1278 306 48 8 chr15 3798194 3798570 -99696404 - MTD LTR MaLR -13 406 16 4 613 287 246 105 16 chr15 3798591 3798715 -99696259 - MTD-int LTR MaLR -6 1252 1118 4 614 1173 275 195 79 chr15 3804881 3804952 -99690022 - MTD-int LTR MaLR -123 1135 1044 4 614 1918 214 42 17 chr15 3804952 3805361 -99689613 - MTC LTR MaLR 0 421 3 4 614 1173 275 195 79 chr15 3805361 3806166 -99688808 - MTD-int LTR MaLR -215 1043 157 4 614 1157 281 94 69 chr15 3806174 3806714 -99688260 + MTC-int LTR MaLR 424 1385 -195 4 614 1021 203 10 15 chr15 3806714 3806914 -99688060 + MTC LTR MaLR 3 201 -220 4 614 1801 245 42 29 chr15 3807529 3807982 -99686992 - RLTR11A LTR ERVK -12 516 58 4 614 802 315 132 39 chr15 3808867 3809201 -99685773 + RMER5 LTR ERV1 4 357 -177 4 614 802 315 132 39 chr15 3809299 3809450 -99685524 + RMER5 LTR ERV1 358 534 0 4 614 3329 23 15 0 chr15 3809618 3810008 -99684966 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 614 3064 67 20 5 chr15 3844507 3844912 -99650062 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 4 614 393 309 133 29 chr15 3855470 3855643 -99639331 + LTR90A LTR LTR 775 965 -11 4 614 1771 148 72 0 chr15 3881699 3882003 -99612971 - MTC LTR MaLR -95 326 1 5 614 3250 108 241 2 chr15 3883292 3883839 -99611135 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 5 614 385 207 120 8 chr15 3887165 3887282 -99607692 + RLTR15 LTR ERVK 1 130 -229 5 614 243 300 72 61 chr15 3887316 3887579 -99607395 + RLTR15 LTR ERVK 84 349 -10 5 614 2156 93 26 7 chr15 3889639 3889942 -99605032 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 5 614 372 54 5 8 chr15 3889967 3890020 -99604954 + RLTR10-int LTR ERVK 163 267 -7314 5 614 680 232 49 16 chr15 3890054 3890238 -99604736 + RLTR10-int LTR ERVK 655 844 -1143 5 614 3725 311 44 33 chr15 3890637 3893121 -99601853 + IAP-d-int LTR ERVK 705 3120 -3422 5 614 2468 302 37 41 chr15 3901090 3902869 -99592105 + IAP-d-int LTR ERVK 3706 5477 -2104 5 614 282 305 0 0 chr15 3903400 3903505 -99591469 + IAP-d-int LTR ERVK 6965 7069 -512 5 614 1328 165 0 65 chr15 3903640 3903918 -99591056 + IAP-d-int LTR ERVK 7321 7580 -1 5 614 2244 107 3 3 chr15 3903925 3904234 -99590740 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 5 614 983 246 123 11 chr15 3905217 3905539 -99589435 - ORR1D1 LTR MaLR -1 378 1 5 614 2886 30 0 3 chr15 3906392 3906730 -99588244 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 614 948 281 87 17 chr15 3910020 3910364 -99584610 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 5 614 2271 189 39 54 chr15 3911955 3912491 -99582483 - RMER19B LTR ERVK 0 902 375 5 614 4965 101 22 73 chr15 3912493 3913339 -99581635 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 5 614 1181 217 57 88 chr15 3913346 3913730 -99581244 - RMER19B LTR ERVK -530 372 1 5 614 258 319 118 25 chr15 3918499 3918618 -99576356 + ORR1E LTR MaLR 20 149 -210 5 614 230 235 60 24 chr15 3918724 3918807 -99576167 + ORR1E LTR MaLR 294 379 0 5 614 1472 201 134 44 chr15 3924036 3924379 -99570595 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 614 278 214 165 0 chr15 3930252 3930355 -99564619 + RMER5 LTR ERV1 353 472 -62 5 615 1179 162 80 216 chr15 3937268 3937708 -99557266 + ORR1C2 LTR MaLR 3 382 -2 5 615 301 287 78 85 chr15 3938298 3938309 -99556665 - MT2B LTR ERVL -304 297 246 5 615 301 287 78 85 chr15 3938424 3938439 -99556535 - MT2B LTR ERVL -304 245 158 5 615 774 251 55 33 chr15 3940329 3940682 -99554292 + BGLII_B LTR ERVK 201 553 0 5 615 232 271 17 0 chr15 3948614 3948673 -99546301 - LTR41 LTR ERVL -230 538 479 6 615 3847 140 65 21 chr15 3948807 3949470 -99545504 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 6 615 241 350 0 30 chr15 3949584 3949684 -99545290 - LTR41 LTR ERVL -327 441 345 6 615 497 322 123 9 chr15 3949753 3949972 -99545002 - LTR41 LTR ERVL -522 246 3 6 615 1909 165 41 33 chr15 3953114 3953503 -99541471 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 6 615 1861 155 233 25 chr15 3954785 3954860 -99540114 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 443 6 615 1861 155 233 25 chr15 3954897 3955258 -99539716 - RLTR12B LTR ERVK -86 442 2 6 615 4538 55 5 17 chr15 3955312 3955888 -99539086 - RLTR44-int LTR ERVK 0 2812 2244 6 615 486 253 47 53 chr15 3955916 3956176 -99538798 - IAPEz-int LTR ERVK -3879 3801 3507 6 615 3507 120 5 48 chr15 3956235 3956843 -99538131 - RLTR44-int LTR ERVK -1473 1339 798 6 615 723 144 17 0 chr15 3956844 3956962 -99538012 - RLTR44-int LTR ERVK -1882 930 811 6 615 304 195 16 33 chr15 3957281 3957373 -99537601 - MTEb LTR MaLR -2 372 278 6 615 2019 154 58 22 chr15 3957445 3957809 -99537165 - RLTR14 LTR ERV1 -3 379 3 6 615 1079 257 62 88 chr15 3960725 3960833 -99534141 - RLTR12B LTR ERVK -5 522 413 6 615 3202 63 8 0 chr15 3960833 3961230 -99533744 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 615 1079 231 39 90 chr15 3961230 3961636 -99533338 - RLTR12B LTR ERVK -105 423 42 6 615 354 324 76 52 chr15 3962573 3962792 -99532182 - ORR1E LTR MaLR -145 214 1 6 615 2379 153 0 31 chr15 3964411 3964803 -99530171 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 6 615 2108 120 6 0 chr15 3965132 3965457 -99529517 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 615 2068 131 0 78 chr15 3966926 3967283 -99527691 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 615 543 195 69 139 chr15 3968303 3968505 -99526469 + RMER13A LTR ERVK 5 192 -716 6 615 1820 144 25 6 chr15 3968556 3968877 -99526097 + RMER13A LTR ERVK 164 490 -370 6 615 747 216 169 14 chr15 3968875 3969082 -99525892 + RMER13A LTR ERVK 618 856 -4 6 615 289 151 99 55 chr15 3969179 3969236 -99525738 - MTEb LTR MaLR 0 379 319 6 615 459 235 0 9 chr15 3970381 3970497 -99524477 + MLT1A0 LTR MaLR 35 149 -216 6 615 1041 229 103 16 chr15 3970557 3970877 -99524097 - MER57C2 LTR ERV1 0 434 87 6 615 1037 258 63 16 chr15 3971243 3971558 -99523416 - ORR1D2 LTR MaLR -40 330 1 6 615 1607 240 61 12 chr15 3971558 3971967 -99523007 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 942 6 615 1916 286 88 50 chr15 3972418 3973329 -99521645 - ORR1D2-int LTR MaLR -425 945 1 6 615 431 221 0 31 chr15 3973340 3973438 -99521536 - ORR1D2 LTR MaLR -18 352 258 6 615 237 211 88 50 chr15 3983832 3983912 -99511062 - MLT1A1 LTR MaLR -18 390 308 6 615 624 89 33 0 chr15 3986112 3986202 -99508772 + RMER6C LTR ERVK 1 93 -597 6 615 1325 219 58 82 chr15 3986206 3986885 -99508089 + RMER6C LTR ERVK 200 720 0 6 615 827 311 26 19 chr15 3988933 3989241 -99505733 - RMER15 LTR ERVL -3 572 263 6 615 271 218 42 84 chr15 3989224 3989319 -99505655 - RMER15 LTR ERVL -415 160 70 6 615 1641 167 51 9 chr15 3999008 3999340 -99495634 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 29 7 615 1144 174 266 8 chr15 3999341 3999667 -99495307 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 7 615 1894 216 48 17 chr15 4000128 4000608 -99494366 - RLTR17 LTR ERVK -73 619 125 2 615 2138 113 3 3 chr15 4001728 4002057 -99492917 + ORR1A1 LTR MaLR 10 338 -8 4 615 1321 156 24 20 chr15 4011171 4011420 -99483554 - MTD LTR MaLR 0 419 170 1 615 2442 161 5 19 chr15 4021531 4021944 -99473030 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 615 2986 85 5 0 chr15 4023598 4023996 -99470978 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 615 1748 146 32 78 chr15 4025925 4026296 -99468678 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 3 615 1235 164 0 0 chr15 4026308 4026521 -99468453 + MTC LTR MaLR 1 213 -208 4 615 2087 100 10 0 chr15 4032225 4032535 -99462439 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 15 4 615 236 290 79 10 chr15 4035033 4035134 -99459840 + RLTR25A LTR ERVK 1 108 -920 5 615 275 296 41 76 chr15 4036024 4036196 -99458778 + RLTR25A LTR ERVK 938 1103 0 5 615 2256 41 253 3 chr15 4037178 4037498 -99457476 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 615 714 264 47 50 chr15 4040074 4040413 -99454561 - RLTR15 LTR ERVK -21 338 1 6 615 2217 151 114 0 chr15 4050191 4050569 -99444405 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 615 2144 46 50 3 chr15 4058463 4058745 -99436229 - ORR1A1 LTR MaLR -51 295 1 8 615 5652 60 42 1 chr15 4058745 4059528 -99435446 - ORR1A1-int LTR MaLR -79 1713 932 8 615 279 316 12 12 chr15 4061762 4061842 -99433132 + MER21B LTR ERV1 253 332 -531 9 615 638 316 71 47 chr15 4061873 4062212 -99432762 + MER21B LTR ERV1 385 731 -132 9 616 317 372 27 27 chr15 4075000 4075149 -99419825 - MLT1J2 LTR MaLR -238 210 62 1 616 2939 98 84 33 chr15 4076624 4077076 -99417898 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 616 2426 178 114 6 chr15 4085393 4085868 -99409106 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 1 1 616 347 123 321 0 chr15 4085907 4085988 -99408986 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -28 2298 2192 1 616 536 59 0 0 chr15 4085990 4086058 -99408916 + RMER17A LTR ERVK 1 68 -683 1 616 276 53 0 0 chr15 4086058 4086096 -99408878 - RMER17A LTR ERVK -713 38 1 1 616 3196 208 138 15 chr15 4086096 4086943 -99408031 - MYSERV-int LTR ERVK -119 6431 5481 1 616 3447 62 2 5 chr15 4090062 4090470 -99404504 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 616 3699 62 22 6 chr15 4114640 4115128 -99379846 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 1 616 2530 172 72 136 chr15 4116536 4117189 -99377785 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 616 1413 221 124 15 chr15 4117806 4118252 -99376722 + RMER15 LTR ERVL 22 575 0 1 616 632 280 66 39 chr15 4120242 4120364 -99374610 - LTR41 LTR ERVL -3 755 644 1 616 632 336 105 98 chr15 4120510 4121142 -99373832 - LTR41 LTR ERVL -125 643 3 1 616 1256 199 171 95 chr15 4126417 4127085 -99367889 - RMER6C LTR ERVK 0 720 5 1 616 917 215 56 0 chr15 4131372 4131567 -99363407 - RMER6D LTR ERVK 0 720 515 1 616 1092 280 75 10 chr15 4131973 4132280 -99362694 + MTE2a LTR MaLR 51 377 -2 2 616 1362 249 51 31 chr15 4135005 4135358 -99359616 - MTE2a LTR MaLR -2 377 18 2 616 474 301 30 0 chr15 4149106 4149239 -99345735 - MER21B LTR ERV1 -515 348 212 2 616 1077 318 89 14 chr15 4150027 4150454 -99344520 + MER21B LTR ERV1 382 840 -23 2 616 2180 177 61 45 chr15 4153248 4153739 -99341235 + RLTR28 LTR ERVL 1 499 -25 2 616 1476 193 64 25 chr15 4153880 4154283 -99340691 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 135 2 616 301 294 15 80 chr15 4154316 4154453 -99340521 + MLT1A LTR MaLR 237 364 -10 2 616 2022 125 23 82 chr15 4154575 4154678 -99340296 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 293 2 616 2022 125 23 82 chr15 4154701 4154988 -99339986 - RLTR9A LTR ERVK -76 292 1 2 616 949 305 34 59 chr15 4155550 4155937 -99339037 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 2 616 1324 198 142 89 chr15 4160011 4160288 -99334686 + MTD LTR MaLR 1 292 -127 2 616 1324 198 142 89 chr15 4160434 4160549 -99334425 + MTD LTR MaLR 293 414 -5 2 616 859 201 197 68 chr15 4163468 4163793 -99331181 + RLTR9A LTR ERVK 2 368 0 2 616 383 280 62 92 chr15 4173113 4173353 -99321621 - RMER4B LTR ERVK -319 266 34 2 616 293 338 72 31 chr15 4173485 4173708 -99321266 + HERV16-int LTR ERVL 213 444 -4552 2 616 307 369 46 9 chr15 4174407 4174626 -99320348 + HERV16-int LTR ERVL 957 1183 -3813 2 616 388 293 141 30 chr15 4174631 4174859 -99320115 + MLT2D LTR ERVL 48 309 -88 2 616 452 313 122 65 chr15 4177685 4178071 -99316903 - MLT1C LTR MaLR -6 461 54 2 616 666 351 96 21 chr15 4179623 4179955 -99315019 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 9 2 616 1796 219 29 31 chr15 4181312 4181731 -99313243 - MTD LTR MaLR 0 419 2 2 616 1344 274 51 71 chr15 4183589 4183718 -99311256 + RMER5 LTR ERV1 1 128 -406 2 616 1344 274 51 71 chr15 4183910 4184314 -99310660 + RMER5 LTR ERV1 129 523 -11 2 616 250 337 9 37 chr15 4184716 4184824 -99310150 - MLT1A0 LTR MaLR -258 107 3 2 616 1572 199 89 3 chr15 4185473 4185800 -99309174 + RMER5 LTR ERV1 2 356 -178 2 616 954 159 65 0 chr15 4188050 4188220 -99306754 + RMER5 LTR ERV1 354 534 0 2 616 357 312 112 25 chr15 4191608 4191805 -99303169 + LTR50 LTR ERVL 3 216 -579 3 616 675 360 41 34 chr15 4192372 4192760 -99302214 + MLT1C LTR MaLR 77 467 0 3 617 371 273 87 67 chr15 4196295 4196444 -99298530 + MTEa LTR MaLR 208 368 -11 3 617 353 333 56 14 chr15 4197672 4197715 -99297259 - MLT2B1 LTR ERVL -153 367 324 3 617 353 333 56 14 chr15 4197736 4197835 -99297139 - MLT2B1 LTR ERVL -197 323 220 3 617 703 308 99 28 chr15 4197857 4198233 -99296741 - MLT2B4 LTR ERVL -75 487 13 3 617 378 271 40 43 chr15 4199310 4199539 -99295435 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 3 617 641 212 42 0 chr15 4202644 4202762 -99292212 - ETnERV2-int LTR ERVK -214 7192 7070 3 617 370 389 83 25 chr15 4208975 4209215 -99285759 - LTR88c LTR Genie? -591 271 18 3 617 257 362 73 53 chr15 4209517 4209762 -99285212 + ORR1E LTR MaLR 102 351 -8 3 617 260 169 67 17 chr15 4211358 4211418 -99283556 - MLT1K LTR MaLR -7 588 526 3 617 3259 43 5 2 chr15 4213526 4213921 -99281053 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 617 388 187 18 0 chr15 4215237 4215331 -99279643 - MTEa LTR MaLR -281 98 1 3 617 1869 222 60 46 chr15 4217923 4218405 -99276569 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 128 3 617 1856 135 55 10 chr15 4219572 4219879 -99275095 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 3 617 231 274 0 0 chr15 4223852 4223903 -99271071 - ORR1E LTR MaLR -245 114 64 3 617 8399 125 43 97 chr15 4225466 4225696 -99269278 - RLTR21 LTR ERVK -27 1545 1305 3 617 8399 125 43 97 chr15 4225754 4227156 -99267818 - RLTR21 LTR ERVK -268 1304 2 3 617 3093 73 10 0 chr15 4240963 4241359 -99253615 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 617 2370 196 35 106 chr15 4241422 4242080 -99252894 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 617 464 155 73 184 chr15 4242194 4242336 -99252638 + RMER17C LTR ERVK 46 184 -226 3 617 464 155 73 184 chr15 4242509 4242627 -99252347 + RMER17C LTR ERVK 185 277 -133 3 617 368 262 39 26 chr15 4242912 4242964 -99252010 + RMER10B LTR ERVL 193 245 -153 3 617 368 262 39 26 chr15 4243142 4243242 -99251732 + RMER10B LTR ERVL 246 347 -51 3 617 3302 50 0 0 chr15 4244362 4244758 -99250216 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 617 731 304 20 170 chr15 4244936 4245336 -99249638 - MTEb LTR MaLR -34 345 6 3 617 785 221 37 52 chr15 4254067 4254394 -99240580 + MTD LTR MaLR 1 368 -51 3 617 290 363 44 0 chr15 4254408 4254499 -99240475 + MLT2D LTR ERVL 134 228 -236 3 617 309 323 22 30 chr15 4254534 4254668 -99240306 + MLT2D LTR ERVL 380 512 -48 3 617 277 274 52 10 chr15 4256473 4256569 -99238405 + MTEb LTR MaLR 272 371 -8 3 617 1230 283 13 76 chr15 4256952 4257349 -99237625 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 3 617 570 293 29 36 chr15 4258363 4258590 -99236384 + MTE2a LTR MaLR 30 230 -149 3 617 1245 78 6 6 chr15 4258544 4258711 -99236263 + LTRIS2 LTR ERV1 398 564 0 3 617 298 209 45 0 chr15 4259270 4259337 -99235637 + RMER16-int LTR ERVK 257 326 -5080 3 617 544 163 0 0 chr15 4259329 4259421 -99235553 + RMER16-int LTR ERVK 679 770 -4636 3 617 3430 113 23 21 chr15 4259422 4259991 -99234983 + RMER16-int LTR ERVK 875 1444 -3962 3 617 2672 205 157 11 chr15 4259982 4260762 -99234212 + MuRRS4-int LTR ERV1 760 1629 -3434 3 617 7493 118 60 14 chr15 4260940 4263315 -99231659 + MuRRS4-int LTR ERV1 1117 4271 -792 3 617 820 239 26 0 chr15 4263306 4263532 -99231442 + MuRRS4-int LTR ERV1 4788 5019 -44 3 617 3595 58 4 34 chr15 4263535 4264032 -99230942 + LTRIS2 LTR ERV1 1 482 -82 3 617 453 309 28 50 chr15 4264147 4264361 -99230613 + MTE2a LTR MaLR 196 404 -15 3 617 2481 187 20 34 chr15 4267457 4267993 -99226981 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 4 617 859 315 189 31 chr15 4269310 4269628 -99225346 + ORR1E LTR MaLR 1 368 -11 4 617 2456 345 77 51 chr15 4270443 4272200 -99222774 - RMER15-int LTR ERVL -3162 1837 44 4 617 2456 345 77 51 chr15 4272236 4272267 -99222707 - RMER15-int LTR ERVL -4956 43 6 4 617 729 321 40 66 chr15 4272267 4272728 -99222246 - RMER15 LTR ERVL -3 572 3 4 617 534 259 137 42 chr15 4273093 4273412 -99221562 + RMER20B LTR ERVK 132 466 -50 4 617 313 286 61 117 chr15 4275729 4275959 -99219015 + MLT1C LTR MaLR 1 217 -250 4 617 284 259 82 50 chr15 4275996 4276174 -99218800 + MLT1C LTR MaLR 251 467 0 4 617 318 73 0 0 chr15 4281422 4281463 -99213511 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 338 4 617 2469 122 31 50 chr15 4281467 4281888 -99213086 - MTC LTR MaLR -8 413 1 4 617 282 281 43 86 chr15 4283081 4283221 -99211753 - RLTR41 LTR ERV1 -62 384 251 4 617 802 179 25 19 chr15 4285677 4285836 -99209138 - RLTR13D4 LTR ERVK 0 1033 874 4 617 3898 120 243 12 chr15 4289716 4290473 -99204501 - RLTR13D4 LTR ERVK -101 932 1 4 617 1760 120 93 3 chr15 4292814 4293114 -99201860 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 4 617 982 319 64 12 chr15 4293632 4293975 -99200999 + MLT1A0 LTR MaLR 1 361 -4 4 617 1036 224 172 26 chr15 4298760 4299108 -99195866 - RLTR9E LTR ERVK -5 404 6 4 617 463 79 25 62 chr15 4299123 4299204 -99195770 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7329 4 617 799 211 274 11 chr15 4299204 4299502 -99195472 - RLTR13D6 LTR ERVK -365 537 162 4 617 292 204 0 0 chr15 4299504 4299558 -99195416 - ETnERV2-int LTR ERVK -196 7210 7157 4 617 8245 218 35 22 chr15 4299558 4302185 -99192789 - ETnERV2-int LTR ERVK -2166 5240 1790 4 617 1032 147 0 11 chr15 4302423 4302602 -99192372 - ETnERV2-int LTR ERVK -1659 1655 1479 4 617 7448 157 53 52 chr15 4302644 4303582 -99191392 - ETnERV2-int LTR ERVK -1794 1520 538 4 617 7448 157 53 52 chr15 4303650 4304160 -99190814 - ETnERV2-int LTR ERVK -1794 537 2 4 617 1049 206 167 53 chr15 4304161 4304520 -99190454 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 10 4 617 398 224 0 130 chr15 4305183 4305306 -99189668 - MT2B LTR ERVL -337 264 158 4 617 2621 199 21 45 chr15 4306239 4306798 -99188176 - RLTR5_Mm LTR ERV1 0 628 83 4 617 1104 260 48 32 chr15 4307856 4308166 -99186808 + MTE2b LTR MaLR 61 375 -4 4 617 1416 181 156 3 chr15 4313665 4313992 -99180982 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 10 4 617 1132 234 192 0 chr15 4314951 4315263 -99179711 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 4 617 920 300 16 20 chr15 4318350 4318605 -99176369 + MTEa LTR MaLR 126 379 0 4 617 2454 148 16 3 chr15 4320918 4321292 -99173682 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 16 4 617 1130 276 14 114 chr15 4322645 4323083 -99171891 + MTD LTR MaLR 6 399 -20 4 617 980 246 31 9 chr15 4323439 4323665 -99171309 + MLT2C2 LTR ERVL 8 238 -226 4 618 2803 161 9 5 chr15 4348453 4348897 -99146077 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 618 269 266 76 0 chr15 4350423 4350502 -99144472 + MTEb LTR MaLR 294 378 -1 5 618 1088 328 68 8 chr15 4351399 4351799 -99143175 - MER68 LTR ERVL -139 424 1 5 618 415 283 65 54 chr15 4355216 4355552 -99139422 + MER31B LTR ERV1 1 654 -7 5 618 288 328 83 30 chr15 4371725 4371857 -99123117 + MLT1A0 LTR MaLR 86 224 -141 5 618 2928 172 100 31 chr15 4371989 4372631 -99122343 - RMER6C LTR ERVK -4 686 1 5 618 366 315 74 92 chr15 4372911 4373016 -99121958 - LTR87 LTR ERVL? -44 580 488 5 618 366 315 74 92 chr15 4373163 4373274 -99121700 - LTR87 LTR ERVL? -137 487 368 5 618 2138 168 8 8 chr15 4375790 4376145 -99118829 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 13 5 618 675 299 94 94 chr15 4378803 4379143 -99115831 - MLT1A0 LTR MaLR -23 342 3 5 618 1152 267 83 14 chr15 4382492 4382842 -99112132 + MTE2b LTR MaLR 6 379 0 5 618 739 251 94 5 chr15 4386395 4386587 -99108387 + MTD LTR MaLR 2 210 -209 5 618 565 294 45 0 chr15 4386958 4387135 -99107839 + MTD LTR MaLR 203 387 -32 5 618 571 286 40 26 chr15 4392082 4392233 -99102741 - ORR1D2 LTR MaLR -198 172 20 5 618 292 351 77 24 chr15 4397578 4397747 -99097227 - MLT1J LTR MaLR -35 477 300 5 618 971 204 52 136 chr15 4398469 4398888 -99096086 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 618 1167 141 42 0 chr15 4401234 4401425 -99093549 - RMER12 LTR ERVK -1120 202 4 5 618 2927 46 0 0 chr15 4415110 4415456 -99079518 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 618 2942 35 9 0 chr15 4416927 4417270 -99077704 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 618 13861 55 11 1 chr15 4417270 4419044 -99075930 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 6 618 3088 17 0 0 chr15 4419044 4419390 -99075584 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 618 5588 35 10 0 chr15 4429826 4430509 -99064465 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 690 -132 6 618 6609 187 10 26 chr15 4430673 4432283 -99062691 + ETnERV3-int LTR ERVK 186 1685 -5568 6 618 252 315 54 122 chr15 4444422 4444570 -99050404 - MT2B LTR ERVL -341 260 123 6 618 2486 47 6 0 chr15 4444694 4445013 -99049961 + MTA_Mm LTR MaLR 22 342 -54 6 618 656 245 34 0 chr15 4446311 4446458 -99048516 + ORR1D2 LTR MaLR 1 152 -218 6 618 537 286 122 25 chr15 4447090 4447294 -99047680 + ORR1D2 LTR MaLR 144 367 -3 6 619 1838 185 15 64 chr15 4461114 4461506 -99033468 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 5 6 619 653 274 28 64 chr15 4465618 4465836 -99029138 - MTEb LTR MaLR 0 379 170 6 619 384 291 124 25 chr15 4467476 4467687 -99027287 - MLT1B LTR MaLR -163 304 60 6 619 494 280 72 136 chr15 4472363 4472603 -99022371 - MER67D LTR ERV1 -150 364 133 6 619 494 280 72 136 chr15 4472791 4472875 -99022099 - MER67D LTR ERV1 -382 132 61 6 619 494 280 72 136 chr15 4473407 4473457 -99021517 - MER67D LTR ERV1 -454 60 13 6 619 244 267 9 106 chr15 4474191 4474304 -99020670 + MT2B LTR ERVL 156 257 -344 6 619 2772 162 6 61 chr15 4477315 4477854 -99017120 - ORR1A3-int LTR MaLR -1453 510 2 6 619 2000 118 9 77 chr15 4477855 4478204 -99016770 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 6 619 528 329 149 32 chr15 4478569 4478917 -99016057 - MER90 LTR ERV1 -184 391 3 7 619 3215 40 25 0 chr15 4489343 4489744 -99005230 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 7 619 1126 269 91 15 chr15 4491702 4492042 -99002932 + MTE2b LTR MaLR 6 371 -8 7 619 2241 203 39 2 chr15 4496593 4497101 -98997873 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 7 619 520 390 78 35 chr15 4507858 4508230 -98986744 - LTR16A LTR ERVL -2 449 62 9 619 1122 147 59 9 chr15 4509581 4509871 -98985103 - RLTR1B-int LTR ERV1 -486 2813 2669 1 619 668 34 0 33 chr15 4509858 4509950 -98985024 - RLTR1B-int LTR ERV1 -744 2555 2467 1 619 2907 71 81 46 chr15 4510087 4510546 -98984428 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 619 944 192 40 32 chr15 4510580 4510828 -98984146 + MuRRS4-int LTR ERV1 4788 5037 -26 1 619 2988 81 24 5 chr15 4510828 4511237 -98983737 + LTRIS2 LTR ERV1 69 485 -79 1 619 290 322 22 11 chr15 4517159 4517250 -98977724 + MLT1A LTR MaLR 232 323 -51 2 619 1931 316 118 21 chr15 4521056 4522037 -98972937 + MTE-int LTR MaLR 366 1553 -27 2 619 820 283 178 42 chr15 4522410 4522742 -98972232 + MTEb LTR MaLR 1 377 -2 3 619 1625 234 17 39 chr15 4532003 4532363 -98962611 - MTD LTR MaLR 0 419 68 4 619 2152 138 8 3 chr15 4542261 4542618 -98952356 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 5 619 316 311 51 15 chr15 4543236 4543373 -98951601 - LTR65 LTR ERV1 -284 385 244 5 619 242 294 63 49 chr15 4543410 4543553 -98951421 - LTR65 LTR ERV1 -524 145 1 5 619 256 359 56 77 chr15 4543574 4543770 -98951204 - MLT1K LTR MaLR -18 577 386 5 619 1410 155 42 68 chr15 4545500 4545828 -98949146 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 406 -3 5 619 4854 71 3 17 chr15 4545828 4546516 -98948458 + ETnERV-int LTR ERVK 12 689 -2625 5 619 14528 124 26 24 chr15 4546507 4549427 -98945547 + ETnERV2-int LTR ERVK 3219 7208 -198 5 619 1574 130 43 61 chr15 4549427 4549755 -98945219 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 619 3335 134 35 95 chr15 4569938 4570735 -98924239 - RMER17A LTR ERVK -2 749 1 8 619 426 97 0 0 chr15 4573870 4573932 -98921042 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 329 8 619 1853 197 21 3 chr15 4575540 4575871 -98919103 - ORR1B1 LTR MaLR -57 337 1 8 619 238 351 64 70 chr15 4579073 4579260 -98915714 + MLT1J LTR MaLR 69 254 -258 9 619 3395 30 5 0 chr15 4585747 4586141 -98908833 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 620 231 387 25 0 chr15 4592784 4592903 -98902071 + MLT1J2 LTR MaLR 62 183 -265 1 620 3041 64 28 3 chr15 4614346 4614736 -98880238 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 620 1010 214 15 5 chr15 4615723 4615920 -98879054 + MTC LTR MaLR 18 216 -205 1 620 230 412 71 62 chr15 4626745 4626970 -98868004 - LTR81A LTR ERV1? -678 672 446 1 620 2253 117 11 36 chr15 4632231 4632594 -98862380 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 1 620 3298 163 70 21 chr15 4632599 4633313 -98861661 + IAPEy-int LTR ERVK 1 749 -6764 1 620 325 137 103 21 chr15 4633355 4633452 -98861522 + IAPEy-int LTR ERVK 848 952 -6629 1 620 1128 189 74 16 chr15 4633564 4633806 -98861168 + RMER16-int LTR ERVK 251 506 -4900 1 620 421 71 0 0 chr15 4633898 4633954 -98861020 + IAPEy-int LTR ERVK 3567 3622 -3784 1 620 567 49 24 12 chr15 4633953 4634035 -98860939 + IAPEy-int LTR ERVK 4567 4649 -2932 1 620 3191 84 0 14 chr15 4634314 4634760 -98860214 + IAPEy-int LTR ERVK 5203 5642 -1939 1 620 3332 75 0 7 chr15 4634751 4635208 -98859766 + IAPEy-int LTR ERVK 5761 6214 -1367 1 620 4191 104 0 6 chr15 4635198 4635828 -98859146 + IAPEy-int LTR ERVK 6735 7360 -153 1 620 1222 105 21 5 chr15 4635834 4636026 -98858948 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 160 354 -3 1 620 7397 97 29 28 chr15 4647107 4648205 -98846769 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1099 -15 1 620 3233 86 5 78 chr15 4648205 4648772 -98846202 + RMER17A LTR ERVK 1 526 -225 1 620 438 287 114 24 chr15 4650065 4650274 -98844700 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 1 620 1480 200 44 39 chr15 4650349 4650755 -98844219 - RMER17C LTR ERVK -2 408 1 1 620 819 309 57 40 chr15 4651839 4652315 -98842659 + RLTR12B LTR ERVK 39 522 -6 1 620 2695 203 18 29 chr15 4652334 4652887 -98842087 + RLTR1D LTR ERV1 59 605 0 1 620 434 238 36 58 chr15 4654111 4654249 -98840725 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 296 1 620 13866 173 50 29 chr15 4665931 4667587 -98827387 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1552 4209 2537 1 620 13866 173 49 28 chr15 4667647 4668696 -98826278 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3225 2536 1449 1 620 2832 133 2 17 chr15 4668696 4669156 -98825818 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 1 620 444 215 6 139 chr15 4669160 4669333 -98825641 - MYSERV-int LTR ERVK -1 6549 6400 1 620 647 235 56 17 chr15 4669333 4669560 -98825414 - MT2A LTR ERVL -118 483 95 1 620 600 221 57 82 chr15 4669536 4669694 -98825280 - MT2A LTR ERVL -379 154 1 1 620 1003 230 143 42 chr15 4671384 4671720 -98823254 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 620 3042 163 69 42 chr15 4682312 4682977 -98811997 + RMER6C LTR ERVK 3 685 -5 1 620 1078 248 189 13 chr15 4698535 4698853 -98796121 - MTD LTR MaLR -39 380 7 2 620 238 336 25 41 chr15 4702310 4702431 -98792543 - ORR1E LTR MaLR -238 121 3 2 620 1581 158 205 0 chr15 4706002 4706319 -98788655 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 2 620 1742 201 13 18 chr15 4707566 4707807 -98787167 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 133 2 620 1742 201 13 18 chr15 4707833 4707971 -98787003 - ORR1C1 LTR MaLR -246 132 1 2 620 2001 226 14 62 chr15 4708806 4709379 -98785595 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 553 0 2 621 612 202 7 35 chr15 4735499 4735640 -98759334 + MTD LTR MaLR 1 120 -276 2 621 2795 48 75 3 chr15 4735856 4736229 -98758745 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 621 236 349 60 27 chr15 4736235 4736385 -98758589 - MamGypLTR2c LTR Gypsy -28 1040 886 2 621 436 240 20 0 chr15 4741572 4741672 -98753302 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 273 2 621 866 249 0 16 chr15 4741683 4741867 -98753107 - ORR1D2 LTR MaLR -187 183 3 2 621 1862 161 82 0 chr15 4742066 4742407 -98752567 - ORR1C1 LTR MaLR -7 371 3 2 621 809 312 22 81 chr15 4745598 4745957 -98749017 - ORR1E LTR MaLR -21 338 1 2 621 2949 61 200 9 chr15 4751351 4751781 -98743193 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 621 2067 138 3 9 chr15 4753004 4753327 -98741647 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 2 621 3280 116 6 8 chr15 4766152 4766648 -98728326 + RLTR1C LTR ERV1 1 495 -8 2 621 681 395 97 0 chr15 4773871 4774261 -98720713 + MLT1G LTR MaLR 155 582 -9 3 621 336 324 106 21 chr15 4776335 4776477 -98718497 - MLT1D LTR MaLR -7 498 345 3 621 447 266 165 0 chr15 4776535 4776575 -98718399 - MLT1D LTR MaLR -264 241 194 3 621 447 266 165 0 chr15 4776599 4776746 -98718228 - MLT1D LTR MaLR -312 193 24 3 621 701 237 6 31 chr15 4780932 4781093 -98713881 + MTE2b LTR MaLR 3 159 -220 3 621 324 250 24 24 chr15 4781092 4781174 -98713800 + MTE2b LTR MaLR 95 176 -203 3 621 594 274 143 10 chr15 4781156 4781359 -98713615 + MTEa LTR MaLR 96 325 -54 3 621 1764 120 11 4 chr15 4784515 4784782 -98710192 + RLTR9A LTR ERVK 1 269 -99 3 621 2870 18 74 20 chr15 4784782 4784958 -98710016 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 177 -234 3 621 2007 109 28 19 chr15 4784958 4785277 -98709697 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 621 2870 18 74 20 chr15 4785277 4785490 -98709484 + IAPLTR2a LTR ERVK 178 411 0 3 621 784 76 0 0 chr15 4785490 4785595 -98709379 + RLTR9A LTR ERVK 264 368 0 3 621 329 275 0 24 chr15 4786417 4786499 -98708475 - RMER15 LTR ERVL -32 543 464 3 621 489 299 112 46 chr15 4788359 4788685 -98706289 - RMER15 LTR ERVL -138 437 1 3 621 274 358 25 0 chr15 4788892 4788973 -98706001 + MLT1H2 LTR MaLR 71 153 -336 3 621 887 262 87 62 chr15 4789183 4789472 -98705502 + RMER21B LTR ERV1 269 564 -278 3 621 2288 156 22 65 chr15 4799855 4800301 -98694673 - RMER4A LTR ERVK 0 466 40 3 621 3225 19 0 73 chr15 4802040 4802436 -98692538 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 621 56329 23 17 3 chr15 4802436 4808821 -98686153 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 3 621 3225 19 0 73 chr15 4808821 4809217 -98685757 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 621 1052 182 96 99 chr15 4825951 4826186 -98668788 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 223 -99 3 621 1052 182 96 99 chr15 4826267 4826354 -98668620 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 224 321 -1 3 621 3615 35 2 0 chr15 4827159 4827554 -98667420 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 621 9093 48 16 10 chr15 4827554 4828646 -98666328 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 621 3201 46 62 0 chr15 4828646 4829019 -98665955 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 621 494 302 114 77 chr15 4830135 4830626 -98664348 - RLTR11A2 LTR ERVK -18 509 1 3 621 230 300 54 22 chr15 4842048 4842140 -98652834 + RLTR13A2 LTR ERVK 422 516 -442 3 621 2220 159 55 20 chr15 4842428 4842827 -98652147 - MTC LTR MaLR -8 413 1 3 621 630 164 24 251 chr15 4843261 4843472 -98651502 + RMER19B LTR ERVK 1 163 -739 3 622 1847 216 104 39 chr15 4857167 4857649 -98637325 - RMER15 LTR ERVL -36 539 27 4 622 228 233 32 48 chr15 4864491 4864554 -98630420 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 304 4 622 288 287 101 40 chr15 4864626 4864775 -98630199 - MLT1A0 LTR MaLR -207 158 1 4 622 257 293 35 86 chr15 4870769 4870967 -98624007 + RMER17A2 LTR ERVK 230 417 -489 4 622 308 215 0 37 chr15 4876615 4876697 -98618277 - ORR1E LTR MaLR -13 366 288 4 622 348 303 48 16 chr15 4876793 4876917 -98618057 - ORR1E LTR MaLR -231 128 1 4 622 1176 89 0 6 chr15 4878900 4879058 -98615916 + ORR1A2 LTR MaLR 1 157 -170 4 622 1786 46 0 55 chr15 4888764 4889019 -98605955 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 235 4 622 3020 23 3 0 chr15 4889019 4889365 -98605609 + MERVL-int LTR ERVL 5025 5371 -114 4 622 329 125 26 53 chr15 4889365 4889441 -98605533 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 4 622 321 0 0 0 chr15 4889441 4889479 -98605495 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 4 622 487 47 52 0 chr15 4889479 4889570 -98605404 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 100 -393 4 622 1884 164 47 0 chr15 4900310 4900652 -98594322 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 2 4 622 393 306 16 24 chr15 4913413 4913537 -98581437 + MLT1F LTR MaLR 7 129 -419 4 622 3027 32 0 0 chr15 4914322 4914668 -98580306 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 622 13837 60 12 1 chr15 4914668 4916439 -98578535 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 4 622 3024 32 0 0 chr15 4916439 4916785 -98578189 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 622 457 261 72 7 chr15 4917671 4917810 -98577164 + MLT1F1 LTR MaLR 417 564 -5 4 622 1159 275 25 71 chr15 4921429 4921821 -98573153 + MTE2b LTR MaLR 1 374 -5 5 622 364 343 116 17 chr15 4921826 4922007 -98572967 + ERVL-B4-int LTR ERVL 775 973 -4741 5 622 261 211 0 0 chr15 4922471 4922528 -98572446 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1243 1299 -4415 5 622 383 249 211 36 chr15 4922670 4922915 -98572059 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1510 1752 -3962 5 622 2208 279 82 24 chr15 4922955 4923677 -98571297 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1874 2637 -3077 5 622 778 269 45 42 chr15 4923730 4924017 -98570957 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4998 5285 -429 5 622 1694 155 58 12 chr15 4925894 4926221 -98568753 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 45 5 622 3664 44 5 2 chr15 4930387 4930822 -98564152 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 622 39312 17 24 11 chr15 4930822 4935855 -98559119 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 1885 5 622 331 155 17 0 chr15 4935862 4935920 -98559054 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5627 1779 1721 5 622 663 248 153 72 chr15 4935904 4936290 -98558684 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4819 2425 2079 5 622 481 133 0 43 chr15 4936380 4936474 -98558500 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 863 5 622 773 200 5 10 chr15 4936479 4936671 -98558303 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6662 919 729 5 622 2824 61 0 0 chr15 4936669 4937012 -98557962 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7238 343 1 5 622 3664 44 5 2 chr15 4937012 4937447 -98557527 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 622 3100 68 2 20 chr15 4942505 4942912 -98552062 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 622 2231 90 132 11 chr15 4942982 4943330 -98551644 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 5 622 603 242 162 14 chr15 4947096 4947306 -98547668 + ORR1C1 LTR MaLR 28 268 -110 5 622 802 216 53 34 chr15 4947500 4947706 -98547268 + ORR1C2 LTR MaLR 175 384 0 5 622 1087 253 107 31 chr15 4947867 4948193 -98546781 + ORR1E LTR MaLR 1 351 -8 5 622 2473 162 138 89 chr15 4953819 4954400 -98540574 + RMER19C LTR ERVK 1 609 -2 5 622 725 262 10 25 chr15 4954818 4955014 -98539960 + MTEb LTR MaLR 187 379 0 5 622 3015 74 12 15 chr15 4973616 4974026 -98520948 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 622 812 221 126 50 chr15 4974029 4974386 -98520588 + ETnERV2-int LTR ERVK 4 387 -2927 5 622 1114 142 154 72 chr15 4974396 4974714 -98520260 + ETnERV2-int LTR ERVK 1071 1414 -5992 5 622 4749 190 58 41 chr15 4974706 4976271 -98518703 + ETnERV2-int LTR ERVK 892 3448 -3958 5 622 19539 95 28 29 chr15 4976514 4976980 -98517994 + ETnERV2-int LTR ERVK 3441 3933 -3473 5 622 19539 95 28 29 chr15 4977041 4978836 -98516138 + ETnERV2-int LTR ERVK 3934 5758 -1648 5 622 19539 95 28 29 chr15 4978989 4979726 -98515248 + ETnERV2-int LTR ERVK 5759 6436 -970 5 622 525 67 13 0 chr15 4979922 4979997 -98514977 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7406 0 5 622 2971 91 2 22 chr15 4979997 4980414 -98514560 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 623 2089 124 18 18 chr15 4981005 4981334 -98513640 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 623 1575 172 249 0 chr15 5000480 5000817 -98494157 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 623 2232 174 14 19 chr15 5007659 5008074 -98486900 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 623 618 212 118 29 chr15 5010717 5010921 -98484053 + MTE2b LTR MaLR 150 371 -8 1 623 1622 199 66 177 chr15 5012162 5012250 -98482724 + RLTR18B LTR ERVK 1 81 -431 2 623 1622 199 66 177 chr15 5012292 5012775 -98482199 + RLTR18B LTR ERVK 82 508 -4 2 623 313 326 38 52 chr15 5014129 5014454 -98480520 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 45 2 623 1969 130 84 94 chr15 5015732 5016234 -98478740 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 623 2532 203 73 51 chr15 5023406 5024077 -98470897 - RLTR13C1 LTR ERVK -297 686 1 4 623 952 269 23 96 chr15 5025198 5025610 -98469364 + MTD LTR MaLR 10 414 -5 4 623 3362 33 5 2 chr15 5026708 5027103 -98467871 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 623 2037 154 63 0 chr15 5028005 5028369 -98466605 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 8 5 623 1415 159 77 86 chr15 5030953 5031097 -98463877 + ORR1C2 LTR MaLR 50 169 -215 5 623 1415 159 77 86 chr15 5031188 5031381 -98463593 + ORR1C2 LTR MaLR 170 383 -1 5 623 273 191 14 14 chr15 5032416 5032485 -98462489 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 340 6 623 332 282 124 35 chr15 5034347 5034516 -98460458 + LTR52 LTR ERVL 209 392 -29 6 623 1446 206 90 15 chr15 5034979 5035319 -98459655 - MTD LTR MaLR 0 419 26 7 623 522 284 78 117 chr15 5036799 5037118 -98457856 + RMER5 LTR ERV1 33 339 -195 7 623 522 284 78 117 chr15 5037298 5037476 -98457498 + RMER5 LTR ERV1 340 511 -23 7 623 3081 50 42 3 chr15 5038054 5038435 -98456539 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 623 548 329 23 50 chr15 5039868 5040127 -98454847 + RLTR26 LTR ERVK 168 419 -223 8 623 245 233 31 108 chr15 5041408 5041538 -98453436 + RNLTR23 LTR ERVK 475 594 -48 9 623 2383 32 0 54 chr15 5041546 5041879 -98453095 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -42 315 1 9 623 273 230 65 39 chr15 5045078 5045155 -98449819 + MTD LTR MaLR 5 83 -336 9 623 777 209 204 36 chr15 5045487 5045780 -98449194 + MTD LTR MaLR 50 370 -30 9 623 698 308 50 71 chr15 5055934 5056315 -98438659 + MTE2a LTR MaLR 7 379 0 1 623 1705 163 89 20 chr15 5062480 5062830 -98432144 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 1 623 227 337 11 0 chr15 5065107 5065196 -98429778 + MLT1E3 LTR MaLR 115 204 -420 1 623 1686 179 42 22 chr15 5074416 5074771 -98420203 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 1 1 623 2349 178 186 8 chr15 5075038 5075526 -98419448 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 1 623 615 209 0 0 chr15 5075528 5075638 -98419336 - RMER15-int LTR ERVL -28 4971 4862 1 623 268 246 0 17 chr15 5075802 5075860 -98419114 - RMER15-int LTR ERVL -229 4770 4714 1 623 565 248 0 0 chr15 5076596 5076705 -98418269 - RMER15-int LTR ERVL -4041 958 850 1 623 1582 183 42 39 chr15 5076706 5076944 -98418030 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 134 1 623 4489 106 54 31 chr15 5076944 5077683 -98417291 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 1 623 1582 183 42 39 chr15 5077683 5077813 -98417161 - ORR1C2 LTR MaLR -251 133 13 1 623 2876 171 8 30 chr15 5077813 5078134 -98416840 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 216 1 623 2876 171 8 30 chr15 5078319 5078533 -98416441 - RLTR28 LTR ERVL -309 215 1 1 623 1582 183 42 39 chr15 5078533 5078544 -98416430 - ORR1C2 LTR MaLR -372 12 2 1 623 2223 242 77 47 chr15 5078663 5079015 -98415959 - RMER15-int LTR ERVL -4370 629 258 1 623 2223 242 77 47 chr15 5079201 5079447 -98415527 - RMER15-int LTR ERVL -4742 257 13 1 623 2601 162 48 103 chr15 5079448 5079968 -98415006 - RMER15 LTR ERVL -4 571 80 1 623 2601 162 48 103 chr15 5080061 5080144 -98414830 - RMER15 LTR ERVL -496 79 1 1 623 2811 70 29 41 chr15 5081151 5081567 -98413407 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 1 623 609 105 5 1 chr15 5081927 5082030 -98412944 - ORR1A4 LTR MaLR 0 378 235 1 623 280 307 92 57 chr15 5082114 5082313 -98412661 + MT2A LTR ERVL 241 456 -77 1 623 280 307 92 57 chr15 5082355 5082438 -98412536 + MT2A LTR ERVL 457 533 0 1 623 2012 154 28 23 chr15 5083218 5083609 -98411365 + MTB_Mm LTR MaLR 1 393 -14 1 623 308 314 55 7 chr15 5083661 5083781 -98411193 + ORR1E LTR MaLR 36 174 -196 1 623 241 322 169 24 chr15 5083849 5083941 -98411033 + ORR1E LTR MaLR 175 278 -92 1 623 525 276 22 28 chr15 5083962 5084141 -98410833 + MTC-int LTR MaLR 56 233 -1025 1 623 1943 137 153 24 chr15 5084142 5084561 -98410413 - RLTR12B LTR ERVK -43 485 13 1 623 739 294 34 11 chr15 5084577 5084845 -98410129 + MTC-int LTR MaLR 256 529 -729 1 623 837 279 44 58 chr15 5084870 5084935 -98410039 - RLTR11A2 LTR ERVK -116 411 342 1 623 837 279 44 58 chr15 5085077 5085422 -98409552 - RLTR11A2 LTR ERVK -186 341 7 1 623 1035 258 38 71 chr15 5085435 5085802 -98409172 + ORR1E LTR MaLR 3 357 -2 2 623 849 326 41 26 chr15 5085815 5086119 -98408855 + MLT1A0 LTR MaLR 4 317 -48 2 623 2498 29 16 245 chr15 5086119 5086625 -98408349 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 2 623 849 326 41 26 chr15 5086625 5086660 -98408314 + MLT1A0 LTR MaLR 318 348 -17 2 623 1469 194 17 24 chr15 5087332 5087627 -98407347 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 82 2 623 727 326 155 19 chr15 5088459 5088872 -98406102 + MER21B LTR ERV1 282 750 -113 2 623 365 258 10 10 chr15 5088981 5089079 -98405895 - MLT1A0 LTR MaLR -18 347 250 2 623 398 318 40 0 chr15 5089321 5089447 -98405527 - MTEa LTR MaLR -75 304 174 2 623 2338 77 51 0 chr15 5096054 5096365 -98398609 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 623 1231 194 34 99 chr15 5100501 5100568 -98394406 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 306 2 623 1231 194 34 99 chr15 5100705 5100874 -98394100 - ORR1D1 LTR MaLR -69 305 163 2 623 1231 194 34 99 chr15 5100906 5101022 -98393952 - ORR1D1 LTR MaLR -212 162 41 2 623 317 265 84 24 chr15 5102224 5102390 -98392584 - MLT1C LTR MaLR -2 465 290 2 624 3434 134 132 16 chr15 5120123 5120799 -98374175 - RMER6A LTR ERVK -2 754 1 2 624 270 260 18 88 chr15 5128283 5128397 -98366577 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 3 624 1934 131 83 49 chr15 5134309 5134694 -98360280 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 3 624 1191 211 216 17 chr15 5134948 5135295 -98359679 - MTD LTR MaLR -2 417 2 3 624 2045 171 67 25 chr15 5140061 5140463 -98354511 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 624 261 243 0 28 chr15 5146652 5146724 -98348250 + MER34B-int LTR ERV1 1435 1504 -3852 3 624 1303 153 140 14 chr15 5151506 5151785 -98343189 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 16 3 624 916 202 64 20 chr15 5153522 5153724 -98341250 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 169 3 624 736 148 5 172 chr15 5153761 5153965 -98341009 - ORR1C2 LTR MaLR -199 185 16 3 624 876 252 29 56 chr15 5157027 5157400 -98337574 - ORR1E LTR MaLR 0 379 2 3 624 1141 207 183 12 chr15 5157499 5157827 -98337147 - MTC LTR MaLR -36 385 2 3 624 3414 35 5 0 chr15 5165576 5165970 -98329004 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 624 1276 191 116 0 chr15 5177248 5177577 -98317397 - MTEb LTR MaLR -9 370 4 3 624 673 292 93 69 chr15 5180000 5180333 -98314641 + MLT1B LTR MaLR 13 354 -36 3 624 673 292 93 69 chr15 5180716 5180746 -98314228 + MLT1B LTR MaLR 355 385 -5 3 624 2385 89 176 9 chr15 5180854 5181274 -98313700 + RLTR44C LTR ERVK 1 490 -12 3 624 454 188 0 86 chr15 5198798 5198903 -98296071 - MT2B LTR ERVL -343 258 163 4 624 521 308 27 62 chr15 5199467 5199786 -98295188 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 68 4 624 2367 142 13 23 chr15 5207099 5207494 -98287480 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 4 624 2367 158 35 10 chr15 5207839 5208243 -98286731 - MTC LTR MaLR -3 418 5 4 624 910 248 96 136 chr15 5208457 5208831 -98286143 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 4 624 763 277 65 74 chr15 5209303 5209573 -98285401 + MTE2a LTR MaLR 23 284 -95 4 624 763 277 65 74 chr15 5209777 5209857 -98285117 + MTE2a LTR MaLR 285 370 -9 4 624 726 249 53 30 chr15 5210704 5211067 -98283907 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 624 280 257 35 7 chr15 5211528 5211560 -98283414 + ORR1B1-int LTR MaLR 605 640 -869 4 624 310 289 0 0 chr15 5212898 5212988 -98281986 - MLT1B LTR MaLR -5 385 296 4 624 2363 184 79 54 chr15 5226960 5227553 -98267421 - RMER6C LTR ERVK -82 608 1 4 625 232 251 170 96 chr15 5243013 5243242 -98251732 + RLTR12B LTR ERVK 241 486 -42 4 625 2669 206 90 110 chr15 5245748 5246726 -98248248 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 4 625 1717 239 59 8 chr15 5247199 5247587 -98247387 - MTD LTR MaLR 0 419 12 4 625 251 288 204 18 chr15 5252278 5252391 -98242583 - MLT1H LTR MaLR 0 489 356 4 625 317 347 13 48 chr15 5252573 5252773 -98242201 - MLT1H LTR MaLR -312 237 1 4 625 546 175 158 0 chr15 5254428 5254542 -98240432 - MTC LTR MaLR -52 369 238 4 625 298 172 0 59 chr15 5256180 5256248 -98238726 + MLT1A LTR MaLR 5 68 -306 4 625 1735 222 87 3 chr15 5258202 5258582 -98236392 + MTD LTR MaLR 1 412 -7 5 625 783 241 132 64 chr15 5259225 5259505 -98235469 - ORR1D2 LTR MaLR -67 303 5 5 625 3120 276 39 84 chr15 5259509 5260606 -98234368 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 323 5 625 528 296 47 12 chr15 5261204 5261375 -98233599 - ORR1D2 LTR MaLR -182 177 1 5 625 818 308 43 57 chr15 5261905 5262187 -98232787 - ORR1D2-int LTR MaLR -1078 292 15 5 625 243 243 49 56 chr15 5262195 5262316 -98232658 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 244 5 625 1655 173 110 18 chr15 5269573 5269606 -98225368 - RMER6-int LTR ERVK -216 2961 2928 5 625 1655 173 110 18 chr15 5269644 5270011 -98224963 - RMER6-int LTR ERVK -250 2927 2525 5 625 1368 103 37 41 chr15 5270023 5270266 -98224708 - RMER6-int LTR ERVK -2549 628 387 5 625 1806 184 10 50 chr15 5270464 5270865 -98224109 - RMER6-int LTR ERVK -2787 390 6 5 625 3519 150 75 46 chr15 5270892 5271627 -98223347 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 5 625 363 245 167 0 chr15 5271763 5271865 -98223109 - MT2A LTR ERVL -69 464 346 5 625 468 187 22 0 chr15 5271856 5271947 -98223027 - MT2A LTR ERVL -437 96 4 5 625 884 296 52 41 chr15 5274686 5275052 -98219922 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 625 237 333 10 94 chr15 5301465 5301479 -98193495 + MT2B2 LTR ERVL 171 258 -326 5 625 3204 76 8 2 chr15 5301616 5302014 -98192960 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 625 274 266 0 114 chr15 5306975 5307032 -98187942 + RMER12 LTR ERVK 737 783 -539 5 625 274 266 0 114 chr15 5307087 5307152 -98187822 + RMER12 LTR ERVK 784 845 -477 5 625 2294 51 102 3 chr15 5307537 5307850 -98187124 - MTA_Mm LTR MaLR -52 344 1 5 625 927 51 22 0 chr15 5307850 5307987 -98186987 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 959 5 625 1794 55 12 8 chr15 5307997 5308237 -98186737 + RLTR13C2 LTR ERVK 55 295 -513 5 625 1400 224 44 78 chr15 5311242 5311625 -98183349 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 625 2044 220 29 34 chr15 5311695 5312171 -98182803 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 5 625 374 276 51 14 chr15 5312534 5312671 -98182303 + MLT1A0 LTR MaLR 1 146 -244 5 625 291 305 0 0 chr15 5312906 5312988 -98181986 + MLT1A0 LTR MaLR 319 400 -8 5 625 2103 95 3 69 chr15 5328259 5328608 -98166366 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 6 625 48755 9 4 9 chr15 5328609 5335118 -98159856 + IAPEz-int LTR ERVK 1 6481 0 6 625 2087 95 3 69 chr15 5335118 5335467 -98159507 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 6 625 521 299 128 4 chr15 5335970 5336212 -98158762 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 140 6 625 536 362 52 68 chr15 5338772 5339157 -98155817 + MLT1D LTR MaLR 22 400 -105 6 625 626 287 118 94 chr15 5352394 5352430 -98142544 - MT2A LTR ERVL 0 601 561 6 625 1783 216 142 0 chr15 5352497 5352892 -98142082 - MT2A LTR ERVL -41 560 1 6 625 2983 55 34 8 chr15 5353198 5353584 -98141390 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 625 531 276 104 95 chr15 5355426 5355555 -98139419 + ORR1E LTR MaLR 1 149 -210 6 625 531 276 104 95 chr15 5356020 5356226 -98138748 + ORR1E LTR MaLR 150 339 -20 6 625 5453 184 40 15 chr15 5356234 5357358 -98137616 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3843 1918 767 6 625 727 105 0 20 chr15 5366944 5367090 -98127884 + RMER17B LTR ERVK 318 460 -498 6 625 1628 180 40 54 chr15 5368580 5368992 -98125982 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 6 625 550 272 72 90 chr15 5369997 5370348 -98124626 - MLT1C LTR MaLR 0 390 38 6 626 925 182 78 0 chr15 5376918 5377110 -98117864 - MTC LTR MaLR 0 419 213 6 626 1332 139 14 0 chr15 5377278 5377487 -98117487 - MTC LTR MaLR -209 212 1 6 626 1961 173 104 8 chr15 5380706 5381090 -98113884 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 626 1815 224 70 35 chr15 5386383 5386841 -98108133 - RMER19C LTR ERVK 0 611 138 6 626 372 352 167 43 chr15 5387182 5387506 -98107468 + MLT1A1 LTR MaLR 43 406 -2 6 626 336 335 111 65 chr15 5406344 5406606 -98088368 + MLT1E3 LTR MaLR 351 624 0 6 626 636 341 84 32 chr15 5407532 5407913 -98087061 - MLT1E2 LTR MaLR -74 553 206 7 626 3316 171 51 162 chr15 5411667 5412673 -98082301 - RLTR13D6 LTR ERVK -8 894 1 7 626 358 312 267 27 chr15 5418765 5419111 -98075863 + MLT1F2 LTR MaLR 111 569 0 7 626 320 184 0 169 chr15 5419554 5419672 -98075302 - MT2B LTR ERVL -344 257 160 7 626 3814 119 25 43 chr15 5419710 5420362 -98074612 + RLTR26 LTR ERVK 1 640 -2 7 626 2079 166 41 8 chr15 5425394 5425788 -98069186 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 626 1632 191 83 14 chr15 5434577 5434927 -98060047 + ORR1C1 LTR MaLR 1 374 -4 7 626 945 284 134 7 chr15 5439964 5440255 -98054719 + MTD LTR MaLR 77 404 -15 7 626 371 362 88 32 chr15 5455092 5455469 -98039505 + LTR82A LTR ERVL 459 856 -16 7 626 1417 136 214 30 chr15 5459733 5460036 -98034938 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 7 626 228 191 26 175 chr15 5461605 5461719 -98033255 - MT2B LTR ERVL -337 264 168 7 626 3694 179 81 93 chr15 5474431 5475344 -98019630 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 7 626 1946 198 69 157 chr15 5480751 5481421 -98013553 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 8 626 2860 46 0 0 chr15 5481648 5481994 -98012980 + MTA_Mm LTR MaLR 1 346 0 8 626 7666 84 23 4 chr15 5481994 5483069 -98011905 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1096 -2 8 626 3096 66 2 5 chr15 5483071 5483468 -98011506 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 626 1483 257 74 32 chr15 5488265 5488767 -98006207 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 10 8 626 1073 243 76 49 chr15 5489773 5490102 -98004872 + RMER15 LTR ERVL 238 575 0 8 626 226 196 22 0 chr15 5491563 5491609 -98003365 - MTD LTR MaLR -12 407 361 8 626 295 203 0 80 chr15 5496300 5496375 -97998599 - RMER19C LTR ERVK -37 574 506 8 626 241 200 73 44 chr15 5499227 5499295 -97995679 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 318 8 626 250 186 0 0 chr15 5499420 5499463 -97995511 - MT2A LTR ERVL -490 43 1 8 626 307 136 0 0 chr15 5501939 5501983 -97992991 + SRV_MM-int LTR ERVK 2369 2412 -3755 8 626 303 314 129 13 chr15 5502796 5502951 -97992023 - MLT1D LTR MaLR -312 193 21 1 626 2414 145 19 21 chr15 5503463 5503885 -97991089 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 626 988 224 28 0 chr15 5504551 5504765 -97990209 + ORR1D2 LTR MaLR 1 220 -150 1 627 1100 199 248 109 chr15 5511511 5511547 -97983427 - MT2A LTR ERVL 0 533 498 2 627 1100 199 248 109 chr15 5511601 5511721 -97983253 - MT2A LTR ERVL -36 497 345 2 627 1100 199 248 109 chr15 5511752 5512062 -97982912 - MT2A LTR ERVL -189 344 4 2 627 1443 224 64 6 chr15 5518237 5518583 -97976391 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 2 2 627 2590 181 44 19 chr15 5519837 5520287 -97974687 + RLTR20B3 LTR ERVK 25 471 -106 3 627 2590 181 44 19 chr15 5520320 5520393 -97974581 + RLTR20B3 LTR ERVK 472 560 -17 3 627 347 271 21 10 chr15 5524404 5524501 -97970473 + MTD LTR MaLR 10 107 -312 3 627 1596 238 39 43 chr15 5524512 5525138 -97969836 - ORR1D-int LTR MaLR -300 1070 231 3 627 373 335 60 63 chr15 5527737 5528144 -97966830 - MLT1A LTR MaLR -24 384 6 4 627 1735 219 8 5 chr15 5531504 5531881 -97963093 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 5 627 929 279 91 35 chr15 5532214 5532611 -97962363 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 627 242 361 36 36 chr15 5548219 5548331 -97946643 - LTR16C LTR ERVL -375 114 3 6 627 1130 264 170 3 chr15 5548695 5549007 -97945967 + ORR1D2 LTR MaLR 4 367 -3 6 627 549 330 153 33 chr15 5549425 5549877 -97945097 + RMER5 LTR ERV1 2 507 -27 6 627 3476 20 2 0 chr15 5551691 5552086 -97942888 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 627 1598 268 30 45 chr15 5554829 5555294 -97939680 + LTR80A LTR ERVL 125 582 -1 8 627 922 331 24 24 chr15 5558580 5558954 -97936020 + MLT1B LTR MaLR 6 379 -11 8 627 1579 142 18 73 chr15 5560293 5560634 -97934340 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 9 627 2705 217 92 68 chr15 5563397 5564258 -97930716 + RLTR13D6 LTR ERVK 10 890 -12 9 627 1595 236 60 8 chr15 5571778 5572176 -97922798 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 627 1259 254 48 37 chr15 5572176 5572686 -97922288 + MTD-int LTR MaLR 1 603 -655 1 627 1515 246 49 5 chr15 5572686 5573094 -97921880 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2341 2766 -2995 1 627 1651 139 60 8 chr15 5573100 5573462 -97921512 + RLTR9D LTR ERVK 1 409 0 1 627 486 268 141 16 chr15 5573794 5574023 -97920951 - RMER20B LTR ERVK -236 391 132 1 627 3696 177 35 41 chr15 5574416 5575152 -97919822 + RLTR25B LTR ERVK 1 732 -296 1 627 4456 76 9 3 chr15 5588046 5588630 -97906344 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 1 627 1427 200 187 0 chr15 5592398 5592548 -97902426 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 211 1 627 1427 200 187 0 chr15 5592723 5592887 -97902087 - ORR1D1 LTR MaLR -164 210 3 1 627 1147 269 112 37 chr15 5600557 5600931 -97894043 - MTD LTR MaLR 0 419 18 1 627 781 333 67 20 chr15 5605091 5605437 -97889537 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 3 1 627 585 307 30 30 chr15 5606834 5607032 -97887942 - MER21B LTR ERV1 -102 761 564 1 627 530 308 153 21 chr15 5607109 5607488 -97887486 - MER21B LTR ERV1 -433 430 3 1 627 753 228 34 6 chr15 5610209 5610407 -97884567 + MTD LTR MaLR 1 244 -175 1 627 377 259 97 14 chr15 5610401 5610546 -97884428 + MTC-int LTR MaLR 1102 1258 0 1 627 891 275 42 68 chr15 5611515 5611780 -97883194 + MTD LTR MaLR 4 261 -158 1 627 3352 23 10 0 chr15 5614112 5614504 -97880470 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 627 586 307 48 9 chr15 5617236 5617462 -97877512 + MTD LTR MaLR 139 402 -17 1 627 868 329 100 50 chr15 5617494 5617952 -97877022 + MLT1F2 LTR MaLR 7 487 -73 1 627 469 297 48 32 chr15 5620054 5620242 -97874732 - MLT1H1 LTR MaLR -364 191 1 1 627 467 330 37 47 chr15 5621251 5621442 -97873532 - MLT1F1 LTR MaLR -52 517 329 1 627 315 288 132 32 chr15 5621467 5621657 -97873317 - MLT1F1 LTR MaLR -330 218 10 1 627 3062 30 0 35 chr15 5629495 5629872 -97865102 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 2 1 627 4423 14 0 0 chr15 5631748 5632241 -97862733 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 78 45518 17 0 0 chr15 5632241 5637601 -97857373 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 1 628 380 179 46 35 chr15 5637601 5637688 -97857286 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 1 628 302 0 0 0 chr15 5637688 5637726 -97857248 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 628 3695 14 121 0 chr15 5637726 5638166 -97856808 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 628 740 351 74 24 chr15 5638394 5638837 -97856137 + MLT1E2 LTR MaLR 19 488 -136 1 628 257 268 84 59 chr15 5651129 5651248 -97843726 - MLT1H LTR MaLR 0 549 428 2 628 343 255 37 19 chr15 5651336 5651444 -97843530 - RMER15 LTR ERVL -86 489 380 2 628 230 255 205 13 chr15 5653892 5654043 -97840931 - MLT1H LTR MaLR -369 180 1 2 628 663 327 65 41 chr15 5659976 5660314 -97834660 - MLT1E2 LTR MaLR -4 623 278 2 628 2128 81 38 54 chr15 5663048 5663362 -97831612 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 2 628 1385 176 0 22 chr15 5663362 5663629 -97831345 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 7321 2 628 351 320 17 17 chr15 5663763 5663935 -97831039 - MMERVK10C-int LTR ERVK -512 7069 6898 2 628 350 221 0 0 chr15 5664416 5664493 -97830481 - IAPEz-int LTR ERVK -1145 5336 5260 2 628 2641 314 52 38 chr15 5664490 5665271 -97829703 - IAP-d-int LTR ERVK -3763 2779 2000 2 628 2641 314 52 38 chr15 5665521 5666785 -97828189 - IAP-d-int LTR ERVK -4543 1999 705 2 628 316 264 120 19 chr15 5666971 5667079 -97827895 - RLTR10-int LTR ERVK -6765 915 797 2 628 707 233 46 41 chr15 5667180 5667377 -97827597 - RLTR10-int LTR ERVK -1135 852 655 2 628 378 20 20 20 chr15 5667409 5667460 -97827514 - RLTR10-int LTR ERVK -7314 267 217 2 628 2266 91 3 28 chr15 5667488 5667805 -97827169 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 2 628 228 211 115 0 chr15 5688907 5688959 -97806015 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 347 2 628 668 294 189 22 chr15 5694994 5695311 -97799663 + MER74A LTR ERVL 4 373 -185 2 628 615 327 83 48 chr15 5703833 5703866 -97791108 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 322 2 628 615 327 83 48 chr15 5703894 5704197 -97790777 - MLT1A0 LTR MaLR -44 321 13 2 628 436 157 0 0 chr15 5716380 5716450 -97778524 + MTC LTR MaLR 1 70 -351 2 628 1799 184 0 0 chr15 5716902 5717195 -97777779 + MTC LTR MaLR 127 419 -2 2 628 1876 164 263 60 chr15 5724253 5724677 -97770297 + RMER6C LTR ERVK 10 552 -138 2 628 2159 23 114 0 chr15 5724677 5724939 -97770035 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 2 628 1876 164 263 60 chr15 5724939 5725080 -97769894 + RMER6C LTR ERVK 553 690 0 2 628 288 304 130 63 chr15 5748704 5749021 -97745953 - MLT1B LTR MaLR -5 500 109 3 628 254 322 123 8 chr15 5752174 5752296 -97742678 - MLT1F LTR MaLR -76 472 337 3 628 399 315 63 0 chr15 5752349 5752492 -97742482 - MER76 LTR ERVL -76 615 464 3 628 330 351 81 115 chr15 5758006 5758328 -97736646 + MLT1F LTR MaLR 8 318 -251 3 628 622 264 142 51 chr15 5758407 5758702 -97736272 + MER76 LTR ERVL 102 423 -268 3 628 373 300 161 23 chr15 5758877 5759051 -97735923 + MLT1F LTR MaLR 337 558 -11 3 628 351 267 81 46 chr15 5760744 5760917 -97734057 - MLT1A0 LTR MaLR -84 281 103 3 629 480 304 40 74 chr15 5777475 5777776 -97717198 + MLT1C LTR MaLR 59 443 -24 3 629 3010 70 8 10 chr15 5790440 5790841 -97704133 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 629 1863 147 65 0 chr15 5790945 5791252 -97703722 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 629 2274 75 15 21 chr15 5791839 5792168 -97702806 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 3 629 267 325 8 31 chr15 5795278 5795405 -97699569 + RMER12 LTR ERVK 737 860 -462 3 629 361 305 112 35 chr15 5800340 5800510 -97694464 - MLT2F LTR ERVL -43 620 438 3 629 2289 156 27 82 chr15 5806282 5806770 -97688204 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 4 629 328 358 13 13 chr15 5810251 5810404 -97684570 - RMER15-int LTR ERVL -347 4652 4500 4 629 3350 35 2 5 chr15 5813019 5813416 -97681558 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 629 690 301 50 60 chr15 5814321 5814639 -97680335 - RLTR26 LTR ERVK -207 435 121 4 629 225 89 20 82 chr15 5827754 5827803 -97667171 - MTE-int LTR MaLR -1256 324 279 4 629 2678 63 50 0 chr15 5829926 5830290 -97664684 - RLTR10 LTR ERVK -8 382 1 4 629 8358 37 1 3 chr15 5830290 5831289 -97663685 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 990 4 629 518 318 17 17 chr15 5831439 5831679 -97663295 - RLTR10-int LTR ERVK -5481 1061 822 4 629 3456 56 14 0 chr15 5831819 5832250 -97662724 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 556 4 629 13897 166 21 13 chr15 5832263 5836978 -97657996 - ETnERV-int LTR ERVK -1994 5412 1 4 629 1904 112 28 22 chr15 5836978 5837298 -97657676 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 629 3418 46 2 4 chr15 5837300 5837747 -97657227 - RLTR10-int LTR ERVK -1428 559 41 4 629 2933 57 49 0 chr15 5837759 5838129 -97656845 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 4 629 1752 134 110 0 chr15 5841596 5841888 -97653086 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 3 4 629 1540 241 93 21 chr15 5843870 5844255 -97650719 - MTD LTR MaLR -6 413 1 4 629 3958 156 38 48 chr15 5845272 5846338 -97648636 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 1 4 629 2127 183 39 7 chr15 5849322 5849730 -97645244 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 629 685 215 121 39 chr15 5851548 5851780 -97643194 - RLTR11A LTR ERVK -80 448 198 4 629 611 339 75 38 chr15 5854106 5854452 -97640522 + MLT1I LTR MaLR 43 401 -10 4 629 371 191 0 0 chr15 5868438 5868506 -97626468 + BGLII_B LTR ERVK 1 68 -373 4 629 476 307 65 60 chr15 5868953 5869154 -97625820 + MTEb LTR MaLR 75 276 -103 4 629 3527 18 2 0 chr15 5875424 5875819 -97619155 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 629 2480 96 119 5 chr15 5883496 5883873 -97611101 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 5 629 775 301 37 74 chr15 5887332 5887633 -97607341 - MLT1B LTR MaLR 0 390 101 5 629 775 301 37 74 chr15 5887816 5887919 -97607055 - MLT1B LTR MaLR -290 100 1 5 629 986 284 77 12 chr15 5894223 5894549 -97600425 - ORR1E LTR MaLR -1 369 1 5 630 613 204 92 10 chr15 5901199 5901444 -97593530 - RMER20B LTR ERVK -22 605 281 5 630 1567 192 17 34 chr15 5903178 5903469 -97591505 - RMER20B LTR ERVK -332 295 10 5 630 495 294 182 35 chr15 5903479 5903764 -97591210 - MLT1E2 LTR MaLR -161 466 140 5 630 2389 124 48 23 chr15 5916114 5916394 -97578580 + MTB_Mm LTR MaLR 1 295 -112 5 630 2715 33 0 169 chr15 5916394 5916833 -97578141 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 5 630 2389 124 48 23 chr15 5916833 5916949 -97578025 + MTB_Mm LTR MaLR 296 407 0 5 630 649 303 31 50 chr15 5916949 5917160 -97577814 + MLT1A0 LTR MaLR 105 311 -54 5 630 1913 152 29 0 chr15 5922909 5923218 -97571756 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 5 630 434 272 96 17 chr15 5925348 5925588 -97569386 - MYSERV-int LTR ERVK -2131 4419 4199 5 630 285 329 109 24 chr15 5931076 5931241 -97563733 + MER31B LTR ERV1 5 183 -283 5 630 1696 273 78 137 chr15 5940372 5941706 -97553268 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1322 0 5 630 2366 215 104 79 chr15 5941826 5942703 -97552271 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 1033 0 5 630 264 331 51 70 chr15 5943393 5943549 -97551425 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 460 5 630 290 345 66 54 chr15 5943658 5943900 -97551074 - RLTR18 LTR ERVK -339 277 33 5 630 1782 206 45 132 chr15 5944179 5944470 -97550504 - RLTR18B LTR ERVK -6 506 249 5 630 1782 206 45 132 chr15 5944546 5944807 -97550167 - RLTR18B LTR ERVK -264 248 2 5 630 250 344 45 45 chr15 5945594 5945728 -97549246 + LTR90A LTR LTR 787 920 -56 5 630 1629 144 9 67 chr15 5948138 5948480 -97546494 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 630 3406 20 5 5 chr15 5950126 5950522 -97544452 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 630 876 215 69 39 chr15 5954005 5954191 -97540783 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 175 6 630 876 215 69 39 chr15 5954258 5954274 -97540700 - ORR1D1 LTR MaLR -200 174 166 6 630 2434 114 139 23 chr15 5954438 5954870 -97540104 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 6 630 538 234 29 19 chr15 5963485 5963695 -97531279 + RMER2 LTR ERV1 1 308 -259 6 630 800 198 178 58 chr15 5966628 5966993 -97527981 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 6 630 787 319 75 61 chr15 5967569 5968063 -97526911 + MLT1D LTR MaLR 1 501 -4 6 630 3081 68 2 2 chr15 5972264 5972660 -97522314 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 630 2158 60 113 6 chr15 5972770 5973106 -97521868 + RLTR10 LTR ERVK 1 372 -18 6 630 302 372 15 15 chr15 5973969 5974100 -97520874 + MLT1H1 LTR MaLR 355 485 -70 6 630 402 291 88 35 chr15 5979580 5979725 -97515249 - MTD LTR MaLR -14 405 259 6 630 3679 51 20 16 chr15 5980692 5981186 -97513788 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 6 630 502 376 69 52 chr15 5981515 5981804 -97513170 - LTR16B2 LTR ERVL -155 307 14 6 630 504 333 52 22 chr15 5982041 5982271 -97512703 + MLT1B LTR MaLR 152 388 -2 6 630 1565 168 39 60 chr15 5984259 5984595 -97510379 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 630 336 336 0 0 chr15 5987341 5987448 -97507526 + MLT2C1 LTR ERVL 1 107 -290 6 630 259 321 47 9 chr15 5987385 5987492 -97507482 + MLT1E3 LTR MaLR 66 176 -448 6 630 2925 91 32 0 chr15 5992878 5993287 -97501687 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 6 630 1567 218 51 8 chr15 5993619 5993823 -97501151 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 153 6 630 1567 218 51 8 chr15 5993924 5994071 -97500903 - ORR1B2 LTR MaLR -215 152 2 6 630 1151 174 34 134 chr15 5994425 5994783 -97500191 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 630 573 200 78 14 chr15 5994783 5994925 -97500049 - ETnERV-int LTR ERVK 0 3314 3164 6 630 273 251 204 21 chr15 5994925 5995116 -97499858 - RLTR13D6 LTR ERVK -461 441 216 6 630 742 164 16 28 chr15 5995062 5995214 -97499760 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 190 409 0 6 630 2000 126 3 16 chr15 5997070 5997385 -97497589 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 6 630 389 321 65 18 chr15 6005767 6005935 -97489039 + MLT1A0 LTR MaLR 54 229 -136 8 630 874 164 48 53 chr15 6016021 6016208 -97478766 + RMER19B LTR ERVK 305 490 -412 2 630 332 317 0 0 chr15 6022672 6022776 -97472198 - MLT1B LTR MaLR 0 390 287 3 630 331 345 26 65 chr15 6024103 6024258 -97470716 + MLT1N2 LTR MaLR 26 174 -388 3 631 692 279 96 61 chr15 6030099 6030443 -97464531 - ORR1D2 LTR MaLR -14 356 1 4 631 264 240 69 88 chr15 6031461 6031621 -97463353 - LTR82A LTR ERVL -128 744 588 4 631 1651 83 0 36 chr15 6033996 6034246 -97460728 - ORR1A2 LTR MaLR -86 241 1 5 631 3457 20 2 0 chr15 6035174 6035569 -97459405 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 631 9351 25 2 1 chr15 6035569 6036666 -97458308 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 631 3457 20 2 0 chr15 6036666 6037061 -97457913 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 631 2496 113 118 3 chr15 6041483 6041873 -97453101 - RLTR10C LTR ERVK -1 435 1 5 631 1809 166 6 55 chr15 6045296 6045640 -97449334 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 631 410 316 43 35 chr15 6049697 6049838 -97445136 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 265 7 631 1804 162 102 11 chr15 6050408 6050769 -97444205 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 631 303 159 42 25 chr15 6056291 6056365 -97438609 - MTE2a LTR MaLR 0 379 312 8 631 699 310 53 44 chr15 6056401 6056706 -97438268 - MTE2a LTR MaLR -57 322 1 8 631 1528 53 5 19 chr15 6057589 6057800 -97437174 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 189 8 631 252 133 0 0 chr15 6057792 6057837 -97437137 - MT2C_Mm LTR ERVL -145 330 286 8 631 2212 68 27 0 chr15 6057903 6058198 -97436776 - MT2C_Mm LTR ERVL -172 303 1 8 631 226 350 24 16 chr15 6074266 6074391 -97420583 - MER110 LTR ERV1 -5 486 361 1 631 513 293 151 47 chr15 6075063 6075382 -97419592 - ORR1E LTR MaLR -4 355 4 1 631 260 347 59 39 chr15 6075453 6075606 -97419368 + MLT1C LTR MaLR 310 465 -2 1 631 1531 191 202 6 chr15 6075927 6076279 -97418695 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 631 339 404 110 21 chr15 6079185 6079466 -97415508 - MLT1J2 LTR MaLR -131 317 12 1 631 386 239 54 0 chr15 6080296 6080388 -97414586 - MTE2b LTR MaLR -1 378 282 1 631 602 306 7 34 chr15 6080466 6080615 -97414359 - MTE2b LTR MaLR -213 166 22 1 631 624 275 174 46 chr15 6081296 6081711 -97413263 + MLT2B2 LTR ERVL 3 470 -45 1 631 1382 212 80 44 chr15 6083223 6083584 -97411390 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 631 2577 95 95 91 chr15 6085087 6085572 -97409402 - RLTR1C LTR ERV1 -16 487 1 1 631 4843 162 65 37 chr15 6085735 6086691 -97408283 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 1 631 5936 72 19 1 chr15 6086790 6087599 -97407375 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 823 -985 1 631 290 312 78 69 chr15 6087857 6088074 -97406900 + RMER12 LTR ERVK 1104 1322 0 1 631 1208 254 135 6 chr15 6094603 6094959 -97400015 + MTD LTR MaLR 18 419 0 1 631 433 239 72 66 chr15 6094961 6095113 -97399861 + MTD-int LTR MaLR 3 155 -1215 1 631 976 307 45 51 chr15 6095683 6096019 -97398955 + MTD-int LTR MaLR 306 639 -619 1 631 500 333 65 112 chr15 6109037 6109439 -97385535 + MLT1C LTR MaLR 7 466 -1 1 631 620 179 0 0 chr15 6116605 6116711 -97378263 - MTB_Mm LTR MaLR -283 124 19 1 631 5612 150 29 6 chr15 6126734 6127671 -97367303 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 1 631 2841 156 88 16 chr15 6128140 6128654 -97366320 - RMER4B LTR ERVK 0 585 32 1 631 2841 156 88 16 chr15 6129290 6129321 -97365653 - RMER4B LTR ERVK -554 31 1 1 631 1500 247 126 13 chr15 6137363 6137831 -97357143 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 7 1 631 1126 270 44 28 chr15 6139869 6140189 -97354785 - ORR1E-int LTR MaLR -194 1386 1062 2 631 1436 233 79 24 chr15 6140217 6140246 -97354728 + MTD LTR MaLR 31 56 -363 2 631 1808 162 0 60 chr15 6140246 6140593 -97354381 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 631 1436 233 79 24 chr15 6140593 6140932 -97354042 + MTD LTR MaLR 57 419 0 2 631 429 255 9 47 chr15 6140937 6141044 -97353930 - ORR1E-int LTR MaLR -1474 106 4 2 631 379 279 156 64 chr15 6141052 6141378 -97353596 - ORR1E LTR MaLR -2 357 2 2 631 2935 33 185 0 chr15 6142988 6143356 -97351618 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 631 7599 36 3 0 chr15 6143361 6144289 -97350685 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5 7576 6646 2 631 40129 38 0 1 chr15 6144275 6149219 -97345755 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 2 631 2480 98 53 3 chr15 6149217 6149597 -97345377 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 2 631 2948 30 185 0 chr15 6149597 6149965 -97345009 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 631 704 273 352 11 chr15 6156878 6157156 -97337818 + RMER5 LTR ERV1 80 452 -82 2 631 335 25 0 0 chr15 6158885 6158925 -97336049 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 454 2 631 580 285 86 25 chr15 6158952 6159150 -97335824 - MT2B LTR ERVL -391 210 1 2 631 257 237 118 42 chr15 6159150 6159179 -97335795 - ORR1A3-int LTR MaLR -1348 615 578 2 631 2311 145 42 15 chr15 6159887 6160293 -97334681 + MTC LTR MaLR 5 421 0 2 632 1868 211 86 27 chr15 6163876 6164402 -97330572 - RLTR31_Mm LTR ERVK -3 558 2 2 632 3172 31 2 52 chr15 6176126 6176534 -97318440 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 2 632 8188 41 15 8 chr15 6176536 6177527 -97317447 + RLTR10-int LTR ERVK 1 998 -989 2 632 373 271 31 8 chr15 6177591 6177721 -97317253 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 2 632 9050 14 0 1 chr15 6177803 6178799 -97316175 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 2 632 3192 31 2 51 chr15 6178801 6179211 -97315763 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 632 1337 256 63 3 chr15 6180681 6181030 -97313944 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 632 239 250 0 15 chr15 6181852 6181917 -97313057 + LTR33 LTR ERVL 444 507 -8 2 632 1913 143 15 50 chr15 6184620 6184959 -97310015 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 632 2219 102 3 61 chr15 6185321 6185667 -97309307 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 632 258 262 34 19 chr15 6186690 6186803 -97308171 - MLT1I LTR MaLR -282 207 92 2 632 351 236 22 22 chr15 6187079 6187170 -97307804 - ERVL-E-int LTR ERVL -1340 4327 4237 2 632 3482 20 8 0 chr15 6193255 6193648 -97301326 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 632 1656 100 139 0 chr15 6215574 6215854 -97279120 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 632 1279 175 38 67 chr15 6216906 6217219 -97277755 + MTD LTR MaLR 102 405 -14 3 632 1571 263 12 12 chr15 6232643 6233062 -97261912 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 632 848 222 32 88 chr15 6237379 6237720 -97257254 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 632 1474 228 65 8 chr15 6238285 6238639 -97256335 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 632 2089 150 19 48 chr15 6242957 6243328 -97251646 + ORR1B2 LTR MaLR 1 360 -7 3 632 3656 153 225 56 chr15 6243974 6244831 -97250143 + RLTR25B LTR ERVK 1 1002 -26 3 632 537 385 120 28 chr15 6249851 6250209 -97244765 - LTR16B LTR ERVL -35 428 38 3 632 352 308 47 47 chr15 6273123 6273314 -97221660 - RMER15 LTR ERVL -49 526 336 4 632 368 216 19 93 chr15 6290176 6290187 -97204787 + MT2B LTR ERVL 152 154 -447 4 633 2663 86 3 0 chr15 6300453 6300779 -97194195 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 633 242 191 75 19 chr15 6339170 6339277 -97155697 + RMER17A LTR ERVK 354 466 -285 5 633 249 250 79 56 chr15 6356227 6356316 -97138658 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 174 5 633 569 279 76 69 chr15 6364305 6364609 -97130365 - MLT1C LTR MaLR -16 451 146 5 633 3726 18 2 0 chr15 6365597 6365992 -97128982 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 633 1875 155 111 22 chr15 6373390 6373752 -97121222 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 633 686 276 207 12 chr15 6388259 6388501 -97106473 - MTE2b LTR MaLR -8 371 83 6 633 2989 80 5 0 chr15 6391781 6392179 -97102795 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 633 364 322 60 76 chr15 6396072 6396455 -97098519 + MLT1A1 LTR MaLR 20 396 -12 6 633 735 301 51 82 chr15 6397576 6397967 -97097007 - MLT1B LTR MaLR -8 382 4 6 633 279 344 105 37 chr15 6400066 6400256 -97094718 + MLT1B LTR MaLR 21 223 -167 6 633 366 245 74 11 chr15 6404344 6404439 -97090535 - MLT1E2 LTR MaLR -526 101 1 6 633 446 356 61 13 chr15 6411028 6411297 -97083677 - LTR84a LTR ERVL -13 748 458 6 633 383 341 45 63 chr15 6411366 6411588 -97083386 - LTR84a LTR ERVL -502 259 42 6 633 1523 244 63 6 chr15 6412776 6413126 -97081848 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 633 296 304 139 108 chr15 6419002 6419334 -97075640 + ORR1D1 LTR MaLR 29 370 -4 6 634 1097 199 50 166 chr15 6428411 6428785 -97066189 + RMER19C LTR ERVK 1 296 -441 6 634 490 304 77 118 chr15 6428839 6428936 -97066038 + RMER19C LTR ERVK 297 393 -344 6 634 1704 174 151 52 chr15 6429800 6430183 -97064791 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 634 961 140 22 38 chr15 6430183 6430368 -97064606 + MTC-int LTR MaLR 1 182 -1076 6 634 1040 215 122 135 chr15 6430784 6431161 -97063813 + MTE2a LTR MaLR 3 374 -5 6 634 1780 288 165 53 chr15 6431342 6432481 -97062493 + MTE2a-int LTR MaLR 2 1574 -6 6 634 923 258 139 27 chr15 6432485 6432823 -97062151 + MTE2a LTR MaLR 3 378 -1 6 634 787 251 52 102 chr15 6433693 6434153 -97060821 + RMER2 LTR ERV1 1 539 -28 7 634 518 323 145 0 chr15 6458925 6459235 -97035739 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 11 7 634 8113 38 0 3 chr15 6461820 6462752 -97032222 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 7 634 392 284 72 88 chr15 6475354 6475634 -97019340 - ORR1E LTR MaLR -3 376 91 7 634 1038 152 107 0 chr15 6485852 6486076 -97008898 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 137 7 634 988 17 0 0 chr15 6488844 6488964 -97006010 - MT2_Mm LTR ERVL -196 297 178 7 634 323 23 23 0 chr15 6488934 6488978 -97005996 - MT2_Mm LTR ERVL -227 248 204 7 634 1346 79 101 66 chr15 6488978 6489236 -97005738 - MT2_Mm LTR ERVL -226 267 1 7 634 4612 4 0 0 chr15 6495852 6496345 -96998629 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 634 285 286 24 178 chr15 6496759 6497131 -96997843 - RLTR11A2 LTR ERVK -26 427 135 7 634 381 311 118 0 chr15 6498729 6498848 -96996126 + MTEb LTR MaLR 1 133 -246 7 634 485 282 74 11 chr15 6498887 6499063 -96995911 + MTEb LTR MaLR 193 379 0 7 634 1099 166 125 74 chr15 6501295 6501535 -96993439 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 89 2 634 1099 166 125 74 chr15 6501579 6501650 -96993324 - ORR1A4 LTR MaLR -241 88 1 2 634 485 303 73 62 chr15 6504380 6504801 -96990173 + MTE2a LTR MaLR 1 406 -13 7 634 813 262 147 63 chr15 6522062 6522396 -96972578 + MTEb LTR MaLR 1 362 -17 3 634 244 150 48 32 chr15 6522680 6522742 -96972232 - MLT1C LTR MaLR 0 467 405 3 634 376 213 13 0 chr15 6526567 6526642 -96968332 + MTEa LTR MaLR 284 359 -20 4 635 4163 169 137 38 chr15 6569889 6570852 -96924122 - MTC-int LTR MaLR -199 1059 2 1 635 1912 159 113 3 chr15 6570851 6571222 -96923752 - MTC LTR MaLR 0 421 10 1 635 3231 20 0 0 chr15 6571239 6571581 -96923393 - ORR1A0 LTR MaLR -4 342 1 1 635 287 274 0 0 chr15 6572576 6572638 -96922336 - MER77 LTR ERVL -4 603 542 1 635 2252 148 49 31 chr15 6578299 6578446 -96916528 - RMER10B LTR ERVL -1 397 237 1 635 2252 148 49 31 chr15 6578466 6578708 -96916266 - RMER10B LTR ERVL -162 236 2 1 635 2412 129 84 5 chr15 6581279 6581662 -96913312 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 635 2117 154 83 27 chr15 6583328 6583701 -96911273 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 635 311 234 0 0 chr15 6596884 6596948 -96898026 - ORR1D2-int LTR MaLR -1303 67 4 1 635 630 244 42 53 chr15 6597000 6597190 -96897784 - ORR1D2 LTR MaLR -182 188 1 1 635 1076 295 25 37 chr15 6601977 6602301 -96892673 - MTE2a LTR MaLR 0 379 60 1 635 734 219 6 29 chr15 6604924 6604945 -96890029 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 435 1 635 2044 117 8 112 chr15 6604945 6605312 -96889662 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 635 734 229 33 42 chr15 6605312 6605508 -96889466 - RLTR11B LTR ERVK -38 490 284 1 635 2186 139 64 5 chr15 6611920 6612311 -96882663 - MTC LTR MaLR 0 421 8 2 635 288 371 32 26 chr15 6616232 6616387 -96878587 + LTR16B2 LTR ERVL 1 156 -306 2 635 867 232 115 123 chr15 6616902 6617193 -96877781 + MTEa LTR MaLR 2 278 -101 2 635 1551 150 124 40 chr15 6617193 6617540 -96877434 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 2 635 867 232 115 123 chr15 6617540 6617621 -96877353 + MTEa LTR MaLR 279 370 -9 2 635 460 140 41 116 chr15 6620835 6620956 -96874018 + MT2B LTR ERVL 146 257 -344 2 635 454 248 10 0 chr15 6621192 6621293 -96873681 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 281 2 635 1410 189 31 151 chr15 6628856 6629279 -96865695 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 2 635 4448 8 0 0 chr15 6629807 6630289 -96864685 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 2 635 2657 27 0 0 chr15 6630289 6630589 -96864385 + MuRRS-int LTR ERV1 1 300 -4390 2 635 23882 21 5 8 chr15 6630586 6633299 -96861675 + MuRRS-int LTR ERV1 574 3277 -1413 2 635 12294 35 3 6 chr15 6633331 6634752 -96860222 + MuRRS-int LTR ERV1 3273 4690 0 2 635 4380 19 0 0 chr15 6634752 6635234 -96859740 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 2 635 1830 181 72 17 chr15 6636251 6636599 -96858375 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 635 914 288 33 84 chr15 6636910 6637304 -96857670 + MTE2b LTR MaLR 1 374 -5 2 635 539 293 131 20 chr15 6637366 6637610 -96857364 + MER68 LTR ERVL 1 271 -292 2 635 232 298 38 19 chr15 6637671 6637777 -96857197 + MER68 LTR ERVL 261 368 -195 2 635 400 295 63 114 chr15 6637790 6638027 -96856947 - MLT1J LTR MaLR -243 269 45 2 635 3350 30 5 8 chr15 6638038 6638435 -96856539 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 635 1027 206 148 33 chr15 6639203 6639534 -96855440 + ORR1D1 LTR MaLR 2 370 -4 2 635 1133 198 98 70 chr15 6643141 6643178 -96851796 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 340 2 635 1133 198 98 70 chr15 6643367 6643688 -96851286 - ORR1D1 LTR MaLR -35 339 1 2 635 3733 39 5 2 chr15 6644152 6644587 -96850387 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 635 1413 71 13 20 chr15 6644587 6644852 -96850122 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 343 -7238 2 635 785 195 5 10 chr15 6644850 6645042 -96849932 + MMERVK10C-int LTR ERVK 729 919 -6662 2 635 489 122 0 43 chr15 6645047 6645141 -96849833 + MMERVK10C-int LTR ERVK 863 952 -6629 2 635 686 246 153 72 chr15 6645231 6645617 -96849357 + MMERVK10C-int LTR ERVK 2079 2425 -4819 2 635 331 155 17 0 chr15 6645601 6645659 -96849315 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1721 1779 -5627 2 635 45476 18 1 10 chr15 6645666 6650815 -96844159 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1885 7581 0 2 635 3440 39 0 130 chr15 6650815 6651316 -96843658 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 635 1573 148 207 3 chr15 6669855 6670174 -96824800 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 635 1318 235 98 15 chr15 6673824 6674161 -96820813 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 2 635 1777 167 144 0 chr15 6679832 6680180 -96814794 - MTD LTR MaLR -20 399 2 2 635 280 312 10 41 chr15 6680634 6680731 -96814243 - MLT2B5 LTR ERVL -404 197 104 2 635 241 291 113 66 chr15 6682507 6682658 -96812316 - MT2B LTR ERVL -357 244 87 3 635 626 268 164 29 chr15 6682637 6682948 -96812026 + MLT1A0 LTR MaLR 13 365 0 3 636 1110 161 189 101 chr15 6689209 6689547 -96805427 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 3 636 773 269 168 14 chr15 6691572 6691858 -96803116 + MLT1B LTR MaLR 10 339 -51 3 636 2931 66 29 5 chr15 6696458 6696869 -96798105 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 636 3436 39 53 0 chr15 6751362 6751776 -96743198 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 636 29927 36 9 19 chr15 6751776 6755354 -96739620 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 4038 4 636 2509 114 40 0 chr15 6755354 6755749 -96739225 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 4 636 6224 35 12 12 chr15 6755751 6756495 -96738479 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 4 636 2233 75 0 0 chr15 6756494 6756772 -96738202 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 4 636 3666 68 4 31 chr15 6756772 6757523 -96737451 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 9 4 636 2494 117 40 0 chr15 6757524 6757919 -96737055 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 4 636 12500 48 3 3 chr15 6757919 6759411 -96735563 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3538 4043 2552 4 636 369 117 6 62 chr15 6759419 6759539 -96735435 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5642 1939 1721 4 636 880 195 220 33 chr15 6759523 6759911 -96735063 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4795 611 312 4 636 475 111 0 53 chr15 6759999 6760094 -96734880 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 863 4 636 822 189 5 10 chr15 6760106 6760298 -96734676 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6662 919 729 4 636 1497 74 7 3 chr15 6760296 6760559 -96734415 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7238 343 1 4 636 3122 55 33 0 chr15 6760559 6760981 -96733993 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 636 3032 153 143 10 chr15 6761984 6762593 -96732381 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 636 1474 134 27 64 chr15 6767521 6767817 -96727157 + ORR1B1 LTR MaLR 101 385 -9 4 636 276 320 21 0 chr15 6774759 6774856 -96720118 + ORR1E LTR MaLR 3 101 -258 4 636 635 322 0 40 chr15 6789604 6789827 -96705147 + MER70-int LTR ERVL 1768 1981 -3042 4 636 475 358 5 5 chr15 6789988 6790176 -96704798 + MER70-int LTR ERVL 2051 2238 -2785 4 636 533 290 60 30 chr15 6790279 6790446 -96704528 + MER70-int LTR ERVL 2379 2550 -2473 4 636 1579 161 22 57 chr15 6791312 6791773 -96703201 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 4 636 982 250 59 68 chr15 6794919 6795241 -96699733 + MTE2b LTR MaLR 16 334 -45 4 636 1487 186 113 3 chr15 6798392 6798711 -96696263 + MTC LTR MaLR 1 354 -67 4 636 395 198 0 7 chr15 6798790 6798874 -96696100 + MTD LTR MaLR 282 419 0 4 636 872 241 155 7 chr15 6807121 6807418 -96687556 + MTEb LTR MaLR 20 360 -19 4 637 775 259 202 13 chr15 6821025 6821342 -96673632 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 4 637 318 330 43 11 chr15 6826644 6826831 -96668143 + MLT1C LTR MaLR 269 461 -6 4 637 1089 167 4 35 chr15 6830597 6830827 -96664147 + RLTR11A LTR ERVK 302 524 -4 4 637 582 300 93 0 chr15 6834252 6834499 -96660475 - MER31A LTR ERV1 -56 429 160 4 637 763 258 173 8 chr15 6835247 6835501 -96659473 + MTE2b LTR MaLR 2 297 -82 5 637 317 319 0 11 chr15 6837015 6837107 -96657867 - MER34A LTR ERV1 -8 563 473 5 637 688 249 92 21 chr15 6837430 6837668 -96657306 - MER34A LTR ERV1 -271 300 46 5 637 2311 89 38 0 chr15 6839733 6840046 -96654928 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 5 637 1988 192 95 10 chr15 6840390 6840648 -96654326 - RLTR11A2 LTR ERVK -2 525 261 5 637 1988 192 95 10 chr15 6840710 6840935 -96654039 - RLTR11A2 LTR ERVK -267 260 2 5 637 530 261 18 44 chr15 6853613 6853806 -96641168 + MLT2D LTR ERVL 56 241 -315 5 637 970 176 118 32 chr15 6854639 6854966 -96640008 - RMER10A LTR ERVL 0 442 67 5 637 409 254 43 29 chr15 6870283 6870421 -96624553 + MLT1J LTR MaLR 101 240 -272 5 637 1379 238 38 55 chr15 6873820 6873935 -96621039 - MTD LTR MaLR -20 399 277 5 637 2013 212 73 65 chr15 6873935 6874439 -96620535 + RLTR18B LTR ERVK 1 508 -4 5 637 1379 238 38 55 chr15 6874439 6874723 -96620251 - MTD LTR MaLR -143 276 7 5 637 1659 202 34 41 chr15 6875433 6875820 -96619154 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 637 1268 221 105 7 chr15 6875901 6876236 -96618738 + ORR1D2 LTR MaLR 1 379 0 5 637 2352 216 20 97 chr15 6876565 6877227 -96617747 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 637 2110 90 3 56 chr15 6879285 6879625 -96615349 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 5 637 2100 119 28 9 chr15 6885215 6885538 -96609436 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 637 917 312 63 49 chr15 6892460 6892807 -96602167 + MTEa LTR MaLR 28 379 0 5 637 1064 289 141 18 chr15 6892807 6893255 -96601719 + MTEa-int LTR MaLR 1 503 -1077 5 637 2552 271 101 31 chr15 6893528 6893779 -96601195 + MTEa-int LTR MaLR 598 861 -719 5 637 2552 271 101 31 chr15 6893800 6894421 -96600553 + MTEa-int LTR MaLR 862 1530 -50 5 637 832 344 79 3 chr15 6896329 6896670 -96598304 + MTEa LTR MaLR 11 377 -2 5 637 379 287 42 25 chr15 6898531 6898724 -96596250 - MLT1H LTR MaLR -346 203 5 5 637 879 166 0 32 chr15 6901629 6901785 -96593189 - RMER15 LTR ERVL -17 558 408 5 637 2007 135 57 42 chr15 6902513 6902899 -96592075 - RMER15 LTR ERVL -183 392 1 5 637 1824 176 10 48 chr15 6906491 6906909 -96588065 + RMER17C LTR ERVK 1 402 -8 5 637 622 301 70 44 chr15 6906971 6907315 -96587659 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 13 6 637 1657 161 47 108 chr15 6927460 6927677 -96567297 + RMER10B LTR ERVL 1 225 -173 6 637 1657 161 47 108 chr15 6927724 6927930 -96567044 + RMER10B LTR ERVL 226 398 0 6 637 1895 145 152 11 chr15 6928115 6928484 -96566490 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 637 1022 147 97 4 chr15 6932069 6932295 -96562679 + RMER10B LTR ERVL 19 265 -133 6 637 861 168 5 73 chr15 6932343 6932562 -96562412 + RMER10B LTR ERVL 195 398 0 6 637 2251 164 23 10 chr15 6935424 6935619 -96559355 - RMER10B LTR ERVL 0 398 198 6 637 2251 164 23 10 chr15 6935773 6935970 -96559004 - RMER10B LTR ERVL -201 197 2 6 637 708 268 34 188 chr15 6936158 6936604 -96558370 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 6 637 376 291 119 17 chr15 6939857 6940151 -96554823 + MLT1A0 LTR MaLR 42 365 0 6 638 342 318 21 90 chr15 6948190 6948335 -96546639 - LTR16E2 LTR ERVL -187 381 247 6 638 2379 95 6 0 chr15 6960690 6961015 -96533959 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 638 246 321 233 6 chr15 6964670 6964833 -96530141 + RMER15 LTR ERVL 362 561 -14 6 638 455 275 80 55 chr15 6965646 6965935 -96529039 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 48 6 638 478 275 15 8 chr15 6969256 6969388 -96525586 + MT2A LTR ERVL 1 133 -400 6 638 3006 63 15 12 chr15 6971773 6972172 -96522802 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 638 265 276 95 0 chr15 6978244 6978349 -96516625 - MLT2B4 LTR ERVL -6 548 434 6 638 291 295 71 71 chr15 6978417 6978614 -96516360 - MLT2B4 LTR ERVL -252 263 67 6 638 294 183 14 40 chr15 6978653 6978727 -96516247 - MLT2B4 LTR ERVL -484 72 1 6 638 370 316 108 15 chr15 6991342 6991602 -96503372 + LTR16B2 LTR ERVL 95 378 -84 7 638 249 283 87 0 chr15 6992370 6992462 -96502512 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 308 7 638 305 303 0 76 chr15 6999593 6999711 -96495263 - MLT1K LTR MaLR -34 561 453 7 638 1168 172 15 15 chr15 6999735 7000000 -96494974 - RMER17C LTR ERVK -11 399 135 7 638 650 171 27 14 chr15 7000000 7000148 -96494826 - RMER17C LTR ERVK -260 150 1 1 638 3555 15 8 0 chr15 7003926 7004319 -96490655 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 638 9115 42 6 2 chr15 7004319 7005412 -96489562 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 638 3366 41 8 0 chr15 7005412 7005805 -96489169 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 638 463 265 0 29 chr15 7007643 7007779 -96487195 + MT2B LTR ERVL 1 132 -401 1 638 556 266 81 39 chr15 7007786 7008104 -96486870 + MT2B LTR ERVL 238 546 -55 1 638 265 160 0 39 chr15 7008181 7008233 -96486741 + MT2B LTR ERVL 535 584 0 1 638 915 174 42 80 chr15 7012652 7012889 -96482085 - RMER12 LTR ERVK -106 1216 989 2 638 5342 120 8 18 chr15 7012926 7013812 -96481162 - RMER12 LTR ERVK -432 890 14 2 638 508 223 162 0 chr15 7022440 7022588 -96472386 + MTD LTR MaLR 4 175 -244 3 638 730 231 38 47 chr15 7022772 7023008 -96471966 + MTD LTR MaLR 186 419 0 3 638 353 198 62 0 chr15 7024020 7024101 -96470873 + MTEb LTR MaLR 294 379 0 4 638 2570 174 22 35 chr15 7033468 7034004 -96460970 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 5 638 376 255 149 18 chr15 7036400 7036568 -96458406 - MLT1A LTR MaLR -26 348 159 6 638 266 309 0 129 chr15 7037824 7037917 -96457057 - MTE2a LTR MaLR -298 81 1 6 638 2175 139 72 8 chr15 7043382 7043773 -96451201 - MTC LTR MaLR 0 421 6 7 638 783 232 164 99 chr15 7044936 7045290 -96449684 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 7 638 253 340 88 62 chr15 7055622 7055942 -96439032 + MLT1I LTR MaLR 59 386 -25 9 638 1181 182 186 1 chr15 7057737 7058037 -96436937 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 6 9 638 304 379 54 20 chr15 7059155 7059303 -96435671 + MLT1I LTR MaLR 76 228 -183 9 638 3731 152 127 93 chr15 7059581 7060452 -96434522 - RMER19B LTR ERVK -1 901 1 1 638 735 286 79 127 chr15 7060452 7060868 -96434106 + MTD LTR MaLR 24 419 0 1 638 229 336 154 8 chr15 7061183 7061300 -96433674 - MLT1K LTR MaLR -112 483 350 1 638 956 192 50 23 chr15 7061405 7061609 -96433365 - MTC LTR MaLR -135 286 74 1 638 956 192 50 23 chr15 7061789 7061802 -96433172 - MTC LTR MaLR -348 73 63 1 638 589 116 0 0 chr15 7061821 7061907 -96433067 - MTC LTR MaLR -335 86 1 1 638 603 301 154 29 chr15 7069000 7069240 -96425734 + LTR16A LTR ERVL 1 270 -181 1 638 1497 214 39 20 chr15 7072592 7072934 -96422040 + MTE2b LTR MaLR 18 369 -1 1 639 1831 169 112 16 chr15 7090329 7090713 -96404261 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 639 583 244 135 49 chr15 7093962 7094250 -96400724 + MTEa LTR MaLR 43 355 -24 1 639 601 14 0 0 chr15 7096917 7096988 -96397986 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 71 -411 1 639 3273 51 5 0 chr15 7097313 7097707 -96397267 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 639 314 292 30 78 chr15 7098555 7098826 -96396148 + RMER17C LTR ERVK 104 361 -49 1 639 288 261 150 83 chr15 7107599 7107779 -96387195 - MLT1I LTR MaLR -83 429 238 1 639 406 344 53 16 chr15 7108365 7108554 -96386420 - MLT1I LTR MaLR -198 213 18 1 639 398 279 35 57 chr15 7113427 7113623 -96381351 + ORR1D2 LTR MaLR 223 405 -14 1 639 616 239 171 77 chr15 7126855 7127218 -96367756 + RMER10A LTR ERVL 25 421 -21 2 639 1561 166 34 27 chr15 7136096 7136580 -96358394 - RMER13B LTR ERVK -42 866 282 2 639 1276 237 17 47 chr15 7152468 7152769 -96342205 - MTD LTR MaLR -14 405 122 2 639 530 214 0 0 chr15 7152957 7153055 -96341919 - MTD LTR MaLR -321 98 1 2 639 416 328 68 110 chr15 7154847 7155230 -96339744 + MLT1H LTR MaLR 4 370 -179 2 639 3448 38 0 2 chr15 7160723 7161120 -96333854 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 639 826 309 85 21 chr15 7162772 7163112 -96331862 + MLT1C LTR MaLR 45 406 -61 2 639 804 116 0 125 chr15 7165902 7166070 -96328904 - ORR1B1 LTR MaLR -245 149 3 2 639 277 350 94 17 chr15 7171136 7171316 -96323658 + MLT1L LTR MaLR 413 606 -4 2 639 460 206 56 0 chr15 7171687 7171794 -96323180 - ORR1D1 LTR MaLR -261 113 1 2 639 1314 280 77 39 chr15 7176722 7177190 -96317784 + RMER5 LTR ERV1 5 490 -44 2 639 3618 13 2 0 chr15 7178260 7178655 -96316319 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 639 1615 196 22 142 chr15 7181953 7182412 -96312562 + RMER15 LTR ERVL 41 444 -131 3 639 2353 102 6 0 chr15 7186922 7187247 -96307727 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 639 1173 317 50 92 chr15 7187862 7188397 -96306577 + MLT2B1 LTR ERVL 1 513 -7 3 639 312 286 12 26 chr15 7188779 7188899 -96306075 - ORR1E LTR MaLR 0 370 254 3 639 531 250 8 8 chr15 7188907 7189024 -96305950 + MTC LTR MaLR 305 421 0 3 639 252 291 16 91 chr15 7189111 7189232 -96305742 - MT2B LTR ERVL -338 263 152 3 639 372 292 96 118 chr15 7189250 7189625 -96305349 + MLT1A0 LTR MaLR 1 357 -8 3 639 440 325 160 26 chr15 7192719 7193026 -96301948 + MLT1J2 LTR MaLR 42 389 -59 3 639 657 216 85 101 chr15 7196131 7196378 -96298596 + MLT1B LTR MaLR 61 303 -87 3 639 431 328 39 43 chr15 7198317 7198524 -96296450 + LTR16A1 LTR ERVL 251 456 0 3 640 513 269 36 124 chr15 7210290 7210515 -96284459 + RMER15 LTR ERVL 370 574 -1 3 640 2074 188 35 8 chr15 7213204 7213575 -96281399 + MTC LTR MaLR 33 413 -8 3 640 637 305 42 31 chr15 7214774 7214967 -96280007 - MTE2b LTR MaLR -18 361 167 3 640 574 280 86 35 chr15 7215176 7215227 -96279747 - MTE2b LTR MaLR -196 183 138 3 640 2525 98 0 0 chr15 7215227 7215554 -96279420 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 640 574 280 86 35 chr15 7215554 7215676 -96279298 - MTE2b LTR MaLR -242 137 1 3 640 670 257 92 40 chr15 7218277 7218451 -96276523 + MTD LTR MaLR 19 201 -218 3 640 2112 163 44 11 chr15 7230585 7230951 -96264023 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 640 1771 130 106 0 chr15 7234002 7234295 -96260679 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 3 3 640 393 290 130 0 chr15 7245251 7245382 -96249592 + MTEb LTR MaLR 5 152 -227 3 640 1070 206 18 88 chr15 7245489 7245761 -96249213 + MTEb LTR MaLR 127 379 0 3 640 2208 147 40 10 chr15 7246485 7246885 -96248089 + MTC LTR MaLR 10 421 0 3 640 342 375 154 23 chr15 7252573 7253054 -96241920 + MLT1K LTR MaLR 29 572 -23 4 640 238 261 54 54 chr15 7258474 7258567 -96236407 + MLT1A1 LTR MaLR 44 136 -229 4 640 457 221 75 41 chr15 7258863 7259009 -96235965 + MLT1A1 LTR MaLR 258 408 0 4 640 326 391 86 5 chr15 7261441 7261662 -96233312 + MLT1J LTR MaLR 114 352 -160 4 640 1562 191 117 8 chr15 7266781 7267141 -96227833 + MTD LTR MaLR 13 411 -8 4 640 617 251 14 130 chr15 7268796 7269011 -96225963 + MTE2a LTR MaLR 1 190 -189 4 640 617 239 170 0 chr15 7269222 7269381 -96225593 + MTE2a LTR MaLR 194 379 0 4 640 508 290 21 0 chr15 7271584 7271729 -96223245 + ORR1E LTR MaLR 1 148 -211 4 640 232 217 55 55 chr15 7271851 7271924 -96223050 + ORR1E LTR MaLR 298 370 -9 4 640 382 206 19 81 chr15 7272216 7272388 -96222586 + MLT1A0 LTR MaLR 220 374 0 4 640 489 301 88 79 chr15 7273354 7273478 -96221496 - MTEa LTR MaLR -41 338 211 4 640 489 301 88 79 chr15 7273543 7273746 -96221228 - MTEa LTR MaLR -169 210 8 4 640 227 152 38 12 chr15 7276774 7276854 -96218120 + RMER17C LTR ERVK 179 260 -150 4 640 299 222 0 49 chr15 7284174 7284275 -96210699 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 269 4 640 344 347 8 0 chr15 7284345 7284466 -96210508 - MLT1A0 LTR MaLR -223 142 21 4 640 271 345 9 0 chr15 7287992 7288102 -96206872 - MLT1I LTR MaLR -213 198 88 4 640 377 353 45 52 chr15 7293737 7294024 -96200950 - MLT1G1 LTR MaLR -3 576 292 4 640 487 328 48 73 chr15 7295872 7296227 -96198747 + ORR1E LTR MaLR 10 355 -4 4 640 1290 230 47 80 chr15 7299236 7299623 -96195351 - MTE2a LTR MaLR -5 374 1 4 640 4791 40 28 0 chr15 7299673 7300244 -96194730 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 4 640 1697 76 82 131 chr15 7304567 7304921 -96190053 + ORR1A2 LTR MaLR 1 320 -7 5 640 2571 73 0 15 chr15 7304921 7305253 -96189721 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 640 10650 146 56 13 chr15 7305261 7305916 -96189058 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 723 -1240 5 640 10650 146 56 13 chr15 7305936 7307161 -96187813 + ORR1A2-int LTR MaLR 724 1962 -1 5 640 2567 71 6 0 chr15 7307161 7307484 -96187490 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 5 640 281 289 68 40 chr15 7308853 7309001 -96185973 - MTEa LTR MaLR -25 354 203 5 640 435 307 75 38 chr15 7309775 7309961 -96185013 - LTR90A LTR LTR -702 274 82 5 640 322 47 0 0 chr15 7310412 7310455 -96184519 + ORR1A1-int LTR MaLR 352 394 -1398 5 640 2391 55 31 52 chr15 7317299 7317626 -96177348 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 5 5 640 246 331 31 24 chr15 7318325 7318452 -96176522 + MLT1H LTR MaLR 419 546 -3 5 640 1031 182 62 62 chr15 7322046 7322370 -96172604 + MTD LTR MaLR 10 419 0 5 640 1467 188 53 71 chr15 7325083 7325461 -96169513 + ORR1C1 LTR MaLR 3 373 -5 5 640 310 239 35 35 chr15 7336551 7336664 -96158310 + MLT1A LTR MaLR 59 171 -203 5 640 233 293 13 13 chr15 7337057 7337133 -96157841 + MLT1J2 LTR MaLR 44 119 -329 5 641 561 239 87 143 chr15 7343568 7343924 -96151050 + MTE2a LTR MaLR 5 340 -39 5 641 310 278 110 26 chr15 7352431 7352586 -96142388 + MLT1B LTR MaLR 3 170 -220 5 641 302 164 0 90 chr15 7353148 7353215 -96141759 + MLT1C LTR MaLR 407 467 0 5 641 1451 120 91 118 chr15 7362984 7363314 -96131660 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 5 641 1022 204 138 95 chr15 7363446 7363858 -96131116 + RLTR20C LTR ERVK 1 430 -104 5 641 335 235 55 66 chr15 7363936 7364027 -96130947 + RLTR20C LTR ERVK 452 541 0 5 641 293 190 0 0 chr15 7368208 7368266 -96126708 + MTEa LTR MaLR 1 58 -321 5 641 241 258 0 43 chr15 7368266 7368277 -96126697 + MT2A LTR ERVL 1 66 -467 5 641 709 280 65 76 chr15 7368866 7369156 -96125818 + MTEa LTR MaLR 59 345 -34 5 641 454 297 56 64 chr15 7371664 7371898 -96123076 - MLT1J2 LTR MaLR -213 235 4 5 641 2225 166 12 17 chr15 7379205 7379622 -96115352 - MTC LTR MaLR -6 415 1 6 641 623 211 155 0 chr15 7381543 7381685 -96113289 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 1 6 641 279 357 37 75 chr15 7382589 7382755 -96112219 - MLT1G3 LTR MaLR -313 282 80 6 641 1060 247 115 6 chr15 7382761 7383091 -96111883 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 6 641 432 327 86 52 chr15 7387505 7387758 -96107216 + MLT1A0 LTR MaLR 64 331 -34 6 641 2264 136 161 46 chr15 7387758 7388236 -96106738 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 6 641 432 327 86 52 chr15 7388236 7388272 -96106702 + MLT1A0 LTR MaLR 332 363 -2 6 641 471 299 153 45 chr15 7389926 7390259 -96104715 - MTD LTR MaLR -44 375 7 6 641 274 325 73 73 chr15 7390284 7390463 -96104511 - MLT1I LTR MaLR -144 267 89 6 641 1075 292 25 31 chr15 7390855 7391212 -96103762 + MTEb LTR MaLR 24 378 -1 6 641 266 79 0 0 chr15 7391216 7391254 -96103720 + ORR1A4 LTR MaLR 1 38 -291 6 641 630 311 58 29 chr15 7394985 7395263 -96099711 - MT2A LTR ERVL -78 455 170 6 641 803 187 21 54 chr15 7395862 7396072 -96098902 + MTC LTR MaLR 178 413 -8 6 641 551 274 97 7 chr15 7399454 7399608 -96095366 + ORR1D1 LTR MaLR 22 189 -185 6 641 999 190 19 0 chr15 7399737 7399942 -96095032 + ORR1D1 LTR MaLR 166 374 0 6 641 926 288 73 29 chr15 7401462 7401805 -96093169 - MTE2b LTR MaLR 0 379 22 6 641 650 288 69 74 chr15 7403452 7403816 -96091158 + MTEa LTR MaLR 1 362 -17 6 641 2135 167 25 10 chr15 7405274 7405679 -96089295 + MTC LTR MaLR 1 411 -10 6 641 272 303 101 56 chr15 7421679 7421986 -96072988 + MTEa LTR MaLR 48 373 -6 6 641 1045 250 68 109 chr15 7423049 7423444 -96071530 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 641 3949 160 86 66 chr15 7427296 7428180 -96066794 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 6 641 763 246 292 14 chr15 7436170 7436457 -96058517 - MTE2b LTR MaLR -12 367 1 6 641 373 343 29 0 chr15 7441058 7441195 -96053779 + MLT1D LTR MaLR 2 142 -363 7 641 310 318 24 15 chr15 7442026 7442196 -96052778 + MLT1D LTR MaLR 276 480 -25 7 641 257 330 60 80 chr15 7450361 7450611 -96044363 + MLT1J LTR MaLR 233 477 -35 7 641 763 259 71 87 chr15 7453113 7453379 -96041595 - MTEa LTR MaLR -117 262 1 7 641 484 286 8 0 chr15 7465651 7465770 -96029204 - MTEa LTR MaLR -8 371 252 7 641 447 247 53 33 chr15 7465837 7465988 -96028986 - MTEa LTR MaLR -225 154 1 7 642 282 364 83 31 chr15 7474274 7474563 -96020411 - MLT1L LTR MaLR -305 305 2 7 642 1009 264 74 45 chr15 7477023 7477376 -96017598 + MTEa LTR MaLR 13 375 -4 7 642 315 299 36 36 chr15 7486421 7486532 -96008442 + ORR1E LTR MaLR 1 111 -248 7 642 1582 138 15 22 chr15 7486769 7487043 -96007931 + ORR1B1 LTR MaLR 1 272 -122 7 642 2775 164 18 20 chr15 7487046 7487601 -96007373 - RLTR31_Mm LTR ERVK -7 554 1 7 642 715 136 23 0 chr15 7487601 7487725 -96007249 + ORR1B1 LTR MaLR 268 394 0 7 642 3685 44 5 0 chr15 7489976 7490410 -96004564 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 642 70778 3 0 0 chr15 7490410 7497991 -95996983 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 7581 0 7 642 3685 44 5 0 chr15 7497991 7498425 -95996549 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 642 1580 229 59 10 chr15 7500894 7501282 -95993692 - MTD LTR MaLR 0 419 13 2 642 227 241 241 0 chr15 7503435 7503514 -95991460 - ORR1C2 LTR MaLR -117 261 164 8 642 1024 162 0 26 chr15 7503592 7503782 -95991192 - ORR1C2 LTR MaLR -199 185 1 8 642 766 221 102 43 chr15 7505753 7506131 -95988843 - RMER20B LTR ERVK -38 589 128 1 642 236 378 40 13 chr15 7509409 7509559 -95985415 - MLT1H LTR MaLR -93 517 364 2 642 445 325 148 31 chr15 7510060 7510317 -95984657 - MLT1H LTR MaLR -196 353 67 2 642 657 329 110 64 chr15 7511582 7511906 -95983068 + MER74A LTR ERVL 14 364 -194 2 642 3373 33 5 2 chr15 7511906 7512301 -95982673 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 642 657 329 110 64 chr15 7512301 7512476 -95982498 + MER74A LTR ERVL 365 535 -23 2 642 269 206 62 16 chr15 7517088 7517152 -95977822 - MT2A LTR ERVL -458 75 9 3 642 587 304 14 9 chr15 7517153 7517375 -95977599 + RMER5 LTR ERV1 305 527 -7 3 642 2755 134 58 69 chr15 7518544 7518563 -95976411 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 538 3 642 2755 134 58 69 chr15 7518590 7519039 -95975935 - RLTR31_Mm LTR ERVK -24 537 99 3 642 2755 134 58 69 chr15 7519098 7519195 -95975779 - RLTR31_Mm LTR ERVK -463 98 2 3 642 246 319 33 0 chr15 7521085 7521176 -95973798 - ORR1E LTR MaLR -10 349 256 4 642 1642 156 127 72 chr15 7523037 7523424 -95971550 + RMER17C LTR ERVK 1 408 -2 4 642 258 336 40 27 chr15 7530088 7530238 -95964736 - MER21B LTR ERV1 -264 599 448 5 642 1487 239 38 3 chr15 7532596 7532940 -95962034 + MTE2b LTR MaLR 1 356 -23 5 642 283 301 0 0 chr15 7534374 7534447 -95960527 - MLT1J2 LTR MaLR -130 318 246 6 642 920 270 89 33 chr15 7535213 7535573 -95959401 - MLT2D LTR ERVL -19 395 16 6 642 454 279 96 84 chr15 7537895 7538279 -95956695 + MLT1B LTR MaLR 6 463 -4 6 642 2356 153 3 8 chr15 7538549 7538918 -95956056 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 642 248 312 32 21 chr15 7539343 7539438 -95955536 + MTEa LTR MaLR 6 101 -258 7 642 257 299 30 0 chr15 7539709 7539776 -95955198 + MTEa LTR MaLR 296 364 -15 7 642 227 294 11 32 chr15 7540641 7540736 -95954238 + MLT1A1 LTR MaLR 316 408 0 7 642 1270 246 59 37 chr15 7544786 7545141 -95949833 - MTEa LTR MaLR -11 368 6 7 642 2354 182 108 135 chr15 7553667 7554295 -95940679 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 8 642 842 303 17 95 chr15 7555002 7555359 -95939615 + MTE2a LTR MaLR 3 331 -48 8 642 745 142 12 81 chr15 7556775 7556936 -95938038 - ORR1D1 LTR MaLR -222 152 3 8 642 532 146 18 26 chr15 7558400 7558567 -95936407 - RMER17B LTR ERVK -396 510 345 9 642 1719 132 131 10 chr15 7560132 7560423 -95934551 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 9 642 638 211 57 104 chr15 7566763 7566975 -95927999 + MTE2a LTR MaLR 170 371 -8 9 642 685 247 36 99 chr15 7588178 7588430 -95906544 - MTEa LTR MaLR -7 372 137 1 642 2024 133 45 56 chr15 7591139 7591497 -95903477 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 642 264 257 62 35 chr15 7598295 7598408 -95896566 + MLT1C LTR MaLR 240 355 -112 1 642 371 333 60 13 chr15 7599612 7599761 -95895213 + LTR16C LTR ERVL 176 331 -158 1 642 659 278 55 42 chr15 7599853 7600090 -95894884 - MLT1A0 LTR MaLR -124 241 2 1 643 1913 153 68 108 chr15 7602901 7603281 -95891693 + ORR1B2 LTR MaLR 1 365 -2 1 643 520 339 63 40 chr15 7603646 7603996 -95890978 - MLT1H2 LTR MaLR -1 488 131 1 643 585 332 106 34 chr15 7605868 7606161 -95888813 + ORR1E LTR MaLR 45 358 -1 1 643 398 189 58 47 chr15 7607206 7607378 -95887596 + RMER17C LTR ERVK 102 275 -135 1 643 307 346 54 45 chr15 7612546 7612770 -95882204 - MLT1J1 LTR MaLR -193 251 26 1 643 286 93 0 0 chr15 7615378 7615421 -95879553 - MT2B LTR ERVL 0 584 542 1 643 694 259 33 43 chr15 7615508 7615801 -95879173 - MT2B LTR ERVL -56 545 274 1 643 487 266 31 8 chr15 7615812 7615941 -95879033 - MT2B LTR ERVL -400 133 2 1 643 462 322 61 61 chr15 7616317 7616529 -95878445 - MT2A LTR ERVL -132 401 190 1 643 795 196 131 20 chr15 7618116 7618314 -95876660 + MTE2b LTR MaLR 1 220 -159 1 643 680 323 107 23 chr15 7621040 7621433 -95873541 + MT2A LTR ERVL 1 426 -107 1 643 233 293 105 70 chr15 7621856 7621999 -95872975 + LTR16C LTR ERVL 342 489 0 1 643 966 251 98 25 chr15 7622553 7622880 -95872094 + MTEb LTR MaLR 13 363 -16 1 643 426 315 13 26 chr15 7634360 7634513 -95860461 - MLT1I LTR MaLR -202 209 59 2 643 382 254 166 24 chr15 7636941 7637110 -95857864 + LTR16C LTR ERVL 286 478 -11 2 643 886 297 57 35 chr15 7640686 7641000 -95853974 + MLT2C2 LTR ERVL 1 321 -143 2 643 307 247 11 76 chr15 7641453 7641545 -95853429 + MLT2C2 LTR ERVL 411 496 -67 2 643 888 212 68 40 chr15 7646437 7646687 -95848287 + MLT1D LTR MaLR 249 505 0 2 643 858 326 66 25 chr15 7649385 7649439 -95845535 - MLT2D LTR ERVL -2 412 357 2 643 858 326 66 25 chr15 7649481 7649738 -95845236 - MLT2D LTR ERVL -58 356 93 2 643 858 326 66 25 chr15 7649918 7650001 -95844973 - MLT2D LTR ERVL -322 92 1 2 643 379 273 138 71 chr15 7650559 7650784 -95844190 + MLT1F LTR MaLR 220 459 -89 2 643 667 260 24 6 chr15 7652179 7652349 -95842625 - MTEb LTR MaLR -3 376 204 2 643 647 266 27 59 chr15 7654451 7654671 -95840303 - MTEb LTR MaLR -166 213 1 2 643 923 286 34 3 chr15 7661088 7661379 -95833595 - MLT2C1 LTR ERVL -48 349 50 2 643 334 296 143 55 chr15 7663633 7663940 -95831034 + MER74B LTR ERVL 58 391 -231 2 643 228 295 11 33 chr15 7663952 7664043 -95830931 + MER74B LTR ERVL 433 521 -101 2 643 639 334 112 6 chr15 7665523 7665863 -95829111 - MLT1I LTR MaLR -2 409 34 2 643 1507 160 66 35 chr15 7669723 7670040 -95824934 + ORR1B2 LTR MaLR 1 327 -40 2 643 351 127 0 0 chr15 7671034 7671089 -95823885 + ORR1B2 LTR MaLR 340 394 0 2 643 443 191 28 9 chr15 7678320 7678426 -95816548 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 267 2 643 267 206 155 22 chr15 7680945 7681034 -95813940 - ORR1E LTR MaLR -14 365 269 2 643 263 279 93 0 chr15 7681259 7681345 -95813629 - MLT1A1 LTR MaLR -278 130 37 2 643 2320 95 38 0 chr15 7682800 7683115 -95811859 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 643 797 293 116 27 chr15 7683647 7684019 -95810955 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 4 2 643 1824 205 64 3 chr15 7684626 7685002 -95809972 + MTD LTR MaLR 13 411 -8 2 643 851 244 135 42 chr15 7686775 7687109 -95807865 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 2 643 251 328 65 8 chr15 7691260 7691383 -95803591 + MLT1H LTR MaLR 402 531 -18 3 643 1771 184 76 22 chr15 7697138 7697494 -95797480 - ORR1C1 LTR MaLR -3 375 1 3 643 594 299 85 37 chr15 7699404 7699838 -95795136 - MLT1D LTR MaLR -2 503 49 3 643 446 278 86 6 chr15 7704305 7704460 -95790514 - ORR1E LTR MaLR -56 303 136 3 643 608 261 99 37 chr15 7704460 7704783 -95790191 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 3 643 550 268 14 21 chr15 7704793 7704934 -95790040 - ORR1E LTR MaLR -219 140 1 3 643 1134 263 101 27 chr15 7705200 7705586 -95789388 - MTD LTR MaLR -14 405 5 3 643 5595 167 21 23 chr15 7707786 7708913 -95786061 - MTC-int LTR MaLR -128 1130 6 3 643 2136 124 101 48 chr15 7708916 7709313 -95785661 - MTC LTR MaLR 0 421 4 3 643 4429 174 67 12 chr15 7709315 7710164 -95784810 + RMER19B LTR ERVK 1 896 -6 3 643 240 287 68 11 chr15 7712183 7712271 -95782703 + LTR33C LTR ERVL 30 122 -507 3 643 967 319 52 36 chr15 7717697 7718140 -95776834 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 231 3 643 457 279 21 69 chr15 7718279 7718468 -95776506 - MLT1E1A LTR MaLR -442 212 33 3 643 1221 187 142 25 chr15 7720281 7720604 -95774370 + ORR1D1 LTR MaLR 14 374 0 3 643 1046 286 86 52 chr15 7722871 7723292 -95771682 - MLT1J LTR MaLR -59 453 19 3 643 1302 259 36 14 chr15 7726561 7726921 -95768053 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 3 643 1445 279 33 6 chr15 7727783 7728143 -95766831 + MTEa LTR MaLR 6 375 -4 3 644 953 262 311 23 chr15 7733836 7734213 -95760761 + MLT2B2 LTR ERVL 3 488 -27 3 644 310 222 148 0 chr15 7734386 7734467 -95760507 - MTD LTR MaLR -227 192 100 3 644 302 158 0 50 chr15 7735934 7735994 -95758980 - MTD LTR MaLR -360 59 3 3 644 245 358 91 8 chr15 7736089 7736210 -95758764 + LTR16C LTR ERVL 2 132 -357 3 644 855 327 47 69 chr15 7741457 7741821 -95753153 - MTE-int LTR MaLR -486 1094 741 3 644 2516 105 67 13 chr15 7745814 7746200 -95748774 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 644 697 329 36 59 chr15 7749974 7750278 -95744696 - MLT1H LTR MaLR -207 342 46 4 644 1599 135 33 72 chr15 7754005 7754340 -95740634 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 644 581 192 123 37 chr15 7757834 7757996 -95736978 + MTEa LTR MaLR 202 377 -2 4 644 863 255 158 21 chr15 7781596 7781849 -95713125 - MTD LTR MaLR -5 414 115 4 644 863 255 158 21 chr15 7782029 7782103 -95712871 - MTD LTR MaLR -305 114 42 4 644 1811 137 88 64 chr15 7791176 7791551 -95703423 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 644 404 345 81 23 chr15 7792037 7792298 -95702676 + MLT1I LTR MaLR 136 411 0 4 644 490 346 82 26 chr15 7794016 7794357 -95700617 - MLT1K LTR MaLR -136 459 100 4 644 731 233 19 96 chr15 7794376 7794468 -95700506 + ORR1E LTR MaLR 5 92 -267 4 644 2499 114 21 97 chr15 7794468 7794933 -95700041 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 4 644 731 233 19 96 chr15 7794933 7795049 -95699925 + ORR1E LTR MaLR 93 197 -162 4 644 614 225 533 9 chr15 7795088 7795298 -95699676 - MTD LTR MaLR -99 320 1 4 644 350 212 25 12 chr15 7795333 7795414 -95699560 + ORR1E LTR MaLR 209 290 -80 4 644 3304 53 5 0 chr15 7797622 7798020 -95696954 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 644 338 198 165 0 chr15 7807212 7807303 -95687671 + MLT1A1 LTR MaLR 291 396 -12 4 644 404 264 0 74 chr15 7814397 7814532 -95680442 - MLT1C LTR MaLR -10 457 333 4 644 1049 238 98 72 chr15 7818624 7819041 -95675933 - MLT1C LTR MaLR 0 467 40 4 644 366 353 26 19 chr15 7819652 7819808 -95675166 - MLT1G1 LTR MaLR 0 579 423 4 644 622 176 179 19 chr15 7844810 7844972 -95650002 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 916 5 644 263 337 126 21 chr15 7852610 7852801 -95642173 - RMER15 LTR ERVL -18 557 347 5 644 3403 26 21 3 chr15 7853622 7854011 -95640963 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 644 7636 81 8 69 chr15 7854011 7855181 -95639793 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 644 3254 56 2 2 chr15 7855181 7855577 -95639397 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 644 2212 19 114 0 chr15 7855865 7856127 -95638847 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 1 5 644 2875 33 0 6 chr15 7860877 7861216 -95633758 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 5 80 56633 25 11 7 chr15 7861216 7867663 -95627311 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 5 645 2875 33 0 6 chr15 7867663 7868002 -95626972 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 5 645 507 347 59 22 chr15 7875790 7876111 -95618863 + HERV16-int LTR ERVL 505 837 -4159 5 645 407 283 76 38 chr15 7879567 7879725 -95615249 + LTR16B2 LTR ERVL 287 450 -12 5 645 719 271 101 84 chr15 7880715 7881082 -95613892 - MTEa LTR MaLR -4 375 3 5 645 1654 173 163 3 chr15 7889920 7890251 -95604723 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 645 801 190 68 11 chr15 7895786 7895962 -95599012 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 186 -341 5 645 274 262 88 0 chr15 7898644 7898724 -95596250 + RLTR11A2 LTR ERVK 181 267 -260 5 645 488 99 109 11 chr15 7898728 7898820 -95596154 + RLTR11A2 LTR ERVK 423 523 -4 5 645 1176 200 35 4 chr15 7914431 7914657 -95580317 + MTC LTR MaLR 1 233 -188 6 645 532 287 98 123 chr15 7914647 7915045 -95579929 + RLTR23 LTR ERV1 39 426 -4 6 645 1382 114 14 28 chr15 7915049 7915265 -95579709 + MTC LTR MaLR 209 421 0 6 645 2112 96 209 3 chr15 7915505 7915849 -95579125 + RLTR9F LTR ERVK 1 415 0 6 645 1652 253 156 80 chr15 7916123 7916986 -95577988 + RMER17B LTR ERVK 1 929 -29 6 645 525 321 113 61 chr15 7918742 7919220 -95575754 + MLT1D LTR MaLR 3 505 0 6 645 914 235 162 19 chr15 7919739 7920047 -95574927 - ORR1D2 LTR MaLR -18 352 1 6 645 1627 157 80 10 chr15 7924746 7925048 -95569926 + ORR1B2 LTR MaLR 2 324 -43 6 645 268 167 0 0 chr15 7925773 7925815 -95569159 + ORR1B2 LTR MaLR 312 353 -14 6 645 1630 191 115 3 chr15 7933869 7934199 -95560775 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 645 576 350 79 45 chr15 7938954 7939310 -95555664 + LTR16B1 LTR ERVL 10 377 -103 6 645 1443 174 63 0 chr15 7939957 7940210 -95554764 + MTC LTR MaLR 153 421 0 6 645 285 296 36 5 chr15 7951072 7951168 -95543806 + LTR48B LTR ERV1 4 99 -523 7 645 248 226 0 19 chr15 7951198 7951252 -95543722 + LTR48B LTR ERV1 184 236 -408 7 645 249 207 64 75 chr15 7964679 7964773 -95530201 - MLT1H LTR MaLR -209 340 248 7 645 250 291 12 12 chr15 7964822 7964902 -95530072 - MLT1H LTR MaLR -415 134 55 7 645 500 364 53 26 chr15 7966959 7967261 -95527713 - MLT1B LTR MaLR -31 359 50 7 645 795 87 13 32 chr15 7970420 7970575 -95524399 + RMER17B LTR ERVK 309 460 -498 7 645 765 73 48 24 chr15 7971746 7971872 -95523102 - RLTR15 LTR ERVK -230 129 1 7 645 345 311 98 11 chr15 7972728 7972962 -95522012 + MLT1E3 LTR MaLR 201 496 -9 7 645 282 338 200 0 chr15 7975617 7975777 -95519197 + MLT1E3-int LTR MaLR 623 814 -675 7 645 793 312 92 56 chr15 7975773 7976133 -95518841 + MLT1E3 LTR MaLR 252 624 0 7 645 2610 169 28 10 chr15 7979603 7980100 -95514874 + RLTR19C LTR ERVK 1 506 0 7 645 327 269 129 15 chr15 7981556 7981688 -95513286 + RMER15 LTR ERVL 416 562 -13 7 645 1691 154 128 0 chr15 7983230 7983542 -95511432 + ORR1B2 LTR MaLR 7 358 -9 7 645 457 245 101 13 chr15 7987038 7987187 -95507787 + LTR41 LTR ERVL 471 632 -136 7 645 375 218 76 46 chr15 7990709 7990828 -95504146 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 234 8 645 1535 217 195 11 chr15 7990828 7991290 -95503684 + RMER4B LTR ERVK 28 574 -11 8 645 270 252 67 121 chr15 7991910 7992008 -95502966 - LTR82A LTR ERVL -714 158 56 8 645 270 252 67 121 chr15 7992156 7992206 -95502768 - LTR82A LTR ERVL -817 55 18 8 646 644 249 149 48 chr15 8001215 8001510 -95493464 + MTE2a LTR MaLR 52 376 -3 6 646 640 58 0 0 chr15 8006290 8006373 -95488601 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 505 2 646 2334 114 22 84 chr15 8006373 8006901 -95488073 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 2 646 3019 45 2 2 chr15 8006903 8007304 -95487670 - LTRIS_Mm LTR ERV1 -81 401 1 2 646 4477 91 53 30 chr15 8007799 8008576 -95486398 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 1033 1 2 646 237 267 0 26 chr15 8016883 8016960 -95478014 + RMER10A LTR ERVL 343 417 -25 4 646 2154 129 85 3 chr15 8018140 8018528 -95476446 - RLTR28 LTR ERVL -13 511 92 5 646 268 190 114 0 chr15 8018856 8018935 -95476039 - RLTR28 LTR ERVL -419 105 18 5 646 424 183 87 30 chr15 8019035 8019170 -95475804 - MTC LTR MaLR -255 152 3 5 646 3179 44 13 5 chr15 8021157 8021548 -95473426 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 6 646 7535 72 13 71 chr15 8021548 8021931 -95473043 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 391 -707 6 646 7535 72 13 71 chr15 8022118 8022900 -95472074 + MTA_Mm-int LTR MaLR 392 1098 0 6 646 3320 36 5 8 chr15 8022900 8023297 -95471677 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 646 5811 119 60 22 chr15 8025402 8026493 -95468481 + MTC-int LTR MaLR 2 1134 -124 6 646 247 355 32 0 chr15 8027441 8027565 -95467409 - MLT1A LTR MaLR -5 369 242 6 646 234 322 44 11 chr15 8027825 8027916 -95467058 - MLT1A LTR MaLR -261 104 11 6 646 246 224 45 0 chr15 8036787 8036854 -95458120 + MLT1L LTR MaLR 4 73 -537 1 646 290 347 63 16 chr15 8040994 8041120 -95453854 + MER21B LTR ERV1 663 794 -69 1 646 230 304 104 38 chr15 8051281 8051387 -95443587 - MER57E1 LTR ERV1 -10 362 250 1 646 3721 95 19 24 chr15 8051433 8051867 -95443107 - MT2B LTR ERVL -22 579 148 1 646 2942 79 11 130 chr15 8051867 8052406 -95442568 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 646 3721 95 19 24 chr15 8052406 8052553 -95442421 - MT2B LTR ERVL -454 147 1 1 646 329 219 38 105 chr15 8052553 8052592 -95442382 - ORR1A3-int LTR MaLR -1350 613 584 1 646 1851 116 16 138 chr15 8052879 8053181 -95441793 + ORR1A3 LTR MaLR 1 269 -57 1 646 1851 116 16 138 chr15 8053323 8053391 -95441583 + ORR1A3 LTR MaLR 270 326 0 1 646 1236 143 157 137 chr15 8056868 8057052 -95437922 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 347 1 646 2792 148 13 38 chr15 8057052 8057523 -95437451 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 1 646 1236 143 157 137 chr15 8057523 8057663 -95437311 - RLTR24 LTR ERV1 -183 346 195 1 646 1236 143 157 137 chr15 8057813 8057844 -95437130 - RLTR24 LTR ERV1 -335 194 166 1 646 1181 179 9 22 chr15 8057830 8058053 -95436921 - RLTR24 LTR ERV1 -308 221 2 1 646 227 298 0 0 chr15 8066091 8066212 -95428762 - ORR1B1-int LTR MaLR -758 751 631 1 646 1976 90 183 0 chr15 8077718 8078018 -95416956 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -2 355 1 2 646 1693 153 142 21 chr15 8083500 8083874 -95411100 + RMER4A LTR ERVK 48 466 0 2 646 1857 59 129 0 chr15 8111891 8112163 -95382811 - BGLII LTR ERVK -114 307 1 2 646 6556 169 109 68 chr15 8116446 8116978 -95377996 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -461 1865 1316 3 646 6556 169 109 68 chr15 8117125 8117461 -95377513 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1011 1315 943 3 646 6556 169 109 68 chr15 8117524 8118176 -95376798 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1011 942 217 3 646 384 178 54 14 chr15 8120390 8120464 -95374510 + MTD LTR MaLR 4 80 -339 3 646 432 299 87 44 chr15 8120631 8120837 -95374137 - MLT1G LTR MaLR -304 287 73 3 646 655 309 47 53 chr15 8121289 8121627 -95373347 + ORR1E LTR MaLR 1 336 -23 3 647 339 224 135 58 chr15 8130044 8130148 -95364826 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 3 647 4431 124 64 29 chr15 8141748 8142478 -95352496 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 3 647 271 371 127 33 chr15 8143281 8143462 -95351512 - MLT1J LTR MaLR -101 411 214 3 647 993 217 256 10 chr15 8145412 8145724 -95349250 - MTD LTR MaLR -30 389 1 3 647 268 68 0 0 chr15 8146497 8146541 -95348433 + RMER4B LTR ERVK 2 45 -540 3 647 2368 139 144 10 chr15 8148285 8148771 -95346203 + RMER4B LTR ERVK 35 585 0 3 647 282 294 15 0 chr15 8153896 8153964 -95341010 - LTR80B LTR ERVL -310 274 206 4 647 622 236 216 9 chr15 8158377 8158604 -95336370 - MLT1E2 LTR MaLR -2 625 352 4 647 1126 215 128 36 chr15 8164687 8164991 -95329983 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 4 647 463 187 278 0 chr15 8173174 8173347 -95321627 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 164 4 647 625 173 78 67 chr15 8173446 8173626 -95321348 - ORR1D1 LTR MaLR -192 182 1 4 647 732 242 152 0 chr15 8174313 8174544 -95320430 + MTD LTR MaLR 27 292 -127 4 647 265 304 39 0 chr15 8177899 8178001 -95316973 - MTE2a LTR MaLR -9 370 265 4 647 481 291 162 52 chr15 8178128 8178418 -95316556 - MTE2a LTR MaLR -57 322 1 4 647 284 71 24 0 chr15 8182365 8182407 -95312567 - ORR1C2 LTR MaLR -12 366 324 4 647 1324 169 111 88 chr15 8182557 8182900 -95312074 - ORR1C2 LTR MaLR -33 351 1 4 647 2506 81 116 42 chr15 8184102 8184552 -95310422 - LTRIS2 LTR ERV1 -81 483 1 4 647 767 200 155 0 chr15 8184553 8184753 -95310221 - MuRRS4-int LTR ERV1 -42 5021 4791 4 647 12355 102 26 5 chr15 8185087 8186807 -95308167 - MuRRS4-int LTR ERV1 -917 4146 2391 4 647 2417 112 14 33 chr15 8186785 8187337 -95307637 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2800 2263 1633 4 647 1629 203 128 14 chr15 8187359 8187983 -95306991 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3619 1444 750 4 647 5097 117 18 16 chr15 8187967 8188733 -95306241 - RMER16-int LTR ERVK -3958 1448 681 4 647 757 119 213 6 chr15 8188703 8188872 -95306102 - RMER16-int LTR ERVK -5062 344 141 4 647 251 155 50 33 chr15 8189423 8189483 -95305491 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3637 61 1 4 647 1112 96 12 6 chr15 8189483 8189651 -95305323 - LTRIS3 LTR ERV1 0 512 344 4 647 411 0 19 0 chr15 8192975 8193027 -95301947 + RLTR1B-int LTR ERV1 3247 3299 0 4 647 1267 48 87 6 chr15 8193027 8193367 -95301607 + RLTR1B LTR ERV1 1 410 -102 4 647 471 142 14 0 chr15 8193371 8193461 -95301513 + RLTR1 LTR ERV1 470 550 -74 4 647 233 256 158 43 chr15 8218175 8218359 -95276615 + RLTR15 LTR ERVK 1 205 -154 5 647 925 58 188 0 chr15 8223384 8223522 -95271452 + MT2C_Mm LTR ERVL 312 475 0 5 647 1154 217 145 24 chr15 8223651 8224024 -95270950 - MTD LTR MaLR -1 418 1 5 647 261 242 0 142 chr15 8224088 8224194 -95270780 - MT2B LTR ERVL -329 272 182 5 647 233 293 0 0 chr15 8224707 8224765 -95270209 - MT2A LTR ERVL -133 400 343 5 647 523 327 36 43 chr15 8224766 8225095 -95269879 - MT2A LTR ERVL -107 426 100 5 647 3145 109 23 12 chr15 8225803 8226285 -95268689 - RLTR1C LTR ERV1 -16 487 1 5 647 593 124 22 57 chr15 8226285 8226433 -95268541 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 3221 5 647 5085 99 8 8 chr15 8226418 8227175 -95267799 - MMVL30-int LTR ERV1 -68 3630 2874 5 647 3096 44 0 11 chr15 8227367 8227736 -95267238 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 5 647 4932 102 37 8 chr15 8227965 8228772 -95266202 - MMVL30-int LTR ERV1 -2409 2654 1500 5 647 570 143 56 126 chr15 8228839 8229116 -95265858 - MMVL30-int LTR ERV1 -2187 1511 964 5 647 2147 107 0 9 chr15 8229197 8229517 -95265457 - MMVL30-int LTR ERV1 -2245 1453 1137 5 647 453 201 99 141 chr15 8229677 8229794 -95265180 - MMVL30-int LTR ERV1 -2521 778 669 5 647 453 201 99 141 chr15 8229966 8230160 -95264814 - MMVL30-int LTR ERV1 -2631 668 482 5 647 1526 210 124 119 chr15 8230266 8230872 -95264102 - MMERGLN-int LTR ERV1 -6933 623 15 5 647 1668 171 21 9 chr15 8230887 8231205 -95263769 - RLTR1C LTR ERV1 0 507 185 5 647 1642 87 29 9 chr15 8231206 8231543 -95263431 - IAPEY3-int LTR ERVK -161 7420 7146 5 647 1207 181 246 15 chr15 8244445 8244787 -95250187 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 648 1152 272 143 3 chr15 8270381 8270463 -95224511 + MTC LTR MaLR 1 95 -312 6 648 1249 196 62 0 chr15 8270739 8271013 -95223961 + MTC LTR MaLR 96 421 0 6 648 4684 178 146 35 chr15 8271013 8272146 -95222828 + MTC-int LTR MaLR 1 1258 0 6 648 505 188 69 0 chr15 8272146 8272247 -95222727 + MTC LTR MaLR 1 108 -313 6 648 2372 68 12 12 chr15 8278503 8278828 -95216146 + ORR1A2 LTR MaLR 2 326 -1 6 648 1317 172 11 9 chr15 8279518 8279779 -95215195 + RLTR11B LTR ERVK 3 271 -256 6 648 434 273 91 0 chr15 8287198 8287341 -95207633 + LTR33 LTR ERVL 59 214 -301 6 648 577 285 95 175 chr15 8297206 8297618 -95197356 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 6 648 1524 217 110 38 chr15 8339947 8340549 -95154425 + ORR1D-int LTR MaLR 584 1403 -106 7 648 361 294 88 35 chr15 8345954 8346180 -95148794 + MLT1C LTR MaLR 221 458 -9 7 648 642 296 97 48 chr15 8354528 8354952 -95140022 + MLT1H1 LTR MaLR 2 546 -9 7 648 3046 47 39 0 chr15 8359237 8359618 -95135356 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 648 248 349 85 31 chr15 8359930 8360060 -95134914 + MLT1I LTR MaLR 101 237 -174 8 648 1279 274 72 6 chr15 8363372 8363721 -95131253 + MTE2b LTR MaLR 1 372 -7 8 648 872 189 61 27 chr15 8365584 8365882 -95129092 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 1 8 648 356 258 51 10 chr15 8368225 8368323 -95126651 + MLT1F2 LTR MaLR 457 558 -2 8 648 1303 248 133 0 chr15 8368560 8368883 -95126091 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 8 648 2011 115 73 70 chr15 8378409 8378792 -95116182 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 8 648 2700 153 97 19 chr15 8380184 8380625 -95114349 + RLTR20D LTR ERVK 1 475 -93 8 648 2700 153 97 19 chr15 8380677 8380762 -95114212 + RLTR20D LTR ERVK 476 567 -1 8 649 305 304 0 74 chr15 8419176 8419297 -95075677 + MTE2b LTR MaLR 8 119 -260 9 649 517 261 45 13 chr15 8419325 8419480 -95075494 + MTE2b LTR MaLR 183 342 -37 9 649 2087 92 43 0 chr15 8419907 8420212 -95074762 + ORR1A2 LTR MaLR 1 318 -9 9 649 720 153 86 31 chr15 8422269 8422431 -95072543 + MTD LTR MaLR 249 419 0 9 649 3782 64 71 2 chr15 8422617 8423136 -95071838 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 10 9 649 2911 49 0 0 chr15 8423155 8423501 -95071473 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 9 649 854 242 156 13 chr15 8425916 8426344 -95068630 - MTD LTR MaLR -92 327 5 9 649 1653 124 14 221 chr15 8426911 8427427 -95067547 + RMER17C LTR ERVK 2 410 0 9 649 2842 101 43 38 chr15 8427697 8428140 -95066834 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 140 9 649 416 321 49 23 chr15 8429188 8429505 -95065469 + MLT1A0 LTR MaLR 11 408 0 9 649 256 284 91 84 chr15 8431991 8432145 -95062829 - MLT1A1 LTR MaLR -253 155 1 9 649 2139 160 24 11 chr15 8434529 8434908 -95060066 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 9 649 755 307 164 19 chr15 8437515 8437930 -95057044 - MLT1G1 LTR MaLR 0 579 105 9 649 741 296 105 22 chr15 8439437 8439761 -95055213 - ORR1E LTR MaLR -8 351 1 9 649 260 315 33 33 chr15 8449111 8449321 -95045653 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 132 1 649 331 184 99 99 chr15 8449403 8449524 -95045450 - RLTR15 LTR ERVK -238 121 1 1 649 2202 101 9 58 chr15 8454447 8454793 -95040181 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 649 412 266 85 67 chr15 8456206 8456371 -95038603 + MTEa LTR MaLR 66 233 -146 1 649 264 294 106 19 chr15 8461768 8461872 -95033102 + MLT1A LTR MaLR 15 127 -247 1 649 900 271 15 53 chr15 8461878 8462217 -95032757 - ORR1E LTR MaLR -2 357 32 1 649 229 333 96 51 chr15 8462465 8462642 -95032332 + LTR33A_ LTR ERVL 126 310 -221 1 649 2049 151 113 3 chr15 8472350 8472729 -95022245 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 649 451 311 40 109 chr15 8478292 8478643 -95016331 + ORR1E LTR MaLR 34 367 -3 1 649 1321 310 112 12 chr15 8480648 8481164 -95013810 + MLT1F1 LTR MaLR 1 568 -1 1 649 450 384 75 5 chr15 8483031 8483369 -95011605 - MLT1G3 LTR MaLR -38 541 161 1 649 774 166 31 19 chr15 8483821 8483981 -95010993 - MTD LTR MaLR -10 409 248 1 649 804 316 22 11 chr15 8484132 8484401 -95010573 - MTD LTR MaLR -130 289 18 1 649 265 210 48 0 chr15 8484579 8484641 -95010333 + MLT1D LTR MaLR 1 65 -440 1 649 309 314 128 52 chr15 8484963 8485412 -95009562 - MLT1C LTR MaLR 0 467 1 1 649 274 296 14 0 chr15 8485455 8485526 -95009448 - ERVL-E-int LTR ERVL -2394 3273 3202 1 649 2198 67 96 13 chr15 8486705 8487007 -95007967 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 649 331 294 0 0 chr15 8488254 8488346 -95006628 + MLT1B LTR MaLR 298 389 -1 1 649 259 247 123 0 chr15 8491176 8491257 -95003717 + MLT1H2 LTR MaLR 396 486 -3 1 649 305 312 30 46 chr15 8493074 8493205 -95001769 + MLT1D LTR MaLR 346 474 -31 1 649 324 226 20 51 chr15 8496641 8496739 -94998235 - ORR1E LTR MaLR -10 369 275 1 649 1589 168 94 6 chr15 8496749 8497079 -94997895 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 1 649 477 273 34 81 chr15 8497089 8497181 -94997793 - ORR1E LTR MaLR -131 228 146 1 649 477 273 34 81 chr15 8497333 8497475 -94997499 - ORR1E LTR MaLR -214 145 5 1 649 601 278 188 19 chr15 8497729 8498037 -94996937 + MLT1C LTR MaLR 1 360 -107 1 649 2519 121 46 48 chr15 8498038 8498514 -94996460 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 649 13803 7 1 0 chr15 8498514 8500000 -94994974 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4994 1 649 13674 4 1 0 chr15 8500000 8501468 -94993506 - IAPEz-int LTR ERVK -1488 4993 3525 1 649 953 80 24 0 chr15 8501468 8501593 -94993381 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4783 2 649 1876 111 4 4 chr15 8501588 8501850 -94993124 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 2 649 454 66 0 32 chr15 8501839 8501902 -94993072 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 2 649 4631 48 68 21 chr15 8501902 8502519 -94992455 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 17 2 649 259 235 57 73 chr15 8502527 8502542 -94992432 + MLT1D LTR MaLR 381 394 -111 3 649 2509 124 46 48 chr15 8502542 8503018 -94991956 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 649 324 231 46 37 chr15 8503018 8503126 -94991848 + MLT1B LTR MaLR 279 387 -3 5 649 257 274 0 40 chr15 8503147 8503223 -94991751 + LTR16A1 LTR ERVL 384 456 0 6 649 579 323 145 48 chr15 8504313 8504896 -94990078 - MLT1E1A LTR MaLR -11 613 1 8 649 1271 122 25 0 chr15 8505123 8505319 -94989655 - ORR1A2 LTR MaLR -102 225 25 9 649 1123 136 63 99 chr15 8505369 8505643 -94989331 + ORR1D1 LTR MaLR 1 288 -71 1 649 2227 88 6 0 chr15 8505649 8505966 -94989008 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 649 412 169 72 0 chr15 8505966 8506037 -94988937 + ORR1D1 LTR MaLR 298 374 0 1 649 3026 79 94 51 chr15 8507065 8507556 -94987418 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 649 334 345 115 35 chr15 8508629 8508917 -94986057 + LTR16E2 LTR ERVL 258 568 0 1 649 2814 30 63 0 chr15 8514965 8515298 -94979676 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 2 649 875 211 8 16 chr15 8517389 8517635 -94977339 + RMER17C LTR ERVK 1 244 -166 3 649 675 217 88 26 chr15 8517609 8517917 -94977057 + RMER17C LTR ERVK 84 410 0 3 650 244 227 39 39 chr15 8521400 8521478 -94973496 - MLT1E2 LTR MaLR -37 468 391 4 650 468 279 19 109 chr15 8521519 8521802 -94973172 - MLT1E2 LTR MaLR -225 280 9 4 650 352 301 0 0 chr15 8523081 8523174 -94971800 + MLT1B LTR MaLR 1 93 -297 4 650 257 228 151 11 chr15 8526661 8526754 -94968220 + MLT1B LTR MaLR 81 186 -204 4 650 339 227 0 13 chr15 8526827 8526903 -94968071 + MLT1B LTR MaLR 314 388 -2 4 650 916 268 89 41 chr15 8537917 8538286 -94956688 - MT2A LTR ERVL 0 533 147 7 650 3112 66 2 5 chr15 8541343 8541740 -94953234 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 650 801 272 32 58 chr15 8544542 8544819 -94950155 + MTEa LTR MaLR 79 348 -31 8 650 834 168 57 23 chr15 8550494 8550671 -94944303 - MTC LTR MaLR 0 421 239 9 650 621 217 8 0 chr15 8550876 8551005 -94943969 - MTC LTR MaLR -157 264 135 9 650 287 185 46 0 chr15 8551174 8551239 -94943735 - MTE2b LTR MaLR -18 361 294 9 650 896 283 79 62 chr15 8553043 8553397 -94941577 - MTD LTR MaLR -38 381 22 9 650 3338 41 5 2 chr15 8554263 8554658 -94940316 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 650 320 339 43 85 chr15 8560094 8560516 -94934458 + ERVL-int LTR ERVL 2109 2512 -3245 1 650 2692 68 5 34 chr15 8560517 8560577 -94934397 - MTB LTR MaLR 0 400 346 1 650 2729 48 33 0 chr15 8560577 8560912 -94934062 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 650 2692 68 5 34 chr15 8560912 8561263 -94933711 - MTB LTR MaLR -55 345 1 1 650 280 324 87 47 chr15 8561269 8561418 -94933556 + ERVL-int LTR ERVL 2426 2580 -3087 1 650 860 148 102 60 chr15 8563164 8563347 -94931627 + ORR1C2 LTR MaLR 1 176 -208 1 650 860 148 102 60 chr15 8563375 8563406 -94931568 + ORR1C2 LTR MaLR 177 223 -161 1 650 1446 269 63 32 chr15 8566961 8567467 -94927507 - RMER5 LTR ERV1 0 534 13 1 650 784 291 24 22 chr15 8567557 8567857 -94927117 + MLT1D LTR MaLR 164 496 -9 1 650 282 308 128 16 chr15 8576934 8577122 -94917852 + LTR81A LTR ERV1? 80 281 -1112 1 650 271 298 184 12 chr15 8577523 8577686 -94917288 - MLT1A LTR MaLR -1 373 183 1 650 353 259 41 5 chr15 8578225 8578388 -94916586 - MLT1A LTR MaLR -2 372 192 1 650 259 299 157 9 chr15 8590031 8590139 -94904835 + MLT1J LTR MaLR 74 197 -315 1 650 862 57 0 47 chr15 8606159 8606287 -94888687 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 286 1 650 2059 100 71 3 chr15 8606306 8606656 -94888318 - MTB_Mm-int LTR MaLR -724 374 1 1 650 1576 177 105 39 chr15 8606656 8607038 -94887936 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 650 989 134 219 16 chr15 8610878 8611188 -94883786 + RMER10A LTR ERVL 53 425 -17 1 650 515 144 103 0 chr15 8611598 8611695 -94883279 - RMER10A LTR ERVL -335 107 1 1 650 435 141 9 217 chr15 8625850 8626076 -94868898 + RMER17C LTR ERVK 97 275 -135 2 650 2920 53 2 113 chr15 8640171 8640373 -94854601 + MTB LTR MaLR 1 196 -204 2 650 2920 53 2 113 chr15 8640520 8640767 -94854207 + MTB LTR MaLR 197 400 0 2 650 1246 159 71 42 chr15 8649525 8649731 -94845243 + RMER17C LTR ERVK 1 212 -198 2 650 1246 111 256 39 chr15 8649877 8650033 -94844941 + RMER17C LTR ERVK 213 402 -8 2 651 2389 98 3 0 chr15 8664344 8664670 -94830304 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 651 2016 136 17 22 chr15 8665793 8666154 -94828820 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 2 651 660 190 94 41 chr15 8674267 8674437 -94820537 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 268 3 651 3107 28 2 116 chr15 8674447 8674885 -94820089 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 3 651 9004 16 0 2 chr15 8674887 8675884 -94819090 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 3 651 373 271 31 8 chr15 8675966 8676096 -94818878 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 3 651 7850 33 33 2 chr15 8676160 8677090 -94817884 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 40 3 651 3056 34 2 116 chr15 8677101 8677539 -94817435 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 3 651 795 112 59 191 chr15 8677542 8677762 -94817212 - RLTR41 LTR ERV1 -194 252 62 3 651 1930 134 114 12 chr15 8678993 8679326 -94815648 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 651 1551 176 63 3 chr15 8680315 8680617 -94814357 + ORR1D1 LTR MaLR 55 374 0 3 651 235 345 128 60 chr15 8684811 8685045 -94809929 - MLT1J LTR MaLR -187 325 76 3 651 2567 66 0 62 chr15 8685123 8685487 -94809487 + MTB_Mm LTR MaLR 1 350 -57 3 651 3315 46 5 2 chr15 8685487 8685882 -94809092 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 651 7126 77 51 71 chr15 8685882 8687003 -94807971 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 651 3195 32 42 3 chr15 8687005 8687384 -94807590 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 3 651 2567 66 0 62 chr15 8687384 8687403 -94807571 + MTB_Mm LTR MaLR 351 363 -44 3 651 1878 70 0 8 chr15 8688127 8688293 -94806681 - MT2B LTR ERVL -437 164 1 3 651 381 248 19 29 chr15 8688400 8688504 -94806470 + MLT1A1 LTR MaLR 306 408 0 3 651 2105 101 3 164 chr15 8694828 8694933 -94800041 + ORR1A2 LTR MaLR 1 91 -236 3 651 2105 101 3 164 chr15 8695080 8695364 -94799610 + ORR1A2 LTR MaLR 92 327 0 3 651 231 313 109 20 chr15 8695530 8695631 -94799343 + ORR1E LTR MaLR 1 110 -249 3 651 2383 163 88 112 chr15 8698917 8699544 -94795430 - RMER20B LTR ERVK -3 624 13 3 651 803 189 100 41 chr15 8701052 8701323 -94793651 + RLTR15 LTR ERVK 43 329 -30 3 651 2629 119 18 5 chr15 8707938 8708327 -94786647 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 651 358 311 37 15 chr15 8719966 8720100 -94774874 + ORR1E LTR MaLR 1 137 -222 4 651 404 70 70 0 chr15 8720275 8720332 -94774642 + MYSERV6-int LTR ERVK 4958 5018 -3941 4 651 821 112 0 0 chr15 8720458 8720574 -94774400 + MYSERV6-int LTR ERVK 6336 6451 -2508 4 651 7999 124 32 75 chr15 8720634 8721372 -94773602 + MYSERV6-int LTR ERVK 6469 7155 -1804 4 651 7999 124 32 75 chr15 8721520 8722287 -94772687 + MYSERV6-int LTR ERVK 7156 7910 -1049 4 651 406 340 6 66 chr15 8726620 8726787 -94768187 - MLT1A LTR MaLR -27 347 191 4 651 412 311 72 17 chr15 8726862 8727042 -94767932 - MLT1A LTR MaLR -182 192 3 4 651 1456 242 30 5 chr15 8727776 8727981 -94766993 + MTEb LTR MaLR 1 205 -174 4 651 1456 242 30 5 chr15 8728029 8728193 -94766781 + MTEb LTR MaLR 206 378 -1 4 651 678 285 121 32 chr15 8728564 8728879 -94766095 + MLT1D LTR MaLR 150 492 -13 4 651 230 222 13 40 chr15 8728865 8728940 -94766034 + MLT1D LTR MaLR 433 505 0 4 651 1196 302 97 26 chr15 8733226 8733722 -94761252 - MER21B LTR ERV1 -61 802 272 4 651 2193 137 64 6 chr15 8735030 8735374 -94759600 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 4 4 651 810 185 6 13 chr15 8736454 8736613 -94758361 + MTC LTR MaLR 264 421 0 4 651 2014 66 73 0 chr15 8743147 8743436 -94751538 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 18 4 651 501 341 148 8 chr15 8743571 8743828 -94751146 - MLT1F LTR MaLR -254 294 2 4 651 1183 199 53 35 chr15 8744151 8744433 -94750541 + MTD LTR MaLR 41 327 -92 4 651 837 146 67 29 chr15 8744443 8744684 -94750290 + ORR1B1 LTR MaLR 30 394 0 4 651 348 130 72 0 chr15 8744686 8744755 -94750219 + MTD LTR MaLR 346 419 0 4 651 416 204 51 34 chr15 8749102 8749280 -94745694 - RMER17C LTR ERVK -133 277 97 4 651 3185 64 8 2 chr15 8761177 8761571 -94733403 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 651 1594 207 73 18 chr15 8763483 8763882 -94731092 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 651 1075 214 186 20 chr15 8764831 8765175 -94729799 + RMER15 LTR ERVL 27 427 -148 4 651 249 200 33 0 chr15 8765190 8765250 -94729724 - MTD LTR MaLR -8 411 350 4 651 1714 210 97 82 chr15 8768413 8768988 -94725986 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 4 651 1142 251 46 97 chr15 8769543 8770121 -94724853 - RLTR18B LTR ERVK -1 615 91 4 651 1101 269 68 133 chr15 8770309 8770374 -94724600 - RLTR18B LTR ERVK -526 90 14 4 651 2115 77 28 16 chr15 8771246 8771564 -94723410 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 651 5360 36 39 3 chr15 8771564 8772226 -94722748 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 4159 4 651 3051 58 0 5 chr15 8772216 8772640 -94722334 - MMETn-int LTR ERVK -2933 381 1 4 651 2115 77 28 16 chr15 8772640 8772958 -94722016 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 651 5528 99 25 42 chr15 8773489 8774391 -94720583 - RMER17D LTR ERVK -2 887 1 4 651 243 200 55 136 chr15 8774996 8775106 -94719868 + MLT1J LTR MaLR 1 101 -264 4 651 284 312 82 20 chr15 8777535 8777682 -94717292 - MLT1A0 LTR MaLR -206 159 4 5 651 276 280 83 25 chr15 8777709 8777830 -94717144 + MLT1J LTR MaLR 246 373 -139 4 651 465 212 26 70 chr15 8779852 8779904 -94715070 - MTD LTR MaLR -14 405 318 5 651 1840 118 82 14 chr15 8779904 8780195 -94714779 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 651 465 216 24 77 chr15 8780195 8780296 -94714678 - MTD LTR MaLR -51 368 283 5 651 839 266 80 49 chr15 8780320 8780608 -94714366 - MTD LTR MaLR -116 303 7 5 651 284 75 0 0 chr15 8780980 8781020 -94713954 + RMER6C LTR ERVK 650 689 -1 5 652 2715 99 28 13 chr15 8781861 8782258 -94712716 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 5 652 3367 35 5 2 chr15 8782692 8783087 -94711887 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 652 2150 108 13 3 chr15 8790124 8790430 -94704544 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 5 652 2212 117 60 82 chr15 8792245 8792646 -94702328 + RLTR9C LTR ERVK 2 393 0 5 652 313 279 71 9 chr15 8798137 8798249 -94696725 + LTR65 LTR ERV1 202 320 -349 5 652 957 291 79 11 chr15 8798553 8798907 -94696067 + MTEb LTR MaLR 1 378 -1 5 652 274 352 188 3 chr15 8800079 8800367 -94694607 + LTR16C LTR ERVL 149 489 0 5 652 404 285 138 18 chr15 8803554 8803829 -94691145 + LTR40b LTR ERVL 153 460 -2 5 652 231 335 90 45 chr15 8807174 8807352 -94687622 - LTR16C LTR ERVL -2 487 302 5 652 320 329 33 65 chr15 8807466 8807619 -94687355 - LTR16C LTR ERVL -338 151 4 5 652 2998 79 7 17 chr15 8813190 8813601 -94681373 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 652 312 279 8 67 chr15 8818231 8818350 -94676624 - MLT1A LTR MaLR -197 177 66 5 652 292 352 52 66 chr15 8819878 8819975 -94674999 - LTR48B LTR ERV1 0 644 546 5 652 292 352 52 66 chr15 8820153 8820326 -94674648 - LTR48B LTR ERV1 -99 545 379 5 652 313 328 43 58 chr15 8822527 8822619 -94672355 + MER21B LTR ERV1 100 196 -667 5 652 313 328 43 58 chr15 8822811 8822905 -94672069 + MER21B LTR ERV1 197 283 -580 5 652 286 279 144 60 chr15 8822944 8823297 -94671677 + MTEa LTR MaLR 4 396 -12 6 652 397 337 92 75 chr15 8823366 8823712 -94671262 + MER21B LTR ERV1 405 756 -107 5 652 288 234 10 41 chr15 8823790 8823888 -94671086 - MER34 LTR ERV1 -65 477 383 6 652 2851 152 136 0 chr15 8826944 8827459 -94667515 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 6 652 585 294 62 6 chr15 8828284 8828462 -94666512 + MTEa LTR MaLR 1 188 -191 6 652 1368 228 83 11 chr15 8841444 8841817 -94653157 + MTD LTR MaLR 18 417 -2 6 652 552 0 0 0 chr15 8843500 8843566 -94651408 - MTB LTR MaLR 0 400 335 6 652 4079 58 13 22 chr15 8843561 8844157 -94650817 - MTA_Mm-int LTR MaLR -507 591 1 6 652 3311 38 2 10 chr15 8844157 8844556 -94650418 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 652 396 330 110 49 chr15 8845333 8845578 -94649396 + MTEa LTR MaLR 41 300 -79 6 652 349 188 0 0 chr15 8845803 8845872 -94649102 + MTEa LTR MaLR 311 379 0 6 652 512 138 62 16 chr15 8853606 8853726 -94641248 + RMER19B LTR ERVK 357 455 -447 6 652 1534 207 98 51 chr15 8861887 8862336 -94632638 + RMER19C LTR ERVK 142 611 0 6 652 2370 81 19 9 chr15 8863425 8863749 -94631225 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 652 238 175 0 0 chr15 8865590 8865630 -94629344 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 343 6 652 1855 117 40 19 chr15 8867950 8868272 -94626702 - IAPEY_LTR LTR ERVK -2 383 55 6 652 2077 71 0 0 chr15 8868272 8868526 -94626448 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7581 7328 6 652 28063 58 7 1 chr15 8868539 8871960 -94623014 - IAPEY3-int LTR ERVK -420 7260 3820 6 652 1088 55 0 0 chr15 8876540 8876668 -94618306 - IAPEY3-int LTR ERVK -3733 3947 3820 6 652 7387 165 21 23 chr15 8876661 8877986 -94616988 - IAPEy-int LTR ERVK -6191 1322 1 6 652 1847 102 42 4 chr15 8877986 8878297 -94616677 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 411 32 6 652 254 372 10 0 chr15 8880450 8880552 -94614422 + MLT1J LTR MaLR 73 175 -337 6 652 2164 131 58 15 chr15 8881891 8882167 -94612807 - RLTR31_Mm LTR ERVK -149 412 134 6 652 2164 131 58 15 chr15 8882195 8882313 -94612661 - RLTR31_Mm LTR ERVK -428 133 2 6 652 2029 110 49 58 chr15 8882672 8883001 -94611973 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 6 652 2066 165 67 19 chr15 8887950 8888326 -94606648 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 652 430 381 11 22 chr15 8893151 8893336 -94601638 + MLT1H1 LTR MaLR 9 191 -364 6 652 893 358 86 112 chr15 8893773 8894454 -94600520 + MLT1H1-int LTR MaLR 83 787 -622 6 652 893 358 86 112 chr15 8894662 8895303 -94599671 + MLT1H1-int LTR MaLR 788 1375 -34 6 652 2323 123 9 9 chr15 8895303 8895632 -94599342 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 652 893 358 86 112 chr15 8895632 8895659 -94599315 + MLT1H1-int LTR MaLR 1376 1398 -11 6 652 368 209 93 0 chr15 8896109 8896195 -94598779 + MLT1H2 LTR MaLR 392 485 -4 6 652 2035 196 39 12 chr15 8899346 8899754 -94595220 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 652 2042 135 78 40 chr15 8902914 8903284 -94591690 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 652 1856 101 45 75 chr15 8903534 8903738 -94591236 + ORR1A4 LTR MaLR 1 186 -143 7 652 3278 56 5 15 chr15 8903738 8904138 -94590836 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 652 1856 101 45 75 chr15 8904138 8904264 -94590710 + ORR1A4 LTR MaLR 187 321 -8 7 652 377 295 126 29 chr15 8905221 8905462 -94589512 + MLT1A0 LTR MaLR 108 374 0 7 652 3457 100 87 58 chr15 8906662 8907000 -94587974 + RMER2 LTR ERV1 1 359 -208 7 652 3457 100 87 58 chr15 8907028 8907240 -94587734 + RMER2 LTR ERV1 360 566 -1 7 652 2076 122 98 16 chr15 8910766 8911132 -94583842 + MTB_Mm LTR MaLR 1 396 -11 7 653 3347 60 8 2 chr15 8913688 8914086 -94580888 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 653 3340 55 142 0 chr15 8916038 8916454 -94578520 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 7 653 303 286 36 0 chr15 8921723 8921807 -94573167 - MLT2B4 LTR ERVL -328 228 142 7 653 986 349 111 43 chr15 8922161 8922853 -94572121 - MER21B LTR ERV1 -111 752 14 7 653 266 245 9 93 chr15 8926188 8926296 -94568678 + MTEa LTR MaLR 278 376 -3 7 653 3121 155 31 20 chr15 8926876 8927439 -94567535 - RLTR17 LTR ERVK -139 553 1 7 653 2701 84 84 5 chr15 8928915 8929296 -94565678 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 7 653 977 319 126 32 chr15 8929468 8929967 -94565007 - LTR82A LTR ERVL -8 864 319 7 653 2659 77 3 6 chr15 8932399 8932726 -94562248 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 7 653 311 148 0 0 chr15 8947190 8947244 -94547730 + ORR1C1 LTR MaLR 1 54 -324 7 653 3191 33 33 7 chr15 8947396 8947821 -94547153 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 653 414 206 114 10 chr15 8949148 8949276 -94545698 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 188 7 653 983 192 14 14 chr15 8949401 8949612 -94545362 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 174 7 653 838 212 11 0 chr15 8949836 8950015 -94544959 - ORR1C2 LTR MaLR -193 181 1 7 653 1266 219 72 67 chr15 8955197 8955584 -94539390 - MTD LTR MaLR -13 406 18 8 653 1373 273 24 24 chr15 8958227 8958606 -94536368 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 8 653 232 312 72 10 chr15 8959550 8959647 -94535327 + RLTR12B LTR ERVK 117 219 -309 8 653 4002 55 2 62 chr15 8960071 8960263 -94534711 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 321 8 653 4002 55 2 62 chr15 8960315 8960667 -94534307 - RLTR1B LTR ERV1 -192 320 1 8 653 2512 109 142 19 chr15 8964723 8965152 -94529822 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 8 653 1671 139 64 174 chr15 8965451 8965859 -94529115 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 8 653 307 162 57 29 chr15 8968031 8968101 -94526873 + RLTR25B LTR ERVK 501 572 -531 8 653 246 100 39 20 chr15 8969497 8969532 -94525442 - MTEb LTR MaLR -3 376 341 8 653 246 100 39 20 chr15 8969870 8969885 -94525089 - MTEb LTR MaLR -39 340 325 8 653 1375 206 146 13 chr15 8970049 8970433 -94524541 + RLTR25B LTR ERVK 594 1028 0 8 653 1617 137 72 36 chr15 8970668 8971001 -94523973 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 25 8 653 294 200 29 58 chr15 8971194 8971263 -94523711 - RMER13A LTR ERVK -227 681 615 8 653 986 201 168 28 chr15 8971315 8971655 -94523319 - RMER13A LTR ERVK -387 521 96 8 653 2886 97 60 22 chr15 8973788 8974252 -94520722 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 8 653 227 303 14 43 chr15 8975062 8975131 -94519843 - MLT1J1 LTR MaLR -334 110 44 8 653 3666 73 39 23 chr15 8975961 8976532 -94518442 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 227 8 653 2689 160 33 28 chr15 8976505 8977045 -94517929 - RLTR13D1 LTR ERVK -359 543 1 8 653 322 62 0 0 chr15 8984528 8984576 -94510398 - RLTR1B LTR ERV1 -464 48 1 8 653 619 201 102 42 chr15 8984590 8984756 -94510218 - RMER16 LTR ERVK -251 282 107 8 653 983 226 177 0 chr15 8997097 8997402 -94497572 - ORR1D2 LTR MaLR -11 359 1 8 653 299 333 112 21 chr15 9019449 9019636 -94475338 + MLT1F LTR MaLR 211 414 -134 1 653 773 203 97 20 chr15 9022703 9022899 -94472075 - RLTR11A LTR ERVK -308 220 10 2 653 1733 196 50 29 chr15 9022912 9023328 -94471646 - MYSERV-int LTR ERVK -3 6547 6123 2 653 1299 147 156 11 chr15 9023338 9023614 -94471360 - ORR1B1 LTR MaLR -73 321 6 2 653 289 361 87 0 chr15 9023784 9023995 -94470979 - MLT1F1 LTR MaLR -11 558 328 2 653 1502 130 41 107 chr15 9023995 9024340 -94470634 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 653 289 361 87 0 chr15 9024340 9024358 -94470616 - MLT1F1 LTR MaLR -242 327 310 2 653 273 257 151 69 chr15 9031839 9031998 -94462976 - MLT1J2 LTR MaLR -8 440 269 3 653 4039 160 53 70 chr15 9035160 9035801 -94459173 - RMER12 LTR ERVK 0 1404 388 4 653 4039 134 44 48 chr15 9035947 9036255 -94458719 - RMER12 LTR ERVK -935 387 69 4 654 1092 254 44 39 chr15 9057891 9058255 -94436719 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 6 654 319 276 118 41 chr15 9061033 9061203 -94433771 - LTR16C LTR ERVL -80 409 227 7 654 1380 144 14 104 chr15 9074834 9075113 -94419861 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 141 1 654 824 71 9 9 chr15 9075104 9075218 -94419756 - ORR1A2-int LTR MaLR -190 1602 1489 1 654 599 208 0 118 chr15 9075211 9075347 -94419627 - MT2B LTR ERVL -325 276 157 1 654 2792 148 74 34 chr15 9075340 9075878 -94419096 - ORR1A2-int LTR MaLR -1403 560 1 1 654 2221 111 65 3 chr15 9075878 9076186 -94418788 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 654 2786 141 26 157 chr15 9077517 9078124 -94416850 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 1 1 654 1735 177 29 63 chr15 9084895 9085245 -94409729 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 41 1 654 471 254 70 9 chr15 9087945 9088060 -94406914 - MLT1C LTR MaLR -15 452 331 1 654 660 259 154 18 chr15 9091135 9091469 -94403505 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 1 654 3200 278 95 55 chr15 9091471 9092559 -94402415 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 321 1 654 527 330 85 6 chr15 9092990 9093167 -94401807 - MTEb-int LTR MaLR -1225 355 165 1 654 2133 137 38 0 chr15 9097365 9097680 -94397294 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 654 11307 126 81 23 chr15 9097680 9099536 -94395438 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 1 654 2411 108 3 18 chr15 9099536 9099864 -94395110 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 1 654 347 337 92 76 chr15 9106405 9106733 -94388241 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 25 1 654 3822 162 79 11 chr15 9109986 9110729 -94384245 - RMER13B LTR ERVK -107 801 8 1 654 279 331 107 96 chr15 9112601 9112882 -94382092 - ORR1E LTR MaLR 0 359 76 1 654 824 267 95 83 chr15 9114533 9115087 -94379887 - RLTR12B LTR ERVK -27 501 1 1 654 739 209 126 53 chr15 9119571 9119896 -94375078 - RMER4B LTR ERVK -140 471 1 1 654 1382 181 107 32 chr15 9121553 9121794 -94373180 - RLTR40 LTR ERVK -7 810 561 1 654 1382 181 107 32 chr15 9121840 9121906 -94373068 - RLTR40 LTR ERVK -257 560 482 1 654 1921 184 147 5 chr15 9122048 9122485 -94372489 - RLTR40 LTR ERVK -318 499 1 1 654 349 215 16 116 chr15 9130557 9130678 -94364296 + MT2B LTR ERVL 156 264 -337 2 654 281 217 138 21 chr15 9134223 9134317 -94360657 + MLT2B3 LTR ERVL 1 105 -449 2 654 262 321 152 0 chr15 9134317 9134335 -94360639 + MTEb LTR MaLR 1 129 -250 2 654 886 211 173 8 chr15 9134566 9134814 -94360160 + RLTR28B LTR ERVL 17 305 -176 2 654 811 252 59 43 chr15 9135020 9135273 -94359701 + MTEb LTR MaLR 111 367 -12 2 654 421 312 206 20 chr15 9138430 9138766 -94356208 + MLT1-int LTR MaLR 66 603 -768 2 654 2943 227 55 88 chr15 9138809 9140002 -94354972 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 2 654 964 325 111 14 chr15 9140110 9140472 -94354502 - MER70A LTR ERVL -13 459 63 2 654 3880 160 84 29 chr15 9142607 9143462 -94351512 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 2 654 8777 145 16 37 chr15 9143475 9145179 -94349795 - ETnERV3-int LTR ERVK -31 5777 4122 2 654 5250 112 45 8 chr15 9145183 9146077 -94348897 - ETnERV2-int LTR ERVK -3986 3420 2494 2 654 4069 140 42 39 chr15 9146068 9147006 -94347968 - ETnERV2-int LTR ERVK -5019 789 3 2 654 276 185 148 0 chr15 9147337 9147391 -94347583 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 313 2 654 3574 72 19 2 chr15 9148795 9149269 -94345705 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 654 7161 43 0 41 chr15 9149269 9150220 -94344754 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 6333 2 654 2043 97 13 3 chr15 9150220 9150519 -94344455 - RLTR13B1 LTR ERVK -385 508 207 2 654 7783 43 3 9 chr15 9150541 9151555 -94343419 - RLTR45-int LTR ERVK -1172 6072 5065 2 654 3744 82 30 36 chr15 9151548 9152159 -94342815 - RLTR45-int LTR ERVK -3258 3986 3380 2 654 11312 41 40 8 chr15 9152129 9153961 -94341013 - RLTR45-int LTR ERVK -4032 3212 1322 2 654 1041 58 0 0 chr15 9154736 9154874 -94340100 - RLTR45-int LTR ERVK -6426 818 681 2 654 4245 64 107 19 chr15 9155172 9155808 -94339166 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 1 2 654 3574 72 19 2 chr15 9155808 9156282 -94338692 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 654 2138 83 38 9 chr15 9156970 9157286 -94337688 - IAPLTR2b LTR ERVK -2 325 1 2 654 3283 48 5 0 chr15 9163525 9163919 -94331055 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 654 753 238 234 16 chr15 9166527 9166685 -94328289 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 177 2 654 753 238 234 16 chr15 9166803 9166900 -94328074 - ORR1D2 LTR MaLR -194 176 57 2 654 689 307 81 81 chr15 9167050 9167530 -94327444 - RMER13A LTR ERVK -295 613 79 2 654 1796 166 47 33 chr15 9167596 9167958 -94327016 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 654 1312 264 64 21 chr15 9168374 9168749 -94326225 + MTD LTR MaLR 1 391 -28 2 654 242 294 73 40 chr15 9169357 9169481 -94325493 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 276 2 654 470 253 63 3 chr15 9169664 9169805 -94325169 - MTC LTR MaLR -116 280 130 2 654 594 173 78 16 chr15 9169802 9169931 -94325043 + MTD LTR MaLR 283 419 0 2 654 1845 169 11 37 chr15 9172978 9173354 -94321620 - RLTR9A LTR ERVK -2 366 1 2 654 316 132 0 36 chr15 9173374 9173429 -94321545 - ETnERV2-int LTR ERVK -23 7383 7331 2 654 385 236 83 19 chr15 9173882 9173990 -94320984 - ETnERV2-int LTR ERVK -1195 6211 6097 2 654 1683 89 41 30 chr15 9173998 9174265 -94320709 - RMER16-int LTR ERVK -1230 4176 3907 2 654 4338 183 58 38 chr15 9174265 9174467 -94320507 - RMER16-int LTR ERVK -2260 3146 2948 2 654 3215 43 69 39 chr15 9174467 9174928 -94320046 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 654 4338 183 58 38 chr15 9174928 9175002 -94319972 - RMER16-int LTR ERVK -2459 2947 2877 2 655 4338 184 57 38 chr15 9175044 9175829 -94319145 - RMER16-int LTR ERVK -2883 3598 2077 2 655 2710 177 66 20 chr15 9175992 9176632 -94318342 - RMER16-int LTR ERVK -4267 3139 2471 2 655 2321 136 65 90 chr15 9176633 9177198 -94317776 - RLTR45-int LTR ERVK -4625 2619 2069 2 655 2001 151 11 32 chr15 9177603 9177973 -94317001 - RLTR9A LTR ERVK -6 362 1 2 655 5245 119 60 16 chr15 9181209 9182178 -94312796 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1 2 655 2554 37 43 126 chr15 9187842 9188240 -94306734 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 3 655 3110 61 2 10 chr15 9192583 9192982 -94301992 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 655 3167 23 0 0 chr15 9197748 9198101 -94296873 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -4 353 1 3 655 268 281 36 123 chr15 9202823 9202961 -94292013 + MTE2a LTR MaLR 63 188 -191 3 655 929 135 21 21 chr15 9203012 9203156 -94291818 + RLTR27 LTR ERVK 166 309 0 3 655 281 51 51 0 chr15 9203181 9203220 -94291754 + RLTR10-int LTR ERVK 163 203 -1784 3 655 546 264 45 45 chr15 9203228 9203426 -94291548 + RLTR10-int LTR ERVK 655 852 -1135 3 655 2634 302 43 42 chr15 9203819 9205643 -94289331 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3653 5477 -2104 3 655 331 312 18 24 chr15 9205862 9206026 -94288948 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6907 7069 -512 3 655 1413 161 0 22 chr15 9206147 9206414 -94288560 + MMERVK10C-int LTR ERVK 7321 7581 0 3 655 2180 111 10 16 chr15 9206414 9206725 -94288249 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 3 655 792 277 94 38 chr15 9208181 9208235 -94286739 - MLT2B3 LTR ERVL -272 282 232 3 655 792 277 94 38 chr15 9208415 9208626 -94286348 - MLT2B3 LTR ERVL -323 231 2 3 655 489 218 48 66 chr15 9213492 9213659 -94281315 + RNLTR23 LTR ERVK 479 642 0 3 655 347 86 89 62 chr15 9216745 9216768 -94278206 - RMER17D LTR ERVK -394 495 381 3 655 225 326 41 20 chr15 9216768 9216857 -94278117 - RMER10B LTR ERVL -122 276 190 3 655 225 326 41 20 chr15 9216951 9217008 -94277966 - RMER10B LTR ERVL -209 189 128 3 655 283 355 17 11 chr15 9220549 9220723 -94274251 - LTR52-int LTR ERVL -3163 393 219 3 655 2595 189 67 23 chr15 9222209 9222734 -94272240 - RMER19C LTR ERVK -17 594 47 3 655 1011 133 48 0 chr15 9222759 9222924 -94272050 - RMER19C LTR ERVK -436 175 3 3 655 272 232 93 51 chr15 9231562 9231680 -94263294 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 270 3 655 4578 101 11 40 chr15 9234076 9234822 -94260152 - RMER17A LTR ERVK -19 732 9 3 655 3223 24 42 0 chr15 9247022 9247402 -94247572 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 655 3908 66 11 10 chr15 9247403 9247952 -94247022 - MTA_Mm-int LTR MaLR -426 1366 560 3 655 1011 133 48 0 chr15 9247957 9248122 -94246852 - RMER19C LTR ERVK -436 175 3 3 655 3223 24 42 0 chr15 9254232 9254612 -94240362 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 655 7922 64 8 6 chr15 9254613 9255691 -94239283 - MTA_Mm-int LTR MaLR -17 1081 1 3 655 3152 49 21 0 chr15 9255691 9256079 -94238895 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 655 1856 52 295 22 chr15 9259739 9260017 -94234957 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 3 655 8942 127 11 20 chr15 9260022 9261648 -94233326 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 1982 -5698 3 655 3390 65 9 0 chr15 9261625 9262073 -94232901 + IAPEY3-int LTR ERVK 2238 2689 -4991 3 655 2749 115 15 31 chr15 9262202 9262853 -94232121 + IAPEY3-int LTR ERVK 6984 7576 -5 3 655 2761 200 29 21 chr15 9281336 9281897 -94213077 - RMER19C LTR ERVK 0 611 47 4 655 1008 129 49 0 chr15 9281897 9282060 -94212914 - RMER19C LTR ERVK -440 171 1 4 655 2688 40 0 3 chr15 9284386 9284709 -94210265 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 655 453 50 0 0 chr15 9284709 9284769 -94210205 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 4785 4 655 15567 32 0 3 chr15 9284769 9286701 -94208273 - MMETn-int LTR ERVK -2917 1927 1 4 655 2732 34 0 3 chr15 9286701 9287024 -94207950 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 655 3048 71 12 7 chr15 9289342 9289751 -94205223 - RLTR9F LTR ERVK -4 411 1 4 655 6259 60 12 22 chr15 9295423 9296253 -94198721 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 4 655 230 261 58 0 chr15 9301719 9301788 -94193186 + MT2B2 LTR ERVL 169 241 -343 4 655 397 297 112 26 chr15 9302350 9302502 -94192472 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 266 4 655 346 336 13 83 chr15 9303735 9303891 -94191083 - RLTR23 LTR ERV1 -278 152 8 4 656 471 295 61 13 chr15 9346056 9346286 -94148688 - ERVL-int LTR ERVL -819 4938 4698 4 656 432 322 7 0 chr15 9350385 9350528 -94144446 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4089 1625 1482 4 656 1132 206 135 25 chr15 9361449 9361723 -94133251 - ORR1D1 LTR MaLR -66 308 5 4 656 1761 144 121 9 chr15 9374288 9374603 -94120371 - ORR1B2 LTR MaLR -17 350 1 5 656 670 149 3 5 chr15 9375396 9375513 -94119461 - MTC LTR MaLR -168 253 124 5 656 258 262 86 112 chr15 9375510 9375858 -94119116 + RMER17D LTR ERVK 157 495 -394 5 656 1756 193 89 8 chr15 9380331 9380713 -94114261 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 656 537 280 38 13 chr15 9380817 9380976 -94113998 + MLT1A1 LTR MaLR 222 384 -24 5 656 4406 170 116 15 chr15 9382401 9383331 -94111643 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 5 5 656 1117 185 28 28 chr15 9387597 9387814 -94107160 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 158 5 656 340 217 0 0 chr15 9387878 9387947 -94107027 - ORR1D1 LTR MaLR -305 69 1 5 656 413 284 35 0 chr15 9388742 9388858 -94106116 + RMER20B LTR ERVK 1 120 -507 5 656 2582 198 29 27 chr15 9389196 9389721 -94105253 - RLTR20B2 LTR ERVK -34 526 1 5 656 2633 92 174 31 chr15 9396929 9397294 -94097680 - RMER2 LTR ERV1 -56 511 82 5 656 2633 92 174 31 chr15 9397413 9397494 -94097480 - RMER2 LTR ERV1 -486 81 1 5 656 1770 136 21 7 chr15 9398003 9398284 -94096690 - RMER6C LTR ERVK -404 286 2 5 656 1199 236 7 7 chr15 9398284 9398578 -94096396 - RMER6-int LTR ERVK -10 3167 2874 5 656 315 169 132 0 chr15 9398590 9398673 -94096301 - RMER6-int LTR ERVK -3083 94 1 5 656 909 174 89 5 chr15 9398673 9398864 -94096110 - RMER6C LTR ERVK 0 690 484 5 656 1466 175 30 53 chr15 9398884 9399186 -94095788 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 398 5 656 246 275 29 14 chr15 9407693 9407763 -94087211 - RLTR24 LTR ERV1 -457 72 2 5 656 296 281 54 61 chr15 9408787 9408935 -94086039 + MLT1A0 LTR MaLR 219 365 0 5 656 240 177 109 31 chr15 9413755 9413819 -94081155 + MLT2C2 LTR ERVL 235 303 -161 5 656 696 334 58 28 chr15 9422489 9422849 -94072125 + MLT1D LTR MaLR 82 452 -53 5 656 3349 25 22 2 chr15 9428918 9429321 -94065653 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 656 905 159 27 11 chr15 9429322 9429506 -94065468 + IAPEz-int LTR ERVK 9 195 -6286 5 656 226 321 0 0 chr15 9429506 9429559 -94065415 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 5 656 3443 55 1 16 chr15 9429559 9430137 -94064837 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 5 656 932 50 0 0 chr15 9430137 9430256 -94064718 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1477 -5004 5 656 1789 91 8 0 chr15 9430251 9430503 -94064471 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 5 656 13337 68 9 0 chr15 9430521 9432307 -94062667 + IAPEz-int LTR ERVK 4678 6479 -2 5 656 3246 30 27 2 chr15 9432309 9432710 -94062264 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 656 392 248 115 8 chr15 9435184 9435306 -94059668 + MLT1N2 LTR MaLR 426 560 -2 5 657 470 335 154 7 chr15 9445219 9445497 -94049477 + MLT2C2 LTR ERVL 96 417 -47 6 657 470 335 154 7 chr15 9445605 9445618 -94049356 + MLT2C2 LTR ERVL 418 430 -34 6 657 946 212 68 205 chr15 9473437 9473615 -94021359 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 177 6 657 946 212 68 205 chr15 9473687 9473952 -94021022 - ORR1C2 LTR MaLR -208 176 1 6 657 737 202 29 52 chr15 9473976 9474123 -94020851 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 385 6 657 3405 35 2 0 chr15 9474123 9474518 -94020456 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 657 8892 40 9 15 chr15 9474518 9475623 -94019351 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 657 737 202 29 52 chr15 9475623 9475646 -94019328 - RLTR11A LTR ERVK -144 384 362 6 657 659 44 0 52 chr15 9475646 9475719 -94019255 + MTA_Mm LTR MaLR 1 91 -305 6 657 703 174 0 0 chr15 9475703 9475818 -94019156 - ORR1C2 LTR MaLR -269 115 1 6 657 1179 224 77 158 chr15 9475842 9476416 -94018558 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 2 6 657 3265 35 30 5 chr15 9486863 9487264 -94007710 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 6 657 1667 81 8 8 chr15 9487265 9487502 -94007472 + RLTR10-int LTR ERVK 312 548 -1439 6 657 3717 80 68 7 chr15 9487501 9488058 -94006916 + RLTR10-int LTR ERVK 402 992 -995 6 657 355 324 41 29 chr15 9488228 9488473 -94006501 + RLTR10-int LTR ERVK 1317 1564 -6017 6 657 335 143 0 0 chr15 9488492 9488548 -94006426 + RLTR10-int LTR ERVK 447 502 -6040 6 657 3439 56 81 22 chr15 9488548 9489041 -94005933 + RLTR10-int LTR ERVK 5006 5527 -1015 6 657 4886 102 30 39 chr15 9489053 9489964 -94005010 + RLTR10-int LTR ERVK 1288 1987 0 6 657 2950 52 54 0 chr15 9489965 9490353 -94004621 + RLTR10A LTR ERVK 3 411 0 6 657 917 268 54 5 chr15 9512791 9513037 -93981937 + MTD LTR MaLR 161 405 -14 1 657 259 298 126 24 chr15 9514812 9514939 -93980035 + LTR86A1 LTR ERVL 305 444 -69 1 657 239 328 75 33 chr15 9519456 9519576 -93975398 + MLT1E1A LTR MaLR 556 680 0 2 657 2178 148 59 0 chr15 9534290 9534647 -93960327 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 657 3186 36 31 0 chr15 9535831 9536215 -93958759 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 657 1382 179 29 4 chr15 9544356 9544630 -93950344 + RLTR24 LTR ERV1 1 281 -248 5 657 383 204 34 11 chr15 9544672 9544761 -93950213 + RLTR24 LTR ERV1 191 281 -248 5 657 1572 195 75 3 chr15 9544811 9545119 -93949855 + RLTR24 LTR ERV1 199 528 -1 5 657 834 244 43 5 chr15 9545209 9545421 -93949553 - MTD LTR MaLR -14 405 196 5 657 544 300 132 23 chr15 9545872 9546046 -93948928 - MTD LTR MaLR -212 195 3 5 657 3008 47 3 3 chr15 9549035 9549400 -93945574 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 6 657 1625 198 46 14 chr15 9549721 9550070 -93944904 + MTD LTR MaLR 1 360 -59 6 657 1274 231 62 65 chr15 9556649 9557033 -93937941 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 7 657 508 282 94 14 chr15 9562703 9562915 -93932059 - RMER5 LTR ERV1 0 534 306 8 657 315 345 36 76 chr15 9563338 9563457 -93931517 + MER67C LTR ERV1 1 109 -405 9 657 320 354 40 60 chr15 9563496 9563655 -93931319 + MER67C LTR ERV1 110 304 -407 9 658 1241 287 120 17 chr15 9568638 9569056 -93925918 - RMER15 LTR ERVL -45 530 70 1 658 2661 71 22 5 chr15 9571052 9571422 -93923552 + RLTR10A LTR ERVK 1 376 -35 1 658 362 120 0 0 chr15 9572140 9572190 -93922784 + RLTR10A LTR ERVK 362 411 0 1 658 1320 70 11 19 chr15 9572192 9572435 -93922539 + IAP-d-int LTR ERVK 121 602 -1385 1 658 757 212 0 6 chr15 9572432 9572589 -93922385 + IAP-d-int LTR ERVK 347 502 -6040 1 658 3436 59 86 13 chr15 9572593 9573057 -93921917 + IAP-d-int LTR ERVK 5028 5525 -1017 1 658 1583 69 9 5 chr15 9573063 9573280 -93921694 + IAP-d-int LTR ERVK 5667 5884 -658 1 658 4969 80 19 14 chr15 9573281 9573977 -93920997 + RLTR10-int LTR ERVK 1288 1986 -1 1 658 3104 50 25 10 chr15 9573977 9574382 -93920592 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 1 658 252 211 41 27 chr15 9575716 9575789 -93919185 - RMER15 LTR ERVL -470 105 32 1 658 5269 211 53 16 chr15 9579496 9580684 -93914290 + ORR1D1-int LTR MaLR 138 1369 -1 1 658 1023 244 168 19 chr15 9580685 9581007 -93913967 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 1 658 4135 56 0 10 chr15 9593077 9593585 -93901389 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 1 658 2789 167 5 40 chr15 9593585 9594140 -93900834 + MMERGLN-int LTR ERV1 1 536 -7020 1 658 1107 93 0 0 chr15 9594622 9594773 -93900201 + MMERGLN-int LTR ERV1 772 922 -2776 1 658 1492 192 84 22 chr15 9594768 9595221 -93899753 + MMERGLN-int LTR ERV1 2051 2231 -1467 1 658 721 288 5 5 chr15 9595226 9595439 -93899535 + MMERGLN-int LTR ERV1 4335 4547 -3231 1 658 3351 40 2 0 chr15 9595940 9596335 -93898639 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 658 847 297 76 31 chr15 9602889 9603261 -93891713 - MTD LTR MaLR -26 393 22 1 658 272 286 0 101 chr15 9606914 9607023 -93887951 - MT2B LTR ERVL -344 257 160 1 658 409 309 60 139 chr15 9640807 9641160 -93853814 - MLT1C LTR MaLR 0 467 66 1 658 763 246 45 20 chr15 9662045 9662244 -93832730 - MTC LTR MaLR -8 413 210 2 658 876 258 132 31 chr15 9662633 9662892 -93832082 - MTD LTR MaLR 0 419 126 2 658 876 224 36 5 chr15 9662934 9662999 -93831975 - MTD LTR MaLR -294 125 8 2 658 851 214 11 28 chr15 9663265 9663443 -93831531 + ORR1D1 LTR MaLR 7 181 -193 2 658 773 208 57 81 chr15 9663776 9663985 -93830989 + ORR1D1 LTR MaLR 171 374 0 2 658 1025 216 108 41 chr15 9667060 9667275 -93827699 + ORR1D2 LTR MaLR 1 240 -130 2 658 1025 216 108 41 chr15 9668048 9668170 -93826804 + ORR1D2 LTR MaLR 241 363 -7 2 658 674 314 113 66 chr15 9687365 9687727 -93807247 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 658 373 303 48 27 chr15 9695544 9695690 -93799284 - MER77 LTR ERVL -14 593 445 2 658 503 363 31 93 chr15 9697452 9697741 -93797233 - MLT1F2 LTR MaLR -19 541 271 2 659 2058 136 143 30 chr15 9702198 9702562 -93792412 + RLTR44A LTR ERVK 1 405 0 2 659 352 143 0 0 chr15 9702562 9702618 -93792356 + RLTR44-int LTR ERVK 1 56 -2756 2 659 616 167 0 0 chr15 9702628 9702736 -93792238 + RLTR44-int LTR ERVK 874 981 -1831 2 659 3864 312 45 47 chr15 9702914 9707739 -93787235 + RLTR44-int LTR ERVK 658 5118 -1424 2 659 5441 35 0 1 chr15 9707947 9708612 -93786362 + RLTR44-int LTR ERVK 2142 2805 -7 2 659 2008 138 140 30 chr15 9708619 9708984 -93785990 + RLTR44A LTR ERVK 1 405 0 2 659 3019 22 43 0 chr15 9709815 9710186 -93784788 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 10 2 659 342 325 8 16 chr15 9713862 9713984 -93780990 + MLT1A1 LTR MaLR 9 129 -279 2 659 358 342 39 91 chr15 9714011 9714320 -93780654 + ORR1E LTR MaLR 67 359 0 3 659 1878 273 10 59 chr15 9714855 9715447 -93779527 - RMER19C LTR ERVK 0 611 49 3 659 339 324 154 84 chr15 9721625 9721925 -93773049 - MLT1E LTR MaLR -31 622 291 3 659 257 257 0 63 chr15 9723262 9723341 -93771633 - RLTR11A LTR ERVK -80 448 375 3 659 315 305 77 49 chr15 9723673 9723856 -93771118 + MLT1F1 LTR MaLR 379 566 -3 3 659 3275 48 2 5 chr15 9724471 9724868 -93770106 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 659 239 213 0 0 chr15 9726247 9726294 -93768680 - MTC LTR MaLR 0 421 375 3 659 305 158 48 13 chr15 9728585 9728666 -93766308 - ORR1C2 LTR MaLR -12 372 228 3 659 684 251 73 92 chr15 9732462 9732752 -93762222 - ORR1D1 LTR MaLR -71 296 2 3 659 2477 47 3 21 chr15 9732925 9733254 -93761720 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 354 -3 3 659 287 365 121 18 chr15 9734267 9734490 -93760484 - LTR16A1 LTR ERVL -34 422 177 3 659 1052 227 31 18 chr15 9735520 9735749 -93759225 - ORR1D1 LTR MaLR -142 232 1 3 659 570 298 126 91 chr15 9736616 9736989 -93757985 - MLT1D LTR MaLR -2 503 118 3 659 340 307 57 55 chr15 9737418 9737605 -93757369 - MLT1D LTR MaLR -435 192 5 3 659 2419 80 9 6 chr15 9740157 9740483 -93754491 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 659 2933 16 2 129 chr15 9743066 9743486 -93751488 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 659 372 323 117 47 chr15 9753528 9753761 -93741213 - MTC-int LTR MaLR -8 1250 1000 3 659 372 323 117 47 chr15 9753921 9754090 -93740884 - MTC-int LTR MaLR -259 999 820 3 659 448 332 95 27 chr15 9756290 9756584 -93738390 + MLT1E2 LTR MaLR 270 583 -44 3 659 2835 98 5 19 chr15 9757461 9757876 -93737098 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 3 659 272 244 24 24 chr15 9765324 9765408 -93729566 + RLTR42-int LTR ERVK 1236 1319 -4203 3 659 1039 274 4 11 chr15 9766686 9766963 -93728011 + MT2A LTR ERVL 215 489 -44 3 659 249 133 13 39 chr15 9767052 9767130 -93727844 + MT2A LTR ERVL 458 533 0 3 659 2370 140 18 114 chr15 9767408 9767545 -93727429 + RLTR11B LTR ERVK 1 137 -316 3 659 2370 140 18 114 chr15 9767603 9767966 -93727008 + RLTR11B LTR ERVK 138 452 -1 3 659 6548 53 60 2 chr15 9769653 9770496 -93724478 - RLTR13B1 LTR ERVK -1 892 1 3 659 264 382 88 16 chr15 9772151 9772276 -93722698 - MLT1G LTR MaLR -435 156 23 3 659 2219 134 29 6 chr15 9774497 9774843 -93720131 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 4 659 400 360 17 22 chr15 9776614 9776793 -93718181 + RMER5 LTR ERV1 345 522 -12 4 659 1678 162 81 21 chr15 9778214 9778383 -93716591 + RMER17C LTR ERVK 1 183 -227 4 659 1678 162 81 21 chr15 9778562 9778777 -93716197 + RMER17C LTR ERVK 184 408 -2 4 659 326 293 63 87 chr15 9785496 9785623 -93709351 + MLT1A0 LTR MaLR 3 126 -239 4 659 257 345 50 0 chr15 9787433 9787552 -93707422 + ORR1E LTR MaLR 9 133 -226 4 659 441 335 140 47 chr15 9794668 9795075 -93699899 - MLT2B2 LTR ERVL -61 454 10 4 659 288 277 143 6 chr15 9806332 9806449 -93688525 + MLT1B LTR MaLR 240 357 -33 4 659 345 262 0 0 chr15 9807819 9807880 -93687094 + ORR1E LTR MaLR 30 90 -269 4 659 827 259 148 30 chr15 9810846 9811177 -93683797 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 659 420 350 76 5 chr15 9812965 9813163 -93681811 + RMER15 LTR ERVL 261 472 -103 4 659 1171 347 30 8 chr15 9813174 9813543 -93681431 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 4 659 294 315 80 27 chr15 9815890 9816040 -93678934 - MLT1B LTR MaLR -232 158 1 4 659 886 65 24 0 chr15 9817779 9817903 -93677071 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 262 4 659 259 152 34 0 chr15 9817907 9817966 -93677008 - RLTR10 LTR ERVK -71 319 259 4 659 2287 73 9 15 chr15 9817995 9818328 -93676646 - RLTR10 LTR ERVK -59 331 1 4 659 1094 251 129 0 chr15 9818334 9818668 -93676306 + MTEb LTR MaLR 3 379 0 4 659 1403 308 66 32 chr15 9818673 9819206 -93675768 + MTEb-int LTR MaLR 6 556 -1024 4 659 389 266 126 33 chr15 9822491 9822674 -93672300 + MLT1A1 LTR MaLR 2 201 -207 4 659 570 265 39 31 chr15 9829392 9829552 -93665422 - MTE2a LTR MaLR -15 364 179 5 659 412 362 92 18 chr15 9829744 9829816 -93665158 - MTE2a LTR MaLR -181 178 99 5 660 2890 48 3 0 chr15 9832529 9832882 -93662092 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 5 660 1484 254 34 29 chr15 9845970 9846387 -93648587 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 660 441 303 38 32 chr15 9847830 9847987 -93646987 + MER57E1 LTR ERV1 17 174 -198 5 660 3268 41 5 2 chr15 9850327 9850722 -93644252 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 660 8212 63 6 7 chr15 9850722 9851821 -93643153 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 660 3104 51 8 8 chr15 9851821 9852217 -93642757 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 660 1040 220 160 17 chr15 9854800 9855100 -93639874 + MTD LTR MaLR 1 343 -76 5 660 1675 229 104 27 chr15 9855150 9855638 -93639336 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 3 5 660 1211 233 70 12 chr15 9858442 9858761 -93636213 - MTD LTR MaLR -2 419 68 5 660 405 210 0 62 chr15 9859744 9859857 -93635117 - MTD LTR MaLR -314 105 1 5 660 998 249 53 138 chr15 9869165 9869543 -93625431 + MTE2a LTR MaLR 19 364 -15 5 660 461 339 57 22 chr15 9874360 9874589 -93620385 + LTR16C LTR ERVL 253 489 0 5 660 294 333 68 0 chr15 9874736 9874868 -93620106 - MLT1D LTR MaLR -6 499 359 5 660 3240 46 5 0 chr15 9877448 9877842 -93617132 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 660 688 266 94 64 chr15 9877926 9878336 -93616638 + RLTR11B LTR ERVK 5 433 -8 5 660 346 306 45 12 chr15 9884263 9884397 -93610577 + MLT1F LTR MaLR 27 172 -383 5 660 398 214 66 22 chr15 9885206 9885297 -93609677 + RMER10A LTR ERVL 323 417 -25 5 660 376 339 9 85 chr15 9886374 9886596 -93608378 + MLT1E2 LTR MaLR 3 216 -289 5 660 302 326 84 7 chr15 9886689 9886831 -93608143 + MLT1E2 LTR MaLR 346 498 -7 5 660 1234 323 76 50 chr15 9888920 9889634 -93605340 + MLT-int LTR MaLR 2 733 -1002 5 660 936 252 135 39 chr15 9890005 9890339 -93604635 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 4 5 660 1416 254 135 46 chr15 9900218 9900692 -93594282 + RMER19C LTR ERVK 96 611 0 5 660 1019 318 92 33 chr15 9902252 9902427 -93592547 + RMER5 LTR ERV1 17 196 -338 5 660 1019 318 92 33 chr15 9902450 9902753 -93592221 + RMER5 LTR ERV1 197 522 -12 5 660 1911 112 205 6 chr15 9902957 9903308 -93591666 + BGLII_Mus LTR ERVK 2 422 0 5 660 3033 94 2 2 chr15 9904377 9904784 -93590190 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 660 449 200 0 0 chr15 9915230 9915310 -93579664 + ORR1D2 LTR MaLR 6 85 -285 6 660 1037 218 13 25 chr15 9921246 9921481 -93573493 + RMER12 LTR ERVK 1 232 -1090 6 660 4065 211 50 18 chr15 9928078 9928619 -93566355 + RMER12 LTR ERVK 218 767 -555 6 660 4065 221 67 30 chr15 9928639 9929138 -93565836 + RMER12 LTR ERVK 768 1205 -117 6 660 1216 274 56 19 chr15 9931788 9932162 -93562812 - MTD LTR MaLR -14 393 1 6 660 643 196 52 8 chr15 9932766 9932900 -93562074 + MTD LTR MaLR 86 225 -194 6 660 1996 61 0 0 chr15 9933048 9933295 -93561679 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 161 6 660 1932 156 12 12 chr15 9937812 9938137 -93556837 + ORR1A4 LTR MaLR 1 325 -4 6 660 4208 159 37 43 chr15 9938141 9938997 -93555977 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 806 -1157 6 660 3928 181 29 219 chr15 9939118 9939661 -93555313 + ORR1A4-int LTR MaLR 618 1134 -658 6 660 358 258 115 16 chr15 9944361 9944483 -93550491 - MLT1B LTR MaLR -2 388 255 6 660 3918 122 88 16 chr15 9947737 9948434 -93546540 + RMER17A LTR ERVK 1 747 -4 6 660 428 302 194 71 chr15 9951053 9951377 -93543597 + MTE2b LTR MaLR 1 364 -15 6 660 428 302 194 71 chr15 9954029 9954353 -93540621 + MTE2b LTR MaLR 1 364 -15 6 660 544 296 135 68 chr15 9957288 9957643 -93537331 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 6 661 1827 148 80 31 chr15 9966273 9966663 -93528311 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 6 661 1656 185 108 0 chr15 9967328 9967471 -93527503 + ORR1B2 LTR MaLR 1 152 -215 6 661 1656 185 108 0 chr15 9967548 9967728 -93527246 + ORR1B2 LTR MaLR 153 358 -9 6 661 3614 78 45 4 chr15 9972353 9972845 -93522129 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 661 1286 202 160 61 chr15 9979188 9979531 -93515443 + ORR1C1 LTR MaLR 1 377 -1 6 661 1303 199 91 36 chr15 9983088 9983452 -93511522 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 661 564 341 87 66 chr15 9984103 9984495 -93510479 + MLT1C LTR MaLR 51 450 -17 6 661 442 347 60 77 chr15 9984500 9984931 -93510043 - MLT1G1 LTR MaLR -136 433 10 6 661 367 262 25 0 chr15 9985388 9985468 -93509506 - MTE2b LTR MaLR -297 82 1 6 661 2010 141 3 38 chr15 9989064 9989403 -93505571 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 661 8834 179 21 23 chr15 9989403 9991199 -93503775 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1792 1 7 661 1937 161 12 3 chr15 9991199 9991522 -93503452 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 1 7 661 448 308 62 86 chr15 9991797 9992121 -93502853 - ORR1E LTR MaLR -43 316 1 7 661 229 220 34 0 chr15 9992405 9992464 -93502510 - LTR37A LTR ERV1 -277 149 89 7 661 1776 161 9 60 chr15 9998920 9999256 -93495718 - ORR1A3 LTR MaLR -7 319 1 7 661 363 269 93 31 chr15 10000132 10000293 -93494681 - MLT1C LTR MaLR -14 453 283 1 661 543 397 83 16 chr15 10008246 10008669 -93486305 + MLT1F1 LTR MaLR 119 569 0 1 661 892 259 203 16 chr15 10011443 10011749 -93483225 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 3 1 661 1583 171 99 29 chr15 10012762 10013105 -93481869 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 661 1364 262 67 6 chr15 10016541 10016887 -93478087 + MTEb LTR MaLR 1 367 -12 2 661 440 212 6 190 chr15 10017590 10017753 -93477221 - RMER19C LTR ERVK 0 611 479 2 661 952 176 103 69 chr15 10017751 10017983 -93476991 - RMER19B LTR ERVK -355 547 308 2 661 1539 223 27 6 chr15 10021503 10021832 -93473142 + RLTR17 LTR ERVK 1 336 -356 3 661 3366 25 22 0 chr15 10025359 10025761 -93469213 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 661 1926 153 16 19 chr15 10028144 10028464 -93466510 + RLTR17 LTR ERVK 315 633 -59 3 661 569 286 76 69 chr15 10029105 10029394 -93465580 + RLTR11B LTR ERVK 7 297 -156 3 661 434 252 60 49 chr15 10029439 10029600 -93465374 + RLTR11B LTR ERVK 259 462 -66 3 661 1460 212 58 55 chr15 10033176 10033342 -93461632 + ORR1D1 LTR MaLR 9 175 -199 4 661 1460 212 58 55 chr15 10033429 10033626 -93461348 + ORR1D1 LTR MaLR 176 373 -1 4 661 2095 219 138 60 chr15 10035144 10035971 -93459003 + RLTR13B1 LTR ERVK 3 893 0 5 661 2656 43 0 6 chr15 10040084 10040411 -93454563 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 33 5 661 903 341 86 46 chr15 10045688 10046167 -93448807 - MT2A LTR ERVL 0 533 36 7 661 1932 147 25 28 chr15 10053446 10053768 -93441206 - ORR1B2 LTR MaLR -46 321 1 8 661 6506 182 61 15 chr15 10053768 10055211 -93439763 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 1 8 661 2096 158 22 0 chr15 10055215 10055570 -93439404 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 8 661 661 342 67 19 chr15 10062602 10063032 -93431942 + MLT1F1 LTR MaLR 1 476 -93 8 661 1219 267 46 33 chr15 10069676 10070044 -93424930 + MTEa LTR MaLR 1 373 -6 9 661 477 242 189 43 chr15 10071297 10071501 -93423473 + MTD LTR MaLR 174 404 -17 9 661 411 299 90 0 chr15 10072386 10072520 -93422454 + MLT1A0 LTR MaLR 216 361 -4 9 661 502 275 72 72 chr15 10076192 10076228 -93418746 - MT2B LTR ERVL -283 318 232 1 661 502 275 72 72 chr15 10076353 10076400 -93418574 - MT2B LTR ERVL -283 231 111 1 661 3441 28 2 0 chr15 10086029 10086424 -93408550 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 661 1057 176 0 6 chr15 10089907 10090090 -93404884 + ORR1D1 LTR MaLR 1 182 -192 1 661 870 250 11 130 chr15 10091149 10091503 -93403471 - ORR1C2 LTR MaLR -72 312 1 1 662 3087 84 50 4 chr15 10094073 10094529 -93400445 + RLTR44C LTR ERVK 1 477 -25 1 662 1202 142 75 13 chr15 10094540 10094768 -93400206 + RLTR44-int LTR ERVK 1 242 -2570 1 662 826 86 0 0 chr15 10094788 10094904 -93400070 + RLTR44-int LTR ERVK 816 931 -1881 1 662 545 141 20 20 chr15 10094904 10095005 -93399969 + RLTR44-int LTR ERVK 845 945 -1867 1 662 2957 110 2 5 chr15 10095026 10095466 -93399508 + RLTR44-int LTR ERVK 877 1315 -1497 1 662 5057 56 2 0 chr15 10095472 10096115 -93398859 + RLTR44-int LTR ERVK 2169 2812 0 1 662 3149 96 33 2 chr15 10096115 10096573 -93398401 + RLTR44C LTR ERVK 1 472 -30 1 662 3539 23 0 0 chr15 10099335 10099731 -93395243 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 662 689 216 63 23 chr15 10131832 10132007 -93362967 + MTD LTR MaLR 104 285 -134 1 662 1436 212 28 70 chr15 10138586 10138941 -93356033 + ORR1D1 LTR MaLR 10 349 -25 1 662 704 291 101 46 chr15 10150472 10150776 -93344198 - MLT1C LTR MaLR -2 465 181 1 662 353 285 101 65 chr15 10151145 10151314 -93343660 - MLT1C LTR MaLR -287 180 6 1 662 868 327 58 53 chr15 10169304 10169721 -93325253 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 662 2066 126 30 12 chr15 10176276 10176613 -93318361 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 2 662 303 322 2 22 chr15 10182244 10182392 -93312582 + MLT1A1 LTR MaLR 236 396 -12 2 662 690 266 48 26 chr15 10187574 10187763 -93307211 - MLT1G LTR MaLR -3 588 396 2 662 246 315 158 40 chr15 10188114 10188266 -93306708 - MLT1G LTR MaLR -243 205 36 2 662 1862 169 103 8 chr15 10190176 10190527 -93304447 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 662 3488 31 51 0 chr15 10191012 10191216 -93303758 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 233 2 662 3488 31 51 0 chr15 10191252 10191462 -93303512 - RLTR10C LTR ERVK -204 232 2 2 662 2016 202 2 30 chr15 10198774 10199207 -93295767 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 662 1649 134 61 138 chr15 10201661 10202068 -93292906 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 2 662 668 302 80 167 chr15 10203161 10203713 -93291261 - MLT2B3 LTR ERVL -8 512 9 2 662 478 337 77 35 chr15 10205345 10205606 -93289368 - MLT1C LTR MaLR -4 463 192 2 662 391 244 164 8 chr15 10205618 10205746 -93289228 - MLT1C LTR MaLR -314 153 6 2 662 263 321 73 98 chr15 10207073 10207318 -93287656 - MLT1A LTR MaLR -62 312 74 2 662 256 296 42 0 chr15 10213894 10213965 -93281009 + MLT1A0 LTR MaLR 225 298 -67 2 663 2890 27 65 34 chr15 10228093 10228477 -93266497 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 663 233 352 93 0 chr15 10229096 10229235 -93265739 - MLT1L LTR MaLR -10 600 449 3 663 255 275 151 21 chr15 10229414 10229507 -93265467 - MLT1L LTR MaLR -503 107 3 3 663 227 347 84 0 chr15 10235653 10235748 -93259226 - MLT1J2 LTR MaLR -308 140 38 3 663 239 277 67 38 chr15 10274543 10274648 -93220326 + RMER12 LTR ERVK 720 827 -495 3 663 482 353 78 60 chr15 10279430 10279777 -93215197 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 3 663 1030 294 269 24 chr15 10279782 10280417 -93214557 - ORR1E-int LTR MaLR -73 1507 717 3 663 1720 325 39 11 chr15 10286929 10287546 -93207428 - ORR1E-int LTR MaLR -944 636 3 3 663 553 304 70 73 chr15 10287550 10287908 -93207066 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 3 663 2092 108 106 13 chr15 10289717 10290018 -93204956 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 663 428 146 173 8 chr15 10293964 10294074 -93200900 + ORR1C2 LTR MaLR 258 384 0 3 663 1719 247 27 93 chr15 10296827 10297382 -93197592 - RLTR11A2 LTR ERVK -1 526 10 3 663 3530 22 141 9 chr15 10298000 10298420 -93196554 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 663 555 258 81 30 chr15 10302288 10302555 -93192419 + MTE2a LTR MaLR 1 350 -29 3 663 554 342 86 51 chr15 10322965 10323338 -93171636 - MLT1B LTR MaLR 0 390 5 4 663 477 312 86 7 chr15 10326982 10327172 -93167802 - RMER19B LTR ERVK -192 419 153 4 663 787 195 91 70 chr15 10327232 10327431 -93167543 - MurERV4_19-int LTR ERVK -5449 331 129 4 663 742 167 14 14 chr15 10327451 10327597 -93167377 + RMER19B LTR ERVK 755 900 -2 4 663 231 351 94 33 chr15 10339459 10339671 -93155303 + MLT1L LTR MaLR 52 276 -334 4 663 482 285 72 10 chr15 10339753 10339948 -93155026 + MLT1L LTR MaLR 391 597 -13 4 663 501 275 33 65 chr15 10344395 10344609 -93150365 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1194 4 663 1359 191 217 157 chr15 10344818 10345268 -93149706 + MT2A LTR ERVL 1 465 -68 4 663 1359 191 217 157 chr15 10345316 10345368 -93149606 + MT2A LTR ERVL 466 533 0 4 663 2930 73 3 19 chr15 10347145 10347510 -93147464 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 664 235 321 25 13 chr15 10357208 10357287 -93137687 + MER21B LTR ERV1 407 486 -377 4 664 382 317 134 50 chr15 10357478 10357740 -93137234 + MER21B LTR ERV1 469 752 -111 4 664 483 344 52 63 chr15 10358896 10359166 -93135808 + LTR16A LTR ERVL 1 267 -184 5 664 235 297 72 28 chr15 10363430 10363623 -93131351 + MTEb LTR MaLR 165 379 0 5 664 483 336 209 11 chr15 10363656 10363933 -93131041 - MLT1E2 LTR MaLR -158 469 138 5 664 2272 98 3 12 chr15 10365956 10366278 -93128696 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 664 396 206 37 56 chr15 10368622 10368730 -93126244 + MLT1D LTR MaLR 108 213 -292 5 664 345 291 72 72 chr15 10369659 10369852 -93125122 + MLT1D LTR MaLR 261 453 -52 5 664 225 224 0 20 chr15 10370012 10370062 -93124912 + MLT1D LTR MaLR 449 497 -8 5 664 342 286 142 76 chr15 10372244 10372532 -93122442 + ORR1D1 LTR MaLR 9 315 -59 5 664 296 270 168 18 chr15 10373969 10374082 -93120892 - MLT1J LTR MaLR -382 130 1 5 664 1530 171 77 15 chr15 10395181 10395519 -93099455 + ORR1D1 LTR MaLR 16 374 0 5 664 846 193 102 29 chr15 10401734 10402087 -93092887 - RMER10A LTR ERVL -29 413 2 5 664 572 250 161 11 chr15 10403995 10404169 -93090805 + MTD LTR MaLR 19 218 -201 6 664 257 268 164 8 chr15 10404181 10404309 -93090665 + MTD LTR MaLR 272 419 0 6 664 3113 133 186 5 chr15 10405045 10405685 -93089289 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 6 664 1108 230 91 40 chr15 10418565 10418918 -93076056 - MTEa LTR MaLR -8 371 1 6 664 4064 134 83 51 chr15 10426270 10427067 -93067907 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 6 664 570 314 126 59 chr15 10427149 10427671 -93067303 + LTR82A LTR ERVL 251 807 -65 6 664 2387 63 119 11 chr15 10428064 10428416 -93066558 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 664 704 257 36 51 chr15 10442306 10442638 -93052336 - RLTR15 LTR ERVK -32 327 1 6 664 309 225 170 9 chr15 10444294 10444406 -93050568 + MT2A LTR ERVL 3 132 -401 6 664 713 202 79 39 chr15 10444452 10444624 -93050350 + MT2A LTR ERVL 316 543 -58 6 664 713 190 87 39 chr15 10444676 10444741 -93050233 + MT2A LTR ERVL 462 532 -1 6 664 3444 177 103 80 chr15 10448872 10449748 -93045226 - RMER19B LTR ERVK -6 896 1 6 664 1238 232 108 6 chr15 10451863 10452188 -93042786 + MTC LTR MaLR 62 419 -2 7 664 1963 196 63 20 chr15 10452609 10453114 -93041860 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 7 664 972 296 32 41 chr15 10457427 10457769 -93037205 + MTEa LTR MaLR 40 378 -1 7 664 1647 161 45 96 chr15 10471215 10471613 -93023361 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 7 664 1166 265 61 26 chr15 10479822 10480213 -93014761 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 7 664 1647 180 34 25 chr15 10484174 10484527 -93010447 + ORR1D1 LTR MaLR 15 370 -4 7 665 465 286 30 117 chr15 10491723 10491953 -93003021 + MTD LTR MaLR 5 214 -205 7 665 1558 177 30 58 chr15 10491948 10492278 -93002696 - ORR1B2 LTR MaLR -46 321 1 7 665 280 219 9 127 chr15 10492455 10492525 -93002449 - MTEb LTR MaLR 0 379 321 7 665 280 219 9 127 chr15 10493377 10493416 -93001558 - MTEb LTR MaLR -59 320 283 7 665 235 373 51 29 chr15 10493545 10493683 -93001291 - MTEb LTR MaLR -168 191 51 7 665 950 126 7 7 chr15 10494009 10494161 -93000813 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 952 7 665 2175 151 62 13 chr15 10494156 10494620 -93000354 - RLTR25A LTR ERVK -534 569 1 7 665 1188 238 48 40 chr15 10494808 10495162 -92999812 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 7 665 2071 201 43 171 chr15 10497117 10497818 -92997156 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 7 665 242 262 24 48 chr15 10500132 10500216 -92994758 + MamGypLTR2 LTR Gypsy 665 746 -443 1 665 423 83 181 0 chr15 10502946 10503018 -92991956 - MTC LTR MaLR -307 114 30 4 665 1649 198 22 22 chr15 10503373 10503693 -92991281 + MTC LTR MaLR 100 419 -2 7 665 269 239 80 0 chr15 10522352 10522465 -92972509 - ORR1B1-int LTR MaLR -756 753 632 3 665 621 195 45 163 chr15 10524218 10524463 -92970511 + MTEb LTR MaLR 164 379 0 3 665 2456 121 17 43 chr15 10526440 10526854 -92968120 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 4 665 1030 274 95 52 chr15 10538821 10539167 -92955807 - MTE2a LTR MaLR -18 361 1 6 665 473 305 146 71 chr15 10542570 10542948 -92952026 + LTR33 LTR ERVL 24 429 -86 7 665 439 261 72 7 chr15 10543955 10544094 -92950880 + MTD LTR MaLR 216 363 -56 7 665 373 284 131 34 chr15 10547348 10547523 -92947451 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 8 665 268 231 84 66 chr15 10553763 10553930 -92941044 + LTR33A LTR ERVL 7 176 -344 9 665 1157 156 29 5 chr15 10554630 10554836 -92940138 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 211 -373 9 665 310 212 72 169 chr15 10554838 10555003 -92939971 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 433 584 0 9 665 864 248 134 40 chr15 10555003 10555160 -92939814 + ORR1D2 LTR MaLR 55 230 -140 9 665 864 248 134 40 chr15 10555199 10555318 -92939656 + ORR1D2 LTR MaLR 231 357 -13 9 665 2330 224 72 91 chr15 10555327 10556104 -92938870 - ORR1D2-int LTR MaLR -577 793 32 9 665 1992 181 117 14 chr15 10556133 10556559 -92938415 + RLTR28 LTR ERVL 41 510 -14 1 665 993 228 169 32 chr15 10556593 10556901 -92938073 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 21 9 665 474 271 74 56 chr15 10568993 10569224 -92925750 + MTE2a LTR MaLR 128 362 -17 1 665 1174 214 50 14 chr15 10576192 10576472 -92918502 - MTD LTR MaLR -2 417 128 1 665 1154 206 93 4 chr15 10583563 10583821 -92911153 + MT2A LTR ERVL 1 281 -252 1 665 1220 194 225 86 chr15 10584053 10584520 -92910454 - MT2A LTR ERVL 0 533 2 1 665 282 305 93 60 chr15 10585792 10585942 -92909032 + MLT2C2 LTR ERVL 32 186 -278 1 665 597 330 46 57 chr15 10586108 10586474 -92908500 - MLT1B LTR MaLR -10 380 19 1 665 226 300 151 92 chr15 10588766 10589005 -92905969 + RLTR12B LTR ERVK 18 270 -258 1 665 525 281 43 82 chr15 10590558 10590825 -92904149 + MLT1G3 LTR MaLR 140 401 -194 1 665 376 330 42 51 chr15 10597261 10597475 -92897499 + MLT1A0 LTR MaLR 24 235 -130 1 665 580 276 39 34 chr15 10600359 10600565 -92894409 + MLT1B LTR MaLR 1 207 -183 1 665 1716 166 165 6 chr15 10600595 10600935 -92894039 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 665 2037 139 94 14 chr15 10610901 10611251 -92883723 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 665 985 248 89 106 chr15 10615145 10615618 -92879356 + MLT1C LTR MaLR 3 467 0 1 666 370 293 154 21 chr15 10628164 10628443 -92866531 - MLT1B LTR MaLR -10 380 65 2 666 4186 139 92 0 chr15 10646529 10647203 -92847771 - RMER19A LTR ERVK -1 736 1 2 666 330 254 85 31 chr15 10649145 10649275 -92845699 - RMER15 LTR ERVL -17 558 422 2 666 1797 149 19 111 chr15 10653125 10653541 -92841433 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 666 284 292 15 77 chr15 10655390 10655520 -92839454 + MER34 LTR ERV1 1 122 -420 2 666 294 271 83 23 chr15 10655692 10655824 -92839150 + LTR48 LTR ERV1 481 620 -167 2 666 247 211 0 19 chr15 10656936 10656989 -92837985 + MLT1A1 LTR MaLR 291 342 -66 2 666 1951 86 12 84 chr15 10657000 10657343 -92837631 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 2 666 686 271 99 48 chr15 10658801 10659115 -92835859 + MLT1B LTR MaLR 61 390 0 2 666 841 304 82 30 chr15 10662524 10662853 -92832121 - MLT1A0 LTR MaLR -19 346 1 2 666 295 183 0 0 chr15 10664222 10664282 -92830692 - ORR1E LTR MaLR 0 379 320 2 666 798 246 5 30 chr15 10664650 10664851 -92830123 - ORR1E LTR MaLR -163 196 1 2 666 3034 26 3 0 chr15 10671480 10671825 -92823149 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 666 4426 66 24 29 chr15 10673414 10674004 -92820970 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 2 666 1105 225 109 89 chr15 10674205 10674664 -92820310 + RMER13A LTR ERVK 1 468 -392 2 666 664 295 49 26 chr15 10679620 10679846 -92815128 - RMER15 LTR ERVL -47 528 298 2 666 267 266 30 68 chr15 10679894 10680027 -92814947 - RMER15 LTR ERVL -445 130 3 2 666 415 295 61 131 chr15 10680680 10681039 -92813935 + MLT1B LTR MaLR 18 351 -39 2 666 2501 210 10 12 chr15 10690386 10690902 -92804072 - RMER5 LTR ERV1 -19 515 1 3 666 1889 123 33 62 chr15 10693102 10693487 -92801487 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 19 3 666 1923 146 100 0 chr15 10693894 10694244 -92800730 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 1 3 666 899 295 83 79 chr15 10694778 10695234 -92799740 + MLT2B1 LTR ERVL 1 465 -55 3 666 899 295 83 79 chr15 10695323 10695374 -92799600 + MLT2B1 LTR ERVL 466 510 -10 3 666 314 335 140 44 chr15 10695797 10696118 -92798856 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 57 3 666 335 398 59 17 chr15 10696397 10696752 -92798222 + LTR16C LTR ERVL 118 487 -2 3 666 1169 184 131 18 chr15 10710658 10710940 -92784034 - MTC LTR MaLR 0 421 108 3 666 1014 122 64 30 chr15 10717145 10717347 -92777627 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 316 3 666 349 211 0 0 chr15 10717343 10717414 -92777560 - MTC LTR MaLR -343 78 8 3 666 2902 134 133 11 chr15 10717411 10717938 -92777036 - RMER19C LTR ERVK -20 591 1 3 666 246 211 123 27 chr15 10722903 10722976 -92771998 - MLT1A1 LTR MaLR -325 83 4 3 666 1191 240 62 23 chr15 10727510 10727817 -92767157 + MTEa LTR MaLR 30 348 -31 3 666 2036 104 0 62 chr15 10728393 10728732 -92766242 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 3 666 767 272 53 104 chr15 10730008 10730402 -92764572 - MTEa LTR MaLR -1 378 5 3 666 2016 182 53 47 chr15 10733153 10733644 -92761330 - RMER5 LTR ERV1 -40 494 1 3 666 1220 169 52 16 chr15 10734205 10734457 -92760517 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 250 3 666 1854 154 74 6 chr15 10734466 10734819 -92760155 - MTC LTR MaLR -44 377 1 3 666 1331 165 36 0 chr15 10734821 10734866 -92760108 - RLTR28 LTR ERVL -266 258 214 3 666 1331 165 36 0 chr15 10734891 10735094 -92759880 - RLTR28 LTR ERVL -311 213 2 3 666 642 273 91 12 chr15 10744154 10744406 -92750568 + MLT1C LTR MaLR 192 463 -4 3 666 233 291 80 18 chr15 10745871 10745983 -92748991 - MLT1E2 LTR MaLR -475 152 34 3 83 357 305 114 13 chr15 10747864 10748100 -92746874 - LTR16A LTR ERVL -183 268 9 3 667 1034 295 92 0 chr15 10749262 10749587 -92745387 - MTD LTR MaLR -32 387 33 3 667 2010 158 12 70 chr15 10749764 10750165 -92744809 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 9 3 667 245 223 125 0 chr15 10750484 10750562 -92744412 - MLT1B LTR MaLR -16 374 304 3 667 378 168 109 27 chr15 10750614 10750724 -92744250 + RLTR15 LTR ERVK 3 121 -238 3 667 362 171 14 28 chr15 10750740 10750812 -92744162 + RLTR25B LTR ERVK 1 71 -957 3 667 655 166 0 137 chr15 10750802 10750963 -92744011 + RLTR25B LTR ERVK 890 1028 0 3 667 288 260 10 20 chr15 10750963 10751063 -92743911 + RLTR15 LTR ERVK 130 228 -131 3 667 300 325 125 36 chr15 10751701 10752004 -92742970 - MLT1C LTR MaLR -87 380 51 3 667 552 285 151 47 chr15 10753636 10754000 -92740974 + LTR16E1 LTR ERVL 9 410 -128 3 667 305 221 52 30 chr15 10754370 10754477 -92740497 + LTR16E1 LTR ERVL 553 640 -11 3 667 1516 256 48 35 chr15 10755137 10755537 -92739437 - MTD LTR MaLR 0 419 15 4 667 687 167 8 8 chr15 10755755 10755882 -92739092 + ORR1B2 LTR MaLR 241 367 0 4 667 1112 237 93 44 chr15 10757131 10757497 -92737477 + MLT1B LTR MaLR 4 387 -3 4 667 521 274 152 5 chr15 10757835 10758033 -92736941 + MTEb LTR MaLR 1 227 -152 4 667 3270 133 26 16 chr15 10758039 10758611 -92736363 - RMER4B LTR ERVK -4 581 4 4 667 425 235 140 0 chr15 10758612 10758748 -92736226 + MTEb LTR MaLR 225 379 0 4 667 3566 270 167 12 chr15 10758748 10760115 -92734859 + MTEb-int LTR MaLR 1 1578 -2 4 667 954 258 135 12 chr15 10760119 10760452 -92734522 + MTEb LTR MaLR 6 379 0 4 667 266 279 86 90 chr15 10762769 10763013 -92731961 + RLTR15 LTR ERVK 49 291 -68 4 667 3585 15 2 0 chr15 10764966 10765361 -92729613 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 667 9738 19 0 0 chr15 10765361 10766459 -92728515 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 667 3585 15 2 0 chr15 10766459 10766854 -92728120 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 667 294 172 17 0 chr15 10768200 10768258 -92726716 + MLT2B2 LTR ERVL 1 59 -456 4 667 635 293 9 57 chr15 10768334 10768544 -92726430 + MLT2B1 LTR ERVL 364 563 -4 4 667 364 335 39 17 chr15 10768895 10769074 -92725900 - MLT1N2 LTR MaLR -24 538 356 4 667 668 286 72 62 chr15 10773129 10773355 -92721619 + RLTR11B LTR ERVK 1 232 -221 4 667 668 288 68 52 chr15 10773441 10773642 -92721332 + RLTR11B LTR ERVK 233 494 -34 4 667 523 313 140 15 chr15 10773916 10774188 -92720786 - MLT1C LTR MaLR -128 339 34 4 667 556 279 285 1 chr15 10776543 10776836 -92718138 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 4 667 545 292 138 34 chr15 10789793 10790147 -92704827 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 16 4 667 353 326 71 55 chr15 10790163 10790416 -92704558 - MLT1B LTR MaLR -63 327 71 4 667 296 271 23 12 chr15 10790426 10790512 -92704462 - MLT1B LTR MaLR -260 130 44 4 667 302 283 105 29 chr15 10792492 10792663 -92702311 + MER34A1 LTR ERV1 396 579 -8 4 667 510 309 129 23 chr15 10794967 10795279 -92699695 - MLT1A LTR MaLR -17 373 2 4 667 646 307 59 39 chr15 10798271 10798576 -92696398 - MLT1C LTR MaLR -156 311 1 4 667 731 294 59 39 chr15 10805047 10805302 -92689672 - MLT1A0 LTR MaLR -23 342 83 4 667 369 324 16 70 chr15 10805439 10805622 -92689352 + MLT1F1 LTR MaLR 1 173 -396 4 667 1116 266 66 40 chr15 10805622 10805868 -92689106 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 248 -279 4 667 1116 266 66 40 chr15 10805893 10806116 -92688858 + RLTR11A2 LTR ERVK 249 481 -46 4 667 782 272 125 22 chr15 10806181 10806500 -92688474 + MLT1F1 LTR MaLR 169 520 -49 4 667 1257 239 113 20 chr15 10807530 10807885 -92687089 - MTD LTR MaLR -14 405 18 4 667 1411 155 52 117 chr15 10808523 10808866 -92686108 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 667 294 138 138 75 chr15 10808919 10809013 -92685961 + RMER5 LTR ERV1 369 468 -66 4 667 2237 137 50 26 chr15 10809018 10809401 -92685573 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 4 667 3390 33 8 0 chr15 10809404 10809797 -92685177 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 667 9128 49 3 0 chr15 10809797 10810892 -92684082 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 667 3419 35 5 0 chr15 10810892 10811286 -92683688 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 667 455 335 104 95 chr15 10811368 10811790 -92683184 - MLT1A0-int LTR MaLR -417 992 567 4 667 2263 190 35 132 chr15 10813934 10814601 -92680373 - RMER19C LTR ERVK -9 602 1 4 667 422 311 166 22 chr15 10815027 10815340 -92679634 - LTR50 LTR ERVL -341 454 97 4 667 1397 154 102 7 chr15 10815415 10815709 -92679265 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 86 4 667 444 211 18 55 chr15 10816129 10816239 -92678735 - MTB_Mm LTR MaLR -301 106 1 4 667 1477 137 42 46 chr15 10816429 10816473 -92678501 - RMER6B LTR ERVK 0 461 425 5 667 2202 110 3 58 chr15 10816473 10816821 -92678153 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 667 1477 137 42 46 chr15 10816821 10817083 -92677891 - RMER6B LTR ERVK -37 424 156 5 667 403 174 0 0 chr15 10817082 10817151 -92677823 - MTB_Mm LTR MaLR -314 93 25 5 667 1420 92 222 23 chr15 10819535 10819837 -92675137 - RMER10B LTR ERVL -2 396 35 5 667 2847 65 28 0 chr15 10821656 10822011 -92672963 + RLTR8 LTR ERVK 1 365 0 5 667 2999 100 57 47 chr15 10822578 10823091 -92671883 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 2 5 667 335 297 38 21 chr15 10826043 10826229 -92668745 - RMER15 LTR ERVL -48 527 339 5 667 2473 184 20 69 chr15 10830133 10830686 -92664288 + RLTR24 LTR ERV1 1 526 -3 5 667 2703 190 158 23 chr15 10833008 10833655 -92661319 + RMER19A LTR ERVK 1 734 -3 5 667 1416 239 62 14 chr15 10834718 10834941 -92660033 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 5 667 1416 239 62 14 chr15 10834977 10835110 -92659864 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 5 667 235 253 81 0 chr15 10835215 10835302 -92659672 - MLT1B LTR MaLR -4 386 293 5 667 544 278 46 41 chr15 10835332 10835550 -92659424 - MLT1B LTR MaLR -171 219 1 5 667 2180 120 43 17 chr15 10835761 10836109 -92658865 + RLTR15 LTR ERVK 3 359 0 5 667 546 341 60 36 chr15 10836492 10836827 -92658147 - MLT1A LTR MaLR -5 369 27 5 667 247 277 123 18 chr15 10836838 10836952 -92658022 + RLTR9E LTR ERVK 281 406 -3 5 667 1187 317 45 32 chr15 10837206 10837806 -92657168 + ETnERV2-int LTR ERVK 1790 2397 -3770 5 667 8497 283 36 26 chr15 10837825 10839966 -92655008 + ETnERV2-int LTR ERVK 2471 5417 -1989 5 667 3455 33 2 0 chr15 10839966 10840361 -92654613 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 667 8497 257 18 14 chr15 10840361 10841102 -92653872 + ETnERV2-int LTR ERVK 5418 6152 -1254 5 667 1058 320 45 44 chr15 10842224 10842839 -92652135 + RLTR6-int LTR ERV1 7049 7664 -114 5 667 401 224 47 111 chr15 10843324 10843495 -92651479 + RLTR9B LTR ERVK 278 437 0 5 667 277 262 46 55 chr15 10843633 10843742 -92651232 - MTE2b LTR MaLR -13 366 259 5 667 3655 218 97 26 chr15 10844770 10845897 -92649077 + RMER12B LTR ERVK 1 1230 -342 5 667 620 275 59 111 chr15 10845946 10846236 -92648738 + RMER12B LTR ERVK 1155 1404 0 5 667 322 267 105 46 chr15 10846323 10846476 -92648498 + MamGypLTR1c LTR Gypsy 639 800 -3 5 667 1623 226 50 20 chr15 10848241 10848648 -92646326 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 5 667 2316 204 79 7 chr15 10848880 10849424 -92645550 + RMER19C LTR ERVK 3 585 -26 5 667 1025 173 61 0 chr15 10852477 10852674 -92642300 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 175 5 667 362 143 0 0 chr15 10852798 10852861 -92642113 - ORR1C2 LTR MaLR -285 99 37 5 667 231 143 0 67 chr15 10852927 10852972 -92642002 - ORR1C2 LTR MaLR -342 42 1 5 667 1834 161 63 14 chr15 10854161 10854508 -92640466 + MTC LTR MaLR 56 419 -2 5 667 1081 276 34 36 chr15 10855490 10855877 -92639097 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1048 800 415 5 667 287 247 110 22 chr15 10855958 10856049 -92638925 + RLTR23 LTR ERV1 332 430 0 5 667 328 327 12 42 chr15 10858053 10858219 -92636755 + RMER5 LTR ERV1 354 514 -20 5 667 611 281 33 67 chr15 10859664 10859807 -92635167 - MT2A LTR ERVL -71 462 320 5 667 611 281 33 67 chr15 10860046 10860112 -92634862 - MT2A LTR ERVL -214 319 260 5 667 624 304 117 15 chr15 10862792 10863126 -92631848 + MLT2D LTR ERVL 2 369 -45 5 667 281 247 51 13 chr15 10864139 10864217 -92630757 + MLT1B LTR MaLR 3 83 -307 5 667 251 125 42 0 chr15 10864468 10864516 -92630458 + MLT1B LTR MaLR 129 178 -289 5 667 943 274 32 64 chr15 10874472 10874619 -92620355 + MLT2D LTR ERVL 8 148 -266 5 667 1399 210 82 36 chr15 10874619 10874975 -92619999 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 5 667 943 274 32 64 chr15 10874975 10874997 -92619977 + MLT2D LTR ERVL 149 161 -253 5 667 777 280 52 110 chr15 10874997 10875398 -92619576 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 5 667 943 274 32 64 chr15 10875398 10875570 -92619404 + MLT2D LTR ERVL 162 339 -75 5 667 632 316 90 50 chr15 10875576 10875953 -92619021 + MT2A LTR ERVL 1 392 -141 5 667 281 230 40 0 chr15 10876779 10876853 -92618121 + LTR50 LTR ERVL 719 795 0 6 668 598 291 17 23 chr15 10879631 10879807 -92615167 - MLT1C LTR MaLR -73 394 220 6 668 3312 18 42 0 chr15 10891321 10891701 -92603273 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 668 874 266 95 10 chr15 10902850 10903154 -92591820 + ORR1E LTR MaLR 1 330 -29 6 668 2058 282 66 44 chr15 10903154 10903859 -92591115 + ORR1E-int LTR MaLR 810 1530 -50 6 668 633 236 63 6 chr15 10903859 10904017 -92590957 + ORR1E LTR MaLR 4 170 -189 6 668 346 288 58 36 chr15 10905662 10905799 -92589175 - ORR1E LTR MaLR -3 376 237 6 668 652 208 8 8 chr15 10905909 10906040 -92588934 - ORR1E LTR MaLR -228 131 1 6 668 274 330 128 72 chr15 10906235 10906555 -92588419 - MLT1J-int LTR MaLR -440 947 610 6 668 3129 61 29 5 chr15 10906703 10907114 -92587860 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 668 1629 186 80 17 chr15 10907354 10907715 -92587259 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 668 1781 154 26 42 chr15 10912670 10913055 -92581919 - RMER10B LTR ERVL -5 393 15 6 668 3507 23 10 0 chr15 10919463 10919855 -92575119 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 668 283 301 176 20 chr15 10927048 10927292 -92567682 - ORR1E LTR MaLR -3 356 75 6 668 366 325 83 0 chr15 10929689 10929809 -92565165 - LTR33A LTR ERVL -358 162 33 6 668 382 295 39 8 chr15 10934611 10934741 -92560233 - MLT1B LTR MaLR -46 344 211 6 668 237 280 143 71 chr15 10938316 10938470 -92556504 - LTR16E2 LTR ERVL -112 456 292 6 668 291 358 63 31 chr15 10944051 10944273 -92550701 - LTR16B LTR ERVL -8 455 227 6 668 1591 177 100 37 chr15 10946648 10946985 -92547989 + MTD LTR MaLR 1 362 -57 7 668 2006 175 47 50 chr15 10946985 10947407 -92547567 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 668 1591 177 100 37 chr15 10947407 10947450 -92547524 + MTD LTR MaLR 363 405 -14 7 668 919 318 99 49 chr15 10950742 10951249 -92543725 - MLT1E2 LTR MaLR -49 578 47 7 668 255 250 36 0 chr15 10951625 10951709 -92543265 - MLT1E2 LTR MaLR -68 559 473 7 668 1689 200 37 45 chr15 10952396 10952778 -92542196 + RMER4B LTR ERVK 17 395 -190 7 668 573 137 33 41 chr15 10952791 10952913 -92542061 + RMER4B LTR ERVK 465 585 0 7 668 421 271 116 92 chr15 10959840 10960133 -92534841 - RMER20B LTR ERVK -210 417 118 7 668 1613 170 80 26 chr15 10960464 10960649 -92534325 + RMER17C LTR ERVK 3 188 -222 7 668 1613 170 80 26 chr15 10960712 10960913 -92534061 + RMER17C LTR ERVK 189 409 -1 7 668 1886 208 58 10 chr15 10963510 10963909 -92531065 - MTC LTR MaLR 0 421 4 7 668 485 300 202 8 chr15 10974365 10974627 -92520347 + MLT1A0 LTR MaLR 1 313 -52 7 668 841 199 11 6 chr15 10987955 10988137 -92506837 + MTC LTR MaLR 1 183 -238 7 668 393 245 51 0 chr15 10988182 10988280 -92506694 - MTEb LTR MaLR -276 103 1 7 668 1162 162 5 16 chr15 10988537 10988731 -92506243 + MTC LTR MaLR 197 388 -33 7 668 1087 243 85 18 chr15 10989747 10990078 -92504896 + MTD LTR MaLR 1 353 -66 7 668 649 239 137 15 chr15 10992669 10992873 -92502101 + MLT1D LTR MaLR 249 477 -28 7 668 1004 271 142 8 chr15 11004752 11005110 -92489864 + MTD LTR MaLR 1 406 -13 1 668 3543 18 2 0 chr15 11009265 11009660 -92485314 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 669 1320 160 205 14 chr15 11034311 11034608 -92460366 - MTC LTR MaLR 0 421 68 5 669 539 107 12 14 chr15 11034738 11034835 -92460139 - MTC LTR MaLR -329 90 1 5 669 323 343 57 24 chr15 11035600 11035890 -92459084 - MLT1E3 LTR MaLR -5 500 277 5 669 326 339 53 0 chr15 11036834 11037023 -92457951 - MLT1E3 LTR MaLR -425 199 1 5 669 1995 148 35 3 chr15 11039697 11040043 -92454931 + RLTR15 LTR ERVK 2 358 -1 6 669 638 333 99 22 chr15 11051533 11051988 -92442986 - LTR82A LTR ERVL -160 712 223 8 669 1939 97 50 0 chr15 11055734 11056033 -92438941 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 6 9 669 2035 168 67 5 chr15 11060957 11061346 -92433628 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 669 1507 225 108 8 chr15 11064454 11064835 -92430139 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 669 310 298 98 29 chr15 11065442 11065615 -92429359 - MLT1D LTR MaLR -3 502 318 1 669 351 308 134 5 chr15 11069810 11069996 -92424978 - MLT1D LTR MaLR -259 246 37 1 669 322 310 191 88 chr15 11070183 11070466 -92424508 + ORR1E LTR MaLR 1 312 -47 1 669 699 350 29 37 chr15 11070647 11071029 -92423945 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 669 824 244 121 49 chr15 11073160 11073429 -92421545 - MTD LTR MaLR -13 406 109 1 669 3665 165 41 24 chr15 11073429 11073776 -92421198 - RMER6D LTR ERVK 0 720 374 1 669 3665 165 41 24 chr15 11073806 11073838 -92421136 - RMER6D LTR ERVK -347 373 337 1 669 3665 165 41 24 chr15 11074015 11074336 -92420638 - RMER6D LTR ERVK -386 334 1 1 669 824 270 152 40 chr15 11074336 11074403 -92420571 - MTD LTR MaLR -311 108 42 1 669 287 279 65 65 chr15 11074521 11074659 -92420315 - ORR1E LTR MaLR -221 138 1 1 669 1563 148 38 100 chr15 11078069 11078408 -92416566 - ORR1B1 LTR MaLR -36 358 41 1 669 4909 147 37 35 chr15 11078415 11079302 -92415672 - ORR1B1-int LTR MaLR -323 1640 757 1 669 4569 152 69 43 chr15 11079302 11080231 -92414743 - RMER17B LTR ERVK -4 954 2 1 669 4909 147 37 35 chr15 11080231 11080335 -92414639 - ORR1B1-int LTR MaLR -1207 756 647 1 669 337 186 0 0 chr15 11080311 11080370 -92414604 - MT2B LTR ERVL -542 59 1 1 669 353 303 42 7 chr15 11086664 11086807 -92408167 - MLT2C1 LTR ERVL -188 209 62 1 669 1824 225 68 53 chr15 11093406 11093951 -92401023 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 1 669 6169 178 65 64 chr15 11093956 11095411 -92399563 - RMER3D-int LTR ERVK -5 2837 1382 1 669 1180 180 104 70 chr15 11101848 11102147 -92392827 + ORR1C1 LTR MaLR 6 314 -64 1 669 3250 58 5 2 chr15 11103124 11103523 -92391451 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 669 1181 300 44 8 chr15 11106651 11107011 -92387963 - MTE2b LTR MaLR -5 374 2 1 669 347 278 103 0 chr15 11107447 11107573 -92387401 + MLT1A1 LTR MaLR 258 396 -12 1 669 503 287 82 31 chr15 11107606 11107951 -92387023 + MER57F LTR ERV1 49 435 -1 1 669 3475 48 5 0 chr15 11112162 11112556 -92382418 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 669 9529 46 3 2 chr15 11112556 11113653 -92381321 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 669 3329 68 5 0 chr15 11113653 11114047 -92380927 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 669 505 335 37 34 chr15 11114200 11114497 -92380477 - MER110 LTR ERV1 -103 388 91 1 669 487 270 137 6 chr15 11117196 11117371 -92377603 - ORR1E LTR MaLR 0 359 162 1 669 228 156 0 135 chr15 11117370 11117422 -92377552 - ORR1E LTR MaLR -329 45 1 1 669 267 269 10 106 chr15 11133328 11133432 -92361542 + RLTR25A LTR ERVK 489 582 -521 2 669 2891 136 21 18 chr15 11136143 11136654 -92358320 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 16 2 669 890 295 129 47 chr15 11137566 11138093 -92356881 - RMER15 LTR ERVL -5 570 1 2 670 2420 190 14 5 chr15 11143366 11143783 -92351191 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 670 2968 46 3 0 chr15 11167670 11168032 -92326942 + MTA_Mm LTR MaLR 1 363 -33 2 670 1989 107 9 51 chr15 11168032 11168368 -92326606 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 670 301 26 0 0 chr15 11168368 11168406 -92326568 + MTA_Mm LTR MaLR 363 400 0 2 670 1378 242 96 0 chr15 11172168 11172502 -92322472 + MTEa LTR MaLR 3 368 -11 2 670 600 241 17 0 chr15 11172546 11172662 -92322312 + MTE2b LTR MaLR 252 369 -10 2 670 325 388 80 29 chr15 11174881 11175120 -92319854 - LTR16C LTR ERVL -172 317 67 2 670 297 346 9 0 chr15 11177410 11177517 -92317457 + MLT1C LTR MaLR 360 467 0 2 670 2170 114 9 64 chr15 11185658 11186003 -92308971 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 670 978 199 229 0 chr15 11186112 11186442 -92308532 + MTD LTR MaLR 13 418 -1 3 670 1064 219 108 16 chr15 11193770 11194085 -92300889 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 184 3 670 913 293 71 10 chr15 11194105 11194512 -92300462 - MYSERV-int LTR ERVK -1924 4626 4195 3 670 245 281 30 97 chr15 11195622 11195756 -92299218 + RMER12 LTR ERVK 746 870 -452 3 670 601 261 196 30 chr15 11200585 11200928 -92294046 - MTD LTR MaLR -14 405 6 3 670 1487 187 75 52 chr15 11201056 11201280 -92293694 - RMER17C LTR ERVK 0 410 184 3 670 1487 187 75 52 chr15 11201367 11201543 -92293431 - RMER17C LTR ERVK -227 183 1 3 670 346 366 90 36 chr15 11214098 11214376 -92280598 - ORR1E LTR MaLR 0 359 67 3 670 463 326 76 34 chr15 11221404 11221718 -92273256 - MLT1G3 LTR MaLR -5 590 254 3 670 894 326 79 8 chr15 11225923 11226316 -92268658 - MER31A LTR ERV1 -2 483 63 3 670 1083 251 110 6 chr15 11226344 11226672 -92268302 - MTD LTR MaLR -53 366 5 3 670 593 289 92 59 chr15 11226767 11227072 -92267902 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 51 3 670 1542 215 110 0 chr15 11234133 11234468 -92260506 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 3 670 508 313 104 59 chr15 11235296 11235740 -92259234 - MLT1C LTR MaLR -3 464 1 3 670 1375 180 59 63 chr15 11236639 11237083 -92257891 - RMER17C LTR ERVK -517 441 13 3 670 277 301 101 43 chr15 11245402 11245541 -92249433 - MLT1H LTR MaLR -198 351 205 3 670 768 60 33 33 chr15 11252475 11252596 -92242378 - RMER4A LTR ERVK 0 466 346 3 670 1706 180 34 26 chr15 11252609 11252992 -92241982 - RMER4A LTR ERVK -75 391 6 3 670 942 254 71 24 chr15 11254509 11254804 -92240170 + MTE2a LTR MaLR 62 370 -9 3 670 3203 63 5 0 chr15 11255997 11256395 -92238579 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 670 862 231 131 11 chr15 11263398 11263665 -92231309 + MTD LTR MaLR 121 419 0 4 670 3518 23 2 0 chr15 11270446 11270841 -92224133 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 670 416 296 146 84 chr15 11271462 11271724 -92223250 - MLT1C LTR MaLR 0 467 187 4 670 416 296 146 84 chr15 11271815 11271957 -92223017 - MLT1C LTR MaLR -281 186 39 4 671 1742 137 92 32 chr15 11279201 11279547 -92215427 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 4 671 2291 53 0 0 chr15 11282164 11282463 -92212511 - RLTR13A2 LTR ERVK 0 958 660 4 671 1149 217 87 16 chr15 11282462 11282771 -92212203 - ORR1D2 LTR MaLR -37 333 3 4 671 1010 301 79 41 chr15 11284636 11285228 -92209746 + MER67B LTR ERV1 31 546 -115 4 671 258 258 226 25 chr15 11285306 11285465 -92209509 - MLT1G LTR MaLR -138 453 263 4 671 841 330 40 59 chr15 11287686 11288111 -92206863 - MT2A LTR ERVL -116 417 1 4 671 259 296 126 7 chr15 11291503 11291646 -92203328 - MER89 LTR ERV1 -396 163 4 4 671 1155 217 180 73 chr15 11298738 11299150 -92195824 + MT2A LTR ERVL 6 461 -72 4 671 425 298 39 59 chr15 11300311 11300514 -92194460 - RLTR25A LTR ERVK -900 203 5 4 671 1368 249 71 15 chr15 11303201 11303596 -92191378 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 4 671 5671 69 15 2 chr15 11303714 11304527 -92190447 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 823 -985 4 671 257 298 66 44 chr15 11304784 11304921 -92190053 + RMER12 LTR ERVK 1105 1244 -78 4 671 2840 47 6 11 chr15 11307639 11307987 -92186987 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 671 1789 171 75 8 chr15 11308539 11308899 -92186075 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 671 1606 159 67 31 chr15 11314388 11314745 -92180229 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 4 671 2135 124 3 17 chr15 11331999 11332343 -92162631 + ORR1A1 LTR MaLR 1 339 -7 5 671 1583 140 93 7 chr15 11332577 11332878 -92162096 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 5 671 1349 251 80 34 chr15 11334155 11334630 -92160344 + RMER5 LTR ERV1 33 529 -5 5 671 291 262 442 22 chr15 11334830 11335016 -92159958 - MLT2B4 LTR ERVL -36 520 257 5 671 2890 36 45 0 chr15 11335108 11335439 -92159535 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 671 919 267 4 17 chr15 11335609 11335845 -92159129 + RLTR28B LTR ERVL 105 337 -144 5 671 1398 148 52 33 chr15 11335845 11336117 -92158857 - ORR1B2 LTR MaLR -11 356 80 5 671 1187 129 136 134 chr15 11336117 11336347 -92158627 - RMER17C LTR ERVK 0 410 181 5 671 1187 129 136 134 chr15 11336422 11336595 -92158379 - RMER17C LTR ERVK -230 180 6 5 671 705 251 225 80 chr15 11337940 11338265 -92156709 + MTD LTR MaLR 1 372 -7 5 671 310 241 225 44 chr15 11340434 11340654 -92154320 + RMER20B LTR ERVK 132 388 -239 5 671 1922 163 56 3 chr15 11340850 11341207 -92153767 + RLTR14 LTR ERV1 7 382 0 5 671 256 267 45 82 chr15 11346116 11346131 -92148843 + MT2B LTR ERVL 152 162 -439 5 671 2989 55 3 0 chr15 11357901 11358246 -92136728 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 671 1826 181 129 9 chr15 11361353 11361694 -92133280 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 5 671 345 363 40 0 chr15 11369996 11370120 -92124854 - LTR33 LTR ERVL -340 175 47 5 671 522 296 106 89 chr15 11377718 11378067 -92116907 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 5 671 300 358 57 57 chr15 11381386 11381561 -92113413 - MLT1I LTR MaLR -15 396 222 5 671 394 307 17 17 chr15 11381914 11382030 -92112944 - ORR1E LTR MaLR -6 353 238 5 671 236 322 124 107 chr15 11382155 11382257 -92112717 - ORR1E LTR MaLR -122 237 132 5 671 236 322 124 107 chr15 11382292 11382422 -92112552 - ORR1E LTR MaLR -228 131 2 5 671 807 285 154 3 chr15 11382422 11382695 -92112279 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1210 5 671 1206 196 180 7 chr15 11382730 11382863 -92112111 - ORR1C1 LTR MaLR -46 332 169 5 671 1206 196 180 7 chr15 11382895 11383044 -92111930 - ORR1C1 LTR MaLR -210 168 2 5 671 1826 148 31 6 chr15 11383044 11383364 -92111610 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 1182 5 671 1288 218 116 21 chr15 11383499 11383827 -92111147 - ORR1D1 LTR MaLR -15 359 1 6 671 457 193 49 172 chr15 11384125 11384288 -92110686 - MTEb LTR MaLR -29 350 208 6 671 2633 101 91 0 chr15 11391486 11391871 -92103103 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 6 671 2617 61 47 0 chr15 11392015 11392375 -92102599 + RLTR10 LTR ERVK 12 388 -2 6 671 226 300 59 111 chr15 11392572 11392707 -92102267 + LTR45C LTR ERV1 353 480 -59 6 671 528 304 24 63 chr15 11393151 11393358 -92101616 - RLTR33 LTR ERVK -33 645 447 6 671 1380 197 20 171 chr15 11401237 11401366 -92093608 + ORR1D1 LTR MaLR 1 129 -245 6 671 1380 197 20 171 chr15 11401558 11401868 -92093106 + ORR1D1 LTR MaLR 130 374 0 6 672 296 311 206 51 chr15 11403728 11404141 -92090833 - LTR78 LTR ERV1 -659 645 169 6 672 327 211 153 8 chr15 11412334 11412458 -92082516 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 225 6 672 235 158 0 0 chr15 11412461 11412499 -92082475 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 336 6 672 714 263 48 29 chr15 11412933 11413247 -92081727 - MER57D LTR ERV1 -2 409 1 6 672 1034 173 54 10 chr15 11414636 11414840 -92080134 + RMER4A LTR ERVK 1 213 -253 6 672 435 412 39 17 chr15 11422886 11423065 -92071909 + MLT1G1 LTR MaLR 114 299 -280 6 672 1413 208 93 9 chr15 11423065 11423409 -92071565 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 6 672 435 383 81 85 chr15 11423409 11423526 -92071448 + MLT1G1 LTR MaLR 255 357 -191 6 672 3131 63 8 0 chr15 11434161 11434558 -92060416 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 672 1089 267 78 37 chr15 11437170 11437542 -92057432 - MTEa LTR MaLR -6 373 1 6 672 627 326 35 63 chr15 11445788 11446043 -92048931 + ORR1E LTR MaLR 1 248 -111 6 672 377 303 110 39 chr15 11450327 11450581 -92044393 - LTR73 LTR ERV1 -101 471 200 7 672 374 287 62 8 chr15 11450981 11451111 -92043863 + MER57A-int LTR ERV1 5291 5427 -760 7 672 1935 129 120 28 chr15 11451188 11451547 -92043427 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 12 7 672 2323 194 110 0 chr15 11457849 11458314 -92036660 + RMER15 LTR ERVL 1 516 -59 7 672 2211 181 81 38 chr15 11464207 11464781 -92030193 - RLTR31_Mm LTR ERVK -20 564 1 7 672 282 291 99 33 chr15 11467187 11467308 -92027666 - MT2B LTR ERVL -332 269 141 7 672 1019 266 96 30 chr15 11469270 11469635 -92025339 + MLT1B LTR MaLR 1 389 -1 7 672 305 283 198 58 chr15 11470561 11470826 -92024148 + MLT1E1 LTR MaLR 303 645 -35 7 672 736 309 142 29 chr15 11474359 11474803 -92020171 - RMER5 LTR ERV1 -17 517 24 7 672 910 180 15 90 chr15 11481691 11481892 -92013082 + ORR1D1 LTR MaLR 1 186 -188 7 672 3461 53 2 0 chr15 11483765 11484164 -92010810 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 672 742 308 80 75 chr15 11493751 11494112 -92000862 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 43 7 672 3593 28 5 0 chr15 11497142 11497536 -91997438 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 672 571 273 0 14 chr15 11498966 11499107 -91995867 + MT2A LTR ERVL 326 464 -69 7 672 1242 295 101 23 chr15 11507857 11508343 -91986631 - MLT2B4 LTR ERVL -25 531 8 1 672 3127 14 0 0 chr15 11510420 11510766 -91984208 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 672 14657 42 1 1 chr15 11510766 11512558 -91982416 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 1 672 3084 17 3 0 chr15 11512558 11512903 -91982071 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 672 287 287 90 56 chr15 11515051 11515195 -91979779 - ORR1E LTR MaLR 0 379 231 2 672 444 331 37 12 chr15 11515213 11515375 -91979599 - ORR1E LTR MaLR -188 171 6 2 672 427 254 40 0 chr15 11518042 11518179 -91976795 + MLT1B LTR MaLR 218 366 -8 2 672 250 324 0 0 chr15 11518841 11518915 -91976059 - MER90 LTR ERV1 -452 123 50 2 672 862 270 120 4 chr15 11525859 11526154 -91968820 - MLT1A0 LTR MaLR -21 369 1 4 672 2459 101 60 30 chr15 11526829 11527226 -91967748 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 672 229 385 55 43 chr15 11531116 11531279 -91963695 - MLT1H LTR MaLR -237 312 148 5 672 252 349 118 70 chr15 11531732 11532089 -91962885 + ORR1C2 LTR MaLR 1 374 0 5 672 498 237 127 85 chr15 11532431 11532643 -91962331 + MTE2a LTR MaLR 159 379 0 5 672 814 291 117 30 chr15 11532952 11533123 -91961851 - RMER5 LTR ERV1 -19 515 325 5 672 3212 48 2 8 chr15 11533123 11533521 -91961453 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 672 814 291 117 30 chr15 11533521 11533784 -91961190 - RMER5 LTR ERV1 -210 324 43 5 10 291 229 167 28 chr15 11534334 11534442 -91960532 - MTD LTR MaLR -17 402 280 5 673 1096 242 82 28 chr15 11537921 11538267 -91956707 - MTD LTR MaLR -14 393 1 6 673 291 406 66 39 chr15 11539765 11540021 -91954953 - MLT1J2 LTR MaLR -184 264 2 6 673 325 366 99 5 chr15 11542998 11543190 -91951784 - MLT1J1 LTR MaLR -218 226 17 7 673 349 273 11 11 chr15 11554360 11554449 -91940525 - MLT1C LTR MaLR -8 459 371 8 673 3414 150 38 13 chr15 11560062 11560691 -91934283 - RLTR17 LTR ERVK -118 574 1 9 673 778 318 89 84 chr15 11561814 11561935 -91933039 - MLT2B1 LTR ERVL -44 476 345 9 673 3466 23 2 0 chr15 11561935 11562330 -91932644 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 673 778 318 89 84 chr15 11562330 11562682 -91932292 - MLT2B1 LTR ERVL -176 344 1 9 673 513 299 103 47 chr15 11563780 11564120 -91930854 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 9 673 2359 114 167 15 chr15 11567176 11567638 -91927336 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 532 0 1 673 2951 167 56 51 chr15 11568501 11569087 -91925887 + RMER20B LTR ERVK 39 627 0 1 673 398 289 134 118 chr15 11570570 11570876 -91924098 + MTE2a LTR MaLR 13 323 -56 1 673 269 250 90 83 chr15 11573852 11573996 -91920978 - MLT1B LTR MaLR -6 384 240 1 673 693 277 9 36 chr15 11580282 11580515 -91914459 - MTD LTR MaLR -101 306 88 1 673 249 289 31 62 chr15 11580699 11580795 -91914179 - MTD LTR MaLR -327 94 2 1 673 2839 44 7 129 chr15 11583768 11584210 -91910764 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 673 394 151 96 0 chr15 11603093 11603166 -91891808 + RLTR28 LTR ERVL 1 80 -401 1 673 1162 142 93 14 chr15 11603194 11603409 -91891565 + RLTR28 LTR ERVL 293 524 0 1 673 311 362 44 50 chr15 11603574 11603754 -91891220 - MLT1G3 LTR MaLR -2 593 415 1 673 463 189 45 56 chr15 11605594 11605773 -91889201 + RMER17C LTR ERVK 101 277 -133 1 673 304 318 94 91 chr15 11613175 11613525 -91881449 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 24 1 673 3028 68 65 5 chr15 11614814 11615198 -91879776 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 673 7094 46 4 9 chr15 11616651 11617463 -91877511 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 1 673 1911 191 20 36 chr15 11618875 11619265 -91875709 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 673 2450 153 68 13 chr15 11619560 11619957 -91875017 - MTC LTR MaLR -2 419 1 1 673 268 182 103 93 chr15 11621274 11621371 -91873603 + MLT1A1 LTR MaLR 305 402 -6 1 673 275 312 39 0 chr15 11633312 11633389 -91861585 + MLT1J1 LTR MaLR 3 82 -362 2 673 2728 86 0 0 chr15 11634641 11634967 -91860007 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 2 673 3630 30 2 0 chr15 11635518 11635913 -91859061 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 673 1028 237 198 19 chr15 11639318 11639632 -91855342 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 673 7839 13 2 0 chr15 11640418 11641238 -91853736 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 2 673 988 296 86 17 chr15 11643526 11643889 -91851085 + MTD LTR MaLR 1 404 -17 2 673 261 267 25 16 chr15 11643913 11644005 -91850969 - ORR1E LTR MaLR -7 372 281 2 673 296 324 106 60 chr15 11644052 11644269 -91850705 - ORR1E LTR MaLR -105 254 28 2 673 946 238 52 127 chr15 11645934 11646319 -91848655 - ORR1E LTR MaLR -2 357 2 2 673 1977 132 123 27 chr15 11648597 11648970 -91846004 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 673 278 271 92 20 chr15 11662082 11662180 -91832794 + LTR33A_ LTR ERVL 9 113 -418 2 674 899 170 328 16 chr15 11672976 11673102 -91821872 - RMER17C LTR ERVK 0 410 234 2 674 899 170 328 16 chr15 11673173 11673357 -91821617 - RMER17C LTR ERVK -177 233 3 2 674 2288 150 20 25 chr15 11678098 11678494 -91816480 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 674 1566 178 50 9 chr15 11686078 11686401 -91808573 + MTD LTR MaLR 1 336 -83 2 674 2378 76 31 0 chr15 11687556 11687873 -91807101 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 674 1522 97 4 20 chr15 11687873 11688126 -91806848 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1715 2 674 5199 147 83 19 chr15 11688116 11689200 -91805774 + ORR1A3-int LTR MaLR 277 1429 -534 2 674 862 114 0 0 chr15 11689195 11689327 -91805647 - ORR1A2 LTR MaLR -195 132 1 2 674 269 298 97 66 chr15 11690331 11690658 -91804316 + MTE2a LTR MaLR 11 302 -117 2 674 1022 198 127 46 chr15 11692334 11692641 -91802333 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 674 996 286 94 16 chr15 11700978 11701362 -91793612 + MTD LTR MaLR 6 419 0 3 674 364 326 242 13 chr15 11702248 11702492 -91792482 - MLT1F LTR MaLR -184 364 65 3 674 608 310 71 76 chr15 11706849 11707216 -91787758 + MLT1A LTR MaLR 6 370 -4 3 674 1417 150 11 26 chr15 11707817 11708084 -91786890 + ORR1B1 LTR MaLR 1 263 -131 3 674 1241 255 57 8 chr15 11709319 11709702 -91785272 - BGLII_B LTR ERVK -25 416 15 3 674 349 348 64 43 chr15 11711123 11711297 -91783677 + MLT1B LTR MaLR 1 185 -205 3 674 349 348 64 43 chr15 11711407 11711514 -91783460 + MLT1B LTR MaLR 186 288 -102 3 674 247 315 8 92 chr15 11719965 11720084 -91774890 + MTE2a LTR MaLR 229 337 -42 3 674 292 337 52 67 chr15 11720452 11720646 -91774328 - MLT1E3 LTR MaLR -126 498 308 3 674 1102 210 188 21 chr15 11721299 11721635 -91773339 + MTD LTR MaLR 1 392 -27 3 674 1530 208 48 43 chr15 11722898 11723270 -91771704 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 674 1862 172 54 30 chr15 11723459 11723830 -91771144 + MTB_Mm LTR MaLR 27 406 -1 3 674 628 282 14 28 chr15 11727472 11727715 -91767259 - MLT1B LTR MaLR 0 408 172 3 674 460 326 5 40 chr15 11727757 11727955 -91767019 - MLT1B LTR MaLR -183 191 1 3 674 270 139 153 0 chr15 11746948 11747020 -91747954 + MLT1K LTR MaLR 513 595 0 3 674 243 395 108 14 chr15 11747411 11747624 -91747350 - LTR81C LTR ERV1? -285 868 636 3 674 489 334 142 18 chr15 11747671 11748177 -91746797 - MER92B LTR ERV1 -57 579 11 3 674 298 129 97 0 chr15 11750006 11750068 -91744906 - MTD LTR MaLR -284 135 68 3 674 272 199 73 60 chr15 11750327 11750477 -91744497 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 603 4 674 3923 121 31 57 chr15 11752169 11752940 -91742034 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 4 674 643 345 35 60 chr15 11754050 11754385 -91740589 + MLT1E1A LTR MaLR 326 674 -6 4 674 2877 77 43 13 chr15 11754842 11755237 -91739737 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 674 250 333 78 0 chr15 11756563 11756653 -91738321 - MER52-int LTR ERV1 -2558 4533 4437 4 674 386 295 68 59 chr15 11757395 11757615 -91737359 - MTEb LTR MaLR -157 222 1 4 674 320 257 173 26 chr15 11757960 11758116 -91736858 - MLT1L LTR MaLR -5 605 427 4 674 854 290 36 95 chr15 11792534 11792892 -91702082 - MTE2b LTR MaLR -31 348 12 4 674 248 324 122 5 chr15 11795489 11795703 -91699271 + LTR33 LTR ERVL 277 515 0 4 675 839 309 26 48 chr15 11798097 11798410 -91696564 - MTE2a LTR MaLR -73 306 1 4 675 3002 45 45 16 chr15 11805310 11805691 -91689283 + MTA_Mm LTR MaLR 1 392 -4 4 675 1376 141 60 167 chr15 11809120 11809503 -91685471 - ORR1C2 LTR MaLR -42 342 1 4 675 229 228 53 0 chr15 11817926 11817983 -91676991 + MTE2a LTR MaLR 3 62 -317 5 675 270 303 53 83 chr15 11817995 11818128 -91676846 + MTE2a LTR MaLR 125 253 -126 5 675 240 251 153 105 chr15 11845632 11845869 -91649105 - RLTR41 LTR ERV1 -56 476 258 5 675 2646 46 60 18 chr15 11846067 11846399 -91648575 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 675 4603 82 68 7 chr15 11846399 11847147 -91647827 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 794 -998 5 675 2664 50 47 0 chr15 11847134 11847518 -91647456 + ORR1A1-int LTR MaLR 1391 1792 0 5 675 1928 53 84 21 chr15 11847518 11847805 -91647169 + ORR1A1 LTR MaLR 1 305 -41 5 675 449 18 0 0 chr15 11854340 11854395 -91640579 + ORR1A1 LTR MaLR 292 346 0 5 675 424 326 99 60 chr15 11855345 11855727 -91639247 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 93 5 675 975 284 45 24 chr15 11856152 11856441 -91638533 + MTE2b LTR MaLR 51 345 -34 5 675 284 205 83 71 chr15 11857373 11857457 -91637517 + MLT1J LTR MaLR 225 309 -203 5 675 509 235 0 34 chr15 11860021 11860140 -91634834 + MTD LTR MaLR 196 310 -109 5 675 2790 12 0 0 chr15 11860540 11860878 -91634096 + ORR1A0 LTR MaLR 1 338 -8 5 675 14396 51 2 6 chr15 11860882 11862681 -91632293 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 5 675 3077 26 3 0 chr15 11862681 11863026 -91631948 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 675 3230 111 206 12 chr15 11864059 11864692 -91630282 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 5 675 644 244 134 41 chr15 11865195 11865464 -91629510 - MER31A LTR ERV1 -163 322 29 5 675 323 366 52 10 chr15 11867767 11867960 -91627014 - MER74B LTR ERVL -3 619 419 5 675 3883 159 81 40 chr15 11869909 11870841 -91624133 + RMER12 LTR ERVK 168 1144 -178 5 675 542 208 25 152 chr15 11871005 11871209 -91623765 + RMER12 LTR ERVK 1145 1322 0 5 675 1893 147 46 22 chr15 11874095 11874214 -91620760 + ORR1C1 LTR MaLR 1 118 -260 5 675 2547 72 6 0 chr15 11874214 11874535 -91620439 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 5 675 1893 147 46 22 chr15 11874535 11874784 -91620190 + ORR1C1 LTR MaLR 119 378 0 5 675 1938 122 20 0 chr15 11877240 11877544 -91617430 + ORR1A2 LTR MaLR 1 310 -17 5 675 860 178 127 76 chr15 11877992 11878283 -91616691 + RLTR20C LTR ERVK 1 306 -228 5 675 641 231 0 39 chr15 11878293 11878446 -91616528 + RLTR20C LTR ERVK 432 578 0 5 675 2059 143 12 29 chr15 11880602 11881019 -91613955 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 675 230 308 118 15 chr15 11881819 11881954 -91613020 + MLT1D LTR MaLR 1 149 -356 5 675 494 223 338 14 chr15 11882372 11882656 -91612318 - MTE2b LTR MaLR 0 374 5 5 675 616 301 63 35 chr15 11882676 11882931 -91612043 + MLT1D LTR MaLR 225 486 -19 5 675 285 232 39 69 chr15 11884790 11884892 -91610082 + MLT1D LTR MaLR 489 587 -8 5 675 2437 190 89 73 chr15 11886770 11887399 -91607575 + RLTR26 LTR ERVK 4 642 0 6 675 2432 93 12 0 chr15 11888013 11888336 -91606638 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 675 775 207 128 91 chr15 11890431 11890864 -91604110 + MT2B LTR ERVL 1 546 -55 6 675 338 231 120 0 chr15 11896602 11896719 -91598255 + ORR1D2 LTR MaLR 1 131 -239 6 675 277 269 53 64 chr15 11896919 11897090 -91597884 + ORR1D2 LTR MaLR 197 365 -14 6 675 1293 236 53 25 chr15 11897380 11897736 -91597238 + ORR1D2 LTR MaLR 3 368 -2 6 675 2231 124 62 0 chr15 11897785 11898172 -91596802 - MTC LTR MaLR -10 411 1 6 675 720 247 58 30 chr15 11900213 11900492 -91594482 + RLTR11B LTR ERVK 2 279 -162 6 675 392 241 48 41 chr15 11900582 11900729 -91594245 + RLTR11B LTR ERVK 284 431 -22 6 675 373 219 11 15 chr15 11902402 11902510 -91592464 + MTE2a LTR MaLR 274 379 0 6 675 911 180 127 9 chr15 11902794 11903007 -91591967 - ORR1D1 LTR MaLR -136 238 1 6 675 3247 148 106 3 chr15 11903707 11904351 -91590623 - RMER6D LTR ERVK -3 717 8 6 675 287 230 270 0 chr15 11905042 11905246 -91589728 + MLT2B1 LTR ERVL 191 449 -152 6 675 732 177 34 0 chr15 11908098 11908245 -91586729 + ORR1E LTR MaLR 1 152 -207 6 675 413 281 33 94 chr15 11909232 11909444 -91585530 + ORR1E LTR MaLR 155 353 -6 6 675 1406 150 197 52 chr15 11910513 11910843 -91584131 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 675 1040 253 157 3 chr15 11911806 11912119 -91582855 + MTE2a LTR MaLR 19 379 0 6 675 505 269 122 27 chr15 11915498 11915720 -91579254 + MTEb LTR MaLR 3 245 -134 6 675 269 123 102 2 chr15 11915733 11915798 -91579176 + MTEb LTR MaLR 307 376 -3 6 675 423 220 62 15 chr15 11917314 11917453 -91577521 + ORR1B1 LTR MaLR 1 132 -262 6 675 2304 119 52 40 chr15 11917478 11917924 -91577050 - RMER6B LTR ERVK -10 451 1 6 675 513 198 40 0 chr15 11917939 11918040 -91576934 + ORR1B1 LTR MaLR 133 237 -157 6 675 490 113 29 58 chr15 11918051 11918154 -91576820 + ORR1B1 LTR MaLR 266 365 -2 6 675 1490 169 124 41 chr15 11918408 11918747 -91576227 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 675 3489 28 2 0 chr15 11927021 11927416 -91567558 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 84 7489 56 52 75 chr15 11927416 11928539 -91566435 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 676 3105 37 56 0 chr15 11928539 11928913 -91566061 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 6 676 300 363 98 60 chr15 11932409 11932910 -91562064 - MER34A LTR ERV1 -2 569 50 6 676 571 294 45 33 chr15 11933124 11933461 -91561513 + RLTR15 LTR ERVK 3 343 -16 6 676 3077 78 5 0 chr15 11934168 11934564 -91560410 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 6 676 323 320 41 0 chr15 11934629 11934726 -91560248 + MLT1A LTR MaLR 1 101 -273 6 676 550 257 255 5 chr15 11934723 11934907 -91560067 - ORR1D2 LTR MaLR -140 230 1 6 676 225 323 70 10 chr15 11935395 11935495 -91559479 + RMER15 LTR ERVL 403 508 -67 6 676 2770 88 30 12 chr15 11938187 11938589 -91556385 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 6 676 1592 211 64 6 chr15 11942309 11942666 -91552308 - MTD LTR MaLR -39 380 3 7 676 1057 220 55 4 chr15 11943374 11943630 -91551344 - MTD LTR MaLR -150 269 1 7 676 2074 169 31 21 chr15 11943660 11944046 -91550928 + RMER4A LTR ERVK 1 390 -76 7 676 1524 219 48 71 chr15 11944080 11944473 -91550501 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 676 448 243 63 42 chr15 11944752 11944894 -91550080 - MLT1D LTR MaLR -336 169 25 7 676 342 258 300 59 chr15 11945465 11945743 -91549231 - ORR1E LTR MaLR -3 376 32 7 676 642 304 98 61 chr15 11948202 11948479 -91546495 - MLT2D LTR ERVL -3 411 125 7 676 540 268 83 30 chr15 11950348 11950596 -91544378 - MER34A1 LTR ERV1 -18 553 287 7 676 330 290 73 134 chr15 11950944 11951123 -91543851 + MER21B LTR ERV1 681 848 -15 7 676 2393 134 85 27 chr15 11958719 11959164 -91535810 - RMER6A LTR ERVK 0 756 286 7 676 2004 125 12 15 chr15 11959289 11959614 -91535360 - RMER6A LTR ERVK -432 324 1 7 676 1793 163 49 47 chr15 11960245 11960444 -91534530 + RMER17C LTR ERVK 1 187 -223 7 676 1793 163 49 47 chr15 11960500 11960705 -91534269 + RMER17C LTR ERVK 188 405 -5 7 676 410 299 0 46 chr15 11961994 11962145 -91532829 + MLT1A LTR MaLR 48 191 -183 7 676 1216 265 63 61 chr15 11962377 11962866 -91532108 + RLTR20B3 LTR ERVK 8 471 -106 7 676 823 246 104 44 chr15 11962916 11962985 -91531989 + RLTR20B3 LTR ERVK 459 528 0 7 676 634 265 89 30 chr15 11965048 11965250 -91529724 + MLT1D LTR MaLR 31 244 -261 7 676 603 114 291 7 chr15 11965384 11965525 -91529449 + ORR1D1 LTR MaLR 1 181 -193 7 676 568 279 51 107 chr15 11966298 11966715 -91528259 - MTE2a LTR MaLR -13 406 10 7 676 520 294 26 52 chr15 11967222 11967376 -91527598 - MTC LTR MaLR -140 281 132 7 676 416 237 103 69 chr15 11967998 11968143 -91526831 - MT2B LTR ERVL -344 257 108 7 676 268 336 32 83 chr15 11970292 11970448 -91524526 - LTR88a LTR Gypsy -22 794 647 7 676 593 258 164 40 chr15 11971094 11971204 -91523770 + LTR37B LTR ERV1 15 158 -310 7 676 593 258 164 40 chr15 11971244 11971383 -91523591 + LTR37B LTR ERV1 159 294 -174 7 676 2178 177 16 0 chr15 11971762 11972130 -91522844 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 7 676 402 182 11 11 chr15 11972484 11972573 -91522401 + RLTR9E LTR ERVK 320 408 -1 7 676 229 316 8 114 chr15 11972574 11972662 -91522312 + LTR37B LTR ERV1 351 437 -31 7 676 229 316 8 114 chr15 11972852 11972895 -91522079 + LTR37B LTR ERV1 438 468 0 7 676 480 231 29 9 chr15 11973182 11973287 -91521687 - MLT1A LTR MaLR 0 374 268 7 676 3376 38 5 2 chr15 11973322 11973717 -91521257 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 676 395 333 70 6 chr15 11973727 11973884 -91521090 - MLT1A LTR MaLR -198 167 1 7 676 716 254 124 168 chr15 11977966 11978178 -91516796 - MTD LTR MaLR -1 418 191 8 676 716 254 124 168 chr15 11978367 11978566 -91516408 - MTD LTR MaLR -229 190 25 8 676 268 383 41 46 chr15 11979219 11979438 -91515536 - LTR78 LTR ERV1 -193 1111 894 8 676 316 247 78 0 chr15 11981951 11982028 -91512946 - ERVL-E-int LTR ERVL -3971 1696 1614 8 676 345 310 61 65 chr15 11983816 11984095 -91510879 - RMER2 LTR ERV1 0 567 290 8 676 3007 8 2 133 chr15 11985685 11986107 -91508867 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 8 676 54959 25 14 2 chr15 11986107 11992426 -91502548 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 8 676 3007 8 2 133 chr15 11992426 11992848 -91502126 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 8 676 256 309 144 37 chr15 11995935 11996123 -91498851 + MLT1K LTR MaLR 262 469 -126 8 676 1244 209 138 3 chr15 12000000 12000326 -91494648 - MTD LTR MaLR -6 413 44 1 676 4331 119 71 18 chr15 12000506 12000626 -91494348 + RMER6A LTR ERVK 1 166 -590 3 676 2763 52 0 62 chr15 12000626 12000995 -91493979 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 676 4331 119 71 18 chr15 12000995 12001592 -91493382 + RMER6A LTR ERVK 167 756 0 3 676 234 250 16 16 chr15 12001936 12001997 -91492977 - MTD LTR MaLR -358 61 1 1 676 398 346 79 74 chr15 12002159 12002512 -91492462 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 5 676 265 267 17 0 chr15 12003087 12003147 -91491827 + MTEb LTR MaLR 38 98 -281 7 676 1780 224 31 0 chr15 12003159 12003512 -91491462 - MTE2b LTR MaLR -15 364 1 8 676 386 188 112 9 chr15 12003512 12003706 -91491268 + MTEb LTR MaLR 104 379 0 7 676 254 247 122 12 chr15 12003914 12003996 -91490978 + ORR1E LTR MaLR 269 359 0 9 676 337 273 22 22 chr15 12004231 12004321 -91490653 + MLT1A1 LTR MaLR 307 396 -12 1 676 225 306 71 43 chr15 12005888 12006028 -91488946 - LTR40a LTR ERVL -91 428 285 1 676 320 308 124 110 chr15 12008995 12009367 -91485607 + LTR16C LTR ERVL 105 481 -8 2 676 731 296 115 16 chr15 12010496 12010818 -91484156 + MER34A1 LTR ERV1 209 562 -25 2 676 401 354 49 137 chr15 12010885 12011229 -91483745 - MLT1J LTR MaLR -197 315 2 2 676 1050 266 63 123 chr15 12012040 12012469 -91482505 + MLT2D LTR ERVL 1 403 -11 2 676 942 186 57 26 chr15 12016641 12016868 -91478106 - RLTR31_Mm LTR ERVK -216 345 112 4 676 341 234 101 48 chr15 12020591 12020734 -91474240 - MLT2B2 LTR ERVL -197 357 202 5 676 1997 157 71 11 chr15 12020987 12021354 -91473620 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 6 5 676 2418 93 6 0 chr15 12024367 12024690 -91470284 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 6 676 1179 292 71 25 chr15 12027395 12027763 -91467211 - MER21B LTR ERV1 -32 831 447 7 676 1327 186 82 73 chr15 12027966 12028062 -91466912 - ORR1D1 LTR MaLR -28 346 248 7 676 1327 186 82 73 chr15 12029131 12029142 -91465832 - ORR1D1 LTR MaLR -134 240 236 7 676 1327 186 82 73 chr15 12029567 12029778 -91465196 - ORR1D1 LTR MaLR -139 235 11 7 676 870 251 76 65 chr15 12031174 12031528 -91463446 - ORR1E LTR MaLR -1 358 1 8 676 299 313 60 0 chr15 12034175 12034256 -91460718 - MLT1A1 LTR MaLR -188 220 135 9 676 404 331 50 102 chr15 12034256 12034639 -91460335 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 6 9 676 333 339 48 12 chr15 12037518 12037685 -91457289 + ERVL-E-int LTR ERVL 3101 3273 -2394 1 676 298 257 50 50 chr15 12038052 12038171 -91456803 - ORR1E LTR MaLR -240 119 1 1 676 2952 129 5 5 chr15 12038711 12039147 -91455827 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 676 250 238 333 0 chr15 12039855 12039960 -91455014 + MLT1D LTR MaLR 75 214 -291 1 676 1084 246 136 37 chr15 12042851 12043226 -91451748 - MTD LTR MaLR -4 415 4 1 677 469 179 0 102 chr15 12099385 12099401 -91395573 + MT2B LTR ERVL 153 156 -445 2 677 996 189 221 66 chr15 12103620 12103830 -91391144 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 153 2 677 2091 103 44 13 chr15 12103830 12104145 -91390829 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 2 677 996 189 221 66 chr15 12104145 12104250 -91390724 - ORR1D1 LTR MaLR -222 152 6 2 677 3835 207 67 28 chr15 12104250 12104975 -91389999 - ORR1D1-int LTR MaLR -3 1367 625 2 677 3835 203 137 19 chr15 12105236 12105782 -91389192 - ORR1D1-int LTR MaLR -746 624 3 2 677 1388 212 128 0 chr15 12105790 12106111 -91388863 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 1 2 677 394 230 19 48 chr15 12108491 12108596 -91386378 - MT2B LTR ERVL -323 278 177 2 677 1512 120 111 76 chr15 12115456 12115852 -91379122 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 677 355 202 89 0 chr15 12115936 12116015 -91378959 - RLTR40 LTR ERVK -731 86 1 2 677 1117 203 90 84 chr15 12117574 12117896 -91377078 + ORR1C1 LTR MaLR 3 326 -52 3 677 1880 149 46 49 chr15 12118058 12118426 -91376548 - RLTR14 LTR ERV1 -15 367 1 3 677 1109 266 117 53 chr15 12123220 12123656 -91371318 - RLTR12B LTR ERVK -18 510 47 3 677 737 310 149 50 chr15 12132083 12132565 -91362409 - MT2A LTR ERVL -1 532 3 3 677 453 273 80 70 chr15 12132978 12133113 -91361861 - MLT1A0 LTR MaLR -18 347 210 3 677 453 273 80 70 chr15 12133293 12133370 -91361604 - MLT1A0 LTR MaLR -156 209 133 3 677 485 166 309 0 chr15 12139317 12139492 -91355482 + MTD LTR MaLR 180 408 -11 3 677 2280 153 71 2 chr15 12151574 12151968 -91343006 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 677 250 283 113 21 chr15 12155879 12156020 -91338954 + ORR1D1 LTR MaLR 87 240 -134 4 677 495 171 41 46 chr15 12165400 12165596 -91329378 + RMER17C LTR ERVK 80 274 -136 4 677 2886 34 112 0 chr15 12166291 12166647 -91328327 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 677 2518 135 52 2 chr15 12168243 12168644 -91326330 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 677 1504 215 97 6 chr15 12175190 12175541 -91319433 - MT2A LTR ERVL -150 383 1 4 677 2493 229 97 63 chr15 12178824 12179695 -91315279 - RMER19B LTR ERVK -13 889 48 4 677 410 313 30 7 chr15 12179674 12179809 -91315165 - RMER19B LTR ERVK -552 185 48 4 677 424 298 23 8 chr15 12179793 12179925 -91315049 - RMER19B LTR ERVK -557 180 47 4 677 387 202 60 0 chr15 12179895 12179979 -91314995 - RMER19B LTR ERVK -765 137 49 4 677 633 226 52 0 chr15 12180008 12180224 -91314750 - RMER19B LTR ERVK -407 204 1 4 677 310 173 25 74 chr15 12188853 12188934 -91306040 - RLTR25B LTR ERVK -505 523 447 4 84 3569 25 0 0 chr15 12189664 12190060 -91304914 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 678 806 266 110 8 chr15 12203550 12203804 -91291170 + MTEa LTR MaLR 44 323 -56 5 678 595 256 118 27 chr15 12207887 12208108 -91286866 - RMER15 LTR ERVL -58 517 277 5 678 285 196 41 103 chr15 12208399 12208496 -91286478 - RMER15 LTR ERVL -406 169 79 5 678 311 228 61 61 chr15 12208896 12208994 -91285980 - RMER15 LTR ERVL -475 100 3 5 678 452 289 68 77 chr15 12209050 12209271 -91285703 - MTEa LTR MaLR -159 220 2 5 678 2494 107 102 5 chr15 12209389 12209773 -91285201 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 678 401 344 79 12 chr15 12209848 12209993 -91284981 - LTR16C LTR ERVL 0 489 333 5 678 401 344 79 12 chr15 12210165 12210178 -91284796 - LTR16C LTR ERVL -157 332 320 5 678 1870 162 54 17 chr15 12214028 12214379 -91280595 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 3 5 678 2321 106 19 3 chr15 12216703 12217025 -91277949 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 678 433 290 64 47 chr15 12218553 12218840 -91276134 + RLTR12B LTR ERVK 232 507 -20 5 678 2248 154 31 20 chr15 12221501 12221891 -91273083 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 678 3488 30 2 0 chr15 12222098 12222493 -91272481 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 678 1761 208 23 25 chr15 12226897 12227292 -91267682 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 678 2099 142 47 3 chr15 12227969 12228328 -91266646 + RLTR14 LTR ERV1 7 381 -1 5 678 439 250 108 13 chr15 12229545 12229703 -91265271 - MER54A LTR ERVL -683 218 46 5 678 280 267 46 28 chr15 12230004 12230112 -91264862 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 799 908 -14 5 678 1253 199 44 137 chr15 12231034 12231050 -91263924 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 364 6 678 3338 28 5 18 chr15 12231050 12231451 -91263523 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 678 1253 199 44 137 chr15 12231451 12231823 -91263151 - ORR1D1 LTR MaLR -11 363 23 6 678 1253 199 44 137 chr15 12231852 12231870 -91263104 - ORR1D1 LTR MaLR -352 22 5 6 678 752 177 28 22 chr15 12233204 12233383 -91261591 - RMER10A LTR ERVL 0 442 263 6 678 273 143 0 0 chr15 12233382 12233424 -91261550 - RMER10A LTR ERVL -400 42 1 6 678 401 353 85 0 chr15 12235607 12235831 -91259143 - MLT1G1 LTR MaLR -256 323 81 6 678 294 287 32 0 chr15 12237462 12237556 -91257418 - MTE2b LTR MaLR -282 97 1 6 678 2116 138 0 0 chr15 12238865 12239199 -91255775 + MTC LTR MaLR 88 421 0 6 678 256 353 0 47 chr15 12240355 12240462 -91254512 + MLT1H1 LTR MaLR 50 151 -404 6 678 931 142 44 86 chr15 12240985 12241372 -91253602 - RMER10A LTR ERVL -13 429 1 6 678 273 301 115 0 chr15 12241469 12241582 -91253392 + MLT1F2 LTR MaLR 1 126 -434 6 678 3378 43 2 2 chr15 12247349 12247745 -91247229 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 678 642 238 140 81 chr15 12254043 12254437 -91240537 + RMER10A LTR ERVL 1 417 -25 6 678 1570 195 118 16 chr15 12259531 12259911 -91235063 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 679 235 248 134 62 chr15 12323288 12323400 -91171574 - MT2B LTR ERVL -348 253 134 8 679 802 297 73 84 chr15 12330449 12330820 -91164154 - MTE2a LTR MaLR 0 379 13 8 679 267 252 0 154 chr15 12334849 12334985 -91159989 + MT2B LTR ERVL 150 264 -337 8 679 2421 156 197 10 chr15 12335439 12335932 -91159042 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 8 679 3208 44 29 0 chr15 12339468 12339853 -91155121 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 679 1042 219 117 120 chr15 12342775 12343133 -91151841 - MTE2a LTR MaLR -19 360 4 8 679 2214 98 69 0 chr15 12352753 12353059 -91141915 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 679 2602 169 6 30 chr15 12355840 12356005 -91138969 - RMER6B LTR ERVK -2 459 295 8 679 2602 169 6 30 chr15 12356028 12356331 -91138643 - RMER6B LTR ERVK -167 294 3 8 679 1009 228 115 36 chr15 12368441 12368786 -91126188 - MTD LTR MaLR -31 388 1 8 679 396 161 10 121 chr15 12370357 12370456 -91124518 - MT2B LTR ERVL -361 240 153 8 679 263 362 79 43 chr15 12371666 12371969 -91123005 + ORR1D1 LTR MaLR 53 366 -8 8 679 246 291 92 11 chr15 12373075 12373162 -91121812 - MamGypLTR1a LTR Gypsy -57 725 632 8 679 521 359 45 71 chr15 12373324 12373681 -91121293 - MamGypLTR1a LTR Gypsy -404 380 42 8 679 2557 83 6 0 chr15 12383423 12383748 -91111226 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 679 365 180 17 152 chr15 12386039 12386157 -91108817 - MT2B LTR ERVL -344 257 156 9 679 262 290 39 29 chr15 12391302 12391405 -91103569 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 304 9 679 308 293 42 33 chr15 12393938 12394058 -91100916 + LTR40b LTR ERVL 331 451 -11 9 679 1066 249 151 13 chr15 12409112 12409417 -91085557 + ORR1D2 LTR MaLR 24 370 0 9 679 2001 121 52 42 chr15 12410301 12410707 -91084267 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 9 679 1839 187 71 16 chr15 12411611 12411992 -91082982 + MTD LTR MaLR 18 419 0 9 679 1682 149 109 55 chr15 12414738 12415086 -91079888 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 9 679 378 299 96 92 chr15 12415982 12416471 -91078503 + MLT2B5 LTR ERVL 6 515 0 9 679 2182 165 64 10 chr15 12417368 12417760 -91077214 - MTC LTR MaLR -8 413 1 9 679 3582 20 2 0 chr15 12426448 12426843 -91068131 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 679 782 146 2 41 chr15 12438125 12438284 -91056690 + ORR1B1 LTR MaLR 1 135 -259 1 679 284 355 167 15 chr15 12440143 12440406 -91054568 + MLT1A LTR MaLR 47 349 -25 1 679 908 255 83 89 chr15 12442262 12442623 -91052351 - MTE2a LTR MaLR -14 365 7 1 680 2063 186 48 13 chr15 12451908 12452300 -91042674 + MTD LTR MaLR 1 406 -13 1 680 754 255 47 14 chr15 12453250 12453461 -91041513 - RMER15 LTR ERVL -12 563 346 1 680 1404 157 137 4 chr15 12453916 12454178 -91040796 + ORR1B2 LTR MaLR 63 359 -8 1 680 2442 138 74 35 chr15 12456528 12456985 -91037989 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 680 355 118 0 0 chr15 12456987 12457038 -91037936 + IAPEz-int LTR ERVK 3 53 -1934 1 680 3099 54 7 19 chr15 12457038 12457697 -91037277 + IAPEz-int LTR ERVK 17 591 -5890 1 680 450 82 0 32 chr15 12457729 12457792 -91037182 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 1 680 1886 107 4 4 chr15 12457781 12458043 -91036931 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 1 680 948 80 24 0 chr15 12458038 12458163 -91036811 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 1 680 27391 8 1 0 chr15 12458163 12461117 -91033857 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 1 680 2453 136 74 35 chr15 12461117 12461574 -91033400 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 680 441 286 95 31 chr15 12463437 12463750 -91031224 + MTEb LTR MaLR 18 363 -7 1 680 311 327 0 0 chr15 12464431 12464535 -91030439 + MLT2C2 LTR ERVL 1 104 -360 1 680 483 340 104 30 chr15 12464691 12464988 -91029986 + MLT2C2 LTR ERVL 97 415 -49 1 680 308 328 26 61 chr15 12470742 12470823 -91024151 + MT2B LTR ERVL 97 165 -419 1 680 431 333 93 58 chr15 12470987 12471422 -91023552 - LTR33 LTR ERVL 0 515 20 1 680 256 247 37 93 chr15 12478163 12478270 -91016704 + MT2B2 LTR ERVL 162 262 -322 1 680 324 279 94 141 chr15 12496749 12497311 -90997663 - MLT2F LTR ERVL -3 660 125 1 680 312 309 163 109 chr15 12500174 12500450 -90994524 - ORR1E LTR MaLR -7 352 62 2 680 3563 15 5 0 chr15 12501959 12502353 -90992621 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 680 481 31 0 0 chr15 12502353 12502417 -90992557 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1035 8 680 861 10 0 0 chr15 12502416 12502513 -90992461 + MTA_Mm LTR MaLR 300 396 0 9 680 511 298 73 86 chr15 12508047 12508124 -90986850 - MLT1E3 LTR MaLR -8 616 549 2 680 511 298 73 86 chr15 12508302 12508525 -90986449 - MLT1E3 LTR MaLR -76 548 320 2 680 1344 259 140 10 chr15 12518688 12519101 -90975873 - MLT1C LTR MaLR 0 467 1 4 680 245 325 0 25 chr15 12519703 12519782 -90975192 + MLT1A0 LTR MaLR 3 79 -286 4 680 1182 297 215 8 chr15 12520726 12521218 -90973756 + MER77 LTR ERVL 6 599 -8 4 680 4388 121 29 28 chr15 12530631 12531381 -90963593 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 6 680 1835 221 63 10 chr15 12533146 12533543 -90961431 - MTD LTR MaLR 0 419 2 7 680 247 296 71 44 chr15 12536803 12536916 -90958058 + MLT1A1 LTR MaLR 290 405 -3 7 680 471 247 167 83 chr15 12538780 12539032 -90955942 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 97 7 680 316 250 0 29 chr15 12539141 12539211 -90955763 - ORR1D2 LTR MaLR -306 68 1 7 680 671 280 171 40 chr15 12553662 12553951 -90941023 - MTE2b LTR MaLR -3 376 43 1 680 1390 168 116 174 chr15 12553951 12554348 -90940626 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 680 671 288 103 51 chr15 12554348 12554394 -90940580 - MTE2b LTR MaLR -337 42 1 1 680 240 331 38 38 chr15 12577910 12578042 -90916932 - RMER12 LTR ERVK -460 862 731 1 680 677 309 62 90 chr15 12579130 12579486 -90915488 + ORR1E LTR MaLR 3 348 -11 1 680 630 262 291 10 chr15 12582537 12582826 -90912148 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 681 640 219 124 6 chr15 12583037 12583198 -90911776 + MTEb LTR MaLR 1 180 -199 1 681 277 233 0 2 chr15 12583427 12583491 -90911483 + MTEb LTR MaLR 162 224 -155 1 681 1689 198 38 20 chr15 12583493 12583838 -90911136 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 24 1 681 304 209 193 11 chr15 12583847 12583947 -90911027 + MTEb LTR MaLR 209 383 -36 1 681 554 262 74 18 chr15 12585739 12585902 -90909072 - MTEb LTR MaLR 0 379 208 1 681 294 329 186 6 chr15 12585980 12586136 -90908838 - MLT1K LTR MaLR -209 386 203 1 681 4501 12 0 2 chr15 12586580 12587074 -90907900 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 681 390 311 168 36 chr15 12594180 12594216 -90900758 + MLT1N2 LTR MaLR 13 48 -514 1 681 2336 58 40 95 chr15 12594216 12594562 -90900412 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 681 390 311 168 36 chr15 12594562 12594775 -90900199 + MLT1N2 LTR MaLR 49 295 -267 1 681 278 312 20 40 chr15 12595318 12595418 -90899556 - MTE2a LTR MaLR -4 375 278 1 681 988 251 64 38 chr15 12595561 12595821 -90899153 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 104 1 681 1703 121 78 35 chr15 12595821 12596186 -90898788 + ORR1A2 LTR MaLR 1 346 0 1 681 490 244 88 95 chr15 12597090 12597314 -90897660 + MLT1B LTR MaLR 148 353 -37 1 681 411 308 99 48 chr15 12599768 12600161 -90894813 + MER74B LTR ERVL 94 619 -3 1 681 2178 122 25 0 chr15 12601691 12602010 -90892964 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 681 1805 189 70 17 chr15 12602807 12602996 -90891978 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 167 1 681 1805 189 70 17 chr15 12603058 12603223 -90891751 - ORR1D1 LTR MaLR -208 166 2 1 681 543 333 49 29 chr15 12603301 12603727 -90891247 + MLT1H1 LTR MaLR 10 500 -55 1 681 1079 158 256 89 chr15 12605523 12605836 -90889138 + ORR1B2 LTR MaLR 1 365 -2 1 681 286 308 89 89 chr15 12607740 12607943 -90887031 - MT2B LTR ERVL -312 289 87 1 681 268 28 0 77 chr15 12609812 12609851 -90885123 - MTB_Mm LTR MaLR -371 36 1 2 681 2257 132 38 150 chr15 12611226 12611700 -90883274 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 681 1863 156 172 70 chr15 12614048 12614461 -90880513 - RMER15 LTR ERVL 0 575 121 2 681 1098 210 109 14 chr15 12614498 12614875 -90880099 + RMER15-int LTR ERVL 4496 4908 -91 2 681 2697 174 13 114 chr15 12614964 12615569 -90879405 + RMER15 LTR ERVL 32 575 0 2 681 1340 243 32 26 chr15 12617072 12617415 -90877559 + MTE2b LTR MaLR 29 373 -6 2 681 1966 172 57 0 chr15 12618807 12619161 -90875813 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 681 470 326 50 18 chr15 12621125 12621347 -90873627 + MLT1D LTR MaLR 8 236 -269 2 681 1904 127 180 0 chr15 12623760 12624083 -90870891 + ORR1B1 LTR MaLR 14 394 0 2 681 450 285 217 6 chr15 12624210 12624376 -90870598 + MLT1A LTR MaLR 173 373 -1 2 681 412 289 56 37 chr15 12624376 12624531 -90870443 + MLT1A-int LTR MaLR 12 169 -1202 2 681 1393 181 128 12 chr15 12624541 12624571 -90870403 + ORR1D1 LTR MaLR 1 30 -344 2 681 1393 181 128 12 chr15 12624618 12624810 -90870164 + ORR1D1 LTR MaLR 31 248 -126 2 681 3450 35 2 0 chr15 12624810 12625205 -90869769 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 681 1393 181 128 12 chr15 12625205 12625316 -90869658 + ORR1D1 LTR MaLR 249 372 -2 2 681 437 158 0 43 chr15 12625507 12625594 -90869380 + MT2A LTR ERVL 1 74 -510 2 681 1296 224 99 14 chr15 12625735 12626029 -90868945 + MT2A LTR ERVL 68 386 -147 2 681 253 323 35 83 chr15 12630775 12630920 -90864054 + MLT1A0 LTR MaLR 1 138 -227 2 681 248 230 53 26 chr15 12631112 12631188 -90863786 + MLT1A0 LTR MaLR 318 395 -13 2 681 4254 166 65 52 chr15 12632154 12633090 -90861884 - RMER17B LTR ERVK -6 952 5 2 681 382 186 86 20 chr15 12633962 12634079 -90860895 + MTC LTR MaLR 257 377 -44 2 681 2152 222 0 12 chr15 12634374 12634798 -90860176 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 681 438 271 7 72 chr15 12636260 12636399 -90858575 + RMER10B LTR ERVL 269 398 0 2 681 739 304 79 55 chr15 12637240 12637570 -90857404 - MLT1A LTR MaLR -3 371 34 2 681 1185 174 190 50 chr15 12639262 12639424 -90855550 + ORR1D1 LTR MaLR 8 165 -209 2 681 1185 174 190 50 chr15 12639475 12639633 -90855341 + ORR1D1 LTR MaLR 166 372 -2 2 681 1838 150 96 28 chr15 12645115 12645471 -90849503 + ORR1B1 LTR MaLR 1 380 -14 2 681 260 210 98 12 chr15 12645730 12645812 -90849162 + MLT1J LTR MaLR 71 159 -353 2 681 535 318 96 38 chr15 12647626 12647940 -90847034 + MLT1A0 LTR MaLR 30 361 -4 2 681 238 277 107 81 chr15 12655254 12655333 -90839641 + MT2B2 LTR ERVL 89 171 -413 3 681 722 299 13 71 chr15 12660379 12660617 -90834357 + MT2A LTR ERVL 234 457 -76 3 681 528 279 69 17 chr15 12660735 12660910 -90834064 + MLT1C LTR MaLR 270 453 -14 3 681 2283 113 163 0 chr15 12672428 12672783 -90822191 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 681 1902 151 41 106 chr15 12675282 12675697 -90819277 + RMER10B LTR ERVL 11 398 0 3 681 1606 221 58 14 chr15 12675909 12676272 -90818702 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 3 681 551 125 44 43 chr15 12677071 12677205 -90817769 + ORR1A4 LTR MaLR 1 156 -238 3 681 2089 106 53 0 chr15 12677202 12677505 -90817469 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 681 262 254 0 45 chr15 12677506 12677572 -90817402 + ORR1A4 LTR MaLR 146 208 -186 3 681 1157 185 229 23 chr15 12680829 12681139 -90813835 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 681 397 344 106 91 chr15 12681948 12682236 -90812738 + LTR33 LTR ERVL 16 291 -224 3 681 397 344 106 91 chr15 12682538 12682742 -90812232 + LTR33 LTR ERVL 292 514 -1 3 681 1260 192 5 0 chr15 12684033 12684252 -90810722 + MTC LTR MaLR 3 222 -199 3 681 1418 161 19 59 chr15 12684333 12684603 -90810371 + MTC LTR MaLR 145 403 -18 3 681 1511 224 107 66 chr15 12687247 12687306 -90807668 - MTD LTR MaLR -9 410 352 3 681 1511 224 107 66 chr15 12687333 12687665 -90807309 - MTD LTR MaLR -68 351 5 3 681 621 318 142 79 chr15 12688523 12688841 -90806133 + LTR16A LTR ERVL 94 431 -20 3 681 1769 114 70 27 chr15 12695688 12695986 -90798988 + MTC LTR MaLR 2 312 -109 3 681 1066 218 124 124 chr15 12702835 12703213 -90791761 - MTE2a LTR MaLR 0 379 2 4 681 340 332 96 39 chr15 12704478 12704792 -90790182 + LTR33 LTR ERVL 85 413 -102 4 681 2140 200 103 31 chr15 12705521 12706033 -90788941 + RMER15 LTR ERVL 27 575 0 4 681 1000 313 69 61 chr15 12706033 12706523 -90788451 + RMER15-int LTR ERVL 1 494 -4505 4 681 2070 125 73 9 chr15 12706593 12706923 -90788051 + ORR1B2 LTR MaLR 9 359 -8 4 681 307 262 8 47 chr15 12706936 12707064 -90787910 + RMER15-int LTR ERVL 665 787 -4212 4 681 687 344 18 33 chr15 12707110 12707441 -90787533 + RMER15-int LTR ERVL 1284 1609 -3390 4 681 1510 172 18 21 chr15 12707773 12708053 -90786921 - MTC LTR MaLR -142 279 1 4 681 1285 284 11 17 chr15 12708225 12708576 -90786398 + RMER15-int LTR ERVL 2090 2438 -2561 4 681 1469 318 64 22 chr15 12708610 12709202 -90785772 + RMER15-int LTR ERVL 4163 4779 -220 4 681 440 350 131 20 chr15 12712860 12713359 -90781615 - MLT1A-int LTR MaLR -85 1324 771 4 682 563 338 166 3 chr15 12714162 12714485 -90780489 - MLT1A-int LTR MaLR -729 680 305 4 682 512 330 63 107 chr15 12714524 12714907 -90780067 - MLT1A LTR MaLR -1 373 8 4 682 320 313 65 39 chr15 12714936 12715089 -90779885 - MLT1H2 LTR MaLR 0 489 333 4 682 1002 288 97 7 chr15 12715069 12715359 -90779615 - MTEa LTR MaLR -6 373 58 4 682 360 284 45 14 chr15 12715387 12715530 -90779444 - MLT1H2 LTR MaLR -256 323 128 4 682 231 228 70 0 chr15 12715992 12716049 -90778925 + MER34 LTR ERV1 385 445 -97 4 682 232 296 26 53 chr15 12716052 12716166 -90778808 - MLT1H LTR MaLR 0 408 298 4 682 302 254 73 17 chr15 12716365 12716475 -90778499 - MLT1H LTR MaLR -255 110 5 4 682 231 326 73 29 chr15 12716581 12716717 -90778257 - MLT1H-int LTR MaLR -1183 226 85 4 682 483 314 178 40 chr15 12717055 12717403 -90777571 - MLT1H LTR MaLR -31 518 123 4 682 2212 123 3 0 chr15 12720284 12720610 -90774364 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 682 333 291 59 8 chr15 12721934 12722052 -90772922 - LTR48 LTR ERV1 -85 702 579 4 682 866 192 108 67 chr15 12725567 12725968 -90769006 - LTR48B LTR ERV1 -183 604 1 4 682 487 283 28 48 chr15 12725968 12726113 -90768861 - MLT1D LTR MaLR -18 487 346 4 682 719 95 69 0 chr15 12728864 12728980 -90765994 - ORR1D1 LTR MaLR -250 124 1 4 682 1114 184 88 40 chr15 12728980 12729207 -90765767 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1133 4 682 2152 202 50 13 chr15 12729116 12729573 -90765401 + ORR1D-int LTR MaLR 591 1064 -306 4 682 4867 142 46 38 chr15 12731658 12732607 -90762367 - RMER17B LTR ERVK -1 957 1 4 682 2872 46 0 23 chr15 12735629 12735983 -90758991 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 682 789 270 148 52 chr15 12736604 12737062 -90757912 + RMER20B LTR ERVK 90 591 -36 5 682 757 348 85 7 chr15 12741371 12741678 -90753296 - MLT1D LTR MaLR -157 348 18 5 682 429 134 30 0 chr15 12744111 12744178 -90750796 + MTC LTR MaLR 1 69 -352 5 682 929 129 109 23 chr15 12744175 12744336 -90750638 + MTC LTR MaLR 209 384 -37 5 682 2269 196 132 84 chr15 12744336 12745137 -90749837 + MTC-int LTR MaLR 4 885 -213 5 682 229 275 45 101 chr15 12748188 12748277 -90746697 + MLT1J LTR MaLR 81 164 -348 5 682 2931 71 2 22 chr15 12752448 12752852 -90742122 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 682 226 179 118 15 chr15 12752882 12752950 -90742024 + ORR1C2 LTR MaLR 1 75 -309 5 682 393 250 30 40 chr15 12752944 12753044 -90741930 - MTE2a LTR MaLR -276 103 5 5 682 327 229 3 57 chr15 12757396 12757498 -90737476 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 601 486 5 682 1348 111 0 46 chr15 12757498 12757716 -90737258 + ORR1A2 LTR MaLR 1 208 -119 5 682 1147 105 19 0 chr15 12757716 12757878 -90737096 - MERVL_2A-int LTR ERVL -529 5232 5068 5 682 622 146 122 128 chr15 12757880 12758076 -90736898 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 338 5 682 642 231 59 159 chr15 12758095 12758376 -90736598 + MT2A LTR ERVL 2 253 -280 5 682 1285 97 40 6 chr15 12758376 12758576 -90736398 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 533 305 5 682 319 322 0 22 chr15 12758630 12758722 -90736252 + MT2B LTR ERVL 168 257 -344 5 682 295 294 74 25 chr15 12759058 12759180 -90735794 - MLT1A LTR MaLR -114 260 133 5 682 808 179 137 173 chr15 12759199 12759470 -90735504 - ORR1D1 LTR MaLR -111 263 3 5 682 3034 29 0 0 chr15 12759968 12760313 -90734661 - ORR1A0 LTR MaLR -1 345 1 5 682 14518 49 2 1 chr15 12760313 12762104 -90732870 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 5 682 3099 17 3 0 chr15 12762104 12762449 -90732525 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 682 469 265 108 30 chr15 12765199 12765366 -90729608 - MTD LTR MaLR -21 398 219 5 682 1340 160 255 20 chr15 12770934 12771228 -90723746 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 5 682 853 262 43 129 chr15 12772487 12772881 -90722093 - ORR1D2 LTR MaLR -10 360 1 5 682 514 290 82 15 chr15 12774618 12774870 -90720104 - MLT1D LTR MaLR -8 619 325 5 682 297 123 73 110 chr15 12778618 12778700 -90716274 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 431 5 682 461 373 46 19 chr15 12783721 12784087 -90710887 - ERVL-E-int LTR ERVL -2580 3087 2712 6 682 632 325 112 20 chr15 12786439 12786788 -90708186 + LTR69 LTR ERVL 202 582 -6 6 682 257 205 0 170 chr15 12794441 12794541 -90700433 + MT2B LTR ERVL 158 240 -361 6 682 825 247 92 97 chr15 12806973 12807354 -90687620 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 682 3273 166 65 23 chr15 12816604 12817268 -90677706 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 6 682 1983 98 9 28 chr15 12821979 12822205 -90672769 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 97 6 682 1983 98 9 28 chr15 12822788 12822885 -90672089 - ORR1A3 LTR MaLR -230 96 1 6 682 730 284 127 13 chr15 12822971 12823271 -90671703 + ORR1E LTR MaLR 1 334 -25 6 682 789 313 99 28 chr15 12823794 12824149 -90670825 - MTD LTR MaLR -32 387 8 6 682 609 208 353 4 chr15 12827606 12827872 -90667102 - ORR1D1 LTR MaLR -14 360 2 6 682 1929 133 77 25 chr15 12830083 12830446 -90664528 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 6 683 3550 18 2 0 chr15 12862036 12862431 -90632543 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 683 9117 41 4 1 chr15 12862431 12863526 -90631448 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 683 3550 18 2 0 chr15 12863526 12863921 -90631053 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 683 2166 116 9 26 chr15 12867115 12867482 -90627492 - ORR1A2 LTR MaLR -2 368 1 6 683 3075 68 5 2 chr15 12868151 12868550 -90626424 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 683 8016 76 25 7 chr15 12868550 12869628 -90625346 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 7 683 2896 59 5 0 chr15 12869632 12870022 -90624952 - MTB LTR MaLR -8 392 1 7 683 480 117 10 87 chr15 12880242 12880345 -90614629 + ORR1B1 LTR MaLR 37 131 -263 7 683 843 119 66 62 chr15 12880313 12880507 -90614467 + RLTR25B LTR ERVK 11 217 -886 7 683 1082 197 29 106 chr15 12880505 12880778 -90614196 + ORR1B1 LTR MaLR 142 393 -1 7 683 273 217 68 107 chr15 12883084 12883187 -90611787 - ORR1E LTR MaLR -2 377 279 7 683 4857 150 110 11 chr15 12883290 12884225 -90610749 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 7 683 306 403 14 7 chr15 12884225 12884362 -90610612 - ORR1E LTR MaLR -218 141 4 7 683 387 292 0 16 chr15 12884611 12884733 -90610241 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 289 7 683 1121 214 109 30 chr15 12885814 12885972 -90609002 - ORR1C2 LTR MaLR -30 344 184 7 683 1121 181 113 12 chr15 12886119 12886287 -90608687 - ORR1C2 LTR MaLR -194 190 1 7 683 1764 170 32 27 chr15 12886763 12887101 -90607873 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 35 7 683 5029 185 79 103 chr15 12887271 12887439 -90607535 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1186 7 683 5029 185 79 103 chr15 12887460 12888297 -90606677 - ORR1D1-int LTR MaLR -185 1185 351 7 683 4782 186 82 102 chr15 12888826 12889222 -90605752 - ORR1D1-int LTR MaLR -1020 350 2 7 683 1622 187 59 3 chr15 12889222 12889576 -90605398 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 683 3357 132 101 22 chr15 12890964 12891187 -90603787 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 454 7 683 4503 101 5 5 chr15 12891187 12891815 -90603159 - RLTR5_Mm LTR ERV1 0 628 1 7 683 3357 132 101 22 chr15 12891815 12892232 -90602742 - RLTR17 LTR ERVK -239 453 1 7 683 226 256 30 91 chr15 12897547 12897646 -90597328 + MLT1A0 LTR MaLR 1 93 -272 7 683 700 204 314 48 chr15 12897837 12898044 -90596930 + MTC LTR MaLR 5 266 -155 7 683 899 181 0 6 chr15 12898094 12898266 -90596708 + MTC LTR MaLR 243 413 -8 7 683 263 305 54 47 chr15 12898309 12898457 -90596517 + MLT1J-int LTR MaLR 1208 1356 -31 7 683 262 291 116 29 chr15 12902552 12902690 -90592284 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 773 922 0 7 683 278 288 70 31 chr15 12904980 12905109 -90589865 + LTR85c LTR Gypsy? 16 149 -674 7 683 578 300 56 53 chr15 12906058 12906378 -90588596 + ORR1E LTR MaLR 19 339 -20 7 683 438 206 228 0 chr15 12906403 12906539 -90588435 + ORR1E-int LTR MaLR 3 169 -1411 7 683 1006 318 35 32 chr15 12906506 12906888 -90588086 + ORR1E-int LTR MaLR 1145 1527 -53 7 683 451 250 0 0 chr15 12906888 12906980 -90587994 + ORR1E LTR MaLR 1 92 -267 7 683 2107 148 8 11 chr15 12907003 12907358 -90587616 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 7 683 341 243 112 0 chr15 12907795 12907902 -90587072 + MLT1E3 LTR MaLR 1 119 -255 7 683 386 282 98 114 chr15 12908725 12909214 -90585760 + MLT1E3 LTR MaLR 122 602 -22 7 683 291 250 0 0 chr15 12911175 12911243 -90583731 - RMER15 LTR ERVL -105 470 403 7 683 1179 262 96 0 chr15 12912482 12912826 -90582148 + MTE2a LTR MaLR 2 378 -1 7 683 1303 188 176 178 chr15 12913012 12913320 -90581654 - MT2B LTR ERVL 0 601 353 7 683 1303 188 176 178 chr15 12913346 12913639 -90581335 - MT2B LTR ERVL -249 352 1 7 683 1532 235 34 0 chr15 12914361 12914719 -90580255 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 683 361 286 142 14 chr15 12915287 12915473 -90579501 - MLT1B LTR MaLR -1 373 175 7 683 2282 142 59 3 chr15 12915473 12915846 -90579128 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 683 361 320 94 20 chr15 12915846 12915971 -90579003 - MLT1B LTR MaLR -216 174 30 7 683 918 236 58 154 chr15 12916110 12916525 -90578449 - MTE2a LTR MaLR -4 375 1 7 683 629 227 177 6 chr15 12919441 12919605 -90575369 - MTC LTR MaLR -8 413 222 7 683 443 194 0 11 chr15 12919613 12919707 -90575267 + MTD LTR MaLR 322 414 -5 7 683 511 192 173 39 chr15 12919712 12919891 -90575083 + MTD-int LTR MaLR 1 203 -1055 7 683 2307 214 73 36 chr15 12920398 12921013 -90573961 + MTD-int LTR MaLR 302 939 -319 7 683 1306 72 5 2 chr15 12923673 12923873 -90571101 - ORR1A3 LTR MaLR 0 346 144 7 683 1665 148 67 78 chr15 12925899 12926257 -90568717 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 7 683 594 193 148 192 chr15 12926433 12926748 -90568226 + MTE2a LTR MaLR 2 316 -63 7 683 594 193 148 192 chr15 12926939 12927014 -90567960 + MTE2a LTR MaLR 317 375 -4 7 683 1356 204 87 6 chr15 12927424 12927770 -90567204 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 683 1385 175 4 11 chr15 12936410 12936681 -90558293 - MTC LTR MaLR -1 420 152 8 683 2194 151 62 5 chr15 12936898 12937271 -90557703 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 8 683 1673 169 51 28 chr15 12940912 12941265 -90553709 + ORR1C1 LTR MaLR 10 370 -8 8 683 2584 197 65 22 chr15 12942633 12943184 -90551790 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 8 683 2028 165 114 64 chr15 12943611 12944110 -90550864 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 8 683 677 130 28 9 chr15 12946005 12946114 -90548860 + RMER6C LTR ERVK 1 111 -579 8 683 242 258 45 15 chr15 12946100 12946167 -90548807 + MT2B LTR ERVL 183 251 -350 8 683 1380 180 123 10 chr15 12946141 12946449 -90548525 + RMER6C LTR ERVK 348 690 0 8 683 1515 160 196 13 chr15 12948066 12948382 -90546592 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 8 683 3853 231 52 55 chr15 12948382 12949700 -90545274 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1251 -258 8 683 2779 283 72 109 chr15 12949734 12949981 -90544993 + ORR1D1-int LTR MaLR 1252 1509 0 8 683 1308 224 139 3 chr15 12949987 12950310 -90544664 + ORR1D1 LTR MaLR 7 373 -1 8 683 1077 252 86 99 chr15 12951259 12951633 -90543341 - MTD LTR MaLR 0 419 51 8 683 2381 153 54 61 chr15 12953354 12953778 -90541196 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 683 392 267 47 9 chr15 12954086 12954192 -90540782 + RMER15 LTR ERVL 452 561 -14 8 683 354 339 46 46 chr15 12954354 12954549 -90540425 - ORR1E LTR MaLR -162 197 3 8 683 1183 245 83 34 chr15 12957257 12957582 -90537392 + ORR1D2 LTR MaLR 1 341 -29 8 683 244 300 43 22 chr15 12969579 12969671 -90525303 - MTEa LTR MaLR -8 371 278 8 684 240 244 9 182 chr15 12984821 12984931 -90510043 - MT2B LTR ERVL -356 245 155 8 684 3710 15 5 0 chr15 12985153 12985547 -90509427 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 684 573 333 110 43 chr15 12989216 12989589 -90505385 - MLT1I LTR MaLR -11 400 3 8 684 1179 243 233 3 chr15 12990267 12990606 -90504368 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 8 684 1315 228 141 27 chr15 12998811 12999145 -90495829 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 9 684 269 208 96 14 chr15 12999462 12999535 -90495439 - MTEa LTR MaLR -23 356 278 9 684 385 304 49 111 chr15 13003613 13003839 -90491135 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -5 1184 973 5 684 536 310 89 98 chr15 13005374 13005732 -90489242 + MLT1D LTR MaLR 1 355 -150 9 684 353 266 43 60 chr15 13006459 13006575 -90488399 + MLT1D LTR MaLR 382 495 -10 9 684 392 314 48 26 chr15 13012541 13012770 -90482204 + RMER15 LTR ERVL 327 560 -15 2 684 403 234 16 56 chr15 13015673 13015816 -90479158 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 226 3 684 288 321 70 40 chr15 13032326 13032527 -90462447 - LTR79 LTR ERVL -1 526 320 4 684 1000 258 79 13 chr15 13034828 13035013 -90459961 + MLT1A0 LTR MaLR 1 201 -164 4 684 1000 262 72 14 chr15 13035079 13035227 -90459747 + MLT1A0 LTR MaLR 202 457 -10 4 684 581 284 91 59 chr15 13051432 13051772 -90443202 + LTR88b LTR Gypsy? 2 352 -485 6 684 1093 185 52 9 chr15 13053851 13054064 -90440910 + ORR1C2 LTR MaLR 161 382 -2 6 684 1216 268 40 22 chr15 13062466 13062836 -90432138 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 7 684 237 288 0 0 chr15 13068027 13068086 -90426888 + MLT1D LTR MaLR 272 330 -175 8 684 749 250 57 57 chr15 13068692 13068972 -90426002 + MTE2a LTR MaLR 1 280 -99 8 684 504 196 88 0 chr15 13073193 13073295 -90421679 + MTC LTR MaLR 1 111 -310 9 684 1467 173 74 10 chr15 13073520 13073830 -90421144 + MTC LTR MaLR 90 419 -2 9 684 2465 89 3 9 chr15 13074542 13074871 -90420103 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 684 387 325 38 19 chr15 13077344 13077504 -90417470 - MLT2B4 LTR ERVL -390 166 4 9 684 280 320 0 10 chr15 13079363 13079461 -90415513 - RMER15 LTR ERVL -108 467 371 1 684 291 307 48 105 chr15 13080310 13080605 -90414369 - ORR1E LTR MaLR 0 359 82 1 685 785 243 119 35 chr15 13110120 13110216 -90384758 - RMER15 LTR ERVL -15 560 469 1 685 785 243 119 35 chr15 13110296 13110459 -90384515 - RMER15 LTR ERVL -107 468 280 1 685 2310 218 77 23 chr15 13115813 13116334 -90378640 - RMER15 LTR ERVL 0 575 27 1 685 340 203 0 0 chr15 13116464 13116523 -90378451 - RMER15 LTR ERVL -516 59 1 1 685 320 331 93 80 chr15 13132119 13132375 -90362599 - MT2A LTR ERVL -141 392 1 1 685 347 295 130 15 chr15 13132375 13132506 -90362468 - MTE2a LTR MaLR -233 146 1 1 685 2498 111 0 0 chr15 13132624 13132949 -90362025 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 1 685 275 301 12 24 chr15 13133014 13133099 -90361875 - MER34 LTR ERV1 -65 477 394 1 685 621 308 79 52 chr15 13139078 13139383 -90355591 - LTR40a LTR ERVL 0 519 207 1 685 272 297 222 14 chr15 13139533 13139745 -90355229 - MLT1A1 LTR MaLR -113 295 40 1 685 347 366 33 0 chr15 13139789 13139942 -90355032 - LTR40a LTR ERVL -355 164 7 1 685 619 287 187 57 chr15 13140015 13140433 -90354541 + MLT2B2 LTR ERVL 4 475 -40 1 685 3472 115 19 32 chr15 13142772 13143303 -90351671 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 1 685 1550 250 40 183 chr15 13151373 13152044 -90342930 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 2 685 1020 40 0 0 chr15 13159711 13159837 -90335137 + ORR1A1-int LTR MaLR 1172 1297 -495 2 685 2716 34 14 3 chr15 13159836 13160192 -90334782 - ORR1A1-int LTR MaLR -267 1525 1166 2 685 1280 257 40 122 chr15 13168861 13169313 -90325661 + MTD LTR MaLR 5 419 0 2 685 288 391 120 56 chr15 13178010 13178403 -90316571 + LTR78 LTR ERV1 469 886 -418 2 685 237 298 163 13 chr15 13178605 13178758 -90316216 + LTR78 LTR ERV1 1035 1210 -94 2 685 2962 156 106 42 chr15 13178804 13178894 -90316080 - RMER4B LTR ERVK 0 585 501 2 685 2962 156 106 42 chr15 13178983 13179442 -90315532 - RMER4B LTR ERVK -85 500 2 2 685 622 335 0 6 chr15 13185264 13185447 -90309527 + MLT1A LTR MaLR 192 373 -1 2 685 269 367 61 83 chr15 13188163 13188239 -90306735 + LTR88c LTR Genie? 44 267 -595 2 685 285 384 20 46 chr15 13188239 13188392 -90306582 + LTR88b LTR Gypsy? 109 257 -580 2 685 751 246 62 37 chr15 13190855 13191176 -90303798 + RLTR15 LTR ERVK 1 329 -30 2 685 804 283 96 77 chr15 13195531 13195895 -90299079 - MTEa LTR MaLR 0 379 9 2 685 540 331 57 85 chr15 13196005 13196358 -90298616 + MLT1A LTR MaLR 13 355 -19 2 685 234 250 21 0 chr15 13197503 13197551 -90297423 + RMER13B LTR ERVK 645 693 -215 2 685 454 294 102 43 chr15 13199873 13200166 -90294808 + ORR1E LTR MaLR 38 364 -15 2 685 1145 289 67 13 chr15 13200205 13200577 -90294397 + MTE-int LTR MaLR 49 440 -1140 3 685 301 237 137 21 chr15 13200614 13200709 -90294265 + MT2B LTR ERVL 152 257 -344 3 685 1937 332 98 40 chr15 13200866 13201907 -90293067 + MTE-int LTR MaLR 454 1554 -26 3 685 259 196 39 0 chr15 13202147 13202198 -90292776 + ORR1E LTR MaLR 327 379 0 2 685 510 352 92 17 chr15 13214192 13214432 -90280542 + MLT1I LTR MaLR 26 283 -128 3 685 464 328 103 31 chr15 13216609 13216870 -90278104 + MLT1A0 LTR MaLR 1 280 -85 3 685 1035 293 113 32 chr15 13217012 13217474 -90277500 + MLT1D LTR MaLR 3 501 -4 3 685 2078 184 39 16 chr15 13219743 13220174 -90274800 - RMER10A LTR ERVL -1 441 1 3 685 348 335 182 20 chr15 13221266 13221375 -90273599 - RMER15 LTR ERVL -14 561 421 3 685 348 335 182 20 chr15 13221412 13221549 -90273425 - RMER15 LTR ERVL -155 420 275 3 685 565 324 47 43 chr15 13221549 13221567 -90273407 - RMER15-int LTR ERVL -553 4446 4428 3 685 565 324 47 43 chr15 13221673 13221912 -90273062 - RMER15-int LTR ERVL -572 4427 4188 3 685 253 333 71 82 chr15 13222039 13222222 -90272752 - RMER15-int LTR ERVL -3088 1911 1731 3 685 932 197 33 4 chr15 13222226 13222471 -90272503 + RMER17C LTR ERVK 1 252 -158 3 685 1177 199 15 15 chr15 13222447 13222773 -90272201 + RMER17C LTR ERVK 85 410 0 3 685 1820 267 89 13 chr15 13222821 13223810 -90271164 - RMER15-int LTR ERVL -3358 1641 578 3 685 1675 155 47 58 chr15 13223812 13224251 -90270723 + RMER17C LTR ERVK 7 439 -519 3 685 1239 249 62 11 chr15 13233647 13234000 -90260974 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 3 3 685 263 343 58 17 chr15 13237468 13237640 -90257334 + ORR1E LTR MaLR 9 187 -172 3 686 523 332 57 90 chr15 13240322 13240676 -90254298 + ORR1E LTR MaLR 8 349 -10 3 686 795 206 152 99 chr15 13241686 13242041 -90252933 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 686 1521 213 151 22 chr15 13242439 13242809 -90252165 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 3 686 1311 226 81 42 chr15 13247123 13247455 -90247519 + MLT1E LTR MaLR 306 650 -3 3 686 1347 281 32 32 chr15 13254926 13255360 -90239614 - LTR40b LTR ERVL -18 444 11 3 686 1653 222 83 5 chr15 13266333 13266705 -90228269 + MTD LTR MaLR 5 405 -14 3 686 1109 191 34 86 chr15 13276616 13276650 -90218324 + RMER17C LTR ERVK 80 114 -296 3 686 1109 191 34 86 chr15 13276833 13277147 -90217827 + RMER17C LTR ERVK 115 410 0 3 686 833 133 21 43 chr15 13277147 13277204 -90217770 - ORR1A3 LTR MaLR -34 292 241 3 686 2861 58 0 0 chr15 13277204 13277550 -90217424 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 686 833 133 21 43 chr15 13277550 13277633 -90217341 - ORR1A3 LTR MaLR -86 240 155 3 686 858 149 7 0 chr15 13277861 13278002 -90216972 - ORR1A3 LTR MaLR -184 142 1 3 686 2375 87 5 231 chr15 13284133 13284749 -90210225 - RLTR44C LTR ERVK -25 477 1 4 686 2165 126 0 3 chr15 13286529 13286848 -90208126 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 4 686 522 337 85 25 chr15 13289642 13289995 -90204979 + MLT1A LTR MaLR 1 374 0 4 686 765 325 92 6 chr15 13291569 13291894 -90203080 - MLT1B LTR MaLR -7 383 31 4 686 965 311 47 71 chr15 13294959 13295426 -90199548 - MER31B LTR ERV1 0 466 11 4 686 501 326 24 86 chr15 13301523 13301778 -90193196 + RMER15 LTR ERVL 325 563 -12 4 686 729 296 5 34 chr15 13312045 13312251 -90182723 - MER34 LTR ERV1 -8 534 335 4 686 1144 229 100 100 chr15 13312989 13313122 -90181852 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 245 4 686 1144 229 100 100 chr15 13313368 13313403 -90181571 - ORR1D1 LTR MaLR -130 244 225 4 686 1144 229 100 100 chr15 13313650 13313701 -90181273 - ORR1D1 LTR MaLR -150 224 179 4 686 1144 229 100 100 chr15 13313882 13314015 -90180959 - ORR1D1 LTR MaLR -196 178 16 4 686 836 250 5 67 chr15 13324168 13324391 -90170583 + MTEa LTR MaLR 7 215 -164 4 686 378 257 114 63 chr15 13324818 13325025 -90169949 + MLT1B LTR MaLR 100 306 -161 4 686 237 259 72 57 chr15 13334425 13334545 -90160429 - MTEa LTR MaLR -41 338 202 4 686 2916 82 23 3 chr15 13337062 13337454 -90157520 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 686 2141 144 3 78 chr15 13342818 13343201 -90151773 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 686 1398 262 32 24 chr15 13354185 13354557 -90140417 - MTE2b LTR MaLR -3 376 2 4 686 350 327 0 0 chr15 13356566 13356670 -90138304 - MamGypLTR2c LTR Gypsy -957 111 8 4 686 1793 253 105 45 chr15 13358753 13359182 -90135792 - MTD-int LTR MaLR -375 723 279 5 686 1793 236 109 42 chr15 13359353 13359617 -90135357 - MTD-int LTR MaLR -980 278 1 5 686 1592 228 93 48 chr15 13359617 13360013 -90134961 - MTD LTR MaLR 0 419 6 5 686 561 270 134 6 chr15 13361097 13361261 -90133713 + MTD LTR MaLR 101 285 -134 5 686 1099 231 34 119 chr15 13362115 13362528 -90132446 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 5 686 334 281 99 49 chr15 13364473 13364615 -90130359 - LTR33B LTR ERVL -326 177 29 5 687 622 204 152 23 chr15 13386700 13386823 -90108151 + MTD LTR MaLR 8 133 -286 5 687 622 204 152 23 chr15 13386859 13386906 -90108068 + MTD LTR MaLR 134 200 -219 5 687 767 315 97 33 chr15 13389225 13389298 -90105676 + MLT1B LTR MaLR 6 82 -308 5 687 767 315 97 33 chr15 13389508 13389623 -90105351 + MLT1B LTR MaLR 83 215 -175 5 687 357 309 75 67 chr15 13389623 13389994 -90104980 + MLT1A LTR MaLR 1 374 0 5 687 767 315 97 33 chr15 13389994 13390164 -90104810 + MLT1B LTR MaLR 216 387 -3 5 687 499 279 160 93 chr15 13395935 13396114 -90098860 - MT2A LTR ERVL -35 682 336 5 687 2139 169 30 0 chr15 13396114 13396481 -90098493 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 687 499 279 160 93 chr15 13396481 13396555 -90098419 - MT2A LTR ERVL -255 462 159 5 687 460 289 118 55 chr15 13396555 13396793 -90098181 - MTEa LTR MaLR -118 261 9 5 687 472 324 50 122 chr15 13397206 13397337 -90097637 - MLT1B LTR MaLR -2 388 274 5 687 472 324 50 122 chr15 13397514 13397800 -90097174 - MLT1B LTR MaLR -117 273 1 5 687 3200 31 37 3 chr15 13402736 13403119 -90091855 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 687 514 325 60 68 chr15 13406291 13406644 -90088330 + MLT1A LTR MaLR 23 372 -2 5 687 1551 209 131 3 chr15 13409275 13409634 -90085340 + MTD LTR MaLR 7 411 -8 5 687 4062 156 37 6 chr15 13415860 13416584 -90078390 + RMER6A LTR ERVK 1 747 -9 5 687 278 379 72 6 chr15 13417310 13417520 -90077454 + LTR16B1 LTR ERVL 134 388 -92 5 687 493 360 149 46 chr15 13418449 13418819 -90076155 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 5 687 903 233 34 144 chr15 13423705 13424116 -90070858 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 6 687 1399 239 71 14 chr15 13427967 13428332 -90066642 + MTD LTR MaLR 25 410 -9 6 687 847 270 39 71 chr15 13429051 13429362 -90065612 - MTE2b LTR MaLR -6 373 73 6 687 569 282 125 77 chr15 13442504 13442857 -90052117 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 687 461 304 133 10 chr15 13446653 13446956 -90048018 + MLT2B2 LTR ERVL 1 340 -175 6 687 1785 184 24 78 chr15 13446997 13447380 -90047594 + ORR1C1 LTR MaLR 15 376 -2 6 687 3453 229 41 87 chr15 13447382 13448368 -90046606 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 940 -430 6 687 385 295 83 12 chr15 13451978 13452146 -90042828 - MLT1A LTR MaLR 0 374 195 6 687 315 296 65 70 chr15 13452345 13452530 -90042444 - MLT1A LTR MaLR -172 202 19 6 687 439 277 14 35 chr15 13453144 13453286 -90041688 + MLT1A1 LTR MaLR 270 408 0 6 687 902 316 73 50 chr15 13455519 13455999 -90038975 - LTR40a LTR ERVL -22 497 7 6 687 876 318 43 20 chr15 13459147 13459494 -90035480 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 11 6 687 641 312 68 69 chr15 13459505 13459964 -90035010 + MLT2D LTR ERVL 36 456 -8 6 687 1692 159 29 71 chr15 13460391 13460742 -90034232 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 43 6 687 1764 225 95 87 chr15 13462618 13462898 -90032076 + RMER19C LTR ERVK 8 312 -299 6 687 1764 225 95 87 chr15 13463073 13463390 -90031584 + RMER19C LTR ERVK 313 610 -1 6 687 1977 187 58 18 chr15 13469023 13469421 -90025553 + MTC LTR MaLR 1 414 -7 6 687 348 227 42 8 chr15 13473223 13473343 -90021631 + RMER17A LTR ERVK 333 456 -295 6 687 247 236 0 0 chr15 13473466 13473538 -90021436 - RMER17C LTR ERVK -155 255 184 6 687 792 315 89 67 chr15 13484552 13484943 -90010031 + MLT2B3 LTR ERVL 155 554 0 6 85 1828 171 107 71 chr15 13500328 13500795 -89994179 + RMER6C LTR ERVK 1 484 -206 2 688 1297 181 19 93 chr15 13500989 13501311 -89993663 + RMER6C LTR ERVK 393 690 0 4 688 781 311 64 52 chr15 13509166 13509492 -89985482 - MLT1A0 LTR MaLR -33 332 3 2 688 598 341 93 14 chr15 13515734 13516100 -89978874 + MER90a LTR ERV1 56 450 -164 2 688 867 330 131 11 chr15 13519708 13520152 -89974822 - LTR33 LTR ERVL 0 515 19 3 688 1388 215 67 22 chr15 13525788 13526119 -89968855 + ORR1D1 LTR MaLR 1 347 -27 4 688 1388 215 67 22 chr15 13526271 13526296 -89968678 + ORR1D1 LTR MaLR 348 372 -2 4 688 2804 55 0 0 chr15 13535085 13535431 -89959543 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 688 1187 297 49 20 chr15 13535983 13536333 -89958641 - MTE2b LTR MaLR 0 379 20 6 688 1318 240 46 0 chr15 13539568 13539851 -89955123 + MTC LTR MaLR 64 359 -62 6 688 1459 226 175 90 chr15 13539850 13540405 -89954569 - RMER20B LTR ERVK -25 602 1 6 688 335 238 18 79 chr15 13540405 13540480 -89954494 + MTC LTR MaLR 352 419 0 6 688 1566 261 26 16 chr15 13543098 13543480 -89951494 - MTD LTR MaLR 0 419 34 7 688 466 371 107 48 chr15 13543900 13544254 -89950720 + MER70B LTR ERVL 114 488 -90 7 688 249 153 121 66 chr15 13544393 13544484 -89950490 - MLT2C2 LTR ERVL 0 562 467 7 688 345 292 91 41 chr15 13549135 13549326 -89945648 + MLT1A0 LTR MaLR 162 374 0 8 688 1167 219 57 148 chr15 13556795 13557213 -89937761 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 9 688 1715 209 67 34 chr15 13566347 13566734 -89928240 + MTD LTR MaLR 20 419 0 1 688 237 299 0 0 chr15 13570379 13570456 -89924518 + ORR1E LTR MaLR 25 101 -258 1 688 951 237 34 25 chr15 13570876 13570978 -89923996 - MTE2b LTR MaLR 0 379 277 1 688 951 275 284 16 chr15 13571039 13571249 -89923725 - MTE2b LTR MaLR -103 276 10 1 688 360 356 102 28 chr15 13573054 13573308 -89921666 + LTR16B2 LTR ERVL 153 425 -37 1 688 1414 266 2 115 chr15 13585521 13585569 -89909405 - RMER19C LTR ERVK 0 611 579 1 688 1414 278 38 119 chr15 13586172 13586919 -89908055 - RMER19C LTR ERVK -33 869 8 1 688 697 325 93 12 chr15 13591871 13592300 -89902674 + MLT1C LTR MaLR 1 464 -3 1 688 4298 104 53 22 chr15 13600725 13601439 -89893535 - RMER17A LTR ERVK -15 736 1 1 688 291 294 130 56 chr15 13611433 13611649 -89883325 + MLT2B1 LTR ERVL 274 519 -48 1 689 1347 326 83 16 chr15 13635372 13635936 -89859038 + MLT1H-int LTR MaLR 32 633 -776 2 689 612 331 98 43 chr15 13636178 13636547 -89858427 + MLT1H-int LTR MaLR 944 1332 -77 2 689 1364 281 62 11 chr15 13636664 13637035 -89857939 + MTD LTR MaLR 18 407 -12 2 689 793 348 59 18 chr15 13637392 13637731 -89857243 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 10 2 689 2756 88 25 22 chr15 13637800 13638206 -89856768 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 689 717 119 0 8 chr15 13638206 13638333 -89856641 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1098 973 2 689 1992 94 49 67 chr15 13638333 13638662 -89856312 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 2 689 1907 128 40 7 chr15 13640828 13641127 -89853847 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 2 689 371 67 7 0 chr15 13641152 13641205 -89853769 + RLTR10-int LTR ERVK 163 267 -7314 2 689 632 254 46 41 chr15 13641237 13641434 -89853540 + RLTR10-int LTR ERVK 655 852 -1135 2 689 1262 336 50 19 chr15 13641833 13642588 -89852386 + IAP-d-int LTR ERVK 705 1483 -5059 2 689 1207 279 29 29 chr15 13642602 13643048 -89851926 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3105 3515 -4066 2 689 1139 256 47 49 chr15 13643138 13643606 -89851368 + MMERVK10C-int LTR ERVK 5011 5477 -2104 2 689 342 299 37 31 chr15 13644095 13644257 -89850717 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6907 7069 -512 2 689 1483 141 23 27 chr15 13644395 13644657 -89850317 + MMERVK10C-int LTR ERVK 7321 7581 0 2 689 2119 102 13 7 chr15 13644657 13644964 -89850010 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 2 689 325 214 44 77 chr15 13644967 13644983 -89849991 + ORR1D2 LTR MaLR 228 243 -127 2 689 325 214 44 77 chr15 13645018 13645092 -89849882 + ORR1D2 LTR MaLR 244 314 -56 2 689 230 224 0 0 chr15 13645364 13645413 -89849561 + ORR1D2 LTR MaLR 324 372 -2 2 689 336 327 18 9 chr15 13667479 13667590 -89827384 + ORR1C1 LTR MaLR 6 117 -261 2 689 240 318 25 43 chr15 13667737 13667791 -89827183 + ORR1C1 LTR MaLR 205 259 -111 2 689 256 290 31 23 chr15 13667938 13668044 -89826930 + ORR1C1 LTR MaLR 260 366 -8 2 689 276 224 0 33 chr15 13675938 13675998 -89818976 + RLTR25A LTR ERVK 515 572 -531 2 689 392 241 119 8 chr15 13676985 13677119 -89817855 + MER34 LTR ERV1 394 542 0 2 689 714 335 65 15 chr15 13683006 13683345 -89811629 + MLT1A0 LTR MaLR 10 365 0 2 689 353 379 75 24 chr15 13684778 13685111 -89809863 - MLT1D LTR MaLR -122 383 34 2 689 2214 98 35 6 chr15 13687707 13688025 -89806949 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 689 245 246 15 30 chr15 13690682 13690749 -89804225 - MTEb LTR MaLR -18 361 296 2 689 1137 156 61 14 chr15 13690823 13691037 -89803937 + RLTR17 LTR ERVK 145 368 -324 2 689 2150 197 3 15 chr15 13696705 13697096 -89797878 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 2 689 640 132 9 0 chr15 13697100 13697206 -89797768 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 107 -1856 2 689 3450 203 81 19 chr15 13697207 13698051 -89796923 + ORR1B1-int LTR MaLR 614 1509 0 2 689 1837 171 76 33 chr15 13698059 13698427 -89796547 + ORR1B1 LTR MaLR 9 392 -2 2 689 249 206 27 164 chr15 13703464 13703574 -89791400 + MTEa LTR MaLR 282 376 -3 3 689 669 309 67 78 chr15 13704523 13704884 -89790090 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 3 689 508 408 40 45 chr15 13707376 13707688 -89787286 - MLT2B2 LTR ERVL -93 422 110 3 689 508 408 40 45 chr15 13707893 13708002 -89786972 - MLT2B2 LTR ERVL -406 109 3 3 689 238 310 69 0 chr15 13716162 13716249 -89778725 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 950 1042 -26 3 689 3389 28 5 0 chr15 13719518 13719912 -89775062 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 689 8616 46 22 0 chr15 13719912 13720986 -89773988 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 689 3077 39 33 28 chr15 13720988 13721382 -89773592 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 689 257 319 72 67 chr15 13722515 13722710 -89772264 - ORR1E LTR MaLR -163 196 1 3 689 536 265 84 195 chr15 13724974 13725354 -89769620 + MT2B LTR ERVL 3 476 -125 3 689 2020 190 90 37 chr15 13729663 13730172 -89764802 - RMER6C LTR ERVK -4 686 151 3 689 443 243 53 26 chr15 13731090 13731204 -89763770 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 249 3 689 3135 53 0 10 chr15 13745061 13745461 -89749513 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 689 7473 77 37 1 chr15 13745461 13746184 -89748790 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 349 3 689 7473 77 37 1 chr15 13746408 13746744 -89748230 - MTA_Mm-int LTR MaLR -750 348 2 3 689 3131 61 0 5 chr15 13746744 13747142 -89747832 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 689 703 289 78 5 chr15 13755349 13755554 -89739420 - MTC LTR MaLR -3 418 199 3 689 888 208 67 29 chr15 13756078 13756286 -89738688 - MTC LTR MaLR -205 216 1 3 689 397 234 191 41 chr15 13756673 13756820 -89738154 + MLT1B LTR MaLR 5 173 -217 3 689 406 238 159 45 chr15 13757395 13757571 -89737403 + MLT1B LTR MaLR 189 384 -6 3 690 562 254 26 47 chr15 13763574 13763764 -89731210 + RLTR14 LTR ERV1 3 188 -194 3 690 788 381 46 33 chr15 13764336 13764876 -89730098 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 81 3 690 342 323 49 87 chr15 13774217 13774400 -89720574 + MLT1A1 LTR MaLR 23 198 -210 4 690 464 338 59 42 chr15 13775597 13775879 -89719095 + ORR1E LTR MaLR 68 355 -4 4 690 905 279 25 8 chr15 13775959 13776194 -89718780 + ORR1D1 LTR MaLR 3 241 -133 4 690 2089 183 11 16 chr15 13776399 13776765 -89718209 - MTC LTR MaLR 0 421 58 4 690 343 293 19 39 chr15 13779905 13780008 -89714966 + ORR1D1 LTR MaLR 230 330 -44 4 690 305 268 121 47 chr15 13782944 13783093 -89711881 + RMER15 LTR ERVL 403 562 -13 4 690 356 353 63 40 chr15 13785836 13786010 -89708964 - MLT1A1 LTR MaLR -230 178 1 4 690 1764 207 25 28 chr15 13801004 13801397 -89693577 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 4 690 423 338 77 52 chr15 13806150 13806500 -89688474 + ORR1E LTR MaLR 2 367 -3 4 690 1315 282 32 75 chr15 13806502 13807124 -89687850 + ORR1E-int LTR MaLR 2 624 -956 4 690 673 112 19 0 chr15 13810425 13810532 -89684442 + MT2C_Mm LTR ERVL 290 398 -77 4 690 1557 244 63 10 chr15 13820394 13820788 -89674186 - MTD LTR MaLR 0 419 5 4 690 860 300 35 38 chr15 13834131 13834502 -89660472 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 690 645 296 101 92 chr15 13839150 13839455 -89655519 + BGLII_B LTR ERVK 1 326 -115 4 690 645 296 101 92 chr15 13839640 13839769 -89655205 + BGLII_B LTR ERVK 327 439 -2 4 690 266 238 112 53 chr15 13840297 13840466 -89654508 + BGLII_B LTR ERVK 21 199 -242 4 690 236 344 81 89 chr15 13840487 13840723 -89654251 + MLT1J LTR MaLR 71 304 -208 4 690 350 283 167 0 chr15 13841385 13841505 -89653469 + MTEa LTR MaLR 1 140 -239 4 690 278 347 57 24 chr15 13841546 13841877 -89653097 + MT2B2 LTR ERVL 190 581 -3 4 690 740 333 24 49 chr15 13843713 13844041 -89650933 - MLT2D LTR ERVL -94 320 1 4 690 1123 287 75 9 chr15 13844807 13845138 -89649836 - MTEa LTR MaLR -21 358 6 4 690 394 286 67 93 chr15 13845835 13845982 -89648992 + RLTR11B LTR ERVK 94 236 -217 4 690 394 286 67 93 chr15 13846044 13846239 -89648735 + RLTR11B LTR ERVK 237 427 -26 4 690 742 312 35 23 chr15 13867721 13868023 -89626951 - MTD LTR MaLR -14 405 111 5 690 811 307 169 67 chr15 13869462 13870274 -89624700 - MTC-int LTR MaLR -263 995 1 5 690 286 197 182 13 chr15 13870300 13870377 -89624597 - MTD LTR MaLR -68 351 262 5 690 756 267 68 138 chr15 13891005 13891405 -89603569 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 5 691 424 290 103 7 chr15 13900399 13900646 -89594328 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 4 5 691 225 263 55 71 chr15 13914135 13914262 -89580712 + LTR45C LTR ERV1 374 498 -41 5 691 319 372 76 53 chr15 13914596 13914897 -89580077 - MLT1H LTR MaLR -137 412 105 5 691 3168 51 8 10 chr15 13916861 13917258 -89577716 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 691 491 400 31 8 chr15 13935131 13935388 -89559586 + MLT2B1 LTR ERVL 256 518 -2 5 691 284 187 0 78 chr15 13938112 13938192 -89556782 + MLT1G LTR MaLR 333 415 -180 6 691 508 298 52 6 chr15 13941063 13941235 -89553739 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 186 6 691 266 350 24 49 chr15 13942254 13942377 -89552597 - MLT1A0 LTR MaLR -178 187 68 6 691 588 352 94 28 chr15 13943974 13944369 -89550605 + MLT2B4 LTR ERVL 82 502 -54 6 691 359 291 10 10 chr15 13945438 13945542 -89549432 - RMER10B LTR ERVL -26 372 269 6 691 3306 167 100 9 chr15 13946056 13946420 -89548554 + RMER6A LTR ERVK 1 376 -380 6 691 3306 167 100 9 chr15 13946481 13946809 -89548165 + RMER6A LTR ERVK 377 755 -1 6 691 515 327 19 29 chr15 13955580 13955785 -89539189 - ORR1D2 LTR MaLR -167 203 1 6 691 1522 163 75 16 chr15 13975765 13976071 -89518903 - RMER6C LTR ERVK 0 690 367 6 691 523 236 101 15 chr15 13976237 13976435 -89518539 - RMER6C LTR ERVK -230 460 246 6 691 403 213 89 36 chr15 13976440 13976552 -89518422 - RMER6C LTR ERVK -572 118 1 6 691 404 324 86 52 chr15 13977143 13977314 -89517660 + MTD LTR MaLR 105 286 -133 6 691 7006 31 9 4 chr15 13977314 13978132 -89516842 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 6 691 404 324 86 52 chr15 13978132 13978250 -89516724 + MTD LTR MaLR 287 404 -15 6 691 461 282 41 65 chr15 13978414 13978706 -89516268 + BGLII_B LTR ERVK 122 406 -35 6 691 245 352 98 30 chr15 13979438 13979602 -89515372 + MLT2C1 LTR ERVL 126 300 -97 6 691 232 299 113 57 chr15 13984231 13984408 -89510566 - MLT1H-int LTR MaLR -174 1315 1129 6 691 1927 149 36 11 chr15 13984555 13985005 -89509969 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 6 691 274 363 92 31 chr15 13985061 13985257 -89509717 - MLT1H-int LTR MaLR -642 767 560 6 691 1588 193 108 3 chr15 13987364 13987696 -89507278 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 691 231 391 75 38 chr15 13995797 13996036 -89498938 + MLT1G LTR MaLR 71 318 -273 6 691 1358 213 43 117 chr15 13996453 13996761 -89498213 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 81 6 691 3025 12 6 3 chr15 13996761 13997106 -89497868 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 691 13721 60 11 1 chr15 13997106 13998879 -89496095 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 6 691 3061 23 0 0 chr15 13998879 13999225 -89495749 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 691 1358 213 43 117 chr15 13999225 13999307 -89495667 - ORR1D1 LTR MaLR -294 80 11 6 691 1331 261 83 5 chr15 14001906 14002280 -89492694 + MTD LTR MaLR 17 419 0 5 691 1820 189 95 0 chr15 14009891 14010250 -89484724 - MTC LTR MaLR 0 421 29 1 691 2211 11 114 0 chr15 14016333 14016595 -89478379 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 2 691 2104 178 48 5 chr15 14017500 14017900 -89477074 - MTC LTR MaLR -2 419 3 2 691 623 273 193 32 chr15 14019689 14019969 -89475005 - MTC LTR MaLR -52 369 45 3 691 2683 70 3 3 chr15 14022389 14022735 -89472239 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 691 12746 78 14 11 chr15 14022737 14024522 -89470452 - ORR1A1-int LTR MaLR -2 1790 1 3 86 2613 69 0 60 chr15 14024522 14024890 -89470084 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 692 1580 229 18 3 chr15 14028568 14028905 -89466069 + MTC LTR MaLR 78 419 -2 4 692 464 223 0 30 chr15 14029961 14030094 -89464880 - ORR1C1 LTR MaLR -39 355 236 4 692 2004 154 19 46 chr15 14048124 14048538 -89446436 + RLTR9E LTR ERVK 7 409 0 7 692 876 218 12 111 chr15 14048545 14048870 -89446104 + MMETn-int LTR ERVK 7 299 -4545 7 692 378 176 0 13 chr15 14048860 14048935 -89446039 + RLTR45-int LTR ERVK 2091 2164 -5080 7 692 1708 184 68 16 chr15 14049382 14049808 -89445166 + MMETn-int LTR ERVK 716 1163 -3681 7 692 665 256 5 43 chr15 14049813 14050001 -89444973 + ETnERV2-int LTR ERVK 2428 2608 -4798 7 692 16212 125 26 4 chr15 14050001 14052472 -89442502 + ETnERV2-int LTR ERVK 3055 5580 -1826 7 692 1686 201 44 60 chr15 14052472 14052902 -89442072 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 183 7 692 810 252 31 22 chr15 14052902 14053129 -89441845 - RLTR1D LTR ERV1 -359 246 18 7 692 4517 126 37 30 chr15 14053129 14054001 -89440973 + ETnERV2-int LTR ERVK 5592 6227 -1179 7 692 500 110 0 0 chr15 14054212 14054285 -89440689 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7403 -3 7 692 2053 169 12 36 chr15 14054287 14054705 -89440269 + RLTR9E LTR ERVK 1 408 -1 7 692 2570 180 96 75 chr15 14057033 14058424 -89436550 + ORR1A3-int LTR MaLR 458 1772 -191 8 692 526 238 59 11 chr15 14060790 14060956 -89434018 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 210 8 692 378 250 18 36 chr15 14060936 14061048 -89433926 - ORR1D2-int LTR MaLR -158 1212 1103 8 692 2135 120 32 0 chr15 14061521 14061837 -89433137 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 8 692 2036 135 13 3 chr15 14071728 14072032 -89422942 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 3 1 692 1471 164 4 27 chr15 14072039 14072302 -89422672 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4 7577 7321 1 692 386 302 19 19 chr15 14072436 14072598 -89422376 - MMERVK10C-int LTR ERVK -512 7069 6908 1 692 1155 262 32 39 chr15 14073091 14073524 -89421450 - MMERVK10C-int LTR ERVK -2099 5482 5053 1 692 1834 302 29 52 chr15 14073524 14074705 -89420269 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5271 2310 673 1 692 694 238 46 41 chr15 14075062 14075259 -89419715 - RLTR10-int LTR ERVK -1135 852 655 1 692 402 29 7 0 chr15 14075291 14075344 -89419630 - RLTR10-int LTR ERVK -7314 267 163 1 692 2017 138 6 22 chr15 14075369 14075680 -89419294 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 4 1 692 265 215 35 4 chr15 14078138 14078203 -89416771 + MTE2a LTR MaLR 283 347 -32 1 692 2834 66 39 3 chr15 14080990 14081372 -89413602 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 692 1909 237 41 7 chr15 14083413 14083825 -89411149 - RLTR25B LTR ERVK -602 426 1 1 692 2818 89 13 0 chr15 14085056 14085449 -89409525 - MTB LTR MaLR -2 398 1 1 692 1368 274 12 72 chr15 14085808 14086335 -89408639 + RMER19C LTR ERVK 1 761 -141 1 692 1981 120 6 65 chr15 14086362 14086701 -89408273 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 692 284 192 0 0 chr15 14086705 14086757 -89408217 + RLTR15 LTR ERVK 174 225 -134 1 692 629 187 14 43 chr15 14087200 14087313 -89407661 + RLTR15 LTR ERVK 218 331 -28 1 692 629 187 14 43 chr15 14087356 14087382 -89407592 + RLTR15 LTR ERVK 332 352 -7 1 692 6571 54 11 0 chr15 14089920 14090719 -89404255 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 1 692 2948 214 5 11 chr15 14092592 14092699 -89402275 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 454 1 692 2948 214 5 11 chr15 14092789 14093244 -89401730 - RLTR20B2 LTR ERVK -107 453 1 1 692 471 363 18 6 chr15 14103876 14104045 -89390929 - MTEa LTR MaLR -50 329 159 1 692 405 239 7 124 chr15 14111860 14111903 -89383071 + MT2B LTR ERVL 130 154 -447 1 692 2976 62 29 3 chr15 14132002 14132388 -89362586 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 692 255 332 129 51 chr15 14135325 14135619 -89359355 + MTEb LTR MaLR 41 357 -2 2 692 3177 150 27 4 chr15 14135745 14136261 -89358713 + MT2B LTR ERVL 1 528 -73 2 692 580 241 47 101 chr15 14140168 14140464 -89354510 - RMER6C LTR ERVK -116 574 295 2 692 1887 186 5 110 chr15 14140549 14140967 -89354007 - ORR1B1 LTR MaLR -20 374 1 2 692 392 156 0 0 chr15 14140967 14141025 -89353949 - RMER6C LTR ERVK -522 168 111 2 692 3440 20 5 0 chr15 14142643 14143037 -89351937 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 692 1690 186 44 6 chr15 14143877 14144217 -89350757 - MTC LTR MaLR -66 355 3 2 692 692 144 0 126 chr15 14144219 14144410 -89350564 - MTC-int LTR MaLR 0 1098 932 2 692 770 154 73 0 chr15 14144404 14144540 -89350434 + ORR1A4-int LTR MaLR 923 1068 -895 2 692 2470 154 49 10 chr15 14144537 14145201 -89349773 + ORR1A4-int LTR MaLR 1001 1963 0 2 692 987 194 150 78 chr15 14145201 14145508 -89349466 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 692 1771 243 19 36 chr15 14149809 14150227 -89344747 - MTC LTR MaLR -8 413 3 2 692 6496 57 9 2 chr15 14152599 14153402 -89341572 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 2 692 296 335 160 31 chr15 14153529 14153723 -89341251 + RMER15 LTR ERVL 275 493 -82 2 693 1854 168 24 18 chr15 14171174 14171513 -89323461 + RMER20B LTR ERVK 1 341 -286 2 693 640 246 159 19 chr15 14171600 14171857 -89323117 + RMER20B LTR ERVK 335 627 0 2 693 298 220 44 0 chr15 14186616 14186707 -89308267 - MER57A-int LTR ERV1 -227 5960 5866 2 693 641 305 126 18 chr15 14187994 14188328 -89306646 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 693 264 269 57 19 chr15 14191548 14191654 -89303320 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 256 2 693 248 376 21 28 chr15 14192515 14192660 -89302314 + RMER12 LTR ERVK 715 858 -464 2 693 1406 351 64 32 chr15 14194273 14195277 -89299697 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4099 5134 -580 2 693 417 292 171 37 chr15 14196134 14196433 -89298541 + RMER5 LTR ERV1 40 378 -156 3 693 659 305 19 47 chr15 14196706 14196919 -89298055 + MTEb LTR MaLR 4 210 -169 3 693 385 246 103 17 chr15 14197023 14197139 -89297835 + MTEb LTR MaLR 251 376 -3 3 693 2535 88 90 0 chr15 14197447 14197812 -89297162 - MTB LTR MaLR -2 398 1 3 693 5594 134 99 14 chr15 14197812 14198824 -89296150 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 3 693 2934 88 2 2 chr15 14198824 14199224 -89295750 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 693 886 375 105 65 chr15 14200419 14201630 -89293344 - MTE-int LTR MaLR -281 1299 41 3 693 1540 189 34 141 chr15 14203650 14204124 -89290850 + RLTR23 LTR ERV1 1 423 -7 3 693 2673 170 61 23 chr15 14205877 14206436 -89288538 + RMER6C LTR ERVK 111 690 0 3 693 327 373 39 22 chr15 14207583 14207764 -89287210 - LTR33 LTR ERVL -8 507 324 3 693 296 200 0 0 chr15 14213659 14213719 -89281255 - ORR1C1 LTR MaLR -318 60 1 3 693 758 207 81 43 chr15 14227169 14227638 -89267336 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 902 413 3 693 1310 147 0 5 chr15 14227638 14227836 -89267138 - RLTR13D6 LTR ERVK -705 197 1 3 693 289 316 33 33 chr15 14231645 14231766 -89263208 + MER68 LTR ERVL 246 366 -197 3 693 1061 233 30 27 chr15 14253331 14253455 -89241519 + RLTR12A LTR ERVK 3 129 -439 3 693 1061 233 30 27 chr15 14253548 14253664 -89241310 + RLTR12A LTR ERVK 130 241 -327 3 693 1061 233 30 27 chr15 14253736 14253790 -89241184 + RLTR12A LTR ERVK 242 299 -269 3 693 3067 75 0 12 chr15 14257602 14258007 -89236967 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 693 339 250 0 0 chr15 14258481 14258557 -89236417 + ORR1D1 LTR MaLR 1 76 -298 3 693 279 172 52 0 chr15 14258784 14258842 -89236132 + ORR1D1 LTR MaLR 61 121 -253 3 693 1880 199 29 2 chr15 14259856 14260265 -89234709 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 3 4 693 554 377 15 0 chr15 14262214 14262407 -89232567 - ORR1D2 LTR MaLR -176 202 3 4 693 261 338 62 27 chr15 14271935 14272081 -89222893 - MLT1B LTR MaLR 0 390 240 4 693 248 344 82 0 chr15 14272357 14272479 -89222495 + MLT1A1 LTR MaLR 4 135 -273 4 693 941 227 225 23 chr15 14272556 14272793 -89222181 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 71 4 693 2688 213 25 12 chr15 14272793 14273396 -89221578 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 693 941 227 225 23 chr15 14273396 14273465 -89221509 - ORR1D1 LTR MaLR -304 70 1 4 693 433 307 16 16 chr15 14281361 14281490 -89213484 + MTEa LTR MaLR 249 377 -2 4 86 743 278 67 104 chr15 14286454 14286856 -89208118 + RLTR9C LTR ERVK 1 387 -6 4 694 229 330 25 17 chr15 14290831 14290951 -89204023 + MLT1D LTR MaLR 383 503 -2 4 694 3118 185 36 10 chr15 14314032 14314612 -89180362 + RLTR17 LTR ERVK 98 692 0 4 694 337 300 41 131 chr15 14319562 14319807 -89175167 + MLT1A LTR MaLR 1 223 -142 4 694 2882 52 52 0 chr15 14324664 14325033 -89169941 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 4 694 1359 58 6 0 chr15 14325045 14325216 -89169758 + RLTR10-int LTR ERVK 41 212 -1775 4 694 265 200 38 95 chr15 14325241 14325346 -89169628 + RLTR10 LTR ERVK 292 390 0 4 694 2165 43 139 0 chr15 14325346 14325707 -89169267 + RLTR10-int LTR ERVK 302 793 -1194 4 694 1625 183 0 0 chr15 14326493 14326782 -89168192 + ORR1A3 LTR MaLR 6 294 -32 4 694 7601 164 127 81 chr15 14326771 14327614 -89167360 + ORR1A3-int LTR MaLR 15 1028 -935 4 694 7601 164 127 81 chr15 14328033 14329052 -89165922 + ORR1A3-int LTR MaLR 1029 1963 0 4 694 1836 182 6 0 chr15 14329052 14329376 -89165598 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 694 226 237 16 33 chr15 14329379 14329440 -89165534 - RMER12 LTR ERVK -518 804 745 4 694 310 299 42 54 chr15 14331930 14332096 -89162878 + MLT1D LTR MaLR 319 482 -23 5 694 718 230 63 11 chr15 14332998 14333278 -89161696 + RLTR40 LTR ERVK 376 753 -64 5 694 1973 137 3 4 chr15 14333463 14333776 -89161198 + RLTR10E LTR ERVK 1 388 -2 5 694 236 167 46 77 chr15 14335237 14335302 -89159672 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 5 694 701 273 67 5 chr15 14336669 14336879 -89158095 - MTD LTR MaLR 0 419 197 5 694 545 363 5 0 chr15 14337837 14338038 -89156936 - MTD LTR MaLR -217 202 1 5 694 3544 10 2 0 chr15 14344334 14344729 -89150245 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 694 8941 40 6 1 chr15 14344729 14345822 -89149152 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 694 3555 8 2 0 chr15 14345822 14346217 -89148757 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 694 1605 101 4 34 chr15 14353910 14353942 -89141032 + BGLII LTR ERVK 1 30 -391 5 694 1605 101 4 34 chr15 14354064 14354298 -89140676 + BGLII LTR ERVK 31 259 -162 5 694 1795 222 186 21 chr15 14356334 14356803 -89138171 - RMER19B LTR ERVK 0 902 357 5 694 2671 174 198 3 chr15 14359541 14360158 -89134816 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 694 3727 11 121 0 chr15 14362464 14362904 -89132070 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 694 47358 15 6 0 chr15 14362904 14368230 -89126744 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 5 694 385 167 46 35 chr15 14368230 14368317 -89126657 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 5 694 314 0 0 0 chr15 14368317 14368355 -89126619 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 5 694 3702 14 121 0 chr15 14368355 14368795 -89126179 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 694 581 348 29 110 chr15 14375738 14376148 -89118826 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 5 694 249 400 40 27 chr15 14384739 14384888 -89110086 + RMER15 LTR ERVL 335 485 -90 5 694 811 342 29 31 chr15 14387562 14388048 -89106926 + RMER15-int LTR ERVL 649 1133 -3866 5 694 1698 171 24 61 chr15 14389025 14389355 -89105619 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 5 694 1961 176 84 0 chr15 14389359 14389739 -89105235 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 412 -1551 5 694 259 176 20 0 chr15 14389755 14389806 -89105168 + ORR1A3-int LTR MaLR 634 685 -1278 5 694 496 276 46 36 chr15 14389767 14389981 -89104993 + MT2B LTR ERVL 35 259 -342 5 694 1277 180 103 0 chr15 14390022 14390283 -89104691 + ORR1A3 LTR MaLR 42 329 0 5 694 1334 333 59 6 chr15 14390315 14390844 -89104130 + RMER15-int LTR ERVL 1140 1696 -3303 5 694 236 316 52 21 chr15 14393652 14393749 -89101225 + MLT1D LTR MaLR 289 388 -117 5 694 332 303 34 8 chr15 14398294 14398427 -89096547 + MLT1I LTR MaLR 68 205 -243 6 694 2631 42 3 3 chr15 14410226 14410557 -89084417 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 6 694 7076 94 18 9 chr15 14410557 14411606 -89083368 + IAPEy-int LTR ERVK 1 1058 -6455 6 694 21802 47 3 6 chr15 14411606 14414325 -89080649 + IAPEy-int LTR ERVK 4804 7513 0 6 694 2655 39 3 3 chr15 14414325 14414656 -89080318 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 6 86 2956 157 69 5 chr15 14417846 14418410 -89076564 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 6 695 338 372 30 10 chr15 14420745 14420946 -89074028 + MERVL-int LTR ERVL 4224 4428 -1057 6 695 1854 224 165 26 chr15 14421916 14422522 -89072452 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 6 695 3298 50 0 0 chr15 14439837 14440233 -89054741 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 695 296 371 73 17 chr15 14454958 14455136 -89039838 + MLT2B5 LTR ERVL 105 292 -309 6 695 1304 238 28 78 chr15 14455465 14455634 -89039340 + ORR1C1 LTR MaLR 3 157 -221 6 695 1304 238 28 78 chr15 14455697 14455923 -89039051 + ORR1C1 LTR MaLR 158 378 0 6 695 239 326 152 68 chr15 14456592 14456829 -89038145 - ORR1D-int LTR MaLR -650 930 674 6 695 1226 264 88 35 chr15 14456836 14457212 -89037762 - MTC LTR MaLR 0 421 26 6 695 313 319 37 47 chr15 14457272 14457486 -89037488 - ORR1D-int LTR MaLR -1106 264 53 6 695 636 312 57 117 chr15 14457528 14457913 -89037061 - MTE2a LTR MaLR -4 375 14 6 695 458 281 133 32 chr15 14458126 14458405 -89036569 + MER67C LTR ERV1 224 530 -181 6 695 433 268 65 0 chr15 14458416 14458554 -89036420 + MER67C LTR ERV1 562 708 -3 6 695 369 353 36 6 chr15 14459927 14460095 -89034879 + MLT1A0 LTR MaLR 181 353 -12 6 695 296 345 63 86 chr15 14474446 14474925 -89020049 + MT2A LTR ERVL 13 480 -53 6 695 232 118 0 105 chr15 14480243 14480300 -89014674 - MT2A LTR ERVL -1 532 482 7 695 231 351 83 26 chr15 14480490 14480683 -89014291 - MT2A LTR ERVL -329 204 1 7 695 1330 258 105 43 chr15 14481876 14482410 -89012564 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 7 695 3560 203 58 32 chr15 14495300 14496248 -88998726 - MYSERV6-int LTR ERVK -128 8831 7859 7 695 424 236 48 61 chr15 14496281 14496484 -88998490 - RMER4A LTR ERVK -28 557 254 7 695 328 269 55 49 chr15 14496489 14496653 -88998321 - MYSERV-int LTR ERVK -412 5368 5204 7 695 1464 266 58 72 chr15 14496824 14497517 -88997457 - MYSERV-int LTR ERVK -2118 4432 3750 7 695 2450 26 39 193 chr15 14498320 14498751 -88996223 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 7 695 1634 213 122 59 chr15 14513508 14514002 -88980972 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 1 2 695 961 307 20 51 chr15 14526160 14526455 -88968519 + MTD LTR MaLR 1 286 -133 3 695 1199 248 143 30 chr15 14527417 14527693 -88967281 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 312 -249 3 695 1199 248 143 30 chr15 14527756 14527983 -88966991 + RLTR31_Mm LTR ERVK 313 561 0 3 695 1089 210 193 51 chr15 14529053 14529266 -88965708 + RMER10B LTR ERVL 5 257 -141 3 695 1089 210 193 51 chr15 14529337 14529439 -88965535 + RMER10B LTR ERVL 258 365 -33 3 695 1639 163 39 15 chr15 14533736 14534072 -88960902 + RLTR9A LTR ERVK 1 344 -24 4 695 2511 119 17 19 chr15 14536488 14536898 -88958076 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 695 285 220 0 0 chr15 14537422 14537472 -88957502 + RMER10B LTR ERVL 349 398 0 3 695 897 348 59 0 chr15 14541447 14541786 -88953188 - MTE2a LTR MaLR -18 361 3 5 695 324 322 32 15 chr15 14546824 14546989 -88947985 + RMER20B LTR ERVK 1 161 -355 6 695 312 200 0 0 chr15 14547858 14547913 -88947061 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 340 6 86 1708 214 30 14 chr15 14548717 14549106 -88945868 - ORR1B1 LTR MaLR -3 375 1 6 696 5092 207 64 54 chr15 14549106 14550411 -88944563 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 192 6 696 608 240 65 7 chr15 14552638 14552793 -88942181 - ORR1B1-int LTR MaLR -1336 173 10 6 696 1444 202 140 23 chr15 14552803 14553153 -88941821 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 6 696 1379 132 185 114 chr15 14553736 14554103 -88940871 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 6 696 3596 86 11 5 chr15 14555755 14556256 -88938718 - RLTR1C LTR ERV1 0 507 1 7 696 574 77 0 0 chr15 14556257 14556335 -88938639 - RLTR1B-int LTR ERV1 -1 3298 3221 7 696 1685 94 0 0 chr15 14556374 14556598 -88938376 - MMVL30-int LTR ERV1 -77 3621 3398 7 696 609 330 72 68 chr15 14558422 14558922 -88936052 - LTR55 LTR ERV -18 530 29 7 696 988 269 8 16 chr15 14560849 14561095 -88933879 + RLTR18B LTR ERVK 7 250 -262 8 696 944 274 31 8 chr15 14561096 14561353 -88933621 + RLTR18B LTR ERVK 202 464 -48 8 696 8464 172 62 93 chr15 14561653 14563679 -88931295 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1963 0 8 696 1572 174 31 25 chr15 14563679 14564003 -88930971 + ORR1A4 LTR MaLR 1 326 -3 8 696 468 179 32 0 chr15 14565672 14565767 -88929207 + RLTR12A LTR ERVK 101 198 -370 8 696 1177 299 54 59 chr15 14570807 14571216 -88923758 + MTD LTR MaLR 1 407 -12 9 696 1169 290 12 39 chr15 14573490 14573801 -88921173 - MTD LTR MaLR 0 419 110 9 696 1169 290 12 39 chr15 14574061 14574176 -88920798 - MTD LTR MaLR -310 109 2 9 696 357 180 0 0 chr15 14574557 14574618 -88920356 + RLTR40 LTR ERVK 516 576 -241 1 696 2616 177 14 137 chr15 14574649 14575435 -88919539 - RMER6C LTR ERVK 0 690 2 1 696 518 245 42 36 chr15 14575518 14575683 -88919291 + RLTR40 LTR ERVK 647 812 -5 1 696 253 315 73 44 chr15 14582799 14582935 -88912039 + MLT1A1 LTR MaLR 263 402 -6 1 696 340 361 39 27 chr15 14587569 14587778 -88907196 - MER74C LTR ERVL -219 339 48 1 696 502 325 80 50 chr15 14587839 14588140 -88906834 + RMER15-int LTR ERVL 1662 1971 -3028 1 696 531 273 202 4 chr15 14588332 14588596 -88906378 + RMER15-int LTR ERVL 2074 2389 -2610 1 696 2178 270 128 31 chr15 14588571 14589448 -88905526 + RMER15-int LTR ERVL 4012 4973 -26 1 696 414 194 48 10 chr15 14589448 14589552 -88905422 + RMER15 LTR ERVL 1 108 -467 1 696 1319 78 88 0 chr15 14589561 14589754 -88905220 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 118 1 696 760 289 89 72 chr15 14599810 14600269 -88894705 + RLTR12B LTR ERVK 47 513 -15 1 696 1122 204 173 43 chr15 14605880 14606203 -88888771 + ORR1B2 LTR MaLR 1 365 -2 1 696 1494 253 77 8 chr15 14606217 14606579 -88888395 + ORR1B2-int LTR MaLR 8 395 -1114 1 696 1946 175 22 144 chr15 14606579 14607205 -88887769 - RMER6C LTR ERVK 0 690 141 1 696 2233 269 106 57 chr15 14607262 14607349 -88887625 + ORR1B2-int LTR MaLR 407 496 -874 1 696 3060 41 0 5 chr15 14607349 14607716 -88887258 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 1 696 2233 269 106 57 chr15 14607716 14608522 -88886452 + ORR1B2-int LTR MaLR 497 1344 -26 1 696 264 390 92 5 chr15 14610391 14610597 -88884377 + MTD LTR MaLR 36 259 -160 1 696 630 266 94 149 chr15 14612067 14612487 -88882487 + MTE2a LTR MaLR 17 405 -14 1 696 825 276 73 70 chr15 14612644 14612960 -88882014 - MTEb LTR MaLR -12 367 51 1 696 459 289 138 29 chr15 14616296 14616535 -88878439 - MLT1C LTR MaLR -44 423 159 1 696 702 181 34 32 chr15 14621177 14621334 -88873640 - ORR1C2 LTR MaLR -236 148 1 1 696 1967 113 40 52 chr15 14622654 14622981 -88871993 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 1 696 1867 165 40 40 chr15 14624187 14624584 -88870390 + RLTR44D LTR ERVK 53 449 0 1 696 1076 150 5 49 chr15 14624584 14624787 -88870187 + RLTR44-int LTR ERVK 1 194 -2618 1 696 608 171 25 32 chr15 14624807 14625006 -88869968 + RLTR44-int LTR ERVK 803 981 -1831 1 696 2704 92 3 0 chr15 14625186 14625545 -88869429 + RLTR44-int LTR ERVK 973 1332 -1480 1 696 528 287 37 67 chr15 14625624 14625893 -88869081 + IAPEz-int LTR ERVK 3423 3683 -2798 1 696 4577 55 2 11 chr15 14625904 14626478 -88868496 + RLTR44-int LTR ERVK 2244 2812 0 1 696 2208 117 168 5 chr15 14626478 14626890 -88868084 + RLTR44D LTR ERVK 1 479 -7 1 696 2840 105 5 5 chr15 14626990 14627393 -88867581 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 1 696 300 140 0 50 chr15 14627406 14627466 -88867508 - ETnERV2-int LTR ERVK -19 7387 7331 1 696 3447 203 30 49 chr15 14627682 14628042 -88866932 - ETnERV2-int LTR ERVK -1687 3157 3100 1 696 6527 175 59 24 chr15 14628405 14630581 -88864393 - ETnERV2-int LTR ERVK -3308 4098 1836 1 696 2731 24 0 55 chr15 14636366 14636712 -88858262 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 1 696 279 349 76 51 chr15 14640751 14640908 -88854066 + MLT1E1A LTR MaLR 137 297 -383 2 696 582 248 24 0 chr15 14643408 14643533 -88851441 + RLTR11A LTR ERVK 1 128 -399 2 696 1901 201 41 7 chr15 14644007 14644422 -88850552 + RLTR11A LTR ERVK 100 528 0 2 696 2553 90 121 16 chr15 14656607 14657037 -88837937 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 696 3405 62 5 12 chr15 14657047 14657755 -88837219 + IAPEz-int LTR ERVK 35 662 -5819 2 696 442 66 0 32 chr15 14657755 14657818 -88837156 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 2 696 1826 115 4 4 chr15 14657807 14658069 -88836905 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 2 696 907 81 24 0 chr15 14658066 14658189 -88836785 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 2 696 25973 17 7 0 chr15 14658189 14661127 -88833847 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 2 696 2567 92 119 14 chr15 14661127 14661557 -88833417 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 696 3314 48 23 103 chr15 14668201 14668717 -88826257 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 696 6146 68 12 19 chr15 14668719 14669552 -88825422 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5653 2 696 2657 70 0 3 chr15 14669547 14669890 -88825084 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1359 2 696 3366 60 22 16 chr15 14669890 14670456 -88824518 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 2 696 237 250 0 0 chr15 14670456 14670500 -88824474 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 232 2 696 234 295 49 0 chr15 14670537 14670598 -88824376 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 212 2 696 496 69 0 227 chr15 14670598 14670730 -88824244 - IAPEz-int LTR ERVK -6371 110 9 2 696 2985 39 155 5 chr15 14670731 14671144 -88823830 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 696 1003 304 81 14 chr15 14674969 14675339 -88819635 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 124 2 696 363 269 0 44 chr15 14675713 14675826 -88819148 - RMER5 LTR ERV1 -425 109 2 2 696 989 187 0 0 chr15 14675901 14676088 -88818886 - RMER6C LTR ERVK 0 690 504 2 696 657 344 19 60 chr15 14676762 14677127 -88817847 - ORR1E LTR MaLR -7 352 3 2 696 1059 252 38 81 chr15 14678926 14679566 -88815408 + RLTR11A LTR ERVK 1 523 -5 2 10 781 243 71 5 chr15 14679867 14680087 -88814887 + ORR1D1 LTR MaLR 144 376 -2 2 697 2619 90 32 10 chr15 14681047 14681243 -88813731 - BGLII LTR ERVK -8 413 209 2 697 2619 90 32 10 chr15 14681316 14681523 -88813451 - BGLII LTR ERVK -213 208 1 2 697 3067 59 23 0 chr15 14684366 14684753 -88810221 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 697 2378 196 140 19 chr15 14687545 14688159 -88806815 - RMER6C LTR ERVK -2 688 1 2 697 682 258 61 15 chr15 14691707 14691904 -88803070 + ORR1C2 LTR MaLR 171 376 -8 2 697 2744 42 95 6 chr15 14693963 14694321 -88800653 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 697 1299 89 11 0 chr15 14694321 14694501 -88800473 + RLTR10-int LTR ERVK 1 182 -7399 2 697 407 194 130 0 chr15 14694613 14694721 -88800253 + RLTR10A LTR ERVK 290 411 0 2 697 2684 55 66 0 chr15 14694721 14695174 -88799800 + RLTR10-int LTR ERVK 302 857 -1130 2 697 362 321 19 19 chr15 14695294 14695453 -88799521 + IAP-d-int LTR ERVK 3536 3694 -2848 2 697 442 286 12 12 chr15 14695524 14695697 -88799277 + RLTR10-int LTR ERVK 1422 1594 -5987 2 697 8274 39 5 8 chr15 14695774 14696774 -88798200 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 2 697 3012 52 5 42 chr15 14696774 14697179 -88797795 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 2 697 4479 69 10 5 chr15 14709005 14709589 -88785385 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 3 697 614 311 10 31 chr15 14709700 14709896 -88785078 + MTC LTR MaLR 230 421 0 3 697 3510 183 77 76 chr15 14709912 14710744 -88784230 - RLTR25B LTR ERVK -195 833 1 3 697 321 314 41 8 chr15 14711175 14711297 -88783677 - ERVL-E-int LTR ERVL -3219 2448 2323 3 697 3520 108 30 30 chr15 14716214 14716778 -88778196 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 3 697 3045 78 5 2 chr15 14727148 14727547 -88767427 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 697 272 161 0 111 chr15 14729089 14729152 -88765822 + RLTR25B LTR ERVK 442 497 -531 3 697 245 312 117 23 chr15 14739718 14739846 -88755128 + MTEb LTR MaLR 4 143 -231 3 697 437 279 84 36 chr15 14740235 14740402 -88754572 + MTEb LTR MaLR 203 377 -2 3 697 552 335 132 47 chr15 14740491 14740789 -88754185 + MTEb-int LTR MaLR 26 359 -1221 3 697 552 335 132 47 chr15 14740816 14741000 -88753974 + MTEb-int LTR MaLR 360 549 -1031 3 697 1420 73 5 0 chr15 14741000 14741192 -88753782 + MTA_Mm LTR MaLR 1 193 -203 3 697 1790 28 5 0 chr15 14742483 14742699 -88752275 + MTA_Mm LTR MaLR 178 394 -2 3 697 1316 351 108 44 chr15 14742712 14743509 -88751465 + MTEb-int LTR MaLR 553 1408 -172 3 697 2879 239 53 79 chr15 14743509 14744392 -88750582 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 3 697 1316 351 108 44 chr15 14744392 14744505 -88750469 + MTEb-int LTR MaLR 1409 1524 -56 3 697 334 346 15 15 chr15 14744505 14744640 -88750334 + MTEb LTR MaLR 1 135 -224 3 697 341 331 113 55 chr15 14744674 14744930 -88750044 - MTE-int LTR MaLR -143 1437 1167 3 697 607 271 99 0 chr15 14752139 14752320 -88742654 + ORR1B1 LTR MaLR 1 199 -168 3 697 901 216 17 0 chr15 14754154 14754335 -88740639 + ORR1B1 LTR MaLR 211 394 0 3 697 448 349 52 44 chr15 14755441 14755711 -88739263 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 99 3 697 768 334 67 36 chr15 14757407 14757823 -88737151 + MER67D LTR ERV1 53 481 -33 3 697 1148 306 35 37 chr15 14758087 14758488 -88736486 + MTD LTR MaLR 3 402 -17 3 697 237 276 35 0 chr15 14763917 14763975 -88730999 - RMER12 LTR ERVK -162 1160 1101 3 697 3199 48 30 0 chr15 14771548 14771947 -88723027 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 4 697 4696 94 21 13 chr15 14771962 14772641 -88722333 - RLTR10-int LTR ERVK -16 1971 1288 4 697 1580 68 23 0 chr15 14772642 14772861 -88722113 - IAP-d-int LTR ERVK -658 5884 5661 4 697 3553 60 86 22 chr15 14772861 14773352 -88721622 - IAP-d-int LTR ERVK -1015 5527 5006 4 697 738 197 26 0 chr15 14773352 14773504 -88721470 - IAP-d-int LTR ERVK -6040 502 347 4 697 1528 144 73 15 chr15 14773498 14773803 -88721171 - IAP-d-int LTR ERVK -1385 602 55 4 697 3080 60 19 19 chr15 14773803 14774214 -88720760 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 4 697 2251 73 56 0 chr15 14774688 14774991 -88719983 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 4 697 19297 238 35 25 chr15 14775018 14782554 -88712420 - IAPEY3-int LTR ERVK -350 7330 3 4 697 2218 73 56 0 chr15 14782556 14782859 -88712115 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 4 697 252 267 139 16 chr15 14798168 14798290 -88696684 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 272 4 697 238 346 62 57 chr15 14801059 14801150 -88693824 + MLT-int LTR MaLR 1453 1539 -196 4 697 238 346 62 57 chr15 14801858 14801993 -88692981 + MLT-int LTR MaLR 1540 1680 -55 4 697 2237 114 220 26 chr15 14802884 14803343 -88691631 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 37 4 697 1292 54 0 0 chr15 14803453 14803621 -88691353 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 7611 4 697 35170 15 21 0 chr15 14803609 14807884 -88687090 - RLTR6-int LTR ERV1 -3411 4367 1 4 697 2343 115 210 27 chr15 14807884 14808365 -88686609 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -49 605 37 4 697 235 218 194 65 chr15 14808367 14808475 -88686499 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -532 122 1 4 698 658 335 41 97 chr15 14817299 14817639 -88677335 + MTE2b LTR MaLR 59 379 0 4 698 1442 267 32 10 chr15 14836625 14837037 -88657937 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 698 1390 162 4 0 chr15 14841457 14841688 -88653286 - RMER6C LTR ERVK -358 332 101 4 698 2865 71 2 53 chr15 14841688 14841781 -88653193 + MTA_Mm LTR MaLR 1 93 -303 4 698 2562 52 6 3 chr15 14841781 14842106 -88652868 - IAPLTR3 LTR ERVK 0 326 1 4 698 2865 71 2 53 chr15 14842106 14842206 -88652768 + MTA_Mm LTR MaLR 94 188 -208 4 698 2865 71 2 53 chr15 14842810 14843022 -88651952 + MTA_Mm LTR MaLR 189 396 0 4 698 418 200 11 22 chr15 14843027 14843119 -88651855 - RMER6C LTR ERVK -597 93 3 4 698 1491 215 70 37 chr15 14852495 14852990 -88641984 - RLTR12A LTR ERVK -2 566 1 4 698 259 228 204 19 chr15 14857840 14857943 -88637031 - MTE2a LTR MaLR 0 379 258 5 698 623 359 33 72 chr15 14859086 14859419 -88635555 - MTEa LTR MaLR -55 324 5 5 698 2057 155 12 3 chr15 14865670 14866013 -88628961 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 698 660 272 132 75 chr15 14868691 14868957 -88626017 - RMER20B LTR ERVK 0 627 347 5 698 441 245 43 0 chr15 14868989 14869083 -88625891 - RMER20B LTR ERVK -525 102 5 5 698 444 237 29 36 chr15 14869089 14869229 -88625745 - RLTR15 LTR ERVK -220 139 1 5 698 431 221 6 128 chr15 14869230 14869386 -88625588 - MYSERV6-int LTR ERVK 0 8959 8823 5 698 8043 232 41 45 chr15 14869390 14871617 -88623357 - MYSERV6-int LTR ERVK -4344 4615 2948 5 698 8043 216 18 36 chr15 14871717 14872123 -88622851 - MYSERV6-int LTR ERVK -6012 2947 2573 5 698 1961 263 36 88 chr15 14875013 14875838 -88619136 - MYSERV6-int LTR ERVK -6374 2585 1804 5 698 2293 66 65 6 chr15 14875838 14875955 -88619019 + RLTR10C LTR ERVK 96 222 -214 5 698 2293 66 65 6 chr15 14876003 14876207 -88618767 + RLTR10C LTR ERVK 223 434 -2 5 698 316 353 82 11 chr15 14877846 14878115 -88616859 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 4 5 698 448 354 42 42 chr15 14878956 14879239 -88615735 + RLTR26 LTR ERVK 135 417 -225 5 698 1114 238 4 47 chr15 14883510 14883766 -88611208 - MTC LTR MaLR -176 245 1 5 698 257 257 194 69 chr15 14887462 14887679 -88607295 + RLTR47_MM LTR ERV1 238 481 -51 5 698 280 326 76 33 chr15 14897109 14897293 -88597681 + MLT1A1 LTR MaLR 14 205 -203 5 698 1593 227 90 40 chr15 14902698 14903252 -88591722 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 3 584 0 5 698 838 346 48 44 chr15 14913555 14914078 -88580896 + RMER5 LTR ERV1 1 525 -9 5 698 232 203 55 78 chr15 14914836 14914964 -88580010 - RLTR25B LTR ERVK -507 521 397 5 698 1993 241 39 11 chr15 14915172 14915634 -88579340 - RLTR40 LTR ERVK -5 812 338 5 698 1270 229 18 48 chr15 14915845 14916180 -88578794 - RLTR40 LTR ERVK -490 327 3 5 698 1113 319 31 26 chr15 14920084 14920499 -88574475 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 5 698 240 321 56 42 chr15 14925819 14925962 -88569012 + RLTR14 LTR ERV1 225 369 -13 5 698 3241 181 29 46 chr15 14926679 14927110 -88567864 + RMER17A LTR ERVK 3 418 -333 5 698 3241 181 29 46 chr15 14927188 14927518 -88567456 + RMER17A LTR ERVK 419 751 0 5 698 1374 70 0 41 chr15 14941499 14941693 -88553281 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 290 6 698 1882 71 15 13 chr15 14941627 14941935 -88553039 - MTA_Mm LTR MaLR -106 301 3 6 87 328 315 139 60 chr15 14942049 14942380 -88552594 - MER67B LTR ERV1 -304 357 1 6 699 644 269 44 28 chr15 14942688 14942937 -88552037 + RMER5 LTR ERV1 33 285 -249 6 699 1984 162 63 11 chr15 14949181 14949562 -88545412 + RLTR9D LTR ERVK 1 401 -2 6 699 2812 108 10 0 chr15 14953716 14954132 -88540842 - BGLII LTR ERVK 0 421 2 6 699 12123 82 35 10 chr15 14956778 14957289 -88537685 - RLTR22_Mus LTR ERVK -6 1802 1292 6 699 12123 82 35 10 chr15 14957384 14958630 -88536344 - RLTR22_Mus LTR ERVK -517 1291 3 6 699 2023 178 39 6 chr15 14959543 14959905 -88535069 + MTC LTR MaLR 1 374 -47 6 699 791 196 32 76 chr15 14961290 14961539 -88533435 - RMER16 LTR ERVK 0 533 296 6 699 361 218 139 95 chr15 14961539 14961676 -88533298 - RMER16 LTR ERVK -177 356 214 6 699 265 243 13 39 chr15 14961644 14961721 -88533253 - RMER16 LTR ERVK -458 75 1 6 699 249 407 105 14 chr15 14968319 14968538 -88526436 - MLT1E2 LTR MaLR -65 562 324 6 699 2820 49 0 3 chr15 14968772 14969119 -88525855 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 699 720 350 110 26 chr15 14971947 14972555 -88522419 + MLT2B5 LTR ERVL 3 661 -56 6 699 479 176 42 69 chr15 14974681 14974870 -88520104 - RMER17C LTR ERVK -136 274 91 6 699 1916 109 28 22 chr15 14978357 14978677 -88516297 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 699 13088 44 6 16 chr15 14978677 14981163 -88513811 - ETnERV-int LTR ERVK 0 3314 949 6 699 1848 132 231 60 chr15 14981163 14981631 -88513343 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 37 6 699 231 230 211 39 chr15 14981633 14981737 -88513237 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -532 122 1 6 699 58400 38 13 0 chr15 14981737 14989339 -88505635 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 1 6 699 2018 131 249 32 chr15 14989340 14989806 -88505168 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -51 603 37 6 699 231 230 211 39 chr15 14989808 14989912 -88505062 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -532 122 1 6 699 7994 19 0 3 chr15 14989912 14990867 -88504107 - ETnERV-int LTR ERVK -2362 952 1 6 699 1897 112 28 22 chr15 14990867 14991187 -88503787 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 699 2062 207 67 44 chr15 14997889 14998589 -88496385 + ORR1A2 LTR MaLR 1 419 0 6 699 1450 218 59 24 chr15 15000119 15000458 -88494516 + ORR1B2 LTR MaLR 17 367 0 1 699 279 273 49 180 chr15 15002594 15002777 -88492197 + ORR1B1 LTR MaLR 78 236 -158 4 699 1335 160 0 33 chr15 15004408 15004653 -88490321 + RMER6D LTR ERVK 113 349 -371 9 699 2737 90 25 17 chr15 15007777 15008183 -88486791 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 699 990 235 137 20 chr15 15008184 15008527 -88486447 + ETnERV2-int LTR ERVK 2 384 -2930 1 699 5076 138 72 23 chr15 15008544 15009512 -88485462 + ETnERV2-int LTR ERVK 1071 2086 -5320 1 699 5331 143 41 22 chr15 15009536 15010543 -88484431 + ETnERV2-int LTR ERVK 1995 3448 -3958 1 699 3046 100 24 7 chr15 15010770 15011222 -88483752 + ETnERV2-int LTR ERVK 3441 3900 -3506 1 699 2418 199 34 70 chr15 15011214 15012327 -88482647 + MMETn-int LTR ERVK 1989 3141 -1703 1 699 744 289 154 40 chr15 15012347 15012743 -88482231 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 42 1 699 1039 241 22 136 chr15 15012808 15013003 -88481971 - MMETn-int LTR ERVK -483 4361 4173 1 699 1039 241 22 136 chr15 15013044 15013270 -88481704 - MMETn-int LTR ERVK -483 4172 3953 1 699 3358 325 73 60 chr15 15013288 15017837 -88477137 - RNERVK23-int LTR ERVK -420 7797 3333 1 699 3358 331 75 60 chr15 15017891 15018548 -88476426 - RNERVK23-int LTR ERVK -4885 3332 2662 1 699 259 212 15 139 chr15 15018869 15019006 -88475968 - RLTR45-int LTR ERVK -6213 1031 912 2 699 253 311 0 0 chr15 15019003 15019093 -88475881 - RNERVK23-int LTR ERVK -5336 1917 1828 1 699 489 250 8 8 chr15 15019241 15019366 -88475608 - RNERVK23-int LTR ERVK -6427 817 693 1 699 644 194 0 0 chr15 15019714 15019838 -88475136 - RNERVK23-int LTR ERVK -6552 692 569 1 699 1157 288 19 8 chr15 15020563 15020924 -88474050 - RNERVK23-int LTR ERVK -6749 495 131 1 699 840 113 16 8 chr15 15020985 15021110 -88473864 + ETnERV3-int LTR ERVK 5651 5776 -32 2 699 1681 176 40 19 chr15 15021129 15021642 -88473332 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 539 -363 2 699 252 51 0 114 chr15 15021642 15021686 -88473288 + ETnERV2-int LTR ERVK 7368 7406 0 2 699 2580 98 32 15 chr15 15021686 15022088 -88472886 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 699 1655 232 68 71 chr15 15024631 15025319 -88469655 + RLTR40 LTR ERVK 19 704 -113 2 699 1827 137 111 16 chr15 15025742 15026121 -88468853 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 1 2 699 1796 137 112 92 chr15 15030612 15031078 -88463896 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 699 2112 245 24 59 chr15 15033632 15034208 -88460766 - RMER2 LTR ERV1 -11 556 1 4 699 2030 136 3 6 chr15 15037794 15038106 -88456868 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 4 699 2319 202 57 43 chr15 15038505 15038668 -88456306 + RLTR25A LTR ERVK 513 686 -417 4 699 2319 202 57 43 chr15 15038720 15039139 -88455835 + RLTR25A LTR ERVK 687 1102 -1 4 699 350 288 82 18 chr15 15041906 15042076 -88452898 - MTE2a LTR MaLR -2 377 197 5 699 1760 163 28 37 chr15 15043697 15044022 -88450952 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 3 5 699 1924 131 34 34 chr15 15045133 15045458 -88449516 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 6 699 1037 228 103 55 chr15 15050669 15051017 -88443957 + ORR1D1 LTR MaLR 1 365 -9 7 699 2000 159 17 14 chr15 15056034 15056379 -88438595 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 699 691 307 52 5 chr15 15067338 15067551 -88427423 - MTD LTR MaLR -196 223 1 8 699 393 278 108 126 chr15 15068708 15068922 -88426052 + MTE2a LTR MaLR 156 365 -14 8 699 1122 242 178 22 chr15 15072087 15072442 -88422532 - RMER20B LTR ERVK -205 422 13 8 87 1631 184 256 46 chr15 15072747 15073317 -88421657 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 9 700 886 250 86 0 chr15 15081519 15081751 -88413223 - ORR1D1 LTR MaLR -122 252 1 1 700 790 339 102 38 chr15 15081767 15082267 -88412707 - MTE-int LTR MaLR -940 640 109 1 700 314 241 26 63 chr15 15084394 15084441 -88410533 - RLTR25B LTR ERVK -516 587 487 1 700 314 241 26 63 chr15 15084536 15084551 -88410423 - RLTR25B LTR ERVK -516 486 451 1 700 952 267 38 101 chr15 15090692 15091059 -88403915 + ORR1C2 LTR MaLR 1 344 -40 1 700 313 120 20 0 chr15 15091280 15091330 -88403644 + ORR1C2 LTR MaLR 334 384 0 1 700 324 330 74 15 chr15 15100465 15100668 -88394306 - LTR50 LTR ERVL -569 226 12 1 700 4614 146 50 15 chr15 15104694 15105569 -88389405 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 1 700 1442 163 122 46 chr15 15112383 15112723 -88382251 - ORR1A4 LTR MaLR -1 393 3 1 700 461 145 26 0 chr15 15112778 15112854 -88382120 - RMER6C LTR ERVK -81 609 532 1 700 341 286 139 23 chr15 15114169 15114341 -88380633 + RMER15 LTR ERVL 246 437 -138 1 700 1748 203 108 142 chr15 15120167 15120878 -88374096 - RMER6C LTR ERVK 0 690 4 1 700 3000 182 58 67 chr15 15124885 15125373 -88369601 - RMER6D LTR ERVK -4 716 208 1 700 3000 182 58 67 chr15 15125680 15125913 -88369061 - RMER6D LTR ERVK -513 207 1 1 700 1154 274 24 27 chr15 15126495 15126829 -88368145 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 42 1 700 1403 277 68 13 chr15 15137989 15138443 -88356531 - RLTR16 LTR ERVK -26 479 1 1 700 285 395 53 53 chr15 15146185 15146372 -88348602 - ORR1D2 LTR MaLR -173 197 11 1 700 426 327 23 1 chr15 15148793 15148941 -88346033 - MTD LTR MaLR -15 404 267 1 700 650 355 49 51 chr15 15150642 15150746 -88344228 + MT2A LTR ERVL 72 176 -357 1 700 650 355 49 51 chr15 15150825 15151109 -88343865 + MT2A LTR ERVL 177 458 -75 1 700 246 179 16 82 chr15 15151091 15151152 -88343822 + MLT2B2 LTR ERVL 506 562 0 1 700 859 207 122 35 chr15 15153392 15153622 -88341352 + ORR1B2 LTR MaLR 1 250 -117 1 700 1292 241 47 9 chr15 15153649 15153968 -88341006 + ORR1B2-int LTR MaLR 138 468 -1041 1 700 376 353 0 8 chr15 15156882 15157002 -88337972 + ORR1B2 LTR MaLR 6 124 -235 1 700 1548 241 87 31 chr15 15157835 15158353 -88336621 - RMER6C LTR ERVK -122 568 22 2 700 462 271 126 31 chr15 15160119 15160365 -88334609 + ORR1D1 LTR MaLR 1 281 -89 2 700 579 356 42 8 chr15 15161156 15161419 -88333555 + MT2A LTR ERVL 189 460 -73 2 700 1558 189 138 77 chr15 15162371 15163177 -88331797 - RMER6C LTR ERVK -4 716 1 2 700 1729 145 116 0 chr15 15169802 15170112 -88324862 - ORR1B2 LTR MaLR -21 346 1 2 700 1065 236 94 14 chr15 15174584 15174872 -88320102 + ORR1C2 LTR MaLR 73 383 -1 2 700 283 164 18 18 chr15 15175043 15175099 -88319875 + MTE2b LTR MaLR 323 378 -1 2 700 355 316 109 26 chr15 15175316 15175494 -88319480 + MTE-int LTR MaLR 1334 1527 -53 2 700 506 374 29 83 chr15 15175494 15175844 -88319130 + ORR1E LTR MaLR 1 331 -28 2 700 1752 118 70 0 chr15 15184688 15184959 -88310015 - ORR1A2 LTR MaLR -37 290 1 2 700 245 358 18 35 chr15 15189221 15189334 -88305640 - MLT1A0 LTR MaLR -246 119 9 2 700 1995 97 30 20 chr15 15190051 15190355 -88304619 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 307 -20 2 700 1408 178 233 3 chr15 15191288 15191631 -88303343 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 2 700 684 215 216 16 chr15 15191704 15191898 -88303076 + ORR1B2 LTR MaLR 92 324 -43 2 700 2507 214 34 32 chr15 15192517 15192983 -88301991 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 484 -93 2 700 2507 214 34 32 chr15 15193076 15193162 -88301812 + RLTR20B3 LTR ERVK 485 575 -2 2 700 2367 198 65 10 chr15 15193796 15194285 -88300689 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 2 87 2288 100 153 10 chr15 15204316 15204709 -88290265 - RLTR44B LTR ERVK 0 449 1 2 701 415 341 126 40 chr15 15206362 15206640 -88288334 - MLT2B4 LTR ERVL -199 357 56 2 701 2865 190 37 20 chr15 15207200 15207795 -88287179 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 1 2 701 1972 184 91 105 chr15 15212403 15212746 -88282228 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1244 2 701 1972 184 91 105 chr15 15212782 15212928 -88282046 - RLTR21 LTR ERVK -329 1243 1089 2 701 2237 190 96 30 chr15 15212928 15213428 -88281546 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 2 701 1972 125 0 200 chr15 15213428 15213461 -88281513 - RLTR21 LTR ERVK -484 1088 1066 2 701 442 256 167 105 chr15 15213625 15213850 -88281124 - RLTR21 LTR ERVK -266 1306 1094 2 701 442 256 167 105 chr15 15213877 15213956 -88281018 - RLTR21 LTR ERVK -479 1093 983 2 701 1260 154 14 9 chr15 15214631 15214854 -88280120 - RLTR21 LTR ERVK -1008 564 341 2 701 811 144 0 0 chr15 15214864 15214996 -88279978 - RLTR17 LTR ERVK -88 604 473 3 701 1627 164 39 7 chr15 15214995 15215278 -88279696 - RLTR17 LTR ERVK -400 292 1 3 701 1212 159 93 0 chr15 15215329 15215555 -88279419 - RLTR21 LTR ERVK -1325 247 1 2 701 288 397 26 21 chr15 15217855 15218089 -88276885 + MLT1D LTR MaLR 3 237 -268 3 701 1886 225 41 10 chr15 15219841 15220352 -88274622 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 3 701 313 278 10 62 chr15 15221086 15221182 -88273792 + RMER12 LTR ERVK 1232 1322 0 3 701 860 256 142 42 chr15 15224554 15224933 -88270041 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 701 1515 131 1 52 chr15 15229338 15229626 -88265348 + ORR1A3-int LTR MaLR 1618 1861 -102 3 701 265 353 32 32 chr15 15237776 15237931 -88257043 - MLT1-int LTR MaLR -668 703 549 3 701 539 188 10 10 chr15 15240099 15240201 -88254773 - ORR1D-int LTR MaLR -1029 341 240 3 701 293 286 22 60 chr15 15250544 15250566 -88244408 + MER67D LTR ERV1 47 68 -446 3 701 293 286 22 60 chr15 15251295 15251406 -88243568 + MER67D LTR ERV1 69 175 -339 3 701 282 402 57 45 chr15 15251669 15251914 -88243060 + MLT1E2 LTR MaLR 329 576 -51 3 701 1530 185 86 21 chr15 15252994 15253555 -88241419 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 3 701 590 298 11 11 chr15 15257935 15258118 -88236856 + MTC LTR MaLR 18 200 -221 3 701 446 299 91 34 chr15 15262971 15263210 -88231764 + MER67C LTR ERV1 20 279 -432 3 701 673 298 159 25 chr15 15264175 15264499 -88230475 - MTD LTR MaLR -14 405 12 3 701 310 309 84 39 chr15 15271728 15271883 -88223091 + MLT1A0 LTR MaLR 157 318 -47 3 701 2991 76 2 2 chr15 15286894 15287288 -88207686 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 4 701 294 342 67 55 chr15 15288075 15288239 -88206735 - MTE-int LTR MaLR -962 618 453 4 701 382 311 50 50 chr15 15288549 15288564 -88206410 - MTE-int LTR MaLR -1264 316 303 4 701 382 311 50 50 chr15 15288660 15288783 -88206191 - MTE-int LTR MaLR -1278 302 178 4 701 487 278 41 96 chr15 15290309 15290528 -88204446 - MTE2b LTR MaLR 0 379 173 4 701 1754 227 29 12 chr15 15294524 15294938 -88200036 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 701 1081 164 68 5 chr15 15295938 15296128 -88198846 - MTB LTR MaLR 0 400 199 4 701 432 188 105 50 chr15 15298126 15298317 -88196657 + RMER17D2 LTR ERVK 234 452 -357 4 701 609 273 84 44 chr15 15298317 15298332 -88196642 + ORR1C2 LTR MaLR 174 185 -199 4 701 432 188 105 50 chr15 15298382 15298394 -88196580 + RMER17D2 LTR ERVK 453 464 -345 4 701 609 273 84 44 chr15 15298394 15298569 -88196405 + ORR1C2 LTR MaLR 186 384 0 4 701 1058 189 49 32 chr15 15298894 15299297 -88195677 - RMER6B LTR ERVK 0 461 7 4 701 547 325 46 17 chr15 15302985 15303223 -88191751 - RMER15-int LTR ERVL -3841 1158 914 4 701 1546 249 6 8 chr15 15303799 15304155 -88190819 + ORR1C1 LTR MaLR 24 378 0 4 701 324 325 53 35 chr15 15304766 15304935 -88190039 + ORR1C1-int LTR MaLR 186 357 -1013 4 701 284 389 61 45 chr15 15305006 15305316 -88189658 + ORR1C1-int LTR MaLR 828 1142 -438 4 701 252 372 104 0 chr15 15305869 15306033 -88188941 + MTE-int LTR MaLR 965 1145 -435 4 701 527 291 100 79 chr15 15320394 15320739 -88174235 - MTE2a LTR MaLR -2 377 35 4 701 659 306 33 25 chr15 15331882 15332123 -88162851 - ORR1B2 LTR MaLR -104 263 21 4 702 1201 266 70 102 chr15 15355345 15355759 -88139215 - RMER6D LTR ERVK 0 720 332 5 702 1201 266 70 102 chr15 15356961 15357028 -88137946 - RMER6D LTR ERVK -389 331 254 5 702 536 275 0 0 chr15 15364557 15364677 -88130297 - ORR1D1 LTR MaLR -236 138 19 5 702 1082 274 48 51 chr15 15364774 15365105 -88129869 + ORR1D1 LTR MaLR 1 330 -44 5 702 2161 115 9 58 chr15 15383592 15383935 -88111039 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 702 618 198 52 0 chr15 15387665 15387781 -88107193 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7191 -215 5 702 313 211 0 40 chr15 15393765 15393839 -88101135 + ORR1B1-int LTR MaLR 1300 1370 0 5 702 1111 205 4 35 chr15 15393839 15394067 -88100907 + ORR1B1 LTR MaLR 1 221 -173 5 702 608 215 50 0 chr15 15395072 15395193 -88099781 + RMER10A LTR ERVL 39 165 -277 5 702 471 300 79 75 chr15 15401791 15402032 -88092942 + RLTR12B LTR ERVK 48 289 -239 5 702 703 113 0 0 chr15 15402041 15402138 -88092836 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 97 -286 5 702 13540 163 34 47 chr15 15402166 15404805 -88090169 + ETnERV2-int LTR ERVK 1325 3929 -3477 5 702 13540 167 68 35 chr15 15404840 15406065 -88088909 + ETnERV2-int LTR ERVK 2871 4176 -1230 5 702 470 219 8 50 chr15 15406073 15406193 -88088781 + ETnERV2-int LTR ERVK 6097 6211 -1195 5 702 389 278 16 57 chr15 15406319 15406379 -88088595 + ETnERV2-int LTR ERVK 6306 6363 -1043 5 702 7080 15 17 0 chr15 15406379 15407187 -88087787 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 5 702 389 278 16 57 chr15 15407187 15407248 -88087726 + ETnERV2-int LTR ERVK 6364 6422 -984 5 702 336 280 86 78 chr15 15407525 15407536 -88087438 + RLTR12B LTR ERVK 241 248 -280 5 702 2135 124 78 6 chr15 15407536 15407893 -88087081 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 5 702 336 280 86 78 chr15 15407893 15408137 -88086837 + RLTR12B LTR ERVK 249 498 -30 5 702 3572 62 24 18 chr15 15408704 15408750 -88086224 + LTRIS2 LTR ERV1 69 114 -450 5 702 3572 62 24 18 chr15 15408774 15409220 -88085754 + LTRIS2 LTR ERV1 115 563 -1 5 702 773 162 114 3 chr15 15409592 15409760 -88085214 + RLTR25A LTR ERVK 216 398 -705 5 702 1762 189 13 67 chr15 15412611 15412985 -88081989 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 702 735 224 163 5 chr15 15416187 15416389 -88078585 - ORR1D1 LTR MaLR -140 234 1 6 702 3172 51 5 0 chr15 15416580 15416974 -88078000 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 702 624 335 50 88 chr15 15418054 15418467 -88076507 + MER34 LTR ERV1 2 402 -140 6 702 624 335 50 88 chr15 15418711 15418857 -88076117 + MER34 LTR ERV1 403 540 -2 6 702 3100 46 3 3 chr15 15420045 15420436 -88074538 + MTA_Mm LTR MaLR 6 396 0 6 702 8461 60 7 2 chr15 15420436 15421528 -88073446 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 702 3194 51 2 2 chr15 15421528 15421924 -88073050 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 702 318 232 14 14 chr15 15422769 15422839 -88072135 + MTC LTR MaLR 5 74 -347 6 702 1286 214 63 47 chr15 15424221 15424629 -88070345 - RLTR1 LTR ERV1 0 624 135 6 702 1758 224 64 90 chr15 15424714 15425258 -88069716 - RMER15 LTR ERVL -43 532 3 6 702 1283 215 152 6 chr15 15425979 15426321 -88068653 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 6 702 648 138 7 146 chr15 15426869 15426950 -88068024 + ORR1A3 LTR MaLR 203 275 -51 6 702 648 138 7 146 chr15 15427161 15427223 -88067751 + ORR1A3 LTR MaLR 276 326 0 6 702 443 333 65 0 chr15 15431288 15431474 -88063500 + MTEb LTR MaLR 6 203 -176 6 702 927 349 46 0 chr15 15431715 15432039 -88062935 + MTE2a LTR MaLR 18 356 -23 6 702 2636 47 6 196 chr15 15432813 15433293 -88061681 + RLTR10 LTR ERVK 1 389 -1 6 702 8222 165 35 23 chr15 15443442 15443700 -88051274 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1293 6 702 8222 165 35 23 chr15 15443747 15445041 -88049933 - RLTR21 LTR ERVK -280 1292 2 6 702 1592 212 82 174 chr15 15445326 15445999 -88048975 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 702 821 238 243 59 chr15 15464723 15465197 -88029777 + RMER2 LTR ERV1 3 563 -4 6 703 333 135 0 0 chr15 15472191 15472243 -88022731 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7382 -24 6 703 1823 154 37 34 chr15 15472276 15472599 -88022375 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 324 -96 6 703 443 287 0 62 chr15 15490253 15490383 -88004591 + RMER5 LTR ERV1 21 142 -392 7 703 1166 273 95 30 chr15 15491225 15491700 -88003274 + MER67C LTR ERV1 204 709 -2 7 703 1577 186 12 68 chr15 15495568 15495908 -87999066 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 7 703 1265 266 50 11 chr15 15497802 15498159 -87996815 + ORR1D1 LTR MaLR 4 374 0 7 703 549 275 36 3 chr15 15498162 15498317 -87996657 + ORR1D1-int LTR MaLR 13 169 -1340 7 703 873 273 26 22 chr15 15499768 15500000 -87994974 + MTD LTR MaLR 21 253 -166 7 703 461 252 143 0 chr15 15500000 15500147 -87994827 + MTC LTR MaLR 254 421 0 1 703 362 353 125 29 chr15 15502763 15503043 -87991931 - MLT1A0 LTR MaLR -58 307 1 6 703 3326 33 5 0 chr15 15513512 15513906 -87981068 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 703 485 303 62 6 chr15 15513989 15514168 -87980806 + MT2A LTR ERVL 1 189 -344 2 703 1192 216 38 112 chr15 15514251 15514649 -87980325 - RLTR11A LTR ERVK -160 368 1 2 703 4660 87 16 65 chr15 15518702 15519491 -87975483 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 2 703 3174 178 81 21 chr15 15523007 15523720 -87971254 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 3 703 1654 219 24 5 chr15 15523929 15524300 -87970674 + RLTR14 LTR ERV1 3 380 -2 3 703 2571 139 10 0 chr15 15532065 15532461 -87962513 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 703 4092 121 16 62 chr15 15533383 15534170 -87960804 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 4 703 2589 99 0 24 chr15 15537220 15537601 -87957373 + MTB_Mm LTR MaLR 1 372 -35 4 703 559 330 128 71 chr15 15539960 15540427 -87954547 - RMER13A LTR ERVK -131 729 236 5 703 312 307 52 52 chr15 15540686 15540858 -87954116 - RMER13A LTR ERVK -591 269 98 5 703 402 238 69 0 chr15 15544304 15544405 -87950569 + RMER20B LTR ERVK 2 109 -518 5 703 352 241 43 26 chr15 15546124 15546239 -87948735 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 314 5 703 2430 219 113 128 chr15 15547306 15547427 -87947547 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 896 6 703 2430 219 113 128 chr15 15547549 15548430 -87946544 - RLTR25B LTR ERVK -133 895 28 6 703 254 59 0 0 chr15 15553480 15553514 -87941460 + RMER19C LTR ERVK 1 34 -577 7 703 357 312 112 40 chr15 15556259 15556483 -87938491 - MLT1B LTR MaLR -17 373 134 8 703 1461 322 73 17 chr15 15567001 15567589 -87927385 - MER67B LTR ERV1 -2 659 39 9 703 481 338 29 29 chr15 15568749 15568953 -87926021 + MLT1F-int LTR MaLR 367 570 -919 1 703 898 265 139 21 chr15 15577592 15577931 -87917043 - MTD LTR MaLR 0 419 41 1 703 883 285 99 38 chr15 15580167 15580459 -87914515 - ORR1C2 LTR MaLR -63 321 12 1 703 309 343 13 53 chr15 15583174 15583325 -87911649 + MLT1A0 LTR MaLR 196 340 -25 1 703 719 309 30 27 chr15 15585573 15585872 -87909102 + RMER5 LTR ERV1 224 523 -11 1 703 418 290 86 7 chr15 15586020 15586150 -87908824 - MLT2B4 LTR ERVL -402 154 13 1 703 593 184 58 58 chr15 15589106 15589302 -87905672 + RMER17C LTR ERVK 80 276 -134 1 703 593 184 58 58 chr15 15589343 15589371 -87905603 + RMER17C LTR ERVK 277 304 -106 1 703 1144 251 90 67 chr15 15596437 15596869 -87898105 - RMER19C LTR ERVK 0 611 170 1 704 2665 40 3 27 chr15 15611101 15611436 -87883538 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 1 704 583 226 45 0 chr15 15613393 15613526 -87881448 - ORR1B2 LTR MaLR -228 139 1 1 704 1676 186 18 41 chr15 15613526 15613919 -87881055 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 1126 1 704 1563 210 36 6 chr15 15613891 15614221 -87880753 - ORR1B2-int LTR MaLR -1169 340 1 1 704 1533 212 21 70 chr15 15614221 15614607 -87880367 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 704 418 298 35 14 chr15 15615743 15615886 -87879088 + MLT2F LTR ERVL 11 156 -507 1 704 380 241 12 0 chr15 15616181 15616264 -87878710 + ORR1C1 LTR MaLR 1 84 -283 1 704 667 211 8 0 chr15 15616268 15616396 -87878578 + ORR1C1 LTR MaLR 250 378 0 1 704 556 290 20 25 chr15 15617744 15617942 -87877032 + ERVL-E-int LTR ERVL 2264 2460 -3207 1 704 235 375 16 32 chr15 15619735 15619859 -87875115 - RMER12 LTR ERVK -472 850 729 1 704 2972 134 154 0 chr15 15624043 15624549 -87870425 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 1 704 5631 148 25 81 chr15 15624553 15625712 -87869262 + MTB_Mm-int LTR MaLR 3 1096 -2 1 704 2582 128 14 31 chr15 15625714 15626127 -87868847 + MTB_Mm LTR MaLR 1 406 -1 1 704 1386 169 4 181 chr15 15628148 15628646 -87866328 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 704 519 273 65 53 chr15 15628842 15629179 -87865795 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 1 1 704 235 245 68 68 chr15 15635996 15636114 -87858860 + RLTR21 LTR ERVK 1010 1127 -445 2 704 1577 170 30 170 chr15 15637681 15638176 -87856798 + RLTR23 LTR ERV1 3 428 -2 2 704 2437 221 107 72 chr15 15639117 15639692 -87855282 + RLTR40 LTR ERVK 14 567 -250 2 704 2437 221 107 72 chr15 15639774 15639965 -87855009 + RLTR40 LTR ERVK 568 807 -10 2 704 265 349 18 18 chr15 15642391 15642502 -87852472 + ORR1D1 LTR MaLR 1 111 -263 2 704 242 271 54 0 chr15 15655761 15655890 -87839084 - RMER17A LTR ERVK -289 462 327 2 704 338 258 68 74 chr15 15659680 15659843 -87835131 + MTE-int LTR MaLR 1329 1490 -90 2 704 607 329 40 37 chr15 15659849 15660203 -87834771 + ORR1E LTR MaLR 4 358 -1 2 704 3067 31 0 0 chr15 15677483 15677840 -87817134 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 2 704 2857 46 0 0 chr15 15677920 15678266 -87816708 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 704 260 280 54 36 chr15 15679869 15679980 -87814994 + MLT1C LTR MaLR 350 462 -5 2 704 776 290 25 83 chr15 15685784 15686116 -87808858 + MER67D LTR ERV1 1 343 -368 2 704 521 306 24 29 chr15 15690608 15690817 -87804157 - RMER15 LTR ERVL -5 570 363 2 704 894 311 103 57 chr15 15700746 15701203 -87793771 + MTC-int LTR MaLR 552 1029 -229 3 704 378 262 50 76 chr15 15702427 15702625 -87792349 + MTC-int LTR MaLR 1066 1258 0 3 704 292 224 15 15 chr15 15702674 15702742 -87792232 + MTC LTR MaLR 15 82 -339 3 704 2036 151 3 3 chr15 15702805 15703124 -87791850 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 704 4423 207 114 26 chr15 15703125 15704763 -87790211 - ORR1A2-int LTR MaLR -1 1791 1 3 704 1740 131 110 0 chr15 15704763 15705054 -87789920 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 3 704 694 210 51 0 chr15 15706627 15706765 -87788209 + RMER6C LTR ERVK 1 145 -545 3 704 325 276 0 0 chr15 15706747 15706823 -87788151 + MT2B LTR ERVL 181 256 -345 3 704 3262 39 3 0 chr15 15709479 15709863 -87785111 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 3 704 3193 52 3 0 chr15 15714529 15714913 -87780061 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 3 704 21649 48 5 6 chr15 15714913 15717626 -87777348 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 4804 3 704 6694 101 50 9 chr15 15717626 15718642 -87776332 - IAPEy-int LTR ERVK -6455 1058 1 3 704 3193 52 3 0 chr15 15718642 15719026 -87775948 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 3 704 554 261 93 25 chr15 15721790 15721994 -87772980 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 265 3 704 464 333 130 36 chr15 15723270 15723600 -87771374 + MTB_Mm LTR MaLR 1 361 -46 3 705 370 284 26 44 chr15 15732444 15732558 -87762416 - MT2B LTR ERVL -332 269 158 3 705 2411 224 40 25 chr15 15732559 15733157 -87761817 - ORR1B2-int LTR MaLR -889 620 14 3 705 1020 231 65 20 chr15 15733157 15733404 -87761570 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 110 3 705 353 234 53 11 chr15 15733497 15733592 -87761382 - ORR1B2 LTR MaLR -266 101 3 3 705 1013 238 117 0 chr15 15734993 15735266 -87759708 - ORR1A3 LTR MaLR -21 305 1 3 705 304 241 0 12 chr15 15738134 15738218 -87756756 + MTD LTR MaLR 8 90 -329 3 705 503 259 139 12 chr15 15738210 15738382 -87756592 + MTD LTR MaLR 226 419 0 3 705 1211 293 124 26 chr15 15742043 15742582 -87752392 + MER67B LTR ERV1 70 661 0 3 705 282 358 97 15 chr15 15742712 15742908 -87752066 + MLT2E LTR ERVL 192 403 -225 3 705 383 328 144 52 chr15 15743125 15743472 -87751502 + MLT1H-int LTR MaLR 776 1154 -255 3 705 238 339 32 41 chr15 15743810 15743933 -87751041 + MLT1E1A LTR MaLR 559 680 0 3 705 292 258 120 38 chr15 15743975 15744108 -87750866 - MTE2b LTR MaLR -14 365 222 3 705 1806 204 39 11 chr15 15751146 15751502 -87743472 + MTC LTR MaLR 2 367 -54 3 705 1586 204 62 24 chr15 15756913 15757249 -87737725 + ORR1B1 LTR MaLR 39 387 -7 3 705 422 250 17 35 chr15 15757414 15757530 -87737444 + RMER15 LTR ERVL 340 453 -122 3 705 332 331 12 55 chr15 15761320 15761483 -87733491 - RLTR40 LTR ERVK -598 219 64 4 705 426 273 109 0 chr15 15761655 15761723 -87733251 - MTD LTR MaLR 0 419 345 4 705 426 273 109 0 chr15 15761754 15761813 -87733161 - MTD LTR MaLR -75 344 279 4 705 319 383 82 18 chr15 15761932 15762102 -87732872 - MTD LTR MaLR -143 278 98 4 705 1411 209 69 0 chr15 15762737 15763057 -87731917 - RMER6C LTR ERVK 0 690 349 4 705 344 193 0 0 chr15 15763111 15763168 -87731806 - MT2B LTR ERVL -364 237 181 4 705 588 167 28 9 chr15 15763152 15763261 -87731713 - RMER6C LTR ERVK -579 111 1 4 705 306 271 0 0 chr15 15763494 15763564 -87731410 - ORR1D-int LTR MaLR -48 1322 1253 4 705 3211 201 74 95 chr15 15764083 15764401 -87730573 + RMER13A LTR ERVK 1 312 -548 4 705 3211 201 74 95 chr15 15765135 15765669 -87729305 + RMER13A LTR ERVK 313 835 -25 4 705 6925 95 29 8 chr15 15768867 15769869 -87725105 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 4 705 1434 247 88 43 chr15 15776961 15777023 -87717951 - RMER5 LTR ERV1 -26 508 432 4 705 1434 247 88 43 chr15 15777644 15778046 -87716928 - RMER5 LTR ERV1 -103 431 24 4 705 540 327 179 9 chr15 15779387 15779601 -87715373 - MTE2b LTR MaLR -122 257 7 4 705 721 134 0 26 chr15 15784866 15784981 -87709993 - RLTR19C LTR ERVK -43 463 352 4 705 1949 132 0 7 chr15 15785041 15785347 -87709627 - RLTR19C LTR ERVK -166 340 37 4 705 694 266 40 0 chr15 15787262 15787439 -87707535 + RLTR19-int LTR ERVK 5415 5598 -539 4 705 306 308 111 0 chr15 15788867 15788984 -87705990 + ORR1A4 LTR MaLR 4 133 -226 4 705 254 316 59 30 chr15 15789664 15789765 -87705209 + ORR1A4 LTR MaLR 146 249 -121 4 705 306 182 14 57 chr15 15789736 15789806 -87705168 + ORR1A4 LTR MaLR 89 155 -174 4 705 8601 171 77 85 chr15 15789823 15790757 -87704217 + ORR1A4-int LTR MaLR 2 973 -990 4 705 8601 171 77 85 chr15 15791085 15792128 -87702846 + ORR1A4-int LTR MaLR 974 1963 0 4 705 1714 203 12 9 chr15 15792128 15792456 -87702518 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 705 388 310 76 60 chr15 15796546 15796731 -87698243 + RLTR23 LTR ERV1 1 188 -242 4 705 1375 180 62 93 chr15 15801465 15801789 -87693185 + ORR1A4 LTR MaLR 1 314 -15 4 705 2824 16 0 0 chr15 15808781 15809103 -87685871 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 705 3716 62 19 0 chr15 15810610 15811074 -87683900 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 3 4 705 852 284 194 0 chr15 15813716 15814016 -87680958 + ORR1C1 LTR MaLR 21 378 0 4 705 382 355 51 13 chr15 15816856 15817013 -87677961 + ORR1D2 LTR MaLR 5 167 -203 4 705 1055 213 111 44 chr15 15817076 15817419 -87677555 + RMER10A LTR ERVL 77 442 0 4 705 260 339 39 31 chr15 15817419 15817534 -87677440 + ORR1D2 LTR MaLR 255 370 0 4 705 515 283 83 0 chr15 15818025 15818205 -87676769 + MTEb LTR MaLR 185 379 0 4 705 839 280 36 113 chr15 15828176 15828634 -87666340 - MT2B LTR ERVL -83 518 1 4 705 2927 176 56 31 chr15 15856447 15857033 -87637941 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 5 88 3323 41 5 0 chr15 15859482 15859876 -87635098 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 706 424 374 98 14 chr15 15860216 15860493 -87634481 - MLT1A0 LTR MaLR -57 308 9 5 706 4377 45 0 0 chr15 15865387 15865937 -87629037 - MT-int LTR MaLR -77 1021 472 5 706 2071 246 100 18 chr15 15877910 15878355 -87616619 + RMER20B LTR ERVK 2 465 -162 5 706 2071 246 100 18 chr15 15878443 15878547 -87616427 + RMER20B LTR ERVK 466 596 -31 5 706 793 286 87 0 chr15 15884251 15884482 -87610492 + MTD LTR MaLR 113 363 -56 5 706 1043 259 117 110 chr15 15889040 15889413 -87605561 - RMER6D LTR ERVK -33 687 347 5 706 1043 250 121 105 chr15 15889439 15889691 -87605283 - RMER6D LTR ERVK -374 346 6 5 706 1073 204 33 84 chr15 15894520 15894755 -87600219 - RMER6C LTR ERVK 0 690 467 5 706 1073 204 33 84 chr15 15895663 15895723 -87599251 - RMER6C LTR ERVK -224 466 407 5 706 671 148 0 36 chr15 15895804 15895916 -87599058 - RMER6C LTR ERVK -607 113 6 5 706 1903 120 3 75 chr15 15900265 15900598 -87594376 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 5 706 264 282 65 78 chr15 15901551 15901606 -87593368 - MER21B LTR ERV1 -286 577 528 5 706 2247 101 169 19 chr15 15901606 15902019 -87592955 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 706 264 282 65 78 chr15 15902019 15902117 -87592857 - MER21B LTR ERV1 -336 527 426 5 706 2535 78 27 0 chr15 15902407 15902742 -87592232 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 3 5 706 378 219 121 62 chr15 15914431 15914558 -87580416 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 200 6 706 872 267 39 16 chr15 15915484 15915739 -87579235 + RLTR18B LTR ERVK 1 261 -251 6 706 973 238 46 78 chr15 15915758 15916041 -87578933 + RLTR18B LTR ERVK 238 511 -1 6 706 1629 249 83 66 chr15 15916047 15916639 -87578335 - RMER19C LTR ERVK 0 611 10 6 706 756 201 43 27 chr15 15917360 15917616 -87577358 + RMER17C LTR ERVK 15 274 -136 6 706 273 250 0 121 chr15 15922424 15922515 -87572459 - MT2B LTR ERVL -374 227 148 6 706 402 244 0 13 chr15 15922512 15922591 -87572383 - MT2B LTR ERVL -342 259 182 6 706 431 177 156 0 chr15 15922576 15922672 -87572302 - RMER6C LTR ERVK -579 111 1 6 706 312 75 0 0 chr15 15924426 15924466 -87570508 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 285 6 706 1989 152 3 3 chr15 15924466 15924777 -87570197 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 6 706 1798 118 113 122 chr15 15924777 15925203 -87569771 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 422 -7159 6 706 809 124 0 0 chr15 15925304 15925425 -87569549 + MMERVK10C-int LTR ERVK 441 561 -7020 6 706 1064 102 12 29 chr15 15925408 15925579 -87569395 + MMERVK10C-int LTR ERVK 668 835 -6746 6 706 1217 190 169 14 chr15 15925592 15926006 -87568968 + RMER16-int LTR ERVK 192 661 -5476 6 706 267 186 0 0 chr15 15926002 15926045 -87568929 + RMER16-int LTR ERVK 950 992 -995 6 706 500 313 21 21 chr15 15926185 15926465 -87568509 + IAPEY3-int LTR ERVK 822 1063 -5479 6 706 359 143 0 0 chr15 15926483 15926539 -87568435 + IAP-d-int LTR ERVK 448 503 -6039 6 706 1452 112 112 0 chr15 15926539 15926763 -87568211 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5255 -1287 6 706 4076 125 8 9 chr15 15926763 15927455 -87567519 + IAPEY3-int LTR ERVK 6965 7680 0 6 706 829 173 7 7 chr15 15927455 15927595 -87567379 + RLTR10E LTR ERVK 1 140 -171 6 706 1974 36 120 0 chr15 15927590 15927866 -87567108 - ORR1A1 LTR MaLR -36 310 2 6 706 1827 112 0 68 chr15 15935187 15935483 -87559491 - ORR1A2 LTR MaLR -51 276 1 6 706 7164 202 106 6 chr15 15935483 15935763 -87559211 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1792 1507 6 706 7164 202 106 6 chr15 15936210 15937559 -87557415 - ORR1A2-int LTR MaLR -286 1506 2 6 706 381 43 0 0 chr15 15937563 15937610 -87557364 - ORR1A2 LTR MaLR -8 338 292 6 706 1209 130 0 11 chr15 15938567 15938787 -87556187 - ORR1A2 LTR MaLR -19 327 104 6 706 1139 287 67 12 chr15 15942239 15942584 -87552390 + MTD LTR MaLR 3 366 -53 6 706 516 336 75 51 chr15 15942590 15942681 -87552293 - MTE2a LTR MaLR -77 302 218 6 706 2677 88 67 3 chr15 15942681 15943057 -87551917 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 706 516 336 75 51 chr15 15943057 15943260 -87551714 - MTE2a LTR MaLR -162 217 1 6 706 2057 232 79 92 chr15 15943338 15943970 -87551004 + RMER20B LTR ERVK 4 627 0 6 706 2489 232 20 63 chr15 15944341 15944979 -87549995 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 706 3390 180 29 37 chr15 15945968 15946730 -87548244 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 6 706 1106 283 42 89 chr15 15951791 15951886 -87543088 - RLTR28B LTR ERVL 0 481 390 6 706 1106 283 42 89 chr15 15952324 15952709 -87542265 - RLTR28B LTR ERVL -92 389 26 6 706 1514 184 11 18 chr15 15955653 15955935 -87539039 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 32 6 706 403 332 107 50 chr15 15958944 15959242 -87535732 + MLT1D LTR MaLR 191 505 0 6 706 274 366 47 44 chr15 15959473 15959747 -87535227 - LTR83 LTR ERVL -485 295 21 6 706 265 367 27 54 chr15 15969043 15969190 -87525784 - MTEa LTR MaLR -233 146 4 7 706 376 342 110 51 chr15 15977431 15977884 -87517090 - MLT1D LTR MaLR -20 485 6 7 706 1169 282 147 36 chr15 15983970 15984466 -87510508 - RMER15 LTR ERVL -24 551 1 7 707 306 256 24 24 chr15 15991293 15991377 -87503597 - ORR1E LTR MaLR -166 193 110 7 707 244 311 17 28 chr15 16000551 16000677 -87494297 + MLT2B4 LTR ERVL 1 120 -395 1 707 621 219 0 8 chr15 16004012 16004136 -87490838 - MTE2b LTR MaLR -256 123 1 6 707 299 340 73 81 chr15 16009645 16009879 -87485095 - ORR1E LTR MaLR -120 239 8 2 707 1235 222 147 42 chr15 16010140 16010493 -87484481 - RMER10B LTR ERVL 0 398 9 2 707 1263 239 57 3 chr15 16010994 16011292 -87483682 - MTC LTR MaLR -2 419 106 2 707 233 217 0 0 chr15 16014279 16014325 -87480649 - MTC LTR MaLR -299 120 75 2 707 577 180 71 165 chr15 16020966 16021297 -87473677 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 402 -7 3 707 3331 22 2 2 chr15 16047214 16047625 -87447349 + MT-int LTR MaLR 614 1024 -74 7 707 864 153 7 0 chr15 16058944 16059081 -87435893 + RLTR13D6 LTR ERVK 21 158 -744 8 707 3036 175 88 33 chr15 16060541 16061232 -87433742 + RLTR13D6 LTR ERVK 164 892 -10 8 707 942 302 46 86 chr15 16063659 16064333 -87430641 - MTC-int LTR MaLR -192 1066 307 9 707 1581 251 136 57 chr15 16065105 16065651 -87429323 - RMER19B LTR ERVK 0 902 314 9 707 3349 40 0 0 chr15 16066997 16067393 -87427581 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 707 381 380 81 21 chr15 16088533 16088767 -87406207 + MLT1E3 LTR MaLR 309 556 -68 1 707 1804 249 87 45 chr15 16090160 16090677 -87404297 - RLTR20A LTR ERVK -2 539 1 1 707 2247 70 129 11 chr15 16092305 16092654 -87402320 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 707 870 337 37 43 chr15 16092962 16093337 -87401637 - MTE2b LTR MaLR -1 378 6 1 707 423 372 101 17 chr15 16094593 16094940 -87400034 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 21 1 707 326 338 77 58 chr15 16097680 16097887 -87397087 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 145 1 707 2751 44 0 139 chr15 16100907 16101331 -87393643 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 1 707 2814 65 52 0 chr15 16103749 16104118 -87390856 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 1 707 3275 46 5 0 chr15 16105029 16105423 -87389551 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 707 8634 50 22 0 chr15 16105423 16106497 -87388477 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 707 3272 46 5 0 chr15 16106497 16106890 -87388084 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 707 4947 154 17 16 chr15 16109955 16110840 -87384134 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 21 1 707 1962 106 11 70 chr15 16111242 16111598 -87383376 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 1 707 3387 80 4 44 chr15 16111598 16112445 -87382529 + IAPEz-int LTR ERVK 6 662 -5819 1 707 418 125 0 30 chr15 16112445 16112511 -87382463 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1422 -5059 1 707 1813 119 4 4 chr15 16112497 16112759 -87382215 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 1 707 917 88 24 0 chr15 16112754 16112879 -87382095 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 1 707 25641 22 6 0 chr15 16112879 16115818 -87379156 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 1 707 1967 103 11 70 chr15 16115818 16116174 -87378800 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 1 88 2322 202 57 31 chr15 16121472 16122018 -87372956 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 1 1 708 371 178 8 144 chr15 16122882 16123000 -87371974 - MT2B LTR ERVL -337 264 163 1 708 443 349 94 21 chr15 16124944 16125275 -87369699 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 11 1 708 1242 315 28 13 chr15 16125880 16126275 -87368699 - MTD LTR MaLR -1 418 18 1 708 367 321 50 179 chr15 16126297 16126610 -87368364 + MTE2b LTR MaLR 83 387 -32 1 708 468 258 40 58 chr15 16133031 16133204 -87361770 - MTEa LTR MaLR -4 375 206 1 708 621 290 60 43 chr15 16139301 16139650 -87355324 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 2 708 1925 249 11 115 chr15 16141112 16141597 -87353377 - RMER19C LTR ERVK -47 564 128 2 708 1925 249 11 115 chr15 16141632 16141763 -87353211 - RMER19C LTR ERVK -484 127 12 2 708 1115 279 19 3 chr15 16141828 16142137 -87352837 - RLTR30 LTR ERV1 -18 361 48 2 708 1068 203 130 8 chr15 16147354 16147607 -87347367 - RMER6C LTR ERVK 0 690 407 2 708 930 150 310 8 chr15 16148305 16148560 -87346414 - RMER6C LTR ERVK -358 332 1 2 708 234 133 0 118 chr15 16150325 16150376 -87344598 - MT2C_Mm LTR ERVL -235 240 196 2 708 537 271 169 92 chr15 16154297 16154569 -87340405 - ORR1E LTR MaLR -66 293 1 2 708 264 353 145 29 chr15 16158307 16158479 -87336495 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 196 2 708 608 241 14 36 chr15 16164806 16164972 -87330002 + ORR1D2 LTR MaLR 1 125 -245 2 708 450 274 89 0 chr15 16165178 16165335 -87329639 + ORR1D2 LTR MaLR 198 368 -2 2 708 387 309 20 54 chr15 16170349 16170496 -87324478 - MTEb LTR MaLR -161 218 77 2 708 1771 186 16 139 chr15 16173834 16173903 -87321071 + ORR1B1 LTR MaLR 11 80 -314 2 708 1771 186 16 139 chr15 16174737 16175105 -87319869 + ORR1B1 LTR MaLR 81 394 0 2 708 872 178 0 0 chr15 16175105 16175257 -87319717 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 152 -1357 2 708 268 351 86 36 chr15 16176184 16176462 -87318512 + MLT1E2 LTR MaLR 221 489 -138 2 708 629 336 62 83 chr15 16179542 16180013 -87314961 + MT2A LTR ERVL 63 523 -10 2 708 2394 162 18 26 chr15 16184595 16184709 -87310265 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 336 2 708 2394 162 18 26 chr15 16184742 16185083 -87309891 - RLTR11B LTR ERVK -118 335 2 2 708 3002 224 141 13 chr15 16186591 16187455 -87307519 + ORR1B1-int LTR MaLR 535 1509 0 2 708 1764 227 17 6 chr15 16187455 16187808 -87307166 + ORR1B1 LTR MaLR 38 394 0 2 708 2061 179 177 38 chr15 16209069 16209668 -87285306 - RMER6C LTR ERVK -8 682 1 3 708 234 314 14 41 chr15 16215122 16215195 -87279779 - LTR78 LTR ERV1 -1031 273 203 3 708 2944 67 26 0 chr15 16221070 16221456 -87273518 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 708 7818 64 5 9 chr15 16221456 16222178 -87272796 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 380 3 708 8111 63 5 9 chr15 16222981 16223361 -87271613 - MTA_Mm-int LTR MaLR -719 379 1 3 708 2992 79 5 2 chr15 16223361 16223756 -87271218 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 708 3083 62 25 0 chr15 16224799 16225200 -87269774 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 3 708 249 312 109 9 chr15 16226080 16226190 -87268784 - MLT1B LTR MaLR -252 138 18 3 708 297 254 61 122 chr15 16242353 16242501 -87252473 - MTE2a LTR MaLR 0 379 241 3 708 244 328 78 31 chr15 16247208 16247337 -87247637 - ORR1E LTR MaLR -224 135 1 3 708 291 294 56 42 chr15 16248074 16248216 -87246758 + LTR16A LTR ERVL 300 443 -8 3 708 451 212 0 96 chr15 16251116 16251139 -87243835 + MT2B LTR ERVL 145 155 -446 3 708 269 209 72 29 chr15 16251184 16251253 -87243721 + RLTR25A LTR ERVK 522 593 -510 3 709 2888 67 20 15 chr15 16254691 16255085 -87239889 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 709 2001 214 108 43 chr15 16258483 16258759 -87236215 + RMER6C LTR ERVK 11 299 -391 3 709 2001 214 108 43 chr15 16258950 16259255 -87235719 + RMER6C LTR ERVK 300 630 -60 3 709 1051 291 70 15 chr15 16260888 16261216 -87233758 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 29 3 709 7075 91 19 20 chr15 16262281 16263306 -87231668 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 4 709 1810 133 32 16 chr15 16263927 16264239 -87230735 + ORR1A4 LTR MaLR 1 317 -12 4 709 1451 194 9 40 chr15 16284653 16284759 -87210215 - RMER6A LTR ERVK -112 644 542 4 709 1509 168 219 25 chr15 16284759 16285119 -87209855 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 4 709 1451 194 9 40 chr15 16285119 16285334 -87209640 - RMER6A LTR ERVK -215 541 333 4 709 766 178 7 7 chr15 16285307 16285454 -87209520 - RMER6A LTR ERVK -571 185 39 4 709 568 282 46 137 chr15 16288179 16288615 -87206359 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 6 4 709 396 295 9 19 chr15 16288615 16288722 -87206252 - ORR1C2 LTR MaLR -179 180 75 4 709 1872 250 19 34 chr15 16289449 16290155 -87204819 + RLTR25A LTR ERVK 1 745 -283 4 709 519 220 37 29 chr15 16292825 16292961 -87202013 + RLTR25A LTR ERVK 892 1028 0 4 709 364 241 38 55 chr15 16293759 16293926 -87201048 - MTC LTR MaLR -22 399 188 4 709 251 283 77 14 chr15 16293903 16294054 -87200920 - MTC LTR MaLR -144 235 95 4 709 1955 188 22 50 chr15 16295637 16296040 -87198934 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 4 709 990 75 0 8 chr15 16302885 16303019 -87191955 + RLTR9E LTR ERVK 7 139 -270 4 709 1638 144 11 4 chr15 16303386 16303658 -87191316 + RLTR9E LTR ERVK 131 404 -5 4 709 282 332 265 35 chr15 16304474 16304761 -87190213 + MTD LTR MaLR 1 353 -66 4 709 1155 285 39 141 chr15 16314269 16314414 -87180560 + RMER15 LTR ERVL 3 106 -469 4 709 1155 285 39 141 chr15 16314469 16314961 -87180013 + RMER15 LTR ERVL 107 575 0 4 709 2991 32 0 0 chr15 16327549 16327895 -87167079 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 709 520 351 44 14 chr15 16329630 16329905 -87165069 - MTEb LTR MaLR -4 375 93 4 709 307 291 20 27 chr15 16329899 16330021 -87164953 - MLT1A0 LTR MaLR -46 362 220 4 709 1908 155 3 0 chr15 16330851 16331167 -87163807 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 3 4 709 2223 239 13 41 chr15 16331230 16331782 -87163192 - RMER20B LTR ERVK 0 627 98 4 709 2083 179 46 161 chr15 16333437 16334361 -87160613 - RMER6C LTR ERVK 0 720 3 4 709 1019 271 61 67 chr15 16334438 16334814 -87160160 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 709 1894 199 30 66 chr15 16338091 16338528 -87156446 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 709 473 271 185 46 chr15 16339385 16339711 -87155263 - RMER13A LTR ERVK -392 468 98 5 709 3111 70 0 2 chr15 16340094 16340495 -87154479 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 709 408 345 67 73 chr15 16346320 16346676 -87148298 - ORR1E LTR MaLR -4 355 2 5 709 3369 143 82 34 chr15 16356009 16356990 -87137984 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 1023 0 5 709 501 185 311 0 chr15 16361321 16361456 -87133518 + RMER6C LTR ERVK 1 177 -513 5 709 1468 179 39 3 chr15 16361492 16361777 -87133197 + RMER6C LTR ERVK 396 690 0 5 709 737 340 76 14 chr15 16363114 16363469 -87131505 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 5 709 3547 179 180 23 chr15 16365105 16365890 -87129084 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 5 709 292 175 0 45 chr15 16379789 16379855 -87115119 - ORR1C2 LTR MaLR -232 152 90 5 710 6002 46 3 11 chr15 16384625 16385375 -87109599 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 5 710 2033 97 0 0 chr15 16385374 16385652 -87109322 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 5 710 3450 54 25 16 chr15 16385652 16386218 -87108756 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 5 710 230 315 0 0 chr15 16386218 16386272 -87108702 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 222 5 710 1064 102 11 33 chr15 16386272 16386454 -87108520 - IAPEz-int LTR ERVK -6287 194 17 5 710 292 82 77 64 chr15 16386552 16386630 -87108344 - IAPEz-int LTR ERVK -1906 81 3 5 710 2190 129 86 67 chr15 16386632 16387098 -87107876 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 710 2950 95 2 0 chr15 16392019 16392418 -87102556 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 710 7100 97 8 70 chr15 16392418 16393589 -87101385 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 5 710 2894 93 8 0 chr15 16393589 16393986 -87100988 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 710 4424 10 2 0 chr15 16394202 16394694 -87100280 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 710 295 267 55 94 chr15 16402452 16402580 -87092394 + RMER20B LTR ERVK 476 598 -29 6 710 987 238 71 86 chr15 16402644 16402970 -87092004 - MT2A LTR ERVL -109 424 104 6 710 247 333 17 138 chr15 16403006 16403040 -87091934 - MT2B LTR ERVL -334 267 234 6 710 361 253 12 0 chr15 16406700 16406783 -87088191 - MT2A LTR ERVL -447 86 3 6 710 608 119 8 106 chr15 16414228 16414463 -87080511 + RMER17D LTR ERVK 287 498 -391 6 710 1637 266 108 36 chr15 16414861 16415503 -87079471 - RMER6C LTR ERVK -2 688 1 6 710 2182 136 65 12 chr15 16417758 16418159 -87076815 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 6 710 1944 141 21 88 chr15 16418217 16418605 -87076369 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 151 6 710 513 262 28 21 chr15 16418769 16418913 -87076061 + MTD LTR MaLR 66 210 -209 6 710 1435 239 57 87 chr15 16422386 16423038 -87071936 + RMER6C LTR ERVK 3 634 -56 6 710 2055 125 13 7 chr15 16423399 16423706 -87071268 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 6 710 1160 238 109 63 chr15 16426329 16426696 -87068278 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 710 372 236 13 2 chr15 16429632 16429735 -87065239 - MTD LTR MaLR -292 104 1 6 710 1062 227 34 85 chr15 16431673 16431769 -87063205 + RLTR12A LTR ERVK 37 131 -437 6 710 1062 227 34 85 chr15 16432252 16432449 -87062525 + RLTR12A LTR ERVK 132 315 -253 6 710 1188 248 34 20 chr15 16432499 16432857 -87062117 + RLTR12A LTR ERVK 202 564 -4 6 710 570 234 9 0 chr15 16443371 16443478 -87051496 - ETnERV2-int LTR ERVK -205 7201 7094 6 710 405 342 121 0 chr15 16443810 16443959 -87051015 + ORR1D2 LTR MaLR 73 239 -131 6 710 264 292 14 0 chr15 16445891 16445963 -87049011 - MT2A LTR ERVL -460 73 1 6 710 2563 103 28 3 chr15 16455902 16456292 -87038682 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 710 521 240 73 8 chr15 16461397 16461569 -87033405 - ORR1C2 LTR MaLR -190 180 1 7 710 332 321 94 45 chr15 16475038 16475240 -87019734 + RLTR9C LTR ERVK 182 393 0 7 710 436 306 30 43 chr15 16481013 16481177 -87013797 - ORR1D2 LTR MaLR -208 162 1 7 710 266 333 90 0 chr15 16487399 16487477 -87007497 - MTE2a LTR MaLR -143 236 152 7 710 340 327 43 12 chr15 16488325 16488486 -87006488 - MTE2a LTR MaLR -13 366 201 7 710 445 248 0 54 chr15 16489469 16489580 -87005394 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 473 7 710 1099 212 45 11 chr15 16492084 16492370 -87002604 - RMER12B LTR ERVK -942 462 167 7 710 1604 230 40 15 chr15 16501534 16501931 -86993043 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 710 709 296 59 16 chr15 16510623 16511031 -86983943 + RLTR18B LTR ERVK 1 509 -3 1 710 230 328 45 15 chr15 16512412 16512545 -86982429 + MLT2C1 LTR ERVL 16 152 -245 1 711 421 378 61 26 chr15 16518305 16518440 -86976534 + MLT1A1 LTR MaLR 4 139 -269 1 711 421 378 61 26 chr15 16518568 16518777 -86976197 + MLT1A1 LTR MaLR 140 359 -49 1 711 313 340 143 54 chr15 16521594 16521930 -86973044 - MTEa LTR MaLR 0 379 14 2 711 322 339 132 55 chr15 16526299 16526571 -86968403 - MER31A LTR ERV1 0 485 193 3 711 281 365 53 63 chr15 16530735 16530925 -86964049 - MTEb LTR MaLR -115 264 77 3 711 742 246 72 54 chr15 16537527 16537880 -86957094 - RMER6A LTR ERVK -4 716 415 4 711 715 180 53 23 chr15 16537921 16538092 -86956882 - RMER6A LTR ERVK -326 394 219 4 711 235 226 0 36 chr15 16538105 16538160 -86956814 - RMER6A LTR ERVK -665 55 3 4 711 1588 193 29 3 chr15 16538198 16538546 -86956428 + RLTR15 LTR ERVK 1 357 -2 4 711 582 277 19 13 chr15 16540143 16540300 -86954674 - MTC LTR MaLR -2 419 262 5 711 2404 116 145 0 chr15 16541730 16542145 -86952829 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 711 301 133 120 0 chr15 16542147 16542222 -86952752 + IAPEz-int LTR ERVK 3 86 -1901 5 711 435 152 17 125 chr15 16542228 16542348 -86952626 + IAPEz-int LTR ERVK 17 123 -6358 5 711 227 267 0 0 chr15 16542348 16542393 -86952581 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 5 711 242 302 0 0 chr15 16542421 16542474 -86952500 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 5 711 3359 79 39 40 chr15 16542474 16543115 -86951859 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 5 711 2189 68 0 0 chr15 16543115 16543393 -86951581 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 5 711 5907 49 4 20 chr15 16543392 16544148 -86950826 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 5 711 2400 114 125 5 chr15 16544150 16544574 -86950400 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 711 558 280 54 22 chr15 16545479 16545702 -86949272 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4541 1173 944 5 711 584 329 63 31 chr15 16545730 16546258 -86948716 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4990 771 184 5 711 399 336 81 84 chr15 16546860 16547302 -86947672 - MT2A LTR ERVL -92 441 1 5 711 234 272 80 93 chr15 16549471 16549621 -86945353 + MLT1A LTR MaLR 208 355 -19 6 711 1009 281 108 61 chr15 16556468 16557064 -86937910 - ORR1D-int LTR MaLR -491 879 232 7 711 14909 90 10 8 chr15 16557600 16559003 -86935971 + MuRRS4-int LTR ERV1 2370 3777 -1286 7 711 5310 120 31 59 chr15 16559003 16559280 -86935694 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 657 7 711 5310 120 31 59 chr15 16559427 16560077 -86934897 - RLTR13D6 LTR ERVK -246 656 1 7 711 14909 242 30 31 chr15 16560077 16562658 -86932316 + MuRRS4-int LTR ERV1 3778 7353 -99 7 711 2297 132 54 7 chr15 16562659 16563065 -86931909 + LTRIS4 LTR ERV1 24 507 0 7 711 335 217 0 0 chr15 16563277 16563337 -86931637 - MTB LTR MaLR -6 394 335 7 711 2507 103 3 0 chr15 16563538 16563889 -86931085 - MTB LTR MaLR -43 357 6 7 711 235 319 126 63 chr15 16568327 16568501 -86926473 + MTE2b LTR MaLR 191 375 -4 8 711 359 348 103 70 chr15 16568710 16568760 -86926214 + MLT1C LTR MaLR 46 95 -372 8 711 359 348 103 70 chr15 16568930 16569151 -86925823 + MLT1C LTR MaLR 96 326 -141 8 711 239 284 104 59 chr15 16572207 16572342 -86922632 + MER89 LTR ERV1 235 375 -184 8 711 1062 254 65 11 chr15 16573309 16573584 -86921390 + RMER15 LTR ERVL 173 462 -113 9 711 683 276 38 84 chr15 16577535 16577772 -86917202 - MTEa LTR MaLR -46 333 108 9 711 351 189 94 10 chr15 16578016 16578112 -86916862 + RMER20B LTR ERVK 260 363 -264 9 711 228 326 33 11 chr15 16579566 16579656 -86915318 + LTR48B LTR ERV1 41 132 -655 1 711 296 335 148 34 chr15 16580026 16580202 -86914772 + LTR48B LTR ERV1 429 624 -20 1 711 717 311 54 60 chr15 16584232 16584618 -86910356 + MLT1B LTR MaLR 3 386 -4 1 711 293 247 39 49 chr15 16585448 16585550 -86909424 + MTC-int LTR MaLR 200 300 -958 1 711 2950 194 57 10 chr15 16591181 16591775 -86903199 + RLTR17 LTR ERVK 1 622 -70 1 711 3068 76 2 0 chr15 16593203 16593598 -86901376 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 711 8255 52 6 5 chr15 16593598 16594687 -86900287 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1091 -7 1 711 2690 52 57 3 chr15 16594685 16595055 -86899919 + MTA_Mm LTR MaLR 7 396 0 1 711 344 164 0 0 chr15 16603291 16603352 -86891622 - RMER19C LTR ERVK -550 61 1 1 711 860 243 100 17 chr15 16612331 16612561 -86882413 - MTD LTR MaLR -2 417 169 1 711 1014 283 307 42 chr15 16618592 16618950 -86876024 + MT2A LTR ERVL 1 453 -80 1 711 1740 228 19 35 chr15 16620640 16621068 -86873906 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 711 1942 287 98 17 chr15 16621601 16622372 -86872602 - ORR1D1-int LTR MaLR -534 836 3 1 711 245 301 126 21 chr15 16622382 16622477 -86872497 - ORR1D1 LTR MaLR -12 358 254 1 711 336 298 10 0 chr15 16622570 16622674 -86872300 - ORR1D1 LTR MaLR -269 105 1 1 711 387 367 109 9 chr15 16626899 16627229 -86867745 - MLT2B2 LTR ERVL -152 363 1 1 711 2136 198 5 15 chr15 16627246 16627657 -86867317 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 711 1691 242 33 3 chr15 16627922 16628311 -86866663 - MTD LTR MaLR -6 413 13 1 711 1101 324 16 6 chr15 16629687 16630053 -86864921 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 711 1055 303 64 81 chr15 16630915 16631443 -86863531 + MTC-int LTR MaLR 585 1103 -155 2 711 553 270 107 44 chr15 16631471 16631676 -86863298 + MTC LTR MaLR 1 218 -203 2 711 411 232 0 12 chr15 16631662 16631745 -86863229 + MTC LTR MaLR 335 416 -5 2 711 399 232 10 0 chr15 16631759 16631858 -86863116 + MTD-int LTR MaLR 1148 1247 -11 2 711 441 242 20 0 chr15 16631901 16632000 -86862974 + MTD LTR MaLR 8 108 -313 2 711 998 294 40 20 chr15 16632172 16632470 -86862504 + MTD LTR MaLR 116 419 0 2 711 557 186 56 21 chr15 16633129 16633272 -86861702 - ORR1A3-int LTR MaLR -1750 213 66 2 711 454 265 71 52 chr15 16642005 16642160 -86852814 + ORR1D1 LTR MaLR 7 164 -210 2 712 830 247 158 34 chr15 16647525 16647876 -86847098 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 2 712 2416 111 97 5 chr15 16672732 16673105 -86821869 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 712 3044 66 13 5 chr15 16688832 16689229 -86805745 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 712 597 322 35 106 chr15 16694728 16695134 -86799840 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 2 712 808 311 19 34 chr15 16700997 16701135 -86793839 + ORR1D1 LTR MaLR 5 140 -234 3 712 808 311 19 34 chr15 16701160 16701284 -86793690 + ORR1D1 LTR MaLR 141 263 -111 3 712 320 228 24 48 chr15 16705461 16705544 -86789430 - MTD LTR MaLR -272 147 67 3 712 2788 179 111 20 chr15 16709953 16710586 -86784388 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 712 314 346 54 30 chr15 16711372 16711539 -86783435 - RMER15 LTR ERVL -105 470 300 3 712 3204 48 10 2 chr15 16711829 16712226 -86782748 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 712 356 327 32 13 chr15 16747196 16747354 -86747620 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1476 4238 4078 3 712 595 339 63 23 chr15 16747379 16747681 -86747293 - ORR1E LTR MaLR -45 314 1 3 712 327 269 90 28 chr15 16763878 16763932 -86731042 - MT2A LTR ERVL 0 533 480 3 712 327 269 90 28 chr15 16763999 16764089 -86730885 - MT2A LTR ERVL -54 479 381 3 712 401 288 94 66 chr15 16764108 16764320 -86730654 - RMER12 LTR ERVK -4 1318 1101 4 712 5154 108 23 14 chr15 16764506 16765331 -86729643 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 1 4 712 358 229 151 7 chr15 16765331 16765466 -86729508 - MT2B LTR ERVL -135 466 384 4 712 2957 228 43 51 chr15 16766419 16767216 -86727758 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1227 2016 -3745 4 712 1269 230 7 64 chr15 16767216 16767421 -86727553 - RMER17C LTR ERVK 0 410 220 4 712 1269 228 49 32 chr15 16767519 16767788 -86727186 - RMER17C LTR ERVK -536 422 16 4 712 3930 216 50 14 chr15 16767789 16768680 -86726294 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2020 2943 -2818 4 712 1421 246 134 3 chr15 16768868 16769479 -86725495 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3487 4178 -1583 4 712 4641 176 38 32 chr15 16769947 16770950 -86724024 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 144 4 712 1697 211 116 130 chr15 16771270 16771433 -86723541 - RLTR25A LTR ERVK -885 143 1 4 713 1528 146 17 81 chr15 16795960 16796304 -86698670 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 713 408 210 47 57 chr15 16799319 16799366 -86695608 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 285 4 713 3214 43 8 0 chr15 16799366 16799759 -86695215 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 713 408 210 47 57 chr15 16799759 16799817 -86695157 - ORR1A3 LTR MaLR -42 284 222 4 713 1354 195 11 66 chr15 16800968 16801254 -86693720 - ORR1A3 LTR MaLR -56 270 1 4 713 385 324 58 12 chr15 16801879 16802051 -86692923 - RMER15 LTR ERVL -17 558 379 4 713 1471 242 14 62 chr15 16804610 16804962 -86690012 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 36 4 713 698 276 21 62 chr15 16804957 16805267 -86689707 - RLTR11A LTR ERVK -48 515 221 4 713 386 326 50 83 chr15 16805384 16805416 -86689558 - RLTR11A LTR ERVK -343 220 189 4 713 3572 172 59 59 chr15 16807489 16807619 -86687355 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 125 -1838 4 713 2845 102 0 2 chr15 16807619 16808020 -86686954 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 713 3572 172 59 59 chr15 16808020 16808647 -86686327 + ORR1A3-int LTR MaLR 126 758 -1205 4 713 1283 165 55 63 chr15 16808502 16808755 -86686219 + MT2B LTR ERVL 37 287 -314 4 713 3889 163 45 4 chr15 16808715 16809453 -86685521 + ORR1A3-int LTR MaLR 718 1485 -478 4 713 714 201 46 58 chr15 16810127 16810301 -86684673 + RMER19B LTR ERVK 308 479 -423 4 713 859 113 193 0 chr15 16812036 16812186 -86682788 + RMER19A LTR ERVK 2 180 -557 4 713 1672 148 45 69 chr15 16812186 16812520 -86682454 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 713 2111 180 66 7 chr15 16812525 16812950 -86682024 - ORR1A3-int LTR MaLR -5 1958 1509 4 713 274 324 41 134 chr15 16816267 16816609 -86678365 - ORR1E LTR MaLR -6 353 44 4 713 1337 236 34 40 chr15 16825505 16825965 -86669009 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 455 -122 4 713 1163 174 282 46 chr15 16839108 16839434 -86655540 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 4 713 408 111 41 14 chr15 16839434 16839507 -86655467 - RLTR45-int LTR ERVK -1 7405 7331 4 713 3860 173 54 60 chr15 16839706 16841790 -86653184 - RLTR45-int LTR ERVK -1812 5432 2396 4 713 7009 169 55 119 chr15 16842070 16843047 -86651927 - RLTR45-int LTR ERVK -3002 4242 3363 4 713 7009 174 71 91 chr15 16843103 16844390 -86650584 - RLTR45-int LTR ERVK -3882 3362 2088 4 713 703 259 107 26 chr15 16844406 16844715 -86650259 - ETnERV-int LTR ERVK -2933 381 48 5 713 2334 135 35 25 chr15 16844762 16845165 -86649809 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 3 5 713 2895 113 0 2 chr15 16846388 16846796 -86648178 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 713 609 342 48 16 chr15 16856879 16857194 -86637780 + MER67C LTR ERV1 299 623 -88 5 713 359 309 73 0 chr15 16857253 16857376 -86637598 + MLT1C LTR MaLR 328 459 -8 5 713 337 303 128 56 chr15 16859605 16859801 -86635173 + MTE2b LTR MaLR 139 348 -31 5 713 2264 187 100 80 chr15 16862731 16863330 -86631644 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 713 644 297 71 116 chr15 16863880 16864345 -86630629 - RLTR12B LTR ERVK -43 485 42 5 713 1166 126 23 6 chr15 16865356 16865531 -86629443 + MERVL-int LTR ERVL 2506 2683 -2802 5 713 2210 87 101 15 chr15 16877619 16877946 -86617028 - RLTR10D LTR ERVK -1 358 4 5 713 4380 16 2 0 chr15 16878539 16879031 -86615943 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 713 314 0 0 0 chr15 16879031 16879069 -86615905 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 5 713 392 167 46 35 chr15 16879069 16879156 -86615818 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 5 713 40503 16 14 0 chr15 16879156 16884400 -86610574 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 44 5 713 4368 18 2 0 chr15 16884443 16884935 -86610039 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 713 3042 23 0 0 chr15 16885600 16885946 -86609028 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 713 467 341 28 76 chr15 16888270 16888587 -86606387 - MT2A LTR ERVL -231 302 1 5 713 2140 165 306 11 chr15 16889883 16890169 -86604805 + RMER6C LTR ERVK 1 309 -381 5 713 2140 165 306 11 chr15 16890247 16890493 -86604481 + RMER6C LTR ERVK 310 689 -1 5 713 475 314 29 7 chr15 16892601 16892739 -86602235 + ORR1E LTR MaLR 5 145 -214 5 713 653 308 66 22 chr15 16894977 16895339 -86599635 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 5 713 952 296 64 0 chr15 16895599 16895896 -86599078 + MTD LTR MaLR 47 362 -57 5 713 968 250 37 20 chr15 16896069 16896314 -86598660 - RLTR40 LTR ERVK -3 814 566 5 713 847 238 37 120 chr15 16896381 16896730 -86598244 - RLTR40 LTR ERVK -128 689 370 5 713 331 235 103 47 chr15 16896947 16897054 -86597920 - RLTR40 LTR ERVK -462 355 243 5 713 284 0 0 0 chr15 16902164 16902197 -86592777 - MTB LTR MaLR 0 400 368 5 713 845 70 17 0 chr15 16902196 16902311 -86592663 + MTA_Mm LTR MaLR 280 396 0 5 713 6959 60 15 1 chr15 16905613 16906494 -86588480 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 5 714 3208 199 85 99 chr15 16925389 16926375 -86568599 - RLTR25A LTR ERVK -4 1024 1 6 714 372 211 13 0 chr15 16933425 16933501 -86561473 + RMER6C LTR ERVK 614 690 0 6 714 822 211 251 78 chr15 16933504 16933594 -86561380 - RMER6C LTR ERVK -140 616 535 6 714 1408 186 101 76 chr15 16933625 16934074 -86560900 - RMER6C LTR ERVK -222 534 3 6 714 2106 119 57 91 chr15 16941310 16941717 -86553257 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 6 714 327 91 0 0 chr15 16941790 16941834 -86553140 - MMETn-int LTR ERVK -32 7374 7331 6 714 3831 184 25 34 chr15 16942050 16943842 -86551132 - MMETn-int LTR ERVK -3321 4085 2356 6 714 462 197 49 83 chr15 16944489 16944633 -86550341 + MT2B LTR ERVL 140 278 -323 6 714 2568 215 57 35 chr15 16946322 16946974 -86548000 - RMER6C LTR ERVK -9 681 16 6 714 473 253 87 88 chr15 16947046 16947203 -86547771 + RLTR22_Mur LTR ERVK 410 689 -715 6 714 515 279 109 71 chr15 16947396 16947772 -86547202 + RLTR22_Mur LTR ERVK 587 1022 -382 6 714 439 211 27 137 chr15 16947800 16948025 -86546949 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1193 1347 -501 6 714 309 373 52 14 chr15 16949457 16949669 -86545305 - MLT2D LTR ERVL -190 224 5 6 714 3836 156 45 27 chr15 16951665 16952416 -86542558 + RMER12 LTR ERVK 1 765 -557 6 714 613 262 73 86 chr15 16952420 16952654 -86542320 + RMER12 LTR ERVK 951 1181 -141 6 714 1588 127 116 60 chr15 16953786 16954088 -86540886 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 714 335 314 88 78 chr15 16963780 16964074 -86530900 - LTR37B LTR ERV1 -10 458 162 6 714 1882 145 15 47 chr15 16964995 16965335 -86529639 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 714 8354 179 34 104 chr15 16965337 16967439 -86527535 - ORR1A4-int LTR MaLR -2 1961 6 6 714 2072 181 40 35 chr15 16978650 16979080 -86515894 + RLTR22_Mur LTR ERVK 267 698 -1150 7 714 613 282 200 32 chr15 16979085 16979400 -86515574 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 7 714 2828 215 62 70 chr15 16979528 16980444 -86514530 + RLTR22_Mur LTR ERVK 925 1633 -215 7 714 282 207 41 61 chr15 16980530 16980650 -86514324 + MTEa LTR MaLR 240 350 -29 7 714 742 206 26 86 chr15 16997102 16997335 -86497639 + MTC-int LTR MaLR 886 1104 -154 7 714 749 186 37 12 chr15 16998600 16998763 -86496211 + MTC-int LTR MaLR 1085 1251 -7 7 714 1940 218 19 12 chr15 16998770 16999188 -86495786 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 714 1096 263 35 117 chr15 17013813 17014239 -86480735 + MTD LTR MaLR 9 399 -20 1 714 2707 110 8 0 chr15 17018532 17018933 -86476041 - RLTR9E LTR ERVK -5 404 1 2 714 514 41 25 63 chr15 17018933 17019012 -86475962 - ETnERV2-int LTR ERVK 0 7406 7331 2 714 15212 203 47 33 chr15 17019230 17021392 -86473582 - ETnERV2-int LTR ERVK -984 6422 3960 2 714 15212 203 47 33 chr15 17021456 17024928 -86470046 - ETnERV2-int LTR ERVK -984 3959 2 2 714 3006 83 2 10 chr15 17024929 17025341 -86469633 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 2 714 1344 214 75 14 chr15 17025727 17026007 -86468967 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 80 3 714 448 226 20 0 chr15 17026213 17026315 -86468659 - ORR1C1 LTR MaLR -272 106 3 3 714 227 254 0 43 chr15 17035196 17035266 -86459708 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 312 4 714 316 246 34 5 chr15 17035263 17035345 -86459629 + ORR1C2 LTR MaLR 183 307 -77 4 715 344 359 113 52 chr15 17042775 17043163 -86451811 - MLT1E1A LTR MaLR -55 625 214 5 715 1117 138 0 6 chr15 17043403 17043578 -86451396 + ORR1A3 LTR MaLR 153 326 0 5 715 879 302 54 42 chr15 17043578 17043895 -86451079 - ORR1D1 LTR MaLR -49 325 5 5 715 1980 167 41 35 chr15 17054533 17055045 -86439929 + RMER2 LTR ERV1 12 567 0 8 715 604 222 20 86 chr15 17058793 17058990 -86435984 - RMER10B LTR ERVL 0 398 215 8 715 919 276 39 25 chr15 17058996 17059278 -86435696 - RMER10A LTR ERVL -156 286 1 8 715 764 229 93 45 chr15 17059625 17059915 -86435059 - RLTR19-int LTR ERVK -334 2904 2627 9 715 1456 215 91 13 chr15 17060122 17060508 -86434466 - RLTR19-int LTR ERVK -3130 3007 2592 9 715 495 181 146 0 chr15 17060517 17060661 -86434313 - RLTR19-int LTR ERVK -4797 1340 1176 9 715 1475 202 31 114 chr15 17061656 17062076 -86432898 - RMER10B LTR ERVL -6 392 8 9 715 869 326 53 0 chr15 17065454 17065755 -86429219 + MTE-int LTR MaLR 93 409 -1171 9 715 454 422 90 13 chr15 17066086 17066563 -86428411 + MTE-int LTR MaLR 830 1343 -237 9 715 255 238 96 36 chr15 17077773 17077856 -86417118 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 343 1 715 2940 24 0 0 chr15 17086649 17086986 -86407988 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 715 55332 21 17 6 chr15 17086986 17093387 -86401587 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 1 715 2940 24 0 0 chr15 17093387 17093724 -86401250 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 1 715 1330 274 120 63 chr15 17104689 17105422 -86389552 - ORR1C2-int LTR MaLR -573 797 1 1 715 1175 214 84 73 chr15 17105430 17105788 -86389186 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 15 1 715 307 264 0 0 chr15 17105799 17105871 -86389103 + MTC-int LTR MaLR 1187 1258 0 1 715 1396 246 11 90 chr15 17105872 17106328 -86388646 + MTC LTR MaLR 2 421 0 1 715 2164 164 5 37 chr15 17106493 17106903 -86388071 - MTB_Mm LTR MaLR -4 403 7 1 715 311 362 71 10 chr15 17107231 17107429 -86387545 - MER77 LTR ERVL -52 555 346 1 715 1020 320 39 39 chr15 17111046 17111736 -86383238 + MERVL_2A-int LTR ERVL 175 927 -4834 1 715 573 259 18 87 chr15 17111749 17111962 -86383012 + MTD LTR MaLR 228 412 -7 1 715 3099 51 2 15 chr15 17112180 17112581 -86382393 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 715 2814 52 0 3 chr15 17123635 17123982 -86370992 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 715 1076 308 22 28 chr15 17127340 17127704 -86367270 + ORR1D1 LTR MaLR 1 362 -12 1 715 325 299 101 27 chr15 17129709 17129857 -86365117 + RMER5 LTR ERV1 349 507 -27 1 715 1628 227 66 193 chr15 17135943 17136643 -86358331 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 715 2200 206 154 34 chr15 17137896 17138188 -86356786 - RMER6D LTR ERVK 0 720 374 1 715 2200 206 154 34 chr15 17138240 17138253 -86356721 - RMER6D LTR ERVK -347 373 364 1 715 2200 206 154 34 chr15 17138281 17138617 -86356357 - RMER6D LTR ERVK -357 363 1 1 715 296 346 52 44 chr15 17144163 17144299 -86350675 - MTE-int LTR MaLR -11 1569 1433 1 715 854 340 63 34 chr15 17144967 17145286 -86349688 - MTE-int LTR MaLR -235 1345 1018 1 715 854 356 60 40 chr15 17146161 17146253 -86348721 - MTE-int LTR MaLR -563 1017 954 1 715 332 326 103 14 chr15 17146638 17146784 -86348190 - MTE-int LTR MaLR -1236 344 186 1 715 311 230 50 44 chr15 17155474 17155633 -86339341 + RMER17A LTR ERVK 296 455 -296 2 715 2174 112 34 6 chr15 17155784 17156142 -86338832 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 715 522 281 81 102 chr15 17157655 17157691 -86337283 - MTC LTR MaLR -14 365 325 2 715 1450 199 79 27 chr15 17157715 17158023 -86336951 - MTC LTR MaLR -59 362 40 2 715 1237 217 145 33 chr15 17158021 17158555 -86336419 - RMER6C LTR ERVK -51 639 3 2 715 2041 236 60 16 chr15 17164102 17164605 -86330369 + RMER5 LTR ERV1 1 525 -9 2 716 376 255 26 94 chr15 17171125 17171242 -86323732 + ORR1D2 LTR MaLR 3 111 -259 2 716 304 148 0 18 chr15 17171253 17171308 -86323666 + RLTR12A LTR ERVK 12 65 -503 2 716 778 276 72 83 chr15 17176164 17176562 -86318412 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 3 2 716 571 329 109 48 chr15 17192784 17193180 -86301794 - MER21B LTR ERV1 -54 809 390 2 716 375 343 65 24 chr15 17193200 17193370 -86301604 - MER21B LTR ERV1 -524 339 163 2 716 400 288 57 7 chr15 17193822 17193962 -86301012 - RMER5 LTR ERV1 -13 521 375 2 716 486 318 115 23 chr15 17195181 17195442 -86299532 - MTE2a LTR MaLR -18 361 77 2 716 1467 265 66 78 chr15 17209973 17210742 -86284232 + RLTR40 LTR ERVK 1 760 -57 2 716 585 282 60 26 chr15 17217884 17218122 -86276852 - MTE-int LTR MaLR -69 1511 1288 3 716 333 330 0 68 chr15 17218312 17218429 -86276545 - MTE-int LTR MaLR -446 1134 1026 3 716 940 370 66 37 chr15 17218967 17219531 -86275443 - MTE-int LTR MaLR -586 994 415 3 716 248 241 53 75 chr15 17219549 17219643 -86275331 - MTE-int LTR MaLR -1444 136 45 3 716 1104 239 60 74 chr15 17221132 17221512 -86273462 + ORR1C1 LTR MaLR 4 378 0 3 716 255 259 45 45 chr15 17230059 17230148 -86264826 - MLT-int LTR MaLR -970 765 677 3 716 234 358 51 51 chr15 17230380 17230633 -86264341 - MLT-int LTR MaLR -1114 621 369 3 716 280 359 0 0 chr15 17230774 17230866 -86264108 - MLT1-int LTR MaLR -1275 96 5 3 716 275 333 66 82 chr15 17232985 17233181 -86261793 - ORR1E LTR MaLR -164 195 3 3 716 1125 196 9 0 chr15 17236102 17236321 -86258653 - RMER6C LTR ERVK -8 682 462 3 716 965 221 13 59 chr15 17236905 17237141 -86257833 - RMER6C LTR ERVK -331 359 135 3 716 398 155 0 40 chr15 17237551 17237625 -86257349 + ORR1A2 LTR MaLR 93 163 -164 3 716 3041 195 39 21 chr15 17237598 17238315 -86256659 + ORR1A2-int LTR MaLR 353 1082 -710 3 716 553 326 0 45 chr15 17242656 17242858 -86252116 - RMER13A LTR ERVK -573 287 95 3 716 1023 204 5 18 chr15 17243009 17243350 -86251624 + MERVK26-int LTR ERVK 3196 3566 -3353 3 716 418 364 58 11 chr15 17245303 17245492 -86249482 + LTR80A LTR ERVL 373 570 -13 3 716 424 336 0 0 chr15 17249701 17249817 -86245157 + MLT1A0 LTR MaLR 246 361 -4 3 716 2658 104 8 12 chr15 17252169 17252569 -86242405 - MTB LTR MaLR -2 398 1 3 716 449 277 189 65 chr15 17258806 17259191 -86235783 + RLTR12B LTR ERVK 76 508 -20 3 716 481 211 11 0 chr15 17266765 17266860 -86228114 - ORR1B1 LTR MaLR -51 343 248 3 716 258 395 0 50 chr15 17276334 17276454 -86218520 - MTEa LTR MaLR -172 207 94 4 716 772 309 16 53 chr15 17277366 17277820 -86217154 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2086 2631 -3126 4 716 1746 197 284 42 chr15 17280617 17281153 -86213821 - RMER6A LTR ERVK -80 676 10 4 716 1318 174 89 144 chr15 17294676 17295093 -86199881 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 716 1262 185 14 0 chr15 17297934 17298156 -86196818 - ORR1B1 LTR MaLR -6 388 164 4 716 467 372 69 28 chr15 17301094 17301484 -86193490 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 3 4 717 322 377 81 20 chr15 17302338 17302695 -86192279 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 717 988 299 61 12 chr15 17308785 17309130 -86185844 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 1 4 717 407 336 54 24 chr15 17312857 17313195 -86181779 + MTEa LTR MaLR 32 376 -3 4 717 557 289 37 75 chr15 17315428 17315723 -86179251 - RMER15 LTR ERVL -270 305 22 4 717 1631 180 5 121 chr15 17321976 17322348 -86172626 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 717 280 286 87 11 chr15 17327074 17327166 -86167808 - RMER20B LTR ERVK -208 419 321 4 717 413 234 10 41 chr15 17336762 17336860 -86158114 + ORR1D1 LTR MaLR 1 95 -279 5 717 436 135 14 0 chr15 17341468 17341542 -86153432 - RLTR10 LTR ERVK -310 80 6 5 717 2883 67 5 32 chr15 17341699 17342100 -86152874 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 5 717 580 93 0 27 chr15 17345440 17345550 -86149424 - RMER17B LTR ERVK -495 463 357 5 717 457 305 124 32 chr15 17348047 17348386 -86146588 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 717 1900 252 105 13 chr15 17348837 17349154 -86145820 + RMER6D LTR ERVK 3 321 -399 5 717 1900 252 105 13 chr15 17349212 17349448 -86145526 + RMER6D LTR ERVK 322 606 -114 5 717 2201 225 28 30 chr15 17350304 17350845 -86144129 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 2 5 717 2459 91 136 21 chr15 17358659 17358961 -86136013 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 358 -117 5 717 2459 91 136 21 chr15 17358981 17359104 -86135870 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 359 474 -1 5 717 568 340 64 32 chr15 17370217 17370594 -86124380 + RMER5 LTR ERV1 146 534 0 5 717 2825 38 38 0 chr15 17373460 17373825 -86121149 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 115 5 717 2791 107 12 19 chr15 17398821 17399231 -86095743 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 717 3731 56 26 0 chr15 17400770 17401233 -86093741 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 717 773 283 175 3 chr15 17403251 17403577 -86091397 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 6 717 2640 307 87 32 chr15 17403577 17404008 -86090966 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 460 -910 6 717 6052 59 44 4 chr15 17404008 17404785 -86090189 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 6 717 2640 302 74 47 chr15 17404785 17405564 -86089410 + ORR1C2-int LTR MaLR 461 1422 -158 6 717 251 233 17 0 chr15 17405778 17405838 -86089136 + ORR1D-int LTR MaLR 1206 1266 -104 6 717 943 294 93 19 chr15 17406761 17407073 -86087901 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 178 6 717 1920 122 3 57 chr15 17407299 17407630 -86087344 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 15 6 717 2879 73 36 8 chr15 17408820 17409205 -86085769 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 717 2932 38 0 0 chr15 17409674 17410020 -86084954 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 717 500 281 83 24 chr15 17412828 17412996 -86081978 + ORR1D1 LTR MaLR 6 183 -191 6 717 638 233 100 5 chr15 17413048 17413064 -86081910 + ORR1D1 LTR MaLR 167 182 -192 6 717 638 233 100 5 chr15 17413137 17413174 -86081800 + ORR1D1 LTR MaLR 183 226 -148 6 717 2679 38 67 55 chr15 17413174 17413535 -86081439 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 6 717 638 233 100 5 chr15 17413535 17413670 -86081304 + ORR1D1 LTR MaLR 227 372 -2 6 717 2884 89 13 2 chr15 17413800 17414196 -86080778 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 717 834 232 89 44 chr15 17418249 17418474 -86076500 - RMER6C LTR ERVK -453 237 3 6 717 1369 196 113 21 chr15 17419152 17419406 -86075568 + ORR1B2 LTR MaLR 1 283 -84 6 717 2194 115 3 0 chr15 17419406 17419728 -86075246 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 6 717 1369 196 113 21 chr15 17419728 17419801 -86075173 + ORR1B2 LTR MaLR 284 358 -9 6 717 2512 201 83 17 chr15 17419814 17420391 -86074583 + ORR1B2-int LTR MaLR 5 619 -890 6 717 2864 181 107 21 chr15 17420724 17421343 -86073631 + RLTR33 LTR ERVK 7 678 0 6 717 853 218 62 5 chr15 17421343 17421536 -86073438 + ORR1B2-int LTR MaLR 792 995 -514 6 717 1444 194 70 17 chr15 17421523 17421864 -86073110 + ORR1B2 LTR MaLR 26 386 -8 6 717 506 308 34 29 chr15 17421919 17422123 -86072851 + MT2A LTR ERVL 228 432 -101 6 717 233 160 20 0 chr15 17422294 17422344 -86072630 + MT2A LTR ERVL 483 533 0 6 717 758 309 168 6 chr15 17423505 17423827 -86071147 - MTEa LTR MaLR -1 378 5 6 717 309 367 176 58 chr15 17425221 17425346 -86069628 + MER70B LTR ERVL 72 224 -354 6 717 309 367 176 58 chr15 17425493 17425731 -86069243 + MER70B LTR ERVL 225 478 -100 6 717 317 211 50 40 chr15 17426825 17426924 -86068050 - RLTR15 LTR ERVK -241 118 19 6 717 647 215 0 71 chr15 17426924 17427094 -86067880 - ORR1A4 LTR MaLR -166 163 6 6 718 964 249 71 58 chr15 17433760 17434156 -86060818 - RLTR12B LTR ERVK -80 448 48 7 718 754 172 145 5 chr15 17434215 17434391 -86060583 - ORR1C1 LTR MaLR -7 371 131 7 718 298 211 43 32 chr15 17434463 17434556 -86060418 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 266 7 718 359 344 30 18 chr15 17437341 17437507 -86057467 - MER76 LTR ERVL -24 667 500 7 718 3615 44 7 0 chr15 17444744 17445177 -86049797 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 718 381 321 45 6 chr15 17449770 17449927 -86045047 - RMER15 LTR ERVL -391 184 22 7 718 275 265 15 0 chr15 17450186 17450254 -86044720 - RMER15 LTR ERVL -103 472 404 7 718 1302 186 20 24 chr15 17456696 17456949 -86038025 + RLTR23 LTR ERV1 179 430 0 7 718 3268 43 2 8 chr15 17472112 17472510 -86022464 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 718 371 235 282 0 chr15 17476493 17476642 -86018332 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 180 7 718 2813 107 22 0 chr15 17488669 17489082 -86005892 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 7 718 285 396 35 15 chr15 17497700 17497900 -85997074 + MTE2b LTR MaLR 19 222 -157 7 718 383 340 42 61 chr15 17498446 17498709 -85996265 - MLT2B1 LTR ERVL -262 258 1 7 718 1608 318 41 26 chr15 17501130 17501912 -85993062 + SRV_MM-int LTR ERVK 1799 2592 -3575 5 718 2843 57 177 7 chr15 17502148 17502554 -85992420 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 718 25829 46 29 44 chr15 17502555 17505994 -85988980 + IAPEz-int LTR ERVK 9 3393 -3088 6 718 8365 137 49 49 chr15 17505991 17507532 -85987442 - IAPEz-int LTR ERVK -4936 1545 6 7 718 2175 109 18 6 chr15 17507532 17507863 -85987111 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -2 335 1 7 718 25609 38 5 3 chr15 17507863 17510911 -85984063 + IAPEz-int LTR ERVK 3427 6479 -2 6 718 2498 34 50 41 chr15 17510913 17511277 -85983697 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 367 -44 6 718 394 326 123 6 chr15 17516556 17516735 -85978239 + MTD LTR MaLR 206 405 -14 1 718 1759 210 60 201 chr15 17518407 17519088 -85975886 + RMER19C LTR ERVK 26 610 -1 2 718 326 337 81 35 chr15 17519094 17519291 -85975683 + ORR1D2 LTR MaLR 112 327 -32 2 718 298 337 51 0 chr15 17521345 17521443 -85973531 - RMER12 LTR ERVK -471 851 749 2 718 347 238 46 73 chr15 17526139 17526248 -85968726 + MT2B LTR ERVL 151 256 -345 4 718 873 350 44 38 chr15 17527112 17527477 -85967497 - MTEa LTR MaLR -12 367 1 4 718 323 252 52 11 chr15 17529249 17529359 -85965615 - MTEa LTR MaLR -245 134 15 4 718 710 289 53 120 chr15 17531996 17532445 -85962529 + RLTR23 LTR ERV1 8 426 -4 5 718 1596 244 31 46 chr15 17543149 17543683 -85951291 + RMER4B LTR ERVK 17 574 -11 6 718 243 272 32 95 chr15 17551772 17551898 -85943076 - RMER4A LTR ERVK -332 134 17 7 718 3056 46 15 3 chr15 17561538 17561927 -85933047 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 9 718 349 319 96 12 chr15 17562461 17562712 -85932262 + MER57F LTR ERV1 1 272 -164 9 719 4635 225 55 23 chr15 17567449 17568196 -85926778 + RMER12 LTR ERVK 1 767 -555 9 719 4635 225 55 23 chr15 17568253 17568641 -85926333 + RMER12 LTR ERVK 768 1172 -150 9 719 2779 113 2 7 chr15 17573169 17573578 -85921396 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 719 946 315 44 18 chr15 17574382 17574721 -85920253 + RMER15 LTR ERVL 214 561 -14 1 719 756 211 17 35 chr15 17578254 17578426 -85916548 + RLTR40 LTR ERVK 8 176 -641 1 719 1556 244 86 24 chr15 17578747 17579167 -85915807 + RLTR40 LTR ERVK 372 817 0 1 719 325 320 24 16 chr15 17579223 17579347 -85915627 + MTE2b LTR MaLR 3 127 -252 1 719 575 294 60 53 chr15 17582629 17582895 -85912079 + ORR1E LTR MaLR 36 303 -56 1 719 3878 121 28 82 chr15 17591837 17592631 -85902343 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 1 719 669 263 156 64 chr15 17593404 17593914 -85901060 - RMER20A LTR ERVK -58 569 1 1 719 1604 191 32 142 chr15 17598679 17599142 -85895832 + RMER15 LTR ERVL 4 415 -160 1 719 845 313 111 3 chr15 17599510 17599834 -85895140 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 4 1 719 3866 185 94 13 chr15 17601161 17601956 -85893018 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 1 719 893 302 75 31 chr15 17603646 17604005 -85890969 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 1 719 465 384 80 44 chr15 17604738 17605149 -85889825 + MTE-int LTR MaLR 43 468 -1112 1 719 272 370 78 56 chr15 17608944 17609250 -85885724 - MLT2B2 LTR ERVL -150 365 53 1 719 2382 54 31 28 chr15 17621365 17621691 -85873283 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 1 719 2172 52 0 0 chr15 17621695 17621966 -85873008 - RLTR10-int LTR ERVK -1415 572 302 1 719 2209 69 122 14 chr15 17621966 17622318 -85872656 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 1 719 2328 204 58 8 chr15 17623337 17623822 -85871152 + RLTR20C LTR ERVK 1 509 -25 1 719 1623 236 38 36 chr15 17624330 17624591 -85870383 + RLTR11A LTR ERVK 10 276 -252 1 719 1623 236 38 36 chr15 17624803 17624989 -85869985 + RLTR11A LTR ERVK 277 458 -70 1 719 284 234 25 25 chr15 17625011 17625090 -85869884 + RLTR11A LTR ERVK 450 528 0 1 719 797 310 43 97 chr15 17645264 17645686 -85849288 + MER57D LTR ERV1 13 411 0 2 719 847 262 46 12 chr15 17647352 17647611 -85847363 - ORR1C2 LTR MaLR -15 369 102 2 719 734 236 39 74 chr15 17647628 17647987 -85846987 + RMER2 LTR ERV1 1 445 -122 2 719 231 215 0 97 chr15 17647965 17648037 -85846937 - ORR1C2 LTR MaLR -301 83 19 2 719 2972 292 78 26 chr15 17648040 17649096 -85845878 - ORR1C2-int LTR MaLR -2 1368 258 2 719 395 331 97 23 chr15 17650462 17650604 -85844370 + ORR1C2 LTR MaLR 1 151 -223 2 719 395 339 110 21 chr15 17650671 17650740 -85844234 + ORR1C2 LTR MaLR 152 233 -145 2 719 300 300 0 11 chr15 17650752 17650843 -85844131 + ORR1C2 LTR MaLR 154 243 -131 2 719 554 211 107 20 chr15 17650899 17651049 -85843925 + ORR1C2 LTR MaLR 222 384 0 2 719 1089 274 105 133 chr15 17654748 17655547 -85839427 + RLTR40 LTR ERVK 31 807 -10 2 719 721 276 37 41 chr15 17655688 17655930 -85839044 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 134 2 719 293 259 24 12 chr15 17662436 17662518 -85832456 + MTE2b LTR MaLR 18 100 -279 2 719 277 339 86 83 chr15 17665322 17665670 -85829304 + MLT-int LTR MaLR 221 569 -1166 2 719 788 399 57 46 chr15 17666425 17666966 -85828008 + MLT-int LTR MaLR 1053 1599 -136 2 719 2004 259 42 31 chr15 17686317 17686866 -85808108 - ORR1B1-int LTR MaLR -1408 555 1 2 719 1551 217 32 74 chr15 17686866 17687270 -85807704 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 8 2 719 814 258 27 12 chr15 17690199 17690528 -85804446 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 9 2 720 282 252 188 35 chr15 17696056 17696200 -85798774 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 7613 2 720 4005 132 35 11 chr15 17696189 17696855 -85798119 - MMVL30-int LTR ERV1 -96 3602 2921 2 720 793 172 7 15 chr15 17701724 17701860 -85793114 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 969 2 720 3450 182 139 17 chr15 17703695 17704478 -85790496 + MTB_Mm-int LTR MaLR 380 1258 0 2 720 1365 190 26 145 chr15 17704478 17704940 -85790034 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 720 2066 128 10 16 chr15 17720393 17720704 -85774270 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 3 720 633 293 12 0 chr15 17721932 17722096 -85772878 - MTE2a LTR MaLR -1 378 213 3 720 375 362 22 41 chr15 17733011 17733279 -85761695 + MLT1F2 LTR MaLR 286 548 -12 3 720 912 199 29 6 chr15 17749136 17749308 -85745666 + RMER19B LTR ERVK 357 532 -370 3 720 2654 81 0 0 chr15 17749312 17749644 -85745330 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 720 43619 74 11 8 chr15 17749644 17755361 -85739613 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 5732 -1948 3 720 2168 39 0 0 chr15 17755351 17755605 -85739369 - IAPEY3-int LTR ERVK -2364 5316 5063 3 720 9338 95 42 4 chr15 17755603 17757453 -85737521 + IAPEY3-int LTR ERVK 5735 7680 0 3 720 2625 75 0 0 chr15 17757453 17757785 -85737189 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 720 969 268 9 82 chr15 17757789 17758106 -85736868 + RMER19C LTR ERVK 318 611 0 3 720 1744 178 81 30 chr15 17759301 17759694 -85735280 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 720 1909 351 41 24 chr15 17759684 17760634 -85734340 - MTE-int LTR MaLR -20 1560 595 3 720 426 184 204 20 chr15 17760750 17760915 -85734059 - MT2A LTR ERVL -2 599 394 3 720 339 322 17 17 chr15 17761209 17761329 -85733645 - MT2A LTR ERVL -323 210 91 3 720 276 376 40 57 chr15 17761332 17761580 -85733394 - MTE-int LTR MaLR -1047 533 290 3 720 229 386 124 10 chr15 17761813 17762022 -85732952 - MTE2b LTR MaLR -19 360 128 3 720 324 310 68 115 chr15 17767992 17768287 -85726687 - MT2A LTR ERVL -184 349 69 3 720 2379 209 64 62 chr15 17771449 17772123 -85722851 - RMER6C LTR ERVK -15 675 1 3 720 1258 198 48 60 chr15 17776048 17776381 -85718593 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 720 3024 80 2 2 chr15 17782106 17782506 -85712468 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 720 1917 165 3 57 chr15 17787066 17787432 -85707542 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 720 489 225 88 34 chr15 17798169 17798316 -85696658 - MTC LTR MaLR -72 347 193 4 720 3121 60 2 10 chr15 17799063 17799466 -85695508 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 720 602 306 62 48 chr15 17799726 17800062 -85694912 + RLTR15 LTR ERVK 5 345 -14 4 720 694 235 117 0 chr15 17802742 17802921 -85692053 - MTC LTR MaLR -221 200 1 4 720 3361 250 111 10 chr15 17802921 17804063 -85690911 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1 4 720 1377 207 103 28 chr15 17804063 17804451 -85690523 - MTC LTR MaLR 0 421 5 4 720 986 198 94 0 chr15 17804894 17805106 -85689868 - RMER6D LTR ERVK -488 232 1 4 720 709 209 6 38 chr15 17810689 17810848 -85684126 + RLTR40 LTR ERVK 34 187 -630 4 720 2017 243 80 38 chr15 17814380 17814980 -85679994 + RLTR40 LTR ERVK 179 803 -14 4 720 1801 162 119 14 chr15 17815391 17815761 -85679213 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 720 2925 60 10 0 chr15 17816716 17817100 -85677874 + MTA_Mm LTR MaLR 1 388 -8 4 721 1252 160 22 48 chr15 17841681 17841950 -85653024 + RMER6A LTR ERVK 345 606 -150 4 721 1766 120 115 10 chr15 17846083 17846378 -85648596 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 5 721 240 307 53 0 chr15 17847626 17847701 -85647273 + MTE2a LTR MaLR 1 79 -300 5 721 413 340 29 64 chr15 17847677 17847881 -85647093 + MTE2a LTR MaLR 29 225 -154 5 721 2057 111 10 19 chr15 17863776 17864088 -85630886 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 5 721 3318 18 2 10 chr15 17867875 17868268 -85626706 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 5 721 1805 180 20 20 chr15 17868918 17869269 -85625705 - RMER6C LTR ERVK -337 353 3 5 721 309 304 45 0 chr15 17871417 17871529 -85623445 - MTD LTR MaLR -2 417 301 5 721 618 351 83 4 chr15 17872749 17873015 -85621959 - MTD LTR MaLR -128 291 5 5 721 262 338 143 35 chr15 17873048 17873278 -85621696 + MLT1D LTR MaLR 100 354 -151 5 721 2059 94 35 25 chr15 17874940 17875007 -85619967 - MT2B2 LTR ERVL -2 582 514 5 721 3299 169 75 66 chr15 17875007 17875905 -85619069 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 5 721 2059 98 38 24 chr15 17875905 17876167 -85618807 - MT2B2 LTR ERVL -71 513 210 5 721 327 87 0 0 chr15 17876155 17876201 -85618773 - MT2B2 LTR ERVL -538 46 1 5 721 324 259 25 0 chr15 17876228 17876309 -85618665 - MurERV4-int LTR ERVK -902 5648 5566 5 721 1218 327 37 14 chr15 17876437 17876999 -85617975 - MurERV4-int LTR ERVK -167 5093 4519 5 721 348 272 163 68 chr15 17884752 17885004 -85609970 + MTC-int LTR MaLR 889 1164 -94 5 721 2253 201 63 67 chr15 17885007 17885557 -85609417 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 721 3111 193 52 58 chr15 17885560 17886716 -85608258 - MurERV4_19-int LTR ERVK -4 5776 4703 5 721 2306 149 14 21 chr15 17886716 17887141 -85607833 - MurERV4_19-int LTR ERVK -1267 4513 4092 5 721 3222 43 5 2 chr15 17889902 17890297 -85604677 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 721 2451 98 41 5 chr15 17892311 17892679 -85602295 - MTB LTR MaLR -19 381 1 5 721 356 243 0 98 chr15 17902434 17902557 -85592417 - ORR1C2 LTR MaLR -264 120 10 5 721 1069 224 88 34 chr15 17903543 17903792 -85591182 + ORR1C2 LTR MaLR 74 326 -58 5 721 1069 224 88 34 chr15 17903813 17903858 -85591116 + ORR1C2 LTR MaLR 327 383 -1 5 721 239 167 46 77 chr15 17910515 17910580 -85584394 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 6 721 287 269 0 0 chr15 17912904 17912971 -85582003 - MTD LTR MaLR -154 265 199 6 721 295 243 13 63 chr15 17915600 17915679 -85579295 - MTEb LTR MaLR -5 374 300 6 721 1116 300 25 25 chr15 17916613 17916972 -85578002 - MTEa LTR MaLR -20 359 1 6 721 450 333 13 6 chr15 17919289 17919446 -85575528 - MTD LTR MaLR 0 419 262 6 721 1242 230 43 64 chr15 17919647 17920178 -85574796 + RLTR1D LTR ERV1 1 605 0 6 721 722 286 20 25 chr15 17926136 17926337 -85568637 - ORR1D1 LTR MaLR -170 204 5 6 721 246 234 118 47 chr15 17927810 17927895 -85567079 + MER70B LTR ERVL 62 152 -426 6 721 592 292 109 21 chr15 17928090 17928373 -85566601 + RMER5 LTR ERV1 46 353 -181 6 721 269 335 97 19 chr15 17930267 17930474 -85564500 - MLT1C LTR MaLR -242 225 3 6 721 690 306 62 20 chr15 17933066 17933419 -85561555 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 6 721 2633 102 15 10 chr15 17935538 17935933 -85559041 + MTB LTR MaLR 4 400 0 6 721 4295 175 37 12 chr15 17935932 17936769 -85558205 + MTB-int LTR MaLR 2 859 -399 6 721 719 208 112 15 chr15 17947975 17948180 -85546794 + MTC LTR MaLR 1 225 -196 6 721 906 179 118 15 chr15 17948438 17948642 -85546332 + MTC LTR MaLR 196 420 -1 6 721 515 321 54 40 chr15 17950490 17950714 -85544260 - ORR1E LTR MaLR 0 370 144 6 721 535 313 13 13 chr15 17950932 17951084 -85543890 - ORR1E LTR MaLR -199 160 9 6 721 754 357 39 24 chr15 17954747 17955077 -85539897 - LTR16C LTR ERVL -154 335 1 6 722 612 270 87 36 chr15 17958245 17958464 -85536510 + MTE2b LTR MaLR 148 377 -2 6 722 2148 74 26 16 chr15 17976033 17976337 -85518637 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 307 -20 7 722 225 333 67 50 chr15 17986536 17986620 -85508354 - MLT1H-int LTR MaLR -162 1247 1166 7 722 4396 14 0 0 chr15 17986620 17987113 -85507861 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 722 225 333 67 50 chr15 17987113 17987208 -85507766 - MLT1H-int LTR MaLR -244 1165 1065 7 722 2171 236 44 60 chr15 17990573 17990807 -85504167 + RMER19C LTR ERVK 1 248 -363 7 722 2427 112 60 3 chr15 17990807 17991192 -85503782 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 722 2171 236 44 60 chr15 17991192 17991574 -85503400 + RMER19C LTR ERVK 249 607 -4 7 722 1344 354 82 62 chr15 18004190 18005421 -85489553 + ORR1E-int LTR MaLR 47 1302 -68 1 722 466 348 49 16 chr15 18005471 18005655 -85489319 + ORR1E LTR MaLR 1 190 -169 1 722 262 333 45 56 chr15 18005698 18005876 -85489098 + ORR1E LTR MaLR 201 376 -3 1 722 3697 108 29 166 chr15 18008190 18009061 -85485913 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 1 722 828 346 70 15 chr15 18014391 18014734 -85480240 + MTEb LTR MaLR 9 370 -9 2 722 2887 103 9 5 chr15 18017468 18017887 -85477087 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 722 368 328 0 16 chr15 18028131 18028255 -85466719 - MTEb LTR MaLR -4 375 254 4 722 988 269 42 48 chr15 18029993 18030322 -85464652 - ORR1C2 LTR MaLR 0 394 58 4 722 601 181 131 7 chr15 18030279 18030424 -85464550 + RMER6C LTR ERVK 111 273 -417 4 722 976 214 29 50 chr15 18030864 18031079 -85463895 + RMER6C LTR ERVK 382 624 -66 4 722 3174 43 0 12 chr15 18031079 18031479 -85463495 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 5 722 976 198 9 36 chr15 18031479 18031551 -85463423 + RMER6C LTR ERVK 625 690 0 4 722 446 191 85 0 chr15 18031551 18031645 -85463329 - ORR1C2 LTR MaLR -248 136 35 4 722 3047 276 82 49 chr15 18031667 18032751 -85462223 - ORR1C2-int LTR MaLR -2 1368 249 4 722 304 340 44 64 chr15 18033452 18033656 -85461318 + MER67D LTR ERV1 3 202 -312 5 722 998 276 182 49 chr15 18036353 18036825 -85458149 - MT2B2 LTR ERVL -49 535 1 5 722 275 174 0 42 chr15 18036864 18036936 -85458038 - ORR1B1-int LTR MaLR -1323 640 572 5 722 489 167 109 16 chr15 18036940 18037068 -85457906 - MERVL_2A-int LTR ERVL -132 5629 5490 6 722 1366 199 78 87 chr15 18037071 18037124 -85457850 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 340 5 722 1366 199 78 87 chr15 18037676 18037980 -85456994 - ORR1B1 LTR MaLR -55 339 40 5 722 248 167 0 0 chr15 18041055 18041097 -85453877 - RMER6C LTR ERVK -2 754 713 6 722 689 246 97 45 chr15 18041125 18041393 -85453581 + RLTR12B LTR ERVK 47 328 -200 6 722 371 275 90 100 chr15 18041377 18041656 -85453318 + RLTR12B LTR ERVK 239 514 -14 6 722 1729 243 100 44 chr15 18041667 18042286 -85452688 - RMER6C LTR ERVK -36 654 1 6 722 1304 186 0 4 chr15 18051297 18051534 -85443440 - RMER6D LTR ERVK 0 690 455 7 722 433 216 24 118 chr15 18051533 18051694 -85443280 - MT2B LTR ERVL -315 286 154 8 722 806 251 10 19 chr15 18053769 18053976 -85440998 - RMER6-int LTR ERVK -2972 205 1 7 722 1907 217 152 93 chr15 18053976 18054656 -85440318 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 7 722 2902 28 2 145 chr15 18054780 18055235 -85439739 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 8 722 16600 21 16 1 chr15 18055237 18057151 -85437823 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 8 722 2902 28 2 145 chr15 18057161 18057616 -85437358 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 8 722 594 348 115 38 chr15 18059454 18059768 -85435206 + ORR1D2 LTR MaLR 33 370 0 8 722 568 305 0 7 chr15 18059768 18059920 -85435054 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 151 -1219 8 722 3061 291 37 68 chr15 18060669 18061141 -85433833 + ORR1D2-int LTR MaLR 192 682 -688 8 722 2116 192 149 32 chr15 18061141 18061759 -85433215 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 9 722 3061 291 37 68 chr15 18061759 18061882 -85433092 + ORR1D2-int LTR MaLR 683 803 -567 8 722 3061 291 37 68 chr15 18061989 18062541 -85432433 + ORR1D2-int LTR MaLR 804 1304 -66 8 722 1589 275 73 60 chr15 18063110 18063266 -85431708 - RLTR40 LTR ERVK -38 779 607 9 722 1589 275 73 60 chr15 18063345 18063664 -85431310 - RLTR40 LTR ERVK -211 606 302 9 722 1589 275 73 60 chr15 18063703 18063995 -85430979 - RLTR40 LTR ERVK -516 301 1 9 722 547 338 95 21 chr15 18072638 18072880 -85422094 - MTE2a LTR MaLR -5 374 115 1 722 261 304 0 0 chr15 18073710 18073779 -85421195 - MTE2a LTR MaLR -310 69 1 1 722 2770 49 0 28 chr15 18074030 18074386 -85420588 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 90 1570 244 68 68 chr15 18087617 18088106 -85406868 + RMER15 LTR ERVL 56 531 -44 1 723 1570 244 68 68 chr15 18088136 18088164 -85406810 + RMER15 LTR ERVL 532 573 -2 1 723 2679 209 36 19 chr15 18092642 18093174 -85401800 + RLTR20A LTR ERVK 1 541 0 1 723 425 358 35 44 chr15 18095734 18095962 -85399012 - RMER15 LTR ERVL -14 561 336 1 723 675 222 115 57 chr15 18096400 18096644 -85398330 - ERVL-int LTR ERVL -2179 3578 3321 1 723 386 225 3 10 chr15 18096669 18096771 -85398203 - ERVL-int LTR ERVL -2488 3269 3193 1 723 389 196 59 49 chr15 18097213 18097315 -85397659 - RMER15 LTR ERVL -451 124 22 1 723 619 346 61 29 chr15 18097429 18097529 -85397445 - ERVL-int LTR ERVL -3377 2337 2238 1 723 3462 18 5 0 chr15 18097529 18097923 -85397051 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 723 619 346 61 29 chr15 18097923 18098298 -85396676 - ERVL-int LTR ERVL -3477 2237 1848 1 723 1440 238 38 109 chr15 18098408 18098710 -85396264 - MTC LTR MaLR 0 421 108 1 723 1440 238 38 109 chr15 18098850 18098996 -85395978 - MTC LTR MaLR -314 107 5 1 723 337 266 21 0 chr15 18099138 18099232 -85395742 - ERVL-int LTR ERVL -3150 2607 2512 1 723 237 339 169 28 chr15 18099668 18099987 -85394987 - MLT-int LTR MaLR 0 1735 1372 1 723 501 359 75 61 chr15 18100666 18101108 -85393866 + MLT2B3 LTR ERVL 29 476 -78 1 723 666 352 59 7 chr15 18101414 18101835 -85393139 - ERVL-int LTR ERVL -4242 1515 1073 1 723 398 402 41 27 chr15 18103191 18103616 -85391358 - MLT2B2 LTR ERVL -116 438 1 1 723 1234 178 72 129 chr15 18111395 18111744 -85383230 + ORR1B1 LTR MaLR 58 386 -8 1 723 746 251 11 21 chr15 18112322 18112513 -85382461 - RLTR42-int LTR ERVK -4123 1399 1211 1 723 553 282 56 19 chr15 18112859 18113072 -85381902 + RMER15 LTR ERVL 352 572 -3 1 723 697 337 32 64 chr15 18114246 18114609 -85380365 + MTE2a LTR MaLR 23 391 -28 1 723 243 224 0 0 chr15 18114625 18114674 -85380300 + MTE2a LTR MaLR 331 379 0 1 723 3120 56 2 5 chr15 18115033 18115430 -85379544 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 723 647 281 38 110 chr15 18126498 18126790 -85368184 - RLTR11B LTR ERVK -182 271 1 1 723 2594 81 3 0 chr15 18128374 18128719 -85366255 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 723 456 293 31 148 chr15 18129561 18129757 -85365217 - MTEa LTR MaLR -201 178 6 2 723 235 401 92 49 chr15 18141257 18141585 -85353389 - LTR16B2 LTR ERVL -82 380 39 2 723 675 250 8 0 chr15 18142440 18142572 -85352402 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 2 723 652 307 45 41 chr15 18143325 18143755 -85351219 - RLTR40 LTR ERVK -11 806 286 2 723 554 251 36 52 chr15 18143981 18144174 -85350800 - RLTR40 LTR ERVK -609 208 19 2 723 1282 190 107 13 chr15 18144239 18144538 -85350436 - ORR1B2 LTR MaLR -7 360 34 2 723 2044 192 133 40 chr15 18146573 18147202 -85347772 - RMER6C LTR ERVK 0 690 3 2 723 310 326 20 98 chr15 18150752 18150905 -85344069 - MLT1A LTR MaLR -214 160 20 2 723 1092 249 54 89 chr15 18151395 18151766 -85343208 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 25 2 723 1491 265 27 65 chr15 18164016 18164528 -85330446 - MT2A LTR ERVL -13 520 28 2 723 505 186 11 8 chr15 18164622 18164739 -85330235 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4598 1163 1064 2 723 367 242 55 0 chr15 18164815 18164906 -85330068 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4827 934 839 2 723 310 185 0 28 chr15 18167288 18167366 -85327608 + MT2A LTR ERVL 1 72 -403 2 723 2256 250 76 3 chr15 18167383 18168002 -85326972 + MERVL_2A-int LTR ERVL 113 776 -4985 2 723 1796 201 22 83 chr15 18169740 18170197 -85324777 + RLTR28 LTR ERVL 72 500 -24 2 723 777 171 36 24 chr15 18170283 18170451 -85324523 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1084 1253 -4508 2 723 648 260 138 17 chr15 18176573 18176862 -85318112 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1239 1562 -4199 2 723 2980 211 65 6 chr15 18176972 18177607 -85317367 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1630 2301 -3460 2 723 2503 89 19 11 chr15 18177609 18177900 -85317074 + RLTR8 LTR ERVK 1 296 -69 2 723 4154 50 0 44 chr15 18177900 18178443 -85316531 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 2 723 2503 89 19 11 chr15 18178443 18178513 -85316461 + RLTR8 LTR ERVK 297 365 0 2 723 960 171 0 0 chr15 18178513 18178677 -85316297 + SRV_MM-int LTR ERVK 1 164 -6003 2 723 1005 173 168 43 chr15 18179301 18179694 -85315280 + SRV_MM-int LTR ERVK 489 930 -5237 2 723 1894 131 40 22 chr15 18186104 18186233 -85308741 + ORR1A2 LTR MaLR 1 129 -198 2 723 1894 131 40 22 chr15 18186728 18186919 -85308055 + ORR1A2 LTR MaLR 130 327 0 2 723 2983 186 12 28 chr15 18186919 18187488 -85307486 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 560 -1403 2 723 2970 120 9 0 chr15 18187481 18187905 -85307069 + MT2B2 LTR ERVL 157 584 0 2 723 1047 59 7 0 chr15 18190850 18190985 -85303989 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 261 3 723 2112 81 84 43 chr15 18190987 18191334 -85303640 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 5 3 723 304 48 0 0 chr15 18191341 18191383 -85303591 - RLTR10B LTR ERVK -250 42 1 3 723 2018 61 0 4 chr15 18191383 18191648 -85303326 - MTA_Mm LTR MaLR -132 264 1 3 723 327 236 269 0 chr15 18194286 18194416 -85300558 + ORR1A2-int LTR MaLR 1005 1169 -340 2 723 407 224 0 0 chr15 18194445 18194521 -85300453 + ORR1A2 LTR MaLR 1 76 -318 2 723 2701 289 72 31 chr15 18194544 18194938 -85300036 + ORR1A2-int LTR MaLR 223 636 -734 2 723 2701 289 72 31 chr15 18195367 18195953 -85299021 + ORR1A2-int LTR MaLR 637 1243 -127 2 723 2356 105 37 8 chr15 18204670 18205025 -85289949 + RLTR8 LTR ERVK 1 365 0 3 723 710 342 26 12 chr15 18213563 18213863 -85281111 - MTE2b LTR MaLR -88 291 1 3 723 919 365 77 24 chr15 18214008 18214463 -85280511 - MTE-int LTR MaLR -268 1312 834 3 723 687 313 75 5 chr15 18214929 18215141 -85279833 - MTE-int LTR MaLR -776 804 578 3 723 930 350 33 111 chr15 18215964 18216577 -85278397 - MTE-int LTR MaLR -978 602 38 3 90 1122 275 162 40 chr15 18218625 18219066 -85275908 + MT2A LTR ERVL 1 499 -34 3 724 1122 275 162 40 chr15 18219113 18219141 -85275833 + MT2A LTR ERVL 500 527 -6 3 724 1963 217 131 82 chr15 18223524 18224111 -85270863 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 1 3 724 2528 44 89 0 chr15 18225075 18225391 -85269583 - ORR1A1 LTR MaLR -2 344 1 3 724 436 308 22 108 chr15 18226260 18226482 -85268492 - MTEa LTR MaLR -174 205 3 3 724 235 333 94 31 chr15 18227328 18227455 -85267519 + MLT1D LTR MaLR 46 180 -325 3 724 1244 294 44 37 chr15 18227927 18228336 -85266638 + RMER15 LTR ERVL 128 539 -36 3 724 1496 207 78 21 chr15 18228490 18228825 -85266149 + ORR1B2 LTR MaLR 6 359 -8 3 724 491 223 96 67 chr15 18228919 18229097 -85265877 - RLTR18B LTR ERVK -69 443 261 3 724 462 307 38 54 chr15 18230331 18230517 -85264457 - RLTR18B LTR ERVK -329 183 1 3 724 1675 257 57 71 chr15 18237207 18237844 -85257130 - RLTR40 LTR ERVK -35 782 155 3 724 2720 50 18 0 chr15 18239456 18239796 -85255178 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 724 13328 64 19 1 chr15 18239796 18241555 -85253419 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 3 724 2827 44 6 0 chr15 18241555 18241899 -85253075 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 724 258 361 46 23 chr15 18258306 18258479 -85236495 + MLT2C1 LTR ERVL 136 312 -85 3 724 772 238 214 22 chr15 18259213 18259484 -85235490 - RMER20B LTR ERVK -289 338 16 3 724 321 245 0 102 chr15 18262201 18262319 -85232655 - MTEb LTR MaLR -12 367 262 3 724 8152 175 48 62 chr15 18265401 18267214 -85227760 + ORR1B1-int LTR MaLR 176 1963 0 4 724 1531 233 20 31 chr15 18267220 18267575 -85227399 + ORR1B1 LTR MaLR 40 390 -4 4 724 2002 127 34 37 chr15 18268051 18268404 -85226570 - MTB_Mm LTR MaLR -55 352 1 4 724 1543 213 32 24 chr15 18277454 18277825 -85217149 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 724 1618 241 25 83 chr15 18280587 18281153 -85213821 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 4 724 426 346 84 46 chr15 18282556 18282841 -85212133 + LTR52 LTR ERVL 5 300 -121 4 724 228 272 0 80 chr15 18282989 18283089 -85211885 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 314 4 724 452 205 0 0 chr15 18285831 18285914 -85209060 + RLTR23 LTR ERV1 8 90 -340 4 724 1216 281 80 112 chr15 18288722 18289496 -85205478 + RLTR40 LTR ERVK 1 749 -68 4 724 1652 214 32 23 chr15 18297015 18297360 -85197614 - ORR1B2 LTR MaLR -15 352 5 4 724 2884 35 6 3 chr15 18310712 18311057 -85183917 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 724 599 288 128 77 chr15 18320177 18320530 -85174444 - MTD LTR MaLR -17 402 9 4 724 808 278 134 24 chr15 18321010 18321345 -85173629 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 4 724 2121 114 7 0 chr15 18325841 18326148 -85168826 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 4 724 328 290 0 20 chr15 18334218 18334320 -85160654 - MTD LTR MaLR -311 108 9 4 724 227 153 62 92 chr15 18336336 18336401 -85158573 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 5 724 983 299 9 37 chr15 18342369 18342695 -85152279 + ORR1D2-int LTR MaLR 197 513 -857 5 724 550 241 0 0 chr15 18342725 18342837 -85152137 + MYSERV-int LTR ERVK 3937 4048 -2502 5 724 1318 321 83 89 chr15 18343078 18343905 -85151069 + ORR1D2-int LTR MaLR 532 1353 -17 5 724 297 385 20 65 chr15 18343938 18344091 -85150883 + ORR1D2 LTR MaLR 11 156 -214 5 724 1419 231 93 37 chr15 18344104 18344482 -85150492 + RMER4B LTR ERVK 21 419 -166 5 724 353 224 91 10 chr15 18344516 18344615 -85150359 + RMER4B LTR ERVK 479 585 0 5 724 497 283 96 35 chr15 18344616 18344814 -85150160 + ORR1D2 LTR MaLR 153 362 -8 5 725 5816 92 19 93 chr15 18353578 18354541 -85140433 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 891 -2 5 725 682 349 70 6 chr15 18364041 18364433 -85130541 - LTR86A2 LTR ERVL -76 437 1 5 725 2544 50 12 124 chr15 18365379 18365790 -85129184 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 5 725 859 234 124 63 chr15 18369052 18369399 -85125575 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 725 1746 228 87 118 chr15 18369674 18370304 -85124670 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 725 2016 129 3 10 chr15 18374584 18374897 -85120077 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 725 1272 73 84 17 chr15 18374899 18375103 -85119871 + RLTR10-int LTR ERVK 3 270 -7311 5 725 320 133 0 0 chr15 18375309 18375354 -85119620 + IAPEY3-int LTR ERVK 93 137 -6405 5 725 2802 59 0 0 chr15 18375357 18375698 -85119276 + IAPEY3-int LTR ERVK 652 992 -995 5 725 508 315 35 45 chr15 18375723 18376122 -85118852 + IAPEY3-int LTR ERVK 1172 1566 -6015 5 725 293 182 36 0 chr15 18376139 18376194 -85118780 + IAP-d-int LTR ERVK 447 503 -6039 5 725 1469 112 112 0 chr15 18376194 18376418 -85118556 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5255 -1287 5 725 4151 124 9 1 chr15 18376418 18377100 -85117874 + IAPEY3-int LTR ERVK 6965 7680 0 5 725 912 286 59 25 chr15 18379950 18380071 -85114903 + RMER6C LTR ERVK 333 455 -265 5 725 912 185 38 72 chr15 18380207 18380234 -85114740 + RMER6C LTR ERVK 409 432 -324 5 725 1131 209 0 0 chr15 18380587 18380817 -85114157 + RMER6C LTR ERVK 461 690 0 5 725 1393 221 54 86 chr15 18381842 18382214 -85112760 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 35 5 725 429 292 88 94 chr15 18382399 18382717 -85112257 + RLTR18B LTR ERVK 5 320 -296 5 725 583 299 44 79 chr15 18383561 18383842 -85111132 + RLTR18B LTR ERVK 237 608 -8 5 725 1111 326 136 14 chr15 18387872 18388366 -85106608 + MTE-int LTR MaLR 982 1535 -45 5 725 787 269 84 0 chr15 18389680 18389907 -85105067 + MTEb LTR MaLR 130 375 -4 5 725 1663 173 82 125 chr15 18393524 18393973 -85101001 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 5 725 3337 191 116 108 chr15 18393991 18394788 -85100186 + RLTR25B LTR ERVK 1 837 -191 5 725 3337 191 116 108 chr15 18394856 18395078 -85099896 + RLTR25B LTR ERVK 838 1028 0 5 725 1723 144 80 7 chr15 18397801 18398101 -85096873 + ORR1A3 LTR MaLR 5 326 0 5 725 254 275 43 58 chr15 18412217 18412314 -85082660 - RLTR26 LTR ERVK -7 635 542 6 725 254 275 43 58 chr15 18412340 18412381 -85082593 - RLTR26 LTR ERVK -101 541 499 6 725 657 237 62 124 chr15 18412400 18412641 -85082333 - RLTR26 LTR ERVK -279 363 138 6 725 777 109 0 32 chr15 18413234 18413357 -85081617 + RMER6B LTR ERVK 1 119 -342 6 725 1586 166 276 3 chr15 18414212 18414499 -85080475 + RMER6D LTR ERVK 1 335 -385 6 725 1586 166 276 3 chr15 18414620 18414712 -85080262 + RMER6D LTR ERVK 336 483 -237 6 725 1110 218 4 8 chr15 18415032 18415268 -85079706 + RMER6D LTR ERVK 456 690 0 6 725 1653 203 32 69 chr15 18440467 18440875 -85054099 + ORR1B1 LTR MaLR 1 393 -1 6 725 271 275 41 103 chr15 18446479 18446625 -85048349 - MLT1A1 LTR MaLR -271 137 1 6 725 1835 102 31 22 chr15 18449493 18449812 -85045162 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 725 18272 146 29 20 chr15 18449812 18456624 -85038350 - ETnERV2-int LTR ERVK -282 7124 1 6 725 1845 99 31 22 chr15 18456624 18456943 -85038031 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 725 275 301 42 59 chr15 18461934 18462067 -85032907 + MLT1A1 LTR MaLR 244 403 -5 6 725 6723 77 19 0 chr15 18463313 18464189 -85030785 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 6 725 420 321 61 36 chr15 18466021 18466186 -85028788 + MTE2b LTR MaLR 2 170 -209 6 725 228 286 214 0 chr15 18470977 18471089 -85023885 + MLT1J LTR MaLR 247 382 -130 6 725 430 330 98 80 chr15 18473089 18473475 -85021499 - MTE-int LTR MaLR -35 1545 1153 6 725 499 297 97 0 chr15 18476167 18476342 -85018632 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1961 3796 3605 6 725 552 341 42 45 chr15 18476415 18476728 -85018246 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2254 3503 3192 6 725 1337 249 99 39 chr15 18476760 18477174 -85017800 - RMER10A LTR ERVL -1 441 3 6 725 350 324 94 56 chr15 18477232 18477397 -85017577 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2778 2936 2773 6 725 350 324 94 56 chr15 18478252 18478446 -85016528 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2942 2772 2564 6 725 1152 83 6 0 chr15 18478780 18478936 -85016038 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 319 6 725 1974 301 51 20 chr15 18479364 18480052 -85014922 - ERVL-B4-int LTR ERVL -5004 710 2 6 726 3335 38 2 0 chr15 18482700 18483095 -85011879 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 726 8317 58 16 6 chr15 18483095 18484178 -85010796 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 5 7 726 2996 60 26 0 chr15 18484179 18484565 -85010409 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 726 2958 74 15 0 chr15 18488913 18489307 -85005667 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 726 390 333 51 84 chr15 18490089 18490364 -85004610 + MT2A LTR ERVL 7 272 -261 7 726 682 343 49 6 chr15 18493130 18493435 -85001539 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 254 7 726 1111 259 90 27 chr15 18497458 18497792 -84997182 + ORR1D1 LTR MaLR 6 360 -14 7 726 3031 283 79 83 chr15 18498501 18499168 -84995806 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 617 -892 7 726 3031 243 56 64 chr15 18499189 18499989 -84994985 + ORR1D1-int LTR MaLR 533 1324 -46 7 726 243 192 77 0 chr15 18507157 18507209 -84987765 - MTEa LTR MaLR -3 376 321 1 726 436 370 51 98 chr15 18507298 18507638 -84987336 - MTEa LTR MaLR -54 325 3 1 726 316 344 88 50 chr15 18508922 18509161 -84985813 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 113 1 726 1132 336 43 29 chr15 18522565 18523123 -84971851 - MER89-int LTR ERV1 -647 6154 5589 3 726 279 75 0 0 chr15 18523885 18523925 -84971049 + ORR1A3 LTR MaLR 287 326 0 3 726 359 352 109 25 chr15 18524970 18525410 -84969564 - MER89-int LTR ERV1 -3206 3595 3119 3 726 279 333 13 0 chr15 18525843 18525921 -84969053 - MER89-int LTR ERV1 -4175 2626 2548 3 726 1140 291 82 115 chr15 18529762 18530396 -84964578 + RLTR18 LTR ERVK 1 613 -3 4 726 544 294 76 40 chr15 18531804 18532105 -84962869 - MLT1B LTR MaLR -45 345 34 4 726 944 296 46 40 chr15 18533922 18534225 -84960749 + MTE2a LTR MaLR 75 379 0 4 726 607 278 39 69 chr15 18535715 18536001 -84958973 + RLTR11A2 LTR ERVK 10 283 -170 4 726 342 262 71 43 chr15 18536053 18536222 -84958752 + RLTR11A2 LTR ERVK 284 490 -38 4 726 433 316 107 15 chr15 18539969 18540165 -84954809 - MTD LTR MaLR -45 374 161 5 726 1463 150 264 25 chr15 18540842 18541164 -84953810 + RLTR17 LTR ERVK 98 496 -196 5 726 915 301 68 36 chr15 18541832 18542246 -84952728 + MERVK26-int LTR ERVK 6213 6639 -280 6 726 257 274 0 0 chr15 18542837 18542899 -84952075 + MTEa LTR MaLR 3 64 -315 6 726 557 297 54 0 chr15 18542943 18543128 -84951846 + MTEa LTR MaLR 177 371 -8 6 726 455 336 84 68 chr15 18543403 18543713 -84951261 - MLT2B2 LTR ERVL -200 315 1 6 726 1786 123 86 3 chr15 18545458 18545760 -84949214 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -5 327 1 6 726 700 355 78 58 chr15 18551371 18551914 -84943060 - MERVK26-int LTR ERVK -2759 4160 3613 7 726 3068 63 5 8 chr15 18551914 18552311 -84942663 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 726 700 355 78 58 chr15 18552311 18553299 -84941675 - MERVK26-int LTR ERVK -3307 3612 2599 7 726 362 343 91 40 chr15 18553505 18553957 -84941017 - MERVK26-int LTR ERVK -4916 2003 1529 7 726 363 338 29 116 chr15 18555132 18555443 -84939531 - MERVK26-int LTR ERVK -6564 355 72 7 726 1235 209 60 2 chr15 18555537 18555994 -84938980 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 7 726 853 332 74 12 chr15 18560527 18560683 -84934291 - MTD LTR MaLR -8 411 246 8 726 853 332 74 12 chr15 18560741 18560922 -84934052 - MTD LTR MaLR -174 245 53 8 726 320 26 0 0 chr15 18570981 18571019 -84923955 + RLTR13B4 LTR ERVK 268 305 -588 1 726 3885 96 4 16 chr15 18571019 18571570 -84923404 + RLTR13B4 LTR ERVK 260 803 0 1 726 246 317 104 47 chr15 18573273 18573370 -84921604 - MLT2B3 LTR ERVL -212 342 239 1 726 297 326 113 53 chr15 18573397 18573698 -84921276 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1791 3923 3605 1 726 551 350 78 51 chr15 18574274 18574708 -84920266 + MLT1D LTR MaLR 35 480 -25 1 726 1898 200 51 107 chr15 18578290 18578916 -84916058 - RMER6C LTR ERVK -4 686 96 1 726 964 286 60 14 chr15 18605108 18605459 -84889515 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 4 1 726 1036 226 221 58 chr15 18606559 18607043 -84887931 + RMER2 LTR ERV1 1 563 -4 1 727 2359 201 83 79 chr15 18622450 18623137 -84871837 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 727 7913 157 13 106 chr15 18626732 18628464 -84866510 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1 1 727 361 347 81 91 chr15 18628609 18629005 -84865969 - MLT1C LTR MaLR -61 406 15 1 727 996 274 151 3 chr15 18634227 18634546 -84860428 + ORR1D1 LTR MaLR 7 372 -2 1 727 2194 255 66 18 chr15 18634567 18635170 -84859804 + ORR1D1-int LTR MaLR 24 655 -715 1 727 717 295 56 52 chr15 18635200 18635450 -84859524 - ORR1D-int LTR MaLR -374 996 746 1 727 1938 135 61 79 chr15 18636073 18636466 -84858508 + RLTR9C LTR ERVK 6 391 -2 2 727 438 154 27 55 chr15 18636470 18636580 -84858394 + ETnERV2-int LTR ERVK 2 108 -4736 2 727 277 301 53 47 chr15 18636618 18636789 -84858185 + ETnERV2-int LTR ERVK 201 372 -2942 2 727 1167 179 111 57 chr15 18636788 18636908 -84858066 + ETnERV2-int LTR ERVK 1090 1196 -6210 2 727 4346 73 2 12 chr15 18636908 18637478 -84857496 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 2 727 1167 179 111 57 chr15 18637478 18637689 -84857285 + ETnERV2-int LTR ERVK 1197 1438 -5968 2 727 2534 175 97 10 chr15 18644104 18644704 -84850270 + ETnERV2-int LTR ERVK 1434 2085 -5321 2 727 4042 198 34 40 chr15 18644732 18647533 -84847441 + ETnERV2-int LTR ERVK 2356 6422 -984 2 727 514 83 0 0 chr15 18647750 18647822 -84847152 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7402 -4 2 727 2161 125 55 75 chr15 18647829 18648228 -84846746 + RLTR9C LTR ERVK 1 391 -2 2 727 823 195 134 28 chr15 18649887 18650304 -84844670 - RMER3D-int LTR ERVK -2006 836 353 2 727 2724 83 31 24 chr15 18650692 18651110 -84843864 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 727 297 311 88 35 chr15 18653477 18653675 -84841299 - ORR1C1 LTR MaLR -144 230 1 2 727 1560 191 111 3 chr15 18654194 18654509 -84840465 - RMER6D LTR ERVK -4 716 368 2 727 350 301 198 31 chr15 18661399 18661591 -84833383 + RMER15 LTR ERVL 337 560 -15 2 727 303 346 96 19 chr15 18682535 18682824 -84812150 - MLT1A1 LTR MaLR -38 370 8 2 727 336 337 62 101 chr15 18693019 18693326 -84801648 - MLT1K LTR MaLR -115 480 186 2 727 290 317 20 10 chr15 18698875 18698977 -84795997 + MTEb LTR MaLR 20 122 -257 2 727 666 283 134 28 chr15 18699675 18699922 -84795052 + MTEb LTR MaLR 101 373 -6 2 727 679 310 108 29 chr15 18706442 18706721 -84788253 + ORR1E LTR MaLR 58 358 -1 2 727 1083 281 82 39 chr15 18707266 18707732 -84787242 + RLTR40 LTR ERVK 281 766 -51 2 727 341 258 57 89 chr15 18707779 18707957 -84787017 + MLT1D LTR MaLR 13 193 -434 2 727 253 256 133 0 chr15 18722138 18722228 -84772746 - MTE2b LTR MaLR -4 375 274 3 727 388 298 179 31 chr15 18722457 18722748 -84772226 - MTE-int LTR MaLR -54 1526 1193 3 727 2675 102 0 8 chr15 18722813 18723210 -84771764 + MTB LTR MaLR 1 394 -6 3 727 748 325 35 89 chr15 18723396 18723801 -84771173 - MTE-int LTR MaLR -1131 449 67 3 727 335 227 32 29 chr15 18728397 18728541 -84766433 + MLT2C2 LTR ERVL 82 221 -335 3 727 545 272 91 42 chr15 18730853 18730980 -84763994 - MTC LTR MaLR -13 408 269 3 727 1602 160 29 65 chr15 18730980 18731321 -84763653 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 727 545 272 91 42 chr15 18731321 18731358 -84763616 - MTC LTR MaLR -153 268 236 3 727 551 169 53 20 chr15 18732037 18732165 -84762809 + ORR1A3 LTR MaLR 152 284 -62 3 727 951 238 40 40 chr15 18740104 18740402 -84754572 - RLTR11A2 LTR ERVK -15 512 215 3 727 306 270 11 33 chr15 18740384 18740476 -84754498 - RLTR11A2 LTR ERVK -438 90 1 3 727 475 340 0 65 chr15 18740497 18740745 -84754229 + MT2A LTR ERVL 188 419 -114 3 727 245 322 0 0 chr15 18741406 18741465 -84753509 + RMER15 LTR ERVL 1 59 -516 3 727 1836 251 2 73 chr15 18741518 18741639 -84753335 + RMER15 LTR ERVL 38 150 -425 3 727 1836 251 2 73 chr15 18741671 18742044 -84752930 + RMER15 LTR ERVL 151 497 -78 3 90 342 364 66 29 chr15 18743258 18743551 -84751423 + LTR40a LTR ERVL 190 452 -13 3 728 3199 173 84 6 chr15 18779258 18779892 -84715082 - RMER6C LTR ERVK -7 683 1 4 728 523 353 107 58 chr15 18782224 18782792 -84712182 - MLT-int LTR MaLR 0 1735 1140 4 728 1390 229 91 29 chr15 18786123 18786514 -84708460 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 4 728 277 269 63 27 chr15 18800838 18800949 -84694025 + MTC LTR MaLR 1 115 -281 4 728 1366 220 64 47 chr15 18805690 18806033 -84688941 + MTC LTR MaLR 73 421 0 4 728 1793 152 12 64 chr15 18815951 18816295 -84678679 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 728 1921 149 14 53 chr15 18821891 18822309 -84672665 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 6 4 728 254 161 16 82 chr15 18831038 18831099 -84663875 - ORR1D1 LTR MaLR -11 359 303 4 728 581 269 120 5 chr15 18831382 18831591 -84663383 - ORR1D1 LTR MaLR -140 234 2 4 728 964 167 86 0 chr15 18833025 18833199 -84661775 - RMER15 LTR ERVL -2 573 385 4 728 1375 188 37 182 chr15 18833909 18834370 -84660604 - RMER15 LTR ERVL -178 397 4 4 728 1420 231 57 35 chr15 18834624 18835111 -84659863 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 1 4 728 798 304 56 15 chr15 18846067 18846337 -84648637 + MLT1D LTR MaLR 16 296 -209 5 728 1081 233 102 69 chr15 18851260 18851726 -84643248 - RMER2 LTR ERV1 -17 550 1 5 728 2733 130 0 7 chr15 18860404 18860814 -84634160 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 728 1481 255 71 11 chr15 18861928 18862308 -84632666 - MTD LTR MaLR -1 418 16 5 728 4184 186 36 24 chr15 18866076 18866925 -84628049 + RLTR25B LTR ERVK 2 862 -166 5 728 4184 186 36 24 chr15 18867047 18867062 -84627912 + RLTR25B LTR ERVK 863 875 -153 5 729 259 344 11 0 chr15 18875839 18875929 -84619045 - MTD LTR MaLR -17 362 272 5 729 340 304 77 47 chr15 18875945 18876242 -84618732 - RLTR15 LTR ERVK -3 356 51 5 729 1226 220 52 30 chr15 18876319 18876624 -84618350 - MTD LTR MaLR -103 316 5 5 729 1464 263 22 35 chr15 18877496 18877901 -84617073 - MTD LTR MaLR 0 419 20 5 729 683 314 118 35 chr15 18881877 18882217 -84612757 - MTD LTR MaLR -50 371 4 5 729 226 281 70 8 chr15 18883448 18883577 -84611397 - RMER17A2 LTR ERVK -520 386 250 5 729 296 358 8 16 chr15 18883934 18884059 -84610915 + MLT1A0 LTR MaLR 1 124 -241 5 729 820 372 122 49 chr15 18884514 18885731 -84609243 + MTE-int LTR MaLR 144 1448 -132 5 729 601 291 68 23 chr15 18885935 18886254 -84608720 - ORR1D2 LTR MaLR 0 359 21 5 729 376 173 59 89 chr15 18910752 18910900 -84584074 + ORR1C2 LTR MaLR 93 234 -144 6 729 1643 139 59 134 chr15 18932844 18933046 -84561928 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 161 6 729 1643 139 59 134 chr15 18933491 18933662 -84561312 - ORR1A1 LTR MaLR -186 160 1 6 729 242 265 0 0 chr15 18956712 18956761 -84538213 + MTC LTR MaLR 179 227 -194 6 729 373 335 67 34 chr15 18956765 18957003 -84537971 + MLT2B1 LTR ERVL 9 254 -266 6 729 269 293 53 82 chr15 18957067 18957238 -84537736 + MLT2B1 LTR ERVL 390 555 0 6 729 245 306 22 101 chr15 18957661 18957799 -84537175 + MTD-int LTR MaLR 1132 1258 0 6 729 1070 255 90 71 chr15 18957799 18958166 -84536808 + MTD LTR MaLR 1 374 -45 6 729 1889 211 10 22 chr15 18964271 18964683 -84530291 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 729 2029 186 198 39 chr15 18971336 18971841 -84523133 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 6 729 2041 183 116 115 chr15 18974875 18975562 -84519412 - RMER6C LTR ERVK -2 688 1 6 729 251 214 18 18 chr15 18975668 18975725 -84519249 - MTC LTR MaLR -169 252 196 6 729 548 246 75 40 chr15 18976571 18976770 -84518204 - RLTR45 LTR ERVK -12 470 265 6 729 2190 114 15 6 chr15 18978914 18979248 -84515726 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 729 23964 43 32 17 chr15 18979248 18982273 -84512701 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 6 729 6532 57 12 18 chr15 18982259 18983114 -84511860 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6479 -2 6 729 2190 114 15 6 chr15 18983116 18983450 -84511524 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 729 262 367 59 13 chr15 18983477 18983629 -84511345 + LTR40b LTR ERVL 255 413 -49 6 729 4329 16 2 12 chr15 18987079 18987577 -84507397 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 729 47333 15 6 0 chr15 18987577 18992903 -84502071 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 7 729 375 179 46 35 chr15 18992903 18992990 -84501984 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 7 729 314 0 0 0 chr15 18992990 18993028 -84501946 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 7 729 4329 16 2 12 chr15 18993028 18993526 -84501448 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 729 594 245 30 24 chr15 18994714 18994804 -84500170 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 492 7 729 594 245 30 24 chr15 18994844 18994920 -84500054 - RLTR20A2 LTR ERVK -87 491 412 7 729 402 231 22 11 chr15 18994900 18994992 -84499982 - RLTR20A2 LTR ERVK -285 283 191 7 729 3695 64 20 2 chr15 18997489 18997976 -84496998 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 7 729 389 340 0 81 chr15 18998387 18998560 -84496414 - MER67D LTR ERV1 -243 271 113 7 729 238 254 15 15 chr15 19001827 19001895 -84493079 + RLTR12B LTR ERVK 41 108 -420 3 729 300 242 81 59 chr15 19001935 19002071 -84492903 + RLTR12B LTR ERVK 383 521 -7 3 729 2602 134 33 9 chr15 19004980 19005403 -84489571 - RLTR10C LTR ERVK -3 433 1 6 730 2982 270 61 25 chr15 19006282 19007365 -84487609 + MYSERV6-int LTR ERVK 329 1450 -7509 9 730 3258 259 48 42 chr15 19008139 19009225 -84485749 + MYSERV6-int LTR ERVK 1744 2835 -6124 9 730 1155 143 0 33 chr15 19009261 19009471 -84485503 + MYSERV6-int LTR ERVK 8163 8365 -594 9 730 382 274 10 0 chr15 19009577 19009679 -84485295 + MYSERV6-int LTR ERVK 8424 8526 -433 9 730 2089 244 14 19 chr15 19009683 19010197 -84484777 + MYSERV-int LTR ERVK 6014 6524 -26 1 730 402 276 151 68 chr15 19010219 19010508 -84484466 + RLTR12B LTR ERVK 1 307 -220 1 730 4620 133 17 52 chr15 19010513 19010666 -84484308 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 662 1 730 4620 133 17 52 chr15 19010694 19011373 -84483601 - RLTR13D1 LTR ERVK -145 661 4 1 730 1921 165 58 29 chr15 19012427 19012807 -84482167 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 1 730 239 286 134 16 chr15 19020942 19021138 -84473836 + RMER20B LTR ERVK 126 329 -298 3 730 247 308 93 47 chr15 19021182 19021332 -84473642 + RMER20B LTR ERVK 460 616 -11 3 730 728 288 55 55 chr15 19035778 19036090 -84458884 - RMER5 LTR ERV1 -222 312 1 4 730 228 344 91 30 chr15 19036622 19036754 -84458220 - MLT-int LTR MaLR -902 833 694 4 730 407 319 68 27 chr15 19040598 19040891 -84454083 + MLT1-int LTR MaLR 245 549 -822 4 730 435 395 65 53 chr15 19048912 19049268 -84445706 + LTR16E1 LTR ERVL 68 427 -111 5 730 1890 185 66 48 chr15 19050763 19051201 -84443773 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 6 730 12771 70 13 39 chr15 19052018 19052184 -84442790 - RLTR22_Mus LTR ERVK 0 1808 1664 6 730 3063 86 0 2 chr15 19052184 19052581 -84442393 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 730 12771 70 13 39 chr15 19052581 19052953 -84442021 - RLTR22_Mus LTR ERVK -145 1663 1311 6 730 12771 70 13 39 chr15 19052988 19054304 -84440670 - RLTR22_Mus LTR ERVK -498 1310 1 6 730 2336 196 38 56 chr15 19055778 19056504 -84438470 - RMER6C LTR ERVK -10 680 1 6 730 947 320 77 9 chr15 19056959 19057299 -84437675 - MTE2b LTR MaLR -4 375 13 7 730 792 334 56 27 chr15 19071874 19072261 -84422713 + MLT-int LTR MaLR 1388 1734 -1 8 730 1172 169 23 208 chr15 19074059 19074454 -84420520 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 107 8 730 1777 164 11 57 chr15 19085822 19086172 -84408802 + RMER6A LTR ERVK 1 334 -422 9 730 979 191 26 112 chr15 19105035 19105351 -84389623 - RMER16 LTR ERVK -76 457 1 1 730 756 247 12 0 chr15 19106461 19106623 -84388351 + MTC LTR MaLR 2 165 -256 1 730 1410 202 8 0 chr15 19108765 19109023 -84385951 + MTC LTR MaLR 162 421 0 1 730 272 364 73 44 chr15 19120480 19120753 -84374221 + MER90 LTR ERV1 176 456 -119 1 730 2722 119 51 9 chr15 19122380 19122830 -84372144 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 469 -88 1 730 2205 193 131 34 chr15 19132415 19133042 -84361932 - RMER6C LTR ERVK -2 688 1 1 731 2773 81 10 7 chr15 19150766 19151176 -84343798 + BGLII LTR ERVK 11 421 0 1 731 2330 234 53 13 chr15 19152512 19152694 -84342280 + RMER15 LTR ERVL 1 200 -375 1 731 2330 234 53 13 chr15 19152720 19153087 -84341887 + RMER15 LTR ERVL 201 571 -4 1 731 260 290 118 24 chr15 19158509 19158636 -84336338 + MLT1A1 LTR MaLR 268 406 -2 2 731 1805 201 125 86 chr15 19161181 19161845 -84333129 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 2 731 1150 149 36 5 chr15 19164217 19164412 -84330562 - RMER6C LTR ERVK -489 201 1 2 731 3311 154 42 29 chr15 19166957 19167550 -84327424 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 2 731 426 259 156 34 chr15 19168172 19168500 -84326474 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 2 731 1605 153 88 157 chr15 19172611 19173045 -84321929 - RLTR9F LTR ERVK -11 404 1 2 731 412 111 27 14 chr15 19173046 19173119 -84321855 - ETnERV2-int LTR ERVK -2 7404 7331 2 731 14858 182 14 17 chr15 19173331 19176206 -84318768 - ETnERV2-int LTR ERVK -981 6425 2798 2 731 2555 250 24 29 chr15 19176239 19177120 -84317854 - ETnERV-int LTR ERVK -2371 943 3 2 731 1754 203 31 79 chr15 19177136 19177590 -84317384 - RLTR9B LTR ERVK -5 432 1 2 731 1290 255 57 23 chr15 19180216 19180601 -84314373 - MTD LTR MaLR -2 405 10 2 731 250 372 73 33 chr15 19184868 19185018 -84309956 + MLT1A1 LTR MaLR 46 201 -207 2 731 265 386 53 43 chr15 19189107 19189500 -84305474 - MERVL_2A-int LTR ERVL -833 4928 4532 2 731 3909 183 110 78 chr15 19191127 19192118 -84302856 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1023 0 2 731 4280 10 2 0 chr15 19193897 19194378 -84300596 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 2 731 1849 179 43 30 chr15 19199330 19199728 -84295246 + MTB_Mm LTR MaLR 3 405 -2 2 731 318 352 77 15 chr15 19203037 19203233 -84291741 + MLT1A0 LTR MaLR 156 363 -2 2 731 2233 122 3 0 chr15 19212903 19213224 -84281750 - ORR1A2 LTR MaLR -5 322 1 3 731 9482 158 31 6 chr15 19213224 19214971 -84280003 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1792 1 3 731 2040 125 21 59 chr15 19214971 19215311 -84279663 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 731 2620 88 23 3 chr15 19215822 19216174 -84278800 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 3 731 49899 71 10 17 chr15 19216174 19217075 -84277899 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 5673 3 731 49899 71 10 17 chr15 19217434 19223117 -84271857 - IAP-d-int LTR ERVK -870 5672 3 3 731 2610 89 32 0 chr15 19223119 19223467 -84271507 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 3 731 436 318 97 84 chr15 19223578 19224031 -84270943 - RLTR11A2 LTR ERVK -68 459 1 3 731 784 214 14 107 chr15 19239815 19240030 -84254944 - RLTR24 LTR ERV1 -334 195 1 3 731 330 265 30 30 chr15 19248003 19248104 -84246870 - MLT1H2 LTR MaLR -319 170 70 3 731 753 289 45 64 chr15 19248452 19248810 -84246164 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 80 3 731 506 236 0 9 chr15 19248877 19248984 -84245990 - RLTR23 LTR ERV1 -317 113 8 3 731 330 313 0 180 chr15 19250943 19251126 -84243848 + RLTR23 LTR ERV1 8 157 -273 3 731 2525 179 88 75 chr15 19257737 19258126 -84236848 + RMER6C LTR ERVK 1 376 -314 3 731 2525 179 88 75 chr15 19258209 19258497 -84236477 + RMER6C LTR ERVK 377 687 -3 3 731 4156 192 72 19 chr15 19258842 19259687 -84235287 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 3 731 405 192 59 118 chr15 19263257 19263393 -84231581 - MER74C LTR ERVL -11 449 322 3 731 1258 200 42 11 chr15 19265075 19265338 -84229636 + RLTR12B LTR ERVK 258 528 0 3 731 570 271 8 179 chr15 19265338 19265586 -84229388 - MT2A LTR ERVL -316 217 13 3 732 782 313 24 30 chr15 19275224 19275596 -84219378 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 732 278 364 84 32 chr15 19276218 19276408 -84218566 + MTEa LTR MaLR 63 262 -117 3 732 611 290 115 18 chr15 19280851 19281069 -84213905 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 119 3 732 251 324 0 0 chr15 19281490 19281564 -84213410 - ORR1D2 LTR MaLR -293 77 4 3 732 4525 192 76 11 chr15 19284063 19284838 -84210136 + RLTR25B LTR ERVK 19 831 -197 3 732 4525 192 76 11 chr15 19284917 19285089 -84209885 + RLTR25B LTR ERVK 832 1027 -1 3 732 941 323 42 18 chr15 19285733 19286067 -84208907 - MTEa LTR MaLR -24 355 14 4 732 3644 58 14 62 chr15 19291314 19291832 -84203142 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 732 356 315 109 27 chr15 19293112 19293259 -84201715 - MTEb LTR MaLR -14 365 207 4 732 426 318 91 11 chr15 19293580 19293755 -84201219 - MTEb LTR MaLR -186 193 5 4 732 1294 362 88 48 chr15 19293767 19293896 -84201078 - MTE-int LTR MaLR -49 1531 1396 4 732 1294 362 88 48 chr15 19294144 19294927 -84200047 - MTE-int LTR MaLR -185 1395 583 4 732 520 149 11 0 chr15 19295079 19295166 -84199808 + ORR1C1 LTR MaLR 8 95 -283 4 732 341 277 41 16 chr15 19295343 19295464 -84199510 - RLTR45-int LTR ERVK -6940 304 181 4 732 563 271 46 15 chr15 19296030 19296161 -84198813 - ETnERV2-int LTR ERVK -202 7204 7070 4 732 1210 182 138 8 chr15 19296162 19296438 -84198536 + ORR1C1 LTR MaLR 55 378 0 4 732 776 200 25 75 chr15 19296759 19296959 -84198015 + RMER13B LTR ERVK 67 256 -652 4 732 330 298 0 126 chr15 19296990 19297109 -84197865 + RMER13B LTR ERVK 682 785 -123 4 732 347 221 128 0 chr15 19297164 19297250 -84197724 - MTEa LTR MaLR -255 124 28 4 732 406 241 125 33 chr15 19297989 19298109 -84196865 - MTD LTR MaLR -36 383 253 4 732 2603 131 52 40 chr15 19298591 19299067 -84195907 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 732 1531 227 65 81 chr15 19299112 19299455 -84195519 + RLTR11A LTR ERVK 17 354 -174 4 732 1531 227 65 81 chr15 19299644 19299804 -84195170 + RLTR11A LTR ERVK 355 512 -16 4 732 2664 84 62 123 chr15 19299927 19300440 -84194534 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 4 732 290 352 31 16 chr15 19300741 19300868 -84194106 - MTD LTR MaLR -239 180 52 4 732 3447 101 52 48 chr15 19302112 19302597 -84192377 + RMER2 LTR ERV1 4 498 -69 4 732 3447 101 52 48 chr15 19302756 19302831 -84192143 + RMER2 LTR ERV1 499 566 -1 4 732 551 45 0 0 chr15 19307076 19307143 -84187831 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 67 -408 4 732 2498 141 10 10 chr15 19307143 19307552 -84187422 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 732 2792 53 95 0 chr15 19307552 19307930 -84187044 + MT2C_Mm LTR ERVL 62 475 0 4 732 2686 35 28 0 chr15 19308118 19308436 -84186538 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 4 732 334 238 122 19 chr15 19314111 19314218 -84180756 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2779 2978 2861 4 732 350 306 89 9 chr15 19314242 19314466 -84180508 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3013 2701 2460 4 732 435 344 65 4 chr15 19314741 19314986 -84179988 + MLT1-int LTR MaLR 298 557 -814 4 732 808 198 135 0 chr15 19315175 19315367 -84179607 + RLTR11A LTR ERVK 1 218 -310 4 732 424 262 8 47 chr15 19315366 19315494 -84179480 + RLTR11A LTR ERVK 404 526 -2 4 732 294 333 81 43 chr15 19315671 19315856 -84179118 - MLT1C LTR MaLR -271 196 5 4 732 3052 20 0 0 chr15 19315902 19316248 -84178726 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 732 767 346 78 29 chr15 19318001 19318403 -84176571 - MER70A LTR ERVL 0 472 48 4 732 767 346 78 29 chr15 19318432 19318478 -84176496 - MER70A LTR ERVL -425 47 2 4 732 4212 174 120 5 chr15 19318877 19319676 -84175298 + RMER19B LTR ERVK 7 897 -5 4 732 1989 150 314 2 chr15 19320079 19320534 -84174440 + RLTR25B LTR ERVK 108 704 -399 4 732 843 191 128 5 chr15 19321078 19321289 -84173685 + RLTR25B LTR ERVK 617 853 -175 4 732 2353 225 33 38 chr15 19321461 19322048 -84172926 - RLTR1D LTR ERV1 -16 589 24 4 732 924 239 43 47 chr15 19322451 19322706 -84172268 + RLTR25B LTR ERVK 850 1103 0 4 732 350 330 52 61 chr15 19323239 19323468 -84171506 + MLT1E2 LTR MaLR 393 619 -8 4 732 3420 171 55 28 chr15 19325046 19325720 -84169254 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 4 732 2469 50 6 212 chr15 19332353 19332839 -84162135 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 4 732 16279 18 5 1 chr15 19332841 19334776 -84160198 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 41 4 732 2502 50 6 212 chr15 19334792 19335278 -84159696 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 4 732 242 341 23 39 chr15 19341118 19341246 -84153728 - RMER12 LTR ERVK -466 856 731 4 732 1788 234 24 38 chr15 19342920 19343224 -84151750 - MTC LTR MaLR -9 412 107 5 732 1788 234 24 38 chr15 19343408 19343521 -84151453 - MTC LTR MaLR -315 106 1 5 732 431 208 8 102 chr15 19344194 19344312 -84150662 - MT2B LTR ERVL -344 257 151 5 732 413 370 75 4 chr15 19348374 19348629 -84146345 + RMER15 LTR ERVL 301 573 -2 5 732 1090 248 134 10 chr15 19350808 19351106 -84143868 + ORR1D1 LTR MaLR 1 335 -39 5 732 3103 23 209 0 chr15 19351375 19351768 -84143206 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 732 588 308 44 85 chr15 19355552 19355868 -84139106 - MT2B LTR ERVL -61 540 238 5 732 3277 222 41 14 chr15 19355954 19356790 -84138184 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 4904 5 732 337 201 0 68 chr15 19356874 19356961 -84138013 - MERVL_2A-int LTR ERVL -735 4750 4609 5 732 1024 253 44 15 chr15 19356965 19357238 -84137736 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1393 4368 4088 5 732 3915 227 144 18 chr15 19357236 19357624 -84137350 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2454 3307 2868 5 732 3915 220 38 28 chr15 19357898 19358050 -84136924 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2894 2867 2719 5 732 3915 225 96 21 chr15 19358356 19359422 -84135552 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3043 2718 1571 5 732 1125 281 75 36 chr15 19359582 19360039 -84134935 - RMER20A LTR ERVK 0 516 8 5 732 1762 198 67 25 chr15 19360554 19360958 -84134016 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 732 2007 132 50 28 chr15 19363379 19363737 -84131237 - RLTR9E LTR ERVK -43 366 1 5 732 449 308 72 87 chr15 19370925 19371203 -84123771 + MLT2C1 LTR ERVL 113 395 -2 5 732 2784 221 124 26 chr15 19371799 19372533 -84122441 - RMER21B LTR ERV1 -2 840 35 5 732 402 338 117 12 chr15 19373242 19373482 -84121492 + MLT1B LTR MaLR 111 375 -15 5 732 355 346 42 0 chr15 19373722 19373936 -84121038 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4809 5031 -683 5 732 253 213 0 176 chr15 19374349 19374457 -84120517 + RLTR25A LTR ERVK 529 617 -486 5 732 3401 25 2 2 chr15 19381827 19382223 -84112751 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 732 9221 29 5 1 chr15 19382223 19383317 -84111657 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 732 3401 25 2 2 chr15 19383317 19383713 -84111261 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 732 406 353 20 48 chr15 19387184 19387434 -84107540 - MTEa LTR MaLR -44 335 93 5 732 447 281 25 81 chr15 19387450 19387614 -84107360 + MTEa LTR MaLR 243 405 -14 5 732 2881 84 15 39 chr15 19389496 19389905 -84105069 - MTB LTR MaLR -1 399 1 5 732 1349 197 52 70 chr15 19392214 19392437 -84102537 + RMER20A LTR ERVK 1 208 -308 5 732 1349 276 89 70 chr15 19393236 19393588 -84101386 + RMER20A LTR ERVK 206 596 -31 5 732 1777 161 63 30 chr15 19393647 19394043 -84100931 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 5 732 227 250 53 53 chr15 19395411 19395487 -84099487 - MLT2B3 LTR ERVL -389 165 90 5 732 697 289 37 96 chr15 19397982 19398254 -84096720 - ORR1E LTR MaLR 0 359 104 5 91 2562 303 91 76 chr15 19398272 19399609 -84095365 - ORR1E-int LTR MaLR -13 1357 1 5 733 464 339 97 62 chr15 19399611 19399951 -84095023 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 5 733 240 381 13 26 chr15 19403062 19403213 -84091761 + MLT1B LTR MaLR 224 372 -18 5 733 887 68 14 0 chr15 19407224 19407371 -84087603 - RMER17B LTR ERVK -498 460 312 5 733 318 320 48 72 chr15 19410450 19410659 -84084315 + MLT-int LTR MaLR 1417 1620 -115 5 733 368 200 66 11 chr15 19413049 19413140 -84081834 + ORR1D2 LTR MaLR 1 96 -274 5 733 317 316 22 15 chr15 19413164 19413299 -84081675 + ORR1D2 LTR MaLR 235 370 0 5 733 517 207 199 41 chr15 19415120 19415291 -84079683 + ORR1D1 LTR MaLR 177 374 0 5 733 788 316 125 39 chr15 19416082 19416546 -84078428 + RMER5 LTR ERV1 31 534 0 5 733 398 325 20 131 chr15 19417227 19417300 -84077674 + MTE2a LTR MaLR 1 69 -310 5 733 398 325 20 131 chr15 19417345 19417568 -84077406 + MTE2a LTR MaLR 70 264 -115 5 733 332 315 70 70 chr15 19417719 19417934 -84077040 - MLT2D LTR ERVL -182 215 1 5 733 2590 58 3 3 chr15 19425121 19425452 -84069522 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 6 733 2760 161 13 23 chr15 19425452 19426131 -84068843 + IAPEy-int LTR ERVK 1 1058 -6455 6 733 21407 48 11 4 chr15 19426131 19428823 -84066151 + IAPEy-int LTR ERVK 4804 7513 0 6 733 2604 55 3 3 chr15 19428823 19429154 -84065820 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 6 733 293 236 27 27 chr15 19430735 19430809 -84064165 + MTB_Mm LTR MaLR 194 267 -140 6 733 837 299 53 73 chr15 19437580 19437985 -84056989 - MTE2a LTR MaLR -14 405 1 6 733 244 289 32 53 chr15 19439794 19439889 -84055085 - MER31A LTR ERV1 -177 308 216 6 733 242 262 104 19 chr15 19440639 19440734 -84054240 - ORR1E LTR MaLR -17 362 264 6 733 235 200 120 76 chr15 19440801 19440893 -84054081 - ORR1E LTR MaLR -241 126 31 6 733 845 359 82 55 chr15 19441002 19441695 -84053279 - MTE-int LTR MaLR -34 1546 835 6 733 430 364 117 16 chr15 19442534 19442841 -84052133 - MTE-int LTR MaLR -13 1567 1230 6 733 3267 43 2 2 chr15 19444884 19445280 -84049694 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 733 8843 46 4 3 chr15 19445280 19446377 -84048597 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 733 3083 32 45 3 chr15 19446377 19446757 -84048217 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 733 2855 158 48 30 chr15 19457807 19458257 -84036717 + RLTR20A1 LTR ERVK 1 446 -105 6 733 2855 158 48 30 chr15 19458325 19458415 -84036559 + RLTR20A1 LTR ERVK 447 550 -1 6 733 811 313 58 29 chr15 19466844 19467008 -84027966 + RLTR40 LTR ERVK 127 296 -521 6 733 811 313 58 29 chr15 19467045 19467294 -84027680 + RLTR40 LTR ERVK 297 551 -266 6 733 2712 109 45 0 chr15 19476167 19476570 -84018404 + BGLII_Mus LTR ERVK 2 422 0 6 733 523 344 31 27 chr15 19477944 19478111 -84016863 - MER67D LTR ERV1 -248 266 104 6 733 523 344 31 27 chr15 19478588 19478680 -84016294 - MER67D LTR ERV1 -411 103 7 6 733 371 227 32 113 chr15 19481573 19481614 -84013360 - MT2B LTR ERVL -444 157 127 6 733 5035 116 28 7 chr15 19514263 19515077 -83979897 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 831 -1017 6 733 269 335 40 84 chr15 19515299 19515524 -83979450 + RMER12 LTR ERVK 1108 1322 0 7 733 1452 207 205 144 chr15 19527336 19527912 -83967062 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 734 434 349 112 34 chr15 19538440 19538763 -83956211 + MTE2a LTR MaLR 1 348 -31 3 734 2660 104 36 0 chr15 19551107 19551492 -83943482 + MTB LTR MaLR 2 400 0 4 734 1789 156 115 24 chr15 19551810 19552383 -83942591 - RLTR1B LTR ERV1 0 624 1 4 734 2133 113 26 112 chr15 19552666 19553096 -83941878 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 4 734 702 342 104 4 chr15 19555311 19555581 -83939393 - MTD LTR MaLR -14 405 109 5 734 1780 249 138 14 chr15 19562067 19562580 -83932394 + RMER19C LTR ERVK 35 611 0 5 734 930 311 106 92 chr15 19562580 19563144 -83931830 - MTC-int LTR MaLR -456 1336 430 5 734 2450 146 24 5 chr15 19564226 19564639 -83930335 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 734 326 289 0 0 chr15 19565783 19565859 -83929115 - MTD LTR MaLR 0 419 344 6 734 400 230 147 33 chr15 19565869 19566000 -83928974 + RMER17C LTR ERVK 65 219 -191 6 734 400 230 147 33 chr15 19566067 19566119 -83928855 + RMER17C LTR ERVK 220 269 -141 6 734 594 259 28 28 chr15 19566167 19566310 -83928664 - MTD LTR MaLR -108 311 169 6 734 303 147 66 50 chr15 19576413 19576501 -83918473 - ORR1D-int LTR MaLR 0 1370 1298 7 734 2634 101 39 3 chr15 19576661 19577047 -83917927 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 734 2587 138 5 22 chr15 19577047 19577492 -83917482 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 662 7 734 366 227 23 0 chr15 19577495 19577583 -83917391 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 322 7 734 362 183 25 108 chr15 19577599 19577723 -83917251 - RLTR10A LTR ERVK -170 241 114 7 734 1808 232 41 34 chr15 19577751 19578534 -83916440 - RLTR45-int LTR ERVK -202 7042 6522 7 734 703 304 16 5 chr15 19578579 19578959 -83916015 - RLTR45-int LTR ERVK -3527 4054 3511 7 734 388 191 61 41 chr15 19579411 19579509 -83915465 - RLTR10-int LTR ERVK -1569 418 319 7 734 232 240 53 115 chr15 19579525 19579638 -83915336 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 204 8 734 451 221 25 16 chr15 19579647 19579772 -83915202 - RLTR10A LTR ERVK -166 245 104 7 734 3860 136 34 13 chr15 19579817 19580504 -83914470 - MTB-int LTR MaLR -397 701 1 8 734 2893 86 5 2 chr15 19580506 19580903 -83914071 - MTB LTR MaLR -2 398 1 8 734 342 128 0 114 chr15 19594543 19594622 -83900352 - RMER6C LTR ERVK -2 688 619 1 734 390 102 0 0 chr15 19594622 19594681 -83900293 + RMER6D LTR ERVK 1 59 -661 1 734 369 198 40 99 chr15 19594944 19595045 -83899929 + RMER6C LTR ERVK 43 137 -553 1 734 262 86 207 0 chr15 19595595 19595653 -83899321 + RMER6C LTR ERVK 168 237 -453 1 734 485 281 125 58 chr15 19595655 19595999 -83898975 - RLTR9A LTR ERVK -1 367 1 1 734 973 204 88 69 chr15 19595999 19596339 -83898635 + RMER6C LTR ERVK 235 690 0 1 734 1894 169 27 3 chr15 19651130 19651468 -83843506 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 735 449 280 6 103 chr15 19663904 19664079 -83830895 + MT2B LTR ERVL 119 276 -325 2 735 981 115 58 0 chr15 19678893 19679049 -83815925 + MT2B2 LTR ERVL 338 502 -82 2 735 7739 65 14 3 chr15 19681978 19683013 -83811961 + MTA_Mm-int LTR MaLR 53 1098 0 2 735 3149 56 2 8 chr15 19683013 19683411 -83811563 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 735 2571 107 146 18 chr15 19685600 19686046 -83808928 + MT2B2 LTR ERVL 1 503 -81 2 735 400 336 36 23 chr15 19687812 19688031 -83806943 + ERVL-B4-int LTR ERVL 324 545 -5169 2 735 258 361 41 20 chr15 19688031 19688226 -83806748 + ERVL-B4-int LTR ERVL 766 964 -4793 2 735 2857 316 81 19 chr15 19689598 19691268 -83803706 + ERVL-B4-int LTR ERVL 985 2833 -2928 2 735 2838 84 2 27 chr15 19693420 19693826 -83801148 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 735 1756 155 76 0 chr15 19694957 19695261 -83799713 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 735 282 316 36 14 chr15 19696265 19696403 -83798571 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3157 3297 -2188 2 735 456 349 112 47 chr15 19701393 19701733 -83793241 + MTEa LTR MaLR 18 379 0 2 735 1558 214 48 31 chr15 19708456 19708809 -83786165 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 2 735 1090 127 12 12 chr15 19712683 19712851 -83782123 + RLTR9A LTR ERVK 129 296 -72 2 735 463 119 0 67 chr15 19713009 19713099 -83781875 + RMER12 LTR ERVK 1 84 -1238 2 735 1859 151 11 46 chr15 19713289 19713301 -83781673 + RMER12 LTR ERVK 456 467 -855 2 735 1859 151 11 46 chr15 19713436 19713792 -83781182 + RMER12 LTR ERVK 468 810 -512 2 735 780 206 110 73 chr15 19713776 19714022 -83780952 + RMER12 LTR ERVK 945 1199 -123 2 735 2966 83 2 2 chr15 19729025 19729422 -83765552 - MTB LTR MaLR -2 398 2 3 735 278 326 20 20 chr15 19735600 19735747 -83759227 - RMER17C LTR ERVK -127 283 137 3 735 1413 258 61 23 chr15 19746840 19747233 -83747741 + MT2A LTR ERVL 3 410 -123 3 735 1324 259 114 44 chr15 19748120 19748534 -83746440 + RMER2 LTR ERV1 1 457 -110 3 735 2202 145 259 2 chr15 19748534 19748997 -83745977 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -2 582 1 3 735 1324 259 114 44 chr15 19748997 19749107 -83745867 + RMER2 LTR ERV1 458 562 -5 3 735 336 352 40 27 chr15 19752545 19752694 -83742280 + ORR1E LTR MaLR 5 155 -204 3 735 234 311 112 24 chr15 19755486 19755611 -83739363 - MLT2B4 LTR ERVL -402 154 19 3 735 250 312 43 35 chr15 19756130 19756246 -83738728 + ORR1D2 LTR MaLR 254 370 0 3 735 584 287 172 21 chr15 19758444 19758771 -83736203 - MTEb LTR MaLR -2 377 2 3 735 3552 147 46 19 chr15 19759500 19760217 -83734757 - RMER17A LTR ERVK -15 736 1 3 735 254 327 68 25 chr15 19765567 19765730 -83729244 + RMER15 LTR ERVL 385 554 -21 3 735 1734 172 21 50 chr15 19770886 19771307 -83723667 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 735 1524 184 308 51 chr15 19772813 19773362 -83721612 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 3 735 657 309 51 32 chr15 19781675 19782012 -83712962 + RMER15 LTR ERVL 2 396 -179 3 735 1202 112 0 50 chr15 19785287 19785485 -83709489 + MTB_Mm LTR MaLR 1 188 -208 4 735 1504 105 0 0 chr15 19785676 19785885 -83709089 + MTB_Mm LTR MaLR 195 403 -4 4 735 3117 85 23 33 chr15 19786937 19787424 -83707550 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 735 640 363 20 24 chr15 19789116 19789367 -83705607 + MTE2b LTR MaLR 20 269 -110 4 735 321 244 0 34 chr15 19790858 19790947 -83704027 - RMER3D-int LTR ERVK -1595 1247 1162 4 735 1973 179 41 56 chr15 19790974 19791490 -83703484 - RMER3D-int LTR ERVK -410 2432 1925 4 735 572 177 48 41 chr15 19791509 19791656 -83703318 - RMER3D-int LTR ERVK -1163 1679 1532 4 91 1887 186 5 18 chr15 19791689 19792073 -83702901 - RMER3D-int LTR ERVK -1309 1533 1155 4 736 435 154 2 11 chr15 19792088 19792184 -83702790 - RMER3D-int LTR ERVK -2285 557 470 4 736 745 185 71 27 chr15 19792310 19792642 -83702332 - RMER3D-int LTR ERVK -2006 836 359 4 736 358 250 0 29 chr15 19792708 19792844 -83702130 - RMER3D-int LTR ERVK -1993 849 718 4 736 2805 74 14 24 chr15 19792844 19793257 -83701717 + RLTR9F LTR ERVK 1 409 -6 4 736 390 162 0 63 chr15 19793258 19793337 -83701637 - RMER3D-int LTR ERVK -2117 725 652 4 736 311 111 0 0 chr15 19793353 19793398 -83701576 - RMER3D-int LTR ERVK -6351 1055 1011 4 736 523 84 0 0 chr15 19793365 19793436 -83701538 - RMER3D-int LTR ERVK -2278 564 494 4 736 1265 88 112 2 chr15 19793752 19793974 -83701000 - BGLII LTR ERVK -196 226 1 4 736 811 322 63 23 chr15 19794122 19794421 -83700553 + MTEa LTR MaLR 69 379 0 4 736 349 327 95 38 chr15 19797033 19797243 -83697731 - RMER5 LTR ERV1 -273 261 40 4 736 1037 267 29 39 chr15 19798897 19799205 -83695769 + MTD LTR MaLR 115 419 0 4 736 1792 157 21 51 chr15 19804117 19804452 -83690522 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 5 4 736 307 388 55 17 chr15 19805784 19805965 -83689009 + MLT1E2 LTR MaLR 268 455 -172 4 736 461 318 59 47 chr15 19808700 19808938 -83686036 + ORR1E LTR MaLR 3 241 -129 4 736 414 373 5 21 chr15 19811662 19811851 -83683123 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 172 4 736 448 277 20 0 chr15 19811912 19812013 -83682961 - ORR1D2 LTR MaLR -255 115 13 4 736 535 338 24 5 chr15 19812025 19812230 -83682744 - ORR1D2-int LTR MaLR -6 1364 1156 4 736 297 355 176 73 chr15 19813269 19813570 -83681404 + MER70B LTR ERVL 14 345 -233 4 736 275 329 75 41 chr15 19813707 19813973 -83681001 - RMER12 LTR ERVK -358 964 690 4 736 2438 263 69 66 chr15 19833347 19834301 -83660673 - RMER17B LTR ERVK -1 957 1 4 736 878 334 14 66 chr15 19841591 19841953 -83653021 + ORR1D1 LTR MaLR 4 346 -28 4 736 281 331 62 43 chr15 19858821 19858982 -83635992 - MLT1G3 LTR MaLR -87 508 345 5 736 678 368 19 8 chr15 19859384 19859650 -83635324 + MTD LTR MaLR 8 276 -143 5 736 1475 309 86 62 chr15 19860998 19861742 -83633232 + MTC-int LTR MaLR 1 762 -496 5 736 2954 98 2 2 chr15 19863950 19864371 -83630603 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 736 506 117 0 0 chr15 19864774 19864862 -83630112 + RMER3D-int LTR ERVK 489 564 -2278 5 736 747 236 72 58 chr15 19864877 19865121 -83629853 + RMER3D-int LTR ERVK 331 583 -2259 5 736 747 236 72 58 chr15 19865501 19865545 -83629429 + RMER3D-int LTR ERVK 584 626 -2216 5 736 1648 183 129 25 chr15 19865537 19866017 -83628957 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1543 -1299 5 736 587 164 44 82 chr15 19866040 19866199 -83628775 + RMER3D-int LTR ERVK 1538 1690 -1152 5 736 2950 223 46 47 chr15 19866203 19867117 -83627857 + RMER3D-int LTR ERVK 1925 2837 -5 5 736 2730 84 42 5 chr15 19867122 19867528 -83627446 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 736 247 349 19 9 chr15 19878779 19878886 -83616088 - LTR40a LTR ERVL -300 219 112 5 736 1354 117 29 0 chr15 19893330 19893535 -83601439 - MTB LTR MaLR -8 392 182 5 736 794 194 30 6 chr15 19897955 19898153 -83596821 + ORR1A3 LTR MaLR 180 384 0 5 736 672 239 54 30 chr15 19898896 19899064 -83595910 + MTB_Mm LTR MaLR 1 172 -235 5 736 525 252 8 22 chr15 19899049 19899183 -83595791 + MTB_Mm LTR MaLR 288 419 -2 5 736 295 221 8 111 chr15 19901356 19901473 -83593501 + MT2B LTR ERVL 165 269 -332 5 736 462 235 118 41 chr15 19905939 19906108 -83588866 + RLTR40 LTR ERVK 104 285 -532 5 736 663 201 56 56 chr15 19906567 19906762 -83588212 - RMER17C-int LTR ERVK -2910 328 134 5 736 647 198 75 64 chr15 19906783 19906956 -83588018 - RMER17C-int LTR ERVK -3062 176 2 5 736 1380 203 70 63 chr15 19906965 19907364 -83587610 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 5 736 499 236 64 64 chr15 19907379 19907583 -83587391 + RLTR40 LTR ERVK 409 612 -205 5 736 4991 114 64 65 chr15 19914273 19914367 -83580607 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 803 5 736 4991 114 64 65 chr15 19914418 19914478 -83580496 - RLTR13D6 LTR ERVK -100 802 737 5 736 4991 114 64 65 chr15 19914625 19915372 -83579602 - RLTR13D6 LTR ERVK -166 736 3 5 736 1832 222 13 102 chr15 19915695 19916186 -83578788 + RLTR11A LTR ERVK 38 500 -28 5 736 1475 228 28 36 chr15 19916263 19916627 -83578347 + RMER6C LTR ERVK 330 690 0 5 736 3300 166 19 31 chr15 19916888 19917524 -83577450 - RLTR5_Mm LTR ERV1 0 628 1 5 736 279 298 73 70 chr15 19919893 19920226 -83574748 - BGLII_B LTR ERVK -29 498 123 5 736 1871 133 253 31 chr15 19921234 19921684 -83573290 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 586 -68 5 737 2439 212 115 70 chr15 19924248 19925098 -83569876 + RLTR13D6 LTR ERVK 6 856 -46 5 737 708 304 17 57 chr15 19926024 19926051 -83568923 - MT2B LTR ERVL -41 560 532 6 737 708 292 58 38 chr15 19926112 19926404 -83568570 - MT2B LTR ERVL -70 531 92 6 737 735 193 116 23 chr15 19926566 19926902 -83568072 - RLTR19 LTR ERVK -77 422 1 6 737 231 220 203 0 chr15 19926932 19926991 -83567983 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 491 6 737 760 158 29 7 chr15 19926958 19927098 -83567876 - RLTR17 LTR ERVK -259 433 291 6 737 2759 67 229 9 chr15 19927100 19927520 -83567454 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 737 63473 21 0 0 chr15 19927520 19935070 -83559904 - MMERGLN-int LTR ERV1 0 7556 7 6 737 2893 66 200 9 chr15 19935076 19935506 -83559468 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 737 1453 178 83 4 chr15 19935506 19935776 -83559198 - RLTR17 LTR ERVK -399 293 2 6 737 386 169 0 0 chr15 19936687 19936752 -83558222 + RMER6D LTR ERVK 1 65 -655 6 737 2227 109 78 3 chr15 19943194 19943526 -83551448 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 6 737 2673 148 4 17 chr15 19943526 19943986 -83550988 + IAPEy-int LTR ERVK 1 454 -7059 6 737 1018 142 31 30 chr15 19944397 19944812 -83550162 + IAPEy-int LTR ERVK 409 952 -6629 6 737 1356 189 148 68 chr15 19944924 19945390 -83549584 + IAPEy-int LTR ERVK 251 819 -4587 6 737 441 220 93 0 chr15 19945392 19945510 -83549464 + IAPEy-int LTR ERVK 1721 1849 -5557 6 737 280 279 0 55 chr15 19945521 19945612 -83549362 + IAPEy-int LTR ERVK 2454 2539 -4867 6 737 584 227 0 0 chr15 19945624 19945743 -83549231 + IAPEy-int LTR ERVK 2635 2753 -4653 6 737 437 71 0 0 chr15 19945769 19945825 -83549149 + IAPEy-int LTR ERVK 3567 3622 -3784 6 737 604 61 47 66 chr15 19945824 19945930 -83549044 + IAPEy-int LTR ERVK 4567 4670 -2911 6 737 3145 105 2 16 chr15 19946185 19946631 -83548343 + IAPEy-int LTR ERVK 5203 5642 -1939 6 737 3479 82 0 2 chr15 19946622 19947077 -83547897 + IAPEy-int LTR ERVK 5761 6214 -1367 6 737 5263 105 10 8 chr15 19947069 19947844 -83547130 + IAPEy-int LTR ERVK 6737 7513 0 6 737 2213 94 16 3 chr15 19947855 19948176 -83546798 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 33 357 0 6 737 263 267 7 20 chr15 19955146 19955188 -83539786 - ORR1B1-int LTR MaLR -863 646 607 6 737 883 276 117 72 chr15 19966474 19966860 -83528114 - MTD LTR MaLR -8 411 9 6 737 1296 81 0 0 chr15 19970486 19970659 -83524315 + BGLII LTR ERVK 1 173 -248 6 737 2129 54 26 45 chr15 19970681 19970990 -83523984 - IAPLTR2b LTR ERVK -24 303 1 6 737 1600 85 22 75 chr15 19970990 19971258 -83523716 + BGLII LTR ERVK 168 421 0 6 737 1932 154 3 61 chr15 19973446 19973791 -83521183 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 6 737 2949 35 0 3 chr15 19985428 19985775 -83509199 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 737 3347 38 2 0 chr15 19998457 19998852 -83496122 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 737 746 332 5 9 chr15 19999319 19999529 -83495445 + MTD LTR MaLR 1 209 -210 6 737 1378 275 16 30 chr15 20009679 20010106 -83484868 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 737 457 301 63 14 chr15 20010116 20010338 -83484636 - MER67C LTR ERV1 -478 233 1 1 737 315 352 19 34 chr15 20022476 20022682 -83472292 - MTE-int LTR MaLR -1306 274 72 3 737 1483 234 56 63 chr15 20023494 20023890 -83471084 + MTC LTR MaLR 1 393 -28 3 737 474 269 74 28 chr15 20024129 20024408 -83470566 - RMER6D LTR ERVK -8 712 521 3 737 649 161 0 25 chr15 20024412 20024533 -83470441 + RMER6-int LTR ERVK 7 124 -3053 4 737 1377 209 4 0 chr15 20024530 20024803 -83470171 + RMER6-int LTR ERVK 956 1229 -1948 4 737 1893 175 148 10 chr15 20025506 20025898 -83469076 + RMER6-int LTR ERVK 1315 1760 -1417 4 737 693 281 51 54 chr15 20025883 20026075 -83468899 + MurERV4-int LTR ERVK 4691 4888 -372 4 737 2748 64 2 106 chr15 20026075 20026510 -83468464 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 4 737 693 281 51 54 chr15 20026510 20026633 -83468341 + MurERV4-int LTR ERVK 4889 5005 -255 4 737 550 172 0 0 chr15 20026637 20026724 -83468250 + RMER6-int LTR ERVK 2744 2830 -347 4 737 2970 187 82 19 chr15 20026941 20027574 -83467400 + RLTR33 LTR ERVK 5 677 -1 4 737 1612 180 45 6 chr15 20027574 20027904 -83467070 + RMER6-int LTR ERVK 2825 3167 -10 4 737 512 171 171 0 chr15 20027911 20028016 -83466958 + RMER6D LTR ERVK 21 143 -577 4 737 2762 195 92 31 chr15 20030052 20030723 -83464251 + RMER6D LTR ERVK 1 712 -8 4 737 282 318 54 36 chr15 20031161 20031272 -83463702 - MLT1A0 LTR MaLR -252 113 1 4 737 1468 234 83 26 chr15 20035479 20036075 -83458899 - RMER6A LTR ERVK -131 625 2 5 737 867 272 37 37 chr15 20036140 20036468 -83458506 + RLTR15 LTR ERVK 14 341 -18 6 737 2025 277 73 68 chr15 20042050 20042615 -83452359 + RLTR40 LTR ERVK 5 590 -227 7 737 2025 277 73 68 chr15 20042646 20042883 -83452091 + RLTR40 LTR ERVK 591 811 -6 7 737 298 319 30 24 chr15 20043606 20043770 -83451204 - MER34A1 LTR ERV1 -73 514 350 7 737 1463 185 95 50 chr15 20045898 20046257 -83448717 + ORR1C1 LTR MaLR 3 377 -1 8 737 1491 47 0 5 chr15 20047706 20047897 -83447077 + MTA_Mm LTR MaLR 207 396 0 8 737 1707 10 0 0 chr15 20051414 20051614 -83443360 + ORR1A0 LTR MaLR 147 346 0 8 738 391 309 36 7 chr15 20060843 20060983 -83433991 + MLT1A0 LTR MaLR 9 152 -213 9 738 229 342 81 24 chr15 20069686 20069809 -83425165 - MLT1A LTR MaLR -13 361 232 1 738 289 388 41 32 chr15 20073133 20073354 -83421620 + MTE2a LTR MaLR 1 223 -156 1 738 3256 51 2 0 chr15 20074004 20074399 -83420575 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 738 8138 67 12 3 chr15 20074399 20075487 -83419487 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 738 3028 76 2 0 chr15 20075487 20075882 -83419092 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 738 277 354 17 26 chr15 20079402 20079518 -83415456 - RMER15 LTR ERVL -14 561 447 1 738 2417 96 127 23 chr15 20084464 20084891 -83410083 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 5 1 738 26138 18 4 0 chr15 20084895 20087841 -83407133 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 1 738 932 73 24 0 chr15 20087841 20087964 -83407010 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 1 738 1800 123 4 4 chr15 20087961 20088223 -83406751 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 1 738 433 82 0 32 chr15 20088212 20088275 -83406699 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 1 738 3423 66 6 43 chr15 20088275 20089112 -83405862 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 8 1 738 2423 99 121 19 chr15 20089112 20089543 -83405431 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 738 264 269 93 43 chr15 20090336 20090409 -83404565 - RMER12 LTR ERVK -474 848 766 1 738 264 269 93 43 chr15 20090567 20090633 -83404341 - RMER12 LTR ERVK -557 765 703 1 738 328 167 0 0 chr15 20090849 20090903 -83404071 + MTC LTR MaLR 1 54 -367 1 738 253 371 50 17 chr15 20096461 20096642 -83398332 + ERVL-E-int LTR ERVL 1968 2154 -3513 1 738 309 289 0 66 chr15 20097045 20097167 -83397807 + ERVL-int LTR ERVL 4854 4967 -790 1 738 2032 234 32 140 chr15 20106442 20107101 -83387873 + RMER19C LTR ERVK 24 611 0 1 738 303 382 7 13 chr15 20112995 20113149 -83381825 + MER77 LTR ERVL 446 598 -9 1 738 258 394 70 81 chr15 20112997 20113342 -83381632 + MER21B LTR ERV1 408 748 -115 1 738 1209 264 65 3 chr15 20113979 20114317 -83380657 - ORR1D1 LTR MaLR -7 367 9 1 738 3012 124 106 17 chr15 20115122 20115640 -83379334 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 1 738 2308 119 143 9 chr15 20119763 20120188 -83374786 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 738 239 291 288 11 chr15 20125275 20125466 -83369508 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 290 1 738 269 300 26 26 chr15 20127313 20127426 -83367548 + RLTR8 LTR ERVK 253 365 0 1 738 387 322 102 40 chr15 20129256 20129482 -83365492 - RMER5 LTR ERV1 -262 272 33 1 738 2816 211 43 22 chr15 20131667 20132296 -83362678 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 1 738 394 250 7 126 chr15 20136896 20137047 -83357927 - MT2B LTR ERVL -337 264 132 2 738 2353 89 23 11 chr15 20150950 20151303 -83343671 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 2 738 273 173 394 0 chr15 20167511 20167615 -83327359 + BGLII_B LTR ERVK 19 163 -278 2 738 1875 96 31 22 chr15 20180178 20180497 -83314477 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 738 710 228 33 65 chr15 20182982 20183250 -83311724 + BGLII_B LTR ERVK 1 263 -159 2 739 997 259 54 62 chr15 20185973 20186360 -83308614 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 739 2995 97 10 0 chr15 20187414 20187817 -83307157 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 739 318 312 18 9 chr15 20188340 20188448 -83306526 + MTD LTR MaLR 80 188 -231 2 739 354 315 54 0 chr15 20188448 20188578 -83306396 + MTC-int LTR MaLR 4 140 -1118 2 739 270 191 47 113 chr15 20192611 20192717 -83302257 + RLTR9E LTR ERVK 6 104 -264 2 739 481 279 60 36 chr15 20192750 20192917 -83302057 + RLTR9E LTR ERVK 236 406 -3 2 739 477 138 36 122 chr15 20198096 20198318 -83296656 - RMER17C LTR ERVK -133 277 75 3 739 1053 218 128 36 chr15 20204574 20204878 -83290096 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 739 1714 129 116 119 chr15 20204880 20205301 -83289673 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3 422 -7159 3 739 845 96 8 0 chr15 20205404 20205529 -83289445 + MMERVK10C-int LTR ERVK 708 833 -6748 3 739 732 201 104 0 chr15 20205538 20205692 -83289282 + IAPEz-int LTR ERVK 334 503 -4903 3 739 599 233 234 13 chr15 20205660 20205895 -83289079 + RLTR19-int LTR ERVK 376 662 -5475 3 739 255 211 58 0 chr15 20205890 20205942 -83289032 + RLTR19-int LTR ERVK 950 1004 -983 3 739 280 260 49 20 chr15 20206015 20206117 -83288857 + RLTR19-int LTR ERVK 1462 1566 -6015 3 739 332 175 0 0 chr15 20206134 20206191 -83288783 + IAPEz-int LTR ERVK 447 503 -6039 3 739 1344 138 107 0 chr15 20206191 20206416 -83288558 + IAPEz-int LTR ERVK 5007 5255 -1287 3 739 1626 139 47 25 chr15 20206416 20206755 -83288219 + IAPEY3-int LTR ERVK 6965 7338 -342 3 739 1350 177 67 26 chr15 20206772 20207115 -83287859 + IAPEz-int LTR ERVK 6125 6481 0 3 739 1096 190 141 49 chr15 20207115 20207419 -83287555 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 739 260 310 67 42 chr15 20214222 20214387 -83280587 - RLTR12B LTR ERVK -44 484 316 3 739 960 215 153 133 chr15 20216621 20217071 -83277903 - RMER6B LTR ERVK 0 461 3 3 739 427 219 33 32 chr15 20223603 20223735 -83271239 + RLTR18B LTR ERVK 186 307 -205 3 739 810 287 22 9 chr15 20223751 20223976 -83270998 + RLTR18B LTR ERVK 280 507 -5 3 739 519 246 113 0 chr15 20224030 20224172 -83270802 + RLTR18-int LTR ERVK 31 188 -5173 3 739 1658 267 82 73 chr15 20224541 20225216 -83269758 + RLTR18-int LTR ERVK 641 1321 -4040 3 739 2058 309 88 20 chr15 20225473 20226280 -83268694 + RLTR18-int LTR ERVK 1641 2502 -2859 3 739 589 289 18 0 chr15 20226520 20226686 -83268288 + RLTR18-int LTR ERVK 2492 2660 -2701 3 739 2622 228 30 60 chr15 20228054 20228834 -83266140 + RLTR18-int LTR ERVK 2670 3425 -1936 3 739 381 143 0 0 chr15 20229636 20229692 -83265282 + RMER6C LTR ERVK 2 57 -663 3 739 384 177 95 103 chr15 20229733 20229859 -83265115 + RMER6C LTR ERVK 203 327 -363 3 739 260 277 37 37 chr15 20230592 20230727 -83264247 - MLT2B4 LTR ERVL -94 462 276 3 739 313 336 8 25 chr15 20231076 20231195 -83263779 - MLT2B4 LTR ERVL -439 117 1 3 739 262 343 110 47 chr15 20237504 20237822 -83257152 - MLT1E1A LTR MaLR -6 674 304 3 739 1116 265 112 3 chr15 20263977 20264280 -83230694 - MTD LTR MaLR 0 419 84 3 739 941 278 96 66 chr15 20264865 20265692 -83229282 - MTD-int LTR MaLR -120 1138 6 3 739 757 333 89 39 chr15 20265717 20266060 -83228914 - MTD LTR MaLR -14 405 18 3 739 2553 80 3 14 chr15 20270476 20270830 -83224144 + MTA_Mm LTR MaLR 47 396 0 3 739 7064 84 23 65 chr15 20270830 20271205 -83223769 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 376 -722 3 739 7064 84 23 65 chr15 20271564 20272335 -83222639 + MTA_Mm-int LTR MaLR 377 1097 -1 3 739 3067 56 5 12 chr15 20272335 20272734 -83222240 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 739 643 335 68 31 chr15 20288574 20288925 -83206049 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 5 4 739 3952 138 98 85 chr15 20288925 20289818 -83205156 + RMER17A2 LTR ERVK 1 905 -1 4 739 442 210 23 98 chr15 20290114 20290163 -83204811 - RMER4B LTR ERVK 0 585 543 4 739 2175 129 0 12 chr15 20290163 20290493 -83204481 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 739 646 213 367 37 chr15 20290493 20290867 -83204107 - RMER4B LTR ERVK -43 542 5 4 739 2580 197 32 79 chr15 20290971 20291692 -83203282 - RMER6C LTR ERVK 0 690 4 4 739 310 267 67 0 chr15 20295794 20295884 -83199090 + RLTR23 LTR ERV1 9 104 -326 4 739 580 250 32 93 chr15 20296004 20296282 -83198692 + RLTR23 LTR ERV1 170 430 0 4 739 335 150 0 62 chr15 20296929 20296993 -83197981 + RLTR19-int LTR ERVK 289 348 -5789 4 739 661 267 56 85 chr15 20297417 20297687 -83197287 + RLTR19-int LTR ERVK 562 823 -5314 4 739 3530 160 151 20 chr15 20297803 20298184 -83196790 + RLTR19-int LTR ERVK 930 1361 -4776 4 739 3642 195 177 27 chr15 20298225 20299815 -83195159 + RLTR19-int LTR ERVK 1362 3190 -2947 4 739 544 176 0 121 chr15 20299972 20300121 -83194853 + RLTR19-int LTR ERVK 3484 3614 -2523 4 739 1373 290 24 17 chr15 20302932 20302994 -83191980 + MTC LTR MaLR 8 70 -351 4 739 1373 290 24 17 chr15 20303047 20303394 -83191580 + MTC LTR MaLR 71 419 -2 4 739 2173 108 38 0 chr15 20306041 20306356 -83188618 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 739 2357 220 10 27 chr15 20312748 20313271 -83181703 + RLTR28 LTR ERVL 7 520 -4 4 740 676 298 111 4 chr15 20317964 20318217 -83176757 + ORR1D2 LTR MaLR 90 369 -1 4 740 2074 283 85 46 chr15 20318219 20319580 -83175394 + ORR1D2-int LTR MaLR 2 1337 -172 4 740 328 243 104 2 chr15 20319997 20320151 -83174823 + ORR1D2-int LTR MaLR 1264 1366 -4 4 740 855 297 93 43 chr15 20320158 20320503 -83174471 + ORR1D2 LTR MaLR 7 368 -2 4 740 908 133 7 0 chr15 20320760 20320903 -83174071 - RMER6C LTR ERVK 0 690 547 4 740 1437 210 82 85 chr15 20321394 20321867 -83173107 - RMER6C LTR ERVK -132 558 87 4 740 1016 286 48 111 chr15 20323991 20324153 -83170821 - MTD LTR MaLR 0 419 249 4 740 1016 286 48 111 chr15 20324302 20324514 -83170460 - MTD LTR MaLR -171 248 72 4 740 1016 286 48 111 chr15 20324538 20324603 -83170371 - MTD LTR MaLR -348 71 7 4 740 1797 208 147 42 chr15 20325823 20326436 -83168538 - RMER6C LTR ERVK -13 677 1 4 740 1918 219 5 12 chr15 20334067 20334488 -83160486 - MTC LTR MaLR -3 418 1 4 740 3523 225 148 13 chr15 20334488 20335534 -83159440 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 2 4 740 873 245 15 25 chr15 20335537 20335727 -83159247 - MTC LTR MaLR -2 419 231 4 740 360 268 136 14 chr15 20336840 20336980 -83157994 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3301 3457 -2028 4 740 1175 278 109 69 chr15 20336980 20337625 -83157349 + RMER13A LTR ERVK 1 709 -199 4 740 1100 266 101 65 chr15 20337736 20338459 -83156515 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3555 4303 -1458 4 740 1813 264 47 4 chr15 20338444 20338931 -83156043 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4746 5253 -508 4 740 1657 237 51 7 chr15 20340428 20340861 -83154113 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5239 5690 -71 4 740 429 250 21 7 chr15 20340859 20341000 -83153974 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5619 5761 0 4 740 641 319 46 20 chr15 20341002 20341424 -83153550 + MT2B LTR ERVL 3 597 -4 4 740 243 347 31 31 chr15 20346987 20347115 -83147859 - MLT1B LTR MaLR -55 335 208 4 740 841 301 66 19 chr15 20347256 20347574 -83147400 - MLT-int LTR MaLR -32 1703 1371 4 740 234 381 30 48 chr15 20347748 20347916 -83147058 - MLT1B LTR MaLR -4 386 222 4 740 308 241 48 12 chr15 20348187 20348271 -83146703 - RMER15 LTR ERVL -132 443 357 4 740 570 249 77 57 chr15 20348547 20348756 -83146218 + ORR1D2 LTR MaLR 6 218 -152 4 740 804 216 149 27 chr15 20348754 20349016 -83145958 + RMER15 LTR ERVL 6 299 -276 4 740 358 258 0 49 chr15 20349089 20349191 -83145783 + ORR1D2 LTR MaLR 261 357 -13 4 740 536 309 116 2 chr15 20349215 20349466 -83145508 + ORR1D2-int LTR MaLR 12 333 -1247 4 740 791 329 114 117 chr15 20349515 20350172 -83144802 + ORR1D2-int LTR MaLR 524 1178 -192 4 740 512 222 0 0 chr15 20350481 20350580 -83144394 - MTC LTR MaLR -219 202 104 4 740 376 227 45 14 chr15 20351377 20351481 -83143493 - MTC LTR MaLR -290 106 1 4 740 287 354 69 12 chr15 20361218 20361378 -83133596 + MTEa LTR MaLR 5 173 -206 5 740 3308 43 5 0 chr15 20363249 20363643 -83131331 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 740 881 297 90 19 chr15 20367096 20367408 -83127566 + ORR1D2 LTR MaLR 11 344 -26 5 740 539 262 172 5 chr15 20373712 20373729 -83121245 - MTEb LTR MaLR -43 336 320 5 740 3138 56 5 2 chr15 20373729 20374124 -83120850 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 740 539 262 172 5 chr15 20374124 20374298 -83120676 - MTEb LTR MaLR -60 319 113 5 740 250 363 52 52 chr15 20393321 20393629 -83101345 - LTR33C LTR ERVL -4 625 318 5 740 1191 270 38 49 chr15 20395185 20395551 -83099423 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 5 5 740 313 316 26 94 chr15 20396414 20396606 -83098368 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 850 5 740 1697 241 24 27 chr15 20397131 20397545 -83097429 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 740 263 306 16 126 chr15 20412603 20412730 -83082244 + MT2A LTR ERVL 84 196 -337 5 740 771 308 76 8 chr15 20412813 20413075 -83081899 + MT2A LTR ERVL 180 459 -74 5 740 381 265 12 0 chr15 20413392 20413475 -83081499 + MT2A LTR ERVL 377 460 -73 5 740 233 264 91 91 chr15 20420819 20420940 -83074034 - LTR81B LTR ERV1? -974 419 299 6 740 368 287 17 0 chr15 20444144 20444259 -83050715 + MLT2C1 LTR ERVL 16 132 -265 6 740 2038 221 206 8 chr15 20445056 20445657 -83049317 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 6 741 2916 56 15 3 chr15 20454296 20454645 -83040329 + MTA_Mm LTR MaLR 1 352 -44 6 741 2916 56 15 3 chr15 20454864 20454905 -83040069 + MTA_Mm LTR MaLR 353 394 -2 6 741 1790 207 48 38 chr15 20457860 20458277 -83036697 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 741 323 177 62 25 chr15 20458277 20458358 -83036616 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 1175 6 741 418 362 54 38 chr15 20458890 20459203 -83035771 - MT2A LTR ERVL -1 532 215 6 741 231 292 0 14 chr15 20460640 20460713 -83034261 + RLTR40 LTR ERVK 227 298 -519 6 741 226 310 118 72 chr15 20471460 20471613 -83023361 + MLT1F2 LTR MaLR 101 260 -300 6 741 1482 203 111 15 chr15 20477948 20478273 -83016701 + ORR1B1 LTR MaLR 31 386 -8 6 741 531 328 16 11 chr15 20487101 20487289 -83007685 - MTEb LTR MaLR -185 194 6 6 741 589 272 38 69 chr15 20488403 20488664 -83006310 - RMER6D LTR ERVK -39 717 487 6 741 2124 186 131 35 chr15 20489789 20490369 -83004605 - RMER6C LTR ERVK -54 636 1 6 741 756 307 117 37 chr15 20493284 20493654 -83001320 - MTD LTR MaLR -15 404 14 6 741 306 363 138 44 chr15 20497981 20498344 -82996630 + MLT2D LTR ERVL 18 414 0 6 741 446 271 28 6 chr15 20507892 20508070 -82986904 + MTC-int LTR MaLR 1057 1238 -20 1 741 563 242 0 0 chr15 20508478 20508598 -82986376 - ORR1D1 LTR MaLR -254 120 1 1 741 347 328 59 66 chr15 20514253 20514524 -82980450 - MLT2B4 LTR ERVL -201 355 87 1 741 1079 170 27 0 chr15 20519455 20519643 -82975331 + MTC LTR MaLR 148 340 -81 3 741 2724 63 3 6 chr15 20522474 20522840 -82972134 - MTA_Mm LTR MaLR -31 365 1 3 741 296 284 17 17 chr15 20530526 20530644 -82964330 - MER77 LTR ERVL -19 588 471 4 741 295 296 62 0 chr15 20540325 20540406 -82954568 - RMER15 LTR ERVL -6 569 484 5 741 346 326 66 56 chr15 20540416 20540614 -82954360 - RMER15 LTR ERVL -349 226 27 5 741 273 264 59 99 chr15 20562567 20562668 -82932306 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 434 8 741 752 213 0 6 chr15 20566489 20566645 -82928329 - ORR1A4 LTR MaLR -174 155 1 9 741 1725 266 10 12 chr15 20567091 20567509 -82927465 - MTC LTR MaLR 0 421 5 9 741 1772 204 77 135 chr15 20570049 20570781 -82924193 - RMER6C LTR ERVK 0 690 2 9 741 1941 238 71 10 chr15 20573996 20574505 -82920469 - RMER19C LTR ERVK -22 589 50 1 742 1238 224 55 55 chr15 20589829 20590186 -82904788 + RMER19A LTR ERVK 4 417 -320 1 742 1573 165 142 15 chr15 20590142 20590540 -82904434 - ORR1B1-int LTR MaLR -41 1468 933 1 742 1192 248 44 99 chr15 20590540 20590993 -82903981 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 3 1 742 5366 176 47 52 chr15 20591012 20592176 -82902798 - ORR1A1-int LTR MaLR -360 1603 446 1 742 2651 84 3 0 chr15 20593316 20593661 -82901313 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 742 2460 220 111 11 chr15 20602943 20603504 -82891470 - RMER20B LTR ERVK -3 624 8 1 742 235 291 67 17 chr15 20603498 20603617 -82891357 + MLT1D LTR MaLR 381 505 0 1 742 1095 276 66 109 chr15 20612869 20613012 -82881962 + RMER12 LTR ERVK 15 163 -1241 1 742 1817 190 14 24 chr15 20613302 20613690 -82881284 + RMER12 LTR ERVK 122 523 -881 1 742 466 325 18 65 chr15 20613731 20613948 -82881026 + RMER12 LTR ERVK 938 1144 -178 1 742 233 300 158 15 chr15 20613985 20614188 -82880786 + RLTR21 LTR ERVK 1341 1572 0 1 742 290 200 33 0 chr15 20628609 20628669 -82866305 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 332 1 742 1219 228 30 87 chr15 20630643 20630975 -82863999 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 41 1 742 516 328 113 12 chr15 20634538 20634794 -82860180 + MTEb LTR MaLR 1 282 -97 1 742 1492 207 15 36 chr15 20640430 20640761 -82854213 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 3 2 742 275 244 121 12 chr15 20649164 20649247 -82845727 + RMER10A LTR ERVL 321 412 -30 2 742 571 188 7 59 chr15 20663454 20663607 -82831367 + ORR1C2 LTR MaLR 5 134 -250 2 742 1363 236 87 8 chr15 20666537 20666714 -82828260 + ORR1C2 LTR MaLR 3 171 -213 2 742 1363 232 92 6 chr15 20666776 20666955 -82828019 + ORR1C2 LTR MaLR 172 368 -16 2 742 643 294 45 26 chr15 20674715 20675007 -82819967 + MTE2a LTR MaLR 131 419 0 2 742 3144 33 51 0 chr15 20675671 20676062 -82818912 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 2 742 353 299 17 8 chr15 20678794 20678912 -82816062 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 406 2 742 431 282 48 55 chr15 20679377 20679542 -82815432 - RMER5 LTR ERV1 -325 209 46 2 742 927 271 101 35 chr15 20680762 20681110 -82813864 + RMER13A LTR ERVK 96 466 -394 2 742 2908 93 10 0 chr15 20689802 20690219 -82804755 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 742 3005 206 108 8 chr15 20690220 20691156 -82803818 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1 2325 1297 2 742 2577 185 91 66 chr15 20691145 20691832 -82803142 - RMER3D-int LTR ERVK -1145 1697 470 2 742 505 181 52 0 chr15 20691834 20691950 -82803024 - RMER3D-int LTR ERVK -2232 610 489 2 742 802 195 62 37 chr15 20691986 20692292 -82802682 - RMER3D-int LTR ERVK -1991 851 354 2 742 2354 100 107 13 chr15 20692665 20692853 -82802121 - BGLII LTR ERVK 0 421 206 2 742 2354 100 107 13 chr15 20692931 20693127 -82801847 - BGLII LTR ERVK -216 205 1 2 742 537 292 123 8 chr15 20693127 20693379 -82801595 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 252 2 742 3013 107 50 60 chr15 20693843 20694360 -82800614 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 2 742 1000 278 152 18 chr15 20698676 20699113 -82795861 - RLTR16 LTR ERVK -9 496 1 2 742 960 280 89 22 chr15 20699531 20699713 -82795261 - ORR1C2 LTR MaLR 0 374 178 2 742 960 280 89 22 chr15 20699763 20699894 -82795080 - ORR1C2 LTR MaLR -197 177 40 2 742 1284 286 81 26 chr15 20699900 20700482 -82794492 - ORR1C2-int LTR MaLR -345 1025 601 2 742 389 165 182 20 chr15 20700479 20700571 -82794403 - ORR1C2-int LTR MaLR -998 372 264 2 742 470 233 41 8 chr15 20701028 20701149 -82793825 - ORR1C2-int LTR MaLR -1123 247 123 2 742 484 224 19 0 chr15 20701739 20701846 -82793128 - ORR1C2-int LTR MaLR -1261 109 1 2 742 1258 236 99 10 chr15 20701873 20702186 -82792788 - ORR1C2 LTR MaLR -41 343 3 2 743 3793 180 90 46 chr15 20709588 20710529 -82784445 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 1 3 743 604 159 37 0 chr15 20710698 20710805 -82784169 + RMER6C LTR ERVK 1 111 -579 3 743 428 212 12 0 chr15 20710791 20710871 -82784103 + MT2B LTR ERVL 183 263 -338 3 743 269 233 100 77 chr15 20710986 20711116 -82783858 + RMER6C LTR ERVK 342 474 -216 3 743 900 251 62 33 chr15 20713773 20714049 -82780925 - BGLII_B LTR ERVK -10 431 148 3 743 283 279 0 12 chr15 20714049 20714129 -82780845 - BGLII_A LTR ERVK -348 97 19 3 743 2914 57 31 10 chr15 20718433 20718821 -82776153 - MTB LTR MaLR 0 396 1 3 743 7402 97 23 7 chr15 20718821 20719901 -82775073 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 3 743 3204 60 5 0 chr15 20719901 20720299 -82774675 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 743 779 315 25 4 chr15 20720843 20721082 -82773892 - MTD LTR MaLR -172 247 4 3 743 1190 272 34 21 chr15 20721719 20722046 -82772928 - RMER15 LTR ERVL 0 575 245 3 743 1181 262 46 46 chr15 20724089 20724501 -82770473 - RMER5 LTR ERV1 0 534 123 3 743 538 305 89 32 chr15 20730433 20730680 -82764294 - RMER15 LTR ERVL -16 559 299 3 743 237 347 62 68 chr15 20740278 20740439 -82754535 - RMER13A LTR ERVK -687 173 14 3 743 3260 43 5 0 chr15 20741125 20741519 -82753455 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 743 670 342 62 16 chr15 20742982 20743303 -82751671 + MLT2B4 LTR ERVL 2 337 -219 3 743 531 352 50 25 chr15 20743657 20744017 -82750957 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1264 1674 -4083 3 743 623 274 70 42 chr15 20744181 20744493 -82750481 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2404 2724 -2990 3 743 297 335 68 107 chr15 20749573 20749854 -82745120 - MTD LTR MaLR -132 287 18 3 743 294 353 134 59 chr15 20750327 20750634 -82744340 - MTE2a LTR MaLR -41 338 9 3 743 4228 80 3 27 chr15 20758707 20759299 -82735675 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -9 578 1 3 743 5328 112 158 25 chr15 20760283 20760855 -82734119 - RLTR13D4 LTR ERVK 0 1033 344 3 743 5328 112 158 25 chr15 20761019 20761357 -82733617 - RLTR13D4 LTR ERVK -690 343 2 3 743 1076 308 47 39 chr15 20761357 20761402 -82733572 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 326 3 743 1076 308 47 39 chr15 20761802 20762117 -82732857 - ORR1D2 LTR MaLR -45 325 1 3 743 1075 276 57 23 chr15 20769712 20770064 -82724910 - MTD LTR MaLR -9 410 47 3 743 667 231 130 1 chr15 20774436 20774630 -82720344 - ORR1C2 LTR MaLR -11 367 144 3 743 317 352 39 0 chr15 20776215 20776343 -82718631 + MLT1B LTR MaLR 258 390 0 4 743 338 390 67 98 chr15 20777406 20777694 -82717280 - MER74A LTR ERVL -86 472 176 4 743 323 393 63 105 chr15 20777876 20777965 -82717009 - MER74A LTR ERVL -383 175 95 4 743 323 393 63 105 chr15 20778042 20778140 -82716834 - MER74A LTR ERVL -464 94 16 4 743 964 243 90 25 chr15 20779148 20779427 -82715547 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 86 4 743 272 292 28 0 chr15 20788424 20788496 -82706478 + RMER5 LTR ERV1 40 113 -421 4 743 539 345 77 18 chr15 20788866 20789202 -82705772 + RMER5 LTR ERV1 113 468 -66 4 743 848 272 118 112 chr15 20792297 20792789 -82702185 - RLTR12B LTR ERVK -17 511 17 4 743 330 314 84 83 chr15 20793830 20794135 -82700839 + MLT1C LTR MaLR 63 434 -33 4 743 870 215 80 76 chr15 20794152 20794521 -82700453 - RMER10A LTR ERVL -6 436 1 4 743 276 350 66 34 chr15 20803102 20803402 -82691572 + MLT1C LTR MaLR 23 352 -115 4 743 227 353 35 70 chr15 20807326 20807469 -82687505 + MLT1I LTR MaLR 271 408 -3 4 743 1418 211 88 22 chr15 20814059 20814422 -82680552 - RMER12 LTR ERVK -5 1317 931 4 743 233 370 58 58 chr15 20821437 20821592 -82673382 + MLT1D LTR MaLR 53 207 -298 4 743 293 222 92 69 chr15 20824851 20825025 -82669949 - RLTR40 LTR ERVK -74 743 566 4 743 2778 166 52 20 chr15 20839258 20839482 -82655492 - RLTR12A LTR ERVK -13 555 324 5 743 2778 166 52 20 chr15 20839568 20839879 -82655095 - RLTR12A LTR ERVK -245 323 4 5 92 2904 46 52 0 chr15 20840144 20840513 -82654461 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 5 744 444 286 127 73 chr15 20852780 20853025 -82641949 - MLT1J-int LTR MaLR -284 1103 846 5 744 1098 172 11 33 chr15 20853233 20853456 -82641518 - ORR1C2 LTR MaLR -202 182 1 5 744 1799 175 44 13 chr15 20855141 20855459 -82639515 + RLTR26 LTR ERVK 1 328 -314 5 744 360 60 0 20 chr15 20855455 20855506 -82639468 - RLTR26 LTR ERVK -353 289 240 5 744 808 357 110 76 chr15 20860320 20861336 -82633638 - MLT1-int LTR MaLR -66 1305 255 5 744 352 250 83 9 chr15 20864561 20864670 -82630304 + MTD LTR MaLR 280 396 -23 5 744 1126 191 36 48 chr15 20880685 20881015 -82613959 + RMER3D-int LTR ERVK 2517 2842 0 5 744 1452 158 19 19 chr15 20881038 20881309 -82613665 + RLTR17 LTR ERVK 98 368 -324 5 744 1335 239 90 7 chr15 20882918 20883217 -82611757 + ORR1B2 LTR MaLR 1 324 -43 5 744 604 172 26 0 chr15 20883344 20883460 -82611514 - BGLII_Mus LTR ERVK -91 331 213 5 744 776 308 78 25 chr15 20888023 20888383 -82606591 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 6 744 1490 217 48 82 chr15 20889540 20889748 -82605226 + RMER10B LTR ERVL 1 193 -205 6 744 1490 217 48 82 chr15 20889843 20890046 -82604928 + RMER10B LTR ERVL 194 398 0 6 744 383 316 105 46 chr15 20892324 20892543 -82602431 - RLTR18 LTR ERVK -2 614 383 6 744 1092 202 77 32 chr15 20893904 20894441 -82600533 - RMER10B LTR ERVL -5 437 1 6 744 268 302 79 28 chr15 20901925 20902102 -82592872 - RLTR15 LTR ERVK -102 257 72 6 744 2820 23 48 8 chr15 20902609 20902962 -82592012 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 744 28770 21 1 1 chr15 20902962 20906233 -82588741 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 6 744 7566 75 107 12 chr15 20906232 20907421 -82587553 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 67 6 744 1017 119 74 0 chr15 20907392 20907568 -82587406 - IAPEz-int LTR ERVK -6285 196 8 6 744 2792 26 48 8 chr15 20907568 20907921 -82587053 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 744 497 266 34 57 chr15 20908047 20908310 -82586664 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 35 6 744 684 299 15 5 chr15 20911351 20911556 -82583418 + MTE2a LTR MaLR 172 378 -1 6 744 329 336 60 117 chr15 20913362 20913696 -82581278 - MLT1E1A LTR MaLR -141 539 225 6 744 254 362 56 17 chr15 20926002 20926235 -82568739 - MLT1B LTR MaLR -139 251 10 6 744 4225 90 9 0 chr15 20928671 20929250 -82565724 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 6 744 1031 289 32 44 chr15 20931928 20932272 -82562702 + RMER15 LTR ERVL 199 538 -37 6 744 265 259 35 0 chr15 20934331 20934389 -82560585 + MLT1D LTR MaLR 13 72 -433 6 744 446 239 34 82 chr15 20936225 20936445 -82558529 + ORR1D1 LTR MaLR 87 379 -5 6 744 578 327 47 50 chr15 20941542 20941819 -82553155 + RMER15 LTR ERVL 300 575 0 6 744 1166 314 42 17 chr15 20951496 20951849 -82543125 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 2 7 744 665 330 75 28 chr15 20951922 20952281 -82542693 - RMER5 LTR ERV1 -82 452 77 7 744 770 311 65 26 chr15 20952328 20952635 -82542339 - MTE-int LTR MaLR -1183 397 79 7 744 790 278 71 9 chr15 20954416 20954627 -82540347 - MTC LTR MaLR -2 419 196 7 744 611 297 71 38 chr15 20955378 20955404 -82539570 - MTC LTR MaLR -225 182 160 7 744 624 250 136 0 chr15 20955431 20955615 -82539359 - MTD LTR MaLR -208 211 3 7 744 517 281 40 23 chr15 20955655 20955830 -82539144 - MTEb LTR MaLR -3 376 199 7 744 1003 328 24 3 chr15 20956563 20956893 -82538081 + MTE2b LTR MaLR 3 339 -40 7 744 444 253 44 7 chr15 20956924 20957073 -82537901 + ORR1D2 LTR MaLR 1 163 -196 7 745 893 283 152 98 chr15 20975352 20975671 -82519303 + RMER19C LTR ERVK 1 284 -453 7 745 1252 261 13 72 chr15 20975730 20976107 -82518867 + RMER19C LTR ERVK 269 734 -3 7 745 1985 193 31 20 chr15 20980212 20980666 -82514308 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 7 745 2464 207 221 5 chr15 20981191 20981748 -82513226 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 7 745 683 182 12 43 chr15 20989095 20989256 -82505718 - RMER6C LTR ERVK 0 690 535 7 745 410 232 0 29 chr15 20989300 20989402 -82505572 - RMER6C LTR ERVK -197 523 425 7 745 1576 195 9 61 chr15 20989408 20989752 -82505222 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 7 745 627 167 48 48 chr15 20989752 20989897 -82505077 - ORR1A3-int LTR MaLR -21 1942 1798 7 745 4960 170 20 31 chr15 20989870 20990773 -82504201 - RMER19B LTR ERVK -9 893 1 7 745 4200 168 57 20 chr15 20990773 20991723 -82503251 - ORR1A3-int LTR MaLR -247 1716 963 7 745 849 218 41 20 chr15 20993070 20993314 -82501660 - ORR1A3-int LTR MaLR -997 966 718 7 745 892 179 121 20 chr15 20993320 20993519 -82501455 - MT2B LTR ERVL -345 256 38 7 745 2004 189 57 78 chr15 20993409 20993868 -82501106 - ORR1A3-int LTR MaLR -1232 731 283 7 745 233 242 32 16 chr15 20995327 20995390 -82499584 + MLT1G1 LTR MaLR 323 386 -193 7 745 2156 205 22 58 chr15 21016050 21016583 -82478391 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 14 2 745 413 305 63 58 chr15 21016690 21016864 -82478110 - MTE2a LTR MaLR -4 375 201 2 745 350 380 41 33 chr15 21016879 21017144 -82477830 - MTE2a LTR MaLR -148 231 1 2 745 2451 192 59 10 chr15 21017190 21017695 -82477279 - RMER6D LTR ERVK -1 719 190 2 745 351 335 104 64 chr15 21018001 21018221 -82476753 + RMER2 LTR ERV1 308 536 -31 3 745 1082 144 28 6 chr15 21018245 21018427 -82476547 - RMER6D LTR ERVK -529 191 6 3 745 596 317 68 51 chr15 21019681 21019977 -82474997 - MLT2C1 LTR ERVL -73 324 24 3 745 2436 67 2 202 chr15 21021950 21022435 -82472539 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 3 745 416 196 65 9 chr15 21025611 21025719 -82469255 - MTC LTR MaLR -307 114 1 4 745 1665 234 172 20 chr15 21029944 21030431 -82464543 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 3 4 745 1725 76 0 12 chr15 21030705 21030945 -82464029 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 237 -85 4 745 2225 19 8 0 chr15 21030945 21031204 -82463770 - ETnERV-int LTR ERVK -2877 437 177 5 745 282 143 63 0 chr15 21051140 21051203 -82443771 + ORR1B1 LTR MaLR 47 113 -281 8 745 344 107 71 0 chr15 21051179 21051235 -82443739 + ORR1B1 LTR MaLR 331 390 -4 8 745 277 376 46 92 chr15 21066880 21067208 -82427766 + ORR1E LTR MaLR 6 318 -41 1 745 3004 182 21 39 chr15 21077852 21078468 -82416506 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 1 1 745 955 217 24 76 chr15 21090804 21091053 -82403921 - MT2A LTR ERVL -297 236 1 1 745 226 303 22 22 chr15 21094215 21094306 -82400668 + MLT1B LTR MaLR 279 369 -21 1 745 1623 271 24 28 chr15 21095423 21095883 -82399091 + MT2A LTR ERVL 1 458 -75 1 745 255 366 44 40 chr15 21100138 21100363 -82394611 - MTEa LTR MaLR -37 342 117 1 745 1448 281 34 29 chr15 21101618 21102032 -82392942 + MTC LTR MaLR 6 421 0 1 746 2965 84 12 12 chr15 21106370 21106791 -82388183 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 746 1319 188 12 12 chr15 21115507 21115765 -82379209 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1591 1 746 3534 191 60 18 chr15 21115926 21116747 -82378227 - RLTR22_Mur LTR ERVK -990 858 4 1 746 666 309 81 75 chr15 21116780 21117102 -82377872 + ORR1E LTR MaLR 2 325 -34 1 746 402 329 98 37 chr15 21117677 21117841 -82377133 - MTE2b LTR MaLR -97 282 109 1 746 392 322 197 0 chr15 21117867 21118019 -82376955 + MTD LTR MaLR 1 182 -237 1 746 365 234 20 4 chr15 21118505 21118611 -82376363 - MTE2b LTR MaLR -265 114 5 1 746 1190 268 36 72 chr15 21121041 21121431 -82373543 + RLTR14 LTR ERV1 7 382 0 1 746 598 248 74 25 chr15 21123236 21123480 -82371494 - ORR1A3-int LTR MaLR -990 973 718 1 746 260 206 0 191 chr15 21123434 21123518 -82371456 - MT2B LTR ERVL -309 292 225 1 746 608 157 12 141 chr15 21123534 21123697 -82371277 - ORR1B1 LTR MaLR -226 168 1 1 746 480 328 82 46 chr15 21125786 21126010 -82368964 + MTE2a LTR MaLR 39 275 -104 1 746 480 328 82 46 chr15 21126250 21126354 -82368620 + MTE2a LTR MaLR 276 379 0 1 746 448 288 37 68 chr15 21127431 21127465 -82367509 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 333 1 746 6325 61 7 22 chr15 21127465 21127884 -82367090 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 404 1 746 6325 61 7 22 chr15 21127906 21128320 -82366654 - RLTR13B2 LTR ERVK -419 403 2 1 746 448 288 37 68 chr15 21128320 21128475 -82366499 - MLT1A0 LTR MaLR -33 332 182 1 746 491 287 123 111 chr15 21128882 21129054 -82365920 + MTE2b LTR MaLR 43 186 -193 1 746 491 287 123 111 chr15 21129076 21129236 -82365738 + MTE2b LTR MaLR 187 379 0 1 746 241 376 59 0 chr15 21129946 21130132 -82364842 + MLT2B4 LTR ERVL 289 485 -71 1 746 253 297 67 29 chr15 21130678 21130782 -82364192 - LTR40a LTR ERVL -397 122 15 1 746 227 314 158 24 chr15 21131136 21131263 -82363711 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 216 359 -423 1 746 726 329 45 58 chr15 21139273 21139672 -82355302 - MTE2a LTR MaLR -18 401 8 2 746 721 338 34 75 chr15 21146920 21147307 -82347667 + MTEa LTR MaLR 9 379 0 2 746 350 370 62 62 chr15 21148995 21149401 -82345573 + MER34 LTR ERV1 76 481 -61 2 746 600 318 52 49 chr15 21149584 21149931 -82345043 - LTR40b LTR ERVL 0 462 115 2 746 3970 107 37 3 chr15 21151382 21151947 -82343027 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 2 746 599 302 6 0 chr15 21152709 21152871 -82342103 + MLT1C LTR MaLR 302 464 -3 2 746 1029 192 61 161 chr15 21157060 21157439 -82337535 - RMER20B LTR ERVK 0 627 287 2 746 1083 251 28 14 chr15 21159473 21159756 -82335218 - RMER20B LTR ERVK -332 295 9 2 746 425 244 109 58 chr15 21160568 21160742 -82334232 - RMER2 LTR ERV1 0 567 385 2 746 2489 208 122 60 chr15 21170430 21171279 -82323695 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 2 746 328 286 10 0 chr15 21172917 21173015 -82321959 - ERVL-int LTR ERVL -71 5686 5588 2 746 2251 114 147 26 chr15 21174377 21174807 -82320167 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 746 2194 320 89 67 chr15 21176041 21178336 -82316638 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2841 2873 464 2 746 338 405 0 18 chr15 21179040 21179211 -82315763 - MLT2C1 LTR ERVL -103 294 127 2 746 367 365 48 131 chr15 21180437 21180749 -82314225 - ORR1D2 LTR MaLR -67 303 18 2 746 3362 176 48 48 chr15 21187666 21188422 -82306552 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 2 746 333 226 0 70 chr15 21191702 21191802 -82303172 + MTD LTR MaLR 8 100 -321 2 746 800 310 53 11 chr15 21198317 21198601 -82296373 + MTD LTR MaLR 124 419 0 2 746 780 285 102 109 chr15 21198763 21198907 -82296067 + MTD-int LTR MaLR 655 824 -434 2 746 780 285 102 109 chr15 21198953 21199415 -82295559 + MTD-int LTR MaLR 825 1257 -1 2 746 887 253 68 93 chr15 21199499 21199693 -82295281 + MTD LTR MaLR 3 201 -218 2 746 887 253 68 93 chr15 21199716 21199949 -82295025 + MTD LTR MaLR 202 419 0 2 746 2445 193 111 21 chr15 21200935 21201566 -82293408 + RMER6C LTR ERVK 3 690 0 2 746 263 376 102 11 chr15 21215347 21215632 -82279342 - MLT1A LTR MaLR -36 338 28 3 746 2397 187 18 64 chr15 21217059 21217259 -82277715 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 393 3 746 2397 187 18 64 chr15 21217304 21217713 -82277261 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -192 392 4 3 746 1294 221 28 18 chr15 21222957 21223243 -82271731 + ORR1C2 LTR MaLR 1 289 -95 3 746 437 182 0 0 chr15 21224206 21224283 -82270691 + ORR1C2 LTR MaLR 278 354 -30 3 746 2074 136 3 6 chr15 21224389 21224715 -82270259 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 3 746 9708 173 42 14 chr15 21224715 21225626 -82269348 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1030 3 746 9708 173 42 14 chr15 21226041 21226326 -82268648 - ORR1A2-int LTR MaLR -934 1029 734 3 746 9708 173 42 14 chr15 21226471 21227170 -82267804 - ORR1A2-int LTR MaLR -1230 733 16 3 746 2097 107 6 31 chr15 21227180 21227507 -82267467 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 747 2894 40 0 6 chr15 21240475 21240823 -82254151 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 747 870 184 220 27 chr15 21241440 21241533 -82253441 - RMER6D LTR ERVK -3 717 589 3 747 2914 87 7 15 chr15 21241533 21241943 -82253031 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 747 870 184 220 27 chr15 21241943 21242072 -82252902 - RMER6D LTR ERVK -132 588 452 3 747 575 234 206 41 chr15 21242064 21242450 -82252524 - RMER20B LTR ERVK -193 434 1 3 747 256 258 261 40 chr15 21242450 21242660 -82252314 - RMER6D LTR ERVK -231 489 230 3 747 1032 180 90 5 chr15 21242867 21243074 -82251900 - RMER6D LTR ERVK -495 225 1 3 747 3129 34 39 3 chr15 21247936 21248318 -82246656 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 747 7404 86 40 8 chr15 21248318 21249382 -82245592 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 747 3202 28 21 0 chr15 21249382 21249770 -82245204 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 747 2951 70 42 0 chr15 21258487 21258871 -82236103 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 747 1635 182 34 29 chr15 21259513 21259921 -82235053 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 3 747 2989 166 46 66 chr15 21263830 21264590 -82230384 + RMER17A LTR ERVK 1 745 -6 3 747 585 259 47 20 chr15 21265557 21265707 -82229267 - MTC-int LTR MaLR -713 545 392 3 747 667 200 122 161 chr15 21281453 21281515 -82213459 - ORR1D1 LTR MaLR -28 301 270 3 747 815 252 143 18 chr15 21282399 21282678 -82212296 - ORR1D1 LTR MaLR -58 316 3 3 747 4210 275 47 29 chr15 21282690 21284022 -82210952 - ORR1D1-int LTR MaLR -10 1360 5 3 747 329 160 22 4 chr15 21284026 21284098 -82210876 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 271 3 747 499 305 174 13 chr15 21294940 21295176 -82199798 + MTD LTR MaLR 134 407 -12 4 747 2882 289 72 42 chr15 21295187 21295954 -82199020 + MTD-int LTR MaLR 1 770 -488 4 747 5236 86 126 16 chr15 21295954 21296767 -82198207 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 4 747 2882 289 72 42 chr15 21296767 21297102 -82197872 + MTD-int LTR MaLR 771 1136 -122 4 747 276 231 101 100 chr15 21298827 21299016 -82195958 - RMER16 LTR ERVK -164 369 1 4 747 6139 164 40 15 chr15 21302482 21303649 -82191325 + RMER12B LTR ERVK 1 1197 -207 4 747 549 199 95 0 chr15 21303747 21303884 -82191090 + RMER12B LTR ERVK 1285 1471 -101 4 747 470 317 67 144 chr15 21312898 21313244 -82181730 + MTE2a LTR MaLR 3 320 -59 4 747 809 229 151 5 chr15 21313244 21313463 -82181511 + MTD LTR MaLR 1 251 -168 4 747 1856 203 45 0 chr15 21319723 21320097 -82174877 + ORR1B1 LTR MaLR 1 391 -3 4 747 1896 120 170 31 chr15 21321185 21321538 -82173436 - RLTR44A LTR ERVK 0 405 4 4 747 980 291 105 24 chr15 21325545 21325879 -82169095 - MTE2a LTR MaLR 0 379 19 4 747 1663 161 94 71 chr15 21343923 21344314 -82150660 + RMER6C LTR ERVK 1 401 -355 4 747 519 184 125 23 chr15 21344294 21344422 -82150552 + RMER6C LTR ERVK 580 720 0 4 747 361 328 82 27 chr15 21345965 21346222 -82148752 - MLT2C1 LTR ERVL -126 271 1 4 747 338 360 61 18 chr15 21352172 21352336 -82142638 - MT2A LTR ERVL -301 232 62 4 747 254 342 17 34 chr15 21352322 21352440 -82142534 - MTE2b LTR MaLR -261 118 3 4 747 309 304 2 167 chr15 21357693 21357846 -82137128 + MTE2b LTR MaLR 190 317 -62 4 747 1175 233 49 116 chr15 21361771 21362160 -82132814 + ORR1C2 LTR MaLR 2 364 -20 5 93 1642 235 68 72 chr15 21364503 21365030 -82129944 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -55 529 5 5 748 255 274 78 26 chr15 21365754 21365870 -82129104 - RMER3D-int LTR ERVK -2545 297 176 5 748 1933 195 36 15 chr15 21366064 21366455 -82128519 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 143 5 748 323 233 40 60 chr15 21384662 21384863 -82110111 - RMER17D LTR ERVK -447 442 246 5 748 584 299 117 75 chr15 21386089 21386396 -82108578 + ORR1E LTR MaLR 2 321 -57 5 748 2851 46 3 0 chr15 21391786 21392131 -82102843 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 748 226 183 46 77 chr15 21403468 21403533 -82091441 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 5 748 491 308 98 17 chr15 21417723 21417919 -82077055 - MTE2a LTR MaLR 0 419 167 5 748 2981 74 13 3 chr15 21440739 21441131 -82053843 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 748 369 285 89 60 chr15 21446560 21446728 -82048246 + RMER10A LTR ERVL 4 176 -266 5 748 258 274 232 21 chr15 21446991 21447185 -82047789 + RMER10A LTR ERVL 195 429 -13 5 748 685 294 16 46 chr15 21450530 21450819 -82044155 + MTE-int LTR MaLR 55 356 -1224 6 748 430 296 54 14 chr15 21450910 21451078 -82043896 + MTE2a LTR MaLR 209 374 -5 6 748 709 322 27 10 chr15 21451177 21451469 -82043505 + MTE-int LTR MaLR 78 374 -1206 6 748 3026 48 50 0 chr15 21451922 21452299 -82042675 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 748 6954 81 39 71 chr15 21452299 21453434 -82041540 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 748 1094 35 7 21 chr15 21453434 21453578 -82041396 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 255 6 748 764 80 8 66 chr15 21453540 21453661 -82041313 + MTA_Mm LTR MaLR 189 302 -94 6 748 1159 216 23 23 chr15 21458875 21459136 -82035838 - ORR1C1 LTR MaLR -83 295 35 6 748 305 340 79 69 chr15 21468314 21468600 -82026374 - MLT1A LTR MaLR -61 313 12 6 748 584 382 37 20 chr15 21468618 21469027 -82025947 - MLT-int LTR MaLR -8 1727 1312 6 748 327 329 49 25 chr15 21469957 21470119 -82024855 - MLT-int LTR MaLR -1425 310 145 6 748 1342 249 84 6 chr15 21476806 21477141 -82017833 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 1 6 748 397 294 55 89 chr15 21478577 21478837 -82016137 - ORR1E LTR MaLR 0 379 111 6 748 583 238 583 62 chr15 21484305 21484483 -82010491 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 100 6 748 250 238 107 0 chr15 21484645 21484722 -82010252 - ORR1D2 LTR MaLR -271 99 14 6 748 291 357 0 0 chr15 21489001 21489099 -82005875 + MTE2b LTR MaLR 1 98 -281 6 748 738 276 84 4 chr15 21489176 21489402 -82005572 + MTE2b LTR MaLR 128 371 -8 6 748 920 295 43 15 chr15 21489409 21489736 -82005238 + MTE2b-int LTR MaLR 1 336 -1244 6 748 1325 199 48 69 chr15 21492395 21492729 -82002245 + ORR1B1 LTR MaLR 1 327 -2 6 748 7771 190 63 62 chr15 21492729 21494687 -82000287 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 1962 -1 6 748 1566 175 34 45 chr15 21494694 21494967 -82000007 + ORR1B1 LTR MaLR 41 314 -80 6 748 2724 25 6 27 chr15 21494967 21495301 -81999673 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 6 748 1566 175 34 45 chr15 21495301 21495385 -81999589 + ORR1B1 LTR MaLR 315 394 0 6 749 736 289 158 17 chr15 21495949 21496353 -81998621 + MTD LTR MaLR 8 398 -21 6 749 1080 254 51 51 chr15 21496530 21496944 -81998030 - BGLII_B LTR ERVK -27 414 1 6 749 4175 145 66 100 chr15 21498439 21499377 -81995597 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 6 749 602 333 88 36 chr15 21501162 21501629 -81993345 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 3 2 749 541 308 54 29 chr15 21506254 21506458 -81988516 - MT2B LTR ERVL -8 593 385 1 749 298 204 28 67 chr15 21506711 21506809 -81988165 - MT2B LTR ERVL -359 174 103 1 749 491 189 163 8 chr15 21506809 21506932 -81988042 - MT2B LTR ERVL -391 142 1 1 749 1011 292 48 40 chr15 21509708 21510079 -81984895 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 749 560 322 138 0 chr15 21531678 21531976 -81962998 - MERVK26-int LTR ERVK -5356 1563 1225 3 749 5143 93 14 50 chr15 21532810 21533644 -81961330 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 804 -1044 3 749 1073 138 13 98 chr15 21533787 21534012 -81960962 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1624 1829 -19 3 749 1497 263 99 119 chr15 21539023 21539640 -81955334 - RMER17B LTR ERVK -43 915 347 4 749 1497 263 99 119 chr15 21539807 21540122 -81954852 - RMER17B LTR ERVK -612 346 4 4 749 1880 231 71 10 chr15 21545516 21546007 -81948967 + RLTR11A2 LTR ERVK 7 527 0 5 749 1856 169 178 26 chr15 21553379 21553835 -81941139 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 1 6 749 610 205 115 104 chr15 21559577 21559935 -81935039 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 7 749 369 303 46 98 chr15 21560918 21561112 -81933862 + MLT1E2 LTR MaLR 444 627 0 7 749 3259 46 2 0 chr15 21564739 21565134 -81929840 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 749 249 343 62 57 chr15 21573718 21573829 -81921145 - MLT2B3 LTR ERVL -332 222 112 9 749 587 281 196 10 chr15 21573829 21574141 -81920833 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 9 749 249 343 62 57 chr15 21574141 21574239 -81920735 - MLT2B3 LTR ERVL -443 111 12 9 749 2780 84 18 5 chr15 21575768 21576161 -81918813 - MTB LTR MaLR 0 400 3 9 749 823 303 107 16 chr15 21583019 21583338 -81911636 - MTEa LTR MaLR -14 365 18 1 749 587 294 51 59 chr15 21583351 21583604 -81911370 + MTEa-int LTR MaLR 1302 1552 -28 1 749 487 330 42 128 chr15 21583619 21584025 -81910949 + MTEa LTR MaLR 1 371 -8 1 749 1345 192 132 19 chr15 21587709 21588027 -81906947 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 749 1334 298 71 0 chr15 21590475 21590854 -81904120 - MTD LTR MaLR -12 407 2 1 749 684 298 91 52 chr15 21594796 21595104 -81899870 - ORR1E LTR MaLR -38 321 2 1 749 257 333 39 86 chr15 21602486 21602614 -81892360 - MER21B LTR ERV1 -193 670 549 1 749 526 355 20 15 chr15 21602715 21602918 -81892056 - MER21B LTR ERV1 -455 408 205 1 749 3214 26 34 0 chr15 21606464 21606847 -81888127 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 749 736 102 0 0 chr15 21607878 21607986 -81886988 + RLTR9F LTR ERVK 1 108 -307 1 749 911 168 29 11 chr15 21607981 21608156 -81886818 + RLTR9F LTR ERVK 238 415 0 1 749 930 188 66 28 chr15 21615357 21615570 -81879404 + RLTR24 LTR ERV1 3 223 -306 1 749 471 248 21 177 chr15 21615609 21615877 -81879097 + RLTR24 LTR ERV1 133 346 -183 1 749 1018 307 105 32 chr15 21623079 21623360 -81871614 - MTD LTR MaLR 0 419 115 1 749 1018 307 105 32 chr15 21623884 21623982 -81870992 - MTD LTR MaLR -305 114 12 1 749 3125 65 2 2 chr15 21624777 21625177 -81869797 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 750 2816 84 7 17 chr15 21633183 21633596 -81861378 + BGLII LTR ERVK 1 409 -12 1 750 618 247 143 57 chr15 21641746 21641991 -81852983 + RMER21B LTR ERV1 302 567 -275 2 750 331 323 83 31 chr15 21647174 21647462 -81847512 - MLT1B LTR MaLR -18 372 70 2 750 243 263 50 59 chr15 21648697 21648798 -81846176 + RLTR12B LTR ERVK 17 116 -412 2 750 269 291 69 53 chr15 21648867 21649056 -81845918 + RLTR15 LTR ERVK 48 239 -120 2 750 3338 26 128 5 chr15 21649240 21649663 -81845311 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 750 943 132 25 85 chr15 21649664 21649863 -81845111 + IAPEz-int LTR ERVK 9 195 -6286 2 750 260 283 0 0 chr15 21649863 21649916 -81845058 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 2 750 3871 55 2 18 chr15 21649916 21650419 -81844555 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 2 750 2690 58 0 6 chr15 21650419 21650763 -81844211 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 2 750 6212 65 12 18 chr15 21650756 21651590 -81843384 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 2 750 3362 24 128 5 chr15 21651592 21652015 -81842959 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 2 750 299 256 0 82 chr15 21652533 21652631 -81842343 - RMER15 LTR ERVL -56 519 430 2 750 447 297 23 0 chr15 21652808 21652936 -81842038 - RMER15 LTR ERVL -159 416 286 2 750 593 298 66 28 chr15 21653465 21653676 -81841298 - RMER15 LTR ERVL -349 226 8 2 750 262 324 56 49 chr15 21656788 21657053 -81837921 + MTC LTR MaLR 58 369 -5 2 750 299 270 8 139 chr15 21669242 21669371 -81825603 + MTE2a LTR MaLR 4 115 -264 2 750 253 267 198 0 chr15 21669443 21669544 -81825430 + MTE2a LTR MaLR 235 355 -24 2 750 249 375 134 0 chr15 21673641 21673753 -81821221 + MLT1H2 LTR MaLR 225 351 -138 2 750 1618 218 12 18 chr15 21682677 21683014 -81811960 + RLTR25B LTR ERVK 1 335 -693 2 750 2047 41 7 254 chr15 21683649 21684109 -81810865 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 45 2 750 6595 51 43 0 chr15 21685410 21686230 -81808744 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 2 750 1104 254 80 0 chr15 21686752 21687039 -81807935 - MTC LTR MaLR -24 397 88 2 750 1938 214 77 78 chr15 21689199 21689696 -81805278 - RLTR12A LTR ERVK -3 565 70 2 750 2194 153 10 26 chr15 21692889 21693305 -81801669 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 750 1734 247 29 96 chr15 21693495 21694149 -81800825 - RMER19C LTR ERVK -1 610 1 2 750 443 220 30 8 chr15 21697816 21697949 -81797025 - MERVL_2A-int LTR ERVL -6 5755 5620 2 750 510 259 6 90 chr15 21697958 21698136 -81796838 - ORR1D-int LTR MaLR -1160 349 187 2 750 1296 156 61 8 chr15 21704322 21704568 -81790406 + RLTR11A LTR ERVK 268 526 -2 2 750 2289 67 104 9 chr15 21704636 21704952 -81790022 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 750 13848 116 6 5 chr15 21705703 21706989 -81787985 + MERVL-int LTR ERVL 3358 4646 -839 3 750 2283 75 116 11 chr15 21706989 21707342 -81787632 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 3 750 13848 116 6 5 chr15 21707342 21708052 -81786922 + MERVL-int LTR ERVL 4647 5356 -129 3 750 268 200 14 41 chr15 21708174 21708247 -81786727 + ORR1A3-int LTR MaLR 569 639 -1324 3 750 277 79 0 0 chr15 21708248 21708286 -81786688 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 750 3033 116 19 39 chr15 21708288 21708771 -81786203 + MT2C_Mm LTR ERVL 3 475 0 3 750 403 239 462 27 chr15 21712934 21713190 -81781784 + MTEa LTR MaLR 3 371 -8 3 750 1428 258 25 19 chr15 21730699 21731066 -81763908 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 3 750 676 348 52 8 chr15 21733766 21734105 -81760869 + ORR1E LTR MaLR 2 374 -5 3 750 2348 203 57 26 chr15 21735674 21736273 -81758701 + RMER6C LTR ERVK 1 689 -1 3 750 315 274 75 58 chr15 21740532 21740652 -81754322 - MTD LTR MaLR -7 412 291 3 750 4133 189 66 17 chr15 21751850 21752710 -81742264 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 3 750 239 291 11 55 chr15 21755215 21755306 -81739668 + ORR1A3-int LTR MaLR 1455 1541 -422 3 751 3643 9 136 0 chr15 21759304 21759738 -81735236 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 751 2858 66 50 3 chr15 21761461 21761842 -81733132 - MTB LTR MaLR -1 399 1 3 751 2136 220 69 89 chr15 21765876 21766530 -81728444 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 2 3 751 233 365 92 31 chr15 21768318 21768513 -81726461 + MER70A LTR ERVL 262 468 -4 3 751 322 164 45 0 chr15 21775922 21775989 -81718985 - MTD LTR MaLR -5 414 345 3 751 351 221 35 11 chr15 21776587 21776674 -81718300 - MTD LTR MaLR -330 89 1 3 751 2409 100 55 9 chr15 21787333 21787676 -81707298 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 3 751 15933 181 23 8 chr15 21787678 21790701 -81704273 + IAP-d-int LTR ERVK 3 3070 -3472 3 751 11667 200 8 3 chr15 21809947 21812276 -81682698 + IAP-d-int LTR ERVK 3056 5394 -1148 3 751 5341 108 0 15 chr15 21812315 21813116 -81681858 + IAP-d-int LTR ERVK 5394 6182 -360 3 751 2481 192 17 24 chr15 21813132 21813793 -81681181 + IAP-d-int LTR ERVK 5665 6542 0 3 751 2176 97 125 3 chr15 21813795 21814115 -81680859 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 3 751 2645 31 2 231 chr15 21819077 21819583 -81675391 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 4 751 16190 21 1 13 chr15 21819593 21821561 -81673413 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1984 -3 4 751 2645 31 2 231 chr15 21821563 21822069 -81672905 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 4 751 847 267 27 46 chr15 21828039 21828339 -81666635 - MT2B LTR ERVL -56 545 99 4 751 301 232 88 69 chr15 21828353 21828455 -81666519 - MT2B LTR ERVL -415 118 15 4 751 659 354 25 14 chr15 21845435 21845796 -81649178 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 5 4 751 302 326 54 7 chr15 21846233 21846381 -81648593 + MLT1A LTR MaLR 2 156 -218 4 751 2474 97 118 39 chr15 21847390 21847830 -81647144 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 751 56555 23 5 4 chr15 21847830 21854298 -81640676 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 9 4 751 2442 102 121 41 chr15 21854299 21854739 -81640235 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 751 6000 263 62 32 chr15 21856234 21858446 -81636528 + MurERV4-int LTR ERVK 1 2336 -2924 4 751 3198 211 23 27 chr15 21858450 21859187 -81635787 + MurERV4-int LTR ERVK 4447 5180 -80 4 751 1474 176 36 29 chr15 21859618 21859712 -81635262 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 88 -496 4 751 1474 176 36 29 chr15 21859762 21859948 -81635026 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 89 282 -302 4 751 549 319 24 24 chr15 21862603 21862812 -81632162 + MTD LTR MaLR 40 248 -171 4 751 1898 186 48 143 chr15 21868865 21869510 -81625464 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 4 751 3097 211 39 14 chr15 21869821 21870540 -81624434 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 751 727 186 27 27 chr15 21872167 21872307 -81622667 + ORR1B1 LTR MaLR 1 144 -250 4 751 1206 212 31 176 chr15 21872354 21872633 -81622341 + ORR1B1 LTR MaLR 135 386 -8 4 751 3163 207 19 8 chr15 21880129 21880797 -81614177 - RLTR33 LTR ERVK -2 676 1 4 751 1027 220 98 85 chr15 21882987 21883595 -81611379 - RMER6A LTR ERVK -59 697 2 4 751 1176 204 104 60 chr15 21883595 21883980 -81610994 + RMER17C LTR ERVK 1 402 -8 4 751 237 98 24 0 chr15 21888148 21888189 -81606785 - MT2C_Mm LTR ERVL -78 397 356 4 93 850 304 79 22 chr15 21888986 21889353 -81605621 + MER89 LTR ERV1 167 554 -5 4 752 2891 161 84 65 chr15 21891215 21891892 -81603082 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 752 945 316 20 121 chr15 21893298 21893751 -81601223 - MTD LTR MaLR -12 407 1 5 752 2731 28 0 3 chr15 21896035 21896358 -81598616 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 752 613 216 151 0 chr15 21905862 21906047 -81588927 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 172 5 752 410 272 48 0 chr15 21906094 21906197 -81588777 - ORR1C2 LTR MaLR -190 194 87 5 752 2542 86 43 20 chr15 21907799 21908018 -81586956 - MTB LTR MaLR 0 400 183 5 752 2542 86 43 20 chr15 21908528 21908684 -81586290 - MTB LTR MaLR -218 182 25 5 752 2542 86 43 20 chr15 21908726 21908740 -81586234 - MTB LTR MaLR -376 24 3 5 752 309 301 103 22 chr15 21915221 21915357 -81579617 - RMER15 LTR ERVL 0 575 429 5 752 452 302 67 42 chr15 21915583 21915839 -81579135 + MT2B LTR ERVL 138 532 -69 5 752 749 208 12 12 chr15 21917280 21917441 -81577533 + ORR1C2 LTR MaLR 6 166 -218 5 752 348 378 21 45 chr15 21918297 21918632 -81576342 + LTR86C LTR ERVL 19 345 -276 5 752 433 305 15 45 chr15 21918682 21918816 -81576158 - RMER15 LTR ERVL 0 575 446 5 752 241 157 0 38 chr15 21918861 21918914 -81576060 - ORR1D1 LTR MaLR -228 146 96 5 752 235 269 32 32 chr15 21918924 21919047 -81575927 - RMER15 LTR ERVL -166 409 287 5 752 1188 281 19 32 chr15 21926277 21926652 -81568322 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 5 752 298 333 0 9 chr15 21926908 21927017 -81567957 - MLT1A1 LTR MaLR -281 127 20 5 752 816 352 30 31 chr15 21928061 21928437 -81566537 - MTE2a LTR MaLR -23 396 31 5 752 4921 151 69 16 chr15 21929468 21930378 -81564596 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 5 752 406 377 54 25 chr15 21931203 21931335 -81563639 + MTE2a LTR MaLR 77 218 -161 5 752 406 377 54 25 chr15 21931392 21931501 -81563473 + MTE2a LTR MaLR 219 325 -54 5 752 703 201 73 7 chr15 21938940 21939090 -81555884 - ORR1C2 LTR MaLR -23 361 202 5 752 968 168 89 0 chr15 21939391 21939581 -81555393 - ORR1C2 LTR MaLR -177 207 1 5 752 610 148 118 14 chr15 21940666 21940810 -81554164 - RMER17B LTR ERVK -493 465 307 5 752 1460 303 48 19 chr15 21940936 21941454 -81553520 + RMER5 LTR ERV1 1 533 -1 5 752 3128 26 56 15 chr15 21942215 21942610 -81552364 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 5 752 2502 182 17 34 chr15 21942878 21943384 -81551590 + RLTR1D LTR ERV1 107 605 0 5 752 845 329 56 31 chr15 21945208 21945566 -81549408 + MTD LTR MaLR 39 405 -14 5 752 948 278 58 24 chr15 21946080 21946408 -81548566 + ORR1E LTR MaLR 11 349 -10 5 752 350 335 76 23 chr15 21946704 21946989 -81547985 - MLT2C1 LTR ERVL -78 336 27 6 752 2932 53 45 3 chr15 21954100 21954480 -81540494 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 752 6716 69 21 2 chr15 21954480 21955410 -81539564 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 151 6 752 261 293 100 62 chr15 21966975 21967135 -81527839 + MLT1C LTR MaLR 289 454 -13 6 752 236 273 45 15 chr15 21969599 21969666 -81525308 + MER110 LTR ERV1 325 393 -98 6 752 770 287 53 41 chr15 21971993 21972331 -81522643 + RMER5 LTR ERV1 33 374 -160 6 752 250 305 103 21 chr15 21974593 21974690 -81520284 + RMER5 LTR ERV1 428 532 -2 6 752 797 111 47 34 chr15 21977004 21977153 -81517821 - RLTR10A LTR ERVK -144 267 117 6 752 397 89 18 0 chr15 21984782 21984838 -81510136 - IAPEz-int LTR ERVK -6257 224 168 6 752 244 302 0 0 chr15 21984838 21984891 -81510083 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 6 752 913 123 27 90 chr15 21984891 21985079 -81509895 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 20 6 752 2494 89 76 33 chr15 21985144 21985538 -81509436 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 752 1047 295 46 33 chr15 21986099 21986467 -81508507 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 6 752 361 207 49 12 chr15 21992223 21992385 -81502589 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 171 6 752 650 291 0 32 chr15 21992466 21992651 -81502323 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 3 6 752 2591 103 55 5 chr15 21996369 21996770 -81498204 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 752 1545 150 15 166 chr15 22009222 22009615 -81485359 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 752 409 307 73 0 chr15 22011516 22011666 -81483308 + MER54A LTR ERVL 680 840 -61 2 752 3024 56 201 2 chr15 22013895 22014322 -81480652 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 752 256 269 12 71 chr15 22014649 22014733 -81480241 + RLTR40 LTR ERVK 25 103 -714 2 752 558 281 47 60 chr15 22014715 22014950 -81480024 + RLTR40 LTR ERVK 269 500 -317 2 752 1571 241 83 44 chr15 22014950 22015445 -81479529 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 514 -70 2 752 1210 249 49 7 chr15 22015470 22015777 -81479197 + RLTR40 LTR ERVK 494 813 -4 2 752 1693 166 76 43 chr15 22016702 22017098 -81477876 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 3 752 301 261 90 11 chr15 22017487 22017576 -81477398 + MLT1D LTR MaLR 402 497 -8 3 752 2687 70 6 0 chr15 22017653 22017997 -81476977 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 753 2049 132 25 0 chr15 22033998 22034317 -81460657 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 753 424 326 113 38 chr15 22038673 22038743 -81456231 - RMER5 LTR ERV1 -66 468 404 6 753 2719 54 0 0 chr15 22038743 22039075 -81455899 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 6 753 424 326 113 38 chr15 22039075 22039323 -81455651 - RMER5 LTR ERV1 -131 403 126 6 753 339 319 95 106 chr15 22039325 22039683 -81455291 + RLTR12B LTR ERVK 1 354 -214 6 753 352 313 8 38 chr15 22042011 22042144 -81452830 - MLT1L LTR MaLR -63 547 419 6 753 3290 206 110 35 chr15 22043498 22044388 -81450586 + RMER17B LTR ERVK 2 958 0 7 753 2379 151 84 12 chr15 22046604 22047034 -81447940 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 7 753 451 375 106 15 chr15 22047136 22047542 -81447432 - MLT2B5 LTR ERVL -150 567 125 7 753 1004 112 275 5 chr15 22056907 22057114 -81437860 - MYSERV6-int LTR ERVK -121 8838 8576 9 753 1075 259 86 110 chr15 22058437 22059053 -81435921 - RMER6D LTR ERVK -4 716 116 9 753 1802 226 66 93 chr15 22059067 22059691 -81435283 + RMER19C LTR ERVK 2 608 -3 9 753 434 341 134 7 chr15 22064357 22064640 -81430334 - RMER15 LTR ERVL -2 573 255 1 753 266 252 78 29 chr15 22064682 22064784 -81430190 - RMER15 LTR ERVL -441 134 28 1 753 302 297 75 25 chr15 22066019 22066178 -81428796 + MLT1B LTR MaLR 31 197 -193 1 753 254 329 56 42 chr15 22067241 22067384 -81427590 - ORR1E LTR MaLR -7 372 228 1 753 677 245 20 61 chr15 22067390 22067586 -81427388 + ORR1D1 LTR MaLR 2 189 -185 1 753 635 266 105 21 chr15 22067713 22067921 -81427053 + ORR1D1 LTR MaLR 147 384 0 1 753 477 345 39 15 chr15 22067935 22068138 -81426836 - ORR1E LTR MaLR -151 208 1 1 753 719 111 8 0 chr15 22068511 22068628 -81426346 + RMER2 LTR ERV1 450 567 0 1 753 5107 84 55 27 chr15 22072535 22072826 -81422148 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 523 1 753 5107 84 55 27 chr15 22072905 22073392 -81421582 - RLTR13C2 LTR ERVK -286 522 1 1 753 2655 133 0 12 chr15 22077341 22077753 -81417221 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 753 4192 141 144 92 chr15 22077755 22078799 -81416175 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 753 2873 93 28 2 chr15 22078799 22079196 -81415778 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 753 1526 180 81 0 chr15 22079383 22079678 -81415296 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 753 333 284 25 76 chr15 22081416 22081534 -81413440 - MT2B LTR ERVL -336 265 154 1 753 393 207 138 35 chr15 22083604 22083749 -81411225 - RMER12B LTR ERVK -11 1393 1234 1 753 332 305 42 14 chr15 22083794 22083937 -81411037 - MLT2B4 LTR ERVL -409 147 1 1 753 2029 115 17 67 chr15 22084023 22084367 -81410607 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 1 753 1130 310 22 0 chr15 22085619 22085977 -81408997 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 1 753 289 362 17 17 chr15 22091166 22091284 -81403690 + ORR1E LTR MaLR 1 118 -241 1 753 1721 189 19 0 chr15 22092584 22092907 -81402067 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 753 261 277 121 0 chr15 22092942 22093025 -81401949 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 270 1 753 837 338 104 3 chr15 22095213 22095539 -81399435 + MTE2b LTR MaLR 4 362 -17 1 753 1073 161 148 62 chr15 22097213 22097504 -81397470 - RLTR23 LTR ERV1 -104 326 11 1 753 1701 274 49 40 chr15 22099807 22100378 -81394596 + MT-int LTR MaLR 249 824 -274 1 753 2128 242 69 71 chr15 22102329 22102951 -81392023 - RMER20B LTR ERVK 0 627 7 1 753 457 145 0 38 chr15 22109059 22109138 -81385836 - MTB LTR MaLR -2 398 323 1 753 743 33 0 0 chr15 22109107 22109199 -81385775 - MTA_Mm LTR MaLR -304 92 1 1 753 9101 34 6 1 chr15 22109199 22110292 -81384682 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 753 473 18 0 0 chr15 22110292 22110348 -81384626 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 345 1 753 767 33 0 0 chr15 22110342 22110434 -81384540 - MTA_Mm LTR MaLR -304 92 1 1 753 729 300 88 44 chr15 22111591 22111867 -81383107 + ORR1D2 LTR MaLR 40 332 -38 1 753 1719 172 151 62 chr15 22111867 22112270 -81382704 + BGLII_B LTR ERVK 1 439 -2 1 753 729 300 88 44 chr15 22112270 22112310 -81382664 + ORR1D2 LTR MaLR 333 370 0 1 753 1268 219 11 29 chr15 22113779 22114052 -81380922 - MTC LTR MaLR -2 419 152 1 753 1523 213 93 20 chr15 22115643 22115876 -81379098 + BGLII_B LTR ERVK 5 261 -180 1 753 1523 213 93 20 chr15 22115941 22116104 -81378870 + BGLII_B LTR ERVK 262 430 -11 1 753 760 187 7 20 chr15 22125911 22126064 -81368910 - RMER6-int LTR ERVK -3026 151 1 1 753 1430 187 268 30 chr15 22126080 22126588 -81368386 - RMER6C LTR ERVK -61 629 1 1 753 228 398 0 10 chr15 22130681 22130780 -81364194 + MLT1H LTR MaLR 130 227 -322 2 753 2945 96 78 88 chr15 22132972 22133196 -81361778 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 200 -319 2 753 2945 96 78 88 chr15 22133218 22133517 -81361457 + MURVY-LTR LTR ERV1 201 519 0 2 753 2430 81 39 3 chr15 22137214 22137548 -81357426 - MTB LTR MaLR -54 346 1 2 753 4826 116 68 78 chr15 22137548 22138486 -81356488 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 170 2 753 1981 234 83 18 chr15 22143763 22143842 -81351132 + RLTR40 LTR ERVK 21 100 -717 2 753 1981 234 83 18 chr15 22144125 22144549 -81350425 + RLTR40 LTR ERVK 101 559 -258 2 753 1981 234 83 18 chr15 22144646 22144681 -81350293 + RLTR40 LTR ERVK 560 594 -223 2 753 1246 226 49 30 chr15 22146781 22147086 -81347888 - ORR1B2 LTR MaLR -56 311 1 2 754 418 272 172 44 chr15 22165572 22165776 -81329198 - RMER15 LTR ERVL -18 557 328 2 754 321 283 0 0 chr15 22166934 22167033 -81327941 + ERVL-int LTR ERVL 5315 5413 -344 2 754 239 332 51 67 chr15 22167694 22167914 -81327060 + MLT2D LTR ERVL 242 560 0 2 754 1767 199 78 10 chr15 22174690 22175075 -81319899 + MTC LTR MaLR 3 413 -8 2 754 330 368 60 68 chr15 22178078 22178414 -81316560 + ORR1E LTR MaLR 27 359 0 2 754 2323 193 24 86 chr15 22183706 22184255 -81310719 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 15 2 754 851 311 42 60 chr15 22193046 22193191 -81301783 + MTEa LTR MaLR 1 139 -240 3 754 2254 217 30 25 chr15 22193191 22193715 -81301259 + RLTR24 LTR ERV1 1 527 -2 3 754 851 311 42 60 chr15 22193715 22193754 -81301220 + MTEa LTR MaLR 140 182 -197 3 754 851 311 42 60 chr15 22193938 22194138 -81300836 + MTEa LTR MaLR 183 379 0 3 754 467 335 119 38 chr15 22195307 22195651 -81299323 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 3 3 754 352 361 77 67 chr15 22196448 22196745 -81298229 - ORR1E LTR MaLR -52 307 8 3 754 2432 161 66 36 chr15 22239299 22239800 -81255174 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 3 754 1152 242 83 129 chr15 22245100 22245703 -81249271 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 3 754 2789 91 34 0 chr15 22245943 22246350 -81248624 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 754 1695 192 116 22 chr15 22246555 22246914 -81248060 + RMER6B LTR ERVK 1 393 -68 3 754 1695 192 116 22 chr15 22247033 22247077 -81247897 + RMER6B LTR ERVK 394 441 -20 3 754 2686 28 3 30 chr15 22249840 22250175 -81244799 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 2 3 754 413 200 82 21 chr15 22251825 22251922 -81243052 + RMER20B LTR ERVK 318 420 -207 3 754 2685 57 0 0 chr15 22252369 22252701 -81242273 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 754 1111 164 15 5 chr15 22255230 22255426 -81239548 - ORR1A2 LTR MaLR -51 276 79 3 754 1948 249 38 38 chr15 22259189 22259667 -81235307 + MT2A LTR ERVL 1 482 -51 4 754 1948 249 38 38 chr15 22259838 22259882 -81235092 + MT2A LTR ERVL 483 523 -10 4 754 336 300 22 58 chr15 22261936 22262074 -81232900 + ORR1D-int LTR MaLR 587 719 -651 4 754 708 364 42 13 chr15 22265182 22265494 -81229480 - ORR1D2 LTR MaLR -47 323 3 4 754 600 221 29 22 chr15 22265499 22265638 -81229336 - ORR1D2-int LTR MaLR -3 1367 1228 4 754 1965 309 91 62 chr15 22266363 22267494 -81227480 - ORR1D2-int LTR MaLR -180 1190 1 4 754 945 298 53 12 chr15 22267529 22267848 -81227126 - ORR1D2 LTR MaLR -38 332 1 4 754 257 257 94 106 chr15 22268840 22269010 -81225964 - RMER15 LTR ERVL -407 168 1 4 754 244 276 58 86 chr15 22269489 22269628 -81225346 + MLT1A LTR MaLR 239 373 -1 4 754 1301 317 93 14 chr15 22269629 22270093 -81224881 + MLT1A-int LTR MaLR 2 507 -1228 4 754 1301 317 93 14 chr15 22270696 22270801 -81224173 + MLT1A-int LTR MaLR 508 616 -1119 4 754 343 350 74 28 chr15 22271022 22271307 -81223667 + MLT1A0 LTR MaLR 29 326 -39 4 754 1726 105 14 40 chr15 22277958 22278236 -81216738 + RMER17A LTR ERVK 1 271 -618 4 754 2709 122 34 56 chr15 22279754 22280292 -81214682 + RMER17A LTR ERVK 226 751 0 4 754 587 289 140 92 chr15 22281318 22281646 -81213328 + MTD LTR MaLR 44 387 -13 4 755 1246 246 71 147 chr15 22284074 22284735 -81210239 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 755 2258 198 42 9 chr15 22284741 22285195 -81209779 - RMER6D LTR ERVK -249 471 3 4 755 235 345 82 44 chr15 22285385 22285567 -81209407 - MLT1A LTR MaLR -42 332 144 4 755 298 316 23 97 chr15 22285713 22285888 -81209086 + MLT1A1 LTR MaLR 229 390 -18 4 755 333 148 0 0 chr15 22289091 22289145 -81205829 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 341 4 755 2177 77 51 3 chr15 22292442 22292753 -81202221 - IAPLTR2b LTR ERVK -1 326 1 4 755 4938 76 14 16 chr15 22292753 22293461 -81201513 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5775 4 755 3009 17 0 0 chr15 22293461 22293821 -81201153 - IAPEz-int LTR ERVK -2121 4360 4001 4 755 11288 72 75 52 chr15 22293819 22296525 -81198449 - IAPEz-int LTR ERVK -3707 2774 9 4 755 2191 80 51 3 chr15 22296526 22296838 -81198136 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 4 755 1328 229 87 18 chr15 22299211 22299545 -81195429 - ORR1B1 LTR MaLR -33 361 5 4 755 645 286 132 65 chr15 22299544 22299854 -81195120 - MER67C LTR ERV1 -321 390 60 4 755 2089 234 20 110 chr15 22300469 22301113 -81193861 - RMER13B LTR ERVK -12 896 311 4 755 1208 199 129 103 chr15 22301088 22301563 -81193411 - RMER17B LTR ERVK -519 439 1 4 755 4811 191 37 38 chr15 22302672 22304277 -81190697 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1792 8 4 755 572 192 79 65 chr15 22304277 22304416 -81190558 - MT2B LTR ERVL -279 322 182 4 755 789 228 20 49 chr15 22304410 22304654 -81190320 - ORR1A3-int LTR MaLR -350 1613 1377 4 755 279 240 40 40 chr15 22304657 22304757 -81190217 - ORR1A3-int LTR MaLR -1245 718 619 4 755 527 174 0 0 chr15 22304668 22304760 -81190214 - MT2B LTR ERVL -507 94 3 4 755 265 79 0 0 chr15 22304766 22304804 -81190170 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5 5756 5719 4 755 377 235 9 47 chr15 22304804 22304911 -81190063 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 538 4 755 2988 74 15 5 chr15 22308921 22309317 -81185657 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 755 2750 45 3 0 chr15 22313594 22313925 -81181049 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 4 755 633 364 70 40 chr15 22313960 22314489 -81180485 - MLT1J-int LTR MaLR -692 695 151 4 755 300 274 12 0 chr15 22321727 22321811 -81173163 + MTEb LTR MaLR 107 191 -168 4 755 462 309 47 35 chr15 22321910 22322081 -81172893 + MTEb LTR MaLR 201 373 -6 4 755 227 331 108 86 chr15 22322309 22322358 -81172616 + MLT1D LTR MaLR 318 360 -145 4 755 2952 57 2 70 chr15 22322358 22322774 -81172200 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 4 755 227 331 108 86 chr15 22322774 22322863 -81172111 + MLT1D LTR MaLR 361 459 -46 4 755 3564 32 121 0 chr15 22324648 22325088 -81169886 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 755 343 322 163 50 chr15 22330661 22330900 -81164074 + MLT1A0 LTR MaLR 31 297 -68 4 755 343 322 163 50 chr15 22331046 22331107 -81163867 + MLT1A0 LTR MaLR 298 365 0 4 755 1667 34 5 0 chr15 22331484 22331688 -81163286 - MTA_Mm LTR MaLR -191 205 1 4 755 525 374 116 69 chr15 22335922 22337193 -81157781 + MLT-int LTR MaLR 406 1735 0 5 755 2715 199 58 73 chr15 22338290 22338979 -81155995 - RMER6C LTR ERVK -2 688 10 5 755 1188 331 144 25 chr15 22344079 22344792 -81150182 - MTE-int LTR MaLR -711 869 72 5 755 475 206 43 0 chr15 22345577 22345669 -81149305 - MTC LTR MaLR -5 416 321 5 755 1426 203 33 0 chr15 22345985 22346261 -81148713 - MTC LTR MaLR -132 289 5 5 755 437 294 49 138 chr15 22349380 22349771 -81145203 + MLT1B LTR MaLR 27 382 -8 5 755 563 347 122 27 chr15 22350367 22350699 -81144275 - MLT1C LTR MaLR -19 448 91 5 755 563 347 122 27 chr15 22351289 22351365 -81143609 - MLT1C LTR MaLR -377 90 1 5 755 278 271 63 22 chr15 22353296 22353410 -81141564 - MLT1A0 LTR MaLR -6 402 236 5 755 330 258 75 0 chr15 22360482 22360575 -81134399 - RLTR40 LTR ERVK -716 101 2 5 755 4313 190 98 41 chr15 22364103 22365142 -81129832 + RLTR25A LTR ERVK 6 1103 0 5 755 517 184 101 0 chr15 22368786 22368895 -81126079 - RLTR11A2 LTR ERVK -406 121 2 5 755 3852 129 5 0 chr15 22370493 22371074 -81123900 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 5 755 974 219 65 108 chr15 22371545 22371822 -81123152 + RMER19C LTR ERVK 1 265 -346 5 755 441 354 72 58 chr15 22372346 22372915 -81122059 + MLT2B3 LTR ERVL 165 695 -22 5 755 2908 173 40 59 chr15 22373869 22374464 -81120510 + RLTR25B LTR ERVK 7 590 -438 5 755 502 259 60 0 chr15 22374964 22375080 -81119894 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7192 -214 5 755 351 324 17 6 chr15 22381854 22382034 -81112940 + RMER16-int LTR ERVK 185 366 -6878 5 755 1826 170 162 45 chr15 22382228 22382715 -81112259 + RMER16-int LTR ERVK 268 811 -4595 5 755 668 224 16 0 chr15 22382727 22382852 -81112122 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7196 -210 5 755 343 282 49 38 chr15 22383416 22383600 -81111374 + RLTR45-int LTR ERVK 181 366 -6878 5 755 1832 184 124 18 chr15 22383749 22384256 -81110718 + RMER16-int LTR ERVK 192 671 -4735 5 755 454 191 133 0 chr15 22384259 22384364 -81110610 + RMER16-int LTR ERVK 938 1056 -5081 5 755 1169 248 56 21 chr15 22384381 22384669 -81110305 + RLTR45-int LTR ERVK 2454 2751 -4655 5 755 4560 124 16 17 chr15 22384697 22385403 -81109571 + RLTR45-int LTR ERVK 3567 4271 -3135 5 755 4692 156 84 105 chr15 22385405 22386630 -81108344 + RLTR45-int LTR ERVK 4873 6071 -1173 5 755 750 292 22 15 chr15 22386632 22386987 -81107987 + RLTR45-int LTR ERVK 7506 7828 -389 5 755 4483 169 14 3 chr15 22387015 22387717 -81107257 + ETnERV2-int LTR ERVK 6493 7202 -204 5 755 229 325 8 81 chr15 22387981 22388105 -81106869 + RNLTR23 LTR ERVK 528 642 0 5 755 453 125 268 10 chr15 22388110 22388207 -81106767 + RMER16-int LTR ERVK 1089 1210 -4196 5 755 403 243 197 58 chr15 22388219 22388407 -81106567 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2667 -4739 5 755 8745 153 41 45 chr15 22388394 22389459 -81105515 + ETnERV2-int LTR ERVK 2979 4055 -3351 5 755 8745 153 41 45 chr15 22390238 22390879 -81104095 + ETnERV2-int LTR ERVK 4056 4679 -2727 5 755 2771 89 33 5 chr15 22390877 22391273 -81103701 + ETnERV2-int LTR ERVK 5356 5762 -1644 5 755 3068 173 95 85 chr15 22391261 22392074 -81102900 + ETnERV2-int LTR ERVK 4670 5490 -1754 5 755 585 357 42 44 chr15 22392480 22393002 -81101972 + MuRRS4-int LTR ERV1 4366 4886 -177 5 755 1304 291 17 17 chr15 22392665 22393081 -81101893 + RNERVK23-int LTR ERVK 7411 7826 -391 5 755 3766 156 5 19 chr15 22393112 22393686 -81101288 + ETnERV2-int LTR ERVK 6494 7059 -347 5 755 1054 291 101 26 chr15 22395135 22395512 -81099462 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 108 5 755 270 330 9 28 chr15 22399198 22399307 -81095667 - RMER4A LTR ERVK -352 114 8 5 755 641 165 90 79 chr15 22401118 22401296 -81093678 + ORR1B2 LTR MaLR 1 180 -198 5 755 866 222 22 86 chr15 22401359 22401581 -81093393 + ORR1B2 LTR MaLR 160 367 0 5 755 518 365 64 17 chr15 22402094 22402392 -81092582 + MTD LTR MaLR 1 312 -107 5 755 768 253 112 27 chr15 22404903 22405126 -81089848 - MTD LTR MaLR 0 419 178 6 755 363 280 33 70 chr15 22406319 22406531 -81088443 - MTD LTR MaLR -15 404 166 6 755 269 384 35 9 chr15 22406645 22406758 -81088216 - MTD LTR MaLR -168 191 76 6 755 1009 269 52 20 chr15 22409030 22409332 -81085642 - ORR1D2 LTR MaLR -53 326 2 6 755 247 327 45 9 chr15 22410358 22410469 -81084505 + RMER15 LTR ERVL 406 520 -55 6 755 567 296 5 104 chr15 22412963 22413108 -81081866 - RMER5 LTR ERV1 0 534 394 6 94 1671 165 21 45 chr15 22413108 22413445 -81081529 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 756 567 296 5 104 chr15 22413445 22413521 -81081453 - RMER5 LTR ERV1 -141 393 335 6 756 1537 195 46 25 chr15 22413530 22413856 -81081118 + RMER10A LTR ERVL 1 333 -109 6 756 565 146 0 0 chr15 22414328 22414424 -81080550 + RMER10A LTR ERVL 334 429 -13 6 756 586 301 36 120 chr15 22414451 22414810 -81080164 - RMER5 LTR ERV1 -205 329 1 6 756 916 198 36 37 chr15 22416819 22417086 -81077888 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 756 1072 280 134 34 chr15 22432257 22432551 -81062423 + MTD LTR MaLR 1 329 -90 6 756 1072 280 134 34 chr15 22432785 22432871 -81062103 + MTD LTR MaLR 330 419 0 6 756 230 374 60 70 chr15 22436214 22436499 -81058475 - RLTR26 LTR ERVK -190 452 171 6 756 575 344 88 22 chr15 22447697 22448015 -81046959 - MTEb LTR MaLR -25 354 16 6 756 628 319 62 14 chr15 22448026 22448236 -81046738 - MTEb-int LTR MaLR 0 1580 1361 6 756 285 392 10 10 chr15 22448608 22448711 -81046263 - MTEb-int LTR MaLR -602 768 666 6 756 291 320 55 60 chr15 22449590 22449773 -81045201 - MTEb-int LTR MaLR -1075 505 324 6 756 818 292 107 24 chr15 22450894 22451231 -81043743 - MTEb-int LTR MaLR -1215 365 1 6 756 508 269 101 39 chr15 22451610 22451788 -81043186 - MTEb LTR MaLR -189 190 2 6 756 967 309 85 56 chr15 22454169 22454618 -81040356 + MT2A LTR ERVL 1 462 -71 6 756 478 289 61 100 chr15 22455296 22455557 -81039417 - MT2B LTR ERVL -64 537 287 6 756 2732 30 3 0 chr15 22469626 22469962 -81025012 - ORR1A0 LTR MaLR -9 337 1 7 756 13124 65 21 3 chr15 22469962 22471723 -81023251 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 7 756 2913 43 0 0 chr15 22471723 22472069 -81022905 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 7 756 1483 249 78 21 chr15 22473390 22473775 -81021199 - MTD LTR MaLR -3 416 10 7 756 1308 241 51 14 chr15 22474222 22474592 -81020382 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 756 5008 140 61 29 chr15 22487621 22488549 -81006425 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 7 756 2233 185 20 22 chr15 22488794 22489248 -81005726 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 7 756 1391 206 0 0 chr15 22494462 22494729 -81000245 - RMER6C LTR ERVK 0 690 424 7 756 896 166 306 20 chr15 22494848 22495090 -80999884 - RMER6C LTR ERVK -409 311 1 7 756 310 276 105 95 chr15 22495546 22495746 -80999228 + MTD LTR MaLR 1 202 -217 7 756 353 270 28 75 chr15 22495769 22495905 -80999069 + MTD LTR MaLR 251 405 -14 7 756 1569 240 77 26 chr15 22501348 22501750 -80993224 + RLTR20B1 LTR ERVK 26 456 -107 2 756 1569 235 76 27 chr15 22501815 22501893 -80993081 + RLTR20B1 LTR ERVK 457 547 -16 2 756 3346 153 189 22 chr15 22505866 22506640 -80988334 - RMER17A2 LTR ERVK -3 903 1 8 756 5340 132 41 52 chr15 22506648 22507550 -80987424 - RMER17A-int LTR ERVK -3 1725 797 8 756 2789 91 26 5 chr15 22507550 22507938 -80987036 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 756 5340 132 41 52 chr15 22507938 22508055 -80986919 - RMER17A-int LTR ERVK -932 796 717 8 756 598 200 63 14 chr15 22508373 22508515 -80986459 - RMER17A-int LTR ERVK -1577 151 3 8 756 1233 172 15 39 chr15 22508517 22508777 -80986197 - RMER17A2 LTR ERVK 0 809 556 8 756 286 203 14 0 chr15 22508751 22508825 -80986149 - RMER17A2 LTR ERVK -5 901 827 8 756 992 178 11 0 chr15 22512770 22512944 -80982030 - ORR1B1 LTR MaLR -210 184 9 1 756 363 182 105 35 chr15 22519181 22519295 -80975679 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 463 584 0 3 756 420 347 88 0 chr15 22520090 22520283 -80974691 - MLT1E3 LTR MaLR -60 564 355 3 756 307 241 59 24 chr15 22520381 22520466 -80974508 - MTE2b LTR MaLR -15 364 277 3 756 233 305 10 78 chr15 22529370 22529473 -80965501 - RMER5 LTR ERV1 -274 260 165 5 756 1986 214 63 4 chr15 22535111 22535426 -80959548 - RMER6C LTR ERVK 0 690 357 6 756 1986 214 63 4 chr15 22535475 22535619 -80959355 - RMER6C LTR ERVK -334 356 205 6 756 712 320 76 47 chr15 22541117 22541461 -80953513 + MTEa LTR MaLR 22 375 -4 7 757 276 186 37 64 chr15 22544784 22544893 -80950081 + RLTR25B LTR ERVK 397 502 -526 7 757 2576 52 2 163 chr15 22546573 22547008 -80947966 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 8 757 2323 66 119 11 chr15 22552969 22553321 -80941653 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 9 757 2489 203 92 31 chr15 22558429 22558950 -80936024 - RMER20B LTR ERVK 0 627 69 1 757 2489 203 92 31 chr15 22559255 22559321 -80935653 - RMER20B LTR ERVK -559 68 4 1 757 1710 167 46 9 chr15 22565986 22566331 -80928643 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 2 1 757 2538 94 67 21 chr15 22578213 22578602 -80916372 - RLTR10A LTR ERVK -4 407 1 1 757 312 238 12 0 chr15 22583934 22584014 -80910960 + MER31B LTR ERV1 377 457 -9 1 757 3406 176 48 12 chr15 22595462 22596130 -80898844 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 1 757 236 339 50 62 chr15 22597570 22597749 -80897225 + MLT1B LTR MaLR 104 280 -110 1 757 261 296 110 27 chr15 22604006 22604152 -80890822 + RMER15 LTR ERVL 411 568 -7 1 757 4093 65 40 9 chr15 22629405 22629948 -80865026 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 1 757 871 243 17 4 chr15 22629951 22630182 -80864792 - RLTR1B-int LTR ERV1 -42 5021 4788 1 757 9388 144 146 48 chr15 22630173 22632928 -80862046 - RLTR1B-int LTR ERV1 -792 4271 760 1 757 4387 150 39 16 chr15 22632919 22633664 -80861310 - RMER16-int LTR ERVK -3962 1444 683 1 757 943 157 61 17 chr15 22633649 22633830 -80861144 - RMER16-int LTR ERVK -5076 330 142 1 757 1019 137 24 61 chr15 22634182 22634448 -80860526 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3011 288 60 1 757 257 209 25 76 chr15 22634475 22634594 -80860380 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3585 113 1 1 757 4080 67 40 9 chr15 22634594 22635137 -80859837 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 1 757 556 330 59 21 chr15 22641355 22641643 -80853331 - RMER15 LTR ERVL -6 569 271 1 757 665 318 15 25 chr15 22646166 22646440 -80848534 - RLTR15 LTR ERVK -56 303 33 2 757 1205 312 64 54 chr15 22648945 22649629 -80845345 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4447 1314 624 2 757 583 228 79 18 chr15 22649643 22649808 -80845166 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5181 580 406 2 757 3203 195 43 135 chr15 22650371 22651250 -80843724 + RMER21B LTR ERV1 40 837 -5 2 757 290 408 77 24 chr15 22661942 22662188 -80832786 - LTR16B2 LTR ERVL -178 284 26 2 757 2102 180 2 44 chr15 22668731 22669161 -80825813 - RLTR11B LTR ERVK -2 451 40 2 757 380 329 117 14 chr15 22669321 22669534 -80825440 + ORR1E LTR MaLR 118 352 -7 2 757 554 279 113 66 chr15 22669545 22669998 -80824976 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 474 -53 2 757 1458 195 78 29 chr15 22670054 22670402 -80824572 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 2 758 3152 58 180 2 chr15 22676439 22676873 -80818101 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 2 2 758 2800 9 88 6 chr15 22681247 22681586 -80813388 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 758 7767 80 89 50 chr15 22681586 22682843 -80812131 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1313 -5168 2 758 28788 20 2 2 chr15 22682841 22686115 -80808859 + IAPEz-int LTR ERVK 3209 6481 0 2 758 2788 12 88 6 chr15 22686115 22686454 -80808520 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 758 3821 82 60 2 chr15 22690635 22691183 -80803791 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 806 227 2 758 2957 142 37 26 chr15 22691156 22691693 -80803281 - RLTR13D1 LTR ERVK -359 543 1 2 758 3035 142 49 15 chr15 22692218 22692753 -80802221 - RLTR1D LTR ERV1 -16 589 37 2 758 2489 146 46 40 chr15 22696361 22696840 -80798134 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 758 748 316 102 35 chr15 22698478 22698793 -80796181 - MTE2b LTR MaLR -41 338 3 2 758 4278 138 99 19 chr15 22705554 22705966 -80789008 - RMER17A2 LTR ERVK -3 903 482 2 758 4278 138 99 19 chr15 22706048 22706471 -80788503 - RMER17A2 LTR ERVK -425 481 3 2 758 990 231 29 8 chr15 22721856 22722096 -80772878 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 280 3 758 3112 251 39 24 chr15 22726380 22727216 -80767758 + ORR1D2-int LTR MaLR 509 1364 -6 3 758 1185 270 57 28 chr15 22727222 22727576 -80767398 + ORR1D2 LTR MaLR 1 364 -6 3 758 1528 232 93 16 chr15 22728302 22728679 -80766295 - MTC LTR MaLR 0 421 16 3 758 771 245 50 81 chr15 22729185 22729443 -80765531 + RMER20B LTR ERVK 364 613 -14 3 758 230 265 0 56 chr15 22730646 22730718 -80764256 + RMER20B LTR ERVK 556 623 -4 3 758 1010 144 330 8 chr15 22733353 22733611 -80761363 - RMER6C LTR ERVK -349 341 1 3 758 2181 189 178 25 chr15 22746189 22746786 -80748188 - RMER6C LTR ERVK 0 690 3 3 758 418 208 52 0 chr15 22755773 22755869 -80739105 - MTD LTR MaLR -309 110 10 3 758 943 211 126 72 chr15 22758436 22758962 -80736012 - RLTR21 LTR ERVK -4 1400 745 3 758 792 326 19 43 chr15 22765249 22765573 -80729401 - ORR1E LTR MaLR -41 318 3 3 758 543 355 97 16 chr15 22786560 22786932 -80708042 + MTD LTR MaLR 18 419 0 4 94 3219 137 92 32 chr15 22806336 22806903 -80688071 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 4 759 715 354 30 73 chr15 22807035 22807404 -80687570 + MTEa LTR MaLR 19 371 -8 4 759 4287 112 10 86 chr15 22807719 22808532 -80686442 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 4 759 2222 213 86 37 chr15 22809826 22810454 -80684520 + RMER6C LTR ERVK 1 659 -31 4 759 350 330 165 13 chr15 22812212 22812436 -80682538 + MLT1H2 LTR MaLR 152 409 -80 4 759 847 289 91 30 chr15 22817924 22818282 -80676692 - MTD LTR MaLR -42 377 22 4 759 454 281 66 27 chr15 22818358 22818530 -80676444 - MTE-int LTR MaLR -503 1077 949 4 759 674 237 45 30 chr15 22819362 22819562 -80675412 - MTE-int LTR MaLR -1350 230 28 4 759 314 249 185 24 chr15 22819747 22819926 -80675048 - MTD LTR MaLR -216 203 18 4 759 1795 216 195 42 chr15 22825387 22825957 -80669017 + RMER6C LTR ERVK 1 657 -33 4 759 921 275 87 60 chr15 22840746 22840973 -80654001 - RLTR12B LTR ERVK 0 568 261 4 759 1020 247 39 30 chr15 22841217 22841499 -80653475 - RLTR12B LTR ERVK -246 282 1 4 759 2990 219 48 105 chr15 22850510 22851473 -80643501 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 5 759 4181 163 56 22 chr15 22865736 22866608 -80628366 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 5 759 295 350 65 0 chr15 22873713 22873836 -80621138 + RMER5 LTR ERV1 51 181 -353 5 759 288 247 30 61 chr15 22882551 22882650 -80612324 + MT2B LTR ERVL 161 256 -345 5 759 2541 180 123 28 chr15 22885814 22886430 -80608544 - RMER6C LTR ERVK -15 675 1 5 759 2713 84 36 10 chr15 22886584 22886970 -80608004 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 759 2846 84 10 3 chr15 22891182 22891574 -80603400 - MTB LTR MaLR 0 400 6 5 759 314 244 77 11 chr15 22897455 22897546 -80597428 + MTD LTR MaLR 1 97 -322 5 759 1504 144 55 31 chr15 22903685 22903978 -80590996 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 27 5 759 408 146 50 20 chr15 22904072 22904174 -80590800 - ORR1A4 LTR MaLR -253 141 4 5 759 1713 249 38 5 chr15 22916139 22916531 -80578443 - MTC LTR MaLR -4 417 13 6 759 1837 213 121 39 chr15 22916731 22917075 -80577899 - RMER6C LTR ERVK 0 690 334 6 759 1837 213 121 39 chr15 22917126 22917416 -80577558 - RMER6C LTR ERVK -357 333 4 6 759 739 226 57 24 chr15 22919880 22920089 -80574885 - RMER4B LTR ERVK -344 241 26 6 759 253 330 125 39 chr15 22921069 22921277 -80573697 + MLT1E3 LTR MaLR 396 621 -3 6 759 741 261 82 37 chr15 22925818 22926061 -80568913 - MTD LTR MaLR 0 419 166 6 759 2032 217 67 50 chr15 22930042 22930668 -80564306 + BGLII_B LTR ERVK 1 546 -7 6 759 798 251 25 20 chr15 22931115 22931314 -80563660 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 175 6 759 535 253 189 45 chr15 22933511 22933745 -80561229 - MTD LTR MaLR -24 395 154 6 760 1250 253 44 28 chr15 22942605 22942967 -80552007 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 6 760 3765 160 125 16 chr15 22950330 22951130 -80543844 + RMER17B LTR ERVK 68 954 -4 6 760 558 305 117 14 chr15 22951146 22951359 -80543615 + MTD LTR MaLR 171 405 -14 6 760 307 278 128 9 chr15 22952107 22952216 -80542758 - MTE2a LTR MaLR -57 322 201 6 760 275 139 0 0 chr15 22952583 22952626 -80542348 - ORR1B1 LTR MaLR -69 325 283 6 760 455 209 11 0 chr15 22952635 22952726 -80542248 - ORR1B1-int LTR MaLR -204 1166 1075 6 760 2581 213 87 32 chr15 22952752 22953499 -80541475 + ORR1B1-int LTR MaLR 422 1209 -300 6 760 443 239 85 8 chr15 22977600 22977718 -80517256 + MLT1A1 LTR MaLR 268 394 -14 7 760 427 244 71 43 chr15 22996527 22996668 -80498306 - MTD LTR MaLR 0 419 275 7 760 466 299 23 23 chr15 22996641 22996812 -80498162 - MTD LTR MaLR -248 171 1 7 760 2546 109 39 10 chr15 23003150 23003539 -80491435 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 760 557 365 58 3 chr15 23006866 23007157 -80487817 - MLT1A0 LTR MaLR -6 359 53 1 760 578 333 67 30 chr15 23017893 23018193 -80476781 + ORR1E LTR MaLR 43 353 -6 3 760 399 233 0 94 chr15 23018913 23018929 -80476045 + MT2B LTR ERVL 149 164 -437 3 760 6649 78 22 0 chr15 23018929 23019803 -80475171 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 3 760 399 233 0 94 chr15 23019803 23019914 -80475060 + MT2B LTR ERVL 165 263 -338 3 760 259 412 117 13 chr15 23022762 23022993 -80471981 - MLT1G LTR MaLR -135 456 202 4 760 324 311 86 78 chr15 23023015 23023270 -80471704 - RMER2 LTR ERV1 -11 556 300 4 760 1510 193 27 48 chr15 23029121 23029496 -80465478 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 760 437 290 67 18 chr15 23030255 23030420 -80464554 - MTE2b LTR MaLR -37 342 170 5 760 719 290 120 59 chr15 23061752 23062093 -80432881 + ORR1D2 LTR MaLR 1 362 -8 1 760 1396 229 82 6 chr15 23066725 23067067 -80427907 - ORR1C1 LTR MaLR -10 368 1 1 761 799 336 41 10 chr15 23089423 23089715 -80405259 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 70 1 761 677 371 54 0 chr15 23094132 23094485 -80400489 + MTE2b LTR MaLR 1 372 -7 1 761 310 330 26 0 chr15 23102828 23102943 -80392031 - MTEa LTR MaLR -2 377 260 1 761 359 390 34 0 chr15 23102966 23103112 -80391862 - MTEa LTR MaLR -200 179 29 1 761 2460 90 113 16 chr15 23104962 23105333 -80389641 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 761 290 336 52 7 chr15 23117008 23117143 -80377831 - MLT1B LTR MaLR -216 174 34 1 761 1664 236 114 37 chr15 23118901 23119472 -80375502 + RLTR18 LTR ERVK 1 615 -1 1 761 1427 199 56 123 chr15 23121400 23121961 -80373013 - RMER6C LTR ERVK 0 720 298 1 761 1427 238 100 97 chr15 23122109 23122412 -80372562 - RMER6C LTR ERVK -393 297 1 1 761 826 321 53 45 chr15 23125239 23125598 -80369376 + MTE2a LTR MaLR 17 378 -1 1 761 768 208 130 107 chr15 23126027 23126297 -80368677 + ORR1B1 LTR MaLR 1 276 -118 1 761 833 319 57 18 chr15 23126310 23126591 -80368383 + MTE-int LTR MaLR 87 378 -1202 1 761 353 379 156 29 chr15 23126619 23127029 -80367945 + MTE-int LTR MaLR 539 1000 -580 1 761 311 399 119 11 chr15 23127372 23127734 -80367240 - MLT2B2 LTR ERVL -74 441 41 2 761 233 276 19 67 chr15 23130990 23131095 -80363879 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 305 2 761 448 309 77 14 chr15 23134096 23134414 -80360560 + MTD LTR MaLR 51 403 -16 2 761 919 297 87 34 chr15 23151112 23151559 -80343415 - RLTR40 LTR ERVK -38 779 307 2 761 3014 50 37 0 chr15 23151559 23151941 -80343033 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 761 919 297 87 34 chr15 23151941 23151964 -80343010 - RLTR40 LTR ERVK -511 306 284 2 761 598 287 62 23 chr15 23152103 23152360 -80342614 - RLTR40 LTR ERVK -525 292 26 2 761 249 333 56 19 chr15 23165080 23165187 -80329787 - ORR1E LTR MaLR -223 136 26 2 761 552 330 107 46 chr15 23166189 23166516 -80328458 - ORR1E LTR MaLR -1 358 12 2 761 3076 8 43 0 chr15 23170137 23170489 -80324485 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 761 55589 21 17 2 chr15 23170489 23176867 -80318107 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 761 3076 8 43 0 chr15 23176867 23177219 -80317755 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 761 408 387 52 40 chr15 23178313 23178641 -80316333 - MER89 LTR ERV1 -225 334 3 2 761 1075 200 16 116 chr15 23179786 23179978 -80314996 - RMER17C LTR ERVK -1 409 228 2 761 1075 200 16 116 chr15 23180022 23180208 -80314766 - RMER17C LTR ERVK -183 227 69 2 761 300 246 0 0 chr15 23185384 23185449 -80309525 + RLTR23 LTR ERV1 366 430 0 2 761 458 202 0 0 chr15 23185876 23185955 -80309019 - RMER17C LTR ERVK -328 82 4 2 761 2330 79 9 15 chr15 23196367 23196612 -80298362 - MTB LTR MaLR -69 331 90 2 761 3770 64 2 75 chr15 23196612 23197155 -80297819 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 2 761 2330 79 9 15 chr15 23197155 23197242 -80297732 - MTB LTR MaLR -311 89 1 2 761 518 267 76 0 chr15 23199440 23199532 -80295442 - MTC LTR MaLR -165 256 155 2 761 518 267 76 0 chr15 23199567 23199605 -80295369 - MTC LTR MaLR -267 154 117 2 762 688 112 133 47 chr15 23210660 23210810 -80284164 - MTB_Mm LTR MaLR -54 353 191 3 762 244 328 92 72 chr15 23213927 23214177 -80280797 - LTR33A LTR ERVL -3 517 263 3 762 777 330 48 41 chr15 23228863 23229179 -80265795 + MTE2b LTR MaLR 46 363 -16 3 762 1083 239 80 53 chr15 23237673 23237974 -80257000 + ORR1B2 LTR MaLR 1 309 -58 3 762 1057 267 140 35 chr15 23238119 23238369 -80256605 - RLTR40 LTR ERVK -19 798 521 3 762 1057 267 140 35 chr15 23238420 23238569 -80256405 - RLTR40 LTR ERVK -297 520 357 3 762 323 372 70 66 chr15 23246496 23246936 -80248038 - MLT1E3 LTR MaLR -85 539 98 3 762 321 274 39 135 chr15 23248071 23248214 -80246760 - RLTR12B LTR ERVK -300 228 105 3 762 321 274 39 135 chr15 23248272 23248335 -80246639 - RLTR12B LTR ERVK -424 104 42 3 762 233 320 84 23 chr15 23248645 23248776 -80246198 - MLT1A0 LTR MaLR -61 304 166 3 762 1377 276 59 23 chr15 23257905 23258383 -80236591 + RMER5 LTR ERV1 14 508 -26 3 762 3500 169 61 1 chr15 23286167 23286820 -80208154 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 4 762 286 317 41 23 chr15 23305305 23305476 -80189498 - MER67C LTR ERV1 -537 174 1 4 762 1242 281 73 102 chr15 23313083 23313712 -80181262 - RMER13A LTR ERVK -249 611 1 4 762 1762 188 73 11 chr15 23314688 23315059 -80179915 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 762 542 250 199 41 chr15 23322986 23323106 -80171868 - RLTR25B LTR ERVK -2 1026 903 4 762 542 250 199 41 chr15 23323167 23323292 -80171682 - RLTR25B LTR ERVK -126 902 742 4 762 3489 183 114 29 chr15 23323361 23324222 -80170752 - RLTR25A LTR ERVK -157 871 1 4 762 286 355 127 48 chr15 23327989 23328305 -80166669 + MLT1A0 LTR MaLR 25 365 0 4 762 1003 212 132 36 chr15 23329483 23329786 -80165188 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 4 763 1523 167 32 102 chr15 23332162 23332293 -80162681 - RMER17C LTR ERVK 0 410 283 5 763 1523 167 32 102 chr15 23332385 23332694 -80162280 - RMER17C LTR ERVK -128 282 1 5 763 1272 215 67 98 chr15 23332889 23333265 -80161709 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 166 5 763 234 341 0 83 chr15 23338272 23338368 -80156606 - MTEa LTR MaLR -281 98 11 5 763 1515 245 40 110 chr15 23345553 23346098 -80148876 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 2 5 763 653 329 61 24 chr15 23346712 23347010 -80147964 - MLT2B4 LTR ERVL -96 318 11 5 763 2673 205 82 21 chr15 23348147 23348812 -80146162 + RLTR25A LTR ERVK 239 913 -190 5 763 1503 220 59 59 chr15 23348878 23348907 -80146067 + RLTR25A LTR ERVK 861 885 -143 5 763 1792 150 4 212 chr15 23348923 23349455 -80145519 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 10 5 763 813 162 178 19 chr15 23349496 23349704 -80145270 + RLTR25B LTR ERVK 788 1028 0 5 763 447 302 24 65 chr15 23351132 23351302 -80143672 - MTEb LTR MaLR -209 170 8 5 763 899 194 163 53 chr15 23352120 23352365 -80142609 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 757 5 763 663 231 44 73 chr15 23352435 23352640 -80142334 - RLTR25B LTR ERVK -824 204 6 5 763 1276 75 20 63 chr15 23358349 23358581 -80136393 - ORR1A0 LTR MaLR -122 205 1 5 763 1261 263 66 48 chr15 23364199 23364594 -80130380 + MTD LTR MaLR 18 419 0 5 763 374 207 70 47 chr15 23370471 23370643 -80124331 + RMER17C LTR ERVK 91 266 -144 5 763 2965 93 0 2 chr15 23377045 23377453 -80117521 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 763 974 294 67 45 chr15 23379639 23380087 -80114887 - RMER5 LTR ERV1 -23 511 54 5 763 587 305 189 23 chr15 23380612 23380914 -80114060 + ORR1E LTR MaLR 3 354 -5 5 763 283 236 19 136 chr15 23407678 23407781 -80087193 + MT2B LTR ERVL 174 264 -337 6 763 393 370 69 6 chr15 23417065 23417239 -80077735 + MLT1A0 LTR MaLR 88 272 -93 6 763 3253 175 66 39 chr15 23418525 23419220 -80075754 - RMER6D LTR ERVK -4 716 3 6 763 1372 182 39 61 chr15 23419222 23419532 -80075442 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 2875 6 763 412 220 0 60 chr15 23420807 23420876 -80074098 + MYSERV6-int LTR ERVK 2164 2232 -945 6 763 2360 127 38 8 chr15 23420876 23421273 -80073701 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 6 763 412 220 0 60 chr15 23421273 23421319 -80073655 + MYSERV6-int LTR ERVK 2233 2272 -905 6 763 921 240 0 12 chr15 23421329 23421578 -80073396 + MYSERV6-int LTR ERVK 2606 2851 -6108 6 763 1625 209 136 59 chr15 23427109 23427750 -80067224 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 6 763 691 285 60 77 chr15 23427845 23428259 -80066715 - RLTR19 LTR ERVK -2 497 91 6 763 395 304 22 0 chr15 23428638 23428776 -80066198 - MMERGLN-int LTR ERV1 -325 7231 7091 6 763 476 268 72 12 chr15 23436465 23436664 -80058310 - ORR1D1 LTR MaLR -164 214 1 6 763 342 305 57 57 chr15 23447403 23447615 -80047359 + MLT1B LTR MaLR 31 242 -148 6 763 275 253 56 33 chr15 23450314 23450404 -80044570 + MTD LTR MaLR 308 399 -20 6 763 2436 103 3 70 chr15 23451886 23452271 -80042703 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 6 763 721 213 0 0 chr15 23452309 23452459 -80042515 + IAP-d-int LTR ERVK 347 496 -6046 6 763 4181 65 57 0 chr15 23452465 23453426 -80041548 + IAP-d-int LTR ERVK 5006 6021 -521 6 763 3439 60 0 0 chr15 23453429 23453844 -80041130 + IAP-d-int LTR ERVK 6128 6542 0 6 763 2408 112 3 68 chr15 23453844 23454228 -80040746 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 6 763 6641 99 25 25 chr15 23454831 23455814 -80039160 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 1 6 763 237 389 33 65 chr15 23460667 23461003 -80033971 - MLT1B LTR MaLR -17 373 49 6 764 2992 162 5 63 chr15 23466166 23466757 -80028217 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 557 0 7 764 249 274 81 35 chr15 23467452 23467539 -80027435 - LTR84a LTR ERVL -648 109 19 7 764 827 298 125 34 chr15 23484503 23484854 -80010120 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 7 764 1273 268 6 59 chr15 23486774 23487111 -80007863 + ORR1C1 LTR MaLR 1 319 -59 7 764 225 317 95 40 chr15 23492739 23492887 -80002087 - MLT1J-int LTR MaLR -391 996 841 7 764 271 372 42 42 chr15 23493995 23494310 -80000664 + MLT1B LTR MaLR 19 362 -28 7 764 533 197 17 25 chr15 23497646 23497766 -79997208 - RLTR25B LTR ERVK -645 383 265 7 764 385 114 29 0 chr15 23497827 23497897 -79997077 + RLTR25B LTR ERVK 295 366 -662 7 764 670 307 56 50 chr15 23498304 23498661 -79996313 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 7 764 1522 211 20 28 chr15 23498661 23499017 -79995957 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 6190 7 764 2652 255 10 7 chr15 23499012 23499692 -79995282 - IAP-d-int LTR ERVK -459 6083 5402 7 764 713 258 29 21 chr15 23499740 23499978 -79994996 - IAP-d-int LTR ERVK -1148 5394 5155 7 764 2780 278 8 5 chr15 23500046 23500816 -79994158 - IAP-d-int LTR ERVK -1457 5085 4314 1 764 425 266 12 3 chr15 23500869 23501002 -79993972 - RLTR10D LTR ERVK -277 134 1 2 764 1272 188 42 0 chr15 23501402 23501641 -79993333 + RLTR25A LTR ERVK 159 407 -696 4 764 917 248 30 38 chr15 23503677 23503940 -79991034 + RLTR25A LTR ERVK 394 631 -472 4 764 1897 157 92 11 chr15 23505308 23505516 -79989458 + RLTR25A LTR ERVK 715 952 -151 4 764 1897 157 92 11 chr15 23505556 23505707 -79989267 + RLTR25A LTR ERVK 953 1102 -1 4 764 859 266 131 27 chr15 23506987 23507246 -79987728 - MTD LTR MaLR -2 417 132 1 764 2726 35 6 0 chr15 23512492 23512831 -79982143 - ORR1A0 LTR MaLR -5 341 1 1 764 476 338 53 24 chr15 23514730 23514976 -79979998 + MLT-int LTR MaLR 1413 1665 -70 2 764 3924 48 0 17 chr15 23515077 23515560 -79979414 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 764 2293 166 86 32 chr15 23520028 23520495 -79974479 + RLTR19 LTR ERVK 3 494 -5 3 764 309 182 49 49 chr15 23522226 23522307 -79972667 - MT2A LTR ERVL -447 86 6 3 764 1690 180 7 22 chr15 23524192 23524579 -79970395 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 110 4 764 641 172 0 59 chr15 23524987 23525123 -79969851 - RLTR31_Mm LTR ERVK -433 128 1 4 764 1701 195 80 36 chr15 23525558 23525947 -79969027 + MTC LTR MaLR 16 421 0 4 764 2461 137 8 8 chr15 23531076 23531472 -79963502 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 764 805 308 38 24 chr15 23533301 23533594 -79961380 + MLT1B LTR MaLR 54 350 -40 5 764 305 342 128 51 chr15 23533868 23534164 -79960810 + MLT1A0 LTR MaLR 43 361 -4 5 764 2365 83 125 16 chr15 23551992 23552359 -79942615 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 764 242 308 0 0 chr15 23556110 23556188 -79938786 + MLT2C2 LTR ERVL 1 78 -386 8 764 272 362 103 12 chr15 23559082 23559247 -79935727 - MTEb LTR MaLR -194 185 6 9 764 665 158 223 6 chr15 23565123 23565289 -79929685 - RMER6C LTR ERVK -4 686 485 1 764 1218 186 204 78 chr15 23565783 23566179 -79928795 - RMER6C LTR ERVK -244 446 1 1 764 1528 196 51 43 chr15 23566749 23567100 -79927874 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 764 791 129 14 0 chr15 23567107 23567246 -79927728 + ORR1B1-int LTR MaLR 8 148 -1815 1 764 4380 130 16 6 chr15 23567253 23567940 -79927034 + MERVL-int LTR ERVL 2361 3054 -2431 1 764 592 175 12 122 chr15 23567940 23568115 -79926859 - ORR1A3 LTR MaLR -181 186 1 1 764 976 254 92 26 chr15 23570461 23570687 -79924287 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 143 1 764 976 254 92 26 chr15 23570742 23570862 -79924112 - ORR1D2 LTR MaLR -228 142 1 1 764 241 186 0 0 chr15 23570902 23570945 -79924029 - MTEa LTR MaLR -3 376 334 1 764 1995 102 56 0 chr15 23586232 23586537 -79908437 + ORR1A2 LTR MaLR 1 322 -5 1 765 1075 243 303 53 chr15 23601069 23601438 -79893536 - MT2B LTR ERVL -59 542 85 1 765 278 272 74 0 chr15 23601527 23601608 -79893366 - MT2B LTR ERVL -514 87 1 1 765 355 328 3 26 chr15 23601717 23601858 -79893116 + MTC LTR MaLR 240 402 -19 1 765 1329 294 45 33 chr15 23601929 23602418 -79892556 + RMER5 LTR ERV1 40 534 0 1 765 798 205 9 18 chr15 23603891 23604080 -79890894 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 161 1 765 2369 310 92 19 chr15 23604304 23605295 -79889679 - ORR1C2-int LTR MaLR -307 1063 1 1 765 911 174 112 49 chr15 23605295 23605518 -79889456 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 148 1 765 516 343 70 65 chr15 23606123 23606478 -79888496 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 1 765 733 264 21 71 chr15 23617115 23617355 -79877619 + ORR1D1 LTR MaLR 3 230 -144 1 765 815 207 17 22 chr15 23618454 23618632 -79876342 + ORR1D1 LTR MaLR 197 373 -1 1 765 601 168 25 0 chr15 23619106 23619225 -79875749 - RMER12 LTR ERVK -543 779 658 1 765 1351 286 75 5 chr15 23621438 23621825 -79873149 + MTD LTR MaLR 6 419 0 2 765 294 299 99 53 chr15 23622967 23623119 -79871855 - MTEb LTR MaLR -219 160 2 2 765 2650 50 3 14 chr15 23623315 23623662 -79871312 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 43 2 765 661 313 136 18 chr15 23623766 23624080 -79870894 + MTE2b LTR MaLR 1 356 -23 2 765 661 313 136 18 chr15 23624405 23624422 -79870552 + MTE2b LTR MaLR 357 371 -8 2 765 232 211 18 0 chr15 23632532 23632589 -79862385 - MTE2b LTR MaLR 0 379 322 2 765 748 233 58 33 chr15 23632596 23632901 -79862073 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 618 2 765 1193 167 154 2 chr15 23633978 23634286 -79860688 - RLTR25A LTR ERVK -415 613 188 2 765 270 0 0 0 chr15 23634311 23634345 -79860629 - RMER17D LTR ERVK -855 34 1 2 765 406 226 128 0 chr15 23634427 23634529 -79860445 - MTE2b LTR MaLR -264 115 1 2 765 281 310 357 9 chr15 23639223 23639447 -79855527 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 91 2 765 3212 37 34 0 chr15 23640119 23640501 -79854473 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 2 765 7813 78 26 5 chr15 23640501 23641576 -79853398 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 765 3158 46 5 8 chr15 23641576 23641973 -79853001 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 765 3369 43 38 7 chr15 23646768 23647191 -79847783 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 765 1237 207 29 29 chr15 23647914 23648192 -79846782 + ORR1B2 LTR MaLR 2 279 -88 2 765 1868 152 7 155 chr15 23652732 23653177 -79841797 - RLTR21 LTR ERVK -26 1546 1168 2 765 1109 289 53 3 chr15 23655619 23655938 -79839036 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 40 2 765 1225 276 58 11 chr15 23655984 23656332 -79838642 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 3 2 765 1032 315 86 13 chr15 23658549 23658932 -79836042 - MTD LTR MaLR -4 415 5 2 765 1606 235 204 24 chr15 23665478 23665774 -79829200 + RMER6C LTR ERVK 2 377 -313 2 765 1606 235 204 24 chr15 23666525 23666812 -79828162 + RMER6C LTR ERVK 378 689 -1 2 765 2425 90 26 14 chr15 23667775 23668124 -79826850 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 353 -4 2 765 6390 144 8 11 chr15 23668127 23669179 -79825795 + IAPEy-int LTR ERVK 10 1058 -6455 2 765 21691 86 2 6 chr15 23669174 23672142 -79822832 + IAPEy-int LTR ERVK 4551 7507 -6 2 765 2262 114 35 3 chr15 23672142 23672485 -79822489 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 4 357 0 2 765 2942 182 70 31 chr15 23672937 23673555 -79821419 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 2 765 3055 71 2 8 chr15 23678637 23679035 -79815939 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 765 1503 194 121 61 chr15 23687910 23688306 -79806668 + MTC LTR MaLR 2 421 0 2 765 1253 232 91 19 chr15 23690803 23690967 -79804007 - ORR1D1 LTR MaLR -31 343 178 2 765 1253 232 91 19 chr15 23691147 23691302 -79803672 - ORR1D1 LTR MaLR -197 177 1 2 765 300 258 0 0 chr15 23691309 23691375 -79803599 - ORR1D1-int LTR MaLR -7 1363 1298 2 765 897 295 129 18 chr15 23691374 23691716 -79803258 - ORR1D1-int LTR MaLR -368 1002 623 2 765 1071 278 31 7 chr15 23691811 23692097 -79802877 - ORR1D1-int LTR MaLR -975 395 103 2 765 2258 184 78 13 chr15 23694568 23695040 -79799934 + RLTR11A LTR ERVK 26 528 0 3 765 241 317 19 38 chr15 23707963 23708068 -79786906 + MTE2b LTR MaLR 269 371 -8 3 765 1153 249 126 0 chr15 23709930 23710255 -79784719 + ORR1D1 LTR MaLR 9 374 0 3 765 377 341 62 79 chr15 23713587 23713894 -79781080 - MTE2a LTR MaLR -31 388 56 3 765 1253 134 34 67 chr15 23716246 23716485 -79778489 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 231 -244 3 765 1447 120 68 36 chr15 23718516 23718766 -79776208 + MT2C_Mm LTR ERVL 218 475 0 3 766 280 381 134 17 chr15 23745791 23746090 -79748884 + ORR1E LTR MaLR 21 354 -5 3 766 554 356 54 83 chr15 23746109 23746253 -79748721 + ORR1E-int LTR MaLR 14 145 -1435 3 766 554 356 54 83 chr15 23746399 23746698 -79748276 + ORR1E-int LTR MaLR 146 444 -1136 3 766 783 319 35 13 chr15 23748043 23748272 -79746702 + MTD LTR MaLR 186 419 0 3 766 3397 38 0 0 chr15 23749910 23750306 -79744668 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 766 565 308 97 67 chr15 23750565 23750938 -79744036 - RMER20A LTR ERVK 0 516 133 3 766 2807 200 32 45 chr15 23751286 23751904 -79743070 + RMER19C LTR ERVK 1 610 -1 3 766 683 250 31 7 chr15 23752149 23752347 -79742627 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 140 3 766 545 227 55 17 chr15 23752566 23752715 -79742259 - ORR1C1 LTR MaLR -244 134 1 3 766 1397 229 90 14 chr15 23753521 23753932 -79741042 + RLTR1B LTR ERV1 54 512 0 3 766 783 177 124 56 chr15 23753932 23754357 -79740617 + RLTR1B-int LTR ERV1 1 515 -7041 3 766 5997 175 56 62 chr15 23754959 23757658 -79737316 + RLTR1B-int LTR ERV1 1081 4273 -790 3 766 418 177 3 14 chr15 23757696 23757830 -79737144 + RLTR1B-int LTR ERV1 3231 3298 -1 3 766 1047 226 201 13 chr15 23757923 23758241 -79736733 + RLTR1B LTR ERV1 135 512 0 3 766 531 316 101 66 chr15 23761521 23761748 -79733226 + MTD LTR MaLR 50 284 -135 3 766 717 252 97 42 chr15 23763679 23763989 -79730985 - RMER10A LTR ERVL -1 441 115 4 766 1023 214 5 23 chr15 23764024 23764244 -79730730 + ORR1B2 LTR MaLR 100 315 -52 4 766 465 341 91 64 chr15 23776085 23776427 -79718547 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 44 4 766 302 296 129 52 chr15 23776838 23777109 -79717865 + LTR65 LTR ERV1 52 343 -326 4 766 1018 232 159 85 chr15 23778693 23779221 -79715753 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 4 766 371 205 69 132 chr15 23781735 23781909 -79713065 + MT2B LTR ERVL 102 264 -320 4 766 274 281 104 0 chr15 23783663 23783759 -79711215 - RLTR42-int LTR ERVK -4153 1369 1264 4 766 284 271 21 0 chr15 23783775 23783871 -79711103 - RLTR42-int LTR ERVK -4318 1204 1107 4 766 3243 51 5 0 chr15 23784695 23785089 -79709885 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 766 1171 252 119 9 chr15 23786978 23787298 -79707676 + MTD LTR MaLR 6 360 -59 4 766 305 343 68 71 chr15 23799322 23799630 -79695344 - MT2A LTR ERVL -212 321 15 4 766 303 353 31 25 chr15 23801410 23801570 -79693404 + LTR16A1 LTR ERVL 296 456 0 4 766 240 206 159 53 chr15 23802876 23802989 -79691985 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -408 179 55 4 766 358 308 0 64 chr15 23803184 23803309 -79691665 + RMER12 LTR ERVK 759 875 -447 4 766 3515 13 2 0 chr15 23815748 23816143 -79678831 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 766 8844 40 6 2 chr15 23816143 23817236 -79677738 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 766 3515 13 2 0 chr15 23817236 23817631 -79677343 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 766 616 271 88 115 chr15 23820478 23820862 -79674112 + ORR1C1 LTR MaLR 1 374 -4 4 766 2860 84 5 10 chr15 23827040 23827438 -79667536 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 766 6395 96 16 136 chr15 23827438 23828686 -79666288 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 766 2354 92 117 6 chr15 23828686 23829046 -79665928 + MTA_Mm LTR MaLR 1 400 0 4 766 628 245 29 89 chr15 23829860 23830118 -79664856 + ORR1E LTR MaLR 114 411 -8 4 766 707 269 70 98 chr15 23835623 23835859 -79659115 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 140 5 766 707 269 70 98 chr15 23836113 23836234 -79658740 - ORR1D1 LTR MaLR -235 139 27 5 766 380 308 105 19 chr15 23838861 23839023 -79655951 + MTD LTR MaLR 229 404 -15 5 766 1497 98 21 8 chr15 23840520 23840756 -79654218 + ORR1A2-int LTR MaLR 1725 1963 0 5 766 1868 156 31 6 chr15 23840756 23841073 -79653901 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 5 766 401 258 11 0 chr15 23842703 23842796 -79652178 + MTC LTR MaLR 9 102 -319 5 766 889 245 48 9 chr15 23843869 23844079 -79650895 + MTC LTR MaLR 199 416 -5 5 766 1138 320 61 26 chr15 23845310 23845734 -79649240 - RMER15 LTR ERVL -109 466 28 5 766 237 318 24 0 chr15 23846288 23846373 -79648601 - MLT1A LTR MaLR -273 101 15 5 766 846 337 37 23 chr15 23854372 23854721 -79640253 - MT2A LTR ERVL -179 354 1 5 95 1345 357 70 48 chr15 23854721 23855766 -79639208 - MTE-int LTR MaLR -455 1125 58 5 767 277 335 100 25 chr15 23864053 23864292 -79630682 - MLT1H-int LTR MaLR -1004 405 149 5 767 762 294 90 64 chr15 23865043 23865388 -79629586 + RLTR18 LTR ERVK 1 354 -262 5 767 414 232 127 38 chr15 23865392 23865549 -79629425 + RLTR18B LTR ERVK 269 439 -73 5 767 417 158 104 10 chr15 23870359 23870455 -79624519 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 423 5 767 741 253 65 15 chr15 23870459 23870660 -79624314 - RLTR11A2 LTR ERVK -260 267 57 5 767 1755 224 35 35 chr15 23870678 23871192 -79623782 - MYSERV-int LTR ERVK -1 6549 6036 5 767 857 246 64 85 chr15 23871188 23871578 -79623396 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -989 1337 956 5 767 876 259 32 18 chr15 23874650 23874870 -79620104 + MTD LTR MaLR 197 419 0 5 767 2617 9 17 83 chr15 23888104 23888454 -79606520 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 327 0 5 767 1106 137 44 19 chr15 23888455 23888719 -79606255 + IAPEz-int LTR ERVK 9 252 -7329 5 767 229 321 0 0 chr15 23888719 23888772 -79606202 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 5 767 4712 94 70 55 chr15 23888772 23889663 -79605311 + IAPEz-int LTR ERVK 168 995 -5486 5 767 1831 88 4 0 chr15 23889725 23889964 -79605010 + IAPEY3-int LTR ERVK 2258 2497 -5183 5 767 2647 131 0 0 chr15 23889963 23890346 -79604628 + IAPEz-int LTR ERVK 4656 5038 -1443 5 767 5968 87 20 2 chr15 23890336 23891147 -79603827 + IAPEz-int LTR ERVK 5655 6479 -2 5 767 2675 23 161 0 chr15 23891149 23891503 -79603471 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 767 1268 180 265 6 chr15 23894579 23894892 -79600082 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 767 226 312 116 61 chr15 23898470 23898634 -79596340 - MTEb LTR MaLR -39 340 168 5 767 236 240 0 0 chr15 23898652 23898702 -79596272 - MTEb LTR MaLR -327 52 3 5 767 2173 122 22 0 chr15 23900198 23900518 -79594456 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 767 1765 163 42 28 chr15 23907960 23908314 -79586660 - RMER17B LTR ERVK -2 956 598 6 767 247 376 68 0 chr15 23909575 23909692 -79585282 - MER89 LTR ERV1 -9 550 426 6 767 559 255 74 12 chr15 23918341 23918504 -79576470 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 189 6 767 308 329 118 19 chr15 23918711 23918872 -79576102 - ORR1D2 LTR MaLR -162 208 32 6 767 529 197 154 0 chr15 23921248 23921365 -79573609 + RLTR11A LTR ERVK 1 135 -393 6 767 1621 158 35 62 chr15 23930444 23930782 -79564192 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 767 473 312 84 5 chr15 23931440 23931630 -79563344 + RMER15 LTR ERVL 355 559 -16 6 767 294 275 56 42 chr15 23933443 23933561 -79561413 - MER57F LTR ERV1 -130 306 185 6 767 1904 191 26 0 chr15 23933561 23933943 -79561031 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 6 767 294 275 56 42 chr15 23933943 23933968 -79561006 - MER57F LTR ERV1 -252 184 161 6 767 274 253 23 11 chr15 23936774 23936862 -79558112 + RLTR15 LTR ERVK 180 268 -91 6 767 300 341 52 100 chr15 23939445 23939676 -79555298 - MLT-int LTR MaLR -72 1663 1444 6 767 1595 185 93 15 chr15 23941214 23941548 -79553426 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 35 6 767 3325 174 5 126 chr15 23941550 23942334 -79552640 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 1275 6 767 4048 231 57 57 chr15 23943159 23944428 -79550546 - ORR1B1-int LTR MaLR -694 1269 1 6 767 1277 231 28 46 chr15 23944432 23944759 -79550215 - ORR1B1 LTR MaLR -8 321 1 6 767 5025 131 44 15 chr15 23955033 23955903 -79539071 - RMER17A2 LTR ERVK -11 895 1 6 767 516 307 288 16 chr15 23972984 23973353 -79521621 + RMER20B LTR ERVK 123 596 -31 7 767 353 285 104 26 chr15 23975130 23975293 -79519681 - MTEa LTR MaLR -3 376 211 7 767 1278 211 40 46 chr15 23983896 23984219 -79510755 + ORR1B1 LTR MaLR 1 321 -8 7 767 1607 151 270 8 chr15 23984223 23984590 -79510384 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 463 -1500 7 95 5965 192 39 126 chr15 23985086 23986745 -79508229 + ORR1B1-int LTR MaLR 450 1963 0 7 768 1610 175 20 84 chr15 23986745 23987122 -79507852 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 7 768 711 243 7 0 chr15 24009678 24009830 -79485144 - RLTR14 LTR ERV1 -227 155 3 1 768 663 161 7 110 chr15 24009850 24010004 -79484970 - RLTR14-int LTR ERV1 0 5317 5180 1 768 410 376 52 6 chr15 24013189 24013363 -79481611 + MER54B LTR ERVL 598 779 -14 2 768 763 344 35 38 chr15 24017122 24017323 -79477651 + MTE2a LTR MaLR 51 253 -126 2 768 763 344 35 38 chr15 24017640 24017755 -79477219 + MTE2a LTR MaLR 254 366 -13 2 768 278 266 94 34 chr15 24019971 24020088 -79474886 + MLT1D LTR MaLR 379 502 -3 3 768 349 186 24 33 chr15 24028859 24028958 -79466016 - MTC LTR MaLR -1 418 323 4 768 1342 189 148 25 chr15 24040744 24040932 -79454042 + RMER17C LTR ERVK 2 184 -226 5 768 1342 189 148 25 chr15 24041011 24041186 -79453788 + RMER17C LTR ERVK 185 409 -1 5 768 669 312 131 21 chr15 24041665 24042002 -79452972 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 5 768 1644 210 65 3 chr15 24047719 24048044 -79446930 + ORR1B1 LTR MaLR 42 386 -8 7 768 2116 114 6 9 chr15 24050727 24051047 -79443927 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 768 1164 265 72 23 chr15 24053197 24053583 -79441391 + MTD LTR MaLR 10 414 -5 7 768 958 281 102 25 chr15 24062231 24062633 -79432341 - MER67C LTR ERV1 -3 708 276 8 768 1589 213 17 39 chr15 24062737 24063098 -79431876 - RLTR15 LTR ERVK -6 353 1 9 768 320 338 145 63 chr15 24063226 24063558 -79431416 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 9 768 1150 339 117 20 chr15 24063702 24064250 -79430724 + MTE-int LTR MaLR 661 1261 -319 9 768 724 334 75 25 chr15 24064282 24064604 -79430370 + MTEa LTR MaLR 37 374 -5 9 768 449 280 8 8 chr15 24064614 24064733 -79430241 + MTE-int LTR MaLR 1261 1379 -201 9 768 231 272 94 26 chr15 24065553 24065661 -79429313 + MTE-int LTR MaLR 1414 1529 -51 9 768 675 333 109 24 chr15 24065661 24065990 -79428984 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 9 768 2952 10 2 155 chr15 24066947 24067405 -79427569 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 768 4638 35 4 0 chr15 24067413 24067982 -79426992 + RLTR10-int LTR ERVK 34 591 -1396 1 768 2076 100 18 30 chr15 24067985 24068314 -79426660 - IAPLTR2b LTR ERVK -2 325 1 1 768 2079 186 96 73 chr15 24072448 24072969 -79422005 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 1 768 300 203 0 0 chr15 24075309 24075368 -79419606 + RLTR42-int LTR ERVK 1547 1605 -3917 1 768 672 232 23 92 chr15 24077175 24077393 -79417581 - ORR1D1 LTR MaLR -171 203 1 1 768 493 340 109 94 chr15 24081716 24082489 -79412485 - RMER13A LTR ERVK -63 797 14 1 768 2155 250 88 63 chr15 24085808 24086765 -79408209 + RMER17B LTR ERVK 1 859 -1 1 768 3754 193 50 65 chr15 24087270 24088185 -79406789 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 768 347 193 11 4 chr15 24089100 24089187 -79405787 + RLTR20B1 LTR ERVK 192 280 -261 1 768 780 290 39 28 chr15 24091690 24092045 -79402929 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 1 768 247 355 67 50 chr15 24095877 24096117 -79398857 - MLT1E LTR MaLR -3 650 407 1 768 267 333 68 8 chr15 24101610 24101728 -79393246 - MLT1D LTR MaLR -367 138 14 1 769 253 301 30 115 chr15 24126665 24126830 -79368144 - RLTR21 LTR ERVK -332 1240 1090 1 769 2465 190 23 13 chr15 24129822 24130345 -79364629 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 769 294 322 81 38 chr15 24130930 24131140 -79363834 - MLT1A LTR MaLR -2 372 154 1 769 1642 158 82 32 chr15 24131787 24132128 -79362846 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 37 1 769 4073 181 66 12 chr15 24132127 24133166 -79361808 - ORR1B1-int LTR MaLR -193 1770 964 1 769 581 241 171 8 chr15 24135384 24135635 -79359339 - ORR1B1-int LTR MaLR -988 975 684 1 769 955 202 89 106 chr15 24142019 24142301 -79352673 + ORR1B1 LTR MaLR 1 277 -117 1 769 527 197 536 5 chr15 24157460 24157652 -79337322 - ORR1C2 LTR MaLR -11 373 80 2 769 411 186 14 0 chr15 24157897 24157967 -79337007 - ORR1C2 LTR MaLR -313 71 1 2 769 1390 254 62 8 chr15 24159968 24160337 -79334637 + MTD LTR MaLR 2 390 -29 2 769 450 308 124 50 chr15 24172010 24172348 -79322626 + RMER5 LTR ERV1 163 525 -9 2 769 824 260 60 47 chr15 24174267 24174649 -79320325 + MER67C LTR ERV1 5 419 -292 2 769 2698 58 0 20 chr15 24176528 24176881 -79318093 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 769 1489 150 109 89 chr15 24182411 24182761 -79312213 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 38 2 769 1520 214 123 70 chr15 24184184 24184687 -79310287 - RLTR20B3 LTR ERVK -43 534 5 2 769 446 365 31 52 chr15 24186019 24186426 -79308548 + MLT1C LTR MaLR 3 467 0 2 769 261 244 109 70 chr15 24189863 24189991 -79304983 + MT2B LTR ERVL 146 278 -323 2 769 290 382 81 48 chr15 24192125 24192521 -79302453 + LTR79 LTR ERVL 65 473 -54 2 769 3338 35 5 0 chr15 24192857 24193251 -79301723 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 769 1460 243 95 7 chr15 24197001 24197423 -79297551 + MT2A LTR ERVL 75 533 0 2 769 342 323 0 10 chr15 24198429 24198529 -79296445 + ORR1E LTR MaLR 1 99 -260 2 769 366 295 11 0 chr15 24198947 24199042 -79295932 + ORR1E LTR MaLR 262 357 -2 2 769 317 70 0 0 chr15 24206057 24206100 -79288874 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 600 2 769 251 150 131 16 chr15 24206077 24206138 -79288836 - RMER17B LTR ERVK -890 68 1 2 769 2533 59 16 3 chr15 24208000 24208322 -79286652 - IAPLTR2b LTR ERVK -1 326 1 2 769 2006 201 71 8 chr15 24208842 24209238 -79285736 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 769 1008 314 19 84 chr15 24211277 24211656 -79283318 - MTE2b LTR MaLR -23 356 3 3 769 1036 224 39 67 chr15 24227435 24227541 -79267433 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 433 3 769 3459 28 2 0 chr15 24227541 24227936 -79267038 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 769 1036 224 39 67 chr15 24227936 24228159 -79266815 - RLTR11A LTR ERVK -96 432 208 3 769 302 289 20 49 chr15 24229116 24229218 -79265756 - RLTR11A LTR ERVK -233 295 197 3 769 3525 18 2 0 chr15 24229397 24229792 -79265182 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 769 1362 289 35 33 chr15 24229902 24230299 -79264675 - MTD LTR MaLR -8 411 14 3 769 349 279 77 47 chr15 24230314 24230483 -79264491 - MTD-int LTR MaLR -3 1255 1082 3 769 777 254 154 26 chr15 24232418 24232510 -79262464 - ORR1D1 LTR MaLR -110 264 165 3 769 777 254 154 26 chr15 24232571 24232712 -79262262 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 1 3 769 659 282 47 14 chr15 24233161 24233373 -79261601 + RLTR45 LTR ERVK 264 482 0 3 769 675 243 140 5 chr15 24233559 24233745 -79261229 + ORR1D2 LTR MaLR 160 370 0 3 769 566 335 24 12 chr15 24235445 24235696 -79259278 + MER67C LTR ERV1 410 663 -48 3 769 4407 20 0 0 chr15 24240031 24240524 -79254450 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 769 44721 18 8 0 chr15 24240549 24245844 -79249130 + MERVL-int LTR ERVL 26 5360 -125 3 769 383 167 46 35 chr15 24245844 24245931 -79249043 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 769 302 0 0 0 chr15 24245931 24245969 -79249005 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 769 4407 20 0 0 chr15 24245969 24246462 -79248512 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 770 2192 94 162 0 chr15 24250927 24251279 -79243695 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 409 -2 3 770 22939 49 23 18 chr15 24251286 24254356 -79240618 + IAPEz-int LTR ERVK 3 3076 -3405 3 770 6188 59 12 16 chr15 24254342 24255190 -79239784 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6473 -8 3 770 2192 94 162 0 chr15 24255197 24255549 -79239425 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 409 -2 3 770 1775 230 22 3 chr15 24255866 24256232 -79238742 + RMER15 LTR ERVL 203 575 0 3 770 1009 289 42 8 chr15 24260534 24260796 -79234178 - MTD LTR MaLR 0 419 149 3 770 652 289 83 86 chr15 24261848 24262196 -79232778 - ORR1E LTR MaLR -12 347 1 3 770 6179 53 18 1 chr15 24265395 24266190 -79228784 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 3 770 325 270 47 13 chr15 24272068 24272218 -79222756 - RLTR15 LTR ERVK -46 313 159 3 770 3229 55 8 0 chr15 24273111 24273508 -79221466 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 770 494 331 175 32 chr15 24276182 24276491 -79218483 - ORR1E LTR MaLR -5 354 2 3 770 1530 166 19 156 chr15 24276611 24276678 -79218296 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 272 4 770 1530 166 19 156 chr15 24277224 24277534 -79217440 - ORR1A4 LTR MaLR -58 271 4 4 770 534 139 0 258 chr15 24277624 24277779 -79217195 - ORR1B1 LTR MaLR -240 154 4 4 770 2324 111 139 2 chr15 24284568 24284991 -79209983 + RLTR47_MM LTR ERV1 52 532 0 4 770 735 225 64 101 chr15 24286378 24286457 -79208517 - RMER10B LTR ERVL -139 259 191 4 770 735 225 64 101 chr15 24286672 24286858 -79208116 - RMER10B LTR ERVL -208 190 4 4 770 1797 168 13 16 chr15 24295030 24295344 -79199630 + ORR1B1 LTR MaLR 74 386 -8 4 770 493 272 8 16 chr15 24303003 24303130 -79191844 - MTEa LTR MaLR -87 292 167 4 770 3854 116 63 33 chr15 24304921 24305650 -79189324 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 4 770 2223 201 54 11 chr15 24312712 24313108 -79181866 + RLTR20B1 LTR ERVK 55 469 -94 4 770 2223 201 54 11 chr15 24313155 24313205 -79181769 + RLTR20B1 LTR ERVK 470 520 -43 4 770 1820 138 24 65 chr15 24314304 24314644 -79180330 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 770 357 312 92 56 chr15 24315428 24315733 -79179241 + RMER10A LTR ERVL 121 436 -6 4 770 958 258 198 52 chr15 24316407 24316902 -79178072 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 4 770 319 109 55 0 chr15 24317081 24317136 -79177838 + RLTR42-int LTR ERVK 2035 2092 -3430 4 770 909 255 31 88 chr15 24317154 24317507 -79177467 + MYSERV6-int LTR ERVK 7172 7504 -1455 4 770 1130 273 72 13 chr15 24323299 24323603 -79171371 + MTEb LTR MaLR 1 322 -57 4 770 313 120 0 20 chr15 24323962 24324013 -79170961 - ORR1B2 LTR MaLR 0 370 321 4 770 942 219 91 17 chr15 24324262 24324494 -79170480 - ORR1B2 LTR MaLR -118 249 1 4 770 2027 187 166 45 chr15 24325263 24325879 -79169095 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 770 2523 117 111 9 chr15 24325912 24326343 -79168631 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 770 332 242 28 83 chr15 24330032 24330140 -79164834 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 515 4 770 664 245 124 19 chr15 24335167 24335393 -79159581 + RLTR11A LTR ERVK 16 248 -329 4 770 1652 233 70 18 chr15 24336204 24336602 -79158372 + MTC LTR MaLR 3 421 0 4 770 2518 59 22 61 chr15 24339226 24339586 -79155388 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 770 1067 191 25 33 chr15 24341113 24341366 -79153608 + RLTR20B3 LTR ERVK 3 246 -288 5 770 522 288 37 16 chr15 24348363 24348591 -79146383 + RMER15 LTR ERVL 29 353 -222 5 770 1452 187 170 16 chr15 24348680 24348940 -79146034 - MTC LTR MaLR 0 421 123 5 770 1452 187 170 16 chr15 24348979 24349083 -79145891 - MTC LTR MaLR -299 122 1 5 770 2241 112 8 101 chr15 24351697 24352093 -79142881 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 5 770 261 336 47 16 chr15 24356125 24356252 -79138722 + MLT1J1 LTR MaLR 231 361 -83 5 770 555 320 88 57 chr15 24357069 24357387 -79137587 - MLT1C LTR MaLR -129 338 11 5 770 673 129 0 0 chr15 24363435 24363535 -79131439 - BGLII LTR ERVK 0 421 322 5 770 1019 138 18 0 chr15 24363535 24363702 -79131272 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 343 5 770 1124 65 13 0 chr15 24363706 24363860 -79131114 - RLTR1B LTR ERV1 -102 410 255 5 770 2171 94 3 0 chr15 24363983 24364301 -79130673 - BGLII LTR ERVK -95 326 8 5 770 894 283 24 36 chr15 24376157 24376406 -79118568 + MTD LTR MaLR 80 325 -94 5 771 359 226 24 94 chr15 24385630 24385757 -79109217 + RMER10B LTR ERVL 274 391 -7 5 771 2023 273 22 47 chr15 24387158 24387780 -79107194 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 10 5 771 2811 191 29 33 chr15 24388796 24389374 -79105600 + RMER6D LTR ERVK 1 576 -144 5 771 286 95 0 0 chr15 24389375 24389417 -79105557 + RLTR12A LTR ERVK 1 42 -526 5 771 2318 197 96 6 chr15 24393637 24394127 -79100847 + RLTR12A LTR ERVK 35 568 0 5 771 824 197 13 7 chr15 24394127 24394275 -79100699 + RMER6D LTR ERVK 572 720 0 5 771 951 242 160 21 chr15 24394597 24394922 -79100052 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 771 985 195 35 55 chr15 24397204 24397640 -79097334 - RMER17C LTR ERVK 0 410 48 5 771 231 318 44 61 chr15 24397671 24397785 -79097189 + RLTR14 LTR ERV1 271 382 0 5 771 4130 170 106 33 chr15 24397847 24398676 -79096298 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 5 771 2215 135 0 0 chr15 24402923 24403250 -79091724 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 771 680 323 63 39 chr15 24403324 24403707 -79091267 + RLTR11B LTR ERVK 3 394 -59 5 771 777 274 149 9 chr15 24403920 24404248 -79090726 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 771 2641 181 68 153 chr15 24405382 24405683 -79089291 + RMER6D LTR ERVK 1 334 -386 5 771 2641 181 68 153 chr15 24405751 24406214 -79088760 + RMER6D LTR ERVK 335 700 -20 5 771 1138 222 20 12 chr15 24406215 24406461 -79088513 + RMER6D LTR ERVK 473 720 0 5 771 236 128 26 0 chr15 24409770 24409809 -79085165 + MLT2D LTR ERVL 1 40 -374 5 771 239 262 115 53 chr15 24417505 24417618 -79077356 + MLT1H2 LTR MaLR 89 208 -281 6 771 1151 296 108 5 chr15 24418180 24418560 -79076414 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 771 877 311 88 129 chr15 24418601 24419586 -79075388 + MT-int LTR MaLR 57 1000 -98 6 771 846 208 30 84 chr15 24419586 24419849 -79075125 - RMER16 LTR ERVK 0 533 285 6 771 254 119 329 43 chr15 24419883 24419953 -79075021 - RMER16 LTR ERVK -230 303 214 6 771 268 129 58 101 chr15 24419926 24419995 -79074979 - RMER16 LTR ERVK -463 70 5 6 771 357 282 60 0 chr15 24419998 24420115 -79074859 + MT-int LTR MaLR 1121 1244 -14 6 771 1037 283 105 3 chr15 24425764 24426069 -79068905 + MTD LTR MaLR 70 405 -14 6 771 249 191 130 14 chr15 24426254 24426323 -79068651 + MTD LTR MaLR 299 375 -44 6 771 767 282 14 54 chr15 24432477 24432698 -79062276 - MTE2a LTR MaLR -1 378 167 6 771 239 327 77 19 chr15 24433311 24433467 -79061507 + MER31A LTR ERV1 118 282 -203 6 771 1143 239 206 38 chr15 24444151 24444638 -79050336 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 2 6 771 3182 233 145 67 chr15 24451451 24452437 -79042537 - MTC-int LTR MaLR -194 1064 2 6 771 1570 242 79 10 chr15 24452441 24452833 -79042141 - MTC LTR MaLR -2 419 1 6 771 1637 201 53 40 chr15 24453693 24454072 -79040902 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 771 1162 260 78 55 chr15 24456704 24457193 -79037781 - MT2B LTR ERVL 0 601 13 6 771 256 340 142 91 chr15 24458081 24458544 -79036430 - MT2A LTR ERVL -11 522 36 6 771 4717 51 3 2 chr15 24458544 24459130 -79035844 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 6 771 4933 171 81 21 chr15 24459397 24460419 -79034555 + RLTR25A LTR ERVK 1 1083 -20 6 771 1069 134 48 5 chr15 24460873 24461060 -79033914 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 138 332 0 6 771 2504 49 61 9 chr15 24462330 24462659 -79032315 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 771 281 355 21 28 chr15 24465317 24465462 -79029512 + MLT1A1 LTR MaLR 256 399 -9 6 771 405 303 147 11 chr15 24465462 24465639 -79029335 + MLT2B1 LTR ERVL 47 247 -273 6 771 674 336 35 15 chr15 24467840 24468100 -79026874 - ERVL-int LTR ERVL -2608 3149 2885 6 771 688 336 47 20 chr15 24468465 24468808 -79026166 - ERVL-int LTR ERVL -3938 1819 1468 6 771 347 250 102 0 chr15 24470023 24470151 -79024823 - ERVL-int LTR ERVL -5106 608 468 6 771 253 214 0 18 chr15 24474386 24474443 -79020531 + MTD LTR MaLR 104 159 -260 6 771 1148 284 29 34 chr15 24474959 24475324 -79019650 + MTD LTR MaLR 24 388 -31 6 771 1148 284 29 34 chr15 24475347 24475367 -79019607 + MTD LTR MaLR 389 406 -13 6 771 2369 87 12 3 chr15 24478477 24478801 -79016173 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 771 1736 207 70 17 chr15 24485054 24485467 -79009507 + RMER10A LTR ERVL 3 437 -5 7 771 602 271 128 12 chr15 24489881 24490129 -79004845 + MTD LTR MaLR 6 285 -134 7 771 1309 267 36 17 chr15 24490446 24490857 -79004117 - MTD LTR MaLR 0 419 1 7 771 2044 262 99 19 chr15 24494536 24495170 -78999804 - MTC-int LTR MaLR -194 1064 380 7 771 590 242 23 149 chr15 24500001 24500215 -78994759 + MT2A LTR ERVL 38 224 -309 1 771 1292 249 56 11 chr15 24501733 24502091 -78992883 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 5 772 2440 68 3 69 chr15 24511087 24511437 -78983537 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 772 387 282 117 78 chr15 24511939 24512170 -78982804 + MLT2B4 LTR ERVL 1 240 -280 2 772 1929 118 31 9 chr15 24512341 24512665 -78982309 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 55 2 772 1836 171 36 124 chr15 24513707 24514208 -78980766 - RMER6C LTR ERVK -28 662 206 2 772 851 126 0 34 chr15 24514820 24514968 -78980006 + RMER6C LTR ERVK 442 584 -106 3 772 271 258 0 16 chr15 24515482 24515545 -78979429 - MTE2a LTR MaLR -261 118 57 3 772 300 329 33 0 chr15 24525839 24525960 -78969014 + MLT1B LTR MaLR 261 462 -5 5 772 699 303 52 33 chr15 24530754 24531024 -78963950 - MTEb LTR MaLR -2 377 103 5 772 305 355 54 9 chr15 24531241 24531352 -78963622 - MTEb LTR MaLR -263 116 1 5 772 1146 190 46 40 chr15 24535968 24536312 -78958662 + RLTR10E LTR ERVK 1 360 -5 6 772 2447 181 147 17 chr15 24537617 24538203 -78956771 + RMER6C LTR ERVK 2 663 -27 7 772 2824 104 10 7 chr15 24543225 24543631 -78951343 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 772 1951 161 71 25 chr15 24543631 24544025 -78950949 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 412 -686 7 772 857 240 29 5 chr15 24545144 24545353 -78949621 + MTC LTR MaLR 2 215 -206 7 772 2146 80 10 0 chr15 24545353 24545641 -78949333 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 37 8 772 767 294 92 4 chr15 24545752 24545991 -78948983 + MTC LTR MaLR 162 421 0 8 772 242 222 0 31 chr15 24547442 24547507 -78947467 - MLT1A1 LTR MaLR -345 63 1 8 772 1693 157 30 56 chr15 24550024 24550362 -78944612 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 9 772 1307 247 87 20 chr15 24551137 24551530 -78943444 + MTD LTR MaLR 1 419 0 9 772 362 254 75 23 chr15 24556355 24556488 -78938486 - RLTR15 LTR ERVK -214 145 6 1 772 2797 53 41 26 chr15 24566749 24567139 -78927835 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 772 895 256 143 47 chr15 24570074 24570238 -78924736 - RMER5 LTR ERV1 -42 492 324 1 772 2665 70 75 3 chr15 24570238 24570609 -78924365 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 1 772 895 256 143 47 chr15 24570609 24570871 -78924103 - RMER5 LTR ERV1 -211 323 25 1 772 940 199 227 99 chr15 24579275 24579711 -78915263 + RMER6C LTR ERVK 1 492 -198 1 772 766 179 18 43 chr15 24580455 24580618 -78914356 + ORR1B2 LTR MaLR 118 276 -91 1 772 253 304 74 68 chr15 24582496 24582644 -78912330 + MER34A LTR ERV1 190 338 -233 1 772 305 297 125 137 chr15 24591011 24591362 -78903612 + LTR16C LTR ERVL 141 487 -2 1 772 313 389 54 54 chr15 24591780 24592133 -78902841 + ORR1E LTR MaLR 7 359 0 1 772 3042 71 5 8 chr15 24592150 24592547 -78902427 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 772 431 328 67 33 chr15 24636406 24636575 -78858399 - MLT1E1A LTR MaLR -73 607 430 1 772 255 342 80 45 chr15 24636640 24636839 -78858135 - MLT1E1A LTR MaLR -446 208 3 1 773 741 197 0 0 chr15 24644083 24644210 -78850764 + ORR1C1 LTR MaLR 169 295 -83 1 773 560 376 122 36 chr15 24647627 24648048 -78846926 - MLT1E2 LTR MaLR -9 618 159 1 773 1088 242 54 0 chr15 24649066 24649306 -78845668 - MTC LTR MaLR -166 255 3 1 773 436 273 70 36 chr15 24653309 24653519 -78841455 - MTD-int LTR MaLR -930 328 112 1 773 549 264 29 70 chr15 24655268 24655439 -78839535 - MTD-int LTR MaLR -1094 164 1 1 773 667 236 165 72 chr15 24655439 24655724 -78839250 - MTD LTR MaLR 0 419 109 1 773 1799 128 41 109 chr15 24664354 24664794 -78830180 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 773 296 298 178 66 chr15 24678838 24679143 -78815831 + ORR1E LTR MaLR 11 369 -1 2 773 400 262 162 51 chr15 24684438 24684691 -78810283 - LTR50 LTR ERVL -503 292 12 2 773 492 254 103 0 chr15 24701434 24701560 -78793414 - ORR1D1 LTR MaLR -235 139 1 2 773 1744 203 81 10 chr15 24710115 24710508 -78784466 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 773 4326 171 39 105 chr15 24711737 24711848 -78783126 - RMER19B LTR ERVK 0 902 793 2 773 4326 171 39 105 chr15 24712396 24713249 -78781725 - RMER19B LTR ERVK -110 792 3 2 773 327 240 37 83 chr15 24719254 24719272 -78775702 + ORR1A3-int LTR MaLR 601 613 -1350 2 773 1358 207 306 7 chr15 24719272 24719680 -78775294 + MT2B LTR ERVL 1 530 -71 2 773 1890 121 69 9 chr15 24725613 24725946 -78769028 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 70 2 773 1553 271 32 12 chr15 24728472 24728876 -78766098 - MTD LTR MaLR -2 417 6 2 773 265 372 56 20 chr15 24740065 24740260 -78754714 + MLT1C LTR MaLR 193 394 -73 2 773 468 349 53 66 chr15 24740255 24740559 -78754415 - MLT1B LTR MaLR -22 368 69 2 773 813 269 109 26 chr15 24744597 24744937 -78750037 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 3 773 1961 175 207 57 chr15 24745084 24745512 -78749462 + RMER6C LTR ERVK 1 466 -224 3 773 1961 175 207 57 chr15 24745725 24745890 -78749084 + RMER6C LTR ERVK 487 689 -1 3 773 1766 226 54 23 chr15 24748505 24748895 -78746079 - MTD LTR MaLR 0 419 18 3 773 1231 282 76 84 chr15 24751496 24752112 -78742862 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 3 773 583 365 68 15 chr15 24755195 24755532 -78739442 + MLT1A0 LTR MaLR 11 365 0 3 773 234 253 47 81 chr15 24757745 24757831 -78737143 - MER50B LTR ERV1 -523 174 92 3 773 1630 152 11 107 chr15 24759427 24759877 -78735097 + RMER17C LTR ERVK 1 407 -3 3 773 1346 212 150 53 chr15 24759882 24760370 -78734604 + RMER17C-int LTR ERVK 2 536 -2702 3 773 570 300 84 29 chr15 24768358 24768730 -78726244 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 774 1930 92 15 0 chr15 24773856 24774128 -78720846 - MTB_Mm LTR MaLR -131 276 1 3 774 1501 232 13 29 chr15 24775852 24776230 -78718744 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 3 774 491 280 157 36 chr15 24776296 24776633 -78718341 + MTEb LTR MaLR 2 379 0 3 774 3609 331 54 28 chr15 24776633 24777863 -78717111 + MTEb-int LTR MaLR 1 1271 -309 3 774 4119 58 0 12 chr15 24777863 24778372 -78716602 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 3 774 3500 332 54 28 chr15 24778372 24778650 -78716324 + MTEb-int LTR MaLR 1272 1549 -31 3 774 1595 176 57 91 chr15 24781053 24781460 -78713514 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 3 774 2993 75 2 2 chr15 24782458 24782857 -78712117 + MTB LTR MaLR 2 400 0 3 774 320 226 58 23 chr15 24785186 24785272 -78709702 + MTE2a LTR MaLR 1 89 -330 3 774 2195 232 31 105 chr15 24785276 24785913 -78709061 + RMER19C LTR ERVK 1 590 -21 3 774 718 277 81 58 chr15 24785918 24786228 -78708746 + MTE2a LTR MaLR 63 379 0 3 774 338 341 151 51 chr15 24800207 24800559 -78694415 + MLT1F-int LTR MaLR 1023 1488 -1 3 774 593 159 473 0 chr15 24803604 24803811 -78691163 - ORR1B2 LTR MaLR -46 321 17 3 774 1054 112 265 43 chr15 24803900 24804134 -78690840 - RMER6C LTR ERVK -399 291 6 3 774 1074 322 50 8 chr15 24804711 24805087 -78689887 - MTD LTR MaLR -15 404 13 3 774 2821 53 12 0 chr15 24813121 24813463 -78681511 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 774 609 232 302 3 chr15 24819600 24819899 -78675075 - MTD LTR MaLR -31 388 1 4 774 3183 48 5 2 chr15 24821380 24821775 -78673199 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 774 611 312 102 35 chr15 24826231 24826329 -78668645 - MER70A LTR ERVL -9 463 368 4 774 3220 21 42 0 chr15 24826329 24826709 -78668265 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 774 9349 24 2 1 chr15 24826711 24827806 -78667168 - MTA_Mm-int LTR MaLR -2 1096 1 4 774 3220 21 42 0 chr15 24827806 24828186 -78666788 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 774 611 312 102 35 chr15 24828186 24828309 -78666665 - MER70A LTR ERVL -105 367 224 4 774 2389 104 3 0 chr15 24828728 24829054 -78665920 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 774 300 333 33 20 chr15 24838670 24838820 -78656154 - MLT2D LTR ERVL -226 188 37 4 774 438 330 35 60 chr15 24839405 24839605 -78655369 - ORR1E LTR MaLR -2 357 163 4 774 552 333 11 11 chr15 24839703 24839724 -78655250 - ORR1E LTR MaLR -168 191 171 4 774 552 333 11 11 chr15 24839836 24840005 -78654969 - ORR1E LTR MaLR -189 170 2 4 774 257 240 38 51 chr15 24842837 24842916 -78652058 + MLT1A0 LTR MaLR 15 92 -282 4 774 308 324 0 29 chr15 24843591 24843696 -78651278 + MLT1A0 LTR MaLR 93 194 -171 4 774 254 401 33 104 chr15 24847489 24847759 -78647215 + LTR40a LTR ERVL 150 400 -119 4 774 239 359 70 6 chr15 24849153 24849310 -78645664 + MLT1D LTR MaLR 1 167 -338 4 774 310 271 110 39 chr15 24849654 24849762 -78645212 + MLT1D LTR MaLR 336 452 -53 4 774 731 93 12 20 chr15 24862485 24862614 -78632360 + MTB_Mm LTR MaLR 1 129 -292 4 774 770 91 9 0 chr15 24869671 24869781 -78625193 + MT2B2 LTR ERVL 474 584 0 5 774 15419 146 41 38 chr15 24869781 24872075 -78622899 + MERVL-int LTR ERVL 1 2322 -3163 5 774 15419 117 96 14 chr15 24872664 24874160 -78620814 + MERVL-int LTR ERVL 2323 3919 -1566 5 774 448 38 0 0 chr15 24874158 24874211 -78620763 + MERVL-int LTR ERVL 4447 4499 -986 5 774 3066 61 5 8 chr15 24874212 24874609 -78620365 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 774 4467 181 10 36 chr15 24874718 24875329 -78619645 - RMER13B LTR ERVK -58 850 246 5 774 3404 25 5 0 chr15 24875329 24875723 -78619251 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 774 4467 181 10 36 chr15 24875723 24875983 -78618991 - RMER13B LTR ERVK -663 245 1 5 774 2149 177 53 38 chr15 24877538 24877990 -78616984 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 5 774 1810 169 3 59 chr15 24880421 24880761 -78614213 + RMER13B LTR ERVK 1 321 -587 5 774 2982 83 2 10 chr15 24884539 24884942 -78610032 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 774 425 263 35 9 chr15 24888111 24888226 -78606748 - ORR1D2 LTR MaLR -153 217 100 5 774 523 331 156 19 chr15 24895424 24895732 -78599242 + MLT1A0 LTR MaLR 15 364 -1 5 774 1072 268 54 11 chr15 24898272 24898623 -78596351 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 5 775 1027 250 121 43 chr15 24904299 24904646 -78590328 - MTEb LTR MaLR -5 374 1 5 775 793 209 98 16 chr15 24905218 24905412 -78589562 - ORR1C1 LTR MaLR -3 375 166 5 775 513 247 141 13 chr15 24905596 24905752 -78589222 - ORR1C1 LTR MaLR -188 186 11 5 775 382 289 71 13 chr15 24910804 24910958 -78584016 - MLT1E2 LTR MaLR -390 237 75 5 775 285 325 88 82 chr15 24920178 24920349 -78574625 - LTR16B1 LTR ERVL 0 480 309 5 775 287 291 11 75 chr15 24920393 24920486 -78574488 + ORR1E LTR MaLR 1 87 -272 5 775 2178 259 124 27 chr15 24921043 24921821 -78573153 - RMER13A LTR ERVK -76 784 1 5 775 836 271 154 3 chr15 24924882 24925201 -78569773 + MTEb LTR MaLR 1 367 -12 5 775 3144 289 86 132 chr15 24925208 24925294 -78569680 + MTEb-int LTR MaLR 16 99 -1481 5 775 3144 289 86 132 chr15 24925347 24926600 -78568374 + MTEb-int LTR MaLR 100 1266 -314 5 775 3144 289 86 132 chr15 24926638 24926930 -78568044 + MTEb-int LTR MaLR 1267 1571 -9 5 775 778 255 75 0 chr15 24926938 24927138 -78567836 + MTEb LTR MaLR 1 215 -164 5 775 232 239 109 43 chr15 24927163 24927255 -78567719 + MTEb LTR MaLR 282 379 0 5 775 1894 106 43 31 chr15 24927941 24928041 -78566933 + ORR1A2 LTR MaLR 1 100 -227 5 775 1894 106 43 31 chr15 24928437 24928659 -78566315 + ORR1A2 LTR MaLR 101 325 -2 5 775 981 298 41 32 chr15 24929922 24930265 -78564709 - ORR1E LTR MaLR -9 350 5 5 775 389 353 105 29 chr15 24931808 24932085 -78562889 - MLT1J2 LTR MaLR -78 370 73 5 775 685 339 52 73 chr15 24932089 24932458 -78562516 - MLT1E1A LTR MaLR -9 671 311 5 775 3664 60 20 6 chr15 24939917 24940406 -78554568 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 6 775 2779 105 8 5 chr15 24941293 24941695 -78553279 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 6 775 391 125 27 14 chr15 24941696 24941769 -78553205 - MMETn-int LTR ERVK -2 7404 7331 6 775 2881 188 20 43 chr15 24941980 24942920 -78552054 - MMETn-int LTR ERVK -1703 3141 2539 6 775 8262 182 72 27 chr15 24944734 24947385 -78547589 - ETnERV2-int LTR ERVK -2082 5162 812 6 775 994 117 81 5 chr15 24947387 24947585 -78547389 - ETnERV2-int LTR ERVK -6119 1287 1075 6 775 941 257 35 66 chr15 24947604 24948000 -78546974 - ETnERV2-int LTR ERVK -2928 386 3 6 775 2803 112 5 2 chr15 24948002 24948404 -78546570 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 6 775 1947 154 28 12 chr15 24952567 24952637 -78542337 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 252 6 775 1947 154 28 12 chr15 24952995 24953246 -78541728 - ORR1A2 LTR MaLR -76 251 1 6 775 941 148 64 35 chr15 24961498 24961701 -78533273 + RMER6A LTR ERVK 345 553 -203 6 775 1964 183 84 110 chr15 24964705 24965252 -78529722 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 6 775 3661 56 29 4 chr15 24966517 24967001 -78527973 + LTRIS2 LTR ERV1 69 564 0 6 775 817 317 119 29 chr15 24967258 24967602 -78527372 - MTE2b LTR MaLR -2 377 3 6 775 244 382 60 15 chr15 24975927 24976060 -78518914 + LTR78 LTR ERV1 1063 1201 -103 6 775 2705 31 47 0 chr15 24981242 24981564 -78513410 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 775 19580 40 47 14 chr15 24981564 24984141 -78510833 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2670 -3811 6 775 8994 20 2 6 chr15 24984122 24985205 -78509769 + IAPEz-int LTR ERVK 5403 6481 0 6 775 2692 34 47 0 chr15 24985205 24985527 -78509447 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 6 775 490 324 41 122 chr15 24988295 24988615 -78506359 - ORR1E LTR MaLR -65 294 1 6 775 1286 230 37 61 chr15 25001621 25001755 -78493219 + ORR1D1 LTR MaLR 1 131 -243 3 775 1286 230 37 61 chr15 25001778 25002022 -78492952 + ORR1D1 LTR MaLR 132 370 -4 3 775 785 268 44 59 chr15 25004668 25004938 -78490036 + MTEa LTR MaLR 114 379 0 1 775 6871 64 5 0 chr15 25009941 25010820 -78484154 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 11 2 775 2575 78 140 156 chr15 25016868 25017388 -78477586 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 775 10507 39 62 2 chr15 25017388 25018754 -78476220 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 1853 2 775 232 397 111 53 chr15 25018887 25019246 -78475728 - MLT1F2 LTR MaLR -146 414 35 2 775 1778 200 104 82 chr15 25028190 25028642 -78466332 - MT2A LTR ERVL -71 462 1 4 775 496 351 62 95 chr15 25029238 25029575 -78465399 + LTR16A LTR ERVL 30 355 -96 4 776 2988 62 17 0 chr15 25036371 25036774 -78458200 + BGLII LTR ERVK 12 421 0 4 776 1360 191 25 216 chr15 25054021 25054377 -78440597 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 123 6 776 2579 101 20 139 chr15 25054377 25054916 -78440058 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 6 776 1360 191 25 216 chr15 25054916 25055032 -78439942 - ORR1C2 LTR MaLR -262 122 2 6 776 298 318 102 53 chr15 25070611 25070877 -78424097 - LTR33A_ LTR ERVL -13 507 229 9 776 338 353 58 26 chr15 25071239 25071393 -78423581 - LTR33A_ LTR ERVL -355 176 18 9 776 390 255 198 46 chr15 25080100 25080263 -78414711 - MTE2b LTR MaLR 0 379 186 1 776 264 309 85 73 chr15 25080327 25080424 -78414550 - MTE2b LTR MaLR -194 185 93 1 776 345 285 153 111 chr15 25082350 25082638 -78412336 + MLT1A0 LTR MaLR 3 302 -63 1 776 445 151 11 9 chr15 25089747 25089839 -78405135 - MTB LTR MaLR -1 406 308 1 776 2202 70 92 3 chr15 25095827 25096141 -78398833 - MTB LTR MaLR -58 342 1 1 776 247 150 0 0 chr15 25096538 25096578 -78398396 - MT2B2 LTR ERVL -1 583 544 1 776 732 259 55 128 chr15 25096640 25096985 -78397989 - MT2B LTR ERVL -281 320 1 1 776 653 175 18 61 chr15 25096985 25097149 -78397825 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5605 1 776 270 143 0 0 chr15 25097134 25097176 -78397798 - MERVL_2A-int LTR ERVL -71 5690 5649 1 776 11527 168 68 8 chr15 25097162 25097942 -78397032 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3511 2250 1411 1 776 2537 70 37 22 chr15 25097942 25098264 -78396710 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 776 11527 168 68 8 chr15 25098264 25099606 -78395368 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4351 1410 1 1 776 1176 169 102 60 chr15 25099606 25099921 -78395053 - MT2B LTR ERVL 0 601 274 1 776 935 177 93 16 chr15 25099944 25100166 -78394808 - MTC-int LTR MaLR -1311 269 2 1 776 1305 188 20 8 chr15 25100165 25100412 -78394562 - MTC LTR MaLR 0 421 172 1 776 1731 159 95 30 chr15 25103938 25104275 -78390699 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 9 1 776 1731 43 0 0 chr15 25107002 25107213 -78387761 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 186 1 776 435 0 0 0 chr15 25107211 25107261 -78387713 + MT2_Mm LTR ERVL 444 493 0 1 776 702 225 24 9 chr15 25112237 25112448 -78382526 + RLTR19-int LTR ERVK 1929 2142 -3380 1 776 2449 251 63 84 chr15 25112431 25113802 -78381172 + RLTR19-int LTR ERVK 2338 3680 -2457 1 776 272 171 56 28 chr15 25113996 25114068 -78380906 + RLTR19-int LTR ERVK 4025 4098 -2039 1 776 1026 269 113 51 chr15 25118552 25118905 -78376069 - MTE2a LTR MaLR -4 375 1 1 776 1612 249 30 10 chr15 25134561 25134966 -78360008 + MTD LTR MaLR 4 416 -3 1 776 473 205 9 35 chr15 25138284 25138400 -78356574 - LTR40b LTR ERVL -5 514 402 1 776 564 382 31 8 chr15 25138409 25138665 -78356309 - LTR40b LTR ERVL -171 291 30 1 776 5578 87 30 10 chr15 25143015 25143807 -78351167 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 1 776 757 215 105 19 chr15 25146991 25147200 -78347774 + MTD LTR MaLR 193 419 0 1 776 1244 294 43 13 chr15 25147201 25147594 -78347380 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 776 1769 182 125 11 chr15 25149275 25149626 -78345348 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 1 776 1776 177 58 55 chr15 25149812 25150177 -78344797 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 13 1 776 868 246 48 97 chr15 25162531 25162762 -78332212 - RLTR11B LTR ERVK -41 412 195 2 776 868 246 48 97 chr15 25162808 25162902 -78332072 - RLTR11B LTR ERVK -259 194 97 2 776 2250 114 15 3 chr15 25162902 25163235 -78331739 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 776 868 246 48 97 chr15 25163235 25163341 -78331633 - RLTR11B LTR ERVK -357 96 2 2 777 446 312 53 48 chr15 25171960 25172169 -78322805 - RLTR42-int LTR ERVK -4124 1398 1189 2 777 1997 125 3 0 chr15 25172627 25172923 -78322051 - ORR1A2 LTR MaLR -30 297 1 2 777 1061 255 55 49 chr15 25175350 25175697 -78319277 - ORR1E LTR MaLR -6 353 5 2 777 435 379 22 11 chr15 25184803 25184982 -78309992 - LTR16B1 LTR ERVL -285 195 15 2 777 1158 256 116 38 chr15 25193026 25193424 -78301550 + RLTR20B3 LTR ERVK 93 521 -56 2 777 632 282 117 16 chr15 25195117 25195460 -78299514 - MTD LTR MaLR -13 406 1 2 777 612 299 71 17 chr15 25197183 25197421 -78297553 - MER57F LTR ERV1 -6 430 180 2 777 498 308 58 114 chr15 25202341 25202718 -78292256 - MLT1C LTR MaLR -5 385 30 2 777 377 332 136 45 chr15 25209372 25209593 -78285381 + MTEb LTR MaLR 43 283 -96 2 777 2383 133 75 79 chr15 25209615 25210121 -78284853 + RLTR28 LTR ERVL 1 504 -20 2 777 582 319 89 101 chr15 25211612 25212038 -78282936 - MLT1F2 LTR MaLR -25 535 115 2 777 1073 258 124 27 chr15 25212330 25212661 -78282313 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 5 2 777 319 171 12 62 chr15 25224128 25224209 -78270765 + MLT2C1 LTR ERVL 150 226 -171 3 777 236 348 108 29 chr15 25225226 25225430 -78269544 - MLT2C2 LTR ERVL -233 231 12 3 777 267 264 8 109 chr15 25228460 25228579 -78266395 - LTR33A LTR ERVL -1 519 413 3 777 232 295 58 72 chr15 25228692 25228831 -78266143 - LTR33A LTR ERVL -288 215 79 3 777 326 287 103 48 chr15 25233509 25233674 -78261300 + MLT1D LTR MaLR 305 478 -27 3 777 269 103 0 0 chr15 25234698 25234737 -78260237 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1065 3 777 798 238 88 14 chr15 25235461 25235678 -78259296 - RLTR25B LTR ERVK -175 853 621 3 777 2567 185 53 22 chr15 25241822 25242365 -78252609 - RLTR25B LTR ERVK -468 560 1 3 777 1426 208 58 23 chr15 25244165 25244221 -78250753 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 314 3 777 1426 208 58 23 chr15 25244248 25244535 -78250439 - ORR1D2 LTR MaLR -57 313 13 3 777 331 340 50 31 chr15 25247002 25247163 -78247811 + MLT1F2 LTR MaLR 331 494 -66 3 777 385 232 10 50 chr15 25249021 25249121 -78245853 + MTE2b LTR MaLR 1 96 -283 3 777 2207 185 82 10 chr15 25262252 25262739 -78232235 + RMER5 LTR ERV1 13 534 0 3 777 589 306 60 90 chr15 25267563 25267897 -78227077 - ORR1E LTR MaLR -10 349 26 3 777 1340 252 61 25 chr15 25274302 25274664 -78220310 - MTE2b LTR MaLR -2 377 3 4 777 1204 253 97 34 chr15 25275760 25276141 -78218833 - MTD LTR MaLR -14 405 1 4 778 1018 174 102 14 chr15 25297655 25297871 -78197103 + ORR1D1 LTR MaLR 137 371 -3 4 778 1413 157 123 29 chr15 25310014 25310182 -78184792 + RMER17C LTR ERVK 2 194 -216 4 778 1413 157 123 29 chr15 25310362 25310567 -78184407 + RMER17C LTR ERVK 195 410 0 4 778 525 273 120 17 chr15 25332898 25333073 -78161901 + MLT1B LTR MaLR 1 193 -197 4 778 755 227 108 33 chr15 25333091 25333305 -78161669 + MTEb LTR MaLR 1 230 -149 4 778 291 329 47 14 chr15 25333295 25333443 -78161531 + MLT1B LTR MaLR 222 374 -16 4 778 2313 162 42 7 chr15 25349498 25349903 -78145071 + MTC LTR MaLR 3 421 0 4 778 2627 164 73 4 chr15 25351549 25352039 -78142935 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 4 778 2726 176 50 57 chr15 25352436 25352493 -78142481 - RMER15 LTR ERVL 0 575 508 4 778 3198 71 28 0 chr15 25352493 25352889 -78142085 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 778 2726 176 50 57 chr15 25352889 25353410 -78141564 - RMER15 LTR ERVL -68 507 2 4 778 2964 149 25 12 chr15 25353785 25354302 -78140672 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 5 778 2769 147 8 23 chr15 25357667 25358148 -78136826 + RMER6A LTR ERVK 86 559 -197 5 778 253 369 33 13 chr15 25360674 25360825 -78134149 + MLT1I LTR MaLR 59 212 -199 5 778 683 308 132 50 chr15 25362920 25363262 -78131712 + MTE2a LTR MaLR 1 370 -9 5 778 3172 52 10 17 chr15 25363495 25363905 -78131069 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 778 314 324 108 35 chr15 25368661 25368984 -78125990 - MLT1C LTR MaLR -6 461 90 5 778 910 334 75 6 chr15 25371869 25372218 -78122756 + MLT1C LTR MaLR 91 463 -4 5 778 1009 168 31 5 chr15 25378145 25378336 -78116638 + ORR1D1 LTR MaLR 177 372 -2 5 778 226 247 114 34 chr15 25379419 25379507 -78115467 + ORR1E-int LTR MaLR 1363 1457 -335 5 778 285 308 24 40 chr15 25380935 25381060 -78113914 - MLT1L LTR MaLR -1 609 487 5 778 286 352 106 32 chr15 25382532 25382720 -78112254 + ORR1E LTR MaLR 1 202 -157 5 778 2306 178 48 71 chr15 25386090 25386184 -78108790 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 429 5 778 2306 178 48 71 chr15 25386213 25386655 -78108319 - RLTR24 LTR ERV1 -101 428 7 5 778 3424 42 0 5 chr15 25392856 25393265 -78101709 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 778 1620 187 67 9 chr15 25394775 25394936 -78100038 + ORR1D1 LTR MaLR 1 163 -211 5 778 1620 187 67 9 chr15 25394980 25395164 -78099810 + ORR1D1 LTR MaLR 164 366 -8 5 778 683 283 90 38 chr15 25397117 25397445 -78097529 + MLT1B LTR MaLR 1 347 -43 5 778 683 283 90 38 chr15 25397472 25397510 -78097464 + MLT1B LTR MaLR 348 385 -5 5 778 517 163 0 32 chr15 25400487 25400582 -78094392 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 293 5 778 225 286 58 67 chr15 25402362 25402482 -78092492 + MLT1A0 LTR MaLR 1 119 -246 5 778 791 196 72 90 chr15 25402815 25403129 -78091845 - RLTR20C LTR ERVK -293 275 1 5 778 247 333 32 0 chr15 25406824 25406947 -78088027 - MLT1A LTR MaLR -3 546 420 6 778 708 178 65 7 chr15 25407013 25407166 -78087808 - ORR1D1 LTR MaLR -212 162 1 6 778 1505 147 96 63 chr15 25407666 25408001 -78086973 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 6 778 1898 111 15 68 chr15 25409110 25409449 -78085525 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 6 778 451 300 98 85 chr15 25409858 25409994 -78084980 - MLT1A LTR MaLR -17 357 211 6 778 1744 108 17 110 chr15 25409994 25410349 -78084625 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 778 451 300 98 85 chr15 25410349 25410540 -78084434 - MLT1A LTR MaLR -164 210 26 6 778 456 265 161 60 chr15 25410574 25410892 -78084082 - ORR1E LTR MaLR -14 365 1 6 778 2591 166 10 0 chr15 25414847 25415264 -78079710 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 778 2686 30 0 0 chr15 25417154 25417492 -78077482 + ORR1A0 LTR MaLR 1 338 -8 6 778 2135 122 0 15 chr15 25423917 25424249 -78070725 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 779 923 264 91 30 chr15 25435914 25436253 -78058721 + MTEa LTR MaLR 20 379 0 6 779 2776 119 117 2 chr15 25441361 25442124 -78052850 - RMER17B LTR ERVK -69 889 1 6 779 296 244 48 24 chr15 25444595 25444679 -78050295 + MTEb LTR MaLR 294 379 0 6 779 3052 247 45 41 chr15 25445631 25446325 -78048649 - ORR1C1-int LTR MaLR -391 979 294 6 779 3052 247 45 41 chr15 25446462 25446742 -78048232 - ORR1C1-int LTR MaLR -1077 293 1 6 779 1318 167 192 3 chr15 25446748 25447055 -78047919 - ORR1C1 LTR MaLR -10 368 4 6 779 1073 214 12 16 chr15 25447486 25447738 -78047236 + ORR1C1 LTR MaLR 1 251 -127 6 779 607 310 27 40 chr15 25449923 25450148 -78044826 + ORR1E LTR MaLR 1 222 -137 6 779 425 284 155 16 chr15 25451731 25451965 -78043009 - MLT1C LTR MaLR -71 319 53 6 779 975 167 92 12 chr15 25452061 25452310 -78042664 + RMER17C LTR ERVK 142 410 0 6 779 2851 36 145 0 chr15 25456563 25456922 -78038052 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 6 779 485 298 98 60 chr15 25457512 25457830 -78037144 + ORR1E LTR MaLR 25 354 -5 6 779 445 277 81 50 chr15 25458582 25458780 -78036194 + MTE-int LTR MaLR 414 617 -963 6 779 330 291 67 113 chr15 25460043 25460326 -78034648 + ORR1E LTR MaLR 88 357 -2 6 779 2500 78 19 0 chr15 25462275 25462595 -78032379 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 7 779 705 136 8 0 chr15 25462816 25462934 -78032040 + MTC LTR MaLR 169 287 -134 7 779 3140 75 20 2 chr15 25463847 25464247 -78030727 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 779 4273 144 76 20 chr15 25464387 25465319 -78029655 + RMER17B LTR ERVK 5 958 0 7 779 907 39 19 19 chr15 25474123 25474281 -78020693 - RMER17B LTR ERVK -495 463 306 7 779 1217 257 20 26 chr15 25475323 25475666 -78019308 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 25 7 779 2996 153 25 6 chr15 25478355 25478869 -78016105 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 7 779 284 256 0 60 chr15 25482722 25482805 -78012169 - MLT1A1 LTR MaLR -308 100 23 7 779 438 274 161 92 chr15 25484385 25484904 -78010070 + RMER20B LTR ERVK 29 596 -31 7 779 306 245 30 50 chr15 25487930 25488029 -78006945 - ORR1E LTR MaLR -239 120 24 7 779 880 254 91 20 chr15 25488837 25489171 -78005803 - MTD LTR MaLR -6 353 1 7 779 2247 148 40 13 chr15 25500264 25500660 -77994314 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 779 729 239 150 72 chr15 25500781 25500896 -77994078 - MTE2a LTR MaLR -4 375 241 3 779 729 239 150 72 chr15 25500948 25501179 -77993795 - MTE2a LTR MaLR -139 240 3 3 779 1202 244 65 120 chr15 25501717 25502085 -77992889 + ORR1E LTR MaLR 10 357 -2 9 779 494 241 59 74 chr15 25503026 25503228 -77991746 + LTR52 LTR ERVL 1 199 -222 1 779 523 294 159 22 chr15 25503425 25503745 -77991229 + MLT1A0 LTR MaLR 1 364 -1 1 779 1141 191 226 19 chr15 25505798 25506108 -77988866 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 779 234 255 118 39 chr15 25508598 25508700 -77986274 + MT2B2 LTR ERVL 99 208 -376 2 779 1442 216 18 26 chr15 25513049 25513392 -77981582 - RLTR15 LTR ERVK -19 340 1 2 779 1450 225 54 78 chr15 25518705 25518853 -77976121 - MTD LTR MaLR -5 414 253 4 779 1450 225 54 78 chr15 25519063 25519079 -77975895 - MTD LTR MaLR -167 252 239 4 779 1450 225 54 78 chr15 25519110 25519368 -77975606 - MTD LTR MaLR -181 238 1 4 779 505 251 155 6 chr15 25523553 25523721 -77971253 - ORR1D1 LTR MaLR -24 350 158 5 779 3420 111 189 5 chr15 25523845 25524415 -77970559 - RLTR33 LTR ERVK -3 675 1 5 779 513 262 117 18 chr15 25524600 25524622 -77970352 - ORR1D1 LTR MaLR -182 188 166 5 779 679 197 31 4 chr15 25524794 25524942 -77970032 - ORR1D1 LTR MaLR -205 165 1 5 779 310 278 93 0 chr15 25528761 25528858 -77966116 - MLT1D LTR MaLR -37 468 363 6 779 344 333 16 16 chr15 25529469 25529591 -77965383 + MLT1I LTR MaLR 246 367 -44 7 779 3426 35 2 0 chr15 25529769 25530164 -77964810 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 779 1712 73 4 21 chr15 25530181 25530418 -77964556 - MTB LTR MaLR -167 233 1 7 779 897 227 6 22 chr15 25535698 25535713 -77959261 + MTD LTR MaLR 1 15 -404 8 779 897 263 109 52 chr15 25535753 25536092 -77958882 + MTD LTR MaLR 16 400 -7 8 779 473 272 83 73 chr15 25541141 25541359 -77953615 - MLT1B LTR MaLR -7 383 164 9 779 267 273 79 20 chr15 25543306 25543407 -77951567 + MTEa LTR MaLR 273 379 0 1 779 2293 15 0 0 chr15 25543550 25543819 -77951155 + MT-int LTR MaLR 756 1024 -74 1 779 306 224 17 0 chr15 25546071 25546129 -77948845 - ORR1D2 LTR MaLR -286 84 26 1 779 913 266 138 0 chr15 25546125 25546400 -77948574 + ORR1D2 LTR MaLR 17 329 -41 1 779 286 134 106 35 chr15 25547105 25547126 -77947848 + ORR1D2 LTR MaLR 334 356 -18 1 780 1741 169 145 0 chr15 25564652 25564990 -77929984 - MTC LTR MaLR -34 387 1 1 780 995 273 93 21 chr15 25568353 25568686 -77926288 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 1 780 1725 157 82 65 chr15 25577813 25578181 -77916793 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 780 1091 188 175 31 chr15 25579701 25579992 -77914982 - MTD LTR MaLR 0 419 87 1 780 1911 201 30 42 chr15 25582217 25582643 -77912331 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 780 332 268 30 30 chr15 25584406 25584506 -77910468 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 308 1 780 566 209 357 44 chr15 25590046 25590325 -77904649 - ORR1D1 LTR MaLR -4 366 1 1 780 380 209 11 34 chr15 25591723 25591812 -77903162 - MTE2b LTR MaLR -54 325 239 1 780 854 240 6 0 chr15 25591836 25592007 -77902967 - MTE2b LTR MaLR -207 172 1 1 780 623 232 73 77 chr15 25598322 25598569 -77896405 - ORR1D2 LTR MaLR -124 246 1 2 780 718 296 86 39 chr15 25604629 25604991 -77889983 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 2 780 525 316 128 77 chr15 25605674 25605989 -77888985 + MLT1A LTR MaLR 25 373 -1 2 780 983 254 113 41 chr15 25610384 25610729 -77884245 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 780 508 248 94 21 chr15 25626667 25626876 -77868098 - MTD LTR MaLR -164 243 3 2 780 560 263 44 38 chr15 25634168 25634424 -77860550 - MLT1E2 LTR MaLR -143 484 300 2 780 2156 110 62 12 chr15 25638665 25639005 -77855969 - ORR1B2 LTR MaLR -10 357 1 2 780 474 317 86 5 chr15 25642597 25642784 -77852190 - MLT1B LTR MaLR -156 234 33 2 780 545 258 57 25 chr15 25647596 25647755 -77847219 - MER57A-int LTR ERV1 -204 5983 5820 3 780 901 284 94 113 chr15 25667959 25668319 -77826655 - RMER5 LTR ERV1 -12 522 129 3 780 901 284 94 113 chr15 25668467 25668638 -77826336 - RMER5 LTR ERV1 -406 128 1 3 780 259 280 47 47 chr15 25685624 25685639 -77809335 - MT2B LTR ERVL -364 237 152 3 781 1847 178 56 46 chr15 25696137 25696531 -77798443 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 4 781 591 253 16 48 chr15 25710486 25710673 -77784301 - MLT1B LTR MaLR -200 190 10 4 781 2083 156 85 13 chr15 25718062 25718439 -77776535 - MTB_Mm LTR MaLR -3 404 1 4 781 1707 209 88 8 chr15 25719854 25720239 -77774735 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 4 781 244 176 115 125 chr15 25731302 25731384 -77763590 - MLT1G1 LTR MaLR -379 200 118 4 781 244 176 115 125 chr15 25731462 25731483 -77763491 - MLT1G1 LTR MaLR -462 117 98 4 781 903 254 121 103 chr15 25743755 25744158 -77750816 - RMER4A LTR ERVK -4 462 62 5 781 903 254 121 103 chr15 25744209 25744243 -77750731 - RMER4A LTR ERVK -405 61 18 5 781 3733 199 97 51 chr15 25744636 25744942 -77750032 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 661 5 781 3733 168 119 25 chr15 25745079 25745578 -77749396 - RLTR25A LTR ERVK -443 660 137 5 781 3733 168 119 25 chr15 25745627 25745743 -77749231 - RLTR25A LTR ERVK -967 136 1 5 781 248 83 28 0 chr15 25749237 25749273 -77745701 - MLT1H LTR MaLR 0 549 513 5 781 553 203 117 14 chr15 25749307 25749452 -77745522 - MTEb LTR MaLR -21 358 199 5 781 327 260 52 0 chr15 25749463 25749540 -77745434 - MTEb LTR MaLR -225 154 74 5 781 315 319 108 112 chr15 25750016 25750274 -77744700 - MLT1H LTR MaLR -292 257 1 5 781 2975 139 30 51 chr15 25750374 25750965 -77744009 - RMER6C LTR ERVK 0 690 112 5 781 298 321 105 18 chr15 25751343 25751560 -77743414 + MLT1G1 LTR MaLR 2 248 -307 5 781 343 299 170 7 chr15 25751762 25751897 -77743077 + MLT1G1 LTR MaLR 422 578 -1 5 781 338 260 94 0 chr15 25752133 25752229 -77742745 + MLT1G1-int LTR MaLR 333 437 -1052 5 781 365 351 20 7 chr15 25753255 25753404 -77741570 + HERV16-int LTR ERVL 1724 1874 -3122 5 781 812 263 162 26 chr15 25754359 25754664 -77740310 + MTD LTR MaLR 35 393 -28 5 781 440 207 0 12 chr15 25755486 25755569 -77739405 - ORR1D2 LTR MaLR -182 188 107 5 781 251 105 0 26 chr15 25755573 25755612 -77739362 - ORR1D2 LTR MaLR -226 144 107 5 781 229 105 0 26 chr15 25755616 25755655 -77739319 - ORR1D2 LTR MaLR -226 144 107 5 781 251 105 0 26 chr15 25755659 25755698 -77739276 - ORR1D2 LTR MaLR -226 144 107 5 781 257 79 0 26 chr15 25755702 25755741 -77739233 - ORR1D2 LTR MaLR -226 144 107 5 781 604 211 6 107 chr15 25755745 25755904 -77739070 - ORR1D2 LTR MaLR -226 144 2 5 781 621 328 97 31 chr15 25756331 25756818 -77738156 + MLT2B1 LTR ERVL 1 519 -1 5 781 230 247 34 80 chr15 25758137 25758225 -77736749 + MTE2a LTR MaLR 281 364 -15 5 781 1166 253 63 114 chr15 25759291 25759336 -77735638 - MT2A LTR ERVL -8 525 488 5 781 1166 253 63 114 chr15 25759365 25759872 -77735102 - MT2A LTR ERVL -46 487 1 5 781 1317 263 29 12 chr15 25761006 25761418 -77733556 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 781 3215 68 18 0 chr15 25763656 25764056 -77730918 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 781 330 203 103 22 chr15 25764529 25764665 -77730309 + RMER10A LTR ERVL 258 404 -38 5 781 352 379 14 0 chr15 25764884 25765024 -77729950 + MTE-int LTR MaLR 518 659 -921 5 781 719 346 93 47 chr15 25765666 25766288 -77728686 + MER21B LTR ERV1 126 776 -87 5 781 1097 264 83 30 chr15 25767228 25767567 -77727407 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 14 5 781 365 224 50 37 chr15 25767650 25767789 -77727185 + MLT1A1 LTR MaLR 302 450 -17 5 781 1904 146 38 144 chr15 25777344 25777768 -77717206 - ORR1B1 LTR MaLR -15 379 1 5 781 1727 146 62 101 chr15 25778971 25779103 -77715871 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 244 5 781 1727 146 62 101 chr15 25779212 25779467 -77715507 - ORR1D1 LTR MaLR -131 243 4 5 781 304 250 0 0 chr15 25781519 25781575 -77713399 + MERVK26-int LTR ERVK 6863 6918 -1 5 781 2649 212 125 69 chr15 25781577 25782391 -77712583 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 5 781 1148 221 193 7 chr15 25783195 25783496 -77711478 + ORR1D2 LTR MaLR 1 357 -13 5 781 310 276 101 36 chr15 25784834 25784973 -77710001 + MLT1A1 LTR MaLR 259 406 -2 5 781 586 335 6 6 chr15 25786427 25786607 -77708367 + MLT1A0 LTR MaLR 80 259 -106 5 781 410 271 177 147 chr15 25788942 25788998 -77705976 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 346 5 781 410 271 177 147 chr15 25789204 25789508 -77705466 - MLT1A1 LTR MaLR -63 345 19 5 781 1123 261 53 38 chr15 25794121 25794460 -77700514 - MTEb LTR MaLR 0 379 36 6 781 235 119 143 0 chr15 25795261 25795303 -77699671 - MTEb LTR MaLR -323 56 9 6 781 1336 274 153 49 chr15 25800246 25800937 -77694037 + MTD LTR MaLR 6 418 -1 6 781 307 277 69 91 chr15 25805216 25805391 -77689583 + MLT1B LTR MaLR 178 348 -42 6 781 265 315 11 11 chr15 25805621 25805714 -77689260 + MLT1A0 LTR MaLR 266 358 -7 6 781 1695 229 23 6 chr15 25817189 25817536 -77677438 + MTC LTR MaLR 1 353 -68 6 781 2792 81 71 0 chr15 25817752 25818146 -77676828 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 6 781 932 204 32 11 chr15 25818310 25818498 -77676476 - MTEb LTR MaLR -29 350 159 6 782 258 348 120 18 chr15 25821685 25821852 -77673122 - MLT1D LTR MaLR -5 462 279 6 782 453 295 103 21 chr15 25821863 25822057 -77672917 - MLT1D LTR MaLR -242 263 54 6 782 1647 115 20 206 chr15 25829866 25830370 -77664604 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 782 1264 188 63 9 chr15 25831005 25831322 -77663652 - RMER17C LTR ERVK 0 410 77 6 782 820 181 81 34 chr15 25831307 25831542 -77663432 - RMER17C LTR ERVK -164 246 1 6 782 397 239 208 21 chr15 25831779 25831971 -77663003 + MLT1D LTR MaLR 15 242 -263 6 782 3343 30 18 0 chr15 25832136 25832529 -77662445 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 782 310 250 44 67 chr15 25835418 25835508 -77659466 - ORR1E LTR MaLR -268 91 4 6 782 286 268 88 66 chr15 25836005 25836141 -77658833 - MLT1A LTR MaLR -11 363 225 6 782 851 272 124 59 chr15 25837509 25838187 -77656787 - RMER13A LTR ERVK -19 841 98 6 782 348 222 33 81 chr15 25838593 25838733 -77656241 - MLT-int LTR MaLR -19 1716 1609 6 782 636 287 25 0 chr15 25841355 25841512 -77653462 - MTE2b LTR MaLR -216 163 3 6 782 385 274 74 149 chr15 25841579 25841875 -77653099 - ORR1E LTR MaLR -5 354 81 6 782 3148 51 13 0 chr15 25842915 25843305 -77651669 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 6 782 313 336 29 79 chr15 25847193 25847332 -77647642 + MLT1A LTR MaLR 34 165 -209 7 782 2081 211 134 16 chr15 25854350 25854841 -77640133 - RMER15 LTR ERVL 0 575 27 7 782 701 260 79 51 chr15 25855623 25855838 -77639136 - ORR1D2 LTR MaLR -149 221 1 7 782 364 341 47 0 chr15 25858872 25859001 -77635973 + MLT2C2 LTR ERVL 19 153 -311 7 782 450 227 33 84 chr15 25861490 25861602 -77633372 + MLT1A1 LTR MaLR 236 367 -41 7 782 2007 143 136 11 chr15 25861602 25861976 -77632998 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 782 450 214 28 90 chr15 25861976 25862023 -77632951 + MLT1A1 LTR MaLR 368 407 -1 7 782 296 307 78 10 chr15 25864385 25864487 -77630487 - MLT1A0 LTR MaLR -225 140 32 7 782 237 350 41 16 chr15 25868286 25868408 -77626566 + MLT1B LTR MaLR 70 194 -196 7 782 644 370 78 28 chr15 25881489 25881925 -77613049 + MLT1J LTR MaLR 12 469 -43 7 782 616 271 36 99 chr15 25883512 25883733 -77611241 - MTE2a LTR MaLR -172 207 1 7 782 994 229 67 78 chr15 25900479 25900688 -77594286 - MTEb LTR MaLR 0 379 160 7 782 994 229 67 78 chr15 25900834 25900998 -77593976 - MTEb LTR MaLR -220 159 10 7 782 556 294 32 18 chr15 25905619 25905837 -77589137 + RMER15 LTR ERVL 336 556 -19 7 782 785 64 36 0 chr15 25909024 25909134 -77585840 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 283 7 782 565 37 25 0 chr15 25909135 25909216 -77585758 - MT-int LTR MaLR -1015 83 1 7 782 3720 64 15 2 chr15 25909218 25909687 -77585287 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 7 782 479 56 0 14 chr15 25910279 25910352 -77584622 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 404 8 782 336 350 159 30 chr15 25912182 25912415 -77582559 + MLT1F LTR MaLR 204 466 -82 8 782 483 319 62 59 chr15 25915897 25916187 -77578787 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 118 8 782 1282 211 141 3 chr15 25929955 25930274 -77564700 - MTD LTR MaLR -56 363 1 8 782 367 323 24 72 chr15 25930275 25930442 -77564532 + MTE-int LTR MaLR 904 1062 -447 8 782 349 325 90 24 chr15 25930547 25930802 -77564172 + MLT1G3 LTR MaLR 104 375 -220 8 782 335 270 167 7 chr15 25933492 25933630 -77561344 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 206 8 782 273 215 102 30 chr15 25933728 25933811 -77561163 - MLT1A0 LTR MaLR -316 92 1 8 782 1357 337 114 45 chr15 25933892 25934856 -77560118 - MLT1A1-int LTR MaLR -487 1248 218 8 782 373 223 105 18 chr15 25934871 25934985 -77559989 - MLT1A1-int LTR MaLR -1584 151 28 8 782 345 247 51 10 chr15 25935017 25935115 -77559859 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 307 8 782 292 377 49 12 chr15 25937941 25938105 -77556869 + LTR16A LTR ERVL 271 440 -11 8 782 324 295 32 0 chr15 25938401 25938496 -77556478 + HERV16-int LTR ERVL 332 429 -4567 8 782 263 224 0 17 chr15 25939960 25940019 -77554955 + MTEa LTR MaLR 320 377 -2 8 782 267 333 67 20 chr15 25940054 25940204 -77554770 + HERV16-int LTR ERVL 1741 1897 -3099 8 782 312 356 70 21 chr15 25940372 25940656 -77554318 + HERV16-int LTR ERVL 2094 2391 -2605 8 782 2225 162 63 2 chr15 25941377 25941774 -77553200 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 782 232 281 56 0 chr15 25942755 25942844 -77552130 + LTR16A LTR ERVL 239 332 -119 8 782 751 249 124 19 chr15 25948043 25948301 -77546673 - MLT2D LTR ERVL -129 285 1 8 782 804 239 68 26 chr15 25948913 25949166 -77545808 + ORR1D2 LTR MaLR 63 345 -25 8 782 255 246 75 83 chr15 25949344 25949477 -77545497 + RLTR20A LTR ERVK 90 221 -320 8 782 1128 236 144 65 chr15 25949683 25950217 -77544757 - RMER4B LTR ERVK -9 576 1 8 783 563 329 141 19 chr15 25956108 25956585 -77538389 + MER90a LTR ERV1 6 540 -74 8 783 2233 84 62 0 chr15 25956991 25957299 -77537675 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 783 650 306 113 27 chr15 25957363 25957699 -77537275 - MTEa LTR MaLR -9 370 6 8 783 638 269 134 38 chr15 25958310 25958630 -77536344 + MTD LTR MaLR 1 351 -68 8 783 1489 204 58 52 chr15 25959314 25959696 -77535278 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 8 783 312 295 44 9 chr15 25959854 25959967 -77535007 - MLT1A LTR MaLR -15 359 243 8 783 1282 147 9 4 chr15 25960612 25960837 -77534137 + MTC LTR MaLR 196 421 0 8 783 248 182 0 52 chr15 25960847 25960905 -77534069 - MLT1A LTR MaLR -301 73 19 8 783 420 274 56 25 chr15 25962178 25962339 -77532635 + MLT1B LTR MaLR 207 372 -18 8 783 2421 151 62 0 chr15 25962630 25963020 -77531954 + MTC LTR MaLR 5 418 -3 9 783 3132 177 50 58 chr15 25963022 25964142 -77530832 + MTC-int LTR MaLR 1 1227 -31 9 783 832 225 91 36 chr15 25964179 25964400 -77530574 - MTEa LTR MaLR -125 254 22 9 783 492 159 0 21 chr15 25965429 25965525 -77529449 + MTC-int LTR MaLR 497 590 -668 9 783 339 297 53 23 chr15 25967293 25967424 -77527550 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 258 9 783 549 242 53 24 chr15 25967930 25968099 -77526875 - MLT1A1 LTR MaLR -230 178 5 9 783 380 295 71 33 chr15 25968693 25968875 -77526099 - ORR1E LTR MaLR -170 189 1 9 783 651 145 206 6 chr15 25970334 25970494 -77524480 + RMER4B LTR ERVK 55 246 -339 9 783 374 269 44 91 chr15 25970538 25970796 -77524178 + RMER4B LTR ERVK 375 601 -10 9 783 243 200 16 62 chr15 25973567 25973631 -77521343 + MLT2D LTR ERVL 3 63 -351 9 783 685 305 50 23 chr15 25973710 25973972 -77521002 + MLT2D LTR ERVL 91 359 -55 9 783 2296 133 37 22 chr15 25976975 25977382 -77517592 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 783 5793 163 109 19 chr15 25977387 25978539 -77516435 + MTC-int LTR MaLR 2 1257 -1 9 783 636 163 282 1 chr15 25978555 25978739 -77516235 + MTC LTR MaLR 33 265 -154 9 783 2515 179 20 42 chr15 25979940 25980493 -77514481 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 9 783 673 221 107 65 chr15 25984594 25984650 -77510324 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 977 9 783 2676 113 139 0 chr15 25984650 25985117 -77509857 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 9 783 673 221 107 65 chr15 25985117 25985321 -77509653 - RLTR25B LTR ERVK -52 976 757 9 783 3737 180 48 62 chr15 25985507 25986379 -77508595 - RLTR25A LTR ERVK -243 860 1 9 783 934 296 30 0 chr15 25987821 25988125 -77506849 - MLT1B LTR MaLR -71 319 7 9 783 341 306 55 42 chr15 25989692 25990016 -77504958 + MER34-int LTR ERV1 4671 4854 -3353 9 783 320 339 62 42 chr15 25990392 25990700 -77504274 + MER34-int LTR ERV1 5714 6027 -1064 9 783 1035 317 49 66 chr15 25991016 25991654 -77503320 + RodERV21-int LTR ERV1 2925 3551 -1440 9 783 1361 255 26 16 chr15 25991661 25992039 -77502935 + RodERV21-int LTR ERV1 4412 4793 -198 9 783 665 257 99 66 chr15 25994926 25995259 -77499715 + ORR1E LTR MaLR 1 344 -15 9 783 960 306 136 10 chr15 25997747 25998233 -77496741 + MLT1F LTR MaLR 2 548 0 9 783 837 234 140 44 chr15 25998899 25999220 -77495754 - ORR1E LTR MaLR -5 354 3 9 783 409 317 45 97 chr15 26000295 26000585 -77494389 + ORR1D2 LTR MaLR 86 360 -10 1 783 2601 59 15 61 chr15 26001454 26001797 -77493177 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 783 297 314 83 6 chr15 26003636 26003793 -77491181 - MER34 LTR ERV1 -65 477 309 8 783 235 262 0 0 chr15 26004076 26004137 -77490837 - MTEa LTR MaLR -3 376 316 9 783 1164 284 49 21 chr15 26004358 26004646 -77490328 - MTEa LTR MaLR -52 327 32 9 783 1082 295 38 71 chr15 26005374 26005742 -77489232 - ORR1E LTR MaLR -2 357 2 1 783 787 182 16 78 chr15 26007852 26008043 -77486931 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 3 1 783 3290 12 3 0 chr15 26010978 26011323 -77483651 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 783 1650 228 72 11 chr15 26020412 26020771 -77474203 - RLTR18B LTR ERVK -11 501 121 2 783 440 164 0 0 chr15 26020771 26020844 -77474130 - RLTR18B LTR ERVK -238 274 202 2 783 849 269 46 10 chr15 26021017 26021248 -77473726 - RLTR18B LTR ERVK -383 233 1 2 783 566 178 219 0 chr15 26021252 26021398 -77473576 + ORR1D1 LTR MaLR 189 366 -8 2 783 388 308 106 65 chr15 26057224 26057539 -77437435 + RMER20B LTR ERVK 163 480 -380 5 783 639 308 36 4 chr15 26058195 26058420 -77436554 + MLT1A1 LTR MaLR 177 408 0 5 783 1506 194 65 54 chr15 26058467 26058837 -77436137 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 783 779 303 105 37 chr15 26059432 26059639 -77435335 + LTR55 LTR ERV 1 222 -326 6 783 779 303 105 37 chr15 26059716 26059909 -77435065 + LTR55 LTR ERV 223 428 -120 6 783 2971 81 18 2 chr15 26060614 26061008 -77433966 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 783 1020 271 27 146 chr15 26061492 26061902 -77433072 - MTE2a LTR MaLR -18 361 1 6 783 563 253 50 114 chr15 26063066 26063267 -77431707 + MLT1A LTR MaLR 1 188 -186 6 783 260 299 52 59 chr15 26063402 26063555 -77431419 + MLT1B LTR MaLR 5 156 -234 6 783 246 208 183 61 chr15 26064567 26064649 -77430325 - MER21B LTR ERV1 -107 756 665 7 783 498 328 119 31 chr15 26064717 26065010 -77429964 - MER21B LTR ERV1 -511 352 34 7 783 228 237 32 48 chr15 26065278 26065340 -77429634 + ORR1E LTR MaLR 1 61 -298 7 783 295 250 53 80 chr15 26066588 26066701 -77428273 + MER34 LTR ERV1 377 501 -70 7 783 294 262 35 70 chr15 26068219 26068334 -77426640 - MTEb LTR MaLR -23 356 246 8 783 251 323 73 0 chr15 26068398 26068494 -77426480 - MTEb LTR MaLR -253 121 19 8 783 2786 348 83 41 chr15 26068488 26068662 -77426312 - MTEb-int LTR MaLR -28 1552 1362 8 783 2786 348 83 42 chr15 26068709 26070015 -77424959 - MTEb-int LTR MaLR -219 1361 2 8 783 557 273 244 13 chr15 26070018 26070326 -77424648 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 8 783 278 261 43 11 chr15 26072038 26072131 -77422843 - MLT1E2 LTR MaLR -377 250 155 8 783 852 318 52 22 chr15 26073784 26074147 -77420827 - MLT1A LTR MaLR 0 374 1 8 784 327 345 38 33 chr15 26090853 26091036 -77403938 - LTR79 LTR ERVL -19 508 325 1 784 1610 154 29 114 chr15 26093304 26093655 -77401319 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 1 784 2440 173 33 63 chr15 26093655 26094166 -77400808 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1509 1014 1 784 2040 156 125 0 chr15 26094150 26094573 -77400401 - ORR1A4-int LTR MaLR -770 1193 718 1 784 472 301 51 23 chr15 26097964 26098141 -77396833 - RMER15 LTR ERVL -47 528 347 1 784 610 251 126 75 chr15 26109157 26109452 -77385522 - RLTR11A2 LTR ERVK -199 329 1 1 784 2669 51 0 6 chr15 26109855 26110189 -77384785 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 1 784 628 292 44 22 chr15 26126735 26126917 -77368057 + ORR1D2 LTR MaLR 1 186 -184 1 784 3192 74 0 2 chr15 26126947 26127355 -77367619 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 784 1856 195 102 0 chr15 26133076 26133450 -77361524 - MTC LTR MaLR 0 421 10 1 784 331 324 117 18 chr15 26142153 26142376 -77352598 + MLT1C LTR MaLR 38 282 -185 1 784 287 341 179 35 chr15 26143631 26143999 -77350975 - MLT1D LTR MaLR 0 505 85 1 784 1325 182 47 14 chr15 26144148 26144426 -77350548 + RMER12 LTR ERVK 1 287 -1035 1 784 868 266 106 102 chr15 26145314 26145842 -77349132 + RLTR22_Mur LTR ERVK 267 796 -1052 1 784 404 216 65 43 chr15 26145934 26146026 -77348948 + RMER12 LTR ERVK 988 1081 -241 1 784 635 223 145 35 chr15 26146234 26146245 -77348729 + RMER12 LTR ERVK 1096 1105 -217 1 784 635 223 145 35 chr15 26146439 26146627 -77348347 + RMER12 LTR ERVK 1106 1317 -5 1 784 823 195 77 6 chr15 26146972 26147142 -77347832 + ORR1D1 LTR MaLR 8 189 -185 1 784 906 202 62 48 chr15 26147293 26147501 -77347473 + ORR1D1 LTR MaLR 164 374 0 1 784 1110 297 107 22 chr15 26148048 26148061 -77346913 - MLT2B2 LTR ERVL -64 451 439 1 784 1110 297 107 22 chr15 26148116 26148515 -77346459 - MLT2B2 LTR ERVL -77 438 4 1 784 645 279 117 114 chr15 26152645 26153021 -77341953 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 1 784 377 342 60 26 chr15 26155171 26155487 -77339487 - ORR1E LTR MaLR 0 379 20 1 784 415 322 79 35 chr15 26155488 26155855 -77339119 - LTR37B LTR ERV1 -28 440 58 1 784 3272 29 37 0 chr15 26157043 26157425 -77337549 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 784 250 375 16 8 chr15 26158087 26158208 -77336766 + MER34A LTR ERV1 4 125 -446 1 784 622 325 43 118 chr15 26158982 26159355 -77335619 + MLT1C LTR MaLR 44 388 -2 1 784 1653 222 31 92 chr15 26163478 26163623 -77331351 - MTD LTR MaLR 0 419 309 2 784 1653 222 31 92 chr15 26164351 26164651 -77330323 - MTD LTR MaLR -111 308 1 2 784 1492 280 28 6 chr15 26167077 26167436 -77327538 + MTD LTR MaLR 18 384 -35 2 784 613 256 49 24 chr15 26168885 26168977 -77325997 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 490 2 784 976 257 67 59 chr15 26169044 26169412 -77325562 - RLTR20C LTR ERVK -89 489 1 2 784 277 256 108 32 chr15 26185818 26185911 -77309063 - MLT1G3 LTR MaLR -250 345 246 2 784 3201 48 8 15 chr15 26195712 26196100 -77298874 + MTB LTR MaLR 1 390 -10 2 784 3201 48 8 15 chr15 26196269 26196280 -77298694 + MTB LTR MaLR 391 397 -3 2 784 579 320 65 17 chr15 26197075 26197270 -77297704 + MTEb LTR MaLR 8 230 -149 2 784 2321 89 24 32 chr15 26197270 26197641 -77297333 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 784 579 276 119 34 chr15 26197641 26197776 -77297198 + MTEb LTR MaLR 231 378 -1 2 784 1879 140 50 3 chr15 26207075 26207377 -77287597 + MTC LTR MaLR 1 316 -105 2 785 230 374 40 16 chr15 26216860 26216985 -77277989 - MLT1H1 LTR MaLR -138 417 290 2 785 3106 131 217 2 chr15 26217535 26218093 -77276881 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 2 785 1723 157 85 38 chr15 26218347 26218520 -77276454 + ORR1C2 LTR MaLR 1 165 -219 2 785 1723 157 85 38 chr15 26218600 26218791 -77276183 + ORR1C2 LTR MaLR 166 382 -2 2 785 568 271 73 72 chr15 26219349 26219724 -77275250 + MTD LTR MaLR 9 405 -14 2 785 233 329 33 73 chr15 26221250 26221401 -77273573 - MLT1N2 LTR MaLR -14 548 404 2 785 491 346 85 79 chr15 26221695 26222149 -77272825 + MLT1F2 LTR MaLR 76 649 -4 2 785 395 318 84 28 chr15 26222378 26222556 -77272418 - MER21B LTR ERV1 -128 735 548 2 785 241 290 107 29 chr15 26222671 26222774 -77272200 - MER21B LTR ERV1 -492 371 261 2 785 402 253 54 11 chr15 26222777 26222869 -77272105 - MER21B LTR ERV1 -739 124 29 2 785 322 372 106 63 chr15 26227918 26228713 -77266261 - LTR78 LTR ERV1 -203 1101 273 2 785 1419 232 71 12 chr15 26229764 26230104 -77264870 + ORR1D2 LTR MaLR 1 360 -10 2 785 250 145 31 46 chr15 26231272 26231337 -77263637 - RMER16-int LTR ERVK -4718 688 625 3 785 1842 147 168 25 chr15 26234295 26234616 -77260358 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 785 297 361 47 0 chr15 26244195 26244342 -77250632 - MLT1H LTR MaLR -347 202 46 3 785 1424 279 98 26 chr15 26251488 26252110 -77242864 + MTEb-int LTR MaLR 829 1580 0 3 785 278 274 55 0 chr15 26252110 26252183 -77242791 + MTEb LTR MaLR 1 77 -302 3 785 813 270 68 0 chr15 26252194 26252326 -77242648 + MTEb LTR MaLR 143 274 -105 3 785 1149 284 45 45 chr15 26252326 26252702 -77242272 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 3 785 813 270 68 0 chr15 26252702 26252791 -77242183 + MTEb LTR MaLR 275 378 -1 3 785 913 310 50 28 chr15 26253134 26253587 -77241387 + MLT2B4 LTR ERVL 42 499 -57 3 785 522 359 85 40 chr15 26255014 26255342 -77239632 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 23 3 785 2116 150 56 22 chr15 26258619 26258817 -77236157 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 248 3 785 2116 150 56 22 chr15 26258932 26259142 -77235832 - RLTR11B LTR ERVK -206 247 31 3 785 316 236 52 41 chr15 26264148 26264245 -77230729 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 412 3 785 3508 35 2 10 chr15 26274548 26274947 -77220027 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 785 4469 48 4 0 chr15 26279305 26279806 -77215168 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 3 785 593 288 26 0 chr15 26282339 26282492 -77212482 - MTE2b LTR MaLR -14 365 209 3 785 281 265 35 105 chr15 26282528 26282642 -77212332 - MTE2b LTR MaLR -273 106 1 3 785 299 336 42 126 chr15 26283152 26283319 -77211655 - LTR33 LTR ERVL -265 250 98 3 785 1240 296 43 28 chr15 26283700 26284093 -77210881 - MTD LTR MaLR -20 399 1 3 785 277 333 79 24 chr15 26288491 26288617 -77206357 - MLT1C LTR MaLR -49 418 286 3 785 387 287 42 42 chr15 26289872 26290014 -77204960 - MLT1H LTR MaLR 0 549 408 3 785 346 269 69 110 chr15 26292460 26292706 -77202268 + ORR1E LTR MaLR 81 316 -43 3 785 1228 280 12 57 chr15 26292713 26293126 -77201848 - MTE2a LTR MaLR -5 374 5 3 785 377 368 60 20 chr15 26297341 26297593 -77197381 + MTEb-int LTR MaLR 908 1169 -411 3 785 232 287 67 84 chr15 26297592 26297638 -77197336 + MTEb-int LTR MaLR 1291 1330 -179 3 785 362 298 74 67 chr15 26297721 26297898 -77197076 + MTEb-int LTR MaLR 1331 1538 -42 3 785 253 275 90 108 chr15 26298118 26298285 -77196689 + MTEb LTR MaLR 207 379 0 3 785 397 317 111 82 chr15 26298337 26298653 -77196321 - MER21B LTR ERV1 -64 799 475 3 785 518 371 37 23 chr15 26298809 26299027 -77195947 - MER21B LTR ERV1 -630 233 13 3 785 2235 144 108 13 chr15 26301771 26302143 -77192831 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 785 1149 296 58 31 chr15 26310628 26310650 -77184324 - MTE2b LTR MaLR 0 379 358 4 785 1149 296 58 31 chr15 26310672 26311008 -77183966 - MTE2b LTR MaLR -22 357 12 4 785 3264 288 140 37 chr15 26311012 26312444 -77182530 - MTE2b-int LTR MaLR 0 1580 2 4 785 846 241 106 94 chr15 26312447 26312664 -77182310 - MTE2b LTR MaLR 0 379 160 4 785 846 241 106 94 chr15 26312694 26312796 -77182178 - MTE2b LTR MaLR -220 159 56 4 785 253 188 99 165 chr15 26320309 26320430 -77174544 + MER65D LTR ERV1 12 124 -349 4 785 229 271 34 45 chr15 26334312 26334401 -77160573 + MTEb LTR MaLR 269 356 -23 4 785 356 320 75 45 chr15 26334569 26334703 -77160271 - MLT1B LTR MaLR -19 389 251 4 785 518 335 64 15 chr15 26343814 26344078 -77150896 + MLT1C LTR MaLR 191 467 0 4 786 2305 89 79 11 chr15 26348751 26349105 -77145869 + MTB LTR MaLR 23 400 0 4 786 244 248 65 105 chr15 26353420 26353573 -77141401 - RLTR22_Mur LTR ERVK -394 1454 1308 4 786 1049 251 92 78 chr15 26364990 26365348 -77129626 + MTEa LTR MaLR 15 377 -2 4 786 371 262 114 30 chr15 26366397 26366615 -77128359 - MLT1C LTR MaLR 0 467 172 4 786 336 283 49 77 chr15 26366974 26367245 -77127729 + ORR1E LTR MaLR 4 269 -101 4 786 389 313 67 70 chr15 26370968 26371401 -77123573 + MLT2B4 LTR ERVL 1 520 0 5 786 265 309 55 41 chr15 26377446 26377591 -77117383 - MLT1A1 LTR MaLR -256 152 6 5 786 809 187 5 51 chr15 26377967 26378153 -77116821 - MTEa LTR MaLR -32 327 164 5 786 3852 297 110 17 chr15 26378709 26378928 -77116046 - MTE2b-int LTR MaLR -2 1578 1363 5 786 3852 297 110 17 chr15 26379005 26380135 -77114839 - MTE2b-int LTR MaLR -218 1362 104 5 786 1438 169 219 3 chr15 26381679 26381981 -77112993 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 786 468 252 83 16 chr15 26382047 26382168 -77112806 - MTE2b-int LTR MaLR -1451 129 1 5 786 657 308 105 74 chr15 26382179 26382344 -77112630 - MTE2b LTR MaLR -12 367 184 5 786 657 308 105 74 chr15 26382367 26382552 -77112422 - MTE2b LTR MaLR -196 183 6 5 786 326 366 111 39 chr15 26386382 26386868 -77108106 - MLT1E2 LTR MaLR -24 603 83 5 786 276 339 23 19 chr15 26394518 26394633 -77100341 + MLT1B LTR MaLR 187 322 -68 5 786 267 295 44 18 chr15 26407612 26407726 -77087248 + MLT1A0 LTR MaLR 218 334 -31 5 786 3359 43 0 0 chr15 26417989 26418385 -77076589 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 786 3122 68 2 8 chr15 26422984 26423382 -77071592 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 786 2792 194 85 133 chr15 26431082 26431931 -77063043 + RLTR40 LTR ERVK 3 810 -7 5 786 429 241 73 72 chr15 26434355 26434559 -77060415 - MLT1E LTR MaLR -349 305 44 5 786 250 250 138 46 chr15 26434549 26434679 -77060295 - MLT2F LTR ERVL -516 147 6 5 786 1005 301 25 22 chr15 26442882 26443198 -77051776 - MTEb LTR MaLR -2 377 61 6 786 606 303 41 0 chr15 26443250 26443445 -77051529 - MTE-int LTR MaLR 0 1580 1378 6 786 1190 278 62 21 chr15 26443496 26443834 -77051140 - MTEa LTR MaLR -3 376 25 6 786 1653 319 47 17 chr15 26443839 26444419 -77050555 - MTE-int LTR MaLR -318 1262 666 6 786 711 319 65 88 chr15 26444586 26444940 -77050034 - MTE-int LTR MaLR -929 651 306 6 786 580 282 19 67 chr15 26446659 26446868 -77048106 + MLT2C2 LTR ERVL 34 232 -232 6 786 1042 207 3 19 chr15 26447271 26447490 -77047484 - MTD LTR MaLR -3 416 182 6 786 641 249 17 42 chr15 26447700 26447883 -77047091 - MTD LTR MaLR -202 219 58 6 786 614 284 4 142 chr15 26447906 26447976 -77046998 - MTD LTR MaLR -364 57 1 6 786 303 404 67 5 chr15 26447976 26448174 -77046800 - MLT2B1 LTR ERVL -16 538 328 6 786 397 247 118 43 chr15 26448218 26448404 -77046570 - MLT2B1 LTR ERVL -319 201 2 6 786 914 249 115 39 chr15 26450816 26451147 -77043827 + RLTR14 LTR ERV1 24 379 -3 6 786 324 227 93 0 chr15 26452720 26452817 -77042157 - MER34A1 LTR ERV1 -81 506 401 6 786 229 281 76 42 chr15 26454617 26454736 -77040238 + MLT1A1 LTR MaLR 265 387 -21 6 786 615 311 166 40 chr15 26457027 26457479 -77037495 + MLT1F LTR MaLR 11 519 -29 6 786 933 322 21 18 chr15 26461252 26461578 -77033396 - MTEb-int LTR MaLR -1253 327 1 6 786 444 259 82 49 chr15 26461580 26461763 -77033211 - MTEb LTR MaLR -18 361 171 6 786 2288 135 57 3 chr15 26466648 26467034 -77027940 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 786 5437 169 93 55 chr15 26467034 26468163 -77026811 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1258 58 6 786 5437 169 93 55 chr15 26468847 26468927 -77026047 - MTB_Mm-int LTR MaLR -1201 57 3 6 786 588 137 0 0 chr15 26468945 26469040 -77025934 + ORR1B1 LTR MaLR 19 113 -281 6 786 874 138 7 14 chr15 26469030 26469170 -77025804 + ORR1B1 LTR MaLR 254 392 -2 6 786 2418 98 3 0 chr15 26474947 26475273 -77019701 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 787 893 294 61 61 chr15 26489336 26489695 -77005279 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 787 474 327 45 18 chr15 26490010 26490231 -77004743 + RMER15 LTR ERVL 344 570 -5 6 787 292 310 8 87 chr15 26493087 26493214 -77001760 + MLT1C LTR MaLR 1 117 -350 6 787 2177 155 50 8 chr15 26496694 26497072 -76997902 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 787 624 298 126 20 chr15 26497591 26497892 -76997082 + MLT1A0 LTR MaLR 33 365 0 6 787 507 330 73 11 chr15 26506174 26506352 -76988622 + MTE2b LTR MaLR 183 371 -8 9 787 285 274 62 21 chr15 26508502 26508599 -76986375 + MTEa LTR MaLR 278 378 -1 1 787 642 329 40 55 chr15 26512386 26512711 -76982263 + MLT1A LTR MaLR 51 370 -4 2 787 1285 134 38 29 chr15 26513324 26513563 -76981411 + RLTR11B LTR ERVK 212 452 -1 2 787 338 411 28 19 chr15 26517319 26517530 -76977444 + MLT1F2 LTR MaLR 1 213 -347 3 787 504 286 29 49 chr15 26517559 26517811 -76977163 + MLT1F2 LTR MaLR 396 622 -2 3 787 1970 186 52 8 chr15 26519387 26519787 -76975187 - MTC LTR MaLR -2 419 2 3 787 1644 35 0 0 chr15 26522710 26522909 -76972065 - MTB LTR MaLR -196 204 6 3 787 3203 71 0 2 chr15 26527104 26527512 -76967462 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 787 709 165 70 28 chr15 26532155 26532298 -76962676 + RMER5 LTR ERV1 59 207 -327 4 787 1016 259 49 36 chr15 26532493 26532820 -76962154 + RMER5 LTR ERV1 202 532 -2 4 787 333 360 104 44 chr15 26535161 26535478 -76959496 - MLT1E1A LTR MaLR -72 608 273 4 787 773 251 145 6 chr15 26536778 26537115 -76957859 + MER57F LTR ERV1 53 436 0 5 787 253 259 0 17 chr15 26544303 26544362 -76950612 + LTR81A LTR ERV1? 164 221 -1129 6 787 442 308 148 40 chr15 26546781 26547079 -76947895 + MLT1A1 LTR MaLR 1 330 -78 7 787 1267 288 72 112 chr15 26548124 26548749 -76946225 + RLTR18 LTR ERVK 17 616 0 7 787 2185 125 16 6 chr15 26552416 26552739 -76942235 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 7 787 300 294 87 8 chr15 26558255 26558382 -76936592 + MLT1B LTR MaLR 227 363 -27 8 787 306 173 57 161 chr15 26560202 26560326 -76934648 - MER57C2 LTR ERV1 -105 329 219 8 787 494 308 141 21 chr15 26563470 26563712 -76931262 + MLT2C1 LTR ERVL 3 273 -124 9 787 672 264 65 23 chr15 26566615 26566832 -76928142 + ERVL-E-int LTR ERVL 4057 4282 -1385 9 787 648 291 62 18 chr15 26566833 26567060 -76927914 - MTD LTR MaLR -182 237 1 9 787 243 367 56 21 chr15 26574561 26574703 -76920271 - MLT1C LTR MaLR -2 465 319 1 787 853 350 45 35 chr15 26592590 26593017 -76901957 + MLT2B2 LTR ERVL 13 443 -72 1 787 397 312 145 82 chr15 26595413 26595744 -76899230 + MLT1F2 LTR MaLR 201 552 -8 1 787 1033 304 54 25 chr15 26600514 26600882 -76894092 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 788 779 242 0 18 chr15 26613806 26613974 -76881000 + ORR1E LTR MaLR 4 168 -191 1 788 1944 179 27 13 chr15 26614564 26614937 -76880037 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 788 298 184 77 26 chr15 26614994 26615072 -76879902 + RLTR25B LTR ERVK 428 509 -519 1 788 355 278 0 0 chr15 26630624 26630721 -76864253 - MLT1D LTR MaLR -2 503 407 1 788 307 267 79 55 chr15 26630875 26631002 -76863972 - MLT1D LTR MaLR -485 142 13 1 788 2824 159 15 35 chr15 26635642 26636178 -76858796 + RLTR11A LTR ERVK 4 528 0 1 788 1174 196 23 9 chr15 26657809 26658030 -76836944 - MTD LTR MaLR 0 419 196 2 788 712 250 7 0 chr15 26659471 26659615 -76835359 - MTD LTR MaLR -209 210 66 2 788 393 265 63 69 chr15 26662158 26662323 -76832651 + MLT1J1 LTR MaLR 67 205 -243 2 788 4088 71 90 0 chr15 26674001 26674537 -76820437 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 2 788 276 294 52 67 chr15 26675591 26675700 -76819274 + ORR1E LTR MaLR 1 112 -247 2 788 276 294 52 67 chr15 26675849 26675874 -76819100 + ORR1E LTR MaLR 113 133 -226 2 788 269 276 50 86 chr15 26675963 26676102 -76818872 + ORR1E LTR MaLR 237 370 -9 2 788 897 264 228 12 chr15 26681454 26681875 -76813099 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 13 2 788 270 169 31 73 chr15 26698050 26698146 -76796828 + RMER10B LTR ERVL 201 292 -106 2 788 629 286 91 33 chr15 26698634 26698962 -76796012 - MLT2B4 LTR ERVL -58 356 15 2 788 471 306 79 106 chr15 26699477 26699817 -76795157 + MLT1C LTR MaLR 1 331 -136 2 788 413 359 68 49 chr15 26720489 26720694 -76774280 + MLT1E LTR MaLR 436 644 -9 3 788 721 346 98 9 chr15 26720804 26721139 -76773835 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 3 788 1060 312 75 25 chr15 26724669 26725109 -76769865 - MLT1C LTR MaLR 0 467 6 3 788 384 318 71 108 chr15 26726966 26727234 -76767740 - ORR1E LTR MaLR -51 308 51 3 788 320 206 12 88 chr15 26728461 26728541 -76766433 - MTE2b LTR MaLR 0 379 306 3 788 846 269 50 14 chr15 26728555 26728774 -76766200 - MTE2b LTR MaLR -128 251 25 3 788 799 332 118 66 chr15 26730409 26730970 -76764004 - MER21B LTR ERV1 -271 592 3 3 789 1312 180 31 82 chr15 26738727 26739058 -76755916 - ORR1C2 LTR MaLR -65 305 1 3 789 2899 39 45 6 chr15 26740015 26740348 -76754626 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 789 2022 192 62 22 chr15 26742004 26742409 -76752565 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 789 4049 141 72 50 chr15 26748174 26748233 -76746741 + RMER6A LTR ERVK 1 59 -697 3 789 4049 141 72 50 chr15 26748301 26748444 -76746530 + RMER6A LTR ERVK 60 214 -542 3 789 4049 141 72 50 chr15 26748635 26749170 -76745804 + RMER6A LTR ERVK 215 755 -1 3 789 1233 224 175 3 chr15 26750550 26750864 -76744110 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 1 3 789 607 337 213 45 chr15 26755315 26755672 -76739302 + MER70B LTR ERVL 23 439 -139 3 789 1062 269 95 9 chr15 26755685 26756012 -76738962 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 3 789 632 260 152 43 chr15 26756024 26756281 -76738693 - ORR1E-int LTR MaLR -13 1357 1073 3 789 1710 188 17 3 chr15 26756291 26756590 -76738384 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 303 -260 3 789 499 344 109 20 chr15 26757183 26757477 -76737497 - ORR1E-int LTR MaLR -1255 325 6 3 789 693 279 71 62 chr15 26761152 26761477 -76733497 - RLTR28B LTR ERVL -38 443 116 3 789 887 250 84 63 chr15 26766873 26767282 -76727692 + MLT2B1 LTR ERVL 87 520 0 3 789 477 311 139 25 chr15 26773335 26773753 -76721221 + MLT2B1 LTR ERVL 2 567 0 3 789 1130 202 132 36 chr15 26773851 26774154 -76720820 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 3 789 669 391 87 3 chr15 26779621 26779942 -76715032 + MER70B LTR ERVL 3 350 -228 3 789 3454 51 5 0 chr15 26780490 26780884 -76714090 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 789 568 355 64 25 chr15 26786158 26786438 -76708536 + MLT1A0 LTR MaLR 61 351 -14 4 789 2590 183 17 142 chr15 26789677 26790332 -76704642 + RMER19C LTR ERVK 37 609 -2 4 789 327 343 144 29 chr15 26794267 26794510 -76700464 + MER68 LTR ERVL 292 562 -1 4 789 872 283 72 44 chr15 26799095 26799413 -76695561 - MTD LTR MaLR -90 329 3 4 789 1486 268 107 11 chr15 26813357 26813817 -76681157 - RMER20A LTR ERVK -2 514 11 4 789 229 246 28 28 chr15 26818221 26818292 -76676682 + MLT1A1 LTR MaLR 8 78 -330 4 789 332 325 126 83 chr15 26820105 26820407 -76674567 + MLT1A0 LTR MaLR 25 339 -26 4 789 285 331 81 81 chr15 26833621 26833782 -76661192 + LTR16A LTR ERVL 195 355 -96 4 789 2934 30 0 0 chr15 26834803 26835140 -76659834 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 789 7281 23 2 7 chr15 26835140 26836028 -76658946 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5598 4 789 26154 30 29 11 chr15 26836019 26839304 -76655670 - IAPEz-int LTR ERVK -3130 3351 8 4 789 3008 15 0 0 chr15 26839304 26839641 -76655333 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 789 484 122 0 0 chr15 26841053 26841127 -76653847 + ORR1B2 LTR MaLR 1 74 -320 4 789 589 188 119 45 chr15 26841106 26841240 -76653734 + ORR1B2 LTR MaLR 224 367 0 4 789 3305 43 5 0 chr15 26842101 26842495 -76652479 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 789 787 344 40 48 chr15 26855122 26855473 -76639501 + ORR1E LTR MaLR 12 359 0 5 789 2703 153 163 39 chr15 26855835 26856449 -76638525 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 789 266 330 25 42 chr15 26859010 26859130 -76635844 - MLT2B2 LTR ERVL -179 336 219 5 789 251 289 0 73 chr15 26859300 26859382 -76635592 - MLT2B2 LTR ERVL -433 82 7 5 789 313 213 27 0 chr15 26859477 26859552 -76635422 + MLT2B2 LTR ERVL 18 94 -421 5 789 872 313 23 8 chr15 26860833 26861094 -76633880 - MTEa LTR MaLR -5 374 110 5 789 483 267 39 68 chr15 26861687 26861892 -76633082 - RLTR14 LTR ERV1 -13 369 171 5 789 635 327 88 69 chr15 26864791 26865281 -76629693 - MLT1D LTR MaLR -3 502 4 5 789 478 370 111 31 chr15 26865434 26865822 -76629152 - MER74B LTR ERVL -128 494 76 5 789 743 229 36 58 chr15 26868557 26868780 -76626194 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 153 5 789 1791 188 39 6 chr15 26868786 26869123 -76625851 - MTC LTR MaLR 0 421 74 5 789 1565 246 34 44 chr15 26869498 26869543 -76625431 - MTC LTR MaLR -339 80 41 5 790 423 223 14 5 chr15 26869782 26869892 -76625082 - MTC LTR MaLR -309 110 1 5 790 704 203 19 45 chr15 26869895 26870050 -76624924 - ORR1D1 LTR MaLR -223 151 1 5 790 1920 187 22 0 chr15 26870051 26870414 -76624560 - ORR1D1-int LTR MaLR -1 1369 999 5 790 2598 185 51 2 chr15 26881068 26881540 -76613434 + RMER5 LTR ERV1 13 507 -27 5 790 1014 285 41 74 chr15 26881932 26882299 -76612675 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 5 790 612 315 34 133 chr15 26882506 26882920 -76612054 + MLT1A LTR MaLR 2 374 0 5 790 2051 226 17 149 chr15 26887153 26887856 -76607118 + RMER19C LTR ERVK 2 611 0 5 790 360 357 41 59 chr15 26893810 26894081 -76600893 + ORR1E LTR MaLR 87 352 -7 5 790 967 215 19 51 chr15 26895870 26896086 -76598888 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 166 5 790 789 241 68 35 chr15 26896167 26896409 -76598565 - ORR1D1 LTR MaLR -109 261 1 5 790 325 292 10 73 chr15 26898044 26898140 -76596834 + MLT1A LTR MaLR 1 90 -284 5 790 3169 23 9 0 chr15 26903853 26904196 -76590778 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 790 2334 87 58 0 chr15 26906379 26906688 -76588286 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 790 348 341 21 43 chr15 26907036 26907177 -76587797 + MT2A LTR ERVL 70 207 -326 6 790 1075 247 103 47 chr15 26910532 26910872 -76584102 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 6 790 2742 100 26 3 chr15 26919814 26920204 -76574770 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 6 790 2080 127 57 89 chr15 26928123 26928529 -76566445 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 6 790 4155 216 28 55 chr15 26934383 26935411 -76559563 + ORR1C1-int LTR MaLR 370 1370 0 6 790 1974 204 8 31 chr15 26935413 26935798 -76559176 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 6 790 253 217 0 0 chr15 26945127 26945187 -76549787 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 337 6 790 1754 189 39 90 chr15 26945404 26945484 -76549490 + MTC LTR MaLR 1 72 -349 6 790 1754 189 39 90 chr15 26945691 26946043 -76548931 + MTC LTR MaLR 73 413 -8 6 790 229 224 85 96 chr15 26946047 26946141 -76548833 - MLT1A1 LTR MaLR -272 93 1 6 790 2183 180 26 31 chr15 26948624 26948750 -76546224 + MTC LTR MaLR 5 130 -291 6 790 3437 28 0 0 chr15 26948750 26949146 -76545828 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 790 2183 180 26 31 chr15 26949146 26949438 -76545536 + MTC LTR MaLR 131 421 0 6 790 614 296 23 17 chr15 26951414 26951589 -76543385 - MTE2b LTR MaLR -11 368 193 6 790 690 262 30 6 chr15 26952118 26952287 -76542687 - MTE2b LTR MaLR -206 173 1 6 790 389 333 27 20 chr15 26952882 26953032 -76541942 + MLT1A0 LTR MaLR 215 365 0 6 790 423 298 190 17 chr15 26960119 26960351 -76534623 + MLT-int LTR MaLR 1462 1733 -2 6 790 251 322 75 29 chr15 26962333 26962573 -76532401 - HERVL40-int LTR ERVL -1714 4043 3793 6 790 299 374 18 37 chr15 26962630 26962794 -76532180 + LTR40a LTR ERVL 1 161 -358 6 790 787 345 59 28 chr15 26962846 26963386 -76531588 - HERVL40-int LTR ERVL -2612 2918 2362 6 790 895 326 43 41 chr15 26964850 26965218 -76529756 - LTR40a LTR ERVL -2 517 149 6 790 1478 273 105 35 chr15 26972170 26972807 -76522167 + MTD-int LTR MaLR 658 1578 -2 6 790 879 315 79 14 chr15 26972834 26973188 -76521786 + MTD LTR MaLR 26 402 -17 6 790 3517 25 2 154 chr15 26987874 26988434 -76506540 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 790 742 161 269 6 chr15 26989500 26989656 -76505318 - MTC LTR MaLR 0 421 225 7 790 2456 161 14 5 chr15 26989656 26990073 -76504901 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 790 3578 186 112 45 chr15 26990073 26990879 -76504095 - MTC-int LTR MaLR 0 1258 399 7 790 1898 220 0 45 chr15 26991601 26992025 -76502949 - MTC-int LTR MaLR -853 405 1 7 790 1824 203 68 2 chr15 26992025 26992420 -76502554 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 790 427 334 157 9 chr15 26993719 26994092 -76500882 - LTR33B LTR ERVL -8 495 35 7 790 2367 286 100 4 chr15 26995950 26996659 -76498315 + MTE-int LTR MaLR 770 1546 -34 7 790 586 340 64 56 chr15 26996647 26996989 -76497985 + ORR1E LTR MaLR 8 352 -7 7 790 569 226 121 35 chr15 26999567 26999741 -76495233 + MLT1A LTR MaLR 175 363 -11 7 790 375 44 0 0 chr15 26999928 26999973 -76495001 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 294 7 790 2163 47 0 0 chr15 27000029 27000306 -76494668 - ORR1A1 LTR MaLR -69 277 1 2 791 342 285 70 23 chr15 27004693 27004862 -76490112 - MLT1C LTR MaLR -2 465 212 6 791 251 284 112 52 chr15 27004948 27005082 -76489892 - MLT1C LTR MaLR -485 142 1 6 791 881 325 45 10 chr15 27007251 27007540 -76487434 + MTE2b LTR MaLR 1 299 -80 9 791 486 314 83 5 chr15 27007759 27007964 -76487010 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 145 1 791 2161 86 12 60 chr15 27008362 27008697 -76486277 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 791 641 273 0 7 chr15 27013477 27013621 -76481353 - MTEa-int LTR MaLR -1236 344 202 1 791 296 210 16 16 chr15 27013646 27013709 -76481265 - MTEa-int LTR MaLR -1517 63 1 1 791 323 318 88 130 chr15 27013712 27014060 -76480914 - MTEa LTR MaLR -3 376 2 1 791 331 338 114 33 chr15 27014204 27014415 -76480559 - MLT1G1 LTR MaLR -280 299 72 1 791 3862 49 19 0 chr15 27016138 27016604 -76478370 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 2 791 426 296 55 27 chr15 27016866 27017012 -76477962 + MLT1A0 LTR MaLR 209 358 -7 2 791 695 256 115 21 chr15 27018000 27018279 -76476695 + RMER20B LTR ERVK 108 412 -215 2 791 472 300 122 79 chr15 27032213 27032522 -76462452 - MTD LTR MaLR -29 378 41 4 791 348 296 128 94 chr15 27032715 27032757 -76462217 - MTD LTR MaLR -381 40 1 4 791 405 312 84 47 chr15 27033682 27033923 -76461051 - RMER12 LTR ERVK -3 1319 1102 4 791 4069 168 28 20 chr15 27034095 27034893 -76460081 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 2 4 791 1115 232 44 42 chr15 27036137 27036434 -76458540 - MTD LTR MaLR -1 378 123 5 791 918 207 368 23 chr15 27041060 27041411 -76453563 - RMER15 LTR ERVL -75 500 29 5 791 1074 294 29 80 chr15 27042658 27042964 -76452010 - MTE2b LTR MaLR -12 367 81 6 791 648 234 175 48 chr15 27042964 27043215 -76451759 + RLTR20D LTR ERVK 1 283 -285 6 791 555 232 158 27 chr15 27043201 27043255 -76451719 + RLTR20D LTR ERVK 404 453 -115 6 791 555 232 158 27 chr15 27043347 27043435 -76451539 + RLTR20D LTR ERVK 454 564 -4 6 791 305 207 146 0 chr15 27043438 27043520 -76451454 - MTE2a LTR MaLR -282 97 4 6 791 1154 189 39 151 chr15 27048483 27048563 -76446411 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 337 7 791 1539 141 60 64 chr15 27048902 27049104 -76445870 - ORR1A2 LTR MaLR -47 280 95 7 791 1539 141 60 64 chr15 27049217 27049295 -76445679 - ORR1A2 LTR MaLR -233 94 1 7 791 1376 201 115 13 chr15 27054465 27054773 -76440201 + MTD LTR MaLR 76 405 -14 8 791 1590 211 48 14 chr15 27062690 27063045 -76431929 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 9 791 2958 76 8 5 chr15 27063045 27063444 -76431530 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 791 2066 182 11 27 chr15 27063668 27063932 -76431042 + ORR1B2 LTR MaLR 1 259 -108 9 791 2515 83 3 0 chr15 27063932 27064258 -76430716 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 791 2066 182 11 27 chr15 27064258 27064366 -76430608 + ORR1B2 LTR MaLR 260 367 0 9 791 324 322 72 39 chr15 27068636 27068887 -76426087 - MLT1A1 LTR MaLR -66 299 46 1 791 1322 257 99 9 chr15 27071215 27071549 -76423425 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 1 1 791 1172 261 45 8 chr15 27073855 27074207 -76420767 + ORR1D2 LTR MaLR 2 366 -4 1 791 274 339 36 73 chr15 27078282 27078419 -76416555 + MLT1J LTR MaLR 239 370 -142 1 791 2942 62 18 0 chr15 27079854 27080243 -76414731 - MTB LTR MaLR -4 396 1 1 791 1080 266 67 30 chr15 27080365 27080695 -76414279 + RMER5 LTR ERV1 37 378 -156 1 791 653 233 27 7 chr15 27081122 27081269 -76413705 + RMER5 LTR ERV1 383 532 -2 1 791 1561 216 78 18 chr15 27082278 27082673 -76412301 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 791 520 286 225 15 chr15 27082997 27083331 -76411643 + MLT1D LTR MaLR 95 498 -7 1 791 739 120 71 8 chr15 27083956 27084082 -76410892 - RMER19B LTR ERVK 0 902 769 1 791 1171 242 60 73 chr15 27085867 27085938 -76409036 + ORR1B2 LTR MaLR 1 69 -298 1 791 1171 242 60 73 chr15 27086085 27086111 -76408863 + ORR1B2 LTR MaLR 70 84 -283 1 791 1171 242 60 73 chr15 27086293 27086381 -76408593 + ORR1B2 LTR MaLR 85 177 -190 1 791 1171 242 60 73 chr15 27086506 27086688 -76408286 + ORR1B2 LTR MaLR 178 364 -3 1 791 530 285 98 47 chr15 27090903 27091181 -76403793 - ORR1E LTR MaLR -106 264 1 1 791 578 294 104 118 chr15 27092259 27092633 -76402341 - MLT1B LTR MaLR -21 369 1 1 791 325 213 147 0 chr15 27093627 27093702 -76401272 - RLTR40 LTR ERVK -7 810 725 1 791 3573 190 51 19 chr15 27094119 27094168 -76400806 - RLTR40 LTR ERVK -68 749 710 1 791 3573 190 51 19 chr15 27094613 27095289 -76399685 - RLTR40 LTR ERVK -108 709 1 1 791 682 281 174 16 chr15 27095299 27095552 -76399422 - MTEa LTR MaLR -26 353 61 1 791 228 171 24 0 chr15 27096114 27096155 -76398819 - MT2A LTR ERVL -491 42 1 1 791 1003 276 72 33 chr15 27097418 27097778 -76397196 - MTEb LTR MaLR 0 379 6 1 791 1667 84 0 78 chr15 27097948 27098206 -76396768 - ORR1A2 LTR MaLR -89 238 1 1 791 3933 297 75 41 chr15 27099052 27100252 -76394722 - ORR1E-int LTR MaLR -40 1540 290 1 791 3933 297 75 41 chr15 27100303 27100590 -76394384 - ORR1E-int LTR MaLR -1291 289 2 1 791 837 276 89 75 chr15 27100593 27100942 -76394032 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 1 791 679 168 25 0 chr15 27100946 27101065 -76393909 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 238 1 791 226 258 0 0 chr15 27104259 27104321 -76390653 - MLT1G1 LTR MaLR -2 487 426 1 791 310 303 30 20 chr15 27104594 27104695 -76390279 - MLT1G1 LTR MaLR -267 312 211 1 791 1107 340 93 16 chr15 27104762 27105373 -76389601 - MLT1G1-int LTR MaLR -176 1313 656 1 791 3454 25 2 0 chr15 27109822 27110215 -76384759 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 1 791 1409 228 48 149 chr15 27110340 27110865 -76384109 + RMER19C LTR ERVK 138 609 -2 1 791 708 247 54 16 chr15 27111123 27111308 -76383666 - MTEb LTR MaLR -6 373 182 1 791 256 278 84 70 chr15 27119787 27119930 -76375044 + MLT1I LTR MaLR 252 396 -15 1 791 585 155 1 0 chr15 27129603 27129706 -76365268 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 281 1 791 278 79 0 0 chr15 27129692 27129730 -76365244 + ORR1D1 LTR MaLR 333 370 -4 1 791 1373 185 33 164 chr15 27130195 27130449 -76364525 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 122 1 791 1373 185 33 164 chr15 27130674 27130840 -76364134 - ORR1D1 LTR MaLR -253 121 1 1 792 3532 54 0 5 chr15 27132719 27133128 -76361846 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 792 393 325 73 39 chr15 27133540 27133745 -76361229 - LTR16C LTR ERVL -1 488 277 1 792 240 340 81 32 chr15 27133917 27134072 -76360902 - LTR16C LTR ERVL -230 338 199 1 792 393 310 78 0 chr15 27134921 27134964 -76360010 + MLT1A1 LTR MaLR 256 302 -106 1 792 1646 172 228 14 chr15 27134964 27135311 -76359663 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 792 393 310 78 0 chr15 27135311 27135409 -76359565 + MLT1A1 LTR MaLR 303 407 -1 1 792 1099 293 18 46 chr15 27136194 27136630 -76358344 - BGLII_B LTR ERVK -17 424 1 2 792 1136 176 9 53 chr15 27138864 27139092 -76355882 + ORR1B1 LTR MaLR 177 394 0 2 792 1935 218 24 33 chr15 27140134 27140557 -76354417 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 792 2662 143 55 12 chr15 27140936 27141339 -76353635 - MTC LTR MaLR -1 420 1 2 792 3491 50 0 2 chr15 27141468 27141865 -76353109 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 792 354 253 10 78 chr15 27141866 27141969 -76353005 + MTEb LTR MaLR 6 101 -278 2 792 2872 154 17 6 chr15 27141970 27142446 -76352528 - MurERV4-int LTR ERVK -2396 2864 2384 2 792 365 211 173 0 chr15 27142531 27142635 -76352339 + MTEb LTR MaLR 188 309 -70 2 792 4414 52 2 2 chr15 27149519 27150022 -76344952 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 2 792 4300 152 129 72 chr15 27150708 27151561 -76343413 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 2 792 1928 221 21 35 chr15 27151923 27152350 -76342624 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 792 292 278 137 38 chr15 27154728 27154859 -76340115 + RMER21A LTR ERV1 541 684 -263 2 792 7509 159 17 58 chr15 27156246 27156594 -76338380 - RLTR21 LTR ERVK -4 1568 1243 2 792 7509 159 17 58 chr15 27156621 27157659 -76337315 - RLTR21 LTR ERVK -330 1242 246 2 792 7509 159 17 58 chr15 27157711 27157809 -76337165 - RLTR21 LTR ERVK -1327 245 144 2 792 5101 118 20 67 chr15 27159158 27160000 -76334974 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 2 792 988 189 16 11 chr15 27160662 27160844 -76334130 - RLTR21 LTR ERVK -1389 183 1 2 792 2240 120 3 104 chr15 27166501 27166804 -76328170 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 58 2 792 2240 120 3 104 chr15 27166951 27167011 -76327963 - ORR1A2 LTR MaLR -270 57 1 2 792 555 297 59 101 chr15 27170572 27170947 -76324027 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 2 792 317 217 14 0 chr15 27171252 27171321 -76323653 + MTD LTR MaLR 10 79 -342 2 792 517 196 116 0 chr15 27171316 27171454 -76323520 + MTD LTR MaLR 265 418 -1 2 792 2245 175 36 24 chr15 27174455 27174871 -76320103 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 792 235 286 206 7 chr15 27185173 27185328 -76309646 - RMER20B LTR ERVK -261 366 181 2 792 263 353 25 5 chr15 27190796 27190994 -76303980 - RMER15 LTR ERVL -10 565 337 2 792 276 328 0 57 chr15 27192332 27192455 -76302519 - MLT2B4 LTR ERVL -398 158 43 2 792 1776 142 111 6 chr15 27192911 27193244 -76301730 - MTC LTR MaLR -8 413 46 2 792 566 264 57 0 chr15 27194170 27194310 -76300664 + MLT1B LTR MaLR 4 151 -239 3 792 555 301 46 38 chr15 27194380 27194618 -76300356 + MLT1B LTR MaLR 144 383 -7 3 792 821 306 78 68 chr15 27194905 27195434 -76299540 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 3 792 1025 137 11 0 chr15 27195689 27195864 -76299110 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 177 -407 3 792 3316 151 127 46 chr15 27195866 27196734 -76298240 - RMER17B LTR ERVK 0 906 1 3 792 912 139 11 11 chr15 27196734 27196908 -76298066 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 174 347 -237 3 792 1054 234 101 53 chr15 27197220 27197480 -76297494 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 94 3 792 1054 234 101 53 chr15 27197506 27197602 -76297372 - ORR1D1 LTR MaLR -281 93 1 3 792 4011 119 35 66 chr15 27198904 27199679 -76295295 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 3 792 711 88 26 0 chr15 27202563 27202676 -76292298 + ORR1B1 LTR MaLR 30 145 -249 3 792 1346 169 23 15 chr15 27203000 27203167 -76291807 + ORR1B1 LTR MaLR 134 298 -96 3 792 1346 169 23 15 chr15 27203343 27203434 -76291540 + ORR1B1 LTR MaLR 299 392 -2 3 792 2863 16 0 0 chr15 27203583 27203905 -76291069 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 792 41507 29 4 6 chr15 27203905 27208760 -76286214 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 1 3 792 2840 22 0 0 chr15 27208760 27209082 -76285892 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 792 380 329 89 37 chr15 27209718 27209964 -76285010 - MLT1H LTR MaLR -196 353 95 3 792 545 138 0 155 chr15 27210315 27210444 -76284530 + ORR1A4 LTR MaLR 1 109 -220 3 792 248 164 36 0 chr15 27215734 27215789 -76279185 - MTE2b LTR MaLR 0 379 323 3 792 1954 100 3 73 chr15 27215914 27216271 -76278703 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 3 792 59306 11 2 5 chr15 27216271 27222766 -76272208 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 9 3 792 2122 102 3 72 chr15 27222766 27223126 -76271848 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -2 335 1 3 792 1400 217 12 19 chr15 27225764 27226088 -76268886 + RMER19C LTR ERVK 290 611 0 3 792 453 254 21 48 chr15 27227221 27227366 -76267608 + MTEb LTR MaLR 229 369 -10 3 792 1729 169 84 3 chr15 27227673 27228030 -76266944 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 792 506 259 157 12 chr15 27229787 27230029 -76264945 - MER89 LTR ERV1 -86 473 197 3 792 1485 157 124 3 chr15 27233720 27234026 -76260948 + ORR1C2 LTR MaLR 42 384 0 3 792 276 210 81 0 chr15 27237477 27237539 -76257435 + ORR1D1 LTR MaLR 3 69 -305 3 792 869 181 20 49 chr15 27237522 27237649 -76257325 + ORR1D1 LTR MaLR 176 300 -74 3 792 4789 56 2 3 chr15 27237649 27238237 -76256737 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 3 792 869 181 20 49 chr15 27238237 27238312 -76256662 + ORR1D1 LTR MaLR 301 372 -2 3 792 3026 66 20 2 chr15 27239158 27239551 -76255423 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 792 354 246 34 34 chr15 27246811 27246958 -76248016 + MER31A LTR ERV1 200 346 -139 3 792 540 302 165 4 chr15 27248309 27248575 -76246399 + MLT1B LTR MaLR 7 315 -75 3 792 6016 94 50 27 chr15 27260619 27261555 -76233419 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 3 793 943 277 41 48 chr15 27264338 27264691 -76230283 + MTE2a LTR MaLR 53 418 -1 4 793 1011 176 53 10 chr15 27267534 27267741 -76227233 - ORR1D1 LTR MaLR -158 216 1 4 793 447 336 124 11 chr15 27268034 27268308 -76226666 + MLT1A0 LTR MaLR 59 363 -2 4 793 641 281 28 95 chr15 27268490 27268773 -76226201 - MER31B LTR ERV1 -121 345 82 4 793 1732 143 22 103 chr15 27275317 27275675 -76219299 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 793 256 328 51 17 chr15 27278547 27278665 -76216309 - MLT1G1 LTR MaLR -9 570 449 4 793 236 265 131 10 chr15 27282664 27282763 -76212211 + MLT1A0 LTR MaLR 193 303 -62 4 793 1112 235 47 42 chr15 27287127 27287571 -76207403 - MT2A LTR ERVL -48 553 1 4 793 377 273 67 15 chr15 27290582 27290716 -76204258 + MLT2C1 LTR ERVL 85 225 -172 4 793 1339 208 57 65 chr15 27292865 27293185 -76201789 + ORR1C2 LTR MaLR 2 320 -64 4 793 1339 208 57 65 chr15 27293377 27293442 -76201532 + ORR1C2 LTR MaLR 321 384 0 4 793 439 314 75 47 chr15 27294338 27294552 -76200422 - MER31B LTR ERV1 -246 220 1 4 793 615 342 105 31 chr15 27294984 27295433 -76199541 + MER90a LTR ERV1 11 492 -122 4 793 607 313 11 0 chr15 27296259 27296438 -76198536 + MLT1A0 LTR MaLR 137 317 -48 4 793 1868 163 107 13 chr15 27296959 27297344 -76197630 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 793 406 247 135 39 chr15 27297525 27297681 -76197293 - MTE2a LTR MaLR -13 366 196 4 793 3433 35 2 0 chr15 27302760 27303155 -76191819 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 793 2564 114 52 3 chr15 27305398 27305786 -76189188 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 793 1288 201 162 12 chr15 27306966 27307318 -76187656 + MTD LTR MaLR 6 419 0 4 793 1483 176 81 31 chr15 27309486 27309868 -76185106 - RMER17C LTR ERVK -9 401 1 4 793 3036 21 0 0 chr15 27313889 27314226 -76180748 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 793 15233 11 1 0 chr15 27314226 27315879 -76179095 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4827 5 793 32033 28 10 17 chr15 27315865 27319613 -76175361 - IAPEz-int LTR ERVK -2752 3729 8 5 793 3025 24 0 0 chr15 27319613 27319950 -76175024 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 793 2268 160 32 7 chr15 27323996 27324399 -76170575 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 793 277 305 10 31 chr15 27334535 27334633 -76160341 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 313 5 793 237 139 22 44 chr15 27337162 27337207 -76157767 + RLTR9E LTR ERVK 7 50 -318 5 793 475 262 74 56 chr15 27337249 27337497 -76157477 + RLTR9E LTR ERVK 117 402 -1 5 793 521 258 7 50 chr15 27337509 27337648 -76157326 + MTE2a LTR MaLR 57 189 -190 5 793 231 219 0 72 chr15 27340024 27340093 -76154881 - MER34 LTR ERV1 -71 471 408 5 793 1282 304 58 39 chr15 27340298 27340709 -76154265 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 793 2030 132 54 88 chr15 27341114 27341522 -76153452 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 793 1644 237 68 5 chr15 27345331 27345725 -76149249 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 793 2499 147 109 14 chr15 27346599 27347041 -76147933 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 484 -94 5 793 915 290 30 102 chr15 27347853 27348293 -76146681 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 793 313 278 97 26 chr15 27350202 27350357 -76144617 + MLT2B4 LTR ERVL 80 245 -311 5 793 256 293 22 28 chr15 27350631 27350752 -76144222 + MLT2B4 LTR ERVL 412 521 -41 5 793 3221 147 125 30 chr15 27351456 27352088 -76142886 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 5 793 1540 240 58 6 chr15 27354626 27354974 -76140000 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 5 793 2468 98 0 0 chr15 27355063 27355389 -76139585 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 793 344 244 39 0 chr15 27356280 27356358 -76138616 + MTEb LTR MaLR 3 83 -276 5 793 454 237 41 33 chr15 27356549 27356671 -76138303 + MTEb LTR MaLR 257 379 0 5 793 936 229 111 108 chr15 27358058 27358436 -76136538 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 5 793 230 233 40 27 chr15 27359648 27359723 -76135251 + MT2B2 LTR ERVL 169 244 -340 5 793 868 291 61 45 chr15 27361858 27362172 -76132802 - ORR1E LTR MaLR -29 350 6 5 793 652 253 138 141 chr15 27365760 27366087 -76128887 - MTEa LTR MaLR -29 350 25 5 793 2015 192 13 3 chr15 27366656 27367031 -76127943 - RLTR14 LTR ERV1 -3 379 1 6 793 371 255 130 47 chr15 27367681 27367850 -76127124 - MLT1C LTR MaLR -247 220 38 6 793 3118 83 2 0 chr15 27368373 27368771 -76126203 - MTB LTR MaLR 0 400 2 6 793 693 311 15 133 chr15 27372502 27372840 -76122134 + MLT1A0 LTR MaLR 1 298 -67 6 793 3540 25 2 0 chr15 27377658 27378053 -76116921 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 793 348 317 141 41 chr15 27379411 27379730 -76115244 + MLT1C LTR MaLR 113 463 -4 6 793 2304 80 9 64 chr15 27379800 27380146 -76114828 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 793 327 297 132 52 chr15 27388918 27389092 -76105882 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 215 6 793 1568 132 36 66 chr15 27389477 27389809 -76105165 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 6 793 439 165 49 114 chr15 27389811 27389934 -76105040 - MT2B LTR ERVL -337 264 150 6 793 689 249 75 24 chr15 27392523 27392769 -76102205 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 112 6 793 348 247 48 0 chr15 27392817 27392935 -76102039 - ORR1D2 LTR MaLR -245 129 1 6 794 2451 153 4 77 chr15 27399606 27399850 -76095124 - MTC LTR MaLR 0 421 196 6 794 2451 153 4 77 chr15 27400256 27400465 -76094509 - MTC LTR MaLR -226 195 1 6 794 2039 113 98 3 chr15 27400967 27401294 -76093680 + ORR1B2 LTR MaLR 1 358 -9 6 794 2275 98 3 58 chr15 27408756 27409102 -76085872 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 794 2593 55 6 3 chr15 27444585 27444912 -76050062 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 58 7 794 426 298 220 49 chr15 27445367 27445758 -76049216 - MER31B LTR ERV1 -7 459 2 7 794 3137 73 5 0 chr15 27451234 27451630 -76043344 - MTB LTR MaLR -2 398 1 7 794 1797 184 40 48 chr15 27457802 27458179 -76036795 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 794 1986 85 157 0 chr15 27461572 27461853 -76033121 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 7 794 236 247 24 47 chr15 27464439 27464524 -76030450 + RMER17D LTR ERVK 240 322 -567 7 794 233 281 97 0 chr15 27471894 27472008 -76022966 - LTR16A1 LTR ERVL -87 369 245 8 794 234 288 112 0 chr15 27473636 27473716 -76021258 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 153 8 794 373 386 70 12 chr15 27479188 27479432 -76015542 - MLT1H LTR MaLR -281 268 11 8 794 1225 309 48 48 chr15 27481156 27481611 -76013363 - MLT1C LTR MaLR 0 467 13 8 794 1509 254 59 34 chr15 27485927 27486334 -76008640 - MTD LTR MaLR 0 419 3 8 794 2618 132 24 19 chr15 27487759 27488176 -76006798 - MTC LTR MaLR 0 421 3 8 794 1425 271 73 42 chr15 27489310 27489814 -76005160 - RMER5 LTR ERV1 0 534 15 8 794 2600 172 58 16 chr15 27498350 27498835 -75996139 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 8 794 474 236 211 0 chr15 27506473 27506634 -75988340 + MLT1C LTR MaLR 1 195 -272 7 794 293 277 203 23 chr15 27508638 27508771 -75986203 - MLT1D LTR MaLR -348 157 1 1 794 829 271 97 56 chr15 27509032 27509372 -75985602 + MTEa LTR MaLR 7 360 -19 1 794 1000 260 83 9 chr15 27518142 27518468 -75976506 + MTE2b LTR MaLR 1 350 -29 1 795 575 199 65 20 chr15 27533096 27533291 -75961683 + MTE2b LTR MaLR 129 376 -3 2 795 402 305 339 9 chr15 27537949 27538286 -75956688 + MLT1F1 LTR MaLR 12 459 -89 3 795 365 331 16 8 chr15 27561262 27561384 -75933590 + RMER5 LTR ERV1 40 162 -372 6 795 464 212 16 89 chr15 27561580 27561704 -75933270 + RMER5 LTR ERV1 412 526 -8 6 795 800 306 95 31 chr15 27562209 27562567 -75932407 + MLT1C LTR MaLR 87 467 0 7 795 511 234 74 20 chr15 27563281 27563429 -75931545 - MTE2a LTR MaLR -44 335 180 7 795 414 263 10 158 chr15 27563587 27563790 -75931184 - MTE2a LTR MaLR -188 191 19 7 795 858 263 23 14 chr15 27564206 27564422 -75930552 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3064 3281 -2433 7 795 433 332 78 71 chr15 27570825 27571120 -75923854 + MLT1A LTR MaLR 1 297 -77 9 795 2027 158 88 0 chr15 27572337 27572679 -75922295 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 9 795 287 330 20 0 chr15 27573678 27573778 -75921196 - RMER5 LTR ERV1 -52 482 381 1 795 678 283 114 8 chr15 27574118 27574364 -75920610 - RMER5 LTR ERV1 -215 319 48 1 795 2334 142 39 18 chr15 27575064 27575450 -75919524 + MTB_Mm LTR MaLR 1 394 -13 1 795 246 248 49 107 chr15 27575579 27575701 -75919273 + MTEb LTR MaLR 144 258 -121 1 795 4384 169 29 84 chr15 27575713 27576667 -75918307 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 795 722 270 176 12 chr15 27578043 27578298 -75916676 - MTE2b LTR MaLR -74 305 9 1 795 1487 243 50 35 chr15 27583085 27583565 -75911409 - RMER19A LTR ERVK -51 560 107 1 795 337 150 0 0 chr15 27583601 27583661 -75911313 - MurERV4_19-int LTR ERVK 0 5780 5721 1 795 904 283 30 94 chr15 27583705 27583737 -75911237 - MTE2a LTR MaLR 0 379 350 1 795 904 286 36 96 chr15 27583770 27584170 -75910804 - MTE2a LTR MaLR -30 389 4 1 795 907 307 30 78 chr15 27588522 27588904 -75906070 + MLT1A0 LTR MaLR 6 390 0 1 795 1158 249 153 20 chr15 27593592 27593945 -75901029 + MTD LTR MaLR 20 419 0 1 795 1800 171 64 20 chr15 27603384 27603777 -75891197 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 795 992 289 42 19 chr15 27619020 27619327 -75875647 + MLT1A0 LTR MaLR 52 365 0 1 795 526 342 61 101 chr15 27621663 27622008 -75872966 + ORR1E LTR MaLR 1 331 -28 1 795 4651 115 47 10 chr15 27625181 27625585 -75869389 - RMER6A LTR ERVK 0 756 335 1 795 4651 115 47 10 chr15 27625700 27626024 -75868950 - RMER6A LTR ERVK -422 334 1 1 795 365 393 21 0 chr15 27626055 27626200 -75868774 - MLT1K LTR MaLR -6 589 442 1 795 477 260 73 22 chr15 27627602 27627756 -75867218 + MLT1A1 LTR MaLR 201 404 -4 1 795 934 281 25 53 chr15 27628032 27628190 -75866784 + MLT1A0 LTR MaLR 21 165 -200 1 795 934 281 25 53 chr15 27628232 27628393 -75866581 + MLT1A0 LTR MaLR 166 331 -34 1 795 3368 112 47 54 chr15 27629722 27630447 -75864527 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 870 -163 2 795 3154 182 32 145 chr15 27630595 27630780 -75864194 + RLTR13D4 LTR ERVK 647 808 0 2 795 458 227 158 8 chr15 27633090 27633211 -75861763 - MLT1A0 LTR MaLR -17 391 235 2 795 1300 217 100 16 chr15 27633579 27633888 -75861086 + MTE2a LTR MaLR 26 360 -19 2 795 393 200 14 0 chr15 27633929 27633999 -75860975 - LTR40b LTR ERVL -22 440 370 2 795 254 354 130 62 chr15 27635488 27635795 -75859179 + MER54B LTR ERVL 25 352 -441 2 795 281 269 13 0 chr15 27635764 27635842 -75859132 + MER54B LTR ERVL 715 793 0 2 795 296 221 67 24 chr15 27637142 27637234 -75857740 - MTE2b LTR MaLR -41 338 243 2 795 316 324 75 14 chr15 27638474 27638621 -75856353 - MLT1K LTR MaLR -57 538 383 2 795 501 194 39 136 chr15 27645701 27645856 -75849118 + MT2B LTR ERVL 170 309 -292 2 795 2143 204 69 10 chr15 27648334 27648815 -75846159 - RMER13A LTR ERVK 0 860 352 2 795 3009 99 55 17 chr15 27649781 27650091 -75844883 - RLTR44C LTR ERVK -13 489 175 2 795 3009 99 55 17 chr15 27650150 27650310 -75844664 - RLTR44C LTR ERVK -328 174 3 2 795 254 184 94 106 chr15 27650364 27650449 -75844525 - MT2B LTR ERVL -364 237 154 2 795 578 244 62 135 chr15 27651407 27651839 -75843135 + RMER2 LTR ERV1 1 540 -27 2 795 427 291 177 29 chr15 27653691 27654002 -75840972 + MLT1D LTR MaLR 1 357 -148 2 796 2459 60 16 0 chr15 27657447 27657764 -75837210 + ORR1A2 LTR MaLR 1 322 -5 2 796 267 70 233 0 chr15 27657764 27657807 -75837167 + ORR1A3 LTR MaLR 274 326 0 2 796 648 204 61 7 chr15 27657954 27658102 -75836872 + MTEb LTR MaLR 3 158 -221 2 796 425 195 0 12 chr15 27658100 27658183 -75836791 + RMER12 LTR ERVK 1191 1272 -50 2 796 1408 221 62 42 chr15 27664118 27664472 -75830502 + ORR1D1 LTR MaLR 4 364 -10 2 796 286 279 74 37 chr15 27665988 27666096 -75828878 + MTEa LTR MaLR 267 378 -1 2 796 2394 172 14 7 chr15 27668246 27668325 -75826649 + RLTR11A LTR ERVK 104 184 -344 2 796 2394 172 14 7 chr15 27668393 27668735 -75826239 + RLTR11A LTR ERVK 185 527 -1 2 796 310 230 115 0 chr15 27672447 27672534 -75822440 + MLT2B4 LTR ERVL 1 97 -459 2 796 1605 154 184 21 chr15 27685315 27685647 -75809327 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 2 796 290 311 37 9 chr15 27690211 27690318 -75804656 + ORR1E LTR MaLR 12 121 -238 2 796 1171 314 118 154 chr15 27691405 27691966 -75803008 + MTE-int LTR MaLR 7 499 -1081 2 796 1171 314 118 154 chr15 27692154 27693120 -75801854 + MTE-int LTR MaLR 500 1479 -101 2 796 411 328 138 47 chr15 27693111 27693431 -75801543 + ORR1E LTR MaLR 9 357 -2 3 796 548 285 18 12 chr15 27699764 27699931 -75795043 + MER77 LTR ERVL 419 586 -21 3 796 352 307 53 30 chr15 27720950 27721077 -75773897 + MLT1B LTR MaLR 4 133 -257 3 796 333 233 99 84 chr15 27721483 27721614 -75773360 + MLT1B LTR MaLR 253 385 -5 3 796 238 222 16 16 chr15 27724498 27724562 -75770412 + MLT1B LTR MaLR 10 73 -317 3 796 325 272 254 65 chr15 27729619 27729828 -75765146 - MLT1A0 LTR MaLR -97 268 20 3 796 862 328 55 47 chr15 27741607 27741722 -75753252 - MTEa LTR MaLR 0 379 271 3 796 862 328 55 47 chr15 27741902 27742151 -75752823 - MTEa LTR MaLR -109 270 12 3 796 1111 203 62 54 chr15 27742620 27743085 -75751889 + RLTR20C LTR ERVK 1 578 0 3 796 2612 147 153 0 chr15 27743385 27743867 -75751107 + RMER4B LTR ERVK 17 572 -13 3 796 3246 59 7 22 chr15 27752800 27753213 -75741761 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 796 2156 147 57 9 chr15 27772814 27773164 -75721810 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 796 1279 191 138 3 chr15 27779535 27779818 -75715156 + MTC LTR MaLR 89 409 -12 3 797 245 270 52 60 chr15 27802537 27802671 -75692303 - MLT1E3-int LTR MaLR -1198 173 41 3 797 234 269 71 43 chr15 27802737 27802807 -75692167 - MLT1E3 LTR MaLR -68 556 485 3 797 2493 127 32 25 chr15 27804436 27804839 -75690135 + MTC LTR MaLR 16 421 0 3 797 1512 211 92 31 chr15 27809034 27809447 -75685527 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 4 797 297 237 152 17 chr15 27811897 27812026 -75682948 - MLT1A1 LTR MaLR -25 383 254 4 797 469 350 37 0 chr15 27812045 27812208 -75682766 - MLT1A1 LTR MaLR -234 174 6 4 797 303 292 123 7 chr15 27816097 27816235 -75678739 + RMER15 LTR ERVL 422 575 0 4 797 1122 242 161 35 chr15 27837537 27837909 -75657065 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 797 257 292 89 11 chr15 27837965 27838055 -75656919 + MTEa LTR MaLR 2 98 -281 4 797 254 328 0 57 chr15 27838245 27838301 -75656673 + MTEa LTR MaLR 264 316 -63 4 797 254 328 0 57 chr15 27838495 27838561 -75656413 + MTEa LTR MaLR 317 378 -1 4 797 648 245 31 111 chr15 27845996 27846221 -75648753 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 201 4 797 1208 167 60 284 chr15 27863229 27863715 -75631259 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 4 797 598 271 111 35 chr15 27866029 27866044 -75628930 + MTD LTR MaLR 13 23 -356 4 797 954 255 134 7 chr15 27866078 27866403 -75628571 + MTD LTR MaLR 24 419 0 4 797 3315 49 5 15 chr15 27880370 27880781 -75614193 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 797 765 250 111 35 chr15 27890258 27890568 -75604406 + ORR1D2 LTR MaLR 4 372 -7 4 797 1519 249 82 8 chr15 27893790 27894167 -75600807 - MTD LTR MaLR -14 405 1 5 797 240 266 62 25 chr15 27904784 27904865 -75590109 - MER57C2 LTR ERV1 0 434 351 5 797 272 259 167 0 chr15 27904917 27905025 -75589949 - MER57C2 LTR ERV1 -214 220 95 5 797 2319 189 48 98 chr15 27905871 27906433 -75588541 + RMER15 LTR ERVL 38 571 -4 5 797 1268 204 99 37 chr15 27908069 27908421 -75586553 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 797 272 105 0 0 chr15 27909393 27909431 -75585543 + ORR1D2 LTR MaLR 1 38 -332 5 797 486 295 140 97 chr15 27911028 27911471 -75583503 + LTR40b LTR ERVL 1 462 0 5 797 644 134 368 0 chr15 27918039 27918216 -75576758 - MTC LTR MaLR -10 409 169 5 798 1492 197 89 71 chr15 27918512 27918679 -75576295 + MTD LTR MaLR 19 190 -229 5 798 1492 197 89 71 chr15 27918747 27918961 -75576013 + MTD LTR MaLR 191 407 -12 5 798 2229 199 15 5 chr15 27934459 27934869 -75560105 + MTD LTR MaLR 2 415 -4 5 798 316 244 8 73 chr15 27937348 27937472 -75557502 + RMER17A LTR ERVK 361 476 -275 5 798 241 280 53 21 chr15 27941816 27941911 -75553063 + MLT1A1 LTR MaLR 303 400 -8 5 798 437 271 37 9 chr15 27960797 27960905 -75534069 + MLT1C LTR MaLR 22 132 -335 5 798 244 312 112 45 chr15 27961729 27961863 -75533111 - ORR1E LTR MaLR -202 157 15 5 798 488 154 0 13 chr15 27962442 27962521 -75532453 + MTE2b LTR MaLR 5 82 -297 5 798 715 259 39 11 chr15 27962532 27962712 -75532262 + MTE2b LTR MaLR 195 379 0 5 798 387 302 7 80 chr15 27965914 27966065 -75528909 - LTR33A LTR ERVL -361 159 20 6 798 1321 272 21 32 chr15 27969215 27969595 -75525379 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 6 798 261 366 28 73 chr15 27971361 27971538 -75523436 + LTR88b LTR Gypsy? 664 832 -5 6 798 374 270 0 0 chr15 27971845 27971919 -75523055 + MTEa LTR MaLR 9 82 -277 6 798 1736 227 17 6 chr15 27971928 27972273 -75522701 - ORR1D1 LTR MaLR -25 349 1 6 798 440 305 50 61 chr15 27972333 27972602 -75522372 + MTEa LTR MaLR 76 349 -30 6 798 257 321 71 12 chr15 27973831 27973916 -75521058 - ORR1E LTR MaLR -1 358 269 6 798 594 256 124 6 chr15 27977568 27977729 -75517245 + LTR16A LTR ERVL 1 180 -271 6 798 1480 163 49 3 chr15 27978750 27979048 -75515926 + ORR1C1 LTR MaLR 2 378 0 6 798 2259 89 6 31 chr15 27984600 27984923 -75510051 + ORR1A2 LTR MaLR 5 319 -8 6 798 271 169 15 73 chr15 27987480 27987557 -75507417 - MER57A-int LTR ERV1 -298 5889 5827 6 798 318 268 14 99 chr15 27987820 27987888 -75507086 + MLT2B3 LTR ERVL 1 66 -488 6 798 318 268 14 99 chr15 27987937 27988009 -75506965 + MLT2B3 LTR ERVL 67 129 -425 6 798 231 377 19 0 chr15 27988145 27988251 -75506723 + MLT2B3 LTR ERVL 385 492 -62 6 798 1660 166 62 46 chr15 27990003 27990447 -75504527 - RMER17C LTR ERVK -519 439 19 6 798 520 330 118 45 chr15 27990874 27991204 -75503770 + MLT1G1 LTR MaLR 2 355 -224 6 798 400 273 82 48 chr15 27991512 27991658 -75503316 + RMER15 LTR ERVL 425 575 0 6 798 2159 158 11 14 chr15 27992905 27993276 -75501698 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 6 798 450 167 14 0 chr15 27997612 27997684 -75497290 + RLTR14 LTR ERV1 307 379 -3 6 798 2068 137 6 3 chr15 27999060 27999375 -75495599 + ORR1A3 LTR MaLR 11 326 0 6 798 1045 120 0 111 chr15 28001465 28001681 -75493293 - ORR1A3 LTR MaLR -132 194 3 5 798 3510 97 2 6 chr15 28003221 28003698 -75491276 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 1 798 635 237 187 24 chr15 28006431 28006675 -75488299 + MTD LTR MaLR 7 291 -128 2 798 1659 193 32 48 chr15 28006675 28006887 -75488087 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 167 2 798 1659 193 32 48 chr15 28006942 28007105 -75487869 - ORR1C1 LTR MaLR -212 166 9 2 798 422 211 83 0 chr15 28007113 28007222 -75487752 + MTD LTR MaLR 287 404 -15 2 798 633 299 132 53 chr15 28010657 28011035 -75483939 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 1 3 798 446 265 49 117 chr15 28012517 28012722 -75482252 + ORR1E LTR MaLR 1 191 -168 3 798 393 298 61 37 chr15 28013322 28013486 -75481488 + ORR1E LTR MaLR 208 375 -4 3 798 1967 160 66 3 chr15 28014103 28014153 -75480821 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 335 4 798 1967 160 66 3 chr15 28014189 28014501 -75480473 - ORR1B1 LTR MaLR -60 334 2 4 798 1764 207 67 0 chr15 28020329 28020716 -75474258 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 798 1438 201 116 11 chr15 28025802 28026165 -75468809 - MTD LTR MaLR 0 419 19 5 798 1628 186 49 30 chr15 28026493 28026858 -75468116 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 5 798 1015 303 47 29 chr15 28026992 28027478 -75467496 + RMER5 LTR ERV1 40 534 0 6 798 231 399 53 13 chr15 28028137 28028287 -75466687 + LTR16C LTR ERVL 295 450 -39 6 798 2163 211 5 9 chr15 28029437 28029858 -75465116 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 798 256 260 29 59 chr15 28034573 28034675 -75460299 + MLT1I LTR MaLR 301 399 -12 7 798 1893 170 26 23 chr15 28034883 28035232 -75459742 - MTC LTR MaLR -53 368 19 7 798 691 153 23 15 chr15 28037103 28037236 -75457738 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 241 7 798 351 372 53 81 chr15 28041947 28042269 -75452705 + ORR1E LTR MaLR 1 313 -46 8 798 3617 10 2 0 chr15 28042269 28042664 -75452310 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 798 777 302 54 42 chr15 28042865 28043197 -75451777 + MTEa LTR MaLR 8 343 -36 9 798 1256 194 194 19 chr15 28046435 28046586 -75448388 + ORR1C2 LTR MaLR 1 195 -189 9 798 1256 194 194 19 chr15 28046640 28046813 -75448161 + ORR1C2 LTR MaLR 196 381 -3 9 798 1326 240 66 99 chr15 28047155 28047239 -75447735 + MT2A LTR ERVL 1 84 -449 9 798 1326 240 66 99 chr15 28047293 28047754 -75447220 + MT2A LTR ERVL 85 528 -5 9 799 295 269 28 37 chr15 28050160 28050268 -75444706 + RMER13A LTR ERVK 564 670 -190 1 799 545 316 20 60 chr15 28054152 28054401 -75440573 + MLT1D LTR MaLR 265 503 -2 1 799 563 266 92 0 chr15 28055097 28055270 -75439704 + ORR1E LTR MaLR 3 191 -168 1 799 774 311 104 27 chr15 28056566 28057048 -75437926 + LTR53 LTR ERVL 1 519 0 1 799 2727 129 8 33 chr15 28057993 28058483 -75436491 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 478 -79 1 799 295 273 80 0 chr15 28058653 28058741 -75436233 - RMER15 LTR ERVL 0 575 481 1 799 2657 173 39 135 chr15 28058927 28059603 -75435371 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 799 686 268 142 55 chr15 28060074 28060499 -75434475 + MLT1C LTR MaLR 5 443 -24 1 799 1065 202 27 31 chr15 28064049 28064310 -75430664 - MLT1H1 LTR MaLR -48 507 248 1 799 251 306 29 48 chr15 28066031 28066134 -75428840 - MLT1H1 LTR MaLR -356 111 11 1 799 512 209 133 87 chr15 28069733 28069906 -75425068 + MTE2b LTR MaLR 197 377 -2 1 799 1444 166 47 17 chr15 28070457 28070786 -75424188 + ORR1B1 LTR MaLR 1 387 -7 1 799 3297 25 33 0 chr15 28073060 28073458 -75421516 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 1 799 1074 254 117 77 chr15 28074181 28074821 -75420153 - RMER13A LTR ERVK -125 735 1 1 799 1183 256 35 16 chr15 28075191 28075560 -75419414 + MTE2b LTR MaLR 3 378 -1 1 799 389 313 126 57 chr15 28075579 28075928 -75419046 + MLT1B LTR MaLR 1 373 -17 1 799 227 304 223 40 chr15 28081232 28081407 -75413567 - MLT1N2 LTR MaLR -349 213 7 1 799 4271 44 2 6 chr15 28083394 28083899 -75411075 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 1 799 715 321 23 43 chr15 28091250 28091550 -75403424 + MLT1B LTR MaLR 30 323 -67 1 799 294 288 131 25 chr15 28092308 28092470 -75402504 - MLT1G LTR MaLR -289 266 90 1 799 1134 258 46 19 chr15 28092472 28092839 -75402135 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 1 799 357 130 0 0 chr15 28092850 28092904 -75402070 - MurERV4_19-int LTR ERVK -5336 444 391 1 799 1728 214 8 35 chr15 28093087 28093464 -75401510 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 799 325 298 88 125 chr15 28095824 28096303 -75398671 - MLT1C LTR MaLR -4 463 3 1 799 340 318 77 28 chr15 28096904 28097085 -75397889 + MLT1A LTR MaLR 133 322 -52 1 799 626 165 91 0 chr15 28097909 28098030 -75396944 - MTC LTR MaLR -8 413 282 2 799 1687 141 11 0 chr15 28098340 28098616 -75396358 - MTC LTR MaLR -142 279 1 2 799 2384 112 129 2 chr15 28102716 28103111 -75391863 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 1 2 799 1385 214 111 18 chr15 28104225 28104567 -75390407 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 799 476 344 94 75 chr15 28104681 28105096 -75389878 - MLT1D LTR MaLR -70 435 13 2 799 371 311 51 94 chr15 28107945 28108286 -75386688 + RMER13A LTR ERVK 183 567 -60 2 799 1799 138 150 6 chr15 28110364 28110698 -75384276 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 2 799 396 246 384 54 chr15 28111162 28111407 -75383567 + MLT1A0 LTR MaLR 1 326 -39 2 799 673 196 104 6 chr15 28114914 28115078 -75379896 - MTD LTR MaLR -6 413 234 2 799 266 229 163 30 chr15 28116030 28116165 -75378809 - LTR48 LTR ERV1 -633 154 2 2 799 900 289 34 82 chr15 28120461 28120849 -75374125 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 2 799 408 261 17 9 chr15 28125731 28125847 -75369127 + MTEb LTR MaLR 1 117 -262 2 799 1260 155 94 116 chr15 28127063 28127392 -75367582 + ORR1A4 LTR MaLR 8 329 0 2 799 443 289 118 37 chr15 28132178 28132448 -75362526 + LTR48 LTR ERV1 484 775 -12 2 799 1558 148 13 139 chr15 28140018 28140487 -75354487 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 799 709 245 52 52 chr15 28143154 28143365 -75351609 - MTEb LTR MaLR -7 372 162 2 799 1846 174 39 17 chr15 28143478 28143646 -75351328 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 197 2 799 764 223 137 106 chr15 28143646 28144003 -75350971 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 799 1846 174 39 17 chr15 28144003 28144196 -75350778 - ORR1D1 LTR MaLR -178 196 5 2 799 6173 118 21 3 chr15 28149337 28150278 -75344696 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 2 799 1000 254 161 11 chr15 28151772 28152119 -75342855 - MT2A LTR ERVL -134 399 1 3 799 2096 108 16 0 chr15 28152453 28152767 -75342207 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 799 430 290 62 36 chr15 28155943 28156136 -75338838 - LTR78 LTR ERV1 -15 1289 1092 3 799 303 266 124 52 chr15 28157816 28158026 -75336948 - RMER20B LTR ERVK -53 463 235 3 799 358 286 90 34 chr15 28158203 28158380 -75336594 + LTR78 LTR ERV1 1072 1258 -46 3 799 637 336 153 5 chr15 28164495 28164893 -75330081 - MLT1F2 LTR MaLR -9 551 95 3 800 741 223 37 115 chr15 28190701 28190794 -75304180 + MTD LTR MaLR 219 290 -129 3 800 741 223 37 115 chr15 28190944 28191068 -75303906 + MTD LTR MaLR 291 419 0 3 800 668 317 118 38 chr15 28191860 28192257 -75302717 - MLT1D LTR MaLR -76 429 1 3 800 1671 203 22 97 chr15 28192780 28193184 -75301790 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 800 428 342 47 17 chr15 28194632 28194861 -75300113 - MER68 LTR ERVL -287 276 41 3 800 995 304 15 4 chr15 28198587 28198861 -75296113 - MTE2b LTR MaLR -4 375 99 3 800 359 224 50 10 chr15 28217735 28217834 -75277140 - MTEa LTR MaLR 0 379 277 3 800 1326 246 3 41 chr15 28217949 28218241 -75276733 - MTEa LTR MaLR -98 281 1 3 800 291 298 30 49 chr15 28238242 28238349 -75256625 - MLT1C LTR MaLR -46 421 256 4 800 3120 71 13 2 chr15 28238349 28238745 -75256229 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 800 291 344 45 70 chr15 28238745 28238849 -75256125 - MLT1C LTR MaLR -134 333 227 4 800 249 240 24 85 chr15 28245319 28245401 -75249573 + MTEa LTR MaLR 143 219 -160 4 800 8296 25 0 8 chr15 28249267 28250204 -75244770 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 4 800 2482 170 48 10 chr15 28251843 28252325 -75242649 - RLTR17 LTR ERVK -2 690 191 4 800 290 335 110 12 chr15 28258736 28258899 -75236075 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 502 4 800 816 115 0 0 chr15 28263209 28263331 -75231643 + MTB_Mm LTR MaLR 286 407 0 4 800 1564 142 210 32 chr15 28269141 28269326 -75225648 - RMER17C LTR ERVK 0 410 192 4 800 1564 142 210 32 chr15 28269396 28269558 -75225416 - RMER17C LTR ERVK -219 191 1 4 800 572 309 20 25 chr15 28278976 28279172 -75215802 + MTD LTR MaLR 6 200 -219 5 800 575 202 18 0 chr15 28279188 28279302 -75215672 + MTD LTR MaLR 290 405 -14 5 800 616 303 89 57 chr15 28279918 28280289 -75214685 - MLT1B LTR MaLR -4 386 4 5 800 321 229 6 79 chr15 28285192 28285439 -75209535 - RMER17A LTR ERVK -416 473 227 5 800 925 272 48 11 chr15 28297894 28298303 -75196671 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 5 800 873 278 166 24 chr15 28302812 28303144 -75191830 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 800 3418 62 17 12 chr15 28306775 28307180 -75187794 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 800 238 244 90 0 chr15 28308639 28308717 -75186257 - ORR1E LTR MaLR -4 375 291 5 800 324 292 42 50 chr15 28309140 28309259 -75185715 - ORR1E LTR MaLR -224 135 18 5 801 637 225 45 4 chr15 28311896 28312063 -75182911 + MTD LTR MaLR 170 421 0 5 801 1869 212 63 68 chr15 28317960 28318532 -75176442 - RLTR40 LTR ERVK -5 812 244 5 801 1328 157 36 12 chr15 28318918 28319170 -75175804 - RLTR40 LTR ERVK -540 277 20 5 801 2701 68 26 15 chr15 28323508 28323850 -75171124 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 801 3325 134 127 43 chr15 28323933 28324626 -75170348 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 5 801 1516 159 139 16 chr15 28328117 28328517 -75166457 - RMER17C LTR ERVK -531 427 16 5 801 569 318 109 20 chr15 28339936 28340238 -75154736 + LTR52 LTR ERVL 1 329 -92 6 801 972 322 31 36 chr15 28343037 28343456 -75151518 - MTD LTR MaLR -2 417 1 6 801 1050 274 21 18 chr15 28351896 28352182 -75142792 - MTE2b LTR MaLR -35 344 58 6 801 2772 47 18 3 chr15 28352182 28352523 -75142451 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 801 1406 224 57 7 chr15 28354074 28354371 -75140603 - MTC LTR MaLR -49 372 61 6 801 431 320 0 57 chr15 28363807 28363966 -75131008 + MLT1A0 LTR MaLR 214 363 -2 6 801 840 236 46 66 chr15 28364766 28365116 -75129858 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 6 801 7035 61 9 0 chr15 28371248 28372133 -75122841 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 6 801 742 274 94 76 chr15 28393319 28393418 -75101556 - ORR1E LTR MaLR -74 285 176 6 801 742 274 94 76 chr15 28393561 28393737 -75101237 - ORR1E LTR MaLR -184 175 6 6 801 281 333 20 119 chr15 28393889 28394090 -75100884 - LTR86A2 LTR ERVL -225 283 103 6 801 1923 259 41 54 chr15 28402246 28402801 -75092173 + ORR1D1-int LTR MaLR 154 701 -669 6 801 430 166 63 2 chr15 28403303 28403392 -75091582 + ORR1D1 LTR MaLR 289 420 -1 6 801 1315 249 71 15 chr15 28403496 28403891 -75091083 + MTD LTR MaLR 3 419 0 6 801 1823 249 66 4 chr15 28410442 28410942 -75084032 - MT2A LTR ERVL 0 533 3 6 801 608 340 115 4 chr15 28411565 28411825 -75083149 + MLT1A0 LTR MaLR 77 365 0 6 801 351 279 0 0 chr15 28412180 28412248 -75082726 + MT2A LTR ERVL 71 138 -395 6 801 295 319 80 49 chr15 28417347 28417571 -75077403 - MLT1D LTR MaLR -263 242 12 7 801 506 133 33 11 chr15 28418059 28418150 -75076824 + RLTR13C1 LTR ERVK 891 983 0 7 801 253 358 118 31 chr15 28420166 28420394 -75074580 - LTR85c LTR Gypsy? -160 663 416 7 801 792 317 28 68 chr15 28421970 28422363 -75072611 + MLT1C LTR MaLR 83 464 -3 7 801 2231 116 25 6 chr15 28422585 28422906 -75072068 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 801 2589 149 73 28 chr15 28423525 28423593 -75071381 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 460 7 801 2589 157 70 32 chr15 28423632 28424055 -75070919 - RLTR11A LTR ERVK -69 459 15 7 801 4812 161 28 45 chr15 28425753 28426677 -75068297 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 7 801 391 306 78 101 chr15 28433812 28434083 -75060891 + MTEb LTR MaLR 1 271 -108 7 801 264 141 6 17 chr15 28434109 28434171 -75060803 + MTEb LTR MaLR 269 328 -51 7 802 795 351 76 28 chr15 28443060 28443453 -75051521 + MLT2B1 LTR ERVL 65 480 -40 7 802 795 351 76 28 chr15 28443575 28443613 -75051361 + MLT2B1 LTR ERVL 481 517 -3 7 802 681 315 5 77 chr15 28447755 28447975 -75046999 + RMER15 LTR ERVL 187 390 -185 7 802 568 259 102 40 chr15 28450994 28451219 -75043755 + MLT1A0 LTR MaLR 5 243 -122 7 802 380 317 85 74 chr15 28453479 28454062 -75040912 + LTR48 LTR ERV1 1 783 -4 7 802 735 181 23 8 chr15 28457298 28457426 -75037548 + ORR1B1 LTR MaLR 47 176 -218 7 802 1422 144 4 21 chr15 28458788 28459029 -75035945 + ORR1A4 LTR MaLR 93 329 0 7 802 384 290 83 0 chr15 28460413 28460558 -75034416 + MLT1A0 LTR MaLR 5 161 -204 7 802 314 337 39 51 chr15 28460668 28460846 -75034128 + MLT1A0 LTR MaLR 226 401 -7 7 802 321 311 114 12 chr15 28462132 28462298 -75032676 - MLT1A0 LTR MaLR -171 194 12 7 802 5191 82 11 107 chr15 28463619 28464573 -75030401 + RMER17D LTR ERVK 26 887 -2 7 802 1102 262 12 8 chr15 28472081 28472327 -75022647 - ORR1E LTR MaLR -112 247 1 7 802 543 344 44 9 chr15 28478168 28478394 -75016580 + MTD LTR MaLR 41 274 -145 7 802 367 228 146 19 chr15 28489081 28489184 -75005790 + MTD LTR MaLR 1 116 -303 8 802 239 325 62 91 chr15 28492591 28492767 -75002207 + MLT2B3 LTR ERVL 192 362 -192 8 802 1403 196 48 24 chr15 28493507 28493799 -75001175 - MTC LTR MaLR 0 421 123 8 802 472 197 20 12 chr15 28503827 28503935 -74991039 - MTC LTR MaLR -298 109 3 7 802 3218 58 2 0 chr15 28506810 28507205 -74987769 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 802 6858 42 29 1 chr15 28509255 28510087 -74984887 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 1 802 2335 176 36 7 chr15 28514295 28514735 -74980239 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 1 802 1116 248 96 26 chr15 28514738 28515082 -74979892 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 1 802 1179 334 82 25 chr15 28529643 28530165 -74964809 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 9 4 802 2463 152 31 14 chr15 28534125 28534571 -74960403 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 454 -106 5 802 374 242 21 21 chr15 28534804 28534901 -74960073 + RLTR20B2 LTR ERVK 464 560 0 5 802 234 294 138 23 chr15 28535059 28535146 -74959828 - MTD LTR MaLR -26 353 257 5 802 380 282 61 43 chr15 28535200 28535363 -74959611 - MTD LTR MaLR -244 175 10 5 802 367 252 127 78 chr15 28536719 28536861 -74958113 + MTE2a LTR MaLR 125 273 -106 6 802 737 331 76 100 chr15 28538180 28538828 -74956146 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 49 6 802 353 360 12 44 chr15 28541623 28541783 -74953191 + MLT1B LTR MaLR 45 199 -191 6 802 432 200 35 43 chr15 28544540 28544655 -74950319 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 273 7 802 251 312 0 12 chr15 28545470 28545551 -74949423 - MLT1J1 LTR MaLR -2 442 363 8 802 256 305 24 12 chr15 28548178 28548261 -74946713 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 246 8 802 292 315 44 22 chr15 28548662 28548753 -74946221 - ORR1B1 LTR MaLR -73 306 214 7 802 266 303 150 75 chr15 28548837 28549037 -74945937 - ORR1B1 LTR MaLR -162 217 3 7 802 1756 254 108 30 chr15 28551903 28552411 -74942563 - RMER15 LTR ERVL -1 574 27 9 802 2647 88 41 25 chr15 28554506 28554900 -74940074 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 802 4460 140 4 3 chr15 28556522 28557225 -74937749 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1576 2279 -3482 9 802 316 290 78 31 chr15 28558067 28558195 -74936779 + MLT2B3 LTR ERVL 127 260 -410 9 802 298 294 131 95 chr15 28558242 28558464 -74936510 + MLT2B3 LTR ERVL 378 607 -110 9 802 1108 102 45 6 chr15 28572341 28572518 -74922456 - ORR1A2 LTR MaLR -7 320 137 1 802 984 130 166 0 chr15 28572513 28572682 -74922292 - ORR1A1 LTR MaLR -59 287 91 1 802 415 248 187 40 chr15 28572686 28572916 -74922058 + RLTR41 LTR ERV1 254 499 -33 1 802 402 111 0 14 chr15 28572917 28572990 -74921984 - ORR1A2 LTR MaLR -255 72 1 1 803 235 281 132 52 chr15 28574479 28574730 -74920244 - LTR73 LTR ERV1 -46 526 256 1 803 269 286 24 12 chr15 28575708 28575793 -74919181 + MLT1C LTR MaLR 34 119 -348 1 803 532 310 15 46 chr15 28575889 28576085 -74918889 + MLT1C LTR MaLR 276 465 -2 1 803 533 323 126 49 chr15 28576677 28577042 -74917932 - MLT1D LTR MaLR -78 427 35 1 803 523 317 66 26 chr15 28577790 28578017 -74916957 + MLT1B LTR MaLR 18 253 -137 1 803 390 304 51 116 chr15 28585055 28585271 -74909703 + MLT1A LTR MaLR 173 374 0 1 803 1922 149 5 62 chr15 28591786 28592221 -74902753 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 803 342 320 32 45 chr15 28592420 28592574 -74902400 - MER90a LTR ERV1 -22 592 441 1 803 344 241 134 54 chr15 28594648 28594673 -74900301 - MLT2C1 LTR ERVL -7 556 530 1 803 344 249 135 53 chr15 28594725 28594868 -74900106 - MLT2C1 LTR ERVL -34 529 396 1 803 2753 26 8 83 chr15 28596852 28597226 -74897748 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 803 469 309 65 62 chr15 28601603 28601969 -74893005 - ORR1C1 LTR MaLR -2 372 1 1 803 892 176 12 0 chr15 28602022 28602192 -74892782 + RLTR25B LTR ERVK 621 792 -236 1 803 497 227 8 48 chr15 28602193 28602318 -74892656 + RLTR25B LTR ERVK 984 1103 0 1 803 4316 24 0 2 chr15 28605662 28606156 -74888818 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 803 598 174 55 9 chr15 28610369 28610479 -74884495 + MTC LTR MaLR 6 120 -301 1 803 1392 189 15 29 chr15 28610728 28611000 -74883974 + MTC LTR MaLR 146 413 -8 1 803 1305 243 59 96 chr15 28618856 28619584 -74875390 - RMER19B LTR ERVK -13 889 1 2 803 1698 208 190 46 chr15 28622078 28622596 -74872378 + RMER20B LTR ERVK 22 614 -13 2 803 343 299 129 28 chr15 28626714 28626757 -74868217 + MLT1B LTR MaLR 143 188 -202 2 803 343 299 129 28 chr15 28626814 28626987 -74867987 + MLT1B LTR MaLR 189 380 -10 2 803 256 247 105 21 chr15 28629908 28630003 -74864971 + MTEa LTR MaLR 273 375 -4 2 803 366 373 35 6 chr15 28633535 28633705 -74861269 + LTR16A LTR ERVL 261 435 -16 2 803 263 345 24 0 chr15 28635458 28635542 -74859432 + MLT1H LTR MaLR 26 111 -438 2 803 426 281 112 39 chr15 28638974 28639152 -74855822 - RMER15 LTR ERVL -17 558 368 2 803 272 280 13 13 chr15 28642067 28642143 -74852831 + MLT1G3 LTR MaLR 3 78 -517 2 803 416 289 41 0 chr15 28646390 28646511 -74848463 - MLT1B LTR MaLR -2 388 263 2 803 2780 123 0 2 chr15 28649284 28649692 -74845282 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 803 479 322 56 150 chr15 28653970 28654364 -74840610 + MLT1B LTR MaLR 15 371 -19 2 803 2424 203 91 19 chr15 28654920 28655159 -74839815 + RMER15 LTR ERVL 1 273 -302 2 803 2424 203 91 19 chr15 28655854 28656149 -74838825 + RMER15 LTR ERVL 274 574 -1 2 803 1343 192 114 40 chr15 28664438 28664561 -74830413 + ORR1C1 LTR MaLR 1 143 -235 2 803 1343 192 114 40 chr15 28664669 28664897 -74830077 + ORR1C1 LTR MaLR 144 377 -1 2 803 2683 57 18 0 chr15 28667251 28667585 -74827389 - ORR1A1 LTR MaLR -4 342 3 2 803 372 333 80 28 chr15 28669271 28669420 -74825554 + MLT2B3 LTR ERVL 346 499 -55 2 803 372 333 80 28 chr15 28669468 28669494 -74825480 + MLT2B3 LTR ERVL 500 530 -24 2 803 307 364 82 63 chr15 28671662 28671988 -74822986 - ORR1E LTR MaLR -17 353 2 2 803 234 211 169 0 chr15 28671999 28672070 -74822904 + MLT1D LTR MaLR 374 456 -49 2 803 852 293 48 8 chr15 28679012 28679263 -74815711 - MLT1B LTR MaLR 0 390 130 3 803 617 325 68 103 chr15 28680479 28680983 -74813991 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 139 3 803 266 360 132 30 chr15 28681304 28681539 -74813435 - MLT1E2 LTR MaLR -268 281 23 3 803 293 293 55 77 chr15 28683289 28683470 -74811504 - MLT1G1 LTR MaLR -387 192 16 3 803 232 272 12 58 chr15 28690881 28690967 -74804007 - RLTR19B LTR ERVK -260 455 374 3 803 3572 147 75 74 chr15 28691497 28692088 -74802886 + RMER17D LTR ERVK 1 620 -269 3 803 3572 147 75 74 chr15 28692232 28692528 -74802446 + RMER17D LTR ERVK 621 889 0 3 803 311 211 28 0 chr15 28694036 28694107 -74800867 - ORR1D1 LTR MaLR -299 75 3 3 803 462 267 174 68 chr15 28695622 28695915 -74799059 + MLT1E2 LTR MaLR 225 627 0 3 804 408 354 106 47 chr15 28705934 28706275 -74788699 + MT2A LTR ERVL 1 361 -172 3 804 2182 176 94 51 chr15 28714811 28715241 -74779733 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 471 -106 3 804 2182 176 94 51 chr15 28715278 28715381 -74779593 + RLTR20B3 LTR ERVK 472 577 0 3 804 587 330 68 75 chr15 28715517 28715812 -74779162 + LTR52 LTR ERVL 5 297 -124 3 804 1249 222 86 31 chr15 28716765 28717154 -74777820 - MT2B LTR ERVL 0 601 60 3 804 374 269 99 60 chr15 28720129 28720177 -74774797 - MT2B LTR ERVL -305 293 108 3 804 1157 178 147 56 chr15 28720393 28720427 -74774547 + MTB LTR MaLR 34 67 -329 3 804 1189 142 160 44 chr15 28720498 28720748 -74774226 + MTB LTR MaLR 70 348 -52 3 804 464 308 106 45 chr15 28720781 28721046 -74773928 - MLT2F LTR ERVL -104 559 279 3 804 733 336 56 71 chr15 28723986 28724396 -74770578 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 224 3 804 873 306 56 59 chr15 28726047 28726404 -74768570 + MER67D LTR ERV1 23 378 -136 3 804 1795 243 17 42 chr15 28726595 28727071 -74767903 + RMER5 LTR ERV1 43 506 -28 3 804 249 280 48 39 chr15 28727275 28727379 -74767595 - RMER5 LTR ERV1 0 534 430 3 804 670 299 128 24 chr15 28729314 28729650 -74765324 - MTEa LTR MaLR 0 379 9 3 804 1730 176 86 17 chr15 28730689 28731048 -74763926 + ORR1B1 LTR MaLR 3 386 -8 3 804 273 331 99 0 chr15 28732619 28732740 -74762234 - MLT1A0 LTR MaLR -202 163 31 3 804 229 352 74 28 chr15 28735815 28735923 -74759051 - MLT1A0-int LTR MaLR -32 1355 1243 3 804 2117 180 13 5 chr15 28741557 28741931 -74753043 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 4 804 258 305 12 0 chr15 28744599 28744681 -74750293 - ORR1E LTR MaLR -2 377 295 4 804 259 335 111 41 chr15 28745032 28745203 -74749771 - ORR1E LTR MaLR -167 192 10 4 804 1422 258 66 13 chr15 28747466 28747858 -74747116 - MTC LTR MaLR -8 413 1 4 804 407 322 40 150 chr15 28753341 28753740 -74741234 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 4 804 539 299 98 39 chr15 28770718 28770972 -74724002 + MLT1B LTR MaLR 3 271 -119 4 804 306 50 0 0 chr15 28773915 28773955 -74721019 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 354 4 804 3494 149 91 31 chr15 28773955 28774053 -74720921 + RMER6A LTR ERVK 1 122 -634 4 804 3494 149 91 31 chr15 28774756 28775370 -74719604 + RMER6A LTR ERVK 123 756 0 4 804 335 76 7 5 chr15 28775370 28775418 -74719556 - ORR1B1 LTR MaLR -35 359 291 4 804 1402 198 66 28 chr15 28775985 28776271 -74718703 + ORR1B1 LTR MaLR 1 297 -97 4 804 286 212 99 12 chr15 28777768 28777849 -74717125 + ORR1B1 LTR MaLR 272 359 0 4 804 242 159 45 0 chr15 28780258 28780302 -74714672 - MLT2C1 LTR ERVL -2 561 516 4 804 279 266 75 68 chr15 28781594 28781727 -74713247 + MLT1I-int LTR MaLR 126 259 -1128 4 804 228 349 86 40 chr15 28782377 28782529 -74712445 + LTR16B LTR ERVL 105 263 -199 4 804 234 367 29 29 chr15 28782921 28783095 -74711879 + LTR16B LTR ERVL 274 447 -16 4 804 838 185 45 6 chr15 28784267 28784446 -74710528 - RLTR28 LTR ERVL -11 513 328 4 804 334 246 14 0 chr15 28784564 28784633 -74710341 - MTEa LTR MaLR -291 88 19 4 804 248 397 85 62 chr15 28784843 28785232 -74709742 + MLT1I LTR MaLR 12 409 -2 4 804 1454 252 86 38 chr15 28793154 28793629 -74701345 - RMER13A LTR ERVK -362 498 1 4 804 463 203 80 16 chr15 28795964 28796089 -74698885 - RMER12 LTR ERVK -840 482 350 4 804 374 327 194 35 chr15 28796086 28796421 -74698553 + MLT1D LTR MaLR 89 476 -29 4 804 453 370 25 38 chr15 28801498 28801734 -74693240 - MLT1D LTR MaLR -8 497 265 4 804 437 201 145 20 chr15 28803745 28803897 -74691077 + RLTR15 LTR ERVK 1 171 -188 5 804 338 314 43 43 chr15 28803897 28804153 -74690821 + RLTR15 LTR ERVK 83 338 -21 5 804 6390 195 23 62 chr15 28804993 28806454 -74688520 - RMER12B LTR ERVK 0 1404 1 5 804 3096 37 37 0 chr15 28819860 28820242 -74674732 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 804 418 339 25 25 chr15 28821059 28821301 -74673673 - RLTR15 LTR ERVK -47 312 71 5 805 632 237 0 14 chr15 28849008 28849149 -74645825 + ORR1B1-int LTR MaLR 1371 1509 0 5 805 1362 193 188 15 chr15 28849149 28849485 -74645489 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 805 274 276 134 88 chr15 28850417 28850588 -74644386 - MLT1A1 LTR MaLR -23 385 207 5 805 259 227 151 54 chr15 28850603 28850696 -74644278 - MLT1A1 LTR MaLR -263 102 1 5 805 1526 124 112 0 chr15 28857517 28857767 -74637207 + MTB_Mm LTR MaLR 130 407 0 5 805 7384 133 20 4 chr15 28857958 28859184 -74635790 + ORR1A2-int LTR MaLR 718 1963 0 5 805 1951 151 12 6 chr15 28859184 28859504 -74635470 + ORR1A2 LTR MaLR 1 322 -5 5 805 6754 84 36 65 chr15 28860039 28860534 -74634440 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 554 5 805 6754 84 36 65 chr15 28860683 28861241 -74633733 - RLTR13D5 LTR ERVK -470 553 1 5 805 372 346 86 38 chr15 28877735 28877921 -74617053 + LTR16A LTR ERVL 162 356 -95 6 805 2707 91 34 3 chr15 28885298 28885682 -74609292 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 805 280 248 46 46 chr15 28896411 28896442 -74598532 - RLTR43A LTR ERVK -33 331 302 6 805 280 248 46 46 chr15 28896881 28896978 -74597996 - RLTR43A LTR ERVK -63 301 203 6 805 1062 290 59 33 chr15 28898631 28899023 -74595951 - MTD LTR MaLR 0 419 18 6 805 1935 235 157 0 chr15 28902019 28902516 -74592458 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 6 805 590 212 44 0 chr15 28904123 28904236 -74590738 + ETnERV2-int LTR ERVK 7075 7192 -214 6 805 468 350 19 42 chr15 28906463 28906728 -74588246 - RMER15 LTR ERVL -15 560 302 6 805 2756 64 6 0 chr15 28908995 28909339 -74585635 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 6 805 2981 95 166 15 chr15 28909729 28910276 -74584698 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 630 -24 6 805 977 266 21 51 chr15 28917713 28918011 -74576963 + MT2B LTR ERVL 285 553 -48 6 805 3144 53 8 2 chr15 28919111 28919505 -74575469 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 805 1142 274 98 27 chr15 28923169 28923506 -74571468 + ORR1D2 LTR MaLR 1 361 -9 6 805 1015 261 112 18 chr15 28924628 28924968 -74570006 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 6 805 3055 80 10 2 chr15 28930945 28931348 -74563626 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 1 6 805 2407 174 88 40 chr15 28931348 28931485 -74563489 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1098 960 6 805 2407 174 88 40 chr15 28931803 28932187 -74562787 - MTB_Mm-int LTR MaLR -139 959 552 6 805 1190 118 99 60 chr15 28932173 28932369 -74562605 - MTB_Mm-int LTR MaLR -836 262 58 6 805 2991 78 5 2 chr15 28932369 28932768 -74562206 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 805 1190 118 99 60 chr15 28932768 28932823 -74562151 - MTB_Mm-int LTR MaLR -1041 57 1 6 805 2862 107 7 2 chr15 28932823 28933228 -74561746 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 805 4751 183 50 6 chr15 28938785 28939701 -74555273 + RMER17B LTR ERVK 2 958 0 6 805 283 146 73 0 chr15 28939920 28939975 -74554999 + RMER17B LTR ERVK 1 59 -899 6 805 3418 151 30 11 chr15 28939969 28940666 -74554308 - RMER17B LTR ERVK -41 917 1 6 805 497 202 32 2 chr15 28943578 28943725 -74551249 + ORR1B1 LTR MaLR 1 190 -204 7 805 444 240 79 61 chr15 28944010 28944174 -74550800 + RMER5 LTR ERV1 338 504 -30 7 805 3900 68 0 42 chr15 28944229 28944754 -74550220 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 7 805 1391 289 62 38 chr15 28945456 28945865 -74549109 - ORR1D2-int LTR MaLR -755 615 208 7 805 1754 164 22 33 chr15 28945865 28946224 -74548750 + RLTR15 LTR ERVK 1 355 -4 7 805 1391 289 62 38 chr15 28946224 28946347 -74548627 - ORR1D2-int LTR MaLR -1163 207 70 7 805 526 262 39 28 chr15 28946459 28946656 -74548318 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 154 7 805 672 207 85 42 chr15 28946692 28946904 -74548070 + RMER5 LTR ERV1 1 221 -313 7 805 1268 250 21 33 chr15 28946933 28947268 -74547706 + RMER5 LTR ERV1 196 526 -8 7 805 2135 185 74 89 chr15 28950280 28950821 -74544153 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 7 805 568 238 8 0 chr15 28951231 28951353 -74543621 + RMER5 LTR ERV1 1 123 -411 7 805 466 283 6 25 chr15 28951346 28951509 -74543465 + RMER5 LTR ERV1 370 529 -5 7 805 407 292 75 5 chr15 28952085 28952226 -74542748 - ORR1D2 LTR MaLR -254 140 1 7 805 1666 296 10 7 chr15 28952430 28952848 -74542126 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 805 2250 98 6 0 chr15 28953193 28953510 -74541464 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 805 227 162 0 0 chr15 28956571 28956608 -74538366 - RMER15 LTR ERVL -538 37 1 7 805 236 330 22 11 chr15 28956608 28956692 -74538282 - ORR1E LTR MaLR -272 87 3 7 806 238 242 16 16 chr15 28968526 28968589 -74526385 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -45 697 635 7 806 1698 162 18 59 chr15 28976534 28976874 -74518100 + ORR1A4 LTR MaLR 1 326 -3 7 806 2742 59 18 0 chr15 28979375 28979715 -74515259 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 7 806 1411 195 23 32 chr15 28992283 28992591 -74502383 + RMER4A LTR ERVK 1 305 -161 7 806 508 209 122 0 chr15 28992599 28992714 -74502260 - RMER4A LTR ERVK -61 405 277 7 806 420 355 50 32 chr15 28998188 28998470 -74496504 + RMER15 LTR ERVL 275 561 -14 7 806 319 256 55 11 chr15 29000961 29001052 -74493922 - RLTR25B LTR ERVK -500 528 434 2 806 485 207 0 0 chr15 29000975 29001062 -74493912 - MT2B LTR ERVL -333 268 182 3 806 563 141 111 0 chr15 29001048 29001147 -74493827 - RMER6C LTR ERVK -580 110 1 4 806 1082 265 107 17 chr15 29016290 29016636 -74478338 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 2 806 279 333 29 7 chr15 29022315 29022451 -74472523 - MLT1B LTR MaLR -241 149 11 3 806 735 278 15 25 chr15 29023292 29023491 -74471483 - ORR1D2 LTR MaLR -163 207 11 3 806 282 267 139 0 chr15 29024015 29024116 -74470858 + ORR1D2 LTR MaLR 9 123 -247 3 806 560 305 89 42 chr15 29024245 29024481 -74470493 - ORR1E LTR MaLR -109 250 4 3 806 385 306 132 40 chr15 29025205 29025477 -74469497 - RLTR12B LTR ERVK -190 338 42 3 806 521 319 59 88 chr15 29025879 29026346 -74468628 - RMER13A LTR ERVK -28 599 96 3 806 1197 287 67 9 chr15 29027501 29027842 -74467132 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 6 3 806 281 204 37 0 chr15 29031516 29031570 -74463404 - MTE2a LTR MaLR -55 324 269 4 806 2031 211 43 5 chr15 29039614 29040037 -74454937 + BGLII_B LTR ERVK 3 441 0 5 806 1136 284 97 0 chr15 29053345 29053504 -74441470 - MTEa LTR MaLR -2 377 208 7 806 1136 284 97 0 chr15 29053567 29053749 -74441225 - MTEa LTR MaLR -172 207 4 7 806 274 139 0 0 chr15 29057257 29057300 -74437674 + MTEa LTR MaLR 72 114 -265 8 806 497 271 105 47 chr15 29057315 29057505 -74437469 + MTEa LTR MaLR 177 377 -2 8 806 4070 141 73 102 chr15 29058025 29058958 -74436016 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 8 806 1797 110 3 33 chr15 29058964 29059265 -74435709 - RMER17A2 LTR ERVK -607 299 8 8 806 2376 100 78 13 chr15 29060581 29060967 -74434007 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 9 806 2347 105 78 13 chr15 29061009 29061395 -74433579 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 411 1 9 806 5715 62 12 19 chr15 29061395 29062146 -74432828 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 9 806 2128 86 0 0 chr15 29062145 29062423 -74432551 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 9 806 3428 65 18 22 chr15 29062423 29063070 -74431904 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 94 9 806 227 267 0 0 chr15 29063073 29063118 -74431856 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 9 806 483 95 78 186 chr15 29063118 29063247 -74431727 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 9 9 806 2424 118 117 5 chr15 29063248 29063675 -74431299 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 9 806 836 187 54 21 chr15 29069661 29069847 -74425127 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 337 1 806 1139 193 29 72 chr15 29070097 29070337 -74424637 - RLTR11A LTR ERVK -165 386 118 1 806 1139 179 10 72 chr15 29070708 29070769 -74424205 - RLTR11A LTR ERVK -369 159 65 1 806 3293 154 18 94 chr15 29070776 29071572 -74423402 + RMER17A LTR ERVK 1 735 -16 1 806 351 250 11 22 chr15 29071605 29071695 -74423279 - RLTR11A LTR ERVK -439 89 1 1 806 879 322 52 32 chr15 29076090 29076433 -74418541 - ORR1D2 LTR MaLR -16 354 5 1 806 1102 191 59 8 chr15 29076467 29076705 -74418269 + RLTR15 LTR ERVK 106 355 -4 1 806 1353 245 59 31 chr15 29078469 29078696 -74416278 - RMER10B LTR ERVL 0 398 154 1 806 1353 245 59 31 chr15 29078874 29079033 -74415941 - RMER10B LTR ERVL -245 153 1 1 806 1385 278 65 32 chr15 29081381 29082253 -74412721 + MYSERV-int LTR ERVK 3775 4706 -1844 1 806 3446 195 53 44 chr15 29082252 29083088 -74411886 + MYSERV6-int LTR ERVK 8063 8905 -54 1 806 3029 69 38 0 chr15 29083212 29083604 -74411370 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 806 560 207 68 20 chr15 29083605 29083753 -74411221 + RLTR12B LTR ERVK 58 212 -316 1 806 282 308 109 83 chr15 29083734 29083964 -74411010 - RLTR12B LTR ERVK -52 476 241 1 806 648 293 18 23 chr15 29089478 29089649 -74405325 + MT2A LTR ERVL 243 412 -121 1 807 1975 198 73 0 chr15 29107633 29108016 -74386958 - MTC LTR MaLR -8 413 3 1 807 252 59 0 0 chr15 29112794 29112828 -74382146 + RMER19B LTR ERVK 869 902 0 1 807 2647 53 3 0 chr15 29122688 29123028 -74371946 + ORR1A1 LTR MaLR 1 341 -5 1 807 225 315 34 110 chr15 29123760 29123906 -74371068 + RMER15 LTR ERVL 346 480 -95 1 807 3130 31 8 13 chr15 29131222 29131436 -74363538 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 181 2 807 4155 52 4 0 chr15 29131436 29131937 -74363037 - RLTR1C LTR ERV1 0 503 1 2 807 3130 31 8 13 chr15 29131937 29132120 -74362854 - MTA_Mm LTR MaLR -216 180 1 2 807 8074 55 62 1 chr15 29132120 29133155 -74361819 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 807 3037 45 48 0 chr15 29133155 29133533 -74361441 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 807 3205 56 0 5 chr15 29138248 29138646 -74356328 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 807 1659 219 42 44 chr15 29141376 29141759 -74353215 - MTC LTR MaLR -39 382 1 2 807 279 302 66 0 chr15 29141976 29142082 -74352892 - LTR79 LTR ERVL -38 489 377 2 807 1036 232 117 96 chr15 29145157 29145543 -74349431 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 807 458 177 51 244 chr15 29145584 29145801 -74349173 + ORR1B1-int LTR MaLR 531 705 -1258 2 807 1087 187 12 115 chr15 29145739 29146114 -74348860 + MT2B LTR ERVL 32 281 -320 2 807 979 177 50 0 chr15 29146124 29146305 -74348669 + ORR1B1 LTR MaLR 132 321 -8 2 807 1985 96 83 46 chr15 29157382 29157730 -74337244 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 5 2 807 327 24 0 0 chr15 29157755 29157797 -74337177 - RLTR10B LTR ERVK -250 42 1 2 807 330 344 48 30 chr15 29169824 29169992 -74324982 - RMER15 LTR ERVL -3 572 402 2 807 347 327 10 10 chr15 29170202 29170304 -74324670 - RMER15-int LTR ERVL -2 4997 4896 2 807 370 276 20 0 chr15 29170297 29170395 -74324579 - RMER15-int LTR ERVL -674 4325 4226 2 807 914 342 35 5 chr15 29170717 29171111 -74323863 - RMER15-int LTR ERVL -413 4586 4181 2 807 280 231 0 0 chr15 29171127 29171179 -74323795 - RMER15-int LTR ERVL -2612 2387 2336 2 807 1059 262 33 85 chr15 29171470 29171705 -74323269 + ORR1C2 LTR MaLR 2 227 -157 2 807 1059 262 33 85 chr15 29171851 29171978 -74322996 + ORR1C2 LTR MaLR 228 345 -39 2 807 808 315 34 34 chr15 29172114 29172466 -74322508 - RMER15-int LTR ERVL -3354 1645 1294 2 807 1016 351 37 32 chr15 29172714 29172847 -74322127 - RMER15-int LTR ERVL -3695 1304 1172 2 807 2672 84 71 5 chr15 29172847 29173242 -74321732 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 807 1016 351 37 32 chr15 29173242 29173727 -74321247 - RMER15-int LTR ERVL -3828 1171 683 2 807 3071 109 32 9 chr15 29180061 29180238 -74314736 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 286 2 807 3071 109 32 9 chr15 29180290 29180576 -74314398 - MT2C_Mm LTR ERVL -190 285 1 2 807 2540 163 24 94 chr15 29182841 29183469 -74311505 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 2 807 2490 207 15 8 chr15 29187438 29187920 -74307054 - RMER19C LTR ERVK -32 579 1 2 807 281 279 68 130 chr15 29192537 29192698 -74302276 + LTR80A LTR ERVL 44 194 -389 2 807 335 309 27 149 chr15 29197845 29198037 -74296937 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1155 3 807 335 309 27 149 chr15 29198893 29198921 -74296053 - RMER12 LTR ERVK -168 1154 1129 3 807 3140 185 105 52 chr15 29199349 29200236 -74294738 - RMER12 LTR ERVK -187 1135 221 3 807 337 302 60 30 chr15 29201177 29201310 -74293664 + MTD LTR MaLR 117 253 -166 3 807 256 211 17 17 chr15 29201954 29202012 -74292962 - ERVL-E-int LTR ERVL -1222 4445 4388 3 807 390 287 7 78 chr15 29202014 29202156 -74292818 + MTD LTR MaLR 250 405 -14 3 807 1254 276 85 117 chr15 29202190 29203126 -74291848 + MTC-int LTR MaLR 40 1311 -269 3 807 280 216 111 11 chr15 29205930 29206024 -74288950 + MTE-int LTR MaLR 1500 1580 0 3 807 339 314 0 62 chr15 29206569 29206715 -74288259 + MTD LTR MaLR 267 403 -16 3 807 524 256 30 15 chr15 29212224 29212355 -74282619 + ORR1D1 LTR MaLR 9 141 -233 3 807 3712 35 5 0 chr15 29214162 29214596 -74280378 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 807 8003 41 0 0 chr15 29214596 29215532 -74279442 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6646 3 807 42064 38 0 1 chr15 29215518 29220462 -74274512 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 3 807 2633 95 53 3 chr15 29220460 29220840 -74274134 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 3 807 3759 30 5 0 chr15 29220840 29221274 -74273700 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 807 1556 130 151 0 chr15 29222701 29222985 -74271989 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 3 807 1804 211 63 8 chr15 29227336 29227732 -74267242 - MTC LTR MaLR -3 418 1 3 808 269 374 120 38 chr15 29235659 29235976 -74258998 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 19 3 808 3487 23 0 0 chr15 29238916 29239312 -74255662 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 808 387 396 19 6 chr15 29241149 29241309 -74253665 + MTEa LTR MaLR 17 178 -201 3 808 307 291 76 32 chr15 29241338 29241523 -74253451 + MTEa LTR MaLR 164 356 -23 3 808 342 236 14 0 chr15 29241565 29241637 -74253337 + MTE-int LTR MaLR 31 103 -1477 3 808 233 246 59 34 chr15 29241703 29241821 -74253153 + RMER4B LTR ERVK 465 585 0 3 808 766 362 64 44 chr15 29241824 29242231 -74252743 + MTE-int LTR MaLR 297 711 -869 3 808 667 282 47 43 chr15 29242266 29242499 -74252475 - MTEa LTR MaLR -141 238 5 3 808 425 326 57 48 chr15 29248082 29248311 -74246663 - MTE2a LTR MaLR 0 379 149 3 808 227 309 37 0 chr15 29248335 29248416 -74246558 - MTE2a LTR MaLR -287 92 9 3 808 1312 171 0 0 chr15 29256939 29257155 -74237819 - RMER15 LTR ERVL 0 575 360 3 808 323 295 31 31 chr15 29258724 29258822 -74236152 + MLT1C LTR MaLR 356 453 -14 3 808 1298 294 36 16 chr15 29259581 29259965 -74235009 - MTD LTR MaLR -14 405 14 3 808 2835 82 52 72 chr15 29260974 29261459 -74233515 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 808 284 396 73 0 chr15 29265704 29265868 -74229106 - MLT1A LTR MaLR -4 370 195 4 808 830 282 78 78 chr15 29269910 29270268 -74224706 + MTEa LTR MaLR 15 372 -7 4 808 373 280 48 8 chr15 29274586 29274712 -74220262 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 898 4 808 405 207 71 196 chr15 29274696 29274864 -74220110 - RLTR25B LTR ERVK -257 771 625 4 808 1942 220 18 97 chr15 29283365 29283859 -74211115 - RLTR25B LTR ERVK -573 455 1 4 808 368 333 25 61 chr15 29285892 29286055 -74208919 + RMER15 LTR ERVL 296 452 -123 4 808 741 287 149 16 chr15 29287868 29288183 -74206791 + ORR1D2 LTR MaLR 14 370 0 4 808 2125 192 143 45 chr15 29290880 29291508 -74203466 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 4 808 2088 189 36 115 chr15 29294811 29295342 -74199632 - RMER19C LTR ERVK 0 611 123 4 808 815 87 9 0 chr15 29295805 29295920 -74199054 + BGLII_Mus LTR ERVK 271 386 -36 4 808 368 111 0 0 chr15 29302185 29302239 -74192735 + BGLII_Mus LTR ERVK 369 422 0 4 808 2036 139 9 0 chr15 29311558 29311882 -74183092 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 808 8438 170 86 5 chr15 29311882 29313540 -74181434 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1792 0 4 808 822 238 118 79 chr15 29313540 29313855 -74181119 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 808 629 190 129 14 chr15 29318841 29318980 -74175994 + RMER12B LTR ERVK 3 157 -1247 4 808 4894 190 44 11 chr15 29325380 29326423 -74168551 + RMER12B LTR ERVK 144 1220 -184 4 808 233 324 68 10 chr15 29328626 29328729 -74166245 - ORR1E LTR MaLR -250 109 1 4 808 3091 175 35 112 chr15 29336481 29337261 -74157713 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 4 808 2298 208 51 62 chr15 29341835 29342514 -74152460 - BGLII_B LTR ERVK 0 553 1 4 808 3008 73 2 15 chr15 29343272 29343673 -74151301 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 808 2975 18 0 0 chr15 29350923 29351260 -74143714 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 808 1662 163 24 178 chr15 29352176 29352683 -74142291 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 1 4 808 1988 103 56 3 chr15 29352808 29353111 -74141863 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 808 254 360 25 59 chr15 29356085 29356203 -74138771 + MLT1A LTR MaLR 9 122 -252 5 808 6721 76 16 0 chr15 29356651 29357530 -74137444 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 5 809 1575 208 82 55 chr15 29365170 29365245 -74129729 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 448 5 809 1575 208 82 55 chr15 29365291 29365729 -74129245 - RLTR11A LTR ERVK -81 447 2 5 809 265 250 0 0 chr15 29365729 29365793 -74129181 + RLTR42-int LTR ERVK 1542 1605 -3917 5 809 613 105 38 14 chr15 29368155 29368280 -74126694 - ORR1A3 LTR MaLR -2 327 203 5 809 508 241 87 101 chr15 29370798 29370987 -74123987 - ORR1E LTR MaLR 0 379 182 5 809 508 266 149 84 chr15 29371021 29371157 -74123817 - ORR1E LTR MaLR -178 181 9 5 809 3012 73 0 5 chr15 29372455 29372852 -74122122 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 5 809 747 285 22 78 chr15 29376556 29376826 -74118148 - MTEa LTR MaLR -123 256 2 5 809 3366 176 55 29 chr15 29380959 29381515 -74113459 + RMER6A LTR ERVK 1 585 -171 5 809 3366 176 55 29 chr15 29381562 29381694 -74113280 + RMER6A LTR ERVK 586 707 -49 5 809 375 140 0 0 chr15 29381896 29381953 -74113021 + RMER6A LTR ERVK 700 756 0 5 809 1060 299 63 3 chr15 29385324 29385640 -74109334 + MTD LTR MaLR 85 419 0 5 809 935 262 98 63 chr15 29385640 29386279 -74108695 + MTD-int LTR MaLR 2 751 -507 5 809 1723 170 18 35 chr15 29387049 29387465 -74107509 - RLTR11B LTR ERVK -6 447 1 5 809 4395 94 7 118 chr15 29387645 29388490 -74106484 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 5 809 2203 117 3 21 chr15 29389161 29389493 -74105481 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 809 2392 51 13 0 chr15 29391369 29391681 -74103293 + ORR1A0 LTR MaLR 31 346 0 5 809 2629 79 108 0 chr15 29392927 29393308 -74101666 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 5 809 629 248 156 10 chr15 29407801 29408045 -74086929 - RMER20B LTR ERVK -93 423 147 5 809 1062 317 40 49 chr15 29408094 29408645 -74086329 - MERVK26-int LTR ERVK -64 6855 6310 5 809 281 346 125 36 chr15 29412406 29412574 -74082400 - MLT1B LTR MaLR -4 386 204 5 809 318 363 49 85 chr15 29415136 29415650 -74079324 + MLT2B1 LTR ERVL 16 503 -53 5 809 231 360 79 0 chr15 29416210 29416324 -74078650 + RLTR13B1 LTR ERVK 210 332 -561 5 809 541 99 49 0 chr15 29430554 29430635 -74064339 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 234 6 809 2858 145 99 30 chr15 29430635 29431192 -74063782 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 1 6 809 454 144 303 23 chr15 29431192 29431328 -74063646 - ORR1A2 LTR MaLR -89 238 63 6 809 1687 185 148 122 chr15 29431522 29432283 -74062691 - RMER6C LTR ERVK 0 756 1 6 809 1663 218 112 65 chr15 29433679 29434089 -74060885 - RMER6C LTR ERVK 0 690 270 6 809 1663 218 112 65 chr15 29434118 29434366 -74060608 - RMER6C LTR ERVK -421 269 1 6 809 1309 74 10 50 chr15 29436402 29436601 -74058373 - BGLII LTR ERVK -228 193 3 6 809 2626 165 9 17 chr15 29440671 29441134 -74053840 - RLTR25B LTR ERVK -564 464 6 6 809 329 300 28 28 chr15 29441298 29441442 -74053532 + MTE-int LTR MaLR 1391 1534 -46 6 809 1379 163 228 9 chr15 29447884 29448218 -74046756 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 809 416 325 0 103 chr15 29448746 29448890 -74046084 + MTE2a LTR MaLR 1 127 -252 6 809 416 325 0 103 chr15 29449595 29449635 -74045339 + MTE2a LTR MaLR 128 166 -213 6 809 655 270 22 22 chr15 29449946 29450128 -74044846 + MTE2a LTR MaLR 198 379 0 6 809 454 278 53 30 chr15 29450604 29450799 -74044175 + MER67D LTR ERV1 1 200 -511 6 809 2215 228 43 20 chr15 29456422 29456484 -74038490 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 449 6 809 4430 110 47 15 chr15 29456484 29457212 -74037762 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 6 809 2215 228 43 20 chr15 29457212 29457642 -74037332 - RLTR18B LTR ERVK -64 448 5 6 809 615 367 66 29 chr15 29459861 29460349 -74034625 + MER89 LTR ERV1 20 525 -34 6 809 597 386 21 50 chr15 29461439 29461679 -74033295 - MTEa LTR MaLR -122 257 25 6 809 246 388 10 0 chr15 29482812 29482915 -74012059 + MLT1H1 LTR MaLR 65 168 -387 6 809 380 350 89 17 chr15 29483140 29483320 -74011654 + LTR16A LTR ERVL 159 351 -100 6 810 325 291 51 112 chr15 29496860 29497148 -73997826 + ORR1E LTR MaLR 103 379 0 6 810 1527 177 88 0 chr15 29501492 29501797 -73993177 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 3 810 345 333 8 0 chr15 29503047 29503170 -73991804 + MER110 LTR ERV1 343 466 -25 5 810 252 337 30 0 chr15 29503414 29503515 -73991459 - RMER15 LTR ERVL -65 510 407 6 810 428 377 20 10 chr15 29504289 29504490 -73990484 + MLT1A0 LTR MaLR 115 317 -48 7 810 381 236 16 46 chr15 29515620 29515749 -73979225 - RMER13B LTR ERVK 0 908 729 1 810 2678 148 35 11 chr15 29515719 29516178 -73978796 - RMER13B LTR ERVK -438 470 1 1 810 431 311 150 60 chr15 29533269 29533536 -73961438 + MLT2D LTR ERVL 10 300 -114 3 810 293 348 161 38 chr15 29534865 29535206 -73959768 + MLT1E3 LTR MaLR 42 424 -200 3 810 2802 87 23 15 chr15 29543608 29544004 -73950970 - MTB LTR MaLR 0 400 2 5 810 278 319 62 14 chr15 29544004 29544150 -73950824 + MLT1A1 LTR MaLR 244 396 -12 5 810 869 349 36 46 chr15 29548103 29548578 -73946396 - MTE-int LTR MaLR -1014 566 97 5 810 484 259 30 54 chr15 29548630 29548836 -73946138 - MTEa LTR MaLR -1 378 173 6 810 277 292 22 104 chr15 29561037 29561171 -73933803 - MT2B LTR ERVL -323 278 156 8 810 3826 163 51 12 chr15 29562710 29563432 -73931542 + RMER12 LTR ERVK 8 757 -565 8 810 250 266 239 15 chr15 29568721 29568851 -73926123 + RMER15 LTR ERVL 352 510 -65 9 810 231 261 135 0 chr15 29572105 29572177 -73922797 + RMER17A LTR ERVK 356 440 -311 9 810 231 261 135 0 chr15 29572226 29572264 -73922710 + RMER17A LTR ERVK 441 480 -271 9 810 2166 120 3 0 chr15 29575589 29575906 -73919068 + ORR1A2 LTR MaLR 2 319 -8 1 810 4665 189 46 14 chr15 29575910 29576953 -73918021 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1076 -716 1 810 2993 141 12 18 chr15 29576964 29577456 -73917518 + ORR1A2-int LTR MaLR 1475 1963 0 1 810 1937 142 29 13 chr15 29577456 29577770 -73917204 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 810 2224 62 69 0 chr15 29588509 29588814 -73906160 + ORR1A1 LTR MaLR 21 346 0 1 810 499 330 71 37 chr15 29593134 29593402 -73901572 + MLT1A0 LTR MaLR 87 363 -2 1 810 309 315 71 84 chr15 29593608 29593847 -73901127 - MER31A LTR ERV1 -11 455 220 1 810 3277 57 2 2 chr15 29594894 29595301 -73899673 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 810 313 287 87 0 chr15 29602253 29602368 -73892606 + ORR1E LTR MaLR 1 125 -234 1 810 245 267 18 98 chr15 29603339 29603451 -73891523 - LTR37B LTR ERV1 -199 269 167 1 810 2393 122 22 55 chr15 29608224 29608640 -73886334 - RLTR9D LTR ERVK -1 402 1 1 810 691 191 47 130 chr15 29617330 29617559 -73877415 - ORR1C2 LTR MaLR -201 183 1 1 810 2136 200 103 27 chr15 29619031 29619134 -73875840 + RLTR12A LTR ERVK 1 97 -471 1 810 2760 55 9 0 chr15 29619134 29619477 -73875497 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 810 2136 200 103 27 chr15 29619477 29619887 -73875087 + RLTR12A LTR ERVK 98 553 -15 1 810 3024 49 8 3 chr15 29621554 29621943 -73873031 + MTA_Mm LTR MaLR 1 391 -5 1 811 1688 94 80 29 chr15 29623784 29624058 -73870916 + ORR1A2 LTR MaLR 1 288 -39 1 811 334 106 0 0 chr15 29625961 29626008 -73868966 + ORR1A2 LTR MaLR 272 318 -8 1 811 1520 237 110 87 chr15 29633422 29634269 -73860705 + RMER6C LTR ERVK 1 720 0 2 811 2457 113 44 10 chr15 29635691 29636076 -73858898 + MTB LTR MaLR 3 400 0 2 811 1191 69 0 0 chr15 29636076 29636235 -73858739 + MTB-int LTR MaLR 1 159 -939 2 811 2519 153 40 16 chr15 29636537 29636987 -73857987 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 2 811 233 292 30 40 chr15 29640568 29640668 -73854306 + MLT1C LTR MaLR 148 246 -221 2 811 647 239 137 46 chr15 29642942 29643139 -73851835 + ORR1D1 LTR MaLR 1 215 -159 2 811 746 224 62 0 chr15 29645100 29645261 -73849713 + ORR1D1 LTR MaLR 190 360 -14 2 811 785 328 87 62 chr15 29649178 29649698 -73845276 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 811 586 358 94 87 chr15 29650051 29650489 -73844485 + LTR16A LTR ERVL 7 447 -4 2 811 1283 268 103 3 chr15 29652956 29653063 -73841911 + MTD LTR MaLR 12 120 -299 2 811 1283 268 103 3 chr15 29653191 29653450 -73841524 + MTD LTR MaLR 121 414 -5 2 811 2339 94 22 0 chr15 29653971 29654291 -73840683 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 811 1128 239 133 49 chr15 29656524 29656893 -73838081 - MTD LTR MaLR -2 417 18 2 811 230 269 35 96 chr15 29657087 29657202 -73837772 + MLT1A0 LTR MaLR 249 356 -18 2 811 306 222 24 36 chr15 29657660 29657744 -73837230 - MTC-int LTR MaLR -1142 116 34 2 811 1693 224 53 28 chr15 29657779 29658174 -73836800 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 811 3325 114 130 0 chr15 29662205 29662722 -73832252 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 2 811 355 253 49 78 chr15 29665519 29665589 -73829385 - RLTR21 LTR ERVK -239 1333 1264 2 811 355 253 49 78 chr15 29665613 29665786 -73829188 - RLTR21 LTR ERVK -309 1263 1097 2 811 666 302 54 60 chr15 29673131 29673501 -73821473 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 2 811 243 318 84 15 chr15 29675723 29675854 -73819120 + MLT2B1 LTR ERVL 72 211 -309 2 811 412 344 41 41 chr15 29676381 29676578 -73818396 - ORR1E LTR MaLR -162 197 1 2 811 938 238 118 4 chr15 29691680 29691925 -73803049 + MT2A LTR ERVL 72 344 -189 2 811 235 337 90 0 chr15 29695223 29695312 -73799662 - MLT1E3 LTR MaLR -197 427 331 3 811 292 246 115 36 chr15 29699582 29699721 -73795253 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -39 883 734 3 811 530 274 128 22 chr15 29701788 29702076 -73792898 + MER67C LTR ERV1 8 331 -380 3 811 257 308 11 21 chr15 29703505 29703598 -73791376 + MTEb LTR MaLR 55 146 -233 3 811 569 310 53 53 chr15 29705290 29705518 -73789456 - MTE-int LTR MaLR -307 1273 1046 3 811 1087 341 45 53 chr15 29706329 29706840 -73788134 - MTE-int LTR MaLR -593 987 481 3 811 656 305 93 21 chr15 29707370 29707661 -73787313 - MTE-int LTR MaLR -1126 454 143 3 811 861 284 121 7 chr15 29707746 29708019 -73786955 - ORR1D2 LTR MaLR -66 304 1 3 811 330 324 9 0 chr15 29708022 29708130 -73786844 - MTE-int LTR MaLR -1377 203 95 3 811 895 277 60 24 chr15 29708132 29708380 -73786594 - MTE2b LTR MaLR -110 269 13 3 811 2802 41 3 55 chr15 29711462 29711827 -73783147 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 811 13326 57 29 5 chr15 29711827 29713576 -73781398 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 3 811 2856 35 0 55 chr15 29713576 29713942 -73781032 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 811 483 135 44 22 chr15 29714878 29714969 -73780005 + MTD LTR MaLR 1 93 -328 3 811 1019 282 110 37 chr15 29715052 29715380 -73779594 + MTD LTR MaLR 66 417 -2 3 811 273 283 97 39 chr15 29717313 29717416 -73777558 - MTE2b LTR MaLR -266 113 5 3 811 263 335 175 22 chr15 29719278 29719507 -73775467 + MLT2B2 LTR ERVL 125 388 -127 3 811 724 235 137 68 chr15 29721177 29721469 -73773505 + RLTR21 LTR ERVK 1261 1572 0 3 811 1351 274 42 6 chr15 29721505 29721839 -73773135 + ORR1D2 LTR MaLR 25 370 0 3 811 908 255 143 10 chr15 29727080 29727219 -73767755 - ORR1D1 LTR MaLR -65 329 163 3 811 908 253 144 4 chr15 29727267 29727401 -73767573 - ORR1D1 LTR MaLR -212 162 8 3 811 274 192 0 0 chr15 29727401 29727453 -73767521 + ORR1D2 LTR MaLR 319 370 0 3 811 2073 249 22 45 chr15 29727454 29728037 -73766937 + ORR1D2-int LTR MaLR 2 571 -799 3 811 1352 124 0 0 chr15 29728506 29728700 -73766274 + RLTR44B LTR ERVK 1 194 -255 3 811 3403 319 66 47 chr15 29728705 29733188 -73761786 + IAP-d-int LTR ERVK 659 5118 -1424 3 811 5603 52 0 0 chr15 29733395 29734066 -73760908 + RLTR44-int LTR ERVK 2142 2812 0 3 811 1945 133 164 36 chr15 29734066 29734425 -73760549 + RLTR44A LTR ERVK 1 405 0 3 811 898 287 275 36 chr15 29739748 29739995 -73754979 - RLTR16 LTR ERVK -39 466 160 3 811 898 268 47 50 chr15 29740022 29740181 -73754793 - RLTR16 LTR ERVK -346 159 1 3 811 243 274 67 27 chr15 29742292 29742367 -73752607 - ORR1E LTR MaLR -264 95 18 3 811 1187 244 118 44 chr15 29742372 29742711 -73752263 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 3 3 811 342 327 31 25 chr15 29742863 29743023 -73751951 - RMER5 LTR ERV1 0 534 374 3 811 3423 20 8 0 chr15 29745973 29746366 -73748608 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 811 256 279 111 25 chr15 29749172 29749253 -73745721 + MLT1A1 LTR MaLR 1 88 -320 3 811 3722 163 176 16 chr15 29751734 29751753 -73743221 + RLTR25B LTR ERVK 109 127 -901 3 811 3722 163 176 16 chr15 29751786 29752559 -73742415 + RLTR25B LTR ERVK 128 1028 0 3 812 762 274 105 15 chr15 29753650 29753917 -73741057 - MTE-int LTR MaLR -1288 292 2 3 812 1857 259 80 0 chr15 29754157 29754643 -73740331 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 1 3 812 1016 278 71 8 chr15 29754662 29754930 -73740044 - MTD LTR MaLR -134 285 1 3 812 4601 179 20 13 chr15 29759629 29760479 -73734495 + RMER13A LTR ERVK 3 858 -2 3 812 1275 174 139 14 chr15 29761370 29761650 -73733324 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 32 3 812 2047 60 287 0 chr15 29772217 29772531 -73722443 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 4 4 812 1368 217 87 33 chr15 29772563 29772896 -73722078 + ORR1D1 LTR MaLR 1 351 -23 4 812 2851 12 48 0 chr15 29773541 29773871 -73721103 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 4 812 1527 203 86 6 chr15 29782152 29782465 -73712509 + RLTR17 LTR ERVK 355 692 0 4 812 568 282 96 79 chr15 29783292 29783646 -73711328 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 9 4 812 246 261 14 42 chr15 29783786 29783858 -73711116 - RLTR9A LTR ERVK -291 77 8 4 812 1561 169 48 23 chr15 29786456 29786765 -73708209 - RMER6C LTR ERVK 0 690 374 4 812 708 153 31 31 chr15 29786802 29786930 -73708044 - RMER6C LTR ERVK -562 128 1 4 812 802 307 94 37 chr15 29787008 29787334 -73707640 + MTE2a LTR MaLR 11 377 -2 4 812 312 309 168 16 chr15 29788079 29788270 -73706704 - MLT1B LTR MaLR -8 382 163 4 812 331 265 179 0 chr15 29788438 29788600 -73706374 - MLT-int LTR MaLR -15 1720 1530 4 812 1194 248 131 8 chr15 29789583 29789628 -73705346 - MTD LTR MaLR -8 411 367 4 812 1194 248 131 8 chr15 29790018 29790335 -73704639 - MTD LTR MaLR -53 366 7 4 812 306 359 110 0 chr15 29790337 29790463 -73704511 - MLT-int LTR MaLR -1158 577 446 4 812 7350 57 1 1 chr15 29790545 29791438 -73703536 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 4 812 306 359 110 0 chr15 29791685 29791803 -73703171 - MLT-int LTR MaLR -1290 445 307 4 812 432 374 68 8 chr15 29793078 29793315 -73701659 - LTR16C LTR ERVL -56 433 183 4 812 1194 286 8 74 chr15 29793628 29794021 -73700953 + MTE2b LTR MaLR 5 371 -8 4 812 2410 80 9 3 chr15 29794740 29795065 -73699909 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 812 1883 177 73 3 chr15 29801896 29802236 -73692738 + MTC LTR MaLR 1 364 -57 4 812 950 140 92 15 chr15 29808382 29808578 -73686396 + RMER4A LTR ERVK 256 466 0 4 812 1280 272 78 29 chr15 29808578 29808991 -73685983 + MTD-int LTR MaLR 610 1042 -216 4 812 408 257 10 0 chr15 29810731 29810832 -73684142 + MTD-int LTR MaLR 1157 1258 0 4 812 1363 298 19 13 chr15 29810852 29811229 -73683745 + MTD LTR MaLR 29 407 -12 4 812 4382 147 22 12 chr15 29817322 29818052 -73676922 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 812 427 221 276 0 chr15 29818279 29818406 -73676568 + RMER6C LTR ERVK 7 168 -522 5 812 2615 143 85 9 chr15 29823359 29823817 -73671157 - RMER19A LTR ERVK 0 737 245 5 812 690 297 82 5 chr15 29826044 29826264 -73668710 - MLT2B4 LTR ERVL -316 240 4 5 812 987 246 157 2 chr15 29827263 29827595 -73667379 - MTD LTR MaLR -14 405 21 5 812 2556 108 49 183 chr15 29827683 29828252 -73666722 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 812 12459 68 19 1 chr15 29828252 29829957 -73665017 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1736 -56 5 812 2331 71 64 9 chr15 29829957 29830285 -73664689 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 812 255 250 0 0 chr15 29831968 29832024 -73662950 + MLT1D LTR MaLR 398 453 -52 5 812 262 177 29 114 chr15 29838179 29838249 -73656725 + MLT1D LTR MaLR 441 504 -1 5 812 3030 169 166 108 chr15 29840370 29841211 -73653763 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 5 812 404 345 21 38 chr15 29849723 29849961 -73645013 + MLT1C LTR MaLR 15 248 -219 5 812 738 306 111 61 chr15 29861799 29862158 -73632816 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 5 812 3259 20 22 27 chr15 29864117 29864530 -73630444 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 5 812 246 367 0 0 chr15 29866477 29866567 -73628407 - MLT1D LTR MaLR 0 505 416 5 812 636 109 0 0 chr15 29867398 29867490 -73627484 - RMER2 LTR ERV1 -475 92 1 5 812 258 200 0 0 chr15 29873008 29873063 -73621911 + RMER17C LTR ERVK 331 385 -25 5 812 682 321 125 34 chr15 29875795 29876179 -73618795 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 812 3367 28 2 10 chr15 29883790 29884189 -73610785 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 101 8645 23 4 1 chr15 29884189 29885245 -73609729 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 40 5 813 228 241 36 60 chr15 29892544 29892628 -73602346 + ORR1A3 LTR MaLR 80 161 -165 5 813 323 307 61 38 chr15 29899421 29899553 -73595421 - MER68 LTR ERVL -7 556 422 6 813 317 280 49 20 chr15 29901622 29901724 -73593250 - MER68 LTR ERVL -133 430 326 6 813 1213 267 105 3 chr15 29904508 29904842 -73590132 - MTD LTR MaLR -6 413 46 6 813 1574 154 65 65 chr15 29905114 29905468 -73589506 - RLTR15 LTR ERVK -5 354 1 6 813 831 295 73 57 chr15 29922036 29922120 -73572854 - MTE2b LTR MaLR -58 321 235 6 813 831 295 73 57 chr15 29922301 29922532 -73572442 - MTE2b LTR MaLR -145 234 2 6 813 798 254 78 30 chr15 29923239 29923610 -73571364 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 74 424 -1902 6 813 586 338 99 28 chr15 29938272 29938510 -73556464 - MLT1A0 LTR MaLR -17 348 95 6 813 586 338 99 28 chr15 29938734 29938818 -73556156 - MLT1A0 LTR MaLR -271 94 3 6 813 1067 220 20 131 chr15 29940213 29940251 -73554723 - MT2B LTR ERVL -10 591 560 6 813 1067 220 20 131 chr15 29940342 29940373 -73554601 - MT2B LTR ERVL -42 559 547 6 813 2111 127 19 6 chr15 29940373 29940698 -73554276 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 813 1067 250 43 114 chr15 29940769 29941218 -73553756 - MT2B LTR ERVL -55 546 7 6 813 3059 142 50 10 chr15 29941315 29941819 -73553155 + RLTR17 LTR ERVK 98 621 -71 6 813 1671 168 85 21 chr15 29943011 29943351 -73551623 + ORR1B2 LTR MaLR 5 366 -1 6 813 285 306 63 47 chr15 29946384 29946511 -73548463 - MTEb LTR MaLR -11 368 240 6 813 5733 232 82 50 chr15 29949037 29949497 -73545477 - RLTR22_Mur LTR ERVK -178 1670 931 6 813 5733 203 101 31 chr15 29949567 29950811 -73544163 - RLTR22_Mur LTR ERVK -507 1341 3 6 813 1541 159 45 51 chr15 29962774 29963105 -73531869 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 813 374 271 114 0 chr15 29965680 29965815 -73529159 + MTE2b LTR MaLR 2 152 -227 6 813 1712 161 99 106 chr15 29966750 29966939 -73528035 + MTC LTR MaLR 1 205 -216 6 813 3327 40 2 0 chr15 29967228 29967623 -73527351 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 813 1712 161 99 106 chr15 29967803 29967830 -73527144 + MTC LTR MaLR 206 210 -211 6 813 1712 161 99 106 chr15 29968226 29968432 -73526542 + MTC LTR MaLR 211 421 0 6 813 1938 187 71 20 chr15 29982350 29982743 -73512231 + MTC LTR MaLR 9 421 0 7 813 480 305 69 46 chr15 29986459 29986809 -73508165 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 4 7 813 692 327 182 51 chr15 29989209 29989880 -73505094 + RMER13A LTR ERVK 5 763 -97 7 813 2978 205 24 55 chr15 29990382 29990531 -73504443 + RLTR22_Mur LTR ERVK 2 151 -1697 7 813 2978 205 24 55 chr15 29990552 29990594 -73504380 + RLTR22_Mur LTR ERVK 152 175 -1673 7 813 2978 205 24 55 chr15 29990649 29991215 -73503759 + RLTR22_Mur LTR ERVK 176 736 -1112 7 813 391 275 46 77 chr15 29991459 29991662 -73503312 + RMER12 LTR ERVK 994 1172 -150 7 813 241 222 97 0 chr15 29991665 29991737 -73503237 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1733 1811 -37 7 813 1739 70 0 4 chr15 29996192 29996420 -73498554 + MTB_Mm LTR MaLR 1 227 -180 7 813 5003 148 41 87 chr15 29997181 29998375 -73496599 + ETnERV2-int LTR ERVK 1053 2191 -5215 7 813 380 315 14 0 chr15 29998483 29998626 -73496348 + ETnERV2-int LTR ERVK 1432 1576 -1738 7 813 329 169 0 17 chr15 29998605 29998665 -73496309 + ETnERV2-int LTR ERVK 2194 2252 -5154 7 813 4897 182 64 55 chr15 29998659 29999976 -73494998 + ETnERV2-int LTR ERVK 2410 3738 -3668 7 813 7665 137 34 40 chr15 30000000 30001486 -73493488 + RMER16-int LTR ERVK 2700 4176 -1230 1 813 332 264 154 12 chr15 30001681 30001850 -73493124 + ETnERV2-int LTR ERVK 6233 6425 -981 2 813 302 135 0 37 chr15 30002063 30002117 -73492857 + ETnERV2-int LTR ERVK 7333 7384 -22 2 813 336 279 141 40 chr15 30002117 30002136 -73492838 + MTB LTR MaLR 162 184 -195 3 813 2073 128 39 19 chr15 30002136 30002496 -73492478 + RLTR9A LTR ERVK 1 367 -1 4 813 1356 71 2 1 chr15 30002496 30002674 -73492300 + MTB LTR MaLR 185 400 0 3 813 852 37 9 0 chr15 30003041 30003148 -73491826 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 457 5 813 517 56 0 0 chr15 30003147 30003219 -73491755 - LTRIS2 LTR ERV1 -239 325 254 5 813 484 267 49 88 chr15 30003225 30003451 -73491523 - RLTR1B-int LTR ERV1 -6948 608 392 6 813 749 150 63 4 chr15 30003502 30003714 -73491260 - RLTR1B-int LTR ERV1 -7271 285 1 6 813 3311 117 11 52 chr15 30003714 30004248 -73490726 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 813 231 316 62 62 chr15 30006396 30006575 -73488399 + RMER20B LTR ERVK 42 220 -407 1 813 493 318 131 82 chr15 30010034 30010363 -73484611 + ORR1E LTR MaLR 4 348 -11 1 813 2400 183 23 112 chr15 30012825 30012930 -73482044 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 105 -479 2 813 2400 183 23 112 chr15 30012959 30013494 -73481480 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 106 584 0 2 813 929 214 302 13 chr15 30014785 30015090 -73479884 - MTD LTR MaLR -9 410 18 2 813 270 270 16 0 chr15 30015119 30015182 -73479792 - MTD LTR MaLR -315 64 1 2 814 1784 19 0 0 chr15 30025430 30025638 -73469336 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 139 3 814 247 417 56 23 chr15 30025885 30026101 -73468873 - MLT1J LTR MaLR -227 285 63 3 814 1411 227 112 8 chr15 30030646 30031002 -73463972 - MTD LTR MaLR 0 419 27 4 814 2354 118 19 6 chr15 30031274 30031633 -73463341 + RMER19A LTR ERVK 1 364 -373 4 814 1005 271 103 17 chr15 30034078 30034427 -73460547 + MTD LTR MaLR 26 404 -15 5 814 252 341 53 8 chr15 30035104 30035237 -73459737 - MTEb LTR MaLR 0 379 241 5 814 1633 147 14 22 chr15 30035235 30035513 -73459461 - MTC LTR MaLR -104 317 42 5 814 239 372 0 26 chr15 30035620 30035736 -73459238 - MTE-int LTR MaLR -976 604 492 5 814 850 319 31 10 chr15 30036116 30036407 -73458567 - MTE-int LTR MaLR -1225 355 59 5 814 924 330 56 20 chr15 30036410 30036766 -73458208 - MTE2b LTR MaLR -10 369 1 5 814 2619 125 32 12 chr15 30037258 30037662 -73457312 - MTC LTR MaLR -4 417 6 6 814 254 292 22 11 chr15 30038896 30038986 -73455988 - MLT1A0-int LTR MaLR -1643 92 2 6 814 593 248 243 0 chr15 30039005 30039227 -73455747 - MLT1A0 LTR MaLR -20 345 70 6 814 476 323 47 16 chr15 30039231 30039423 -73455551 - MTE-int LTR MaLR -1324 256 59 6 814 266 279 0 0 chr15 30039426 30039494 -73455480 - MTE2a LTR MaLR -10 369 302 6 814 2392 85 13 0 chr15 30049273 30049591 -73445383 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 5 7 814 2570 74 3 0 chr15 30061788 30062114 -73432860 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 8 814 512 336 52 64 chr15 30063763 30064151 -73430823 + MER89 LTR ERV1 175 557 -2 9 814 766 214 89 90 chr15 30064627 30065096 -73429878 + RLTR20C LTR ERVK 1 578 0 9 814 539 296 87 26 chr15 30066557 30066821 -73428153 + MER89-int LTR ERV1 1970 2249 -4552 9 814 260 231 141 0 chr15 30067422 30067500 -73427474 + MER89-int LTR ERV1 4658 4746 -2055 9 814 266 322 24 24 chr15 30067694 30067818 -73427156 + MER89-int LTR ERV1 5821 5944 -857 9 814 423 339 55 38 chr15 30068109 30068526 -73426448 + MER89-int LTR ERV1 6228 6651 -150 9 814 340 322 34 40 chr15 30068842 30068991 -73425983 + MER89 LTR ERV1 322 469 -90 9 814 798 299 59 48 chr15 30069036 30069373 -73425601 + MLT1B LTR MaLR 49 389 -1 9 814 674 300 115 62 chr15 30069481 30069819 -73425155 - MTEa LTR MaLR -21 358 3 9 814 233 247 50 38 chr15 30071167 30071247 -73423727 + RMER21A LTR ERV1 606 686 -261 9 814 602 291 84 89 chr15 30079959 30080317 -73414657 - MLT1A LTR MaLR 0 374 19 1 814 1043 202 77 202 chr15 30082675 30083091 -73411883 + ORR1C1 LTR MaLR 1 364 -14 1 814 3224 195 2 38 chr15 30084809 30085448 -73409526 - RMER20B LTR ERVK -11 616 1 1 814 392 309 104 48 chr15 30086097 30086328 -73408646 - MLT1C LTR MaLR -202 265 22 1 814 277 305 10 10 chr15 30086486 30086582 -73408392 + MLT2B4 LTR ERVL 328 423 -133 1 814 2272 108 6 58 chr15 30087043 30087387 -73407587 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 814 5940 105 25 10 chr15 30087478 30088367 -73406607 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 1 814 667 278 220 12 chr15 30090376 30090503 -73404471 + MTE2a LTR MaLR 11 181 -198 1 814 684 226 132 11 chr15 30090599 30090775 -73404199 + MTE2a LTR MaLR 182 379 0 1 814 522 252 67 20 chr15 30091257 30091407 -73403567 - MLT1B LTR MaLR -227 163 7 1 814 276 312 70 18 chr15 30092810 30092924 -73402050 + MLT1B LTR MaLR 3 122 -268 1 814 282 279 35 0 chr15 30092979 30093065 -73401909 + MLT1B LTR MaLR 211 299 -91 1 814 597 155 8 25 chr15 30097986 30098105 -73396869 + ORR1D2 LTR MaLR 238 354 -16 1 814 421 211 40 0 chr15 30098481 30098616 -73396358 + ORR1D2 LTR MaLR 1 144 -230 1 814 460 279 19 0 chr15 30108875 30108979 -73385995 - LTR79 LTR ERVL -421 106 1 1 814 2135 76 26 73 chr15 30110201 30110541 -73384433 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 1 814 345 312 0 35 chr15 30111627 30111740 -73383234 + RMER12 LTR ERVK 743 851 -471 1 814 314 264 200 40 chr15 30114491 30114641 -73380333 - RMER15 LTR ERVL -102 473 300 1 814 302 267 11 11 chr15 30123608 30123699 -73371275 - LTR33A_ LTR ERVL -31 500 410 1 814 744 249 275 9 chr15 30127417 30127636 -73367338 - RMER17C LTR ERVK 0 410 112 1 814 744 249 275 9 chr15 30127735 30127839 -73367135 - RMER17C LTR ERVK -299 111 2 1 814 379 220 9 57 chr15 30129023 30129129 -73365845 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -158 426 326 1 814 1688 168 117 22 chr15 30130384 30130438 -73364536 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 341 2 814 1688 168 117 22 chr15 30130959 30131259 -73363715 - ORR1B1 LTR MaLR -54 340 1 2 814 316 329 49 59 chr15 30132721 30133025 -73361949 - MLT1D LTR MaLR -22 483 183 2 814 927 279 76 24 chr15 30146004 30146345 -73348629 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 815 230 352 48 8 chr15 30152778 30152904 -73342070 - MLT2C2 LTR ERVL -48 511 381 2 815 246 206 51 64 chr15 30159179 30159257 -73335717 - MLT1C LTR MaLR -369 98 22 2 815 463 194 145 0 chr15 30161624 30161748 -73333226 - MTE2b LTR MaLR -37 342 201 2 815 484 301 95 20 chr15 30161817 30162017 -73332957 - MTE2b LTR MaLR -164 215 1 2 815 824 226 119 163 chr15 30164583 30164926 -73330048 + MTE2b LTR MaLR 50 377 -2 2 815 372 287 224 8 chr15 30172923 30173186 -73321788 + RMER15 LTR ERVL 256 575 0 2 815 364 278 315 28 chr15 30173469 30173650 -73321324 + MTD LTR MaLR 142 374 -45 2 815 257 327 88 117 chr15 30179473 30179722 -73315252 - MLT1E LTR MaLR -99 554 313 2 815 3283 31 13 0 chr15 30188550 30188941 -73306033 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 815 2523 167 29 68 chr15 30201781 30202365 -73292609 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 2 815 3223 53 5 0 chr15 30207784 30208178 -73286796 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 815 316 292 53 9 chr15 30213868 30213982 -73280992 - MLT1C LTR MaLR -44 423 305 3 815 425 285 30 23 chr15 30214081 30214214 -73280760 - MLT1C LTR MaLR -304 163 30 3 815 264 318 98 13 chr15 30216384 30216537 -73278437 - MLT1C LTR MaLR -256 211 46 3 815 985 305 9 38 chr15 30221157 30221498 -73273476 - MTE2b LTR MaLR -4 375 45 3 815 503 232 9 0 chr15 30222924 30223036 -73271938 - MTD LTR MaLR -16 403 291 3 815 1175 252 115 3 chr15 30223030 30223325 -73271649 + MTD LTR MaLR 55 382 -37 3 815 1056 215 65 27 chr15 30224432 30224861 -73270113 - RMER4B LTR ERVK -9 457 16 3 815 270 281 125 44 chr15 30236764 30236924 -73258050 - MLT1A LTR MaLR -183 191 19 3 815 461 360 31 31 chr15 30238159 30238337 -73256637 - MLT1D LTR MaLR -4 501 323 3 815 461 360 31 31 chr15 30238382 30238432 -73256542 - MLT1D LTR MaLR -183 322 273 3 815 1294 251 76 6 chr15 30238792 30239121 -73255853 - MTD LTR MaLR -50 369 18 3 815 503 329 120 0 chr15 30247995 30248229 -73246745 - MLT1F1 LTR MaLR -307 262 1 3 815 1174 121 9 56 chr15 30248296 30248569 -73246405 - ORR1A2 LTR MaLR 0 384 1 3 815 528 357 115 49 chr15 30249012 30249463 -73245511 + MER21B LTR ERV1 21 501 -362 3 815 717 332 30 26 chr15 30260775 30261041 -73233933 - MLT1A0 LTR MaLR -67 298 32 3 815 906 257 23 0 chr15 30269893 30270150 -73224824 - RMER15 LTR ERVL -12 563 301 3 815 500 0 0 0 chr15 30270315 30270375 -73224599 + ORR1A0 LTR MaLR 1 60 -286 3 815 845 274 139 15 chr15 30270544 30270881 -73224093 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 815 1666 237 116 41 chr15 30275957 30276464 -73218510 - RMER15 LTR ERVL -2 573 29 3 816 2048 136 11 85 chr15 30281904 30282282 -73212692 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 41 3 816 406 314 121 62 chr15 30282765 30283088 -73211886 - MLT1E2 LTR MaLR -40 640 290 3 816 468 259 73 25 chr15 30285654 30285813 -73209161 + MTE2b LTR MaLR 202 370 0 3 816 2652 48 232 0 chr15 30286333 30286687 -73208287 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 816 2767 84 3 8 chr15 30293309 30293691 -73201283 + MTA_Mm LTR MaLR 1 380 -16 4 816 1580 258 18 13 chr15 30296972 30297365 -73197609 + MTD LTR MaLR 4 398 -21 4 816 295 305 474 1 chr15 30302613 30302836 -73192138 - MTEa LTR MaLR -38 341 24 4 816 2177 98 6 52 chr15 30303067 30303410 -73191564 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 816 2329 161 57 19 chr15 30309886 30310305 -73184669 - RMER19A LTR ERVK -300 437 3 4 816 379 264 26 121 chr15 30311799 30311989 -73182985 + RLTR23 LTR ERV1 257 428 -2 4 816 2283 198 62 12 chr15 30314952 30315452 -73179522 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 3 4 816 417 312 65 82 chr15 30317530 30317809 -73177165 + RMER5 LTR ERV1 13 286 -248 4 816 453 239 18 18 chr15 30317847 30317958 -73177016 + RMER5 LTR ERV1 368 478 -56 4 816 1445 235 36 36 chr15 30319027 30319389 -73175585 + ORR1D2 LTR MaLR 1 362 -8 4 816 1023 241 20 24 chr15 30323289 30323536 -73171438 - ORR1D1 LTR MaLR -127 247 2 4 816 405 287 101 18 chr15 30323712 30323941 -73171033 - MTEb LTR MaLR -3 376 192 4 816 465 170 36 107 chr15 30324426 30324475 -73170499 - MTEb LTR MaLR -271 108 59 4 816 465 170 36 107 chr15 30324892 30324954 -73170020 - MTEb LTR MaLR -321 58 5 4 816 633 285 62 122 chr15 30325400 30325803 -73169171 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 4 816 1895 238 101 80 chr15 30327865 30328194 -73166780 + RMER17B LTR ERVK 7 356 -602 4 816 1895 245 133 64 chr15 30328840 30329496 -73165478 + RMER17B LTR ERVK 357 899 -9 4 816 342 258 94 31 chr15 30341513 30341641 -73153333 + MLT1A1 LTR MaLR 272 407 -1 4 816 2023 173 83 16 chr15 30342606 30343029 -73151945 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 451 -133 4 816 2007 116 122 0 chr15 30343689 30344025 -73150949 - RMER6A LTR ERVK 0 756 390 4 816 2007 116 122 0 chr15 30344069 30344093 -73150881 - RMER6A LTR ERVK -367 389 354 4 816 669 162 9 0 chr15 30344084 30344195 -73150779 - RMER6A LTR ERVK -583 173 62 4 816 741 228 29 23 chr15 30349816 30349991 -73144983 - MTE2a LTR MaLR 0 379 204 4 816 251 261 69 85 chr15 30349975 30350105 -73144869 - MTC-int LTR MaLR -1128 130 3 4 816 567 354 65 32 chr15 30353407 30353796 -73141178 - MER74A LTR ERVL -140 418 16 5 816 715 277 79 87 chr15 30357941 30358194 -73136780 - ORR1E LTR MaLR -2 357 107 5 816 979 250 99 14 chr15 30359298 30359590 -73135384 + ORR1D1-int LTR MaLR 1054 1370 0 5 816 1515 226 16 32 chr15 30359590 30359970 -73135004 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 816 948 290 85 25 chr15 30362961 30363325 -73131649 + RMER5 LTR ERV1 113 498 -36 5 816 421 286 70 13 chr15 30365954 30366110 -73128864 - MLT1C LTR MaLR -3 464 300 5 816 501 366 41 19 chr15 30366172 30366442 -73128532 - MLT1C LTR MaLR -158 309 34 5 816 403 334 89 103 chr15 30366838 30367275 -73127699 - MLT1E3 LTR MaLR -131 493 63 5 816 1560 239 36 22 chr15 30386159 30386523 -73108451 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 5 816 1648 197 97 14 chr15 30390555 30390925 -73104049 + MTC LTR MaLR 18 418 -3 5 816 1398 234 68 11 chr15 30391814 30392004 -73102970 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 167 5 816 1398 234 68 11 chr15 30392074 30392237 -73102737 - ORR1D1 LTR MaLR -208 166 1 5 816 268 291 55 55 chr15 30407282 30407391 -73087583 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 96 204 -635 5 817 623 300 49 78 chr15 30411805 30412181 -73082793 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 5 817 889 171 59 12 chr15 30421261 30421563 -73073411 + MTC LTR MaLR 23 418 -3 5 817 1589 249 53 10 chr15 30424772 30425166 -73069808 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 5 817 232 306 122 61 chr15 30429167 30429348 -73065626 - ORR1E LTR MaLR -167 192 1 5 817 1045 308 98 27 chr15 30434728 30435205 -73059769 + MLT2B3 LTR ERVL 5 515 -39 6 817 1418 242 69 11 chr15 30458705 30459052 -73035922 - MTD LTR MaLR -47 372 6 6 817 1834 210 29 72 chr15 30467596 30468011 -73026963 + MTD LTR MaLR 23 419 0 6 817 318 399 62 14 chr15 30468468 30468743 -73026231 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 70 6 817 1515 230 24 27 chr15 30476804 30477175 -73017799 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 6 817 1572 210 15 36 chr15 30478566 30478902 -73016072 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 314 6 817 1356 91 5 10 chr15 30498569 30498768 -72996206 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 121 6 817 2524 136 35 2 chr15 30501372 30501799 -72993175 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 3 817 238 368 0 67 chr15 30519886 30520020 -72974954 - LTR48B LTR ERV1 -519 125 1 2 817 623 224 0 0 chr15 30520448 30520573 -72974401 - ORR1D2 LTR MaLR -245 125 1 3 817 1165 193 84 35 chr15 30523768 30524052 -72970922 - MTE2a LTR MaLR -12 367 70 3 817 1086 274 120 27 chr15 30524920 30525295 -72969679 + MTD LTR MaLR 10 419 0 3 817 292 304 0 0 chr15 30530395 30530461 -72964513 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 303 4 817 4064 194 42 89 chr15 30530461 30531678 -72963296 + RLTR25B LTR ERVK 1 1103 0 4 817 300 216 74 32 chr15 30531678 30531786 -72963188 - ORR1D2 LTR MaLR -62 317 208 4 817 332 322 29 133 chr15 30534073 30534352 -72960622 - MLT1G LTR MaLR -305 286 37 5 817 1300 120 107 1 chr15 30539241 30539510 -72955464 - ORR1A2 LTR MaLR -8 386 1 5 818 369 330 138 16 chr15 30546675 30546980 -72947994 - MLT1C LTR MaLR -8 459 118 7 818 735 241 116 20 chr15 30549983 30550233 -72944741 - ORR1D2 LTR MaLR -96 274 1 7 818 228 273 29 48 chr15 30553807 30553911 -72941063 - RMER12 LTR ERVK -488 834 733 8 818 348 380 25 47 chr15 30554114 30554349 -72940625 - LTR33 LTR ERVL -2 513 284 8 818 258 250 10 93 chr15 30588460 30588557 -72906417 - MTEa LTR MaLR -289 90 2 1 818 233 291 0 34 chr15 30589334 30589423 -72905551 - MLT1A0 LTR MaLR -5 360 275 1 818 384 325 19 26 chr15 30589484 30589639 -72905335 - MLT1A0 LTR MaLR -101 264 111 1 818 304 276 32 107 chr15 30590454 30590482 -72904492 + MT2B LTR ERVL 133 221 -380 1 818 304 276 32 107 chr15 30590617 30590641 -72904333 + MT2B LTR ERVL 222 305 -296 1 818 595 294 143 35 chr15 30614618 30614956 -72880018 - MTD LTR MaLR -15 364 21 1 818 277 250 122 26 chr15 30619264 30619420 -72875554 - RLTR21 LTR ERVK -325 1247 1077 1 818 457 326 179 9 chr15 30624055 30624379 -72870595 + MLT1B LTR MaLR 1 379 -11 1 818 2352 172 52 2 chr15 30632246 30632647 -72862327 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 818 3171 77 15 5 chr15 30633375 30633778 -72861196 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 818 448 276 53 16 chr15 30638043 30638229 -72856745 - MLT1A0 LTR MaLR -11 379 157 1 818 235 269 45 0 chr15 30645352 30645419 -72849555 - ORR1D2 LTR MaLR -300 70 1 2 818 3028 58 0 0 chr15 30646278 30646624 -72848350 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 818 253 319 14 0 chr15 30648449 30648521 -72846453 - LTR16E1 LTR ERVL -1 537 465 2 818 903 316 114 3 chr15 30652133 30652457 -72842517 - MLT2D LTR ERVL -52 362 3 2 818 1630 205 74 14 chr15 30652692 30653058 -72841916 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 2 818 384 179 71 12 chr15 30656451 30656536 -72838438 - MTEa LTR MaLR 0 379 290 2 818 364 171 207 0 chr15 30656520 30656602 -72838372 - RMER6A LTR ERVK -596 160 62 2 818 255 242 121 0 chr15 30656613 30656679 -72838295 - MTEa LTR MaLR -96 283 210 2 818 3580 158 132 12 chr15 30656825 30657499 -72837475 + RMER6A LTR ERVK 1 755 -1 2 818 304 317 48 9 chr15 30657712 30657817 -72837157 - MLT1A1 LTR MaLR -251 157 49 2 818 4637 18 0 2 chr15 30660429 30660923 -72834051 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 818 3070 169 63 30 chr15 30666485 30667120 -72827854 - RMER6C LTR ERVK -34 656 1 2 819 492 300 78 74 chr15 30673865 30674286 -72820688 - MLT1C LTR MaLR -37 430 8 2 819 290 200 0 0 chr15 30686859 30686914 -72808060 - MLT1H1 LTR MaLR 0 555 501 2 819 356 352 27 7 chr15 30687076 30687222 -72807752 - MTD LTR MaLR -149 270 122 2 819 486 320 81 94 chr15 30694798 30695329 -72799645 + MER90a LTR ERV1 72 595 -19 2 819 273 250 114 30 chr15 30698576 30698708 -72796266 - MLT1C LTR MaLR -203 264 122 2 819 310 324 87 43 chr15 30700354 30700654 -72794320 - MLT1D LTR MaLR -159 346 34 2 819 1489 202 36 33 chr15 30700702 30701065 -72793909 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 3 2 819 478 274 0 0 chr15 30718846 30718970 -72776004 - MLT1D LTR MaLR -1 504 381 2 819 2547 80 3 0 chr15 30719218 30719544 -72775430 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 819 1365 242 37 6 chr15 30721970 30722319 -72772655 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 5 2 819 3596 25 2 8 chr15 30730012 30730410 -72764564 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 819 1055 246 72 52 chr15 30733693 30733781 -72761193 - ORR1E LTR MaLR -2 357 270 3 819 1055 246 72 52 chr15 30733862 30734115 -72760859 - ORR1E LTR MaLR -93 266 3 3 819 570 191 9 0 chr15 30749446 30749561 -72745413 + ORR1D2 LTR MaLR 3 118 -252 3 819 503 309 185 13 chr15 30770346 30770657 -72724317 - MLT1F1 LTR MaLR -20 549 160 3 819 462 152 109 0 chr15 30774279 30774371 -72720603 - RMER12 LTR ERVK -1046 276 175 3 819 494 264 13 26 chr15 30774377 30774529 -72720445 - RMER15 LTR ERVL -90 485 336 3 819 4738 113 49 23 chr15 30775193 30775975 -72718999 + RMER12 LTR ERVK 2 1246 -158 3 819 3094 70 52 3 chr15 30775975 30776363 -72718611 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 819 355 258 128 70 chr15 30776363 30776588 -72718386 + RMER12 LTR ERVK 1247 1572 0 3 819 255 368 48 7 chr15 30785145 30785290 -72709684 - MLT1B LTR MaLR -107 283 133 3 819 330 330 62 101 chr15 30785387 30785792 -72709182 - LTR16B2 LTR ERVL -72 390 2 3 819 895 272 99 32 chr15 30793052 30793394 -72701580 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 3 819 395 305 143 19 chr15 30794848 30795162 -72699812 - MLT1E2 LTR MaLR -75 552 200 3 819 472 331 73 36 chr15 30796889 30797218 -72697756 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 25 3 819 1004 269 80 34 chr15 30798189 30798604 -72696370 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 86 3 819 703 278 79 94 chr15 30798640 30799021 -72695953 - MTE2a LTR MaLR 0 379 5 3 820 2144 112 21 59 chr15 30803326 30803666 -72691308 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 820 2146 151 45 13 chr15 30805270 30805652 -72689322 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 820 2639 152 62 8 chr15 30805652 30806168 -72688806 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 966 3 820 700 189 0 15 chr15 30811854 30811988 -72682986 - RMER5 LTR ERV1 -13 521 390 4 820 752 304 56 49 chr15 30812204 30812594 -72682380 - RMER5 LTR ERV1 -127 407 15 4 820 2441 82 0 0 chr15 30824487 30824829 -72670145 - MT2B2 LTR ERVL -242 342 1 4 820 313 264 155 63 chr15 30844146 30844320 -72650654 - MLT1J1 LTR MaLR -4 440 251 4 820 1332 149 145 10 chr15 30863680 30863984 -72630990 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 1 4 820 386 262 105 68 chr15 30873104 30873459 -72621515 - MER110A LTR ERV1 0 468 36 4 820 749 316 104 22 chr15 30875622 30875988 -72618986 - MER89 LTR ERV1 -163 396 1 4 820 1104 274 62 36 chr15 30883322 30883708 -72611266 + MTD LTR MaLR 1 396 -23 4 820 757 242 54 50 chr15 30888896 30889118 -72605856 - RMER20B LTR ERVK -25 602 380 5 820 2524 121 48 7 chr15 30901414 30901930 -72593044 - RMER4B LTR ERVK -15 570 17 5 820 409 125 0 0 chr15 30902253 30902325 -72592649 - ORR1A2 LTR MaLR -255 72 1 5 820 230 303 0 0 chr15 30914821 30914887 -72580087 - MLT1J2 LTR MaLR -355 93 28 5 820 1907 133 13 0 chr15 30916276 30916591 -72578383 - ORR1A3 LTR MaLR -7 319 1 5 820 297 296 6 53 chr15 30923105 30923159 -72571815 + RMER12 LTR ERVK 684 735 -587 5 820 297 296 6 53 chr15 30923429 30923545 -72571429 + RMER12 LTR ERVK 736 846 -476 5 821 4427 20 2 0 chr15 30939556 30940048 -72554926 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 821 321 0 0 0 chr15 30940048 30940086 -72554888 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 5 821 362 167 46 35 chr15 30940086 30940173 -72554801 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 5 821 40966 13 6 0 chr15 30940173 30945499 -72549475 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 5 821 4427 20 2 0 chr15 30945499 30945991 -72548983 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 821 297 337 82 22 chr15 30967286 30967468 -72527506 - MLT1K LTR MaLR -23 572 380 5 821 265 238 127 89 chr15 30971827 30971984 -72522990 + MLT1A LTR MaLR 10 172 -202 6 821 247 191 48 0 chr15 30973668 30973731 -72521243 + MLT1A LTR MaLR 411 476 -29 6 821 625 295 145 57 chr15 30986021 30986405 -72508569 + MT2A LTR ERVL 141 553 -1 6 821 3205 26 42 0 chr15 30986462 30986842 -72508132 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 821 2101 161 16 8 chr15 30987484 30987867 -72507107 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 6 821 1847 132 13 0 chr15 31013486 31013788 -72481186 + ORR1A4 LTR MaLR 16 321 -8 5 821 297 283 34 42 chr15 31015129 31015247 -72479727 + MTEb LTR MaLR 263 379 0 7 821 575 295 204 16 chr15 31015435 31015690 -72479284 + MTE-int LTR MaLR 773 1075 -505 8 821 1079 316 8 20 chr15 31019304 31019659 -72475315 + MLT1A0 LTR MaLR 15 365 0 1 821 3176 52 2 36 chr15 31023797 31024218 -72470756 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 821 1575 297 56 10 chr15 31024645 31025149 -72469825 - MLT2B3 LTR ERVL -20 534 8 2 821 7069 135 22 183 chr15 31028626 31030498 -72464476 + RLTR21 LTR ERVK 1 1571 -1 3 821 927 270 52 15 chr15 31032496 31032767 -72462207 + ORR1D2 LTR MaLR 1 281 -89 3 821 3288 58 2 0 chr15 31033917 31034316 -72460658 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 821 944 235 101 49 chr15 31038071 31038438 -72456536 - MLT1B LTR MaLR -3 387 2 3 821 874 287 49 31 chr15 31038821 31039109 -72455865 + MTE2b LTR MaLR 1 293 -86 4 821 350 239 11 11 chr15 31039367 31039456 -72455518 + MTE2b LTR MaLR 262 350 -29 4 821 1066 238 111 38 chr15 31043989 31044330 -72450644 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 3 4 821 1977 182 62 17 chr15 31044564 31044967 -72450007 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 821 902 248 67 43 chr15 31047983 31048337 -72446637 + MTD LTR MaLR 3 403 -16 5 821 506 261 77 51 chr15 31054385 31054619 -72440355 + MER31B LTR ERV1 130 369 -97 6 821 309 320 57 38 chr15 31054698 31054827 -72440147 - MT2B LTR ERVL -344 257 126 6 821 317 255 174 67 chr15 31055916 31056244 -72438730 + ORR1D2 LTR MaLR 5 367 -3 6 821 606 280 45 52 chr15 31056261 31056705 -72438269 + ORR1D2-int LTR MaLR 14 508 -1001 6 821 519 336 54 123 chr15 31057056 31057558 -72437416 + ORR1D2-int LTR MaLR 592 1058 -522 6 821 549 302 91 26 chr15 31061965 31062274 -72432700 - MLT1A0 LTR MaLR -6 359 31 7 821 757 286 23 40 chr15 31063550 31063836 -72431138 + MLT1D LTR MaLR 201 501 -4 7 822 704 291 81 34 chr15 31072772 31073092 -72421882 + MLT1A0 LTR MaLR 21 355 -10 8 822 232 294 15 0 chr15 31074407 31074475 -72420499 + MLT1A0 LTR MaLR 435 503 -9 8 822 860 199 141 27 chr15 31074685 31074940 -72420034 - MTC LTR MaLR -2 419 135 8 822 537 295 112 25 chr15 31077932 31078255 -72416719 - ORR1E LTR MaLR -5 354 4 9 822 291 347 58 23 chr15 31079196 31079367 -72415607 + LTR88c LTR Genie? 207 383 -479 9 822 338 297 147 9 chr15 31080218 31080429 -72414545 - LTR16A1 LTR ERVL -9 447 208 9 822 328 313 13 20 chr15 31082341 31082483 -72412491 - MLT1C LTR MaLR -8 459 241 9 822 508 326 50 10 chr15 31084196 31084394 -72410580 + MamGypLTR2c LTR Gypsy 861 1066 -2 1 822 522 266 25 61 chr15 31084592 31084788 -72410186 - MLT1K LTR MaLR -1 594 406 1 822 273 311 142 51 chr15 31085678 31086010 -72408964 + MLT1K LTR MaLR 194 555 -40 1 822 311 340 18 67 chr15 31086519 31086683 -72408291 + MLT1A LTR MaLR 7 162 -212 1 822 822 229 131 60 chr15 31088314 31088727 -72406247 - MT2B LTR ERVL -55 546 92 1 822 868 197 308 62 chr15 31088858 31089313 -72405661 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 1 822 1665 50 0 5 chr15 31089522 31089742 -72405232 - MTB LTR MaLR 0 400 182 1 822 1323 72 26 5 chr15 31093171 31093366 -72401608 - MTB LTR MaLR -201 199 1 1 822 281 327 10 0 chr15 31095531 31095635 -72399339 - MLT1E1A LTR MaLR -30 650 546 1 822 261 298 163 11 chr15 31096184 31096374 -72398600 - LTR50 LTR ERVL -574 221 3 1 822 3000 187 102 48 chr15 31107887 31108253 -72386721 - RLTR40 LTR ERVK 0 817 432 1 822 3000 187 102 48 chr15 31108331 31108739 -72386235 - RLTR40 LTR ERVK -386 431 1 1 822 653 311 120 10 chr15 31116709 31117008 -72377966 - MLT1B LTR MaLR -6 384 53 1 822 270 216 101 67 chr15 31117745 31117864 -72377110 - MT2B LTR ERVL -344 257 135 1 822 656 317 50 70 chr15 31121198 31121541 -72373433 - MLT1H LTR MaLR -190 359 24 1 822 518 222 54 23 chr15 31124516 31124645 -72370329 - RMER5 LTR ERV1 0 534 402 1 822 1195 235 132 45 chr15 31126517 31126712 -72368262 - RMER5 LTR ERV1 0 534 334 1 822 1517 144 172 33 chr15 31126712 31126889 -72368085 - RMER17C LTR ERVK 0 410 181 1 822 1517 144 172 33 chr15 31126953 31127135 -72367839 - RMER17C LTR ERVK -230 180 1 1 822 1195 235 132 45 chr15 31127135 31127340 -72367634 - RMER5 LTR ERV1 -201 333 99 1 822 1507 248 84 13 chr15 31127523 31127903 -72367071 - MTD LTR MaLR 0 419 13 1 822 1815 123 14 54 chr15 31128376 31128575 -72366399 + RMER17C LTR ERVK 1 193 -217 1 822 1815 123 14 54 chr15 31128624 31128792 -72366182 + RMER17C LTR ERVK 194 353 -57 1 822 2214 85 3 0 chr15 31128787 31129081 -72365893 - ORR1A2 LTR MaLR -32 295 1 1 822 661 276 82 81 chr15 31129345 31129778 -72365196 + MLT1B LTR MaLR 1 361 -29 1 822 1124 181 121 4 chr15 31139114 31139363 -72355611 + ORR1D1 LTR MaLR 97 374 0 1 822 225 255 165 31 chr15 31139363 31139440 -72355534 - MLT1A LTR MaLR -56 318 229 1 822 365 275 87 128 chr15 31139923 31140211 -72354763 + MTEa LTR MaLR 3 278 -101 1 822 358 325 58 0 chr15 31140752 31140872 -72354102 + MLT1A0 LTR MaLR 3 129 -236 1 822 253 358 28 0 chr15 31140980 31141089 -72353885 + MLT1A0 LTR MaLR 297 408 0 1 822 1325 170 39 0 chr15 31144856 31145085 -72349889 + RMER6B LTR ERVK 1 238 -223 1 822 369 172 0 30 chr15 31145089 31145155 -72349819 + RMER6B LTR ERVK 397 460 -1 1 822 502 265 0 0 chr15 31145479 31145581 -72349393 - ORR1E LTR MaLR 0 379 278 1 822 807 235 24 0 chr15 31145730 31145900 -72349074 - ORR1E LTR MaLR -185 174 1 1 822 440 302 49 6 chr15 31145951 31146114 -72348860 - MLT2D LTR ERVL -210 204 35 1 822 3153 17 0 0 chr15 31147514 31147860 -72347114 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 822 246 392 38 8 chr15 31151665 31151796 -72343178 + ORR1E LTR MaLR 3 137 -222 2 822 556 190 20 0 chr15 31161043 31161143 -72333831 - MLT1B LTR MaLR -29 361 260 2 822 501 324 80 91 chr15 31161979 31162342 -72332632 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 2 822 732 299 124 26 chr15 31163233 31163659 -72331315 - RMER5 LTR ERV1 -24 510 43 2 822 413 307 79 45 chr15 31170209 31170612 -72324362 - MLT1C LTR MaLR -4 463 1 2 822 521 264 133 68 chr15 31184970 31185279 -72309695 - ORR1E LTR MaLR -5 354 26 2 822 2568 46 6 9 chr15 31193739 31194067 -72300907 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 823 272 178 135 14 chr15 31200216 31200290 -72294684 + MLT2B5 LTR ERVL 275 357 -198 2 823 346 335 128 6 chr15 31201062 31201218 -72293756 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 349 2 823 560 319 70 9 chr15 31201526 31201754 -72293220 - RMER5 LTR ERV1 -207 327 86 2 823 514 335 137 13 chr15 31210530 31210836 -72284138 - MLT2D LTR ERVL -68 346 3 2 823 477 259 196 18 chr15 31212249 31212469 -72282505 - RMER15 LTR ERVL -18 557 299 2 823 401 299 199 23 chr15 31228900 31229071 -72265903 + MLT2C1 LTR ERVL 1 201 -196 2 823 267 353 42 8 chr15 31229065 31229185 -72265789 + MLT2C1 LTR ERVL 425 548 -15 2 823 1707 194 56 8 chr15 31238873 31239230 -72255744 + MTD LTR MaLR 46 419 0 3 823 1074 180 358 61 chr15 31239653 31239995 -72254979 + RLTR20C LTR ERVK 1 446 -105 3 823 669 213 6 72 chr15 31240043 31240153 -72254821 + RLTR20C LTR ERVK 447 547 -4 3 823 3352 70 18 2 chr15 31240841 31241286 -72253688 + RLTR13D1 LTR ERVK 350 801 -5 3 823 3992 174 96 62 chr15 31242892 31243892 -72251082 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1034 -814 3 823 1385 188 45 110 chr15 31246357 31246758 -72248216 - MTE2a LTR MaLR 0 379 5 3 823 685 162 21 31 chr15 31246918 31247097 -72247877 + ORR1D1 LTR MaLR 1 166 -218 3 823 241 180 0 0 chr15 31247181 31247231 -72247743 + MTEa LTR MaLR 55 104 -263 3 823 362 238 46 37 chr15 31247215 31247324 -72247650 + MTEa LTR MaLR 40 149 -225 3 823 271 276 0 0 chr15 31250013 31250071 -72244903 + MTEa LTR MaLR 4 61 -318 3 823 876 129 85 34 chr15 31250085 31250261 -72244713 + RMER19C LTR ERVK 1 185 -426 3 823 381 179 73 10 chr15 31250261 31250357 -72244617 + MTEa LTR MaLR 276 377 -2 3 823 1115 255 12 120 chr15 31252090 31252514 -72242460 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 3 823 2471 133 56 34 chr15 31252903 31253315 -72241659 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 823 2159 78 59 43 chr15 31255088 31255410 -72239564 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 823 879 321 94 21 chr15 31257579 31257919 -72237055 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 3 823 2389 162 65 30 chr15 31258319 31258828 -72236146 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 3 823 235 273 119 123 chr15 31261685 31261936 -72233038 + MLT1A0 LTR MaLR 116 365 0 3 823 855 267 144 47 chr15 31262247 31262546 -72232428 + MTEa-int LTR MaLR 1019 1346 -234 3 823 875 259 56 22 chr15 31262547 31262815 -72232159 - ORR1E LTR MaLR 0 359 83 3 823 784 280 34 8 chr15 31263299 31263533 -72231441 + MTEa-int LTR MaLR 1336 1575 -5 3 823 802 291 75 100 chr15 31263538 31263590 -72231384 + MTEa LTR MaLR 1 52 -327 3 823 802 291 75 100 chr15 31263814 31264150 -72230824 + MTEa LTR MaLR 53 379 0 3 823 902 260 99 49 chr15 31268215 31268539 -72226435 - ORR1D2 LTR MaLR -27 343 4 3 823 245 349 149 34 chr15 31271625 31271800 -72223174 + MLT1C LTR MaLR 202 396 -71 3 823 801 179 7 7 chr15 31276964 31277110 -72217864 + RMER19B LTR ERVK 757 902 0 4 823 261 236 97 0 chr15 31277689 31277761 -72217213 - MER54A LTR ERVL -374 527 449 4 823 634 208 15 29 chr15 31282426 31282571 -72212403 - MLT2C2 LTR ERVL -5 558 414 4 823 3073 40 5 241 chr15 31284362 31284984 -72209990 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 823 260 297 159 109 chr15 31290855 31291131 -72203843 + ORR1E LTR MaLR 11 300 -59 4 823 298 250 205 16 chr15 31291644 31291766 -72203208 + MLT1H LTR MaLR 3 147 -402 4 823 265 375 71 0 chr15 31292027 31292139 -72202835 + ORR1E LTR MaLR 1 120 -239 4 823 2677 119 140 11 chr15 31300860 31301318 -72193656 + RMER15 LTR ERVL 59 575 0 4 823 316 269 8 111 chr15 31301700 31301715 -72193259 + MT2B LTR ERVL 152 154 -447 4 823 3644 128 52 34 chr15 31301913 31302796 -72192178 - RMER17B LTR ERVK 0 906 1 4 823 627 311 103 59 chr15 31303796 31303947 -72191027 + LTR73 LTR ERV1 3 159 -413 4 823 627 311 103 59 chr15 31304135 31304372 -72190602 + LTR73 LTR ERV1 160 408 -164 4 823 2218 115 3 0 chr15 31305729 31306042 -72188932 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 14 4 823 493 212 29 139 chr15 31307665 31307797 -72187177 + MTD LTR MaLR 246 419 0 4 823 3377 43 2 2 chr15 31313926 31314322 -72180652 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 823 1602 237 83 34 chr15 31320754 31321222 -72173752 + RLTR11A LTR ERVK 1 491 -37 4 823 1331 235 133 24 chr15 31324574 31324905 -72170069 + MTE2b LTR MaLR 10 376 -3 5 824 2110 138 128 8 chr15 31330675 31331026 -72163948 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 5 824 247 271 70 14 chr15 31333689 31333760 -72161214 - MLT1G1 LTR MaLR -346 233 159 5 824 395 250 102 24 chr15 31334634 31334761 -72160213 + MLT1A0 LTR MaLR 229 365 0 5 824 897 287 118 42 chr15 31337778 31337926 -72157048 - RMER5 LTR ERV1 -29 505 354 5 824 897 287 118 42 chr15 31338094 31338126 -72156848 - RMER5 LTR ERV1 -181 353 326 5 824 897 287 118 42 chr15 31338147 31338398 -72156576 - RMER5 LTR ERV1 -209 325 41 5 824 268 377 47 9 chr15 31339102 31339209 -72155765 + MLT1C LTR MaLR 349 459 -8 5 824 1274 249 49 24 chr15 31340074 31340451 -72154523 - MTD LTR MaLR -44 363 3 5 824 258 284 14 0 chr15 31341029 31341103 -72153871 - MLT1C LTR MaLR -148 319 245 5 824 410 304 35 35 chr15 31341149 31341292 -72153682 - MLT1C LTR MaLR -322 145 3 5 824 434 275 40 64 chr15 31342435 31342713 -72152261 + MLT1B LTR MaLR 71 378 -12 5 824 262 267 82 30 chr15 31343180 31343315 -72151659 + RMER12 LTR ERVK 695 836 -486 5 824 577 215 195 0 chr15 31343708 31343857 -72151117 + ORR1D1 LTR MaLR 196 373 -1 5 824 230 304 65 11 chr15 31345620 31345713 -72149261 - MLT1C LTR MaLR -6 461 364 5 824 397 191 0 14 chr15 31345782 31345845 -72149129 - RLTR40 LTR ERVK -393 424 362 5 824 2377 138 58 15 chr15 31345845 31346241 -72148733 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 824 1792 178 80 34 chr15 31346245 31346595 -72148379 - RLTR40 LTR ERVK -451 366 1 5 824 646 302 39 5 chr15 31350929 31351132 -72143842 - ORR1D2 LTR MaLR -160 210 1 5 824 244 269 162 31 chr15 31351878 31352014 -72142960 + ORR1E LTR MaLR 215 357 -2 5 824 285 239 59 50 chr15 31352142 31352261 -72142713 - MTD LTR MaLR -299 120 1 5 824 436 364 34 6 chr15 31355679 31355856 -72139118 + MLT1C LTR MaLR 202 383 -84 5 824 580 262 82 16 chr15 31359323 31359505 -72135469 - LTR41 LTR ERVL 0 768 575 5 824 391 304 27 0 chr15 31359587 31359699 -72135275 - LTR41 LTR ERVL -332 436 322 5 824 249 326 55 22 chr15 31360003 31360094 -72134880 + MLT1A0 LTR MaLR 272 365 0 5 824 250 264 0 99 chr15 31362079 31362180 -72132794 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 318 5 824 2385 210 62 4 chr15 31362290 31362772 -72132202 + RLTR18B LTR ERVK 3 512 0 5 824 840 281 84 75 chr15 31363992 31364582 -72130392 - RMER13A LTR ERVK -224 734 1 6 824 477 287 73 28 chr15 31365455 31365634 -72129340 + MLT1B LTR MaLR 1 187 -203 6 824 316 257 78 91 chr15 31365649 31365803 -72129171 + RMER15 LTR ERVL 8 159 -416 6 824 437 272 27 65 chr15 31365828 31366013 -72128961 + RMER15 LTR ERVL 384 561 -14 6 824 507 215 42 147 chr15 31369257 31369457 -72125517 + MTE2a LTR MaLR 1 206 -213 6 824 1514 147 121 6 chr15 31370275 31370360 -72124614 + RLTR15 LTR ERVK 1 97 -262 6 824 1514 147 121 6 chr15 31370404 31370640 -72124334 + RLTR15 LTR ERVK 98 359 0 6 824 316 91 71 18 chr15 31374089 31374145 -72120829 - MTD LTR MaLR 0 419 361 6 824 1147 213 136 49 chr15 31374337 31374682 -72120292 - MTD LTR MaLR -44 375 1 6 824 1032 229 88 90 chr15 31374753 31375122 -72119852 + MT2A LTR ERVL 1 501 -100 6 824 377 207 24 0 chr15 31375310 31375392 -72119582 + ORR1E LTR MaLR 49 132 -227 6 824 303 295 37 19 chr15 31376635 31376742 -72118232 + ORR1E LTR MaLR 255 363 -16 6 824 621 174 18 18 chr15 31379217 31379328 -72115646 + RMER21A LTR ERV1 73 183 -764 6 824 435 103 15 0 chr15 31379327 31379395 -72115579 - RMER21A LTR ERV1 -434 513 445 6 824 1720 161 33 27 chr15 31379424 31379755 -72115219 + RMER21A LTR ERV1 92 424 -523 6 824 1040 127 45 9 chr15 31379760 31380016 -72114958 + RMER21A LTR ERV1 758 947 0 6 824 459 227 101 31 chr15 31382411 31382570 -72112404 + MLT1D LTR MaLR 28 197 -308 6 824 1585 136 184 9 chr15 31391302 31391628 -72103346 + ORR1B1 LTR MaLR 4 386 -8 6 824 1980 133 116 6 chr15 31393014 31393369 -72101605 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 824 260 265 86 68 chr15 31396412 31396574 -72098400 + MER34A1 LTR ERV1 78 242 -345 6 824 273 333 89 24 chr15 31396730 31396898 -72098076 + MER34A1 LTR ERV1 257 435 -152 6 824 2796 73 42 3 chr15 31397717 31398102 -72096872 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 824 1212 238 37 43 chr15 31408718 31409043 -72085931 + MTE2b LTR MaLR 54 376 -3 6 824 226 259 148 0 chr15 31413443 31413524 -72081450 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 93 -1021 6 824 350 211 99 56 chr15 31414174 31414341 -72080633 + RLTR13D3 LTR ERVK 983 1114 0 6 824 332 367 81 25 chr15 31429533 31429768 -72065206 + MLT1H LTR MaLR 100 347 -202 7 824 228 296 49 57 chr15 31429794 31429916 -72065058 + MLT1H LTR MaLR 496 616 -8 7 824 2188 149 32 34 chr15 31431831 31432240 -72062734 + RLTR11B LTR ERVK 1 408 -45 7 824 331 295 103 88 chr15 31452904 31453235 -72041739 - ORR1E LTR MaLR -6 353 18 7 824 645 256 133 33 chr15 31453686 31453957 -72041017 + MLT1B LTR MaLR 93 390 0 7 824 3103 134 183 5 chr15 31455233 31455819 -72039155 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 7 825 605 176 21 29 chr15 31461760 31461900 -72033074 + RMER4B LTR ERVK 33 171 -414 8 825 304 220 87 20 chr15 31462032 31462162 -72032812 + RMER4B LTR ERVK 343 551 -60 8 825 1448 205 53 28 chr15 31464545 31464902 -72030072 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 8 825 303 221 56 34 chr15 31465313 31465402 -72029572 + MER89 LTR ERV1 1 91 -468 8 825 543 281 166 50 chr15 31465490 31465749 -72029225 + MER89 LTR ERV1 270 558 -1 8 825 1876 155 33 72 chr15 31468039 31468428 -72026546 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 8 825 2265 138 42 11 chr15 31468439 31468821 -72026153 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 825 432 170 0 43 chr15 31470085 31470177 -72024797 + ORR1E LTR MaLR 26 113 -246 8 825 320 239 10 61 chr15 31470219 31470317 -72024657 + ORR1E LTR MaLR 250 342 -37 8 825 1176 188 44 79 chr15 31472321 31472662 -72022312 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 994 8 825 708 260 67 8 chr15 31472957 31473224 -72021750 + RLTR20D LTR ERVK 1 283 -285 8 825 392 254 93 36 chr15 31473209 31473272 -72021702 + RLTR20D LTR ERVK 416 479 -99 8 825 392 254 93 36 chr15 31473312 31473387 -72021587 + RLTR20D LTR ERVK 480 561 -17 8 825 1524 221 33 90 chr15 31473399 31474153 -72020821 - RMER12 LTR ERVK -1156 692 1 8 825 240 286 43 0 chr15 31474772 31474842 -72020132 + MLT1H LTR MaLR 134 206 -343 8 825 2037 180 62 3 chr15 31477210 31477594 -72017380 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 825 4207 165 134 137 chr15 31477594 31478688 -72016286 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1258 162 8 825 4207 165 134 137 chr15 31478883 31479049 -72015925 - MTB_Mm-int LTR MaLR -1097 161 2 8 825 460 221 61 9 chr15 31479049 31479163 -72015811 - MTB_Mm LTR MaLR -1 406 287 8 825 276 261 145 21 chr15 31479169 31479314 -72015660 + MLT1B LTR MaLR 11 173 -217 8 825 7430 117 30 17 chr15 31479348 31480486 -72014488 - MurERV4_19-int LTR ERVK -3240 2540 1388 8 825 898 154 15 76 chr15 31484679 31484876 -72010098 - RLTR28 LTR ERVL -12 512 328 8 825 1208 148 106 14 chr15 31484877 31485301 -72009673 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 8 825 367 96 0 0 chr15 31485325 31485377 -72009597 - RLTR28 LTR ERVL -428 53 2 8 825 529 239 38 206 chr15 31486704 31487131 -72007843 + RMER20B LTR ERVK 245 599 -28 8 825 1639 184 92 39 chr15 31487187 31487576 -72007398 + RMER15 LTR ERVL 87 496 -79 8 825 1328 217 88 25 chr15 31487580 31487916 -72007058 + RLTR11A2 LTR ERVK 5 369 -158 8 825 3427 42 4 123 chr15 31487916 31488411 -72006563 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 8 825 1328 212 92 22 chr15 31488411 31488460 -72006514 + RLTR11A2 LTR ERVK 370 414 -113 8 825 250 191 132 0 chr15 31488649 31488717 -72006257 + RLTR11A2 LTR ERVK 451 527 0 8 825 333 221 13 25 chr15 31488718 31488797 -72006177 + RMER15 LTR ERVL 491 568 -7 8 825 2279 69 79 0 chr15 31489502 31489805 -72005169 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 825 346 247 301 47 chr15 31491087 31491363 -72003611 - MER74A LTR ERVL -188 370 25 8 825 358 313 91 38 chr15 31491548 31491734 -72003240 - MLT1F1 LTR MaLR -113 456 261 8 825 1556 130 253 14 chr15 31491840 31492136 -72002838 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 8 825 915 225 128 55 chr15 31492703 31493103 -72001871 + RMER15 LTR ERVL 45 555 -20 8 825 327 218 146 46 chr15 31493447 31493577 -72001397 - MLT1F LTR MaLR -41 507 365 8 825 265 342 49 24 chr15 31494728 31494851 -72000123 + MLT2F LTR ERVL 1 126 -537 8 825 938 209 45 27 chr15 31502119 31502340 -71992634 - MTD LTR MaLR 0 419 195 3 825 1003 139 87 39 chr15 31502717 31502946 -71992028 - MTC LTR MaLR -77 330 90 4 825 757 219 111 43 chr15 31503053 31503264 -71991710 - MTC LTR MaLR -190 229 1 4 825 305 282 86 52 chr15 31504314 31504430 -71990544 - MLT1C LTR MaLR -63 404 285 1 825 2892 127 42 63 chr15 31508390 31508961 -71986013 - RLTR13C1 LTR ERVK -117 866 308 2 825 2951 52 0 0 chr15 31508965 31509311 -71985663 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 825 14098 58 7 2 chr15 31509311 31511093 -71983881 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 2 825 1537 31 0 72 chr15 31511093 31511301 -71983673 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 154 2 825 354 251 198 21 chr15 31514102 31514289 -71980685 - MLT1K LTR MaLR -19 576 357 3 825 808 250 47 39 chr15 31514445 31514703 -71980271 - RMER5 LTR ERV1 -87 447 188 3 825 741 260 47 33 chr15 31514709 31514920 -71980054 - RMER5 LTR ERV1 -306 228 15 3 825 1830 194 100 43 chr15 31525937 31526378 -71968596 - RMER4A LTR ERVK 0 466 1 5 825 2966 86 2 8 chr15 31530040 31530438 -71964536 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 825 542 177 0 50 chr15 31535989 31536090 -71958884 + ORR1D1 LTR MaLR 85 180 -194 7 825 1820 161 71 11 chr15 31537344 31537695 -71957279 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 7 825 3565 20 2 0 chr15 31551648 31552043 -71942931 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 825 529 281 41 11 chr15 31552861 31553102 -71941872 - MLT1B LTR MaLR -11 379 101 9 825 2002 140 52 91 chr15 31553463 31553848 -71941126 + ORR1B1 LTR MaLR 25 394 0 9 825 1311 254 30 63 chr15 31553921 31554287 -71940687 + MTEa LTR MaLR 3 356 -23 1 825 2037 251 38 42 chr15 31554321 31554899 -71940075 + MTEa-int LTR MaLR 1 576 -1004 1 825 1100 235 130 17 chr15 31554902 31555201 -71939773 + ORR1D2 LTR MaLR 15 347 -23 1 825 1173 220 48 41 chr15 31555226 31555520 -71939454 + MTEa-int LTR MaLR 570 865 -715 1 825 2152 108 9 65 chr15 31555749 31556087 -71938887 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 825 397 274 20 20 chr15 31566943 31567092 -71927882 + MLT1B-int LTR MaLR 1082 1230 -157 1 825 860 250 114 36 chr15 31567136 31567443 -71927531 + MLT1B LTR MaLR 39 369 -21 1 825 273 315 83 9 chr15 31567935 31568044 -71926930 + MLT1I LTR MaLR 292 408 -3 1 825 1164 173 5 18 chr15 31570451 31570836 -71924138 + BGLII_B LTR ERVK 1 431 -10 1 825 3222 54 21 0 chr15 31570958 31571346 -71923628 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 825 320 339 62 21 chr15 31573992 31574185 -71920789 + RMER15 LTR ERVL 359 559 -16 1 825 604 186 40 0 chr15 31574458 31574582 -71920392 + RMER20B LTR ERVK 1 129 -498 1 825 1849 120 60 15 chr15 31575481 31575845 -71919129 + ORR1A4 LTR MaLR 1 394 0 1 825 306 174 0 140 chr15 31575989 31576089 -71918885 - MT2B LTR ERVL -362 239 154 1 825 407 284 0 181 chr15 31576226 31576307 -71918667 + MT2A LTR ERVL 6 85 -448 1 825 407 284 0 181 chr15 31576490 31576559 -71918415 + MT2A LTR ERVL 86 132 -401 1 825 970 195 289 24 chr15 31576597 31576933 -71918041 + MT2A LTR ERVL 109 533 0 1 825 835 346 116 27 chr15 31577723 31578394 -71916580 + LTR78 LTR ERV1 471 1201 -103 1 825 602 281 112 39 chr15 31579537 31579867 -71915107 - MTE2a LTR MaLR -6 373 20 1 825 365 299 34 14 chr15 31580289 31580435 -71914539 + LTR40a LTR ERVL 48 196 -323 1 825 862 251 68 144 chr15 31586631 31587040 -71907934 - MTE2a LTR MaLR 0 379 2 1 103 1834 192 61 5 chr15 31588338 31588734 -71906240 + MTD LTR MaLR 1 408 -11 1 826 2869 117 29 5 chr15 31596504 31596915 -71898059 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 826 3958 120 111 89 chr15 31598076 31598797 -71896177 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 1 826 2697 138 32 5 chr15 31599012 31599421 -71895553 + MTB_Mm LTR MaLR 2 421 0 1 826 5672 147 118 31 chr15 31599421 31600576 -71894398 + MTB_Mm-int LTR MaLR 2 1258 0 1 826 2700 119 10 17 chr15 31600576 31600986 -71893988 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 826 1852 198 55 0 chr15 31601872 31602220 -71892754 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 826 260 343 36 36 chr15 31604605 31604744 -71890230 + MLT1A0 LTR MaLR 227 365 0 1 826 441 309 75 42 chr15 31607636 31607951 -71887023 + MLT1C LTR MaLR 5 337 -130 1 826 295 353 0 8 chr15 31608126 31608246 -71886728 + MLT1B LTR MaLR 268 386 -4 1 826 1669 124 31 61 chr15 31609228 31609554 -71885420 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 11 1 826 4043 86 12 19 chr15 31612056 31612627 -71882347 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 2 826 2050 170 63 41 chr15 31616799 31616862 -71878112 - MTC LTR MaLR 0 421 367 2 826 2295 138 49 49 chr15 31616862 31617267 -71877707 + RLTR44A LTR ERVK 1 405 0 2 826 2050 170 63 41 chr15 31617267 31617615 -71877359 - MTC LTR MaLR -55 366 1 2 826 1461 218 126 26 chr15 31617754 31618182 -71876792 + RMER19C LTR ERVK 141 611 0 2 826 251 265 77 19 chr15 31619152 31619256 -71875718 - MLT1B LTR MaLR -239 151 42 2 826 345 318 143 20 chr15 31623006 31623202 -71871772 + MLT1G1 LTR MaLR 82 301 -278 2 826 1955 173 55 13 chr15 31623252 31623633 -71871341 + MTD LTR MaLR 1 397 -22 2 826 449 171 0 0 chr15 31625558 31625634 -71869340 + ORR1A3-int LTR MaLR 89 164 -1799 2 826 991 181 6 15 chr15 31625626 31625828 -71869146 - ORR1A1 LTR MaLR -161 185 1 2 826 761 258 90 37 chr15 31635489 31635756 -71859218 + MLT1A0 LTR MaLR 87 408 0 2 826 2081 92 35 87 chr15 31636554 31636898 -71858076 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 826 3808 153 202 20 chr15 31637390 31638259 -71856715 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 1 2 826 1295 254 20 11 chr15 31638277 31638635 -71856339 + MTE2b LTR MaLR 19 379 0 2 826 932 219 79 24 chr15 31638659 31638911 -71856063 - MTEa LTR MaLR -4 375 110 2 826 275 255 56 19 chr15 31640577 31640685 -71854289 + MLT1C LTR MaLR 61 172 -295 2 826 339 315 64 46 chr15 31640741 31640914 -71854060 + MLT1C LTR MaLR 282 457 -10 2 826 226 276 90 22 chr15 31644703 31644792 -71850182 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 295 2 826 2778 48 140 3 chr15 31644904 31645262 -71849712 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 826 2586 71 3 0 chr15 31648101 31648425 -71846549 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 2 826 1760 202 108 70 chr15 31650505 31651016 -71843958 - RMER5 LTR ERV1 0 534 5 2 826 261 312 35 26 chr15 31653671 31653786 -71841188 + MLT1H LTR MaLR 381 496 -53 2 826 226 286 0 45 chr15 31653932 31654020 -71840954 + MLT1E LTR MaLR 46 129 -450 2 826 334 283 60 129 chr15 31655409 31655726 -71839248 - MLT1D LTR MaLR -165 340 46 2 826 669 277 142 18 chr15 31658072 31658410 -71836564 + MLT1E LTR MaLR 135 514 -139 2 826 241 323 86 25 chr15 31658861 31659023 -71835951 - MLT1H-int LTR MaLR -1061 348 177 2 826 578 305 155 14 chr15 31666463 31666825 -71828149 + MLT2D LTR ERVL 1 413 -1 2 826 723 258 235 29 chr15 31668070 31668381 -71826593 - MTE2b LTR MaLR 0 379 5 2 826 2170 156 63 79 chr15 31668413 31668983 -71825991 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 2 826 1797 223 34 38 chr15 31673437 31673944 -71821030 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 2 826 321 305 52 61 chr15 31676988 31677359 -71817615 - RLTR12B LTR ERVK -250 278 13 2 826 3230 164 191 51 chr15 31680813 31681067 -71813907 + MTC-int LTR MaLR 267 546 -712 3 826 982 207 246 87 chr15 31681067 31681527 -71813447 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 3 826 3230 164 191 51 chr15 31681527 31681978 -71812996 + MTC-int LTR MaLR 547 1097 -161 3 826 3230 164 191 51 chr15 31682187 31682350 -71812624 + MTC-int LTR MaLR 1098 1258 0 3 826 2142 168 25 53 chr15 31682350 31682549 -71812425 + MTC LTR MaLR 1 210 -211 3 826 2142 168 25 53 chr15 31682827 31683060 -71811914 + MTC LTR MaLR 211 421 0 3 826 432 151 139 0 chr15 31685054 31685140 -71809834 + MTC LTR MaLR 1 98 -323 3 826 3250 20 2 69 chr15 31685615 31686033 -71808941 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 3 826 17609 23 3 0 chr15 31686078 31688046 -71806928 + RLTR10-int LTR ERVK 11 1984 -3 3 826 3250 20 2 69 chr15 31688048 31688466 -71806508 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 3 826 305 127 159 0 chr15 31694175 31694238 -71800736 + RLTR25B LTR ERVK 571 643 -385 3 826 712 148 21 36 chr15 31695681 31695821 -71799153 + RLTR25B LTR ERVK 615 752 -276 3 826 749 164 43 0 chr15 31695795 31695935 -71799039 + RMER19B LTR ERVK 757 902 0 3 826 1626 181 59 27 chr15 31695935 31696300 -71798674 + RLTR12B LTR ERVK 152 528 0 3 826 1569 84 117 4 chr15 31697360 31697624 -71797350 - MTB LTR MaLR -106 294 1 3 826 2345 141 49 23 chr15 31704092 31704150 -71790824 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 383 3 826 2345 141 49 23 chr15 31704198 31704569 -71790405 - BGLII_B LTR ERVK -59 382 1 3 826 1029 274 52 62 chr15 31705249 31705635 -71789339 + MTD LTR MaLR 38 419 0 3 826 570 284 88 13 chr15 31713918 31714146 -71780828 + RMER5 LTR ERV1 38 282 -252 3 826 750 220 146 69 chr15 31714147 31714435 -71780539 + RLTR20C LTR ERVK 3 312 -222 3 826 272 174 0 138 chr15 31714505 31714586 -71780388 + RLTR20C LTR ERVK 481 577 -1 3 826 358 289 126 6 chr15 31714589 31714756 -71780218 + RMER5 LTR ERV1 278 464 -70 3 826 239 333 21 14 chr15 31715885 31716025 -71778949 + MLT1A1 LTR MaLR 268 408 0 3 826 244 304 62 42 chr15 31718577 31718721 -71776253 + ORR1E LTR MaLR 51 197 -162 3 826 245 242 29 57 chr15 31719320 31719390 -71775584 + MLT1A LTR MaLR 1 68 -306 3 827 375 295 30 37 chr15 31719453 31719587 -71775387 + MLT1A LTR MaLR 223 355 -19 3 827 1432 189 111 20 chr15 31719588 31719938 -71775036 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 3 827 1723 181 49 17 chr15 31728994 31729342 -71765632 + ORR1D1 LTR MaLR 3 361 -13 3 827 718 312 35 62 chr15 31729640 31729978 -71764996 + MT2A LTR ERVL 100 428 -105 3 827 244 230 71 100 chr15 31730330 31730470 -71764504 + MLT1D LTR MaLR 1 136 -369 3 827 679 282 57 18 chr15 31742085 31742312 -71752662 - MLT1B LTR MaLR -29 361 126 3 827 306 143 0 31 chr15 31742691 31742756 -71752218 + MLT1A1 LTR MaLR 321 383 -25 3 827 245 286 174 45 chr15 31743770 31743902 -71751072 + MLT1A LTR MaLR 184 332 -42 3 827 1926 130 0 89 chr15 31746950 31747330 -71747644 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 3 827 956 321 86 19 chr15 31748238 31748669 -71746305 - MTE-int LTR MaLR -27 1553 1094 3 827 1347 211 46 25 chr15 31749358 31749684 -71745290 + ORR1D1 LTR MaLR 2 334 -40 3 827 586 256 29 18 chr15 31766560 31766731 -71728243 + MLT2B1 LTR ERVL 30 202 -318 4 827 379 304 85 26 chr15 31774202 31774391 -71720583 - MLT1C LTR MaLR 0 467 268 4 827 853 249 113 8 chr15 31775540 31775787 -71719187 - MTEa LTR MaLR -2 377 105 4 827 2191 204 92 60 chr15 31778881 31779688 -71715286 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 4 827 356 190 0 102 chr15 31780721 31780809 -71714165 - MT2B LTR ERVL -361 240 162 4 827 389 286 36 36 chr15 31781019 31781186 -71713788 - MLT1B LTR MaLR -223 167 1 4 827 388 297 14 61 chr15 31783593 31783807 -71711167 - MLT2D LTR ERVL -154 260 58 4 827 3691 96 126 0 chr15 31791786 31792320 -71702654 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 4 827 520 287 96 14 chr15 31798609 31798828 -71696146 + MER89 LTR ERV1 274 510 -49 4 827 231 363 14 77 chr15 31803455 31803676 -71691298 - RMER4A LTR ERVK -253 213 7 4 827 630 358 57 30 chr15 31805690 31806059 -71688915 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 827 1002 175 92 5 chr15 31806304 31806567 -71688407 + MTC LTR MaLR 1 319 -102 4 827 473 248 8 0 chr15 31807604 31807725 -71687249 + MTC LTR MaLR 298 419 0 4 827 4300 175 157 13 chr15 31807736 31808820 -71686154 + MTC-int LTR MaLR 17 1256 -2 4 827 1961 190 63 37 chr15 31808822 31809232 -71685742 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 827 287 250 88 0 chr15 31810170 31810250 -71684724 + MLT1B LTR MaLR 288 374 -16 4 827 314 309 116 81 chr15 31815949 31816371 -71678603 - MLT1H2 LTR MaLR -4 485 49 4 827 230 350 8 41 chr15 31816552 31816674 -71678300 - MLT2B4 LTR ERVL -402 154 37 4 827 448 267 106 11 chr15 31826243 31826483 -71668491 + MTD LTR MaLR 5 347 -72 4 827 465 269 0 18 chr15 31833647 31833757 -71661217 + MLT1D LTR MaLR 1 108 -397 4 827 1089 281 40 45 chr15 31834098 31834475 -71660499 + MLT1D LTR MaLR 122 496 -9 4 827 522 239 93 88 chr15 31840126 31840319 -71654655 + MLT1C LTR MaLR 1 194 -273 5 827 273 298 111 26 chr15 31840426 31840543 -71654431 + MLT1C LTR MaLR 334 460 -7 5 827 1458 255 59 33 chr15 31846159 31846549 -71648425 - MTD LTR MaLR 0 419 20 5 827 3440 48 5 2 chr15 31847037 31847436 -71647538 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 828 473 341 61 28 chr15 31853578 31853759 -71641215 - MLT2B3 LTR ERVL -24 530 344 5 828 546 280 194 22 chr15 31853902 31854183 -71640791 - MLT2B3 LTR ERVL -194 326 9 5 828 301 403 20 10 chr15 31854452 31854650 -71640324 - LTR82A LTR ERVL -72 800 601 5 828 278 222 60 36 chr15 31854789 31854873 -71640101 - LTR82A LTR ERVL -490 382 297 5 828 416 292 36 7 chr15 31855432 31855554 -71639420 - LTR82A LTR ERVL -746 126 1 5 828 1906 169 84 38 chr15 31855990 31856384 -71638590 + MTD LTR MaLR 1 412 -7 5 828 1098 220 98 55 chr15 31856385 31856712 -71638262 + MTD-int LTR MaLR 2 342 -916 5 828 509 272 119 27 chr15 31856711 31856930 -71638044 - MLT1B LTR MaLR -122 268 30 5 828 2782 39 0 0 chr15 31862205 31862542 -71632432 - IAPLTR4 LTR ERVK -8 337 1 5 828 6356 250 53 40 chr15 31862542 31864933 -71630041 - IAPLTR3-int LTR ERVK -351 7329 5176 5 828 834 89 35 50 chr15 31865206 31865347 -71629627 - IAPLTR3-int LTR ERVK -2911 4670 4532 5 828 453 190 64 2 chr15 31865361 31865477 -71629497 - IAPLTR3-int LTR ERVK -2380 2464 2357 5 828 3278 137 200 0 chr15 31865482 31866068 -71628906 - ETnERV2-int LTR ERVK -3135 4271 3569 5 828 667 232 374 25 chr15 31866094 31866316 -71628658 - ETnERV2-int LTR ERVK -4653 2753 2454 5 828 439 186 93 0 chr15 31866327 31866445 -71628529 - ETnERV2-int LTR ERVK -5557 1849 1721 5 828 1401 209 116 43 chr15 31866429 31866923 -71628051 - ETnERV2-int LTR ERVK -4755 651 251 5 828 468 144 19 116 chr15 31867035 31867266 -71627708 - IAPLTR3-int LTR ERVK -5866 955 831 5 828 516 209 17 42 chr15 31867266 31867386 -71627588 - IAPLTR3-int LTR ERVK -6704 117 1 5 828 2690 65 0 0 chr15 31867392 31867729 -71627245 - IAPLTR4 LTR ERVK -8 337 1 5 828 505 301 171 27 chr15 31877370 31877704 -71617270 - MLT1A1 LTR MaLR -22 386 5 5 828 290 235 15 0 chr15 31879221 31879289 -71615685 + MTE2a LTR MaLR 81 149 -270 5 828 354 269 38 9 chr15 31879314 31879419 -71615555 + MTE2a LTR MaLR 265 372 -7 5 828 4873 64 19 2 chr15 31879988 31880565 -71614409 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 5 828 3401 47 26 0 chr15 31883422 31883808 -71611166 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 828 9224 57 6 3 chr15 31883808 31884902 -71610072 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 828 3433 56 2 8 chr15 31884902 31885300 -71609674 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 828 298 280 194 19 chr15 31886991 31887151 -71607823 + MLT1H LTR MaLR 362 549 0 5 828 1934 94 74 0 chr15 31890545 31890842 -71604132 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 828 676 191 8 8 chr15 31897624 31897751 -71597223 + ORR1D2 LTR MaLR 198 324 -46 5 828 659 324 150 45 chr15 31901846 31902353 -71592621 - MER68 LTR ERVL -1 562 3 5 828 1504 268 86 18 chr15 31912561 31913016 -71581958 - MTEa-int LTR MaLR -96 1484 999 5 828 2961 85 17 5 chr15 31913041 31913443 -71581531 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 828 494 284 21 7 chr15 31913487 31913629 -71581345 - MTEa-int LTR MaLR -1435 145 2 5 828 339 248 100 69 chr15 31913630 31913760 -71581214 - MTEa LTR MaLR 0 379 246 5 828 378 283 33 16 chr15 31913811 31913933 -71581041 - MTEa LTR MaLR -252 127 4 5 828 302 297 100 56 chr15 31915672 31915922 -71579052 + MLT1B LTR MaLR 3 263 -127 5 828 530 303 64 36 chr15 31916023 31916242 -71578732 + MTD LTR MaLR 13 237 -182 5 828 759 167 22 0 chr15 31916504 31916642 -71578332 + MTD LTR MaLR 279 419 0 5 828 1328 233 99 0 chr15 31919763 31920106 -71574868 - MTEb LTR MaLR -2 377 1 5 828 1920 154 60 3 chr15 31921167 31921519 -71573455 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 19 5 828 760 223 29 108 chr15 31924574 31924815 -71570159 + ORR1D2 LTR MaLR 147 368 -2 6 828 1722 240 41 0 chr15 31925082 31925473 -71569501 + MTD LTR MaLR 13 419 0 6 828 1461 149 209 15 chr15 31925543 31925816 -71569158 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 6 828 2042 206 26 158 chr15 31927544 31928246 -71566728 + RMER19C LTR ERVK 1 609 -2 6 828 1572 176 112 37 chr15 31930892 31931240 -71563734 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 828 550 296 49 14 chr15 31931708 31931931 -71563043 - ERVL-E-int LTR ERVL -4079 1588 1358 6 828 2867 38 3 11 chr15 31948620 31948995 -71545979 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 14 6 828 319 274 75 59 chr15 31953176 31953362 -71541612 - MLT1B LTR MaLR -34 356 168 6 828 683 276 69 36 chr15 31953371 31953646 -71541328 - MLT1A0 LTR MaLR -67 298 15 6 828 2827 85 47 2 chr15 31954202 31954605 -71540369 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 828 4472 174 42 5 chr15 31955037 31955866 -71539108 - RMER13B LTR ERVK -48 860 1 6 828 992 261 168 36 chr15 31962640 31962974 -71532000 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 6 828 2117 127 5 81 chr15 31966680 31966762 -71528212 + MTC LTR MaLR 1 82 -339 6 828 2117 127 5 81 chr15 31966918 31967254 -71527720 + MTC LTR MaLR 83 387 -34 6 828 247 180 0 39 chr15 31967341 31967393 -71527581 + MTC-int LTR MaLR 1 50 -1742 6 828 4765 167 74 27 chr15 31967389 31968417 -71526557 + MTC-int LTR MaLR 183 1258 0 6 828 1793 131 68 126 chr15 31968417 31968855 -71526119 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 6 828 423 297 131 30 chr15 31969743 31970160 -71524814 + MLT1C LTR MaLR 1 459 -8 6 828 3090 36 41 8 chr15 31973245 31973632 -71521342 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 828 283 176 0 0 chr15 31975697 31975748 -71519226 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 320 6 828 347 232 0 0 chr15 31975752 31975821 -71519153 - ORR1D2-int LTR MaLR -1301 69 1 6 828 899 261 111 41 chr15 31975821 31976165 -71518809 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 6 829 258 277 39 29 chr15 31986961 31987065 -71507909 + MER31-int LTR ERV1 3178 3282 -1654 6 829 266 268 85 51 chr15 31988165 31988283 -71506691 + LTR37A LTR ERV1 84 205 -221 6 829 1547 231 78 3 chr15 31994113 31994400 -71500574 - MTD LTR MaLR 0 419 105 6 829 1547 231 78 3 chr15 31994808 31994894 -71500080 - MTD LTR MaLR -315 104 19 6 829 2364 154 10 42 chr15 32003215 32003622 -71491352 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 829 1089 288 25 34 chr15 32003629 32003985 -71490989 - MTE2b LTR MaLR -5 374 22 5 829 572 187 0 9 chr15 32004130 32004243 -71490731 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 272 6 829 529 192 0 0 chr15 32004311 32004415 -71490559 - ORR1C2 LTR MaLR -269 105 2 6 829 3133 66 2 5 chr15 32005146 32005543 -71489431 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 829 311 280 25 25 chr15 32005953 32006074 -71488900 - LTR16C LTR ERVL -135 354 234 1 829 668 259 67 14 chr15 32009179 32009387 -71485587 + MTE2b LTR MaLR 159 377 -2 1 829 566 314 90 42 chr15 32009425 32009770 -71485204 + MLT2C1 LTR ERVL 12 404 -10 1 829 826 257 144 9 chr15 32013522 32013848 -71481126 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 829 232 342 57 31 chr15 32016107 32016336 -71478638 + MLT1H LTR MaLR 44 278 -271 2 829 596 272 245 51 chr15 32020266 32020351 -71474623 - MTE2b LTR MaLR -2 377 288 2 829 1997 138 22 6 chr15 32020351 32020673 -71474301 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 829 596 272 245 51 chr15 32020673 32020837 -71474137 - MTE2b LTR MaLR -92 287 97 2 829 596 272 245 51 chr15 32020941 32021004 -71473970 - MTE2b LTR MaLR -283 96 5 2 829 438 278 43 63 chr15 32025485 32025692 -71469282 - RLTR42-int LTR ERVK -4126 1396 1194 3 829 3982 112 9 24 chr15 32029884 32030460 -71464514 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 4 829 1526 154 0 21 chr15 32032594 32032873 -71462101 - RMER6C LTR ERVK 0 690 418 4 829 1218 157 8 42 chr15 32032925 32033165 -71461809 - RMER6C LTR ERVK -488 232 1 4 829 2300 92 32 0 chr15 32035452 32035766 -71459208 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 4 829 731 312 91 13 chr15 32036170 32036488 -71458486 + MLT1B LTR MaLR 40 382 -8 5 829 1716 191 30 14 chr15 32036560 32036926 -71458048 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 5 829 1197 196 117 51 chr15 32043349 32043591 -71451383 - ORR1D1 LTR MaLR -17 357 107 6 829 1197 196 117 51 chr15 32043982 32044072 -71450902 - ORR1D1 LTR MaLR -268 106 5 6 829 857 234 39 85 chr15 32046441 32046862 -71448112 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 6 829 4155 146 28 33 chr15 32049360 32050120 -71444854 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 7 829 2050 129 6 6 chr15 32054604 32054915 -71440059 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 8 829 365 337 48 6 chr15 32062180 32062347 -71432627 + LTR79 LTR ERVL 327 500 -27 9 829 343 223 21 142 chr15 32065657 32065798 -71429176 - MT2B LTR ERVL -323 278 155 9 829 463 306 114 59 chr15 32067726 32068147 -71426827 + MLT1D LTR MaLR 48 491 -14 1 829 587 274 13 27 chr15 32069158 32069308 -71425666 - MLT1C LTR MaLR -30 437 290 1 829 473 305 148 105 chr15 32071725 32072069 -71422905 + MTE2b LTR MaLR 1 359 -20 1 829 246 310 35 12 chr15 32078538 32078623 -71416351 + MLT1I LTR MaLR 260 346 -65 1 829 675 328 125 37 chr15 32078640 32079121 -71415853 + MLT1H LTR MaLR 19 541 -8 1 829 554 300 60 23 chr15 32079818 32080119 -71414855 - MLT1D LTR MaLR 0 654 314 1 829 908 236 181 8 chr15 32080465 32080725 -71414249 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 53 1 829 1115 250 99 38 chr15 32085339 32085688 -71409286 + ORR1D2 LTR MaLR 2 394 0 1 829 241 204 0 20 chr15 32095298 32095348 -71399626 + LTR86A1 LTR ERVL 460 508 -5 1 829 3110 79 38 13 chr15 32103636 32104033 -71390941 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 829 1957 133 135 36 chr15 32105220 32105554 -71389420 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 829 291 302 0 80 chr15 32110430 32110567 -71384407 + MLT1A LTR MaLR 67 192 -182 1 829 3987 132 92 20 chr15 32111086 32111789 -71383185 - RMER6A LTR ERVK -2 754 1 1 830 662 301 138 56 chr15 32120271 32120627 -71374347 + MTD LTR MaLR 20 404 -15 1 830 317 181 22 88 chr15 32121204 32121295 -71373679 + MTD LTR MaLR 1 85 -334 1 830 1600 131 115 16 chr15 32126636 32127002 -71367972 + RMER17C LTR ERVK 9 410 0 1 830 377 297 99 39 chr15 32128913 32129254 -71365720 - MER31A LTR ERV1 -90 376 11 1 830 2227 152 56 7 chr15 32132339 32132784 -71362190 - RLTR28 LTR ERVL -31 493 27 2 830 331 304 66 48 chr15 32133902 32134130 -71360844 - ORR1E LTR MaLR -122 237 6 2 830 955 235 152 24 chr15 32136176 32136512 -71358462 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 830 295 141 62 0 chr15 32145174 32145238 -71349736 + MLT1J LTR MaLR 445 512 0 2 830 497 150 204 104 chr15 32154429 32154630 -71340344 - MTD LTR MaLR 0 419 199 2 830 489 304 75 11 chr15 32154762 32154948 -71340026 - MTD LTR MaLR -219 200 3 2 830 415 207 0 110 chr15 32158310 32158446 -71336528 - MT2B LTR ERVL -337 264 144 2 830 439 278 189 0 chr15 32159896 32160076 -71334898 + ORR1E LTR MaLR 20 233 -126 2 830 1082 306 14 19 chr15 32160683 32161049 -71333925 + MTE2b LTR MaLR 1 364 -15 2 830 2219 72 9 51 chr15 32162708 32163044 -71331930 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 830 556 306 22 6 chr15 32168479 32168660 -71326314 + MLT-int LTR MaLR 228 411 -1324 2 830 1250 251 43 26 chr15 32168739 32169091 -71325883 - MTD LTR MaLR -5 414 57 2 830 270 277 0 0 chr15 32169119 32169184 -71325790 - MTEa LTR MaLR -257 122 58 2 830 3346 30 2 39 chr15 32180172 32180581 -71314393 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 2 830 3252 128 122 13 chr15 32183444 32183757 -71311217 + RMER6C LTR ERVK 8 346 -344 2 830 3252 128 122 13 chr15 32183844 32184145 -71310829 + RMER6C LTR ERVK 347 689 -1 2 830 632 309 53 84 chr15 32199420 32199837 -71295137 - MLT1C LTR MaLR 0 467 64 2 830 2274 145 0 14 chr15 32207215 32207565 -71287409 - ORR1A1 LTR MaLR -1 345 1 3 830 554 338 111 31 chr15 32208886 32209274 -71285700 - MLT2B2 LTR ERVL 0 515 97 3 830 268 314 97 36 chr15 32209730 32209925 -71285049 + MLT1D LTR MaLR 24 230 -275 3 830 571 306 18 23 chr15 32226321 32226542 -71268432 - LTR40a LTR ERVL -251 268 49 3 830 1334 232 22 28 chr15 32231538 32231862 -71263112 + MTEa LTR MaLR 35 356 -23 3 831 1429 105 4 13 chr15 32248221 32248452 -71246522 - RLTR10E LTR ERVK -3 308 80 3 831 822 329 24 72 chr15 32251780 32252239 -71242735 - MER67D LTR ERV1 -77 437 1 3 831 1832 146 49 12 chr15 32262819 32263165 -71231809 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 3 831 296 343 35 83 chr15 32272093 32272322 -71222652 - MER77 LTR ERVL -5 602 385 3 831 496 333 106 12 chr15 32272357 32272603 -71222371 - MER77 LTR ERVL -298 309 41 3 831 258 344 22 79 chr15 32288510 32288548 -71206426 - MT2B LTR ERVL -445 156 127 3 831 565 276 138 4 chr15 32289072 32289312 -71205662 + RLTR10A LTR ERVK 140 411 0 3 831 831 227 189 125 chr15 32290952 32291051 -71203923 + RLTR18 LTR ERVK 2 88 -528 3 831 831 227 189 125 chr15 32291096 32291574 -71203400 + RLTR18 LTR ERVK 89 616 0 3 831 1967 204 3 3 chr15 32292350 32292700 -71202274 + MTC LTR MaLR 1 350 -71 3 831 1900 148 93 50 chr15 32293339 32293717 -71201257 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 831 277 329 149 13 chr15 32298939 32299093 -71195881 + MLT1A LTR MaLR 179 353 -21 4 831 572 286 93 68 chr15 32303390 32303779 -71191195 - RLTR11A2 LTR ERVK -25 416 3 4 831 7237 22 0 4 chr15 32304837 32305662 -71189312 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 4 831 1068 255 63 47 chr15 32309223 32309585 -71185389 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 4 831 1958 106 30 77 chr15 32335931 32336268 -71158706 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 4 831 335 328 16 8 chr15 32343790 32343916 -71151058 - MLT1H1 LTR MaLR -35 520 394 4 831 3221 80 20 5 chr15 32345293 32345694 -71149280 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 831 2867 172 19 18 chr15 32345961 32346476 -71148498 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 4 831 1517 224 61 44 chr15 32371620 32372031 -71122943 + RMER19C LTR ERVK 194 611 0 4 831 1315 221 78 24 chr15 32372031 32372327 -71122647 + MTD LTR MaLR 53 364 -55 4 832 848 259 203 20 chr15 32378992 32379300 -71115674 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 4 832 1154 269 87 15 chr15 32379718 32380107 -71114867 - MTD LTR MaLR -2 417 1 4 832 333 315 26 71 chr15 32380297 32380451 -71114523 - MER77 LTR ERVL -363 244 98 4 832 494 227 13 46 chr15 32389117 32389256 -71105718 + RMER20B LTR ERVK 68 204 -312 5 832 347 340 48 14 chr15 32395202 32395348 -71099626 - MER57E1 LTR ERV1 -219 153 3 5 832 303 366 57 8 chr15 32402954 32403078 -71091896 - ORR1E LTR MaLR -226 133 4 5 832 886 279 57 71 chr15 32409870 32410206 -71084768 + ORR1E LTR MaLR 27 357 -2 5 832 244 396 61 65 chr15 32416762 32417040 -71077934 - LTR16A1 LTR ERVL -102 354 78 5 832 1806 212 73 10 chr15 32418088 32418483 -71076491 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 5 832 419 371 92 26 chr15 32424166 32424620 -71070354 + MLT1D LTR MaLR 5 488 -17 5 832 419 274 28 120 chr15 32425364 32425580 -71069394 - MLT1B LTR MaLR -2 388 193 5 832 1030 258 54 74 chr15 32426991 32427333 -71067641 - ORR1E LTR MaLR -10 409 10 5 832 302 299 93 125 chr15 32428122 32428200 -71066774 - MLT1C LTR MaLR -20 447 364 5 832 302 299 93 125 chr15 32428430 32428664 -71066310 - MLT1C LTR MaLR -104 363 145 5 832 1750 178 69 11 chr15 32431375 32431722 -71063252 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 832 256 320 124 0 chr15 32441067 32441164 -71053810 - MER68 LTR ERVL -247 316 208 5 832 339 309 105 8 chr15 32443780 32443904 -71051070 + RMER12 LTR ERVK 716 851 -471 5 832 250 298 68 62 chr15 32446434 32446595 -71048379 - LTR53 LTR ERVL -328 191 30 5 832 282 350 117 0 chr15 32457157 32457277 -71037697 - MLT1D LTR MaLR -17 488 355 5 832 753 285 110 25 chr15 32462368 32462731 -71032243 + MLT1C LTR MaLR 43 436 -31 5 832 2796 146 47 43 chr15 32481102 32481661 -71013313 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 6 832 347 318 309 40 chr15 32482785 32483034 -71011940 + MLT1A0 LTR MaLR 87 402 -6 6 832 411 288 14 53 chr15 32499219 32499360 -70995614 - MLT1A LTR MaLR -2 465 240 6 832 1929 146 15 58 chr15 32499360 32499702 -70995272 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 6 832 367 325 5 87 chr15 32499702 32499745 -70995229 - MLT1A LTR MaLR -135 332 296 6 832 1062 188 109 34 chr15 32504953 32505218 -70989756 + RLTR20D LTR ERVK 1 285 -283 4 832 382 294 69 31 chr15 32505191 32505261 -70989713 + RLTR20D LTR ERVK 411 479 -99 4 832 382 294 69 31 chr15 32505315 32505374 -70989600 + RLTR20D LTR ERVK 480 544 -34 4 833 366 338 39 114 chr15 32506992 32507326 -70987648 - MLT1A LTR MaLR -63 311 3 8 833 251 169 15 30 chr15 32510513 32510580 -70984394 + RLTR42-int LTR ERVK 1330 1395 -4127 1 833 1322 243 63 47 chr15 32510742 32510960 -70984014 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 149 1 833 1322 243 63 47 chr15 32511157 32511300 -70983674 - ORR1D2 LTR MaLR -222 148 3 1 833 314 390 126 0 chr15 32512261 32512420 -70982554 + LTR16D LTR ERVL 25 203 -448 1 833 2148 148 0 0 chr15 32512421 32512759 -70982215 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 1 833 283 227 117 117 chr15 32516132 32516277 -70978697 + MLT1C LTR MaLR 17 161 -306 2 833 1742 238 7 169 chr15 32520897 32521626 -70973348 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 833 547 318 11 34 chr15 32524101 32524280 -70970694 - ORR1E LTR MaLR -164 195 21 3 833 568 349 58 17 chr15 32529347 32529641 -70965333 - MLT1B LTR MaLR -84 306 1 4 833 2117 175 58 10 chr15 32530699 32531092 -70963882 - MTC LTR MaLR 0 421 10 4 833 394 293 148 58 chr15 32531666 32531699 -70963275 - MLT2B3 LTR ERVL -289 265 1 4 833 917 234 67 43 chr15 32531699 32531909 -70963065 - MTEa LTR MaLR -164 215 1 4 833 511 260 38 8 chr15 32551633 32551765 -70943209 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 260 7 833 290 204 124 41 chr15 32553555 32553652 -70941322 - MTEb LTR MaLR 0 379 275 7 833 255 262 131 0 chr15 32563749 32563833 -70931141 - MLT1E1A LTR MaLR -581 99 5 8 833 688 323 69 44 chr15 32563943 32564260 -70930714 - MLT1E1A-int LTR MaLR -201 1288 964 8 833 492 346 147 29 chr15 32564345 32564604 -70930370 - MLT1E1A-int LTR MaLR -667 822 533 8 833 1512 230 50 29 chr15 32564604 32564980 -70929994 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 8 833 492 346 147 29 chr15 32564980 32565243 -70929731 - MLT1E1A-int LTR MaLR -957 532 239 8 833 279 328 58 58 chr15 32566109 32566297 -70928677 - MLT1E1A-int LTR MaLR -1295 194 7 8 833 251 333 210 31 chr15 32566319 32566610 -70928364 - MLT1E1A LTR MaLR -79 481 139 8 833 249 344 53 94 chr15 32576038 32576282 -70918692 + ORR1E LTR MaLR 69 302 -57 9 833 2590 126 19 37 chr15 32584872 32585333 -70909641 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 1 833 892 266 35 90 chr15 32587128 32587504 -70907470 + ORR1E LTR MaLR 5 359 0 1 833 800 145 74 13 chr15 32591926 32592088 -70902886 - ORR1B1 LTR MaLR -208 162 1 1 833 325 273 113 57 chr15 32597117 32597276 -70897698 + MER68 LTR ERVL 1 168 -395 1 833 323 275 82 29 chr15 32600142 32600438 -70894536 - RMER17C LTR ERVK -520 386 4 1 833 2250 192 24 10 chr15 32603669 32604084 -70890890 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 833 3004 76 30 5 chr15 32609649 32610045 -70884929 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 2 1 833 3039 67 15 5 chr15 32631971 32632363 -70862611 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 833 294 329 89 20 chr15 32636700 32636846 -70858128 + MLT1A0 LTR MaLR 204 359 -6 1 834 1007 238 67 124 chr15 32646376 32646764 -70848210 + MTE2a LTR MaLR 13 378 -1 1 834 1189 204 40 0 chr15 32653101 32653327 -70841647 + MTC LTR MaLR 92 326 -95 1 834 7304 211 63 31 chr15 32653337 32655140 -70839834 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3899 5758 -3 1 834 1105 211 29 195 chr15 32655330 32655799 -70839175 + MT2A LTR ERVL 3 584 0 1 834 249 180 78 47 chr15 32658066 32658130 -70836844 + MLT1A1 LTR MaLR 306 371 -37 1 834 486 362 65 12 chr15 32659638 32659962 -70835012 + MLT1D LTR MaLR 163 503 -2 1 834 1253 231 20 11 chr15 32660166 32660494 -70834480 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 834 375 222 74 0 chr15 32660495 32660576 -70834398 - MER54A LTR ERVL -138 763 677 1 834 333 330 40 48 chr15 32660858 32661109 -70833865 - MER54A LTR ERVL -647 254 6 1 834 246 317 55 46 chr15 32662780 32662889 -70832085 + LTR33 LTR ERVL 156 265 -250 1 834 2254 186 30 10 chr15 32670106 32670507 -70824467 - MTC LTR MaLR -4 417 9 2 834 2199 145 193 17 chr15 32678840 32679317 -70815657 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 2 834 1752 179 52 62 chr15 32683173 32683542 -70811432 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 2 834 2490 189 33 17 chr15 32684982 32685500 -70809474 + RLTR11A LTR ERVK 1 526 -2 2 834 4826 165 95 67 chr15 32690044 32690933 -70804041 + RLTR25A LTR ERVK 1 863 -240 2 834 4826 165 95 67 chr15 32691080 32691263 -70803711 + RLTR25A LTR ERVK 864 1102 -1 2 834 773 199 11 16 chr15 32692888 32693072 -70801902 - MYSERV-int LTR ERVK 0 6550 6368 2 834 864 227 27 14 chr15 32693474 32693693 -70801281 - MYSERV6-int LTR ERVK -256 8703 8482 2 834 964 313 85 12 chr15 32695009 32695339 -70799635 - MTEa LTR MaLR -25 354 1 2 834 277 217 17 0 chr15 32696382 32696427 -70798547 + ORR1C1 LTR MaLR 149 194 -185 2 834 277 209 14 29 chr15 32696455 32696478 -70798496 + ORR1C1 LTR MaLR 195 215 -164 2 834 1153 177 37 23 chr15 32702553 32702767 -70792207 + ORR1C1 LTR MaLR 162 378 0 2 834 3800 103 172 30 chr15 32702845 32703503 -70791471 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 2 834 1406 218 72 64 chr15 32704164 32704541 -70790433 + ORR1C2 LTR MaLR 3 382 -2 2 834 2216 120 32 44 chr15 32713728 32714137 -70780837 - IAPLTR2a LTR ERVK -7 404 1 2 834 5649 50 5 12 chr15 32714137 32714888 -70780086 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 2 834 2102 68 0 0 chr15 32714887 32715165 -70779809 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 2 834 3576 50 26 18 chr15 32715165 32715656 -70779318 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 2 834 237 321 0 0 chr15 32715656 32715709 -70779265 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 2 834 238 309 0 0 chr15 32715737 32715792 -70779182 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 2 834 828 137 14 142 chr15 32715792 32716004 -70778970 - IAPEz-int LTR ERVK -6288 193 9 2 834 2452 99 153 0 chr15 32716005 32716417 -70778557 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 834 1944 140 32 0 chr15 32718265 32718579 -70776395 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 2 834 387 302 23 23 chr15 32723994 32724123 -70770851 - RMER10B LTR ERVL 0 398 270 2 834 869 195 118 31 chr15 32725156 32725384 -70769590 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 248 -558 2 834 3337 98 36 8 chr15 32725362 32725864 -70769110 + RLTR13D2 LTR ERVK 508 1023 0 2 834 1168 198 89 16 chr15 32726152 32726409 -70768565 - RMER15 LTR ERVL -5 570 295 2 834 2450 80 3 6 chr15 32727453 32727780 -70767194 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 32 2 834 609 332 64 45 chr15 32728179 32728876 -70766098 + RLTR6-int LTR ERV1 1041 1695 -6083 2 834 1548 217 38 6 chr15 32741185 32741501 -70753473 - RMER15 LTR ERVL -249 326 1 2 834 615 212 58 112 chr15 32742030 32742329 -70752645 - MT2A LTR ERVL -62 539 326 2 834 333 272 29 10 chr15 32742387 32742491 -70752483 - MT2A LTR ERVL -403 130 25 2 834 2319 168 47 22 chr15 32742491 32742963 -70752011 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3 5758 5226 2 834 829 237 53 62 chr15 32743879 32744236 -70750738 - RLTR10D LTR ERVK 0 411 1 2 834 1525 124 0 9 chr15 32744236 32744464 -70750510 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 6317 2 834 5408 299 24 16 chr15 32744741 32746702 -70748272 - IAP-d-int LTR ERVK -1398 5144 3170 2 834 314 230 14 0 chr15 32746728 32746802 -70748172 - IAP-d-int LTR ERVK -6401 141 67 2 834 544 196 18 0 chr15 32746798 32746910 -70748064 - IAP-d-int LTR ERVK -6407 135 22 2 834 681 291 53 48 chr15 32746957 32747314 -70747660 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 2 834 232 167 46 77 chr15 32752451 32752516 -70742458 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 2 835 1745 197 185 23 chr15 32782957 32783394 -70711580 + RMER19B LTR ERVK 357 864 -38 3 835 2367 111 212 27 chr15 32799489 32799970 -70695004 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 606 -48 3 835 64262 25 15 3 chr15 32799973 32807495 -70687479 + RLTR6-int LTR ERV1 25 7778 0 3 835 2267 107 221 28 chr15 32807604 32808066 -70686908 + RLTR6_Mm LTR ERV1 37 587 -67 3 835 1741 168 109 26 chr15 32812408 32812605 -70682369 + RMER10B LTR ERVL 19 211 -187 3 835 1741 168 109 26 chr15 32812785 32812936 -70682038 + RMER10B LTR ERVL 212 396 -2 3 835 349 250 45 18 chr15 32813672 32813782 -70681192 + MLT1D LTR MaLR 392 504 -1 3 835 435 247 43 55 chr15 32814475 32814638 -70680336 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 482 3 835 316 295 56 27 chr15 32821228 32821411 -70673563 - MLT1A0 LTR MaLR -129 236 1 3 835 950 263 45 44 chr15 32827848 32828220 -70666754 + RLTR26 LTR ERVK 21 417 -225 3 835 3137 58 5 0 chr15 32837973 32838366 -70656608 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 3 835 7411 82 13 70 chr15 32838366 32839530 -70655444 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 835 2908 89 10 2 chr15 32839530 32839923 -70655051 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 835 2766 64 3 0 chr15 32848696 32849041 -70645933 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 835 3363 132 46 35 chr15 32864468 32865103 -70629871 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 3 835 294 274 77 45 chr15 32866564 32866694 -70628280 - MLT1J1 LTR MaLR -313 199 63 3 835 272 315 38 45 chr15 32866895 32867028 -70627946 - MLT1K LTR MaLR -425 170 39 3 835 1713 192 19 37 chr15 32874351 32874729 -70620245 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 4 835 2800 101 5 5 chr15 32884003 32884403 -70610571 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 835 505 205 339 5 chr15 32887795 32887981 -70606993 + RLTR11A2 LTR ERVK 13 260 -267 4 835 812 227 20 52 chr15 32888016 32888252 -70606722 + RLTR11A LTR ERVK 200 445 -132 4 835 3451 23 2 0 chr15 32889031 32889426 -70605548 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 835 408 247 42 18 chr15 32891344 32891474 -70603500 - RLTR11A2 LTR ERVK -365 162 29 4 835 1098 229 113 18 chr15 32893349 32893633 -70601341 + ORR1D2 LTR MaLR 58 368 -2 4 104 3506 13 5 0 chr15 32898999 32899393 -70595581 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 836 9132 33 4 1 chr15 32899394 32900488 -70594486 + MTA_Mm-int LTR MaLR 2 1098 0 4 836 3486 15 5 0 chr15 32900488 32900882 -70594092 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 836 4896 140 24 31 chr15 32914645 32915546 -70579428 - RMER17A2 LTR ERVK -11 895 1 4 836 2135 137 68 0 chr15 32947177 32947543 -70547431 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 4 836 246 317 23 141 chr15 32947802 32948058 -70546916 - MLT1H LTR MaLR 0 569 232 4 836 326 343 41 34 chr15 32948279 32948507 -70546467 - ORR1E LTR MaLR -136 234 4 4 836 688 260 128 135 chr15 32951460 32951771 -70543203 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 84 4 836 688 260 128 135 chr15 32951910 32951990 -70542984 - MLT1A1 LTR MaLR -325 83 18 4 836 344 327 84 98 chr15 32952260 32952529 -70542445 - ORR1E LTR MaLR 0 359 98 4 836 344 327 84 98 chr15 32952732 32952808 -70542166 - ORR1E LTR MaLR -262 97 19 4 836 1765 188 75 105 chr15 32956701 32957130 -70537844 + MTC LTR MaLR 6 421 0 4 836 387 221 0 23 chr15 32958157 32958240 -70536734 - MTE2a LTR MaLR -81 338 240 4 836 237 316 76 0 chr15 32963452 32963531 -70531443 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 490 574 -208 5 836 1511 253 91 3 chr15 32965145 32965517 -70529457 + MTD LTR MaLR 2 406 -13 5 836 279 274 106 12 chr15 32966997 32967082 -70527892 - MLT1I LTR MaLR -280 131 39 5 836 364 247 0 53 chr15 32977426 32977520 -70517454 + MLT1A0 LTR MaLR 260 348 -17 5 836 761 291 49 12 chr15 32986384 32986631 -70508343 - MLT1B LTR MaLR -1 389 134 5 836 848 241 32 0 chr15 32987118 32987305 -70507669 + MTD LTR MaLR 227 419 0 5 836 254 302 84 25 chr15 32987576 32987695 -70507279 - MLT1K LTR MaLR -27 568 443 5 836 1737 103 14 15 chr15 32993384 32993658 -70501316 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 240 5 836 226 31 0 30 chr15 32993638 32993671 -70501303 + RLTR6_Mm LTR ERV1 613 644 -10 5 836 814 130 123 12 chr15 32994285 32994456 -70500518 + RMER16-int LTR ERVK 141 330 -5076 5 836 4008 144 38 20 chr15 32994440 32995178 -70499796 + RMER16-int LTR ERVK 676 1426 -3980 5 836 473 202 37 75 chr15 32995178 32995312 -70499662 + RMER16-int LTR ERVK 1316 1444 -3962 5 836 576 156 23 30 chr15 32995370 32995502 -70499472 + MuRRS4-int LTR ERV1 848 978 -4085 5 836 6033 186 46 38 chr15 32995493 32998360 -70496614 + MuRRS4-int LTR ERV1 1149 4266 -797 5 836 858 192 68 0 chr15 32998356 32998575 -70496399 + MuRRS4-int LTR ERV1 4788 5021 -42 5 836 4196 75 7 16 chr15 32998576 32999145 -70495829 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 5 836 4448 90 13 16 chr15 32999145 33000000 -70494974 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1672 3391 2226 5 836 570 57 0 0 chr15 33000000 33000070 -70494904 - RLTR1B-int LTR ERV1 -1545 1754 1685 1 836 2320 104 8 43 chr15 33000067 33000440 -70494534 + MuRRS4-int LTR ERV1 2003 2362 -2701 2 836 1882 91 5 149 chr15 33000438 33000853 -70494121 - RLTR1B-int LTR ERV1 -1750 1549 1195 1 836 1593 278 30 11 chr15 33000847 33001407 -70493567 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3438 1625 1055 3 836 4284 132 17 17 chr15 33001407 33002131 -70492843 - RMER16-int LTR ERVK -4005 1401 678 4 836 1749 215 8 3 chr15 33002148 33002542 -70492432 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3716 974 374 3 836 3603 74 91 21 chr15 33003150 33003675 -70491299 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 3 5 836 2924 173 58 111 chr15 33004210 33005063 -70489911 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 1114 0 7 836 288 343 20 34 chr15 33010494 33010688 -70484286 - ORR1D2 LTR MaLR -177 193 4 1 836 521 262 397 15 chr15 33017977 33018181 -70476793 + MTE2b LTR MaLR 39 320 -59 3 836 341 232 0 21 chr15 33026156 33026252 -70468722 - MER74A LTR ERVL -26 596 470 4 836 677 249 126 56 chr15 33027220 33027620 -70467354 - RLTR28B LTR ERVL -41 440 1 4 836 2732 59 6 55 chr15 33028909 33029306 -70465668 - ORR1A0 LTR MaLR -12 347 1 5 837 695 261 14 81 chr15 33030268 33030552 -70464422 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 104 5 837 2406 100 158 5 chr15 33031275 33031706 -70463268 - RMER16-int LTR ERVK -3344 2062 1566 5 837 789 198 47 155 chr15 33031718 33032071 -70462903 - RLTR9E LTR ERVK -7 402 1 5 837 305 135 12 119 chr15 33032073 33032157 -70462817 - ETnERV2-int LTR ERVK -3 7403 7329 5 837 837 223 245 10 chr15 33032157 33032496 -70462478 - RLTR13D6 LTR ERVK -365 537 118 5 837 11276 98 21 33 chr15 33032496 33034240 -70460734 - ETnERV2-int LTR ERVK -236 7170 5449 5 837 9021 219 24 18 chr15 33034237 33036959 -70458015 - ETnERV2-int LTR ERVK -2095 5311 1790 5 837 9649 156 8 10 chr15 33037188 33038856 -70456118 - ETnERV2-int LTR ERVK -1647 1667 3 5 837 856 210 169 39 chr15 33038858 33039220 -70455754 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 5 837 4679 163 59 50 chr15 33039460 33039695 -70455279 - ETnERV2-int LTR ERVK -5215 2191 1945 5 837 4679 163 59 50 chr15 33039733 33040620 -70454354 - ETnERV2-int LTR ERVK -5462 1944 1061 5 837 529 206 3 70 chr15 33041013 33041170 -70453804 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 158 6 837 2630 34 0 6 chr15 33041806 33042130 -70452844 - ORR1A1 LTR MaLR -24 322 1 6 837 417 328 110 79 chr15 33042945 33043236 -70451738 - MLT1L LTR MaLR -166 444 145 6 837 616 225 90 36 chr15 33045224 33045390 -70449584 + ORR1D1 LTR MaLR 1 175 -199 7 837 302 329 62 34 chr15 33045380 33045559 -70449415 - MLT1D LTR MaLR -291 214 31 7 837 428 65 0 16 chr15 33045635 33045698 -70449276 + ORR1A1 LTR MaLR 285 346 0 7 837 6462 43 0 2 chr15 33048020 33048836 -70446138 - RLTR10-int LTR ERVK -182 1805 992 7 837 517 329 69 15 chr15 33048920 33049312 -70445662 - IAP-d-int LTR ERVK -5392 1150 738 7 837 6469 67 54 7 chr15 33049366 33049870 -70445104 - RLTR10-int LTR ERVK -993 994 448 7 837 6469 67 54 7 chr15 33050172 33050578 -70444396 - RLTR10-int LTR ERVK -1540 447 41 7 837 2760 65 47 39 chr15 33050590 33050975 -70443999 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 7 837 1226 272 14 101 chr15 33055342 33055780 -70439194 - RLTR11A LTR ERVK -29 499 100 8 837 2002 233 7 29 chr15 33062264 33062376 -70432598 + MTC LTR MaLR 8 115 -306 9 837 2002 233 7 29 chr15 33062695 33063002 -70431972 + MTC LTR MaLR 116 418 -3 9 837 2822 49 7 139 chr15 33068395 33068842 -70426132 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 9 837 14607 32 28 39 chr15 33068842 33070809 -70424165 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 41 9 837 2810 52 7 139 chr15 33070821 33071268 -70423706 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 9 837 2180 98 119 11 chr15 33083044 33083396 -70411578 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 837 1466 148 25 0 chr15 33085128 33085365 -70409609 + RMER19B LTR ERVK 1 243 -659 1 837 1182 148 63 10 chr15 33085359 33085564 -70409410 + RMER19B LTR ERVK 636 851 -51 1 837 2847 169 103 33 chr15 33085659 33086211 -70408763 + RMER19B LTR ERVK 300 890 -12 1 837 368 103 17 0 chr15 33086652 33086710 -70408264 - RLTR25B LTR ERVK -1 1102 1044 1 837 3452 183 54 78 chr15 33086704 33087285 -70407689 - RLTR25B LTR ERVK -227 876 328 1 837 3067 50 39 3 chr15 33087285 33087667 -70407307 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 837 3452 150 22 43 chr15 33087667 33087855 -70407119 - RLTR25B LTR ERVK -701 327 142 1 837 3452 150 22 43 chr15 33087921 33088050 -70406924 - RLTR25B LTR ERVK -887 141 2 1 837 2922 65 151 9 chr15 33088736 33089200 -70405774 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 530 -2 1 837 715 301 87 67 chr15 33110208 33110553 -70384421 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 1 837 2250 120 12 6 chr15 33110933 33111260 -70383714 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 837 692 231 91 21 chr15 33136820 33137006 -70357968 - MTE2b LTR MaLR -43 336 138 1 837 265 336 0 9 chr15 33141096 33141201 -70353773 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 262 1 837 2195 190 19 29 chr15 33153549 33153966 -70341008 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 837 1960 168 35 6 chr15 33157905 33158246 -70336728 + ORR1B1 LTR MaLR 3 353 -41 1 837 398 96 3 0 chr15 33159174 33159248 -70335726 + ORR1B1 LTR MaLR 304 394 0 1 104 708 280 116 94 chr15 33161090 33161461 -70333513 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 838 3292 31 13 0 chr15 33182123 33182514 -70312460 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 838 280 325 230 65 chr15 33182667 33182897 -70312077 - MLT1J2 LTR MaLR -158 290 23 2 838 650 151 24 39 chr15 33189385 33189580 -70305394 + ORR1B1 LTR MaLR 1 186 -160 2 838 1182 199 14 0 chr15 33190588 33190809 -70304165 + ORR1A3 LTR MaLR 93 316 -10 2 838 592 292 137 70 chr15 33192519 33192861 -70302113 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 2 838 787 295 104 39 chr15 33194869 33195289 -70299685 - MLT2B4 LTR ERVL -95 461 1 2 838 2082 170 32 16 chr15 33218010 33218387 -70276587 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 1 2 838 1497 152 36 122 chr15 33226358 33226718 -70268256 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 838 234 183 95 48 chr15 33230003 33230066 -70264908 - MTEb LTR MaLR 0 379 314 2 838 2001 168 104 0 chr15 33238109 33238484 -70256490 + MTC LTR MaLR 8 421 0 2 838 3486 18 2 0 chr15 33238543 33238938 -70256036 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 838 9250 32 2 1 chr15 33238938 33240035 -70254939 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 838 3486 18 2 0 chr15 33240035 33240430 -70254544 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 838 240 172 109 0 chr15 33242546 33242610 -70252364 - LTR90A LTR LTR -842 134 64 2 838 227 253 71 60 chr15 33243845 33243929 -70251045 - ORR1C2 LTR MaLR -126 258 174 2 838 403 353 45 73 chr15 33244189 33244476 -70250498 + MLT1F1 LTR MaLR 15 293 -276 2 838 225 279 156 47 chr15 33246225 33246353 -70248621 + RMER4A LTR ERVK 22 163 -303 2 838 287 277 115 25 chr15 33256517 33256639 -70238335 - LTR16E2 LTR ERVL -2 566 434 3 838 560 205 12 53 chr15 33258098 33258268 -70236706 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 480 3 838 2140 186 29 10 chr15 33266086 33266499 -70228475 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 838 793 322 62 31 chr15 33270291 33270679 -70224295 + MLT1B LTR MaLR 2 390 0 3 838 243 330 143 0 chr15 33273703 33273815 -70221159 - LTR16E1 LTR ERVL 0 538 411 3 838 274 401 31 16 chr15 33275755 33275884 -70219090 - LTR16E1 LTR ERVL -202 336 206 3 838 2597 113 11 5 chr15 33281976 33282357 -70212617 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 1 3 838 326 261 16 112 chr15 33288432 33288557 -70206417 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 3 838 2955 61 5 15 chr15 33289745 33290143 -70204831 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 3 838 278 319 52 17 chr15 33290412 33290527 -70204447 - LTR33 LTR ERVL 0 515 397 3 839 1529 284 62 37 chr15 33300799 33301344 -70193630 - MTEb-int LTR MaLR -1021 559 1 3 839 432 231 185 28 chr15 33301344 33301651 -70193323 - MTEb LTR MaLR 0 379 6 3 839 1523 193 171 0 chr15 33302740 33303061 -70191913 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 3 839 272 118 39 0 chr15 33310026 33310077 -70184897 + RMER6-int LTR ERVK 3125 3177 0 3 839 1911 187 188 41 chr15 33310080 33310839 -70184135 + RMER6C LTR ERVK 4 720 0 3 839 1872 154 21 19 chr15 33313729 33314054 -70180920 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 3 839 2510 138 65 142 chr15 33315763 33316076 -70178898 - RMER4B LTR ERVK 0 585 327 3 839 2510 138 65 142 chr15 33316255 33316575 -70178399 - RMER4B LTR ERVK -259 326 1 3 839 4702 160 29 9 chr15 33337386 33338191 -70156783 + RMER13B LTR ERVK 1 821 -87 3 839 260 149 4 0 chr15 33346513 33346568 -70148406 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 312 3 839 1125 204 63 15 chr15 33346607 33346941 -70148033 + MYSERV6-int LTR ERVK 4348 4697 -4262 3 839 1212 201 89 16 chr15 33346964 33347243 -70147731 - ORR1B1 LTR MaLR -5 374 85 3 839 1006 194 48 0 chr15 33347248 33347434 -70147540 - RMER19B LTR ERVK -6 896 702 3 839 260 149 4 0 chr15 33350464 33350519 -70144455 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 312 3 839 1125 204 63 15 chr15 33350558 33350892 -70144082 + MYSERV6-int LTR ERVK 4348 4697 -4262 3 839 1200 201 86 12 chr15 33350937 33351194 -70143780 - ORR1B1 LTR MaLR -34 360 85 3 839 3059 227 120 33 chr15 33351199 33352023 -70142951 - RMER19B LTR ERVK -6 896 1 4 839 331 168 8 4 chr15 33352023 33352084 -70142890 - ORR1B1 LTR MaLR -330 44 3 3 839 278 305 0 35 chr15 33352167 33352252 -70142722 - LTR33B LTR ERVL -1 502 421 4 839 4827 85 26 33 chr15 33353029 33353784 -70141190 + RMER17A LTR ERVK 1 750 -1 4 839 1967 250 52 9 chr15 33354917 33355437 -70139537 - MTEa-int LTR MaLR -15 1777 1003 4 839 5233 186 16 41 chr15 33355442 33356492 -70138482 - RLTR25B LTR ERVK -4 1024 1 4 839 1358 280 20 70 chr15 33356492 33356885 -70138089 - MTEa-int LTR MaLR -572 1008 636 4 839 1514 301 69 18 chr15 33356885 33357379 -70137595 - MTEa-int LTR MaLR -1061 519 1 4 839 261 227 0 96 chr15 33357380 33357453 -70137521 - MTEa LTR MaLR -1 378 313 4 839 1247 297 6 10 chr15 33357656 33357969 -70137005 - MTEa LTR MaLR -42 337 26 4 839 1840 191 74 39 chr15 33358255 33358686 -70136288 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 4 839 2276 65 54 114 chr15 33362256 33362624 -70132350 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 839 1326 260 74 15 chr15 33369698 33370037 -70124937 - MTD LTR MaLR -60 359 1 4 839 341 336 25 17 chr15 33376380 33376498 -70118476 - MTEa LTR MaLR -15 364 246 4 839 315 321 43 60 chr15 33376733 33376849 -70118125 - MTEa LTR MaLR -258 121 8 4 839 2415 321 115 25 chr15 33376857 33377865 -70117109 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 399 4 839 1351 295 44 67 chr15 33377933 33378343 -70116631 - MTEa-int LTR MaLR -1149 431 9 4 839 1035 316 67 26 chr15 33378412 33378756 -70116218 - MTEa LTR MaLR -21 358 1 4 839 2159 126 3 0 chr15 33389051 33389377 -70105597 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 839 3875 36 0 0 chr15 33397718 33398188 -70096786 - LTRIS_Mm LTR ERV1 -12 470 1 4 839 1295 178 4 39 chr15 33399711 33399833 -70095141 - MTC LTR MaLR -195 226 106 4 839 1295 178 4 39 chr15 33399978 33400089 -70094885 - MTC LTR MaLR -316 105 1 4 839 1069 291 41 20 chr15 33400879 33401220 -70093754 - ORR1E LTR MaLR -4 355 8 4 839 1004 257 42 49 chr15 33407343 33407728 -70087246 + RMER17C LTR ERVK 29 410 0 4 839 1708 246 32 24 chr15 33410280 33410742 -70084232 - RLTR16 LTR ERVK -39 466 1 4 839 363 247 176 49 chr15 33411020 33411166 -70083808 + MLT1D LTR MaLR 275 442 -63 4 839 363 247 176 49 chr15 33411193 33411213 -70083761 + MLT1D LTR MaLR 443 470 -35 4 839 363 247 176 49 chr15 33411919 33411952 -70083022 + MLT1D LTR MaLR 471 504 -1 4 839 916 270 107 47 chr15 33414252 33414569 -70080405 + MT2B LTR ERVL 3 409 -192 4 839 916 247 106 40 chr15 33414613 33414742 -70080232 + MT2B LTR ERVL 410 553 -48 4 839 263 109 0 21 chr15 33414848 33414895 -70080079 + MT2A LTR ERVL 488 533 0 4 840 2524 167 42 68 chr15 33433600 33434171 -70060803 + RLTR31_Mm LTR ERVK 6 561 0 5 840 1941 153 3 52 chr15 33437507 33437552 -70057422 + ORR1A2 LTR MaLR 1 42 -285 5 840 1941 153 3 52 chr15 33437718 33438016 -70056958 + ORR1A2 LTR MaLR 43 327 0 5 840 7443 148 215 9 chr15 33438016 33439643 -70055331 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 5 840 2163 127 16 3 chr15 33439643 33439966 -70055008 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 840 3385 33 2 0 chr15 33439993 33440388 -70054586 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 840 284 303 48 64 chr15 33444118 33444305 -70050669 - RLTR16 LTR ERVK -288 217 34 5 840 520 328 78 59 chr15 33446207 33446707 -70048267 - MER90a LTR ERV1 -16 559 65 5 840 1262 272 42 17 chr15 33447732 33448087 -70046887 - MTEa LTR MaLR 0 379 16 5 840 2504 63 39 3 chr15 33456005 33456037 -70038937 - IAPLTR4 LTR ERVK 0 345 312 5 840 2504 63 39 3 chr15 33456068 33456368 -70038606 - IAPLTR4 LTR ERVK -34 311 2 5 840 1897 155 50 3 chr15 33456980 33457303 -70037671 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 5 840 3053 48 45 0 chr15 33458736 33459115 -70035859 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 840 506 313 151 26 chr15 33459775 33460080 -70034894 - MLT1J2 LTR MaLR -91 357 15 5 840 1766 215 34 40 chr15 33460159 33460605 -70034369 - RLTR20B3 LTR ERVK -66 511 69 5 840 460 252 9 0 chr15 33462548 33462655 -70032319 - MLT1D LTR MaLR 0 505 398 5 840 253 232 122 44 chr15 33464452 33464542 -70030432 - MLT1D LTR MaLR -367 138 42 5 840 294 356 142 18 chr15 33464873 33465099 -70029875 - LTR16C LTR ERVL -2 487 234 5 840 639 368 86 34 chr15 33465885 33465952 -70029022 - LTR82A LTR ERVL -66 806 743 5 840 3344 41 5 0 chr15 33465952 33466346 -70028628 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 840 639 368 86 34 chr15 33466346 33466868 -70028106 - LTR82A LTR ERVL -130 742 186 5 840 552 364 24 0 chr15 33469476 33469682 -70025292 + ORR1E LTR MaLR 1 211 -148 5 840 1124 243 149 40 chr15 33470368 33470456 -70024518 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 560 465 5 840 1201 223 37 35 chr15 33470494 33470833 -70024141 - RLTR20B3 LTR ERVK -96 464 87 5 840 395 271 79 53 chr15 33477333 33477487 -70017487 - ORR1E LTR MaLR -236 158 1 5 840 2443 115 11 8 chr15 33518685 33519063 -69975911 - RLTR11B LTR ERVK -74 379 1 1 840 2442 143 35 23 chr15 33527318 33527748 -69967226 - RMER4B LTR ERVK -150 435 1 2 840 1259 199 25 36 chr15 33544204 33544481 -69950493 + RLTR46 LTR ERVK 42 315 -5 4 840 248 372 37 83 chr15 33545184 33545243 -69949731 + MLT1J LTR MaLR 83 137 -375 5 840 1498 183 27 98 chr15 33545243 33545684 -69949290 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 840 248 372 37 83 chr15 33545684 33545841 -69949133 + MLT1J LTR MaLR 138 289 -223 5 840 477 354 294 45 chr15 33551887 33552207 -69942767 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 9 6 840 1678 208 33 46 chr15 33552368 33552757 -69942217 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 840 4566 226 100 25 chr15 33552757 33554031 -69940943 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 2 6 840 1160 224 67 100 chr15 33554032 33554423 -69940551 - ORR1C2 LTR MaLR 0 378 1 6 841 1057 353 95 8 chr15 33554554 33555059 -69939915 - MER77 LTR ERVL 0 607 59 6 841 234 250 55 119 chr15 33555390 33555499 -69939475 - MTC LTR MaLR -55 366 265 6 841 3593 40 2 0 chr15 33556338 33556733 -69938241 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 841 342 276 23 0 chr15 33556809 33556896 -69938078 + MLT1H2 LTR MaLR 66 154 -335 6 841 446 221 156 26 chr15 33557164 33557336 -69937638 - MTD LTR MaLR -13 406 234 7 841 2443 134 17 43 chr15 33563210 33563630 -69931344 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 8 841 669 242 27 164 chr15 33565292 33565663 -69929311 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 8 841 717 147 0 17 chr15 33567804 33567922 -69927052 + RMER17D2 LTR ERVK 1 116 -693 8 841 2391 320 97 49 chr15 33576030 33577234 -69917740 + MTE-int LTR MaLR 317 1578 -2 9 841 390 270 177 73 chr15 33577822 33577986 -69916988 + ORR1D2 LTR MaLR 1 181 -193 9 841 362 266 61 30 chr15 33578201 33578333 -69916641 + ORR1D2 LTR MaLR 149 284 -86 9 841 2572 236 102 78 chr15 33578363 33579154 -69915820 - RMER13A LTR ERVK 0 860 51 9 841 1022 233 0 71 chr15 33579830 33580084 -69914890 + ORR1C2 LTR MaLR 21 256 -128 1 841 485 327 112 59 chr15 33582968 33583347 -69911627 - MLT1G3 LTR MaLR -114 434 77 1 841 298 306 9 69 chr15 33584182 33584298 -69910676 - MLT1B LTR MaLR -8 382 274 1 841 270 208 46 46 chr15 33587233 33587364 -69907610 + RMER17D LTR ERVK 236 366 -523 1 841 279 187 105 13 chr15 33588429 33588505 -69906469 - MTE2b LTR MaLR -18 361 279 1 841 2571 101 63 68 chr15 33588767 33589180 -69905794 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 1 841 6388 30 4 12 chr15 33589182 33589932 -69905042 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 1 841 2183 76 0 4 chr15 33589931 33590210 -69904764 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 1 841 3849 71 2 18 chr15 33590210 33590713 -69904261 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 1 841 250 302 0 0 chr15 33590713 33590766 -69904208 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 1 841 953 118 22 73 chr15 33590766 33590979 -69903995 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 3 1 841 2560 127 116 14 chr15 33590981 33591412 -69903562 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 475 1 1 841 2209 111 8 109 chr15 33592460 33592826 -69902148 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 841 1070 200 2 91 chr15 33596287 33596538 -69898436 + ORR1C1 LTR MaLR 1 230 -144 1 841 264 352 0 0 chr15 33597395 33597483 -69897491 + MLT1J LTR MaLR 418 505 -7 1 841 1273 209 82 70 chr15 33597536 33597938 -69897036 + RMER17C LTR ERVK 1 407 -3 1 841 473 256 112 25 chr15 33598348 33598544 -69896430 + RMER17C-int LTR ERVK 274 486 -2752 1 841 389 345 0 24 chr15 33598549 33598718 -69896256 + RodERV21-int LTR ERV1 755 919 -4072 1 841 6475 148 30 48 chr15 33599229 33600446 -69894528 + RMER17C-int LTR ERVK 1093 2287 -951 1 841 501 311 23 47 chr15 33605594 33605766 -69889208 + MLT1K LTR MaLR 4 171 -424 1 841 2813 53 11 26 chr15 33608021 33608372 -69886602 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 841 662 260 199 29 chr15 33609896 33610177 -69884797 + MTC LTR MaLR 38 366 -55 1 841 1748 186 36 57 chr15 33610211 33610632 -69884342 + RLTR19-int LTR ERVK 1670 2081 -4056 1 841 728 216 181 16 chr15 33612234 33612544 -69882430 + MLT1B LTR MaLR 30 390 0 1 841 2551 152 29 10 chr15 33623558 33623971 -69871003 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 841 1011 271 119 26 chr15 33626259 33626569 -69868405 + ORR1D1 LTR MaLR 36 374 0 1 841 437 56 0 0 chr15 33641569 33641623 -69853351 + RLTR10B LTR ERVK 239 292 0 1 841 1856 61 26 11 chr15 33641623 33641969 -69853005 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 276 -7305 1 841 976 32 24 0 chr15 33641959 33642083 -69852891 + MMERVK10C-int LTR ERVK 5440 5566 -2015 1 841 1807 64 0 0 chr15 33642083 33642318 -69852656 + MMERVK10C-int LTR ERVK 7347 7581 0 1 841 2213 19 114 0 chr15 33642318 33642580 -69852394 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 1 841 612 270 61 17 chr15 33642925 33643106 -69851868 - MTD LTR MaLR -5 414 226 1 841 2694 67 12 0 chr15 33655411 33655470 -69839504 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 288 2 841 2694 67 12 0 chr15 33655497 33655779 -69839195 - ORR1A1 LTR MaLR -59 287 2 2 841 987 235 74 61 chr15 33656416 33656779 -69838195 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 841 227 323 0 30 chr15 33679910 33679977 -69814997 + MLT1N2 LTR MaLR 494 558 -4 2 841 664 313 73 39 chr15 33680055 33680438 -69814536 - LTR37B LTR ERV1 0 468 73 2 841 259 238 63 0 chr15 33680572 33680635 -69814339 - LTR37B LTR ERV1 -399 69 3 2 842 806 145 0 8 chr15 33687618 33687743 -69807231 - ORR1A2 LTR MaLR -82 245 122 2 842 2234 222 54 65 chr15 33687737 33688310 -69806664 - RMER19C LTR ERVK -44 567 1 2 842 4704 192 68 49 chr15 33689465 33690549 -69804425 + RLTR21 LTR ERVK 3 1107 -465 2 842 269 87 0 0 chr15 33690671 33690717 -69804257 + RLTR21 LTR ERVK 719 764 -808 2 842 358 113 97 0 chr15 33690837 33690899 -69804075 - ORR1C1 LTR MaLR -9 369 302 2 842 1567 171 105 47 chr15 33690904 33691247 -69803727 + ORR1B2 LTR MaLR 5 367 0 2 842 683 294 144 103 chr15 33692360 33692538 -69802436 - MLT1F2 LTR MaLR -9 551 339 2 842 3351 38 5 0 chr15 33692538 33692932 -69802042 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 842 8823 56 3 0 chr15 33692932 33694027 -69800947 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 842 3182 24 48 0 chr15 33694027 33694403 -69800571 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 2 842 683 294 144 103 chr15 33694403 33694582 -69800392 - MLT1F2 LTR MaLR -222 338 179 2 842 712 219 36 0 chr15 33696058 33696195 -69798779 + MTE-int LTR MaLR 59 200 -1380 2 842 907 218 30 57 chr15 33696780 33697019 -69797955 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -139 2 842 570 209 149 11 chr15 33697115 33697267 -69797707 + ORR1D1 LTR MaLR 211 379 0 2 842 644 236 52 46 chr15 33698697 33698870 -69796104 + MTE-int LTR MaLR 789 962 -618 2 842 1320 226 116 35 chr15 33700687 33701058 -69793916 + MTC LTR MaLR 13 413 -8 2 842 765 301 67 72 chr15 33701895 33702311 -69792663 + BGLII_B LTR ERVK 1 414 -27 2 842 1692 192 83 25 chr15 33705512 33705875 -69789099 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 842 2710 72 61 5 chr15 33708471 33708846 -69786128 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 842 812 226 0 0 chr15 33709651 33709810 -69785164 - RLTR16 LTR ERVK -346 159 1 2 842 3389 48 35 2 chr15 33716379 33716801 -69778173 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 842 2423 110 0 58 chr15 33725111 33725458 -69769516 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 842 2684 111 10 5 chr15 33727143 33727543 -69767431 + RLTR9E LTR ERVK 3 404 -5 2 842 275 231 12 82 chr15 33727551 33727636 -69767338 + ETnERV-int LTR ERVK 2 80 -3234 2 842 2072 218 31 23 chr15 33727791 33728275 -69766699 + ETnERV-int LTR ERVK 72 559 -2755 2 842 3744 136 31 37 chr15 33731024 33731675 -69763299 + ETnERV2-int LTR ERVK 5774 6420 -986 2 842 557 93 0 0 chr15 33731888 33731963 -69763011 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7405 -1 2 842 1065 102 0 7 chr15 33731963 33732111 -69762863 + RLTR9E LTR ERVK 1 147 -262 2 842 2396 112 54 108 chr15 33743872 33744374 -69750600 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 842 6251 36 3 19 chr15 33744376 33745132 -69749842 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 2 842 2194 75 0 0 chr15 33745131 33745409 -69749565 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 2 842 3660 55 1 17 chr15 33745409 33745988 -69748986 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 2 842 250 302 0 0 chr15 33745988 33746041 -69748933 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 2 842 228 321 0 0 chr15 33746069 33746122 -69748852 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 2 842 929 137 16 98 chr15 33746122 33746316 -69748658 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 18 2 842 311 127 0 18 chr15 33746314 33746370 -69748604 - IAPEz-int LTR ERVK -1930 57 3 2 842 2453 112 79 90 chr15 33746397 33746877 -69748097 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 842 444 272 63 42 chr15 33748170 33748312 -69746662 - LTR79 LTR ERVL -3 524 380 2 842 439 375 73 36 chr15 33749711 33750013 -69744961 - LTR16A LTR ERVL -102 349 37 2 842 1498 159 116 62 chr15 33751382 33751718 -69743256 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 842 19056 95 10 18 chr15 33754775 33757422 -69737552 + MERVK26-int LTR ERVK 363 2988 -3931 3 842 2413 95 24 9 chr15 33757459 33757800 -69737174 + MERVK26-int LTR ERVK 5191 5536 -1383 3 842 255 333 26 9 chr15 33757827 33757942 -69737032 + LTR48 LTR ERV1 484 600 -187 3 842 2707 73 11 45 chr15 33759099 33759163 -69735811 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 279 3 842 2707 73 11 45 chr15 33759189 33759482 -69735492 - ORR1A1 LTR MaLR -68 278 1 3 842 1035 44 29 7 chr15 33761203 33761339 -69733635 + RLTR45 LTR ERVK 344 482 0 3 842 4430 72 107 19 chr15 33761339 33761975 -69732999 + RLTR45-int LTR ERVK 1 692 -6552 3 842 1156 51 0 0 chr15 33762264 33762402 -69732572 + RLTR45-int LTR ERVK 681 818 -6426 3 842 12103 41 13 11 chr15 33763184 33765007 -69729967 + RLTR45-int LTR ERVK 1322 3212 -4032 3 842 4068 82 30 34 chr15 33764977 33765587 -69729387 + RLTR45-int LTR ERVK 3380 3986 -3258 3 842 8459 37 4 7 chr15 33765580 33766591 -69728383 + RLTR45-int LTR ERVK 5065 6072 -1172 3 842 2013 101 13 3 chr15 33766613 33766912 -69728062 + RLTR13B1 LTR ERVK 207 508 -385 3 842 1953 55 0 4 chr15 33766912 33767149 -69727825 + RLTR45-int LTR ERVK 6333 6568 -676 3 842 6156 46 0 4 chr15 33767141 33767864 -69727110 + RLTR45-int LTR ERVK 6525 7244 0 3 842 2613 81 17 3 chr15 33767864 33768224 -69726750 + RLTR45 LTR ERVK 1 365 -117 3 842 454 224 8 114 chr15 33785749 33785768 -69709206 + MT2B LTR ERVL 147 151 -450 3 842 3751 73 21 4 chr15 33788872 33789339 -69705635 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 842 3498 65 0 0 chr15 33794571 33794971 -69700003 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 842 474 25 25 6 chr15 33795695 33795767 -69699207 - MTB LTR MaLR -110 311 220 3 842 602 331 5 11 chr15 33796612 33796801 -69698173 - MLT2B1 LTR ERVL 0 567 380 3 842 2209 75 6 13 chr15 33796791 33797102 -69697872 + MTB LTR MaLR 92 400 0 3 842 1048 282 87 85 chr15 33804640 33805240 -69689734 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 3 842 2289 167 52 20 chr15 33805668 33806072 -69688902 - MTC LTR MaLR 0 421 5 3 843 362 270 87 52 chr15 33818652 33818824 -69676150 + LTRIS5 LTR ERV1 186 363 -84 3 843 273 353 6 6 chr15 33820289 33820446 -69674528 + RNERVK23-int LTR ERVK 289 445 -7772 3 843 1990 156 32 93 chr15 33820467 33820877 -69674097 + RLTR41 LTR ERV1 62 446 0 3 843 623 318 79 19 chr15 33822069 33822542 -69672432 + RLTR6-int LTR ERV1 1292 1984 -5794 3 843 274 237 120 56 chr15 33822683 33822808 -69672166 + RLTR6-int LTR ERV1 2456 2588 -2102 3 843 2929 307 74 53 chr15 33822941 33824786 -69670188 + MuRRS4-int LTR ERV1 2138 4020 -1043 3 843 557 318 39 13 chr15 33825591 33825861 -69669113 + MuRRS4-int LTR ERV1 4663 4888 -175 3 843 1536 178 84 84 chr15 33825994 33826350 -69668624 + RLTR41 LTR ERV1 91 446 0 3 843 2598 97 62 141 chr15 33826361 33826828 -69668146 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 3 843 473 283 54 29 chr15 33826954 33827168 -69667806 - RLTR6-int LTR ERV1 -287 7491 7303 3 843 1230 326 40 45 chr15 33828000 33828803 -69666171 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1043 4020 3164 3 843 927 334 56 70 chr15 33829273 33829909 -69665065 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3334 4222 3588 3 843 3738 25 0 0 chr15 33829909 33830305 -69664669 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 843 927 328 87 72 chr15 33830305 33830926 -69664048 - MMERGLN-int LTR ERV1 -4107 3671 3050 3 843 373 298 64 48 chr15 33830960 33831147 -69663827 - MMERGLN-int LTR ERV1 -5936 1842 1653 3 843 278 273 66 36 chr15 33831565 33831702 -69663272 + RMER16-int LTR ERVK 5241 5381 -25 3 843 6276 142 35 6 chr15 33832037 33832968 -69662006 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 3 843 1222 211 66 33 chr15 33834783 33835116 -69659858 + RLTR15 LTR ERVK 1 344 -15 3 843 436 326 80 44 chr15 33843228 33843453 -69651521 + MLT1C LTR MaLR 1 233 -234 3 843 377 312 31 0 chr15 33844065 33844193 -69650781 + MLT1C LTR MaLR 336 467 0 3 843 1850 114 85 186 chr15 33846579 33847107 -69647867 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 843 2160 178 128 2 chr15 33847133 33847556 -69647418 - RMER15 LTR ERVL 0 575 100 4 843 667 269 202 125 chr15 33847973 33848325 -69646649 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 4 843 3129 74 25 13 chr15 33852618 33853013 -69641961 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 843 578 308 141 38 chr15 33855481 33855828 -69639146 + MER57D LTR ERV1 27 409 -2 4 843 629 251 80 96 chr15 33857580 33857893 -69637081 - ORR1E LTR MaLR -5 354 47 4 843 309 226 0 0 chr15 33858092 33858150 -69636824 - ORR1E LTR MaLR -294 65 8 4 843 442 108 0 0 chr15 33858321 33858386 -69636588 + ORR1C1 LTR MaLR 314 378 0 4 843 326 221 0 14 chr15 33858884 33858953 -69636021 - MTD LTR MaLR -284 135 68 4 843 478 258 30 42 chr15 33860103 33860269 -69634705 + RLTR43A LTR ERVK 201 364 0 4 843 2401 161 131 27 chr15 33861151 33861662 -69633312 + ETnERV2-int LTR ERVK 256 819 -4587 4 843 2658 177 23 8 chr15 33861666 33862140 -69632834 + ETnERV2-int LTR ERVK 1078 1558 -3848 4 843 9128 224 20 14 chr15 33862156 33864163 -69630811 + ETnERV2-int LTR ERVK 4083 5793 -1613 4 843 1144 162 5 16 chr15 33864158 33864352 -69630622 + RMER16-int LTR ERVK 3791 3982 -1424 4 843 413 335 12 24 chr15 33865286 33865454 -69629520 + RodERV21-int LTR ERV1 4398 4563 -428 4 843 252 219 40 40 chr15 33865789 33865865 -69629109 + RNERVK23-int LTR ERVK 7735 7810 -407 4 843 1508 218 40 29 chr15 33865869 33866219 -69628755 + ETnERV2-int LTR ERVK 6644 6997 -409 4 843 3633 28 2 2 chr15 33871831 33872227 -69622747 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 843 10138 18 4 0 chr15 33872227 33873321 -69621653 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 843 3585 33 2 2 chr15 33873321 33873717 -69621257 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 843 432 297 30 42 chr15 33874481 33874646 -69620328 + RLTR43A LTR ERVK 202 364 0 4 843 387 171 26 13 chr15 33879220 33879297 -69615677 - MTC LTR MaLR -343 78 1 4 843 250 203 66 33 chr15 33881084 33881145 -69613829 - MuLV-int LTR ERV1 -6261 1345 1283 4 843 450 340 96 41 chr15 33881427 33881697 -69613277 - MLT1H LTR MaLR -260 289 5 4 843 349 240 20 29 chr15 33885042 33885170 -69609804 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 233 4 843 3370 46 13 0 chr15 33885359 33885750 -69609224 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 843 2085 88 12 89 chr15 33885969 33886305 -69608669 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 18 4 843 2980 167 4 0 chr15 33892128 33892588 -69602386 - RMER13B LTR ERVK -446 462 1 4 843 1442 254 20 110 chr15 33893579 33893978 -69600996 - MTE2b LTR MaLR -14 365 3 4 843 3304 132 0 0 chr15 33894612 33895058 -69599916 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 4 843 4914 97 33 57 chr15 33895867 33896696 -69598278 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 4 843 872 224 70 28 chr15 33900024 33900340 -69594634 - ORR1D2 LTR MaLR -8 376 1 4 843 1429 252 60 23 chr15 33901112 33901465 -69593509 - MTEa LTR MaLR -13 366 1 4 843 344 355 41 0 chr15 33902949 33903070 -69591904 + MLT1I LTR MaLR 73 198 -213 4 843 313 255 96 70 chr15 33903618 33903774 -69591200 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 410 4 843 3174 131 171 15 chr15 33906862 33907459 -69587515 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 843 6790 58 28 19 chr15 33922849 33923696 -69571278 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 5 843 788 262 49 95 chr15 33924011 33924336 -69570638 - ORR1E LTR MaLR -47 312 3 5 843 1534 201 15 14 chr15 33924349 33924662 -69570312 - RMER19B LTR ERVK -326 411 1 5 843 498 84 0 0 chr15 33924745 33924816 -69570158 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 322 5 843 742 124 234 0 chr15 33924816 33924961 -69570013 - ORR1B1 LTR MaLR -215 179 1 5 843 356 338 26 80 chr15 33925852 33926003 -69568971 - MTE2a LTR MaLR -163 216 74 5 843 3356 203 124 34 chr15 33926003 33926650 -69568324 - RMER17B LTR ERVK 0 958 218 5 843 4729 76 12 27 chr15 33926650 33927246 -69567728 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 5 843 3356 203 124 34 chr15 33927246 33927477 -69567497 - RMER17B LTR ERVK -741 217 2 5 843 339 228 41 52 chr15 33927477 33927565 -69567409 - MTE2a LTR MaLR -315 104 18 5 843 461 246 95 68 chr15 33927565 33927713 -69567261 - ORR1B2 LTR MaLR -215 152 1 5 843 468 262 82 29 chr15 33927714 33927928 -69567046 - ORR1B2-int LTR MaLR -7 1251 1066 5 843 360 187 61 71 chr15 33928998 33929017 -69565957 - MLT1A1 LTR MaLR -21 387 371 5 843 1954 178 110 13 chr15 33929017 33929399 -69565575 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 843 360 187 61 71 chr15 33929399 33929477 -69565497 - MLT1A1 LTR MaLR -38 370 291 5 843 2426 118 33 25 chr15 33932121 33932486 -69562488 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 843 350 171 0 28 chr15 33932489 33932561 -69562413 - ETnERV-int LTR ERVK -6 7400 7331 5 843 3223 206 20 58 chr15 33932835 33933616 -69561358 - ETnERV-int LTR ERVK -984 6422 5671 5 843 2039 170 52 23 chr15 33934330 33934351 -69560623 - ETnERV-int LTR ERVK -2928 4478 4458 5 843 5121 296 34 29 chr15 33934544 33938252 -69556722 - ETnERV-int LTR ERVK -2949 4457 4 5 843 2259 119 60 23 chr15 33938254 33938605 -69556369 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 5 5 843 513 311 68 68 chr15 33938879 33939114 -69555860 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 329 5 843 3231 81 13 0 chr15 33939354 33939749 -69555225 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 843 2420 97 48 0 chr15 33939806 33940117 -69554857 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 5 843 1229 265 221 2 chr15 33941641 33942049 -69552925 + MLT1D LTR MaLR 9 505 0 5 843 2019 149 33 17 chr15 33944784 33945214 -69549760 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 413 -148 5 843 2049 151 136 33 chr15 33945769 33946167 -69548807 + BGLII_B LTR ERVK 2 440 -1 5 844 974 309 33 2 chr15 33947790 33948186 -69546788 + MYSERV6-int LTR ERVK 452 859 -8100 5 844 281 169 169 0 chr15 33952287 33952346 -69542628 + ORR1D1 LTR MaLR 2 70 -304 5 844 829 289 66 106 chr15 33953229 33953336 -69541638 + MTE2a LTR MaLR 1 106 -315 5 844 829 279 36 92 chr15 33953517 33953837 -69541137 + MTE2a LTR MaLR 75 373 -6 5 844 1763 158 70 33 chr15 33954154 33954513 -69540461 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 5 844 1486 217 60 14 chr15 33954705 33955056 -69539918 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 5 844 625 213 146 91 chr15 33955349 33955602 -69539372 + RLTR11A LTR ERVK 1 267 -261 5 844 1092 299 26 35 chr15 33956782 33956881 -69538093 - RodERV21-int LTR ERV1 -202 4789 4696 5 844 2609 142 37 47 chr15 33956881 33957368 -69537606 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 5 844 1092 299 26 35 chr15 33957368 33957695 -69537279 - RodERV21-int LTR ERV1 -296 4695 4367 5 844 2286 319 37 34 chr15 33957949 33958912 -69536062 - RodERV21-int LTR ERV1 -728 4263 3299 5 844 4238 153 127 78 chr15 33958912 33959388 -69535586 - RLTR13D2 LTR ERVK 0 1023 609 5 844 4238 153 127 78 chr15 33959536 33960034 -69534940 - RLTR13D2 LTR ERVK -415 608 1 5 844 2286 319 37 34 chr15 33960034 33960167 -69534807 - RodERV21-int LTR ERV1 -1693 3298 3164 5 844 271 237 52 29 chr15 33962064 33962167 -69532807 - RLTR6-int LTR ERV1 -2734 5044 4979 5 844 272 301 50 40 chr15 33962649 33962871 -69532103 - RodERV21-int LTR ERV1 -1988 5103 4880 5 844 323 295 63 95 chr15 33964737 33964937 -69530037 - RodERV21-int LTR ERV1 -3037 4054 3859 5 844 4207 125 37 74 chr15 33964937 33965776 -69529198 + RMER17D2 LTR ERVK 2 809 0 5 844 323 295 63 95 chr15 33965776 33965953 -69529021 - RodERV21-int LTR ERV1 -3233 3858 3689 5 844 1477 257 34 48 chr15 33966379 33966820 -69528154 - RodERV21-int LTR ERV1 -2273 2718 2284 5 844 296 206 0 16 chr15 33970320 33970384 -69524590 + RMER6B LTR ERVK 368 430 -31 6 844 959 140 17 12 chr15 33971449 33971622 -69523352 + LTRIS3 LTR ERV1 339 512 0 6 844 270 306 139 64 chr15 33973597 33973880 -69521094 - MLT2B4 LTR ERVL -56 500 109 6 844 1812 174 27 79 chr15 33975497 33975903 -69519071 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 62 6 844 576 201 45 0 chr15 33980011 33980145 -69514829 + ORR1D1 LTR MaLR 1 140 -234 6 844 12795 60 11 1 chr15 33980835 33982388 -69512586 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1046 4017 2450 6 844 3228 156 8 8 chr15 33982385 33982883 -69512091 - MuRRS4-int LTR ERV1 -4287 776 279 6 844 1912 144 214 8 chr15 33983279 33983649 -69511325 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 6 844 1557 194 206 39 chr15 33983864 33984321 -69510653 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 6 844 1678 132 137 13 chr15 33985906 33986221 -69508753 + ORR1B2 LTR MaLR 1 354 -13 6 844 1846 198 15 73 chr15 33990867 33991335 -69503639 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 6 844 1934 199 17 14 chr15 33991881 33992045 -69502929 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -19 2307 2147 6 844 1934 199 17 14 chr15 33992186 33992440 -69502534 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -180 2146 1888 6 844 515 267 7 20 chr15 33995394 33995543 -69499431 + MLT1B LTR MaLR 201 347 -43 6 844 2293 111 17 76 chr15 33996679 33997098 -69497876 - RLTR23 LTR ERV1 -36 394 1 6 844 1637 152 114 12 chr15 33997963 33998296 -69496678 + RMER10B LTR ERVL 32 398 0 6 844 737 295 96 24 chr15 33998332 33998665 -69496309 - MLT1E1A-int LTR MaLR -1131 358 2 6 844 298 312 139 65 chr15 33998671 33998817 -69496157 - MLT1E1A LTR MaLR -3 677 507 6 844 3936 83 21 30 chr15 33998817 33999388 -69495586 - RMER2 LTR ERV1 -1 566 1 6 844 298 312 139 65 chr15 33999388 33999471 -69495503 - MLT1E1A LTR MaLR -174 506 432 6 844 331 289 38 38 chr15 34000742 34000875 -69494099 - LTR16A LTR ERVL -12 439 307 3 844 394 289 79 75 chr15 34001741 34002007 -69492967 + ORR1E LTR MaLR 15 337 -42 7 844 238 111 0 0 chr15 34002286 34002320 -69492654 + ORR1E LTR MaLR 339 372 -7 7 844 497 218 18 82 chr15 34003160 34003330 -69491644 + MTEb LTR MaLR 2 160 -219 1 844 3717 202 28 28 chr15 34003185 34004084 -69490890 - RMER17B LTR ERVK -123 835 1 1 844 327 200 58 91 chr15 34004084 34004162 -69490812 + MTEb LTR MaLR 306 379 0 1 844 2752 58 3 0 chr15 34008379 34008724 -69486250 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 844 863 245 125 53 chr15 34009384 34009703 -69485271 + ORR1E LTR MaLR 7 348 -11 2 844 450 253 184 9 chr15 34010608 34010831 -69484143 + LTR65 LTR ERV1 278 539 -130 2 844 1374 166 154 7 chr15 34033987 34034267 -69460707 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 1 844 849 149 223 16 chr15 34039075 34039259 -69455715 - RMER20A LTR ERVK -293 223 2 1 844 465 353 16 21 chr15 34056972 34057163 -69437811 - MT2A LTR ERVL -160 373 184 1 844 610 291 89 20 chr15 34060030 34060276 -69434698 - MT2A LTR ERVL 0 533 271 1 844 467 144 69 0 chr15 34067325 34067428 -69427546 + ORR1C2 LTR MaLR 27 162 -222 1 844 657 136 71 8 chr15 34067560 34067686 -69427288 + ORR1C2 LTR MaLR 251 384 0 1 845 538 230 89 0 chr15 34080923 34081058 -69413916 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 215 2 845 354 205 0 64 chr15 34081083 34081177 -69413797 + RLTR19C LTR ERVK 19 106 -400 2 845 1547 148 38 96 chr15 34081220 34081586 -69413388 + RMER10B LTR ERVL 1 345 -53 2 845 480 301 67 71 chr15 34081608 34081848 -69413126 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -350 7251 7013 2 845 1611 108 73 0 chr15 34082147 34082407 -69412567 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 41 2 845 1124 308 105 51 chr15 34083540 34085244 -69409730 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -2381 5397 3187 2 845 1464 334 76 54 chr15 34085289 34086906 -69408068 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3999 3602 1951 2 845 3618 164 57 21 chr15 34086931 34087599 -69407375 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 2 845 351 314 30 26 chr15 34087849 34088060 -69406914 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -5982 1624 1297 2 845 351 292 55 44 chr15 34088105 34088286 -69406688 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -6332 1446 1163 2 845 368 371 10 19 chr15 34088869 34089075 -69405899 - RodERV21-int LTR ERV1 -521 4470 4267 2 845 2543 328 31 39 chr15 34089298 34090607 -69404367 - RodERV21-int LTR ERV1 -782 4209 2911 2 845 408 310 20 15 chr15 34092025 34092349 -69402625 - MER52-int LTR ERV1 -1867 3450 3170 2 845 294 313 36 36 chr15 34092974 34093199 -69401775 - MER52-int LTR ERV1 -1987 5104 4880 2 845 476 335 46 60 chr15 34094017 34094513 -69400461 - MER52-int LTR ERV1 -3017 4074 3586 2 845 730 129 86 0 chr15 34094882 34095021 -69399953 + RMER10A LTR ERVL 264 414 -28 2 845 726 198 8 0 chr15 34095021 34095147 -69399827 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7196 -210 2 845 1390 141 166 0 chr15 34095630 34095913 -69399061 - ORR1C2 LTR MaLR -5 379 50 2 845 1784 174 13 3 chr15 34095996 34096302 -69398672 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 2 845 2113 72 57 83 chr15 34096373 34096709 -69398265 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 845 354 291 48 10 chr15 34097934 34098038 -69396936 + MTE2a LTR MaLR 58 165 -214 2 845 2328 83 111 0 chr15 34098057 34098464 -69396510 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 81 2 845 489 250 84 19 chr15 34098577 34098732 -69396242 + MTE2a LTR MaLR 184 348 -31 2 845 3471 28 5 0 chr15 34099191 34099585 -69395389 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 845 369 257 103 39 chr15 34102024 34102242 -69392732 + MLT2D LTR ERVL 56 299 -165 2 845 358 127 0 0 chr15 34103110 34103165 -69391809 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 324 2 845 1297 160 145 0 chr15 34103304 34103573 -69391401 - ORR1C1 LTR MaLR -35 343 36 2 845 1377 279 17 71 chr15 34104562 34105083 -69389891 + RLTR19 LTR ERVK 7 499 0 2 845 527 247 118 106 chr15 34105468 34105633 -69389341 + RLTR18 LTR ERVK 282 458 -158 2 845 527 247 118 106 chr15 34105721 34105886 -69389088 + RLTR18 LTR ERVK 459 616 0 2 845 2682 170 98 44 chr15 34106345 34107027 -69387947 + RMER13B LTR ERVK 3 787 -171 2 845 417 190 97 12 chr15 34108369 34108534 -69386440 + RMER17C LTR ERVK 95 273 -137 2 845 488 244 8 16 chr15 34114769 34114894 -69380080 + RMER15 LTR ERVL 302 425 -150 3 845 3586 105 113 2 chr15 34118087 34118689 -69376285 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 10 3 845 1839 92 92 0 chr15 34118709 34119001 -69375973 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 845 2575 72 196 5 chr15 34119441 34119885 -69375089 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 529 -3 3 845 593 273 119 77 chr15 34120637 34120816 -69374158 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 197 3 845 6600 55 42 4 chr15 34120816 34121639 -69373335 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 3 845 2006 104 210 3 chr15 34121639 34121967 -69373007 - MTB LTR MaLR -4 396 1 3 845 593 273 119 77 chr15 34121967 34122139 -69372835 - RLTR9A LTR ERVK -172 196 2 3 845 3431 160 117 37 chr15 34122579 34123317 -69371657 - RLTR19-int LTR ERVK -5201 936 140 3 845 2426 176 12 20 chr15 34123326 34123813 -69371161 - RLTR19C LTR ERVK 0 506 24 3 845 494 294 58 25 chr15 34123813 34124054 -69370920 - RMER17C LTR ERVK -34 376 128 3 845 670 199 54 117 chr15 34124310 34124659 -69370315 + RMER17C-int LTR ERVK 3414 3725 -2412 3 845 1814 206 148 102 chr15 34130782 34131103 -69363871 + RMER17C-int LTR ERVK 2608 2781 -457 3 845 3585 44 51 4 chr15 34131103 34131557 -69363417 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 845 1814 220 80 73 chr15 34131557 34132002 -69362972 + RMER17C-int LTR ERVK 2782 3238 0 3 845 2313 214 46 26 chr15 34132698 34133264 -69361710 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 577 0 3 845 278 49 24 0 chr15 34133718 34133759 -69361215 + RLTR14 LTR ERV1 6 47 -335 3 845 1546 152 92 3 chr15 34134284 34134587 -69360387 + RLTR14 LTR ERV1 44 373 -9 3 845 692 189 22 78 chr15 34136225 34136545 -69358429 - RMER17C LTR ERVK 0 410 4 3 845 1399 245 84 83 chr15 34136974 34137303 -69357671 - RMER17C-int LTR ERVK -54 3184 2838 3 845 1399 245 84 83 chr15 34137653 34137880 -69357094 - RMER17C-int LTR ERVK -401 2837 2627 3 845 798 186 51 169 chr15 34138075 34138430 -69356544 - RLTR19-int LTR ERVK -2412 3725 3413 3 845 284 235 29 0 chr15 34138470 34138538 -69356436 - RLTR19-int LTR ERVK -2889 3248 3179 3 845 2275 195 29 31 chr15 34138665 34139179 -69355795 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 16 3 845 542 113 48 58 chr15 34139211 34139314 -69355660 - MYSERV6-int LTR ERVK -276 8683 8582 3 845 1134 237 83 86 chr15 34139475 34139839 -69355135 - MYSERV6-int LTR ERVK -365 8594 8229 3 845 1134 244 81 98 chr15 34139975 34140213 -69354761 - MYSERV6-int LTR ERVK -731 8228 8117 3 845 825 218 52 48 chr15 34140214 34140484 -69354490 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 171 3 845 733 220 58 25 chr15 34140548 34140790 -69354184 - RLTR42-int LTR ERVK -3403 2119 1870 3 845 283 211 42 53 chr15 34141060 34141155 -69353819 - MYSERV-int LTR ERVK -1065 5485 5392 3 845 359 263 0 106 chr15 34141208 34141237 -69353737 + MT2B LTR ERVL 140 154 -447 3 845 362 247 95 91 chr15 34142779 34143020 -69351954 - RodERV21-int LTR ERV1 -4277 714 473 3 845 311 278 110 14 chr15 34143023 34143169 -69351805 - RodERV21-int LTR ERV1 -4784 207 48 3 845 284 221 156 0 chr15 34143579 34143656 -69351318 - MER74C LTR ERVL -14 446 358 3 845 315 191 0 105 chr15 34143749 34143798 -69351176 + ORR1B1 LTR MaLR 1 77 -317 3 845 1742 134 53 205 chr15 34143798 34144267 -69350707 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 3 845 315 239 0 107 chr15 34144267 34144347 -69350627 + ORR1B1 LTR MaLR 78 150 -244 3 845 442 275 47 6 chr15 34144550 34144722 -69350252 + RLTR41 LTR ERV1 268 446 0 3 845 1163 161 40 24 chr15 34144722 34144970 -69350004 + ORR1B1 LTR MaLR 134 385 -9 3 845 388 221 0 0 chr15 34145222 34145299 -69349675 + LTR33A LTR ERVL 437 513 -7 3 845 1297 225 69 22 chr15 34146256 34146619 -69348355 + RLTR18B LTR ERVK 47 426 -86 3 845 3310 40 25 0 chr15 34147318 34147719 -69347255 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 3 845 4998 82 5 15 chr15 34147719 34148391 -69346583 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 1322 3 845 2029 73 104 0 chr15 34148389 34148791 -69346183 - IAP-d-int LTR ERVK -1092 5450 5007 3 845 371 140 0 0 chr15 34148791 34148848 -69346126 - IAP-d-int LTR ERVK -6039 503 447 3 845 488 316 31 27 chr15 34148865 34149122 -69345852 - RLTR10-int LTR ERVK -6015 1566 1309 3 845 3891 62 23 23 chr15 34149285 34149885 -69345089 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 321 3 845 3237 40 24 20 chr15 34149897 34150306 -69344668 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 3 845 538 88 154 0 chr15 34150418 34150509 -69344465 + RLTR23 LTR ERV1 1 105 -325 3 845 429 313 0 8 chr15 34150597 34150729 -69344245 - RodERV21-int LTR ERV1 -1944 3047 2917 3 845 260 347 36 40 chr15 34151065 34151317 -69343657 - RLTR14-int LTR ERV1 -1868 3449 3199 3 845 1845 191 88 51 chr15 34151717 34152147 -69342827 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 3 845 328 65 0 0 chr15 34152149 34152195 -69342779 - MTB_Mm LTR MaLR -361 46 1 3 845 3259 38 10 2 chr15 34152491 34152884 -69342090 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 845 314 271 79 79 chr15 34153144 34153296 -69341678 + RLTR6-int LTR ERV1 7340 7491 -287 3 845 2335 112 56 160 chr15 34153434 34153914 -69341060 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 3 845 2918 41 9 0 chr15 34154618 34154961 -69340013 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 845 2969 32 32 0 chr15 34155027 34155370 -69339604 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 3 845 3481 113 15 29 chr15 34155370 34156103 -69338871 - IAPEz-int LTR ERVK 0 7581 6907 3 845 502 34 0 0 chr15 34156103 34156162 -69338812 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4852 3 845 1698 81 39 0 chr15 34156129 34156363 -69338611 - IAPEz-int LTR ERVK -4957 2723 2481 3 845 2506 124 46 48 chr15 34156363 34156839 -69338135 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 3 845 12607 26 6 0 chr15 34156839 34158259 -69336715 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5053 3 845 484 134 0 0 chr15 34158247 34158314 -69336660 - IAPEz-int LTR ERVK -5362 2318 2252 3 845 953 50 0 8 chr15 34158315 34158435 -69336539 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 1359 3 845 3538 66 5 29 chr15 34158435 34159175 -69335799 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 17 3 845 302 0 53 0 chr15 34159175 34159213 -69335761 - IAPEz-int LTR ERVK -6434 47 8 3 845 2535 121 46 48 chr15 34159213 34159689 -69335285 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 475 1 3 845 1952 69 12 0 chr15 34159689 34159935 -69335039 - IAPEY3-int LTR ERVK -5194 2486 2238 3 845 9605 121 11 39 chr15 34159912 34161413 -69333561 - IAPEY3-int LTR ERVK -5698 1982 524 3 845 821 147 46 58 chr15 34161412 34161576 -69333398 - IAPLTR4_I LTR ERVK -1290 180 18 3 845 3008 34 14 0 chr15 34161576 34161925 -69333049 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 3 845 884 204 12 66 chr15 34164211 34164452 -69330522 - RLTR1 LTR ERV1 -120 504 277 3 845 2227 192 55 14 chr15 34164837 34165328 -69329646 - RLTR11A2 LTR ERVK -15 512 2 3 845 1632 82 10 20 chr15 34173538 34173823 -69321151 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 267 -588 4 845 257 201 0 35 chr15 34176232 34176305 -69318669 - MER57-int LTR ERV1 -293 7244 7195 4 845 756 203 137 0 chr15 34176659 34176856 -69318118 - RLTR28 LTR ERVL -16 508 285 4 845 1998 133 46 49 chr15 34178176 34178587 -69316387 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 845 2249 150 72 99 chr15 34179177 34179732 -69315242 + RMER15 LTR ERVL 4 543 -32 4 845 2023 263 49 42 chr15 34179775 34180370 -69314604 + RMER15-int LTR ERVL 28 626 -4373 4 845 3041 245 124 47 chr15 34180446 34181811 -69313163 + RMER15-int LTR ERVL 872 2340 -2659 4 845 2555 206 102 31 chr15 34181944 34182559 -69312415 + RMER15-int LTR ERVL 4031 4689 -310 4 845 268 211 0 19 chr15 34182784 34182837 -69312137 + RMER15-int LTR ERVL 4829 4880 -119 4 845 595 169 136 7 chr15 34183703 34183858 -69311116 - RMER10A LTR ERVL -47 395 221 4 845 465 295 168 8 chr15 34184472 34184728 -69310246 + RMER5 LTR ERV1 38 334 -200 4 845 450 260 199 32 chr15 34193382 34193608 -69301366 + MTD LTR MaLR 153 405 -14 4 845 665 213 41 0 chr15 34196394 34196516 -69298458 - ETnERV2-int LTR ERVK -210 7196 7070 4 845 1195 71 30 0 chr15 34196933 34197102 -69297872 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 153 4 845 971 152 19 34 chr15 34199836 34200041 -69294933 - ORR1A2 LTR MaLR -123 204 3 4 845 324 270 68 55 chr15 34200564 34200627 -69294347 - MTEb LTR MaLR -200 179 6 4 845 342 242 55 0 chr15 34200627 34200718 -69294256 - MLT2B3 LTR ERVL -453 101 6 4 846 590 302 121 19 chr15 34214492 34214749 -69280225 + MTE2b LTR MaLR 13 295 -84 5 846 344 216 68 0 chr15 34215539 34215627 -69279347 + MTE2b LTR MaLR 284 377 -2 5 846 1495 151 4 12 chr15 34218698 34218946 -69276028 + MERVK26-int LTR ERVK 3896 4141 -2778 5 846 935 336 54 19 chr15 34218955 34219365 -69275609 + RodERV21-int LTR ERV1 4280 4703 -288 5 846 1803 144 100 0 chr15 34219885 34220109 -69274865 + MERVK26-int LTR ERVK 4152 4381 -2538 5 846 1803 144 100 0 chr15 34220161 34220235 -69274739 + MERVK26-int LTR ERVK 4382 4478 -2441 5 846 4138 208 55 10 chr15 34220245 34221102 -69273872 - MERVK26-int LTR ERVK -5751 1168 287 5 846 4138 208 55 10 chr15 34221156 34221187 -69273787 - MERVK26-int LTR ERVK -6633 286 242 5 846 1752 103 26 214 chr15 34221187 34221692 -69273282 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 846 2483 226 103 92 chr15 34221692 34222647 -69272327 + RMER17C-int LTR ERVK 1 965 -2273 5 846 5965 114 50 24 chr15 34223215 34223472 -69271502 + RMER17C-int LTR ERVK 1338 1602 -1636 5 846 5965 114 50 24 chr15 34223526 34224223 -69270751 + RMER17C-int LTR ERVK 1603 2316 -922 5 846 4530 102 19 3 chr15 34224220 34224856 -69270118 + RMER17C-int LTR ERVK 2593 3238 0 5 846 642 169 3 209 chr15 34224856 34224968 -69270006 + RMER17C LTR ERVK 1 109 -301 5 846 642 169 3 209 chr15 34225164 34225357 -69269617 + RMER17C LTR ERVK 110 243 -167 5 846 974 177 35 65 chr15 34225332 34225562 -69269412 + RMER17C LTR ERVK 188 410 0 5 846 1025 231 37 29 chr15 34225562 34225803 -69269171 - MERVK26-int LTR ERVK -6675 244 2 5 846 764 266 67 58 chr15 34226055 34226405 -69268569 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 21 5 846 881 224 78 41 chr15 34231228 34231538 -69263436 - RLTR11A LTR ERVK -4 524 218 5 846 597 175 216 29 chr15 34232264 34232430 -69262544 - MTD LTR MaLR -7 412 210 5 846 1901 146 75 57 chr15 34242234 34242620 -69252354 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 5 846 253 247 43 96 chr15 34243252 34243263 -69251711 - MT2B LTR ERVL -353 248 160 5 846 2718 130 100 21 chr15 34243843 34244322 -69250652 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 12 5 846 585 213 8 0 chr15 34248208 34248330 -69246644 + ORR1D1 LTR MaLR 12 134 -240 5 846 890 216 115 30 chr15 34248540 34248774 -69246200 + ORR1D1 LTR MaLR 121 374 0 5 846 2905 137 34 26 chr15 34249115 34249610 -69245364 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 5 846 785 178 394 17 chr15 34250782 34251079 -69243895 - MTC LTR MaLR -10 409 1 5 846 314 268 124 127 chr15 34251914 34252333 -69242641 - RMER21B LTR ERV1 -332 510 93 5 846 830 287 32 46 chr15 34253015 34253284 -69241690 - MLT1B LTR MaLR -6 384 117 5 846 830 287 32 46 chr15 34253420 34253431 -69241543 - MLT1B LTR MaLR -274 116 108 5 846 417 200 0 143 chr15 34255258 34255379 -69239595 - MT2B LTR ERVL -337 264 162 6 846 1760 168 200 3 chr15 34255379 34255719 -69239255 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 846 417 200 0 143 chr15 34255719 34255737 -69239237 - MT2B LTR ERVL -440 161 145 6 846 1351 163 211 19 chr15 34256831 34257143 -69237831 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 6 846 1452 255 106 12 chr15 34257614 34258019 -69236955 - RMER15-int LTR ERVL -392 4607 4165 6 846 1901 330 107 53 chr15 34258243 34258975 -69235999 - RMER15-int LTR ERVL -2775 2224 1469 6 846 1901 330 107 53 chr15 34259177 34259566 -69235408 - RMER15-int LTR ERVL -3531 1468 1042 6 846 750 282 56 22 chr15 34273575 34273807 -69221167 + MTD LTR MaLR 21 260 -159 6 846 2787 135 44 56 chr15 34273865 34274384 -69220590 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 12 6 846 645 149 263 8 chr15 34283472 34283637 -69211337 - MTD LTR MaLR -8 411 194 6 846 310 241 238 39 chr15 34283806 34283821 -69211153 - MTD LTR MaLR -203 193 180 6 846 767 212 95 0 chr15 34284004 34284172 -69210802 - MTD LTR MaLR -209 210 26 6 846 3291 158 108 10 chr15 34289382 34290010 -69204964 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 6 846 7580 84 18 15 chr15 34295329 34296349 -69198625 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 6 846 443 206 98 15 chr15 34297376 34297410 -69197564 - RLTR11B LTR ERVK -26 427 393 6 846 443 206 98 15 chr15 34297442 34297540 -69197434 - RLTR11B LTR ERVK -61 392 284 6 846 625 268 59 69 chr15 34297606 34297895 -69197079 - RLTR11B LTR ERVK -167 286 1 6 846 1724 195 33 14 chr15 34307538 34307897 -69187077 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 7 846 225 290 43 0 chr15 34311220 34311289 -69183685 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 337 7 846 426 287 26 0 chr15 34311608 34311723 -69183251 - MLT1A1 LTR MaLR -286 122 5 7 846 298 148 0 0 chr15 34312223 34312277 -69182697 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 317 7 846 232 273 79 20 chr15 34315644 34315745 -69179229 - MLT1C LTR MaLR -12 455 349 7 846 1163 152 4 34 chr15 34316074 34316312 -69178662 - RMER17C LTR ERVK 0 410 180 7 846 2144 143 116 26 chr15 34316833 34317292 -69177682 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 6 7 846 399 148 15 53 chr15 34321936 34322102 -69172872 - ORR1B2 LTR MaLR -248 146 1 7 846 564 216 0 36 chr15 34322102 34322255 -69172719 - ORR1C2 LTR MaLR -255 139 7 7 846 277 339 29 12 chr15 34323569 34323739 -69171235 - RLTR6-int LTR ERV1 -2064 5714 5542 7 846 1304 321 78 54 chr15 34323854 34324930 -69170044 - RLTR6-int LTR ERV1 -1051 4012 2911 7 846 1347 319 66 43 chr15 34324950 34326476 -69168498 - RLTR6-int LTR ERV1 -4890 2716 1186 7 846 457 312 68 26 chr15 34327057 34327313 -69167661 - RLTR6-int LTR ERV1 -6879 899 614 7 846 2005 118 75 0 chr15 34333340 34333646 -69161328 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 846 9788 137 57 112 chr15 34333646 34335724 -69159250 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1963 0 7 846 1763 128 101 26 chr15 34335724 34336030 -69158944 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 846 2043 165 274 54 chr15 34338361 34338862 -69156112 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 7 846 1239 223 144 8 chr15 34339014 34339376 -69155598 - MTD LTR MaLR 0 419 9 7 105 3341 38 2 2 chr15 34340743 34341139 -69153835 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 847 470 271 74 107 chr15 34343794 34344038 -69150936 - MLT1A LTR MaLR 0 374 139 7 847 827 197 4 6 chr15 34346010 34346190 -69148784 - ORR1C2 LTR MaLR -194 180 3 7 847 317 187 10 10 chr15 34346190 34346260 -69148714 - ORR1C2-int LTR MaLR -51 1529 1460 7 847 1695 193 75 8 chr15 34346314 34346701 -69148273 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 81 7 847 354 181 28 0 chr15 34347068 34347140 -69147834 - RLTR16 LTR ERVK -431 74 1 7 847 3339 229 121 96 chr15 34347141 34347261 -69147713 - ORR1C2-int LTR MaLR -44 1326 1218 7 847 3339 229 121 96 chr15 34347329 34348477 -69146497 - ORR1C2-int LTR MaLR -153 1217 26 7 847 1589 166 72 112 chr15 34348490 34348890 -69146084 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 847 265 208 0 0 chr15 34354470 34354523 -69140451 - MLT2D LTR ERVL -48 511 459 7 847 588 217 52 19 chr15 34354522 34354677 -69140297 - MLT2D LTR ERVL -203 211 52 7 847 2462 148 96 20 chr15 34363362 34363852 -69131122 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 7 847 716 222 114 0 chr15 34376713 34376880 -69118094 + MTD LTR MaLR 232 417 -2 8 847 285 284 93 43 chr15 34379007 34379169 -69115805 - ERVL-E-int LTR ERVL -1103 4564 4395 8 847 3512 28 2 0 chr15 34379328 34379723 -69115251 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 847 630 241 84 0 chr15 34381635 34381801 -69113173 + MLT1B LTR MaLR 211 390 0 8 847 1684 201 130 0 chr15 34385970 34386338 -69108636 - MTD LTR MaLR -1 418 3 8 847 3245 91 7 0 chr15 34386976 34387407 -69107567 - RLTR10C LTR ERVK -2 434 1 8 847 2543 152 34 2 chr15 34402107 34402515 -69092459 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 847 3456 30 5 0 chr15 34406451 34406845 -69088129 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 847 498 188 98 0 chr15 34409468 34409580 -69085394 - RLTR18B LTR ERVK -93 419 297 9 847 1735 140 92 68 chr15 34409665 34409893 -69085081 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 151 9 847 1735 140 92 68 chr15 34410046 34410186 -69084788 - ORR1C1 LTR MaLR -228 150 1 9 847 558 206 10 0 chr15 34410286 34410388 -69084586 + RMER10A LTR ERVL 1 103 -339 9 847 1421 17 0 0 chr15 34410388 34410564 -69084410 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 221 9 847 3396 48 0 0 chr15 34410565 34410962 -69084012 - MERVL-int LTR ERVL -1000 4485 4089 9 847 301 51 0 0 chr15 34411059 34411092 -69083882 - MTA_Mm LTR MaLR -361 35 3 9 847 619 191 131 50 chr15 34411094 34411293 -69083681 + RMER10A LTR ERVL 99 313 -129 9 847 278 113 19 0 chr15 34411410 34411463 -69083511 + RMER10A LTR ERVL 386 439 -3 9 847 367 273 73 0 chr15 34411989 34412099 -69082875 + RMER15 LTR ERVL 422 539 -36 9 847 2387 105 9 3 chr15 34412650 34412974 -69082000 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 9 847 791 85 0 99 chr15 34418640 34418771 -69076203 + ORR1A3 LTR MaLR 200 317 -9 9 847 311 342 55 0 chr15 34419215 34419396 -69075578 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 599 789 -6812 9 847 3012 63 7 20 chr15 34432790 34433193 -69061781 - MTB LTR MaLR -2 398 1 9 847 341 226 39 102 chr15 34439991 34440019 -69054955 - MT2B LTR ERVL -443 158 139 9 847 1017 260 60 78 chr15 34463208 34463542 -69031432 + MTE2b LTR MaLR 51 378 -1 1 105 493 334 28 96 chr15 34471840 34472194 -69022780 - MLT1A LTR MaLR -9 365 36 1 848 307 282 0 23 chr15 34472378 34472465 -69022509 + MLT1F1 LTR MaLR 275 359 -189 1 848 285 215 74 25 chr15 34473693 34473774 -69021200 - RMER10A LTR ERVL -37 405 321 1 848 403 231 75 87 chr15 34473936 34474097 -69020877 - RMER10A LTR ERVL -265 177 19 1 848 348 311 77 26 chr15 34474344 34474531 -69020443 + MLT1F1 LTR MaLR 373 569 0 1 848 2669 40 9 6 chr15 34482121 34482447 -69012527 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 1 848 453 279 181 40 chr15 34494562 34494887 -69000087 - MLT1C LTR MaLR -52 415 45 1 848 1454 164 89 10 chr15 34497029 34497331 -68997643 - RLTR9D LTR ERVK -3 400 75 1 848 3460 84 55 6 chr15 34497331 34497883 -68997091 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 929 227 1 848 2870 149 34 24 chr15 34497856 34498394 -68996580 - RLTR13D1 LTR ERVK -359 543 1 1 848 653 25 0 0 chr15 34498394 34498474 -68996500 - RLTR9D LTR ERVK -323 80 1 1 848 290 331 41 8 chr15 34498745 34498867 -68996107 + MTEb LTR MaLR 251 376 -3 1 848 242 302 53 23 chr15 34499271 34499403 -68995571 - MLT1C LTR MaLR 0 467 332 1 848 1044 124 171 5 chr15 34500091 34500278 -68994696 - MTC LTR MaLR 0 421 204 2 848 801 195 91 11 chr15 34500577 34500756 -68994218 - MTC LTR MaLR -216 205 12 2 848 691 115 0 0 chr15 34503998 34504094 -68990880 + RLTR26 LTR ERVK 547 642 0 8 848 236 300 68 29 chr15 34512734 34512837 -68982137 + ORR1A3-int LTR MaLR 1386 1492 -471 1 848 1730 180 135 6 chr15 34530615 34530962 -68964012 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 4 848 242 328 29 36 chr15 34532403 34532542 -68962432 + MLT1E2 LTR MaLR 17 154 -473 4 848 230 219 15 30 chr15 34532640 34532706 -68962268 + MLT1E2 LTR MaLR 326 390 0 4 848 926 235 113 42 chr15 34537156 34537494 -68957480 + MTD LTR MaLR 26 415 -4 5 848 578 171 60 0 chr15 34541222 34541339 -68953635 + RLTR15 LTR ERVK 236 359 0 6 848 8600 72 3 3 chr15 34563044 34564067 -68930907 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 1 848 2861 51 30 3 chr15 34576581 34576918 -68918056 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 848 230 269 53 150 chr15 34585469 34585696 -68909278 - RLTR12B LTR ERVK -296 232 28 1 848 1220 258 65 16 chr15 34588029 34588352 -68906622 + MTE-int LTR MaLR 1239 1577 -3 1 848 366 313 27 109 chr15 34588681 34588761 -68906213 + MTEb LTR MaLR 50 127 -252 1 848 1944 151 126 6 chr15 34588761 34589087 -68905887 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 1 848 480 243 53 169 chr15 34589087 34589362 -68905612 + MTEb LTR MaLR 128 366 -13 1 848 357 233 47 0 chr15 34590253 34590339 -68904635 + RMER15 LTR ERVL 473 562 -13 1 848 864 123 8 8 chr15 34591447 34591578 -68903396 - RLTR25B LTR ERVK 0 1103 973 1 848 4480 136 52 33 chr15 34591552 34592363 -68902611 - RLTR25B LTR ERVK -202 826 1 1 848 308 220 145 3 chr15 34593313 34593419 -68901555 - MTEa LTR MaLR 0 359 256 1 848 246 305 64 99 chr15 34593627 34593860 -68901114 + ORR1D1 LTR MaLR 8 232 -142 1 848 584 278 57 142 chr15 34596186 34596625 -68898349 - MLT1D LTR MaLR -41 426 6 1 849 1987 119 108 0 chr15 34604313 34604608 -68890366 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 1 849 1927 152 6 9 chr15 34613609 34613928 -68881046 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 1 849 230 292 111 0 chr15 34613963 34614035 -68880939 + MLT1H LTR MaLR 132 211 -338 1 849 439 270 26 0 chr15 34624320 34624435 -68870539 + MLT2C2 LTR ERVL 386 503 -56 2 849 1416 221 73 39 chr15 34624436 34624794 -68870180 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 2 849 3998 132 18 35 chr15 34624912 34625564 -68869410 + RLTR26 LTR ERVK 1 641 -1 2 849 1732 149 18 71 chr15 34636538 34636878 -68858096 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 849 722 288 84 58 chr15 34645895 34646238 -68848736 + MLT2B1 LTR ERVL 2 489 -78 2 849 1040 279 114 9 chr15 34647092 34647407 -68847567 - MTEa LTR MaLR -12 367 20 2 849 299 325 109 76 chr15 34647995 34648205 -68846769 - LTR16C LTR ERVL -14 475 259 2 849 791 261 157 58 chr15 34659933 34660226 -68834748 - MTE2a LTR MaLR 0 379 58 2 849 433 299 87 92 chr15 34674681 34675038 -68819936 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 2 849 772 299 99 17 chr15 34682435 34682779 -68812195 - MTEa LTR MaLR 0 379 8 2 849 444 234 23 115 chr15 34683979 34684153 -68810821 - MTC LTR MaLR -2 419 262 2 849 4226 185 87 70 chr15 34690320 34690654 -68804320 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 695 2 849 4226 185 87 70 chr15 34690848 34691477 -68803497 - RLTR25A LTR ERVK -409 694 115 2 849 4226 185 87 70 chr15 34691514 34691634 -68803340 - RLTR25A LTR ERVK -989 114 1 2 849 541 168 45 27 chr15 34700746 34700856 -68794118 - MTC LTR MaLR -307 114 3 3 849 2517 126 52 12 chr15 34701618 34702021 -68792953 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 3 849 485 294 69 59 chr15 34705263 34705567 -68789407 - RLTR19-int LTR ERVK -3248 2889 2583 3 849 847 193 121 73 chr15 34707318 34707672 -68787302 + RLTR20C LTR ERVK 1 479 -99 3 849 528 156 214 23 chr15 34707719 34707792 -68787182 + RLTR20C LTR ERVK 480 576 -2 3 849 3097 23 0 0 chr15 34708117 34708463 -68786511 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 849 701 305 95 21 chr15 34709042 34709421 -68785553 + MLT1C LTR MaLR 5 411 -56 3 849 258 221 0 42 chr15 34709718 34709789 -68785185 - MTEa LTR MaLR 0 379 312 3 849 386 275 130 55 chr15 34709939 34710085 -68784889 - MTEa LTR MaLR -156 223 67 3 849 303 151 0 0 chr15 34718229 34718282 -68776692 - MTEa LTR MaLR -326 53 1 3 849 1946 97 49 12 chr15 34721395 34721719 -68773255 - RLTR9A LTR ERVK -32 336 1 3 849 666 309 59 85 chr15 34722330 34722755 -68772219 - BGLII_B LTR ERVK -27 414 1 3 849 366 164 93 15 chr15 34725987 34726087 -68768887 + MTD LTR MaLR 272 419 0 3 849 226 183 46 77 chr15 34732188 34732253 -68762721 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 3 850 848 215 255 20 chr15 34734400 34734547 -68760427 + ORR1D1 LTR MaLR 1 173 -201 3 850 848 215 255 20 chr15 34734613 34734759 -68760215 + ORR1D1 LTR MaLR 174 362 -12 3 850 2960 134 119 2 chr15 34734836 34734895 -68760079 - RLTR20A2 LTR ERVK -25 553 481 3 850 2960 134 119 2 chr15 34734937 34735210 -68759764 - RLTR20A2 LTR ERVK -98 480 201 3 850 2960 134 119 2 chr15 34735291 34735452 -68759522 - RLTR20A2 LTR ERVK -378 200 4 3 850 232 335 83 70 chr15 34735698 34735939 -68759035 - ORR1E LTR MaLR 0 359 116 3 850 647 274 109 30 chr15 34736990 34737163 -68757811 - RMER21B LTR ERV1 -270 572 378 3 850 647 274 109 30 chr15 34737535 34737591 -68757383 - RMER21B LTR ERV1 -465 377 325 3 850 379 298 0 19 chr15 34737647 34737753 -68757221 - RMER21B LTR ERV1 -651 191 88 3 850 2096 163 24 75 chr15 34739101 34739566 -68755408 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 3 850 472 273 58 73 chr15 34741534 34741673 -68753301 + MTEb LTR MaLR 255 380 -14 3 850 406 339 50 11 chr15 34742030 34742212 -68752762 + MLT1H LTR MaLR 56 244 -305 3 850 745 318 34 42 chr15 34748604 34748925 -68746049 + MLT1G3 LTR MaLR 3 278 -277 3 850 325 284 14 0 chr15 34757498 34757572 -68737402 + MLT1J2 LTR MaLR 73 147 -301 3 850 354 285 43 53 chr15 34760992 34761158 -68733816 + MLT1J1 LTR MaLR 91 269 -179 3 850 259 276 0 62 chr15 34761191 34761272 -68733702 + MLT1J1 LTR MaLR 361 436 -12 3 850 269 262 8 151 chr15 34765453 34765579 -68729395 + MT2B LTR ERVL 150 257 -344 3 850 5414 121 97 1 chr15 34786059 34786450 -68708524 + RMER17B LTR ERVK 1 398 -560 4 850 5414 121 97 1 chr15 34786542 34787024 -68707950 + RMER17B LTR ERVK 399 957 -1 4 850 3367 28 23 0 chr15 34788523 34788910 -68706064 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 850 9446 32 1 3 chr15 34788910 34790010 -68704964 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 850 3494 28 2 0 chr15 34790010 34790405 -68704569 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 850 1186 195 144 13 chr15 34793385 34793697 -68701277 - ORR1C1 LTR MaLR -19 359 7 4 850 2093 320 49 18 chr15 34795056 34795929 -68699045 - RodERV21-int LTR ERV1 -202 4789 3890 4 850 664 332 26 36 chr15 34796120 34796614 -68698360 - RodERV21-int LTR ERV1 -3017 4074 3586 4 850 5769 276 48 66 chr15 34796868 34798938 -68696036 - RodERV21-int LTR ERV1 -2273 2718 686 4 850 1208 199 39 56 chr15 34799599 34799913 -68695061 - ORR1C2 LTR MaLR -16 368 61 4 850 237 125 0 0 chr15 34799911 34799951 -68695023 - ORR1C2 LTR MaLR -266 108 69 4 850 4060 41 47 2 chr15 34802038 34802335 -68692639 + RLTR1B LTR ERV1 1 303 -209 4 850 4060 41 47 2 chr15 34802357 34802549 -68692425 + RLTR1B LTR ERV1 304 510 -2 4 850 2104 142 56 0 chr15 34825980 34826338 -68668636 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 850 728 11 0 0 chr15 34828252 34828340 -68666634 - MTB LTR MaLR 0 400 313 4 850 1240 80 19 24 chr15 34828298 34828504 -68666470 + MTB LTR MaLR 196 400 0 4 850 344 304 141 17 chr15 34828858 34829035 -68665939 + MER34 LTR ERV1 344 542 0 4 850 268 319 65 57 chr15 34837741 34837864 -68657110 + MLT1J LTR MaLR 38 161 -351 4 850 4017 36 6 0 chr15 34838424 34838896 -68656078 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 850 2105 191 148 35 chr15 34846327 34846841 -68648133 + RMER4B LTR ERVK 14 585 0 4 850 286 176 84 42 chr15 34848598 34848669 -68646305 + MLT1D LTR MaLR 420 493 -12 4 850 1894 145 9 67 chr15 34850366 34850652 -68644322 + ORR1A4 LTR MaLR 1 266 -63 5 850 2072 112 76 0 chr15 34850652 34850956 -68644018 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 850 1894 145 9 67 chr15 34850956 34851010 -68643964 + ORR1A4 LTR MaLR 267 321 -8 5 850 2758 22 28 0 chr15 34852537 34852855 -68642119 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 5 850 322 115 80 50 chr15 34853352 34853462 -68641512 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 214 315 -52 5 850 505 254 121 59 chr15 34864083 34864355 -68630619 + RLTR12B LTR ERVK 240 528 0 5 851 278 352 37 63 chr15 34878719 34878910 -68616064 + MLT1J LTR MaLR 327 512 0 5 851 259 282 42 25 chr15 34879774 34879894 -68615080 - RMER17A2 LTR ERVK -541 365 244 5 851 2989 53 50 0 chr15 34886121 34886498 -68608476 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 851 739 263 194 14 chr15 34890466 34890759 -68604215 + MTE2b LTR MaLR 1 346 -33 5 851 529 288 241 21 chr15 34897186 34897477 -68597497 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 5 851 1048 313 58 22 chr15 34907098 34907457 -68587517 - MTE2a LTR MaLR -2 377 6 5 851 2467 140 191 25 chr15 34908770 34909362 -68585612 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 851 250 203 48 63 chr15 34912285 34912348 -68582626 + RLTR9A LTR ERVK 1 62 -306 5 851 4161 165 75 70 chr15 34915021 34915907 -68579067 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 5 851 1853 176 39 17 chr15 34926671 34927030 -68567944 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 851 2005 161 141 36 chr15 34928418 34928895 -68566079 + RLTR24 LTR ERV1 1 527 -2 5 851 339 323 101 29 chr15 34951369 34951576 -68543398 - RMER15 LTR ERVL -5 570 349 6 851 1664 224 28 0 chr15 34969212 34969574 -68525400 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 6 852 1210 168 47 38 chr15 34997222 34997564 -68497410 - MTB_Mm LTR MaLR -59 360 1 6 852 1117 278 93 15 chr15 34999048 34999457 -68495517 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 6 852 821 243 0 7 chr15 34999836 34999989 -68494985 + ORR1B2 LTR MaLR 1 152 -215 6 852 425 160 446 0 chr15 35000000 35000153 -68494821 + ORR1C2 LTR MaLR 164 384 0 1 852 3233 26 15 8 chr15 35000336 35000729 -68494245 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 852 372 323 87 80 chr15 35002947 35003077 -68491897 - MT2B2 LTR ERVL -158 426 197 6 852 372 323 87 80 chr15 35003202 35003233 -68491741 - MT2B2 LTR ERVL -158 196 139 6 852 286 305 82 33 chr15 35003841 35003963 -68491011 + MER21B LTR ERV1 81 208 -655 1 852 332 214 0 22 chr15 35009014 35009105 -68485869 + MER57A-int LTR ERV1 5794 5882 -305 1 852 1926 186 88 10 chr15 35009552 35009937 -68485037 + MTD LTR MaLR 2 416 -3 1 852 312 209 17 42 chr15 35010193 35010313 -68484661 - RMER17D LTR ERVK -389 500 384 2 852 1359 159 129 22 chr15 35033024 35033503 -68461471 + RMER4B LTR ERVK 14 585 0 6 852 1149 142 16 49 chr15 35033689 35033920 -68461054 + MTC LTR MaLR 2 343 -78 6 852 236 292 14 0 chr15 35035259 35035331 -68459643 + RMER5 LTR ERV1 400 472 -62 7 852 681 270 129 43 chr15 35042345 35042624 -68452350 - ORR1E LTR MaLR -15 344 42 7 852 3097 28 6 6 chr15 35054140 35054505 -68440469 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 8 852 544 332 72 43 chr15 35061139 35061436 -68433538 + MLT1A1 LTR MaLR 72 396 -12 9 852 638 276 124 19 chr15 35062382 35062648 -68432326 - ORR1E LTR MaLR -2 357 64 9 852 1596 164 105 54 chr15 35065027 35065419 -68429555 + RMER13A LTR ERVK 14 425 -435 1 852 1760 158 35 41 chr15 35065422 35065869 -68429105 + RMER17C LTR ERVK 19 439 -519 1 852 594 242 88 66 chr15 35067270 35067589 -68427385 + RMER17C LTR ERVK 82 407 -3 1 852 5577 217 101 72 chr15 35067591 35069858 -68425116 + RMER17C-int LTR ERVK 1 2333 -905 1 852 1288 174 74 39 chr15 35074704 35075024 -68419950 - ORR1C1 LTR MaLR 0 374 6 1 852 237 139 0 0 chr15 35087585 35087621 -68407353 + ORR1D1 LTR MaLR 1 36 -338 1 852 733 22 0 11 chr15 35087752 35087845 -68407129 + RMER16-int LTR ERVK 4073 4164 -1242 1 852 542 265 84 51 chr15 35089320 35089535 -68405439 + RLTR9A LTR ERVK 147 368 0 1 852 2771 237 27 25 chr15 35089535 35089559 -68405415 - MYSERV6-int LTR ERVK -479 6071 6052 1 852 3175 51 5 12 chr15 35089559 35089958 -68405016 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 852 2771 237 27 25 chr15 35089958 35090420 -68404554 - MYSERV6-int LTR ERVK -499 6051 5578 1 852 2513 168 148 35 chr15 35090420 35090969 -68404005 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 852 2771 237 27 25 chr15 35090969 35091270 -68403704 - MYSERV6-int LTR ERVK -973 5577 5282 1 852 2534 111 35 15 chr15 35091284 35091685 -68403289 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 852 7969 106 26 3 chr15 35091984 35093196 -68401778 + ETnERV2-int LTR ERVK 3441 4679 -2727 1 852 3122 37 5 2 chr15 35093194 35093600 -68401374 + ETnERV2-int LTR ERVK 5356 5762 -1644 1 852 2765 199 92 65 chr15 35093589 35094164 -68400810 + RMER16-int LTR ERVK 2696 3309 -2097 1 852 2765 199 92 65 chr15 35094203 35095010 -68399964 + RMER16-int LTR ERVK 3310 4173 -1233 1 852 410 76 152 0 chr15 35095225 35095291 -68399683 + RMER16-int LTR ERVK 7331 7406 0 1 852 2197 98 110 16 chr15 35095292 35095665 -68399309 + RLTR9E LTR ERVK 2 409 0 1 852 10095 186 52 24 chr15 35095743 35098454 -68396520 - MYSERV6-int LTR ERVK -1292 5258 2665 1 852 10095 155 42 24 chr15 35098655 35098855 -68396119 - MYSERV6-int LTR ERVK -6295 2664 2472 1 852 258 143 0 0 chr15 35098923 35098965 -68396009 - MYSERV6-int LTR ERVK -2298 2962 2921 1 852 314 268 20 59 chr15 35098965 35099167 -68395807 + RMER17A LTR ERVK 225 418 -333 1 852 2755 192 23 32 chr15 35099167 35099817 -68395157 - MYSERV6-int LTR ERVK -6694 2265 1622 1 852 5135 159 32 43 chr15 35099816 35100071 -68394903 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1058 1316 -1010 1 852 5135 159 32 43 chr15 35100769 35100999 -68393975 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1317 1505 -821 1 852 5135 159 32 43 chr15 35101033 35101247 -68393727 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1506 1732 -594 1 852 5135 159 32 43 chr15 35101283 35101735 -68393239 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1733 2197 -129 1 852 3557 20 0 0 chr15 35108499 35108895 -68386079 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 852 479 144 126 0 chr15 35110255 35110366 -68384608 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2186 2310 -16 1 852 778 272 52 105 chr15 35111028 35111621 -68383353 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 525 -3 1 852 1133 184 40 18 chr15 35111621 35111848 -68383126 - MYSERV6-int LTR ERVK -7817 1142 911 1 852 246 286 101 23 chr15 35112187 35112316 -68382658 - RMER4B LTR ERVK -100 485 347 1 852 2175 343 25 22 chr15 35112376 35113369 -68381605 - RodERV21-int LTR ERV1 -202 4789 3794 1 852 2400 108 121 5 chr15 35113373 35113793 -68381181 + RLTR44D LTR ERVK 1 469 -17 1 852 1332 309 49 34 chr15 35113820 35114426 -68380548 - RodERV21-int LTR ERV1 -1206 3785 3170 1 852 6722 48 11 0 chr15 35114426 35115225 -68379749 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 1 852 4775 50 21 2 chr15 35115462 35116038 -68378936 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 1 852 304 301 90 62 chr15 35116756 35116933 -68378041 - RLTR12B LTR ERVK -228 300 119 1 852 403 125 14 0 chr15 35117012 35117084 -68377890 + RMER10A LTR ERVL 346 418 -24 1 852 304 342 9 9 chr15 35117213 35117325 -68377649 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 251 1 852 318 242 55 0 chr15 35117444 35117527 -68377447 - MTE2b LTR MaLR -15 364 277 1 852 691 264 171 27 chr15 35117527 35117901 -68377073 - RMER10A LTR ERVL -3 439 12 1 852 2256 123 2 112 chr15 35118377 35118824 -68376150 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 1 852 362 291 0 60 chr15 35126154 35126204 -68368770 + MTEa LTR MaLR 10 59 -320 1 852 1302 108 275 76 chr15 35126204 35126331 -68368643 - RMER17C LTR ERVK 0 410 275 1 852 1302 108 275 76 chr15 35126498 35126712 -68368262 - RMER17C LTR ERVK -136 274 1 1 852 362 291 0 60 chr15 35126712 35126778 -68368196 + MTEa LTR MaLR 60 119 -260 1 853 1719 145 48 61 chr15 35127314 35127726 -68367248 - RMER17C LTR ERVK 0 410 4 1 853 288 223 58 32 chr15 35127823 35127945 -68367029 + MLT1J LTR MaLR 38 201 -311 1 853 802 122 53 26 chr15 35129141 35129293 -68365681 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 239 1 853 801 158 5 95 chr15 35131737 35131926 -68363048 + MYSERV-int LTR ERVK 2613 2784 -6175 1 853 2994 260 78 40 chr15 35131926 35133040 -68361934 + MYSERV-int LTR ERVK 4280 5382 -1168 1 853 1642 178 30 3 chr15 35133031 35133335 -68361639 + MYSERV6-int LTR ERVK 8392 8703 -256 1 853 280 146 0 35 chr15 35133427 35133484 -68361490 + MYSERV-int LTR ERVK 6298 6352 -198 1 853 960 175 15 15 chr15 35133612 35133809 -68361165 + MYSERV-int LTR ERVK 6350 6546 -4 1 853 2753 117 35 35 chr15 35139235 35139694 -68355280 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 2 853 1604 139 7 66 chr15 35144212 35144513 -68350461 + ORR1A2 LTR MaLR 1 283 -44 2 853 307 89 0 0 chr15 35145763 35145808 -68349166 + ORR1A2 LTR MaLR 274 318 -8 2 853 402 216 72 0 chr15 35149294 35149391 -68345583 + ORR1E LTR MaLR 1 104 -255 2 853 831 272 98 0 chr15 35149423 35149677 -68345297 + MTEa LTR MaLR 1 279 -100 2 853 2078 131 24 36 chr15 35149753 35150164 -68344810 + RMER17C LTR ERVK 5 410 0 2 853 326 197 0 0 chr15 35150207 35150273 -68344701 + MTEa LTR MaLR 314 379 0 2 853 283 288 30 46 chr15 35150364 35150495 -68344479 + MTEb LTR MaLR 230 358 -21 2 853 3276 40 25 0 chr15 35158008 35158409 -68336565 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 2 853 1572 230 84 38 chr15 35158551 35159052 -68335922 - RMER19C LTR ERVK 0 611 88 2 853 678 286 64 64 chr15 35160159 35160541 -68334433 + RLTR26 LTR ERVK 1 417 -225 2 853 361 317 107 6 chr15 35161215 35161383 -68333591 - MLT1J LTR MaLR -218 294 110 2 853 1611 185 111 23 chr15 35163412 35163569 -68331405 + ORR1D1 LTR MaLR 2 164 -210 2 853 1611 185 111 23 chr15 35163631 35163816 -68331158 + ORR1D1 LTR MaLR 165 374 0 2 853 2337 164 46 27 chr15 35166306 35166719 -68328255 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 853 289 257 124 38 chr15 35167973 35168078 -68326896 + RLTR14 LTR ERV1 224 337 -45 2 853 406 328 72 82 chr15 35168105 35168510 -68326464 + RLTR14-int LTR ERV1 2 402 -4915 2 853 397 188 38 169 chr15 35168732 35168892 -68326082 + RLTR14-int LTR ERV1 447 585 -4732 2 853 591 281 23 140 chr15 35168937 35169280 -68325694 + RLTR14-int LTR ERV1 601 903 -4414 2 853 253 312 72 54 chr15 35169247 35169413 -68325561 + RLTR14-int LTR ERV1 1219 1387 -6169 2 853 361 330 5 68 chr15 35170395 35170587 -68324387 + RLTR14-int LTR ERV1 2229 2408 -2655 2 853 807 291 78 41 chr15 35171034 35171527 -68323447 + RLTR14-int LTR ERV1 3254 3645 -1672 2 853 641 293 5 10 chr15 35171849 35172042 -68322932 + RLTR14-int LTR ERV1 4032 4223 -1094 2 853 286 214 34 45 chr15 35172150 35172238 -68322736 + RLTR14-int LTR ERV1 5228 5314 -3 2 853 1308 252 55 6 chr15 35189094 35189441 -68305533 - MTD LTR MaLR -12 407 44 2 853 582 163 33 3 chr15 35193730 35193864 -68301110 + ORR1D1 LTR MaLR 169 310 -74 2 853 916 265 173 8 chr15 35209257 35209615 -68285359 - MTD LTR MaLR 0 419 3 3 853 343 262 83 21 chr15 35209713 35209857 -68285117 - RMER15 LTR ERVL -20 555 403 3 853 723 232 175 57 chr15 35209865 35210094 -68284880 - MTD LTR MaLR -14 405 143 3 853 723 232 181 59 chr15 35210241 35210323 -68284651 - MTD LTR MaLR -277 142 66 3 853 731 288 5 23 chr15 35210786 35211006 -68283968 + MT2A LTR ERVL 3 218 -315 3 853 631 227 59 75 chr15 35211000 35211154 -68283820 + MTD LTR MaLR 223 386 -33 3 853 631 227 59 75 chr15 35211347 35211378 -68283596 + MTD LTR MaLR 387 405 -14 3 853 476 311 47 47 chr15 35236952 35237188 -68257786 - MLT1L LTR MaLR -221 389 154 3 853 3593 31 30 9 chr15 35246417 35246844 -68248130 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 853 3098 52 39 3 chr15 35252038 35252420 -68242554 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 106 2024 144 75 12 chr15 35258046 35258391 -68236583 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 854 474 285 155 45 chr15 35258770 35259035 -68235939 + MTEa LTR MaLR 9 302 -77 3 854 233 128 26 0 chr15 35260840 35260879 -68234095 + MTD LTR MaLR 1 40 -379 3 854 454 112 12 24 chr15 35260880 35260962 -68234012 + MTD LTR MaLR 339 419 0 3 854 2562 92 8 174 chr15 35263615 35264128 -68230846 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 1 3 854 779 315 131 73 chr15 35283148 35283751 -68211223 - RMER13A LTR ERVK -124 784 101 4 854 1667 10 15 0 chr15 35285083 35285281 -68209693 - MT2_Mm LTR ERVL -292 201 1 4 854 2297 148 106 34 chr15 35286407 35286881 -68208093 - RMER6C LTR ERVK -181 509 2 4 854 1184 191 264 37 chr15 35294227 35294560 -68200414 + MT2B LTR ERVL 1 541 -60 4 854 382 191 0 0 chr15 35294578 35294646 -68200328 - MERVL-int LTR ERVL -4808 677 610 4 854 679 204 124 22 chr15 35294656 35294841 -68200133 + MERVL_2A-int LTR ERVL 6 209 -5552 4 854 1366 176 254 11 chr15 35297547 35297988 -68196986 + MERVL_2A-int LTR ERVL 197 744 -5017 4 854 378 218 85 109 chr15 35298189 35298354 -68196620 - MLT1F1 LTR MaLR -27 542 382 4 854 771 266 99 16 chr15 35298382 35298634 -68196340 - MLT1F1 LTR MaLR -287 282 10 4 854 522 107 0 0 chr15 35298678 35298753 -68196221 - MTD LTR MaLR 0 419 345 4 854 651 164 8 0 chr15 35298751 35298873 -68196101 + MTC-int LTR MaLR 50 172 -1086 4 854 1380 215 160 3 chr15 35304668 35305018 -68189956 + MTD LTR MaLR 15 419 0 4 854 327 324 71 18 chr15 35305397 35305660 -68189314 - RMER15 LTR ERVL 0 575 273 4 854 442 280 52 32 chr15 35305852 35306007 -68188967 - RMER15 LTR ERVL -16 559 402 4 854 243 170 20 41 chr15 35306461 35306510 -68188464 - RMER15 LTR ERVL -176 399 352 4 854 1774 185 45 50 chr15 35320074 35320450 -68174524 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 854 714 116 35 9 chr15 35320765 35320878 -68174096 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 999 4 854 4438 118 71 20 chr15 35328606 35329464 -68165510 - RLTR13D3 LTR ERVK -104 1010 1 4 854 2003 115 76 0 chr15 35329854 35330158 -68164816 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 854 1269 223 72 20 chr15 35330512 35330860 -68164114 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 5 854 1690 132 73 20 chr15 35330860 35331178 -68163796 - ORR1A4 LTR MaLR 0 379 1 5 854 1888 140 77 12 chr15 35331254 35331593 -68163381 + ORR1C2 LTR MaLR 1 361 -23 5 854 487 288 116 0 chr15 35334197 35334343 -68160631 - MTEb LTR MaLR -2 377 215 5 854 629 265 98 8 chr15 35334580 35334833 -68160141 - MTEb LTR MaLR -113 266 1 5 854 3426 20 2 2 chr15 35334980 35335376 -68159598 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 854 2217 203 123 112 chr15 35337685 35338513 -68156461 + RMER17B LTR ERVK 1 837 -121 5 854 3670 50 0 7 chr15 35338601 35339065 -68155909 - RLTR13C2 LTR ERVK -347 461 1 5 854 2679 54 164 140 chr15 35340527 35341026 -68153948 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 2 5 854 1696 255 32 45 chr15 35341079 35341571 -68153403 - RMER19C LTR ERVK 0 611 126 5 854 667 209 83 44 chr15 35342122 35342327 -68152647 + MTD LTR MaLR 1 213 -206 5 854 232 133 0 22 chr15 35342293 35342339 -68152635 + RLTR15 LTR ERVK 315 359 0 5 854 226 296 0 0 chr15 35342339 35342376 -68152598 - MLT1A LTR MaLR -241 133 97 5 854 434 277 30 98 chr15 35345457 35345621 -68149353 - RMER10B LTR ERVL 0 398 246 5 854 2613 158 48 33 chr15 35379728 35380245 -68114729 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 4 5 854 1935 168 17 23 chr15 35385416 35385764 -68109210 - RMER4B LTR ERVK -239 346 1 5 854 1661 294 37 33 chr15 35388202 35388283 -68106691 - RMER15-int LTR ERVL -3507 1492 1417 6 854 658 291 160 13 chr15 35388283 35388596 -68106378 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 6 854 1661 294 37 33 chr15 35388596 35389059 -68105915 - RMER15-int LTR ERVL -3583 1416 946 6 854 251 278 58 58 chr15 35389312 35389415 -68105559 - RMER15-int LTR ERVL -4170 829 727 6 855 383 253 34 11 chr15 35389543 35389631 -68105343 - RMER4B LTR ERVK -150 435 346 6 855 1068 195 126 46 chr15 35389633 35389896 -68105078 - RodERV21-int LTR ERV1 -168 4823 4540 6 855 1559 135 37 24 chr15 35389897 35390193 -68104781 + RMER17A LTR ERVK 444 743 -8 6 855 2092 192 52 39 chr15 35390346 35390440 -68104534 + MTC LTR MaLR 3 113 -308 6 855 2092 192 52 39 chr15 35390641 35390952 -68104022 + MTC LTR MaLR 114 413 -8 6 855 937 268 9 14 chr15 35391574 35391786 -68103188 + MTE2b LTR MaLR 6 216 -163 6 855 734 231 186 22 chr15 35392793 35393068 -68101906 - ORR1D2 LTR MaLR -52 322 3 6 855 3323 227 151 86 chr15 35393070 35394356 -68100618 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 2 6 855 719 254 57 26 chr15 35394356 35394550 -68100424 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 169 6 855 773 154 285 72 chr15 35396603 35396965 -68098009 - RMER6B LTR ERVK -3 458 20 6 855 371 247 10 30 chr15 35397222 35397322 -68097652 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 268 6 855 2826 122 42 0 chr15 35397333 35397758 -68097216 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 3 6 855 3061 176 87 74 chr15 35397760 35398635 -68096339 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1441 6 855 329 130 14 42 chr15 35398631 35398703 -68096271 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2501 341 272 6 855 1468 201 37 31 chr15 35404986 35405086 -68089888 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 433 6 855 1468 169 193 18 chr15 35405238 35405606 -68089368 - RLTR20C LTR ERVK -102 432 1 6 855 2341 88 3 0 chr15 35406890 35407208 -68087766 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 855 506 248 142 0 chr15 35408933 35409074 -68085900 - MTD LTR MaLR -2 417 257 6 855 483 82 11 66 chr15 35409062 35409153 -68085821 - MTD LTR MaLR -333 88 3 6 855 3682 174 106 64 chr15 35409604 35410452 -68084522 - RMER19B LTR ERVK -18 884 1 6 855 1051 269 154 7 chr15 35412846 35413145 -68081829 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 26 6 855 244 333 50 20 chr15 35414202 35414303 -68080671 - MLT1A LTR MaLR -23 351 248 6 855 684 315 62 25 chr15 35420492 35420733 -68074241 - MER68 LTR ERVL -284 279 30 6 855 3395 20 13 0 chr15 35421221 35421612 -68073362 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 855 288 362 70 48 chr15 35424093 35424406 -68070568 - ORR1D1 LTR MaLR -29 345 26 6 855 1772 156 111 43 chr15 35427359 35427728 -68067246 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 855 261 244 15 39 chr15 35432097 35432302 -68062672 + RMER17D LTR ERVK 244 443 -446 6 855 2195 172 26 3 chr15 35453336 35453721 -68041253 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 855 817 203 188 29 chr15 35454334 35454573 -68040401 - RMER20B LTR ERVK -222 405 129 7 855 546 335 84 42 chr15 35458466 35458824 -68036150 - MLT1D LTR MaLR -55 450 78 7 855 628 287 117 98 chr15 35459371 35459738 -68035236 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 7 855 1385 213 138 53 chr15 35461137 35461514 -68033460 - MTD LTR MaLR -10 409 1 7 855 995 278 82 0 chr15 35469399 35469741 -68025233 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 855 498 279 93 114 chr15 35473146 35473435 -68021539 - LTR37A LTR ERV1 -3 423 111 7 855 498 279 93 114 chr15 35473475 35473614 -68021360 - LTR37A LTR ERV1 -316 110 4 7 855 385 192 0 0 chr15 35475195 35475268 -68019706 - MTEb LTR MaLR -12 367 295 7 855 448 276 112 25 chr15 35475311 35475471 -68019503 + MTEa LTR MaLR 104 277 -102 7 855 519 226 16 99 chr15 35482809 35482991 -68011983 - MT2B LTR ERVL -91 510 344 7 855 678 316 88 39 chr15 35487356 35487858 -68007116 - MT2A LTR ERVL 0 533 62 7 855 963 152 70 5 chr15 35489522 35489707 -68005267 + MTC LTR MaLR 1 197 -224 7 855 329 200 0 15 chr15 35489703 35489769 -68005205 + MTC LTR MaLR 347 411 -8 7 855 330 220 3 9 chr15 35499161 35499243 -67995731 + MTD LTR MaLR 25 104 -317 7 855 342 361 115 36 chr15 35512317 35512570 -67982404 - MER70B LTR ERVL -206 372 100 2 855 369 323 0 10 chr15 35513003 35513100 -67981874 - MER70B LTR ERVL -469 109 14 2 856 951 199 316 11 chr15 35521612 35521881 -67973093 - MTB_Mm LTR MaLR -45 351 1 2 856 4810 190 57 88 chr15 35521881 35523178 -67971796 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1258 2 2 856 1334 185 229 9 chr15 35523181 35523508 -67971466 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 2 856 2282 117 0 0 chr15 35529710 35530034 -67964940 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 3 856 621 233 354 8 chr15 35531784 35532087 -67962887 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 3 856 1778 213 83 35 chr15 35568028 35568510 -67926464 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 20 8 856 449 332 42 1 chr15 35577045 35577232 -67917742 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 172 1 856 273 274 47 12 chr15 35577820 35577905 -67917069 - MLT1A1 LTR MaLR -286 88 1 1 856 235 379 17 33 chr15 35584652 35584772 -67910202 - MER21B LTR ERV1 -731 132 15 1 856 401 304 30 43 chr15 35592072 35592272 -67902702 - ORR1E LTR MaLR 0 379 173 1 856 485 291 85 38 chr15 35592296 35592507 -67902467 - ORR1E LTR MaLR -119 240 20 1 856 226 370 11 0 chr15 35617817 35617909 -67877065 - MLT1D LTR MaLR -164 341 249 1 856 1728 164 97 89 chr15 35619508 35620057 -67874917 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 1 856 306 184 79 0 chr15 35622510 35622586 -67872388 - RLTR25A LTR ERVK -11 1092 1011 1 856 2942 51 75 0 chr15 35634070 35634442 -67860532 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 856 300 149 41 82 chr15 35640237 35640310 -67854664 - MTEb LTR MaLR -40 339 270 1 13 3447 28 2 0 chr15 35651398 35651793 -67843181 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 857 1081 222 198 13 chr15 35652541 35652855 -67842119 + MTD LTR MaLR 42 413 -6 1 857 3534 157 99 131 chr15 35657230 35658162 -67836812 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 857 1440 178 62 107 chr15 35660048 35660137 -67834837 + ORR1C2 LTR MaLR 1 87 -297 2 857 1440 178 62 107 chr15 35660318 35660630 -67834344 + ORR1C2 LTR MaLR 88 384 0 2 857 828 204 36 6 chr15 35660630 35660798 -67834176 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 173 -1197 2 857 889 251 137 12 chr15 35660949 35660978 -67833996 - MERVL_2A-int LTR ERVL -295 5462 5428 2 857 1058 224 132 0 chr15 35661043 35661335 -67833639 - MERVL_2A-int LTR ERVL -276 5485 5101 2 857 4543 284 62 22 chr15 35661365 35662836 -67832138 - MERVL_2A-int LTR ERVL -712 5049 3520 2 857 448 306 52 60 chr15 35663098 35663379 -67831595 + MTE2b LTR MaLR 1 269 -150 2 857 508 263 156 7 chr15 35664874 35665062 -67829912 + MTE2b LTR MaLR 176 379 0 2 857 589 88 11 42 chr15 35665322 35665417 -67829557 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 428 2 857 2225 109 77 11 chr15 35686054 35686416 -67808558 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 122 2 857 284 172 0 17 chr15 35686424 35686483 -67808491 - MuRRS4-int LTR ERV1 0 5063 5006 2 857 555 283 127 89 chr15 35688870 35689231 -67805743 - MTEb LTR MaLR -3 376 2 2 857 1827 93 18 22 chr15 35707450 35707724 -67787250 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 203 2 857 4241 103 7 14 chr15 35709383 35709954 -67785020 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 2 857 4842 76 3 0 chr15 35712424 35713004 -67781970 - MT2B2 LTR ERVL -2 582 1 2 857 418 176 43 32 chr15 35713042 35713136 -67781838 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 546 2 857 264 56 28 0 chr15 35713136 35713172 -67781802 - MERVL_2A-int LTR ERVL -153 5608 5572 2 857 1598 131 46 15 chr15 35713185 35713448 -67781526 - MERVL_2A-int LTR ERVL -241 5520 5250 2 857 585 26 90 0 chr15 35713449 35713527 -67781447 - MERVL_2A-int LTR ERVL -450 5035 4951 2 857 10639 109 64 5 chr15 35716758 35718307 -67776667 - MERVL-int LTR ERVL -534 4951 3312 2 857 350 118 0 0 chr15 35718290 35718341 -67776633 + MERVL-int LTR ERVL 751 801 -4684 2 857 286 113 0 232 chr15 35718341 35718410 -67776564 + MT2B LTR ERVL 229 281 -320 2 857 1959 128 81 13 chr15 35718375 35718888 -67776086 + ORR1B2 LTR MaLR 21 941 -1022 2 857 230 260 114 61 chr15 35720167 35720298 -67774676 + RLTR25B LTR ERVK 372 509 -519 2 857 681 244 123 26 chr15 35729310 35729627 -67765347 - MTB LTR MaLR -12 388 10 2 857 648 323 141 33 chr15 35738847 35739180 -67755794 - MLT1J LTR MaLR -30 482 114 2 857 2949 136 97 45 chr15 35741746 35742089 -67752885 - RMER19B LTR ERVK 0 902 541 3 857 2949 136 97 45 chr15 35742330 35742535 -67752439 - RMER19B LTR ERVK -362 540 326 3 857 1301 186 5 5 chr15 35742682 35742903 -67752071 - RMER19B LTR ERVK -586 316 96 3 857 2179 166 56 8 chr15 35761331 35761725 -67733249 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 857 495 309 112 10 chr15 35762781 35763011 -67731963 - LTR40b LTR ERVL -15 504 235 3 857 928 215 10 19 chr15 35767170 35767379 -67727595 + RLTR19-int LTR ERVK 1429 1635 -4502 3 857 1529 181 78 28 chr15 35767554 35767913 -67727061 + RLTR19-int LTR ERVK 1636 2012 -4125 3 858 2065 156 76 8 chr15 35784575 35784757 -67710217 + MTB_Mm LTR MaLR 1 194 -213 3 858 2065 156 76 8 chr15 35785241 35785439 -67709535 + MTB_Mm LTR MaLR 195 407 0 3 858 258 372 72 52 chr15 35786385 35786538 -67708436 + MLT1E3 LTR MaLR 77 232 -392 3 858 266 266 0 0 chr15 35786808 35786872 -67708102 - MLT1F-int LTR MaLR -733 756 693 3 858 532 331 45 20 chr15 35786960 35787207 -67707767 - MLT1F-int LTR MaLR -995 494 242 3 858 1025 323 126 21 chr15 35788037 35788458 -67706516 - MLT1F LTR MaLR -77 471 7 3 858 2204 185 78 24 chr15 35788657 35789155 -67705819 - RLTR11A2 LTR ERVK -2 525 1 3 858 337 363 114 5 chr15 35789767 35789969 -67705005 - MLT1H LTR MaLR -203 346 123 3 858 480 297 120 58 chr15 35803816 35804245 -67690729 - MLT2B4 LTR ERVL -6 458 1 3 858 733 292 159 25 chr15 35807786 35808106 -67686868 - MTEa LTR MaLR -14 365 3 3 858 238 233 66 40 chr15 35818071 35818147 -67676827 - ORR1E LTR MaLR -12 347 270 4 858 251 225 88 5 chr15 35821688 35821775 -67673199 - RMER17B LTR ERVK -126 284 194 4 858 463 159 61 89 chr15 35821953 35822204 -67672770 - RMER17B LTR ERVK -520 438 67 4 858 463 182 243 16 chr15 35823022 35823115 -67671859 - RMER17B LTR ERVK -661 297 172 4 858 737 208 104 0 chr15 35829119 35829311 -67665663 + MTD LTR MaLR 1 212 -207 4 858 376 207 15 8 chr15 35829618 35829711 -67665263 + MTD LTR MaLR 294 404 -15 4 858 285 249 139 35 chr15 35830380 35830503 -67664471 - MTEa LTR MaLR -4 375 236 4 858 274 330 82 39 chr15 35830747 35830955 -67664019 - MLT1A0-int LTR MaLR -272 1115 899 4 858 690 269 13 6 chr15 35831292 35831449 -67663525 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 204 4 858 2274 79 70 26 chr15 35831514 35831827 -67663147 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 858 1136 233 48 54 chr15 35833376 35833487 -67661487 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 268 4 858 1136 233 48 54 chr15 35833541 35833764 -67661210 - ORR1D1 LTR MaLR -107 267 42 4 858 860 206 214 29 chr15 35864333 35864678 -67630296 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 858 384 310 135 24 chr15 35866311 35866711 -67628263 + MLT2B2 LTR ERVL 1 445 -156 4 858 683 158 184 17 chr15 35869350 35869524 -67625450 + RMER6D LTR ERVK 1 203 -517 4 858 981 248 241 37 chr15 35869505 35869970 -67625004 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 4 4 858 2237 146 126 14 chr15 35869976 35870113 -67624861 + RMER6D LTR ERVK 182 332 -388 4 858 2090 134 25 11 chr15 35870113 35870476 -67624498 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 4 858 2237 146 126 14 chr15 35870476 35870823 -67624151 + RMER6D LTR ERVK 333 720 0 4 858 637 115 215 0 chr15 35871488 35871618 -67623356 + RLTR47_MM LTR ERV1 55 212 -320 4 858 433 150 161 70 chr15 35871618 35871761 -67623213 + RLTR47_MM LTR ERV1 377 532 0 4 858 1052 194 92 67 chr15 35871761 35872117 -67622857 - RLTR21 LTR ERVK -491 1081 717 4 858 2580 211 89 62 chr15 35872326 35873035 -67621939 - RLTR21 LTR ERVK -844 728 1 4 858 2743 66 148 140 chr15 35873207 35873715 -67621259 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 858 2146 175 246 12 chr15 35873855 35874546 -67620428 + RLTR25B LTR ERVK 1 853 -175 4 858 369 242 60 149 chr15 35874641 35875048 -67619926 + RLTR25A LTR ERVK 733 1103 0 4 858 535 237 93 16 chr15 35875446 35875639 -67619335 - MLT1D LTR MaLR 0 505 298 4 858 380 214 112 117 chr15 35875640 35875846 -67619128 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 226 4 858 429 47 62 0 chr15 35876008 35876072 -67618902 - RMER16 LTR ERVK 0 533 466 4 858 523 191 98 0 chr15 35876235 35876378 -67618596 - RMER16 LTR ERVK -332 201 3 4 858 365 219 37 0 chr15 35876378 35876453 -67618521 - RLTR23 LTR ERV1 -350 80 3 4 858 269 254 86 78 chr15 35876510 35876638 -67618336 - MLT1A1 LTR MaLR -19 389 261 4 858 4809 52 7 0 chr15 35877057 35877639 -67617335 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 2 4 858 273 295 72 24 chr15 35878063 35878169 -67616805 + MLT1I LTR MaLR 77 188 -223 4 858 3848 62 16 8 chr15 35878169 35878672 -67616302 - LTRIS4 LTR ERV1 0 507 1 4 858 273 295 72 24 chr15 35878672 35878690 -67616284 + MLT1I LTR MaLR 189 206 -205 4 858 1385 188 95 44 chr15 35878860 35879130 -67615844 + ORR1B1 LTR MaLR 54 347 -47 4 858 1385 188 95 44 chr15 35879312 35879356 -67615618 + ORR1B1 LTR MaLR 348 386 -8 4 858 1047 268 76 47 chr15 35879371 35879778 -67615196 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 858 770 216 109 92 chr15 35880024 35880419 -67614555 - MT2A LTR ERVL -43 558 1 4 858 1292 174 177 38 chr15 35880864 35881180 -67613794 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 8 4 858 2182 134 19 0 chr15 35883406 35883726 -67611248 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 858 677 161 88 25 chr15 35883731 35883890 -67611084 - ORR1C2 LTR MaLR -42 342 174 5 858 708 153 39 69 chr15 35883936 35884127 -67610847 + RMER17C LTR ERVK 3 191 -219 5 858 708 153 39 69 chr15 35884233 35884244 -67610730 + RMER17C LTR ERVK 192 199 -211 5 858 2057 132 250 11 chr15 35884288 35884648 -67610326 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 858 341 312 78 45 chr15 35885243 35885511 -67609463 - MMERGLN-int LTR ERV1 -1991 5610 5334 5 858 1123 257 42 35 chr15 35886803 35887089 -67607885 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1068 3995 3708 5 858 346 212 18 5 chr15 35887099 35887193 -67607781 - MMERGLN-int LTR ERV1 -2794 4984 4912 5 858 592 299 99 71 chr15 35887486 35887982 -67606992 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3026 4530 3970 5 858 1249 311 65 71 chr15 35888066 35889297 -67605677 - MMERGLN-int LTR ERV1 -5136 2420 1197 5 858 265 359 84 32 chr15 35889694 35889884 -67605090 - MMERGLN-int LTR ERV1 -6747 809 610 5 858 3022 138 9 2 chr15 35890436 35890879 -67604095 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 858 715 90 8 32 chr15 35890879 35891005 -67603969 + RMER17C LTR ERVK 288 410 0 5 858 536 111 303 113 chr15 35891005 35891144 -67603830 - ORR1C2 LTR MaLR -213 171 6 5 858 237 340 106 26 chr15 35892696 35892847 -67602127 - RMER13A LTR ERVK 0 860 698 5 858 1057 245 93 35 chr15 35892989 35893332 -67601642 - RMER13A LTR ERVK -399 461 99 5 858 1741 168 62 8 chr15 35893467 35893840 -67601134 - RMER10A LTR ERVL -49 393 1 5 858 1318 164 97 102 chr15 35894081 35894442 -67600532 + ORR1B2 LTR MaLR 9 367 0 5 858 313 82 0 0 chr15 35894448 35894497 -67600477 + RLTR12B LTR ERVK 1 49 -479 5 858 1229 171 94 66 chr15 35897715 35897864 -67597110 - RLTR20B3 LTR ERVK -191 369 196 5 858 1229 168 78 55 chr15 35898044 35898249 -67596725 - RLTR20B3 LTR ERVK -372 205 2 5 858 2122 183 66 60 chr15 35912743 35913289 -67581685 + RMER15 LTR ERVL 22 570 -5 5 859 473 182 38 53 chr15 35915462 35915595 -67579379 + RLTR23 LTR ERV1 291 421 -9 5 859 1932 167 79 28 chr15 35916970 35917402 -67577572 - RMER16 LTR ERVK -10 523 70 5 859 505 247 159 41 chr15 35917534 35917768 -67577206 + RMER21B LTR ERV1 275 539 -303 5 859 4081 50 28 4 chr15 35917768 35918268 -67576706 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 5 859 505 247 159 41 chr15 35918268 35918303 -67576671 + RMER21B LTR ERV1 540 576 -266 5 859 872 184 103 72 chr15 35919247 35919470 -67575504 - ORR1B1 LTR MaLR -124 270 41 5 859 439 256 68 53 chr15 35932652 35932842 -67562132 - MTE2b LTR MaLR -46 333 141 5 859 2461 43 37 0 chr15 35932847 35933173 -67561801 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 5 859 1194 178 94 80 chr15 35934136 35934537 -67560437 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 5 859 3760 101 36 9 chr15 35935874 35936423 -67558551 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 5 859 1637 239 89 21 chr15 35936638 35937112 -67557862 - RMER20A LTR ERVK 0 516 11 5 859 1491 213 132 125 chr15 35937444 35938051 -67556923 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 859 252 261 67 11 chr15 35956678 35956767 -67538207 - ORR1D2 LTR MaLR -230 140 47 6 859 312 276 146 38 chr15 35959099 35959304 -67535670 + MTEb LTR MaLR 104 356 -23 6 859 2242 138 73 38 chr15 35959383 35959781 -67535193 - MTC LTR MaLR -8 413 2 6 859 2892 183 114 72 chr15 35959782 35960875 -67534099 - MTC-int LTR MaLR -54 1316 169 6 859 3623 28 5 0 chr15 35963807 35964201 -67530773 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 859 2351 95 201 106 chr15 35969658 35970130 -67524844 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 517 -2 6 859 405 320 105 48 chr15 36005237 36005569 -67489405 + MLT1E1A LTR MaLR 210 680 0 1 859 231 299 30 30 chr15 36021577 36021677 -67473297 - ORR1E LTR MaLR -99 260 161 4 859 449 207 18 9 chr15 36022394 36022506 -67472468 - ORR1E LTR MaLR -246 113 1 4 859 1765 197 42 34 chr15 36024684 36024887 -67470087 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 173 5 859 1765 197 42 34 chr15 36024947 36025121 -67469853 - ORR1C2 LTR MaLR -212 172 3 5 859 5400 202 48 45 chr15 36025123 36025740 -67469234 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 737 5 859 7857 70 18 9 chr15 36025740 36026754 -67468220 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 5 859 5400 202 48 45 chr15 36026754 36027500 -67467474 - ORR1C2-int LTR MaLR -634 736 4 5 859 2074 135 98 0 chr15 36027500 36027847 -67467127 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 1 5 859 517 336 76 33 chr15 36028290 36028619 -67466355 + MLT1D LTR MaLR 6 348 -157 5 859 2359 139 74 13 chr15 36039341 36039735 -67455239 - MTC LTR MaLR 0 421 4 7 860 3149 44 33 13 chr15 36054014 36054406 -67440568 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 860 1070 187 12 49 chr15 36054466 36054713 -67440261 - MTC LTR MaLR -179 242 5 1 860 1916 155 123 86 chr15 36056818 36057248 -67437726 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 1 860 1277 142 31 79 chr15 36057517 36057808 -67437166 - ORR1A4 LTR MaLR -52 277 1 1 860 498 123 0 0 chr15 36057808 36057889 -67437085 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1883 1 860 1834 191 30 32 chr15 36057970 36058376 -67436598 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 860 238 238 136 24 chr15 36066639 36066764 -67428210 - MLT1J LTR MaLR -130 382 244 1 860 2482 145 36 15 chr15 36072941 36073353 -67421621 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 860 285 292 88 46 chr15 36074168 36074362 -67420612 + MER89 LTR ERV1 268 469 -90 1 860 2066 147 97 72 chr15 36089163 36089618 -67405356 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 1 860 1501 190 123 6 chr15 36109852 36110211 -67384763 + MTD LTR MaLR 13 404 -15 2 860 2159 151 53 13 chr15 36114125 36114522 -67380452 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 860 1421 198 203 99 chr15 36114934 36115024 -67379950 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 551 410 2 860 1740 121 196 117 chr15 36115057 36115356 -67379618 - RLTR20A2 LTR ERVK -137 441 123 2 860 1740 121 196 117 chr15 36115503 36115605 -67379369 - RLTR20A2 LTR ERVK -456 122 8 2 860 402 279 160 21 chr15 36118928 36119115 -67375859 - MLT1C LTR MaLR -36 431 219 2 860 524 297 28 68 chr15 36122468 36122717 -67372257 - RMER2 LTR ERV1 0 567 329 2 860 700 255 153 12 chr15 36123617 36123871 -67371103 - MLT1B LTR MaLR -8 382 93 2 860 1081 240 125 29 chr15 36123891 36124235 -67370739 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 2 860 288 253 62 52 chr15 36124279 36124375 -67370599 - MLT1B LTR MaLR -290 100 4 2 860 325 241 36 12 chr15 36124404 36124488 -67370486 - MTEb LTR MaLR 0 379 294 2 860 654 238 0 54 chr15 36124629 36124798 -67370176 - RLTR20A1 LTR ERVK 0 551 377 2 860 824 124 101 23 chr15 36124795 36124953 -67370021 - RLTR20A1 LTR ERVK -313 215 1 2 860 1393 143 201 37 chr15 36125359 36125657 -67369317 + ORR1B1 LTR MaLR 45 391 -3 2 860 853 191 240 45 chr15 36126767 36127075 -67367899 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 2 860 225 286 18 0 chr15 36128195 36128251 -67366723 - LTR40a LTR ERVL 0 462 406 2 860 675 194 54 27 chr15 36128273 36128421 -67366553 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 233 2 860 869 160 159 6 chr15 36128574 36128756 -67366218 - ORR1D1 LTR MaLR -164 210 1 2 860 227 376 89 0 chr15 36128800 36128901 -67366073 - LTR40a LTR ERVL -165 354 245 2 860 990 236 260 43 chr15 36130676 36131114 -67363860 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 2 860 371 215 54 45 chr15 36135808 36135920 -67359054 - RMER15-int LTR ERVL -680 4319 4207 3 860 1246 170 273 3 chr15 36157781 36158070 -67336904 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 860 3795 154 122 67 chr15 36158395 36159248 -67335726 - RMER13B LTR ERVK -8 900 1 3 860 429 269 143 16 chr15 36159248 36159418 -67335556 - MLT1B LTR MaLR -192 198 5 3 860 1010 196 188 22 chr15 36162371 36162695 -67332279 + MTE2b LTR MaLR 1 378 -1 3 860 2172 132 121 3 chr15 36165770 36166157 -67328817 - RMER4A LTR ERVK -33 433 1 3 860 365 221 47 117 chr15 36168854 36168877 -67326097 + MT2B LTR ERVL 139 152 -449 3 860 777 231 140 111 chr15 36169177 36169640 -67325334 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 3 861 556 179 0 0 chr15 36179320 36179402 -67315572 + MTD LTR MaLR 3 84 -335 3 861 1182 208 165 3 chr15 36179658 36179943 -67315031 + MTD LTR MaLR 72 402 -17 3 861 1619 142 62 0 chr15 36180563 36180851 -67314123 + MTC LTR MaLR 1 306 -115 3 861 573 277 0 55 chr15 36180964 36181109 -67313865 + MTC LTR MaLR 283 419 -2 3 861 375 145 81 0 chr15 36187141 36187203 -67307771 + MTC LTR MaLR 355 421 0 4 861 5824 147 59 18 chr15 36187202 36188257 -67306717 + MTC-int LTR MaLR 2 1099 -159 4 861 689 150 130 7 chr15 36188878 36189032 -67305942 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1086 1258 0 4 861 2018 154 50 15 chr15 36189032 36189375 -67305599 + MTB_Mm LTR MaLR 1 355 -52 4 861 483 260 53 37 chr15 36191224 36191412 -67303562 + ORR1C2 LTR MaLR 110 300 -84 4 861 1337 282 66 24 chr15 36199630 36200011 -67294963 + MLT2B1 LTR ERVL 116 512 -8 4 861 439 339 16 66 chr15 36201527 36201710 -67293264 - LTR33 LTR ERVL -312 203 30 4 861 5031 149 40 40 chr15 36202941 36204090 -67290884 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 641 2481 -361 4 861 321 199 132 29 chr15 36206044 36206202 -67288772 - MLT1D LTR MaLR -3 624 410 4 861 2443 143 38 5 chr15 36214122 36214522 -67280452 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 861 454 189 115 199 chr15 36215138 36215329 -67279645 + ORR1D2 LTR MaLR 196 370 0 4 861 344 228 17 129 chr15 36216489 36216517 -67278457 + MT2B LTR ERVL 138 240 -361 4 861 288 249 0 80 chr15 36223707 36223804 -67271170 - MTEa LTR MaLR -14 365 269 4 861 226 185 13 145 chr15 36230421 36230439 -67264535 + MT2B2 LTR ERVL 151 158 -426 4 861 1720 107 79 7 chr15 36233499 36233790 -67261184 - ORR1B1 LTR MaLR -81 313 2 5 861 394 273 86 7 chr15 36241145 36241285 -67253689 + MLT1A1 LTR MaLR 256 406 -2 5 861 462 196 62 0 chr15 36242752 36242849 -67252125 + ORR1D2 LTR MaLR 3 105 -265 5 861 456 212 131 33 chr15 36242843 36242965 -67252009 + ORR1D2 LTR MaLR 237 370 0 5 861 582 235 97 19 chr15 36243808 36244000 -67250974 - MTD LTR MaLR -20 399 181 5 861 341 318 54 9 chr15 36245309 36245420 -67249554 - MTD LTR MaLR -230 189 74 5 861 368 316 36 56 chr15 36245465 36245745 -67249229 - MLT2B5 LTR ERVL -259 295 29 5 861 1543 278 98 25 chr15 36245758 36246360 -67248614 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5714 5069 5 861 268 108 0 0 chr15 36246769 36246806 -67248168 - MERVL_2A-int LTR ERVL -645 5069 5033 5 861 2943 268 132 21 chr15 36246811 36248916 -67246058 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1780 3977 1686 5 861 252 272 126 32 chr15 36249449 36249544 -67245430 + MLT1A1 LTR MaLR 269 372 -36 5 861 244 185 0 18 chr15 36249738 36249793 -67245181 + MLT1A1 LTR MaLR 355 408 0 5 861 2312 86 94 137 chr15 36254321 36254647 -67240327 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 102 5 861 2312 86 94 137 chr15 36254671 36254791 -67240183 - RLTR23 LTR ERV1 -329 101 1 5 861 303 270 0 0 chr15 36255088 36255162 -67239812 - RLTR24 LTR ERV1 -454 75 2 5 861 2067 92 113 5 chr15 36255538 36255908 -67239066 - RLTR47_MM LTR ERV1 -68 464 55 5 861 978 299 37 16 chr15 36256033 36256460 -67238514 - RLTR6-int LTR ERV1 -69 7709 7081 5 861 300 360 40 12 chr15 36256702 36256952 -67238022 - RLTR6-int LTR ERV1 -1991 5610 5354 5 861 1700 149 136 31 chr15 36271466 36271603 -67223371 - RMER10B LTR ERVL 0 398 235 5 861 1700 149 136 31 chr15 36271745 36271967 -67223007 - RMER10B LTR ERVL -164 234 1 5 861 950 281 62 140 chr15 36278808 36279450 -67215524 - RLTR18 LTR ERVK -9 607 16 5 861 1409 171 73 38 chr15 36282384 36282780 -67212194 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 861 328 358 8 8 chr15 36293596 36293720 -67201254 + MLT1K LTR MaLR 399 522 -73 6 861 2566 129 78 25 chr15 36295740 36296176 -67198798 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 6 861 1081 254 75 6 chr15 36297092 36297425 -67197549 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 6 861 2142 139 101 0 chr15 36301641 36301986 -67192988 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 6 861 231 200 54 147 chr15 36301986 36302115 -67192859 + LTR48 LTR ERV1 643 759 -28 6 862 370 277 76 21 chr15 36307093 36307237 -67187737 + MLT1B LTR MaLR 30 181 -209 6 862 1425 248 9 0 chr15 36307245 36307560 -67187414 + MTD LTR MaLR 8 325 -94 6 862 377 209 12 0 chr15 36307729 36307815 -67187159 + MTD LTR MaLR 333 419 0 6 862 272 210 86 0 chr15 36307815 36307891 -67187083 + MLT1B LTR MaLR 190 272 -118 6 862 1728 160 84 3 chr15 36307904 36308236 -67186738 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 6 862 348 261 80 18 chr15 36308236 36308339 -67186635 + MLT1B LTR MaLR 276 385 -5 6 862 1432 202 62 14 chr15 36308427 36308784 -67186190 + RLTR11A2 LTR ERVK 152 525 -2 6 862 298 375 84 113 chr15 36309311 36309796 -67185178 + MLT1N2 LTR MaLR 40 510 -52 6 862 333 230 92 0 chr15 36311676 36311763 -67183211 - MTE2b LTR MaLR -83 296 202 6 862 1862 134 56 18 chr15 36312380 36312721 -67182253 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 6 862 2760 172 125 21 chr15 36313290 36314005 -67180969 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 806 0 6 862 1628 164 132 38 chr15 36319419 36319812 -67175162 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 6 862 2412 176 90 12 chr15 36320339 36320829 -67174145 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 6 862 651 181 92 53 chr15 36323349 36323501 -67171473 - RLTR20D LTR ERVK 0 578 421 6 862 754 214 190 40 chr15 36323480 36323733 -67171241 - RLTR20D LTR ERVK -277 291 1 6 862 1897 182 75 8 chr15 36324147 36324539 -67170435 - MTD LTR MaLR -15 404 1 6 862 527 202 27 27 chr15 36325109 36325297 -67169677 - RMER17C LTR ERVK -135 275 88 6 862 602 275 102 13 chr15 36330848 36331073 -67163901 - MLT1D LTR MaLR 0 505 261 6 862 369 274 95 46 chr15 36332629 36332902 -67162072 + MLT1B LTR MaLR 71 338 -52 6 862 527 331 79 38 chr15 36333997 36334345 -67160629 - ORR1E LTR MaLR -10 369 1 6 862 1595 150 119 29 chr15 36336416 36336505 -67158469 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 285 6 862 3223 41 23 5 chr15 36336505 36336894 -67158080 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 862 1595 150 119 29 chr15 36336894 36337147 -67157827 - ORR1D1 LTR MaLR -90 284 1 6 862 920 263 101 79 chr15 36343961 36344187 -67150787 - MTE2b LTR MaLR -4 375 146 7 862 920 263 101 79 chr15 36344369 36344509 -67150465 - MTE2b LTR MaLR -234 145 2 7 862 937 316 66 9 chr15 36346843 36347191 -67147783 + MLT1B LTR MaLR 9 376 -14 7 862 341 312 110 14 chr15 36351492 36351638 -67143336 + MLT1A1 LTR MaLR 21 180 -228 7 862 2079 208 9 24 chr15 36358988 36359411 -67135563 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 7 862 708 312 39 77 chr15 36359666 36360003 -67134971 - RLTR17 LTR ERVK -253 439 116 7 862 442 318 83 73 chr15 36365913 36366215 -67128759 + ORR1E LTR MaLR 1 305 -54 7 862 2677 91 68 8 chr15 36366215 36366613 -67128361 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 7 862 246 244 96 60 chr15 36366613 36366636 -67128338 + ORR1E LTR MaLR 320 341 -38 7 862 580 248 80 55 chr15 36367231 36367477 -67127497 + MLT1D LTR MaLR 227 504 -1 7 862 317 340 103 57 chr15 36367531 36367793 -67127181 + MTEa LTR MaLR 58 331 -48 7 862 360 304 53 97 chr15 36370511 36370776 -67124198 + MTE2a LTR MaLR 87 361 -18 7 862 266 391 38 66 chr15 36373099 36373310 -67121664 + MLT1J2 LTR MaLR 237 441 -7 7 862 1163 160 174 22 chr15 36374671 36374982 -67119992 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 12 7 862 291 321 137 59 chr15 36381780 36382035 -67112939 - MER31B LTR ERV1 -173 293 19 7 862 746 263 187 0 chr15 36385607 36385885 -67109089 + RMER5 LTR ERV1 70 399 -135 7 862 1253 234 173 22 chr15 36388345 36388703 -67106271 + RMER15 LTR ERVL 30 441 -134 7 862 413 254 15 99 chr15 36389237 36389265 -67105709 + RMER15 LTR ERVL 437 459 -116 7 862 413 254 15 99 chr15 36389451 36389553 -67105421 + RMER15 LTR ERVL 460 556 -19 7 862 465 223 42 54 chr15 36397430 36397596 -67097378 + RNLTR23 LTR ERVK 479 642 0 8 862 943 241 0 28 chr15 36397833 36398051 -67096923 + RNERVK23-int LTR ERVK 217 428 -7789 8 862 1359 203 130 19 chr15 36400366 36400743 -67094231 - MTC LTR MaLR 0 421 3 8 862 566 227 207 34 chr15 36404879 36405116 -67089858 - MTD LTR MaLR -1 418 141 8 862 554 273 309 23 chr15 36405930 36406198 -67088776 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 14 8 862 410 328 30 0 chr15 36423021 36423155 -67071819 + ORR1E LTR MaLR 1 138 -221 8 862 283 284 0 21 chr15 36424984 36425069 -67069905 + ORR1E LTR MaLR 212 292 -87 8 862 232 252 107 121 chr15 36427859 36427873 -67067101 - MURVY-LTR LTR ERV1 -224 295 274 8 862 232 252 107 121 chr15 36427931 36427999 -67066975 - MURVY-LTR LTR ERV1 -224 273 158 8 862 400 289 152 30 chr15 36428109 36428412 -67066562 - MLT1D LTR MaLR -109 396 57 8 862 1368 254 29 18 chr15 36428417 36428757 -67066217 + MTE2b LTR MaLR 36 379 0 8 862 351 284 51 17 chr15 36430414 36430532 -67064442 - MLT2E LTR ERVL -22 606 485 8 862 516 307 45 19 chr15 36431285 36431441 -67063533 + MLT1A0 LTR MaLR 18 177 -188 8 862 310 160 0 138 chr15 36431506 36431593 -67063381 + MLT1A0 LTR MaLR 312 386 -22 8 863 2228 181 33 7 chr15 36438273 36438696 -67056278 + BGLII_B LTR ERVK 1 434 -7 8 863 284 265 0 0 chr15 36440278 36440346 -67054628 + MYSERV6-int LTR ERVK 452 519 -8440 8 863 6852 210 118 97 chr15 36440345 36441359 -67053615 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 5 875 -1451 8 863 6852 194 120 98 chr15 36441506 36442845 -67052129 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 261 2246 -80 8 863 1942 186 37 28 chr15 36442876 36443276 -67051698 + BGLII_B LTR ERVK 1 403 -38 8 863 1942 186 37 28 chr15 36443327 36443363 -67051611 + BGLII_B LTR ERVK 404 441 0 8 863 362 239 199 60 chr15 36444167 36444318 -67050656 + MLT1J LTR MaLR 303 474 -38 8 863 944 213 191 16 chr15 36444333 36444650 -67050324 + MTD LTR MaLR 13 417 -2 8 863 289 209 104 0 chr15 36448417 36448484 -67046490 - MT2B LTR ERVL -361 240 167 9 863 1601 261 112 66 chr15 36449916 36450526 -67044448 - RLTR26 LTR ERVK -4 638 1 9 863 2683 139 10 7 chr15 36451105 36451517 -67043457 + MTC LTR MaLR 6 418 -3 9 863 255 329 63 75 chr15 36452764 36452938 -67042036 + ORR1E LTR MaLR 116 287 -72 9 863 289 278 8 107 chr15 36459009 36459023 -67035951 + MT2B LTR ERVL 155 156 -445 9 863 347 348 204 10 chr15 36467507 36467806 -67027168 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 9 863 596 346 67 30 chr15 36469711 36470039 -67024935 - MER21B LTR ERV1 -112 751 412 9 863 1927 75 131 3 chr15 36471692 36471975 -67022999 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 9 863 444 232 277 32 chr15 36474425 36474686 -67020288 + MTEa LTR MaLR 32 379 0 9 863 3887 141 113 12 chr15 36475688 36476379 -67018595 + RMER19B LTR ERVK 138 898 -4 9 863 518 303 99 41 chr15 36479908 36480210 -67014764 + MTEb LTR MaLR 10 376 -3 9 863 232 362 110 40 chr15 36483674 36483901 -67011073 + LTR86C LTR ERVL 304 546 -75 9 863 388 216 0 0 chr15 36486369 36486443 -67008531 + MTEa LTR MaLR 5 78 -301 9 863 1109 287 110 12 chr15 36487653 36487998 -67006976 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 863 582 126 0 31 chr15 36489470 36489568 -67005406 + ORR1B1 LTR MaLR 1 95 -234 1 863 1708 224 67 59 chr15 36489575 36490098 -67004876 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 1 1 863 1434 134 26 13 chr15 36490099 36490333 -67004641 + ORR1B1 LTR MaLR 158 394 0 1 863 258 287 72 59 chr15 36492413 36492565 -67002409 - RLTR22_Mur LTR ERVK -398 1450 1297 1 863 856 268 54 92 chr15 36493891 36494315 -67000659 + MYSERV6-int LTR ERVK 8283 8690 -269 1 863 1001 295 61 42 chr15 36494499 36494924 -67000050 + BGLII_B LTR ERVK 1 433 -8 1 863 1972 109 37 46 chr15 36495435 36495762 -66999212 + ORR1A4 LTR MaLR 6 329 0 1 863 937 196 105 119 chr15 36495768 36496353 -66998621 + RLTR19-int LTR ERVK 3529 3962 -2175 1 863 1495 189 100 52 chr15 36498214 36498544 -66996430 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 1 863 2195 133 8 10 chr15 36499317 36499685 -66995289 - ORR1A3 LTR MaLR -8 386 2 1 863 1471 139 168 14 chr15 36499709 36500000 -66994974 - ORR1A3-int LTR MaLR -107 1402 1067 1 863 3510 106 27 2 chr15 36500001 36500549 -66994425 - ORR1A3-int LTR MaLR -363 1600 1039 1 863 2590 212 64 72 chr15 36500606 36500979 -66993995 - ORR1A4-int LTR MaLR -869 389 252 3 863 1608 146 13 61 chr15 36500979 36501292 -66993682 - ORR1A4 LTR MaLR -31 298 1 3 863 1599 204 53 61 chr15 36502908 36503320 -66991654 + RLTR20A LTR ERVK 1 409 -132 8 863 1257 205 65 45 chr15 36503416 36503768 -66991206 + RMER17B LTR ERVK 599 957 -1 1 863 246 236 31 73 chr15 36511327 36511423 -66983551 + MT2B2 LTR ERVL 150 241 -343 2 863 1811 127 45 13 chr15 36517896 36518207 -66976767 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 863 541 201 182 8 chr15 36531592 36531781 -66963193 + ORR1D1 LTR MaLR 125 359 -11 6 863 730 264 52 13 chr15 36547191 36547421 -66947553 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 280 1 863 561 302 106 16 chr15 36547547 36547803 -66947171 - RMER5 LTR ERV1 -243 291 13 1 863 978 139 222 201 chr15 36548820 36548979 -66945995 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 192 1 863 978 139 222 201 chr15 36548999 36549208 -66945766 - ORR1C2 LTR MaLR -193 191 4 1 863 3665 42 58 0 chr15 36555885 36556334 -66938640 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 863 3059 45 49 10 chr15 36556890 36557275 -66937699 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 863 669 55 164 0 chr15 36564423 36564551 -66930423 - RMER17B LTR ERVK -498 460 312 1 863 1258 228 178 17 chr15 36564844 36565255 -66929719 + MER31A LTR ERV1 9 485 0 1 864 359 336 79 63 chr15 36571513 36571767 -66923207 - MLT1J LTR MaLR -252 260 3 1 864 264 309 63 63 chr15 36575561 36575720 -66919254 + RMER15 LTR ERVL 14 172 -403 1 864 526 300 139 21 chr15 36575763 36575957 -66919017 + RMER15 LTR ERVL 345 561 -14 1 864 3248 40 27 2 chr15 36576425 36576826 -66918148 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 864 351 192 8 175 chr15 36579159 36579186 -66915788 - MT2B2 LTR ERVL -430 154 149 1 864 280 191 10 160 chr15 36580133 36580233 -66914741 + MT2B LTR ERVL 155 239 -362 1 864 2028 113 74 28 chr15 36590033 36590425 -66904549 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 864 328 250 124 66 chr15 36593058 36593195 -66901779 - MER34 LTR ERV1 -18 553 380 2 864 2733 53 96 13 chr15 36597454 36597839 -66897135 + BGLII LTR ERVK 5 421 0 2 864 1004 148 21 37 chr15 36602273 36602463 -66892511 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 182 2 864 536 131 16 108 chr15 36611007 36611023 -66883951 + MT2B LTR ERVL 148 151 -450 2 864 964 318 152 38 chr15 36614734 36615172 -66879802 + MLT1E1 LTR MaLR 1 496 -158 2 864 964 318 152 38 chr15 36615284 36615352 -66879622 + MLT1E1 LTR MaLR 497 565 -89 2 864 232 278 25 25 chr15 36616625 36616743 -66878231 + RMER12 LTR ERVK 739 856 -466 2 864 996 252 125 16 chr15 36617659 36617970 -66877004 - MTEb LTR MaLR -34 345 1 3 864 1014 267 117 29 chr15 36620639 36621059 -66873915 - RLTR12B LTR ERVK -25 503 47 3 864 538 245 61 22 chr15 36623199 36623409 -66871565 - RLTR11B LTR ERVK -30 498 284 3 864 942 248 22 49 chr15 36623444 36623739 -66871235 - RLTR11B LTR ERVK -243 284 5 3 864 520 299 55 22 chr15 36625387 36625629 -66869345 - MLT1J LTR MaLR -210 238 30 3 864 244 270 40 0 chr15 36626958 36626978 -66867996 + ORR1B1-int LTR MaLR 624 648 -861 3 864 2136 108 22 6 chr15 36628386 36628702 -66866272 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 864 669 297 179 22 chr15 36629289 36629602 -66865372 + MLT1A0 LTR MaLR 4 365 0 3 864 236 330 97 132 chr15 36631970 36632278 -66862696 + MLT1A0 LTR MaLR 4 309 -56 3 864 236 330 97 132 chr15 36632470 36632530 -66862444 + MLT1A0 LTR MaLR 310 359 -6 3 864 240 274 37 120 chr15 36637759 36637867 -66857107 + MER34 LTR ERV1 376 474 -68 3 864 250 240 104 57 chr15 36638350 36638456 -66856518 - LTR41 LTR ERVL -606 162 52 3 864 882 238 9 29 chr15 36639613 36639896 -66855078 - RLTR26 LTR ERVK -648 258 1 3 864 281 26 0 0 chr15 36641409 36641447 -66853527 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 3 864 308 113 38 101 chr15 36641447 36641526 -66853448 - ORR1A1-int LTR MaLR -1323 640 567 3 864 778 121 262 15 chr15 36641526 36641728 -66853246 - MERVL_2A-int LTR ERVL -132 5629 5378 3 864 3404 56 25 0 chr15 36641728 36642172 -66852802 - ORR1A1-int LTR MaLR -1337 455 1 3 864 2393 47 63 45 chr15 36642176 36642508 -66852466 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 3 864 822 338 51 14 chr15 36642537 36642888 -66852086 + MLT1A LTR MaLR 6 369 -5 3 864 2815 214 76 42 chr15 36642888 36643760 -66851214 - RMER13A LTR ERVK -31 877 1 3 864 2253 168 155 26 chr15 36649576 36649882 -66845092 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 160 3 864 2253 168 155 26 chr15 36650067 36650225 -66844749 - RLTR11A LTR ERVK -369 159 1 3 864 502 232 20 0 chr15 36650411 36650510 -66844464 + MTC-int LTR MaLR 258 358 -900 3 864 2563 183 50 17 chr15 36650720 36651237 -66843737 - RMER5 LTR ERV1 0 534 1 3 864 1554 149 237 66 chr15 36652651 36653089 -66841885 - MT2B2 LTR ERVL -71 513 1 3 864 1497 227 110 40 chr15 36653112 36653655 -66841319 + RLTR26 LTR ERVK 2 626 -16 3 864 251 292 59 50 chr15 36654106 36654225 -66840749 - MLT1J LTR MaLR -84 428 309 3 864 1880 126 91 130 chr15 36654808 36655302 -66839672 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 864 2672 187 61 36 chr15 36655338 36655916 -66839058 + RMER20B LTR ERVK 36 627 0 3 864 957 174 167 17 chr15 36656170 36656463 -66838511 + RMER17C LTR ERVK 35 371 -39 3 864 1883 209 77 119 chr15 36656467 36657307 -66837667 + RMER17C-int LTR ERVK 3 807 -2431 3 864 6785 146 38 77 chr15 36657445 36658904 -66836070 + RMER17C-int LTR ERVK 882 2284 -954 3 864 3701 140 12 3 chr15 36658938 36659512 -66835462 - RLTR17 LTR ERVK -16 676 98 3 864 1964 106 137 104 chr15 36659540 36659685 -66835289 + RMER17C-int LTR ERVK 2391 2555 -683 3 864 1964 106 137 104 chr15 36659730 36659993 -66834981 + RMER17C-int LTR ERVK 2556 2858 -380 3 864 2115 126 9 9 chr15 36660048 36660392 -66834582 + RMER17C-int LTR ERVK 2895 3238 0 3 864 1523 136 158 43 chr15 36660392 36660760 -66834214 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 3 864 371 200 18 136 chr15 36661717 36661731 -66833243 - MT2B LTR ERVL -347 254 158 3 864 298 157 20 0 chr15 36664659 36664710 -66830264 + MLT2B5 LTR ERVL 1 52 -665 4 864 255 239 185 120 chr15 36664710 36664859 -66830115 + MTEa LTR MaLR 1 213 -166 4 864 306 293 73 8 chr15 36666247 36666371 -66828603 + MLT2B1 LTR ERVL 430 561 -6 4 864 1594 230 122 18 chr15 36668073 36668130 -66826844 - RLTR20A2 LTR ERVK -36 542 481 4 864 1594 230 122 18 chr15 36668177 36668610 -66826364 - RLTR20A2 LTR ERVK -98 480 1 4 864 785 193 154 23 chr15 36669416 36669687 -66825287 + MTD LTR MaLR 46 419 0 4 864 418 328 73 5 chr15 36677092 36677297 -66817677 - MLT1A0 LTR MaLR -66 299 81 4 864 1911 161 81 6 chr15 36677470 36677827 -66817147 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 864 617 208 28 0 chr15 36679508 36679614 -66815360 - RLTR20B3 LTR ERVK -27 550 442 4 864 2319 174 37 37 chr15 36679780 36680239 -66814735 - RLTR20B3 LTR ERVK -106 471 13 4 864 714 277 97 137 chr15 36680425 36681140 -66813834 + RMER13A LTR ERVK 1 686 -174 4 864 538 272 142 4 chr15 36685409 36685634 -66809340 + MLT1A LTR MaLR 119 374 0 4 864 346 107 0 0 chr15 36686769 36686825 -66808149 + RLTR10D LTR ERVK 4 59 -300 4 864 1188 209 56 41 chr15 36686955 36687265 -66807709 + RLTR10D LTR ERVK 45 359 0 4 864 988 125 0 116 chr15 36687500 36687681 -66807293 + ORR1A3 LTR MaLR 1 160 -166 4 864 360 277 42 21 chr15 36687688 36687784 -66807190 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 331 4 864 1209 251 41 19 chr15 36687813 36688130 -66806844 + RLTR22_Mur LTR ERVK 486 809 -1039 4 864 463 204 36 18 chr15 36688170 36688280 -66806694 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1604 1715 -133 4 864 341 270 121 28 chr15 36689408 36689549 -66805425 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 255 4 864 2952 65 52 12 chr15 36689996 36690401 -66804573 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 864 800 216 157 14 chr15 36690713 36690929 -66804045 + RLTR20D LTR ERVK 45 291 -277 4 864 400 254 148 28 chr15 36690909 36691051 -66803923 + RLTR20D LTR ERVK 407 565 -3 4 864 643 246 189 41 chr15 36692511 36692785 -66802189 + MLT1A LTR MaLR 58 351 -23 4 864 513 281 87 106 chr15 36692933 36692969 -66802005 + MLT1A LTR MaLR 326 362 -3 4 864 1221 183 163 31 chr15 36694889 36695177 -66799797 - RMER15 LTR ERVL -7 568 243 4 865 912 155 5 27 chr15 36701456 36701642 -66793332 - MER34B-int LTR ERV1 -3243 2113 1932 4 865 319 180 33 180 chr15 36701696 36701818 -66793156 - MER34B-int LTR ERV1 -3415 1941 1838 4 865 1353 174 230 3 chr15 36714360 36714695 -66780279 + MTC LTR MaLR 11 421 0 5 865 4516 165 208 20 chr15 36714697 36715754 -66779220 + MTC-int LTR MaLR 3 1258 0 5 865 599 163 207 0 chr15 36715758 36715893 -66779081 + MTC LTR MaLR 1 163 -258 5 865 438 297 62 31 chr15 36716005 36716165 -66778809 + MTB_Mm LTR MaLR 98 262 -145 5 865 485 278 226 41 chr15 36716205 36716400 -66778574 + MTEb LTR MaLR 53 283 -96 5 865 327 308 100 6 chr15 36725939 36726099 -66768875 + MLT1J1 LTR MaLR 7 181 -263 5 865 3382 152 26 9 chr15 36727606 36728175 -66766799 - RLTR17 LTR ERVK -16 676 98 5 865 2047 224 129 12 chr15 36730304 36730814 -66764160 - RMER15 LTR ERVL -5 570 1 5 865 316 299 83 14 chr15 36732853 36733070 -66761904 - RMER12 LTR ERVK -364 958 727 5 865 260 360 103 27 chr15 36735751 36735974 -66759000 + MLT1J LTR MaLR 22 261 -251 5 865 2018 185 34 11 chr15 36737528 36737883 -66757091 - MTC LTR MaLR -13 408 46 5 865 248 292 83 28 chr15 36741328 36741437 -66753537 + MLT1J LTR MaLR 294 408 0 5 865 255 328 7 96 chr15 36741442 36741577 -66753397 - LTR16B1 LTR ERVL -354 126 4 5 865 325 309 109 146 chr15 36745482 36745553 -66749421 - MLT1F LTR MaLR -336 212 170 5 865 325 309 109 146 chr15 36745761 36745909 -66749065 - MLT1F LTR MaLR -379 169 1 5 865 3279 39 7 47 chr15 36747077 36747504 -66747470 + RLTR10A LTR ERVK 2 411 0 5 865 2248 198 12 78 chr15 36750982 36751485 -66743489 + RMER19C LTR ERVK 138 607 -4 5 865 285 329 60 106 chr15 36753673 36753938 -66741036 + MTE2b LTR MaLR 110 362 -17 5 865 247 315 58 77 chr15 36756516 36756528 -66738446 - MT2B2 LTR ERVL -274 259 159 6 865 1799 167 91 6 chr15 36760231 36760550 -66734424 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 6 865 710 239 122 75 chr15 36761736 36761989 -66732985 + RMER15 LTR ERVL 296 560 -15 6 865 528 306 41 115 chr15 36762948 36763313 -66731661 - ORR1E LTR MaLR -4 355 18 6 865 1720 215 50 73 chr15 36763471 36763696 -66731278 - MTD LTR MaLR 0 419 205 6 865 1720 215 50 73 chr15 36763835 36764005 -66730969 - MTD LTR MaLR -215 204 33 6 865 937 330 27 17 chr15 36765791 36766090 -66728884 + MTE2b LTR MaLR 1 302 -77 6 865 380 258 86 62 chr15 36766849 36766977 -66727997 + MTEa LTR MaLR 249 379 0 6 865 294 224 59 106 chr15 36778365 36778450 -66716524 - MT2B LTR ERVL -339 262 182 6 865 273 253 107 12 chr15 36786356 36786440 -66708534 + MLT1F1 LTR MaLR 70 161 -408 6 865 847 265 61 90 chr15 36786592 36786969 -66708005 - MTEa LTR MaLR -13 366 1 6 865 1528 166 29 25 chr15 36788482 36788760 -66706214 - RLTR17 LTR ERVK -413 279 1 6 865 3536 28 0 2 chr15 36789267 36789664 -66705310 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 865 2070 12 0 0 chr15 36789664 36789917 -66705057 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 846 6 865 3614 32 5 0 chr15 36789924 36790367 -66704607 - MTA_Mm-int LTR MaLR -653 445 1 6 865 3522 30 0 2 chr15 36790367 36790764 -66704210 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 865 2213 190 20 3 chr15 36790931 36791322 -66703652 - MT2A LTR ERVL -41 492 95 6 865 343 189 61 82 chr15 36791292 36791390 -66703584 - MT2A LTR ERVL -374 159 64 6 865 239 269 20 79 chr15 36791326 36791427 -66703547 - MTE2b LTR MaLR -254 125 31 6 865 254 316 100 20 chr15 36792098 36792198 -66702776 - LTR33B LTR ERVL -320 183 76 6 865 297 265 169 11 chr15 36793573 36793675 -66701299 + MLT1J LTR MaLR 42 185 -327 6 865 2064 149 11 49 chr15 36795777 36796145 -66698829 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 6 865 931 246 120 55 chr15 36798724 36799075 -66695899 + MTE2b LTR MaLR 4 370 0 7 865 235 236 152 102 chr15 36804963 36805081 -66689893 + RLTR12B LTR ERVK 11 134 -394 7 865 534 289 194 11 chr15 36805138 36805401 -66689573 + MLT1F LTR MaLR 238 548 0 7 865 1566 192 81 20 chr15 36813640 36813985 -66680989 - MTD LTR MaLR -46 373 8 7 865 1167 220 167 108 chr15 36817425 36817516 -66677458 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 444 7 865 1167 220 167 108 chr15 36817799 36817878 -66677096 - RLTR20C LTR ERVK -91 443 403 7 865 1167 189 101 83 chr15 36818086 36818431 -66676543 - RLTR20C LTR ERVK -132 402 5 7 865 426 254 123 0 chr15 36824960 36825082 -66669892 + MLT1A1 LTR MaLR 268 404 -4 7 865 247 250 82 52 chr15 36826603 36826700 -66668274 + MLT1F1 LTR MaLR 361 460 -109 7 865 449 257 41 62 chr15 36826851 36826996 -66667978 + ORR1E LTR MaLR 14 155 -204 7 865 3469 180 81 5 chr15 36827028 36827658 -66667316 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 7 866 332 252 17 108 chr15 36833727 36833847 -66661127 - MT2B LTR ERVL -344 257 149 7 866 708 252 183 118 chr15 36834117 36834473 -66660501 - MTD LTR MaLR 0 379 1 7 866 321 323 97 14 chr15 36837173 36837365 -66657609 + MLT1F2 LTR MaLR 328 538 -31 7 866 2147 159 2 66 chr15 36837858 36838283 -66656691 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 7 866 380 266 110 0 chr15 36838921 36839030 -66655944 + MLT2B4 LTR ERVL 18 138 -418 7 866 1158 243 89 64 chr15 36842197 36842602 -66652372 + MTD LTR MaLR 5 419 0 7 866 1493 175 37 26 chr15 36843486 36843756 -66651218 - ORR1D1 LTR MaLR -101 273 1 7 866 313 314 223 24 chr15 36844983 36845234 -66649740 - ORR1D2 LTR MaLR -69 301 1 7 866 937 275 137 33 chr15 36849093 36849428 -66645546 - MTEa LTR MaLR 0 379 10 8 866 875 204 204 69 chr15 36851624 36851898 -66643076 + MTEa LTR MaLR 67 377 -2 8 866 257 273 78 0 chr15 36853500 36853577 -66641397 + MLT1A0 LTR MaLR 40 122 -243 8 866 851 333 56 42 chr15 36854805 36855254 -66639720 + MT2A LTR ERVL 1 455 -78 8 866 226 290 9 115 chr15 36856491 36856604 -66638370 - MT2B LTR ERVL -343 258 158 8 866 457 296 80 41 chr15 36857609 36857975 -66636999 + MLT1C LTR MaLR 9 465 -2 8 866 898 244 84 4 chr15 36860416 36860673 -66634301 - MTEa LTR MaLR -110 269 1 8 866 1586 158 129 25 chr15 36861287 36861515 -66633459 + ORR1B2 LTR MaLR 1 263 -104 8 866 1829 77 73 189 chr15 36861515 36861657 -66633317 + ORR1A2 LTR MaLR 1 87 -240 8 866 1829 77 73 189 chr15 36861794 36862021 -66632953 + ORR1A2 LTR MaLR 88 327 0 8 866 1586 158 129 25 chr15 36862021 36862117 -66632857 + ORR1B2 LTR MaLR 264 359 -8 8 866 3072 155 18 21 chr15 36862895 36863410 -66631564 - RMER20A LTR ERVK -3 513 1 8 866 270 339 48 48 chr15 36864709 36864833 -66630141 - MLT1A0 LTR MaLR -80 285 162 8 866 286 209 100 44 chr15 36864930 36865020 -66629954 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 415 8 866 364 239 0 22 chr15 36865130 36865220 -66629754 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 321 8 866 279 297 76 143 chr15 36865505 36865729 -66629245 - MLT1A1 LTR MaLR -194 214 6 8 866 1645 166 102 111 chr15 36870547 36870613 -66624361 + MTC LTR MaLR 13 79 -342 8 866 1645 166 102 111 chr15 36870756 36871039 -66623935 + MTC LTR MaLR 80 361 -60 8 866 2678 100 24 0 chr15 36871039 36871419 -66623555 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 5 8 866 1645 166 102 111 chr15 36871419 36871481 -66623493 + MTC LTR MaLR 362 421 0 8 866 249 366 40 0 chr15 36872284 36872385 -66622589 + MLT1H LTR MaLR 427 531 -18 8 866 3459 41 0 128 chr15 36880726 36881226 -66613748 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 8 866 1260 236 81 28 chr15 36881691 36882048 -66612926 + MTE2b LTR MaLR 1 376 -3 8 866 3568 140 40 55 chr15 36885089 36885741 -66609233 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 8 866 675 258 133 106 chr15 36885837 36886197 -66608777 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 8 866 2216 153 58 6 chr15 36886563 36886924 -66608050 - MTC LTR MaLR -37 384 5 8 866 1397 158 88 7 chr15 36886977 36887268 -66607706 - ORR1B2 LTR MaLR 0 384 71 8 866 313 279 82 59 chr15 36887646 36887868 -66607106 + RLTR41 LTR ERV1 194 457 -50 8 866 690 191 23 15 chr15 36887867 36888000 -66606974 - ORR1B2 LTR MaLR -232 135 2 8 866 376 375 35 25 chr15 36889315 36889512 -66605462 - MLT1L LTR MaLR -6 604 406 8 866 6918 61 29 1 chr15 36891878 36892747 -66602227 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 8 866 2321 115 73 11 chr15 36893919 36894288 -66600686 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 8 866 421 314 90 11 chr15 36895078 36895255 -66599719 - ORR1E LTR MaLR -168 191 1 8 866 608 308 145 94 chr15 36895443 36895860 -66599114 + MLT1J LTR MaLR 32 478 -34 8 866 608 308 145 94 chr15 36896008 36896046 -66598928 + MLT1J LTR MaLR 479 510 -2 8 866 413 278 163 58 chr15 36901520 36901845 -66593129 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 9 866 320 331 57 25 chr15 36903613 36903771 -66591203 + MLT1J LTR MaLR 72 234 -278 9 866 3104 6 10 55 chr15 36925320 36925704 -66569270 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 9 866 6001 25 3 10 chr15 36925704 36926395 -66568579 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5796 9 866 1088 143 16 26 chr15 36926399 36926593 -66568381 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7323 258 67 9 866 1050 86 159 0 chr15 36926564 36926727 -66568247 - IAPEz-int LTR ERVK -6285 196 8 9 866 3162 6 5 54 chr15 36926727 36927113 -66567861 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 9 866 1540 122 0 121 chr15 36940974 36941272 -66553702 + RLTR23 LTR ERV1 1 262 -168 9 866 225 182 91 0 chr15 36941268 36941312 -66553662 - MTE2b LTR MaLR -329 50 3 9 866 699 283 110 68 chr15 36945725 36946062 -66548912 + MER74A LTR ERVL 19 369 -189 9 866 2744 137 20 146 chr15 36946393 36946777 -66548197 + RLTR24 LTR ERV1 1 343 -186 9 866 2744 137 20 146 chr15 36946846 36946966 -66548008 + RLTR24 LTR ERV1 344 448 -81 9 866 2744 137 20 146 chr15 36947140 36947234 -66547740 + RLTR24 LTR ERV1 449 528 -1 9 866 3844 63 42 8 chr15 36952897 36953392 -66541582 - LTRIS3 LTR ERV1 0 512 1 9 866 2464 167 22 5 chr15 36954294 36954698 -66540276 + MTC LTR MaLR 1 411 -10 1 866 2472 75 25 3 chr15 36957097 36957417 -66537557 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 866 394 226 48 0 chr15 36958070 36958154 -66536820 + MTEb LTR MaLR 292 379 0 1 866 263 241 19 15 chr15 36960393 36960471 -66534503 + MLT1B LTR MaLR 275 339 -51 1 867 1796 189 91 14 chr15 36963991 36964618 -66530356 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 1 867 352 351 103 18 chr15 36964994 36965267 -66529707 + MLT1H LTR MaLR 46 341 -208 1 867 546 325 79 73 chr15 36965295 36965650 -66529324 - MER68 LTR ERVL -18 589 233 1 867 299 264 14 0 chr15 36965767 36965839 -66529135 + MLT1D LTR MaLR 69 141 -364 1 867 422 319 40 21 chr15 36965861 36966089 -66528885 + MLT1D LTR MaLR 248 505 0 1 867 265 311 45 54 chr15 36966100 36966212 -66528762 - MER68 LTR ERVL -450 113 3 1 867 911 260 141 11 chr15 36967536 36967847 -66527127 - MTE2b LTR MaLR 0 379 20 1 867 262 310 14 0 chr15 36968110 36968181 -66526793 - MTE2b LTR MaLR -304 75 4 1 867 2080 145 53 102 chr15 36970448 36970917 -66524057 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 1 867 561 288 67 58 chr15 36971258 36971629 -66523345 - RLTR16 LTR ERVK -234 458 32 1 867 249 332 152 95 chr15 36972379 36972662 -66522312 - LTR33 LTR ERVL -170 345 47 1 867 457 284 35 136 chr15 36973205 36973491 -66521483 - MLT1B LTR MaLR 0 390 134 1 867 229 164 197 0 chr15 36973507 36973568 -66521406 + RLTR24 LTR ERV1 3 75 -454 1 867 2212 102 13 9 chr15 36973876 36974194 -66520780 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 3 1 867 301 271 77 77 chr15 36978648 36978664 -66516310 + MT2B LTR ERVL 98 253 -348 1 867 2339 111 3 0 chr15 36980438 36980763 -66514211 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 867 390 266 59 94 chr15 36980909 36981079 -66513895 + MTEb LTR MaLR 197 360 -19 1 867 2141 113 47 15 chr15 36981534 36981876 -66513098 + ORR1B1 LTR MaLR 41 393 -1 1 867 4484 63 9 12 chr15 36985722 36986288 -66508686 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 1 867 954 271 159 43 chr15 36989800 36990260 -66504714 + MLT2B2 LTR ERVL 1 513 -2 1 867 360 299 83 0 chr15 36992880 36993024 -66501950 - MLT1E1A LTR MaLR -114 566 411 1 867 4453 63 16 2 chr15 36994499 36995055 -66499919 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 1 867 234 191 0 0 chr15 37000296 37000338 -66494636 - LTR16E1 LTR ERVL -464 74 33 1 867 2688 106 30 12 chr15 37000851 37001253 -66493721 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 867 284 289 19 19 chr15 37001368 37001474 -66493500 - MLT1C LTR MaLR 0 467 362 5 867 265 311 63 32 chr15 37001547 37001673 -66493301 - MLT1C LTR MaLR -145 245 116 5 867 761 274 124 99 chr15 37001891 37002100 -66492874 - RMER5 LTR ERV1 -17 517 327 6 867 761 274 124 99 chr15 37002138 37002394 -66492580 - RMER5 LTR ERV1 -208 326 40 6 867 3601 64 30 4 chr15 37002623 37003093 -66491881 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 8 867 7953 44 0 0 chr15 37003093 37004005 -66490969 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 6333 8 867 1903 104 13 3 chr15 37004005 37004304 -66490670 - RLTR13B1 LTR ERVK -385 508 207 9 867 8218 43 16 5 chr15 37004326 37005323 -66489651 - RLTR45-int LTR ERVK -1172 6072 5065 8 867 11869 55 22 16 chr15 37005316 37007709 -66487265 - RLTR45-int LTR ERVK -3258 3986 1322 8 867 261 218 54 54 chr15 37008002 37008094 -66486880 - MMTV-int LTR ERVK -4749 2504 2413 1 867 1143 58 0 0 chr15 37008493 37008631 -66486343 - RLTR45-int LTR ERVK -6426 818 681 8 867 4368 71 114 19 chr15 37008922 37009554 -66485420 - RLTR45-int LTR ERVK -6552 692 1 8 867 3634 64 30 2 chr15 37009554 37010023 -66484951 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 8 867 1960 142 28 139 chr15 37010662 37011135 -66483839 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 11 1 867 598 173 72 43 chr15 37011490 37011629 -66483345 - MTB_Mm LTR MaLR 0 421 279 1 867 508 231 85 40 chr15 37011981 37012157 -66482817 + RLTR41 LTR ERV1 263 446 0 1 867 1447 171 7 19 chr15 37012157 37012426 -66482548 - MTB_Mm LTR MaLR -141 266 1 1 867 1911 209 165 74 chr15 37014214 37014771 -66480203 + RMER19C LTR ERVK 1 608 -3 2 867 779 127 441 51 chr15 37016316 37016572 -66478402 + ORR1C1 LTR MaLR 5 360 -18 2 867 2484 198 32 48 chr15 37018263 37018889 -66476085 + RMER3D-int LTR ERVK 2225 2840 -2 3 867 2194 164 40 45 chr15 37018891 37019512 -66475462 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 584 0 3 867 354 277 16 40 chr15 37019544 37019668 -66475306 + MLT1L LTR MaLR 151 271 -339 3 867 3386 135 59 8 chr15 37020644 37021255 -66473719 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 4 867 2927 11 5 123 chr15 37021795 37022211 -66472763 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 867 29649 18 1 0 chr15 37022211 37025480 -66469494 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3210 4 867 7735 61 110 92 chr15 37025479 37026762 -66468212 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 8 4 867 2927 11 5 123 chr15 37026762 37027178 -66467796 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 4 867 1014 226 168 25 chr15 37029520 37029842 -66465132 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 5 867 6675 41 24 0 chr15 37032331 37033115 -66461859 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 5 867 318 106 0 0 chr15 37034185 37034232 -66460742 - RMER2 LTR ERV1 -520 47 1 5 867 2388 125 36 87 chr15 37034598 37034824 -66460150 - RMER16-int LTR ERVK -101 5305 5089 6 867 2388 125 36 87 chr15 37035013 37035234 -66459740 - RMER16-int LTR ERVK -318 5088 4881 6 867 299 243 92 105 chr15 37036293 37036445 -66458529 + RMER17C-int LTR ERVK 375 524 -2714 6 867 598 335 10 49 chr15 37036397 37036590 -66458384 + RodERV21-int LTR ERV1 706 895 -4096 6 867 598 335 10 49 chr15 37036727 37036838 -66458136 + RodERV21-int LTR ERV1 896 998 -3993 6 867 1397 274 44 34 chr15 37037161 37037569 -66457405 + RodERV21-int LTR ERV1 1289 1700 -3291 6 867 375 285 158 26 chr15 37038893 37039127 -66455847 - RMER13A LTR ERVK -394 466 202 7 867 1804 171 86 10 chr15 37039126 37039511 -66455463 - RLTR11B LTR ERVK -39 414 1 7 867 562 249 155 27 chr15 37045143 37045362 -66449612 + MTEa LTR MaLR 49 295 -84 9 867 516 148 290 0 chr15 37052206 37052368 -66442606 + MTD LTR MaLR 171 379 -40 9 867 380 282 100 0 chr15 37055590 37055700 -66439274 - MTE2b LTR MaLR -185 194 74 1 867 288 222 80 40 chr15 37055983 37056058 -66438916 - MTE2b LTR MaLR -301 78 1 1 867 260 283 72 98 chr15 37061473 37061566 -66433408 + MLT1A1 LTR MaLR 248 345 -63 1 867 260 283 72 98 chr15 37061743 37061798 -66433176 + MLT1A1 LTR MaLR 346 393 -15 1 867 2677 129 114 62 chr15 37073863 37074398 -66420576 - RLTR20D LTR ERVK -5 563 1 1 867 276 310 49 20 chr15 37074730 37074832 -66420142 + MTD LTR MaLR 1 105 -314 1 867 3422 38 2 0 chr15 37078624 37079019 -66415955 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 867 9314 32 4 2 chr15 37079019 37080115 -66414859 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 867 3449 35 2 0 chr15 37080115 37080510 -66414464 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 867 518 296 127 100 chr15 37080610 37081082 -66413892 + MLT1H2 LTR MaLR 5 489 0 1 867 349 284 42 10 chr15 37081508 37081604 -66413370 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 480 1 867 2347 222 80 103 chr15 37082478 37083475 -66411499 + RMER17B LTR ERVK 1 904 -4 1 867 271 267 10 62 chr15 37084538 37084634 -66410340 + MLT1A1 LTR MaLR 314 404 -4 1 867 3137 75 2 2 chr15 37091757 37092157 -66402817 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 867 7419 65 45 72 chr15 37092157 37093285 -66401689 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 1 108 972 128 7 0 chr15 37093285 37093433 -66401541 - MTB LTR MaLR 0 400 252 1 868 2205 79 76 0 chr15 37103293 37103597 -66391377 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 868 698 271 60 137 chr15 37108792 37108969 -66386005 + RLTR16 LTR ERVK 1 169 -336 2 868 698 271 60 137 chr15 37108990 37109359 -66385615 + RLTR16 LTR ERVK 170 504 -1 2 868 267 192 0 0 chr15 37109432 37109484 -66385490 - MT2A LTR ERVL 0 584 533 2 868 967 242 122 29 chr15 37109562 37109929 -66385045 - MT2A LTR ERVL -63 538 2 2 868 3510 122 30 116 chr15 37110127 37110784 -66384190 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 2 868 1061 258 87 92 chr15 37111248 37111650 -66383324 + RLTR23 LTR ERV1 1 400 -30 2 868 293 253 10 139 chr15 37113072 37113173 -66381801 + MLT1H LTR MaLR 462 549 0 2 868 2893 168 137 23 chr15 37116519 37117133 -66377841 - RMER6C LTR ERVK -6 684 1 2 868 903 224 65 25 chr15 37117813 37118014 -66376960 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 291 2 868 316 264 42 120 chr15 37120247 37120389 -66374585 - MLT1B LTR MaLR -6 384 254 2 868 242 248 18 73 chr15 37121563 37121672 -66373302 - MURVY-LTR LTR ERV1 -178 341 239 2 868 1560 179 107 23 chr15 37125390 37125562 -66369412 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 181 2 868 1560 179 107 23 chr15 37125744 37125925 -66369049 - ORR1C2 LTR MaLR -204 180 2 2 868 1008 254 92 52 chr15 37135028 37135431 -66359543 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 868 451 276 109 87 chr15 37149970 37150200 -66344774 - MT2A LTR ERVL 0 533 299 3 868 451 299 92 40 chr15 37156912 37157086 -66337888 + MLT1B LTR MaLR 205 387 -3 3 868 544 280 46 36 chr15 37159692 37159888 -66335086 + MTD LTR MaLR 220 417 -2 3 868 763 240 298 42 chr15 37173514 37173944 -66321030 + RMER4B LTR ERVK 34 573 -12 3 868 2058 119 13 3 chr15 37177522 37177833 -66317141 - ORR1A3 LTR MaLR -9 317 4 3 868 872 232 137 210 chr15 37180427 37180507 -66314467 + MTD LTR MaLR 3 67 -352 4 868 872 232 137 210 chr15 37180645 37180958 -66314016 + MTD LTR MaLR 68 362 -57 4 868 872 232 137 210 chr15 37181109 37181161 -66313813 + MTD LTR MaLR 363 416 -3 4 868 243 276 75 33 chr15 37183091 37183211 -66311763 - MLT1B LTR MaLR -19 371 247 4 868 267 328 62 18 chr15 37185288 37185430 -66309544 - LTR16B2 LTR ERVL 0 480 338 4 868 344 308 132 27 chr15 37187621 37187841 -66307133 - MLT2B2 LTR ERVL 0 562 320 4 868 416 365 45 6 chr15 37190847 37191026 -66303948 - LTR16B2 LTR ERVL -236 226 41 4 868 2156 159 29 8 chr15 37193981 37194356 -66300618 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 4 868 2438 118 39 16 chr15 37199522 37199909 -66295065 + MTB_Mm LTR MaLR 1 396 -11 4 868 234 368 96 32 chr15 37222228 37222385 -66272589 - LTR33A LTR ERVL -329 191 25 5 868 538 187 28 55 chr15 37223472 37223653 -66271321 + RMER17C LTR ERVK 102 277 -133 5 868 293 250 17 133 chr15 37223916 37224036 -66270938 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 5 869 1610 100 127 67 chr15 37232368 37232667 -66262307 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 5 5 869 3114 63 5 10 chr15 37249284 37249682 -66245292 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 869 405 180 88 112 chr15 37256051 37256176 -66238798 - MT2B LTR ERVL -336 265 144 5 869 554 277 73 73 chr15 37256294 37256594 -66238380 - ORR1E LTR MaLR -5 354 55 5 869 543 293 118 25 chr15 37258406 37258651 -66236323 - MLT1A LTR MaLR 0 374 107 5 869 672 257 171 0 chr15 37262684 37262894 -66232080 - ORR1D2 LTR MaLR -19 351 106 5 869 1428 208 150 0 chr15 37262927 37263274 -66231700 - MTD LTR MaLR 0 419 21 5 869 401 81 68 0 chr15 37284016 37284090 -66210884 - RMER4B LTR ERVK -506 79 1 6 869 406 278 108 41 chr15 37284366 37284678 -66210296 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 869 4819 171 49 25 chr15 37302133 37303115 -66191859 + MYSERV6-int LTR ERVK 7901 8905 -54 6 869 1004 246 39 15 chr15 37303201 37303536 -66191438 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 6 869 2747 52 83 8 chr15 37305692 37306064 -66188910 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 869 7712 70 22 70 chr15 37306064 37307218 -66187756 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 6 869 1049 43 29 0 chr15 37307218 37307357 -66187617 - MTB LTR MaLR 0 400 258 6 869 1550 21 0 0 chr15 37307342 37307534 -66187440 + MTB LTR MaLR 209 400 0 6 869 587 233 8 8 chr15 37310308 37310438 -66184536 - RLTR20B3 LTR ERVK -216 361 232 6 869 1244 250 52 31 chr15 37312934 37313318 -66181656 - RLTR16 LTR ERVK -113 392 1 6 869 347 284 21 21 chr15 37315010 37315107 -66179867 + MLT1D LTR MaLR 1 97 -408 6 869 531 302 88 29 chr15 37315324 37315563 -66179411 + MLT1D LTR MaLR 253 505 0 6 869 15834 132 28 30 chr15 37318287 37319116 -66175858 + MurERV4-int LTR ERVK 2527 3335 -1925 6 869 15834 132 28 30 chr15 37319289 37321090 -66173884 + MurERV4-int LTR ERVK 3336 5150 -110 6 869 1874 245 25 41 chr15 37321144 37321658 -66173316 + MYSERV-int LTR ERVK 4570 5075 -1475 6 869 344 268 81 73 chr15 37321667 37321876 -66173098 + RMER4B LTR ERVK 239 550 -35 6 869 4880 180 22 86 chr15 37321922 37323101 -66171873 + MYSERV6-int LTR ERVK 7856 8959 0 6 869 1650 200 145 44 chr15 37323115 37323457 -66171517 + RMER4B LTR ERVK 23 379 -206 6 869 1041 259 65 109 chr15 37323457 37323982 -66170992 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 4 6 869 1650 200 145 44 chr15 37323982 37324142 -66170832 + RMER4B LTR ERVK 380 576 -9 6 869 1289 177 188 21 chr15 37325917 37326061 -66168913 + ORR1C2 LTR MaLR 1 174 -210 6 869 1289 177 188 21 chr15 37326084 37326268 -66168706 + ORR1C2 LTR MaLR 175 383 -1 6 869 711 276 119 62 chr15 37329844 37330268 -66164706 + RMER13A LTR ERVK 2 498 -410 6 869 494 223 157 13 chr15 37331208 37331367 -66163607 - MTD LTR MaLR -14 405 224 6 869 360 261 103 43 chr15 37331378 37331494 -66163480 - MTD LTR MaLR -236 183 61 6 869 3012 24 5 3 chr15 37332060 37332438 -66162536 + MTA_Mm LTR MaLR 16 394 -2 6 869 3950 60 28 2 chr15 37333153 37333652 -66161322 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 6 869 438 295 62 150 chr15 37334606 37335025 -66159949 + MLT1A1 LTR MaLR 26 407 -1 6 869 364 322 81 108 chr15 37343491 37343665 -66151309 - ORR1E LTR MaLR 0 359 188 6 869 364 322 81 108 chr15 37344298 37344492 -66150482 - ORR1E LTR MaLR -172 187 1 6 869 229 179 286 0 chr15 37345520 37345576 -66149398 + MTC LTR MaLR 1 72 -349 6 869 1186 142 302 0 chr15 37345576 37345851 -66149123 + MTC LTR MaLR 17 374 -47 6 869 2494 191 48 10 chr15 37347660 37348163 -66146811 + MT2A LTR ERVL 12 533 0 6 870 259 183 92 133 chr15 37356593 37356713 -66138261 + RLTR13C1 LTR ERVK 311 425 -558 7 870 251 261 89 22 chr15 37358964 37359054 -66135920 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 724 819 -20 7 870 878 296 74 34 chr15 37364203 37364586 -66130388 + MLT2B4 LTR ERVL 1 400 -64 7 870 1326 245 92 3 chr15 37365317 37365677 -66129297 - MTD LTR MaLR -14 405 14 7 870 525 244 38 0 chr15 37369219 37369350 -66125624 + ORR1E LTR MaLR 1 136 -223 7 870 266 280 116 21 chr15 37369788 37369883 -66125091 + ORR1E LTR MaLR 263 366 -13 7 870 1125 251 66 87 chr15 37378307 37378686 -66116288 - MTE2a LTR MaLR 0 379 9 7 870 1432 157 185 22 chr15 37379870 37380189 -66114785 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 7 870 960 316 96 65 chr15 37382158 37382617 -66112357 - MLT1G3 LTR MaLR -95 484 1 7 870 1458 275 17 14 chr15 37384109 37384459 -66110515 + MTEa LTR MaLR 1 351 -28 7 870 352 303 16 0 chr15 37393056 37393178 -66101796 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 242 7 870 922 209 194 0 chr15 37401037 37401310 -66093664 + ORR1D1 LTR MaLR 1 326 -48 7 870 3322 38 2 34 chr15 37407075 37407484 -66087490 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 870 9051 47 13 0 chr15 37407484 37408568 -66086406 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 7 870 3302 46 5 0 chr15 37408568 37408962 -66086012 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 870 413 261 157 14 chr15 37410649 37410789 -66084185 + MTEa LTR MaLR 13 172 -207 7 870 521 295 60 26 chr15 37415858 37416091 -66078883 + MLT1D LTR MaLR 248 488 -17 7 870 3072 162 75 49 chr15 37416328 37416806 -66078168 - RMER6C LTR ERVK -4 716 333 7 870 3072 149 86 24 chr15 37416857 37417212 -66077762 - RMER6C LTR ERVK -320 370 2 7 870 459 267 73 11 chr15 37427365 37427543 -66067431 + MER34A LTR ERV1 2 190 -381 8 870 3567 20 2 0 chr15 37434812 37435207 -66059767 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 870 1555 240 41 18 chr15 37435739 37436130 -66058844 - MTD LTR MaLR -18 401 2 8 870 817 265 46 52 chr15 37439968 37440294 -66054680 - ORR1E LTR MaLR -35 324 1 8 870 1461 279 39 42 chr15 37443588 37444070 -66050904 - RMER5 LTR ERV1 -11 523 43 8 870 2149 211 20 5 chr15 37451329 37451734 -66043240 - MTD LTR MaLR -8 411 1 8 870 511 299 124 68 chr15 37454516 37454911 -66040063 - MTD LTR MaLR -2 417 1 8 870 1220 294 48 56 chr15 37455268 37455805 -66039169 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 8 870 318 351 33 20 chr15 37457075 37457226 -66037748 + MLT1L LTR MaLR 94 246 -364 8 870 1104 275 75 20 chr15 37457578 37457927 -66037047 - MLT1B LTR MaLR -13 377 10 8 870 952 224 19 14 chr15 37458812 37459025 -66035949 - MTD LTR MaLR -205 214 1 8 870 635 203 32 0 chr15 37465259 37465382 -66029592 + MTEb LTR MaLR 4 130 -249 8 870 1294 243 91 26 chr15 37465696 37466046 -66028928 - MTEb LTR MaLR -6 373 1 8 870 416 361 33 22 chr15 37469062 37469246 -66025728 + MLT1D LTR MaLR 304 489 -16 8 870 1030 285 152 10 chr15 37473955 37474362 -66020612 + MLT1D LTR MaLR 24 488 -17 8 870 317 229 46 138 chr15 37474884 37475036 -66019938 - MT2B LTR ERVL -323 278 141 8 870 1022 125 57 6 chr15 37481231 37481408 -66013566 + ORR1D1 LTR MaLR 1 186 -188 9 870 1099 190 19 0 chr15 37481437 37481706 -66013268 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 9 870 598 179 19 9 chr15 37481710 37481817 -66013157 + ORR1D1 LTR MaLR 267 374 0 9 870 3252 181 72 113 chr15 37482105 37482475 -66012499 + RMER17B LTR ERVK 1 413 -545 9 870 3252 212 64 96 chr15 37482574 37483226 -66011748 + RMER17B LTR ERVK 414 953 -5 9 871 231 291 24 48 chr15 37489240 37489323 -66005651 - MTEb LTR MaLR -14 365 285 9 871 1597 177 3 27 chr15 37496598 37496894 -65998080 + ORR1B2 LTR MaLR 79 367 0 9 871 1920 203 75 7 chr15 37497867 37498256 -65996718 - MTD LTR MaLR -15 404 6 9 871 529 274 104 0 chr15 37502662 37502826 -65992148 - MTE2b LTR MaLR -5 374 194 5 871 692 260 19 24 chr15 37503721 37503930 -65991044 - MTE2b LTR MaLR -171 208 1 5 871 1540 232 44 33 chr15 37504862 37505228 -65989746 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 871 406 325 53 59 chr15 37511593 37511937 -65983037 + ORR1E LTR MaLR 1 340 -30 1 871 814 256 101 46 chr15 37516960 37517267 -65977707 + MLT1A0 LTR MaLR 2 325 -40 2 871 640 284 52 87 chr15 37517287 37517654 -65977320 - ORR1E LTR MaLR 0 359 6 2 871 2223 211 28 10 chr15 37519513 37520010 -65974964 - RMER20A LTR ERVK 0 516 11 3 871 3971 147 43 12 chr15 37520696 37521366 -65973608 + RLTR17 LTR ERVK 1 691 -1 3 871 1931 228 65 113 chr15 37521886 37522880 -65972094 + RMER17B LTR ERVK 1 915 -43 3 871 1107 164 301 20 chr15 37524589 37524881 -65970093 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 871 364 264 107 59 chr15 37526174 37526343 -65968631 - ORR1E LTR MaLR -175 184 8 3 871 2632 43 65 0 chr15 37528130 37528455 -65966519 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 871 1326 189 117 28 chr15 37535491 37535817 -65959157 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 5 871 1939 111 36 3 chr15 37536805 37537113 -65957861 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 5 871 270 331 11 90 chr15 37538222 37538411 -65956563 + MLT1H LTR MaLR 139 312 -237 5 871 2754 138 35 0 chr15 37538818 37539223 -65955751 + MTC LTR MaLR 3 421 0 6 871 745 267 25 47 chr15 37549625 37549900 -65945074 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 149 7 871 2304 120 28 8 chr15 37550615 37550967 -65944007 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 8 871 1255 148 32 40 chr15 37552371 37552624 -65942350 - RMER17A2 LTR ERVK -655 251 1 8 871 1472 231 154 24 chr15 37557938 37558305 -65936669 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 96 9 871 1472 231 154 24 chr15 37558344 37558442 -65936532 - RLTR11A2 LTR ERVK -432 95 1 9 871 559 220 119 119 chr15 37558753 37559191 -65935783 + RMER10A LTR ERVL 1 438 -4 9 871 1587 233 64 29 chr15 37560706 37561136 -65933838 + RLTR20C LTR ERVK 1 458 -105 1 871 1587 225 57 31 chr15 37561201 37561290 -65933684 + RLTR20C LTR ERVK 432 533 -1 1 871 451 252 159 25 chr15 37561709 37561861 -65933113 - MTE2a LTR MaLR -14 365 192 1 871 1518 192 96 3 chr15 37561861 37562196 -65932778 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 1 871 1676 140 111 6 chr15 37562209 37562533 -65932441 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 2 1 871 435 230 168 12 chr15 37562992 37563159 -65931815 + ETnERV2-int LTR ERVK 6233 6425 -981 1 871 2196 121 11 40 chr15 37563441 37563811 -65931163 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 359 -24 1 871 1344 201 18 98 chr15 37563839 37564236 -65930738 + RLTR31_Mm LTR ERVK 197 561 0 1 871 2165 69 131 26 chr15 37570533 37570846 -65924128 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 871 466 322 90 54 chr15 37572043 37572522 -65922452 + LTR33 LTR ERVL 20 515 0 1 871 1315 236 53 17 chr15 37586484 37586841 -65908133 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 871 1914 190 27 3 chr15 37598667 37599036 -65895938 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 871 464 292 143 67 chr15 37599441 37599918 -65895056 + MER34 LTR ERV1 6 518 -24 1 871 342 311 85 24 chr15 37604821 37604986 -65889988 - MLT1A0 LTR MaLR -190 175 1 1 871 995 207 104 68 chr15 37609165 37609502 -65885472 + ORR1E LTR MaLR 9 357 -2 1 871 421 250 0 0 chr15 37609553 37609637 -65885337 + MTE2b LTR MaLR 16 99 -280 1 871 585 326 112 4 chr15 37609691 37609959 -65885015 + MTE2b LTR MaLR 72 368 -11 1 871 1065 209 92 132 chr15 37613932 37614334 -65880640 - RLTR18B LTR ERVK -123 389 4 1 871 2608 49 65 0 chr15 37615707 37616032 -65878942 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 872 1085 258 97 12 chr15 37618426 37618756 -65876218 - MTE2b LTR MaLR -21 358 1 1 872 450 315 81 13 chr15 37618838 37619073 -65875901 + ERVL-E-int LTR ERVL 4955 5302 -459 1 872 2598 165 133 6 chr15 37622210 37622729 -65872245 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 1 872 3081 75 10 7 chr15 37622964 37623382 -65871592 + BGLII LTR ERVK 1 419 -2 1 872 3503 139 176 8 chr15 37624266 37624897 -65870077 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 872 537 286 55 58 chr15 37626362 37626655 -65868319 + MLT1E1A LTR MaLR 389 680 0 2 872 225 312 85 51 chr15 37628956 37629074 -65865900 + LTR78 LTR ERV1 525 646 -658 2 872 3517 25 2 0 chr15 37635370 37635765 -65859209 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 872 239 254 0 78 chr15 37640181 37640258 -65854716 + RLTR20D LTR ERVK 60 130 -438 2 872 1623 227 99 96 chr15 37642727 37643656 -65851318 + RMER17B LTR ERVK 2 904 -4 2 872 304 303 46 60 chr15 37646956 37647107 -65847867 + LTR79 LTR ERVL 369 517 -10 2 872 544 261 43 37 chr15 37648902 37649089 -65845885 + MLT1D LTR MaLR 290 477 -28 2 872 461 342 28 79 chr15 37651710 37652027 -65842947 + ORR1E LTR MaLR 55 355 -4 2 872 654 264 139 27 chr15 37653056 37653422 -65841552 + MLT1A1 LTR MaLR 2 408 0 2 872 5088 117 102 29 chr15 37667971 37668261 -65826713 + RMER17B LTR ERVK 1 317 -641 2 872 5088 117 102 29 chr15 37668408 37669010 -65825964 + RMER17B LTR ERVK 318 958 0 2 872 509 297 182 17 chr15 37669563 37669799 -65825175 + MLT1A0 LTR MaLR 39 313 -52 2 872 777 269 114 79 chr15 37671119 37671340 -65823634 - ORR1E LTR MaLR -4 355 137 2 872 3967 109 187 92 chr15 37671340 37671751 -65823223 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 463 2 872 3967 109 187 92 chr15 37671776 37672191 -65822783 - RMER17A2 LTR ERVK -444 462 3 2 872 777 269 114 79 chr15 37672191 37672312 -65822662 - ORR1E LTR MaLR -223 136 1 2 872 4334 25 12 0 chr15 37674067 37674554 -65820420 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 2 872 1453 124 31 202 chr15 37679619 37679790 -65815184 + RLTR24 LTR ERV1 1 174 -355 2 872 1928 125 76 0 chr15 37679790 37680093 -65814881 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 2 872 1453 124 31 202 chr15 37680093 37680262 -65814712 + RLTR24 LTR ERV1 175 281 -248 2 872 2064 136 9 120 chr15 37680262 37680506 -65814468 + RMER10B LTR ERVL 2 220 -178 2 872 1670 169 214 21 chr15 37680506 37680880 -65814094 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 872 2064 136 9 120 chr15 37680880 37681078 -65813896 + RMER10B LTR ERVL 221 395 -3 2 872 1241 167 87 8 chr15 37681080 37681255 -65813719 + RLTR24 LTR ERV1 262 438 -91 2 872 1241 167 87 8 chr15 37681286 37681352 -65813622 + RLTR24 LTR ERV1 439 521 -8 2 872 291 194 116 29 chr15 37683035 37683104 -65811870 - ORR1A4 LTR MaLR -254 75 1 3 872 1370 172 113 121 chr15 37683201 37683472 -65811502 + RLTR23 LTR ERV1 11 266 -164 3 872 1370 172 113 121 chr15 37683630 37683755 -65811219 + RLTR23 LTR ERV1 267 404 -26 3 872 2370 130 91 29 chr15 37683909 37684329 -65810645 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 872 902 208 101 5 chr15 37685748 37685956 -65809018 - MTD LTR MaLR -191 228 1 3 872 2068 176 2 43 chr15 37686039 37686436 -65808538 + RMER10B LTR ERVL 1 381 -17 3 872 771 225 145 57 chr15 37687055 37687352 -65807622 + RLTR42-int LTR ERVK 235 557 -4965 3 872 1606 170 71 9 chr15 37687455 37687781 -65807193 + RLTR42-int LTR ERVK 687 1032 -4490 3 872 5091 188 100 65 chr15 37687922 37689302 -65805672 + RLTR42-int LTR ERVK 1537 2964 -2558 3 872 357 183 118 0 chr15 37689389 37689409 -65805565 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -155 176 99 3 872 2470 30 43 0 chr15 37689405 37689708 -65805266 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -41 316 1 3 872 5987 153 117 18 chr15 37689710 37692013 -65802961 + RLTR42-int LTR ERVK 2946 5522 0 3 872 1303 195 8 4 chr15 37692014 37692251 -65802723 + RLTR42 LTR ERVK 2 239 0 3 872 257 371 88 50 chr15 37696000 37696261 -65798713 + MLT1K LTR MaLR 150 420 -175 3 872 2053 132 21 21 chr15 37697988 37698313 -65796661 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 3 872 415 296 27 27 chr15 37702343 37702492 -65792482 + MLT1A1 LTR MaLR 247 395 -13 3 872 282 287 103 17 chr15 37702490 37702607 -65792367 + MLT1K LTR MaLR 291 417 -178 3 872 1363 151 179 68 chr15 37702979 37703172 -65791802 + RMER17C LTR ERVK 1 179 -231 3 872 1363 151 179 68 chr15 37703341 37703516 -65791458 + RMER17C LTR ERVK 180 410 0 3 872 1356 240 157 8 chr15 37707664 37708021 -65786953 - MTD LTR MaLR 0 419 10 3 872 244 281 74 94 chr15 37712117 37712266 -65782708 + MTEa LTR MaLR 234 379 0 3 872 225 358 0 60 chr15 37714519 37714635 -65780339 + MLT1E3 LTR MaLR 509 617 -7 3 872 537 302 104 84 chr15 37717096 37717443 -65777531 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 3 872 456 248 83 23 chr15 37723748 37723880 -65771094 + MLT1A1 LTR MaLR 269 408 0 3 872 1169 220 26 8 chr15 37724590 37724856 -65770118 - RLTR20B3 LTR ERVK -42 535 265 3 872 1541 174 24 171 chr15 37724882 37725138 -65769836 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 199 3 872 1541 174 24 171 chr15 37725226 37725420 -65769554 - RLTR41 LTR ERV1 -248 198 62 3 872 1077 161 44 78 chr15 37725478 37725774 -65769200 - RLTR20B3 LTR ERVK -271 306 21 3 872 1531 153 191 127 chr15 37726274 37726693 -65768281 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 872 1458 254 31 3 chr15 37726852 37727207 -65767767 + MTEb LTR MaLR 15 379 0 3 872 533 212 50 66 chr15 37729453 37729635 -65765339 + MTEa LTR MaLR 201 379 0 3 872 285 246 145 16 chr15 37734123 37734247 -65760727 - RMER20A LTR ERVK -236 280 141 4 872 4228 116 177 72 chr15 37736298 37737228 -65757746 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 4 872 775 291 51 84 chr15 37739707 37740041 -65754933 - MLT1A0 LTR MaLR -3 371 48 4 872 1290 247 17 106 chr15 37740317 37740733 -65754241 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 872 236 385 0 0 chr15 37741390 37741481 -65753493 - MLT1B LTR MaLR -104 286 196 4 872 7541 144 64 30 chr15 37742206 37742443 -65752531 - RLTR21 LTR ERVK -52 1520 1289 4 872 7541 144 64 30 chr15 37742481 37742632 -65752342 - RLTR21 LTR ERVK -284 1288 1128 4 872 7541 144 64 30 chr15 37742680 37743760 -65751214 - RLTR21 LTR ERVK -445 1127 1 4 872 1021 235 193 0 chr15 37744214 37744525 -65750449 - MTEa LTR MaLR -8 371 1 4 872 385 226 12 5 chr15 37744820 37744920 -65750054 - MTD LTR MaLR 0 419 273 4 872 538 228 31 16 chr15 37746716 37746845 -65748129 - MTE2b LTR MaLR 0 379 249 4 872 333 200 92 0 chr15 37746871 37746936 -65748038 - MTE2b LTR MaLR -221 158 88 4 872 235 396 22 29 chr15 37746941 37747079 -65747895 - LTR16D1 LTR ERVL -365 310 174 4 872 1989 126 67 0 chr15 37747110 37747451 -65747523 + ORR1B1 LTR MaLR 31 394 0 4 872 2303 193 5 0 chr15 37747452 37747897 -65747077 + ORR1B1-int LTR MaLR 2 448 -1515 4 872 2192 110 12 81 chr15 37747897 37748303 -65746671 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 135 4 13 3512 193 85 27 chr15 37748427 37749321 -65745653 + ORR1B1-int LTR MaLR 453 1398 -111 4 873 460 277 42 0 chr15 37749414 37749533 -65745441 - MTEa LTR MaLR 0 379 256 4 873 1101 65 0 0 chr15 37750791 37750945 -65744029 - ORR1B1 LTR MaLR -240 154 1 4 873 814 250 167 61 chr15 37752036 37752492 -65742482 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 24 4 873 1906 189 97 37 chr15 37752833 37753227 -65741747 + RLTR20C LTR ERVK 23 435 -99 4 873 1906 189 97 37 chr15 37753293 37753380 -65741594 + RLTR20C LTR ERVK 436 533 -1 4 873 467 144 11 22 chr15 37753459 37753551 -65741423 + ORR1D1 LTR MaLR 1 91 -283 4 873 1412 251 38 86 chr15 37753557 37754032 -65740942 - RLTR28B LTR ERVL -29 452 1 4 873 611 284 54 116 chr15 37755109 37755368 -65739606 - MLT1D LTR MaLR -2 503 261 4 873 338 248 231 0 chr15 37755666 37755787 -65739187 - MLT1D LTR MaLR -460 167 19 4 873 1950 128 21 72 chr15 37756065 37756453 -65738521 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 4 873 1823 169 120 5 chr15 37758018 37758392 -65736582 - MTD LTR MaLR 0 419 3 4 873 505 273 76 0 chr15 37759005 37759177 -65735797 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2 5712 5528 4 873 449 287 141 54 chr15 37760461 37760813 -65734161 - ERVL-B4-int LTR ERVL -744 4970 4528 4 873 491 228 36 60 chr15 37764044 37764212 -65730762 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 479 4 873 1968 112 6 56 chr15 37764972 37765311 -65729663 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 873 34659 80 6 38 chr15 37765311 37770315 -65724659 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 2 4 873 1905 113 12 62 chr15 37770316 37770655 -65724319 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 4 873 707 265 5 29 chr15 37770656 37770830 -65724144 - RNERVK23-int LTR ERVK -430 7787 7614 4 873 19909 273 38 19 chr15 37770883 37776897 -65718077 - RNERVK23-int LTR ERVK -637 7580 1450 4 873 454 324 0 16 chr15 37776981 37777169 -65717805 - RNERVK23-int LTR ERVK -7183 1034 850 4 873 1458 247 3 3 chr15 37777578 37777907 -65717067 - RNERVK23-int LTR ERVK -7693 524 196 4 873 508 217 42 60 chr15 37778114 37778281 -65716693 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 479 4 873 3565 67 2 4 chr15 37779324 37779805 -65715169 + RLTR13B1 LTR ERVK 414 893 0 4 873 2174 149 38 23 chr15 37783180 37783571 -65711403 - RMER4B LTR ERVK 0 585 189 4 873 6736 155 46 18 chr15 37784224 37786324 -65708650 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 5 2321 -5 4 873 2479 216 25 18 chr15 37786329 37786885 -65708089 + RLTR20B1 LTR ERVK 1 560 -3 4 873 399 360 74 13 chr15 37787141 37787372 -65707602 + HERV16-int LTR ERVL 1825 2069 -2927 4 873 610 311 45 101 chr15 37787868 37788244 -65706730 - ORR1E LTR MaLR -1 358 4 4 873 374 253 59 114 chr15 37788939 37789229 -65705745 + RMER16-int LTR ERVK 47 320 -2994 4 873 2826 154 127 51 chr15 37789379 37790142 -65704832 + RMER16-int LTR ERVK 256 1755 -5651 4 873 2304 184 96 70 chr15 37796555 37797417 -65697557 + RMER16-int LTR ERVK 1107 2566 -4840 4 873 1135 93 19 120 chr15 37797429 37797637 -65697337 + RMER16-int LTR ERVK 1674 1860 -3546 4 873 12172 132 35 25 chr15 37798275 37800436 -65694538 + RMER16-int LTR ERVK 1840 3866 -1540 4 873 278 224 101 95 chr15 37800703 37800861 -65694113 + RMER16-int LTR ERVK 5221 5379 -27 4 873 654 218 244 49 chr15 37800958 37801266 -65693708 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 4 873 362 296 45 139 chr15 37801326 37801636 -65693338 + RMER10A LTR ERVL 129 409 -33 4 873 2269 174 138 13 chr15 37801702 37802172 -65692802 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 4 873 880 259 133 113 chr15 37803027 37803728 -65691246 + RLTR19-int LTR ERVK 3667 4381 -1756 4 873 2009 186 102 42 chr15 37803944 37804213 -65690761 + RLTR24 LTR ERV1 1 297 -232 4 873 2305 142 53 5 chr15 37804213 37804589 -65690385 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 873 2009 186 102 42 chr15 37804589 37804818 -65690156 + RLTR24 LTR ERV1 298 529 0 4 873 266 295 52 26 chr15 37805484 37805599 -65689375 - MLT1I LTR MaLR -281 130 13 4 873 2900 21 0 21 chr15 37807435 37807769 -65687205 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 873 919 129 87 6 chr15 37807771 37807943 -65687031 + IAPEz-int LTR ERVK 10 195 -6286 5 873 229 244 0 0 chr15 37807951 37807996 -65686978 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 5 873 5245 79 82 59 chr15 37807996 37808805 -65686169 + IAPEz-int LTR ERVK 168 994 -5487 5 873 1859 84 4 0 chr15 37808868 37809107 -65685867 + IAPEY3-int LTR ERVK 2258 2497 -5183 5 873 14356 72 9 6 chr15 37809106 37810926 -65684048 + IAPEz-int LTR ERVK 4656 6481 0 5 873 2922 15 0 21 chr15 37810926 37811260 -65683714 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 5 873 665 109 181 0 chr15 37811301 37811439 -65683535 + ORR1B1 LTR MaLR 1 163 -231 5 873 1740 185 91 83 chr15 37811459 37811966 -65683008 - RLTR11A LTR ERVK -17 511 1 5 873 1343 142 22 0 chr15 37811969 37812195 -65682779 + ORR1B1 LTR MaLR 164 394 0 5 873 326 236 3 172 chr15 37812196 37812362 -65682612 - MTE2a LTR MaLR -31 348 214 5 873 646 272 46 62 chr15 37812621 37812878 -65682096 - MTE2a LTR MaLR -123 256 40 5 873 1847 104 14 81 chr15 37813115 37813460 -65681514 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 873 2132 151 65 0 chr15 37814239 37814623 -65680351 + MTC LTR MaLR 13 421 0 5 873 249 224 52 0 chr15 37814751 37814809 -65680165 + MLT1A1 LTR MaLR 54 114 -294 5 873 274 300 8 68 chr15 37815164 37815282 -65679692 + MTEb LTR MaLR 269 379 0 5 873 818 219 124 159 chr15 37815503 37816074 -65678900 + RLTR19-int LTR ERVK 2531 3081 -3056 5 873 654 232 50 96 chr15 37816517 37816897 -65678077 + RLTR19-int LTR ERVK 3386 3748 -2389 5 873 2565 90 153 3 chr15 37816928 37817308 -65677666 + RLTR9B LTR ERVK 1 437 0 5 873 412 301 24 18 chr15 37817429 37817598 -65677376 + ETnERV-int LTR ERVK 109 278 -3036 5 873 1491 157 71 127 chr15 37817757 37818136 -65676838 + ETnERV2-int LTR ERVK 2092 2449 -4795 5 873 929 217 111 0 chr15 37818139 37818356 -65676618 + MYSERV6-int LTR ERVK 8385 8625 -334 5 873 5130 110 42 69 chr15 37818344 37819255 -65675719 + ETnERV2-int LTR ERVK 2860 3758 -3648 5 873 5130 110 42 69 chr15 37819402 37819473 -65675501 + ETnERV2-int LTR ERVK 3759 3815 -3591 5 873 785 226 102 96 chr15 37819476 37819723 -65675251 + ETnERV2-int LTR ERVK 2610 2750 -488 5 873 785 215 76 99 chr15 37819807 37819915 -65675059 + ETnERV2-int LTR ERVK 2751 2865 -373 5 873 514 43 0 0 chr15 37820027 37820096 -65674878 - RMER16 LTR ERVK 0 533 465 5 873 1104 225 94 14 chr15 37820087 37820384 -65674590 - RMER16 LTR ERVK -212 321 1 5 873 592 168 24 61 chr15 37820435 37820600 -65674374 + RMER10A LTR ERVL 284 442 0 5 873 2169 161 37 59 chr15 37820717 37820886 -65674088 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 282 5 873 3051 76 2 8 chr15 37820886 37821284 -65673690 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 873 2169 161 37 59 chr15 37821284 37821570 -65673404 - RLTR41 LTR ERV1 -165 281 1 5 873 238 313 24 0 chr15 37821581 37821664 -65673310 - MLT1F2 LTR MaLR -475 85 1 5 873 4052 83 26 26 chr15 37822546 37823117 -65671857 - RLTR45-int LTR ERVK -6673 571 1 5 873 3292 64 27 37 chr15 37823117 37823604 -65671370 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 5 873 1483 162 47 35 chr15 37823875 37824214 -65670760 - RLTR15 LTR ERVK -16 343 1 5 873 3554 174 41 21 chr15 37824256 37824962 -65670012 - MYSERV6-int LTR ERVK -41 8918 8199 5 873 1619 165 59 72 chr15 37825708 37826081 -65668893 - RLTR17 LTR ERVK -324 368 1 5 873 7980 169 52 53 chr15 37826082 37827921 -65667053 - RMER3D-int LTR ERVK -1 2841 485 5 873 579 178 34 0 chr15 37827937 37828055 -65666919 - RMER3D-int LTR ERVK -2232 610 489 5 873 1694 203 64 77 chr15 37828091 37828736 -65666238 - RMER3D-int LTR ERVK -1990 852 2 5 873 2219 159 31 21 chr15 37828789 37829212 -65665762 - RLTR17 LTR ERVK -114 578 152 5 873 1540 146 64 18 chr15 37830107 37830434 -65664540 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 5 873 2295 142 45 11 chr15 37831481 37831859 -65663115 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 1 5 873 541 264 62 87 chr15 37832074 37832315 -65662659 + RLTR12B LTR ERVK 39 273 -255 5 873 4731 145 71 36 chr15 37833415 37834275 -65660699 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 5 873 311 252 8 108 chr15 37834373 37834493 -65660481 + MT2B LTR ERVL 151 258 -343 5 873 1431 221 43 83 chr15 37837359 37837754 -65657220 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 873 1750 224 97 68 chr15 37840047 37840117 -65654857 - RLTR20B3 LTR ERVK -14 563 482 5 873 1750 224 97 68 chr15 37840143 37840600 -65654374 - RLTR20B3 LTR ERVK -96 481 23 5 873 3474 42 3 0 chr15 37841359 37841743 -65653231 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 5 873 255 235 90 45 chr15 37842054 37842143 -65652831 + RMER10A LTR ERVL 18 110 -332 5 873 1261 216 35 21 chr15 37846487 37846771 -65648203 + RLTR42-int LTR ERVK 1106 1393 -4129 5 873 251 216 20 0 chr15 37847806 37847857 -65647117 + RLTR42-int LTR ERVK 1555 1606 -3916 5 873 1310 130 135 103 chr15 37848183 37848532 -65646442 + RLTR42-int LTR ERVK 1870 2237 -3285 5 873 1451 249 90 32 chr15 37848532 37849030 -65645944 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 5 873 1310 273 88 142 chr15 37849030 37850337 -65644637 + RLTR42-int LTR ERVK 2238 3700 -2437 5 873 619 221 62 163 chr15 37850435 37850843 -65644131 + RLTR42-int LTR ERVK 3699 3969 -2168 5 873 460 173 12 12 chr15 37851283 37851365 -65643609 + RLTR42-int LTR ERVK 4259 4340 -1797 5 873 260 229 54 151 chr15 37851694 37851879 -65643095 + RMER10A LTR ERVL 253 419 -23 5 873 1113 165 19 14 chr15 37852045 37852254 -65642720 + MTC LTR MaLR 1 210 -211 5 873 1234 133 75 9 chr15 37852545 37852757 -65642217 + MTC LTR MaLR 196 421 0 5 873 1309 195 169 25 chr15 37858433 37858759 -65636215 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 5 873 757 299 132 11 chr15 37858981 37859262 -65635712 + ORR1E LTR MaLR 1 315 -44 5 873 1472 181 138 42 chr15 37860532 37860866 -65634108 + ORR1D1 LTR MaLR 5 370 -4 5 873 951 255 105 22 chr15 37861799 37862112 -65632862 + MTEb LTR MaLR 1 339 -40 5 873 326 215 26 127 chr15 37877704 37877820 -65617154 - MLT1A0 LTR MaLR -3 405 258 6 873 261 254 45 0 chr15 37877820 37877887 -65617087 + MTD LTR MaLR 1 70 -349 6 873 3099 197 119 124 chr15 37877880 37878864 -65616110 + MTD-int LTR MaLR 156 1145 -113 6 873 3099 197 119 124 chr15 37879044 37879168 -65615806 + MTD-int LTR MaLR 1146 1258 0 6 873 1452 190 266 0 chr15 37879168 37879499 -65615475 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 874 320 311 91 87 chr15 37902241 37902516 -65592458 + MER68 LTR ERVL 7 282 -281 6 874 1903 175 55 35 chr15 37908345 37908712 -65586262 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 6 874 866 190 240 42 chr15 37922398 37922706 -65572268 + MTD LTR MaLR 3 371 -48 7 874 251 25 150 0 chr15 37923941 37923981 -65570993 + RLTR12B LTR ERVK 11 56 -472 7 874 225 326 77 14 chr15 37924095 37924238 -65570736 + RLTR15 LTR ERVK 189 340 -19 7 874 2037 196 86 6 chr15 37931270 37931738 -65563236 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 7 874 1004 248 61 36 chr15 37950727 37951148 -65543826 + MT2A LTR ERVL 4 589 -12 7 874 1419 193 187 30 chr15 37968069 37968433 -65526541 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 874 244 279 44 96 chr15 37974671 37974734 -65520240 + MT2B2 LTR ERVL 164 288 -296 8 874 242 218 22 133 chr15 37984222 37984237 -65510737 + MT2B LTR ERVL 155 159 -442 8 874 2439 130 32 5 chr15 37992038 37992440 -65502534 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 8 874 225 202 98 105 chr15 37993297 37993430 -65501544 + MLT1H1 LTR MaLR 419 550 -5 8 874 403 283 20 126 chr15 38005737 38005822 -65489152 + MT2B LTR ERVL 88 151 -450 1 874 238 315 52 61 chr15 38009532 38009647 -65485327 + MT2B LTR ERVL 150 263 -338 2 875 1121 208 7 16 chr15 38010948 38011178 -65483796 + ORR1C2 LTR MaLR 150 384 0 3 875 5238 179 153 72 chr15 38011178 38012574 -65482400 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 1509 0 3 875 341 167 44 29 chr15 38012576 38012644 -65482330 + ORR1C2 LTR MaLR 3 71 -313 3 875 328 246 14 0 chr15 38013885 38013954 -65481020 - LTR16C LTR ERVL -7 531 462 3 875 364 407 55 32 chr15 38014953 38015265 -65479709 - LTR16C LTR ERVL -95 394 76 3 875 683 151 0 0 chr15 38019651 38019757 -65475217 + RMER19B LTR ERVK 1 106 -796 6 875 405 230 29 20 chr15 38019768 38019870 -65475104 + RMER19B LTR ERVK 496 598 -304 6 875 1340 152 160 18 chr15 38019960 38020235 -65474739 + RMER19B LTR ERVK 583 896 -6 6 875 253 279 25 64 chr15 38022450 38022607 -65472367 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 604 7 875 3103 157 10 18 chr15 38027220 38027732 -65467242 + RMER15 LTR ERVL 1 508 -67 8 875 738 251 103 182 chr15 38028561 38028713 -65466261 - MTE2a LTR MaLR 0 379 217 8 875 738 251 103 182 chr15 38028853 38028877 -65466097 - MTE2a LTR MaLR -163 216 216 9 875 738 268 93 158 chr15 38029061 38029315 -65465659 - MTE2a LTR MaLR -144 275 3 8 875 677 273 126 81 chr15 38029909 38030370 -65464604 + RLTR12B LTR ERVK 2 508 -20 9 875 954 239 140 19 chr15 38030680 38030944 -65464030 - MTE2b LTR MaLR -54 325 30 9 875 380 291 203 49 chr15 38031174 38031548 -65463426 - RMER21B LTR ERV1 -113 834 321 9 875 1528 178 77 41 chr15 38032492 38032832 -65462142 - ORR1D1 LTR MaLR -22 352 1 1 875 430 78 0 45 chr15 38036786 38036853 -65458121 + RLTR26 LTR ERVK 1 64 -578 1 875 2649 104 66 11 chr15 38036854 38037309 -65457665 - RMER17B LTR ERVK -257 701 222 1 875 795 208 6 167 chr15 38037394 38037445 -65457529 - RMER17B LTR ERVK -692 266 232 1 875 1442 150 4 38 chr15 38037508 38037773 -65457201 - RMER17B LTR ERVK -651 255 1 1 875 1330 229 138 9 chr15 38038641 38038967 -65456007 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 1 875 2475 122 29 5 chr15 38039131 38039511 -65455463 + MTC LTR MaLR 2 390 -31 1 875 826 307 93 69 chr15 38039639 38040137 -65454837 - RLTR26 LTR ERVK -65 562 4 1 875 2004 131 27 83 chr15 38046680 38047055 -65447919 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 875 2859 136 39 4 chr15 38047303 38047791 -65447183 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 20 1 875 342 277 24 0 chr15 38050077 38050160 -65444814 + MLT1J LTR MaLR 83 167 -345 1 875 3153 83 5 0 chr15 38051737 38052156 -65442818 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 875 1391 187 179 15 chr15 38052442 38052778 -65442196 - MTD LTR MaLR -16 403 13 1 875 2336 96 9 3 chr15 38053234 38053559 -65441415 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 875 611 245 88 0 chr15 38054018 38054177 -65440797 - LTR55 LTR ERV -375 173 1 1 875 324 329 13 73 chr15 38054300 38054451 -65440523 - RMER15 LTR ERVL -12 563 422 1 875 3666 159 132 64 chr15 38057822 38058655 -65436319 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 1 875 405 180 100 0 chr15 38058782 38058882 -65436092 - MTEa LTR MaLR -1 378 269 1 875 286 257 0 26 chr15 38059663 38059739 -65435235 + RMER10A LTR ERVL 1 74 -368 1 875 471 284 66 39 chr15 38059752 38060008 -65434966 + RMER10A LTR ERVL 164 426 -16 1 875 538 283 57 16 chr15 38062651 38062845 -65432129 - RMER15 LTR ERVL -14 561 360 1 875 1535 152 50 112 chr15 38063442 38063879 -65431095 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 875 815 196 117 18 chr15 38066982 38067205 -65427769 + RMER4B LTR ERVK 1 245 -340 1 875 422 229 227 31 chr15 38067299 38067493 -65427481 + RMER4B LTR ERVK 343 574 -11 1 875 797 227 66 20 chr15 38067854 38068027 -65426947 + MurERV4-int LTR ERVK 1 185 -5075 2 875 797 227 66 20 chr15 38068204 38068228 -65426746 + MurERV4-int LTR ERVK 186 207 -5053 2 875 6275 213 38 41 chr15 38068225 38070157 -65424817 + MurERV4-int LTR ERVK 179 2020 -3240 2 875 3022 213 85 40 chr15 38070234 38070374 -65424600 + MurERV4-int LTR ERVK 2021 2174 -3086 2 875 8566 148 29 62 chr15 38070365 38071825 -65423149 + MurERV4-int LTR ERVK 3727 5187 -73 2 875 8566 148 29 62 chr15 38071972 38072054 -65422920 + MurERV4-int LTR ERVK 5188 5224 -36 2 875 8566 148 29 62 chr15 38072196 38072238 -65422736 + MurERV4-int LTR ERVK 5225 5260 0 2 875 1266 198 161 41 chr15 38072238 38072655 -65422319 + RMER4B LTR ERVK 1 467 -118 2 875 435 170 55 71 chr15 38072623 38072749 -65422225 + RMER4B LTR ERVK 356 574 -11 2 875 625 313 5 30 chr15 38073065 38073164 -65421810 + MLT2B1 LTR ERVL 15 113 -407 2 875 2466 77 3 58 chr15 38073164 38073510 -65421464 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 875 625 313 5 30 chr15 38073510 38073611 -65421363 + MLT2B1 LTR ERVL 114 210 -310 2 875 250 298 102 26 chr15 38073629 38073831 -65421143 + MLT2B1 LTR ERVL 351 557 -5 2 875 1910 116 9 59 chr15 38075185 38075524 -65419450 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 875 793 242 90 85 chr15 38076592 38076958 -65418016 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 875 306 235 86 57 chr15 38077056 38077201 -65417773 - RMER16-int LTR ERVK -62 5344 5241 2 875 13737 125 55 35 chr15 38078808 38080833 -65414141 - RMER16-int LTR ERVK -1540 3866 1949 2 875 13737 121 50 39 chr15 38080978 38081392 -65413582 - RMER16-int LTR ERVK -3458 1948 1566 2 875 399 170 240 79 chr15 38081557 38081707 -65413267 - RMER16-int LTR ERVK -4859 2547 2380 2 875 4644 140 32 13 chr15 38081916 38082628 -65412346 - RMER16-int LTR ERVK -3838 1568 856 2 875 4644 167 110 36 chr15 38082660 38083102 -65411872 - RMER16-int LTR ERVK -5922 1484 787 2 875 603 234 107 39 chr15 38083577 38083875 -65411099 - RLTR9A LTR ERVK -57 311 2 2 875 1981 137 152 6 chr15 38085000 38085330 -65409644 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 875 458 266 0 0 chr15 38085691 38085815 -65409159 + MLT1C LTR MaLR 55 178 -289 2 875 231 322 102 51 chr15 38086037 38086281 -65408693 + MLT1C LTR MaLR 165 422 -45 2 875 1812 181 80 10 chr15 38086400 38086786 -65408188 + RLTR25B LTR ERVK 159 571 -457 2 875 834 238 99 45 chr15 38086810 38087122 -65407852 + RMER5 LTR ERV1 202 530 -4 2 875 229 221 92 122 chr15 38088105 38088138 -65406836 - MT2B LTR ERVL -380 221 127 2 875 236 253 22 22 chr15 38088525 38088614 -65406360 + MLT1B LTR MaLR 257 345 -45 2 875 304 233 84 37 chr15 38091245 38091352 -65403622 + RLTR14 LTR ERV1 271 382 0 2 875 492 305 135 49 chr15 38098895 38099222 -65395752 - MTEa LTR MaLR -20 359 5 2 875 1323 318 126 40 chr15 38099226 38099478 -65395496 - MTEa-int LTR MaLR -8 1572 1291 2 875 1323 318 126 40 chr15 38099498 38100053 -65394921 - MTEa-int LTR MaLR -290 1290 696 2 875 513 342 76 99 chr15 38100248 38100631 -65394343 - MTEa-int LTR MaLR -1158 422 49 2 875 375 309 76 42 chr15 38106992 38107305 -65387669 - RMER20B LTR ERVK -120 507 162 2 875 312 242 29 48 chr15 38109843 38109947 -65385027 + MER57A-int LTR ERV1 5798 5899 -288 2 875 553 165 156 16 chr15 38110962 38111173 -65383801 + ORR1C2 LTR MaLR 5 273 -111 2 875 243 203 68 0 chr15 38111327 38111386 -65383588 + ORR1C2 LTR MaLR 310 372 -6 2 875 2857 140 34 34 chr15 38111882 38112443 -65382531 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 2 875 289 235 44 0 chr15 38112553 38112621 -65382353 + MLT1F2 LTR MaLR 68 138 -422 2 875 1045 254 60 93 chr15 38113132 38113604 -65381370 + MT2B LTR ERVL 18 599 -2 2 875 278 324 200 0 chr15 38114265 38114410 -65380564 + MLT1F2 LTR MaLR 332 505 0 2 875 265 200 20 0 chr15 38116678 38116728 -65378246 + LTR85b LTR Gypsy? 729 779 -5 3 875 484 229 245 20 chr15 38116918 38117114 -65377860 + RLTR28B LTR ERVL 108 347 -134 3 875 2256 151 23 20 chr15 38118544 38118935 -65376039 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 3 875 1316 268 29 14 chr15 38119045 38119393 -65375581 + ORR1E LTR MaLR 7 359 0 3 875 417 278 68 20 chr15 38119849 38119996 -65374978 - MER21B LTR ERV1 -150 713 560 3 875 286 187 226 21 chr15 38121975 38122068 -65372906 + MTD LTR MaLR 289 400 -19 3 875 352 270 170 28 chr15 38122743 38122884 -65372090 + MER73 LTR ERVL 38 198 -446 3 875 233 250 25 174 chr15 38123048 38123169 -65371805 + MER73 LTR ERVL 469 571 -73 3 875 309 287 21 31 chr15 38123158 38123255 -65371719 + MER73 LTR ERVL 122 217 -427 3 875 2228 132 105 14 chr15 38124997 38125358 -65369616 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 875 411 256 111 41 chr15 38126166 38126337 -65368637 - MLT1C LTR MaLR -279 188 6 3 875 291 154 19 0 chr15 38126477 38126529 -65368445 + MTD LTR MaLR 20 72 -347 3 875 964 246 159 10 chr15 38126698 38126994 -65367980 + MTD LTR MaLR 79 418 -1 3 875 623 286 125 40 chr15 38132857 38133105 -65361869 - MLT1B LTR MaLR -16 374 106 3 875 506 217 41 72 chr15 38133887 38134042 -65360932 + ORR1E LTR MaLR 2 184 -186 3 875 1192 238 104 41 chr15 38136822 38137216 -65357758 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 875 2396 118 86 39 chr15 38138909 38139342 -65355632 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 3 875 2279 104 0 3 chr15 38141183 38141502 -65353472 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 3 876 2524 135 18 66 chr15 38142356 38142808 -65352166 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 3 876 229 318 118 45 chr15 38145592 38145770 -65349204 - LTR88b LTR Gypsy? -627 210 20 3 876 917 317 58 24 chr15 38157549 38157927 -65337047 - MT2A LTR ERVL -101 432 42 4 876 1556 233 45 42 chr15 38159902 38160260 -65334714 - MTE2a LTR MaLR 0 379 21 4 876 1949 135 31 15 chr15 38160378 38160702 -65334272 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 876 2199 143 107 30 chr15 38160703 38161310 -65333664 - ORR1A4-int LTR MaLR -191 1772 959 4 876 3328 46 5 0 chr15 38162274 38162668 -65332306 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 876 1164 271 84 16 chr15 38164291 38164614 -65330360 - MTE2b LTR MaLR -13 366 22 4 876 1696 172 157 63 chr15 38165364 38165446 -65329528 + RMER20A LTR ERVK 21 142 -374 4 876 1696 172 157 63 chr15 38165493 38165540 -65329434 + RMER20A LTR ERVK 143 184 -332 4 876 1696 172 157 63 chr15 38165687 38166003 -65328971 + RMER20A LTR ERVK 185 509 -7 4 876 368 275 93 46 chr15 38168638 38168919 -65326055 + MLT1D LTR MaLR 174 505 0 4 876 2386 190 140 55 chr15 38169448 38170011 -65324963 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 876 740 233 13 0 chr15 38170419 38170569 -65324405 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 233 4 876 1093 213 58 20 chr15 38170569 38170840 -65324134 + RLTR11A LTR ERVK 1 242 -286 4 876 271 288 29 109 chr15 38174715 38174890 -65320084 - MLT1J1 LTR MaLR -283 161 1 4 876 550 326 82 18 chr15 38175438 38175657 -65319317 + MLT1F2 LTR MaLR 210 442 -118 4 876 1900 177 84 3 chr15 38178229 38178586 -65316388 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 876 314 330 20 20 chr15 38180732 38180834 -65314140 + MTD LTR MaLR 11 112 -307 4 876 455 236 122 151 chr15 38181080 38181325 -65313649 + MTD LTR MaLR 106 343 -76 4 876 2064 150 24 27 chr15 38181315 38181685 -65313289 + ORR1B1 LTR MaLR 26 394 0 4 876 446 132 53 0 chr15 38181686 38181762 -65313212 + MTD LTR MaLR 340 419 0 4 876 1148 145 84 24 chr15 38182133 38182525 -65312449 - RMER6B LTR ERVK -10 451 1 4 876 593 296 188 23 chr15 38187726 38188220 -65306754 + LTR48 LTR ERV1 3 608 -179 4 876 244 291 106 48 chr15 38189256 38189446 -65305528 - MLT1J2 LTR MaLR -198 213 47 4 876 1304 211 99 36 chr15 38192293 38192477 -65302497 + RMER4B LTR ERVK 17 216 -369 4 876 1304 211 99 36 chr15 38192507 38192686 -65302288 + RMER4B LTR ERVK 217 403 -182 4 876 300 180 0 0 chr15 38194780 38194830 -65300144 + MTEb LTR MaLR 3 52 -327 5 876 355 271 63 83 chr15 38195040 38195245 -65299729 + RMER2 LTR ERV1 346 546 -21 5 876 288 229 29 0 chr15 38195834 38195904 -65299070 + MTEa LTR MaLR 306 377 -2 5 876 324 279 26 51 chr15 38196585 38196702 -65298272 + MT2B LTR ERVL 147 260 -341 5 876 505 325 89 8 chr15 38198521 38198769 -65296205 + MLT1C LTR MaLR 200 467 0 5 876 2116 162 60 12 chr15 38199162 38199561 -65295413 - MTD LTR MaLR 0 419 2 5 876 789 270 40 37 chr15 38202711 38202984 -65291990 + RLTR12B LTR ERVK 35 308 -220 5 876 764 259 44 73 chr15 38202985 38203260 -65291714 + RLTR12B LTR ERVK 253 519 -9 5 876 385 275 75 15 chr15 38204228 38204361 -65290613 - ORR1E LTR MaLR -218 141 1 5 876 2786 128 12 79 chr15 38204803 38205295 -65289679 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 5 876 588 207 152 176 chr15 38214412 38214775 -65280199 - MTEb LTR MaLR -23 356 3 5 876 1554 206 53 10 chr15 38215412 38215761 -65279213 + MTB_Mm LTR MaLR 2 365 -54 5 876 1269 243 87 97 chr15 38215952 38216016 -65278958 + MTB_Mm LTR MaLR 366 411 -8 5 876 691 242 22 0 chr15 38216033 38216201 -65278773 + MLT1B LTR MaLR 189 440 -27 5 876 2226 157 33 57 chr15 38216731 38217184 -65277790 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 5 876 230 340 10 49 chr15 38218081 38218183 -65276791 - RMER12 LTR ERVK -476 846 749 5 876 260 330 128 27 chr15 38218408 38218595 -65276379 - MLT1F LTR MaLR -180 368 163 5 876 1064 272 63 17 chr15 38236250 38236612 -65258362 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 6 876 236 333 63 97 chr15 38237716 38238063 -65256911 + MLT1H2 LTR MaLR 114 475 -74 6 876 384 254 339 21 chr15 38242164 38242405 -65252569 - MLT1A0 LTR MaLR -48 317 1 6 876 2302 80 19 13 chr15 38242983 38243301 -65251673 + ORR1A2 LTR MaLR 1 320 -7 6 876 2204 173 120 31 chr15 38247294 38247385 -65247589 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 442 6 876 2204 173 120 31 chr15 38247409 38247807 -65247167 - RLTR20C LTR ERVK -93 441 3 6 876 2315 79 27 59 chr15 38249192 38249530 -65245444 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 876 1543 191 153 6 chr15 38252401 38252754 -65242220 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 6 876 524 284 152 0 chr15 38256176 38256373 -65238601 + LTR33C LTR ERVL 128 354 -275 6 876 2562 80 3 3 chr15 38260838 38261165 -65233809 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 876 1085 253 58 99 chr15 38266390 38266587 -65228387 + MTD LTR MaLR 10 210 -209 7 876 1085 244 50 69 chr15 38266802 38267024 -65227950 + MTD LTR MaLR 211 405 -14 7 876 654 262 85 46 chr15 38267488 38267775 -65227199 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 74 7 876 240 299 37 61 chr15 38268385 38268467 -65226507 - MTEa LTR MaLR -281 98 19 7 876 1866 147 5 69 chr15 38269177 38269546 -65225428 + ORR1B2 LTR MaLR 1 318 -28 7 876 2254 240 25 13 chr15 38269573 38270100 -65224874 + RodERV21-int LTR ERV1 1446 1978 -3013 7 876 417 313 116 94 chr15 38270521 38271032 -65223942 + RodERV21-int LTR ERV1 2718 3239 -1752 7 876 2519 335 29 21 chr15 38271487 38272569 -65222405 + RodERV21-int LTR ERV1 3730 4819 -172 7 876 242 252 143 67 chr15 38272580 38272699 -65222275 + RMER4B LTR ERVK 349 476 -109 7 877 344 167 294 0 chr15 38273346 38273448 -65221526 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 243 7 877 361 317 0 84 chr15 38274960 38275091 -65219883 + MTEa LTR MaLR 1 120 -259 7 877 3546 23 0 0 chr15 38276167 38276561 -65218413 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 7 877 277 296 73 18 chr15 38277768 38277878 -65217096 + MLT1A0 LTR MaLR 6 121 -244 7 877 1448 217 96 40 chr15 38280225 38280600 -65214374 + MTD LTR MaLR 1 396 -23 7 877 1217 117 11 0 chr15 38280786 38280966 -65214008 - RLTR17 LTR ERVK -60 632 451 7 877 270 257 41 114 chr15 38281115 38281238 -65213736 + MLT1D LTR MaLR 23 136 -491 7 877 790 214 49 39 chr15 38281639 38281843 -65213131 + MLT1D LTR MaLR 248 453 -52 7 877 2237 176 65 45 chr15 38282089 38282536 -65212438 + RMER19C LTR ERVK 142 597 -14 7 877 550 222 57 164 chr15 38284573 38284938 -65210036 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 18 7 877 550 222 57 164 chr15 38285129 38285146 -65209828 - RLTR15 LTR ERVK -342 17 1 7 877 381 277 140 51 chr15 38287476 38287823 -65207151 - MLT1C LTR MaLR -10 457 78 7 877 721 254 171 2 chr15 38287842 38288117 -65206857 - MTEb LTR MaLR -9 370 27 7 877 2656 126 56 106 chr15 38290683 38291294 -65203680 + RMER6C LTR ERVK 5 584 -106 7 877 240 255 18 125 chr15 38291638 38291750 -65203224 - MT2B LTR ERVL -355 246 147 7 877 299 197 90 26 chr15 38293218 38293296 -65201678 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 427 7 877 622 312 46 19 chr15 38294593 38294854 -65200120 - ORR1E LTR MaLR -91 268 1 7 877 1540 228 80 78 chr15 38295458 38295505 -65199469 - RLTR20B3 LTR ERVK -43 534 485 7 877 1540 228 80 78 chr15 38295553 38296018 -65198956 - RLTR20B3 LTR ERVK -93 484 23 7 877 2555 106 70 3 chr15 38296839 38297208 -65197766 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 877 468 301 186 23 chr15 38297982 38298203 -65196771 + MLT1H LTR MaLR 220 476 -73 7 877 706 304 62 112 chr15 38299247 38299650 -65195324 - MLT1B LTR MaLR -7 383 1 7 877 270 297 22 0 chr15 38306834 38306903 -65188071 + MLT1B LTR MaLR 272 340 -50 7 877 270 297 22 0 chr15 38307078 38307099 -65187875 + MLT1B LTR MaLR 341 363 -27 7 877 471 286 29 6 chr15 38307504 38307623 -65187351 + MTE2b LTR MaLR 63 180 -199 8 877 956 238 21 0 chr15 38307854 38308047 -65186927 + MTE2b LTR MaLR 169 365 -14 8 877 671 250 65 11 chr15 38308794 38308980 -65185994 - ORR1E LTR MaLR -163 196 1 8 877 366 303 82 5 chr15 38311490 38311676 -65183298 - MLT1D LTR MaLR 0 505 271 8 877 467 128 77 3 chr15 38313229 38313318 -65181656 + ORR1C2 LTR MaLR 282 384 0 8 877 269 306 28 0 chr15 38313412 38313484 -65181490 - MLT1D LTR MaLR -431 74 1 8 877 2195 135 52 0 chr15 38317843 38318190 -65176784 - RMER19B LTR ERVK -8 894 530 8 877 258 327 91 40 chr15 38318189 38318364 -65176610 + RMER13A LTR ERVK 583 766 -94 8 877 251 270 10 128 chr15 38323839 38323850 -65171124 + MT2B LTR ERVL 162 251 -350 8 877 988 194 96 73 chr15 38324430 38324798 -65170176 + RLTR20C LTR ERVK 1 458 -93 8 877 854 161 17 95 chr15 38324848 38324948 -65170026 + RLTR20C LTR ERVK 459 551 0 8 877 313 233 78 0 chr15 38329184 38329300 -65165674 + RLTR19-int LTR ERVK 2723 2847 -3290 8 877 1757 186 73 33 chr15 38330837 38331259 -65163715 + RMER10A LTR ERVL 4 442 0 8 877 254 141 0 72 chr15 38332400 38332469 -65162505 + RLTR19-int LTR ERVK 896 959 -5178 8 877 456 263 0 0 chr15 38333871 38333985 -65160989 + MERVK26-int LTR ERVK 6506 6619 -300 8 877 515 270 143 42 chr15 38337604 38337939 -65157035 + MLT1C LTR MaLR 40 422 -45 8 877 270 203 65 39 chr15 38340893 38340970 -65154004 + RLTR25B LTR ERVK 424 502 -526 8 877 862 302 22 36 chr15 38343570 38343848 -65151126 + MTD LTR MaLR 1 274 -145 8 877 393 319 43 7 chr15 38343891 38344030 -65150944 + MTD LTR MaLR 276 419 0 8 877 1333 222 91 35 chr15 38344829 38345226 -65149748 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 877 239 247 10 150 chr15 38345326 38345426 -65149548 + MT2B2 LTR ERVL 151 236 -348 8 877 2554 133 31 0 chr15 38347054 38347436 -65147538 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 8 877 656 269 222 6 chr15 38348947 38349296 -65145678 - MLT1D LTR MaLR -7 498 74 9 877 1505 115 58 14 chr15 38353984 38354275 -65140699 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -913 1413 1110 9 877 751 148 0 8 chr15 38354849 38354972 -65140002 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 812 933 -1393 9 877 2105 196 71 43 chr15 38355208 38355623 -65139351 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1529 797 356 9 877 2105 196 71 43 chr15 38355778 38355869 -65139105 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1971 355 277 9 877 715 179 74 35 chr15 38355868 38356104 -65138870 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2168 158 1 9 877 658 263 16 66 chr15 38357090 38357273 -65137701 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 395 9 877 484 245 107 87 chr15 38357260 38357517 -65137457 - RLTR20D LTR ERVK -314 254 11 9 877 516 264 138 18 chr15 38357684 38357908 -65137066 + LTR33 LTR ERVL 4 254 -261 9 877 2276 188 128 59 chr15 38358132 38358704 -65136270 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 9 877 1884 128 15 61 chr15 38363406 38363748 -65131226 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 43 9 877 607 227 84 176 chr15 38364022 38364380 -65130594 - ETnERV2-int LTR ERVK -985 6421 6097 9 877 1736 94 0 32 chr15 38364388 38364640 -65130334 - RMER16-int LTR ERVK -1230 4176 3933 9 877 2360 112 44 93 chr15 38364640 38365162 -65129812 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 9 877 2280 124 38 14 chr15 38365162 38365531 -65129443 - RMER16-int LTR ERVK -1470 3936 3559 9 877 7916 166 27 45 chr15 38365515 38366926 -65128048 - ETnERV2-int LTR ERVK -3338 4068 2684 9 877 7916 192 16 139 chr15 38367073 38367274 -65127700 - ETnERV2-int LTR ERVK -4723 2683 2611 9 877 7916 192 16 139 chr15 38367313 38367665 -65127309 - ETnERV2-int LTR ERVK -4723 2610 2484 9 877 1961 162 118 86 chr15 38367665 38368097 -65126877 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 9 877 385 325 19 14 chr15 38368588 38368800 -65126174 + MURVY-int LTR ERV1 582 794 -6807 9 877 479 319 73 35 chr15 38369159 38369628 -65125346 + MURVY-int LTR ERV1 1292 1776 -5676 9 877 376 316 73 82 chr15 38369629 38369984 -65124990 + MURVY-int LTR ERV1 2457 2808 -4798 9 877 1135 341 61 25 chr15 38370070 38370663 -65124311 + MuRRS4-int LTR ERV1 2092 2705 -2358 9 877 1609 275 38 59 chr15 38371156 38371614 -65123360 + MuRRS4-int LTR ERV1 3536 3992 -1071 9 877 1609 320 41 35 chr15 38371792 38372112 -65122862 + MuRRS4-int LTR ERV1 3993 4020 -1043 9 877 513 294 39 25 chr15 38372643 38372896 -65122078 + MURVY-int LTR ERV1 7139 7515 -91 9 877 1973 206 65 32 chr15 38372996 38373428 -65121546 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 9 877 6086 127 36 55 chr15 38373428 38374575 -65120399 - ETnERV2-int LTR ERVK -5225 2181 1057 9 877 385 253 89 89 chr15 38374670 38374952 -65120022 - ETnERV2-int LTR ERVK -3001 313 32 9 877 2013 97 43 64 chr15 38374978 38375354 -65119620 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 9 877 797 236 70 30 chr15 38376691 38376892 -65118082 - MTEb LTR MaLR -1 378 170 9 877 249 277 165 16 chr15 38379740 38379861 -65115113 + MLT1B LTR MaLR 233 371 -19 9 877 537 258 237 9 chr15 38379877 38380200 -65114774 - MTD LTR MaLR -20 399 5 9 877 351 274 47 0 chr15 38380255 38380361 -65114613 - MLT1D LTR MaLR -1 504 394 9 877 286 312 58 87 chr15 38380387 38380594 -65114380 - MLT1D LTR MaLR -270 235 35 9 877 380 308 72 62 chr15 38384904 38385112 -65109862 + MLT1N2 LTR MaLR 1 210 -352 9 877 345 245 125 30 chr15 38385741 38385909 -65109065 + MLT1N2 LTR MaLR 171 354 -113 9 877 2532 99 112 23 chr15 38392180 38392616 -65102358 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 877 6328 35 4 12 chr15 38392616 38393368 -65101606 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 1 877 2261 68 0 0 chr15 38393367 38393645 -65101329 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 1 877 4635 70 23 47 chr15 38393645 38394306 -65100668 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 18 1 877 270 120 100 0 chr15 38394289 38394339 -65100635 - IAPEz-int LTR ERVK -1930 57 3 1 877 2502 96 138 7 chr15 38394341 38394761 -65100213 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 877 2721 161 167 8 chr15 38394807 38395334 -65099640 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 877 529 245 111 7 chr15 38395430 38395574 -65099400 + MTE2b LTR MaLR 98 256 -123 1 877 268 254 0 0 chr15 38395552 38395619 -65099355 + MTE2b LTR MaLR 190 256 -123 1 877 549 222 78 0 chr15 38395595 38395748 -65099226 + MTEb LTR MaLR 185 349 -30 1 877 516 305 148 105 chr15 38396511 38396958 -65098016 + MER21B LTR ERV1 335 800 -63 1 878 400 277 82 28 chr15 38404816 38404998 -65089976 - RMER15-int LTR ERVL -669 4330 4139 1 878 437 323 103 8 chr15 38405052 38405286 -65089688 - RMER15-int LTR ERVL -2487 2512 2257 1 878 1641 259 79 43 chr15 38405932 38406461 -65088513 - RMER15-int LTR ERVL -3151 1848 1301 1 878 731 265 124 55 chr15 38406634 38406797 -65088177 - RMER15-int LTR ERVL -3705 1294 1133 1 878 1333 224 108 9 chr15 38406797 38407130 -65087844 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 1 878 731 265 124 55 chr15 38407130 38407313 -65087661 - RMER15-int LTR ERVL -3867 1132 924 1 878 326 254 28 0 chr15 38407563 38407634 -65087340 - RMER15-int LTR ERVL -4237 762 690 1 878 458 311 49 61 chr15 38407634 38407898 -65087076 - RMER15-int LTR ERVL -4529 470 210 1 878 2866 21 0 45 chr15 38408547 38408900 -65086074 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 878 21704 37 32 14 chr15 38408900 38411522 -65083452 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2674 -3807 1 878 9654 23 3 0 chr15 38411497 38412576 -65082398 + IAPEz-int LTR ERVK 5400 6481 0 1 878 2866 21 0 45 chr15 38412576 38412929 -65082045 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 878 694 59 29 10 chr15 38413278 38413380 -65081594 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 372 1 878 1440 185 114 0 chr15 38413662 38413986 -65080988 + ORR1D1 LTR MaLR 14 374 0 1 878 1002 253 139 10 chr15 38425517 38425820 -65069154 + MTD LTR MaLR 22 363 -56 1 878 267 262 99 60 chr15 38453423 38453577 -65041397 + MLT1A0 LTR MaLR 42 193 -215 1 878 4039 83 33 11 chr15 38456034 38456604 -65038370 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 2 1 878 2353 135 23 18 chr15 38456669 38457061 -65037913 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 878 2346 281 49 115 chr15 38457220 38457946 -65037028 - ORR1D2-int LTR MaLR -533 1047 351 1 878 2346 204 29 77 chr15 38458092 38458430 -65036544 - ORR1D2-int LTR MaLR -1202 378 61 1 878 1417 199 97 6 chr15 38458588 38458678 -65036296 - ORR1D2 LTR MaLR -11 359 260 1 878 1417 199 97 6 chr15 38458710 38458948 -65036026 - ORR1D2 LTR MaLR -111 259 2 1 878 2207 97 15 48 chr15 38461599 38461651 -65033323 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 283 1 878 2207 97 15 48 chr15 38461854 38462138 -65032836 - ORR1A2 LTR MaLR -45 282 1 1 878 835 287 28 34 chr15 38463714 38464039 -65030935 + RLTR15 LTR ERVK 1 323 -36 1 878 4355 179 157 46 chr15 38476278 38476910 -65018064 + RLTR25A LTR ERVK 1 645 -458 1 878 4355 179 157 46 chr15 38477094 38477446 -65017528 + RLTR25A LTR ERVK 646 1103 0 1 878 3406 40 2 0 chr15 38479621 38480016 -65014958 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 878 558 203 130 39 chr15 38482600 38482754 -65012220 + ORR1B1 LTR MaLR 41 208 -186 1 878 1806 135 25 112 chr15 38483367 38483725 -65011249 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 1 878 257 327 43 80 chr15 38487893 38488056 -65006918 + RMER12 LTR ERVK 737 893 -429 1 878 1203 190 146 27 chr15 38493938 38494251 -65000723 + ORR1D1 LTR MaLR 25 384 0 1 878 308 294 89 35 chr15 38497849 38498018 -64996956 - MLT2B4 LTR ERVL -374 182 5 1 878 2547 150 65 70 chr15 38503975 38504949 -64990025 - RMER17B LTR ERVK 0 958 62 1 878 542 105 26 0 chr15 38506547 38506623 -64988351 - RMER17B LTR ERVK -880 78 1 1 878 314 267 116 31 chr15 38508462 38508609 -64986365 + MLT1A0 LTR MaLR 50 222 -152 1 878 3436 25 8 0 chr15 38511209 38511602 -64983372 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 878 264 335 65 83 chr15 38512571 38512740 -64982234 + RMER12 LTR ERVK 689 854 -468 3 878 1012 168 0 0 chr15 38517364 38517531 -64977443 - RLTR28B LTR ERVL -28 453 287 5 878 248 154 0 37 chr15 38517709 38517763 -64977211 - RLTR28B LTR ERVL -186 295 244 5 878 2840 113 49 16 chr15 38517758 38518207 -64976767 - RLTR28 LTR ERVL -60 464 1 5 878 367 328 57 0 chr15 38518411 38518533 -64976441 + RMER10B LTR ERVL 270 398 0 5 878 388 264 73 52 chr15 38519017 38519153 -64975821 + MER21B LTR ERV1 383 521 -342 5 878 318 328 16 53 chr15 38520047 38520237 -64974737 + LTR73 LTR ERV1 321 503 -69 5 878 1472 178 97 43 chr15 38520265 38520617 -64974357 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 6 878 4659 205 130 29 chr15 38520617 38521861 -64973113 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1 6 878 566 167 54 27 chr15 38521861 38521972 -64973002 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 261 6 878 245 274 13 169 chr15 38522806 38522872 -64972102 - LTR16A LTR ERVL -8 443 387 6 878 245 274 13 169 chr15 38523085 38523136 -64971838 - LTR16A LTR ERVL -65 386 345 6 878 245 274 13 169 chr15 38523271 38523306 -64971668 - LTR16A LTR ERVL -107 344 314 6 878 344 365 69 6 chr15 38523956 38524116 -64970858 - LTR16A LTR ERVL -251 200 31 6 878 428 236 7 93 chr15 38526719 38526859 -64968115 - MT2B LTR ERVL -344 257 130 8 878 662 60 0 0 chr15 38528744 38528828 -64966146 - ORR1A4 LTR MaLR -5 324 241 8 878 2503 140 65 2 chr15 38528827 38529272 -64965702 - ORR1A4-int LTR MaLR -776 1187 715 8 878 983 139 84 74 chr15 38529228 38529430 -64965544 - MT2B LTR ERVL -314 287 84 9 878 785 174 54 0 chr15 38529295 38529462 -64965512 - ORR1A4-int LTR MaLR -1157 806 631 8 878 1941 106 18 85 chr15 38529917 38530258 -64964716 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 4 8 878 286 89 21 62 chr15 38534111 38534159 -64960815 - MTC LTR MaLR -375 46 1 1 109 390 228 22 126 chr15 38534968 38535224 -64959750 + RLTR11B LTR ERVK 160 416 -111 1 879 2559 259 127 50 chr15 38535256 38536143 -64958831 - MTE-int LTR MaLR -26 1554 599 1 879 1218 215 36 131 chr15 38537494 38537694 -64957280 + MTE2a LTR MaLR 1 180 -199 1 879 1218 215 36 131 chr15 38537724 38537882 -64957092 + MTE2a LTR MaLR 181 325 -54 1 879 354 187 38 51 chr15 38538018 38538097 -64956877 + MTE2a LTR MaLR 302 379 0 1 879 2182 67 30 20 chr15 38539941 38540245 -64954729 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 307 -20 1 879 49824 56 15 25 chr15 38540262 38546610 -64948364 + IAPEz-int LTR ERVK 21 6481 0 1 879 2194 87 28 19 chr15 38546610 38546927 -64948047 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 320 -7 1 879 1903 131 71 16 chr15 38548023 38548404 -64946570 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 1 879 302 287 55 39 chr15 38549972 38550099 -64944875 - RMER10B LTR ERVL -23 375 247 1 879 295 187 1 156 chr15 38551634 38551721 -64943253 + ORR1D2 LTR MaLR 305 405 -14 1 879 2432 122 54 32 chr15 38552131 38552596 -64942378 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 879 1629 231 55 33 chr15 38552957 38553414 -64941560 - RLTR11A2 LTR ERVK -43 484 18 1 879 259 260 53 88 chr15 38554368 38554482 -64940492 - MT2B LTR ERVL -323 278 169 1 879 369 279 52 90 chr15 38555099 38555387 -64939587 - RMER17C LTR ERVK -68 342 66 1 879 243 203 131 33 chr15 38556087 38556148 -64938826 - MT2B LTR ERVL -362 239 173 1 879 584 265 107 12 chr15 38556264 38556432 -64938542 + MTE2a LTR MaLR 60 243 -136 1 879 435 209 105 63 chr15 38557021 38557164 -64937810 + MTE2a LTR MaLR 231 379 0 1 879 753 165 4 74 chr15 38558450 38558642 -64936332 - RMER17C-int LTR ERVK -704 2534 2265 1 879 257 281 33 33 chr15 38559213 38559305 -64935669 - RLTR19-int LTR ERVK -2865 3272 3181 1 879 3297 148 60 33 chr15 38559354 38559955 -64935019 - RLTR19-int LTR ERVK -2947 3190 2574 1 879 368 186 36 152 chr15 38560183 38560348 -64934626 - RLTR19-int LTR ERVK -3807 2330 2185 1 879 321 182 39 0 chr15 38560571 38560648 -64934326 - RLTR19-int LTR ERVK -4055 2082 2003 1 879 1300 181 47 77 chr15 38560641 38560981 -64933993 - RLTR19-int LTR ERVK -4821 1316 987 1 879 544 112 0 0 chr15 38561321 38561401 -64933573 - RLTR19-int LTR ERVK -5169 968 889 1 879 1172 196 32 32 chr15 38562067 38562320 -64932654 - RodERV21-int LTR ERV1 -3989 1002 750 1 879 1942 208 89 68 chr15 38562321 38562895 -64932079 - RodERV21-int LTR ERV1 -4349 642 57 1 879 1568 115 128 26 chr15 38563150 38563454 -64931520 - RLTR23 LTR ERV1 -77 353 19 1 879 239 316 103 45 chr15 38565806 38565922 -64929052 - MLT1A0 LTR MaLR -85 280 162 1 879 239 316 103 45 chr15 38566076 38566115 -64928859 - MLT1A0 LTR MaLR -204 161 118 1 879 1507 155 15 76 chr15 38567117 38567445 -64927529 + ORR1B2 LTR MaLR 4 311 -56 1 879 956 247 119 75 chr15 38568717 38569025 -64925949 - RMER13A LTR ERVK -202 658 266 1 879 956 221 93 103 chr15 38569190 38569468 -64925506 - RMER13A LTR ERVK -595 265 1 1 879 1831 127 135 9 chr15 38569807 38570133 -64924841 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 879 371 313 136 32 chr15 38570195 38570273 -64924701 - MER57A-int LTR ERV1 -1024 5163 5070 1 879 1172 279 7 98 chr15 38570273 38570690 -64924284 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 879 371 313 136 32 chr15 38570690 38570862 -64924112 - MER57A-int LTR ERV1 -1118 5069 4887 1 879 799 345 59 24 chr15 38571916 38572338 -64922636 - MER57A-int LTR ERV1 -1340 4847 4411 1 879 306 316 90 31 chr15 38573110 38573332 -64921642 - HERV16-int LTR ERVL -4761 235 1 2 879 1791 160 46 57 chr15 38574531 38574902 -64920072 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 879 308 233 35 22 chr15 38576708 38576835 -64918139 - RLTR13D3 LTR ERVK -42 1072 983 2 879 808 154 7 0 chr15 38579590 38579726 -64915248 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 246 2 879 1481 152 15 8 chr15 38579896 38580162 -64914812 - RLTR14 LTR ERV1 -112 270 3 2 879 1818 149 118 3 chr15 38581254 38581611 -64913363 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 2 879 2233 136 121 33 chr15 38581892 38582372 -64912602 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 3 2 879 979 226 70 22 chr15 38583764 38584035 -64910939 - MTD LTR MaLR -2 417 134 2 879 1816 196 50 25 chr15 38584055 38584533 -64910441 - RLTR11A2 LTR ERVK -17 510 4 2 879 389 184 266 0 chr15 38584540 38584649 -64910325 - MTD LTR MaLR -275 144 7 2 879 477 231 134 0 chr15 38585482 38585616 -64909358 - ORR1B2 LTR MaLR -215 152 1 2 879 1258 236 36 0 chr15 38588286 38588566 -64906408 - MTD LTR MaLR -39 380 91 2 879 2906 139 51 59 chr15 38588768 38589296 -64905678 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 2 879 1335 304 75 19 chr15 38589328 38589851 -64905123 - MTE-int LTR MaLR -1027 553 2 2 879 818 249 98 20 chr15 38589914 38590160 -64904814 + ORR1D2 LTR MaLR 5 269 -101 2 879 516 230 95 38 chr15 38590195 38590353 -64904621 - MTE2b LTR MaLR -44 335 169 2 879 470 204 142 0 chr15 38590806 38590919 -64904055 - MTE2b LTR MaLR -239 140 12 2 879 2904 141 70 15 chr15 38607481 38608013 -64886961 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 3 879 485 275 66 17 chr15 38626623 38626804 -64868170 + MTEb LTR MaLR 188 377 -2 3 879 879 311 156 50 chr15 38629351 38629507 -64865467 - MTEa-int LTR MaLR -936 644 465 3 879 879 311 156 50 chr15 38629654 38630079 -64864895 - MTEa-int LTR MaLR -1116 464 1 3 879 603 224 147 97 chr15 38630079 38630367 -64864607 - MTEa LTR MaLR 0 379 44 3 879 256 300 93 118 chr15 38630317 38630638 -64864336 + ORR1E LTR MaLR 42 354 -5 3 879 1226 220 74 43 chr15 38631466 38631818 -64863156 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 4 3 879 2463 104 65 17 chr15 38632763 38633165 -64861809 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 879 325 238 62 106 chr15 38636056 38636202 -64858772 + RMER10A LTR ERVL 12 150 -292 3 879 2523 134 5 70 chr15 38636202 38636643 -64858331 + RLTR23 LTR ERV1 1 412 -18 3 879 379 268 129 7 chr15 38641186 38641325 -64853649 + MER67C LTR ERV1 69 224 -487 3 879 790 284 91 23 chr15 38642883 38643225 -64851749 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 3 879 281 241 82 24 chr15 38644132 38644217 -64850757 - MMERVK10C-int LTR ERVK -930 6651 6562 3 879 234 267 51 103 chr15 38644519 38644636 -64850338 + MLT1G LTR MaLR 148 258 -333 3 879 1181 219 118 56 chr15 38644654 38645115 -64849859 + RMER4B LTR ERVK 46 574 -11 3 879 516 262 0 68 chr15 38645774 38645950 -64849024 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 479 3 879 7548 146 46 62 chr15 38646732 38648201 -64846773 - ORR1A4-int LTR MaLR -517 1446 1 3 879 1802 132 58 29 chr15 38648205 38648517 -64846457 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 879 682 219 78 13 chr15 38648599 38648688 -64846286 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 481 4 879 1183 195 85 60 chr15 38648862 38649220 -64845754 - RLTR20C LTR ERVK -98 480 3 4 879 2438 200 25 130 chr15 38653091 38653774 -64841200 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 879 494 325 165 41 chr15 38658197 38658652 -64836322 + MLT2B2 LTR ERVL 1 545 -9 4 879 1710 180 139 3 chr15 38659071 38659394 -64835580 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 4 4 879 3326 82 4 52 chr15 38660005 38660504 -64834470 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 879 771 273 82 52 chr15 38663143 38663410 -64831564 + MLT1A0 LTR MaLR 35 309 -56 4 880 1217 304 71 40 chr15 38717219 38717641 -64777333 + MLT1C LTR MaLR 32 466 -1 4 880 2320 151 21 45 chr15 38718999 38719337 -64775637 - MTC LTR MaLR -8 413 76 4 880 2320 151 21 45 chr15 38719548 38719632 -64775342 - MTC LTR MaLR -346 75 1 4 880 342 198 0 165 chr15 38721063 38721166 -64773808 + MT2B LTR ERVL 155 240 -361 4 880 269 255 161 9 chr15 38726168 38726313 -64768661 - LTR40b LTR ERVL -5 457 308 4 880 1949 124 71 143 chr15 38728684 38729037 -64765937 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 53 4 880 1949 124 71 143 chr15 38729186 38729257 -64765717 - ORR1B1 LTR MaLR -342 52 1 4 880 2135 152 64 109 chr15 38732168 38732654 -64762320 + MYSERV6-int LTR ERVK 8496 8959 0 4 880 439 283 60 39 chr15 38732663 38732895 -64762079 + RLTR12B LTR ERVK 10 246 -282 4 880 1447 209 13 32 chr15 38732917 38733297 -64761677 - MYSERV6-int LTR ERVK -875 5675 5303 4 880 226 220 141 35 chr15 38733297 38733382 -64761592 - RMER4A LTR ERVK -27 439 346 4 880 448 280 15 29 chr15 38733387 38733523 -64761451 - RMER4A LTR ERVK -79 387 254 4 880 12816 269 63 46 chr15 38733525 38734048 -64760926 - MYSERV6-int LTR ERVK -1423 5127 4612 4 880 14945 249 36 29 chr15 38734380 38738750 -64756224 - MYSERV6-int LTR ERVK -4344 4615 238 4 880 292 280 37 9 chr15 38739211 38739319 -64755655 - RLTR15 LTR ERVK -68 291 181 4 880 889 129 7 0 chr15 38739565 38739704 -64755270 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 255 4 880 2227 168 87 17 chr15 38739708 38740180 -64754794 + RMER19B LTR ERVK 10 514 -388 4 880 1125 96 30 15 chr15 38740174 38740374 -64754600 - ORR1B1 LTR MaLR -191 203 1 4 880 1315 210 139 93 chr15 38740463 38740968 -64754006 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 4 880 673 189 81 0 chr15 38742674 38742822 -64752152 + ORR1D1 LTR MaLR 1 160 -214 4 880 724 238 0 113 chr15 38743483 38743640 -64751334 + ORR1D1 LTR MaLR 171 314 -60 4 880 724 238 0 113 chr15 38743780 38743835 -64751139 + ORR1D1 LTR MaLR 315 359 -15 4 880 229 299 76 42 chr15 38746879 38747116 -64747858 - LTR88b LTR Gypsy? -580 257 13 5 880 1461 230 86 11 chr15 38750180 38750553 -64744421 - MTD LTR MaLR 0 419 19 5 880 316 276 92 49 chr15 38753152 38753390 -64741584 - MLT1A1 LTR MaLR -74 291 41 5 880 323 200 70 5 chr15 38753469 38753553 -64741421 + MLT1A1 LTR MaLR 276 395 -13 5 880 473 281 143 65 chr15 38753799 38754247 -64740727 - RLTR18 LTR ERVK -5 507 25 5 880 865 324 37 14 chr15 38757378 38757732 -64737242 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 1 5 880 1019 296 37 40 chr15 38761272 38761354 -64733620 - MTEb LTR MaLR 0 379 305 5 880 2551 132 101 36 chr15 38761354 38761849 -64733125 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 5 880 1019 296 37 40 chr15 38761849 38762146 -64732828 - MTEb LTR MaLR -75 304 3 5 880 448 58 29 0 chr15 38767569 38767638 -64727336 + LTRIS3 LTR ERV1 442 512 0 5 880 2936 46 7 7 chr15 38768372 38768785 -64726189 + BGLII LTR ERVK 9 421 0 5 880 2299 156 43 39 chr15 38769422 38769882 -64725092 + RLTR18B LTR ERVK 1 462 -50 5 880 568 256 128 148 chr15 38774357 38774723 -64720251 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 5 880 264 366 129 22 chr15 38777643 38777875 -64717099 - LTR16A1 LTR ERVL -2 454 198 5 880 836 226 116 49 chr15 38778533 38778878 -64716096 - RMER13A LTR ERVK -395 465 98 5 880 229 322 88 11 chr15 38779703 38779794 -64715180 - LTR16A1 LTR ERVL -275 176 79 5 880 254 301 72 16 chr15 38783814 38783939 -64711035 + MLT1J LTR MaLR 333 464 -48 5 880 255 240 122 20 chr15 38784618 38784716 -64710258 - MER34 LTR ERV1 -335 207 100 5 880 236 333 35 26 chr15 38785657 38785771 -64709203 + LTR16C LTR ERVL 257 371 -118 5 880 478 271 113 25 chr15 38787355 38787559 -64707415 + RMER20B LTR ERVK 142 363 -264 5 880 1525 214 109 8 chr15 38793484 38793861 -64701113 - MTD LTR MaLR -4 415 1 5 880 1684 152 53 6 chr15 38794434 38794772 -64700202 + RLTR15 LTR ERVK 6 359 0 5 881 265 391 98 71 chr15 38801892 38802288 -64692686 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 140 546 -376 5 881 997 288 151 82 chr15 38807099 38807810 -64687164 + RMER13A LTR ERVK 1 760 -100 6 881 373 291 73 73 chr15 38808284 38808573 -64686401 - MER57-int LTR ERV1 -2048 5489 5201 6 881 2330 147 46 8 chr15 38812029 38812543 -64682431 + RMER4B LTR ERVK 13 585 0 6 881 261 125 0 0 chr15 38812795 38812835 -64682139 - MTC LTR MaLR 0 421 382 6 881 720 229 65 83 chr15 38812860 38812907 -64682067 - RLTR20B3 LTR ERVK -28 500 459 6 881 1086 232 32 79 chr15 38812964 38813445 -64681529 - RLTR20B3 LTR ERVK -106 471 2 6 881 2317 139 5 13 chr15 38813452 38813837 -64681137 - MTC LTR MaLR -39 382 1 6 881 292 318 82 98 chr15 38813996 38814324 -64680650 - ORR1E LTR MaLR -5 354 32 6 881 2772 158 197 14 chr15 38814399 38814972 -64680002 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 6 881 751 276 165 47 chr15 38815975 38816314 -64678660 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 881 234 319 106 16 chr15 38816541 38816729 -64678245 - LTR33A LTR ERVL -8 512 308 6 881 1446 186 97 3 chr15 38819641 38819960 -64675014 - ORR1D1 LTR MaLR -25 349 1 6 881 1249 271 34 93 chr15 38826060 38826421 -64668553 - MT2A LTR ERVL -2 531 189 6 881 1249 271 34 93 chr15 38826589 38826605 -64668369 - MT2A LTR ERVL -345 188 182 6 881 1249 271 34 93 chr15 38826667 38826813 -64668161 - MT2A LTR ERVL -352 181 38 6 881 375 289 93 8 chr15 38826700 38826829 -64668145 - MTE2b LTR MaLR -220 159 20 6 881 1528 290 93 12 chr15 38827850 38828408 -64666566 + MTE2b-int LTR MaLR 976 1578 -2 6 881 1181 257 99 0 chr15 38828421 38828744 -64666230 + MTE2b LTR MaLR 9 363 -16 6 881 1346 220 21 70 chr15 38830054 38830066 -64664908 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 364 6 881 2058 157 24 58 chr15 38830066 38830446 -64664528 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 881 1346 220 21 70 chr15 38830446 38830819 -64664155 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 4 6 881 2403 113 0 0 chr15 38832738 38833065 -64661909 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 881 1694 143 49 9 chr15 38833992 38834317 -64660657 + ORR1B1 LTR MaLR 12 349 -45 6 881 385 114 0 54 chr15 38834459 38834533 -64660441 + ORR1B1 LTR MaLR 325 394 0 6 881 2349 217 25 62 chr15 38835641 38836275 -64658699 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 6 881 1421 172 47 63 chr15 38842411 38842776 -64652198 + ORR1D1 LTR MaLR 1 359 -15 6 881 342 330 77 16 chr15 38846601 38846795 -64648179 - ERVL-E-int LTR ERVL -1556 4111 3906 6 881 2581 198 154 10 chr15 38870940 38871531 -64623443 - RLTR33 LTR ERVK -2 676 1 7 881 2289 116 0 12 chr15 38876720 38877052 -64617922 - ORR1A4 LTR MaLR -1 328 1 7 881 839 109 0 30 chr15 38879901 38880034 -64614940 + RMER6C LTR ERVK 2 130 -560 7 881 1834 155 72 20 chr15 38886231 38886580 -64608394 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 7 881 2985 114 40 29 chr15 38888905 38889382 -64605592 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 7 881 290 114 0 0 chr15 38892820 38892864 -64602110 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 340 7 881 1457 165 27 8 chr15 38893880 38894137 -64600837 - ORR1C2 LTR MaLR -28 356 95 7 881 1738 143 94 14 chr15 38894146 38894443 -64600531 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 7 881 591 154 19 0 chr15 38894446 38894550 -64600424 - ORR1C2 LTR MaLR -273 111 6 7 881 699 134 53 9 chr15 38894793 38894906 -64600068 - RLTR19 LTR ERVK -20 479 362 7 881 2246 119 26 6 chr15 38894906 38895253 -64599721 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 7 881 2517 128 5 18 chr15 38895253 38895624 -64599350 - RLTR19 LTR ERVK -133 366 1 7 881 3870 163 43 12 chr15 38895919 38896588 -64598386 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 7 881 418 235 155 77 chr15 38896711 38896905 -64598069 - RMER2 LTR ERV1 -51 516 308 7 881 961 200 35 107 chr15 38899146 38899493 -64595481 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 7 881 508 67 25 74 chr15 38899493 38899574 -64595400 - ETnERV2-int LTR ERVK -1 7405 7329 7 881 607 232 131 38 chr15 38899574 38899890 -64595084 - RLTR13B1 LTR ERVK -365 537 153 7 881 8821 186 52 55 chr15 38899890 38900220 -64594754 - MMETn-int LTR ERVK -345 4499 4162 7 881 8821 186 48 74 chr15 38900412 38902967 -64592007 - MMETn-int LTR ERVK -1801 5443 2356 7 881 3859 117 17 65 chr15 38903113 38903243 -64591731 - MMETn-int LTR ERVK -3843 3563 3439 7 881 2847 121 36 50 chr15 38903450 38904131 -64590843 - MMETn-int LTR ERVK -2657 2187 1730 7 881 473 242 125 0 chr15 38904218 38904338 -64590636 - MMETn-int LTR ERVK -5318 2088 1954 7 881 4387 149 32 86 chr15 38904333 38905275 -64589699 - MMETn-int LTR ERVK -3953 891 1 7 881 1024 184 38 107 chr15 38905276 38905622 -64589352 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 7 881 1382 186 4 0 chr15 38905862 38906098 -64588876 - RMER19B LTR ERVK -665 237 1 7 881 1729 145 92 14 chr15 38906456 38906962 -64588012 - RLTR33 LTR ERVK -4 674 73 7 881 1592 112 37 8 chr15 38919148 38919392 -64575582 - ETnERV2-int LTR ERVK -3345 4061 3811 7 881 399 189 0 13 chr15 38919392 38919467 -64575507 - MTC LTR MaLR -343 78 5 8 881 3335 74 7 26 chr15 38919720 38920178 -64574796 - RLTR1D LTR ERV1 0 605 157 8 881 299 305 25 29 chr15 38920751 38920890 -64574084 + ERVL-int LTR ERVL 2803 2966 -2791 8 881 340 349 53 12 chr15 38921172 38921343 -64573631 + ERVL-int LTR ERVL 3019 3196 -2561 8 881 2087 78 152 12 chr15 38921872 38922195 -64572779 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 8 882 441 167 68 68 chr15 38933843 38933946 -64561028 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1220 8 882 356 165 63 127 chr15 38934110 38934207 -64560767 - RMER12 LTR ERVK -261 1061 987 8 882 283 286 77 21 chr15 38934253 38934305 -64560669 - RMER12 LTR ERVK -286 1286 1233 8 882 4378 127 35 51 chr15 38934383 38935211 -64559763 - RMER12 LTR ERVK -150 1254 1 8 882 315 143 175 0 chr15 38936212 38936275 -64558699 + ORR1C2 LTR MaLR 311 384 0 8 882 549 264 48 81 chr15 38940173 38940383 -64554591 + MLT1B LTR MaLR 183 385 -5 8 882 1823 169 71 51 chr15 38941601 38942012 -64552962 + MTD LTR MaLR 1 419 0 8 882 2141 88 65 10 chr15 38945181 38945491 -64549483 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 882 258 310 9 83 chr15 38954410 38954424 -64540550 - MT2B LTR ERVL -348 251 153 8 882 1754 129 12 65 chr15 38963631 38963971 -64531003 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 8 882 7095 199 71 82 chr15 38963971 38966880 -64528094 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 1968 8 882 6192 91 9 62 chr15 38966883 38967935 -64527039 - MMETn-int LTR ERVK -3846 998 2 8 882 1777 129 12 65 chr15 38967936 38968276 -64526698 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 8 882 834 254 115 56 chr15 38968565 38969045 -64525929 - RLTR11A2 LTR ERVK -10 517 10 8 882 2337 176 10 12 chr15 38971205 38971609 -64523365 - MTD LTR MaLR -16 403 1 8 882 258 371 26 32 chr15 38983835 38983991 -64510983 + MLT1N2 LTR MaLR 390 544 -18 9 882 2340 131 22 8 chr15 38984210 38984579 -64510395 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 9 882 2360 175 44 30 chr15 38984637 38985161 -64509813 + ORR1C1-int LTR MaLR 110 640 -869 9 882 2508 118 64 8 chr15 38991291 38991682 -64503292 - MTC LTR MaLR -8 413 1 9 882 273 366 72 67 chr15 38993199 38993407 -64501567 + ORR1E LTR MaLR 3 211 -148 9 882 354 284 38 29 chr15 38995739 38995750 -64499224 + MT2B LTR ERVL 173 278 -323 9 882 2795 69 68 2 chr15 38995968 38996363 -64498611 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 9 882 3001 23 12 0 chr15 38997590 38997932 -64497042 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 9 882 1005 163 93 21 chr15 38999803 38999997 -64494977 + MTC LTR MaLR 9 216 -205 9 882 947 175 124 0 chr15 39000003 39000180 -64494794 + MTC LTR MaLR 223 421 0 1 882 555 315 126 58 chr15 39004128 39004573 -64490401 - LTR84b LTR ERVL -285 476 2 1 882 2322 96 63 14 chr15 39004586 39004936 -64490038 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 882 7378 84 98 71 chr15 39004936 39006208 -64488766 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1313 -5168 1 882 29054 21 9 0 chr15 39006207 39009449 -64485525 + IAPEz-int LTR ERVK 3210 6478 -3 1 882 2322 96 63 14 chr15 39009453 39009803 -64485171 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 882 490 241 48 91 chr15 39011298 39011540 -64483434 - RLTR12B LTR ERVK -212 356 113 1 882 290 229 85 22 chr15 39019779 39019880 -64475094 - MLT1A1 LTR MaLR -236 129 15 3 882 811 268 129 23 chr15 39025216 39025393 -64469581 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 185 4 882 811 277 135 37 chr15 39025463 39025574 -64469400 - ORR1D2 LTR MaLR -186 184 56 4 882 565 238 31 20 chr15 39025623 39025750 -64469224 - ORR1D2 LTR MaLR -259 135 7 4 882 1449 232 116 11 chr15 39025770 39026149 -64468825 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 882 234 303 26 0 chr15 39044241 39044317 -64450657 + LTR33 LTR ERVL 359 436 -79 7 882 352 340 38 18 chr15 39046310 39046465 -64448509 - MLT1D LTR MaLR -138 486 343 8 882 388 329 153 67 chr15 39046496 39046856 -64448118 - MLT1D LTR MaLR -222 402 6 8 882 230 328 102 70 chr15 39047372 39047559 -64447415 - ORR1E LTR MaLR -8 351 159 8 882 306 266 59 69 chr15 39048563 39048664 -64446310 - LTR41B LTR ERVL -137 621 522 8 882 249 289 148 9 chr15 39048918 39049033 -64445941 - LTR41B LTR ERVL -552 216 86 8 882 324 336 94 60 chr15 39049113 39049347 -64445627 - MLT1I LTR MaLR -45 366 125 9 110 2500 73 134 0 chr15 39059168 39059564 -64435410 - RLTR47_MM LTR ERV1 -83 449 1 1 883 359 311 20 11 chr15 39059732 39059929 -64435045 - MuRRS4-int LTR ERV1 -266 4797 4663 1 883 2032 290 55 65 chr15 39060472 39062084 -64432890 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2009 5547 2757 1 883 546 303 46 57 chr15 39062171 39062830 -64432144 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5191 2415 1765 1 883 883 322 81 43 chr15 39062798 39064137 -64430837 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5651 1905 512 1 883 759 132 160 0 chr15 39064636 39064780 -64430194 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 366 1 883 612 183 48 21 chr15 39066995 39067140 -64427834 - RMER3D-int LTR ERVK -1162 1680 1532 1 883 1182 151 0 61 chr15 39067160 39067407 -64427567 - RMER3D-int LTR ERVK -1299 1543 1312 1 883 2730 180 21 32 chr15 39067485 39068052 -64426922 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 1 883 4166 59 40 9 chr15 39073391 39073934 -64421040 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 1 883 834 189 62 31 chr15 39073937 39074161 -64420813 - RLTR1B-int LTR ERV1 -42 5021 4791 1 883 1016 227 62 31 chr15 39074254 39074670 -64420304 - RLTR1B-int LTR ERV1 -486 2813 2669 1 883 8570 78 52 86 chr15 39074657 39076080 -64418894 - RLTR1B-int LTR ERV1 -744 2555 1165 1 883 8570 213 136 16 chr15 39076102 39076940 -64418034 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3361 1702 761 1 883 4337 141 24 15 chr15 39076931 39077681 -64417293 - RMER16-int LTR ERVK -3960 1446 690 1 883 738 159 73 78 chr15 39077667 39077858 -64417116 - RMER16-int LTR ERVK -5075 331 142 1 883 691 83 0 2 chr15 39078205 39078314 -64416660 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3006 293 139 1 883 4166 59 40 9 chr15 39078525 39079068 -64415906 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 1 883 1498 234 122 92 chr15 39079705 39080464 -64414510 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 894 -8 1 883 3338 75 38 21 chr15 39081139 39081613 -64413361 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 1 883 1221 251 115 72 chr15 39082560 39082713 -64412261 + RMER5 LTR ERV1 1 140 -394 1 883 1221 251 115 72 chr15 39082932 39083290 -64411684 + RMER5 LTR ERV1 141 534 0 1 883 412 280 30 60 chr15 39084318 39084451 -64410523 - RLTR31_Mur LTR ERVK -43 510 382 1 883 891 335 20 45 chr15 39084433 39084833 -64410141 - RLTR17 LTR ERVK -178 514 125 1 883 3863 124 111 24 chr15 39086018 39086714 -64408260 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 1 883 545 321 64 89 chr15 39089137 39089573 -64405401 - RLTR11B LTR ERVK -105 423 1 1 883 948 209 106 8 chr15 39092209 39092464 -64402510 - ORR1C1-int LTR MaLR -1229 280 1 1 883 890 165 174 10 chr15 39092464 39092660 -64402314 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 151 1 883 755 246 92 134 chr15 39093464 39093950 -64401024 - RMER4B LTR ERVK 0 611 15 1 883 586 248 44 0 chr15 39096355 39096492 -64398482 - ORR1C1 LTR MaLR -231 143 1 1 883 299 242 28 83 chr15 39098413 39098441 -64396533 + MT2B LTR ERVL 139 160 -441 1 883 4980 136 38 79 chr15 39098529 39098799 -64396175 - RLTR21 LTR ERVK -3 1569 1297 1 883 4980 127 39 55 chr15 39098845 39099832 -64395142 - RLTR21 LTR ERVK -276 1296 1 1 883 1381 216 141 6 chr15 39103359 39103705 -64391269 + MTD LTR MaLR 21 415 -4 1 883 301 343 38 98 chr15 39104961 39105226 -64389748 - MTEa LTR MaLR -116 263 15 1 883 278 294 35 0 chr15 39107650 39107735 -64387239 - MLT1J LTR MaLR -318 194 107 1 883 1986 154 21 121 chr15 39113961 39114205 -64380769 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 172 2 883 1986 154 21 121 chr15 39114228 39114404 -64380570 - ORR1C2 LTR MaLR -213 171 6 2 883 1353 188 136 3 chr15 39117353 39117663 -64377311 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 24 2 883 1701 240 99 24 chr15 39124781 39125247 -64369727 - RLTR11A LTR ERVK -27 501 1 2 883 510 362 81 59 chr15 39141753 39142258 -64352716 - MLT2B3 LTR ERVL -38 516 1 2 883 3051 137 40 43 chr15 39142281 39142836 -64352138 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 2 883 3259 21 39 0 chr15 39154065 39154446 -64340528 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 883 4048 160 97 70 chr15 39156914 39157792 -64337182 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 2 883 479 276 40 27 chr15 39161262 39161411 -64333563 + MTEb LTR MaLR 1 151 -228 2 883 309 383 0 62 chr15 39162670 39162862 -64332112 - RMER4A LTR ERVK -279 187 8 2 883 312 221 7 106 chr15 39165655 39165797 -64329177 - MT2A LTR ERVL 0 533 406 2 883 870 261 150 44 chr15 39165837 39166172 -64328802 - MT2A LTR ERVL -76 457 84 2 883 870 261 150 44 chr15 39166192 39166269 -64328705 - MT2A LTR ERVL -450 83 3 2 883 2132 123 15 6 chr15 39167249 39167583 -64327391 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 883 5742 66 13 19 chr15 39167585 39168361 -64326613 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5709 2 883 3102 20 0 0 chr15 39168352 39168709 -64326265 - IAPEz-int LTR ERVK -2124 4357 4001 2 883 387 89 0 0 chr15 39168707 39168763 -64326211 - IAPEz-int LTR ERVK -3707 2774 2719 2 883 17979 45 38 22 chr15 39168762 39171063 -64323911 - IAPEz-int LTR ERVK -4136 2345 8 2 883 2132 123 15 6 chr15 39171063 39171397 -64323577 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 883 1550 160 12 70 chr15 39185898 39186207 -64308767 + ORR1C1 LTR MaLR 1 292 -92 3 883 300 202 114 45 chr15 39186401 39186489 -64308485 + ORR1C1 LTR MaLR 277 370 -8 3 883 908 307 37 47 chr15 39187142 39187525 -64307449 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 883 337 248 0 8 chr15 39190000 39190028 -64304946 - ORR1B1-int LTR MaLR -862 647 621 3 884 1238 282 105 38 chr15 39190738 39191272 -64303702 - MLT1E LTR MaLR -10 643 74 3 884 595 340 133 12 chr15 39194453 39194783 -64300191 + MLT1E2 LTR MaLR 52 421 -206 3 884 516 266 55 23 chr15 39229236 39229559 -64265415 - ORR1E LTR MaLR 0 379 4 3 884 571 353 82 31 chr15 39234077 39234486 -64260488 - MLT1E2 LTR MaLR -140 540 130 3 884 3029 71 2 21 chr15 39234718 39235147 -64259827 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 884 494 324 123 17 chr15 39242329 39242678 -64252296 - MLT1B LTR MaLR 0 390 5 4 884 336 207 29 125 chr15 39245053 39245172 -64249802 - MTEb LTR MaLR 0 379 259 4 884 2127 118 19 24 chr15 39254472 39255017 -64239957 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 4 884 1013 175 20 20 chr15 39285063 39285261 -64209713 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 132 4 884 697 280 184 35 chr15 39296496 39296811 -64198163 - MTE2b LTR MaLR -8 362 1 4 884 2322 72 112 0 chr15 39314843 39315192 -64179782 - RLTR47_MM LTR ERV1 -84 448 61 4 884 456 302 14 24 chr15 39315381 39315588 -64179386 - MURVY-int LTR ERV1 -109 7343 7139 5 884 1838 292 42 25 chr15 39316240 39317101 -64177873 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1038 4025 3465 5 884 1129 310 97 35 chr15 39317729 39318568 -64176406 - MuRRS4-int LTR ERV1 -4632 2969 2079 5 885 1085 214 180 10 chr15 39331915 39332211 -64162763 - MTC LTR MaLR -69 352 3 5 885 3209 50 0 8 chr15 39332641 39333040 -64161934 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 885 2309 198 31 16 chr15 39336706 39337194 -64157780 - RLTR12B LTR ERVK -22 506 12 5 885 243 331 57 99 chr15 39344837 39344978 -64149996 + MTEa LTR MaLR 22 156 -223 5 885 1396 212 97 7 chr15 39344989 39345297 -64149677 - ORR1C1 LTR MaLR -42 336 1 5 885 776 309 88 11 chr15 39345339 39345624 -64149350 + ORR1D2 LTR MaLR 8 314 -56 5 885 571 152 133 311 chr15 39358241 39358784 -64136190 - RMER6C LTR ERVK -134 556 111 5 885 1876 187 134 24 chr15 39388534 39388989 -64105985 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 6 885 643 281 159 7 chr15 39406221 39406511 -64088463 - MLT1B LTR MaLR -56 334 1 6 885 2755 158 50 0 chr15 39407638 39408138 -64086836 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 1 6 885 1449 196 46 57 chr15 39412278 39412692 -64082282 - ORR1D1 LTR MaLR -12 367 1 6 885 3092 56 13 0 chr15 39420045 39420440 -64074534 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 885 6744 146 67 121 chr15 39432214 39433820 -64061154 + ORR1A4-int LTR MaLR 444 1963 0 6 885 1759 138 52 52 chr15 39433820 39434149 -64060825 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 885 574 293 136 31 chr15 39444618 39444962 -64050012 - MTE2a LTR MaLR -14 407 27 6 886 1514 197 64 22 chr15 39459027 39459386 -64035588 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 886 998 207 89 9 chr15 39464139 39464363 -64030611 - RLTR18-int LTR ERVK -667 4694 4453 7 886 427 224 38 81 chr15 39464654 39464814 -64030160 - RLTR18-int LTR ERVK -996 4365 4213 7 886 585 118 178 0 chr15 39466007 39466142 -64028832 - RLTR42-int LTR ERVK -3395 2127 1969 7 886 537 272 53 42 chr15 39470282 39470472 -64024502 + MLT1C LTR MaLR 1 183 -207 7 886 277 287 53 27 chr15 39473003 39473153 -64021821 - MTEa LTR MaLR -22 357 201 7 886 1860 171 80 14 chr15 39476412 39476774 -64018200 + ORR1B1 LTR MaLR 9 394 0 7 886 875 169 11 55 chr15 39479632 39479814 -64015160 - ORR1A4 LTR MaLR -63 266 93 7 886 870 161 169 36 chr15 39479777 39480002 -64014972 - MT2B LTR ERVL -346 255 1 7 886 3287 48 5 0 chr15 39480375 39480769 -64014205 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 886 513 296 254 23 chr15 39484302 39484648 -64010326 + MER21B LTR ERV1 279 704 -159 7 886 225 336 151 14 chr15 39498892 39499031 -63995943 - MLT1N2 LTR MaLR -291 271 114 7 886 518 279 122 51 chr15 39502154 39502549 -63992425 - MLT1E2 LTR MaLR -161 466 52 4 886 369 304 163 74 chr15 39509688 39510013 -63984961 - MLT1B LTR MaLR -3 387 18 1 886 1174 194 277 10 chr15 39516226 39516518 -63978456 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 2 1 886 1698 193 66 24 chr15 39518358 39518735 -63976239 - RMER10B LTR ERVL 0 398 6 1 886 1692 172 24 173 chr15 39522635 39523086 -63971888 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 886 2001 180 103 12 chr15 39541603 39542087 -63952887 + RLTR12B LTR ERVK 1 528 0 3 886 284 286 142 9 chr15 39543944 39544050 -63950924 - MLT2B4 LTR ERVL -47 520 401 3 886 509 253 36 67 chr15 39544084 39544279 -63950695 - MLT2B4 LTR ERVL -312 244 56 3 886 2190 121 15 6 chr15 39545513 39545847 -63949127 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 3 886 22685 70 30 19 chr15 39545847 39548882 -63946092 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 3 886 6692 57 12 18 chr15 39548868 39549723 -63945251 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6479 -2 3 886 2190 121 15 6 chr15 39549725 39550059 -63944915 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 3 886 2965 201 110 88 chr15 39552866 39553799 -63941175 + RMER17B LTR ERVK 1 954 -4 4 886 488 298 47 55 chr15 39555342 39555728 -63939246 - RLTR17 LTR ERVK -249 443 2 4 886 3508 152 29 13 chr15 39556170 39556790 -63938184 - RMER6A LTR ERVK 0 756 127 5 886 517 237 271 0 chr15 39556788 39556965 -63938009 + MTEb LTR MaLR 149 377 -2 5 886 677 169 14 91 chr15 39557048 39557191 -63937783 - RMER6A LTR ERVK -623 133 2 5 886 632 268 74 37 chr15 39557338 39557528 -63937446 + MLT1B LTR MaLR 194 390 0 5 886 344 237 13 0 chr15 39557692 39557768 -63937206 - MTEb LTR MaLR -4 375 299 5 886 295 177 0 0 chr15 39557919 39557998 -63936976 - ORR1A3-int LTR MaLR -1097 866 788 5 886 431 177 25 12 chr15 39557986 39558066 -63936908 - RLTR25B LTR ERVK -431 597 517 5 886 292 255 182 16 chr15 39558009 39558134 -63936840 - ORR1A3-int LTR MaLR -915 594 465 5 886 932 256 0 122 chr15 39558139 39558384 -63936590 - RLTR25A LTR ERVK -881 222 8 5 886 3087 164 138 49 chr15 39560489 39560914 -63934060 + RMER17A2 LTR ERVK 1 481 -425 6 886 3087 164 138 49 chr15 39560988 39561394 -63933580 + RMER17A2 LTR ERVK 482 906 0 6 886 1906 119 40 109 chr15 39572166 39572514 -63922460 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 3 7 886 287 318 45 27 chr15 39573885 39573995 -63920979 - MLT1L LTR MaLR -297 313 202 7 886 818 326 81 13 chr15 39575724 39576032 -63918942 + MLT2D LTR ERVL 1 329 -85 8 886 370 297 100 42 chr15 39580132 39580322 -63914652 + MLT1A LTR MaLR 158 358 -16 8 886 4418 60 40 28 chr15 39580323 39580903 -63914071 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 8 110 1656 178 109 45 chr15 39583506 39583882 -63911092 - MTD LTR MaLR -8 411 12 9 887 419 333 102 21 chr15 39584035 39584349 -63910625 + ORR1E LTR MaLR 3 336 -38 9 887 407 295 33 80 chr15 39584820 39584971 -63910003 + MLT1D LTR MaLR 245 388 -117 9 887 230 293 26 13 chr15 39584971 39585047 -63909927 + MLT1D LTR MaLR 545 621 -3 9 887 443 332 78 32 chr15 39586938 39587156 -63907818 - MLT1D LTR MaLR 0 505 278 9 887 389 311 99 43 chr15 39591507 39591789 -63903185 - LTR37A LTR ERV1 -59 367 70 1 887 1148 246 71 37 chr15 39592176 39592530 -63902444 + ORR1D2 LTR MaLR 2 367 -3 1 887 298 273 156 123 chr15 39594010 39594158 -63900816 + LTR55 LTR ERV 1 167 -381 1 887 298 273 156 123 chr15 39594360 39594570 -63900404 + LTR55 LTR ERV 168 371 -177 1 887 244 318 44 33 chr15 39601937 39602028 -63892946 - LTR16C LTR ERVL -239 250 159 1 887 3864 188 93 18 chr15 39603710 39604540 -63890434 + RMER13B LTR ERVK 1 892 -16 1 887 315 349 119 21 chr15 39604881 39605074 -63889900 - MLT1D LTR MaLR -9 496 285 1 887 789 226 48 55 chr15 39605055 39605385 -63889589 + ORR1D2 LTR MaLR 23 370 0 1 887 1449 192 97 33 chr15 39606633 39606993 -63887981 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 1 1 887 1026 179 97 10 chr15 39607600 39608002 -63886972 + RMER5 LTR ERV1 69 529 -5 1 887 1488 123 0 33 chr15 39611281 39611524 -63883450 + MTB_Mm LTR MaLR 18 252 -155 1 887 365 296 113 60 chr15 39612051 39612317 -63882657 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 167 1 887 3497 33 0 0 chr15 39623891 39624287 -63870687 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 887 348 211 13 0 chr15 39629119 39629195 -63865779 - MTE2b LTR MaLR 0 379 303 1 887 432 307 116 21 chr15 39636704 39636937 -63858037 + RMER15 LTR ERVL 274 528 -47 1 887 371 287 182 12 chr15 39636989 39637236 -63857738 + MLT2F LTR ERVL 249 537 -126 1 887 1661 162 70 47 chr15 39640299 39640700 -63854274 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 887 1066 251 111 41 chr15 39640859 39641203 -63853771 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 1 887 583 264 52 93 chr15 39643601 39643969 -63851005 + ORR1E LTR MaLR 6 377 -2 1 887 1886 160 63 6 chr15 39657382 39657746 -63837228 + MTC LTR MaLR 23 407 -14 2 887 1452 190 110 9 chr15 39663596 39663931 -63831043 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 1 2 887 468 286 35 6 chr15 39663969 39664138 -63830836 + MLT1B LTR MaLR 85 258 -132 2 887 245 390 24 16 chr15 39664291 39664416 -63830558 + MLT1B LTR MaLR 257 382 -8 2 887 1868 193 56 0 chr15 39665160 39665533 -63829441 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 887 1170 84 81 85 chr15 39666511 39666757 -63828217 + ORR1B2-int LTR MaLR 1161 1405 -104 2 887 1287 174 138 7 chr15 39666792 39667088 -63827886 + ORR1B2 LTR MaLR 1 335 -32 2 887 1978 114 12 51 chr15 39667173 39667507 -63827467 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 2 322 0 2 887 487 262 89 83 chr15 39671255 39671580 -63823394 + MLT1D LTR MaLR 1 327 -178 2 887 234 311 61 1 chr15 39671589 39671681 -63823293 + MLT1D LTR MaLR 412 497 -8 2 887 307 321 68 8 chr15 39676656 39676788 -63818186 + MLT1C LTR MaLR 73 212 -255 2 887 272 241 119 12 chr15 39676864 39676948 -63818026 + MLT1C LTR MaLR 328 420 -47 2 887 1970 136 42 30 chr15 39678567 39678968 -63816006 + MT2B LTR ERVL 1 595 -6 2 887 498 264 160 51 chr15 39682370 39682701 -63812273 + RLTR9A LTR ERVK 2 368 0 2 887 243 231 0 0 chr15 39689538 39689590 -63805384 + MTEa LTR MaLR 3 54 -325 2 887 457 247 126 26 chr15 39690833 39691087 -63803887 + ORR1E LTR MaLR 6 355 -4 2 887 644 226 118 36 chr15 39691135 39691355 -63803619 + MLT1A1 LTR MaLR 169 406 -2 2 887 365 342 28 0 chr15 39696197 39696407 -63798567 + MER67D LTR ERV1 163 358 -156 2 887 1483 228 57 47 chr15 39697531 39698061 -63796913 - RLTR20B3 LTR ERVK -34 543 9 2 887 294 351 22 30 chr15 39706522 39706657 -63788317 + MER77 LTR ERVL 451 584 -23 2 888 1113 216 130 30 chr15 39717200 39717539 -63777435 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 2 888 2823 219 123 30 chr15 39728158 39728889 -63766085 + RLTR40 LTR ERVK 8 806 -11 3 888 1252 223 122 18 chr15 39729951 39730294 -63764680 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 3 888 517 266 88 31 chr15 39731127 39731421 -63763553 + MLT1B LTR MaLR 1 323 -51 3 888 2719 147 79 96 chr15 39733861 39734446 -63760528 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 3 888 315 262 91 37 chr15 39734624 39734775 -63760199 + MLT1C LTR MaLR 243 462 -5 3 888 506 286 23 51 chr15 39741103 39741320 -63753654 + RLTR15 LTR ERVK 14 224 -135 3 888 2358 172 13 13 chr15 39743014 39743408 -63751566 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 888 345 340 112 12 chr15 39745091 39745252 -63749722 + MLT1B LTR MaLR 244 467 0 3 888 353 273 69 133 chr15 39749253 39749426 -63745548 + MTEa LTR MaLR 204 365 -14 3 888 375 359 8 0 chr15 39749472 39749600 -63745374 + MTEa-int LTR MaLR 8 136 -1444 3 888 1837 282 84 40 chr15 39749625 39750837 -63744137 + MTEa-int LTR MaLR 200 1513 -67 3 888 381 298 132 46 chr15 39750863 39751060 -63743914 + ORR1E LTR MaLR 24 237 -122 3 888 1855 91 189 90 chr15 39751491 39751630 -63743344 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 347 3 888 1855 91 189 90 chr15 39751785 39752004 -63742970 - RLTR11B LTR ERVK -107 346 101 3 888 1855 91 189 90 chr15 39752040 39752092 -63742882 - RLTR11B LTR ERVK -353 100 3 3 888 1478 202 35 70 chr15 39752443 39752815 -63742159 + RLTR20C LTR ERVK 6 364 -170 3 888 837 236 172 49 chr15 39759689 39760014 -63734960 + MTE2b LTR MaLR 15 379 0 3 888 754 285 141 21 chr15 39786234 39786473 -63708501 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 98 4 888 1180 254 123 6 chr15 39786473 39786805 -63708169 - MTE2b LTR MaLR -4 375 5 4 888 754 285 141 21 chr15 39786805 39786891 -63708083 - MLT1A0 LTR MaLR -268 97 2 4 888 457 278 139 62 chr15 39787385 39787660 -63707314 + MLT2C2 LTR ERVL 99 445 -19 4 888 299 291 65 29 chr15 39788663 39788704 -63706270 - MLT2D LTR ERVL -20 539 503 4 888 362 291 45 18 chr15 39788776 39788889 -63706085 - MLT2D LTR ERVL -57 502 383 4 888 1217 264 56 0 chr15 39788947 39789235 -63705739 - MLT2D LTR ERVL -108 306 3 4 888 2169 147 15 72 chr15 39792468 39792857 -63702117 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 888 521 184 61 0 chr15 39797528 39797626 -63697348 + ORR1D1 LTR MaLR 169 272 -102 4 888 466 236 27 0 chr15 39798582 39798692 -63696282 + ORR1D1 LTR MaLR 262 374 0 4 888 1630 312 53 20 chr15 39800605 39801191 -63693783 - MLT1D-int LTR MaLR -971 609 5 4 888 396 296 56 123 chr15 39801353 39801880 -63693094 - MLT1D LTR MaLR 0 379 5 4 888 737 220 7 0 chr15 39805052 39805193 -63689781 - ORR1E LTR MaLR -217 142 1 4 888 1071 234 106 10 chr15 39810349 39810511 -63684463 - ORR1D1 LTR MaLR -8 362 169 4 888 1071 209 59 4 chr15 39810629 39810785 -63684189 - ORR1D1 LTR MaLR -204 170 2 4 888 3615 23 8 0 chr15 39813538 39813931 -63681043 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 888 547 271 119 42 chr15 39822212 39822402 -63672572 + ORR1E LTR MaLR 1 204 -170 4 888 1747 146 24 20 chr15 39823089 39823442 -63671532 + RMER13B LTR ERVK 23 427 -481 4 888 5289 152 94 53 chr15 39823442 39824453 -63670521 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 51 4 888 5289 152 94 53 chr15 39824987 39825045 -63669929 - RLTR13D3 LTR ERVK -1064 50 1 4 888 1564 209 112 33 chr15 39825045 39825436 -63669538 + RMER13B LTR ERVK 422 843 -65 4 888 518 265 177 77 chr15 39831875 39832186 -63662788 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 24 4 888 854 229 133 58 chr15 39837418 39837816 -63657158 + RMER10A LTR ERVL 1 428 -14 4 889 673 300 47 29 chr15 39847232 39847507 -63647467 + RMER15 LTR ERVL 296 575 0 4 889 564 290 69 31 chr15 39849593 39849853 -63645121 - MLT1K LTR MaLR -94 501 232 4 889 294 243 121 29 chr15 39850045 39850185 -63644789 - MER57C2 LTR ERV1 -6 428 276 4 889 2288 148 77 33 chr15 39850872 39851299 -63643675 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 4 889 245 250 14 14 chr15 39852230 39852299 -63642675 - MTE2b LTR MaLR -15 364 296 4 889 536 353 114 51 chr15 39858701 39859208 -63635766 - MLT1H LTR MaLR -10 539 1 4 889 312 284 111 12 chr15 39861254 39861425 -63633549 + MLT1D LTR MaLR 27 214 -291 5 889 1826 181 55 11 chr15 39862166 39862530 -63632444 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 5 889 4392 141 100 62 chr15 39862550 39862621 -63632353 - RLTR14-int LTR ERV1 0 5317 5231 5 889 4392 141 100 62 chr15 39863089 39863597 -63631377 - RLTR14-int LTR ERV1 -87 5230 4700 5 889 15422 154 88 41 chr15 39863627 39866841 -63628133 - RLTR14-int LTR ERV1 -618 4699 1352 5 889 6245 161 68 90 chr15 39867139 39868529 -63626445 - RLTR14-int LTR ERV1 -3957 1360 1 5 889 835 162 13 7 chr15 39868533 39868682 -63626292 - RLTR14 LTR ERV1 -4 378 229 5 889 1979 177 45 15 chr15 39872719 39873120 -63621854 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 5 889 973 186 0 0 chr15 39874298 39874481 -63620493 - RLTR11A LTR ERVK -4 524 342 5 889 1492 159 129 6 chr15 39874672 39874983 -63619991 - RLTR11A LTR ERVK -179 349 1 5 889 2374 171 22 53 chr15 39875035 39875541 -63619433 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 490 -94 5 889 357 298 48 90 chr15 39876102 39876268 -63618706 + RLTR14 LTR ERV1 224 382 0 5 889 444 194 26 44 chr15 39878391 39878504 -63616470 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 296 5 889 545 268 225 0 chr15 39878908 39879121 -63615853 - MLT1A1 LTR MaLR -147 261 1 5 889 1756 243 30 32 chr15 39888146 39888652 -63606322 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 5 889 253 206 13 105 chr15 39889842 39889918 -63605056 + MLT1J LTR MaLR 105 173 -339 5 889 517 301 118 55 chr15 39894137 39894535 -63600439 + LTR40c LTR ERVL 40 462 -3 5 889 275 336 96 110 chr15 39894583 39894937 -63600037 - MLT1A LTR MaLR -2 372 24 5 889 371 321 54 91 chr15 39900496 39900794 -63594180 + MER57D LTR ERV1 125 411 0 5 889 760 198 152 30 chr15 39901433 39901631 -63593343 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 147 5 889 369 250 91 35 chr15 39901757 39901989 -63592985 - RLTR15 LTR ERVK -67 292 48 5 889 555 221 32 8 chr15 39902036 39902159 -63592815 - ORR1D2 LTR MaLR -244 126 1 5 889 2833 76 3 18 chr15 39906382 39906769 -63588205 - MTB_Mm LTR MaLR -26 381 1 5 889 434 313 229 61 chr15 39907157 39907508 -63587466 + LTR16A1 LTR ERVL 47 456 0 5 889 2624 92 0 3 chr15 39912569 39912896 -63582078 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 889 364 311 88 40 chr15 39914064 39914318 -63580656 + MTEb LTR MaLR 62 325 -45 5 889 623 345 105 77 chr15 39914950 39915626 -63579348 + LTR84b LTR ERVL 57 751 -10 5 889 963 235 68 46 chr15 39917364 39917579 -63577395 - RMER17C LTR ERVK 0 410 180 5 889 963 266 24 60 chr15 39917746 39918085 -63576889 - RMER17C LTR ERVK -156 254 1 5 889 306 311 65 18 chr15 39925330 39925545 -63569429 - MLT1B LTR MaLR -15 375 3 5 889 607 298 84 104 chr15 39937904 39938249 -63556725 - ORR1E LTR MaLR -16 343 6 5 889 2270 181 143 57 chr15 39940763 39941254 -63553720 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 5 889 614 236 140 0 chr15 39950563 39950720 -63544254 + MTEa LTR MaLR 1 179 -200 6 889 2573 138 32 2 chr15 39960173 39960580 -63534394 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 6 889 897 204 115 46 chr15 39963783 39964087 -63530887 + RMER17C LTR ERVK 14 338 -72 6 889 499 271 113 67 chr15 39964454 39964648 -63530326 + MTD LTR MaLR 1 203 -216 6 889 228 274 42 50 chr15 39964714 39964833 -63530141 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1309 1426 -422 6 889 639 234 117 19 chr15 39964998 39965203 -63529771 + MTD LTR MaLR 195 419 0 6 889 625 255 85 81 chr15 39965843 39966138 -63528836 + ORR1D2 LTR MaLR 17 312 -58 6 889 3516 327 56 38 chr15 39966857 39968760 -63526214 - RodERV21-int LTR ERV1 -105 4886 2949 6 889 470 311 37 0 chr15 39969113 39969277 -63525697 - RodERV21-int LTR ERV1 -1144 3847 3678 6 889 6123 270 43 51 chr15 39969507 39971336 -63523638 - RodERV21-int LTR ERV1 -2450 2541 729 6 889 272 212 0 15 chr15 39972669 39972736 -63522238 + ORR1D2 LTR MaLR 305 370 0 6 889 371 260 29 64 chr15 39974543 39974683 -63520291 - MER92C LTR ERV1 -419 135 1 6 889 273 276 0 93 chr15 39976089 39976197 -63518777 + MTEa LTR MaLR 1 98 -281 6 890 2436 124 40 22 chr15 39977072 39977518 -63517456 + RMER6B LTR ERVK 1 454 -7 6 890 761 322 88 58 chr15 39977916 39978483 -63516491 + MTE-int LTR MaLR 38 621 -959 6 890 657 326 32 58 chr15 39979226 39979568 -63515406 + MTE-int LTR MaLR 741 1073 -507 6 890 334 200 143 11 chr15 39980047 39980138 -63514836 + MTE-int LTR MaLR 1435 1537 -43 6 890 1874 122 142 6 chr15 39981196 39981519 -63513455 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 890 241 336 85 26 chr15 39982015 39982168 -63512806 + MER34A LTR ERV1 392 553 -18 6 890 232 355 72 66 chr15 39990187 39990519 -63504455 - LTR16C LTR ERVL -81 408 75 6 890 532 286 16 69 chr15 39991259 39991299 -63503675 + MLT1A0 LTR MaLR 5 44 -321 6 890 532 286 16 69 chr15 39991485 39991632 -63503342 + MLT1A0 LTR MaLR 45 182 -183 6 890 3135 23 0 112 chr15 39992246 39992685 -63502289 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 890 3695 148 102 5 chr15 39993967 39994597 -63500377 + RLTR17 LTR ERVK 2 692 0 6 890 505 322 56 22 chr15 40015730 40015908 -63479066 + MTEa LTR MaLR 1 184 -195 2 890 1150 263 125 0 chr15 40019207 40019485 -63475489 + MTEa LTR MaLR 1 300 -79 2 890 1150 263 125 0 chr15 40019645 40019693 -63475281 + MTEa LTR MaLR 301 367 -12 2 890 374 272 19 0 chr15 40046467 40046570 -63448404 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 292 4 890 626 356 107 6 chr15 40050410 40050738 -63444236 + MLT1J1 LTR MaLR 54 414 -30 5 890 285 274 97 46 chr15 40054681 40054918 -63440056 + ERVL-E-int LTR ERVL 5347 5595 -72 5 890 260 229 27 41 chr15 40059862 40059935 -63435039 - MTE2a LTR MaLR -19 360 289 6 890 367 336 0 23 chr15 40067944 40068075 -63426899 - MTEb LTR MaLR -4 375 248 7 890 933 150 99 120 chr15 40068158 40068460 -63426514 + ORR1B1 LTR MaLR 1 321 -8 7 890 341 292 103 55 chr15 40068451 40068596 -63426378 - MTEb LTR MaLR -207 152 1 7 890 1470 234 81 0 chr15 40069658 40070004 -63424970 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 890 401 73 18 0 chr15 40070332 40070387 -63424587 - ORR1D1 LTR MaLR -318 56 1 7 890 2648 171 45 2 chr15 40072781 40073249 -63421725 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 205 8 890 2276 159 21 90 chr15 40073321 40073798 -63421176 + RLTR41 LTR ERV1 1 444 -2 8 890 3442 25 5 0 chr15 40086066 40086460 -63408514 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 890 1274 234 138 6 chr15 40092166 40092506 -63402468 + MTD LTR MaLR 20 404 -15 1 890 3164 41 20 8 chr15 40093147 40093538 -63401436 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 890 8017 69 3 68 chr15 40093538 40094712 -63400262 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 890 3297 46 5 0 chr15 40094712 40095106 -63399868 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 111 252 411 53 12 chr15 40107931 40108101 -63386873 + MLT1I LTR MaLR 223 399 -12 1 891 277 350 78 44 chr15 40109294 40109500 -63385474 - MLT1I LTR MaLR 0 411 199 1 891 2994 50 1 2 chr15 40114187 40114572 -63380402 + MTA_Mm LTR MaLR 1 365 -31 1 891 1058 285 42 27 chr15 40132094 40132526 -63362448 - RLTR16 LTR ERVK -12 493 3 1 891 248 216 0 0 chr15 40132526 40132577 -63362397 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 276 1 891 2096 91 0 69 chr15 40139321 40139641 -63355333 - ORR1A2 LTR MaLR -29 298 1 1 891 1889 148 30 57 chr15 40142050 40142386 -63352588 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 1 891 345 255 184 6 chr15 40145237 40145395 -63349579 - MLT1C LTR MaLR -281 186 1 1 891 1495 171 69 113 chr15 40147025 40147387 -63347587 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 891 756 297 41 25 chr15 40157643 40157885 -63337089 - MTE2a LTR MaLR -125 254 9 1 891 474 337 25 25 chr15 40160392 40160590 -63334384 + MLT1B LTR MaLR 193 390 0 1 891 443 289 120 99 chr15 40166052 40166394 -63328580 + ORR1E LTR MaLR 6 354 -5 2 891 464 326 73 92 chr15 40168534 40168956 -63326018 + MLT2D LTR ERVL 1 414 0 2 891 971 126 18 93 chr15 40170626 40170838 -63324136 - ORR1A4 LTR MaLR -160 234 4 2 891 786 166 39 19 chr15 40175588 40175742 -63319232 - MTC LTR MaLR -27 394 238 2 891 486 332 96 74 chr15 40192079 40192456 -63302518 + LTR16A1 LTR ERVL 58 442 -14 2 891 1536 204 14 137 chr15 40215236 40215661 -63279313 - RMER20B LTR ERVK -202 425 53 2 891 1557 156 64 58 chr15 40215705 40216017 -63278957 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 117 2 891 1444 231 40 20 chr15 40216010 40216023 -63278951 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 92 104 -480 2 891 1444 230 177 25 chr15 40216084 40216472 -63278502 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 105 561 0 2 891 427 383 29 38 chr15 40217519 40217758 -63277216 + MLT1H LTR MaLR 52 288 -261 2 891 1647 165 41 86 chr15 40221580 40221998 -63272976 - RMER17B LTR ERVK -559 399 1 2 891 340 305 109 0 chr15 40233542 40233670 -63261304 - MLT1F LTR MaLR 0 548 407 2 891 238 298 114 128 chr15 40233690 40233776 -63261198 - MLT1F LTR MaLR -268 280 213 2 891 238 298 114 128 chr15 40233828 40234022 -63260952 - MLT1F LTR MaLR -336 212 4 2 892 1936 228 98 31 chr15 40241433 40241800 -63253174 + RMER15 LTR ERVL 27 419 -156 2 892 3030 63 15 10 chr15 40241800 40242198 -63252776 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 892 6954 95 29 65 chr15 40242198 40243337 -63251637 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 2 892 3656 74 6 2 chr15 40243339 40243812 -63251162 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 3 892 1936 228 98 31 chr15 40243812 40243921 -63251053 + RMER15 LTR ERVL 420 530 -45 2 892 1936 228 98 31 chr15 40244039 40244069 -63250905 + RMER15 LTR ERVL 531 570 -5 2 892 1897 194 16 49 chr15 40244122 40244567 -63250407 + RMER10A LTR ERVL 1 430 -12 3 892 1120 232 64 34 chr15 40245153 40245420 -63249554 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 88 3 892 615 258 84 132 chr15 40245419 40245746 -63249228 + MTE2a LTR MaLR 87 404 -15 3 892 284 115 97 16 chr15 40246106 40246168 -63248806 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1031 1097 -751 3 892 8363 140 109 55 chr15 40246667 40246914 -63248060 + RLTR22_Mur LTR ERVK 5 194 -1654 3 892 8363 140 109 55 chr15 40246964 40247739 -63247235 + RLTR22_Mur LTR ERVK 195 1058 -790 3 892 8363 140 109 55 chr15 40247889 40248615 -63246359 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1059 1847 -1 3 892 549 303 14 59 chr15 40248617 40248795 -63246179 + RMER15 LTR ERVL 350 523 -52 3 892 2059 145 10 79 chr15 40248795 40249200 -63245774 + ORR1C1 LTR MaLR 1 377 -1 3 892 549 303 14 59 chr15 40249200 40249242 -63245732 + RMER15 LTR ERVL 524 560 -15 3 892 1121 278 51 70 chr15 40255581 40256146 -63238828 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 528 1 3 892 334 259 106 0 chr15 40258999 40259084 -63235890 + MTEa LTR MaLR 7 100 -279 3 892 1128 244 31 11 chr15 40260068 40260329 -63234645 + MTEa LTR MaLR 107 372 -7 3 892 455 346 63 5 chr15 40260347 40260553 -63234421 + MTEa-int LTR MaLR 15 232 -1348 3 892 1654 289 133 4 chr15 40260531 40261034 -63233940 + MTEa-int LTR MaLR 789 1356 -224 3 892 450 324 54 76 chr15 40261399 40261716 -63233258 + MLT1A0 LTR MaLR 49 358 -7 3 892 2541 225 9 47 chr15 40296667 40296736 -63198238 - RMER15 LTR ERVL -25 550 483 3 892 2164 131 3 0 chr15 40296736 40297064 -63197910 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 892 2541 225 9 47 chr15 40297064 40297200 -63197774 - RMER15 LTR ERVL -93 482 349 3 892 2541 225 9 47 chr15 40297222 40297585 -63197389 - RMER15 LTR ERVL -227 348 4 3 892 2166 201 99 40 chr15 40298789 40299365 -63195609 + RMER6C LTR ERVK 81 690 0 3 892 931 321 63 6 chr15 40309905 40310240 -63184734 + MLT1A0 LTR MaLR 7 360 -5 4 892 923 315 45 37 chr15 40326106 40326482 -63168492 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 4 892 1106 150 34 11 chr15 40326626 40326843 -63168131 + ORR1A4 LTR MaLR 116 371 -23 4 892 282 274 149 33 chr15 40334961 40335080 -63159894 - MLT1G3 LTR MaLR -353 226 96 4 892 2464 194 32 61 chr15 40339726 40340315 -63154659 - RMER15 LTR ERVL -2 573 2 4 892 1780 194 111 126 chr15 40342848 40343468 -63151506 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 892 1103 154 10 46 chr15 40346447 40346644 -63148330 + MTC LTR MaLR 224 413 -8 4 892 382 289 53 53 chr15 40350509 40350659 -63144315 - RMER15 LTR ERVL 0 575 426 4 892 1072 271 55 81 chr15 40350662 40351047 -63143927 - MTE2b LTR MaLR -2 377 3 4 892 2075 316 79 47 chr15 40351050 40352403 -63142571 - MTE2b-int LTR MaLR -1 1579 27 4 892 482 286 44 60 chr15 40352525 40352619 -63142355 - MTEa LTR MaLR -117 262 169 4 892 482 286 44 60 chr15 40352652 40352739 -63142235 - MTEa LTR MaLR -211 168 84 4 893 3235 36 10 0 chr15 40373740 40374132 -63120842 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 893 4646 141 63 46 chr15 40380858 40381800 -63113174 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 4 893 1895 138 66 0 chr15 40385404 40385708 -63109266 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 4 893 7255 125 57 21 chr15 40385708 40387121 -63107853 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 427 4 893 568 227 8 8 chr15 40389089 40389209 -63105765 + ORR1E LTR MaLR 251 370 0 4 893 3360 300 65 61 chr15 40389208 40390528 -63104446 + ORR1E-int LTR MaLR 2 1326 -44 4 893 716 332 135 13 chr15 40390557 40390868 -63104106 + ORR1E LTR MaLR 11 359 0 4 893 3095 74 3 0 chr15 40391295 40391687 -63103287 + MTA_Mm LTR MaLR 4 396 0 4 893 1412 192 65 93 chr15 40395070 40395426 -63099548 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 4 893 586 334 159 31 chr15 40400251 40400609 -63094365 + MLT1K LTR MaLR 176 579 -16 5 893 446 340 77 87 chr15 40404142 40404561 -63090413 - MLT1F2 LTR MaLR -9 560 177 5 893 3673 64 19 2 chr15 40410213 40410680 -63084294 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 893 249 308 156 70 chr15 40420128 40420327 -63074647 + LTR81B LTR ERV1? 255 470 -923 5 893 911 285 140 7 chr15 40425983 40426290 -63068684 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 5 893 1072 222 10 10 chr15 40427910 40428119 -63066855 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 333 5 893 899 297 59 7 chr15 40431558 40431829 -63063145 + MTE-int LTR MaLR 63 347 -1233 5 893 1104 357 100 61 chr15 40432108 40433056 -63061918 + MTE-int LTR MaLR 339 1323 -257 5 893 320 232 83 10 chr15 40434308 40434404 -63060570 + MTE-int LTR MaLR 1337 1439 -141 5 893 1129 221 128 15 chr15 40436070 40436406 -63058568 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 893 1287 340 45 40 chr15 40437191 40437859 -63057115 - MamGyp-int LTR Gypsy -1294 3768 3098 5 893 542 271 43 98 chr15 40438208 40438483 -63056491 - RLTR20D LTR ERVK -210 368 72 5 893 558 337 105 37 chr15 40441608 40442095 -63052879 + LTR55 LTR ERV 10 529 -19 5 893 537 342 37 29 chr15 40443908 40444149 -63050825 + MLT1A0 LTR MaLR 115 357 -8 5 893 953 159 9 23 chr15 40444163 40444495 -63050479 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 893 596 371 42 21 chr15 40444884 40445214 -63049760 + LTR33B LTR ERVL 43 379 -124 5 893 504 331 46 52 chr15 40445219 40445544 -63049430 + MLT1B LTR MaLR 1 323 -67 5 893 3194 48 5 2 chr15 40447585 40447980 -63046994 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 893 331 80 0 0 chr15 40457348 40457398 -63037576 + BGLII_A LTR ERVK 1 50 -395 5 893 273 236 142 80 chr15 40457399 40457611 -63037363 - RMER3D-int LTR ERVK -2617 225 1 5 893 2401 206 88 29 chr15 40457643 40458224 -63036750 - RLTR17 LTR ERVK -77 615 1 5 893 3977 189 72 29 chr15 40458248 40459456 -63035518 + RMER3D-int LTR ERVK 1583 2842 0 5 893 998 184 60 19 chr15 40459456 40459716 -63035258 + RLTR17 LTR ERVK 1 277 -168 5 893 1663 234 22 38 chr15 40459844 40460288 -63034686 + RLTR17 LTR ERVK 166 602 -90 5 893 250 297 62 9 chr15 40465242 40465354 -63029620 - MLT1B-int LTR MaLR -639 748 631 5 893 509 277 25 13 chr15 40466408 40466565 -63028409 - MLT1B LTR MaLR -229 161 3 5 893 610 271 29 70 chr15 40471930 40472101 -63022873 - MTE2b LTR MaLR 0 379 216 6 893 392 342 48 135 chr15 40474004 40474234 -63020740 - MTE2b LTR MaLR -169 210 1 6 893 263 348 41 75 chr15 40480919 40481065 -63013909 - ORR1E LTR MaLR -13 366 226 6 893 343 319 44 7 chr15 40481091 40481227 -63013747 - ORR1E LTR MaLR -218 141 1 6 111 1103 232 132 4 chr15 40500985 40501266 -62993708 - MTEa LTR MaLR -55 324 8 3 894 364 272 0 0 chr15 40515607 40515688 -62979286 - ORR1D1 LTR MaLR -272 102 22 1 894 5232 210 79 43 chr15 40515657 40516996 -62977978 - ORR1D1-int LTR MaLR -22 1770 1 1 894 1054 239 140 3 chr15 40516996 40517324 -62977650 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 2 1 894 3098 143 73 23 chr15 40517852 40518469 -62976505 + RMER6A LTR ERVK 109 756 0 1 894 458 293 74 48 chr15 40526856 40527193 -62967781 + RLTR15 LTR ERVK 1 346 -13 2 894 3154 48 5 8 chr15 40548161 40548558 -62946416 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 894 343 346 98 40 chr15 40550409 40550734 -62944240 + MER90 LTR ERV1 3 346 -229 5 894 575 218 70 64 chr15 40551629 40551721 -62943253 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 494 5 894 575 218 70 64 chr15 40551756 40551820 -62943154 - RLTR20C LTR ERVK -85 493 421 5 894 1249 191 82 59 chr15 40551813 40552119 -62942855 - RLTR20C LTR ERVK -221 313 1 5 894 233 135 0 0 chr15 40553931 40553968 -62941006 + RLTR20C LTR ERVK 78 114 -420 6 894 1196 283 52 8 chr15 40564303 40564688 -62930286 + MTD LTR MaLR 18 419 0 7 894 2222 8 114 0 chr15 40573406 40573668 -62921306 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 9 894 1566 210 93 6 chr15 40616660 40617005 -62877969 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 4 1 894 1087 259 72 55 chr15 40617308 40617615 -62877359 - MTE2b LTR MaLR -10 369 58 1 894 273 268 42 0 chr15 40617623 40617694 -62877280 - MTE2b LTR MaLR -301 78 5 1 894 225 292 0 110 chr15 40628990 40629090 -62865884 - MLT1F2 LTR MaLR -339 221 133 1 895 285 360 75 29 chr15 40634193 40634433 -62860541 - MLT1B LTR MaLR -130 260 10 1 895 266 366 59 7 chr15 40638664 40638799 -62856175 - MLT1J LTR MaLR -368 144 3 1 895 1026 263 88 10 chr15 40662682 40662978 -62831996 + MTE2b LTR MaLR 58 376 -3 2 895 837 263 74 57 chr15 40665541 40665908 -62829066 - MTE2a LTR MaLR -2 377 5 2 895 669 302 30 59 chr15 40674758 40675029 -62819945 - MLT1B LTR MaLR -32 358 96 2 895 550 348 57 85 chr15 40675032 40675384 -62819590 + ORR1E LTR MaLR 12 353 -6 2 895 228 284 147 0 chr15 40676183 40676278 -62818696 - MLT1B LTR MaLR -6 368 260 2 895 2054 137 6 35 chr15 40676652 40677000 -62817974 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 2 895 277 285 136 15 chr15 40677002 40677134 -62817840 - MLT1B LTR MaLR -207 183 36 2 895 424 337 110 70 chr15 40678077 40678523 -62816451 - MLT1C LTR MaLR 0 467 4 2 895 1083 297 36 61 chr15 40689832 40690191 -62804783 - ORR1E LTR MaLR -5 354 5 2 895 1806 333 51 35 chr15 40690170 40690366 -62804608 - ORR1E-int LTR MaLR -28 1552 1354 2 895 1806 333 51 35 chr15 40690485 40691030 -62803944 - ORR1E-int LTR MaLR -232 1348 791 2 895 1530 216 48 36 chr15 40691083 40691476 -62803498 - RLTR11A2 LTR ERVK -129 398 1 2 895 465 355 36 41 chr15 40704740 40705043 -62789931 - MLT2C1 LTR ERVL -12 385 86 2 895 592 315 167 28 chr15 40723490 40723879 -62771095 - MLT1F2 LTR MaLR -117 443 1 2 895 257 290 54 30 chr15 40740427 40740594 -62754380 - RMER17D LTR ERVK -337 552 382 2 895 263 250 17 0 chr15 40747562 40747622 -62747352 + MTEa LTR MaLR 3 63 -316 3 895 502 307 111 128 chr15 40747627 40747971 -62747003 + MTEa LTR MaLR 40 377 -2 3 896 313 246 0 15 chr15 40774371 40774437 -62720537 + MTE2b LTR MaLR 1 65 -314 3 896 339 289 112 88 chr15 40782165 40782242 -62712732 - MLT1D LTR MaLR -207 298 218 3 896 339 289 112 88 chr15 40782375 40782582 -62712392 - MLT1D LTR MaLR -288 217 7 3 896 410 212 17 103 chr15 40784067 40784084 -62710890 + MT2B LTR ERVL 150 255 -346 3 896 875 277 101 14 chr15 40795217 40795565 -62699409 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 3 896 761 150 18 30 chr15 40819030 40819195 -62675779 - RMER17B LTR ERVK -497 461 299 4 896 1834 200 101 5 chr15 40830145 40830522 -62664452 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 896 272 345 82 58 chr15 40831297 40831503 -62663471 + MLT1J1 LTR MaLR 233 443 -1 4 896 455 288 192 13 chr15 40834550 40834779 -62660195 + LTR87 LTR ERVL? 275 544 -80 4 896 3226 51 2 5 chr15 40839317 40839714 -62655260 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 896 912 269 76 49 chr15 40852306 40852673 -62642301 + MTE2b LTR MaLR 3 379 0 4 896 270 377 141 32 chr15 40856858 40857135 -62637839 - MLT1I LTR MaLR -69 342 36 4 896 1150 362 86 86 chr15 40882554 40884040 -62610934 - MTE-int LTR MaLR -40 1540 54 4 897 289 351 78 46 chr15 40939417 40939635 -62555339 - MLT1D LTR MaLR -280 225 1 5 897 256 278 45 71 chr15 40946437 40946592 -62548382 + RLTR21 LTR ERVK 1090 1240 -332 5 897 817 213 34 34 chr15 40952600 40952804 -62542170 + MTD LTR MaLR 211 414 -5 5 897 3211 48 2 5 chr15 40956670 40957067 -62537907 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 897 1651 238 124 23 chr15 40959977 40960451 -62534523 + RMER15 LTR ERVL 27 548 -27 5 897 855 164 0 14 chr15 40962484 40962626 -62532348 + RLTR41 LTR ERV1 307 446 0 5 897 922 311 32 91 chr15 40964119 40964491 -62530483 + MTE2b LTR MaLR 1 350 -29 5 897 630 256 182 22 chr15 40969752 40970159 -62524815 + RMER5 LTR ERV1 43 514 -20 5 897 636 282 48 26 chr15 40972380 40972609 -62522365 - MTE2a LTR MaLR 0 379 146 5 897 1660 150 42 68 chr15 40972585 40973036 -62521938 + RMER17C LTR ERVK 16 441 -517 5 897 254 330 67 59 chr15 40974641 40974760 -62520214 - MLT1D LTR MaLR -102 403 284 6 897 3485 33 0 0 chr15 40974870 40975266 -62519708 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 897 799 257 86 31 chr15 40975319 40975576 -62519398 - ORR1E LTR MaLR -4 355 85 6 897 317 282 0 96 chr15 40976146 40976240 -62518734 - ORR1E LTR MaLR -283 87 3 6 897 408 303 35 60 chr15 40982579 40982728 -62512246 + MLT2C1 LTR ERVL 203 342 -55 6 897 408 303 35 60 chr15 40983184 40983226 -62511748 + MLT2C1 LTR ERVL 343 388 -9 6 897 1168 274 29 69 chr15 40987409 40987786 -62507188 - MTE2b LTR MaLR 0 379 18 6 897 1870 177 65 30 chr15 40990198 40990684 -62504290 + RLTR41 LTR ERV1 6 445 -1 6 897 2053 126 38 154 chr15 40995622 40996127 -62498847 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 6 897 2230 179 18 5 chr15 40997145 40997539 -62497435 + MTD LTR MaLR 19 417 -2 6 897 249 320 130 76 chr15 40997925 40998003 -62496971 + LTR50 LTR ERVL 194 285 -510 6 897 249 320 130 76 chr15 40998186 40998330 -62496644 + LTR50 LTR ERVL 286 428 -367 6 897 268 340 64 76 chr15 40998706 40998942 -62496032 + MLT1B LTR MaLR 6 238 -152 6 897 543 140 24 3 chr15 40999721 40999829 -62495145 + ORR1B1 LTR MaLR 1 140 -254 6 897 1047 140 58 0 chr15 40999829 41000000 -62494974 - RMER19B LTR ERVK 0 902 722 6 897 1831 189 86 17 chr15 41000011 41000371 -62494603 - RMER19B LTR ERVK -177 725 341 1 897 1072 222 41 68 chr15 41000412 41000707 -62494267 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 287 -290 2 897 1599 238 64 28 chr15 41000700 41001101 -62493873 - RLTR20D LTR ERVK -134 434 51 3 897 787 138 0 8 chr15 41001207 41001331 -62493643 + ORR1B1 LTR MaLR 272 394 0 5 897 2838 158 17 11 chr15 41002632 41003105 -62491869 - RLTR25A LTR ERVK -627 476 1 8 897 1632 256 56 31 chr15 41003256 41003809 -62491165 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 91 657 -1669 9 897 1956 223 146 30 chr15 41003819 41004532 -62490442 + MYSERV-int LTR ERVK 5753 6548 -2 1 897 2548 211 18 2 chr15 41004535 41005030 -62489944 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 505 -22 1 897 335 319 67 37 chr15 41007724 41007988 -62486986 + RMER15 LTR ERVL 275 572 -3 1 897 1478 319 44 10 chr15 41008965 41009580 -62485394 + RMER15-int LTR ERVL 647 1282 -3717 1 897 738 184 7 7 chr15 41010385 41010521 -62484453 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 392 1 897 6051 114 48 19 chr15 41010521 41011036 -62483938 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 522 -461 1 897 4379 126 25 70 chr15 41011036 41011883 -62483091 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 1 897 6051 114 48 19 chr15 41011883 41012322 -62482652 + RLTR13C1 LTR ERVK 523 983 0 1 897 1808 164 141 0 chr15 41012322 41012670 -62482304 - RLTR11A LTR ERVK -131 397 1 1 897 2565 114 121 18 chr15 41016784 41017221 -62477753 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 897 3353 121 29 27 chr15 41017944 41018506 -62476468 + RLTR25A LTR ERVK 520 1082 -21 2 897 287 346 90 75 chr15 41020156 41020473 -62474501 + MLT1A1 LTR MaLR 2 328 -37 2 897 2283 154 40 135 chr15 41020639 41020653 -62474321 + RLTR28 LTR ERVL 1 14 -510 2 897 2270 143 40 151 chr15 41020653 41021155 -62473819 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 3 897 2283 154 40 135 chr15 41021155 41021719 -62473255 + RLTR28 LTR ERVL 15 524 0 2 897 957 227 90 146 chr15 41022091 41022217 -62472757 - RLTR9E LTR ERVK -31 389 301 3 897 1850 102 29 12 chr15 41022408 41022693 -62472281 - RLTR9E LTR ERVK -120 300 1 3 112 1174 280 55 17 chr15 41025454 41025858 -62469116 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 898 2494 156 86 30 chr15 41026951 41027453 -62467521 + RMER16 LTR ERVK 2 531 -2 4 898 944 244 246 29 chr15 41032286 41032628 -62462346 - MTD LTR MaLR -3 416 1 4 898 313 89 22 0 chr15 41034177 41034222 -62460752 - RMER6D LTR ERVK -585 135 90 5 898 300 111 22 0 chr15 41034258 41034303 -62460671 - RMER6D LTR ERVK -585 135 90 5 898 2177 111 6 33 chr15 41034713 41035049 -62459925 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 898 2429 144 31 0 chr15 41036115 41036496 -62458478 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 5 898 3755 157 66 1 chr15 41037420 41038069 -62456905 + RLTR17 LTR ERVK 1 691 -1 5 898 392 277 125 8 chr15 41038442 41038528 -62456446 - RLTR20A1 LTR ERVK 0 551 461 6 898 392 262 128 62 chr15 41038577 41038698 -62456276 - RLTR20A1 LTR ERVK -91 460 314 6 898 706 275 117 15 chr15 41044072 41044391 -62450583 - RMER20B LTR ERVK -2 514 166 6 898 734 281 38 82 chr15 41048513 41048881 -62446093 - RMER17C LTR ERVK -58 352 1 7 898 1145 171 63 23 chr15 41051725 41051946 -62443028 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 201 7 898 449 335 36 14 chr15 41052132 41052499 -62442475 - RLTR6-int LTR ERV1 -102 7676 7053 7 898 259 261 14 14 chr15 41052995 41053065 -62441909 - MuRRS4-int LTR ERV1 -753 4564 4495 7 898 1096 306 52 23 chr15 41053390 41053872 -62441102 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1040 4023 3528 7 898 343 349 0 0 chr15 41054254 41054406 -62440568 - RLTR6-int LTR ERV1 -3256 4522 4371 7 898 1099 326 43 24 chr15 41054671 41055847 -62439127 - RLTR6-int LTR ERV1 -3675 3881 2593 7 898 309 277 61 18 chr15 41056112 41056226 -62438748 - RLTR6-int LTR ERV1 -6251 1527 1409 7 898 259 132 0 0 chr15 41056197 41056235 -62438739 - RLTR6-int LTR ERV1 -6311 1290 1253 7 898 255 294 95 27 chr15 41057256 41057403 -62437571 + LTRIS_Mus LTR ERV1 382 538 -49 8 898 259 170 0 0 chr15 41057948 41058001 -62436973 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 867 919 -2779 8 898 288 300 0 0 chr15 41058230 41058320 -62436654 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 1296 1385 -6216 8 898 267 184 30 30 chr15 41058565 41058666 -62436308 + MMVL30-int LTR ERV1 960 1060 -2239 8 898 325 123 0 0 chr15 41058757 41058814 -62436160 + MMVL30-int LTR ERV1 1455 1511 -2187 8 898 1154 175 51 19 chr15 41059116 41059391 -62435583 + MMVL30-int LTR ERV1 1516 1783 -1915 8 898 1429 292 108 71 chr15 41059404 41059657 -62435317 + MMVL30-int LTR ERV1 3833 4100 -3506 8 898 2827 47 103 0 chr15 41059657 41060016 -62434958 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 898 2554 239 67 47 chr15 41060016 41061188 -62433786 + MMVL30-int LTR ERV1 2874 3347 -351 8 898 347 221 45 23 chr15 41061705 41061793 -62433181 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 339 8 898 282 280 75 35 chr15 41062714 41062940 -62432034 + RMER17C LTR ERVK 15 249 -161 9 898 492 279 113 47 chr15 41062943 41063218 -62431756 + RMER17C LTR ERVK 84 376 -34 9 898 1144 214 4 85 chr15 41064184 41064444 -62430530 + MER67D LTR ERV1 73 311 -203 9 898 353 236 203 0 chr15 41064539 41064662 -62430312 + MER67D LTR ERV1 333 480 -34 9 898 4059 51 94 0 chr15 41065498 41066010 -62428964 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 9 898 437 276 74 29 chr15 41067921 41068096 -62426878 + RLTR41 LTR ERV1 264 446 0 9 898 2099 219 61 17 chr15 41068887 41069348 -62425626 - RMER15 LTR ERVL -86 489 9 1 898 6029 189 86 34 chr15 41070663 41071916 -62423058 - RMER12B LTR ERVK 0 1404 84 1 898 1888 141 151 17 chr15 41071916 41072321 -62422653 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 1 898 6029 189 86 34 chr15 41072321 41072401 -62422573 - RMER12B LTR ERVK -1321 83 1 1 898 1546 235 100 38 chr15 41072479 41072899 -62422075 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 1 898 3595 207 75 30 chr15 41082757 41083580 -62411394 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 1 898 1077 218 0 14 chr15 41083689 41083898 -62411076 - RMER13A LTR ERVK -560 300 95 1 898 1266 187 302 0 chr15 41085556 41085870 -62409104 - MTC LTR MaLR -11 410 2 1 898 705 214 12 0 chr15 41087226 41087365 -62407609 - MTC LTR MaLR 0 421 234 1 898 2845 173 27 15 chr15 41090507 41091034 -62403940 - RLTR20B3 LTR ERVK -40 537 5 1 898 3050 23 0 0 chr15 41092245 41092591 -62402383 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 898 12306 52 7 2 chr15 41092591 41094219 -62400755 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1636 -156 1 898 289 0 0 0 chr15 41094218 41094251 -62400723 + ORR1A0 LTR MaLR 291 323 -3 1 898 327 216 11 33 chr15 41095482 41095573 -62399401 + LTR37B LTR ERV1 339 427 -41 1 898 1629 181 24 111 chr15 41098088 41098467 -62396507 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 1 898 5963 100 38 91 chr15 41098631 41099641 -62395333 + RMER17B LTR ERVK 3 958 0 1 898 1960 164 16 54 chr15 41100206 41100574 -62394400 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 898 479 332 73 71 chr15 41111535 41111770 -62383204 + MLT1C LTR MaLR 72 307 -160 1 898 6671 67 38 13 chr15 41111770 41112677 -62382297 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 1 898 479 332 73 71 chr15 41112677 41112836 -62382138 + MLT1C LTR MaLR 308 466 -1 1 898 2406 260 30 115 chr15 41114057 41115131 -62379843 - RMER17B LTR ERVK -3 857 4 1 898 416 344 67 49 chr15 41115428 41115743 -62379231 + ORR1E LTR MaLR 1 341 -38 1 898 532 314 59 121 chr15 41117807 41118195 -62376779 - RLTR12B LTR ERVK -146 382 19 1 898 687 187 0 171 chr15 41119192 41119379 -62375595 - ORR1D1 LTR MaLR -219 155 1 1 898 389 289 128 60 chr15 41120522 41120787 -62374187 + RMER5 LTR ERV1 72 354 -180 1 898 294 314 19 29 chr15 41120800 41120905 -62374069 + RMER5 LTR ERV1 400 503 -31 1 898 1393 222 167 9 chr15 41121663 41122004 -62372970 + MTD LTR MaLR 5 399 -20 1 898 2275 139 62 1 chr15 41124250 41124664 -62370310 + RLTR20A1 LTR ERVK 6 484 -94 1 898 1965 184 203 7 chr15 41124684 41124756 -62370218 + RLTR20A1 LTR ERVK 485 578 0 1 898 430 331 77 62 chr15 41126069 41126242 -62368732 + RMER5 LTR ERV1 84 251 -283 1 898 401 289 183 43 chr15 41126242 41126564 -62368410 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 2 1 898 430 331 77 62 chr15 41126564 41126728 -62368246 + RMER5 LTR ERV1 252 426 -108 1 898 322 253 159 50 chr15 41130178 41130335 -62364639 + MTEb LTR MaLR 192 376 -3 1 898 431 250 42 32 chr15 41130557 41130652 -62364322 - ORR1E LTR MaLR -298 96 1 1 898 1129 261 55 69 chr15 41136201 41136580 -62358394 - MTE2b LTR MaLR -5 374 1 1 898 269 314 189 60 chr15 41137234 41137451 -62357523 - MLT1A0 LTR MaLR -61 304 60 1 898 1158 253 49 78 chr15 41137590 41137718 -62357256 - RLTR33 LTR ERVK -27 651 522 1 898 1158 219 24 47 chr15 41137902 41138221 -62356753 - RLTR33 LTR ERVK -157 521 175 1 898 1342 201 101 23 chr15 41141131 41141478 -62353496 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 898 1976 197 85 81 chr15 41146652 41147171 -62347803 - RMER13B LTR ERVK 0 908 388 1 898 2064 173 53 3 chr15 41147613 41147972 -62347002 - RMER13B LTR ERVK -524 384 8 1 898 2229 106 139 57 chr15 41150619 41151059 -62343915 - RLTR45 LTR ERVK -6 476 1 2 898 1758 180 90 0 chr15 41151604 41151948 -62343026 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 4 2 899 362 267 41 136 chr15 41159433 41159676 -62335298 + MLT1D LTR MaLR 1 220 -285 2 899 2787 169 105 50 chr15 41160808 41161387 -62333587 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 2 899 1407 218 71 29 chr15 41161972 41162354 -62332620 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 2 899 3336 161 21 26 chr15 41164894 41165507 -62329467 + RLTR25B LTR ERVK 6 615 -413 2 899 5009 140 18 82 chr15 41171803 41172767 -62322207 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 2 899 812 286 42 82 chr15 41172912 41173306 -62321668 - RLTR26 LTR ERVK -182 460 45 2 899 263 281 221 8 chr15 41173391 41173513 -62321461 + MLT1D LTR MaLR 25 172 -333 2 899 1957 158 84 16 chr15 41178140 41178520 -62316454 + MTC LTR MaLR 16 421 0 2 899 1584 200 117 67 chr15 41178890 41179446 -62315528 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 2 899 382 275 224 32 chr15 41183759 41184067 -62310907 + RLTR9A LTR ERVK 1 367 -1 2 899 3022 20 3 0 chr15 41185187 41185532 -62309442 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 899 1755 209 75 65 chr15 41197181 41197672 -62297302 - RLTR20B3 LTR ERVK -61 516 21 2 899 1406 181 43 204 chr15 41201452 41201897 -62293077 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 2 899 661 262 42 60 chr15 41202206 41202452 -62292522 - LTRIS4 LTR ERV1 0 624 298 2 899 314 301 43 43 chr15 41219878 41220017 -62274957 + MLT1H2 LTR MaLR 338 476 -13 2 899 2043 220 20 78 chr15 41223307 41223404 -62271570 + RLTR18B LTR ERVK 1 93 -419 2 899 2191 111 9 0 chr15 41223404 41223728 -62271246 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 899 2043 220 20 78 chr15 41223728 41224118 -62270856 + RLTR18B LTR ERVK 94 460 -52 2 899 3455 15 10 0 chr15 41225980 41226372 -62268602 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 899 1812 123 86 0 chr15 41227050 41227351 -62267623 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 3 899 1643 124 133 69 chr15 41227864 41228210 -62266764 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 3 899 1961 116 36 0 chr15 41229085 41229388 -62265586 - ORR1A2 LTR MaLR -13 314 1 3 899 320 229 49 0 chr15 41229691 41229752 -62265222 - ORR1E LTR MaLR -264 95 32 3 899 2524 144 13 38 chr15 41233030 41233478 -62261496 - RMER6B LTR ERVK -24 437 1 3 899 966 206 36 14 chr15 41235508 41235730 -62259244 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 148 3 899 633 261 28 28 chr15 41236009 41236190 -62258784 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 1 3 899 330 267 47 44 chr15 41238090 41238132 -62256842 - RMER17D2 LTR ERVK -287 522 480 3 899 330 267 47 44 chr15 41238170 41238401 -62256573 - RMER17D2 LTR ERVK -330 479 248 3 899 2151 122 82 8 chr15 41240912 41241276 -62253698 - RLTR9D LTR ERVK -12 391 1 3 899 3131 61 2 8 chr15 41242577 41242975 -62251999 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 899 953 283 24 60 chr15 41243978 41244313 -62250661 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 107 3 899 447 223 11 0 chr15 41244349 41244443 -62250531 - RLTR23 LTR ERV1 -330 100 6 3 899 258 413 6 6 chr15 41246552 41246708 -62248266 + LTR83 LTR ERVL 54 209 -571 3 899 2544 133 18 31 chr15 41250947 41251436 -62243538 + MMETn-int LTR ERVK 4362 4844 0 3 899 1741 138 9 59 chr15 41251436 41251775 -62243199 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 899 239 264 9 165 chr15 41263702 41263811 -62231163 + MT2B LTR ERVL 154 245 -356 3 899 232 288 0 29 chr15 41268030 41268098 -62226876 - MLT1-int LTR MaLR -942 429 364 3 900 1668 169 57 89 chr15 41296151 41296522 -62198452 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 900 1027 293 108 82 chr15 41316296 41316787 -62178187 - MLT2B2 LTR ERVL -10 505 2 4 900 300 219 26 40 chr15 41319193 41319269 -62175705 + MLT1A0 LTR MaLR 289 363 -2 4 900 263 322 211 25 chr15 41319273 41319477 -62175497 - MLT1F2 LTR MaLR -71 489 248 4 900 2022 137 12 12 chr15 41326258 41326577 -62168397 + ORR1A3 LTR MaLR 8 326 0 4 900 333 258 0 49 chr15 41328994 41329006 -62165968 + MT2B LTR ERVL 168 218 -383 4 900 359 150 122 24 chr15 41329006 41329088 -62165886 + RLTR25B LTR ERVK 420 509 -519 4 900 3109 56 0 12 chr15 41339734 41340135 -62154839 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 900 1952 188 61 5 chr15 41343470 41343866 -62151108 - MTC LTR MaLR -2 419 2 4 900 261 245 49 114 chr15 41356795 41356979 -62137995 - ORR1E LTR MaLR -111 248 77 4 900 440 334 168 46 chr15 41357362 41357722 -62137252 + MLT1J LTR MaLR 1 410 -102 4 900 440 334 168 46 chr15 41357769 41357800 -62137174 + MLT1J LTR MaLR 411 440 -72 4 900 2959 46 62 0 chr15 41374331 41374636 -62120338 + MTA_Mm LTR MaLR 1 309 -87 5 900 2959 46 62 0 chr15 41374681 41374748 -62120226 + MTA_Mm LTR MaLR 310 395 -1 5 900 303 234 120 51 chr15 41375860 41375977 -62118997 + MLT1A1 LTR MaLR 271 395 -13 5 900 628 359 86 21 chr15 41394816 41395189 -62099785 - MLT1C LTR MaLR 0 467 71 5 900 778 125 20 34 chr15 41405556 41405705 -62089269 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 147 -437 5 900 895 246 34 68 chr15 41405706 41405999 -62088975 + RLTR31_Mm LTR ERVK 279 561 0 5 900 1415 236 87 6 chr15 41406734 41407067 -62087907 + ORR1D2 LTR MaLR 4 363 -7 5 900 377 270 57 46 chr15 41407331 41407525 -62087449 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3058 2656 2461 5 900 1917 182 11 106 chr15 41408144 41408224 -62086750 + MTC LTR MaLR 1 78 -343 5 900 1917 182 11 106 chr15 41408369 41408414 -62086560 + MTC LTR MaLR 79 85 -336 5 900 1917 182 11 106 chr15 41408510 41408844 -62086130 + MTC LTR MaLR 86 417 -4 5 901 237 214 202 58 chr15 41419106 41419210 -62075764 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 448 566 -273 5 901 237 312 45 18 chr15 41428406 41428517 -62066457 - ORR1E LTR MaLR -17 342 229 5 901 268 313 30 10 chr15 41428605 41428705 -62066269 - ORR1E LTR MaLR -250 109 8 5 901 793 207 84 25 chr15 41435656 41435902 -62059072 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 78 5 901 1344 251 30 19 chr15 41457795 41458188 -62036786 - RLTR18B LTR ERVK -5 507 135 6 901 1144 233 43 53 chr15 41458160 41458464 -62036510 - RLTR18B LTR ERVK -309 307 7 6 901 1056 262 51 54 chr15 41458920 41459271 -62035703 - ORR1E LTR MaLR 0 359 10 6 901 403 305 126 56 chr15 41470759 41471061 -62023913 + LTR78 LTR ERV1 474 796 -508 6 901 616 306 124 42 chr15 41476071 41476402 -62018572 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 8 6 901 1310 223 152 106 chr15 41487686 41487722 -62007252 - MT2A LTR ERVL -71 462 430 6 901 1367 196 103 4 chr15 41487722 41488003 -62006971 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 6 901 1310 223 152 106 chr15 41488003 41488408 -62006566 - MT2A LTR ERVL -104 429 1 6 901 259 172 149 92 chr15 41489542 41489683 -62005291 - RLTR25B LTR ERVK -137 891 743 6 901 3727 196 59 14 chr15 41489761 41490586 -62004388 - RLTR25B LTR ERVK -166 862 1 6 901 3144 118 70 26 chr15 41490864 41491394 -62003580 + RMER2 LTR ERV1 8 560 -7 6 901 1856 152 72 9 chr15 41492994 41493326 -62001648 + ORR1B1 LTR MaLR 42 394 0 6 901 3629 201 34 67 chr15 41493330 41494247 -62000727 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 887 -1076 6 901 723 157 39 8 chr15 41494281 41494409 -62000565 + ORR1B1 LTR MaLR 255 386 -8 6 901 675 321 19 60 chr15 41497819 41498084 -61996890 + MTE2a LTR MaLR 3 256 -123 6 901 1801 144 8 77 chr15 41499638 41499991 -61994983 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 901 2697 173 56 139 chr15 41502628 41503292 -61991682 - RMER19C LTR ERVK 0 611 3 4 901 1439 266 56 50 chr15 41507949 41508447 -61986527 - RLTR20B3 LTR ERVK -56 521 21 1 901 596 362 81 19 chr15 41508612 41508981 -61985993 - LTR33B LTR ERVL -19 484 93 1 901 703 270 82 39 chr15 41510783 41511014 -61983960 - ORR1E LTR MaLR -4 355 115 2 901 402 338 103 43 chr15 41511703 41511984 -61982990 - MLT1A0 LTR MaLR -18 347 50 2 901 1770 224 27 107 chr15 41512968 41513338 -61981636 - RMER15 LTR ERVL -96 479 157 2 901 1770 224 27 107 chr15 41513406 41513549 -61981425 - RMER15 LTR ERVL -419 156 7 2 901 2337 90 9 12 chr15 41516207 41516533 -61978441 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 3 901 292 300 55 41 chr15 41519406 41519552 -61975422 - MLT1A1 LTR MaLR -4 545 398 3 901 757 337 147 11 chr15 41519601 41520057 -61974917 - MLT-int LTR MaLR -1170 565 48 3 901 359 289 168 8 chr15 41520097 41520248 -61974726 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 231 3 901 1174 271 46 92 chr15 41520371 41520895 -61974079 + RLTR12B LTR ERVK 1 500 -28 3 901 723 223 130 37 chr15 41521373 41521643 -61973331 - RMER20B LTR ERVK -208 419 125 4 901 241 316 87 61 chr15 41531052 41531281 -61963693 - MLT1A LTR MaLR -10 600 366 4 901 395 277 43 136 chr15 41532058 41532158 -61962816 - MLT1A LTR MaLR -120 254 174 4 901 395 277 43 136 chr15 41532194 41532277 -61962697 - MLT1A LTR MaLR -201 173 88 4 901 317 277 87 56 chr15 41532338 41532464 -61962510 - MLT1A-int LTR MaLR -22 1349 1220 4 901 308 280 38 46 chr15 41532836 41532967 -61962007 - MLT-int LTR MaLR -177 1558 1429 5 901 1095 329 37 9 chr15 41533348 41533777 -61961197 - MLT1A-int LTR MaLR -644 727 287 4 901 251 276 176 28 chr15 41533753 41533861 -61961113 - MLT-int LTR MaLR -1560 175 52 5 901 549 311 99 46 chr15 41535008 41535271 -61959703 - MLT2B4 LTR ERVL -180 376 100 5 901 3349 28 8 0 chr15 41545182 41545575 -61949399 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 112 2112 175 49 15 chr15 41549714 41550121 -61944853 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 902 453 341 79 79 chr15 41558004 41558315 -61936659 + MLT1A LTR MaLR 2 317 -57 9 902 453 341 79 79 chr15 41558371 41558425 -61936549 + MLT1A LTR MaLR 318 367 -7 9 902 2001 120 11 105 chr15 41564353 41564674 -61930300 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 59 1 902 2001 120 11 105 chr15 41564821 41564881 -61930093 - ORR1A1 LTR MaLR -288 58 1 1 902 283 358 78 75 chr15 41567691 41567999 -61926975 - LTR85c LTR Gypsy? -250 573 265 1 902 256 132 36 54 chr15 41568219 41568275 -61926699 - MLT2C2 LTR ERVL -11 556 502 1 902 851 283 40 58 chr15 41568366 41568771 -61926203 - MLT2C2 LTR ERVL -17 397 7 1 902 554 326 58 56 chr15 41571291 41571749 -61923225 - MLT1D LTR MaLR -9 496 1 1 902 266 271 7 139 chr15 41574037 41574051 -61920923 + MT2B LTR ERVL 186 299 -302 1 902 2832 177 34 84 chr15 41588654 41589277 -61905697 - RMER13B LTR ERVK -323 585 1 1 902 2064 160 25 27 chr15 41590707 41591073 -61903901 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 1 902 864 216 23 6 chr15 41592531 41592708 -61902266 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 195 1 902 1009 171 51 42 chr15 41592942 41592969 -61902005 - ORR1D1 LTR MaLR -156 218 194 1 902 1009 171 51 42 chr15 41593235 41593421 -61901553 - ORR1D1 LTR MaLR -181 193 3 1 902 3302 41 8 0 chr15 41595348 41595741 -61899233 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 902 235 281 169 0 chr15 41604589 41604678 -61890296 + ORR1E LTR MaLR 256 359 0 1 902 2039 278 66 41 chr15 41606773 41606872 -61888102 - RLTR20B2 LTR ERVK -5 546 459 1 902 2039 204 65 11 chr15 41606936 41607373 -61887601 - RLTR20B2 LTR ERVK -96 464 2 1 902 276 287 20 60 chr15 41608686 41608701 -61886273 - MT2B2 LTR ERVL -322 262 167 1 902 362 355 78 19 chr15 41608811 41609067 -61885907 - MLT1J1 LTR MaLR -166 278 8 1 902 1084 246 119 72 chr15 41609136 41609456 -61885518 - ORR1E LTR MaLR -10 349 15 1 902 313 258 168 34 chr15 41618900 41619140 -61875834 - MLT1A0 LTR MaLR -93 272 1 2 902 302 266 49 158 chr15 41625832 41626015 -61868959 - MER31A LTR ERV1 -268 217 55 2 902 717 325 101 17 chr15 41635085 41635382 -61859592 - MTD LTR MaLR -78 341 20 2 902 1966 168 34 17 chr15 41636051 41636402 -61858572 - ORR1C1 LTR MaLR -19 359 3 2 902 575 331 37 52 chr15 41636906 41637174 -61857800 - MLT1C LTR MaLR -2 465 202 2 902 3204 118 95 6 chr15 41672278 41672352 -61822622 - RLTR20A2 LTR ERVK -3 575 481 2 902 3204 118 95 6 chr15 41672416 41672869 -61822105 - RLTR20A2 LTR ERVK -98 480 2 2 902 1739 163 113 19 chr15 41676355 41676717 -61818257 - RMER10B LTR ERVL -2 396 1 2 903 443 286 163 55 chr15 41710593 41710882 -61784092 - RMER20B LTR ERVK -223 404 85 3 903 3012 59 12 20 chr15 41711453 41711854 -61783120 - MTB LTR MaLR 0 400 3 3 903 338 115 82 0 chr15 41711856 41711917 -61783057 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1033 3 903 1663 123 30 19 chr15 41711977 41712276 -61782698 - MTB-int LTR MaLR -255 1003 643 3 903 373 316 127 14 chr15 41714431 41714652 -61780322 - MLT1C LTR MaLR 0 467 222 3 903 861 226 57 70 chr15 41716904 41717108 -61777866 + RMER17C LTR ERVK 12 210 -200 3 903 861 226 57 70 chr15 41717279 41717374 -61777600 + RMER17C LTR ERVK 211 306 -104 3 903 1448 256 75 73 chr15 41717407 41718038 -61776936 + RMER17C-int LTR ERVK 1 632 -2606 3 903 675 165 15 23 chr15 41718468 41718598 -61776376 + RMER17C-int LTR ERVK 1100 1228 -2010 3 903 1920 134 38 23 chr15 41718604 41718948 -61776026 + RMER17C-int LTR ERVK 2890 3238 0 3 903 585 244 139 42 chr15 41718948 41719297 -61775677 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 3 903 238 318 15 0 chr15 41719715 41719781 -61775193 + MLT1F1 LTR MaLR 68 134 -435 3 903 576 167 20 0 chr15 41720165 41720267 -61774707 - RMER19B LTR ERVK 0 902 799 3 903 3177 130 39 25 chr15 41720819 41721378 -61773596 - RMER17A2 LTR ERVK -335 571 5 3 903 935 195 0 0 chr15 41721768 41721922 -61773052 - RMER19B LTR ERVK -107 795 642 3 903 4680 10 0 12 chr15 41721922 41722421 -61772553 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 903 48382 14 6 0 chr15 41722421 41727747 -61767227 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 3 903 355 191 46 35 chr15 41727747 41727834 -61767140 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 903 322 0 0 0 chr15 41727834 41727872 -61767102 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 903 4680 10 0 12 chr15 41727872 41728371 -61766603 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 903 3216 194 60 40 chr15 41728371 41729004 -61765970 - RMER19B LTR ERVK -256 646 1 3 903 2215 171 59 20 chr15 41729463 41729923 -61765051 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1849 2326 0 3 903 801 261 29 114 chr15 41729929 41730271 -61764703 + RLTR20B3 LTR ERVK 23 335 -242 3 903 1678 209 20 80 chr15 41730414 41730815 -61764159 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 136 3 903 4543 180 120 28 chr15 41732463 41733974 -61761000 - ORR1A4-int LTR MaLR -1 1962 1 3 903 1793 152 38 87 chr15 41733974 41734320 -61760654 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 903 841 174 0 0 chr15 41734975 41735113 -61759861 + MTC LTR MaLR 8 145 -276 3 903 2762 179 94 20 chr15 41735116 41735751 -61759223 - RMER6C LTR ERVK 0 690 9 3 903 792 186 132 20 chr15 41735954 41736151 -61758823 + MTC LTR MaLR 202 420 -1 3 903 274 136 0 0 chr15 41737096 41737140 -61757834 - RLTR9E LTR ERVK -2 391 348 3 903 1485 104 0 39 chr15 41737127 41737357 -61757617 - RLTR9E LTR ERVK -188 221 1 3 903 1235 181 203 73 chr15 41737694 41738034 -61756940 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 903 3462 188 66 30 chr15 41739878 41740573 -61754401 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 3 903 503 200 19 9 chr15 41741018 41741124 -61753850 - RLTR15 LTR ERVK -247 112 6 3 903 1071 252 43 60 chr15 41741612 41741999 -61752975 - RLTR20B2 LTR ERVK -148 412 3 3 903 268 284 29 81 chr15 41743605 41743877 -61751097 + RMER17A LTR ERVK 160 417 -334 3 903 708 335 122 26 chr15 41744657 41745083 -61749891 - MLT1D LTR MaLR -36 469 3 3 903 2077 211 96 7 chr15 41745901 41746359 -61748615 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 3 903 372 277 64 0 chr15 41746418 41746559 -61748415 + MLT2B3 LTR ERVL 2 151 -403 3 903 284 234 140 26 chr15 41746609 41746723 -61748251 + MLT2B3 LTR ERVL 426 552 -2 3 903 1523 171 136 38 chr15 41747256 41747545 -61747429 + RMER6C LTR ERVK 1 335 -355 3 903 1523 171 136 38 chr15 41747600 41747656 -61747318 + RMER6C LTR ERVK 336 380 -310 3 903 1117 164 11 0 chr15 41747657 41747846 -61747128 + RMER6C LTR ERVK 500 690 0 3 903 1760 121 6 102 chr15 41752449 41752791 -61742183 - ORR1A4 LTR MaLR -20 309 1 3 903 4134 84 5 23 chr15 41754487 41755085 -61739889 + RLTR19-int LTR ERVK 1430 2016 -4121 3 903 412 245 0 105 chr15 41756028 41756142 -61738832 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 433 3 903 1578 239 79 19 chr15 41756139 41756624 -61738350 - RLTR20B1 LTR ERVK -42 499 3 3 903 4861 127 48 57 chr15 41765499 41766400 -61728574 - RMER17A2 LTR ERVK -11 895 3 3 903 5738 122 41 46 chr15 41766402 41766822 -61728152 - RMER17A-int LTR ERVK -1 1727 1284 3 903 5354 116 18 33 chr15 41766822 41767643 -61727331 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 3 903 5738 122 41 46 chr15 41767643 41768246 -61726728 - RMER17A-int LTR ERVK -445 1283 709 3 903 781 209 60 16 chr15 41768618 41768803 -61726171 - RMER17A-int LTR ERVK -1533 195 3 3 903 1696 163 33 16 chr15 41768818 41769123 -61725851 - RMER17A2 LTR ERVK -9 897 588 3 903 258 353 212 0 chr15 41776928 41777098 -61717876 + MLT1F1 LTR MaLR 325 530 -39 4 903 1555 136 188 3 chr15 41777163 41777466 -61717508 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 903 3515 69 0 0 chr15 41777490 41777910 -61717064 + BGLII LTR ERVK 2 421 0 4 903 3044 149 17 10 chr15 41791879 41792402 -61702572 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 4 903 1603 210 31 3 chr15 41801108 41801455 -61693519 + ORR1B1-int LTR MaLR 44 485 -1250 4 903 516 283 97 40 chr15 41801803 41802031 -61692943 - MLT1A0 LTR MaLR -18 347 107 4 903 1887 125 112 35 chr15 41803126 41803466 -61691508 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 4 903 1896 114 57 7 chr15 41808391 41808690 -61686284 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 14 4 903 1116 253 35 4 chr15 41808704 41808962 -61686012 + MTD LTR MaLR 154 419 0 4 903 625 320 24 87 chr15 41809194 41809526 -61685448 + RLTR17 LTR ERVK 80 390 -302 4 904 2814 180 28 31 chr15 41816436 41817014 -61677960 - RLTR20B3 LTR ERVK -1 576 1 4 904 917 251 44 16 chr15 41818916 41819194 -61675780 + ORR1D1 LTR MaLR 1 283 -87 4 904 743 201 93 29 chr15 41819182 41819387 -61675587 + ORR1D1 LTR MaLR 167 384 0 4 904 1687 230 71 8 chr15 41822616 41823010 -61671964 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 904 2981 32 0 0 chr15 41824051 41824397 -61670577 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 904 894 325 50 36 chr15 41832737 41833232 -61661742 + MTE-int LTR MaLR 1 502 -1078 4 904 656 319 90 22 chr15 41841281 41841413 -61653561 - MLT2B4 LTR ERVL -163 393 256 5 904 656 319 90 22 chr15 41841518 41841544 -61653430 - MLT2B4 LTR ERVL -301 255 227 5 904 656 319 90 22 chr15 41842104 41842312 -61652662 - MLT2B4 LTR ERVL -330 226 2 5 904 2260 175 87 25 chr15 41842913 41843441 -61651533 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 1 5 904 880 242 205 7 chr15 41860105 41860408 -61634566 + MTE2a LTR MaLR 17 379 0 5 904 1394 205 127 65 chr15 41860469 41860664 -61634310 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 167 5 904 1394 205 127 65 chr15 41860762 41860920 -61634054 - ORR1C2 LTR MaLR -218 166 9 5 904 1917 138 27 12 chr15 41861585 41861915 -61633059 - RLTR13D5 LTR ERVK -5 1109 775 5 904 4753 114 19 27 chr15 41865476 41866216 -61628758 - RLTR13D5 LTR ERVK -289 734 1 5 904 240 258 16 16 chr15 41866244 41866307 -61628667 - MLT1D LTR MaLR -348 157 95 5 904 279 286 103 56 chr15 41866427 41866553 -61628421 - MER21B LTR ERV1 -260 603 472 5 904 232 343 170 7 chr15 41867076 41867217 -61627757 - MER21B LTR ERV1 -687 176 13 5 904 1405 172 212 3 chr15 41870041 41870367 -61624607 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 904 5729 193 40 17 chr15 41870367 41871550 -61623424 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1509 300 5 904 227 331 98 49 chr15 41873637 41873821 -61621153 - MLT1I LTR MaLR -29 382 190 5 904 939 169 24 0 chr15 41876806 41876972 -61618002 + MT2A LTR ERVL 29 198 -335 5 904 308 281 121 35 chr15 41880947 41881120 -61613854 + MLT1L LTR MaLR 421 608 -2 5 904 1051 225 166 30 chr15 41883780 41884147 -61610827 + MTD LTR MaLR 3 419 0 5 904 2519 52 64 9 chr15 41891146 41891474 -61603500 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 904 13559 58 16 2 chr15 41891474 41893241 -61601733 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 5 904 2146 83 102 0 chr15 41893241 41893555 -61601419 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 904 268 376 26 13 chr15 41894484 41894635 -61600339 - MLT1E1 LTR MaLR -8 646 494 5 904 513 281 109 36 chr15 41897107 41897429 -61597545 - LTR52 LTR ERVL -2 419 74 5 904 776 365 58 34 chr15 41898161 41898663 -61596311 - LTR52-int LTR ERVL -62 3494 2981 5 904 2949 69 51 0 chr15 41898990 41899381 -61595593 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 5 904 789 315 25 52 chr15 41899630 41899998 -61594976 - LTR52-int LTR ERVL -3198 358 1 5 904 444 302 22 93 chr15 41904179 41904405 -61590569 - MTEb LTR MaLR -118 261 52 5 904 292 280 168 29 chr15 41904259 41904432 -61590542 - MLT2B3 LTR ERVL -328 226 30 5 904 967 288 109 25 chr15 41906986 41907388 -61587586 - MLT1D LTR MaLR -1 504 69 5 904 1525 144 31 15 chr15 41907433 41907694 -61587280 - ORR1A2 LTR MaLR -62 265 1 5 904 702 229 29 0 chr15 41915160 41915330 -61579644 - RMER5 LTR ERV1 -17 517 343 6 904 597 251 115 28 chr15 41916531 41916830 -61578144 + MTD LTR MaLR 68 415 -4 6 904 628 343 85 19 chr15 41917869 41918282 -61576692 - MLT1C LTR MaLR -9 458 19 6 904 299 318 48 96 chr15 41921986 41922195 -61572779 + MLT1A LTR MaLR 9 207 -167 6 904 567 330 72 85 chr15 41925734 41926052 -61568922 - ORR1E LTR MaLR -40 319 6 6 904 1354 260 122 5 chr15 41928887 41929255 -61565719 - MTD LTR MaLR -8 411 1 6 904 782 315 88 42 chr15 41932238 41932622 -61562352 + MLT1G1 LTR MaLR 170 571 -8 6 904 255 245 99 69 chr15 41934421 41934522 -61560452 - MTEa LTR MaLR -271 108 5 6 904 420 248 5 2 chr15 41937132 41937231 -61557743 - MTC LTR MaLR -295 101 1 6 904 234 276 29 26 chr15 41937240 41937316 -61557658 - LTR48B LTR ERV1 -444 200 110 6 904 296 238 80 59 chr15 41938195 41938372 -61556602 + MER34A LTR ERV1 9 192 -350 6 904 2396 166 31 2 chr15 41940683 41941131 -61553843 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 6 904 1039 313 51 3 chr15 41941737 41942029 -61552945 + MTEa LTR MaLR 74 379 0 6 905 225 320 12 49 chr15 41946423 41946505 -61548469 - LTR16A1 LTR ERVL -331 125 47 6 905 794 258 30 30 chr15 41950307 41950507 -61544467 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 169 6 905 794 258 30 30 chr15 41950614 41950648 -61544326 - ORR1D1 LTR MaLR -206 168 140 6 905 275 196 18 18 chr15 41956560 41956617 -61538357 + RLTR11A LTR ERVK 445 501 -27 6 905 760 299 94 27 chr15 41957802 41958132 -61536842 + MLT1A LTR MaLR 18 369 -5 6 905 308 360 29 7 chr15 41958510 41958650 -61536324 + LTR33C LTR ERVL 3 145 -484 6 905 442 309 129 63 chr15 41958679 41959073 -61535901 + MLT2F LTR ERVL 243 662 -1 6 905 4305 152 12 10 chr15 41966480 41967170 -61527804 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 2 6 905 1357 193 22 11 chr15 41978337 41978614 -61516360 - ORR1B1-int LTR MaLR -1132 377 98 6 905 437 114 43 0 chr15 41980205 41980275 -61514699 - ORR1B1-int LTR MaLR -1403 106 34 6 905 2117 159 11 6 chr15 41980563 41980917 -61514057 + ORR1B2 LTR MaLR 4 359 -8 6 905 231 182 0 113 chr15 41980921 41980983 -61513991 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 55 -1454 6 905 540 285 100 40 chr15 41994811 41995023 -61499951 - MTD LTR MaLR -115 292 92 7 905 455 245 244 16 chr15 41998068 41998354 -61496620 - MTD LTR MaLR -16 403 67 7 905 3724 188 17 6 chr15 42000838 42001491 -61493483 - RLTR17 LTR ERVK -16 676 17 2 905 1597 241 19 3 chr15 42001914 42002280 -61492694 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 6 905 1113 303 54 54 chr15 42002353 42002723 -61492251 - MTEb LTR MaLR 0 379 10 7 905 2380 314 88 24 chr15 42002734 42003666 -61491308 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 587 7 905 871 298 56 28 chr15 42003659 42003980 -61490994 - MTEb-int LTR MaLR -1219 361 32 7 905 1027 291 67 35 chr15 42003997 42004310 -61490664 - MTEb LTR MaLR -2 377 55 7 905 509 287 117 38 chr15 42019285 42019581 -61475393 + MTEb LTR MaLR 65 369 -5 1 905 233 312 74 27 chr15 42021037 42021185 -61473789 + MER34 LTR ERV1 333 487 -55 2 905 1460 114 192 10 chr15 42028162 42028454 -61466520 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 2 905 1002 91 25 25 chr15 42028454 42028612 -61466362 + IAPLTR4_I LTR ERVK 19 176 -1294 2 905 654 115 0 0 chr15 42028611 42028707 -61466267 + IAPEY3-int LTR ERVK 407 502 -7178 2 905 1138 118 30 44 chr15 42028705 42029008 -61465966 + IAPLTR4_I LTR ERVK 563 952 -6629 2 905 1213 214 103 70 chr15 42029127 42029613 -61465361 + ETnERV3-int LTR ERVK 255 668 -5469 3 905 344 231 103 0 chr15 42029613 42029730 -61465244 + ETnERV3-int LTR ERVK 1721 1849 -5557 3 905 6690 101 52 7 chr15 42029833 42031219 -61463755 + ETnERV3-int LTR ERVK 2735 4271 -3135 3 905 410 205 23 4 chr15 42031226 42031345 -61463629 + IAPLTR3-int LTR ERVK 2362 2464 -2380 3 905 763 93 17 8 chr15 42031360 42031479 -61463495 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4530 4649 -2932 3 905 2087 194 10 13 chr15 42031617 42032178 -61462796 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5098 5745 -1076 3 905 582 276 50 60 chr15 42032470 42032751 -61462223 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5466 5743 -799 3 905 5635 182 25 7 chr15 42033073 42034106 -61460868 + IAPLTR3-int LTR ERVK 5750 6801 -20 3 905 1422 131 188 7 chr15 42034106 42034398 -61460576 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 3 905 796 266 58 57 chr15 42040115 42040456 -61454518 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 47 4 905 1608 219 66 72 chr15 42044343 42044873 -61450101 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 4 905 452 273 65 53 chr15 42047361 42047531 -61447443 + MTEb LTR MaLR 154 325 -54 5 905 2063 172 42 0 chr15 42047982 42048360 -61446614 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 905 3099 166 29 93 chr15 42051129 42051815 -61443159 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 5 905 6992 99 8 21 chr15 42064774 42065769 -61429205 + RLTR13C1 LTR ERVK 2 983 0 7 905 1109 248 142 6 chr15 42066536 42066852 -61428122 - MTD LTR MaLR -58 361 3 7 905 360 294 45 7 chr15 42066856 42067010 -61427964 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 1097 7 906 3126 148 119 24 chr15 42088882 42089798 -61405176 + RLTR13D1 LTR ERVK 10 1023 0 1 906 625 251 34 83 chr15 42097374 42097426 -61397548 - MTE2a LTR MaLR -10 369 320 1 906 2514 108 20 23 chr15 42097426 42097823 -61397151 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 906 625 257 39 82 chr15 42097823 42098020 -61396954 - MTE2a LTR MaLR -60 319 125 1 906 2679 174 125 15 chr15 42108071 42108169 -61386805 + RMER6C LTR ERVK 23 118 -572 1 906 2679 174 125 15 chr15 42108450 42108646 -61386328 + RMER6C LTR ERVK 119 330 -360 1 906 2679 174 125 15 chr15 42108689 42108995 -61385979 + RMER6C LTR ERVK 331 688 -2 1 906 349 377 50 18 chr15 42126782 42127001 -61367973 + RMER15 LTR ERVL 347 572 -3 1 906 244 143 89 130 chr15 42129352 42129521 -61365453 + RMER17C LTR ERVK 99 260 -150 1 906 894 327 45 45 chr15 42129672 42130047 -61364927 + MTD LTR MaLR 1 375 -44 1 906 391 185 151 11 chr15 42130706 42130799 -61364175 + MTE2b LTR MaLR 1 106 -273 1 906 855 251 162 30 chr15 42131157 42131453 -61363521 + MTE2b LTR MaLR 45 379 0 1 906 805 227 72 58 chr15 42135832 42136365 -61358609 + RMER17B LTR ERVK 236 824 -84 1 906 588 263 73 63 chr15 42138565 42138787 -61356187 + MTD LTR MaLR 197 389 -30 1 906 260 243 28 14 chr15 42139061 42139132 -61355842 + LTR41 LTR ERVL 21 92 -676 1 906 374 415 67 37 chr15 42141936 42142234 -61352740 + LTR88a LTR Gypsy 242 548 -268 1 906 305 273 42 0 chr15 42157737 42157833 -61337141 + MTEb LTR MaLR 277 379 0 1 906 1616 165 111 40 chr15 42164403 42164756 -61330218 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 906 2629 126 37 19 chr15 42166432 42166862 -61328112 - BGLII_B LTR ERVK -3 438 1 1 906 601 114 26 18 chr15 42169645 42169758 -61325216 + ORR1B1 LTR MaLR 1 138 -256 2 906 632 332 127 74 chr15 42170284 42170889 -61324085 - RLTR26 LTR ERVK -2 640 4 2 906 1623 184 36 168 chr15 42171567 42172062 -61322912 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 2 906 7314 80 24 70 chr15 42174124 42175273 -61319701 + MTA_Mm-int LTR MaLR 3 1098 0 2 906 3083 58 2 10 chr15 42175273 42175672 -61319302 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 906 346 217 83 12 chr15 42175805 42175889 -61319085 + MTEa LTR MaLR 3 92 -287 2 906 259 260 57 58 chr15 42175913 42176016 -61318958 + MTEa LTR MaLR 269 379 0 2 906 1831 148 74 57 chr15 42194770 42195122 -61299852 + ORR1C1 LTR MaLR 21 378 0 2 906 245 210 62 46 chr15 42200235 42200300 -61294674 + ORR1B1-int LTR MaLR 846 911 -598 2 907 250 180 0 39 chr15 42205220 42205272 -61289702 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 535 2 907 293 282 16 29 chr15 42206712 42206811 -61288163 + MLT1A1 LTR MaLR 294 396 -12 2 907 287 378 84 5 chr15 42207075 42207277 -61287697 + MER77 LTR ERVL 389 606 -1 2 907 247 233 0 32 chr15 42212477 42212539 -61282435 + MLT2E LTR ERVL 39 98 -530 2 907 252 340 119 26 chr15 42212671 42212822 -61282152 + MLT2F LTR ERVL 326 490 -173 2 907 463 314 44 22 chr15 42223978 42224115 -61270859 - MTEa LTR MaLR -8 371 224 2 907 448 247 79 35 chr15 42224283 42224446 -61270528 - MTEa LTR MaLR -196 183 1 2 907 3722 153 47 26 chr15 42228024 42228688 -61266286 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 2 907 1605 190 81 18 chr15 42231778 42232174 -61262800 + RLTR19-int LTR ERVK 1429 1849 -4288 2 907 469 228 20 52 chr15 42234799 42234925 -61260049 + RLTR19-int LTR ERVK 1854 1976 -4161 2 907 469 228 20 52 chr15 42234950 42234976 -61259998 + RLTR19-int LTR ERVK 1977 2000 -4137 2 907 2998 71 8 2 chr15 42237902 42238300 -61256674 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 907 597 295 74 102 chr15 42238977 42239381 -61255593 - RMER10A LTR ERVL -38 404 12 2 907 528 282 70 6 chr15 42247306 42247477 -61247497 + MLT1E3 LTR MaLR 331 512 -112 3 907 496 103 13 0 chr15 42249721 42249799 -61245175 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 306 3 907 524 246 0 34 chr15 42249798 42249916 -61245058 - ORR1D1 LTR MaLR -254 120 7 3 907 262 352 30 104 chr15 42255318 42255578 -61239396 - MLT1H LTR MaLR -3 546 262 3 907 521 373 34 34 chr15 42286528 42286764 -61208210 - LTR16A LTR ERVL -213 238 3 3 907 869 321 47 63 chr15 42288325 42288417 -61206557 - ORR1E LTR MaLR 0 359 271 3 907 869 321 47 63 chr15 42288626 42288895 -61206079 - ORR1E LTR MaLR -89 270 4 3 907 1366 238 55 36 chr15 42295723 42296141 -61198833 + RMER5 LTR ERV1 33 458 -76 3 907 243 284 111 8 chr15 42309560 42309677 -61185297 - RLTR25B LTR ERVK -656 372 244 3 907 500 76 12 12 chr15 42309739 42309819 -61185155 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 80 -303 3 907 398 176 14 0 chr15 42309816 42309890 -61185084 + RLTR9A2 LTR ERVK 308 382 -1 3 907 2739 57 0 0 chr15 42324534 42324866 -61170108 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 4 907 1032 295 85 6 chr15 42332203 42332534 -61162440 + ORR1D2 LTR MaLR 14 370 0 4 908 1072 273 32 29 chr15 42341526 42341900 -61153074 - MTEa LTR MaLR 0 379 5 4 908 1466 267 34 8 chr15 42347043 42347398 -61147576 + MTD LTR MaLR 48 411 -8 4 908 1060 305 41 35 chr15 42350383 42350726 -61144248 + ORR1E LTR MaLR 1 345 -14 4 908 1020 328 54 16 chr15 42351188 42351616 -61143358 - LTR16B2 LTR ERVL -5 457 14 4 908 412 322 35 104 chr15 42356998 42357258 -61137716 + MLT1K LTR MaLR 289 530 -65 4 908 227 311 155 70 chr15 42379446 42379588 -61115386 - MT2B LTR ERVL -350 251 98 4 908 1019 243 62 122 chr15 42384520 42384653 -61110321 + MTE2b LTR MaLR 1 116 -263 4 908 1019 243 62 122 chr15 42384698 42384967 -61110007 + MTE2b LTR MaLR 117 379 0 4 908 1201 239 42 17 chr15 42387959 42388248 -61106726 + ORR1D1 LTR MaLR 1 296 -78 5 908 1696 202 28 0 chr15 42388248 42388569 -61106405 - ORR1C1 LTR MaLR -48 330 1 5 908 479 141 43 11 chr15 42388569 42388661 -61106313 + ORR1D1 LTR MaLR 280 374 0 5 908 1027 259 95 18 chr15 42393328 42393666 -61101308 - MTEa LTR MaLR 0 379 16 5 908 1330 234 73 65 chr15 42394127 42394525 -61100449 + MTD LTR MaLR 19 419 0 5 908 1092 302 29 34 chr15 42396917 42397298 -61097676 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 908 1482 173 92 19 chr15 42402012 42402323 -61092651 - RMER6C LTR ERVK 0 690 366 5 908 1482 173 92 19 chr15 42402507 42402554 -61092420 - RMER6C LTR ERVK -325 365 306 5 908 973 209 204 68 chr15 42403265 42403416 -61091558 + ORR1C2 LTR MaLR 1 180 -204 5 908 973 209 204 68 chr15 42403534 42403720 -61091254 + ORR1C2 LTR MaLR 181 384 0 5 908 403 286 78 62 chr15 42410223 42410402 -61084572 - MLT1L LTR MaLR -111 499 318 5 908 1426 160 148 15 chr15 42421334 42421664 -61073310 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 908 330 354 69 0 chr15 42424234 42424364 -61070610 + MTE2a LTR MaLR 218 356 -23 5 908 1719 189 102 0 chr15 42424443 42424786 -61070188 + ORR1C2 LTR MaLR 3 380 -4 5 908 410 317 91 19 chr15 42440093 42440394 -61054580 + MER57C2 LTR ERV1 5 340 -71 5 908 1319 270 12 88 chr15 42444135 42444550 -61050424 - MTE2b LTR MaLR 0 419 29 5 908 519 279 61 37 chr15 42456476 42456640 -61038334 + ORR1E LTR MaLR 1 168 -191 5 908 535 173 24 9 chr15 42456747 42456906 -61038068 + RLTR9E LTR ERVK 1 127 -282 5 908 372 296 28 13 chr15 42456873 42457031 -61037943 + ORR1E LTR MaLR 212 379 0 5 908 1184 207 85 0 chr15 42462859 42463105 -61031869 + RLTR16 LTR ERVK 3 269 -236 6 909 492 229 389 15 chr15 42513441 42513715 -60981259 + ORR1D2 LTR MaLR 1 377 -2 1 909 1172 234 79 122 chr15 42519677 42520144 -60974830 + MLT1D LTR MaLR 59 505 0 2 909 414 302 58 12 chr15 42530031 42530193 -60964781 + MLT1A0 LTR MaLR 6 170 -238 4 909 264 281 110 40 chr15 42538801 42538901 -60956073 + MLT1A0 LTR MaLR 3 109 -281 5 909 301 274 61 23 chr15 42538995 42539126 -60955848 + MLT1A0 LTR MaLR 228 363 -2 5 909 318 304 58 75 chr15 42539475 42539649 -60955325 + MLT2F LTR ERVL 493 663 0 5 909 1014 295 40 80 chr15 42540110 42540534 -60954440 - MTE2a LTR MaLR -3 416 1 6 909 232 308 67 0 chr15 42547157 42547261 -60947713 - MLT1H1 LTR MaLR -28 527 417 6 909 291 353 145 28 chr15 42547275 42547594 -60947380 - MLT1H1 LTR MaLR -179 376 19 6 909 563 169 25 43 chr15 42579159 42579329 -60915645 - ORR1A1 LTR MaLR 0 394 230 1 909 2144 87 0 0 chr15 42579862 42580151 -60914823 - ORR1A1 LTR MaLR -57 289 1 1 909 2369 203 39 52 chr15 42587106 42587668 -60907306 + RLTR31_Mm LTR ERVK 7 561 0 1 909 1583 204 79 70 chr15 42588976 42589686 -60905288 - RMER6A LTR ERVK -4 716 3 1 909 474 289 41 65 chr15 42590052 42590331 -60904643 + MLT1D LTR MaLR 109 440 -65 1 909 1274 203 83 44 chr15 42590920 42591116 -60903858 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 182 1 909 1274 203 83 44 chr15 42591182 42591345 -60903629 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 2 1 909 231 274 34 56 chr15 42591698 42591787 -60903187 + LTR48B LTR ERV1 1 87 -557 1 909 1729 144 51 60 chr15 42593664 42593996 -60900978 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 909 2090 186 97 28 chr15 42595564 42596110 -60898864 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 584 0 1 909 1467 248 147 13 chr15 42597446 42597895 -60897079 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 19 1 909 608 227 84 0 chr15 42597924 42598078 -60896896 + RLTR11A2 LTR ERVK 7 173 -354 1 113 720 262 66 36 chr15 42598104 42598405 -60896569 - RLTR11B LTR ERVK -139 314 5 1 910 380 295 81 35 chr15 42603450 42603647 -60891327 - MLT1D LTR MaLR -269 236 31 1 910 1169 278 33 25 chr15 42604226 42604591 -60890383 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 1 910 1668 211 51 0 chr15 42613923 42614279 -60880695 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 910 2798 75 28 8 chr15 42616393 42616783 -60878191 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 1 910 2214 179 8 3 chr15 42617137 42617513 -60877461 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 910 505 336 88 62 chr15 42620003 42620311 -60874663 + ORR1E LTR MaLR 10 325 -34 1 910 2066 233 21 10 chr15 42623653 42624135 -60870839 + RLTR16 LTR ERVK 1 487 -18 1 910 678 329 73 41 chr15 42624314 42624628 -60870346 + ORR1E LTR MaLR 3 326 -33 1 910 875 253 129 30 chr15 42632030 42632425 -60862549 + MER57C2 LTR ERV1 1 434 0 1 910 487 369 99 33 chr15 42635554 42635980 -60858994 + MLT1G1 LTR MaLR 16 469 -110 1 910 243 294 127 60 chr15 42639344 42639478 -60855496 - MLT1C LTR MaLR -285 182 40 1 910 450 291 141 33 chr15 42641913 42642219 -60852755 - MER110A LTR ERV1 0 468 130 1 910 921 311 28 83 chr15 42642404 42642803 -60852171 + MTE2a LTR MaLR 3 379 0 1 910 399 319 62 118 chr15 42642981 42643139 -60851835 + ORR1E LTR MaLR 3 145 -214 2 910 255 319 63 120 chr15 42643468 42643629 -60851345 + ORR1E LTR MaLR 143 304 -70 2 910 319 317 62 52 chr15 42644395 42644588 -60850386 + MER57D LTR ERV1 163 357 -54 2 910 286 340 20 20 chr15 42645937 42646036 -60848938 - MLT1K LTR MaLR -360 235 137 2 910 510 295 78 53 chr15 42647650 42648077 -60846897 + RLTR12B LTR ERVK 47 517 -11 2 910 1165 252 56 56 chr15 42648294 42648458 -60846516 + ORR1D1 LTR MaLR 1 174 -200 2 910 1165 252 56 56 chr15 42648523 42648732 -60846242 + ORR1D1 LTR MaLR 175 374 0 2 910 248 333 105 38 chr15 42649075 42649284 -60845690 - ORR1D2 LTR MaLR -140 230 8 2 910 1920 126 111 31 chr15 42650877 42651237 -60843737 + MTA_Mm LTR MaLR 1 389 -7 2 910 438 255 78 78 chr15 42673860 42674013 -60820961 + MER21B LTR ERV1 661 813 -50 2 910 259 318 0 66 chr15 42676169 42676260 -60818714 + RMER15 LTR ERVL 337 421 -154 2 910 341 365 103 7 chr15 42677242 42677388 -60817586 + LTR33 LTR ERVL 113 272 -243 2 910 298 399 4 68 chr15 42679350 42679584 -60815390 + MLT1J LTR MaLR 70 288 -224 2 910 2697 62 84 0 chr15 42685328 42685686 -60809288 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 2 910 301 333 30 38 chr15 42688652 42688783 -60806191 - RMER15 LTR ERVL -66 509 380 2 910 559 298 41 23 chr15 42689817 42689996 -60804978 - MLT1B LTR MaLR -10 364 193 2 910 385 208 10 62 chr15 42690096 42690198 -60804776 + MTC LTR MaLR 1 94 -327 2 910 1763 203 24 12 chr15 42690774 42691108 -60803866 + MTC LTR MaLR 84 421 0 2 910 1049 132 17 27 chr15 42699668 42699858 -60795116 - ORR1A2-int LTR MaLR -1373 207 1 2 910 2046 109 21 59 chr15 42699858 42700198 -60794776 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 910 2276 101 3 12 chr15 42707240 42707570 -60787404 - MTB_Mm LTR MaLR -78 329 3 2 910 2487 165 61 35 chr15 42707572 42708111 -60786863 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1098 546 2 910 3928 163 93 28 chr15 42719226 42720063 -60774911 + RMER17B LTR ERVK 2 893 -65 2 910 578 331 69 61 chr15 42726145 42726508 -60768466 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 3 910 370 259 25 25 chr15 42726712 42726831 -60768143 + MLT1B LTR MaLR 1 119 -271 3 910 585 329 52 25 chr15 42728421 42728745 -60766229 + MLT1B LTR MaLR 50 382 -8 3 911 313 296 93 31 chr15 42731499 42731628 -60763346 + ORR1E LTR MaLR 1 137 -222 3 911 1009 243 205 17 chr15 42731855 42732202 -60762772 - MTC LTR MaLR -1 420 9 3 911 262 245 105 117 chr15 42735174 42735345 -60759629 + ORR1E LTR MaLR 66 234 -125 3 911 236 280 49 20 chr15 42735398 42735500 -60759474 + ORR1E LTR MaLR 275 379 0 3 911 5861 118 33 25 chr15 42746791 42747427 -60747547 - RMER17B LTR ERVK -4 954 319 3 911 5861 118 33 25 chr15 42747661 42747970 -60747004 - RMER17B LTR ERVK -640 318 2 3 911 1607 268 84 21 chr15 42759667 42760144 -60734830 + RLTR18B LTR ERVK 6 512 0 3 911 231 346 122 0 chr15 42777139 42777246 -60717728 - LTR16A LTR ERVL -235 216 97 3 911 2541 77 118 11 chr15 42779076 42779456 -60715518 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 3 911 856 246 100 0 chr15 42781556 42781796 -60713178 + RMER19A LTR ERVK 474 737 0 3 911 1290 205 186 15 chr15 42781943 42782296 -60712678 - RMER19A LTR ERVK -345 392 1 3 911 995 265 90 33 chr15 42782812 42783144 -60711830 - MTE2b LTR MaLR -13 366 16 3 911 480 360 99 62 chr15 42784188 42784591 -60710383 - MLT1F2 LTR MaLR -77 483 66 3 911 1111 331 76 37 chr15 42786732 42787239 -60707735 + MLT1K LTR MaLR 20 548 -47 3 911 3105 56 5 5 chr15 42788527 42788922 -60706052 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 3 911 850 211 6 25 chr15 42789859 42790019 -60704955 + RLTR25B LTR ERVK 1 157 -871 4 911 535 220 43 3 chr15 42791494 42791623 -60703351 - ORR1D1 LTR MaLR -1 383 234 4 911 336 176 0 42 chr15 42791690 42791761 -60703213 - ORR1D1 LTR MaLR -158 226 159 4 911 3394 149 118 14 chr15 42791761 42792413 -60702561 + RMER6D LTR ERVK 1 720 0 4 911 892 182 7 0 chr15 42792413 42792566 -60702408 - ORR1D1 LTR MaLR -218 156 3 4 911 1950 127 14 58 chr15 42795957 42796301 -60698673 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 911 345 349 91 74 chr15 42796414 42796636 -60698338 + MLT2B1 LTR ERVL 1 229 -327 4 911 617 321 43 42 chr15 42796741 42797020 -60697954 + MLT2B1 LTR ERVL 218 534 -20 4 911 3028 110 220 16 chr15 42798545 42799108 -60695866 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 4 911 1764 189 59 90 chr15 42811827 42812166 -60682808 + RMER6B LTR ERVK 1 336 -125 4 911 1764 189 59 90 chr15 42812239 42812375 -60682599 + RMER6B LTR ERVK 337 461 0 4 911 462 258 0 0 chr15 42812501 42812594 -60682380 - ORR1E LTR MaLR -266 93 1 4 911 535 279 77 18 chr15 42822418 42822586 -60672388 - MTD LTR MaLR -241 178 1 4 911 235 287 0 33 chr15 42828560 42828650 -60666324 + MLT1L LTR MaLR 507 593 -17 4 911 311 159 48 0 chr15 42831861 42831924 -60663050 - MTD LTR MaLR 0 419 354 4 911 637 281 133 18 chr15 42831938 42831977 -60662997 - MTD LTR MaLR -121 298 260 4 911 637 281 133 18 chr15 42832139 42832324 -60662650 - MTD LTR MaLR -160 259 48 4 911 2546 105 70 5 chr15 42843512 42843930 -60651044 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 415 -7 4 911 261 240 111 37 chr15 42847593 42847701 -60647273 - MLT1B LTR MaLR -4 386 271 4 911 245 301 138 14 chr15 42847892 42848030 -60646944 - MLT1B LTR MaLR -293 155 1 4 911 422 367 110 66 chr15 42850934 42851372 -60643602 + LTR33A LTR ERVL 60 516 -4 4 912 905 286 114 34 chr15 42891641 42891992 -60602982 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 912 2378 194 52 76 chr15 42918758 42919321 -60575653 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 549 -28 5 912 807 274 47 107 chr15 42919329 42919693 -60575281 - MTE2a LTR MaLR -30 349 8 5 912 3088 51 12 22 chr15 42927640 42928040 -60566934 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 912 772 317 33 93 chr15 42934914 42935311 -60559663 + MTE2a LTR MaLR 5 377 -2 5 912 803 184 114 0 chr15 42944232 42944390 -60550584 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 176 -351 6 912 260 172 35 0 chr15 42945902 42945960 -60549014 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 832 891 -31 6 912 579 281 136 62 chr15 42949056 42949394 -60545580 + MER31B LTR ERV1 1 363 -103 6 912 971 185 107 0 chr15 42957176 42957354 -60537620 - MTC LTR MaLR 0 421 225 6 912 554 222 0 0 chr15 42957343 42957442 -60537532 - MTC LTR MaLR -313 108 10 6 912 1513 164 35 86 chr15 42960817 42961175 -60533799 + MTC-int LTR MaLR 870 1210 -48 6 912 1513 164 35 86 chr15 42961303 42961317 -60533657 + MTC-int LTR MaLR 1211 1223 -35 6 912 775 194 48 54 chr15 42961317 42961892 -60533082 + RMER3D-int LTR ERVK 221 1204 -1638 6 912 288 143 0 167 chr15 42961918 42962002 -60532972 + RLTR17 LTR ERVK 623 692 0 6 912 285 366 0 0 chr15 42962098 42962180 -60532794 - MTE-int LTR MaLR -970 610 529 6 912 752 271 10 9 chr15 42962176 42962367 -60532607 - MTE-int LTR MaLR -1181 399 177 6 912 2488 83 6 0 chr15 42980842 42981167 -60513807 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 912 386 196 5 131 chr15 42981620 42981826 -60513148 + RMER17C LTR ERVK 98 277 -133 6 912 802 293 117 35 chr15 42984953 42985296 -60509678 - MTD LTR MaLR 0 419 49 6 912 364 282 108 74 chr15 42986995 42987171 -60507803 + MLT1C LTR MaLR 286 467 0 6 913 613 325 77 48 chr15 43008183 43008319 -60486655 - ERVL-E-int LTR ERVL -3543 2124 1989 1 913 613 325 77 48 chr15 43008351 43008550 -60486424 - ERVL-E-int LTR ERVL -3679 1988 1779 1 913 331 372 65 42 chr15 43009240 43009317 -60485657 + MLT2E LTR ERVL 11 98 -530 1 913 331 329 45 77 chr15 43009375 43009748 -60485226 + MLT2E LTR ERVL 99 574 -55 1 913 2931 148 59 68 chr15 43010969 43011645 -60483329 + RMER6C LTR ERVK 1 670 -20 1 913 254 226 30 23 chr15 43014412 43014498 -60480476 - MTD LTR MaLR 0 419 285 2 913 329 261 130 0 chr15 43014500 43014592 -60480382 + MTD LTR MaLR 226 329 -90 2 913 826 203 143 9 chr15 43016263 43016487 -60478487 + ORR1B1 LTR MaLR 1 254 -140 2 913 247 339 87 29 chr15 43024390 43024430 -60470544 + ORR1E LTR MaLR 127 166 -193 4 913 247 339 87 29 chr15 43024500 43024632 -60470342 + ORR1E LTR MaLR 167 308 -51 4 913 225 263 37 112 chr15 43028256 43028363 -60466611 - MTE2a LTR MaLR -3 376 278 4 913 2934 75 64 3 chr15 43039208 43039585 -60455389 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 913 517 335 69 38 chr15 43042959 43043025 -60451949 + MER54A LTR ERVL 272 336 -565 6 913 2291 166 56 0 chr15 43043025 43043398 -60451576 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 913 517 335 69 38 chr15 43043398 43043592 -60451382 + MER54A LTR ERVL 337 540 -361 6 913 822 334 38 19 chr15 43044087 43044401 -60450573 + MTE2b LTR MaLR 58 377 -2 7 913 5430 110 28 8 chr15 43051400 43052123 -60442851 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 7 913 351 254 41 33 chr15 43053385 43053507 -60441467 - ORR1D1 LTR MaLR -104 270 148 8 913 699 208 107 6 chr15 43053620 43053789 -60441185 - ORR1D1 LTR MaLR -188 186 1 8 913 912 169 39 34 chr15 43053789 43053997 -60440977 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1162 8 913 4661 164 45 27 chr15 43054145 43055007 -60439967 - RMER13B LTR ERVK -30 878 1 8 913 724 186 20 20 chr15 43059551 43059699 -60435275 + ORR1D2-int LTR MaLR 1219 1366 -4 9 913 1059 253 59 23 chr15 43059703 43060006 -60434968 + ORR1D2 LTR MaLR 2 315 -55 9 913 2560 143 135 33 chr15 43078407 43078926 -60416048 - RMER15 LTR ERVL -2 573 2 1 913 1780 164 18 21 chr15 43082020 43082357 -60412617 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -222 362 27 1 913 2009 125 19 0 chr15 43084862 43085174 -60409800 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 1 913 444 77 0 0 chr15 43086818 43086883 -60408091 + ORR1A4 LTR MaLR 1 65 -264 1 913 1227 204 90 53 chr15 43089165 43089522 -60405452 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 1 913 1744 212 31 40 chr15 43104564 43104986 -60389988 - MTD LTR MaLR 0 419 2 1 913 1690 157 166 0 chr15 43105538 43105869 -60389105 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 913 989 225 104 84 chr15 43114777 43115181 -60379793 + MT2A LTR ERVL 1 542 -59 1 913 2207 114 9 0 chr15 43115231 43115547 -60379427 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 914 2760 78 51 18 chr15 43130844 43131238 -60363736 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 914 269 280 96 11 chr15 43131359 43131453 -60363521 + MLT1A1 LTR MaLR 302 403 -5 1 914 356 253 0 11 chr15 43131481 43131569 -60363405 + MLT1B LTR MaLR 1 87 -303 1 914 381 241 73 11 chr15 43132292 43132426 -60362548 + MTC LTR MaLR 215 421 0 1 914 1840 224 110 36 chr15 43132430 43132985 -60361989 + MTC-int LTR MaLR 5 600 -658 1 914 643 338 88 75 chr15 43136047 43136578 -60358396 + MLT2B3 LTR ERVL 14 551 -3 1 914 2045 124 38 3 chr15 43140816 43141132 -60353842 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 914 2307 134 118 16 chr15 43143825 43144334 -60350640 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 1 914 1045 228 78 63 chr15 43147435 43147723 -60347251 - ORR1E LTR MaLR -6 353 60 2 914 1392 175 119 55 chr15 43147723 43148068 -60346906 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 914 1045 228 78 63 chr15 43148068 43148098 -60346876 - ORR1E LTR MaLR -300 59 30 2 914 232 368 21 0 chr15 43148164 43148259 -60346715 + MTE-int LTR MaLR 1181 1277 -303 2 914 520 261 15 8 chr15 43148572 43148703 -60346271 + MTE-int LTR MaLR 1286 1417 -163 2 914 306 314 0 21 chr15 43148731 43148850 -60346124 - ORR1E-int LTR MaLR -2 1368 1276 2 914 872 219 75 95 chr15 43149120 43149468 -60345506 + RMER10A LTR ERVL 77 417 -25 2 914 892 284 121 9 chr15 43149463 43149801 -60345173 - MTE-int LTR MaLR -131 1449 1074 2 914 358 328 43 113 chr15 43154891 43155121 -60339853 - MLT1D LTR MaLR -271 234 21 2 914 839 307 48 48 chr15 43155405 43155539 -60339435 + MTEa LTR MaLR 20 161 -218 2 914 839 307 48 48 chr15 43155736 43155807 -60339167 + MTEa LTR MaLR 162 228 -151 2 914 3363 40 2 0 chr15 43155807 43156202 -60338772 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 914 839 307 48 48 chr15 43156202 43156310 -60338664 + MTEa LTR MaLR 229 334 -45 2 914 1009 192 97 9 chr15 43156369 43156668 -60338306 + ORR1B2 LTR MaLR 1 357 -10 2 914 3186 16 0 11 chr15 43162164 43162535 -60332439 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 914 25732 34 22 5 chr15 43162537 43165834 -60329140 + IAPEz-int LTR ERVK 3 3306 -3175 2 914 780 11 0 0 chr15 43165824 43165915 -60329059 + IAPEz-int LTR ERVK 4666 4756 -1725 2 914 9613 23 2 4 chr15 43165915 43167074 -60327900 + IAPEz-int LTR ERVK 5326 6481 0 2 914 3153 16 0 11 chr15 43167074 43167445 -60327529 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 2 914 948 103 6 104 chr15 43176361 43176412 -60318562 - RMER19A LTR ERVK 0 737 702 2 914 948 103 6 104 chr15 43176581 43176700 -60318274 - RMER19A LTR ERVK -36 701 582 2 914 2515 164 151 9 chr15 43177701 43178202 -60316772 - RMER19A LTR ERVK -129 608 1 2 914 314 137 0 0 chr15 43178718 43178769 -60316205 - MT2B LTR ERVL -3 598 548 2 914 1523 168 39 6 chr15 43178819 43179097 -60315877 - MT2B LTR ERVL -62 539 282 2 914 609 120 11 0 chr15 43179103 43179195 -60315779 - MT2B LTR ERVL -508 93 1 2 914 2888 52 39 3 chr15 43181346 43181728 -60313246 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 914 3835 94 31 2 chr15 43182175 43182731 -60312243 + MT2B2 LTR ERVL 13 584 0 2 914 758 305 174 32 chr15 43184420 43184949 -60310025 - MER90a LTR ERV1 -10 604 1 2 914 3097 63 5 2 chr15 43188733 43189132 -60305842 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 914 790 251 39 63 chr15 43190173 43190204 -60304770 - RLTR15 LTR ERVK -36 323 297 2 914 790 251 39 63 chr15 43190290 43190589 -60304385 - RLTR15 LTR ERVK -63 296 1 2 914 2118 129 3 12 chr15 43193677 43194007 -60300967 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 914 415 297 143 34 chr15 43198715 43198924 -60296050 + MLT1L LTR MaLR 379 610 0 2 914 282 316 53 0 chr15 43203860 43203954 -60291020 + MTE2b LTR MaLR 1 99 -280 2 914 1811 208 47 16 chr15 43203954 43204307 -60290667 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 29 2 914 1811 208 47 16 chr15 43205238 43205265 -60289709 - ORR1B1 LTR MaLR -366 28 2 2 914 694 236 75 21 chr15 43205269 43205455 -60289519 + MTE2b LTR MaLR 58 253 -126 2 914 337 252 44 61 chr15 43208278 43208392 -60286582 + ORR1D2 LTR MaLR 226 337 -33 2 914 3481 13 5 0 chr15 43209043 43209437 -60285537 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 914 232 301 112 49 chr15 43211479 43211780 -60283194 - MLT1J-int LTR MaLR -900 509 132 2 914 1582 177 39 29 chr15 43212641 43212949 -60282025 - MTC LTR MaLR -8 413 103 3 914 453 234 17 70 chr15 43213136 43213251 -60281723 - MTC LTR MaLR -298 109 1 3 914 594 333 73 44 chr15 43222188 43222530 -60272444 - MER21B LTR ERV1 -111 752 401 3 914 269 294 8 92 chr15 43226485 43226605 -60268369 - MT2B LTR ERVL -338 263 154 3 914 369 225 0 133 chr15 43228281 43228409 -60266565 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 3 914 242 229 0 0 chr15 43233418 43233466 -60261508 - ORR1C2 LTR MaLR -332 52 5 3 914 226 238 30 45 chr15 43246539 43246605 -60248369 - ORR1E LTR MaLR -290 69 5 3 914 285 327 9 45 chr15 43246731 43246843 -60248131 - MLT1K LTR MaLR -3 592 485 3 914 378 345 17 0 chr15 43248963 43249079 -60245895 - MTEa LTR MaLR -257 122 5 3 914 3525 302 54 16 chr15 43249085 43249364 -60245610 - MTEa-int LTR MaLR -2 1578 1288 3 914 2865 128 93 4 chr15 43249364 43249849 -60245125 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 914 3525 302 54 16 chr15 43249849 43250642 -60244332 - MTEa-int LTR MaLR -293 1287 465 3 914 1842 307 28 12 chr15 43250677 43251396 -60243578 + MYSERV6-int LTR ERVK 456 1185 -7774 3 114 9063 173 46 16 chr15 43252582 43254280 -60240694 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 1749 -577 3 915 9063 272 88 65 chr15 43254349 43254864 -60240110 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1750 1858 -468 3 915 1382 248 149 8 chr15 43254864 43255254 -60239720 + BGLII_A LTR ERVK 1 445 0 3 915 501 273 240 63 chr15 43255385 43255702 -60239272 - MTEa LTR MaLR -2 377 5 3 915 235 302 127 56 chr15 43262845 43262971 -60232003 - MLT1L LTR MaLR -356 254 120 3 915 1673 168 13 29 chr15 43281129 43281441 -60213533 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 61 4 915 1093 198 0 5 chr15 43281449 43281647 -60213327 + RMER4A LTR ERVK 270 466 0 4 915 258 320 48 19 chr15 43283555 43283660 -60211314 - RMER15 LTR ERVL -48 527 420 4 915 2935 27 0 0 chr15 43295702 43296039 -60198935 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 915 7943 25 9 26 chr15 43296049 43297017 -60197957 + RLTR10-int LTR ERVK 41 992 -995 4 915 723 319 64 14 chr15 43297042 43297465 -60197509 + IAP-d-int LTR ERVK 707 1150 -5392 4 915 8606 22 8 1 chr15 43297547 43298535 -60196439 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 4 915 3241 36 8 0 chr15 43298537 43298924 -60196050 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 4 915 326 376 113 17 chr15 43299194 43299494 -60195480 - MT2A LTR ERVL -178 355 27 4 915 4758 126 51 6 chr15 43302730 43303554 -60191420 - RMER17D LTR ERVK -3 886 26 4 915 1775 163 12 41 chr15 43304345 43304665 -60190309 + ORR1C1 LTR MaLR 68 378 0 4 915 326 288 79 8 chr15 43314126 43314252 -60180722 - MLT1A LTR MaLR 0 374 240 4 915 7148 61 5 0 chr15 43318606 43319495 -60175479 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 4 915 295 291 0 72 chr15 43323993 43324062 -60170912 - ORR1D2 LTR MaLR 0 374 314 4 915 1477 201 145 2 chr15 43324062 43324416 -60170558 + MTD LTR MaLR 1 392 -27 4 915 732 212 197 0 chr15 43324451 43324644 -60170330 - ORR1D2 LTR MaLR -139 231 1 4 915 2244 181 32 2 chr15 43332847 43333256 -60161718 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 915 876 271 93 52 chr15 43364470 43364813 -60130161 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 5 915 2022 236 33 49 chr15 43364890 43365438 -60129536 + RLTR20A LTR ERVK 1 539 -2 5 915 1335 251 206 40 chr15 43367411 43367929 -60127045 + RMER20B LTR ERVK 10 613 -14 5 915 233 322 80 32 chr15 43369311 43369436 -60125538 + MTE2b LTR MaLR 1 131 -248 5 915 367 316 65 98 chr15 43369324 43369601 -60125373 + MT2A LTR ERVL 18 285 -248 5 915 278 206 59 0 chr15 43371254 43371322 -60123652 - MTD LTR MaLR -344 75 4 5 915 330 294 121 29 chr15 43371497 43371637 -60123337 + MTEb-int LTR MaLR 15 167 -1413 5 915 263 308 37 37 chr15 43371807 43371915 -60123059 + MTEb-int LTR MaLR 1127 1234 -346 5 915 825 304 49 23 chr15 43372085 43372435 -60122539 + MTEb-int LTR MaLR 1210 1568 -12 5 915 618 297 61 108 chr15 43372423 43372801 -60122173 + MTEb LTR MaLR 20 379 0 5 915 646 185 93 46 chr15 43381318 43381474 -60113500 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 218 5 915 346 261 246 74 chr15 43381558 43381616 -60113358 - ORR1C2 LTR MaLR -153 217 119 5 915 2077 104 39 3 chr15 43381618 43381926 -60113048 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 915 605 197 0 14 chr15 43381928 43382070 -60112904 - ORR1C2 LTR MaLR -263 131 1 5 915 969 220 180 47 chr15 43383183 43383483 -60111491 + MTEb LTR MaLR 1 340 -39 5 915 412 303 89 32 chr15 43383592 43383749 -60111225 + LTR40a LTR ERVL 1 166 -353 5 916 1779 222 5 53 chr15 43386285 43386665 -60108309 - ORR1D1 LTR MaLR -12 362 1 5 916 1896 195 81 10 chr15 43392225 43392618 -60102356 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 916 3979 176 87 30 chr15 43393236 43394048 -60100926 - RMER13A LTR ERVK -1 859 1 5 916 388 292 7 71 chr15 43396532 43396672 -60098302 - MTEb LTR MaLR -248 131 1 5 916 1763 142 68 57 chr15 43397055 43397406 -60097568 - ORR1B2 LTR MaLR -10 357 3 5 916 480 345 142 40 chr15 43397430 43397732 -60097242 - MLT1E1A LTR MaLR -14 666 278 5 916 445 343 46 38 chr15 43398225 43398464 -60096510 + MLT1C LTR MaLR 171 411 -56 5 916 252 118 0 56 chr15 43398744 43398816 -60096158 - MT2A LTR ERVL 0 533 466 5 916 1047 214 105 114 chr15 43398893 43399308 -60095666 - MT2A LTR ERVL -41 560 1 5 916 3104 158 44 12 chr15 43399383 43399948 -60095026 - RMER4B LTR ERVK 0 585 3 5 916 776 263 118 91 chr15 43416488 43416939 -60078035 - RMER4A LTR ERVK -3 463 1 6 916 582 311 112 30 chr15 43419486 43419817 -60075157 + ORR1E LTR MaLR 1 358 -1 6 916 573 219 14 55 chr15 43422150 43422295 -60072679 + ORR1D2 LTR MaLR 230 368 -2 6 916 1669 198 24 73 chr15 43422526 43422853 -60072121 + ORR1D1 LTR MaLR 1 325 -49 6 916 1669 198 24 73 chr15 43423329 43423382 -60071592 + ORR1D1 LTR MaLR 326 362 -12 6 916 1896 132 29 13 chr15 43430976 43431290 -60063684 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 916 3133 73 2 0 chr15 43432210 43432609 -60062365 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 916 420 311 78 50 chr15 43439586 43439913 -60055061 - RLTR17 LTR ERVK -265 427 32 6 916 489 323 93 43 chr15 43440763 43441206 -60053768 - MLT1C LTR MaLR 0 390 1 6 916 719 266 201 21 chr15 43441555 43441920 -60053054 - MLT2B4 LTR ERVL -61 495 2 6 916 1797 216 16 0 chr15 43442978 43443344 -60051630 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 6 916 2171 178 22 14 chr15 43443388 43443805 -60051169 - MTC LTR MaLR 0 421 2 6 916 1136 251 74 37 chr15 43450732 43451083 -60043891 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 4 6 916 532 276 47 16 chr15 43464634 43464763 -60030211 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 6 916 617 281 112 51 chr15 43468238 43468663 -60026311 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 4 6 916 3611 185 82 11 chr15 43468678 43469389 -60025585 + RLTR25B LTR ERVK 1 761 -267 6 916 262 283 66 47 chr15 43472858 43472982 -60021992 - MLT1H LTR MaLR -375 174 45 6 916 1941 194 79 11 chr15 43474213 43474349 -60020625 + RLTR20B3 LTR ERVK 106 242 -335 6 916 1941 194 79 11 chr15 43474394 43474606 -60020368 + RLTR20B3 LTR ERVK 243 470 -107 6 916 1941 194 79 11 chr15 43474649 43474741 -60020233 + RLTR20B3 LTR ERVK 471 575 -2 6 916 716 205 23 40 chr15 43479264 43479437 -60015537 - RLTR16 LTR ERVK -335 170 1 7 916 367 287 122 63 chr15 43482945 43483198 -60011776 + MTEb LTR MaLR 1 268 -111 7 916 452 333 87 66 chr15 43483077 43483469 -60011505 + MT2A LTR ERVL 134 533 0 7 916 242 353 78 0 chr15 43484208 43484310 -60010664 + MT2A LTR ERVL 316 425 -108 7 916 2464 99 67 10 chr15 43487660 43488049 -60006925 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 7 916 378 350 86 88 chr15 43496525 43496967 -59998007 - MER21B LTR ERV1 -11 852 412 7 916 2941 196 127 3 chr15 43497038 43497694 -59997280 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 7 916 3379 196 118 28 chr15 43499200 43499997 -59994977 + RMER13B LTR ERVK 1 869 -39 7 916 3355 186 123 28 chr15 43503387 43504314 -59990660 + RLTR25B LTR ERVK 40 959 -144 1 916 2576 241 98 92 chr15 43504372 43504499 -59990475 + RLTR25B LTR ERVK 960 1099 -4 1 916 2446 164 126 2 chr15 43507502 43507961 -59987013 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 1 916 422 306 48 34 chr15 43509284 43509477 -59985497 + MLT1H2 LTR MaLR 66 307 -242 2 916 1108 260 42 108 chr15 43510468 43510921 -59984053 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 2 916 3816 127 71 41 chr15 43512408 43513122 -59981852 - RMER6A LTR ERVK -2 754 19 2 916 389 88 79 105 chr15 43513125 43513201 -59981773 - RMER6B LTR ERVK -387 74 1 2 916 1143 224 127 26 chr15 43513272 43513612 -59981362 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 916 548 278 68 23 chr15 43513649 43513826 -59981148 + RMER5 LTR ERV1 1 185 -349 2 916 526 280 89 6 chr15 43514482 43514651 -59980323 + RMER5 LTR ERV1 342 524 -10 2 916 335 339 141 17 chr15 43515203 43515437 -59979537 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 4 266 -518 3 916 227 379 67 60 chr15 43515544 43515693 -59979281 + MamGypLTR1a LTR Gypsy 395 544 -240 3 917 228 250 204 0 chr15 43517185 43517273 -59977701 + MLT1D LTR MaLR 104 209 -296 3 917 596 170 15 14 chr15 43517291 43517422 -59977552 + MLT1D LTR MaLR 346 505 0 3 917 817 294 42 44 chr15 43518071 43518431 -59976543 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 3 917 1360 224 56 54 chr15 43522243 43522616 -59972358 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 917 2515 135 61 5 chr15 43525734 43526144 -59968830 + RLTR10C LTR ERVK 1 433 -3 4 917 257 281 164 6 chr15 43527070 43527235 -59967739 + LTR79 LTR ERVL 82 272 -255 4 917 1977 140 3 7 chr15 43527610 43527912 -59967062 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 27 5 917 1851 232 67 79 chr15 43531308 43532006 -59962968 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 917 2023 186 79 44 chr15 43532554 43533050 -59961924 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 72 584 0 5 917 339 358 54 7 chr15 43533334 43533483 -59961491 + LTR16A LTR ERVL 205 360 -91 5 917 1871 126 21 70 chr15 43537428 43537813 -59957161 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 3 6 917 245 377 94 20 chr15 43541050 43541199 -59953775 - MamGypLTR1a LTR Gypsy -284 500 341 6 917 4047 110 125 10 chr15 43542874 43543564 -59951410 + RMER17A2 LTR ERVK 74 842 -64 7 917 815 283 55 73 chr15 43553255 43553583 -59941391 - MTE2a LTR MaLR -57 322 1 8 917 7183 15 6 4 chr15 43554351 43555171 -59939803 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 8 917 805 239 184 12 chr15 43563757 43563901 -59931073 + ORR1D1 LTR MaLR 1 176 -198 9 917 805 239 184 12 chr15 43563956 43564061 -59930913 + ORR1D1 LTR MaLR 177 293 -81 9 917 2197 84 132 11 chr15 43566531 43566879 -59928095 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 917 666 347 61 59 chr15 43584014 43584440 -59910534 - MLT2F LTR ERVL -56 607 181 1 917 1421 58 11 5 chr15 43595705 43595896 -59899078 + MTB LTR MaLR 209 400 0 1 917 1512 161 72 82 chr15 43597353 43597684 -59897290 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 1 917 664 193 164 28 chr15 43600556 43600769 -59894205 - RMER4B LTR ERVK -329 256 15 1 917 1441 154 87 87 chr15 43603538 43603873 -59891101 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 47 1 917 821 249 22 0 chr15 43605965 43606150 -59888824 - ORR1C2 LTR MaLR -15 369 108 1 917 589 187 16 0 chr15 43606301 43606406 -59888568 - ORR1C2 LTR MaLR -267 107 2 1 917 364 262 228 34 chr15 43610104 43610341 -59884633 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 247 1 917 605 324 112 75 chr15 43612619 43613079 -59881895 - MLT1E2 LTR MaLR -124 503 69 1 917 242 290 64 76 chr15 43616934 43617091 -59877883 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1307 1461 -387 1 917 7760 73 16 5 chr15 43618113 43619125 -59875849 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 1 917 1181 282 14 51 chr15 43622377 43622732 -59872242 + MTE2a LTR MaLR 38 379 0 1 917 493 291 34 110 chr15 43625170 43625406 -59869568 + RLTR26 LTR ERVK 269 486 -156 1 917 1279 264 26 45 chr15 43626126 43626507 -59868467 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 917 477 296 118 37 chr15 43627436 43627706 -59867268 + MTEa LTR MaLR 3 294 -85 1 917 242 291 139 46 chr15 43629344 43629452 -59865522 - ORR1E LTR MaLR -220 139 22 1 917 284 382 18 54 chr15 43630456 43630539 -59864435 - MLT1J LTR MaLR -234 278 202 1 917 284 382 18 54 chr15 43630564 43630646 -59864328 - MLT1J LTR MaLR -311 201 119 1 917 1945 142 9 50 chr15 43630994 43631335 -59863639 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 2 917 8499 160 65 102 chr15 43631336 43633367 -59861607 - ORR1A4-int LTR MaLR -8 1955 1 2 917 232 186 194 28 chr15 43633368 43633440 -59861534 - ORR1A4 LTR MaLR -13 314 231 2 917 226 226 21 86 chr15 43633798 43633841 -59861133 - ORR1A4-int LTR MaLR -762 747 707 2 917 392 184 25 149 chr15 43634463 43634479 -59860495 - MT2B LTR ERVL -385 216 153 2 917 226 226 21 86 chr15 43634479 43634500 -59860474 - ORR1A4-int LTR MaLR -803 706 618 2 917 498 347 125 63 chr15 43637077 43637502 -59857472 + MER21B LTR ERV1 44 494 -369 2 917 496 301 27 0 chr15 43637579 43637725 -59857249 + MER21B LTR ERV1 590 739 -124 2 917 2740 194 17 10 chr15 43641891 43642411 -59852563 - RLTR11A2 LTR ERVK -3 524 1 2 917 1074 182 36 50 chr15 43642430 43642707 -59852267 - MYSERV-int LTR ERVK -17 6533 6261 2 917 391 158 0 137 chr15 43646175 43646246 -59848728 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1164 1162 1094 2 917 391 158 0 137 chr15 43646279 43646324 -59848650 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1233 1093 1062 2 917 247 333 103 28 chr15 43646329 43646474 -59848500 - RMER4A LTR ERVK -13 453 298 2 114 1669 263 88 56 chr15 43646485 43647274 -59847700 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1425 901 88 2 918 1433 148 33 77 chr15 43647275 43647612 -59847362 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 918 33200 53 4 11 chr15 43647612 43651891 -59843083 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 593 2 918 3704 44 2 7 chr15 43651888 43652343 -59842631 - MMETn-int LTR ERVK -2861 453 1 2 918 1406 139 39 83 chr15 43652343 43652680 -59842294 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 918 461 238 68 19 chr15 43652680 43652857 -59842117 - MYSERV-int LTR ERVK -4358 4601 4441 2 918 2208 191 68 6 chr15 43653883 43654379 -59840595 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 918 3110 68 2 5 chr15 43654407 43654804 -59840170 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 918 319 334 95 82 chr15 43655387 43655784 -59839190 - MLT2B3 LTR ERVL -2 560 70 2 918 4010 164 11 26 chr15 43656199 43656895 -59838079 - RLTR17 LTR ERVK -3 689 4 2 918 500 275 66 35 chr15 43661204 43661430 -59833544 - RLTR15 LTR ERVK -126 233 1 2 918 4321 174 88 7 chr15 43664902 43665719 -59829255 - RMER19B LTR ERVK -12 890 8 2 918 3775 51 7 68 chr15 43666796 43667341 -59827633 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 2 918 6433 50 11 17 chr15 43668225 43669038 -59825936 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 2 918 1148 252 125 56 chr15 43669691 43670162 -59824812 - MT2B LTR ERVL -2 599 1 2 918 244 255 66 38 chr15 43675910 43676016 -59818958 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 216 2 918 260 364 109 52 chr15 43687697 43687871 -59807103 + MLT1F1 LTR MaLR 135 318 -230 2 918 529 288 18 24 chr15 43688169 43688333 -59806641 + MLT1F1 LTR MaLR 407 569 0 2 918 233 298 138 0 chr15 43688631 43688725 -59806249 + MLT1J1 LTR MaLR 173 279 -165 2 918 677 402 103 20 chr15 43689084 43689581 -59805393 - MLT1J-int LTR MaLR -86 1301 764 2 918 372 231 85 101 chr15 43700857 43701045 -59793929 + RMER17C LTR ERVK 171 355 -55 2 918 259 292 60 34 chr15 43707185 43707302 -59787672 - LTR68 LTR ERV1 -336 404 285 2 918 339 290 83 83 chr15 43707715 43708027 -59786947 + RMER17C LTR ERVK 49 360 -50 2 918 1588 197 92 109 chr15 43708959 43709416 -59785558 - RMER16 LTR ERVK -84 449 1 3 918 527 95 0 0 chr15 43709416 43709490 -59785484 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 5333 3 918 9282 76 12 16 chr15 43709600 43710875 -59784099 - RMER16-int LTR ERVK -103 5303 4034 3 918 2682 87 17 43 chr15 43710875 43711297 -59783677 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 918 11636 38 21 19 chr15 43711307 43712748 -59782226 + IAPEz-int LTR ERVK 35 1477 -5004 3 918 1886 87 8 4 chr15 43712743 43712996 -59781978 + IAPEz-int LTR ERVK 2244 2497 -5183 3 918 999 71 0 0 chr15 43712993 43713119 -59781855 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 3 918 26309 15 2 0 chr15 43713119 43716070 -59778904 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 3 918 2669 89 17 43 chr15 43716070 43716492 -59778482 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 918 18384 81 25 18 chr15 43716492 43717000 -59777974 - RMER16-int LTR ERVK -1367 4039 3521 3 918 1662 137 24 63 chr15 43717000 43717335 -59777639 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 918 18384 81 25 18 chr15 43717335 43719454 -59775520 - RMER16-int LTR ERVK -1886 3520 1393 3 918 400 166 0 22 chr15 43719582 43719674 -59775300 - RLTR19-int LTR ERVK -4882 1255 1185 3 918 8577 106 66 7 chr15 43719735 43721079 -59773895 - RMER16-int LTR ERVK -3982 1424 1 3 918 633 190 32 32 chr15 43721079 43721204 -59773770 - RMER16 LTR ERVK 0 533 409 3 918 338 294 66 61 chr15 43722574 43722755 -59772219 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 247 3 918 369 358 78 58 chr15 43726673 43726916 -59768058 - MLT1H LTR MaLR -237 312 65 3 918 3599 176 128 45 chr15 43728182 43728700 -59766274 - RMER13B LTR ERVK 0 908 340 3 918 848 221 159 31 chr15 43728700 43729059 -59765915 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 5 3 918 3599 176 128 45 chr15 43729059 43729379 -59765595 - RMER13B LTR ERVK -569 339 1 3 918 2412 175 7 2 chr15 43732956 43733375 -59761599 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 918 335 289 151 78 chr15 43742456 43742801 -59752173 + MER57C2 LTR ERV1 65 434 0 3 918 275 185 22 120 chr15 43743986 43744078 -59750896 + ORR1D1 LTR MaLR 1 83 -291 3 918 3014 26 0 0 chr15 43744083 43744429 -59750545 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 918 10723 62 6 1 chr15 43744429 43745873 -59749101 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 342 3 918 572 163 138 0 chr15 43752842 43752965 -59742009 + RLTR47_MM LTR ERV1 355 494 -38 3 918 3188 119 72 0 chr15 43755091 43755578 -59739396 + MT2B LTR ERVL 2 523 -78 3 918 594 290 132 55 chr15 43756660 43756985 -59737989 + MLT1A0 LTR MaLR 13 362 -3 3 918 878 278 47 94 chr15 43757519 43758053 -59736921 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 3 918 5579 193 55 14 chr15 43758056 43759239 -59735735 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 1231 -4530 3 918 962 297 20 58 chr15 43759245 43759592 -59735382 + RLTR18 LTR ERVK 5 338 -278 3 918 567 318 29 31 chr15 43759616 43759872 -59735102 + RLTR18 LTR ERVK 217 572 -44 3 918 1604 229 109 50 chr15 43762624 43762693 -59732281 - RLTR11A LTR ERVK -8 520 459 3 918 1604 229 109 50 chr15 43762728 43763137 -59731837 - RLTR11A LTR ERVK -70 458 16 3 918 288 286 47 19 chr15 43765793 43765900 -59729074 - MER57-int LTR ERV1 -229 7308 7199 3 918 3410 28 2 0 chr15 43769724 43770119 -59724855 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 918 4716 179 37 10 chr15 43770775 43771643 -59723331 + RMER13B LTR ERVK 5 895 -13 3 919 2076 241 29 23 chr15 43785763 43786243 -59708731 + RLTR16 LTR ERVK 1 483 -22 3 919 2054 129 3 6 chr15 43794017 43794329 -59700645 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 3 919 232 319 43 32 chr15 43794616 43794710 -59700264 - MLT2E LTR ERVL -486 142 48 3 919 249 189 19 135 chr15 43796996 43797100 -59697874 - ORR1D-int LTR MaLR -252 1118 1027 3 919 1211 184 117 45 chr15 43797671 43797942 -59697032 + ORR1C1 LTR MaLR 3 279 -80 3 919 432 259 74 34 chr15 43797942 43798118 -59696856 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 264 3 919 445 163 0 34 chr15 43798455 43798544 -59696430 + ORR1C1 LTR MaLR 308 393 -1 3 919 2113 226 23 98 chr15 43804438 43805099 -59689875 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 919 840 290 72 81 chr15 43807415 43807861 -59687113 - RMER5 LTR ERV1 -71 463 22 4 919 1751 166 169 17 chr15 43811903 43812372 -59682602 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 6 4 919 3380 30 2 2 chr15 43812451 43812847 -59682127 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 919 2518 87 76 15 chr15 43814248 43814643 -59680331 - BGLII LTR ERVK -2 419 1 4 919 1806 139 60 171 chr15 43816492 43816580 -59678394 - RLTR23 LTR ERV1 -3 427 344 4 919 1806 139 60 171 chr15 43816622 43816893 -59678081 - RLTR23 LTR ERV1 -87 343 102 4 919 1806 139 60 171 chr15 43816972 43817080 -59677894 - RLTR23 LTR ERV1 -329 101 12 4 919 299 360 99 44 chr15 43819507 43819780 -59675194 - LTR83 LTR ERVL -486 294 7 4 919 560 210 29 23 chr15 43820108 43820257 -59674717 - ORR1D1 LTR MaLR -211 148 3 4 919 909 205 286 0 chr15 43821119 43821277 -59673697 + ORR1C2 LTR MaLR 3 199 -185 4 919 909 205 286 0 chr15 43821330 43821468 -59673506 + ORR1C2 LTR MaLR 200 383 -1 4 919 647 225 89 7 chr15 43821959 43822142 -59672832 + ORR1D2 LTR MaLR 1 199 -179 4 919 471 271 178 49 chr15 43828337 43828663 -59666311 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 4 919 278 245 9 97 chr15 43829206 43829319 -59665655 - RMER16-int LTR ERVK -1207 6199 6097 4 919 14010 166 85 58 chr15 43829323 43833562 -59661412 - RMER16-int LTR ERVK -1226 4180 255 4 919 448 229 47 67 chr15 43834079 43834229 -59660745 - RLTR9A LTR ERVK -9 359 213 4 919 512 199 251 36 chr15 43858981 43859148 -59635826 - ORR1C2 LTR MaLR -8 376 174 4 919 538 209 39 113 chr15 43859298 43859527 -59635447 - ORR1C2 LTR MaLR -119 255 50 4 919 1173 243 12 8 chr15 43859526 43859767 -59635207 - MTD LTR MaLR -165 254 13 4 919 256 61 0 0 chr15 43861413 43861446 -59633528 + RMER17B LTR ERVK 1 33 -925 4 919 559 321 43 16 chr15 43861430 43861617 -59633357 + RMER13B LTR ERVK 690 881 -27 4 919 342 294 226 6 chr15 43861762 43861930 -59633044 - MT2A LTR ERVL -74 459 255 4 919 282 298 108 36 chr15 43861915 43862082 -59632892 - MTEb LTR MaLR -132 247 69 4 919 231 317 151 27 chr15 43861944 43862129 -59632845 - MT2A LTR ERVL -323 210 3 4 919 1495 228 101 44 chr15 43862519 43862905 -59632069 + MTD LTR MaLR 12 419 0 4 919 1017 313 15 4 chr15 43866076 43866342 -59628632 + ORR1D2 LTR MaLR 99 367 -3 4 919 540 306 218 40 chr15 43868124 43868519 -59626455 + MLT1C LTR MaLR 1 465 -2 5 919 3482 28 0 0 chr15 43872353 43872749 -59622225 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 919 9239 29 5 1 chr15 43872749 43873843 -59621131 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 5 919 3425 35 0 0 chr15 43873843 43874239 -59620735 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 919 233 227 73 29 chr15 43874739 43874807 -59620167 + RLTR20C LTR ERVK 72 142 -392 5 919 2711 157 176 10 chr15 43883587 43884109 -59610865 + RMER19C LTR ERVK 1 609 -2 5 919 3328 41 5 0 chr15 43886260 43886654 -59608320 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 919 231 374 51 17 chr15 43891900 43892017 -59602957 + RMER12 LTR ERVK 695 815 -507 5 919 264 315 44 11 chr15 43894478 43894568 -59600406 - ORR1E LTR MaLR -253 106 14 5 919 3892 118 151 80 chr15 43895046 43895892 -59599082 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 5 919 581 331 99 25 chr15 43896620 43897054 -59597920 + MLT1D LTR MaLR 40 505 0 5 919 879 343 52 3 chr15 43897330 43897678 -59597296 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 5 919 297 345 85 65 chr15 43898631 43898972 -59596002 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 10 5 919 239 275 41 55 chr15 43900193 43900266 -59594708 + MLT1B LTR MaLR 1 72 -318 5 919 338 214 11 56 chr15 43900518 43900607 -59594367 + MLT1B LTR MaLR 298 382 -8 5 919 458 305 45 0 chr15 43900863 43901017 -59593957 - MER67D LTR ERV1 -203 311 151 5 919 453 261 17 0 chr15 43901345 43901464 -59593510 - MER67D LTR ERV1 -375 139 19 5 919 2904 35 3 3 chr15 43903474 43903820 -59591154 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 919 2618 161 28 11 chr15 43907317 43907781 -59587193 + RLTR11A2 LTR ERVK 56 527 0 5 920 1935 140 22 104 chr15 43913228 43913642 -59581332 + ORR1B1 LTR MaLR 2 381 -13 5 920 3245 180 19 22 chr15 43913651 43914293 -59580681 + ORR1B1-int LTR MaLR 1 640 -1323 5 920 663 176 351 15 chr15 43914335 43914433 -59580541 + MT2B LTR ERVL 1 166 -435 5 920 1064 239 170 33 chr15 43914563 43915080 -59579894 + RMER20B LTR ERVK 10 597 -30 5 920 294 325 0 24 chr15 43915083 43915165 -59579809 + RMER20B LTR ERVK 525 604 -23 5 920 2919 178 100 65 chr15 43915165 43916179 -59578795 + ORR1B1-int LTR MaLR 855 1894 -69 5 920 1887 192 50 3 chr15 43916179 43916555 -59578419 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 920 2216 189 32 56 chr15 43925982 43926589 -59568385 + RLTR12B LTR ERVK 1 559 -9 5 920 4062 160 46 35 chr15 43926990 43927862 -59567112 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 897 -5 5 920 310 247 14 0 chr15 43933424 43933497 -59561477 - MLT1C LTR MaLR -393 74 1 5 920 374 332 58 58 chr15 43933715 43933923 -59561051 + MLT1G1 LTR MaLR 372 579 0 5 920 1095 275 50 47 chr15 43940450 43940809 -59554165 + MTEa LTR MaLR 20 379 0 5 920 253 337 109 17 chr15 43940877 43941052 -59553922 - LTR40a LTR ERVL -323 196 6 5 920 289 216 0 0 chr15 43945344 43945395 -59549579 + RLTR42-int LTR ERVK 1045 1095 -4427 5 920 296 217 43 0 chr15 43950487 43950556 -59544418 + RLTR19-int LTR ERVK 2722 2793 -3344 6 920 1233 196 60 62 chr15 43950654 43951007 -59543967 + RLTR19-int LTR ERVK 3483 3834 -2303 6 920 463 198 0 29 chr15 43957262 43957366 -59537608 + RLTR19-int LTR ERVK 3861 3961 -2176 6 920 330 258 67 52 chr15 43958382 43958517 -59536457 + RLTR19-int LTR ERVK 4239 4375 -1762 6 920 2652 94 57 63 chr15 43961619 43962108 -59532866 - RLTR44D LTR ERVK 0 486 1 6 920 2446 190 41 0 chr15 43962399 43962842 -59532132 + MT2A LTR ERVL 1 461 -72 6 920 705 303 164 17 chr15 43963781 43964257 -59530717 - MER90a LTR ERV1 0 614 69 6 920 1857 207 48 13 chr15 43977980 43978376 -59516598 - MTC LTR MaLR -11 410 1 6 920 252 256 96 81 chr15 43982680 43982816 -59512158 - ORR1E LTR MaLR -143 216 79 6 920 234 336 17 96 chr15 43982871 43982986 -59511988 - ORR1E LTR MaLR -271 108 3 6 920 336 155 35 0 chr15 43984578 43984636 -59510338 + MT2A LTR ERVL 1 60 -473 6 920 470 243 6 18 chr15 43988221 43988374 -59506600 + ORR1C2 LTR MaLR 155 339 -55 6 920 237 286 50 140 chr15 43988805 43988984 -59505990 - RLTR40 LTR ERVK -471 346 184 6 920 1834 228 64 56 chr15 43990351 43990848 -59504126 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 521 -56 6 920 2592 106 28 5 chr15 43994949 43995339 -59499635 + MTB LTR MaLR 1 399 -1 6 920 263 312 100 72 chr15 43996188 43996437 -59498537 + ORR1E LTR MaLR 63 318 -41 6 920 1181 216 130 2 chr15 44003591 44003994 -59490980 - RLTR17 LTR ERVK -2 690 162 3 920 400 327 78 25 chr15 44012706 44012957 -59482017 - ORR1E LTR MaLR -99 271 1 8 920 1801 183 115 22 chr15 44021269 44021677 -59473297 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 2 921 1449 152 16 65 chr15 44041512 44041821 -59453153 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -28 294 1 4 921 665 132 80 7 chr15 44041821 44041958 -59453016 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 4698 4 921 264 247 56 11 chr15 44041958 44042048 -59452926 - RLTR13D6 LTR ERVK -462 440 347 4 921 1153 138 21 39 chr15 44042049 44042283 -59452691 - MMETn-int LTR ERVK -239 4605 4376 4 921 293 187 76 51 chr15 44042523 44042602 -59452372 - RLTR25A LTR ERVK -521 582 502 5 921 1489 215 128 14 chr15 44043794 44044224 -59450750 + RMER6D LTR ERVK 6 484 -236 5 921 1507 171 146 3 chr15 44044459 44044788 -59450186 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 5 921 2198 95 31 16 chr15 44051740 44052062 -59442912 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 921 1251 254 97 81 chr15 44054334 44054842 -59440132 + RLTR20B2 LTR ERVK 21 578 0 6 921 3287 43 5 0 chr15 44059983 44060377 -59434597 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 921 1053 176 16 0 chr15 44075773 44075960 -59419014 - RLTR15 LTR ERVK -23 336 147 1 921 399 219 51 72 chr15 44082031 44082169 -59412805 - RLTR15 LTR ERVK -172 187 53 1 921 435 94 16 0 chr15 44084847 44084911 -59410063 - RLTR15 LTR ERVK -294 65 1 1 921 1108 248 20 38 chr15 44088367 44088660 -59406314 + MuRRS4-int LTR ERV1 3661 3948 -1115 1 921 322 339 91 34 chr15 44089562 44089825 -59405149 + MuRRS4-int LTR ERV1 4663 4940 -123 1 921 378 169 28 0 chr15 44089927 44089998 -59404976 + RLTR47_MM LTR ERV1 48 120 -412 1 921 1460 85 194 0 chr15 44090183 44090431 -59404543 + RLTR47_MM LTR ERV1 145 440 -92 1 921 2294 162 50 7 chr15 44095638 44096042 -59398932 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 921 1814 199 117 76 chr15 44100551 44101208 -59393766 + RMER6C LTR ERVK 3 686 -4 1 921 570 289 174 32 chr15 44104120 44104367 -59390607 - MTD LTR MaLR -15 404 123 1 921 2231 217 29 84 chr15 44104380 44105040 -59389934 - RMER6D LTR ERVK -6 714 1 1 921 316 279 104 19 chr15 44105042 44105148 -59389826 - MTD LTR MaLR -304 115 1 1 921 639 344 80 54 chr15 44107266 44107616 -59387358 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 921 269 371 62 11 chr15 44108078 44108255 -59386719 + MLT1L LTR MaLR 425 610 0 1 921 3860 112 37 3 chr15 44109286 44109851 -59385123 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 1 921 3278 224 97 55 chr15 44116574 44116799 -59378175 - RLTR25B LTR ERVK -5 1023 768 1 921 3278 224 97 55 chr15 44116844 44117030 -59377944 - RLTR25B LTR ERVK -261 767 624 1 921 3278 224 97 55 chr15 44117078 44117647 -59377327 - RLTR25B LTR ERVK -405 623 3 1 921 1263 278 77 8 chr15 44118518 44118881 -59376093 - MTD LTR MaLR -31 388 1 1 921 242 227 39 78 chr15 44121858 44121987 -59372987 - RMER17D LTR ERVK -386 503 380 1 921 6370 117 19 10 chr15 44126322 44127296 -59367678 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 1 1 921 1757 192 0 0 chr15 44127305 44127639 -59367335 - ETnERV3-int LTR ERVK -28 5780 5447 1 921 4264 94 2 28 chr15 44127662 44128265 -59366709 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 1 921 1050 272 144 12 chr15 44128549 44128895 -59366079 - RLTR18B LTR ERVK -1 511 120 1 921 4814 56 2 2 chr15 44129905 44130492 -59364482 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 1 921 359 332 102 23 chr15 44132340 44132605 -59362369 + MER68 LTR ERVL 28 313 -250 1 921 272 344 131 32 chr15 44135338 44135650 -59359324 + LTR80B LTR ERVL 75 417 -167 1 921 429 206 18 89 chr15 44136975 44137087 -59357887 + MT2B LTR ERVL 153 256 -345 1 921 3480 174 45 23 chr15 44141494 44141947 -59353027 + RLTR17 LTR ERVK 19 472 -220 1 921 4125 165 103 64 chr15 44141947 44142342 -59352632 + RMER13B LTR ERVK 1 397 -511 1 921 4125 165 103 64 chr15 44142480 44142958 -59352016 + RMER13B LTR ERVK 398 908 0 1 921 3480 174 45 23 chr15 44142958 44143163 -59351811 + RLTR17 LTR ERVK 473 692 0 1 921 1025 237 171 173 chr15 44153347 44153816 -59341158 - MT2B LTR ERVL -2 599 6 2 921 347 152 34 0 chr15 44153834 44153893 -59341081 + RMER2 LTR ERV1 1 61 -506 2 921 737 256 108 92 chr15 44153904 44154239 -59340735 + RMER2 LTR ERV1 213 552 -15 2 921 289 308 43 43 chr15 44156402 44156754 -59338220 + MuLV-int LTR ERV1 2440 2821 -4735 2 921 1607 321 141 47 chr15 44156793 44158704 -59336270 + MuLV-int LTR ERV1 3221 5310 -2296 2 921 2294 125 57 5 chr15 44159070 44159471 -59335503 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 2 921 3513 107 23 37 chr15 44160188 44160760 -59334214 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 2 921 758 302 103 34 chr15 44162710 44163146 -59331828 - MER90a LTR ERV1 -1 613 148 2 921 554 242 39 0 chr15 44165860 44165988 -59328986 + MER54B LTR ERVL 27 159 -634 2 115 6946 52 46 0 chr15 44170489 44171343 -59323631 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 2 922 551 369 96 54 chr15 44175103 44175657 -59319317 + MLT1G LTR MaLR 48 579 -12 2 922 683 214 9 97 chr15 44179430 44179464 -59315510 - RMER17B LTR ERVK -187 223 189 2 922 848 164 43 35 chr15 44179523 44179768 -59315206 - RMER17B LTR ERVK -572 386 1 2 922 317 277 76 79 chr15 44180770 44181120 -59313854 + MER31B LTR ERV1 2 415 -51 2 922 4487 156 127 57 chr15 44181212 44181409 -59313565 - RLTR25A LTR ERVK -5 1098 860 2 922 4487 156 127 57 chr15 44181473 44182177 -59312797 - RLTR25A LTR ERVK -244 859 128 2 922 2484 75 203 18 chr15 44182177 44182626 -59312348 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 2 922 4487 156 127 57 chr15 44182626 44182750 -59312224 - RLTR25A LTR ERVK -976 127 1 2 922 1879 132 91 12 chr15 44187928 44188257 -59306717 - ORR1B2 LTR MaLR -10 357 3 2 922 248 199 148 11 chr15 44189310 44189404 -59305570 - RMER21B LTR ERV1 -258 689 520 2 922 3215 93 4 37 chr15 44190780 44191271 -59303703 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 922 737 308 61 9 chr15 44195374 44195603 -59299371 + ORR1E LTR MaLR 3 243 -116 2 922 398 316 44 71 chr15 44197449 44197595 -59297379 - MLT1D LTR MaLR -32 473 340 2 922 398 316 44 71 chr15 44197692 44197797 -59297177 - MLT1D LTR MaLR -166 339 230 2 922 3716 57 116 6 chr15 44198848 44199356 -59295618 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 2 922 742 296 107 46 chr15 44201208 44201555 -59293419 + MTEa LTR MaLR 12 379 0 2 922 544 253 138 53 chr15 44201554 44201742 -59293232 + MTEa-int LTR MaLR 2 205 -1375 2 922 251 288 128 29 chr15 44201778 44201950 -59293024 - MT2A LTR ERVL -2 531 343 2 922 448 308 137 68 chr15 44201947 44202268 -59292706 - MT2A LTR ERVL -101 432 90 2 922 231 154 18 88 chr15 44202281 44202338 -59292636 - MTE2a LTR MaLR -326 53 1 2 922 469 306 28 7 chr15 44202346 44202491 -59292483 + MTEa-int LTR MaLR 303 450 -1130 2 922 299 327 103 54 chr15 44204014 44204237 -59290737 + MLT1K LTR MaLR 356 589 -6 2 922 756 314 97 47 chr15 44213697 44214058 -59280916 + MLT1D LTR MaLR 10 388 -117 2 922 2866 128 241 122 chr15 44214701 44215511 -59279463 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 3 922 2709 44 0 3 chr15 44215776 44216115 -59278859 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 3 922 632 335 72 58 chr15 44216361 44216709 -59278265 - MTEa LTR MaLR -17 362 10 3 922 268 279 62 54 chr15 44236224 44236353 -59258621 + RMER15 LTR ERVL 1 130 -445 3 922 315 318 119 6 chr15 44236400 44236577 -59258397 + RMER15 LTR ERVL 311 507 -68 3 922 507 321 208 30 chr15 44237619 44238064 -59256910 + MLT1F1 LTR MaLR 38 560 0 3 922 376 285 260 45 chr15 44239520 44239994 -59254980 + MER90 LTR ERV1 1 575 0 3 922 1974 167 77 69 chr15 44247461 44247879 -59247095 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 922 1767 139 17 64 chr15 44249646 44249991 -59244983 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 922 1230 265 96 19 chr15 44253127 44253493 -59241481 - MTD LTR MaLR -14 405 12 3 922 832 219 74 141 chr15 44254301 44254705 -59240269 - MTE2a LTR MaLR -1 378 2 3 922 1138 254 65 98 chr15 44255842 44256395 -59238579 + RLTR12B LTR ERVK 12 561 -7 3 922 344 261 27 127 chr15 44257120 44257158 -59237816 + MTE2b LTR MaLR 10 47 -332 3 922 344 261 27 127 chr15 44257356 44257427 -59237547 + MTE2b LTR MaLR 48 108 -271 3 922 228 361 112 24 chr15 44257747 44257872 -59237102 + MLT1H LTR MaLR 253 388 -161 3 922 330 270 69 49 chr15 44258474 44258520 -59236454 + MT2B2 LTR ERVL 183 325 -259 3 922 686 283 88 44 chr15 44262071 44262322 -59232652 - MLT1K LTR MaLR -48 547 286 3 922 338 269 155 9 chr15 44272773 44272889 -59222085 - ORR1E LTR MaLR -226 133 1 3 922 1059 241 134 11 chr15 44272902 44273275 -59221699 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 922 670 274 25 78 chr15 44273276 44273518 -59221456 + MTD-int LTR MaLR 2 230 -1028 3 922 1350 280 35 84 chr15 44280398 44281235 -59213739 + MTD-int LTR MaLR 238 1538 -425 3 922 1231 265 167 0 chr15 44281411 44281758 -59213216 + MTD LTR MaLR 15 419 0 3 922 2569 209 88 49 chr15 44284408 44285036 -59209938 + RLTR21 LTR ERVK 1 652 -920 3 922 503 249 73 44 chr15 44285073 44285251 -59209723 + RLTR21 LTR ERVK 1282 1433 -139 3 922 1367 220 10 110 chr15 44285348 44285747 -59209227 - RMER19B LTR ERVK 0 902 544 3 922 641 287 56 84 chr15 44300180 44300465 -59194509 - MLT1D LTR MaLR -14 491 215 4 923 2759 197 63 20 chr15 44328125 44328216 -59166758 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 483 4 923 2759 197 63 20 chr15 44328260 44328721 -59166253 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 2 4 923 317 384 53 53 chr15 44328909 44329154 -59165820 - ORR1E LTR MaLR -108 251 7 4 923 807 258 28 0 chr15 44362219 44362397 -59132577 - MTD LTR MaLR -92 327 145 4 923 635 201 95 126 chr15 44369476 44369801 -59125173 - RMER2 LTR ERV1 -165 402 3 5 923 441 410 37 40 chr15 44375924 44376252 -59118722 - MLT1I LTR MaLR -18 393 67 5 923 252 322 31 85 chr15 44383248 44383377 -59111597 - ORR1D1 LTR MaLR -237 137 16 5 923 4414 67 3 28 chr15 44384346 44384948 -59110026 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 5 923 243 222 0 0 chr15 44397169 44397214 -59097760 - RMER15 LTR ERVL -447 128 84 5 923 329 263 0 123 chr15 44399334 44399464 -59095510 - MT2B LTR ERVL -344 257 144 5 923 352 340 68 88 chr15 44409418 44409885 -59085089 - MLT1H LTR MaLR 0 549 45 5 923 302 351 72 0 chr15 44411239 44411350 -59083624 + LTR16A1 LTR ERVL 3 121 -335 5 923 3455 160 64 31 chr15 44411566 44412236 -59082738 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 5 923 529 342 75 8 chr15 44419337 44419576 -59075398 - MLT1A LTR MaLR -119 255 1 5 923 1021 231 80 0 chr15 44425214 44425439 -59069535 - MTD LTR MaLR -176 243 1 5 923 740 266 97 4 chr15 44427996 44428223 -59066751 - MTD LTR MaLR -13 406 159 5 923 520 315 152 32 chr15 44428994 44429309 -59065665 - MLT1K LTR MaLR -86 509 157 5 923 449 185 74 32 chr15 44429893 44429988 -59064986 + RMER10A LTR ERVL 3 101 -341 5 923 2168 129 24 201 chr15 44431030 44431572 -59063402 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 5 923 1138 132 82 222 chr15 44431986 44432463 -59062511 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 924 1181 309 116 34 chr15 44435813 44436286 -59058688 + MER21B LTR ERV1 303 814 -49 6 924 470 207 21 29 chr15 44436531 44436653 -59058321 - MTE2a LTR MaLR 0 379 234 6 924 926 143 45 198 chr15 44436650 44437008 -59057966 - RMER17C LTR ERVK -90 320 18 6 924 2955 144 57 4 chr15 44437444 44437932 -59057042 + RMER20A LTR ERVK 1 514 -2 6 924 292 337 49 49 chr15 44438576 44438779 -59056195 + RMER2 LTR ERV1 354 556 -11 6 924 1792 155 9 53 chr15 44440878 44441014 -59053960 + MTC LTR MaLR 96 233 -188 6 924 2894 26 15 0 chr15 44441014 44441355 -59053619 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 924 14430 44 2 3 chr15 44441355 44443148 -59051826 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 6 924 2921 24 15 0 chr15 44443148 44443489 -59051485 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 924 1792 155 9 53 chr15 44443489 44443691 -59051283 + MTC LTR MaLR 234 419 -2 6 924 2125 146 94 75 chr15 44443713 44444150 -59050824 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 2 6 924 1630 205 22 66 chr15 44447173 44447539 -59047435 + RMER10B LTR ERVL 1 350 -48 6 924 2141 181 30 20 chr15 44448450 44448857 -59046117 - MTC LTR MaLR -8 413 3 6 924 358 340 73 33 chr15 44462243 44462496 -59032478 - MLT1F LTR MaLR -6 542 307 6 924 2954 92 25 34 chr15 44462789 44463230 -59031744 - RLTR9B LTR ERVK 0 437 1 6 924 273 91 68 0 chr15 44463246 44463290 -59031684 - ETnERV2-int LTR ERVK -29 7377 7331 6 924 540 243 37 62 chr15 44463508 44463883 -59031091 - ETnERV2-int LTR ERVK -984 6422 6105 6 924 6241 152 56 63 chr15 44463900 44465086 -59029888 - RMER16-int LTR ERVK -1233 4173 2981 6 924 6241 152 56 63 chr15 44465232 44465349 -59029625 - RMER16-int LTR ERVK -2426 2980 2869 6 924 6241 152 56 63 chr15 44465370 44465386 -59029588 - RMER16-int LTR ERVK -2538 2868 2868 6 924 6241 152 56 63 chr15 44465411 44465509 -59029465 - RMER16-int LTR ERVK -2538 2868 2764 6 924 1449 156 39 104 chr15 44465499 44466037 -59028937 - ETnERV2-int LTR ERVK -4408 2998 2354 6 924 2712 47 12 0 chr15 44478624 44478943 -59016031 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 6 924 3102 8 43 0 chr15 44485830 44486182 -59008792 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 924 4636 68 17 15 chr15 44486182 44486836 -59008138 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 6 924 424 38 0 0 chr15 44486836 44486889 -59008085 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1411 -5070 6 924 1669 123 4 15 chr15 44486888 44487153 -59007821 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 6 924 869 81 24 0 chr15 44487150 44487273 -59007701 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 6 924 25107 17 1 2 chr15 44487273 44490232 -59004742 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 6 924 3102 8 43 0 chr15 44490232 44490584 -59004390 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 6 924 5496 106 76 21 chr15 44495201 44496060 -58998914 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 6 924 380 323 93 29 chr15 44507547 44507751 -58987223 + MLT1A LTR MaLR 151 367 -7 1 924 1045 282 54 30 chr15 44512178 44512551 -58982423 + MLT1B LTR MaLR 1 382 -8 1 924 2097 144 92 29 chr15 44530870 44531250 -58963724 + MTB_Mm LTR MaLR 1 404 -3 4 924 1166 53 26 0 chr15 44534096 44534248 -58960726 + ORR1A1 LTR MaLR 141 296 -50 5 924 1847 183 115 33 chr15 44541739 44541995 -58952979 + MT2A LTR ERVL 2 287 -246 5 924 1847 183 115 33 chr15 44542538 44542700 -58952274 + MT2A LTR ERVL 288 454 -79 5 924 878 240 134 35 chr15 44543592 44543933 -58951041 - MTD LTR MaLR -15 404 1 6 924 2079 161 102 16 chr15 44550733 44551105 -58943869 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 4 7 924 3126 27 0 0 chr15 44554667 44555004 -58939970 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 7 924 21609 33 31 13 chr15 44555004 44558076 -58936898 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3165 -3316 7 924 9313 30 2 4 chr15 44558065 44559205 -58935769 + IAPEz-int LTR ERVK 5345 6481 0 7 924 2988 21 0 0 chr15 44559205 44559542 -58935432 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 7 924 940 258 178 23 chr15 44559825 44560167 -58934807 - MTC LTR MaLR -26 395 1 7 924 424 266 26 115 chr15 44563769 44563835 -58931139 - MT2B LTR ERVL -448 153 105 9 925 341 175 9 76 chr15 44592820 44592925 -58902049 - MTC-int LTR MaLR -1160 98 1 1 925 1788 168 20 6 chr15 44616477 44616525 -58878449 + RLTR15 LTR ERVK 1 50 -309 1 925 1788 168 20 6 chr15 44616548 44616853 -58878121 + RLTR15 LTR ERVK 51 358 -1 1 925 239 320 65 52 chr15 44622744 44622899 -58872075 + RMER20A LTR ERVK 92 248 -268 1 925 1456 274 37 3 chr15 44628395 44628746 -58866228 - MTEa LTR MaLR -16 363 1 1 925 1456 149 86 147 chr15 44638094 44638503 -58856471 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 925 522 303 190 35 chr15 44643408 44643719 -58851255 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 2 925 233 180 197 0 chr15 44644525 44644586 -58850388 - MTD LTR MaLR -14 405 333 2 925 410 308 68 35 chr15 44650963 44651203 -58843771 - MTEa LTR MaLR -7 372 102 2 925 596 314 78 57 chr15 44654051 44654385 -58840589 - ORR1E LTR MaLR -18 341 1 2 925 1747 192 54 35 chr15 44672216 44672589 -58822385 + RLTR14 LTR ERV1 3 382 0 2 925 1640 220 74 3 chr15 44673684 44674022 -58820952 + MTD LTR MaLR 1 362 -57 2 925 1750 173 61 61 chr15 44681012 44681388 -58813586 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 7 2 925 474 338 99 48 chr15 44686083 44686356 -58808618 - RMER15 LTR ERVL -14 561 275 2 925 648 294 144 32 chr15 44686797 44687138 -58807836 + MLT1B LTR MaLR 10 388 -2 2 925 368 347 6 45 chr15 44689488 44689666 -58805308 + MLT1F2 LTR MaLR 33 203 -357 2 925 269 302 29 86 chr15 44689781 44689886 -58805088 + MLT1F2 LTR MaLR 443 541 -19 2 926 394 390 25 50 chr15 44701248 44701526 -58793448 + MLT2F LTR ERVL 329 599 -64 2 926 490 275 127 105 chr15 44717944 44718220 -58776754 - MLT2C1 LTR ERVL -40 357 76 3 926 2046 125 11 43 chr15 44718245 44718622 -58776352 - RMER16 LTR ERVK -83 450 1 3 926 17758 89 35 7 chr15 44718622 44721908 -58773066 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 2039 3 926 6338 108 55 23 chr15 44722363 44722813 -58772161 - RMER16-int LTR ERVK -3373 2033 1566 3 926 779 227 48 132 chr15 44722932 44723242 -58771732 - RLTR45-int LTR ERVK -3660 3584 3301 3 926 722 308 34 4 chr15 44723256 44723491 -58771483 - RMER16-int LTR ERVK -1658 1656 1415 3 926 9896 113 30 13 chr15 44723623 44725134 -58769840 - RMER16-int LTR ERVK -3869 1537 1 3 926 846 124 51 0 chr15 44725134 44725271 -58769703 - RMER16 LTR ERVK 0 533 390 3 926 853 320 13 0 chr15 44727224 44727458 -58767516 - MTEa LTR MaLR -142 237 1 3 926 303 377 45 45 chr15 44729431 44729673 -58765301 - LTR16E1 LTR ERVL -7 531 290 3 926 1320 278 92 8 chr15 44731492 44731851 -58763123 + MTD LTR MaLR 8 396 -23 3 926 2156 194 89 18 chr15 44734018 44734511 -58760463 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 926 389 281 66 66 chr15 44736024 44736298 -58758676 + ETnERV3-int LTR ERVK 50 323 -2991 3 926 6105 169 66 59 chr15 44736448 44738498 -58756476 + ETnERV3-int LTR ERVK 340 3474 -3932 3 926 7398 175 14 22 chr15 44738498 44739186 -58755788 + ETnERV3-int LTR ERVK 4397 5071 -737 3 926 7398 175 14 22 chr15 44739364 44740067 -58754907 + ETnERV3-int LTR ERVK 5072 5777 -31 3 926 5327 102 17 17 chr15 44740082 44740888 -58754086 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 806 0 3 926 4162 49 60 8 chr15 44741451 44741983 -58752991 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 3 926 310 325 46 61 chr15 44749210 44749341 -58745633 - MLT1E1 LTR MaLR -54 600 472 3 926 1499 228 61 37 chr15 44756787 44757165 -58737809 - RMER13A LTR ERVK -473 387 1 3 926 2245 237 49 27 chr15 44757856 44758002 -58736972 + RMER15 LTR ERVL 14 158 -417 3 926 2245 237 49 27 chr15 44758548 44758951 -58736023 + RMER15 LTR ERVL 159 575 0 3 926 325 406 105 28 chr15 44759200 44759590 -58735384 + MLT1L LTR MaLR 6 425 -185 3 926 1743 232 39 34 chr15 44762975 44763390 -58731584 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 3 926 804 347 82 51 chr15 44764641 44765272 -58729702 + RMER13A LTR ERVK 113 763 -97 3 926 1978 100 63 0 chr15 44765563 44765864 -58729110 - ORR1A2 LTR MaLR -7 320 1 3 926 388 452 63 14 chr15 44767067 44767417 -58727557 + LTR16B LTR ERVL 2 368 -95 3 926 318 331 27 27 chr15 44769227 44769373 -58725601 + LTR16B2 LTR ERVL 31 176 -286 3 926 2200 114 9 3 chr15 44780186 44780503 -58714471 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 926 4995 163 24 60 chr15 44780917 44781066 -58713908 + RMER13B LTR ERVK 1 118 -790 3 926 8019 38 0 1 chr15 44781066 44781996 -58712978 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 1 3 926 4995 163 24 60 chr15 44781996 44782788 -58712186 + RMER13B LTR ERVK 119 908 0 3 926 3301 41 5 0 chr15 44801015 44801409 -58693565 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 926 354 386 104 4 chr15 44823273 44823533 -58671441 - MLT1E1A LTR MaLR -73 607 322 4 926 1038 257 108 22 chr15 44824813 44825091 -58669883 + MTD LTR MaLR 1 302 -117 4 926 277 170 0 0 chr15 44825117 44825164 -58669810 + MTD LTR MaLR 365 411 -8 4 926 1347 278 38 9 chr15 44825990 44826331 -58668643 + ORR1E LTR MaLR 1 351 -8 4 927 5256 150 72 9 chr15 44831478 44832379 -58662595 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 4 927 766 214 70 18 chr15 44845587 44845758 -58649216 - ORR1D1 LTR MaLR -192 182 3 4 927 5070 234 49 26 chr15 44845762 44847099 -58647875 - ORR1D1-int LTR MaLR -2 1368 1 4 927 1308 224 97 9 chr15 44847101 44847443 -58647531 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 4 927 648 301 53 9 chr15 44848301 44848529 -58646445 + MLT1I LTR MaLR 9 246 -165 4 927 619 332 82 36 chr15 44850598 44850904 -58644070 + MER77 LTR ERVL 52 371 -236 4 927 1274 223 224 6 chr15 44850905 44851247 -58643727 + MTC LTR MaLR 6 421 0 4 927 926 265 39 58 chr15 44851258 44851622 -58643352 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 4 927 611 300 29 10 chr15 44851622 44851831 -58643143 + MER77 LTR ERVL 395 607 0 4 927 460 343 73 102 chr15 44854034 44854593 -58640381 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 85 4 927 4212 194 93 4 chr15 44856061 44856879 -58638095 + RMER19B LTR ERVK 12 902 0 4 927 4309 91 5 5 chr15 44862555 44863139 -58631835 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 4 927 1320 181 98 4 chr15 44871696 44871962 -58623012 + ORR1B2 LTR MaLR 21 311 -56 4 927 297 185 0 0 chr15 44872808 44872862 -58622112 + ORR1B2 LTR MaLR 312 365 -2 4 927 1996 190 28 95 chr15 44873943 44874448 -58620526 - RMER19C LTR ERVK 0 611 141 4 927 1783 132 83 74 chr15 44875923 44876249 -58618725 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 927 382 319 69 74 chr15 44879172 44879375 -58615599 - RMER2 LTR ERV1 -28 539 338 4 927 225 270 116 87 chr15 44889181 44889319 -58605655 - MTEa LTR MaLR -117 262 121 5 927 2730 171 118 60 chr15 44890045 44890697 -58604277 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 927 913 181 3 214 chr15 44892629 44892795 -58602179 - RLTR23 LTR ERV1 -191 239 112 5 927 2066 130 12 58 chr15 44892795 44893138 -58601836 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 927 913 181 3 214 chr15 44893138 44893274 -58601700 - RLTR23 LTR ERV1 -319 111 1 5 927 541 357 97 0 chr15 44893480 44893707 -58601267 + MTEb LTR MaLR 21 269 -110 5 927 3178 124 42 51 chr15 44893980 44894549 -58600425 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 5 927 2036 212 62 59 chr15 44894938 44895080 -58599894 - RLTR20B3 LTR ERVK -13 564 414 5 927 639 265 130 41 chr15 44895080 44895418 -58599556 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 5 927 2036 212 62 59 chr15 44895418 44895837 -58599137 - RLTR20B3 LTR ERVK -164 413 1 5 927 3502 189 24 20 chr15 44895837 44896577 -58598397 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1584 5 927 725 152 54 12 chr15 44896575 44896741 -58598233 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1112 1214 1042 5 927 420 154 0 0 chr15 44899035 44899100 -58595874 - RLTR23 LTR ERV1 -1 429 365 5 927 1487 203 5 76 chr15 44900144 44900527 -58594447 - RLTR20B3 LTR ERVK -221 356 1 5 927 603 317 138 23 chr15 44902330 44902679 -58592295 - MT2A LTR ERVL 0 533 145 5 927 443 303 110 16 chr15 44902615 44902806 -58592168 - MTEa LTR MaLR -159 220 12 5 927 1281 225 136 68 chr15 44903732 44904102 -58590872 - MTD LTR MaLR 0 419 20 5 927 1281 225 136 68 chr15 44904125 44904136 -58590838 - MTD LTR MaLR -400 19 12 5 927 1445 185 107 7 chr15 44905067 44905356 -58589618 - MTC LTR MaLR 0 421 104 5 927 523 155 0 0 chr15 44905663 44905747 -58589227 - MTC LTR MaLR -333 88 5 5 927 511 331 47 16 chr15 44908605 44908795 -58586179 + ORR1E LTR MaLR 1 196 -163 5 927 892 271 69 50 chr15 44909414 44909775 -58585199 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 5 927 723 199 64 5 chr15 44917164 44917351 -58577623 - RMER17B LTR ERVK -562 396 199 5 927 399 159 0 0 chr15 44917343 44917406 -58577568 - RMER17B LTR ERVK -347 63 1 5 927 236 391 65 27 chr15 44917417 44917601 -58577373 - MLT2B3 LTR ERVL -83 471 281 5 927 5624 132 36 48 chr15 44923730 44924700 -58570274 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 5 927 279 282 26 0 chr15 44925113 44925222 -58569752 + MLT2D LTR ERVL 25 138 -326 5 927 244 259 0 0 chr15 44925312 44925366 -58569608 + MLT2D LTR ERVL 514 567 0 5 927 5309 172 80 12 chr15 44925730 44926761 -58568213 - RLTR25A LTR ERVK -2 1101 1 5 927 2187 174 5 27 chr15 44937315 44937682 -58557292 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 5 927 240 228 99 25 chr15 44941557 44941638 -58553336 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 423 6 927 934 96 48 6 chr15 44943412 44943580 -58551394 + RMER17B LTR ERVK 286 460 -498 6 927 381 235 23 27 chr15 44956078 44956197 -58538777 + ORR1D2 LTR MaLR 210 327 -52 6 928 2993 49 2 65 chr15 44961383 44961799 -58533175 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 928 3362 188 71 24 chr15 44962225 44962524 -58532450 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 366 6 928 3362 188 71 24 chr15 44962703 44963064 -58531910 - RLTR17 LTR ERVK -327 365 1 6 928 428 347 31 58 chr15 44966817 44967043 -58527931 + ORR1E LTR MaLR 73 292 -67 6 928 3921 178 27 17 chr15 44970360 44971064 -58523910 - RMER13A LTR ERVK -93 767 57 6 928 8303 71 13 0 chr15 44971063 44972225 -58522749 - ORR1A0-int LTR MaLR -615 1177 1 6 928 2968 29 3 0 chr15 44972225 44972570 -58522404 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 6 928 3155 122 34 56 chr15 44980122 44980677 -58514297 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 543 -359 6 928 4005 87 25 5 chr15 44980650 44981219 -58513755 + RLTR13D1 LTR ERVK 227 806 0 6 928 257 204 0 0 chr15 44983278 44983327 -58511647 - MTC LTR MaLR -360 61 13 6 928 4536 158 33 37 chr15 44983552 44984450 -58510524 - RMER17A2 LTR ERVK -11 895 1 6 928 402 279 90 60 chr15 44984822 44985055 -58509919 + LTR37A LTR ERV1 11 250 -176 6 928 997 234 62 49 chr15 44985955 44986324 -58508650 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 928 382 290 39 37 chr15 44993038 44993397 -58501577 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3081 3532 -3289 6 928 265 235 85 12 chr15 44996367 44996449 -58498525 + MMERVK10C-int LTR ERVK 6562 6649 -932 6 928 233 394 42 89 chr15 44999182 44999441 -58495533 - MLT1K LTR MaLR -190 405 159 6 928 751 319 57 40 chr15 45005252 45005601 -58489373 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 9 1 928 715 182 7 7 chr15 45016076 45016220 -58478754 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -440 144 1 2 928 1297 206 160 15 chr15 45018455 45018786 -58476188 + MTB_Mm LTR MaLR 1 379 -28 3 928 270 161 0 111 chr15 45018931 45018953 -58476021 + MTB_Mm LTR MaLR 352 373 -34 3 928 3053 23 0 0 chr15 45018953 45019299 -58475675 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 928 270 161 0 111 chr15 45019299 45019339 -58475635 + MTB_Mm LTR MaLR 374 407 0 3 928 1820 235 44 118 chr15 45019528 45020183 -58474791 + RMER19C LTR ERVK 1 607 -4 3 928 1154 288 65 48 chr15 45022048 45022402 -58472572 - MTEa LTR MaLR -2 377 18 3 928 2727 85 2 109 chr15 45023054 45023381 -58471593 + MTB LTR MaLR 1 317 -83 4 928 2727 85 2 109 chr15 45023427 45023547 -58471427 + MTB LTR MaLR 318 400 0 4 928 316 335 131 17 chr15 45024026 45024202 -58470772 - MLT1F-int LTR MaLR -512 859 664 4 928 504 352 90 33 chr15 45025297 45025726 -58469248 - MLT1F-int LTR MaLR -765 606 163 4 928 2386 100 152 0 chr15 45026056 45026465 -58468509 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 5 4 928 6083 46 4 12 chr15 45026469 45027221 -58467753 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 4 928 2197 68 0 0 chr15 45027220 45027498 -58467476 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 4 928 3902 53 2 18 chr15 45027498 45028001 -58466973 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 4 928 245 309 0 0 chr15 45028001 45028056 -58466918 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 5 928 1141 104 10 80 chr15 45028056 45028255 -58466719 - IAPEz-int LTR ERVK -6288 193 9 4 928 2386 100 152 0 chr15 45028256 45028665 -58466309 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 5 4 928 818 176 91 43 chr15 45032984 45033192 -58461782 + BGLII_B LTR ERVK 214 431 -10 5 928 3984 128 102 16 chr15 45036690 45037133 -58457841 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 336 6 928 3984 128 102 16 chr15 45037206 45037507 -58457467 - RMER17D2 LTR ERVK -474 335 1 6 928 371 279 26 35 chr15 45043189 45043304 -58451670 + MLT1A0 LTR MaLR 31 144 -221 7 928 753 218 0 41 chr15 45044784 45044956 -58450018 - RMER6C LTR ERVK -26 664 500 7 928 804 175 188 17 chr15 45044967 45045263 -58449711 - RMER6C LTR ERVK -322 398 1 7 928 1014 313 18 33 chr15 45053978 45054308 -58440666 + ORR1E LTR MaLR 2 326 -33 9 928 1444 254 131 48 chr15 45054292 45054563 -58440411 + ORR1E-int LTR MaLR 189 522 -848 9 928 1444 292 103 94 chr15 45054786 45055436 -58439538 + ORR1E-int LTR MaLR 523 1199 -171 9 928 1444 292 103 94 chr15 45055499 45055563 -58439411 + ORR1E-int LTR MaLR 1200 1261 -109 9 928 1345 148 68 84 chr15 45067708 45068091 -58426883 - RMER17C LTR ERVK -33 377 1 1 928 1302 221 39 62 chr15 45068999 45069356 -58425618 - MT2B LTR ERVL 0 601 253 1 928 367 252 68 48 chr15 45069721 45069899 -58425075 + MT2A LTR ERVL 94 375 -100 1 928 1170 257 69 42 chr15 45078097 45078503 -58416471 - RLTR20A2 LTR ERVK -161 417 1 1 928 647 294 145 43 chr15 45079931 45080255 -58414719 + RMER20B LTR ERVK 234 590 -37 1 928 475 206 46 37 chr15 45084574 45084715 -58410259 + MTD LTR MaLR 213 403 -18 1 929 5680 141 47 8 chr15 45110107 45111029 -58383945 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 1 929 861 280 80 36 chr15 45114689 45115052 -58379922 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 1 929 1562 264 10 24 chr15 45116616 45117031 -58377943 + MTD LTR MaLR 3 411 -8 1 929 2262 292 82 101 chr15 45117035 45118226 -58376748 + MTD-int LTR MaLR 1 1169 -89 1 929 421 269 21 28 chr15 45119075 45119107 -58375867 + MTD-int LTR MaLR 1115 1149 -109 1 929 421 269 21 28 chr15 45119134 45119246 -58375728 + MTD-int LTR MaLR 1150 1258 0 1 929 880 283 55 33 chr15 45119616 45119978 -58374996 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 929 382 287 103 43 chr15 45122076 45122309 -58372665 + MLT1C LTR MaLR 59 305 -162 1 929 1082 244 123 69 chr15 45141350 45141813 -58353161 - RMER13A LTR ERVK -372 488 1 1 929 1931 131 11 93 chr15 45145763 45146047 -58348927 + ORR1A2 LTR MaLR 3 269 -58 1 929 1931 131 11 93 chr15 45146330 45146399 -58348575 + ORR1A2 LTR MaLR 270 327 0 1 929 8820 164 30 60 chr15 45146399 45148245 -58346729 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1792 0 1 929 1895 121 36 60 chr15 45148245 45148579 -58346395 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 1 929 235 151 56 19 chr15 45148988 45149042 -58345932 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 56 -1752 1 929 2719 114 5 30 chr15 45151847 45152280 -58342694 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 2 929 427 166 74 163 chr15 45152629 45152831 -58342143 + RMER3D-int LTR ERVK 660 843 -1999 2 929 499 187 319 19 chr15 45152910 45153070 -58341904 + RMER3D-int LTR ERVK 1014 1221 -1621 2 929 4017 172 71 41 chr15 45153071 45154000 -58340974 - RMER17B LTR ERVK 0 958 2 2 929 5128 217 58 61 chr15 45154008 45155640 -58339334 + RMER3D-int LTR ERVK 1216 2841 -1 2 929 2536 112 76 2 chr15 45155641 45156034 -58338940 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 2 929 945 217 39 32 chr15 45161834 45162219 -58332755 - RMER6B LTR ERVK 0 461 14 2 929 705 307 98 70 chr15 45166505 45166946 -58328028 + RMER13A LTR ERVK 1 453 -407 2 929 297 259 188 8 chr15 45177900 45178017 -58316957 - MTE-int LTR MaLR -1184 396 259 2 929 450 271 15 15 chr15 45178339 45178470 -58316504 - MTEb LTR MaLR 0 379 249 2 929 1526 363 74 10 chr15 45178841 45179540 -58315434 + MTE-int LTR MaLR 795 1538 -42 2 929 565 312 70 90 chr15 45179539 45179895 -58315079 + ORR1E LTR MaLR 9 357 -2 2 929 1110 347 104 106 chr15 45185118 45186247 -58308727 + ORR1E-int LTR MaLR 16 1141 -439 2 929 3151 165 68 24 chr15 45186471 45187091 -58307883 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 46 2 929 626 276 149 62 chr15 45187877 45188186 -58306788 + ORR1E-int LTR MaLR 1218 1553 -27 2 929 271 301 99 88 chr15 45188168 45188350 -58306624 + ORR1E LTR MaLR 9 192 -167 2 929 314 357 102 86 chr15 45189440 45189814 -58305160 + LTR55 LTR ERV 140 519 -29 2 929 252 254 0 31 chr15 45190434 45190499 -58304475 + RLTR25A LTR ERVK 509 571 -532 2 929 2573 188 137 95 chr15 45190614 45191480 -58303494 - RMER17A2 LTR ERVK -3 903 1 2 929 286 346 73 51 chr15 45193001 45193102 -58301872 + MLT2B3 LTR ERVL 95 199 -355 2 929 286 346 73 51 chr15 45193148 45193183 -58301791 + MLT2B3 LTR ERVL 200 234 -320 2 929 670 319 46 32 chr15 45193303 45193585 -58301389 - MTE2a LTR MaLR -9 370 85 2 929 596 203 30 30 chr15 45195514 45195646 -58299328 - MTEa LTR MaLR -8 371 240 2 929 303 350 75 63 chr15 45195638 45195722 -58299252 + MTEa LTR MaLR 101 183 -196 2 929 303 350 75 63 chr15 45195827 45195915 -58299059 + MTEa LTR MaLR 184 275 -104 2 929 237 359 67 10 chr15 45195963 45196067 -58298907 - MTEa LTR MaLR -217 162 53 2 929 261 268 48 12 chr15 45196074 45196157 -58298817 - MTEa LTR MaLR -293 86 1 2 929 749 315 25 0 chr15 45200060 45200263 -58294711 + ORR1D2 LTR MaLR 1 208 -162 2 929 424 250 88 119 chr15 45200394 45200553 -58294421 + ORR1D2 LTR MaLR 217 370 0 2 929 1735 318 72 75 chr15 45201214 45202234 -58292740 - MTC-int LTR MaLR -165 1093 77 2 929 1162 286 8 93 chr15 45202235 45202681 -58292293 - RMER19C LTR ERVK 0 611 146 2 929 1376 272 35 41 chr15 45202710 45203104 -58291870 - MTD LTR MaLR -25 394 3 2 929 1390 289 74 55 chr15 45204313 45204753 -58290221 - RLTR40 LTR ERVK -82 735 287 2 929 1390 289 74 55 chr15 45204784 45205047 -58289927 - RLTR40 LTR ERVK -531 286 21 2 929 2626 206 57 13 chr15 45205646 45205730 -58289244 - RLTR20B3 LTR ERVK -7 570 485 2 929 2626 206 57 13 chr15 45205770 45206231 -58288743 - RLTR20B3 LTR ERVK -93 484 2 2 929 282 122 0 0 chr15 45207821 45207862 -58287112 - ORR1A4 LTR MaLR -175 154 114 3 929 1676 174 3 76 chr15 45208089 45208443 -58286531 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 2 3 929 226 253 157 22 chr15 45210183 45210272 -58284702 + LTR40a LTR ERVL 80 180 -339 3 929 333 200 86 32 chr15 45210300 45210393 -58284581 - RMER20A LTR ERVK -25 602 505 3 929 378 338 53 57 chr15 45210659 45211011 -58283963 - RLTR17 LTR ERVK -259 433 32 3 929 365 264 125 51 chr15 45211040 45211334 -58283640 - RMER20A LTR ERVK -82 545 211 3 929 496 362 56 18 chr15 45215517 45215801 -58279173 - MLT1A0 LTR MaLR -33 332 38 3 930 456 330 78 21 chr15 45225927 45226119 -58268855 - MER54A LTR ERVL -627 274 72 3 930 3021 74 5 2 chr15 45237581 45237976 -58256998 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 930 1733 257 10 185 chr15 45249802 45250532 -58244442 - RMER19C LTR ERVK 0 611 10 3 930 1275 295 43 8 chr15 45255989 45256361 -58238613 - MTD LTR MaLR -14 405 21 3 930 935 230 21 30 chr15 45256590 45256823 -58238151 + ORR1D1 LTR MaLR 85 315 -59 3 930 623 241 73 31 chr15 45263111 45263396 -58231578 - RMER19C LTR ERVK -354 257 1 3 930 4067 139 61 28 chr15 45264400 45264745 -58230229 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 460 3 930 4067 139 61 28 chr15 45264785 45265222 -58229752 - RMER17D2 LTR ERVK -350 459 1 3 930 274 235 71 29 chr15 45268510 45268580 -58226394 - MTB_Mm LTR MaLR -314 93 21 3 930 3143 206 20 38 chr15 45270298 45270949 -58224025 - RLTR26 LTR ERVK -1 641 3 3 930 5187 124 76 28 chr15 45274455 45275319 -58219655 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 3 930 1854 122 72 0 chr15 45276609 45276913 -58218061 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 3 930 660 286 47 67 chr15 45280202 45280457 -58214517 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 135 3 930 682 257 7 0 chr15 45281370 45281510 -58213464 - ORR1D1 LTR MaLR -233 141 1 3 930 280 400 76 24 chr15 45282294 45282545 -58212429 + LTR16A LTR ERVL 85 348 -103 3 930 2349 258 104 50 chr15 45286611 45287495 -58207479 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 932 -577 3 930 2684 200 17 34 chr15 45288424 45289013 -58205961 + ORR1C1-int LTR MaLR 931 1509 0 3 930 1170 202 153 24 chr15 45289013 45289307 -58205667 + ORR1C1 LTR MaLR 1 332 -46 3 930 345 372 40 13 chr15 45291909 45292059 -58202915 - MTEa LTR MaLR -225 154 1 4 930 2205 148 62 10 chr15 45299157 45299546 -58195428 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 930 744 305 9 30 chr15 45302978 45303211 -58191763 - ORR1E LTR MaLR -129 230 3 4 930 402 305 11 39 chr15 45304444 45304642 -58190332 - RMER13A LTR ERVK -4 904 673 4 930 1127 175 19 9 chr15 45304642 45304855 -58190119 - RMER13B LTR ERVK -592 316 102 4 930 688 272 30 0 chr15 45304867 45305036 -58189938 - RLTR26 LTR ERVK -468 174 1 4 930 680 221 123 128 chr15 45307690 45308064 -58186910 + MTE2a LTR MaLR 3 374 -5 4 930 1463 99 275 8 chr15 45308147 45308391 -58186583 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 4 930 330 80 38 0 chr15 45308416 45308469 -58186505 + RLTR10-int LTR ERVK 163 267 -7314 4 930 643 236 62 41 chr15 45308501 45308695 -58186279 + RLTR10-int LTR ERVK 655 852 -1135 4 930 345 255 120 19 chr15 45308792 45308900 -58186074 + RLTR10-int LTR ERVK 797 915 -6765 4 930 4299 312 48 36 chr15 45309061 45311787 -58183187 + IAP-d-int LTR ERVK 673 4396 -3010 4 930 307 298 51 36 chr15 45312485 45312680 -58182294 + RLTR45-int LTR ERVK 169 366 -6878 4 930 1599 201 139 83 chr15 45312813 45313336 -58181638 + RMER16-int LTR ERVK 241 688 -5449 4 930 529 204 88 0 chr15 45313323 45313436 -58181538 + RMER16-int LTR ERVK 938 1060 -5077 4 930 1178 231 62 24 chr15 45313449 45313738 -58181236 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2753 -4653 4 930 5225 175 64 107 chr15 45313774 45315686 -58179288 + RLTR45-int LTR ERVK 4122 5907 -1337 4 930 791 301 74 15 chr15 45315709 45316033 -58178941 + RNERVK23-int LTR ERVK 7506 7848 -369 4 930 2642 149 10 2 chr15 45316049 45316458 -58178516 + RLTR45-int LTR ERVK 6495 6906 -500 4 930 1976 40 0 4 chr15 45316458 45316708 -58178266 + RLTR10C LTR ERVK 188 436 0 4 930 591 305 61 12 chr15 45321137 45321457 -58173517 - MTD LTR MaLR 0 419 68 4 930 524 308 21 5 chr15 45333485 45333671 -58161303 - RMER5 LTR ERV1 -21 513 325 4 930 1827 246 110 81 chr15 45345126 45345735 -58149239 + RMER20B LTR ERVK 1 627 0 4 930 656 300 94 97 chr15 45346002 45346364 -58148610 + MTE2a LTR MaLR 19 379 0 4 931 823 357 88 38 chr15 45355892 45356367 -58138607 + MLT2B3 LTR ERVL 9 507 -47 5 931 3205 160 154 102 chr15 45359105 45359962 -58135012 + RMER17A2 LTR ERVK 1 902 -4 5 931 3706 140 128 12 chr15 45362077 45362447 -58132527 + RMER17D2 LTR ERVK 1 431 -378 5 931 3706 140 128 12 chr15 45362512 45362866 -58132108 + RMER17D2 LTR ERVK 432 809 0 5 931 4379 6 8 0 chr15 45368798 45369287 -58125687 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 931 922 303 128 24 chr15 45388681 45389016 -58105958 + MTE2a LTR MaLR 1 370 -9 5 931 2559 189 78 48 chr15 45389533 45390195 -58104779 - RMER6C LTR ERVK 0 690 9 5 931 1501 242 65 22 chr15 45397710 45398112 -58096862 - MTC LTR MaLR 0 421 3 5 931 414 221 53 99 chr15 45400978 45401149 -58093825 - RNLTR23 LTR ERVK -4 638 476 5 931 1714 220 94 7 chr15 45412022 45412448 -58082526 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 465 -62 5 931 256 283 112 15 chr15 45412716 45412867 -58082107 - MLT1A LTR MaLR -202 163 1 5 931 612 332 99 11 chr15 45429680 45430044 -58064930 + RMER20B LTR ERVK 129 516 0 5 931 438 282 26 0 chr15 45431004 45431121 -58063853 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 251 5 931 855 281 36 7 chr15 45445213 45445468 -58049506 + ORR1D1 LTR MaLR 1 276 -83 6 931 449 329 83 111 chr15 45446132 45446519 -58048455 - MTEa LTR MaLR 0 379 4 6 931 263 267 48 40 chr15 45456049 45456174 -58038800 - RLTR15 LTR ERVK -229 130 5 6 931 1317 212 92 6 chr15 45456565 45456892 -58038082 + RLTR15 LTR ERVK 3 357 -2 6 931 921 189 123 32 chr15 45457804 45458088 -58036886 + MYSERV6-int LTR ERVK 6403 6712 -2247 6 931 301 264 22 88 chr15 45458093 45458230 -58036744 + RLTR18-int LTR ERVK 4722 4849 -512 6 931 226 312 57 82 chr15 45459255 45459377 -58035597 + LTR90B LTR LTR 573 691 -105 6 931 755 321 119 19 chr15 45460588 45460906 -58034068 + MTD LTR MaLR 56 405 -14 6 931 4883 178 30 15 chr15 45463294 45464223 -58030751 - RMER17B LTR ERVK -12 946 4 6 931 2366 48 9 6 chr15 45469027 45469344 -58025630 + RLTR10 LTR ERVK 1 318 -72 6 931 266 159 0 31 chr15 45469365 45469430 -58025544 + RLTR10 LTR ERVK 259 321 -69 6 931 992 94 25 18 chr15 45469453 45469616 -58025358 + RLTR10 LTR ERVK 227 390 0 6 931 2456 192 135 15 chr15 45476116 45476791 -58018183 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 6 931 699 204 280 7 chr15 45477267 45477552 -58017422 - ORR1B1 LTR MaLR 0 367 5 6 932 1222 121 112 0 chr15 45488883 45489017 -58005957 + RMER17A2 LTR ERVK 1 146 -760 6 932 2833 186 86 35 chr15 45489066 45489892 -58005082 + RMER17A2 LTR ERVK 144 895 -11 6 932 1917 244 64 49 chr15 45492098 45492646 -58002328 + RMER2 LTR ERV1 1 556 -11 6 932 271 274 0 0 chr15 45493825 45493898 -58001076 - MERVK26-int LTR ERVK -2321 4598 4526 6 932 727 80 136 0 chr15 45495314 45495439 -57999535 - RLTR47_MM LTR ERV1 -386 146 5 6 932 1602 267 15 7 chr15 45495976 45496380 -57998594 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 932 329 263 109 8 chr15 45496659 45496778 -57998196 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 898 6 932 382 232 21 193 chr15 45496755 45496947 -57998027 - RLTR25B LTR ERVK -249 779 621 6 932 2361 118 140 2 chr15 45497027 45497477 -57997497 + RLTR47_MM LTR ERV1 21 532 0 6 932 1225 75 0 0 chr15 45497813 45497974 -57997000 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 186 6 932 1095 78 101 6 chr15 45497966 45498134 -57996840 + MTB LTR MaLR 217 400 0 6 932 3238 42 3 0 chr15 45498612 45498996 -57995978 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 1 6 932 1352 321 22 49 chr15 45499248 45499982 -57994992 + MuRRS4-int LTR ERV1 1050 1763 -3300 6 932 292 227 29 52 chr15 45500020 45500136 -57994838 + MuLV-int LTR ERV1 1987 2196 -5582 1 932 456 337 52 35 chr15 45500224 45500568 -57994406 + MuLV-int LTR ERV1 2094 2466 -5140 1 932 516 335 63 28 chr15 45500575 45501005 -57993969 + MuLV-int LTR ERV1 3991 4435 -3171 1 932 1486 286 18 27 chr15 45501331 45501869 -57993105 + MuRRS4-int LTR ERV1 3591 4014 -1049 2 932 646 309 18 46 chr15 45502318 45502723 -57992251 + MuRRS4-int LTR ERV1 4544 4909 -154 2 932 1896 122 276 0 chr15 45502842 45503259 -57991715 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 532 0 3 932 1249 178 14 9 chr15 45503719 45503940 -57991034 + RLTR23 LTR ERV1 11 232 -198 4 932 807 277 71 26 chr15 45504332 45504640 -57990334 + RLTR41 LTR ERV1 125 446 0 5 932 497 321 48 47 chr15 45505186 45505518 -57989456 + MuRRS4-int LTR ERV1 1159 1715 -6063 8 932 747 328 44 58 chr15 45505908 45506556 -57988418 + MuRRS4-int LTR ERV1 1949 2493 -2570 8 932 404 292 60 12 chr15 45507759 45507948 -57987026 + MuRRS4-int LTR ERV1 7334 7499 -279 8 932 2388 149 28 39 chr15 45508107 45508541 -57986433 + RLTR23 LTR ERV1 2 430 0 9 932 752 232 72 57 chr15 45508620 45508885 -57986089 - RLTR25B LTR ERVK -583 445 177 1 932 1147 255 25 39 chr15 45511000 45511350 -57983624 - RLTR11A LTR ERVK -4 524 188 1 932 807 239 69 36 chr15 45511364 45511611 -57983363 - RLTR11A LTR ERVK -270 258 4 1 932 1501 185 19 67 chr15 45511776 45512089 -57982885 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 29 1 932 2554 98 11 8 chr15 45520939 45521310 -57973664 - RLTR9A2 LTR ERVK -9 374 3 2 932 472 222 116 67 chr15 45521595 45521870 -57973104 - ETnERV2-int LTR ERVK -983 6423 6223 2 932 492 218 45 18 chr15 45521839 45521951 -57973023 - ETnERV2-int LTR ERVK -1195 6211 6097 2 932 4969 142 60 26 chr15 45521959 45522876 -57972098 - ETnERV2-int LTR ERVK -1230 4176 3229 2 932 274 151 38 0 chr15 45522964 45523017 -57971957 - ETnERV2-int LTR ERVK -2546 2860 2806 2 932 4083 65 44 20 chr15 45523017 45523568 -57971406 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 3 932 281 176 104 52 chr15 45523568 45523664 -57971310 + RLTR1B-int LTR ERV1 1 101 -3597 3 932 720 75 0 0 chr15 45523770 45523863 -57971111 + RLTR1B-int LTR ERV1 201 293 -3006 3 932 995 145 63 16 chr15 45524210 45524399 -57970575 + RMER16-int LTR ERVK 141 338 -5068 3 932 4478 152 17 15 chr15 45524404 45525157 -57969817 + RMER16-int LTR ERVK 690 1444 -3962 3 932 316 148 0 32 chr15 45525148 45525211 -57969763 + RLTR1B-int LTR ERV1 760 820 -4243 3 932 2880 256 41 33 chr15 45525260 45525896 -57969078 + RLTR1B-int LTR ERV1 1014 1662 -3401 3 932 2880 81 38 42 chr15 45525939 45526592 -57968382 + RLTR1B-int LTR ERV1 1172 1911 -1388 3 932 1934 142 55 18 chr15 45533096 45533478 -57961496 + RLTR1B-int LTR ERV1 2453 2749 -949 3 932 7438 166 45 81 chr15 45533475 45533891 -57961083 - ETnERV2-int LTR ERVK -4664 2742 2392 2 932 7438 166 45 81 chr15 45534076 45535398 -57959576 - ETnERV2-int LTR ERVK -5015 2391 1066 2 932 2328 119 35 63 chr15 45535799 45536193 -57958781 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 1 3 932 275 339 134 30 chr15 45537006 45537274 -57957700 - ERVL-E-int LTR ERVL -1214 4500 4205 4 932 510 360 56 31 chr15 45537311 45537755 -57957219 - ERVL-E-int LTR ERVL -1634 4033 3579 4 932 2509 132 55 34 chr15 45538363 45538835 -57956139 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 4 932 1042 136 38 5 chr15 45544014 45544199 -57950775 + RMER6C LTR ERVK 500 690 0 5 932 899 214 36 0 chr15 45549643 45549839 -57945135 + ORR1A3 LTR MaLR 124 326 0 5 932 1554 252 158 51 chr15 45550137 45550689 -57944285 - RMER20B LTR ERVK -16 611 1 5 932 335 353 21 42 chr15 45554400 45554542 -57940432 - MLT1A1 LTR MaLR -28 380 242 6 932 420 296 101 42 chr15 45556121 45556428 -57938546 + RLTR15 LTR ERVK 19 343 -16 6 932 4176 197 61 60 chr15 45559301 45559394 -57935580 - RMER13B LTR ERVK 0 908 818 7 932 4176 197 61 60 chr15 45559425 45560238 -57934736 - RMER13B LTR ERVK -91 817 1 7 932 925 173 36 36 chr15 45566360 45566552 -57928422 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 193 8 932 346 145 0 16 chr15 45566552 45566615 -57928359 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 414 8 932 1249 129 0 5 chr15 45566617 45566804 -57928170 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5300 5485 -276 8 932 315 257 67 29 chr15 45566864 45566968 -57928006 + ORR1A3-int LTR MaLR 533 640 -1323 8 932 2270 124 172 38 chr15 45567003 45567422 -57927552 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 8 932 457 159 0 120 chr15 45567451 45567551 -57927423 - ORR1C2 LTR MaLR -263 121 34 8 932 285 310 19 29 chr15 45568129 45568232 -57926742 - MLT1F2 LTR MaLR -103 457 356 8 932 3388 169 50 23 chr15 45580851 45581583 -57913391 - RMER6A LTR ERVK 0 756 5 9 932 321 267 34 34 chr15 45601054 45601143 -57893831 + ORR1E LTR MaLR 28 116 -243 1 932 311 320 53 34 chr15 45602054 45602276 -57892698 - MLT2C1 LTR ERVL -176 238 12 1 932 356 305 45 74 chr15 45603477 45603603 -57891371 - MLT1B LTR MaLR -7 383 270 1 932 2869 95 2 12 chr15 45603603 45604007 -57890967 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 932 356 305 45 74 chr15 45604007 45604082 -57890892 - MLT1B LTR MaLR -121 269 188 1 932 953 274 143 3 chr15 45611634 45611927 -57883047 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 40 1 932 392 268 0 3 chr15 45611933 45612051 -57882923 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1275 1 932 288 358 38 38 chr15 45612181 45612338 -57882636 + RLTR14 LTR ERV1 226 382 0 1 932 390 323 30 24 chr15 45612338 45612495 -57882479 + ORR1D-int LTR MaLR 52 209 -1161 1 933 1885 178 24 3 chr15 45613700 45614039 -57880935 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 933 8600 175 81 19 chr15 45614039 45615887 -57879087 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1963 1 1 933 311 164 0 0 chr15 45615887 45615942 -57879032 - ORR1A1 LTR MaLR 0 326 272 1 933 1246 152 77 153 chr15 45616172 45616248 -57878726 - ORR1A1 LTR MaLR -45 301 257 1 933 1432 152 77 153 chr15 45616771 45617020 -57877954 - ORR1A1 LTR MaLR -90 256 1 1 933 316 270 106 39 chr15 45617023 45617127 -57877847 + MTE2a LTR MaLR 57 167 -212 1 933 454 267 68 8 chr15 45617152 45617284 -57877690 + MTE2a LTR MaLR 240 379 0 1 933 1797 196 86 21 chr15 45618551 45618795 -57876179 - RMER6B LTR ERVK 0 461 218 1 933 1797 196 86 21 chr15 45618830 45619018 -57875956 - RMER6B LTR ERVK -244 217 3 1 933 559 183 48 0 chr15 45619019 45619123 -57875851 - RMER6B LTR ERVK -350 111 3 1 933 1106 342 60 6 chr15 45622498 45622983 -57871991 - LTR75 LTR ERVL 0 562 52 1 933 4372 137 64 8 chr15 45624645 45625411 -57869563 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 1 933 233 327 19 9 chr15 45626375 45626483 -57868491 - LTR40a LTR ERVL -2 460 352 1 933 319 378 26 0 chr15 45626725 45626876 -57868098 - LTR40a LTR ERVL -362 157 3 1 933 1087 226 87 103 chr15 45638998 45639025 -57855949 + ORR1D1 LTR MaLR 1 27 -347 1 933 3728 35 5 0 chr15 45639025 45639459 -57855515 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 1 933 1087 226 87 103 chr15 45639459 45639810 -57855164 + ORR1D1 LTR MaLR 28 373 -1 1 933 830 358 45 15 chr15 45642316 45642648 -57852326 - MTE2b LTR MaLR -20 359 18 1 933 3724 119 7 14 chr15 45651038 45651609 -57843365 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 1 933 1240 202 167 41 chr15 45659767 45660108 -57834866 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 1 933 1327 264 57 27 chr15 45661056 45661461 -57833513 - MTD LTR MaLR 0 419 3 2 933 1569 235 43 24 chr15 45666627 45666998 -57827976 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 933 239 376 25 17 chr15 45668851 45668970 -57826004 + MLT1E LTR MaLR 495 614 -39 2 933 604 171 0 9 chr15 45677408 45677520 -57817454 - MTB-int LTR MaLR -987 111 1 2 933 2406 145 18 5 chr15 45677520 45677915 -57817059 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 933 1261 146 41 5 chr15 45679959 45680180 -57814794 - RMER17A LTR ERVK 0 751 523 2 933 548 94 0 0 chr15 45680374 45680462 -57814512 - RMER3D-int LTR ERVK -2278 564 489 2 933 1071 228 34 95 chr15 45694076 45694203 -57800771 - RMER17C LTR ERVK -8 402 268 2 933 1071 228 34 95 chr15 45694261 45694476 -57800498 - RMER17C LTR ERVK -143 267 85 2 933 1071 208 134 26 chr15 45694529 45694645 -57800329 - RMER17C LTR ERVK -326 84 17 2 933 291 225 36 48 chr15 45695159 45695243 -57799731 - MER67D LTR ERV1 -293 418 336 2 933 550 242 56 102 chr15 45695263 45695479 -57799495 - MER67D LTR ERV1 -308 206 1 2 933 2414 184 63 57 chr15 45699603 45700287 -57794687 - RMER6C LTR ERVK 0 690 3 2 933 443 312 127 83 chr15 45702190 45702553 -57792421 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 2 933 694 275 122 57 chr15 45703232 45703583 -57791391 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 933 851 224 56 31 chr15 45703931 45704306 -57790668 - RMER6A LTR ERVK 0 720 472 2 933 547 150 38 38 chr15 45704377 45704492 -57790482 - RMER6A LTR ERVK -597 123 10 2 933 454 245 53 88 chr15 45704511 45704681 -57790293 - ORR1C2 LTR MaLR -218 166 3 2 933 274 317 20 10 chr15 45704681 45704775 -57790199 + ORR1C2 LTR MaLR 287 381 -3 2 933 1164 225 152 30 chr15 45705744 45706079 -57788895 + MTD LTR MaLR 38 413 -6 2 933 318 311 38 0 chr15 45706693 45706799 -57788175 + MTE2a LTR MaLR 1 110 -269 2 933 274 276 108 35 chr15 45707005 45707206 -57787768 - RMER20A LTR ERVK -194 433 223 2 933 730 322 20 41 chr15 45707403 45707649 -57787325 + MTE2a LTR MaLR 125 365 -14 2 933 436 236 8 39 chr15 45707906 45708034 -57786940 - RMER21A LTR ERV1 -374 573 450 2 933 237 286 295 0 chr15 45708105 45708217 -57786757 + RMER21A LTR ERV1 169 313 -634 2 933 696 296 37 65 chr15 45708898 45709115 -57785859 - MTE2a LTR MaLR -168 211 1 2 933 944 239 67 49 chr15 45713087 45713559 -57781415 + RLTR24 LTR ERV1 1 424 -105 2 933 4200 161 83 37 chr15 45731338 45732278 -57762696 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 1 3 933 2052 70 0 7 chr15 45733053 45733339 -57761635 - BGLII LTR ERVK -137 284 1 3 933 6953 118 31 83 chr15 45733339 45734609 -57760365 + RLTR22_Mur LTR ERVK 646 1848 0 3 933 247 335 151 17 chr15 45736491 45736670 -57758304 + MTD LTR MaLR 19 221 -198 3 933 560 323 20 15 chr15 45738217 45738415 -57756559 - RMER15 LTR ERVL -106 469 271 3 933 2394 105 154 10 chr15 45738949 45739364 -57755610 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 933 13159 21 9 1 chr15 45739374 45741231 -57753743 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1986 -1 3 933 2176 86 16 3 chr15 45741231 45741545 -57753429 + RLTR10 LTR ERVK 1 318 -72 3 933 259 82 0 39 chr15 45741582 45741633 -57753341 + RLTR10 LTR ERVK 259 307 -83 3 933 867 135 39 0 chr15 45741638 45741794 -57753180 + RLTR10 LTR ERVK 227 388 -2 3 116 4104 175 65 58 chr15 45743877 45744854 -57750120 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 1 3 934 5067 300 34 26 chr15 45745148 45746781 -57748193 + RodERV21-int LTR ERV1 1121 2766 -2225 3 934 503 326 31 52 chr15 45746906 45747352 -57747622 + RodERV21-int LTR ERV1 3638 4074 -3017 3 934 285 363 12 12 chr15 45747578 45747748 -57747226 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 3470 3639 -3962 3 934 355 266 15 15 chr15 45748228 45748358 -57746616 + RodERV21-int LTR ERV1 4978 5107 -1984 3 934 346 307 53 6 chr15 45748751 45748981 -57745993 + RodERV21-int LTR ERV1 5675 5771 -1320 3 934 3485 344 38 49 chr15 45749155 45751071 -57743903 + RodERV21-int LTR ERV1 2694 4597 -394 3 934 2548 111 54 74 chr15 45751071 45751556 -57743418 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 934 3485 344 38 49 chr15 45751556 45751781 -57743193 + RodERV21-int LTR ERV1 4598 4812 -179 3 934 307 183 17 0 chr15 45755075 45755135 -57739839 + MTC LTR MaLR 5 65 -356 3 934 4263 143 54 13 chr15 45776059 45776836 -57718138 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 3 934 1985 195 108 31 chr15 45777441 45777922 -57717052 + RLTR11A LTR ERVK 11 528 0 3 934 2897 166 58 43 chr15 45780347 45781020 -57713954 + RMER6C LTR ERVK 4 686 -4 3 934 1897 222 82 27 chr15 45797956 45798515 -57696459 + RMER6C LTR ERVK 97 686 -4 3 934 293 280 21 11 chr15 45803899 45803993 -57690981 - MTEb LTR MaLR -7 372 278 4 934 2334 87 30 3 chr15 45804254 45804590 -57690384 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 4 934 238 283 0 0 chr15 45821758 45821811 -57673163 + ORR1D2 LTR MaLR 6 58 -301 4 934 321 326 33 78 chr15 45821813 45821966 -57673008 + ORR1D2 LTR MaLR 36 181 -189 4 934 438 216 0 89 chr15 45821990 45822102 -57672872 + ORR1D2 LTR MaLR 260 361 -9 4 934 553 233 29 78 chr15 45843921 45844135 -57650839 - RLTR9A LTR ERVK -2 401 195 4 934 3504 207 115 14 chr15 45844776 45845670 -57649304 - ETnERV2-int LTR ERVK -1202 6204 5220 4 934 3629 283 50 31 chr15 45845896 45848083 -57646891 - ETnERV2-int LTR ERVK -2600 4806 1787 4 934 2988 83 2 8 chr15 45848221 45848623 -57646351 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 934 660 291 4 23 chr15 45852338 45852628 -57642346 - ETnERV2-int LTR ERVK -5069 2337 2195 4 934 3480 189 13 17 chr15 45852729 45853418 -57641556 - RMER16-int LTR ERVK -3822 1584 899 4 934 491 301 82 41 chr15 45853683 45853926 -57641048 - RLTR9A LTR ERVK -2 366 114 4 934 1253 252 45 100 chr15 45867747 45868560 -57626414 - RMER17B LTR ERVK -3 857 274 4 934 944 170 225 27 chr15 45868846 45869160 -57625814 - RLTR9E LTR ERVK -29 408 1 4 934 484 67 25 62 chr15 45869162 45869242 -57625732 - ETnERV2-int LTR ERVK -3 7403 7327 4 934 649 202 247 12 chr15 45869246 45869519 -57625455 - RLTR13D6 LTR ERVK -371 531 192 4 934 20974 114 31 40 chr15 45869519 45869924 -57625050 - ETnERV2-int LTR ERVK -229 7177 6712 4 934 20974 114 31 40 chr15 45869976 45872789 -57622185 - ETnERV2-int LTR ERVK -229 6711 3471 4 934 260 207 0 0 chr15 45872806 45872864 -57622110 + RNERVK23-int LTR ERVK 3345 3402 -4815 4 116 10191 239 33 20 chr15 45872859 45875847 -57619127 - ETnERV2-int LTR ERVK -3269 2898 2 4 935 1073 221 138 32 chr15 45875848 45876218 -57618756 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 935 2376 273 25 105 chr15 45876778 45877800 -57617174 + RMER17B LTR ERVK 1 941 -17 4 935 2991 29 0 0 chr15 45882653 45882999 -57611975 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 935 617 319 30 21 chr15 45891996 45892230 -57602744 - RLTR16 LTR ERVK -246 259 24 5 935 391 309 216 34 chr15 45898746 45899100 -57595874 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 935 1627 257 22 15 chr15 45901884 45902291 -57592683 - MTC LTR MaLR 0 421 12 5 935 3631 140 15 72 chr15 45910757 45911551 -57583423 - RMER17A LTR ERVK 0 751 3 5 935 1039 270 89 51 chr15 45918803 45919174 -57575800 + MTD LTR MaLR 1 385 -34 5 935 1038 202 22 97 chr15 45924027 45924295 -57570679 + ORR1A4 LTR MaLR 74 321 -8 5 935 1957 216 69 52 chr15 45925334 45925872 -57569102 + RLTR20B1 LTR ERVK 2 548 -15 5 935 398 299 22 11 chr15 45926194 45926342 -57568632 + MTE2a LTR MaLR 213 371 -8 5 935 541 333 86 12 chr15 45934608 45934863 -57560111 - RMER15 LTR ERVL -2 573 300 5 935 5364 123 20 22 chr15 45939532 45940436 -57554538 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 5 935 990 290 98 65 chr15 45952113 45952195 -57542779 - RLTR20B3 LTR ERVK -1 576 483 6 935 990 290 98 65 chr15 45952237 45952692 -57542282 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 23 6 935 5044 198 20 1 chr15 45953493 45954542 -57540432 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -93 2233 1165 6 935 3302 230 5 70 chr15 45956253 45957178 -57537796 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1156 1170 306 6 935 305 252 42 56 chr15 45957178 45957321 -57537653 - RLTR9B LTR ERVK 0 437 297 6 935 1459 211 10 13 chr15 45957544 45957856 -57537118 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -2015 311 1 6 935 916 299 85 48 chr15 45959071 45959621 -57535353 - RLTR20B3 LTR ERVK -13 564 19 6 935 3490 171 123 7 chr15 45959783 45960466 -57534508 - RMER13B LTR ERVK -142 766 5 6 935 671 295 54 27 chr15 45962481 45962704 -57532270 + ORR1D1 LTR MaLR 145 373 -1 6 935 230 299 104 0 chr15 45964963 45965040 -57529934 + LTR84a LTR ERVL 131 215 -542 6 935 407 307 83 6 chr15 45976031 45976211 -57518763 - MLT1D LTR MaLR -302 203 10 6 935 368 277 42 51 chr15 45976426 45976544 -57518430 + MTEa LTR MaLR 262 378 -1 6 935 314 222 28 0 chr15 45981910 45981982 -57512992 - ORR1D2 LTR MaLR -296 74 1 6 935 475 254 98 0 chr15 45984723 45984845 -57510129 - RLTR40 LTR ERVK -13 804 671 6 935 3583 169 216 22 chr15 45992900 45993723 -57501251 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 6 935 1980 234 68 89 chr15 45994065 45994774 -57500200 - RLTR40 LTR ERVK -117 700 7 6 935 3321 230 109 18 chr15 46003527 46004315 -57490659 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 9 935 495 103 126 0 chr15 46004434 46004521 -57490453 - RLTR47_MM LTR ERV1 -434 98 1 1 935 1542 290 21 12 chr15 46005763 46006242 -57488732 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1048 4015 3533 1 936 508 293 41 45 chr15 46006598 46006888 -57488086 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1946 3117 2929 1 936 265 225 0 40 chr15 46006970 46007044 -57487930 + ORR1D2 LTR MaLR 300 370 0 1 936 234 373 57 0 chr15 46007057 46007215 -57487759 + ORR1B1-int LTR MaLR 68 234 -1136 1 936 1908 329 77 45 chr15 46007384 46007814 -57487160 + ORR1B1-int LTR MaLR 232 641 -729 1 936 1908 329 77 45 chr15 46007856 46008428 -57486546 + ORR1B1-int LTR MaLR 642 1265 -105 1 936 1278 216 28 10 chr15 46010344 46010634 -57484340 + RodERV21-int LTR ERV1 1673 1967 -3024 1 936 1293 276 9 9 chr15 46010668 46010997 -57483977 + RodERV21-int LTR ERV1 2076 2404 -2587 1 936 2615 244 35 101 chr15 46011002 46012056 -57482918 + RMER17B LTR ERVK 1 860 -48 1 936 1389 212 49 97 chr15 46012184 46012575 -57482399 + ORR1B1 LTR MaLR 15 386 -8 1 936 811 201 37 12 chr15 46013701 46013862 -57481112 + RLTR26 LTR ERVK 478 642 0 2 936 269 143 0 0 chr15 46013866 46013908 -57481066 + ORR1B1 LTR MaLR 347 388 -6 2 936 6598 220 27 102 chr15 46013919 46014779 -57480195 + ORR1B1-int LTR MaLR 6 769 -1194 2 936 6598 220 27 102 chr15 46014959 46016152 -57478822 + ORR1B1-int LTR MaLR 770 1905 -58 2 936 1286 249 21 81 chr15 46016179 46016531 -57478443 + ORR1B1 LTR MaLR 1 343 -51 2 936 1286 249 21 81 chr15 46016678 46016744 -57478230 + ORR1B1 LTR MaLR 344 394 0 2 936 823 241 138 47 chr15 46047824 46048483 -57446491 - RMER6A LTR ERVK -38 718 98 5 936 473 164 192 33 chr15 46048971 46049091 -57445883 - RMER6A LTR ERVK -551 139 1 5 936 2176 161 31 20 chr15 46050253 46050645 -57444329 + RLTR26 LTR ERVK 1 396 -246 6 936 3137 46 5 22 chr15 46050949 46051352 -57443622 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 936 557 232 59 81 chr15 46051716 46052018 -57442956 + RMER16 LTR ERVK 1 379 -154 6 936 478 311 44 72 chr15 46056309 46056583 -57438391 - ORR1D1 LTR MaLR -96 274 5 7 936 693 241 87 25 chr15 46057281 46057518 -57437456 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 653 7 936 539 324 42 28 chr15 46057487 46057703 -57437271 + MTE2a LTR MaLR 156 374 -5 7 936 1858 237 57 57 chr15 46059194 46059718 -57435256 - RMER6D LTR ERVK -25 695 172 7 936 242 240 51 39 chr15 46069534 46069612 -57425362 - MTEa LTR MaLR -22 357 279 9 936 3392 186 55 12 chr15 46075814 46076503 -57418471 - RMER6D LTR ERVK -1 719 1 1 936 1573 163 0 0 chr15 46077473 46077725 -57417249 + ORR1A2 LTR MaLR 1 252 -75 1 936 3677 171 19 3 chr15 46077720 46078358 -57416616 + ORR1A2-int LTR MaLR 1316 1963 0 1 936 1797 120 57 22 chr15 46078358 46078674 -57416300 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 936 1460 224 28 72 chr15 46081076 46081533 -57413441 + RMER6C LTR ERVK 1 437 -253 1 936 1187 210 16 4 chr15 46081601 46081850 -57413124 + RMER6C LTR ERVK 391 642 -48 1 936 316 344 82 13 chr15 46085577 46085736 -57409238 - MER70A LTR ERVL 0 472 303 1 936 3425 20 2 0 chr15 46087463 46087858 -57407116 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 936 9276 25 2 1 chr15 46087858 46088953 -57406021 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1096 -2 1 936 3215 21 39 0 chr15 46088955 46089336 -57405638 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 936 1405 106 19 9 chr15 46092858 46093068 -57401906 - MTB_Mm LTR MaLR -15 392 181 1 936 1171 55 6 52 chr15 46093373 46093547 -57401427 - MTB_Mm LTR MaLR -241 166 1 1 936 732 156 45 50 chr15 46093547 46093726 -57401248 - MTB_Mm-int LTR MaLR -42 1216 978 1 936 4466 159 63 77 chr15 46094035 46095015 -57399959 - MTB_Mm-int LTR MaLR -131 967 1 1 936 710 144 0 0 chr15 46095017 46095128 -57399846 - MTB_Mm LTR MaLR -2 405 295 1 936 225 180 32 32 chr15 46095129 46095192 -57399782 + RLTR22_Mus LTR ERVK 290 352 -1456 1 936 1020 293 105 19 chr15 46102929 46103291 -57391683 - MTD LTR MaLR -14 405 13 1 936 1197 301 34 3 chr15 46103575 46103931 -57391043 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 3 1 936 2431 317 42 55 chr15 46105073 46106144 -57388830 + MTD-int LTR MaLR 3 1059 -199 1 936 1079 298 32 9 chr15 46106151 46106466 -57388508 + ORR1D1 LTR MaLR 1 322 -52 1 936 402 272 59 37 chr15 46106703 46106890 -57388084 + MTD-int LTR MaLR 1068 1258 0 1 936 940 284 100 34 chr15 46106890 46107269 -57387705 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 1 936 334 281 34 0 chr15 46111239 46111328 -57383646 - MLT2B3 LTR ERVL -457 97 6 1 936 279 330 102 49 chr15 46111335 46111561 -57383413 - MTE-int LTR MaLR -2 1578 1341 1 936 658 373 51 56 chr15 46112574 46113006 -57381968 - MTE-int LTR MaLR -216 1364 935 1 936 611 380 54 44 chr15 46113499 46113978 -57380996 - MTE-int LTR MaLR -1068 512 29 1 936 296 352 10 25 chr15 46125679 46125883 -57369091 + ERVL-B4-int LTR ERVL 30 230 -5484 1 936 384 312 148 36 chr15 46130077 46130496 -57364478 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2572 3037 -2677 1 936 345 264 67 55 chr15 46137105 46137269 -57357705 - RNLTR23 LTR ERVK -1 641 476 2 937 2655 281 17 10 chr15 46137938 46138141 -57356833 - RNERVK23-int LTR ERVK -403 7814 7612 2 937 2655 281 17 10 chr15 46138185 46138758 -57356216 - RNERVK23-int LTR ERVK -606 7611 7034 2 937 553 328 0 0 chr15 46138765 46138936 -57356038 - RNERVK23-int LTR ERVK -3876 4341 4171 2 937 1969 294 17 26 chr15 46138972 46139667 -57355307 - RNERVK23-int LTR ERVK -6231 1986 1298 2 937 1032 260 51 14 chr15 46139803 46140099 -57354875 - RNERVK23-int LTR ERVK -7728 489 183 2 937 350 274 17 73 chr15 46140308 46140485 -57354489 - RNLTR23 LTR ERVK -2 640 474 2 937 249 222 0 0 chr15 46148945 46148999 -57345975 + RMER6A LTR ERVK 703 756 0 2 937 1215 328 66 49 chr15 46154913 46155986 -57338988 + MuLV-int LTR ERV1 2350 3440 -4166 2 937 527 311 23 19 chr15 46155990 46156206 -57338768 + MuLV-int LTR ERV1 3615 3831 -3770 2 937 1871 321 21 24 chr15 46156595 46157384 -57337590 + MuRRS4-int LTR ERV1 3530 4316 -747 2 937 4212 25 0 0 chr15 46157607 46158089 -57336885 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 2 937 1760 317 54 49 chr15 46158121 46159848 -57335126 + MMERGLN-int LTR ERV1 5730 7717 -61 2 937 337 351 87 38 chr15 46160152 46160439 -57334535 + RLTR41 LTR ERV1 146 446 0 2 937 242 327 27 63 chr15 46164511 46164622 -57330352 + MLT1C LTR MaLR 71 177 -290 2 937 3485 18 2 0 chr15 46187252 46187647 -57307327 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 937 9278 25 3 1 chr15 46187647 46188743 -57306231 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 2 937 3485 18 2 0 chr15 46188743 46189138 -57305836 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 937 5414 147 43 13 chr15 46191817 46192747 -57302227 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 2 937 1835 139 30 77 chr15 46203129 46203465 -57291509 - ORR1A2 LTR MaLR -7 320 1 2 937 723 44 0 0 chr15 46205884 46205975 -57288999 + IAPLTR3 LTR ERVK 1 91 -235 2 937 1978 110 3 37 chr15 46205937 46206258 -57288716 - IAPLTR3 LTR ERVK -16 310 1 2 937 446 325 37 18 chr15 46209933 46210096 -57284878 - MTE2b LTR MaLR -131 248 83 2 937 1830 112 28 28 chr15 46210183 46210505 -57284469 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 937 3279 33 8 0 chr15 46211771 46212164 -57282810 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 937 323 373 88 62 chr15 46213856 46214196 -57280778 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -10 2 937 515 255 69 6 chr15 46214635 46214782 -57280192 - MTD LTR MaLR -53 366 181 2 937 405 322 149 65 chr15 46215452 46215613 -57279361 - MTD LTR MaLR -216 180 10 2 937 3354 141 121 20 chr15 46224062 46224403 -57270571 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 453 3 937 3354 141 121 20 chr15 46224462 46224806 -57270168 - RMER17D2 LTR ERVK -357 452 56 3 937 311 371 72 17 chr15 46227791 46227972 -57267002 - MLT1F2 LTR MaLR -80 480 290 3 937 238 264 51 71 chr15 46231689 46231787 -57263187 + RMER20A LTR ERVK 185 280 -236 3 937 233 254 45 0 chr15 46235392 46235459 -57259515 + MTEb LTR MaLR 306 375 -4 3 937 648 346 64 18 chr15 46245464 46245791 -57249183 + MLT1A1 LTR MaLR 57 398 -10 3 937 281 275 38 29 chr15 46246458 46246563 -57248411 + MLT1A LTR MaLR 269 374 0 3 937 3593 170 35 72 chr15 46246817 46247552 -57247422 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 703 -1145 3 937 3593 170 35 72 chr15 46247643 46247742 -57247232 + RLTR22_Mur LTR ERVK 704 803 -1045 3 937 1493 167 0 19 chr15 46249922 46250184 -57244790 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1592 1848 0 3 937 1217 212 12 35 chr15 46250887 46251141 -57243833 + RMER19C LTR ERVK 32 279 -332 3 937 229 272 84 24 chr15 46258188 46258271 -57236703 - LTR16C LTR ERVL -374 115 28 3 937 2615 202 54 60 chr15 46259613 46260008 -57234966 + RMER6C LTR ERVK 1 369 -321 3 937 4874 138 22 86 chr15 46260008 46260715 -57234259 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 662 -240 3 937 4874 138 22 86 chr15 46260861 46261117 -57233857 + RLTR13D6 LTR ERVK 663 902 0 3 937 2615 202 54 60 chr15 46261117 46261404 -57233570 + RMER6C LTR ERVK 370 679 -11 3 937 570 329 108 30 chr15 46261628 46261960 -57233014 + ORR1D2 LTR MaLR 9 366 -4 3 937 3537 147 71 32 chr15 46262219 46262998 -57231976 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 3 937 1531 228 70 58 chr15 46263397 46263723 -57231251 + MTC LTR MaLR 1 348 -73 3 937 1531 228 70 58 chr15 46263868 46263955 -57231019 + MTC LTR MaLR 349 419 -2 3 937 926 310 21 68 chr15 46266131 46266557 -57228417 - MTD LTR MaLR 0 419 14 3 938 1257 216 257 50 chr15 46274052 46274616 -57220358 + RMER6C LTR ERVK 10 690 0 3 938 962 278 95 19 chr15 46276433 46276549 -57218425 + ORR1D1 LTR MaLR 21 172 -202 3 938 962 263 99 15 chr15 46276590 46276780 -57218194 + ORR1D1 LTR MaLR 173 372 -2 3 938 267 372 122 68 chr15 46285798 46286242 -57208732 + MER74A LTR ERVL 12 479 -79 3 938 2467 221 44 63 chr15 46289208 46289467 -57205507 + RMER6C LTR ERVK 21 284 -406 3 938 2467 221 44 63 chr15 46290334 46290739 -57204235 + RMER6C LTR ERVK 285 672 -18 3 938 1471 276 24 22 chr15 46296983 46297487 -57197487 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 4 938 1986 115 30 47 chr15 46297654 46298019 -57196955 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 10 4 938 921 275 149 15 chr15 46298034 46298370 -57196604 - MTD LTR MaLR -34 385 5 4 938 1400 224 80 0 chr15 46311744 46312043 -57182931 + RLTR17 LTR ERVK 353 675 -17 4 938 7134 209 52 50 chr15 46312065 46314473 -57180501 + RMER3D-int LTR ERVK 23 2842 0 4 938 1787 161 74 31 chr15 46314473 46314825 -57180149 + RLTR17 LTR ERVK 1 367 -325 4 938 347 315 22 52 chr15 46319075 46319209 -57175765 + ORR1D2 LTR MaLR 8 137 -233 4 938 256 314 71 59 chr15 46319967 46320136 -57174838 - MLT1B LTR MaLR -217 173 3 4 938 245 338 100 0 chr15 46320685 46320765 -57174209 + MLT1A0 LTR MaLR 20 107 -258 4 938 277 327 9 80 chr15 46320820 46320933 -57174041 - MTEa LTR MaLR -272 107 3 4 938 333 241 35 0 chr15 46325565 46325652 -57169322 - MTEa LTR MaLR 0 379 290 4 938 1155 279 112 40 chr15 46325663 46326192 -57168782 + RMER15 LTR ERVL 8 574 -1 4 938 332 204 120 34 chr15 46326310 46326427 -57168547 - MTEa LTR MaLR -230 129 3 4 938 587 349 60 0 chr15 46326812 46327040 -57167934 - MTE2b LTR MaLR -69 310 69 4 938 659 291 289 58 chr15 46327040 46327579 -57167395 + RMER13A LTR ERVK 1 689 -219 4 938 386 162 49 12 chr15 46329671 46329752 -57165222 - MTE2a LTR MaLR -3 376 293 4 938 486 384 86 25 chr15 46329968 46330246 -57164728 - MTE2a LTR MaLR -79 300 6 4 938 613 322 126 35 chr15 46330248 46330566 -57164408 - MTE2a-int LTR MaLR 0 1580 1234 4 938 679 307 70 64 chr15 46330548 46330875 -57164099 - MTE2a LTR MaLR -42 337 9 4 938 2261 64 132 11 chr15 46333028 46333376 -57161598 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 4 938 2135 123 15 6 chr15 46333842 46334176 -57160798 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 938 11216 78 90 19 chr15 46334176 46337042 -57157932 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 4 938 6530 60 12 16 chr15 46337028 46337882 -57157092 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6479 -2 4 938 2135 123 15 6 chr15 46337884 46338218 -57156756 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 4 938 281 355 86 14 chr15 46342982 46343202 -57151772 - LTR80A LTR ERVL -280 303 68 4 938 443 298 41 0 chr15 46344078 46344199 -57150775 - RMER15 LTR ERVL 0 575 450 4 938 3251 44 3 0 chr15 46351977 46352361 -57142613 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 4 938 7737 126 54 16 chr15 46352497 46353067 -57141907 + RMER16-int LTR ERVK 87 703 -4703 4 938 7737 126 54 16 chr15 46353103 46353821 -57141153 + RMER16-int LTR ERVK 704 1424 -3982 4 938 1103 174 21 52 chr15 46353854 46354113 -57140861 + RMER16-int LTR ERVK 1328 1537 -3869 4 938 502 330 25 10 chr15 46354242 46354326 -57140648 + RMER16-int LTR ERVK 1416 1499 -1815 5 938 2559 203 107 67 chr15 46354357 46355201 -57139773 + RMER16-int LTR ERVK 1500 2991 -4415 5 938 2559 157 104 6 chr15 46355681 46355886 -57139088 + RMER16-int LTR ERVK 1930 2133 -3273 5 938 483 276 19 53 chr15 46356073 46356262 -57138712 + MTD LTR MaLR 18 365 -54 5 938 1142 156 0 11 chr15 46357303 46357485 -57137489 + RLTR17 LTR ERVK 1 180 -512 5 938 2765 183 51 6 chr15 46357479 46358011 -57136963 + RLTR17 LTR ERVK 91 646 -46 5 938 5202 88 0 3 chr15 46358052 46358757 -57136217 - RLTR13D5 LTR ERVK -320 703 1 5 938 5769 89 0 1 chr15 46364152 46364961 -57130013 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 808 -1000 5 938 470 289 74 101 chr15 46365550 46365846 -57129128 + RMER12 LTR ERVK 1035 1322 0 5 938 2762 140 21 35 chr15 46369420 46369902 -57125072 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 938 575 164 6 136 chr15 46371118 46371294 -57123680 - RLTR19-int LTR ERVK -3831 2306 2154 5 938 253 146 0 0 chr15 46371449 46371490 -57123484 - RLTR19-int LTR ERVK -4070 2067 2027 5 938 235 284 161 22 chr15 46371491 46371628 -57123346 - MTC-int LTR MaLR -192 1066 911 5 938 650 156 16 8 chr15 46371629 46371752 -57123222 - RLTR19-int LTR ERVK -4909 1228 1105 5 938 1016 280 83 3 chr15 46374461 46374751 -57120223 + MTD LTR MaLR 11 323 -96 5 938 226 216 147 13 chr15 46374854 46374929 -57120045 + MTD LTR MaLR 335 419 0 5 938 519 372 23 9 chr15 46375755 46375975 -57118999 + MTE2b LTR MaLR 31 253 -126 5 938 1853 155 3 34 chr15 46378244 46378565 -57116409 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 938 5788 96 1 92 chr15 46378580 46379518 -57115456 - MMERVK10C-int LTR ERVK -31 7550 6698 5 938 8579 86 47 5 chr15 46379504 46381294 -57113680 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1592 5989 4125 5 938 2405 91 46 0 chr15 46381293 46381644 -57113330 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3662 3919 3553 5 938 1662 69 90 4 chr15 46381641 46381875 -57113099 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4515 3066 2813 5 938 3762 87 56 13 chr15 46381897 46382435 -57112539 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5136 2445 1885 5 938 382 185 123 0 chr15 46382426 46382507 -57112467 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4227 1179 1089 5 938 1578 193 179 23 chr15 46382512 46382942 -57112032 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4587 819 323 5 938 2745 117 5 5 chr15 46382942 46383353 -57111621 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6730 851 441 5 938 1174 149 20 10 chr15 46383446 46383650 -57111324 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7151 430 225 5 938 250 227 0 0 chr15 46383650 46383694 -57111280 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 232 5 938 650 82 30 10 chr15 46383695 46383794 -57111180 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7478 103 3 5 938 1836 172 3 3 chr15 46383796 46384105 -57110869 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 3 5 938 2961 15 3 0 chr15 46394196 46394532 -57100442 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 938 21273 11 2 0 chr15 46394532 46396891 -57098083 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4117 5 938 467 66 0 0 chr15 46396883 46396944 -57098030 - IAPEz-int LTR ERVK -2896 3585 3525 5 938 917 81 24 0 chr15 46396944 46397067 -57097907 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 5 938 1833 111 4 4 chr15 46397064 46397326 -57097648 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 5 938 442 66 0 32 chr15 46397315 46397378 -57097596 - IAPEz-int LTR ERVK -5062 1419 1359 5 938 4581 64 28 35 chr15 46397378 46398029 -57096945 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 17 5 938 349 146 0 0 chr15 46398010 46398065 -57096909 - IAPEz-int LTR ERVK -1930 57 3 5 938 2936 21 0 6 chr15 46398067 46398406 -57096568 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 939 444 317 88 46 chr15 46400585 46400823 -57094151 + MLT1B LTR MaLR 6 253 -137 5 939 853 324 60 34 chr15 46400821 46401288 -57093686 - MER67C LTR ERV1 -7 704 226 5 939 310 313 98 89 chr15 46402679 46402914 -57092060 - RLTR12B LTR ERVK -42 486 250 5 939 570 260 93 56 chr15 46402941 46403222 -57091752 - RLTR12B LTR ERVK -261 267 1 5 939 2263 241 32 26 chr15 46415904 46416035 -57078939 + RMER13B LTR ERVK 368 508 -400 5 939 2263 241 32 26 chr15 46416061 46416467 -57078507 + RMER13B LTR ERVK 509 908 0 5 939 2805 87 50 0 chr15 46422533 46422934 -57072040 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 939 612 117 0 0 chr15 46423642 46423736 -57071238 + BGLII LTR ERVK 311 404 -17 6 939 1023 203 74 8 chr15 46423966 46424209 -57070765 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1590 6 939 3277 194 73 20 chr15 46424388 46425000 -57069974 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1040 808 172 6 939 3277 194 73 20 chr15 46425121 46425274 -57069700 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1677 171 2 6 939 1694 216 123 37 chr15 46425612 46426027 -57068947 + RLTR11A LTR ERVK 1 457 -71 6 939 1694 216 123 37 chr15 46426074 46426144 -57068830 + RLTR11A LTR ERVK 458 527 -1 6 939 1008 184 85 16 chr15 46431052 46431300 -57063674 - RMER10A LTR ERVL 0 442 178 6 939 2016 181 10 58 chr15 46431303 46431720 -57063254 - RMER10B LTR ERVL -1 397 1 6 939 396 299 87 47 chr15 46431745 46431998 -57062976 - RMER17C-int LTR ERVK -59 3179 2917 6 939 594 244 11 11 chr15 46432161 46432343 -57062631 + RMER10B LTR ERVL 83 264 -134 6 939 907 223 40 0 chr15 46432368 46432570 -57062404 + RMER10B LTR ERVL 189 398 0 6 939 743 281 0 21 chr15 46432570 46432758 -57062216 - RMER10A LTR ERVL -257 185 2 6 939 992 295 25 174 chr15 46433748 46433890 -57061084 - RMER19C LTR ERVK 0 611 471 6 939 992 295 25 174 chr15 46433952 46434198 -57060776 - RMER19C LTR ERVK -141 470 275 6 939 992 295 25 174 chr15 46434239 46434567 -57060407 - RMER19C LTR ERVK -337 274 1 6 939 1867 138 3 0 chr15 46436240 46436530 -57058444 + ORR1A2 LTR MaLR 1 291 -36 6 939 1329 199 12 4 chr15 46436731 46436988 -57057986 - MYSERV6-int LTR ERVK -7507 1452 1194 6 939 567 278 55 15 chr15 46436987 46437261 -57057713 - MYSERV6-int LTR ERVK -6204 346 62 6 939 382 365 20 20 chr15 46437383 46437579 -57057395 - MYSERV6-int LTR ERVK -8647 312 117 6 939 742 244 79 52 chr15 46439240 46439568 -57055406 - RLTR15 LTR ERVK -21 338 2 6 939 691 254 119 135 chr15 46442311 46442689 -57052285 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 6 939 285 149 21 0 chr15 46445272 46445319 -57049655 + RLTR16 LTR ERVK 1 48 -457 6 939 474 236 62 25 chr15 46448253 46448414 -57046560 - RNLTR23 LTR ERVK -10 632 466 6 939 3048 317 57 41 chr15 46449108 46449317 -57045657 - RNERVK23-int LTR ERVK -403 7814 7579 6 939 3048 317 57 41 chr15 46449496 46450929 -57044045 - RNERVK23-int LTR ERVK -639 7578 6148 6 939 2608 332 39 64 chr15 46453109 46454823 -57040151 - RNERVK23-int LTR ERVK -6379 1838 169 6 939 469 261 6 42 chr15 46454992 46455160 -57039814 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 481 6 939 577 275 144 39 chr15 46460553 46460886 -57034088 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 6 939 627 126 10 10 chr15 46464423 46464527 -57030447 + MT2C_Mm LTR ERVL 294 397 -78 6 939 770 310 62 11 chr15 46470083 46470439 -57024535 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 939 3483 179 79 89 chr15 46482490 46483404 -57011570 + RMER17A2 LTR ERVK 2 906 0 6 939 1200 243 24 119 chr15 46490631 46490844 -57004130 + ORR1C2 LTR MaLR 1 187 -197 6 939 1200 243 24 119 chr15 46490992 46491198 -57003776 + ORR1C2 LTR MaLR 188 380 -4 6 939 286 260 211 0 chr15 46496960 46497083 -56997891 - MTEb LTR MaLR -192 187 39 7 939 484 331 99 59 chr15 46502777 46503149 -56991825 + RMER15 LTR ERVL 189 575 0 4 939 1290 206 10 190 chr15 46503833 46504318 -56990656 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 8 939 262 291 42 164 chr15 46506485 46506723 -56988251 + RLTR15 LTR ERVK 70 278 -81 1 939 410 275 103 27 chr15 46507014 46507160 -56987814 - RMER15 LTR ERVL -24 551 395 1 939 360 283 102 88 chr15 46507215 46507420 -56987554 - RMER15 LTR ERVL -341 234 27 1 939 2332 48 86 0 chr15 46515581 46515895 -56979079 - IAPEY_LTR LTR ERVK -2 383 43 2 939 1135 173 0 0 chr15 46521079 46521270 -56973704 + RMER6C LTR ERVK 500 690 0 3 939 427 176 154 0 chr15 46525042 46525133 -56969841 + RLTR23 LTR ERV1 1 105 -325 3 939 1313 180 16 45 chr15 46525198 46525442 -56969532 + RLTR23 LTR ERV1 194 430 0 3 939 545 202 67 8 chr15 46528127 46528247 -56966727 - RMER10B LTR ERVL 0 398 272 4 939 2433 233 36 27 chr15 46528294 46528884 -56966090 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1167 1761 -87 4 940 275 328 120 92 chr15 46535220 46535536 -56959438 + MT2A LTR ERVL 209 533 0 4 940 1713 236 78 12 chr15 46537444 46537856 -56957118 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 254 5 940 1920 108 31 37 chr15 46537858 46538184 -56956790 + IAPLTR2b LTR ERVK 3 326 -1 5 940 14435 122 47 26 chr15 46538184 46540598 -56954376 + IAPEz-int LTR ERVK 24 2665 -3816 5 940 18439 61 6 34 chr15 46540594 46543080 -56951894 + IAPEz-int LTR ERVK 4067 6481 0 5 940 2067 77 30 20 chr15 46543080 46543384 -56951590 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 307 -20 5 940 1449 184 8 12 chr15 46543404 46543663 -56951311 - RLTR17 LTR ERVK -434 258 1 5 940 4703 148 97 8 chr15 46549818 46550698 -56944276 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 6 940 1836 144 27 12 chr15 46554093 46554424 -56940550 + ORR1A1 LTR MaLR 11 346 0 7 940 457 281 54 78 chr15 46556667 46556833 -56938141 + MT2B LTR ERVL 96 257 -344 8 940 4917 155 30 26 chr15 46564843 46565741 -56929233 - RMER17A2 LTR ERVK -4 902 1 9 940 678 290 149 28 chr15 46567525 46567565 -56927409 + MTD LTR MaLR 47 89 -330 1 940 2450 171 55 127 chr15 46567565 46568308 -56926666 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 940 678 290 149 28 chr15 46568308 46568590 -56926384 + MTD LTR MaLR 90 408 -11 1 940 800 213 17 3 chr15 46570799 46570975 -56923999 - RLTR20D LTR ERVK -348 229 5 1 940 2188 136 69 11 chr15 46580785 46581163 -56913811 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 940 5631 130 53 74 chr15 46581163 46582265 -56912709 - MTB-int LTR MaLR -19 1079 1 1 940 430 97 0 16 chr15 46582265 46582328 -56912646 - MTB LTR MaLR 0 400 339 1 940 2253 129 23 3 chr15 46582604 46582955 -56912019 - MTB LTR MaLR -42 358 1 1 940 1569 229 22 8 chr15 46586477 46586847 -56908127 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 2 1 940 1360 249 29 3 chr15 46586848 46587191 -56907783 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 1158 1 940 3702 148 84 6 chr15 46587191 46587500 -56907474 + RMER17A LTR ERVK 1 355 -396 1 940 3702 148 84 6 chr15 46587642 46588026 -56906948 + RMER17A LTR ERVK 356 747 -4 1 940 282 284 0 24 chr15 46588030 46588113 -56906861 - ORR1C1-int LTR MaLR -1427 82 2 1 940 1514 242 14 52 chr15 46588114 46588365 -56906609 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 141 1 940 1514 242 14 52 chr15 46588431 46588541 -56906433 - ORR1C1 LTR MaLR -238 140 31 1 940 242 163 0 0 chr15 46588729 46588772 -56906202 - ORR1C1 LTR MaLR -340 44 2 1 940 1597 245 106 128 chr15 46590355 46590978 -56903996 - RMER19C LTR ERVK -2 609 1 1 940 3308 35 2 5 chr15 46597568 46597965 -56897009 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 940 1391 258 30 11 chr15 46602259 46602648 -56892326 + MTC LTR MaLR 12 419 -2 1 940 548 317 107 73 chr15 46602714 46602901 -56892073 - MTD LTR MaLR 0 419 213 1 940 548 317 107 73 chr15 46603047 46603186 -56891788 - MTD LTR MaLR -207 212 82 1 940 842 253 27 66 chr15 46603503 46603956 -56891018 + RLTR20D LTR ERVK 3 551 0 1 940 732 261 89 37 chr15 46624504 46624854 -56870120 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 1 940 3809 187 139 76 chr15 46630720 46630949 -56864025 - RMER6-int LTR ERVK -353 2824 2568 2 940 3809 187 139 76 chr15 46631010 46631829 -56863145 - RMER6-int LTR ERVK -353 2567 1646 2 940 1847 182 27 81 chr15 46631829 46632236 -56862738 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 62 2 940 7172 193 65 10 chr15 46632263 46633556 -56861418 - RMER6-int LTR ERVK -1528 1649 306 2 940 7172 193 65 10 chr15 46633620 46633889 -56861085 - RMER6-int LTR ERVK -2872 305 3 2 940 1292 209 122 12 chr15 46633889 46634454 -56860520 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 2 940 3094 199 52 10 chr15 46634783 46635131 -56859843 + RMER6D LTR ERVK 1 373 -347 2 940 3094 199 52 10 chr15 46635192 46635534 -56859440 + RMER6D LTR ERVK 374 720 0 2 940 873 326 46 26 chr15 46635710 46636056 -56858918 + ORR1D2 LTR MaLR 6 358 -12 2 940 3770 28 5 0 chr15 46639434 46639868 -56855106 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 2 940 1133 308 50 50 chr15 46643719 46644136 -56850838 - MTD LTR MaLR -2 417 1 2 940 3429 18 2 10 chr15 46659693 46660092 -56834882 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 941 1603 187 0 10 chr15 46664663 46664955 -56830019 - ORR1A1 LTR MaLR -57 289 1 2 941 883 311 78 52 chr15 46670246 46670295 -56824679 - MT2A LTR ERVL -3 530 477 2 941 1325 205 149 3 chr15 46670295 46670623 -56824351 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 2 941 883 311 78 52 chr15 46670623 46671072 -56823902 - MT2A LTR ERVL -57 476 19 2 941 2271 192 107 37 chr15 46677307 46677952 -56817022 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 2 941 2418 122 48 43 chr15 46685297 46685715 -56809259 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 2 941 1927 112 3 42 chr15 46689846 46690154 -56804820 + RMER2 LTR ERV1 272 567 0 2 941 274 331 53 8 chr15 46691471 46691602 -56803372 + RLTR6-int LTR ERV1 1554 1690 -6088 2 941 462 362 50 0 chr15 46692393 46692611 -56802363 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4006 4234 -3367 2 941 1354 333 11 0 chr15 46692914 46693367 -56801607 + MuRRS4-int LTR ERV1 3557 4014 -1049 2 941 979 116 13 25 chr15 46693802 46693961 -56801013 + RMER2 LTR ERV1 1 157 -410 2 941 2418 65 68 12 chr15 46695932 46696258 -56798716 + ORR1A1 LTR MaLR 3 346 0 2 941 1282 220 40 23 chr15 46717063 46717364 -56777610 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 255 3 941 1766 238 150 91 chr15 46717364 46718299 -56776675 + RMER17B LTR ERVK 1 896 -12 3 941 1083 249 13 4 chr15 46718321 46718551 -56776423 - RLTR20B2 LTR ERVK -328 232 1 3 941 6422 175 29 6 chr15 46718631 46719953 -56775021 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -115 2211 860 3 941 1182 237 65 60 chr15 46726529 46726915 -56768059 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1470 856 469 3 941 1503 189 93 62 chr15 46727045 46727518 -56767456 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1868 458 1 3 941 2081 98 3 69 chr15 46734957 46735306 -56759668 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 3 941 4758 42 29 36 chr15 46735307 46735974 -56759000 + IAPEz-int LTR ERVK 1 662 -5819 3 941 396 81 0 31 chr15 46735974 46736038 -56758936 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1420 -5061 3 941 1719 119 4 4 chr15 46736026 46736288 -56758686 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 3 941 871 81 24 0 chr15 46736285 46736408 -56758566 + IAPEz-int LTR ERVK 4785 4910 -2770 3 941 446 66 0 0 chr15 46736408 46736469 -56758505 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 3585 -2896 3 941 19715 21 6 0 chr15 46736461 46738812 -56756162 + IAPEz-int LTR ERVK 4117 6481 0 3 941 2081 98 3 69 chr15 46738812 46739161 -56755813 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 3 941 598 295 127 39 chr15 46740384 46740716 -56754258 + MLT1B LTR MaLR 16 376 -14 3 941 1830 166 6 24 chr15 46743216 46743549 -56751425 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 941 1700 197 2 140 chr15 46743551 46744008 -56750966 + ORR1A2-int LTR MaLR 3 399 -971 3 941 3837 207 28 20 chr15 46748406 46749628 -56745346 + ORR1A2-int LTR MaLR 375 1767 -196 3 941 655 243 152 96 chr15 46753606 46753888 -56741086 + RLTR10A LTR ERVK 114 411 0 3 941 3968 179 153 29 chr15 46757974 46758287 -56736687 + RLTR25A LTR ERVK 1 321 -782 3 941 3968 179 153 29 chr15 46758340 46758814 -56736160 + RLTR25A LTR ERVK 322 887 -216 3 941 3968 179 153 29 chr15 46758989 46759121 -56735853 + RLTR25A LTR ERVK 888 1034 -69 3 941 4262 179 94 96 chr15 46759092 46760235 -56734739 - ORR1A2-int LTR MaLR -652 1140 1 3 941 1057 157 25 25 chr15 46760235 46760431 -56734543 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 132 3 941 621 355 42 35 chr15 46760807 46761971 -56733003 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3259 4519 3251 3 941 333 346 41 28 chr15 46762041 46762404 -56732570 - MMERGLN-int LTR ERV1 -5940 1616 1249 3 941 2720 106 57 75 chr15 46763006 46763497 -56731477 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 3 941 462 308 75 69 chr15 46763957 46764306 -56730668 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 80 3 941 337 177 127 204 chr15 46764298 46764440 -56730534 - RLTR23 LTR ERV1 -292 138 8 3 941 534 264 7 13 chr15 46764538 46764688 -56730286 - RMER15-int LTR ERVL -250 4749 4601 3 941 1323 220 64 14 chr15 46764688 46765068 -56729906 + RLTR28 LTR ERVL 1 426 -98 3 941 2020 263 48 19 chr15 46765089 46765678 -56729296 - RMER15-int LTR ERVL -1730 3269 2664 3 941 7862 287 26 26 chr15 46766009 46767824 -56727150 - RMER15-int LTR ERVL -2429 2570 755 3 941 2401 209 17 12 chr15 46767824 46768343 -56726631 + RLTR28 LTR ERVL 1 522 -2 3 941 7862 287 26 26 chr15 46768343 46769096 -56725878 - RMER15-int LTR ERVL -4245 754 1 3 941 2056 221 35 43 chr15 46769099 46769676 -56725298 - RMER15 LTR ERVL -3 572 1 3 941 1942 213 73 73 chr15 46773216 46773708 -56721266 + RMER19B LTR ERVK 170 661 -241 3 941 390 315 117 6 chr15 46774453 46774616 -56720358 - MTE2b LTR MaLR -2 377 197 3 941 453 283 28 21 chr15 46775781 46775922 -56719052 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 887 3 941 855 167 57 31 chr15 46776066 46776258 -56718716 - RLTR25B LTR ERVK -221 807 611 3 941 1574 262 65 78 chr15 46776267 46777244 -56717730 + RMER13B LTR ERVK 1 899 -9 3 941 2863 238 21 43 chr15 46777484 46777760 -56717214 - RLTR25A LTR ERVK -402 701 441 3 941 2857 238 21 43 chr15 46777789 46778229 -56716745 - RLTR25A LTR ERVK -663 440 2 3 941 1064 306 16 7 chr15 46778555 46778864 -56716110 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 314 -213 3 941 272 128 115 21 chr15 46781026 46781122 -56713852 + MYSERV6-int LTR ERVK 6425 6529 -2430 3 941 440 207 0 0 chr15 46781227 46781309 -56713665 + MYSERV-int LTR ERVK 4730 4811 -550 3 941 237 325 50 50 chr15 46783881 46784001 -56710973 + RMER4A LTR ERVK 310 429 -37 3 941 1278 243 91 73 chr15 46785190 46785884 -56709090 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1051 1756 -570 3 941 878 267 74 25 chr15 46785886 46786170 -56708804 + RLTR11A LTR ERVK 1 298 -230 3 941 1261 246 138 69 chr15 46786199 46786662 -56708312 + RMER19C LTR ERVK 117 611 0 3 941 1053 205 34 64 chr15 46786662 46786900 -56708074 + RLTR11A LTR ERVK 299 528 0 3 941 1957 217 44 27 chr15 46786930 46787455 -56707519 + MYSERV-int LTR ERVK 6014 6547 -3 3 941 883 196 66 16 chr15 46787459 46787641 -56707333 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 191 -336 3 942 1479 228 45 3 chr15 46797078 46797412 -56697562 - RLTR15 LTR ERVK -1 358 11 3 942 623 288 135 20 chr15 46801249 46801494 -56693480 - MTD LTR MaLR -3 416 144 3 942 453 234 52 110 chr15 46819374 46819528 -56675446 + MTE2a LTR MaLR 1 145 -234 4 942 575 291 55 68 chr15 46819508 46819744 -56675230 + MTE2a LTR MaLR 105 337 -42 4 942 323 310 0 0 chr15 46820538 46820625 -56674349 - LTR87 LTR ERVL? -232 392 306 4 942 351 439 16 21 chr15 46823004 46823195 -56671779 + LTR16A LTR ERVL 63 252 -199 4 942 558 226 161 12 chr15 46824791 46824952 -56670022 + ORR1C2 LTR MaLR 2 186 -188 4 942 699 255 29 171 chr15 46825087 46825333 -56669641 + ORR1C2 LTR MaLR 174 384 0 4 942 1427 277 64 3 chr15 46827686 46828063 -56666911 - MTD LTR MaLR -19 400 1 4 942 402 370 43 17 chr15 46828526 46828760 -56666214 - MLT2B3 LTR ERVL -264 290 51 4 942 261 169 6 58 chr15 46829826 46829924 -56665050 - ORR1D2 LTR MaLR 0 419 329 4 942 467 276 116 7 chr15 46830495 46830641 -56664333 + ORR1D2 LTR MaLR 12 173 -197 4 942 3984 143 78 24 chr15 46835417 46836184 -56658790 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 4 942 278 355 41 61 chr15 46837566 46837713 -56657261 + MTEb LTR MaLR 168 311 -68 4 942 257 227 15 29 chr15 46837755 46837823 -56657151 + MTEb LTR MaLR 310 376 -3 4 942 1103 285 51 24 chr15 46838009 46838343 -56656631 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 28 4 942 279 208 0 0 chr15 46838521 46838569 -56656405 + RMER20B LTR ERVK 1 48 -579 4 942 316 143 52 91 chr15 46838573 46838650 -56656324 + RMER16 LTR ERVK 5 78 -455 4 942 627 256 32 20 chr15 46838834 46839081 -56655893 + RMER16 LTR ERVK 284 533 0 4 942 2267 177 19 12 chr15 46839082 46839499 -56655475 + RMER20B LTR ERVK 44 463 -164 4 942 368 295 129 18 chr15 46841713 46841985 -56652989 - MER67C LTR ERV1 -230 481 146 4 942 227 200 69 59 chr15 46850099 46850200 -56644774 + RLTR25B LTR ERVK 397 498 -530 4 942 415 311 86 20 chr15 46850332 46850483 -56644491 + MTE-int LTR MaLR 1381 1541 -39 4 942 2701 61 6 14 chr15 46853256 46853545 -56641429 + ORR1A1 LTR MaLR 1 287 -59 4 942 2701 61 6 14 chr15 46853574 46853633 -56641341 + ORR1A1 LTR MaLR 288 346 0 4 942 3699 16 121 0 chr15 46854229 46854669 -56640305 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 942 4110 17 38 2 chr15 46860757 46861233 -56633741 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 942 8848 42 6 1 chr15 46861237 46862328 -56632646 + MTA_Mm-int LTR MaLR 3 1098 0 4 942 3487 18 2 0 chr15 46862328 46862723 -56632251 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 942 3075 154 118 54 chr15 46877608 46878368 -56616606 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 5 942 1333 186 175 9 chr15 46891482 46891797 -56603177 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 942 3078 66 5 0 chr15 46901931 46902325 -56592649 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 942 2194 260 82 91 chr15 46908120 46909043 -56585931 - RMER17B LTR ERVK -43 915 1 5 942 869 213 45 10 chr15 46909753 46909952 -56585022 - RMER6C LTR ERVK -1 689 484 5 942 839 306 52 104 chr15 46914825 46915267 -56579707 + RMER2 LTR ERV1 122 540 -27 5 942 1171 295 75 75 chr15 46915798 46916164 -56578810 - RLTR40 LTR ERVK -78 739 351 5 942 1171 295 75 75 chr15 46916187 46916541 -56578433 - RLTR40 LTR ERVK -467 350 20 5 942 1898 114 86 76 chr15 46917273 46917680 -56577294 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 5 942 560 320 40 18 chr15 46921597 46921820 -56573154 + MTB_Mm LTR MaLR 134 361 -46 5 942 1208 237 88 15 chr15 46923168 46923510 -56571464 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 943 2502 94 58 5 chr15 46926291 46926688 -56568286 + BGLII_Mus LTR ERVK 5 422 0 5 943 490 347 57 92 chr15 46928096 46928358 -56566616 - MTEa LTR MaLR -73 306 56 5 943 490 347 57 92 chr15 46928422 46928476 -56566498 - MTEa LTR MaLR -324 55 1 5 943 2000 183 101 49 chr15 46936713 46937220 -56557754 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 5 943 20031 92 24 23 chr15 46937220 46940178 -56554796 - RMER16-int LTR ERVK 0 5406 2446 5 943 3130 145 108 43 chr15 46944786 46945106 -56549868 - RMER17A LTR ERVK -2 749 441 5 943 3130 145 108 43 chr15 46945323 46945702 -56549272 - RMER17A LTR ERVK -311 440 4 5 943 248 320 72 103 chr15 46948615 46948838 -56546136 - MLT1A1 LTR MaLR -143 265 50 6 943 382 331 94 13 chr15 46964743 46964902 -56530072 - RMER15 LTR ERVL -94 481 310 6 943 617 367 92 0 chr15 46967681 46968008 -56526966 + ORR1D2 LTR MaLR 11 367 -3 6 943 647 257 33 107 chr15 46968012 46968254 -56526720 + ORR1D2-int LTR MaLR 2 225 -1145 6 943 1424 245 196 45 chr15 46968254 46968854 -56526120 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 6 943 2584 296 49 38 chr15 46968854 46969778 -56525196 + ORR1D2-int LTR MaLR 220 1153 -217 6 943 1945 140 41 0 chr15 46970627 46970941 -56524033 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 943 297 234 102 41 chr15 46971301 46971328 -56523646 + ORR1D2-int LTR MaLR 1145 1171 -199 6 943 297 234 102 41 chr15 46971398 46971468 -56523506 + ORR1D2-int LTR MaLR 1172 1247 -123 6 943 2159 110 3 58 chr15 46973241 46973587 -56521387 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 943 8944 168 87 12 chr15 46973587 46975413 -56519561 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 6 943 564 91 0 0 chr15 46975414 46975491 -56519483 - ORR1A2 LTR MaLR -1 345 269 6 943 1453 152 0 20 chr15 46976074 46976329 -56518645 - ORR1A2 LTR MaLR -77 250 1 6 943 2366 90 36 0 chr15 46978632 46978966 -56516008 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 6 943 334 228 81 139 chr15 46989742 46989850 -56505124 + RNLTR23 LTR ERVK 480 579 -63 6 943 334 228 81 139 chr15 46989890 46989954 -56505020 + RNLTR23 LTR ERVK 580 642 0 6 943 435 258 17 58 chr15 46990152 46990325 -56504649 + RNLTR23 LTR ERVK 477 642 0 6 943 320 297 85 118 chr15 46995776 46996142 -56498832 + RMER10A LTR ERVL 12 365 -77 6 943 650 324 148 16 chr15 46996622 46996926 -56498048 - MTE-int LTR MaLR -577 1003 660 6 943 2330 213 125 11 chr15 47000380 47000989 -56493985 + RMER6C LTR ERVK 1 678 -12 1 943 2605 109 45 0 chr15 47001740 47002143 -56492831 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 4 943 382 304 101 34 chr15 47019157 47019365 -56475609 - RMER15 LTR ERVL -17 558 337 2 943 1591 163 84 51 chr15 47027624 47027980 -56466994 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 3 943 334 130 0 36 chr15 47027999 47028055 -56466919 - ETnERV2-int LTR ERVK -22 7384 7331 3 943 436 235 0 50 chr15 47028493 47028614 -56466360 - ETnERV2-int LTR ERVK -1195 6211 6097 3 943 13674 166 51 58 chr15 47028622 47031858 -56463116 - ETnERV2-int LTR ERVK -1230 4176 1744 3 943 226 302 0 0 chr15 47031858 47031911 -56463063 - MTC-int LTR MaLR -722 536 484 3 943 13674 166 51 58 chr15 47031911 47032820 -56462154 - ETnERV2-int LTR ERVK -1230 1743 1059 3 943 1945 124 22 27 chr15 47033269 47033635 -56461339 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 5 3 943 399 338 109 71 chr15 47044019 47044442 -56450532 - MLT1D LTR MaLR -13 492 54 5 943 2760 57 2 75 chr15 47045273 47045689 -56449285 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 5 943 7776 39 25 3 chr15 47045698 47046665 -56448309 - RLTR10-int LTR ERVK -10 1977 990 5 943 351 232 62 39 chr15 47046747 47046877 -56448097 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5987 1594 1462 5 944 397 336 129 41 chr15 47059872 47060189 -56434785 - ORR1E LTR MaLR -2 357 13 7 944 295 220 17 0 chr15 47061470 47061529 -56433445 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 7 944 1919 143 6 67 chr15 47064637 47064798 -56430176 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 164 8 944 1919 143 6 67 chr15 47065061 47065244 -56429730 - ORR1A2 LTR MaLR -164 163 3 8 944 5564 126 84 11 chr15 47065715 47066606 -56428368 + RMER17B LTR ERVK 3 958 0 8 944 3751 119 104 144 chr15 47067813 47068757 -56426217 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 8 944 440 333 147 44 chr15 47069533 47069853 -56425121 - RLTR9A LTR ERVK -8 360 8 8 944 3677 152 15 38 chr15 47069890 47070547 -56424427 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 9 944 11042 124 12 6 chr15 47070550 47072144 -56422830 - MERVK26-int LTR ERVK -1 6918 5315 9 944 13980 106 4 1 chr15 47072140 47074071 -56420903 - MERVK26-int LTR ERVK -2969 3950 2015 9 944 823 65 0 0 chr15 47074926 47075033 -56419941 - MERVK26-int LTR ERVK -4894 2025 1919 9 944 952 250 65 82 chr15 47075091 47075442 -56419532 - RLTR20C LTR ERVK -251 317 10 9 944 1544 256 43 23 chr15 47075439 47075878 -56419096 - RMER20A LTR ERVK -68 448 1 9 944 683 281 24 34 chr15 47076214 47076420 -56418554 - RMER15 LTR ERVL -22 553 350 9 944 591 190 60 0 chr15 47076423 47076539 -56418435 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7192 -214 9 944 481 269 35 191 chr15 47076947 47077287 -56417687 - RMER15 LTR ERVL -237 338 52 9 944 1937 175 11 6 chr15 47087622 47087979 -56406995 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 944 1179 318 54 2 chr15 47094555 47095000 -56399974 + MT2A LTR ERVL 65 532 -1 1 944 266 232 20 59 chr15 47098531 47098632 -56396342 - MLT1B LTR MaLR -236 154 58 1 944 7415 12 0 0 chr15 47101503 47102325 -56392649 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 1 944 369 304 29 15 chr15 47104632 47104769 -56390205 + LTR33 LTR ERVL 375 513 -2 1 944 1303 220 81 65 chr15 47113135 47113655 -56381319 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 944 3258 222 24 51 chr15 47118837 47119636 -56375338 + RLTR40 LTR ERVK 38 814 -3 1 944 605 293 74 82 chr15 47120834 47121343 -56373631 - RMER2 LTR ERV1 -29 538 3 1 944 743 305 111 16 chr15 47121930 47122246 -56372728 + MTE2b LTR MaLR 34 379 0 1 944 660 334 122 20 chr15 47122247 47122601 -56372373 + MTE2b-int LTR MaLR 3 392 -1188 1 944 2100 337 94 36 chr15 47122580 47123586 -56371388 + MTE2b-int LTR MaLR 516 1580 0 1 944 1267 293 21 39 chr15 47123586 47123970 -56371004 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 1 944 346 302 204 11 chr15 47124409 47124600 -56370374 - MTEb LTR MaLR -8 371 144 1 944 1603 21 0 0 chr15 47124684 47124875 -56370099 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 303 1 944 336 293 108 44 chr15 47126915 47127078 -56367896 - RMER20B LTR ERVK -38 478 295 1 944 320 282 127 55 chr15 47127125 47127154 -56367820 - RMER20B LTR ERVK -333 294 274 1 944 1729 173 34 9 chr15 47127154 47127475 -56367499 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 944 453 315 92 80 chr15 47127480 47127742 -56367232 - RMER20B LTR ERVK -362 265 1 1 944 2659 93 36 15 chr15 47127850 47128242 -56366732 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 944 1279 175 179 0 chr15 47132619 47132916 -56362058 - RMER6C LTR ERVK 0 690 341 1 944 382 164 0 0 chr15 47133073 47133140 -56361834 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 260 1 944 2227 151 99 5 chr15 47133142 47133568 -56361406 + RMER17B LTR ERVK 430 895 -63 1 944 263 339 18 18 chr15 47136698 47136809 -56358165 + MTD LTR MaLR 161 271 -148 1 944 574 311 68 107 chr15 47137088 47137688 -56357286 + MTC-int LTR MaLR 315 996 -262 1 944 2055 199 92 38 chr15 47139717 47140249 -56354725 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 1 944 692 341 58 35 chr15 47150369 47150679 -56344295 - MTE2a LTR MaLR 0 379 63 1 944 4567 142 25 88 chr15 47174784 47175746 -56319228 - RLTR13D6 LTR ERVK -1 901 1 2 944 1898 157 10 0 chr15 47176219 47176525 -56318449 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 2 944 542 330 38 38 chr15 47179043 47179282 -56315692 + ORR1D2 LTR MaLR 118 356 -14 2 944 1883 162 16 83 chr15 47181162 47181546 -56313428 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 35 2 944 507 328 80 37 chr15 47185064 47185415 -56309559 + ORR1D2 LTR MaLR 3 368 -2 2 945 1245 241 79 50 chr15 47186347 47186766 -56308208 + RMER16 LTR ERVK 103 533 0 2 945 1662 189 37 23 chr15 47187063 47187500 -56307474 - RMER17C LTR ERVK -517 441 16 2 945 2774 27 0 0 chr15 47188057 47188392 -56306582 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 335 -2 2 945 53003 22 9 17 chr15 47188392 47194918 -56300056 + IAPEz-int LTR ERVK 9 6481 0 2 945 2956 21 3 0 chr15 47194918 47195254 -56299720 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 2 945 3014 83 0 2 chr15 47195684 47196081 -56298893 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 945 1293 224 35 60 chr15 47198278 47198563 -56296411 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 169 2 945 586 101 9 9 chr15 47198705 47198815 -56296159 + RLTR1B-int LTR ERV1 1021 1130 -2169 2 945 313 183 523 0 chr15 47198829 47198963 -56296011 + RLTR1B-int LTR ERV1 1442 1645 -5911 2 945 6613 86 96 144 chr15 47199156 47200618 -56294356 + RLTR1B-int LTR ERV1 1221 2612 -687 2 945 8342 23 7 1 chr15 47200626 47201596 -56293378 - RLTR13A3 LTR ERVK -2 976 1 2 945 43967 40 9 11 chr15 47201602 47203399 -56291575 - ETnERV3-int LTR ERVK 0 5808 4010 2 945 43967 40 9 11 chr15 47203431 47207452 -56287522 - ETnERV3-int LTR ERVK -1799 4009 3 2 945 8335 24 7 1 chr15 47207454 47208424 -56286550 - RLTR13A3 LTR ERVK -2 976 1 2 945 3632 91 27 88 chr15 47208435 47209073 -56285901 + RLTR1B-int LTR ERV1 2624 3222 -77 2 945 501 118 3 13 chr15 47209085 47209220 -56285754 + RLTR1B-int LTR ERV1 3231 3299 0 2 945 1487 261 38 40 chr15 47209221 47209689 -56285285 + RLTR1B LTR ERV1 50 512 0 2 945 360 318 46 0 chr15 47209694 47209867 -56285107 - RLTR6-int LTR ERV1 -305 7296 7116 2 945 330 236 56 19 chr15 47210800 47210908 -56284066 - RLTR6-int LTR ERV1 -1261 6295 6184 2 945 573 344 67 58 chr15 47211400 47211863 -56283111 - MuRRS4-int LTR ERV1 -735 4328 3862 2 945 2075 335 44 69 chr15 47213284 47215792 -56279182 - RLTR6-int LTR ERV1 -2535 5243 2800 2 945 236 257 126 19 chr15 47215919 47216022 -56278952 - MLT1F2 LTR MaLR -31 529 416 2 945 1270 319 68 56 chr15 47216024 47217260 -56277714 - RLTR6-int LTR ERV1 -5191 2415 1165 2 945 301 287 24 24 chr15 47217690 47217815 -56277159 - RLTR6-int LTR ERV1 -6959 642 518 2 945 991 224 83 166 chr15 47218487 47218968 -56276006 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 5 2 945 2392 266 169 25 chr15 47228923 47229807 -56265167 - ORR1B2-int LTR MaLR -306 1064 59 2 945 251 232 0 0 chr15 47234927 47234983 -56259991 - ORR1B2-int LTR MaLR -1305 65 10 2 945 1342 248 38 44 chr15 47234994 47235361 -56259613 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 2 945 3065 38 7 82 chr15 47238235 47238663 -56256311 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 945 4849 161 75 25 chr15 47240963 47241876 -56253098 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 2 945 2729 87 42 10 chr15 47254730 47255138 -56239836 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 3 945 1146 228 62 37 chr15 47255698 47256021 -56238953 - RMER6C LTR ERVK 0 690 360 3 945 1218 185 0 30 chr15 47256006 47256240 -56238734 - RMER6C LTR ERVK -463 227 1 3 945 2057 158 29 16 chr15 47256240 47256625 -56238349 - RMER6-int LTR ERVK 0 3177 2788 3 945 692 308 122 37 chr15 47262203 47262530 -56232444 + MTD LTR MaLR 51 405 -14 3 945 255 250 59 12 chr15 47263308 47263393 -56231581 + MTEb LTR MaLR 270 358 -21 3 945 356 266 62 27 chr15 47264306 47264418 -56230556 + MLT1A1 LTR MaLR 291 406 -2 3 945 491 306 126 16 chr15 47267061 47267244 -56227730 - MLT1G3 LTR MaLR -7 588 386 3 945 3562 172 85 14 chr15 47269129 47269997 -56224977 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1395 2324 -2 3 945 1317 270 40 34 chr15 47269999 47270501 -56224473 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 3 945 2023 103 9 45 chr15 47275700 47276034 -56218940 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 945 266 350 70 56 chr15 47276293 47276508 -56218466 + MLT1C LTR MaLR 241 458 -9 3 945 1669 217 113 46 chr15 47278039 47278536 -56216438 + RMER16 LTR ERVK 1 530 -3 3 945 348 326 69 37 chr15 47279001 47279189 -56215785 + LTR41 LTR ERVL 22 215 -553 3 945 700 200 171 41 chr15 47282284 47282543 -56212431 + RMER16 LTR ERVK 1 473 -60 3 945 490 335 30 15 chr15 47303099 47303302 -56191672 + MLT1A1 LTR MaLR 203 408 0 3 945 266 287 56 22 chr15 47307166 47307255 -56187719 + RMER15-int LTR ERVL 4903 4994 -5 3 945 426 351 50 46 chr15 47308575 47308877 -56186097 + RMER15-int LTR ERVL 4210 4512 -487 3 946 1181 181 74 103 chr15 47318891 47319230 -56175744 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 946 637 246 81 78 chr15 47321284 47321606 -56173368 - MT2B LTR ERVL -57 544 185 4 946 3394 18 5 12 chr15 47323570 47323969 -56171005 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 946 2622 221 21 14 chr15 47326014 47326574 -56168400 - RLTR20D LTR ERVK -2 566 3 4 946 1437 211 158 33 chr15 47333275 47333642 -56161332 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 946 377 391 78 0 chr15 47334376 47334555 -56160419 - ORR1D2 LTR MaLR -177 193 1 4 946 4527 82 2 2 chr15 47338102 47338689 -56156285 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 4 946 4148 77 9 16 chr15 47342458 47343026 -56151948 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 4 946 1640 170 47 35 chr15 47353051 47353494 -56141480 + RMER17C LTR ERVK 25 439 -519 4 946 3554 186 46 10 chr15 47355907 47356627 -56138347 - RMER6A LTR ERVK -10 746 1 4 946 318 245 54 54 chr15 47356627 47356706 -56138268 - MTD LTR MaLR -104 315 237 4 946 434 271 55 144 chr15 47356715 47357164 -56137810 - RMER2 LTR ERV1 -16 551 5 4 946 821 309 15 9 chr15 47357315 47357639 -56137335 - RLTR6-int LTR ERV1 -123 7655 7330 4 946 454 355 31 43 chr15 47357984 47358472 -56136502 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3827 3729 3248 4 946 231 297 90 90 chr15 47358539 47358761 -56136213 - MLT2B5 LTR ERVL -139 462 241 4 946 351 331 43 20 chr15 47358762 47359116 -56135858 - MMERGLN-int LTR ERV1 -4646 2910 2545 4 946 273 286 89 50 chr15 47359449 47359651 -56135323 - MMERGLN-int LTR ERV1 -5434 2167 1958 4 946 428 355 99 43 chr15 47359778 47360434 -56134540 - MMERGLN-int LTR ERV1 -3330 1733 1041 4 946 367 258 78 180 chr15 47361596 47361918 -56133056 - RMER2 LTR ERV1 -29 538 250 4 946 1368 143 5 0 chr15 47362306 47362523 -56132451 - RMER6C LTR ERVK 0 690 473 4 946 495 237 0 0 chr15 47362829 47362922 -56132052 + RLTR23 LTR ERV1 6 98 -332 4 946 843 252 40 122 chr15 47362960 47363313 -56131661 + RLTR23 LTR ERV1 107 430 0 4 946 653 222 131 56 chr15 47366728 47367033 -56127941 + RLTR15 LTR ERVK 14 341 -18 4 946 734 350 22 6 chr15 47367242 47367555 -56127419 - MTE-int LTR MaLR -1262 318 1 4 946 1992 146 3 3 chr15 47369086 47369398 -56125576 - RLTR10E LTR ERVK -2 388 1 4 946 4063 105 10 1 chr15 47369398 47370080 -56124894 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 6965 4 946 1294 124 107 0 chr15 47370080 47370305 -56124669 - IAP-d-int LTR ERVK -1287 5255 5007 4 946 302 161 18 0 chr15 47370305 47370361 -56124613 - IAP-d-int LTR ERVK -6039 503 447 4 946 1839 196 121 81 chr15 47370456 47370929 -56124045 - RLTR10-int LTR ERVK -1064 923 401 4 946 1839 196 121 81 chr15 47371110 47371524 -56123450 - RLTR10-int LTR ERVK -1587 400 1 4 946 1960 148 3 3 chr15 47371780 47372085 -56122889 + RLTR10E LTR ERVK 1 305 -6 4 946 1829 181 29 17 chr15 47379704 47380053 -56114921 - RLTR13C2 LTR ERVK -1 807 455 4 946 3363 104 41 10 chr15 47386886 47387393 -56107581 - RLTR13C2 LTR ERVK -285 523 1 4 946 3120 121 115 8 chr15 47401593 47402125 -56092849 + RLTR1D LTR ERV1 1 589 -16 5 946 1816 201 24 50 chr15 47402641 47403059 -56091915 - RLTR9B2 LTR ERVK -13 407 1 5 946 5239 80 33 1 chr15 47415620 47416348 -56078626 + RLTR13D5 LTR ERVK 273 1023 0 5 946 320 74 0 169 chr15 47421505 47421570 -56073404 - RLTR33 LTR ERVK -172 506 453 5 946 1004 156 24 19 chr15 47431201 47431410 -56063564 + RMER17A-int LTR ERVK 782 991 -737 5 946 604 179 8 24 chr15 47431446 47431572 -56063402 + RMER17A-int LTR ERVK 982 1105 -623 5 946 2876 139 79 46 chr15 47431614 47432156 -56062818 + RMER17A-int LTR ERVK 1084 1643 -85 5 946 1821 109 12 0 chr15 47432147 47432395 -56062579 + MERVK26-int LTR ERVK 6669 6919 0 5 946 4752 141 48 36 chr15 47432396 47433350 -56061624 + RMER17B LTR ERVK 1 956 -2 5 946 341 348 77 35 chr15 47437166 47437425 -56057549 + MLT1C LTR MaLR 198 467 0 5 946 1010 303 36 27 chr15 47444035 47444367 -56050607 + ORR1D2 LTR MaLR 36 370 0 5 946 615 310 101 28 chr15 47447500 47447867 -56047107 - MT2A LTR ERVL -50 551 74 5 946 273 338 0 0 chr15 47447855 47447932 -56047042 - MT2A LTR ERVL -404 129 53 5 947 7378 206 51 28 chr15 47448190 47449860 -56045114 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4052 1709 1 5 947 453 269 120 29 chr15 47450493 47450677 -56044297 - MT2A LTR ERVL -133 468 158 5 947 320 180 33 0 chr15 47464704 47464765 -56030209 - MTEb LTR MaLR -20 359 297 5 947 811 281 198 25 chr15 47475063 47475457 -56019517 + RMER15 LTR ERVL 99 560 -15 6 947 610 233 72 18 chr15 47494857 47495017 -55999957 + ORR1D1 LTR MaLR 1 170 -204 6 947 466 327 7 7 chr15 47495064 47495218 -55999756 + MT2B LTR ERVL 387 540 -61 6 947 562 360 80 34 chr15 47518899 47519399 -55975575 + MER90 LTR ERV1 48 570 -5 3 947 5717 76 6 65 chr15 47525089 47525942 -55969032 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 4 947 594 330 91 42 chr15 47540309 47540664 -55954310 + MTEb LTR MaLR 1 356 -23 6 947 2390 116 59 3 chr15 47547426 47547799 -55947175 + RLTR9B LTR ERVK 42 435 -2 7 947 252 194 118 15 chr15 47553028 47553096 -55941878 + MER31-int LTR ERV1 3297 3371 -1565 9 947 580 316 89 53 chr15 47561508 47561812 -55933162 + ORR1E LTR MaLR 43 357 -2 1 947 1414 239 165 3 chr15 47567778 47568135 -55926839 + MTC LTR MaLR 1 415 -6 1 947 230 341 12 0 chr15 47572179 47572261 -55922713 + MLT1A1 LTR MaLR 62 144 -264 1 947 549 74 12 0 chr15 47575033 47575114 -55919860 + RMER17B LTR ERVK 382 463 -495 1 947 1196 223 84 21 chr15 47577106 47577325 -55917649 + BGLII_B LTR ERVK 1 236 -205 1 947 1196 223 84 21 chr15 47577383 47577497 -55917477 + BGLII_B LTR ERVK 237 354 -87 1 947 388 198 81 0 chr15 47577593 47577679 -55917295 + BGLII_B LTR ERVK 349 441 0 1 948 462 317 83 18 chr15 47580057 47580285 -55914689 - MLT-int LTR MaLR -91 1644 1402 1 948 226 315 101 53 chr15 47581765 47581953 -55913021 - MLT-int LTR MaLR -934 801 605 1 948 233 294 109 7 chr15 47581950 47582087 -55912887 - MLT-int LTR MaLR -1059 676 526 1 948 374 311 199 37 chr15 47582248 47582624 -55912350 - MLT-int LTR MaLR -1214 521 39 1 948 406 272 113 60 chr15 47582702 47582870 -55912104 - MLT1A0 LTR MaLR -107 258 82 1 948 573 319 91 82 chr15 47593388 47593706 -55901268 + MER31A LTR ERV1 97 432 -53 1 948 2057 187 47 17 chr15 47599707 47600109 -55894865 + MTC LTR MaLR 6 419 -2 1 948 407 245 430 23 chr15 47601575 47601767 -55893207 + MTE2b LTR MaLR 50 321 -58 1 948 1786 142 73 12 chr15 47601767 47602094 -55892880 + RMER6-int LTR ERVK 662 1008 -2169 1 948 547 128 128 0 chr15 47602072 47602174 -55892800 + RMER6-int LTR ERVK 1114 1228 -1949 1 948 3715 159 116 94 chr15 47602315 47602616 -55892358 + RMER6-int LTR ERVK 2208 2536 -641 1 948 3715 159 116 94 chr15 47602681 47603259 -55891715 + RMER6-int LTR ERVK 2537 3171 -6 1 948 1616 167 70 3 chr15 47603264 47603576 -55891398 + RMER6C LTR ERVK 1 333 -357 1 948 448 353 23 83 chr15 47605519 47605868 -55889106 + LTR73 LTR ERV1 21 348 -224 1 948 1885 194 11 55 chr15 47606174 47606555 -55888419 + ORR1C1 LTR MaLR 7 370 -8 1 948 446 224 41 0 chr15 47610941 47611039 -55883935 + MYSERV6-int LTR ERVK 1327 1428 -7531 1 948 3575 161 43 29 chr15 47611196 47611891 -55883083 + MYSERV6-int LTR ERVK 8255 8959 0 1 948 565 182 9 0 chr15 47612866 47612976 -55881998 + ORR1C1 LTR MaLR 266 376 -2 1 948 1902 212 31 3 chr15 47615660 47616043 -55878931 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 948 1063 47 74 0 chr15 47619522 47619671 -55875303 - ORR1B1-int LTR MaLR -14 1778 1619 1 948 12853 66 25 14 chr15 47619680 47621452 -55873522 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 2 948 2819 58 0 6 chr15 47621452 47621800 -55873174 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 948 1996 175 77 52 chr15 47627405 47627887 -55867087 - RLTR20B3 LTR ERVK -63 514 21 2 948 716 229 96 6 chr15 47628277 47628444 -55866530 + MTC LTR MaLR 196 377 -44 2 948 250 325 62 16 chr15 47639777 47639905 -55855069 + LTR52 LTR ERVL 26 159 -262 2 948 2364 166 21 60 chr15 47640330 47640810 -55854164 + RLTR25A LTR ERVK 1 461 -642 2 948 924 317 105 27 chr15 47641132 47641731 -55853243 + HERVL74-int LTR ERVL 1125 1770 -3915 2 948 399 399 31 9 chr15 47642200 47642425 -55852549 + HERVL74-int LTR ERVL 2729 2958 -598 2 948 235 344 99 7 chr15 47647672 47647824 -55847150 + MLT1C LTR MaLR 288 453 -14 2 948 494 307 100 28 chr15 47654549 47654825 -55840149 + MTE-int LTR MaLR 102 400 -1180 2 948 1211 356 111 28 chr15 47654888 47655599 -55839375 + MTE-int LTR MaLR 772 1578 -2 2 948 984 272 45 45 chr15 47655633 47655922 -55839052 + MTE2b LTR MaLR 88 376 -3 2 948 1766 133 21 91 chr15 47665844 47666184 -55828790 - ORR1A4 LTR MaLR -13 316 1 2 948 7474 149 147 96 chr15 47666184 47667624 -55827350 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 450 2 948 7474 159 151 82 chr15 47667959 47668359 -55826615 - ORR1A4-int LTR MaLR -1507 456 1 2 948 1328 167 193 0 chr15 47668363 47668632 -55826342 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 2 948 269 369 113 49 chr15 47673549 47673877 -55821097 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -10 2 948 1311 213 163 24 chr15 47675833 47676170 -55818804 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 948 538 370 92 50 chr15 47682886 47683387 -55811587 + MER92B LTR ERV1 46 567 -69 2 948 262 119 91 106 chr15 47688262 47688339 -55806635 + RMER17C LTR ERVK 80 147 -263 2 948 262 119 91 106 chr15 47688519 47688639 -55806335 + RMER17C LTR ERVK 148 274 -136 2 948 541 291 97 99 chr15 47690255 47690627 -55804347 - MTE2a LTR MaLR -55 364 10 3 948 740 309 67 114 chr15 47691023 47691410 -55803564 + MTE2a LTR MaLR 2 370 -9 3 948 1792 168 48 183 chr15 47698202 47698699 -55796275 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 3 948 4095 104 127 10 chr15 47701058 47701380 -55793594 + RMER17A LTR ERVK 1 400 -351 3 948 4095 104 127 10 chr15 47701446 47701793 -55793181 + RMER17A LTR ERVK 401 747 -4 3 948 421 375 52 20 chr15 47702198 47702503 -55792471 + MTE-int LTR MaLR 1 315 -1265 3 948 369 278 93 0 chr15 47702567 47702675 -55792299 + MTE-int LTR MaLR 1355 1472 -108 3 948 462 279 91 23 chr15 47702772 47703036 -55791938 + RLTR12B LTR ERVK 47 328 -200 3 948 310 251 98 117 chr15 47703290 47703587 -55791387 + RLTR11A2 LTR ERVK 215 505 -23 3 948 347 342 13 44 chr15 47703644 47703803 -55791171 + ORR1E LTR MaLR 44 197 -162 3 948 652 287 62 11 chr15 47705415 47705591 -55789383 + MTD LTR MaLR 2 186 -233 3 948 481 269 92 0 chr15 47705842 47705972 -55789002 + MTD LTR MaLR 193 334 -85 3 948 952 234 304 62 chr15 47707050 47707534 -55787440 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 3 948 1378 238 60 20 chr15 47709450 47709853 -55785121 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 949 6231 86 120 15 chr15 47711343 47712269 -55782705 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 3 949 418 238 110 75 chr15 47716502 47716675 -55778299 + MLT2C1 LTR ERVL 20 198 -199 3 949 1137 256 58 44 chr15 47717168 47717532 -55777442 - MTD LTR MaLR -49 370 2 3 949 782 300 132 13 chr15 47720692 47720980 -55773994 + ORR1E LTR MaLR 10 335 -24 3 949 782 300 132 13 chr15 47721485 47721500 -55773474 + ORR1E LTR MaLR 336 349 -10 3 949 1191 224 87 34 chr15 47732453 47732808 -55762166 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 949 308 244 95 82 chr15 47735395 47735542 -55759432 - RMER12 LTR ERVK -8 1314 1166 3 949 241 247 101 25 chr15 47737826 47737905 -55757069 - RMER12 LTR ERVK -85 1237 1153 3 949 3709 203 43 29 chr15 47737940 47738920 -55756054 - RMER12 LTR ERVK -126 1196 1 3 949 299 380 57 12 chr15 47741406 47741651 -55753323 + RNERVK23-int LTR ERVK 7432 7687 -530 3 949 1496 88 128 0 chr15 47741861 47742111 -55752863 + RLTR47_MM LTR ERV1 2 283 -249 3 949 3136 43 13 0 chr15 47752095 47752486 -55742488 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 949 234 200 0 68 chr15 47755432 47755491 -55739483 - MTD LTR MaLR -358 61 7 4 949 371 333 78 44 chr15 47764081 47764285 -55730689 - MTEb LTR MaLR -149 230 20 4 949 318 320 0 19 chr15 47764391 47764496 -55730478 + MLT1A1 LTR MaLR 298 400 -8 4 949 518 363 37 24 chr15 47771251 47771547 -55723427 + MLT1E1A LTR MaLR 378 677 -3 4 949 281 139 0 0 chr15 47778144 47778187 -55716787 + BGLII LTR ERVK 379 421 0 4 949 633 354 25 8 chr15 47796792 47797154 -55697820 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 4 949 239 279 42 59 chr15 47798351 47798469 -55696505 + MLT1N2 LTR MaLR 447 562 0 4 949 348 132 58 35 chr15 47800715 47800801 -55694173 + RMER19B LTR ERVK 1 88 -814 4 949 1239 169 80 215 chr15 47800786 47801162 -55693812 - RMER19B LTR ERVK -577 325 1 4 949 1680 234 89 3 chr15 47802362 47802744 -55692230 + MTC LTR MaLR 1 415 -6 4 949 1868 200 66 71 chr15 47811295 47811859 -55683115 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 5 949 503 278 116 26 chr15 47812122 47812355 -55682619 + MLT1B LTR MaLR 3 256 -134 5 949 235 337 0 12 chr15 47812536 47812620 -55682354 + MLT1B LTR MaLR 343 425 -42 5 949 837 195 56 33 chr15 47813817 47813997 -55680977 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 189 5 949 1178 213 65 102 chr15 47815211 47815593 -55679381 + ORR1D1 LTR MaLR 5 372 -2 5 949 1756 192 70 29 chr15 47819108 47819241 -55675733 + MTC LTR MaLR 18 147 -274 5 949 1543 229 16 219 chr15 47819241 47820008 -55674966 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 949 1756 192 70 29 chr15 47820008 47820259 -55674715 + MTC LTR MaLR 148 418 -3 5 949 679 302 40 37 chr15 47821300 47821625 -55673349 + ORR1E LTR MaLR 1 366 -13 5 949 669 178 19 13 chr15 47823880 47824039 -55670935 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 160 -393 5 949 1266 248 108 13 chr15 47825717 47826097 -55668877 - MTD LTR MaLR 0 419 4 5 949 522 255 14 7 chr15 47836817 47836963 -55658011 + ORR1A4 LTR MaLR 77 223 -106 5 949 825 111 24 0 chr15 47837161 47837287 -55657687 + ORR1A4 LTR MaLR 201 329 0 5 949 1242 221 97 60 chr15 47838884 47839254 -55655720 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 118 2943 78 5 12 chr15 47841098 47841501 -55653473 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 950 280 244 37 12 chr15 47849541 47849641 -55645333 - MTD LTR MaLR -20 399 278 5 950 1044 297 122 11 chr15 47849665 47850019 -55644955 - MTD LTR MaLR -14 405 13 5 950 283 250 0 14 chr15 47850012 47850081 -55644893 - MTD LTR MaLR -299 120 53 5 950 440 324 95 30 chr15 47856967 47857231 -55637743 + MER34A LTR ERV1 22 302 -269 5 950 360 330 53 41 chr15 47862633 47862876 -55632098 + MER67C LTR ERV1 50 295 -416 5 950 347 307 26 17 chr15 47873098 47873214 -55621760 + MLT1L LTR MaLR 111 227 -383 5 950 306 300 91 0 chr15 47877400 47877510 -55617464 - MLT1A0 LTR MaLR -245 120 1 6 950 1944 188 19 19 chr15 47878278 47878691 -55616283 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 413 -148 6 950 245 273 0 29 chr15 47878706 47878774 -55616200 + RLTR31_Mm LTR ERVK 496 561 0 6 950 895 318 84 3 chr15 47908001 47908357 -55586617 - MTD LTR MaLR 0 419 35 6 950 280 328 64 21 chr15 47910589 47910729 -55584245 - MLT1A0 LTR MaLR -79 286 141 6 950 1324 202 205 57 chr15 47910934 47911311 -55583663 + RLTR20C LTR ERVK 1 443 -91 6 950 1324 243 175 46 chr15 47911361 47911437 -55583537 + RLTR20C LTR ERVK 444 577 -1 6 950 642 273 57 42 chr15 47921556 47921889 -55573085 - RLTR15 LTR ERVK -21 338 1 6 950 2601 160 160 15 chr15 47942978 47943573 -55551401 + RMER6C LTR ERVK 9 689 -1 7 950 246 296 79 36 chr15 47944833 47944973 -55550001 + RMER12 LTR ERVK 696 841 -481 7 950 1918 178 85 22 chr15 47948959 47949407 -55545567 - RMER6C LTR ERVK 0 690 215 7 950 842 174 19 25 chr15 47949711 47949870 -55545104 - RMER6C LTR ERVK -531 159 2 7 950 966 303 122 6 chr15 47953337 47953672 -55541302 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 950 229 318 0 0 chr15 47968046 47968109 -55526865 + MTEa LTR MaLR 224 286 -93 7 950 470 295 57 8 chr15 47968090 47968273 -55526701 + MTEb LTR MaLR 165 379 0 7 951 1611 198 55 29 chr15 47977435 47977819 -55517155 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 951 1772 185 92 33 chr15 47983726 47984117 -55510857 + MTC LTR MaLR 6 419 -2 7 951 351 310 18 0 chr15 47993632 47993745 -55501229 + ORR1D2 LTR MaLR 8 122 -248 7 951 339 322 8 17 chr15 47994135 47994252 -55500722 + MLT1E LTR MaLR 117 232 -421 7 951 599 269 57 11 chr15 47994618 47994795 -55500179 - MTE2b LTR MaLR -2 377 193 7 951 290 211 18 0 chr15 47994800 47994857 -55500117 - MTE2b LTR MaLR -314 65 8 7 951 1120 236 106 55 chr15 47997157 47997610 -55497364 + RLTR20D LTR ERVK 6 481 -87 7 951 376 263 0 48 chr15 47998468 47998572 -55496402 + RLTR20D LTR ERVK 480 578 0 7 951 485 183 128 40 chr15 47998572 47998720 -55496254 + RMER13A LTR ERVK 236 396 -464 7 951 535 330 40 6 chr15 47999193 47999370 -55495604 - MTE-int LTR MaLR -1314 266 84 7 951 926 228 216 27 chr15 48004358 48004655 -55490319 - MTD LTR MaLR -65 354 2 9 951 594 352 86 19 chr15 48009097 48009470 -55485504 + MLT1A1 LTR MaLR 3 400 -8 1 951 404 371 58 40 chr15 48009870 48010148 -55484826 + RMER15 LTR ERVL 253 535 -40 2 951 251 237 12 50 chr15 48025661 48025741 -55469233 + MTEa LTR MaLR 290 366 -13 4 951 3873 215 38 129 chr15 48031514 48032546 -55462428 - RMER21A LTR ERV1 -6 941 4 5 951 1446 269 65 10 chr15 48032633 48033016 -55461958 - MTD LTR MaLR -2 417 14 5 951 886 285 113 0 chr15 48033662 48033918 -55461056 - MTE2b LTR MaLR -9 370 86 5 951 2717 193 28 28 chr15 48037722 48037828 -55457146 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 433 5 951 2717 193 28 28 chr15 48037876 48038303 -55456671 - RLTR20C LTR ERVK -102 432 1 5 951 392 168 149 16 chr15 48038330 48038451 -55456523 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -23 2303 2167 5 951 477 290 80 64 chr15 48048552 48048740 -55446234 - RMER13B LTR ERVK -4 904 714 7 951 2829 225 20 91 chr15 48048750 48049617 -55445357 - RMER17B LTR ERVK -150 808 4 7 951 681 281 16 0 chr15 48052484 48052669 -55442305 + HERVL40-int LTR ERVL 5339 5526 -4 8 951 4263 165 106 66 chr15 48056870 48057854 -55437120 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1023 0 8 951 682 309 35 26 chr15 48058889 48059118 -55435856 + MTC-int LTR MaLR 758 988 -270 9 951 1552 132 0 54 chr15 48059448 48059727 -55435247 + RMER19A LTR ERVK 474 737 0 9 951 1424 236 13 59 chr15 48062740 48063114 -55431860 - RMER20B LTR ERVK -146 481 125 1 951 251 287 46 76 chr15 48063305 48063486 -55431488 + RLTR17 LTR ERVK 91 253 -439 1 951 336 314 0 71 chr15 48063940 48064067 -55430907 + RLTR31_Mur LTR ERVK 436 553 0 1 951 2025 100 43 0 chr15 48064501 48064801 -55430173 - RLTR13C1 LTR ERVK -125 858 546 1 951 2273 162 127 111 chr15 48064941 48065620 -55429354 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 951 4621 189 37 48 chr15 48066741 48067877 -55427097 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1124 -724 1 951 3206 177 34 8 chr15 48070427 48071049 -55423925 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1119 1756 -92 1 951 381 279 71 64 chr15 48071399 48071682 -55423292 + RLTR15 LTR ERVK 50 334 -25 1 951 387 260 303 17 chr15 48075324 48075611 -55419363 - ORR1E LTR MaLR -4 375 1 1 951 694 247 18 18 chr15 48082929 48083094 -55411880 + ORR1B1 LTR MaLR 47 211 -183 1 951 981 232 4 35 chr15 48083154 48083198 -55411776 + ORR1A4 LTR MaLR 100 140 -189 1 951 981 232 4 35 chr15 48083393 48083576 -55411398 + ORR1A4 LTR MaLR 141 320 -9 1 951 309 206 0 29 chr15 48091993 48092063 -55402911 - RMER15 LTR ERVL -92 483 416 1 952 1499 328 79 28 chr15 48103520 48104203 -55390771 + ORR1B2-int LTR MaLR 15 732 -848 1 952 1591 313 96 39 chr15 48104223 48104858 -55390116 + ORR1B2-int LTR MaLR 902 1572 -8 1 952 1824 168 79 3 chr15 48104929 48105269 -55389705 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 1 952 476 368 47 19 chr15 48105274 48105487 -55389487 + MTEb LTR MaLR 63 281 -98 1 952 1008 296 54 75 chr15 48110170 48110652 -55384322 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 472 -105 1 952 899 267 6 111 chr15 48110949 48111027 -55383947 + RLTR11A LTR ERVK 439 511 -17 1 952 407 170 17 102 chr15 48113705 48113823 -55381151 + MT2B LTR ERVL 157 264 -337 1 952 660 295 58 107 chr15 48115334 48115698 -55379276 - MTE2a LTR MaLR -20 359 14 1 952 1763 200 11 32 chr15 48130316 48130688 -55364286 + ORR1B2 LTR MaLR 2 365 -2 2 952 2224 254 61 36 chr15 48130701 48131477 -55363497 + ORR1B2-int LTR MaLR 16 810 -699 2 952 680 205 8 8 chr15 48131468 48131596 -55363378 + ORR1B2 LTR MaLR 236 363 -4 2 952 1480 204 85 48 chr15 48158169 48158544 -55336430 + ORR1B1 LTR MaLR 1 389 -5 2 952 2671 221 94 32 chr15 48161091 48161498 -55333476 + RMER12 LTR ERVK 358 765 -557 2 952 2671 253 91 47 chr15 48161554 48162101 -55332873 + RMER12 LTR ERVK 766 1842 -6 2 952 2925 79 8 0 chr15 48176460 48176853 -55318121 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 952 1480 288 19 3 chr15 48195006 48195368 -55299606 - MTD LTR MaLR -7 412 45 3 952 5228 129 86 6 chr15 48199134 48200021 -55294953 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 3 952 819 261 40 62 chr15 48203652 48203993 -55290981 + MT2A LTR ERVL 1 477 -124 3 952 246 154 58 0 chr15 48205002 48205054 -55289920 - RMER6C LTR ERVK -136 554 500 3 952 593 238 0 27 chr15 48205161 48205308 -55289666 - RMER6-int LTR ERVK -3034 143 1 3 952 1536 197 32 18 chr15 48205355 48205696 -55289278 + RMER6C LTR ERVK 14 359 -331 3 952 457 195 26 17 chr15 48205776 48205891 -55289083 - RMER6-int LTR ERVK -3026 151 36 3 952 904 134 146 0 chr15 48205988 48206152 -55288822 + RMER6C LTR ERVK 501 688 -2 3 952 2017 222 86 30 chr15 48224140 48224678 -55270296 + RLTR20D LTR ERVK 1 568 0 3 952 3504 15 2 0 chr15 48224739 48225134 -55269840 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 952 477 226 0 0 chr15 48225790 48225883 -55269091 - RMER6C LTR ERVK -105 585 493 3 952 400 301 53 41 chr15 48226612 48226782 -55268192 - RMER13B LTR ERVK -9 899 728 3 952 271 292 200 0 chr15 48226775 48226895 -55268079 + MTEb LTR MaLR 236 379 0 3 953 3016 210 31 42 chr15 48242931 48243630 -55251344 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 3 953 1641 201 38 67 chr15 48248248 48248723 -55246251 - RMER6C LTR ERVK -2 688 228 4 953 2342 229 18 18 chr15 48254970 48255459 -55239515 + RLTR17 LTR ERVK 203 691 -1 4 953 1021 228 69 78 chr15 48255461 48255976 -55238998 + RMER3D-int LTR ERVK 2 855 -1987 4 953 733 215 15 44 chr15 48255987 48256258 -55238716 + RMER3D-int LTR ERVK 1008 1225 -1617 4 953 5788 194 58 44 chr15 48256358 48257952 -55237022 + RMER3D-int LTR ERVK 1227 2842 0 4 953 1064 151 176 3 chr15 48257957 48258268 -55236706 + RLTR17 LTR ERVK 4 368 -324 4 953 319 279 28 19 chr15 48272128 48272234 -55222740 - MTEb LTR MaLR 0 379 273 4 953 2899 49 0 21 chr15 48280315 48280688 -55214286 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 4 953 384 288 127 10 chr15 48293986 48294207 -55200767 + MLT1-int LTR MaLR 80 324 -1047 4 953 627 213 41 8 chr15 48296787 48296910 -55198064 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7196 -210 4 953 293 410 29 15 chr15 48303132 48303474 -55191500 + MLT1D LTR MaLR 156 502 -3 4 953 1319 117 51 0 chr15 48304402 48304598 -55190376 + RLTR10D LTR ERVK 1 206 -153 4 953 808 104 160 57 chr15 48304598 48304776 -55190198 + IAP-d-int LTR ERVK 1 177 -6365 4 953 805 210 0 0 chr15 48304770 48304927 -55190047 + IAP-d-int LTR ERVK 347 503 -6039 4 953 2046 198 0 16 chr15 48304927 48305311 -55189663 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5384 -1158 4 953 5792 110 7 35 chr15 48305293 48306186 -55188788 + IAP-d-int LTR ERVK 5673 6540 -2 4 953 2362 87 33 52 chr15 48306188 48306552 -55188422 + RLTR10D LTR ERVK 1 357 -2 4 953 605 248 152 45 chr15 48310708 48311038 -55183936 + RLTR9A LTR ERVK 4 368 0 5 953 1893 137 126 58 chr15 48311638 48312050 -55182924 + RMER16-int LTR ERVK 231 670 -4736 5 953 3826 194 13 15 chr15 48312054 48312808 -55182166 + RMER16-int LTR ERVK 816 1568 -3838 5 953 338 298 0 0 chr15 48312971 48313055 -55181919 + RMER16-int LTR ERVK 1500 1583 -1731 5 953 902 301 66 57 chr15 48313121 48313681 -55181293 + RMER16-int LTR ERVK 1791 2355 -3812 5 953 2632 172 29 19 chr15 48313719 48314246 -55180728 + RMER16-int LTR ERVK 1566 2081 -3325 5 953 6272 144 61 5 chr15 48314451 48314772 -55180202 + RMER16-int LTR ERVK 2156 2502 -2904 5 953 6272 144 61 5 chr15 48315606 48316355 -55178619 + RMER16-int LTR ERVK 2503 3284 -2122 5 953 673 150 188 18 chr15 48316339 48316484 -55178490 + RMER16-int LTR ERVK 3502 3656 -1750 5 953 673 150 188 18 chr15 48316504 48316528 -55178446 + RMER16-int LTR ERVK 3657 3699 -1707 5 953 261 343 0 0 chr15 48316590 48316695 -55178279 + MuRRS4-int LTR ERV1 4493 4597 -466 5 953 565 283 57 116 chr15 48316938 48317326 -55177648 + RLTR9A LTR ERVK 4 368 0 5 953 1129 249 135 28 chr15 48320926 48321290 -55173684 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 5 953 728 312 48 62 chr15 48322868 48323240 -55171734 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 153 5 953 1089 263 9 60 chr15 48324241 48324557 -55170417 + ORR1D1 LTR MaLR 1 300 -74 5 953 265 333 181 0 chr15 48328867 48329005 -55165969 + MLT1E1A LTR MaLR 94 256 -424 5 953 438 314 68 45 chr15 48333994 48334258 -55160716 + LTR40c LTR ERVL 187 456 -9 5 953 1923 144 19 0 chr15 48343569 48343881 -55151093 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 5 953 1345 233 68 64 chr15 48354248 48354761 -55140213 + RLTR31_Mur LTR ERVK 39 553 0 5 953 2336 126 139 19 chr15 48361784 48362214 -55132760 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 953 225 317 47 19 chr15 48365375 48365481 -55129493 + RMER12 LTR ERVK 742 850 -472 5 954 478 290 113 22 chr15 48369195 48369417 -55125557 + LTR40a LTR ERVL 7 248 -271 5 954 788 309 106 22 chr15 48381392 48381749 -55113225 - MTD LTR MaLR -15 404 18 5 954 285 346 91 52 chr15 48382012 48382320 -55112654 - MLT1J-int LTR MaLR -441 946 627 5 954 1037 302 76 26 chr15 48383175 48383556 -55111418 - MTD LTR MaLR -9 410 11 5 954 1946 219 85 50 chr15 48393179 48393780 -55101194 - RMER13B LTR ERVK -9 899 278 6 954 1797 178 24 78 chr15 48393805 48394269 -55100705 - RMER17B LTR ERVK -519 439 1 6 954 3468 204 87 16 chr15 48402990 48403784 -55091190 + RLTR25B LTR ERVK 4 853 -175 6 954 609 220 146 41 chr15 48404050 48404151 -55090823 + RLTR25B LTR ERVK 757 884 -144 6 954 609 220 146 41 chr15 48404302 48404436 -55090538 + RLTR25B LTR ERVK 890 1025 -3 6 954 795 137 16 8 chr15 48418964 48419089 -55075885 - MTC LTR MaLR -8 413 288 6 954 459 186 103 0 chr15 48419085 48419182 -55075792 - MTC LTR MaLR -314 107 1 6 954 466 271 0 0 chr15 48419743 48419839 -55075135 + ORR1E LTR MaLR 1 96 -263 6 954 417 297 62 62 chr15 48426922 48427179 -55067795 - MTE2a LTR MaLR -154 225 1 6 954 278 341 64 14 chr15 48427181 48427321 -55067653 - MTE2a-int LTR MaLR -3 1577 1431 6 954 250 346 103 87 chr15 48427750 48427811 -55067163 - MTE2a-int LTR MaLR -237 1021 965 6 954 393 327 59 95 chr15 48427838 48428399 -55066575 - MTE2a-int LTR MaLR -279 1091 232 6 954 545 307 57 21 chr15 48429083 48429276 -55065698 - MTE2a-int LTR MaLR -1058 200 1 6 954 476 279 78 166 chr15 48429826 48430122 -55064852 - MTD LTR MaLR -95 284 15 6 954 341 406 6 12 chr15 48432443 48432615 -55062359 - LTR40a LTR ERVL -348 171 1 6 954 616 291 20 0 chr15 48432641 48432837 -55062137 - HERVL40-int LTR ERVL -26 5504 5305 6 954 244 255 46 101 chr15 48440357 48440466 -55054508 - MER72B LTR ERV1 -56 712 610 6 954 458 356 86 14 chr15 48451529 48451751 -55043223 + MLT1E2 LTR MaLR 372 609 -18 7 954 3105 221 93 36 chr15 48454653 48455023 -55039951 + RMER21B LTR ERV1 1 384 -458 7 954 3105 221 93 36 chr15 48455095 48455521 -55039453 + RMER21B LTR ERV1 385 842 0 7 954 620 369 95 19 chr15 48457754 48458132 -55036842 + MLT1D LTR MaLR 45 451 -54 7 954 1189 199 21 12 chr15 48463354 48463595 -55031379 - ORR1A2 LTR MaLR -87 283 1 7 954 489 311 9 1 chr15 48465302 48465447 -55029527 + MTE2a LTR MaLR 226 371 -8 7 954 612 357 57 21 chr15 48465455 48465787 -55029187 + MTE2a-int LTR MaLR 3 346 -1234 7 954 648 355 58 53 chr15 48465829 48466343 -55028631 + MTE2a-int LTR MaLR 543 1106 -474 7 954 950 241 183 29 chr15 48477596 48477908 -55017066 + ORR1D1 LTR MaLR 1 360 -14 7 955 6699 59 37 1 chr15 48511140 48512024 -54982950 + RLTR13D5 LTR ERVK 3 918 -105 1 955 226 345 25 50 chr15 48525675 48525794 -54969180 + MLT1H2 LTR MaLR 274 389 -100 2 955 562 276 110 14 chr15 48528364 48528632 -54966342 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 2 955 774 299 45 11 chr15 48530505 48530792 -54964182 + RMER15 LTR ERVL 277 573 -2 3 955 1500 213 98 17 chr15 48533120 48533500 -54961474 - MTB_Mm LTR MaLR -24 383 3 3 955 943 309 39 8 chr15 48537748 48538070 -54956904 - ORR1D1 LTR MaLR -2 357 1 5 955 259 259 118 0 chr15 48540091 48540176 -54954798 - MLT1D LTR MaLR -15 490 410 5 955 2506 199 58 11 chr15 48544276 48544811 -54950163 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 5 955 889 325 68 58 chr15 48549611 48550026 -54944948 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 955 3178 19 50 0 chr15 48569366 48569743 -54925231 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 955 949 255 65 16 chr15 48605829 48606076 -54888898 + ORR1D2 LTR MaLR 112 370 0 1 956 250 351 75 50 chr15 48634449 48634689 -54860285 + MLT1C LTR MaLR 210 455 -12 2 956 2065 186 246 40 chr15 48637106 48637676 -54857298 - RMER6C LTR ERVK 0 690 3 2 956 430 297 14 35 chr15 48648464 48648607 -54846367 + ORR1D-int LTR MaLR 518 657 -713 2 956 628 294 94 84 chr15 48648801 48649109 -54845865 + MTEb LTR MaLR 62 372 -7 2 956 437 225 55 101 chr15 48649350 48649587 -54845387 + RMER19C LTR ERVK 1 226 -385 2 956 2102 243 14 116 chr15 48649595 48650257 -54844717 + RMER19C LTR ERVK 18 611 0 2 956 697 291 14 45 chr15 48653593 48653816 -54841158 - MTE2a LTR MaLR -163 216 1 2 956 350 281 64 7 chr15 48656090 48656230 -54838744 + ERVL-int LTR ERVL 5279 5426 -331 2 956 682 244 30 6 chr15 48657011 48657180 -54837794 - RMER15 LTR ERVL -95 480 308 2 956 646 268 95 6 chr15 48657116 48657350 -54837624 - ORR1D1 LTR MaLR -96 263 3 2 956 1400 194 42 102 chr15 48658093 48658484 -54836490 + ORR1B1 LTR MaLR 8 376 -2 2 956 321 140 0 0 chr15 48660036 48660086 -54834888 + ORR1B1 LTR MaLR 344 393 -1 2 956 334 324 104 33 chr15 48661399 48661581 -54833393 - MLT1B LTR MaLR -2 388 194 2 956 1167 242 7 63 chr15 48663951 48664251 -54830723 - MTD LTR MaLR -13 406 124 2 956 286 298 85 0 chr15 48670517 48670611 -54824363 - MLT2B1 LTR ERVL -185 335 234 2 956 248 233 33 0 chr15 48670618 48670678 -54824296 + RLTR12A LTR ERVK 9 70 -498 2 956 661 343 101 40 chr15 48674098 48674526 -54820448 + MER90a LTR ERV1 143 596 -18 2 956 1738 227 67 10 chr15 48688028 48688419 -54806555 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 956 3683 209 88 22 chr15 48688423 48689599 -54805375 - MTC-int LTR MaLR -4 1254 1 2 956 257 325 87 40 chr15 48691547 48691720 -54803254 + MLT1A LTR MaLR 115 295 -79 2 956 335 289 48 95 chr15 48701175 48701343 -54793631 + MTE2a LTR MaLR 23 182 -197 3 956 423 275 30 108 chr15 48702442 48702597 -54792377 + ORR1D1 LTR MaLR 28 171 -203 3 956 423 275 30 108 chr15 48702656 48702667 -54792307 + ORR1D1 LTR MaLR 172 181 -193 3 956 684 282 38 38 chr15 48722649 48722859 -54772115 - MTD LTR MaLR -209 210 1 3 956 508 87 0 0 chr15 48728358 48728427 -54766547 + ORR1A3 LTR MaLR 258 326 0 3 956 3267 167 5 4 chr15 48728427 48728986 -54765988 + ORR1A3-int LTR MaLR 1 560 -1403 3 956 541 264 21 28 chr15 48728942 48729086 -54765888 + MT2B LTR ERVL 122 264 -337 3 956 377 214 60 0 chr15 48729598 48729682 -54765292 + MT2B LTR ERVL 169 257 -344 3 956 1216 158 6 93 chr15 48729625 48729947 -54765027 + ORR1A3-int LTR MaLR 767 1060 -903 3 956 2428 114 146 2 chr15 48729993 48730458 -54764516 - RLTR47_MM LTR ERV1 0 532 1 3 956 1468 129 25 0 chr15 48730471 48730711 -54764263 - ORR1A2 LTR MaLR -80 247 2 3 956 1752 142 40 29 chr15 48733721 48734069 -54760905 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 555 3 956 1316 174 37 57 chr15 48733959 48734258 -54760716 + MTB_Mm LTR MaLR 115 407 0 3 956 4257 99 8 148 chr15 48735126 48735490 -54759484 - RMER17A LTR ERVK 0 751 410 3 956 4257 99 8 148 chr15 48735534 48736042 -54758932 - RMER17A LTR ERVK -342 409 1 3 956 332 299 101 145 chr15 48754680 48755067 -54739907 - RLTR23 LTR ERV1 -53 377 8 3 957 226 98 23 47 chr15 48759726 48759769 -54735205 - RLTR25A LTR ERVK -245 783 742 3 957 1242 174 42 8 chr15 48759821 48760082 -54734892 - RLTR25B LTR ERVK -204 824 555 3 957 2291 165 31 24 chr15 48760081 48760502 -54734472 - RLTR23 LTR ERV1 -6 424 1 3 957 2455 180 125 60 chr15 48760502 48761100 -54733874 - RLTR25A LTR ERVK -466 637 1 3 957 456 314 33 0 chr15 48767382 48767503 -54727471 + RMER20B LTR ERVK 1 125 -502 4 957 379 294 99 16 chr15 48767717 48767838 -54727136 + RMER20B LTR ERVK 217 347 -280 4 957 495 240 162 29 chr15 48767941 48768151 -54726823 - RMER20B LTR ERVK -47 469 245 4 957 237 300 58 39 chr15 48779956 48780060 -54714914 - RMER20B LTR ERVK -38 589 484 4 957 530 300 54 58 chr15 48780101 48780377 -54714597 - RMER20B LTR ERVK -263 364 90 4 957 279 319 0 0 chr15 48792829 48792901 -54702073 - MTE2b LTR MaLR -153 226 155 4 957 340 336 52 15 chr15 48794652 48794788 -54700186 + MLT2B2 LTR ERVL 371 511 -51 4 957 323 302 165 33 chr15 48795205 48795448 -54699526 - LTR33 LTR ERVL -3 512 238 4 957 2611 202 100 40 chr15 48796435 48797150 -54697824 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 4 957 264 365 57 67 chr15 48799646 48799943 -54695031 - MLT1D LTR MaLR 0 505 212 4 957 664 281 34 109 chr15 48802954 48803451 -54691523 + RLTR12B LTR ERVK 47 495 -73 4 957 2589 186 102 51 chr15 48808402 48809013 -54685961 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 4 957 13170 123 5 3 chr15 48809018 48810895 -54684079 - MERVK26-int LTR ERVK -3 6916 5035 4 957 1224 108 0 0 chr15 48810897 48811063 -54683911 + MERVK26-int LTR ERVK 3594 3759 -3160 4 957 2238 99 3 0 chr15 48811049 48811372 -54683602 - MERVK26-int LTR ERVK -3376 3543 3220 4 957 533 138 0 0 chr15 48811370 48811450 -54683524 - MERVK26-int LTR ERVK -4786 2133 2054 4 957 1751 111 16 7 chr15 48811450 48811771 -54683203 + MTB LTR MaLR 101 419 0 4 957 230 263 105 81 chr15 48816847 48816971 -54678003 - MLT1E3 LTR MaLR -335 289 163 4 957 1963 219 35 15 chr15 48819282 48819742 -54675232 - RMER13B LTR ERVK 0 908 440 4 957 1067 207 73 117 chr15 48832538 48832949 -54662025 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 4 957 1062 254 119 7 chr15 48839709 48839994 -54654980 - MTC LTR MaLR 0 421 105 5 957 408 286 29 0 chr15 48840392 48840497 -54654477 - MTC LTR MaLR -262 108 1 5 957 282 231 163 49 chr15 48840522 48840645 -54654329 + MTE2a LTR MaLR 243 379 0 5 957 807 350 118 25 chr15 48840646 48841206 -54653768 + MTE2a-int LTR MaLR 2 613 -645 5 957 407 287 45 59 chr15 48841266 48841488 -54653486 + MTE2a-int LTR MaLR 884 1102 -156 5 957 2621 98 66 0 chr15 48843439 48843835 -54651139 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 5 957 2671 73 12 0 chr15 48850261 48850603 -54644371 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 957 3023 99 63 76 chr15 48871401 48871927 -54623047 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 5 957 4900 170 24 28 chr15 48875191 48876145 -54618829 + RMER17B LTR ERVK 5 954 -4 5 957 2872 66 29 0 chr15 48882308 48882685 -54612289 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 5 958 231 318 108 31 chr15 48890208 48890338 -54604636 + MLT1A1 LTR MaLR 48 187 -221 5 958 1792 162 27 27 chr15 48892236 48892604 -54602370 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 5 958 244 336 5 13 chr15 48898981 48899075 -54595899 + MLT1E1 LTR MaLR 396 495 -185 5 958 3442 33 0 0 chr15 48899731 48900127 -54594847 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 958 259 253 40 13 chr15 48903305 48903381 -54591593 + MTE2b LTR MaLR 250 327 -52 5 958 6115 133 15 28 chr15 48905521 48906557 -54588417 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 5 958 229 204 0 0 chr15 48906986 48907030 -54587944 + ORR1E LTR MaLR 1 44 -335 5 958 258 216 0 0 chr15 48909033 48909084 -54585890 - BGLII_A LTR ERVK 0 445 395 5 958 933 236 20 31 chr15 48909087 48909383 -54585591 - BGLII_B LTR ERVK -2 439 127 5 958 247 286 0 0 chr15 48909622 48909685 -54585289 - MTEa LTR MaLR -31 348 286 5 958 358 288 79 109 chr15 48911085 48911350 -54583624 + ORR1E LTR MaLR 61 317 -42 5 958 1604 157 112 7 chr15 48912569 48912864 -54582110 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 6 958 1103 267 82 41 chr15 48916750 48916813 -54578161 - MTC LTR MaLR -65 356 276 6 958 1103 267 82 41 chr15 48917628 48917646 -54577328 - MTC LTR MaLR -146 275 264 6 958 4696 122 52 18 chr15 48917646 48918505 -54576469 + RMER17D LTR ERVK 1 889 0 6 958 1103 267 82 41 chr15 48918505 48918762 -54576212 - MTC LTR MaLR -158 263 3 6 958 334 310 137 12 chr15 48918779 48919027 -54575947 - MERVL_2A-int LTR ERVL -56 5701 5423 6 958 2634 323 77 26 chr15 48919622 48919772 -54575202 - MERVL_2A-int LTR ERVL -713 5048 4900 6 958 2806 107 21 19 chr15 48919772 48920192 -54574782 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 6 958 2634 323 77 26 chr15 48920192 48921254 -54573720 - MERVL_2A-int LTR ERVL -862 4899 3775 6 958 1014 339 62 38 chr15 48921432 48922364 -54572610 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4603 1158 138 6 958 313 317 40 77 chr15 48922488 48922761 -54572213 - MT2A LTR ERVL -2 531 269 6 958 2576 89 0 72 chr15 48924162 48924549 -54570425 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 6 958 6351 63 10 7 chr15 48934936 48935801 -54559173 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 111 6 958 6665 111 28 25 chr15 48937399 48938419 -54556555 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 6 958 1563 229 21 19 chr15 48949078 48949451 -54545523 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 958 257 77 51 0 chr15 48955661 48955700 -54539274 + MTB_Mm LTR MaLR 1 41 -366 6 958 4057 54 81 0 chr15 48963159 48963677 -54531297 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 6 958 464 87 0 0 chr15 48966401 48966470 -54528504 - RMER19C LTR ERVK -542 69 1 6 958 1590 223 234 16 chr15 48972559 48973047 -54521927 - RMER19B LTR ERVK -2 900 307 6 958 7791 97 47 11 chr15 48980217 48981421 -54513553 - RMER16-int LTR ERVK -856 4550 3303 6 958 4151 227 75 71 chr15 48981423 48982862 -54512112 - RMER16-int LTR ERVK -3902 3504 1415 6 958 549 106 12 12 chr15 48983005 48983091 -54511883 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 361 6 958 368 253 139 56 chr15 48983092 48983272 -54511702 - RLTR41 LTR ERV1 -251 195 1 6 958 896 222 0 46 chr15 48983277 48983471 -54511503 - RMER16-int LTR ERVK -3894 1512 1328 6 958 4495 146 74 44 chr15 48983520 48984663 -54510311 - RMER16-int LTR ERVK -3975 1431 192 6 958 3760 74 70 37 chr15 48984891 48985437 -54509537 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 6 958 1526 139 7 42 chr15 48986442 48986727 -54508247 + RLTR10A LTR ERVK 137 411 0 6 958 518 354 81 24 chr15 48987885 48988131 -54506843 - MT2A LTR ERVL -128 405 146 6 958 2371 195 84 8 chr15 48988523 48989096 -54505878 + RMER6C LTR ERVK 1 688 -2 6 958 1391 108 23 9 chr15 48994195 48994410 -54500564 + RMER16-int LTR ERVK 5189 5406 0 6 958 1876 196 59 17 chr15 48994445 48994849 -54500125 + RMER16 LTR ERVK 113 533 0 6 958 595 332 76 46 chr15 48994870 48995132 -54499842 - ORR1D2 LTR MaLR -100 270 1 6 958 2455 77 236 26 chr15 49000405 49000858 -54494116 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 37 2 958 66273 16 20 1 chr15 49000968 49008596 -54486378 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 1 2 958 2560 84 226 25 chr15 49008596 49009070 -54485904 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -49 605 37 3 958 2937 32 3 0 chr15 49018441 49018786 -54476188 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 119 2487 130 59 38 chr15 49020468 49020940 -54474034 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 959 2729 90 7 65 chr15 49024164 49024592 -54470382 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 2 959 3384 28 4 136 chr15 49025527 49026029 -54468945 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 3 959 1431 62 0 0 chr15 49026029 49026207 -54468767 + RLTR10-int LTR ERVK 1 178 -7403 3 959 346 89 0 0 chr15 49026389 49026434 -54468540 + RLTR10-int LTR ERVK 93 137 -6405 3 959 1975 9 9 4 chr15 49026437 49026670 -54468304 + RLTR10-int LTR ERVK 652 885 -1102 3 959 1798 47 0 4 chr15 49026639 49026872 -54468102 + MMERVK10C-int LTR ERVK 3512 3743 -3838 3 959 5798 30 0 0 chr15 49026865 49027531 -54467443 + MMERVK10C-int LTR ERVK 4790 5455 -2126 3 959 267 220 0 48 chr15 49032253 49032315 -54462659 + RMER10A LTR ERVL 364 422 -20 3 959 766 266 33 33 chr15 49032317 49032558 -54462416 + ORR1C2-int LTR MaLR 1114 1354 -16 3 959 1097 236 97 0 chr15 49032611 49032870 -54462104 + ORR1C2 LTR MaLR 100 383 -1 3 959 395 321 0 9 chr15 49035312 49035425 -54459549 + ORR1E LTR MaLR 1 112 -247 4 959 1108 269 55 63 chr15 49035419 49035784 -54459190 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 3 4 959 487 324 98 44 chr15 49036613 49036910 -54458064 - MT2A LTR ERVL -11 590 278 4 959 656 156 32 24 chr15 49036960 49037085 -54457889 - MT2A LTR ERVL -407 126 1 4 959 496 152 11 11 chr15 49046967 49047060 -54447914 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 267 5 959 370 125 0 59 chr15 49048745 49048813 -54446161 - RLTR15 LTR ERVK -290 69 6 5 959 596 296 138 22 chr15 49051454 49051730 -54443244 + MTD LTR MaLR 104 411 -8 6 959 1276 306 18 0 chr15 49058634 49058974 -54436000 - MTD LTR MaLR -73 346 1 8 959 562 311 67 26 chr15 49059336 49059645 -54435329 + MLT1A0 LTR MaLR 1 322 -43 8 959 1485 187 39 68 chr15 49060670 49061159 -54433815 + RLTR41 LTR ERV1 1 429 -17 8 959 1885 118 39 63 chr15 49061786 49062120 -54432854 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 8 959 1354 198 105 54 chr15 49065481 49065654 -54429320 + RMER17C LTR ERVK 2 184 -226 9 959 1354 198 105 54 chr15 49065732 49065947 -54429027 + RMER17C LTR ERVK 185 410 0 9 959 991 157 162 20 chr15 49067389 49067636 -54427338 - RMER6C LTR ERVK -406 284 3 9 959 4135 157 91 34 chr15 49073663 49074575 -54420399 + RMER17B LTR ERVK 1 954 -4 1 959 2992 69 8 5 chr15 49075295 49075688 -54419286 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 1 959 3979 141 126 19 chr15 49075690 49076471 -54418503 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1258 395 1 959 1626 26 0 0 chr15 49085615 49085808 -54409166 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 301 1 959 639 273 30 71 chr15 49089488 49089685 -54405289 + MTD LTR MaLR 68 256 -163 1 959 262 173 74 74 chr15 49091999 49092080 -54402894 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 429 1 959 2949 77 12 2 chr15 49094340 49094757 -54400217 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 959 1417 217 105 6 chr15 49095170 49095494 -54399480 + ORR1B2 LTR MaLR 4 359 -8 1 959 290 361 20 59 chr15 49095662 49095815 -54399159 + MTE-int LTR MaLR 1395 1541 -39 1 959 1387 219 110 55 chr15 49102653 49103127 -54391847 - RLTR11A LTR ERVK -28 500 1 1 959 1621 180 11 0 chr15 49105247 49105530 -54389444 + ORR1A1 LTR MaLR 1 286 -60 1 959 993 251 55 41 chr15 49105560 49105851 -54389123 + ORR1C1 LTR MaLR 84 378 0 1 959 593 313 65 73 chr15 49107504 49107921 -54387053 + BGLII_B LTR ERVK 20 424 -17 1 959 4565 141 218 15 chr15 49109413 49110339 -54384635 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 1 959 1508 201 7 16 chr15 49111668 49111972 -54383002 - RLTR10E LTR ERVK -10 301 1 1 959 280 265 60 12 chr15 49112352 49112436 -54382538 - RMER20B LTR ERVK -26 601 514 1 959 1508 167 23 0 chr15 49112434 49112697 -54382277 - RMER6C LTR ERVK -421 269 1 1 959 295 352 80 0 chr15 49113471 49113596 -54381378 + MTE2a LTR MaLR 1 135 -244 1 959 404 283 0 42 chr15 49113560 49113678 -54381296 + MT2A LTR ERVL 100 212 -321 1 960 320 300 50 0 chr15 49154098 49154178 -54340796 + ORR1D2 LTR MaLR 3 86 -273 1 960 3143 22 3 3 chr15 49154179 49154546 -54340428 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 960 24631 33 30 14 chr15 49154546 49157566 -54337408 + IAPEz-int LTR ERVK 8 3076 -3405 1 960 7313 27 3 1 chr15 49157552 49158402 -54336572 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 6481 0 1 960 3143 22 3 3 chr15 49158402 49158769 -54336205 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 1 960 1369 229 73 62 chr15 49158835 49159189 -54335785 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 2 1 960 437 332 133 38 chr15 49159192 49159402 -54335572 + ORR1D2 LTR MaLR 131 360 -10 1 960 3400 32 4 132 chr15 49159472 49159972 -54335002 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 960 608 296 43 70 chr15 49167887 49168214 -54326760 + RLTR12B LTR ERVK 17 334 -194 2 960 325 326 75 40 chr15 49168233 49168485 -54326489 + RLTR12B LTR ERVK 237 497 -31 2 960 4114 141 70 7 chr15 49168791 49169548 -54325426 + RMER17D2 LTR ERVK 1 805 -4 2 960 920 138 21 0 chr15 49171158 49171303 -54323671 + MT-int LTR MaLR 188 335 -763 2 960 2324 136 27 61 chr15 49173478 49173923 -54321051 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 2 960 768 319 60 16 chr15 49177018 49177373 -54317601 - MTD LTR MaLR -8 411 1 2 960 413 328 111 55 chr15 49180482 49180789 -54314185 - LTR86B2 LTR ERVL -98 389 66 2 960 268 281 0 0 chr15 49185941 49186005 -54308969 - MTEa LTR MaLR -315 64 1 2 960 2537 198 61 35 chr15 49191431 49191476 -54303498 - RMER6D LTR ERVK -4 716 680 2 960 2537 196 122 21 chr15 49191626 49192228 -54302746 - RMER6D LTR ERVK -41 679 1 2 960 433 371 49 12 chr15 49215312 49215550 -54279424 + MLT1G3 LTR MaLR 333 580 -15 2 960 561 175 0 0 chr15 49216486 49216589 -54278385 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 425 2 960 1179 214 80 4 chr15 49216582 49216844 -54278130 - RLTR11A2 LTR ERVK -245 282 1 2 960 1916 177 37 67 chr15 49217745 49218151 -54276823 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 960 855 285 123 6 chr15 49222754 49223086 -54271888 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 4 2 960 234 210 14 101 chr15 49228352 49228421 -54266553 - RLTR22_Mur LTR ERVK -479 1369 1307 2 960 252 260 58 68 chr15 49233866 49233878 -54261096 + ORR1B1 LTR MaLR 229 238 -129 2 960 316 260 58 68 chr15 49233977 49234067 -54260907 + ORR1B1 LTR MaLR 239 358 -36 2 960 468 278 149 6 chr15 49239387 49239561 -54255413 + MTE2b LTR MaLR 1 199 -180 2 960 493 333 0 0 chr15 49239899 49240040 -54254934 + MTE2b LTR MaLR 225 365 -14 2 960 1808 171 92 6 chr15 49242600 49242936 -54252038 + RLTR26 LTR ERVK 1 365 -277 2 960 1769 178 32 12 chr15 49244089 49244468 -54250506 - RMER6C LTR ERVK -325 395 1 3 960 1509 216 108 11 chr15 49252824 49253176 -54241798 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 9 3 960 2330 56 9 45 chr15 49253492 49253827 -54241147 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 35 357 0 3 960 3122 110 2 58 chr15 49257411 49257914 -54237060 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 960 493 47 0 45 chr15 49264164 49264231 -54230743 - RLTR10-int LTR ERVK -1620 367 304 3 960 2368 88 164 0 chr15 49264233 49264316 -54230658 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 280 3 960 2368 88 164 0 chr15 49264422 49264691 -54230283 - RLTR10A LTR ERVK -132 279 2 3 960 742 54 40 27 chr15 49265303 49265444 -54229530 + IAP-d-int LTR ERVK 477 602 -1385 3 960 793 196 0 0 chr15 49265441 49265594 -54229380 + IAP-d-int LTR ERVK 347 499 -6043 3 960 3619 64 82 12 chr15 49265595 49266083 -54228891 + IAP-d-int LTR ERVK 5006 5527 -1015 3 960 1575 83 5 5 chr15 49266087 49266305 -54228669 + IAP-d-int LTR ERVK 5667 5884 -658 3 960 4816 87 28 13 chr15 49266306 49266995 -54227979 + RLTR10-int LTR ERVK 1288 1986 -1 3 960 2574 74 125 5 chr15 49266995 49267264 -54227710 + RLTR10A LTR ERVK 1 278 -133 3 960 2574 74 125 5 chr15 49267322 49267419 -54227555 + RLTR10A LTR ERVK 279 410 -1 3 960 1338 198 25 69 chr15 49268545 49268865 -54226109 - ORR1A4 LTR MaLR -23 306 1 3 960 806 156 14 0 chr15 49268865 49269006 -54225968 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 1821 3 960 3768 181 62 10 chr15 49269139 49270004 -54224970 - ORR1A4-int LTR MaLR -191 1772 1001 3 960 343 301 0 75 chr15 49270134 49270234 -54224740 - ORR1A4-int LTR MaLR -906 886 795 3 960 343 301 0 75 chr15 49270753 49270784 -54224190 - ORR1A4-int LTR MaLR -998 794 765 3 960 7225 132 13 5 chr15 49270786 49271953 -54223021 + ORR1A2-int LTR MaLR 788 1963 0 3 960 2107 122 22 3 chr15 49271954 49272275 -54222699 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 960 1624 170 70 65 chr15 49274038 49274441 -54220533 + RLTR31_Mm LTR ERVK 157 561 0 3 960 1002 236 55 65 chr15 49274443 49274946 -54220028 + RMER3D-int LTR ERVK 3 847 -1995 3 960 399 231 21 43 chr15 49275022 49275162 -54219812 + RMER3D-int LTR ERVK 1015 1151 -1691 3 960 4518 207 58 74 chr15 49275213 49276594 -54218380 + RMER3D-int LTR ERVK 1463 2822 -20 3 960 4518 207 58 74 chr15 49276629 49276648 -54218326 + RMER3D-int LTR ERVK 2823 2840 -2 3 960 2075 201 52 55 chr15 49276650 49277213 -54217761 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 3 960 1219 167 4 13 chr15 49277361 49277591 -54217383 + MTB LTR MaLR 1 228 -172 3 960 1104 153 45 50 chr15 49277886 49277917 -54217057 + MTB LTR MaLR 182 214 -186 3 960 1104 153 45 50 chr15 49278097 49278285 -54216689 + MTB LTR MaLR 215 400 0 3 961 2642 198 40 42 chr15 49286211 49286913 -54208061 + RMER17B LTR ERVK 1 952 -6 3 961 843 213 145 53 chr15 49288513 49289059 -54205915 - RMER6C LTR ERVK -59 697 1 3 961 1147 177 152 15 chr15 49294762 49295026 -54199948 + RMER6C LTR ERVK 1 300 -390 3 961 373 343 103 17 chr15 49295007 49295182 -54199792 - MLT1D LTR MaLR -315 190 1 3 961 2081 237 18 34 chr15 49297372 49297878 -54197096 + RLTR16 LTR ERVK 8 505 0 3 961 422 264 75 30 chr15 49299820 49299953 -54195021 + MTD LTR MaLR 6 144 -275 3 961 760 355 39 0 chr15 49306649 49306905 -54188069 + MTD LTR MaLR 124 389 -30 3 961 1181 221 38 76 chr15 49307927 49308269 -54186705 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 961 3650 183 34 56 chr15 49308269 49309087 -54185887 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 800 -1163 3 961 1032 201 77 0 chr15 49308907 49309024 -54185950 + MT2B LTR ERVL 35 167 -434 3 961 923 254 7 34 chr15 49309137 49309431 -54185543 + ORR1A4-int LTR MaLR 719 1004 -959 3 961 1217 204 25 4 chr15 49311272 49311513 -54183461 - RMER6D LTR ERVK -1 719 474 3 961 780 228 63 128 chr15 49311533 49311900 -54183074 - RMER2 LTR ERV1 -35 532 190 3 961 238 191 43 0 chr15 49311904 49311951 -54183023 - RMER2 LTR ERV1 -517 50 2 3 961 2022 206 35 67 chr15 49311952 49312445 -54182529 - RMER6D LTR ERVK -243 477 1 3 961 985 187 26 75 chr15 49313061 49313287 -54181687 + RLTR16 LTR ERVK 1 215 -290 3 961 961 229 72 14 chr15 49313274 49313495 -54181479 - RLTR16 LTR ERVK -32 473 240 3 961 310 270 43 43 chr15 49313518 49313611 -54181363 - MLT2C1 LTR ERVL -304 93 1 3 961 576 254 22 0 chr15 49313836 49313974 -54181000 - RLTR40 LTR ERVK -15 802 662 3 961 343 341 86 26 chr15 49313983 49314215 -54180759 - MLT2C1 LTR ERVL -151 246 1 3 961 741 245 56 123 chr15 49315363 49315831 -54179143 + RMER2 LTR ERV1 3 540 -27 3 961 369 335 36 31 chr15 49318490 49318684 -54176290 + MLT1B LTR MaLR 3 197 -193 4 961 1146 193 77 27 chr15 49319632 49319893 -54175081 - RMER6C LTR ERVK 0 690 417 4 961 1547 201 33 78 chr15 49320245 49320640 -54174334 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 4 961 278 385 60 9 chr15 49327361 49327594 -54167380 - MER31A LTR ERV1 -3 482 238 4 961 296 295 34 43 chr15 49327653 49327770 -54167204 - MER31A LTR ERV1 -359 126 11 4 961 1589 237 21 180 chr15 49329018 49329744 -54165230 + RMER19C LTR ERVK 2 611 0 4 961 5922 165 38 32 chr15 49331976 49333083 -54161891 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 4 961 2822 173 32 39 chr15 49337390 49337832 -54157142 + RLTR20C LTR ERVK 3 432 -102 4 961 2822 173 32 39 chr15 49337888 49337981 -54156993 + RLTR20C LTR ERVK 433 533 -1 4 961 1371 232 15 86 chr15 49343070 49343475 -54151499 + ORR1C1 LTR MaLR 1 376 -2 4 961 2210 222 31 27 chr15 49343482 49343995 -54150979 + ORR1C1-int LTR MaLR 6 520 -989 4 961 2894 249 55 36 chr15 49345221 49346092 -54148882 + ORR1C1-int LTR MaLR 511 1398 -111 4 961 1186 256 30 75 chr15 49346164 49346578 -54148396 + ORR1C1 LTR MaLR 11 394 0 4 961 227 183 46 77 chr15 49351252 49351317 -54143657 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 4 961 2480 215 39 71 chr15 49354508 49355596 -54139378 + RMER16-int LTR ERVK 184 1196 -4612 4 961 2223 249 48 99 chr15 49355774 49355802 -54139172 + RMER16-int LTR ERVK 1197 1224 -4584 4 961 285 202 6 52 chr15 49355882 49355991 -54138983 + RMER16-int LTR ERVK 1326 1394 -6012 4 961 419 142 0 1 chr15 49355993 49356072 -54138902 + RMER16-int LTR ERVK 2926 2996 -4410 4 961 5518 119 46 61 chr15 49356075 49356369 -54138605 + RMER16-int LTR ERVK 3307 3589 -1817 4 961 5518 119 46 61 chr15 49356539 49356878 -54138096 + RMER16-int LTR ERVK 3590 3927 -1479 4 961 3412 18 10 0 chr15 49356878 49357270 -54137704 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 961 5518 119 46 61 chr15 49357270 49357631 -54137343 + RMER16-int LTR ERVK 3928 4290 -1116 4 961 1903 228 11 23 chr15 49357602 49358038 -54136936 + RMER16-int LTR ERVK 5350 5780 -28 4 961 6906 123 47 2 chr15 49358047 49359113 -54135861 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 4 961 292 301 35 141 chr15 49359944 49360114 -54134860 - MLT1C LTR MaLR -2 465 314 4 961 4706 179 63 78 chr15 49366640 49367758 -54127216 + RLTR25A LTR ERVK 1 1102 -1 4 961 391 292 84 52 chr15 49369989 49370245 -54124729 - RLTR16 LTR ERVK -245 323 24 4 961 382 315 60 24 chr15 49380263 49380436 -54114538 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 169 5 961 2639 88 15 22 chr15 49380482 49380888 -54114086 - BGLII LTR ERVK -18 403 1 5 961 281 294 68 10 chr15 49380889 49380992 -54113982 - ORR1D2 LTR MaLR -265 114 6 5 961 3284 181 30 7 chr15 49385495 49386102 -54108872 - RLTR17 LTR ERVK -71 621 1 5 961 774 344 62 31 chr15 49386489 49386843 -54108131 - MTE2a LTR MaLR -9 370 6 5 961 1915 101 61 58 chr15 49392842 49393168 -54101806 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 961 385 333 55 12 chr15 49399723 49399887 -54095087 + MLT2B4 LTR ERVL 13 183 -373 5 961 7296 91 6 22 chr15 49400244 49401284 -54093690 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 5 961 2108 111 0 12 chr15 49402679 49403008 -54091966 - BGLII LTR ERVK 0 421 97 5 961 2092 145 6 0 chr15 49403361 49403685 -54091289 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 5 961 735 317 57 42 chr15 49407512 49407845 -54087129 + MTEb LTR MaLR 20 357 -22 5 961 276 209 22 44 chr15 49407954 49408044 -54086930 - RLTR11A LTR ERVK -3 524 437 5 961 1178 241 79 77 chr15 49409462 49409906 -54085068 - RLTR11A LTR ERVK -83 445 1 5 961 1446 232 137 19 chr15 49409919 49410615 -54084359 - RMER6A LTR ERVK -16 740 1 5 962 310 370 19 0 chr15 49415315 49415423 -54079551 + MTEa LTR MaLR 3 112 -267 5 962 241 283 73 32 chr15 49420013 49420077 -54074897 - MLT1D LTR MaLR -8 497 429 5 962 5523 120 8 13 chr15 49420077 49420955 -54074019 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 118 5 962 875 262 75 68 chr15 49426727 49427153 -54067821 - RMER19A LTR ERVK -4 733 285 5 962 2027 233 37 76 chr15 49427153 49427719 -54067255 + RLTR20B3 LTR ERVK 6 549 -28 5 962 918 196 138 29 chr15 49427726 49427969 -54067005 - RMER19A LTR ERVK -356 255 1 5 962 423 287 16 16 chr15 49437310 49437434 -54057540 + RMER15 LTR ERVL 362 485 -90 6 962 698 303 59 62 chr15 49439316 49439719 -54055255 - MT2A LTR ERVL -74 527 1 6 962 1215 285 23 23 chr15 49441113 49441458 -54053516 + ORR1D1 LTR MaLR 30 374 0 6 962 3685 272 45 29 chr15 49441458 49442520 -54052454 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1079 -291 6 962 1171 262 98 18 chr15 49442577 49442601 -54052373 + ORR1D1 LTR MaLR 1 24 -350 6 962 1171 262 98 18 chr15 49442659 49442972 -54052002 + ORR1D1 LTR MaLR 25 364 -10 6 962 701 220 23 127 chr15 49449814 49450074 -54044900 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 198 6 962 361 218 11 44 chr15 49450197 49450288 -54044686 - RLTR23 LTR ERV1 -337 93 6 6 962 412 268 10 0 chr15 49457949 49458046 -54036928 + MTC LTR MaLR 1 98 -323 6 962 2036 146 29 18 chr15 49458080 49458463 -54036511 - BGLII_B LTR ERVK -54 387 1 6 962 1431 181 58 40 chr15 49458463 49458843 -54036131 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1940 6 962 1583 193 29 24 chr15 49461932 49462272 -54032702 + ORR1A1 LTR MaLR 3 344 -2 6 962 1130 209 24 4 chr15 49462274 49462529 -54032445 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 255 -1115 6 962 2617 223 119 23 chr15 49465279 49466068 -54028906 + ORR1A1-int LTR MaLR 229 1093 -870 6 962 593 131 63 3 chr15 49466071 49466215 -54028759 + ORR1A1 LTR MaLR 151 374 0 6 962 4030 185 80 20 chr15 49468990 49469836 -54025138 + RMER19B LTR ERVK 1 897 -5 6 962 2782 73 39 5 chr15 49470457 49470840 -54024134 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 962 1556 151 77 0 chr15 49471785 49472070 -54022904 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 14 320 -12 6 962 1028 101 43 25 chr15 49472070 49472233 -54022741 + IAPLTR4_I LTR ERVK 11 176 -1294 6 962 1602 132 121 24 chr15 49472232 49472629 -54022345 + IAPEY3-int LTR ERVK 407 952 -6629 6 962 1582 181 96 45 chr15 49472741 49473118 -54021856 + RMER16-int LTR ERVK 251 646 -4760 6 962 250 287 68 11 chr15 49473169 49473257 -54021717 + RMER16-int LTR ERVK 727 819 -4587 6 962 446 241 89 0 chr15 49473262 49473374 -54021600 + RMER16-int LTR ERVK 938 1059 -5078 6 962 298 279 0 55 chr15 49473388 49473479 -54021495 + IAPEY3-int LTR ERVK 2454 2539 -4867 6 962 661 193 0 0 chr15 49473491 49473610 -54021364 + IAPEY3-int LTR ERVK 2635 2753 -4653 6 962 2196 152 58 3 chr15 49473636 49474252 -54020722 + IAPEY3-int LTR ERVK 3567 4271 -3135 6 962 417 198 18 36 chr15 49474257 49474367 -54020607 + MMETn-int LTR ERVK 2357 2464 -2380 6 962 831 81 35 49 chr15 49474393 49474536 -54020438 + IAPEY3-int LTR ERVK 4530 4670 -2911 6 962 3261 98 0 16 chr15 49474791 49475238 -54019736 + IAPEY3-int LTR ERVK 5203 5642 -1939 6 962 3514 84 0 0 chr15 49475229 49475683 -54019291 + IAPEY3-int LTR ERVK 5761 6214 -1367 6 962 4220 92 29 0 chr15 49475673 49476252 -54018722 + IAPEY3-int LTR ERVK 6743 7338 -342 6 962 1391 196 61 20 chr15 49476269 49476612 -54018362 + IAPEz-int LTR ERVK 6125 6481 0 6 962 1575 159 78 0 chr15 49476620 49476916 -54018058 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 14 332 0 6 962 1847 223 21 0 chr15 49477078 49477464 -54017510 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 962 324 257 114 9 chr15 49477647 49477761 -54017213 + LTR40a LTR ERVL 12 137 -382 6 962 1109 233 38 0 chr15 49481470 49481706 -54013268 + RMER19C LTR ERVK 104 348 -263 6 962 2248 239 99 44 chr15 49496517 49497629 -53997345 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1342 -506 6 962 2146 246 132 32 chr15 49497686 49498118 -53996856 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1343 1812 -36 6 962 2400 143 58 68 chr15 49500299 49500786 -53994188 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 962 3163 85 98 6 chr15 49502850 49503321 -53991653 + LTRIS2 LTR ERV1 5 518 -46 4 962 3007 66 10 5 chr15 49503354 49503748 -53991226 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 962 1511 218 98 53 chr15 49504794 49505454 -53989520 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 8 962 1814 191 41 38 chr15 49506936 49506994 -53987980 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 332 1 962 1814 191 41 38 chr15 49507077 49507411 -53987563 - ORR1B1 LTR MaLR -63 331 2 1 962 2254 240 42 17 chr15 49513329 49513859 -53981115 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 18 2 962 957 261 65 111 chr15 49518376 49518825 -53976149 + RLTR23 LTR ERV1 3 430 0 2 962 1634 248 71 55 chr15 49532372 49532450 -53962524 + RMER19C LTR ERVK 109 207 -404 5 962 1634 248 71 55 chr15 49532476 49532892 -53962082 + RMER19C LTR ERVK 208 610 -1 5 962 2412 172 27 21 chr15 49536188 49536810 -53958164 - RMER17B LTR ERVK 0 958 287 5 962 1928 134 28 13 chr15 49542485 49542802 -53952172 - RMER17B LTR ERVK -636 322 1 5 962 954 321 42 3 chr15 49543803 49544087 -53950887 + ORR1D2 LTR MaLR 1 295 -75 6 962 235 169 32 48 chr15 49545008 49545070 -53949904 + ORR1D2 LTR MaLR 283 343 -27 6 963 2837 167 151 42 chr15 49545842 49546659 -53948315 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 7 963 737 236 134 26 chr15 49547539 49547947 -53947027 + RLTR20A2 LTR ERVK 2 578 0 7 963 1652 233 59 33 chr15 49554549 49554775 -53940199 - RMER10A LTR ERVL -1 441 217 8 963 1652 233 59 33 chr15 49555219 49555414 -53939560 - RMER10A LTR ERVL -226 216 9 8 963 3184 128 97 61 chr15 49555515 49556240 -53938734 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 8 963 433 178 151 2 chr15 49556867 49556965 -53938009 + MTC LTR MaLR 3 111 -285 8 963 256 136 16 33 chr15 49557736 49557797 -53937177 + RMER3D-int LTR ERVK 1193 1252 -1074 8 963 3460 196 41 53 chr15 49557780 49558728 -53936246 + RMER3D-int LTR ERVK 1906 2842 0 8 963 2177 144 84 8 chr15 49558728 49558918 -53936056 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 190 -232 8 963 2177 144 84 8 chr15 49558985 49559186 -53935788 + BGLII_Mus LTR ERVK 191 422 0 8 963 337 174 0 12 chr15 49559735 49559804 -53935170 + MTD LTR MaLR 303 419 0 9 963 609 273 0 20 chr15 49561493 49561639 -53933335 - RLTR20D LTR ERVK -13 565 423 9 963 772 265 44 71 chr15 49561620 49561916 -53933058 - RLTR20D LTR ERVK -277 291 4 9 963 1411 206 84 35 chr15 49561973 49562435 -53932539 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -21 2305 1821 9 963 1599 150 182 0 chr15 49562925 49563312 -53931662 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -496 1830 1373 9 963 1139 145 54 0 chr15 49563323 49563564 -53931410 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1015 1311 1058 9 963 1836 176 109 50 chr15 49563560 49564038 -53930936 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1392 934 429 9 963 3132 34 161 2 chr15 49565226 49565636 -53929338 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 1 963 13657 78 9 8 chr15 49565638 49567460 -53927514 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 4656 1 963 1555 93 0 0 chr15 49567459 49567663 -53927311 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2294 1 963 7873 82 63 93 chr15 49567656 49569005 -53925969 - IAPEz-int LTR ERVK -5164 1317 9 1 963 2920 35 105 0 chr15 49569006 49569378 -53925596 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 1 963 912 183 30 141 chr15 49572426 49572788 -53922186 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 963 457 276 16 70 chr15 49577239 49577426 -53917548 - RNLTR23 LTR ERVK 0 642 466 1 963 627 235 73 0 chr15 49579746 49579882 -53915092 + MTC LTR MaLR 40 185 -236 1 963 923 248 36 22 chr15 49579963 49580186 -53914788 + MTC LTR MaLR 196 421 0 1 963 5070 135 48 36 chr15 49586650 49587541 -53907433 + RMER17A2 LTR ERVK 1 902 -4 1 963 4027 11 62 0 chr15 49592559 49593023 -53901951 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 963 1385 215 134 43 chr15 49593211 49593673 -53901301 + RMER6C LTR ERVK 1 504 -186 1 963 417 277 11 88 chr15 49594497 49594679 -53900295 - RMER17A-int LTR ERVK -1529 199 32 1 963 1745 264 62 139 chr15 49594702 49595735 -53899239 - RMER13B LTR ERVK -9 899 1 1 963 686 260 165 13 chr15 49597298 49597528 -53897446 + ORR1D2 LTR MaLR 1 265 -105 1 963 2801 45 0 0 chr15 49615754 49616086 -53878888 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 1 963 23338 82 29 3 chr15 49616086 49620097 -53874877 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 1 1 963 2838 42 0 0 chr15 49620098 49620429 -53874545 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -1 331 1 1 963 314 224 27 144 chr15 49620997 49621065 -53873909 - RMER10A LTR ERVL 0 442 380 1 963 314 224 27 144 chr15 49621097 49621174 -53873800 - RMER10A LTR ERVL -63 379 314 1 963 1035 153 26 11 chr15 49622633 49622824 -53872150 + RMER17B LTR ERVK 761 954 -4 1 963 1622 213 36 61 chr15 49623091 49623536 -53871438 + RMER17B LTR ERVK 3 436 -522 1 963 1119 274 33 78 chr15 49623556 49623979 -53870995 + RMER13B LTR ERVK 315 718 -190 1 963 400 373 60 15 chr15 49624291 49624558 -53870416 - MER110 LTR ERV1 -207 284 6 1 963 2021 224 41 74 chr15 49627074 49627590 -53867384 + RLTR18 LTR ERVK 1 499 -117 1 963 252 106 149 0 chr15 49627597 49627644 -53867330 - RMER15 LTR ERVL -120 455 402 1 963 337 289 54 95 chr15 49636626 49636794 -53858180 + MLT1A0 LTR MaLR 63 223 -142 1 963 813 202 20 0 chr15 49640994 49641154 -53853820 + ORR1D1 LTR MaLR 1 175 -184 1 963 549 333 123 22 chr15 49641249 49641290 -53853684 + ORR1D1 LTR MaLR 176 217 -142 1 963 549 333 123 22 chr15 49641320 49641433 -53853541 + ORR1D1 LTR MaLR 218 347 -12 1 963 815 309 131 81 chr15 49644077 49644777 -53850197 + RMER13A LTR ERVK 1 735 -125 1 963 399 91 0 0 chr15 49645536 49645591 -53849383 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 340 1 963 1516 168 29 101 chr15 49645738 49646083 -53848891 - ORR1B1 LTR MaLR -34 360 41 1 963 235 286 43 11 chr15 49657951 49658043 -53836931 + RMER5 LTR ERV1 13 107 -427 2 963 493 319 117 25 chr15 49663063 49663458 -53831516 + RMER5 LTR ERV1 81 511 -23 2 964 1364 247 67 88 chr15 49676805 49677399 -53817575 - RMER19C LTR ERVK 0 902 108 2 964 3967 62 0 62 chr15 49689347 49689900 -53805074 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 2 964 2059 239 38 50 chr15 49691717 49692299 -53802675 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 2 964 775 286 90 114 chr15 49701737 49702104 -53792870 - MTE2a LTR MaLR 0 379 22 2 964 363 344 46 10 chr15 49702699 49702893 -53792081 - LTR82A LTR ERVL -592 280 80 2 964 234 290 127 27 chr15 49707383 49707493 -53787481 - MTEb LTR MaLR -5 374 254 2 964 735 72 0 0 chr15 49707583 49707680 -53787294 - RMER17A LTR ERVK -654 97 1 2 964 2528 55 15 0 chr15 49711741 49712067 -53782907 - IAPEY_LTR LTR ERVK 0 385 55 2 964 2144 224 108 25 chr15 49713508 49714139 -53780835 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4803 5485 -276 2 964 830 217 36 18 chr15 49715611 49715832 -53779142 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5466 5690 -71 2 964 265 216 67 19 chr15 49715830 49715934 -53779040 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5619 5727 -34 2 964 2791 167 74 36 chr15 49715993 49716086 -53778888 - RLTR20B3 LTR ERVK -2 575 471 2 964 2791 167 74 36 chr15 49716238 49716697 -53778277 - RLTR20B3 LTR ERVK -107 470 2 2 964 1947 151 43 3 chr15 49721009 49721334 -53773640 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 2 964 1284 293 70 14 chr15 49736134 49736592 -53758382 + MT2A LTR ERVL 5 491 -42 3 964 1284 293 70 14 chr15 49736620 49736660 -53758314 + MT2A LTR ERVL 492 531 -2 3 964 453 297 124 60 chr15 49737911 49738176 -53756798 + RMER13A LTR ERVK 101 382 -478 3 964 1418 218 16 29 chr15 49739055 49739401 -53755573 - MTC LTR MaLR -65 331 3 3 964 3881 141 35 99 chr15 49743018 49743883 -53751091 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 3 964 765 263 112 59 chr15 49746376 49746685 -53748289 - RLTR20B3 LTR ERVK -43 534 237 3 964 286 207 92 18 chr15 49746698 49746789 -53748185 + RLTR11A LTR ERVK 144 242 -286 3 964 991 223 82 22 chr15 49747200 49747517 -53747457 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 6 3 964 2121 147 3 0 chr15 49749870 49750183 -53744791 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 14 3 964 1577 237 22 44 chr15 49750396 49750806 -53744168 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 161 3 964 1141 155 36 14 chr15 49750876 49751098 -53743876 - RMER3D-int LTR ERVK -1309 1533 1307 3 964 701 148 19 19 chr15 49751098 49751212 -53743762 + RLTR31_Mm LTR ERVK 2 113 -448 3 964 701 148 19 19 chr15 49751306 49751349 -53743625 + RLTR31_Mm LTR ERVK 114 158 -403 3 964 1597 199 66 64 chr15 49751319 49751787 -53743187 + RLTR31_Mm LTR ERVK 62 530 -31 3 964 3240 53 0 2 chr15 49752108 49752505 -53742469 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 964 4052 200 96 62 chr15 49753551 49753893 -53741081 + RLTR25A LTR ERVK 1 319 -784 3 964 4052 200 96 62 chr15 49753926 49754650 -53740324 + RLTR25A LTR ERVK 320 1103 0 3 964 265 250 118 11 chr15 49754907 49755000 -53739974 + MLT1A LTR MaLR 266 368 -6 3 964 731 323 103 54 chr15 49755130 49755559 -53739415 - LTR40a LTR ERVL -14 505 56 3 964 237 277 74 65 chr15 49756642 49756750 -53738224 + MLT1A1 LTR MaLR 267 375 -33 3 964 1278 242 65 44 chr15 49756735 49757052 -53737922 + MTC LTR MaLR 6 323 -98 3 964 1278 242 65 44 chr15 49757210 49757259 -53737715 + MTC LTR MaLR 324 380 -41 3 964 3753 9 121 0 chr15 49758444 49758884 -53736090 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 964 28649 16 0 0 chr15 49758884 49762101 -53732873 + MERVL-int LTR ERVL 1 3216 -2269 3 964 12951 28 1 0 chr15 49762099 49763589 -53731385 + MERVL-int LTR ERVL 3870 5360 -125 3 964 392 167 46 35 chr15 49763589 49763676 -53731298 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 3 964 314 0 0 0 chr15 49763676 49763714 -53731260 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 3 964 4412 12 0 2 chr15 49763714 49764208 -53730766 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 3 964 227 273 38 25 chr15 49766906 49766985 -53727989 - RLTR19C LTR ERVK -184 322 243 3 964 280 330 90 5 chr15 49772116 49772317 -53722657 - MT2A LTR ERVL 0 554 305 3 964 514 268 104 52 chr15 49773879 49774072 -53720902 - ORR1D1 LTR MaLR -135 239 37 3 964 1145 209 70 35 chr15 49774073 49774266 -53720708 - ORR1D1-int LTR MaLR -5 1365 1157 3 964 2339 102 8 60 chr15 49774266 49774651 -53720323 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 3 964 1145 209 70 35 chr15 49774651 49774770 -53720204 - ORR1D1-int LTR MaLR -214 1156 1042 3 964 1950 280 87 85 chr15 49775440 49776244 -53718730 - ORR1D1-int LTR MaLR -305 1065 260 3 964 1085 268 86 12 chr15 49776611 49776947 -53718027 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 8 3 964 301 305 148 30 chr15 49795135 49795270 -53699704 + MLT2C1 LTR ERVL 65 215 -182 3 964 2058 137 44 62 chr15 49798619 49799009 -53695965 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 1 3 964 1128 212 93 80 chr15 49799413 49799666 -53695308 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 324 3 964 1128 212 93 80 chr15 49799814 49799935 -53695039 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -261 323 205 3 964 3066 98 19 66 chr15 49799937 49800450 -53694524 + RLTR1B LTR ERV1 1 489 -23 3 964 617 201 28 42 chr15 49800520 49800699 -53694275 + RLTR1B-int LTR ERV1 319 493 -4570 3 964 387 292 57 75 chr15 49801079 49801238 -53693736 + RLTR1B-int LTR ERV1 534 689 -2610 3 964 1384 76 5 5 chr15 49801421 49801606 -53693368 + RLTR1B-int LTR ERV1 3038 3222 -77 3 964 593 109 7 36 chr15 49801611 49801759 -53693215 + RLTR1B-int LTR ERV1 3221 3299 0 3 964 3219 109 15 63 chr15 49801759 49802297 -53692677 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 3 964 1061 183 14 34 chr15 49802297 49802506 -53692468 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -378 206 2 3 964 279 331 80 32 chr15 49804126 49804251 -53690723 - MLT1A1 LTR MaLR -140 268 138 4 964 1679 229 62 0 chr15 49804828 49805199 -53689775 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 965 473 341 145 35 chr15 49810937 49811475 -53683499 - MER21B LTR ERV1 -44 819 223 4 965 794 308 72 70 chr15 49814126 49814499 -53680475 + MTE2b LTR MaLR 3 376 -3 4 965 2412 154 59 2 chr15 49819095 49819518 -53675456 + RLTR11B LTR ERVK 5 451 -2 4 965 916 262 98 50 chr15 49819592 49819930 -53675044 + RMER13A LTR ERVK 198 551 -309 4 965 303 300 0 60 chr15 49821543 49821660 -53673314 - MLT2B4 LTR ERVL -45 511 402 4 965 1848 132 124 23 chr15 49822018 49822366 -53672608 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 4 965 1235 250 106 31 chr15 49830464 49831025 -53663949 - RMER20B LTR ERVK -24 603 1 4 965 2809 146 51 4 chr15 49833538 49834046 -53660928 - RLTR31_Mm LTR ERVK -29 532 1 4 965 304 332 62 86 chr15 49835398 49835688 -53659286 - MER67D LTR ERV1 -156 358 76 4 965 1469 194 84 9 chr15 49835980 49836303 -53658671 + MTC LTR MaLR 14 360 -61 4 965 230 295 60 60 chr15 49836346 49836429 -53658545 - MER67D LTR ERV1 -429 85 3 4 965 592 243 56 11 chr15 49843318 49843497 -53651477 + MTE2b LTR MaLR 193 379 0 4 965 1936 49 4 0 chr15 49845098 49845345 -53649629 + MTA_Mm LTR MaLR 149 396 0 4 965 1371 104 25 10 chr15 49853472 49853676 -53641298 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 140 4 965 1539 254 97 47 chr15 49858437 49859094 -53635880 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 965 376 322 53 53 chr15 49859516 49859703 -53635271 + MTE2a LTR MaLR 193 379 0 4 965 1508 230 195 46 chr15 49863014 49863753 -53631221 + RMER6A LTR ERVK 1 720 0 4 965 6870 65 12 1 chr15 49865934 49866817 -53628157 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 4 965 337 279 58 84 chr15 49869073 49869249 -53625725 - RLTR9A LTR ERVK -24 385 236 4 965 344 171 23 68 chr15 49869306 49869394 -53625580 - RLTR9A LTR ERVK -284 84 1 4 965 1238 182 9 31 chr15 49869980 49870263 -53624711 - RMER16-int LTR ERVK -4437 969 532 5 965 386 211 51 31 chr15 49870263 49870346 -53624628 - RLTR20D LTR ERVK -16 489 404 5 965 386 211 51 31 chr15 49870384 49870398 -53624576 - RLTR20D LTR ERVK -102 403 390 5 965 355 145 0 0 chr15 49870713 49870775 -53624199 - RLTR20A2 LTR ERVK -94 484 423 5 965 574 274 71 67 chr15 49870760 49871020 -53623954 - RLTR20D LTR ERVK -285 283 1 5 965 2499 143 52 0 chr15 49871127 49871546 -53623428 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 5 965 791 349 74 3 chr15 49878099 49878424 -53616550 - LTR16C LTR ERVL -56 433 86 5 965 233 183 46 77 chr15 49893216 49893281 -53601693 - RMER20A LTR ERVK -268 248 186 5 965 2834 55 0 0 chr15 49899892 49900238 -53594736 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 965 14596 45 0 1 chr15 49900238 49902031 -53592943 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 5 965 2592 58 48 0 chr15 49902031 49902361 -53592613 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 965 291 328 39 23 chr15 49909630 49909758 -53585216 - RMER10B LTR ERVL 0 398 269 5 965 2567 267 52 32 chr15 49915361 49915866 -53579108 - RLTR40 LTR ERVK -19 798 286 5 965 2567 267 52 32 chr15 49915909 49916185 -53578789 - RLTR40 LTR ERVK -532 285 2 5 965 311 111 0 0 chr15 49918246 49918291 -53576683 - MTB LTR MaLR 0 400 356 5 965 2854 204 17 28 chr15 49925333 49925909 -53569065 + RLTR20B3 LTR ERVK 5 574 -3 5 965 1907 162 21 56 chr15 49928725 49928792 -53566182 + ORR1B2 LTR MaLR 1 58 -309 5 965 1907 162 21 56 chr15 49929009 49929317 -53565657 + ORR1B2 LTR MaLR 59 365 -2 5 965 787 352 120 39 chr15 49929687 49930322 -53564652 + MLT1J-int LTR MaLR 242 927 -460 5 965 1146 268 111 23 chr15 49932210 49932554 -53562420 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 965 383 255 55 62 chr15 49937599 49937745 -53557229 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 286 5 966 1768 195 56 8 chr15 49939071 49939444 -53555530 + ORR1B1 LTR MaLR 4 394 0 5 966 1233 184 99 37 chr15 49941774 49942068 -53552906 + RLTR25B LTR ERVK 2 313 -715 5 966 386 367 60 33 chr15 49943518 49944000 -53550974 + MuRRS4-int LTR ERV1 2095 2589 -2474 5 966 2140 98 46 0 chr15 49944235 49944542 -53550432 + ORR1A2 LTR MaLR 1 321 -6 5 966 284 323 63 29 chr15 49944563 49944802 -53550172 + MuRRS4-int LTR ERV1 2484 2730 -2587 5 966 292 287 28 80 chr15 49946401 49946651 -53548323 + RMER17C LTR ERVK 80 316 -94 6 966 1699 150 38 71 chr15 49947031 49947455 -53547519 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 966 313 307 30 15 chr15 49947882 49948013 -53546961 + MMERGLN-int LTR ERV1 7092 7211 -345 6 966 650 278 81 35 chr15 49951748 49952009 -53542965 + MER57D LTR ERV1 135 407 -4 6 966 1566 194 27 87 chr15 49956284 49956651 -53538323 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 41 6 966 1209 243 109 3 chr15 49958948 49959286 -53535688 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 966 1232 236 113 48 chr15 49959838 49960252 -53534722 + RMER13A LTR ERVK 1 441 -419 6 966 331 375 65 71 chr15 49960285 49960609 -53534365 + RMER13A LTR ERVK 538 859 -1 6 966 2451 218 64 12 chr15 49969056 49969622 -53525352 + RLTR17 LTR ERVK 1 595 -97 6 966 1539 166 55 31 chr15 49969749 49970041 -53524933 - ORR1A4 LTR MaLR -12 317 19 6 966 1219 273 58 39 chr15 49971267 49971648 -53523326 - MTD LTR MaLR 0 419 32 6 966 9009 189 87 56 chr15 49975280 49978237 -53516737 - RMER16-int LTR ERVK -1195 6211 938 6 966 2878 59 0 3 chr15 49978237 49978595 -53516379 - IAPEY2_LTR LTR ERVK 0 357 1 6 966 4965 184 118 40 chr15 49978595 49979164 -53515810 - RMER16-int LTR ERVK -4469 937 263 6 966 961 244 20 84 chr15 49979687 49980080 -53514894 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 6 966 3129 167 22 76 chr15 49983274 49983781 -53511193 - RMER17A LTR ERVK 0 751 283 6 966 2819 41 2 122 chr15 49983781 49984222 -53510752 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 6 966 3129 167 22 76 chr15 49984222 49984486 -53510488 - RMER17A LTR ERVK -469 282 22 6 966 435 308 80 10 chr15 50004011 50004211 -53490763 - RMER5 LTR ERV1 -296 238 25 4 966 2528 169 49 2 chr15 50006296 50006331 -53488643 - RLTR20A1 LTR ERVK -58 493 459 1 966 2528 169 49 2 chr15 50006443 50006856 -53488118 - RLTR20A1 LTR ERVK -93 458 28 1 966 603 170 38 0 chr15 50014672 50014778 -53480196 + BGLII_A LTR ERVK 1 110 -335 2 966 1320 166 0 5 chr15 50014770 50014976 -53479998 + RLTR17 LTR ERVK 362 566 -126 2 966 229 226 0 184 chr15 50014957 50015071 -53479903 + RLTR31_Mm LTR ERVK 469 561 0 2 966 271 306 42 0 chr15 50021616 50021688 -53473286 - RLTR20A1 LTR ERVK 0 551 477 3 966 4276 189 41 12 chr15 50021826 50022626 -53472348 + RMER13A LTR ERVK 1 823 -37 3 966 2084 186 20 17 chr15 50023256 50023662 -53471312 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 966 1295 190 36 4 chr15 50024172 50024421 -53470553 + RMER20B LTR ERVK 328 584 -43 4 966 802 267 33 19 chr15 50024437 50024647 -53470327 - MTE2a LTR MaLR -162 217 5 4 966 2031 124 41 0 chr15 50025137 50025451 -53469523 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 966 522 318 37 18 chr15 50026346 50026564 -53468410 + RMER15 LTR ERVL 340 561 -14 4 966 1002 173 0 6 chr15 50026674 50026848 -53468126 + RMER6D LTR ERVK 1 173 -547 4 966 1197 227 76 71 chr15 50032942 50033322 -53461652 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 3 5 966 795 318 121 3 chr15 50033322 50033655 -53461319 - MTD LTR MaLR -36 383 11 5 966 592 329 83 61 chr15 50045867 50046229 -53448745 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 966 2443 87 6 0 chr15 50056123 50056444 -53438530 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 8 966 1929 205 61 15 chr15 50062688 50063079 -53431895 + MTC LTR MaLR 13 421 0 9 966 762 300 30 30 chr15 50064310 50064540 -53430434 + MTE2b LTR MaLR 142 371 -8 9 967 2349 147 51 8 chr15 50070928 50071319 -53423655 + RLTR26 LTR ERVK 1 408 -234 1 967 712 152 0 0 chr15 50071356 50071468 -53423506 + RLTR26 LTR ERVK 531 642 0 1 967 305 191 70 21 chr15 50082736 50082923 -53412051 + RMER17D LTR ERVK 320 515 -374 1 967 3418 18 8 0 chr15 50085109 50085502 -53409472 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 967 314 281 138 138 chr15 50087134 50087596 -53407378 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4369 4830 -927 1 967 1433 210 70 45 chr15 50087599 50087973 -53407001 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 1 1 967 609 275 134 51 chr15 50088076 50088329 -53406645 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4845 5118 -596 1 967 396 278 10 225 chr15 50088980 50089189 -53405785 + MTD LTR MaLR 3 166 -253 1 967 747 239 24 44 chr15 50089308 50089514 -53405460 + MTD LTR MaLR 204 405 -14 1 967 544 319 47 33 chr15 50090513 50090724 -53404250 + MLT1E LTR MaLR 1 214 -439 1 967 349 364 79 0 chr15 50090723 50090888 -53404086 + MLT1E LTR MaLR 368 545 -109 1 967 367 361 74 80 chr15 50100197 50100549 -53394425 - MLT2D LTR ERVL -61 353 4 1 967 230 315 78 68 chr15 50102165 50102356 -53392618 + MLT1D LTR MaLR 104 296 -209 1 967 478 328 21 16 chr15 50104918 50105110 -53389864 + MTEa LTR MaLR 184 376 -3 1 967 3381 33 2 5 chr15 50109868 50110265 -53384709 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 967 2376 231 29 34 chr15 50116424 50116984 -53377990 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 577 0 1 967 253 295 36 71 chr15 50121647 50121731 -53373243 + ORR1E LTR MaLR 21 101 -258 1 967 418 311 19 90 chr15 50124285 50124497 -53370477 + MT2A LTR ERVL 177 373 -160 1 967 267 242 49 21 chr15 50130225 50130329 -53364645 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 271 1 967 684 300 51 86 chr15 50130430 50130722 -53364252 + MTD LTR MaLR 83 364 -55 1 967 1831 184 92 13 chr15 50147102 50147481 -53347493 - MTC LTR MaLR -12 409 1 2 967 3105 156 27 6 chr15 50148902 50149413 -53345561 + RLTR17 LTR ERVK 1 522 -170 2 967 1916 180 27 12 chr15 50153711 50154043 -53340931 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 50 2 967 296 308 171 20 chr15 50159382 50159528 -53335446 - MLT1H2 LTR MaLR -35 454 287 2 967 2645 104 8 8 chr15 50159842 50160239 -53334735 - RLTR9D LTR ERVK -6 397 1 2 967 399 322 68 64 chr15 50161856 50162075 -53332899 + MLT1B LTR MaLR 157 376 -14 2 967 2797 84 47 0 chr15 50167074 50167456 -53327518 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 967 1600 221 108 3 chr15 50172305 50172686 -53322288 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 968 1887 150 28 20 chr15 50212354 50212707 -53282267 + RLTR15 LTR ERVK 4 359 0 3 968 518 323 133 9 chr15 50215999 50216224 -53278750 - RMER15 LTR ERVL -111 464 212 3 968 1863 176 56 81 chr15 50219823 50220379 -53274595 - RMER17D2 LTR ERVK -1 808 267 3 968 1843 94 0 0 chr15 50222278 50222532 -53272442 - RMER17D2 LTR ERVK -497 254 1 3 968 438 272 94 22 chr15 50223384 50223567 -53271407 - MLT1B LTR MaLR -194 180 3 3 968 553 209 18 9 chr15 50224642 50224753 -53270221 - RMER20A LTR ERVK -394 122 11 3 968 2087 91 3 4 chr15 50229477 50229798 -53265176 - MTB LTR MaLR 0 407 1 3 968 372 270 22 0 chr15 50231407 50231496 -53263478 - LTR33B LTR ERVL -318 185 95 3 968 283 259 79 45 chr15 50233663 50233732 -53261242 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 292 3 968 611 329 52 31 chr15 50233884 50234194 -53260780 - MLT1A0 LTR MaLR -46 362 6 3 968 640 281 28 57 chr15 50242127 50242338 -53252636 + MTEa LTR MaLR 13 217 -162 3 968 1498 141 72 7 chr15 50242359 50242519 -53252455 + RLTR13D3 LTR ERVK 707 866 -248 3 968 1498 141 72 7 chr15 50242584 50242702 -53252272 + RLTR13D3 LTR ERVK 867 1002 -112 3 968 447 324 21 26 chr15 50242754 50242944 -53252030 + MTEa LTR MaLR 189 377 -2 3 968 935 286 75 72 chr15 50246617 50247005 -53247969 + MTD LTR MaLR 26 414 -5 3 968 3141 25 34 41 chr15 50253236 50253650 -53241324 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 3 968 243 392 93 62 chr15 50278147 50278340 -53216634 - LTR33A_ LTR ERVL -323 208 10 4 968 666 281 34 45 chr15 50279846 50280193 -53214781 + MTEa LTR MaLR 30 377 -2 4 968 308 264 113 24 chr15 50280540 50280664 -53214310 - MTE2b LTR MaLR -36 343 209 4 968 302 148 74 0 chr15 50280921 50280975 -53213999 - MTE2b LTR MaLR -321 58 1 4 968 803 271 103 83 chr15 50285470 50285820 -53209154 + MTEa LTR MaLR 11 367 -12 4 968 1619 149 17 110 chr15 50291881 50292363 -53202611 - RMER17C LTR ERVK -522 436 19 4 968 746 299 129 29 chr15 50302601 50303011 -53191963 + MLT1F LTR MaLR 84 534 -14 4 968 1048 258 131 27 chr15 50309064 50309399 -53185575 + MTEb LTR MaLR 1 370 -9 4 968 1641 222 23 67 chr15 50309704 50310095 -53184879 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 4 968 4531 244 75 25 chr15 50310096 50311397 -53183577 - ORR1C1-int LTR MaLR -4 1366 1 4 968 1586 191 44 57 chr15 50311397 50311780 -53183194 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 968 874 284 29 35 chr15 50312278 50312625 -53182349 - RLTR15 LTR ERVK -13 346 2 4 968 1163 285 0 14 chr15 50314012 50314290 -53180684 - ORR1D1 LTR MaLR -53 321 48 4 968 377 96 0 0 chr15 50314371 50314423 -53180551 + RMER6D LTR ERVK 1 52 -668 4 968 439 53 18 0 chr15 50314423 50314480 -53180494 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 343 4 968 2591 47 47 0 chr15 50322491 50322829 -53172145 - MTA_Mm LTR MaLR -42 354 1 4 968 2950 180 86 39 chr15 50322829 50323103 -53171871 + RMER6D LTR ERVK 48 320 -400 4 968 2950 180 86 39 chr15 50323179 50323387 -53171587 + RMER6D LTR ERVK 321 563 -157 4 968 2950 180 86 39 chr15 50323946 50324105 -53170869 + RMER6D LTR ERVK 564 719 -1 4 968 262 241 17 0 chr15 50324930 50324988 -53169986 + RMER15 LTR ERVL 1 59 -516 4 968 322 214 33 22 chr15 50325041 50325132 -53169842 + RMER15 LTR ERVL 27 118 -457 4 968 1859 168 58 26 chr15 50325138 50325481 -53169493 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 4 968 713 278 24 5 chr15 50325609 50325815 -53169159 + RMER15 LTR ERVL 363 572 -3 4 968 459 286 66 127 chr15 50326156 50326384 -53168590 - MTE2a LTR MaLR -14 365 152 4 968 1357 311 61 14 chr15 50326391 50326831 -53168143 + MT2A LTR ERVL 4 464 -69 4 968 246 115 0 62 chr15 50327427 50327492 -53167482 + MT2A LTR ERVL 473 533 0 4 968 298 324 56 19 chr15 50327506 50327613 -53167361 - MTE2a LTR MaLR -235 144 34 4 968 393 308 24 24 chr15 50328503 50328626 -53166348 + MER21B LTR ERV1 627 749 -114 4 969 600 144 19 9 chr15 50340553 50340658 -53154316 - RMER10B LTR ERVL 0 398 293 4 969 536 251 60 153 chr15 50343608 50344026 -53150948 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 969 829 276 56 100 chr15 50344375 50344737 -53150237 - ORR1E LTR MaLR 0 379 1 4 969 1596 228 61 8 chr15 50344816 50345211 -53149763 - MTD LTR MaLR -14 405 3 4 969 763 306 91 98 chr15 50350111 50350571 -53144403 - RMER13A LTR ERVK -306 554 98 5 969 472 337 112 56 chr15 50351161 50351519 -53143455 + MLT1A1 LTR MaLR 18 395 -13 5 969 244 362 69 63 chr15 50354249 50354438 -53140536 + LTR33C LTR ERVL 434 623 -6 5 969 259 326 150 0 chr15 50355334 50355521 -53139453 + MLT1H LTR MaLR 5 219 -360 5 969 228 153 62 92 chr15 50359292 50359357 -53135617 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 5 969 3297 21 21 3 chr15 50359436 50359825 -53135149 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 969 9363 16 18 1 chr15 50359825 50360905 -53134069 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 5 969 3296 26 21 0 chr15 50360905 50361293 -53133681 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 969 1643 244 90 36 chr15 50374113 50374644 -53120330 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 5 969 1742 151 87 46 chr15 50378275 50378624 -53116350 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 100 5 969 1742 150 89 47 chr15 50378701 50378782 -53116192 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -458 99 2 5 969 2430 218 40 45 chr15 50378784 50379509 -53115465 - RMER3D-int LTR ERVK -2 2840 2120 5 969 728 168 39 111 chr15 50379509 50379690 -53115284 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -389 168 1 5 969 3165 184 115 43 chr15 50379746 50380427 -53114547 - RMER3D-int LTR ERVK -747 2095 1371 5 969 3165 193 65 33 chr15 50380454 50380803 -53114171 - RMER3D-int LTR ERVK -1472 1370 1005 5 969 377 236 95 90 chr15 50380827 50380949 -53114025 - RMER3D-int LTR ERVK -2641 201 67 5 969 377 236 95 90 chr15 50381000 50381077 -53113897 - RMER3D-int LTR ERVK -2776 66 1 5 969 2099 212 52 72 chr15 50381079 50381731 -53113243 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -2 559 1 5 969 3732 164 40 25 chr15 50383119 50383801 -53111173 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 5 969 396 350 62 29 chr15 50395634 50395875 -53099099 + LTR16E1 LTR ERVL 290 538 0 5 969 251 373 100 17 chr15 50397207 50397496 -53097478 + LTR78 LTR ERV1 991 1303 -1 5 969 1022 312 41 11 chr15 50399727 50400093 -53094881 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 5 969 2581 163 169 12 chr15 50411445 50412041 -53082933 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 5 969 290 296 90 63 chr15 50412084 50412324 -53082650 + RLTR20D LTR ERVK 1 257 -306 5 969 3484 69 39 2 chr15 50420839 50421304 -53073670 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 969 318 381 89 41 chr15 50423066 50423337 -53071637 + ORR1E LTR MaLR 32 315 -44 5 969 1761 58 109 4 chr15 50423846 50424122 -53070852 + BGLII LTR ERVK 1 305 -116 5 969 3552 72 19 4 chr15 50426172 50426647 -53068327 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 969 4374 66 107 19 chr15 50426647 50427283 -53067691 + RLTR45-int LTR ERVK 1 692 -6552 5 969 1132 51 0 0 chr15 50427583 50427721 -53067253 + RLTR45-int LTR ERVK 681 818 -6426 5 969 4496 47 101 1 chr15 50428532 50429428 -53065546 + RLTR45-int LTR ERVK 1329 2314 -4930 5 969 7023 50 1 8 chr15 50431517 50432430 -53062544 + RLTR45-int LTR ERVK 2306 3212 -4032 5 969 3161 68 38 14 chr15 50432411 50432857 -53062117 + RLTR45-int LTR ERVK 3385 3841 -3403 5 969 1350 100 29 53 chr15 50432856 50433099 -53061875 + RLTR45-int LTR ERVK 3750 3986 -3258 5 969 7935 55 2 8 chr15 50433092 50434106 -53060868 + RLTR45-int LTR ERVK 5065 6072 -1172 5 969 2032 97 13 3 chr15 50434128 50434427 -53060547 + RLTR13B1 LTR ERVK 207 508 -385 5 969 7640 50 1 2 chr15 50434427 50435340 -53059634 + RLTR45-int LTR ERVK 6333 7244 0 5 969 3517 78 19 4 chr15 50435340 50435815 -53059159 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 969 301 349 89 28 chr15 50449513 50449693 -53045281 + LTR16E2 LTR ERVL 274 464 -104 6 969 1597 240 25 14 chr15 50452898 50453266 -53041708 - MTD LTR MaLR -2 417 46 6 969 1047 330 92 36 chr15 50453567 50454085 -53040889 - MLT1F LTR MaLR -3 545 3 6 969 2068 95 3 69 chr15 50456719 50457068 -53037906 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 6 121 55924 8 1 5 chr15 50457069 50463572 -53031402 + IAPEz-int LTR ERVK 1 6481 0 6 970 2068 95 3 69 chr15 50463572 50463921 -53031053 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 326 -11 6 970 683 240 160 56 chr15 50467050 50467319 -53027655 + MTEb LTR MaLR 66 362 -17 6 970 231 311 156 0 chr15 50476279 50476369 -53018605 + MTEa LTR MaLR 2 105 -274 6 970 467 304 66 66 chr15 50476417 50476648 -53018326 + MT2A LTR ERVL 213 443 -90 6 970 1335 248 96 69 chr15 50476648 50477055 -53017919 + MTC LTR MaLR 4 421 0 6 970 557 339 110 26 chr15 50480585 50480894 -53014080 - MLT1A0 LTR MaLR -8 357 23 6 970 280 308 2 81 chr15 50494031 50494152 -53000822 + MLT1B LTR MaLR 255 390 0 6 970 464 312 14 28 chr15 50560245 50560390 -52934584 + MLT1E LTR MaLR 454 596 -57 8 970 228 169 67 17 chr15 50583137 50583197 -52911777 + RLTR40 LTR ERVK 15 77 -740 1 971 232 216 78 0 chr15 50597501 50597552 -52897422 + RMER12 LTR ERVK 749 803 -519 1 971 1293 265 50 0 chr15 50627524 50627845 -52867129 + MTD LTR MaLR 26 362 -57 1 971 240 325 60 0 chr15 50636372 50636455 -52858519 + LTR79 LTR ERVL 427 514 -13 1 971 2112 190 32 7 chr15 50655567 50655976 -52838998 - MTC LTR MaLR 0 421 3 1 971 789 119 0 0 chr15 50656861 50656979 -52837995 + ORR1D1 LTR MaLR 5 122 -252 1 972 317 335 63 58 chr15 50728233 50728423 -52766551 + LTR33 LTR ERVL 325 515 0 2 972 411 168 40 48 chr15 50730153 50730278 -52764696 - RMER17C LTR ERVK -135 275 152 2 972 2818 201 84 8 chr15 50731817 50732524 -52762450 - RLTR25B LTR ERVK -174 854 3 2 972 1736 225 36 40 chr15 50742570 50742991 -52751983 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 972 411 309 216 0 chr15 50748787 50748981 -52745993 + MLT1D LTR MaLR 6 241 -264 3 972 793 333 136 89 chr15 50765727 50766433 -52728541 - MER21B LTR ERV1 -113 750 12 3 972 893 327 59 11 chr15 50778458 50778814 -52716160 - MTE2a LTR MaLR -4 375 3 3 972 341 343 50 43 chr15 50779232 50779372 -52715602 + MLT1E1 LTR MaLR 414 554 -100 3 972 386 260 175 26 chr15 50779824 50779978 -52714996 + MLT2B4 LTR ERVL 21 197 -359 3 972 1065 256 170 46 chr15 50783472 50783971 -52711003 + RMER4B LTR ERVK 15 575 -10 3 972 262 262 106 53 chr15 50785409 50785522 -52709452 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 288 3 972 1200 316 24 21 chr15 50785707 50786082 -52708892 - MTEb LTR MaLR -3 376 1 3 972 1258 309 86 30 chr15 50786082 50786557 -52708417 - MTEb-int LTR MaLR -29 1551 1049 3 972 677 362 143 17 chr15 50790497 50791022 -52703952 - MLT1G3 LTR MaLR -1 594 4 3 972 304 262 55 18 chr15 50802626 50802735 -52692239 + RMER12 LTR ERVK 738 850 -472 3 972 442 353 122 67 chr15 50817961 50818304 -52676670 + MTEa LTR MaLR 4 365 -14 4 972 2373 171 113 72 chr15 50818313 50818976 -52675998 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 972 387 337 156 16 chr15 50823954 50824210 -52670764 + LTR16A1 LTR ERVL 19 310 -146 4 972 1812 142 49 31 chr15 50825598 50825947 -52669027 + RLTR15 LTR ERVK 1 355 -4 4 972 429 320 145 122 chr15 50835813 50836069 -52658905 + MTD-int LTR MaLR 1088 1395 -185 4 972 544 276 86 46 chr15 50836143 50836367 -52658607 + MTD-int LTR MaLR 1112 1258 0 4 972 1434 275 20 37 chr15 50836367 50836769 -52658205 + MTD LTR MaLR 25 419 0 4 972 566 188 20 0 chr15 50838726 50838827 -52656147 + MTC LTR MaLR 3 105 -316 4 972 1888 176 68 3 chr15 50838947 50839317 -52655657 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 973 304 314 101 8 chr15 50862238 50862357 -52632617 - MTE2b LTR MaLR -85 294 165 4 973 481 242 8 239 chr15 50868941 50869175 -52625799 - MTE2b LTR MaLR -199 180 1 4 973 791 216 112 198 chr15 50869688 50869875 -52625099 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 183 4 973 791 216 112 198 chr15 50869965 50870178 -52624796 - ORR1D1 LTR MaLR -192 182 1 4 973 887 351 8 58 chr15 50909773 50909955 -52585019 - ORR1E LTR MaLR 0 359 190 5 973 887 351 8 58 chr15 50909975 50910170 -52584804 - ORR1E LTR MaLR -170 189 1 5 973 317 273 54 54 chr15 50939516 50939663 -52555311 + MLT1F1 LTR MaLR 418 564 -5 5 973 1161 287 123 5 chr15 50941236 50941611 -52553363 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 973 1794 192 7 75 chr15 50951948 50952375 -52542599 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 5 973 776 327 53 56 chr15 50961053 50961412 -52533562 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 8 5 973 465 279 225 18 chr15 50962684 50963023 -52531951 + MLT1F LTR MaLR 191 569 0 5 973 391 274 0 57 chr15 50968466 50968590 -52526384 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 249 5 973 235 400 10 0 chr15 50968679 50968779 -52526195 - MLT1A0 LTR MaLR -222 143 43 5 973 1462 136 40 130 chr15 50973350 50973797 -52521177 - RMER17C LTR ERVK 0 410 4 5 973 226 300 28 149 chr15 50979538 50979679 -52515295 - MT2B LTR ERVL -343 258 135 6 974 241 192 0 71 chr15 50990296 50990352 -52504622 - RMER16 LTR ERVK -348 185 134 6 974 300 365 131 41 chr15 51016552 51016872 -52478102 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 15 2 974 245 352 89 68 chr15 51017083 51017318 -52477656 - MLT2E LTR ERVL -351 277 38 2 974 289 241 48 136 chr15 51017399 51017494 -52477480 + RMER15 LTR ERVL 45 134 -441 2 974 2383 213 29 53 chr15 51017494 51018083 -52476891 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 2 974 289 241 48 136 chr15 51018083 51018112 -52476862 + RMER15 LTR ERVL 135 158 -417 2 974 646 306 12 12 chr15 51018108 51018280 -52476694 + RMER15 LTR ERVL 273 444 -131 2 974 1230 236 77 60 chr15 51018280 51018645 -52476329 + ORR1D1 LTR MaLR 1 371 -3 2 974 409 255 10 0 chr15 51018655 51018757 -52476217 + RMER15 LTR ERVL 452 554 -21 2 974 657 271 365 7 chr15 51018960 51019258 -52475716 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 2 974 622 261 77 79 chr15 51031098 51031451 -52463523 + RLTR15 LTR ERVK 1 352 -7 4 974 228 234 0 0 chr15 51031535 51031582 -52463392 + RMER15 LTR ERVL 420 466 -109 4 974 598 351 58 67 chr15 51042764 51043228 -52451746 + MLT1C LTR MaLR 8 467 0 6 974 292 291 243 49 chr15 51049860 51050127 -52444847 + MLT1A LTR MaLR 1 319 -55 7 974 2640 199 34 90 chr15 51057724 51058135 -52436839 - RMER6D LTR ERVK -4 716 347 8 974 2640 199 34 90 chr15 51058267 51058610 -52436364 - RMER6D LTR ERVK -374 346 4 8 974 974 295 47 73 chr15 51066515 51066896 -52428078 - MTEa LTR MaLR -5 374 4 1 974 262 322 11 22 chr15 51072909 51073001 -52421973 + LTR33A_ LTR ERVL 15 105 -426 1 974 283 312 52 67 chr15 51077966 51078100 -52416874 + LTR33 LTR ERVL 14 145 -370 1 974 767 279 148 28 chr15 51080630 51080954 -52414020 + MTE2b LTR MaLR 2 364 -15 1 974 233 290 90 15 chr15 51086424 51086557 -52408417 - MLT1D LTR MaLR 0 505 363 1 974 230 368 5 104 chr15 51086640 51086852 -52408122 - MLT1D LTR MaLR -302 203 13 1 974 462 348 12 47 chr15 51108143 51108315 -52386659 + MTD LTR MaLR 20 185 -234 1 974 509 325 343 21 chr15 51108970 51109198 -52385776 - MTEa LTR MaLR -1 369 65 1 974 509 358 30 20 chr15 51109222 51109286 -52385688 - MTEa LTR MaLR -315 64 3 1 974 322 254 270 32 chr15 51113709 51113835 -52381139 + MTE2b LTR MaLR 222 377 -2 1 975 738 286 77 25 chr15 51128477 51128800 -52366174 + MER67C LTR ERV1 57 396 -315 1 975 917 317 79 46 chr15 51131081 51131560 -52363414 + MLT1D LTR MaLR 1 495 -10 1 975 259 343 64 43 chr15 51135523 51135663 -52359311 - MLT1G1 LTR MaLR -337 242 100 1 975 318 355 37 37 chr15 51135780 51135944 -52359030 - MLT1G1-int LTR MaLR -48 1441 1278 1 975 554 325 46 65 chr15 51135931 51136237 -52358737 - MLT1G1 LTR MaLR -47 532 233 1 975 256 264 0 103 chr15 51138308 51138405 -52356569 + MT2B LTR ERVL 169 255 -346 1 975 349 304 67 110 chr15 51139986 51140404 -52354570 - RMER10A LTR ERVL -25 417 18 1 975 568 314 70 93 chr15 51141745 51142057 -52352917 + ORR1E LTR MaLR 3 307 -52 2 975 321 261 135 0 chr15 51142247 51142358 -52352616 + MLT1B LTR MaLR 249 374 -16 2 975 264 159 0 0 chr15 51160183 51160227 -52334747 + MLT2D LTR ERVL 515 558 -2 2 975 297 357 24 8 chr15 51173274 51173401 -52321573 + MLT1A0 LTR MaLR 12 140 -225 2 975 346 227 84 76 chr15 51178377 51178496 -52316478 + LTR40b LTR ERVL 115 234 -228 2 975 225 226 0 75 chr15 51178645 51178712 -52316262 + LTR40b LTR ERVL 319 380 -82 2 975 243 320 42 105 chr15 51178873 51179016 -52315958 - MLT1K LTR MaLR -442 153 20 2 975 302 303 208 17 chr15 51182458 51182636 -52312338 + RMER15 LTR ERVL 364 575 0 2 975 1896 322 49 44 chr15 51182732 51183505 -52311469 + RMER15-int LTR ERVL 106 882 -4117 2 975 734 332 41 6 chr15 51183748 51184066 -52310908 + RMER15-int LTR ERVL 873 1201 -3798 2 975 384 339 93 67 chr15 51184180 51184597 -52310377 + RMER15-int LTR ERVL 1370 1797 -3202 2 975 888 279 71 15 chr15 51197417 51197755 -52297219 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 2 975 2291 122 0 0 chr15 51203681 51204008 -52290966 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 975 354 372 32 16 chr15 51217802 51217988 -52276986 + MLT1A LTR MaLR 186 374 0 2 975 358 326 98 81 chr15 51240167 51240270 -52254704 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 258 3 975 358 326 98 81 chr15 51240304 51240557 -52254417 - ORR1D2 LTR MaLR -113 257 5 3 975 519 330 50 66 chr15 51244931 51245328 -52249646 + MTEa LTR MaLR 6 370 0 3 975 2479 204 2 42 chr15 51246209 51246714 -52248260 + RMER6D LTR ERVK 231 715 -5 3 976 469 314 67 44 chr15 51255008 51255188 -52239786 + MLT2B3 LTR ERVL 111 294 -260 3 976 244 346 25 81 chr15 51261498 51261585 -52233389 - MLT1J2 LTR MaLR -14 434 346 3 976 2025 125 148 3 chr15 51261585 51261929 -52233045 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 976 244 346 25 81 chr15 51261929 51262039 -52232935 - MLT1J2 LTR MaLR -103 345 248 3 976 737 281 78 24 chr15 51273835 51274201 -52220773 + MTD LTR MaLR 1 413 -6 3 976 526 269 80 6 chr15 51290042 51290218 -52204756 - MTEb LTR MaLR -27 352 164 3 976 443 312 31 49 chr15 51290198 51290230 -52204744 + MTE2a LTR MaLR 200 227 -152 3 976 2124 177 2 40 chr15 51290230 51290653 -52204321 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 976 443 312 31 49 chr15 51290653 51290782 -52204192 + MTE2a LTR MaLR 228 358 -21 3 976 427 276 0 0 chr15 51290795 51290893 -52204081 - MTEb LTR MaLR -273 106 9 3 976 882 303 87 62 chr15 51296971 51297421 -52197553 + MER74B LTR ERVL 64 524 -98 3 976 250 320 45 53 chr15 51302269 51302401 -52192573 + RMER12 LTR ERVK 720 850 -472 4 976 319 193 0 0 chr15 51315028 51315085 -52179889 - RMER17C LTR ERVK -352 58 2 4 976 1894 209 162 37 chr15 51317228 51317741 -52177233 + RMER19B LTR ERVK 308 884 -18 4 976 1113 224 18 14 chr15 51320414 51320636 -52174338 + MTC LTR MaLR 1 223 -198 4 976 705 280 18 45 chr15 51321217 51321241 -52173733 + MTC LTR MaLR 179 203 -193 4 976 1095 178 30 11 chr15 51321420 51321619 -52173355 + MTC LTR MaLR 204 421 0 4 976 1325 252 15 26 chr15 51347165 51347507 -52147467 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 241 4 976 1513 196 91 23 chr15 51350484 51350834 -52144140 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 976 903 290 35 92 chr15 51354244 51354646 -52140328 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 4 976 3523 15 2 0 chr15 51363455 51363850 -52131124 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 976 9584 20 0 0 chr15 51363850 51364948 -52130026 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 976 3523 15 2 0 chr15 51364948 51365343 -52129631 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 976 843 368 66 13 chr15 51372330 51372726 -52122248 + LTR16B LTR ERVL 2 418 -45 5 977 841 314 173 42 chr15 51383420 51384015 -52110959 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 1 5 977 4885 138 46 46 chr15 51385913 51386811 -52108163 - RMER17A2 LTR ERVK -8 898 1 5 977 2846 123 35 4 chr15 51390732 51391100 -52103874 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -86 471 102 5 977 2846 123 35 4 chr15 51391167 51391255 -52103719 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -456 101 3 5 977 298 327 42 60 chr15 51391909 51392075 -52102899 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 217 5 977 464 252 84 49 chr15 51392348 51392487 -52102487 - ORR1D2 LTR MaLR -226 144 1 5 977 1128 222 45 151 chr15 51393196 51393620 -52101354 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 977 1049 283 52 39 chr15 51394778 51395258 -52099716 + RMER15 LTR ERVL 4 570 -5 5 977 687 324 117 9 chr15 51402478 51402924 -52092050 - MLT1D LTR MaLR 0 505 12 5 977 443 314 69 59 chr15 51403132 51403335 -52091639 + RLTR9A2 LTR ERVK 179 383 0 5 977 288 348 53 5 chr15 51408994 51409110 -52085864 + MLT1G3 LTR MaLR 89 207 -342 5 977 373 305 61 31 chr15 51410688 51410884 -52084090 + RMER15 LTR ERVL 349 550 -25 5 977 419 324 104 58 chr15 51417672 51418024 -52076950 + MLT1E2 LTR MaLR 7 377 -128 5 977 581 287 78 129 chr15 51420842 51421229 -52073745 - ORR1E LTR MaLR 0 370 4 5 977 1099 222 147 42 chr15 51425499 51425832 -52069142 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 6 5 977 2045 173 60 9 chr15 51445708 51446057 -52048917 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 977 407 332 121 36 chr15 51447268 51447599 -52047375 - MLT1L LTR MaLR -217 393 35 6 977 229 312 47 0 chr15 51449075 51449139 -52045835 + LTR16A1 LTR ERVL 15 81 -375 6 977 297 274 15 127 chr15 51451161 51451187 -52043787 + MT2B LTR ERVL 145 155 -446 6 977 537 247 135 73 chr15 51469191 51469436 -52025538 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 106 6 977 351 340 188 15 chr15 51470191 51470388 -52024586 - LTR33 LTR ERVL -261 254 24 6 977 361 276 190 0 chr15 51473560 51473676 -52021298 + MLT1B LTR MaLR 8 145 -245 6 977 1356 219 97 15 chr15 51473711 51474041 -52020933 + MTE2a LTR MaLR 6 362 -17 6 977 744 261 98 8 chr15 51474111 51474347 -52020627 + MLT1B LTR MaLR 132 388 -2 6 977 3072 81 8 5 chr15 51480784 51481179 -52013795 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 977 8536 78 14 5 chr15 51481179 51482267 -52012707 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 977 3215 68 5 5 chr15 51482267 51482663 -52012311 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 977 254 335 103 73 chr15 51485518 51485750 -52009224 - ORR1E LTR MaLR -113 246 8 6 977 3488 166 138 16 chr15 51488871 51489580 -52005394 + RLTR25B LTR ERVK 1 796 -232 6 977 621 143 181 8 chr15 51489562 51489689 -52005285 + RLTR25B LTR ERVK 955 1103 0 6 977 1423 289 29 46 chr15 51493709 51494234 -52000740 - MT2A LTR ERVL -16 517 2 6 977 788 323 109 32 chr15 51496337 51496804 -51998170 + MER90 LTR ERV1 3 505 -70 7 978 2598 146 138 14 chr15 51514373 51514893 -51980081 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 1 978 1144 284 129 23 chr15 51520674 51520759 -51974215 + MT2A LTR ERVL 10 94 -439 2 978 2531 145 0 47 chr15 51520759 51521186 -51973788 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 978 1144 284 129 23 chr15 51521186 51521572 -51973402 + MT2A LTR ERVL 95 531 -2 2 978 500 269 102 21 chr15 51522383 51522569 -51972405 + MLT1A0 LTR MaLR 85 285 -80 2 978 321 198 43 35 chr15 51525336 51525433 -51969541 + MTEa LTR MaLR 282 377 -2 2 978 456 288 68 40 chr15 51525866 51526106 -51968868 - MLT1A LTR MaLR -19 371 138 3 978 1036 253 94 34 chr15 51529154 51529506 -51965468 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 978 306 303 178 53 chr15 51529796 51530043 -51964931 + MLT1A0 LTR MaLR 27 304 -61 3 978 311 329 66 83 chr15 51531592 51531834 -51963140 - MLT2D LTR ERVL -83 331 94 4 978 515 294 75 82 chr15 51538170 51538488 -51956486 + ORR1E LTR MaLR 1 316 -43 5 978 2959 171 52 79 chr15 51539249 51539780 -51955194 - RMER20B LTR ERVK 0 627 79 5 978 2959 171 52 79 chr15 51539928 51539953 -51955021 - RMER20B LTR ERVK -549 78 78 5 978 2959 171 52 79 chr15 51540130 51540207 -51954767 - RMER20B LTR ERVK -549 78 10 5 978 1032 271 78 12 chr15 51546617 51546950 -51948024 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 14 6 978 290 293 37 89 chr15 51551518 51551709 -51943265 + MLT1H LTR MaLR 366 546 -3 7 978 993 263 40 105 chr15 51555012 51555268 -51939706 - MTE2b LTR MaLR 0 379 115 7 978 993 263 40 105 chr15 51555452 51555594 -51939380 - MTE2b LTR MaLR -265 114 7 7 978 291 376 13 32 chr15 51555648 51555802 -51939172 + MLT1I LTR MaLR 63 213 -198 8 978 482 278 0 0 chr15 51557622 51557737 -51937237 - MLT1B LTR MaLR 0 390 276 8 978 442 273 105 30 chr15 51557749 51557949 -51937025 - MLT1A LTR MaLR 0 374 160 8 978 465 342 18 42 chr15 51565562 51565730 -51929244 + MTE2b LTR MaLR 51 214 -165 1 978 243 269 135 0 chr15 51565726 51565830 -51929144 - MLT2C2 LTR ERVL -16 543 426 1 978 2170 150 63 15 chr15 51566407 51566806 -51928168 - MTC LTR MaLR -1 420 3 1 978 395 274 14 56 chr15 51567016 51567135 -51927839 - MLT1B LTR MaLR -73 317 200 1 978 395 274 14 56 chr15 51567200 51567223 -51927751 - MLT1B LTR MaLR -191 199 181 1 978 424 297 50 22 chr15 51567277 51567456 -51927518 - MLT1B LTR MaLR -204 186 3 1 978 4260 27 0 0 chr15 51569781 51570263 -51924711 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 1 978 1652 124 41 118 chr15 51570322 51570688 -51924286 - MTC LTR MaLR 0 421 84 1 978 675 270 115 80 chr15 51572577 51572952 -51922022 + MLT1B LTR MaLR 3 390 0 1 978 983 247 167 12 chr15 51574464 51574800 -51920174 - MTD LTR MaLR -14 405 18 1 978 453 346 48 32 chr15 51579501 51579752 -51915222 + LTR88c LTR Genie? 3 257 -605 1 978 387 255 119 126 chr15 51581314 51581624 -51913350 - ORR1E LTR MaLR -4 355 48 1 978 478 248 44 0 chr15 51583028 51583165 -51911809 + MLT1A LTR MaLR 18 160 -214 1 978 267 281 74 104 chr15 51584078 51584241 -51910733 + MLT1A LTR MaLR 190 347 -27 1 978 995 282 88 29 chr15 51587372 51587781 -51907193 - MLT1D LTR MaLR 0 505 73 1 978 302 350 30 24 chr15 51588502 51588669 -51906305 + LTR16B2 LTR ERVL 279 446 -16 1 978 237 380 0 0 chr15 51589445 51589524 -51905450 - MLT1J LTR MaLR -198 314 236 1 978 1277 270 65 37 chr15 51595184 51595696 -51899278 - RLTR20A2 LTR ERVK -52 526 1 1 978 261 274 186 71 chr15 51599361 51599613 -51895361 - MLT1H LTR MaLR -2 547 267 1 978 4928 123 12 69 chr15 51601274 51602126 -51892848 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 1 978 384 252 25 34 chr15 51604725 51604844 -51890130 + MTE2b LTR MaLR 2 119 -260 1 978 260 307 108 32 chr15 51605426 51605584 -51889390 + LTR16B LTR ERVL 207 376 -87 1 978 759 230 48 39 chr15 51613702 51613882 -51881092 + ORR1D1 LTR MaLR 1 184 -190 1 978 759 230 48 39 chr15 51613950 51613977 -51880997 + ORR1D1 LTR MaLR 185 210 -164 1 978 718 168 93 51 chr15 51614310 51614538 -51880436 + ORR1C2 LTR MaLR 148 374 -10 1 979 414 268 167 68 chr15 51646962 51647298 -51847676 - MLT1A LTR MaLR -4 370 2 2 979 284 313 111 74 chr15 51654972 51655134 -51839840 - RMER5 LTR ERV1 -154 380 213 2 979 359 281 109 30 chr15 51675169 51675334 -51819640 + ORR1E LTR MaLR 1 178 -181 2 979 300 316 91 29 chr15 51675552 51675793 -51819181 - ORR1E LTR MaLR -86 240 32 2 979 330 296 106 22 chr15 51679851 51680031 -51814943 - MER21B LTR ERV1 -267 596 402 2 979 1599 214 153 0 chr15 51682857 51683217 -51811757 - MTD LTR MaLR 0 419 5 2 979 1385 181 88 31 chr15 51683217 51683560 -51811414 - ORR1B2 LTR MaLR -12 347 1 2 979 2221 104 9 3 chr15 51684337 51684654 -51810320 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 979 1841 153 51 3 chr15 51697938 51698273 -51796701 - RLTR28 LTR ERVL -173 351 1 3 979 3720 97 103 2 chr15 51701579 51702094 -51792880 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 3 979 798 264 87 77 chr15 51702474 51702644 -51792330 - ORR1E LTR MaLR -42 317 151 3 979 798 264 87 77 chr15 51702671 51702812 -51792162 - ORR1E LTR MaLR -209 150 4 3 979 588 178 18 27 chr15 51704953 51705063 -51789911 + RMER15 LTR ERVL 465 573 -2 3 979 403 247 50 141 chr15 51710738 51710813 -51784161 - MT2B LTR ERVL -446 155 99 3 979 3547 38 0 8 chr15 51714772 51715171 -51779803 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 979 2340 119 68 16 chr15 51720893 51721278 -51773696 + RLTR28 LTR ERVL 1 405 -119 3 979 2954 168 46 96 chr15 51721428 51722033 -51772941 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 3 979 1707 151 128 20 chr15 51722620 51722971 -51772003 + ORR1B1 LTR MaLR 1 389 -5 3 979 314 333 46 26 chr15 51725551 51725702 -51769272 - MLT1J LTR MaLR -61 451 298 3 979 1384 227 79 79 chr15 51727068 51727488 -51767486 - RLTR18B LTR ERVK -19 493 74 3 979 353 169 28 0 chr15 51727892 51727963 -51767011 - RLTR18B LTR ERVK -435 77 5 3 979 800 244 17 70 chr15 51732128 51732338 -51762636 + RLTR11B LTR ERVK 3 201 -252 3 979 1846 193 56 101 chr15 51732338 51732429 -51762545 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 449 3 979 1846 193 56 101 chr15 51732619 51733080 -51761894 - RLTR11A LTR ERVK -80 448 1 3 979 800 244 17 70 chr15 51733080 51733169 -51761805 + RLTR11B LTR ERVK 202 285 -168 3 979 817 258 21 25 chr15 51733981 51734220 -51760754 + MT2A LTR ERVL 3 240 -293 3 979 838 220 78 38 chr15 51734591 51734884 -51760090 + RLTR20B3 LTR ERVK 22 326 -251 3 979 776 264 80 89 chr15 51734881 51735205 -51759769 - RLTR23 LTR ERV1 -17 413 93 3 979 446 202 10 21 chr15 51735238 51735334 -51759640 - RLTR23 LTR ERV1 -330 100 6 3 979 285 351 25 19 chr15 51738573 51738730 -51756244 - LTR84a LTR ERVL -480 277 120 4 979 317 258 114 24 chr15 51739970 51740093 -51754881 - MLT1K LTR MaLR -7 588 455 4 979 861 292 68 34 chr15 51740783 51741134 -51753840 + MLT1A0 LTR MaLR 1 363 -2 4 979 640 258 95 23 chr15 51741558 51741820 -51753154 - RMER20B LTR ERVK -219 408 128 4 979 1748 138 86 180 chr15 51741955 51742388 -51752586 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 4 979 893 262 134 56 chr15 51744155 51744514 -51750460 - MLT1B LTR MaLR 0 390 4 4 979 1817 153 162 21 chr15 51745333 51745352 -51749622 + RMER15 LTR ERVL 1 17 -558 4 979 2023 212 35 68 chr15 51745352 51745924 -51749050 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 553 0 4 979 1817 153 162 21 chr15 51745924 51746329 -51748645 + RMER15 LTR ERVL 18 485 -90 4 979 2260 167 8 47 chr15 51746329 51746433 -51748541 + RLTR28 LTR ERVL 1 100 -424 4 979 2260 167 8 47 chr15 51746605 51746971 -51748003 + RLTR28 LTR ERVL 101 453 -71 4 979 699 141 103 0 chr15 51746987 51747143 -51747831 + RLTR28 LTR ERVL 343 514 -10 4 979 487 221 0 21 chr15 51747163 51747260 -51747714 + RMER15 LTR ERVL 481 575 0 4 979 1240 232 76 78 chr15 51748225 51748595 -51746379 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 4 979 1014 266 97 15 chr15 51753754 51754094 -51740880 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 4 979 3257 48 5 5 chr15 51754712 51755108 -51739866 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 979 563 329 108 15 chr15 51759103 51759445 -51735529 - MLT1D LTR MaLR -119 386 13 4 979 2401 184 207 11 chr15 51760257 51760871 -51734103 + RMER19A LTR ERVK 1 734 -3 4 979 404 207 27 54 chr15 51763074 51763258 -51731716 - RMER17C LTR ERVK -135 275 97 4 979 1481 195 39 26 chr15 51769203 51769514 -51725460 - RLTR20B2 LTR ERVK -20 540 226 4 979 744 169 0 0 chr15 51769502 51769626 -51725348 - RLTR20B2 LTR ERVK -436 124 1 4 979 1860 175 165 84 chr15 51769767 51770567 -51724407 - RMER6C LTR ERVK 0 720 1 4 980 2115 134 6 15 chr15 51774854 51775186 -51719788 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 980 229 307 22 11 chr15 51775572 51775661 -51719313 - MTE2b LTR MaLR -15 364 275 4 980 822 204 145 31 chr15 51775752 51775979 -51718995 - MTE2b LTR MaLR -112 267 15 4 980 237 287 115 39 chr15 51775991 51776147 -51718827 - ORR1E LTR MaLR -113 246 79 4 980 1848 104 45 7 chr15 51777456 51777766 -51717208 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 4 980 2511 77 3 9 chr15 51778177 51778505 -51716469 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 4 980 2045 161 17 0 chr15 51781194 51781547 -51713427 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 5 980 834 286 40 66 chr15 51784089 51784467 -51710507 + MTD LTR MaLR 2 369 -50 5 980 1364 180 36 4 chr15 51787786 51788037 -51706937 - MTC LTR MaLR -8 413 155 5 980 1473 76 5 9 chr15 51788041 51788253 -51706721 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 128 5 980 734 203 154 26 chr15 51789858 51790091 -51704883 - RLTR11A2 LTR ERVK -262 265 3 5 980 293 228 26 137 chr15 51792621 51792738 -51702236 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 5 980 247 350 62 0 chr15 51826885 51826982 -51667992 + MLT1J LTR MaLR 205 307 -205 5 980 813 213 52 74 chr15 51829165 51829242 -51665732 - RMER6B LTR ERVK -198 263 176 5 980 813 213 52 74 chr15 51829388 51829579 -51665395 - RMER6B LTR ERVK -286 175 1 5 980 298 355 43 65 chr15 51831529 51831913 -51663061 - ORR1E LTR MaLR -2 368 1 5 980 240 232 22 109 chr15 51832258 51832350 -51662624 + MTEb LTR MaLR 278 361 -18 5 980 2087 132 72 42 chr15 51834167 51834571 -51660403 - MTC LTR MaLR -5 416 1 5 980 766 314 141 22 chr15 51837668 51837987 -51656987 + MER21B LTR ERV1 1 357 -506 5 980 2370 131 12 66 chr15 51839489 51839897 -51655077 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 980 277 361 100 24 chr15 51840167 51840337 -51654637 + MLT1G LTR MaLR 396 578 -13 6 980 1565 168 30 54 chr15 51842727 51843145 -51651829 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 6 980 1475 62 19 32 chr15 51844609 51844825 -51650149 + LTRIS2 LTR ERV1 1 213 -351 6 980 6962 48 14 0 chr15 51852838 51853630 -51641344 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 6 980 479 281 83 97 chr15 51861981 51862269 -51632705 - ORR1E LTR MaLR -33 337 54 6 980 324 238 20 39 chr15 51866460 51866505 -51628469 - ORR1B1-int LTR MaLR -863 646 605 6 980 3101 77 52 63 chr15 51874751 51874896 -51620078 - RLTR9B LTR ERVK 0 437 288 6 980 3101 77 52 63 chr15 51875047 51875343 -51619631 - RLTR9B LTR ERVK -150 287 1 6 980 576 284 24 72 chr15 51887586 51887737 -51607237 + MTE2a LTR MaLR 1 147 -272 6 980 576 218 0 95 chr15 51887949 51888021 -51606953 + MTE2a LTR MaLR 118 199 -220 6 980 750 272 33 24 chr15 51889670 51889881 -51605093 + MTE2a LTR MaLR 167 379 0 6 980 312 242 117 39 chr15 51895028 51895131 -51599843 + RLTR18B LTR ERVK 401 511 -1 6 980 233 311 54 0 chr15 51899964 51900038 -51594936 - LTR85b LTR Gypsy? -4 780 703 6 980 3087 96 9 40 chr15 51900617 51901072 -51593902 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 6 980 3551 45 2 0 chr15 51903054 51903453 -51591521 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 981 237 381 48 26 chr15 51905578 51905807 -51589167 + LTR78 LTR ERV1 914 1147 -157 6 981 1006 295 108 9 chr15 51906050 51906375 -51588599 + MLT1A0 LTR MaLR 3 359 -6 6 981 738 329 148 44 chr15 51906618 51907231 -51587743 + MLT1A0-int LTR MaLR 1 677 -710 6 981 571 353 108 66 chr15 51907425 51908035 -51586939 + MLT1A0-int LTR MaLR 673 1308 -79 6 981 242 345 16 57 chr15 51908089 51908212 -51586762 + MLT1A0 LTR MaLR 17 134 -378 6 981 2039 226 77 16 chr15 51912147 51912642 -51582332 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 525 -2 7 981 3219 29 99 0 chr15 51913504 51913878 -51581096 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 411 0 7 981 1033 121 25 81 chr15 51913879 51914077 -51580897 + IAPEz-int LTR ERVK 9 195 -6286 7 981 250 302 0 0 chr15 51914077 51914130 -51580844 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 7 981 3668 57 4 17 chr15 51914130 51914709 -51580265 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 7 981 2706 67 0 3 chr15 51914709 51915052 -51579922 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 7 981 6420 67 12 11 chr15 51915045 51915873 -51579101 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 7 981 3986 39 17 27 chr15 51915875 51916355 -51578619 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 7 981 260 279 74 96 chr15 51916842 51916977 -51577997 - RMER4B LTR ERVK -107 478 347 7 981 901 294 46 10 chr15 51917092 51917398 -51577576 - RodERV21-int LTR ERV1 -274 4717 4401 7 981 988 328 53 62 chr15 51917393 51918052 -51576922 - RodERV21-int LTR ERV1 -1455 3536 2884 7 981 276 357 6 6 chr15 51919018 51919187 -51575787 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3963 3638 3470 7 981 391 371 12 38 chr15 51919428 51919560 -51575414 - RodERV21-int LTR ERV1 -3017 4074 3941 7 981 3303 84 43 2 chr15 51919560 51919979 -51574995 + RLTR9B LTR ERVK 2 437 0 7 981 391 371 12 38 chr15 51919979 51920348 -51574626 - RodERV21-int LTR ERV1 -3151 3940 3587 7 981 1026 266 42 60 chr15 51920418 51920821 -51574153 - RodERV21-int LTR ERV1 -2226 2765 2370 7 981 5047 274 46 61 chr15 51921594 51923264 -51571710 - RodERV21-int LTR ERV1 -2606 2385 741 7 981 1529 220 93 46 chr15 51924911 51925413 -51569561 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 1 7 981 276 208 0 0 chr15 51925462 51925515 -51569459 - RLTR15 LTR ERVK -306 53 1 7 981 5121 117 109 11 chr15 51928204 51929029 -51565945 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 7 981 350 290 132 132 chr15 51936815 51937125 -51557849 + MLT1C LTR MaLR 54 440 -27 7 981 2879 132 45 2 chr15 51941078 51941548 -51553426 - RLTR28 LTR ERVL -32 492 3 7 981 1692 206 82 6 chr15 51943757 51944123 -51550851 + MTD LTR MaLR 2 395 -24 7 981 248 294 73 73 chr15 51944291 51944401 -51550573 - MLT1J LTR MaLR -193 319 210 7 981 508 310 78 78 chr15 51952485 51952842 -51542132 + ORR1D2 LTR MaLR 6 362 -8 7 981 4703 126 34 16 chr15 51953204 51953945 -51541029 - RMER6A LTR ERVK -2 754 1 7 981 306 289 57 19 chr15 51956645 51956751 -51538223 + MTEa LTR MaLR 72 181 -198 7 981 838 257 9 32 chr15 51963376 51963597 -51531377 + MTEa LTR MaLR 164 379 0 7 981 1238 179 126 74 chr15 51964558 51964910 -51530064 - ORR1D1 LTR MaLR -16 358 1 7 981 1184 271 40 106 chr15 51967809 51968205 -51526769 - MTE2b LTR MaLR -9 370 1 7 981 426 239 9 35 chr15 51973875 51973988 -51520986 + RLTR9D LTR ERVK 190 299 -104 7 981 7948 80 23 2 chr15 51976334 51977336 -51517638 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 7 981 421 353 58 29 chr15 51983060 51983337 -51511637 + MLT1D LTR MaLR 176 460 -45 7 981 349 311 140 83 chr15 51994294 51994715 -51500259 - MLT1M LTR MaLR -186 486 42 8 981 1917 103 73 159 chr15 51996026 51996079 -51498895 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 277 8 981 1917 103 73 159 chr15 51996271 51996575 -51498399 - ORR1A2 LTR MaLR -51 276 1 8 981 543 322 55 6 chr15 52007073 52007254 -51487720 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 176 1 981 1308 293 49 16 chr15 52011782 52012268 -51482706 - RMER5 LTR ERV1 0 534 33 2 981 252 319 104 16 chr15 52014079 52014261 -51480713 + LTR81B LTR ERV1? 1167 1364 -29 2 981 964 297 25 31 chr15 52015733 52016056 -51478918 + RMER15 LTR ERVL 226 546 -29 2 981 329 373 105 35 chr15 52016541 52016855 -51478119 + MLT1K LTR MaLR 216 551 -44 3 981 440 318 37 57 chr15 52020255 52020518 -51474456 - MLT1H LTR MaLR -249 300 1 3 981 622 308 60 41 chr15 52021571 52021842 -51473132 - MLT2B1 LTR ERVL -15 505 218 4 981 755 279 98 141 chr15 52021938 52022334 -51472640 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 981 591 273 53 35 chr15 52022334 52022411 -51472563 - MLT2B1 LTR ERVL -346 174 98 4 981 591 273 53 35 chr15 52022581 52022674 -51472300 - MLT2B1 LTR ERVL -423 97 1 4 981 603 343 73 33 chr15 52029492 52029601 -51465373 - MLT1A LTR MaLR -8 366 251 5 981 603 343 73 33 chr15 52029624 52029843 -51465131 - MLT1A LTR MaLR -124 250 25 5 981 582 386 107 10 chr15 52032070 52032481 -51462493 + LTR16A LTR ERVL 1 451 0 6 981 281 339 27 18 chr15 52032588 52032699 -51462275 + MLT1I LTR MaLR 298 409 -2 6 981 306 319 164 96 chr15 52033424 52033674 -51461300 + ORR1E LTR MaLR 93 359 0 6 982 929 260 127 32 chr15 52036593 52036931 -51458043 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 982 374 255 48 34 chr15 52039366 52039512 -51455462 + MTE2a LTR MaLR 1 148 -271 6 982 3421 35 2 0 chr15 52040743 52041138 -51453836 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 982 766 218 125 57 chr15 52045640 52045888 -51449086 + MTE2a LTR MaLR 108 372 -7 6 982 672 319 141 28 chr15 52046571 52046890 -51448084 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 11 8 982 1316 122 408 11 chr15 52055139 52055421 -51439553 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 982 392 330 64 41 chr15 52058063 52058281 -51436693 - MLT1C LTR MaLR -25 442 220 1 982 2233 177 37 7 chr15 52058850 52059259 -51435715 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 982 853 326 78 136 chr15 52059649 52060419 -51434555 - MLT1C-int LTR MaLR -16 1355 631 1 982 615 274 63 14 chr15 52061992 52062214 -51432760 - MLT1C-int LTR MaLR -737 634 402 1 982 2260 50 0 90 chr15 52063513 52063846 -51431128 + RLTR10E LTR ERVK 1 303 -8 1 982 621 265 103 23 chr15 52065648 52065954 -51429020 - MLT1C-int LTR MaLR -1422 313 4 1 982 583 255 204 28 chr15 52066075 52066366 -51428608 - MLT2C2 LTR ERVL -58 339 1 1 982 2763 152 59 73 chr15 52067226 52067802 -51427172 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 1 1 982 260 378 154 25 chr15 52070002 52070287 -51424687 - MLT1K LTR MaLR -204 391 70 1 982 1519 277 41 3 chr15 52077025 52077416 -51417558 + MTD LTR MaLR 14 419 0 1 982 1262 292 99 53 chr15 52077418 52078233 -51416741 + MTD-int LTR MaLR 1 958 -300 1 982 2390 127 8 14 chr15 52078444 52078812 -51416162 - RLTR17 LTR ERVK -326 366 1 1 982 236 242 0 29 chr15 52078958 52079026 -51415948 + MTD-int LTR MaLR 956 1021 -237 1 982 417 250 104 48 chr15 52081631 52081876 -51413098 + MTD-int LTR MaLR 1069 1252 -6 1 982 1571 257 35 12 chr15 52081876 52082278 -51412696 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 1 982 225 156 22 0 chr15 52090404 52090449 -51404525 + MTE2b LTR MaLR 289 334 -45 1 982 481 264 119 19 chr15 52093890 52094060 -51400914 + MTC-int LTR MaLR 312 463 -795 1 982 1176 253 72 40 chr15 52094338 52094642 -51400332 + MTD LTR MaLR 67 380 -39 1 982 534 94 93 12 chr15 52115544 52115630 -51379344 + RLTR23 LTR ERV1 1 93 -337 1 982 512 83 129 12 chr15 52115723 52115808 -51379166 + RLTR23 LTR ERV1 104 198 -232 1 982 1465 144 50 70 chr15 52119323 52119621 -51375353 + RLTR23 LTR ERV1 139 430 0 1 982 512 83 129 12 chr15 52120708 52120793 -51374181 - RLTR23 LTR ERV1 -232 198 104 1 982 355 340 114 76 chr15 52130680 52131023 -51363951 + MLT1B LTR MaLR 17 388 -2 2 982 1618 190 99 3 chr15 52133337 52133670 -51361304 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 2 982 6405 178 85 18 chr15 52133692 52135058 -51359916 - ORR1B2-int LTR MaLR -51 1458 1 2 982 1888 131 0 106 chr15 52135215 52135583 -51359391 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 982 336 303 81 80 chr15 52136292 52136583 -51358391 - ORR1E LTR MaLR -2 377 51 2 982 240 338 79 50 chr15 52143989 52144129 -51350845 + MLT1K LTR MaLR 443 586 -9 2 982 1829 218 30 19 chr15 52145075 52145293 -51349681 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 155 2 982 3766 150 71 9 chr15 52145293 52145945 -51349029 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 2 982 1829 218 30 19 chr15 52145945 52146095 -51348879 - ORR1D1 LTR MaLR -220 154 1 2 982 400 241 3 73 chr15 52149585 52149729 -51345245 + MLT1A1 LTR MaLR 243 406 -2 2 982 687 333 56 18 chr15 52151179 52151625 -51343349 - MLT1C LTR MaLR -3 464 2 2 982 1084 238 114 62 chr15 52152101 52152487 -51342487 + MTD LTR MaLR 2 407 -12 2 982 433 233 168 40 chr15 52154055 52154213 -51340761 + MLT1C LTR MaLR 295 497 -8 2 982 3393 38 0 0 chr15 52155084 52155479 -51339495 - MTA_Mm LTR MaLR -1 395 1 2 982 655 38 0 0 chr15 52158059 52158138 -51336836 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 79 -286 2 982 9968 49 0 0 chr15 52158138 52159395 -51335579 - MMERVK10C-int LTR ERVK -3662 3919 2663 2 982 451 33 0 16 chr15 52159395 52159457 -51335517 + RLTR10B2 LTR ERVK 305 365 0 2 982 549 235 91 58 chr15 52160661 52160869 -51334105 + RMER5 LTR ERV1 188 402 -132 2 983 1384 238 156 47 chr15 52171859 52171911 -51323063 - RLTR20B3 LTR ERVK -39 538 474 2 983 1384 238 156 47 chr15 52172008 52172422 -51322552 - RLTR20B3 LTR ERVK -104 473 21 2 983 299 351 177 61 chr15 52178544 52179153 -51315821 + LTR50 LTR ERVL 1 680 -115 2 983 613 259 87 37 chr15 52180797 52181096 -51313878 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 2 983 2311 174 59 17 chr15 52182058 52182531 -51312443 - RMER5 LTR ERV1 -26 508 16 2 983 1811 235 47 10 chr15 52190008 52190412 -51304562 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 983 1973 105 204 0 chr15 52190778 52191150 -51303824 - RLTR47_MM LTR ERV1 -84 448 1 2 983 253 331 8 0 chr15 52191233 52191366 -51303608 - MuRRS4-int LTR ERV1 -51 7727 7594 2 983 440 317 45 55 chr15 52192039 52192494 -51302480 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1045 4018 3876 2 983 587 321 52 50 chr15 52192919 52193378 -51301596 - MuLV-int LTR ERV1 -3156 4450 3991 2 983 1348 324 65 24 chr15 52193455 52194739 -51300235 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5129 2427 1050 2 983 349 276 30 30 chr15 52195132 52195263 -51299711 - MuRRS4-int LTR ERV1 -6900 656 526 2 983 681 154 130 37 chr15 52195741 52195903 -51299071 - RLTR47_MM LTR ERV1 -2 530 354 2 983 1776 187 30 44 chr15 52196241 52196558 -51298416 + ORR1B2 LTR MaLR 1 313 -54 2 983 1776 187 30 44 chr15 52196658 52196703 -51298271 + ORR1B2 LTR MaLR 314 358 -9 2 983 250 376 85 28 chr15 52202079 52202290 -51292684 - MLT1J LTR MaLR -3 509 287 3 983 467 328 35 74 chr15 52212115 52212372 -51282602 - ORR1E LTR MaLR -5 354 108 3 983 259 310 14 14 chr15 52213808 52213880 -51281094 - ORR1E LTR MaLR -282 77 6 3 983 1986 160 67 5 chr15 52219451 52219822 -51275152 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 983 957 280 9 5 chr15 52224421 52224633 -51270341 + MTEb LTR MaLR 2 214 -165 3 983 2378 230 95 66 chr15 52224690 52225417 -51269557 + RMER13A LTR ERVK 1 748 -112 3 983 241 311 48 48 chr15 52225607 52225732 -51269242 + RMER21B LTR ERV1 84 208 -634 3 983 753 250 98 20 chr15 52225762 52225966 -51269008 + RMER21B LTR ERV1 348 567 -275 3 983 259 280 0 85 chr15 52225973 52226055 -51268919 + RMER21B LTR ERV1 761 835 -112 3 983 315 340 101 48 chr15 52233574 52233887 -51261087 + MLT1F LTR MaLR 16 343 -236 3 983 995 326 6 28 chr15 52240685 52241007 -51253967 - MTE2b LTR MaLR 0 379 65 3 983 253 295 0 0 chr15 52241957 52242018 -51252956 - MTE2b LTR MaLR -316 63 3 3 983 1214 254 68 30 chr15 52248869 52249206 -51245768 - ORR1E LTR MaLR -4 355 6 3 983 448 238 58 1 chr15 52249922 52250028 -51244946 - MTD LTR MaLR -14 405 290 3 983 2131 164 44 13 chr15 52250375 52250456 -51244518 - RLTR20C LTR ERVK -5 529 446 3 983 2131 164 44 13 chr15 52250508 52250810 -51244164 - RLTR20C LTR ERVK -89 445 136 3 983 943 296 53 109 chr15 52254302 52254488 -51240486 + ORR1E LTR MaLR 5 174 -185 3 983 943 296 53 109 chr15 52254568 52254757 -51240217 + ORR1E LTR MaLR 175 358 -1 3 983 1595 241 44 35 chr15 52256086 52256521 -51238453 - RLTR20A2 LTR ERVK -139 439 1 3 983 485 274 72 98 chr15 52265862 52266251 -51228723 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 3 983 276 150 17 0 chr15 52268683 52268743 -51226231 - MTC LTR MaLR -1 420 375 3 983 1502 207 132 3 chr15 52269063 52269388 -51225586 - MTC LTR MaLR -54 367 1 3 983 303 206 101 14 chr15 52269435 52269583 -51225391 - RMER17C LTR ERVK -133 277 117 3 983 2424 187 139 22 chr15 52270787 52271334 -51223640 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 983 340 379 49 56 chr15 52274011 52274103 -51220871 - MLT1C LTR MaLR -75 392 299 4 983 340 379 49 56 chr15 52274145 52274337 -51220637 - MLT1C LTR MaLR -169 298 110 4 983 978 233 194 6 chr15 52275216 52275531 -51219443 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 983 271 353 51 127 chr15 52275963 52276255 -51218719 + MLT1J LTR MaLR 214 483 -29 4 983 3054 141 23 49 chr15 52278135 52278703 -51216271 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 4 983 570 317 32 110 chr15 52281144 52281544 -51213430 + RMER20B LTR ERVK 234 602 -25 4 983 914 306 77 31 chr15 52284275 52284599 -51210375 - MTE2a LTR MaLR 0 379 41 4 983 587 320 49 5 chr15 52284678 52284882 -51210092 - MTE-int LTR MaLR 0 1580 1368 4 983 1568 310 69 22 chr15 52284880 52285430 -51209544 - MTE-int LTR MaLR -973 607 32 4 983 303 264 213 8 chr15 52285883 52286005 -51208969 + MLT1D LTR MaLR 63 209 -296 4 983 326 324 29 0 chr15 52286041 52286146 -51208828 + MLT1D LTR MaLR 268 375 -130 4 983 407 280 162 18 chr15 52286837 52287004 -51207970 + MLT1D LTR MaLR 57 247 -258 4 983 1938 128 10 113 chr15 52292086 52292483 -51202491 + ORR1B1 LTR MaLR 39 394 0 4 984 239 262 117 39 chr15 52298666 52298845 -51196129 + RMER17D LTR ERVK 216 408 -481 4 984 1427 217 138 35 chr15 52299167 52299544 -51195430 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 4 984 2811 54 5 111 chr15 52300675 52301109 -51193865 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 4 984 572 217 35 0 chr15 52307019 52307134 -51187840 + ETnERV2-int LTR ERVK 7078 7196 -210 4 984 4025 106 13 5 chr15 52307880 52308479 -51186495 - RMER17B LTR ERVK -301 657 54 4 984 1074 265 54 11 chr15 52313119 52313470 -51181504 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 4 984 233 360 68 111 chr15 52314120 52314445 -51180529 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -17 786 476 4 984 4499 40 67 2 chr15 52320720 52321271 -51173703 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 4 984 366 286 124 59 chr15 52328039 52328225 -51166749 + MLT1J1 LTR MaLR 121 318 -126 4 984 234 293 39 39 chr15 52329747 52329825 -51165149 - MLT1D LTR MaLR -318 187 110 4 984 2298 106 16 0 chr15 52334660 52334982 -51159992 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 984 395 413 58 35 chr15 52342634 52342895 -51152079 - MLT2B1 LTR ERVL -140 380 114 5 984 671 261 67 79 chr15 52343222 52343476 -51151498 - MLT1A1 LTR MaLR -11 397 147 5 984 1854 129 26 67 chr15 52344061 52344402 -51150572 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 5 984 236 308 0 49 chr15 52348639 52348721 -51146253 + MLT1C LTR MaLR 373 450 -17 5 984 1966 176 26 9 chr15 52349831 52350180 -51144794 + ORR1B1 LTR MaLR 40 394 0 5 984 395 122 37 0 chr15 52351490 52351572 -51143402 - RMER17C LTR ERVK -136 274 190 5 984 2426 112 3 77 chr15 52375993 52376381 -51118593 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 5 984 3224 55 0 2 chr15 52376381 52376797 -51118177 - IAP-d-int LTR ERVK 0 6542 6128 5 984 21563 51 12 14 chr15 52376800 52379284 -51115690 - IAP-d-int LTR ERVK -521 6021 3531 5 984 21563 51 12 14 chr15 52379824 52380179 -51114795 - IAP-d-int LTR ERVK -3012 3530 3188 5 984 5092 50 45 43 chr15 52380246 52380984 -51113990 - IAP-d-int LTR ERVK -5803 739 1 5 984 2496 101 3 70 chr15 52380984 52381369 -51113605 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 5 984 266 288 27 14 chr15 52386302 52386376 -51108598 + LTR50 LTR ERVL 68 142 -653 5 984 272 303 118 24 chr15 52386768 52386937 -51108037 + LTR50 LTR ERVL 471 655 -140 5 984 335 279 97 56 chr15 52393524 52393668 -51101306 - MER70B LTR ERVL 0 472 323 5 984 448 253 21 0 chr15 52393769 52393864 -51101110 - MER70B LTR ERVL -434 144 48 5 984 464 344 76 51 chr15 52394890 52395166 -51099808 + ORR1E LTR MaLR 75 357 -2 5 984 976 282 70 33 chr15 52395932 52396364 -51098610 - MLT2B4 LTR ERVL -42 512 1 5 984 480 381 73 25 chr15 52408117 52408362 -51086612 + LTR16A LTR ERVL 181 437 -14 5 984 389 330 25 10 chr15 52409249 52409451 -51085523 + HERV16-int LTR ERVL 947 1151 -3845 5 984 1007 324 31 39 chr15 52410441 52410827 -51084147 + MLT1B LTR MaLR 4 386 -4 5 984 3097 40 42 0 chr15 52412424 52412804 -51082170 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 984 267 300 65 22 chr15 52414663 52414755 -51080219 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1475 1570 -4144 5 984 4936 136 59 23 chr15 52418851 52419770 -51075204 + RMER17B LTR ERVK 1 952 -6 5 984 829 350 63 17 chr15 52420325 52420849 -51074125 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3855 4402 -1312 5 984 615 240 156 39 chr15 52425581 52425976 -51068998 - RMER20B LTR ERVK -14 613 116 6 984 1470 210 115 6 chr15 52427784 52428105 -51066869 + ORR1B2 LTR MaLR 1 356 -11 6 985 1219 159 34 0 chr15 52429170 52429376 -51065598 + ORR1C2 LTR MaLR 1 213 -171 6 985 1980 216 168 33 chr15 52429376 52429893 -51065081 - RMER19B LTR ERVK 0 902 316 6 985 916 189 47 6 chr15 52429921 52430091 -51064883 + ORR1C2 LTR MaLR 208 384 0 6 985 2164 123 9 9 chr15 52433299 52433626 -51061348 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 985 325 404 57 13 chr15 52436018 52436246 -51058728 + MLT1B LTR MaLR 29 266 -246 6 985 656 330 76 76 chr15 52436539 52437041 -51057933 - MLT1D LTR MaLR -3 502 1 6 985 4780 171 63 7 chr15 52437120 52437980 -51056994 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 6 985 372 319 80 62 chr15 52438187 52438511 -51056463 + MLT1B-int LTR MaLR 407 736 -651 6 985 664 340 99 9 chr15 52439467 52439811 -51055163 + MLT1B LTR MaLR 16 390 0 6 985 2078 177 18 13 chr15 52440182 52440572 -51054402 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 6 985 410 368 88 33 chr15 52442243 52442608 -51052366 - MLT1D LTR MaLR 0 505 121 6 985 893 226 103 16 chr15 52443447 52443794 -51051180 - MTD LTR MaLR -2 417 19 6 985 1446 259 245 74 chr15 52444005 52445044 -51049930 - MTD-int LTR MaLR -39 1219 3 6 985 745 207 46 9 chr15 52445059 52445254 -51049720 - MTD LTR MaLR -13 408 196 6 985 457 196 58 19 chr15 52445262 52445366 -51049608 - RMER15 LTR ERVL -105 470 363 6 985 458 337 21 32 chr15 52445357 52445544 -51049430 - MTD LTR MaLR -196 223 39 6 985 449 255 179 118 chr15 52452917 52453264 -51041710 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 6 985 420 309 122 78 chr15 52454075 52454345 -51040629 + LTR85a LTR Gypsy? 295 576 -126 6 985 1092 235 43 172 chr15 52458681 52458880 -51036094 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 192 6 985 1092 235 43 172 chr15 52458990 52459232 -51035742 - ORR1B1 LTR MaLR -203 191 1 6 985 426 210 24 8 chr15 52466292 52466428 -51028546 + MTC LTR MaLR 3 146 -254 6 985 517 234 40 16 chr15 52470756 52470882 -51024092 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 280 6 985 228 35 0 0 chr15 52473496 52473525 -51021449 + BGLII LTR ERVK 16 44 -377 6 985 2484 80 53 42 chr15 52475070 52475449 -51019525 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 6 985 2447 156 41 5 chr15 52489588 52489981 -51004993 + MTC LTR MaLR 1 407 -14 6 985 1763 189 70 8 chr15 52500351 52500709 -50994265 - RMER20B LTR ERVK -247 380 1 2 985 2177 191 175 18 chr15 52503240 52503737 -50991237 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 7 985 233 271 27 41 chr15 52505632 52505705 -50989269 + MLT1J-int LTR MaLR 848 919 -468 1 985 254 298 0 0 chr15 52510792 52510849 -50984125 - ERVL-int LTR ERVL -4311 1446 1390 1 985 2199 115 3 0 chr15 52511960 52512273 -50982701 + ORR1A2 LTR MaLR 1 314 -13 1 985 1849 175 78 3 chr15 52512768 52513112 -50981862 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 2 985 302 351 47 46 chr15 52523337 52523547 -50971427 - MLT1F2 LTR MaLR -184 443 183 3 985 1252 232 50 93 chr15 52523556 52523755 -50971219 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 173 3 985 1252 232 50 93 chr15 52523812 52524011 -50970963 - ORR1C2 LTR MaLR -212 172 2 3 985 662 238 69 11 chr15 52529504 52529635 -50965339 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 234 5 985 1296 174 8 28 chr15 52529635 52529883 -50965091 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 243 -1605 5 985 681 237 15 0 chr15 52530254 52530385 -50964589 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 5 985 9261 134 15 51 chr15 52530386 52532046 -50962928 + RLTR22_Mur LTR ERVK 224 1824 -24 5 985 601 220 222 17 chr15 52532049 52532225 -50962749 - ORR1D1 LTR MaLR -162 212 1 5 985 767 207 121 6 chr15 52537670 52537835 -50957139 + ORR1D1 LTR MaLR 1 184 -190 5 985 992 231 5 33 chr15 52537935 52538150 -50956824 + ORR1D1 LTR MaLR 166 374 0 5 985 705 217 19 32 chr15 52539362 52539517 -50955457 - MTE2b LTR MaLR 0 379 227 6 985 1411 135 94 160 chr15 52539517 52539561 -50955413 - RMER10B LTR ERVL -2 396 356 6 985 1411 135 94 160 chr15 52539587 52539966 -50955008 - RMER10B LTR ERVL -43 355 3 6 985 340 255 68 68 chr15 52539971 52540089 -50954885 - MTE2b LTR MaLR -152 227 110 6 985 883 239 70 26 chr15 52540088 52540259 -50954715 - RMER17C LTR ERVK -5 405 186 6 985 883 147 15 40 chr15 52540312 52540498 -50954476 - RMER17C LTR ERVK -225 185 2 6 985 694 266 137 18 chr15 52541537 52541688 -50953286 + ORR1D2 LTR MaLR 4 172 -198 6 985 694 266 137 18 chr15 52541748 52541821 -50953153 + ORR1D2 LTR MaLR 173 255 -115 6 985 938 185 63 122 chr15 52541858 52542111 -50952863 - ORR1B1 LTR MaLR -116 278 41 6 985 340 279 137 91 chr15 52542126 52542323 -50952651 + MLT1E2 LTR MaLR 20 225 -402 7 985 331 333 18 9 chr15 52542475 52542584 -50952390 + MLT1E2 LTR MaLR 273 382 -123 7 985 3453 25 2 0 chr15 52545857 52546252 -50948722 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 985 2819 153 73 4 chr15 52552697 52553219 -50941755 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 135 8 986 952 304 88 78 chr15 52560258 52560954 -50934020 - RMER13A LTR ERVK -156 704 2 9 986 1163 205 74 168 chr15 52561077 52561482 -50933492 + ORR1D1 LTR MaLR 8 374 0 9 986 4360 23 38 0 chr15 52575035 52575510 -50919464 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 986 353 333 16 16 chr15 52576205 52576327 -50918647 + RMER15 LTR ERVL 300 421 -154 1 986 443 328 35 70 chr15 52584060 52584319 -50910655 - MLT1L LTR MaLR -111 499 250 1 986 2264 122 6 17 chr15 52584766 52585124 -50909850 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 986 956 286 50 3 chr15 52587646 52587944 -50907030 + MTE2a LTR MaLR 5 316 -63 1 986 594 321 123 20 chr15 52588536 52588886 -50906088 - LTR82A LTR ERVL -400 472 87 1 986 513 328 66 57 chr15 52590243 52590604 -50904370 + ORR1E LTR MaLR 4 379 0 1 986 232 253 43 98 chr15 52608589 52608681 -50886293 - LTR90A LTR LTR -58 918 832 1 986 269 391 33 82 chr15 52615809 52616079 -50878895 - ORR1E LTR MaLR -41 318 62 1 986 378 311 104 39 chr15 52617845 52618076 -50876898 + ORR1E LTR MaLR 8 253 -106 1 986 2697 146 133 19 chr15 52623575 52624100 -50870874 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 1 986 347 324 141 21 chr15 52631184 52631279 -50863695 + MLT1B LTR MaLR 68 170 -220 1 986 347 324 141 21 chr15 52631315 52631503 -50863471 + MLT1B LTR MaLR 171 384 -6 1 986 1978 174 53 0 chr15 52634789 52635163 -50859811 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 986 872 318 57 78 chr15 52638965 52639402 -50855572 + LTR16A1 LTR ERVL 1 428 -28 2 986 251 301 104 15 chr15 52640185 52640320 -50854654 + ERVL-E-int LTR ERVL 1241 1387 -4280 2 986 303 302 21 0 chr15 52641110 52641206 -50853768 - MLT1J2 LTR MaLR -3 445 348 2 986 277 330 99 91 chr15 52642125 52642368 -50852606 + MLT1F2 LTR MaLR 201 445 -124 2 986 1129 156 83 7 chr15 52653447 52653702 -50841272 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2027 2299 -27 2 986 1129 156 83 7 chr15 52653727 52653748 -50841226 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 2300 2323 -3 2 986 2547 188 30 18 chr15 52653750 52654249 -50840725 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 2 986 300 337 0 0 chr15 52657229 52657321 -50837653 + MTD LTR MaLR 43 134 -285 2 986 230 221 45 125 chr15 52667041 52667129 -50827845 - LTR45 LTR ERV1 -302 223 143 2 986 328 354 76 83 chr15 52678862 52679164 -50815810 - ORR1E LTR MaLR -4 355 56 2 986 274 385 68 64 chr15 52681873 52682092 -50812882 + MLT1I-int LTR MaLR 2 221 -1166 2 986 271 384 35 47 chr15 52683984 52684156 -50810818 + MLT1I LTR MaLR 13 182 -229 2 987 1044 279 119 20 chr15 52695065 52695409 -50799565 - MTD LTR MaLR -24 395 18 2 987 478 300 115 52 chr15 52700577 52700925 -50794049 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 987 617 279 108 99 chr15 52714844 52715206 -50779768 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 2 987 271 317 73 8 chr15 52719636 52719760 -50775214 + MLT1I LTR MaLR 5 136 -275 3 987 4610 90 49 29 chr15 52719871 52720604 -50774370 + RMER17A LTR ERVK 1 748 -3 3 987 1202 247 35 112 chr15 52722157 52722558 -50772416 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 987 347 297 98 49 chr15 52732125 52732493 -50762481 - MLT1B LTR MaLR -2 388 3 3 987 1604 235 84 13 chr15 52734979 52735358 -50759616 + MTD LTR MaLR 12 417 -2 3 987 2437 179 56 34 chr15 52735860 52736364 -50758610 - RLTR20B3 LTR ERVK -42 535 21 3 987 495 232 49 8 chr15 52739368 52739505 -50755469 + MLT1A0 LTR MaLR 226 407 -1 3 987 523 365 65 60 chr15 52742533 52742574 -50752400 + MLT1G1 LTR MaLR 1 38 -541 3 987 2180 201 28 63 chr15 52742574 52743115 -50751859 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 1 3 987 523 365 65 60 chr15 52743115 52743440 -50751534 + MLT1G1 LTR MaLR 39 369 -210 3 987 751 303 38 42 chr15 52743452 52743714 -50751260 - MLT1A0 LTR MaLR -12 353 93 3 987 385 333 8 24 chr15 52743794 52743920 -50751054 + MLT1G1 LTR MaLR 373 496 -99 3 987 2272 87 214 0 chr15 52743921 52744058 -50750916 + RLTR44E LTR ERVK 1 159 -293 3 987 2272 87 214 0 chr15 52744103 52744335 -50750639 + RLTR44E LTR ERVK 160 448 -4 3 987 572 163 0 0 chr15 52744347 52744445 -50750529 + RLTR44-int LTR ERVK 1 98 -2714 3 987 847 118 0 48 chr15 52744465 52744771 -50750203 + RLTR44-int LTR ERVK 816 981 -1831 3 987 4134 313 41 45 chr15 52744951 52749771 -50745203 + RLTR44-int LTR ERVK 659 5106 -1436 3 987 5480 43 0 0 chr15 52749992 52750663 -50744311 + RLTR44-int LTR ERVK 2142 2812 0 3 987 662 78 0 0 chr15 52750670 52750760 -50744214 + RLTR44E LTR ERVK 1 90 -362 3 987 1443 188 123 48 chr15 52751555 52751912 -50743062 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 987 1128 274 79 32 chr15 52752090 52752433 -50742541 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 3 987 5108 277 61 24 chr15 52752435 52753868 -50741106 + ORR1E-int LTR MaLR 1 1486 -94 3 987 991 302 80 83 chr15 52753908 52754269 -50740705 + ORR1E LTR MaLR 11 370 0 3 987 590 270 77 34 chr15 52755216 52755423 -50739551 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 153 3 987 791 113 11 6 chr15 52755430 52755580 -50739394 + MTB_Mm LTR MaLR 237 407 0 3 987 1776 161 0 55 chr15 52755891 52756239 -50738735 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 987 340 280 115 34 chr15 52766135 52766283 -50728691 + MTEb LTR MaLR 209 377 -2 3 987 626 301 158 29 chr15 52769759 52770109 -50724865 + MLT1I LTR MaLR 17 411 0 3 987 325 326 130 60 chr15 52772597 52772881 -50722093 - MLT1J1 LTR MaLR -136 308 5 3 987 2182 176 27 12 chr15 52776863 52777277 -50717697 - MTC LTR MaLR 0 421 2 3 987 515 320 120 37 chr15 52780967 52781317 -50713657 - LTR16A1 LTR ERVL -2 454 76 3 987 785 279 45 75 chr15 52785507 52785948 -50709026 + LTR37B LTR ERV1 39 466 -2 4 987 727 298 47 79 chr15 52789632 52789974 -50705000 + MLT1B LTR MaLR 1 331 -59 4 987 383 365 13 66 chr15 52791418 52791644 -50703330 - MamGypLTR1a LTR Gypsy -36 748 535 4 987 298 378 124 5 chr15 52794924 52795118 -50699856 - MLT1A0 LTR MaLR -100 265 49 4 987 3273 37 77 0 chr15 52797520 52797925 -50697049 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 987 231 281 112 20 chr15 52798551 52798649 -50696325 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 272 4 987 695 274 43 5 chr15 52808404 52808591 -50686383 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 173 4 987 2037 112 46 3 chr15 52810474 52810780 -50684194 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 987 1224 215 148 21 chr15 52811260 52811597 -50683377 - MTD LTR MaLR 0 419 40 4 987 1842 194 38 35 chr15 52817440 52817835 -50677139 + MTB_Mm LTR MaLR 1 396 -11 4 988 269 363 47 82 chr15 52829958 52830129 -50664845 + MLT1G1 LTR MaLR 223 387 -192 4 988 2080 137 19 0 chr15 52833944 52834265 -50660709 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 988 4109 146 109 25 chr15 52835529 52836209 -50658765 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 988 225 308 81 49 chr15 52836549 52836672 -50658302 + MLT1L LTR MaLR 255 381 -229 4 988 347 316 95 60 chr15 52837479 52837711 -50657263 - MT2A LTR ERVL -4 529 290 4 988 257 241 17 0 chr15 52837860 52837918 -50657056 - MTEa LTR MaLR -320 59 1 4 988 551 317 72 55 chr15 52840132 52840408 -50654566 + ORR1E LTR MaLR 3 282 -102 4 988 348 315 74 57 chr15 52840625 52840659 -50654315 + ORR1E LTR MaLR 283 317 -67 4 988 229 376 191 0 chr15 52854138 52854300 -50640674 - MLT1G1 LTR MaLR -290 289 97 5 988 265 304 201 16 chr15 52854402 52854596 -50640378 - MLT1G1-int LTR MaLR -23 1466 1237 5 988 4342 120 3 39 chr15 52854729 52855352 -50639622 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 5 988 1963 184 7 124 chr15 52855652 52855854 -50639120 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 207 5 988 1963 184 7 124 chr15 52856183 52856245 -50638729 - ORR1C2 LTR MaLR -178 206 172 5 988 1963 184 7 124 chr15 52856330 52856498 -50638476 - ORR1C2 LTR MaLR -213 171 2 5 988 2137 171 42 3 chr15 52857280 52857660 -50637314 - MTC LTR MaLR -26 395 1 5 988 1759 241 125 103 chr15 52858169 52859001 -50635973 + RMER17B LTR ERVK 30 879 -79 5 988 3495 48 2 5 chr15 52861399 52861796 -50633178 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 988 961 279 97 15 chr15 52861885 52862216 -50632758 + MLT1B LTR MaLR 27 384 -6 5 988 236 294 10 80 chr15 52863129 52863229 -50631745 - MLT1L LTR MaLR -344 266 174 5 988 440 317 169 35 chr15 52864162 52864476 -50630498 - ORR1E LTR MaLR -2 357 2 5 988 378 310 35 8 chr15 52869356 52869501 -50625473 + MLT1A1 LTR MaLR 1 159 -249 5 988 3329 19 0 39 chr15 52870892 52871274 -50623700 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 988 4778 64 46 16 chr15 52871274 52871910 -50623064 + IAPEz-int LTR ERVK 8 662 -5819 5 988 446 66 0 32 chr15 52871910 52871973 -50623001 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 5 988 1798 123 4 15 chr15 52871962 52872227 -50622747 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 5 988 937 88 24 0 chr15 52872222 52872347 -50622627 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 5 988 26651 19 2 2 chr15 52872347 52875305 -50619669 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 5 988 3329 19 0 39 chr15 52875305 52875687 -50619287 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 988 1815 169 64 39 chr15 52876437 52876825 -50618149 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 10 5 988 3221 26 0 0 chr15 52877320 52877665 -50617309 - ORR1A0 LTR MaLR -1 345 1 5 988 597 130 0 11 chr15 52882680 52882773 -50612201 + MTC LTR MaLR 1 92 -329 5 988 275 191 0 0 chr15 52882774 52882821 -50612153 + MTC LTR MaLR 375 421 0 5 988 692 219 88 0 chr15 52882821 52882981 -50611993 + MTC-int LTR MaLR 1 174 -1084 5 988 2955 241 61 39 chr15 52882965 52883674 -50611300 + MTC-int LTR MaLR 364 1086 -172 5 988 2955 241 61 39 chr15 52884335 52884499 -50610475 + MTC-int LTR MaLR 1087 1255 -3 5 988 246 235 6 24 chr15 52884499 52884575 -50610399 + MTC LTR MaLR 23 96 -325 5 988 806 253 196 20 chr15 52889078 52889384 -50605590 - ORR1D1 LTR MaLR -14 360 1 5 988 454 357 7 0 chr15 52904497 52904637 -50590337 + MLT1A LTR MaLR 222 362 -12 5 988 1797 192 30 12 chr15 52905388 52905726 -50589248 + MTEb LTR MaLR 35 378 -1 5 988 2270 128 54 14 chr15 52908585 52908956 -50586018 + MTB_Mm LTR MaLR 22 407 0 5 988 229 352 37 0 chr15 52910532 52910640 -50584334 + MLT2B1 LTR ERVL 5 116 -399 6 988 345 327 89 66 chr15 52911029 52911261 -50583713 + MLT2B1 LTR ERVL 247 539 -15 6 988 603 339 61 67 chr15 52912432 52912792 -50582182 + MTEa LTR MaLR 1 358 -21 6 988 1070 285 84 27 chr15 52927386 52927721 -50567253 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 6 988 1296 209 142 27 chr15 52941834 52942164 -50552810 + ORR1D1 LTR MaLR 5 372 -2 6 988 358 318 31 72 chr15 52950603 52950796 -50544178 + ORR1E LTR MaLR 54 238 -121 6 989 1755 204 37 42 chr15 52975736 52976145 -50518829 + MTD LTR MaLR 5 411 -8 6 989 264 250 146 11 chr15 52980730 52980819 -50514155 + MLT1J LTR MaLR 193 293 -219 6 989 1509 260 41 16 chr15 52996091 52996579 -50498395 + RMER5 LTR ERV1 35 534 0 7 989 1241 192 140 59 chr15 53005283 53005675 -50489299 + RLTR20B3 LTR ERVK 47 470 -107 6 989 244 254 86 122 chr15 53005879 53006018 -50488956 + MLT1A1 LTR MaLR 1 134 -274 8 989 1947 162 40 66 chr15 53020620 53021044 -50473930 - MTC LTR MaLR -8 413 1 2 989 285 204 114 47 chr15 53030609 53030758 -50464216 + RMER17A LTR ERVK 311 469 -282 4 989 1416 190 26 38 chr15 53032137 53032481 -50462493 + RLTR15 LTR ERVK 1 340 -19 4 989 302 306 91 62 chr15 53035242 53035451 -50459523 - MER21B LTR ERV1 -148 715 501 4 989 232 163 0 0 chr15 53043691 53043734 -50451240 - ORR1D2 LTR MaLR -27 343 301 5 989 2307 126 93 65 chr15 53052174 53052623 -50442351 + RMER4A LTR ERVK 5 466 0 7 989 302 332 213 17 chr15 53057009 53057248 -50437726 - MLT1E3 LTR MaLR -97 527 242 7 989 829 149 89 6 chr15 53058512 53058681 -50436293 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 201 8 989 1954 167 102 38 chr15 53066374 53066797 -50428177 + RLTR11A LTR ERVK 1 445 -83 9 989 1954 167 102 38 chr15 53066829 53066884 -50428090 + RLTR11A LTR ERVK 446 509 -19 9 989 413 244 136 16 chr15 53072049 53072174 -50422800 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 224 1 989 1074 244 75 58 chr15 53080468 53080829 -50414145 - MTEa LTR MaLR -12 367 1 1 990 505 335 77 55 chr15 53090330 53090785 -50404189 + MLT1C LTR MaLR 1 465 -2 1 990 852 218 128 0 chr15 53095381 53095695 -50399279 - MTD LTR MaLR -31 390 1 1 990 283 223 17 134 chr15 53109778 53109798 -50385176 + MT2B LTR ERVL 153 158 -443 1 990 1935 177 136 26 chr15 53121645 53122110 -50372864 + RMER5 LTR ERV1 16 531 -3 1 990 2115 131 27 56 chr15 53122249 53122268 -50372706 - MTC LTR MaLR -21 400 382 1 990 2115 131 27 56 chr15 53122288 53122680 -50372294 - MTC LTR MaLR -40 381 1 1 990 490 294 50 94 chr15 53127322 53127684 -50367290 - ORR1E LTR MaLR -4 375 1 1 990 559 266 164 27 chr15 53129322 53129704 -50365270 + LTR33C LTR ERVL 192 625 -4 1 990 1478 219 87 15 chr15 53160670 53161059 -50333915 - MTD LTR MaLR 0 419 3 2 990 310 283 0 78 chr15 53172963 53172976 -50321998 + MT2B LTR ERVL 152 155 -446 2 990 376 335 69 43 chr15 53190313 53190544 -50304430 - MLT1F2 LTR MaLR -2 558 322 2 990 271 233 86 32 chr15 53192958 53193051 -50301923 - MTEa LTR MaLR -2 377 280 3 990 2350 202 42 18 chr15 53200340 53200844 -50294130 - RLTR20D LTR ERVK -51 517 2 3 990 647 320 110 21 chr15 53200898 53201224 -50293750 + MLT1A0 LTR MaLR 5 359 -6 3 123 2161 158 130 2 chr15 53214967 53215398 -50279576 + RLTR25A LTR ERVK 5 490 -613 3 991 592 245 68 141 chr15 53215385 53215755 -50279219 + RLTR25A LTR ERVK 686 1028 0 3 991 331 265 32 8 chr15 53221204 53221332 -50273642 - MLT1D LTR MaLR -358 147 20 3 991 365 239 108 72 chr15 53222195 53222468 -50272506 + BGLII_B LTR ERVK 194 476 -52 3 991 841 341 125 32 chr15 53223130 53223561 -50271413 - LTR16B1 LTR ERVL -9 471 1 3 991 1082 280 108 19 chr15 53225847 53225910 -50269064 + ORR1D2 LTR MaLR 6 68 -302 3 991 3831 166 93 68 chr15 53225910 53226789 -50268185 - RMER19B LTR ERVK -1 901 1 3 991 1082 280 108 19 chr15 53226789 53227049 -50267925 + ORR1D2 LTR MaLR 69 358 -12 3 991 390 243 194 0 chr15 53234073 53234176 -50260798 + MTC LTR MaLR 67 189 -232 3 991 556 161 0 0 chr15 53234211 53234298 -50260676 + MTC LTR MaLR 1 87 -334 3 991 1743 215 6 9 chr15 53239791 53240110 -50254864 + MTC LTR MaLR 104 421 0 3 991 765 275 5 21 chr15 53240147 53240340 -50254634 - MTD LTR MaLR -225 194 5 3 991 2078 198 13 16 chr15 53240349 53240724 -50254250 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 991 1858 179 63 63 chr15 53252171 53252565 -50242409 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 991 717 301 76 23 chr15 53254523 53254785 -50240189 - MER21B LTR ERV1 -109 754 479 4 991 286 246 15 15 chr15 53254979 53255045 -50239929 - RMER15 LTR ERVL -107 468 403 4 991 311 315 165 50 chr15 53255785 53256046 -50238928 - MER21B LTR ERV1 -553 310 20 4 991 2035 209 56 104 chr15 53261258 53261813 -50233161 - RMER15 LTR ERVL -26 549 22 4 991 913 293 30 81 chr15 53270338 53270735 -50224239 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 4 991 291 246 180 28 chr15 53272938 53273072 -50221902 - MTE2a LTR MaLR -85 334 179 4 991 521 271 112 58 chr15 53273223 53273465 -50221509 - MTE2a LTR MaLR -162 259 6 4 991 3235 277 60 30 chr15 53274483 53275506 -50219468 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1410 4351 3300 4 991 2027 171 38 18 chr15 53275506 53275905 -50219069 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 991 3235 277 60 30 chr15 53275905 53276040 -50218934 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2462 3299 3158 4 991 343 140 40 70 chr15 53298054 53298154 -50196820 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK -52 315 219 4 991 570 301 40 20 chr15 53300703 53300919 -50194055 + MLT2B4 LTR ERVL 1 223 -297 4 991 3595 33 2 2 chr15 53300919 53301315 -50193659 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 991 375 348 60 85 chr15 53301315 53301415 -50193559 + MLT2B4 LTR ERVL 224 309 -245 4 991 2390 190 5 7 chr15 53311512 53311931 -50183043 - MTC LTR MaLR 0 421 4 5 991 338 355 144 52 chr15 53313072 53313399 -50181575 + MLT1G1 LTR MaLR 216 572 -7 5 991 233 314 88 47 chr15 53318468 53318685 -50176289 + MLT1H1 LTR MaLR 4 234 -357 5 991 534 308 47 42 chr15 53330639 53330829 -50164145 + MLT1J2 LTR MaLR 60 250 -198 5 991 379 339 115 11 chr15 53338623 53338814 -50156160 + MLT1F1 LTR MaLR 342 552 -17 5 991 1088 224 101 22 chr15 53345078 53345356 -50149618 - ORR1E LTR MaLR -13 346 47 5 991 274 217 16 16 chr15 53345764 53345825 -50149149 - ORR1E LTR MaLR -298 61 1 5 992 333 262 146 89 chr15 53346496 53346743 -50148231 + ORR1D1 LTR MaLR 101 361 -13 5 992 931 274 64 11 chr15 53368776 53369134 -50125840 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 6 992 242 317 12 0 chr15 53370740 53370822 -50124152 - RMER12 LTR ERVK -495 827 745 6 992 1494 233 53 22 chr15 53374520 53374636 -50120338 - MTD LTR MaLR -15 404 289 6 992 1907 202 62 10 chr15 53374636 53375036 -50119938 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 992 1494 233 53 22 chr15 53375036 53375275 -50119699 - MTD LTR MaLR -131 288 38 6 992 1531 190 127 3 chr15 53381293 53381662 -50113312 + MTD LTR MaLR 5 419 0 6 992 1534 216 44 84 chr15 53386159 53386709 -50108265 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 6 992 935 254 132 20 chr15 53400365 53400655 -50094319 + MTE2b LTR MaLR 1 327 -43 6 992 2149 216 10 24 chr15 53402929 53403346 -50091628 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 6 992 249 393 74 0 chr15 53415698 53415820 -50079154 + LTR33A LTR ERVL 9 139 -381 6 992 292 346 53 61 chr15 53416240 53416468 -50078506 + MLT1J LTR MaLR 283 508 -4 6 992 1654 192 16 55 chr15 53417809 53418194 -50076780 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 6 992 794 231 253 142 chr15 53418346 53418825 -50076149 - MT2A LTR ERVL -1 532 1 6 992 245 322 33 0 chr15 53419281 53419371 -50075603 + LTR33B LTR ERVL 391 483 -20 6 992 2162 130 62 9 chr15 53424760 53425101 -50069873 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 6 992 3067 104 32 13 chr15 53425709 53426175 -50068799 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 992 1075 287 60 52 chr15 53427121 53427485 -50067489 + MLT1B LTR MaLR 16 382 -8 6 992 718 303 83 65 chr15 53427883 53428445 -50066529 + RLTR12B LTR ERVK 1 525 -3 6 992 413 300 106 7 chr15 53430089 53430230 -50064744 + MLT1J1 LTR MaLR 1 155 -289 6 992 293 345 116 7 chr15 53430260 53430406 -50064568 + MLT1J1 LTR MaLR 283 444 0 6 992 3447 33 0 0 chr15 53430841 53431237 -50063737 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 992 1609 187 70 6 chr15 53435033 53435345 -50059629 - MTC LTR MaLR -88 333 2 6 992 289 385 79 52 chr15 53446883 53447135 -50047839 - MLT1H1 LTR MaLR -288 267 9 7 992 298 306 66 0 chr15 53447207 53447328 -50047646 - MLT1B LTR MaLR -19 371 243 7 992 1218 339 57 11 chr15 53451510 53451984 -50042990 - MER68 LTR ERVL -12 551 56 7 992 287 206 15 31 chr15 53457476 53457541 -50037433 + MLT1K LTR MaLR 526 589 -6 7 992 299 233 82 64 chr15 53458599 53458709 -50036265 + MLT1A1 LTR MaLR 228 339 -69 7 992 806 310 18 29 chr15 53463399 53463678 -50031296 + MLT1B LTR MaLR 113 388 -2 7 992 1063 308 144 24 chr15 53466118 53466667 -50028307 - MLT1E1 LTR MaLR -16 638 24 7 992 491 371 74 30 chr15 53467439 53467845 -50027129 + MLT1D LTR MaLR 1 424 -81 7 992 851 314 34 26 chr15 53470368 53470742 -50024232 + MLT2B4 LTR ERVL 3 381 -33 7 992 1208 333 85 17 chr15 53470829 53471299 -50023675 + MLT2B2 LTR ERVL 14 515 0 7 992 275 211 45 136 chr15 53473697 53473807 -50021167 - ORR1E LTR MaLR 0 359 260 7 992 2397 81 9 0 chr15 53475015 53475337 -50019637 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 3 7 993 547 265 176 34 chr15 53486727 53486989 -50007985 + MLT1A LTR MaLR 24 322 -52 7 993 1223 259 99 12 chr15 53486994 53487338 -50007636 + MTEa LTR MaLR 1 374 -5 7 993 337 317 321 19 chr15 53492177 53492491 -50002483 + MLT1D LTR MaLR 62 469 -36 7 993 268 333 0 0 chr15 53495281 53495356 -49999618 + MLT2B4 LTR ERVL 3 77 -479 8 993 480 332 59 23 chr15 53496773 53496992 -49997982 - MLT1D LTR MaLR -1 504 278 8 993 1238 258 24 55 chr15 53498497 53498879 -49996095 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 8 993 232 361 66 88 chr15 53499815 53499997 -49994977 + MLT1K LTR MaLR 221 398 -197 8 993 320 241 157 0 chr15 53500036 53500144 -49994830 + MLT1K LTR MaLR 400 524 -71 1 993 2538 194 60 20 chr15 53505386 53505846 -49989128 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 471 -106 1 993 2538 194 60 20 chr15 53505887 53505962 -49989012 + RLTR20B3 LTR ERVK 472 556 -21 1 993 273 361 122 27 chr15 53507311 53507390 -49987584 + LTR16A LTR ERVL 27 117 -334 1 993 273 361 122 27 chr15 53507422 53507490 -49987484 + LTR16A LTR ERVL 118 188 -263 1 993 305 298 51 117 chr15 53507733 53507870 -49987104 + LTR16A LTR ERVL 239 366 -85 1 993 355 188 16 0 chr15 53507890 53507954 -49987020 + MTEa LTR MaLR 2 66 -313 1 993 429 250 0 0 chr15 53507990 53508070 -49986904 + MTEa LTR MaLR 156 235 -144 1 993 496 250 125 125 chr15 53508821 53508842 -49986132 + ORR1C2 LTR MaLR 27 48 -298 2 993 692 240 163 78 chr15 53509074 53509195 -49985779 + ORR1C2 LTR MaLR 49 189 -195 2 993 692 235 183 55 chr15 53509255 53509431 -49985543 + ORR1C2 LTR MaLR 190 383 -1 2 993 1302 161 48 264 chr15 53516053 53516535 -49978439 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 3 993 598 336 157 55 chr15 53517839 53518330 -49976644 + MLT1H1 LTR MaLR 9 549 -6 3 993 446 202 0 0 chr15 53526917 53527006 -49967968 + RLTR14-int LTR ERV1 839 927 -4390 3 993 262 291 119 14 chr15 53528560 53528703 -49966271 + RLTR14-int LTR ERV1 2932 3089 -2228 3 993 547 302 57 48 chr15 53528707 53529075 -49965899 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4831 5294 -2484 4 993 486 269 76 49 chr15 53531158 53531486 -49963488 + RLTR14-int LTR ERV1 4981 5317 0 3 993 846 257 110 36 chr15 53531486 53531842 -49963132 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 3 993 239 299 88 27 chr15 53533450 53533583 -49961391 - ORR1E LTR MaLR -219 146 1 4 993 987 265 117 37 chr15 53534903 53535228 -49959746 + ORR1E LTR MaLR 1 351 -8 4 993 579 296 106 0 chr15 53538761 53538950 -49956024 + ORR1D2 LTR MaLR 1 209 -161 5 993 608 209 77 36 chr15 53539784 53539943 -49955031 + ORR1D2 LTR MaLR 195 350 -9 5 993 245 277 38 98 chr15 53546703 53546732 -49948242 - LTR37A LTR ERV1 -7 461 437 6 993 350 297 72 53 chr15 53546875 53547096 -49947878 - LTR37A LTR ERV1 -32 436 163 6 993 243 181 167 0 chr15 53547426 53547498 -49947476 - LTR37A LTR ERV1 -295 131 48 6 993 675 239 32 0 chr15 53552819 53552991 -49941983 + ORR1D1 LTR MaLR 1 183 -187 8 993 399 258 55 87 chr15 53553199 53553376 -49941598 + ORR1D1 LTR MaLR 201 379 0 8 993 631 403 76 9 chr15 53553452 53553795 -49941179 + MLT1G3 LTR MaLR 51 416 -179 8 993 1358 237 71 23 chr15 53557031 53557081 -49937893 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 311 8 993 1358 237 71 23 chr15 53557134 53557437 -49937537 - ORR1D1 LTR MaLR -64 310 2 8 993 282 289 0 10 chr15 53563262 53563360 -49931614 + MLT1B LTR MaLR 294 390 0 9 993 1603 208 76 3 chr15 53564914 53565281 -49929693 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 9 993 1575 158 56 40 chr15 53581954 53582278 -49912696 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 993 447 302 157 35 chr15 53591270 53591500 -49903474 + LTR84b LTR ERVL 2 259 -502 1 993 423 307 42 28 chr15 53600386 53600530 -49894444 + MLT1D LTR MaLR 13 158 -347 1 993 563 333 43 91 chr15 53601545 53601799 -49893175 + MLT1D LTR MaLR 255 496 -9 1 993 303 395 70 0 chr15 53601953 53602082 -49892892 - LTR33 LTR ERVL -238 277 140 1 993 2338 209 42 31 chr15 53603150 53603704 -49891270 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 1 993 398 345 16 60 chr15 53605216 53605401 -49889573 - MLT1J LTR MaLR -263 249 73 1 993 333 265 0 58 chr15 53605589 53605693 -49889281 + ORR1D2 LTR MaLR 1 98 -281 1 993 663 256 75 54 chr15 53606468 53606712 -49888262 + ORR1D2 LTR MaLR 111 373 -6 1 994 700 259 128 56 chr15 53608973 53609223 -49885751 + MLT1D LTR MaLR 168 435 -70 1 994 468 351 98 63 chr15 53612384 53612731 -49882243 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 994 328 284 17 85 chr15 53614592 53614769 -49880205 + RLTR42-int LTR ERVK 1236 1400 -4122 1 994 228 336 30 74 chr15 53619400 53619535 -49875439 + MLT1D LTR MaLR 260 388 -117 1 994 443 343 72 39 chr15 53620004 53620283 -49874691 + MLT1J LTR MaLR 216 503 -9 1 994 1013 265 176 17 chr15 53623939 53624285 -49870689 - MTD LTR MaLR -1 418 18 1 994 854 246 242 15 chr15 53625822 53626150 -49868824 - MTD LTR MaLR -2 417 14 1 994 744 308 109 133 chr15 53626150 53626210 -49868764 - MTD-int LTR MaLR 0 1098 1029 1 994 1756 305 60 70 chr15 53626329 53626395 -49868579 - MTD-int LTR MaLR -143 1115 1064 1 994 1756 306 71 84 chr15 53626543 53627538 -49867436 - MTD-int LTR MaLR -195 1063 3 1 994 866 293 108 57 chr15 53627699 53628068 -49866906 - MTD LTR MaLR -31 388 1 1 994 373 313 86 63 chr15 53643505 53643856 -49851118 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 2 994 339 331 94 47 chr15 53657844 53658015 -49836959 + MLT2C1 LTR ERVL 141 319 -78 2 994 3672 25 2 0 chr15 53671568 53671963 -49823011 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 994 422 280 137 26 chr15 53675846 53676191 -49818783 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 2 994 373 310 16 34 chr15 53677378 53677558 -49817416 - MTE2a LTR MaLR 0 379 201 2 994 3069 38 0 88 chr15 53684479 53684879 -49810095 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 2 994 1350 43 0 0 chr15 53684889 53685050 -49809924 + RLTR10-int LTR ERVK 41 201 -1786 2 994 233 278 0 0 chr15 53685050 53685104 -49809870 + RLTR27 LTR ERVK 222 275 -34 2 994 366 47 0 0 chr15 53685104 53685147 -49809827 + RLTR10-int LTR ERVK 225 267 -7314 2 994 324 95 0 0 chr15 53685411 53685453 -49809521 + RLTR10-int LTR ERVK 96 137 -6405 2 994 2871 53 0 3 chr15 53685456 53685798 -49809176 + RLTR10-int LTR ERVK 652 992 -995 2 994 453 326 38 38 chr15 53685823 53686218 -49808756 + RLTR10-int LTR ERVK 1172 1566 -6015 2 994 1511 125 99 0 chr15 53686218 53686450 -49808524 + IAP-d-int LTR ERVK 5001 5255 -1287 2 994 4257 145 13 12 chr15 53686454 53687139 -49807835 + IAPEY3-int LTR ERVK 6995 7680 0 2 994 526 56 0 0 chr15 53687139 53687210 -49807764 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 71 -294 2 994 3280 71 5 2 chr15 53692489 53692884 -49802090 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 994 1624 209 72 34 chr15 53704287 53704694 -49790280 + MTC LTR MaLR 8 503 -2 2 994 1592 224 79 10 chr15 53708384 53708776 -49786198 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 994 227 337 55 66 chr15 53711137 53711318 -49783656 + RMER15 LTR ERVL 291 469 -106 3 994 974 231 68 18 chr15 53722392 53722612 -49772362 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 131 3 994 749 161 8 0 chr15 53723064 53723188 -49771786 - ORR1D2 LTR MaLR -245 125 1 3 994 1391 196 4 4 chr15 53724090 53724352 -49770622 + MTC-int LTR MaLR 681 934 -324 3 994 599 206 30 0 chr15 53724351 53724482 -49770492 + MTC-int LTR MaLR 1124 1258 0 3 994 1756 188 108 5 chr15 53724482 53724862 -49770112 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 3 994 565 286 78 6 chr15 53727658 53727837 -49767137 + RMER15 LTR ERVL 371 562 -13 3 994 649 120 41 49 chr15 53729915 53730038 -49764936 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 781 3 124 1346 241 53 63 chr15 53739507 53740017 -49754957 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 3 995 365 250 51 35 chr15 53745293 53745404 -49749570 - MLT1C LTR MaLR -393 112 3 3 995 753 351 49 14 chr15 53748291 53748577 -49746397 - MLT1F LTR MaLR -97 451 156 3 995 1597 244 54 44 chr15 53751942 53752471 -49742503 + RLTR20C LTR ERVK 5 534 0 3 995 4106 111 63 45 chr15 53756434 53757229 -49737745 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 3 995 229 318 78 82 chr15 53758068 53758274 -49736700 - MLT1A1 LTR MaLR -203 205 1 3 995 399 300 30 0 chr15 53768092 53768192 -49726782 + MTD LTR MaLR 3 105 -314 3 995 2446 51 33 70 chr15 53775750 53776109 -49718865 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 995 778 328 24 20 chr15 53777988 53778234 -49716740 + MLT1E LTR MaLR 365 611 -42 3 995 1022 245 129 29 chr15 53780509 53780849 -49714125 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 995 369 298 74 99 chr15 53780991 53781233 -49713741 + MER68 LTR ERVL 10 245 -318 3 995 648 273 90 5 chr15 53781239 53781427 -49713547 - MTEb LTR MaLR 0 379 176 3 995 321 401 97 36 chr15 53805743 53806103 -49688871 - LTR33 LTR ERVL -131 384 3 4 995 3251 39 15 0 chr15 53808284 53808674 -49686300 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 995 9183 33 5 0 chr15 53808674 53809767 -49685207 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 995 3324 38 5 0 chr15 53809767 53810161 -49684813 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 995 249 83 0 0 chr15 53820634 53820670 -49674304 - MT2A LTR ERVL 0 533 498 4 995 248 299 189 60 chr15 53822001 53822218 -49672756 - MLT2B2 LTR ERVL -2 560 316 4 995 410 315 68 7 chr15 53822303 53822450 -49672524 - MTEa LTR MaLR -219 160 5 4 995 294 328 111 115 chr15 53825831 53826110 -49668864 + MTEa LTR MaLR 1 278 -101 4 995 2276 248 147 28 chr15 53832626 53833347 -49661627 + RMER13A LTR ERVK 14 820 -40 4 995 1414 209 54 22 chr15 53835095 53835307 -49659667 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 177 4 995 1414 209 54 22 chr15 53835375 53835533 -49659441 - ORR1C2 LTR MaLR -208 176 3 4 995 2010 166 97 8 chr15 53835710 53836093 -49658881 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 4 995 3252 51 121 2 chr15 53837855 53838286 -49656688 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 4 995 3081 56 10 0 chr15 53840948 53841340 -49653634 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 995 650 333 144 28 chr15 53843518 53843975 -49650999 - LTR40a LTR ERVL 0 519 10 4 995 562 365 120 20 chr15 53847467 53847766 -49647208 - LTR16A LTR ERVL -70 381 53 4 995 270 364 67 17 chr15 53848143 53848263 -49646711 + LTR33 LTR ERVL 86 211 -304 4 995 2179 157 63 0 chr15 53851020 53851383 -49643591 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 4 995 353 218 36 120 chr15 53856428 53856595 -49638379 + MT2B2 LTR ERVL 112 264 -320 4 996 2461 72 3 89 chr15 53877986 53878141 -49616833 - MTB LTR MaLR -53 347 197 5 996 2461 72 3 89 chr15 53878322 53878546 -49616428 - MTB LTR MaLR -204 196 1 5 996 274 328 36 66 chr15 53878850 53878987 -49615987 + MLT1A1 LTR MaLR 2 134 -274 5 996 276 322 102 92 chr15 53879015 53879299 -49615675 + ORR1E LTR MaLR 73 359 0 5 996 575 261 255 36 chr15 53888879 53889185 -49605789 + MTC-int LTR MaLR 876 1248 -10 5 996 1279 279 75 8 chr15 53889210 53889585 -49605389 + MTC LTR MaLR 22 421 0 5 996 2010 162 99 13 chr15 53889972 53890261 -49604713 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 116 5 996 2010 162 99 13 chr15 53890928 53891013 -49603961 - MTB_Mm LTR MaLR -292 115 2 5 996 261 371 89 56 chr15 53891120 53891423 -49603551 + MLT1I LTR MaLR 30 342 -69 5 996 552 345 110 62 chr15 53892950 53893575 -49601399 + MLT2F LTR ERVL 3 657 -6 5 996 2021 136 6 0 chr15 53894602 53894918 -49600056 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 5 996 4096 160 141 42 chr15 53895543 53896438 -49598536 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 5 996 857 304 19 23 chr15 53897242 53897505 -49597469 + MLT2D LTR ERVL 99 360 -54 5 996 712 247 69 32 chr15 53908249 53908437 -49586537 + MLT1A0 LTR MaLR 140 334 -31 5 996 317 346 28 31 chr15 53908828 53909105 -49585869 + MTE2b LTR MaLR 1 342 -37 5 996 1107 286 32 81 chr15 53925919 53926037 -49568937 - ORR1E LTR MaLR 0 359 242 5 996 1679 201 11 154 chr15 53926037 53926497 -49568477 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 996 1107 286 32 81 chr15 53926497 53926747 -49568227 - ORR1E LTR MaLR -118 241 9 5 996 2008 134 108 3 chr15 53942007 53942358 -49552616 + ORR1B1 LTR MaLR 3 390 -4 5 996 980 183 10 34 chr15 53955159 53955368 -49539606 - RMER10B LTR ERVL 0 398 195 6 996 1753 156 70 28 chr15 53957505 53957677 -49537297 + RMER10B LTR ERVL 28 196 -202 6 996 1753 156 70 28 chr15 53957730 53957913 -49537061 + RMER10B LTR ERVL 197 398 0 6 996 237 315 34 122 chr15 53958146 53958294 -49536680 - LTR85c LTR Gypsy? -630 193 59 6 996 293 382 49 38 chr15 53959419 53959604 -49535370 + LTR16A LTR ERVL 84 270 -181 6 996 1915 170 0 9 chr15 53962360 53962692 -49532282 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 996 1705 132 63 87 chr15 53970961 53971294 -49523680 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 1 6 996 238 297 10 29 chr15 53988570 53988674 -49506300 + MER34 LTR ERV1 372 473 -69 6 996 497 317 54 16 chr15 53990794 53990980 -49503994 - MER21B LTR ERV1 -557 306 114 6 996 434 287 115 51 chr15 53991307 53991638 -49503336 - MLT1B LTR MaLR -34 340 7 6 996 583 346 45 38 chr15 53994332 53994623 -49500351 - MLT1E1A LTR MaLR -2 678 386 6 996 1479 245 52 19 chr15 53999373 53999735 -49495239 - MTEa LTR MaLR 0 379 6 6 997 542 314 47 10 chr15 54009446 54009639 -49485335 - LTR33 LTR ERVL -5 510 311 1 997 265 359 53 98 chr15 54009663 54009907 -49485067 + MER110A LTR ERV1 95 327 -141 1 997 266 294 102 105 chr15 54009940 54010244 -49484730 + ORR1E LTR MaLR 45 347 -12 1 997 431 269 75 30 chr15 54010398 54010532 -49484442 - MTEa LTR MaLR -8 371 232 1 997 505 320 33 95 chr15 54010539 54010812 -49484162 - MTEa LTR MaLR -123 256 1 1 997 3172 11 3 16 chr15 54012386 54012758 -49482216 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 997 52936 23 16 2 chr15 54012758 54019141 -49475833 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 2 997 3172 11 3 16 chr15 54019141 54019513 -49475461 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 997 229 424 51 17 chr15 54022169 54022404 -49472570 - LTR33 LTR ERVL -2 513 271 2 997 650 345 58 50 chr15 54027631 54027991 -49466983 + MTEb LTR MaLR 6 368 -11 3 997 4858 177 73 23 chr15 54028596 54029567 -49465407 - RLTR25B LTR ERVK -1 1027 8 3 997 683 360 94 9 chr15 54029574 54030019 -49464955 - MLT2F LTR ERVL -48 615 133 3 997 334 328 159 47 chr15 54032223 54032582 -49462392 - MLT1A1 LTR MaLR -5 403 5 4 997 283 342 151 38 chr15 54032904 54033173 -49461801 + MLT1A0 LTR MaLR 11 317 -48 4 997 1035 271 24 109 chr15 54033173 54033587 -49461387 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 997 283 342 151 38 chr15 54033587 54033636 -49461338 + MLT1A0 LTR MaLR 318 365 0 4 997 279 350 123 54 chr15 54035227 54035357 -49459617 - LTR16A1 LTR ERVL -284 172 34 4 997 4444 134 40 16 chr15 54049967 54050757 -49444217 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 6 997 1875 173 57 0 chr15 54050883 54051219 -49443755 + ORR1B2 LTR MaLR 4 358 -9 6 997 715 351 91 45 chr15 54052705 54053210 -49441764 + MLT1F2 LTR MaLR 31 558 -2 6 997 673 298 46 14 chr15 54058433 54058651 -49436323 + MLT1A0 LTR MaLR 102 326 -39 8 997 781 198 239 31 chr15 54065261 54065412 -49429562 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 189 8 997 781 198 239 31 chr15 54065432 54065598 -49429376 - ORR1C2 LTR MaLR -196 188 1 8 997 289 341 80 59 chr15 54069965 54070152 -49424822 + MLT1D LTR MaLR 315 505 0 9 997 424 333 41 7 chr15 54081631 54081776 -49413198 - MLT1D LTR MaLR -322 183 34 1 997 1236 237 37 99 chr15 54104853 54105256 -49389718 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 1 997 781 303 68 57 chr15 54111282 54111618 -49383356 + MTD LTR MaLR 26 365 -54 1 997 2015 156 30 33 chr15 54115486 54115850 -49379124 + ORR1B2 LTR MaLR 1 363 -4 1 997 4316 103 21 94 chr15 54116019 54116810 -49378164 + RMER17A LTR ERVK 4 737 -14 1 997 998 293 76 11 chr15 54117578 54117934 -49377040 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 1 997 1854 172 65 44 chr15 54130682 54131094 -49363880 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 998 384 316 59 9 chr15 54134064 54134234 -49360740 - MLT1L LTR MaLR -82 513 330 1 998 1786 187 6 3 chr15 54140572 54140900 -49354074 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 998 519 376 35 91 chr15 54141312 54141791 -49353183 - MLT1E1 LTR MaLR -78 576 3 1 998 3767 166 26 15 chr15 54142419 54143103 -49351871 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 1 998 3434 23 5 0 chr15 54146236 54146630 -49348344 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 998 9112 38 2 1 chr15 54146633 54147727 -49347247 + MTA_Mm-int LTR MaLR 4 1098 0 2 998 3471 23 2 0 chr15 54147727 54148122 -49346852 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 998 1699 203 8 60 chr15 54154645 54155044 -49339930 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 998 403 347 19 61 chr15 54155215 54155427 -49339547 - RMER15 LTR ERVL -158 417 215 2 998 695 296 32 102 chr15 54164497 54164614 -49330360 - MLT1B LTR MaLR 0 390 297 2 998 695 296 32 102 chr15 54164824 54165046 -49329928 - MLT1B LTR MaLR -94 296 73 2 998 526 258 111 32 chr15 54168042 54168258 -49326716 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 293 2 998 1088 228 6 34 chr15 54172026 54172322 -49322652 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 998 4425 230 103 39 chr15 54172322 54172917 -49322057 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 606 -764 2 998 4425 230 103 39 chr15 54172945 54173636 -49321338 + ORR1C2-int LTR MaLR 607 1370 0 2 998 801 238 25 60 chr15 54173636 54173837 -49321137 + ORR1C2 LTR MaLR 1 194 -190 2 998 568 237 74 0 chr15 54174167 54174302 -49320672 + ORR1C2 LTR MaLR 175 319 -65 2 998 492 232 95 62 chr15 54174479 54174522 -49320452 + ORR1C2 LTR MaLR 309 351 -27 2 998 314 176 14 14 chr15 54174706 54174775 -49320199 + ORR1C2 LTR MaLR 309 377 -1 2 998 293 284 11 11 chr15 54174988 54175077 -49319897 - RMER15 LTR ERVL -215 360 272 2 998 1960 190 11 6 chr15 54175088 54175453 -49319521 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 998 395 100 17 0 chr15 54175459 54175519 -49319455 + ORR1C2 LTR MaLR 324 384 0 2 998 2434 118 70 82 chr15 54175843 54176331 -49318643 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 2 998 1706 93 38 147 chr15 54176447 54176814 -49318160 - RLTR9F LTR ERVK -4 411 85 2 998 695 62 10 0 chr15 54177568 54177665 -49317309 - RLTR9F LTR ERVK -317 98 1 2 998 1273 312 50 42 chr15 54182122 54182641 -49312333 + RMER5 LTR ERV1 1 523 -11 2 998 290 380 88 60 chr15 54185395 54185678 -49309296 + LTR16E2 LTR ERVL 4 294 -274 2 998 260 240 30 0 chr15 54185979 54186053 -49308921 + LTR16E2 LTR ERVL 455 547 -21 2 998 360 348 88 65 chr15 54189810 54190151 -49304823 - MLT1A LTR MaLR 0 374 26 2 998 554 283 55 16 chr15 54190361 54190544 -49304430 + LTR16E2 LTR ERVL 325 514 -54 2 998 271 330 30 10 chr15 54190894 54190995 -49303979 + MLT1J1 LTR MaLR 41 143 -301 2 998 251 367 134 13 chr15 54203268 54203417 -49291557 - LTR16A LTR ERVL -254 197 31 3 998 332 267 210 6 chr15 54211041 54211203 -49283771 - MLT1E2 LTR MaLR -338 289 95 3 998 261 373 69 28 chr15 54211819 54212037 -49282937 + LTR81A LTR ERV1? 221 447 -903 3 998 602 266 94 16 chr15 54212358 54212549 -49282425 + ORR1D1 LTR MaLR 169 374 0 3 998 387 143 0 0 chr15 54214034 54214090 -49280884 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 312 3 998 1725 178 32 10 chr15 54214453 54214765 -49280209 - ORR1B2 LTR MaLR -48 319 1 3 998 1495 189 3 101 chr15 54214928 54215264 -49279710 + ORR1B1 LTR MaLR 41 343 -51 3 998 410 125 0 30 chr15 54216466 54216532 -49278442 + ORR1B1 LTR MaLR 315 378 0 3 998 324 309 75 109 chr15 54220431 54220725 -49274249 + ORR1E LTR MaLR 64 347 -12 3 998 472 332 39 70 chr15 54222033 54222289 -49272685 + RLTR26 LTR ERVK 169 416 -226 3 998 658 339 46 71 chr15 54230374 54230742 -49264232 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 3 998 504 306 67 62 chr15 54232004 54232213 -49262761 - MTE2a LTR MaLR -3 376 167 3 998 494 286 51 38 chr15 54233470 54233690 -49261284 - MTE2a LTR MaLR -208 211 3 3 998 726 314 131 36 chr15 54236527 54236978 -49257996 - MLT1D LTR MaLR -10 495 3 3 998 233 269 14 29 chr15 54240597 54240666 -49254308 + MLT1C LTR MaLR 400 467 0 3 999 1429 202 26 168 chr15 54274652 54275111 -49219863 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 999 352 266 169 77 chr15 54291603 54291786 -49203188 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 330 4 999 327 297 16 63 chr15 54291911 54292037 -49202937 - RLTR24 LTR ERV1 -409 120 1 4 999 2524 191 103 69 chr15 54296946 54297537 -49197437 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 999 394 307 24 46 chr15 54299731 54299926 -49195048 - MTEa LTR MaLR -7 372 170 4 999 277 310 62 0 chr15 54299955 54300068 -49194906 + RMER15 LTR ERVL 385 504 -71 4 999 2131 191 161 43 chr15 54304058 54304593 -49190381 + RMER19B LTR ERVK 305 902 0 4 999 354 332 10 115 chr15 54307660 54307712 -49187262 - MLT1A0 LTR MaLR -2 406 366 4 999 360 332 10 115 chr15 54307861 54308016 -49186958 - MLT1A0 LTR MaLR -43 365 199 4 999 279 371 48 48 chr15 54308411 54308578 -49186396 - LTR33 LTR ERVL -343 172 6 4 999 3981 134 229 45 chr15 54309085 54309953 -49185021 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 1 4 999 297 335 31 63 chr15 54310147 54310338 -49184636 - RMER4A LTR ERVK -274 192 8 4 999 751 316 77 33 chr15 54311625 54311962 -49183012 - MLT1J-int LTR MaLR -475 912 561 4 999 246 277 125 21 chr15 54317612 54317708 -49177266 - ORR1E LTR MaLR -251 108 3 4 999 227 193 16 81 chr15 54324950 54325012 -49169962 + RMER12B LTR ERVK 465 522 -882 4 999 990 299 56 16 chr15 54330958 54331261 -49163713 + MTE2b LTR MaLR 8 322 -57 5 999 1779 216 35 14 chr15 54331909 54332078 -49162896 + ORR1D1 LTR MaLR 1 180 -194 5 999 1779 216 35 14 chr15 54332210 54332403 -49162571 + ORR1D1 LTR MaLR 181 373 -1 5 999 447 345 96 25 chr15 54333625 54334068 -49160906 + MLT1D LTR MaLR 3 502 -3 5 999 536 278 0 38 chr15 54335761 54335892 -49159082 + MT2B LTR ERVL 1 126 -407 5 999 472 188 74 48 chr15 54335951 54336059 -49158915 + MT2B LTR ERVL 135 228 -305 5 999 603 256 72 67 chr15 54336485 54336635 -49158339 + MT2B LTR ERVL 406 544 -57 5 999 603 256 72 67 chr15 54336696 54336738 -49158236 + MT2B LTR ERVL 545 598 -3 5 999 704 292 55 44 chr15 54341732 54342060 -49152914 + MLT1A0 LTR MaLR 1 402 -6 5 999 1145 224 7 83 chr15 54350882 54351184 -49143790 + RMER19C LTR ERVK 1 279 -332 5 999 1395 244 68 92 chr15 54351242 54351736 -49143238 + RMER19C LTR ERVK 218 737 0 5 999 515 256 37 15 chr15 54352286 54352421 -49142553 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 237 5 999 290 182 167 0 chr15 54352421 54352487 -49142487 - ORR1D1 LTR MaLR -297 77 1 5 999 323 351 53 11 chr15 54356566 54356753 -49138221 - LTR16E1 LTR ERVL -1 537 343 5 999 1734 188 63 6 chr15 54356983 54357330 -49137644 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 999 2156 187 58 0 chr15 54361618 54362014 -49132960 - MTC LTR MaLR -2 419 1 5 999 2338 148 45 8 chr15 54369590 54369992 -49124982 - MTC LTR MaLR 0 421 5 5 999 658 284 62 151 chr15 54370131 54370516 -49124458 + ORR1D1 LTR MaLR 16 366 -8 5 999 332 350 67 34 chr15 54371400 54371673 -49123301 + LTR75 LTR ERVL 20 340 -222 5 999 3188 179 84 20 chr15 54393006 54393649 -49101325 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 9 5 124 5049 225 66 72 chr15 54393650 54396027 -49098947 - RMER3D-int LTR ERVK 0 2842 1 5 1000 2391 152 144 9 chr15 54400514 54400978 -49093996 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1000 665 278 77 71 chr15 54413278 54413603 -49081371 - ORR1E LTR MaLR -10 349 23 6 1000 228 330 10 39 chr15 54423822 54423926 -49071048 + RMER12 LTR ERVK 749 849 -473 6 1000 2191 206 35 10 chr15 54427141 54427622 -49067352 - RLTR11A2 LTR ERVK -34 493 1 6 1000 298 355 103 38 chr15 54435983 54436273 -49058701 - LTR16B1 LTR ERVL -159 321 13 6 1000 2071 146 30 25 chr15 54439673 54440038 -49054936 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1000 269 264 90 104 chr15 54441412 54441556 -49053418 - MLT1B LTR MaLR -18 372 231 6 1000 1674 209 13 20 chr15 54443329 54443687 -49051287 + MTD LTR MaLR 54 419 0 6 1000 311 263 46 99 chr15 54445889 54446000 -49048974 + RMER15 LTR ERVL 409 514 -61 6 1000 2664 86 0 3 chr15 54446000 54446328 -49048646 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1000 311 263 46 99 chr15 54446328 54446347 -49048627 + RMER15 LTR ERVL 515 532 -43 6 1000 245 279 166 65 chr15 54459853 54459929 -49035045 + ORR1E LTR MaLR 6 96 -263 7 1000 2302 176 41 34 chr15 54459929 54460346 -49034628 - MTC LTR MaLR 0 421 2 7 1000 245 279 166 65 chr15 54460346 54460438 -49034536 + ORR1E LTR MaLR 97 191 -168 7 1000 236 346 103 67 chr15 54465358 54465581 -49029393 - ORR1E LTR MaLR -52 307 77 7 1000 1445 246 78 11 chr15 54465692 54466049 -49028925 + MTD LTR MaLR 4 384 -35 7 1000 4643 179 34 29 chr15 54466133 54467026 -49027948 - RMER13B LTR ERVK 0 908 12 7 1000 330 325 91 82 chr15 54481804 54482156 -49012818 - MLT1A LTR MaLR -19 355 1 7 1000 590 296 102 22 chr15 54483075 54483300 -49011674 - MER21B LTR ERV1 -109 754 512 7 1000 870 321 86 17 chr15 54483321 54483670 -49011304 - MER21B LTR ERV1 -427 436 64 7 1000 240 323 68 92 chr15 54484323 54484572 -49010402 - RMER15 LTR ERVL -15 560 318 7 1000 418 228 184 16 chr15 54488852 54488977 -49005997 - MTD LTR MaLR -161 258 113 7 1000 625 209 0 0 chr15 54489009 54489124 -49005850 - MTD LTR MaLR -299 120 6 7 1000 422 202 13 0 chr15 54493715 54493794 -49001180 + MTC LTR MaLR 1 80 -341 7 1000 563 168 37 18 chr15 54495217 54495326 -48999648 + MTC LTR MaLR 121 231 -190 7 1000 903 215 22 32 chr15 54495365 54495564 -48999410 + MTC LTR MaLR 177 421 0 7 1000 1683 190 53 53 chr15 54502153 54502531 -48992443 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1001 382 270 71 0 chr15 54528605 54528739 -48966235 + MLT1A0 LTR MaLR 8 160 -214 2 1001 295 247 93 12 chr15 54530294 54530380 -48964594 + MLT1A0 LTR MaLR 294 386 -4 2 1001 256 376 86 38 chr15 54535217 54535340 -48959634 + MLT1D LTR MaLR 1 137 -368 3 1001 256 376 86 38 chr15 54535536 54535622 -48959352 + MLT1D LTR MaLR 138 220 -285 3 1001 527 341 39 14 chr15 54535637 54535845 -48959129 + MLT1D LTR MaLR 279 491 -14 3 1001 666 382 71 0 chr15 54537431 54537813 -48957161 + MLT1E2 LTR MaLR 219 627 0 4 1001 924 282 85 58 chr15 54539357 54539734 -48955240 + MTD LTR MaLR 18 404 -15 4 1001 714 226 62 51 chr15 54545378 54545555 -48949419 + ORR1D1 LTR MaLR 3 181 -193 5 1001 255 247 11 69 chr15 54545800 54545887 -48949087 + ORR1D1 LTR MaLR 235 316 -58 5 1001 2109 219 22 65 chr15 54545895 54546403 -48948571 + RMER19C LTR ERVK 126 611 0 5 1001 453 224 0 0 chr15 54546403 54546476 -48948498 + ORR1D1 LTR MaLR 295 367 -7 5 1001 233 267 67 22 chr15 54556230 54556328 -48938646 + MTE2a LTR MaLR 280 379 0 6 1001 2880 49 0 3 chr15 54559755 54560102 -48934872 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 1001 489 220 36 45 chr15 54568774 54568998 -48925976 - RMER17D2 LTR ERVK -340 469 248 9 1001 4199 122 3 2 chr15 54573140 54573750 -48921224 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1001 5518 150 41 37 chr15 54573750 54574927 -48920047 - MurERV4_19-int LTR ERVK 0 5780 4600 1 1001 865 271 39 57 chr15 54575036 54575450 -48919524 - RLTR11B LTR ERVK -29 412 1 1 1001 2194 126 124 11 chr15 54587368 54587746 -48907228 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1001 1839 122 54 60 chr15 54597267 54597598 -48897376 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1001 542 259 37 7 chr15 54598388 54598508 -48896466 + MTE-int LTR MaLR 1404 1527 -53 1 1001 1147 282 82 34 chr15 54598508 54598861 -48896113 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1001 389 318 95 71 chr15 54603654 54603840 -48891134 + MLT1A0 LTR MaLR 90 282 -83 1 1001 1789 208 50 5 chr15 54603840 54604241 -48890733 + MTC LTR MaLR 3 421 0 1 1001 389 318 95 71 chr15 54604241 54604264 -48890710 + MLT1A0 LTR MaLR 283 304 -61 1 1001 3859 136 86 23 chr15 54604642 54605350 -48889624 - RMER6A LTR ERVK 0 756 4 1 1001 359 252 39 109 chr15 54606478 54606510 -48888464 + MT2B LTR ERVL 137 157 -444 1 1001 1684 183 68 15 chr15 54606724 54607063 -48887911 + ORR1B2 LTR MaLR 3 359 -8 1 1001 300 132 7 52 chr15 54608632 54608703 -48886271 - ORR1B1 LTR MaLR -1 420 343 1 1001 1538 127 53 8 chr15 54611161 54611422 -48883552 - ORR1B2 LTR MaLR -39 328 56 1 1001 821 108 87 4 chr15 54611422 54611675 -48883299 + RLTR15 LTR ERVK 1 343 -16 1 1001 293 293 24 0 chr15 54617353 54617435 -48877539 + MLT1F1 LTR MaLR 12 95 -474 1 1001 3508 46 5 0 chr15 54619221 54619615 -48875359 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1001 2174 126 70 3 chr15 54621881 54622239 -48872735 + MTB_Mm LTR MaLR 26 407 0 1 1001 244 162 0 0 chr15 54624378 54624415 -48870559 - RLTR33 LTR ERVK -1 677 641 2 1001 1750 106 221 15 chr15 54624416 54624742 -48870232 - RLTR33 LTR ERVK -284 394 2 2 1001 724 339 71 51 chr15 54626921 54627316 -48867658 + MLT1A1 LTR MaLR 3 405 -3 2 1001 1230 256 35 69 chr15 54627607 54628016 -48866958 - MTE2b LTR MaLR -15 364 1 2 1001 3238 73 2 8 chr15 54646789 54647187 -48847787 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1001 803 332 49 26 chr15 54653266 54653612 -48841362 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 2 1002 769 182 7 7 chr15 54662532 54662670 -48832304 + MT2A LTR ERVL 1 138 -395 2 1002 818 237 252 51 chr15 54666719 54667053 -48827921 - MTD LTR MaLR 0 419 19 2 1002 1865 150 7 106 chr15 54683050 54683476 -48811498 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1002 648 292 93 52 chr15 54688891 54689234 -48805740 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 3 1002 231 209 101 29 chr15 54691658 54691727 -48803247 + RMER4A LTR ERVK 309 382 -84 3 1002 403 326 47 0 chr15 54693282 54693411 -48801563 + LTR33 LTR ERVL 32 166 -349 3 1002 2284 182 5 29 chr15 54725434 54725842 -48769132 + MTC LTR MaLR 5 402 -19 3 1002 2541 128 70 5 chr15 54733588 54733958 -48761016 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1002 946 270 38 23 chr15 54736007 54736269 -48758705 - MTE2a LTR MaLR -6 373 108 3 1002 311 303 0 99 chr15 54737389 54737510 -48757464 - MTE2a LTR MaLR -262 117 9 3 1002 248 269 78 69 chr15 54737545 54737661 -48757313 + LTR16A1 LTR ERVL 340 456 0 3 1002 2832 158 54 24 chr15 54761569 54762070 -48732904 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 4 1002 1624 226 45 8 chr15 54768512 54768869 -48726105 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1002 757 260 207 26 chr15 54769207 54769407 -48725567 + MTD LTR MaLR 1 216 -203 4 1002 757 265 193 25 chr15 54769613 54769768 -48725206 + MTD LTR MaLR 217 405 -14 4 1002 1061 276 35 32 chr15 54775127 54775471 -48719503 - MLT1B LTR MaLR -45 345 1 4 1002 653 254 34 28 chr15 54781979 54782157 -48712817 + MTEa LTR MaLR 27 205 -174 4 1003 1583 235 58 43 chr15 54789894 54790409 -48704565 - RMER19C LTR ERVK -3 608 86 4 1003 261 207 35 0 chr15 54797583 54797641 -48697333 - MTD LTR MaLR -128 291 232 5 1003 232 376 28 0 chr15 54803883 54803992 -48690982 + MLT1J LTR MaLR 86 197 -315 5 1003 238 283 93 89 chr15 54805907 54806155 -48688819 - RLTR11A LTR ERVK -53 475 227 5 1003 561 272 30 102 chr15 54806190 54806485 -48688489 - RLTR11A2 LTR ERVK -164 277 4 5 1003 572 231 205 16 chr15 54808132 54808317 -48686657 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 348 5 1003 4324 209 67 38 chr15 54808504 54809678 -48685296 - ORR1C2-int LTR MaLR -162 1208 1 5 1003 1649 158 87 84 chr15 54809680 54809863 -48685111 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 191 5 1003 1649 158 87 84 chr15 54809942 54810138 -48684836 - ORR1C2 LTR MaLR -194 190 3 5 1003 403 289 96 0 chr15 54812444 54812610 -48682364 + MLT1B LTR MaLR 209 390 0 5 1003 683 269 119 24 chr15 54817768 54818019 -48676955 - MTD LTR MaLR -140 279 5 5 1003 3752 135 36 6 chr15 54823391 54824053 -48670921 - RLTR17 LTR ERVK -10 682 1 5 1003 2194 158 56 15 chr15 54827068 54827459 -48667515 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1003 1693 149 97 76 chr15 54828525 54828895 -48666079 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 1003 1426 264 58 36 chr15 54839057 54839524 -48655450 - MT2A LTR ERVL -16 517 41 6 1003 304 315 104 20 chr15 54843381 54843582 -48651392 - MLT1A0 LTR MaLR -145 220 3 6 1003 259 265 0 108 chr15 54854905 54854998 -48639976 - LTR78 LTR ERV1 -296 1008 926 6 1003 3151 35 3 0 chr15 54864445 54864790 -48630184 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1003 522 306 29 12 chr15 54872641 54872813 -48622161 + MTEa LTR MaLR 48 222 -157 6 1003 1692 136 50 62 chr15 54882186 54882508 -48612466 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 6 1003 2552 222 52 21 chr15 54882908 54883488 -48611486 + ORR1D1-int LTR MaLR 768 1365 -5 6 1003 579 205 123 19 chr15 54883493 54883647 -48611327 + ORR1D1 LTR MaLR 1 170 -204 6 1003 667 222 63 21 chr15 54884163 54884352 -48610622 + RMER5 LTR ERV1 338 534 0 6 1003 317 348 78 35 chr15 54884352 54884605 -48610369 - MTE-int LTR MaLR -239 1341 1078 6 1003 1156 271 39 3 chr15 54884863 54885170 -48609804 - MTE-int LTR MaLR -1260 320 3 6 1003 234 316 77 72 chr15 54885300 54885508 -48609466 - MTEa LTR MaLR -163 216 8 6 1003 243 293 0 83 chr15 54892908 54892923 -48602051 + MT2B2 LTR ERVL 155 160 -424 7 1003 291 239 50 71 chr15 54899125 54899153 -48595821 - MT2B LTR ERVL -436 165 140 7 1003 274 159 0 0 chr15 54901735 54901779 -48593195 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2168 2211 -3503 7 1003 1027 187 45 78 chr15 54906223 54906686 -48588288 + MT2A LTR ERVL 3 543 -58 7 1003 2625 71 3 0 chr15 54914109 54914435 -48580539 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1003 569 224 211 35 chr15 54915266 54915465 -48579509 - ETnERV2-int LTR ERVK -4719 2687 2454 7 1003 387 132 191 2 chr15 54915478 54915568 -48579406 - RLTR19-int LTR ERVK -5077 1060 974 7 1004 867 229 19 28 chr15 54921019 54921235 -48573739 + ORR1D2 LTR MaLR 1 214 -156 7 1004 2227 125 89 22 chr15 54923592 54923961 -48571013 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1004 1345 237 45 17 chr15 54924135 54924487 -48570487 - MTEb LTR MaLR -13 366 5 7 1004 1020 75 30 24 chr15 54924487 54924631 -48570343 + MTB LTR MaLR 1 145 -255 7 1004 1794 123 150 91 chr15 54924631 54925070 -48569904 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 55 7 1004 1965 68 14 4 chr15 54925084 54925362 -48569612 + MTB LTR MaLR 120 400 0 7 1004 1812 129 27 145 chr15 54926261 54926468 -48568506 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 204 7 1004 1812 129 27 145 chr15 54926615 54926814 -48568160 - RLTR15 LTR ERVK -156 203 1 7 1004 5556 85 15 14 chr15 54926997 54927852 -48567122 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 856 -992 7 1004 330 302 78 60 chr15 54928060 54928278 -48566696 + RMER12 LTR ERVK 1101 1322 0 8 1004 835 100 326 0 chr15 54928845 54929061 -48565913 + ORR1A2 LTR MaLR 1 318 -8 8 1004 802 205 82 251 chr15 54929490 54929940 -48565034 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 8 1004 5315 120 36 19 chr15 54930056 54930993 -48563981 - RMER17B LTR ERVK -5 953 1 8 1004 659 271 112 13 chr15 54931003 54931227 -48563747 + ORR1D2 LTR MaLR 122 367 -3 8 1004 262 295 76 76 chr15 54931230 54931362 -48563612 - LTR33A_ LTR ERVL -383 148 17 8 1004 489 200 17 43 chr15 54931519 54931634 -48563340 - RMER5 LTR ERV1 0 534 423 8 1004 1759 156 114 11 chr15 54931632 54931982 -48562992 + MTB_Mm LTR MaLR 22 407 0 8 1004 1240 231 92 18 chr15 54931982 54932374 -48562600 - RMER5 LTR ERV1 -113 421 1 8 1004 588 254 23 62 chr15 54933902 54934078 -48560896 - RMER12 LTR ERVK -9 1313 1145 8 1004 1871 62 43 2 chr15 54935097 54935388 -48559586 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 57 8 1004 665 186 51 57 chr15 54935361 54935538 -48559436 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1214 634 459 8 1004 2384 166 42 58 chr15 54936611 54937029 -48557945 + RMER6C LTR ERVK 127 542 -148 8 1004 2476 113 11 24 chr15 54937029 54937402 -48557572 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 8 1004 2384 166 42 58 chr15 54937402 54937554 -48557420 + RMER6C LTR ERVK 543 688 -2 8 1004 2164 116 3 58 chr15 54939934 54940282 -48554692 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1004 2229 106 45 40 chr15 54941207 54941609 -48553365 + RLTR9F LTR ERVK 1 404 -11 8 1004 790 257 69 20 chr15 54950414 54950660 -48544314 + RMER5 LTR ERV1 75 332 -202 8 1004 1636 155 62 49 chr15 54955067 54955392 -48539582 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 8 1004 431 174 0 122 chr15 54956210 54956308 -48538666 + MT2B LTR ERVL 172 257 -344 8 1004 232 227 0 0 chr15 54961106 54961150 -48533824 - MT2B LTR ERVL -314 287 244 8 1004 247 308 115 31 chr15 54962559 54962750 -48532224 + RMER17D2 LTR ERVK 175 381 -428 8 1004 1853 172 83 3 chr15 54963287 54963626 -48531348 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 8 1004 2830 68 52 3 chr15 54965871 54966252 -48528722 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1004 269 252 57 90 chr15 54967453 54967490 -48527484 + MT2B LTR ERVL 123 155 -446 9 1004 1993 118 75 55 chr15 54967586 54967753 -48527221 + RMER17C LTR ERVK 1 184 -226 9 1004 1993 118 75 55 chr15 54967848 54968082 -48526892 + RMER17C LTR ERVK 185 410 0 9 1004 691 213 61 79 chr15 54968491 54968705 -48526269 - RMER5 LTR ERV1 -282 252 43 9 1004 384 195 0 121 chr15 54969789 54969888 -48525086 - MT2B LTR ERVL -337 264 178 9 1004 1132 270 68 38 chr15 54975156 54975495 -48519479 - ORR1C2 LTR MaLR -35 349 1 9 1004 424 102 0 0 chr15 54976535 54976594 -48518380 - ORR1A2 LTR MaLR 0 329 271 9 1004 1741 138 0 4 chr15 54976884 54977153 -48517821 - ORR1A2 LTR MaLR -43 284 17 9 1004 1253 190 178 34 chr15 54982066 54982392 -48512582 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 9 1004 1932 208 40 5 chr15 54982426 54982823 -48512151 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 9 1004 294 266 51 76 chr15 54988621 54988739 -48506235 - MT2B LTR ERVL -344 257 143 9 1004 533 355 67 32 chr15 54989264 54989549 -48505425 - LTR40a LTR ERVL -221 298 4 9 1004 298 319 109 0 chr15 54994886 54995005 -48499969 + LTR33 LTR ERVL 30 161 -354 9 1004 439 225 24 98 chr15 54998224 54998347 -48496627 - MT2B LTR ERVL -337 264 151 9 1004 300 268 7 28 chr15 54998229 54998371 -48496603 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 616 9 1004 1978 157 45 6 chr15 54999523 54999876 -48495098 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 9 1004 251 258 73 82 chr15 55011229 55011339 -48483635 - MLT1A0 LTR MaLR -93 272 164 3 1004 670 297 152 74 chr15 55014523 55014621 -48480353 - MLT1F LTR MaLR -8 540 469 4 1004 2242 106 0 10 chr15 55014621 55014935 -48480039 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 4 1004 670 297 152 74 chr15 55014935 55015337 -48479637 - MLT1F LTR MaLR -80 468 1 4 1004 3327 147 40 192 chr15 55016686 55017577 -48477397 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 5 1004 2129 182 30 2 chr15 55022874 55023276 -48471698 - MTC LTR MaLR 0 421 9 6 1004 794 225 105 40 chr15 55026441 55026836 -48468138 - MT2A LTR ERVL 0 601 24 7 1004 1166 227 62 22 chr15 55027289 55027613 -48467361 + MTE2b LTR MaLR 25 361 -18 7 1004 2018 115 38 9 chr15 55028734 55029066 -48465908 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 41 8 1004 2571 187 137 16 chr15 55029066 55029671 -48465303 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 1 8 1004 2021 105 50 19 chr15 55033649 55033968 -48461006 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1004 1041 236 70 89 chr15 55037876 55038346 -48456628 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 1 1004 1784 138 17 136 chr15 55041535 55041998 -48452976 + RMER17C LTR ERVK 1 408 -2 1 1004 1834 124 64 61 chr15 55048356 55048405 -48446569 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 287 1 1004 1834 124 64 61 chr15 55048574 55048847 -48446127 - ORR1A2 LTR MaLR -41 286 1 1 1005 2036 119 61 6 chr15 55050328 55050674 -48444300 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 314 1 1005 1180 116 0 21 chr15 55056794 55056988 -48437986 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 338 1 1005 258 155 0 49 chr15 55056988 55057049 -48437925 - RLTR11A2 LTR ERVK -469 58 1 1 1005 371 194 0 129 chr15 55057869 55057887 -48437087 + MT2B LTR ERVL 165 270 -331 1 1005 235 306 39 39 chr15 55058095 55058197 -48436777 + MLT1C LTR MaLR 366 467 0 1 1005 2271 157 5 85 chr15 55064987 55065412 -48429562 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 4 1 1005 340 336 68 49 chr15 55066354 55066625 -48428349 - LTR33C LTR ERVL -341 288 8 1 1005 1167 238 95 3 chr15 55068838 55069133 -48425841 - MTE2a LTR MaLR 0 379 58 2 1005 1985 227 79 46 chr15 55069692 55070361 -48424613 - RLTR40 LTR ERVK -39 778 88 2 1005 379 161 40 64 chr15 55070396 55070569 -48424405 - RMER17C LTR ERVK -136 274 106 2 1005 279 200 17 0 chr15 55070566 55070626 -48424348 - RLTR40 LTR ERVK -725 92 32 2 1005 364 224 25 89 chr15 55073853 55073929 -48421045 - RMER17C LTR ERVK -263 147 80 2 1005 3920 106 62 5 chr15 55073929 55074497 -48420477 - MT2B LTR ERVL -1 600 1 2 1005 364 224 25 89 chr15 55074497 55074577 -48420397 - RMER17C LTR ERVK -331 79 1 2 1005 3056 137 48 9 chr15 55078304 55078397 -48416577 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 479 2 1005 3056 137 48 9 chr15 55078422 55078875 -48416099 - RLTR20D LTR ERVK -90 478 3 2 1005 2272 170 20 64 chr15 55079333 55079705 -48415269 + MTC LTR MaLR 1 364 -57 2 1005 2272 170 20 64 chr15 55079900 55079967 -48415007 + MTC LTR MaLR 365 421 0 2 1005 1568 168 84 109 chr15 55082763 55083157 -48411817 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 2 1005 243 276 22 44 chr15 55088449 55088540 -48406434 + MTEa LTR MaLR 278 366 -13 2 1005 251 341 12 0 chr15 55088925 55089010 -48405964 - MLT1H1 LTR MaLR -461 94 9 2 1005 229 252 83 45 chr15 55091260 55091393 -48403581 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 395 2 1005 234 286 148 15 chr15 55092148 55092283 -48402691 - RMER5 LTR ERV1 -336 198 46 2 1005 3692 51 21 25 chr15 55093582 55094066 -48400908 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1005 3454 157 121 17 chr15 55094275 55094461 -48400513 - RLTR25B LTR ERVK -206 822 626 2 1005 3454 157 121 17 chr15 55094486 55095044 -48399930 - RLTR25B LTR ERVK -403 625 2 2 1005 536 214 39 72 chr15 55095076 55095106 -48399868 + RMER4B LTR ERVK 1 32 -434 2 1005 968 228 54 60 chr15 55095253 55095471 -48399503 + RMER4B LTR ERVK 33 267 -318 2 1005 968 258 87 32 chr15 55095516 55095685 -48399289 + RMER4B LTR ERVK 268 434 -151 2 1005 1697 168 14 84 chr15 55096324 55096752 -48398222 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 2 1005 1422 165 94 30 chr15 55098296 55098658 -48396316 + RMER10B LTR ERVL 14 398 0 2 1005 987 163 5 5 chr15 55099447 55099632 -48395342 - RMER10B LTR ERVL -212 186 2 2 1005 4348 61 31 7 chr15 55103289 55103837 -48391137 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 4 3 1005 1951 186 75 33 chr15 55104360 55104788 -48390186 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 3 1005 242 271 132 46 chr15 55107731 55107882 -48387092 + MLT1J2 LTR MaLR 265 428 -20 3 1005 787 229 119 45 chr15 55111312 55111664 -48383310 + RMER17C LTR ERVK 1 378 -32 3 1005 232 321 42 59 chr15 55113456 55113575 -48381399 + LTR16A1 LTR ERVL 333 449 -7 3 1005 292 247 0 114 chr15 55113808 55113913 -48381061 - MT2B LTR ERVL -337 264 172 3 1005 1042 248 20 71 chr15 55114435 55114830 -48380144 + RMER17C LTR ERVK 1 375 -35 3 1005 611 274 6 32 chr15 55116146 55116304 -48378670 + MTEa LTR MaLR 1 154 -225 3 1005 392 264 0 0 chr15 55118234 55118321 -48376653 - ORR1E LTR MaLR -269 90 4 3 1005 5362 146 76 15 chr15 55119783 55120823 -48374151 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 3 1005 362 266 51 19 chr15 55121265 55121422 -48373552 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 203 3 1005 513 316 88 10 chr15 55121650 55121842 -48373132 - ORR1D2 LTR MaLR -153 217 11 3 1005 739 239 139 25 chr15 55126046 55126364 -48368610 - ORR1D1 LTR MaLR -13 357 1 3 1005 294 167 45 15 chr15 55133457 55133524 -48361450 - MTD LTR MaLR -45 376 308 3 1005 551 126 170 9 chr15 55133502 55133614 -48361360 - MTD LTR MaLR -285 134 5 3 1005 954 249 41 58 chr15 55156693 55157070 -48337904 + MTE2a LTR MaLR 30 419 0 4 1005 735 262 89 28 chr15 55157221 55157468 -48337506 + RLTR18 LTR ERVK 355 616 0 4 1005 2846 61 0 3 chr15 55157981 55158328 -48336646 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1005 1981 169 60 18 chr15 55166671 55167052 -48327922 - MTD LTR MaLR 0 419 23 4 1005 1533 137 66 0 chr15 55170366 55170607 -48324367 + ORR1A2 LTR MaLR 1 257 -70 4 1005 474 346 28 70 chr15 55170707 55171095 -48323879 - MTEa LTR MaLR -3 376 5 4 1005 333 235 0 0 chr15 55175635 55175703 -48319271 - RMER15 LTR ERVL -105 470 403 4 125 2150 141 52 44 chr15 55181050 55181382 -48313592 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 32 4 1006 2150 141 52 44 chr15 55181575 55181606 -48313368 - ORR1B2 LTR MaLR -336 31 1 4 1006 764 266 68 103 chr15 55182579 55182948 -48312026 - ORR1E LTR MaLR -3 356 1 4 1006 2811 162 19 38 chr15 55185218 55185750 -48309224 - RLTR20B3 LTR ERVK -55 522 1 4 1006 240 275 170 100 chr15 55188242 55188658 -48306316 - MLT2B1 LTR ERVL -31 525 14 5 1006 2316 129 49 44 chr15 55199440 55199805 -48295169 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1006 1022 129 0 6 chr15 55200669 55200825 -48294149 - ORR1B2 LTR MaLR -52 315 161 5 1006 391 240 17 96 chr15 55200850 55200965 -48294009 - MT2B LTR ERVL -343 258 153 5 1006 888 181 322 67 chr15 55204713 55204968 -48290006 - ORR1C1 LTR MaLR -58 320 1 5 1006 402 136 84 24 chr15 55204968 55205051 -48289923 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 1422 5 1006 1260 239 75 0 chr15 55216645 55216938 -48278036 - MTD LTR MaLR -7 412 98 5 1006 242 309 104 77 chr15 55220904 55221086 -48273888 - MLT1G1 LTR MaLR -235 344 158 5 1006 2420 92 6 0 chr15 55236741 55237066 -48257908 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1006 228 382 66 44 chr15 55241076 55241213 -48253761 - LTR16A LTR ERVL -180 271 132 5 1006 387 21 0 0 chr15 55248057 55248104 -48246870 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 313 5 1006 1871 239 58 60 chr15 55257578 55258577 -48236397 - RMER13B LTR ERVK -50 908 1 6 1006 659 318 104 61 chr15 55262671 55263113 -48231861 - MLT1K LTR MaLR -73 522 62 6 1006 584 253 52 164 chr15 55278175 55278444 -48216530 + MTE2b LTR MaLR 1 239 -140 6 1006 1068 253 50 90 chr15 55282353 55282469 -48212505 + MTD LTR MaLR 1 112 -307 6 1006 1068 250 40 73 chr15 55282777 55283093 -48211881 + MTD LTR MaLR 113 405 -14 6 1006 736 261 251 29 chr15 55295962 55296305 -48198669 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1007 401 276 93 44 chr15 55313535 55313717 -48181257 - MLT1A1 LTR MaLR -217 191 1 6 1007 295 284 132 42 chr15 55314972 55315185 -48179789 + LTR16A1 LTR ERVL 212 443 -13 6 1007 2207 140 77 6 chr15 55316523 55316889 -48178085 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 6 1007 267 254 44 67 chr15 55318160 55318295 -48176679 - MLT1J1 LTR MaLR -307 137 6 7 1007 344 233 21 72 chr15 55321164 55321261 -48173713 - MLT1D LTR MaLR -373 132 41 7 1007 986 282 9 79 chr15 55335124 55335329 -48159645 - MTE2a LTR MaLR -4 375 195 7 1007 986 299 47 71 chr15 55335382 55335592 -48159382 - MTE2a LTR MaLR -178 241 1 7 1007 337 300 172 28 chr15 55338680 55338965 -48156009 - MLT1F1 LTR MaLR -186 383 58 7 1007 457 264 57 16 chr15 55340932 55341055 -48153919 - ETnERV2-int LTR ERVK -213 7193 7066 7 1007 225 309 0 41 chr15 55342212 55342310 -48152664 + LTR33A LTR ERVL 425 518 -2 7 1007 2817 111 17 60 chr15 55343504 55343973 -48151001 - RLTR11B LTR ERVK -4 449 1 7 1007 331 272 26 107 chr15 55345787 55346019 -48148955 + MTEb LTR MaLR 132 372 -7 7 1007 334 215 31 41 chr15 55347043 55347140 -48147834 + MT2B LTR ERVL 168 263 -338 7 1007 429 313 83 23 chr15 55358746 55358962 -48136012 + MLT1E1 LTR MaLR 424 652 -2 7 1007 1036 136 128 22 chr15 55363122 55363348 -48131626 + MTB_Mm LTR MaLR 1 250 -157 7 1007 421 244 123 32 chr15 55401990 55402157 -48092817 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 202 8 1007 3268 14 0 6 chr15 55402189 55402537 -48092437 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 8 1007 257 247 105 12 chr15 55402545 55402631 -48092343 - ORR1D2 LTR MaLR -276 94 1 8 1007 2636 138 39 7 chr15 55405679 55406087 -48088887 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1007 929 289 7 118 chr15 55408309 55408733 -48086241 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 8 1007 3216 54 5 32 chr15 55409551 55409954 -48085020 - MTA_Mm LTR MaLR -4 392 1 8 1007 653 191 85 239 chr15 55410206 55410328 -48084646 + RLTR18B LTR ERVK 6 67 -549 8 1007 2063 191 41 47 chr15 55410516 55410965 -48084009 + RLTR18B LTR ERVK 68 511 -1 8 1007 702 328 103 39 chr15 55419032 55419266 -48075708 - MER70A LTR ERVL -57 415 168 8 1007 3619 23 8 0 chr15 55419266 55419659 -48075315 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1007 702 328 103 39 chr15 55419659 55419814 -48075160 - MER70A LTR ERVL -305 167 1 8 1007 1144 223 226 76 chr15 55428129 55428590 -48066384 - MT2A LTR ERVL 0 533 4 8 1007 992 294 97 26 chr15 55429832 55430174 -48064800 - MTEa LTR MaLR -8 371 6 8 1007 374 149 13 26 chr15 55430203 55430279 -48064695 - RMER13A LTR ERVK -639 221 147 8 1007 395 246 17 34 chr15 55430274 55430392 -48064582 - RLTR26 LTR ERVK -372 270 155 8 1007 1041 281 29 86 chr15 55430780 55430846 -48064128 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 306 8 1007 1041 281 29 86 chr15 55430994 55431312 -48063662 - ORR1D1 LTR MaLR -69 305 8 8 1007 1238 226 112 38 chr15 55435125 55435473 -48059501 - MTD LTR MaLR -14 405 44 8 1007 415 238 14 106 chr15 55439685 55439826 -48055148 + RLTR24 LTR ERV1 7 134 -395 8 1007 229 347 37 93 chr15 55439883 55439991 -48054983 + RLTR24 LTR ERV1 319 420 -109 8 1007 1562 182 141 14 chr15 55442018 55442380 -48052594 - MTD LTR MaLR 0 419 12 8 1008 2048 170 81 18 chr15 55446369 55446765 -48048209 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1008 774 281 60 39 chr15 55450659 55450998 -48043976 - MTE2a LTR MaLR -14 405 20 8 1008 411 219 226 52 chr15 55458026 55458238 -48036736 + ORR1D2 LTR MaLR 1 249 -121 9 1008 1398 172 98 58 chr15 55461091 55461468 -48033506 - RMER20B LTR ERVK -214 413 22 9 1008 1036 240 108 6 chr15 55462899 55463213 -48031761 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 21 9 1008 233 333 71 36 chr15 55464176 55464316 -48030658 + MLT1H2 LTR MaLR 321 465 -24 9 1008 234 279 117 45 chr15 55466132 55466286 -48028688 + RMER15 LTR ERVL 406 570 -5 9 1008 279 359 2 0 chr15 55466295 55466384 -48028590 - LTR16D1 LTR ERVL -397 278 165 9 1008 533 247 94 39 chr15 55471806 55471987 -48022987 - MTE2b LTR MaLR -2 377 187 9 1008 3421 30 5 0 chr15 55476212 55476606 -48018368 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1008 270 270 149 28 chr15 55483792 55483933 -48011041 + MLT1B LTR MaLR 210 367 -23 9 1008 2279 146 39 12 chr15 55486405 55486814 -48008160 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 9 1008 374 327 88 57 chr15 55491654 55491985 -48002989 + MLT1B LTR MaLR 12 352 -38 9 1008 403 297 9 18 chr15 55493285 55493398 -48001576 + MTEa LTR MaLR 213 324 -55 9 1008 4134 130 33 17 chr15 55495049 55495802 -47999172 + RMER12 LTR ERVK 1 765 -557 9 1008 362 257 38 83 chr15 55495852 55496009 -47998965 + RMER12 LTR ERVK 995 1144 -178 9 1008 249 279 199 31 chr15 55496046 55496242 -47998732 + RLTR21 LTR ERVK 1344 1572 0 9 1008 4503 144 28 16 chr15 55499166 55499997 -47994977 - MTC-int LTR MaLR -388 870 30 9 1008 2832 82 48 15 chr15 55500024 55500418 -47994556 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1008 1198 182 38 146 chr15 55518758 55519183 -47975791 + RMER13B LTR ERVK 5 383 -525 1 1008 979 295 85 16 chr15 55522064 55522424 -47972550 + MTEa LTR MaLR 1 359 0 2 1008 1170 295 14 17 chr15 55525460 55525815 -47969159 - MTEa LTR MaLR -21 358 5 2 1008 624 331 79 7 chr15 55525824 55526116 -47968858 + MLT1C LTR MaLR 143 455 -12 3 1008 350 293 178 50 chr15 55527388 55527647 -47967327 - MLT1D LTR MaLR -174 331 40 3 1008 430 335 67 11 chr15 55528029 55528207 -47966767 + MLT2B2 LTR ERVL 13 200 -315 3 1008 763 139 94 58 chr15 55531061 55531252 -47963722 + RMER13B LTR ERVK 1 198 -710 4 1008 1421 177 7 26 chr15 55531249 55531522 -47963452 - RMER13B LTR ERVK -509 399 132 4 1008 627 346 17 50 chr15 55541574 55541976 -47952998 + MT2A LTR ERVL 1 389 -144 5 1008 234 196 0 0 chr15 55542792 55542838 -47952136 + MT2A LTR ERVL 486 531 -2 5 1008 2378 142 97 15 chr15 55543301 55543774 -47951200 + RLTR28 LTR ERVL 1 512 -12 5 1008 889 290 68 13 chr15 55544232 55544616 -47950358 + RMER5 LTR ERV1 128 532 -2 6 1008 358 236 0 101 chr15 55544830 55544929 -47950045 + MLT2C1 LTR ERVL 460 548 -15 6 1008 3652 196 85 75 chr15 55549792 55550235 -47944739 + RMER19B LTR ERVK 4 425 -477 6 1008 3652 196 85 75 chr15 55550331 55550776 -47944198 + RMER19B LTR ERVK 426 901 -1 6 1008 679 291 108 44 chr15 55552894 55553254 -47941720 + MLT1B LTR MaLR 8 390 0 7 1008 240 167 91 18 chr15 55556861 55556916 -47938058 - LTR39 LTR ERV1 -683 100 42 7 1008 1320 254 86 26 chr15 55562156 55562612 -47932362 + RMER5 LTR ERV1 33 515 -19 8 1008 376 323 143 22 chr15 55565167 55565439 -47929535 + LTR16A1 LTR ERVL 94 398 -58 8 1008 711 279 62 44 chr15 55565706 55565980 -47928994 + LTR53 LTR ERVL 239 517 -2 8 1009 383 287 76 56 chr15 55577567 55577711 -47917263 + LTR33 LTR ERVL 214 360 -155 1 1009 463 238 65 45 chr15 55581720 55581874 -47913100 + ORR1C2 LTR MaLR 1 157 -227 1 1009 3004 216 16 11 chr15 55581872 55582500 -47912474 + ORR1C2-int LTR MaLR 11 641 -868 1 1009 226 191 0 0 chr15 55582485 55582548 -47912426 + ORR1C2-int LTR MaLR 763 825 -684 1 1009 3404 216 3 13 chr15 55583722 55584417 -47910557 + ORR1C2-int LTR MaLR 820 1507 -2 1 1009 1939 186 74 30 chr15 55584419 55584785 -47910189 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 1 1009 455 246 15 58 chr15 55588921 55589063 -47905911 - MLT1F2 LTR MaLR -5 675 435 1 1009 415 300 30 66 chr15 55589368 55589565 -47905409 + MLT1C LTR MaLR 262 443 -24 1 1009 1278 271 45 14 chr15 55591506 55591858 -47903116 - MTE2b LTR MaLR -12 367 5 1 1009 248 271 207 46 chr15 55592335 55592509 -47902465 + MLT1N2 LTR MaLR 151 352 -210 1 1009 276 274 142 0 chr15 55601870 55601976 -47892998 + MLT1C LTR MaLR 7 127 -340 1 1009 501 257 59 18 chr15 55601998 55602168 -47892806 + MLT1C LTR MaLR 291 467 0 1 1009 578 338 42 46 chr15 55602384 55602691 -47892283 + ORR1E LTR MaLR 48 353 -6 1 1009 1932 196 99 13 chr15 55603043 55603425 -47891549 + MTC LTR MaLR 5 419 -2 1 1009 1600 172 118 6 chr15 55603725 55604047 -47890927 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 2 1 1009 231 289 36 63 chr15 55609480 55609591 -47885383 + LTR33 LTR ERVL 268 375 -140 1 1009 333 356 24 0 chr15 55614048 55614243 -47880731 - MLT1A1 LTR MaLR -8 400 154 1 1009 1054 328 163 29 chr15 55614257 55614743 -47880231 - MLT1A0-int LTR MaLR -235 1500 950 1 1009 1313 310 139 23 chr15 55614781 55615511 -47879463 - MLT1A0-int LTR MaLR -914 821 2 1 1009 676 315 59 61 chr15 55615512 55615852 -47879122 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 33 1 1009 310 264 14 0 chr15 55616347 55616419 -47878555 - MLT1A1 LTR MaLR -325 83 11 1 1009 989 245 91 47 chr15 55630681 55631030 -47863944 - MTE2b LTR MaLR 0 379 21 2 1009 830 238 20 40 chr15 55639107 55639287 -47855687 - MTE2b LTR MaLR 0 379 204 2 1009 500 330 80 49 chr15 55639419 55639460 -47855514 - MTE2b LTR MaLR -138 241 207 2 1009 500 330 80 49 chr15 55639556 55639740 -47855234 - MTE2b LTR MaLR -173 206 9 2 1009 227 200 31 77 chr15 55644442 55644507 -47850467 + RLTR3_Mm LTR ERVK 1004 1065 -263 2 1009 243 273 29 39 chr15 55649338 55649441 -47845533 - ORR1D1 LTR MaLR 0 379 278 2 1009 378 277 50 78 chr15 55649482 55649662 -47845312 - ORR1D1 LTR MaLR -195 179 5 2 1009 1792 219 16 32 chr15 55656902 55657274 -47837700 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 2 1009 294 331 108 36 chr15 55657625 55657983 -47836991 + ORR1E LTR MaLR 1 384 0 2 1009 946 275 50 105 chr15 55669690 55669785 -47825189 + MLT1B LTR MaLR 44 141 -249 2 1009 2366 151 59 3 chr15 55669785 55670158 -47824816 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1009 946 275 50 105 chr15 55670158 55670424 -47824550 + MLT1B LTR MaLR 142 385 -5 2 1009 628 302 116 32 chr15 55672556 55672867 -47822107 + MLT1A0 LTR MaLR 1 337 -28 2 1009 1610 179 92 50 chr15 55672928 55673351 -47821623 - RMER10A LTR ERVL -1 441 1 2 1009 1014 162 6 55 chr15 55674067 55674250 -47820724 + RMER10A LTR ERVL 1 174 -268 2 1009 244 319 79 75 chr15 55691057 55691123 -47803851 + MLT1K LTR MaLR 381 446 -164 3 1009 307 268 76 36 chr15 55691496 55691653 -47803321 + MLT1K LTR MaLR 447 608 -2 3 1009 999 272 98 47 chr15 55694025 55694384 -47800590 + MTEb LTR MaLR 3 379 0 3 1009 651 243 147 29 chr15 55700908 55701237 -47793737 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 1009 2166 83 31 16 chr15 55703023 55703340 -47791634 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 126 25888 33 11 10 chr15 55703340 55708243 -47786731 + MMETn-int LTR ERVK 1 4844 0 3 1010 2166 83 31 16 chr15 55708243 55708560 -47786414 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 3 1010 542 305 83 57 chr15 55716676 55717078 -47777896 - MLT1C LTR MaLR -1 389 1 3 1010 335 335 15 55 chr15 55730949 55731151 -47763823 + MLT1E2 LTR MaLR 8 200 -305 3 1010 1430 232 70 36 chr15 55732336 55732694 -47762280 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 3 3 1010 252 302 52 10 chr15 55741401 55741498 -47753476 - MTEb LTR MaLR -7 372 272 3 1010 451 321 95 0 chr15 55745302 55745439 -47749535 + MLT1A0 LTR MaLR 1 150 -215 3 1010 370 169 15 0 chr15 55746055 55746120 -47748854 + MLT1A0 LTR MaLR 342 407 -1 3 1010 286 219 0 59 chr15 55746140 55746208 -47748766 + MLT1A0-int LTR MaLR 21 84 -1651 3 1010 842 303 65 24 chr15 55746742 55747083 -47747891 + MLT1A0-int LTR MaLR 232 586 -1149 3 1010 1128 362 73 17 chr15 55747171 55747756 -47747218 + MLT1A0-int LTR MaLR 1094 1711 -24 3 1010 407 272 112 76 chr15 55747856 55748079 -47746895 + MLT1A1 LTR MaLR 176 406 -2 3 1010 2177 174 52 16 chr15 55752839 55752889 -47742085 - RLTR20B3 LTR ERVK -42 535 485 4 1010 2177 181 53 21 chr15 55752934 55753373 -47741601 - RLTR20B3 LTR ERVK -93 484 21 4 1010 296 372 61 30 chr15 55759472 55759702 -47735272 - MLT1J LTR MaLR -3 509 273 4 1010 2140 189 68 8 chr15 55768348 55768414 -47726560 - MTD LTR MaLR 0 419 349 4 1010 2140 189 68 8 chr15 55768436 55768763 -47726211 - MTD LTR MaLR -71 348 2 4 1010 330 375 44 0 chr15 55772382 55772542 -47722432 + MLT1E1 LTR MaLR 464 630 -24 4 1010 1058 280 83 14 chr15 55772946 55773297 -47721677 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 4 1010 3365 55 25 0 chr15 55776443 55776844 -47718130 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 4 1010 602 323 65 111 chr15 55780546 55780943 -47714031 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 4 1010 232 217 111 78 chr15 55783526 55783616 -47711358 + MLT1A LTR MaLR 54 146 -228 4 1010 327 281 61 0 chr15 55787042 55787156 -47707818 + MLT1C LTR MaLR 75 195 -272 4 1010 855 186 185 23 chr15 55791251 55791510 -47703464 + RMER4B LTR ERVK 1 301 -284 4 1010 730 308 101 20 chr15 55793425 55793770 -47701204 - MTD LTR MaLR -44 375 3 4 1010 2066 184 81 34 chr15 55796012 55796081 -47698893 - RLTR16 LTR ERVK -13 492 415 4 1010 2066 184 81 34 chr15 55796151 55796547 -47698427 - RLTR16 LTR ERVK -91 414 5 4 1010 1074 216 39 55 chr15 55803703 55803958 -47691016 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 120 4 1010 457 224 57 49 chr15 55804479 55804601 -47690373 - ORR1D2 LTR MaLR -247 123 1 4 1010 949 284 39 110 chr15 55813222 55813468 -47681506 + MTEa LTR MaLR 1 243 -136 5 1010 2654 40 65 0 chr15 55813468 55813793 -47681181 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1010 949 284 39 110 chr15 55813793 55813954 -47681020 + MTEa LTR MaLR 244 379 0 5 1010 440 283 26 17 chr15 55813954 55814068 -47680906 - ORR1E LTR MaLR -232 127 13 5 1010 3487 15 5 0 chr15 55815481 55815875 -47679099 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1010 1232 120 43 33 chr15 55822401 55822695 -47672279 + MTB_Mm-int LTR MaLR 285 508 -750 5 1010 943 210 218 114 chr15 55826420 55826930 -47668044 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 1 5 1010 2142 97 49 0 chr15 55828281 55828610 -47666364 - BGLII LTR ERVK -76 345 1 5 1010 364 345 46 75 chr15 55830262 55830575 -47664399 - MLT1A LTR MaLR -8 400 63 5 1010 465 306 118 72 chr15 55835016 55835347 -47659627 - ORR1D1 LTR MaLR -5 369 24 5 1010 232 299 65 0 chr15 55835450 55835527 -47659447 + MLT1J1 LTR MaLR 21 102 -342 5 1011 316 312 82 20 chr15 55838820 55838967 -47656007 - MLT1F-int LTR MaLR -619 870 715 5 1011 773 218 28 34 chr15 55840265 55840441 -47654533 + MTE2b LTR MaLR 205 379 0 5 1011 342 333 87 44 chr15 55840441 55840669 -47654305 + MLT1A LTR MaLR 137 374 0 5 1011 990 286 78 34 chr15 55846464 55846867 -47648107 + MLT1C LTR MaLR 3 452 -53 5 1011 276 359 85 35 chr15 55851387 55851586 -47643388 + LTR79 LTR ERVL 186 394 -133 5 1011 1177 236 92 17 chr15 55856436 55856793 -47638181 + RMER17C LTR ERVK 1 384 -26 5 1011 275 358 96 33 chr15 55861832 55862080 -47632894 - LTR33A_ LTR ERVL -232 299 32 6 1011 278 363 77 38 chr15 55862883 55863092 -47631882 + MLT1C LTR MaLR 31 247 -258 6 1011 288 348 101 19 chr15 55863113 55863271 -47631703 + MLT1C LTR MaLR 292 462 -5 6 1011 620 296 36 46 chr15 55863724 55863919 -47631055 + MLT1F1 LTR MaLR 110 302 -267 6 1011 4620 12 0 0 chr15 55864115 55864597 -47630377 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 6 1011 36570 29 14 11 chr15 55864597 55869121 -47625853 - MuRRS-int LTR ERV1 0 4690 1 6 1011 4599 14 0 0 chr15 55869121 55869603 -47625371 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 6 1011 249 314 0 0 chr15 55869906 55869957 -47625017 + MLT1F1 LTR MaLR 390 440 -120 6 1011 324 331 80 29 chr15 55870319 55870456 -47624518 - MLT1G1 LTR MaLR -23 556 413 6 1011 712 361 89 28 chr15 55870809 55871268 -47623706 + MLT1G1 LTR MaLR 81 567 -12 6 1011 444 284 19 51 chr15 55883593 55883749 -47611225 - RMER15 LTR ERVL -3 572 422 6 1011 1381 245 75 83 chr15 55886138 55886695 -47608279 + RLTR31_Mur LTR ERVK 1 553 0 6 1011 1500 249 50 21 chr15 55887215 55887597 -47607377 + MTD LTR MaLR 4 396 -23 6 1011 228 269 19 0 chr15 55889112 55889164 -47605810 - ORR1E LTR MaLR -262 97 45 6 1011 2303 100 9 0 chr15 55889996 55890316 -47604658 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 6 1011 424 273 101 16 chr15 55890329 55890624 -47604350 - MTE2b LTR MaLR -7 372 8 6 1011 373 347 82 38 chr15 55898891 55899183 -47595791 - MTEa LTR MaLR -35 344 4 6 1011 1448 236 86 13 chr15 55900405 55900779 -47594195 - MTD LTR MaLR -14 405 5 6 1011 1717 228 144 43 chr15 55904184 55904902 -47590072 - RMER6C LTR ERVK 0 720 81 6 1011 310 149 0 0 chr15 55905687 55905734 -47589240 - RMER6C LTR ERVK -673 47 1 6 1011 300 336 18 0 chr15 55908344 55908454 -47586520 - MLT1N2 LTR MaLR -17 545 434 6 1011 329 255 147 7 chr15 55912744 55912894 -47582080 + MTEa LTR MaLR 19 189 -190 6 1011 1239 218 108 71 chr15 55912900 55913418 -47581556 - MT2B LTR ERVL -3 598 1 6 1011 584 269 80 0 chr15 55913419 55913594 -47581380 + MTEa LTR MaLR 191 379 0 6 1011 2243 176 39 5 chr15 55917477 55917883 -47577091 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 6 1011 351 329 89 0 chr15 55921011 55921157 -47573817 - MLT1A LTR MaLR -215 159 1 7 1011 308 330 37 37 chr15 55922254 55922361 -47572613 + MLT1I LTR MaLR 133 239 -172 7 1011 741 238 52 43 chr15 55923101 55923324 -47571650 - RMER17C LTR ERVK 0 410 186 7 1011 644 292 49 95 chr15 55928013 55928268 -47566706 + MTE2a LTR MaLR 10 264 -115 7 1011 1990 144 16 65 chr15 55928268 55928654 -47566320 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1011 644 256 36 104 chr15 55928654 55928778 -47566196 + MTE2a LTR MaLR 265 379 0 7 1011 4526 178 26 32 chr15 55930144 55931053 -47563921 - RMER13B LTR ERVK 0 908 5 7 1011 266 374 111 75 chr15 55931501 55932033 -47562941 + MLT1K LTR MaLR 45 595 0 7 1011 746 327 149 32 chr15 55938301 55938671 -47556303 - MLT2B2 LTR ERVL -54 466 54 7 1011 1109 243 62 61 chr15 55948466 55948828 -47546146 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 19 7 1011 970 143 12 6 chr15 55949126 55949288 -47545686 + RMER17C LTR ERVK 248 410 0 7 1012 515 308 34 108 chr15 55973151 55973420 -47521554 - MTEa LTR MaLR -106 273 25 7 1012 701 296 76 31 chr15 55973428 55973738 -47521236 - MTEa-int LTR MaLR -3 1577 1254 7 1012 1770 188 79 3 chr15 55975773 55976114 -47518860 - ORR1B1 LTR MaLR -27 367 1 7 1012 2271 183 14 5 chr15 55983620 55984037 -47510937 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1012 448 344 56 6 chr15 55989244 55989405 -47505569 + MLT1E3 LTR MaLR 377 545 -79 7 1012 1835 218 22 19 chr15 55994058 55994469 -47500505 + MTD LTR MaLR 3 414 -5 7 1012 381 234 258 31 chr15 55995183 55995342 -47499632 - MT2A LTR ERVL -12 521 327 7 1012 436 366 63 42 chr15 55996022 55996356 -47498618 - LTR16E2 LTR ERVL -21 547 207 7 1012 305 389 64 43 chr15 55996827 55997109 -47497865 - MLT1A0 LTR MaLR -66 299 12 7 1012 413 359 132 36 chr15 55999275 55999555 -47495419 + MER21B LTR ERV1 404 710 -153 8 1012 2068 123 41 41 chr15 56007357 56007722 -47487252 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 365 -2 8 1012 53969 19 7 10 chr15 56007722 56014216 -47480758 + IAPEz-int LTR ERVK 6 6481 0 8 1012 2068 123 41 41 chr15 56014216 56014581 -47480393 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 365 -2 8 1012 1764 189 88 16 chr15 56019270 56019440 -47475534 - MTB_Mm LTR MaLR -3 404 225 1 1012 1764 189 88 16 chr15 56019466 56019671 -47475303 - MTB_Mm LTR MaLR -183 224 3 1 1012 427 284 58 39 chr15 56021442 56021596 -47473378 + MTD LTR MaLR 10 166 -253 2 1012 775 305 88 56 chr15 56021530 56021740 -47473234 + MT2A LTR ERVL 72 291 -242 2 1012 775 305 88 56 chr15 56021888 56022052 -47472922 + MT2A LTR ERVL 292 458 -75 2 1012 263 403 35 7 chr15 56027402 56027547 -47467427 + MTEb LTR MaLR 1 149 -230 2 1012 453 374 25 10 chr15 56027651 56027848 -47467126 + MT2A LTR ERVL 231 430 -103 3 1012 255 214 129 0 chr15 56031866 56031936 -47463038 - ORR1E LTR MaLR -23 356 278 4 1012 273 305 72 72 chr15 56031965 56032117 -47462857 - ORR1E LTR MaLR -110 249 98 4 1012 458 346 153 38 chr15 56052159 56052531 -47442443 + MLT1D LTR MaLR 19 433 -72 5 1012 1725 140 52 34 chr15 56058840 56059224 -47435750 + RLTR12A LTR ERVK 1 406 -122 6 1012 234 289 61 9 chr15 56061597 56061623 -47433351 + RLTR12A LTR ERVK 390 416 -112 6 1012 682 153 15 15 chr15 56062603 56062738 -47432236 + RLTR12A LTR ERVK 417 568 0 6 1012 272 272 524 47 chr15 56063255 56063423 -47431551 + MLT1A0 LTR MaLR 119 366 -42 7 1012 1578 261 27 19 chr15 56063540 56063950 -47431024 - MTC LTR MaLR -8 413 1 7 1012 404 355 85 15 chr15 56067502 56067762 -47427212 - MER31A LTR ERV1 -14 471 194 7 1012 2392 149 44 10 chr15 56071971 56072378 -47422596 + MTC LTR MaLR 1 421 0 9 1012 806 166 23 2 chr15 56074137 56074290 -47420684 + ORR1A2 LTR MaLR 1 171 -175 9 1012 346 323 78 18 chr15 56092497 56092664 -47402310 + MLT1G3 LTR MaLR 288 464 -131 1 1012 1607 211 175 80 chr15 56096464 56096938 -47398036 - MT2A LTR ERVL 0 533 15 1 1013 1159 290 34 21 chr15 56101079 56101407 -47393567 + MTEb LTR MaLR 27 358 -21 1 1013 426 379 91 4 chr15 56101600 56101841 -47393133 - MLT1G LTR MaLR -318 273 12 1 1013 293 235 69 23 chr15 56111227 56111314 -47383660 - MTEa LTR MaLR -19 360 270 1 1013 4043 183 65 15 chr15 56114391 56115250 -47379724 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 1013 623 352 104 43 chr15 56115438 56115833 -47379141 - RMER15 LTR ERVL -156 419 1 1 1013 587 358 98 23 chr15 56119013 56119442 -47375532 + MLT1J-int LTR MaLR 130 590 -797 1 1013 3406 20 8 0 chr15 56120659 56121052 -47373922 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1013 9089 33 6 1 chr15 56121052 56122143 -47372831 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 3 1 1013 4302 24 0 2 chr15 56122147 56122641 -47372333 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1013 2731 92 36 72 chr15 56123954 56124400 -47370574 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 1 1013 399 268 55 48 chr15 56129935 56130100 -47364874 + RLTR23 LTR ERV1 265 430 0 1 1013 1219 187 106 100 chr15 56143567 56143631 -47351343 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 324 1 1013 1219 187 106 100 chr15 56143991 56144247 -47350727 - ORR1C1 LTR MaLR -55 323 56 1 1013 756 52 10 0 chr15 56150445 56150541 -47344433 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 97 -323 1 1013 1571 251 67 3 chr15 56151260 56151647 -47343327 - MTD LTR MaLR -5 414 3 1 1013 907 278 62 16 chr15 56152142 56152398 -47342576 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 241 1 1013 698 298 91 9 chr15 56153464 56153694 -47341280 - RLTR18B LTR ERVK -263 249 1 1 1013 3478 30 0 0 chr15 56153958 56154354 -47340620 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1013 413 296 123 15 chr15 56155543 56155839 -47339135 + MLT1D LTR MaLR 1 414 -91 2 1013 247 318 51 43 chr15 56170731 56170869 -47324105 + MLT1A0 LTR MaLR 31 169 -196 2 1013 271 237 13 13 chr15 56178383 56178460 -47316514 + MLT1A1 LTR MaLR 300 376 -32 2 1013 1439 162 34 47 chr15 56183042 56183340 -47311634 - RLTR11A LTR ERVK -3 525 232 2 1013 292 308 132 0 chr15 56184953 56185044 -47309930 - MLT1D LTR MaLR -381 124 22 2 1013 247 343 44 104 chr15 56187128 56187497 -47307477 + MT2A LTR ERVL 134 477 -56 2 1013 247 343 44 104 chr15 56187649 56187691 -47307283 + MT2A LTR ERVL 478 520 -13 2 1013 2811 122 13 6 chr15 56190714 56191284 -47303690 + RMER17B LTR ERVK 1 756 -202 2 1013 3060 228 31 84 chr15 56192222 56193118 -47301856 + RMER17B LTR ERVK 1 849 -109 2 1013 396 248 45 96 chr15 56200341 56200519 -47294455 - RMER10A LTR ERVL -13 429 261 2 1013 1004 218 42 62 chr15 56200540 56200799 -47294175 - ORR1C1 LTR MaLR -122 256 3 2 1013 953 299 89 3 chr15 56215105 56215407 -47279567 - MTE2b LTR MaLR 0 379 52 2 1013 292 326 0 21 chr15 56215407 56215501 -47279473 - MTE2b LTR MaLR -287 92 1 2 1013 2275 64 227 0 chr15 56219133 56219477 -47275497 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 2 1013 1514 183 98 80 chr15 56221036 56221422 -47273552 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 2 1014 710 300 137 31 chr15 56239304 56239655 -47255319 - MTD LTR MaLR -14 405 18 3 1014 299 250 25 0 chr15 56240212 56240291 -47254683 - RMER19C LTR ERVK 0 611 531 3 1014 1106 240 24 38 chr15 56240291 56240641 -47254333 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 89 3 1014 1428 260 51 33 chr15 56240635 56241025 -47253949 - RMER19C LTR ERVK -76 535 139 3 1014 3088 107 9 0 chr15 56241369 56241798 -47253176 + RLTR10C LTR ERVK 1 433 -3 3 1014 325 370 65 43 chr15 56243228 56243505 -47251469 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 83 3 1014 385 384 89 48 chr15 56250488 56250781 -47244193 + LTR33B LTR ERVL 60 364 -139 3 1014 846 277 99 82 chr15 56255573 56255927 -47239047 + MTEb LTR MaLR 20 379 0 3 1014 288 375 142 51 chr15 56256132 56256385 -47238589 - LTR16B1 LTR ERVL -197 283 8 3 1014 439 284 17 25 chr15 56263884 56264003 -47230971 + MTE2b LTR MaLR 262 379 0 3 1014 967 285 88 40 chr15 56271227 56271578 -47223396 + MTE2a LTR MaLR 11 378 -1 3 1014 428 325 19 62 chr15 56277220 56277479 -47217495 - RLTR12B LTR ERVK -12 516 269 3 1014 582 300 15 70 chr15 56277591 56277891 -47217083 - RLTR11A2 LTR ERVK -163 278 9 3 1014 387 259 51 106 chr15 56278082 56278319 -47216655 - RMER10A LTR ERVL 0 442 219 3 1014 274 216 119 131 chr15 56278325 56278485 -47216489 - RMER10A LTR ERVL 0 442 285 3 1014 558 188 132 33 chr15 56278474 56278595 -47216379 - RMER10A LTR ERVL -309 133 1 3 1014 253 197 0 116 chr15 56279105 56279174 -47215800 + RMER10A LTR ERVL 78 138 -304 3 1014 549 248 11 1 chr15 56281207 56281328 -47213646 + MT2A LTR ERVL 351 521 -63 3 1014 358 385 92 5 chr15 56282741 56282937 -47212037 + MLT1E2 LTR MaLR 296 508 -116 3 1014 891 251 26 26 chr15 56285538 56285767 -47209207 + MTD LTR MaLR 1 229 -190 3 1014 2242 101 125 5 chr15 56290456 56290823 -47204151 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 1014 993 132 25 81 chr15 56290824 56291022 -47203952 + IAPEz-int LTR ERVK 9 195 -6286 3 1014 252 302 0 0 chr15 56291022 56291075 -47203899 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 3 1014 3437 64 25 22 chr15 56291078 56291722 -47203252 + IAPEz-int LTR ERVK 94 662 -5819 3 1014 2619 79 0 3 chr15 56291722 56292065 -47202909 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1700 -4781 3 1014 6768 46 4 11 chr15 56292058 56292893 -47202081 + IAPEz-int LTR ERVK 5651 6479 -2 3 1014 2414 100 78 5 chr15 56292895 56293278 -47201696 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 1014 238 326 109 0 chr15 56299433 56299525 -47195449 - MLT1B LTR MaLR -69 321 220 3 1014 293 303 118 62 chr15 56307536 56307747 -47187227 + RMER4A LTR ERVK 8 230 -236 4 1014 721 105 41 14 chr15 56312441 56312586 -47182388 - RMER17B LTR ERVK -498 460 312 4 1014 3114 63 12 2 chr15 56318310 56318727 -47176247 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1014 1751 77 50 84 chr15 56320867 56321165 -47173809 + ORR1A3 LTR MaLR 5 292 -34 4 1014 311 311 45 119 chr15 56325560 56325761 -47169213 - MLT2B4 LTR ERVL -357 199 14 4 1014 330 374 65 0 chr15 56334323 56334462 -47160512 - MTEb LTR MaLR -75 304 157 4 1014 496 259 0 0 chr15 56334476 56334584 -47160390 - MTEb LTR MaLR -269 110 3 4 1014 258 377 138 73 chr15 56338699 56338879 -47156095 + MLT1J2 LTR MaLR 83 264 -184 4 1014 258 377 138 73 chr15 56339287 56339447 -47155527 + MLT1J2 LTR MaLR 265 445 -3 4 1014 334 119 0 38 chr15 56342706 56342787 -47152187 + MT2B2 LTR ERVL 456 584 0 4 1014 1078 313 158 38 chr15 56342904 56343481 -47151493 + ORR1E-int LTR MaLR 879 1527 -53 4 1014 414 290 127 38 chr15 56343481 56343817 -47151157 + ORR1E LTR MaLR 3 379 0 4 1014 1000 277 99 109 chr15 56344790 56345014 -47149960 + MT2B LTR ERVL 1 193 -408 4 1014 1000 277 99 109 chr15 56345391 56345773 -47149201 + MT2B LTR ERVL 194 601 0 4 1014 1307 219 130 59 chr15 56350280 56350414 -47144560 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 238 4 1014 1307 219 130 59 chr15 56350764 56350984 -47143990 - RLTR14 LTR ERV1 -145 237 3 4 126 1315 180 31 31 chr15 56360824 56361116 -47133858 - RLTR11A2 LTR ERVK -228 299 8 4 1015 292 310 109 25 chr15 56385532 56385651 -47109323 - MLT1H LTR MaLR -259 290 162 5 1015 1743 203 36 86 chr15 56391051 56391471 -47103503 - RMER4A LTR ERVK -38 428 30 5 1015 1666 184 12 15 chr15 56399459 56399785 -47095189 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 1 5 1015 3056 204 92 97 chr15 56399785 56401377 -47093597 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1509 1 5 1015 2101 134 3 15 chr15 56401377 56401710 -47093264 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 5 1015 289 333 83 6 chr15 56428130 56428287 -47066687 - MLT1D LTR MaLR -136 369 201 5 1015 2344 69 119 11 chr15 56428733 56429085 -47065889 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 5 1015 774 195 119 42 chr15 56432954 56433319 -47061655 - RMER17B LTR ERVK -519 439 19 5 1015 252 319 114 9 chr15 56436387 56436501 -47058473 + MTEb LTR MaLR 254 379 0 5 1015 887 271 65 75 chr15 56467275 56467785 -47027189 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 6 1015 241 284 74 0 chr15 56469686 56469767 -47025207 - MLT1J1 LTR MaLR -357 87 1 6 1015 4500 157 24 73 chr15 56474152 56475100 -47019874 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 6 1015 2386 154 57 48 chr15 56478650 56479092 -47015882 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 6 1015 299 351 0 35 chr15 56481174 56481289 -47013685 - MLT1C LTR MaLR -37 430 320 6 1015 853 220 91 161 chr15 56485037 56485465 -47009509 - RMER4A LTR ERVK -15 451 54 6 1016 235 314 125 17 chr15 56493142 56493262 -47001712 - LTR81B LTR ERV1? -726 667 535 6 1016 828 329 95 10 chr15 56495729 56496024 -46998950 + MTEb LTR MaLR 12 331 -48 6 1016 353 207 67 22 chr15 56501910 56501999 -46992975 + MLT1A1 LTR MaLR 304 396 -12 2 1016 565 308 95 86 chr15 56502126 56502464 -46992510 + ORR1E LTR MaLR 2 342 -17 3 1016 3344 35 2 2 chr15 56518829 56519224 -46975750 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 3 1016 712 285 55 26 chr15 56535902 56536136 -46958838 + ORR1E LTR MaLR 1 229 -155 5 1016 937 263 13 161 chr15 56539623 56540089 -46954885 - RLTR11B LTR ERVK -41 412 16 6 1016 669 286 61 50 chr15 56546844 56547105 -46947869 + MTE2a LTR MaLR 73 336 -43 7 1016 330 247 0 0 chr15 56550086 56550167 -46944807 - MER57A-int LTR ERV1 -290 5897 5817 8 1016 354 346 71 124 chr15 56553749 56554128 -46940846 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 8 1016 2883 80 5 36 chr15 56556449 56556862 -46938112 - MTB LTR MaLR 0 400 1 9 1016 529 223 37 49 chr15 56558444 56558621 -46936353 - MTC LTR MaLR 0 421 183 1 1016 859 217 70 11 chr15 56558605 56558791 -46936183 + MTC LTR MaLR 225 421 0 1 1016 606 345 88 52 chr15 56559020 56559384 -46935590 - MLT2D LTR ERVL -17 397 21 1 1016 232 221 55 136 chr15 56569948 56570058 -46924916 - RLTR25B LTR ERVK -186 842 742 1 1016 309 266 49 111 chr15 56572632 56572675 -46922299 - MT2B LTR ERVL -444 157 124 1 1016 1530 196 158 27 chr15 56585102 56585469 -46909505 - MTD LTR MaLR 0 419 5 1 1016 353 281 10 40 chr15 56589255 56589355 -46905619 - MTEa LTR MaLR -42 337 241 1 1016 1686 172 6 68 chr15 56589585 56589909 -46905065 + ORR1A4 LTR MaLR 1 304 -25 1 1016 620 311 39 61 chr15 56590896 56591208 -46903766 - MTEb LTR MaLR -74 305 1 1 1016 2414 301 114 42 chr15 56591210 56591450 -46903524 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 1360 1 1016 2414 312 200 32 chr15 56591632 56592761 -46902213 - MTEb-int LTR MaLR -221 1359 2 1 1016 511 240 8 16 chr15 56592762 56592885 -46902089 - MTEb LTR MaLR 0 379 258 1 1016 359 315 118 56 chr15 56592899 56593094 -46901880 - MTEb LTR MaLR -160 219 13 1 1016 1965 159 38 50 chr15 56593743 56594250 -46900724 - RLTR31_Mm LTR ERVK -144 440 1 1 1016 1366 205 104 42 chr15 56594434 56594790 -46900184 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1016 1232 277 100 48 chr15 56598427 56598927 -46896047 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 1 1 1016 257 324 14 0 chr15 56599288 56599359 -46895615 + MTD LTR MaLR 263 334 -85 1 1016 1157 222 53 170 chr15 56604660 56605261 -46889713 + RMER16 LTR ERVK 3 533 0 1 1016 535 243 13 46 chr15 56609359 56609510 -46885464 + MTE2b LTR MaLR 234 379 0 1 1016 396 342 41 5 chr15 56621535 56621729 -46873245 + MLT1C LTR MaLR 267 467 0 2 1016 277 204 46 29 chr15 56622080 56622185 -46872789 - MTE2a LTR MaLR 0 379 258 2 1017 2307 97 83 118 chr15 56634484 56634976 -46859998 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1017 6149 34 3 26 chr15 56634976 56635740 -46859234 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5736 2 1017 2253 58 0 0 chr15 56635739 56636017 -46858957 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 2 1017 3439 70 20 31 chr15 56636017 56636756 -46858218 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 9 2 1017 2459 106 112 23 chr15 56636757 56637193 -46857781 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1017 712 277 149 54 chr15 56637255 56637591 -46857383 + ORR1D2 LTR MaLR 2 369 -1 2 1017 277 264 33 33 chr15 56640507 56640597 -46854377 + MTEa LTR MaLR 290 379 0 2 1017 400 289 269 32 chr15 56641542 56641653 -46853321 - MLT2B4 LTR ERVL -4 552 403 2 1017 1599 124 24 65 chr15 56641653 56641989 -46852985 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1017 400 289 269 32 chr15 56641989 56642249 -46852725 - MLT2B4 LTR ERVL -154 402 94 2 1017 1013 230 273 12 chr15 56642209 56642535 -46852439 + MTD LTR MaLR 9 419 0 2 1017 261 347 73 0 chr15 56642535 56642659 -46852315 - MLT2B4 LTR ERVL -408 148 16 2 1017 735 272 253 33 chr15 56655394 56655694 -46839280 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 2 1017 273 400 104 42 chr15 56656179 56656584 -46838390 - LTR16A1 LTR ERVL -4 452 23 2 1017 1974 114 18 61 chr15 56656734 56657062 -46837912 + ORR1A3 LTR MaLR 13 326 0 2 1017 1101 301 21 75 chr15 56658162 56658536 -46836438 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 2 1017 6339 198 58 74 chr15 56662041 56662168 -46832806 - RMER3D-int LTR ERVK -426 2416 2298 2 1017 6339 202 59 70 chr15 56662379 56664361 -46830613 - RMER3D-int LTR ERVK -545 2297 1 2 1017 3433 195 16 5 chr15 56664395 56665009 -46829965 - RLTR17 LTR ERVK -71 621 1 2 1017 2069 189 32 10 chr15 56669401 56669813 -46825161 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1017 1971 236 29 14 chr15 56680863 56681348 -46813626 + RLTR16 LTR ERVK 2 493 -12 3 1017 477 359 84 48 chr15 56682590 56683006 -46811968 + MLT1E2 LTR MaLR 18 448 -179 3 1017 1044 296 57 126 chr15 56693370 56694019 -46800955 - RLTR18 LTR ERVK -10 606 3 3 1017 939 273 86 100 chr15 56694530 56694982 -46799992 - RLTR18B LTR ERVK -52 460 15 3 1017 2398 52 3 26 chr15 56705366 56705705 -46789269 + RLTR10 LTR ERVK 1 331 -59 3 1017 961 107 19 12 chr15 56705743 56705904 -46789070 + RLTR10 LTR ERVK 227 388 -2 3 1017 7803 40 7 5 chr15 56705904 56706908 -46788066 + RLTR10-int LTR ERVK 6 988 -999 3 1017 8249 22 7 0 chr15 56706986 56707974 -46787000 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1984 -3 3 1017 2398 52 3 26 chr15 56707976 56708315 -46786659 + RLTR10 LTR ERVK 1 331 -59 3 1017 961 107 19 12 chr15 56708353 56708514 -46786460 + RLTR10 LTR ERVK 227 388 -2 3 1017 227 271 139 85 chr15 56714415 56714580 -46780394 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 367 3 1017 328 355 59 98 chr15 56715110 56715313 -46779661 - MLT1A0 LTR MaLR -101 264 70 3 1017 742 250 25 12 chr15 56726789 56726951 -46768023 - MTC LTR MaLR -62 359 196 3 1017 777 213 136 5 chr15 56727346 56727361 -46767613 - MTC LTR MaLR -213 208 194 3 1017 777 213 136 5 chr15 56727998 56728166 -46766808 - MTC LTR MaLR -228 193 1 3 1017 281 342 84 80 chr15 56753901 56753922 -46741052 + MTEb LTR MaLR 68 83 -276 3 127 408 326 63 54 chr15 56753968 56754232 -46740742 + MTEb LTR MaLR 84 372 -7 3 1018 1295 285 25 0 chr15 56759287 56759652 -46735322 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1018 466 343 117 16 chr15 56784406 56784655 -46710319 - MTEa LTR MaLR -31 348 75 4 1018 3000 123 87 10 chr15 56786464 56787045 -46707929 - RMER17A2 LTR ERVK -190 716 1 4 1018 1060 286 81 42 chr15 56791165 56791523 -46703451 - MTE2b LTR MaLR -7 372 1 4 1018 284 320 164 57 chr15 56807985 56808082 -46686892 - MLT1E3 LTR MaLR 0 624 508 4 1018 284 320 164 57 chr15 56808126 56808187 -46686787 - MLT1E3 LTR MaLR -117 507 449 4 1018 305 377 45 45 chr15 56835256 56835456 -46659518 - MLT1C LTR MaLR -158 309 110 4 1018 228 304 43 0 chr15 56835462 56835531 -46659443 + MLT1B LTR MaLR 319 390 0 4 1018 4829 94 81 143 chr15 56836252 56837243 -46657731 + RLTR13B3 LTR ERVK 1 929 0 4 1018 3069 88 0 12 chr15 56838805 56839231 -46655743 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 4 1018 2297 141 12 29 chr15 56839261 56839677 -46655297 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 4 1018 286 236 55 14 chr15 56845132 56845205 -46649769 + ORR1E LTR MaLR 1 76 -283 4 1018 271 291 25 12 chr15 56845259 56845339 -46649635 + MTE2a LTR MaLR 18 98 -281 4 1018 660 277 110 84 chr15 56845341 56845443 -46649531 + MTE2a LTR MaLR 60 161 -218 4 1018 3258 207 115 43 chr15 56845443 56846286 -46648688 + RMER13B LTR ERVK 5 908 0 4 1018 660 277 110 84 chr15 56846286 56846482 -46648492 + MTE2a LTR MaLR 162 366 -13 4 1018 652 259 111 25 chr15 56847940 56848138 -46646836 + MTD LTR MaLR 141 355 -64 4 1018 390 335 109 6 chr15 56848475 56848658 -46646316 + MLT1E LTR MaLR 70 271 -382 4 1018 1167 228 239 11 chr15 56850266 56850639 -46644335 + RMER20B LTR ERVK 1 458 -169 4 1018 829 311 64 14 chr15 56857619 56857978 -46636996 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 5 1018 393 335 114 41 chr15 56859451 56859722 -46635252 - ORR1E LTR MaLR -63 296 6 5 1018 827 306 143 22 chr15 56861842 56862156 -46632818 - MTE2b LTR MaLR -17 362 11 5 1018 4154 185 92 89 chr15 56870392 56871417 -46623557 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 5 1018 962 207 52 42 chr15 56873439 56873881 -46621093 + RMER10B LTR ERVL 6 398 0 5 1018 636 207 75 31 chr15 56874071 56874282 -46620692 - RMER13B LTR ERVK -378 264 5 5 1018 303 348 126 119 chr15 56875042 56875319 -46619655 - MLT1E1 LTR MaLR -35 619 341 5 1018 1671 204 31 12 chr15 56879271 56879586 -46615388 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 74 5 1018 1517 193 43 31 chr15 56879586 56879912 -46615062 + RMER4A LTR ERVK 3 332 -134 5 1018 1293 171 38 30 chr15 56880262 56880527 -46614447 + RMER4A LTR ERVK 319 585 0 5 1018 456 119 0 0 chr15 56880527 56880594 -46614380 - ORR1B1 LTR MaLR -327 67 1 5 127 409 417 56 33 chr15 56884986 56885323 -46609651 - LTR16D1 LTR ERVL -167 508 164 5 1019 366 394 47 35 chr15 56890299 56890557 -46604417 - LTR16A LTR ERVL -17 434 174 5 1019 773 312 38 57 chr15 56896318 56896701 -46598273 + MTE2a LTR MaLR 18 404 -15 5 1019 236 357 78 36 chr15 56897212 56897404 -46597570 - MLT1G LTR MaLR -315 276 77 5 1019 319 273 89 18 chr15 56897466 56897578 -46597396 - MLT1A0 LTR MaLR -227 138 19 5 1019 357 119 29 29 chr15 56899225 56899294 -46595680 - RLTR25B LTR ERVK -200 828 760 5 1019 1155 179 10 20 chr15 56899400 56899599 -46595375 + RLTR25B LTR ERVK 832 1028 0 5 1019 2015 173 62 43 chr15 56900188 56900733 -46594241 - RLTR25A LTR ERVK -2 1101 72 5 1019 2125 108 59 87 chr15 56917342 56917746 -46577228 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 5 1019 281 335 90 69 chr15 56917839 56918028 -46576946 - RMER15 LTR ERVL -12 563 371 5 1019 607 316 70 101 chr15 56923817 56924204 -46570770 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 5 1019 298 350 36 21 chr15 56925554 56925694 -46569280 - MLT1A0 LTR MaLR -214 151 10 5 1019 2831 160 118 122 chr15 56930989 56931393 -46563581 + RMER6D LTR ERVK 1 334 -386 6 1019 2831 160 118 122 chr15 56931453 56931767 -46563207 + RMER6D LTR ERVK 335 715 -5 6 1019 1419 249 47 18 chr15 56934768 56935169 -46559805 - MTD LTR MaLR -2 417 5 6 1019 822 258 48 37 chr15 56954192 56954572 -46540402 - BGLII_B LTR ERVK -9 432 6 6 1019 246 218 136 11 chr15 56955200 56955288 -46539686 + MTE2a LTR MaLR 273 371 -8 6 1019 1577 226 31 11 chr15 56959562 56959920 -46535054 + MT2A LTR ERVL 169 533 0 6 1019 316 372 92 11 chr15 56976455 56976629 -46518345 - LTR16A LTR ERVL -19 432 245 6 1019 450 335 13 30 chr15 57000003 57000034 -46494940 - MT2A LTR ERVL -24 509 478 1 1019 450 335 13 30 chr15 57000074 57000276 -46494698 - MT2A LTR ERVL -56 477 280 1 1019 334 338 59 15 chr15 57000381 57000516 -46494458 - MTEa LTR MaLR -238 141 1 3 1019 240 349 73 22 chr15 57000901 57001080 -46493894 + MLT2C1 LTR ERVL 22 209 -188 4 1019 1251 194 62 75 chr15 57005695 57006002 -46488972 + ORR1D1 LTR MaLR 1 303 -71 9 1019 717 302 88 25 chr15 57012580 57012945 -46482029 + MLT1A1 LTR MaLR 1 386 -22 2 127 769 249 139 27 chr15 57016246 57016577 -46478397 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 2 1020 1696 129 0 4 chr15 57017664 57017912 -46477062 + ORR1A2 LTR MaLR 1 247 -80 2 1020 1416 64 0 5 chr15 57017906 57018095 -46476879 + ORR1A2 LTR MaLR 213 400 0 2 1020 437 280 32 0 chr15 57018650 57018775 -46476199 + ORR1E LTR MaLR 10 138 -221 3 1020 909 287 37 85 chr15 57020545 57020922 -46474052 + MTE2a LTR MaLR 21 379 0 3 1020 812 311 21 63 chr15 57021895 57022180 -46472794 - MTEa LTR MaLR -101 278 6 3 1020 1601 251 22 89 chr15 57051847 57052028 -46442946 + RLTR18 LTR ERVK 15 191 -425 6 1020 1601 251 22 89 chr15 57052246 57052558 -46442416 + RLTR18 LTR ERVK 192 475 -141 6 1020 487 287 79 54 chr15 57056007 57056374 -46438600 - RMER20A LTR ERVK -22 605 229 7 1020 263 389 63 46 chr15 57061346 57061521 -46433453 - LTR41B LTR ERVL -97 661 484 8 1020 275 290 36 95 chr15 57062101 57062238 -46432736 - LTR41 LTR ERVL -549 219 91 8 1020 237 33 0 0 chr15 57070373 57070403 -46424571 + RLTR10 LTR ERVK 361 390 0 9 1020 895 261 76 38 chr15 57073216 57073596 -46421378 + MYSERV-int LTR ERVK 3913 4201 -4758 9 1020 2446 162 17 2 chr15 57078326 57078741 -46416233 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1020 1201 216 122 59 chr15 57079992 57080369 -46414605 + RMER13B LTR ERVK 474 876 -32 1 1020 1201 216 122 59 chr15 57080389 57080420 -46414554 + RMER13B LTR ERVK 877 907 -1 1 1020 1156 187 165 12 chr15 57086986 57087235 -46407739 - MTD LTR MaLR -132 287 1 1 1020 262 158 69 59 chr15 57087337 57087438 -46407536 - RLTR25B LTR ERVK -530 498 397 1 1020 4153 217 70 93 chr15 57091034 57091422 -46403552 + RMER12 LTR ERVK 1 386 -936 1 1020 4153 217 70 93 chr15 57091569 57092230 -46402744 + RMER12 LTR ERVK 387 1007 -315 1 1020 4153 217 70 93 chr15 57092288 57092489 -46402485 + RMER12 LTR ERVK 1008 1221 -101 1 1020 697 241 108 32 chr15 57093484 57093740 -46401234 + ORR1D1 LTR MaLR 12 317 -57 1 1020 367 206 9 21 chr15 57094134 57094243 -46400731 + ORR1D1 LTR MaLR 280 414 -5 1 1020 4043 113 70 20 chr15 57106208 57106937 -46388037 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 1 1020 256 361 36 45 chr15 57107674 57107897 -46387077 - MLT1C LTR MaLR -237 230 10 1 1020 379 280 32 8 chr15 57108161 57108287 -46386687 - LTR85a LTR Gypsy? -44 658 530 1 1020 335 244 112 65 chr15 57108461 57108693 -46386281 + LTR37A LTR ERV1 184 426 0 1 1020 226 315 85 46 chr15 57110166 57110319 -46384655 + RMER15 LTR ERVL 266 424 -151 1 1020 259 237 194 0 chr15 57117188 57117281 -46377693 - RMER15 LTR ERVL -43 532 422 1 1020 791 322 13 98 chr15 57118289 57118308 -46376666 + ORR1E LTR MaLR 1 17 -342 1 1020 1223 196 51 109 chr15 57118308 57118703 -46376271 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 1 1020 791 322 13 98 chr15 57118703 57119000 -46375974 + ORR1E LTR MaLR 18 290 -69 1 1020 388 399 45 5 chr15 57130112 57130336 -46364638 + LTR16A LTR ERVL 160 392 -59 1 1020 2051 158 14 89 chr15 57130462 57130887 -46364087 - RLTR9C LTR ERVK 0 393 1 1 1020 2592 112 17 19 chr15 57140760 57141170 -46353804 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 1020 729 276 61 42 chr15 57141171 57141550 -46353424 + ETnERV2-int LTR ERVK 2 387 -2927 1 1020 4667 133 76 34 chr15 57141560 57142086 -46352888 + ETnERV2-int LTR ERVK 1071 1624 -5782 1 1020 4667 133 76 34 chr15 57142126 57142574 -46352400 + ETnERV2-int LTR ERVK 1625 2085 -5321 1 1020 5089 132 50 13 chr15 57142598 57143579 -46351395 + ETnERV2-int LTR ERVK 1995 3448 -3958 1 1020 2668 119 29 5 chr15 57143823 57144269 -46350705 + ETnERV2-int LTR ERVK 3441 3897 -3509 1 1020 531 217 28 69 chr15 57144272 57144531 -46350443 + ETnERV2-int LTR ERVK 2696 2818 -2026 1 1020 1189 184 34 35 chr15 57144529 57145061 -46349913 + ETnERV2-int LTR ERVK 6238 6429 -977 1 1020 363 75 56 56 chr15 57145154 57145225 -46349749 + RLTR45-int LTR ERVK 6002 6072 -1172 1 1020 1473 164 0 4 chr15 57145238 57145495 -46349479 + ETnERV3-int LTR ERVK 5529 5784 -24 1 1020 1627 174 51 8 chr15 57145504 57145970 -46349004 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 539 -363 1 1020 494 66 0 50 chr15 57145970 57146050 -46348924 + ETnERV2-int LTR ERVK 7331 7406 0 1 1020 2803 95 20 17 chr15 57146050 57146458 -46348516 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 1 1021 720 53 16 103 chr15 57147684 57147810 -46347164 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -207 115 1 2 1021 328 230 192 31 chr15 57150399 57150529 -46344445 - MTEa LTR MaLR 0 379 229 2 1021 234 337 29 19 chr15 57157836 57157939 -46337035 - LTR16A1 LTR ERVL -8 448 345 2 1021 355 290 9 83 chr15 57164724 57164833 -46330141 - MTEa LTR MaLR -278 101 1 2 1021 350 296 120 40 chr15 57167092 57167342 -46327632 - RMER12 LTR ERVK -312 1010 741 2 1021 5914 125 33 19 chr15 57170264 57171209 -46323765 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 2 1021 363 308 7 52 chr15 57172700 57172854 -46322120 + RMER12 LTR ERVK 705 851 -471 2 1021 463 350 66 30 chr15 57175325 57175658 -46319316 + MLT1A LTR MaLR 1 345 -29 2 1021 2848 331 68 53 chr15 57175963 57177160 -46317814 + MTE-int LTR MaLR 359 1572 -8 2 1021 752 294 29 66 chr15 57177356 57177600 -46317374 + MTE2b LTR MaLR 70 304 -75 2 1021 256 349 72 114 chr15 57184807 57185114 -46309860 - ORR1E LTR MaLR 0 359 66 2 1021 1665 341 62 11 chr15 57185159 57185882 -46309092 - MTE-int LTR MaLR -43 1537 778 2 1021 897 331 73 52 chr15 57186196 57186623 -46308351 + MER67D LTR ERV1 1 436 -78 2 1021 6078 110 60 3 chr15 57189762 57190669 -46304305 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 2 1021 1702 253 72 34 chr15 57201879 57202353 -46292621 + RLTR18B LTR ERVK 13 504 -8 3 1021 3195 61 2 0 chr15 57206941 57207336 -46287638 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1021 637 312 98 35 chr15 57210511 57210797 -46284177 + RMER15 LTR ERVL 272 575 0 3 1021 282 317 30 38 chr15 57219889 57220070 -46274904 + ORR1C1 LTR MaLR 1 184 -175 3 1021 1224 282 46 35 chr15 57220355 57220726 -46274248 + MTEb LTR MaLR 2 376 -3 3 1021 2415 72 3 0 chr15 57220932 57221250 -46273724 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 1021 1239 274 26 10 chr15 57225558 57225867 -46269107 + ORR1D2 LTR MaLR 1 314 -56 3 1021 1165 182 50 12 chr15 57232292 57232522 -46262452 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 154 3 1021 1733 178 36 82 chr15 57236793 57237185 -46257789 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1021 1113 93 6 6 chr15 57243560 57243722 -46251252 - IAPLTR3 LTR ERVK 0 326 165 3 1021 3480 21 39 0 chr15 57243863 57244244 -46250730 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1021 1111 90 5 68 chr15 57258488 57258679 -46236295 - IAPLTR3 LTR ERVK -147 179 1 3 1021 290 304 71 24 chr15 57258685 57258851 -46236123 + ORR1D2 LTR MaLR 8 194 -190 3 1021 274 312 59 59 chr15 57269137 57269256 -46225718 + MER77 LTR ERVL 88 206 -401 3 1021 982 326 65 68 chr15 57269233 57269547 -46225427 + MER21B LTR ERV1 97 415 -448 3 1021 982 326 65 68 chr15 57269600 57269854 -46225120 + MER21B LTR ERV1 416 663 -200 3 1022 4337 142 31 27 chr15 57284089 57284540 -46210434 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 349 4 1022 4337 142 31 27 chr15 57284692 57285044 -46209930 - RMER17D2 LTR ERVK -461 348 4 4 1022 1116 188 19 158 chr15 57287719 57288035 -46206939 + RMER20B LTR ERVK 347 618 -9 4 1022 745 299 193 98 chr15 57289647 57290237 -46204737 + MLT1E LTR MaLR 1 646 -7 4 1022 295 325 79 79 chr15 57290850 57291014 -46203960 + MLT1B LTR MaLR 20 183 -207 4 1022 1573 272 101 98 chr15 57291024 57291385 -46203589 + RMER13A LTR ERVK 3 388 -472 4 1022 1573 272 101 98 chr15 57291439 57291921 -46203053 + RMER13A LTR ERVK 389 848 -12 4 1022 544 243 80 34 chr15 57291940 57292115 -46202859 + MLT1B LTR MaLR 204 386 -4 4 1022 421 318 44 74 chr15 57293476 57293843 -46201131 + ORR1E LTR MaLR 4 359 0 4 1022 263 300 51 45 chr15 57294782 57294904 -46200070 + MLT1H LTR MaLR 48 207 -342 4 1022 282 304 0 11 chr15 57302173 57302266 -46192708 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 317 4 1022 2136 81 218 23 chr15 57304479 57304668 -46190306 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 178 4 1022 2136 81 218 23 chr15 57304734 57304897 -46190077 - BGLII_Mus LTR ERVK -245 177 3 4 1022 244 309 199 26 chr15 57305466 57305622 -46189352 - LTR16C LTR ERVL -1 488 306 4 1022 518 310 52 6 chr15 57311114 57311286 -46183688 - MLT1B LTR MaLR -19 371 192 4 1022 374 217 146 65 chr15 57311471 57311594 -46183380 - MTEa LTR MaLR -240 139 7 4 1022 1641 319 64 47 chr15 57311676 57313003 -46181971 - MTEa-int LTR MaLR -154 1426 1 4 1022 692 299 99 99 chr15 57313013 57313355 -46181619 - MTEa LTR MaLR -13 366 25 4 1022 434 329 34 14 chr15 57313333 57313481 -46181493 - MLT1B LTR MaLR -223 151 1 4 1022 1217 266 19 58 chr15 57315893 57316272 -46178702 - ORR1E LTR MaLR 0 421 1 4 1022 1606 199 108 41 chr15 57324363 57324750 -46170224 - MTD LTR MaLR -6 413 1 4 1022 569 259 28 7 chr15 57325845 57325989 -46168985 + RMER15 LTR ERVL 410 556 -19 4 1022 892 215 89 34 chr15 57326474 57326710 -46168264 + MT2A LTR ERVL 1 249 -284 4 1022 324 261 128 161 chr15 57335045 57335287 -46159687 + MT2A LTR ERVL 1 234 -299 4 1022 734 308 57 17 chr15 57335325 57335622 -46159352 + MT2A LTR ERVL 225 533 0 4 1022 1011 269 45 38 chr15 57339805 57340118 -46154856 + MTEa LTR MaLR 65 379 0 5 1022 420 328 109 16 chr15 57353795 57353978 -46140996 - MLT1H1 LTR MaLR -33 522 323 5 1022 246 333 64 9 chr15 57354469 57354578 -46140396 - MLT1H1 LTR MaLR -304 245 131 5 1022 259 257 98 10 chr15 57361786 57361888 -46133086 + LTR48B LTR ERV1 118 228 -416 5 1022 373 299 41 78 chr15 57362797 57363015 -46131959 + ORR1E LTR MaLR 1 210 -149 5 1022 380 288 75 8 chr15 57363229 57363362 -46131612 + MLT1A LTR MaLR 205 346 -28 5 1022 289 221 13 13 chr15 57369562 57369640 -46125334 - MLT1I LTR MaLR -19 392 315 5 1022 485 298 154 20 chr15 57370016 57370263 -46124711 + MLT1A0 LTR MaLR 86 365 0 5 1022 364 320 24 1 chr15 57371977 57372117 -46122857 - MLT1A LTR MaLR -2 388 234 5 1022 242 295 12 25 chr15 57372094 57372174 -46122800 - MLT1A LTR MaLR -287 103 25 5 1022 331 136 86 54 chr15 57374901 57374987 -46119987 + MLT2D LTR ERVL 5 93 -321 5 1022 775 204 261 120 chr15 57374987 57375221 -46119753 + MT2A LTR ERVL 1 195 -338 5 1022 775 204 261 120 chr15 57375284 57375406 -46119568 + MT2A LTR ERVL 196 407 -126 5 1022 275 288 202 17 chr15 57376017 57376190 -46118784 + MLT2D LTR ERVL 210 414 0 5 1022 2406 124 2 23 chr15 57389877 57390274 -46104700 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 19 5 1022 344 325 9 0 chr15 57390717 57390831 -46104143 + MLT2B1 LTR ERVL 1 115 -405 5 1022 256 250 16 0 chr15 57390912 57390976 -46103998 - ORR1C1 LTR MaLR -313 65 1 5 1022 246 257 57 0 chr15 57391031 57391101 -46103873 - MLT2B5 LTR ERVL -388 213 140 5 1022 402 190 0 37 chr15 57391136 57391218 -46103756 + MTEa LTR MaLR 1 79 -300 5 1022 1717 224 60 48 chr15 57391235 57391729 -46103245 + RMER19C LTR ERVK 35 611 0 5 1022 772 253 34 75 chr15 57391729 57391968 -46103006 + MTEa LTR MaLR 74 302 -77 5 1022 343 272 225 0 chr15 57392012 57392185 -46102789 + MLT2B1 LTR ERVL 351 562 0 5 1022 321 330 62 36 chr15 57394136 57394328 -46100646 - MLT1A LTR MaLR -159 215 19 5 1022 1298 221 115 15 chr15 57402689 57403029 -46091945 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1022 1290 231 32 97 chr15 57403059 57403400 -46091574 + MTEa LTR MaLR 3 319 -60 5 1022 1290 231 32 97 chr15 57403859 57403920 -46091054 + MTEa LTR MaLR 320 379 0 5 1022 284 259 112 30 chr15 57407668 57407821 -46087153 + MLT1I LTR MaLR 287 448 0 5 1022 226 306 177 0 chr15 57409198 57409322 -46085652 + LTR16B LTR ERVL 293 438 -25 5 1023 393 63 5 2 chr15 57409548 57409610 -46085364 - ORR1A3-int LTR MaLR -1729 63 1 5 1023 364 103 0 33 chr15 57409610 57409661 -46085313 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 277 5 1023 2444 132 12 65 chr15 57411050 57411464 -46083510 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 6 1023 1326 170 134 0 chr15 57412010 57412286 -46082688 - ORR1A3 LTR MaLR -13 313 1 5 1023 289 316 25 0 chr15 57414389 57414503 -46080471 + MLT1E3 LTR MaLR 325 464 -216 6 1023 2125 108 6 21 chr15 57415855 57415967 -46079007 + ORR1A2 LTR MaLR 2 113 -214 6 1023 1400 196 51 42 chr15 57415967 57416323 -46078651 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 6 1023 2125 108 6 21 chr15 57416323 57416541 -46078433 + ORR1A2 LTR MaLR 114 327 0 6 1023 247 375 89 76 chr15 57417138 57417453 -46077521 - LTR16C LTR ERVL -72 417 99 6 1023 463 282 167 9 chr15 57419946 57420161 -46074813 + RMER15 LTR ERVL 327 575 0 6 1023 438 302 113 13 chr15 57422405 57422643 -46072331 - MLT1C LTR MaLR -3 464 203 6 1023 1390 287 34 58 chr15 57425844 57425927 -46069047 - MTE-int LTR MaLR -795 785 711 6 1023 1847 166 122 19 chr15 57425927 57426296 -46068678 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1023 1390 278 29 58 chr15 57426296 57426869 -46068105 - MTE-int LTR MaLR -870 710 75 6 1023 440 289 18 50 chr15 57426891 57427082 -46067892 - ORR1E LTR MaLR -200 184 6 6 1023 388 290 139 63 chr15 57435510 57435662 -46059312 - ORR1E LTR MaLR 0 359 193 6 1023 388 290 139 63 chr15 57435682 57435860 -46059114 - ORR1E LTR MaLR -167 192 5 6 1023 580 271 143 40 chr15 57435996 57436276 -46058698 - MTE2b LTR MaLR -9 370 58 6 1023 239 317 129 8 chr15 57438273 57438397 -46056577 + LTR78 LTR ERV1 386 524 -780 6 1023 1235 269 30 22 chr15 57445406 57445774 -46049200 - MTEa LTR MaLR -8 371 1 6 1023 1774 182 104 19 chr15 57445879 57446253 -46048721 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 2 6 1023 305 260 37 7 chr15 57454583 57454710 -46040264 + LTR37A LTR ERV1 315 461 -7 6 1023 456 291 14 3 chr15 57458120 57458250 -46036724 - MTEa LTR MaLR -14 405 262 6 1023 277 266 101 0 chr15 57458273 57458352 -46036622 - MTEa LTR MaLR -292 87 1 6 1023 367 360 78 12 chr15 57459684 57459837 -46035137 + MLT1E2 LTR MaLR 367 517 -110 6 1023 963 262 115 35 chr15 57459837 57460185 -46034789 + MTEa LTR MaLR 1 376 -3 6 1023 367 360 78 12 chr15 57460185 57460276 -46034698 + MLT1E2 LTR MaLR 518 626 -1 6 1023 1958 172 25 11 chr15 57472495 57472854 -46022120 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 2 6 1023 263 328 61 23 chr15 57473721 57473852 -46021122 + MLT1J LTR MaLR 44 179 -333 6 1023 341 341 52 105 chr15 57478003 57478403 -46016571 - MLT1D LTR MaLR -85 420 42 6 1023 474 290 76 19 chr15 57479944 57480155 -46014819 - MLT1C LTR MaLR -16 451 229 7 1023 564 295 62 65 chr15 57482991 57483281 -46011693 + ORR1E LTR MaLR 10 298 -61 7 1023 598 254 70 19 chr15 57487066 57487279 -46007695 - ORR1E LTR MaLR -117 242 19 7 1023 370 309 150 19 chr15 57495890 57496157 -45998817 + RMER15 LTR ERVL 274 575 0 7 1023 288 343 119 27 chr15 57501264 57501483 -45993491 + ORR1E LTR MaLR 1 239 -120 7 1023 227 270 135 106 chr15 57501504 57501645 -45993329 + ORR1E LTR MaLR 230 374 -5 7 1023 337 255 46 101 chr15 57508322 57508431 -45986543 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 2 1023 1810 128 31 22 chr15 57508596 57508915 -45986059 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1023 2246 158 85 57 chr15 57510526 57511022 -45983952 + RLTR28 LTR ERVL 1 510 -14 3 1023 1883 178 15 12 chr15 57511576 57511884 -45983090 + MTB_Mm LTR MaLR 1 313 -94 3 1023 3041 119 223 31 chr15 57511884 57512151 -45982823 - RMER6C LTR ERVK 0 690 418 3 1023 3041 119 223 31 chr15 57512190 57512501 -45982473 - RMER6C LTR ERVK -273 417 2 3 1023 1883 178 15 12 chr15 57512501 57512517 -45982457 + MTB_Mm LTR MaLR 314 326 -81 3 1023 778 273 35 26 chr15 57512518 57512744 -45982230 - MTD LTR MaLR -187 232 5 3 1023 412 312 94 40 chr15 57514741 57514965 -45980009 - MLT1D LTR MaLR -8 497 262 4 1023 596 277 48 26 chr15 57514984 57515173 -45979801 - MLT1D LTR MaLR -312 193 1 4 1023 397 309 81 77 chr15 57515489 57515710 -45979264 - MTEa LTR MaLR -157 222 1 4 1023 827 350 101 12 chr15 57515715 57516132 -45978842 - MLT1G LTR MaLR -76 515 62 4 1023 226 371 15 36 chr15 57516304 57516441 -45978533 - RMER15 LTR ERVL -14 561 428 4 1023 329 308 9 27 chr15 57516766 57516876 -45978098 - RMER15 LTR ERVL -169 406 299 4 1023 281 289 71 10 chr15 57517185 57517283 -45977691 - MLT1H2 LTR MaLR -10 479 376 5 1023 549 369 87 32 chr15 57517972 57518350 -45976624 + MLT1I LTR MaLR 13 411 0 5 1023 1235 214 188 9 chr15 57523877 57524222 -45970752 - MTD LTR MaLR 0 419 13 8 1023 977 290 18 73 chr15 57538617 57539015 -45955959 + MTE2a LTR MaLR 2 377 -2 1 1023 231 250 27 27 chr15 57539032 57539106 -45955868 - MLT1J1 LTR MaLR -9 435 362 1 1024 385 314 149 33 chr15 57545732 57545946 -45949028 - LTR16C LTR ERVL 0 489 251 1 1024 1261 240 41 27 chr15 57550348 57550716 -45944258 - MTEa LTR MaLR -2 377 5 1 1024 250 283 93 86 chr15 57550937 57551088 -45943886 - LTR79 LTR ERVL 0 527 376 1 1024 2146 95 6 57 chr15 57552976 57553312 -45941662 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1024 489 272 84 31 chr15 57555227 57555429 -45939545 - MLT1J1 LTR MaLR -156 292 64 1 1024 2238 148 72 8 chr15 57556394 57556782 -45938192 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1024 297 169 17 0 chr15 57557206 57557265 -45937709 + MTC LTR MaLR 242 301 -120 1 1024 779 278 39 46 chr15 57562872 57563155 -45931819 - MLT1A LTR MaLR -54 320 40 1 1024 310 371 0 0 chr15 57579816 57579913 -45915061 + RMER15 LTR ERVL 371 467 -108 1 1024 2382 135 8 33 chr15 57590885 57591277 -45903697 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 26 1 1024 231 233 0 99 chr15 57596652 57596733 -45898241 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 336 2 1024 968 251 93 65 chr15 57600322 57600689 -45894285 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 2 1024 1518 288 11 19 chr15 57602231 57602572 -45892402 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 28 2 1024 2978 77 40 15 chr15 57602572 57602969 -45892005 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1024 1518 288 11 19 chr15 57602969 57602995 -45891979 - ORR1D2 LTR MaLR -343 27 3 2 1024 2894 44 0 90 chr15 57603399 57603800 -45891174 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 2 1024 332 272 248 0 chr15 57605624 57605749 -45889225 - MTEa LTR MaLR -222 157 2 2 1024 247 225 87 130 chr15 57606237 57606375 -45888599 + MT2B LTR ERVL 107 238 -363 2 1024 368 152 0 17 chr15 57611009 57611069 -45883905 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 271 2 1024 687 43 0 0 chr15 57611052 57611145 -45883829 - ORR1A4 LTR MaLR -236 93 1 2 1024 10014 156 53 57 chr15 57611145 57613116 -45881858 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 2 2 1024 2137 132 3 15 chr15 57613117 57613448 -45881526 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 2 1024 1390 233 94 27 chr15 57614330 57614701 -45880273 + MTD LTR MaLR 9 404 -15 2 1024 1470 233 150 11 chr15 57616582 57616942 -45878032 - MTD LTR MaLR -9 410 1 2 1024 709 246 68 174 chr15 57618491 57618944 -45876030 - RMER10A LTR ERVL -20 422 18 2 1024 230 273 137 50 chr15 57619801 57619940 -45875034 + RMER21A LTR ERV1 750 900 -47 2 1024 426 295 135 53 chr15 57624341 57624660 -45870314 - ORR1E LTR MaLR 0 359 15 2 1024 575 236 79 78 chr15 57626563 57626803 -45868171 - RLTR11B LTR ERVK -35 493 249 2 1024 536 268 47 109 chr15 57626861 57627137 -45867837 - RLTR11B LTR ERVK -268 259 1 2 1024 580 286 106 127 chr15 57629050 57629466 -45865508 + MLT1A1 LTR MaLR 2 408 0 2 1024 397 304 108 81 chr15 57631768 57632065 -45862909 - LTR88c LTR Genie? -547 315 11 2 1024 433 320 71 46 chr15 57635941 57636180 -45858794 + ORR1E LTR MaLR 1 245 -114 2 1024 284 210 102 52 chr15 57636726 57636845 -45858129 + MLT1A LTR MaLR 56 187 -203 2 1024 266 234 187 42 chr15 57637039 57637227 -45857747 + MLT1A LTR MaLR 171 393 -15 2 1024 598 305 57 13 chr15 57640300 57640547 -45854427 - MLT1D LTR MaLR -365 262 3 2 1024 3143 20 0 0 chr15 57642288 57642634 -45852340 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1024 1067 247 111 12 chr15 57662060 57662384 -45832590 - ORR1E LTR MaLR -3 356 1 3 1024 1961 108 3 54 chr15 57662439 57662752 -45832222 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 23 3 1024 643 286 113 39 chr15 57663036 57663320 -45831654 - MLT1B LTR MaLR -13 377 73 3 1024 239 278 74 53 chr15 57663892 57663987 -45830987 + MTD LTR MaLR 178 274 -145 3 1024 655 169 24 66 chr15 57664005 57664187 -45830787 + MTD LTR MaLR 210 405 -14 3 1024 355 45 0 0 chr15 57665529 57665573 -45829401 - ORR1A1 LTR MaLR -55 291 248 3 1024 2500 66 3 0 chr15 57666127 57666444 -45828530 + ORR1A2 LTR MaLR 2 319 -8 3 1024 1628 178 79 50 chr15 57668172 57668204 -45826770 + RMER13A LTR ERVK 2 28 -832 3 1024 3600 13 2 0 chr15 57668204 57668599 -45826375 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1024 1628 217 226 34 chr15 57668599 57669143 -45825831 + RMER13A LTR ERVK 29 684 -176 3 1024 610 312 81 61 chr15 57669644 57669989 -45824985 - ORR1E LTR MaLR -1 358 7 3 15 296 321 16 118 chr15 57671578 57671705 -45823269 - MLT1J1 LTR MaLR -300 144 31 3 1025 402 161 0 0 chr15 57672720 57672782 -45822192 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 313 3 1025 2036 196 111 78 chr15 57678488 57679037 -45815937 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 3 1025 841 244 171 5 chr15 57682529 57682751 -45812223 - MTD LTR MaLR -160 259 1 3 1025 1108 240 173 7 chr15 57684068 57684374 -45810600 + ORR1E LTR MaLR 3 359 0 3 1025 1808 169 112 12 chr15 57687672 57688074 -45806900 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 3 1025 466 295 26 20 chr15 57688446 57688598 -45806376 + MTD LTR MaLR 45 197 -222 3 1025 354 263 144 0 chr15 57688614 57688732 -45806242 + MLT1N2 LTR MaLR 356 490 -72 3 1025 318 333 14 102 chr15 57692249 57692317 -45802657 + MLT1J2 LTR MaLR 280 342 -106 3 1025 318 333 14 102 chr15 57692354 57692432 -45802542 + MLT1J2 LTR MaLR 343 413 -35 3 1025 700 278 127 43 chr15 57693649 57694037 -45800937 - MLT1C LTR MaLR 0 467 42 3 1025 2868 158 54 6 chr15 57697634 57698136 -45796838 + RLTR12B LTR ERVK 3 528 0 3 1025 727 296 63 67 chr15 57698215 57698722 -45796252 - RLTR11B LTR ERVK -17 510 1 3 1025 311 259 11 76 chr15 57715849 57715941 -45779033 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 4 1025 347 318 102 56 chr15 57724748 57725121 -45769853 - LTR65 LTR ERV1 -37 632 243 4 1025 3062 101 5 0 chr15 57730202 57730607 -45764367 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1025 2403 92 82 26 chr15 57731566 57731955 -45763019 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1025 4249 87 13 32 chr15 57731956 57732792 -45762182 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 4 1025 2194 69 7 0 chr15 57732792 57733068 -45761906 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 4 1025 6282 39 4 12 chr15 57733067 57733817 -45761157 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 4 1025 2450 92 76 35 chr15 57733819 57734214 -45760760 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1025 1815 149 103 107 chr15 57735069 57735399 -45759575 - RLTR23 LTR ERV1 -2 428 101 4 1025 1815 149 103 107 chr15 57735439 57735537 -45759437 - RLTR23 LTR ERV1 -330 100 2 4 1025 601 313 115 42 chr15 57735829 57736116 -45758858 + MLT1H2 LTR MaLR 179 486 -3 4 1025 1983 156 42 27 chr15 57738647 57739049 -45755925 - RMER17C LTR ERVK -2 408 1 4 1025 1344 134 9 9 chr15 57744896 57745122 -45749852 + RMER6A LTR ERVK 519 744 -12 4 1025 2466 142 304 9 chr15 57756164 57756697 -45738277 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 5 1025 271 200 36 48 chr15 57761147 57761231 -45733743 + MLT1A1 LTR MaLR 314 396 -12 5 1025 1381 186 199 70 chr15 57779750 57780148 -45714826 - MT2A LTR ERVL 0 533 85 5 1025 481 317 110 59 chr15 57781535 57781790 -45713184 - MTEb LTR MaLR -11 368 101 5 1025 586 230 31 8 chr15 57781949 57782076 -45712898 + MTEa LTR MaLR 1 130 -249 5 1026 853 252 47 59 chr15 57803120 57803458 -45691516 - RLTR15 LTR ERVK -25 334 1 6 1026 304 295 187 0 chr15 57804172 57804338 -45690636 - LTR41B LTR ERVL 0 758 562 6 1026 338 308 17 0 chr15 57806776 57806896 -45688078 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1867 1988 -3773 6 1026 1146 221 163 6 chr15 57808203 57808535 -45686439 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1026 696 151 358 13 chr15 57809185 57809414 -45685560 + RMER15 LTR ERVL 33 340 -235 6 1026 786 152 0 48 chr15 57809404 57809549 -45685425 - ORR1B1 LTR MaLR -256 138 1 6 1026 365 150 83 0 chr15 57809549 57809609 -45685365 - MT2A LTR ERVL -468 65 1 6 1026 427 269 133 51 chr15 57809631 57809827 -45685147 + MLT1B LTR MaLR 135 346 -44 6 1026 339 307 0 10 chr15 57822648 57822750 -45672224 - ORR1E LTR MaLR -258 101 1 6 1026 760 350 81 21 chr15 57823133 57823568 -45671406 - MLT1K LTR MaLR -112 483 23 6 1026 855 304 87 0 chr15 57826376 57826711 -45668263 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 2 6 1026 603 264 47 13 chr15 57828497 57828648 -45666326 - MLT1A0 LTR MaLR -3 405 207 6 1026 1186 153 89 42 chr15 57830525 57830920 -45664054 - RMER10A LTR ERVL -1 441 2 6 1026 467 239 7 78 chr15 57831025 57831166 -45663808 - ORR1E LTR MaLR -8 371 241 6 1026 1386 245 49 0 chr15 57831232 57831559 -45663415 - MTE2b LTR MaLR -36 343 1 6 1026 585 306 28 41 chr15 57831559 57831755 -45663219 - ORR1E LTR MaLR -166 193 1 6 1026 477 260 15 59 chr15 57831755 57831890 -45663084 - MLT1A0 LTR MaLR -227 138 10 6 1026 479 316 34 41 chr15 57838128 57838365 -45656609 + ORR1E LTR MaLR 1 232 -138 6 1026 269 245 9 138 chr15 57840328 57840437 -45654537 - MT2B2 LTR ERVL -329 255 161 6 1026 301 287 93 0 chr15 57844515 57844623 -45650351 + MLT1I LTR MaLR 292 409 -2 7 1026 236 243 14 41 chr15 57847613 57847686 -45647288 - MLT1B LTR MaLR -15 359 289 7 1026 650 272 211 18 chr15 57847861 57848089 -45646885 + ORR1D2 LTR MaLR 97 368 -2 7 1026 770 312 128 36 chr15 57848507 57848988 -45645986 + MLT2B4 LTR ERVL 3 520 0 7 1026 269 204 56 0 chr15 57849005 57849059 -45645915 - MLT1B LTR MaLR -292 98 42 7 1026 1008 195 19 108 chr15 57851348 57851419 -45643555 + MTEa LTR MaLR 140 197 -182 7 1026 1008 195 19 108 chr15 57851486 57851673 -45643301 + MTEa LTR MaLR 198 375 -4 7 1026 227 153 243 27 chr15 57852890 57852964 -45642010 + LTR40b LTR ERVL 24 113 -406 7 1026 392 287 30 59 chr15 57853063 57853268 -45641706 + LTR40b LTR ERVL 265 476 -43 7 1026 319 319 65 74 chr15 57853401 57853660 -45641314 + ORR1E LTR MaLR 1 254 -116 7 1026 2080 118 54 65 chr15 57858514 57858885 -45636089 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1026 257 271 46 111 chr15 57859366 57859474 -45635500 + MT2B LTR ERVL 140 240 -361 7 1026 2862 82 139 2 chr15 57867747 57868163 -45626811 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 473 -2 7 1026 679 304 117 65 chr15 57869972 57870313 -45624661 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 7 1026 362 245 40 30 chr15 57891122 57891223 -45603751 + ORR1D1 LTR MaLR 62 163 -221 8 1026 843 207 19 120 chr15 57891648 57891906 -45603068 + ORR1D1 LTR MaLR 143 374 0 8 1026 737 93 42 9 chr15 57898411 57898534 -45596440 + ORR1A2 LTR MaLR 129 272 -98 8 1026 436 286 161 18 chr15 57901247 57901471 -45593503 - ORR1E LTR MaLR -18 341 86 8 1026 369 219 8 146 chr15 57904402 57904525 -45590449 - MT2B LTR ERVL -349 252 147 8 1026 411 361 129 74 chr15 57913641 57914006 -45580968 - MLT1H LTR MaLR -102 447 63 8 1026 331 171 58 126 chr15 57915503 57915590 -45579384 + MTEa LTR MaLR 299 379 0 8 1026 1339 224 134 6 chr15 57916320 57916648 -45578326 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 8 1026 1158 224 197 80 chr15 57916927 57917339 -45577635 + MT2A LTR ERVL 5 464 -69 8 1026 248 311 71 39 chr15 57929808 57929962 -45565012 - MT2B LTR ERVL -337 264 106 9 1026 1281 189 198 55 chr15 57931993 57932397 -45562577 - RMER6A LTR ERVK -294 462 1 9 1026 580 204 97 21 chr15 57933275 57933420 -45561554 - RMER10B LTR ERVL -51 347 192 9 1027 621 257 0 7 chr15 57946913 57947050 -45547924 + MTE-int LTR MaLR 981 1116 -464 9 1027 585 177 35 0 chr15 57947051 57947164 -45547810 + ORR1D2 LTR MaLR 192 308 -62 9 1027 2402 87 79 2 chr15 57955970 57956384 -45538590 + RMER16 LTR ERVK 1 532 -1 9 1027 1377 202 155 12 chr15 57959247 57959583 -45535391 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1027 667 148 145 7 chr15 57960033 57960179 -45534795 + ORR1B1 LTR MaLR 1 150 -244 1 1027 403 222 69 62 chr15 57960326 57960363 -45534611 + ORR1B1 LTR MaLR 111 152 -174 1 1027 1311 128 22 9 chr15 57960475 57960704 -45534270 + ORR1B1 LTR MaLR 155 386 -8 1 1027 383 295 59 42 chr15 57967208 57967445 -45527529 + RLTR19-int LTR ERVK 2330 2570 -3567 1 1027 257 248 93 93 chr15 57967712 57967863 -45527111 + MYSERV6-int LTR ERVK 7358 7508 -1451 1 1027 281 265 33 33 chr15 57967833 57967954 -45527020 + MYSERV6-int LTR ERVK 8428 8548 -411 1 1027 338 224 20 124 chr15 57967940 57968093 -45526881 + RLTR19-int LTR ERVK 2849 2985 -3152 1 1027 610 243 180 63 chr15 57968949 57969265 -45525709 + MER67B LTR ERV1 41 393 -268 1 1027 405 146 11 43 chr15 57969724 57969817 -45525157 + ORR1A4 LTR MaLR 1 90 -239 1 1027 2306 164 118 31 chr15 57969826 57969964 -45525010 + ORR1A4-int LTR MaLR 68 205 -1758 1 1027 2306 164 118 31 chr15 57970150 57970534 -45524440 + ORR1A4-int LTR MaLR 206 636 -1327 1 1027 2963 50 56 31 chr15 57971179 57971569 -45523405 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1027 366 286 36 36 chr15 57971694 57971861 -45523113 - LTR41B LTR ERVL -591 167 1 1 1027 872 218 87 54 chr15 57974448 57974725 -45520249 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 743 1 1027 2753 158 163 19 chr15 57975185 57975800 -45519174 - RLTR25B LTR ERVK -325 703 1 1 1027 820 247 44 48 chr15 57976609 57976860 -45518114 + MTEa LTR MaLR 1 250 -129 1 1027 352 272 43 17 chr15 57982383 57982499 -45512475 + MTEb LTR MaLR 57 175 -184 1 1027 365 291 0 35 chr15 57982588 57982702 -45512272 + MTEb LTR MaLR 248 357 -22 1 1027 270 234 9 153 chr15 57995391 57995416 -45499558 + MT2B LTR ERVL 145 153 -448 1 1027 3181 69 5 7 chr15 57995542 57995964 -45499010 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 1027 1050 287 88 11 chr15 57996961 57997338 -45497636 - MTD LTR MaLR -13 406 1 1 1027 259 253 83 12 chr15 57997735 57997819 -45497155 - MTE2b LTR MaLR -30 349 260 1 1027 1595 204 87 11 chr15 57998153 57998509 -45496465 + MTD LTR MaLR 23 405 -14 1 1027 895 289 91 28 chr15 58005653 58005953 -45489021 + ORR1E LTR MaLR 10 324 -35 1 1027 557 332 40 80 chr15 58006097 58006172 -45488802 + ORR1E LTR MaLR 295 369 -1 1 1027 1584 298 59 12 chr15 58006186 58006696 -45488278 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 2 1027 1464 196 81 17 chr15 58014034 58014379 -45480595 - MTD LTR MaLR -53 368 1 3 1027 2961 168 16 121 chr15 58049205 58049465 -45445509 + RMER15 LTR ERVL 1 194 -381 9 1027 2961 168 16 121 chr15 58049514 58049890 -45445084 + RMER15 LTR ERVL 195 570 -5 9 1027 251 204 0 0 chr15 58052743 58052792 -45442182 - RMER15 LTR ERVL -104 471 423 1 1027 408 206 62 52 chr15 58052788 58052885 -45442089 - RMER15 LTR ERVL -107 468 371 1 1027 2016 112 40 116 chr15 58053057 58053453 -45441521 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 1 1027 546 305 123 23 chr15 58055665 58055957 -45439017 + ORR1E LTR MaLR 25 367 -3 1 1027 655 279 134 25 chr15 58056498 58056737 -45438237 + MTEa LTR MaLR 34 298 -81 1 1027 1308 228 140 3 chr15 58056750 58057106 -45437868 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1027 1251 179 153 181 chr15 58060178 58060654 -45434320 - MT2A LTR ERVL -70 463 1 1 1027 612 140 9 9 chr15 58064095 58064203 -45430771 - MT2C_Mm LTR ERVL -75 400 293 1 1027 610 315 113 7 chr15 58064341 58064616 -45430358 - LTR33 LTR ERVL -168 347 44 1 1028 279 220 17 0 chr15 58065147 58065206 -45429768 - MTE2a LTR MaLR -29 350 291 1 1028 991 269 81 7 chr15 58068091 58068375 -45426599 + MTD LTR MaLR 18 322 -97 1 1028 474 226 0 57 chr15 58068385 58068507 -45426467 + RMER2 LTR ERV1 1 115 -452 1 1028 403 216 120 139 chr15 58068565 58068823 -45426151 + RMER2 LTR ERV1 288 540 -27 1 1028 245 243 45 8 chr15 58068825 58068914 -45426060 + MTD LTR MaLR 290 419 0 1 1028 933 262 43 22 chr15 58069674 58070018 -45424956 + MTE2a LTR MaLR 7 379 0 1 1028 2466 97 106 7 chr15 58070878 58071295 -45423679 - RLTR22_Mur LTR ERVK -384 1464 1007 1 1028 254 132 0 0 chr15 58073258 58073296 -45421678 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1066 1 1028 4139 145 291 8 chr15 58073300 58073496 -45421478 - RLTR25A LTR ERVK -89 939 696 1 1028 4139 155 57 10 chr15 58073688 58074344 -45420630 - RLTR25A LTR ERVK -408 695 1 1 1028 479 281 163 25 chr15 58075705 58076024 -45418950 - MLT1A1 LTR MaLR -2 363 1 1 1028 1785 100 40 62 chr15 58077253 58077574 -45417400 + ORR1A4 LTR MaLR 8 321 -8 1 1028 1142 292 54 0 chr15 58078399 58078735 -45416239 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 1 1028 245 291 38 113 chr15 58078919 58079078 -45415896 + MLT1D LTR MaLR 4 150 -477 1 1028 326 296 17 17 chr15 58079119 58079236 -45415738 + MLT1D LTR MaLR 382 498 -7 1 1028 606 256 131 76 chr15 58083691 58084034 -45410940 + MTEa LTR MaLR 1 362 -17 1 1028 2155 105 9 69 chr15 58096290 58096639 -45398335 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 1 1028 3194 68 5 0 chr15 58098372 58098770 -45396204 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1028 281 344 39 15 chr15 58104917 58105047 -45389927 - MLT2D LTR ERVL -107 307 175 2 1028 230 283 92 28 chr15 58106046 58106155 -45388819 - MLT1J LTR MaLR -287 225 110 2 1028 338 240 20 0 chr15 58109552 58109652 -45385322 + MLT2B3 LTR ERVL 2 103 -451 2 1028 1243 188 164 149 chr15 58110429 58110954 -45384020 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 2 1028 416 310 107 40 chr15 58112184 58112460 -45382514 + ORR1E LTR MaLR 3 289 -81 2 1028 305 212 176 0 chr15 58120517 58120602 -45374372 - MER89 LTR ERV1 -7 552 453 2 1028 505 274 47 129 chr15 58120662 58120704 -45374270 - MER89 LTR ERV1 -267 292 254 2 1028 3241 50 2 15 chr15 58120704 58121109 -45373865 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1028 505 274 47 129 chr15 58121109 58121384 -45373590 - MER89 LTR ERV1 -306 253 1 2 1028 462 295 79 58 chr15 58125231 58125507 -45369467 - MLT1G1 LTR MaLR -25 530 265 2 1028 509 357 19 14 chr15 58128670 58128883 -45366091 + MLT1F LTR MaLR 56 269 -279 2 1028 2269 105 6 39 chr15 58129436 58129774 -45365200 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1028 1544 177 188 10 chr15 58130166 58130480 -45364494 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 2 1028 2692 117 5 41 chr15 58131016 58131435 -45363539 + MTB_Mm LTR MaLR 4 407 0 2 1028 1613 156 141 33 chr15 58132314 58132711 -45362263 - RMER10A LTR ERVL -2 440 1 2 1028 2090 182 39 11 chr15 58133901 58134263 -45360711 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 2 1028 641 319 91 97 chr15 58134324 58134821 -45360153 + RLTR11A2 LTR ERVK 7 500 -27 2 1028 351 302 95 36 chr15 58135744 58135912 -45359062 - MLT1C LTR MaLR -7 460 283 2 1028 1427 226 152 83 chr15 58136212 58136646 -45358328 + MT2A LTR ERVL 1 464 -69 2 1028 534 297 24 58 chr15 58136823 58137119 -45357855 - ORR1E LTR MaLR -1 378 1 2 1028 2401 156 39 12 chr15 58141803 58142213 -45352761 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1028 1185 154 5 37 chr15 58143031 58143246 -45351728 + RLTR11A LTR ERVK 293 500 -28 2 1028 1145 39 383 0 chr15 58145630 58145886 -45349088 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 354 -3 2 1028 244 301 59 42 chr15 58153363 58153481 -45341493 + RMER12 LTR ERVK 737 856 -466 3 1028 1832 112 10 72 chr15 58158071 58158378 -45336596 - ORR1A3 LTR MaLR -38 288 1 3 1028 306 214 27 67 chr15 58165888 58165963 -45329011 - ORR1E LTR MaLR 0 359 288 3 1028 628 239 30 18 chr15 58165987 58166153 -45328821 - ORR1E LTR MaLR -184 175 8 3 1028 1082 266 84 34 chr15 58167888 58168246 -45326728 - MTEa LTR MaLR 0 379 4 3 1028 3101 73 111 45 chr15 58171077 58171564 -45323410 - MURVY-LTR LTR ERV1 0 519 1 3 1028 377 189 2 14 chr15 58180530 58180614 -45314360 + ORR1D2 LTR MaLR 296 379 0 3 1028 392 317 79 15 chr15 58181287 58181489 -45313485 + RMER15 LTR ERVL 346 560 -15 3 1028 1640 222 128 57 chr15 58182438 58182978 -45311996 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 578 0 3 1028 271 316 16 47 chr15 58190530 58190664 -45304310 + MLT1C LTR MaLR 327 480 -25 3 1028 236 273 26 13 chr15 58192445 58192523 -45302451 - MLT1D LTR MaLR -32 358 280 3 1028 427 261 23 63 chr15 58192795 58192956 -45302018 - MLT1D LTR MaLR -309 196 41 3 1029 360 250 60 0 chr15 58198479 58198563 -45296411 + ORR1C2 LTR MaLR 1 89 -289 3 1029 1508 146 100 4 chr15 58198823 58199092 -45295882 + ORR1C2 LTR MaLR 89 383 -1 3 1029 2176 88 26 65 chr15 58213325 58213665 -45281309 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1029 1009 237 127 18 chr15 58213665 58213940 -45281034 + ORR1D2 LTR MaLR 66 370 0 4 1029 670 307 135 36 chr15 58225921 58226372 -45268602 + RMER5 LTR ERV1 39 534 0 4 1029 2205 119 19 0 chr15 58228740 58229060 -45265914 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 1029 2294 129 105 29 chr15 58229703 58230151 -45264823 + RLTR19 LTR ERVK 15 496 -3 4 1029 271 184 176 46 chr15 58230777 58230885 -45264089 - MLT1K LTR MaLR -9 586 465 4 1029 2212 182 68 24 chr15 58231705 58232201 -45262773 + RLTR11A LTR ERVK 11 528 0 4 1029 2373 149 84 60 chr15 58234814 58235045 -45259929 + RLTR11A LTR ERVK 1 257 -271 4 1029 2373 149 84 60 chr15 58235067 58235348 -45259626 + RLTR11A LTR ERVK 258 524 -4 4 1029 226 311 86 99 chr15 58236113 58236334 -45258640 + LTR16E2 LTR ERVL 275 492 -76 4 1029 308 246 98 11 chr15 58244183 58244371 -45250603 - MLT1D LTR MaLR 0 505 275 4 1029 254 255 75 0 chr15 58244401 58244495 -45250479 - MLT1D LTR MaLR -312 193 93 4 1029 1006 280 134 20 chr15 58256577 58257076 -45237898 - RLTR20A2 LTR ERVK -19 559 4 5 1029 1458 198 139 8 chr15 58263422 58263774 -45231200 - MTD LTR MaLR -14 405 8 5 1029 2865 164 19 19 chr15 58265224 58265751 -45229223 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 5 1029 594 308 35 31 chr15 58267218 58267446 -45227528 + MER92B LTR ERV1 46 274 -362 5 1029 275 277 75 8 chr15 58275860 58275980 -45218994 - MTE2b LTR MaLR -1 378 251 5 1029 349 280 136 0 chr15 58276035 58276160 -45218814 - MTE2b LTR MaLR -237 142 1 5 1029 509 250 228 47 chr15 58276620 58276963 -45218011 - MTD LTR MaLR -14 405 1 5 1029 1368 185 138 32 chr15 58283934 58284281 -45210693 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1029 599 145 66 41 chr15 58289464 58289586 -45205388 + MTD LTR MaLR 5 129 -290 5 1029 604 144 50 65 chr15 58289579 58289741 -45205233 - MTD LTR MaLR -73 348 190 5 1029 2242 129 45 33 chr15 58292193 58292617 -45202357 - RMER4A LTR ERVK -6 460 32 5 1029 1113 281 12 88 chr15 58292909 58293319 -45201655 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1029 2481 71 6 3 chr15 58293361 58293687 -45201287 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1029 7061 65 10 6 chr15 58295459 58296348 -45198626 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 5 1029 351 247 21 0 chr15 58296693 58296790 -45198184 - MTEb LTR MaLR 0 379 281 5 1029 1247 229 67 64 chr15 58298386 58298760 -45196214 + MTEa LTR MaLR 5 379 0 5 1029 1897 157 48 14 chr15 58300827 58301183 -45193791 - ORR1C1 LTR MaLR -10 368 1 5 1029 285 217 0 0 chr15 58303026 58303086 -45191888 - MLT1B LTR MaLR 0 390 331 5 1029 288 255 31 31 chr15 58305112 58305209 -45189765 + MTD LTR MaLR 1 97 -322 5 1029 352 335 18 72 chr15 58305234 58305401 -45189573 + MTD LTR MaLR 42 199 -220 5 1029 440 233 49 20 chr15 58308157 58308361 -45186613 - MTEa LTR MaLR -54 365 89 5 1029 951 212 60 95 chr15 58309090 58309407 -45185567 + MTD LTR MaLR 114 419 0 5 1029 253 264 42 114 chr15 58313067 58313234 -45181740 - RMER10A LTR ERVL -27 415 261 6 1029 413 355 42 17 chr15 58313751 58313989 -45180985 + MLT1L LTR MaLR 359 602 -8 6 1029 491 182 10 0 chr15 58314394 58314493 -45180481 - RMER15 LTR ERVL -71 504 405 6 1029 296 264 18 70 chr15 58314528 58314642 -45180332 - RMER15 LTR ERVL -128 447 340 6 1029 256 342 72 0 chr15 58319940 58320051 -45174923 - MLT1J1 LTR MaLR -321 123 5 6 1029 2318 131 13 25 chr15 58322641 58323033 -45171941 + ORR1B1 LTR MaLR 6 392 -2 6 1029 517 307 51 6 chr15 58324009 58324186 -45170788 - MLT1A LTR MaLR 0 374 190 6 1029 1793 204 62 3 chr15 58324386 58324744 -45170230 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1029 231 315 64 21 chr15 58324804 58324898 -45170076 - RMER10A LTR ERVL -27 415 318 6 1030 2331 75 27 59 chr15 58333339 58333677 -45161297 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1030 432 229 185 123 chr15 58348254 58348637 -45146337 + RMER10A LTR ERVL 12 418 -24 6 1030 230 391 0 0 chr15 58348784 58348871 -45146103 + MLT1N2 LTR MaLR 145 231 -331 6 1030 228 185 0 122 chr15 58349051 58349125 -45145849 + MLT1N2 LTR MaLR 494 558 -4 6 1030 2112 172 66 15 chr15 58350876 58351272 -45143702 + MTC LTR MaLR 3 418 -3 6 1030 667 324 54 40 chr15 58357306 58357750 -45137224 - LTR16B LTR ERVL -2 461 12 6 1030 433 209 0 0 chr15 58362535 58362626 -45132348 - ORR1C2 LTR MaLR -293 91 1 6 1030 280 205 103 10 chr15 58364254 58364352 -45130622 - MTEa LTR MaLR 0 379 281 6 1030 967 242 58 97 chr15 58364391 58364702 -45130272 - MTEa LTR MaLR -77 302 4 6 1030 256 277 136 43 chr15 58367650 58367812 -45127162 - MTEb LTR MaLR -2 377 201 7 1030 550 162 317 6 chr15 58367850 58368011 -45126963 - MTD LTR MaLR 0 419 209 7 1030 702 256 50 0 chr15 58368520 58368700 -45126274 - MTD LTR MaLR -224 195 7 7 1030 2315 86 3 79 chr15 58374885 58375238 -45119736 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 7 1030 252 336 53 8 chr15 58379104 58379236 -45115738 - ORR1E LTR MaLR -221 138 1 7 1030 1010 247 154 12 chr15 58384623 58384947 -45110027 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 7 1030 227 127 105 35 chr15 58391256 58391313 -45103661 - ORR1B1 LTR MaLR -331 63 3 7 1030 665 286 58 33 chr15 58397387 58397629 -45097345 - MLT1F1 LTR MaLR -155 414 167 7 1030 885 217 81 12 chr15 58398206 58398453 -45096521 - MTEa LTR MaLR 0 379 89 7 1030 1745 132 97 62 chr15 58399707 58400079 -45094895 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 1 7 1030 747 253 157 11 chr15 58403926 58404194 -45090780 - ORR1E LTR MaLR -15 344 38 7 1030 549 291 65 81 chr15 58410668 58410990 -45083984 - MTEb LTR MaLR -59 320 4 7 1030 662 235 35 6 chr15 58415804 58415975 -45078999 - MLT1C LTR MaLR -291 176 1 7 1030 973 245 28 117 chr15 58416244 58416637 -45078337 + MTEa LTR MaLR 22 379 0 7 1030 277 301 64 61 chr15 58417647 58417940 -45077034 - MTE2b LTR MaLR -4 375 60 7 1030 938 249 90 73 chr15 58420250 58420618 -45074356 - MTEa LTR MaLR -1 378 5 7 1030 525 271 149 43 chr15 58434982 58435283 -45059691 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 31 8 1030 6603 96 34 8 chr15 58455704 58456637 -45038337 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 8 1031 732 259 36 14 chr15 58460615 58460834 -45034140 + MTE-int LTR MaLR 135 358 -1222 8 1031 435 288 46 64 chr15 58462339 58462558 -45032416 - MLT1B LTR MaLR 0 390 160 8 1031 1525 228 37 6 chr15 58481405 58481758 -45013216 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 6 8 1031 1623 176 107 8 chr15 58484240 58484595 -45010379 - MTD LTR MaLR -28 391 2 8 1031 393 300 169 36 chr15 58484597 58484905 -45010069 - MER67C LTR ERV1 -86 625 277 8 1031 638 279 26 16 chr15 58485070 58485259 -45009715 - MER67C LTR ERV1 -456 255 65 8 1031 885 240 97 37 chr15 58486763 58487062 -45007912 - MTEb LTR MaLR -20 359 43 8 1031 572 293 105 24 chr15 58488204 58488498 -45006476 - ORR1E LTR MaLR -40 319 2 8 1031 3141 45 24 0 chr15 58497637 58498013 -44996961 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 8 1031 672 189 20 27 chr15 58499853 58500000 -44994974 - MTD LTR MaLR -207 212 67 8 1031 457 291 98 14 chr15 58503436 58503579 -44991395 - MLT1B LTR MaLR -180 210 56 3 1031 2114 144 20 9 chr15 58505427 58505777 -44989197 + ORR1B2 LTR MaLR 1 354 -13 7 1031 1478 241 6 37 chr15 58505796 58506106 -44988868 - MTEa LTR MaLR -62 317 17 8 1031 3350 53 2 0 chr15 58506106 58506504 -44988470 + MTB LTR MaLR 2 400 0 9 1031 1478 241 6 37 chr15 58506504 58506520 -44988454 - MTEa LTR MaLR -363 16 1 8 1031 1749 221 101 0 chr15 58507434 58507810 -44987164 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 1 1031 289 317 79 112 chr15 58507815 58508206 -44986768 - MTEa LTR MaLR -1 378 1 1 1031 547 250 14 35 chr15 58511273 58511414 -44983560 - ORR1E LTR MaLR 0 379 242 1 1031 969 180 43 5 chr15 58511562 58511746 -44983228 - ORR1E LTR MaLR -168 191 1 1 1031 376 327 9 0 chr15 58514896 58515006 -44979968 - ORR1E LTR MaLR -248 111 1 3 1031 350 316 25 25 chr15 58517973 58518093 -44976881 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 289 3 1031 311 296 84 89 chr15 58521792 58521943 -44973031 + MLT1C LTR MaLR 74 234 -233 4 1031 311 296 84 89 chr15 58522216 58522300 -44972674 + MLT1C LTR MaLR 235 308 -159 4 1031 936 285 198 66 chr15 58522550 58523140 -44971834 + LTR65 LTR ERV1 1 668 -1 4 1031 3524 33 0 0 chr15 58523691 58524087 -44970887 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1031 1281 189 33 40 chr15 58525064 58525339 -44969635 - RLTR46 LTR ERVK -5 315 43 5 1031 745 126 0 0 chr15 58525349 58525460 -44969514 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7581 7471 5 1031 2666 63 0 0 chr15 58525480 58525797 -44969177 - RLTR10-int LTR ERVK -188 1799 1483 5 1031 3357 143 2 89 chr15 58525796 58526438 -44968536 - IAPEY3-int LTR ERVK -147 7434 6849 5 1031 10673 207 5 6 chr15 58526457 58528666 -44966308 - IAPEY3-int LTR ERVK -1882 5699 3474 5 1031 1852 268 63 40 chr15 58528655 58529274 -44965700 - IAPEY3-int LTR ERVK -6513 1167 535 5 1031 470 258 30 110 chr15 58529270 58529470 -44965504 - IAPEY3-int LTR ERVK -7494 186 3 5 1031 1282 212 35 13 chr15 58529480 58529769 -44965205 - RLTR46 LTR ERVK -6 314 13 5 1031 427 312 28 21 chr15 58530300 58530441 -44964533 + LTR33 LTR ERVL 25 166 -349 6 1031 250 159 0 43 chr15 58535118 58535164 -44959810 + MERVK26-int LTR ERVK 6875 6918 -1 7 1031 2107 155 147 22 chr15 58535179 58535634 -44959340 + RMER13A LTR ERVK 14 525 -335 7 1031 572 274 64 10 chr15 58535623 58535826 -44959148 - RMER13A LTR ERVK -137 723 510 7 1031 268 327 37 87 chr15 58541793 58542048 -44952926 + MLT1D LTR MaLR 1 244 -261 8 1031 500 219 82 182 chr15 58542191 58542615 -44952359 + RMER10A LTR ERVL 18 399 -43 8 1031 750 276 40 10 chr15 58542651 58542852 -44952122 + MLT1D LTR MaLR 299 505 0 8 1031 989 207 57 184 chr15 58542945 58543401 -44951573 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 8 1031 595 324 57 65 chr15 58543858 58544261 -44950713 - ERVL-E-int LTR ERVL -2919 2748 2349 8 1031 265 289 74 52 chr15 58544587 58544722 -44950252 - ERVL-E-int LTR ERVL -3731 1936 1799 8 1031 712 306 105 8 chr15 58547479 58547736 -44947238 - RMER15 LTR ERVL -16 559 278 8 1031 277 350 112 60 chr15 58551405 58551770 -44943204 - MLT1D LTR MaLR -117 388 5 9 1031 986 332 60 30 chr15 58551816 58552248 -44942726 + MT2A LTR ERVL 1 445 -88 9 1031 2144 105 3 60 chr15 58552367 58552702 -44942272 - ORR1A3 LTR MaLR -10 316 1 9 1031 532 284 85 52 chr15 58553467 58553864 -44941110 + MLT1D LTR MaLR 13 433 -72 1 1031 2471 93 9 0 chr15 58554930 58555251 -44939723 + ORR1A3 LTR MaLR 1 324 -2 1 1031 1683 161 111 38 chr15 58558709 58559051 -44935923 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1031 383 208 76 152 chr15 58559109 58559307 -44935667 - MTEb LTR MaLR 0 379 197 1 1031 523 358 78 45 chr15 58559730 58560061 -44934913 + MLT2F LTR ERVL 269 610 -53 1 1031 1825 156 18 103 chr15 58562465 58562852 -44932122 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 1031 344 263 92 72 chr15 58565539 58565725 -44929249 + RMER15 LTR ERVL 336 558 -17 1 1031 4733 87 75 34 chr15 58570076 58570853 -44924121 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 1 1031 2084 136 47 15 chr15 58570854 58571197 -44923777 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 1031 1941 152 19 17 chr15 58571404 58571782 -44923192 - MTC LTR MaLR 0 421 24 1 1031 236 326 93 0 chr15 58573493 58573579 -44921395 + LTR33 LTR ERVL 276 369 -146 1 1031 426 250 162 64 chr15 58579076 58579305 -44915669 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 201 1 1031 3042 129 43 8 chr15 58579305 58579811 -44915163 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 1 1031 272 122 0 0 chr15 58582478 58582519 -44912455 + MT2A LTR ERVL 493 533 0 1 1031 3265 63 2 2 chr15 58582659 58583059 -44911915 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1031 311 253 70 17 chr15 58584139 58584261 -44910713 - ORR1E LTR MaLR -10 369 244 1 1031 2334 148 168 72 chr15 58584367 58584892 -44910082 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 1 1031 776 276 57 10 chr15 58584956 58585150 -44909824 - ORR1E LTR MaLR -82 277 75 1 1031 777 258 148 109 chr15 58587955 58588351 -44906623 + MTE2a LTR MaLR 8 419 0 1 1031 488 250 139 108 chr15 58588586 58588873 -44906101 - RMER15 LTR ERVL -90 485 190 1 1032 802 297 74 16 chr15 58593269 58593580 -44901394 + ORR1E LTR MaLR 25 353 -6 1 1032 295 246 177 50 chr15 58594209 58594350 -44900624 + MTEa LTR MaLR 2 160 -219 1 1032 689 280 47 82 chr15 58594651 58594690 -44900284 + MT2A LTR ERVL 168 209 -324 1 1032 689 280 47 82 chr15 58594963 58594997 -44899977 + MT2A LTR ERVL 210 245 -288 1 1032 689 280 47 82 chr15 58595024 58595268 -44899706 + MT2A LTR ERVL 246 475 -58 1 1032 271 100 0 0 chr15 58595465 58595505 -44899469 - MTC LTR MaLR 0 421 382 1 1032 2231 146 49 15 chr15 58596269 58596659 -44898315 - MTC LTR MaLR 0 421 19 1 1032 1114 223 34 4 chr15 58596762 58597001 -44897973 + RLTR42-int LTR ERVK 1105 1350 -4172 1 1032 525 195 34 176 chr15 58597862 58598023 -44896951 + RLTR19-int LTR ERVK 3524 3665 -2472 2 1032 525 195 34 176 chr15 58598210 58598253 -44896721 + RLTR19-int LTR ERVK 3666 3699 -2438 2 1032 462 143 0 0 chr15 58598665 58598735 -44896239 + RLTR19-int LTR ERVK 4039 4108 -2029 2 1032 315 325 43 61 chr15 58602681 58602845 -44892129 - MLT1H-int LTR MaLR -4 1485 1325 2 1032 368 307 162 53 chr15 58603237 58603504 -44891470 - MLT1H-int LTR MaLR -340 1149 867 2 1032 806 296 155 57 chr15 58603723 58603975 -44890999 - MLT1H-int LTR MaLR -651 758 474 2 1032 806 296 155 57 chr15 58604028 58604316 -44890658 - MLT1H-int LTR MaLR -936 473 165 2 1032 1235 256 49 27 chr15 58606043 58606409 -44888565 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1032 702 291 173 18 chr15 58608900 58609177 -44885797 - MLT1E2 LTR MaLR -59 568 249 2 1032 356 374 72 42 chr15 58610129 58610394 -44884580 + MLT1J LTR MaLR 227 499 -13 2 1032 293 297 0 13 chr15 58642252 58642327 -44852647 + LTR16A LTR ERVL 377 450 -1 2 1032 629 349 28 62 chr15 58649482 58649586 -44845388 + MLT1H1 LTR MaLR 65 161 -394 2 1032 969 207 141 168 chr15 58649586 58650103 -44844871 + MLT1D LTR MaLR 3 505 0 2 1032 629 349 41 67 chr15 58650103 58650368 -44844606 + MLT1H1 LTR MaLR 162 441 -150 2 1032 313 325 100 0 chr15 58651278 58651398 -44843576 + MLT1H1 LTR MaLR 363 494 -75 2 1032 385 332 46 89 chr15 58656394 58656675 -44838299 + MT2A LTR ERVL 102 370 -163 2 1032 2059 206 95 34 chr15 58656726 58657269 -44837705 - RLTR18 LTR ERVK -82 534 23 2 1032 1937 112 0 66 chr15 58657745 58658050 -44836924 + ORR1A2 LTR MaLR 1 285 -42 2 1032 1796 94 0 0 chr15 58658066 58658320 -44836654 - ORR1A3-int LTR MaLR -1708 255 2 2 1032 334 65 0 61 chr15 58658320 58658369 -44836605 - ORR1A3 LTR MaLR -7 319 274 2 1032 1738 96 0 0 chr15 58658369 58658599 -44836375 - MERVL-int LTR ERVL -1628 3857 3628 2 1032 1835 82 193 0 chr15 58658599 58658879 -44836095 - MT2B2 LTR ERVL -250 334 1 2 1032 395 299 50 36 chr15 58658901 58659040 -44835934 + MLT1H2 LTR MaLR 2 142 -347 2 1032 1973 119 0 20 chr15 58659248 58659549 -44835425 + ORR1A1 LTR MaLR 3 297 -49 2 1032 376 311 152 67 chr15 58660073 58660438 -44834536 - MLT1F LTR MaLR -86 462 67 3 1032 479 264 84 132 chr15 58660440 58660794 -44834180 - ORR1E LTR MaLR -11 359 33 3 1032 313 273 19 83 chr15 58660792 58660900 -44834074 - ORR1E LTR MaLR -270 109 9 3 1032 258 259 129 27 chr15 58661107 58661254 -44833720 + MLT1H2 LTR MaLR 207 368 -180 2 1032 1984 223 78 44 chr15 58664289 58664829 -44830145 + RLTR18 LTR ERVK 1 558 -58 3 1032 318 320 65 57 chr15 58671614 58671859 -44823115 + RMER2 LTR ERV1 294 540 -27 3 1032 741 313 101 25 chr15 58672257 58672575 -44822399 + MER21B LTR ERV1 287 628 -235 3 1032 1546 233 94 73 chr15 58675551 58676494 -44818480 - RMER17B LTR ERVK -9 899 1 3 1032 254 125 0 0 chr15 58676764 58676804 -44818170 + MLT2B2 LTR ERVL 1 40 -475 3 1032 394 304 9 0 chr15 58676797 58676912 -44818062 + MLT2B2 LTR ERVL 396 511 -51 3 1032 248 259 0 0 chr15 58677040 58677094 -44817880 + MLT2B2 LTR ERVL 511 564 -3 3 1032 3423 145 122 96 chr15 58681262 58682129 -44812845 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 3 1032 493 285 187 20 chr15 58682672 58682966 -44812008 + MER21B LTR ERV1 465 807 -56 3 1032 415 227 145 17 chr15 58683933 58684112 -44810862 + RMER10A LTR ERVL 241 442 0 3 1032 1284 282 112 62 chr15 58684496 58685267 -44809707 + RMER13A LTR ERVK 2 810 -50 3 1032 748 248 103 126 chr15 58688305 58688355 -44806619 - MTE2a LTR MaLR 0 379 340 3 1032 748 248 103 126 chr15 58688551 58688888 -44806086 - MTE2a LTR MaLR -40 339 1 3 1032 2049 199 114 32 chr15 58690259 58690720 -44804254 + RMER2 LTR ERV1 1 507 -60 3 1032 3672 95 82 2 chr15 58690720 58691245 -44803729 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 3 1032 2049 199 114 32 chr15 58691245 58691307 -44803667 + RMER2 LTR ERV1 508 567 0 3 1032 822 285 70 39 chr15 58691495 58691853 -44803121 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 3 1032 633 235 89 72 chr15 58692559 58692950 -44802024 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 3 1032 2905 38 9 0 chr15 58693068 58693411 -44801563 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1032 1650 230 83 65 chr15 58693912 58694469 -44800505 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 3 1032 354 367 8 8 chr15 58694888 58695017 -44799957 - MLT1C LTR MaLR -7 460 332 3 1032 315 248 154 9 chr15 58695129 58695239 -44799735 - MLT1C LTR MaLR -289 178 53 3 1032 1432 173 72 156 chr15 58697212 58697616 -44797358 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 3 1032 1658 132 250 8 chr15 58698412 58698881 -44796093 + RLTR33 LTR ERVK 1 678 0 3 1032 1574 151 161 55 chr15 58698931 58699278 -44795696 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 3 3 1032 388 147 15 0 chr15 58708105 58708173 -44786801 + RLTR11A LTR ERVK 460 528 0 3 1032 267 358 9 0 chr15 58710909 58711018 -44783956 + HERV16-int LTR ERVL 2581 2690 -2306 3 1032 836 204 95 148 chr15 58712096 58712194 -44782780 + ORR1D1 LTR MaLR 75 143 -231 3 1032 836 204 95 148 chr15 58712341 58712491 -44782483 + ORR1D1 LTR MaLR 144 308 -66 3 1032 836 204 95 148 chr15 58712666 58712733 -44782241 + ORR1D1 LTR MaLR 309 374 0 3 1032 653 270 50 125 chr15 58714676 58715133 -44779841 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 3 1033 1070 227 159 35 chr15 58722715 58723148 -44771826 - RMER5 LTR ERV1 0 534 48 4 1033 378 364 93 54 chr15 58727079 58727521 -44767453 - MER21B LTR ERV1 -331 532 74 4 1033 3624 18 0 0 chr15 58743020 58743416 -44751558 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1033 9286 37 2 1 chr15 58743416 58744513 -44750461 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1033 3624 18 0 0 chr15 58744513 58744909 -44750065 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1033 1154 159 138 10 chr15 58748603 58748824 -44746150 - RMER17C LTR ERVK -58 352 93 4 1033 1154 159 138 10 chr15 58748844 58748934 -44746040 - RMER17C LTR ERVK -318 92 2 4 1033 960 193 92 158 chr15 58760773 58761173 -44733801 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1033 1579 82 24 12 chr15 58761641 58761888 -44733086 + RMER6A LTR ERVK 1 250 -506 4 1033 840 243 17 0 chr15 58780748 58780929 -44714045 + ORR1D1 LTR MaLR 1 184 -190 4 1033 2098 86 38 6 chr15 58785846 58786163 -44708811 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1033 1717 118 55 70 chr15 58791188 58791597 -44703377 + MT2B LTR ERVL 1 475 0 4 1033 241 303 15 0 chr15 58794063 58794129 -44700845 + MER21B LTR ERV1 21 87 -776 4 1033 504 246 181 52 chr15 58814590 58814920 -44680054 - MTEa LTR MaLR -5 374 2 5 1033 1830 154 29 58 chr15 58839570 58839914 -44655060 - RLTR25A LTR ERVK -755 348 15 5 1033 423 320 66 12 chr15 58849103 58849305 -44645669 + MLT1A0 LTR MaLR 113 328 -46 5 1034 1209 228 84 53 chr15 58858792 58859149 -44635825 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 6 1034 1638 161 122 15 chr15 58870344 58870679 -44624295 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 4 6 1034 310 279 45 134 chr15 58877072 58877341 -44617633 + MT2B LTR ERVL 20 264 -337 6 1034 392 245 77 77 chr15 58921416 58921624 -44573350 - LTR33 LTR ERVL -18 497 290 7 1034 437 323 171 23 chr15 58926372 58926629 -44568345 + RMER15 LTR ERVL 267 561 -14 7 1034 296 247 0 76 chr15 58926924 58927016 -44567958 + MLT1A1 LTR MaLR 315 399 -9 7 1034 1189 299 79 56 chr15 58927033 58927565 -44567409 + MER89 LTR ERV1 7 550 -9 7 1034 556 312 80 53 chr15 58930477 58930741 -44564233 + MLT2C1 LTR ERVL 120 390 -7 7 1034 4534 12 0 0 chr15 58931593 58932086 -44562888 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 1034 264 316 108 83 chr15 58932910 58933113 -44561861 - ORR1E LTR MaLR -44 315 108 7 1034 336 158 18 0 chr15 58933113 58933170 -44561804 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 325 7 1034 2063 130 49 15 chr15 58933384 58933711 -44561263 - RLTR14 LTR ERV1 -44 338 1 7 1034 252 287 127 18 chr15 58933791 58933901 -44561073 - MLT1A1 LTR MaLR -286 122 1 7 1034 1519 223 56 70 chr15 58936282 58936696 -44558278 - MTD LTR MaLR 0 419 12 7 1034 489 255 8 41 chr15 58938026 58938163 -44556811 + ORR1E LTR MaLR 7 147 -227 7 1034 1897 172 75 17 chr15 58944690 58944745 -44550229 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 331 7 1034 1962 98 55 62 chr15 58944745 58945070 -44549904 - ORR1A4 LTR MaLR -4 325 3 7 1034 1897 172 75 17 chr15 58945070 58945375 -44549599 - RLTR14 LTR ERV1 -52 330 2 7 1034 1821 144 118 9 chr15 58945772 58946094 -44548880 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 3 7 1034 347 230 39 117 chr15 58948771 58948899 -44546075 + MT2B LTR ERVL 161 278 -323 7 1034 1758 166 110 43 chr15 58951159 58951550 -44543424 - MTC LTR MaLR 0 421 5 7 1034 275 288 49 0 chr15 58951738 58951849 -44543125 + MLT1A1 LTR MaLR 6 126 -233 7 1034 1203 262 69 20 chr15 58953438 58953785 -44541189 + MTEa LTR MaLR 3 366 -13 7 1034 1603 167 66 13 chr15 58955002 58955231 -44539743 + ORR1D1 LTR MaLR 1 228 -146 8 1034 1603 167 66 13 chr15 58955252 58955325 -44539649 + ORR1D1 LTR MaLR 229 317 -57 8 1034 409 154 2 5 chr15 58956380 58956464 -44538510 + ORR1D1 LTR MaLR 288 374 0 8 1034 2254 154 56 15 chr15 58960167 58960563 -44534411 + MTC LTR MaLR 5 416 -5 8 1034 621 236 147 0 chr15 58964119 58964310 -44530664 - MLT2B1 LTR ERVL 0 567 349 8 1034 624 301 57 5 chr15 58964424 58964618 -44530356 - MLT2B1 LTR ERVL -207 313 110 8 1034 541 200 2 8 chr15 58964740 58964871 -44530103 - MLT2B1 LTR ERVL -426 128 2 8 1034 2133 157 178 54 chr15 58967501 58968115 -44526859 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 8 1034 1045 211 226 22 chr15 58972296 58972611 -44522363 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 8 1034 239 321 35 86 chr15 58973723 58973757 -44521217 + MT2B LTR ERVL 131 158 -443 8 1034 2056 124 20 73 chr15 58974514 58974741 -44520233 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 112 8 1034 2056 124 20 73 chr15 58974871 58975000 -44519974 - ORR1A1 LTR MaLR -235 111 1 8 1034 362 319 54 20 chr15 58975612 58975752 -44519222 + LTR79 LTR ERVL 10 155 -372 8 1034 231 287 11 84 chr15 58979781 58979876 -44515098 + MLT1K LTR MaLR 190 277 -318 8 1034 567 345 56 38 chr15 58981285 58981626 -44513348 - ORR1E LTR MaLR -9 350 4 8 1034 241 294 77 49 chr15 58982074 58982217 -44512757 - LTR33 LTR ERVL -2 513 367 8 1035 1368 205 38 84 chr15 58983662 58984088 -44510886 - RMER10A LTR ERVL -4 438 33 8 1035 842 293 161 5 chr15 58984347 58984725 -44510249 - MLT1C LTR MaLR -30 437 1 8 1035 364 289 136 71 chr15 58986696 58987035 -44507939 + LTR16A1 LTR ERVL 7 367 -89 8 1035 282 320 170 65 chr15 58987948 58988418 -44506556 + LTR50 LTR ERVL 45 508 -12 8 1035 1839 186 27 32 chr15 58991387 58991759 -44503215 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 9 1035 1579 239 51 36 chr15 58992437 58992793 -44502181 + ORR1D2 LTR MaLR 3 363 -7 9 1035 269 330 58 50 chr15 58993080 58993201 -44501773 + MLT1A LTR MaLR 1 122 -252 9 1035 600 266 22 0 chr15 58993211 58993350 -44501624 + ORR1E LTR MaLR 1 142 -217 9 1035 2114 95 3 71 chr15 58993360 58993710 -44501264 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -11 326 1 9 1035 8872 37 9 0 chr15 58993710 58994737 -44500237 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5446 9 1035 34232 10 1 0 chr15 58994736 58998442 -44496532 - IAPEz-int LTR ERVK -2764 3717 9 9 1035 2124 105 3 70 chr15 58998442 58998801 -44496173 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -2 335 1 9 1035 269 298 14 109 chr15 58998843 58998990 -44495984 + ORR1E LTR MaLR 203 335 -44 9 1035 256 296 40 101 chr15 58999209 58999347 -44495627 + MLT1A1 LTR MaLR 302 450 -17 9 1035 1500 144 130 62 chr15 59006534 59006918 -44488056 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 1035 1536 206 136 19 chr15 59016705 59017072 -44477902 - MTD LTR MaLR 0 419 10 3 1035 594 325 76 48 chr15 59017123 59017414 -44477560 - MLT1F LTR MaLR -22 526 228 3 1035 343 256 0 44 chr15 59017471 59017561 -44477413 + MLT1F LTR MaLR 50 135 -413 3 1035 490 292 133 12 chr15 59017972 59018145 -44476829 - MLT1F LTR MaLR -331 217 24 3 1035 234 324 87 19 chr15 59018747 59018851 -44476123 - ORR1E LTR MaLR -170 189 79 3 1035 261 167 105 53 chr15 59020751 59020827 -44474147 - MTEb LTR MaLR -113 266 187 4 1035 525 322 63 46 chr15 59021141 59021379 -44473595 - MTEa LTR MaLR -107 272 31 4 1035 512 291 116 52 chr15 59022434 59022666 -44472308 - MLT1D LTR MaLR 0 505 259 4 1035 264 51 26 0 chr15 59023220 59023259 -44471715 + RMER4A LTR ERVK 1 40 -545 5 1035 1419 136 10 31 chr15 59023462 59023845 -44471129 + RMER4A LTR ERVK 33 466 0 5 1035 345 321 92 61 chr15 59028134 59028460 -44466514 + LTR33 LTR ERVL 109 486 -29 6 1035 784 299 79 48 chr15 59030727 59030840 -44464134 + MLT1C LTR MaLR 63 173 -294 6 1035 1548 230 63 27 chr15 59030840 59031206 -44463768 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 6 1035 784 299 79 48 chr15 59031206 59031297 -44463677 + MLT1C LTR MaLR 174 271 -196 6 1035 1885 124 105 35 chr15 59031297 59031640 -44463334 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1035 784 299 79 48 chr15 59031640 59031750 -44463224 + MLT1C LTR MaLR 272 388 -79 6 1035 1209 216 157 31 chr15 59032742 59033067 -44461907 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 7 1035 366 277 110 33 chr15 59035888 59036103 -44458871 - ORR1E LTR MaLR -133 245 1 7 1035 1628 223 62 18 chr15 59038172 59038560 -44456414 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 8 1035 246 203 148 33 chr15 59041728 59041789 -44453185 + RLTR20C LTR ERVK 74 141 -393 8 1035 779 253 42 5 chr15 59041831 59042022 -44452952 - MTE2b LTR MaLR -59 320 123 8 1035 317 237 31 156 chr15 59044449 59044609 -44450365 - LTR16E1 LTR ERVL 0 568 413 9 1035 1141 232 3 0 chr15 59046210 59046527 -44448447 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 9 1035 328 266 21 31 chr15 59046776 59046873 -44448101 + MTD LTR MaLR 3 98 -321 1 1035 849 339 51 26 chr15 59048090 59048481 -44446493 + MLT1C LTR MaLR 59 459 -8 1 1035 2098 150 47 3 chr15 59048608 59048970 -44446004 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1035 269 276 13 26 chr15 59049174 59049252 -44445722 + MLT1C LTR MaLR 534 610 0 1 1035 307 333 25 33 chr15 59051588 59051709 -44443265 - MLT1I LTR MaLR -214 197 78 1 1035 2154 142 8 52 chr15 59053400 59053787 -44441187 - ORR1C1 LTR MaLR -8 370 1 1 1035 895 293 38 14 chr15 59055864 59056151 -44438823 - RMER15 LTR ERVL -6 569 276 1 1035 473 258 43 62 chr15 59056152 59056313 -44438661 - RMER15 LTR ERVL -417 158 1 1 1035 4394 183 47 76 chr15 59057237 59058312 -44436662 + RMER12 LTR ERVK 1 1306 -266 1 1035 682 239 141 130 chr15 59058341 59058550 -44436424 + RMER12 LTR ERVK 1307 1572 0 1 1035 552 328 19 26 chr15 59059115 59059325 -44435649 - MLT1A0 LTR MaLR -4 386 182 1 1035 1738 184 41 44 chr15 59059582 59059945 -44435029 + MTD LTR MaLR 1 362 -57 1 1035 2407 90 9 30 chr15 59060325 59060658 -44434316 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1035 548 230 48 58 chr15 59061316 59061505 -44433469 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 244 1 1035 2913 126 50 6 chr15 59063078 59063556 -44431418 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 1 1035 864 169 411 10 chr15 59063801 59064093 -44430881 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 620 1 1035 1168 185 8 4 chr15 59064071 59064332 -44430642 - ORR1A3-int LTR MaLR -999 964 703 1 1035 1286 145 65 96 chr15 59064275 59064535 -44430439 - MT2B LTR ERVL -314 287 36 1 1035 901 168 109 61 chr15 59064393 59064640 -44430334 - ORR1A3-int LTR MaLR -1205 758 500 1 1035 582 221 50 35 chr15 59064528 59064665 -44430309 - RLTR25B LTR ERVK -542 561 423 1 1035 961 83 15 0 chr15 59064665 59064798 -44430176 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 175 1 1035 2189 27 0 0 chr15 59064782 59065043 -44429931 - RLTR10A LTR ERVK -150 261 1 1 1035 2132 177 4 100 chr15 59065044 59065503 -44429471 - RLTR25B LTR ERVK -604 424 10 1 1035 668 305 94 47 chr15 59066512 59066927 -44428047 - RLTR26 LTR ERVK -120 507 1 1 1035 3552 132 23 14 chr15 59078814 59079376 -44415598 - RLTR20D LTR ERVK -1 567 1 1 1035 506 253 68 14 chr15 59079604 59079752 -44415222 - MLT1E LTR MaLR -112 541 386 1 1035 381 297 16 63 chr15 59083146 59083272 -44411702 + RMER15 LTR ERVL 351 470 -105 1 1035 342 355 41 34 chr15 59083296 59083442 -44411532 - MLT1J LTR MaLR -360 152 6 1 1035 1018 316 123 41 chr15 59091147 59091635 -44403339 - MLT1F LTR MaLR 0 548 21 1 1035 225 253 54 98 chr15 59100630 59100722 -44394252 - MLT1G LTR MaLR -302 289 202 2 1035 225 386 73 34 chr15 59102238 59102415 -44392559 + MLT1I LTR MaLR 85 268 -327 2 1035 347 338 193 52 chr15 59102706 59103302 -44391672 + MLT1I-int LTR MaLR 492 1171 -216 2 1035 237 229 0 0 chr15 59106816 59106864 -44388110 + MLT1I LTR MaLR 86 133 -278 2 1035 1134 228 102 108 chr15 59112142 59112357 -44382617 - MTD LTR MaLR -14 405 211 2 1035 1134 226 107 114 chr15 59112512 59112692 -44382282 - MTD LTR MaLR -209 210 24 2 1036 432 228 50 42 chr15 59116329 59116448 -44378526 + MT2B LTR ERVL 159 278 -323 2 1036 1940 194 18 20 chr15 59117937 59118337 -44376637 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 2 1036 1548 229 52 3 chr15 59118879 59119225 -44375749 + ORR1D2 LTR MaLR 1 363 -7 2 1036 2826 50 40 38 chr15 59120315 59120639 -44374335 - MTB LTR MaLR 0 400 72 2 1036 5331 81 89 56 chr15 59120639 59121512 -44373462 - RMER17A2 LTR ERVK -4 902 1 2 1036 2826 50 40 38 chr15 59121512 59121584 -44373390 - MTB LTR MaLR -329 71 3 2 1036 4229 101 63 17 chr15 59124364 59125027 -44369947 + ORR1A2-int LTR MaLR 1270 1963 0 2 1036 2445 86 3 38 chr15 59125027 59125311 -44369663 + ORR1A2 LTR MaLR 1 285 -42 2 1036 2445 86 3 38 chr15 59125501 59125555 -44369419 + ORR1A2 LTR MaLR 286 327 0 2 1036 4575 145 60 30 chr15 59125821 59126691 -44368283 - RLTR13D6 LTR ERVK -46 856 1 2 1036 1235 139 20 5 chr15 59126693 59126888 -44368086 + RLTR20B2 LTR ERVK 13 210 -350 2 1036 1433 206 143 3 chr15 59127625 59127961 -44367013 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 2 1036 2807 135 0 12 chr15 59130480 59130906 -44364068 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1036 3067 20 0 17 chr15 59131027 59131379 -44363595 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1036 12871 46 51 59 chr15 59131379 59132918 -44362056 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 243 2 1036 12871 46 51 59 chr15 59133111 59133377 -44361597 - ORR1A0-int LTR MaLR -1550 242 2 2 1036 635 13 0 0 chr15 59133377 59133452 -44361522 - ORR1A0 LTR MaLR -271 75 1 2 1036 2238 138 14 8 chr15 59134028 59134393 -44360581 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1036 984 194 66 35 chr15 59137266 59137555 -44357419 + RMER17C LTR ERVK 1 298 -112 2 1036 355 300 6 85 chr15 59137812 59137976 -44356998 - MLT1A LTR MaLR -6 368 218 2 1036 1393 196 156 25 chr15 59141988 59142303 -44352671 + MTD LTR MaLR 6 361 -58 2 1036 1126 211 37 85 chr15 59158374 59158809 -44336165 - RMER17A LTR ERVK 0 751 338 3 1036 1758 59 0 0 chr15 59158792 59159013 -44335961 - RMER17A LTR ERVK -530 221 1 3 1036 1624 224 135 6 chr15 59159814 59160281 -44334693 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 3 1036 890 302 24 75 chr15 59173140 59173473 -44321501 + MTEa LTR MaLR 58 373 -6 3 1036 1045 239 131 0 chr15 59183653 59183983 -44310991 + MTEa LTR MaLR 3 372 -7 3 1036 1725 202 51 32 chr15 59185825 59186253 -44308721 + RLTR11A LTR ERVK 55 526 -2 3 1036 2123 131 164 0 chr15 59186728 59187087 -44307887 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 3 1036 1797 145 29 20 chr15 59187974 59188319 -44306655 + ORR1B1 LTR MaLR 41 388 -6 3 1036 1004 268 81 6 chr15 59188316 59188650 -44306324 + MER68 LTR ERVL 83 441 -122 3 1036 1859 117 139 42 chr15 59202692 59203023 -44291951 - ORR1B2 LTR MaLR -4 363 1 3 1036 862 290 66 23 chr15 59207043 59207392 -44287582 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 1 3 1036 3234 39 21 0 chr15 59207549 59207937 -44287037 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1036 1182 242 131 11 chr15 59212034 59212393 -44282581 + MTD LTR MaLR 4 405 -14 4 1036 1196 202 238 93 chr15 59212491 59212551 -44282423 + MT2A LTR ERVL 4 53 -480 4 1036 1196 202 238 93 chr15 59212738 59213140 -44281834 + MT2A LTR ERVL 54 533 0 4 1036 1203 210 121 18 chr15 59214607 59214946 -44280028 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1036 1884 152 53 8 chr15 59226870 59227229 -44267745 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 20 4 1036 1138 204 72 24 chr15 59228881 59229172 -44265802 + ORR1D2 LTR MaLR 5 309 -61 4 1036 275 360 121 25 chr15 59229775 59230014 -44264960 - LTR40a LTR ERVL -8 511 250 4 1036 299 310 17 33 chr15 59230027 59230147 -44264827 - LTR40a LTR ERVL -377 142 25 4 1036 1168 206 205 123 chr15 59233234 59233676 -44261298 + MT2A LTR ERVL 1 459 -74 4 1036 1168 206 205 123 chr15 59233743 59233787 -44261187 + MT2A LTR ERVL 460 526 -7 4 1036 350 51 0 17 chr15 59239622 59239682 -44255292 + RMER17A2 LTR ERVK 450 508 -398 4 1037 2530 173 33 12 chr15 59257709 59258194 -44236780 + RLTR17 LTR ERVK 198 692 0 4 1037 252 280 85 31 chr15 59258747 59258876 -44236098 + MTEa LTR MaLR 244 379 0 4 1037 1872 181 118 11 chr15 59270403 59270783 -44224191 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1037 1238 212 107 48 chr15 59270892 59271228 -44223746 - ORR1E LTR MaLR -3 356 1 5 1037 473 273 129 53 chr15 59271832 59272095 -44222879 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 83 5 1037 3624 150 77 14 chr15 59272901 59273552 -44221422 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 5 1037 3686 182 82 4 chr15 59275185 59276005 -44218969 - ORR1B2-int LTR MaLR -623 886 3 5 1037 1573 140 219 7 chr15 59276005 59276306 -44218668 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 5 1037 379 277 82 34 chr15 59283948 59284094 -44210880 + MLT1B LTR MaLR 95 247 -143 5 1037 360 349 28 47 chr15 59284194 59284379 -44210595 + MLT1B LTR MaLR 200 467 0 5 1037 248 258 66 22 chr15 59285229 59285320 -44209654 + RMER21A LTR ERV1 93 187 -655 5 1037 260 257 26 95 chr15 59285323 59285361 -44209613 + RMER21A LTR ERV1 409 444 -503 5 1037 260 257 26 95 chr15 59285388 59285465 -44209509 + RMER21A LTR ERV1 445 516 -431 5 1037 346 277 21 84 chr15 59291062 59291204 -44203770 - ORR1E LTR MaLR -20 359 227 5 1037 463 274 94 19 chr15 59291223 59291383 -44203591 - ORR1E LTR MaLR -185 174 3 5 1037 2326 190 42 60 chr15 59302514 59303063 -44191911 + RLTR20A LTR ERVK 3 541 0 5 1037 2997 152 18 114 chr15 59310683 59311299 -44183675 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 557 0 5 1037 455 306 64 12 chr15 59338687 59338859 -44156115 + MLT1G3 LTR MaLR 107 287 -308 6 1037 260 183 10 146 chr15 59344256 59344352 -44150622 + MT2B LTR ERVL 154 236 -365 6 1037 3181 11 0 49 chr15 59350557 59350943 -44144031 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1037 778 196 0 7 chr15 59358528 59358667 -44136307 - MTEb LTR MaLR -241 138 1 6 1037 352 264 54 9 chr15 59361228 59361339 -44133635 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 293 6 1037 275 319 25 58 chr15 59361598 59361718 -44133256 - MLT1A1 LTR MaLR -266 142 27 6 1038 264 228 23 92 chr15 59391315 59391402 -44103572 + RLTR25B LTR ERVK 432 512 -516 6 1038 228 202 103 186 chr15 59403850 59403947 -44091027 + MT2B2 LTR ERVL 149 237 -347 7 1038 397 150 219 61 chr15 59410972 59410999 -44083975 + ORR1C2 LTR MaLR 253 277 -107 7 1038 397 150 219 61 chr15 59411021 59411107 -44083867 + ORR1C2 LTR MaLR 278 384 0 7 1038 1092 240 64 88 chr15 59441770 59442158 -44052816 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 7 1038 499 239 23 62 chr15 59442461 59442635 -44052339 + MTE2a LTR MaLR 245 404 -17 7 1038 3257 114 54 81 chr15 59442665 59443255 -44051719 + RMER15 LTR ERVL 1 574 -1 7 1038 352 247 23 23 chr15 59445808 59445895 -44049079 + ORR1E LTR MaLR 1 87 -272 8 1038 258 295 0 33 chr15 59449038 59449129 -44045845 + MLT1A1 LTR MaLR 314 401 -7 8 1038 874 247 123 38 chr15 59449839 59449891 -44045083 - MTEb LTR MaLR 0 379 327 8 1038 874 247 123 38 chr15 59449951 59450005 -44044969 - MTEb LTR MaLR -53 326 246 8 1038 874 247 123 38 chr15 59450068 59450276 -44044698 - MTEb LTR MaLR -134 245 39 8 1038 2046 142 83 0 chr15 59450592 59450999 -44043975 - RMER10A LTR ERVL -1 441 1 8 1038 255 268 124 0 chr15 59453844 59453941 -44041033 + LTR16A LTR ERVL 330 438 -13 8 1038 837 262 60 16 chr15 59458328 59458580 -44036394 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 146 8 1038 263 321 131 6 chr15 59458799 59458959 -44036015 + MLT1H LTR MaLR 72 251 -298 8 1038 239 303 89 20 chr15 59459071 59459172 -44035802 + MLT1H LTR MaLR 370 477 -12 8 1038 556 325 105 38 chr15 59460151 59460626 -44034348 + MLT2B4 LTR ERVL 1 497 -18 8 1038 250 228 150 75 chr15 59463900 59464033 -44030941 - MT2B LTR ERVL -367 234 92 8 1038 343 329 32 19 chr15 59467533 59467691 -44027283 - MLT1B LTR MaLR -5 385 226 8 1038 322 275 62 27 chr15 59470635 59470747 -44024227 - MTEa LTR MaLR -1 378 263 8 1038 292 373 33 14 chr15 59471149 59471361 -44023613 - MLT1H1 LTR MaLR -269 286 71 8 1038 850 344 10 13 chr15 59472070 59472379 -44022595 + MTEa LTR MaLR 61 368 -11 8 1038 512 258 44 34 chr15 59472476 59472940 -44022034 + RMER17C LTR ERVK 1 361 -49 8 1038 382 330 99 33 chr15 59477231 59477504 -44017470 - LTR33A LTR ERVL -20 500 210 8 1038 828 257 30 0 chr15 59498048 59498250 -43996724 + MTD LTR MaLR 14 221 -198 9 1038 659 188 102 0 chr15 59500222 59500350 -43994624 + MTD LTR MaLR 1 141 -278 1 1038 679 187 15 23 chr15 59504254 59504404 -43990570 + ORR1C1 LTR MaLR 1 141 -253 7 1038 310 164 0 38 chr15 59504405 59504487 -43990487 + ORR1B1 LTR MaLR 44 124 -270 8 1039 1345 172 27 24 chr15 59507247 59507364 -43987610 - RMER17C LTR ERVK -112 298 185 1 1039 1345 172 27 24 chr15 59507479 59507658 -43987316 - RMER17C LTR ERVK -226 184 2 1 1039 2007 152 13 155 chr15 59509104 59509563 -43985411 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1039 805 237 21 5 chr15 59513136 59513327 -43981647 + MT2A LTR ERVL 1 194 -339 3 1039 452 250 158 0 chr15 59514834 59514954 -43980020 + MTE2b LTR MaLR 1 139 -240 3 1039 414 272 19 37 chr15 59514985 59515092 -43979882 + MTE2b LTR MaLR 272 376 -3 3 1039 629 251 57 61 chr15 59515092 59515288 -43979686 + MTEa LTR MaLR 184 378 -1 3 1039 566 233 231 110 chr15 59516162 59516300 -43978674 - MTEb LTR MaLR -52 327 211 3 1039 566 233 231 110 chr15 59516380 59516531 -43978443 - MTEb LTR MaLR -169 210 5 3 1039 2028 125 34 15 chr15 59520304 59520629 -43974345 - MTB_Mm LTR MaLR -76 331 1 4 1039 461 277 21 21 chr15 59521748 59521888 -43973086 + MLT1A0 LTR MaLR 7 146 -219 4 1039 291 242 60 16 chr15 59521916 59522038 -43972936 + MLT1A0 LTR MaLR 227 340 -25 4 1039 801 234 64 57 chr15 59525633 59525714 -43969260 + ORR1C2 LTR MaLR 81 211 -173 5 1039 801 189 60 44 chr15 59525772 59525938 -43969036 + ORR1C2 LTR MaLR 212 384 0 5 1039 1431 250 62 71 chr15 59525943 59526293 -43968681 + MT2A LTR ERVL 1 347 -186 5 1039 1431 250 62 71 chr15 59526439 59526540 -43968434 + MT2A LTR ERVL 348 447 -86 5 1039 291 232 90 0 chr15 59526844 59526934 -43968040 + MTD LTR MaLR 273 379 0 5 1039 307 271 83 17 chr15 59527992 59528112 -43966862 + MLT1A1 LTR MaLR 1 128 -280 6 1039 242 232 70 28 chr15 59529356 59529427 -43965547 - MTEb LTR MaLR 0 379 306 6 1039 322 236 52 78 chr15 59533703 59533818 -43961156 + MLT1A0 LTR MaLR 6 117 -248 7 1039 822 248 101 64 chr15 59537009 59537354 -43957620 + ORR1E LTR MaLR 1 358 -1 8 1039 232 283 17 0 chr15 59537677 59537737 -43957237 + MLT1H LTR MaLR 70 130 -419 8 1039 3444 35 2 0 chr15 59542286 59542681 -43952293 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1039 290 176 105 26 chr15 59545624 59545700 -43949274 - RMER21B LTR ERV1 -113 834 753 1 1039 442 284 117 63 chr15 59545708 59546127 -43948847 - RMER21B LTR ERV1 -275 567 83 1 1039 2473 155 142 21 chr15 59547226 59547739 -43947235 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 1 1039 372 238 89 16 chr15 59549896 59550020 -43944954 - MTE2a LTR MaLR 0 379 247 1 1039 2879 102 5 5 chr15 59551493 59551896 -43943078 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 1 1039 1544 265 34 6 chr15 59554858 59555215 -43939759 - MTE2b LTR MaLR -3 376 10 1 1039 308 325 26 0 chr15 59555474 59555588 -43939386 + MLT2B3 LTR ERVL 1 117 -437 1 1039 536 276 79 0 chr15 59555800 59556073 -43938901 + MTEa LTR MaLR 8 367 -12 1 1039 231 298 47 19 chr15 59558028 59558134 -43936840 + LTR16E1 LTR ERVL 422 530 -8 1 1039 497 307 0 16 chr15 59558815 59558970 -43936004 - MTE2b LTR MaLR -216 163 13 1 1039 382 349 64 23 chr15 59561643 59561816 -43933158 + MLT1F2 LTR MaLR 20 199 -356 1 1039 459 308 117 32 chr15 59563612 59563810 -43931164 + MLT1F2 LTR MaLR 194 494 -186 1 1039 1122 323 129 65 chr15 59569144 59569581 -43925393 - MER21B LTR ERV1 -70 793 326 1 1039 1122 323 129 65 chr15 59569683 59569973 -43925001 - MER21B LTR ERV1 -538 325 20 1 1039 814 311 131 71 chr15 59570084 59570579 -43924395 - MLT1F2 LTR MaLR -24 536 12 1 1039 635 338 113 26 chr15 59573702 59574012 -43920962 + MLT1D LTR MaLR 151 487 -18 1 1039 1018 249 99 69 chr15 59574707 59574799 -43920175 + MTE2a LTR MaLR 6 80 -299 1 1039 1018 249 99 69 chr15 59574852 59575122 -43919852 + MTE2a LTR MaLR 81 379 0 1 1039 465 333 0 0 chr15 59575481 59575613 -43919361 + ORR1E LTR MaLR 18 149 -210 1 1039 437 300 52 112 chr15 59575630 59575881 -43919093 + ORR1E LTR MaLR 124 359 0 1 1039 580 284 54 86 chr15 59583865 59584143 -43910831 - ORR1E LTR MaLR -9 350 82 1 1039 2528 188 64 32 chr15 59589858 59590418 -43904556 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 578 0 2 1039 341 264 11 11 chr15 59593910 59594002 -43900972 + ORR1E LTR MaLR 1 92 -267 2 1039 338 299 91 106 chr15 59594034 59594232 -43900742 + ORR1E LTR MaLR 165 359 0 2 1039 365 185 11 27 chr15 59595444 59595534 -43899440 + ORR1D1 LTR MaLR 292 384 0 2 1039 2066 73 70 0 chr15 59595841 59596127 -43898847 + RLTR10D LTR ERVK 1 306 -53 2 1039 34865 175 8 11 chr15 59596132 59602012 -43892962 + IAP-d-int LTR ERVK 323 6184 -358 2 1039 2716 188 21 22 chr15 59602055 59602690 -43892284 + IAP-d-int LTR ERVK 5645 6542 0 2 1039 2655 73 56 0 chr15 59602690 59603030 -43891944 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 2 1039 825 292 80 54 chr15 59603569 59603905 -43891069 - ORR1E LTR MaLR -6 353 9 2 1039 317 315 56 7 chr15 59604788 59604932 -43890042 + MLT1J1 LTR MaLR 36 186 -258 2 1039 319 352 190 38 chr15 59605195 59605557 -43889417 - LTR79 LTR ERVL -110 417 1 2 1039 926 241 142 39 chr15 59609742 59610193 -43884781 - MT2A LTR ERVL 0 533 56 2 1039 607 179 0 9 chr15 59610506 59610613 -43884361 - MT2A LTR ERVL -427 106 1 2 1039 318 288 11 119 chr15 59611500 59611677 -43883297 + MLT1B LTR MaLR 187 344 -46 2 1039 405 324 25 66 chr15 59612383 59612648 -43882326 - MLT1H2 LTR MaLR 0 680 192 2 1039 368 329 19 44 chr15 59615315 59615474 -43879500 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 680 834 -5 2 1039 529 332 117 76 chr15 59619929 59620271 -43874703 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 2 1039 920 307 113 34 chr15 59622443 59622770 -43872204 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 2 1039 2039 122 18 56 chr15 59626113 59626451 -43868523 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 2 1039 657 297 172 53 chr15 59629484 59629804 -43865170 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 2 1039 699 281 94 89 chr15 59630576 59630959 -43864015 + MLT1B LTR MaLR 1 385 -5 2 1039 3529 13 5 8 chr15 59632040 59632437 -43862537 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1039 9263 35 4 1 chr15 59632437 59633532 -43861442 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1039 3555 15 5 0 chr15 59633532 59633926 -43861048 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1039 605 307 27 111 chr15 59635222 59635573 -43859401 + ORR1E LTR MaLR 8 364 -15 2 1040 383 379 82 5 chr15 59638680 59638900 -43856074 + MLT1H LTR MaLR 49 285 -264 2 1040 389 193 0 78 chr15 59641343 59641433 -43853541 + MTEb LTR MaLR 289 371 -8 2 1040 348 264 26 60 chr15 59642405 59642522 -43852452 + ORR1E LTR MaLR 1 113 -246 2 1040 234 327 79 47 chr15 59645776 59645988 -43848986 + MLT1E2 LTR MaLR 17 293 -334 2 1040 1070 201 156 40 chr15 59651825 59652146 -43842828 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 3 1040 862 234 69 136 chr15 59653190 59653595 -43841379 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 3 1040 625 325 104 88 chr15 59664041 59664071 -43830903 + MLT1E1A LTR MaLR 1 35 -525 3 1040 659 320 69 67 chr15 59664535 59665051 -43829923 + MLT1E1A LTR MaLR 36 670 -10 3 1040 233 400 47 41 chr15 59666331 59666503 -43828471 - LTR16C LTR ERVL -124 365 193 3 1040 844 324 92 36 chr15 59672075 59672661 -43822313 - LTR83 LTR ERVL -139 641 23 3 1040 661 267 15 0 chr15 59679352 59679483 -43815491 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 3 1040 229 213 0 0 chr15 59679880 59679927 -43815047 - ORR1E LTR MaLR -4 355 309 3 1040 936 241 52 121 chr15 59684505 59684911 -43810063 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 3 1040 4229 35 0 0 chr15 59686699 59687181 -43807793 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 3 1040 302 208 48 68 chr15 59689288 59689391 -43805583 + RMER15 LTR ERVL 61 161 -414 3 1040 795 299 45 10 chr15 59689388 59689679 -43805295 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 3 1040 266 172 69 0 chr15 59691453 59691511 -43803463 + MLT1A1 LTR MaLR 35 96 -312 3 1040 313 261 45 0 chr15 59696411 59696499 -43798475 - MLT1J1 LTR MaLR -350 94 3 3 1040 515 320 64 67 chr15 59699393 59699705 -43795269 - MLT1J LTR MaLR -140 372 62 3 1040 973 294 85 76 chr15 59699736 59700180 -43794794 - RMER5 LTR ERV1 0 534 73 3 1040 973 294 85 76 chr15 59700376 59700460 -43794514 - RMER5 LTR ERV1 -462 72 1 3 1040 1492 203 130 24 chr15 59701566 59701935 -43793039 - MTD LTR MaLR -9 410 3 3 1040 2272 132 56 70 chr15 59702244 59702726 -43792248 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1040 4897 67 4 33 chr15 59702728 59703415 -43791559 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 3 1040 454 66 0 32 chr15 59703415 59703478 -43791496 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 3 1040 1876 111 4 4 chr15 59703467 59703729 -43791245 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 3 1040 937 88 24 0 chr15 59703724 59703849 -43791125 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 3 1040 21321 16 2 2 chr15 59703851 59706212 -43788762 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 3 1040 2122 138 48 62 chr15 59706212 59706693 -43788281 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 474 -1 3 1040 1403 226 70 146 chr15 59706971 59707540 -43787434 - RMER15 LTR ERVL -20 555 30 3 1040 1283 245 49 19 chr15 59709471 59709837 -43785137 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 3 1040 692 240 223 31 chr15 59709977 59710300 -43784674 - MT2B LTR ERVL -216 385 1 4 1040 4519 239 128 18 chr15 59710300 59711681 -43783293 - MTEb-int LTR MaLR -43 1537 1 4 1040 1335 241 57 29 chr15 59711798 59712149 -43782825 - MTEb LTR MaLR -18 361 1 4 1040 274 248 18 98 chr15 59713168 59713280 -43781694 - MLT1A0 LTR MaLR -260 105 3 4 1040 422 280 195 24 chr15 59714470 59714675 -43780299 - MLT1C LTR MaLR -4 463 224 4 1040 768 251 22 0 chr15 59714813 59714996 -43779978 + MTE2a LTR MaLR 5 191 -188 4 1040 566 220 98 25 chr15 59715700 59715863 -43779111 + MTE2a LTR MaLR 205 379 0 4 1040 3336 64 5 0 chr15 59718388 59718793 -43776181 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1040 483 281 41 167 chr15 59720863 59721252 -43773722 - ORR1E LTR MaLR 0 359 20 4 1040 638 267 143 8 chr15 59723311 59723549 -43771425 - MLT2D LTR ERVL -140 274 5 4 1040 1301 298 106 35 chr15 59724894 59725555 -43769419 + LTR82A LTR ERVL 2 709 -163 4 1040 276 140 20 20 chr15 59725644 59725695 -43769279 - MLT2D LTR ERVL -363 51 1 4 1040 289 317 0 0 chr15 59726837 59726919 -43768055 + MER34 LTR ERV1 1 82 -460 4 1040 332 319 79 58 chr15 59729832 59730072 -43764902 + LTR79 LTR ERVL 273 517 -10 4 1040 308 284 98 43 chr15 59739251 59739424 -43755550 + MLT1A1 LTR MaLR 1 185 -223 4 1040 931 270 83 26 chr15 59740519 59740869 -43754105 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 1040 1719 270 153 78 chr15 59740869 59741544 -43753430 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 646 4 1040 264 312 119 91 chr15 59741820 59741996 -43752978 + LTR16B LTR ERVL 51 231 -232 4 1040 556 347 68 32 chr15 59742013 59742453 -43752521 + MLT2C2 LTR ERVL 1 456 -8 4 1040 344 289 102 76 chr15 59742855 59743091 -43751883 + MLT1D LTR MaLR 1 242 -263 4 1040 1134 219 53 8 chr15 59750471 59750733 -43744241 + MTD LTR MaLR 132 405 -14 4 1040 258 350 10 0 chr15 59750774 59750877 -43744097 - MLT1L LTR MaLR -394 216 113 4 1040 2022 173 8 8 chr15 59751011 59751384 -43743590 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 4 4 1040 888 277 80 40 chr15 59755315 59755642 -43739332 - MLT1A0 LTR MaLR -11 354 15 4 1040 279 388 50 11 chr15 59756713 59756893 -43738081 - MLT1H1 LTR MaLR -342 213 27 4 1040 632 289 62 81 chr15 59757595 59757967 -43737007 + MLT1A0 LTR MaLR 1 365 0 4 1040 431 332 140 86 chr15 59762324 59762732 -43732242 + MLT2B1 LTR ERVL 1 430 -90 4 1040 839 277 21 34 chr15 59762811 59763050 -43731924 + MTE2b LTR MaLR 2 237 -142 4 1040 313 325 170 30 chr15 59763562 59763797 -43731177 + MLT1L LTR MaLR 335 602 -8 4 1040 455 342 84 71 chr15 59764138 59764506 -43730468 + MTEb LTR MaLR 1 373 -6 4 1040 1519 183 81 39 chr15 59766305 59766664 -43728310 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1040 2104 131 140 13 chr15 59767564 59767936 -43727038 - MTC LTR MaLR -2 419 1 5 1041 633 288 106 11 chr15 59769163 59769437 -43725537 + RMER15 LTR ERVL 274 573 -2 5 1041 775 282 79 25 chr15 59771148 59771428 -43723546 - MTE2a LTR MaLR -84 295 1 5 1041 484 351 41 90 chr15 59771873 59772239 -43722735 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 5 1041 335 289 106 53 chr15 59772399 59772644 -43722330 - LTR81B LTR ERV1? -1134 259 2 5 1041 1999 174 70 0 chr15 59772899 59773256 -43721718 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 5 1041 976 238 96 119 chr15 59773956 59774288 -43720686 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1041 462 186 21 0 chr15 59774306 59774403 -43720571 - ORR1C2 LTR MaLR -285 99 1 5 1041 332 298 102 31 chr15 59785703 59785831 -43709143 + LTR45 LTR ERV1 372 508 -17 5 1041 925 312 84 25 chr15 59789078 59789472 -43705502 + LTR16C LTR ERVL 71 487 -2 5 1041 295 335 59 19 chr15 59793340 59793492 -43701482 + MLT1H LTR MaLR 38 229 -320 5 1041 2260 135 112 6 chr15 59796140 59796506 -43698468 - RLTR44A LTR ERVK 0 405 1 5 1041 972 338 23 14 chr15 59796912 59797257 -43697717 + MLT1A0 LTR MaLR 1 348 -17 5 1041 288 248 25 107 chr15 59797526 59797648 -43697326 - MT2B LTR ERVL -338 263 152 5 1041 1144 270 36 92 chr15 59798122 59798570 -43696404 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 5 1041 3365 56 5 2 chr15 59801148 59801543 -43693431 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1041 1522 171 89 3 chr15 59808309 59808615 -43686359 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -7 360 1 5 1041 259 323 51 58 chr15 59812511 59812649 -43682325 + MLT1J2 LTR MaLR 281 417 -31 5 1041 299 229 47 24 chr15 59816170 59816255 -43678719 - MTD LTR MaLR -323 96 10 5 1041 1403 204 121 6 chr15 59819444 59819774 -43675200 + ORR1D1 LTR MaLR 1 368 -6 5 1041 488 317 46 77 chr15 59819782 59820042 -43674932 + MLT1D-int LTR MaLR 1120 1371 0 5 1041 705 311 158 23 chr15 59820042 59820433 -43674541 + MLT1D LTR MaLR 15 459 -46 5 1041 315 232 67 59 chr15 59825119 59825238 -43669736 - MLT1G3 LTR MaLR 0 489 370 6 1041 477 297 50 7 chr15 59826791 59826930 -43668044 - MLT1G3 LTR MaLR -429 166 22 6 1041 518 201 48 14 chr15 59830568 59830590 -43664384 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -69 2257 2237 6 1041 518 201 48 14 chr15 59831245 59831368 -43663606 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -90 2236 2107 6 1041 1762 121 48 0 chr15 59831371 59831643 -43663331 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 6 1041 4299 188 75 78 chr15 59833564 59834636 -43660338 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 36 6 1041 10384 140 29 39 chr15 59834808 59836671 -43658303 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 5 6 1041 1060 261 149 21 chr15 59840696 59841032 -43653942 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1041 591 305 0 7 chr15 59850431 59850583 -43644391 + MTD LTR MaLR 46 196 -223 6 1041 971 262 33 0 chr15 59851044 59851258 -43643716 + MTD LTR MaLR 196 416 -3 6 1041 296 320 58 0 chr15 59854108 59854211 -43640763 + ORR1E LTR MaLR 3 111 -248 6 1041 302 376 22 22 chr15 59858428 59858564 -43636410 - MLT2F LTR ERVL -308 355 220 6 1041 335 164 29 29 chr15 59862995 59863064 -43631910 + MLT1B LTR MaLR 308 376 -14 6 1041 2338 99 12 0 chr15 59863663 59863986 -43630988 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1041 489 348 99 108 chr15 59865117 59865562 -43629412 - LTR16B1 LTR ERVL -9 471 31 6 1041 302 396 48 40 chr15 59879586 59879836 -43615138 - LTR16E1 LTR ERVL -80 458 207 7 1041 535 309 78 11 chr15 59880868 59881048 -43613926 - MER77 LTR ERVL -1 606 415 7 1041 316 290 60 110 chr15 59888785 59888967 -43606007 + MLT1J LTR MaLR 224 396 -116 7 1042 1187 258 84 32 chr15 59904839 59905184 -43589790 + ORR1D2 LTR MaLR 1 363 -7 7 1042 2969 76 2 12 chr15 59907489 59907889 -43587085 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1042 574 198 0 70 chr15 59913763 59913877 -43581097 + RMER12 LTR ERVK 1217 1322 0 7 1042 281 281 67 52 chr15 59928428 59928563 -43566411 - MT2B LTR ERVL -322 279 143 7 1042 3380 61 71 11 chr15 59940942 59941390 -43553584 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 8 1042 238 293 163 15 chr15 59950227 59950362 -43544612 - RMER15 LTR ERVL -15 560 406 8 1042 298 344 126 82 chr15 59956156 59956473 -43538501 - MER92A LTR ERV1 -1 411 81 8 1042 249 373 52 65 chr15 59956776 59957224 -43537750 + MLT1H LTR MaLR 17 447 -132 8 1042 2199 131 50 25 chr15 59965418 59965817 -43529157 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 8 1042 685 330 94 101 chr15 59966844 59966955 -43528019 - MER34A1 LTR ERV1 -7 580 466 8 1042 685 330 94 101 chr15 59967009 59967481 -43527493 - MER34A1 LTR ERV1 -122 465 1 8 1042 352 295 62 54 chr15 59970803 59970932 -43524042 + LTR16C LTR ERVL 357 486 -3 8 1042 390 325 116 64 chr15 59972014 59972264 -43522710 - MTEa LTR MaLR -116 263 1 8 1042 266 254 13 90 chr15 59996524 59996602 -43498372 + MER31B LTR ERV1 5 76 -390 8 1042 258 359 57 20 chr15 60011794 60012095 -43482879 - MER31-int LTR ERV1 -746 4190 3879 3 1042 996 285 49 88 chr15 60017183 60017914 -43477060 - MER31-int LTR ERV1 -3490 1446 744 3 1042 984 204 31 129 chr15 60019054 60019410 -43475564 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 409 0 5 1042 271 300 129 32 chr15 60022776 60022890 -43472084 + MER89 LTR ERV1 213 338 -221 9 1042 659 299 117 96 chr15 60022890 60023128 -43471846 - MTD LTR MaLR 0 419 165 1 1042 659 299 117 96 chr15 60023266 60023404 -43471570 - MTD LTR MaLR -255 164 35 1 1042 248 382 52 26 chr15 60023399 60023590 -43471384 + MER89 LTR ERV1 326 521 -38 9 1042 399 359 52 12 chr15 60024710 60024961 -43470013 + MER89-int LTR ERV1 3140 3400 -3401 1 1042 250 390 88 4 chr15 60025970 60026220 -43468754 + MER89-int LTR ERV1 4542 4812 -1989 1 1042 269 333 84 19 chr15 60026851 60027065 -43467909 + MER89-int LTR ERV1 4855 5082 -1719 1 1042 772 288 30 15 chr15 60027346 60027614 -43467360 + MER89-int LTR ERV1 5587 5858 -943 1 1042 240 283 0 0 chr15 60027968 60028028 -43466946 + MER92B LTR ERV1 1 60 -576 1 1043 465 359 51 47 chr15 60038645 60038920 -43456054 - MLT1H LTR MaLR -206 343 68 3 1043 1052 281 100 3 chr15 60039425 60039735 -43455239 - MTD LTR MaLR -1 418 68 3 1043 1484 248 134 54 chr15 60040014 60040589 -43454385 - MTC-int LTR MaLR -4 1254 634 3 1043 2955 62 39 13 chr15 60041541 60041931 -43453043 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1043 651 244 15 0 chr15 60042502 60042633 -43452341 - ETnERV2-int LTR ERVK -204 7202 7070 3 1043 247 384 103 36 chr15 60045715 60046045 -43448929 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 4 1043 1642 245 49 8 chr15 60049406 60049793 -43445181 + MTD LTR MaLR 1 403 -16 5 1043 1541 246 68 8 chr15 60049827 60050224 -43444750 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1043 1857 134 73 179 chr15 60050280 60050661 -43444313 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 107 5 1043 1857 134 73 179 chr15 60050842 60050941 -43444033 - RLTR23 LTR ERV1 -324 106 1 5 1043 1258 203 28 39 chr15 60052522 60052806 -43442168 + ORR1C2 LTR MaLR 4 287 -72 5 1043 902 308 57 62 chr15 60053684 60054055 -43440919 + MLT1B LTR MaLR 20 388 -2 5 1043 610 334 83 65 chr15 60056134 60056579 -43438395 - MLT1C LTR MaLR 0 467 15 6 1043 491 297 73 99 chr15 60058023 60058296 -43436678 + LTR80B LTR ERVL 71 336 -248 6 1043 875 338 116 23 chr15 60058537 60058934 -43436040 + MER70A LTR ERVL 39 472 0 6 1043 634 328 133 63 chr15 60071040 60071467 -43423507 + MLT1D LTR MaLR 21 477 -28 8 1043 1334 246 122 9 chr15 60075947 60076275 -43418699 + ORR1D2 LTR MaLR 1 365 -5 9 1043 953 235 51 0 chr15 60076280 60076497 -43418477 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 228 -1142 9 1043 526 304 96 63 chr15 60081126 60081428 -43413546 - LTR52 LTR ERVL -69 352 41 1 1043 287 166 139 5 chr15 60082111 60082305 -43412669 + RMER17A2 LTR ERVK 270 489 -417 1 1043 1357 223 31 0 chr15 60084180 60084440 -43410534 - MTD LTR MaLR -151 268 1 1 1043 1848 203 25 60 chr15 60086885 60087283 -43407691 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1043 263 290 0 28 chr15 60087668 60087739 -43407235 - MLT1I LTR MaLR -267 144 76 1 1043 1246 295 87 8 chr15 60093996 60094751 -43400223 - ERVL-int LTR ERVL -3250 2507 1630 1 1043 1297 221 50 48 chr15 60095918 60096266 -43398708 + ORR1C2 LTR MaLR 36 384 0 1 1043 244 319 0 0 chr15 60096604 60096676 -43398298 - MLT2B2 LTR ERVL -406 109 38 1 1043 1173 217 75 83 chr15 60103029 60103459 -43391515 - RLTR26 LTR ERVK -168 474 15 1 1043 2245 168 13 0 chr15 60103462 60103843 -43391131 - MERVK26-int LTR ERVK -7 6912 6527 1 1043 660 320 77 52 chr15 60107152 60107522 -43387452 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1043 679 297 70 16 chr15 60109869 60110112 -43384862 + MLT1C LTR MaLR 39 294 -173 1 1043 286 318 14 79 chr15 60110126 60110266 -43384708 + MLT1C LTR MaLR 337 467 0 1 1043 892 304 75 43 chr15 60114029 60114427 -43380547 - MTD LTR MaLR 0 419 9 1 1043 1882 22 5 0 chr15 60116301 60116524 -43378450 + MTA_Mm LTR MaLR 119 342 -54 1 1043 813 232 58 50 chr15 60117241 60117518 -43377456 - RLTR12B LTR ERVK -10 518 240 1 1043 797 268 39 46 chr15 60117500 60117785 -43377189 - RLTR12B LTR ERVK -199 329 47 1 1043 1781 231 95 78 chr15 60120780 60121381 -43373593 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1043 730 318 35 10 chr15 60121508 60121797 -43373177 + MERVK26-int LTR ERVK 6311 6606 -313 1 1043 442 313 52 167 chr15 60125848 60126404 -43368570 - MLT1D LTR MaLR -2 503 12 1 1043 288 231 0 49 chr15 60130533 60130615 -43364359 - MTEa LTR MaLR -47 332 255 1 1043 2590 202 20 10 chr15 60131852 60132353 -43362621 + RLTR19C LTR ERVK 1 506 0 1 1043 894 278 99 76 chr15 60133720 60134183 -43360791 - RLTR26 LTR ERVK -168 474 1 1 1043 7683 55 10 1 chr15 60136815 60137814 -43357160 - MTA_Mm-int LTR MaLR -88 1010 3 1 1043 3629 25 5 0 chr15 60137817 60138211 -43356763 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1043 768 290 83 8 chr15 60139201 60139441 -43355533 + MTEb LTR MaLR 3 260 -119 1 1043 499 253 90 37 chr15 60140580 60140769 -43354205 + LTR50 LTR ERVL 13 211 -584 1 1043 661 308 41 59 chr15 60142586 60143016 -43351958 - BGLII_B LTR ERVK -18 423 11 2 1043 2196 135 45 15 chr15 60143298 60143696 -43351278 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 1043 885 212 108 120 chr15 60150790 60151189 -43343785 + MT2A LTR ERVL 1 526 -75 2 1043 2897 18 0 0 chr15 60151486 60151824 -43343150 + ORR1A0 LTR MaLR 1 338 -8 2 1043 934 274 67 93 chr15 60155699 60155965 -43339009 - MTE2b LTR MaLR 0 379 115 2 1043 3600 33 2 0 chr15 60155965 60156358 -43338616 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 2 1043 934 274 67 93 chr15 60156358 60156478 -43338496 - MTE2b LTR MaLR -265 114 3 2 1043 508 175 57 57 chr15 60157906 60158100 -43336874 - RMER17C LTR ERVK -135 275 82 2 1043 510 305 199 35 chr15 60158466 60158843 -43336131 + LTR16A LTR ERVL 9 447 -4 2 1043 1487 196 81 10 chr15 60159697 60160006 -43334968 + ORR1B2 LTR MaLR 1 331 -36 2 1044 287 262 25 12 chr15 60168074 60168155 -43326819 - MLT1D LTR MaLR -153 352 271 2 1044 1213 321 138 58 chr15 60168309 60169069 -43325905 + MER21B LTR ERV1 43 863 0 2 1044 239 302 31 10 chr15 60175238 60175335 -43319639 + MTEb LTR MaLR 279 377 -2 2 1044 3539 132 34 49 chr15 60175758 60176409 -43318565 - RLTR26 LTR ERVK -1 641 1 2 1044 352 384 54 48 chr15 60200900 60201015 -43293959 - MLT1C LTR MaLR -29 438 332 2 1044 352 384 54 48 chr15 60201239 60201495 -43293479 - MLT1C LTR MaLR -136 331 65 2 1044 421 274 11 0 chr15 60202142 60202237 -43292737 - MTE2b LTR MaLR -282 97 2 2 1044 1131 228 96 55 chr15 60202847 60203314 -43291660 - MT2B LTR ERVL -60 541 6 2 1044 804 235 64 133 chr15 60204746 60205153 -43289821 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1044 286 317 12 0 chr15 60205429 60205511 -43289463 + MTE2a LTR MaLR 282 364 -15 2 1044 237 233 48 135 chr15 60205548 60205652 -43289322 + MT2B LTR ERVL 160 254 -347 2 1044 228 352 113 9 chr15 60207794 60207900 -43287074 - MLT1B LTR MaLR -70 320 204 2 1044 804 208 112 0 chr15 60209626 60209804 -43285170 - MTD LTR MaLR -8 411 214 2 1044 665 194 239 28 chr15 60210035 60210206 -43284768 - MTD LTR MaLR -212 209 1 2 1044 2533 135 79 49 chr15 60210780 60210884 -43284090 + RLTR17 LTR ERVK 212 326 -366 2 1044 2533 135 79 49 chr15 60211096 60211458 -43283516 + RLTR17 LTR ERVK 327 692 0 2 1044 986 228 67 61 chr15 60211466 60211853 -43283121 + RMER3D-int LTR ERVK 10 713 -2129 2 1044 6808 177 54 56 chr15 60212019 60213879 -43281095 + RMER3D-int LTR ERVK 464 2842 0 2 1044 2118 131 35 54 chr15 60213879 60214251 -43280723 + RLTR17 LTR ERVK 4 368 -324 2 1044 495 186 0 97 chr15 60240280 60240393 -43254581 - ORR1B1 LTR MaLR -292 102 1 3 1044 752 290 111 41 chr15 60250963 60251279 -43243695 + RLTR14 LTR ERV1 1 338 -44 3 1044 1708 240 34 124 chr15 60256302 60256972 -43238002 + RMER19C LTR ERVK 2 611 0 3 1044 1425 205 199 3 chr15 60282452 60282794 -43212180 - MTD LTR MaLR -8 411 3 3 1044 515 331 72 72 chr15 60284038 60284373 -43210601 + ORR1E LTR MaLR 25 359 0 3 1044 1655 229 83 71 chr15 60288002 60288036 -43206938 - RLTR11A LTR ERVK -28 500 466 3 1044 1655 229 83 71 chr15 60288108 60288137 -43206837 - RLTR11A LTR ERVK -63 465 452 3 1044 1655 229 83 71 chr15 60288209 60288638 -43206336 - RLTR11A LTR ERVK -77 451 2 3 1045 1789 187 40 3 chr15 60303486 60303835 -43191139 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 4 3 1045 1333 198 205 46 chr15 60305489 60305860 -43189114 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 3 1045 766 316 88 50 chr15 60306094 60306457 -43188517 - MLT2D LTR ERVL -11 403 27 3 1045 297 274 106 65 chr15 60308659 60308893 -43186081 - MTEa LTR MaLR -3 376 115 3 1045 1660 258 39 22 chr15 60309368 60309780 -43185194 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1045 2077 164 51 17 chr15 60310967 60311376 -43183598 - RMER10A LTR ERVL -19 423 1 4 1045 444 362 7 0 chr15 60319834 60319972 -43175002 + MTEb LTR MaLR 3 141 -218 4 1045 1130 329 3 16 chr15 60320035 60320350 -43174624 + MTE2b LTR MaLR 58 368 -11 4 1045 458 180 37 171 chr15 60320397 60320516 -43174458 + MTEb LTR MaLR 212 339 -40 4 1045 449 172 33 174 chr15 60320864 60320909 -43174065 + MTEb LTR MaLR 335 368 -11 4 1045 252 267 158 104 chr15 60335151 60335555 -43159419 - MLT1H1 LTR MaLR -28 461 42 4 1045 1575 182 111 9 chr15 60342444 60342777 -43152197 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 1045 4388 148 47 51 chr15 60345244 60346153 -43148821 + RMER17A2 LTR ERVK 1 906 0 4 1045 1524 279 47 0 chr15 60346870 60347257 -43147717 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1045 1577 236 162 45 chr15 60347894 60348426 -43146548 - RMER19B LTR ERVK 0 902 309 4 1045 273 333 83 0 chr15 60350953 60351073 -43143901 - MLT1F2 LTR MaLR -25 480 351 4 1045 489 323 40 45 chr15 60351363 60351561 -43143413 - MLT1F2 LTR MaLR -77 483 287 4 1045 5161 150 10 47 chr15 60351662 60352387 -43142587 + RMER12 LTR ERVK 7 713 -609 4 1045 5161 150 10 47 chr15 60352635 60352818 -43142156 + RMER12 LTR ERVK 714 890 -432 4 1045 821 180 68 98 chr15 60353184 60353456 -43141518 + RMER12 LTR ERVK 988 1302 -20 4 1045 297 388 158 32 chr15 60353959 60354212 -43140762 - MLT1F2 LTR MaLR -275 285 1 4 1045 348 317 0 0 chr15 60356793 60356912 -43138062 - MTEa LTR MaLR -258 121 3 4 1045 462 377 10 10 chr15 60358618 60358819 -43136155 - MLT1D LTR MaLR -11 494 294 4 1045 251 267 0 32 chr15 60359017 60359079 -43135895 - MLT2B4 LTR ERVL -473 83 24 4 1045 446 297 43 19 chr15 60359167 60359328 -43135646 - MLT1D LTR MaLR -309 196 32 4 1045 1016 75 22 0 chr15 60360862 60360996 -43133978 + ORR1A2 LTR MaLR 148 284 -43 4 1045 2609 212 19 61 chr15 60366276 60366914 -43128060 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 1045 2487 89 37 37 chr15 60367963 60368372 -43126602 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 1045 387 349 132 35 chr15 60369496 60369754 -43125220 + RMER15 LTR ERVL 275 557 -18 4 1045 255 264 0 94 chr15 60371829 60371925 -43123049 + MTE2a LTR MaLR 1 87 -292 4 1045 594 265 186 80 chr15 60371917 60372266 -43122708 - RMER12 LTR ERVK -141 1181 952 4 1045 706 249 63 28 chr15 60372331 60372561 -43122413 + MTE2a LTR MaLR 141 379 0 4 1045 1380 224 68 20 chr15 60373604 60373955 -43121019 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 4 1045 2205 156 73 13 chr15 60374618 60375015 -43119959 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1045 241 250 104 42 chr15 60377981 60378077 -43116897 + ORR1B1-int LTR MaLR 823 924 -585 5 1045 518 314 38 63 chr15 60378092 60378330 -43116644 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 171 5 1045 2036 148 0 0 chr15 60378335 60378653 -43116321 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 5 1045 253 319 0 21 chr15 60378696 60378789 -43116185 - MLT1A1 LTR MaLR -273 92 2 5 1045 1063 343 85 45 chr15 60378897 60379459 -43115515 + MER21B LTR ERV1 172 756 -107 5 1045 276 150 62 62 chr15 60383123 60383187 -43111787 - LTR37A LTR ERV1 -355 71 8 5 1045 663 155 46 8 chr15 60384360 60384490 -43110484 - RLTR24 LTR ERV1 -188 341 207 5 1045 240 73 122 0 chr15 60384826 60384867 -43110107 - RLTR24 LTR ERV1 -296 233 188 5 1045 1044 278 27 79 chr15 60384866 60385274 -43109700 + MTE2a LTR MaLR 20 405 -14 5 1045 366 214 21 53 chr15 60386764 60386858 -43108116 + MLT1A1 LTR MaLR 316 406 -2 5 1045 652 176 110 0 chr15 60386950 60387086 -43107888 + RLTR24 LTR ERV1 1 151 -378 5 1045 2543 76 139 2 chr15 60387160 60387584 -43107390 - RLTR47_MM LTR ERV1 -50 482 1 5 1045 2170 211 91 56 chr15 60387700 60388324 -43106650 - RMER13A LTR ERVK -214 646 1 5 1045 614 166 116 120 chr15 60388324 60388557 -43106417 + RLTR24 LTR ERV1 109 340 -189 5 1045 827 248 242 73 chr15 60388605 60389007 -43105967 + RLTR33 LTR ERVK 182 651 -27 5 1045 1025 145 105 0 chr15 60389033 60389205 -43105769 + RLTR24 LTR ERV1 340 529 0 5 1045 3091 20 0 0 chr15 60390300 60390646 -43104328 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 1045 570 294 89 72 chr15 60391328 60391848 -43103126 - RMER13A LTR ERVK -28 599 14 5 1045 289 299 131 22 chr15 60393980 60394202 -43100772 + RMER12 LTR ERVK 742 987 -335 5 1045 1437 185 89 72 chr15 60398850 60399241 -43095733 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 5 1045 1376 190 96 75 chr15 60399844 60400065 -43094909 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 173 5 1045 1376 190 96 75 chr15 60400100 60400254 -43094720 - ORR1C2 LTR MaLR -212 172 1 5 1045 980 281 58 55 chr15 60404665 60405019 -43089955 - MTE2a LTR MaLR 0 419 56 5 1045 327 310 91 26 chr15 60405044 60405223 -43089751 - MLT2B4 LTR ERVL -354 200 1 5 1045 712 215 163 93 chr15 60410843 60411187 -43083787 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 1045 235 338 93 13 chr15 60411394 60411544 -43083430 + MLT1K LTR MaLR 387 548 -47 5 1045 964 225 102 73 chr15 60414550 60414982 -43079992 + RMER2 LTR ERV1 1 539 -28 5 1045 336 384 132 18 chr15 60416830 60417225 -43077749 + MLT1K LTR MaLR 154 593 -2 5 1045 1106 286 12 120 chr15 60418131 60418454 -43076520 - ORR1E LTR MaLR -1 358 66 5 1045 1106 286 12 120 chr15 60418834 60418911 -43076063 - ORR1E LTR MaLR -294 65 1 5 1045 2929 41 57 0 chr15 60423575 60423942 -43071032 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 5 130 8441 18 0 0 chr15 60423944 60424939 -43070035 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 5 1046 320 289 12 25 chr15 60425021 60425184 -43069790 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1434 5 1046 7599 36 6 0 chr15 60425228 60426174 -43068800 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 41 5 1046 2929 41 57 0 chr15 60426186 60426553 -43068421 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 5 1046 1757 226 163 28 chr15 60435224 60435757 -43059217 + RLTR17 LTR ERVK 1 605 -87 6 1046 249 330 33 11 chr15 60442769 60442861 -43052113 - ORR1E LTR MaLR -257 102 9 6 1046 249 321 131 38 chr15 60444974 60445232 -43049742 + ORR1D2 LTR MaLR 73 368 -2 6 1046 2318 110 3 10 chr15 60446011 60446324 -43048650 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 6 1046 838 327 54 14 chr15 60459598 60459952 -43035022 + MER68 LTR ERVL 178 545 -18 6 1046 227 364 42 26 chr15 60459957 60460146 -43034828 + LTR78 LTR ERV1 766 957 -347 6 1046 814 216 80 137 chr15 60468607 60468944 -43026030 - RLTR14 LTR ERV1 -54 328 11 6 1046 412 236 236 20 chr15 60469099 60469298 -43025676 - RLTR14-int LTR ERV1 -151 5166 4925 6 1046 686 332 61 46 chr15 60470238 60470764 -43024210 - RLTR14-int LTR ERV1 -1665 3652 3167 6 1046 323 373 33 25 chr15 60471137 60471379 -43023595 - RLTR14-int LTR ERV1 -3273 4505 4262 6 1046 1983 207 67 12 chr15 60471892 60472488 -43022486 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 6 1046 485 316 73 37 chr15 60473048 60473683 -43021291 - RLTR14-int LTR ERV1 -3448 1615 820 6 1046 267 195 60 83 chr15 60473991 60474075 -43020899 - RLTR14-int LTR ERV1 -4789 528 447 6 1046 575 322 96 57 chr15 60474329 60474734 -43020240 - RLTR14-int LTR ERV1 -4895 422 2 6 1046 798 284 130 52 chr15 60474734 60474872 -43020102 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 246 6 1046 798 284 130 52 chr15 60474909 60475116 -43019858 - RLTR14 LTR ERV1 -137 245 11 6 1046 225 309 10 40 chr15 60483836 60483937 -43011037 + MLT1A1 LTR MaLR 278 375 -33 6 1046 516 323 164 40 chr15 60486894 60487217 -43007757 + MLT1A0 LTR MaLR 1 363 -2 6 1046 1201 241 53 30 chr15 60488429 60488732 -43006242 - MTEb LTR MaLR -10 369 60 6 1046 3624 25 2 2 chr15 60490095 60490491 -43004483 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1046 798 185 7 0 chr15 60491739 60491874 -43003100 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 232 6 1046 375 200 10 69 chr15 60493120 60493222 -43001752 + MLT1J2 LTR MaLR 353 448 0 6 1046 2040 112 28 22 chr15 60493486 60493806 -43001168 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1046 512 329 74 39 chr15 60493850 60494160 -43000814 + ORR1E LTR MaLR 22 342 -17 6 1046 429 317 37 27 chr15 60494186 60494374 -43000600 - MLT2C2 LTR ERVL -255 209 20 6 1046 3951 180 117 14 chr15 60495640 60496447 -42998527 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 7 1046 329 167 125 0 chr15 60498005 60498077 -42996897 - MTC LTR MaLR 0 421 341 7 1046 1811 157 42 67 chr15 60498304 60498541 -42996433 - MTC LTR MaLR -72 349 121 7 1046 1811 157 42 67 chr15 60499514 60499632 -42995342 - MTC LTR MaLR -301 120 3 7 1046 2491 148 91 16 chr15 60500398 60500659 -42994315 + RMER6B LTR ERVK 3 295 -166 3 1046 2491 148 91 16 chr15 60500694 60500859 -42994115 + RMER6B LTR ERVK 296 461 0 3 1046 335 252 46 61 chr15 60501098 60501229 -42993745 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 279 5 1046 1480 204 62 0 chr15 60501337 60501641 -42993333 + MTC LTR MaLR 1 323 -98 6 1046 2675 215 37 7 chr15 60501703 60502152 -42992822 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 452 -108 7 1046 2675 215 37 7 chr15 60502214 60502308 -42992666 + RLTR20B2 LTR ERVK 453 559 -1 7 1046 429 145 29 0 chr15 60503870 60503939 -42991035 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 314 1 1046 337 302 60 42 chr15 60503991 60504025 -42990949 - ORR1D1 LTR MaLR -40 334 301 1 1046 438 246 84 38 chr15 60504139 60504270 -42990704 - ORR1D1 LTR MaLR -76 302 166 1 1046 638 240 42 100 chr15 60504370 60504471 -42990503 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 92 1 1046 638 240 42 100 chr15 60504516 60504604 -42990370 - ORR1D1 LTR MaLR -283 91 3 1 1046 313 294 65 115 chr15 60505241 60505441 -42989533 - LTR48B LTR ERV1 -20 624 435 1 1046 231 246 130 0 chr15 60505590 60505659 -42989315 - MER34 LTR ERV1 -464 78 1 1 1046 379 271 61 54 chr15 60510876 60510916 -42984058 - MLT1B LTR MaLR -57 333 294 2 1046 3620 20 13 0 chr15 60510916 60511307 -42983667 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1046 379 271 61 54 chr15 60511307 60511414 -42983560 - MLT1B LTR MaLR -97 293 186 2 1046 264 333 192 6 chr15 60513200 60513372 -42981602 + MLT1C LTR MaLR 260 463 -4 3 1046 260 301 92 98 chr15 60514051 60514235 -42980739 + RLTR24 LTR ERV1 6 188 -341 3 1046 302 359 104 14 chr15 60514256 60514400 -42980574 + RLTR24 LTR ERV1 287 443 -86 3 1046 932 286 86 92 chr15 60514440 60514795 -42980179 - ORR1E LTR MaLR -5 414 8 3 1046 1088 267 44 70 chr15 60516148 60516535 -42978439 + RMER5 LTR ERV1 3 379 -155 4 1046 742 208 23 23 chr15 60518744 60518916 -42976058 + RMER5 LTR ERV1 363 534 0 4 1046 311 341 125 46 chr15 60524405 60524645 -42970329 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -36 803 545 5 1046 462 352 22 11 chr15 60529041 60529222 -42965752 - MLT1E2 LTR MaLR -169 458 276 5 1046 441 304 32 81 chr15 60532073 60532259 -42962715 + MLT1E2 LTR MaLR 341 517 -110 6 1046 330 273 12 0 chr15 60532631 60532752 -42962222 + MLT1E2 LTR MaLR 421 627 0 6 1046 880 306 73 20 chr15 60542639 60542996 -42951978 + MLT1B LTR MaLR 4 379 -11 9 1046 841 259 78 36 chr15 60544835 60545167 -42949807 - RLTR15 LTR ERVK -12 347 2 9 1046 4108 187 57 34 chr15 60550579 60551461 -42943513 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 1046 961 286 170 6 chr15 60552428 60552752 -42942222 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 1 1046 415 320 63 69 chr15 60554174 60554509 -42940465 - ORR1D1 LTR MaLR -36 338 6 1 1046 336 309 11 11 chr15 60554597 60554692 -42940282 + MTE2a LTR MaLR 1 95 -284 1 1046 974 294 39 39 chr15 60554696 60555004 -42939970 + MTE2a LTR MaLR 58 365 -14 1 1047 383 347 137 47 chr15 60556951 60557293 -42937681 + MER21B LTR ERV1 365 737 -126 1 1047 660 350 107 60 chr15 60558069 60558510 -42936464 - MER21B LTR ERV1 -129 734 291 1 1047 660 350 107 60 chr15 60558704 60558830 -42936144 - MER21B LTR ERV1 -573 290 140 1 1047 467 337 20 30 chr15 60567362 60567561 -42927413 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 165 1 1047 1785 135 62 3 chr15 60571968 60572273 -42922701 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 1 1047 283 331 83 0 chr15 60581364 60581533 -42913441 + RMER15 LTR ERVL 392 574 -1 1 1047 254 361 40 29 chr15 60584949 60585123 -42909851 + RMER4A LTR ERVK 6 181 -285 1 1047 230 310 38 48 chr15 60585748 60585853 -42909121 + MLT1A LTR MaLR 269 372 -2 1 1047 490 294 96 20 chr15 60587094 60587292 -42907682 + ORR1E LTR MaLR 4 216 -143 1 1047 1417 244 71 14 chr15 60588251 60588601 -42906373 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1047 243 253 22 28 chr15 60589107 60589197 -42905777 - RMER17C LTR ERVK -137 273 185 1 1047 243 253 22 28 chr15 60589358 60589446 -42905528 - RMER17C LTR ERVK -226 184 96 1 1047 362 319 114 80 chr15 60589753 60590015 -42904959 - MLT1E2 LTR MaLR -313 314 44 1 1047 1203 208 99 0 chr15 60590191 60590485 -42904489 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 61 1 1047 411 317 108 19 chr15 60593761 60593973 -42901001 - MLT1J2 LTR MaLR -205 243 13 1 1047 307 311 113 65 chr15 60595261 60595570 -42899404 - RMER10A LTR ERVL 0 442 119 1 1047 2172 150 71 3 chr15 60596644 60597012 -42897962 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 1 1047 1019 39 0 0 chr15 60610146 60610274 -42884700 - MTB LTR MaLR 0 400 273 1 1047 2024 65 4 0 chr15 60610983 60611259 -42883715 - MTB LTR MaLR -123 277 1 1 1047 803 243 44 35 chr15 60612172 60612398 -42882576 + MTE2b LTR MaLR 151 378 -1 1 1047 345 274 28 64 chr15 60614054 60614163 -42880811 - ORR1E LTR MaLR -230 129 25 1 1047 512 330 32 45 chr15 60614318 60614565 -42880409 + MLT1E3 LTR MaLR 380 623 -1 2 1047 1713 164 101 52 chr15 60616427 60616775 -42878199 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 2 1047 795 277 50 155 chr15 60620341 60620474 -42874500 + MTD LTR MaLR 20 125 -294 2 1047 795 277 50 155 chr15 60620679 60620925 -42874049 + MTD LTR MaLR 126 359 -60 2 1047 2522 130 63 47 chr15 60621201 60621524 -42873450 + RMER6A LTR ERVK 1 321 -435 2 1047 2522 143 79 40 chr15 60621606 60621924 -42873050 + RMER6A LTR ERVK 322 689 -1 2 1047 428 318 61 35 chr15 60621924 60622155 -42872819 + MLT1C LTR MaLR 69 305 -162 2 1047 680 293 57 48 chr15 60622398 60622731 -42872243 - MLT1A LTR MaLR -4 370 35 2 1047 552 311 62 123 chr15 60625543 60625975 -42868999 - MTC LTR MaLR -15 406 1 2 1047 1154 208 81 120 chr15 60626074 60626483 -42868491 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 2 1047 1293 138 24 107 chr15 60626487 60626778 -42868196 + MMETn-int LTR ERVK 3 269 -4575 2 1047 237 284 105 44 chr15 60627106 60627220 -42867754 - ORR1D2 LTR MaLR -207 163 43 2 1047 814 268 96 18 chr15 60630766 60631047 -42863927 + MLT1B LTR MaLR 1 303 -87 2 1047 2358 123 27 56 chr15 60632499 60632980 -42861994 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 467 -8 2 1047 59342 9 6 0 chr15 60632981 60639422 -42855552 + IAPEz-int LTR ERVK 1 6481 0 2 1047 2358 123 27 56 chr15 60639422 60639903 -42855071 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 467 -8 2 1047 533 311 74 66 chr15 60640000 60640244 -42854730 + MTEa LTR MaLR 79 324 -55 2 1047 492 341 31 4 chr15 60642013 60642240 -42852734 - MLT1D LTR MaLR -21 484 252 2 1047 1458 239 94 0 chr15 60663900 60664281 -42830693 + MTD LTR MaLR 3 419 0 2 1047 528 257 58 17 chr15 60664301 60664475 -42830499 - MLT1A0 LTR MaLR -127 238 58 2 1047 696 285 43 98 chr15 60666733 60667152 -42827822 + MTE2a LTR MaLR 2 405 -14 2 1047 335 258 30 20 chr15 60667753 60667852 -42827122 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 331 2 1047 395 219 83 111 chr15 60668377 60668557 -42826417 + RMER10A LTR ERVL 263 437 -5 2 1047 2039 171 35 53 chr15 60673827 60674260 -42820714 - RMER10A LTR ERVL -17 425 1 2 1047 400 317 49 28 chr15 60675363 60675506 -42819468 + MTEa LTR MaLR 174 319 -60 2 1048 698 303 187 29 chr15 60688098 60688383 -42806591 + MTD LTR MaLR 2 346 -73 3 1048 1987 151 12 61 chr15 60688383 60688729 -42806245 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1048 392 264 162 48 chr15 60688729 60688807 -42806167 + MTD LTR MaLR 347 419 0 3 1048 414 316 112 50 chr15 60689168 60689408 -42805566 + MLT1H LTR MaLR 257 511 -38 3 1048 880 297 99 31 chr15 60690944 60691367 -42803607 - MLT2B3 LTR ERVL -40 677 167 3 1048 252 281 25 61 chr15 60691826 60691951 -42803023 - MLT1E1A LTR MaLR -38 642 493 3 1048 555 322 38 34 chr15 60695289 60695553 -42799421 - MLT1B LTR MaLR -125 265 1 3 1048 416 209 15 218 chr15 60699905 60700107 -42794867 + RMER15 LTR ERVL 1 161 -414 3 1048 2316 162 10 22 chr15 60700183 60700587 -42794387 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 3 1048 679 263 80 14 chr15 60700587 60700797 -42794177 + RMER15 LTR ERVL 352 575 0 3 1048 380 320 36 102 chr15 60701019 60701322 -42793652 + ORR1E LTR MaLR 75 357 -2 3 1048 230 296 101 40 chr15 60701348 60701496 -42793478 - RLTR13A LTR ERVK -350 505 349 3 1048 2426 73 9 0 chr15 60702049 60702365 -42792609 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 3 1048 271 288 86 23 chr15 60705891 60706019 -42788955 - LTR48 LTR ERV1 -48 739 604 3 1048 301 303 61 49 chr15 60706195 60706358 -42788616 - LTR48 LTR ERV1 -523 264 100 3 1048 327 301 77 88 chr15 60706351 60706479 -42788495 + MER21B LTR ERV1 355 486 -377 3 1048 1168 270 39 121 chr15 60706479 60706892 -42788082 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 3 1048 327 301 77 88 chr15 60706892 60706945 -42788029 + MER21B LTR ERV1 487 534 -329 3 1048 416 326 64 51 chr15 60708267 60708517 -42786457 - ORR1D2 LTR MaLR -11 359 99 3 1048 438 381 34 44 chr15 60708678 60708884 -42786090 - MER21B LTR ERV1 -559 304 101 3 1048 329 341 109 60 chr15 60709132 60709382 -42785592 + MER57E1 LTR ERV1 5 271 -101 3 1048 329 341 109 60 chr15 60709442 60709540 -42785434 + MER57E1 LTR ERV1 272 369 -3 3 1048 2815 142 147 16 chr15 60711672 60712188 -42782786 + RMER4B LTR ERVK 2 585 0 3 1048 1258 336 55 11 chr15 60714425 60714882 -42780092 + MTE-int LTR MaLR 854 1330 -250 3 1048 227 365 85 33 chr15 60723110 60723263 -42771711 - MLT1J LTR MaLR -332 180 20 3 1048 2106 150 32 70 chr15 60728688 60729089 -42765885 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 1048 503 325 88 53 chr15 60733874 60734215 -42760759 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 3 1048 1892 162 56 24 chr15 60735228 60735602 -42759372 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 1048 236 253 53 84 chr15 60737659 60737754 -42757220 + MER72B LTR ERV1 100 191 -577 3 1048 280 266 116 78 chr15 60739569 60739794 -42755180 - ORR1E LTR MaLR 0 379 124 3 1048 3594 33 5 0 chr15 60743894 60744288 -42750686 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1048 476 298 179 18 chr15 60754397 60754783 -42740191 - MLT1C LTR MaLR -19 448 1 4 1048 1750 149 81 22 chr15 60759042 60759365 -42735609 + RLTR9A2 LTR ERVK 42 383 0 4 1048 285 286 21 21 chr15 60759609 60759702 -42735272 + MLT1A LTR MaLR 1 93 -281 4 1048 2025 171 32 3 chr15 60767301 60767646 -42727328 + ORR1B2 LTR MaLR 13 367 0 4 1048 947 274 73 104 chr15 60771196 60771579 -42723395 - MTEb LTR MaLR -3 376 6 4 1048 1673 292 65 33 chr15 60771758 60772329 -42722645 - MTEb-int LTR MaLR -30 1550 962 4 1048 486 263 116 58 chr15 60782121 60782311 -42712663 + MLT1H LTR MaLR 349 549 0 4 1048 608 256 37 12 chr15 60782673 60782835 -42712139 + MLT1E1 LTR MaLR 489 654 0 4 1048 1431 232 11 7 chr15 60783998 60784276 -42710698 - MTC LTR MaLR 0 421 143 4 1048 954 121 81 0 chr15 60784623 60784772 -42710202 - MTC LTR MaLR -259 162 2 4 1048 1031 267 93 57 chr15 60798557 60798942 -42696032 + MTD LTR MaLR 21 419 0 4 1048 237 355 75 26 chr15 60802640 60802841 -42692133 + MLT1H LTR MaLR 154 364 -215 4 1048 722 249 66 42 chr15 60812240 60812572 -42682402 - RMER6A LTR ERVK -8 748 410 4 1048 722 249 66 42 chr15 60812746 60812869 -42682105 - RMER6A LTR ERVK -347 409 282 4 1048 1434 196 42 16 chr15 60812993 60813333 -42681641 - RMER6A LTR ERVK -187 533 157 4 1049 798 237 34 204 chr15 60820397 60820843 -42674131 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 5 4 1049 2055 148 114 8 chr15 60824206 60824582 -42670392 + MTC LTR MaLR 6 421 0 4 1049 4537 173 117 11 chr15 60824581 60825535 -42669439 + MTC-int LTR MaLR 3 1057 -201 4 1049 431 157 0 0 chr15 60825541 60825611 -42669363 + MTC LTR MaLR 352 421 0 4 1049 781 291 30 91 chr15 60826881 60827234 -42667740 - MLT2D LTR ERVL -1 396 68 4 1049 729 321 110 7 chr15 60830870 60831162 -42663812 + LTR78 LTR ERV1 262 583 -721 5 1049 494 358 91 31 chr15 60831561 60831815 -42663159 + MER68 LTR ERVL 62 330 -233 5 1049 349 240 61 20 chr15 60844423 60844521 -42650453 - ORR1E LTR MaLR -2 357 256 5 1049 230 296 75 85 chr15 60855038 60855226 -42639748 - RMER20B LTR ERVK 0 516 331 5 1049 347 252 48 40 chr15 60855380 60855504 -42639470 - RMER20B LTR ERVK -502 125 1 5 1049 425 285 25 167 chr15 60857337 60857535 -42637439 + MTE2a LTR MaLR 1 170 -209 5 1049 4775 116 65 71 chr15 60868858 60869768 -42625206 + RMER17A2 LTR ERVK 1 904 -2 5 1049 1230 234 100 57 chr15 60873723 60874072 -42620902 + ORR1D2 LTR MaLR 1 364 -6 5 1049 277 317 88 122 chr15 60874648 60874910 -42620064 - RMER13A LTR ERVK -63 797 545 5 1049 755 240 89 95 chr15 60874958 60875285 -42619689 - RMER13A LTR ERVK -535 325 1 5 1049 1911 241 58 49 chr15 60877221 60877789 -42617185 - RMER19C LTR ERVK 0 611 39 5 1049 2478 249 23 37 chr15 60878253 60878895 -42616079 - RMER13B LTR ERVK -4 904 272 5 1049 1459 211 91 31 chr15 60878901 60879008 -42615966 - RMER17B LTR ERVK -517 441 307 5 1049 1459 211 91 31 chr15 60879093 60879401 -42615573 - RMER17B LTR ERVK -652 306 2 5 1049 573 306 45 54 chr15 60879938 60880180 -42614794 - MTC LTR MaLR -181 240 1 5 1049 658 352 43 3 chr15 60884733 60885032 -42609942 + RMER5 LTR ERV1 212 522 -12 5 1049 423 334 111 45 chr15 60888229 60888693 -42606281 + MT2A LTR ERVL 21 553 -3 5 1049 533 297 68 41 chr15 60888864 60889085 -42605889 + MTEb LTR MaLR 7 233 -146 5 1049 1772 186 62 27 chr15 60890660 60891031 -42603943 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 1049 562 335 0 32 chr15 60900831 60901019 -42593955 - MTEb LTR MaLR 0 379 198 6 1049 363 323 10 0 chr15 60901010 60901109 -42593865 - MTEa LTR MaLR -112 267 168 6 1049 510 329 13 6 chr15 60901296 60901455 -42593519 - MTEa LTR MaLR -200 179 20 6 1049 1873 196 144 75 chr15 60906065 60906805 -42588169 + RMER6C LTR ERVK 1 720 0 6 1049 493 342 32 64 chr15 60907616 60907866 -42587108 + RLTR26 LTR ERVK 176 417 -225 6 1049 281 329 176 40 chr15 60928737 60928780 -42566194 + MLT1A0 LTR MaLR 112 164 -201 6 1049 281 329 176 40 chr15 60928813 60928991 -42565983 + MLT1A0 LTR MaLR 165 362 -3 6 1049 656 245 216 117 chr15 60929832 60930174 -42564800 + MTE2a LTR MaLR 4 379 0 6 1049 1610 180 45 84 chr15 60934931 60935289 -42559685 + ORR1B1 LTR MaLR 43 386 -8 6 1049 292 319 56 36 chr15 60945401 60945581 -42549393 + ORR1E LTR MaLR 195 377 -2 6 1049 487 338 113 45 chr15 60946997 60947288 -42547686 + MLT1A0 LTR MaLR 1 311 -54 6 1050 236 351 0 13 chr15 60949773 60949851 -42545123 - MLT1I LTR MaLR -272 139 63 6 1050 1699 216 77 3 chr15 60953470 60953846 -42541128 + MTD LTR MaLR 3 406 -13 6 1050 238 294 95 80 chr15 60954702 60954839 -42540135 - MLT1I-int LTR MaLR -288 1099 961 6 1050 2048 92 22 7 chr15 60963242 60963574 -42531400 - ORR1A2 LTR MaLR -3 391 33 6 1050 531 265 72 60 chr15 60963663 60963785 -42531189 + RLTR15 LTR ERVK 1 121 -238 6 1050 531 265 72 60 chr15 60963814 60963956 -42531018 + RLTR15 LTR ERVK 122 268 -91 6 1050 3661 76 32 2 chr15 60972771 60972946 -42522028 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 300 6 1050 3661 76 32 2 chr15 60972996 60973281 -42521693 - MT2C_Mm LTR ERVL -176 299 2 6 1050 657 335 83 14 chr15 60978924 60979272 -42515702 - MLT1D LTR MaLR -11 494 123 7 1050 260 262 49 12 chr15 60993106 60993187 -42501787 + HUERS-P3b-int LTR ERV1 1739 1822 -5596 7 1050 243 288 41 0 chr15 60998133 60998206 -42496768 + LTR33 LTR ERVL 2 77 -438 7 1050 320 104 0 0 chr15 60998481 60998529 -42496445 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 312 7 1050 1311 195 115 23 chr15 60998947 60999046 -42495928 - ORR1B2 LTR MaLR -34 333 232 7 1050 3436 16 45 0 chr15 60999046 60999425 -42495549 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1050 1311 195 115 23 chr15 60999425 60999630 -42495344 - ORR1B2 LTR MaLR -136 231 1 7 1050 796 252 129 47 chr15 61012944 61013285 -42481689 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 1 1050 1380 246 39 37 chr15 61017559 61017914 -42477060 - ORR1D2 LTR MaLR -14 356 1 2 1050 2348 107 72 3 chr15 61023421 61023796 -42471178 + RMER17B LTR ERVK 62 462 -496 3 1050 413 162 0 0 chr15 61023790 61023864 -42471110 + RMER17B LTR ERVK 885 958 0 3 1050 3052 26 0 0 chr15 61026928 61027274 -42467700 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 3 1050 1771 188 14 51 chr15 61027422 61027775 -42467199 + ORR1C1 LTR MaLR 1 340 -38 3 1050 238 121 0 0 chr15 61028142 61028175 -42466799 + ORR1C1 LTR MaLR 346 378 0 3 1050 245 211 0 19 chr15 61035883 61035936 -42459038 + RMER19B LTR ERVK 1 52 -850 5 1050 1874 122 0 17 chr15 61035932 61036225 -42458749 + RMER19B LTR ERVK 615 902 0 5 1050 301 385 149 10 chr15 61041258 61041547 -42453427 + LTR16C LTR ERVL 125 453 -36 5 1050 597 318 114 129 chr15 61043810 61044283 -42450691 + MLT1F2 LTR MaLR 66 531 -29 6 1050 440 336 67 129 chr15 61066902 61067029 -42427945 - MLT1C LTR MaLR -113 354 239 9 1050 440 336 67 129 chr15 61067217 61067461 -42427513 - MLT1C LTR MaLR -229 238 6 9 1050 779 303 36 60 chr15 61067939 61068241 -42426733 + MLT2B2 LTR ERVL 219 513 -2 1 1050 591 295 115 47 chr15 61069530 61069783 -42425191 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 133 1 1050 5093 114 68 84 chr15 61069825 61070113 -42424861 + RMER17B LTR ERVK 1 297 -661 1 1050 5093 114 68 84 chr15 61070245 61070930 -42424044 + RMER17B LTR ERVK 298 958 0 1 1050 523 333 43 60 chr15 61073301 61073601 -42421373 - MLT1J2 LTR MaLR -146 302 8 1 1050 407 299 71 28 chr15 61074777 61074918 -42420056 + MTE-int LTR MaLR 1 147 -1433 1 1050 1105 340 66 61 chr15 61075301 61075922 -42419052 + MTE-int LTR MaLR 479 1073 -507 1 1050 1367 257 23 121 chr15 61075924 61076451 -42418523 - RMER15 LTR ERVL -74 501 27 1 1050 625 300 165 23 chr15 61076599 61076939 -42418035 + MTE-int LTR MaLR 918 1450 -130 1 1050 468 275 109 60 chr15 61077192 61077393 -42417581 + RMER5 LTR ERV1 72 282 -252 1 1050 458 268 38 75 chr15 61077691 61077824 -42417150 + RMER10B LTR ERVL 271 398 0 1 1050 561 227 46 7 chr15 61077831 61077982 -42416992 + RMER5 LTR ERV1 332 488 -46 1 1051 228 200 0 0 chr15 61084079 61084124 -42410850 - MT2A LTR ERVL 0 533 489 1 1051 571 220 0 48 chr15 61084652 61084776 -42410198 - MT2A LTR ERVL -415 118 1 1 1051 617 350 72 30 chr15 61092357 61092761 -42402213 - LTR37A LTR ERV1 0 426 6 1 1051 756 262 38 108 chr15 61098403 61098690 -42396284 - MTE2a LTR MaLR -5 374 108 1 1051 234 221 72 14 chr15 61099379 61099448 -42395526 - MLT2E LTR ERVL -49 579 507 1 1051 883 284 27 12 chr15 61100432 61100689 -42394285 + MTE2b LTR MaLR 105 365 -14 1 1051 974 280 126 18 chr15 61104988 61105322 -42389652 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1051 2317 69 119 11 chr15 61111822 61112174 -42382800 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1051 237 379 39 70 chr15 61121775 61121931 -42373043 - LTR16A LTR ERVL -253 198 48 1 1051 4376 141 74 37 chr15 61122851 61123721 -42371253 + RMER17A2 LTR ERVK 5 906 0 1 1051 236 378 62 14 chr15 61128922 61129067 -42365907 + MLT1F1 LTR MaLR 383 534 -35 1 1051 2319 139 32 30 chr15 61144248 61144648 -42350326 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 7 1 1051 273 229 52 13 chr15 61149599 61149690 -42345284 - MLT1A0 LTR MaLR -25 442 288 2 1051 650 266 63 15 chr15 61150204 61150405 -42344569 + MTEa LTR MaLR 140 379 0 2 1051 847 315 110 12 chr15 61151563 61151891 -42343083 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 6 2 1051 1487 231 19 3 chr15 61152082 61152391 -42342583 + MTC LTR MaLR 1 314 -107 2 1051 747 176 24 18 chr15 61152716 61152887 -42342087 + MTC LTR MaLR 213 421 0 2 1051 580 272 218 0 chr15 61152986 61153243 -42341731 - MER34A LTR ERV1 -229 342 30 2 1051 237 356 50 0 chr15 61160983 61161084 -42333890 + LTR37A LTR ERV1 7 112 -314 2 1051 551 315 110 23 chr15 61161822 61162121 -42332853 + MLT1A1 LTR MaLR 84 408 0 2 1051 537 324 68 51 chr15 61163827 61164178 -42330796 + ORR1E LTR MaLR 4 379 0 2 1051 351 361 27 27 chr15 61164371 61164596 -42330378 - MLT2C1 LTR ERVL -171 226 2 2 1051 1756 212 63 5 chr15 61166474 61166853 -42328121 - RMER5 LTR ERV1 -49 485 85 2 1051 1262 237 64 7 chr15 61172771 61173068 -42321906 - MTEb LTR MaLR 0 379 66 2 1051 906 306 43 25 chr15 61177514 61177836 -42317138 - MTEb LTR MaLR -8 371 44 2 1051 359 355 0 0 chr15 61192776 61192897 -42302077 + MLT1A0 LTR MaLR 238 358 -7 2 1051 545 350 112 15 chr15 61199397 61199430 -42295544 + MLT1C LTR MaLR 173 208 -259 2 1051 545 350 112 15 chr15 61199889 61200122 -42294852 + MLT1C LTR MaLR 209 465 -2 2 1051 265 340 53 53 chr15 61207934 61208086 -42286888 + LTR40a LTR ERVL 1 152 -367 2 1051 475 360 73 48 chr15 61208120 61208409 -42286565 + LTR40a LTR ERVL 224 519 0 2 1052 740 236 72 29 chr15 61215717 61215926 -42279048 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 167 3 1052 738 183 108 12 chr15 61216140 61216306 -42278668 - ORR1C2 LTR MaLR -188 196 15 3 1052 4182 105 59 84 chr15 61216504 61217334 -42277640 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 3 1052 5609 146 80 18 chr15 61220083 61221122 -42273852 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 3 1052 3827 136 93 20 chr15 61241099 61241795 -42253179 + MTC-int LTR MaLR 394 1140 -118 3 1052 914 294 94 29 chr15 61245201 61245575 -42249399 - MTD LTR MaLR -14 386 4 3 1052 1286 160 0 39 chr15 61250165 61250241 -42244733 + RLTR28 LTR ERVL 1 74 -450 3 1052 2269 129 3 0 chr15 61250241 61250567 -42244407 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1052 1286 160 0 39 chr15 61250567 61250724 -42244250 + RLTR28 LTR ERVL 75 225 -299 3 1052 1291 206 101 14 chr15 61250968 61251264 -42243710 + RLTR28 LTR ERVL 203 524 0 3 1052 340 154 50 25 chr15 61296195 61296275 -42198699 + ORR1D2 LTR MaLR 289 370 0 4 1052 1237 188 149 33 chr15 61301234 61301569 -42193405 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1052 349 401 65 28 chr15 61302648 61302923 -42192051 + LTR16A LTR ERVL 143 425 -26 4 1052 349 401 65 28 chr15 61302959 61302973 -42192001 + LTR16A LTR ERVL 426 442 -9 4 1052 428 354 96 73 chr15 61311949 61312237 -42182737 - MLT1K LTR MaLR -186 409 114 4 1052 428 354 96 73 chr15 61312272 61312297 -42182677 - MLT1K LTR MaLR -482 113 89 4 1052 450 365 99 61 chr15 61312508 61312870 -42182104 + LTR16C LTR ERVL 15 390 -99 4 1052 634 388 66 86 chr15 61314179 61314588 -42180386 - MLT1H LTR MaLR -118 431 31 4 1052 252 324 35 26 chr15 61314763 61314877 -42180097 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 259 4 1052 311 344 91 8 chr15 61318175 61318307 -42176667 - MLT1A0 LTR MaLR -222 143 1 4 1052 1273 256 48 51 chr15 61319686 61320057 -42174917 + MTD LTR MaLR 2 371 -48 4 1052 1007 284 61 34 chr15 61331459 61331754 -42163220 + ORR1D2 LTR MaLR 1 303 -67 4 1052 336 369 57 62 chr15 61336684 61337071 -42157903 + LTR79 LTR ERVL 112 496 -31 4 1052 1196 207 152 53 chr15 61339199 61339655 -42155319 + RMER2 LTR ERV1 1 554 -13 4 1053 801 278 58 111 chr15 61342429 61342789 -42152185 - MTEa LTR MaLR -8 371 31 4 1053 360 348 152 39 chr15 61342956 61343291 -42151683 + MLT1K LTR MaLR 196 568 -27 4 1053 235 343 29 19 chr15 61345919 61346023 -42148951 + MLT1E1A LTR MaLR 1 105 -549 4 1053 281 373 31 8 chr15 61346020 61346147 -42148827 + MLT1E1A LTR MaLR 330 459 -221 4 1053 443 319 0 0 chr15 61347156 61347291 -42147683 + MLT1D LTR MaLR 367 501 -4 4 1053 435 358 76 36 chr15 61361067 61361290 -42133684 - MLT1G1 LTR MaLR 0 579 348 4 1053 499 257 92 7 chr15 61367801 61367942 -42127032 + MLT1A1 LTR MaLR 256 408 0 4 1053 252 386 61 37 chr15 61369093 61369257 -42125717 + MLT1H2 LTR MaLR 57 224 -325 4 1053 436 309 29 0 chr15 61369422 61369561 -42125413 + MLT1H2 LTR MaLR 342 484 -5 4 1053 599 281 121 31 chr15 61384014 61384238 -42110736 + MLT1D LTR MaLR 258 501 -4 5 1053 637 303 67 39 chr15 61394865 61395169 -42099805 + ORR1E LTR MaLR 7 315 -55 5 1053 400 378 62 23 chr15 61397265 61397441 -42097533 - LTR16E2 LTR ERVL -122 446 264 5 1053 485 246 68 34 chr15 61406482 61406629 -42088345 - MLT1D LTR MaLR -28 477 326 5 1053 312 366 127 49 chr15 61418161 61418468 -42076506 + MLT1K LTR MaLR 132 462 -133 5 1053 1064 253 125 31 chr15 61419347 61419730 -42075244 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1053 2894 9 0 0 chr15 61421002 61421324 -42073650 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1053 689 302 192 42 chr15 61423429 61423859 -42071115 - MLT1F LTR MaLR -5 555 54 5 1053 1598 189 47 64 chr15 61424634 61424995 -42069979 + ORR1C1 LTR MaLR 24 378 0 5 1053 447 324 108 86 chr15 61428407 61428815 -42066159 + MLT1C LTR MaLR 47 463 -4 5 1053 628 330 129 12 chr15 61433366 61433691 -42061283 + MLT1A LTR MaLR 8 370 -4 5 1053 308 364 82 104 chr15 61434045 61434508 -42060466 - MLT1K LTR MaLR -2 593 141 5 1053 800 323 168 91 chr15 61437511 61438021 -42056953 - MLT1H1 LTR MaLR 0 555 1 5 1053 851 324 46 43 chr15 61448685 61449014 -42045960 + ORR1E LTR MaLR 20 349 -10 6 1053 1071 236 75 36 chr15 61454000 61454307 -42040667 + ORR1E LTR MaLR 39 357 -2 6 1053 1495 278 19 16 chr15 61454591 61454961 -42040013 + MTE2b LTR MaLR 1 371 -8 6 1053 3493 36 8 5 chr15 61458988 61459383 -42035591 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1053 534 329 58 65 chr15 61461672 61461997 -42032977 + RLTR26 LTR ERVK 95 417 -225 6 1053 577 283 158 9 chr15 61469847 61470068 -42024906 - MTEb LTR MaLR 0 379 126 6 1053 352 328 34 8 chr15 61471806 61471923 -42023051 + LTR33 LTR ERVL 340 459 -56 6 1053 245 114 0 154 chr15 61472654 61472706 -42022268 - MT2A LTR ERVL 0 533 490 6 1054 842 315 77 22 chr15 61488517 61488932 -42006042 + MLT1D LTR MaLR 28 465 -40 6 1054 805 322 96 90 chr15 61501268 61501746 -41993228 + MLT1F2 LTR MaLR 26 506 -63 3 1054 773 276 68 68 chr15 61517878 61518244 -41976730 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 3 1054 857 274 50 72 chr15 61526879 61527197 -41967777 - MTD LTR MaLR -14 405 95 4 1054 1323 190 206 18 chr15 61529975 61530419 -41964555 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 5 1054 1186 238 86 35 chr15 61530419 61530767 -41964207 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 5 1054 3106 150 106 59 chr15 61537077 61537737 -41957237 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 2 6 1054 1198 282 54 35 chr15 61542267 61542635 -41952339 + MTE2a LTR MaLR 5 379 0 7 1054 743 288 113 58 chr15 61559004 61559071 -41935903 + MTEa LTR MaLR 1 64 -315 9 1054 743 288 113 58 chr15 61559391 61559669 -41935305 + MTEa LTR MaLR 65 365 -14 9 1054 1448 190 147 21 chr15 61560107 61560146 -41934828 - MT2A LTR ERVL -3 530 459 9 1054 1448 190 147 21 chr15 61560198 61560491 -41934483 - MT2A LTR ERVL -75 458 156 9 1054 390 309 134 0 chr15 61560975 61560994 -41933980 - MTE2b LTR MaLR -205 174 6 9 1054 708 169 92 0 chr15 61560994 61561124 -41933850 - MT2A LTR ERVL -386 147 6 9 1054 480 371 64 76 chr15 61569990 61570462 -41924512 - MLT1J LTR MaLR -41 471 6 1 1054 3004 146 27 14 chr15 61570559 61571080 -41923894 - MT2B LTR ERVL -6 595 12 1 1054 1621 246 50 23 chr15 61571373 61571772 -41923202 - MTC LTR MaLR -8 413 4 1 1054 1702 170 57 116 chr15 61573997 61574369 -41920605 + ORR1C1 LTR MaLR 21 370 -8 1 1054 2043 128 97 39 chr15 61577010 61577393 -41917581 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 1 1054 1957 172 103 3 chr15 61580362 61580730 -41914244 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 1 1054 237 344 39 39 chr15 61584485 61584602 -41910372 + MLT1F LTR MaLR 2 118 -430 1 1054 1362 260 79 49 chr15 61600818 61601263 -41893711 - RLTR20B3 LTR ERVK -27 550 93 1 1054 1487 240 60 3 chr15 61603376 61603710 -41891264 + MTD LTR MaLR 66 418 -1 1 1055 1017 330 58 30 chr15 61606486 61606948 -41888026 - MLT1D LTR MaLR 0 505 31 1 1055 583 291 51 0 chr15 61611879 61612037 -41882937 - MLT1G LTR MaLR -85 506 341 1 1055 310 297 161 59 chr15 61624405 61624641 -41870333 + MLT1J2 LTR MaLR 6 265 -183 2 1055 247 271 11 105 chr15 61633881 61633976 -41860998 + MT2B2 LTR ERVL 152 237 -347 2 1055 338 196 0 252 chr15 61639237 61639360 -41855614 + MT2B LTR ERVL 149 240 -361 2 1055 529 169 0 31 chr15 61641729 61641827 -41853147 - RMER6D LTR ERVK -515 205 111 2 1055 1844 203 131 73 chr15 61641820 61641971 -41853003 + RMER6C LTR ERVK 44 175 -515 2 1055 1844 203 131 73 chr15 61642118 61642578 -41852396 + RMER6C LTR ERVK 176 690 0 2 1055 2488 194 65 50 chr15 61643225 61643799 -41851175 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -2 582 1 2 1055 379 356 87 36 chr15 61647504 61647781 -41847193 + MLT1C LTR MaLR 151 441 -26 2 1055 376 379 57 43 chr15 61661689 61662096 -41832878 - MLT1G LTR MaLR -71 524 23 2 1055 436 337 35 0 chr15 61670216 61670388 -41824586 + MLT1D LTR MaLR 310 487 -18 2 1055 231 354 10 20 chr15 61691226 61691327 -41803647 + RMER15 LTR ERVL 371 470 -105 3 1055 255 295 79 15 chr15 61696264 61696418 -41798556 - MLT1J LTR MaLR -296 216 17 3 1055 457 127 0 0 chr15 61700736 61700799 -41794175 + ORR1D1 LTR MaLR 1 63 -311 3 1055 442 248 10 5 chr15 61700922 61701044 -41793930 + ORR1D1 LTR MaLR 188 327 -57 3 1055 284 194 45 0 chr15 61701246 61701313 -41793661 + ORR1D1 LTR MaLR 315 384 0 3 1055 588 186 72 8 chr15 61701313 61701435 -41793539 + MTEa LTR MaLR 250 379 0 3 1055 629 179 8 31 chr15 61702447 61702574 -41792400 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 255 3 1055 748 299 160 72 chr15 61707044 61707396 -41787578 - MTD LTR MaLR 0 379 17 3 1055 388 382 90 33 chr15 61712368 61712436 -41782538 - MT2A LTR ERVL -29 504 426 3 1055 4282 142 45 12 chr15 61712436 61713106 -41781868 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 3 1055 388 382 90 33 chr15 61713106 61713459 -41781515 - MT2A LTR ERVL -108 425 59 3 1055 1043 314 42 6 chr15 61717418 61717754 -41777220 - ORR1E LTR MaLR -11 348 1 3 1055 2668 212 173 14 chr15 61718236 61718872 -41776102 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 3 1055 348 306 87 35 chr15 61718890 61719005 -41775969 - MTEa LTR MaLR -10 369 249 3 1055 1221 245 71 74 chr15 61719166 61719202 -41775772 + MTEb LTR MaLR 2 30 -349 3 1055 1622 213 67 25 chr15 61719202 61719558 -41775416 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 3 1055 1221 245 71 74 chr15 61719558 61719874 -41775100 + MTEb LTR MaLR 31 353 -26 3 1055 531 383 45 62 chr15 61721298 61721652 -41773322 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 3 1055 1440 207 120 26 chr15 61727822 61727969 -41767005 + ORR1D1 LTR MaLR 1 177 -197 3 1055 1440 207 120 26 chr15 61728045 61728239 -41766735 + ORR1D1 LTR MaLR 178 374 0 3 1055 315 352 41 0 chr15 61733726 61733848 -41761126 - ORR1E LTR MaLR -227 132 6 4 1056 609 306 97 42 chr15 61738201 61738511 -41756463 - MLT2D LTR ERVL -84 330 4 4 1056 310 285 135 41 chr15 61743178 61743445 -41751529 + MLT1B LTR MaLR 81 384 -83 4 1056 2385 174 29 14 chr15 61747484 61747899 -41747075 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1056 773 221 87 13 chr15 61747909 61747973 -41747001 + MTB_Mm LTR MaLR 176 250 -171 4 1056 3527 30 0 128 chr15 61747973 61748473 -41746501 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 1056 773 221 87 13 chr15 61748473 61748637 -41746337 + MTB_Mm LTR MaLR 251 421 0 4 1056 4260 176 78 67 chr15 61748636 61749694 -41745280 + MTB_Mm-int LTR MaLR 2 1071 -187 4 1056 579 116 209 7 chr15 61750008 61750156 -41744818 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1080 1257 -1 4 1056 2080 196 10 17 chr15 61750157 61750567 -41744407 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1056 1269 162 107 163 chr15 61761242 61761634 -41733340 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 4 1056 577 338 98 28 chr15 61764025 61764351 -41730623 + ORR1E LTR MaLR 1 349 -10 4 1056 249 316 56 55 chr15 61772972 61773133 -41721841 - MLT1E LTR MaLR -11 643 489 4 1056 413 324 15 0 chr15 61775083 61775219 -41719755 + RMER15 LTR ERVL 422 559 -16 4 1056 512 156 41 12 chr15 61776837 61777015 -41717959 + MYSERV-int LTR ERVK 1154 1266 -1060 4 1056 3933 202 46 84 chr15 61777855 61778609 -41716365 + MYSERV-int LTR ERVK 5522 6306 -244 4 1056 3933 202 46 84 chr15 61778799 61778829 -41716145 + MYSERV-int LTR ERVK 6307 6329 -221 4 1056 3933 202 46 84 chr15 61778975 61779257 -41715717 + MYSERV-int LTR ERVK 6330 6548 -2 4 1056 2315 178 28 56 chr15 61779261 61779801 -41715173 + RLTR11A2 LTR ERVK 3 527 0 4 1056 2808 166 67 56 chr15 61783300 61783869 -41711105 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 5 1056 733 278 77 35 chr15 61784946 61785256 -41709718 - MLT1F LTR MaLR -98 450 128 5 1056 498 60 0 0 chr15 61787006 61787073 -41707901 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 257 5 1056 3879 45 13 0 chr15 61787262 61787731 -41707243 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 5 1056 1988 78 0 0 chr15 61788060 61788330 -41706644 - ORR1A2 LTR MaLR -57 270 1 5 1056 442 179 22 152 chr15 61790020 61790158 -41704816 - MT2B LTR ERVL -337 264 145 5 1056 911 266 122 108 chr15 61795364 61795762 -41699212 - MTD LTR MaLR 0 379 4 5 1056 1954 127 9 6 chr15 61796042 61796080 -41698894 + ORR1A1 LTR MaLR 21 57 -289 5 1056 1954 127 9 6 chr15 61796469 61796747 -41698227 + ORR1A1 LTR MaLR 58 336 -10 5 1056 3232 51 2 5 chr15 61804249 61804645 -41690329 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 5 1056 388 208 19 86 chr15 61808928 61809033 -41685941 + MT2B LTR ERVL 160 257 -344 5 1056 2392 110 0 3 chr15 61809226 61809553 -41685421 + ORR1A4 LTR MaLR 4 329 0 5 1056 603 318 71 101 chr15 61811513 61811891 -41683083 - MTEa LTR MaLR -12 367 1 5 1056 2761 76 52 3 chr15 61826663 61826678 -41668296 + MTB LTR MaLR 1 15 -385 6 1056 2761 76 52 3 chr15 61826736 61827101 -41667873 + MTB LTR MaLR 16 398 -2 6 1056 269 243 26 120 chr15 61827411 61827528 -41667446 - MT2B LTR ERVL -341 260 155 6 1056 391 257 36 18 chr15 61837878 61837989 -41656985 + MLT1I LTR MaLR 25 137 -274 6 1056 1556 185 116 14 chr15 61838579 61838924 -41656050 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 6 1056 1122 260 78 26 chr15 61843333 61843681 -41651293 + MTE2b LTR MaLR 1 366 -13 6 1056 240 349 24 0 chr15 61846544 61846627 -41648347 + LTR16A LTR ERVL 208 292 -159 6 1056 808 212 57 19 chr15 61848183 61848394 -41646580 - MLT1C LTR MaLR -243 224 6 6 1056 281 277 151 77 chr15 61850717 61851042 -41643932 - RLTR12B LTR ERVK -19 509 161 6 1056 1511 115 22 106 chr15 61851558 61851869 -41643105 + ORR1A4 LTR MaLR 1 285 -44 6 1056 618 284 58 31 chr15 61853272 61853497 -41641477 - MER67A LTR ERV1 -288 255 25 6 1056 1127 225 191 14 chr15 61854029 61854385 -41640589 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1056 1178 246 130 14 chr15 61854902 61855272 -41639702 - MTD LTR MaLR -6 413 1 6 1056 3336 71 24 72 chr15 61855849 61856348 -41638626 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1056 225 333 31 39 chr15 61858042 61858170 -41636804 - MLT1L LTR MaLR -318 292 166 6 1056 388 209 0 127 chr15 61862234 61862360 -41632614 + MT2B LTR ERVL 155 264 -337 7 1057 690 294 87 89 chr15 61882736 61882834 -41612140 + MTD LTR MaLR 18 119 -300 7 1057 690 294 87 89 chr15 61882870 61883174 -41611800 + MTD LTR MaLR 120 418 -1 7 1057 1178 277 19 16 chr15 61887280 61887658 -41607316 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 7 1057 227 342 52 35 chr15 61889964 61890079 -41604895 - MT2B2 LTR ERVL -303 281 165 7 1057 360 191 19 144 chr15 61890676 61890688 -41604286 - MT2B LTR ERVL -355 246 156 7 1057 958 173 51 25 chr15 61892907 61893273 -41601701 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 7 1057 256 296 64 90 chr15 61916273 61916429 -41578545 - MER34 LTR ERV1 -97 445 294 8 1057 1627 179 84 26 chr15 61916492 61916837 -41578137 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 8 1057 2034 131 83 52 chr15 61921076 61921462 -41573512 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 8 1057 1931 166 91 60 chr15 61921674 61922090 -41572884 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 2 8 1057 630 269 38 11 chr15 61922256 61922440 -41572534 - RLTR6-int LTR ERV1 -287 7491 7303 8 1057 897 179 36 0 chr15 61925353 61925521 -41569453 - RMER10A LTR ERVL -268 174 1 8 1057 1773 251 12 40 chr15 61928689 61929116 -41565858 + MTD LTR MaLR 3 417 -2 8 1057 372 145 11 18 chr15 61934221 61934333 -41560641 - MT2A LTR ERVL 0 533 366 8 1057 454 355 31 36 chr15 61934389 61934611 -41560363 - MTEa LTR MaLR -158 221 1 8 1057 1922 204 93 24 chr15 61944597 61945090 -41549884 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 9 1057 336 280 14 132 chr15 61945514 61945658 -41549316 + MT2B LTR ERVL 153 279 -322 9 1057 229 366 38 112 chr15 61945688 61945848 -41549126 - MamGypLTR2b LTR Gypsy -712 210 63 9 1057 1650 166 53 0 chr15 61961606 61961890 -41533084 + MTC LTR MaLR 123 421 0 9 1057 1360 191 115 21 chr15 61963484 61963815 -41531159 + ORR1D1 LTR MaLR 13 374 0 9 1057 2231 128 3 15 chr15 61967096 61967429 -41527545 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 9 1057 452 305 88 20 chr15 61967677 61967881 -41527093 + MER31A LTR ERV1 110 327 -158 9 1057 542 308 6 43 chr15 61967986 61968148 -41526826 + MTEa LTR MaLR 15 170 -209 9 1057 1186 246 79 52 chr15 61975707 61975907 -41519067 - MTE2b LTR MaLR 0 379 182 9 1057 1186 246 79 52 chr15 61976054 61976222 -41518752 - MTE2b LTR MaLR -198 181 1 9 1057 984 249 70 74 chr15 61977970 61978129 -41516845 - MTEa LTR MaLR -67 312 167 9 1057 984 249 70 74 chr15 61978164 61978316 -41516658 - MTEa LTR MaLR -213 166 2 9 1057 811 294 59 33 chr15 61981135 61981472 -41513502 + MLT1B LTR MaLR 38 383 -7 9 1057 327 312 72 56 chr15 61987094 61987221 -41507753 + MLT1B LTR MaLR 58 190 -200 9 1057 327 312 72 56 chr15 61987250 61987302 -41507672 + MLT1B LTR MaLR 191 240 -150 9 1057 1075 299 63 73 chr15 61993066 61993448 -41501526 - MTEa LTR MaLR 0 379 2 9 1058 573 316 155 26 chr15 62000178 62000487 -41494487 - LTR16A LTR ERVL -41 410 62 2 1058 277 324 0 47 chr15 62009132 62009239 -41485735 + MLT1A0 LTR MaLR 257 358 -7 1 1058 468 316 62 94 chr15 62011035 62011491 -41483483 - MLT2B2 LTR ERVL 0 555 18 1 1058 692 311 120 24 chr15 62013384 62013717 -41481257 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 1 1 1058 1475 173 203 20 chr15 62013978 62014332 -41480642 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1058 1172 180 139 8 chr15 62015038 62015072 -41479902 - ORR1C1 LTR MaLR -84 300 262 2 1058 1251 178 28 14 chr15 62015104 62015327 -41479647 - ORR1C1 LTR MaLR -123 261 9 2 1058 330 282 144 39 chr15 62015447 62015628 -41479346 - MLT1A LTR MaLR 0 374 175 2 1058 267 169 61 61 chr15 62015976 62016022 -41478952 - MT2A LTR ERVL -23 510 460 2 1058 267 169 61 61 chr15 62016057 62016092 -41478882 - MT2A LTR ERVL -74 459 429 2 1058 603 179 9 19 chr15 62016150 62016258 -41478716 + MT2A LTR ERVL 198 304 -229 2 1058 2281 85 22 12 chr15 62026480 62026801 -41468173 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 1 4 1058 253 360 29 29 chr15 62031889 62032029 -41462945 + MLT1E2 LTR MaLR 24 163 -464 5 1058 535 351 63 30 chr15 62032231 62032563 -41462411 + MLT1E2 LTR MaLR 171 513 -114 5 1058 291 313 82 73 chr15 62033362 62033595 -41461379 + ORR1E LTR MaLR 74 298 -76 5 1058 1260 231 107 24 chr15 62043260 62043597 -41451377 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 7 1058 487 281 23 63 chr15 62047576 62047793 -41447181 + MLT2D LTR ERVL 108 326 -71 7 1058 438 289 45 45 chr15 62061866 62062000 -41432974 - MTE2b LTR MaLR 0 379 246 9 1058 506 329 47 0 chr15 62062028 62062198 -41432776 - MTE2b LTR MaLR -201 178 1 9 1058 433 299 15 66 chr15 62062827 62063024 -41431950 - MLT1E2 LTR MaLR -440 187 1 9 1058 687 218 228 40 chr15 62065851 62066123 -41428851 + MTD LTR MaLR 81 403 -16 9 1058 269 271 0 0 chr15 62070930 62070989 -41423985 + MTEa LTR MaLR 13 71 -308 1 1058 432 312 101 28 chr15 62080708 62080955 -41414019 + MLT1L LTR MaLR 344 608 -2 1 1058 364 311 61 18 chr15 62083014 62083178 -41411796 + MLT1F LTR MaLR 364 534 -14 1 1058 318 363 38 38 chr15 62086640 62086852 -41408122 - MTEa LTR MaLR -116 263 52 1 1058 795 231 164 30 chr15 62087789 62088084 -41406890 + ORR1E LTR MaLR 25 382 -2 1 1058 378 310 81 89 chr15 62088101 62088448 -41406526 + ORR1E LTR MaLR 1 344 -15 1 1058 1153 247 107 23 chr15 62090198 62090583 -41404391 + MTD LTR MaLR 3 419 0 1 1058 257 269 111 37 chr15 62096595 62096703 -41398271 - MTEa LTR MaLR -263 116 1 1 1058 1180 256 43 13 chr15 62100589 62100870 -41394104 - ORR1D2 LTR MaLR -56 314 24 1 1058 1180 256 43 13 chr15 62100937 62100959 -41394015 - ORR1D2 LTR MaLR -347 23 2 1 1058 308 275 35 48 chr15 62105671 62105816 -41389158 - MLT1J1 LTR MaLR -239 205 63 1 1058 1957 114 58 61 chr15 62106447 62106775 -41388199 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1058 2036 197 5 17 chr15 62109105 62109523 -41385451 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1058 4982 183 34 5 chr15 62109526 62110486 -41384488 + MTC-int LTR MaLR 2 989 -269 1 1058 273 276 98 67 chr15 62111853 62112047 -41382927 + MLT1H LTR MaLR 350 549 0 1 1058 2257 166 0 10 chr15 62112882 62113272 -41381702 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 1 1058 426 300 189 7 chr15 62113715 62114000 -41380974 + MLT1F1 LTR MaLR 198 534 -35 1 1058 279 281 22 0 chr15 62120804 62120893 -41374081 + MLT1K LTR MaLR 501 591 -4 1 1059 1127 254 92 9 chr15 62138841 62139187 -41355787 - MLT1B LTR MaLR -2 388 14 2 1059 369 296 48 42 chr15 62145826 62145992 -41348982 - MLT1J1 LTR MaLR -260 184 18 2 1059 591 350 90 70 chr15 62150701 62151030 -41343944 - MLT1G LTR MaLR -28 563 214 2 1059 591 350 90 70 chr15 62151113 62151326 -41343648 - MLT1G LTR MaLR -378 213 10 2 1059 297 318 124 30 chr15 62158348 62158549 -41336425 + MTE2a LTR MaLR 119 338 -41 2 1059 300 351 176 0 chr15 62164027 62164232 -41330742 + MLT1H LTR MaLR 102 342 -207 2 1059 265 294 110 47 chr15 62172750 62172895 -41322079 - MTEa LTR MaLR -1 420 215 2 1059 265 346 113 110 chr15 62172949 62172986 -41321988 - MTEa LTR MaLR -165 214 194 2 1059 265 346 113 110 chr15 62173107 62173284 -41321690 - MTEa LTR MaLR -186 193 12 2 1059 2072 131 0 71 chr15 62174704 62175058 -41319916 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1059 519 284 26 157 chr15 62180719 62180949 -41314025 - MTEb LTR MaLR -178 201 2 2 1059 774 324 52 40 chr15 62182560 62182932 -41312042 - LTR16B LTR ERVL -45 418 8 2 1059 1042 301 47 18 chr15 62188999 62189341 -41305633 - ORR1E LTR MaLR 0 359 8 3 1059 1703 157 141 6 chr15 62196411 62196751 -41298223 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 3 1059 1859 179 16 64 chr15 62197113 62197489 -41297485 - ORR1B2 LTR MaLR -9 358 1 3 1059 1332 228 136 17 chr15 62207976 62208328 -41286646 + MTD LTR MaLR 18 411 -8 3 1059 2442 137 15 13 chr15 62212502 62212895 -41282079 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1059 232 331 107 8 chr15 62213197 62213328 -41281646 + MLT1F2 LTR MaLR 138 281 -279 3 1059 264 258 129 57 chr15 62224407 62224547 -41270427 + LTR33B LTR ERVL 325 474 -29 3 1059 399 331 121 48 chr15 62226859 62227173 -41267801 - ORR1E LTR MaLR -20 339 3 3 1059 2145 118 0 25 chr15 62238246 62238569 -41256405 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 12 3 1059 821 225 217 20 chr15 62243010 62243309 -41251665 - MTEa LTR MaLR -2 377 20 3 1059 359 348 55 51 chr15 62257327 62257584 -41237390 + MLT1J1 LTR MaLR 18 275 -169 4 1060 1075 274 71 24 chr15 62270660 62271000 -41223974 + MTEa LTR MaLR 1 356 -23 4 1060 776 261 93 107 chr15 62272114 62272298 -41222676 - ORR1D2 LTR MaLR -74 296 124 4 1060 776 261 93 107 chr15 62272935 62273050 -41221924 - ORR1D2 LTR MaLR -247 123 1 4 1060 1168 287 12 109 chr15 62282481 62282892 -41212082 - MTE2a LTR MaLR -8 371 1 4 1060 1247 238 71 38 chr15 62284782 62285149 -41209825 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1060 1390 247 99 6 chr15 62285379 62285721 -41209253 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 4 1060 2168 117 9 0 chr15 62285836 62286152 -41208822 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1060 3355 46 15 0 chr15 62290770 62291164 -41203810 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1060 2062 195 23 23 chr15 62293545 62293934 -41201040 + MTD LTR MaLR 24 412 -7 4 1060 281 229 120 83 chr15 62298303 62298436 -41196538 - MLT1H LTR MaLR -2 547 410 4 1060 492 312 117 15 chr15 62298533 62298738 -41196236 - MLT1H LTR MaLR -268 281 56 4 1060 1558 242 46 27 chr15 62312781 62313147 -41181827 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 5 1060 435 250 24 124 chr15 62317939 62318108 -41176866 - RMER10B LTR ERVL 0 398 247 5 1060 1328 266 63 23 chr15 62324332 62324682 -41170292 + MTE2b LTR MaLR 16 379 0 5 1060 229 337 31 98 chr15 62331435 62331629 -41163345 - MER34A LTR ERV1 -364 207 27 5 1060 239 361 25 0 chr15 62333777 62333896 -41161078 - MLT1B LTR MaLR -14 453 332 5 1060 299 292 52 10 chr15 62333948 62334045 -41160929 - MLT1B LTR MaLR -227 163 63 5 1060 504 332 19 19 chr15 62336356 62336571 -41158403 + RMER15 LTR ERVL 348 562 -13 5 1060 550 205 11 33 chr15 62342368 62342512 -41152462 - MTD LTR MaLR -14 405 260 5 1060 1360 217 49 80 chr15 62344267 62344653 -41150321 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1060 256 254 89 8 chr15 62356519 62356599 -41138375 - MTE2a LTR MaLR -301 78 1 5 1060 539 332 127 23 chr15 62356803 62357102 -41137872 - MLT1C LTR MaLR -17 450 121 5 1060 233 158 12 12 chr15 62357987 62358070 -41136904 + RMER17C LTR ERVK 171 253 -157 5 1060 1631 215 71 0 chr15 62363483 62363822 -41131152 - RMER15 LTR ERVL 0 575 213 5 1060 246 314 31 24 chr15 62363832 62363959 -41131015 - RMER15 LTR ERVL -291 284 157 5 1060 3150 56 2 8 chr15 62365345 62365743 -41129231 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1060 405 340 68 6 chr15 62373830 62373993 -41120981 + ORR1E LTR MaLR 1 173 -186 5 1060 383 400 24 65 chr15 62378228 62378474 -41116500 + ORR1E LTR MaLR 4 239 -120 6 1060 2309 334 98 58 chr15 62378662 62378930 -41116044 + MTE-int LTR MaLR 58 304 -1276 6 1060 2309 334 98 58 chr15 62378992 62380159 -41114815 + MTE-int LTR MaLR 305 1550 -30 6 1060 252 333 32 84 chr15 62380301 62380455 -41114519 + ORR1E LTR MaLR 219 364 -15 6 1060 370 329 118 53 chr15 62382332 62382560 -41112414 + ORR1E LTR MaLR 75 317 -42 6 1061 1425 245 30 60 chr15 62394090 62394459 -41100515 + MTD LTR MaLR 13 370 -49 6 1061 1127 222 37 109 chr15 62394467 62394816 -41100158 + MTC-int LTR MaLR 1 324 -934 6 1061 638 306 16 16 chr15 62394822 62395011 -41099963 + MTD LTR MaLR 22 210 -209 6 1061 554 365 34 71 chr15 62395782 62396133 -41098841 + MTEa LTR MaLR 40 377 -2 6 1061 4822 164 93 6 chr15 62407640 62408519 -41086455 + RMER17B LTR ERVK 3 958 0 6 1061 465 315 71 68 chr15 62408589 62408841 -41086133 + MTEa LTR MaLR 121 373 -6 6 1061 594 331 67 22 chr15 62408851 62409163 -41085811 + MLT1A0 LTR MaLR 27 352 -13 6 1061 530 219 18 0 chr15 62416121 62416235 -41078739 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 269 6 1061 901 265 217 3 chr15 62427286 62427581 -41067393 + ORR1D2 LTR MaLR 4 361 -9 6 1061 384 419 55 31 chr15 62427686 62428011 -41066963 + MLT1H LTR MaLR 13 345 -204 6 1061 426 343 130 24 chr15 62428345 62428599 -41066375 - RMER15 LTR ERVL -55 520 240 6 1061 312 376 0 0 chr15 62431634 62431735 -41063239 + MLT1J1 LTR MaLR 100 200 -244 6 1061 1922 224 2 18 chr15 62443733 62444128 -41050846 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 19 6 1061 283 354 16 84 chr15 62444603 62444794 -41050180 + ORR1D2 LTR MaLR 1 178 -192 6 1061 302 405 35 12 chr15 62445511 62445681 -41049293 - LTR33 LTR ERVL -307 208 35 6 1061 226 286 96 32 chr15 62448870 62448964 -41046010 + MLT1K LTR MaLR 493 592 -3 6 1061 1594 135 16 4 chr15 62457006 62457252 -41037722 + RLTR27 LTR ERVK 1 249 -60 6 1061 625 327 54 57 chr15 62461952 62462305 -41032669 + ORR1E LTR MaLR 4 355 -4 7 1061 669 333 40 71 chr15 62462452 62462830 -41032144 - MLT1A LTR MaLR 0 374 9 7 1061 2626 44 6 204 chr15 62463769 62464255 -41030719 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 7 1061 16413 17 1 13 chr15 62464257 62466251 -41028723 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 16 7 1061 2426 47 6 204 chr15 62466288 62466772 -41028202 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 7 1061 415 349 128 23 chr15 62466772 62467014 -41027960 + ORR1D2 LTR MaLR 64 332 -38 7 1061 233 275 46 81 chr15 62467230 62467317 -41027657 + ORR1A1 LTR MaLR 141 224 -122 7 1061 437 292 35 0 chr15 62479245 62479358 -41015616 + MTEa LTR MaLR 8 124 -255 7 1061 578 268 207 48 chr15 62489762 62490052 -41004922 - ORR1E LTR MaLR 0 359 24 7 1061 882 296 44 28 chr15 62492589 62492906 -41002068 + MLT1A0 LTR MaLR 20 341 -24 7 1061 346 255 108 9 chr15 62493547 62493658 -41001316 - ORR1E LTR MaLR -10 349 228 7 1061 326 137 0 0 chr15 62493656 62493707 -41001267 + ORR1B1 LTR MaLR 343 393 -1 7 1061 832 236 136 19 chr15 62500084 62500348 -40994626 + ORR1D1 LTR MaLR 80 374 0 1 1061 679 363 58 63 chr15 62501356 62501912 -40993062 + MLT1F2 LTR MaLR 4 556 -4 4 1061 670 259 25 55 chr15 62501950 62502150 -40992824 - ORR1C2 LTR MaLR -24 360 167 5 1061 620 249 37 53 chr15 62502219 62502406 -40992568 - ORR1C2 LTR MaLR -185 189 6 5 1061 677 328 44 0 chr15 62508225 62508405 -40986569 + ORR1E LTR MaLR 4 191 -168 1 1061 1565 213 127 81 chr15 62508405 62508478 -40986496 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 459 1 1061 1565 213 127 81 chr15 62508533 62508954 -40986020 - RLTR11A LTR ERVK -70 458 12 1 1061 640 245 70 13 chr15 62508963 62509120 -40985854 + ORR1E LTR MaLR 211 376 -3 1 1061 1232 225 144 9 chr15 62512425 62512752 -40982222 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 3 1 1061 576 359 131 24 chr15 62515909 62516329 -40978645 + MLT1C LTR MaLR 3 467 0 2 1062 353 218 64 0 chr15 62535224 62535302 -40959672 - MTE2b LTR MaLR -8 371 289 4 1062 1187 227 35 58 chr15 62535324 62535637 -40959337 + RLTR18 LTR ERVK 18 323 -293 4 1062 651 304 14 40 chr15 62535666 62535889 -40959085 + RLTR18 LTR ERVK 296 512 0 4 1062 982 268 60 30 chr15 62535889 62536155 -40958819 - MTE2b LTR MaLR -96 283 10 4 1062 232 146 49 0 chr15 62536168 62536209 -40958765 - MTC LTR MaLR -346 75 33 4 1062 2401 159 31 17 chr15 62536897 62537312 -40957662 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1062 727 215 36 15 chr15 62538003 62538168 -40956806 - MTE2a LTR MaLR -14 393 209 4 1062 1512 184 67 3 chr15 62538170 62538498 -40956476 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 11 4 1062 582 302 48 79 chr15 62538437 62538598 -40956376 - MTE2a LTR MaLR -112 267 108 4 1062 1929 177 68 3 chr15 62538598 62538966 -40956008 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 4 1062 582 282 33 80 chr15 62538966 62539104 -40955870 - MTE2a LTR MaLR -281 138 1 4 1062 225 224 0 39 chr15 62549642 62549693 -40945281 - MTE2a LTR MaLR -53 326 278 6 1062 731 303 53 53 chr15 62551478 62551778 -40943196 + MLT1A0 LTR MaLR 66 365 0 6 1062 701 244 0 19 chr15 62558730 62558889 -40936085 - MLT1A1 LTR MaLR -10 398 243 8 1062 886 295 132 41 chr15 62559149 62559513 -40935461 + MLT1A1 LTR MaLR 2 398 -10 8 1062 541 197 71 21 chr15 62567687 62567827 -40927147 - MTD LTR MaLR -7 412 266 9 1062 782 326 32 32 chr15 62567884 62568137 -40926837 - MTD LTR MaLR -149 270 18 9 1062 1305 159 49 161 chr15 62568812 62569179 -40925795 - ORR1C2 LTR MaLR -58 326 1 9 1062 2111 246 48 48 chr15 62582244 62582811 -40912163 - RMER15 LTR ERVL -2 573 7 1 1062 954 288 20 85 chr15 62592912 62593253 -40901721 + MTE2a LTR MaLR 58 376 -3 1 1062 310 315 56 0 chr15 62595518 62595626 -40899348 - MTEb LTR MaLR -102 277 164 1 1062 430 279 72 22 chr15 62606192 62606331 -40888643 + MLT2B1 LTR ERVL 420 565 -2 1 1062 432 367 84 20 chr15 62614394 62614644 -40880330 + LTR16A LTR ERVL 90 355 -96 1 1062 471 384 39 12 chr15 62623450 62623785 -40871189 + MLT1B LTR MaLR 43 386 -4 1 1062 642 317 154 15 chr15 62623791 62624248 -40870726 + MLT1B-int LTR MaLR 3 633 -738 1 1062 642 343 122 28 chr15 62629893 62630181 -40864793 + MTD LTR MaLR 18 332 -87 1 1062 431 299 400 20 chr15 62633702 62633946 -40861028 + MTD LTR MaLR 69 405 -14 1 1062 364 384 7 0 chr15 62646044 62646195 -40848779 - MTEb LTR MaLR -215 164 13 1 1062 2057 309 98 11 chr15 62646205 62646913 -40848061 - MTEb-int LTR MaLR -2 1578 810 1 1062 683 249 50 28 chr15 62646915 62647097 -40847877 - MTEb LTR MaLR -185 194 9 1 1062 482 296 138 79 chr15 62649024 62649314 -40845660 - ORR1E LTR MaLR -39 320 14 2 1063 365 314 97 17 chr15 62656177 62656352 -40838622 + MLT1C LTR MaLR 279 467 0 2 1063 298 401 60 19 chr15 62661055 62661271 -40833703 + MLT1H LTR MaLR 101 325 -224 2 1063 603 305 6 22 chr15 62671043 62671221 -40823753 - LTR40a LTR ERVL 0 519 345 2 1063 739 323 23 36 chr15 62674082 62674387 -40820587 + MLT1B LTR MaLR 90 390 0 2 1063 3452 18 5 0 chr15 62689416 62689810 -40805164 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1063 9365 27 0 1 chr15 62689810 62690909 -40804065 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1063 3452 18 5 0 chr15 62690909 62691303 -40803671 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1063 913 313 89 35 chr15 62700817 62701188 -40793786 + MTD LTR MaLR 9 399 -20 2 1063 302 292 31 20 chr15 62704450 62704548 -40790426 - RMER15 LTR ERVL -138 437 339 2 1063 853 306 64 43 chr15 62704607 62705000 -40789974 - RMER15-int LTR ERVL -168 4831 4431 2 1063 2041 342 49 48 chr15 62705849 62706964 -40788010 - RMER15-int LTR ERVL -3357 1642 525 2 1063 2041 342 49 48 chr15 62707102 62707155 -40787819 - RMER15-int LTR ERVL -4475 524 473 2 1063 1796 221 210 22 chr15 62719748 62720248 -40774726 + RMER19B LTR ERVK 301 894 -8 2 1063 259 342 127 30 chr15 62722951 62723117 -40771857 + MLT1D LTR MaLR 280 461 -44 3 1063 918 177 28 6 chr15 62723967 62724143 -40770831 + ORR1B2 LTR MaLR 188 367 0 3 1063 704 329 107 45 chr15 62726313 62726733 -40768241 + MLT2F LTR ERVL 205 650 -13 3 1063 293 322 0 22 chr15 62728622 62728711 -40766263 - MLT2F LTR ERVL -561 102 16 3 1063 388 239 67 58 chr15 62732631 62732751 -40762223 - MTD LTR MaLR -18 401 281 3 1063 630 310 45 34 chr15 62732805 62733069 -40761905 - MTD LTR MaLR -149 270 4 3 1063 497 317 53 120 chr15 62737130 62737431 -40757543 - MLT1F2 LTR MaLR -54 600 285 3 1063 242 370 0 0 chr15 62737508 62737589 -40757385 - MLT1F2 LTR MaLR -476 84 4 3 1063 1406 250 55 3 chr15 62738847 62739192 -40755782 + MTD LTR MaLR 1 363 -56 3 1063 1784 237 20 0 chr15 62741944 62742302 -40752672 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 10 3 1063 939 303 104 13 chr15 62743595 62743903 -40751071 + MLT1A0 LTR MaLR 30 365 0 3 1063 1001 323 27 21 chr15 62747768 62748141 -40746833 + MLT1A1 LTR MaLR 25 399 -9 3 1063 250 376 24 8 chr15 62752863 62752989 -40741985 + MLT1J1 LTR MaLR 15 142 -302 3 1063 1723 157 14 15 chr15 62765001 62765316 -40729658 + ORR1A2 LTR MaLR 47 374 0 3 1063 490 357 13 7 chr15 62771990 62772145 -40722829 + MLT2B1 LTR ERVL 348 503 -64 3 1063 411 320 127 60 chr15 62776716 62777074 -40717900 + MLT1B LTR MaLR 7 374 0 3 1063 352 337 13 90 chr15 62778638 62778886 -40716088 + MLT1E2 LTR MaLR 1 233 -272 3 1063 321 302 19 39 chr15 62778867 62779022 -40715952 + MLT1E2 LTR MaLR 354 505 0 3 1063 689 128 78 0 chr15 62779057 62779144 -40715830 + RMER17B LTR ERVK 312 400 -558 3 1063 689 183 79 57 chr15 62779207 62779333 -40715641 + RMER17B LTR ERVK 401 568 -338 3 1063 398 207 24 0 chr15 62779432 62779514 -40715460 + ORR1D-int LTR MaLR 1098 1181 -189 3 1063 2175 19 110 0 chr15 62781147 62781410 -40713564 + RLTR10B LTR ERVK 1 292 0 3 1063 808 332 85 30 chr15 62782642 62782805 -40712169 + RMER5 LTR ERV1 33 210 -324 3 1063 808 332 85 30 chr15 62783004 62783300 -40711674 + RMER5 LTR ERV1 211 516 -18 3 1064 1649 168 27 76 chr15 62787146 62787613 -40707361 + RMER17C LTR ERVK 16 437 -521 3 1064 245 325 112 25 chr15 62788782 62788943 -40706031 - ORR1E LTR MaLR -165 194 20 3 1064 492 291 82 29 chr15 62789073 62789461 -40705513 - LTR48 LTR ERV1 -40 747 154 3 1064 3677 200 98 78 chr15 62790125 62790860 -40704114 + RLTR25B LTR ERVK 1 809 -219 3 1064 3677 200 98 78 chr15 62790897 62791168 -40703806 + RLTR25B LTR ERVK 810 1027 -1 3 1064 229 292 52 10 chr15 62791254 62791351 -40703623 - MER34 LTR ERV1 -65 477 377 3 1064 308 273 136 32 chr15 62791659 62791784 -40703190 - LTR48 LTR ERV1 -649 138 1 3 1064 954 272 108 50 chr15 62792021 62792362 -40702612 + MTEa LTR MaLR 19 379 0 4 1064 963 360 83 96 chr15 62795549 62797067 -40697907 + MLT-int LTR MaLR 5 1726 -9 4 1064 678 339 97 19 chr15 62809089 62809408 -40685566 - MLT1E3 LTR MaLR -25 599 256 4 1064 564 285 236 68 chr15 62811677 62811968 -40683006 - MTEb LTR MaLR -37 342 3 4 1064 629 275 103 109 chr15 62819304 62819635 -40675339 + ORR1E LTR MaLR 29 357 -2 4 1064 284 295 32 76 chr15 62820171 62820329 -40674645 + RMER4B LTR ERVK 12 162 -423 4 1064 1272 277 20 42 chr15 62823781 62824135 -40670839 - ORR1E LTR MaLR -4 355 10 4 1064 558 365 75 11 chr15 62827370 62827800 -40667174 - MER74A LTR ERVL 0 558 89 4 1064 2160 202 109 2 chr15 62833043 62833519 -40661455 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 4 1064 1711 188 59 46 chr15 62834145 62834518 -40660456 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1064 739 349 83 25 chr15 62834564 62834890 -40660084 + ORR1E LTR MaLR 10 354 -5 4 1064 315 296 36 18 chr15 62836491 62836601 -40658373 - MLT1A1 LTR MaLR -103 305 194 4 1064 3385 142 19 134 chr15 62842053 62842378 -40652596 + RMER17A LTR ERVK 1 313 -438 4 1064 3385 142 19 134 chr15 62842406 62842924 -40652050 + RMER17A LTR ERVK 314 747 -4 4 1064 325 388 56 19 chr15 62846121 62846334 -40648640 + MLT1K LTR MaLR 47 267 -328 4 1064 760 307 92 47 chr15 62850771 62851215 -40643759 + MLT1C LTR MaLR 4 467 0 4 1064 1962 135 35 0 chr15 62878071 62878382 -40616592 - ORR1A2 LTR MaLR -5 322 1 5 1064 347 289 76 30 chr15 62891788 62891920 -40603054 + MLT1A LTR MaLR 14 151 -223 5 1064 532 290 85 16 chr15 62892503 62892692 -40602282 + MLT1A LTR MaLR 173 374 0 5 1064 266 298 96 0 chr15 62894457 62894551 -40600423 - MLT1C LTR MaLR -9 458 356 5 1064 450 290 51 19 chr15 62896035 62896193 -40598781 - MLT1C LTR MaLR -291 176 14 5 1064 790 329 84 12 chr15 62899405 62899737 -40595237 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 5 1065 514 374 39 11 chr15 62919638 62919967 -40575007 + MLT1E1 LTR MaLR 272 641 -13 5 1065 3368 187 36 7 chr15 62931265 62931938 -40563036 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 5 1065 2022 116 3 13 chr15 62943280 62943594 -40551380 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 1065 1212 254 69 47 chr15 62949428 62949792 -40545182 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 6 1065 864 292 70 58 chr15 62954420 62954762 -40540212 - MTEb LTR MaLR -20 359 14 6 1065 2046 104 50 0 chr15 62956364 62956663 -40538311 - ORR1A2 LTR MaLR -13 314 1 6 1065 3250 139 135 91 chr15 62970124 62970830 -40524144 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 6 1065 820 19 26 70 chr15 62970912 62971027 -40523947 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 237 6 1065 581 198 35 0 chr15 62972546 62972662 -40522312 + RMER15 LTR ERVL 456 575 0 6 1065 702 266 84 55 chr15 62988334 62988608 -40506366 - RMER21B LTR ERV1 -289 553 272 6 1065 1178 267 143 3 chr15 62989490 62989847 -40505127 - MTD LTR MaLR -12 407 1 6 1065 260 312 63 18 chr15 62991734 62991845 -40503129 + MLT1E2 LTR MaLR 141 256 -371 6 1065 356 355 8 8 chr15 62991926 62992072 -40502902 - MLT1A1 LTR MaLR -2 465 282 6 1065 411 402 58 12 chr15 62992175 62992432 -40502542 - MLT1A1 LTR MaLR -132 276 8 6 1065 597 325 37 95 chr15 62992434 62992730 -40502244 + MLT1E2 LTR MaLR 349 627 0 6 1065 399 307 65 14 chr15 62998123 62998262 -40496712 - RMER15 LTR ERVL -155 420 275 6 1065 680 371 88 55 chr15 62998459 62999164 -40495810 + MLT1H-int LTR MaLR 5 732 -677 6 1065 267 329 105 25 chr15 62999377 62999590 -40495384 + MLT1H-int LTR MaLR 1068 1357 -132 6 1065 798 268 159 16 chr15 63000672 63000991 -40493983 - MTD LTR MaLR -5 414 50 2 1065 3230 105 17 8 chr15 63007752 63008223 -40486751 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1065 454 338 197 22 chr15 63020284 63020553 -40474421 - MLT1F2 LTR MaLR -240 320 5 2 1065 274 287 128 81 chr15 63021113 63021261 -40473713 + MLT1K LTR MaLR 324 478 -117 2 1065 797 239 205 61 chr15 63022538 63022850 -40472124 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 2 1065 2718 177 37 8 chr15 63024064 63024576 -40470398 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 3 1065 804 265 60 0 chr15 63033440 63033640 -40461334 - MTD LTR MaLR -14 407 196 4 1065 1019 226 0 24 chr15 63034281 63034494 -40460480 - MTD LTR MaLR -210 209 2 4 1065 397 344 31 110 chr15 63037709 63038000 -40456974 + MLT1B LTR MaLR 42 309 -81 5 1065 250 306 116 9 chr15 63040603 63040715 -40454259 + MLT2B3 LTR ERVL 429 552 -2 6 1066 3119 66 5 0 chr15 63071286 63071680 -40423294 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1066 282 399 67 35 chr15 63086494 63086777 -40408197 + LTR33A LTR ERVL 9 300 -220 1 1066 280 326 116 74 chr15 63087925 63088320 -40406654 - MLT1F LTR MaLR -189 359 6 1 1066 340 258 53 91 chr15 63101447 63101598 -40393376 + RMER17C LTR ERVK 80 234 -176 1 1066 340 258 53 91 chr15 63101882 63101994 -40392980 + RMER17C LTR ERVK 235 332 -78 1 1066 856 303 48 20 chr15 63118996 63119245 -40375729 - MTE2b LTR MaLR -123 256 1 1 1066 857 252 46 23 chr15 63139844 63140063 -40354911 + ORR1D2 LTR MaLR 1 224 -146 2 1066 2610 188 108 40 chr15 63140169 63140718 -40354256 - RMER20B LTR ERVK -22 605 20 2 1066 2862 62 88 0 chr15 63141403 63141790 -40353184 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1066 241 373 0 18 chr15 63149016 63149128 -40345846 + RMER12 LTR ERVK 742 851 -471 2 1066 1095 194 128 36 chr15 63152805 63153109 -40341865 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 2 1066 561 276 135 91 chr15 63153659 63154022 -40340952 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 2 1066 714 322 254 22 chr15 63154022 63154384 -40340590 + MTEa-int LTR MaLR 1 446 -1134 2 1066 784 240 23 6 chr15 63154386 63154558 -40340416 + MTEa-int LTR MaLR 574 748 -832 2 1066 1512 312 138 29 chr15 63155242 63155893 -40339081 + MTEa-int LTR MaLR 857 1578 -2 2 1066 1167 318 25 15 chr15 63156073 63156479 -40338495 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1143 4571 4162 2 1066 1477 319 90 13 chr15 63156476 63157272 -40337702 - ERVL-B4-int LTR ERVL -1724 4037 3055 2 1066 2031 206 35 118 chr15 63168357 63169024 -40325950 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 2 1066 236 369 101 65 chr15 63174086 63174393 -40320581 + MLT1J2 LTR MaLR 88 405 -43 2 1067 1504 167 44 45 chr15 63180249 63180694 -40314280 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 2 1067 312 290 91 163 chr15 63180700 63181161 -40313813 - LTR78 LTR ERV1 -181 1123 696 2 1067 6253 118 13 4 chr15 63182813 63183763 -40311211 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 2 1067 3071 70 14 0 chr15 63193424 63193839 -40301135 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 2 1067 295 273 83 69 chr15 63200740 63201004 -40293970 - MER57D LTR ERV1 -65 369 56 3 1067 291 221 125 10 chr15 63204894 63204990 -40289984 - MTEa LTR MaLR -116 263 157 3 1067 664 286 28 11 chr15 63206345 63206525 -40288449 - MTEa LTR MaLR -196 183 1 3 1067 272 275 44 35 chr15 63208160 63208273 -40286701 - MLT1K LTR MaLR -5 590 477 3 1067 443 347 76 43 chr15 63214489 63214859 -40280115 + MLT1B LTR MaLR 1 382 -8 3 1067 1969 177 13 40 chr15 63218921 63219298 -40275676 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 1067 1865 130 83 0 chr15 63219764 63220065 -40274909 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 3 1067 521 350 113 29 chr15 63229438 63229818 -40265156 + MLT1F2 LTR MaLR 143 554 -6 3 1067 353 304 186 81 chr15 63233331 63233765 -40261209 + MLT1E3 LTR MaLR 123 622 -5 3 1067 342 326 63 26 chr15 63238139 63238328 -40256646 - MLT1M LTR MaLR -318 354 159 3 1067 3087 184 104 15 chr15 63238805 63238919 -40256055 + RMER17B LTR ERVK 236 355 -603 3 1067 3087 184 104 15 chr15 63238978 63239526 -40255448 + RMER17B LTR ERVK 356 956 -2 3 1067 267 313 0 74 chr15 63249257 63249378 -40245596 - ORR1E LTR MaLR -104 255 144 4 1067 427 278 204 55 chr15 63250493 63250801 -40244173 + ORR1E LTR MaLR 4 357 -2 4 1067 514 352 80 31 chr15 63255181 63255407 -40239567 - LTR16A LTR ERVL -176 275 39 4 1067 2075 146 112 13 chr15 63264839 63265213 -40229761 + MTC LTR MaLR 1 411 -10 4 1067 792 298 16 25 chr15 63271840 63272079 -40222895 - MTC LTR MaLR -14 407 171 4 1067 719 147 47 0 chr15 63272079 63272208 -40222766 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 1 135 -422 4 1067 929 219 35 96 chr15 63272208 63272551 -40222423 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 1067 467 168 257 18 chr15 63272557 63272666 -40222308 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 139 273 -288 4 1067 695 330 7 43 chr15 63275491 63275767 -40219207 + ORR1D-int LTR MaLR 107 372 -998 4 1067 255 292 68 42 chr15 63288988 63289106 -40205868 + LTR16A LTR ERVL 331 451 0 4 1067 2246 91 21 50 chr15 63292304 63292641 -40202333 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1067 3516 20 2 0 chr15 63296504 63296899 -40198075 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1067 1865 131 24 68 chr15 63297203 63297539 -40197435 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 1067 319 216 28 43 chr15 63297836 63297946 -40197028 + MTD LTR MaLR 94 201 -128 4 1067 2312 145 32 20 chr15 63298100 63298502 -40196472 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1067 572 171 179 0 chr15 63299130 63299253 -40195721 + MTD LTR MaLR 230 374 -45 4 1067 382 328 68 91 chr15 63300783 63300982 -40193992 - ORR1E LTR MaLR -2 357 166 4 1067 382 328 68 91 chr15 63301003 63301155 -40193819 - ORR1E LTR MaLR -194 165 14 4 1067 236 234 101 25 chr15 63303766 63303845 -40191129 + MTEa LTR MaLR 16 100 -279 4 1067 1158 199 121 4 chr15 63304090 63304347 -40190627 - MTD LTR MaLR -4 415 129 4 1067 255 306 24 0 chr15 63306193 63306278 -40188696 + MTE2b LTR MaLR 291 377 -2 4 1068 306 237 65 13 chr15 63308198 63308275 -40186699 + MTEa LTR MaLR 2 82 -297 4 1068 626 272 57 11 chr15 63308560 63308735 -40186239 + MTEa LTR MaLR 197 379 0 4 1068 328 229 65 143 chr15 63312321 63312514 -40182460 - RLTR25B LTR ERVK -56 972 750 5 1068 4601 174 38 6 chr15 63312795 63313664 -40181310 - RLTR25A LTR ERVK -206 897 1 5 1068 1358 235 103 6 chr15 63314962 63315292 -40179682 + ORR1D2 LTR MaLR 9 370 0 5 1068 1001 308 67 17 chr15 63317795 63318188 -40176786 + MTD LTR MaLR 2 404 -15 5 1068 2530 150 68 56 chr15 63324936 63325437 -40169537 - RMER15 LTR ERVL -57 518 12 5 1068 1181 291 71 95 chr15 63335504 63336135 -40158839 + RLTR18 LTR ERVK 1 616 0 5 1068 2781 156 24 0 chr15 63338986 63339441 -40155533 + RLTR25A LTR ERVK 1 466 -637 5 1068 589 160 80 0 chr15 63339437 63339537 -40155437 + RLTR25A LTR ERVK 996 1103 0 5 1068 634 296 50 15 chr15 63340111 63340310 -40154664 + MTE2b LTR MaLR 1 206 -173 5 1068 3213 302 96 48 chr15 63340633 63341008 -40153966 + MTE2b-int LTR MaLR 257 627 -953 5 1068 3213 302 96 48 chr15 63341035 63341247 -40153727 + MTE2b-int LTR MaLR 628 878 -702 5 1068 3213 302 96 48 chr15 63341288 63341956 -40153018 + MTE2b-int LTR MaLR 879 1573 -7 5 1068 374 341 24 0 chr15 63341962 63342088 -40152886 + MTE2b LTR MaLR 1 129 -250 5 1068 409 345 80 28 chr15 63349973 63350149 -40144825 - MLT1K LTR MaLR -10 585 401 5 1068 2767 85 12 40 chr15 63351450 63351877 -40143097 + RLTR9F LTR ERVK 1 415 0 5 1068 304 303 126 63 chr15 63359502 63359692 -40135282 + MLT2C2 LTR ERVL 88 289 -175 5 1068 1536 184 13 146 chr15 63365169 63365628 -40129346 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 5 1068 236 224 51 17 chr15 63367188 63367247 -40127727 - LTR50 LTR ERVL -18 777 717 5 1068 257 333 159 12 chr15 63367504 63367674 -40127300 - LTR50 LTR ERVL -190 605 411 5 1068 311 332 177 28 chr15 63367702 63367950 -40127024 - LTR50 LTR ERVL -497 298 14 5 1068 590 290 28 17 chr15 63370320 63370499 -40124475 - RMER15 LTR ERVL -96 479 299 5 1068 230 281 66 22 chr15 63372073 63372164 -40122810 - ORR1E LTR MaLR -264 95 1 5 1068 426 307 119 34 chr15 63373910 63374146 -40120828 - ORR1E LTR MaLR -103 256 1 6 1068 2025 132 28 12 chr15 63375199 63375521 -40119453 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1068 246 207 107 24 chr15 63375938 63376022 -40118952 + MTEa LTR MaLR 276 366 -13 6 1068 633 358 98 59 chr15 63376188 63376627 -40118347 - MLT2B3 LTR ERVL -95 459 4 6 1068 3092 188 35 12 chr15 63376904 63377479 -40117495 - RMER19C LTR ERVK -23 588 1 6 1068 619 292 37 9 chr15 63379198 63379412 -40115562 - MLT2D LTR ERVL -194 220 1 6 1068 3145 63 0 8 chr15 63380115 63380514 -40114460 - MTB LTR MaLR -2 398 3 6 1068 238 336 128 25 chr15 63381470 63381705 -40113269 + MLT1B LTR MaLR 116 374 -16 6 1068 308 319 41 25 chr15 63382741 63382863 -40112111 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 285 6 1068 2031 187 26 48 chr15 63386542 63386958 -40108016 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1068 271 321 84 12 chr15 63389305 63389472 -40105502 + RMER4A LTR ERVK 8 186 -280 6 1068 2880 49 0 3 chr15 63400494 63400841 -40094133 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1068 254 189 62 75 chr15 63401746 63401826 -40093148 - MLT1F2 LTR MaLR -23 444 366 6 1068 876 351 88 19 chr15 63401812 63402175 -40092799 - MLT1F2 LTR MaLR -154 406 19 6 1068 245 231 118 44 chr15 63403150 63403218 -40091756 - MLT1D LTR MaLR -432 73 1 6 1068 2399 154 171 52 chr15 63405473 63405987 -40088987 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 6 1068 1233 252 65 40 chr15 63406998 63407349 -40087625 + ORR1D2 LTR MaLR 7 366 -4 6 1068 557 335 120 57 chr15 63412572 63412634 -40082340 - MLT1C LTR MaLR -9 458 386 6 1068 557 335 120 57 chr15 63413050 63413411 -40081563 - MLT1C LTR MaLR -82 385 8 6 1068 824 277 103 4 chr15 63416434 63416666 -40078308 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 116 6 1068 1241 190 15 40 chr15 63418870 63419174 -40075800 - RMER19B LTR ERVK -1 901 335 6 1068 481 345 50 93 chr15 63429921 63430298 -40064676 + MLT2C1 LTR ERVL 17 377 -20 7 1068 310 310 43 34 chr15 63430305 63430422 -40064552 + MLT-int LTR MaLR 20 137 -1598 7 1068 542 288 87 94 chr15 63430940 63431054 -40063920 - MLT1E1 LTR MaLR -68 586 482 7 1068 542 288 87 94 chr15 63431729 63431901 -40063073 - MLT1E1 LTR MaLR -173 481 302 7 1069 242 215 62 0 chr15 63454916 63454981 -40039993 + LTR33B LTR ERVL 423 491 -12 7 1069 3256 48 15 0 chr15 63457237 63457631 -40037343 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1069 315 214 28 37 chr15 63491929 63492036 -40002938 - MLT1D LTR MaLR -1 504 399 7 1069 594 306 6 0 chr15 63494677 63494857 -40000117 + MT2A LTR ERVL 5 185 -348 8 1069 2851 92 52 0 chr15 63496806 63497207 -39997767 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 8 1069 1646 205 61 14 chr15 63501769 63502130 -39992844 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 7 1069 430 297 17 0 chr15 63505455 63505573 -39989401 - MTE2a LTR MaLR -259 120 1 1 1069 631 296 67 91 chr15 63505809 63506037 -39988937 + MLT1B LTR MaLR 18 253 -137 1 1069 631 296 67 91 chr15 63506241 63506387 -39988587 + MLT1B LTR MaLR 254 383 -7 1 1069 1420 190 165 30 chr15 63511559 63511928 -39983046 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1069 895 266 104 4 chr15 63513305 63513584 -39981390 - MTE2b LTR MaLR -17 362 56 2 1069 277 214 51 120 chr15 63513916 63514033 -39980941 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 2 1069 951 269 136 3 chr15 63519989 63520306 -39974668 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 3 1069 1119 97 12 0 chr15 63531019 63531184 -39963790 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 160 6 1069 1422 169 41 105 chr15 63531797 63532140 -39962834 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 7 1069 357 339 119 24 chr15 63540088 63540339 -39954635 - LTR33 LTR ERVL -240 275 1 8 1069 290 328 63 128 chr15 63560770 63560971 -39934003 + MLT1D LTR MaLR 6 190 -315 1 1069 290 280 135 56 chr15 63561113 63561350 -39933624 + MLT1D LTR MaLR 184 408 -59 1 1070 541 327 92 31 chr15 63577124 63577484 -39917490 + MLT1D LTR MaLR 117 498 -7 1 1070 290 205 94 24 chr15 63585716 63585801 -39909173 + MTEa LTR MaLR 288 378 -1 1 1070 459 308 23 59 chr15 63601253 63601474 -39893500 + MLT1F1 LTR MaLR 343 555 -14 1 1070 1497 198 65 9 chr15 63603650 63603986 -39890988 - MTD LTR MaLR -64 355 1 2 1070 3251 53 5 2 chr15 63604091 63604490 -39890484 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1070 1761 156 67 90 chr15 63604672 63605059 -39889915 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1070 285 342 102 20 chr15 63605161 63605358 -39889616 + MLT1C LTR MaLR 61 273 -194 2 1070 2084 134 0 57 chr15 63631849 63632198 -39862776 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1070 332 206 20 49 chr15 63638151 63638253 -39856721 - MTEb LTR MaLR 0 379 281 2 1070 238 257 68 0 chr15 63640504 63640578 -39854396 - MTEa LTR MaLR -17 362 284 2 1070 5356 160 104 56 chr15 63642876 63644079 -39850895 + RMER17A-int LTR ERVK 468 1728 0 2 1070 1083 107 0 18 chr15 63644080 63644251 -39850723 + RMER17A2 LTR ERVK 1 168 -738 2 1070 1046 236 172 6 chr15 63644913 63645267 -39849707 - MTD LTR MaLR -2 417 5 2 1070 3173 149 66 28 chr15 63645677 63646256 -39848718 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 2 1070 1155 161 67 22 chr15 63646543 63646900 -39848074 + RMER10A LTR ERVL 32 441 -1 2 1070 259 159 154 31 chr15 63653245 63653310 -39841664 - ETnERV2-int LTR ERVK -7333 73 1 2 1070 2078 96 21 12 chr15 63653325 63653664 -39841310 - RLTR13D6 LTR ERVK -1 901 560 2 1070 3074 23 3 0 chr15 63654190 63654535 -39840439 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1070 1916 144 6 63 chr15 63663259 63663608 -39831366 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1070 245 241 37 0 chr15 63667073 63667127 -39827847 + MT2B LTR ERVL 185 240 -361 2 1070 341 202 30 50 chr15 63669482 63669581 -39825393 - MTEb LTR MaLR -2 377 281 2 1070 258 287 143 36 chr15 63669688 63669761 -39825213 + RMER12 LTR ERVK 770 854 -468 2 1070 312 241 43 159 chr15 63672692 63672830 -39822144 + MT2B LTR ERVL 155 276 -325 3 1070 1392 218 55 55 chr15 63674662 63675046 -39819928 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1070 850 270 188 11 chr15 63675745 63676097 -39818877 - MTC LTR MaLR -2 419 6 3 1070 3223 146 65 29 chr15 63676495 63677075 -39817899 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 3 1070 1434 169 182 6 chr15 63677359 63677710 -39817264 + RMER10A LTR ERVL 29 441 -1 3 1070 1552 235 152 37 chr15 63683126 63683613 -39811361 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 136 3 1070 362 356 70 46 chr15 63683757 63683998 -39810976 - MLT1J LTR MaLR -26 486 240 3 1070 247 330 143 0 chr15 63684010 63684101 -39810873 - MLT1J LTR MaLR -340 172 69 3 1070 295 168 132 3 chr15 63687006 63687082 -39807892 - ETnERV2-int LTR ERVK -7333 73 1 3 1070 2222 104 21 9 chr15 63687085 63687424 -39807550 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 560 3 1070 1892 147 6 63 chr15 63696591 63696940 -39798034 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1070 245 241 37 0 chr15 63700426 63700480 -39794494 + MT2B LTR ERVL 185 240 -361 3 1071 341 202 30 50 chr15 63702886 63702985 -39791989 - MTEb LTR MaLR -2 377 281 3 1071 258 287 143 36 chr15 63703092 63703165 -39791809 + RMER12 LTR ERVK 770 854 -468 3 1071 312 241 43 159 chr15 63706074 63706212 -39788762 + MT2B LTR ERVL 155 276 -325 3 1071 236 168 42 101 chr15 63707224 63707343 -39787631 - RMER17C LTR ERVK -250 160 49 3 1071 1408 215 55 55 chr15 63708044 63708428 -39786546 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1071 850 270 188 11 chr15 63709127 63709479 -39785495 - MTC LTR MaLR -2 419 6 3 1071 3212 146 65 29 chr15 63709877 63710457 -39784517 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 3 1071 1434 169 182 6 chr15 63710741 63711092 -39783882 + RMER10A LTR ERVL 29 441 -1 3 1071 1574 232 152 37 chr15 63716736 63717223 -39777751 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 136 3 1071 362 356 70 46 chr15 63717367 63717608 -39777366 - MLT1J LTR MaLR -26 486 240 3 1071 247 330 143 0 chr15 63717620 63717711 -39777263 - MLT1J LTR MaLR -340 172 69 3 1071 228 232 71 35 chr15 63719891 63719976 -39774998 + MURVY-LTR LTR ERV1 351 438 -81 3 1071 295 168 132 3 chr15 63720616 63720692 -39774282 - ETnERV2-int LTR ERVK -7333 73 1 4 1071 2232 98 24 9 chr15 63720695 63721033 -39773941 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 560 4 1071 1866 143 23 64 chr15 63730214 63730557 -39764417 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1071 309 227 20 49 chr15 63736453 63736555 -39758419 - MTEb LTR MaLR 0 379 281 4 1071 274 225 70 0 chr15 63738984 63739055 -39755919 - MTEa LTR MaLR -21 358 283 4 1071 266 241 43 159 chr15 63739675 63739813 -39755161 + MT2B LTR ERVL 155 276 -325 4 1071 1421 212 55 55 chr15 63741762 63742146 -39752828 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1071 1132 219 172 6 chr15 63742837 63743191 -39751783 - MTD LTR MaLR -2 417 5 4 1071 3140 145 75 30 chr15 63743616 63744191 -39750783 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 4 1071 1298 175 182 6 chr15 63744475 63744826 -39750148 + RMER10A LTR ERVL 29 441 -1 4 1071 1342 234 143 33 chr15 63750431 63750886 -39744088 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 174 4 1071 274 346 80 27 chr15 63751062 63751249 -39743725 - MLT1J LTR MaLR -26 486 290 4 1071 525 291 64 0 chr15 63761159 63761331 -39733643 - MLT1C LTR MaLR 0 467 285 4 1071 248 315 76 16 chr15 63761356 63761540 -39733434 - MLT1C LTR MaLR -268 237 43 4 1071 260 206 14 113 chr15 63782032 63782103 -39712871 - MT2B2 LTR ERVL -340 244 181 4 1071 1607 244 49 3 chr15 63791375 63791720 -39703254 + ORR1D2 LTR MaLR 2 362 -8 5 1071 1395 150 192 13 chr15 63797322 63797639 -39697335 + ORR1C1 LTR MaLR 1 374 -4 5 1071 1870 118 15 24 chr15 63799328 63799629 -39695345 + ORR1A4 LTR MaLR 63 348 -11 5 1071 529 321 118 30 chr15 63804838 63805108 -39689866 + LTR16E2 LTR ERVL 267 560 -8 5 1071 1529 185 132 38 chr15 63806640 63806982 -39687992 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1071 2218 184 27 2 chr15 63809692 63810095 -39684879 - MTC LTR MaLR -8 413 1 5 1071 451 323 59 20 chr15 63813338 63813540 -39681434 + ORR1E LTR MaLR 138 347 -12 5 1071 668 267 144 37 chr15 63814404 63814703 -39680271 - ORR1E LTR MaLR -28 331 1 5 1071 1556 170 38 142 chr15 63815654 63816071 -39678903 + ORR1C1 LTR MaLR 5 378 0 5 1071 232 280 16 123 chr15 63819777 63819801 -39675173 + MT2B LTR ERVL 148 158 -443 5 1071 686 203 111 50 chr15 63822076 63822362 -39672612 - ORR1D1 LTR MaLR -14 370 8 5 1071 858 277 62 47 chr15 63824979 63825312 -39669662 + MTD LTR MaLR 22 403 -16 5 1072 1055 261 94 7 chr15 63837020 63837306 -39657668 + MTEb LTR MaLR 68 378 -1 6 1072 1324 244 21 99 chr15 63840228 63840667 -39654307 - MTE2a LTR MaLR -14 405 6 6 1072 227 179 32 97 chr15 63841716 63841778 -39653196 - MLT1I LTR MaLR 0 411 354 6 1072 356 253 33 11 chr15 63843145 63843237 -39651737 + MTD LTR MaLR 3 96 -323 6 1072 1052 249 122 20 chr15 63843452 63843751 -39651223 + MTD LTR MaLR 90 419 0 6 1072 258 295 58 88 chr15 63844893 63845064 -39649910 + MLT1L LTR MaLR 119 284 -326 6 1072 338 316 57 31 chr15 63847240 63847433 -39647541 + MLT1K LTR MaLR 94 291 -304 6 1072 630 328 109 25 chr15 63867807 63868164 -39626810 - MLT1D LTR MaLR -116 389 3 6 1072 228 258 47 123 chr15 63871347 63871453 -39623521 + MLT1L LTR MaLR 345 442 -168 6 1072 1218 255 50 56 chr15 63876835 63877192 -39617782 - MTE2b LTR MaLR -23 356 2 6 1072 488 328 91 49 chr15 63879208 63879516 -39615458 - MTEa LTR MaLR -48 331 11 6 1072 671 278 70 36 chr15 63896392 63896694 -39598280 - MLT1A0 LTR MaLR -53 312 1 7 1072 2675 87 81 3 chr15 63899777 63900148 -39594826 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1072 8137 71 16 13 chr15 63900148 63900853 -39594121 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 391 7 1072 8137 71 16 13 chr15 63901047 63901435 -39593539 - MTB-int LTR MaLR -708 390 1 7 1072 3613 40 65 0 chr15 63901437 63901615 -39593359 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 297 7 1072 3613 40 65 0 chr15 63901680 63901947 -39593027 - MT2C_Mm LTR ERVL -179 296 2 7 1072 1184 239 101 14 chr15 63902958 63903299 -39591675 - MTE2b LTR MaLR 0 370 1 7 1072 414 342 175 16 chr15 63905323 63905626 -39589348 + MLT1D LTR MaLR 150 500 -5 7 1072 317 320 108 52 chr15 63909572 63909892 -39585082 + MLT1A1 LTR MaLR 33 400 -8 7 1072 1225 300 171 28 chr15 63914226 63914870 -39580104 + MER21B LTR ERV1 12 747 -116 7 1072 389 267 211 6 chr15 63918070 63918236 -39576738 + RMER15 LTR ERVL 373 572 -3 7 1072 1657 167 130 9 chr15 63927343 63927682 -39567292 + ORR1C2 LTR MaLR 1 380 -4 7 1072 245 255 18 101 chr15 63929050 63929159 -39565815 + MLT1A1 LTR MaLR 290 389 -19 7 1072 370 235 0 143 chr15 63931285 63931401 -39563573 - MT2B LTR ERVL -351 250 152 7 1072 270 280 54 14 chr15 63939395 63939546 -39555428 + MLT1B LTR MaLR 271 451 -16 8 1072 226 297 96 51 chr15 63939594 63939750 -39555224 + LTR16A1 LTR ERVL 285 447 -9 8 1072 311 269 208 12 chr15 63953107 63953273 -39541701 + MLT2C2 LTR ERVL 5 200 -214 8 1072 246 310 11 22 chr15 63953337 63953426 -39541548 + MLT2C2 LTR ERVL 447 534 -25 8 1072 291 238 47 56 chr15 63954504 63954611 -39540363 + MLT1A LTR MaLR 65 170 -204 8 1072 373 341 56 6 chr15 63962547 63962727 -39532247 + ORR1E LTR MaLR 2 190 -169 8 1073 1305 253 24 39 chr15 63978413 63978796 -39516178 - MTEa LTR MaLR -2 377 1 8 1073 1169 182 247 20 chr15 63980761 63981053 -39513921 + MTC LTR MaLR 1 358 -63 8 1073 836 253 108 94 chr15 63988155 63988517 -39506457 + MTE2a LTR MaLR 13 379 0 8 1073 243 269 0 8 chr15 63993349 63993414 -39501560 - MTEb LTR MaLR -317 62 1 8 1073 239 273 122 22 chr15 64010542 64010632 -39484342 + MLT2B3 LTR ERVL 1 99 -455 1 1073 305 259 77 8 chr15 64020367 64020484 -39474490 - MTEb LTR MaLR -2 377 253 2 1073 248 241 60 12 chr15 64026715 64026799 -39468175 + MER34A LTR ERV1 475 562 -9 3 1073 240 385 10 0 chr15 64030453 64030549 -39464425 + MER21B LTR ERV1 313 409 -454 4 1073 285 326 149 5 chr15 64030674 64030862 -39464112 + MER21B LTR ERV1 447 661 -202 4 1073 1900 189 18 41 chr15 64031839 64032226 -39462748 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1073 356 105 53 0 chr15 64032711 64032768 -39462206 - MTC LTR MaLR -8 413 354 4 1073 326 332 69 37 chr15 64036280 64036496 -39458478 - MLT1F1 LTR MaLR -340 229 7 5 1073 967 226 58 4 chr15 64038225 64038483 -39456491 + MT2A LTR ERVL 1 272 -261 5 1073 415 236 6 8 chr15 64038460 64038576 -39456398 + MT2A LTR ERVL 347 490 -94 5 1073 826 240 131 54 chr15 64041120 64041472 -39453502 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 1073 323 201 286 32 chr15 64042466 64042620 -39452354 + MTC LTR MaLR 203 395 -26 6 1073 1939 154 133 34 chr15 64044968 64045351 -39449623 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1073 355 292 76 64 chr15 64053038 64053228 -39441746 + MTD LTR MaLR 1 208 -211 7 1073 314 306 130 73 chr15 64053373 64053385 -39441589 + MTD LTR MaLR 186 201 -178 7 1073 314 306 130 73 chr15 64053407 64053503 -39441471 + MTD LTR MaLR 202 315 -64 7 1073 1019 220 90 18 chr15 64058819 64059182 -39435792 + MTD LTR MaLR 7 396 0 8 1073 237 278 82 18 chr15 64073023 64073133 -39421841 - ORR1E LTR MaLR 0 359 243 9 1074 1984 137 0 3 chr15 64094389 64094703 -39400271 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 6 1 1074 263 339 37 0 chr15 64100013 64100122 -39394852 + MLT1J LTR MaLR 24 136 -376 1 1074 3071 109 69 2 chr15 64113932 64114406 -39380568 + RLTR11A LTR ERVK 18 523 -5 1 1074 451 246 35 43 chr15 64116906 64117077 -39377897 - MTD LTR MaLR -16 403 189 1 1074 471 323 109 42 chr15 64117100 64117339 -39377635 - MTD LTR MaLR -159 260 6 1 1074 1909 142 105 9 chr15 64126057 64126390 -39368584 + ORR1D1 LTR MaLR 3 367 -7 1 1074 398 257 52 17 chr15 64126418 64126533 -39368441 - RMER15 LTR ERVL -77 498 380 1 1074 2610 133 131 66 chr15 64136137 64136686 -39358288 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 1 1074 773 291 78 13 chr15 64155695 64155925 -39339049 + MTEa LTR MaLR 1 245 -134 2 1074 233 167 250 53 chr15 64156068 64156144 -39338830 + MTEa LTR MaLR 289 379 0 2 1074 1512 211 94 24 chr15 64158465 64158805 -39336169 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 11 2 1074 339 268 113 21 chr15 64160343 64160484 -39334490 + LTR33 LTR ERVL 361 514 -1 2 1074 2164 153 106 21 chr15 64161894 64162282 -39332692 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1074 430 345 97 38 chr15 64162996 64163315 -39331659 - LTR16C LTR ERVL -10 479 142 2 1074 230 240 67 77 chr15 64165769 64165873 -39329101 - LTR77 LTR ERV1 -124 498 396 2 1074 470 353 134 20 chr15 64166661 64166959 -39328015 + MLT1K LTR MaLR 20 351 -244 2 1074 776 209 204 0 chr15 64167302 64167601 -39327373 + MTEa LTR MaLR 20 379 0 2 1074 1405 251 15 24 chr15 64173847 64174186 -39320788 + MTEa LTR MaLR 1 336 -43 2 1074 226 232 124 34 chr15 64174840 64174929 -39320045 + MLT1C LTR MaLR 14 110 -357 2 1074 308 343 160 28 chr15 64175087 64175143 -39319831 + MLT1C LTR MaLR 87 136 -331 2 1074 308 343 160 28 chr15 64175178 64175409 -39319565 + MLT1C LTR MaLR 137 411 -56 2 1074 251 375 0 0 chr15 64178757 64178829 -39316145 + MLT1J LTR MaLR 118 189 -323 2 1074 593 284 101 72 chr15 64186918 64186943 -39308031 + ORR1E LTR MaLR 1 24 -335 2 1074 593 284 101 72 chr15 64186989 64187270 -39307704 + ORR1E LTR MaLR 25 316 -43 2 1074 794 256 85 31 chr15 64187719 64188078 -39306896 + MLT2B1 LTR ERVL 4 462 -93 2 1074 1080 269 39 88 chr15 64190451 64190892 -39304082 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1074 457 279 78 0 chr15 64197235 64197389 -39297585 + MLT1J2 LTR MaLR 48 245 -267 2 1074 437 274 106 86 chr15 64200629 64200885 -39294089 - MLT1B LTR MaLR -2 465 205 3 1074 1617 238 49 5 chr15 64200941 64201308 -39293666 - MTD LTR MaLR 0 419 37 3 1074 453 258 53 23 chr15 64201555 64201686 -39293288 - MLT1B LTR MaLR -255 135 1 3 1074 318 227 139 43 chr15 64203797 64203902 -39291072 - MLT1L LTR MaLR -320 290 175 3 1074 1147 272 72 10 chr15 64204133 64204438 -39290536 + MTEa LTR MaLR 54 377 -2 3 1074 476 239 228 5 chr15 64209851 64210040 -39284934 + MLT1D LTR MaLR 275 505 0 3 1074 268 331 72 0 chr15 64216638 64216777 -39278197 + LTR16E2 LTR ERVL 420 568 0 3 1074 812 296 44 8 chr15 64219802 64220051 -39274923 - MTE2b LTR MaLR -45 334 77 3 1074 1520 228 65 69 chr15 64220263 64220668 -39274306 - RMER19B LTR ERVK -420 482 1 3 1074 1177 244 99 48 chr15 64220668 64221018 -39273956 + MTE2b LTR MaLR 12 379 0 3 1074 296 127 0 137 chr15 64222169 64222242 -39272732 + MLT1A1 LTR MaLR 346 408 0 3 1074 941 212 18 27 chr15 64224819 64225063 -39269911 + ORR1D2 LTR MaLR 159 370 0 3 1075 238 355 85 39 chr15 64237022 64237327 -39257647 - LTR79 LTR ERVL -31 496 178 3 1075 2268 156 57 12 chr15 64237343 64237386 -39257588 - MTC LTR MaLR 0 421 379 3 1075 2268 156 57 12 chr15 64237472 64237831 -39257143 - MTC LTR MaLR -43 378 3 3 1075 1474 249 90 0 chr15 64239145 64239490 -39255484 - MTE2b LTR MaLR -3 376 1 3 1075 952 257 83 19 chr15 64241174 64241500 -39253474 + MTD LTR MaLR 47 406 -1 4 1075 991 269 42 4 chr15 64241503 64241764 -39253210 + ORR1D2 LTR MaLR 5 275 -95 4 1075 1483 213 45 47 chr15 64242233 64242421 -39252553 + ORR1C2 LTR MaLR 1 175 -209 4 1075 1483 213 45 47 chr15 64242478 64242669 -39252305 + ORR1C2 LTR MaLR 176 379 -5 4 1075 2464 95 3 0 chr15 64245923 64246248 -39248726 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 4 1075 235 259 57 34 chr15 64248214 64248302 -39246672 + MTEb LTR MaLR 260 349 -30 4 1075 365 312 74 101 chr15 64249103 64249184 -39245790 + ORR1E LTR MaLR 1 68 -291 4 1075 365 312 74 101 chr15 64249346 64249630 -39245344 + ORR1E LTR MaLR 69 356 -3 4 1075 2711 38 28 0 chr15 64250113 64250431 -39244543 - IAPLTR2b LTR ERVK 0 327 1 4 1075 935 211 159 38 chr15 64256750 64257115 -39237859 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 4 1075 965 113 129 40 chr15 64259459 64259661 -39235313 - RMER4A LTR ERVK -246 220 1 4 1075 333 164 0 0 chr15 64261935 64261981 -39232993 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 322 4 1075 1573 127 18 108 chr15 64261981 64262369 -39232605 - RMER17C LTR ERVK 0 410 58 4 1075 1471 161 93 7 chr15 64262365 64262665 -39232309 - ORR1B2 LTR MaLR -41 326 1 4 1075 309 321 167 10 chr15 64264990 64265182 -39229792 - RMER15 LTR ERVL -58 517 296 4 1075 351 297 27 139 chr15 64267494 64267752 -39227222 + MTEa LTR MaLR 149 377 -2 4 1075 2257 79 135 14 chr15 64270435 64270783 -39224191 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 4 1075 2536 87 12 0 chr15 64270966 64271289 -39223685 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1075 2290 148 19 60 chr15 64273277 64273695 -39221279 - MTB_Mm LTR MaLR -4 403 3 4 1075 825 205 52 16 chr15 64273850 64274043 -39220931 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 167 4 1075 679 193 30 116 chr15 64274087 64274286 -39220688 - ORR1D1 LTR MaLR -192 182 1 4 1075 2566 77 3 0 chr15 64274854 64275180 -39219794 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1075 370 163 61 10 chr15 64276505 64276604 -39218370 + RMER17C LTR ERVK 307 410 0 4 1075 1486 194 116 79 chr15 64278762 64279166 -39215808 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1075 1567 223 43 27 chr15 64287436 64287809 -39207165 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1075 265 311 55 11 chr15 64288321 64288412 -39206562 + MLT1A0 LTR MaLR 89 183 -182 4 1075 353 310 61 37 chr15 64289376 64289540 -39205434 + MLT1A0 LTR MaLR 139 306 -59 4 1075 406 295 97 44 chr15 64290152 64290379 -39204595 + MLT1C LTR MaLR 34 272 -195 4 1075 1052 241 75 113 chr15 64290453 64290959 -39204015 - RLTR12B LTR ERVK -31 497 11 4 1075 1501 229 89 8 chr15 64296042 64296425 -39198549 + MTD LTR MaLR 6 419 0 5 1075 1418 201 146 36 chr15 64296648 64296983 -39197991 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 5 1075 717 272 51 59 chr15 64297853 64298170 -39196804 - ORR1E LTR MaLR -7 372 36 5 1075 1253 243 54 46 chr15 64299226 64299633 -39195341 + MTE2a LTR MaLR 1 417 -2 5 1075 226 233 0 0 chr15 64301312 64301355 -39193619 + MTD LTR MaLR 136 178 -241 5 1075 710 146 223 33 chr15 64301473 64301544 -39193430 + MTD LTR MaLR 196 270 -149 5 1075 2518 60 96 72 chr15 64301544 64301918 -39193056 + RLTR9A2 LTR ERVK 1 383 0 5 1075 710 146 223 33 chr15 64301918 64302030 -39192944 + MTD LTR MaLR 271 414 -5 5 1075 2435 193 145 15 chr15 64305475 64306007 -39188967 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 5 1075 986 285 76 37 chr15 64306085 64306467 -39188507 - MLT1F1-int LTR MaLR -914 575 179 5 1075 232 268 42 0 chr15 64306826 64306897 -39188077 - MLT1F1-int LTR MaLR -1415 74 1 5 1075 720 275 143 82 chr15 64306920 64307327 -39187647 - MLT1F1 LTR MaLR -46 523 92 5 1075 283 317 29 38 chr15 64307669 64307774 -39187200 - MLT1F1 LTR MaLR -452 108 5 5 1075 306 271 136 62 chr15 64310673 64310850 -39184124 - MLT1A1 LTR MaLR -195 213 24 5 1075 226 354 90 0 chr15 64313392 64313536 -39181438 + MLT1B LTR MaLR 6 162 -212 5 1075 306 331 172 0 chr15 64313599 64313768 -39181206 + MLT1B LTR MaLR 189 386 -4 5 1075 619 311 131 56 chr15 64316005 64316342 -39178632 - MLT1E1A LTR MaLR -8 672 311 5 1075 3641 161 59 5 chr15 64321456 64322097 -39172877 - RLTR17 LTR ERVK -16 676 1 5 1075 3362 65 5 0 chr15 64324954 64325352 -39169622 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1075 232 282 0 14 chr15 64326710 64326782 -39168192 + MT2A LTR ERVL 20 90 -443 5 1075 264 217 109 36 chr15 64328109 64328219 -39166755 - ORR1B1 LTR MaLR -5 389 272 5 1075 1425 263 134 69 chr15 64334329 64334905 -39160069 - RLTR26 LTR ERVK -29 613 1 5 1075 287 369 60 27 chr15 64338050 64338234 -39156740 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1133 5 1075 4512 134 25 24 chr15 64338558 64339362 -39155612 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1043 805 1 5 1075 1388 257 86 22 chr15 64345111 64345528 -39149446 + RLTR17 LTR ERVK 200 643 -49 6 1075 265 133 47 62 chr15 64345550 64345614 -39149360 + RMER3D-int LTR ERVK 1 63 -2779 6 1075 3582 188 3 30 chr15 64345638 64346341 -39148633 + RMER3D-int LTR ERVK 2135 2818 -24 6 1075 1130 239 4 48 chr15 64346395 64346668 -39148306 + RLTR17 LTR ERVK 105 365 -327 6 1075 1735 207 30 27 chr15 64349418 64349791 -39145183 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1075 226 259 0 36 chr15 64351808 64351864 -39143110 + LTR16B1 LTR ERVL 1 54 -426 6 1075 1153 246 45 108 chr15 64354366 64354763 -39140211 - MTEa LTR MaLR -5 374 3 6 1076 989 216 24 5 chr15 64361123 64361332 -39133642 + ORR1D1 LTR MaLR 3 215 -159 6 1076 397 246 68 15 chr15 64361333 64361465 -39133509 + RLTR15 LTR ERVK 1 139 -220 6 1076 646 235 61 53 chr15 64361492 64361739 -39133235 + RLTR15 LTR ERVK 90 338 -21 6 1076 430 154 39 0 chr15 64361773 64361851 -39133123 + ORR1D1 LTR MaLR 284 364 -10 6 1076 1710 160 9 73 chr15 64368142 64368472 -39126502 + ORR1A3 LTR MaLR 18 326 0 6 1076 695 299 140 24 chr15 64375688 64375978 -39118996 + MLT1D LTR MaLR 139 466 -39 6 1076 695 299 140 24 chr15 64376015 64376053 -39118921 + MLT1D LTR MaLR 467 504 -1 6 1076 358 270 147 41 chr15 64376221 64376418 -39118556 + MTEb LTR MaLR 138 355 -24 6 1076 1664 187 75 18 chr15 64376879 64377211 -39117763 - MTC LTR MaLR 0 421 71 6 1076 280 128 0 41 chr15 64378722 64378771 -39116203 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 340 6 1076 543 271 105 11 chr15 64379514 64379704 -39115270 + MLT2B4 LTR ERVL 9 216 -340 6 1076 322 260 48 48 chr15 64382628 64382733 -39112241 - MLT1A0 LTR MaLR -12 353 249 6 1076 247 288 61 0 chr15 64383191 64383257 -39111717 - MLT1A0 LTR MaLR -94 271 202 6 1076 446 330 80 27 chr15 64383898 64384085 -39110889 - MLT1A0 LTR MaLR -165 200 4 6 1076 348 370 44 4 chr15 64391823 64392073 -39102901 + LTR16C LTR ERVL 228 487 -2 6 1076 730 330 58 13 chr15 64393964 64394274 -39100700 - MLT1G1 LTR MaLR -8 571 248 6 1076 1114 242 77 51 chr15 64397256 64397609 -39097365 - MTE2b LTR MaLR -8 371 10 6 1076 754 329 54 40 chr15 64399131 64399485 -39095489 + LTR40a LTR ERVL 4 362 -157 6 1076 267 316 0 0 chr15 64399906 64400001 -39094973 - MLT1B LTR MaLR 0 390 296 6 1076 269 171 146 47 chr15 64400017 64400143 -39094831 - ORR1E LTR MaLR -20 359 209 6 1076 553 337 32 20 chr15 64401382 64401633 -39093341 + ORR1E LTR MaLR 1 254 -105 6 1076 262 216 30 7 chr15 64401693 64401768 -39093206 - MTD LTR MaLR 0 379 295 6 1076 332 283 39 55 chr15 64401812 64401939 -39093035 - MT2B LTR ERVL -325 276 152 6 1076 268 203 2 0 chr15 64401960 64402018 -39092956 - MTD LTR MaLR -144 275 211 6 1076 2901 88 49 3 chr15 64402191 64402580 -39092394 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 1076 1121 251 44 33 chr15 64404158 64404524 -39090450 + MTD LTR MaLR 50 419 0 7 1076 1196 254 32 52 chr15 64405365 64405734 -39089240 + MTEa LTR MaLR 1 362 -17 7 1076 793 307 39 61 chr15 64409750 64410159 -39084815 + MTD LTR MaLR 6 405 -14 7 1076 634 296 49 70 chr15 64412164 64412451 -39082523 - ORR1E LTR MaLR -71 288 8 7 1076 2136 316 39 39 chr15 64412439 64413209 -39081765 - MTE-int LTR MaLR -34 1546 777 7 1076 1878 248 62 104 chr15 64415046 64415918 -39079056 - RMER13A LTR ERVK -70 838 14 7 1076 746 250 45 87 chr15 64416157 64416490 -39078484 - RMER17A-int LTR ERVK -312 1416 1098 7 1076 511 219 9 0 chr15 64416639 64416744 -39078230 - RMER17A-int LTR ERVK -641 1087 982 7 1076 987 291 20 90 chr15 64417508 64417863 -39077111 - MTEa LTR MaLR -17 362 33 7 1076 790 299 137 39 chr15 64421837 64422356 -39072618 - MLT1L LTR MaLR -4 606 37 7 1076 553 224 101 17 chr15 64423047 64423315 -39071659 - ORR1D2 LTR MaLR -1 406 23 7 1076 4460 12 0 24 chr15 64423315 64423820 -39071154 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1076 321 0 0 0 chr15 64423820 64423858 -39071116 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 7 1076 324 157 58 46 chr15 64423858 64423945 -39071029 - ORR1D2-int LTR MaLR -1323 640 553 7 1076 48265 16 7 0 chr15 64423949 64429268 -39065706 - MERVL-int LTR ERVL -130 5355 1 7 1076 4478 10 0 24 chr15 64429268 64429773 -39065201 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1076 340 322 128 50 chr15 64430553 64430896 -39064078 - MLT1C LTR MaLR 0 467 98 7 1076 719 174 18 13 chr15 64431161 64431312 -39063662 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 178 7 1076 2219 177 39 77 chr15 64431619 64432152 -39062822 - RLTR20B1 LTR ERVK -50 513 1 7 1076 229 240 58 117 chr15 64432957 64433094 -39061880 + RMER15 LTR ERVL 1 129 -446 7 1076 1775 222 38 181 chr15 64433126 64433815 -39061159 - RMER19C LTR ERVK 0 611 22 7 1076 549 285 96 11 chr15 64433827 64434015 -39060959 + RMER15 LTR ERVL 280 483 -92 7 1076 640 298 124 62 chr15 64441886 64441993 -39052981 - MLT2B1 LTR ERVL -209 311 295 7 1076 2903 54 56 3 chr15 64441993 64442367 -39052607 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 7 1076 640 304 38 60 chr15 64442367 64442662 -39052312 - MLT2B1 LTR ERVL -226 294 1 7 1076 336 354 75 33 chr15 64445388 64445628 -39049346 + MLT1L LTR MaLR 361 610 0 7 1076 340 352 109 41 chr15 64447012 64447279 -39047695 + MLT1H LTR MaLR 2 286 -263 7 1076 256 300 77 108 chr15 64449202 64449502 -39045472 + MLT1G1 LTR MaLR 3 304 -291 7 1076 1620 208 33 8 chr15 64452631 64452990 -39041984 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 7 7 1076 878 308 26 10 chr15 64455594 64455899 -39039075 + MLT1A0 LTR MaLR 28 337 -28 7 1076 455 286 64 18 chr15 64456152 64456323 -39038651 - MER77 LTR ERVL -111 496 318 7 1076 1700 186 117 23 chr15 64459633 64460018 -39034956 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1076 335 307 51 51 chr15 64461483 64461641 -39033333 + MLT1A LTR MaLR 3 160 -214 7 1076 436 308 7 0 chr15 64462117 64462263 -39032711 + MLT1A LTR MaLR 224 370 -4 7 1076 317 274 63 119 chr15 64462681 64462934 -39032040 - LTR81B LTR ERV1? -1104 289 51 7 1076 2411 192 10 16 chr15 64462934 64463443 -39031531 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 506 -54 7 1076 3595 13 2 0 chr15 64465839 64466234 -39028740 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1076 2115 174 46 5 chr15 64469900 64470292 -39024682 - MTC LTR MaLR -13 408 1 7 1076 560 329 40 73 chr15 64473421 64473792 -39021182 + MTE2b LTR MaLR 21 379 0 7 1076 2165 101 6 0 chr15 64475817 64476134 -39018840 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 8 1076 2250 145 55 0 chr15 64476138 64476539 -39018435 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 423 -1540 8 1076 1181 92 0 0 chr15 64476525 64476698 -39018276 - ORR1A2 LTR MaLR -154 173 1 8 1076 341 218 0 164 chr15 64483306 64483465 -39011509 - MT2B LTR ERVL -344 257 125 8 1076 1531 184 55 29 chr15 64485300 64485648 -39009326 - MTC LTR MaLR 0 421 65 8 1076 1130 245 63 43 chr15 64486313 64486612 -39008362 - MTEa LTR MaLR -4 375 71 8 1076 294 246 0 14 chr15 64486614 64486684 -39008290 + MTE2b LTR MaLR 9 77 -302 8 1077 294 314 72 55 chr15 64487513 64487749 -39007225 - RMER15 LTR ERVL -7 568 329 8 1077 625 301 144 53 chr15 64489282 64489769 -39005205 + MT2A LTR ERVL 1 531 -2 8 1077 311 317 154 0 chr15 64491185 64491308 -39003666 + MLT1A0 LTR MaLR 172 313 -52 8 1077 408 257 83 99 chr15 64493429 64493699 -39001275 + MTD LTR MaLR 6 240 -179 8 1077 1563 228 176 17 chr15 64499266 64499744 -38995230 - RMER15 LTR ERVL 0 575 22 8 1077 392 278 141 23 chr15 64501677 64501854 -38993120 + MLT1A LTR MaLR 176 373 -1 2 1077 230 310 11 11 chr15 64515202 64515290 -38979684 - LTR89 LTR ERVL? -541 338 251 1 1077 2118 81 15 45 chr15 64519290 64519346 -38975628 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 286 1 1077 2118 81 15 45 chr15 64519977 64520257 -38974717 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 1 1077 779 316 12 76 chr15 64520319 64520648 -38974326 - LTR55 LTR ERV -235 313 6 2 1077 2061 114 9 0 chr15 64521215 64521531 -38973443 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1077 1184 288 72 21 chr15 64524608 64525041 -38969933 + MTE-int LTR MaLR 1092 1546 -34 2 1077 1461 227 37 24 chr15 64526639 64527013 -38967961 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 1077 734 234 58 111 chr15 64528584 64528998 -38965976 - MTD LTR MaLR -17 402 41 3 1077 1829 191 154 44 chr15 64535095 64535621 -38959353 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 4 1077 359 230 544 12 chr15 64536532 64536701 -38958273 - MLT1A LTR MaLR -17 391 133 4 1077 2034 160 43 81 chr15 64537314 64537361 -38957613 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 365 4 1077 2034 160 43 81 chr15 64537405 64537778 -38957196 - MTB_Mm LTR MaLR -43 364 3 4 1077 255 348 34 34 chr15 64538996 64539115 -38955859 + LTR16C LTR ERVL 103 221 -268 4 1077 237 282 25 13 chr15 64540508 64540587 -38954387 - MLT1B LTR MaLR -305 85 6 4 1077 3641 37 39 17 chr15 64542585 64543050 -38951924 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1077 405 282 99 22 chr15 64545727 64545908 -38949066 + MLT1C LTR MaLR 71 265 -202 5 1077 2790 135 179 0 chr15 64546088 64546584 -38948390 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 5 1077 538 333 24 76 chr15 64548062 64548445 -38946529 + MLT1A LTR MaLR 1 363 -11 5 1077 567 290 141 14 chr15 64556173 64556485 -38938489 + ORR1E LTR MaLR 1 377 -2 7 1077 2670 42 9 3 chr15 64558042 64558378 -38936596 + ORR1A0 LTR MaLR 1 338 -8 7 1077 308 384 61 53 chr15 64565768 64566013 -38928961 + MLT1A LTR MaLR 1 247 -127 8 1077 258 228 204 19 chr15 64568450 64568553 -38926421 + LTR16D LTR ERVL 530 651 0 9 1077 2220 173 42 5 chr15 64579755 64580161 -38914813 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1077 1961 148 8 88 chr15 64584915 64585300 -38909674 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 1077 689 359 83 50 chr15 64585317 64585760 -38909214 - MLT2B3 LTR ERVL -96 458 1 1 1077 1039 266 51 139 chr15 64598322 64598732 -38896242 + MTE2b LTR MaLR 1 374 -5 1 1077 241 384 9 0 chr15 64606568 64606680 -38888294 + LTR84a LTR ERVL 584 696 -61 1 1078 340 346 106 30 chr15 64625907 64626238 -38868736 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 10 1 1078 892 269 136 47 chr15 64629139 64629478 -38865496 + MTEa LTR MaLR 4 372 -7 1 1078 237 245 135 58 chr15 64639343 64639447 -38855527 - MER67C LTR ERV1 -436 275 164 1 1078 3574 33 5 0 chr15 64650205 64650599 -38844375 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1078 9112 44 3 59 chr15 64650599 64651763 -38843211 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1078 3642 25 5 0 chr15 64651763 64652157 -38842817 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1078 1849 116 54 48 chr15 64659393 64659709 -38835265 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 2 1078 1860 153 96 62 chr15 64664587 64664942 -38830032 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1078 663 352 25 43 chr15 64668907 64669233 -38825741 + MLT2D LTR ERVL 39 358 -56 2 1078 2739 48 3 3 chr15 64677755 64678086 -38816888 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 331 -1 2 1078 3494 23 2 0 chr15 64681303 64681698 -38813276 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1078 3135 149 67 65 chr15 64684902 64685589 -38809385 + RMER6C LTR ERVK 3 690 0 2 1078 382 293 43 109 chr15 64687309 64687520 -38807454 - MLT1C LTR MaLR -212 255 59 2 1078 236 278 28 119 chr15 64689694 64689837 -38805137 + RMER15 LTR ERVL 1 130 -445 2 1078 360 279 57 8 chr15 64689969 64690092 -38804882 + RMER15 LTR ERVL 433 561 -14 2 1078 1555 186 58 88 chr15 64693739 64694104 -38800870 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 2 1078 405 178 42 0 chr15 64694117 64694203 -38800771 + ORR1E LTR MaLR 12 101 -258 2 1078 868 252 34 92 chr15 64694840 64695049 -38799925 + ORR1E LTR MaLR 109 307 -52 2 1078 1916 169 25 33 chr15 64695049 64695417 -38799557 + ORR1B2 LTR MaLR 3 367 0 2 1078 868 252 34 92 chr15 64695417 64695469 -38799505 + ORR1E LTR MaLR 308 355 -4 2 1078 1929 173 47 23 chr15 64695834 64696219 -38798755 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1078 1780 191 108 8 chr15 64698144 64698525 -38796449 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 2 1078 2453 212 54 13 chr15 64700248 64700782 -38794192 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 556 -4 2 1078 1903 208 74 76 chr15 64707616 64708184 -38786790 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 2 1078 1592 246 8 19 chr15 64708973 64709337 -38785637 + ORR1D2 LTR MaLR 3 362 -8 2 1078 452 331 78 57 chr15 64713675 64714049 -38780925 - ORR1E LTR MaLR 0 370 4 3 1078 2940 176 52 11 chr15 64714069 64714621 -38780353 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 3 1078 1948 196 15 30 chr15 64721129 64721535 -38773439 - MTB_Mm LTR MaLR -7 400 1 3 1078 252 200 117 0 chr15 64722289 64722349 -38772625 + LTR33 LTR ERVL 449 515 0 3 1078 1806 196 45 19 chr15 64726255 64726634 -38768340 - MTC LTR MaLR 0 421 33 3 1078 346 412 50 32 chr15 64728032 64728250 -38766724 + LTR16A LTR ERVL 225 446 -5 3 1078 864 301 44 34 chr15 64736369 64736665 -38758309 + ORR1E LTR MaLR 61 359 0 3 1079 506 311 184 40 chr15 64764016 64764391 -38730583 + MLT1F LTR MaLR 117 545 -3 3 1079 917 127 68 19 chr15 64767368 64767529 -38727445 + MTC LTR MaLR 196 364 -57 3 1079 323 230 0 0 chr15 64774560 64774634 -38720340 - MLT1A LTR MaLR 0 374 301 3 1079 241 372 0 42 chr15 64774747 64774865 -38720109 - MLT1A LTR MaLR -246 162 50 3 1079 1536 187 251 6 chr15 64776454 64776808 -38718166 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 4 1079 2517 168 36 54 chr15 64780903 64781349 -38713625 + RLTR20C LTR ERVK 1 435 -99 4 1079 2517 168 36 54 chr15 64781399 64781473 -38713501 + RLTR20C LTR ERVK 436 512 -22 4 1079 1088 249 61 33 chr15 64783254 64783499 -38711475 - MTEa LTR MaLR -120 259 8 4 1079 322 315 72 26 chr15 64797652 64797805 -38697169 + MLT1A0 LTR MaLR 2 161 -204 4 1079 819 269 122 57 chr15 64799229 64799338 -38695636 + RMER19B LTR ERVK 1 111 -626 4 1079 5549 137 15 25 chr15 64799424 64800309 -38694665 + RMER19B LTR ERVK 44 897 -5 4 1079 3198 56 32 14 chr15 64801314 64801750 -38693224 - RLTR13D5 LTR ERVK -49 974 531 4 1079 310 292 98 15 chr15 64807428 64807560 -38687414 + MLT1C LTR MaLR 26 168 -299 4 1079 543 307 111 50 chr15 64812223 64812521 -38682453 - ORR1E LTR MaLR -43 316 1 4 1079 2213 90 15 61 chr15 64814242 64814585 -38680389 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1079 754 279 34 175 chr15 64818436 64818848 -38676126 - MTEa LTR MaLR -24 355 2 4 1079 1733 256 39 50 chr15 64821538 64822023 -38672951 + RLTR11A2 LTR ERVK 48 527 0 4 1079 279 325 0 81 chr15 64828354 64828478 -38666496 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 252 4 1079 2018 188 32 15 chr15 64832092 64832492 -38662482 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1079 252 315 37 9 chr15 64835695 64835804 -38659170 + LTR79 LTR ERVL 351 462 -65 4 1079 1385 270 31 8 chr15 64842069 64842420 -38652554 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 5 1079 1503 209 121 83 chr15 64854093 64854158 -38640816 - RLTR11A LTR ERVK -4 524 459 5 1079 1503 209 121 83 chr15 64854203 64854642 -38640332 - RLTR11A LTR ERVK -70 458 3 5 1079 226 286 52 0 chr15 64858468 64858545 -38636429 - ORR1E LTR MaLR -2 357 277 5 1079 744 333 8 17 chr15 64858634 64858872 -38636102 - ORR1E LTR MaLR -123 236 1 5 1079 1180 315 25 22 chr15 64859864 64860231 -38634743 + MTE2b LTR MaLR 5 372 -7 5 1079 3751 300 74 25 chr15 64860242 64861540 -38633434 + MTE2b-int LTR MaLR 1 1362 -218 5 1079 484 270 32 13 chr15 64861842 64861996 -38632978 + MTE2b-int LTR MaLR 1422 1578 -2 5 1079 228 291 217 43 chr15 64862015 64862130 -38632844 + MTE2b LTR MaLR 29 163 -216 5 1079 330 313 164 74 chr15 64864096 64864365 -38630609 - ORR1D2 LTR MaLR -35 335 43 5 1079 1258 240 49 84 chr15 64864818 64865209 -38629765 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 5 1079 1960 236 56 50 chr15 64867189 64867729 -38627245 - RLTR20B3 LTR ERVK -14 563 21 5 1079 261 343 120 42 chr15 64869482 64869698 -38625276 + MLT1J2 LTR MaLR 74 306 -142 5 1079 3207 43 10 0 chr15 64875971 64876363 -38618611 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1079 350 360 78 12 chr15 64876389 64876555 -38618419 + MTE2a LTR MaLR 19 195 -224 5 1079 1533 196 80 71 chr15 64877073 64877575 -38617399 - RMER19B LTR ERVK -253 649 93 5 1079 701 292 6 12 chr15 64877589 64877762 -38617212 + MTE2a LTR MaLR 207 378 -1 5 1080 915 314 85 28 chr15 64881490 64881928 -38613046 - MLT2B2 LTR ERVL -125 476 1 5 1080 2075 133 160 11 chr15 64883823 64884204 -38610770 + RLTR44B LTR ERVK 12 449 0 5 1080 2887 59 20 40 chr15 64884244 64884648 -38610326 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1080 471 340 80 40 chr15 64902321 64902398 -38592576 - MLT1I LTR MaLR -124 287 199 6 1080 471 340 80 40 chr15 64902542 64902740 -38592234 - MLT1I LTR MaLR -213 198 2 6 1080 2544 74 65 3 chr15 64908026 64908364 -38586610 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 6 1080 2825 88 49 3 chr15 64910502 64910891 -38584083 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1080 644 339 65 56 chr15 64917460 64917801 -38577173 - ORR1E LTR MaLR -13 346 3 6 1080 3094 67 12 5 chr15 64921186 64921604 -38573370 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 6 1080 3058 206 102 6 chr15 64921605 64922546 -38572428 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1296 6 1080 1503 215 43 38 chr15 64941332 64941704 -38553270 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1080 766 296 64 100 chr15 64941711 64941879 -38553095 + MTEa LTR MaLR 3 177 -202 6 1080 766 296 64 100 chr15 64942002 64942224 -38552750 + MTEa LTR MaLR 178 379 0 6 1080 3203 175 41 17 chr15 64942276 64942925 -38552049 - RMER6A LTR ERVK -49 707 10 6 1080 1162 303 52 14 chr15 64946099 64946447 -38548527 + MTEa LTR MaLR 19 379 0 6 1080 4355 14 2 12 chr15 64947184 64947682 -38547292 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1080 302 0 0 0 chr15 64947682 64947720 -38547254 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 6 1080 390 167 46 35 chr15 64947720 64947807 -38547167 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 6 1080 38753 16 14 0 chr15 64947807 64953094 -38541880 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 6 1080 4355 14 2 12 chr15 64953094 64953592 -38541382 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1080 2289 230 66 47 chr15 64955632 64956387 -38538587 - RMER19B LTR ERVK -14 888 1 6 1080 778 327 119 20 chr15 64963448 64963801 -38531173 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 6 1080 3849 186 20 0 chr15 64964222 64964916 -38530058 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3814 4521 -1240 6 1080 488 286 40 7 chr15 64965085 64965233 -38529741 - MLT1A1 LTR MaLR -253 155 3 6 1080 438 321 101 26 chr15 64970339 64970528 -38524446 - MER21B LTR ERV1 -215 648 446 7 1080 678 306 91 76 chr15 64974778 64975107 -38519867 - ORR1E LTR MaLR -25 334 1 7 1080 2284 174 100 34 chr15 64975158 64975658 -38519316 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 7 1080 1457 270 33 69 chr15 64975849 64976330 -38518644 - RMER19C LTR ERVK -10 601 138 7 1080 905 155 103 0 chr15 64979782 64979956 -38515018 + ORR1C2 LTR MaLR 3 194 -190 7 1080 861 203 59 6 chr15 64980124 64980343 -38514631 + ORR1C2 LTR MaLR 87 357 -27 7 1080 284 348 88 26 chr15 64999111 64999303 -38495671 + MLT1A1 LTR MaLR 70 273 -135 7 1080 240 351 0 13 chr15 64999843 64999921 -38495053 - MLT1I LTR MaLR -239 172 96 7 1080 588 300 221 4 chr15 65002354 65002625 -38492349 - MTE2b LTR MaLR -11 368 39 4 1080 825 278 56 108 chr15 65003709 65004136 -38490838 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 1 7 1080 2011 61 18 13 chr15 65005633 65006011 -38488963 - RLTR10A LTR ERVK 0 309 1 1 1080 4588 102 26 10 chr15 65006011 65006753 -38488221 - RLTR10-int LTR ERVK -1 1986 1288 1 1080 3504 60 82 12 chr15 65006753 65007241 -38487733 - RLTR10-int LTR ERVK -1015 5527 5006 1 1080 737 194 6 13 chr15 65007241 65007398 -38487576 - RLTR10-int LTR ERVK -6040 502 347 1 1080 625 108 17 35 chr15 65007400 65007515 -38487459 - RLTR10-int LTR ERVK -6373 169 57 1 1080 321 25 0 0 chr15 65007534 65007574 -38487400 - RLTR10-int LTR ERVK -6387 155 116 1 1080 372 88 35 0 chr15 65007744 65007801 -38487173 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7314 267 209 1 1080 2035 89 23 37 chr15 65007823 65008202 -38486772 - RLTR10A LTR ERVK 0 359 1 1 1080 3177 26 2 78 chr15 65009661 65010083 -38484891 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1080 7285 45 26 21 chr15 65010085 65011076 -38483898 + RLTR10-int LTR ERVK 3 998 -989 1 1080 280 256 62 39 chr15 65011140 65011270 -38483704 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 1 16 8366 19 0 2 chr15 65011352 65012351 -38482623 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 1 1081 3177 26 2 78 chr15 65012351 65012773 -38482201 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1081 437 367 102 45 chr15 65016546 65016860 -38478114 + MLT1K LTR MaLR 103 434 -161 2 1081 487 315 12 24 chr15 65022478 65022550 -38472424 + MTE2b LTR MaLR 11 78 -301 2 1081 487 315 12 24 chr15 65022702 65022798 -38472176 + MTE2b LTR MaLR 79 176 -203 2 1081 973 232 25 72 chr15 65024340 65024618 -38470356 - MT2A LTR ERVL -265 268 4 3 1081 258 302 78 70 chr15 65025468 65025596 -38469378 - LTR40a LTR ERVL -387 132 4 3 1081 682 222 65 202 chr15 65032165 65032566 -38462408 - RLTR14 LTR ERV1 -34 348 3 4 1081 1007 156 22 82 chr15 65033294 65033525 -38461449 + RLTR20B3 LTR ERVK 75 291 -286 4 1081 347 137 0 0 chr15 65033507 65033558 -38461416 + RLTR20B3 LTR ERVK 421 471 -106 4 1081 1731 141 51 69 chr15 65033768 65034103 -38460871 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1081 342 319 160 40 chr15 65034695 65035073 -38459901 - MTE2b LTR MaLR -18 401 1 4 1081 306 341 171 59 chr15 65036998 65037285 -38457689 - ORR1E LTR MaLR -26 333 15 5 1081 638 307 11 5 chr15 65037358 65037548 -38457426 - MTE-int LTR MaLR -217 1363 1173 5 1081 1940 145 11 66 chr15 65039149 65039497 -38455477 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1081 1320 193 110 83 chr15 65045225 65045598 -38449376 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 6 1081 4959 110 11 69 chr15 65047851 65048704 -38446270 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 7 1081 589 167 86 57 chr15 65049681 65049821 -38445153 + ORR1C2 LTR MaLR 1 144 -234 7 1081 445 193 11 0 chr15 65049792 65049880 -38445094 + ORR1C2-int LTR MaLR 1197 1285 -224 7 1081 714 166 258 27 chr15 65049879 65050054 -38444920 - MTC LTR MaLR -14 407 190 7 1081 1887 235 163 15 chr15 65050054 65050589 -38444385 + RMER20B LTR ERVK 1 614 -13 7 1081 920 189 48 43 chr15 65050574 65050762 -38444212 - MTC LTR MaLR -230 191 3 7 1081 1336 151 0 17 chr15 65050762 65050997 -38443977 + ORR1C2-int LTR MaLR 1279 1509 0 7 1081 1559 167 24 183 chr15 65050998 65051452 -38443522 + ORR1C2 LTR MaLR 3 384 0 7 1081 474 354 52 82 chr15 65060731 65061195 -38433779 + MLT1D LTR MaLR 1 450 -55 9 1081 1428 225 75 36 chr15 65064980 65065482 -38429492 - RMER4B LTR ERVK -13 572 16 1 1081 1781 161 17 64 chr15 65072424 65072769 -38422205 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1081 1554 150 256 31 chr15 65073578 65073929 -38421045 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 1 1081 1443 285 33 6 chr15 65083763 65084123 -38410851 + MTE2b LTR MaLR 6 375 -4 1 1081 630 195 55 0 chr15 65085417 65085545 -38409429 + ORR1D2 LTR MaLR 1 135 -235 1 1081 467 313 103 134 chr15 65087308 65087629 -38407345 + MLT1C LTR MaLR 1 311 -79 1 1081 1454 187 51 30 chr15 65090144 65090480 -38404494 - RMER6C LTR ERVK 0 690 348 1 1081 2941 158 40 13 chr15 65090585 65091033 -38403941 + RLTR20B2 LTR ERVK 2 452 -108 1 1081 2941 158 40 13 chr15 65091107 65091201 -38403773 + RLTR20B2 LTR ERVK 453 558 -2 1 1081 509 130 19 148 chr15 65091319 65091394 -38403580 - MT2B LTR ERVL -342 259 199 1 1081 308 271 52 10 chr15 65091642 65091739 -38403235 - ORR1E LTR MaLR -258 101 1 1 1081 359 294 16 40 chr15 65096317 65096441 -38398533 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 262 1 1081 364 233 11 11 chr15 65097843 65097934 -38397040 - RLTR42-int LTR ERVK -3735 1787 1697 1 1081 1847 107 128 3 chr15 65111654 65111944 -38383030 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 1 1081 2561 85 53 0 chr15 65112267 65112608 -38382366 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 1 1081 274 278 20 163 chr15 65112685 65112887 -38382087 - MTEb LTR MaLR -1 378 206 1 1081 280 338 88 34 chr15 65113036 65113183 -38381791 - MLT2B3 LTR ERVL -399 155 1 1 1081 1193 316 32 29 chr15 65115923 65116301 -38378673 - MER70B LTR ERVL -196 382 4 1 1081 776 261 113 91 chr15 65121647 65122009 -38372965 - RMER13A LTR ERVK -394 466 97 1 1081 1265 261 91 33 chr15 65122167 65122528 -38372446 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 1 1081 1881 142 14 58 chr15 65123778 65124122 -38370852 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1081 346 330 68 95 chr15 65125156 65125377 -38369597 - LTR16E1 LTR ERVL -101 437 223 1 1081 250 368 51 6 chr15 65126372 65126528 -38368446 - HERV16-int LTR ERVL -2983 2013 1851 1 1081 1785 148 62 105 chr15 65128039 65128066 -38366908 + ORR1C2 LTR MaLR 1 22 -362 1 1081 1466 208 37 3 chr15 65128066 65128365 -38366609 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 1 1081 1785 148 62 105 chr15 65128365 65128568 -38366406 + ORR1C2 LTR MaLR 23 193 -191 1 1081 1785 148 62 105 chr15 65128637 65128805 -38366169 + ORR1C2 LTR MaLR 194 383 -1 1 1081 236 381 37 49 chr15 65130111 65130274 -38364700 - LTR16D LTR ERVL -323 328 168 1 1081 484 291 97 117 chr15 65142405 65142662 -38352312 - RMER15 LTR ERVL -18 557 306 2 1082 2977 62 5 33 chr15 65146119 65146518 -38348456 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 2 1082 231 367 61 61 chr15 65156363 65156543 -38338431 + ORR1E LTR MaLR 73 252 -107 2 1082 3857 168 39 14 chr15 65160092 65160829 -38334145 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 2 1082 226 311 113 0 chr15 65162270 65162376 -38332598 + MLT1-int LTR MaLR 86 203 -1168 2 1082 237 309 111 53 chr15 65179467 65179638 -38315336 + MLT1H LTR MaLR 43 223 -326 2 1082 289 325 122 0 chr15 65179812 65179935 -38315039 - MLT1H2 LTR MaLR -68 421 284 2 1082 264 300 11 11 chr15 65180401 65180492 -38314482 + MLT1H LTR MaLR 413 503 -46 2 1082 795 216 17 23 chr15 65180813 65180988 -38313986 + MTEa LTR MaLR 206 379 0 2 1082 364 373 102 43 chr15 65210827 65211219 -38283755 + MLT1H LTR MaLR 9 423 -126 3 1082 1588 124 41 142 chr15 65212283 65212649 -38282325 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1082 1854 185 90 16 chr15 65218348 65218727 -38276247 - MTC LTR MaLR -2 419 13 3 1082 2110 218 116 34 chr15 65219198 65219697 -38275277 + RMER20B LTR ERVK 1 540 -87 3 1082 427 380 34 82 chr15 65240909 65241264 -38253710 - ORR1E LTR MaLR 0 359 22 3 1082 235 256 112 34 chr15 65244085 65244174 -38250800 + MT2_Mm LTR ERVL 286 381 -112 3 1082 566 274 244 91 chr15 65244396 65244793 -38250181 - MT2A LTR ERVL -75 458 1 3 1082 888 166 78 6 chr15 65246952 65247140 -38247834 + ORR1D1 LTR MaLR 1 201 -177 3 1082 828 249 35 20 chr15 65247269 65247470 -38247504 + ORR1D1 LTR MaLR 166 369 -5 3 1082 2315 61 3 0 chr15 65265588 65265883 -38229091 + MTA_Mm LTR MaLR 47 342 -54 3 1082 538 333 35 24 chr15 65268336 65268580 -38226394 + LTR16D LTR ERVL 428 674 -1 3 1083 512 308 48 0 chr15 65275024 65275181 -38219793 - MLT2B4 LTR ERVL -68 488 286 3 1083 1072 290 66 9 chr15 65275225 65275559 -38219415 + MTEa LTR MaLR 22 374 -5 3 1083 3745 310 90 49 chr15 65275572 65275981 -38218993 + MTEa-int LTR MaLR 9 419 -1161 3 1083 2796 81 34 7 chr15 65275981 65276390 -38218584 + BGLII LTR ERVK 2 421 0 3 1083 3745 310 90 49 chr15 65276390 65277485 -38217489 + MTEa-int LTR MaLR 420 1575 -5 3 1083 461 251 22 82 chr15 65279282 65279309 -38215665 - RMER17C LTR ERVK -239 171 150 4 1083 461 251 22 82 chr15 65279375 65279529 -38215445 - RMER17C LTR ERVK -261 149 1 4 1083 1936 149 87 22 chr15 65281247 65281617 -38213357 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1083 1108 268 172 52 chr15 65281751 65282227 -38212747 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 4 1083 976 314 76 65 chr15 65285584 65285685 -38209289 + MLT1E3 LTR MaLR 139 249 -375 4 1083 976 314 76 65 chr15 65285740 65286112 -38208862 + MLT1E3 LTR MaLR 250 617 -7 4 1083 1074 254 153 3 chr15 65295451 65295771 -38199203 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 4 1083 1765 138 74 0 chr15 65300777 65301074 -38193900 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1083 3928 133 110 38 chr15 65301721 65302629 -38192345 + RMER17B LTR ERVK 3 947 -11 4 1083 931 311 35 126 chr15 65309765 65310162 -38184812 - MTEa LTR MaLR 0 379 19 4 1083 436 326 58 32 chr15 65313498 65313688 -38181286 + LTR87 LTR ERVL? 275 469 -155 4 1083 269 246 54 23 chr15 65313931 65313960 -38181014 + ORR1B1-int LTR MaLR 615 647 -862 4 1083 490 288 65 18 chr15 65315405 65315575 -38179399 - MLT1B LTR MaLR -212 178 1 4 1083 806 286 132 29 chr15 65316601 65316911 -38178063 - MTEa LTR MaLR -7 372 31 4 1083 1145 148 22 31 chr15 65319842 65320065 -38174909 - LTRIS5 LTR ERV1 0 447 227 4 1083 766 56 84 0 chr15 65320062 65320169 -38174805 - LTRIS5 LTR ERV1 -331 116 1 4 1083 1582 178 84 21 chr15 65321769 65322102 -38172872 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 4 1083 4014 125 51 15 chr15 65322493 65323218 -38171756 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 4 1083 2608 96 3 37 chr15 65335761 65336139 -38158835 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 4 1083 5237 84 49 3 chr15 65336139 65336914 -38158060 - SRV_MM-int LTR ERVK 0 6167 5357 4 1083 1632 51 0 40 chr15 65337147 65337373 -38157601 - SRV_MM-int LTR ERVK -799 5368 5152 4 1083 18785 76 15 12 chr15 65337373 65339976 -38154998 - SRV_MM-int LTR ERVK -3556 2611 2 4 1083 2329 110 31 6 chr15 65339977 65340333 -38154641 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 4 1083 2926 81 8 2 chr15 65340641 65341039 -38153935 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1083 2698 69 110 5 chr15 65341943 65342324 -38152650 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 4 1083 362 250 179 45 chr15 65354789 65354923 -38140051 - MLT1J2 LTR MaLR -56 392 241 5 1083 307 337 112 46 chr15 65360825 65361021 -38133953 - MLT1E LTR MaLR -75 578 370 5 1083 270 388 8 8 chr15 65361051 65361173 -38133801 - MLT1E LTR MaLR -396 164 43 5 1083 258 345 26 17 chr15 65368286 65368401 -38126573 - MLT1K LTR MaLR -79 516 401 5 1083 2626 62 24 3 chr15 65369365 65369704 -38125270 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1083 327 265 24 0 chr15 65377008 65377091 -38117883 + RLTR40 LTR ERVK 1 85 -732 5 1083 2698 168 17 15 chr15 65380136 65380663 -38114311 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 5 1083 514 272 107 118 chr15 65383683 65383954 -38111020 - MER68 LTR ERVL -28 535 268 5 1083 1053 294 31 59 chr15 65383995 65384367 -38110607 - MTE2b LTR MaLR -6 413 5 5 1083 1885 195 24 21 chr15 65385649 65386026 -38108948 + ORR1B1 LTR MaLR 13 390 -4 5 1083 417 270 155 51 chr15 65386210 65386501 -38108473 + MLT1B LTR MaLR 23 367 -100 5 1083 394 316 170 36 chr15 65386548 65386591 -38108383 + MLT1B LTR MaLR 368 410 -57 5 1083 433 188 24 0 chr15 65387466 65387551 -38107423 + MTC LTR MaLR 1 87 -334 5 1083 1884 201 11 23 chr15 65389034 65389381 -38105593 + MTC LTR MaLR 71 413 -8 5 1083 978 261 119 20 chr15 65392096 65392389 -38102585 - ORR1D2 LTR MaLR -48 322 1 5 1083 1260 210 179 0 chr15 65392458 65392755 -38102219 + MTD LTR MaLR 18 371 -48 5 1083 907 229 44 15 chr15 65392755 65392959 -38102015 + MTD LTR MaLR 1 210 -209 5 1083 952 213 66 5 chr15 65396225 65396423 -38098551 + MTD LTR MaLR 196 405 -14 5 1083 229 111 28 0 chr15 65396391 65396427 -38098547 + ORR1C2 LTR MaLR 340 376 -8 5 1083 2445 150 23 19 chr15 65401351 65401779 -38093195 + RMER4A LTR ERVK 6 435 -31 5 1083 2643 97 120 0 chr15 65404180 65404604 -38090370 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1084 230 314 11 44 chr15 65409979 65410069 -38084905 - LTR48 LTR ERV1 -17 770 684 5 1084 932 318 50 8 chr15 65410934 65411292 -38083682 + LTR55 LTR ERV 10 382 -166 5 1084 424 321 74 16 chr15 65411424 65411614 -38083360 - MT2A LTR ERVL 0 533 333 5 1084 1862 173 35 0 chr15 65411750 65412097 -38082877 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 5 1084 1373 295 58 11 chr15 65414183 65414649 -38080325 - MERVL_2A-int LTR ERVL -294 5467 4980 5 1084 1796 85 11 7 chr15 65420412 65420685 -38074289 + MTB-int LTR MaLR 825 1098 0 6 1084 2771 71 55 3 chr15 65420685 65421065 -38073909 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1084 603 304 152 91 chr15 65421172 65421255 -38073719 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 259 6 1084 603 304 152 91 chr15 65421334 65421578 -38073396 - ORR1D2 LTR MaLR -112 258 23 6 1084 320 287 73 9 chr15 65421580 65421689 -38073285 - ORR1D2-int LTR MaLR -2 1368 1253 6 1084 1532 229 38 67 chr15 65423583 65423993 -38070981 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 6 1084 240 253 71 31 chr15 65437381 65437479 -38057495 - MTEb LTR MaLR 0 379 278 6 1084 2001 189 83 33 chr15 65442894 65443375 -38051599 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 6 1084 895 246 58 133 chr15 65443905 65444304 -38050670 + RMER15 LTR ERVL 188 556 -19 6 1084 776 329 42 37 chr15 65445524 65445877 -38049097 - MLT1A LTR MaLR -11 363 9 6 1084 1703 189 47 60 chr15 65448621 65449004 -38045970 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1084 1082 267 70 13 chr15 65451320 65451620 -38043354 - MTE2a LTR MaLR 0 379 63 6 1084 2241 173 42 7 chr15 65456151 65456558 -38038416 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1084 455 274 76 23 chr15 65458334 65458506 -38036468 + MLT1D LTR MaLR 325 505 0 6 1084 985 273 85 62 chr15 65459209 65459561 -38035413 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 5 6 1084 1184 294 75 11 chr15 65460470 65460842 -38034132 + MTD LTR MaLR 24 419 0 6 1084 946 271 48 77 chr15 65461245 65461581 -38033393 - MLT1B LTR MaLR -20 370 45 6 1084 490 372 76 27 chr15 65462941 65463270 -38031704 + MLT1D LTR MaLR 145 489 -16 6 1084 251 372 59 44 chr15 65464583 65464718 -38030256 + MLT1K LTR MaLR 99 235 -360 6 1084 1484 234 83 3 chr15 65467417 65467768 -38027206 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 6 1084 631 292 219 16 chr15 65475423 65475679 -38019295 + MLT1A0 LTR MaLR 11 318 -47 6 1084 1650 145 40 101 chr15 65496464 65496810 -37998164 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 7 1084 8015 152 16 14 chr15 65496811 65497049 -37997925 + ORR1A4-int LTR MaLR 2 243 -1720 7 1084 8015 152 16 14 chr15 65497069 65498233 -37996741 + ORR1A4-int LTR MaLR 244 1407 -556 7 1084 2865 15 3 43 chr15 65498234 65498585 -37996389 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 7 1084 11086 28 73 0 chr15 65498585 65500000 -37994974 + IAPEz-int LTR ERVK 8 1525 -4956 7 1084 44940 19 1 1 chr15 65500000 65504958 -37990016 + IAPEz-int LTR ERVK 1526 6481 0 1 1084 3042 15 3 43 chr15 65504958 65505309 -37989665 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1084 1936 169 35 58 chr15 65505309 65505982 -37988992 + ORR1A4-int LTR MaLR 1001 1963 0 2 1084 1724 136 11 112 chr15 65505982 65506338 -37988636 + ORR1A4 LTR MaLR 1 320 -9 2 1084 818 304 104 7 chr15 65510559 65510857 -37984117 + MLT1A0 LTR MaLR 39 365 0 1 1084 1857 152 93 12 chr15 65513153 65513485 -37981489 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 1 1084 2174 132 28 0 chr15 65526492 65526810 -37968164 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1084 567 257 274 19 chr15 65530222 65530488 -37964486 + MLT1G3 LTR MaLR 212 545 -50 4 1084 1210 186 86 74 chr15 65530594 65530945 -37964029 - ORR1C2 LTR MaLR -19 327 1 4 1084 306 317 87 57 chr15 65534063 65534349 -37960625 - ORR1E LTR MaLR -4 374 75 4 1085 1311 239 72 51 chr15 65536560 65536934 -37958040 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 5 1085 1186 275 43 98 chr15 65537073 65537301 -37957673 + MTD LTR MaLR 5 210 -209 5 1085 1186 275 43 98 chr15 65537836 65538045 -37956929 + MTD LTR MaLR 211 418 -1 5 1085 1182 284 43 33 chr15 65538063 65538431 -37956543 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1882 2253 -3508 5 1085 2313 113 0 94 chr15 65538747 65539036 -37955938 + ORR1A2 LTR MaLR 1 287 -40 5 1085 2313 113 0 94 chr15 65539183 65539198 -37955776 + ORR1A2 LTR MaLR 288 288 -39 5 1085 2313 113 0 94 chr15 65539224 65539279 -37955695 + ORR1A2 LTR MaLR 288 327 0 6 1085 1224 197 171 10 chr15 65539749 65540047 -37954927 + ORR1B2 LTR MaLR 1 346 -21 6 1085 2579 182 193 0 chr15 65540054 65540575 -37954399 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 616 -893 6 1085 2579 182 193 0 chr15 65540654 65540698 -37954276 + ORR1B2-int LTR MaLR 617 674 -835 6 1085 1329 251 0 45 chr15 65541389 65541566 -37953408 + ORR1B2-int LTR MaLR 708 883 -626 6 1085 1329 251 0 45 chr15 65542001 65542177 -37952797 + ORR1B2-int LTR MaLR 884 1045 -464 6 1085 1748 150 88 58 chr15 65542181 65542543 -37952431 - RLTR19 LTR ERVK -5 494 122 6 1085 837 191 168 72 chr15 65542542 65542887 -37952087 - RMER17C LTR ERVK -32 378 1 6 1085 8419 159 81 99 chr15 65542887 65543218 -37951756 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 2900 6 1085 8419 159 81 99 chr15 65543294 65543588 -37951386 - RMER17C-int LTR ERVK -339 2899 2600 6 1085 8419 159 81 99 chr15 65543641 65544125 -37950849 - RMER17C-int LTR ERVK -339 2599 2104 6 1085 8419 159 81 99 chr15 65544306 65545149 -37949825 - RMER17C-int LTR ERVK -1135 2103 1269 6 1085 998 277 65 154 chr15 65554169 65554944 -37940030 - RMER17C-int LTR ERVK -1968 1270 586 6 1085 998 277 65 154 chr15 65555038 65555568 -37939406 - RMER17C-int LTR ERVK -2653 585 81 6 1085 638 224 39 108 chr15 65555625 65556073 -37938901 - RMER17C LTR ERVK -32 378 1 6 1085 656 123 122 9 chr15 65556073 65556188 -37938786 - RLTR19 LTR ERVK -371 128 1 7 1085 2592 175 24 2 chr15 65556188 65556647 -37938327 + ORR1B2-int LTR MaLR 1041 1509 0 7 1085 1428 172 74 140 chr15 65556647 65557040 -37937934 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1085 692 225 101 43 chr15 65557647 65557856 -37937118 + RLTR20D LTR ERVK 5 225 -343 8 1085 679 252 0 31 chr15 65557860 65558020 -37936954 + RLTR20D LTR ERVK 397 551 0 8 1085 1426 254 79 14 chr15 65558026 65558382 -37936592 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 8 1085 352 261 23 2 chr15 65559174 65559271 -37935703 + MLT1B LTR MaLR 1 97 -370 8 1085 2019 107 80 3 chr15 65559568 65559869 -37935105 + ORR1A2 LTR MaLR 1 324 -3 8 1085 232 140 140 0 chr15 65560022 65560068 -37934906 + MLT1A0 LTR MaLR 15 67 -298 8 1085 703 305 71 53 chr15 65560068 65560126 -37934848 - MTD LTR MaLR 0 419 364 8 1085 1703 176 73 38 chr15 65560126 65560497 -37934477 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 8 1085 703 305 71 53 chr15 65560497 65560623 -37934351 - MTD LTR MaLR -56 363 240 8 1085 3432 30 2 0 chr15 65560623 65561018 -37933956 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1085 9486 15 14 0 chr15 65561018 65562101 -37932873 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 8 1085 3445 28 2 0 chr15 65562101 65562496 -37932478 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1085 703 308 52 26 chr15 65562496 65562689 -37932285 - MTD LTR MaLR -180 239 1 8 1085 356 264 0 33 chr15 65562689 65562764 -37932210 + MLT1A LTR MaLR 67 138 -236 8 1085 336 181 90 67 chr15 65562969 65563058 -37931916 + MLT1A LTR MaLR 300 390 0 8 1085 2465 162 39 72 chr15 65565312 65565852 -37929122 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 7 9 1085 1685 168 11 102 chr15 65567883 65568334 -37926640 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 9 1085 656 205 131 134 chr15 65576809 65577220 -37917754 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 1 1085 974 276 41 88 chr15 65578782 65579123 -37915851 + MTEb LTR MaLR 55 379 0 1 1085 320 356 0 55 chr15 65579497 65579607 -37915367 + RMER15 LTR ERVL 359 462 -113 1 1085 832 204 21 31 chr15 65579904 65580096 -37914878 - RMER17C LTR ERVK 0 410 221 1 1085 620 238 99 12 chr15 65580232 65580394 -37914580 - RMER5 LTR ERV1 -327 207 32 1 1085 1451 283 119 43 chr15 65581075 65581426 -37913548 + MER67C LTR ERV1 27 372 -339 1 1085 1451 283 119 43 chr15 65581461 65581733 -37913241 + MER67C LTR ERV1 373 697 -14 1 1085 968 269 212 18 chr15 65581965 65582362 -37912612 + RMER5 LTR ERV1 50 523 -11 1 1085 1498 247 84 71 chr15 65588097 65588270 -37906704 - RLTR20A2 LTR ERVK 0 578 391 1 1085 2553 68 0 0 chr15 65588270 65588581 -37906393 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 1 1085 1498 247 84 71 chr15 65588581 65588969 -37906005 - RLTR20A2 LTR ERVK -188 390 10 1 1085 6282 131 47 19 chr15 65588979 65589969 -37905005 - MYSERV16_I-int LTR ERVK 0 2326 1316 1 1085 6282 181 52 37 chr15 65590117 65591218 -37903756 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1011 1315 68 1 1085 253 206 23 175 chr15 65591229 65591400 -37903574 - RMER3D-int LTR ERVK -1565 1277 1133 1 1085 1038 162 58 39 chr15 65591413 65591618 -37903356 + RLTR20C LTR ERVK 326 534 0 1 1085 470 336 7 7 chr15 65591788 65591932 -37903042 + MLT1A0 LTR MaLR 196 339 -26 1 1085 656 279 82 34 chr15 65598745 65599012 -37895962 - MLT1B LTR MaLR -108 282 3 1 1085 563 269 29 18 chr15 65600244 65600414 -37894560 + MLT2B4 LTR ERVL 1 172 -384 1 1085 272 346 30 0 chr15 65600751 65600884 -37894090 + ERVL-E-int LTR ERVL 4753 4889 -778 1 1085 453 305 151 46 chr15 65607465 65607688 -37887286 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 175 1 1085 453 305 151 46 chr15 65607712 65607773 -37887201 - MLT1A1 LTR MaLR -234 174 94 1 1085 415 338 127 65 chr15 65608463 65608802 -37886172 + MLT1H LTR MaLR 190 549 0 1 1085 341 174 14 0 chr15 65617094 65617163 -37877811 - MTE2b LTR MaLR -6 373 304 1 1085 244 308 46 0 chr15 65617308 65617373 -37877601 - MTE2b LTR MaLR -59 320 253 1 1085 643 134 13 36 chr15 65617433 65617557 -37877417 - MTE2b LTR MaLR -253 126 1 1 1085 1489 265 23 20 chr15 65622086 65622440 -37872534 + MTE2b LTR MaLR 19 373 -6 1 1085 265 290 9 115 chr15 65622773 65622886 -37872088 - MT2B LTR ERVL -344 257 157 1 1085 2253 179 134 25 chr15 65625248 65625769 -37869205 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 578 0 1 1085 5161 144 111 14 chr15 65631061 65631998 -37862976 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 1 1 1085 475 303 96 83 chr15 65635482 65635867 -37859107 - MLT1B LTR MaLR 0 390 1 1 1085 248 303 121 81 chr15 65636224 65636538 -37858436 - MLT1C LTR MaLR 0 390 65 1 1085 1973 212 37 22 chr15 65647572 65647977 -37846997 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 1085 1207 204 98 82 chr15 65652689 65653057 -37841917 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1086 2327 4 158 0 chr15 65685462 65685740 -37809234 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 2 1086 3861 125 47 5 chr15 65705521 65706138 -37788836 + RMER12 LTR ERVK 11 653 -669 2 1086 796 233 93 106 chr15 65706129 65706451 -37788523 + RMER12 LTR ERVK 1005 1322 0 2 1086 260 215 30 30 chr15 65706528 65706595 -37788379 + LTR16E2 LTR ERVL 496 562 -6 2 1086 369 362 140 41 chr15 65706874 65707217 -37787757 - LTR16E2 LTR ERVL -31 537 161 2 1086 2177 133 74 0 chr15 65708716 65709069 -37785905 + ORR1B1 LTR MaLR 3 381 -13 2 1086 1107 187 134 67 chr15 65714739 65715083 -37779891 + ORR1D1 LTR MaLR 4 370 -4 2 1086 1627 87 84 74 chr15 65716507 65716783 -37778191 + ORR1A3 LTR MaLR 1 286 -60 2 1086 1498 155 60 157 chr15 65717779 65717821 -37777153 + ORR1A3 LTR MaLR 287 292 -54 2 1086 1498 155 60 157 chr15 65718783 65718837 -37776137 + ORR1A3 LTR MaLR 293 346 0 2 1086 544 278 9 52 chr15 65722163 65722360 -37772614 + ORR1E LTR MaLR 9 195 -199 3 1086 285 271 52 0 chr15 65722628 65722724 -37772250 + RMER15 LTR ERVL 453 553 -22 3 1086 293 294 66 16 chr15 65722842 65722963 -37772011 + ORR1E LTR MaLR 253 379 0 3 1086 7306 62 6 0 chr15 65727386 65728274 -37766700 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 3 1086 284 278 14 76 chr15 65732277 65732421 -37762553 - LTR87 LTR ERVL? -19 605 471 3 1086 394 272 77 26 chr15 65745111 65745228 -37749746 + ORR1E LTR MaLR 1 123 -236 3 1086 1150 212 72 56 chr15 65746613 65746988 -37747986 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 2 3 1086 261 368 90 0 chr15 65747658 65747791 -37747183 + MER77 LTR ERVL 53 197 -410 3 1086 279 349 39 16 chr15 65750650 65750778 -37744196 - LTR33A_ LTR ERVL -363 168 38 3 1086 1064 237 202 3 chr15 65756044 65756360 -37738614 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 3 1086 256 220 0 0 chr15 65757445 65757504 -37737470 + LTR37A LTR ERV1 304 362 -64 3 1086 4662 134 56 21 chr15 65757637 65758508 -37736466 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 3 1086 470 210 92 21 chr15 65768801 65768942 -37726032 + RLTR12B LTR ERVK 47 197 -331 3 1086 1496 189 65 88 chr15 65768947 65769301 -37725673 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 3 1086 567 236 46 211 chr15 65769345 65769738 -37725236 + RLTR12B LTR ERVK 189 516 -12 3 1086 2962 86 10 2 chr15 65771078 65771475 -37723499 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1086 7037 102 14 70 chr15 65771475 65772638 -37722336 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1086 2952 76 39 3 chr15 65772638 65773020 -37721954 - MTB LTR MaLR 0 396 1 3 1086 2044 165 53 29 chr15 65775101 65775512 -37719462 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1086 1659 256 47 24 chr15 65778336 65778828 -37716146 + RLTR11A2 LTR ERVK 7 509 -18 3 1086 1428 251 83 0 chr15 65780430 65780817 -37714157 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1086 231 340 10 10 chr15 65789485 65789583 -37705391 - MLT1E2 LTR MaLR -8 619 522 3 1086 2755 85 52 0 chr15 65796156 65796557 -37698417 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 3 1086 294 254 37 119 chr15 65797380 65797514 -37697460 + RLTR25A LTR ERVK 460 582 -521 3 1087 1225 246 96 15 chr15 65799588 65799996 -37694978 + BGLII_B LTR ERVK 1 441 0 4 1087 2215 222 63 23 chr15 65801086 65801612 -37693362 + RMER15 LTR ERVL 15 561 -14 4 1087 875 305 108 62 chr15 65806165 65806682 -37688292 + MER34A LTR ERV1 13 553 -18 4 1087 446 282 77 27 chr15 65810283 65810505 -37684469 + MER74A LTR ERVL 270 502 -56 4 1087 276 214 86 67 chr15 65817531 65817636 -37677338 + MLT1J1 LTR MaLR 33 139 -305 4 1087 408 282 8 39 chr15 65825923 65826052 -37668922 + LTR86A2 LTR ERVL 375 499 -9 4 1087 382 284 101 0 chr15 65827732 65827880 -37667094 + LTR86A1 LTR ERVL 119 281 -232 4 1087 459 318 81 89 chr15 65834363 65834722 -37660252 - ORR1E LTR MaLR 0 359 4 4 1087 569 284 111 57 chr15 65842602 65842953 -37652021 + MLT1C LTR MaLR 98 467 0 4 1087 923 293 88 9 chr15 65853513 65853830 -37641144 + ORR1E LTR MaLR 9 350 -9 4 1087 653 246 72 0 chr15 65857321 65857516 -37637458 + RMER4B LTR ERVK 17 225 -360 4 1087 571 251 118 43 chr15 65857545 65857807 -37637167 + RMER4B LTR ERVK 344 576 -9 4 1087 694 269 102 56 chr15 65858453 65858790 -37636184 + ORR1E LTR MaLR 2 368 -11 4 1087 1465 192 50 66 chr15 65860859 65861066 -37633908 + ORR1D1 LTR MaLR 1 206 -168 4 1087 1465 192 50 66 chr15 65861151 65861322 -37633652 + ORR1D1 LTR MaLR 207 373 -1 4 1087 426 312 87 0 chr15 65870232 65870405 -37624569 + MLT1F2 LTR MaLR 1 188 -372 4 1087 239 333 21 43 chr15 65871705 65871799 -37623175 - MTEa LTR MaLR -287 92 1 4 1087 786 257 87 35 chr15 65876460 65876771 -37618203 + RMER5 LTR ERV1 51 377 -157 5 1087 2385 111 121 14 chr15 65876771 65877200 -37617774 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1087 1180 93 10 80 chr15 65877201 65877400 -37617574 + IAPEz-int LTR ERVK 9 193 -6288 5 1087 239 309 0 0 chr15 65877400 65877455 -37617519 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 5 1087 3809 56 26 18 chr15 65877455 65877946 -37617028 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 5 1087 2275 68 0 0 chr15 65877946 65878224 -37616750 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 5 1087 6131 49 4 12 chr15 65878223 65878973 -37616001 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 5 1087 2385 111 121 14 chr15 65878975 65879404 -37615570 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1087 1197 110 28 62 chr15 65879405 65879685 -37615289 + IAPEz-int LTR ERVK 9 250 -7331 5 1087 239 309 0 0 chr15 65879685 65879740 -37615234 + RLTR27 LTR ERVK 221 275 -34 5 1087 3809 56 26 18 chr15 65879740 65880231 -37614743 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 5 1087 2287 65 0 0 chr15 65880231 65880509 -37614465 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 5 1087 6145 47 4 12 chr15 65880508 65881258 -37613716 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 5 1087 2470 106 116 14 chr15 65881260 65881691 -37613283 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1087 1325 252 49 32 chr15 65881813 65882182 -37612792 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 5 1087 404 167 0 13 chr15 65884579 65884658 -37610316 + MT2B2 LTR ERVL 1 78 -506 5 1087 3609 161 124 143 chr15 65884596 65885447 -37609527 + ORR1B1-int LTR MaLR 627 1434 -529 5 1087 3609 161 124 143 chr15 65886443 65886739 -37608235 + ORR1B1-int LTR MaLR 1435 1752 -211 5 1087 1143 157 29 0 chr15 65886747 65886951 -37608023 + ORR1B1 LTR MaLR 185 394 0 5 1087 310 272 36 51 chr15 65887155 65887303 -37607671 - MLT1E2 LTR MaLR -125 528 358 5 1087 718 240 104 144 chr15 65900409 65900804 -37594170 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1087 311 294 58 22 chr15 65901939 65902078 -37592896 - ORR1E LTR MaLR -162 197 54 5 1087 239 377 40 27 chr15 65911277 65911427 -37583547 + MLT1I LTR MaLR 259 410 -1 5 1087 618 308 23 83 chr15 65916600 65916985 -37577989 + ORR1E LTR MaLR 12 361 -9 5 1087 2529 308 127 28 chr15 65916987 65918106 -37576868 + MTE-int LTR MaLR 1 1230 -350 5 1087 439 281 17 9 chr15 65918226 65918341 -37576633 + ORR1E LTR MaLR 256 371 -8 5 1087 2091 190 93 129 chr15 65922747 65923381 -37571593 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 5 1088 1810 157 48 3 chr15 65934606 65934939 -37560035 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 47 5 1088 256 373 44 39 chr15 65936888 65937182 -37557792 - MTE2a LTR MaLR 0 379 80 5 1088 312 352 9 0 chr15 65937259 65937367 -37557607 - MLT2B3 LTR ERVL -445 109 1 5 1088 244 328 16 16 chr15 65948170 65948297 -37546677 + MLT2B4 LTR ERVL 66 192 -364 5 1088 286 386 56 36 chr15 65949717 65949967 -37545007 + MER21B LTR ERV1 482 736 -127 5 1088 342 241 106 40 chr15 65954687 65954838 -37540136 - MTD LTR MaLR 0 419 219 6 1088 473 250 60 20 chr15 65956323 65956474 -37538500 - MTEb LTR MaLR -26 353 197 6 1088 1049 207 16 25 chr15 65957856 65958136 -37536838 + RLTR20B1 LTR ERVK 80 369 -194 6 1088 682 307 45 8 chr15 65961690 65961956 -37533018 + MTD LTR MaLR 20 295 -124 6 1088 568 237 0 48 chr15 65965224 65965370 -37529604 + MTEa LTR MaLR 41 179 -200 6 1088 484 248 89 7 chr15 65965436 65965582 -37529392 + MTEa LTR MaLR 168 325 -54 6 1088 4196 134 50 30 chr15 65966977 65967718 -37527256 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 6 1088 1553 227 49 72 chr15 65972412 65972943 -37522031 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 1 6 1088 1550 257 84 14 chr15 65973232 65973718 -37521256 + RMER5 LTR ERV1 15 534 0 6 1088 228 310 24 12 chr15 65977798 65977883 -37517091 + MLT1C LTR MaLR 199 284 -183 6 1088 425 267 10 0 chr15 65986321 65986422 -37508552 + MTEa LTR MaLR 68 169 -210 6 1088 3477 23 5 0 chr15 65995048 65995442 -37499532 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1088 1097 235 45 104 chr15 65995895 65996298 -37498676 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1088 1010 249 170 0 chr15 65997998 65998031 -37496943 - MTEa LTR MaLR -8 371 324 6 1088 1010 249 170 0 chr15 65998198 65998481 -37496493 - MTEa LTR MaLR -56 323 2 6 1088 1543 229 128 11 chr15 66008098 66008474 -37486500 - MTC LTR MaLR 0 421 2 9 1088 378 270 54 9 chr15 66010008 66010120 -37484854 - LTR16E1 LTR ERVL 0 538 422 1 1088 1285 263 91 28 chr15 66017949 66017978 -37476996 - MTE2a LTR MaLR -2 377 350 1 1088 1285 263 91 28 chr15 66018017 66018339 -37476635 - MTE2a LTR MaLR -30 349 4 1 1088 1294 249 58 44 chr15 66022827 66023192 -37471782 + ORR1D1 LTR MaLR 1 370 -4 2 1088 297 338 96 0 chr15 66026240 66026376 -37468598 + MTEb LTR MaLR 4 152 -227 3 1088 235 309 25 0 chr15 66026502 66026583 -37468391 - MLT1A1 LTR MaLR -47 361 279 3 1088 515 320 104 30 chr15 66029711 66030062 -37464912 + MLT2B1 LTR ERVL 1 377 -177 3 1088 1549 149 45 192 chr15 66030754 66031202 -37463772 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 3 1088 241 373 70 16 chr15 66031409 66031537 -37463437 + MLT1L LTR MaLR 5 139 -471 3 1088 1537 167 103 6 chr15 66043757 66044077 -37450897 - ORR1B2 LTR MaLR -15 352 2 5 1088 313 171 39 13 chr15 66044545 66044622 -37450352 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 455 5 1088 297 189 0 0 chr15 66045457 66045510 -37449464 - MTC-int LTR MaLR -816 442 390 5 1088 1726 189 55 8 chr15 66045622 66046006 -37448968 - MTC-int LTR MaLR -856 402 1 5 1088 1664 190 91 89 chr15 66046006 66046422 -37448552 - MTC LTR MaLR 0 421 5 5 1088 2851 166 142 34 chr15 66046422 66047157 -37447817 + MTC-int LTR MaLR 445 1258 0 6 1088 1060 165 455 7 chr15 66047161 66047449 -37447525 + MTC LTR MaLR 5 421 0 6 1088 2823 57 50 29 chr15 66047968 66048348 -37446626 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 6 1088 5477 55 121 112 chr15 66048359 66049301 -37445673 + RLTR10-int LTR ERVK 41 991 -996 6 1088 644 287 62 62 chr15 66049327 66049750 -37445224 + RLTR10-int LTR ERVK 1172 1594 -5987 6 1088 8699 31 2 2 chr15 66049832 66050829 -37444145 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 6 1088 2799 62 50 26 chr15 66050829 66051208 -37443766 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 6 1088 248 241 19 0 chr15 66053060 66053114 -37441860 + MLT1E3 LTR MaLR 93 147 -477 6 1088 464 251 138 24 chr15 66057817 66058120 -37436854 + ORR1E LTR MaLR 7 352 -7 7 1089 907 280 61 56 chr15 66063925 66064300 -37430674 - MTEb LTR MaLR -2 377 1 8 1089 637 317 163 40 chr15 66065634 66066203 -37428771 + MLT1E1 LTR MaLR 6 644 -10 8 1089 986 294 44 20 chr15 66068795 66069163 -37425811 + MTE2b LTR MaLR 32 392 -27 8 1089 392 289 73 78 chr15 66069756 66069974 -37425000 + MTEa LTR MaLR 51 267 -112 8 1089 436 209 10 113 chr15 66069978 66070129 -37424845 + MTEa LTR MaLR 241 374 -5 8 1089 358 279 71 40 chr15 66073904 66074102 -37420872 - LTR33 LTR ERVL -56 459 256 9 1089 311 302 60 53 chr15 66077164 66077297 -37417677 + MLT1A LTR MaLR 3 136 -238 9 1089 744 309 29 63 chr15 66077484 66077842 -37417132 + ORR1E LTR MaLR 2 369 -10 9 1089 255 311 510 8 chr15 66077826 66078062 -37416912 - MLT1A1 LTR MaLR -51 357 3 9 1089 733 318 34 70 chr15 66079413 66079711 -37415263 + MTE2a LTR MaLR 16 302 -77 9 1089 1594 157 89 44 chr15 66080467 66080827 -37414147 - RMER10B LTR ERVL -22 376 1 9 1089 298 333 25 17 chr15 66081770 66081889 -37413085 - MLT1C LTR MaLR -5 462 343 9 1089 225 200 0 41 chr15 66085126 66085199 -37409775 + LTR53 LTR ERVL 10 79 -440 1 1089 259 273 148 76 chr15 66085253 66085503 -37409471 + LTR53 LTR ERVL 233 500 -19 1 1089 368 259 93 47 chr15 66086145 66086295 -37408679 + RLTR14 LTR ERV1 225 381 -1 1 1089 252 280 118 0 chr15 66086296 66086389 -37408585 + ORR1E LTR MaLR 8 111 -248 1 1089 590 332 53 14 chr15 66090546 66090754 -37404220 + MLT2B3 LTR ERVL 321 536 -18 1 1089 2256 70 3 9 chr15 66092967 66093284 -37401690 + ORR1A2 LTR MaLR 5 319 -8 1 1089 435 231 69 69 chr15 66096241 66096385 -37398589 + MLT1A1 LTR MaLR 265 408 0 1 1089 518 260 157 65 chr15 66096452 66096789 -37398185 + MLT1D LTR MaLR 133 500 -5 1 1089 285 275 10 71 chr15 66101275 66101373 -37393601 - RMER15 LTR ERVL -113 462 371 1 1089 578 250 49 27 chr15 66110604 66110789 -37384185 - ORR1E LTR MaLR -164 195 7 1 1089 439 189 72 0 chr15 66111540 66111651 -37383323 - MTD LTR MaLR -1 418 300 1 1089 628 325 64 22 chr15 66112465 66112765 -37382209 + MLT1A1 LTR MaLR 40 335 -30 1 1089 1233 118 241 7 chr15 66119548 66119822 -37375152 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 1 1089 426 352 68 54 chr15 66120841 66121195 -37373779 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1089 720 275 184 37 chr15 66121536 66121857 -37373117 + MTD LTR MaLR 38 405 -14 1 1089 1084 275 31 44 chr15 66122665 66123026 -37371948 - ORR1D2 LTR MaLR -7 372 5 1 1089 602 312 46 0 chr15 66124336 66124509 -37370465 + ORR1E LTR MaLR 10 190 -169 1 1089 342 264 46 48 chr15 66124549 66124733 -37370241 + ORR1E LTR MaLR 197 375 -4 1 1089 490 312 43 66 chr15 66127449 66127751 -37367223 - MLT1B LTR MaLR -3 387 93 1 1089 289 306 9 18 chr15 66127957 66128067 -37366907 - MLT1B LTR MaLR -281 109 1 1 1089 429 319 51 36 chr15 66132544 66132877 -37362097 - MLT1G LTR MaLR -8 587 206 1 1089 709 232 123 34 chr15 66135252 66135491 -37359483 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 88 1 1089 749 177 23 103 chr15 66135696 66135910 -37359064 - ORR1C2 LTR MaLR -187 197 1 1 1089 797 261 70 62 chr15 66136475 66136847 -37358127 - MTEb LTR MaLR -4 375 1 1 1089 336 242 39 39 chr15 66137573 66137676 -37357298 + MLT1J LTR MaLR 161 263 -249 1 1089 2061 175 45 8 chr15 66141956 66142354 -37352620 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1089 1221 254 32 38 chr15 66142359 66142703 -37352271 + MTEa LTR MaLR 35 376 -3 1 1089 336 333 73 77 chr15 66145737 66146216 -37348758 + MLT1J LTR MaLR 1 477 -35 1 1089 922 239 133 35 chr15 66148233 66148602 -37346372 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1089 901 258 78 118 chr15 66149253 66149508 -37345466 + MTD LTR MaLR 53 269 -150 1 1089 901 258 78 118 chr15 66150089 66150215 -37344759 + MTD LTR MaLR 270 419 0 1 1089 348 316 159 77 chr15 66150729 66151055 -37343919 + MLT1C LTR MaLR 20 372 -18 1 1089 565 276 64 27 chr15 66151264 66151484 -37343490 - MLT1D LTR MaLR -258 247 20 1 1089 606 343 56 46 chr15 66151691 66152250 -37342724 + ERVL-E-int LTR ERVL 1335 2055 -3706 1 1089 263 287 83 47 chr15 66152873 66153088 -37341886 - MTEb LTR MaLR -1 378 132 1 1089 577 380 68 12 chr15 66156762 66157278 -37337696 + MER90a LTR ERV1 70 614 0 1 1089 275 347 0 8 chr15 66157756 66157875 -37337099 + MLT1L LTR MaLR 165 282 -328 1 1089 369 332 116 39 chr15 66160155 66160490 -37334484 + MLT1A0 LTR MaLR 4 364 -1 2 1089 933 257 23 94 chr15 66160727 66160884 -37334090 + ORR1D1 LTR MaLR 20 184 -190 2 1089 933 241 17 82 chr15 66160942 66161137 -37333837 + ORR1D1 LTR MaLR 185 374 0 2 1089 2056 205 40 0 chr15 66161464 66161869 -37333105 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1089 2427 106 3 68 chr15 66161979 66162363 -37332611 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 2 1089 2381 191 69 72 chr15 66164765 66165374 -37329600 - RMER19C LTR ERVK -3 608 2 2 1089 494 335 87 69 chr15 66165377 66165755 -37329219 - MLT1J LTR MaLR -80 432 48 2 1089 296 196 247 0 chr15 66166297 66166394 -37328580 + RLTR40 LTR ERVK 1 121 -696 2 1089 2850 232 69 47 chr15 66166517 66167210 -37327764 + RLTR40 LTR ERVK 107 813 -4 2 1089 299 329 128 60 chr15 66168981 66169263 -37325711 - LTR16A1 LTR ERVL -13 476 148 2 1089 311 349 22 43 chr15 66174534 66174672 -37320302 - ORR1E LTR MaLR -210 149 15 2 1089 295 378 44 7 chr15 66176150 66176286 -37318688 + MLT1I LTR MaLR 47 187 -224 2 1089 1787 159 24 80 chr15 66187521 66187817 -37307157 + ORR1B1 LTR MaLR 41 342 -52 2 1089 1787 159 24 80 chr15 66188731 66188809 -37306165 + ORR1B1 LTR MaLR 343 394 0 2 1089 392 181 62 13 chr15 66190467 66190579 -37304395 - ORR1E LTR MaLR 0 374 265 2 1090 655 257 145 21 chr15 66200932 66201174 -37293800 - MER68 LTR ERVL -283 280 9 2 1090 351 328 116 16 chr15 66203840 66204029 -37290945 + MLT1G3 LTR MaLR 14 221 -374 2 1090 463 289 151 54 chr15 66205859 66206064 -37288910 + ORR1D2 LTR MaLR 146 370 0 2 1090 1112 339 49 35 chr15 66206072 66206766 -37288208 + ERVL-E-int LTR ERVL 4232 4935 -732 2 1090 230 299 86 86 chr15 66207130 66207350 -37287624 + LTR33C LTR ERVL 410 629 0 2 1090 896 241 77 104 chr15 66208010 66208452 -37286522 - MT2B LTR ERVL -40 561 1 2 1090 1143 269 126 8 chr15 66208953 66209309 -37285665 + MTD LTR MaLR 22 419 0 2 1090 1115 255 182 90 chr15 66209309 66210345 -37284629 + MTD-int LTR MaLR 1 1249 -9 2 1090 959 284 82 101 chr15 66210358 66210746 -37284228 + MTD LTR MaLR 5 385 -34 2 1090 837 224 132 16 chr15 66211022 66211271 -37283703 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 85 2 1090 261 293 141 15 chr15 66219584 66219719 -37275255 + MER68 LTR ERVL 387 538 -25 2 1090 3476 176 35 0 chr15 66220984 66221580 -37273394 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2774 3390 -2371 2 1090 261 264 0 0 chr15 66221811 66221864 -37273110 - MER70A LTR ERVL 0 472 420 2 1090 424 280 49 103 chr15 66222225 66222412 -37272562 - ORR1E LTR MaLR -129 230 51 3 1090 424 280 49 103 chr15 66222619 66222674 -37272300 - ORR1E LTR MaLR -309 50 1 3 1090 449 224 1 15 chr15 66222674 66222768 -37272206 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1448 3 1090 797 280 61 24 chr15 66222924 66223170 -37271804 - MTE-int LTR MaLR -110 1470 1215 3 1090 797 280 61 24 chr15 66223350 66223398 -37271576 - MTE-int LTR MaLR -366 1214 1165 3 1090 370 333 36 29 chr15 66223441 66223580 -37271394 - MTE-int LTR MaLR -551 1029 890 3 1090 315 310 143 6 chr15 66223819 66223994 -37270980 + RMER20B LTR ERVK 192 390 -237 3 1090 259 317 37 0 chr15 66224177 66224258 -37270716 - MTE-int LTR MaLR -1229 351 268 3 1090 1124 243 121 44 chr15 66224258 66224598 -37270376 + MTE2b LTR MaLR 3 368 -11 3 1090 694 265 102 9 chr15 66224600 66224825 -37270149 - MTE-int LTR MaLR -1300 280 35 3 1090 386 349 92 79 chr15 66224834 66225126 -37269848 - ORR1E LTR MaLR -11 348 53 3 1090 401 302 38 70 chr15 66229878 66230063 -37264911 + LTR16A LTR ERVL 260 438 -13 3 1090 2879 193 17 18 chr15 66231371 66232074 -37262900 - RLTR40 LTR ERVK -10 807 2 3 1090 494 228 83 107 chr15 66238916 66239132 -37255842 + MTE2a LTR MaLR 125 335 -44 3 1090 367 234 10 41 chr15 66239130 66239228 -37255746 - MTE2a LTR MaLR -280 99 5 3 1090 254 183 46 77 chr15 66239487 66239552 -37255422 + MTE2a LTR MaLR 316 378 -1 3 1090 1196 302 2 108 chr15 66241487 66241903 -37253071 - MTEb LTR MaLR -5 374 3 3 1090 323 320 29 59 chr15 66246193 66246329 -37248645 - MTEa LTR MaLR 0 379 248 3 1090 262 297 32 32 chr15 66247792 66247886 -37247088 - MLT1A0 LTR MaLR -9 399 306 3 1090 362 261 60 30 chr15 66248011 66248145 -37246829 - MLT1A0 LTR MaLR -222 143 6 3 1090 831 222 137 88 chr15 66248765 66249116 -37245858 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 3 1090 445 174 92 17 chr15 66249502 66249608 -37245366 + ETnERV2-int LTR ERVK 311 397 -5009 3 1090 3602 84 30 2 chr15 66249610 66250111 -37244863 + LTRIS2 LTR ERV1 50 564 0 3 1090 3688 154 92 94 chr15 66250146 66250942 -37244032 + ETnERV2-int LTR ERVK 1158 2003 -5403 3 1090 232 277 46 0 chr15 66250942 66251007 -37243967 + MTC-int LTR MaLR 484 551 -707 3 1090 3688 154 92 94 chr15 66251007 66251180 -37243794 + ETnERV2-int LTR ERVK 2004 2189 -5217 3 1090 5448 183 46 50 chr15 66251262 66253035 -37241939 + ETnERV2-int LTR ERVK 1415 3826 -1982 3 1090 3979 173 20 39 chr15 66253136 66253977 -37240997 + ETnERV2-int LTR ERVK 5387 6211 -1195 3 1090 273 188 46 23 chr15 66254123 66254210 -37240764 + ETnERV2-int LTR ERVK 6336 6424 -982 3 1090 823 202 147 89 chr15 66254476 66254824 -37240150 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 3 1090 1562 157 99 3 chr15 66258213 66258507 -37236467 + RLTR24 LTR ERV1 131 452 -77 3 1090 1015 294 74 41 chr15 66259775 66260165 -37234809 - MTD LTR MaLR -14 405 3 3 1090 2032 164 56 8 chr15 66261833 66262209 -37232765 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1090 227 310 11 22 chr15 66264054 66264143 -37230831 + MLT1L LTR MaLR 518 605 -5 3 1090 232 293 112 68 chr15 66264957 66265118 -37229856 + MTB_Mm LTR MaLR 95 262 -145 3 1090 1340 158 288 3 chr15 66267556 66267855 -37227119 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1090 323 293 118 31 chr15 66275316 66275443 -37219531 + MLT1J LTR MaLR 1 138 -374 3 1090 1155 230 26 46 chr15 66280375 66280412 -37214562 + RLTR11A LTR ERVK 226 259 -269 3 1090 1155 230 26 46 chr15 66280459 66280726 -37214248 + RLTR11A LTR ERVK 260 523 -5 3 1090 1751 139 71 26 chr15 66287982 66288292 -37206682 + MTB_Mm LTR MaLR 29 352 -55 3 1090 614 245 148 110 chr15 66293475 66293902 -37201072 + MLT1D LTR MaLR 57 499 -6 3 1090 649 323 64 76 chr15 66295348 66295783 -37199191 + MLT1C LTR MaLR 38 467 0 3 1090 493 280 123 75 chr15 66300227 66300455 -37194519 + MER21B LTR ERV1 493 731 -132 4 1090 236 297 55 78 chr15 66304650 66304778 -37190196 + MLT1G1 LTR MaLR 68 192 -387 4 1090 776 317 117 40 chr15 66306164 66306660 -37188314 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 4 1090 298 152 14 57 chr15 66310398 66310468 -37184506 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 67 -1781 4 1090 2116 204 14 19 chr15 66312998 66313418 -37181556 - MTD LTR MaLR -1 418 1 4 1090 3726 20 2 0 chr15 66314478 66314873 -37180101 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1090 9790 34 2 1 chr15 66314873 66315970 -37179004 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 4 1090 3726 20 2 0 chr15 66315970 66316365 -37178609 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1090 1197 186 80 186 chr15 66319097 66319297 -37175677 + ORR1D1 LTR MaLR 1 155 -219 4 1090 1197 186 80 186 chr15 66319540 66319754 -37175220 + ORR1D1 LTR MaLR 156 371 -3 4 1091 600 100 190 0 chr15 66322883 66322995 -37171979 - RLTR11A LTR ERVK -59 468 322 4 1091 1396 164 14 47 chr15 66322984 66323259 -37171715 + RLTR15 LTR ERVK 94 359 0 4 1091 228 275 12 48 chr15 66326610 66326694 -37168280 - RLTR25B LTR ERVK -520 508 428 4 1091 516 334 203 23 chr15 66328492 66328841 -37166133 + LTR16A LTR ERVL 33 444 -7 4 1091 1613 246 66 24 chr15 66330195 66330592 -37164382 - MTD LTR MaLR -14 405 1 4 1091 296 323 21 10 chr15 66334615 66334712 -37160262 + MLT1A1 LTR MaLR 14 111 -297 4 1091 554 316 169 61 chr15 66339369 66339777 -37155197 - MER77 LTR ERVL 0 607 156 4 1091 1770 161 42 55 chr15 66343279 66343661 -37151313 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 4 1091 923 313 74 6 chr15 66347870 66348182 -37146792 - MLT2C2 LTR ERVL -125 339 7 4 1091 1022 288 31 126 chr15 66348701 66349114 -37145860 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 4 1091 618 286 138 35 chr15 66349156 66349417 -37145557 + MLT1A LTR MaLR 31 318 -56 4 1091 480 372 49 35 chr15 66352993 66353341 -37141633 + MT2A LTR ERVL 1 353 -180 4 1091 241 376 91 86 chr15 66353488 66353678 -37141296 - MER21B LTR ERV1 -225 638 452 5 1091 284 395 167 58 chr15 66353875 66354241 -37140733 - MER21B LTR ERV1 -412 451 41 5 1091 660 261 137 20 chr15 66354534 66354852 -37140122 - RMER20B LTR ERVK -5 511 147 5 1091 660 228 147 26 chr15 66354902 66354958 -37140016 - RMER20B LTR ERVK -481 146 92 5 1091 1716 101 31 41 chr15 66355505 66355824 -37139150 + RLTR10A LTR ERVK 96 411 0 5 1091 364 364 116 25 chr15 66356769 66357096 -37137878 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 5 1091 1188 255 36 62 chr15 66357825 66358214 -37136760 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 1091 413 333 120 49 chr15 66358582 66358948 -37136026 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 15 5 1091 1169 271 33 81 chr15 66360116 66360509 -37134465 + MTE2a LTR MaLR 6 379 0 5 1091 800 262 44 129 chr15 66373556 66373968 -37121006 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 5 1091 3224 19 48 0 chr15 66375897 66376275 -37118699 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1091 862 277 87 21 chr15 66379666 66380001 -37114973 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 5 1091 1831 205 53 19 chr15 66383844 66384222 -37110752 + MTC LTR MaLR 18 408 -13 5 1091 701 192 14 7 chr15 66384284 66384431 -37110543 + RMER5 LTR ERV1 382 529 -5 5 1091 402 278 17 34 chr15 66384737 66384856 -37110118 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 408 5 1091 435 241 26 9 chr15 66384811 66384924 -37110050 + RMER5 LTR ERV1 415 529 -5 5 1091 1412 201 55 71 chr15 66388630 66389010 -37105964 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1091 270 229 43 0 chr15 66394348 66394418 -37100556 + MLT2F LTR ERVL 2 74 -589 5 1091 732 284 60 142 chr15 66394490 66394905 -37100069 + MTE2a LTR MaLR 1 375 -44 5 1091 363 366 72 51 chr15 66394996 66395385 -37099589 + MLT2F LTR ERVL 263 659 -4 5 1091 2018 159 49 11 chr15 66397850 66398199 -37096775 - ORR1C2 LTR MaLR -22 362 1 5 1091 472 326 85 20 chr15 66400991 66401332 -37093642 + MLT1A0 LTR MaLR 2 364 -1 5 1091 1812 170 9 22 chr15 66405631 66405950 -37089024 + ORR1B2 LTR MaLR 1 315 -52 5 1091 2661 243 68 58 chr15 66405951 66406802 -37088172 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 5 1091 468 208 206 8 chr15 66413570 66413701 -37081273 - RMER19B LTR ERVK 0 902 746 6 1091 259 81 0 0 chr15 66413707 66413744 -37081230 - RMER19B LTR ERVK -865 37 1 6 1091 792 268 126 26 chr15 66449369 66449599 -37045375 - MTE2b LTR MaLR -52 327 75 6 1092 494 292 19 32 chr15 66457803 66458027 -37036947 + MLT1C LTR MaLR 177 467 0 6 1092 345 319 122 79 chr15 66458781 66459135 -37035839 - MLT1D LTR MaLR -117 388 20 6 1092 229 318 22 67 chr15 66460889 66460930 -37034044 - MT2B2 LTR ERVL -333 251 123 6 1092 230 280 60 70 chr15 66465652 66465752 -37029222 + BGLII_Mus LTR ERVK 53 151 -271 6 1092 352 311 103 46 chr15 66477798 66477973 -37017001 - LTR16E1 LTR ERVL -3 535 351 6 1092 420 338 23 88 chr15 66485820 66485873 -37009101 + MTE2b-int LTR MaLR 285 330 -1250 6 1092 420 338 23 88 chr15 66486390 66486599 -37008375 + MTE2b-int LTR MaLR 331 530 -1050 6 1092 539 309 93 28 chr15 66492780 66492996 -37001978 + MTE2b-int LTR MaLR 577 806 -774 6 1092 2192 266 57 12 chr15 66492989 66493570 -37001404 + MTE2b-int LTR MaLR 971 1577 -3 6 1092 817 301 123 18 chr15 66493577 66493896 -37001078 + MTE2b LTR MaLR 10 367 -12 6 1092 3011 56 15 8 chr15 66496231 66496624 -36998350 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1092 941 252 62 12 chr15 66497322 66497563 -36997411 - MTEa LTR MaLR -126 253 1 7 1092 961 287 81 14 chr15 66500766 66501126 -36993848 + MLT1B LTR MaLR 1 384 -6 1 1092 2015 147 103 11 chr15 66505834 66506022 -36988952 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 178 4 1092 2015 147 103 11 chr15 66506250 66506410 -36988564 - ORR1C2 LTR MaLR -207 177 2 4 1092 301 266 32 103 chr15 66509301 66509330 -36985644 - MT2B2 LTR ERVL -422 162 143 1 1092 616 287 81 107 chr15 66512535 66512918 -36982056 - MLT1B LTR MaLR -12 378 6 1 1092 342 261 31 94 chr15 66513072 66513102 -36981872 + MT2B LTR ERVL 139 160 -441 1 1092 727 308 63 24 chr15 66516170 66516423 -36978551 + MTD LTR MaLR 8 270 -149 1 1092 404 263 44 41 chr15 66516455 66516607 -36978367 + MTD LTR MaLR 225 413 -6 1 1092 404 294 103 43 chr15 66530761 66530946 -36964028 - MLT1D LTR MaLR -69 436 241 3 1092 256 282 38 114 chr15 66530962 66531094 -36963880 - MLT1D LTR MaLR -474 153 32 3 1092 514 186 81 7 chr15 66535007 66535246 -36959728 + RMER6C LTR ERVK 3 301 -455 3 1092 396 286 68 49 chr15 66538335 66538497 -36956477 - MLT1A LTR MaLR -209 165 1 4 1092 499 265 8 17 chr15 66539013 66539132 -36955842 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 248 4 1092 691 276 174 32 chr15 66547779 66548060 -36946914 - MLT1B LTR MaLR -69 321 1 5 1092 321 304 109 48 chr15 66561635 66561929 -36933045 - MLT1H LTR MaLR -209 340 29 7 1092 1251 235 161 0 chr15 66568522 66568871 -36926103 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 8 1092 528 329 97 31 chr15 66577300 66577620 -36917354 - MER21B LTR ERV1 -57 806 466 9 1093 419 350 42 66 chr15 66587391 66587679 -36907295 + MLT1A0 LTR MaLR 64 344 -21 1 1093 271 316 147 20 chr15 66599764 66599961 -36895013 - MLT1B LTR MaLR -162 228 7 1 1093 984 308 44 18 chr15 66603770 66604111 -36890863 - MTEa LTR MaLR -8 371 22 1 1093 1803 193 41 28 chr15 66610293 66610655 -36884319 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1093 3465 18 10 0 chr15 66651313 66651705 -36843269 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1093 1446 190 23 23 chr15 66653548 66653849 -36841125 - RLTR16 LTR ERVK -103 402 102 1 1093 233 291 56 44 chr15 66672107 66672197 -36822777 - MLT1B LTR MaLR -76 289 199 1 1093 589 299 41 32 chr15 66673134 66673355 -36821619 - MLT1B LTR MaLR -151 239 17 1 1093 243 335 106 79 chr15 66679161 66679453 -36815521 - ORR1D1 LTR MaLR -28 346 47 2 1093 289 246 29 0 chr15 66683296 66683365 -36811609 - MER87 LTR ERV1 -71 470 400 2 1093 678 316 101 42 chr15 66684093 66684430 -36810544 + MLT1D LTR MaLR 149 505 0 2 1093 808 262 90 118 chr15 66690523 66690749 -36804225 + MTE2a LTR MaLR 1 221 -158 2 1093 808 262 90 118 chr15 66690795 66690958 -36804016 + MTE2a LTR MaLR 222 379 0 2 1093 963 262 121 42 chr15 66695560 66695831 -36799143 - MTE2b LTR MaLR -3 376 76 2 1093 963 262 121 42 chr15 66696055 66696114 -36798860 - MTE2b LTR MaLR -304 75 20 2 1093 238 340 113 71 chr15 66697816 66697879 -36797095 + ORR1D2 LTR MaLR 77 137 -233 2 1093 2303 151 22 81 chr15 66697879 66698015 -36796959 + MTC LTR MaLR 1 120 -301 2 1093 2303 151 22 81 chr15 66698158 66698468 -36796506 + MTC LTR MaLR 121 421 0 2 1093 238 340 113 71 chr15 66698468 66698686 -36796288 + ORR1D2 LTR MaLR 138 370 0 2 1093 1023 287 89 31 chr15 66699254 66699581 -36795393 - MTE2b LTR MaLR -30 349 4 2 1093 4487 225 46 39 chr15 66704784 66705866 -36789108 - ORR1D1-int LTR MaLR -428 1535 1 2 1093 1238 227 106 12 chr15 66705888 66706227 -36788747 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 2 1093 571 255 132 0 chr15 66706290 66706494 -36788480 + MT2A LTR ERVL 303 533 0 2 1093 468 328 65 55 chr15 66708991 66709298 -36785676 - MLT1C LTR MaLR -108 359 50 2 1093 327 102 164 33 chr15 66709426 66709487 -36785487 - RMER15 LTR ERVL -156 419 351 2 1093 286 226 164 62 chr15 66709576 66709722 -36785252 - RMER15 LTR ERVL -414 161 1 2 1094 1796 202 112 14 chr15 66715723 66716089 -36778885 - MTD LTR MaLR -5 414 13 2 1094 355 301 117 37 chr15 66716248 66716410 -36778564 + MLT1B LTR MaLR 176 350 -40 2 1094 3083 46 20 13 chr15 66718264 66718657 -36776317 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1094 1558 271 16 11 chr15 66718716 66719085 -36775889 + MTE2b LTR MaLR 1 371 -8 2 1094 230 258 113 0 chr15 66721389 66721451 -36773523 - MLT1J LTR MaLR -176 336 268 2 1094 297 245 54 81 chr15 66730403 66730514 -36764460 - MT2B LTR ERVL -325 276 169 2 1094 959 258 61 173 chr15 66747882 66747980 -36746994 - MTEa LTR MaLR 0 379 290 3 1094 959 258 61 173 chr15 66748172 66748500 -36746474 - MTEa LTR MaLR -90 289 1 3 1094 425 332 181 4 chr15 66755054 66755335 -36739639 - RMER15 LTR ERVL -184 391 61 3 1094 2935 81 39 0 chr15 66757211 66757595 -36737379 - MTB LTR MaLR 0 400 2 3 1094 291 130 0 0 chr15 66759402 66759448 -36735526 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 327 3 1094 676 276 222 17 chr15 66763253 66763599 -36731375 + MLT1C LTR MaLR 17 433 -34 3 1094 2342 115 50 42 chr15 66779011 66779392 -36715582 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1094 317 219 13 27 chr15 66779392 66779467 -36715507 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 74 -1296 3 1094 1444 179 106 50 chr15 66780845 66781203 -36713771 + ORR1C2 LTR MaLR 4 381 -3 3 1094 1053 254 47 121 chr15 66783856 66784286 -36710688 - MTD LTR MaLR -21 398 1 3 1094 282 348 108 38 chr15 66804064 66804276 -36690698 - MLT1C LTR MaLR 0 467 241 3 1094 691 282 41 44 chr15 66804730 66805001 -36689973 + MT2A LTR ERVL 173 442 -91 3 1094 309 301 58 128 chr15 66805529 66805841 -36689133 + MLT1I LTR MaLR 25 314 -97 3 1094 1098 247 28 114 chr15 66815323 66815745 -36679229 + MTE2a LTR MaLR 2 403 -16 3 1094 2678 155 131 19 chr15 66817303 66817630 -36677344 + RMER4B LTR ERVK 1 342 -243 3 1094 2678 155 131 19 chr15 66817845 66818041 -36676933 + RMER4B LTR ERVK 343 585 0 3 1094 844 264 114 17 chr15 66818133 66818479 -36676495 - MLT1B LTR MaLR -10 457 1 4 1094 2185 199 22 7 chr15 66818616 66819021 -36675953 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 4 1094 452 380 89 17 chr15 66819755 66820057 -36674917 + MLT1J LTR MaLR 142 465 -47 4 1094 244 277 101 0 chr15 66823336 66823455 -36671519 - LTR33A LTR ERVL -2 518 388 4 1094 254 290 47 115 chr15 66825352 66825500 -36669474 + MLT1A1 LTR MaLR 271 408 0 4 1094 226 183 46 77 chr15 66832984 66833049 -36661925 + RMER20A LTR ERVK 186 248 -268 4 1094 247 256 193 21 chr15 66838519 66838659 -36656315 - RMER21B LTR ERV1 -85 757 594 4 1094 1049 147 144 1 chr15 66838881 66839114 -36655860 + ORR1B1 LTR MaLR 106 392 -2 4 1094 993 275 80 75 chr15 66839195 66839345 -36655629 - MTEb LTR MaLR -1 378 230 4 1094 2280 152 24 5 chr15 66839345 66839716 -36655258 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 4 1094 993 275 80 75 chr15 66839716 66839938 -36655036 - MTEb LTR MaLR -150 229 4 4 1094 323 154 0 0 chr15 66841480 66841532 -36653442 - MTE2a LTR MaLR -327 52 1 4 1094 226 346 12 12 chr15 66841743 66841825 -36653149 - MLT1I LTR MaLR -4 407 326 4 1094 570 339 127 10 chr15 66844529 66844836 -36650138 + MLT1B LTR MaLR 46 388 -2 4 1095 262 263 117 50 chr15 66846955 66847075 -36647899 - MLT1A LTR MaLR -139 235 108 4 1095 1725 218 35 41 chr15 66847427 66847795 -36647179 - ORR1C1 LTR MaLR -12 366 1 4 1095 808 279 118 12 chr15 66848378 66848648 -36646326 - MLT1B LTR MaLR -102 288 1 4 1095 318 217 208 36 chr15 66850026 66850236 -36644738 + MTE2b LTR MaLR 142 379 0 4 1095 546 318 53 109 chr15 66851836 66852175 -36642799 + MTD LTR MaLR 6 325 -82 4 1095 4151 176 50 25 chr15 66852594 66853427 -36641547 + RLTR25B LTR ERVK 1 854 -174 4 1095 980 192 7 123 chr15 66853682 66853969 -36641005 + RLTR25A LTR ERVK 766 1103 0 4 1095 899 253 95 147 chr15 66854247 66854636 -36640338 - MTE2b LTR MaLR 0 379 11 4 1095 314 301 95 19 chr15 66855121 66855226 -36639748 + RMER15 LTR ERVL 325 437 -138 4 1095 381 221 208 28 chr15 66855290 66855434 -36639540 + RMER15 LTR ERVL 404 573 -2 4 1095 1996 149 18 114 chr15 66855498 66855938 -36639036 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 4 1095 769 264 151 47 chr15 66858957 66859097 -36635877 - MTEa LTR MaLR 0 379 200 4 1095 769 264 151 47 chr15 66859153 66859310 -36635664 - MTEa LTR MaLR -180 199 51 4 1095 1119 282 32 115 chr15 66859331 66859731 -36635243 - MTE2a LTR MaLR -4 375 9 4 1095 343 137 0 0 chr15 66859746 66859797 -36635177 - MTEa LTR MaLR -325 54 4 4 1095 521 342 98 16 chr15 66860117 66860361 -36634613 - MLT1C LTR MaLR -197 270 7 4 1095 321 381 60 12 chr15 66860742 66860992 -36633982 + MLT1K LTR MaLR 316 577 -18 4 1095 309 294 12 12 chr15 66862971 66863057 -36631917 + MLT1D LTR MaLR 365 450 -55 4 1095 1218 256 40 40 chr15 66864199 66864569 -36630405 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 4 1095 2899 46 0 6 chr15 66864738 66865086 -36629888 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1095 510 282 84 24 chr15 66869244 66869411 -36625563 + MLT1D LTR MaLR 22 198 -307 4 1095 358 321 77 15 chr15 66869431 66869627 -36625347 + MLT1D LTR MaLR 265 472 -33 4 1095 2440 92 3 0 chr15 66874541 66874867 -36620107 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1095 336 187 39 39 chr15 66876684 66876762 -36618212 - MTEa LTR MaLR -24 355 278 5 1095 298 267 56 19 chr15 66881216 66881323 -36613651 - MLT1A LTR MaLR -2 406 296 5 1095 2479 87 12 0 chr15 66881389 66881712 -36613262 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1095 339 280 68 37 chr15 66886362 66886378 -36608596 - MLT1A LTR MaLR -206 168 155 5 1095 339 280 68 37 chr15 66886398 66886544 -36608430 - MLT1A LTR MaLR -220 154 1 5 1095 811 289 80 50 chr15 66886854 66887156 -36607818 - ORR1E LTR MaLR -41 318 8 5 1095 351 274 199 30 chr15 66887439 66887643 -36607331 + MLT1A0 LTR MaLR 127 364 -1 5 1095 253 261 138 0 chr15 66888484 66888549 -36606425 + MTEb LTR MaLR 292 365 -14 5 1095 1252 257 125 3 chr15 66888586 66888914 -36606060 - MTE2b LTR MaLR -8 371 4 5 1095 407 345 61 61 chr15 66888917 66889130 -36605844 - MLT1F1 LTR MaLR -354 215 3 5 1095 306 276 118 31 chr15 66890281 66890408 -36604566 + MLT1A1 LTR MaLR 268 405 -3 5 1095 228 236 67 117 chr15 66892770 66892850 -36602124 - MT2C_Mm LTR ERVL -200 275 205 5 1095 228 236 67 117 chr15 66893053 66893092 -36601882 - MT2C_Mm LTR ERVL -271 204 164 5 1095 870 248 196 16 chr15 66897537 66897849 -36597125 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 5 1095 3136 72 2 12 chr15 66898038 66898449 -36596525 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1095 288 343 53 45 chr15 66898449 66898686 -36596288 - MLT1H LTR MaLR -303 246 8 5 1095 2056 89 11 116 chr15 66899996 66900350 -36594624 - ORR1A2 LTR MaLR -10 317 1 5 1095 1696 214 74 72 chr15 66902030 66902448 -36592526 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1095 462 304 25 126 chr15 66903905 66903979 -36590995 - RMER10A LTR ERVL 0 442 388 5 1095 462 304 25 126 chr15 66904124 66904406 -36590568 - RMER10A LTR ERVL -55 387 122 5 1095 271 167 42 0 chr15 66904664 66904712 -36590262 + MTE2b LTR MaLR 1 50 -329 5 1095 1450 199 54 70 chr15 66905177 66905382 -36589592 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 175 5 1095 1450 199 54 70 chr15 66905452 66905633 -36589341 - ORR1C2 LTR MaLR -210 174 2 5 1095 1989 178 87 8 chr15 66906186 66906370 -36588604 + MTC LTR MaLR 1 196 -225 5 1095 1989 178 87 8 chr15 66906406 66906611 -36588363 + MTC LTR MaLR 197 420 -1 5 1095 263 370 102 46 chr15 66907000 66907283 -36587691 - MLT1E1A LTR MaLR -38 642 344 5 1095 2389 136 38 76 chr15 66909291 66909738 -36585236 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 5 1095 1295 261 42 6 chr15 66909797 66910110 -36584864 - MTEb LTR MaLR -54 325 2 5 1095 812 343 68 11 chr15 66911221 66911575 -36583399 + MLT1D LTR MaLR 36 409 -96 5 1095 453 301 108 14 chr15 66915304 66915452 -36579522 + ORR1E LTR MaLR 5 166 -193 5 1095 257 271 134 10 chr15 66915483 66915580 -36579394 + ORR1E LTR MaLR 236 344 -35 5 1095 394 244 23 19 chr15 66915574 66915682 -36579292 - MLT1D LTR MaLR -458 169 69 5 1095 1232 199 60 39 chr15 66915953 66916287 -36578687 + RLTR15 LTR ERVK 1 341 -18 5 1095 277 264 101 62 chr15 66918518 66918647 -36576327 + MLT1G3 LTR MaLR 268 401 -7 5 1095 635 226 80 7 chr15 66919093 66919231 -36575743 + MLT1G3 LTR MaLR 440 587 -8 5 1095 415 257 91 80 chr15 66919239 66919438 -36575536 - LTR85a LTR Gypsy? -489 213 13 6 1095 250 308 70 70 chr15 66920057 66920186 -36574788 - LTR50 LTR ERVL -615 180 52 6 1095 2504 81 72 0 chr15 66921478 66921813 -36573161 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 6 1095 335 324 124 21 chr15 66927289 66927434 -36567540 - MLT1G1 LTR MaLR -14 565 406 6 1095 259 333 0 12 chr15 66929908 66929993 -36564981 + MLT1I LTR MaLR 328 411 0 6 1095 230 277 67 78 chr15 66944705 66944795 -36550179 + MLT1D LTR MaLR 407 495 -10 6 1095 356 284 84 56 chr15 66946084 66946263 -36548711 + MTEa LTR MaLR 189 372 -7 6 1095 840 299 92 9 chr15 66949713 66949942 -36545032 + MTEa LTR MaLR 71 318 -61 6 1095 389 298 97 0 chr15 66949951 66950065 -36544909 + ORR1E LTR MaLR 6 130 -229 6 1095 374 231 0 13 chr15 66950097 66950176 -36544798 + ORR1E LTR MaLR 302 379 0 6 1095 1370 242 88 3 chr15 66950453 66950793 -36544181 + ORR1D2 LTR MaLR 2 370 0 6 1095 242 176 39 0 chr15 66955150 66955201 -36539773 - RLTR22_Mus LTR ERVK -493 1315 1263 6 1095 875 239 17 62 chr15 66961984 66962225 -36532749 - MTE2a LTR MaLR 0 379 150 6 1095 282 272 57 28 chr15 66962395 66962501 -36532473 + RMER10A LTR ERVL 318 426 -16 6 1095 870 267 67 85 chr15 66962514 66962948 -36532026 - RMER10A LTR ERVL -16 426 1 6 1095 371 273 35 16 chr15 66962959 66963083 -36531891 - MTE2a LTR MaLR -191 188 64 6 1095 315 281 141 38 chr15 66963497 66963682 -36531292 + MLT1B LTR MaLR 178 381 -9 6 1095 2000 137 63 23 chr15 66967640 66967990 -36526984 + ORR1B2 LTR MaLR 1 364 -3 6 1095 333 179 0 82 chr15 66970725 66970798 -36524176 - RMER15 LTR ERVL -422 153 87 6 1095 2441 156 38 34 chr15 66970891 66971309 -36523665 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 6 1096 916 296 77 75 chr15 66979504 66979573 -36515401 + RMER5 LTR ERV1 49 111 -423 6 1096 916 296 77 75 chr15 66979782 66980180 -36514794 + RMER5 LTR ERV1 112 517 -17 6 1096 1390 189 130 42 chr15 66981642 66981838 -36513136 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 157 6 1096 1390 189 130 42 chr15 66981882 66982038 -36512936 - ORR1C2 LTR MaLR -228 156 1 6 1096 422 286 16 39 chr15 66983691 66983808 -36511166 + ORR1E LTR MaLR 1 126 -244 6 1096 226 297 114 72 chr15 66983852 66983908 -36511066 + ORR1E LTR MaLR 127 181 -189 6 1096 227 310 91 11 chr15 66985366 66985454 -36509520 + MLT1H LTR MaLR 43 137 -412 6 1096 3466 54 75 0 chr15 66988584 66989026 -36505948 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1096 2710 121 13 0 chr15 66990205 66990594 -36504380 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1096 249 339 36 80 chr15 66996377 66996515 -36498459 - MT2B2 LTR ERVL -347 237 106 7 1096 300 282 8 76 chr15 67001779 67001898 -36493076 + MLT1A1 LTR MaLR 286 396 -12 4 1096 290 302 43 8 chr15 67011596 67011713 -36483261 - RMER15 LTR ERVL -18 557 437 1 1096 275 305 32 41 chr15 67013255 67013378 -36481596 + MLT1K LTR MaLR 455 576 -19 1 1096 283 291 111 21 chr15 67014031 67014175 -36480799 - MLT1C LTR MaLR -305 162 6 1 1096 814 309 22 69 chr15 67016244 67016606 -36478368 - ORR1E LTR MaLR -13 346 2 1 1096 3428 31 5 0 chr15 67018226 67018617 -36476357 + MTA_Mm LTR MaLR 4 396 0 2 1096 1068 236 153 9 chr15 67021213 67021534 -36473440 + ORR1D2 LTR MaLR 4 370 0 3 1096 1382 219 45 21 chr15 67022937 67023273 -36471701 + ORR1D1 LTR MaLR 1 344 -30 3 1096 667 92 10 0 chr15 67024235 67024333 -36470641 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 231 3 1096 1343 128 0 107 chr15 67024711 67024974 -36470000 - ORR1A4 LTR MaLR -94 235 1 3 1096 4560 57 39 5 chr15 67028458 67029026 -36465948 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 4 1096 283 254 70 0 chr15 67037199 67037270 -36457704 + ORR1D1 LTR MaLR 106 181 -193 5 1096 897 217 26 0 chr15 67037353 67037542 -36457432 + ORR1D1 LTR MaLR 173 366 -8 5 1096 612 195 16 0 chr15 67037747 67037870 -36457104 + ORR1C2 LTR MaLR 260 384 0 5 1096 4434 172 98 4 chr15 67048196 67048978 -36445996 - RMER13A LTR ERVK 0 860 5 6 1096 1482 183 120 75 chr15 67050593 67050721 -36444253 + MTD LTR MaLR 1 120 -299 7 1096 1482 183 120 75 chr15 67050910 67051182 -36443792 + MTD LTR MaLR 121 419 0 7 1096 1522 223 79 8 chr15 67056725 67057100 -36437874 + MTD LTR MaLR 23 405 -14 7 1096 713 253 57 111 chr15 67058822 67058858 -36436116 - RLTR11A LTR ERVK -33 495 460 7 1096 713 253 57 111 chr15 67058905 67059201 -36435773 - RLTR11A LTR ERVK -69 459 182 7 1096 404 252 15 44 chr15 67059206 67059343 -36435631 + RLTR11A LTR ERVK 379 511 -17 8 1096 1879 201 27 25 chr15 67062478 67062881 -36432093 + MTB_Mm LTR MaLR 4 407 0 8 1096 293 261 267 56 chr15 67064912 67065107 -36429867 - MLT1D LTR MaLR -10 495 260 9 1096 1550 208 49 33 chr15 67066220 67066588 -36428386 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 1096 1246 270 22 34 chr15 67066588 67066937 -36428037 - ORR1E LTR MaLR -10 349 4 9 1096 249 253 72 0 chr15 67069467 67069550 -36425424 + MTEa LTR MaLR 288 376 -3 9 1096 445 376 93 25 chr15 67070167 67070532 -36424442 + MLT1I LTR MaLR 22 411 0 9 1096 1991 182 80 10 chr15 67075816 67076204 -36418770 + MTC LTR MaLR 5 419 -2 1 1096 1056 264 14 113 chr15 67078792 67079207 -36415767 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 1 1096 1007 282 74 44 chr15 67085895 67086259 -36408715 + MTE2b LTR MaLR 1 375 -4 1 1096 891 269 81 43 chr15 67094248 67094594 -36400380 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1096 515 253 112 162 chr15 67104817 67105155 -36389819 + MTE2b LTR MaLR 1 320 -59 1 1096 642 217 7 7 chr15 67105155 67105294 -36389680 + MTD LTR MaLR 3 141 -278 1 1097 1311 213 71 51 chr15 67110492 67110844 -36384130 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1097 3319 34 21 3 chr15 67113977 67114366 -36380608 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1097 477 333 71 18 chr15 67116058 67116339 -36378635 - MLT1D LTR MaLR -7 498 203 1 1097 483 329 76 67 chr15 67117276 67117483 -36377491 - ORR1E LTR MaLR 0 379 153 1 1097 3133 63 2 8 chr15 67117483 67117881 -36377093 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1097 8296 70 11 5 chr15 67117881 67118972 -36376002 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1097 3104 56 2 12 chr15 67118972 67119372 -36375602 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1097 483 326 80 77 chr15 67119372 67119520 -36375454 - ORR1E LTR MaLR -207 152 3 1 1097 1619 153 127 3 chr15 67122803 67123118 -36371856 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 1 1097 2248 101 3 0 chr15 67124016 67124334 -36370640 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1097 2028 161 22 14 chr15 67124461 67124825 -36370149 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1097 3449 40 0 0 chr15 67133999 67134395 -36360579 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1097 310 317 43 21 chr15 67135775 67135962 -36359012 + RMER15 LTR ERVL 370 560 -15 1 1097 290 303 0 0 chr15 67136188 67136264 -36358710 - MLT1N2 LTR MaLR -369 193 118 1 1097 232 176 61 98 chr15 67136770 67136852 -36358122 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 318 1 1097 322 248 85 42 chr15 67146744 67146862 -36348112 - MT2A LTR ERVL -410 123 1 2 1097 557 97 0 28 chr15 67149920 67150026 -36344948 - RMER17B LTR ERVK -498 460 358 2 1097 262 247 45 126 chr15 67153233 67153344 -36341630 + RLTR24 LTR ERV1 353 454 -75 2 1097 462 374 78 36 chr15 67153854 67154365 -36340609 + MLT1F2 LTR MaLR 12 546 -14 2 1097 247 362 98 80 chr15 67166868 67167144 -36327830 + MLT1H1 LTR MaLR 69 349 -206 2 1097 337 254 96 101 chr15 67171422 67171610 -36323364 + RMER10A LTR ERVL 13 199 -243 2 1097 262 271 71 30 chr15 67172195 67172294 -36322680 + RMER10A LTR ERVL 315 417 -25 2 1097 877 272 58 80 chr15 67172316 67172466 -36322508 + MLT1A0 LTR MaLR 11 167 -198 2 1097 877 272 58 80 chr15 67172658 67172870 -36322104 + MLT1A0 LTR MaLR 168 365 0 2 1097 4490 134 51 6 chr15 67176571 67177276 -36317698 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 2 1097 461 239 25 25 chr15 67178740 67178860 -36316114 + MTD LTR MaLR 1 120 -299 2 1097 1020 271 0 17 chr15 67180558 67180798 -36314176 + MTD LTR MaLR 111 346 -73 2 1097 832 281 135 30 chr15 67181267 67181630 -36313344 + MLT1A1 LTR MaLR 8 408 0 2 1097 265 295 10 93 chr15 67182247 67182344 -36312630 + MT2B LTR ERVL 169 257 -344 2 1097 2442 139 8 83 chr15 67182497 67182976 -36311998 + RMER6B LTR ERVK 1 443 -18 2 1097 703 206 27 32 chr15 67183670 67183856 -36311118 - RMER15 LTR ERVL -348 227 43 2 1097 335 349 132 37 chr15 67185250 67185628 -36309346 - MLT1C LTR MaLR 0 467 54 2 1097 335 313 112 45 chr15 67186629 67186853 -36308121 - MLT1C LTR MaLR 0 467 229 2 1097 600 309 70 0 chr15 67187416 67187617 -36307357 + MTE2b LTR MaLR 1 215 -164 2 1097 258 284 14 0 chr15 67191664 67191738 -36303236 - ORR1E LTR MaLR -16 363 289 2 1097 286 288 0 0 chr15 67192000 67192073 -36302901 + RMER10B LTR ERVL 269 341 -57 2 1097 849 278 43 28 chr15 67192126 67192381 -36302593 - ORR1E LTR MaLR -100 259 1 2 1097 1630 230 47 11 chr15 67195302 67195663 -36299311 + MTEb LTR MaLR 3 376 -3 2 1097 1548 143 24 31 chr15 67198483 67198771 -36296203 + ORR1C2 LTR MaLR 99 384 0 2 1097 233 332 45 79 chr15 67199683 67199974 -36295000 + RMER10A LTR ERVL 18 298 -144 2 1097 1456 180 44 19 chr15 67200401 67200718 -36294256 - ORR1D1 LTR MaLR -49 325 1 2 1097 423 337 62 31 chr15 67203338 67203531 -36291443 + MLT2B2 LTR ERVL 364 562 0 2 1097 269 349 95 74 chr15 67204133 67204458 -36290516 - MLT1K LTR MaLR -223 372 41 2 1097 2210 127 12 0 chr15 67206152 67206475 -36288499 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1097 466 283 158 4 chr15 67207315 67207549 -36287425 - RMER15 LTR ERVL -3 572 303 2 1097 245 357 90 59 chr15 67212752 67213008 -36281966 - MLT1J2 LTR MaLR -2 446 183 2 1097 2056 136 20 14 chr15 67213015 67213372 -36281602 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 2 1097 922 192 14 19 chr15 67213376 67213588 -36281386 - RLTR12A LTR ERVK -23 545 335 2 1097 1528 196 13 16 chr15 67213683 67213999 -36280975 - RLTR12A LTR ERVK -253 315 1 2 1097 516 294 232 18 chr15 67213999 67214279 -36280695 + MTEa LTR MaLR 38 377 -2 2 1097 244 224 106 10 chr15 67226572 67226693 -36268281 + RLTR13D3 LTR ERVK 981 1072 -42 3 1097 321 300 54 9 chr15 67228862 67228973 -36266001 - MTEa LTR MaLR -9 370 255 3 1097 274 336 35 28 chr15 67229024 67229165 -36265809 - MTEa LTR MaLR -154 205 64 3 1097 2059 174 46 5 chr15 67231266 67231658 -36263316 - MTC LTR MaLR -9 412 5 3 1097 439 301 53 94 chr15 67233007 67233444 -36261530 + RMER10A LTR ERVL 12 430 -12 3 1097 241 322 40 33 chr15 67236474 67236625 -36258349 - RMER12 LTR ERVK -467 855 704 3 1098 1181 264 36 58 chr15 67242465 67242827 -36252147 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 3 1098 649 278 85 54 chr15 67243136 67243467 -36251507 - MTEa LTR MaLR 0 379 39 3 1098 278 292 155 27 chr15 67245655 67245803 -36249171 - LTR16A LTR ERVL -272 179 13 3 1098 1058 264 121 3 chr15 67245925 67246256 -36248718 + MTE2b LTR MaLR 1 370 -9 3 1098 1534 177 25 106 chr15 67250159 67250564 -36244410 + RMER5 LTR ERV1 13 384 -150 3 1098 333 240 51 20 chr15 67250845 67250943 -36244031 + RMER5 LTR ERV1 423 523 -11 3 1098 1024 314 31 3 chr15 67252946 67253265 -36241709 + MTE2b LTR MaLR 13 340 -39 3 1098 269 359 68 68 chr15 67254742 67255139 -36239835 - LTR33A LTR ERVL -2 518 122 3 1098 279 323 45 90 chr15 67259653 67259830 -36235144 - HERV16-int LTR ERVL -1915 3081 2913 3 1098 579 278 81 30 chr15 67261489 67261686 -36233288 - MTD LTR MaLR -201 218 12 3 1098 241 282 28 0 chr15 67263523 67263594 -36231380 + MTEa LTR MaLR 294 366 -13 3 1098 825 284 61 53 chr15 67267549 67267951 -36227023 - MTE2a LTR MaLR -14 405 1 3 1098 757 280 84 48 chr15 67271138 67271220 -36223754 + MLT2B4 LTR ERVL 1 83 -473 3 1098 757 280 84 48 chr15 67271426 67271737 -36223237 + MLT2B4 LTR ERVL 84 408 -148 3 1098 702 306 72 62 chr15 67272949 67273350 -36221624 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 1098 2222 78 3 3 chr15 67273527 67273837 -36221137 + ORR1A2 LTR MaLR 10 319 -8 3 1098 2750 197 82 82 chr15 67283895 67284697 -36210277 + RLTR40 LTR ERVK 3 804 -13 4 1098 1244 203 167 108 chr15 67284810 67285297 -36209677 + MT2B LTR ERVL 1 547 -54 4 1098 1244 203 167 108 chr15 67285404 67285479 -36209495 + MT2B LTR ERVL 548 596 -5 4 1098 1776 158 14 0 chr15 67288825 67289122 -36205852 + ORR1A4 LTR MaLR 1 301 -28 4 1098 362 281 93 87 chr15 67294530 67294713 -36200261 - MLT1G1 LTR MaLR -1 578 395 4 1098 295 377 46 13 chr15 67294706 67294859 -36200115 - MLT1G1 LTR MaLR -313 236 79 4 1098 484 350 27 62 chr15 67294988 67295087 -36199887 - MLT1G1-int LTR MaLR -64 1345 1252 4 1098 1751 238 44 35 chr15 67295087 67295609 -36199365 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 4 1098 484 350 27 62 chr15 67295609 67295768 -36199206 - MLT1G1-int LTR MaLR -158 1251 1096 4 1098 758 279 44 118 chr15 67295919 67296326 -36198648 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 4 1098 267 368 57 0 chr15 67299669 67299775 -36195199 - LTR16A1 LTR ERVL -5 451 340 4 1098 2597 152 12 2 chr15 67302528 67302937 -36192037 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1098 5412 76 58 117 chr15 67303279 67304228 -36190746 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 4 1098 726 236 78 208 chr15 67308593 67309026 -36185948 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 4 1098 518 291 57 63 chr15 67311348 67311506 -36183468 - MTEa LTR MaLR -222 157 1 4 1098 760 300 36 46 chr15 67313485 67313897 -36181077 + MLT1A1 LTR MaLR 1 408 0 4 1098 298 316 122 70 chr15 67316097 67316540 -36178434 - RMER5 LTR ERV1 -47 487 22 4 1098 385 298 44 30 chr15 67319177 67319312 -36175662 + RLTR14 LTR ERV1 246 382 0 4 1098 265 340 39 20 chr15 67326044 67326146 -36168828 - LTR16A LTR ERVL 0 451 348 4 1098 382 331 13 33 chr15 67334567 67334717 -36160257 - RMER15 LTR ERVL -130 445 299 4 1098 1104 334 63 52 chr15 67334932 67335770 -36159204 - RMER15-int LTR ERVL -8 4991 4145 4 1098 257 392 0 10 chr15 67336125 67336223 -36158751 - RMER15-int LTR ERVL -3190 1809 1713 4 1098 948 304 96 69 chr15 67336435 67336652 -36158322 - RMER15-int LTR ERVL -3418 1581 1380 4 1098 948 304 96 69 chr15 67336719 67337084 -36157890 - RMER15-int LTR ERVL -3620 1379 983 4 1098 259 350 16 16 chr15 67337148 67337273 -36157701 - RMER15-int LTR ERVL -4163 836 712 4 1098 624 313 69 55 chr15 67337515 67337894 -36157080 - RMER15-int LTR ERVL -4601 398 15 4 1098 512 342 79 15 chr15 67337913 67338180 -36156794 - RMER15 LTR ERVL -16 559 276 4 1098 249 284 61 40 chr15 67342569 67342668 -36152306 - LTR33 LTR ERVL -22 493 393 4 1098 525 291 7 22 chr15 67345460 67345597 -36149377 - ORR1E LTR MaLR -224 135 1 4 1098 1124 244 34 128 chr15 67348292 67348705 -36146269 - MTE2b LTR MaLR -1 378 5 4 1098 1467 260 51 8 chr15 67350718 67351113 -36143861 + MTD LTR MaLR 8 419 0 4 1098 1186 233 60 36 chr15 67355768 67356133 -36138841 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1098 288 204 230 44 chr15 67356955 67357068 -36137906 + MLT1B LTR MaLR 6 139 -251 5 1098 3859 184 92 77 chr15 67361845 67362733 -36132241 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 5 1098 342 252 18 88 chr15 67362901 67363014 -36131960 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1218 5 1098 319 304 62 7 chr15 67363109 67363255 -36131719 - RLTR22_Mur LTR ERVK -275 1573 1420 5 1098 1347 181 127 106 chr15 67363234 67363667 -36131307 - RMER12 LTR ERVK -412 910 469 5 1098 2237 149 35 105 chr15 67369790 67370306 -36124668 - RMER12 LTR ERVK -842 480 1 5 1099 230 388 43 91 chr15 67372701 67372911 -36122063 + LTR16A1 LTR ERVL 81 285 -171 5 1099 2972 66 8 22 chr15 67372911 67373313 -36121661 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1099 230 388 43 91 chr15 67373313 67373332 -36121642 + LTR16A1 LTR ERVL 286 298 -158 5 1099 513 286 76 81 chr15 67373579 67373960 -36121014 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 1099 1069 239 29 110 chr15 67379376 67379785 -36115189 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 5 1099 558 253 98 49 chr15 67386878 67387061 -36107913 + MLT1D LTR MaLR 31 222 -283 5 1099 584 297 25 20 chr15 67387083 67387279 -36107695 + MLT1D LTR MaLR 305 501 -4 5 1099 228 286 18 0 chr15 67387506 67387562 -36107412 + LTR78 LTR ERV1 309 365 -939 5 1099 466 308 62 46 chr15 67388365 67388624 -36106350 + MLT1C LTR MaLR 69 331 -136 5 1099 226 247 89 40 chr15 67391500 67391601 -36103373 - LTR9 LTR ERV1 -380 232 127 5 1099 1978 205 25 23 chr15 67396772 67397211 -36097763 - BGLII_B LTR ERVK -1 440 1 5 1099 2763 79 19 3 chr15 67417217 67417596 -36077378 - MTB LTR MaLR -15 385 1 5 1099 2107 184 54 3 chr15 67419050 67419436 -36075538 + MTC LTR MaLR 14 419 -2 6 1099 787 170 88 0 chr15 67419438 67419585 -36075389 + MTC-int LTR MaLR 1 160 -1098 6 1099 1432 225 129 47 chr15 67420566 67421009 -36073965 + MTC-int LTR MaLR 145 623 -635 6 1099 787 241 13 48 chr15 67424452 67424679 -36070295 + MLT2C2 LTR ERVL 9 227 -237 6 1099 302 200 18 0 chr15 67427137 67427192 -36067782 + MLT1A1 LTR MaLR 94 149 -259 6 1099 347 348 101 14 chr15 67428820 67429027 -36065947 + RMER15 LTR ERVL 337 561 -14 6 1099 679 312 90 55 chr15 67438717 67439063 -36055911 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 6 1099 1445 252 135 11 chr15 67447935 67448465 -36046509 + RMER20B LTR ERVK 10 605 -22 6 1099 961 253 39 67 chr15 67449919 67450330 -36044644 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 414 -27 6 1099 3199 43 10 0 chr15 67451673 67452065 -36042909 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1099 2023 160 39 34 chr15 67453361 67453743 -36041231 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 1099 301 280 76 48 chr15 67455520 67455625 -36039349 - MER77 LTR ERVL -269 338 231 6 1099 339 262 38 0 chr15 67455546 67455626 -36039348 - MER21B LTR ERV1 -554 309 227 6 1099 239 380 14 42 chr15 67462851 67462994 -36031980 - LTR33A_ LTR ERVL -352 179 41 6 1099 728 324 69 47 chr15 67467806 67468123 -36026851 - MLT1F LTR MaLR -144 404 81 6 1099 1689 224 69 8 chr15 67470116 67470441 -36024533 + MTD LTR MaLR 4 351 -68 6 1099 1689 224 69 8 chr15 67470469 67470535 -36024439 + MTD LTR MaLR 352 418 -1 6 1099 443 333 66 24 chr15 67470939 67471151 -36023823 - RMER15 LTR ERVL -19 556 336 6 1099 543 309 82 6 chr15 67481629 67481811 -36013163 - ORR1E-int LTR MaLR -640 730 535 6 1099 1255 214 135 40 chr15 67481884 67482254 -36012720 - ORR1E-int LTR MaLR -965 405 1 6 1099 727 324 52 20 chr15 67482256 67482600 -36012374 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 6 1099 317 277 49 104 chr15 67484535 67484766 -36010208 - MLT1E3 LTR MaLR -8 645 421 6 1100 2747 192 73 18 chr15 67504973 67505518 -35989456 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 5 1100 276 256 78 0 chr15 67505621 67505711 -35989263 - ERVL-B4-int LTR ERVL -36 5678 5582 6 1100 245 338 0 14 chr15 67505711 67505780 -35989194 - MTD-int LTR MaLR -120 1460 1393 7 1100 902 214 215 11 chr15 67508722 67508982 -35985992 + MTD LTR MaLR 107 419 0 1 1100 2746 254 77 74 chr15 67511173 67512114 -35982860 - MTD-int LTR MaLR -11 1247 305 7 1100 541 291 59 72 chr15 67512398 67512635 -35982339 - MTD-int LTR MaLR -1023 235 2 7 1100 1259 276 57 6 chr15 67512636 67512968 -35982006 - MTD LTR MaLR 0 419 71 7 1100 231 360 11 0 chr15 67513020 67513109 -35981865 + MLT1A1 LTR MaLR 3 92 -316 1 1100 678 149 133 3 chr15 67515934 67516067 -35978907 - ORR1D2 LTR MaLR -11 348 194 2 1100 829 231 103 24 chr15 67516434 67516647 -35978327 + MTEb LTR MaLR 1 230 -149 2 1100 707 274 32 58 chr15 67516643 67516833 -35978141 - ORR1D2 LTR MaLR -185 185 1 2 1100 238 355 120 8 chr15 67518771 67518896 -35976078 + LTR33A_ LTR ERVL 68 206 -325 2 1100 431 248 120 7 chr15 67521910 67522060 -35972914 + MLT2C1 LTR ERVL 3 169 -228 3 1100 241 275 196 11 chr15 67522400 67522492 -35972482 + MLT2C1 LTR ERVL 182 290 -174 3 1100 661 211 188 54 chr15 67528095 67528335 -35966639 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 140 4 1100 1793 169 15 24 chr15 67528376 67528754 -35966220 - RLTR45-int LTR ERVK -202 7042 6590 4 1100 612 334 78 33 chr15 67529916 67530250 -35964724 - MLT1A LTR MaLR 0 374 26 4 1100 478 278 168 75 chr15 67532917 67533185 -35961789 + MLT1A0 LTR MaLR 54 346 -19 5 1100 1909 151 39 127 chr15 67533812 67534244 -35960730 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1100 382 296 135 50 chr15 67534531 67534812 -35960162 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3536 2178 1874 5 1100 400 308 52 78 chr15 67535048 67535280 -35959694 + MER31B LTR ERV1 211 436 -30 5 1100 480 315 0 0 chr15 67538937 67539048 -35955926 + MTEa LTR MaLR 18 128 -251 6 1100 2110 160 0 3 chr15 67539060 67539399 -35955575 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 6 1100 629 298 44 56 chr15 67539399 67539648 -35955326 + MTEa LTR MaLR 132 377 -2 6 1100 391 165 12 17 chr15 67545993 67546075 -35948899 - RMER13B LTR ERVK -879 79 1 6 1100 243 295 110 50 chr15 67550362 67550462 -35944512 + MLT1H LTR MaLR 106 211 -338 7 1100 285 351 104 30 chr15 67553272 67553407 -35941567 + MLT1I LTR MaLR 72 216 -195 8 1100 265 293 114 51 chr15 67561853 67562029 -35932945 - MLT1E2 LTR MaLR -293 334 148 9 1100 258 291 12 25 chr15 67563056 67563137 -35931837 + LTR16A1 LTR ERVL 370 449 -7 9 1100 753 214 190 25 chr15 67564580 67564901 -35930073 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1100 2910 34 2 149 chr15 67565384 67565839 -35929135 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 1100 12181 29 7 40 chr15 67565851 67567936 -35927038 + RLTR10-int LTR ERVK 41 1984 -3 1 1100 3028 31 2 116 chr15 67567938 67568378 -35926596 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1100 298 343 14 21 chr15 67570812 67570955 -35924019 - MLT2F LTR ERVL -520 143 2 1 1100 575 306 121 46 chr15 67574947 67575228 -35919746 - RMER15 LTR ERVL -1 574 273 1 1100 306 260 69 50 chr15 67576112 67576213 -35918761 + MLT1A1 LTR MaLR 2 104 -304 1 1100 1364 243 110 6 chr15 67576469 67576833 -35918141 + MTD LTR MaLR 1 402 -17 1 1100 460 117 0 13 chr15 67577227 67577305 -35917669 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 399 1 1100 3034 49 29 15 chr15 67577619 67578031 -35916943 - MT2C_Mm LTR ERVL -57 418 1 1 1100 261 306 142 59 chr15 67581089 67581308 -35913666 - RMER15 LTR ERVL -2 573 337 1 1100 3010 82 17 12 chr15 67588923 67589328 -35905646 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1100 357 325 57 13 chr15 67592987 67593146 -35901828 - MLT1D LTR MaLR -80 425 260 1 1100 709 289 114 17 chr15 67597213 67597229 -35897745 - MER31A LTR ERV1 -56 429 415 1 1100 709 289 114 17 chr15 67597271 67597543 -35897431 - MER31A LTR ERV1 -71 414 113 1 1100 834 295 105 36 chr15 67599223 67599557 -35895417 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 1 1100 814 233 24 63 chr15 67600497 67600613 -35894361 + RMER16 LTR ERVK 289 395 -138 1 1100 814 233 24 63 chr15 67600968 67601103 -35893871 + RMER16 LTR ERVK 396 530 -3 1 1100 1243 253 104 9 chr15 67604091 67604426 -35890548 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 1 1100 1812 184 16 16 chr15 67607603 67607967 -35887007 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 3 1 1100 292 158 88 0 chr15 67607967 67608024 -35886950 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1370 1309 1 1100 721 144 0 53 chr15 67608010 67608142 -35886832 - ORR1B2 LTR MaLR -269 125 1 1 1100 1911 191 36 25 chr15 67615393 67615786 -35879188 + MTB_Mm LTR MaLR 3 399 -8 1 1100 245 215 191 27 chr15 67617617 67617727 -35877247 + MLT1A LTR MaLR 4 131 -259 1 1100 385 373 6 17 chr15 67618083 67618263 -35876711 + MLT1A LTR MaLR 197 374 0 1 1100 1764 208 74 15 chr15 67623457 67623847 -35871127 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 1 1100 2849 61 0 0 chr15 67630735 67631081 -35863893 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 2 1101 1022 291 31 25 chr15 67642738 67643081 -35851893 + MTD LTR MaLR 3 335 -44 2 1101 3082 180 71 16 chr15 67643773 67644382 -35850592 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 1 2 1101 590 182 0 20 chr15 67647168 67647269 -35847705 - RMER20B LTR ERVK 0 627 529 2 1101 1538 164 73 16 chr15 67647261 67647604 -35847370 - RMER20B LTR ERVK -213 414 1 2 1101 484 201 44 77 chr15 67647796 67647957 -35847017 - RMER17B LTR ERVK -396 510 326 2 1101 331 253 27 93 chr15 67648011 67648053 -35846921 - RMER17B LTR ERVK -527 379 340 2 1101 873 212 85 0 chr15 67649455 67649644 -35845330 + ORR1C1 LTR MaLR 167 371 -7 2 1101 913 246 46 49 chr15 67653593 67653939 -35841035 - RLTR15 LTR ERVK -14 345 1 2 1101 618 195 0 34 chr15 67657028 67657145 -35837829 - RMER20A LTR ERVK -393 123 11 2 1101 270 375 73 62 chr15 67672782 67672961 -35822013 - MLT1H1 LTR MaLR -23 572 392 2 1101 312 363 51 56 chr15 67673038 67673254 -35821720 - MLT1H1 LTR MaLR -207 348 134 2 1101 686 275 46 70 chr15 67673762 67674090 -35820884 + RLTR15 LTR ERVK 1 320 -39 2 1101 1184 320 64 78 chr15 67678235 67678764 -35816210 + RMER15 LTR ERVL 1 522 -53 2 1101 393 319 135 91 chr15 67678832 67679190 -35815784 + MLT1A1 LTR MaLR 25 374 0 2 1101 309 346 5 84 chr15 67680246 67680461 -35814513 + MLT1J2 LTR MaLR 109 310 -134 2 1101 549 287 83 12 chr15 67683184 67683353 -35811621 + MLT1F LTR MaLR 1 181 -367 2 1101 660 355 53 17 chr15 67683368 67683669 -35811305 + MLT1F LTR MaLR 237 548 0 2 1101 1752 199 20 70 chr15 67684970 67685429 -35809545 - RMER10A LTR ERVL -3 439 4 2 1101 228 303 87 92 chr15 67694874 67695070 -35799904 + MLT1H-int LTR MaLR 871 1065 -344 2 1101 2371 98 109 3 chr15 67700905 67701253 -35793721 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 3 1101 256 139 23 0 chr15 67705933 67705976 -35788998 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 331 3 1101 1093 301 14 20 chr15 67706276 67706610 -35788364 + ORR1E LTR MaLR 10 367 -12 3 1101 577 295 77 74 chr15 67707177 67707528 -35787446 + MLT1B LTR MaLR 35 386 -4 3 1101 1473 229 126 3 chr15 67709375 67709748 -35785226 + MTD LTR MaLR 1 419 0 3 1101 804 287 144 34 chr15 67711121 67711503 -35783471 + MLT1C LTR MaLR 44 467 0 3 1101 939 280 109 29 chr15 67716614 67716927 -35778047 + MTD LTR MaLR 46 383 -36 3 1101 279 294 0 0 chr15 67718860 67718928 -35776046 + MLT1E1 LTR MaLR 568 635 -19 3 1101 1803 187 93 79 chr15 67719360 67719854 -35775120 + RLTR11A LTR ERVK 1 501 -27 3 1101 838 272 63 96 chr15 67724480 67724846 -35770128 + ORR1E LTR MaLR 6 359 0 3 1101 405 308 33 70 chr15 67726544 67726785 -35768189 + LTR16C LTR ERVL 257 488 -1 3 1101 340 289 119 125 chr15 67731353 67731681 -35763293 + ORR1E LTR MaLR 32 357 -2 3 1101 510 353 38 23 chr15 67731798 67732062 -35762912 - LTR16C LTR ERVL -78 411 144 3 1101 400 309 65 7 chr15 67754967 67755120 -35739854 - MER70B LTR ERVL -415 163 2 3 1101 1504 246 40 43 chr15 67758974 67759344 -35735630 + ORR1C1 LTR MaLR 5 373 -5 3 1101 246 330 143 33 chr15 67760312 67760494 -35734480 - ORR1E LTR MaLR -115 244 43 3 1101 480 369 25 5 chr15 67761701 67761900 -35733074 + LTR16C LTR ERVL 275 477 -12 3 1101 1857 205 66 94 chr15 67763164 67763782 -35731192 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 3 1102 375 340 79 66 chr15 67765024 67765329 -35729645 + MLT1C LTR MaLR 2 310 -157 3 1102 247 316 79 0 chr15 67765528 67765604 -35729370 + MLT1C LTR MaLR 307 388 -117 3 1102 3274 174 17 52 chr15 67766668 67767317 -35727657 + RMER20B LTR ERVK 1 626 -1 3 1102 1498 138 112 147 chr15 67769038 67769412 -35725562 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 24 3 1102 397 346 36 7 chr15 67769435 67769572 -35725402 + MLT1J1 LTR MaLR 63 203 -241 3 1102 276 299 6 67 chr15 67770503 67770647 -35724327 - MLT1I LTR MaLR -223 188 59 3 1102 2089 158 81 18 chr15 67776761 67777142 -35717832 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 3 4 1102 4751 131 34 34 chr15 67778535 67779272 -35715702 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 1102 376 253 0 11 chr15 67781440 67781528 -35713446 - MTEb LTR MaLR -4 375 289 4 1102 614 303 122 21 chr15 67783552 67783879 -35711095 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 5 4 1102 7875 82 24 8 chr15 67788809 67789816 -35705158 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 4 1102 351 337 86 24 chr15 67793338 67793404 -35701570 + MuRRS4-int LTR ERV1 4663 4746 -317 4 1102 351 337 86 24 chr15 67793461 67793649 -35701325 + MuRRS4-int LTR ERV1 4747 4933 -130 4 1102 2232 85 154 0 chr15 67793730 67794119 -35700855 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 449 -83 4 1102 233 322 50 25 chr15 67794385 67794506 -35700468 + MTE2b LTR MaLR 241 364 -15 4 1102 5226 169 11 38 chr15 67802076 67803009 -35691965 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 4 1102 266 359 104 59 chr15 67805063 67805285 -35689689 - LTR16C LTR ERVL -113 376 145 4 1102 364 300 86 40 chr15 67805479 67805677 -35689297 + MLT1D LTR MaLR 34 240 -265 4 1102 429 293 85 11 chr15 67805711 67805887 -35689087 + MLT1D LTR MaLR 316 504 -1 4 1102 868 233 93 108 chr15 67806251 67806583 -35688391 - MTE2a LTR MaLR 0 379 53 4 1102 1293 256 13 78 chr15 67807138 67807319 -35687655 + MTEa LTR MaLR 11 187 -192 4 1102 1293 256 13 78 chr15 67807476 67807667 -35687307 + MTEa LTR MaLR 188 359 -20 4 1102 494 261 40 60 chr15 67812677 67812828 -35682146 - MTE2b LTR MaLR -6 373 226 4 1102 2402 171 12 10 chr15 67812830 67813238 -35681736 + MTC LTR MaLR 5 413 -8 4 1102 762 225 134 43 chr15 67813214 67813446 -35681528 - MTE2b LTR MaLR -115 264 12 4 1102 3390 61 23 0 chr15 67818622 67819013 -35675961 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1102 321 82 0 0 chr15 67819502 67819552 -35675422 + MTB LTR MaLR 215 264 -143 4 1102 2986 76 43 33 chr15 67824198 67824594 -35670380 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1102 1179 266 80 9 chr15 67824950 67825287 -35669687 + MLT1A0 LTR MaLR 1 361 -4 4 1102 3414 51 0 15 chr15 67832760 67833162 -35661812 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1102 3886 93 123 2 chr15 67834680 67835216 -35659758 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 5 1102 563 164 44 26 chr15 67838467 67838580 -35656394 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1000 5 1102 370 339 35 30 chr15 67838942 67839191 -35655783 - RLTR3_Mm LTR ERVK -522 806 459 5 1102 359 226 82 126 chr15 67839429 67839611 -35655363 - RLTR13D3 LTR ERVK -940 174 1 5 1102 2187 142 19 0 chr15 67839763 67840081 -35654893 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 1 5 1102 693 292 100 40 chr15 67843022 67843540 -35651434 - LTR48B LTR ERV1 -41 746 8 5 1102 802 235 43 11 chr15 67844545 67844730 -35650244 - MTEa LTR MaLR -188 191 1 5 1102 563 257 67 7 chr15 67844767 67844916 -35650058 + MTD LTR MaLR 262 419 0 5 1102 783 291 84 13 chr15 67846041 67846351 -35648623 + MLT1A0 LTR MaLR 34 365 0 5 1102 2405 113 3 12 chr15 67847248 67847578 -35647396 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1102 2094 143 38 3 chr15 67854987 67855302 -35639672 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 1102 1287 242 119 39 chr15 67856665 67857004 -35637970 + MTE2b LTR MaLR 11 370 0 5 1102 429 234 84 8 chr15 67857178 67857313 -35637661 - MTD LTR MaLR -2 417 261 5 1102 851 210 103 16 chr15 67858548 67858732 -35636242 - MTD LTR MaLR -209 210 11 5 1102 323 367 49 62 chr15 67859520 67859764 -35635210 + MLT1K LTR MaLR 79 319 -276 5 1102 284 357 75 20 chr15 67859789 67859935 -35635039 + MLT1K LTR MaLR 385 538 -57 5 1102 228 368 81 76 chr15 67860366 67860551 -35634423 + LTR16A1 LTR ERVL 6 191 -265 5 1102 669 315 70 28 chr15 67872899 67873258 -35621716 - ERVL-E-int LTR ERVL -1119 4548 4175 5 1102 329 328 66 50 chr15 67873418 67873659 -35621315 - ERVL-E-int LTR ERVL -2378 3289 3045 5 1102 251 314 118 59 chr15 67874402 67874656 -35620318 - ERVL-E-int LTR ERVL -2834 2833 2565 5 1102 553 342 118 51 chr15 67874688 67875258 -35619716 - ERVL-E-int LTR ERVL -3146 2521 1914 5 1102 1065 257 102 48 chr15 67885911 67886263 -35608711 + MTEa LTR MaLR 8 378 -1 5 1102 954 275 82 44 chr15 67893367 67893732 -35601242 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 5 1102 401 283 153 17 chr15 67894040 67894216 -35600758 - MLT2C1 LTR ERVL -172 225 26 5 1103 368 287 138 113 chr15 67895318 67895688 -35599286 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 1103 710 292 114 32 chr15 67897916 67898288 -35596686 + ORR1E LTR MaLR 2 359 0 5 1103 1851 160 25 64 chr15 67898466 67898631 -35596343 + ORR1B1 LTR MaLR 41 188 -206 5 1103 1851 160 25 64 chr15 67898697 67898891 -35596083 + ORR1B1 LTR MaLR 189 385 -9 5 1103 402 284 194 0 chr15 67899700 67899855 -35595119 - RMER15 LTR ERVL -20 555 371 5 1103 2841 113 21 2 chr15 67901093 67901526 -35593448 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 5 1103 278 227 176 7 chr15 67909330 67909472 -35585502 + RMER17C LTR ERVK 137 302 -108 5 1103 1837 159 0 13 chr15 67920865 67921164 -35573810 + MTC LTR MaLR 8 302 -119 5 1103 465 155 2 34 chr15 67924314 67924412 -35570562 - ORR1D2 LTR MaLR 0 419 293 5 1103 651 348 31 65 chr15 67924733 67925087 -35569887 - MLT1A0 LTR MaLR -20 345 4 5 1103 265 329 56 42 chr15 67929762 67929965 -35565009 + ORR1E LTR MaLR 18 215 -155 6 1103 2288 163 17 29 chr15 67937558 67937969 -35557005 + MTB_Mm LTR MaLR 2 407 0 6 1103 4612 178 64 26 chr15 67937969 67938966 -35556008 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 1171 -87 6 1103 1192 155 43 5 chr15 67938977 67939184 -35555790 + MTB_Mm LTR MaLR 193 407 0 6 1103 3757 125 9 60 chr15 67943343 67943975 -35550999 + MT2B LTR ERVL 2 601 0 6 1103 1607 194 77 34 chr15 67944915 67945268 -35549706 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 6 1103 896 296 138 5 chr15 67946131 67946572 -35548402 + MLT1D LTR MaLR 5 504 -1 6 1103 428 169 39 0 chr15 67950774 67950851 -35544123 - MTD LTR MaLR -1 418 339 6 1103 991 214 19 14 chr15 67950844 67951057 -35543917 - MTD LTR MaLR -200 219 6 6 1103 258 291 117 0 chr15 67967116 67967219 -35527755 - MER68 LTR ERVL -357 206 92 6 1103 250 260 101 47 chr15 67975611 67975740 -35519234 + MLT1D LTR MaLR 200 335 -170 6 1103 1790 149 128 3 chr15 67979859 67980195 -35514779 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 6 1103 3382 185 50 22 chr15 67980195 67981028 -35513946 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 522 6 1103 1350 172 187 22 chr15 67982330 67982651 -35512323 - ORR1C1 LTR MaLR 0 374 1 6 1103 3909 119 97 20 chr15 67985529 67986178 -35508796 - RMER6A LTR ERVK 0 756 62 6 1103 3909 119 97 20 chr15 67986211 67986263 -35508711 - RMER6A LTR ERVK -695 61 3 6 1103 475 335 124 24 chr15 67988914 67989333 -35505641 + MLT1D LTR MaLR 37 497 -8 6 1103 538 243 85 45 chr15 68007622 68007799 -35487175 - RMER15 LTR ERVL 0 575 392 1 1103 1605 187 114 26 chr15 68008997 68009349 -35485625 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 1 1103 1880 207 39 44 chr15 68017544 68017743 -35477231 + MTD LTR MaLR 2 209 -210 1 1103 1880 207 39 44 chr15 68017889 68018099 -35476875 + MTD LTR MaLR 210 409 -10 1 1103 488 283 45 108 chr15 68021578 68021854 -35473120 - MTEa LTR MaLR -4 375 84 2 1103 347 321 66 57 chr15 68023538 68023766 -35471208 - RMER15 LTR ERVL -7 568 339 2 1103 589 329 120 17 chr15 68023983 68024274 -35470700 + ORR1E LTR MaLR 39 359 0 2 1104 318 289 50 91 chr15 68028644 68028976 -35465998 + RMER17C LTR ERVK 1 376 -34 3 1104 428 378 48 0 chr15 68029547 68029735 -35465239 + LTR33 LTR ERVL 14 210 -305 3 1104 1860 185 52 8 chr15 68029777 68030143 -35464831 + RLTR14 LTR ERV1 1 382 0 3 1104 272 248 220 18 chr15 68031117 68031285 -35463689 + MTEb LTR MaLR 177 378 -1 3 1104 316 252 95 48 chr15 68032541 68032798 -35462176 + RMER10B LTR ERVL 18 287 -155 3 1104 2227 151 162 43 chr15 68034349 68034860 -35460114 + RMER15 LTR ERVL 4 575 0 3 1104 2976 146 50 0 chr15 68034923 68035418 -35459556 + RLTR28 LTR ERVL 2 521 -3 3 1104 1177 215 162 145 chr15 68040914 68041377 -35453597 + MT2B LTR ERVL 1 555 -46 5 1104 715 275 48 29 chr15 68047635 68047845 -35447129 + RMER15 LTR ERVL 348 561 -14 5 1104 2058 161 79 36 chr15 68050396 68050816 -35444158 + RMER10A LTR ERVL 5 442 0 6 1104 668 227 318 4 chr15 68060377 68060646 -35434328 - MTE2b LTR MaLR 0 370 18 8 1104 1923 128 103 17 chr15 68071321 68071670 -35423304 + ORR1C2 LTR MaLR 1 379 -5 9 1104 316 241 102 57 chr15 68079641 68079729 -35415245 - MTD-int LTR MaLR -342 916 831 1 1104 1143 207 159 54 chr15 68080035 68080414 -35414560 - MTD LTR MaLR -18 401 2 1 1104 453 184 26 0 chr15 68081474 68081550 -35413424 + ORR1E LTR MaLR 7 84 -275 1 1104 228 220 136 0 chr15 68081722 68081781 -35413193 + MTEb LTR MaLR 294 360 -19 1 1104 725 293 75 7 chr15 68082259 68082519 -35412455 + MTEa LTR MaLR 18 289 -90 1 1104 3263 51 2 8 chr15 68084356 68084754 -35410220 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1104 634 252 6 44 chr15 68085154 68085312 -35409662 + RMER5 LTR ERV1 1 152 -382 1 1104 1925 203 22 3 chr15 68085422 68085787 -35409187 + RMER5 LTR ERV1 163 534 0 1 1104 5399 119 27 27 chr15 68086279 68087166 -35407808 - RMER17D LTR ERVK -2 887 1 1 1104 667 218 87 12 chr15 68093763 68093935 -35401039 + RMER20B LTR ERVK 228 412 -215 1 1104 1922 113 23 104 chr15 68094219 68094603 -35400371 + RLTR15 LTR ERVK 1 353 -6 1 1104 1818 128 3 133 chr15 68096170 68096288 -35398686 + ORR1A4 LTR MaLR 1 95 -234 1 1104 4207 168 74 77 chr15 68096288 68097192 -35397782 + RMER19B LTR ERVK 2 902 0 1 1104 1818 128 3 133 chr15 68097192 68097442 -35397532 + ORR1A4 LTR MaLR 96 321 -8 1 1104 2032 164 84 16 chr15 68101184 68101567 -35393407 - MTC LTR MaLR 0 421 13 1 1104 642 152 118 29 chr15 68101571 68101741 -35393233 - MTC-int LTR MaLR -1 1257 1073 1 1104 443 336 67 51 chr15 68102062 68102316 -35392658 + MLT1B LTR MaLR 131 388 -2 1 1104 482 282 102 76 chr15 68117550 68117853 -35377121 - RLTR23 LTR ERV1 -21 409 99 1 1104 267 322 123 95 chr15 68120520 68120805 -35374169 + ORR1D2 LTR MaLR 78 370 0 1 1104 377 368 114 23 chr15 68120935 68121285 -35373689 + LTR16C LTR ERVL 73 454 -35 1 1104 286 249 253 30 chr15 68121328 68121494 -35373480 - RMER5 LTR ERV1 -327 207 5 1 1104 653 231 42 0 chr15 68123000 68123143 -35371831 - MTD LTR MaLR -122 297 149 1 1104 856 235 22 74 chr15 68123622 68123852 -35371122 - MTD LTR MaLR -8 411 194 1 1104 2085 199 46 2 chr15 68124613 68125007 -35369967 - MTD LTR MaLR -8 411 1 1 1104 587 290 98 5 chr15 68126699 68126914 -35368060 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 131 1 1104 2942 144 42 105 chr15 68126944 68127025 -35367949 + RMER15 LTR ERVL 2 75 -500 1 1104 2942 144 42 105 chr15 68127059 68127589 -35367385 + RMER15 LTR ERVL 76 575 0 1 1104 975 230 155 126 chr15 68128426 68128943 -35366031 - MT2A LTR ERVL 0 533 2 1 1104 2696 157 19 48 chr15 68133468 68134009 -35360965 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 5 1 1104 2847 143 25 80 chr15 68135840 68136388 -35358586 - RMER19B LTR ERVK 0 902 385 1 1104 7525 77 15 3 chr15 68136393 68137404 -35357570 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 1023 0 1 1104 1621 164 16 143 chr15 68137498 68137862 -35357112 - RMER19B LTR ERVK -584 318 1 1 1104 258 311 124 16 chr15 68139089 68139210 -35355764 - MLT1A1 LTR MaLR -274 134 1 1 1104 966 212 88 32 chr15 68156457 68156776 -35338198 - ORR1E LTR MaLR -8 371 19 2 1105 1696 314 106 33 chr15 68162835 68163568 -35331406 + MER21B LTR ERV1 20 806 -57 2 1105 987 214 170 25 chr15 68182452 68182769 -35312205 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 8 2 1105 1127 216 96 48 chr15 68197372 68197868 -35297106 - RMER4B LTR ERVK -14 571 17 2 1105 491 254 118 21 chr15 68198496 68198803 -35296171 + MTD LTR MaLR 34 419 0 2 1105 761 183 19 50 chr15 68199562 68199723 -35295251 + RMER16 LTR ERVK 1 156 -377 2 1105 1057 168 16 5 chr15 68206313 68206499 -35288475 + RMER16 LTR ERVK 346 533 0 2 1105 309 305 131 38 chr15 68210448 68210608 -35284366 + MLT1I LTR MaLR 170 344 -67 2 1105 584 369 65 30 chr15 68210697 68210957 -35284017 + MLT1I-int LTR MaLR 42 307 -1080 2 1105 4814 153 64 14 chr15 68210957 68211822 -35283152 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 2 1105 584 369 65 30 chr15 68211822 68211961 -35283013 + MLT1I-int LTR MaLR 308 455 -932 2 1105 475 264 122 24 chr15 68212460 68212639 -35282335 + ORR1E LTR MaLR 3 187 -187 2 1105 491 179 21 0 chr15 68215244 68215339 -35279635 + MTC LTR MaLR 7 103 -318 2 1105 1644 183 117 15 chr15 68215881 68216214 -35278760 + MTC LTR MaLR 1 367 -54 2 1105 1393 168 115 7 chr15 68216226 68216513 -35278461 + MTC LTR MaLR 104 421 0 2 1105 580 291 85 33 chr15 68217459 68217729 -35277245 - MLT1J LTR MaLR -161 351 68 2 1105 4635 133 18 109 chr15 68227382 68228374 -35266600 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 3 1105 460 298 76 6 chr15 68232333 68232505 -35262469 - MLT2D LTR ERVL -51 363 180 3 1105 2837 229 109 24 chr15 68234920 68235739 -35259235 + RMER19B LTR ERVK 1 888 -14 3 1105 2684 221 101 40 chr15 68242972 68243407 -35251567 - RMER13A LTR ERVK -21 839 384 3 1105 2684 221 101 40 chr15 68243555 68243910 -35251064 - RMER13A LTR ERVK -477 383 1 3 1105 265 295 42 0 chr15 68251462 68251557 -35243417 - MLT1C LTR MaLR -9 458 360 3 1105 392 317 24 24 chr15 68252742 68252865 -35242109 + MTEa LTR MaLR 48 170 -209 3 1105 328 319 129 16 chr15 68253373 68253567 -35241407 + RMER15 LTR ERVL 346 561 -14 3 1105 2770 349 62 33 chr15 68253619 68254184 -35240790 + MTEa-int LTR MaLR 1 582 -998 3 1105 2770 349 62 33 chr15 68254743 68255710 -35239264 + MTEa-int LTR MaLR 583 1578 -2 3 1105 397 340 67 51 chr15 68255713 68256033 -35238941 + MTEa LTR MaLR 2 335 -44 3 1105 1836 114 55 70 chr15 68256483 68256812 -35238162 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 3 3 1105 518 315 48 75 chr15 68261422 68261796 -35233178 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 2 3 1105 1535 176 68 68 chr15 68264634 68264821 -35230153 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 177 3 1105 1535 176 68 68 chr15 68264900 68265096 -35229878 - ORR1C2 LTR MaLR -208 176 1 3 1105 235 367 92 13 chr15 68270031 68270183 -35224791 - MLT1J2 LTR MaLR -4 444 281 3 1105 586 309 164 54 chr15 68270792 68270989 -35223985 + MLT2B3 LTR ERVL 1 237 -317 3 1105 2952 73 12 30 chr15 68270989 68271396 -35223578 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1105 586 309 164 54 chr15 68271396 68271660 -35223314 + MLT2B3 LTR ERVL 238 513 -41 3 1105 257 366 44 7 chr15 68279958 68280093 -35214881 + MLT1N2 LTR MaLR 67 206 -356 3 1105 326 295 49 21 chr15 68281377 68281519 -35213455 + MLT1F LTR MaLR 21 166 -382 3 1105 234 315 0 14 chr15 68281823 68281897 -35213077 + MLT1F LTR MaLR 183 255 -293 3 1105 228 120 160 0 chr15 68282042 68282092 -35212882 + MLT1F LTR MaLR 448 505 -43 3 1105 259 314 0 0 chr15 68287075 68287145 -35207829 + MLT1D LTR MaLR 3 72 -433 3 1105 482 294 171 21 chr15 68287363 68287703 -35207271 + MLT1D LTR MaLR 107 497 -8 3 1106 3788 60 17 0 chr15 68289885 68290352 -35204622 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 3 1106 1857 200 32 13 chr15 68291852 68292227 -35202747 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 3 1106 571 328 38 21 chr15 68292399 68292636 -35202338 - RLTR14-int LTR ERV1 -183 5134 4894 3 1106 552 214 16 8 chr15 68293295 68293422 -35201552 - RLTR14 LTR ERV1 -242 140 13 3 1106 423 245 135 20 chr15 68296204 68296372 -35198602 + ORR1E LTR MaLR 7 183 -187 3 1106 279 267 85 9 chr15 68296392 68296498 -35198476 + ORR1E LTR MaLR 261 374 -5 3 1106 382 349 53 68 chr15 68299071 68299412 -35195562 - MLT1A1 LTR MaLR -60 348 1 3 1106 292 338 60 84 chr15 68311221 68311376 -35183598 - MLT1E1A LTR MaLR -6 674 528 4 1106 292 342 62 83 chr15 68311428 68311552 -35183422 - MLT1E1A LTR MaLR -153 527 346 4 1106 1141 251 47 44 chr15 68312633 68313031 -35181943 + MTE2a LTR MaLR 13 405 -14 4 1106 312 330 54 27 chr15 68314410 68314522 -35180452 - LTR75 LTR ERVL -436 126 12 4 1106 831 248 153 22 chr15 68325640 68325954 -35169020 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 4 1106 660 257 44 6 chr15 68338611 68338791 -35156183 - MTE2a LTR MaLR 0 379 193 4 1106 277 314 32 8 chr15 68342675 68342800 -35152174 + ORR1E LTR MaLR 4 131 -228 4 1106 230 256 77 0 chr15 68342950 68343028 -35151946 + ORR1E LTR MaLR 293 376 -3 4 1106 308 351 23 46 chr15 68348853 68349026 -35145948 + MLT1H LTR MaLR 157 325 -224 4 1106 356 328 8 15 chr15 68352061 68352194 -35142780 + MLT1H LTR MaLR 418 549 0 4 1106 260 286 31 52 chr15 68358022 68358118 -35136856 + MLT2B3 LTR ERVL 24 117 -437 4 1106 421 232 186 38 chr15 68361214 68361444 -35133530 + MTD LTR MaLR 65 345 -55 4 1106 583 285 122 16 chr15 68361444 68361633 -35133341 + ORR1D2 LTR MaLR 1 209 -150 4 1106 568 179 115 46 chr15 68361774 68361959 -35133015 + ORR1D2 LTR MaLR 166 357 -17 4 1106 266 309 78 16 chr15 68364663 68364791 -35130183 + MLT1A1 LTR MaLR 268 403 -5 4 1106 2408 101 3 6 chr15 68373002 68373330 -35121644 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1106 234 342 78 9 chr15 68376102 68376217 -35118757 - MLT1E2 LTR MaLR -192 435 313 4 1106 2050 106 16 19 chr15 68378664 68378973 -35116001 + RLTR27 LTR ERVK 2 309 0 4 1106 2871 18 0 3 chr15 68388983 68389323 -35105651 - ORR1A0 LTR MaLR -7 339 1 5 1106 381 346 147 4 chr15 68392430 68392662 -35102312 - RMER15 LTR ERVL -15 560 296 5 1106 726 190 21 21 chr15 68392679 68392824 -35102150 - MTE2b LTR MaLR 0 379 235 5 1106 339 382 117 6 chr15 68401255 68401426 -35093548 + LTR16E2 LTR ERVL 97 286 -282 5 1106 334 157 60 13 chr15 68412103 68412200 -35082774 + MTEb LTR MaLR 256 376 -3 5 1106 573 368 111 44 chr15 68413252 68413775 -35081199 + MLT1E3 LTR MaLR 62 619 -5 5 1106 337 238 11 56 chr15 68414683 68414772 -35080202 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 290 5 1106 502 191 245 0 chr15 68414780 68414875 -35080099 - ORR1D1 LTR MaLR -191 183 64 5 1106 502 191 245 0 chr15 68415395 68415446 -35079528 - ORR1D1 LTR MaLR -311 63 3 5 1106 3242 23 0 0 chr15 68416907 68417253 -35077721 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 1106 295 357 48 60 chr15 68417421 68417588 -35077386 + MLT1F2 LTR MaLR 40 204 -356 5 1106 408 337 37 48 chr15 68417647 68417834 -35077140 + MLT1F2 LTR MaLR 314 498 -62 5 1107 364 98 16 16 chr15 68431662 68431724 -35063250 + RLTR25B LTR ERVK 967 1028 0 5 1107 3122 81 12 12 chr15 68433586 68433986 -35060988 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1107 368 382 35 48 chr15 68435182 68435413 -35059561 + ORR1E LTR MaLR 1 228 -131 5 1107 428 325 8 0 chr15 68442459 68442582 -35052392 + MTEa LTR MaLR 3 126 -233 5 1107 430 301 78 24 chr15 68442712 68442879 -35052095 + MTEa LTR MaLR 204 379 0 5 1107 1248 262 12 82 chr15 68444290 68444693 -35050281 + MTE2b LTR MaLR 5 379 0 5 1107 2520 68 3 58 chr15 68449277 68449623 -35045351 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1107 4745 139 16 46 chr15 68452974 68453896 -35041078 + RMER17A2 LTR ERVK 1 895 -11 6 1107 3352 38 5 0 chr15 68474237 68474631 -35020343 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1107 592 285 60 97 chr15 68478421 68478720 -35016254 + ORR1E LTR MaLR 3 290 -69 6 1107 794 221 78 16 chr15 68479191 68479384 -35015590 - MTEa LTR MaLR 0 379 175 6 1107 544 307 36 12 chr15 68479641 68479806 -35015168 - MTEa LTR MaLR -210 169 1 6 1107 269 236 25 127 chr15 68480935 68481097 -35013877 - MLT1F1 LTR MaLR 0 549 417 6 1107 226 359 56 25 chr15 68481157 68481317 -35013657 - MLT1F1 LTR MaLR -352 197 33 6 1107 630 301 53 71 chr15 68481376 68481601 -35013373 + MTE2a LTR MaLR 58 278 -101 6 1107 463 284 199 34 chr15 68481954 68482275 -35012699 + MLT1A1 LTR MaLR 33 406 -2 6 1107 1228 246 70 20 chr15 68482578 68482934 -35012040 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1107 308 192 0 161 chr15 68483366 68483484 -35011490 + MTE2b LTR MaLR 2 100 -279 6 1107 558 284 23 86 chr15 68483518 68483737 -35011237 + MTE2b LTR MaLR 81 285 -94 6 1107 1207 254 22 60 chr15 68483737 68484105 -35010869 + ORR1E LTR MaLR 1 354 -5 6 1107 381 240 10 0 chr15 68484110 68484210 -35010764 + MTE2b LTR MaLR 279 379 0 6 1107 299 281 21 10 chr15 68490989 68491086 -35003888 + MLT1H2 LTR MaLR 34 131 -358 6 1107 492 266 140 108 chr15 68491579 68491921 -35003053 - MTEa LTR MaLR -26 353 1 6 1107 352 157 70 14 chr15 68492336 68492407 -35002567 - ORR1B2 LTR MaLR -292 75 1 6 1107 435 298 47 21 chr15 68508774 68508966 -34986008 + ORR1E LTR MaLR 41 237 -122 5 1107 485 231 43 0 chr15 68509876 68509993 -34984981 - ORR1D1 LTR MaLR -250 124 3 6 1107 1304 188 66 113 chr15 68512011 68512390 -34982584 - MTEb LTR MaLR -17 362 2 1 1107 706 203 22 0 chr15 68513120 68513258 -34981716 + MTE2b LTR MaLR 102 242 -137 1 1107 2377 53 3 3 chr15 68513257 68513579 -34981395 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 33 354 -3 1 1107 706 308 82 57 chr15 68524151 68524482 -34970492 + MTEa LTR MaLR 3 341 -38 2 1107 254 377 82 28 chr15 68524559 68524911 -34970063 - LTR33 LTR ERVL -103 412 42 2 1107 495 371 15 27 chr15 68526705 68526965 -34968009 + MLT1C LTR MaLR 207 463 -4 2 1107 812 214 56 166 chr15 68527457 68527794 -34967180 - MTE2b LTR MaLR -76 303 4 3 1107 260 365 64 70 chr15 68527836 68528163 -34966811 - ORR1D2 LTR MaLR -16 354 30 3 1107 356 184 10 94 chr15 68528205 68528301 -34966673 - MTEa LTR MaLR -291 88 1 3 1107 2937 149 100 30 chr15 68532569 68533169 -34961805 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 4 1107 1018 266 55 19 chr15 68533229 68533554 -34961420 + MLT1A LTR MaLR 24 360 -14 4 1107 366 79 16 0 chr15 68534206 68534269 -34960705 + ORR1A4 LTR MaLR 1 64 -265 4 1107 3355 38 2 2 chr15 68534273 68534669 -34960305 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1107 4722 20 2 0 chr15 68534669 68535266 -34959708 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 501 4 1107 1554 36 0 0 chr15 68535272 68535468 -34959506 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 298 5 1107 1188 40 0 0 chr15 68535463 68535636 -34959338 + MTA_Mm-int LTR MaLR 926 1098 0 5 1107 3526 23 2 0 chr15 68535636 68536031 -34958943 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1107 295 71 0 0 chr15 68536032 68536074 -34958900 + ORR1A4 LTR MaLR 288 329 0 4 1107 1021 296 73 70 chr15 68538215 68538646 -34956328 + ORR1E-int LTR MaLR 1060 1462 -47 5 1107 436 302 62 66 chr15 68538719 68538992 -34955982 + ORR1E LTR MaLR 82 353 -6 5 1107 1748 163 47 9 chr15 68539388 68539729 -34955245 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 5 1107 1672 226 86 34 chr15 68542321 68542820 -34952154 + RMER5 LTR ERV1 5 529 -5 6 1107 3205 44 18 5 chr15 68548303 68548694 -34946280 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1107 377 232 20 20 chr15 68548695 68548796 -34946178 - MTEa LTR MaLR 0 379 279 7 1108 3477 28 2 0 chr15 68555170 68555565 -34939409 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1108 420 306 119 45 chr15 68556294 68556378 -34938596 + LTR80B LTR ERVL 168 263 -321 8 1108 2355 149 82 0 chr15 68556378 68556767 -34938207 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1108 420 306 119 45 chr15 68556767 68556925 -34938049 + LTR80B LTR ERVL 264 428 -156 8 1108 439 239 43 34 chr15 68559743 68559860 -34935114 - RLTR14 LTR ERV1 -14 368 251 9 1108 508 303 131 55 chr15 68563472 68563800 -34931174 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 9 1108 343 355 57 0 chr15 68568430 68568675 -34926299 + ERVL-E-int LTR ERVL 4660 4918 -749 1 1108 225 358 60 0 chr15 68569172 68569239 -34925735 + MLT1G LTR MaLR 202 272 -319 1 1108 243 357 85 71 chr15 68572598 68572809 -34922165 + ORR1E LTR MaLR 36 249 -110 1 1108 361 224 104 74 chr15 68576322 68576457 -34918517 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 268 1 1108 636 224 21 28 chr15 68576715 68576863 -34918111 + MTEb LTR MaLR 3 149 -230 1 1108 929 266 29 33 chr15 68576897 68577138 -34917836 + MTEb LTR MaLR 139 378 -1 1 1108 733 303 43 84 chr15 68584764 68585110 -34909864 - ORR1E LTR MaLR -19 340 9 1 1108 571 289 60 25 chr15 68587813 68588012 -34906962 - MT2A LTR ERVL -10 523 318 1 1108 277 152 0 0 chr15 68588041 68588087 -34906887 - MT2A LTR ERVL -487 46 1 1 1108 678 321 12 28 chr15 68591749 68591999 -34902975 + RMER15 LTR ERVL 328 573 -2 1 1108 1074 214 70 7 chr15 68604427 68604697 -34890277 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 298 -279 1 1108 382 221 120 37 chr15 68605439 68605547 -34889427 + RLTR20B2 LTR ERVK 282 398 -165 1 1108 489 175 79 93 chr15 68605547 68605584 -34889390 - RLTR20B2 LTR ERVK -59 501 465 1 1108 489 175 79 93 chr15 68605629 68605730 -34889244 - RLTR20B2 LTR ERVK -96 464 365 1 1108 605 265 132 40 chr15 68606833 68607061 -34887913 - MLT1F1 LTR MaLR 0 569 321 1 1108 444 264 114 74 chr15 68607057 68607233 -34887741 + MLT1F LTR MaLR 108 290 -258 1 1108 240 330 217 11 chr15 68609755 68610022 -34884952 - MLT1F1 LTR MaLR -150 362 41 1 1108 902 276 77 42 chr15 68612904 68613241 -34881733 - ORR1E LTR MaLR -2 357 9 1 1108 4043 163 37 11 chr15 68614801 68615531 -34879443 - RMER6A LTR ERVK -7 749 1 1 1108 3105 49 2 108 chr15 68618792 68619226 -34875748 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 1 1108 274 383 20 56 chr15 68623283 68623532 -34871442 + LTR16D2 LTR ERVL 325 564 -8 1 1108 766 255 206 23 chr15 68636805 68637106 -34857868 + ORR1D2 LTR MaLR 1 356 -14 2 1108 454 274 69 60 chr15 68638312 68638587 -34856387 - MTEa LTR MaLR -2 377 77 2 1108 351 346 110 51 chr15 68640387 68640913 -34854061 - MLT1G1 LTR MaLR -16 608 1 2 1108 370 349 24 0 chr15 68642375 68642501 -34852473 - MTEa LTR MaLR -246 133 5 2 1108 875 256 147 3 chr15 68648356 68648655 -34846319 + ORR1E LTR MaLR 1 370 0 2 1108 1012 256 72 95 chr15 68650871 68651259 -34843715 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1108 419 287 40 47 chr15 68651699 68651849 -34843125 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 260 2 1108 1956 149 125 3 chr15 68654090 68654427 -34840547 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1108 494 378 77 28 chr15 68658276 68658961 -34836013 - ERVL-B4-int LTR ERVL -2065 3649 2931 2 1108 1929 247 57 16 chr15 68659056 68659562 -34835412 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 2 1108 323 208 240 0 chr15 68659639 68659735 -34835239 + LTR48 LTR ERV1 37 155 -632 2 1108 729 299 125 65 chr15 68661362 68661795 -34833179 + MLT1C LTR MaLR 1 459 -8 2 1108 586 340 103 28 chr15 68662349 68662785 -34832189 - MLT1D LTR MaLR -13 492 24 2 1108 1933 206 44 15 chr15 68663362 68663767 -34831207 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 2 1108 1481 229 12 134 chr15 68664532 68664941 -34830033 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 2 1108 884 310 66 16 chr15 68668203 68668567 -34826407 - MLT1B LTR MaLR -7 383 2 2 1108 1699 164 3 112 chr15 68670613 68670784 -34824190 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 153 2 1108 1699 164 3 112 chr15 68670973 68671159 -34823815 - ORR1A4 LTR MaLR -177 152 3 2 1108 302 355 24 18 chr15 68673988 68674045 -34820929 + MLT1B LTR MaLR 107 165 -225 2 1108 302 355 24 18 chr15 68674208 68674319 -34820655 + MLT1B LTR MaLR 166 275 -115 2 1108 439 253 0 0 chr15 68679142 68679237 -34815737 + MTE2b LTR MaLR 19 113 -266 2 1109 286 152 0 0 chr15 68684551 68684597 -34810377 - MLT2C2 LTR ERVL 0 559 514 2 1109 817 308 92 38 chr15 68684897 68685319 -34809655 - MT2A LTR ERVL -84 449 5 2 1109 520 363 94 50 chr15 68690439 68690949 -34804025 + MLT1G1 LTR MaLR 1 575 -4 2 1109 1703 216 41 17 chr15 68691344 68691706 -34803268 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 4 2 1109 358 259 131 39 chr15 68705044 68705197 -34789777 - MTEb LTR MaLR -8 371 205 3 1109 313 316 162 0 chr15 68705214 68705331 -34789643 - MTEb LTR MaLR -223 136 1 3 1109 1426 274 55 8 chr15 68705331 68705704 -34789270 - MTEb-int LTR MaLR -53 1527 1136 3 1109 707 315 36 27 chr15 68705781 68706019 -34788955 - MTEb-int LTR MaLR -1353 227 12 3 1109 717 370 145 28 chr15 68709402 68709762 -34785212 + MLT1J-int LTR MaLR 226 662 -725 3 1109 717 370 145 28 chr15 68709977 68710335 -34784639 + MLT1J-int LTR MaLR 663 1028 -359 3 1109 254 289 12 50 chr15 68715166 68715246 -34779728 + MLT1J1 LTR MaLR 366 442 -2 3 1109 1791 158 35 6 chr15 68723192 68723505 -34771469 - RLTR25B LTR ERVK -706 322 1 3 1109 1473 219 109 19 chr15 68724755 68725123 -34769851 + MTD LTR MaLR 4 404 -15 3 1109 289 306 97 16 chr15 68726495 68726623 -34768351 - MLT1H1 LTR MaLR -373 196 55 3 1109 675 307 123 18 chr15 68726627 68726969 -34768005 - MLT1A1 LTR MaLR -30 378 1 3 1109 385 298 35 46 chr15 68729615 68729812 -34765162 - MLT1D LTR MaLR -283 222 28 3 1109 266 316 0 9 chr15 68730569 68730684 -34764290 + MLT2D LTR ERVL 10 123 -291 3 1109 953 189 5 32 chr15 68730684 68730870 -34764104 + ORR1D1 LTR MaLR 1 181 -193 3 1109 234 349 116 35 chr15 68731116 68731315 -34763659 + MLT2D LTR ERVL 169 383 -14 3 1109 695 330 70 11 chr15 68734520 68734995 -34759979 + MLT2B2 LTR ERVL 1 510 -5 3 1109 1559 227 60 30 chr15 68741213 68741351 -34753623 + RLTR11A LTR ERVK 77 228 -300 3 1109 1559 227 60 30 chr15 68741531 68741823 -34753151 + RLTR11A LTR ERVK 229 520 -8 3 1109 525 228 89 7 chr15 68742273 68742419 -34752555 + ORR1D1 LTR MaLR 1 158 -216 3 1109 313 192 933 17 chr15 68742615 68742719 -34752255 + ORR1D1 LTR MaLR 169 367 0 3 1109 737 261 44 48 chr15 68743713 68744006 -34750968 - MTEa LTR MaLR -7 372 1 3 1109 1283 212 156 0 chr15 68747012 68747332 -34747642 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1109 1291 217 122 61 chr15 68751522 68751915 -34743059 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 3 1109 262 308 64 18 chr15 68775613 68775722 -34719252 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 295 4 1109 259 343 121 6 chr15 68776787 68776969 -34718005 - MLT1A1 LTR MaLR -302 203 1 4 1109 1531 198 60 24 chr15 68791761 68792143 -34702831 - RMER5 LTR ERV1 -126 408 13 4 1109 1570 134 363 32 chr15 68795892 68796326 -34698648 - RMER4B LTR ERVK -8 577 1 4 1109 1398 262 89 24 chr15 68801540 68801998 -34692976 - RMER20A LTR ERVK 0 516 29 4 1109 1844 146 15 56 chr15 68807946 68808286 -34686688 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1109 294 115 0 3 chr15 68808801 68808855 -34686119 - MT2A LTR ERVL 0 533 488 4 1109 656 249 162 34 chr15 68808893 68809288 -34685686 - MT2A LTR ERVL -142 459 3 4 1109 4910 172 63 68 chr15 68809288 68810344 -34684630 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1 5760 4710 4 1110 1885 196 12 3 chr15 68816990 68817323 -34677651 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1040 4721 4386 4 1110 482 186 78 132 chr15 68817471 68817638 -34677336 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3685 2076 1919 4 1110 389 242 89 65 chr15 68818485 68818653 -34676321 - RLTR14 LTR ERV1 -206 176 5 4 1110 329 285 27 62 chr15 68826778 68826924 -34668050 + MLT1A LTR MaLR 19 159 -215 4 1110 298 347 73 29 chr15 68845593 68845839 -34649135 - ERVL-E-int LTR ERVL -1420 4247 3991 4 1110 671 277 45 98 chr15 68854531 68854795 -34640179 + MTE2b LTR MaLR 5 254 -125 5 1110 1631 149 20 87 chr15 68865509 68866000 -34628974 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 5 1110 387 268 92 117 chr15 68890031 68890280 -34604694 - MLT1B LTR MaLR -80 310 68 5 1110 3810 133 47 26 chr15 68904749 68905499 -34589475 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 5 1110 638 277 184 7 chr15 68909832 68910126 -34584848 - MTEa LTR MaLR 0 379 34 5 1110 583 252 158 109 chr15 68915412 68915759 -34579215 + MTE2a LTR MaLR 16 379 0 5 1110 226 266 89 0 chr15 68934980 68935059 -34559915 - MLT1A0 LTR MaLR -264 101 16 5 1110 447 325 72 65 chr15 68935976 68936266 -34558708 - MLT1F LTR MaLR -253 295 4 5 1110 2253 153 35 15 chr15 68936520 68936918 -34558056 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 2 5 1110 512 244 23 8 chr15 68938795 68938923 -34556051 - MTD LTR MaLR -12 407 278 5 1110 306 301 108 0 chr15 68942087 68942253 -34552721 + MLT1D LTR MaLR 267 450 -55 5 1111 795 338 70 60 chr15 68950275 68950783 -34544191 - MLT2B5 LTR ERVL -56 545 28 5 1111 1051 231 111 37 chr15 68960388 68960712 -34534262 + ORR1D2 LTR MaLR 19 366 -4 5 1111 357 391 70 7 chr15 68963395 68963681 -34531293 - LTR16A LTR ERVL -46 405 102 6 1111 1779 187 29 9 chr15 68963685 68964035 -34530939 - ORR1B2 LTR MaLR -10 357 1 6 1111 416 349 103 31 chr15 68970380 68970729 -34524245 - MLT1C LTR MaLR -7 460 87 6 1111 274 297 18 73 chr15 68970730 68970839 -34524135 - MLT2B1 LTR ERVL -374 146 44 6 1111 1959 187 40 18 chr15 68971071 68971469 -34523505 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1111 539 176 0 9 chr15 68971564 68971673 -34523301 + MTB LTR MaLR 264 371 -29 6 1111 245 122 0 0 chr15 68973844 68973885 -34521089 + ORR1A4 LTR MaLR 1 41 -288 6 1111 746 161 23 0 chr15 68973881 68974011 -34520963 + ORR1A4 LTR MaLR 197 329 0 6 1111 2466 69 52 3 chr15 68981218 68981582 -34513392 + MTB LTR MaLR 1 382 -18 6 1111 233 241 58 46 chr15 68984264 68984351 -34510623 + LTR48 LTR ERV1 69 156 -631 6 1111 1194 240 121 30 chr15 68986318 68986657 -34508317 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 6 1111 265 335 89 63 chr15 68986889 68987080 -34507894 + ORR1E LTR MaLR 59 254 -105 6 1111 225 272 71 141 chr15 68987466 68987642 -34507332 + RLTR25A LTR ERVK 43 207 -896 6 1111 549 288 102 69 chr15 68991043 68991476 -34503498 - MLT1C LTR MaLR -8 459 13 6 1111 3508 23 8 0 chr15 68993117 68993510 -34501464 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1111 9442 25 6 1 chr15 68993510 68994603 -34500371 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1111 3543 28 0 0 chr15 68994603 68994999 -34499975 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1111 561 361 48 24 chr15 68997710 68998085 -34496889 + MLT1C LTR MaLR 80 463 -4 6 1111 594 186 165 58 chr15 68998551 68998665 -34496309 + RLTR25A LTR ERVK 832 969 -134 6 1111 594 186 165 58 chr15 68998754 68998845 -34496129 + RLTR25A LTR ERVK 970 1059 -44 6 1111 379 310 238 47 chr15 69003872 69004234 -34490740 - MLT1H LTR MaLR -118 431 1 1 1111 649 270 201 50 chr15 69008422 69008765 -34486209 + MTD LTR MaLR 1 395 -24 1 1111 386 260 9 19 chr15 69012608 69012714 -34482260 + RMER12 LTR ERVK 752 856 -466 2 1111 851 209 60 25 chr15 69013924 69014125 -34480849 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 167 3 1111 440 255 26 70 chr15 69014267 69014439 -34480535 - ORR1D1 LTR MaLR -157 210 68 3 1111 254 340 51 13 chr15 69021749 69021907 -34473067 - MLT1F-int LTR MaLR -1056 353 190 4 1111 517 268 217 44 chr15 69022563 69022887 -34472087 - MLT1F LTR MaLR -12 543 157 4 1111 648 288 81 104 chr15 69028284 69028641 -34466333 - ORR1E LTR MaLR -10 349 1 5 1111 1622 219 75 29 chr15 69040410 69040814 -34454160 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1111 352 332 69 35 chr15 69049196 69049459 -34445515 - LTR16C LTR ERVL -20 518 242 8 1111 2097 311 57 50 chr15 69053016 69053837 -34441137 - MER21B LTR ERV1 -5 858 32 8 1111 3437 23 5 0 chr15 69066435 69066829 -34428145 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1111 2839 74 25 10 chr15 69069540 69069934 -34425040 - MTB LTR MaLR 0 400 1 9 1111 3016 113 12 34 chr15 69069934 69070546 -34424428 - MTB-int LTR MaLR -761 1202 604 9 1112 713 306 36 92 chr15 69075892 69076252 -34418722 - MTEa LTR MaLR -22 357 18 1 1112 474 324 28 33 chr15 69078085 69078267 -34416707 - RMER15 LTR ERVL -40 535 355 1 1112 436 316 53 65 chr15 69080089 69080336 -34414638 + MLT1C LTR MaLR 13 256 -211 1 1112 668 303 65 72 chr15 69080735 69081027 -34413947 + MLT2B1 LTR ERVL 16 305 -215 1 1112 319 270 8 67 chr15 69081038 69081157 -34413817 + MLT2B1 LTR ERVL 436 547 -20 1 1112 383 320 84 66 chr15 69081348 69081685 -34413289 - MTEa LTR MaLR -8 371 7 1 1112 324 245 66 27 chr15 69081793 69081912 -34413062 + MLT1C LTR MaLR 342 502 -3 1 1112 939 267 122 58 chr15 69084378 69084772 -34410202 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1112 1326 260 26 42 chr15 69085206 69085632 -34409342 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1112 315 336 115 52 chr15 69092442 69092712 -34402262 - MLT1I LTR MaLR -107 304 18 1 1112 879 281 64 35 chr15 69093755 69094160 -34400814 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 1 1112 490 232 53 9 chr15 69095069 69095182 -34399792 + MTD LTR MaLR 1 118 -301 1 1112 1328 179 128 4 chr15 69101735 69102009 -34392965 + MTD LTR MaLR 112 419 0 1 1112 278 246 0 71 chr15 69102238 69102308 -34392666 + MLT1E1A LTR MaLR 579 643 -37 1 1112 519 300 87 107 chr15 69105736 69106102 -34388872 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1112 279 250 87 101 chr15 69108483 69108621 -34386353 - MLT1A0 LTR MaLR -9 586 451 1 1112 425 306 43 6 chr15 69109146 69109307 -34385667 - MLT1A0 LTR MaLR -28 337 171 1 1112 316 319 71 14 chr15 69109532 69109672 -34385302 - MLT1A0 LTR MaLR -215 150 3 1 1112 530 330 85 15 chr15 69119621 69119892 -34375082 + RMER15 LTR ERVL 286 575 0 1 1112 1900 177 79 42 chr15 69127192 69127598 -34367376 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1112 265 383 26 0 chr15 69128396 69128550 -34366424 - ERVL-E-int LTR ERVL -714 4953 4796 1 1112 412 339 136 17 chr15 69129690 69129867 -34365107 - MLT1E3 LTR MaLR -44 580 383 1 1112 234 195 0 0 chr15 69140665 69140706 -34354268 - MLT2B1 LTR ERVL 0 559 519 1 1112 599 314 230 18 chr15 69140703 69141046 -34353928 - MLT2B1 LTR ERVL -104 416 1 1 1112 429 337 36 12 chr15 69144768 69144936 -34350038 - MLT1C LTR MaLR -39 428 257 1 1112 2040 88 64 61 chr15 69144947 69145273 -34349701 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1112 529 266 39 8 chr15 69150033 69150162 -34344812 + MLT1J LTR MaLR 238 370 -142 2 1112 466 354 126 4 chr15 69150376 69150614 -34344360 + RMER15 LTR ERVL 296 562 -13 2 1112 2715 183 46 4 chr15 69151936 69152435 -34342539 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 520 -7 2 1112 647 287 64 67 chr15 69161430 69161828 -34333146 - RMER20A LTR ERVK -59 568 177 2 1112 898 196 42 16 chr15 69164259 69164451 -34330523 - RMER20A LTR ERVK -317 199 3 2 1112 1244 223 135 137 chr15 69165233 69165767 -34329207 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 2 1112 298 337 117 54 chr15 69168060 69168377 -34326597 + MLT1A LTR MaLR 4 340 -34 2 1112 1699 195 108 12 chr15 69171606 69171948 -34323026 - MTC LTR MaLR 0 421 47 2 1112 437 156 13 0 chr15 69172178 69172255 -34322719 - MTC LTR MaLR -342 79 2 2 1112 643 327 34 62 chr15 69179612 69180006 -34314968 - MTE2a LTR MaLR -45 374 1 2 1112 314 239 154 49 chr15 69181657 69181780 -34313194 + RMER15 LTR ERVL 424 559 -16 2 1112 243 259 0 0 chr15 69185070 69185124 -34309850 + MLT1C LTR MaLR 3 56 -411 2 1112 282 345 11 0 chr15 69188897 69188984 -34305990 - MLT2F LTR ERVL -560 103 16 2 1112 2890 52 0 0 chr15 69190470 69190816 -34304158 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 2 1112 13358 61 23 1 chr15 69190816 69192568 -34302406 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 2 1112 2027 29 0 0 chr15 69192568 69192813 -34302161 + ORR1A0 LTR MaLR 1 245 -101 2 1112 2143 91 32 3 chr15 69192824 69193132 -34301842 - IAPLTR2b LTR ERVK -10 317 1 2 1112 816 58 0 0 chr15 69193132 69193236 -34301738 + ORR1A0 LTR MaLR 235 338 -8 2 1112 235 346 42 76 chr15 69195134 69195278 -34299696 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -9 830 692 2 1112 328 335 112 14 chr15 69204637 69204852 -34290122 + MLT1K LTR MaLR 196 431 -164 2 1113 3080 78 2 0 chr15 69216060 69216457 -34278517 - MTB LTR MaLR -2 398 1 3 1113 477 98 0 24 chr15 69217346 69217430 -34277544 + RMER19B LTR ERVK 1 82 -820 3 1113 859 239 14 22 chr15 69217421 69217784 -34277190 - RMER19B LTR ERVK -663 239 1 3 1113 392 367 159 26 chr15 69227472 69227824 -34267150 - LTR16D LTR ERVL -31 620 222 3 1113 1821 204 66 3 chr15 69233731 69234094 -34260880 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 3 1113 3944 42 8 32 chr15 69234192 69234686 -34260288 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 3 1113 583 256 137 147 chr15 69242343 69242636 -34252338 + MTE2a LTR MaLR 9 298 -81 3 1113 319 306 133 77 chr15 69246446 69246613 -34248361 + MLT1C LTR MaLR 1 183 -284 3 1113 319 306 133 77 chr15 69246854 69246881 -34248093 + MLT1C LTR MaLR 184 205 -262 3 1113 379 300 110 17 chr15 69247019 69247192 -34247782 + MLT1C LTR MaLR 264 452 -15 3 1113 1297 228 123 18 chr15 69255265 69255605 -34239369 + ORR1B2 LTR MaLR 1 376 -2 3 1113 1615 279 10 7 chr15 69255610 69256025 -34238949 + ORR1B2-int LTR MaLR 4 419 -951 3 1113 584 147 27 9 chr15 69256028 69256138 -34238836 + ORR1B2-int LTR MaLR 1398 1509 0 3 1113 1524 219 51 26 chr15 69256139 69256490 -34238484 + ORR1B2 LTR MaLR 8 367 0 3 1113 249 312 113 106 chr15 69259829 69260112 -34234862 + LTR33 LTR ERVL 218 502 -13 3 1113 238 379 302 12 chr15 69260910 69261155 -34233819 + MLT2F LTR ERVL 204 519 -144 3 1113 2077 98 27 48 chr15 69263334 69263667 -34231307 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 2 3 1113 3568 165 24 62 chr15 69268666 69269331 -34225643 + RLTR26 LTR ERVK 1 640 -2 3 1113 1586 300 15 5 chr15 69270188 69270580 -34224394 - MTD LTR MaLR 0 419 24 3 1113 303 279 143 67 chr15 69278064 69278359 -34216615 + MTE2b LTR MaLR 1 345 -34 3 1113 3774 133 67 14 chr15 69284024 69284664 -34210310 + RLTR25A LTR ERVK 4 661 -442 3 1113 892 216 77 30 chr15 69284756 69284990 -34209984 + RLTR25A LTR ERVK 609 853 -175 3 1113 768 233 117 62 chr15 69285369 69285493 -34209481 + RLTR25B LTR ERVK 757 889 -139 3 1113 768 233 117 62 chr15 69285545 69285675 -34209299 + RLTR25B LTR ERVK 890 1025 -3 3 1113 1964 248 72 50 chr15 69286250 69286849 -34208125 - RLTR17 LTR ERVK -80 612 1 4 1113 496 351 60 24 chr15 69291400 69291731 -34203243 + ORR1D2 LTR MaLR 1 355 -24 4 1113 292 371 79 17 chr15 69295618 69295796 -34199178 + ORR1E LTR MaLR 5 193 -166 4 1113 1004 67 29 7 chr15 69306679 69306815 -34188159 - RLTR45 LTR ERVK -1 481 343 4 1113 1743 197 77 21 chr15 69307194 69307572 -34187402 + MTB_Mm LTR MaLR 9 407 0 4 1113 268 277 29 19 chr15 69307700 69307803 -34187171 + ERVL-E-int LTR ERVL 437 540 -5127 4 1113 546 297 39 40 chr15 69315732 69316022 -34178952 + ORR1E LTR MaLR 6 344 -15 4 1113 1586 203 67 170 chr15 69316701 69317295 -34177679 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 4 1113 825 380 43 24 chr15 69319339 69319808 -34175166 - MLT2B1 LTR ERVL 0 520 43 4 1113 3967 160 45 8 chr15 69326648 69327377 -34167597 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 4 1113 892 206 92 5 chr15 69331767 69331962 -34163012 + ORR1D1 LTR MaLR 163 374 0 4 1113 5115 232 90 14 chr15 69331978 69332545 -34162429 + ORR1D1-int LTR MaLR 22 619 -751 4 1113 5115 232 90 14 chr15 69332664 69333347 -34161627 + ORR1D1-int LTR MaLR 620 1367 -3 4 1113 1317 219 15 76 chr15 69333347 69333687 -34161287 + ORR1D1 LTR MaLR 9 327 -47 4 1113 1246 269 45 10 chr15 69335860 69336172 -34158802 - ORR1D2 LTR MaLR -47 323 1 4 1113 409 265 104 42 chr15 69336590 69336846 -34158128 + MLT2D LTR ERVL 96 500 -56 4 1114 393 219 25 78 chr15 69337542 69337837 -34157137 + RMER17D2 LTR ERVK 1 483 -326 4 1114 1110 292 24 5 chr15 69338100 69338472 -34156502 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 1114 2284 81 71 6 chr15 69344716 69345041 -34149933 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1114 13649 59 11 1 chr15 69345041 69346816 -34148158 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 4 1114 2369 65 61 61 chr15 69346816 69347162 -34147812 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1114 492 236 58 45 chr15 69349852 69350003 -34144971 + MLT1A0 LTR MaLR 8 160 -205 4 1114 329 394 23 42 chr15 69350557 69350774 -34144200 + MLT1G LTR MaLR 4 216 -375 5 1114 249 336 16 39 chr15 69366140 69366267 -34128707 - RMER15 LTR ERVL -158 417 294 5 1114 436 216 0 105 chr15 69367092 69367216 -34127758 - MT2B LTR ERVL -344 257 147 5 1114 406 270 44 18 chr15 69374065 69374178 -34120796 - MT2B LTR ERVL -233 368 253 5 1114 342 282 63 16 chr15 69374170 69374296 -34120678 - MT2B LTR ERVL -401 132 1 5 1114 227 289 161 15 chr15 69379290 69379420 -34115554 - MLT2B4 LTR ERVL -78 478 330 5 1114 1259 201 49 42 chr15 69385126 69385412 -34109562 - ORR1C2 LTR MaLR -95 289 2 5 1114 473 294 57 81 chr15 69386657 69386868 -34108106 + RMER10B LTR ERVL 147 352 -46 5 1114 675 301 76 126 chr15 69390092 69390594 -34104380 + RMER5 LTR ERV1 1 477 -57 5 1114 736 305 52 25 chr15 69393099 69393385 -34101589 + MLT1A0 LTR MaLR 5 298 -67 5 1114 725 261 31 5 chr15 69394934 69395130 -34099844 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 170 5 1114 14896 18 4 0 chr15 69400367 69402053 -34092921 + IAPEz-int LTR ERVK 4789 6481 0 5 1114 584 330 63 59 chr15 69407203 69407506 -34087468 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 257 5 1114 744 308 10 95 chr15 69408656 69408753 -34086221 + MTEb LTR MaLR 3 75 -304 5 1114 744 308 10 95 chr15 69408806 69409120 -34085854 + MTEb LTR MaLR 76 379 0 5 1114 1686 173 111 3 chr15 69417602 69417926 -34077048 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 6 1114 239 270 0 101 chr15 69421574 69421673 -34073301 - MT2B LTR ERVL -344 257 169 6 1114 430 303 33 39 chr15 69429904 69430086 -34064888 - HERV16-int LTR ERVL -1465 3531 3351 6 1114 353 319 53 71 chr15 69434784 69435146 -34059828 - MTEb LTR MaLR -22 357 7 6 1114 367 296 0 0 chr15 69435594 69435692 -34059282 - MER90a LTR ERV1 -147 467 370 6 1114 542 262 8 8 chr15 69436295 69436422 -34058552 + MT2A LTR ERVL 3 129 -404 6 1114 302 222 0 16 chr15 69436412 69436476 -34058498 + MT2A LTR ERVL 86 148 -385 6 1114 265 238 16 16 chr15 69436612 69436676 -34058298 + MT2A LTR ERVL 241 304 -229 6 1114 227 246 25 76 chr15 69445851 69445930 -34049044 - LTR78 LTR ERV1 -1229 75 1 6 1114 309 225 30 101 chr15 69452779 69452793 -34042181 + MT2B LTR ERVL 155 241 -355 6 1114 475 360 89 14 chr15 69458654 69458936 -34036038 - MLT1B LTR MaLR -36 354 52 6 1114 1125 318 42 0 chr15 69459544 69459903 -34035071 - MTE2b LTR MaLR -4 375 2 6 1114 1199 236 118 28 chr15 69464354 69464677 -34030297 + ORR1D1 LTR MaLR 21 372 -2 6 1114 599 157 83 0 chr15 69465701 69465809 -34029165 + MTC LTR MaLR 9 125 -296 6 1114 515 149 23 0 chr15 69465878 69465965 -34029009 + MTC LTR MaLR 120 208 -213 6 1115 757 361 65 12 chr15 69468574 69468913 -34026061 - MLT1H1 LTR MaLR -31 524 168 6 1115 364 258 218 41 chr15 69469037 69469207 -34025767 - ORR1E LTR MaLR -151 208 9 6 1115 396 323 154 8 chr15 69470461 69470695 -34024279 - MLT1B LTR MaLR -122 268 1 6 1115 2167 138 82 12 chr15 69471938 69472340 -34022634 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 6 1115 338 365 30 40 chr15 69486518 69486718 -34008256 + LTR84b LTR ERVL 65 262 -499 6 1115 584 308 25 75 chr15 69487331 69487531 -34007443 - MTE2a LTR MaLR -97 282 93 6 1115 249 318 28 18 chr15 69487742 69487851 -34007123 - MTE2a LTR MaLR -291 128 19 6 1115 336 370 75 54 chr15 69494599 69494933 -34000041 - ORR1E LTR MaLR -11 348 8 7 1115 342 310 16 84 chr15 69495249 69495325 -33999649 - MTE-int LTR MaLR -131 1449 1385 7 1115 342 310 16 84 chr15 69495447 69495560 -33999414 - MTE-int LTR MaLR -196 1384 1273 7 1115 1906 357 108 35 chr15 69495740 69496901 -33998073 - MTE-int LTR MaLR -296 1284 39 7 1115 372 353 132 59 chr15 69496943 69497232 -33997742 - ORR1E LTR MaLR -6 353 44 7 1115 2525 213 30 28 chr15 69497397 69497933 -33997041 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 557 -20 7 1115 392 233 12 0 chr15 69506063 69506158 -33988816 - MTC LTR MaLR -323 96 1 8 1115 1547 319 67 33 chr15 69521120 69521761 -33973213 - MTE-int LTR MaLR -796 784 122 3 1115 4012 189 74 19 chr15 69521761 69522559 -33972415 + RMER21B LTR ERV1 1 842 0 3 1115 379 276 57 0 chr15 69522560 69522665 -33972309 - MTE-int LTR MaLR -1456 124 14 3 1115 813 288 134 18 chr15 69524835 69525118 -33969856 - MTEb LTR MaLR -57 322 7 4 1115 703 301 49 128 chr15 69529299 69529627 -33965347 - MTE2a LTR MaLR -71 308 7 4 1115 675 318 46 79 chr15 69536203 69536572 -33958402 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 5 1115 1367 299 75 21 chr15 69536572 69536916 -33958058 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 1185 5 1115 1367 299 75 21 chr15 69536937 69537097 -33957877 - ORR1E-int LTR MaLR -396 1184 997 5 1115 1467 316 55 42 chr15 69539568 69540228 -33954746 - ORR1E-int LTR MaLR -912 668 1 5 1115 506 348 44 19 chr15 69540228 69540436 -33954538 - ORR1E LTR MaLR 0 379 181 5 1115 506 375 69 34 chr15 69540490 69540663 -33954311 - ORR1E LTR MaLR -179 180 4 5 1115 1966 122 31 25 chr15 69542888 69543215 -33951759 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1115 1099 182 57 22 chr15 69546724 69546954 -33948020 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 506 743 -1583 7 1115 2754 93 10 5 chr15 69546954 69547352 -33947622 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1115 700 159 15 22 chr15 69547532 69547667 -33947307 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 820 953 -1373 7 1115 3518 171 98 76 chr15 69547669 69548093 -33946881 + RMER17B LTR ERVK 1 399 -507 7 1115 3518 171 101 30 chr15 69548160 69548701 -33946273 + RMER17B LTR ERVK 369 958 0 7 1115 6272 164 16 9 chr15 69551761 69552961 -33942013 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1051 2258 -68 7 1115 2032 204 129 15 chr15 69552997 69553419 -33941555 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 483 -94 8 1115 2032 204 129 15 chr15 69553466 69553561 -33941413 + RLTR20B3 LTR ERVK 484 576 -1 8 1115 414 346 42 63 chr15 69559395 69559728 -33935246 + MLT1A0 LTR MaLR 11 336 -29 9 1115 310 148 62 0 chr15 69559829 69559910 -33935064 - RMER4B LTR ERVK -2 583 498 9 1115 1391 233 142 24 chr15 69559960 69560369 -33934605 - RMER4B LTR ERVK -128 457 1 9 1115 395 355 50 41 chr15 69567897 69568117 -33926857 + LTR16C LTR ERVL 247 468 -21 1 1115 327 328 60 94 chr15 69590966 69591314 -33903660 - ORR1E LTR MaLR -6 364 16 1 1115 416 388 87 33 chr15 69592510 69592878 -33902096 + MLT2B1 LTR ERVL 3 390 -130 1 1115 254 275 43 11 chr15 69594326 69594418 -33900556 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2 96 -5618 1 1115 1466 262 78 3 chr15 69594434 69594816 -33900158 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 1 1115 486 387 59 31 chr15 69595004 69595293 -33899681 + MLT-int LTR MaLR 215 516 -1219 1 1115 486 387 59 31 chr15 69596109 69596206 -33898768 + MLT-int LTR MaLR 517 611 -1124 1 1115 597 295 74 17 chr15 69596523 69596754 -33898220 + MLT1A0 LTR MaLR 120 363 -2 1 139 646 379 58 35 chr15 69599230 69599572 -33895402 - MTEa LTR MaLR -8 371 22 1 1116 829 208 323 41 chr15 69604944 69605237 -33889737 - MTC LTR MaLR 0 421 42 1 1116 544 216 88 82 chr15 69605457 69605501 -33889473 - MTC LTR MaLR -380 41 1 1 1116 366 353 59 12 chr15 69606778 69606947 -33888027 - MER74A LTR ERVL 0 558 382 1 1116 271 91 0 0 chr15 69614544 69614588 -33880386 - MTC LTR MaLR -180 239 196 1 1116 687 203 98 0 chr15 69614911 69615064 -33879910 - MTC LTR MaLR -222 199 32 1 1116 528 291 50 110 chr15 69619402 69619826 -33875148 + RMER20B LTR ERVK 220 595 -32 1 1116 2048 141 16 0 chr15 69620573 69620892 -33874082 - ORR1A3 LTR MaLR -2 324 1 1 1116 870 301 66 18 chr15 69625667 69626063 -33868911 - MTD LTR MaLR 0 419 5 1 1116 764 259 253 10 chr15 69626317 69626621 -33868353 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 1 1116 1076 250 25 11 chr15 69626623 69626902 -33868072 + ORR1C1-int LTR MaLR 3 285 -1224 1 1116 1536 219 64 110 chr15 69626912 69627395 -33867579 - RMER4A LTR ERVK 0 466 6 1 1116 1602 216 31 59 chr15 69627413 69627767 -33867207 + ORR1C1 LTR MaLR 35 378 0 1 1116 345 317 19 0 chr15 69630695 69630799 -33864175 - MTEa LTR MaLR -271 108 3 1 1116 424 339 65 30 chr15 69638556 69638787 -33856187 - RMER15 LTR ERVL 0 575 337 1 1116 1807 181 17 14 chr15 69638983 69639337 -33855637 - RLTR15 LTR ERVK -4 355 1 2 1116 1693 244 88 75 chr15 69648237 69648470 -33846504 - RLTR40 LTR ERVK -38 779 542 2 1116 1693 244 88 75 chr15 69648500 69649028 -33845946 - RLTR40 LTR ERVK -276 541 8 2 1116 911 321 81 6 chr15 69654379 69654727 -33840247 + MTEa LTR MaLR 6 379 0 2 1116 678 347 68 14 chr15 69654807 69655172 -33839802 + MTE-int LTR MaLR 158 542 -1038 2 1116 1812 340 70 29 chr15 69656179 69656909 -33838065 + MTE-int LTR MaLR 596 1355 -225 2 1116 781 300 69 31 chr15 69657063 69657352 -33837622 + MTE-int LTR MaLR 1273 1572 -8 2 1116 431 279 118 28 chr15 69657495 69657639 -33837335 + MTEa LTR MaLR 146 302 -77 2 1116 2307 160 9 16 chr15 69658230 69658655 -33836319 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 2 1116 3285 175 60 30 chr15 69658682 69659354 -33835620 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 1 2 1116 1751 221 60 13 chr15 69659802 69660200 -33834774 - MTC LTR MaLR 0 421 5 2 1116 436 256 49 8 chr15 69660351 69660473 -33834501 + RLTR17 LTR ERVK 201 327 -365 2 1116 2251 118 0 3 chr15 69662213 69662536 -33832438 + ORR1A2 LTR MaLR 5 326 -1 2 1116 3294 209 109 35 chr15 69668111 69668985 -33825989 - RMER17B LTR ERVK -16 942 5 2 1116 320 325 69 13 chr15 69669205 69669364 -33825610 + RMER15 LTR ERVL 299 466 -109 2 1116 1667 166 7 33 chr15 69670043 69670349 -33824625 + ORR1A3 LTR MaLR 29 326 0 2 1116 720 306 69 44 chr15 69670349 69670462 -33824512 + RMER15-int LTR ERVL 817 925 -4074 2 1116 720 306 69 44 chr15 69670649 69670925 -33824049 + RMER15-int LTR ERVL 926 1216 -3783 2 1116 352 252 108 0 chr15 69670953 69671064 -33823910 + RMER15-int LTR ERVL 1284 1406 -3593 2 1116 383 324 82 46 chr15 69671195 69671555 -33823419 - MTC LTR MaLR -9 410 13 2 1116 562 309 169 8 chr15 69671993 69672276 -33822698 - ORR1E LTR MaLR -33 346 2 2 1116 1395 275 44 85 chr15 69675830 69676374 -33818600 - RMER5 LTR ERV1 -12 522 1 2 1116 3046 50 13 3 chr15 69676762 69677146 -33817828 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 1 2 1116 266 264 0 27 chr15 69680694 69680768 -33814206 - MLT1A1 LTR MaLR -23 385 314 2 1116 1428 268 77 23 chr15 69684950 69685340 -33809634 - MTD LTR MaLR -8 411 1 2 1116 392 333 84 7 chr15 69686062 69686216 -33808758 + MLT1K LTR MaLR 8 173 -422 2 1116 258 357 72 48 chr15 69686286 69686536 -33808438 + MLT1K LTR MaLR 295 550 -45 2 1116 513 361 73 75 chr15 69688051 69688476 -33806498 - MLT2B3 LTR ERVL -121 433 10 2 1116 478 346 16 21 chr15 69689266 69689452 -33805522 - RMER15 LTR ERVL -17 558 374 2 1116 1739 239 13 16 chr15 69691072 69691447 -33803527 + MTC LTR MaLR 3 376 -45 2 1116 418 300 81 91 chr15 69691585 69691882 -33803092 + LTR73 LTR ERV1 15 308 -264 2 1116 1591 142 64 78 chr15 69693142 69693487 -33801487 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 114 2 1116 2755 108 12 12 chr15 69693487 69693891 -33801083 - MTB_Mm LTR MaLR -3 404 1 2 1116 3785 156 122 21 chr15 69693891 69694668 -33800306 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1258 403 2 1116 2654 115 0 20 chr15 69694695 69695095 -33799879 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 16 2 1116 513 155 68 0 chr15 69695197 69695300 -33799674 - RLTR11B LTR ERVK -320 133 24 2 1116 1588 156 41 63 chr15 69701224 69701539 -33793435 - ORR1A4 LTR MaLR -21 308 1 3 1116 4712 112 27 25 chr15 69702386 69702712 -33792262 + RMER17D2 LTR ERVK 1 318 -491 3 1116 4712 112 27 25 chr15 69702814 69703294 -33791680 + RMER17D2 LTR ERVK 319 809 0 3 1116 1119 219 108 119 chr15 69703844 69704629 -33790345 + RMER17B LTR ERVK 53 863 -43 3 1116 325 182 127 25 chr15 69707249 69707328 -33787646 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 423 3 1116 264 374 69 64 chr15 69708350 69708553 -33786421 + MLT1A1 LTR MaLR 1 204 -204 3 1116 1627 128 7 6 chr15 69715185 69715442 -33779532 + LTRIS_Mus LTR ERV1 349 603 -51 3 1116 1277 171 17 8 chr15 69715452 69715693 -33779281 + MuRRS-int LTR ERV1 31 273 -4417 3 1116 2557 255 27 55 chr15 69715818 69716717 -33778257 + MuRRS-int LTR ERV1 396 1269 -3794 3 1116 4350 168 9 20 chr15 69716786 69717800 -33777174 + MuRRS-int LTR ERV1 3332 4453 -237 3 1116 1758 329 19 32 chr15 69718580 69719693 -33775281 + RLTR6-int LTR ERV1 6666 7763 -15 3 1116 3813 132 14 48 chr15 69719693 69719708 -33775266 - RMER17A2 LTR ERVK -229 677 665 3 1116 4425 82 0 30 chr15 69719708 69720313 -33774661 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 3 1116 3813 132 14 48 chr15 69720313 69720998 -33773976 - RMER17A2 LTR ERVK -242 664 1 3 1116 400 335 114 29 chr15 69721107 69721415 -33773559 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 72 3 1116 424 366 89 34 chr15 69723292 69723617 -33771357 - ORR1D2 LTR MaLR -23 347 5 3 1116 412 231 78 48 chr15 69726217 69726485 -33768489 - RMER17D LTR ERVK -446 443 168 3 1117 409 320 103 80 chr15 69732818 69733157 -33761817 + ORR1E LTR MaLR 8 354 -5 3 1117 670 182 54 7 chr15 69735795 69735944 -33759030 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 215 3 1117 644 306 30 17 chr15 69750896 69751132 -33743842 - MT2A LTR ERVL -294 239 1 3 1117 1296 244 80 5 chr15 69759442 69759830 -33735144 - MTD LTR MaLR 0 419 3 4 1117 1534 75 0 5 chr15 69761230 69761430 -33733544 + RMER17A-int LTR ERVK 1126 1324 -404 4 1117 290 167 19 0 chr15 69761432 69761486 -33733488 - RMER17A-int LTR ERVK -1673 55 1 4 1117 4944 130 47 15 chr15 69761489 69762349 -33732625 - RMER17D LTR ERVK -2 887 1 4 1117 430 340 66 37 chr15 69762707 69762951 -33732023 + MLT1A0 LTR MaLR 94 344 -21 4 1117 255 357 96 19 chr15 69770766 69770923 -33724051 + MLT1B LTR MaLR 1 169 -221 4 1117 322 278 11 0 chr15 69771160 69771250 -33723724 + MLT1B LTR MaLR 263 353 -37 4 1117 332 394 56 28 chr15 69773080 69773404 -33721570 - MLT1A LTR MaLR -41 333 1 4 1117 349 217 136 36 chr15 69775561 69775671 -33719303 - MTE2b LTR MaLR -37 342 222 4 1117 445 244 40 0 chr15 69784312 69784419 -33710555 - MTE2b LTR MaLR -119 260 158 4 1117 305 304 65 0 chr15 69784530 69784622 -33710352 - MTE2b LTR MaLR -281 98 1 4 1117 237 229 111 28 chr15 69785529 69785601 -33709373 + MLT1A1 LTR MaLR 1 78 -330 4 1117 328 293 20 10 chr15 69785795 69785895 -33709079 + MLT1A1 LTR MaLR 308 408 0 4 1117 348 269 107 146 chr15 69786699 69786960 -33708014 + MTE2a LTR MaLR 125 375 -4 4 1117 951 258 130 34 chr15 69787614 69787907 -33707067 + ORR1D2 LTR MaLR 41 361 -13 4 1117 2911 40 0 0 chr15 69790404 69790750 -33704224 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1117 259 353 76 51 chr15 69801044 69801202 -33693772 - LTR16A LTR ERVL -115 336 175 4 1117 1776 113 45 0 chr15 69804843 69805109 -33689865 - RLTR9B LTR ERVK -159 278 1 4 1117 2816 39 3 0 chr15 69821010 69821341 -33673633 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 4 1117 240 291 49 37 chr15 69824556 69824638 -33670336 - ORR1E LTR MaLR -262 97 15 4 1117 1672 221 17 88 chr15 69837310 69837717 -33657257 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 5 1117 1276 183 8 8 chr15 69837712 69837960 -33657014 - ORR1C1-int LTR MaLR 0 1509 1262 5 1117 1072 278 75 30 chr15 69837980 69838380 -33656594 - ORR1C1-int LTR MaLR -558 951 534 5 1117 1309 194 52 0 chr15 69838383 69838631 -33656343 + RMER6D LTR ERVK 445 705 -15 5 1117 1075 294 77 24 chr15 69839748 69840125 -33654849 + MTD LTR MaLR 23 419 0 5 1117 411 167 0 25 chr15 69845779 69845859 -33649115 + ORR1C1-int LTR MaLR 1432 1509 0 5 1117 1583 212 35 59 chr15 69845867 69846238 -33648736 + ORR1C1 LTR MaLR 9 370 -8 5 1117 564 327 78 22 chr15 69860915 69861146 -33633828 + MTE2b LTR MaLR 11 254 -125 5 1118 1285 259 69 3 chr15 69867957 69868306 -33626668 + MTD LTR MaLR 34 405 -14 5 1118 517 331 134 24 chr15 69872347 69872638 -33622336 - MTE2a LTR MaLR -1 378 56 5 1118 588 229 153 30 chr15 69888193 69888396 -33606578 - RLTR15 LTR ERVK -131 228 1 5 1118 2368 250 19 35 chr15 69897416 69897980 -33596994 + RLTR21 LTR ERVK 6 560 -1012 5 1118 320 161 0 0 chr15 69898018 69898074 -33596900 + RLTR21 LTR ERVK 562 617 -955 5 1118 994 217 14 43 chr15 69898107 69898386 -33596588 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 1 271 -2055 5 1118 909 312 94 35 chr15 69898405 69898860 -33596114 + RLTR20B2 LTR ERVK 22 503 -57 5 1118 1747 238 17 133 chr15 69898988 69899716 -33595258 + RLTR25B LTR ERVK 21 672 -431 5 1118 1083 220 154 131 chr15 69899552 69899717 -33595257 + ORR1A3-int LTR MaLR 430 739 -1224 5 1118 1316 176 54 62 chr15 69899717 69899977 -33594997 + MT2B LTR ERVL 35 292 -309 5 1118 718 244 109 112 chr15 69899870 69900263 -33594711 + RLTR25A LTR ERVK 521 912 -191 5 1118 1083 220 154 131 chr15 69899977 69900117 -33594857 + ORR1A3-int LTR MaLR 740 1007 -956 5 1118 277 208 139 0 chr15 69900278 69900350 -33594624 + RLTR25A LTR ERVK 947 1028 0 5 1118 498 304 130 6 chr15 69900352 69900521 -33594453 - RMER15 LTR ERVL -101 474 285 5 1118 358 347 7 13 chr15 69923876 69924025 -33570949 - RMER12 LTR ERVK -467 855 708 6 1118 257 236 102 92 chr15 69925258 69925356 -33569618 + RMER15 LTR ERVL 437 535 -40 6 1118 315 291 95 41 chr15 69926110 69926257 -33568717 + MLT1F-int LTR MaLR 1000 1154 -335 6 1118 273 211 156 13 chr15 69926383 69926460 -33568514 + MTC LTR MaLR 1 88 -333 6 1118 744 258 319 33 chr15 69927534 69927772 -33567202 + MTC LTR MaLR 108 413 -8 6 1118 4571 214 51 118 chr15 69927775 69928851 -33566123 + MTC-int LTR MaLR 2 1075 -183 6 1118 4571 214 51 118 chr15 69928974 69929049 -33565925 + MTC-int LTR MaLR 1076 1079 -179 6 1118 4182 115 50 43 chr15 69929049 69929792 -33565182 - RMER17A LTR ERVK -3 748 1 6 1118 4571 214 51 118 chr15 69929792 69929807 -33565167 + MTC-int LTR MaLR 1080 1082 -176 6 1118 4571 214 51 118 chr15 69930305 69930469 -33564505 + MTC-int LTR MaLR 1089 1258 0 6 1118 574 163 10 0 chr15 69930469 69930567 -33564407 + MTC LTR MaLR 1 99 -322 6 1118 1531 207 19 13 chr15 69931236 69931544 -33563430 + MTC LTR MaLR 110 419 -2 6 1118 2626 211 75 28 chr15 69932065 69932678 -33562296 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 6 1118 245 301 42 58 chr15 69936268 69936388 -33558586 + MLT1D LTR MaLR 1 118 -387 6 1118 580 321 88 49 chr15 69936467 69936775 -33558199 - MTE-int LTR MaLR -152 1428 1109 6 1118 507 269 48 118 chr15 69937492 69937726 -33557248 - MTE-int LTR MaLR -670 1293 929 6 1118 2095 251 52 66 chr15 69940285 69941090 -33553884 - RMER17D2 LTR ERVK -15 794 1 6 1118 2840 65 10 15 chr15 69943090 69943480 -33551494 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 6 1118 249 326 58 43 chr15 69943986 69944124 -33550850 + MLT1D LTR MaLR 366 505 0 6 1118 601 286 37 46 chr15 69951950 69952184 -33542790 - MTD LTR MaLR -160 261 12 6 1118 245 244 110 11 chr15 69973820 69973911 -33521063 + MTD LTR MaLR 1 100 -319 6 1118 2042 194 16 0 chr15 69973961 69974348 -33520626 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 2 6 1118 273 395 40 0 chr15 69977605 69977757 -33517217 + MER67D LTR ERV1 154 311 -203 6 1118 260 296 126 85 chr15 69982992 69983262 -33511712 + RMER20A LTR ERVK 122 402 -114 6 1119 1551 209 3 110 chr15 70003867 70004248 -33490726 + ORR1B1 LTR MaLR 41 380 -14 7 1119 1008 182 89 8 chr15 70014753 70015045 -33479929 + ORR1B1 LTR MaLR 6 394 0 2 1119 285 265 14 13 chr15 70015444 70015552 -33479422 + ORR1E LTR MaLR 300 414 -5 2 1119 623 299 129 80 chr15 70017858 70018207 -33476767 - MTE2a LTR MaLR -13 366 1 3 1119 447 333 129 4 chr15 70018207 70018435 -33476539 - MTE2a-int LTR MaLR -8 1572 1316 3 1119 930 233 107 38 chr15 70018424 70018714 -33476260 + ORR1E-int LTR MaLR 1041 1350 -20 2 1119 722 328 48 39 chr15 70018733 70019089 -33475885 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 2 1119 312 351 13 57 chr15 70021868 70022081 -33472893 - RMER4A LTR ERVK -370 215 7 3 1119 291 376 50 34 chr15 70027452 70027631 -33467343 + MLT1F2 LTR MaLR 7 188 -372 4 1119 233 400 45 40 chr15 70027909 70028107 -33466867 + MLT1F2 LTR MaLR 344 542 -18 4 1119 569 239 92 153 chr15 70029680 70030104 -33464870 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 4 1119 710 206 22 62 chr15 70030352 70030579 -33464395 - RMER10A LTR ERVL -1 441 224 4 1119 679 289 59 47 chr15 70030585 70030923 -33464051 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 4 1119 796 230 71 96 chr15 70030923 70031112 -33463862 - RMER10A LTR ERVL -208 234 45 4 1119 796 230 71 96 chr15 70031814 70031864 -33463110 - RMER10A LTR ERVL -398 44 1 4 1119 425 211 0 11 chr15 70044151 70044242 -33450732 - ORR1B1 LTR MaLR -304 90 1 6 1119 2049 203 68 8 chr15 70047567 70048063 -33446911 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 2 7 1119 633 323 83 32 chr15 70050575 70051007 -33443967 - RMER5 LTR ERV1 -5 529 76 7 1119 673 335 59 56 chr15 70051962 70052287 -33442687 - MTEb LTR MaLR 0 379 56 7 1119 673 335 59 56 chr15 70052330 70052377 -33442597 - MTEb LTR MaLR -324 55 6 7 1119 2177 77 10 0 chr15 70052562 70052861 -33442113 + MTA_Mm LTR MaLR 1 302 -94 7 1119 1361 233 53 17 chr15 70059335 70059693 -33435281 + ORR1D1 LTR MaLR 1 371 -3 9 1119 232 333 57 16 chr15 70064029 70064151 -33430823 - RMER12 LTR ERVK -471 851 725 9 1119 814 272 75 80 chr15 70064932 70065300 -33429674 - MTE2a LTR MaLR -46 373 5 9 1119 685 272 15 77 chr15 70070352 70070611 -33424363 - MT2A LTR ERVL 0 533 291 1 1119 489 304 5 114 chr15 70070755 70070948 -33424026 - MT2A LTR ERVL -313 220 49 1 1119 234 216 20 0 chr15 70071383 70071434 -33423540 - MT2A LTR ERVL -481 52 1 1 1119 2611 144 2 18 chr15 70084305 70084750 -33410224 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 4 1 1119 432 343 112 86 chr15 70085286 70085634 -33409340 - ORR1D2 LTR MaLR -13 357 1 1 1119 540 338 32 23 chr15 70093935 70094153 -33400821 + MTD LTR MaLR 1 220 -199 1 1119 234 358 63 24 chr15 70094516 70094642 -33400332 + MTD LTR MaLR 275 405 -14 1 1119 533 335 46 54 chr15 70097584 70097824 -33397150 - MLT2B2 LTR ERVL -277 238 1 1 1119 2197 219 45 22 chr15 70104916 70105424 -33389550 + RMER5 LTR ERV1 13 532 -2 1 1119 611 366 58 72 chr15 70108365 70108727 -33386247 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 1 1119 264 265 12 24 chr15 70108739 70108824 -33386150 - MTEb LTR MaLR -18 361 278 1 1119 235 376 33 62 chr15 70108897 70109107 -33385867 - MTEb LTR MaLR -153 206 3 1 1119 1399 263 111 24 chr15 70111940 70112399 -33382575 + RMER5 LTR ERV1 2 500 -34 1 1119 612 152 0 27 chr15 70112868 70113017 -33381957 - RMER17B LTR ERVK -495 463 319 1 1119 1008 275 114 87 chr15 70113865 70114383 -33380591 - MT2A LTR ERVL 0 533 2 1 1119 393 321 80 35 chr15 70116876 70117037 -33377937 + MLT1D LTR MaLR 1 167 -338 1 1119 393 321 80 35 chr15 70117107 70117171 -33377803 + MLT1D LTR MaLR 168 235 -270 1 1119 484 191 51 56 chr15 70117113 70117291 -33377683 - RMER17C LTR ERVK -135 275 99 1 1119 255 337 22 0 chr15 70122329 70122418 -33372556 + RMER12 LTR ERVK 750 840 -482 1 1120 716 316 66 63 chr15 70127106 70127777 -33367197 + RLTR6-int LTR ERV1 2096 2768 -4838 1 1120 352 327 32 33 chr15 70127814 70128061 -33366913 + RLTR6-int LTR ERV1 4269 4576 -3202 1 1120 1195 316 59 25 chr15 70128403 70129200 -33365774 + RLTR6-int LTR ERV1 4737 5552 -2004 1 1120 1916 150 84 22 chr15 70136315 70136731 -33358243 + RLTR47_MM LTR ERV1 91 532 0 2 1120 266 134 200 89 chr15 70136915 70137005 -33357969 + RLTR23 LTR ERV1 1 100 -330 2 1120 1649 234 16 0 chr15 70144288 70144664 -33350310 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 2 1120 673 340 54 24 chr15 70144729 70145024 -33349950 + ORR1D2 LTR MaLR 1 304 -66 2 1120 368 171 14 0 chr15 70145065 70145135 -33349839 + ORR1D2 LTR MaLR 298 368 -2 2 1120 319 360 112 51 chr15 70169751 70169947 -33325027 + MLT1A0 LTR MaLR 152 359 -6 2 1120 301 341 7 110 chr15 70170699 70170854 -33324120 + MLT1A0 LTR MaLR 9 147 -218 2 1120 1269 274 40 51 chr15 70172509 70172859 -33322115 + ORR1E LTR MaLR 9 354 -5 2 1120 339 339 21 84 chr15 70182725 70182867 -33312107 + MT2B LTR ERVL 125 257 -344 2 1120 239 325 108 87 chr15 70183566 70183751 -33311223 + ORR1E LTR MaLR 100 288 -71 2 1120 236 327 45 27 chr15 70184489 70184599 -33310375 + MLT1A1 LTR MaLR 294 405 -3 2 1120 517 304 116 52 chr15 70185332 70185770 -33309204 - MER67C LTR ERV1 -237 474 9 2 1120 1368 244 58 11 chr15 70187948 70188286 -33306688 - MTD LTR MaLR 0 419 19 2 1120 2367 114 18 86 chr15 70201328 70201781 -33293193 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 3 1120 227 239 0 0 chr15 70209060 70209106 -33285868 + MLT2D LTR ERVL 122 167 -247 3 1120 342 355 15 7 chr15 70229239 70229375 -33265599 + MTEa LTR MaLR 1 137 -242 3 1120 596 291 110 59 chr15 70229369 70229723 -33265251 + MT2A LTR ERVL 160 531 -2 3 1120 779 318 93 9 chr15 70229847 70230171 -33264803 - MTEa LTR MaLR 0 379 29 3 1120 1847 208 69 3 chr15 70230176 70230537 -33264437 - ORR1B1 LTR MaLR -9 385 1 3 1120 441 207 0 123 chr15 70234473 70234499 -33260475 - MT2B LTR ERVL -337 264 144 3 1120 300 309 12 0 chr15 70236413 70236494 -33258480 + ORR1E LTR MaLR 37 118 -241 3 1120 1342 278 12 21 chr15 70244924 70245346 -33249628 - MTD LTR MaLR -1 418 1 3 1120 603 280 35 70 chr15 70246799 70247171 -33247803 + RLTR10D LTR ERVK 1 359 0 3 1120 241 383 55 16 chr15 70254197 70254380 -33240594 + MLT1J-int LTR MaLR 188 377 -1010 3 1121 241 239 129 20 chr15 70262790 70262991 -33231983 - RMER17C LTR ERVK -164 246 24 3 1121 2765 92 0 3 chr15 70264630 70265010 -33229964 - MTA_Mm LTR MaLR -17 379 1 4 1121 289 297 59 44 chr15 70268194 70268398 -33226576 + RLTR42-int LTR ERVK 1167 1373 -4149 4 1121 2610 221 118 0 chr15 70268443 70269087 -33225887 - RMER6D LTR ERVK 0 720 1 4 1121 3357 38 2 0 chr15 70279788 70280183 -33214791 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1121 818 203 33 0 chr15 70286825 70286978 -33207996 + MTC LTR MaLR 1 158 -263 4 1121 225 258 14 96 chr15 70294236 70294309 -33200665 + MLT1B LTR MaLR 2 68 -322 4 1121 1336 175 40 8 chr15 70294473 70294726 -33200248 + RMER5 LTR ERV1 274 534 0 4 1121 2178 23 114 0 chr15 70296162 70296424 -33198550 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 1 4 1121 254 311 75 52 chr15 70300908 70301081 -33193893 - MLT1A LTR MaLR -8 366 190 4 1121 1431 258 34 56 chr15 70302880 70303291 -33191683 + MTD LTR MaLR 2 403 -16 4 1121 981 274 124 63 chr15 70306562 70307088 -33187886 + RMER4B LTR ERVK 17 574 -11 4 1121 3565 221 34 32 chr15 70307125 70307248 -33187726 + MurERV4-int LTR ERVK 2210 2341 -2919 4 1121 3565 221 34 32 chr15 70307303 70308034 -33186940 + MurERV4-int LTR ERVK 2342 3065 -2195 4 1121 402 232 8 111 chr15 70310320 70310446 -33184528 - MT2B LTR ERVL -337 264 152 4 1121 466 326 163 10 chr15 70310811 70311111 -33183863 - ORR1E LTR MaLR -2 357 12 4 1121 661 254 133 19 chr15 70321332 70321620 -33173354 - MT2A LTR ERVL -112 489 87 4 1121 386 233 12 0 chr15 70322585 70322671 -33172303 - MT2A LTR ERVL -446 87 1 4 1121 824 286 135 33 chr15 70337951 70338255 -33156719 - MTE2b LTR MaLR -13 366 32 5 1121 264 365 36 62 chr15 70344483 70344676 -33150298 + MLT1K LTR MaLR 351 538 -57 5 1121 3698 234 58 15 chr15 70354819 70355773 -33139201 - RLTR25A LTR ERVK 0 1028 11 5 1121 964 306 92 8 chr15 70361703 70362062 -33132912 - MTD LTR MaLR -16 403 15 5 1121 4357 148 18 0 chr15 70369124 70369805 -33125169 + RMER19A LTR ERVK 2 694 -43 5 1121 1710 158 37 16 chr15 70370951 70371273 -33123701 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1121 2449 198 41 10 chr15 70375096 70375607 -33119367 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 2 5 1121 864 274 68 19 chr15 70379341 70379605 -33115369 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 94 5 1122 3366 193 90 70 chr15 70388274 70388470 -33106504 + RMER19B LTR ERVK 56 240 -662 5 1122 3366 190 88 75 chr15 70388497 70389150 -33105824 + RMER19B LTR ERVK 241 902 0 5 1122 367 261 15 92 chr15 70390137 70390268 -33104706 - MT2B LTR ERVL -337 264 144 5 1122 1089 266 108 37 chr15 70390573 70391080 -33103894 + RMER20B LTR ERVK 1 543 -84 5 1122 294 295 0 25 chr15 70391184 70391264 -33103710 + RMER20B LTR ERVK 527 604 -23 5 1122 1328 297 28 3 chr15 70393711 70394069 -33100905 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 5 1122 307 264 14 0 chr15 70396568 70396640 -33098334 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 339 5 1122 362 342 26 26 chr15 70396676 70396865 -33098109 - RLTR10A LTR ERVK -76 335 147 5 1122 736 261 142 4 chr15 70404009 70404248 -33090726 - ORR1D1 LTR MaLR -11 363 92 5 1122 1014 223 63 5 chr15 70404243 70404464 -33090510 + ORR1B1 LTR MaLR 161 394 0 6 1122 1019 324 35 51 chr15 70405778 70406152 -33088822 - MTE2a LTR MaLR -5 374 7 6 1122 367 280 1 37 chr15 70410214 70410339 -33084635 - MTEa LTR MaLR -3 376 255 6 1122 433 316 35 0 chr15 70412780 70412894 -33082080 + ORR1E LTR MaLR 76 193 -166 6 1122 1890 125 51 13 chr15 70412922 70413237 -33081737 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1122 851 338 124 75 chr15 70413422 70414177 -33080797 + ORR1E-int LTR MaLR 672 1434 -146 6 1122 573 323 35 25 chr15 70414184 70414384 -33080590 + ORR1E LTR MaLR 1 202 -157 6 1122 275 185 19 0 chr15 70414447 70414501 -33080473 + ORR1E LTR MaLR 325 379 0 6 1122 610 211 19 24 chr15 70418162 70418356 -33076618 + RMER10A LTR ERVL 303 441 -1 6 1122 266 233 91 119 chr15 70419522 70419741 -33075233 + RLTR19-int LTR ERVK 2861 3073 -3064 6 1122 5070 184 25 76 chr15 70419953 70420470 -33074504 + RLTR25A LTR ERVK 1 503 -600 6 1122 5070 184 25 76 chr15 70420502 70421146 -33073828 + RLTR25A LTR ERVK 504 1103 0 6 1122 256 285 53 99 chr15 70423704 70423856 -33071118 + RMER17C-int LTR ERVK 2744 2888 -350 6 1122 280 294 0 14 chr15 70424049 70424118 -33070856 + RLTR19-int LTR ERVK 4252 4319 -1818 6 1122 1387 242 71 33 chr15 70424167 70424590 -33070384 + RMER10A LTR ERVL 1 439 -3 6 1122 915 117 490 0 chr15 70429453 70429643 -33065331 + ORR1A2 LTR MaLR 1 283 -44 6 1122 2030 110 3 0 chr15 70434146 70434436 -33060538 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 29 6 1122 308 393 101 30 chr15 70434559 70434926 -33060048 + MLT1J2 LTR MaLR 7 399 -49 6 1122 731 318 116 39 chr15 70435087 70435424 -33059550 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 8 6 1122 666 346 58 47 chr15 70444283 70444647 -33050327 - MTEb LTR MaLR -2 377 10 6 1122 1834 256 85 43 chr15 70452304 70452997 -33041977 + RMER6C LTR ERVK 1 697 -59 6 1122 930 178 0 45 chr15 70452988 70453165 -33041809 + RMER6D LTR ERVK 552 720 0 6 1122 425 207 34 25 chr15 70455651 70455770 -33039204 + RLTR15 LTR ERVK 2 121 -238 6 1122 1864 222 14 12 chr15 70461977 70462396 -33032578 - MTC LTR MaLR -1 420 1 6 1122 251 281 162 7 chr15 70466148 70466284 -33028690 - ERVL-E-int LTR ERVL -1550 4117 3961 6 1122 678 226 62 12 chr15 70466407 70466568 -33028406 - RMER15 LTR ERVL -111 464 296 6 1122 256 376 64 68 chr15 70467701 70467952 -33027022 + ORR1E LTR MaLR 64 313 -46 6 1122 2317 105 3 9 chr15 70469276 70469603 -33025371 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 6 1122 2113 191 28 2 chr15 70469758 70470152 -33024822 + MTC LTR MaLR 18 421 0 6 1122 1945 218 51 24 chr15 70477963 70478117 -33016857 - MTC LTR MaLR 0 421 268 6 1122 1945 218 51 24 chr15 70478230 70478485 -33016489 - MTC LTR MaLR -154 267 1 6 1122 1496 206 53 32 chr15 70479613 70479989 -33014985 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 6 1122 1936 208 24 5 chr15 70481654 70482010 -33012964 - MTC LTR MaLR -2 419 58 7 1122 1936 208 24 5 chr15 70482034 70482088 -33012886 - MTC LTR MaLR -364 57 2 7 1122 396 295 7 103 chr15 70482688 70482897 -33012077 + RMER17C LTR ERVK 1 182 -228 7 1122 396 295 7 103 chr15 70482988 70483001 -33011973 + RMER17C LTR ERVK 183 195 -215 7 1122 396 295 7 103 chr15 70483182 70483230 -33011744 + RMER17C LTR ERVK 196 244 -166 7 1122 258 258 166 4 chr15 70492307 70492434 -33002540 + ORR1C2 LTR MaLR 61 194 -190 7 1122 752 263 44 18 chr15 70492445 70492666 -33002308 + ORR1C2 LTR MaLR 153 384 0 7 1122 368 308 118 67 chr15 70507670 70507924 -32987050 - MLT1A0 LTR MaLR -95 270 4 1 1122 663 352 72 53 chr15 70508926 70509301 -32985673 + MLT1B LTR MaLR 1 382 -8 1 1123 1403 228 39 87 chr15 70516891 70517304 -32977670 + RMER10B LTR ERVL 6 398 0 2 1123 1817 270 10 2 chr15 70518053 70518465 -32976509 + MTC LTR MaLR 7 421 0 2 1123 602 171 76 8 chr15 70521222 70521340 -32973634 - RMER13A LTR ERVK -734 126 1 2 1123 4306 121 25 42 chr15 70521531 70522292 -32972682 + RMER17A LTR ERVK 1 748 -3 2 1123 372 434 44 6 chr15 70533682 70534000 -32960974 - LTR16C LTR ERVL -5 484 155 3 1123 1415 241 64 8 chr15 70536561 70536934 -32958040 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1123 419 287 105 112 chr15 70542295 70542581 -32952393 - MER67D LTR ERV1 -207 307 24 5 1123 583 344 116 12 chr15 70544933 70545296 -32949678 + MLT2B1 LTR ERVL 8 503 -64 5 1123 380 292 188 34 chr15 70551240 70551276 -32943698 - MLT2B3 LTR ERVL -278 276 241 6 1123 380 292 188 34 chr15 70551345 70551542 -32943432 - MLT2B3 LTR ERVL -314 240 9 6 1123 870 228 118 50 chr15 70555172 70555644 -32939330 - RMER20B LTR ERVK -114 513 10 7 1123 446 305 142 59 chr15 70556743 70557067 -32937907 + ORR1E LTR MaLR 5 355 -4 7 1123 1153 176 124 89 chr15 70564298 70564678 -32930296 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 8 1123 2163 113 3 58 chr15 70570623 70570969 -32924005 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 9 1123 1427 189 92 102 chr15 70571645 70572016 -32922958 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1123 3570 197 26 46 chr15 70572016 70572605 -32922369 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 936 1 1123 3570 197 26 46 chr15 70572648 70572863 -32922111 - ORR1B2-int LTR MaLR -574 935 721 1 1123 1035 282 90 10 chr15 70572976 70573277 -32921697 + MTD LTR MaLR 93 417 -2 1 1123 773 316 114 19 chr15 70573307 70573675 -32921299 + RMER5 LTR ERV1 132 534 0 1 1123 265 369 27 34 chr15 70575713 70575859 -32919115 + MER74B LTR ERVL 12 156 -402 1 1123 267 302 151 35 chr15 70575876 70576075 -32918899 + MER74B LTR ERVL 266 487 -135 1 1123 841 254 171 31 chr15 70576073 70576366 -32918608 - MTD LTR MaLR -81 338 5 1 1123 231 257 68 68 chr15 70576489 70576606 -32918368 + RMER19A LTR ERVK 597 713 -24 1 1123 301 220 50 50 chr15 70578147 70578286 -32916688 + RMER17B LTR ERVK 321 459 -499 1 1123 2131 155 0 3 chr15 70591196 70591539 -32903435 + ORR1A1 LTR MaLR 1 342 -4 1 1123 9216 168 49 6 chr15 70591543 70593328 -32901646 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1830 -133 1 1123 237 331 41 68 chr15 70593264 70593410 -32901564 + MT2A LTR ERVL 323 464 -69 1 1123 586 262 251 120 chr15 70599420 70599897 -32895077 + MT2B LTR ERVL 2 540 -61 1 1123 248 371 58 33 chr15 70603573 70603693 -32891281 + MLT1D LTR MaLR 1 123 -382 1 1123 239 349 16 93 chr15 70607887 70608070 -32886904 - ORR1E LTR MaLR -127 232 64 1 1123 1146 178 19 0 chr15 70609405 70609613 -32885361 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 230 1 1123 694 332 41 22 chr15 70610956 70611227 -32883747 + MTD LTR MaLR 130 405 -14 1 1123 231 286 60 125 chr15 70613669 70613763 -32881211 - MT2A LTR ERVL -3 581 495 1 1123 616 284 85 51 chr15 70613816 70614207 -32880767 - MT2A LTR ERVL -90 511 3 1 1123 553 316 104 28 chr15 70621698 70621957 -32873017 - MTD LTR MaLR -20 399 108 1 1123 651 297 72 91 chr15 70627644 70628007 -32866967 + MLT1A LTR MaLR 19 374 0 1 1123 321 325 72 41 chr15 70629700 70629921 -32865053 + MLT2D LTR ERVL 54 281 -133 1 1123 1191 244 81 21 chr15 70630346 70630631 -32864343 + MT2A LTR ERVL 1 302 -231 1 1124 4168 98 24 142 chr15 70657199 70658051 -32836923 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 2 1124 357 200 35 12 chr15 70669438 70669524 -32825450 - ORR1D2 LTR MaLR -7 367 280 2 1124 1589 237 107 57 chr15 70671032 70671537 -32823437 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 550 -27 2 1124 2268 211 17 22 chr15 70673902 70674363 -32820611 + MT2A LTR ERVL 1 459 -74 2 1124 2519 298 84 63 chr15 70674462 70675597 -32819377 - ORR1D2-int LTR MaLR -212 1158 1 2 1124 715 288 228 13 chr15 70675597 70675900 -32819074 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 2 1124 423 327 25 56 chr15 70677158 70677320 -32817654 - ORR1E LTR MaLR -194 165 9 2 1124 1003 279 106 21 chr15 70677714 70678054 -32816920 + ORR1D2 LTR MaLR 1 369 -1 2 1124 853 316 10 31 chr15 70680910 70681204 -32813770 - ORR1D2 LTR MaLR -55 315 28 2 1124 4486 140 84 16 chr15 70688985 70689822 -32805152 + RMER17A2 LTR ERVK 2 895 -11 2 1124 1900 208 80 15 chr15 70693049 70693439 -32801535 - MTC LTR MaLR 0 421 7 2 1124 588 352 49 54 chr15 70693577 70693887 -32801087 - MLT1D LTR MaLR -2 503 196 2 1124 588 352 49 54 chr15 70694034 70694113 -32800861 - MLT1D LTR MaLR -310 195 117 2 1124 900 244 246 60 chr15 70694377 70694812 -32800162 - MT2A LTR ERVL -17 516 1 2 1124 252 334 175 41 chr15 70694889 70695204 -32799770 - ORR1E LTR MaLR 0 359 3 2 1124 946 239 133 23 chr15 70697093 70697401 -32797573 + ORR1D2 LTR MaLR 1 342 -28 2 1124 1550 181 62 35 chr15 70704076 70704507 -32790467 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 2 1124 1968 207 80 128 chr15 70706411 70707077 -32787897 - RLTR40 LTR ERVK -19 798 165 3 1124 2831 76 5 8 chr15 70718475 70718860 -32776114 - MTA_Mm LTR MaLR -8 388 5 3 1124 3596 5 2 0 chr15 70720533 70720928 -32774046 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1124 344 351 69 0 chr15 70723488 70723619 -32771355 + ORR1E LTR MaLR 8 147 -212 3 1124 556 347 73 38 chr15 70724744 70725088 -32769886 - MLT2D LTR ERVL -52 362 7 3 1124 265 371 93 29 chr15 70738173 70738345 -32756629 - MLT1A LTR MaLR -2 372 190 3 1124 2459 143 46 52 chr15 70741290 70741823 -32753151 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 3 1124 4729 64 9 18 chr15 70741825 70742499 -32752475 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 3 1124 429 65 0 31 chr15 70742499 70742563 -32752411 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1420 -5061 3 1124 1727 115 4 4 chr15 70742551 70742813 -32752161 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 3 1124 857 81 24 0 chr15 70742810 70742933 -32752041 + IAPEy-int LTR ERVK 4801 4926 -2587 3 1124 446 66 0 0 chr15 70742933 70742994 -32751980 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 3585 -2896 3 1124 12858 9 1 0 chr15 70742986 70744470 -32750504 + IAPEz-int LTR ERVK 4117 5601 -880 3 1124 1905 142 50 55 chr15 70744470 70744886 -32750088 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 62 475 0 3 1124 2139 135 30 3 chr15 70744886 70745221 -32749753 - ORR1A1 LTR MaLR -2 344 1 3 1124 896 314 78 25 chr15 70746436 70746832 -32748142 + RMER5 LTR ERV1 52 468 -66 3 1124 924 267 62 58 chr15 70749954 70750353 -32744621 - RMER16 LTR ERVK 0 533 6 3 1124 2890 186 45 18 chr15 70756525 70757078 -32737896 - RMER15 LTR ERVL -5 570 3 3 1124 373 325 12 60 chr15 70759392 70759525 -32735449 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 254 3 1124 3112 58 2 30 chr15 70759525 70759932 -32735042 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1124 373 325 12 60 chr15 70759932 70759965 -32735009 - RLTR14 LTR ERV1 -129 253 224 3 1124 440 267 70 20 chr15 70766467 70766666 -32728308 + RMER17C-int LTR ERVK 2658 2866 -372 3 1124 376 291 49 37 chr15 70766765 70767065 -32727909 + RMER17C-int LTR ERVK 3031 3235 -3 3 1124 1100 215 19 55 chr15 70772848 70773158 -32721816 + RMER17C LTR ERVK 1 299 -111 3 1124 255 305 69 59 chr15 70773607 70773708 -32721266 + MT2B LTR ERVL 158 259 -342 3 1124 288 378 67 75 chr15 70775235 70775587 -32719387 - MTEb LTR MaLR -39 340 3 4 1125 1601 160 169 22 chr15 70780801 70781121 -32713853 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 10 4 1125 407 284 65 80 chr15 70781370 70781695 -32713279 + RMER10A LTR ERVL 122 441 -1 4 1125 3072 164 38 23 chr15 70785764 70785855 -32709119 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 477 4 1125 3072 164 38 23 chr15 70785898 70786366 -32708608 - RLTR20D LTR ERVK -92 476 3 4 1125 314 302 45 23 chr15 70786476 70786564 -32708410 - ORR1E LTR MaLR -227 132 43 4 1125 560 276 7 138 chr15 70786604 70786742 -32708232 - MTE-int LTR MaLR -76 1504 1393 4 1125 560 276 7 138 chr15 70786913 70787043 -32707931 - MTE-int LTR MaLR -188 1392 1271 4 1125 485 348 143 25 chr15 70787263 70787584 -32707390 - MTE-int LTR MaLR -398 1182 824 4 1125 423 385 119 23 chr15 70787754 70788267 -32706707 - MTE-int LTR MaLR -955 625 64 4 1125 2243 107 0 9 chr15 70792424 70792746 -32702228 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1125 259 391 0 25 chr15 70797456 70797574 -32697400 + MLT1B LTR MaLR 18 132 -258 4 1125 1880 211 44 21 chr15 70799541 70799924 -32695050 + MTB_Mm LTR MaLR 8 399 -8 4 1125 2165 181 32 7 chr15 70806045 70806375 -32688599 - MTC LTR MaLR 0 421 84 4 1125 2165 181 32 7 chr15 70806908 70806982 -32687992 - MTC LTR MaLR -338 83 9 4 1125 2153 123 13 0 chr15 70814513 70814829 -32680145 + ORR1A2 LTR MaLR 8 327 0 4 1125 1722 209 57 26 chr15 70816632 70817019 -32677955 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 4 1125 311 318 93 55 chr15 70821424 70821607 -32673367 + MLT1C LTR MaLR 73 262 -205 4 1125 305 301 119 30 chr15 70822294 70822496 -32672478 - MLT2C2 LTR ERVL 0 464 245 4 1125 883 278 39 9 chr15 70822932 70823164 -32671810 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 124 4 1125 321 246 0 0 chr15 70823164 70823233 -32671741 - RMER17B LTR ERVK 0 958 890 4 1125 5057 152 72 9 chr15 70830461 70831356 -32663618 + RMER17B LTR ERVK 1 951 -7 4 1125 944 308 75 18 chr15 70831528 70831851 -32663123 + ORR1E LTR MaLR 1 343 -16 4 1125 482 305 60 6 chr15 70833106 70833274 -32661700 + LTR82A LTR ERVL 144 320 -552 4 1125 388 277 54 103 chr15 70845936 70846121 -32648853 + MLT1A1 LTR MaLR 221 396 -12 5 1125 736 361 31 20 chr15 70848375 70848731 -32646243 + MLT2B3 LTR ERVL 1 360 -194 5 1125 1038 159 86 36 chr15 70850862 70851084 -32643890 + RMER6A LTR ERVK 36 268 -488 5 1125 1875 141 21 56 chr15 70861229 70861567 -32633407 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 1125 680 332 127 62 chr15 70863459 70864150 -32630824 + LTR68 LTR ERV1 3 738 -2 5 1125 1101 287 46 22 chr15 70865410 70865780 -32629194 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 5 1125 802 293 142 56 chr15 70871125 70871483 -32623491 - MTD LTR MaLR -14 405 17 5 1125 289 336 115 60 chr15 70872978 70873212 -32621762 - MLT1F1 LTR MaLR -10 559 313 5 1125 923 320 35 41 chr15 70879503 70879848 -32615126 + MTEb LTR MaLR 35 377 -2 5 1125 2101 181 56 8 chr15 70883283 70883678 -32611296 - MTC LTR MaLR -5 416 3 5 1125 1640 188 106 23 chr15 70886222 70886609 -32608365 - MTC LTR MaLR 0 421 3 5 1125 313 351 84 22 chr15 70889497 70889724 -32605250 + LTR89 LTR ERVL? 2 242 -637 5 1125 232 238 15 73 chr15 70890080 70890148 -32604826 - MTEa LTR MaLR -4 375 312 5 1125 572 341 63 24 chr15 70890298 70890550 -32604424 - MTEa LTR MaLR -99 280 19 5 1125 1016 272 86 12 chr15 70892748 70893087 -32601887 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 3 5 1125 265 357 71 0 chr15 70894618 70894730 -32600244 - MLT2F LTR ERVL -537 126 7 5 1125 857 301 83 24 chr15 70900251 70900503 -32594471 - MTEa LTR MaLR -110 269 3 5 1125 2417 211 74 10 chr15 70900901 70901412 -32593562 - RMER15 LTR ERVL -2 573 30 5 1126 855 201 73 11 chr15 70922379 70922570 -32572404 + MTC LTR MaLR 1 203 -218 6 1126 972 204 65 0 chr15 70923091 70923292 -32571682 + MTC LTR MaLR 199 412 -9 6 1126 2441 159 38 21 chr15 70928597 70929020 -32565954 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 6 1126 1749 130 86 0 chr15 70930985 70931286 -32563688 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 327 -5 6 1126 5544 104 15 42 chr15 70932830 70933741 -32561233 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 6 1126 2155 177 32 10 chr15 70942971 70943371 -32551603 - MTC LTR MaLR 0 421 13 6 1126 265 323 197 29 chr15 70943377 70943657 -32551317 - MLT2B4 LTR ERVL -89 467 90 6 1126 794 271 87 21 chr15 70943670 70944024 -32550950 + MTD LTR MaLR 7 405 -14 6 1126 1280 222 74 54 chr15 70946033 70946230 -32548744 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 164 6 1126 1280 222 74 54 chr15 70946398 70946552 -32548422 - ORR1D1 LTR MaLR -211 163 10 6 1126 725 313 60 65 chr15 70946920 70947274 -32547700 + MTE2a LTR MaLR 63 377 -42 6 1126 782 94 0 0 chr15 70947645 70947751 -32547223 + LTRIS2 LTR ERV1 380 485 -79 6 1126 7158 83 47 6 chr15 70954511 70955494 -32539480 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 6 1126 1128 319 30 3 chr15 70957623 70957960 -32537014 + MTEa LTR MaLR 34 379 0 6 1126 469 227 38 87 chr15 70959550 70959815 -32535159 + RMER17C LTR ERVK 1 252 -158 6 1126 344 222 46 107 chr15 70962618 70962749 -32532225 - MT2B LTR ERVL -337 264 142 6 1126 933 277 20 0 chr15 70965828 70966030 -32528944 + ORR1D1 LTR MaLR 1 206 -168 6 1126 258 130 259 0 chr15 70975556 70975610 -32519364 - RLTR20A1 LTR ERVK -483 68 1 6 1126 2155 225 27 8 chr15 70978344 70978819 -32516155 - RLTR16 LTR ERVK -11 494 11 7 1126 300 289 70 0 chr15 70979962 70980076 -32514898 - MLT2D LTR ERVL -273 141 20 7 1126 1010 243 41 96 chr15 70989351 70989690 -32505284 + MT2A LTR ERVL 1 454 -147 7 1126 3026 57 26 0 chr15 70994953 70995342 -32499632 - MTB LTR MaLR 0 400 2 7 1126 386 218 82 8 chr15 70996272 70996377 -32498597 - MTD LTR MaLR -19 400 272 7 1126 1569 273 82 21 chr15 70996378 70996901 -32498073 - RMER19C LTR ERVK 0 611 57 7 1126 567 349 36 5 chr15 70996904 70997100 -32497874 - MTD LTR MaLR -121 298 97 7 1126 669 223 119 11 chr15 71003756 71003933 -32491041 - MTEa LTR MaLR 0 379 184 3 1126 313 349 137 0 chr15 71004410 71004556 -32490418 - MTEa LTR MaLR -213 166 1 3 1126 752 261 171 46 chr15 71010354 71010723 -32484251 + MTD LTR MaLR 5 419 0 1 1126 562 309 97 44 chr15 71011636 71011957 -32483017 + MLT2B3 LTR ERVL 31 368 -188 1 1126 1197 258 34 67 chr15 71011959 71012346 -32482628 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 3 1 1126 232 139 70 0 chr15 71012418 71012461 -32482513 + MLT2D LTR ERVL 510 555 -5 1 1126 466 304 97 82 chr15 71013862 71014200 -32480774 + MLT1A LTR MaLR 2 344 -30 1 1126 441 378 50 18 chr15 71014200 71014537 -32480437 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 16 1 1126 727 323 36 36 chr15 71016450 71016607 -32478367 + RMER5 LTR ERV1 33 190 -344 2 1126 727 323 36 36 chr15 71016790 71016937 -32478037 + RMER5 LTR ERV1 191 337 -197 2 1126 532 267 55 13 chr15 71019089 71019241 -32475733 - MTD LTR MaLR -260 159 6 2 140 2373 88 95 8 chr15 71040942 71041320 -32453654 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1127 536 159 16 124 chr15 71041321 71041450 -32453524 + IAPEz-int LTR ERVK 9 123 -6358 4 1127 227 267 0 0 chr15 71041450 71041495 -32453479 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 4 1127 3448 66 7 16 chr15 71041495 71042070 -32452904 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 4 1127 2211 68 0 0 chr15 71042070 71042348 -32452626 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 4 1127 6195 36 4 12 chr15 71042342 71043097 -32451877 + IAPEz-int LTR ERVK 5731 6479 -2 4 1127 2368 86 101 8 chr15 71043099 71043475 -32451499 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 4 1127 476 357 50 43 chr15 71044788 71045069 -32449905 - RMER15 LTR ERVL -14 561 279 4 1127 485 326 21 0 chr15 71058630 71058774 -32436200 - MLT2B4 LTR ERVL -409 147 1 6 1127 292 300 59 37 chr15 71058778 71058913 -32436061 - MLT1C LTR MaLR -329 138 1 6 1127 492 385 43 31 chr15 71060169 71060424 -32434550 - LTR16A LTR ERVL -27 424 167 6 1127 2773 33 0 45 chr15 71061396 71061749 -32433225 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 7 1127 7568 20 3 0 chr15 71061749 71062649 -32432325 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 5579 7 1127 41112 24 16 7 chr15 71062650 71067660 -32427314 - IAPEz-int LTR ERVK -1418 5063 8 7 1127 2773 33 0 45 chr15 71067660 71068013 -32426961 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 7 1127 401 307 124 96 chr15 71073855 71074251 -32420723 - MLT1H1 LTR MaLR -1 554 148 7 1127 2089 169 66 6 chr15 71085677 71086041 -32408933 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 9 1127 1585 209 75 39 chr15 71086303 71086661 -32408313 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 1 9 1127 645 259 155 0 chr15 71087029 71087222 -32407752 - MTD LTR MaLR -20 399 177 9 1127 312 264 180 52 chr15 71102141 71102313 -32392661 - MLT2B2 LTR ERVL -37 525 310 1 1127 3007 103 220 47 chr15 71103501 71103836 -32391138 - RMER17A LTR ERVK 0 751 354 1 1127 3007 103 220 47 chr15 71104015 71104319 -32390655 - RMER17A LTR ERVK -398 353 1 1 1127 947 232 116 91 chr15 71104826 71105187 -32389787 + RLTR12B LTR ERVK 12 381 -147 1 1127 362 300 117 6 chr15 71105539 71105710 -32389264 + MLT1D LTR MaLR 3 192 -313 1 1127 367 297 155 19 chr15 71105761 71105967 -32389007 + MLT1D LTR MaLR 272 505 0 1 1127 1264 290 18 40 chr15 71107701 71108097 -32386877 - MTE2a LTR MaLR -2 417 20 1 1127 306 364 0 8 chr15 71108689 71108811 -32386163 + MLT1C LTR MaLR 343 463 -4 1 1127 795 319 40 52 chr15 71109265 71109612 -32385362 - MLT2B1 LTR ERVL -172 348 6 1 1127 2002 228 36 17 chr15 71110757 71111280 -32383694 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 1 1127 1788 153 181 10 chr15 71114989 71115386 -32379588 - RMER4A LTR ERVK -1 465 1 1 1127 228 224 20 0 chr15 71120356 71120405 -32374569 - MER67B LTR ERV1 -274 387 338 1 1127 1105 289 56 74 chr15 71120633 71121010 -32373964 + MTEa LTR MaLR 1 370 -9 1 1127 226 214 10 152 chr15 71121432 71121531 -32373443 - RMER17D2 LTR ERVK -666 143 59 1 1127 744 258 5 26 chr15 71122347 71122538 -32372436 + MTD LTR MaLR 1 187 -232 1 1127 4634 147 20 64 chr15 71125071 71126014 -32368960 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 1 1127 612 311 86 86 chr15 71129514 71129876 -32365098 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 4 1 1127 740 223 162 78 chr15 71131791 71132014 -32362960 - RMER10A LTR ERVL 0 442 206 1 1127 740 223 162 78 chr15 71132041 71132225 -32362749 - RMER10A LTR ERVL -237 205 1 1 1127 611 351 129 15 chr15 71133915 71134311 -32360663 + MLT2B2 LTR ERVL 3 443 -72 1 1127 293 320 132 76 chr15 71147396 71147646 -32347328 - MLT1E3 LTR MaLR 0 624 361 1 1127 976 307 50 20 chr15 71149386 71149763 -32345211 - MTD LTR MaLR -14 386 11 1 1127 1313 259 61 21 chr15 71151382 71151709 -32343265 + ORR1D2 LTR MaLR 3 342 -28 1 1127 1789 208 31 31 chr15 71153711 71154093 -32340881 - ORR1B1 LTR MaLR -12 382 1 1 1127 976 242 41 60 chr15 71156070 71156523 -32338451 + RLTR16 LTR ERVK 6 493 -12 1 1127 442 267 107 56 chr15 71158223 71158540 -32336434 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 1 1127 387 276 19 19 chr15 71163605 71163712 -32331262 + MTD LTR MaLR 10 116 -303 2 1127 548 270 71 104 chr15 71167747 71167958 -32327016 + MTEa LTR MaLR 176 379 0 2 1127 529 219 38 156 chr15 71170200 71170411 -32324563 + MTE2a LTR MaLR 8 193 -186 2 1128 3783 152 123 94 chr15 71180157 71180950 -32314024 - RMER19B LTR ERVK 0 902 72 2 1128 1214 201 196 81 chr15 71180950 71181455 -32313519 + RMER2 LTR ERV1 1 563 -4 2 1128 3783 152 123 94 chr15 71181455 71181537 -32313437 - RMER19B LTR ERVK -831 71 1 2 1128 275 222 0 87 chr15 71186352 71186421 -32308553 - ORR1E LTR MaLR -296 63 1 2 1128 2938 161 167 3 chr15 71189689 71190263 -32304711 - RLTR33 LTR ERVK -10 668 1 2 1128 329 335 210 8 chr15 71193904 71194142 -32300832 + RMER15 LTR ERVL 276 561 -14 2 1128 1551 249 54 21 chr15 71201263 71201652 -32293322 + MTD LTR MaLR 18 419 0 2 1128 253 339 8 48 chr15 71204459 71204583 -32290391 + MLT1D LTR MaLR 99 217 -410 2 1128 283 292 105 53 chr15 71204647 71204799 -32290175 + MLT1D LTR MaLR 343 502 -3 2 1128 361 294 289 16 chr15 71212887 71213195 -32281779 - MER57C2 LTR ERV1 0 434 43 2 1128 888 314 101 15 chr15 71214583 71214832 -32280142 - MTE2b LTR MaLR -12 367 99 2 1128 888 314 101 15 chr15 71214877 71214963 -32280011 - MTE2b LTR MaLR -281 98 3 2 1128 424 324 160 10 chr15 71222341 71222547 -32272427 + RMER15 LTR ERVL 296 532 -43 2 1128 2559 174 26 45 chr15 71222906 71223478 -32271496 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 2 1128 968 250 29 80 chr15 71224614 71225037 -32269937 + RLTR11B LTR ERVK 1 414 -27 2 1128 740 298 31 81 chr15 71232033 71232292 -32262682 - MTEa LTR MaLR -133 246 1 2 1128 874 313 60 34 chr15 71245816 71246218 -32248756 + MTE2a LTR MaLR 1 419 0 3 1128 2778 83 24 52 chr15 71246439 71246858 -32248116 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1128 6691 116 15 68 chr15 71246858 71248018 -32246956 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1128 999 91 0 0 chr15 71248020 71248152 -32246822 + MTB_Mm LTR MaLR 3 134 -266 3 1128 3644 124 7 28 chr15 71248154 71248733 -32246241 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 3 1128 1146 292 29 45 chr15 71249174 71249658 -32245316 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1109 3954 3612 3 1128 298 354 90 9 chr15 71250127 71250338 -32244636 - MuLV-int LTR ERV1 -3352 4254 4027 3 1128 1911 122 0 4 chr15 71250656 71250935 -32244039 + MTB_Mm LTR MaLR 130 407 0 3 1128 309 281 92 0 chr15 71252253 71252359 -32242615 + MTEa LTR MaLR 12 127 -252 3 1128 2675 61 0 52 chr15 71252650 71253015 -32241959 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1128 1055 291 124 16 chr15 71258658 71259022 -32235952 - MTD LTR MaLR -2 417 15 3 1128 382 175 50 0 chr15 71259725 71259805 -32235169 + MTD LTR MaLR 22 105 -316 3 1128 740 276 114 8 chr15 71259899 71260144 -32234830 + MTD LTR MaLR 135 405 -14 3 1128 228 345 136 54 chr15 71260618 71260802 -32234172 - MTEa LTR MaLR -16 363 165 3 1128 268 316 127 104 chr15 71264187 71264399 -32230575 - MTEb LTR MaLR -162 217 1 3 1128 2262 201 27 5 chr15 71266665 71267109 -32227865 - RLTR17 LTR ERVK -73 619 166 3 1128 450 214 62 16 chr15 71267814 71267942 -32227032 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 297 3 1128 1639 245 72 13 chr15 71284818 71285189 -32209785 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 3 1128 533 181 67 59 chr15 71296710 71296845 -32198129 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 557 3 1128 1373 168 11 19 chr15 71296836 71297097 -32197877 - RLTR17 LTR ERVK -336 356 98 3 1128 2411 158 107 25 chr15 71299181 71299669 -32195305 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 3 1128 988 270 61 134 chr15 71299728 71300122 -32194852 + MTE2a LTR MaLR 1 365 -14 3 1129 721 321 132 63 chr15 71303396 71303811 -32191163 + MLT2B3 LTR ERVL 83 526 -28 3 1129 965 257 75 99 chr15 71306346 71306730 -32188244 - MTE2a LTR MaLR -4 375 1 3 1129 1166 215 72 18 chr15 71306844 71307183 -32187791 + MTEa LTR MaLR 1 370 -9 3 1129 803 270 184 16 chr15 71312708 71313028 -32181946 + MTE2b LTR MaLR 4 377 -2 3 1129 313 348 68 72 chr15 71314793 71315056 -32179918 + MER21B LTR ERV1 40 301 -562 4 1129 705 308 125 45 chr15 71315470 71315847 -32179127 + MER21B LTR ERV1 300 706 -157 4 1129 653 346 60 32 chr15 71317991 71318424 -32176550 + LTR31 LTR ERV1 173 617 -2 4 1129 292 200 82 41 chr15 71329065 71329138 -32165836 + ORR1E LTR MaLR 1 76 -303 4 1129 314 319 99 86 chr15 71329413 71329646 -32165328 + ORR1E LTR MaLR 64 299 -60 4 1129 1227 251 60 30 chr15 71330877 71331210 -32163764 + MTE2a LTR MaLR 37 379 0 4 1129 1832 182 57 55 chr15 71336265 71336648 -32158326 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 4 1129 2029 101 7 3 chr15 71340842 71341131 -32153843 + ORR1A2 LTR MaLR 38 327 0 4 1129 485 335 73 73 chr15 71349322 71349731 -32145243 + MLT2D LTR ERVL 5 413 -1 4 1129 1103 270 81 107 chr15 71359921 71360306 -32134668 + MTE2a LTR MaLR 1 375 -4 4 1129 402 347 98 51 chr15 71364947 71365202 -32129772 + MLT1A0 LTR MaLR 99 365 0 4 1129 1142 243 67 17 chr15 71365358 71365655 -32129319 + ORR1D2 LTR MaLR 11 322 -48 4 1129 390 145 0 0 chr15 71370923 71370985 -32123989 + ORR1B1 LTR MaLR 1 62 -332 4 1129 410 332 112 60 chr15 71374388 71374673 -32120301 + ORR1E LTR MaLR 42 341 -18 4 1129 500 319 27 81 chr15 71378617 71378876 -32116098 + MLT1B LTR MaLR 96 340 -50 4 1129 737 320 115 56 chr15 71385926 71386429 -32108545 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 4 1129 229 200 0 146 chr15 71390594 71390653 -32104321 + RLTR13B3 LTR ERVK 532 578 -351 4 1129 762 266 0 11 chr15 71390653 71390839 -32104135 + RLTR28B LTR ERVL 1 184 -297 4 1129 254 297 27 118 chr15 71390866 71390909 -32104065 + RLTR28B LTR ERVL 271 314 -167 4 1129 254 297 27 118 chr15 71390936 71391079 -32103895 + RLTR28B LTR ERVL 315 440 -41 4 1129 931 242 73 77 chr15 71398910 71399316 -32095658 - MTE2a LTR MaLR -7 412 1 5 1129 515 344 67 27 chr15 71400978 71401277 -32093697 + MLT1D LTR MaLR 183 493 -12 5 1129 295 282 14 78 chr15 71401386 71401528 -32093446 + ORR1C1 LTR MaLR 6 138 -240 5 1129 1365 161 180 30 chr15 71401784 71402118 -32092856 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 5 1129 1170 283 58 35 chr15 71405567 71405915 -32089059 - ORR1D2 LTR MaLR -9 361 6 5 1129 1753 165 3 113 chr15 71412704 71413074 -32081900 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1129 295 260 51 13 chr15 71426311 71426389 -32068585 + MTE2a LTR MaLR 60 140 -239 5 1129 283 340 59 63 chr15 71427534 71427852 -32067122 - ORR1E LTR MaLR -4 355 3 5 1129 2331 75 3 54 chr15 71428369 71428719 -32066255 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 5 141 54638 17 3 6 chr15 71428719 71435214 -32059760 + IAPEz-int LTR ERVK 6 6481 0 5 1130 2331 75 3 54 chr15 71435214 71435564 -32059410 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 5 1130 2942 41 3 0 chr15 71436699 71437044 -32057930 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1130 697 229 109 22 chr15 71438209 71438392 -32056582 - MTD LTR MaLR 0 419 221 5 1130 229 307 53 0 chr15 71446822 71446897 -32048077 + MTE-int LTR MaLR 1383 1461 -119 5 1130 545 261 24 51 chr15 71448284 71448537 -32046437 + MT2A LTR ERVL 132 539 -45 5 1130 976 160 6 56 chr15 71451963 71452142 -32042832 - MTC LTR MaLR -3 418 249 5 1130 3721 168 65 13 chr15 71458612 71459294 -32035680 + RMER6D LTR ERVK 4 720 0 5 1130 420 276 192 60 chr15 71471508 71471774 -32023200 + RMER15 LTR ERVL 275 575 0 6 1130 779 222 79 141 chr15 71473979 71474383 -32020591 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1130 604 235 59 24 chr15 71474546 71474716 -32020258 + MTC LTR MaLR 246 421 0 6 1130 994 242 161 29 chr15 71475141 71475452 -32019522 + MTE2b LTR MaLR 27 378 -1 6 1130 930 277 131 45 chr15 71476458 71476511 -32018463 - MTD LTR MaLR 0 419 363 6 1130 930 277 131 45 chr15 71476687 71477015 -32017959 - MTD LTR MaLR -57 362 5 6 1130 310 319 146 81 chr15 71478883 71479204 -32015770 + MLT1A LTR MaLR 33 374 0 6 1130 849 280 40 136 chr15 71498279 71498676 -31996298 - MTE2a LTR MaLR -15 364 6 6 1130 384 340 81 44 chr15 71507526 71507797 -31987177 - MLT1G3 LTR MaLR -299 296 16 1 1130 525 335 95 16 chr15 71513259 71513511 -31981463 - MER31B LTR ERV1 -52 414 143 2 1130 283 280 21 11 chr15 71513910 71514004 -31980970 - MER31B LTR ERV1 -388 97 3 2 1130 1075 276 81 51 chr15 71521506 71521899 -31973075 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 1130 669 314 68 39 chr15 71522004 71522028 -31972946 + MLT2B4 LTR ERVL 13 35 -521 4 1130 1630 146 28 169 chr15 71522028 71522489 -31972485 + RMER10B LTR ERVL 1 396 -2 4 1130 669 314 68 39 chr15 71522489 71522775 -31972199 + MLT2B4 LTR ERVL 36 332 -224 4 1130 723 301 86 53 chr15 71523246 71523616 -31971358 - MTE2a LTR MaLR 0 379 26 4 1130 1114 269 115 18 chr15 71529238 71529621 -31965353 + RLTR20C LTR ERVK 49 468 -66 5 1130 1059 249 18 115 chr15 71560773 71561173 -31933801 + MTE2a LTR MaLR 19 379 0 8 1130 294 363 83 74 chr15 71561654 71561978 -31932996 + MamGypLTR3 LTR Gypsy 380 706 -133 8 1130 1166 225 147 13 chr15 71564234 71564540 -31930434 + MTD LTR MaLR 72 418 -1 9 1131 689 298 108 21 chr15 71569090 71569423 -31925551 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 2 1 1131 927 321 33 4 chr15 71573382 71573654 -31921320 - MTE2b LTR MaLR -59 320 41 1 1131 993 164 223 60 chr15 71580369 71580687 -31914287 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 1 1131 264 340 98 80 chr15 71582896 71583120 -31911854 - MLT1H LTR MaLR -109 440 213 1 1131 253 362 0 0 chr15 71583368 71583448 -31911526 - MLT1H LTR MaLR -338 151 72 1 1131 246 330 21 11 chr15 71585181 71585276 -31909698 - LTR37B LTR ERV1 -174 294 199 1 1131 2643 198 25 113 chr15 71585808 71586496 -31908478 + RMER20B LTR ERVK 1 627 0 1 1131 4563 152 66 69 chr15 71588331 71589235 -31905739 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 1131 322 345 145 66 chr15 71589256 71589712 -31905262 + MLT1D LTR MaLR 14 505 0 1 1131 394 297 65 115 chr15 71590105 71590322 -31904652 + RLTR25A LTR ERVK 3 208 -895 1 1131 974 239 71 62 chr15 71590383 71590776 -31904198 - RMER19C LTR ERVK -199 412 1 1 1131 243 305 68 38 chr15 71595228 71595361 -31899613 + MLT1D LTR MaLR 367 503 -2 1 1131 352 321 73 56 chr15 71595690 71595924 -31899050 - MLT1E3 LTR MaLR -9 615 378 1 1131 240 340 61 49 chr15 71598268 71598432 -31896542 + MLT1H LTR MaLR 84 249 -300 1 1131 539 325 104 40 chr15 71610448 71610698 -31884276 - MLT1E1A LTR MaLR -85 595 330 1 1131 587 339 104 34 chr15 71611097 71611482 -31883492 + LTR53 LTR ERVL 94 505 -14 1 1131 346 322 16 8 chr15 71612039 71612161 -31882813 + LTR53 LTR ERVL 189 311 -208 1 1131 483 299 28 7 chr15 71619777 71619922 -31875052 - MTEa LTR MaLR -231 148 1 1 1131 663 288 78 89 chr15 71621172 71621320 -31873654 - MTE2a LTR MaLR -13 366 204 1 1131 663 288 78 89 chr15 71621525 71621745 -31873229 - MTE2a LTR MaLR -176 203 2 1 1131 1861 201 49 24 chr15 71627572 71627646 -31867328 + MTD LTR MaLR 1 70 -349 1 1131 1861 201 49 24 chr15 71628054 71628388 -31866586 + MTD LTR MaLR 71 419 0 1 1131 281 288 47 23 chr15 71649782 71649910 -31845064 + MLT1C LTR MaLR 28 158 -309 2 1131 1584 208 134 3 chr15 71650941 71651307 -31843667 - MTD LTR MaLR 0 419 6 2 1131 2920 30 3 0 chr15 71653141 71653477 -31841497 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 2 1131 1140 251 117 27 chr15 71674740 71675116 -31819858 + MTD LTR MaLR 1 410 -9 2 1131 241 270 86 43 chr15 71681733 71681849 -31813125 - MTEa LTR MaLR -8 371 251 2 1131 246 83 0 0 chr15 71681948 71681984 -31812990 + ORR1D2 LTR MaLR 335 370 0 2 1131 293 356 18 24 chr15 71682020 71682187 -31812787 + MER67C LTR ERV1 200 365 -346 2 1131 375 91 18 0 chr15 71684108 71684163 -31810811 + RMER17C LTR ERVK 1 56 -354 2 1131 1700 161 5 90 chr15 71684142 71684617 -31810357 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 2 1131 1189 290 88 24 chr15 71689728 71690261 -31804713 + MER67C LTR ERV1 141 707 -4 2 1132 694 338 58 62 chr15 71700707 71701032 -31793942 + MTE2a LTR MaLR 42 365 -14 2 1132 383 315 77 39 chr15 71705137 71705480 -31789494 + MTEb LTR MaLR 41 379 0 2 1132 2186 173 0 20 chr15 71706664 71707071 -31787903 - MTD LTR MaLR -20 399 1 2 1132 386 343 92 29 chr15 71708233 71708473 -31786501 + LTR16C LTR ERVL 172 426 -63 2 1132 722 266 41 21 chr15 71715510 71715752 -31779222 + ORR1E LTR MaLR 1 247 -112 2 1132 469 279 23 17 chr15 71715820 71715995 -31778979 + ORR1E LTR MaLR 184 359 0 2 1132 234 294 107 10 chr15 71723063 71723166 -31771808 - LTR16C LTR ERVL -150 339 227 2 1132 350 172 0 0 chr15 71723785 71723843 -31771131 + RMER6A LTR ERVK 1 58 -403 2 1132 3845 125 23 15 chr15 71723984 71724638 -31770336 + RMER6A LTR ERVK 52 756 0 2 1132 828 262 104 49 chr15 71728560 71728945 -31766029 + BGLII_B LTR ERVK 9 414 -27 3 1132 317 270 157 21 chr15 71732680 71732820 -31762154 + RMER5 LTR ERV1 113 271 -263 3 1132 1008 287 73 44 chr15 71735842 71736225 -31758749 + RMER5 LTR ERV1 141 534 0 3 1132 777 308 60 55 chr15 71738693 71739092 -31755882 + MLT1A1 LTR MaLR 1 401 -7 3 1132 243 292 20 92 chr15 71744044 71744142 -31750832 - MT2B2 LTR ERVL -345 239 149 3 1132 1353 212 129 13 chr15 71746445 71746817 -31748157 + MTD LTR MaLR 1 415 -4 3 1132 2753 109 113 25 chr15 71751367 71751837 -31743137 + MURVY-LTR LTR ERV1 2 512 -7 3 1132 770 242 242 13 chr15 71755910 71756211 -31738763 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 3 1132 237 170 149 0 chr15 71765078 71765125 -31729849 + ORR1B1-int LTR MaLR 255 308 -1201 3 1132 1288 69 4 0 chr15 71765083 71765274 -31729700 - ORR1A1-int LTR MaLR -1364 599 405 3 1132 1422 232 113 11 chr15 71770668 71771039 -31723935 - MTD LTR MaLR -10 409 1 3 1132 230 296 9 75 chr15 71780893 71780920 -31714054 - RMER12 LTR ERVK -506 816 790 3 1132 230 296 9 75 chr15 71780964 71781042 -31713932 - RMER12 LTR ERVK -533 789 718 3 1132 353 308 81 7 chr15 71787335 71787583 -31707391 + MLT1A0 LTR MaLR 33 332 -33 3 1132 484 197 60 120 chr15 71790051 71790108 -31704866 - MT2B LTR ERVL -447 154 107 3 1132 591 327 22 31 chr15 71790480 71790704 -31704270 - MLT1A0 LTR MaLR -31 334 113 3 1132 2075 189 112 18 chr15 71791922 71792422 -31702552 - RLTR40 LTR ERVK -5 812 266 3 1132 346 339 75 51 chr15 71822573 71822875 -31672099 + MTEb LTR MaLR 62 374 -5 4 1132 2363 127 82 13 chr15 71825711 71826103 -31668871 + MTC LTR MaLR 3 421 0 4 1132 229 286 32 0 chr15 71826432 71826495 -31668479 - MLT1B LTR MaLR -80 310 246 4 1133 1076 253 12 121 chr15 71828070 71828492 -31666482 + MTE2a LTR MaLR 4 379 0 4 1133 2350 142 48 15 chr15 71840768 71841162 -31653812 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1133 1106 245 92 123 chr15 71843168 71843647 -31651327 + RMER4B LTR ERVK 2 572 -13 4 1133 231 339 87 97 chr15 71847473 71847669 -31647305 + MLT1D LTR MaLR 13 206 -299 4 1133 236 329 12 48 chr15 71852126 71852209 -31642765 - RMER13A LTR ERVK -211 697 618 4 1133 871 269 70 37 chr15 71852491 71852761 -31642213 - RMER13A LTR ERVK -469 391 113 4 1133 493 283 187 9 chr15 71853330 71853572 -31641402 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 90 4 1133 431 254 63 56 chr15 71853819 71853961 -31641013 - MLT1A0 LTR MaLR -217 148 6 4 1133 1327 249 82 17 chr15 71854523 71854879 -31640095 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 4 1133 2968 58 45 3 chr15 71871923 71872303 -31622671 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1133 2638 157 0 30 chr15 71876794 71877221 -31617753 + MTC LTR MaLR 3 416 -5 4 1133 315 260 91 0 chr15 71878480 71878557 -31616417 - RMER15 LTR ERVL 0 575 492 4 1133 1748 162 61 96 chr15 71878961 71879356 -31615618 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 1 4 1133 337 263 50 58 chr15 71879556 71879677 -31615297 + RMER15 LTR ERVL 39 158 -417 4 1133 729 247 147 5 chr15 71879670 71879861 -31615113 + RMER15 LTR ERVL 270 487 -88 4 1133 396 306 54 9 chr15 71879863 71879975 -31614999 - RMER15 LTR ERVL -189 386 270 4 1133 337 263 50 58 chr15 71879968 71880089 -31614885 - RMER15 LTR ERVL -417 158 39 4 1133 1748 162 61 96 chr15 71880289 71880684 -31614290 + ORR1C2 LTR MaLR 1 381 -3 4 1133 458 313 107 40 chr15 71881698 71881951 -31613023 + MLT2B4 LTR ERVL 4 273 -283 4 1133 1387 261 67 19 chr15 71885597 71885968 -31609006 - MTD LTR MaLR -13 406 18 5 1133 480 244 141 30 chr15 71886915 71887050 -31607924 - MTE2b LTR MaLR -23 356 199 5 1133 1963 209 44 12 chr15 71891207 71891613 -31603361 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1133 775 329 34 44 chr15 71892407 71892792 -31602182 - MER89 LTR ERV1 0 559 179 5 1133 2501 80 0 0 chr15 71896356 71896667 -31598307 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 1133 610 109 22 0 chr15 71896667 71896759 -31598215 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 94 -7487 5 1133 624 261 7 0 chr15 71896754 71896907 -31598067 + MMERVK10C-int LTR ERVK 271 424 -7157 5 1133 631 218 51 10 chr15 71896908 71897074 -31597900 + MMERVK10C-int LTR ERVK 664 836 -6745 5 1133 631 218 51 10 chr15 71897249 71897277 -31597697 + MMERVK10C-int LTR ERVK 837 865 -6716 5 1133 615 125 0 37 chr15 71897280 71897388 -31597586 + IAP-d-int LTR ERVK 74 177 -6365 5 1133 794 179 40 0 chr15 71897382 71897533 -31597441 + IAP-d-int LTR ERVK 347 503 -6039 5 1133 1685 86 103 0 chr15 71897533 71897766 -31597208 + IAP-d-int LTR ERVK 5007 5263 -1279 5 1133 1718 213 14 6 chr15 71897765 71898124 -31596850 + IAPEY3-int LTR ERVK 7046 7407 -273 5 1133 2500 84 0 0 chr15 71898213 71898524 -31596450 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 1133 1125 236 70 49 chr15 71898909 71899265 -31595709 - ORR1D2 LTR MaLR -2 417 1 5 1133 334 279 48 0 chr15 71899356 71899460 -31595514 + ORR1E LTR MaLR 1 109 -250 5 1133 361 255 64 0 chr15 71909303 71909397 -31585577 - MER89 LTR ERV1 0 559 460 5 1133 1904 155 42 25 chr15 71913478 71913881 -31581093 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1133 917 301 90 20 chr15 71916624 71916970 -31578004 + MTEa LTR MaLR 1 370 -9 5 1133 274 285 43 106 chr15 71929059 71929220 -31565754 + MLT1F LTR MaLR 256 406 -142 5 1133 669 322 82 62 chr15 71929284 71930163 -31564811 + MLT1F-int LTR MaLR 1 1002 -487 5 1133 339 295 129 43 chr15 71931031 71931194 -31563780 + MLT1F-int LTR MaLR 1129 1305 -104 5 1133 299 312 71 9 chr15 71938610 71938723 -31556251 - MLT1B LTR MaLR -19 371 236 5 1133 3253 23 0 0 chr15 71943348 71943694 -31551280 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 1133 15050 55 2 2 chr15 71943694 71945487 -31549487 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1792 0 5 1133 3093 32 3 6 chr15 71945487 71945834 -31549140 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 1133 2596 101 3 0 chr15 71946193 71946519 -31548455 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1133 418 324 17 12 chr15 71949112 71949284 -31545690 + MLT1F1 LTR MaLR 395 567 -2 5 1133 351 163 22 55 chr15 71958165 71958256 -31536718 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1167 5 1134 1181 280 104 6 chr15 71960714 71960872 -31534102 + MTE2b LTR MaLR 1 169 -210 5 1134 1181 280 104 6 chr15 71960898 71961084 -31533890 + MTE2b LTR MaLR 170 378 -1 5 1134 1134 235 41 11 chr15 71963516 71963787 -31531187 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 92 6 1134 1345 261 58 17 chr15 71963863 71964222 -31530752 + MTE2b LTR MaLR 1 374 -5 6 1134 750 340 102 30 chr15 71966255 71966688 -31528286 - MLT1D LTR MaLR -21 484 21 6 1134 1247 304 28 29 chr15 71969693 71970089 -31524885 - MTE2b LTR MaLR 0 419 3 6 1134 810 276 100 19 chr15 71970658 71970927 -31524047 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4197 4487 -1227 6 1134 408 342 48 24 chr15 71971241 71971406 -31523568 + LTR41 LTR ERVL 47 215 -553 6 1134 1228 257 40 40 chr15 71971453 71971805 -31523169 + ORR1D2 LTR MaLR 3 354 -16 6 1134 402 325 70 53 chr15 71978606 71978883 -31516091 + MTEb LTR MaLR 56 360 -19 6 1134 314 342 35 47 chr15 71980460 71980629 -31514345 - MLT1L LTR MaLR -41 569 403 6 1134 2055 178 94 0 chr15 71982651 71983011 -31511963 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1134 2104 152 68 39 chr15 71987715 71988098 -31506876 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1134 2048 125 175 14 chr15 71991209 71991558 -31503416 + RLTR44A LTR ERVK 1 405 0 6 1134 333 158 5 30 chr15 71992402 71992475 -31502499 - MTC LTR MaLR -8 413 339 6 1134 2118 122 13 6 chr15 71994020 71994333 -31500641 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2398 2712 -3049 6 1134 1207 183 0 5 chr15 71994332 71994530 -31500444 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4818 5014 -747 6 1134 3831 140 3 14 chr15 71994527 71995114 -31499860 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1077 1657 -4104 6 1134 456 155 0 0 chr15 71995114 71995185 -31499789 + MT2B LTR ERVL 1 71 -530 6 1134 1451 185 14 14 chr15 71995182 71995462 -31499512 + MT2B LTR ERVL 322 601 0 6 1134 704 208 87 48 chr15 72000487 72000694 -31494280 + MTD LTR MaLR 1 215 -204 3 1134 524 229 163 45 chr15 72001791 72001969 -31493005 + MTD LTR MaLR 217 415 -4 3 1134 1441 206 101 21 chr15 72006839 72007176 -31487798 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 3 1 1134 1093 220 168 38 chr15 72009036 72009352 -31485622 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 8 1 1134 657 223 66 75 chr15 72009361 72009589 -31485385 - ORR1D2-int LTR MaLR -147 1223 998 1 1134 702 290 90 39 chr15 72010776 72011088 -31483886 - ORR1E LTR MaLR -31 328 1 1 1134 2626 206 8 15 chr15 72012878 72013400 -31481574 + RLTR12B LTR ERVK 1 518 -10 1 1134 1990 194 25 29 chr15 72019637 72020045 -31474929 + MTC LTR MaLR 8 413 -8 2 1134 1692 85 263 8 chr15 72020787 72021049 -31473925 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1134 1131 261 73 81 chr15 72021154 72021572 -31473402 - MTD LTR MaLR -20 399 1 2 1134 442 312 106 89 chr15 72022717 72023065 -31471909 - MTEa LTR MaLR 0 379 26 2 1134 972 231 159 67 chr15 72025859 72026090 -31468884 - MTD LTR MaLR -13 406 136 3 1134 972 231 159 67 chr15 72026187 72026327 -31468647 - MTD LTR MaLR -284 135 1 3 1134 857 244 191 22 chr15 72028551 72028865 -31466109 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 4 3 1134 609 247 153 24 chr15 72030781 72030951 -31464023 + MTD LTR MaLR 1 192 -227 3 1134 903 263 95 0 chr15 72033919 72034151 -31460823 - MTEa LTR MaLR -125 254 1 3 1134 3489 145 2 60 chr15 72040996 72041036 -31453938 + RMER4B LTR ERVK 17 40 -545 4 1134 3489 145 2 60 chr15 72041059 72041621 -31453353 + RMER4B LTR ERVK 41 584 -1 4 1134 447 302 37 12 chr15 72055621 72055782 -31439192 + RMER15 LTR ERVL 363 527 -48 5 1134 436 282 94 39 chr15 72059359 72059540 -31435434 + MLT1C LTR MaLR 274 464 -3 6 1134 367 252 48 19 chr15 72059791 72059896 -31435078 + MTEa LTR MaLR 264 371 -8 6 1134 356 330 75 28 chr15 72059908 72060120 -31434854 + MLT2B3 LTR ERVL 4 225 -329 6 1134 542 209 9 9 chr15 72065402 72065513 -31429461 + MTC LTR MaLR 1 111 -310 7 1134 825 291 45 60 chr15 72065516 72065914 -31429060 - RMER19C LTR ERVK 0 611 220 7 1134 675 131 106 65 chr15 72066193 72066457 -31428517 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 111 7 1134 1511 233 30 76 chr15 72067208 72067816 -31427158 - RLTR31_Mur LTR ERVK 0 553 1 7 1134 311 308 36 36 chr15 72072660 72072798 -31422176 + MLT1A0 LTR MaLR 27 164 -201 8 1134 594 259 25 0 chr15 72072939 72073097 -31421877 + MLT1A0 LTR MaLR 143 304 -61 8 1134 3039 32 0 0 chr15 72080453 72080799 -31414175 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 9 1134 3039 32 0 0 chr15 72082150 72082496 -31412478 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 9 1134 3039 32 0 0 chr15 72083847 72084193 -31410781 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 9 1135 5538 137 88 6 chr15 72093346 72094365 -31400609 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 1 1135 2011 137 180 2 chr15 72096454 72096854 -31398120 + RLTR11A LTR ERVK 1 471 -57 1 1135 229 218 73 0 chr15 72105754 72105809 -31389165 - MLT1H LTR MaLR -261 288 230 1 1135 2100 143 19 83 chr15 72109239 72109659 -31385315 + RLTR9C LTR ERVK 1 393 0 1 1135 1203 263 89 18 chr15 72115822 72116213 -31378761 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1135 1058 243 78 20 chr15 72123757 72124114 -31370860 - RMER17C LTR ERVK -32 378 1 1 1135 1690 205 52 30 chr15 72124884 72125178 -31369796 - MTC LTR MaLR -5 416 112 1 1135 1690 205 52 30 chr15 72125410 72125522 -31369452 - MTC LTR MaLR -310 111 1 1 1135 2903 33 191 0 chr15 72125683 72126049 -31368925 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 1 1135 1249 248 67 3 chr15 72126386 72126717 -31368257 - ORR1D2 LTR MaLR -12 358 7 1 1135 756 178 26 0 chr15 72128016 72128168 -31366806 + ORR1D1 LTR MaLR 1 156 -218 1 1135 241 339 39 68 chr15 72128500 72128706 -31366268 - MER57E1 LTR ERV1 -91 281 82 1 1135 363 258 111 70 chr15 72131107 72131396 -31363578 + RMER20A LTR ERVK 117 409 -218 1 1135 770 209 32 109 chr15 72131389 72131674 -31363300 - RLTR40 LTR ERVK -308 509 247 1 1135 929 304 63 13 chr15 72133553 72133950 -31361024 + RMER5 LTR ERV1 33 449 -85 1 1135 1752 165 30 73 chr15 72135829 72136227 -31358747 + RLTR41 LTR ERV1 66 446 0 1 1135 374 214 23 2 chr15 72138871 72138981 -31355993 - ORR1E LTR MaLR -2 377 257 1 1135 1658 214 39 0 chr15 72140953 72141308 -31353666 + MTEa LTR MaLR 7 375 -4 1 1135 2919 78 44 0 chr15 72143863 72144246 -31350728 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1135 2019 179 88 44 chr15 72146830 72147333 -31347641 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 4 1 1135 923 235 11 30 chr15 72147971 72148235 -31346739 - RLTR20B3 LTR ERVK -107 470 181 1 1135 875 254 90 44 chr15 72148283 72148430 -31346544 - RLTR20B3 LTR ERVK -348 180 16 1 1135 368 306 38 86 chr15 72149833 72150019 -31344955 + ORR1E LTR MaLR 16 192 -167 1 1135 257 265 30 20 chr15 72150099 72150199 -31344775 + ORR1E LTR MaLR 279 379 0 1 1135 1731 172 118 0 chr15 72153704 72154042 -31340932 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 1135 622 261 55 41 chr15 72157343 72157563 -31337411 + RMER15 LTR ERVL 353 575 0 1 1135 4906 106 22 21 chr15 72157967 72158774 -31336200 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 1 1135 1244 251 60 11 chr15 72162684 72163035 -31331939 - MTEb LTR MaLR -11 368 1 2 1135 700 282 49 84 chr15 72167265 72167610 -31327364 + MLT1C LTR MaLR 28 360 -107 2 1135 584 248 86 20 chr15 72170140 72170292 -31324682 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 407 2 1135 311 253 21 21 chr15 72170281 72170374 -31324600 - RLTR20D LTR ERVK -285 283 191 2 1135 320 24 0 0 chr15 72170459 72170501 -31324473 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 42 -250 2 1135 1858 94 84 39 chr15 72170523 72170856 -31324118 + RLTR10B2 LTR ERVK 18 365 0 2 1135 414 191 37 4 chr15 72170861 72170982 -31323992 - RLTR20D LTR ERVK -355 179 1 2 1135 822 262 73 63 chr15 72171300 72171649 -31323325 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 2 1135 531 333 127 21 chr15 72172335 72172675 -31322299 + MER89 LTR ERV1 184 559 0 2 1135 840 168 6 35 chr15 72174281 72174454 -31320520 + RMER20B LTR ERVK 1 168 -459 2 1135 1767 142 49 10 chr15 72178970 72179277 -31315697 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1135 1131 258 31 153 chr15 72179610 72180218 -31314756 - RMER5 LTR ERV1 0 534 1 2 1135 742 287 77 27 chr15 72185087 72185424 -31309550 + ERVL-E-int LTR ERVL 3751 4104 -1563 2 1135 260 282 50 25 chr15 72186763 72186843 -31308131 - MLT1A0 LTR MaLR -21 344 263 2 1135 990 189 5 20 chr15 72197538 72197738 -31297236 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1649 199 3 2 1135 3229 137 31 10 chr15 72204735 72205251 -31289723 + RLTR11A LTR ERVK 1 527 -1 2 1135 242 278 44 11 chr15 72209572 72209663 -31285311 - MLT1A LTR MaLR -280 94 1 2 1135 941 283 30 68 chr15 72210369 72210767 -31284207 - MLT1B LTR MaLR -5 385 3 2 1135 236 362 100 8 chr15 72214233 72214492 -31280482 - MER68 LTR ERVL -189 374 92 2 1135 372 293 42 24 chr15 72215366 72215534 -31279440 - MLT1D LTR MaLR -334 171 1 2 1135 2667 126 51 29 chr15 72218013 72218464 -31276510 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 2 1135 1421 204 29 66 chr15 72218564 72219077 -31275897 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 3 1135 1197 241 64 44 chr15 72220030 72220307 -31274667 - MTE2b LTR MaLR -12 367 88 3 1135 1197 241 64 44 chr15 72220510 72220592 -31274382 - MTE2b LTR MaLR -292 87 1 3 1136 951 217 51 19 chr15 72222401 72222617 -31272357 + MTEa LTR MaLR 3 225 -154 3 1136 295 270 0 22 chr15 72222621 72222712 -31272262 - MTE2b LTR MaLR -290 89 1 3 1136 497 354 67 45 chr15 72222917 72223473 -31271501 + ERVL-E-int LTR ERVL 4564 5131 -536 3 1136 249 363 61 35 chr15 72224254 72224485 -31270489 + LTR33A_ LTR ERVL 295 531 0 3 1136 5045 110 14 61 chr15 72231050 72231892 -31263082 + RLTR13B4 LTR ERVK 1 803 0 3 1136 781 322 48 54 chr15 72233844 72234198 -31260776 + ORR1E LTR MaLR 2 353 -6 3 1136 421 206 28 18 chr15 72236488 72236597 -31258377 + RMER5 LTR ERV1 69 178 -356 3 1136 392 309 22 14 chr15 72236954 72237092 -31257882 + RMER5 LTR ERV1 196 334 -200 3 1136 499 284 23 47 chr15 72237294 72237508 -31257466 + RMER10B LTR ERVL 179 387 -11 3 1136 281 280 84 0 chr15 72239229 72239336 -31255638 - MLT1D LTR MaLR -349 156 41 3 1136 532 188 20 19 chr15 72241099 72241216 -31253758 - ORR1E LTR MaLR -246 128 1 3 1136 5165 158 13 44 chr15 72241287 72242223 -31252751 - RMER13B LTR ERVK -1 907 1 3 1136 435 328 103 4 chr15 72242665 72242907 -31252067 - LTR16B LTR ERVL -11 452 187 3 1136 3042 189 26 39 chr15 72248190 72248803 -31246171 + RLTR1D LTR ERV1 1 605 0 3 1136 587 217 0 9 chr15 72250491 72250607 -31244367 - MT2A LTR ERVL -68 465 351 3 1136 2005 162 13 24 chr15 72251288 72251668 -31243306 + RLTR14 LTR ERV1 7 382 0 3 1136 271 175 15 45 chr15 72270260 72270326 -31224648 - RMER16-int LTR ERVK -3241 2165 2102 3 1136 456 277 76 13 chr15 72271435 72271592 -31223382 - MTE2b LTR MaLR -207 172 6 3 1136 480 307 134 12 chr15 72272958 72273212 -31221762 - RMER15 LTR ERVL -5 570 286 3 1136 299 233 87 10 chr15 72273217 72273321 -31221653 - RMER15 LTR ERVL -416 159 48 3 1136 2404 101 3 0 chr15 72273784 72274110 -31220864 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1136 9586 145 118 39 chr15 72274110 72275929 -31219045 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1963 0 3 1136 2466 74 3 24 chr15 72275930 72276263 -31218711 + ORR1A2 LTR MaLR 2 327 0 3 1136 1128 200 176 53 chr15 72277930 72278252 -31216722 - MTC LTR MaLR -3 418 49 3 1136 4501 110 28 8 chr15 72280452 72281122 -31213852 - RMER12 LTR ERVK -638 684 1 3 1136 485 309 121 77 chr15 72283141 72283481 -31211493 - ORR1E LTR MaLR -4 355 1 3 1136 3928 197 16 87 chr15 72288156 72289253 -31205721 - RMER12 LTR ERVK -160 1412 1 3 1136 1770 204 44 11 chr15 72295225 72295587 -31199387 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 3 1136 1211 257 131 0 chr15 72297816 72298151 -31196823 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 4 1136 1925 164 126 0 chr15 72298168 72298533 -31196441 - MTD LTR MaLR -8 411 1 4 1136 2230 167 16 14 chr15 72299584 72299949 -31195025 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 4 1136 782 248 25 90 chr15 72300355 72300599 -31194375 - MTE2a LTR MaLR -4 375 148 4 1136 773 275 126 32 chr15 72300659 72300944 -31194030 - ORR1E LTR MaLR -4 355 44 4 1136 2222 92 42 62 chr15 72301773 72302109 -31192865 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1136 225 416 0 56 chr15 72302668 72302775 -31192199 + LTR33B LTR ERVL 55 155 -348 4 1136 261 358 16 39 chr15 72302974 72303102 -31191872 + LTR33B LTR ERVL 357 481 -22 4 1136 379 393 86 45 chr15 72304274 72304543 -31190431 + LTR16C LTR ERVL 81 360 -129 4 1136 1167 159 327 63 chr15 72305433 72305611 -31189363 + RMER10B LTR ERVL 1 258 -140 4 1136 1167 159 327 63 chr15 72305758 72305894 -31189080 + RMER10B LTR ERVL 259 397 -1 4 1136 907 168 190 52 chr15 72306605 72306836 -31188138 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 168 4 1136 808 205 222 5 chr15 72306817 72307033 -31187941 - RLTR23 LTR ERV1 -158 272 10 4 1136 263 349 97 71 chr15 72307098 72307490 -31187484 - LTR33B LTR ERVL -21 482 81 4 1136 226 62 0 0 chr15 72308766 72308798 -31186176 + MTA_Mm LTR MaLR 1 32 -364 4 1136 876 110 58 9 chr15 72308815 72309045 -31185929 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 290 4 1136 3072 42 3 3 chr15 72309055 72309433 -31185541 + MTA_Mm LTR MaLR 19 396 0 4 1136 9554 39 13 1 chr15 72309433 72310518 -31184456 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 4 1136 3257 29 56 3 chr15 72310518 72310894 -31184080 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1136 344 282 174 8 chr15 72312746 72312878 -31182096 - MTEa LTR MaLR -60 319 166 4 1136 683 227 15 80 chr15 72313044 72313537 -31181437 - RMER17C LTR ERVK -51 359 1 4 1136 758 140 0 0 chr15 72313551 72313665 -31181309 + RMER17C-int LTR ERVK 2652 2765 -473 4 1136 746 132 19 106 chr15 72313663 72313824 -31181150 + RMER17C-int LTR ERVK 2209 2355 -883 4 1136 5200 151 85 42 chr15 72313820 72314824 -31180150 - RMER17C-int LTR ERVK -1029 2209 1163 4 1136 581 165 16 141 chr15 72315302 72315486 -31179488 - RMER17C-int LTR ERVK -2606 632 472 4 1136 276 195 22 154 chr15 72315523 72315614 -31179360 - RMER17C-int LTR ERVK -3159 79 1 4 1136 901 211 25 70 chr15 72315615 72315859 -31179115 - RMER17C LTR ERVK 0 410 178 4 1136 2486 134 103 3 chr15 72315935 72316315 -31178659 - MTC LTR MaLR -3 418 1 4 1136 323 312 76 23 chr15 72317041 72317172 -31177802 - RMER5 LTR ERV1 -348 186 49 4 1136 3225 62 23 8 chr15 72319291 72319681 -31175293 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1136 681 244 117 45 chr15 72321093 72321316 -31173658 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 790 4 1136 1631 178 84 9 chr15 72321425 72321759 -31173215 - RLTR25B LTR ERVK -220 808 450 4 1136 378 337 62 28 chr15 72321796 72321973 -31173001 - MTC LTR MaLR -221 200 18 4 1136 318 224 81 23 chr15 72327625 72327712 -31167262 + MTEb LTR MaLR 278 369 -10 4 1136 367 342 51 13 chr15 72328659 72328816 -31166158 + RLTR40 LTR ERVK 642 804 -13 4 1136 384 297 144 45 chr15 72330510 72330711 -31164263 - MLT1I LTR MaLR -139 272 52 4 1136 243 202 104 139 chr15 72338998 72339113 -31155861 - MLT2B4 LTR ERVL -173 383 273 4 1136 227 283 88 29 chr15 72349555 72349657 -31145317 - RLTR22_Mur LTR ERVK -153 1695 1588 4 1137 305 260 27 0 chr15 72359729 72359802 -31135172 + MLT1A0 LTR MaLR 244 318 -47 5 1137 366 287 87 73 chr15 72373912 72374130 -31120844 + RMER12 LTR ERVK 768 988 -334 5 1137 421 263 32 53 chr15 72374220 72374409 -31120565 + RMER12 LTR ERVK 770 954 -368 5 1137 1743 237 31 8 chr15 72381539 72381896 -31113078 + MTE2b LTR MaLR 4 368 -11 5 1137 1329 102 5 5 chr15 72390948 72391154 -31103820 + RMER6A LTR ERVK 2 207 -549 5 1137 706 202 316 18 chr15 72391897 72392179 -31102795 + MTD LTR MaLR 13 378 -41 5 1137 1128 231 66 16 chr15 72394911 72395214 -31099760 + RMER19A LTR ERVK 221 538 -199 5 1137 2255 138 74 0 chr15 72399671 72400034 -31094940 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 1 5 1137 1143 235 78 42 chr15 72400200 72400559 -31094415 - MTE2b LTR MaLR -2 377 6 5 1137 231 281 35 35 chr15 72401060 72401145 -31093829 + MLT1A1 LTR MaLR 312 396 -12 5 1137 967 284 110 66 chr15 72402621 72403103 -31091871 - MLT1D LTR MaLR 0 505 3 5 1137 663 207 116 26 chr15 72405992 72406181 -31088793 + MTD LTR MaLR 1 206 -213 5 1137 417 171 132 1 chr15 72406203 72406315 -31088659 + MTD LTR MaLR 256 405 -14 5 1137 624 141 89 38 chr15 72408599 72408748 -31086226 + ORR1B1 LTR MaLR 1 156 -238 5 1137 375 162 0 79 chr15 72417468 72417595 -31077379 - RMER17C LTR ERVK -136 274 158 6 1137 1719 163 98 9 chr15 72428018 72428365 -31066609 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 6 1137 518 269 28 0 chr15 72433775 72433916 -31061058 + MLT1C LTR MaLR 313 457 -10 6 1137 289 238 74 12 chr15 72437022 72437103 -31057871 + MLT1B LTR MaLR 133 218 -172 6 1137 2321 211 79 0 chr15 72442810 72443302 -31051672 + MT2A LTR ERVL 3 533 0 6 1137 1258 222 123 43 chr15 72448564 72449213 -31045761 + RLTR40 LTR ERVK 27 727 -90 6 1137 1204 225 70 15 chr15 72463281 72463608 -31031366 + MTC LTR MaLR 43 377 -2 6 1137 577 365 72 40 chr15 72476015 72476392 -31018582 - MLT1B LTR MaLR 0 390 2 6 1137 496 245 101 17 chr15 72477526 72477808 -31017166 - MTE2b LTR MaLR -8 371 4 6 1138 524 266 230 16 chr15 72483092 72483279 -31011695 - MLT1B LTR MaLR -4 386 160 6 1138 327 244 48 40 chr15 72483377 72483501 -31011473 - MLT1B LTR MaLR -231 236 112 6 1138 362 286 127 14 chr15 72485446 72485588 -31009386 + MLT1E2 LTR MaLR 312 469 -158 6 1138 338 325 116 40 chr15 72496129 72496328 -30998646 + MLT1J LTR MaLR 44 257 -255 6 1138 236 241 69 0 chr15 72496441 72496499 -30998475 + MLT1J LTR MaLR 444 505 -7 6 1138 2615 134 12 36 chr15 72510676 72511093 -30983881 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 1 1138 2591 52 59 38 chr15 72526064 72526403 -30968571 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1138 308 240 146 51 chr15 72532897 72533055 -30961919 + RLTR21 LTR ERVK 1071 1243 -329 3 1138 2060 157 23 66 chr15 72543705 72544100 -30950874 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1138 1523 196 79 109 chr15 72549789 72550279 -30944695 - RMER20B LTR ERVK -42 474 1 5 1138 4854 141 72 95 chr15 72551496 72552547 -30942427 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 2 5 1138 445 303 61 52 chr15 72554889 72555119 -30939855 - MLT1D LTR MaLR -273 232 1 5 1138 435 301 50 102 chr15 72564372 72564649 -30930325 + MLT1A0 LTR MaLR 1 284 -90 6 1138 254 279 60 88 chr15 72567953 72568169 -30926805 + MLT1J LTR MaLR 216 425 -87 6 1138 246 221 133 114 chr15 72570611 72570769 -30924205 + RMER15 LTR ERVL 1 161 -414 7 1138 311 321 71 0 chr15 72570780 72570892 -30924082 + RMER15 LTR ERVL 302 421 -154 7 1138 995 170 114 34 chr15 72571757 72571994 -30922980 + ORR1D1 LTR MaLR 1 256 -118 7 1138 399 366 71 77 chr15 72572038 72572517 -30922457 - LTR16E2 LTR ERVL 0 568 93 7 1138 1033 200 101 41 chr15 72589871 72590222 -30904752 - MTC LTR MaLR -8 413 5 1 1138 793 220 69 6 chr15 72592852 72593026 -30901948 - MTE2a LTR MaLR 0 379 195 1 1138 1223 271 52 14 chr15 72598942 72599286 -30895688 + MTE2b LTR MaLR 19 375 -4 1 1138 3348 108 9 209 chr15 72600534 72600902 -30894072 + MT2B LTR ERVL 1 345 -256 1 1138 3348 108 9 209 chr15 72600972 72601354 -30893620 + MT2B LTR ERVL 346 601 0 1 1138 1118 234 48 105 chr15 72604505 72604559 -30890415 - MTEa LTR MaLR -3 376 323 1 1138 1158 246 82 46 chr15 72604559 72604925 -30890049 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1138 1118 234 48 105 chr15 72604925 72605242 -30889732 - MTEa LTR MaLR -57 322 26 1 1138 1273 173 258 100 chr15 72607844 72608243 -30886731 + MT2A LTR ERVL 1 462 -71 1 1139 1753 182 74 17 chr15 72614637 72614989 -30879985 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 1 1139 5307 229 68 18 chr15 72614989 72616294 -30878680 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 1370 0 1 1139 1399 160 165 30 chr15 72616537 72616834 -30878140 + ORR1D1 LTR MaLR 38 374 0 1 1139 227 273 0 18 chr15 72618105 72618161 -30876813 + MLT1A LTR MaLR 320 374 0 1 1139 1375 133 180 38 chr15 72620010 72620314 -30874660 - RLTR20A2 LTR ERVK -102 432 1 1 1139 313 215 0 147 chr15 72622297 72622406 -30872568 + MLT1A0 LTR MaLR 2 94 -271 1 1139 234 336 70 35 chr15 72648585 72648727 -30846247 + LTR33A_ LTR ERVL 43 189 -342 1 1139 511 256 157 0 chr15 72655726 72655917 -30839057 + MTE-int LTR MaLR 1163 1383 -197 1 1139 497 361 22 27 chr15 72656097 72656319 -30838655 + MTE2b LTR MaLR 3 223 -156 1 1139 478 272 22 7 chr15 72656346 72656472 -30838502 + ORR1C1 LTR MaLR 3 130 -248 1 1139 1829 107 10 81 chr15 72656472 72656768 -30838206 + ORR1A3 LTR MaLR 1 275 -51 1 1139 1644 92 9 0 chr15 72660338 72660565 -30834409 + MTB_Mm LTR MaLR 1 229 -178 1 1139 335 354 40 62 chr15 72662866 72663008 -30831966 + MLT1E1 LTR MaLR 384 522 -158 2 1139 2875 62 69 13 chr15 72663008 72663397 -30831577 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 2 1139 335 353 38 63 chr15 72663397 72663548 -30831426 + MLT1E1 LTR MaLR 497 646 -8 2 1139 1687 232 32 9 chr15 72666397 72666741 -30828233 - MTE2b LTR MaLR 0 379 28 2 1139 1207 266 12 121 chr15 72668833 72669239 -30825735 + MTEa LTR MaLR 8 369 -10 2 1139 1128 267 70 35 chr15 72669336 72669650 -30825324 - MTE2b LTR MaLR -38 341 17 2 1139 1122 259 66 77 chr15 72670718 72671187 -30823787 + RLTR12B LTR ERVK 47 510 -18 2 1139 927 197 94 217 chr15 72678881 72679315 -30815659 + ORR1C2 LTR MaLR 4 384 0 2 1139 1623 171 77 76 chr15 72687946 72688510 -30806464 - ORR1A1-int LTR MaLR -650 859 304 2 1139 265 276 98 62 chr15 72692595 72692707 -30802267 + MLT1D LTR MaLR 2 117 -388 2 1139 271 292 161 78 chr15 72692744 72692870 -30802104 + MLT1D LTR MaLR 220 339 -166 2 1139 271 292 161 78 chr15 72692906 72693009 -30801965 + MLT1D LTR MaLR 340 467 -38 2 1139 1438 257 69 26 chr15 72705350 72705736 -30789238 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 1139 1540 170 93 77 chr15 72707274 72707650 -30787324 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 2 1139 1122 208 149 104 chr15 72714728 72715083 -30779891 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 2 2 1139 299 265 67 29 chr15 72720374 72720479 -30774495 + MLT1A1 LTR MaLR 300 408 0 2 1139 429 353 38 6 chr15 72735700 72735857 -30759117 + MLT2B2 LTR ERVL 330 491 -71 3 1139 1969 119 26 67 chr15 72740744 72741086 -30753888 + ORR1A4 LTR MaLR 2 329 0 3 1140 1590 216 94 6 chr15 72748798 72749138 -30745836 + MTD LTR MaLR 8 377 -42 3 1140 325 269 10 79 chr15 72749538 72749639 -30745335 + MT2B LTR ERVL 164 257 -344 3 1140 486 326 96 36 chr15 72753622 72753873 -30741101 + MLT1A LTR MaLR 109 374 0 3 1140 409 319 145 31 chr15 72755222 72755547 -30739427 + MLT1A0 LTR MaLR 1 390 0 3 1140 3174 70 5 0 chr15 72768344 72768741 -30726233 - MTB LTR MaLR -1 399 1 3 1140 1532 214 111 36 chr15 72774805 72775288 -30719686 + RMER4B LTR ERVK 1 451 -15 3 1140 2498 230 128 17 chr15 72783787 72784512 -30710462 - RLTR40 LTR ERVK -8 809 4 3 1140 2259 92 13 10 chr15 72788793 72789101 -30705873 + RLTR27 LTR ERVK 1 309 0 3 1140 388 316 27 86 chr15 72789828 72790015 -30704959 + MTEa LTR MaLR 201 376 -3 3 1140 606 279 76 138 chr15 72790187 72790212 -30704762 + MTE2a LTR MaLR 46 64 -355 3 1140 1117 230 62 98 chr15 72790381 72790742 -30704232 + MTE2a LTR MaLR 36 404 -15 3 1140 1598 152 100 45 chr15 72797639 72797817 -30697157 + ORR1C2 LTR MaLR 1 166 -218 4 1140 1598 152 100 45 chr15 72797916 72798067 -30696907 + ORR1C2 LTR MaLR 167 347 -37 4 1140 2205 157 44 8 chr15 72800203 72800570 -30694404 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 4 1140 490 223 176 55 chr15 72802317 72802516 -30692458 + ORR1D2 LTR MaLR 5 229 -141 4 1140 255 225 20 0 chr15 72806664 72806730 -30688244 + MLT1B LTR MaLR 40 107 -360 4 1140 485 309 61 0 chr15 72806929 72807094 -30687880 + MLT1B LTR MaLR 83 257 -133 4 1140 434 301 72 77 chr15 72808167 72808376 -30686598 + MLT1B LTR MaLR 181 388 -2 4 1140 1244 192 38 15 chr15 72808536 72808801 -30686173 + MTEb LTR MaLR 105 375 -4 4 1140 1671 223 56 21 chr15 72810502 72810878 -30684096 - MTD LTR MaLR 0 419 31 4 1140 2219 53 163 0 chr15 72815551 72815870 -30679104 - MTB LTR MaLR -29 371 1 4 1140 310 164 0 0 chr15 72819664 72819719 -30675255 - ORR1B2 LTR MaLR 0 394 340 4 1140 1537 147 134 17 chr15 72820347 72820638 -30674336 - ORR1B2 LTR MaLR -42 325 1 4 1140 1979 125 156 0 chr15 72823748 72824100 -30670874 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1140 779 276 49 45 chr15 72824704 72824861 -30670113 + RLTR17 LTR ERVK 102 260 -432 4 1140 3419 33 5 0 chr15 72824861 72825255 -30669719 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1140 779 276 49 45 chr15 72825255 72825363 -30669611 + RLTR17 LTR ERVK 261 368 -324 4 1140 1769 160 223 31 chr15 72829517 72829997 -30664977 + RLTR17 LTR ERVK 122 692 0 4 1140 498 261 94 67 chr15 72829997 72830242 -30664732 + ORR1E LTR MaLR 103 374 -5 4 1140 3162 44 36 8 chr15 72838083 72838470 -30656504 + MTB LTR MaLR 3 400 0 4 1140 391 125 29 59 chr15 72843987 72844055 -30650919 + RMER15 LTR ERVL 3 68 -507 4 1140 2122 143 204 36 chr15 72844212 72844654 -30650320 + RMER15 LTR ERVL 58 573 -2 4 1140 273 238 111 0 chr15 72845105 72845168 -30649806 + MLT1A0 LTR MaLR 83 152 -213 4 1140 1077 191 46 90 chr15 72861059 72861509 -30633465 + MTC LTR MaLR 1 419 0 5 1141 685 268 266 22 chr15 72878023 72878301 -30616673 + MTE2a LTR MaLR 32 377 -2 5 1141 1481 241 81 16 chr15 72879785 72880216 -30614758 + RMER5 LTR ERV1 37 495 -39 5 1141 244 325 60 12 chr15 72894117 72894201 -30600773 - MLT1A0 LTR MaLR -8 459 372 6 1141 598 259 69 9 chr15 72895125 72895343 -30599631 - MLT1A0 LTR MaLR -134 231 1 6 1141 1894 103 112 13 chr15 72900892 72901226 -30593748 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 6 1141 927 253 110 49 chr15 72902853 72903198 -30591776 - MTD LTR MaLR -1 418 53 6 1141 571 230 15 15 chr15 72905827 72905964 -30589010 + ORR1C2 LTR MaLR 1 137 -247 6 1141 1621 192 117 9 chr15 72908927 72909269 -30585705 - MTD LTR MaLR 0 419 41 6 1141 985 271 93 44 chr15 72909362 72909732 -30585242 - MTD LTR MaLR -15 404 10 6 1141 1776 124 39 20 chr15 72911113 72911343 -30583631 + RLTR15 LTR ERVK 49 283 -76 6 1141 1776 124 39 20 chr15 72911392 72911466 -30583508 + RLTR15 LTR ERVK 284 359 0 6 1141 540 287 122 6 chr15 72911527 72911699 -30583275 + MTE2b LTR MaLR 170 361 -18 6 1141 3170 8 43 0 chr15 72911841 72912193 -30582781 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1141 14450 22 1 4 chr15 72912193 72913896 -30581078 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4784 6 1141 34695 26 22 2 chr15 72913891 72918030 -30576944 - IAPEz-int LTR ERVK -2252 4229 8 6 1141 3145 11 43 0 chr15 72918030 72918382 -30576592 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1141 249 309 13 134 chr15 72921680 72921749 -30573225 - MT2B2 LTR ERVL -432 152 103 6 1141 1852 153 109 20 chr15 72924751 72925109 -30569865 - MTB_Mm LTR MaLR -27 380 1 6 1141 311 269 27 161 chr15 72925445 72925631 -30569343 - MT2B LTR ERVL -324 277 117 6 1141 226 274 112 107 chr15 72938842 72939075 -30555899 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -295 292 59 7 1141 253 243 54 45 chr15 72939224 72939336 -30555638 - RMER17D2 LTR ERVK -457 352 240 7 1141 531 250 205 5 chr15 72942353 72942542 -30552432 - MTD LTR MaLR -15 404 192 7 1141 734 284 20 20 chr15 72942670 72942871 -30552103 - MTD LTR MaLR -209 210 10 7 1141 882 188 232 104 chr15 72945064 72945358 -30549616 + MT2A LTR ERVL 9 364 -169 7 1141 882 188 232 104 chr15 72945470 72945520 -30549454 + MT2A LTR ERVL 365 397 -136 7 1141 1304 192 58 74 chr15 72950957 72951266 -30543708 - RMER4A LTR ERVK 0 466 163 7 1141 242 319 10 60 chr15 72952005 72952033 -30542941 - MT2B LTR ERVL -349 250 158 7 1141 439 124 33 125 chr15 72953412 72953428 -30541546 + MT2B LTR ERVL 149 153 -448 7 1141 1936 199 58 2 chr15 72954915 72955314 -30539660 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1141 703 212 128 178 chr15 72962681 72962985 -30531989 + MTD LTR MaLR 1 289 -130 7 1141 1347 279 176 32 chr15 72963242 72963956 -30531018 + MTD-int LTR MaLR 1 817 -281 7 1141 243 272 32 32 chr15 72964075 72964170 -30530804 + MTD-int LTR MaLR 969 1063 -195 7 1141 272 284 11 0 chr15 72964899 72964978 -30529996 + MTD-int LTR MaLR 1017 1096 -2 7 1141 974 229 106 12 chr15 72964985 72965241 -30529733 + MTD LTR MaLR 18 297 -122 7 1141 1584 122 126 48 chr15 72965306 72965333 -30529641 + ORR1B1 LTR MaLR 3 27 -367 7 1141 1584 122 126 48 chr15 72965500 72965781 -30529193 + ORR1B1 LTR MaLR 28 335 -59 7 1141 235 237 104 0 chr15 72965775 72965910 -30529064 + RMER17C LTR ERVK 128 276 -134 7 1141 310 206 0 0 chr15 72965921 72965984 -30528990 + ORR1B1 LTR MaLR 324 386 -8 7 1141 225 292 13 53 chr15 72965991 72966067 -30528907 + MTA_Mm LTR MaLR 310 382 -14 7 1141 1944 147 8 62 chr15 72990255 72990639 -30504335 + ORR1B1 LTR MaLR 24 386 -8 7 1141 455 251 71 13 chr15 72995659 72995871 -30499103 + MTC LTR MaLR 166 421 0 7 1141 740 264 127 20 chr15 72996277 72996521 -30498453 + MTEb LTR MaLR 101 370 -9 8 1141 886 243 131 34 chr15 73002783 73002977 -30491997 - RLTR20B3 LTR ERVK -43 534 322 1 1141 886 243 131 34 chr15 73003012 73003115 -30491859 - RLTR20B3 LTR ERVK -256 321 209 1 1141 1330 143 105 14 chr15 73006474 73006714 -30488260 - RMER4B LTR ERVK -284 301 45 1 1141 1330 143 105 14 chr15 73006906 73006945 -30488029 - RMER4B LTR ERVK -541 44 2 1 1142 897 227 141 28 chr15 73008871 73009120 -30485854 + ORR1D2 LTR MaLR 91 367 -3 2 1142 1961 155 119 79 chr15 73023915 73024343 -30470631 + RLTR41 LTR ERV1 2 446 0 5 1142 1560 184 148 31 chr15 73024679 73025038 -30469936 + RMER16 LTR ERVK 3 403 -130 5 1142 863 129 14 7 chr15 73025195 73025336 -30469638 + RMER16 LTR ERVK 392 533 0 5 1142 425 217 0 124 chr15 73025523 73025644 -30469330 - MT2B LTR ERVL -344 257 152 6 1142 4199 57 10 2 chr15 73025785 73026293 -30468681 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 6 1142 1391 202 71 24 chr15 73027034 73027328 -30467646 + ORR1C1 LTR MaLR 63 370 -8 6 1142 502 205 83 133 chr15 73027439 73027619 -30467355 + MT2B LTR ERVL 167 337 -264 7 1142 244 233 32 169 chr15 73030144 73030268 -30464706 + MT2B2 LTR ERVL 153 259 -325 7 1142 2260 90 14 80 chr15 73038062 73038412 -30456562 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1142 2037 157 103 16 chr15 73046971 73047358 -30447616 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1142 3497 28 2 0 chr15 73047751 73048146 -30446828 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1142 8582 18 2 0 chr15 73048146 73049155 -30445819 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1011 -87 1 1142 762 159 118 7 chr15 73049529 73049681 -30445293 - RMER4A LTR ERVK 0 466 298 1 1142 570 251 57 18 chr15 73050297 73050548 -30444426 + ORR1D2 LTR MaLR 1 377 -2 1 1142 1735 191 109 0 chr15 73059092 73059458 -30435516 - MTD LTR MaLR -8 411 6 1 1142 275 275 177 61 chr15 73062604 73062751 -30432223 + MLT1D LTR MaLR 140 303 -202 1 1142 3308 43 2 5 chr15 73068350 73068747 -30426227 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1142 285 294 32 32 chr15 73070235 73070358 -30424616 + RMER15 LTR ERVL 357 479 -96 1 1142 416 284 7 29 chr15 73094281 73094419 -30400555 + ORR1E LTR MaLR 1 135 -224 2 1142 297 281 190 15 chr15 73102179 73102316 -30392658 + MLT2D LTR ERVL 387 547 -13 2 1142 880 250 56 136 chr15 73116163 73116575 -30378399 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 2 1142 338 266 68 44 chr15 73116860 73117079 -30377895 + MTB_Mm LTR MaLR 162 379 0 2 1142 467 223 26 126 chr15 73130172 73130362 -30364612 - MT2B LTR ERVL -337 264 94 2 1142 1986 172 92 8 chr15 73137412 73137793 -30357181 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1143 1559 159 117 6 chr15 73154914 73155231 -30339743 + ORR1D1-int LTR MaLR 1019 1370 0 3 1143 1953 151 38 25 chr15 73155233 73155600 -30339374 + ORR1D1 LTR MaLR 3 374 0 3 1143 1695 94 82 11 chr15 73156333 73156603 -30338371 + MT2B2 LTR ERVL 296 584 0 3 1143 3091 58 10 2 chr15 73158192 73158589 -30336385 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1143 1642 149 164 41 chr15 73163104 73163446 -30331528 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1143 1123 247 93 81 chr15 73165618 73166089 -30328885 + RLTR12B LTR ERVK 42 518 -10 3 1143 374 328 22 0 chr15 73167341 73167475 -30327499 - MLT1D LTR MaLR 0 505 369 3 1143 1956 178 18 31 chr15 73167535 73167924 -30327050 + RMER10B LTR ERVL 15 398 0 3 1143 725 116 6 127 chr15 73175562 73175720 -30319254 - ORR1C1 LTR MaLR -237 141 3 3 1143 2078 127 9 3 chr15 73177302 73177626 -30317348 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 1143 894 169 455 0 chr15 73182604 73182866 -30312108 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 1 3 1143 3611 174 39 36 chr15 73182866 73183617 -30311357 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1509 757 3 1143 1485 211 29 90 chr15 73183605 73183695 -30311279 - ORR1C2-int LTR MaLR -1155 354 263 3 1143 1485 211 29 90 chr15 73183882 73184167 -30310807 - ORR1C2-int LTR MaLR -1247 262 2 3 1143 1787 170 39 45 chr15 73184172 73184554 -30310420 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 1 3 1143 1728 225 26 23 chr15 73196545 73196973 -30298001 + RLTR18-int LTR ERVK 3 431 -4930 3 1143 5514 166 77 20 chr15 73197580 73197895 -30297079 + RLTR18-int LTR ERVK 4118 4468 -893 3 1143 5514 166 77 20 chr15 73198070 73198930 -30296044 + RLTR18-int LTR ERVK 4469 5361 0 3 1143 2572 154 73 47 chr15 73198976 73199467 -30295507 + RLTR18B LTR ERVK 1 504 -8 3 1143 457 266 58 80 chr15 73202660 73202848 -30292126 + RLTR23 LTR ERV1 247 430 0 4 1143 2307 135 62 43 chr15 73203655 73204121 -30290853 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 4 1143 25675 7 1 0 chr15 73204121 73207075 -30287899 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3525 4 1143 886 73 24 0 chr15 73207075 73207198 -30287776 - IAPEz-int LTR ERVK -2770 4910 4785 4 1143 1741 111 4 4 chr15 73207195 73207457 -30287517 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2236 4 1143 424 38 0 0 chr15 73207456 73207509 -30287465 - IAPEz-int LTR ERVK -5070 1411 1359 4 1143 4132 61 68 23 chr15 73207509 73208127 -30286847 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 17 4 1143 2292 133 63 43 chr15 73208150 73208612 -30286362 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 5 4 1143 242 279 191 64 chr15 73209249 73209406 -30285568 + MTEa LTR MaLR 136 312 -67 4 1143 806 206 339 18 chr15 73210275 73210552 -30284422 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 4 1143 2729 67 3 3 chr15 73210689 73211035 -30283939 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1143 652 216 289 13 chr15 73212299 73212444 -30282530 - RMER17C LTR ERVK -21 389 190 4 1143 652 216 289 13 chr15 73212542 73212701 -30282273 - RMER17C LTR ERVK -221 189 1 4 1143 808 260 148 39 chr15 73212874 73213158 -30281816 + MTE2a LTR MaLR 64 378 -1 4 1143 266 221 158 59 chr15 73214071 73214172 -30280802 - MTEa LTR MaLR -11 410 298 4 1143 225 271 59 8 chr15 73215537 73215556 -30279418 + ORR1B1-int LTR MaLR 630 654 -855 4 1143 563 211 41 0 chr15 73216522 73216645 -30278329 - MTEa LTR MaLR -45 334 207 4 1143 721 333 26 0 chr15 73217308 73217500 -30277474 - MTEa LTR MaLR -163 216 20 4 1143 2548 143 126 174 chr15 73220782 73221504 -30273470 + RMER6C LTR ERVK 1 687 -3 4 1143 225 268 40 40 chr15 73222209 73222283 -30272691 + MT2B LTR ERVL 187 260 -341 4 1143 2122 178 51 57 chr15 73223572 73223698 -30271276 + MTC LTR MaLR 6 107 -314 4 1143 2122 168 55 60 chr15 73223823 73224126 -30270848 + MTC LTR MaLR 108 421 0 4 1143 2882 184 144 47 chr15 73230163 73230437 -30264537 + RLTR40 LTR ERVK 1 282 -535 4 1143 2882 184 144 47 chr15 73230512 73230967 -30264007 + RLTR40 LTR ERVK 283 800 -17 4 1143 243 211 0 37 chr15 73234666 73234720 -30260254 + LTR33A LTR ERVL 457 508 -12 4 1143 339 287 11 11 chr15 73236147 73236235 -30258739 + MER77 LTR ERVL 53 140 -467 4 1143 674 286 66 17 chr15 73236655 73236908 -30258066 + MER77 LTR ERVL 206 515 -92 4 1143 363 204 10 111 chr15 73239170 73239269 -30255705 + MT2B LTR ERVL 167 255 -346 5 1143 827 237 137 84 chr15 73243118 73243477 -30251497 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 5 1143 406 296 141 80 chr15 73255500 73255809 -30239165 + MLT1H1 LTR MaLR 1 371 -178 5 1143 370 214 74 46 chr15 73256640 73256748 -30238226 + MT2B LTR ERVL 168 278 -323 5 1143 233 264 26 65 chr15 73264208 73264285 -30230689 - RMER15 LTR ERVL -154 421 348 5 1143 252 283 73 42 chr15 73266400 73266496 -30228478 - MTEa LTR MaLR -4 375 277 5 1143 492 146 37 179 chr15 73266766 73266809 -30228165 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 332 5 1143 492 146 37 179 chr15 73267013 73267100 -30227874 - ORR1D2 LTR MaLR -39 331 256 5 1143 297 318 78 86 chr15 73267500 73267744 -30227230 + ORR1E LTR MaLR 74 315 -44 5 1144 1754 185 58 39 chr15 73269950 73270384 -30224590 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 5 1144 231 228 35 0 chr15 73271596 73271653 -30223321 + MLT1C LTR MaLR 371 429 -38 5 1144 1108 248 47 30 chr15 73280684 73280983 -30213991 + MTEa LTR MaLR 39 342 -37 6 1144 303 160 0 0 chr15 73288396 73288446 -30206528 + MuRRS-int LTR ERV1 3749 3798 -892 6 1144 275 155 0 65 chr15 73288599 73288661 -30206313 + RMER10A LTR ERVL 385 442 0 6 1144 787 301 30 106 chr15 73292189 73292586 -30202388 - MTE2a LTR MaLR -6 373 7 6 1144 329 245 110 77 chr15 73292586 73292741 -30202233 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 271 6 1144 2875 133 34 32 chr15 73294457 73294626 -30200348 + RLTR24 LTR ERV1 31 198 -331 6 1144 2875 133 34 32 chr15 73294774 73295102 -30199872 + RLTR24 LTR ERV1 199 529 0 6 1144 420 264 56 8 chr15 73295539 73295665 -30199309 - RMER15 LTR ERVL -64 511 380 6 1144 284 275 182 67 chr15 73298436 73298705 -30196269 - MLT1C LTR MaLR -32 358 59 6 1144 1077 256 64 58 chr15 73299399 73299726 -30195248 + MTE2a LTR MaLR 41 369 -10 6 1144 743 304 65 11 chr15 73299789 73300049 -30194925 - MLT1A LTR MaLR -11 363 90 6 1144 234 305 168 8 chr15 73300612 73300731 -30194243 + LTR33 LTR ERVL 378 515 0 6 1144 1465 233 76 36 chr15 73304249 73304605 -30190369 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 6 1144 295 293 23 103 chr15 73309191 73309238 -30185736 - MT2B2 LTR ERVL -305 278 119 7 1144 1372 130 149 80 chr15 73313064 73313365 -30181609 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 7 1144 807 68 34 8 chr15 73314509 73314628 -30180346 + ORR1D1 LTR MaLR 1 122 -252 7 1144 247 329 0 13 chr15 73316150 73316213 -30178761 + MTEb LTR MaLR 1 62 -317 7 1144 544 329 8 88 chr15 73316453 73316713 -30178261 + MT2A LTR ERVL 192 430 -103 7 1144 253 319 0 71 chr15 73323945 73324043 -30170931 - MER21B LTR ERV1 -254 609 519 7 1144 468 245 36 9 chr15 73324182 73324293 -30170681 - MER21B LTR ERV1 -535 328 215 7 1144 2482 166 2 24 chr15 73324465 73324891 -30170083 - MTC LTR MaLR 0 421 5 7 1144 395 158 51 26 chr15 73330406 73330484 -30164490 + MTC LTR MaLR 2 81 -340 7 1144 1260 95 11 63 chr15 73330986 73331177 -30163797 - MTB_Mm LTR MaLR -226 181 1 7 1144 229 172 0 206 chr15 73331368 73331394 -30163580 + MTC LTR MaLR 362 386 -33 7 1144 229 172 0 206 chr15 73331616 73331662 -30163312 + MTC LTR MaLR 387 419 0 7 1144 6170 148 33 106 chr15 73331661 73331822 -30163152 + MTC-int LTR MaLR 2 165 -1093 7 1144 6170 148 33 106 chr15 73331975 73332139 -30162835 + MTC-int LTR MaLR 166 287 -971 7 1144 6170 148 33 106 chr15 73332284 73332913 -30162061 + MTC-int LTR MaLR 288 919 -339 7 1144 5038 150 35 105 chr15 73333093 73333285 -30161689 + MTC-int LTR MaLR 920 1068 -190 7 1144 5038 150 35 105 chr15 73333470 73333481 -30161493 + MTC-int LTR MaLR 1069 1073 -185 7 1144 5038 150 35 105 chr15 73333676 73333747 -30161227 + MTC-int LTR MaLR 1074 1138 -120 7 1144 5038 150 35 105 chr15 73333889 73334019 -30160955 + MTC-int LTR MaLR 1139 1258 0 7 1144 2168 154 62 22 chr15 73334019 73334424 -30160550 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1144 3325 25 2 2 chr15 73340968 73341364 -30153610 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1144 2146 125 75 27 chr15 73347705 73347745 -30147229 + MTC LTR MaLR 1 40 -381 8 1144 2146 125 75 27 chr15 73347929 73348290 -30146684 + MTC LTR MaLR 41 421 0 8 1144 249 229 121 0 chr15 73350163 73350246 -30144728 - RMER13B LTR ERVK -4 904 812 8 1144 3086 68 0 7 chr15 73351004 73351407 -30143567 - MTB LTR MaLR 0 400 1 8 1144 3258 171 19 5 chr15 73376818 73377404 -30117570 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 99 8 1144 1468 83 289 4 chr15 73381621 73381874 -30113100 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 8 1144 412 352 91 9 chr15 73396607 73396839 -30098135 - MLT1B LTR MaLR -139 251 1 9 17 4866 160 85 7 chr15 73399836 73400788 -30094186 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 78 9 1145 746 243 52 5 chr15 73403824 73404051 -30090923 - MTEa LTR MaLR 0 379 123 9 1145 667 236 170 25 chr15 73423075 73423356 -30071618 - MTD LTR MaLR -44 375 14 9 1145 577 304 93 100 chr15 73433887 73434198 -30060776 - MLT1F2 LTR MaLR -2 567 259 9 1145 361 263 128 68 chr15 73465433 73465682 -30029292 + MLT1A0 LTR MaLR 72 335 -30 1 1145 1760 133 35 32 chr15 73480359 73480700 -30014274 + ORR1A4 LTR MaLR 28 347 -12 1 1145 750 203 35 47 chr15 73486337 73486595 -30008379 + RMER17B LTR ERVK 172 426 -532 1 1145 251 259 86 0 chr15 73493845 73493926 -30001048 + MLT1C LTR MaLR 1 88 -379 1 1145 2438 119 144 28 chr15 73494129 73494594 -30000380 - RLTR28 LTR ERVL -2 522 4 1 1145 1566 209 146 73 chr15 73496706 73497228 -29997746 + RMER4B LTR ERVK 17 576 -9 1 1145 656 223 106 40 chr15 73497967 73498229 -29996745 - MTD LTR MaLR 0 419 121 1 1145 1595 161 82 6 chr15 73500126 73500445 -29994529 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 32 1 1145 518 290 106 31 chr15 73505275 73505567 -29989407 - RMER10A LTR ERVL -9 433 120 7 1145 1239 227 52 70 chr15 73507835 73508275 -29986699 - RMER10A LTR ERVL -10 432 1 1 1145 284 278 104 60 chr15 73518805 73518914 -29976060 + MTEb LTR MaLR 210 324 -55 4 1145 284 278 104 60 chr15 73519099 73519123 -29975851 + MTEb LTR MaLR 325 348 -31 4 1145 258 254 13 53 chr15 73519378 73519453 -29975521 - MTE-int LTR MaLR -939 641 570 4 1145 361 237 100 50 chr15 73519467 73519587 -29975387 - MTEb LTR MaLR -169 210 85 4 1145 7231 33 2 1 chr15 73529142 73530072 -29964902 - MTA_Mm-int LTR MaLR -167 931 1 5 1145 3511 28 2 0 chr15 73530072 73530467 -29964507 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1145 376 176 63 42 chr15 73530846 73530941 -29964033 - RMER10A LTR ERVL -25 417 321 5 1145 442 291 40 97 chr15 73531022 73531322 -29963652 - RMER10A LTR ERVL -148 294 12 5 1146 1729 203 63 23 chr15 73545759 73546157 -29948817 + RMER10A LTR ERVL 1 414 -28 8 1146 236 255 102 68 chr15 73552290 73552408 -29942566 + MLT1F1 LTR MaLR 342 463 -106 9 1146 235 331 39 70 chr15 73587872 73588028 -29906946 + MER21B LTR ERV1 135 285 -578 1 1146 2174 142 12 0 chr15 73588121 73588444 -29906530 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1146 1588 184 12 33 chr15 73596010 73596341 -29898633 - ORR1D1 LTR MaLR -50 324 1 1 1146 283 232 0 0 chr15 73596375 73596431 -29898543 - RMER20B LTR ERVK -392 235 180 1 1146 528 230 35 121 chr15 73598351 73598549 -29896425 + MTEb LTR MaLR 199 379 0 1 1146 2012 185 10 20 chr15 73601138 73601536 -29893438 + MTB_Mm LTR MaLR 1 394 -13 1 1146 236 315 23 61 chr15 73601603 73601662 -29893312 + MLT1B LTR MaLR 119 179 -211 1 1146 236 315 23 61 chr15 73601815 73601887 -29893087 + MLT1B LTR MaLR 180 245 -145 1 1146 1820 148 168 9 chr15 73609602 73609930 -29885044 + ORR1C2 LTR MaLR 5 384 0 1 1146 474 122 0 0 chr15 73609972 73610046 -29884928 - ORR1A2-int LTR MaLR -1889 74 1 1 1146 2211 104 62 0 chr15 73610046 73610354 -29884620 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1146 1329 187 32 4 chr15 73624228 73624475 -29870499 + ORR1D1-int LTR MaLR 1117 1370 0 1 1146 1945 177 50 22 chr15 73624475 73624839 -29870135 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1146 256 302 25 41 chr15 73627631 73627752 -29867222 + LTR31 LTR ERV1 480 598 -21 1 1146 1067 223 188 26 chr15 73632448 73632793 -29862181 - MTD LTR MaLR -1 418 18 2 1146 851 314 99 36 chr15 73632987 73633453 -29861521 + MER21B LTR ERV1 248 742 -121 2 1146 1481 218 71 128 chr15 73636834 73637328 -29857646 + RLTR18B LTR ERVK 43 508 -4 2 1146 281 245 120 60 chr15 73637689 73637789 -29857185 - ORR1E LTR MaLR -4 375 270 2 1146 300 271 90 35 chr15 73637809 73637974 -29857000 - ORR1E LTR MaLR -173 201 1 2 1146 547 125 37 46 chr15 73642009 73642085 -29852889 + ORR1D1 LTR MaLR 1 75 -299 2 1146 3114 55 39 0 chr15 73642085 73642470 -29852504 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1146 547 125 37 46 chr15 73642470 73642502 -29852472 + ORR1D1 LTR MaLR 76 108 -266 2 1146 417 237 11 21 chr15 73643608 73643703 -29851271 + ORR1C2 LTR MaLR 55 148 -219 2 1146 5198 224 81 21 chr15 73643694 73644957 -29850017 + ORR1C2-int LTR MaLR 32 1369 -1 2 1146 1731 201 34 31 chr15 73644958 73645339 -29849635 + ORR1C2 LTR MaLR 1 382 -2 2 1146 1772 218 57 112 chr15 73646843 73647406 -29847568 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 1 2 1146 913 228 238 24 chr15 73647818 73648146 -29846828 - MTD LTR MaLR -21 398 1 2 1146 253 268 48 12 chr15 73660079 73660162 -29834812 + MLT1A LTR MaLR 74 159 -215 2 1147 227 350 29 10 chr15 73662717 73662821 -29832153 + MLT1A LTR MaLR 179 284 -81 2 1147 1103 219 28 209 chr15 73673705 73674168 -29820806 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 2 1147 238 373 42 8 chr15 73686035 73686154 -29808820 - MLT1B LTR MaLR -264 126 4 2 1147 1368 247 78 21 chr15 73688722 73689114 -29805860 + MTD LTR MaLR 12 405 -14 2 1147 279 262 25 127 chr15 73691552 73691670 -29803304 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 260 2 1147 402 301 96 0 chr15 73693264 73693430 -29801544 - MTEa LTR MaLR 0 379 198 2 1147 323 339 95 69 chr15 73698519 73698836 -29796138 - ORR1E LTR MaLR 0 359 35 2 1147 505 279 67 13 chr15 73703304 73703564 -29791410 - ORR1E LTR MaLR -18 361 50 2 1147 3050 26 42 3 chr15 73703590 73703943 -29791031 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1147 53464 27 14 2 chr15 73703943 73710398 -29784576 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 3 2 1147 3050 26 42 3 chr15 73710400 73710753 -29784221 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1147 237 240 0 0 chr15 73720834 73720884 -29774090 - MTD LTR MaLR -286 133 84 3 1147 2004 161 23 78 chr15 73725471 73725869 -29769105 + ORR1C1 LTR MaLR 1 376 -2 3 1147 1306 242 25 86 chr15 73726897 73727291 -29767683 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1147 275 283 128 37 chr15 73731488 73731675 -29763299 + MLT1B LTR MaLR 124 327 -63 3 1147 380 332 64 118 chr15 73736529 73736743 -29758231 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 154 3 1147 380 332 64 118 chr15 73736929 73737010 -29757964 - ORR1D2 LTR MaLR -217 153 87 3 1147 380 332 64 118 chr15 73737240 73737332 -29757642 - ORR1D2 LTR MaLR -284 86 3 3 1147 243 335 90 26 chr15 73737470 73737626 -29757348 + MLT1A0 LTR MaLR 105 270 -95 3 1147 1979 190 76 13 chr15 73738217 73738611 -29756363 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1147 1326 235 82 42 chr15 73741443 73741799 -29753175 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1147 1653 208 42 16 chr15 73741834 73742249 -29752725 - ORR1D2-int LTR MaLR -191 1772 971 3 1147 2365 83 0 79 chr15 73745602 73745957 -29749017 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1147 1421 174 172 6 chr15 73748751 73749064 -29745910 - MTC LTR MaLR -1 420 56 3 1147 712 246 25 25 chr15 73750610 73750806 -29744168 - ORR1D2 LTR MaLR -26 344 149 3 1147 241 266 152 30 chr15 73758611 73758743 -29736231 + ORR1E LTR MaLR 69 216 -143 3 1147 587 333 37 9 chr15 73758886 73759101 -29735873 + MTE-int LTR MaLR 22 242 -1338 3 1147 1013 254 215 41 chr15 73759115 73759575 -29735399 - RMER2 LTR ERV1 -27 540 1 3 1147 814 267 42 14 chr15 73759575 73759801 -29735173 + MTE-int LTR MaLR 210 446 -1134 3 1147 1837 118 113 21 chr15 73762156 73762284 -29732690 + ORR1B2 LTR MaLR 2 151 -216 3 1147 1837 118 113 21 chr15 73762379 73762577 -29732397 + ORR1B2 LTR MaLR 152 358 -9 3 1147 277 256 60 3 chr15 73768803 73768901 -29726073 + MTEa LTR MaLR 279 379 0 3 1147 1252 262 168 53 chr15 73779226 73779787 -29715187 + RMER20B LTR ERVK 3 627 0 3 143 1792 171 21 6 chr15 73793247 73793582 -29701392 - ORR1C1 LTR MaLR -38 340 1 3 1148 1350 164 115 126 chr15 73794778 73795142 -29699832 - MTC LTR MaLR 0 421 62 3 1148 487 155 225 20 chr15 73795160 73795311 -29699663 - ORR1D1 LTR MaLR -192 182 1 3 1148 960 251 114 56 chr15 73796646 73797004 -29697970 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 3 1148 261 253 66 44 chr15 73798413 73798504 -29696470 - MLT1J1 LTR MaLR -299 145 53 3 1148 404 241 35 26 chr15 73798962 73799077 -29695897 + ORR1E LTR MaLR 1 116 -243 4 1148 251 300 77 57 chr15 73801589 73801850 -29693124 - MTEb LTR MaLR -14 365 91 4 1148 240 344 78 26 chr15 73803911 73804081 -29690893 + MLT2C1 LTR ERVL 89 266 -131 4 1148 228 339 25 50 chr15 73804062 73804183 -29690791 + MLT2C1 LTR ERVL 427 544 -15 4 1148 409 312 110 80 chr15 73814064 73814391 -29680583 + ORR1E LTR MaLR 18 354 -5 4 1148 286 342 30 54 chr15 73831375 73831542 -29663432 + MLT1K LTR MaLR 150 312 -283 4 1148 470 200 38 53 chr15 73841511 73841643 -29653331 + RMER15 LTR ERVL 1 130 -445 4 1148 540 281 49 39 chr15 73841691 73841895 -29653079 + RMER15 LTR ERVL 357 562 -13 4 1148 2116 107 25 0 chr15 73842848 73843166 -29651808 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 1148 2099 153 25 3 chr15 73843356 73843724 -29651250 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 4 1148 3098 74 0 12 chr15 73844079 73844491 -29650483 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1148 2083 72 42 3 chr15 73844943 73845250 -29649724 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1148 1148 215 180 19 chr15 73848872 73849233 -29645741 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1148 1030 209 115 2 chr15 73850059 73850336 -29644638 + MTEb LTR MaLR 77 379 0 4 1148 567 290 87 76 chr15 73850702 73850822 -29644152 + ORR1E LTR MaLR 1 138 -221 4 1148 567 290 87 76 chr15 73850865 73851099 -29643875 + ORR1E LTR MaLR 139 359 0 4 1148 1276 237 97 9 chr15 73860424 73860764 -29634210 - MTE2a LTR MaLR -9 370 1 4 1148 285 301 67 93 chr15 73862473 73862667 -29632307 + MLT1D LTR MaLR 1 189 -316 4 1148 2786 136 22 45 chr15 73863139 73863678 -29631296 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 4 1148 535 280 136 13 chr15 73864676 73864911 -29630063 - MLT1B LTR MaLR -121 269 6 4 1148 4514 155 87 18 chr15 73868802 73869651 -29625323 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 4 1148 268 346 132 33 chr15 73893000 73893212 -29601762 + MLT1E LTR MaLR 398 630 -23 5 1148 1401 217 132 9 chr15 73894972 73895338 -29599636 - MT2A LTR ERVL -85 448 1 5 1148 231 261 77 0 chr15 73895338 73895398 -29599576 - MLT1B LTR MaLR -323 67 3 5 1148 2531 151 37 2 chr15 73900823 73901228 -29593746 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 5 1148 297 280 64 83 chr15 73917744 73917853 -29577121 - MLT1A LTR MaLR -158 216 110 5 1148 253 215 30 30 chr15 73918373 73918440 -29576534 + MLT1J2 LTR MaLR 80 146 -302 5 1148 1736 177 85 9 chr15 73919240 73919570 -29575404 - MTB_Mm LTR MaLR -52 355 1 5 1149 2155 87 30 58 chr15 73928659 73928987 -29565987 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 5 1149 1470 196 29 136 chr15 73930281 73930701 -29564273 - MTEb LTR MaLR -4 375 1 5 1149 895 271 60 54 chr15 73934197 73934529 -29560445 - MTEa LTR MaLR -7 372 39 5 1149 2656 133 2 37 chr15 73934543 73934929 -29560045 - MTC LTR MaLR -8 413 41 5 1149 2656 133 2 37 chr15 73935141 73935182 -29559792 - MTC LTR MaLR -381 40 1 5 1149 284 384 23 39 chr15 73937103 73937233 -29557741 - MTEa LTR MaLR -251 128 1 5 1149 312 227 259 23 chr15 73937233 73937362 -29557612 - MER31A LTR ERV1 -325 160 1 5 1149 734 306 64 52 chr15 73937905 73938250 -29556724 + MLT1B LTR MaLR 8 356 -34 5 1149 2006 150 3 50 chr15 73939552 73939895 -29555079 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1149 1025 256 109 37 chr15 73953412 73953761 -29541213 + MTE2b LTR MaLR 6 379 0 5 1149 331 308 45 15 chr15 73955576 73955708 -29539266 - MLT1D LTR MaLR -350 155 20 6 1149 285 289 55 27 chr15 73959991 73960101 -29534873 - MLT1K LTR MaLR -88 522 411 6 1149 446 346 89 27 chr15 73964276 73964614 -29530360 + MLT1A0 LTR MaLR 7 365 0 6 1149 948 246 73 117 chr15 73965347 73965742 -29529232 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 6 1149 1004 263 91 47 chr15 73965811 73966194 -29528780 + MTD LTR MaLR 20 419 0 6 1149 326 331 73 112 chr15 73967570 73967981 -29526993 - MLT1A1 LTR MaLR -13 395 1 6 1149 4761 142 50 28 chr15 73969452 73970341 -29524633 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 6 1149 271 214 0 0 chr15 73971940 73971996 -29522978 + LTR50 LTR ERVL 25 80 -715 6 1149 477 336 62 74 chr15 73974475 73974784 -29520190 + MTEa LTR MaLR 1 305 -74 6 1149 1225 288 48 12 chr15 73977580 73977917 -29517057 + MTEa LTR MaLR 6 354 -25 6 1149 353 293 78 20 chr15 73995609 73995762 -29499212 - MLT1B LTR MaLR -17 373 212 6 1149 244 294 58 10 chr15 74004335 74004438 -29490536 + RMER15 LTR ERVL 422 529 -46 7 1149 2876 68 12 30 chr15 74008514 74008921 -29486053 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1149 742 256 188 9 chr15 74010409 74010729 -29484245 - MTE2a LTR MaLR -2 377 1 1 1149 336 231 88 0 chr15 74013141 74013232 -29481742 + MLT1A1 LTR MaLR 308 406 -2 2 1149 615 249 18 12 chr15 74014796 74014963 -29480011 + MTD LTR MaLR 1 168 -251 3 1149 1810 265 34 16 chr15 74015015 74015522 -29479452 + RMER20A LTR ERVK 1 516 0 3 1149 695 178 86 33 chr15 74015523 74015674 -29479300 + MTD LTR MaLR 247 405 -14 3 1149 2184 93 13 0 chr15 74016249 74016561 -29478413 - ORR1A2 LTR MaLR -7 320 5 3 1149 2310 84 12 0 chr15 74019849 74020171 -29474803 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 3 1149 260 314 37 19 chr15 74020793 74020900 -29474074 - LTR16B LTR ERVL -343 120 12 4 1149 251 381 80 0 chr15 74033178 74033354 -29461620 + MER74B LTR ERVL 281 470 -152 5 1149 3312 40 0 0 chr15 74038464 74038860 -29456114 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1149 312 271 116 55 chr15 74039504 74039668 -29455306 - MLT1C LTR MaLR -274 193 20 6 1149 839 157 140 6 chr15 74040765 74041041 -29453933 + RMER17B LTR ERVK 16 439 -519 6 1149 1800 139 19 69 chr15 74042484 74042916 -29452058 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 1149 1698 177 48 97 chr15 74043229 74043316 -29451658 - RMER10A LTR ERVL 0 442 372 6 1149 2857 56 43 12 chr15 74043316 74043715 -29451259 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 6 1149 1698 177 48 97 chr15 74043715 74044090 -29450884 - RMER10A LTR ERVL -71 371 3 6 1149 559 312 41 16 chr15 74047409 74047653 -29447321 + MLT1A0 LTR MaLR 74 323 -42 7 1149 319 268 139 83 chr15 74053655 74053871 -29441103 - MLT1B LTR MaLR -161 229 2 7 1149 259 278 144 31 chr15 74055065 74055225 -29439749 + MLT1E LTR MaLR 469 646 -7 7 1150 256 297 98 9 chr15 74065681 74065793 -29429181 - MLT1A LTR MaLR -247 127 6 8 1150 1109 259 76 15 chr15 74068357 74068620 -29426354 + MTE2b LTR MaLR 4 282 -97 9 1150 445 55 0 0 chr15 74069624 74069679 -29425295 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 272 9 1150 1901 120 54 10 chr15 74069794 74070088 -29424886 - ORR1A2 LTR MaLR -20 307 1 9 1150 5613 107 22 10 chr15 74070088 74070916 -29424058 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1126 9 1150 966 170 13 0 chr15 74072138 74072297 -29422677 + MTD LTR MaLR 2 162 -257 9 1150 247 281 61 30 chr15 74075410 74075509 -29419465 + MLT1A0 LTR MaLR 22 123 -242 9 1150 934 310 30 61 chr15 74076434 74076799 -29418175 + ORR1E LTR MaLR 10 379 0 1 1150 1404 238 86 41 chr15 74079474 74079891 -29415083 - RMER4B LTR ERVK -133 452 17 1 1150 1575 228 61 14 chr15 74081313 74081504 -29413470 - MTE2b LTR MaLR 0 379 182 1 1150 1575 228 61 14 chr15 74081717 74081884 -29413090 - MTE2b LTR MaLR -198 181 4 1 1150 226 300 134 37 chr15 74083305 74083492 -29411482 - MLT2B2 LTR ERVL -80 435 231 1 1150 801 260 86 131 chr15 74084556 74084915 -29410059 + ORR1E LTR MaLR 7 349 -10 1 1150 1568 259 11 17 chr15 74086145 74086499 -29408475 - MTE2b LTR MaLR -8 371 20 1 1150 1664 206 24 20 chr15 74086626 74086967 -29408007 - MTE2b LTR MaLR -3 376 35 1 1150 291 279 10 31 chr15 74089476 74089572 -29405402 + MTEb LTR MaLR 1 94 -285 1 1150 272 75 13 130 chr15 74097247 74097298 -29397676 + MT2A LTR ERVL 466 514 -19 1 1150 272 75 13 130 chr15 74097530 74097555 -29397419 + MT2A LTR ERVL 515 533 0 1 1150 1145 211 76 80 chr15 74097900 74098314 -29396660 - MT2A LTR ERVL -79 454 1 1 1150 283 140 0 0 chr15 74098316 74098366 -29396608 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2 5759 5710 1 1150 274 237 0 38 chr15 74098366 74098445 -29396529 - ORR1A3-int LTR MaLR -1321 642 567 1 1150 24555 157 27 4 chr15 74098451 74102608 -29392366 - MERVL_2A-int LTR ERVL -71 5690 1439 1 1150 551 196 19 201 chr15 74102608 74102810 -29392164 - MT2A LTR ERVL -422 162 1 1 1150 2831 192 64 24 chr15 74109066 74109648 -29385326 + RMER19C LTR ERVK 1 605 -6 1 1150 268 332 128 40 chr15 74110768 74111019 -29383955 - MLT1C LTR MaLR -12 455 183 1 1150 383 266 97 67 chr15 74114687 74114852 -29380122 + MLT1C LTR MaLR 290 459 -8 1 1150 307 298 90 28 chr15 74116440 74116585 -29378389 - MLT1C LTR MaLR -1 466 313 1 1150 263 347 99 61 chr15 74128359 74128540 -29366434 - LTR33 LTR ERVL -291 224 37 1 1150 688 248 58 137 chr15 74130575 74130832 -29364142 + MTEa LTR MaLR 8 260 -119 1 1150 688 253 58 122 chr15 74130880 74131019 -29363955 + MTEa LTR MaLR 261 359 0 1 1150 2220 104 25 19 chr15 74132050 74132414 -29362560 + MTB_Mm LTR MaLR 4 369 -38 1 1150 248 326 11 33 chr15 74138375 74138467 -29356507 - ORR1E LTR MaLR -2 357 268 1 1150 313 344 30 0 chr15 74141998 74142129 -29352845 - MER77 LTR ERVL -188 419 285 1 1150 261 291 58 0 chr15 74153326 74153412 -29341562 + MLT1B LTR MaLR 7 97 -293 2 1150 2388 98 86 8 chr15 74166969 74167320 -29327654 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1150 1038 228 124 31 chr15 74168700 74169022 -29325952 - MTEa LTR MaLR -2 377 26 2 1150 703 351 87 24 chr15 74175636 74176062 -29318912 + MLT1G1 LTR MaLR 75 527 -52 2 1150 2120 128 76 11 chr15 74182480 74182835 -29312139 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 2 1150 5874 118 88 18 chr15 74183561 74184517 -29310457 + RLTR13D2 LTR ERVK 1 1023 0 2 1151 2251 101 54 8 chr15 74191161 74191512 -29303462 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1151 53213 31 9 6 chr15 74191516 74197971 -29297003 - IAPEz-int LTR ERVK -3 6478 8 2 1151 2251 101 54 8 chr15 74197971 74198322 -29296652 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1151 1646 133 15 0 chr15 74207492 74207755 -29287219 - ORR1C1 LTR MaLR -111 267 1 2 1151 1226 255 48 56 chr15 74208731 74208939 -29286035 + MTEb LTR MaLR 3 201 -178 2 1151 1226 255 48 56 chr15 74208983 74209152 -29285822 + MTEb LTR MaLR 202 377 -2 2 1151 1796 179 64 13 chr15 74210546 74210919 -29284055 - MTD LTR MaLR -1 418 27 2 1151 2212 135 33 52 chr15 74214088 74214319 -29280655 - MTC LTR MaLR -7 414 191 2 1151 3180 54 18 3 chr15 74214319 74214709 -29280265 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1151 2212 135 33 52 chr15 74214709 74214899 -29280075 - MTC LTR MaLR -231 190 1 2 1151 1634 181 149 16 chr15 74215289 74215659 -29279315 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1151 391 340 199 9 chr15 74226593 74226920 -29268054 + MLT1J LTR MaLR 41 429 -83 2 1151 500 338 48 52 chr15 74237370 74237679 -29257295 + MLT1G LTR MaLR 207 514 -77 2 1151 1022 286 84 14 chr15 74239118 74239486 -29255488 - MTE-int LTR MaLR -406 1174 781 2 1151 226 295 0 64 chr15 74246954 74247048 -29247926 + RMER6D LTR ERVK 121 208 -512 2 1151 2118 108 0 3 chr15 74256663 74256969 -29238005 + MTC LTR MaLR 117 421 0 2 1151 363 333 35 29 chr15 74257451 74257624 -29237350 + MTE2a LTR MaLR 1 174 -245 2 1151 650 259 47 66 chr15 74258226 74258437 -29236537 + MTE2a LTR MaLR 173 379 0 2 1151 2647 134 61 0 chr15 74267031 74267426 -29227548 - MTC LTR MaLR -2 419 1 2 1151 2074 188 155 10 chr15 74294209 74294326 -29200648 - RMER4B LTR ERVK 0 585 469 3 1151 3644 15 0 0 chr15 74294326 74294722 -29200252 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1151 2074 188 155 10 chr15 74294722 74295115 -29199859 - RMER4B LTR ERVK -117 468 2 3 1151 375 297 75 37 chr15 74295632 74295793 -29199181 + MLT1A0 LTR MaLR 28 194 -171 3 1151 230 279 0 32 chr15 74305230 74305293 -29189681 - MLT1E2 LTR MaLR 0 627 567 3 1151 495 167 21 0 chr15 74305989 74306085 -29188889 + ORR1E LTR MaLR 3 100 -259 3 1151 2563 89 0 0 chr15 74306248 74306575 -29188399 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 3 1152 2370 115 18 3 chr15 74324090 74324431 -29170543 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1152 2485 98 3 12 chr15 74328641 74328971 -29166003 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1152 363 345 113 9 chr15 74332348 74332570 -29162404 - RMER15 LTR ERVL -5 570 326 3 1152 1818 170 97 6 chr15 74333734 74334094 -29160880 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 1 3 1152 333 293 91 0 chr15 74338601 74338700 -29156274 - MLT1C LTR MaLR 0 467 360 3 1152 3286 55 8 0 chr15 74412839 74413236 -29081738 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1152 1802 161 164 0 chr15 74415937 74416267 -29078707 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1152 1883 76 84 23 chr15 74421815 74421859 -29073115 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 290 4 1152 3046 82 20 2 chr15 74421859 74422252 -29072722 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1152 1883 76 84 23 chr15 74422252 74422515 -29072459 - ORR1A2 LTR MaLR -38 289 1 4 1152 589 338 23 37 chr15 74427344 74427559 -29067415 + MER21B LTR ERV1 53 264 -599 4 1152 297 235 91 77 chr15 74427550 74427693 -29067281 - MLT1B LTR MaLR -44 346 202 4 1152 244 372 75 30 chr15 74427680 74427813 -29067161 + MER21B LTR ERV1 258 396 -467 4 1152 310 269 43 0 chr15 74427849 74427942 -29067032 + MER21B LTR ERV1 637 733 -130 4 1152 1480 239 34 20 chr15 74432339 74432694 -29062280 - MTEb LTR MaLR 0 379 20 4 1152 298 270 40 87 chr15 74434533 74434683 -29060291 - RMER20B LTR ERVK -251 376 234 4 1152 232 271 80 40 chr15 74438926 74439026 -29055948 + LTR85c LTR Gypsy? 703 806 -17 4 1152 2204 167 32 30 chr15 74439284 74439723 -29055251 + BGLII_B LTR ERVK 2 441 0 4 1153 527 310 48 5 chr15 74451884 74452072 -29042902 - MER21B LTR ERV1 -98 765 570 4 1153 453 329 143 30 chr15 74452584 74452850 -29042124 - MER21B LTR ERV1 -300 563 268 4 1153 2249 119 22 0 chr15 74454145 74454465 -29040509 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1153 1178 158 144 227 chr15 74462346 74462755 -29032219 + ORR1C1 LTR MaLR 4 378 0 4 1153 763 265 139 73 chr15 74463279 74463580 -29031394 + MTEb LTR MaLR 27 347 -32 4 1153 232 296 64 91 chr15 74470446 74470762 -29024212 - ORR1D2 LTR MaLR -52 307 4 4 1153 230 262 110 24 chr15 74475098 74475180 -29019794 - MLT1J-int LTR MaLR -442 945 857 4 1153 324 278 21 0 chr15 74479585 74479682 -29015292 - MER52-int LTR ERV1 -3363 3728 3630 4 1153 279 279 16 98 chr15 74479766 74479860 -29015114 - MT2B LTR ERVL -344 257 169 4 1153 279 279 16 98 chr15 74480072 74480084 -29014890 - MT2B LTR ERVL -433 168 159 4 1153 1666 169 119 9 chr15 74480084 74480419 -29014555 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 5 1153 5806 206 61 63 chr15 74480419 74481302 -29013672 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 512 5 1153 5806 206 61 63 chr15 74481361 74481849 -29013125 - ORR1D1-int LTR MaLR -859 511 2 5 1153 279 279 16 98 chr15 74481849 74481862 -29013112 - MT2B LTR ERVL -443 158 148 4 1153 866 183 57 6 chr15 74481862 74482025 -29012949 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 190 5 1153 984 221 16 0 chr15 74482517 74482707 -29012267 - ORR1D1 LTR MaLR -181 193 1 5 1153 4166 164 13 6 chr15 74482729 74483415 -29011559 - RLTR17 LTR ERVK -1 691 1 5 1153 362 331 85 12 chr15 74483473 74483638 -29011336 - MER52-int LTR ERV1 -3547 3544 3368 4 1153 1754 241 62 15 chr15 74485927 74486327 -29008647 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1153 1459 216 105 14 chr15 74486883 74487254 -29007720 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 5 1153 246 213 15 62 chr15 74487447 74487506 -29007468 - RMER5 LTR ERV1 -478 56 1 5 1153 2254 145 50 100 chr15 74488513 74489051 -29005923 + RLTR24 LTR ERV1 19 529 0 5 1153 286 300 110 50 chr15 74515090 74515290 -28979684 - MLT1F1 LTR MaLR -357 212 1 1 1153 4370 89 28 39 chr15 74518337 74519082 -28975892 - RMER17A LTR ERVK -14 737 1 1 1153 2018 108 22 9 chr15 74528690 74529007 -28965967 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 3 1153 284 319 66 54 chr15 74531002 74531168 -28963806 + LTR33A LTR ERVL 81 248 -272 3 1153 393 309 196 14 chr15 74540316 74540602 -28954372 + MLT1D LTR MaLR 159 496 -9 3 1153 249 307 100 82 chr15 74544100 74544320 -28950654 - LTR33 LTR ERVL -161 354 131 4 1153 257 350 110 11 chr15 74568060 74568242 -28926732 + MER110A LTR ERV1 2 201 -267 6 1153 1282 261 89 26 chr15 74569372 74569754 -28925220 + MER21B LTR ERV1 2 407 -456 6 1153 405 331 15 0 chr15 74570212 74570348 -28924626 + MER21B LTR ERV1 625 762 -101 6 1153 256 314 16 47 chr15 74570375 74570502 -28924472 + MER65D LTR ERV1 4 126 -347 6 1154 556 241 216 10 chr15 74584317 74584632 -28910342 + ORR1D1 LTR MaLR 1 392 -2 7 1154 397 305 17 17 chr15 74590683 74590803 -28904171 + RMER15 LTR ERVL 339 458 -117 8 1154 1129 296 47 33 chr15 74600811 74600972 -28894002 + MTE2b LTR MaLR 5 175 -204 9 1154 1129 296 47 33 chr15 74601179 74601377 -28893597 + MTE2b LTR MaLR 176 369 -10 9 1154 226 238 0 0 chr15 74615475 74615517 -28879457 - MTE2a LTR MaLR -49 330 289 1 1154 386 324 67 137 chr15 74616406 74616792 -28878182 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 1 1154 1883 210 40 15 chr15 74617747 74618143 -28876831 - MTD LTR MaLR -13 406 1 1 1154 1711 197 47 60 chr15 74620428 74620812 -28874162 + MTD LTR MaLR 26 404 -15 1 1154 4072 111 93 70 chr15 74621081 74621768 -28873206 - RMER6A LTR ERVK 0 756 59 1 1154 4072 111 93 70 chr15 74621798 74621849 -28873125 - RMER6A LTR ERVK -698 58 3 1 1154 632 286 156 95 chr15 74622093 74622410 -28872564 + MLT1A0 LTR MaLR 1 366 -42 1 1154 604 286 156 95 chr15 74622564 74622625 -28872349 + MLT1A0 LTR MaLR 367 402 -6 1 1154 1674 179 76 22 chr15 74623042 74623397 -28871577 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1154 1133 265 50 29 chr15 74624681 74624961 -28870013 - MTE2b LTR MaLR -93 286 1 1 1154 340 62 22 0 chr15 74625819 74625870 -28869104 - MTD LTR MaLR -327 92 41 1 1154 2775 34 0 0 chr15 74626893 74627219 -28867755 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 32 357 0 1 1154 549 310 66 9 chr15 74631316 74631531 -28863443 - MLT1A0 LTR MaLR 0 408 162 1 1154 1497 178 103 46 chr15 74631671 74631871 -28863103 - RMER17C LTR ERVK 0 410 185 1 1154 1497 178 103 46 chr15 74632020 74632207 -28862767 - RMER17C LTR ERVK -226 184 1 1 1154 3787 105 21 16 chr15 74632706 74633267 -28861707 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 1 1154 2323 144 185 9 chr15 74633295 74633744 -28861230 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 1 1154 1492 211 68 6 chr15 74635440 74635792 -28859182 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1154 2676 162 82 4 chr15 74636282 74636353 -28858621 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 457 1 1154 2676 162 82 4 chr15 74636394 74636812 -28858162 - RLTR11A LTR ERVK -72 456 3 1 1154 7850 168 75 42 chr15 74640571 74642338 -28852636 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 1825 -23 1 1154 271 299 85 23 chr15 74643040 74643170 -28851804 + MLT2C2 LTR ERVL 122 259 -205 1 1154 1219 190 103 98 chr15 74646069 74646436 -28848538 + ORR1D1 LTR MaLR 1 369 -5 1 1154 1204 193 104 88 chr15 74652184 74652548 -28842426 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 1 1154 2788 34 0 0 chr15 74655501 74655823 -28839151 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1154 13423 45 12 8 chr15 74655823 74657463 -28837511 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 3199 1 1154 20729 29 4 12 chr15 74657444 74659927 -28835047 - MMETn-int LTR ERVK -2379 2465 1 1 1154 2748 31 9 0 chr15 74659927 74660246 -28834728 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1154 271 299 85 23 chr15 74660333 74660463 -28834511 - MLT2C2 LTR ERVL -205 259 122 1 1154 1827 213 48 46 chr15 74661977 74662434 -28832540 - RMER5 LTR ERV1 -9 525 68 1 1154 295 268 118 26 chr15 74672684 74672837 -28822137 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1088 1 1154 3542 294 79 59 chr15 74674082 74674719 -28820255 + ORR1E-int LTR MaLR 192 809 -771 1 1154 2326 93 19 12 chr15 74674719 74675044 -28819930 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1154 3542 294 79 59 chr15 74675044 74675480 -28819494 + ORR1E-int LTR MaLR 810 1283 -297 1 1154 1041 244 66 109 chr15 74675480 74675876 -28819098 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1154 3542 294 79 59 chr15 74675876 74676111 -28818863 + ORR1E-int LTR MaLR 1284 1527 -53 1 1154 976 294 13 95 chr15 74676111 74676409 -28818565 + ORR1E LTR MaLR 1 271 -88 1 1154 1104 224 40 152 chr15 74676409 74676836 -28818138 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 1 1154 976 294 13 95 chr15 74676836 74676928 -28818046 + ORR1E LTR MaLR 272 359 0 1 1154 333 244 11 11 chr15 74679093 74679180 -28815794 + ORR1E LTR MaLR 41 127 -232 2 1154 392 258 108 44 chr15 74680135 74680338 -28814636 - MLT1B LTR MaLR -8 382 167 2 1154 366 287 67 40 chr15 74687753 74687902 -28807072 + RMER15 LTR ERVL 381 533 -42 2 1154 1872 199 109 17 chr15 74689764 74690169 -28804805 - RMER13A LTR ERVK -273 587 146 2 1154 455 271 133 62 chr15 74690948 74691258 -28803716 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 31 2 1154 3383 78 50 2 chr15 74691493 74691953 -28803021 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1154 26925 68 31 21 chr15 74691953 74694217 -28800757 + RLTR45-int LTR ERVK 1 2303 -4941 2 1154 26925 68 31 21 chr15 74694243 74695607 -28799367 + RLTR45-int LTR ERVK 2304 3665 -3579 2 1154 337 275 0 0 chr15 74695599 74695668 -28799306 + RMER16-int LTR ERVK 1565 1633 -3773 2 1154 29667 39 9 10 chr15 74695716 74696847 -28798127 + RLTR45-int LTR ERVK 3651 4745 -2499 2 1154 29667 39 9 10 chr15 74696895 74698414 -28796560 + RLTR45-int LTR ERVK 4746 6284 -960 2 1154 29667 39 9 10 chr15 74698458 74699403 -28795571 + RLTR45-int LTR ERVK 6285 7242 -2 2 1154 3689 68 19 0 chr15 74699403 74699876 -28795098 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 2 1154 2100 139 22 36 chr15 74700274 74700633 -28794341 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 1154 1187 111 48 27 chr15 74700939 74701125 -28793849 + RLTR24 LTR ERV1 1 190 -339 2 1154 1835 169 47 82 chr15 74701496 74701543 -28793431 + RLTR24 LTR ERV1 166 194 -335 2 1154 1835 149 55 107 chr15 74702200 74702547 -28792427 + RLTR24 LTR ERV1 195 529 0 2 1154 610 225 163 11 chr15 74703284 74703468 -28791506 - MTD LTR MaLR -2 417 206 2 1154 2557 107 29 11 chr15 74704614 74704993 -28789981 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 2 1155 2211 206 56 10 chr15 74718580 74719084 -28775890 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 2 1155 298 192 122 49 chr15 74724218 74724300 -28770674 - MTEb LTR MaLR -14 365 278 2 1155 389 207 96 12 chr15 74724663 74724740 -28770234 + RMER20B LTR ERVK 16 99 -528 2 1155 2863 64 11 5 chr15 74724740 74725119 -28769855 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 16 2 1155 850 249 71 46 chr15 74725232 74725472 -28769502 + RMER20B LTR ERVK 359 604 -23 2 1155 293 250 0 15 chr15 74725471 74725536 -28769438 + RMER20B LTR ERVK 527 590 -37 2 1155 1030 221 247 15 chr15 74727313 74727653 -28767321 - MTD LTR MaLR 0 419 1 2 1155 227 314 55 76 chr15 74728571 74728716 -28766258 + LTR81A LTR ERV1? 431 572 -778 2 1155 2319 164 65 0 chr15 74729190 74729575 -28765399 - MTC LTR MaLR -10 411 2 2 1155 2244 203 53 97 chr15 74733122 74733728 -28761246 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 579 -5 2 1155 1626 116 205 12 chr15 74734953 74735101 -28759873 + RMER17C LTR ERVK 1 155 -255 3 1155 1626 116 205 12 chr15 74735197 74735389 -28759585 + RMER17C LTR ERVK 156 406 -4 3 1155 293 360 72 0 chr15 74736771 74736910 -28758064 + RMER15 LTR ERVL 422 570 -5 3 1155 271 310 151 61 chr15 74736934 74737340 -28757634 + MLT2D LTR ERVL 69 560 0 3 1155 1401 179 198 6 chr15 74738059 74738373 -28756601 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1155 270 346 83 0 chr15 74746221 74746354 -28748620 - MER67C LTR ERV1 -165 546 403 3 1155 249 327 58 0 chr15 74746878 74746982 -28747992 + MLT1A0 LTR MaLR 218 327 -38 3 1155 598 297 142 42 chr15 74747214 74747483 -28747491 - MER31B LTR ERV1 -14 452 150 3 1155 598 243 231 28 chr15 74747673 74747785 -28747189 - MER31B LTR ERV1 -317 149 1 3 1155 905 293 74 36 chr15 74747853 74748218 -28746756 + MLT-int LTR MaLR 249 627 -1108 3 1155 235 347 41 41 chr15 74748237 74748360 -28746614 + MLT-int LTR MaLR 670 792 -943 3 1155 291 226 22 154 chr15 74749978 74750114 -28744860 - LTR83 LTR ERVL -152 628 511 3 1155 367 152 0 29 chr15 74750383 74750451 -28744523 - MTD LTR MaLR 0 419 354 3 1155 226 261 101 0 chr15 74751187 74751256 -28743718 - MTD LTR MaLR -68 351 276 3 1155 234 340 127 13 chr15 74752953 74753111 -28741863 + MLT1F LTR MaLR 134 309 -239 3 1155 457 138 195 0 chr15 74756879 74756966 -28738008 + RLTR24 LTR ERV1 426 529 0 3 1155 448 256 39 137 chr15 74757393 74757678 -28737296 - MER31A LTR ERV1 -210 275 19 3 1155 254 310 19 39 chr15 74759546 74759650 -28735324 - RMER5 LTR ERV1 -16 518 417 3 1155 428 270 148 34 chr15 74759813 74760289 -28734685 + RMER19C LTR ERVK 33 591 -20 3 1155 1085 230 58 44 chr15 74760317 74760518 -28734456 + MurERV4-int LTR ERVK 2 218 -5042 3 1155 1085 276 89 64 chr15 74760725 74760943 -28734031 + MurERV4-int LTR ERVK 196 434 -5346 3 1155 790 269 77 53 chr15 74761134 74761472 -28733502 + MurERV4-int LTR ERVK 1404 1749 -3511 3 1155 1505 218 59 28 chr15 74761518 74761909 -28733065 + RMER17C LTR ERVK 1 403 -7 3 1155 509 303 103 47 chr15 74762460 74762971 -28732003 + RLTR6-int LTR ERV1 1058 1841 -5937 3 1155 343 239 88 30 chr15 74762998 74763138 -28731836 + RLTR6-int LTR ERV1 2936 3179 -4599 3 1155 635 283 9 49 chr15 74763200 74763423 -28731551 + RLTR6-int LTR ERV1 3315 3528 -4250 3 1155 2217 68 0 20 chr15 74764147 74764448 -28730526 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 448 3 1155 1725 75 78 8 chr15 74764422 74764678 -28730296 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -468 274 1 3 1155 474 240 21 85 chr15 74765183 74765212 -28729762 - MT2B LTR ERVL -449 152 133 3 1155 775 310 114 53 chr15 74765212 74765850 -28729124 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 4911 5587 -2014 3 1155 588 138 11 0 chr15 74766135 74766229 -28728745 - RMER16 LTR ERVK 0 533 439 3 1155 799 191 14 7 chr15 74766388 74766536 -28728438 - RMER16 LTR ERVK -384 149 1 3 1155 822 129 106 7 chr15 74768418 74768559 -28726415 + MTD LTR MaLR 3 157 -262 3 1155 783 249 65 45 chr15 74768614 74768899 -28726075 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 298 -230 3 1155 1217 181 157 9 chr15 74768889 74769207 -28725767 + MTC-int LTR MaLR 884 1248 -10 3 1155 714 237 48 78 chr15 74769845 74770051 -28724923 + ORR1D2 LTR MaLR 1 200 -170 3 1155 3886 190 34 32 chr15 74770051 74770904 -28724070 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 3 1155 36170 85 17 22 chr15 74770927 74772588 -28722386 - ETnERV3-int LTR ERVK -126 5682 4010 3 1155 36170 85 17 22 chr15 74772632 74773083 -28721891 - ETnERV3-int LTR ERVK -1799 4009 3535 3 1155 36170 98 15 20 chr15 74773230 74776640 -28718334 - ETnERV3-int LTR ERVK -2274 3534 186 3 1155 1129 143 11 11 chr15 74776981 74777165 -28717809 - ETnERV3-int LTR ERVK -5622 186 3 3 1155 3870 195 34 32 chr15 74777167 74778020 -28716954 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 3 1155 438 205 45 52 chr15 74778037 74778171 -28716803 + ORR1D2 LTR MaLR 230 362 -8 3 1155 945 228 107 8 chr15 74778822 74779074 -28715900 - RMER5 LTR ERV1 -17 517 241 3 1155 3897 122 40 15 chr15 74779670 74780752 -28714222 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 806 0 3 1155 2113 157 20 73 chr15 74781385 74781659 -28713315 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 109 3 1155 2633 79 161 141 chr15 74781659 74782161 -28712813 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 3 1155 2113 157 20 73 chr15 74782161 74782285 -28712689 - ORR1C1 LTR MaLR -270 108 1 3 1155 1523 128 56 137 chr15 74784017 74784111 -28710863 - RMER17C LTR ERVK -35 375 263 3 1155 1523 128 56 137 chr15 74784155 74784273 -28710701 - RMER17C LTR ERVK -148 262 185 3 1155 1523 128 56 137 chr15 74784394 74784588 -28710386 - RMER17C LTR ERVK -226 184 1 3 1155 286 310 69 26 chr15 74789848 74789964 -28705010 + MT2B2 LTR ERVL 145 265 -319 4 1155 2365 138 43 57 chr15 74792638 74792848 -28702126 - MTC LTR MaLR -4 417 206 4 1155 2365 138 43 57 chr15 74793045 74793254 -28701720 - MTC LTR MaLR -216 205 1 4 1155 572 278 112 57 chr15 74794630 74795038 -28699936 - RLTR26 LTR ERVK -113 514 2 4 1155 12471 143 48 24 chr15 74795051 74795649 -28699325 - MERVK26-int LTR ERVK -1 6918 6319 4 1155 12471 143 48 24 chr15 74795707 74796672 -28698302 - MERVK26-int LTR ERVK -601 6318 5326 4 1155 698 276 135 30 chr15 74796672 74797005 -28697969 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 4 1155 12471 143 48 24 chr15 74797005 74797303 -28697671 - MERVK26-int LTR ERVK -1594 5325 5015 4 1155 12471 143 48 24 chr15 74797330 74797629 -28697345 - MERVK26-int LTR ERVK -1905 5014 4708 4 1155 1445 286 107 70 chr15 74799184 74799886 -28695088 - RMER13A LTR ERVK -35 825 98 4 1155 802 213 0 0 chr15 74799970 74800125 -28694849 + MERVK26-int LTR ERVK 3609 3763 -3156 4 1155 2820 142 93 14 chr15 74800125 74800611 -28694363 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 4 1155 1146 227 37 46 chr15 74802656 74803008 -28691966 - MT2A LTR ERVL -7 594 114 4 1155 452 269 49 88 chr15 74803008 74803212 -28691762 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1127 4 1155 5466 112 24 32 chr15 74803446 74803769 -28691205 - RLTR22_Mur LTR ERVK -973 875 545 4 1155 5466 112 24 32 chr15 74803936 74804494 -28690480 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1304 544 1 4 1155 709 125 0 9 chr15 74804494 74804599 -28690375 - MT2A LTR ERVL -426 107 4 4 1155 488 301 68 55 chr15 74805506 74805742 -28689232 + RMER2 LTR ERV1 329 567 0 4 1155 2066 207 43 70 chr15 74806345 74806499 -28688475 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 153 -407 4 1155 3131 52 10 5 chr15 74806499 74806887 -28688087 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 4 1155 2066 207 43 70 chr15 74806887 74807179 -28687795 + RLTR20B2 LTR ERVK 154 455 -105 4 1155 2066 207 43 70 chr15 74807325 74807337 -28687637 + RLTR20B2 LTR ERVK 456 456 -104 4 1155 2066 207 43 70 chr15 74807376 74807445 -28687529 + RLTR20B2 LTR ERVK 456 516 -44 4 1155 446 291 0 30 chr15 74807448 74807578 -28687396 - RLTR33 LTR ERVK -150 528 403 4 1155 1889 181 12 8 chr15 74807578 74808032 -28686942 - RLTR33 LTR ERVK -1 677 181 4 1155 1348 179 66 103 chr15 74808034 74808412 -28686562 + RMER16 LTR ERVK 3 533 0 4 1155 976 100 87 71 chr15 74808412 74808575 -28686399 - RLTR33 LTR ERVK -492 186 18 4 1155 976 100 87 71 chr15 74808761 74808780 -28686194 - RLTR33 LTR ERVK -661 17 1 4 1155 848 183 48 24 chr15 74808986 74809154 -28685820 - RLTR33 LTR ERVK -345 333 162 4 1155 292 290 31 31 chr15 74815280 74815376 -28679598 - RMER15 LTR ERVL -124 451 356 4 1155 1763 168 11 73 chr15 74820082 74820519 -28674455 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 1155 373 306 7 71 chr15 74821582 74821737 -28673237 + RLTR14 LTR ERV1 224 368 -14 4 1155 1372 261 73 25 chr15 74821791 74821896 -28673078 - RMER5 LTR ERV1 0 534 434 4 1155 1769 149 19 167 chr15 74821896 74822188 -28672786 - RMER10B LTR ERVL 0 398 174 4 1155 1769 149 19 167 chr15 74822236 74822410 -28672564 - RMER10B LTR ERVL -225 173 2 4 1155 1372 261 73 25 chr15 74822410 74822783 -28672191 - RMER5 LTR ERV1 -101 433 33 4 1155 754 273 24 42 chr15 74823562 74823847 -28671127 - RLTR18B LTR ERVK -44 572 187 4 1155 356 339 16 71 chr15 74823907 74824091 -28670883 - RLTR18 LTR ERVK -335 281 108 4 1155 2725 131 101 28 chr15 74824501 74825117 -28669857 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 192 4 1155 378 148 0 16 chr15 74825121 74825183 -28669791 - RMER17A2 LTR ERVK -845 61 1 4 1155 270 262 88 69 chr15 74829448 74829608 -28665366 - RMER15 LTR ERVL -55 520 358 4 1155 1261 195 104 61 chr15 74830777 74831170 -28663804 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 1155 4002 105 18 4 chr15 74831502 74832058 -28662916 - RMER2 LTR ERV1 0 567 4 4 1155 2585 118 0 19 chr15 74832934 74833306 -28661668 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 4 1155 406 221 28 19 chr15 74833727 74833833 -28661141 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 324 4 1155 6671 62 49 0 chr15 74834132 74834983 -28659991 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 4 1155 2724 82 141 139 chr15 74835423 74835934 -28659040 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1155 268 338 0 0 chr15 74836079 74836153 -28658821 - ORR1E LTR MaLR -259 100 27 4 1155 1119 194 12 210 chr15 74836239 74836519 -28658455 - RMER10B LTR ERVL 0 398 193 4 1155 1119 194 12 210 chr15 74836695 74836910 -28658064 - RMER10B LTR ERVL -206 192 1 4 1155 1559 175 44 3 chr15 74836971 74837264 -28657710 - MTC LTR MaLR -55 366 62 4 1155 19532 132 24 2 chr15 74838458 74841370 -28653604 + MERVL-int LTR ERVL 1999 4975 -510 4 1156 2561 152 103 50 chr15 74842319 74842844 -28652130 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5077 5629 -132 4 1156 249 181 26 53 chr15 74842844 74842920 -28652054 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 4 1156 288 54 0 0 chr15 74842921 74842958 -28652016 + MERVL-int LTR ERVL 5449 5485 0 4 1156 2800 132 27 40 chr15 74842958 74843439 -28651535 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 1156 918 216 0 0 chr15 74843439 74843624 -28651350 - ORR1A3 LTR MaLR -94 232 48 4 1156 342 167 0 0 chr15 74849877 74849937 -28645037 - ORR1A3 LTR MaLR -267 60 1 4 1156 380 291 108 25 chr15 74849998 74850202 -28644772 + MLT1B LTR MaLR 32 252 -138 4 1156 857 228 125 12 chr15 74852913 74853241 -28641733 + RMER5 LTR ERV1 69 433 -101 5 1156 1480 216 3 27 chr15 74853241 74853515 -28641459 + RMER10B LTR ERVL 1 268 -130 5 1156 1480 216 3 27 chr15 74853592 74853655 -28641319 + RMER10B LTR ERVL 269 330 -68 5 1156 296 300 20 10 chr15 74853873 74853974 -28641000 + RMER5 LTR ERV1 433 534 0 5 1156 548 210 8 16 chr15 74854830 74854951 -28640023 - RMER17C LTR ERVK -1 409 290 5 1156 235 254 15 0 chr15 74858501 74858568 -28636406 + RLTR18 LTR ERVK 2 69 -443 5 1156 271 353 17 77 chr15 74858588 74858769 -28636205 + RLTR18 LTR ERVK 113 282 -334 5 1156 398 265 92 12 chr15 74858855 74859019 -28635955 + RLTR18B LTR ERVK 193 369 -143 5 1156 230 222 0 18 chr15 74859054 74859109 -28635865 + RLTR18B LTR ERVK 371 424 -88 5 1156 753 78 35 9 chr15 74859473 74859589 -28635385 - MTB_Mm LTR MaLR 0 400 282 5 1156 4749 86 36 29 chr15 74859592 74860396 -28634578 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 983 0 5 1156 1928 78 35 3 chr15 74860396 74860677 -28634297 - MTB_Mm LTR MaLR -117 290 1 5 1156 5228 122 11 81 chr15 74860677 74861684 -28633290 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1098 164 5 1156 2381 50 10 0 chr15 74861684 74862184 -28632790 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1156 812 174 6 0 chr15 74862184 74862353 -28632621 - MTB_Mm-int LTR MaLR -928 170 1 5 1156 1252 124 50 0 chr15 74862353 74862555 -28632419 - MTB_Mm LTR MaLR 0 400 189 5 1156 3655 61 43 50 chr15 74862555 74863071 -28631903 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 5 1156 7423 85 25 71 chr15 74863071 74864912 -28630062 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 1961 5 1156 2974 91 5 2 chr15 74871546 74871966 -28623008 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 5 1156 803 162 0 13 chr15 74872674 74872824 -28622150 - RLTR33 LTR ERVK -350 328 181 5 1156 480 158 38 49 chr15 74872824 74872987 -28621987 + RMER16 LTR ERVK 198 335 -198 5 1156 727 222 11 16 chr15 74873181 74873364 -28621610 + RMER16 LTR ERVK 352 533 0 5 1156 865 129 85 12 chr15 74873373 74873538 -28621436 - RLTR33 LTR ERVK -501 177 1 5 1156 687 229 62 26 chr15 74873713 74873906 -28621068 - RLTR33 LTR ERVK -317 361 162 5 1156 651 262 52 30 chr15 74874369 74874634 -28620340 - RLTR18B LTR ERVK -47 569 193 5 1156 1268 188 96 56 chr15 74881680 74882074 -28612900 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1156 3851 110 18 4 chr15 74882386 74882942 -28612032 - RMER2 LTR ERV1 0 567 4 5 1156 2509 126 0 19 chr15 74883785 74884157 -28610817 - RLTR8 LTR ERVK 0 365 1 5 1156 3318 125 4 37 chr15 74884194 74884526 -28610448 - RLTR45-int LTR ERVK -1173 6071 5973 5 1156 1878 142 154 28 chr15 74884526 74884954 -28610020 + RLTR45 LTR ERVK 1 482 0 5 1156 3318 83 6 35 chr15 74884954 74885332 -28609642 - RLTR45-int LTR ERVK -1272 5972 5597 5 1156 278 136 16 33 chr15 74885625 74885686 -28609288 + RLTR1B LTR ERV1 81 140 -372 5 1156 1419 132 110 52 chr15 74885683 74886011 -28608963 - MURVY-LTR LTR ERV1 -127 392 46 5 1156 18116 113 33 4 chr15 74886691 74889950 -28605024 + MERVL-int LTR ERVL 1999 5352 -133 5 1156 271 100 100 0 chr15 74890011 74890071 -28604903 + MERVL-int LTR ERVL 5564 5629 -132 5 1156 233 233 13 40 chr15 74890071 74890147 -28604827 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 5 1156 2886 138 14 35 chr15 74890185 74890667 -28604307 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 472 -3 5 1156 1222 205 0 0 chr15 74890669 74890903 -28604071 - ORR1A3 LTR MaLR -92 234 1 5 1156 294 270 92 35 chr15 74891018 74891160 -28603814 + MLT1B LTR MaLR 103 252 -138 5 1156 1105 270 68 22 chr15 74893744 74894086 -28600888 + RMER5 LTR ERV1 69 433 -101 5 1156 1843 176 14 91 chr15 74894086 74894447 -28600527 + RMER10B LTR ERVL 1 335 -63 5 1156 1843 176 14 91 chr15 74894505 74894574 -28600400 + RMER10B LTR ERVL 336 397 -1 5 1156 1105 270 68 22 chr15 74894574 74894675 -28600299 + RMER5 LTR ERV1 434 532 -2 5 1156 1154 189 29 52 chr15 74895537 74896081 -28598893 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 1156 706 267 49 31 chr15 74906242 74906523 -28588451 + RLTR18B LTR ERVK 178 569 -47 5 1156 703 197 14 7 chr15 74907073 74907216 -28587758 + RLTR33 LTR ERVK 200 343 -335 5 1156 837 116 96 13 chr15 74907432 74907589 -28587385 + RLTR33 LTR ERVK 8 177 -501 5 1156 1013 216 32 122 chr15 74907598 74907828 -28587146 - RMER16 LTR ERVK 0 533 343 5 1156 1013 169 19 116 chr15 74907973 74908145 -28586829 - RMER16 LTR ERVK -191 342 1 5 1156 844 146 0 19 chr15 74908145 74908296 -28586678 + RLTR33 LTR ERVK 181 328 -350 5 1156 589 268 47 0 chr15 74908561 74908688 -28586286 + ETnERV2-int LTR ERVK 7070 7202 -204 5 1156 3121 77 5 2 chr15 74909302 74909719 -28585255 - BGLII LTR ERVK 0 421 4 5 1156 19459 140 9 5 chr15 74910819 74913784 -28581190 + MERVL-int LTR ERVL 1999 4977 -508 6 1156 2484 127 5 62 chr15 74915460 74915879 -28579095 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5077 5471 -290 6 1156 328 179 0 60 chr15 74917381 74917476 -28577498 - RLTR11A LTR ERVK -53 474 386 6 1156 336 125 137 14 chr15 74917526 74917599 -28577375 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5548 5629 -132 6 1156 257 181 26 53 chr15 74917599 74917675 -28577299 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 6 1156 288 54 0 0 chr15 74917676 74917713 -28577261 + MERVL-int LTR ERVL 5449 5485 0 6 1156 2724 137 31 36 chr15 74917713 74918190 -28576784 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 6 1156 1204 198 4 0 chr15 74918190 74918422 -28576552 - ORR1A4 LTR MaLR -96 233 1 6 1156 351 309 81 24 chr15 74918483 74918692 -28576282 + MLT1B LTR MaLR 32 252 -138 6 1156 863 230 130 25 chr15 74921375 74921736 -28573238 + RMER5 LTR ERV1 33 431 -103 6 1156 1797 177 14 98 chr15 74921738 74922165 -28572809 + RMER10B LTR ERVL 1 391 -7 6 1156 1500 210 3 27 chr15 74922260 74922534 -28572440 + RMER10B LTR ERVL 1 268 -130 6 1156 1500 210 3 27 chr15 74922575 74922638 -28572336 + RMER10B LTR ERVL 269 330 -68 6 1156 315 290 20 10 chr15 74922850 74922951 -28572023 + RMER5 LTR ERV1 433 534 0 6 1156 229 273 32 103 chr15 74923005 74923160 -28571814 - RLTR14 LTR ERV1 -14 368 225 6 1156 252 254 15 0 chr15 74926078 74926145 -28568829 + RLTR18 LTR ERVK 2 69 -443 6 1156 290 335 18 83 chr15 74926165 74926334 -28568640 + RLTR18 LTR ERVK 113 270 -346 6 1156 408 268 78 12 chr15 74926430 74926596 -28568378 + RLTR18B LTR ERVK 193 369 -143 6 1156 230 222 0 18 chr15 74926631 74926686 -28568288 + RLTR18B LTR ERVK 371 424 -88 6 1156 741 87 35 9 chr15 74927043 74927159 -28567815 - MTB_Mm LTR MaLR 0 400 282 6 1156 4754 85 36 29 chr15 74927162 74927966 -28567008 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 983 0 6 1156 1886 78 35 17 chr15 74927966 74928251 -28566723 - MTB_Mm LTR MaLR -117 290 1 6 1156 6475 127 9 70 chr15 74928251 74929420 -28565554 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 6 1156 1265 124 50 0 chr15 74929420 74929622 -28565352 - MTB_Mm LTR MaLR 0 400 189 6 1156 2512 81 17 64 chr15 74929622 74930031 -28564943 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 123 6 1156 2966 89 12 2 chr15 74934698 74935115 -28559859 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 6 1156 812 155 0 20 chr15 74935807 74935958 -28559016 - RLTR33 LTR ERVK -350 328 181 6 1156 952 189 18 103 chr15 74935958 74936132 -28558842 + RMER16 LTR ERVK 1 343 -190 6 1156 952 222 33 107 chr15 74936276 74936498 -28558476 + RMER16 LTR ERVK 344 533 0 6 1156 865 129 85 12 chr15 74936507 74936672 -28558302 - RLTR33 LTR ERVK -501 177 1 6 1156 671 226 59 27 chr15 74936854 74937040 -28557934 - RLTR33 LTR ERVK -325 353 162 6 1156 674 257 52 30 chr15 74937505 74937770 -28557204 - RLTR18B LTR ERVK -47 569 193 6 1156 272 325 12 61 chr15 74937856 74938020 -28556954 - RLTR18 LTR ERVK -334 282 127 6 1156 2455 125 44 15 chr15 74944695 74945100 -28549874 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 417 -3 6 1156 1690 197 34 64 chr15 74945992 74946482 -28548492 + RMER17C LTR ERVK 1 486 -420 6 1156 370 290 18 94 chr15 74947129 74947300 -28547674 + RLTR14 LTR ERV1 225 382 0 6 1156 1354 261 74 29 chr15 74947340 74947445 -28547529 - RMER5 LTR ERV1 0 534 434 6 1156 1644 206 17 42 chr15 74947445 74947590 -28547384 - RMER10B LTR ERVL 0 398 256 6 1156 1644 206 17 42 chr15 74947664 74947924 -28547050 - RMER10B LTR ERVL -143 255 3 6 1156 1354 261 74 29 chr15 74947924 74948264 -28546710 - RMER5 LTR ERV1 -101 433 69 6 1156 303 299 116 29 chr15 74950674 74950812 -28544162 - MLT1B LTR MaLR -138 252 103 6 1156 1273 207 4 0 chr15 74950937 74951169 -28543805 + ORR1A4 LTR MaLR 1 233 -96 6 1156 2912 119 27 38 chr15 74951169 74951649 -28543325 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1156 272 81 0 0 chr15 74951649 74951686 -28543288 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5449 6 1156 274 194 26 53 chr15 74951687 74951763 -28543211 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 6 1156 2720 141 117 4 chr15 74951763 74952260 -28542714 - MERVL-int LTR ERVL -132 5629 5077 6 1156 20078 131 12 2 chr15 74953926 74956888 -28538086 - MERVL-int LTR ERVL -497 4988 1999 6 1156 3037 86 7 2 chr15 74958011 74958430 -28536544 + BGLII LTR ERVK 1 421 0 6 1156 868 215 53 57 chr15 74958788 74959047 -28535927 - RLTR33 LTR ERVK -240 438 181 6 1156 1322 147 34 58 chr15 74959047 74959222 -28535752 + RMER16 LTR ERVK 1 345 -188 6 1156 1322 199 59 22 chr15 74959425 74959603 -28535371 + RMER16 LTR ERVK 346 529 -4 6 1156 890 164 87 12 chr15 74959603 74959776 -28535198 - RLTR33 LTR ERVK -492 186 1 6 1156 802 242 35 40 chr15 74959964 74960166 -28534808 - RLTR33 LTR ERVK -330 348 148 7 1156 682 275 52 29 chr15 74960630 74960895 -28534079 - RLTR18B LTR ERVK -47 569 193 7 1156 282 329 36 77 chr15 74960981 74961149 -28533825 - RLTR18 LTR ERVK -334 282 122 7 1156 247 304 42 25 chr15 74967525 74967643 -28527331 - RMER15 LTR ERVL -100 475 356 7 1156 1399 153 22 196 chr15 74968770 74968952 -28526022 + RMER17C LTR ERVK 1 180 -230 7 1156 1399 153 22 196 chr15 74968988 74969301 -28525673 + RMER17C LTR ERVK 181 410 0 7 1156 2996 30 0 0 chr15 74969367 74969699 -28525275 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 7 1156 251 307 54 96 chr15 74970282 74970448 -28524526 + RLTR14 LTR ERV1 224 382 0 7 1156 1329 276 71 21 chr15 74970488 74970591 -28524383 - RMER5 LTR ERV1 0 534 434 7 1156 1424 171 2 255 chr15 74970591 74970707 -28524267 - RMER10B LTR ERVL 0 398 342 7 1156 1424 171 2 255 chr15 74970744 74971160 -28523814 - RMER10B LTR ERVL -57 341 1 7 1156 1329 276 71 21 chr15 74971160 74971534 -28523440 - RMER5 LTR ERV1 -101 433 33 7 1157 394 328 93 19 chr15 74974350 74974555 -28520419 - MLT1B LTR MaLR -138 252 33 7 1157 1331 197 16 0 chr15 74974617 74974849 -28520125 + ORR1A2 LTR MaLR 1 236 -91 7 1157 2865 145 6 33 chr15 74974849 74975328 -28519646 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 10 7 1157 277 245 54 45 chr15 74975245 74975356 -28519618 - ORR1A3-int LTR MaLR -1258 705 594 7 1157 298 219 13 40 chr15 74975368 74975444 -28519530 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 7 1157 331 97 65 0 chr15 74975444 74975506 -28519468 - MERVL-int LTR ERVL -132 5629 5564 7 1157 11400 134 39 12 chr15 74975557 74975624 -28519350 - MERVL-int LTR ERVL -128 5357 5300 7 1157 11400 134 39 12 chr15 74975807 74977506 -28517468 - MERVL-int LTR ERVL -186 5299 3544 7 1157 9542 118 33 1 chr15 74977508 74978876 -28516098 - MERVL-int LTR ERVL -2075 3410 1999 7 1157 1744 181 46 35 chr15 74980081 74980444 -28514530 + MTC LTR MaLR 32 391 -30 7 1157 1015 188 20 224 chr15 74980450 74980950 -28514024 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 7 1157 889 284 79 29 chr15 74981013 74981351 -28513623 + ORR1E LTR MaLR 3 366 -8 7 1157 1894 146 129 6 chr15 74981352 74981539 -28513435 - RMER17C LTR ERVK 0 410 214 7 1157 1894 146 129 6 chr15 74981603 74981780 -28513194 - RMER17C LTR ERVK -197 213 2 7 1157 3103 128 17 4 chr15 74982072 74982536 -28512438 + RMER2 LTR ERV1 98 567 0 7 1157 1377 186 65 38 chr15 74982882 74983279 -28511695 - RMER17C LTR ERVK 0 410 3 7 1157 254 282 31 168 chr15 74984428 74984624 -28510350 + RMER15 LTR ERVL 350 518 -57 7 1157 5782 109 15 57 chr15 74990236 74991178 -28503796 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 7 1157 338 350 113 55 chr15 74992229 74992486 -28502488 + RLTR18B LTR ERVK 2 273 -239 7 1157 482 286 66 22 chr15 74992568 74992750 -28502224 + RLTR18B LTR ERVK 193 382 -130 7 1157 761 200 47 24 chr15 74993268 74993437 -28501537 + RLTR33 LTR ERVK 162 334 -344 7 1157 868 157 85 23 chr15 74993647 74993813 -28501161 + RLTR33 LTR ERVK 8 184 -494 7 1157 1310 178 80 34 chr15 74993813 74994155 -28500819 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 7 1157 713 111 0 41 chr15 74994155 74994274 -28500700 + RLTR33 LTR ERVK 181 294 -384 7 1157 369 194 14 14 chr15 74996233 74996306 -28498668 - RMER5 LTR ERV1 0 534 462 7 1157 1984 181 11 94 chr15 74996333 74996767 -28498207 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 7 1157 1048 234 127 17 chr15 74996767 74997128 -28497846 - RMER5 LTR ERV1 -101 433 33 7 1157 17758 124 29 8 chr15 75006179 75008118 -28486856 - MERVL-int LTR ERVL -790 4695 2712 8 1157 17758 124 29 8 chr15 75008173 75008201 -28486773 - MERVL-int LTR ERVL -2774 2711 2695 8 1157 17758 124 29 8 chr15 75008348 75009021 -28485953 - MERVL-int LTR ERVL -2791 2694 1999 8 1157 600 317 63 42 chr15 75009503 75009815 -28485159 + ORR1E LTR MaLR 29 369 -10 1 1157 1739 188 66 0 chr15 75009822 75010200 -28484774 - RMER17C LTR ERVK -7 403 1 1 1157 1505 162 53 53 chr15 75011289 75011720 -28483254 + RMER17C LTR ERVK 16 440 -518 1 1157 520 197 17 8 chr15 75012495 75012613 -28482361 - RLTR22_Mur LTR ERVK -140 1708 1590 1 1157 394 246 26 26 chr15 75013933 75014050 -28480924 + RLTR23 LTR ERV1 314 430 0 2 1157 2557 107 3 37 chr15 75014480 75014858 -28480116 + RLTR8 LTR ERVK 1 365 0 2 1157 3465 133 23 18 chr15 75015695 75016255 -28478719 + RMER2 LTR ERV1 5 567 0 2 1157 770 228 56 28 chr15 75016579 75016938 -28478036 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 2 1157 329 260 30 68 chr15 75017832 75017946 -28477028 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 260 2 1157 2686 121 22 59 chr15 75017946 75018091 -28476883 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 141 -334 2 1157 4675 109 115 54 chr15 75018091 75018941 -28476033 + RMER17A2 LTR ERVK 1 902 -4 3 1157 2686 121 22 59 chr15 75018941 75019288 -28475686 + MT2C_Mm LTR ERVL 142 475 0 2 1157 1312 188 4 0 chr15 75019288 75019520 -28475454 - ORR1A4 LTR MaLR -96 233 1 3 1157 469 272 97 19 chr15 75019579 75019785 -28475189 + MLT1B LTR MaLR 31 252 -138 3 1157 3164 248 43 35 chr15 75025074 75026024 -28468950 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 4 1157 15051 124 57 25 chr15 75028332 75030841 -28464133 - RMER16-int LTR ERVK -1252 4154 1566 4 1157 16018 122 43 8 chr15 75031849 75032922 -28462052 - MERVL-int LTR ERVL -995 4490 3361 5 1157 4935 104 114 15 chr15 75032922 75033729 -28461245 + RMER17D LTR ERVK 1 887 -2 5 1157 16018 122 43 8 chr15 75033729 75035062 -28459912 - MERVL-int LTR ERVL -2125 3360 1999 5 1157 3005 24 0 0 chr15 75036090 75036427 -28458547 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 1157 56580 20 17 7 chr15 75036427 75042836 -28452138 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 5 1157 3029 18 0 0 chr15 75042836 75043173 -28451801 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 5 1157 1534 157 4 4 chr15 75043176 75043439 -28451535 + MTC LTR MaLR 104 366 -55 5 1157 1264 216 28 107 chr15 75043539 75043969 -28451005 + RMER10B LTR ERVL 3 398 0 5 1157 741 331 45 17 chr15 75044055 75044344 -28450630 + ORR1E LTR MaLR 27 323 -36 5 1157 1889 171 0 95 chr15 75044370 75044823 -28450151 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 1157 306 299 152 47 chr15 75045052 75045414 -28449560 - RMER10A LTR ERVL -25 417 18 6 1157 3281 228 40 19 chr15 75049477 75049917 -28445057 - RMER17B LTR ERVK -73 885 430 6 1157 3281 228 40 19 chr15 75050097 75050522 -28444452 - RMER17B LTR ERVK -529 429 2 6 1157 282 330 90 49 chr15 75053617 75053890 -28441084 + RLTR18 LTR ERVK 2 288 -328 7 1157 490 283 56 52 chr15 75053955 75054205 -28440769 + RLTR18B LTR ERVK 182 432 -80 7 1157 871 343 49 57 chr15 75054767 75055708 -28439266 + MuRRS4-int LTR ERV1 1581 2513 -5265 7 1157 1106 255 34 40 chr15 75055740 75055786 -28439188 + MuRRS4-int LTR ERV1 3691 3732 -1331 7 1157 6257 59 33 3 chr15 75055786 75056570 -28438404 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 1 7 1157 1117 255 34 40 chr15 75056570 75056850 -28438124 + MuRRS4-int LTR ERV1 3733 4015 -1048 7 1157 253 360 0 0 chr15 75057065 75057154 -28437820 + RLTR6-int LTR ERV1 5611 5699 -2079 7 1157 4931 43 3 5 chr15 75057176 75057764 -28437210 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 7 1157 664 323 11 11 chr15 75058316 75058582 -28436392 + RLTR6-int LTR ERV1 7447 7712 -66 7 1157 2476 111 124 0 chr15 75058680 75059131 -28435843 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 507 -25 7 1157 417 248 17 76 chr15 75059638 75059756 -28435218 + ORR1E LTR MaLR 1 111 -248 7 1157 291 218 147 16 chr15 75059838 75059949 -28435025 + ORR1E LTR MaLR 240 359 -20 7 1157 816 190 18 41 chr15 75061487 75061657 -28433317 - RLTR33 LTR ERVK -350 328 163 8 1157 1269 204 73 26 chr15 75061646 75061981 -28432993 + RMER16 LTR ERVK 9 533 0 8 1157 779 171 93 44 chr15 75061981 75062156 -28432818 - RLTR33 LTR ERVK -494 184 1 8 1157 818 209 12 37 chr15 75062337 75062501 -28432473 - RLTR33 LTR ERVK -322 356 197 8 1157 582 278 75 29 chr15 75062997 75063260 -28431714 - RLTR18B LTR ERVK -44 572 193 8 1157 292 371 11 66 chr15 75063342 75063524 -28431450 - RLTR18 LTR ERVK -330 286 115 8 1157 228 344 36 65 chr15 75070391 75070559 -28424415 - RMER15 LTR ERVL -54 521 359 9 1157 1386 213 45 28 chr15 75071724 75072124 -28422850 + RMER17C LTR ERVK 4 410 0 9 1157 684 282 52 26 chr15 75072541 75072774 -28422200 - RLTR18B LTR ERVK -80 432 194 9 1157 2604 80 19 139 chr15 75072820 75073083 -28421891 - RLTR9F LTR ERVK -4 411 172 9 1157 2604 80 19 139 chr15 75073244 75073447 -28421527 - RLTR9F LTR ERVK -244 171 1 9 1157 278 313 16 95 chr15 75073494 75073762 -28421212 - RLTR18B LTR ERVK -334 282 2 9 1157 509 184 11 0 chr15 75078808 75078895 -28416079 + RMER17C LTR ERVK 1 88 -322 1 1157 309 182 14 70 chr15 75078890 75078961 -28416013 - RLTR25A LTR ERVK -512 591 525 1 1157 942 133 93 0 chr15 75078909 75079059 -28415915 - MT2B LTR ERVL -344 257 94 1 1157 4515 138 13 56 chr15 75078972 75079101 -28415873 - ORR1A2-int LTR MaLR -1205 758 631 1 1157 4515 138 13 56 chr15 75079291 75079305 -28415669 - ORR1A3-int LTR MaLR -1333 630 630 1 1157 4515 138 13 56 chr15 75079326 75079973 -28415001 - ORR1A2-int LTR MaLR -1333 630 1 1 1157 1722 102 75 0 chr15 75079973 75080228 -28414746 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 54 1 1157 516 179 17 59 chr15 75081025 75081144 -28413830 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1592 1705 -143 1 1157 409 230 188 35 chr15 75081587 75081731 -28413243 - RLTR6-int LTR ERV1 0 7778 7613 1 1157 4386 233 33 39 chr15 75081720 75083255 -28411719 - MMVL30-int LTR ERV1 -790 4273 2757 1 1157 1259 180 50 20 chr15 75083330 75083592 -28411382 - MMVL30-int LTR ERV1 -1926 1772 1516 1 1157 282 158 0 0 chr15 75083927 75083984 -28410990 - MMVL30-int LTR ERV1 -2187 1511 1455 1 1157 347 238 60 0 chr15 75084469 75084553 -28410421 - MMVL30-int LTR ERV1 -2251 1447 1359 1 1157 486 231 0 103 chr15 75084823 75084968 -28410006 - MMVL30-int LTR ERV1 -2725 973 844 1 1157 286 88 0 136 chr15 75085051 75085117 -28409857 - MMVL30-int LTR ERV1 -2870 828 772 1 1157 3331 43 2 17 chr15 75085895 75086297 -28408677 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1157 8480 65 12 2 chr15 75086297 75087384 -28407590 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1157 2943 36 85 0 chr15 75087384 75087747 -28407227 + MTA_Mm LTR MaLR 1 394 -2 1 1157 2809 117 2 5 chr15 75087938 75088343 -28406631 + MERVL-int LTR ERVL 2538 2941 -2544 1 1157 8913 133 9 10 chr15 75088341 75088477 -28406497 + MERVL-int LTR ERVL 3171 3313 -2172 1 1157 3185 12 0 0 chr15 75088477 75088823 -28406151 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1157 14691 46 1 2 chr15 75088823 75090616 -28404358 - ORR1A0-int LTR MaLR 0 1792 1 1 1157 3150 17 0 0 chr15 75090616 75090962 -28404012 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1157 8913 133 9 10 chr15 75090962 75092144 -28402830 + MERVL-int LTR ERVL 3314 4488 -997 1 1157 306 228 9 65 chr15 75092157 75092265 -28402709 + RLTR45-int LTR ERVK 3484 3585 -3659 1 1157 15641 128 44 16 chr15 75092501 75092758 -28402216 + RMER16-int LTR ERVK 1565 1821 -3585 1 1157 15641 128 44 16 chr15 75092884 75095174 -28399800 + RMER16-int LTR ERVK 1822 4181 -1225 1 1157 301 252 55 64 chr15 75095176 75095286 -28399688 + ETnERV2-int LTR ERVK 6097 6205 -1201 1 1157 266 309 70 45 chr15 75095526 75095682 -28399292 + ETnERV2-int LTR ERVK 6361 6520 -22 1 1157 859 234 12 72 chr15 75095786 75096160 -28398814 - RMER17C LTR ERVK -370 536 1 1 1157 310 318 70 25 chr15 75096872 75097030 -28397944 + RMER15 LTR ERVL 357 521 -54 1 1157 278 289 0 11 chr15 75103414 75103505 -28391469 + MuLV-int LTR ERV1 2359 2448 -5108 1 1157 563 306 70 23 chr15 75103699 75104000 -28390974 + MuLV-int LTR ERV1 2629 2943 -4663 1 144 1996 312 45 51 chr15 75104249 75105887 -28389087 + MuRRS4-int LTR ERV1 2744 5628 -1973 1 1158 481 362 7 4 chr15 75106416 75106696 -28388278 + RLTR6-int LTR ERV1 7447 7727 -51 1 1158 2536 118 90 77 chr15 75106780 75107303 -28387671 + RLTR47_MM LTR ERV1 1 530 -2 1 1158 412 245 19 19 chr15 75107787 75107891 -28387083 + ORR1E LTR MaLR 1 104 -255 1 1158 271 248 168 22 chr15 75108007 75108113 -28386861 + ORR1E LTR MaLR 256 379 0 1 1158 1200 167 46 113 chr15 75110522 75110867 -28384107 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1158 491 100 23 70 chr15 75110867 75110953 -28384021 - ETnERV2-int LTR ERVK -1 7405 7324 1 1158 248 219 141 0 chr15 75110953 75111017 -28383957 - RLTR13B1 LTR ERVK -371 531 459 1 1158 415 204 343 16 chr15 75111034 75111231 -28383743 - RLTR13B1 LTR ERVK -487 415 155 1 1158 6270 135 21 29 chr15 75111233 75111253 -28383721 - MMETn-int LTR ERVK -203 7203 7188 1 1158 4345 23 0 0 chr15 75111253 75111735 -28383239 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 1 1158 6364 139 21 30 chr15 75111735 75112705 -28382269 - MMETn-int LTR ERVK -219 7187 6222 1 1158 294 238 60 0 chr15 75112753 75112837 -28382137 - MMETn-int LTR ERVK -1191 6215 6127 1 1158 7765 119 26 39 chr15 75112806 75114546 -28380428 - MMETn-int LTR ERVK -1703 3141 1730 1 1158 406 138 0 0 chr15 75114537 75114595 -28380379 - MMETn-int LTR ERVK -5162 2244 2187 1 1158 7620 118 15 82 chr15 75115412 75116775 -28378199 - MMETn-int LTR ERVK -3564 1280 10 1 1158 1142 182 26 112 chr15 75116782 75117122 -28377852 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 12 1 1158 2047 162 27 3 chr15 75118335 75118700 -28376274 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1158 2347 213 44 9 chr15 75118746 75119287 -28375687 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 1 1 1158 1057 182 30 88 chr15 75119551 75119892 -28375082 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 409 0 1 1158 429 314 71 5 chr15 75121698 75121739 -28373235 - RLTR18B LTR ERVK -102 410 367 1 1158 429 314 71 5 chr15 75121786 75121955 -28373019 - RLTR18B LTR ERVK -146 366 187 1 1158 228 339 21 109 chr15 75122030 75122222 -28372752 - RLTR18 LTR ERVK -334 282 108 1 1158 235 235 115 19 chr15 75135248 75135352 -28359622 - RMER15 LTR ERVL -57 518 405 1 1158 1202 207 42 92 chr15 75137135 75137514 -28357460 + MTC LTR MaLR 51 405 -14 1 1158 1070 236 40 112 chr15 75137562 75137816 -28357158 + RMER10B LTR ERVL 1 223 -175 1 1158 1070 236 40 112 chr15 75137929 75138103 -28356871 + RMER10B LTR ERVL 224 397 -1 1 1158 571 321 88 12 chr15 75138167 75138498 -28356476 + ORR1E LTR MaLR 1 356 -3 1 1158 1323 198 142 19 chr15 75138498 75138685 -28356289 - RMER17C LTR ERVK 0 410 190 1 1158 1323 198 142 19 chr15 75138734 75138909 -28356065 - RMER17C LTR ERVK -221 189 4 1 1158 1026 158 105 0 chr15 75139192 75139439 -28355535 - RLTR47_MM LTR ERV1 -6 526 254 1 1158 613 211 24 55 chr15 75139444 75139609 -28355365 - ORR1C1 LTR MaLR -58 320 161 1 1158 437 196 10 49 chr15 75139651 75139753 -28355221 + ORR1C1 LTR MaLR 1 98 -280 1 1158 1224 138 81 4 chr15 75139751 75139999 -28354975 - RLTR47_MM LTR ERV1 -265 267 1 1 1158 4373 126 60 26 chr15 75143409 75144189 -28350785 - RMER17D2 LTR ERVK -2 807 1 1 1158 731 198 252 0 chr15 75148132 75148334 -28346640 + ORR1A1 LTR MaLR 1 253 -93 2 1158 2648 146 14 39 chr15 75148344 75148829 -28346145 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 3 2 1158 303 75 0 0 chr15 75148831 75148871 -28346103 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5446 2 1158 273 172 0 45 chr15 75148878 75148945 -28346029 - ORR1A3-int LTR MaLR -1333 630 567 2 1158 343 97 81 0 chr15 75148945 75149007 -28345967 - MERVL-int LTR ERVL -132 5629 5563 2 1158 17373 145 14 4 chr15 75149069 75149961 -28345013 - MERVL-int LTR ERVL -134 5351 4450 2 1158 2916 81 5 10 chr15 75149961 75150359 -28344615 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1158 17373 145 14 4 chr15 75150359 75152188 -28342786 - MERVL-int LTR ERVL -1036 4449 2604 2 1158 3613 151 38 38 chr15 75152190 75153081 -28341893 - RLTR13C1 LTR ERVK -7 895 33 2 1158 756 100 41 16 chr15 75153082 75153204 -28341770 - RMER10B LTR ERVL -273 125 1 2 1158 785 253 104 18 chr15 75153204 75153542 -28341432 - RMER5 LTR ERV1 -101 433 67 2 1158 479 112 150 0 chr15 75153637 75153717 -28341257 - MERVL-int LTR ERVL -3057 2704 2613 2 1158 273 278 105 39 chr15 75153724 75153894 -28341080 + ORR1D2 LTR MaLR 170 362 -8 2 1158 1642 174 32 47 chr15 75153971 75154376 -28340598 - RMER17C LTR ERVK -11 399 1 2 1158 2368 141 87 0 chr15 75154668 75155150 -28339824 - RLTR47_MM LTR ERV1 -8 524 1 2 1158 1496 191 13 0 chr15 75161868 75162167 -28332807 - ORR1D1 LTR MaLR -70 304 2 2 1158 461 184 221 13 chr15 75170522 75170676 -28324298 + RLTR33 LTR ERVK 1 186 -492 2 1158 1202 208 72 22 chr15 75170676 75170996 -28323978 - RMER16 LTR ERVK 0 533 198 2 1158 643 240 0 14 chr15 75171027 75171175 -28323799 + RLTR33 LTR ERVK 178 323 -355 2 1158 1824 260 27 12 chr15 75171683 75172207 -28322767 + MuRRS4-int LTR ERV1 3556 4025 -1038 2 1158 621 95 32 0 chr15 75173927 75174022 -28320952 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 228 2 1158 2225 152 44 8 chr15 75174022 75174408 -28320566 + MTB_Mm LTR MaLR 1 400 0 2 1158 6401 131 13 73 chr15 75174408 75175576 -28319398 + MTB_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1158 2549 109 8 10 chr15 75175576 75175976 -28318998 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 2 1158 2668 65 18 0 chr15 75176502 75176842 -28318132 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1158 350 313 66 6 chr15 75177162 75177329 -28317645 - RLTR18B LTR ERVK -143 369 193 2 1158 251 335 29 81 chr15 75177413 75177585 -28317389 - RLTR18 LTR ERVK -345 271 109 2 1158 1543 175 27 71 chr15 75181819 75182187 -28312787 - RMER17A2 LTR ERVK -554 352 1 2 1158 1070 229 93 35 chr15 75184967 75185342 -28309632 + RMER17C LTR ERVK 8 404 -6 2 1158 280 232 45 110 chr15 75186005 75186160 -28308814 + RLTR14 LTR ERV1 224 368 -14 2 1158 341 252 29 29 chr15 75186214 75186316 -28308658 - RMER5 LTR ERV1 0 534 433 2 1158 648 245 30 12 chr15 75186320 75186485 -28308489 - RMER10B LTR ERVL 0 398 231 2 1158 1434 188 40 36 chr15 75187368 75187672 -28307302 + MTC LTR MaLR 62 366 -55 2 1158 939 186 3 113 chr15 75187771 75188007 -28306967 + RMER10A LTR ERVL 1 216 -226 2 1158 939 186 3 113 chr15 75188116 75188163 -28306811 + RMER10A LTR ERVL 217 253 -189 2 1158 2611 95 35 50 chr15 75188153 75188609 -28306365 + RLTR44C LTR ERVK 28 476 -26 2 1158 14587 132 30 76 chr15 75188622 75191568 -28303406 + RLTR44-int LTR ERVK 1 2812 0 2 1158 3210 82 23 127 chr15 75191568 75192128 -28302846 + RLTR44C LTR ERVK 1 502 0 2 1158 517 246 36 7 chr15 75192128 75192267 -28302707 + RMER10A LTR ERVL 256 398 0 2 1158 683 293 82 38 chr15 75192331 75192672 -28302302 + ORR1E LTR MaLR 1 356 -3 2 1158 1694 166 39 72 chr15 75192674 75193090 -28301884 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 2 1158 5941 100 8 0 chr15 75193175 75193958 -28301016 - ETnERV2-int LTR ERVK -1756 5650 4862 2 1158 2425 109 47 11 chr15 75193944 75194466 -28300508 - ETnERV2-int LTR ERVK -3371 4035 3442 2 1158 3714 142 13 44 chr15 75194710 75195550 -28299424 - ETnERV2-int LTR ERVK -4271 3135 1946 2 1158 3134 152 77 17 chr15 75195581 75196215 -28298759 - ETnERV2-int LTR ERVK -5327 2079 1408 2 1158 1487 208 62 107 chr15 75201391 75202033 -28292941 - ETnERV2-int LTR ERVK -4281 563 2 2 1158 2202 127 83 18 chr15 75202034 75202418 -28292556 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 2 1158 5058 36 2 2 chr15 75205084 75205670 -28289304 + LTRIS_Mus LTR ERV1 2 587 0 2 1158 4503 80 84 9 chr15 75205907 75206658 -28288316 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 1033 0 2 1158 301 325 111 19 chr15 75210522 75210729 -28284245 - MLT1B LTR MaLR -132 258 33 2 1158 1110 181 35 0 chr15 75210791 75211015 -28283959 + ORR1A2 LTR MaLR 1 232 -95 2 1158 2504 138 21 40 chr15 75211015 75211490 -28283484 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 10 2 1158 267 75 0 91 chr15 75211492 75211536 -28283438 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5446 2 1158 249 188 0 45 chr15 75211543 75211610 -28283364 - ORR1A3-int LTR MaLR -1333 630 567 2 1158 343 97 81 0 chr15 75211610 75211672 -28283302 - MERVL-int LTR ERVL -132 5629 5563 2 1158 22168 136 9 1 chr15 75211733 75215059 -28279915 - MERVL-int LTR ERVL -134 5351 1999 2 1158 1372 178 41 93 chr15 75216024 75216353 -28278621 + MTC LTR MaLR 32 358 -63 2 1158 974 224 18 72 chr15 75216455 75216734 -28278240 + RMER10B LTR ERVL 1 264 -134 2 1158 455 269 24 48 chr15 75216808 75217015 -28277959 + RMER10B LTR ERVL 197 398 0 2 1158 720 306 70 58 chr15 75217078 75217422 -28277552 + ORR1E LTR MaLR 1 348 -11 2 1158 1663 197 48 20 chr15 75217427 75217826 -28277148 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 1158 539 200 33 0 chr15 75218352 75218472 -28276502 + RMER17B LTR ERVK 176 299 -659 3 1158 1220 187 37 60 chr15 75220328 75220680 -28274294 + RMER17C LTR ERVK 67 410 0 3 1158 3042 116 91 8 chr15 75221579 75222076 -28272898 - RMER16-int LTR ERVK -4782 624 87 3 1158 246 216 74 83 chr15 75222421 75222542 -28272432 - RLTR8 LTR ERVK -3 362 243 3 1158 1263 296 30 39 chr15 75225242 75225784 -28269190 - RNERVK23-int LTR ERVK -950 7267 6731 3 1158 6308 291 28 38 chr15 75225852 75225968 -28269006 - RNERVK23-int LTR ERVK -4770 3447 3350 3 1158 6308 291 28 38 chr15 75226540 75228065 -28266909 - RNERVK23-int LTR ERVK -4868 3349 1819 3 1158 6308 291 28 38 chr15 75228553 75229134 -28265840 - RNERVK23-int LTR ERVK -6399 1818 1245 3 1158 352 343 19 19 chr15 75229527 75229741 -28265233 - RNERVK23-int LTR ERVK -7157 1060 847 3 1158 792 274 5 23 chr15 75230119 75230336 -28264638 - RNERVK23-int LTR ERVK -7728 489 277 3 1158 4617 114 16 61 chr15 75230966 75231813 -28263161 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 3 1158 410 251 2 72 chr15 75231878 75232055 -28262919 - RLTR43A LTR ERVK 0 364 248 3 1158 780 158 0 41 chr15 75232306 75232451 -28262523 + MERVL-int LTR ERVL 1530 1668 -3817 3 144 20612 133 15 4 chr15 75232439 75235546 -28259428 + MERVL-int LTR ERVL 2212 5353 -132 3 1159 243 222 0 45 chr15 75235670 75235736 -28259238 + ORR1A3-int LTR MaLR 569 631 -1332 3 1159 335 45 0 0 chr15 75235738 75235782 -28259192 + MERVL-int LTR ERVL 5442 5485 0 3 1159 2621 148 16 43 chr15 75235782 75236270 -28258704 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 1159 1279 172 4 0 chr15 75236270 75236502 -28258472 - ORR1A4 LTR MaLR -96 233 1 3 1159 281 329 71 0 chr15 75236676 75236816 -28258158 + MLT1B LTR MaLR 103 252 -138 3 1159 765 272 125 9 chr15 75239278 75239605 -28255369 + RMER5 LTR ERV1 69 433 -101 3 1159 1913 122 54 17 chr15 75239544 75239919 -28255055 - MTB LTR MaLR -8 411 5 3 1159 290 289 20 10 chr15 75240015 75240113 -28254861 + RMER5 LTR ERV1 433 531 -3 3 1159 2038 165 102 20 chr15 75240112 75240602 -28254372 - RLTR47_MM LTR ERV1 -1 531 2 3 1159 488 303 6 6 chr15 75240694 75240870 -28254104 - RLTR6-int LTR ERV1 -57 7721 7546 3 1159 1850 312 59 59 chr15 75241717 75243309 -28251665 - MuRRS4-int LTR ERV1 -2000 5606 2744 3 1159 764 317 30 46 chr15 75243327 75243764 -28251210 - RLTR6-int LTR ERV1 -4676 3102 2673 3 1159 3696 116 11 33 chr15 75243933 75244567 -28250407 + RLTR5_Mm LTR ERV1 9 628 0 3 1159 746 329 85 42 chr15 75244574 75245754 -28249220 - RLTR6-int LTR ERV1 -5129 2427 1040 3 1159 374 289 28 57 chr15 75246114 75246388 -28248586 - RLTR6-int LTR ERV1 -6906 872 527 3 1159 1170 138 100 12 chr15 75246973 75247222 -28247752 - RLTR47_MM LTR ERV1 -9 523 253 3 1159 1500 117 68 0 chr15 75253886 75254135 -28240839 - RLTR47_MM LTR ERV1 -266 266 1 3 1159 625 201 7 20 chr15 75254849 75254998 -28239976 - RLTR33 LTR ERVK -351 327 181 3 1159 1187 193 77 29 chr15 75254998 75255340 -28239634 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 3 1159 715 174 96 13 chr15 75255349 75255506 -28239468 - RLTR33 LTR ERVK -501 177 8 3 1159 397 307 115 66 chr15 75255671 75255942 -28239032 - RLTR18 LTR ERVK -330 286 2 3 1159 725 245 130 64 chr15 75260903 75261248 -28233726 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 3 1159 4506 122 38 45 chr15 75263947 75264762 -28230212 - RMER17D2 LTR ERVK 0 809 1 3 1159 259 329 78 32 chr15 75264794 75264948 -28230026 - RMER15 LTR ERVL -57 518 358 3 1159 1585 172 136 24 chr15 75272274 75272461 -28222513 + RMER17C LTR ERVK 1 188 -222 3 1159 1585 172 136 24 chr15 75272614 75272795 -28222179 + RMER17C LTR ERVK 189 409 -1 3 1159 2033 138 19 0 chr15 75275637 75275956 -28219018 + ORR1A3 LTR MaLR 1 325 -1 3 1159 2885 189 29 14 chr15 75277846 75278398 -28216576 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 3 1159 359 102 34 0 chr15 75278445 75278504 -28216470 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 314 3 1159 2827 91 7 15 chr15 75278507 75278910 -28216064 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1159 1525 212 10 7 chr15 75278910 75279209 -28215765 - ORR1D1 LTR MaLR -74 300 1 3 1159 268 244 154 11 chr15 75282784 75282875 -28212099 - ORR1E LTR MaLR -20 359 256 3 1159 368 232 88 18 chr15 75282972 75283086 -28211888 - ORR1E LTR MaLR -235 124 3 3 1159 1283 237 58 66 chr15 75285085 75285447 -28209527 + ORR1D2 LTR MaLR 10 368 -2 3 1159 346 302 117 36 chr15 75289889 75290085 -28204889 + RMER5 LTR ERV1 1 212 -322 3 1159 424 256 51 36 chr15 75290417 75290555 -28204419 + RMER5 LTR ERV1 350 489 -45 3 1159 1913 195 35 35 chr15 75291781 75292175 -28202799 + MTD LTR MaLR 14 407 -12 3 1159 401 347 73 46 chr15 75294115 75294344 -28200630 - MTEa LTR MaLR -3 376 139 4 1159 2227 196 19 183 chr15 75294344 75295075 -28199899 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 1159 480 222 3 2 chr15 75295075 75295179 -28199795 - MTEa LTR MaLR -241 138 2 4 1159 292 225 62 12 chr15 75295558 75295639 -28199335 + RMER15 LTR ERVL 420 504 -71 4 1159 379 273 133 93 chr15 75300572 75300798 -28194176 - MLT1B LTR MaLR -138 252 18 4 1159 1905 150 22 3 chr15 75300835 75301156 -28193818 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1159 2727 192 46 9 chr15 75303065 75303605 -28191369 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 4 1159 352 103 35 0 chr15 75303653 75303711 -28191263 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 314 4 1159 2814 93 8 12 chr15 75303714 75304116 -28190858 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1159 1606 205 10 3 chr15 75304116 75304414 -28190560 - ORR1D1 LTR MaLR -74 300 1 4 1159 227 261 169 11 chr15 75307868 75307957 -28187017 - ORR1D2 LTR MaLR -20 359 257 4 1159 231 279 115 0 chr15 75308063 75308167 -28186807 - ORR1D2 LTR MaLR -244 126 11 4 1159 1142 222 54 101 chr15 75310187 75310573 -28184401 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 4 1159 2800 64 3 3 chr15 75320569 75320914 -28174060 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 4 1159 939 259 78 153 chr15 75322443 75322826 -28172148 + RMER5 LTR ERV1 1 347 -187 4 1159 939 259 78 153 chr15 75322965 75323110 -28171864 + RMER5 LTR ERV1 348 489 -45 4 1159 1919 138 28 0 chr15 75324977 75325295 -28169679 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1159 2787 211 16 11 chr15 75327226 75327783 -28167191 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 4 1159 1778 176 78 3 chr15 75327830 75327886 -28167088 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 302 4 1159 2758 98 10 12 chr15 75327886 75328287 -28166687 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1159 1778 176 78 3 chr15 75328287 75328578 -28166396 - ORR1D1 LTR MaLR -73 301 2 4 1159 367 277 21 0 chr15 75332342 75332436 -28162538 - ORR1E LTR MaLR -261 98 3 4 1159 1006 242 52 91 chr15 75334453 75334816 -28160158 + ORR1D2 LTR MaLR 10 358 -12 4 1159 415 241 51 36 chr15 75345827 75345965 -28149009 + RMER5 LTR ERV1 350 489 -45 4 1159 1790 104 7 4 chr15 75346503 75346773 -28148201 + MTB LTR MaLR 130 400 0 4 1159 1583 174 10 3 chr15 75346775 75347069 -28147905 - ORR1D1 LTR MaLR -78 296 1 4 1159 294 286 33 0 chr15 75350833 75350924 -28144050 - ORR1E LTR MaLR -255 104 11 4 1159 988 251 57 87 chr15 75352919 75353289 -28141685 + ORR1D2 LTR MaLR 10 368 -2 4 1159 1113 171 52 48 chr15 75364342 75364593 -28130381 + MTD LTR MaLR 156 407 -12 4 1160 275 317 38 19 chr15 75366499 75366605 -28128369 - MTEa LTR MaLR -8 371 264 4 1160 1515 234 14 82 chr15 75366721 75367461 -28127513 - RMER19C LTR ERVK 0 902 1 4 1160 426 221 0 0 chr15 75367476 75367565 -28127409 - MTEa LTR MaLR -289 90 2 4 1160 583 227 16 25 chr15 75367885 75368007 -28126967 + ETnERV2-int LTR ERVK 7058 7178 -228 4 1160 369 311 25 15 chr15 75368239 75368435 -28126539 + RLTR45-int LTR ERVK 169 366 -6878 4 1160 2181 164 154 38 chr15 75368590 75369096 -28125878 + RMER16-int LTR ERVK 255 819 -4587 5 1160 422 165 268 0 chr15 75369101 75369198 -28125776 + RMER16-int LTR ERVK 938 1060 -5077 5 1160 1321 232 55 21 chr15 75369211 75369501 -28125473 + ETnERV2-int LTR ERVK 2454 2753 -4653 5 1160 447 248 0 16 chr15 75369571 75369694 -28125280 + ETnERV2-int LTR ERVK 2942 3062 -4344 5 1160 5368 249 102 100 chr15 75369666 75370371 -28124603 + ETnERV2-int LTR ERVK 4097 4812 -2594 5 1160 5368 249 102 100 chr15 75370424 75372812 -28122162 + ETnERV2-int LTR ERVK 4813 7195 -211 5 1160 245 272 64 21 chr15 75373256 75373350 -28121624 + RMER15 LTR ERVL 420 517 -58 5 1160 786 238 161 7 chr15 75380479 75380683 -28114291 - ORR1D2 LTR MaLR -18 352 132 5 1160 786 238 161 7 chr15 75380753 75380853 -28114121 - ORR1D2 LTR MaLR -239 131 3 5 1160 1324 112 0 5 chr15 75382446 75382653 -28112321 + ORR1A2 LTR MaLR 1 206 -121 5 1160 1042 240 73 35 chr15 75385355 75385670 -28109304 + ORR1D2 LTR MaLR 1 327 -43 5 1160 743 231 128 23 chr15 75385783 75386091 -28108883 - ORR1E LTR MaLR -1 378 22 5 1160 684 205 6 44 chr15 75388118 75388276 -28106698 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 382 5 1160 1780 119 62 13 chr15 75388279 75388586 -28106388 + ORR1A4 LTR MaLR 1 322 -7 5 1160 693 274 48 89 chr15 75388985 75389322 -28105652 - RMER5 LTR ERV1 -154 380 58 5 1160 318 329 88 72 chr15 75400445 75400707 -28094267 + ORR1E LTR MaLR 85 350 -9 5 1160 467 213 38 0 chr15 75401505 75401632 -28093342 + MLT2D LTR ERVL 5 136 -379 5 1160 1499 260 46 46 chr15 75401837 75402316 -28092658 - RMER20A LTR ERVK -37 479 1 5 1160 1661 223 128 41 chr15 75402336 75402424 -28092550 - RMER15 LTR ERVL 0 575 487 5 1160 2781 79 9 76 chr15 75402424 75402531 -28092443 + MTB_Mm LTR MaLR 1 111 -296 5 1160 2781 79 9 76 chr15 75402677 75403005 -28091969 + MTB_Mm LTR MaLR 112 407 0 5 1160 1661 223 128 41 chr15 75403005 75403361 -28091613 - RMER15 LTR ERVL -89 486 82 5 1160 1532 204 117 139 chr15 75403361 75403912 -28091062 - RMER4B LTR ERVK 0 585 53 5 1160 1532 204 117 139 chr15 75403936 75403982 -28090992 - RMER4B LTR ERVK -533 52 1 5 1160 1661 223 128 41 chr15 75403982 75404046 -28090928 - RMER15 LTR ERVL -494 81 22 5 1160 246 211 53 0 chr15 75404070 75404127 -28090847 - RMER15 LTR ERVL -515 60 1 5 1160 624 249 183 26 chr15 75404258 75404526 -28090448 + MLT2D LTR ERVL 102 411 -3 5 1160 417 279 145 17 chr15 75405469 75405684 -28089290 + MLT1F2 LTR MaLR 311 620 -7 5 1160 1578 195 65 9 chr15 75408622 75408958 -28086016 - MTD LTR MaLR -14 405 51 5 1160 1291 239 141 30 chr15 75413010 75413472 -28081502 + RMER20A LTR ERVK 1 513 -3 5 1160 388 296 234 26 chr15 75416997 75417309 -28077665 + MLT1B LTR MaLR 12 388 -2 5 1160 355 322 67 22 chr15 75418695 75418767 -28076207 + RMER15 LTR ERVL 275 349 -226 5 1160 355 322 67 22 chr15 75418951 75419056 -28075918 + RMER15 LTR ERVL 350 460 -115 5 1160 2374 136 19 35 chr15 75420231 75420659 -28074315 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1160 1958 122 3 86 chr15 75420664 75421023 -28073951 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1160 3201 45 0 7 chr15 75421277 75421680 -28073294 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1160 3136 28 28 5 chr15 75422209 75422600 -28072374 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1160 360 291 228 22 chr15 75429703 75429935 -28065039 + MLT1J LTR MaLR 204 483 -29 6 1160 3224 85 39 2 chr15 75431272 75431730 -28063244 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1160 1758 151 71 24 chr15 75431733 75432073 -28062901 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 17 6 1160 551 235 94 0 chr15 75434453 75434602 -28060372 - MLT1B LTR MaLR -184 206 44 6 1160 229 309 51 41 chr15 75435328 75435426 -28059548 - RMER15 LTR ERVL -44 531 433 6 1160 1246 238 119 11 chr15 75435630 75436008 -28058966 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1160 1132 243 55 65 chr15 75436311 75436694 -28058280 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 6 1160 5067 320 64 49 chr15 75438159 75438675 -28056299 - RMER15-int LTR ERVL -226 4773 4246 6 1160 2434 83 3 0 chr15 75438675 75439001 -28055973 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1160 5067 320 64 49 chr15 75439001 75440915 -28054059 - RMER15-int LTR ERVL -754 4245 2307 6 1160 534 307 181 19 chr15 75441842 75442108 -28052866 - RMER15 LTR ERVL 0 575 267 6 1160 961 180 24 6 chr15 75450335 75450503 -28044471 + MTEa LTR MaLR 10 180 -199 6 1160 513 182 284 7 chr15 75450710 75450865 -28044109 + MTEa LTR MaLR 166 363 -16 6 1160 1796 181 48 21 chr15 75456998 75457397 -28037577 - RLTR14 LTR ERV1 -3 379 6 6 1160 491 176 48 19 chr15 75457397 75457501 -28037473 - RLTR14-int LTR ERV1 -73 5244 5138 6 1160 1060 248 50 0 chr15 75458575 75458857 -28036117 + RLTR42-int LTR ERVK 1106 1401 -4121 6 1160 364 77 39 0 chr15 75459146 75459198 -28035776 + RLTR42-int LTR ERVK 1045 1098 -4424 6 1160 228 309 60 82 chr15 75459501 75459635 -28035339 - MER49 LTR ERV1 -316 607 477 6 1160 862 197 73 29 chr15 75460214 75460460 -28034514 + RLTR42-int LTR ERVK 1871 2127 -3395 6 1160 323 240 0 0 chr15 75460446 75460521 -28034453 + RLTR42-int LTR ERVK 2330 2404 -3733 6 1160 320 244 12 12 chr15 75460580 75460663 -28034311 - RLTR14-int LTR ERV1 -1690 3627 3545 6 1160 3650 138 40 48 chr15 75460666 75461357 -28033617 + RMER6A LTR ERVK 4 689 -67 6 1160 348 138 0 0 chr15 75461357 75461415 -28033559 + RLTR14-int LTR ERV1 2421 2478 -2839 6 1160 1802 131 145 6 chr15 75461411 75461631 -28033343 - RLTR14-int LTR ERV1 -2878 2439 2197 6 1160 1802 131 145 6 chr15 75461670 75461794 -28033180 - RLTR14-int LTR ERV1 -3121 2196 2049 6 1160 1539 142 47 4 chr15 75461794 75462049 -28032925 + ORR1B1 LTR MaLR 121 386 -8 6 1160 1007 151 0 29 chr15 75462127 75462298 -28032676 - RLTR14-int LTR ERV1 -3277 2040 1875 6 1160 352 300 125 62 chr15 75462298 75462458 -28032516 - RLTR9E LTR ERVK -6 403 234 6 1160 548 112 33 11 chr15 75462725 75462815 -28032159 - RLTR14-int LTR ERV1 -3434 1883 1792 6 1160 2000 200 19 63 chr15 75462910 75463385 -28031589 - RLTR14-int LTR ERV1 -3579 1738 1285 6 1160 1171 149 200 27 chr15 75463460 75463732 -28031242 - RLTR14-int LTR ERV1 -4030 1287 969 6 1160 1768 144 149 13 chr15 75463736 75464052 -28030922 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 6 1160 1357 219 180 66 chr15 75464185 75464792 -28030182 - RLTR14-int LTR ERV1 -4447 870 195 6 1160 367 323 113 71 chr15 75464792 75465145 -28029829 + RLTR9A LTR ERVK 1 368 0 6 1160 16132 169 62 71 chr15 75465801 75466336 -28028638 + RMER16-int LTR ERVK 240 785 -4621 6 1160 16132 169 62 71 chr15 75466519 75468809 -28026165 + RMER16-int LTR ERVK 786 3138 -2268 6 1160 16132 169 62 71 chr15 75468985 75469032 -28025942 + RMER16-int LTR ERVK 3139 3185 -2221 6 1160 16132 169 62 71 chr15 75469140 75469921 -28025053 + RMER16-int LTR ERVK 3186 3970 -1436 6 1160 738 193 38 99 chr15 75470978 75471191 -28023783 - RLTR14-int LTR ERV1 -5117 200 1 6 1160 2379 137 16 5 chr15 75471191 75471565 -28023409 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 5 6 1160 3030 51 75 0 chr15 75474220 75474592 -28020382 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1160 578 29 0 0 chr15 75474789 75474859 -28020115 - MTB LTR MaLR -26 374 305 6 1160 1176 228 82 75 chr15 75478973 75479400 -28015574 + RLTR42-int LTR ERVK 1105 1534 -3988 6 1160 349 96 39 0 chr15 75479550 75479602 -28015372 + RLTR19-int LTR ERVK 1045 1098 -4424 6 1160 411 197 194 63 chr15 75480562 75480599 -28014375 + RLTR19-int LTR ERVK 1870 1921 -3601 6 1160 411 197 194 63 chr15 75480679 75480863 -28014111 + RLTR19-int LTR ERVK 1922 2119 -3403 6 1160 1319 279 53 44 chr15 75481176 75481704 -28013270 + RLTR19-int LTR ERVK 2353 2885 -3252 6 1160 443 255 60 120 chr15 75481779 75481994 -28012980 + RLTR19-int LTR ERVK 2877 3076 -3061 6 1160 443 255 60 120 chr15 75482039 75482122 -28012852 + RLTR19-int LTR ERVK 3077 3156 -2981 6 1160 286 241 122 68 chr15 75482360 75482565 -28012409 + RLTR19-int LTR ERVK 3186 3401 -2736 6 1160 676 220 87 100 chr15 75483009 75483374 -28011600 + RLTR19-int LTR ERVK 3657 3967 -2170 6 1160 431 276 40 29 chr15 75483579 75483754 -28011220 + RLTR19-int LTR ERVK 4231 4407 -1730 6 1160 456 194 36 36 chr15 75484598 75484648 -28010326 + RMER17C LTR ERVK 112 163 -247 6 1160 456 194 36 36 chr15 75484674 75484789 -28010185 + RMER17C LTR ERVK 164 277 -133 6 1160 2428 84 19 0 chr15 75485863 75486184 -28008790 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1160 460 311 86 5 chr15 75490170 75490367 -28004607 + MER68 LTR ERVL 13 225 -338 7 1160 2067 165 39 17 chr15 75496289 75496647 -27998327 + ORR1B2 LTR MaLR 1 366 -1 7 1161 2404 46 39 0 chr15 75498537 75498844 -27996130 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1161 717 249 120 106 chr15 75503401 75503512 -27991462 + RLTR40 LTR ERVK 2 107 -710 8 1161 717 249 120 106 chr15 75503694 75503865 -27991109 + RLTR40 LTR ERVK 108 288 -529 8 1161 446 196 237 32 chr15 75503860 75504050 -27990924 + RLTR40 LTR ERVK 515 743 -74 8 1161 2471 176 27 12 chr15 75514955 75515368 -27979606 + MTC LTR MaLR 3 421 0 2 1161 1188 282 106 41 chr15 75518725 75518917 -27976057 + MT2A LTR ERVL 5 198 -335 4 1161 1449 241 82 12 chr15 75518917 75519257 -27975717 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 5 4 1161 1188 282 106 41 chr15 75519257 75519555 -27975419 + MT2A LTR ERVL 199 527 -6 4 1161 356 301 129 100 chr15 75527786 75528026 -27966948 - ORR1E LTR MaLR -36 323 77 5 1161 286 283 250 49 chr15 75529901 75530209 -27964765 - MLT1A LTR MaLR 0 374 5 6 1161 1190 208 43 20 chr15 75548583 75548838 -27946136 + MTD LTR MaLR 2 262 -157 8 1161 1698 169 131 33 chr15 75555490 75555557 -27939417 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 312 8 1161 1698 169 131 33 chr15 75555707 75555976 -27938998 - ORR1D1 LTR MaLR -63 311 1 8 1161 294 281 61 20 chr15 75564436 75564534 -27930440 - ORR1E LTR MaLR -236 123 22 9 1161 238 358 6 132 chr15 75568616 75568790 -27926184 + MLT1J LTR MaLR 12 163 -285 1 1161 245 304 251 12 chr15 75568924 75569087 -27925887 + MLT1J LTR MaLR 244 445 -67 1 1161 260 309 52 43 chr15 75581071 75581186 -27913788 - MLT1E LTR MaLR -32 621 506 1 1161 1229 233 165 65 chr15 75595814 75596656 -27898318 + MTC-int LTR MaLR 78 1204 -54 1 1161 1621 210 104 23 chr15 75597025 75597411 -27897563 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 1 1161 418 186 99 25 chr15 75598564 75598685 -27896289 + RLTR15 LTR ERVK 1 130 -229 1 1161 299 307 76 36 chr15 75598779 75599029 -27895945 + RLTR15 LTR ERVK 97 356 -3 1 1161 2081 139 14 49 chr15 75600547 75600917 -27894057 + ORR1B2 LTR MaLR 11 367 0 1 1161 715 329 92 6 chr15 75624731 75625077 -27869897 - MLT1B LTR MaLR -14 376 1 1 1162 544 328 81 73 chr15 75634886 75635007 -27859967 + MLT1A LTR MaLR 3 115 -259 1 1162 544 328 81 73 chr15 75635206 75635453 -27859521 + MLT1A LTR MaLR 116 374 0 1 1162 1979 222 47 10 chr15 75656370 75656774 -27838200 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1162 237 255 116 139 chr15 75657228 75657308 -27837666 + MT2B LTR ERVL 69 144 -457 2 1162 6274 133 15 62 chr15 75673687 75674921 -27820053 + ORR1A4-int LTR MaLR 788 1963 0 2 1162 1842 107 54 69 chr15 75674921 75675254 -27819720 + ORR1A4 LTR MaLR 1 328 -1 2 1162 304 248 40 128 chr15 75677300 75677378 -27817596 + MLT1A0 LTR MaLR 11 82 -283 2 1162 304 248 40 128 chr15 75677567 75677613 -27817361 + MLT1A0 LTR MaLR 83 124 -241 2 1162 1222 215 70 32 chr15 75677845 75678157 -27816817 + MT2A LTR ERVL 1 324 -209 2 1162 2543 202 30 58 chr15 75684315 75684940 -27810034 + RLTR18 LTR ERVK 5 612 -4 2 1162 3060 63 2 2 chr15 75685785 75686181 -27808793 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1162 648 276 153 106 chr15 75689262 75689613 -27805361 - MTD LTR MaLR -12 407 1 2 1162 268 189 38 0 chr15 75697967 75698020 -27796954 - RMER15 LTR ERVL 0 575 521 2 1162 2169 143 42 18 chr15 75698021 75698104 -27796870 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 318 2 1162 3103 56 0 10 chr15 75698104 75698504 -27796470 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1162 2169 143 42 18 chr15 75698504 75698805 -27796169 - ORR1B1 LTR MaLR -77 317 1 2 1162 1722 230 35 40 chr15 75698805 75699255 -27795719 - RMER15 LTR ERVL -51 524 77 2 1162 293 291 9 88 chr15 75699982 75700095 -27794879 - RMER10B LTR ERVL -26 372 269 2 1162 2983 62 5 54 chr15 75701034 75701234 -27793740 + MTB_Mm LTR MaLR 1 196 -211 2 1162 2983 62 5 54 chr15 75701424 75701651 -27793323 + MTB_Mm LTR MaLR 197 407 0 2 1162 881 286 124 97 chr15 75701865 75702420 -27792554 - MYSERV6-int LTR ERVK -2416 3721 3150 2 1162 1632 272 83 46 chr15 75702449 75703249 -27791725 - MYSERV6-int LTR ERVK -276 8683 8088 2 1162 279 195 33 54 chr15 75703451 75703543 -27791431 - RLTR19-int LTR ERVK -3928 2209 2120 2 1162 730 127 13 0 chr15 75703574 75703724 -27791250 - RMER17A2 LTR ERVK -393 513 362 2 1162 323 164 0 0 chr15 75704198 75704253 -27790721 - ORR1B1 LTR MaLR 0 384 330 2 1162 1799 111 101 37 chr15 75705489 75705567 -27789407 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 275 2 1162 1437 196 138 21 chr15 75705567 75705891 -27789083 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 61 2 1162 1437 196 138 21 chr15 75706030 75706090 -27788884 - RLTR23 LTR ERV1 -370 60 1 2 1162 1799 111 101 37 chr15 75706090 75706339 -27788635 - ORR1B1 LTR MaLR -120 274 5 2 1162 1063 217 67 44 chr15 75706349 75706619 -27788355 - ORR1A4 LTR MaLR -108 276 1 3 1162 380 221 0 0 chr15 75709833 75709910 -27785064 - ORR1B1-int LTR MaLR -43 1466 1390 3 1162 5504 120 69 62 chr15 75710091 75711207 -27783767 - ORR1A4-int LTR MaLR -136 1827 619 3 1162 1350 253 87 50 chr15 75711193 75711676 -27783298 + RLTR20B3 LTR ERVK 21 521 -56 3 1162 629 165 104 15 chr15 75711707 75711842 -27783132 - MT2B LTR ERVL -437 164 18 3 1162 260 89 44 0 chr15 75711885 75711930 -27783044 - ORR1A4-int LTR MaLR -1304 659 613 3 1162 266 67 44 0 chr15 75711961 75712006 -27782968 - ORR1A4-int LTR MaLR -1304 659 613 3 1162 335 119 34 0 chr15 75711999 75712058 -27782916 - ORR1A4-int LTR MaLR -1304 659 599 3 1162 656 154 0 0 chr15 75712062 75712180 -27782794 + ORR1A3-int LTR MaLR 377 501 -1008 3 1162 367 214 37 30 chr15 75712323 75712348 -27782626 + ORR1A3-int LTR MaLR 502 530 -979 3 1162 1931 173 44 0 chr15 75712380 75712744 -27782230 - ORR1A4-int LTR MaLR -1583 380 1 3 1162 2085 79 12 60 chr15 75712750 75713085 -27781889 - ORR1A4 LTR MaLR -10 319 1 3 1162 1658 155 100 36 chr15 75720092 75720453 -27774521 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1162 1896 178 58 23 chr15 75720883 75721310 -27773664 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 3 1162 364 322 65 29 chr15 75729020 75729228 -27765746 + MLT1D LTR MaLR 255 471 -34 3 1162 392 344 108 82 chr15 75729449 75729864 -27765110 + MLT1D-int LTR MaLR 424 849 -522 3 1162 283 266 53 11 chr15 75730345 75730440 -27764534 + MLT1D LTR MaLR 399 497 -8 3 1162 547 274 108 21 chr15 75746823 75747017 -27747957 - RMER15 LTR ERVL -13 562 352 3 1162 414 315 0 37 chr15 75748153 75748288 -27746686 + RMER10B LTR ERVL 269 398 0 3 1162 255 336 26 85 chr15 75751148 75751215 -27743759 + MT2B LTR ERVL 97 154 -447 3 1162 785 251 130 28 chr15 75753792 75754184 -27740790 + MT2A LTR ERVL 41 595 -6 3 1163 1403 244 57 62 chr15 75761372 75761582 -27733392 - MurERV4-int LTR ERVK -4362 898 656 3 1163 1403 244 57 62 chr15 75761630 75761685 -27733289 - MurERV4-int LTR ERVK -4362 655 591 3 1163 1403 223 73 48 chr15 75761859 75762226 -27732748 - MurERV4-int LTR ERVK -4670 590 91 3 1163 1623 195 189 87 chr15 75762246 75762751 -27732223 + RMER19B LTR ERVK 308 886 -16 3 1163 1623 195 189 87 chr15 75762931 75762965 -27732009 + RMER19B LTR ERVK 887 902 0 3 1163 834 184 36 18 chr15 75762970 75763192 -27731782 - RMER17C LTR ERVK -184 226 1 3 1163 1666 121 16 60 chr15 75764668 75764984 -27729990 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 21 322 0 3 1163 873 296 142 49 chr15 75765245 75765753 -27729221 - RMER13A LTR ERVK -210 650 96 3 1163 538 135 96 0 chr15 75766462 75766549 -27728425 + MTC LTR MaLR 10 106 -315 3 1163 950 158 227 3 chr15 75766549 75766839 -27728135 + RMER6C LTR ERVK 1 355 -335 3 1163 884 262 0 32 chr15 75766894 75767142 -27727832 + RLTR11B LTR ERVK 3 242 -211 3 1163 487 263 10 176 chr15 75767148 75767443 -27727531 + RLTR11B LTR ERVK 200 445 -8 3 1163 1239 149 0 0 chr15 75767528 75767736 -27727238 + RMER6C LTR ERVK 483 690 0 3 1163 1682 160 25 19 chr15 75767736 75768055 -27726919 + MTC LTR MaLR 93 413 -8 3 1163 673 237 48 37 chr15 75768059 75768281 -27726693 + MTC-int LTR MaLR 1 257 -1001 3 1163 1987 137 18 15 chr15 75770295 75770628 -27724346 + MTC-int LTR MaLR 245 578 -680 3 1163 2008 149 196 7 chr15 75773127 75773757 -27721217 - RMER6C LTR ERVK -12 744 1 3 1163 2014 95 60 32 chr15 75774393 75774709 -27720265 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 3 1163 3684 122 38 10 chr15 75780512 75781124 -27713850 - RLTR33 LTR ERVK -49 629 1 3 1163 317 98 78 0 chr15 75783174 75783225 -27711749 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 272 4 1163 2100 56 7 24 chr15 75783393 75783687 -27711287 - ORR1A2 LTR MaLR -38 289 1 4 1163 1238 118 32 28 chr15 75783687 75783905 -27711069 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1745 4 1163 6662 112 47 79 chr15 75783922 75785101 -27709873 + RMER16-int LTR ERVK 69 1222 -4184 4 1163 6662 112 47 79 chr15 75785252 75785332 -27709642 + RMER16-int LTR ERVK 1223 1287 -4119 4 1163 1507 156 88 112 chr15 75785335 75785711 -27709263 - RMER16 LTR ERVK -12 521 155 4 1163 1408 95 0 23 chr15 75785711 75785927 -27709047 + RMER16-int LTR ERVK 1306 1516 -3890 4 1163 885 128 0 0 chr15 75785924 75786065 -27708909 + RMER16-int LTR ERVK 2565 2705 -2701 4 1163 5333 78 13 11 chr15 75786059 75786818 -27708156 + RMER16-int LTR ERVK 4646 5406 0 4 1163 2627 86 61 10 chr15 75786818 75787251 -27707723 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 4 1163 2164 159 12 0 chr15 75787251 75787673 -27707301 - ORR1A2-int LTR MaLR -819 1144 718 4 1163 663 176 0 127 chr15 75787632 75787782 -27707192 - MT2B LTR ERVL -314 287 157 4 1163 1603 119 48 26 chr15 75787734 75788044 -27706930 - ORR1A2-int LTR MaLR -1188 604 288 4 1163 2589 68 143 139 chr15 75788044 75788554 -27706420 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1163 442 17 0 0 chr15 75788554 75788614 -27706360 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 3240 4 1163 2944 151 7 42 chr15 75788636 75788667 -27706307 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 507 4 1163 2944 151 7 42 chr15 75788853 75789362 -27705612 - RLTR11A LTR ERVK -22 506 7 4 1163 877 211 77 9 chr15 75789368 75789588 -27705386 - RMER19A LTR ERVK -14 723 489 4 1163 622 262 48 0 chr15 75789579 75789747 -27705227 - RMER19A LTR ERVK -355 382 207 4 1163 835 313 45 7 chr15 75791091 75791512 -27703462 + MuRRS4-int LTR ERV1 1306 1742 -3321 4 1163 322 281 7 41 chr15 75791707 75791852 -27703122 + MuRRS4-int LTR ERV1 2690 2829 -4727 4 1163 777 338 30 23 chr15 75791894 75792333 -27702641 + MuRRS4-int LTR ERV1 3208 3649 -3957 4 1163 1140 311 58 22 chr15 75792329 75792911 -27702063 + MuRRS4-int LTR ERV1 2515 3117 -1946 4 1163 424 205 109 13 chr15 75793533 75793681 -27701293 - RMER19A LTR ERVK -389 222 1 4 1163 1560 147 16 186 chr15 75795432 75795926 -27699048 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 4 1163 1526 193 142 26 chr15 75796601 75797009 -27697965 + RMER6B LTR ERVK 1 455 -6 4 1163 433 205 178 149 chr15 75800809 75801050 -27693924 + MTE2a LTR MaLR 1 248 -131 4 1163 311 320 52 0 chr15 75802402 75802499 -27692475 + MTE2b LTR MaLR 75 176 -203 4 1163 319 257 263 40 chr15 75803014 75803149 -27691825 - MTEb LTR MaLR -2 377 210 4 1163 319 257 263 40 chr15 75803284 75803399 -27691575 - MTEb LTR MaLR -170 209 72 4 1163 341 235 102 85 chr15 75804515 75804552 -27690422 - MT2B LTR ERVL -259 342 213 4 1163 341 235 102 85 chr15 75804680 75804692 -27690282 - MT2B LTR ERVL -259 212 163 4 1163 1032 243 96 32 chr15 75807631 75807975 -27686999 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 4 1163 1614 129 62 17 chr15 75815475 75815766 -27679208 + ORR1B1 LTR MaLR 91 394 0 4 1163 290 365 18 36 chr15 75816574 75816739 -27678235 + RMER15 LTR ERVL 354 515 -60 4 1163 239 270 55 22 chr15 75817373 75817464 -27677510 - ORR1D1 LTR MaLR -44 330 237 4 1163 410 234 35 26 chr15 75817665 75817779 -27677195 - ORR1D1 LTR MaLR -255 119 5 4 1163 1066 194 50 93 chr15 75818399 75818555 -27676419 - MTD LTR MaLR -141 278 128 4 1163 1066 194 50 93 chr15 75818736 75818857 -27676117 - MTD LTR MaLR -292 127 13 4 1163 1636 162 140 43 chr15 75819372 75819765 -27675209 - RMER10A LTR ERVL 0 442 12 4 1163 756 185 61 39 chr15 75848161 75848223 -27646751 - MTEb LTR MaLR -1 378 318 5 1163 756 185 61 39 chr15 75848251 75848368 -27646606 - MTEb LTR MaLR -62 317 196 5 1163 720 238 67 10 chr15 75848530 75848725 -27646249 - MTEb LTR MaLR -173 206 1 5 1163 232 308 0 0 chr15 75848787 75848852 -27646122 - MLT1D LTR MaLR -437 68 4 5 1163 410 89 0 0 chr15 75852842 75852898 -27642076 + MTB_Mm LTR MaLR 297 352 -55 5 1163 704 170 22 7 chr15 75852906 75853042 -27641932 + ORR1B2 LTR MaLR 13 150 -217 5 1163 563 265 104 31 chr15 75853042 75853264 -27641710 + RMER17C-int LTR ERVK 2648 2885 -353 5 1163 314 141 3 76 chr15 75853278 75853359 -27641615 + ORR1B2 LTR MaLR 253 394 0 5 1163 870 300 101 113 chr15 75853849 75854083 -27640891 - RLTR42-int LTR ERVK -2287 3850 3625 5 1163 870 300 101 113 chr15 75854229 75854850 -27640124 - RLTR42-int LTR ERVK -2513 3624 2981 5 1163 870 300 101 113 chr15 75855054 75855386 -27639588 - RLTR42-int LTR ERVK -3157 2980 2659 5 1163 870 300 101 113 chr15 75855466 75855813 -27639161 - RLTR42-int LTR ERVK -3479 2658 2333 5 1163 1043 156 86 21 chr15 75855800 75856043 -27638931 - RLTR42-int LTR ERVK -3395 2127 1869 5 1163 499 270 134 26 chr15 75856411 75856605 -27638369 - RLTR42-int LTR ERVK -3727 1795 1581 5 1163 318 261 22 125 chr15 75857595 75857731 -27637243 + MT2B LTR ERVL 143 264 -337 5 1163 1774 172 58 84 chr15 75860740 75860835 -27634139 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 320 5 1163 1774 172 58 84 chr15 75861022 75861320 -27633654 - ORR1C2 LTR MaLR -65 319 1 5 1163 1396 249 35 17 chr15 75869195 75869542 -27625432 - ORR1E LTR MaLR -6 353 1 5 1163 481 261 8 30 chr15 75869542 75869662 -27625312 - MTE-int LTR MaLR -53 1527 1411 5 1163 405 254 0 91 chr15 75870213 75870334 -27624640 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 5 1163 1688 259 47 64 chr15 75870906 75871422 -27623552 - MTE-int LTR MaLR -149 1431 925 5 1163 314 236 8 120 chr15 75871538 75871663 -27623311 + MT2B LTR ERVL 154 264 -337 5 1163 344 186 0 57 chr15 75872809 75872900 -27622074 + ORR1E LTR MaLR 1 81 -297 5 1163 318 312 42 35 chr15 75874964 75875107 -27619867 - LTR55 LTR ERV -327 221 78 5 1164 2820 102 296 9 chr15 75915078 75915545 -27579429 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 6 1164 769 320 77 138 chr15 75916120 75916572 -27578402 + MLT1E3 LTR MaLR 52 499 -125 6 1164 532 319 72 148 chr15 75916603 75916656 -27578318 + MLT1E3 LTR MaLR 449 500 -5 6 1164 353 372 98 33 chr15 75922976 75923190 -27571784 + MER77 LTR ERVL 10 237 -370 6 1164 283 269 129 65 chr15 75924687 75924826 -27570148 + MLT1F2 LTR MaLR 214 361 -199 6 1164 391 311 145 16 chr15 75925639 75925832 -27569142 - MLT1B LTR MaLR -9 381 164 6 1164 1980 85 44 10 chr15 75926032 75926330 -27568644 + ORR1A4 LTR MaLR 1 308 -21 6 1164 226 281 95 54 chr15 75928108 75928255 -27566719 + RLTR40 LTR ERVK 478 630 -187 6 1164 340 308 68 0 chr15 75945012 75945158 -27549816 + MLT1C LTR MaLR 6 161 -306 6 1164 376 171 0 89 chr15 75950002 75950092 -27544882 + MT2B LTR ERVL 175 256 -345 6 1164 4483 104 69 4 chr15 75958933 75959625 -27535349 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 6 1164 1791 185 68 6 chr15 75960396 75960750 -27534224 + ORR1C2 LTR MaLR 9 384 0 6 1164 255 364 63 47 chr15 75961173 75961536 -27533438 + MLT1B LTR MaLR 9 377 -13 6 1164 2801 214 72 85 chr15 75961679 75962548 -27532426 - RMER13A LTR ERVK -1 859 2 6 1164 421 263 134 33 chr15 75967063 75967250 -27527724 - MLT1C LTR MaLR -5 500 278 6 1164 422 259 299 43 chr15 75968183 75968528 -27526446 + MLT1C LTR MaLR 5 437 -30 6 1164 869 154 6 24 chr15 75980048 75980214 -27514760 - MTC LTR MaLR -174 247 85 7 1164 1559 197 5 158 chr15 75982073 75982496 -27512478 - MTC LTR MaLR -59 362 5 7 1164 840 245 136 102 chr15 75983553 75983848 -27511126 - MTE2a LTR MaLR -55 324 20 7 1164 246 342 134 10 chr15 75983827 75984028 -27510946 - MLT1I LTR MaLR -18 393 168 7 1164 2539 85 77 0 chr15 75984178 75984544 -27510430 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1164 3212 45 5 0 chr15 75995082 75995480 -27499494 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1164 3164 49 0 17 chr15 75997231 75997645 -27497329 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 1165 246 313 20 29 chr15 76045757 76045859 -27449115 + MLT1A1 LTR MaLR 1 101 -307 3 1165 3232 101 110 17 chr15 76046619 76047154 -27447820 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 4 1165 300 347 121 54 chr15 76047542 76047822 -27447152 + MLT1B LTR MaLR 7 305 -85 4 1165 367 168 86 34 chr15 76048068 76048185 -27446789 + MLT1A1-int LTR MaLR 35 157 -1214 3 1165 1936 194 47 11 chr15 76048669 76049029 -27445945 + ORR1D1 LTR MaLR 2 374 0 5 1165 1365 260 157 42 chr15 76049356 76049947 -27445027 + MLT1A1-int LTR MaLR 312 1012 -477 3 1165 259 184 89 38 chr15 76051849 76051928 -27443046 + RLTR25B LTR ERVK 427 509 -519 6 1165 265 265 9 89 chr15 76069236 76069348 -27425626 - RLTR25B LTR ERVK -508 520 418 1 1165 701 271 92 116 chr15 76075679 76076050 -27418924 + MTE2a LTR MaLR 3 364 -15 1 1165 613 215 61 31 chr15 76082844 76083007 -27411967 + MER90a LTR ERV1 29 196 -418 1 1165 2445 134 5 24 chr15 76087374 76087756 -27407218 - ORR1C1 LTR MaLR -3 375 1 1 1165 236 154 113 19 chr15 76089675 76089728 -27405246 - MTD LTR MaLR -4 415 358 1 1165 1412 214 104 14 chr15 76089933 76090289 -27404685 - MTD LTR MaLR -30 389 2 1 1165 356 200 14 0 chr15 76091004 76091074 -27403900 + MLT1A LTR MaLR 1 71 -303 1 1165 306 323 69 46 chr15 76091259 76091434 -27403540 + MLT1A LTR MaLR 173 351 -23 1 1165 598 235 19 67 chr15 76096915 76097125 -27397849 - MLT2C2 LTR ERVL -262 202 3 1 1165 622 292 18 0 chr15 76105024 76105192 -27389782 - MTEa LTR MaLR -168 211 41 1 1165 226 224 20 0 chr15 76105342 76105391 -27389583 - MTEa LTR MaLR -329 50 1 1 1165 1042 210 126 14 chr15 76111308 76111593 -27383381 - ORR1D1 LTR MaLR -57 317 1 1 1165 1538 120 56 4 chr15 76117725 76117992 -27376982 - RLTR28B LTR ERVL -199 282 2 2 1165 1641 106 28 90 chr15 76120546 76120587 -27374387 - ORR1A3 LTR MaLR -13 313 286 2 1165 1641 106 28 90 chr15 76121047 76121328 -27373646 - ORR1A3 LTR MaLR -41 285 11 2 1165 423 234 144 8 chr15 76121335 76121460 -27373514 - RMER13A LTR ERVK -307 553 412 2 1165 3924 133 102 17 chr15 76129331 76130026 -27364948 + RMER6A LTR ERVK 3 756 0 2 1165 706 248 15 147 chr15 76134047 76134438 -27360536 + RLTR20D LTR ERVK 1 439 -95 2 1165 294 364 8 0 chr15 76142046 76142164 -27352810 + MLT1E3 LTR MaLR 159 277 -347 2 1165 332 304 49 28 chr15 76142933 76143075 -27351899 + RLTR14 LTR ERV1 224 368 -14 2 1165 1951 162 31 31 chr15 76143675 76144095 -27350879 - RMER10A LTR ERVL -20 422 3 2 1165 272 324 71 82 chr15 76145957 76146239 -27348735 - RMER10A LTR ERVL -145 297 19 2 1165 319 315 134 23 chr15 76146847 76147019 -27347955 - MLT1D LTR MaLR -307 198 8 2 1165 2345 95 0 60 chr15 76147118 76147465 -27347509 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1166 984 259 152 20 chr15 76153475 76153877 -27341097 + MER68 LTR ERVL 74 528 -35 2 1166 1007 226 110 90 chr15 76153931 76154432 -27340542 + RMER4B LTR ERVK 17 455 -11 2 1166 341 215 116 21 chr15 76154487 76154582 -27340392 + MT2B LTR ERVL 154 257 -344 2 1166 484 331 24 12 chr15 76154910 76155078 -27339896 + MTEa LTR MaLR 53 222 -157 2 1166 249 261 29 0 chr15 76158200 76158269 -27336705 + MER68 LTR ERVL 275 345 -218 2 1166 586 161 42 0 chr15 76158452 76158570 -27336404 + RMER4B LTR ERVK 17 139 -446 2 1166 395 19 75 0 chr15 76167951 76168004 -27326970 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 344 3 1166 2685 40 6 8 chr15 76168852 76169207 -27325767 - MTA_Mm LTR MaLR -42 354 1 3 1166 4294 52 13 5 chr15 76170007 76170633 -27324341 + ORR1A1-int LTR MaLR 573 1762 -30 3 1166 821 199 95 0 chr15 76195086 76195406 -27299568 + MTD LTR MaLR 19 419 0 3 1166 485 264 38 145 chr15 76196004 76196044 -27298930 - MTE2a LTR MaLR -6 373 337 3 1166 485 264 38 145 chr15 76196175 76196191 -27298783 - MTE2a LTR MaLR -43 336 336 3 1166 485 264 38 145 chr15 76196305 76196482 -27298492 - MTE2a LTR MaLR -43 336 164 3 1166 1455 193 136 40 chr15 76197042 76197275 -27297699 - RLTR19 LTR ERVK -55 444 204 3 1166 1455 193 136 40 chr15 76197675 76197835 -27297139 - RLTR19 LTR ERVK -303 196 1 3 1166 331 268 126 139 chr15 76197835 76198066 -27296908 - MTE2a LTR MaLR -137 242 15 3 1166 247 310 129 47 chr15 76198739 76198932 -27296042 + MLT1K LTR MaLR 387 595 0 3 1166 2290 152 63 25 chr15 76206031 76206058 -27288916 + RMER4A LTR ERVK 6 32 -434 3 1166 2290 152 63 25 chr15 76206137 76206553 -27288421 + RMER4A LTR ERVK 33 465 -1 3 1166 423 197 31 93 chr15 76216828 76216855 -27278119 + MT2B LTR ERVL 137 155 -446 3 1166 333 228 163 0 chr15 76216969 76217092 -27277882 - ORR1D2 LTR MaLR -78 292 150 3 1166 1333 165 248 0 chr15 76218843 76219177 -27275797 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1166 355 262 106 27 chr15 76219250 76219635 -27275339 - RLTR12B LTR ERVK -56 303 10 4 1166 503 360 27 23 chr15 76219645 76219864 -27275110 - MLT1E2 LTR MaLR -306 321 102 4 1166 1389 312 147 44 chr15 76227775 76228463 -27266511 - MER21B LTR ERV1 -102 761 3 4 1166 493 256 206 0 chr15 76239590 76239750 -27255224 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 177 4 1166 697 229 163 26 chr15 76239750 76239790 -27255184 - MT2A LTR ERVL 0 533 496 4 1166 697 229 163 26 chr15 76239823 76240015 -27254959 - MT2A LTR ERVL -38 495 271 4 1166 402 187 186 8 chr15 76240039 76240163 -27254811 - RLTR40 LTR ERVK -570 247 102 4 1166 311 208 110 40 chr15 76244895 76244995 -27249979 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 268 4 1166 550 208 42 2 chr15 76244995 76245141 -27249833 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 1 4 1166 2216 72 15 61 chr15 76245346 76245400 -27249574 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 287 4 1166 2216 72 15 61 chr15 76245553 76245841 -27249133 - ORR1A2 LTR MaLR -41 286 1 4 1166 286 292 9 86 chr15 76247988 76248104 -27246870 - MT2B LTR ERVL -341 260 154 4 1166 656 329 170 18 chr15 76251883 76251988 -27242986 - MER77 LTR ERVL -12 595 476 4 1166 656 329 170 18 chr15 76252088 76252483 -27242491 - MER77 LTR ERVL -132 475 19 4 1166 1595 187 50 30 chr15 76254707 76255073 -27239901 - ORR1D2 LTR MaLR 0 419 2 4 1166 283 284 36 9 chr15 76260995 76261113 -27233861 - ORR1E LTR MaLR 0 370 242 4 1167 1125 252 106 55 chr15 76305802 76306150 -27188824 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 5 1167 453 330 98 15 chr15 76315065 76315268 -27179706 - MLT1C LTR MaLR -214 253 34 5 1167 513 195 58 36 chr15 76315304 76315527 -27179447 - RMER17C LTR ERVK -86 281 65 5 1167 2114 95 12 16 chr15 76316793 76317114 -27177860 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 2 5 1167 1083 219 43 43 chr15 76323045 76323115 -27171859 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 322 5 1167 1083 219 43 43 chr15 76323314 76323501 -27171473 - ORR1C2 LTR MaLR -63 321 124 5 1167 250 326 65 22 chr15 76331374 76331512 -27163462 - RMER12 LTR ERVK -464 858 715 5 1167 296 221 0 93 chr15 76338203 76338278 -27156696 + MT2B2 LTR ERVL 172 239 -345 6 1167 262 279 82 90 chr15 76340679 76340813 -27154161 + MT2B LTR ERVL 132 264 -337 6 1167 2311 156 119 88 chr15 76345611 76346158 -27148816 + RMER2 LTR ERV1 1 564 -3 6 1167 239 348 37 52 chr15 76356006 76356197 -27138777 - ORR1E LTR MaLR -113 246 59 6 1167 274 345 42 35 chr15 76356187 76356331 -27138643 - MLT1A1 LTR MaLR -263 145 1 6 1167 237 232 18 0 chr15 76359791 76359847 -27135127 + MLT1C LTR MaLR 270 326 -141 6 1167 379 365 23 55 chr15 76360033 76360203 -27134771 + MLT1H-int LTR MaLR 290 462 -947 6 1167 379 365 23 55 chr15 76360412 76360461 -27134513 + MLT1H-int LTR MaLR 463 502 -907 6 1167 1422 225 163 3 chr15 76377992 76378353 -27116621 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1167 300 332 58 29 chr15 76380432 76380640 -27114334 - MER52-int LTR ERV1 -1221 5870 5657 6 1167 966 177 126 0 chr15 76388426 76388624 -27106350 + RLTR19 LTR ERVK 10 232 -267 7 1167 1238 212 3 58 chr15 76389051 76389346 -27105628 + RLTR19 LTR ERVK 221 499 0 7 1167 5763 46 65 0 chr15 76390246 76390943 -27104031 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 1 7 1167 30685 12 3 0 chr15 76390943 76394467 -27100507 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 0 7601 4068 7 1167 19968 14 0 2 chr15 76394441 76396735 -27098239 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -5310 2291 1 7 1167 5763 46 65 0 chr15 76396735 76397432 -27097542 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 1 7 1167 3993 115 168 92 chr15 76397468 76397832 -27097142 + RLTR25B LTR ERVK 30 437 -591 7 1167 3993 115 168 92 chr15 76398017 76398580 -27096394 + RLTR25B LTR ERVK 438 1028 0 7 1167 1584 179 94 70 chr15 76398801 76398853 -27096121 + MTC LTR MaLR 29 81 -340 7 1167 1584 179 94 70 chr15 76399001 76399113 -27095861 + MTC LTR MaLR 82 170 -251 7 1167 3584 116 189 23 chr15 76399113 76399759 -27095215 + RMER6A LTR ERVK 1 753 -3 7 1167 1584 179 94 70 chr15 76399907 76400124 -27094850 + MTC LTR MaLR 171 420 -1 7 1167 244 350 29 10 chr15 76403984 76404088 -27090886 - RMER15 LTR ERVL -65 510 405 7 1167 275 210 136 29 chr15 76408717 76408732 -27086242 + MT2B LTR ERVL 167 272 -328 7 1168 383 228 28 234 chr15 76440707 76440925 -27054049 + RMER15 LTR ERVL 364 536 -39 8 1168 356 304 26 9 chr15 76442377 76442493 -27052481 + MLT1B LTR MaLR 273 390 0 8 1168 2467 212 71 77 chr15 76450352 76450727 -27044247 + RLTR21 LTR ERVK 5 373 -1199 8 1168 2467 212 71 77 chr15 76450873 76451203 -27043771 + RLTR21 LTR ERVK 374 705 -867 8 1168 2083 199 71 93 chr15 76451475 76451768 -27043206 + RLTR21 LTR ERVK 665 944 -628 8 1168 2083 199 71 93 chr15 76451812 76452027 -27042947 + RLTR21 LTR ERVK 945 1200 -372 8 1168 2083 224 70 122 chr15 76452054 76452315 -27042659 + RLTR21 LTR ERVK 1176 1401 -3 8 1168 259 387 28 51 chr15 76463901 76464116 -27030858 + MER50B LTR ERV1 341 550 -147 8 1168 259 179 81 95 chr15 76471814 76471888 -27023086 - MT2B2 LTR ERVL -356 228 156 8 1168 486 298 72 10 chr15 76509300 76509493 -26985481 - MLT1F1 LTR MaLR -57 512 308 3 1168 304 204 93 84 chr15 76510777 76510884 -26984090 - MT2B2 LTR ERVL -322 262 155 4 1168 268 164 55 0 chr15 76517314 76517369 -26977605 - MTD LTR MaLR 0 419 362 6 1168 938 229 88 17 chr15 76517391 76517631 -26977343 - MTD LTR MaLR -162 257 1 6 1168 1440 165 164 75 chr15 76537792 76538080 -26956894 + ORR1C2 LTR MaLR 5 338 -46 7 1168 1440 165 164 75 chr15 76538226 76538284 -26956690 + ORR1C2 LTR MaLR 339 382 -2 7 1169 235 360 42 79 chr15 76578329 76578519 -26916455 + MT2B2 LTR ERVL 96 278 -306 1 1169 406 206 0 142 chr15 76580159 76580175 -26914799 + MT2B LTR ERVL 161 175 -426 1 1169 406 206 0 142 chr15 76580325 76580421 -26914553 + MT2B LTR ERVL 176 257 -344 1 1169 1158 81 32 26 chr15 76585720 76585910 -26909064 + RMER17C LTR ERVK 220 410 0 1 1169 650 237 255 55 chr15 76586225 76586515 -26908459 + ORR1D2 LTR MaLR 8 355 -4 1 1169 800 279 65 65 chr15 76587955 76588308 -26906666 + MTE2a LTR MaLR 27 379 0 1 1169 1037 249 99 20 chr15 76590285 76590615 -26904359 - ORR1E LTR MaLR 0 370 1 1 1169 2277 136 76 13 chr15 76604515 76604909 -26890065 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 2 1169 1225 248 39 21 chr15 76605975 76606255 -26888719 - MTEb LTR MaLR -94 285 1 2 1169 3613 15 2 0 chr15 76606576 76606971 -26888003 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1169 9215 38 2 2 chr15 76606971 76608069 -26886905 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1169 3613 15 2 0 chr15 76608069 76608464 -26886510 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1169 1246 191 216 12 chr15 76609897 76610216 -26884758 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1169 276 221 135 63 chr15 76612081 76612192 -26882782 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 123 2 1169 1764 151 17 7 chr15 76617507 76617808 -26877166 + MTC LTR MaLR 1 304 -117 2 1169 280 335 74 25 chr15 76618010 76618265 -26876709 - MTEa LTR MaLR -59 320 18 2 1169 1182 220 66 36 chr15 76623440 76623775 -26871199 + ORR1D1 LTR MaLR 30 374 0 2 1169 262 243 213 7 chr15 76624317 76624458 -26870516 + RMER15 LTR ERVL 405 574 -1 2 1169 246 314 81 24 chr15 76631899 76632023 -26862951 - ORR1E LTR MaLR -225 134 4 2 1169 226 312 17 84 chr15 76637449 76637568 -26857406 - RMER12 LTR ERVK -462 860 750 2 1169 249 171 30 180 chr15 76638452 76638552 -26856422 - MT2B LTR ERVL -366 235 151 2 1169 245 303 43 43 chr15 76641725 76641818 -26853156 - RLTR18 LTR ERVK -332 284 192 3 1169 641 197 143 0 chr15 76642467 76642614 -26852360 + ORR1C2 LTR MaLR 176 343 -41 3 1169 998 274 30 84 chr15 76653024 76653359 -26841615 + MTEa LTR MaLR 51 367 -12 3 1169 3353 48 0 5 chr15 76659580 76659982 -26834992 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1169 263 267 11 95 chr15 76660404 76660418 -26834556 + MT2B LTR ERVL 154 159 -442 3 1169 824 159 32 73 chr15 76661640 76661748 -26833226 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 174 3 1169 824 163 181 49 chr15 76661785 76661938 -26833036 - ORR1C2 LTR MaLR -211 173 2 3 1169 1369 265 148 86 chr15 76664028 76664824 -26830150 + MTE-int LTR MaLR 6 1098 -482 3 1169 668 143 9 0 chr15 76664824 76664929 -26830045 - RLTR19C LTR ERVK 0 496 391 3 1169 1347 156 26 53 chr15 76665026 76665290 -26829684 - RLTR19C LTR ERVK -104 402 146 3 1169 730 209 116 81 chr15 76665481 76665679 -26829295 + MTE2a LTR MaLR 172 376 -3 3 1169 3538 28 0 0 chr15 76665750 76666146 -26828828 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1169 9482 34 0 1 chr15 76666146 76667245 -26827729 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1169 3189 48 0 17 chr15 76667245 76667542 -26827432 + MTA_Mm LTR MaLR 1 297 -99 3 1169 3703 33 16 0 chr15 76667542 76667971 -26827003 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 3 1169 3189 48 0 17 chr15 76667971 76668076 -26826898 + MTA_Mm LTR MaLR 298 396 0 3 1169 267 295 93 55 chr15 76668868 76669049 -26825925 + RMER17D LTR ERVK 117 303 -586 3 1169 267 295 93 55 chr15 76669241 76669336 -26825638 + RMER17D LTR ERVK 304 405 -484 3 1169 267 295 93 55 chr15 76669438 76669451 -26825523 + RMER17D LTR ERVK 406 417 -472 3 1169 232 288 62 12 chr15 76669556 76669637 -26825337 + MLT1J2 LTR MaLR 97 181 -331 3 1169 316 217 0 0 chr15 76669645 76669705 -26825269 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 3 1169 2408 209 37 30 chr15 76670186 76670729 -26824245 + RMER15 LTR ERVL 27 573 -2 3 1169 252 312 138 48 chr15 76670807 76670952 -26824022 + MLT1J2 LTR MaLR 265 422 -26 3 1169 3147 265 113 69 chr15 76670970 76671361 -26823613 + MTE-int LTR MaLR 465 912 -668 3 1169 2632 145 49 57 chr15 76671361 76671788 -26823186 + RLTR28 LTR ERVL 1 431 -93 3 1169 2632 145 49 57 chr15 76671968 76672068 -26822906 + RLTR28 LTR ERVL 432 524 0 3 1169 3147 265 113 69 chr15 76672068 76672599 -26822375 + MTE-int LTR MaLR 913 1427 -153 3 1169 3147 265 113 69 chr15 76672784 76672929 -26822045 + MTE-int LTR MaLR 1428 1580 0 3 1169 1787 153 35 13 chr15 76672937 76673249 -26821725 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 56 4 1169 279 200 0 0 chr15 76673308 76673353 -26821621 - ORR1D1 LTR MaLR -339 45 1 4 1169 342 284 25 0 chr15 76673364 76673445 -26821529 + MTEb LTR MaLR 20 102 -277 4 1169 620 241 61 31 chr15 76673550 76673713 -26821261 + MTEb LTR MaLR 210 377 -2 4 1169 548 156 0 11 chr15 76674100 76674191 -26820783 + ORR1C2 LTR MaLR 11 100 -278 4 1169 296 336 9 28 chr15 76674368 76674383 -26820591 + ORR1C2 LTR MaLR 102 115 -255 4 1169 1146 138 157 35 chr15 76674534 76674789 -26820185 + ORR1C2 LTR MaLR 99 384 0 4 146 1039 238 122 49 chr15 76676947 76677129 -26817845 + RMER5 LTR ERV1 39 230 -304 4 1170 4316 21 2 0 chr15 76677129 76677610 -26817364 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 4 1170 1039 238 122 49 chr15 76677610 76677812 -26817162 + RMER5 LTR ERV1 231 451 -83 4 1170 1864 167 50 19 chr15 76678481 76678842 -26816132 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 4 1170 299 257 14 0 chr15 76678844 76678914 -26816060 + ORR1D1-int LTR MaLR 1 71 -1299 4 1170 260 242 93 62 chr15 76681229 76681326 -26813648 + MuLV-int LTR ERV1 2894 2993 -4613 4 1170 256 264 88 52 chr15 76688752 76688888 -26806086 + RMER15 LTR ERVL 9 149 -426 4 1170 307 207 100 33 chr15 76689474 76689564 -26805410 + RMER15 LTR ERVL 374 469 -106 4 1170 362 320 65 26 chr15 76691509 76691663 -26803311 + MLT1A LTR MaLR 1 160 -214 4 1170 916 239 150 87 chr15 76698046 76698380 -26796594 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 4 1170 298 214 21 116 chr15 76702203 76702298 -26792676 + MT2B LTR ERVL 172 257 -344 4 1170 3003 120 5 16 chr15 76704493 76704941 -26790033 - RLTR13C1 LTR ERVK -477 506 64 4 1170 244 252 16 25 chr15 76706393 76706409 -26788565 + ORR1B1-int LTR MaLR 634 648 -861 5 1170 1033 159 58 77 chr15 76706817 76706897 -26788077 + RMER10A LTR ERVL 189 263 -179 5 1170 5468 163 72 39 chr15 76706897 76707975 -26786999 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 5 1170 1033 159 58 77 chr15 76707975 76708153 -26786821 + RMER10A LTR ERVL 264 441 -1 5 1170 323 283 94 50 chr15 76714114 76714274 -26780700 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 642 5 1170 226 270 132 22 chr15 76714947 76715038 -26779936 - RLTR13C2 LTR ERVK -1013 101 1 5 1170 313 234 19 130 chr15 76718204 76718312 -26776662 - MT2B LTR ERVL -344 257 162 5 1170 591 318 112 14 chr15 76719578 76719902 -26775072 - MTD LTR MaLR -31 388 1 5 1170 1309 212 56 59 chr15 76722261 76722636 -26772338 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1170 453 240 64 138 chr15 76722910 76722986 -26771988 - ORR1D1-int LTR MaLR -859 511 446 5 1170 453 240 64 138 chr15 76723357 76723482 -26771492 - ORR1D1-int LTR MaLR -925 445 325 5 1170 425 177 25 0 chr15 76723709 76723788 -26771186 - ORR1D1-int LTR MaLR -1046 324 244 5 1170 410 228 138 21 chr15 76723823 76724011 -26770963 - RMER17C LTR ERVK -139 271 62 5 1170 349 261 169 15 chr15 76723987 76724123 -26770851 - ORR1D1-int LTR MaLR -1308 272 116 5 1170 303 348 14 7 chr15 76724724 76724863 -26770111 - ERVL-E-int LTR ERVL -2365 3302 3163 5 1170 1280 189 8 24 chr15 76726617 76726867 -26768107 + MTC LTR MaLR 176 421 0 5 1170 2871 17 8 83 chr15 76727625 76727872 -26767102 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 126 5 1170 2871 17 8 83 chr15 76728021 76728147 -26766827 - ORR1A0 LTR MaLR -221 125 1 5 1170 1821 173 189 14 chr15 76728348 76728776 -26766198 - RLTR19C LTR ERVK 0 506 4 5 1170 341 327 66 76 chr15 76729126 76729414 -26765560 + MLT1C LTR MaLR 4 288 -179 5 1170 250 219 131 66 chr15 76729997 76730119 -26764855 - MT2B2 LTR ERVL -302 282 153 5 1170 991 242 183 37 chr15 76739580 76739651 -26755323 + MTD LTR MaLR 43 113 -306 6 1170 991 242 183 37 chr15 76739839 76740089 -26754885 + MTD LTR MaLR 114 411 -8 6 1170 289 218 66 63 chr15 76740113 76740215 -26754759 + MTC-int LTR MaLR 87 187 -1183 6 1170 352 290 19 29 chr15 76757650 76757753 -26737221 - LTR52 LTR ERVL -92 329 228 6 1170 291 202 270 10 chr15 76757770 76757870 -26737104 + MT2A LTR ERVL 3 128 -405 6 1170 931 267 121 7 chr15 76757794 76758092 -26736882 + MTE2b LTR MaLR 48 379 0 6 1170 283 227 153 111 chr15 76758123 76758267 -26736707 - LTR52 LTR ERVL -258 163 14 6 1170 1078 169 209 5 chr15 76759248 76759468 -26735506 + MTB_Mm LTR MaLR 143 407 0 6 1170 4410 30 0 6 chr15 76761545 76762051 -26732923 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 6 1170 545 342 73 69 chr15 76769957 76770170 -26724804 - MLT1A LTR MaLR -72 302 88 7 1170 545 342 73 69 chr15 76770255 76770302 -26724672 - MLT1A LTR MaLR -287 87 42 7 1170 303 86 208 16 chr15 76774774 76774845 -26720129 - MTD LTR MaLR -334 87 4 7 1170 1519 202 122 101 chr15 76774845 76775510 -26719464 - MTC-int LTR MaLR -188 1070 260 7 1170 1519 180 163 92 chr15 76775647 76775749 -26719225 - MTC-int LTR MaLR -1242 267 165 7 1170 461 192 95 9 chr15 76775759 76775801 -26719173 + MTD LTR MaLR 306 349 -70 7 1170 461 192 95 9 chr15 76775831 76775893 -26719081 + MTD LTR MaLR 350 418 -1 7 1170 226 250 108 113 chr15 76776512 76776697 -26718277 - RLTR20A LTR ERVK -299 242 59 7 1170 3708 41 10 1 chr15 76776989 76777812 -26717162 + MT-int LTR MaLR 55 1016 -82 7 1170 3135 23 0 0 chr15 76777812 76778161 -26716813 + MERVL-int LTR ERVL 4776 5124 -361 7 1170 636 232 0 0 chr15 76778165 76778290 -26716684 - ORR1D-int LTR MaLR -205 1165 1041 7 1170 957 218 146 29 chr15 76778322 76778596 -26716378 + MT2A LTR ERVL 5 310 -223 7 1170 3241 123 170 29 chr15 76781460 76782120 -26712854 - RMER6A LTR ERVK 0 756 4 7 1170 1111 176 40 128 chr15 76787450 76787769 -26707205 - RMER19C LTR ERVK -430 307 1 7 1170 1918 148 74 111 chr15 76787769 76787858 -26707116 - RLTR19 LTR ERVK -73 426 353 7 1170 1918 148 74 111 chr15 76788186 76788527 -26706447 - RLTR19 LTR ERVK -147 352 9 7 1170 2245 104 28 12 chr15 76788982 76789304 -26705670 + ORR1A4 LTR MaLR 3 329 0 7 1170 1857 116 89 0 chr15 76789889 76790182 -26704792 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1170 7465 50 5 0 chr15 76790409 76791297 -26703677 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 892 -1 7 1170 591 218 17 46 chr15 76792099 76792272 -26702702 + RNLTR23 LTR ERVK 475 642 0 7 1170 3629 18 0 0 chr15 76794972 76795368 -26699606 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1170 4505 12 2 0 chr15 76795408 76795900 -26699074 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1170 319 0 0 0 chr15 76795900 76795938 -26699036 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 7 1170 403 167 46 35 chr15 76795938 76796025 -26698949 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 7 1170 41507 16 14 0 chr15 76796025 76801312 -26693662 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 7 1170 4505 12 2 0 chr15 76801312 76801804 -26693170 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1170 2067 149 54 19 chr15 76801838 76802208 -26692766 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 2 7 1170 246 267 32 65 chr15 76802500 76802624 -26692350 + RMER12 LTR ERVK 736 855 -467 7 1170 861 207 66 11 chr15 76806088 76806269 -26688705 + RLTR33 LTR ERVK 175 365 -313 7 1170 520 329 107 82 chr15 76806731 76807399 -26687575 + MMERGLN-int LTR ERV1 2669 3337 -4219 7 1170 520 329 107 82 chr15 76807438 76807968 -26687006 + MMERGLN-int LTR ERV1 3338 3897 -3659 7 1171 315 367 4 48 chr15 76808649 76808898 -26686076 + MMERGLN-int LTR ERV1 4887 5124 -2477 7 1171 290 170 75 0 chr15 76808993 76809046 -26685928 + RLTR14-int LTR ERV1 3517 3573 -1744 7 1171 2434 80 0 60 chr15 76810723 76811071 -26683903 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1171 225 202 266 0 chr15 76811450 76811529 -26683445 - RMER21B LTR ERV1 -277 565 466 7 1171 2353 216 102 86 chr15 76811935 76812142 -26682832 + RLTR19-int LTR ERVK 2346 2557 -3580 7 1171 2353 216 102 86 chr15 76812333 76812955 -26682019 + RLTR19-int LTR ERVK 2558 3189 -2948 7 1171 918 185 5 33 chr15 76813413 76813597 -26681377 + RMER10B LTR ERVL 220 398 0 7 1171 2342 115 17 11 chr15 76813631 76813983 -26680991 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 7 1171 266 291 25 25 chr15 76813999 76814119 -26680855 + RLTR14-int LTR ERV1 4891 5010 -307 7 1171 448 224 92 50 chr15 76816544 76816685 -26678289 + RLTR41 LTR ERV1 300 446 0 8 1171 3247 67 2 12 chr15 76819249 76819660 -26675314 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1171 225 286 0 20 chr15 76819708 76819758 -26675216 + MER67C LTR ERV1 179 227 -484 8 1171 2440 111 67 178 chr15 76823516 76824003 -26670971 + RLTR24 LTR ERV1 1 397 -132 8 1171 2440 111 67 178 chr15 76824034 76824141 -26670833 + RLTR24 LTR ERV1 398 529 0 8 1171 4027 112 110 2 chr15 76827809 76828417 -26666557 - RLTR33 LTR ERVK -4 674 1 8 1171 2114 131 99 16 chr15 76831182 76831546 -26663428 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 8 1171 4254 97 55 53 chr15 76838262 76839012 -26655962 - RMER17A LTR ERVK 0 751 1 8 1171 237 250 242 0 chr15 76840986 76841106 -26653868 - MLT2C2 LTR ERVL 0 560 412 8 1171 254 253 32 84 chr15 76841233 76841290 -26653684 - MLT2C2 LTR ERVL -365 99 46 8 1171 2222 113 3 60 chr15 76841290 76841639 -26653335 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 8 1171 254 253 32 84 chr15 76841639 76841676 -26653298 - MLT2C2 LTR ERVL -419 45 10 8 1171 296 307 76 65 chr15 76855344 76855405 -26639569 - MT2B LTR ERVL -426 158 107 8 1171 296 311 99 11 chr15 76860491 76860673 -26634301 + RLTR21 LTR ERVK 1053 1250 -322 8 1171 282 204 204 0 chr15 76865714 76865807 -26629167 - ORR1A2 LTR MaLR 0 374 263 8 1171 1927 143 67 6 chr15 76865814 76866145 -26628829 + RMER13A LTR ERVK 1 351 -509 8 1171 1066 103 6 18 chr15 76866145 76866313 -26628661 - ORR1A2 LTR MaLR -161 166 1 8 1171 504 140 67 39 chr15 76866313 76866414 -26628560 - MTD LTR MaLR -315 104 1 8 1171 238 309 47 102 chr15 76869853 76870196 -26624778 + RMER17C LTR ERVK 46 369 -41 9 1171 3457 30 8 0 chr15 76871626 76872019 -26622955 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1171 8070 72 15 21 chr15 76872019 76872408 -26622566 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 389 -709 9 1171 8070 72 15 21 chr15 76872777 76873487 -26621487 + MTA_Mm-int LTR MaLR 390 1098 0 9 1171 3131 40 53 0 chr15 76873487 76873863 -26621111 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1171 1574 222 92 88 chr15 76874405 76874914 -26620060 + RLTR18B LTR ERVK 1 511 -1 9 1171 2269 135 40 11 chr15 76877641 76878014 -26616960 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 9 1171 1882 181 46 59 chr15 76878450 76878909 -26616065 - RMER20A LTR ERVK -53 463 11 9 1171 251 310 71 82 chr15 76879785 76879968 -26615006 + RMER13A LTR ERVK 678 858 -2 9 1171 230 368 35 45 chr15 76882632 76882834 -26612140 + RMER2 LTR ERV1 368 567 0 9 1171 1302 163 36 58 chr15 76882834 76883108 -26611866 - MTD LTR MaLR -147 272 5 9 1171 315 328 74 0 chr15 76885501 76885623 -26609351 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 235 9 1171 254 174 0 21 chr15 76885741 76885788 -26609186 - MLT1A0 LTR MaLR -273 92 47 9 1171 1779 130 66 43 chr15 76887675 76888068 -26606906 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 9 1171 1281 199 21 200 chr15 76888906 76889377 -26605597 - RLTR23 LTR ERV1 -36 394 8 9 1171 263 267 294 0 chr15 76889472 76889506 -26605468 + MTE2a LTR MaLR 172 206 -164 9 1171 4271 53 2 8 chr15 76889506 76890021 -26604953 - LTRIS3 LTR ERV1 0 512 1 9 1171 274 267 294 0 chr15 76890021 76890132 -26604842 + MTE2a LTR MaLR 207 359 -11 9 1171 2986 127 32 8 chr15 76891518 76892017 -26602957 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 16 9 1171 952 97 108 97 chr15 76892097 76892153 -26602821 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 349 9 1171 952 116 103 99 chr15 76892314 76892543 -26602431 - ORR1B1 LTR MaLR -46 348 84 9 1171 557 233 112 36 chr15 76894683 76894959 -26600015 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 9 1171 1552 197 83 8 chr15 76895016 76895334 -26599640 + ORR1D2 LTR MaLR 1 337 -33 9 1171 1033 272 65 90 chr15 76895354 76895366 -26599608 + ORR1D2 LTR MaLR 329 335 -24 9 1171 1033 272 65 90 chr15 76895665 76895697 -26599277 + ORR1D2 LTR MaLR 336 359 0 9 1171 333 279 82 65 chr15 76895798 76896043 -26598931 - MLT1E1 LTR MaLR -7 647 399 9 1171 1526 169 28 65 chr15 76896101 76896333 -26598641 + RMER17C LTR ERVK 16 406 -552 9 1171 1526 172 100 38 chr15 76896435 76896623 -26598351 + RMER17C LTR ERVK 187 406 -4 9 1171 515 294 77 45 chr15 76897753 76897974 -26597000 + RMER2 LTR ERV1 335 562 -5 9 1171 1673 158 73 32 chr15 76900682 76901022 -26593952 - ORR1D2 LTR MaLR -8 362 9 9 1171 368 311 28 0 chr15 76903581 76903687 -26591287 + MTEb LTR MaLR 3 111 -248 9 1171 407 310 18 88 chr15 76904140 76904310 -26590664 + MTEb LTR MaLR 205 362 -17 9 1171 303 272 88 97 chr15 76904629 76904963 -26590011 + RLTR12B LTR ERVK 12 328 -200 9 1171 1333 194 45 5 chr15 76905425 76905697 -26589277 + ORR1D1 LTR MaLR 1 289 -70 9 1171 272 328 78 0 chr15 76908375 76908491 -26586483 - LTR40b LTR ERVL -33 429 305 9 1171 253 217 357 18 chr15 76930045 76930157 -26564817 + MTD LTR MaLR 270 419 0 1 1171 533 254 7 43 chr15 76939096 76939236 -26555738 + MLT1D LTR MaLR 5 139 -366 1 1172 1632 144 47 21 chr15 76950947 76951287 -26543687 + RMER6A LTR ERVK 408 756 0 1 1172 470 180 11 0 chr15 76952496 76952585 -26542389 - MTC LTR MaLR 0 419 330 1 1172 545 150 10 0 chr15 76952807 76952907 -26542067 - MTC LTR MaLR -148 273 173 1 1172 389 91 0 0 chr15 76952905 76952960 -26542014 - MTC LTR MaLR -366 55 1 1 1172 668 230 22 48 chr15 76960204 76960432 -26534542 - RLTR15 LTR ERVK -136 223 2 1 1172 256 167 0 20 chr15 76964902 76964951 -26530023 - MTD LTR MaLR -40 379 332 1 1172 850 244 120 49 chr15 76965227 76965494 -26529480 - MTD LTR MaLR -131 288 3 1 1172 3146 65 8 0 chr15 76966028 76966425 -26528549 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1172 1306 192 179 3 chr15 76977566 76977884 -26517090 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1172 316 254 32 41 chr15 76996501 76996624 -26498350 + MTEb LTR MaLR 248 369 -10 1 1172 781 226 82 133 chr15 76998272 76998308 -26496666 - MTE2a LTR MaLR -67 312 272 1 1172 781 226 82 133 chr15 76998364 76998643 -26496331 - MTE2a LTR MaLR -108 271 13 1 1172 1681 335 85 50 chr15 76998663 76998719 -26496255 + MTE-int LTR MaLR 58 114 -1466 1 1172 1681 335 85 50 chr15 76998927 76999936 -26495038 + MTE-int LTR MaLR 115 1161 -419 1 1172 233 307 23 0 chr15 77000008 77000096 -26494878 + MTE-int LTR MaLR 1252 1341 -239 1 1172 2280 77 41 6 chr15 77001066 77001381 -26493593 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 5 1172 2390 113 77 0 chr15 77014744 77015108 -26479866 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 3 1172 384 258 173 20 chr15 77016137 77016424 -26478550 + MTEa LTR MaLR 29 375 -4 3 1172 226 135 54 0 chr15 77020687 77020724 -26474250 + ORR1E LTR MaLR 2 40 -319 4 1172 840 283 39 26 chr15 77022958 77023266 -26471708 - MLT1F2-int LTR MaLR -303 1186 875 5 1172 625 262 193 19 chr15 77023417 77023728 -26471246 - MLT1F2-int LTR MaLR -996 493 129 5 1172 457 253 262 18 chr15 77024033 77024319 -26470655 - MLT1F2 LTR MaLR -5 555 200 5 1172 312 261 27 128 chr15 77058716 77058865 -26436109 + MT2B LTR ERVL 124 257 -344 1 1172 888 225 100 44 chr15 77060840 77061091 -26433883 + RLTR33 LTR ERVK 414 678 0 1 1172 1645 73 45 4 chr15 77067136 77067382 -26427592 + ORR1A2 LTR MaLR 1 256 -71 1 1172 359 243 168 0 chr15 77068262 77068369 -26426605 + LTR41 LTR ERVL 71 195 -573 1 1172 311 328 139 0 chr15 77068459 77068581 -26426393 + LTR41 LTR ERVL 414 552 -216 1 1172 230 250 83 0 chr15 77069321 77069381 -26425593 + MER68 LTR ERVL 77 141 -422 1 1173 977 243 122 41 chr15 77079899 77080242 -26414732 - MTEa LTR MaLR -8 371 1 1 1173 1977 144 189 30 chr15 77087466 77087868 -26407106 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 1 1173 341 259 0 23 chr15 77090696 77090783 -26404191 - ORR1E LTR MaLR -251 108 24 1 1173 4707 133 93 236 chr15 77092463 77093031 -26401943 + ORR1B1-int LTR MaLR 336 718 -1245 1 1173 4707 135 92 233 chr15 77093224 77094504 -26400470 + ORR1B1-int LTR MaLR 719 1905 -58 1 1173 2108 128 101 0 chr15 77094521 77094879 -26400095 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 1 1173 1360 201 111 32 chr15 77118249 77118590 -26376384 + ORR1D1 LTR MaLR 11 378 0 2 1173 450 291 130 88 chr15 77132469 77132497 -26362477 + MLT1A LTR MaLR 18 41 -349 2 1173 741 291 130 87 chr15 77132608 77132937 -26362037 + MLT1A LTR MaLR 30 386 -4 2 1173 232 242 0 43 chr15 77136328 77136397 -26358577 + MER74C LTR ERVL 63 128 -332 2 1173 246 360 35 54 chr15 77139322 77139601 -26355373 + MTEa LTR MaLR 91 377 -2 2 1173 2954 78 22 29 chr15 77140150 77140560 -26354414 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1173 511 200 85 52 chr15 77142067 77142220 -26352754 + RMER15 LTR ERVL 3 160 -415 2 1173 656 335 30 58 chr15 77142224 77142519 -26352455 + RMER15 LTR ERVL 289 575 0 2 1173 246 343 52 15 chr15 77143283 77143419 -26351555 + MLT1J LTR MaLR 372 512 0 2 1173 238 297 16 0 chr15 77147529 77147593 -26347381 - LTR81A LTR ERV1? -1164 186 122 2 1173 315 343 7 28 chr15 77150568 77150709 -26344265 - LTR79 LTR ERVL -275 252 115 2 1173 2505 135 11 13 chr15 77150871 77151253 -26343721 + ORR1B1 LTR MaLR 1 381 -13 2 1173 225 280 84 21 chr15 77155278 77155373 -26339601 - ORR1E LTR MaLR -255 104 4 3 1173 731 278 120 48 chr15 77155419 77155752 -26339222 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 3 1173 359 313 38 62 chr15 77158909 77158932 -26336042 + RMER10A LTR ERVL 131 153 -448 3 1173 1065 224 59 24 chr15 77159161 77159182 -26335792 + RMER10A LTR ERVL 2 23 -419 3 1173 1065 224 59 24 chr15 77159271 77159657 -26335317 + RMER10A LTR ERVL 24 442 0 3 1173 1056 160 145 13 chr15 77163082 77163310 -26331664 + RLTR11A LTR ERVK 1 258 -270 3 1173 353 318 35 62 chr15 77167744 77167961 -26327013 + MLT2C1 LTR ERVL 156 522 -34 3 1173 349 301 107 60 chr15 77176477 77176693 -26318281 - MLT1A LTR MaLR -32 342 117 3 1173 1149 257 67 31 chr15 77178102 77178459 -26316515 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1173 2787 90 55 0 chr15 77178926 77179348 -26315626 + BGLII_A LTR ERVK 1 445 0 3 1173 3297 30 2 0 chr15 77181014 77181409 -26313565 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1173 8981 28 2 1 chr15 77181409 77182506 -26312468 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 3 1173 549 0 0 0 chr15 77182506 77182571 -26312403 - MTA_Mm LTR MaLR 0 400 336 3 1173 1608 20 10 0 chr15 77182552 77182755 -26312219 + MTA_Mm LTR MaLR 192 396 0 3 1173 440 373 136 43 chr15 77188014 77188278 -26306696 - MLT1I LTR MaLR 0 411 110 3 1173 440 373 136 43 chr15 77188584 77188694 -26306280 - MLT1I LTR MaLR -302 109 2 3 1173 324 258 0 22 chr15 77191704 77191795 -26303179 + MER54A LTR ERVL 30 118 -783 4 1173 664 197 7 0 chr15 77195537 77195674 -26299300 - MTD LTR MaLR -189 230 93 4 1173 927 226 70 9 chr15 77199876 77200090 -26294884 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 144 4 1173 251 268 0 0 chr15 77200773 77200829 -26294145 - ORR1D2 LTR MaLR -229 138 83 4 146 3319 151 184 18 chr15 77200842 77201563 -26293411 + RMER21B LTR ERV1 1 841 -1 4 1174 3227 199 96 83 chr15 77201564 77202585 -26292389 + RodERV21-int LTR ERV1 5 1040 -3951 4 1174 3227 199 96 83 chr15 77202718 77202764 -26292210 + RodERV21-int LTR ERV1 1041 1085 -3906 4 1174 14110 188 39 37 chr15 77203101 77203159 -26291815 + RodERV21-int LTR ERV1 1988 2044 -2947 4 1174 14110 188 39 37 chr15 77203354 77203823 -26291151 + RodERV21-int LTR ERV1 2045 2506 -2485 4 1174 2192 131 312 6 chr15 77203823 77204291 -26290683 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 1174 14110 188 39 37 chr15 77204291 77206517 -26288457 + RodERV21-int LTR ERV1 2507 4759 -232 4 1174 14110 188 39 37 chr15 77206874 77206933 -26288041 + RodERV21-int LTR ERV1 4760 4807 -184 4 1174 444 244 7 64 chr15 77207111 77207251 -26287723 + RLTR6-int LTR ERV1 2203 2334 -5444 4 1174 1774 299 88 59 chr15 77207292 77208540 -26286434 + MuRRS4-int LTR ERV1 2929 4450 -3156 4 1174 383 274 8 17 chr15 77208697 77208816 -26286158 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 5493 5610 -1991 4 1174 454 281 6 63 chr15 77209060 77209235 -26285739 + MURVY-int LTR ERV1 6986 7150 -302 4 1174 1386 199 193 46 chr15 77209455 77209844 -26285130 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 4 1174 368 229 0 12 chr15 77209844 77209928 -26285046 + MuRRS4-int LTR ERV1 4804 4886 -105 4 1174 264 250 0 26 chr15 77209931 77210009 -26284965 + RMER4B LTR ERVK 378 453 -132 4 1174 3915 154 113 18 chr15 77210034 77210801 -26284173 + RMER21B LTR ERV1 1 840 -2 4 1174 2620 47 100 3 chr15 77210828 77211189 -26283785 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1174 839 220 131 18 chr15 77212025 77212421 -26282553 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 479 -99 4 1174 830 228 211 8 chr15 77212463 77212534 -26282440 + RLTR20A2 LTR ERVK 447 568 -10 4 1174 1159 233 215 51 chr15 77212524 77212873 -26282101 + RMER17B LTR ERVK 534 958 0 4 1174 2493 48 130 3 chr15 77214545 77214900 -26280074 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1174 305 289 157 69 chr15 77221852 77222157 -26272817 + MER31B LTR ERV1 1 332 -134 4 1174 293 252 161 54 chr15 77222890 77223020 -26271954 - MLT1B LTR MaLR -246 144 1 4 1174 313 333 46 40 chr15 77224318 77224493 -26270481 + MLT1B LTR MaLR 215 390 0 4 1174 442 271 53 30 chr15 77226862 77226995 -26267979 - RMER10B LTR ERVL -68 330 195 4 1174 423 256 14 101 chr15 77227227 77227366 -26267608 + MT2B LTR ERVL 138 264 -337 4 1174 1743 157 36 3 chr15 77227436 77227737 -26267237 - ORR1C1 LTR MaLR -60 318 3 4 1174 974 244 44 105 chr15 77229256 77229600 -26265374 - MT2B LTR ERVL 0 601 279 4 1174 762 235 16 16 chr15 77232838 77233020 -26261954 + RMER5 LTR ERV1 38 219 -315 4 1174 1201 269 31 9 chr15 77233516 77233842 -26261132 + RMER5 LTR ERV1 202 534 0 4 1174 1319 131 102 11 chr15 77236519 77236798 -26258176 - MTB_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1174 2486 165 59 20 chr15 77239719 77240226 -26254748 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 4 1174 255 311 72 29 chr15 77245413 77245552 -26249422 + LTR16E2 LTR ERVL 322 466 -102 5 1174 5342 201 73 83 chr15 77250512 77250961 -26244013 - RLTR21 LTR ERVK -136 1436 1005 5 1174 5342 191 79 81 chr15 77251098 77251762 -26243212 - RLTR21 LTR ERVK -568 1004 407 5 1174 5342 191 79 81 chr15 77251953 77252340 -26242634 - RLTR21 LTR ERVK -1166 406 2 5 1174 259 302 61 81 chr15 77252579 77252839 -26242135 - RLTR41 LTR ERV1 -27 480 194 5 1174 240 240 152 71 chr15 77254789 77254901 -26240073 - MLT1B LTR MaLR -246 144 24 5 1174 302 329 121 49 chr15 77256136 77256538 -26238436 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 5 1174 1761 152 26 109 chr15 77257522 77257899 -26237075 + ORR1B1 LTR MaLR 41 386 -8 5 1174 2021 162 33 6 chr15 77258581 77258947 -26236027 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 3 5 1174 4335 20 10 2 chr15 77260847 77261336 -26233638 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1174 305 0 0 0 chr15 77261336 77261374 -26233600 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 5 1174 364 125 26 53 chr15 77261374 77261450 -26233524 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 567 5 1174 45697 18 8 0 chr15 77261450 77266779 -26228195 - MERVL-int LTR ERVL -114 5371 1 5 1174 4322 22 10 2 chr15 77266779 77267268 -26227706 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 5 1174 2020 98 6 78 chr15 77268237 77268506 -26226468 + ORR1A2 LTR MaLR 1 258 -69 5 1174 5009 130 17 5 chr15 77268653 77269496 -26225478 + ORR1A2-int LTR MaLR 259 1104 -688 5 1174 3513 78 39 0 chr15 77269797 77270261 -26224713 + LTRIS_Mm LTR ERV1 1 482 0 5 1174 3368 59 84 5 chr15 77270433 77270873 -26224101 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 1174 1493 283 55 13 chr15 77270998 77271474 -26223500 + RMER5 LTR ERV1 38 533 -1 5 1174 440 196 91 43 chr15 77271894 77271905 -26223069 + RLTR42-int LTR ERVK 1946 1956 -3566 5 1174 440 196 91 43 chr15 77272057 77272232 -26222742 + RLTR42-int LTR ERVK 1957 2140 -3382 5 1174 330 242 197 55 chr15 77272210 77272520 -26222454 + RLTR42-int LTR ERVK 2329 2682 -3455 5 1174 344 165 10 99 chr15 77272744 77272845 -26222129 + RLTR42-int LTR ERVK 2946 3037 -3100 5 1174 3675 103 7 22 chr15 77273342 77273927 -26221047 - RLTR19-int LTR ERVK -4133 2004 1429 5 1174 3033 118 38 30 chr15 77276528 77276999 -26217975 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 1174 758 162 168 32 chr15 77277578 77277763 -26217211 + RMER17C LTR ERVK 201 410 0 5 1174 979 139 6 0 chr15 77278339 77278504 -26216470 + RLTR14 LTR ERV1 3 168 -214 5 1174 628 75 0 11 chr15 77278630 77278724 -26216250 - RMER16 LTR ERVK 0 533 441 5 1174 479 250 50 31 chr15 77278896 77279057 -26215917 - MMVL30-int LTR ERV1 -2 7776 7613 5 1174 3870 246 36 35 chr15 77279043 77281082 -26213892 - MMVL30-int LTR ERV1 -2386 5392 1613 5 1174 482 222 21 49 chr15 77287213 77287355 -26207619 - MMVL30-int LTR ERV1 -2068 1630 1493 5 1174 593 324 24 27 chr15 77287339 77287669 -26207305 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3321 1742 1414 5 1174 260 257 81 120 chr15 77287732 77288015 -26206959 + RMER16-int LTR ERVK 47 318 -2996 5 1174 16394 181 82 62 chr15 77288146 77290630 -26204344 + RMER16-int LTR ERVK 255 3567 -3839 5 1174 16394 102 48 27 chr15 77290810 77292488 -26202486 + RMER16-int LTR ERVK 2489 4182 -1224 5 1174 320 226 50 70 chr15 77292501 77292601 -26202373 + ETnERV2-int LTR ERVK 6108 6205 -1201 5 1174 570 244 178 72 chr15 77293255 77293586 -26201388 + RLTR9A LTR ERVK 3 368 0 5 1174 2959 61 199 12 chr15 77293817 77294248 -26200726 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 5 1174 734 304 34 30 chr15 77297543 77297808 -26197166 - RMER15 LTR ERVL 0 575 310 5 1174 548 117 188 0 chr15 77298912 77299040 -26195934 + ORR1B1 LTR MaLR 1 152 -242 5 1174 688 262 73 21 chr15 77299038 77299272 -26195702 + RMER12 LTR ERVK 973 1218 -104 5 1174 511 259 7 41 chr15 77299340 77299485 -26195489 + RLTR12B LTR ERVK 121 260 -268 5 1174 4292 153 53 44 chr15 77299487 77300369 -26194605 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 5 1174 1956 153 32 5 chr15 77301905 77302510 -26192464 - RLTR33 LTR ERVK -15 663 1 5 1174 1568 175 19 40 chr15 77302982 77303352 -26191622 - RMER10A LTR ERVL 0 442 81 5 1174 935 313 41 31 chr15 77303517 77304005 -26190969 + RLTR6-int LTR ERV1 7158 7650 -128 5 1174 4216 128 65 18 chr15 77304405 77305259 -26189715 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1 5 1174 338 49 213 0 chr15 77305724 77305785 -26189189 - MT2B LTR ERVL -527 74 1 5 1174 364 169 289 0 chr15 77306037 77306120 -26188854 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 922 5 1174 266 286 62 9 chr15 77306124 77306237 -26188737 - RLTR25B LTR ERVK -252 776 658 5 1174 373 215 301 38 chr15 77306618 77306832 -26188142 - RLTR40 LTR ERVK -83 734 465 5 1174 754 189 73 6 chr15 77306834 77306999 -26187975 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 209 5 1174 1419 168 5 112 chr15 77308598 77309018 -26185956 - RMER17C LTR ERVK 0 410 36 5 1174 3218 71 19 15 chr15 77309018 77309441 -26185533 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 50 5 1174 3457 38 2 0 chr15 77309441 77309836 -26185138 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1174 3218 71 19 15 chr15 77309836 77309885 -26185089 - MT2C_Mm LTR ERVL -426 49 1 5 1174 242 125 0 0 chr15 77309885 77309925 -26185049 - RMER17C LTR ERVK -370 40 1 5 1174 307 302 14 72 chr15 77311864 77312003 -26182971 + ORR1D2 LTR MaLR 11 141 -229 5 1174 1666 129 31 37 chr15 77312414 77312457 -26182517 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 287 5 1174 1666 129 31 37 chr15 77312650 77312929 -26182045 - ORR1A4 LTR MaLR -43 286 1 5 1174 1187 310 59 50 chr15 77312984 77313728 -26181246 + ORR1D-int LTR MaLR 60 810 -560 5 1174 3177 56 8 2 chr15 77317725 77318119 -26176855 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1174 443 200 46 39 chr15 77322903 77323033 -26171941 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 898 6 1174 342 265 12 0 chr15 77323171 77323254 -26171720 - MT2B LTR ERVL -316 285 202 6 1174 1845 214 88 55 chr15 77323227 77323794 -26171180 - RLTR25B LTR ERVK -431 597 12 6 1174 2704 166 31 10 chr15 77326770 77327281 -26167693 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 3 6 1175 620 272 73 85 chr15 77335352 77335518 -26159456 + RLTR40 LTR ERVK 300 462 -355 6 1175 1478 211 65 24 chr15 77335518 77335686 -26159288 + ORR1C2 LTR MaLR 1 171 -213 6 1175 1478 211 65 24 chr15 77335752 77335952 -26159022 + ORR1C2 LTR MaLR 172 383 -1 6 1175 620 272 73 85 chr15 77335952 77336114 -26158860 + RLTR40 LTR ERVK 463 624 -193 6 1175 1741 176 115 16 chr15 77337323 77337688 -26157286 + MTD LTR MaLR 6 406 -13 6 1175 1788 162 37 34 chr15 77339820 77340229 -26154745 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 1175 465 323 71 0 chr15 77341567 77341722 -26153252 + ORR1E LTR MaLR 4 169 -190 6 1175 2051 118 16 6 chr15 77342094 77342409 -26152565 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 6 1175 391 191 0 0 chr15 77342458 77342535 -26152439 + ORR1E-int LTR MaLR 61 151 -1429 6 1175 227 342 109 24 chr15 77342817 77342982 -26151992 - MLT1C LTR MaLR -287 180 2 6 1175 225 339 89 24 chr15 77345944 77346113 -26148861 - MER31B LTR ERV1 -76 390 211 6 1175 2141 194 56 46 chr15 77351253 77351754 -26143220 + RMER20A LTR ERVK 11 516 0 6 1175 1617 222 60 74 chr15 77352086 77352616 -26142358 + RLTR11A LTR ERVK 6 528 0 6 1175 287 288 121 71 chr15 77354805 77355040 -26139934 - MLT1B LTR MaLR -114 334 114 6 1175 367 266 164 75 chr15 77358073 77358378 -26136596 + MER31B LTR ERV1 1 332 -134 6 1175 313 225 173 55 chr15 77358947 77359074 -26135900 - MLT1B LTR MaLR -248 142 1 6 1175 826 209 96 199 chr15 77359679 77360116 -26134858 + RLTR11B LTR ERVK 4 392 -61 6 1175 826 209 96 199 chr15 77360142 77360181 -26134793 + RLTR11B LTR ERVK 393 431 -22 6 1175 1722 209 18 3 chr15 77364236 77364572 -26130402 + RLTR14 LTR ERV1 7 347 -35 6 1175 2032 148 9 3 chr15 77364572 77364897 -26130077 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 6 1175 4372 77 33 2 chr15 77364910 77365479 -26129495 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 6 1175 10075 147 62 59 chr15 77365479 77367430 -26127544 + ORR1A4-int LTR MaLR 8 1963 0 6 1175 1970 141 16 0 chr15 77367430 77367742 -26127232 + ORR1A4 LTR MaLR 1 317 -12 6 1175 5526 257 91 83 chr15 77367801 77370320 -26124654 + RLTR14-int LTR ERV1 69 2607 -2710 6 1175 360 125 0 59 chr15 77370576 77370644 -26124330 + RLTR14-int LTR ERV1 2645 2708 -2609 6 1175 3979 131 22 59 chr15 77374657 77375437 -26119537 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 6 1175 448 302 35 76 chr15 77375931 77376128 -26118846 + RMER13A LTR ERVK 497 685 -175 6 1175 458 285 75 56 chr15 77376228 77376388 -26118586 + RMER13A LTR ERVK 698 860 0 6 1175 382 319 160 76 chr15 77376414 77376662 -26118312 - RMER12 LTR ERVK -396 1008 770 6 1175 1599 250 79 36 chr15 77376854 77377351 -26117623 - RMER12 LTR ERVK -635 769 59 6 1175 1599 172 33 7 chr15 77377382 77377445 -26117529 - RMER12 LTR ERVK -1258 64 2 6 1175 995 182 2 19 chr15 77377587 77377799 -26117175 + RLTR19-int LTR ERVK 3024 3193 -2944 6 1175 2381 226 34 39 chr15 77377815 77378405 -26116569 + RLTR19-int LTR ERVK 3795 4381 -1756 6 1175 430 271 45 66 chr15 77379717 77379992 -26114982 + RMER12B LTR ERVK 402 653 -1195 6 1175 368 288 97 108 chr15 77386386 77386756 -26108218 + RMER12B LTR ERVK 868 1233 -171 6 1175 2302 154 16 35 chr15 77387294 77387745 -26107229 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 6 1175 265 198 69 59 chr15 77388129 77388231 -26106743 + RLTR25B LTR ERVK 397 499 -529 6 1175 383 308 155 16 chr15 77393873 77394232 -26100742 + MLT1E3 LTR MaLR 124 553 -101 6 1175 616 226 136 51 chr15 77395422 77395599 -26099375 - MTEb LTR MaLR -161 218 27 7 1175 1253 195 4 8 chr15 77397479 77397717 -26097257 - RLTR19C LTR ERVK -269 237 1 7 1175 2384 112 68 28 chr15 77399888 77400283 -26094691 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 7 1175 467 126 47 72 chr15 77400285 77400443 -26094531 + IAPEz-int LTR ERVK 3 123 -6358 7 1175 255 244 0 0 chr15 77400443 77400488 -26094486 + RLTR27 LTR ERVK 231 275 -34 7 1175 3974 53 2 18 chr15 77400489 77400991 -26093983 + IAPEz-int LTR ERVK 169 662 -5819 7 1175 2193 90 0 0 chr15 77400991 77401269 -26093705 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 7 1175 6268 35 3 19 chr15 77401268 77402024 -26092950 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 7 1175 2345 115 68 28 chr15 77402026 77402421 -26092553 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 7 1175 230 174 13 104 chr15 77408169 77408246 -26086728 + RLTR25B LTR ERVK 427 496 -532 7 1175 715 237 196 72 chr15 77408414 77408652 -26086322 - RLTR40 LTR ERVK -64 753 463 7 1175 1448 191 95 20 chr15 77408652 77408837 -26086137 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 165 7 1175 1448 191 95 20 chr15 77408884 77409045 -26085929 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 2 7 1175 715 237 196 72 chr15 77409045 77409210 -26085764 - RLTR40 LTR ERVK -355 462 300 7 1175 2722 175 25 10 chr15 77410726 77411240 -26083734 + RLTR28 LTR ERVL 3 524 0 7 1175 2216 158 37 30 chr15 77414134 77414564 -26080410 + RLTR25B LTR ERVK 9 437 -666 7 1175 2193 197 36 52 chr15 77414601 77414673 -26080301 + RLTR25B LTR ERVK 438 503 -600 7 1175 1535 312 52 55 chr15 77420755 77421518 -26073456 - ORR1E-int LTR MaLR -551 819 59 7 1175 1393 107 47 89 chr15 77421578 77421835 -26073139 + ORR1A4 LTR MaLR 21 266 -63 7 1175 231 372 10 0 chr15 77421944 77422046 -26072928 - ORR1E LTR MaLR -110 249 147 7 1175 505 270 52 13 chr15 77422216 77422367 -26072607 - ORR1E LTR MaLR -193 166 10 7 1175 1802 157 7 106 chr15 77424406 77424446 -26070528 + RMER17C LTR ERVK 1 40 -370 7 1175 3411 78 2 83 chr15 77424446 77424963 -26070011 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 7 1175 1802 157 7 106 chr15 77424963 77425377 -26069597 + RMER17C LTR ERVK 41 410 0 7 1175 242 268 28 14 chr15 77427088 77427160 -26067814 + MT2A LTR ERVL 51 123 -478 7 1175 327 178 10 126 chr15 77427253 77427356 -26067618 + MT2A LTR ERVL 153 243 -290 7 1175 502 216 55 23 chr15 77428751 77428879 -26066095 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 299 7 1175 232 213 61 76 chr15 77429100 77429166 -26065808 - RLTR23 LTR ERV1 -311 119 55 7 1175 265 198 69 59 chr15 77433728 77433830 -26061144 - RLTR25B LTR ERVK -529 499 397 7 1175 2211 160 22 38 chr15 77434217 77434666 -26060308 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 7 1175 589 284 225 70 chr15 77435217 77435830 -26059144 - RMER12B LTR ERVK -182 1222 515 7 1175 3450 23 15 0 chr15 77437081 77437471 -26057503 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1175 2386 216 45 39 chr15 77437523 77438107 -26056867 - RLTR19-int LTR ERVK -1756 4381 3795 7 1175 543 249 91 33 chr15 77438136 77438340 -26056634 - RLTR19-int LTR ERVK -2947 3190 3020 7 1175 1646 252 31 87 chr15 77438474 77439241 -26055733 + RMER12 LTR ERVK 1 700 -1148 7 1175 497 316 75 58 chr15 77439268 77439713 -26055261 - RMER13A LTR ERVK 0 860 508 7 1175 2492 164 32 67 chr15 77440227 77440857 -26054117 - RMER17A LTR ERVK 0 751 154 7 1175 5157 260 83 77 chr15 77442689 77445313 -26049661 - RLTR14-int LTR ERV1 -2609 2708 69 7 1175 1967 141 16 0 chr15 77445372 77445684 -26049290 - ORR1A4 LTR MaLR -12 317 1 7 1175 10085 152 56 62 chr15 77445684 77447646 -26047328 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1963 12 7 1175 4314 108 3 2 chr15 77447646 77448232 -26046742 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 7 1175 10085 152 56 62 chr15 77448232 77448243 -26046731 - ORR1A4-int LTR MaLR -1952 11 1 7 1175 2209 138 0 0 chr15 77448245 77448572 -26046402 - ORR1A4 LTR MaLR -2 327 1 7 1175 1805 186 21 3 chr15 77448572 77448907 -26046067 - RLTR14 LTR ERV1 -35 347 7 7 1175 760 271 50 147 chr15 77452934 77452973 -26042001 - RLTR11B LTR ERVK -22 431 393 7 1175 760 271 50 147 chr15 77452999 77453422 -26041552 - RLTR11B LTR ERVK -61 392 14 7 1175 300 225 168 84 chr15 77453984 77454115 -26040859 + MLT1B LTR MaLR 1 142 -248 7 1175 379 290 190 68 chr15 77454581 77454992 -26039982 - MER31B LTR ERV1 -5 461 1 8 1175 291 322 75 66 chr15 77458093 77458306 -26036668 + MLT1B LTR MaLR 97 311 -133 7 1175 1466 235 83 68 chr15 77460514 77461029 -26033945 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 6 8 1175 2126 199 56 46 chr15 77461361 77461862 -26033112 - RMER20A LTR ERVK 0 516 11 8 1176 277 298 170 30 chr15 77466929 77467164 -26027810 + MER31B LTR ERV1 194 461 -5 8 1176 396 272 0 0 chr15 77469850 77469948 -26025026 - ORR1E-int LTR MaLR -1429 151 61 8 1176 2039 121 16 6 chr15 77469997 77470312 -26024662 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 8 1176 495 307 40 0 chr15 77470695 77470845 -26024129 - ORR1E LTR MaLR -200 159 4 8 1176 1861 159 37 34 chr15 77472181 77472590 -26022384 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 8 1176 1705 187 115 16 chr15 77474732 77475097 -26019877 - MTD LTR MaLR -13 406 6 8 1176 641 275 59 70 chr15 77476282 77476499 -26018475 - RLTR40 LTR ERVK -64 753 463 8 1176 1501 214 65 24 chr15 77476499 77476699 -26018275 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 173 8 1176 1501 214 65 24 chr15 77476781 77476949 -26018025 - ORR1C2 LTR MaLR -212 172 2 8 1176 641 268 70 88 chr15 77476949 77477115 -26017859 - RLTR40 LTR ERVK -355 462 300 8 1176 2698 172 31 10 chr15 77478750 77479261 -26015713 + RLTR28 LTR ERVL 3 524 0 8 1176 2046 214 72 49 chr15 77482231 77482843 -26012131 + RLTR25B LTR ERVK 12 597 -431 8 1176 375 265 12 0 chr15 77482775 77482858 -26012116 + MT2B LTR ERVL 202 285 -316 8 1176 500 200 46 39 chr15 77482996 77483126 -26011848 + RLTR25B LTR ERVK 898 1028 0 8 1176 3275 82 13 11 chr15 77487878 77487906 -26007068 + MT2C_Mm LTR ERVL 20 44 -431 8 1176 3548 20 2 2 chr15 77487906 77488302 -26006672 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 8 1176 3275 82 13 11 chr15 77488302 77488728 -26006246 + MT2C_Mm LTR ERVL 45 475 0 8 1176 1601 159 10 95 chr15 77488728 77489138 -26005836 + RMER17C LTR ERVK 36 410 0 8 1176 873 188 82 11 chr15 77490763 77490946 -26004028 + ORR1C2 LTR MaLR 189 384 0 8 1176 459 219 299 37 chr15 77490948 77491162 -26003812 + RLTR40 LTR ERVK 465 734 -83 8 1176 337 261 83 8 chr15 77491555 77491675 -26003299 + RLTR25B LTR ERVK 658 786 -242 8 1176 398 132 289 0 chr15 77491671 77491754 -26003220 + RLTR25A LTR ERVK 997 1103 0 8 1176 357 66 213 0 chr15 77492006 77492067 -26002907 + MT2B LTR ERVL 1 74 -527 8 1176 4489 128 65 20 chr15 77492529 77493385 -26001589 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 8 1176 815 324 37 29 chr15 77493784 77494273 -26000701 - RLTR6-int LTR ERV1 -128 7650 7158 8 1176 1698 163 16 40 chr15 77494438 77494809 -26000165 + RMER10A LTR ERVL 81 442 0 8 1176 2141 154 32 5 chr15 77495281 77495886 -25999088 + RLTR33 LTR ERVK 1 663 -15 8 1176 263 263 100 10 chr15 77495994 77496094 -25998880 - RMER10A LTR ERVL -13 429 321 8 1176 4671 153 56 48 chr15 77497421 77498316 -25996658 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 8 1176 534 259 7 59 chr15 77498318 77498470 -25996504 - RLTR12B LTR ERVK -268 260 117 8 1176 803 240 69 34 chr15 77498534 77498767 -25996207 - RMER12 LTR ERVK -104 1218 978 8 1176 650 105 174 20 chr15 77498766 77498913 -25996061 - ORR1B1 LTR MaLR -242 152 1 8 1176 660 316 35 31 chr15 77500003 77500264 -25994710 + RMER15 LTR ERVL 314 575 0 1 1176 502 263 175 70 chr15 77504439 77504770 -25990204 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 3 6 1176 304 255 40 69 chr15 77505420 77505521 -25989453 - ETnERV2-int LTR ERVK -1201 6205 6108 8 1176 16473 104 40 35 chr15 77505535 77507256 -25987718 - RMER16-int LTR ERVK -1224 4182 2489 9 1176 16473 184 73 70 chr15 77507402 77509864 -25985110 - RMER16-int LTR ERVK -3864 3542 1059 9 1176 577 330 25 21 chr15 77510392 77510717 -25984257 + MuRRS4-int LTR ERV1 1417 1742 -3321 1 1176 465 230 21 49 chr15 77510701 77510843 -25984131 + MMVL30-int LTR ERV1 1493 1630 -2068 1 1176 297 268 61 76 chr15 77514300 77514498 -25980476 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 126 1 1176 40466 189 21 4 chr15 77514627 77521940 -25973034 - IAPEY3-int LTR ERVK 0 7680 246 1 1176 266 191 60 60 chr15 77521925 77521992 -25972982 - IAPLTR3-int LTR ERVK -6375 446 380 1 1176 310 273 61 76 chr15 77522277 77522475 -25972499 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 126 1 1176 3789 246 35 33 chr15 77525016 77527050 -25967924 + MMVL30-int LTR ERV1 2876 5392 -2386 1 1176 501 244 50 31 chr15 77527036 77527197 -25967777 + MMVL30-int LTR ERV1 7613 7776 -2 1 1176 266 303 59 33 chr15 77527381 77527612 -25967362 + RLTR41 LTR ERV1 186 457 -50 1 1176 391 136 0 0 chr15 77527630 77527696 -25967278 - RLTR14 LTR ERV1 -162 220 155 2 1176 1479 199 114 40 chr15 77527767 77528169 -25966805 + RMER16 LTR ERVK 1 432 -101 2 1176 291 279 65 16 chr15 77528180 77528304 -25966670 + RLTR6-int LTR ERV1 7647 7776 -2 2 1176 655 75 0 0 chr15 77528476 77528569 -25966405 + RMER16 LTR ERVK 441 533 0 2 1176 979 139 6 0 chr15 77528699 77528864 -25966110 - RLTR14 LTR ERV1 -214 168 3 2 1176 667 178 117 33 chr15 77529445 77529625 -25965349 - RMER17C LTR ERVK 0 410 216 2 1176 3028 116 38 30 chr15 77530206 77530677 -25964297 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 2 1176 3820 107 7 22 chr15 77533264 77533849 -25961125 + RLTR19-int LTR ERVK 1429 2004 -4133 3 1176 311 172 52 103 chr15 77534346 77534443 -25960531 - RLTR42-int LTR ERVK -3100 3037 2946 3 1176 374 252 192 58 chr15 77534667 77534979 -25959995 - RLTR42-int LTR ERVK -3455 2682 2329 3 1176 462 192 102 53 chr15 77534957 77535132 -25959842 - RLTR42-int LTR ERVK -3381 2141 1958 3 1176 462 192 102 53 chr15 77535318 77535329 -25959645 - RLTR42-int LTR ERVK -3565 1957 1947 3 1176 1341 281 55 13 chr15 77535749 77536225 -25958749 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 38 3 1176 3371 59 84 5 chr15 77536350 77536790 -25958184 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 3 1176 4575 48 48 0 chr15 77536962 77537522 -25957452 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 3 1176 4520 136 17 6 chr15 77537818 77538666 -25956308 - ORR1A2-int LTR MaLR -688 1104 259 3 1176 1859 95 6 92 chr15 77538813 77539082 -25955892 - ORR1A2 LTR MaLR -69 258 1 3 1176 1896 176 33 6 chr15 77541977 77542343 -25952631 + ORR1C1 LTR MaLR 3 378 0 4 1176 1582 158 26 109 chr15 77543026 77543403 -25951571 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 4 1176 4783 189 68 102 chr15 77550016 77550403 -25944571 + RLTR21 LTR ERVK 1 411 -1161 5 1176 4783 189 68 102 chr15 77550594 77551279 -25943695 + RLTR21 LTR ERVK 412 1004 -568 5 1176 4783 200 61 102 chr15 77551416 77551891 -25943083 + RLTR21 LTR ERVK 1005 1436 -136 5 1176 2439 169 59 20 chr15 77560798 77561305 -25933669 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 6 1176 1236 122 83 9 chr15 77564244 77564460 -25930514 + MTB_Mm LTR MaLR 1 232 -175 6 1176 407 149 0 0 chr15 77564456 77564523 -25930451 + MTB_Mm LTR MaLR 334 400 0 6 1176 1130 263 30 24 chr15 77567188 77567519 -25927455 - RMER5 LTR ERV1 0 534 202 7 1176 750 209 28 28 chr15 77568204 77568386 -25926588 - RMER5 LTR ERV1 -315 219 38 7 1176 905 232 79 46 chr15 77571104 77571449 -25923525 + MT2B LTR ERVL 94 601 0 7 1176 1625 149 6 20 chr15 77572464 77572732 -25922242 + RLTR22_Mus LTR ERVK 28 285 -1563 7 1176 653 36 0 0 chr15 77572732 77572816 -25922158 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 392 7 1176 1370 77 14 0 chr15 77572815 77573022 -25921952 - MTA_Mm-int LTR MaLR -888 210 1 8 1176 3254 34 48 0 chr15 77573022 77573400 -25921574 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1176 10739 54 19 19 chr15 77573400 77574398 -25920576 + RLTR22_Mus LTR ERVK 289 1282 -526 8 1176 10739 54 19 19 chr15 77574469 77574986 -25919988 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1283 1803 -5 8 1176 670 275 6 18 chr15 77574996 77575166 -25919808 + RMER20A LTR ERVK 349 516 0 8 1176 1000 147 65 12 chr15 77576400 77576604 -25918370 - ORR1C1 LTR MaLR -7 387 176 8 1176 993 234 228 67 chr15 77576865 77577300 -25917674 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 8 1176 3093 155 32 6 chr15 77578131 77578630 -25916344 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 1 8 1176 6066 48 67 13 chr15 77589183 77589948 -25905026 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 806 0 1 1177 247 269 199 26 chr15 77605754 77605945 -25889029 + ORR1D2 LTR MaLR 5 228 -142 1 1177 1285 208 88 43 chr15 77608998 77609349 -25885625 + MTEa LTR MaLR 13 379 0 1 1177 811 251 148 33 chr15 77611094 77611393 -25883581 + ORR1D2 LTR MaLR 35 372 -2 1 1177 1487 168 138 53 chr15 77656084 77656462 -25838512 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 1177 1475 182 60 33 chr15 77664322 77664657 -25830317 + MTD LTR MaLR 66 409 -10 1 1177 358 257 0 96 chr15 77680589 77680714 -25814260 + MT2B LTR ERVL 152 264 -337 2 1177 3406 45 28 0 chr15 77683566 77683990 -25810984 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 2 1177 2191 101 3 12 chr15 77689151 77689481 -25805493 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 2 1177 295 345 14 89 chr15 77692504 77692717 -25802257 - MT2B2 LTR ERVL -320 264 68 2 1177 1299 216 54 113 chr15 77693878 77693990 -25800984 - MTD LTR MaLR -1 418 300 2 1177 1299 216 54 113 chr15 77694137 77694468 -25800506 - MTD LTR MaLR -120 299 1 2 1177 3370 20 2 0 chr15 77699443 77699838 -25795136 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1177 8538 53 1 2 chr15 77699838 77700936 -25794038 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1097 -1 2 1177 3270 25 2 37 chr15 77700937 77701304 -25793670 + MTA_Mm LTR MaLR 1 367 -29 2 1177 3270 25 2 37 chr15 77701495 77701537 -25793437 + MTA_Mm LTR MaLR 368 396 0 2 1177 397 207 11 203 chr15 77703225 77703279 -25791695 - MTE2b LTR MaLR -2 377 330 3 1177 397 207 11 203 chr15 77703449 77703573 -25791401 - MTE2b LTR MaLR -50 329 231 3 1177 2052 91 14 102 chr15 77703628 77703858 -25791116 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 108 3 1177 2052 91 14 102 chr15 77704008 77704131 -25790843 - ORR1A2 LTR MaLR -220 107 5 3 1177 298 306 90 122 chr15 77708009 77708268 -25786706 + MLT1E LTR MaLR 210 588 -65 3 1177 3346 15 8 0 chr15 77708268 77708661 -25786313 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1177 298 300 56 155 chr15 77708661 77708714 -25786260 + MLT1E LTR MaLR 589 638 -15 3 1177 370 341 36 41 chr15 77708838 77709058 -25785916 + MLT1K LTR MaLR 20 238 -357 3 1177 635 176 249 17 chr15 77709383 77709556 -25785418 - ORR1A4 LTR MaLR -3 416 204 3 1177 1120 128 98 0 chr15 77711990 77712194 -25782780 - ORR1A4 LTR MaLR -105 224 1 3 1177 230 277 48 12 chr15 77714614 77714698 -25780276 - MLT1D LTR MaLR -366 139 53 3 1177 915 206 0 88 chr15 77715049 77715310 -25779664 - RMER17C LTR ERVK -17 393 156 3 1177 894 295 56 61 chr15 77722509 77722646 -25772328 + MLT1A LTR MaLR 1 138 -236 3 1177 894 295 56 61 chr15 77722827 77723065 -25771909 + MLT1A LTR MaLR 139 374 0 3 147 2213 112 51 14 chr15 77725636 77725990 -25768984 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 1178 53587 30 7 2 chr15 77725994 77732433 -25762541 - IAPEz-int LTR ERVK -3 6478 8 3 1178 2213 112 51 14 chr15 77732433 77732787 -25762187 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 3 1178 236 340 0 109 chr15 77733031 77733150 -25761824 - MT2B2 LTR ERVL -325 259 154 3 1178 509 308 19 6 chr15 77738845 77739002 -25755972 + MLT1B LTR MaLR 12 170 -220 3 1178 328 209 42 95 chr15 77740087 77740182 -25754792 + MT2B LTR ERVL 168 257 -344 3 1178 275 360 0 26 chr15 77740476 77740593 -25754381 + MLT1B LTR MaLR 164 277 -113 3 1178 374 279 84 15 chr15 77755373 77755504 -25739470 + MTE2a LTR MaLR 45 184 -195 4 1178 654 214 167 11 chr15 77755657 77755837 -25739137 + MTE2a LTR MaLR 172 379 0 4 1178 2628 189 12 24 chr15 77761280 77761783 -25733191 - RLTR18B LTR ERVK -15 497 1 4 1178 815 248 66 26 chr15 77767103 77767331 -25727643 + MTEa LTR MaLR 82 318 -61 4 1178 2343 203 89 151 chr15 77768060 77768562 -25726412 + RLTR40 LTR ERVK 1 554 -263 4 1178 2343 203 89 151 chr15 77768709 77769060 -25725914 + RLTR40 LTR ERVK 555 801 -16 4 1178 2496 150 5 0 chr15 77769170 77769549 -25725425 - RLTR14 LTR ERV1 -1 381 1 4 1178 271 218 0 0 chr15 77774044 77774099 -25720875 + MTC LTR MaLR 2 56 -365 4 1178 1167 215 135 29 chr15 77774400 77774749 -25720225 + MTC LTR MaLR 36 421 0 4 1178 445 321 138 18 chr15 77791081 77791357 -25703617 + MLT1E3 LTR MaLR 348 656 -24 5 1178 430 295 62 52 chr15 77806522 77806733 -25688241 + RMER15 LTR ERVL 363 575 0 5 1178 268 291 29 93 chr15 77806972 77807112 -25687862 - MLT1G LTR MaLR -10 479 349 5 1178 274 293 213 37 chr15 77807196 77807384 -25687590 - MLT1G LTR MaLR -310 281 61 5 1178 1222 276 55 30 chr15 77807391 77807570 -25687404 + MTE2a LTR MaLR 2 194 -185 5 1178 3169 17 0 0 chr15 77807570 77807916 -25687058 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 5 1178 1222 276 55 30 chr15 77807916 77808102 -25686872 + MTE2a LTR MaLR 195 375 -4 5 1178 504 284 150 23 chr15 77808343 77808563 -25686411 + MTE2b LTR MaLR 1 248 -131 5 1178 1233 216 115 58 chr15 77838547 77838628 -25656346 + MTE2b LTR MaLR 1 83 -296 6 1178 1233 216 115 58 chr15 77838773 77839039 -25655935 + MTE2b LTR MaLR 84 368 -11 6 1178 1926 169 14 6 chr15 77840086 77840431 -25654543 + ORR1B1 LTR MaLR 47 394 0 6 1178 1844 130 69 12 chr15 77841193 77841528 -25653446 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 6 1178 350 294 3 62 chr15 77854349 77854510 -25640464 + MLT1J LTR MaLR 1 183 -329 6 1178 230 224 35 0 chr15 77856596 77856654 -25638320 + RMER15 LTR ERVL 1 60 -515 6 147 1957 196 146 15 chr15 77856682 77857163 -25637811 + RMER15 LTR ERVL 32 575 0 6 1179 2257 180 40 45 chr15 77868193 77868722 -25626252 + RLTR17 LTR ERVK 105 630 -62 6 1179 444 324 169 35 chr15 77883426 77883794 -25611180 + MLT1J1 LTR MaLR 24 440 -8 6 1179 2448 67 0 65 chr15 77885500 77885852 -25609122 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 7 1179 1115 253 141 6 chr15 77886090 77886424 -25608550 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 7 1179 363 200 29 156 chr15 77890428 77890626 -25604348 - ORR1D1 LTR MaLR -25 359 174 7 1179 509 232 138 7 chr15 77890681 77890698 -25604276 - ORR1D1 LTR MaLR -198 180 163 7 1179 529 183 160 8 chr15 77890874 77891008 -25603966 - ORR1D1 LTR MaLR -216 162 9 7 1179 2329 137 60 15 chr15 77898626 77899027 -25595947 - MTC LTR MaLR -2 419 1 7 1179 443 255 44 115 chr15 77917080 77917262 -25577712 + MTE2a LTR MaLR 9 177 -202 7 1179 334 202 31 59 chr15 77917556 77917663 -25577311 + MTE2a LTR MaLR 270 388 -31 7 1179 360 278 191 28 chr15 77917719 77917832 -25577142 - MLT2B3 LTR ERVL -345 209 73 7 1179 360 278 191 28 chr15 77917881 77917945 -25577029 - MLT2B3 LTR ERVL -482 72 3 7 1179 5361 141 124 32 chr15 77930723 77931836 -25563138 + RMER12 LTR ERVK 1 1215 -107 7 1179 1109 240 68 11 chr15 77931888 77932153 -25562821 + MTE2a LTR MaLR 98 377 -2 7 1179 286 343 166 13 chr15 77936336 77936649 -25558325 + MLT1D LTR MaLR 136 496 -9 8 1179 1022 254 94 29 chr15 77938417 77938725 -25556249 + MTE2b LTR MaLR 21 348 -31 8 1179 1237 224 63 49 chr15 77940949 77941297 -25553677 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 8 1179 565 309 71 110 chr15 77958076 77958440 -25536534 + MTEa LTR MaLR 1 350 -29 8 1179 1127 254 60 106 chr15 77974075 77974472 -25520502 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 8 1179 413 336 79 51 chr15 77978072 77978326 -25516648 - MLT1J2-int LTR MaLR -841 648 388 8 1179 365 302 72 26 chr15 77979119 77979313 -25515661 - MLT1J2 LTR MaLR -241 207 5 8 1180 1068 275 105 43 chr15 77997696 77998133 -25496841 + RMER4A LTR ERVK 3 466 0 8 1180 1155 255 82 9 chr15 78003115 78003432 -25491542 + MTEa LTR MaLR 39 378 -1 5 1180 288 233 0 0 chr15 78005544 78005604 -25489370 - MTEb LTR MaLR -17 362 303 6 1180 2622 64 3 3 chr15 78005765 78006092 -25488882 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1180 247 307 98 21 chr15 78006403 78006546 -25488428 + RMER15 LTR ERVL 384 537 -38 8 1180 380 326 24 82 chr15 78013163 78013370 -25481604 - MLT1C LTR MaLR -5 462 191 2 1180 257 326 83 43 chr15 78013875 78014151 -25480823 - RMER17C LTR ERVK -46 364 78 2 1180 1120 266 151 75 chr15 78016447 78016890 -25478084 + RLTR33 LTR ERVK 175 651 -27 2 1180 292 327 80 0 chr15 78017183 78017296 -25477678 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 244 3 1180 776 277 48 149 chr15 78017381 78017885 -25477089 - RLTR12B LTR ERVK -29 499 47 3 1180 1302 246 54 43 chr15 78021221 78021594 -25473380 + MTEa LTR MaLR 1 377 -2 3 1180 242 342 65 53 chr15 78037860 78038107 -25456867 - ORR1E LTR MaLR -20 339 90 5 1180 7089 149 9 31 chr15 78039526 78040665 -25454309 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 5 1180 425 392 56 13 chr15 78043311 78043616 -25451358 + MLT1B LTR MaLR 2 319 -71 6 1180 339 306 0 18 chr15 78044733 78044846 -25450128 - MLT1H2 LTR MaLR -10 479 369 7 1180 1582 187 105 14 chr15 78046567 78046930 -25448044 - MTD LTR MaLR -14 405 10 7 1180 245 271 0 125 chr15 78047236 78047316 -25447658 + RMER15 LTR ERVL 393 462 -113 7 1180 229 247 31 92 chr15 78050787 78050885 -25444089 + MLT1H-int LTR MaLR 524 615 -794 8 1180 618 242 19 57 chr15 78050897 78051055 -25443919 + MTEa LTR MaLR 1 152 -227 8 1180 249 247 99 0 chr15 78051258 78051339 -25443635 + MTEa LTR MaLR 279 367 -12 8 1180 439 341 186 22 chr15 78051807 78052119 -25442855 + MLT1H-int LTR MaLR 881 1243 -166 8 1180 1231 191 160 53 chr15 78053486 78053824 -25441150 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 1180 3130 41 36 46 chr15 78054771 78055182 -25439792 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 9 1180 932 215 0 46 chr15 78061812 78061928 -25433046 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 263 1 1180 1579 198 83 17 chr15 78061928 78062147 -25432827 + ORR1D1 LTR MaLR 2 242 -132 1 1180 1579 198 83 17 chr15 78062178 78062308 -25432666 + ORR1D1 LTR MaLR 243 373 -1 1 1180 932 224 14 48 chr15 78062308 78062437 -25432537 - ORR1D1 LTR MaLR -112 262 118 1 1180 4543 41 0 0 chr15 78063375 78063887 -25431087 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 1180 428 364 34 9 chr15 78064679 78064912 -25430062 + RMER5 LTR ERV1 296 534 0 1 1180 277 299 99 50 chr15 78068059 78068200 -25426774 + MLT1A0 LTR MaLR 214 361 -4 1 1180 2409 176 87 15 chr15 78068219 78068757 -25426217 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 1 1 1180 257 316 26 0 chr15 78079534 78079610 -25415364 - MLT1J LTR MaLR -324 188 111 1 1180 1679 190 98 3 chr15 78089129 78089389 -25405585 - MTD LTR MaLR -14 405 113 1 1180 1679 190 98 3 chr15 78089421 78089529 -25405445 - MTD LTR MaLR -307 112 3 1 1180 234 321 59 29 chr15 78089948 78090118 -25404856 - RLTR22_Mur LTR ERVK -387 1461 1287 1 1180 253 383 50 33 chr15 78090621 78090802 -25404172 - MTEb LTR MaLR 0 379 196 1 1180 400 336 104 94 chr15 78093439 78093813 -25401161 - MLT1B LTR MaLR -12 378 1 1 1180 2849 128 9 67 chr15 78094633 78095168 -25399806 + RLTR28 LTR ERVL 4 507 -17 1 1180 1620 181 37 24 chr15 78095803 78096148 -25398826 + RLTR41 LTR ERV1 62 446 0 1 1180 264 336 40 73 chr15 78100367 78100518 -25394456 + RMER12 LTR ERVK 711 856 -466 1 1180 1492 264 32 12 chr15 78102247 78102654 -25392320 + MTD LTR MaLR 5 419 0 1 1180 377 290 83 0 chr15 78102655 78102800 -25392174 + MTD-int LTR MaLR 3 159 -1421 1 1180 527 238 54 16 chr15 78102850 78103034 -25391940 + MTD-int LTR MaLR 1066 1256 -2 1 1180 1551 255 38 6 chr15 78103036 78103447 -25391527 + MTD LTR MaLR 1 419 -2 1 1180 255 252 80 80 chr15 78105680 78105818 -25389156 + RMER15 LTR ERVL 421 558 -17 1 1180 890 157 84 0 chr15 78107069 78107247 -25387727 - RLTR11A LTR ERVK -2 526 334 2 1180 277 308 80 36 chr15 78107527 78107665 -25387309 - MLT1B LTR MaLR -215 175 32 2 1180 1472 248 24 19 chr15 78107952 78108322 -25386652 - MTEa LTR MaLR -6 373 2 2 1181 864 219 156 59 chr15 78119511 78119679 -25375295 + ORR1D1 LTR MaLR 1 201 -173 2 1181 864 219 156 59 chr15 78119820 78119991 -25374983 + ORR1D1 LTR MaLR 202 373 -1 2 1181 1706 111 103 3 chr15 78121295 78121585 -25373389 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1181 447 272 83 36 chr15 78129797 78130053 -25364921 - MLT1A0 LTR MaLR -42 323 1 2 1181 897 234 131 19 chr15 78138239 78138527 -25356447 + MTD LTR MaLR 74 400 -21 2 1181 1662 156 77 57 chr15 78140869 78141271 -25353703 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 2 1181 468 277 129 11 chr15 78141550 78141736 -25353238 + MER76 LTR ERVL 388 595 -96 2 1181 840 257 137 0 chr15 78142631 78142872 -25352102 - MTEa LTR MaLR -101 278 5 2 1181 445 288 52 35 chr15 78145885 78146109 -25348865 + MLT1B LTR MaLR 82 305 -162 2 1181 265 339 0 0 chr15 78146153 78146218 -25348756 + RMER12B LTR ERVK 10 74 -1330 2 1181 3411 158 46 88 chr15 78146185 78146923 -25348051 + RMER12B LTR ERVK 241 947 -457 2 1181 859 262 131 0 chr15 78149587 78149831 -25345143 + MTEa LTR MaLR 5 280 -99 2 1181 419 326 130 44 chr15 78150662 78151180 -25343794 - MER76 LTR ERVL -30 661 72 2 1181 811 261 125 20 chr15 78153294 78153613 -25341361 - MTD LTR MaLR -31 390 46 2 1181 228 330 33 11 chr15 78153672 78153764 -25341210 - MTD LTR MaLR -326 95 2 2 1181 466 391 12 53 chr15 78162838 78163081 -25331893 - MLT1J LTR MaLR -185 327 95 2 1181 561 299 67 14 chr15 78163854 78164130 -25330844 + MLT1A0 LTR MaLR 1 345 -20 2 1181 2042 114 13 0 chr15 78172586 78172901 -25322073 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1181 487 209 172 25 chr15 78174243 78174400 -25320574 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 195 2 1181 518 197 147 33 chr15 78174592 78174776 -25320198 - ORR1D1 LTR MaLR -169 205 1 2 1181 584 339 68 16 chr15 78184352 78184661 -25310313 + MER68 LTR ERVL 87 411 -152 3 1181 820 183 7 0 chr15 78187007 78187160 -25307814 + ORR1B2 LTR MaLR 1 154 -213 3 1181 231 146 0 24 chr15 78187157 78187199 -25307775 + ORR1B2 LTR MaLR 346 386 -8 3 1181 6325 204 40 22 chr15 78187203 78188684 -25306290 + ORR1B2-int LTR MaLR 1 1509 0 3 1181 1546 228 63 6 chr15 78188684 78189019 -25305955 + ORR1B2 LTR MaLR 1 354 -13 3 1181 3772 174 123 76 chr15 78191985 78192167 -25302807 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 820 3 1181 3772 174 123 76 chr15 78192281 78192582 -25302392 - RLTR25B LTR ERVK -209 819 478 3 1181 3772 174 123 76 chr15 78192684 78193178 -25301796 - RLTR25B LTR ERVK -551 477 4 3 1181 322 215 22 23 chr15 78196067 78196170 -25298804 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 108 -1700 3 1181 3462 141 23 5 chr15 78196265 78196879 -25298095 + RLTR22_Mur LTR ERVK 179 803 -1045 3 1181 1096 183 30 46 chr15 78197074 78197337 -25297637 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1590 1848 0 3 1181 1132 301 104 40 chr15 78197666 78197686 -25297288 - MLT2B3 LTR ERVL -4 550 539 3 1181 1132 301 104 40 chr15 78197907 78198387 -25296587 - MLT2B3 LTR ERVL -16 538 18 3 1181 234 304 0 145 chr15 78199118 78199249 -25295725 - MT2B LTR ERVL -337 264 153 3 1181 704 316 67 6 chr15 78200134 78200449 -25294525 + MER67B LTR ERV1 46 379 -282 3 1181 695 302 69 0 chr15 78200683 78200885 -25294089 + MTE2b LTR MaLR 1 216 -163 3 1181 547 238 43 6 chr15 78200942 78201103 -25293871 + MTE2b LTR MaLR 208 374 -5 3 1181 673 194 8 0 chr15 78203942 78204066 -25290908 + RMER20A LTR ERVK 392 516 0 3 1181 1018 226 139 36 chr15 78205276 78205537 -25289437 + MTEa LTR MaLR 1 268 -111 3 1181 1018 226 139 36 chr15 78205563 78205631 -25289343 + MTEa LTR MaLR 269 364 -15 3 1181 631 271 181 61 chr15 78206416 78206762 -25288212 + RLTR12B LTR ERVK 47 446 -82 3 1181 631 271 181 61 chr15 78206951 78206997 -25287977 + RLTR12B LTR ERVK 447 486 -42 3 1181 296 359 98 45 chr15 78207628 78207873 -25287101 + MLT1H2 LTR MaLR 3 260 -229 3 1181 607 312 124 19 chr15 78209493 78209800 -25285174 - MTE2a-int LTR MaLR -1226 354 16 3 1181 402 242 18 32 chr15 78209824 78209964 -25285010 - MTE2a LTR MaLR -13 406 270 3 1181 294 250 30 172 chr15 78209962 78210131 -25284843 - MTE2a LTR MaLR -234 145 1 3 1181 225 330 124 64 chr15 78213043 78213276 -25281698 + ORR1E LTR MaLR 6 252 -107 3 1181 1400 202 41 72 chr15 78221465 78221854 -25273120 - MTE2a LTR MaLR 0 379 3 3 1181 364 325 99 84 chr15 78222153 78222516 -25272458 + MLT1F2 LTR MaLR 9 363 -197 3 1181 433 294 124 34 chr15 78222892 78223159 -25271815 + MLT1F-int LTR MaLR 2 292 -1197 3 1181 393 306 73 10 chr15 78225188 78225364 -25269610 + MLT1F2 LTR MaLR 412 680 0 3 1181 2439 161 5 5 chr15 78225381 78225757 -25269217 + ORR1C1 LTR MaLR 2 377 -1 3 1181 4005 52 37 20 chr15 78227200 78227709 -25267265 + MURVY-LTR LTR ERV1 2 519 0 3 1181 287 306 159 39 chr15 78227796 78228123 -25266851 - MLT1F2 LTR MaLR -138 431 59 3 1181 605 151 8 0 chr15 78228849 78228968 -25266006 + RMER17A2 LTR ERVK 394 513 -393 3 1181 636 279 40 6 chr15 78229532 78229705 -25265269 + RMER15 LTR ERVL 304 482 -93 3 1181 425 165 71 0 chr15 78229803 78229888 -25265086 + RMER15 LTR ERVL 483 573 -2 3 1181 241 297 25 67 chr15 78239791 78239910 -25255064 - MT2B LTR ERVL -338 263 150 4 1181 225 288 13 27 chr15 78241446 78241521 -25253453 + RMER19A LTR ERVK 520 593 -144 4 1181 246 289 23 57 chr15 78248090 78248178 -25246796 + MT2B2 LTR ERVL 168 252 -332 4 1182 359 231 0 136 chr15 78253844 78253969 -25241005 - MT2B LTR ERVL -341 260 153 4 1182 877 186 116 64 chr15 78254268 78254635 -25240339 - RMER19C LTR ERVK 0 611 309 4 1182 295 265 28 14 chr15 78256371 78256468 -25238506 + ORR1E LTR MaLR 2 100 -270 4 1182 1332 227 29 79 chr15 78257624 78258002 -25236972 + MTE2a LTR MaLR 21 379 0 4 1182 252 342 17 8 chr15 78262255 78262373 -25232601 - MLT1A0 LTR MaLR -235 130 12 4 1182 331 318 27 104 chr15 78280753 78281141 -25213833 + MLT1A1 LTR MaLR 19 405 -3 4 1182 1619 165 195 0 chr15 78293629 78293962 -25201012 + MTD LTR MaLR 14 411 -8 4 1182 458 270 177 23 chr15 78301604 78301674 -25193300 + MLT1C LTR MaLR 116 187 -280 4 1182 458 270 177 23 chr15 78301775 78302003 -25192971 + MLT1C LTR MaLR 188 460 -7 4 1182 409 189 16 138 chr15 78313395 78313518 -25181456 - MT2B LTR ERVL -344 257 150 5 1182 450 311 50 54 chr15 78326556 78326777 -25168197 + RMER15 LTR ERVL 319 538 -37 5 1182 411 325 74 29 chr15 78326958 78327211 -25167763 - ORR1E LTR MaLR 0 379 97 5 1182 234 316 101 0 chr15 78328314 78328453 -25166521 + MLT1J2 LTR MaLR 62 214 -234 5 1182 2462 150 49 17 chr15 78329598 78330004 -25164970 + MTC LTR MaLR 3 421 0 5 1182 385 350 6 24 chr15 78330132 78330296 -25164678 - MLT1J LTR MaLR -164 348 188 5 1182 1510 151 57 136 chr15 78331274 78331641 -25163333 - ORR1A0 LTR MaLR -8 338 1 5 1182 402 312 56 39 chr15 78333349 78333529 -25161445 + LTR84b LTR ERVL 126 308 -453 5 1182 4934 109 74 0 chr15 78335016 78335702 -25159272 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 1182 889 241 214 29 chr15 78335902 78336244 -25158730 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 5 1182 3156 190 54 98 chr15 78343426 78344273 -25150701 - RLTR40 LTR ERVK -3 814 5 5 1182 932 301 47 42 chr15 78346771 78347174 -25147800 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 123 5 1182 561 286 80 25 chr15 78347226 78347427 -25147547 - MTE2a LTR MaLR -5 374 163 5 1182 492 353 43 85 chr15 78348336 78348664 -25146310 - ORR1E LTR MaLR -45 314 1 5 1182 1036 225 154 25 chr15 78353108 78353427 -25141547 + MTEa LTR MaLR 18 377 -2 5 1182 276 340 78 24 chr15 78364735 78364901 -25130073 - MLT1C LTR MaLR -62 405 231 6 1182 466 308 146 21 chr15 78364971 78365210 -25129764 - MLT1C LTR MaLR -198 269 1 6 1182 379 286 132 45 chr15 78378480 78378722 -25116252 + MER34 LTR ERV1 4 266 -276 6 1182 250 250 42 0 chr15 78378835 78378907 -25116067 + MER34 LTR ERV1 446 520 -22 6 1183 552 309 32 11 chr15 78381284 78381474 -25113500 + MTE-int LTR MaLR 1 194 -1386 6 1183 332 233 11 65 chr15 78381480 78381572 -25113402 + MTC LTR MaLR 330 416 -3 6 1183 3943 189 112 60 chr15 78381575 78382122 -25112852 + MTC-int LTR MaLR 1 733 -525 6 1183 2308 165 31 0 chr15 78382122 78382504 -25112470 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1183 3943 170 105 27 chr15 78382504 78383039 -25111935 + MTC-int LTR MaLR 734 1258 0 6 1183 1628 158 205 6 chr15 78383039 78383390 -25111584 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1183 1354 315 84 111 chr15 78383391 78383899 -25111075 + MTE-int LTR MaLR 193 737 -843 6 1183 1354 315 84 111 chr15 78383928 78384515 -25110459 + MTE-int LTR MaLR 738 1258 -322 6 1183 893 254 35 28 chr15 78385377 78385665 -25109309 - RLTR15 LTR ERVK -69 290 1 6 1183 400 317 43 14 chr15 78385789 78385930 -25109044 + ERVL-int LTR ERVL 5610 5754 -3 6 1183 277 326 87 44 chr15 78391173 78391356 -25103618 + MLT1K LTR MaLR 399 589 -6 6 1183 341 260 62 0 chr15 78394246 78394342 -25100632 + MTEa LTR MaLR 201 302 -77 6 1183 1331 218 133 26 chr15 78404786 78405125 -25089849 - MTE2a LTR MaLR -2 377 3 6 1183 2355 146 171 2 chr15 78409367 78409648 -25085326 + RMER4B LTR ERVK 17 319 -266 6 1183 2355 146 171 2 chr15 78409775 78409974 -25085000 + RMER4B LTR ERVK 320 577 -8 6 1183 251 282 150 24 chr15 78413333 78413500 -25081474 + MLT1A0 LTR MaLR 169 356 -9 6 1183 312 306 38 64 chr15 78416164 78416321 -25078653 + MLT1B LTR MaLR 61 213 -177 6 1183 2525 83 3 9 chr15 78418785 78419114 -25075860 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1183 1104 260 116 48 chr15 78419684 78420039 -25074935 - MTE2b LTR MaLR 0 379 1 7 1183 550 316 57 9 chr15 78423276 78423487 -25071487 + RMER15 LTR ERVL 348 568 -7 7 1183 845 203 90 5 chr15 78424104 78424292 -25070682 + ORR1D1 LTR MaLR 167 370 -4 7 1183 1599 205 53 51 chr15 78425339 78425714 -25069260 - MTE2b LTR MaLR 0 379 4 7 1183 238 331 14 97 chr15 78430661 78430805 -25064169 - RMER12 LTR ERVK -456 866 735 7 1183 286 200 33 33 chr15 78432761 78432864 -25062110 + MLT1J LTR MaLR 33 148 -364 7 1183 329 390 32 37 chr15 78444782 78444971 -25050003 - MLT1K LTR MaLR -323 272 85 7 1183 1124 238 168 12 chr15 78448222 78448550 -25046424 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 7 1183 1896 203 105 67 chr15 78457759 78457977 -25036997 + RMER15 LTR ERVL 1 252 -323 7 1183 1896 203 105 67 chr15 78458173 78458508 -25036466 + RMER15 LTR ERVL 253 575 0 7 1183 329 321 80 0 chr15 78458604 78458741 -25036233 - MLT1I LTR MaLR -230 181 34 7 1183 1763 220 9 47 chr15 78482355 78482780 -25012194 - MTD LTR MaLR -4 415 7 8 1183 792 258 154 15 chr15 78485460 78485720 -25009254 + MTEa LTR MaLR 77 372 -7 8 1183 1128 228 91 53 chr15 78486106 78486448 -25008526 + ORR1D2 LTR MaLR 15 369 -1 8 1183 1083 262 78 31 chr15 78486439 78486795 -25008179 + ORR1D2-int LTR MaLR 4 344 -1619 8 1183 305 332 206 44 chr15 78487575 78487827 -25007147 + ORR1D2-int LTR MaLR 322 614 -966 8 1183 2380 261 107 74 chr15 78487802 78488404 -25006570 + ORR1D2-int LTR MaLR 717 1324 -256 8 1183 2380 261 107 74 chr15 78488446 78488676 -25006298 + ORR1D2-int LTR MaLR 1325 1576 -4 8 1183 728 240 228 76 chr15 78488680 78489009 -25005965 + ORR1D2 LTR MaLR 1 379 0 8 1183 288 343 172 42 chr15 78489200 78489532 -25005442 - MLT1J LTR MaLR -93 419 45 8 1183 3074 91 43 9 chr15 78491992 78492414 -25002560 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 8 1184 310 266 51 33 chr15 78561177 78561359 -24933615 - ORR1E LTR MaLR -134 250 63 8 1184 774 335 77 14 chr15 78565201 78565567 -24929407 + LTR31 LTR ERV1 210 598 -21 9 1184 883 261 127 53 chr15 78569766 78569867 -24925107 + MLT1A0 LTR MaLR 1 92 -273 1 1184 883 261 127 53 chr15 78570135 78570373 -24924601 + MLT1A0 LTR MaLR 93 365 0 1 1184 3379 46 5 0 chr15 78577731 78578125 -24916849 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1184 1954 156 3 7 chr15 78578483 78578792 -24916182 + RLTR10E LTR ERVK 1 308 -3 1 1184 1344 222 101 56 chr15 78584529 78584924 -24910050 - MTD LTR MaLR 0 419 7 1 1184 247 311 40 13 chr15 78586376 78586451 -24908523 - MLT1J LTR MaLR -194 318 242 1 1184 227 189 37 19 chr15 78591777 78591831 -24903143 + MLT1K LTR MaLR 135 189 -406 1 1184 1687 209 41 60 chr15 78592897 78593310 -24901664 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1184 338 256 134 16 chr15 78595077 78595220 -24899754 - RLTR18 LTR ERVK -134 482 264 1 1184 301 353 71 59 chr15 78595510 78595763 -24899211 - RLTR18 LTR ERVK -328 288 33 1 1184 1977 161 63 3 chr15 78597908 78598288 -24896686 + MTD LTR MaLR 3 405 -14 1 1184 997 172 179 32 chr15 78598889 78599135 -24895839 + ORR1B1 LTR MaLR 1 282 -112 1 1184 236 314 71 63 chr15 78631514 78631640 -24863334 - MT2B LTR ERVL -320 281 155 2 1184 486 296 95 16 chr15 78640652 78640884 -24854090 - MLT1G LTR MaLR -247 308 65 2 1184 278 266 0 0 chr15 78642301 78642365 -24852609 + MTEb LTR MaLR 316 379 0 2 1185 1045 206 212 3 chr15 78646216 78646537 -24848437 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 2 1185 692 192 310 39 chr15 78648249 78648266 -24846708 - ORR1A4 LTR MaLR -42 352 336 2 1185 920 192 310 39 chr15 78648295 78648532 -24846442 - ORR1A4 LTR MaLR -59 335 1 2 1185 362 299 86 8 chr15 78649476 78649604 -24845370 - MLT1D LTR MaLR -36 469 332 2 1185 505 224 133 13 chr15 78650036 78650194 -24844780 - MLT1D LTR MaLR -307 198 22 2 1185 628 221 73 6 chr15 78651039 78651203 -24843771 - MTD LTR MaLR 0 419 245 2 1185 642 128 9 27 chr15 78653530 78653642 -24841332 - MTD LTR MaLR -105 316 207 2 1185 2434 162 86 12 chr15 78653642 78654130 -24840844 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 2 1185 871 218 66 5 chr15 78654333 78654531 -24840443 - MTD LTR MaLR -209 210 1 2 1185 241 220 20 0 chr15 78654772 78654822 -24840152 - MTEb LTR MaLR -6 373 323 2 1185 840 231 103 74 chr15 78655400 78655817 -24839157 + RMER2 LTR ERV1 24 546 -21 3 1185 255 333 28 9 chr15 78657502 78657611 -24837363 + MLT1C LTR MaLR 357 467 0 3 1185 1068 161 229 54 chr15 78667597 78667716 -24827258 + RMER17C LTR ERVK 1 184 -226 3 1185 1068 161 229 54 chr15 78667869 78668098 -24826876 + RMER17C LTR ERVK 185 410 0 3 1185 227 241 17 17 chr15 78682487 78682546 -24812428 - LTR39 LTR ERV1 -406 377 319 3 1185 334 246 69 99 chr15 78683084 78683106 -24811868 + MT2B LTR ERVL 137 154 -447 3 1185 253 346 51 73 chr15 78688160 78688297 -24806677 + MLT1A0 LTR MaLR 25 158 -402 3 1185 302 344 39 19 chr15 78688629 78688783 -24806191 + MLT1A0 LTR MaLR 209 365 0 3 1185 287 219 126 63 chr15 78688918 78689045 -24805929 + MLT1F2 LTR MaLR 374 508 -52 3 1185 237 185 18 18 chr15 78690776 78690831 -24804143 - MTEb LTR MaLR 0 379 325 3 1185 1228 256 73 20 chr15 78690838 78690878 -24804096 + MTE2b LTR MaLR 3 42 -337 3 1185 1228 256 73 20 chr15 78691060 78691328 -24803646 + MTE2b LTR MaLR 43 330 -49 3 1185 1228 256 73 20 chr15 78691515 78691559 -24803415 + MTE2b LTR MaLR 331 374 -5 3 1185 247 324 9 79 chr15 78691868 78691896 -24803078 - MTEb LTR MaLR -273 106 1 3 1185 268 294 47 12 chr15 78691896 78691982 -24802992 - MLT2B3 LTR ERVL -465 89 1 3 1185 866 259 203 13 chr15 78693674 78693975 -24800999 - MTEb LTR MaLR -6 373 16 4 1185 385 302 24 29 chr15 78693944 78694090 -24800884 + MLT1A1 LTR MaLR 312 467 0 4 1185 565 307 157 64 chr15 78695759 78696081 -24798893 - MT2A LTR ERVL -1 553 1 4 1185 382 331 39 0 chr15 78696081 78696208 -24798766 - MTEb LTR MaLR -247 132 1 4 1185 485 227 21 0 chr15 78696217 78696314 -24798660 + MTEb LTR MaLR 23 121 -258 4 1185 1014 214 0 22 chr15 78696314 78696539 -24798435 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5401 360 141 4 1185 544 276 47 93 chr15 78696550 78696786 -24798188 + MTEb LTR MaLR 130 354 -25 4 1185 1103 264 62 137 chr15 78699241 78699772 -24795202 + MT2A LTR ERVL 1 490 -43 4 1185 1103 264 62 137 chr15 78699916 78699960 -24795014 + MT2A LTR ERVL 491 533 0 4 1185 1197 140 128 36 chr15 78700908 78701182 -24793792 - ORR1C2 LTR MaLR -12 372 74 4 1185 648 178 9 33 chr15 78701378 78701571 -24793403 - RMER19B LTR ERVK -728 174 5 4 1185 613 146 0 0 chr15 78701577 78701673 -24793301 - ORR1C2 LTR MaLR -278 96 1 4 1185 248 264 0 65 chr15 78703168 78703245 -24791729 + IAPLTR4 LTR ERVK 216 287 -58 4 1185 227 306 34 45 chr15 78703609 78703698 -24791276 - MT2B LTR ERVL -348 253 166 4 1185 569 259 106 35 chr15 78705127 78705493 -24789481 + RLTR28B LTR ERVL 1 443 -38 4 1185 1075 266 119 26 chr15 78705584 78705928 -24789046 + MTE2b LTR MaLR 1 376 -3 4 1185 3381 43 2 2 chr15 78709131 78709527 -24785447 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1185 233 315 10 98 chr15 78716602 78716704 -24778270 + MT2B2 LTR ERVL 163 255 -329 4 1185 236 275 123 12 chr15 78716985 78717066 -24777908 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1260 1349 -499 4 1185 978 268 134 52 chr15 78739852 78740129 -24754845 - MTD LTR MaLR -14 405 105 5 1185 978 265 139 55 chr15 78740150 78740250 -24754724 - MTD LTR MaLR -315 104 8 5 1185 1242 271 69 17 chr15 78747278 78747627 -24747347 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 2 5 1185 240 333 39 39 chr15 78749464 78749592 -24745382 - RMER12 LTR ERVK -101 1221 1094 5 1185 1052 268 58 42 chr15 78751905 78752216 -24742758 + MTEb LTR MaLR 50 365 -14 5 1185 1440 265 68 11 chr15 78752234 78752616 -24742358 + MTEb-int LTR MaLR 1 404 -1176 5 1185 671 231 341 11 chr15 78767261 78767537 -24727437 - MTE2b LTR MaLR -1 378 12 5 1185 1138 262 164 27 chr15 78769995 78770360 -24724614 - MTD LTR MaLR 0 419 5 5 1185 387 337 0 0 chr15 78772665 78772760 -24722214 - MLT1J LTR MaLR -203 309 215 5 1186 1390 209 36 117 chr15 78774351 78774763 -24720211 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 5 1186 348 305 88 44 chr15 78776138 78776320 -24718654 + RMER15 LTR ERVL 321 510 -65 5 1186 353 233 190 0 chr15 78795590 78795706 -24699268 - MTEa LTR MaLR -33 346 209 6 1186 488 337 64 0 chr15 78796181 78796353 -24698621 - MTEa LTR MaLR -196 183 1 6 1186 297 259 137 66 chr15 78801036 78801218 -24693756 - MT2B LTR ERVL -343 258 64 6 1186 244 333 48 0 chr15 78809891 78809975 -24684999 - MLT1G1 LTR MaLR -388 191 104 6 1186 231 354 40 0 chr15 78822514 78822613 -24672361 - MLT1J LTR MaLR -337 175 73 6 1186 634 275 142 51 chr15 78825837 78826148 -24668826 - MTE2b LTR MaLR 0 379 41 6 1186 287 290 14 0 chr15 78826149 78826218 -24668756 - MTE2b LTR MaLR -301 78 9 6 1186 247 247 35 47 chr15 78837202 78837287 -24657687 + MLT1L LTR MaLR 157 240 -370 7 1186 234 338 92 66 chr15 78839135 78839363 -24655611 - MLT1F1 LTR MaLR -269 300 67 7 1186 242 273 75 38 chr15 78840767 78840847 -24654127 + LTR90A LTR LTR 5 87 -889 7 1186 348 241 32 65 chr15 78841227 78841254 -24653720 - MT2B LTR ERVL -441 160 138 7 1186 3786 14 121 0 chr15 78841278 78841718 -24653256 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1186 398 306 80 37 chr15 78851033 78851196 -24643778 - MLT1D LTR MaLR -46 459 290 7 1186 3492 18 5 15 chr15 78863527 78863927 -24631047 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1186 228 273 42 68 chr15 78864162 78864280 -24630694 - RLTR25B LTR ERVK -526 502 388 7 1186 362 289 62 58 chr15 78869001 78869225 -24625749 - RMER17C LTR ERVK -68 342 118 7 1186 372 308 94 0 chr15 78883510 78883669 -24611305 - MLT1D LTR MaLR -26 479 306 8 1186 303 360 72 0 chr15 78883708 78883861 -24611113 - MLT1D LTR MaLR -309 196 33 8 1186 2123 178 139 33 chr15 78885101 78885493 -24609481 + RLTR20A LTR ERVK 9 442 -99 8 1186 2123 178 139 33 chr15 78885527 78885616 -24609358 + RLTR20A LTR ERVK 443 540 -1 8 1186 974 149 31 114 chr15 78888126 78888353 -24606621 + ORR1A4 LTR MaLR 1 208 -121 8 1186 565 279 94 84 chr15 78895571 78896008 -24598966 + RMER21B LTR ERV1 1 512 -330 8 1186 1853 141 124 0 chr15 78896008 78896356 -24598618 + ORR1B1 LTR MaLR 3 393 -1 8 1186 565 249 81 84 chr15 78896356 78896403 -24598571 + RMER21B LTR ERV1 513 565 -277 8 1186 1150 191 41 55 chr15 78896483 78896940 -24598034 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 8 1186 1858 128 68 18 chr15 78897198 78897524 -24597450 - ORR1B1 LTR MaLR -13 381 40 8 1186 720 218 189 16 chr15 78897597 78897840 -24597134 + RMER21B LTR ERV1 283 567 -275 8 1186 532 148 151 34 chr15 78898058 78898177 -24596797 + RMER4B LTR ERVK 49 181 -404 8 1186 332 234 99 73 chr15 78898168 78898413 -24596561 + RMER4B LTR ERVK 348 610 -1 8 1186 1766 217 104 22 chr15 78898970 78899423 -24595551 + RLTR18 LTR ERVK 1 490 -126 8 1186 533 253 160 127 chr15 78899570 78899742 -24595232 + RLTR18B LTR ERVK 383 512 0 8 1186 1615 171 30 83 chr15 78900780 78901176 -24593798 + RMER10B LTR ERVL 1 375 -23 8 1186 2262 99 82 109 chr15 78901380 78901820 -24593154 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 3 8 1187 1813 205 48 7 chr15 78910224 78910641 -24584333 - RLTR11A2 LTR ERVK -93 434 1 8 1187 853 176 70 58 chr15 78910643 78910884 -24584090 - MYSERV-int LTR ERVK -2 6548 6305 8 1187 1309 218 10 23 chr15 78911065 78911375 -24583599 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -505 1821 1516 8 1187 237 293 76 57 chr15 78913913 78914018 -24580956 - MT2B LTR ERVL -342 259 153 8 1187 313 183 0 66 chr15 78921794 78921870 -24573104 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 304 9 1187 294 164 18 0 chr15 78921856 78921911 -24573063 - ORR1D1 LTR MaLR -322 56 1 9 1187 421 292 106 155 chr15 78934894 78935003 -24559971 + MTEa LTR MaLR 3 138 -241 9 1187 1211 209 154 12 chr15 78935003 78935327 -24559647 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 3 9 1187 421 292 106 155 chr15 78935327 78935369 -24559605 + MTEa LTR MaLR 139 180 -199 9 1187 421 292 106 155 chr15 78935626 78935821 -24559153 + MTEa LTR MaLR 181 333 -46 9 1187 284 236 37 111 chr15 78941739 78941901 -24553073 + MT2B LTR ERVL 115 264 -337 9 1187 244 308 10 108 chr15 78945746 78945848 -24549126 + MT2B2 LTR ERVL 164 255 -329 9 1187 463 214 7 125 chr15 78956981 78957003 -24537971 + MT2B LTR ERVL 152 156 -445 1 1187 637 267 47 24 chr15 79008581 79008792 -24486182 - MTEb LTR MaLR 0 379 164 1 1187 536 248 83 18 chr15 79008982 79009150 -24485824 - MTEb LTR MaLR -197 182 4 1 1187 334 279 22 96 chr15 79016914 79017049 -24477925 + MT2B LTR ERVL 153 277 -324 4 1187 672 258 52 91 chr15 79017465 79017580 -24477394 - MTD LTR MaLR -186 233 116 4 1187 672 258 52 91 chr15 79017727 79017841 -24477133 - MTD LTR MaLR -304 115 13 4 1187 2765 49 18 33 chr15 79019090 79019288 -24475686 - MTB LTR MaLR -8 392 197 5 1187 2765 49 18 33 chr15 79019479 79019678 -24475296 - MTB LTR MaLR -204 196 1 5 1188 238 293 18 100 chr15 79042304 79042414 -24452560 - MT2B LTR ERVL -350 251 151 1 1188 1112 221 29 0 chr15 79047826 79048070 -24446904 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 277 1 1188 1088 217 33 40 chr15 79048217 79048246 -24446728 - RLTR11A2 LTR ERVK -253 275 257 1 1188 3139 44 46 3 chr15 79057867 79058256 -24436718 + MTB_Mm LTR MaLR 1 406 -1 1 1188 2266 225 48 22 chr15 79058376 79058875 -24436099 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 1 1 1188 364 281 0 80 chr15 79064633 79064647 -24430327 + MT2B LTR ERVL 152 156 -445 1 1188 261 228 248 0 chr15 79065938 79066039 -24428935 - MTEa LTR MaLR -195 184 59 1 1188 1190 318 116 28 chr15 79066754 79067298 -24427676 - MTE-int LTR MaLR -155 1425 834 1 1188 383 233 100 6 chr15 79067407 79067567 -24427407 - MTD LTR MaLR 0 419 245 1 1188 1121 95 63 5 chr15 79067634 79067824 -24427150 - MTC LTR MaLR -117 304 104 1 1188 503 272 95 45 chr15 79067998 79068211 -24426763 - MTC LTR MaLR -311 110 1 1 1188 336 355 169 54 chr15 79068318 79068772 -24426202 - MTC-int LTR MaLR -1054 526 2 1 1188 2692 91 19 63 chr15 79071986 79072398 -24422576 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1188 381 220 23 117 chr15 79072782 79072946 -24422028 - MT2B LTR ERVL -320 264 118 1 1188 1097 184 101 0 chr15 79074967 79075195 -24419779 - RLTR28B LTR ERVL -230 251 1 2 1188 338 77 0 0 chr15 79085790 79085842 -24409132 - MTB-int LTR MaLR -2 1096 1045 2 1188 5671 94 61 82 chr15 79087087 79088170 -24406804 - MTB-int LTR MaLR -38 1060 1 2 1188 3452 38 2 0 chr15 79088170 79088569 -24406405 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1188 2537 123 31 10 chr15 79094237 79094623 -24400351 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1188 3276 123 90 55 chr15 79094683 79095303 -24399671 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 2 1188 335 292 19 0 chr15 79097741 79097847 -24397127 + RNERVK23-int LTR ERVK 7423 7530 -687 2 1188 1852 128 78 9 chr15 79098520 79098851 -24396123 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 2 1188 427 55 0 0 chr15 79107724 79107779 -24387195 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 292 2 1188 410 220 30 106 chr15 79121345 79121477 -24373497 - MT2B LTR ERVL -337 264 143 2 1188 566 205 147 6 chr15 79124867 79124900 -24370074 + ORR1D1 LTR MaLR 196 228 -146 2 1188 566 205 147 6 chr15 79124932 79125055 -24369919 + ORR1D1 LTR MaLR 229 373 -1 2 1188 340 229 9 95 chr15 79126476 79126492 -24368482 + MT2B LTR ERVL 152 157 -444 3 1188 789 335 39 36 chr15 79130602 79130796 -24364178 + MTE2a LTR MaLR 1 190 -189 3 1188 789 335 39 36 chr15 79130830 79130969 -24364005 + MTE2a LTR MaLR 191 335 -44 3 1188 717 44 0 0 chr15 79139432 79139523 -24355451 + MTA_Mm LTR MaLR 306 396 0 3 1188 9785 16 1 4 chr15 79139523 79140624 -24354350 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 3 1188 3437 28 13 0 chr15 79140624 79141015 -24353959 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1188 1745 185 115 48 chr15 79141046 79141827 -24353147 + RMER19B LTR ERVK 211 902 0 3 1188 381 308 54 0 chr15 79145890 79146020 -24348954 + MLT1G1 LTR MaLR 429 565 -14 3 1188 2316 138 67 33 chr15 79152150 79152623 -24342351 + RLTR11A LTR ERVK 1 514 -14 3 1188 1533 119 76 3 chr15 79160993 79161354 -24333620 + ORR1A4 LTR MaLR 1 344 -50 3 1188 891 179 25 62 chr15 79163299 79163724 -24331250 - RMER10A LTR ERVL -3 439 52 3 1188 1693 132 3 47 chr15 79166379 79166632 -24328342 - RLTR15 LTR ERVK -56 303 61 3 1188 1693 132 3 47 chr15 79166807 79166870 -24328104 - RLTR15 LTR ERVK -299 60 1 3 1189 676 157 11 98 chr15 79170731 79170927 -24324047 + ORR1A4 LTR MaLR 34 229 -117 3 1189 588 344 56 12 chr15 79174067 79174366 -24320608 - MLT1B LTR MaLR 0 467 84 4 1189 3370 43 5 0 chr15 79174480 79174874 -24320100 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1189 473 217 78 0 chr15 79201371 79201486 -24293488 - RLTR11A LTR ERVK -4 524 401 4 1189 1801 164 63 8 chr15 79201471 79201822 -24293152 + RLTR11A LTR ERVK 159 528 0 4 1189 643 235 239 0 chr15 79210764 79211011 -24283963 + MLT1A0 LTR MaLR 56 361 -4 4 1189 970 264 52 33 chr15 79214357 79214662 -24280312 + MTE2a LTR MaLR 17 327 -52 4 1189 414 217 0 109 chr15 79228264 79228383 -24266591 + MT2B LTR ERVL 159 264 -337 5 1189 290 250 93 28 chr15 79235186 79235293 -24259681 - RMER15 LTR ERVL -45 530 417 5 1189 395 320 63 44 chr15 79235433 79235471 -24259503 + RMER15 LTR ERVL 352 392 -183 5 1189 395 320 63 44 chr15 79235494 79235661 -24259313 + RMER15 LTR ERVL 393 561 -14 5 1189 287 212 50 126 chr15 79235963 79236082 -24258892 + MT2B LTR ERVL 169 278 -323 5 1189 2788 84 63 8 chr15 79236504 79236886 -24258088 - MTB_Mm LTR MaLR -4 403 1 5 1189 391 331 108 8 chr15 79239593 79239843 -24255131 - MLT1K LTR MaLR -296 299 25 5 1189 742 234 106 42 chr15 79241977 79242213 -24252761 + MTEa LTR MaLR 120 370 -9 5 1189 2292 90 51 0 chr15 79247425 79247736 -24247238 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1189 1347 158 251 60 chr15 79259014 79259364 -24235610 + MTC LTR MaLR 1 417 -4 5 1189 658 247 204 88 chr15 79259617 79259936 -24235038 + ORR1D2 LTR MaLR 4 359 -11 5 1189 419 232 8 97 chr15 79266543 79266557 -24228417 + MT2B LTR ERVL 152 154 -447 6 1189 2626 160 35 7 chr15 79283420 79283873 -24211101 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 6 1190 3176 20 0 0 chr15 79299255 79299601 -24195373 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 6 1190 1357 222 58 44 chr15 79300924 79301287 -24193687 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 6 1190 952 272 131 6 chr15 79306018 79306347 -24188627 + MTD LTR MaLR 1 387 -32 7 1190 258 346 39 23 chr15 79308930 79309060 -24185914 - ORR1E LTR MaLR -222 137 6 7 1190 2837 127 138 4 chr15 79345340 79345832 -24149142 + RMER15 LTR ERVL 1 558 -17 7 1190 402 252 43 98 chr15 79353892 79354076 -24140898 + MT2B LTR ERVL 93 257 -327 8 1190 703 218 21 14 chr15 79356512 79356656 -24138318 + ORR1B1 LTR MaLR 8 152 -242 8 1190 1054 177 128 0 chr15 79356656 79356859 -24138115 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4756 4984 -777 8 1190 254 277 67 38 chr15 79356859 79356964 -24138010 - ORR1B1 LTR MaLR -196 198 91 8 1190 297 325 0 111 chr15 79372353 79372391 -24122583 + MT2B LTR ERVL 133 155 -446 8 1190 266 264 87 130 chr15 79372813 79372871 -24122103 - MT2B LTR ERVL -457 144 94 8 1190 354 306 14 120 chr15 79373741 79373949 -24121025 + MT2B2 LTR ERVL 72 257 -327 8 1190 2391 72 19 12 chr15 79379103 79379428 -24115546 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1190 2773 121 193 94 chr15 79381565 79381838 -24113136 - RLTR21 LTR ERVK 0 1572 1303 8 1190 2773 121 193 94 chr15 79381958 79382278 -24112696 - RLTR21 LTR ERVK -270 1302 957 8 1190 2773 121 193 94 chr15 79382423 79382519 -24112455 - RLTR21 LTR ERVK -616 956 815 8 1190 1194 67 139 0 chr15 79382691 79382871 -24112103 - RLTR21 LTR ERVK -947 625 421 8 1190 1069 165 90 5 chr15 79382870 79383059 -24111915 - RLTR21 LTR ERVK -1367 205 1 8 1190 269 317 116 8 chr15 79384296 79384417 -24110557 + MLT1L LTR MaLR 297 430 -180 8 1190 3403 43 0 12 chr15 79386458 79386859 -24108115 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1190 2260 106 22 0 chr15 79389075 79389397 -24105577 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 1190 235 270 168 42 chr15 79389497 79389640 -24105334 + MER89 LTR ERV1 361 521 -38 9 1190 365 335 62 36 chr15 79389659 79389966 -24105008 + MLT1K LTR MaLR 274 588 -7 9 1190 4540 116 44 8 chr15 79389966 79390696 -24104278 + RMER6A LTR ERVK 1 756 0 9 1190 594 244 53 8 chr15 79395957 79396089 -24098885 + ETnERV2-int LTR ERVK 7065 7202 -204 9 1190 2861 148 52 6 chr15 79405232 79405716 -24089258 + RLTR19C LTR ERVK 1 506 0 9 1190 382 181 28 0 chr15 79406859 79406939 -24088035 + MTC LTR MaLR 17 98 -309 9 1190 2317 140 42 3 chr15 79411959 79412338 -24082636 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 9 1190 1966 148 90 50 chr15 79419440 79419763 -24075211 + ORR1B1 LTR MaLR 1 349 -45 1 1190 1966 148 90 50 chr15 79419923 79419975 -24074999 + ORR1B1 LTR MaLR 350 393 -1 1 1190 550 149 0 0 chr15 79424764 79424851 -24070123 - MTD LTR MaLR -2 417 331 1 1191 1780 166 67 18 chr15 79433125 79433511 -24061463 - MTD LTR MaLR -14 405 1 1 1191 6025 137 62 63 chr15 79439839 79440954 -24054020 + RLTR13D3 LTR ERVK 1 1114 0 1 1191 2457 75 6 53 chr15 79444283 79444385 -24050589 + ORR1A3 LTR MaLR 5 106 -220 1 1191 2457 75 6 53 chr15 79444577 79444812 -24050162 + ORR1A3 LTR MaLR 107 326 0 1 1191 1385 140 3 175 chr15 79446633 79446970 -24048004 + RLTR23 LTR ERV1 152 430 0 1 1191 876 248 97 111 chr15 79454099 79454440 -24040534 + MTE2b LTR MaLR 1 336 -43 1 1191 4685 147 10 74 chr15 79455694 79456614 -24038360 - RLTR13A3 LTR ERVK 0 978 118 1 1191 4714 157 12 58 chr15 79457418 79458370 -24036604 + RMER13B LTR ERVK 1 908 0 1 1191 350 341 71 53 chr15 79460871 79461097 -24033877 - MLT1J LTR MaLR -49 463 234 1 1191 650 269 139 65 chr15 79461098 79461480 -24033494 + RLTR11B LTR ERVK 1 410 -43 1 1191 1840 131 173 3 chr15 79462216 79462546 -24032428 + ORR1B1 LTR MaLR 1 386 -8 1 1191 449 235 46 77 chr15 79472046 79472231 -24022743 + MTEa LTR MaLR 158 372 -7 1 1191 1191 232 96 58 chr15 79476004 79476180 -24018794 + MTD LTR MaLR 11 210 -209 1 1191 1191 232 96 58 chr15 79476360 79476577 -24018397 + MTD LTR MaLR 211 419 0 1 1191 582 253 133 20 chr15 79477325 79477629 -24017345 - MTE2b LTR MaLR -24 395 16 1 1191 2676 160 76 13 chr15 79481362 79481790 -24013184 + RLTR20B2 LTR ERVK 3 464 -96 1 1191 2676 160 76 13 chr15 79481827 79481923 -24013051 + RLTR20B2 LTR ERVK 465 560 0 1 1191 448 186 128 0 chr15 79485719 79485805 -24009169 + RLTR18B LTR ERVK 1 97 -415 1 1191 592 218 56 73 chr15 79486189 79486367 -24008607 + RLTR18B LTR ERVK 80 254 -258 1 1191 1504 204 18 40 chr15 79486355 79486682 -24008292 + RLTR18B LTR ERVK 190 509 -3 1 1191 381 213 102 85 chr15 79499457 79499575 -23995399 - MT2B LTR ERVL -337 264 145 1 1191 611 136 148 23 chr15 79500516 79500644 -23994330 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 239 4 1191 290 51 0 0 chr15 79500674 79500713 -23994261 - RLTR14 LTR ERV1 -343 39 1 4 1191 322 284 98 0 chr15 79519790 79519892 -23975082 - MER21B LTR ERV1 -147 716 605 4 1191 2134 16 545 0 chr15 79530250 79530569 -23964405 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1191 297 0 0 0 chr15 79530569 79530607 -23964367 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 6 1191 374 167 46 35 chr15 79530607 79530694 -23964280 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 6 1191 39325 16 14 0 chr15 79530694 79535981 -23958993 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 6 1191 4491 14 2 0 chr15 79535981 79536473 -23958501 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1191 3091 163 152 103 chr15 79540467 79541313 -23953661 - RMER19B LTR ERVK -14 888 1 6 1191 950 297 53 35 chr15 79544182 79544521 -23950453 - MT2A LTR ERVL 0 533 189 8 1191 1924 116 89 48 chr15 79545215 79545265 -23949709 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 354 8 1191 1924 116 89 48 chr15 79545533 79545853 -23949121 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 1 8 1192 2274 105 17 14 chr15 79562783 79563139 -23931835 + RLTR15 LTR ERVK 1 357 -2 9 1192 1648 236 59 27 chr15 79574583 79574988 -23919986 - MTD LTR MaLR 0 419 2 1 1192 335 232 179 0 chr15 79579584 79579735 -23915239 + MER68 LTR ERVL 247 424 -139 1 1192 452 250 0 0 chr15 79584823 79584923 -23910051 - RLTR18B LTR ERVK -407 105 6 1 1192 1123 230 124 93 chr15 79590382 79590746 -23904228 - MTE2a LTR MaLR -2 377 3 1 1192 2554 184 43 2 chr15 79599335 79599821 -23895153 - RLTR18B LTR ERVK -6 506 1 1 1192 1629 172 54 12 chr15 79599821 79600157 -23894817 - RLTR18-int LTR ERVK 0 5361 5012 1 1192 624 316 79 62 chr15 79606665 79606951 -23888023 + ORR1E LTR MaLR 2 298 -61 1 1192 624 316 79 62 chr15 79607091 79607145 -23887829 + ORR1E LTR MaLR 299 348 -11 1 1192 1578 174 93 6 chr15 79609125 79609502 -23885472 + MTC LTR MaLR 3 421 0 1 1192 2413 130 89 23 chr15 79610210 79610604 -23884370 + MTC LTR MaLR 2 421 0 1 1192 320 293 77 28 chr15 79611399 79611574 -23883400 + ORR1E LTR MaLR 8 186 -188 1 1192 1866 163 123 3 chr15 79612401 79612751 -23882223 + ORR1B1 LTR MaLR 1 392 -2 1 1192 396 192 26 103 chr15 79613035 79613151 -23881823 - MT2B LTR ERVL -325 276 170 1 1192 2390 80 3 6 chr15 79613866 79614205 -23880769 - MTB LTR MaLR -62 338 1 1 1192 225 394 44 25 chr15 79621168 79621327 -23873647 + RLTR25B LTR ERVK 486 647 -381 2 1192 1140 255 79 32 chr15 79621627 79621967 -23873007 + MTEa LTR MaLR 8 363 -16 2 1192 546 347 131 16 chr15 79636930 79637235 -23857739 + LTR40a LTR ERVL 80 419 -100 2 1192 291 262 0 91 chr15 79637427 79637515 -23857459 - MT2B2 LTR ERVL -344 240 161 2 1192 270 369 157 29 chr15 79666522 79666754 -23828220 - MLT1D LTR MaLR 0 505 246 2 1192 270 369 157 29 chr15 79666896 79667045 -23827929 - MLT1D LTR MaLR -260 245 76 2 1192 891 302 179 11 chr15 79668148 79668516 -23826458 + MLT1E1 LTR MaLR 44 473 -181 3 1192 6544 100 22 21 chr15 79668632 79669585 -23825389 + RMER17B LTR ERVK 1 954 -4 3 1192 1483 208 122 15 chr15 79669646 79669983 -23824991 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 1192 922 220 79 41 chr15 79673511 79673828 -23821146 + RLTR15 LTR ERVK 14 342 -17 3 1192 450 270 35 35 chr15 79675172 79675313 -23819661 + ORR1E LTR MaLR 21 161 -198 3 1192 275 291 152 24 chr15 79675607 79675740 -23819234 + ORR1E LTR MaLR 219 378 -1 3 1192 2669 76 31 92 chr15 79676874 79677024 -23817950 - BGLII LTR ERVK 0 421 284 3 1192 2669 76 31 92 chr15 79677169 79677466 -23817508 - BGLII LTR ERVK -138 283 1 3 1192 6255 101 55 15 chr15 79678745 79679666 -23815308 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 3 1192 1309 101 36 32 chr15 79680152 79680399 -23814575 - ORR1B1 LTR MaLR -19 375 108 3 1192 1653 210 32 19 chr15 79680980 79680995 -23813979 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 362 3 1192 1653 210 32 19 chr15 79681141 79681494 -23813480 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 3 1192 2230 124 80 24 chr15 79681774 79682021 -23812953 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 149 3 1192 2230 124 80 24 chr15 79682212 79682337 -23812637 - ORR1B1 LTR MaLR -246 148 1 3 1192 355 299 0 30 chr15 79685284 79685384 -23809590 - RMER12 LTR ERVK -466 856 760 3 1192 765 280 23 102 chr15 79686462 79686728 -23808246 + MT2B LTR ERVL 284 528 -73 3 1192 11039 156 30 12 chr15 79686852 79688792 -23806182 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3705 5679 -82 3 1192 256 149 84 56 chr15 79689019 79689090 -23805884 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 639 -1324 3 1192 298 146 36 0 chr15 79689293 79689348 -23805626 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5705 5761 0 3 1192 846 289 93 93 chr15 79689348 79689481 -23805493 + MT2A LTR ERVL 1 142 -391 3 1192 846 289 93 93 chr15 79689620 79689948 -23805026 + MT2A LTR ERVL 143 461 -72 3 1192 333 120 0 0 chr15 79690162 79690212 -23804762 + MT2A LTR ERVL 535 584 0 3 1193 2118 143 26 4 chr15 79691868 79692347 -23802627 + RLTR33 LTR ERVK 4 538 -140 3 1193 484 193 171 12 chr15 79692550 79692682 -23802292 + RLTR33 LTR ERVK 402 613 -65 3 1193 266 294 25 76 chr15 79695516 79695625 -23799349 - MT2B LTR ERVL -336 265 163 3 1193 397 216 21 126 chr15 79696531 79696674 -23798300 - MT2B LTR ERVL -337 264 137 4 1193 1437 224 98 18 chr15 79697655 79697992 -23796982 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 1 4 1193 3569 99 48 9 chr15 79698583 79699123 -23795851 - RMER2 LTR ERV1 0 567 7 4 1193 1541 84 29 61 chr15 79699349 79699627 -23795347 - BGLII LTR ERVK -152 269 1 4 1193 2906 39 2 119 chr15 79700213 79700650 -23794324 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 4 1193 8529 17 0 3 chr15 79700652 79701650 -23793324 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 990 4 1193 323 248 62 39 chr15 79701732 79701862 -23793112 - RLTR10-int LTR ERVK -5987 1594 1462 4 1193 7826 35 4 2 chr15 79701926 79702882 -23792092 - RLTR10-int LTR ERVK -989 998 41 4 1193 2906 39 2 119 chr15 79702898 79703335 -23791639 - RLTR10 LTR ERVK -4 386 1 4 1193 1209 276 46 19 chr15 79703477 79703846 -23791128 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 4 1193 2574 120 82 7 chr15 79704488 79704915 -23790059 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 4 1193 247 287 9 122 chr15 79705363 79705378 -23789596 + MT2B LTR ERVL 155 156 -445 4 1193 7866 62 23 7 chr15 79706383 79707390 -23787584 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 1 4 1193 415 191 0 141 chr15 79707779 79707907 -23787067 + MT2B LTR ERVL 155 264 -337 4 1193 1116 195 56 0 chr15 79708484 79708804 -23786170 + RLTR24 LTR ERV1 1 411 -118 4 1193 481 303 57 25 chr15 79713136 79713316 -23781658 + MLT1I LTR MaLR 2 177 -234 4 1193 1085 212 149 33 chr15 79716066 79716423 -23778551 + MT2B LTR ERVL 1 541 -60 4 1193 310 140 0 39 chr15 79716496 79716548 -23778426 + MT2B LTR ERVL 535 584 0 4 1193 391 260 56 117 chr15 79719702 79719898 -23775076 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 247 4 1193 1625 194 101 22 chr15 79720357 79720715 -23774259 + MTB LTR MaLR 2 387 -13 4 1193 2147 61 0 20 chr15 79725992 79726293 -23768681 - RLTR4_Mm LTR ERV1 0 742 448 4 1193 1616 71 78 8 chr15 79726267 79726523 -23768451 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -468 274 1 4 1193 283 238 36 45 chr15 79731222 79731332 -23763642 + MT2B LTR ERVL 148 256 -345 5 1193 2822 92 25 8 chr15 79735109 79735505 -23759469 - RLTR9D LTR ERVK 0 403 1 5 1193 252 234 0 0 chr15 79735617 79735664 -23759310 - MER83A-int LTR ERV1 -4108 177 131 5 1193 286 289 12 24 chr15 79739264 79739349 -23755625 - MTE-int LTR MaLR -52 1528 1445 5 1193 297 200 108 32 chr15 79739655 79739748 -23755226 - MTE-int LTR MaLR -128 1452 1353 5 1193 495 211 99 40 chr15 79739910 79739992 -23754982 - MTE-int LTR MaLR -143 1437 1340 5 1193 1225 290 124 24 chr15 79740140 79740660 -23754314 - MTE-int LTR MaLR -218 1362 832 5 1193 271 236 0 24 chr15 79741192 79741318 -23753656 - MTE-int LTR MaLR -755 754 632 5 1193 691 184 200 6 chr15 79742095 79742270 -23752704 - MTD LTR MaLR -15 404 196 5 1193 930 199 18 72 chr15 79742706 79742928 -23752046 - MTD LTR MaLR -209 210 1 5 1193 302 304 0 87 chr15 79743476 79743491 -23751483 + MT2B LTR ERVL 150 153 -448 5 1193 3440 228 43 88 chr15 79767955 79768880 -23726094 + RMER19B LTR ERVK 1 884 -18 5 1193 569 312 148 40 chr15 79773083 79773460 -23721514 + RMER15-int LTR ERVL 1782 2199 -2800 6 1193 357 197 28 0 chr15 79773486 79773557 -23721417 + RMER15-int LTR ERVL 2297 2369 -2630 6 1193 1750 158 78 12 chr15 79773890 79774235 -23720739 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 1 6 1193 1912 113 171 43 chr15 79775716 79775870 -23719104 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 203 6 1193 1912 113 171 43 chr15 79776223 79776412 -23718562 - MTA_Mm LTR MaLR -194 202 2 6 1193 349 125 158 24 chr15 79777875 79777957 -23717017 + MT2A LTR ERVL 1 93 -440 6 1193 681 238 129 46 chr15 79778231 79778574 -23716400 + MT2A LTR ERVL 92 599 -2 6 1193 3269 166 145 83 chr15 79785556 79785896 -23709078 + RMER17B LTR ERVK 1 432 -526 6 1193 3269 166 145 83 chr15 79785984 79786530 -23708444 + RMER17B LTR ERVK 433 942 -16 6 1193 232 360 48 36 chr15 79788874 79789041 -23705933 - MLT1K LTR MaLR -343 252 84 6 1193 2566 112 28 12 chr15 79790332 79790758 -23704216 + RMER17B LTR ERVK 2 434 -524 6 1193 1386 147 125 13 chr15 79790726 79791037 -23703937 + RMER17B LTR ERVK 613 958 0 6 1193 712 276 18 52 chr15 79792804 79793128 -23701846 - MTE2b LTR MaLR -3 376 1 6 1193 1681 175 204 11 chr15 79793839 79793949 -23701025 + MTC LTR MaLR 1 117 -304 6 1193 1681 175 204 11 chr15 79794119 79794360 -23700614 + MTC LTR MaLR 118 420 -1 6 1193 441 220 0 84 chr15 79795839 79795958 -23699016 - MT2B LTR ERVL -344 257 149 6 1193 289 215 92 0 chr15 79798974 79799039 -23695935 - MMERVK10C-int LTR ERVK -949 6632 6562 6 1193 280 104 21 0 chr15 79803062 79803110 -23691864 + RLTR11A LTR ERVK 337 385 -143 6 1193 555 325 5 54 chr15 79803112 79803317 -23691657 - RodERV21-int LTR ERV1 -862 4129 3935 6 1193 306 314 64 64 chr15 79803360 79803556 -23691418 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3388 4218 4002 6 1193 354 389 7 24 chr15 79803810 79804102 -23690872 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3851 3750 3464 6 1193 288 267 35 149 chr15 79804912 79804971 -23690003 + MT2B LTR ERVL 109 233 -368 6 1193 3834 35 5 0 chr15 79805053 79805487 -23689487 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1193 7735 33 4 1 chr15 79805487 79806415 -23688559 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6651 6 1193 8489 33 0 0 chr15 79806406 79807427 -23687547 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 4790 6 1193 1867 47 0 2 chr15 79807420 79807855 -23687119 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1100 887 652 6 1193 309 68 23 0 chr15 79807858 79807902 -23687072 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6405 137 93 6 1193 2072 38 15 4 chr15 79808075 79808339 -23686635 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7314 267 1 6 1193 3834 35 5 0 chr15 79808339 79808773 -23686201 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 6 1193 5964 104 62 6 chr15 79811809 79812716 -23682258 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 7 1193 1499 202 93 18 chr15 79813361 79813704 -23681270 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 2 7 1193 304 347 94 47 chr15 79816545 79816799 -23678175 - MLT1L LTR MaLR -224 386 121 7 1193 227 309 47 93 chr15 79821172 79821322 -23673652 + MLT1N2 LTR MaLR 420 562 0 7 1194 4869 136 38 14 chr15 79824221 79825082 -23669892 + RMER13B LTR ERVK 19 900 -8 7 1194 1910 207 82 10 chr15 79837399 79837518 -23657456 + MTD LTR MaLR 1 118 -301 7 1194 1910 207 82 10 chr15 79837551 79837822 -23657152 + MTD LTR MaLR 119 418 -1 7 1194 335 248 0 95 chr15 79841250 79841264 -23653710 + MT2B LTR ERVL 152 154 -447 7 1194 1704 184 68 125 chr15 79849048 79849293 -23645681 - MTD LTR MaLR 0 419 206 7 1194 1704 184 68 125 chr15 79849470 79849665 -23645309 - MTD LTR MaLR -214 205 4 7 1194 236 282 41 98 chr15 79852172 79852294 -23642680 - MT2B LTR ERVL -305 296 182 7 1194 3255 36 29 0 chr15 79858716 79859101 -23635873 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1194 1231 236 46 82 chr15 79861231 79861619 -23633355 - MTEb LTR MaLR 0 379 6 8 1194 2359 108 31 3 chr15 79862828 79863153 -23631821 + ORR1B1 LTR MaLR 1 336 -58 8 1194 2359 108 31 3 chr15 79863670 79863725 -23631249 + ORR1B1 LTR MaLR 337 390 -4 8 1194 573 289 61 38 chr15 79864956 79865168 -23629806 - MTEb LTR MaLR -145 234 18 8 1194 734 263 83 41 chr15 79870139 79870381 -23624593 - MTD LTR MaLR -30 389 138 8 1194 325 289 109 22 chr15 79870746 79870867 -23624107 - MTD LTR MaLR -269 150 15 8 1194 3268 68 2 2 chr15 79870867 79871267 -23623707 + MTB LTR MaLR 1 400 0 8 1194 6494 95 10 82 chr15 79871267 79872433 -23622541 + MTB-int LTR MaLR 1 1082 -16 8 1194 293 237 69 49 chr15 79874290 79874392 -23620582 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 8 1194 342 273 38 13 chr15 79875224 79875381 -23619593 + MLT1A1 LTR MaLR 235 406 -2 8 1194 645 189 43 19 chr15 79883189 79883351 -23611623 + MTD LTR MaLR 253 418 -1 8 1194 297 269 81 96 chr15 79887842 79888174 -23606800 - MLT1C LTR MaLR -33 434 45 9 1194 512 270 64 44 chr15 79916994 79917383 -23577591 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 9 1194 1860 95 11 0 chr15 79917635 79917908 -23577066 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 52 9 1194 228 320 51 0 chr15 79918194 79918272 -23576702 - MER21B LTR ERV1 -778 85 4 9 1194 899 307 44 107 chr15 79937482 79937955 -23557019 - MLT1F2 LTR MaLR 0 569 119 1 1194 3113 69 25 8 chr15 79938865 79939258 -23555716 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1194 6648 106 45 71 chr15 79939258 79940385 -23554589 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1194 2052 58 3 23 chr15 79940385 79940708 -23554266 - MTB LTR MaLR 0 400 85 1 1194 263 360 268 24 chr15 79945662 79945916 -23549058 - MLT1J LTR MaLR -97 415 100 1 1195 239 268 0 35 chr15 79958538 79958590 -23536384 + MTEb LTR MaLR 3 52 -327 1 1195 1138 252 50 0 chr15 79958738 79959016 -23535958 + MTEb LTR MaLR 88 379 0 1 1195 4604 134 95 10 chr15 79959511 79960334 -23534640 - RMER19B LTR ERVK -8 894 2 1 1195 235 289 7 14 chr15 79962350 79962494 -23532480 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 612 1 1195 886 165 321 38 chr15 79965320 79965663 -23529311 + RMER10A LTR ERVL 1 440 -2 1 1195 1445 247 86 92 chr15 79966661 79967174 -23527800 - RLTR18B LTR ERVK -2 510 1 1 1195 2274 151 56 25 chr15 79969343 79969738 -23525236 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1195 241 217 16 32 chr15 79973980 79974042 -23520932 - RMER6B LTR ERVK -33 428 368 1 1195 251 333 46 28 chr15 79981328 79981436 -23513538 - RLTR18B LTR ERVK -2 510 401 1 1195 736 273 128 102 chr15 79981649 79981769 -23513205 - RLTR18B LTR ERVK -105 511 380 1 1195 1142 237 52 85 chr15 79981916 79982198 -23512776 - RLTR18B LTR ERVK -237 379 92 1 1195 1142 232 42 83 chr15 79982390 79982484 -23512490 - RLTR18B LTR ERVK -419 93 1 1 1195 497 277 97 128 chr15 79983620 79983980 -23510994 - ORR1E LTR MaLR -4 355 7 1 1195 3478 35 0 2 chr15 79996476 79996872 -23498102 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 1 1195 250 262 61 24 chr15 79998570 79998652 -23496322 - MLT1H LTR MaLR -345 204 120 1 1195 1397 148 54 60 chr15 80010871 80011202 -23483772 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 2 1195 557 194 9 0 chr15 80012287 80012395 -23482579 + ORR1C1 LTR MaLR 5 113 -265 2 1195 1212 172 0 135 chr15 80014098 80014401 -23480573 + ORR1C1 LTR MaLR 111 372 -6 2 1195 802 88 71 8 chr15 80015931 80016057 -23478917 - RMER19B LTR ERVK -12 890 757 3 1195 810 322 84 3 chr15 80019060 80019371 -23475603 - RLTR18B LTR ERVK -9 503 168 4 1195 805 222 106 119 chr15 80019742 80019805 -23475169 - RMER10A LTR ERVL -9 433 367 4 1195 805 222 106 119 chr15 80019827 80020142 -23474832 - RMER10A LTR ERVL -76 366 61 4 1195 450 280 58 29 chr15 80024922 80025128 -23469846 - RLTR15 LTR ERVK -3 356 145 5 1195 378 186 0 0 chr15 80025353 80025423 -23469551 - ORR1A2 LTR MaLR -297 70 1 5 1195 7439 160 55 13 chr15 80025423 80026588 -23468386 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1509 289 5 1195 7439 160 55 13 chr15 80026609 80026891 -23468083 - ORR1A2-int LTR MaLR -1221 288 1 5 1195 1856 130 79 40 chr15 80026891 80027244 -23467730 - ORR1A2 LTR MaLR 0 367 1 5 1195 3566 136 58 10 chr15 80028664 80029251 -23465723 - MurERV4_19-int LTR ERVK -4950 830 216 5 1195 3254 148 35 38 chr15 80029251 80030317 -23464657 - ORR1A2-int LTR MaLR -817 1146 1 5 1195 2047 125 6 0 chr15 80030498 80030818 -23464156 - ORR1A2 LTR MaLR -5 322 1 5 1195 3086 56 2 8 chr15 80033462 80033860 -23461114 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1195 232 320 0 118 chr15 80034166 80034276 -23460698 + MTE2b LTR MaLR 82 178 -201 6 1195 1039 267 128 28 chr15 80034194 80034583 -23460391 + MLT2B3 LTR ERVL 127 554 0 6 1195 447 337 83 10 chr15 80036374 80036566 -23458408 - MLT2B3 LTR ERVL -321 233 28 7 1195 400 330 60 32 chr15 80044259 80044444 -23450530 - MLT1J LTR MaLR -271 241 52 9 1195 243 164 82 82 chr15 80052955 80053028 -23441946 - RLTR19C LTR ERVK -400 106 34 1 1195 1644 166 135 44 chr15 80053779 80054164 -23440810 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 1 1195 242 297 0 86 chr15 80057547 80057628 -23437346 + RLTR25B LTR ERVK 426 499 -529 1 1195 3315 18 8 0 chr15 80063042 80063435 -23431539 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1195 349 158 43 129 chr15 80070140 80070256 -23424718 - MT2B2 LTR ERVL -308 276 171 1 1195 2421 121 63 43 chr15 80074754 80075195 -23419779 - MT2C_Mm LTR ERVL -1 474 25 1 1195 278 213 33 0 chr15 80075182 80075243 -23419731 + MT2B LTR ERVL 154 216 -385 1 1195 6057 126 35 73 chr15 80075256 80075427 -23419547 + ORR1A2-int LTR MaLR 670 872 -920 1 1195 6179 96 11 12 chr15 80075618 80076612 -23418362 + ORR1A2-int LTR MaLR 873 1962 -1 1 1195 2222 100 22 0 chr15 80076613 80076933 -23418041 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1196 1546 205 58 80 chr15 80100285 80100763 -23394211 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 2 2 1196 1304 207 196 11 chr15 80116269 80116616 -23378358 + MTD LTR MaLR 9 419 0 2 1196 247 330 50 10 chr15 80129359 80129460 -23365514 - MLT1A1 LTR MaLR -294 114 10 2 1196 545 134 34 43 chr15 80132345 80132462 -23362512 + MTD LTR MaLR 5 120 -299 3 1196 480 194 11 0 chr15 80132832 80132925 -23362049 + MTD LTR MaLR 110 203 -216 3 1196 340 364 14 20 chr15 80154421 80154567 -23340407 - LTR37B LTR ERV1 -249 219 75 3 1196 236 232 18 18 chr15 80160099 80160156 -23334818 - MLT1A0 LTR MaLR -50 315 259 3 1196 374 323 134 50 chr15 80167804 80168087 -23326887 - RLTR12B LTR ERVK -220 308 2 3 1196 2052 147 55 57 chr15 80178991 80179410 -23315564 - MTC LTR MaLR -2 419 2 3 1196 949 248 19 39 chr15 80213418 80213674 -23281300 - RLTR14 LTR ERV1 -131 251 1 4 1196 666 289 18 22 chr15 80213824 80214047 -23280927 - RLTR14-int LTR ERV1 -151 5166 4945 4 1196 275 300 21 7 chr15 80215009 80215153 -23279821 - MuLV-int LTR ERV1 -2719 5059 4885 4 1196 296 302 86 39 chr15 80215504 80215873 -23279101 - RLTR14-int LTR ERV1 -3231 4370 4226 4 1197 1381 181 24 4 chr15 80223442 80223697 -23271277 - MTEa LTR MaLR 0 379 120 4 1197 508 244 46 0 chr15 80223697 80223828 -23271146 - MTEa LTR MaLR -221 158 22 4 1197 2098 155 31 0 chr15 80229061 80229416 -23265558 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 11 4 1197 271 327 39 32 chr15 80229597 80229752 -23265222 - MLT1K LTR MaLR -57 538 383 4 1197 268 248 257 4 chr15 80234247 80234440 -23260534 - RMER15 LTR ERVL 0 575 305 4 1197 2097 121 62 100 chr15 80234596 80235066 -23259908 - RMER4A LTR ERVK 0 466 15 4 1197 1553 91 223 71 chr15 80235161 80235444 -23259530 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1197 2264 123 45 35 chr15 80237054 80237451 -23257523 - MTC LTR MaLR 0 421 21 4 1197 373 312 97 0 chr15 80240086 80240230 -23254744 - MLT1A LTR MaLR -216 158 1 4 1197 595 298 21 30 chr15 80240327 80240660 -23254314 + ORR1E LTR MaLR 2 366 -13 4 1197 267 277 48 0 chr15 80241023 80241106 -23253868 - MLT2C1 LTR ERVL -296 101 15 4 1197 243 189 20 19 chr15 80242109 80242173 -23252801 - MLT1J1 LTR MaLR -344 104 44 4 1197 2547 63 25 0 chr15 80249272 80249591 -23245383 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1197 444 302 165 11 chr15 80253474 80253735 -23241239 + RMER5 LTR ERV1 223 523 -11 4 1197 1277 268 111 11 chr15 80254481 80254858 -23240116 - MTD LTR MaLR 0 419 5 4 1197 227 337 28 37 chr15 80260124 80260232 -23234742 - MLT1I LTR MaLR -300 111 5 4 1197 312 241 12 37 chr15 80264015 80264097 -23230877 - ORR1E LTR MaLR -5 354 275 5 1197 385 330 103 74 chr15 80264467 80264847 -23230127 + MLT1C LTR MaLR 1 391 -76 5 1197 321 219 60 95 chr15 80266469 80266585 -23228389 - ORR1E LTR MaLR -247 112 1 5 1197 236 289 242 0 chr15 80267316 80267444 -23227530 - LTR48 LTR ERV1 -628 159 1 5 1197 377 256 12 0 chr15 80267476 80267562 -23227412 + MLT1A0 LTR MaLR 279 365 0 5 1197 1857 137 142 12 chr15 80270960 80271285 -23223689 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1197 497 325 95 40 chr15 80271411 80271741 -23223233 - ORR1E LTR MaLR -2 377 6 5 1197 733 254 20 30 chr15 80274330 80274533 -23220441 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 170 5 1197 660 263 44 3 chr15 80275221 80275415 -23219559 - ORR1D2 LTR MaLR -181 193 1 5 1197 2051 137 29 3 chr15 80278298 80278614 -23216360 - RMER19B LTR ERVK 0 902 579 5 1197 2155 161 37 127 chr15 80278606 80279117 -23215857 - RMER19B LTR ERVK -436 466 2 5 1197 780 232 142 86 chr15 80279393 80279752 -23215222 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 5 1197 1500 174 291 68 chr15 80280104 80280574 -23214400 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 5 1197 1328 250 34 38 chr15 80280581 80280901 -23214073 + ORR1E LTR MaLR 3 321 -38 5 1197 252 289 53 117 chr15 80289011 80289199 -23205775 + MTEb LTR MaLR 204 379 0 5 1197 715 198 173 1 chr15 80293149 80293439 -23201535 - MTE2b LTR MaLR -2 357 20 5 1197 376 290 64 14 chr15 80293316 80293456 -23201518 - MT2A LTR ERVL -386 147 1 5 1197 2258 153 73 8 chr15 80294533 80294928 -23200046 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1197 1170 256 109 21 chr15 80316326 80316657 -23178317 - MTD LTR MaLR -55 364 5 5 1197 3546 20 5 0 chr15 80318751 80319145 -23175829 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1197 251 319 58 131 chr15 80319591 80319865 -23175109 - LTR78 LTR ERV1 -1050 254 1 6 1197 380 308 52 47 chr15 80321012 80321203 -23173771 + ORR1E LTR MaLR 14 205 -154 6 1197 499 326 57 30 chr15 80327700 80328000 -23166974 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3189 3496 -2218 6 1197 2473 73 28 0 chr15 80328098 80328415 -23166559 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 6 1197 1163 246 90 98 chr15 80335432 80335986 -23158988 + MLT1G3 LTR MaLR 8 557 -38 6 1197 1822 122 79 183 chr15 80339979 80340075 -23154899 + MTC LTR MaLR 1 97 -324 6 1197 1822 122 79 183 chr15 80340266 80340349 -23154625 + MTC LTR MaLR 98 116 -305 6 1197 1822 122 79 183 chr15 80340485 80340774 -23154200 + MTC LTR MaLR 117 421 0 6 1198 516 246 40 119 chr15 80348730 80349033 -23145941 - MTE2a LTR MaLR -122 257 2 6 1198 341 329 20 40 chr15 80351791 80351943 -23143031 - LTR16A LTR ERVL -248 203 55 6 1198 601 294 138 8 chr15 80353968 80354229 -23140745 - MLT1E2 LTR MaLR -119 508 214 6 1198 423 250 123 12 chr15 80364019 80364189 -23130785 - MLT1A0 LTR MaLR -171 194 6 6 1198 1918 132 116 46 chr15 80367594 80367966 -23127008 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 7 1198 3412 35 5 0 chr15 80370599 80370993 -23123981 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 7 1198 472 169 0 157 chr15 80376734 80376760 -23118214 + MT2B LTR ERVL 147 150 -451 7 1198 232 370 73 34 chr15 80379962 80380141 -23114833 - ORR1E LTR MaLR -123 236 51 7 1198 504 248 47 0 chr15 80384281 80384410 -23110564 - ORR1D2 LTR MaLR -26 344 210 7 1198 558 99 0 0 chr15 80385178 80385259 -23109715 - MTC LTR MaLR -340 81 1 7 1198 1958 155 38 42 chr15 80386383 80386813 -23108161 - RMER20A LTR ERVK -14 502 3 7 1198 1700 157 68 15 chr15 80387359 80387706 -23107268 + MTC LTR MaLR 1 411 -8 7 1198 473 189 0 70 chr15 80401752 80401765 -23093209 + MT2B LTR ERVL 152 156 -445 7 1198 261 269 0 60 chr15 80419210 80419293 -23075681 + MT2B LTR ERVL 163 240 -361 8 1198 1202 171 165 48 chr15 80433706 80434170 -23060804 - RMER5 LTR ERV1 0 534 17 8 1198 2662 174 67 20 chr15 80434177 80434272 -23060702 - RLTR20B3 LTR ERVK 0 577 483 8 1198 2662 174 67 20 chr15 80434316 80434771 -23060203 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 3 8 1198 359 315 89 67 chr15 80455074 80455401 -23039573 + RMER17C LTR ERVK 37 370 -40 9 1198 1698 176 113 16 chr15 80456994 80457375 -23037599 - MTD LTR MaLR 0 419 2 9 1198 1904 161 88 0 chr15 80470368 80470721 -23024253 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 9 1198 1771 133 111 32 chr15 80473141 80473330 -23021644 - RMER17C LTR ERVK 0 410 224 9 1198 1771 133 111 32 chr15 80473433 80473623 -23021351 - RMER17C LTR ERVK -187 223 1 9 1198 293 297 59 59 chr15 80473836 80473972 -23021002 + RMER15 LTR ERVL 438 573 -2 9 1199 1979 213 93 66 chr15 80483033 80483560 -23011414 + RMER15 LTR ERVL 21 561 -14 9 1199 387 179 46 35 chr15 80486852 80486939 -23008035 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 9 1199 237 252 33 83 chr15 80486948 80486977 -23007997 + ORR1A3-int LTR MaLR 591 613 -1350 9 1199 940 0 0 0 chr15 80486977 80487082 -23007892 + MT2_Mm LTR ERVL 1 105 -388 9 1199 1415 237 64 61 chr15 80493022 80493259 -23001715 - MTEb LTR MaLR 0 379 162 1 1199 1415 237 64 61 chr15 80493443 80493582 -23001392 - MTEb LTR MaLR -218 161 2 1 1199 327 305 99 76 chr15 80494305 80494619 -23000355 - MER31A LTR ERV1 0 466 133 1 1199 234 300 9 107 chr15 80495846 80495958 -22999016 + LTR80A LTR ERVL 402 502 -81 1 1199 1900 254 70 71 chr15 80497441 80497680 -22997294 - ORR1D2-int LTR MaLR -966 614 368 1 1199 1900 239 53 70 chr15 80497878 80498222 -22996752 - ORR1D2-int LTR MaLR -1003 367 12 1 1199 2969 79 47 0 chr15 80498222 80498625 -22996349 - BGLII_Mus LTR ERVK 0 422 1 1 1199 1900 239 53 70 chr15 80498625 80498637 -22996337 - ORR1D2-int LTR MaLR -1359 11 2 1 1199 1125 266 14 40 chr15 80498638 80498916 -22996058 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 100 1 1199 999 229 82 188 chr15 80498922 80499138 -22995836 + ORR1D2 LTR MaLR 1 146 -224 1 1199 999 229 82 188 chr15 80499415 80499602 -22995372 + ORR1D2 LTR MaLR 147 361 -9 1 1199 481 230 44 123 chr15 80499607 80499721 -22995253 - ORR1D2 LTR MaLR -269 105 1 1 1199 246 267 110 55 chr15 80509106 80509233 -22985741 - RLTR4_Mm LTR ERV1 -161 581 448 2 1199 747 284 147 15 chr15 80518562 80518834 -22976140 - MLT2D LTR ERVL -98 316 9 3 1199 1995 150 81 6 chr15 80521408 80521756 -22973218 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1199 1864 142 61 17 chr15 80530980 80531324 -22963650 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 4 1199 333 279 81 46 chr15 80531451 80531667 -22963307 - RLTR15 LTR ERVK -279 249 48 4 1199 446 228 133 57 chr15 80547543 80547701 -22947273 + MT2B LTR ERVL 94 263 -338 8 1199 1812 151 123 3 chr15 80549482 80549807 -22945167 - RMER15 LTR ERVL -5 570 207 9 1199 253 208 0 70 chr15 80559530 80559587 -22935387 + MT2B LTR ERVL 191 243 -358 1 1199 377 136 22 90 chr15 80559574 80559663 -22935311 - MT2B LTR ERVL -365 236 154 1 1199 234 240 0 107 chr15 80567290 80567374 -22927600 - RMER15 LTR ERVL -154 421 347 1 1199 1404 224 129 0 chr15 80570544 80570915 -22924059 - MTD LTR MaLR 0 419 1 1 1199 1708 153 83 29 chr15 80573246 80573595 -22921379 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 9 1 1199 342 298 97 23 chr15 80583159 80583334 -22911640 - LTR79 LTR ERVL -3 524 337 2 1199 360 268 72 16 chr15 80585340 80585465 -22909509 + LTR33 LTR ERVL 286 417 -98 2 1199 2436 120 14 8 chr15 80587316 80587678 -22907296 + ORR1B2 LTR MaLR 4 367 0 2 1199 2133 148 73 16 chr15 80589194 80589565 -22905409 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 2 1199 519 278 146 53 chr15 80595859 80596252 -22898722 - MLT1G1 LTR MaLR -96 483 72 2 1199 248 244 72 12 chr15 80596468 80596551 -22898423 + MT2B2 LTR ERVL 154 241 -343 2 1199 299 200 30 15 chr15 80597906 80597972 -22897002 - MTD LTR MaLR -77 342 276 2 1199 273 177 0 0 chr15 80597974 80598027 -22896947 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4451 4497 -1217 2 1199 374 288 129 18 chr15 80598027 80598197 -22896777 - MTD LTR MaLR -155 264 76 2 1199 1720 112 4 11 chr15 80598203 80598466 -22896508 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 59 2 1199 3226 118 97 4 chr15 80604100 80604636 -22890338 + MT2B LTR ERVL 1 586 -15 2 1199 1898 156 41 160 chr15 80604886 80605374 -22889600 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 2 1199 566 300 45 16 chr15 80605536 80605780 -22889194 - MuRRS4-int LTR ERV1 -269 4794 4569 2 1199 1431 333 83 71 chr15 80607212 80609058 -22885916 - RLTR6-int LTR ERV1 -2009 5592 3729 2 149 1431 328 84 73 chr15 80609078 80609859 -22885115 - RLTR6-int LTR ERV1 -3908 3870 3051 2 1200 492 300 42 46 chr15 80610127 80610437 -22884537 - MuRRS4-int LTR ERV1 -3141 1549 1216 2 1200 313 255 60 54 chr15 80610625 80610774 -22884200 - MURVY-int LTR ERV1 -6188 1368 1156 2 1200 1793 139 91 141 chr15 80611723 80612176 -22882798 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 1 2 1200 1255 199 99 25 chr15 80617695 80618019 -22876955 - MTEa LTR MaLR -23 356 9 2 1200 271 217 33 0 chr15 80635574 80635634 -22859340 + RMER15 LTR ERVL 404 465 -110 3 1200 3242 128 98 11 chr15 80646069 80646607 -22848367 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 3 1200 394 302 134 20 chr15 80656208 80656455 -22838519 - MLT1C LTR MaLR 0 467 193 3 1200 784 257 58 73 chr15 80658879 80659139 -22835835 - MTE2a LTR MaLR -67 312 57 3 1200 1672 174 33 90 chr15 80660565 80660987 -22833987 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 3 1200 356 216 56 47 chr15 80665033 80665140 -22829834 + LTR50 LTR ERVL 686 793 -2 4 1200 291 235 8 136 chr15 80666524 80666642 -22828332 - MT2B LTR ERVL -343 258 156 4 1200 1740 155 63 19 chr15 80670051 80670366 -22824608 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1200 1918 195 68 10 chr15 80673262 80673645 -22821329 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1200 885 217 145 19 chr15 80683269 80683579 -22811395 - RLTR15 LTR ERVK -10 349 1 4 1200 887 93 40 0 chr15 80691178 80691329 -22803645 + RMER17B LTR ERVK 307 463 -495 4 1200 2264 126 116 16 chr15 80697077 80697447 -22797527 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1200 300 218 16 141 chr15 80733448 80733576 -22761398 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 5 1200 2607 78 96 5 chr15 80738359 80738745 -22756229 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 5 1200 3730 184 43 45 chr15 80738746 80739673 -22755301 - RMER3D-int LTR ERVK -1 2841 1917 5 1200 2156 178 127 75 chr15 80739667 80740332 -22754642 - RMER3D-int LTR ERVK -1149 1693 470 5 1201 4527 155 65 150 chr15 80750010 80750406 -22744568 - ORR1A2-int LTR MaLR -472 1320 891 5 1201 4527 155 65 150 chr15 80750431 80750558 -22744416 - ORR1A2-int LTR MaLR -902 890 853 5 1201 4527 155 65 150 chr15 80750750 80751312 -22743662 - ORR1A2-int LTR MaLR -940 852 402 5 1201 4527 155 65 150 chr15 80751459 80751813 -22743161 - ORR1A2-int LTR MaLR -1391 401 1 5 1201 438 18 0 0 chr15 80751813 80751868 -22743106 - ORR1A2 LTR MaLR 0 346 292 5 1201 246 254 18 0 chr15 80751865 80751920 -22743054 - MT2B LTR ERVL -389 212 157 5 1201 826 127 51 0 chr15 80751875 80752033 -22742941 - ORR1A2-int LTR MaLR -1187 605 440 5 1201 1677 112 11 18 chr15 80752187 80752459 -22742515 - ORR1A2 LTR MaLR -57 270 1 5 1201 1731 105 22 138 chr15 80773107 80773206 -22721768 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 268 6 1201 1731 105 22 138 chr15 80773351 80773614 -22721360 - ORR1A4 LTR MaLR -62 267 1 6 1201 1333 238 135 49 chr15 80775705 80776217 -22718757 + RMER2 LTR ERV1 1 556 -11 6 1201 310 172 94 0 chr15 80792380 80792444 -22702530 + MT2B LTR ERVL 168 237 -364 7 1201 1293 246 65 56 chr15 80801790 80802346 -22692628 - RLTR18B LTR ERVK 0 616 70 7 1201 2325 73 19 3 chr15 80802320 80802634 -22692340 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1201 485 170 53 11 chr15 80802634 80802728 -22692246 - RLTR18B LTR ERVK -408 104 7 7 1201 509 319 68 34 chr15 80807211 80807445 -22687529 + RMER15 LTR ERVL 324 565 -10 7 1201 340 238 53 71 chr15 80813230 80813343 -22681631 - MT2B LTR ERVL -339 262 152 7 1201 851 303 53 50 chr15 80816244 80816563 -22678411 - MLT1G3 LTR MaLR -221 374 49 8 1201 851 303 53 50 chr15 80816750 80816791 -22678183 - MLT1G3 LTR MaLR -547 48 13 8 1201 994 129 14 0 chr15 80819668 80819815 -22675159 + MTC LTR MaLR 273 421 0 8 1201 1912 157 96 57 chr15 80823655 80824060 -22670914 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1201 447 231 48 32 chr15 80824704 80824829 -22670145 - MTD LTR MaLR -292 127 1 8 1201 333 277 30 105 chr15 80826599 80826732 -22668242 + MT2B LTR ERVL 144 266 -335 8 1201 374 226 25 102 chr15 80827926 80828044 -22666930 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 8 1201 302 194 71 88 chr15 80835449 80835562 -22659412 - MT2B LTR ERVL -337 264 154 8 1201 554 235 69 138 chr15 80863263 80863510 -22631464 + MTD LTR MaLR 5 234 -145 9 1202 20978 120 22 3 chr15 80881021 80884106 -22610868 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1580 4723 -1038 9 1202 4793 154 62 6 chr15 80884438 80885305 -22609669 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4714 5629 -132 9 1202 381 137 13 40 chr15 80885305 80885381 -22609593 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 9 1202 4473 81 5 10 chr15 80885419 80886006 -22608968 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 9 1202 2413 159 58 8 chr15 80887754 80888153 -22606821 - MTD LTR MaLR 0 419 1 9 1202 2209 141 60 11 chr15 80898371 80898737 -22596237 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 9 1202 1950 162 70 12 chr15 80898737 80899150 -22595824 + ORR1C2-int LTR MaLR 1 437 -1072 9 1202 489 178 24 48 chr15 80899128 80899252 -22595722 - MT2A LTR ERVL -329 204 84 9 1202 643 167 45 60 chr15 80899271 80899405 -22595569 - MT2A LTR ERVL -401 132 1 9 1202 2239 130 71 5 chr15 80900456 80900836 -22594138 - MTC LTR MaLR -9 412 8 9 1202 325 248 83 60 chr15 80904982 80905115 -22589859 + MLT1A1 LTR MaLR 268 403 -5 9 1202 2021 112 27 67 chr15 80905441 80905813 -22589161 - RMER4A LTR ERVK 0 466 110 9 1202 802 271 0 27 chr15 80906079 80906265 -22588709 + MTE2b LTR MaLR 154 334 -45 9 1202 297 175 18 0 chr15 80906462 80906519 -22588455 + MTE2b LTR MaLR 322 379 0 9 1202 265 351 82 12 chr15 80916574 80916744 -22578230 + RMER15 LTR ERVL 377 558 -17 1 1202 258 260 12 72 chr15 80921049 80921132 -22573842 + MER21B LTR ERV1 12 89 -774 1 1202 996 305 93 43 chr15 80921395 80921857 -22573117 + MER21B LTR ERV1 222 706 -157 1 1202 1465 166 226 80 chr15 80937183 80937648 -22557326 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 1 1202 441 18 0 0 chr15 80943610 80943665 -22551309 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 292 1 1202 1773 63 87 0 chr15 80944268 80944520 -22550454 - ORR1A0 LTR MaLR -43 303 30 1 1202 497 165 20 30 chr15 80945913 80946013 -22548961 - ORR1C1 LTR MaLR -40 344 246 1 1202 555 140 11 0 chr15 80946010 80946103 -22548871 - ORR1C1 LTR MaLR -284 94 1 1 1202 490 268 57 32 chr15 80954427 80954585 -22540389 + MLT1H1 LTR MaLR 1 162 -393 1 1202 233 328 74 25 chr15 80954801 80954923 -22540051 + MLT1H1 LTR MaLR 299 426 -129 1 1202 377 222 23 93 chr15 80957567 80957585 -22537389 + MT2B LTR ERVL 145 153 -448 1 1202 2781 60 5 3 chr15 80962668 80963050 -22531924 + MTA_Mm LTR MaLR 6 388 -8 1 1202 798 232 22 12 chr15 80963315 80963546 -22531428 + RMER17C LTR ERVK 1 410 -399 1 1202 241 323 47 31 chr15 80963615 80963639 -22531335 + RMER17C LTR ERVK 411 434 -375 1 1202 437 332 133 31 chr15 80965942 80966228 -22528746 + MLT1J LTR MaLR 23 337 -175 1 1202 1074 189 155 52 chr15 80974861 80975262 -22519712 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 1 1202 4507 16 0 0 chr15 80975897 80976390 -22518584 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1202 41692 14 14 0 chr15 80976390 80981688 -22513286 + MERVL-int LTR ERVL 1 5371 -114 1 1202 374 123 13 40 chr15 80981688 80981764 -22513210 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 640 -1323 1 1202 321 0 0 0 chr15 80981764 80981802 -22513172 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1202 4507 16 0 0 chr15 80981802 80982295 -22512679 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1202 5542 165 88 48 chr15 80983227 80984477 -22510497 + RMER12 LTR ERVK 4 1303 -19 1 1202 322 209 0 131 chr15 80986588 80986604 -22508370 + MT2B LTR ERVL 155 157 -444 1 1202 3299 46 5 2 chr15 80987258 80987653 -22507321 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1202 321 292 44 70 chr15 80990118 80990232 -22504742 + ORR1E LTR MaLR 49 159 -215 1 1202 717 252 62 28 chr15 80990291 80990614 -22504360 + RLTR15 LTR ERVK 10 343 -16 1 1203 280 387 58 6 chr15 81004556 81004712 -22490262 + MLT2C1 LTR ERVL 32 195 -202 2 1203 451 319 108 51 chr15 81005031 81005260 -22489714 + MLT1D-int LTR MaLR 2 243 -1128 2 1203 451 316 109 58 chr15 81005377 81005660 -22489314 + MLT1D-int LTR MaLR 244 550 -821 2 1203 962 269 77 74 chr15 81005900 81005918 -22489056 + MLT1D-int LTR MaLR 509 527 -844 2 1203 962 269 77 74 chr15 81006065 81006411 -22488563 + MLT1D-int LTR MaLR 528 874 -497 2 1203 986 137 6 0 chr15 81007071 81007232 -22487742 - MTC LTR MaLR -259 162 1 3 1203 290 312 85 59 chr15 81008142 81008295 -22486679 + MLT1D-int LTR MaLR 938 1094 -395 2 1203 289 303 26 3 chr15 81008732 81008834 -22486140 + MLT1D-int LTR MaLR 1638 1729 -6 2 1203 643 289 161 55 chr15 81008839 81009223 -22485751 + MLT1D LTR MaLR 7 431 -74 2 1203 1342 224 102 66 chr15 81010140 81010526 -22484448 + MT2A LTR ERVL 1 405 -128 3 1203 1342 224 102 66 chr15 81010673 81010758 -22484216 + MT2A LTR ERVL 406 489 -44 3 1203 294 116 0 80 chr15 81010809 81010884 -22484090 + MT2A LTR ERVL 462 530 -3 3 1203 542 333 52 18 chr15 81016794 81017023 -22477951 + MLT1F LTR MaLR 226 462 -86 5 1203 423 263 154 44 chr15 81022197 81022424 -22472550 - RMER15 LTR ERVL -11 564 313 7 1203 264 300 38 0 chr15 81025451 81025531 -22469443 + MLT1K LTR MaLR 225 307 -288 8 1203 260 276 89 105 chr15 81025956 81026146 -22468828 - LTR16A1 LTR ERVL -244 212 26 8 1203 1923 121 48 128 chr15 81033026 81033337 -22461637 + ORR1B2 LTR MaLR 1 312 -55 1 1203 1923 121 48 128 chr15 81033484 81033571 -22461403 + ORR1B2 LTR MaLR 313 367 0 1 1203 1861 172 106 13 chr15 81034455 81034831 -22460143 - MTD LTR MaLR -1 418 8 1 1203 780 257 19 29 chr15 81035776 81035867 -22459107 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 284 1 1203 5915 82 40 32 chr15 81035867 81036766 -22458208 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 1 1 1203 780 257 19 29 chr15 81036766 81036882 -22458092 - ORR1D1 LTR MaLR -91 283 169 1 1203 2192 97 9 67 chr15 81037457 81037799 -22457175 + ORR1A4 LTR MaLR 8 329 0 1 1203 358 215 13 92 chr15 81041234 81041354 -22453620 - MTE2a LTR MaLR 0 379 264 1 1203 618 295 12 6 chr15 81041365 81041532 -22453442 - MTE2a LTR MaLR -185 194 27 1 1203 360 244 78 71 chr15 81042500 81042543 -22452431 - MT2B2 LTR ERVL -425 159 116 1 1203 274 265 36 12 chr15 81042831 81042915 -22452059 + MLT1K LTR MaLR 218 303 -292 1 1203 815 257 86 71 chr15 81044223 81044415 -22450559 - RMER10A LTR ERVL -13 429 243 1 1203 815 257 86 71 chr15 81044476 81044677 -22450297 - RMER10A LTR ERVL -200 242 30 1 1203 2894 133 45 23 chr15 81044934 81045448 -22449526 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 525 -36 1 1203 290 231 0 47 chr15 81045926 81046053 -22448921 + ORR1B1-int LTR MaLR 634 754 -755 1 1203 1407 180 187 25 chr15 81046255 81046614 -22448360 - RMER10A LTR ERVL -8 434 18 1 1203 250 294 43 21 chr15 81047178 81047272 -22447702 + MLT1A1 LTR MaLR 286 381 -27 1 1203 2670 126 9 47 chr15 81048782 81048861 -22446113 + MTC LTR MaLR 1 80 -341 1 1203 2670 126 9 47 chr15 81049187 81049528 -22445446 + MTC LTR MaLR 81 408 -13 1 1203 2745 67 178 0 chr15 81050573 81050978 -22443996 + RLTR44C LTR ERVK 1 477 -25 1 1203 2248 184 103 67 chr15 81052990 81053200 -22441774 + RMER20B LTR ERVK 31 274 -353 2 1203 2248 184 103 67 chr15 81053388 81053728 -22441246 + RMER20B LTR ERVK 275 601 -26 2 1203 273 317 81 40 chr15 81056705 81056773 -22438201 - ERVL-int LTR ERVL -2588 3126 3057 2 1203 273 317 81 40 chr15 81057004 81057109 -22437865 - ERVL-int LTR ERVL -2658 3056 2946 2 1203 772 297 38 21 chr15 81057239 81057700 -22437274 - ERVL-int LTR ERVL -2938 2776 2303 2 1203 298 316 11 0 chr15 81058401 81058496 -22436478 - ERVL-int LTR ERVL -3504 2163 2068 2 1203 471 330 98 10 chr15 81061111 81061316 -22433658 + LTR33 LTR ERVL 293 515 0 2 1203 329 348 37 19 chr15 81061338 81061499 -22433475 - MLT1L LTR MaLR -242 368 205 2 1203 918 205 249 23 chr15 81064409 81064714 -22430260 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1203 1878 145 11 165 chr15 81074508 81074962 -22420012 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 2 1203 338 295 61 82 chr15 81075601 81075785 -22419189 - MT2B LTR ERVL -319 265 90 2 1203 2472 46 105 0 chr15 81076527 81076851 -22418123 + MTB LTR MaLR 1 358 -42 2 1203 458 37 0 0 chr15 81076977 81077031 -22417943 + MTB LTR MaLR 351 404 -3 2 1203 228 286 113 73 chr15 81081306 81081483 -22413491 - RLTR14 LTR ERV1 -45 337 154 2 1203 376 268 127 89 chr15 81083169 81083382 -22411592 + LTR81A LTR ERV1? 41 261 -1089 2 1203 673 178 103 23 chr15 81083702 81083913 -22411061 - RMER17C LTR ERVK -267 143 1 2 1203 291 356 32 32 chr15 81084021 81084175 -22410799 + LTR81C LTR ERV1? 955 1108 -45 2 1203 355 257 9 35 chr15 81089696 81089809 -22405165 + RMER10B LTR ERVL 265 374 -24 3 1203 339 292 0 73 chr15 81091363 81091459 -22403515 - MT2B LTR ERVL -361 240 152 3 1203 3587 67 28 4 chr15 81091577 81091750 -22403224 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 299 3 1203 3587 67 28 4 chr15 81091799 81092089 -22402885 - MT2C_Mm LTR ERVL -177 298 1 3 1203 1471 196 126 29 chr15 81092579 81092920 -22402054 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1203 1731 157 160 0 chr15 81097404 81097563 -22397411 + ORR1C2 LTR MaLR 1 189 -195 3 1203 1731 157 160 0 chr15 81097624 81097795 -22397179 + ORR1C2 LTR MaLR 190 383 -1 3 1203 1342 147 29 0 chr15 81098279 81098483 -22396491 - RLTR33 LTR ERVK -43 635 426 3 1203 390 240 29 29 chr15 81099109 81099212 -22395762 + MTEa LTR MaLR 277 379 0 3 1203 2198 148 87 34 chr15 81101310 81101722 -22393252 - RLTR24 LTR ERV1 -86 443 10 3 1203 2021 127 34 19 chr15 81102035 81102356 -22392618 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 1203 1182 245 35 4 chr15 81103960 81104214 -22390760 - MTE2b LTR MaLR -73 306 45 3 1203 250 255 25 37 chr15 81105242 81105347 -22389627 - RMER21B LTR ERV1 -273 569 522 3 1203 482 357 187 8 chr15 81105813 81106172 -22388802 + LTR16A1 LTR ERVL 4 426 -30 3 1203 922 199 116 116 chr15 81106238 81106417 -22388557 - MTE2a LTR MaLR -1 378 173 3 1203 922 199 116 116 chr15 81106653 81106773 -22388201 - MTE2a LTR MaLR -207 172 77 3 1203 310 236 32 53 chr15 81107343 81107437 -22387537 - MTE2a LTR MaLR -310 109 18 3 1203 282 311 58 53 chr15 81107759 81107954 -22387020 - MLT1C LTR MaLR -14 453 256 3 1203 600 248 6 98 chr15 81108086 81108269 -22386705 - MLT1C LTR MaLR -299 168 3 3 1203 1979 129 3 47 chr15 81110148 81110466 -22384508 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 22 3 1203 283 307 68 0 chr15 81119606 81119694 -22375280 - MLT2C2 LTR ERVL -232 232 139 4 1203 451 226 27 36 chr15 81119813 81119923 -22375051 - MLT2C2 LTR ERVL -352 112 4 4 1203 254 271 82 0 chr15 81120431 81120516 -22374458 + MLT1A0 LTR MaLR 263 354 -11 4 1203 614 279 87 30 chr15 81125662 81125886 -22369088 + MLT2B1 LTR ERVL 140 473 -94 4 1203 2821 47 44 59 chr15 81127710 81128116 -22366858 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1203 426 269 265 47 chr15 81128131 81128342 -22366632 - MER21B LTR ERV1 -104 759 503 4 1203 238 277 136 15 chr15 81128367 81128499 -22366475 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 223 4 1203 619 287 187 54 chr15 81128621 81129006 -22365968 - MER21B LTR ERV1 -356 507 72 4 1203 1891 139 14 48 chr15 81131824 81132180 -22362794 + BGLII_B LTR ERVK 1 344 -97 4 1203 1263 213 81 38 chr15 81133114 81133460 -22361514 - ORR1D1 LTR MaLR -13 361 1 4 1204 493 123 0 0 chr15 81137650 81137723 -22357251 + MTC LTR MaLR 1 73 -348 4 1204 1857 161 10 19 chr15 81138248 81138558 -22356416 + MTC LTR MaLR 107 413 -8 4 1204 290 146 42 0 chr15 81141283 81141331 -22353643 + MTE2a LTR MaLR 1 50 -329 4 1204 247 200 27 67 chr15 81141331 81141406 -22353568 - MLT2B1 LTR ERVL 0 567 496 4 1204 2206 230 64 88 chr15 81141477 81142254 -22352720 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4014 1747 989 4 1204 1368 282 55 27 chr15 81142255 81142942 -22352032 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4987 774 3 4 1204 870 302 42 122 chr15 81142944 81143509 -22351465 - MT2A LTR ERVL 0 533 14 4 1204 1250 230 58 119 chr15 81143468 81143789 -22351185 + MTD LTR MaLR 5 318 -101 4 1204 1250 230 58 119 chr15 81143935 81144042 -22350932 + MTD LTR MaLR 319 407 -12 4 1204 364 200 29 0 chr15 81148718 81148788 -22346186 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 313 4 1204 1335 150 137 18 chr15 81149016 81149301 -22345673 - ORR1D1 LTR MaLR -55 319 1 4 1204 3113 158 29 8 chr15 81151734 81152245 -22342729 + RLTR12B LTR ERVK 1 522 -6 5 1204 3150 133 74 93 chr15 81155373 81156086 -22338888 - RMER6A LTR ERVK 0 756 57 5 1204 297 296 71 16 chr15 81162138 81162265 -22332709 + LTR48 LTR ERV1 292 425 -219 5 1204 335 256 67 0 chr15 81162623 81162713 -22332261 + LTR48 LTR ERV1 692 787 0 5 1204 366 348 35 28 chr15 81164434 81164576 -22330398 + RMER15 LTR ERVL 337 479 -96 5 1204 660 288 108 37 chr15 81164819 81165115 -22329859 + RMER15-int LTR ERVL 227 543 -4456 5 1204 235 213 0 0 chr15 81165616 81165663 -22329311 + ORR1E LTR MaLR 146 192 -167 5 1204 324 372 14 42 chr15 81168586 81168729 -22326245 + ORR1E LTR MaLR 1 139 -220 5 1204 306 225 325 0 chr15 81168745 81168865 -22326109 + ORR1E LTR MaLR 219 377 -2 5 1204 551 306 72 56 chr15 81176688 81176856 -22318118 + MLT1D LTR MaLR 182 347 -158 5 1204 551 306 72 56 chr15 81177063 81177213 -22317761 + MLT1D LTR MaLR 348 505 0 5 1204 3225 78 5 2 chr15 81179050 81179449 -22315525 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1204 232 226 0 54 chr15 81183098 81183154 -22311820 + MER21B LTR ERV1 19 71 -792 5 1204 5924 63 7 35 chr15 81186265 81187113 -22307861 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 824 -984 6 1204 1522 142 51 0 chr15 81187304 81187557 -22307417 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1543 1808 0 6 1204 2947 34 42 10 chr15 81192369 81192752 -22302222 - MTB LTR MaLR -5 395 1 6 1204 338 200 33 91 chr15 81197175 81197296 -22297678 + MT2B LTR ERVL 165 278 -323 6 1204 2367 134 105 3 chr15 81197772 81198154 -22296820 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1204 2363 148 205 10 chr15 81200776 81201255 -22293719 + RMER15 LTR ERVL 4 575 0 6 1204 510 262 96 59 chr15 81202553 81202953 -22292021 + RLTR15 LTR ERVK 2 303 -225 6 1204 289 164 32 16 chr15 81203027 81203089 -22291885 + RMER15 LTR ERVL 404 466 -109 6 1204 260 265 51 0 chr15 81204720 81204837 -22290137 + ORR1B1-int LTR MaLR 632 754 -755 6 1204 368 194 0 117 chr15 81211609 81211720 -22283254 + MT2B LTR ERVL 160 257 -344 6 1204 1238 211 95 37 chr15 81215097 81215446 -22279528 + ORR1C2 LTR MaLR 4 372 -12 6 1204 339 292 31 70 chr15 81218334 81218372 -22276602 + MT2B LTR ERVL 123 155 -446 6 1204 336 188 36 48 chr15 81220280 81220364 -22274610 - RLTR31_Mm LTR ERVK 0 561 479 7 1204 772 223 24 18 chr15 81220359 81220528 -22274446 + RLTR17 LTR ERVK 441 610 -82 7 1204 1688 147 134 27 chr15 81222287 81222616 -22272358 + ORR1C2 LTR MaLR 17 380 -4 7 1204 3247 50 52 0 chr15 81232743 81233127 -22261847 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 4 7 1204 266 213 82 0 chr15 81235976 81236037 -22258937 + MT2B2 LTR ERVL 175 240 -344 7 1204 1783 168 394 2 chr15 81243512 81244038 -22250936 - RMER19A LTR ERVK -2 735 4 7 1204 779 220 150 79 chr15 81247307 81247687 -22247287 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -2 407 1 7 1204 418 221 0 0 chr15 81249489 81249566 -22245408 - MTC LTR MaLR -324 97 21 7 1204 634 293 53 117 chr15 81262919 81263278 -22231696 - MER74B LTR ERVL -218 404 69 8 1205 508 198 45 0 chr15 81284614 81284725 -22210249 + RMER10B LTR ERVL 232 347 -51 9 1205 1269 226 78 16 chr15 81287936 81288272 -22206702 + ORR1E LTR MaLR 3 421 0 9 1205 4114 157 77 101 chr15 81289716 81289841 -22205133 - RMER19B LTR ERVK -14 888 764 9 1205 4114 157 77 101 chr15 81290033 81290778 -22204196 - RMER19B LTR ERVK -139 763 39 9 1205 4114 157 77 101 chr15 81290954 81290992 -22203982 - RMER19B LTR ERVK -864 38 1 9 1205 601 79 21 43 chr15 81291257 81291347 -22203627 - RMER16 LTR ERVK 0 533 446 9 1205 3398 26 5 5 chr15 81291347 81291766 -22203208 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 169 9 1205 262 175 66 66 chr15 81292441 81292502 -22202472 - RMER15 LTR ERVL -112 463 403 9 1205 3159 39 18 0 chr15 81300513 81300896 -22194078 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 9 1205 307 241 0 112 chr15 81303101 81303190 -22191784 - MT2B LTR ERVL -366 235 157 9 1205 364 312 104 63 chr15 81307310 81307532 -22187442 + RMER15 LTR ERVL 343 573 -2 9 1205 229 194 90 77 chr15 81311055 81311133 -22183841 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 431 9 1205 233 206 73 110 chr15 81311280 81311362 -22183612 - MT2B2 LTR ERVL -448 136 58 9 1205 1739 153 45 112 chr15 81314074 81314449 -22180525 - ORR1B1 LTR MaLR -4 390 41 1 1205 397 232 93 23 chr15 81314456 81314628 -22180346 + RMER10A LTR ERVL 247 430 -12 1 1205 279 266 177 0 chr15 81315574 81315653 -22179321 + LTR81A LTR ERV1? 98 190 -1160 1 1205 1224 187 100 45 chr15 81317440 81317745 -22177229 + RMER19B LTR ERVK 1 356 -381 1 1205 2450 149 56 31 chr15 81321967 81322417 -22172557 + RMER4A LTR ERVK 6 466 0 1 1205 2779 42 2 152 chr15 81322840 81323295 -22171679 - RLTR10 LTR ERVK -3 387 1 1 1205 17058 27 1 30 chr15 81323297 81325341 -22169633 - RLTR10-int LTR ERVK -3 1984 1 1 1205 2858 31 2 153 chr15 81325343 81325795 -22169179 - RLTR10 LTR ERVK -2 388 5 1 1205 12806 20 0 0 chr15 81325795 81327199 -22167775 + IAPEz-int LTR ERVK 1673 3076 -3405 1 1205 2467 25 0 0 chr15 81327185 81327462 -22167512 + IAPEz-int LTR ERVK 5630 5906 -575 1 1205 1199 42 0 0 chr15 81327462 81327606 -22167368 - RLTR10 LTR ERVK -246 144 1 1 1205 3440 58 94 0 chr15 81330478 81330912 -22164062 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 1 1205 1812 144 55 16 chr15 81335189 81335500 -22159474 + ORR1B1 LTR MaLR 1 323 -71 1 1205 1415 56 39 0 chr15 81342973 81343152 -22151822 + MT2C_Mm LTR ERVL 290 475 0 1 1205 319 248 24 153 chr15 81343861 81343985 -22150989 - MT2B LTR ERVL -353 248 141 1 1205 1559 122 14 214 chr15 81346204 81346525 -22148449 + RMER17C LTR ERVK 1 267 -143 1 1205 1559 122 14 214 chr15 81346672 81346863 -22148111 + RMER17C LTR ERVK 268 410 0 1 1205 1582 136 83 58 chr15 81355731 81356001 -22138973 + RMER17C LTR ERVK 1 283 -127 1 1205 1582 136 83 58 chr15 81356174 81356300 -22138674 + RMER17C LTR ERVK 284 407 -3 1 1205 5816 102 33 117 chr15 81358356 81359400 -22135574 - RMER17B LTR ERVK -2 956 1 1 1205 357 246 2 2 chr15 81360710 81360799 -22134175 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3165 1831 1743 1 1205 3974 144 98 127 chr15 81361671 81362292 -22132682 - RMER19B LTR ERVK -16 886 218 1 1205 3974 144 98 127 chr15 81362436 81362727 -22132247 - RMER19B LTR ERVK -685 217 1 1 1205 262 288 92 39 chr15 81363039 81363169 -22131805 + MT2B2 LTR ERVL 116 252 -332 1 1205 1752 208 110 75 chr15 81364523 81364739 -22130235 + RMER15 LTR ERVL 11 233 -342 1 1205 1752 208 110 75 chr15 81364925 81365254 -22129720 + RMER15 LTR ERVL 234 575 0 1 1205 863 310 44 83 chr15 81367606 81367968 -22127006 - MLT2B3 LTR ERVL -44 510 163 1 1205 1049 269 112 16 chr15 81368482 81368796 -22126178 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 26 1 1205 2198 112 150 6 chr15 81369446 81369805 -22125169 + MTC LTR MaLR 3 413 -8 1 1205 1948 188 26 81 chr15 81371527 81371727 -22123247 + MTB_Mm LTR MaLR 1 195 -212 1 1205 1948 188 26 81 chr15 81371873 81372094 -22122880 + MTB_Mm LTR MaLR 196 399 -8 1 1205 383 296 72 27 chr15 81373243 81373398 -22121576 - ORR1D2 LTR MaLR -6 413 253 1 1205 1482 196 35 32 chr15 81373420 81373736 -22121238 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 48 1 1205 4938 191 93 92 chr15 81373740 81374806 -22120168 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 286 1 1205 4938 191 93 92 chr15 81374924 81375226 -22119748 - ORR1D1-int LTR MaLR -1085 285 1 1 1205 1947 205 11 0 chr15 81375226 81375596 -22119378 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1205 585 225 7 14 chr15 81375598 81375738 -22119236 - ORR1D2 LTR MaLR -231 139 1 1 1205 1092 262 110 17 chr15 81376766 81377112 -22117862 + MTE2b LTR MaLR 1 378 -1 1 1205 1783 141 31 16 chr15 81378535 81378852 -22116122 + RMER4B LTR ERVK 17 338 -247 1 1205 582 240 152 84 chr15 81379025 81379103 -22115871 + RMER4B LTR ERVK 319 407 -178 1 1205 582 240 152 84 chr15 81379232 81379403 -22115571 + RMER4B LTR ERVK 408 585 0 1 1205 2163 267 152 88 chr15 81379921 81381163 -22113811 + RMER12 LTR ERVK 1 1322 0 1 1205 489 336 60 14 chr15 81381191 81381408 -22113566 + RMER15 LTR ERVL 336 562 -13 1 1205 290 242 37 92 chr15 81391660 81391769 -22103205 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 1 1205 971 190 52 0 chr15 81392637 81392848 -22102126 - MTD LTR MaLR -2 417 196 1 1205 536 217 115 44 chr15 81393040 81393223 -22101751 - MTD LTR MaLR -217 204 9 1 1205 381 223 7 110 chr15 81394244 81394380 -22100594 + MT2B LTR ERVL 160 281 -320 1 1206 1683 180 27 96 chr15 81397083 81397488 -22097486 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 1 1206 443 150 118 20 chr15 81398131 81398233 -22096741 - ORR1C1 LTR MaLR -266 112 1 1 1206 456 188 82 11 chr15 81400726 81400909 -22094065 + RMER17C LTR ERVK 80 275 -135 1 1206 275 286 116 0 chr15 81401090 81401202 -22093772 + RMER15 LTR ERVL 393 517 -58 1 1206 1410 49 0 0 chr15 81405830 81406015 -22088959 + MT2_Mm LTR ERVL 309 493 0 1 1206 693 192 340 122 chr15 81407982 81408326 -22086648 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1206 2231 180 75 57 chr15 81436098 81436645 -22058329 - RMER15 LTR ERVL 0 575 19 1 1206 877 250 43 78 chr15 81452275 81452622 -22042352 - ORR1C1 LTR MaLR -27 351 17 1 1206 336 181 11 98 chr15 81452642 81452734 -22042240 - MT2B LTR ERVL -362 239 156 1 1206 407 329 204 17 chr15 81456098 81456394 -22038580 - ORR1E LTR MaLR -4 355 5 1 1206 1998 137 186 16 chr15 81484241 81484686 -22010288 - RMER15 LTR ERVL -47 528 8 1 1206 776 185 71 19 chr15 81484686 81484840 -22010134 - RMER15-int LTR ERVL -23 4976 4815 1 1206 895 183 71 82 chr15 81484847 81485127 -22009847 - RMER15-int LTR ERVL -721 4278 4002 1 1206 2074 234 154 46 chr15 81485201 81485915 -22009059 - RMER15-int LTR ERVL -2755 2244 1454 1 1206 1496 282 14 0 chr15 81485929 81486298 -22008676 - RMER15-int LTR ERVL -3685 1314 941 1 1206 414 247 73 45 chr15 81486845 81487023 -22007951 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 264 1 1206 1917 249 64 15 chr15 81487236 81487468 -22007506 - RMER15-int LTR ERVL -4367 632 384 1 1206 1917 249 64 15 chr15 81487659 81487907 -22007067 - RMER15-int LTR ERVL -4616 383 128 1 1206 1570 196 51 68 chr15 81507678 81507890 -21987084 - MTD LTR MaLR -5 414 211 2 1206 1570 196 51 68 chr15 81508027 81508224 -21986750 - MTD LTR MaLR -209 210 12 2 1206 253 317 98 100 chr15 81521097 81521377 -21973597 + MLT1B LTR MaLR 3 275 -115 5 1206 253 317 98 100 chr15 81521894 81522002 -21972972 + MLT1B LTR MaLR 276 390 0 5 1206 437 242 195 7 chr15 81523149 81523303 -21971671 + MTD LTR MaLR 164 346 -73 5 1207 938 178 385 13 chr15 81531085 81531451 -21963523 + RLTR18B LTR ERVK 1 503 -9 7 1207 494 229 51 18 chr15 81538643 81538815 -21956159 + MurERV4_19-int LTR ERVK 4484 4714 -546 9 1207 558 194 56 0 chr15 81538938 81539046 -21955928 + MYSERV6-int LTR ERVK 8439 8552 -407 9 1207 303 276 124 80 chr15 81544437 81544638 -21950336 - MTE2a LTR MaLR -67 312 103 1 1207 717 236 169 72 chr15 81556825 81557104 -21937870 - MER21B LTR ERV1 -92 771 466 1 1207 469 300 130 39 chr15 81557335 81557543 -21937431 - MER21B LTR ERV1 -390 473 247 1 1207 238 220 20 0 chr15 81557653 81557703 -21937271 - MER21B LTR ERV1 -811 52 2 1 1207 292 120 20 0 chr15 81558010 81558060 -21936914 + ORR1C2 LTR MaLR 1 51 -333 1 1207 251 270 68 0 chr15 81559031 81559105 -21935869 - RMER21A LTR ERV1 -59 888 810 1 1207 1182 185 88 88 chr15 81559096 81559482 -21935492 - RMER10B LTR ERVL -12 386 1 1 1207 349 250 32 104 chr15 81562309 81562434 -21932540 - MT2B LTR ERVL -343 258 143 1 1207 874 269 91 36 chr15 81563930 81564239 -21930735 - ORR1D2 LTR MaLR -43 327 2 1 1207 601 169 0 8 chr15 81564240 81564359 -21930615 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 1253 1 1207 419 254 35 119 chr15 81564682 81564883 -21930091 + RLTR23 LTR ERV1 247 430 0 1 1207 327 282 48 102 chr15 81565267 81565433 -21929541 - ORR1D2-int LTR MaLR -168 1202 1046 1 1207 236 171 0 0 chr15 81565709 81565750 -21929224 - ORR1D2-int LTR MaLR -325 1045 1005 1 1207 2437 239 55 165 chr15 81566060 81567141 -21927833 - ORR1D2-int LTR MaLR -392 978 16 1 1207 1158 239 133 24 chr15 81567162 81567492 -21927482 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 1 1207 1507 133 218 3 chr15 81567656 81567964 -21927010 - RMER10B LTR ERVL 0 398 25 1 1207 276 258 108 0 chr15 81567973 81568066 -21926908 - MLT2B4 LTR ERVL -9 547 445 1 1207 917 296 75 47 chr15 81568148 81568542 -21926432 - MLT2B4 LTR ERVL -100 456 1 1 1207 605 292 130 16 chr15 81569477 81569724 -21925250 - MLT1A0 LTR MaLR -13 352 78 1 1207 820 264 63 109 chr15 81570292 81570734 -21924240 + RLTR23 LTR ERV1 8 429 -1 1 1207 294 299 9 9 chr15 81574531 81574639 -21920335 + MER31A LTR ERV1 114 221 -264 2 1207 728 248 88 26 chr15 81574864 81575092 -21919882 + MER31A LTR ERV1 226 467 -18 2 1207 2466 21 49 41 chr15 81581522 81581736 -21913238 + ORR1A0-int LTR MaLR 1444 1654 -138 2 1207 2466 21 49 41 chr15 81581921 81582051 -21912923 + ORR1A0-int LTR MaLR 1655 1791 -1 2 1207 2152 34 0 88 chr15 81582052 81582371 -21912603 + ORR1A0 LTR MaLR 1 291 -55 2 1207 4354 56 24 27 chr15 81586569 81587158 -21907816 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 2 1207 2305 132 17 37 chr15 81601052 81601234 -21893740 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 227 2 1207 2305 132 17 37 chr15 81601597 81601726 -21893248 - ORR1B1 LTR MaLR -168 226 96 2 1207 2305 132 17 37 chr15 81601913 81602002 -21892972 - ORR1B1 LTR MaLR -299 95 3 2 1207 2035 163 26 16 chr15 81620472 81620852 -21874122 - MTC LTR MaLR -37 384 1 3 1207 351 276 66 66 chr15 81629253 81629389 -21865585 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 269 3 1207 1621 166 172 11 chr15 81630091 81630539 -21864435 + MT2A LTR ERVL 4 523 -10 3 1207 261 248 57 127 chr15 81638477 81638634 -21856340 + MT2B2 LTR ERVL 133 278 -306 3 1208 333 337 0 0 chr15 81659220 81659315 -21835659 + MTE2b LTR MaLR 3 97 -282 4 1208 277 295 61 26 chr15 81659322 81659437 -21835537 + MTE2b LTR MaLR 64 182 -197 4 1208 1975 162 45 47 chr15 81660212 81660660 -21834314 - RMER4A LTR ERVK 0 466 20 4 1208 1933 171 0 105 chr15 81692860 81693299 -21801675 - RMER10B LTR ERVL 0 398 6 4 1208 983 249 80 18 chr15 81700057 81700395 -21794579 + MTD LTR MaLR 5 419 0 5 1208 311 288 51 59 chr15 81712321 81712439 -21782535 - LTR75 LTR ERVL -91 471 355 5 1208 303 270 87 87 chr15 81712452 81712602 -21782372 - LTR75 LTR ERVL -296 266 117 5 1208 1572 181 171 8 chr15 81718022 81718378 -21776596 + MTD LTR MaLR 6 419 0 5 1208 492 268 68 51 chr15 81718667 81718844 -21776130 - MLT1F LTR MaLR -2 546 367 5 1208 603 306 88 18 chr15 81718917 81719143 -21775831 - MLT1F LTR MaLR -186 362 121 5 1208 285 295 0 69 chr15 81720987 81721089 -21773885 + MT2B LTR ERVL 198 292 -309 5 1208 245 350 0 37 chr15 81728035 81728142 -21766832 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 306 5 1208 2251 153 46 8 chr15 81731525 81731895 -21763079 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 6 1208 235 333 65 0 chr15 81751874 81751982 -21742992 + MLT1H LTR MaLR 50 164 -385 6 1208 1212 226 139 6 chr15 81754238 81754576 -21740398 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 6 1208 541 160 7 9 chr15 81755064 81755171 -21739803 + RLTR13D4 LTR ERVK 1 106 -1008 6 1208 2238 183 17 134 chr15 81760741 81761339 -21733635 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 2 6 1208 389 228 184 40 chr15 81761943 81762001 -21732973 + RLTR42-int LTR ERVK 1254 1315 -4207 6 1208 389 228 184 40 chr15 81762046 81762079 -21732895 + RLTR42-int LTR ERVK 1316 1355 -4167 6 1208 389 228 184 40 chr15 81762267 81762348 -21732626 + RLTR42-int LTR ERVK 1356 1451 -4071 6 1208 345 299 0 107 chr15 81764759 81764789 -21730185 + MT2B LTR ERVL 141 156 -445 6 1208 353 217 0 124 chr15 81765109 81765128 -21729846 + MT2B LTR ERVL 151 256 -345 6 1208 281 128 0 21 chr15 81777476 81777524 -21717450 - RMER10A LTR ERVL -395 47 1 7 1209 816 169 71 5 chr15 81793936 81794120 -21700854 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5476 5671 -90 7 1209 1402 219 45 88 chr15 81794855 81795133 -21699841 + RMER16 LTR ERVK 1 351 -182 7 1209 1402 212 51 83 chr15 81795310 81795494 -21699480 + RMER16 LTR ERVK 352 530 -3 7 1209 2377 129 21 92 chr15 81798232 81798666 -21696308 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 7 1209 620 165 222 63 chr15 81799063 81799169 -21695805 - RLTR25A LTR ERVK -32 1071 963 7 1209 620 165 222 63 chr15 81799217 81799316 -21695658 - RLTR25A LTR ERVK -141 962 833 7 1209 240 213 219 21 chr15 81799419 81799515 -21695459 - RLTR25A LTR ERVK -174 854 740 7 1209 1125 204 53 77 chr15 81799516 81799868 -21695106 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -1 408 1 7 1209 450 107 25 74 chr15 81799868 81799949 -21695025 - ETnERV2-int LTR ERVK -1 7405 7329 7 1209 585 251 270 3 chr15 81799949 81800249 -21694725 - RLTR13D6 LTR ERVK -365 537 158 7 1209 6286 137 40 44 chr15 81800249 81801336 -21693638 - ETnERV2-int LTR ERVK -198 7208 6127 7 1209 4912 170 25 18 chr15 81801305 81802802 -21692172 - ETnERV2-int LTR ERVK -3321 4085 2356 7 1209 1091 142 29 14 chr15 81803345 81803552 -21691422 - ETnERV2-int LTR ERVK -3756 3650 3441 7 1209 2438 118 73 57 chr15 81803783 81804417 -21690557 - ETnERV2-int LTR ERVK -2657 2187 1731 7 1209 5928 126 14 91 chr15 81804439 81805597 -21689377 - ETnERV2-int LTR ERVK -3714 1130 66 7 1209 2216 132 3 3 chr15 81805597 81805908 -21689066 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 7 1209 5928 126 14 91 chr15 81805908 81805971 -21689003 - ETnERV2-int LTR ERVK -4779 65 3 7 1209 1108 174 76 87 chr15 81805975 81806324 -21688650 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 409 1 7 1209 1247 194 441 27 chr15 81806327 81806632 -21688342 - RLTR25A LTR ERVK -286 817 362 7 1209 1247 239 137 49 chr15 81806778 81806856 -21688118 - RLTR25A LTR ERVK -742 361 299 7 1209 1247 239 137 49 chr15 81807050 81807247 -21687727 - RLTR25A LTR ERVK -805 298 85 7 1209 3341 124 123 100 chr15 81807707 81807813 -21687161 - RMER6A LTR ERVK -2 754 651 8 1209 3341 124 123 100 chr15 81808001 81808355 -21686619 - RMER6A LTR ERVK -106 650 319 8 1209 3341 124 123 100 chr15 81808501 81808776 -21686198 - RMER6A LTR ERVK -438 318 1 8 1209 322 318 142 32 chr15 81808952 81809261 -21685713 - MER77 LTR ERVL -221 386 44 8 1209 2257 142 26 88 chr15 81813895 81814423 -21680551 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 8 1209 672 197 50 137 chr15 81815012 81815046 -21679928 + RLTR19-int LTR ERVK 3812 3847 -2290 8 1209 1940 129 11 69 chr15 81815046 81815395 -21679579 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 8 1209 672 202 60 134 chr15 81815395 81815629 -21679345 + RLTR19-int LTR ERVK 3848 4031 -2106 8 1209 1330 187 57 79 chr15 81815652 81816006 -21678968 + RLTR19-int LTR ERVK 4036 4381 -1756 8 1209 1890 204 13 13 chr15 81816470 81816848 -21678126 + RLTR11A2 LTR ERVK 150 527 0 8 1209 237 235 46 69 chr15 81826031 81826118 -21668856 + MLT1A1 LTR MaLR 2 86 -322 8 1209 2244 135 111 0 chr15 81839726 81840105 -21654869 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1209 264 284 8 142 chr15 81843157 81843284 -21651690 + MT2B LTR ERVL 155 264 -337 9 1209 3030 164 74 18 chr15 81850062 81850613 -21644361 - RMER4B LTR ERVK 0 585 4 9 1209 332 239 116 32 chr15 81855764 81855776 -21639198 + MT2B LTR ERVL 152 171 -430 9 1209 267 304 37 25 chr15 81855805 81855886 -21639088 + RLTR25A LTR ERVK 522 603 -500 9 1209 362 226 31 51 chr15 81861217 81861315 -21633659 - LTR50 LTR ERVL -322 473 378 9 1209 261 218 0 38 chr15 81865319 81865403 -21629571 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 584 507 9 1209 345 47 0 0 chr15 81869218 81869261 -21625713 + MTB LTR MaLR 209 251 -149 9 1209 424 171 87 119 chr15 81879764 81879890 -21615084 - MT2B LTR ERVL -344 257 136 1 1209 261 181 74 111 chr15 81880507 81880588 -21614386 + MLT1A1 LTR MaLR 1 78 -330 1 1209 226 203 35 149 chr15 81880739 81880826 -21614148 + MLT1A1 LTR MaLR 66 142 -232 1 1209 847 97 16 16 chr15 81881642 81881768 -21613206 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 202 1 1209 1050 209 168 33 chr15 81881771 81882129 -21612845 + RMER2 LTR ERV1 4 515 -52 1 1209 1760 178 174 65 chr15 81882157 81882668 -21612306 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 1 1209 831 142 7 21 chr15 81882675 81882819 -21612155 - ORR1A4 LTR MaLR -119 210 69 1 1209 4465 150 95 50 chr15 81882819 81883682 -21611292 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 1209 533 115 23 0 chr15 81883682 81883769 -21611205 - ORR1B1 LTR MaLR -267 127 39 1 1209 494 291 52 104 chr15 81884720 81885046 -21609928 + RLTR25B LTR ERVK 1 309 -719 1 1209 326 255 84 78 chr15 81885858 81886024 -21608950 + RLTR25B LTR ERVK 862 1028 0 1 1209 3145 68 2 5 chr15 81886668 81887069 -21607905 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1209 2551 66 0 0 chr15 81897289 81897608 -21597366 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1209 340 244 0 95 chr15 81898051 81898146 -21596828 + MT2B LTR ERVL 155 240 -361 1 1209 769 160 41 7 chr15 81898241 81898386 -21596588 - RLTR30 LTR ERV1 -3 376 227 1 1209 518 305 135 50 chr15 81898940 81899461 -21595513 + RMER13B LTR ERVK 96 718 -190 1 1209 279 271 10 124 chr15 81906383 81906480 -21588494 - MT2B LTR ERVL -364 237 152 1 1209 931 203 137 16 chr15 81911857 81912112 -21582862 + MTD LTR MaLR 134 419 0 1 1209 345 345 36 6 chr15 81912739 81912873 -21582101 - MER68 LTR ERVL -24 583 416 1 1209 413 329 135 48 chr15 81912958 81913188 -21581786 - MER68 LTR ERVL -292 271 22 1 1209 1322 188 25 89 chr15 81914236 81914563 -21580411 - RLTR11A LTR ERVK -1 527 222 1 1209 235 267 93 28 chr15 81914725 81914833 -21580141 - LTR48B LTR ERV1 -141 503 389 1 1209 265 167 178 14 chr15 81919409 81919482 -21575492 + MLT1C LTR MaLR 217 301 -166 1 1209 253 170 308 39 chr15 81919617 81919721 -21575253 + MTE2a LTR MaLR 5 136 -243 1 1210 1764 150 55 35 chr15 81920404 81920613 -21574361 - RMER10B LTR ERVL -6 392 189 1 1210 1764 150 55 35 chr15 81920791 81920948 -21574026 - RMER10B LTR ERVL -210 188 19 1 1210 314 209 30 2 chr15 81926595 81926667 -21568307 - MTD LTR MaLR 0 419 303 1 1210 574 274 66 56 chr15 81926855 81927052 -21567922 - MTD LTR MaLR -208 211 13 1 1210 303 233 135 118 chr15 81932843 81933013 -21561961 - MTEa LTR MaLR -200 179 7 1 1210 990 303 84 12 chr15 81939327 81939661 -21555313 - MLT1A0 LTR MaLR -7 358 1 1 1210 409 297 110 0 chr15 81941332 81941480 -21553494 - RMER15-int LTR ERVL -4668 331 195 1 1210 2425 93 0 0 chr15 81942466 81942788 -21552186 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 6 1 1210 226 109 87 0 chr15 81946462 81946508 -21548466 - MT2A LTR ERVL 0 533 484 1 1210 12395 85 14 55 chr15 81947753 81948136 -21546838 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1471 1 1210 12395 85 14 55 chr15 81948298 81948572 -21546402 - RLTR22_Mur LTR ERVK -378 1470 1251 1 1210 12395 85 14 55 chr15 81948765 81948985 -21545989 - RLTR22_Mur LTR ERVK -598 1250 1046 1 1210 12395 85 14 55 chr15 81949163 81950200 -21544774 - RLTR22_Mur LTR ERVK -803 1045 10 1 1210 2615 65 78 34 chr15 81955765 81956147 -21538827 - MTB LTR MaLR 0 400 2 1 1210 228 225 40 53 chr15 81960899 81960974 -21534000 - LTR81C LTR ERV1? -374 779 706 1 1210 1330 200 19 58 chr15 81960993 81961301 -21533673 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 89 1 1210 243 297 27 0 chr15 81962113 81962187 -21532787 - MER49 LTR ERV1 -824 99 24 1 1210 1102 244 153 35 chr15 81964400 81964773 -21530201 - MTD LTR MaLR 0 419 3 1 1210 260 279 59 0 chr15 81966148 81966216 -21528758 - LTR40c LTR ERVL -10 452 381 1 1210 450 368 81 15 chr15 81966233 81966491 -21528483 - LTR40c LTR ERVL -129 333 63 1 1210 2796 67 45 0 chr15 81966891 81967266 -21527708 - MTB LTR MaLR 0 400 9 1 1210 379 280 75 50 chr15 81967403 81967602 -21527372 - HERVL40-int LTR ERVL -203 5327 5124 1 1210 339 314 46 15 chr15 81967677 81967874 -21527100 - HERVL40-int LTR ERVL -550 4980 4778 1 1210 228 284 9 112 chr15 81967883 81967990 -21526984 - RLTR13D2 LTR ERVK -319 704 609 1 1210 230 256 154 0 chr15 81968393 81968471 -21526503 - MER68 LTR ERVL -136 427 338 1 1210 235 284 149 41 chr15 81969042 81969163 -21525811 - LTR40c LTR ERVL -331 134 1 1 1210 1720 207 41 70 chr15 81987220 81987636 -21507338 - MTD LTR MaLR -14 405 2 1 1210 1284 244 86 47 chr15 82006994 82007377 -21487597 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 2 1210 548 295 124 25 chr15 82010303 82010626 -21484348 - ORR1E LTR MaLR 0 359 5 2 1210 328 305 295 64 chr15 82015342 82015610 -21479364 - ORR1E LTR MaLR -38 341 12 3 1210 766 263 37 31 chr15 82015926 82016194 -21478780 - ORR1E LTR MaLR -83 296 3 3 1210 267 242 0 31 chr15 82018087 82018151 -21476823 + MT2B LTR ERVL 196 257 -344 4 1210 401 262 94 86 chr15 82021676 82021931 -21473043 + RMER17C LTR ERVK 138 394 -16 5 1210 413 225 8 98 chr15 82044709 82044832 -21450142 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 8 1211 307 286 0 42 chr15 82052266 82052361 -21442613 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 318 1 1211 1986 129 191 13 chr15 82068015 82068045 -21426929 + RMER4A LTR ERVK 5 31 -435 1 1211 1986 129 191 13 chr15 82068178 82068539 -21426435 + RMER4A LTR ERVK 32 465 -1 1 1211 966 259 81 89 chr15 82073762 82073848 -21421126 + MTE2a LTR MaLR 1 79 -300 1 1211 966 259 81 89 chr15 82074013 82074308 -21420666 + MTE2a LTR MaLR 80 379 0 1 1211 262 241 183 33 chr15 82076065 82076185 -21418789 + RLTR19-int LTR ERVK 2684 2821 -417 1 1211 1763 142 29 50 chr15 82076187 82076527 -21418447 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 98 1 1211 569 88 154 0 chr15 82076816 82076907 -21418067 - RLTR23 LTR ERV1 -325 105 1 1 1211 935 196 113 53 chr15 82076917 82077164 -21417810 + RLTR19-int LTR ERVK 4024 4285 -1852 1 1211 249 248 252 17 chr15 82077540 82077659 -21417315 - RMER21B LTR ERV1 -277 565 419 1 1211 738 242 130 37 chr15 82077904 82078119 -21416855 - RodERV21-int LTR ERV1 -317 4674 4440 1 1211 317 340 21 0 chr15 82080870 82080967 -21414007 - LTR40c LTR ERVL -19 443 345 1 1211 2051 118 16 110 chr15 82081295 82081677 -21413297 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1211 463 232 87 8 chr15 82081895 82082021 -21412953 - LTR40c LTR ERVL -286 179 44 1 1211 1680 150 62 45 chr15 82083715 82084051 -21410923 - RMER10B LTR ERVL -38 360 19 2 1211 1981 131 57 41 chr15 82084773 82085140 -21409834 + RMER10B LTR ERVL 19 391 -7 2 1211 1016 214 113 33 chr15 82088135 82088410 -21406564 - ORR1D1 LTR MaLR -71 303 7 2 1211 2346 152 84 36 chr15 82091947 82092445 -21402529 - RLTR24 LTR ERV1 -2 527 6 2 1211 254 336 43 17 chr15 82096426 82096541 -21398433 + MLT1I LTR MaLR 8 125 -286 2 1211 2272 84 32 0 chr15 82114467 82114776 -21380198 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 8 2 1211 2233 137 84 43 chr15 82127395 82127836 -21367138 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 2 1211 2375 24 3 3 chr15 82133255 82133553 -21361421 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -22 371 1 3 1211 2006 146 79 3 chr15 82134229 82134558 -21360416 + ORR1B2 LTR MaLR 5 358 -9 3 1211 3440 40 2 0 chr15 82137013 82137412 -21357562 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1211 2191 127 9 6 chr15 82141827 82142152 -21352822 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 3 1211 1397 247 79 15 chr15 82143113 82143454 -21351520 - ORR1D1 LTR MaLR -11 363 1 3 1211 904 280 89 73 chr15 82146478 82146663 -21348311 + MTEa LTR MaLR 3 179 -200 3 1211 3205 33 48 0 chr15 82146663 82147055 -21347919 - IAPLTR2a LTR ERVK 0 411 1 3 1211 904 280 89 73 chr15 82147055 82147239 -21347735 + MTEa LTR MaLR 180 378 -1 3 1211 230 242 209 45 chr15 82147835 82147969 -21347005 + MTE-int LTR MaLR 1256 1411 -169 3 1211 3590 181 122 71 chr15 82148372 82148991 -21345983 + RLTR25B LTR ERVK 1 624 -404 3 1211 3590 181 122 71 chr15 82149137 82149255 -21345719 + RLTR25B LTR ERVK 625 765 -263 3 1211 3590 181 122 71 chr15 82149434 82149480 -21345494 + RLTR25B LTR ERVK 766 819 -209 3 1211 3590 181 122 71 chr15 82149533 82149705 -21345269 + RLTR25B LTR ERVK 820 1006 -22 3 1211 2583 71 12 9 chr15 82149720 82150046 -21344928 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 3 1211 1626 173 97 7 chr15 82151012 82151321 -21343653 - ORR1B1 LTR MaLR -57 337 1 3 1211 331 353 90 8 chr15 82156681 82156815 -21338159 - MT2A LTR ERVL -104 429 285 3 1211 484 207 68 8 chr15 82157868 82157985 -21336989 + RMER10B LTR ERVL 275 398 0 3 1211 344 321 30 48 chr15 82158586 82158753 -21336221 + MTD LTR MaLR 12 175 -244 3 1211 643 292 138 25 chr15 82158670 82158996 -21335978 + MT2A LTR ERVL 63 425 -108 3 1211 245 346 93 9 chr15 82159000 82159108 -21335866 + MT2A LTR ERVL 349 465 -68 3 1212 811 198 172 22 chr15 82185838 82186070 -21308904 - ORR1D1 LTR MaLR -107 267 1 4 1212 745 206 82 10 chr15 82188767 82188973 -21306001 - RMER10A LTR ERVL -6 436 216 4 1212 3082 82 27 40 chr15 82190266 82190747 -21304227 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 1212 586 257 21 0 chr15 82192316 82192456 -21302518 - MTE2b LTR MaLR -46 333 191 4 1212 618 241 166 6 chr15 82192704 82192879 -21302095 - MTE2b LTR MaLR -155 224 22 4 1212 3791 36 84 125 chr15 82192964 82193630 -21301344 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 639 -15 4 1212 6404 23 46 17 chr15 82193631 82194437 -21300537 + RLTR6-int LTR ERV1 1 829 -6949 4 1212 356 153 146 35 chr15 82194445 82194568 -21300406 + MMVL30-int LTR ERV1 280 377 -2922 4 1212 15151 35 26 6 chr15 82194861 82197786 -21297188 + MMVL30-int LTR ERV1 716 3698 0 4 1212 3645 36 87 128 chr15 82197786 82198432 -21296542 + RLTR6_Mm LTR ERV1 1 619 -35 4 1212 2167 109 113 26 chr15 82198510 82198935 -21296039 + RMER4A LTR ERVK 5 466 0 4 1212 973 202 28 24 chr15 82199149 82199362 -21295612 - RLTR42 LTR ERVK -25 214 1 4 1212 381 77 15 30 chr15 82199362 82199429 -21295545 - RLTR42-int LTR ERVK -1 5521 5456 4 1212 272 208 18 127 chr15 82199429 82199539 -21295435 - RLTR14 LTR ERV1 -283 99 2 4 1212 417 331 12 0 chr15 82200102 82200262 -21294712 - RLTR14-int LTR ERV1 -262 5055 4894 4 1212 449 262 8 8 chr15 82200612 82200739 -21294235 - RLTR14-int LTR ERV1 -4900 417 291 4 1212 2103 147 47 0 chr15 82200922 82201282 -21293692 - RLTR14 LTR ERV1 -3 379 3 4 1212 504 244 93 23 chr15 82212120 82212292 -21282682 - MTD LTR MaLR -18 401 218 4 1212 7479 232 88 61 chr15 82212773 82214197 -21280777 - MurERV4-int LTR ERVK -1555 3705 2299 4 1212 7479 247 82 63 chr15 82214275 82215968 -21279006 - MurERV4-int LTR ERVK -2962 2298 532 4 1212 303 130 0 0 chr15 82216355 82216401 -21278573 - MurERV4-int LTR ERVK -2562 2698 2653 4 1212 250 335 148 27 chr15 82218516 82218853 -21276121 + MER77 LTR ERVL 8 385 -222 4 1212 2173 131 66 11 chr15 82223055 82223434 -21271540 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1212 356 305 86 40 chr15 82226448 82226622 -21268352 + MER77 LTR ERVL 337 518 -89 4 1212 3397 38 5 0 chr15 82227170 82227564 -21267410 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1212 3443 38 0 0 chr15 82227767 82228163 -21266811 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1212 1143 237 188 3 chr15 82229559 82229889 -21265085 - MTD LTR MaLR -11 408 18 4 1212 3629 144 36 11 chr15 82231500 82232132 -21262842 + RMER17A2 LTR ERVK 1 648 -258 5 1212 241 294 122 24 chr15 82232647 82232811 -21262163 + MER77 LTR ERVL 422 601 -6 5 1212 236 250 78 29 chr15 82240674 82240777 -21254197 + MER72B LTR ERV1 280 387 -381 5 1212 592 192 8 60 chr15 82243612 82243745 -21251229 - RLTR20B2 LTR ERVK -434 126 1 5 1212 3212 36 31 0 chr15 82244779 82245163 -21249811 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1212 367 44 0 0 chr15 82246620 82246665 -21248309 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 282 5 1212 1931 150 8 10 chr15 82246905 82247262 -21247712 - ORR1A2 LTR MaLR -41 353 1 5 1212 589 244 18 55 chr15 82249318 82249483 -21245491 + RLTR9A LTR ERVK 210 368 0 5 1212 775 294 35 8 chr15 82249491 82249752 -21245222 + RodERV21-int LTR ERV1 730 997 -3994 5 1212 1263 156 188 28 chr15 82249995 82250460 -21244514 + RMER17C-int LTR ERVK 1477 2016 -1222 5 1212 2182 191 34 24 chr15 82250493 82250906 -21244068 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 276 5 1212 785 238 39 26 chr15 82250920 82250959 -21244015 + RMER17C LTR ERVK 77 114 -296 5 1212 785 238 39 26 chr15 82251138 82251409 -21243565 + RMER17C LTR ERVK 115 390 -20 5 1212 2144 132 0 19 chr15 82254831 82254923 -21240051 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 233 5 1212 3229 46 18 0 chr15 82254923 82255316 -21239658 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1212 2144 132 0 19 chr15 82255316 82255548 -21239426 - ORR1A2 LTR MaLR -95 232 1 5 1212 3309 153 28 91 chr15 82255549 82256230 -21238744 - ORR1A2-int LTR MaLR -1 1962 1325 5 1212 2245 50 11 0 chr15 82256564 82256844 -21238130 + LTRIS_Mus LTR ERV1 10 292 -295 5 1212 710 64 0 0 chr15 82256842 82256936 -21238038 + LTRIS_Mus LTR ERV1 494 587 0 5 1212 3373 168 14 14 chr15 82256936 82257583 -21237391 - ORR1A2-int LTR MaLR -648 1315 329 5 1212 606 229 18 95 chr15 82257542 82257711 -21237263 - MT2B LTR ERVL -314 287 132 5 1212 275 205 63 13 chr15 82257643 82257721 -21237253 - ORR1A2-int LTR MaLR -1187 605 524 5 1212 1216 231 39 84 chr15 82257721 82258152 -21236822 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 5 1212 7368 190 53 32 chr15 82258152 82258813 -21236161 + RMER16-int LTR ERVK 1 698 -4708 5 1212 10631 158 47 16 chr15 82258840 82261534 -21233440 + RMER16-int LTR ERVK 699 3455 -1951 5 1212 2180 176 15 20 chr15 82262678 82263085 -21231889 + ORR1A3-int LTR MaLR 848 1252 -711 5 1212 4684 65 5 22 chr15 82263085 82263682 -21231292 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 5 1212 6254 132 62 39 chr15 82264345 82265433 -21229541 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 1 5 1212 496 319 66 19 chr15 82267424 82267680 -21227294 - RodERV21-int LTR ERV1 -3994 997 730 5 1212 513 242 228 45 chr15 82267688 82267999 -21226975 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 1212 2421 175 2 5 chr15 82269572 82269986 -21224988 + ORR1A2-int LTR MaLR 1551 1963 0 5 1212 2033 154 9 0 chr15 82269986 82270310 -21224664 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1212 298 283 124 18 chr15 82271655 82271824 -21223150 - MER77 LTR ERVL -36 571 385 5 1212 367 291 147 33 chr15 82275156 82275462 -21219512 - MER77 LTR ERVL -222 385 45 5 1212 5419 116 53 17 chr15 82275686 82276216 -21218758 - RMER17A2 LTR ERVK 0 906 370 5 1212 5419 116 53 17 chr15 82276270 82276614 -21218360 - RMER17A2 LTR ERVK -537 369 1 5 1212 1015 234 188 3 chr15 82278200 82278530 -21216444 + MTD LTR MaLR 18 408 -11 5 1212 293 308 86 25 chr15 82280664 82280827 -21214147 - MER77 LTR ERVL -99 508 336 5 1212 1575 132 33 66 chr15 82289720 82290053 -21204921 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 5 1212 430 178 294 0 chr15 82298910 82299036 -21195938 + ORR1A2 LTR MaLR 6 168 -159 5 1212 2771 61 3 3 chr15 82308618 82308962 -21186012 + ORR1A1 LTR MaLR 3 346 0 5 1212 2222 83 28 8 chr15 82308962 82309315 -21185659 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 360 -1432 5 1212 11527 75 11 4 chr15 82309301 82311399 -21183575 + ORR1A1-int LTR MaLR 94 1792 0 5 1212 2374 54 105 6 chr15 82311399 82311714 -21183260 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 5 1213 399 138 0 30 chr15 82315191 82315258 -21179716 + RMER16-int LTR ERVK 3441 3505 -1901 5 1213 6423 146 41 9 chr15 82315270 82316769 -21178205 + RMER16-int LTR ERVK 3567 5113 -293 5 1213 374 202 12 0 chr15 82316771 82316855 -21178119 + RMER16 LTR ERVK 449 533 0 5 1213 2302 184 26 53 chr15 82316855 82317386 -21177588 - ORR1A3-int LTR MaLR -1441 522 6 5 1213 755 162 62 49 chr15 82317386 82317477 -21177497 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 225 5 1213 7446 64 12 23 chr15 82317477 82318466 -21176508 + RLTR13A3 LTR ERVK 1 978 0 5 1213 755 162 62 49 chr15 82318466 82318536 -21176438 - ORR1A3 LTR MaLR -102 224 155 5 1213 3465 218 73 14 chr15 82330879 82331731 -21163243 - RMER16-int LTR ERVK -3429 1977 1076 5 1213 418 205 78 64 chr15 82331731 82331872 -21163102 - RMER16 LTR ERVK -149 384 242 5 1213 284 227 29 43 chr15 82331872 82331941 -21163033 - ETnERV2-int LTR ERVK -4866 2540 2473 5 1213 338 109 0 18 chr15 82332014 82332070 -21162904 + ORR1A2-int LTR MaLR 523 577 -1215 5 1213 499 229 0 115 chr15 82332052 82332200 -21162774 + MT2B LTR ERVL 157 287 -314 5 1213 4796 172 30 69 chr15 82332158 82332742 -21162232 + ORR1A2-int LTR MaLR 718 1335 -628 5 1213 4796 171 19 84 chr15 82333094 82333787 -21161187 + ORR1A2-int LTR MaLR 1166 1791 -1 5 1213 2205 116 25 0 chr15 82333788 82334107 -21160867 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1213 2763 100 49 3 chr15 82335323 82335714 -21159260 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 5 1213 2894 148 30 42 chr15 82336653 82337293 -21157681 + RMER17A LTR ERVK 120 751 0 5 1213 1294 108 50 36 chr15 82337293 82337514 -21157460 + RMER17A-int LTR ERVK 1 224 -1504 5 1213 7226 104 14 43 chr15 82337592 82338834 -21156140 + RMER17A-int LTR ERVK 185 1728 0 5 1213 2983 132 61 18 chr15 82338847 82339451 -21155523 + RMER17A LTR ERVK 120 749 -2 5 1213 1343 174 25 111 chr15 82340764 82341240 -21153734 - RMER17C LTR ERVK -520 438 16 6 1213 795 212 0 17 chr15 82341245 82341418 -21153556 - RMER17C-int LTR ERVK 0 3238 3069 6 1213 1209 187 13 19 chr15 82342069 82342351 -21152623 + ORR1A2 LTR MaLR 1 272 -122 6 1213 316 235 104 60 chr15 82342351 82342513 -21152461 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 983 6 1213 1087 323 40 29 chr15 82343309 82344099 -21150875 - ETnERV3-int LTR ERVK -30 5778 4980 6 1213 1867 317 35 33 chr15 82345264 82346431 -21148543 - MMTV-int LTR ERVK -1971 5282 4113 6 1213 674 304 55 40 chr15 82349716 82350285 -21144689 - MMTV-int LTR ERVK -3382 3871 3295 6 1213 1091 126 6 6 chr15 82350761 82350936 -21144038 + RLTR13D5 LTR ERVK 1 175 -848 6 1213 2235 90 132 11 chr15 82353922 82354270 -21140704 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1213 8666 252 43 38 chr15 82354270 82359526 -21135448 - RLTR10-int LTR ERVK -1299 5243 707 6 1213 6141 22 4 0 chr15 82359551 82360239 -21134735 - RLTR10-int LTR ERVK -995 992 302 6 1213 2277 73 138 17 chr15 82360239 82360587 -21134387 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1213 5885 70 25 12 chr15 82363810 82364675 -21130299 + RLTR13D5 LTR ERVK 147 1023 0 6 1213 2460 312 60 54 chr15 82364677 82366743 -21128231 - MMTV-int LTR ERVK -4019 3234 1155 6 1213 834 18 0 18 chr15 82366748 82366860 -21128114 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 213 6 1213 1066 126 6 17 chr15 82368437 82368614 -21126360 - RLTR13D5 LTR ERVK -848 175 1 6 1213 2387 320 45 41 chr15 82369095 82371074 -21123900 + MMTV-int LTR ERVK 3295 5282 -1971 6 1213 1087 323 40 29 chr15 82372240 82373030 -21121944 + ETnERV3-int LTR ERVK 4980 5778 -30 6 1213 316 235 104 60 chr15 82373827 82373989 -21120985 + RLTR13D3 LTR ERVK 983 1114 0 6 1213 1157 183 12 17 chr15 82373989 82374271 -21120703 - ORR1A2 LTR MaLR -122 272 1 6 1213 795 212 0 17 chr15 82374923 82375096 -21119878 + RMER17C-int LTR ERVK 3069 3238 0 6 1213 1361 172 25 114 chr15 82375101 82375579 -21119395 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 6 1213 2927 141 60 17 chr15 82376887 82377491 -21117483 - RMER17A LTR ERVK -2 749 120 6 1213 2831 97 38 5 chr15 82378419 82378815 -21116159 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 6 1213 2189 119 25 0 chr15 82380031 82380350 -21114624 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1213 4965 173 8 77 chr15 82380351 82381049 -21113925 - ORR1A2-int LTR MaLR -1 1791 1166 6 1213 4965 172 48 28 chr15 82381402 82381986 -21112988 - ORR1A2-int LTR MaLR -628 1335 718 6 1213 499 229 0 115 chr15 82381944 82382092 -21112882 - MT2B LTR ERVL -314 287 157 6 1213 338 109 0 18 chr15 82382074 82382130 -21112844 - ORR1A2-int LTR MaLR -1215 577 523 6 1213 296 250 0 14 chr15 82382204 82382273 -21112701 + ETnERV2-int LTR ERVK 2473 2540 -4866 6 1213 424 216 63 63 chr15 82382273 82382416 -21112558 + RMER16 LTR ERVK 242 384 -149 6 1213 3441 217 74 14 chr15 82382416 82383267 -21111707 + RMER16-int LTR ERVK 1076 1977 -3429 6 1213 5224 143 62 12 chr15 82384290 82384490 -21110484 + RMER17B LTR ERVK 1 202 -756 6 1213 5224 143 62 12 chr15 82384543 82385254 -21109720 + RMER17B LTR ERVK 203 958 0 6 1213 319 294 165 11 chr15 82390369 82390744 -21104230 - MER77 LTR ERVL -6 601 169 6 1213 268 313 95 61 chr15 82390749 82390980 -21103994 - MER77 LTR ERVL -153 454 216 6 1213 7440 13 5 0 chr15 82394489 82395307 -21099667 + RLTR13B2 LTR ERVK 1 822 0 6 1213 435 161 0 0 chr15 82399399 82399486 -21095488 + ORR1A2 LTR MaLR 6 92 -235 6 1213 1851 146 115 14 chr15 82399622 82399970 -21095004 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 1 6 1213 290 198 56 34 chr15 82400258 82400347 -21094627 - ETnERV2-int LTR ERVK -984 6422 6332 6 1213 279 245 14 55 chr15 82400437 82400541 -21094433 - MMETn-int LTR ERVK -1298 3546 3460 6 1213 15076 175 84 76 chr15 82400621 82401883 -21093091 - RMER16-int LTR ERVK -1230 4176 2871 6 1213 15076 175 84 76 chr15 82401972 82403034 -21091940 - RMER16-int LTR ERVK -2536 2870 1830 6 1213 15076 175 84 76 chr15 82403055 82403718 -21091256 - RMER16-int LTR ERVK -3577 1829 1260 6 1213 15076 175 84 76 chr15 82403913 82404758 -21090216 - RMER16-int LTR ERVK -4147 1259 316 6 1213 1850 154 77 0 chr15 82405115 82405466 -21089508 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 6 6 1213 7470 17 1 0 chr15 82407535 82408356 -21086618 - RLTR13B2 LTR ERVK 0 822 1 6 1213 2272 127 67 15 chr15 82409135 82409536 -21085438 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 6 1213 9226 156 26 18 chr15 82412614 82413148 -21081826 + RMER16-int LTR ERVK 3455 4000 -1406 6 1213 2791 79 164 7 chr15 82413148 82413582 -21081392 + RLTR44C LTR ERVK 1 502 0 6 1213 9226 156 26 18 chr15 82413582 82414693 -21080281 + RMER16-int LTR ERVK 4001 5112 -294 6 1213 427 155 12 0 chr15 82414695 82414779 -21080195 + RMER16 LTR ERVK 449 533 0 6 1213 2553 192 4 19 chr15 82414779 82415309 -21079665 - ORR1A1-int LTR MaLR -1441 522 1 6 1213 994 169 17 0 chr15 82415309 82415486 -21079488 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 167 6 1213 5227 112 27 5 chr15 82416684 82417527 -21077447 + RLTR22_Mus LTR ERVK 5 866 -942 6 1213 3030 18 0 0 chr15 82421226 82421563 -21073411 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 6 1213 57393 22 6 6 chr15 82421563 82428030 -21066944 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 18 6 1213 3030 18 0 0 chr15 82428055 82428392 -21066582 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 6 1213 451 180 162 3 chr15 82431912 82432056 -21062918 - ORR1A1 LTR MaLR -139 207 6 6 1213 2970 71 118 0 chr15 82435538 82435963 -21059011 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1213 14886 51 9 3 chr15 82435965 82437756 -21057218 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 4678 6 1213 1920 89 0 0 chr15 82437774 82438020 -21056954 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2252 6 1213 962 59 0 0 chr15 82438021 82438140 -21056834 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 1359 6 1213 3694 54 1 19 chr15 82438140 82438720 -21056254 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 6 1213 226 327 0 0 chr15 82438720 82438775 -21056199 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 221 6 1213 1207 71 10 107 chr15 82438775 82438980 -21055994 - IAPEz-int LTR ERVK -6288 193 9 6 1213 2994 66 118 0 chr15 82438981 82439406 -21055568 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 6 1214 253 172 35 0 chr15 82445428 82445486 -21049488 + MER77 LTR ERVL 395 454 -153 6 1214 343 289 160 8 chr15 82445491 82445867 -21049107 + MER77 LTR ERVL 169 601 -6 6 1214 2902 64 19 62 chr15 82449610 82449828 -21045146 - MTB LTR MaLR 0 400 196 6 1214 2902 64 19 62 chr15 82450162 82450354 -21044620 - MTB LTR MaLR -205 195 1 6 1214 339 313 91 21 chr15 82453338 82453524 -21041450 + MER77 LTR ERVL 317 515 -92 6 1214 10104 97 45 91 chr15 82454101 82454119 -21040855 - RLTR22_Mur LTR ERVK -4 1844 1825 6 1214 10104 97 45 91 chr15 82454153 82456066 -21038908 - RLTR22_Mur LTR ERVK -24 1824 2 6 1214 396 207 94 94 chr15 82456670 82456798 -21038176 + MT2B LTR ERVL 137 264 -337 6 1214 1234 204 191 3 chr15 82464913 82465242 -21029732 - MTD LTR MaLR -11 408 18 6 1214 242 208 140 70 chr15 82465987 82466112 -21028862 - RLTR13C2 LTR ERVK -58 750 642 6 1214 4119 184 73 47 chr15 82467475 82468409 -21026565 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 7 1214 450 236 36 24 chr15 82474385 82474550 -21020424 + MER77 LTR ERVL 384 550 -57 7 1214 2093 127 29 0 chr15 82476012 82476326 -21018648 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 7 1214 4988 132 24 5 chr15 82476330 82477176 -21017798 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1102 7 1214 536 241 27 79 chr15 82477208 82477411 -21017563 - MT2B LTR ERVL -318 283 154 7 1214 2756 164 33 6 chr15 82477404 82477949 -21017025 - ORR1A2-int LTR MaLR -1403 560 1 7 1214 2166 123 9 0 chr15 82477949 82478273 -21016701 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1214 391 327 66 31 chr15 82479495 82479754 -21015220 + MER77 LTR ERVL 331 598 -9 7 1214 1055 237 59 61 chr15 82480707 82480959 -21014015 + RMER17C LTR ERVK 16 406 -552 7 1214 1055 234 58 71 chr15 82481109 82481320 -21013654 + RMER17C LTR ERVK 188 391 -19 7 1214 233 328 24 39 chr15 82487138 82487265 -21007709 + MER77 LTR ERVL 384 508 -99 7 1214 1145 214 24 24 chr15 82488562 82488854 -21006120 + RMER16 LTR ERVK 242 533 0 7 1214 8996 176 72 54 chr15 82488855 82489645 -21005329 + RMER16-int LTR ERVK 2 803 -4603 7 1214 8996 176 72 54 chr15 82489787 82491006 -21003968 + RMER16-int LTR ERVK 804 2048 -3358 7 1214 7651 151 9 29 chr15 82491005 82492334 -21002640 + RMER16-int LTR ERVK 3808 5110 -296 7 1214 342 238 12 0 chr15 82492335 82492419 -21002555 + RMER16 LTR ERVK 449 533 0 7 1214 2361 192 9 32 chr15 82492419 82492949 -21002025 - ORR1A1-int LTR MaLR -1441 522 5 7 1214 941 137 12 6 chr15 82492957 82493119 -21001855 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 176 7 1214 10303 73 18 167 chr15 82494334 82494632 -21000342 + RLTR22_Mus LTR ERVK 5 288 -1520 7 1214 10303 73 18 167 chr15 82494676 82495761 -20999213 + RLTR22_Mus LTR ERVK 289 1230 -578 7 1214 10303 73 18 167 chr15 82495908 82496639 -20998335 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1231 1803 -5 7 1214 914 159 0 12 chr15 82498457 82498622 -20996352 - ORR1A1 LTR MaLR -159 168 6 7 1214 246 355 26 26 chr15 82500863 82501089 -20993885 + MER77 LTR ERVL 331 556 -51 2 1214 3593 112 4 7 chr15 82505223 82505769 -20989205 + RLTR1D LTR ERV1 62 605 0 5 1214 5901 159 42 45 chr15 82511471 82512584 -20982390 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 1114 5 7 1214 2114 123 0 0 chr15 82515135 82515451 -20979523 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 12 1 1214 7007 176 62 15 chr15 82515457 82517032 -20977942 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 315 1 1214 1038 131 0 0 chr15 82517028 82517196 -20977778 - ORR1A2 LTR MaLR -159 168 1 1 1214 312 277 146 28 chr15 82525096 82525308 -20969666 + MER77 LTR ERVL 311 547 -60 1 1214 2353 100 12 0 chr15 82526658 82526977 -20967997 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 2 1214 304 100 40 0 chr15 82526981 82527031 -20967943 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1912 2 1214 848 341 55 26 chr15 82527054 82527632 -20967342 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 2412 3123 -4478 2 1214 462 235 21 36 chr15 82527642 82527836 -20967138 - ORR1A2-int LTR MaLR -1055 908 718 2 1214 821 173 26 0 chr15 82527904 82528060 -20966914 - ORR1A2 LTR MaLR -11 316 157 2 1214 2413 101 3 0 chr15 82532527 82532853 -20962121 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1214 986 154 5 0 chr15 82532853 82533041 -20961933 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1775 2 1214 2338 166 2 20 chr15 82533046 82533453 -20961521 + RMER16-int LTR ERVK 5003 5402 -4 2 1214 1207 69 34 0 chr15 82535229 82535404 -20959570 + RMER17B LTR ERVK 1 181 -777 2 1214 2834 136 41 22 chr15 82535399 82535909 -20959065 + RMER17B LTR ERVK 341 860 -98 2 1214 407 296 91 34 chr15 82539514 82539811 -20955163 + MER77 LTR ERVL 216 529 -78 3 1214 2085 125 25 6 chr15 82541203 82541524 -20953450 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1214 8227 181 60 17 chr15 82541524 82542724 -20952250 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 714 3 1214 2596 104 39 3 chr15 82542724 82543067 -20951907 - MTB LTR MaLR -1 399 56 3 1214 2596 104 39 3 chr15 82543092 82543133 -20951841 - MTB LTR MaLR -345 55 2 3 1214 8227 181 60 17 chr15 82543133 82543577 -20951397 - ORR1A2-int LTR MaLR -1250 713 243 3 1214 8227 181 60 17 chr15 82543807 82544041 -20950933 - ORR1A2-int LTR MaLR -1721 242 4 3 1214 1985 148 22 0 chr15 82544041 82544359 -20950615 - ORR1A2 LTR MaLR -2 325 1 3 1214 252 359 77 0 chr15 82545594 82545803 -20949171 + MER77 LTR ERVL 331 555 -52 3 1214 720 163 164 29 chr15 82546642 82546813 -20948161 + RMER17C-int LTR ERVK 1731 1924 -1314 3 1214 2955 134 160 17 chr15 82546810 82547386 -20947588 + RMER17C-int LTR ERVK 2581 3238 0 3 1214 1390 202 47 48 chr15 82547389 82547822 -20947152 + RMER17C LTR ERVK 16 441 -517 3 1214 1962 85 11 65 chr15 82549846 82550199 -20944775 - RMER17A LTR ERVK 0 751 418 4 1214 305 113 75 0 chr15 82550199 82550252 -20944722 + RMER3D-int LTR ERVK 2763 2819 -23 4 1214 3974 164 26 10 chr15 82550280 82550958 -20944016 + RLTR17 LTR ERVK 2 690 -2 4 1214 527 234 12 110 chr15 82551048 82551221 -20943753 - MT2B LTR ERVL -314 287 132 4 1214 365 193 0 12 chr15 82551149 82551233 -20943741 - ORR1A1-int LTR MaLR -1188 604 522 4 1214 1208 191 104 67 chr15 82551267 82551672 -20943302 + RMER16 LTR ERVK 114 533 0 4 1214 494 149 7 110 chr15 82551672 82551808 -20943166 + RMER16-int LTR ERVK 1 122 -5284 4 1214 541 177 5 86 chr15 82551812 82552034 -20942940 - RMER17C LTR ERVK -128 282 79 4 1214 248 206 0 42 chr15 82552052 82552123 -20942851 - RMER17C LTR ERVK -308 102 35 4 1214 1423 120 5 9 chr15 82552128 82552346 -20942628 + RMER16-int LTR ERVK 3039 3255 -2151 4 1214 6608 131 21 26 chr15 82552345 82553450 -20941524 + RMER16-int LTR ERVK 4015 5113 -293 4 1214 373 202 12 0 chr15 82553452 82553536 -20941438 + RMER16 LTR ERVK 449 533 0 4 1214 2779 178 4 4 chr15 82553536 82554058 -20940916 - ORR1A1-int LTR MaLR -1441 522 1 4 1214 1028 151 0 0 chr15 82554058 82554230 -20940744 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 175 4 1214 5518 120 28 57 chr15 82563284 82564213 -20930761 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 5 1214 287 143 479 24 chr15 82568637 82568762 -20926212 - ORR1A1 LTR MaLR -139 188 6 4 1214 263 339 75 35 chr15 82571385 82571611 -20923363 + MER77 LTR ERVL 331 565 -42 5 1214 654 282 88 57 chr15 82572864 82573381 -20921593 + IAP-d-int LTR ERVK 2596 3365 -3116 6 1214 549 346 51 46 chr15 82574707 82575337 -20919637 + MERVK26-int LTR ERVK 4510 5142 -1777 6 1215 250 182 36 0 chr15 82576018 82576073 -20918901 + IAPEY3-int LTR ERVK 7485 7541 -139 6 1215 437 259 96 36 chr15 82578043 82578263 -20916711 + MER77 LTR ERVL 330 562 -45 6 1215 2077 156 0 0 chr15 82579686 82580013 -20914961 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1215 833 169 33 5 chr15 82580013 82580197 -20914777 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1775 6 1215 274 123 228 0 chr15 82580244 82580301 -20914673 + RMER16-int LTR ERVK 5011 5080 -326 6 1215 1664 168 3 50 chr15 82581386 82581507 -20913467 + RMER16-int LTR ERVK 5092 5212 -194 6 1215 1664 168 3 50 chr15 82581720 82581918 -20913056 + RMER16-int LTR ERVK 5213 5396 -10 6 1215 1174 189 117 86 chr15 82581927 82582326 -20912648 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 6 1215 2392 177 45 4 chr15 82582326 82582827 -20912147 - ORR1A2-int LTR MaLR -1441 522 1 6 1215 807 177 38 6 chr15 82582831 82582990 -20911984 - ORR1A2 LTR MaLR -8 318 155 6 1215 4010 193 87 16 chr15 82586831 82587679 -20907295 - RMER13B LTR ERVK 0 908 1 7 1215 316 311 39 45 chr15 82596550 82596705 -20898269 + MER77 LTR ERVL 378 531 -76 8 1215 2017 158 0 0 chr15 82598087 82598410 -20896564 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 8 1215 617 179 15 15 chr15 82598414 82598550 -20896424 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1828 8 1215 1131 211 9 4 chr15 82598550 82598779 -20896195 + RMER16-int LTR ERVK 5173 5402 -4 8 1215 1177 210 49 102 chr15 82598782 82599197 -20895777 + RMER16 LTR ERVK 1 516 -17 8 1215 2271 187 40 8 chr15 82599198 82599700 -20895274 - ORR1A2-int LTR MaLR -1445 518 1 8 1215 909 145 0 50 chr15 82599700 82599882 -20895092 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 155 8 1215 3107 75 2 2 chr15 82601230 82601630 -20893344 - MTB LTR MaLR 0 400 1 8 1215 816 180 27 38 chr15 82605218 82605362 -20889612 - ORR1A2 LTR MaLR -144 183 41 8 1215 2380 147 20 10 chr15 82605362 82605767 -20889207 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 9 1215 816 180 27 38 chr15 82605767 82605807 -20889167 - ORR1A2 LTR MaLR -287 40 1 8 1215 399 286 38 61 chr15 82614464 82614676 -20880298 + MER77 LTR ERVL 312 518 -89 9 1215 1915 103 57 0 chr15 82616130 82616431 -20878543 - ORR1A2 LTR MaLR -9 318 1 9 1215 9579 140 114 14 chr15 82616431 82618216 -20876758 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 1 9 1215 2378 89 9 0 chr15 82618216 82618540 -20876434 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1215 250 356 82 0 chr15 82619769 82619977 -20874997 + MER77 LTR ERVL 331 555 -52 1 1215 633 306 119 61 chr15 82652777 82652919 -20842055 + MTD LTR MaLR 17 155 -264 1 1215 633 306 119 61 chr15 82653095 82653331 -20841643 + MTD LTR MaLR 156 417 -2 1 1215 363 311 54 12 chr15 82658793 82658959 -20836015 + MLT1D LTR MaLR 264 436 -69 1 1215 456 220 0 62 chr15 82674016 82674113 -20820861 + ORR1D2 LTR MaLR 1 91 -279 1 1215 595 257 56 0 chr15 82674150 82674294 -20820680 + ORR1D2 LTR MaLR 211 362 -8 1 1215 2013 194 58 18 chr15 82675602 82676000 -20818974 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 1 1215 1703 162 76 57 chr15 82677782 82678149 -20816825 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1215 1598 241 102 3 chr15 82680258 82680632 -20814342 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 2 1215 250 217 0 0 chr15 82689953 82689999 -20804975 + LTR33 LTR ERVL 468 513 -2 2 1215 1902 105 46 59 chr15 82696239 82696562 -20798412 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 2 1215 4205 104 148 44 chr15 82696698 82697000 -20797974 + RMER17B LTR ERVK 1 318 -640 2 1215 4205 104 148 44 chr15 82697150 82697591 -20797383 + RMER17B LTR ERVK 319 821 -137 2 1215 1582 136 217 10 chr15 82699956 82700260 -20794714 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1215 239 271 0 96 chr15 82703192 82703286 -20791688 - MT2B LTR ERVL -362 239 155 2 1216 288 288 0 8 chr15 82710413 82710432 -20784542 + ORR1B1-int LTR MaLR 630 647 -862 2 1216 1787 167 46 9 chr15 82720497 82720823 -20774151 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 2 1216 1272 240 108 17 chr15 82761080 82761424 -20733550 + MTE2a LTR MaLR 4 378 -1 3 1216 233 275 215 43 chr15 82766509 82766718 -20728256 + ORR1E LTR MaLR 41 285 -74 3 1216 1498 265 13 39 chr15 82774354 82774743 -20720231 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 3 1216 440 361 87 43 chr15 82788168 82788559 -20706415 - MLT1K LTR MaLR 0 595 188 3 1216 426 208 0 120 chr15 82796499 82796528 -20698446 + MT2B LTR ERVL 140 151 -450 4 1216 521 240 23 8 chr15 82819455 82819585 -20675389 - MLT1C LTR MaLR -270 197 66 4 1216 356 326 133 24 chr15 82820978 82821226 -20673748 - MLT1D LTR MaLR -4 501 227 4 1216 2544 86 3 3 chr15 82835916 82836243 -20658731 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1216 2012 119 116 8 chr15 82836569 82836932 -20658042 + MTC LTR MaLR 3 404 -17 5 1217 234 297 30 24 chr15 82838987 82839050 -20655924 + ORR1B1-int LTR MaLR 585 648 -861 5 1217 2180 106 48 3 chr15 82848524 82848836 -20646138 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1217 2188 124 14 38 chr15 82853552 82853972 -20641002 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1217 243 287 58 7 chr15 82860117 82860254 -20634720 + RMER17D LTR ERVK 385 528 -361 5 1217 237 188 32 158 chr15 82869948 82869964 -20625010 + MT2B LTR ERVL 155 237 -364 5 1217 1941 155 27 88 chr15 82875831 82876241 -20618733 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 62 5 1217 2691 148 49 2 chr15 82876979 82877472 -20617502 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 5 1217 445 282 192 103 chr15 82879714 82879906 -20615068 - RMER20B LTR ERVK -44 583 324 5 1217 445 282 192 103 chr15 82880092 82880220 -20614754 - RMER20B LTR ERVK -304 323 199 5 1217 445 282 192 103 chr15 82880363 82880495 -20614479 - RMER20B LTR ERVK -429 198 90 5 1217 229 288 144 0 chr15 82883752 82883863 -20611111 + MLT1F1 LTR MaLR 433 559 -10 6 1217 1215 237 41 3 chr15 82893336 82893628 -20601346 + MTEb LTR MaLR 52 354 -25 6 1217 1655 231 50 12 chr15 82896236 82896640 -20598334 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1217 2295 87 9 12 chr15 82896655 82896983 -20597991 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1217 2078 120 130 64 chr15 82897189 82897318 -20597656 - RMER4A LTR ERVK 0 466 349 6 1217 2078 120 130 64 chr15 82897359 82897666 -20597308 - RMER4A LTR ERVK -118 348 1 6 1217 577 313 68 80 chr15 82897851 82897892 -20597082 + MTE2a LTR MaLR 18 62 -357 6 1217 1826 141 87 11 chr15 82897892 82898258 -20596716 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 6 1217 1252 265 17 38 chr15 82898258 82898616 -20596358 + MTE2a LTR MaLR 58 411 -8 6 1217 759 233 40 6 chr15 82901471 82901682 -20593292 - MTC-int LTR MaLR -402 856 669 6 1217 679 285 101 4 chr15 82901680 82901914 -20593060 - MTD LTR MaLR -148 271 5 6 1217 256 286 71 81 chr15 82902690 82902888 -20592086 + RLTR25B LTR ERVK 314 509 -519 6 1217 328 204 151 0 chr15 82903881 82903974 -20591000 + ORR1D2 LTR MaLR 9 115 -255 6 1217 720 319 81 42 chr15 82904596 82904956 -20590018 - LTR16B1 LTR ERVL -102 360 1 6 1217 3899 135 137 32 chr15 82908029 82908833 -20586141 + RMER19B LTR ERVK 1 888 -14 6 1217 227 236 175 73 chr15 82909895 82910032 -20584942 - MTEa LTR MaLR -55 324 174 7 1217 574 286 154 52 chr15 82909995 82910320 -20584654 - MER89 LTR ERV1 -63 496 139 7 1217 323 318 26 63 chr15 82912985 82913154 -20581820 + MLT1A LTR MaLR 31 192 -182 7 1217 288 266 19 95 chr15 82913299 82913338 -20581636 + RLTR25B LTR ERVK 449 572 -456 7 1217 416 301 75 33 chr15 82913458 82913671 -20581303 - MLT1C LTR MaLR -194 273 52 7 1217 654 302 51 1 chr15 82917230 82917481 -20577493 - MTE2b LTR MaLR -107 272 5 7 1217 2937 169 88 22 chr15 82922422 82922745 -20572229 - RLTR33 LTR ERVK -1 677 328 7 1217 2937 169 88 22 chr15 82922892 82923203 -20571771 - RLTR33 LTR ERVK -351 327 1 7 1217 5402 135 54 145 chr15 82923576 82924057 -20570917 + MTC-int LTR MaLR 2 394 -864 7 1217 5402 135 54 145 chr15 82924191 82924926 -20570048 + MTC-int LTR MaLR 395 1095 -163 7 1217 5402 135 54 145 chr15 82925072 82925236 -20569738 + MTC-int LTR MaLR 1096 1258 0 7 1217 2008 150 107 31 chr15 82925236 82925627 -20569347 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1217 767 264 22 19 chr15 82926047 82926309 -20568665 + ORR1E LTR MaLR 4 251 -116 7 1217 538 255 40 80 chr15 82926341 82926541 -20568433 + ORR1E LTR MaLR 168 359 0 7 1217 517 288 82 52 chr15 82926571 82926765 -20568209 - MTE2b LTR MaLR -165 214 15 7 1217 2121 89 26 0 chr15 82927389 82927702 -20567272 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 7 1217 232 306 14 108 chr15 82934202 82934237 -20560737 - MT2B2 LTR ERVL -434 150 129 7 1217 1068 269 95 26 chr15 82936588 82936936 -20558038 - MTEa LTR MaLR -3 376 5 7 1217 1687 126 46 13 chr15 82937780 82938086 -20556888 - RMER6A LTR ERVK -13 743 428 7 1217 2427 164 131 29 chr15 82938086 82938712 -20556262 - RMER17B LTR ERVK 0 958 307 7 1217 401 83 0 16 chr15 82938814 82938875 -20556099 - RMER6A LTR ERVK -641 115 56 7 1217 328 190 0 0 chr15 82938903 82938961 -20556013 - RMER6A LTR ERVK -403 58 1 7 1217 3093 50 2 8 chr15 82939334 82939736 -20555238 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1217 255 244 46 0 chr15 82940378 82940482 -20554492 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 648 7 1217 255 244 46 0 chr15 82940510 82940536 -20554438 - ORR1B1-int LTR MaLR -862 647 619 7 1217 1544 199 109 8 chr15 82954499 82954874 -20540100 - MTC LTR MaLR 0 421 9 8 1217 772 262 374 11 chr15 82955135 82955567 -20539407 + MTE-int LTR MaLR 713 1306 -274 8 1217 772 268 179 8 chr15 82955714 82955767 -20539207 + MTE-int LTR MaLR 1307 1364 -216 8 1218 1592 122 101 0 chr15 82969552 82969830 -20525144 + ORR1A4 LTR MaLR 24 329 0 8 1218 351 222 16 129 chr15 82972747 82972871 -20522103 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 8 1218 3060 82 156 0 chr15 82981763 82982251 -20512723 + MT2B2 LTR ERVL 1 564 -20 8 1218 2040 141 46 62 chr15 82982507 82982550 -20512424 + MTC LTR MaLR 3 38 -383 8 1218 4883 48 10 2 chr15 82982550 82983132 -20511842 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 8 1218 2040 141 46 62 chr15 82983132 82983504 -20511470 + MTC LTR MaLR 39 411 -10 8 1218 404 221 183 27 chr15 82988154 82988340 -20506634 + RMER15 LTR ERVL 275 489 -86 8 1218 378 283 160 21 chr15 82996150 82996338 -20498636 + RMER15 LTR ERVL 349 562 -13 9 1218 231 315 174 41 chr15 82997309 82997481 -20497493 + MTEb LTR MaLR 149 343 -36 9 1218 1586 207 22 35 chr15 83003574 83003944 -20491030 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 1 3 1218 256 286 143 83 chr15 83010159 83010376 -20484598 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 334 2 1218 348 319 33 16 chr15 83013153 83013274 -20481700 - MLT1K LTR MaLR -326 269 147 3 1218 472 178 64 82 chr15 83014846 83014956 -20480018 - MT2B LTR ERVL -344 257 150 4 1218 258 54 0 51 chr15 83016607 83016646 -20478328 - ORR1A2 LTR MaLR -290 37 1 5 1218 1362 159 54 65 chr15 83017050 83017240 -20477734 + MTC LTR MaLR 8 210 -211 5 1218 1362 159 54 65 chr15 83017461 83017545 -20477429 + MTC LTR MaLR 211 279 -142 5 1218 2196 133 56 6 chr15 83017559 83017914 -20477060 + RLTR14 LTR ERV1 10 382 0 5 1218 2527 163 49 125 chr15 83017936 83018510 -20476464 - RMER19C LTR ERVK 0 611 82 5 1218 906 120 56 208 chr15 83018511 83018742 -20476232 + RMER19B LTR ERVK 27 222 -680 5 1218 2558 145 98 20 chr15 83018758 83019257 -20475717 + RMER19B LTR ERVK 349 886 -16 5 1218 510 148 11 0 chr15 83019641 83019729 -20475245 - RMER19C LTR ERVK -522 89 1 5 1218 521 231 137 0 chr15 83019729 83019842 -20475132 + MTC LTR MaLR 283 411 -10 5 1218 451 271 16 8 chr15 83019842 83019965 -20475009 + MTC-int LTR MaLR 3 126 -1132 5 1218 1036 176 33 6 chr15 83019962 83020145 -20474829 + MTC LTR MaLR 232 419 -2 5 1218 766 61 0 0 chr15 83020624 83020721 -20474253 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 225 6 1218 5444 49 0 3 chr15 83020721 83021390 -20473584 + RLTR13D1 LTR ERVK 1 667 -139 6 1218 2955 174 68 65 chr15 83021537 83021676 -20473298 + RLTR13D2 LTR ERVK 871 1002 -21 6 1218 885 132 0 202 chr15 83021697 83021915 -20473059 - ORR1A4 LTR MaLR -154 175 2 6 1218 524 179 84 0 chr15 83023386 83023481 -20471493 + RMER6B LTR ERVK 2 104 -357 7 1218 991 144 139 0 chr15 83023677 83023857 -20471117 + RMER6B LTR ERVK 1 205 -256 7 1218 835 75 0 0 chr15 83024066 83024172 -20470802 + RMER6B LTR ERVK 332 437 -24 7 1218 3010 61 200 9 chr15 83024188 83024618 -20470356 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 7 1218 65286 18 0 0 chr15 83024618 83032173 -20462801 + MMERGLN-int LTR ERV1 1 7556 0 7 1218 3010 61 200 9 chr15 83032173 83032603 -20462371 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 7 1218 1034 213 46 11 chr15 83033508 83033788 -20461186 + RMER10A LTR ERVL 2 291 -151 7 1218 262 240 0 0 chr15 83033835 83033885 -20461089 - MTC LTR MaLR -68 353 304 8 1218 2231 71 117 6 chr15 83034106 83034447 -20460527 + RLTR10 LTR ERVK 12 390 0 8 1218 2385 129 30 37 chr15 83037204 83037608 -20457366 - MTB_Mm LTR MaLR -6 401 1 9 1218 240 237 0 63 chr15 83038798 83038861 -20456113 - RMER21B LTR ERV1 -124 718 660 1 1218 673 236 229 9 chr15 83038891 83039109 -20455865 - RMER21B LTR ERV1 -278 564 299 1 1218 1326 223 261 57 chr15 83039148 83039264 -20455710 - RMER20B LTR ERVK 0 627 466 1 1218 1326 223 261 57 chr15 83039317 83039636 -20455338 - RMER20B LTR ERVK -162 465 84 1 1218 1326 223 261 57 chr15 83039809 83039885 -20455089 - RMER20B LTR ERVK -544 83 11 1 1218 235 364 47 47 chr15 83042278 83042405 -20452569 - RMER17D LTR ERVK -20 869 743 1 1218 249 314 92 87 chr15 83042400 83042585 -20452389 - MT2B2 LTR ERVL -263 321 136 1 1218 306 267 12 136 chr15 83043602 83043650 -20451324 - MT2B LTR ERVL -294 307 190 1 1218 248 359 81 53 chr15 83045700 83045909 -20449065 + MLT1J LTR MaLR 250 464 -48 1 1218 2044 148 44 0 chr15 83049229 83049573 -20445401 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 1 1218 4505 106 60 23 chr15 83049886 83050613 -20444361 - RMER6A LTR ERVK 0 756 3 1 1218 1573 275 34 29 chr15 83050637 83051079 -20443895 - RLTR18B LTR ERVK -6 506 63 1 1218 2002 180 39 34 chr15 83053218 83053631 -20441343 + MTD LTR MaLR 1 415 -4 1 1218 2905 40 81 3 chr15 83055502 83055873 -20439101 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1218 1614 152 98 13 chr15 83062508 83062810 -20432164 + ORR1B2 LTR MaLR 1 328 -39 1 1218 1134 123 278 37 chr15 83066228 83066473 -20428501 + ORR1B1 LTR MaLR 1 304 -90 1 1218 685 97 0 0 chr15 83066837 83066930 -20428044 + ORR1B2 LTR MaLR 275 367 0 1 1218 4006 172 81 84 chr15 83067119 83067606 -20427368 + RMER17B LTR ERVK 1 438 -520 1 1218 4006 172 81 84 chr15 83067655 83068128 -20426846 + RMER17B LTR ERVK 439 958 0 1 1218 4522 75 63 0 chr15 83068533 83069202 -20425772 - ORR1A1-int LTR MaLR -983 809 99 1 1218 2532 66 9 12 chr15 83069220 83069559 -20425415 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 1 1218 13508 63 20 2 chr15 83069560 83071320 -20423654 - ORR1A1-int LTR MaLR -1 1791 1 1 1218 1496 44 16 0 chr15 83071320 83071502 -20423472 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 162 1 1218 1781 122 124 16 chr15 83075773 83076080 -20418894 - MTC LTR MaLR -73 348 9 1 1218 490 249 173 46 chr15 83076619 83076926 -20418048 - RMER10A LTR ERVL -24 418 73 2 1218 225 250 117 13 chr15 83086265 83086342 -20408632 + ORR1A4 LTR MaLR 106 190 -139 2 1218 4742 52 24 0 chr15 83092970 83093543 -20401431 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 2 1218 1180 161 106 84 chr15 83094013 83094196 -20400778 - RLTR24 LTR ERV1 -194 335 161 2 1218 1180 175 32 32 chr15 83094349 83094541 -20400433 - RLTR24 LTR ERV1 -309 220 30 2 1218 334 67 22 0 chr15 83094765 83094810 -20400164 - RLTR24 LTR ERV1 -483 46 1 2 1218 4812 108 29 7 chr15 83096248 83096948 -20398026 - RLTR19B LTR ERVK 0 715 1 2 1218 4094 50 4 18 chr15 83097058 83097568 -20397406 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 2 1218 2583 170 26 34 chr15 83097568 83098105 -20396869 + MMVL30-int LTR ERV1 1 533 -7023 2 1218 5194 84 14 3 chr15 83098560 83099290 -20395684 + MMVL30-int LTR ERV1 716 1453 -2245 2 1218 630 108 61 202 chr15 83099373 83099571 -20395403 + MMVL30-int LTR ERV1 960 1129 -2170 2 152 337 125 28 0 chr15 83099582 83099654 -20395320 + MMVL30-int LTR ERV1 1438 1511 -2187 2 1219 7604 83 36 18 chr15 83099913 83101169 -20393805 + MMVL30-int LTR ERV1 1408 2826 -872 2 1219 670 288 15 10 chr15 83101228 83101500 -20393474 + RLTR6-int LTR ERV1 4222 4563 -3215 2 1219 1364 154 47 111 chr15 83101578 83101922 -20393052 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1219 475 123 136 23 chr15 83102139 83102235 -20392739 + RLTR6-int LTR ERV1 2874 2943 -755 2 1219 3228 104 73 97 chr15 83102252 83102878 -20392096 + RLTR1B-int LTR ERV1 2689 3299 0 2 1219 4333 44 2 0 chr15 83102878 83103380 -20391594 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 2 1219 1604 50 206 0 chr15 83104638 83104876 -20390098 + ORR1A1-int LTR MaLR 1455 1741 -51 2 1219 1269 38 6 0 chr15 83104894 83105052 -20389922 + ORR1A1-int LTR MaLR 1634 1792 0 2 1219 2892 49 0 11 chr15 83105052 83105402 -20389572 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1219 1897 114 36 54 chr15 83106164 83106497 -20388477 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 3 2 1219 2261 126 78 3 chr15 83107185 83107544 -20387430 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 9 2 1219 3254 38 20 5 chr15 83108221 83108615 -20386359 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1219 529 160 45 53 chr15 83109102 83109234 -20385740 + ORR1B1 LTR MaLR 25 155 -239 2 1219 410 331 22 0 chr15 83109250 83109386 -20385588 + MLT1A0 LTR MaLR 63 201 -164 2 1219 318 254 104 34 chr15 83110567 83110721 -20384253 - MLT2B2 LTR ERVL -390 211 44 2 1219 995 210 50 9 chr15 83112981 83113202 -20381772 + RLTR42 LTR ERVK 4 233 -6 2 1219 1838 195 133 22 chr15 83117348 83117850 -20377124 + RMER4B LTR ERVK 1 574 -11 3 1219 233 238 0 31 chr15 83118883 83118948 -20376026 - MLT1A0 LTR MaLR -54 311 249 3 1219 884 192 89 16 chr15 83120313 83120496 -20374478 + MTD LTR MaLR 21 218 -201 3 1219 1766 157 55 50 chr15 83122204 83122566 -20372408 - ORR1D1 LTR MaLR -10 364 1 3 1219 1390 176 122 98 chr15 83123699 83123899 -20371075 - MTD LTR MaLR 0 419 211 3 1219 1390 176 122 98 chr15 83124090 83124298 -20370676 - MTD LTR MaLR -209 210 1 3 1219 1676 140 86 29 chr15 83127040 83127238 -20367736 - RMER17C LTR ERVK -5 405 181 3 1219 1676 140 86 29 chr15 83127275 83127459 -20367515 - RMER17C LTR ERVK -230 180 1 3 1219 1671 273 109 109 chr15 83150957 83151713 -20343261 + RMER12 LTR ERVK 1 746 -576 3 1219 1671 273 109 109 chr15 83151858 83152093 -20342881 + RMER12 LTR ERVK 747 993 -329 3 1219 1671 236 106 70 chr15 83152428 83152673 -20342301 + RMER12 LTR ERVK 994 1293 -29 3 1219 2381 136 7 29 chr15 83153547 83153963 -20341011 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 3 1219 297 258 97 0 chr15 83156508 83156601 -20338373 + RMER10A LTR ERVL 322 423 -19 3 1219 909 240 129 18 chr15 83171121 83171393 -20323581 + ORR1E LTR MaLR 45 346 -13 4 1219 881 249 184 3 chr15 83173122 83173404 -20321570 + MTEa LTR MaLR 4 336 -43 4 1219 310 305 77 21 chr15 83174472 83174630 -20320344 + MLT1F LTR MaLR 135 321 -248 4 1219 2088 142 154 13 chr15 83181714 83182163 -20312811 - RLTR28 LTR ERVL -3 521 10 4 1219 240 238 95 0 chr15 83184248 83184311 -20310663 - MTEa LTR MaLR -18 361 293 4 1219 236 287 62 108 chr15 83192406 83192535 -20302439 + MTEb LTR MaLR 249 371 -8 4 1219 226 343 15 0 chr15 83196802 83196869 -20298105 + MLT1F1 LTR MaLR 109 176 -393 4 1219 352 205 0 57 chr15 83198497 83198585 -20296389 - RMER21B LTR ERV1 -8 834 752 4 1219 2755 78 13 24 chr15 83201716 83202096 -20292878 - MTB LTR MaLR 0 400 25 5 1219 1276 189 36 139 chr15 83204624 83204904 -20290070 + RMER16 LTR ERVK 1 351 -182 5 1219 1276 188 40 148 chr15 83205041 83205218 -20289756 + RMER16 LTR ERVK 352 533 0 5 1219 805 124 122 14 chr15 83213122 83213269 -20281705 + BGLII_B LTR ERVK 279 441 0 5 1219 239 261 171 0 chr15 83216256 83216344 -20278630 + MLT1C LTR MaLR 352 454 -13 5 1219 1700 156 52 0 chr15 83225965 83226254 -20268720 - MTC LTR MaLR -8 413 110 5 1219 2516 114 123 5 chr15 83228462 83228883 -20266091 - RMER4B LTR ERVK -113 472 2 5 1219 588 113 29 58 chr15 83229923 83230026 -20264948 - MTC LTR MaLR -321 100 1 5 1220 228 278 40 80 chr15 83231197 83231322 -20263652 - MLT2F LTR ERVL -236 427 308 5 1220 1337 208 254 68 chr15 83232747 83232828 -20262146 + MT2A LTR ERVL 5 84 -449 5 1220 1337 208 254 68 chr15 83232986 83233348 -20261626 + MT2A LTR ERVL 85 531 -2 5 1220 905 214 52 43 chr15 83236714 83236923 -20258051 + ORR1D1 LTR MaLR 1 211 -163 5 1220 242 261 29 14 chr15 83237877 83237947 -20257027 + ORR1D1 LTR MaLR 294 364 -15 5 1220 1307 218 92 22 chr15 83238717 83239031 -20255943 - MTEb LTR MaLR -37 342 7 5 1220 3742 32 0 29 chr15 83250879 83251328 -20243646 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 5 1220 239 290 37 98 chr15 83260091 83260305 -20234669 + RMER10A LTR ERVL 218 418 -24 5 1220 232 261 88 33 chr15 83264740 83264831 -20230143 - MLT1G LTR MaLR -215 376 281 5 1220 928 206 262 7 chr15 83267162 83267464 -20227510 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 5 1220 1681 204 49 19 chr15 83268083 83268448 -20226526 + RMER10B LTR ERVL 1 376 -22 6 1220 494 261 65 56 chr15 83269189 83269420 -20225554 + RLTR12B LTR ERVK 80 312 -216 6 1220 763 184 72 59 chr15 83279394 83279694 -20215280 + RMER10A LTR ERVL 1 305 -93 6 1220 1596 137 73 104 chr15 83279703 83279769 -20215205 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 349 6 1220 1596 137 73 104 chr15 83279919 83280209 -20214765 - ORR1B1 LTR MaLR -46 348 41 6 1220 283 224 17 0 chr15 83280218 83280276 -20214698 + RMER10A LTR ERVL 308 366 -32 6 1220 750 253 111 36 chr15 83286901 83287208 -20207766 + MLT1A0 LTR MaLR 24 353 -12 6 1220 234 241 43 141 chr15 83292184 83292201 -20202773 - MT2B2 LTR ERVL -323 261 181 6 1220 1855 136 35 172 chr15 83303250 83303448 -20191526 + MTC LTR MaLR 1 209 -212 6 1220 1855 136 35 172 chr15 83303597 83303886 -20191088 + MTC LTR MaLR 210 421 0 6 1220 932 212 27 36 chr15 83305012 83305237 -20189737 + MTC LTR MaLR 133 355 -66 6 1220 1962 161 14 14 chr15 83310246 83310599 -20184375 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 41 7 1220 1733 160 73 18 chr15 83315982 83316325 -20178649 + RMER12B LTR ERVK 1 362 -1042 7 1220 1068 175 129 10 chr15 83316344 83316638 -20178336 + RMER17C LTR ERVK 82 410 0 7 1220 3289 99 69 34 chr15 83316638 83317216 -20177758 + RMER12 LTR ERVK 290 888 -434 7 1220 667 154 15 23 chr15 83317299 83317432 -20177542 + RMER12 LTR ERVK 1191 1322 0 7 1220 382 301 23 161 chr15 83320249 83320318 -20174656 + MTC LTR MaLR 60 123 -296 7 1220 382 301 23 161 chr15 83320510 83320544 -20174430 + MTC LTR MaLR 124 137 -282 7 1220 455 282 111 5 chr15 83320710 83320882 -20174092 + MTC LTR MaLR 117 286 -114 7 1220 984 240 69 69 chr15 83322428 83322702 -20172272 + MTEa LTR MaLR 50 333 -46 7 1220 984 240 69 69 chr15 83322729 83322758 -20172216 + MTEa LTR MaLR 334 353 -26 7 1220 1074 112 67 0 chr15 83324110 83324289 -20170685 - RMER6C LTR ERVK 0 690 500 7 1220 1992 211 18 28 chr15 83324536 83325034 -20169940 + RLTR16 LTR ERVK 1 493 -12 7 1220 1188 124 218 4 chr15 83325163 83325397 -20169577 - RMER6C LTR ERVK -406 284 1 7 1220 268 130 43 0 chr15 83327080 83327126 -20167848 + MTC LTR MaLR 372 419 -2 7 1220 283 324 45 18 chr15 83329168 83329278 -20165696 + MTE2a LTR MaLR 8 120 -299 7 1220 720 241 158 29 chr15 83329447 83329720 -20165254 + MTE2a LTR MaLR 72 379 0 7 1220 278 239 69 14 chr15 83331429 83331501 -20163473 + MTD LTR MaLR 2 77 -342 7 1220 489 180 180 0 chr15 83332017 83332139 -20162835 + MTD LTR MaLR 67 210 -209 7 1220 732 187 103 6 chr15 83332297 83332453 -20162521 + MTD LTR MaLR 203 373 -46 7 1220 676 250 57 19 chr15 83334429 83334549 -20160425 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 244 7 1220 676 250 57 19 chr15 83334994 83335074 -20159900 - ORR1D1 LTR MaLR -140 234 149 7 1220 3534 127 64 165 chr15 83342942 83343858 -20151116 + RMER21A LTR ERV1 1 824 -123 8 1220 1425 106 9 9 chr15 83343862 83344082 -20150892 + ORR1A4 LTR MaLR 102 321 -8 8 1220 2028 179 106 59 chr15 83346485 83346997 -20147977 + RMER2 LTR ERV1 1 536 -31 8 1220 582 279 68 64 chr15 83347018 83347282 -20147692 - MTE2a LTR MaLR -5 374 110 8 1220 338 381 20 20 chr15 83347469 83347619 -20147355 - MTE2a LTR MaLR -267 152 3 8 1220 2564 130 116 15 chr15 83347698 83348173 -20146801 + RMER15 LTR ERVL 53 575 0 8 1220 2597 64 0 58 chr15 83350764 83351111 -20143863 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1220 1329 224 169 25 chr15 83351331 83351697 -20143277 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1220 745 253 126 110 chr15 83352370 83352734 -20142240 + MTE2a LTR MaLR 10 379 0 8 1220 1867 114 67 14 chr15 83352757 83353114 -20141860 + RMER6A LTR ERVK 378 753 -3 8 1221 1147 202 160 31 chr15 83367072 83367574 -20127400 - RLTR13B1 LTR ERVK -58 965 425 8 1221 570 183 26 0 chr15 83367577 83367692 -20127282 - RLTR13B1 LTR ERVK -456 446 329 8 1221 1460 139 16 8 chr15 83367862 83368116 -20126858 - RLTR13B1 LTR ERVK -632 261 6 8 1221 240 167 54 152 chr15 83375235 83375327 -20119647 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 427 8 1221 608 268 40 23 chr15 83387083 83387259 -20107715 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 187 9 1221 608 275 24 48 chr15 83387392 83387602 -20107372 + RMER10B LTR ERVL 194 398 0 9 1221 388 283 102 76 chr15 83387603 83387760 -20107214 - MLT1A0 LTR MaLR -174 191 31 9 1221 4473 133 70 26 chr15 83389183 83389980 -20104994 + RMER13A LTR ERVK 1 832 -28 9 1221 289 200 140 50 chr15 83390180 83390280 -20104694 + MT2B LTR ERVL 156 264 -337 9 1221 243 186 62 125 chr15 83390941 83391021 -20103953 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 435 9 1221 440 212 0 88 chr15 83396943 83396958 -20098016 + MT2B LTR ERVL 150 253 -348 9 1221 1449 180 96 19 chr15 83399177 83399500 -20095474 - MTD LTR MaLR 0 419 72 9 1221 1523 197 96 54 chr15 83400015 83400369 -20094605 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 9 1221 364 288 79 2 chr15 83415554 83415713 -20079261 + MLT1F1 LTR MaLR 147 325 -254 9 1221 398 284 112 17 chr15 83415731 83415910 -20079064 + MLT1F1 LTR MaLR 358 553 -16 9 1221 698 289 53 40 chr15 83420700 83420927 -20074047 + MTE2a LTR MaLR 43 272 -107 9 1221 241 290 140 0 chr15 83420978 83421078 -20073896 + MTE2a LTR MaLR 250 363 -16 9 1221 1484 179 87 12 chr15 83427876 83427924 -20067050 - RLTR14 LTR ERV1 -1 381 334 1 1221 1484 179 87 12 chr15 83427955 83428239 -20066735 - RLTR14 LTR ERV1 -49 333 25 1 1221 334 165 172 20 chr15 83430521 83430620 -20064354 + RMER10A LTR ERVL 273 386 -56 1 1221 358 282 108 75 chr15 83435484 83435915 -20059059 + MLT2B2 LTR ERVL 7 547 -15 1 1221 337 235 46 92 chr15 83441940 83442071 -20052903 + MT2B LTR ERVL 154 278 -323 1 1221 300 322 116 27 chr15 83447662 83447809 -20047165 + ORR1E LTR MaLR 42 201 -158 1 1221 1723 124 119 16 chr15 83449240 83449551 -20045423 + ORR1B1 LTR MaLR 1 343 -51 1 1221 464 123 25 0 chr15 83449771 83449844 -20045130 + ORR1B1 LTR MaLR 320 394 0 1 1221 2019 79 0 70 chr15 83453712 83454040 -20040934 - ORR1A4 LTR MaLR -24 305 1 1 1221 1670 127 120 57 chr15 83456857 83457208 -20037766 + ORR1C2 LTR MaLR 1 373 -11 1 1221 1974 67 3 66 chr15 83457595 83457898 -20037076 + ORR1A2 LTR MaLR 1 284 -43 1 1221 282 75 0 0 chr15 83458258 83458298 -20036676 + ORR1A2 LTR MaLR 287 326 0 1 1221 4778 185 147 120 chr15 83461123 83461431 -20033543 + ORR1A2-int LTR MaLR 3 312 -1197 1 1221 4778 185 147 120 chr15 83461456 83462512 -20032462 + ORR1A2-int LTR MaLR 313 1461 -48 1 1221 4778 185 147 120 chr15 83462644 83462692 -20032282 + ORR1A2-int LTR MaLR 1462 1462 -47 1 1221 4778 185 147 120 chr15 83462841 83462893 -20032081 + ORR1A2-int LTR MaLR 1462 1508 -1 1 1221 1784 171 91 20 chr15 83462893 83463246 -20031728 + ORR1A2 LTR MaLR 1 378 -6 1 1221 406 261 106 21 chr15 83487767 83487908 -20007066 + RMER15 LTR ERVL 422 574 -1 1 1222 315 311 92 33 chr15 83497784 83497937 -19997037 + MLT1A0 LTR MaLR 118 279 -86 1 1222 245 306 0 53 chr15 83503344 83503420 -19991554 + MamGypLTR2 LTR Gypsy 1087 1158 -31 7 1222 2157 98 6 0 chr15 83507816 83508132 -19986842 + ORR1A2 LTR MaLR 1 318 -9 1 1222 2067 110 19 0 chr15 83515755 83516063 -19978911 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 11 1 1222 1379 224 53 103 chr15 83516643 83517042 -19977932 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1222 2183 137 39 18 chr15 83524579 83524925 -19970049 + ORR1B1 LTR MaLR 1 359 -35 2 1222 2047 191 47 49 chr15 83524925 83525372 -19969602 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 2 1222 2183 137 39 18 chr15 83525372 83525411 -19969563 + ORR1B1 LTR MaLR 360 394 0 2 1222 770 277 58 16 chr15 83531701 83531943 -19963031 - MTE2b LTR MaLR -110 269 18 3 1222 631 355 111 7 chr15 83531997 83532286 -19962688 + MLT1C LTR MaLR 143 461 -6 3 1222 422 281 144 0 chr15 83532614 83532753 -19962221 + MLT1B LTR MaLR 4 162 -228 4 1222 1518 225 36 90 chr15 83532989 83533020 -19961954 + ORR1D2 LTR MaLR 1 28 -342 4 1222 1518 225 36 90 chr15 83533168 83533526 -19961448 + ORR1D2 LTR MaLR 29 369 -1 4 1222 992 232 26 158 chr15 83534075 83534499 -19960475 + MTE2a LTR MaLR 12 379 0 4 1222 2023 136 196 3 chr15 83535126 83535479 -19959495 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1222 629 274 100 129 chr15 83545058 83545398 -19949576 + MTE2a LTR MaLR 7 336 -43 6 1222 255 348 62 6 chr15 83561235 83561397 -19933577 + RLTR21 LTR ERVK 1084 1254 -318 9 1222 801 186 131 25 chr15 83562960 83562987 -19931987 - RMER10B LTR ERVL -179 219 197 1 1222 801 186 131 25 chr15 83563032 83563202 -19931772 - RMER10B LTR ERVL -202 196 1 1 1222 3405 33 2 24 chr15 83563855 83564264 -19930710 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1222 249 271 127 0 chr15 83583747 83583865 -19911109 - LTR16A LTR ERVL -318 133 1 1 1222 263 326 0 33 chr15 83586683 83586775 -19908199 + MLT1A0 LTR MaLR 257 345 -20 1 1222 646 324 60 30 chr15 83588220 83588487 -19906487 + MT2A LTR ERVL 188 462 -71 1 1222 455 181 0 103 chr15 83588488 83588605 -19906369 + MT2B LTR ERVL 160 264 -337 1 1222 282 141 0 0 chr15 83588650 83588701 -19906273 + MT2A LTR ERVL 488 561 -1 1 1222 2463 142 102 19 chr15 83598758 83599161 -19895813 + RLTR11A LTR ERVK 18 458 -70 2 1222 2463 142 102 19 chr15 83599194 83599262 -19895712 + RLTR11A LTR ERVK 459 527 -1 2 1222 1608 211 121 5 chr15 83601488 83601860 -19893114 - MTD LTR MaLR -2 417 3 2 1223 594 219 129 118 chr15 83629923 83630242 -19864732 - MTEa LTR MaLR -44 335 1 2 1223 928 253 49 12 chr15 83639989 83640233 -19854741 - MTEa LTR MaLR 0 379 127 2 1223 640 252 42 0 chr15 83640450 83640593 -19854381 - MTEa LTR MaLR -228 151 3 2 1223 1098 266 26 130 chr15 83644965 83645388 -19849586 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 2 1223 373 286 51 36 chr15 83647299 83647437 -19847537 - MLT1B LTR MaLR -70 320 181 3 1223 484 272 86 22 chr15 83647669 83647891 -19847083 - MLT1B LTR MaLR -139 251 16 3 1223 491 291 10 38 chr15 83648111 83648270 -19846704 - MLT1C LTR MaLR 0 624 330 3 1223 2276 127 68 10 chr15 83649465 83649862 -19845112 - MTC LTR MaLR 0 421 2 3 1223 2071 169 2 53 chr15 83653415 83653809 -19841165 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 5 3 1223 962 216 102 69 chr15 83655276 83655639 -19839335 - MTE2a LTR MaLR -4 375 1 3 1223 1496 164 161 19 chr15 83657925 83658285 -19836689 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 3 1223 236 304 25 0 chr15 83658924 83659003 -19835971 + MER74A LTR ERVL 69 149 -473 3 1223 366 327 113 21 chr15 83659020 83659304 -19835670 + MER74A LTR ERVL 153 462 -96 3 1223 1362 151 67 0 chr15 83660625 83660864 -19834110 + ORR1C1 LTR MaLR 113 367 -11 3 1223 271 270 97 18 chr15 83671413 83671526 -19823448 - MTC LTR MaLR -299 122 1 3 1223 2107 111 101 16 chr15 83691235 83691603 -19803371 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 3 1223 2519 127 29 17 chr15 83694131 83694539 -19800435 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 3 1223 1652 164 115 40 chr15 83696638 83697013 -19797961 - MTD LTR MaLR -16 403 1 3 1223 294 261 200 49 chr15 83697786 83697971 -19797003 + MLT1J LTR MaLR 290 502 -10 3 1223 271 133 0 0 chr15 83704699 83704744 -19790230 - MTD LTR MaLR 0 419 375 3 1223 1341 292 33 8 chr15 83707880 83708242 -19786732 + MTE2b LTR MaLR 1 371 -8 3 1223 682 280 84 39 chr15 83716221 83716529 -19778445 + ORR1D2 LTR MaLR 3 324 -46 4 1223 2104 164 3 19 chr15 83731600 83731979 -19762995 - MTB_Mm LTR MaLR -31 376 4 4 1223 2284 106 158 3 chr15 83740108 83740449 -19754525 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1223 7118 182 108 102 chr15 83740449 83742400 -19752574 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 2 4 1223 2497 125 62 3 chr15 83742404 83742772 -19752202 - ORR1B1 LTR MaLR -3 391 2 4 1223 1641 102 34 191 chr15 83746314 83746480 -19748494 + ORR1A3 LTR MaLR 1 106 -220 4 1223 1641 102 34 191 chr15 83746978 83747198 -19747776 + ORR1A3 LTR MaLR 107 326 0 4 1223 3701 36 18 88 chr15 83750979 83751490 -19743484 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1224 428 317 125 53 chr15 83768386 83768706 -19726268 + LTR75 LTR ERVL 82 424 -138 4 1224 2504 202 24 32 chr15 83771936 83772472 -19722502 - RMER5 LTR ERV1 -2 532 1 4 1224 1333 240 113 16 chr15 83773663 83774044 -19720930 - MTD LTR MaLR -1 418 1 4 1224 920 248 68 84 chr15 83775959 83776274 -19718700 + MTE2b LTR MaLR 7 321 -58 4 1224 1936 194 14 19 chr15 83783223 83783591 -19711383 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 4 1224 276 250 71 0 chr15 83786018 83786102 -19708872 + MLT1E2 LTR MaLR 98 187 -440 4 1224 468 272 85 42 chr15 83787070 83787235 -19707739 + MT2A LTR ERVL 296 467 -66 4 1224 389 302 9 9 chr15 83791054 83791161 -19703813 + RMER10B LTR ERVL 269 375 -23 4 1224 261 283 49 29 chr15 83793881 83793983 -19700991 + RMER15 LTR ERVL 414 517 -58 5 1224 2755 123 9 12 chr15 83795698 83796127 -19698847 - MERVK26-int LTR ERVK -326 6593 6166 5 1224 949 206 158 29 chr15 83797189 83797533 -19697441 + MTD LTR MaLR 10 419 0 5 1224 337 250 134 47 chr15 83807853 83808025 -19686949 + MTEa LTR MaLR 173 359 -20 5 1224 1503 252 29 11 chr15 83808481 83808830 -19686144 + ORR1B1 LTR MaLR 9 363 -16 5 1224 674 323 149 37 chr15 83808812 83809037 -19685937 + ORR1B1-int LTR MaLR 5 238 -1132 5 1224 1156 237 192 15 chr15 83809183 83809546 -19685428 + ORR1B1-int LTR MaLR 239 709 -871 5 1224 1751 133 143 15 chr15 83809536 83809872 -19685102 + ORR1B1 LTR MaLR 15 393 -1 5 1224 1701 283 168 13 chr15 83809896 83810526 -19684448 + MTE-int LTR MaLR 711 1438 -142 5 1224 496 291 26 32 chr15 83810927 83811095 -19683879 + MTE-int LTR MaLR 1427 1575 -5 5 1224 2101 105 123 42 chr15 83811096 83811453 -19683521 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 5 1224 1431 230 164 9 chr15 83823511 83823858 -19671116 - MTD LTR MaLR -14 405 5 5 1224 1018 271 144 15 chr15 83825668 83826002 -19668972 - MTE2b LTR MaLR 0 379 3 5 1224 234 217 158 6 chr15 83827602 83827760 -19667214 - RMER17C LTR ERVK -147 263 82 5 1224 273 132 0 0 chr15 83832741 83832779 -19662195 + ORR1C2 LTR MaLR 2 39 -345 5 1224 2357 141 148 81 chr15 83832788 83833321 -19661653 + RMER4B LTR ERVK 17 585 0 5 1224 1293 167 199 14 chr15 83833321 83833607 -19661367 + ORR1C2 LTR MaLR 35 373 -11 5 1224 2367 95 3 58 chr15 83833607 83833953 -19661021 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1224 1152 262 37 65 chr15 83837122 83837473 -19657501 - MTE2a LTR MaLR 0 379 39 5 1224 228 261 15 30 chr15 83844560 83844627 -19650347 - MLT1A1 LTR MaLR -273 135 70 5 1224 2414 145 50 43 chr15 83844711 83845129 -19649845 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1224 380 245 32 0 chr15 83845685 83845779 -19649195 + MLT1A0 LTR MaLR 248 344 -21 6 1224 2589 128 13 0 chr15 83847871 83848260 -19646714 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1224 2117 89 47 74 chr15 83855562 83855900 -19639074 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 6 1224 368 306 47 40 chr15 83865223 83865373 -19629601 + MTEb LTR MaLR 211 361 -18 6 1224 4344 23 12 0 chr15 83866314 83866801 -19628173 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 1224 794 233 104 124 chr15 83866867 83867166 -19627808 - MTE2a LTR MaLR -83 296 4 6 1224 1436 196 122 35 chr15 83879090 83879272 -19615702 - MTD LTR MaLR 0 419 211 6 1224 1436 196 122 35 chr15 83879459 83879646 -19615328 - MTD LTR MaLR -209 210 18 6 1225 1865 224 27 171 chr15 83886373 83886971 -19608003 + RLTR18B LTR ERVK 1 512 0 6 1225 456 289 98 85 chr15 83887294 83887324 -19607650 - MTD LTR MaLR 0 379 352 7 1225 1178 252 88 66 chr15 83887470 83887851 -19607123 - MTD LTR MaLR -44 375 1 7 1225 2675 94 82 73 chr15 83890438 83890864 -19604110 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 7 1225 2539 87 12 0 chr15 83891514 83891837 -19603137 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1225 1043 229 123 51 chr15 83891844 83892194 -19602780 - MTD LTR MaLR -44 375 1 7 1225 2072 151 61 25 chr15 83893594 83893761 -19601213 - MTC LTR MaLR -8 413 242 7 1225 2833 49 6 6 chr15 83893761 83894107 -19600867 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 1225 2072 151 61 25 chr15 83894107 83894332 -19600642 - MTC LTR MaLR -180 241 7 7 1225 2483 60 91 16 chr15 83896773 83897145 -19597829 - MTB_Mm LTR MaLR -7 400 1 7 1225 352 258 52 116 chr15 83898618 83899025 -19595949 + RMER17C LTR ERVK 15 395 -15 7 1225 1589 149 29 84 chr15 83902088 83902560 -19592414 - RMER17C LTR ERVK -484 474 16 7 1225 348 235 17 136 chr15 83913207 83913325 -19581649 + MT2B LTR ERVL 155 258 -343 7 1225 333 301 68 104 chr15 83913800 83913963 -19581011 + ORR1D2 LTR MaLR 30 186 -184 7 1225 3283 33 18 5 chr15 83927357 83927750 -19567224 - MTB LTR MaLR 0 400 3 7 1225 1520 89 192 29 chr15 83927752 83928065 -19566909 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 735 7 1225 2438 89 82 23 chr15 83928065 83928492 -19566482 + RLTR44E LTR ERVK 1 452 0 7 1225 4648 120 34 16 chr15 83928492 83929304 -19565670 - MTB-int LTR MaLR -429 829 3 7 1225 3218 68 10 8 chr15 83929304 83929703 -19565271 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1225 1147 253 105 45 chr15 83932182 83932563 -19562411 + MTD LTR MaLR 2 405 -14 7 1225 2025 177 22 46 chr15 83938018 83938221 -19556753 - MTD LTR MaLR -14 405 206 7 1225 2025 177 22 46 chr15 83938403 83938614 -19556360 - MTD LTR MaLR -214 205 1 7 1225 887 208 124 21 chr15 83947092 83947322 -19547652 + ORR1D1 LTR MaLR 5 231 -163 8 1225 555 289 55 128 chr15 83947490 83947558 -19547416 + ORR1D1 LTR MaLR 232 394 0 8 1225 631 265 27 57 chr15 83960531 83960969 -19534005 - RMER17C LTR ERVK -32 378 3 8 1225 260 232 0 18 chr15 83964389 83964446 -19530528 + RLTR11A2 LTR ERVK 463 518 -9 8 1225 957 247 71 92 chr15 83965718 83966012 -19528962 + MTEa LTR MaLR 58 345 -34 8 1225 297 167 39 65 chr15 83966006 83966019 -19528955 + MTEb LTR MaLR 281 291 -68 8 1225 369 175 0 0 chr15 83966232 83966295 -19528679 + MTEb LTR MaLR 311 373 -6 8 1225 607 229 71 7 chr15 83967598 83967728 -19527246 + ORR1D2 LTR MaLR 1 139 -231 8 1225 6006 170 84 21 chr15 83967728 83968913 -19526061 + RMER12 LTR ERVK 1 1707 -101 8 1225 367 274 157 36 chr15 83968919 83969055 -19525919 + ORR1D2 LTR MaLR 135 287 -83 8 1225 395 256 0 22 chr15 83969449 83969541 -19525433 + ORR1D2 LTR MaLR 281 370 0 8 1225 3654 98 48 39 chr15 83971962 83972524 -19522450 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 8 1225 2928 138 13 126 chr15 83972641 83973237 -19521737 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 8 1225 446 160 76 102 chr15 83973735 83973853 -19521121 + MT2B LTR ERVL 143 257 -344 8 1225 1759 143 27 72 chr15 83976229 83976561 -19518413 + RLTR24 LTR ERV1 1 317 -212 8 1225 1012 216 94 0 chr15 83976721 83976934 -19518040 + RLTR24 LTR ERV1 297 529 0 8 1225 3424 30 115 2 chr15 83976968 83977395 -19517579 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 8 1225 6671 44 2 6 chr15 83977397 83978227 -19516747 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5653 8 1225 2643 58 0 3 chr15 83978222 83978565 -19516409 - IAPEz-int LTR ERVK -4781 1700 1359 8 1225 3559 79 13 32 chr15 83978565 83979218 -19515756 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 8 1225 255 302 0 0 chr15 83979218 83979271 -19515703 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 223 8 1225 1009 115 25 85 chr15 83979271 83979470 -19515504 - IAPEz-int LTR ERVK -6286 195 9 8 1225 3410 30 115 2 chr15 83979471 83979898 -19515076 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 8 1225 3176 53 24 0 chr15 83983478 83983854 -19511120 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 8 1225 2149 95 7 14 chr15 83984938 83985285 -19509689 + ORR1A2 LTR MaLR 19 346 0 8 1225 4186 70 3 136 chr15 83987737 83988414 -19506560 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 9 1225 1378 279 95 44 chr15 83988416 83988752 -19506222 + MuRRS-int LTR ERV1 5 344 -4719 9 1225 2476 115 12 47 chr15 83988783 83989184 -19505790 + MuRRS-int LTR ERV1 719 1108 -3582 9 1225 3010 249 38 36 chr15 83989267 83990450 -19504524 + MuRRS-int LTR ERV1 1118 2792 -2271 9 1225 6121 120 14 17 chr15 83990497 83991444 -19503530 + MuRRS-int LTR ERV1 3747 4690 0 9 1225 4720 73 3 0 chr15 83991444 83992029 -19502945 + LTRIS_Mus LTR ERV1 1 587 0 9 1225 368 197 0 14 chr15 83993819 83993891 -19501083 - MTEa LTR MaLR -2 377 307 9 1225 660 298 62 89 chr15 83994146 83994470 -19500504 - MTEa LTR MaLR -59 320 6 9 1225 857 246 139 70 chr15 83995199 83995601 -19499373 - RLTR28B LTR ERVL -51 430 1 9 1225 1396 249 13 70 chr15 84005144 84005541 -19489433 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 1 1225 1564 151 86 146 chr15 84008740 84009159 -19485815 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1225 297 248 92 37 chr15 84010703 84010812 -19484162 + MLT1A0 LTR MaLR 200 314 -51 3 1225 226 321 63 18 chr15 84015009 84015120 -19479854 - RMER10B LTR ERVL -11 387 272 4 1226 1728 128 54 168 chr15 84017194 84017529 -19477445 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 56 5 1226 1728 128 54 168 chr15 84017674 84017743 -19477231 - RLTR15 LTR ERVK -304 55 1 5 1226 968 201 88 9 chr15 84020489 84020705 -19474269 + RLTR42 LTR ERVK 7 239 0 5 1226 2451 121 45 37 chr15 84033830 84034234 -19460740 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1226 1702 153 176 6 chr15 84035260 84035595 -19459379 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 8 1226 241 325 0 13 chr15 84054070 84054148 -19440826 + MT2A LTR ERVL 317 393 -140 1 1226 493 245 62 7 chr15 84055682 84055826 -19439148 + ORR1E LTR MaLR 1 152 -207 1 1226 324 188 14 55 chr15 84056343 84056416 -19438558 + ORR1E LTR MaLR 307 376 -3 1 1226 554 155 61 35 chr15 84056852 84057001 -19437973 + ORR1D2 LTR MaLR 256 370 0 1 1226 1235 179 178 77 chr15 84059287 84059345 -19435629 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 322 1 1226 1235 179 178 77 chr15 84059526 84059637 -19435337 - ORR1D1 LTR MaLR -53 321 195 1 1226 1235 179 178 77 chr15 84059694 84059860 -19435114 - ORR1D1 LTR MaLR -180 194 4 1 1226 314 147 117 26 chr15 84060670 84060747 -19434227 - MTE2b LTR MaLR -34 345 262 1 1226 276 238 32 0 chr15 84060782 84060845 -19434129 - MT2A LTR ERVL -360 173 109 1 1226 772 175 20 27 chr15 84060845 84060992 -19433982 - MT2A LTR ERVL -387 146 1 1 1226 331 310 22 52 chr15 84061063 84061199 -19433775 - MTE2b LTR MaLR -242 137 6 1 1226 344 235 154 49 chr15 84067778 84067921 -19427053 - MTD LTR MaLR -261 158 1 1 1226 596 249 174 33 chr15 84070388 84070544 -19424430 - MTE2a LTR MaLR 0 379 195 1 1226 2969 55 42 8 chr15 84070544 84070927 -19424047 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1226 596 249 174 33 chr15 84070927 84071040 -19423934 - MTE2a LTR MaLR -185 194 72 1 1226 514 284 128 89 chr15 84072492 84072560 -19422414 - MTE2a LTR MaLR -1 378 318 1 1226 514 284 128 89 chr15 84072736 84072802 -19422172 - MTE2a LTR MaLR -62 317 236 1 1226 514 289 117 90 chr15 84072878 84073078 -19421896 - MTE2a LTR MaLR -144 235 35 1 1226 415 283 152 24 chr15 84085597 84085807 -19409167 - MER21B LTR ERV1 -608 255 19 2 1226 346 169 204 31 chr15 84088451 84088549 -19406425 - MTEb LTR MaLR -14 365 251 2 1226 2627 116 79 15 chr15 84091865 84092258 -19402716 + MTC LTR MaLR 4 421 0 2 1226 253 304 175 55 chr15 84100898 84101190 -19393784 - MER54A LTR ERVL -570 331 5 2 1226 226 287 54 81 chr15 84101600 84101748 -19393226 - LTR9 LTR ERV1 -320 292 149 2 1226 2606 55 31 88 chr15 84102206 84102455 -19392519 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 195 2 1226 2606 55 31 88 chr15 84102603 84102774 -19392200 - MTB_Mm LTR MaLR -213 194 11 2 1226 1227 273 68 20 chr15 84104622 84105022 -19389952 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1226 1055 245 39 78 chr15 84106002 84106334 -19388640 - MTE2a LTR MaLR -55 324 6 2 1226 458 318 58 41 chr15 84106659 84106902 -19388072 + MLT1D LTR MaLR 250 496 -9 2 1226 1488 213 129 6 chr15 84110583 84110947 -19384027 - MTD LTR MaLR -10 409 1 2 1226 3209 180 23 18 chr15 84112308 84112869 -19382105 - RLTR12A LTR ERVK -4 564 1 2 1226 454 184 144 88 chr15 84118012 84118106 -19376868 + MTC LTR MaLR 2 106 -315 2 1226 454 184 144 88 chr15 84118295 84118325 -19376649 + MTC LTR MaLR 107 133 -288 2 1226 496 220 144 0 chr15 84118326 84118458 -19376516 + MTC LTR MaLR 271 421 0 2 1226 248 176 39 0 chr15 84118461 84118512 -19376462 + MLT1B LTR MaLR 45 97 -293 2 1226 250 287 0 122 chr15 84122263 84122378 -19372596 + MT2B LTR ERVL 136 236 -365 2 1226 813 234 89 65 chr15 84127502 84127853 -19367121 - MTC-int LTR MaLR -585 513 66 2 1226 2492 52 62 0 chr15 84138046 84138351 -19356623 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 4 3 1226 1665 208 97 0 chr15 84147731 84148102 -19346872 - MTD LTR MaLR 0 419 13 3 1227 368 353 73 65 chr15 84148981 84149351 -19345623 - MLT1A LTR MaLR 0 374 2 3 1227 385 311 6 74 chr15 84150795 84150958 -19344016 + MLT1H2 LTR MaLR 3 154 -335 3 1227 1443 157 211 12 chr15 84152780 84152954 -19342020 - RMER17C LTR ERVK 0 410 180 3 1227 1443 157 211 12 chr15 84153043 84153209 -19341765 - RMER17C LTR ERVK -231 179 2 3 1227 603 254 243 24 chr15 84156904 84157207 -19337767 - MTEb LTR MaLR -10 369 1 3 1227 360 294 70 0 chr15 84158941 84159084 -19335890 - MLT1-int LTR MaLR -1218 153 1 3 1227 393 289 79 25 chr15 84167994 84168196 -19326778 - ORR1D2 LTR MaLR -132 238 26 3 1227 1690 237 77 12 chr15 84173588 84174079 -19320895 + RLTR11A2 LTR ERVK 5 527 0 3 1227 1677 167 45 48 chr15 84174408 84174449 -19320525 - RMER10B LTR ERVL -3 395 352 3 1227 1677 167 45 48 chr15 84174498 84174852 -19320122 - RMER10B LTR ERVL -47 351 2 3 1227 369 321 51 41 chr15 84175046 84175241 -19319733 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 165 3 1227 301 110 0 4 chr15 84177272 84177324 -19317650 - MT2A LTR ERVL 0 584 488 3 1227 1042 227 143 174 chr15 84177512 84177994 -19316980 - MT2A LTR ERVL -52 532 2 3 1227 383 252 53 14 chr15 84178843 84179009 -19315965 - MLT1A1 LTR MaLR 0 505 202 3 1227 1815 203 78 5 chr15 84181459 84181841 -19313133 + MTD LTR MaLR 1 410 -9 3 1227 2099 145 3 3 chr15 84184306 84184644 -19310330 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 3 1227 1406 201 75 6 chr15 84189630 84189950 -19305024 + MTD LTR MaLR 1 342 -77 4 1227 234 215 29 58 chr15 84190172 84190241 -19304733 + MTD LTR MaLR 339 405 -14 4 1227 2523 71 3 0 chr15 84192115 84192441 -19302533 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1227 1770 117 38 76 chr15 84193738 84193899 -19301075 + ORR1A4 LTR MaLR 1 152 -177 4 1227 3164 55 8 0 chr15 84193899 84194296 -19300678 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1227 1770 117 38 76 chr15 84194296 84194476 -19300498 + ORR1A4 LTR MaLR 153 329 0 4 1227 338 276 102 65 chr15 84195265 84195451 -19299523 + MLT1G3 LTR MaLR 218 410 -185 4 1227 340 304 323 30 chr15 84195581 84195834 -19299140 - MLT1A1 LTR MaLR -57 351 25 4 1227 579 191 202 0 chr15 84198336 84198504 -19296470 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 173 4 1227 888 148 28 28 chr15 84198741 84198922 -19296052 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 1 4 1227 368 209 231 0 chr15 84199073 84199164 -19295810 - ORR1E-int LTR MaLR -1256 324 213 4 1227 409 200 0 104 chr15 84200991 84201017 -19293957 - MT2B LTR ERVL -362 239 145 4 1227 721 253 77 0 chr15 84202309 84202503 -19292471 - ORR1E-int LTR MaLR -1370 210 2 4 1227 564 286 118 82 chr15 84202516 84202847 -19292127 - ORR1E LTR MaLR -9 350 8 4 1227 415 335 69 69 chr15 84203370 84203630 -19291344 - MLT1A1 LTR MaLR -93 315 56 4 1227 315 182 23 105 chr15 84204435 84204521 -19290453 - MT2B LTR ERVL -361 240 162 4 1227 1023 240 45 77 chr15 84205547 84205859 -19289115 - MTD LTR MaLR -72 347 46 4 1227 1983 112 16 13 chr15 84207870 84208188 -19286786 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1227 1200 258 125 11 chr15 84218561 84218922 -19276052 - MTD LTR MaLR 0 419 18 4 1227 367 246 158 138 chr15 84219359 84219599 -19275375 - MTEa LTR MaLR -25 354 93 4 1227 1048 293 91 0 chr15 84219786 84220127 -19274847 + MTEa LTR MaLR 1 372 -7 4 1227 1089 241 242 9 chr15 84226738 84227073 -19267901 + MTD LTR MaLR 7 419 0 4 1227 225 294 110 0 chr15 84233400 84233509 -19261465 + RMER15 LTR ERVL 275 395 -180 4 1227 1277 251 28 66 chr15 84246333 84246696 -19248278 + ORR1E LTR MaLR 9 357 -2 5 1227 3609 204 91 20 chr15 84255030 84255925 -19239049 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 5 1227 960 219 36 0 chr15 84265537 84265733 -19229241 + MTD LTR MaLR 8 210 -209 5 1227 782 213 30 50 chr15 84265911 84266049 -19228925 + MTD LTR MaLR 196 338 -81 5 1227 782 213 30 50 chr15 84266124 84266183 -19228791 + MTD LTR MaLR 339 389 -30 5 1228 1551 218 50 6 chr15 84286343 84286684 -19208290 - MTEb LTR MaLR -11 368 13 5 1228 4289 263 159 10 chr15 84286697 84288072 -19206902 - MTEb-int LTR MaLR 0 1580 1 5 1228 1016 225 80 57 chr15 84288086 84288297 -19206677 - MTEb LTR MaLR -12 367 171 5 1228 1016 225 80 57 chr15 84288330 84288467 -19206507 - MTEb LTR MaLR -209 170 13 5 1228 1183 178 47 41 chr15 84290706 84290982 -19203992 + RMER19B LTR ERVK 1 240 -662 5 1228 1183 190 50 7 chr15 84291034 84291083 -19203891 + RMER19B LTR ERVK 241 279 -623 5 1228 5719 120 7 14 chr15 84293073 84293962 -19201012 + RMER19B LTR ERVK 1 885 -17 5 1228 2052 108 170 0 chr15 84295588 84295911 -19199063 + RLTR14 LTR ERV1 5 382 0 5 1228 266 285 56 84 chr15 84298015 84298157 -19196817 + MLT1A1 LTR MaLR 271 408 0 5 1228 239 143 35 35 chr15 84298322 84298380 -19196594 + RLTR25B LTR ERVK 467 524 -504 5 1228 5529 120 60 35 chr15 84303739 84304618 -19190356 + RMER19B LTR ERVK 2 902 0 5 1228 929 320 45 39 chr15 84306245 84306651 -19188323 - MTD LTR MaLR -16 403 18 5 1228 347 324 26 26 chr15 84306704 84306856 -19188118 + MLT1C LTR MaLR 290 441 -26 5 1228 3137 64 18 0 chr15 84308470 84308863 -19186111 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1228 333 368 78 10 chr15 84314259 84314465 -19180509 + MLT1E3 LTR MaLR 267 486 -138 5 1228 2133 93 20 72 chr15 84316325 84316672 -19178302 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 5 1228 978 165 84 5 chr15 84316711 84316924 -19178050 + RMER4B LTR ERVK 17 246 -339 5 1228 591 171 234 0 chr15 84317001 84317159 -19177815 + MTD LTR MaLR 225 419 0 5 1228 3459 39 100 96 chr15 84318909 84319419 -19175555 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 1228 1191 224 99 23 chr15 84324902 84325204 -19169770 - MTE2b LTR MaLR -54 325 1 6 1228 261 345 49 67 chr15 84339568 84339792 -19155182 + MLT1C LTR MaLR 45 264 -203 6 1228 243 247 24 47 chr15 84344145 84344230 -19150744 - MTE2a LTR MaLR -124 255 173 6 1228 1804 164 68 38 chr15 84344260 84344315 -19150659 - MTD LTR MaLR -8 411 359 6 1228 1822 160 175 11 chr15 84344315 84344675 -19150299 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1228 1804 164 68 38 chr15 84344675 84344852 -19150122 - MTD LTR MaLR -61 358 179 6 1228 1278 198 55 79 chr15 84344852 84344872 -19150102 - RMER17C LTR ERVK -3 407 388 6 1228 1278 198 55 79 chr15 84345056 84345071 -19149903 - RMER17C LTR ERVK -23 387 377 6 1228 1278 198 55 79 chr15 84345225 84345403 -19149571 - RMER17C LTR ERVK -34 376 190 6 1228 1278 198 55 79 chr15 84345546 84345747 -19149227 - RMER17C LTR ERVK -221 189 2 6 1228 1804 164 68 38 chr15 84345747 84345799 -19149175 - MTD LTR MaLR -241 178 117 6 1228 1804 164 68 38 chr15 84345919 84346031 -19148943 - MTD LTR MaLR -303 116 2 6 1228 518 283 7 28 chr15 84346031 84346149 -19148825 - MTE2a LTR MaLR -208 171 57 6 1228 249 246 31 0 chr15 84356246 84356311 -19138663 + MLT1K LTR MaLR 522 588 -7 6 1228 1279 295 144 10 chr15 84359590 84359897 -19135077 - MTE-int LTR MaLR -29 1551 1191 6 1228 1279 295 144 10 chr15 84359920 84360125 -19134849 - MTE-int LTR MaLR -390 1190 971 6 1228 245 286 26 13 chr15 84360573 84360651 -19134323 - MLT1A0 LTR MaLR -256 109 31 6 1228 282 411 43 10 chr15 84360779 84360988 -19133986 - MLT1A1 LTR MaLR -190 218 3 6 1228 703 149 274 0 chr15 84361331 84361499 -19133475 - MTD LTR MaLR 0 419 206 6 1228 507 292 153 25 chr15 84363598 84363879 -19131095 + MLT1D LTR MaLR 105 421 -84 6 1228 335 233 23 25 chr15 84364118 84364222 -19130752 + MTEa LTR MaLR 273 379 0 6 1228 236 263 154 26 chr15 84368808 84368924 -19126050 + RMER15 LTR ERVL 432 562 -13 6 1228 2031 115 19 65 chr15 84368924 84369295 -19125679 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 6 1228 577 251 94 93 chr15 84369521 84369884 -19125090 - RMER10A LTR ERVL -12 430 53 6 1228 367 250 0 37 chr15 84372789 84372897 -19122077 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 305 6 1228 580 203 29 111 chr15 84373941 84374113 -19120861 + RMER15 LTR ERVL 3 160 -415 6 1228 1163 281 42 0 chr15 84374111 84374399 -19120575 + RMER15 LTR ERVL 275 574 -1 6 1228 2302 108 50 151 chr15 84376754 84377122 -19117852 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 112 7 1228 2302 108 50 151 chr15 84377154 84377263 -19117711 - RLTR23 LTR ERV1 -319 111 1 7 1228 312 341 11 0 chr15 84377733 84377824 -19117150 + RMER15 LTR ERVL 371 462 -113 7 1228 2531 175 12 25 chr15 84379399 84379909 -19115065 - RMER20A LTR ERVK -3 513 11 7 1228 2837 122 45 0 chr15 84380964 84381367 -19113607 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1228 1092 249 92 35 chr15 84381501 84381847 -19113127 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 3 7 1228 3302 57 2 5 chr15 84390478 84390886 -19104088 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1228 449 315 24 0 chr15 84391059 84391224 -19103750 - RLTR42-int LTR ERVK -4197 1325 1157 7 1228 1862 162 128 54 chr15 84391501 84391930 -19103044 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 7 1228 2931 46 0 0 chr15 84392584 84392930 -19102044 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 7 1228 1356 255 106 26 chr15 84394084 84394471 -19100503 - MTD LTR MaLR -1 418 1 7 1228 413 232 12 0 chr15 84395503 84395585 -19099389 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 284 7 1228 1278 229 32 32 chr15 84395787 84396067 -19098907 - ORR1D2 LTR MaLR -88 282 3 7 1228 1922 172 36 14 chr15 84396309 84396668 -19098306 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 7 1228 4078 67 19 7 chr15 84399820 84400359 -19094615 - MT2B2 LTR ERVL -38 546 2 7 1228 2041 170 22 22 chr15 84400784 84401150 -19093824 + ORR1D1 LTR MaLR 1 366 -8 7 1228 240 224 17 17 chr15 84401306 84401365 -19093609 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 343 7 1228 2036 229 107 50 chr15 84401431 84402009 -19092965 + RLTR18 LTR ERVK 1 611 -5 7 1228 1326 240 71 9 chr15 84402688 84403024 -19091950 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 7 1228 283 311 48 40 chr15 84407386 84407510 -19087464 + MER92B LTR ERV1 405 529 -107 7 1228 255 295 77 0 chr15 84408711 84408789 -19086185 - RMER21A LTR ERV1 -258 689 606 7 1228 1459 231 40 35 chr15 84409905 84410277 -19084697 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 7 153 2227 146 112 18 chr15 84410296 84410679 -19084295 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 7 1229 1642 131 28 28 chr15 84410836 84411120 -19083854 - ORR1D1-int LTR MaLR -1086 284 1 7 1229 2062 156 18 50 chr15 84411120 84411504 -19083470 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 7 1229 338 304 201 45 chr15 84411507 84411686 -19083288 - MER21B LTR ERV1 -162 701 495 7 1229 1790 284 42 29 chr15 84411694 84412212 -19082762 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 2 7 1229 249 283 125 42 chr15 84412223 84412319 -19082655 - MER21B LTR ERV1 -396 467 364 7 1229 271 360 80 9 chr15 84412495 84412607 -19082367 - MER21B LTR ERV1 -725 138 19 7 1229 1767 102 87 11 chr15 84413878 84414165 -19080809 + ORR1B2 LTR MaLR 1 309 -58 7 1229 440 178 0 27 chr15 84414463 84414538 -19080436 + ORR1B2 LTR MaLR 295 367 0 7 1229 1163 169 201 86 chr15 84416749 84416892 -19078082 + ORR1D1 LTR MaLR 2 179 -195 7 1229 1163 169 201 86 chr15 84416927 84417049 -19077925 + ORR1D1 LTR MaLR 180 303 -71 7 1229 1163 169 201 86 chr15 84417197 84417230 -19077744 + ORR1D1 LTR MaLR 304 335 -39 7 1229 329 140 0 0 chr15 84417318 84417368 -19077606 + ORR1D1 LTR MaLR 325 374 0 7 1229 333 286 112 50 chr15 84417618 84417887 -19077087 - ORR1E LTR MaLR -4 375 53 7 1229 869 186 97 10 chr15 84418374 84418570 -19076404 - ORR1E LTR MaLR -146 213 1 7 1229 338 338 107 30 chr15 84419382 84419550 -19075424 + LTR16A LTR ERVL 121 301 -150 7 1229 499 218 70 43 chr15 84420909 84421024 -19073950 + MTEa LTR MaLR 6 123 -256 8 1229 343 247 14 0 chr15 84421025 84421098 -19073876 + MTEa LTR MaLR 85 158 -221 8 1229 1069 207 102 17 chr15 84421098 84421334 -19073640 + MTEa LTR MaLR 120 375 -4 8 1229 323 266 99 85 chr15 84426372 84426573 -19068401 - ORR1E LTR MaLR -146 213 10 8 1229 389 310 89 89 chr15 84427646 84427993 -19066981 + ORR1D2 LTR MaLR 24 370 0 8 1229 533 226 126 25 chr15 84428919 84429057 -19065917 + ORR1E LTR MaLR 2 155 -204 8 1229 322 209 155 49 chr15 84429057 84429237 -19065737 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 154 8 1229 2560 125 40 20 chr15 84435093 84435492 -19059482 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1229 251 327 76 87 chr15 84435611 84435638 -19059336 - MLT1J LTR MaLR -117 395 374 8 1229 1949 166 104 62 chr15 84435638 84435998 -19058976 + MTC LTR MaLR 1 387 -34 8 1229 1949 166 104 62 chr15 84436196 84436238 -19058736 + MTC LTR MaLR 388 420 -1 8 1229 251 327 76 87 chr15 84436238 84436300 -19058674 - MLT1J LTR MaLR -139 373 304 8 1229 251 327 76 87 chr15 84436342 84436469 -19058505 - MLT1J LTR MaLR -209 303 187 8 1229 251 327 76 87 chr15 84436715 84436783 -19058191 - MLT1J LTR MaLR -326 186 113 8 1229 834 256 50 29 chr15 84437555 84437796 -19057178 + RLTR1D LTR ERV1 1 246 -359 8 1229 3190 67 14 7 chr15 84437796 84438216 -19056758 + RLTR1D LTR ERV1 183 605 0 8 1229 1069 289 114 37 chr15 84439054 84439511 -19055463 - RMER5 LTR ERV1 0 534 43 8 1229 396 338 66 81 chr15 84441861 84442209 -19052765 + MLT1C LTR MaLR 117 459 -8 8 1229 303 340 65 20 chr15 84445374 84445527 -19049447 - RMER15 LTR ERVL -11 564 405 8 1229 2436 133 46 112 chr15 84447178 84447653 -19047321 - RLTR41 LTR ERV1 -2 444 1 8 1229 2344 131 2 70 chr15 84449775 84450187 -19044787 + RLTR41 LTR ERV1 63 446 0 8 1229 2147 171 81 20 chr15 84456978 84457371 -19037603 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 8 1229 325 298 97 53 chr15 84459641 84459847 -19035127 + MLT1B LTR MaLR 164 378 -12 8 1229 832 255 182 14 chr15 84463623 84463884 -19031090 - MTEa LTR MaLR -1 378 70 8 1229 347 224 53 0 chr15 84464193 84464269 -19030705 - MTEa LTR MaLR -297 82 3 8 1229 237 246 18 0 chr15 84466064 84466121 -19028853 - MTD LTR MaLR -12 407 350 8 1229 904 180 248 5 chr15 84466358 84466576 -19028398 - MTD LTR MaLR -59 360 90 8 1229 816 282 47 93 chr15 84467728 84468029 -19026945 - RMER15 LTR ERVL -14 561 275 8 1229 332 191 59 69 chr15 84468027 84468128 -19026846 - RMER15 LTR ERVL -415 160 61 8 1229 1900 161 12 99 chr15 84468288 84468710 -19026264 + ORR1C1 LTR MaLR 1 421 0 8 1229 355 234 13 0 chr15 84468713 84468797 -19026177 + MTEa LTR MaLR 1 85 -294 8 1229 697 254 199 11 chr15 84468896 84469163 -19025811 + MTEa LTR MaLR 63 379 0 8 1229 2848 131 48 85 chr15 84471414 84471955 -19023019 + RLTR28 LTR ERVL 2 522 -2 9 1229 272 254 14 0 chr15 84473401 84473472 -19021502 + MLT1C LTR MaLR 113 184 -283 9 1229 263 317 80 119 chr15 84473532 84473631 -19021343 + MLT1C LTR MaLR 156 238 -229 9 1229 263 317 80 119 chr15 84473668 84473819 -19021155 + MLT1C LTR MaLR 239 396 -71 9 1229 240 272 43 21 chr15 84473907 84474001 -19020973 - LTR40a LTR ERVL -423 96 1 9 1229 1557 217 183 33 chr15 84475672 84475733 -19019241 + RMER15 LTR ERVL 11 70 -505 9 1229 1557 217 183 33 chr15 84475920 84476349 -19018625 + RMER15 LTR ERVL 71 575 0 9 1229 782 233 68 0 chr15 84476535 84476698 -19018276 + ORR1D2 LTR MaLR 1 174 -196 9 1229 1524 181 154 81 chr15 84476705 84476901 -19018073 + RMER20A LTR ERVK 4 186 -330 9 1229 1524 181 154 81 chr15 84477083 84477294 -19017680 + RMER20A LTR ERVK 187 441 -75 9 1229 732 259 85 5 chr15 84477605 84477818 -19017156 + ORR1D2 LTR MaLR 130 368 -2 9 1229 284 324 0 0 chr15 84477818 84477888 -19017086 + MTEa LTR MaLR 19 88 -291 9 1229 1659 200 3 40 chr15 84477962 84478338 -19016636 + RMER19C LTR ERVK 190 610 -1 9 1229 1172 249 44 37 chr15 84478339 84478635 -19016339 + MTEa LTR MaLR 82 379 0 9 1229 921 211 77 38 chr15 84478697 84479136 -19015838 + RLTR20A2 LTR ERVK 1 568 0 9 1229 868 266 126 24 chr15 84479708 84480001 -19014973 - MTD LTR MaLR -64 355 33 9 1229 1845 243 98 6 chr15 84481195 84481676 -19013298 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 525 -2 9 1229 1707 181 65 40 chr15 84486528 84486926 -19008048 + MTD LTR MaLR 12 419 0 9 1229 798 222 46 168 chr15 84486926 84487191 -19007783 + MTD-int LTR MaLR 1 256 -1002 9 1229 798 222 46 168 chr15 84487395 84487475 -19007499 + MTD-int LTR MaLR 257 304 -954 9 1229 391 317 109 10 chr15 84489055 84489256 -19005718 - MLT1D LTR MaLR -263 242 22 9 1229 354 342 96 0 chr15 84515092 84515291 -18979683 + MLT1D LTR MaLR 1 218 -287 2 1229 280 303 98 0 chr15 84515308 84515440 -18979534 + MLT1D LTR MaLR 251 395 -110 2 1229 1387 182 99 35 chr15 84523033 84523375 -18971599 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 3 1229 927 255 107 23 chr15 84524563 84524930 -18970044 - MTE2a LTR MaLR 0 379 6 4 1229 983 239 276 0 chr15 84525128 84525425 -18969549 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 4 1229 1544 144 50 50 chr15 84534840 84534930 -18960044 - MTC LTR MaLR -120 301 201 5 1229 1544 144 50 50 chr15 84535092 84535301 -18959673 - MTC LTR MaLR -221 200 2 5 1229 924 192 77 161 chr15 84535758 84536056 -18958918 - MT2A LTR ERVL -260 273 1 5 1229 264 243 31 126 chr15 84537384 84537511 -18957463 - MT2B2 LTR ERVL -319 265 151 6 1229 3420 161 147 34 chr15 84538830 84539659 -18955315 + RMER19B LTR ERVK 35 896 -6 6 153 6188 107 53 19 chr15 84540887 84541814 -18953160 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 6 1230 2612 170 73 23 chr15 84543330 84543811 -18951163 - RLTR18B LTR ERVK -4 508 4 7 1230 1866 173 71 122 chr15 84544024 84544229 -18950745 + MTD LTR MaLR 5 209 -210 7 1230 1866 173 71 122 chr15 84544377 84544606 -18950368 + MTD LTR MaLR 210 417 -2 7 1230 1050 220 205 3 chr15 84544669 84545015 -18949959 + RMER5 LTR ERV1 1 416 -118 7 1230 865 190 102 168 chr15 84546798 84546891 -18948083 + MT2A LTR ERVL 15 88 -445 8 1230 865 190 102 168 chr15 84547099 84547308 -18947666 + MT2A LTR ERVL 94 305 -228 8 1230 630 178 224 26 chr15 84547610 84547723 -18947251 + MT2A LTR ERVL 347 462 -71 8 1230 630 178 224 26 chr15 84547757 84547799 -18947175 + MT2A LTR ERVL 463 533 0 8 1230 294 214 14 0 chr15 84548622 84548692 -18946282 + MTEb LTR MaLR 39 109 -270 8 1230 272 272 75 110 chr15 84553075 84553302 -18941672 - MT2B LTR ERVL -204 397 179 9 1230 2271 85 3 0 chr15 84554265 84554583 -18940391 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1230 1419 267 51 23 chr15 84556631 84556802 -18938172 + MTD LTR MaLR 13 177 -242 1 1230 1548 113 88 141 chr15 84556802 84557080 -18937894 + RMER17C LTR ERVK 1 234 -176 1 1230 1548 113 88 141 chr15 84557269 84557423 -18937551 + RMER17C LTR ERVK 235 410 0 1 1230 1419 267 51 23 chr15 84557423 84557646 -18937328 + MTD LTR MaLR 178 418 -1 1 1230 527 202 233 17 chr15 84565439 84565615 -18929359 - MTD LTR MaLR 0 419 206 1 1230 1783 204 88 5 chr15 84565739 84566211 -18928763 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3191 2476 1941 1 1230 350 314 68 56 chr15 84567984 84568373 -18926601 - MLT1C LTR MaLR -12 455 6 1 1230 263 355 134 17 chr15 84571658 84571890 -18923084 - MLT1C LTR MaLR -5 462 204 1 1230 239 390 94 10 chr15 84576682 84576874 -18918100 - MER77 LTR ERVL -252 355 148 1 1230 4542 10 2 0 chr15 84577002 84577494 -18917480 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1230 39446 15 14 0 chr15 84577494 84582781 -18912193 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 1 1230 374 167 46 35 chr15 84582781 84582868 -18912106 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 1 1230 297 0 0 0 chr15 84582868 84582906 -18912068 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1230 4542 10 2 0 chr15 84582906 84583398 -18911576 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1230 313 352 141 21 chr15 84584067 84584351 -18910623 + MLT1D LTR MaLR 10 327 -178 1 1230 1141 265 48 17 chr15 84586139 84586497 -18908477 + MTE2b LTR MaLR 2 357 -22 1 1230 342 305 103 26 chr15 84588291 84588486 -18906488 + MLT1D LTR MaLR 1 210 -295 1 1230 269 194 30 75 chr15 84590001 84590068 -18904906 - RMER15 LTR ERVL -154 421 358 1 1230 336 267 67 0 chr15 84592245 84592350 -18902624 + MLT1A1 LTR MaLR 295 406 -2 1 1230 263 372 59 35 chr15 84595148 84595351 -18899623 - MLT1I LTR MaLR 0 411 204 1 1230 480 231 60 23 chr15 84603278 84603411 -18891563 - MLT1K LTR MaLR -317 278 141 1 1230 611 271 56 56 chr15 84603580 84603830 -18891144 - ORR1E LTR MaLR -95 264 15 1 1230 1289 213 142 3 chr15 84604200 84604525 -18890449 - MTD LTR MaLR -21 398 29 1 1230 6409 55 30 2 chr15 84607281 84608067 -18886907 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 2 1230 1475 219 45 71 chr15 84609797 84610165 -18884809 - MTD LTR MaLR -15 404 47 2 1230 1050 291 166 26 chr15 84611762 84612214 -18882760 + MT2A LTR ERVL 15 529 -4 2 1230 281 304 58 10 chr15 84612806 84612909 -18882065 - LTR41B LTR ERVL -125 633 526 2 1230 303 306 8 75 chr15 84613847 84613967 -18881007 + MTEb LTR MaLR 1 112 -267 2 1230 278 290 1 37 chr15 84614278 84614379 -18880595 + MTEb LTR MaLR 270 366 -13 2 1230 475 234 12 94 chr15 84618296 84618456 -18876518 + MT2A LTR ERVL 1 147 -386 2 1230 303 345 0 98 chr15 84618456 84618479 -18876495 + MTE2b LTR MaLR 1 165 -214 2 1230 4147 135 16 65 chr15 84618479 84619000 -18875974 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4975 5486 -275 2 1230 4147 170 32 75 chr15 84619146 84619498 -18875476 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5384 5714 0 2 1230 1290 188 85 66 chr15 84619498 84619900 -18875074 + MT2A LTR ERVL 1 543 -58 2 1230 943 218 45 108 chr15 84619936 84619970 -18875004 + MT2A LTR ERVL 535 566 -18 2 1230 1854 141 72 17 chr15 84627981 84628327 -18866647 + ORR1C2 LTR MaLR 20 384 0 2 1230 320 270 155 4 chr15 84653111 84653277 -18841697 + MTEb LTR MaLR 176 372 -7 2 1230 824 204 121 22 chr15 84653644 84653875 -18841099 - MTD LTR MaLR -157 262 9 2 1230 1219 167 40 28 chr15 84655998 84656250 -18838724 + ORR1D1 LTR MaLR 6 260 -114 2 1230 2669 117 266 2 chr15 84657105 84657568 -18837406 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 2 1230 435 328 67 102 chr15 84660528 84660752 -18834222 - MLT2B3 LTR ERVL -167 387 1 2 1230 471 219 23 147 chr15 84660752 84660929 -18834045 - MTEa LTR MaLR -224 155 1 2 1230 298 111 0 0 chr15 84664773 84664818 -18830156 + MT2A LTR ERVL 489 533 0 2 1231 3382 40 2 17 chr15 84674582 84674988 -18819986 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1231 2246 107 31 12 chr15 84679158 84679479 -18815495 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1231 1074 255 125 6 chr15 84688793 84689105 -18805869 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 21 3 1231 252 300 57 0 chr15 84689408 84689478 -18805496 + MER21B LTR ERV1 15 88 -775 3 1231 2168 150 6 0 chr15 84689959 84690286 -18804688 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1231 1611 180 14 0 chr15 84693970 84694264 -18800710 - MTC LTR MaLR -123 298 1 3 1231 1672 214 60 13 chr15 84694701 84695098 -18799876 - MTD LTR MaLR -14 405 5 3 1231 295 197 41 27 chr15 84696131 84696204 -18798770 + ORR1D1 LTR MaLR 301 374 0 3 1231 252 298 80 8 chr15 84696227 84696352 -18798622 + MTEb-int LTR MaLR 1445 1578 -2 3 1231 1090 220 209 49 chr15 84696354 84696679 -18798295 + MTEb LTR MaLR 1 377 -2 3 1231 3327 58 0 2 chr15 84698446 84698847 -18796127 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1231 275 308 187 27 chr15 84699647 84699904 -18795070 + MLT1D LTR MaLR 53 350 -155 3 1231 2110 139 30 73 chr15 84700432 84700491 -18794483 + MTC LTR MaLR 5 54 -367 3 1231 2110 139 30 73 chr15 84700675 84700932 -18794042 + MTC LTR MaLR 55 312 -109 3 1231 2281 102 12 64 chr15 84700932 84701277 -18793697 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1231 2110 139 30 73 chr15 84701277 84701386 -18793588 + MTC LTR MaLR 313 413 -8 3 1231 2146 134 66 9 chr15 84702668 84703015 -18791959 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 1231 235 305 40 50 chr15 84703929 84704029 -18790945 + RLTR25A LTR ERVK 526 624 -479 3 1231 2483 173 85 28 chr15 84705702 84706232 -18788742 + ORR1D1-int LTR MaLR 809 1368 -2 3 1231 933 202 232 11 chr15 84706238 84706380 -18788594 + ORR1D1 LTR MaLR 6 188 -186 3 1231 933 202 232 11 chr15 84706410 84706547 -18788427 + ORR1D1 LTR MaLR 189 347 -27 3 1231 1415 191 270 36 chr15 84707830 84708275 -18786699 - RMER15 LTR ERVL 0 575 27 3 1231 324 261 48 130 chr15 84708719 84708783 -18786191 + MT2B LTR ERVL 182 357 -244 3 1231 3503 124 12 2 chr15 84708790 84709284 -18785690 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 3 1231 3127 60 39 0 chr15 84711727 84712112 -18782862 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1231 1081 282 113 0 chr15 84713138 84713316 -18781658 - MTEa LTR MaLR 0 379 169 3 1231 1081 282 113 0 chr15 84713491 84713649 -18781325 - MTEa LTR MaLR -211 168 6 3 1231 427 238 139 44 chr15 84715210 84715386 -18779588 + MTD LTR MaLR 1 164 -215 4 1231 240 185 37 0 chr15 84715359 84715413 -18779561 + MTD LTR MaLR 273 328 -51 4 1231 277 282 59 0 chr15 84719869 84719954 -18775020 + ORR1E LTR MaLR 270 359 0 4 1231 2221 91 0 9 chr15 84720708 84721030 -18773944 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1231 590 281 29 29 chr15 84721713 84721885 -18773089 + MLT1A LTR MaLR 2 173 -201 4 1231 360 274 87 16 chr15 84723092 84723218 -18771756 + MLT1A LTR MaLR 270 404 -4 4 1231 2950 118 51 11 chr15 84724059 84724532 -18770442 - RLTR44C LTR ERVK -10 492 1 4 1231 4985 30 2 0 chr15 84724532 84725100 -18769874 - RLTR44-int LTR ERVK 0 2812 2244 4 1231 604 282 34 63 chr15 84725111 84725380 -18769594 - IAPEz-int LTR ERVK -2798 3683 3423 4 1231 2225 141 36 23 chr15 84725648 84726273 -18768701 - RLTR44-int LTR ERVK -1480 1332 816 4 1231 942 111 7 0 chr15 84726293 84726428 -18768546 - RLTR44-int LTR ERVK -2666 146 11 4 1231 3069 95 42 10 chr15 84726428 84726909 -18768065 - RLTR44C LTR ERVK -6 496 1 4 1231 1727 101 165 29 chr15 84727104 84727420 -18767554 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 4 1231 1100 156 48 11 chr15 84727420 84727574 -18767400 + RMER19B LTR ERVK 742 902 0 4 1231 282 273 26 13 chr15 84730824 84730902 -18764072 + MLT1K LTR MaLR 350 428 -167 4 1231 1739 113 271 0 chr15 84731524 84731834 -18763140 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 4 1231 341 115 0 0 chr15 84733796 84733848 -18761126 - RMER19B LTR ERVK -77 825 774 4 1231 4560 62 14 9 chr15 84737552 84738133 -18756841 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 4 1231 1495 189 129 25 chr15 84741178 84741503 -18753471 - ORR1D2 LTR MaLR -10 360 2 4 1231 2071 200 43 159 chr15 84742018 84742709 -18752265 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 4 1231 3057 20 9 0 chr15 84743051 84743394 -18751580 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 4 1231 2439 82 3 0 chr15 84746245 84746563 -18748411 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1231 1143 267 104 49 chr15 84746905 84747378 -18747596 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4734 5232 -482 4 1231 747 251 171 58 chr15 84747454 84747763 -18747211 - MLT2D LTR ERVL -51 363 20 4 1231 1447 249 104 32 chr15 84749332 84749589 -18745385 - MT2A LTR ERVL -8 525 229 4 1231 1447 249 104 32 chr15 84749630 84749804 -18745170 - MT2A LTR ERVL -305 228 63 4 1231 264 322 39 65 chr15 84749723 84749876 -18745098 - MTD LTR MaLR -253 166 18 4 1231 307 259 41 82 chr15 84749864 84749986 -18744988 - MTD-int LTR MaLR -12 1568 1452 4 1231 332 333 22 52 chr15 84750442 84750578 -18744396 - MTD-int LTR MaLR -293 1287 1156 4 1231 1510 164 64 49 chr15 84750890 84751217 -18743757 - MERVL_2A-int LTR ERVL -242 5519 5188 4 1231 1266 181 182 27 chr15 84751355 84751684 -18743290 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 3 4 1231 458 106 75 140 chr15 84757001 84757187 -18737787 + RMER17C LTR ERVK 101 274 -136 5 1231 368 191 104 73 chr15 84760875 84760971 -18734003 - MT2B LTR ERVL -362 239 141 5 1231 1205 208 202 0 chr15 84762034 84762371 -18732603 - MTD LTR MaLR 0 419 15 5 1231 265 248 81 90 chr15 84771682 84771793 -18723181 - RLTR25A LTR ERVK -472 631 522 5 1231 407 186 93 73 chr15 84797404 84797561 -18697413 + RMER2 LTR ERV1 27 326 -241 5 1232 461 265 61 0 chr15 84807658 84807805 -18687169 - RMER15 LTR ERVL 0 575 420 5 1232 236 322 45 11 chr15 84808174 84808262 -18686712 + MER34 LTR ERV1 381 471 -71 5 1232 963 276 93 68 chr15 84815255 84815319 -18679655 + MTE2b LTR MaLR 1 59 -320 6 1232 963 276 93 68 chr15 84815490 84815659 -18679315 + MTE2b LTR MaLR 60 219 -160 6 1232 963 276 93 68 chr15 84815699 84815830 -18679144 + MTE2b LTR MaLR 220 375 -4 6 1232 252 256 23 47 chr15 84821001 84821087 -18673887 + MLT1E2 LTR MaLR 513 596 -31 6 1232 3350 59 0 26 chr15 84821638 84822056 -18672918 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1232 334 230 36 99 chr15 84824080 84824191 -18670783 - MT2B LTR ERVL -344 257 154 6 1232 289 264 8 106 chr15 84826317 84826440 -18668534 + RMER15 LTR ERVL 379 489 -86 6 1232 260 330 17 26 chr15 84828013 84828128 -18666846 - RMER12 LTR ERVK -470 852 739 6 1232 268 316 69 64 chr15 84828371 84828653 -18666321 - MTE2a LTR MaLR -14 365 65 6 1232 241 315 21 63 chr15 84828691 84828786 -18666188 - MLT1A1 LTR MaLR -279 129 39 6 1232 430 225 13 115 chr15 84831361 84831387 -18663587 + MT2B LTR ERVL 189 296 -305 6 1232 970 228 133 77 chr15 84831455 84831807 -18663167 + MTE2a LTR MaLR 8 379 0 6 1232 250 172 118 0 chr15 84833421 84833514 -18661460 - RLTR14-int LTR ERV1 -4877 440 337 6 1232 374 256 67 17 chr15 84833845 84833964 -18661010 + MLT1A LTR MaLR 27 151 -223 6 1232 340 302 68 25 chr15 84834719 84834882 -18660092 - MLT1D LTR MaLR 0 505 336 6 1232 256 368 45 13 chr15 84854202 84854359 -18640615 - RLTR42-int LTR ERVK -4196 1326 1165 7 1232 463 271 35 35 chr15 84854744 84854889 -18640085 + MLT1A0 LTR MaLR 14 158 -207 7 1232 1910 94 16 140 chr15 84855082 84855136 -18639838 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 285 7 1232 1910 94 16 140 chr15 84855320 84855357 -18639617 - ORR1A3 LTR MaLR -42 284 284 7 1232 1910 94 16 140 chr15 84855504 84855783 -18639191 - ORR1A3 LTR MaLR -42 284 1 7 1232 3357 112 42 25 chr15 84856034 84856180 -18638794 + MT2B2 LTR ERVL 5 145 -439 7 1232 3357 112 42 25 chr15 84856322 84856745 -18638229 + MT2B2 LTR ERVL 146 584 0 7 1232 2521 58 6 0 chr15 84859256 84859581 -18635393 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1232 10466 128 13 12 chr15 84859581 84861370 -18633604 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 1792 0 7 1232 2431 62 12 9 chr15 84861370 84861694 -18633280 + ORR1A2 LTR MaLR 1 325 -2 7 1232 952 198 21 160 chr15 84864506 84864880 -18630094 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 7 1232 331 272 14 101 chr15 84871770 84871810 -18623164 - MT2B LTR ERVL -443 158 131 7 1232 277 326 12 0 chr15 84872111 84872197 -18622777 - MLT1H2 LTR MaLR -327 162 76 7 1232 1537 149 155 19 chr15 84879478 84879800 -18615174 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 9 7 1232 562 225 8 0 chr15 84887195 84887315 -18607659 + ORR1D2 LTR MaLR 1 121 -249 8 1232 319 291 71 43 chr15 84887424 84887564 -18607410 - MTE-int LTR MaLR -564 1016 873 8 1232 571 307 138 31 chr15 84887711 84888000 -18606974 - MTE-int LTR MaLR -940 640 321 8 1232 417 320 155 54 chr15 84888145 84888403 -18606571 - MTE-int LTR MaLR -1254 326 43 8 1232 245 356 83 52 chr15 84888594 84888846 -18606128 - ORR1E LTR MaLR -3 356 97 8 1232 261 308 40 32 chr15 84888853 84888977 -18605997 - MLT1A1 LTR MaLR -280 128 4 8 1232 532 213 92 78 chr15 84897796 84897949 -18597025 + MTD LTR MaLR 265 419 0 8 1232 255 119 24 0 chr15 84903712 84903754 -18591220 + RLTR42 LTR ERVK 1 43 -196 8 1232 10489 122 62 32 chr15 84903756 84905264 -18589710 + RLTR42-int LTR ERVK 2233 3770 -1752 8 1232 10489 122 62 32 chr15 84905413 84905921 -18589053 + RLTR42-int LTR ERVK 3771 4310 -1212 8 1232 5579 139 62 34 chr15 84905944 84906996 -18587978 + RLTR42-int LTR ERVK 4394 5474 -48 8 1232 901 172 38 0 chr15 84906996 84907153 -18587821 + RLTR42 LTR ERVK 76 238 -1 8 1232 241 275 49 12 chr15 84907984 84908065 -18586909 + MER21B LTR ERV1 5 88 -775 8 1232 427 310 131 50 chr15 84908265 84908400 -18586574 + MER21B LTR ERV1 326 466 -397 8 1232 1724 175 72 40 chr15 84908400 84908783 -18586191 + RMER10A LTR ERVL 1 396 -46 8 1232 1724 175 72 40 chr15 84908862 84908906 -18586068 + RMER10A LTR ERVL 397 442 0 8 1232 427 286 125 54 chr15 84908906 84909140 -18585834 + MER21B LTR ERV1 467 765 -98 8 1232 2118 129 13 0 chr15 84916954 84917263 -18577711 + ORR1A2 LTR MaLR 1 313 -14 8 1232 2379 162 34 20 chr15 84917266 84917708 -18577266 + ORR1A2-int LTR MaLR 1 448 -1515 8 1232 582 96 12 0 chr15 84917700 84917783 -18577191 + ORR1A2-int LTR MaLR 1880 1963 0 8 1232 937 93 0 0 chr15 84917783 84917912 -18577062 + ORR1A2 LTR MaLR 1 129 -197 8 1232 1629 232 48 10 chr15 84917915 84918382 -18576592 + RMER4B LTR ERVK 72 585 0 8 1232 231 299 16 0 chr15 84924921 84925048 -18569926 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 626 8 1232 807 216 118 128 chr15 84929703 84929796 -18565178 - MT2A LTR ERVL -239 294 179 8 1232 807 216 118 128 chr15 84929892 84930095 -18564879 - MT2A LTR ERVL -355 178 2 8 1232 276 132 57 0 chr15 84930095 84930148 -18564826 - MERVL-int LTR ERVL 0 5761 5706 8 1232 269 187 0 39 chr15 84930149 84930227 -18564747 - ORR1A3-int LTR MaLR -1325 638 564 8 1232 15263 196 55 24 chr15 84930352 84932150 -18562824 - MERVL-int LTR ERVL -106 5379 3517 8 1232 15263 196 55 24 chr15 84932346 84933915 -18561059 - MERVL-int LTR ERVL -1969 3516 1906 8 1232 1726 153 37 0 chr15 84933921 84934215 -18560759 - MERVL-int LTR ERVL -4586 1175 871 8 1233 2976 178 56 10 chr15 84934673 84935296 -18559678 - MERVL-int LTR ERVL -5109 652 1 8 1233 1268 193 219 87 chr15 84935296 84935340 -18559634 - MT2A LTR ERVL 0 533 464 8 1233 1268 193 219 87 chr15 84935384 84935810 -18559164 - MT2A LTR ERVL -70 463 2 8 1233 331 70 0 0 chr15 84935945 84935988 -18558986 - MTD LTR MaLR 0 419 377 8 1233 1640 228 73 22 chr15 84936150 84936518 -18558456 - MTD LTR MaLR -30 389 3 8 1233 498 157 134 15 chr15 84940326 84940501 -18554473 + RMER17A2 LTR ERVK 1 79 -827 9 1233 402 108 85 98 chr15 84950113 84950195 -18544779 + RMER4A LTR ERVK 312 392 -74 9 1233 1908 137 65 10 chr15 84956096 84956406 -18538568 + RLTR25A LTR ERVK 7 333 -770 9 1233 1239 169 95 37 chr15 84956557 84956852 -18538122 + RLTR25A LTR ERVK 551 862 -166 9 1233 252 140 113 81 chr15 84957035 84957097 -18537877 + RLTR25B LTR ERVK 757 820 -208 9 1233 356 236 191 0 chr15 84957114 84957145 -18537829 + RLTR25B LTR ERVK 898 936 -92 9 1233 356 236 191 0 chr15 84957183 84957261 -18537713 + RLTR25B LTR ERVK 937 1027 -1 9 1233 391 296 413 3 chr15 84960799 84961124 -18533850 + MER68 LTR ERVL 90 547 -16 9 1233 502 205 89 47 chr15 84966144 84966313 -18528661 - MTD LTR MaLR 0 419 244 9 1233 1354 252 47 49 chr15 84970267 84970697 -18524277 + BGLII_B LTR ERVK 1 429 -12 9 1233 811 216 132 40 chr15 84970778 84971090 -18523884 - MT2A LTR ERVL 0 601 114 9 1233 946 246 127 34 chr15 84971090 84971345 -18523629 - ORR1C1 LTR MaLR -2 376 1 9 1233 529 159 63 36 chr15 84971345 84971456 -18523518 - MT2A LTR ERVL -419 114 1 9 1233 272 295 149 46 chr15 84975141 84975443 -18519531 - MLT1J LTR MaLR -30 482 150 9 1233 263 192 215 13 chr15 84976254 84976331 -18518643 - MLT1J LTR MaLR -297 170 78 9 1233 665 176 26 25 chr15 84976331 84976564 -18518410 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 178 9 1233 1931 177 40 6 chr15 84976687 84977039 -18517935 + ORR1B2 LTR MaLR 2 365 -2 9 1233 287 292 25 102 chr15 84977790 84977908 -18517066 + MT2B2 LTR ERVL 147 255 -329 9 1233 2166 132 93 10 chr15 84982430 84982837 -18512137 - RMER10A LTR ERVL 0 442 2 9 1233 535 249 32 111 chr15 84984681 84984871 -18510103 - MER57C2 LTR ERV1 -245 189 15 1 1233 2317 117 73 3 chr15 84987722 84988090 -18506884 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1233 1406 211 99 20 chr15 84988163 84988506 -18506468 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1233 796 338 57 12 chr15 84989904 84990236 -18504738 - LTR16A LTR ERVL -8 443 97 1 1233 2097 146 12 49 chr15 84992106 84992532 -18502442 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 1 1233 368 215 0 48 chr15 84995419 84995502 -18499472 + RMER15 LTR ERVL 351 429 -146 1 1233 918 230 68 9 chr15 84997861 84998080 -18496894 - RMER15 LTR ERVL 0 575 344 1 1233 1184 241 110 22 chr15 84998215 84998430 -18496544 - RMER15 LTR ERVL -201 374 128 1 1233 1184 241 110 22 chr15 84998510 84998612 -18496362 - RMER15 LTR ERVL -448 127 29 1 1233 648 242 107 29 chr15 85001366 85001608 -18493366 - MLT1B LTR MaLR -88 302 42 3 1233 1675 127 120 0 chr15 85006945 85007236 -18487738 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 2 1233 368 301 100 97 chr15 85008797 85009106 -18485868 + LTR31 LTR ERV1 292 601 -18 2 1233 1096 180 31 170 chr15 85015622 85016098 -18478876 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 4 1233 4257 14 2 0 chr15 85020628 85021120 -18473854 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1233 301 0 0 0 chr15 85021120 85021158 -18473816 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 6 1233 377 167 46 35 chr15 85021158 85021245 -18473729 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 6 1233 39368 16 14 0 chr15 85021245 85026532 -18468442 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 6 1233 4257 14 2 0 chr15 85026532 85027024 -18467950 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 6 1233 2342 137 5 5 chr15 85028265 85028648 -18466326 + ORR1B1 LTR MaLR 3 385 -9 6 1233 269 269 65 0 chr15 85029612 85029705 -18465269 - MLT1B LTR MaLR -291 99 1 7 1233 432 194 17 120 chr15 85031833 85031950 -18463024 - MT2B LTR ERVL -345 256 152 7 1233 244 243 29 29 chr15 85031950 85031967 -18463007 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 724 615 7 1233 1757 136 70 99 chr15 85039311 85039695 -18455279 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 9 1233 1926 117 26 10 chr15 85046718 85047030 -18447944 - ORR1A2 LTR MaLR -9 318 2 1 1233 3338 23 5 0 chr15 85055691 85056089 -18438885 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1233 2241 124 52 41 chr15 85056760 85057123 -18437851 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 1 1233 469 342 21 62 chr15 85058809 85059049 -18435925 - MLT2D LTR ERVL -113 301 72 1 1233 3345 43 7 15 chr15 85065270 85065673 -18429301 - MTB LTR MaLR 0 400 1 1 1234 3493 30 5 2 chr15 85066466 85066864 -18428110 - MTB LTR MaLR 0 400 2 1 1234 252 342 44 26 chr15 85069906 85070020 -18424954 - MER67B LTR ERV1 -508 153 38 1 1234 297 214 67 67 chr15 85079408 85079513 -18415461 - MT2B LTR ERVL -344 257 153 1 1234 1979 151 40 11 chr15 85084511 85084860 -18410114 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 1 1 1234 268 308 54 40 chr15 85086398 85086547 -18408427 - MLT1C LTR MaLR -158 309 159 1 1234 531 252 48 51 chr15 85086833 85087069 -18407905 + MTD LTR MaLR 1 277 -142 1 1234 977 264 53 79 chr15 85087756 85088135 -18406839 + MTEa LTR MaLR 3 371 -8 1 1234 748 270 89 53 chr15 85090693 85091030 -18403944 - ORR1E LTR MaLR 0 359 11 1 1234 786 181 121 0 chr15 85091256 85091422 -18403552 - MTD LTR MaLR -5 414 229 1 1234 1121 178 4 84 chr15 85091497 85091541 -18403433 - MTD LTR MaLR -195 224 192 1 1234 1121 178 4 84 chr15 85091717 85091911 -18403063 - MTD LTR MaLR -228 191 5 1 1234 620 326 210 11 chr15 85101802 85102328 -18392646 - MER54A LTR ERVL -263 638 7 1 1234 1812 213 95 15 chr15 85106643 85107052 -18387922 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 1 1234 286 346 136 28 chr15 85107056 85107270 -18387704 - MTEb LTR MaLR -25 354 118 1 1234 258 246 0 0 chr15 85116664 85116721 -18378253 - MLT1A LTR MaLR -16 392 336 2 1234 291 250 0 126 chr15 85116884 85117003 -18377971 - MLT1A LTR MaLR -251 123 20 2 1234 276 271 39 78 chr15 85117917 85118045 -18376929 - ORR1E LTR MaLR -164 195 73 2 1234 230 248 132 63 chr15 85118611 85118770 -18376204 + MLT1H-int LTR MaLR 1219 1388 -21 2 1234 298 341 74 42 chr15 85118771 85118961 -18376013 + RMER15 LTR ERVL 322 517 -58 2 1234 464 244 47 63 chr15 85124535 85124662 -18370312 - MT2B LTR ERVL -344 257 133 2 1234 247 337 33 0 chr15 85126901 85126993 -18367981 - LTR75 LTR ERVL -31 531 437 2 1234 269 244 41 112 chr15 85127344 85127639 -18367335 + RMER17D LTR ERVK 271 544 -345 2 1234 2672 112 5 5 chr15 85134542 85134920 -18360054 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1234 1311 231 101 13 chr15 85137743 85138050 -18356924 + ORR1E LTR MaLR 1 334 -25 2 1234 1826 143 25 81 chr15 85138089 85138447 -18356527 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 49 2 1234 2386 90 6 59 chr15 85139450 85139791 -18355183 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 2 1234 1666 216 35 42 chr15 85151654 85151985 -18342989 - MTEb LTR MaLR -1 378 51 3 1234 2113 169 27 79 chr15 85151985 85152201 -18342773 - MTC LTR MaLR -1 420 203 3 1234 2113 169 27 79 chr15 85152321 85152332 -18342642 - MTC LTR MaLR -219 202 202 3 1234 2113 169 27 79 chr15 85152504 85152718 -18342256 - MTC LTR MaLR -219 202 1 3 1234 1666 216 35 42 chr15 85152718 85152763 -18342211 - MTEb LTR MaLR -329 50 5 3 1234 1370 147 105 31 chr15 85153435 85153729 -18341245 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 316 -211 3 1234 1009 269 40 121 chr15 85154723 85155204 -18339770 + MLT1D LTR MaLR 1 442 -63 3 1234 367 250 39 54 chr15 85157399 85157602 -18337372 - RMER17C LTR ERVK -135 275 76 3 1234 297 287 188 7 chr15 85159598 85159742 -18335232 - MTD LTR MaLR -199 220 51 3 1234 1042 229 184 48 chr15 85159912 85160228 -18334746 + MTD LTR MaLR 47 405 -14 3 1234 1383 229 114 3 chr15 85161403 85161701 -18333273 + MTD LTR MaLR 53 383 -36 3 1234 1861 169 157 6 chr15 85162799 85163163 -18331811 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 3 1234 326 186 17 0 chr15 85163276 85163335 -18331639 - MTC LTR MaLR -210 211 152 3 1234 1860 164 60 50 chr15 85164076 85164168 -18330806 + ORR1C2 LTR MaLR 1 88 -296 3 1234 1860 164 60 50 chr15 85164315 85164602 -18330372 + ORR1C2 LTR MaLR 89 384 0 3 1234 1851 125 72 83 chr15 85165144 85165492 -18329482 + ORR1B1 LTR MaLR 42 385 -9 3 1234 1115 260 131 6 chr15 85165629 85165950 -18329024 + MTE2b LTR MaLR 10 370 -9 3 1234 1420 192 116 50 chr15 85172652 85173014 -18321960 - MTD LTR MaLR 0 419 34 3 1234 2543 74 118 6 chr15 85175385 85175570 -18319404 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 197 3 1234 2543 74 118 6 chr15 85175744 85175923 -18319051 - MTB_Mm LTR MaLR -211 196 2 3 1234 712 213 173 106 chr15 85176004 85176345 -18318629 - MTEa LTR MaLR -7 372 9 3 1234 234 309 15 0 chr15 85176540 85176608 -18318366 + ORR1E LTR MaLR 1 69 -290 3 1234 338 192 186 31 chr15 85193137 85193266 -18301708 - MLT1D LTR MaLR 0 505 357 4 1234 2546 45 6 0 chr15 85193266 85193597 -18301377 - RLTR10B2 LTR ERVK -32 333 1 4 1234 374 339 64 34 chr15 85194129 85194364 -18300610 - MER21B LTR ERV1 -415 448 207 4 1234 394 198 108 10 chr15 85194790 85194892 -18300082 - MLT1D-int LTR MaLR -152 1219 1108 4 1234 405 336 78 19 chr15 85194926 85195196 -18299778 - MLT1D-int LTR MaLR -1194 295 10 4 1234 459 306 209 21 chr15 85195197 85195592 -18299382 - MLT1D LTR MaLR 0 467 8 4 1234 631 297 133 12 chr15 85195990 85196314 -18298660 - MLT1A0 LTR MaLR -2 363 1 4 1234 386 291 93 51 chr15 85196382 85196596 -18298378 + MLT1B LTR MaLR 152 374 -16 4 154 658 261 73 77 chr15 85196648 85196988 -18297986 + ORR1E LTR MaLR 1 339 -20 4 1235 369 143 45 125 chr15 85201409 85201521 -18293453 - MT2B LTR ERVL -337 264 162 4 1235 888 207 167 38 chr15 85207804 85208175 -18286799 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1235 229 274 109 31 chr15 85208473 85208601 -18286373 - LTR75 LTR ERVL -421 141 4 4 1235 356 237 40 56 chr15 85215199 85215324 -18279650 - ORR1E LTR MaLR -186 173 51 4 1235 1238 254 99 10 chr15 85238592 85238977 -18255997 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1235 337 199 147 0 chr15 85256038 85256174 -18238800 - RMER17C LTR ERVK -137 273 118 5 1235 4195 38 0 0 chr15 85261700 85262175 -18232799 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 5 1235 766 282 120 56 chr15 85265718 85266075 -18228899 + MLT1C LTR MaLR 67 446 -21 5 1235 1132 231 112 6 chr15 85277161 85277500 -18217474 - MTE2a LTR MaLR -4 375 1 5 1235 438 268 55 8 chr15 85280208 85280336 -18214638 - MTD LTR MaLR -14 405 272 5 1235 323 118 0 0 chr15 85280402 85280453 -18214521 - ORR1A3-int LTR MaLR -1346 617 567 5 1235 353 97 65 0 chr15 85280453 85280515 -18214459 - MERVL_2A-int LTR ERVL -132 5629 5564 5 1235 932 196 48 51 chr15 85280581 85280800 -18214174 - MTD LTR MaLR -218 201 1 5 1235 230 349 27 112 chr15 85292857 85293044 -18201930 + LTR16D1 LTR ERVL 115 285 -390 6 1235 230 266 100 52 chr15 85296879 85297089 -18197885 + ORR1A1-int LTR MaLR 1147 1366 -426 6 1235 845 262 68 64 chr15 85298402 85298683 -18196291 + MLT1B LTR MaLR 1 282 -108 6 1235 359 320 103 19 chr15 85299157 85299313 -18195661 + MLT1F2 LTR MaLR 12 180 -380 6 1235 234 344 0 91 chr15 85302423 85302522 -18192452 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 152 6 1235 269 244 51 0 chr15 85303120 85303198 -18191776 + ERVL-int LTR ERVL 2987 3068 -2646 6 1235 502 229 44 32 chr15 85303230 85303388 -18191586 + ERVL-int LTR ERVL 4144 4303 -1454 6 1235 352 224 71 0 chr15 85303377 85303475 -18191499 + ERVL-int LTR ERVL 4233 4337 -1330 6 1235 334 261 33 25 chr15 85303759 85303881 -18191093 + ERVL-int LTR ERVL 5631 5753 -4 6 1235 525 242 0 30 chr15 85304481 85304613 -18190361 + ERVL-int LTR ERVL 831 958 -4799 6 1235 962 255 136 17 chr15 85304614 85304901 -18190073 - MTE2b LTR MaLR -58 321 1 6 1235 724 232 40 6 chr15 85304902 85305075 -18189899 + MLT1B LTR MaLR 201 379 -11 6 1235 720 256 95 174 chr15 85323112 85323454 -18171520 - MTD LTR MaLR 0 419 101 6 1235 720 256 95 174 chr15 85323508 85323619 -18171355 - MTD LTR MaLR -319 100 2 6 1235 3152 48 18 15 chr15 85325446 85325845 -18169129 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1235 2555 147 29 10 chr15 85327311 85327723 -18167251 - MTC LTR MaLR -1 420 1 6 1236 550 313 34 106 chr15 85350918 85351304 -18143670 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 7 1236 239 304 17 113 chr15 85371598 85371713 -18123261 + MLT1D LTR MaLR 280 383 -122 7 1236 263 331 28 74 chr15 85402207 85402383 -18092591 - MT2B2 LTR ERVL -343 241 74 8 1236 1882 185 51 18 chr15 85402595 85402986 -18091988 + MTD LTR MaLR 14 417 -2 8 1236 3371 86 51 0 chr15 85414502 85414778 -18080196 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 298 -177 8 1236 3371 86 51 0 chr15 85414820 85414995 -18079979 + MT2C_Mm LTR ERVL 299 474 -1 8 1236 1528 215 125 24 chr15 85415206 85415265 -18079709 - MTD LTR MaLR 0 419 335 8 1236 1528 215 125 24 chr15 85415291 85415608 -18079366 - MTD LTR MaLR -85 334 5 8 1236 3860 212 68 174 chr15 85415614 85415731 -18079243 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 1149 8 1236 3860 212 68 174 chr15 85415856 85417143 -18077831 - MTD-int LTR MaLR -110 1148 1 8 1236 1670 176 143 0 chr15 85417143 85417506 -18077468 - MTD LTR MaLR 0 419 5 8 1236 287 294 7 106 chr15 85417982 85418123 -18076851 - MT2B LTR ERVL -319 282 156 8 1236 1322 198 107 58 chr15 85419674 85420039 -18074935 + MTD LTR MaLR 1 383 -36 8 1236 1805 191 59 23 chr15 85421990 85422383 -18072591 + MTC LTR MaLR 12 407 -14 8 1236 328 300 127 5 chr15 85422991 85423163 -18071811 - MLT1J LTR MaLR -332 180 3 8 1236 231 308 37 46 chr15 85423552 85423661 -18071313 - MLT1J LTR MaLR -179 333 226 8 1236 1426 290 70 55 chr15 85423664 85424175 -18070799 + MT2A LTR ERVL 6 524 -9 8 1236 258 340 47 47 chr15 85424239 85424387 -18070587 - MLT1J LTR MaLR -361 151 4 8 1236 2317 95 34 31 chr15 85426825 85426876 -18068098 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 286 8 1236 2317 95 34 31 chr15 85427055 85427329 -18067645 - ORR1A2 LTR MaLR -42 285 1 8 1236 469 160 11 0 chr15 85428601 85428695 -18066279 + RMER4B LTR ERVK 17 111 -474 8 1236 1561 106 4 13 chr15 85428677 85428915 -18066059 + RMER12 LTR ERVK 507 742 -580 8 1236 1085 120 151 19 chr15 85428920 85429132 -18065842 - MTC LTR MaLR -181 240 1 8 1236 2762 104 46 24 chr15 85433823 85434235 -18060739 + MTC LTR MaLR 1 421 0 8 1236 960 198 127 0 chr15 85438004 85438216 -18056758 + MTD LTR MaLR 4 242 -177 8 1236 1082 212 179 25 chr15 85448965 85449289 -18045685 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 8 1236 235 273 0 29 chr15 85451198 85451254 -18043720 + MTEa LTR MaLR 324 377 -2 8 1236 262 250 0 116 chr15 85454831 85454926 -18040048 + MT2B LTR ERVL 157 240 -361 8 1236 704 118 50 29 chr15 85454985 85455124 -18039850 + ORR1D1 LTR MaLR 1 142 -232 9 1236 799 260 48 69 chr15 85457964 85458340 -18036634 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 2 9 1237 1930 114 9 62 chr15 85469521 85469857 -18025117 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 9 1237 314 358 51 7 chr15 85481481 85481619 -18013355 - MLT1D LTR MaLR -359 146 3 9 1237 225 302 89 54 chr15 85504495 85504663 -17990311 + LTR79 LTR ERVL 215 388 -139 6 1237 300 240 132 13 chr15 85528728 85528880 -17966094 - RLTR15 LTR ERVK -3 356 187 3 1237 361 264 126 24 chr15 85528970 85529137 -17965837 - RLTR15 LTR ERVK -175 184 1 3 1237 2286 104 49 0 chr15 85539039 85539346 -17955628 - ORR1A3 LTR MaLR -4 322 1 3 1237 365 295 120 8 chr15 85543500 85543633 -17951341 + MTD LTR MaLR 260 407 -12 3 1237 4803 142 39 94 chr15 85544044 85544999 -17949975 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 4 1237 1559 212 134 6 chr15 85546209 85546579 -17948395 - MTD LTR MaLR -16 403 1 4 1237 233 313 44 30 chr15 85550946 85551081 -17943893 - ORR1A3-int LTR MaLR -488 1475 1339 4 1237 1833 129 66 51 chr15 85557030 85557364 -17937610 + ORR1B2 LTR MaLR 1 339 -28 5 1237 326 236 28 129 chr15 85569652 85569818 -17925156 + MT2B LTR ERVL 106 264 -320 8 1237 1339 136 63 31 chr15 85571153 85571445 -17923529 + MTB_Mm LTR MaLR 1 409 -12 8 1237 1647 222 108 19 chr15 85583140 85583512 -17911462 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 1 1237 772 224 42 18 chr15 85583526 85583694 -17911280 + MT2A LTR ERVL 283 454 -79 1 1237 1173 225 112 23 chr15 85589708 85590013 -17904961 + MTD LTR MaLR 75 406 -13 1 1238 263 329 24 0 chr15 85591443 85591525 -17903449 - MLT1A0 LTR MaLR -25 340 257 1 1238 406 227 21 20 chr15 85591614 85591724 -17903250 - MLT1A0 LTR MaLR -251 114 5 1 1238 1185 217 174 26 chr15 85594336 85594681 -17900293 - MTD LTR MaLR -1 418 23 1 1238 498 203 0 115 chr15 85606363 85606543 -17888431 - MT2B LTR ERVL -320 264 103 1 1238 472 336 143 69 chr15 85612883 85613331 -17881643 - MLT2B3 LTR ERVL -45 509 29 1 1238 425 310 16 90 chr15 85613170 85613358 -17881616 - MTEa LTR MaLR -193 186 13 1 1238 771 269 45 0 chr15 85613488 85613689 -17881285 - MTE2a LTR MaLR 0 379 170 1 1238 391 228 21 52 chr15 85613902 85613992 -17880982 - MTE2a LTR MaLR -200 179 93 1 1238 1920 125 231 3 chr15 85624598 85624919 -17870055 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1238 967 193 351 7 chr15 85626923 85627199 -17867775 - MTEa LTR MaLR -4 375 5 2 1238 434 185 0 115 chr15 85630451 85630555 -17864419 + MT2B LTR ERVL 173 264 -337 2 1238 229 306 14 0 chr15 85642413 85642485 -17852489 - RMER15 LTR ERVL -78 497 425 2 1238 1505 255 77 53 chr15 85642711 85643257 -17851717 - RMER15-int LTR ERVL -7 4992 4434 2 1238 512 281 139 6 chr15 85643268 85643440 -17851534 - RMER15-int LTR ERVL -620 4379 4185 2 1238 1035 280 94 45 chr15 85658607 85658851 -17836123 + RMER5 LTR ERV1 58 322 -212 2 1238 1863 114 157 64 chr15 85658851 85659048 -17835926 + RMER17C LTR ERVK 1 178 -232 2 1238 1863 114 157 64 chr15 85659142 85659319 -17835655 + RMER17C LTR ERVK 179 410 0 2 1238 1035 280 94 45 chr15 85659319 85659519 -17835455 + RMER5 LTR ERV1 323 524 -10 2 1238 247 319 21 11 chr15 85659619 85659714 -17835260 + MLT1A0 LTR MaLR 204 299 -66 2 1238 423 302 70 60 chr15 85666876 85667205 -17827769 - ORR1E LTR MaLR -1 378 26 3 1238 624 305 38 67 chr15 85669907 85670018 -17824956 - MLT2D LTR ERVL -161 253 142 3 1238 3176 138 126 70 chr15 85670018 85670734 -17824240 - RMER6A LTR ERVK 0 756 1 3 1238 624 305 38 67 chr15 85670734 85670861 -17824113 - MLT2D LTR ERVL -273 141 22 3 1238 2406 140 8 10 chr15 85676937 85677333 -17817641 - MTC LTR MaLR 0 421 27 3 1238 1341 257 34 9 chr15 85677418 85677744 -17817230 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 35 3 1238 322 269 27 27 chr15 85686243 85686354 -17808620 + MLT1A1 LTR MaLR 298 408 0 3 1238 1707 135 6 84 chr15 85687729 85688061 -17806913 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 24 3 1238 331 148 148 0 chr15 85688229 85688290 -17806684 - ORR1A4 LTR MaLR -324 70 1 3 1238 228 295 89 59 chr15 85690566 85690667 -17804307 - RMER15 LTR ERVL -44 531 428 3 1238 2971 149 26 57 chr15 85695610 85696205 -17798769 - RMER13B LTR ERVK 0 908 333 3 1238 1623 146 142 25 chr15 85696205 85696571 -17798403 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 1238 1856 119 62 6 chr15 85696571 85696892 -17798082 - RMER13B LTR ERVK -569 339 1 3 1238 648 175 94 7 chr15 85700128 85700266 -17794708 - MTC LTR MaLR 0 421 272 3 1238 323 202 110 77 chr15 85700269 85700360 -17794614 - MTC LTR MaLR -245 176 68 3 1238 1190 138 178 9 chr15 85700747 85701049 -17793925 - MTC LTR MaLR -8 413 67 3 1238 363 235 88 0 chr15 85702464 85702566 -17792408 + MTC LTR MaLR 309 419 -2 3 1238 640 273 110 32 chr15 85703117 85703363 -17791611 - MLT1A0 LTR MaLR -99 266 2 3 1238 1275 210 179 11 chr15 85708388 85708735 -17786239 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 1238 1709 245 42 22 chr15 85710733 85711142 -17783832 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 1238 1176 204 116 4 chr15 85713636 85713912 -17781062 + MTC LTR MaLR 101 407 -14 3 1238 347 185 181 58 chr15 85714582 85714670 -17780304 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 263 3 1238 347 192 211 55 chr15 85714855 85714980 -17779994 - ORR1D2 LTR MaLR -108 262 54 3 1238 2023 104 49 6 chr15 85714984 85715341 -17779633 - ORR1A2 LTR MaLR -8 386 3 3 1238 2927 193 173 78 chr15 85717113 85717421 -17777553 + RMER12 LTR ERVK 1 334 -988 3 1238 2927 193 173 78 chr15 85717612 85717652 -17777322 + RMER12 LTR ERVK 335 335 -987 3 1238 2927 193 173 78 chr15 85717912 85718271 -17776703 + RMER12 LTR ERVK 335 739 -583 3 1238 2927 193 173 78 chr15 85718460 85718538 -17776436 + RMER12 LTR ERVK 740 844 -478 3 1238 2927 193 173 78 chr15 85718608 85718773 -17776201 + RMER12 LTR ERVK 845 1052 -270 3 1238 262 269 48 40 chr15 85718822 85718946 -17776028 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1687 1811 -37 4 1238 700 223 259 0 chr15 85719761 85719981 -17774993 - MTD LTR MaLR -38 381 105 4 1239 1035 211 80 130 chr15 85745896 85746272 -17748702 + MTE2a LTR MaLR 3 359 -20 4 1239 1924 201 37 17 chr15 85748382 85748787 -17746187 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1239 387 230 37 90 chr15 85764307 85764441 -17730533 + MT2B LTR ERVL 131 257 -344 4 1239 708 237 32 122 chr15 85768789 85769019 -17725955 + MTE2a LTR MaLR 126 334 -45 4 1239 708 237 32 122 chr15 85769204 85769252 -17725722 + MTE2a LTR MaLR 335 379 0 4 1239 272 240 79 50 chr15 85774272 85774341 -17720633 - RMER12 LTR ERVK -477 845 774 4 1239 1817 116 123 15 chr15 85774341 85774665 -17720309 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 4 1239 1091 229 127 48 chr15 85785618 85785655 -17709319 + RMER4B LTR ERVK 17 48 -537 5 1239 1091 229 106 47 chr15 85785826 85786287 -17708687 + RMER4B LTR ERVK 49 574 -11 5 1239 2539 80 3 3 chr15 85787771 85788095 -17706879 + ORR1A3 LTR MaLR 3 326 0 5 1239 1400 205 109 32 chr15 85793827 85794165 -17700809 - MTD LTR MaLR -55 364 1 5 1239 2831 283 38 23 chr15 85810349 85811144 -17683830 + MTE-int LTR MaLR 772 1578 -2 5 1239 803 220 102 79 chr15 85827364 85827630 -17667344 - MTD LTR MaLR -146 273 2 5 1239 1176 241 121 58 chr15 85830077 85830456 -17664518 - MTD LTR MaLR -14 405 3 5 1239 484 268 133 10 chr15 85831970 85832166 -17662808 - MTD LTR MaLR -1 418 199 5 1239 246 200 79 13 chr15 85834504 85834580 -17660394 - MLT1D LTR MaLR -344 161 81 5 1239 3139 44 28 8 chr15 85845680 85846068 -17648906 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1240 503 303 55 130 chr15 85872613 85872958 -17622016 - MLT1D LTR MaLR -69 436 118 6 1240 1800 129 44 99 chr15 85877928 85878198 -17616776 + ORR1A3 LTR MaLR 3 285 -41 6 1240 1800 129 44 99 chr15 85878351 85878423 -17616551 + ORR1A3 LTR MaLR 286 326 0 6 1240 1849 141 27 36 chr15 85878454 85878553 -17616421 + ORR1A4 LTR MaLR 1 95 -234 6 1240 1849 141 27 36 chr15 85878688 85878920 -17616054 + ORR1A4 LTR MaLR 96 329 0 6 1240 1001 254 60 80 chr15 85882741 85883191 -17611783 - RMER4A LTR ERVK -9 457 17 6 1240 428 302 24 112 chr15 85886050 85886126 -17608848 - MLT1B LTR MaLR -162 228 174 6 1240 428 302 24 112 chr15 85886269 85886442 -17608532 - MLT1B LTR MaLR -217 173 1 6 1240 1736 173 54 11 chr15 85887112 85887463 -17607511 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 1 6 1240 565 215 42 0 chr15 85903748 85903892 -17591082 + RMER15 LTR ERVL 422 571 -4 6 1240 475 298 119 46 chr15 85911873 85912133 -17582841 - RMER15 LTR ERVL -22 553 275 7 1240 930 203 61 5 chr15 85914812 85915025 -17579949 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 150 7 1240 290 238 0 0 chr15 85915190 85915253 -17579721 - ORR1D1 LTR MaLR -217 157 95 7 1240 560 306 20 25 chr15 85915706 85915904 -17579070 - RMER15 LTR ERVL -15 560 364 7 1240 4912 105 13 44 chr15 85923614 85924110 -17570864 - RMER6A LTR ERVK 0 756 278 7 1240 4912 105 13 44 chr15 85924286 85924569 -17570405 - RMER6A LTR ERVK -479 277 1 7 1240 5062 38 3 2 chr15 85927705 85928291 -17566683 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 7 1240 635 289 136 59 chr15 85941892 85942296 -17552678 + MLT1D LTR MaLR 3 437 -68 7 1240 288 181 81 46 chr15 85942328 85942415 -17552559 - RLTR25B LTR ERVK -511 517 428 7 1240 2171 63 0 0 chr15 85942547 85942833 -17552141 - ORR1A2 LTR MaLR -41 286 1 7 1240 2317 127 109 13 chr15 85944493 85944877 -17550097 + MTC LTR MaLR 1 421 0 7 1240 322 258 82 45 chr15 85949028 85949162 -17545812 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 223 7 1240 2601 103 2 15 chr15 85951493 85951895 -17543079 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 11 7 1240 3480 102 107 11 chr15 85973698 85974231 -17520743 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 7 1240 2123 145 40 22 chr15 85980396 85980799 -17514175 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 7 1240 1298 230 125 27 chr15 85982801 85982948 -17512026 + MTD LTR MaLR 13 165 -254 7 1240 3312 89 53 39 chr15 85982948 85983175 -17511799 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 241 -278 8 19 3312 89 53 39 chr15 85983201 85983485 -17511489 + MURVY-LTR LTR ERV1 242 519 0 8 1241 1298 230 125 27 chr15 85983485 85983704 -17511270 + MTD LTR MaLR 166 415 -4 7 1241 225 286 62 52 chr15 85984503 85984599 -17510375 - MTEb LTR MaLR -282 97 1 8 1241 574 224 54 31 chr15 85986502 85986631 -17508343 + MTD LTR MaLR 18 149 -270 8 1241 550 199 52 96 chr15 85987314 85987564 -17507410 + RMER17C LTR ERVK 15 253 -157 8 1241 267 268 25 107 chr15 85990801 85990960 -17504014 + MT2B2 LTR ERVL 131 276 -308 8 1241 388 224 39 77 chr15 85993860 85993926 -17501048 + MT2B LTR ERVL 146 287 -314 8 1241 262 287 31 21 chr15 85995910 85996006 -17498968 + RMER15 LTR ERVL 409 505 -70 8 1241 247 227 26 39 chr15 86005783 86005861 -17489113 + RMER15 LTR ERVL 406 482 -93 8 1241 326 284 68 17 chr15 86018018 86018136 -17476838 + MLT1B LTR MaLR 7 130 -260 3 1241 342 324 100 56 chr15 86018418 86018598 -17476376 + MLT1B LTR MaLR 113 300 -90 3 1241 2610 93 159 89 chr15 86023091 86023576 -17471398 + MURVY-LTR LTR ERV1 1 519 0 4 1241 412 345 87 33 chr15 86024271 86024547 -17470427 - MLT1A1 LTR MaLR -37 371 81 4 1241 347 85 0 0 chr15 86024599 86024646 -17470328 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 340 4 1241 1855 61 57 0 chr15 86024922 86025184 -17469790 + RLTR10A LTR ERVK 1 277 -134 4 1241 1064 82 0 0 chr15 86025847 86025994 -17468980 - ORR1B1 LTR MaLR -41 353 207 5 1241 920 112 0 296 chr15 86026724 86026952 -17468022 - ORR1B1 LTR MaLR -186 208 1 5 1241 1997 233 41 43 chr15 86027281 86027814 -17467160 + RMER5 LTR ERV1 1 532 -2 5 1241 282 266 8 117 chr15 86029198 86029326 -17465648 + MT2B LTR ERVL 144 257 -344 6 1241 819 138 35 40 chr15 86031033 86031255 -17463719 + RMER17C LTR ERVK 1 382 -427 6 1241 2477 137 21 3 chr15 86035415 86035802 -17459172 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 7 1241 678 273 134 18 chr15 86039092 86039367 -17455607 - ORR1E LTR MaLR -38 341 8 8 1241 498 299 177 30 chr15 86046905 86047171 -17447803 + MLT1C LTR MaLR 65 369 -98 1 1241 2059 142 103 69 chr15 86048668 86048990 -17445984 - MTC LTR MaLR 0 421 82 1 1241 2059 142 103 69 chr15 86049228 86049306 -17445668 - MTC LTR MaLR -340 81 1 1 1241 363 316 232 54 chr15 86051102 86051535 -17443439 + MLT1E2 LTR MaLR 3 505 -122 1 1241 1178 259 69 62 chr15 86052323 86052756 -17442218 - RLTR1B LTR ERV1 -76 436 1 1 1241 2886 28 22 0 chr15 86052756 86053365 -17441609 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 2598 1 1241 4247 23 45 2 chr15 86053363 86053878 -17441096 - RLTR1B-int LTR ERV1 -1191 2108 1572 1 1241 1883 84 26 79 chr15 86053880 86054456 -17440518 - RLTR1B-int LTR ERV1 -3161 537 1 1 1241 1037 114 24 0 chr15 86054456 86054622 -17440352 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 343 1 1241 375 42 0 0 chr15 86054626 86054674 -17440300 - RLTR1B LTR ERV1 -102 410 363 1 1241 241 275 85 71 chr15 86059009 86059027 -17435947 - MT2B2 LTR ERVL -315 269 222 1 1241 241 275 85 71 chr15 86059118 86059150 -17435824 - MT2B2 LTR ERVL -315 221 127 1 1241 783 207 36 97 chr15 86059653 86059946 -17435028 + MTD LTR MaLR 114 419 0 1 1241 256 298 89 24 chr15 86061384 86061508 -17433466 - MLT1G LTR MaLR -53 538 407 1 1241 1847 180 12 112 chr15 86067896 86068081 -17426893 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 216 1 1241 1847 180 12 112 chr15 86068230 86068464 -17426510 - ORR1C1 LTR MaLR -163 215 1 1 1241 2470 129 88 3 chr15 86077281 86077669 -17417305 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1241 249 265 67 19 chr15 86082212 86082316 -17412658 - MLT1B LTR MaLR -95 295 187 1 1241 244 320 112 24 chr15 86082863 86082988 -17411986 - MLT1B LTR MaLR -254 136 1 1 1241 1338 224 74 36 chr15 86084973 86085338 -17409636 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 1 1241 1513 122 283 0 chr15 86085843 86086129 -17408845 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1241 1270 234 136 15 chr15 86093399 86093737 -17401237 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 1 1241 346 283 30 71 chr15 86097184 86097283 -17397691 + MTE2b LTR MaLR 1 95 -284 1 1241 1037 255 38 26 chr15 86097387 86097698 -17397276 + MTE2b LTR MaLR 91 369 -1 1 1241 775 241 239 9 chr15 86102734 86103073 -17391901 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 1 1241 1804 153 102 6 chr15 86113837 86114172 -17380802 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1242 242 327 65 37 chr15 86116452 86116560 -17378414 + ORR1E LTR MaLR 1 111 -248 1 1242 1570 193 18 11 chr15 86125309 86125587 -17369387 - MTC LTR MaLR -14 407 128 2 1242 294 314 84 55 chr15 86134556 86134758 -17360216 - MLT1J LTR MaLR -194 318 111 2 1242 1650 153 164 9 chr15 86135768 86136092 -17358882 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1242 284 226 124 50 chr15 86142412 86142427 -17352547 - MT2B LTR ERVL -37 438 422 2 1242 867 216 52 43 chr15 86142459 86142693 -17352281 - MT2B LTR ERVL -55 546 309 2 1242 2992 20 48 3 chr15 86142693 86143044 -17351930 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1242 28220 17 1 2 chr15 86143049 86146320 -17348654 - IAPEz-int LTR ERVK -4 6477 3210 2 1242 6895 91 104 34 chr15 86146319 86147536 -17347438 - IAPEz-int LTR ERVK -5168 1313 67 2 1242 1014 85 146 0 chr15 86147507 86147672 -17347302 - IAPEz-int LTR ERVK -6285 196 8 2 1242 2992 20 48 3 chr15 86147672 86148023 -17346951 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 2 1242 374 208 14 14 chr15 86148023 86148096 -17346878 - MT2B LTR ERVL -376 157 85 2 1242 779 142 0 24 chr15 86148511 86148634 -17346340 - MT2B LTR ERVL -412 121 2 2 1242 507 285 88 36 chr15 86153063 86153360 -17341614 + MLT2C1 LTR ERVL 27 348 -49 2 1242 297 247 76 76 chr15 86154127 86154141 -17340833 + MT2B LTR ERVL 145 236 -365 2 1242 1003 283 76 3 chr15 86154718 86155041 -17339933 + ORR1E LTR MaLR 2 366 -13 2 1242 429 196 21 11 chr15 86159698 86159791 -17335183 + MTD LTR MaLR 5 98 -321 2 1242 1012 222 141 19 chr15 86173799 86174061 -17320913 + MTE2b LTR MaLR 1 294 -85 2 1242 1008 270 52 8 chr15 86190591 86190841 -17304133 - MTE2b LTR MaLR 0 379 119 2 1242 251 210 48 16 chr15 86194524 86194587 -17300387 - LTR79 LTR ERVL -37 490 426 3 1242 286 208 12 83 chr15 86204543 86204627 -17290347 - MLT1A LTR MaLR -241 133 56 3 1242 363 283 91 138 chr15 86209476 86209751 -17285223 + MLT1E1 LTR MaLR 266 527 -127 3 1242 3117 170 204 73 chr15 86210061 86210853 -17284121 - RMER19B LTR ERVK -6 896 1 3 1242 322 319 107 40 chr15 86220002 86220152 -17274822 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 246 3 1242 2193 157 82 8 chr15 86220708 86221100 -17273874 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1242 810 248 179 105 chr15 86223294 86223646 -17271328 + MTE2b LTR MaLR 1 378 -1 3 1242 390 322 97 11 chr15 86225748 86225924 -17269050 + MLT1F2 LTR MaLR 242 432 -128 3 1242 1455 193 14 14 chr15 86231635 86231913 -17263061 - RMER13B LTR ERVK 0 908 631 3 1242 363 148 0 0 chr15 86231910 86231964 -17263010 - RMER13B LTR ERVK -854 54 1 3 1242 482 213 0 115 chr15 86238319 86238339 -17256635 + MT2B LTR ERVL 150 155 -446 3 1242 242 255 86 67 chr15 86239351 86239456 -17255518 - MLT1F LTR MaLR -11 568 462 3 1242 279 208 0 0 chr15 86239577 86239625 -17255349 - MLT1F LTR MaLR -295 253 206 3 1242 1312 202 133 47 chr15 86240157 86240495 -17254479 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 3 1243 859 274 116 47 chr15 86263176 86263563 -17231411 + MLT2D LTR ERVL 1 414 0 3 1243 968 238 139 24 chr15 86269213 86269368 -17225606 + ORR1D2 LTR MaLR 1 179 -191 3 1243 968 238 139 24 chr15 86269411 86269587 -17225387 + ORR1D2 LTR MaLR 180 370 0 3 1243 294 329 50 75 chr15 86275961 86276122 -17218852 - RMER15 LTR ERVL -12 563 407 3 1243 2198 141 93 33 chr15 86276679 86277076 -17217898 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1243 400 348 159 57 chr15 86285775 86286058 -17208916 - MLT1A0 LTR MaLR -38 327 16 3 1243 247 325 204 16 chr15 86286534 86286725 -17208249 - MER68 LTR ERVL -273 290 64 3 1243 2441 330 121 29 chr15 86296353 86297646 -17197328 + MTE-int LTR MaLR 135 1549 -31 3 1243 4545 204 54 41 chr15 86298131 86299220 -17195754 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 1 3 1243 1553 161 139 9 chr15 86299308 86299647 -17195327 + ORR1C2 LTR MaLR 1 383 -1 3 1243 5316 196 155 49 chr15 86299650 86301013 -17193961 + ORR1C2-int LTR MaLR 3 1509 0 3 1243 1003 191 5 23 chr15 86303422 86303636 -17191338 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 318 3 1243 340 240 226 49 chr15 86304099 86304291 -17190683 - MLT1A0 LTR MaLR -2 465 147 3 1243 823 235 152 5 chr15 86310316 86310607 -17184367 + MTE2b LTR MaLR 62 371 -8 3 1243 521 295 82 64 chr15 86317855 86318193 -17176781 + MTEa LTR MaLR 2 370 -9 4 1243 680 197 0 30 chr15 86320323 86320454 -17174520 + MT2A LTR ERVL 1 127 -406 4 1243 608 199 60 29 chr15 86320445 86320590 -17174384 + MT2A LTR ERVL 85 217 -316 4 1243 2579 189 38 18 chr15 86323817 86324366 -17170608 + RLTR20B2 LTR ERVK 1 560 0 4 1243 3437 38 5 0 chr15 86331303 86331697 -17163277 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1243 1181 223 153 93 chr15 86331934 86331970 -17163004 - MT2A LTR ERVL -7 526 490 4 1243 1181 223 153 93 chr15 86332012 86332459 -17162515 - MT2A LTR ERVL -44 489 14 4 1243 230 108 0 51 chr15 86333275 86333314 -17161660 + MLT1E3 LTR MaLR 588 624 0 4 1243 1134 254 75 11 chr15 86336516 86336795 -17158179 - ORR1E LTR MaLR -2 357 61 4 1243 1230 258 28 96 chr15 86338154 86338582 -17156392 + MT2A LTR ERVL 1 399 -134 4 1243 608 217 116 0 chr15 86342809 86342947 -17152027 + MTD LTR MaLR 234 387 -32 4 1243 231 253 11 141 chr15 86343198 86343290 -17151684 + MLT1J2 LTR MaLR 198 277 -171 4 1243 1223 269 112 65 chr15 86345045 86345537 -17149437 + RMER15 LTR ERVL 1 515 -60 4 1243 273 283 0 98 chr15 86346926 86347028 -17147946 + MLT1E3 LTR MaLR 530 621 -3 4 1243 2471 92 0 9 chr15 86348949 86349279 -17145695 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1243 247 333 18 37 chr15 86349404 86349513 -17145461 + MLT1N2 LTR MaLR 454 560 -2 4 1243 596 264 32 86 chr15 86351719 86351785 -17143189 - MT2A LTR ERVL 0 533 469 4 1243 596 259 47 85 chr15 86351905 86352118 -17142856 - MT2A LTR ERVL -65 468 190 4 1243 292 278 0 110 chr15 86360346 86360361 -17134613 - MT2B LTR ERVL -351 227 154 4 1243 1036 255 11 66 chr15 86360374 86360647 -17134327 - MTEa LTR MaLR -95 284 27 4 1243 254 154 77 0 chr15 86367404 86367456 -17127518 + LTR79 LTR ERVL 1 56 -471 4 1243 753 198 18 48 chr15 86368887 86369075 -17125899 + ORR1A2 LTR MaLR 185 359 0 4 1243 3034 98 255 0 chr15 86370971 86371481 -17123493 + RMER19A LTR ERVK 98 737 0 4 1244 251 175 35 17 chr15 86377255 86377313 -17117661 - MLT2D LTR ERVL -2 558 500 4 1244 4561 123 30 14 chr15 86377531 86378263 -17116711 + RMER6A LTR ERVK 1 744 -12 4 1244 492 242 7 20 chr15 86378497 86378614 -17116360 - MTE-int LTR MaLR -1143 437 331 4 1244 1197 266 75 15 chr15 86378852 86379184 -17115790 - MTE-int LTR MaLR -1215 365 14 4 1244 238 335 83 96 chr15 86379230 86379448 -17115526 - ORR1E LTR MaLR -60 299 85 4 1244 1215 147 22 26 chr15 86379681 86379912 -17115062 - LTRIS5 LTR ERV1 0 447 218 4 1244 407 94 47 0 chr15 86379970 86380034 -17114940 - LTRIS5 LTR ERV1 -380 67 1 4 1244 770 184 162 13 chr15 86382340 86382656 -17112318 + MTE2a LTR MaLR 1 363 -16 4 1244 1413 187 43 86 chr15 86383035 86383339 -17111635 + ORR1C1 LTR MaLR 1 291 -87 5 1244 1212 236 165 9 chr15 86389050 86389384 -17105590 - MTD LTR MaLR -13 406 21 5 1244 264 292 184 9 chr15 86389586 86389700 -17105274 - MLT1I LTR MaLR -82 329 196 5 1244 3124 78 82 2 chr15 86390201 86390641 -17104333 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 5 1244 360 295 144 59 chr15 86390701 86390903 -17104071 + MLT1D LTR MaLR 135 353 -152 5 1244 251 330 57 48 chr15 86390917 86391022 -17103952 + MLT1D LTR MaLR 400 505 0 5 1244 2258 101 3 109 chr15 86394770 86395136 -17099838 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1244 1351 266 62 23 chr15 86400845 86401234 -17093740 + MTD LTR MaLR 2 405 -14 5 1244 518 282 124 73 chr15 86401291 86401566 -17093408 + MLT1D LTR MaLR 127 415 -90 5 1244 388 352 53 61 chr15 86408057 86408302 -17086672 - MLT1C LTR MaLR 0 467 225 5 1244 3166 58 2 29 chr15 86411230 86411639 -17083335 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 5 1244 713 336 60 12 chr15 86412358 86412689 -17082285 + MLT1B LTR MaLR 6 352 -38 5 1244 1408 236 118 11 chr15 86415472 86415820 -17079154 - MTD LTR MaLR -14 405 21 5 1244 1084 254 14 39 chr15 86416278 86416598 -17078376 + ORR1E LTR MaLR 1 322 -62 5 1244 326 269 75 99 chr15 86421829 86421990 -17072984 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 226 5 1244 231 240 189 19 chr15 86421965 86422071 -17072903 - MER72B LTR ERV1 -27 741 618 5 1244 628 291 113 21 chr15 86422506 86422790 -17072184 - MLT2D LTR ERVL -72 342 33 5 1244 352 246 150 24 chr15 86423301 86423438 -17071536 + MLT1A0 LTR MaLR 218 408 0 5 1244 403 305 59 13 chr15 86425292 86425445 -17069529 + MLT2F LTR ERVL 408 567 -96 5 1244 1147 193 110 17 chr15 86426458 86426748 -17068226 + MTD LTR MaLR 1 317 -102 5 1244 302 344 39 8 chr15 86427047 86427176 -17067798 + LTR33B LTR ERVL 369 501 -2 5 1244 3349 48 2 2 chr15 86430237 86430637 -17064337 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1244 1493 258 19 11 chr15 86432914 86433290 -17061684 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 5 1244 311 312 67 43 chr15 86433512 86433676 -17061298 - MLT1C LTR MaLR -12 455 288 5 1244 1558 217 86 0 chr15 86433801 86434138 -17060836 + MTEb LTR MaLR 7 372 -7 5 1244 289 338 74 15 chr15 86434455 86434590 -17060384 - MT2A LTR ERVL -135 398 256 5 1244 3225 58 2 5 chr15 86434999 86435396 -17059578 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1244 3178 70 5 0 chr15 86442195 86442593 -17052381 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1244 1066 238 206 6 chr15 86443441 86443762 -17051212 + MTD LTR MaLR 4 388 -31 5 1244 1115 245 20 40 chr15 86445615 86445917 -17049057 - RMER10A LTR ERVL -146 296 1 6 1244 347 291 70 16 chr15 86446038 86446167 -17048807 + MLT2C1 LTR ERVL 3 138 -259 6 1244 315 310 11 0 chr15 86446231 86446318 -17048656 + MLT2C1 LTR ERVL 414 501 -62 6 1244 1980 119 0 108 chr15 86454101 86454470 -17040504 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 6 1244 2183 165 10 18 chr15 86455621 86456016 -17038958 - MTC LTR MaLR -24 397 6 6 1244 1393 232 77 12 chr15 86458264 86458600 -17036374 - MTD LTR MaLR -2 417 60 6 1244 382 128 11 103 chr15 86459750 86459812 -17035162 + RLTR15 LTR ERVK 1 61 -298 6 1244 2257 120 6 3 chr15 86459812 86460138 -17034836 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1244 441 260 282 60 chr15 86460138 86460372 -17034602 + RLTR15 LTR ERVK 62 343 -16 6 1244 1184 248 64 91 chr15 86462754 86463127 -17031847 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 3 6 1244 401 185 32 21 chr15 86464472 86464566 -17030408 + MTD LTR MaLR 3 97 -322 6 1244 1692 188 54 0 chr15 86465038 86465336 -17029638 + MTD LTR MaLR 91 404 -15 6 1244 450 296 165 87 chr15 86469023 86469393 -17025581 + MLT1D LTR MaLR 26 424 -81 6 1244 873 224 102 44 chr15 86470208 86470505 -17024469 - RLTR12B LTR ERVK -254 314 21 6 1244 1653 206 85 10 chr15 86473339 86473726 -17021248 + MTD LTR MaLR 1 416 -3 6 1244 928 200 65 5 chr15 86476838 86477024 -17017950 - MTC LTR MaLR 0 421 225 6 1244 689 173 0 0 chr15 86477011 86477121 -17017853 - MTC LTR MaLR -311 110 1 6 1244 292 279 105 49 chr15 86477857 86478019 -17016955 - MLT1C LTR MaLR -7 460 290 6 1244 472 238 71 0 chr15 86481302 86481428 -17013546 - RMER15 LTR ERVL 0 575 441 6 1244 412 217 71 79 chr15 86481521 86481661 -17013313 - RMER15 LTR ERVL -414 161 23 6 1244 871 166 0 44 chr15 86482645 86482803 -17012171 - RMER10B LTR ERVL 0 398 248 6 1244 540 307 119 4 chr15 86486362 86486588 -17008386 + RLTR18B LTR ERVK 29 280 -232 6 1244 760 269 69 75 chr15 86486676 86486982 -17007992 + RLTR18B LTR ERVK 187 490 -22 6 1244 1151 231 176 3 chr15 86491115 86491427 -17003547 + ORR1D2 LTR MaLR 3 368 -2 6 1244 976 251 59 4 chr15 86492620 86492856 -17002118 + ORR1D2 LTR MaLR 2 250 -120 6 1244 968 202 10 10 chr15 86492838 86493033 -17001941 + MTC LTR MaLR 5 199 -222 6 1244 916 229 71 31 chr15 86493144 86493369 -17001605 + MTC LTR MaLR 185 418 -1 6 1244 308 302 69 0 chr15 86493378 86493494 -17001480 + ORR1D2 LTR MaLR 241 364 -6 6 1244 1633 222 54 22 chr15 86494149 86494555 -17000419 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1244 547 290 53 43 chr15 86495298 86495507 -16999467 - ORR1E LTR MaLR -21 338 128 7 1244 299 308 93 35 chr15 86496717 86496964 -16998010 - MTEb LTR MaLR 0 379 94 7 1244 567 283 100 114 chr15 86496988 86497339 -16997635 - ORR1E LTR MaLR -12 347 2 7 1244 398 309 60 33 chr15 86498150 86498334 -16996640 - MLT2D LTR ERVL -214 200 12 7 1244 552 241 53 11 chr15 86504363 86504571 -16990403 - MLT1A1 LTR MaLR -9 399 137 7 1244 1027 194 63 51 chr15 86505506 86506020 -16988954 - RMER17C LTR ERVK -1 409 1 9 1244 1042 287 81 31 chr15 86506211 86506596 -16988378 + MTD LTR MaLR 1 404 -15 1 1244 1751 118 96 91 chr15 86506752 86507115 -16987859 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 3 1 1245 487 315 68 21 chr15 86512144 86512381 -16982593 - MER74B LTR ERVL -316 306 59 2 1245 944 231 62 121 chr15 86516339 86516728 -16978246 + RMER20B LTR ERVK 234 599 -28 2 1245 279 297 49 43 chr15 86516940 86517102 -16977872 + MLT1D LTR MaLR 40 202 -303 2 1245 2241 122 11 30 chr15 86517122 86517494 -16977480 + ORR1B1 LTR MaLR 1 365 -29 2 1245 411 306 58 132 chr15 86519465 86519860 -16975114 - MLT1B LTR MaLR -20 370 5 2 1245 251 339 59 34 chr15 86520661 86520706 -16974268 + MLT1H1 LTR MaLR 4 46 -509 3 1245 2223 153 2 38 chr15 86520706 86521127 -16973847 + MTB_Mm LTR MaLR 1 406 -1 3 1245 251 339 59 34 chr15 86521127 86521200 -16973774 + MLT1H1 LTR MaLR 47 125 -430 3 1245 379 121 0 0 chr15 86523194 86523252 -16971722 + RMER10B LTR ERVL 341 398 0 3 1245 352 321 56 10 chr15 86523449 86523644 -16971330 + MLT1D LTR MaLR 19 222 -283 3 1245 291 308 22 82 chr15 86523791 86523856 -16971118 - MT2A LTR ERVL 0 533 477 3 1245 291 308 22 82 chr15 86524055 86524173 -16970801 - MT2A LTR ERVL -57 476 361 3 1245 244 277 128 0 chr15 86528034 86528128 -16966846 - ORR1E LTR MaLR -36 323 218 3 1245 360 344 86 0 chr15 86529610 86529831 -16965143 - MLT1E LTR MaLR -406 247 8 4 1245 2264 110 3 0 chr15 86539819 86540145 -16954829 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1245 561 286 32 26 chr15 86540200 86540390 -16954584 - ORR1E LTR MaLR -166 193 3 5 1245 1869 324 78 37 chr15 86540390 86541219 -16953755 - ORR1E-int LTR MaLR -51 1529 676 5 1245 1869 324 78 37 chr15 86541365 86541442 -16953532 - ORR1E-int LTR MaLR -905 675 585 5 1245 665 321 109 63 chr15 86541765 86542224 -16952750 - ORR1E-int LTR MaLR -1100 480 1 5 1245 277 265 12 12 chr15 86542292 86542376 -16952598 - ORR1E LTR MaLR -8 371 288 5 1245 527 321 70 29 chr15 86542468 86542712 -16952262 + MTE-int LTR MaLR 761 1014 -566 5 1245 1287 240 89 0 chr15 86546328 86546665 -16948309 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 6 1245 949 148 14 19 chr15 86547068 86547279 -16947695 + ORR1B1 LTR MaLR 169 386 -8 6 1245 740 258 86 26 chr15 86547308 86547575 -16947399 - MTEb LTR MaLR -96 283 1 6 1245 773 321 7 15 chr15 86554213 86554482 -16940492 - RLTR14-int LTR ERV1 -157 5160 4894 7 1245 309 333 21 14 chr15 86555587 86555730 -16939244 - RLTR14-int LTR ERV1 -1890 3427 3284 7 1245 2300 101 13 0 chr15 86556161 86556478 -16938496 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 8 1245 412 306 26 75 chr15 86556481 86556707 -16938267 - RLTR14-int LTR ERV1 -2685 2632 2418 7 1245 402 248 37 0 chr15 86557816 86557925 -16937049 - RLTR14 LTR ERV1 -269 113 1 8 1245 401 319 131 57 chr15 86564412 86564748 -16930226 - MER31A LTR ERV1 -42 443 83 9 1245 394 349 187 0 chr15 86565604 86565802 -16929172 + ORR1E LTR MaLR 1 235 -124 9 1245 434 284 10 0 chr15 86566210 86566312 -16928662 + MLT1A0 LTR MaLR 255 357 -8 9 1245 517 337 76 76 chr15 86566701 86566833 -16928141 + MLT1C LTR MaLR 7 133 -334 9 1245 517 337 76 76 chr15 86566978 86567279 -16927695 + MLT1C LTR MaLR 134 439 -28 9 1245 473 221 244 19 chr15 86567487 86567661 -16927313 - MTE2a LTR MaLR 0 374 182 9 1245 366 307 0 17 chr15 86569383 86569499 -16925475 - MLT1H2 LTR MaLR -342 147 34 1 1245 722 257 52 65 chr15 86576219 86576448 -16918526 - MTEb LTR MaLR -7 372 147 1 1245 2325 127 51 10 chr15 86576462 86576852 -16918122 + MTC LTR MaLR 14 419 -2 1 1245 484 268 57 0 chr15 86576857 86576980 -16917994 - MTEb LTR MaLR -233 146 17 1 1245 4552 157 77 9 chr15 86580269 86581074 -16913900 - RMER13A LTR ERVK 0 860 1 1 1245 290 227 124 11 chr15 86587112 86587201 -16907773 + MLT1A0 LTR MaLR 6 104 -261 1 1245 920 169 27 0 chr15 86587195 86587343 -16907631 - RLTR20B2 LTR ERVK -133 427 276 1 1245 438 291 47 58 chr15 86587359 86587549 -16907425 + MLT1A0 LTR MaLR 127 314 -51 1 1245 2699 168 85 2 chr15 86587837 86587921 -16907053 - RLTR20B2 LTR ERVK 0 560 467 1 1245 2699 168 85 2 chr15 86587969 86588217 -16906757 - RLTR20B2 LTR ERVK -94 466 200 1 1245 2699 168 85 2 chr15 86588240 86588413 -16906561 - RLTR20B2 LTR ERVK -361 199 14 1 1245 1461 232 71 0 chr15 86593358 86593711 -16901263 - MTE2b LTR MaLR 0 379 2 1 1245 356 324 18 8 chr15 86593736 86593915 -16901059 + MLT1A0 LTR MaLR 279 467 0 1 1245 1299 219 143 3 chr15 86595465 86595786 -16899188 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 1 1245 478 273 76 25 chr15 86596685 86596711 -16898263 - ORR1D1 LTR MaLR -189 170 148 1 1245 759 166 3 1 chr15 86596758 86596893 -16898081 - ORR1D1 LTR MaLR -212 147 1 1 1245 3534 25 2 0 chr15 86605477 86605872 -16889102 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1245 316 344 32 32 chr15 86606573 86606729 -16888245 - MLT1K LTR MaLR -339 256 101 1 1245 763 224 40 18 chr15 86607200 86607413 -16887561 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 184 -343 1 1245 719 210 64 35 chr15 86610196 86610398 -16884576 + MTEb LTR MaLR 134 341 -38 1 1245 2299 66 0 114 chr15 86612252 86612612 -16882362 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 1 1245 822 228 65 20 chr15 86613892 86614093 -16880881 + MTE2a LTR MaLR 170 379 0 1 1245 2449 133 23 13 chr15 86614186 86614574 -16880400 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 1 1245 2235 142 104 10 chr15 86614737 86615120 -16879854 - MTC LTR MaLR 0 421 3 1 1245 1379 237 63 3 chr15 86615167 86615514 -16879460 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 1 1245 356 260 49 20 chr15 86616247 86616349 -16878625 - MER21B LTR ERV1 -758 105 1 1 1245 646 289 63 78 chr15 86620100 86620485 -16874489 - MTEb LTR MaLR -10 369 1 1 1245 753 290 109 62 chr15 86621177 86621515 -16873459 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 1 1245 1113 252 84 31 chr15 86622039 86622417 -16872557 + MTE2a LTR MaLR 3 377 -2 2 1245 430 256 8 69 chr15 86629571 86629701 -16865273 + MTE2a LTR MaLR 136 257 -122 2 1245 1088 279 23 78 chr15 86629979 86630423 -16864551 + MTE2a LTR MaLR 3 395 -24 2 1245 225 335 22 120 chr15 86630823 86631006 -16863968 + MLT1C LTR MaLR 1 165 -302 2 1245 569 290 171 108 chr15 86631245 86631597 -16863377 - MLT1C LTR MaLR -16 374 1 2 1245 304 361 56 10 chr15 86631720 86631916 -16863058 + MT2A LTR ERVL 16 220 -313 2 1245 261 271 104 56 chr15 86635208 86635333 -16859641 + MLT1D LTR MaLR 203 333 -172 2 1245 342 315 64 41 chr15 86635304 86635476 -16859498 + MLT1D LTR MaLR 213 388 -117 2 1246 2698 68 61 71 chr15 86641603 86642014 -16852960 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1246 982 223 164 12 chr15 86643060 86643383 -16851591 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 2 1246 243 115 27 0 chr15 86644547 86644589 -16850385 + MLT2D LTR ERVL 1 43 -421 2 1246 585 308 28 37 chr15 86647976 86648192 -16846782 + MTE2b LTR MaLR 3 216 -163 2 1246 572 279 89 30 chr15 86648293 86648329 -16846645 + MTE2a LTR MaLR 164 194 -185 2 1246 572 279 89 30 chr15 86648362 86648528 -16846446 + MTE2a LTR MaLR 195 377 -2 2 1246 490 226 32 0 chr15 86648529 86648622 -16846352 - MTE2b LTR MaLR -259 120 25 2 1246 3050 164 85 50 chr15 86655029 86655815 -16839159 + RLTR25A LTR ERVK 23 979 -124 2 1246 780 282 118 77 chr15 86655919 86656039 -16838935 + RLTR25A LTR ERVK 980 1101 -2 2 1246 876 222 35 40 chr15 86660059 86660261 -16834713 + MTEb LTR MaLR 179 379 0 2 1246 2571 130 15 7 chr15 86667526 86667930 -16827044 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1246 1792 213 54 0 chr15 86669562 86669933 -16825041 - MTD LTR MaLR -28 391 1 2 1246 1167 233 75 4 chr15 86673107 86673374 -16821600 - ORR1D2 LTR MaLR -81 289 4 2 1246 661 258 153 51 chr15 86678205 86678519 -16816455 - MTEa LTR MaLR -33 346 1 2 1246 1243 262 112 24 chr15 86678763 86679139 -16815835 - MTD LTR MaLR 0 419 11 2 1246 256 283 131 58 chr15 86681450 86681641 -16813333 - LTR33B LTR ERVL -33 470 266 2 1246 889 257 163 28 chr15 86683419 86683707 -16811267 - MTE2b LTR MaLR -14 365 39 2 1246 355 310 25 17 chr15 86686694 86686812 -16808162 - MLT1A0 LTR MaLR -159 206 88 2 1246 944 251 84 97 chr15 86687699 86688082 -16806892 + MTE2a LTR MaLR 2 379 0 2 1246 232 206 14 81 chr15 86688143 86688217 -16806757 - BGLII_B LTR ERVK -118 323 255 3 1246 360 343 56 23 chr15 86689553 86689768 -16805206 - MLT1D LTR MaLR -140 365 144 3 1246 1682 242 217 11 chr15 86692996 86693532 -16801442 + RMER13A LTR ERVK 1 647 -213 3 1246 301 236 111 0 chr15 86693923 86693995 -16800979 + MT2A LTR ERVL 2 81 -452 3 1246 1226 271 64 49 chr15 86694173 86694626 -16800348 - MT2A LTR ERVL -2 531 72 3 1246 253 278 116 111 chr15 86694527 86694717 -16800257 - MTA_Mm LTR MaLR -199 197 7 3 1246 1704 234 8 8 chr15 86695029 86695399 -16799575 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1246 672 329 26 26 chr15 86699620 86699851 -16795123 - MTE2b LTR MaLR 0 379 149 3 1246 376 309 363 17 chr15 86702720 86702953 -16792021 + LTR69 LTR ERVL 1 314 -274 3 1246 1301 239 72 14 chr15 86708454 86708802 -16786172 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 3 1246 1403 197 89 40 chr15 86709553 86709902 -16785072 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 3 1246 327 324 79 46 chr15 86711102 86711185 -16783789 + RMER15 LTR ERVL 375 467 -108 3 1246 1388 227 50 30 chr15 86711185 86711548 -16783426 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 3 1246 327 324 79 46 chr15 86711548 86711616 -16783358 + RMER15 LTR ERVL 468 531 -44 3 1246 1036 242 4 73 chr15 86721307 86721566 -16773408 + ORR1D1 LTR MaLR 1 241 -133 3 1246 1439 258 69 6 chr15 86722432 86722795 -16772179 + MTD LTR MaLR 18 403 -16 3 1246 340 330 153 11 chr15 86723140 86723330 -16771644 + LTR16B LTR ERVL 218 434 -29 3 1246 1589 219 77 0 chr15 86724575 86724899 -16770075 + ORR1D2 LTR MaLR 22 370 0 3 1246 2244 141 27 45 chr15 86725794 86725952 -16769022 + ORR1B1 LTR MaLR 1 155 -239 3 1246 2244 141 27 45 chr15 86726043 86726284 -16768690 + ORR1B1 LTR MaLR 156 393 -1 3 1246 418 293 34 100 chr15 86729535 86729804 -16765170 - RMER15 LTR ERVL -13 562 312 3 1246 368 187 154 27 chr15 86729845 86729955 -16765019 - RMER15 LTR ERVL -451 124 1 3 1246 282 265 226 68 chr15 86731496 86731642 -16763332 - RMER15 LTR ERVL 0 575 407 3 1246 234 307 48 78 chr15 86731712 86731878 -16763096 - RMER15 LTR ERVL -414 161 1 3 1246 226 338 68 0 chr15 86732001 86732075 -16762899 + ORR1E LTR MaLR 42 120 -239 3 1246 3278 141 15 45 chr15 86732736 86733302 -16761672 + RLTR25A LTR ERVK 349 902 -126 3 1246 888 293 84 97 chr15 86733373 86733495 -16761479 + RLTR25A LTR ERVK 903 1028 0 3 1246 333 344 70 66 chr15 86746256 86746483 -16748491 + MLT1E2 LTR MaLR 306 533 -94 4 1246 1026 256 55 93 chr15 86749195 86749600 -16745374 + MTE2a LTR MaLR 17 419 0 4 1246 832 266 123 67 chr15 86750805 86751164 -16743810 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 4 1246 1199 295 73 77 chr15 86751228 86751760 -16743214 + MTE2b-int LTR MaLR 1 530 -1050 4 1246 986 236 72 37 chr15 86751965 86752268 -16742706 - MTE2b LTR MaLR -12 407 55 4 1246 698 292 62 82 chr15 86756185 86756525 -16738449 - MTEa LTR MaLR 0 379 47 4 1246 3503 33 2 0 chr15 86757376 86757771 -16737203 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1246 321 302 142 19 chr15 86765284 86765446 -16729528 - MLT1C LTR MaLR 0 467 209 4 1246 1565 248 34 22 chr15 86766806 86767214 -16727760 + MTD LTR MaLR 5 417 -2 4 1246 455 369 43 18 chr15 86769267 86769430 -16725544 - MT2A LTR ERVL -71 462 296 4 1247 521 332 75 21 chr15 86770689 86770969 -16724005 - MT2A LTR ERVL -232 301 7 4 1247 3633 173 74 48 chr15 86774492 86775276 -16719698 - RLTR40 LTR ERVK -5 812 9 4 1247 727 225 7 0 chr15 86777431 86777582 -16717392 - MTD LTR MaLR -260 159 8 4 1247 1192 217 71 62 chr15 86778564 86778903 -16716071 - LTRIS5 LTR ERV1 0 447 106 4 1247 1427 193 164 106 chr15 86787310 86787809 -16707165 + MT2A LTR ERVL 6 533 0 4 1247 344 276 0 0 chr15 86787995 86788071 -16706903 + MTE2b LTR MaLR 304 379 0 4 1247 263 312 79 48 chr15 86792979 86793144 -16701830 + MLT1B LTR MaLR 6 175 -215 4 1247 845 236 111 25 chr15 86793257 86793500 -16701474 + ORR1D2 LTR MaLR 1 264 -106 4 1247 570 240 42 22 chr15 86793617 86793827 -16701147 + ORR1D2 LTR MaLR 164 374 0 4 1247 1652 236 88 3 chr15 86795133 86795519 -16699455 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1247 1108 263 36 15 chr15 86798785 86799061 -16695913 - MTD LTR MaLR -21 398 131 4 1247 1154 233 86 42 chr15 86802586 86802922 -16692052 - ORR1E LTR MaLR -4 355 5 5 1247 1383 228 115 18 chr15 86803689 86804028 -16690946 + MTE2a LTR MaLR 1 372 -7 5 1247 2617 159 2 19 chr15 86805512 86805940 -16689034 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1247 311 288 184 0 chr15 86809868 86809993 -16684981 - MLT1D LTR MaLR -14 491 344 5 1247 1261 260 43 46 chr15 86811594 86811965 -16683009 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 1247 768 311 56 22 chr15 86813283 86813553 -16681421 + MTEa LTR MaLR 101 379 0 5 1247 1340 267 38 16 chr15 86813979 86814345 -16680629 - MTEa LTR MaLR -4 375 2 5 1247 441 185 0 0 chr15 86814388 86814469 -16680505 - ORR1D1 LTR MaLR -293 81 1 5 1247 1334 211 89 45 chr15 86815841 86816199 -16678775 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 5 1247 1217 251 110 17 chr15 86816562 86816907 -16678067 - MTEb LTR MaLR 0 379 3 5 1247 1672 193 77 16 chr15 86819242 86819606 -16675368 + MTD LTR MaLR 3 388 -31 5 1247 287 350 153 9 chr15 86819855 86820077 -16674897 - MLT1D LTR MaLR 0 505 252 5 1247 238 118 0 0 chr15 86825357 86825391 -16669583 - RMER19C LTR ERVK -393 218 185 5 1247 3279 152 28 98 chr15 86827096 86827751 -16667223 - RMER19C LTR ERVK 0 611 3 5 1247 260 344 101 30 chr15 86828044 86828208 -16666766 + MLT1A0 LTR MaLR 24 199 -166 5 1247 245 317 44 97 chr15 86828842 86829069 -16665905 - RMER17C LTR ERVK 0 410 196 5 1247 853 243 127 95 chr15 86830196 86830542 -16664432 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 5 1247 599 314 113 26 chr15 86831135 86831451 -16663523 + MLT1A1 LTR MaLR 52 360 -48 5 1247 664 338 51 27 chr15 86831977 86832035 -16662939 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 502 5 1247 664 338 51 27 chr15 86832620 86832935 -16662039 - MLT1F2 LTR MaLR -59 501 178 5 1247 1392 229 77 21 chr15 86833981 86834359 -16660615 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1247 1104 248 72 80 chr15 86836943 86837316 -16657658 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 1247 3473 33 2 0 chr15 86838252 86838647 -16656327 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1247 281 279 44 52 chr15 86843513 86843649 -16651325 - MLT1A1 LTR MaLR -6 402 268 5 1247 442 315 12 54 chr15 86849168 86849453 -16645521 - RMER15 LTR ERVL -115 460 68 5 1247 283 255 111 10 chr15 86852794 86852893 -16642081 - MLT1C LTR MaLR -76 391 283 5 1247 827 246 63 153 chr15 86860552 86861000 -16633974 + MTD LTR MaLR 3 365 -14 5 1247 1156 197 90 23 chr15 86861972 86862307 -16632667 - MTD LTR MaLR -10 409 25 6 1247 487 330 90 22 chr15 86862434 86862657 -16632317 - MLT1A0 LTR MaLR -1 364 127 6 1247 235 343 54 40 chr15 86869759 86869908 -16625066 - MLT1A1 LTR MaLR -12 396 246 6 1247 1282 213 118 51 chr15 86871881 86872076 -16622898 + MTD LTR MaLR 3 213 -206 6 1247 1282 213 118 51 chr15 86872222 86872417 -16622557 + MTD LTR MaLR 214 419 0 6 1247 2419 95 6 21 chr15 86874948 86875280 -16619694 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1247 2400 93 19 0 chr15 86877356 86877677 -16617297 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1247 2062 133 3 6 chr15 86879337 86879648 -16615326 - RLTR10E LTR ERVK -1 310 1 6 1247 894 202 88 37 chr15 86881288 86881504 -16613470 - MTD LTR MaLR 0 419 193 6 1247 798 219 25 35 chr15 86882405 86882608 -16612366 - MTD LTR MaLR -209 210 10 6 1247 1156 217 78 32 chr15 86888470 86888751 -16606223 + MTD LTR MaLR 63 356 -63 6 1247 896 287 56 8 chr15 86888721 86888988 -16605986 - MTD LTR MaLR -139 280 1 6 1247 522 295 155 55 chr15 86889548 86889946 -16605028 - MLT1F2 LTR MaLR -16 544 89 6 1247 278 329 159 54 chr15 86889970 86890023 -16604951 - MLT1F2 LTR MaLR -460 88 32 6 1247 1949 156 6 35 chr15 86892183 86892522 -16602452 + ORR1B2 LTR MaLR 39 367 0 6 1247 673 279 82 5 chr15 86894409 86894593 -16600381 - MTEa LTR MaLR -6 373 176 6 1247 679 253 80 0 chr15 86894759 86894909 -16600065 - MTEa LTR MaLR -217 162 1 6 1247 370 354 33 19 chr15 86900050 86900260 -16594714 - ERVL-E-int LTR ERVL -4591 1076 864 6 1248 298 294 97 44 chr15 86901278 86901484 -16593490 - LTR33A LTR ERVL -2 518 302 6 1248 1607 186 118 3 chr15 86901944 86902273 -16592701 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 6 1248 1309 278 103 3 chr15 86905416 86905784 -16589190 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1248 397 310 0 17 chr15 86906317 86906435 -16588539 - MTD LTR MaLR -255 164 49 6 1248 274 308 135 0 chr15 86908473 86908577 -16586397 - MER74A LTR ERVL -424 134 17 6 1248 977 230 96 78 chr15 86908743 86909104 -16585870 - ORR1E LTR MaLR -4 375 4 6 1248 236 354 36 54 chr15 86915743 86915964 -16579010 + MER31B LTR ERV1 99 315 -151 6 1248 640 325 41 72 chr15 86916356 86916701 -16578273 + MLT1C LTR MaLR 23 356 -111 7 1248 1296 233 79 3 chr15 86917050 86917368 -16577606 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 31 7 1248 587 313 151 20 chr15 86922464 86922908 -16572066 - MER92B LTR ERV1 -74 562 61 7 1248 854 295 53 8 chr15 86924427 86924690 -16570284 - MLT1A0 LTR MaLR -4 361 87 7 1248 824 267 128 28 chr15 86933922 86934241 -16560733 + ORR1D2 LTR MaLR 46 394 0 7 1248 2958 275 53 35 chr15 86934306 86935252 -16559722 - ORR1D2-int LTR MaLR -407 963 1 7 1248 1208 250 73 31 chr15 86935252 86935607 -16559367 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 7 1248 1019 259 73 94 chr15 86937261 86937755 -16557219 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 7 1248 277 235 134 12 chr15 86937833 86937915 -16557059 + MLT1A1 LTR MaLR 315 406 -2 7 1248 1446 248 70 15 chr15 86940095 86940492 -16554482 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1248 596 307 148 46 chr15 86944495 86944758 -16550216 + MTE2b LTR MaLR 13 302 -77 7 1248 1953 150 67 26 chr15 86946202 86946593 -16548381 + RLTR28 LTR ERVL 105 511 -13 7 1248 313 317 0 61 chr15 86946934 86947065 -16547909 + MTEa LTR MaLR 2 124 -255 7 1248 4070 162 86 69 chr15 86948413 86949300 -16545674 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 7 1248 273 266 25 12 chr15 86953671 86953751 -16541223 - RMER12 LTR ERVK -141 1181 1101 7 1248 4959 93 19 23 chr15 86953930 86954764 -16540210 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1017 831 1 7 1248 303 133 0 0 chr15 86959305 86959350 -16535624 - ORR1B1 LTR MaLR -9 358 314 7 1248 1888 121 64 15 chr15 86961544 86961887 -16533087 - ORR1B1 LTR MaLR -32 362 3 7 1248 1367 191 195 9 chr15 86963803 86964121 -16530853 - MTC LTR MaLR -8 413 37 7 1248 1095 252 59 48 chr15 86965198 86965552 -16529422 - ORR1E LTR MaLR -1 358 1 7 1248 404 202 87 0 chr15 86966069 86966173 -16528801 - MTEa LTR MaLR -3 376 264 7 1248 1198 240 50 0 chr15 86966295 86966578 -16528396 - MTEa LTR MaLR -76 303 7 7 1248 897 302 120 15 chr15 86967712 86968186 -16526788 - MLT2B5 LTR ERVL -98 619 96 7 1248 555 288 27 23 chr15 86969027 86969247 -16525727 - RMER15 LTR ERVL -15 560 340 7 1248 307 319 35 0 chr15 86970793 86970909 -16524065 + MLT1D-int LTR MaLR 1369 1488 -1 7 1248 285 189 53 13 chr15 86971011 86971086 -16523888 + MLT1D LTR MaLR 428 505 0 7 1248 2064 161 16 11 chr15 86972469 86972833 -16522141 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 7 1248 227 306 122 43 chr15 86981461 86981625 -16513349 + MLT1A0 LTR MaLR 16 192 -173 7 1248 324 269 27 60 chr15 86982577 86982727 -16512247 + MTEa LTR MaLR 231 375 -4 7 1248 766 264 238 18 chr15 86987844 86988176 -16506798 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 8 1248 2026 170 3 8 chr15 86990424 86990785 -16504189 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 8 1248 2119 162 77 37 chr15 86991210 86991615 -16503359 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1248 822 242 37 130 chr15 86995457 86995756 -16499218 - MTE2a LTR MaLR -108 271 1 8 1248 535 292 149 29 chr15 87009134 87009409 -16485565 + MLT1D LTR MaLR 126 433 -72 6 1248 2019 137 78 23 chr15 87011137 87011481 -16483493 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 7 1248 1288 249 6 43 chr15 87011755 87012082 -16482892 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 214 8 1248 957 201 90 30 chr15 87012270 87012550 -16482424 - RLTR11A LTR ERVK -165 280 1 1 1248 535 310 86 22 chr15 87013514 87013833 -16481141 - MLT2B2 LTR ERVL -54 513 143 1 1248 484 315 65 50 chr15 87017003 87017359 -16477615 - MLT1C LTR MaLR -6 384 35 2 1248 339 356 61 12 chr15 87018139 87018282 -16476692 + MLT1A1 LTR MaLR 25 175 -233 2 1248 709 289 35 175 chr15 87018282 87018688 -16476286 - MTE2a LTR MaLR 0 379 31 2 1248 510 252 73 26 chr15 87018740 87018891 -16476083 + MLT1A1 LTR MaLR 228 385 -23 2 1248 230 333 132 69 chr15 87019265 87019729 -16475245 + LTR33 LTR ERVL 21 513 -2 2 1248 731 277 82 65 chr15 87023036 87023329 -16471645 - MTEa LTR MaLR -32 347 50 2 1248 1362 134 0 15 chr15 87023632 87023837 -16471137 + MTC LTR MaLR 2 203 -218 2 1248 602 221 33 0 chr15 87028585 87028707 -16466267 - MTEa LTR MaLR -52 327 202 3 1248 422 325 49 61 chr15 87029093 87029335 -16465639 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 281 3 1248 483 326 114 9 chr15 87029510 87029730 -16465244 - RMER5 LTR ERV1 -260 274 32 3 1248 263 265 193 62 chr15 87030436 87030581 -16464393 + RMER15 LTR ERVL 352 515 -60 3 1249 889 151 76 91 chr15 87033209 87033406 -16461568 + ORR1C2 LTR MaLR 1 194 -190 4 1249 2035 131 27 50 chr15 87034492 87034829 -16460145 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 4 1249 920 205 30 15 chr15 87051785 87051983 -16442991 - MTEa LTR MaLR -11 368 168 7 1249 378 265 207 37 chr15 87053923 87054111 -16440863 - RMER15 LTR ERVL -20 555 336 8 1249 1070 256 102 6 chr15 87061415 87061749 -16433225 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 9 1249 710 255 120 87 chr15 87069132 87069587 -16425387 + RMER13A LTR ERVK 88 599 -28 1 1249 866 320 58 37 chr15 87079584 87080016 -16414958 + MT2A LTR ERVL 93 533 0 1 1249 1688 209 53 3 chr15 87080452 87080808 -16414166 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 1 1249 284 290 102 59 chr15 87081174 87081524 -16413450 + RLTR21 LTR ERVK 742 1306 -266 1 1249 249 233 0 75 chr15 87081455 87081548 -16413426 - RLTR40 LTR ERVK -162 655 570 1 1249 597 220 13 54 chr15 87083136 87083285 -16411689 - MTD LTR MaLR -14 405 263 1 1249 641 239 51 46 chr15 87083311 87083486 -16411488 - MTD LTR MaLR -241 178 3 1 1249 295 345 60 33 chr15 87093002 87093185 -16401789 + ORR1E LTR MaLR 3 190 -169 1 1249 319 300 117 0 chr15 87093272 87093392 -16401582 + RMER15 LTR ERVL 439 572 -3 1 1249 3044 277 13 1 chr15 87093424 87094137 -16400837 + RMER15-int LTR ERVL 35 755 -4244 1 1249 1303 264 64 75 chr15 87097281 87097440 -16397534 + MTEa LTR MaLR 20 181 -198 1 1249 1303 264 64 75 chr15 87097586 87097787 -16397187 + MTEa LTR MaLR 182 376 -3 1 1249 424 311 100 17 chr15 87098029 87098209 -16396765 + MTEb-int LTR MaLR 232 426 -1154 1 1249 378 271 91 23 chr15 87098230 87098362 -16396612 + MTEb-int LTR MaLR 1434 1574 -6 1 1249 471 323 80 30 chr15 87098373 87098574 -16396400 + MTEb LTR MaLR 17 227 -152 1 1249 2190 192 15 12 chr15 87101511 87101918 -16393056 + MTD LTR MaLR 1 408 -11 1 1249 330 328 27 86 chr15 87102100 87102287 -16392687 + MLT1B LTR MaLR 5 180 -210 1 1249 1221 221 39 119 chr15 87103033 87103444 -16391530 + MTE2a LTR MaLR 1 378 -1 1 1249 1871 198 16 24 chr15 87106372 87106749 -16388225 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1249 360 317 43 43 chr15 87111171 87111405 -16383569 + RLTR15 LTR ERVK 53 286 -73 1 1249 453 343 121 63 chr15 87113951 87114315 -16380659 - MLT1J-int LTR MaLR -711 676 292 1 1249 859 276 35 76 chr15 87115190 87115558 -16379416 + ORR1E LTR MaLR 5 357 -2 1 1249 1319 230 85 5 chr15 87115706 87116034 -16378940 + MTD LTR MaLR 68 403 -16 1 1249 370 303 30 10 chr15 87116174 87116274 -16378700 + ORR1E LTR MaLR 1 102 -257 1 1249 344 294 55 66 chr15 87116294 87116476 -16378498 + ORR1E LTR MaLR 173 352 -7 1 1249 1224 287 59 3 chr15 87118692 87119014 -16375960 - MTE2b LTR MaLR -38 341 2 1 1249 227 236 57 106 chr15 87120851 87120974 -16374000 + MER67B LTR ERV1 243 359 -302 1 1249 3018 15 6 0 chr15 87124392 87124727 -16370247 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1249 57910 16 11 4 chr15 87124727 87131158 -16363816 + IAPEz-int LTR ERVK 8 6481 0 1 1249 3032 12 6 0 chr15 87131158 87131493 -16363481 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 337 0 1 1249 367 319 21 14 chr15 87135025 87135165 -16359809 + MLT1B LTR MaLR 35 175 -215 1 1249 1551 241 53 41 chr15 87135456 87135872 -16359102 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1249 1069 283 86 40 chr15 87139468 87139818 -16355156 - MTEb LTR MaLR 0 379 14 2 1249 317 287 88 62 chr15 87140560 87140784 -16354190 - MTEb LTR MaLR -33 346 100 2 1249 1028 241 64 111 chr15 87141454 87141880 -16353094 + MTD LTR MaLR 5 389 -30 2 1249 232 328 120 34 chr15 87149117 87149325 -16345649 - RMER12 LTR ERVK -350 972 747 2 1249 312 280 103 38 chr15 87149439 87149598 -16345376 - LTR33A LTR ERVL -292 239 72 2 1249 236 243 181 75 chr15 87154772 87154932 -16340042 + MLT2C1 LTR ERVL 156 332 -65 2 1249 3845 130 97 19 chr15 87155955 87156653 -16338321 + RMER6A LTR ERVK 3 755 -1 2 1249 976 244 101 36 chr15 87158583 87158889 -16336085 + MTD LTR MaLR 5 330 -89 2 1250 1955 109 141 39 chr15 87174117 87174450 -16320524 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1250 538 314 110 25 chr15 87175760 87176077 -16318897 - MLT1C LTR MaLR -123 344 1 2 1250 2188 131 84 3 chr15 87178122 87178491 -16316483 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 2 1250 1235 265 65 15 chr15 87185500 87185899 -16309075 + MTD LTR MaLR 1 419 0 2 1250 1309 282 33 29 chr15 87187691 87188111 -16306863 + BGLII_B LTR ERVK 10 431 -10 2 1250 2235 163 20 23 chr15 87191360 87191755 -16303219 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1250 1950 209 60 5 chr15 87192806 87193069 -16301905 - MTD LTR MaLR -14 405 121 2 1250 1950 209 60 5 chr15 87193114 87193230 -16301744 - MTD LTR MaLR -299 120 7 2 1250 274 250 0 0 chr15 87193375 87193431 -16301543 - MTD LTR MaLR -210 209 154 2 1250 1925 165 37 6 chr15 87193469 87193817 -16301157 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 2 1250 233 290 161 47 chr15 87193975 87194167 -16300807 - MLT1K LTR MaLR -10 585 372 2 1250 1157 274 83 11 chr15 87195440 87195790 -16299184 - MTEa LTR MaLR 0 379 5 2 1250 231 232 42 28 chr15 87197646 87197717 -16297257 - RMER12 LTR ERVK -506 816 745 3 1250 1013 284 107 19 chr15 87201935 87202254 -16292720 - MTE2b LTR MaLR -11 368 22 3 1250 2304 102 15 15 chr15 87202678 87203005 -16291969 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1250 448 343 27 33 chr15 87209558 87209742 -16285232 + MTD LTR MaLR 6 188 -231 3 1250 256 315 0 0 chr15 87214993 87215066 -16279908 - MTEb LTR MaLR -11 368 296 3 1250 234 340 29 20 chr15 87215346 87215448 -16279526 - MTEb LTR MaLR -222 137 35 3 1250 394 309 123 24 chr15 87219066 87219278 -16275696 - RMER15 LTR ERVL -68 507 275 3 1250 471 215 68 23 chr15 87219285 87219418 -16275556 - RMER15 LTR ERVL -436 139 1 3 1250 1517 174 11 19 chr15 87220250 87220514 -16274460 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 133 3 1250 1857 144 107 17 chr15 87226910 87227074 -16267900 + ORR1C1 LTR MaLR 1 165 -213 3 1250 1857 144 107 17 chr15 87227207 87227389 -16267585 + ORR1C1 LTR MaLR 166 377 -1 3 1250 1464 173 128 43 chr15 87227774 87228119 -16266855 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 3 1250 261 286 78 26 chr15 87228162 87228277 -16266697 + MLT1B LTR MaLR 243 363 -27 3 1250 651 324 75 69 chr15 87230642 87231004 -16263970 + MTEa LTR MaLR 2 365 -14 3 1250 1936 107 145 6 chr15 87231175 87231486 -16263488 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 3 1250 307 400 92 13 chr15 87231757 87231985 -16262989 + MLT1F2 LTR MaLR 90 335 -225 3 1250 1812 205 49 59 chr15 87232181 87232606 -16262368 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1250 383 245 32 0 chr15 87236938 87237032 -16257942 - ERVL-int LTR ERVL -3683 2074 1978 3 1250 1037 81 0 7 chr15 87253890 87254027 -16240947 - MTB LTR MaLR 0 400 265 3 1250 438 66 82 0 chr15 87254017 87254078 -16240896 - MTB LTR MaLR -337 70 5 3 1250 264 332 82 24 chr15 87258618 87258825 -16236149 + ORR1E LTR MaLR 140 358 -1 3 1250 304 302 12 0 chr15 87260534 87260620 -16234354 - MLT1A LTR MaLR -22 352 266 3 1250 945 274 149 36 chr15 87265068 87265397 -16229577 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 3 1250 2185 153 3 8 chr15 87268850 87269205 -16225769 + ORR1B1 LTR MaLR 42 394 0 3 1250 366 321 8 51 chr15 87271210 87271328 -16223646 - MTEa LTR MaLR -264 115 3 3 1250 332 342 57 19 chr15 87271503 87271661 -16223313 + MER70A LTR ERVL 288 451 -21 3 1250 4989 87 12 19 chr15 87273272 87274018 -16220956 + RLTR22_Mur LTR ERVK 92 832 -1016 3 1250 412 281 80 66 chr15 87274233 87274446 -16220528 + RMER12 LTR ERVK 1101 1316 -6 3 1250 322 241 46 46 chr15 87275340 87275427 -16219547 + ORR1E LTR MaLR 1 87 -272 4 1250 246 282 142 40 chr15 87275816 87275964 -16219010 + MLT1A LTR MaLR 197 359 -15 4 1250 746 279 50 111 chr15 87280090 87280494 -16214480 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1250 2224 166 55 12 chr15 87282507 87282911 -16212063 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1250 1467 208 86 14 chr15 87283289 87283640 -16211334 + MTE2a LTR MaLR 1 376 -3 4 1250 327 256 67 0 chr15 87285491 87285581 -16209393 - MLT1B LTR MaLR -172 218 123 4 1250 1415 223 33 86 chr15 87289257 87289654 -16205320 - MTEa LTR MaLR -3 376 1 4 1250 1809 185 17 34 chr15 87290161 87290513 -16204461 - ORR1B2 LTR MaLR -17 350 5 4 1250 2055 168 33 11 chr15 87291955 87292322 -16202652 + ORR1C1 LTR MaLR 4 378 0 4 1250 4265 196 256 19 chr15 87292322 87293542 -16201432 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 1509 0 4 1250 2010 167 29 16 chr15 87293543 87293714 -16201260 + ORR1C1 LTR MaLR 3 170 -214 4 156 2010 167 29 16 chr15 87293848 87294053 -16200921 + ORR1C1 LTR MaLR 171 383 -1 4 1251 230 350 40 24 chr15 87297177 87297303 -16197671 - LTR83 LTR ERVL -492 288 161 4 1251 233 365 89 11 chr15 87303090 87303270 -16191704 - MLT1C LTR MaLR -74 393 200 4 1251 572 240 152 23 chr15 87306424 87306723 -16188251 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 5 4 1251 1228 223 32 16 chr15 87309087 87309333 -16185641 - MTD LTR MaLR 0 419 170 4 1251 901 213 103 202 chr15 87310378 87310843 -16184131 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1251 594 304 82 88 chr15 87323285 87323638 -16171336 - MLT1B LTR MaLR -27 363 13 4 1251 2091 146 17 102 chr15 87325008 87325428 -16169546 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 4 1251 4073 152 111 84 chr15 87326049 87326921 -16168053 - RMER19B LTR ERVK -6 896 1 4 1251 2412 58 58 3 chr15 87328795 87329105 -16165869 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1251 482 305 79 51 chr15 87330900 87331114 -16163860 + RMER15-int LTR ERVL 193 412 -4587 4 1251 246 88 0 0 chr15 87331152 87331186 -16163788 + ORR1A4 LTR MaLR 294 327 -2 4 1251 1658 232 99 8 chr15 87332545 87332919 -16162055 + MTD LTR MaLR 12 419 0 4 1251 252 364 36 0 chr15 87333038 87333148 -16161826 + MLT1A1 LTR MaLR 1 114 -294 4 1251 647 293 120 39 chr15 87335331 87335640 -16159334 - MLT1B LTR MaLR -56 334 1 5 1251 691 320 44 28 chr15 87339583 87339943 -16155031 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2718 3083 -2631 5 1251 370 314 13 79 chr15 87340094 87340246 -16154728 + MTD LTR MaLR 18 159 -260 5 1251 2393 166 68 40 chr15 87340267 87340813 -16154161 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 5 1251 698 249 95 35 chr15 87340819 87341019 -16153955 + MTD LTR MaLR 193 404 -15 5 1251 1010 291 132 36 chr15 87341034 87341668 -16153306 + ERVL-B4-int LTR ERVL 3305 3999 -1715 5 1251 1187 297 142 51 chr15 87341805 87342703 -16152271 + ERVL-B4-int LTR ERVL 4198 5177 -537 5 1251 2476 91 194 0 chr15 87344994 87345392 -16149582 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1251 5768 47 4 19 chr15 87345394 87346149 -16148825 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5736 5 1251 2115 69 4 0 chr15 87346148 87346425 -16148549 - IAPEz-int LTR ERVK -4845 1636 1359 5 1251 3460 63 1 16 chr15 87346425 87347003 -16147971 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 168 5 1251 234 267 0 0 chr15 87347003 87347048 -16147926 - RLTR27 LTR ERVK -34 275 231 5 1251 492 134 27 112 chr15 87347048 87347191 -16147783 - IAPEz-int LTR ERVK -6358 123 3 5 1251 2476 91 194 0 chr15 87347193 87347591 -16147383 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1251 614 247 180 30 chr15 87353347 87353647 -16141327 - RLTR15 LTR ERVK -14 345 1 5 1251 3335 55 5 2 chr15 87356015 87356418 -16138556 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 4 5 1251 1544 213 83 28 chr15 87363314 87363417 -16131557 + MTD LTR MaLR 1 106 -313 5 1251 1544 213 83 28 chr15 87363453 87363745 -16131229 + MTD LTR MaLR 107 417 -2 5 1251 1080 248 47 93 chr15 87365191 87365617 -16129357 + MTE2a LTR MaLR 6 419 0 5 1251 969 234 47 63 chr15 87367002 87367257 -16127717 - MTEa LTR MaLR -119 260 10 5 1251 1135 256 60 45 chr15 87367478 87367497 -16127477 + MLT2D LTR ERVL 10 30 -384 5 1251 1999 146 46 11 chr15 87367497 87367844 -16127130 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 5 1251 1135 256 60 45 chr15 87367844 87368176 -16126798 + MLT2D LTR ERVL 31 366 -48 5 1251 233 316 54 66 chr15 87371079 87371245 -16123729 - MLT1J-int LTR MaLR -705 682 519 5 1251 240 333 86 99 chr15 87391319 87391496 -16103478 - ORR1E LTR MaLR -5 354 185 5 1251 240 333 86 99 chr15 87391596 87391661 -16103313 - ORR1E LTR MaLR -175 184 116 5 1251 244 284 68 0 chr15 87391725 87391813 -16103161 - ORR1E LTR MaLR -259 100 7 5 1251 1026 236 132 25 chr15 87409901 87410219 -16084755 - MTEa LTR MaLR -2 377 26 6 1251 301 281 76 23 chr15 87414055 87414186 -16080788 + RMER15 LTR ERVL 380 517 -58 6 1251 2253 162 8 3 chr15 87416241 87416606 -16078368 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1251 1697 176 6 56 chr15 87422527 87422887 -16072087 + RLTR15 LTR ERVK 1 342 -17 6 1252 1039 252 156 31 chr15 87426195 87426522 -16068452 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 3 6 1252 1496 217 116 3 chr15 87428650 87429020 -16065954 - MTD LTR MaLR -7 412 1 6 1252 290 299 114 21 chr15 87434556 87434696 -16060278 - RMER15 LTR ERVL 0 575 423 6 1252 787 323 56 33 chr15 87438140 87438499 -16056475 + MLT1B LTR MaLR 4 370 -20 6 1252 229 320 20 30 chr15 87439643 87439743 -16055231 + MLT1A LTR MaLR 31 129 -245 6 1252 343 296 262 0 chr15 87443087 87443259 -16051715 - RMER15 LTR ERVL -63 512 296 6 1252 262 250 29 108 chr15 87443304 87443443 -16051531 - RMER15 LTR ERVL -445 130 3 6 1252 1024 258 122 18 chr15 87447766 87448101 -16046873 - MTEb LTR MaLR -7 372 3 6 1252 1957 197 40 2 chr15 87464798 87465195 -16029779 + MTD LTR MaLR 2 413 -6 6 1252 2798 229 155 97 chr15 87465201 87466387 -16028587 + MTD-int LTR MaLR 1 1255 -3 6 1252 1590 202 69 83 chr15 87466392 87466813 -16028161 + MTD LTR MaLR 3 417 -2 6 1252 346 345 34 0 chr15 87471000 87471119 -16023855 - MLT1B LTR MaLR -12 378 256 6 1252 698 237 67 48 chr15 87472153 87472361 -16022613 - MTE2a LTR MaLR -167 212 1 6 1252 471 310 34 27 chr15 87476960 87477109 -16017865 - MLT2D LTR ERVL -238 176 27 6 1252 452 244 2 39 chr15 87490804 87490952 -16004022 - MTE2a LTR MaLR -7 372 226 6 1252 296 324 190 12 chr15 87494034 87494281 -16000693 - MLT2B3 LTR ERVL 0 554 264 6 1252 372 226 37 19 chr15 87503705 87503813 -15991161 + RMER15 LTR ERVL 405 514 -61 2 1252 492 220 44 41 chr15 87518646 87518808 -15976166 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 196 1 1252 704 319 104 78 chr15 87519754 87520176 -15974798 - MT2A LTR ERVL 0 533 101 1 1252 775 256 269 11 chr15 87524707 87525146 -15969828 - RMER15 LTR ERVL -2 573 22 2 1252 329 322 70 0 chr15 87528534 87528649 -15966325 + MLT1A0 LTR MaLR 211 333 -32 2 1252 1176 274 34 65 chr15 87543198 87543584 -15951390 - MTE2b LTR MaLR -5 374 1 3 1252 385 350 43 78 chr15 87549886 87550118 -15944856 - MTEa LTR MaLR -128 251 28 3 1252 990 202 84 42 chr15 87554587 87554825 -15940149 + MTD LTR MaLR 24 271 -148 4 1253 2084 118 116 37 chr15 87559324 87559424 -15935550 - MTC LTR MaLR 0 421 322 4 1253 1674 166 321 69 chr15 87559424 87559467 -15935507 - MT2B LTR ERVL -1 600 554 4 1253 1674 166 321 69 chr15 87559492 87559927 -15935047 - MT2B LTR ERVL -48 553 1 4 1253 2084 118 116 37 chr15 87559927 87560206 -15934768 - MTC LTR MaLR -100 321 12 4 1253 1751 165 65 0 chr15 87567084 87567393 -15927581 + ORR1B1 LTR MaLR 66 394 0 5 1253 260 188 42 0 chr15 87569283 87569331 -15925643 - MLT1C LTR MaLR 0 624 575 5 1253 648 324 66 57 chr15 87570878 87571212 -15923762 - MLT1C LTR MaLR -42 425 89 5 1253 1202 267 29 109 chr15 87574826 87575238 -15919736 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 6 1253 248 244 20 118 chr15 87578675 87578777 -15916197 - RLTR25B LTR ERVK -506 522 431 6 1253 2619 119 63 2 chr15 87579915 87580312 -15914662 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1253 1554 226 38 38 chr15 87581880 87582248 -15912726 - RLTR20A LTR ERVK 0 541 174 7 1253 440 118 0 14 chr15 87582248 87582317 -15912657 - RLTR20A LTR ERVK -473 68 1 7 1253 1909 187 75 3 chr15 87582323 87582698 -15912276 - MTD LTR MaLR -15 404 3 7 1253 769 183 0 7 chr15 87583233 87583376 -15911598 - RLTR26 LTR ERVK 0 642 501 7 1253 2156 161 254 7 chr15 87583373 87583809 -15911165 - RLTR26 LTR ERVK -98 544 1 7 1253 786 228 64 5 chr15 87590735 87590938 -15904036 - RMER15 LTR ERVL -40 535 321 8 1253 271 235 58 14 chr15 87592791 87592860 -15902114 - MTE2a LTR MaLR -307 72 1 8 1253 311 282 25 13 chr15 87593344 87593423 -15901551 - RMER12 LTR ERVK -142 1180 1101 8 1253 3356 161 44 15 chr15 87593543 87594212 -15900762 - RLTR22_Mur LTR ERVK -997 851 170 8 1253 249 275 61 24 chr15 87601456 87601538 -15893436 + ORR1E LTR MaLR 9 93 -266 9 1253 1426 214 90 45 chr15 87601552 87602048 -15892926 - RMER4B LTR ERVK -9 576 17 9 1253 1516 220 118 3 chr15 87605489 87605845 -15889129 + MTD LTR MaLR 21 417 -2 1 1253 2332 155 38 107 chr15 87613343 87613849 -15881125 + RMER15 LTR ERVL 76 546 -29 1 1253 2112 195 43 3 chr15 87614890 87615281 -15879693 - MTC LTR MaLR 0 421 15 1 1253 2483 83 0 58 chr15 87618435 87618782 -15876192 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1253 291 216 21 83 chr15 87631084 87631180 -15863794 + MLT1A1 LTR MaLR 311 400 -8 1 1253 1155 237 56 125 chr15 87633067 87633458 -15861516 + MTE2a LTR MaLR 1 364 -15 1 1253 3454 25 5 0 chr15 87635348 87635741 -15859233 + MTA_Mm LTR MaLR 2 396 0 1 1253 4226 166 93 46 chr15 87638595 87639457 -15855517 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 1 1253 356 213 40 0 chr15 87648791 87648866 -15846108 - MTE2a LTR MaLR -6 373 296 1 1253 1936 141 131 6 chr15 87652008 87652358 -15842616 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1253 948 202 149 18 chr15 87659077 87659377 -15835597 - MT2B LTR ERVL 0 601 94 1 1253 473 264 0 39 chr15 87659415 87659545 -15835429 - MT2B LTR ERVL -405 128 4 1 1253 1687 142 57 69 chr15 87660338 87660453 -15834521 + ORR1A4 LTR MaLR 1 111 -218 1 1253 1687 142 57 69 chr15 87660515 87660732 -15834242 + ORR1A4 LTR MaLR 112 329 0 1 1253 2100 156 47 8 chr15 87665416 87665778 -15829196 + ORR1C1 LTR MaLR 1 376 -2 1 1253 487 282 97 51 chr15 87668015 87668232 -15826742 + RMER15 LTR ERVL 336 562 -13 1 1253 1898 169 136 112 chr15 87672057 87672220 -15822754 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 368 2 1253 1898 169 136 112 chr15 87672399 87672735 -15822239 - RLTR11A2 LTR ERVK -160 367 16 2 1253 253 332 81 0 chr15 87682478 87682588 -15812386 - MLT1A0 LTR MaLR -10 364 247 2 156 2256 158 24 47 chr15 87686787 87687237 -15807737 - RMER10A LTR ERVL -2 440 1 2 1254 3032 147 78 40 chr15 87690125 87690729 -15804245 + RMER20B LTR ERVK 1 627 0 2 1254 1980 178 18 3 chr15 87690744 87691087 -15803887 + RLTR11A2 LTR ERVK 180 527 0 2 1254 292 275 81 32 chr15 87691379 87691503 -15803471 + ORR1E LTR MaLR 1 130 -229 2 1254 377 272 110 57 chr15 87691741 87692076 -15802898 - RMER10A LTR ERVL -76 366 14 2 1254 1631 257 63 44 chr15 87692148 87692652 -15802322 - RMER5 LTR ERV1 -20 514 1 2 1254 1335 159 154 130 chr15 87693502 87693598 -15801376 + ORR1C1 LTR MaLR 1 128 -250 2 1254 3370 33 8 0 chr15 87693598 87693991 -15800983 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1254 1335 159 154 130 chr15 87693991 87694186 -15800788 + ORR1C1 LTR MaLR 129 333 -45 2 1254 1335 159 154 130 chr15 87694332 87694408 -15800566 + ORR1C1 LTR MaLR 334 378 0 2 1254 3389 13 39 0 chr15 87694539 87694920 -15800054 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1254 9593 24 2 3 chr15 87694920 87696019 -15798955 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 2 1254 3389 13 39 0 chr15 87696019 87696400 -15798574 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1254 357 207 81 0 chr15 87705803 87705890 -15789084 - MLT1A LTR MaLR -53 321 228 2 1254 1185 218 140 32 chr15 87706406 87706748 -15788226 - MTEa LTR MaLR 0 379 1 2 1254 785 246 30 98 chr15 87715532 87715752 -15779222 - MTE2a LTR MaLR -74 305 104 2 1254 1510 206 67 27 chr15 87715752 87715868 -15779106 + ORR1C2 LTR MaLR 2 171 -213 2 1254 1510 189 67 25 chr15 87715926 87716126 -15778848 + ORR1C2 LTR MaLR 172 383 -1 2 1254 323 229 93 19 chr15 87716126 87716231 -15778743 - MTD LTR MaLR -289 130 18 2 1254 246 323 231 36 chr15 87716776 87717001 -15777973 - MLT2B2 LTR ERVL -98 417 149 2 1254 913 295 82 12 chr15 87716997 87717346 -15777628 + MLT2B1 LTR ERVL 10 475 -87 2 1254 404 342 159 17 chr15 87717579 87717930 -15777044 + ERVL-B4-int LTR ERVL 196 596 -5118 2 1254 1587 198 131 24 chr15 87718619 87718907 -15776067 + MTD LTR MaLR 5 337 -82 2 1254 2151 108 11 74 chr15 87718907 87719258 -15775716 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1254 1587 198 131 24 chr15 87719258 87719342 -15775632 + MTD LTR MaLR 338 417 -2 2 1254 655 339 88 31 chr15 87719351 87720388 -15774586 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3008 2753 1544 2 1254 5525 92 29 10 chr15 87721705 87722498 -15772476 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 2 1254 2466 66 0 6 chr15 87722888 87723207 -15771767 - ORR1A2 LTR MaLR -10 317 1 2 1254 3422 87 35 165 chr15 87725307 87725643 -15769331 + LTRIS2 LTR ERV1 1 246 -318 2 1254 3422 87 35 165 chr15 87725678 87725989 -15768985 + LTRIS2 LTR ERV1 247 564 0 2 1254 1300 245 128 22 chr15 87726456 87726823 -15768151 - MTD LTR MaLR -9 410 5 2 1254 232 343 107 11 chr15 87729410 87729587 -15765387 - MLT1J2 LTR MaLR -8 440 247 2 1254 252 252 79 31 chr15 87735042 87735169 -15759805 - MLT1B LTR MaLR -139 251 119 3 1254 273 301 93 35 chr15 87736213 87736385 -15758589 + MLT1C LTR MaLR 1 182 -285 3 1254 468 263 72 82 chr15 87741992 87742285 -15752689 + ORR1D2 LTR MaLR 46 370 0 3 1254 1330 247 123 13 chr15 87742945 87743318 -15751656 - MTC LTR MaLR 0 421 8 3 1254 1769 215 75 40 chr15 87744235 87744705 -15750269 - RMER5 LTR ERV1 -46 488 3 3 1254 1582 209 111 14 chr15 87755392 87755761 -15739213 - MTD LTR MaLR -13 406 2 3 1254 2256 107 6 6 chr15 87756647 87756976 -15737998 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1254 1757 253 15 24 chr15 87757881 87758290 -15736684 - MTD LTR MaLR -14 405 1 3 1254 1606 256 125 56 chr15 87758290 87759257 -15735717 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 46 3 1254 1397 289 58 33 chr15 87759482 87759876 -15735098 - MTD LTR MaLR -13 406 3 3 1254 276 358 112 44 chr15 87760198 87760449 -15734525 - MLT1J LTR MaLR -205 307 40 3 1254 2065 149 0 21 chr15 87760647 87760983 -15733991 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1254 1860 224 28 5 chr15 87768152 87768543 -15726431 - MTD LTR MaLR -2 417 18 3 1254 260 233 43 43 chr15 87771334 87771428 -15723546 + MLT2B3 LTR ERVL 3 96 -458 3 1254 360 105 0 0 chr15 87773345 87773402 -15721572 - ORR1B1 LTR MaLR -305 89 33 3 1254 3702 20 121 0 chr15 87779941 87780381 -15714593 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 3 1254 1630 229 118 16 chr15 87781289 87781728 -15713246 + RMER5 LTR ERV1 41 524 -10 3 1254 988 262 20 48 chr15 87783911 87784163 -15710811 - MTE2a LTR MaLR -8 371 127 3 1254 845 194 32 6 chr15 87784158 87784314 -15710660 - MTE2a LTR MaLR -218 161 2 3 1254 259 274 76 50 chr15 87785599 87785718 -15709256 - LTRIS_Mus LTR ERV1 -314 273 152 3 1254 544 331 91 16 chr15 87785732 87785984 -15708990 - RMER15 LTR ERVL -16 559 289 3 1254 3040 33 0 67 chr15 87799995 87800386 -15694588 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 3 1254 1382 238 59 31 chr15 87800946 87801394 -15693580 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 3 1254 2189 187 48 5 chr15 87805887 87806284 -15688690 - MTC LTR MaLR -3 418 5 3 1254 294 217 145 0 chr15 87814266 87814335 -15680639 + MTEb LTR MaLR 292 370 -9 4 1254 2265 122 91 3 chr15 87815425 87815787 -15679187 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1255 374 222 9 61 chr15 87819488 87819603 -15675371 + ORR1D2 LTR MaLR 1 109 -261 4 1255 392 111 13 65 chr15 87820416 87820493 -15674481 + RMER4A LTR ERVK 394 466 0 4 1255 287 209 0 3 chr15 87822252 87822317 -15672657 + MTEa LTR MaLR 3 66 -313 4 1255 1929 182 38 39 chr15 87822567 87823047 -15671927 - BGLII_B LTR ERVK -5 436 14 4 1255 501 331 92 4 chr15 87827684 87827933 -15667041 - MLT1A0 LTR MaLR -21 344 74 4 1255 1986 109 131 18 chr15 87829128 87829464 -15665510 - ORR1C2 LTR MaLR -7 377 4 4 1255 1440 259 39 22 chr15 87829569 87829973 -15665001 - MTD LTR MaLR 0 419 9 4 1255 1602 241 164 101 chr15 87829973 87830117 -15664857 - MTD-int LTR MaLR -3 1577 1362 4 1255 1602 241 164 101 chr15 87830256 87831114 -15663860 - MTD-int LTR MaLR -3 1361 68 4 1255 235 329 0 38 chr15 87831110 87831189 -15663785 - MTD LTR MaLR -331 88 13 4 1255 232 274 27 14 chr15 87836725 87836799 -15658175 - MTEa LTR MaLR -18 361 287 4 1255 229 268 77 23 chr15 87841853 87841983 -15652991 + MTC-int LTR MaLR 1093 1229 -29 4 1255 540 305 71 31 chr15 87842077 87842350 -15652624 + MTE2a LTR MaLR 59 379 0 4 1255 1791 200 190 19 chr15 87845164 87845637 -15649337 - RMER15 LTR ERVL 0 575 22 4 1255 237 296 0 53 chr15 87845677 87845752 -15649222 - RMER15 LTR ERVL -503 72 2 4 1255 3456 42 0 10 chr15 87846753 87847164 -15647810 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1255 1519 202 77 47 chr15 87849848 87850024 -15644950 + ORR1D1 LTR MaLR 1 166 -208 4 1255 1519 202 77 47 chr15 87850067 87850253 -15644721 + ORR1D1 LTR MaLR 167 374 0 4 1255 1602 177 54 95 chr15 87850262 87850631 -15644343 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 4 1255 1732 214 52 22 chr15 87852498 87852905 -15642069 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1255 897 294 96 45 chr15 87855204 87855539 -15639435 + ORR1E LTR MaLR 8 359 0 4 1255 1835 290 119 145 chr15 87855545 87856046 -15638928 + ORR1E-int LTR MaLR 6 564 -1016 4 1255 1835 290 119 145 chr15 87856077 87857024 -15637950 + ORR1E-int LTR MaLR 565 1417 -163 4 1255 820 236 208 66 chr15 87857488 87857820 -15637154 + MTE2a LTR MaLR 1 379 0 4 1255 1681 238 52 45 chr15 87859549 87859950 -15635024 - MTD LTR MaLR -15 404 1 4 1255 382 252 14 121 chr15 87860027 87860167 -15634807 + ORR1A4 LTR MaLR 1 125 -204 4 1255 350 253 25 0 chr15 87863654 87863733 -15631241 - MTEb LTR MaLR -7 372 292 4 1255 707 253 17 17 chr15 87864042 87864215 -15630759 - MTEb LTR MaLR -203 176 4 4 1255 5039 156 28 28 chr15 87871180 87872087 -15622887 - RMER13B LTR ERVK 0 908 2 4 1255 237 358 31 10 chr15 87872970 87873066 -15621908 + ORR1E LTR MaLR 1 98 -281 4 1255 243 200 40 0 chr15 87873129 87873179 -15621795 + ORR1E LTR MaLR 87 138 -221 4 1255 361 313 57 57 chr15 87875442 87875601 -15619373 + RMER15 LTR ERVL 1 159 -416 4 1255 741 301 83 15 chr15 87875613 87875879 -15619095 + RMER15 LTR ERVL 289 572 -3 4 1255 2459 138 55 8 chr15 87883195 87883597 -15611377 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1255 253 271 14 14 chr15 87883933 87884004 -15610970 + MTE2a LTR MaLR 285 355 -24 4 1255 3046 47 2 65 chr15 87885821 87886235 -15608739 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 4 1255 1550 255 42 17 chr15 87893912 87894319 -15600655 - MTD LTR MaLR 0 419 3 5 1255 254 303 11 22 chr15 87894479 87894570 -15600404 + MER74B LTR ERVL 76 165 -457 5 1255 376 256 77 0 chr15 87895667 87895825 -15599149 + RMER12 LTR ERVK 770 856 -466 5 1255 338 333 33 16 chr15 87922560 87922682 -15572292 + MTD LTR MaLR 1 124 -295 5 1255 770 291 130 24 chr15 87922834 87923056 -15571918 + MTD LTR MaLR 97 345 -74 5 1255 770 291 130 24 chr15 87923094 87923163 -15571811 + MTD LTR MaLR 346 418 -1 5 1255 304 291 48 19 chr15 87925101 87925206 -15569768 - MTEa LTR MaLR 0 379 272 5 1255 625 183 89 30 chr15 87926238 87926373 -15568601 + MTC LTR MaLR 1 143 -278 5 1255 1382 181 44 29 chr15 87926457 87926730 -15568244 + MTC LTR MaLR 145 421 0 5 1255 339 311 235 105 chr15 87927198 87927501 -15567473 - ORR1E LTR MaLR -38 341 3 5 1255 310 252 202 8 chr15 87930156 87930280 -15564694 - ORR1E LTR MaLR 0 379 232 5 1255 646 224 75 43 chr15 87930462 87930552 -15564422 - ORR1E LTR MaLR -166 193 98 5 1255 646 224 75 43 chr15 87930862 87930958 -15564016 - ORR1E LTR MaLR -262 97 1 5 1255 247 336 67 0 chr15 87937896 87938015 -15556959 + MTE-int LTR MaLR 8 134 -1446 5 1255 1054 258 138 12 chr15 87939188 87939525 -15555449 - MTD LTR MaLR 0 419 20 5 1255 230 349 90 15 chr15 87940975 87941109 -15553865 + MLT2C1 LTR ERVL 154 297 -100 5 1255 2662 123 22 20 chr15 87943536 87943942 -15551032 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1255 589 200 14 63 chr15 87944376 87944522 -15550452 - MTD LTR MaLR 0 421 283 5 1256 1202 161 247 127 chr15 87955664 87955814 -15539160 - MT2A LTR ERVL -93 440 203 5 1256 1202 161 247 127 chr15 87955849 87956083 -15538891 - MT2A LTR ERVL -331 202 10 5 1256 720 265 35 10 chr15 87956439 87956641 -15538333 - RMER5 LTR ERV1 0 534 328 5 1256 956 241 312 10 chr15 87956788 87957072 -15537902 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 5 1256 1949 211 76 18 chr15 87957072 87957521 -15537453 - ORR1D2-int LTR MaLR 0 1370 896 5 1256 331 291 39 185 chr15 87959389 87959805 -15535169 + ORR1E LTR MaLR 9 354 -5 5 1256 2115 190 39 17 chr15 87960658 87961070 -15533904 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1256 428 83 0 0 chr15 87961220 87961280 -15533694 - MTEb LTR MaLR 0 379 320 5 1256 829 281 155 71 chr15 87961280 87961602 -15533372 - MT2A LTR ERVL 0 554 206 5 1256 1281 254 39 10 chr15 87963127 87963433 -15531541 + MTEa LTR MaLR 61 375 -4 5 1256 2400 150 37 0 chr15 87963975 87964355 -15530619 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 5 1256 647 275 73 55 chr15 87970379 87970692 -15524282 + MTEa LTR MaLR 7 379 0 6 1256 264 292 34 0 chr15 87970745 87970834 -15524140 - MLT2D LTR ERVL -60 500 409 6 1256 2496 183 52 27 chr15 87970844 87970895 -15524079 - RLTR20B3 LTR ERVK -43 534 483 6 1256 2496 183 52 27 chr15 87970938 87971407 -15523567 - RLTR20B3 LTR ERVK -95 482 3 6 1256 339 263 32 0 chr15 87971438 87971533 -15523441 + MLT2D LTR ERVL 133 230 -184 6 1256 986 285 103 24 chr15 87979113 87979454 -15515520 - MTEa LTR MaLR -9 370 3 6 1256 759 278 168 8 chr15 87980188 87980438 -15514536 - MTD LTR MaLR -1 418 129 6 1256 3251 48 7 15 chr15 87981189 87981592 -15513382 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1256 1167 276 113 19 chr15 87983279 87983649 -15511325 - MTD LTR MaLR -14 405 1 6 1256 269 280 4 27 chr15 87988693 87988780 -15506194 + MLT1B LTR MaLR 1 84 -383 6 1256 2155 176 101 16 chr15 87988865 87989349 -15505625 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 525 -2 6 1256 1654 237 42 6 chr15 87989437 87989797 -15505177 + MTE2b LTR MaLR 3 375 -4 6 1256 1935 99 81 10 chr15 87991872 87992169 -15502805 + ORR1A3 LTR MaLR 1 318 -8 6 1256 597 287 158 12 chr15 87992186 87992426 -15502548 - MLT1B LTR MaLR -82 308 34 6 1256 1039 282 57 93 chr15 87994572 87994959 -15500015 + MTE2a LTR MaLR 1 373 -6 6 1256 721 279 130 33 chr15 87995489 87995790 -15499184 - MTD LTR MaLR -36 383 26 6 1256 1915 221 37 59 chr15 87995883 87996423 -15498551 + RLTR11A LTR ERVK 1 528 0 6 1256 2954 146 29 81 chr15 87998313 87998930 -15496044 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 6 1256 1116 267 10 145 chr15 87999610 87999996 -15494978 + MTEa LTR MaLR 1 334 -45 6 1256 1330 221 63 3 chr15 88000295 88000595 -15494379 - MTD LTR MaLR -15 404 87 2 1256 269 281 33 33 chr15 88009833 88009925 -15485049 - MTEa LTR MaLR -13 366 275 1 1256 301 226 129 12 chr15 88011033 88011118 -15483856 + ORR1E LTR MaLR 9 103 -256 1 1256 298 298 70 0 chr15 88012534 88012648 -15482326 - MLT1B LTR MaLR -16 374 253 1 1256 2318 129 86 0 chr15 88014029 88014082 -15480892 + RMER6B LTR ERVK 1 53 -408 1 1256 2318 129 86 0 chr15 88014104 88014422 -15480552 + RMER6B LTR ERVK 54 402 -59 1 1256 599 242 144 17 chr15 88015116 88015297 -15479677 - MT2A LTR ERVL 0 533 330 2 1256 480 241 175 24 chr15 88015249 88015415 -15479559 - MTE-int LTR MaLR -100 1480 1290 2 1256 639 286 40 45 chr15 88015447 88015645 -15479329 - MT2A LTR ERVL -198 335 139 2 1256 3330 291 78 14 chr15 88015662 88016602 -15478372 + MTE-int LTR MaLR 581 1580 0 2 1256 250 271 0 17 chr15 88016611 88016671 -15478303 + MTE2b LTR MaLR 38 96 -283 2 1256 775 303 94 0 chr15 88016913 88017147 -15477827 + MTE2b LTR MaLR 123 378 -1 2 1256 1398 256 58 14 chr15 88018521 88018882 -15476092 + MTEa LTR MaLR 3 379 0 2 1256 420 321 41 55 chr15 88024267 88024412 -15470562 + MTD LTR MaLR 31 173 -246 3 1256 2294 228 82 0 chr15 88024420 88024893 -15470081 - MT2A LTR ERVL -21 512 1 3 1256 444 306 51 92 chr15 88024893 88025128 -15469846 + MTE2b LTR MaLR 143 365 -14 3 1256 253 333 67 13 chr15 88032202 88032351 -15462623 + MLT1B LTR MaLR 234 390 0 4 1256 285 330 9 9 chr15 88036075 88036188 -15458786 - MER89-int LTR ERV1 -5039 1762 1650 5 1256 432 340 69 58 chr15 88037652 88037999 -15456975 - MER89 LTR ERV1 -4 555 205 5 1256 1852 118 161 0 chr15 88045416 88045696 -15449278 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 1 6 1256 2173 100 45 60 chr15 88050086 88050417 -15444557 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 7 1256 842 268 54 167 chr15 88051205 88051430 -15443544 + MTE2a LTR MaLR 1 203 -176 7 1256 842 268 54 167 chr15 88051499 88051698 -15443276 + MTE2a LTR MaLR 204 377 -2 7 1256 252 262 34 57 chr15 88054679 88054805 -15440169 - MLT2D LTR ERVL -8 555 430 7 1256 493 351 45 20 chr15 88054960 88055207 -15439767 + MLT2C1 LTR ERVL 18 270 -127 7 1256 1430 118 270 7 chr15 88059354 88059628 -15435346 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 8 1256 981 209 59 10 chr15 88061226 88061429 -15433545 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 172 8 1256 557 271 54 74 chr15 88066700 88066903 -15428071 - MTEa LTR MaLR -17 362 164 9 1256 1139 255 49 32 chr15 88068486 88068855 -15426119 - MTEa LTR MaLR 0 379 5 9 1256 2005 163 68 11 chr15 88070044 88070409 -15424565 - MTC LTR MaLR -35 386 1 9 1256 226 298 90 60 chr15 88070605 88070705 -15424269 - MTE-int LTR MaLR -42 1538 1436 9 1256 333 370 51 11 chr15 88070756 88070931 -15424043 - MLT2B1 LTR ERVL -13 554 373 9 1256 530 246 39 0 chr15 88071017 88071147 -15423827 - MLT2B4 LTR ERVL -419 137 3 9 1256 367 320 125 11 chr15 88073132 88073345 -15421629 - MLT2B2 LTR ERVL -102 499 255 1 1256 249 239 111 14 chr15 88073368 88073440 -15421534 - MLT2B2 LTR ERVL -457 97 19 1 1256 1181 250 83 6 chr15 88074741 88075091 -15419883 + MTEb LTR MaLR 3 379 0 1 1256 2292 166 57 12 chr15 88079590 88079992 -15414982 - MTC LTR MaLR -1 420 1 1 1257 2684 107 46 48 chr15 88087421 88087875 -15407099 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 1 1257 398 272 46 39 chr15 88089495 88089648 -15405326 - RLTR42-int LTR ERVK -4122 1400 1247 1 1257 721 214 308 24 chr15 88093950 88094242 -15400732 + MTE2b LTR MaLR 5 379 0 1 1257 1975 151 11 49 chr15 88095521 88095889 -15399085 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 1 1257 1137 297 76 23 chr15 88095899 88096081 -15398893 + MTD LTR MaLR 6 198 -221 1 1257 1137 297 76 23 chr15 88096111 88096321 -15398653 + MTD LTR MaLR 199 418 -1 1 1257 924 260 23 98 chr15 88097625 88097971 -15397003 - RLTR46 LTR ERVK 0 320 1 1 1257 1037 249 84 25 chr15 88098092 88098450 -15396524 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 1 1257 1217 223 35 39 chr15 88098451 88098735 -15396239 - MTEb-int LTR MaLR -1 1579 1297 1 1257 2116 279 150 30 chr15 88100059 88100950 -15394024 - MTEb-int LTR MaLR -242 1128 203 1 1257 849 232 84 76 chr15 88101141 88101376 -15393598 - MTEb-int LTR MaLR -1343 237 1 1 1257 873 301 44 50 chr15 88101394 88101737 -15393237 + MTD LTR MaLR 7 347 -72 1 1257 1032 241 81 0 chr15 88101858 88102094 -15392880 - MTEb LTR MaLR -120 259 5 1 1257 1262 238 138 24 chr15 88105955 88106295 -15388679 - MTD LTR MaLR -3 416 38 1 1257 1323 282 41 24 chr15 88106339 88106677 -15388297 + MTE2b LTR MaLR 25 368 -11 1 1257 231 392 18 61 chr15 88108069 88108183 -15386791 + ORR1E LTR MaLR 1 109 -270 1 1257 282 333 116 45 chr15 88108297 88108495 -15386479 + ORR1E LTR MaLR 101 312 -47 1 1257 373 332 96 51 chr15 88108525 88108978 -15385996 - MLT2B3 LTR ERVL -20 534 31 1 1257 334 328 89 11 chr15 88109311 88109502 -15385472 + MTE-int LTR MaLR 73 278 -1302 1 1257 565 271 83 83 chr15 88109487 88109692 -15385282 - MTEa LTR MaLR -16 363 159 1 1257 439 308 26 71 chr15 88109778 88109932 -15385042 - MTEa LTR MaLR -232 147 1 1 1257 2428 318 123 48 chr15 88109940 88110966 -15384008 + MTE-int LTR MaLR 266 1363 -217 1 1257 2428 318 123 48 chr15 88111047 88111227 -15383747 + MTE-int LTR MaLR 1364 1562 -18 1 1257 385 341 57 99 chr15 88111216 88111548 -15383426 + ORR1E LTR MaLR 38 355 -4 1 1257 1264 281 40 50 chr15 88111660 88112064 -15382910 - MTD LTR MaLR 0 419 20 1 1257 951 226 46 17 chr15 88112782 88113020 -15381954 - ORR1D2 LTR MaLR -125 245 1 1 1257 239 283 0 0 chr15 88115509 88115569 -15379405 + MER31A LTR ERV1 5 64 -421 1 1257 542 283 101 27 chr15 88115639 88115897 -15379077 + MER31A LTR ERV1 140 416 -69 1 1257 801 243 247 16 chr15 88116739 88116990 -15377984 - MTEa LTR MaLR -5 374 66 1 1257 774 147 79 43 chr15 88116996 88117160 -15377814 - RLTR26 LTR ERVK -472 170 1 1 1257 319 125 0 0 chr15 88117164 88117212 -15377762 - MTEa LTR MaLR -331 48 1 1 1257 1956 192 13 51 chr15 88117271 88117661 -15377313 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 4 1 1257 372 276 83 40 chr15 88117670 88117849 -15377125 + MLT1B LTR MaLR 178 364 -1 1 1257 252 302 140 75 chr15 88119080 88119359 -15375615 - MLT1A0 LTR MaLR -3 621 325 1 1257 459 278 69 3 chr15 88120533 88120706 -15374268 - MLT1A0 LTR MaLR -163 211 21 1 1257 2300 76 76 0 chr15 88127382 88127686 -15367288 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1257 278 260 167 0 chr15 88133281 88133377 -15361597 - MER74A LTR ERVL -440 118 7 1 1257 796 276 151 60 chr15 88135588 88135913 -15359061 - MTE2a LTR MaLR -7 372 11 1 1257 527 286 151 21 chr15 88135919 88135997 -15358977 + MLT1B LTR MaLR 42 136 -254 1 1257 2974 51 81 0 chr15 88135997 88136367 -15358607 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1257 527 286 151 21 chr15 88136367 88136527 -15358447 + MLT1B LTR MaLR 137 311 -79 1 1257 1026 266 60 45 chr15 88139434 88139765 -15355209 - MTEa LTR MaLR -42 337 2 2 1257 259 323 131 97 chr15 88142131 88142481 -15352493 - MLT1A0 LTR MaLR -3 362 1 2 1257 1000 288 88 6 chr15 88142536 88142878 -15352096 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 1257 466 333 83 40 chr15 88144152 88144430 -15350544 - MLT1D LTR MaLR -16 489 200 2 1257 615 279 313 40 chr15 88148072 88148522 -15346452 + RMER15 LTR ERVL 4 575 0 2 1257 3827 85 40 56 chr15 88149355 88149927 -15345047 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 1 2 1257 1638 240 64 8 chr15 88151906 88152263 -15342711 + MTD LTR MaLR 2 378 -41 2 1257 2583 41 3 0 chr15 88152394 88152709 -15342265 - MTA_Mm LTR MaLR -80 316 1 2 1257 731 244 132 27 chr15 88162670 88162927 -15332047 + RMER20B LTR ERVK 122 405 -222 2 1257 887 277 25 94 chr15 88163036 88163442 -15331532 - MTE2a LTR MaLR 0 379 2 2 1257 2893 45 112 0 chr15 88164210 88164586 -15330388 + BGLII LTR ERVK 4 421 0 2 1257 2727 72 10 11 chr15 88166033 88166416 -15328558 + ORR1A0 LTR MaLR 1 374 0 2 1257 2442 122 54 8 chr15 88175425 88175798 -15319176 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 2 1257 362 375 17 45 chr15 88178136 88178312 -15316662 - MLT1F LTR MaLR -237 311 141 2 1257 2013 156 127 8 chr15 88186162 88186531 -15308443 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 2 1257 501 147 8 37 chr15 88187021 88187123 -15307851 - MTC LTR MaLR -8 413 278 2 1257 518 304 12 30 chr15 88187609 88187775 -15307199 + MTC LTR MaLR 12 174 -247 2 1257 1899 145 26 13 chr15 88187781 88188088 -15306886 + ORR1A3 LTR MaLR 16 326 0 2 1257 643 273 92 42 chr15 88188097 88188357 -15306617 - MLT1B LTR MaLR -9 381 109 2 1257 1187 264 22 99 chr15 88190361 88190757 -15304217 - MTE2a LTR MaLR -13 366 2 2 1257 459 302 237 10 chr15 88192880 88193184 -15301790 - MLT1A LTR MaLR -1 373 1 2 1257 321 283 126 169 chr15 88194013 88194379 -15300595 - MLT1C LTR MaLR -16 451 25 2 1257 278 265 44 0 chr15 88201356 88201424 -15293550 + MER92C LTR ERV1 270 340 -214 3 1257 402 321 100 31 chr15 88204091 88204351 -15290623 - MLT2C2 LTR ERVL -175 289 12 3 1257 626 94 85 25 chr15 88209608 88209740 -15285234 - ORR1A2 LTR MaLR -241 133 1 3 1258 684 265 146 5 chr15 88214405 88214617 -15280357 + ORR1D2 LTR MaLR 103 344 -26 3 1258 1356 176 153 35 chr15 88215710 88216082 -15278892 + MTD LTR MaLR 2 417 -2 3 1258 2953 43 0 3 chr15 88218262 88218609 -15276365 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1258 14435 47 7 2 chr15 88218609 88220390 -15274584 + ORR1A0-int LTR MaLR 1 1790 -2 3 1258 2636 29 0 3 chr15 88220390 88220702 -15274272 + ORR1A0 LTR MaLR 36 346 0 3 1258 339 197 28 0 chr15 88224497 88224568 -15270406 - MLT1I LTR MaLR 0 411 339 3 1258 3111 26 0 0 chr15 88225812 88226158 -15268816 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1258 1053 251 132 20 chr15 88236133 88236474 -15258500 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 3 1258 255 277 84 92 chr15 88238335 88238527 -15256447 + RMER12 LTR ERVK 771 964 -358 3 1258 255 277 84 92 chr15 88238740 88238809 -15256165 + RMER12 LTR ERVK 965 1030 -292 3 1258 1513 252 40 43 chr15 88240025 88240191 -15254783 + MTEa LTR MaLR 6 162 -217 3 1258 1513 252 40 43 chr15 88240448 88240625 -15254349 + MTEa LTR MaLR 163 338 -41 3 1258 1513 252 40 43 chr15 88240719 88240747 -15254227 + MTEa LTR MaLR 339 377 -2 3 1258 2325 178 5 28 chr15 88241736 88242158 -15252816 - MTD LTR MaLR -7 412 1 3 1258 1740 166 116 77 chr15 88242344 88242723 -15252251 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1258 1954 211 30 5 chr15 88243075 88243470 -15251504 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 1258 814 216 9 31 chr15 88244501 88244749 -15250225 + ORR1D1 LTR MaLR 82 379 0 3 1258 702 278 94 94 chr15 88250525 88250963 -15244011 + RMER15 LTR ERVL 1 566 -9 3 1258 858 272 92 23 chr15 88251877 88252137 -15242837 - ORR1E LTR MaLR -2 357 80 3 1258 414 253 11 0 chr15 88252821 88252912 -15242062 - ORR1E LTR MaLR -267 92 1 3 1258 3459 285 83 44 chr15 88252912 88254276 -15240698 - ORR1E-int LTR MaLR -53 1527 6 3 1258 493 169 10 15 chr15 88254279 88254377 -15240597 - ORR1E LTR MaLR 0 379 268 3 1258 1273 240 75 35 chr15 88254510 88254911 -15240063 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 3 1258 1290 258 72 61 chr15 88262884 88263243 -15231731 - MTE2b LTR MaLR -14 365 3 3 1258 504 215 58 13 chr15 88264074 88264215 -15230759 - MTD LTR MaLR 0 419 265 3 1258 351 333 72 26 chr15 88268305 88268499 -15226475 - MER89 LTR ERV1 -280 279 77 3 1258 1903 201 57 18 chr15 88269648 88270049 -15224925 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 1258 1181 275 26 60 chr15 88270402 88270750 -15224224 + MTE2a LTR MaLR 43 378 -1 3 1258 855 290 43 82 chr15 88271413 88271758 -15223216 + RLTR26 LTR ERVK 12 410 -217 3 1258 645 274 54 30 chr15 88274869 88275118 -15219856 + RLTR15 LTR ERVK 41 296 -63 3 1258 645 274 54 30 chr15 88275143 88275190 -15219784 + RLTR15 LTR ERVK 297 343 -16 3 1258 631 293 131 29 chr15 88275770 88276149 -15218825 - MLT2B4 LTR ERVL -79 488 1 3 1258 1355 191 191 152 chr15 88277235 88277272 -15217702 - MT2A LTR ERVL 0 533 466 3 1258 1355 191 191 152 chr15 88277326 88277801 -15217173 - MT2A LTR ERVL -68 465 1 3 1258 1050 126 157 57 chr15 88282235 88282445 -15212529 + MT2A LTR ERVL 1 231 -302 4 1258 490 271 39 59 chr15 88282570 88282723 -15212251 - MT2A LTR ERVL -69 464 315 4 1258 802 139 102 0 chr15 88282726 88282863 -15212111 + MTB_Mm LTR MaLR 256 406 -1 4 1258 1992 148 9 12 chr15 88283800 88284122 -15210852 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 4 1258 274 275 35 115 chr15 88285869 88286035 -15208939 + MLT1A0 LTR MaLR 243 369 -21 4 1258 1624 217 104 33 chr15 88287335 88287363 -15207611 + RMER5 LTR ERV1 13 40 -494 4 1258 1624 217 104 33 chr15 88287399 88287817 -15207157 + RMER5 LTR ERV1 41 490 -44 4 1258 2292 198 87 8 chr15 88287817 88288312 -15206662 - RMER5 LTR ERV1 0 534 1 4 1258 1586 247 58 23 chr15 88288880 88289277 -15205697 - MTD LTR MaLR -8 411 1 4 1258 1641 237 46 93 chr15 88289277 88289894 -15205080 - MTD-int LTR MaLR -95 1163 570 4 1258 770 201 14 0 chr15 88290203 88290347 -15204627 + ORR1D1 LTR MaLR 11 156 -218 4 1258 973 239 45 5 chr15 88290529 88290752 -15204222 + ORR1D1 LTR MaLR 143 374 0 4 1258 1453 231 55 53 chr15 88291413 88291774 -15203200 - MTD LTR MaLR -14 405 44 4 1258 1252 253 119 57 chr15 88292675 88293061 -15201913 - MTD LTR MaLR -9 410 1 4 1258 924 108 21 86 chr15 88297142 88297182 -15197792 + RMER17C LTR ERVK 1 40 -370 4 1258 4557 8 0 0 chr15 88297182 88297675 -15197299 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 1258 924 108 21 86 chr15 88297675 88297828 -15197146 + RMER17C LTR ERVK 41 180 -230 4 1258 924 189 63 69 chr15 88297927 88298059 -15196915 + RMER17C LTR ERVK 181 410 0 4 1258 915 231 11 11 chr15 88310945 88311120 -15183854 + MTD LTR MaLR 1 175 -244 4 1258 787 169 17 18 chr15 88311129 88311300 -15183674 - MTD LTR MaLR -108 311 129 4 1258 534 309 101 72 chr15 88312562 88312938 -15182036 - MLT1B LTR MaLR -1 389 3 4 1258 226 379 42 25 chr15 88313855 88313974 -15181000 - MLT1L LTR MaLR -335 275 155 4 1258 3370 40 2 19 chr15 88315147 88315558 -15179416 + MTB_Mm LTR MaLR 4 407 0 4 1258 850 260 70 59 chr15 88317090 88317376 -15177598 + RLTR20D LTR ERVK 3 291 -277 4 1258 366 280 106 20 chr15 88317350 88317414 -15177560 + RLTR20D LTR ERVK 401 478 -100 4 1258 366 292 102 26 chr15 88317459 88317553 -15177421 + RLTR20D LTR ERVK 464 567 -1 4 1258 231 248 221 41 chr15 88320026 88320148 -15174826 + MLT1A1 LTR MaLR 63 206 -261 4 1258 3243 53 2 8 chr15 88324279 88324677 -15170297 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1258 339 325 243 0 chr15 88326847 88327012 -15167962 + MLT1A1 LTR MaLR 189 393 -15 4 1258 1682 172 71 18 chr15 88329531 88329869 -15165105 + RLTR15 LTR ERVK 4 359 0 4 1258 306 172 69 0 chr15 88330068 88330126 -15164848 + MTD LTR MaLR 1 62 -317 4 1258 3378 30 2 38 chr15 88330132 88330554 -15164420 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1258 1551 201 70 17 chr15 88331384 88331739 -15163235 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 4 1258 520 293 126 26 chr15 88331939 88332265 -15162709 - MLT1C LTR MaLR -79 388 18 4 1258 469 268 105 30 chr15 88332910 88333204 -15161770 + MLT2B4 LTR ERVL 15 338 -59 4 1258 1314 236 119 35 chr15 88333512 88333881 -15161093 + MTD LTR MaLR 19 418 -1 4 1258 2025 120 12 138 chr15 88336933 88337338 -15157636 + ORR1B1 LTR MaLR 41 394 0 4 1258 1007 252 101 22 chr15 88341969 88342237 -15152737 - MTD LTR MaLR -14 405 117 4 1259 1203 215 58 83 chr15 88343152 88343449 -15151525 - RMER4B LTR ERVK -9 576 256 4 1259 1203 227 81 72 chr15 88343485 88343716 -15151258 - RMER4B LTR ERVK -330 255 18 4 1259 285 266 16 0 chr15 88344792 88344856 -15150118 + MTEa LTR MaLR 238 302 -77 5 1259 2579 144 10 20 chr15 88345437 88345835 -15149139 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1259 2560 42 42 15 chr15 88353078 88353413 -15141561 + MTB LTR MaLR 1 344 -56 5 1259 358 65 0 0 chr15 88353534 88353578 -15141396 + MTB LTR MaLR 364 407 0 5 1259 1443 235 97 6 chr15 88354924 88355275 -15139699 + MTD LTR MaLR 22 404 -15 5 1259 495 127 0 14 chr15 88357539 88357611 -15137363 + ORR1B2 LTR MaLR 2 72 -295 5 1259 889 148 7 21 chr15 88360229 88360374 -15134600 + ORR1B2 LTR MaLR 55 197 -170 5 1259 1369 260 48 3 chr15 88360376 88360685 -15134289 + MTE2b LTR MaLR 19 341 -38 5 1259 3085 297 94 35 chr15 88360709 88361996 -15132978 + MTE-int LTR MaLR 3 1484 -96 5 1259 842 302 94 21 chr15 88368686 88369017 -15125957 + MER54A LTR ERVL 2 356 -545 5 1259 241 247 92 169 chr15 88369885 88370163 -15124811 - ORR1C2 LTR MaLR -103 281 21 5 1259 3268 36 39 0 chr15 88372176 88372561 -15122413 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1259 465 276 108 23 chr15 88373944 88374139 -15120835 + MLT1A LTR MaLR 37 250 -140 5 1259 2128 90 21 58 chr15 88374275 88374605 -15120369 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 1 5 1259 2588 161 34 7 chr15 88375984 88376423 -15118551 + RMER4A LTR ERVK 1 451 -15 5 1259 1352 150 28 79 chr15 88376462 88376715 -15118259 - ORR1D1 LTR MaLR -132 242 3 5 1259 440 165 109 40 chr15 88376708 88376740 -15118234 + MTE2a LTR MaLR 272 303 -76 5 1259 440 165 109 40 chr15 88376764 88376832 -15118142 + MTE2a LTR MaLR 304 379 0 5 1259 4183 94 5 11 chr15 88378997 88379567 -15115407 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 5 1259 509 175 89 184 chr15 88381556 88381670 -15113304 + ORR1D2 LTR MaLR 169 276 -94 5 1259 509 175 89 184 chr15 88381853 88381906 -15113068 + ORR1D2 LTR MaLR 277 320 -50 5 1259 276 282 80 94 chr15 88387745 88388097 -15106877 + RMER10A LTR ERVL 29 375 -67 5 1259 228 297 79 42 chr15 88388121 88388311 -15106663 + RMER10A LTR ERVL 216 412 -30 5 1259 2196 142 66 14 chr15 88388650 88389014 -15105960 - ORR1C2 LTR MaLR -1 383 1 5 1259 2429 69 12 51 chr15 88389083 88389419 -15105555 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 5 5 1259 386 297 135 17 chr15 88389442 88389620 -15105354 + RMER15 LTR ERVL 372 570 -5 5 1259 1308 257 27 27 chr15 88394462 88394812 -15100162 + ORR1D2 LTR MaLR 6 350 -9 5 1259 376 250 109 68 chr15 88396195 88396395 -15098579 - MLT1C LTR MaLR -269 236 18 5 1259 3163 58 28 13 chr15 88398047 88398490 -15096484 + RLTR10C LTR ERVK 1 418 -18 5 1259 1146 214 170 54 chr15 88402122 88402457 -15092517 - MTE2a LTR MaLR -1 378 5 5 1259 423 327 32 19 chr15 88402479 88402635 -15092339 - MTD LTR MaLR -261 158 1 5 1259 2516 101 0 0 chr15 88403211 88403538 -15091436 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1259 2335 72 6 62 chr15 88409523 88409861 -15085113 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 6 1259 317 267 119 42 chr15 88413200 88413368 -15081606 + ORR1D2 LTR MaLR 3 183 -187 6 1259 1098 153 20 26 chr15 88413507 88413702 -15081272 + ORR1C2 LTR MaLR 1 194 -190 6 1259 1046 166 28 6 chr15 88413884 88414060 -15080914 + ORR1C2 LTR MaLR 192 371 -13 6 1259 863 296 105 20 chr15 88418769 88419111 -15075863 + RMER5 LTR ERV1 80 450 -84 6 1259 3301 52 3 0 chr15 88419521 88419905 -15075069 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 6 1259 2966 150 10 19 chr15 88419905 88420582 -15074392 + IAPEy-int LTR ERVK 1 1058 -6455 6 1259 21237 43 8 4 chr15 88420582 88423280 -15071694 + IAPEy-int LTR ERVK 4804 7511 -2 6 1259 3290 55 3 0 chr15 88423282 88423666 -15071308 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 6 1259 297 253 61 78 chr15 88426447 88426667 -15068307 - RMER10B LTR ERVL -135 307 76 6 1259 254 214 117 48 chr15 88427152 88427182 -15067792 + MT2A LTR ERVL 4 111 -420 6 1259 340 155 183 0 chr15 88427182 88427253 -15067721 + MTD LTR MaLR 58 141 -278 6 1259 2435 124 83 20 chr15 88427255 88427651 -15067323 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1259 599 211 96 64 chr15 88427654 88427841 -15067133 + MTD LTR MaLR 187 379 -40 6 1259 338 264 124 139 chr15 88427806 88428000 -15066974 - RLTR24 LTR ERV1 -18 511 321 6 1259 325 222 54 32 chr15 88428158 88428251 -15066723 - RLTR24 LTR ERV1 -434 95 1 6 1259 331 167 185 22 chr15 88428251 88428322 -15066652 + MTD LTR MaLR 333 418 -1 6 1259 2944 99 5 15 chr15 88432672 88433080 -15061894 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 4 6 1259 748 216 364 4 chr15 88435908 88436175 -15058799 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 3 6 1259 635 276 131 40 chr15 88437557 88437878 -15057096 + ORR1E LTR MaLR 10 359 0 6 1259 1612 107 28 16 chr15 88442678 88442925 -15052049 + RMER4B LTR ERVK 1 250 -335 6 1259 413 187 25 116 chr15 88445727 88445848 -15049126 + MT2B LTR ERVL 147 256 -345 6 1259 467 214 61 0 chr15 88446747 88446845 -15048129 + MTEa LTR MaLR 1 104 -275 6 1259 3055 42 46 16 chr15 88450098 88450486 -15044488 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1259 287 293 108 45 chr15 88450538 88450695 -15044279 - ORR1E LTR MaLR -120 239 73 6 1259 2632 139 15 83 chr15 88455260 88455739 -15039235 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 6 1259 2088 152 8 74 chr15 88457393 88457783 -15037191 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 31 6 1259 388 279 89 117 chr15 88458529 88458878 -15036096 + MTEa LTR MaLR 1 379 0 6 1259 1915 219 133 17 chr15 88462142 88462616 -15032358 - RMER5 LTR ERV1 -5 529 1 7 1259 1353 224 115 65 chr15 88467537 88467919 -15027055 - MTD LTR MaLR 0 419 19 7 1259 260 259 35 47 chr15 88468377 88468462 -15026512 - MLT2B4 LTR ERVL -469 87 4 7 1260 363 257 70 57 chr15 88473817 88473974 -15021000 - RMER17C LTR ERVK -68 342 184 7 1260 1999 131 9 100 chr15 88476422 88476873 -15018101 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 7 1260 273 250 118 52 chr15 88478293 88478428 -15016546 - ORR1E LTR MaLR -162 197 54 7 1260 785 236 28 22 chr15 88484754 88484932 -15010042 + MTE2b LTR MaLR 1 179 -200 7 1260 396 299 89 6 chr15 88491248 88491406 -15003568 - RMER15 LTR ERVL 0 575 405 7 1260 469 240 194 7 chr15 88493976 88494131 -15000843 - MTEb LTR MaLR -168 211 28 7 1260 235 260 120 40 chr15 88497928 88498028 -14996946 + MLT1A0 LTR MaLR 44 151 -214 7 1260 719 93 9 0 chr15 88502944 88503052 -14991922 + ORR1C2 LTR MaLR 1 109 -275 1 1260 1133 127 133 122 chr15 88503495 88503601 -14991373 + ORR1C2 LTR MaLR 97 185 -199 1 1260 1133 127 133 122 chr15 88503660 88503823 -14991151 + ORR1C2 LTR MaLR 186 369 -15 1 1260 238 237 120 78 chr15 88505250 88505392 -14989582 + MLT1E2 LTR MaLR 304 451 -176 1 1260 448 228 74 4 chr15 88505419 88505543 -14989431 - MTD LTR MaLR -2 377 238 1 1260 407 305 48 16 chr15 88505580 88505726 -14989248 - MTD LTR MaLR -127 294 145 1 1260 2177 123 75 3 chr15 88505726 88506061 -14988913 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 2 1260 578 218 38 64 chr15 88506062 88506219 -14988755 - MTD LTR MaLR -263 156 4 1 1260 1715 240 36 28 chr15 88509272 88509765 -14985209 - RLTR16 LTR ERVK -4 501 5 2 1260 3405 28 8 8 chr15 88512048 88512444 -14982530 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1260 3779 47 14 22 chr15 88512529 88513029 -14981945 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 69 3 1260 726 142 123 45 chr15 88513566 88513721 -14981253 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 227 3 1260 231 260 200 40 chr15 88514483 88514583 -14980391 - MLT1J LTR MaLR -154 358 243 3 1260 2685 214 131 22 chr15 88528736 88529430 -14965544 + ORR1D1-int LTR MaLR 601 1370 0 5 1260 1574 188 33 93 chr15 88529430 88529828 -14965146 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 5 1260 1923 107 76 0 chr15 88538804 88539095 -14955879 + ORR1A2 LTR MaLR 7 319 -8 6 1260 6182 155 187 104 chr15 88539098 88540909 -14954065 + ORR1A2-int LTR MaLR 3 1963 0 6 1260 2044 92 114 14 chr15 88540909 88541206 -14953768 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1260 958 103 38 13 chr15 88546455 88546612 -14948362 + ORR1A4 LTR MaLR 169 329 0 7 1260 256 241 73 97 chr15 88553381 88553505 -14941469 + MT2B LTR ERVL 120 240 -361 8 1260 373 161 33 110 chr15 88566327 88566418 -14928556 - MT2B LTR ERVL -347 254 171 1 1260 647 214 210 3 chr15 88568997 88569297 -14925677 - MTE2b LTR MaLR 0 379 18 1 1260 435 303 63 47 chr15 88570554 88570807 -14924167 + LTR37B LTR ERV1 198 454 -14 1 1260 352 360 54 54 chr15 88570989 88571250 -14923724 + MLT1B LTR MaLR 78 338 -52 1 1260 618 239 42 78 chr15 88572660 88572851 -14922123 + RLTR23 LTR ERV1 247 430 0 1 1260 710 77 13 8 chr15 88574242 88574346 -14920628 - MT2B2 LTR ERVL -424 109 3 1 1260 807 192 68 28 chr15 88575387 88575564 -14919410 + ORR1C2 LTR MaLR 185 368 -16 1 1260 304 127 127 0 chr15 88575677 88575732 -14919242 + ORR1D1 LTR MaLR 312 373 -1 1 1260 588 291 73 62 chr15 88575760 88576020 -14918954 + MLT2D LTR ERVL 91 353 -61 1 1260 739 230 163 70 chr15 88576510 88576879 -14918095 + RMER10A LTR ERVL 27 429 -13 1 1260 241 203 33 17 chr15 88583333 88583393 -14911581 + MTD LTR MaLR 1 61 -358 1 1260 1153 196 150 19 chr15 88584200 88584460 -14910514 + MTD LTR MaLR 116 409 -10 1 1260 402 278 214 24 chr15 88601623 88601833 -14893141 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 280 2 1260 347 271 219 20 chr15 88602555 88602751 -14892223 - RLTR14-int LTR ERV1 -150 5167 4933 2 157 1873 153 162 3 chr15 88604406 88604746 -14890228 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1261 1265 211 156 15 chr15 88604751 88605079 -14889895 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 2 1261 1136 167 183 65 chr15 88608067 88608158 -14886816 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 296 2 1261 1136 167 183 65 chr15 88608305 88608552 -14886422 - RLTR14 LTR ERV1 -87 295 4 2 1261 243 97 0 0 chr15 88615216 88615247 -14879727 + RMER16 LTR ERVK 418 448 -85 2 1261 233 306 34 51 chr15 88616014 88616131 -14878843 - RLTR13D3 LTR ERVK 0 929 815 2 1261 313 218 155 20 chr15 88616794 88616899 -14878075 - RLTR13D3 LTR ERVK -862 121 1 2 1261 1836 164 66 0 chr15 88617411 88617715 -14877259 - MTC LTR MaLR -2 419 96 2 1261 681 140 19 0 chr15 88617826 88617933 -14877041 - MTC LTR MaLR -312 109 1 2 1261 292 93 23 0 chr15 88617935 88617978 -14876996 - RLTR18B LTR ERVK -244 268 225 2 1261 407 229 105 0 chr15 88618002 88618107 -14876867 - RLTR18B LTR ERVK -357 155 40 2 1261 356 224 58 23 chr15 88620388 88620475 -14874499 + MT2B LTR ERVL 168 257 -344 2 1261 2140 126 22 0 chr15 88622554 88622872 -14872102 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 2 1261 594 171 69 54 chr15 88623650 88623780 -14871194 + MT2B LTR ERVL 1 132 -469 2 1261 969 206 21 86 chr15 88623774 88623936 -14871038 + MT2B LTR ERVL 384 546 -55 2 1261 969 206 21 86 chr15 88623981 88624051 -14870923 + MT2B LTR ERVL 547 600 -1 2 1261 954 249 155 33 chr15 88624118 88624421 -14870553 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 35 2 1261 1564 139 24 119 chr15 88624857 88625125 -14869849 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 130 2 1261 1564 139 24 119 chr15 88625317 88625351 -14869623 - ORR1C2 LTR MaLR -255 129 113 2 1261 3898 125 98 157 chr15 88625351 88626145 -14868829 - RLTR13B3 LTR ERVK 0 929 206 2 1261 3898 125 98 157 chr15 88626334 88626526 -14868448 - RLTR13B3 LTR ERVK -724 205 1 2 1261 1564 139 24 119 chr15 88626526 88626557 -14868417 - ORR1C2 LTR MaLR -272 112 82 2 1261 1098 230 100 33 chr15 88627322 88627507 -14867467 - MTD LTR MaLR -2 417 213 2 1261 1098 230 100 33 chr15 88627693 88627777 -14867197 - MTD LTR MaLR -207 212 130 2 1261 528 188 153 23 chr15 88628535 88628661 -14866313 - MTD LTR MaLR -276 143 1 2 1261 520 160 102 23 chr15 88628663 88628791 -14866183 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 1119 2 1261 471 250 301 25 chr15 88629011 88629290 -14865684 - MTD-int LTR MaLR -105 1153 798 2 1261 733 216 22 0 chr15 88629277 88629416 -14865558 - MTD LTR MaLR -259 160 19 2 1261 1429 164 164 112 chr15 88631553 88631938 -14863036 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 3 1261 238 386 19 50 chr15 88633826 88633987 -14860987 + RMER4A LTR ERVK 8 163 -303 3 1261 295 184 0 0 chr15 88640608 88640657 -14854317 - ORR1E LTR MaLR -282 77 29 3 1261 1084 214 5 10 chr15 88644166 88644369 -14850605 + ORR1D1 LTR MaLR 1 202 -172 3 1261 239 79 0 73 chr15 88644543 88644584 -14850390 + ORR1D1 LTR MaLR 172 209 -175 3 1261 977 151 108 15 chr15 88644612 88644807 -14850167 + ORR1D1 LTR MaLR 172 384 0 3 1261 1031 225 136 15 chr15 88646796 88647170 -14847804 + MT2A LTR ERVL 1 543 -58 3 1261 1732 166 51 22 chr15 88647377 88647692 -14847282 - MTD LTR MaLR -1 418 95 3 1261 286 239 121 89 chr15 88656144 88656268 -14838706 - MLT1B LTR MaLR -174 216 89 3 1261 261 167 91 58 chr15 88671587 88671708 -14823266 + RMER17A2 LTR ERVK 247 371 -535 3 1261 1799 185 40 20 chr15 88671790 88672192 -14822782 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 3 1261 321 300 92 0 chr15 88674676 88674796 -14820178 + MLT1F2 LTR MaLR 374 504 -56 3 1261 2130 145 158 27 chr15 88676350 88676755 -14818219 + RMER6B LTR ERVK 2 459 -2 3 1261 298 205 75 25 chr15 88684303 88684383 -14810591 + RLTR25B LTR ERVK 426 509 -519 4 1261 401 276 92 69 chr15 88698341 88698559 -14796415 - ORR1E LTR MaLR -129 230 8 4 1261 1068 201 95 154 chr15 88699151 88699213 -14795761 + RMER10B LTR ERVL 1 60 -338 4 1261 3530 50 28 12 chr15 88699213 88699642 -14795332 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 4 1261 1068 201 95 154 chr15 88699642 88700002 -14794972 + RMER10B LTR ERVL 61 398 0 4 1261 253 132 9 276 chr15 88701661 88701707 -14793267 - MTE2b LTR MaLR 0 379 336 4 1261 253 132 9 276 chr15 88701857 88701915 -14793059 - MTE2b LTR MaLR -44 335 303 4 1261 718 271 145 77 chr15 88702727 88702934 -14792040 - MTD LTR MaLR -14 405 198 4 1261 718 290 86 129 chr15 88703130 88703200 -14791774 - MTD LTR MaLR -222 197 149 4 1261 1890 139 149 64 chr15 88703200 88703623 -14791351 + RMER6B LTR ERVK 1 459 -2 4 1261 718 290 86 129 chr15 88703623 88703776 -14791198 - MTD LTR MaLR -271 148 5 4 1261 2197 116 96 0 chr15 88710635 88710980 -14783994 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 4 1261 415 330 135 58 chr15 88720160 88720537 -14774437 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 1 4 1261 1079 207 124 84 chr15 88726654 88726976 -14767998 + MTD LTR MaLR 11 345 -74 4 1261 249 276 44 33 chr15 88730176 88730266 -14764708 + ORR1E LTR MaLR 2 92 -287 4 1261 440 272 105 52 chr15 88730466 88730714 -14764260 + ORR1E LTR MaLR 87 347 -12 4 1261 543 281 99 38 chr15 88732592 88732803 -14762171 + LTR40c LTR ERVL 22 245 -220 4 1261 231 297 63 42 chr15 88732782 88732877 -14762097 + LTR40c LTR ERVL 350 446 -73 4 1262 1114 231 175 13 chr15 88739472 88739538 -14755436 + MTD LTR MaLR 7 110 -309 5 1262 1114 231 175 13 chr15 88739579 88739815 -14755159 + MTD LTR MaLR 111 357 -62 5 1262 237 288 99 64 chr15 88743330 88743501 -14751473 + MLT1C LTR MaLR 34 210 -257 5 1262 2132 141 137 5 chr15 88758551 88758923 -14736051 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1262 266 273 51 13 chr15 88762325 88762403 -14732571 + MER57E2 LTR ERV1 321 401 -1 5 1262 1764 152 172 46 chr15 88767071 88767443 -14727531 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1262 263 321 122 52 chr15 88767789 88768019 -14726955 + MLT1A1 LTR MaLR 155 400 -8 5 1262 345 248 78 11 chr15 88768262 88768412 -14726562 + MLT1E3 LTR MaLR 102 299 -381 5 1262 3150 14 3 0 chr15 88768660 88769005 -14725969 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 5 1262 2154 139 6 15 chr15 88770515 88770844 -14724130 + ORR1B2 LTR MaLR 1 326 -41 5 1262 403 103 0 0 chr15 88770977 88771042 -14723932 + ORR1B2 LTR MaLR 314 394 0 5 1262 1004 256 96 60 chr15 88773335 88773772 -14721202 + RMER5 LTR ERV1 70 522 -12 5 1262 1205 235 82 128 chr15 88774656 88775046 -14719928 - MTE2b LTR MaLR -5 374 3 5 1262 1317 232 239 11 chr15 88777160 88777609 -14717365 + MTEa-int LTR MaLR 243 786 -472 5 1262 420 221 22 29 chr15 88779638 88779778 -14715196 + MTEa LTR MaLR 211 367 -12 5 1262 756 268 93 54 chr15 88781630 88781962 -14713012 + RLTR15 LTR ERVK 1 345 -14 5 1262 2608 61 0 0 chr15 88781979 88782290 -14712684 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 1262 2171 109 59 18 chr15 88795177 88795514 -14699460 + ORR1B1 LTR MaLR 42 392 -2 6 1262 743 297 77 83 chr15 88798056 88798523 -14696451 + RMER5 LTR ERV1 43 506 -28 6 1262 397 152 42 118 chr15 88799178 88799195 -14695779 + MT2B LTR ERVL 151 158 -443 6 1262 273 360 25 34 chr15 88799438 88799556 -14695418 + MER74A LTR ERVL 1 117 -441 6 1262 837 322 102 0 chr15 88799593 88799916 -14695058 + MER74A LTR ERVL 203 558 0 6 1262 2022 210 25 38 chr15 88802125 88802570 -14692404 - MT2A LTR ERVL -19 514 76 6 1262 573 110 59 10 chr15 88802749 88802850 -14692124 - MT2A LTR ERVL -427 106 1 6 1262 279 265 50 75 chr15 88807839 88808039 -14686935 + ORR1B1-int LTR MaLR 560 754 -755 6 1262 2850 72 63 5 chr15 88814641 88815019 -14679955 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1262 980 261 40 12 chr15 88820126 88820374 -14674600 + RLTR30 LTR ERV1 1 255 -124 6 1262 742 287 33 65 chr15 88821383 88821659 -14673315 + MTEa LTR MaLR 111 377 -2 6 1262 457 261 115 0 chr15 88821677 88821834 -14673140 + MTEa-int LTR MaLR 9 183 -1397 6 1262 1686 275 156 19 chr15 88821903 88823003 -14671971 + MTEa-int LTR MaLR 290 1575 -5 6 1262 982 227 169 72 chr15 88823008 88823340 -14671634 + MTEa LTR MaLR 6 369 -10 6 1262 239 160 0 22 chr15 88828905 88828963 -14666011 - ORR1D2 LTR MaLR 0 379 323 6 1262 301 262 0 0 chr15 88828960 88829021 -14665953 - MTE2b LTR MaLR -318 61 1 6 1262 1596 178 85 13 chr15 88834569 88834887 -14660087 - MTB_Mm LTR MaLR -66 341 1 6 1262 1073 238 112 8 chr15 88836887 88837154 -14657820 - MTD LTR MaLR -2 417 123 7 1262 282 221 33 44 chr15 88841354 88841444 -14653530 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 318 7 1262 262 333 46 86 chr15 88844052 88844145 -14650829 - RMER15 LTR ERVL -121 454 366 7 1262 262 333 46 86 chr15 88844252 88844332 -14650642 - RMER15 LTR ERVL -210 365 288 7 1262 894 275 116 60 chr15 88847202 88847632 -14647342 + MLT2B4 LTR ERVL 1 454 -102 7 1262 888 248 103 61 chr15 88856134 88856444 -14638530 - MTEa LTR MaLR -19 360 38 7 1262 769 319 103 0 chr15 88859739 88860059 -14634915 - MER54A LTR ERVL -548 353 1 7 157 3352 83 6 37 chr15 88866798 88867288 -14627686 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 1263 15570 40 5 3 chr15 88867288 88869110 -14625864 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4656 7 1263 1883 98 0 0 chr15 88869109 88869355 -14625619 - IAPEz-int LTR ERVK -5183 2497 2252 7 1263 985 67 0 0 chr15 88869356 88869475 -14625499 - IAPEz-int LTR ERVK -5004 1477 1359 7 1263 3561 52 17 31 chr15 88869475 88870190 -14624784 - IAPEz-int LTR ERVK -5819 662 35 7 1263 3374 81 6 37 chr15 88870200 88870690 -14624284 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 1263 1845 240 96 38 chr15 88876645 88877177 -14617797 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 1 7 1263 405 207 338 34 chr15 88882198 88882375 -14612599 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 140 7 1263 517 294 73 11 chr15 88883044 88883223 -14611751 - ORR1E-int LTR MaLR -1377 203 14 7 1263 589 292 86 80 chr15 88883232 88883545 -14611429 - ORR1E LTR MaLR -10 349 35 7 1263 353 337 84 45 chr15 88891946 88892164 -14602810 - MLT1D LTR MaLR -27 440 165 7 1263 285 316 63 42 chr15 88893118 88893260 -14601714 + MLT1C LTR MaLR 291 435 -32 7 1263 457 282 83 6 chr15 88894369 88894526 -14600448 - MLT1D LTR MaLR -302 203 35 7 1263 276 284 161 0 chr15 88896446 88896527 -14598447 - ORR1E LTR MaLR -2 377 284 8 1263 637 251 26 7 chr15 88896550 88896722 -14598252 - ORR1E LTR MaLR -220 174 1 8 1263 1790 180 42 66 chr15 88901582 88901963 -14593011 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 8 1263 467 290 179 41 chr15 88902809 88903100 -14591874 - MER74A LTR ERVL -56 502 172 8 1263 485 373 131 16 chr15 88907394 88907707 -14587267 - MLT1A LTR MaLR -7 367 19 8 1263 431 282 115 23 chr15 88914033 88914207 -14580767 - MER77 LTR ERVL -143 464 275 8 1263 344 331 75 19 chr15 88914426 88914586 -14580388 - MER77 LTR ERVL -409 198 30 8 1263 1984 157 78 8 chr15 88938588 88938960 -14556014 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 8 1263 2198 146 88 33 chr15 88943179 88943575 -14551399 + MTD LTR MaLR 2 419 0 8 1263 301 265 14 83 chr15 88944684 88944828 -14550146 - MT2B LTR ERVL -315 286 153 8 1263 293 234 76 93 chr15 88951696 88951814 -14543160 + MT2B2 LTR ERVL 143 258 -326 9 1263 280 281 76 16 chr15 88984706 88984789 -14510185 + MT2B LTR ERVL 154 270 -331 9 1263 1335 162 86 51 chr15 88985019 88985332 -14509642 + ORR1D1 LTR MaLR 8 331 -43 9 1263 2174 162 62 16 chr15 88993952 88994401 -14500573 + RMER4A LTR ERVK 1 585 0 9 1264 703 222 93 32 chr15 89021661 89021880 -14473094 + MTD LTR MaLR 1 213 -183 1 1264 1781 140 76 47 chr15 89032364 89032747 -14462227 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1264 1688 121 142 3 chr15 89033246 89033570 -14461404 - ORR1B1 LTR MaLR -24 370 2 6 1264 1767 185 30 63 chr15 89036661 89037088 -14457886 + RMER10A LTR ERVL 1 413 -29 8 1264 417 333 85 17 chr15 89038635 89038788 -14456186 + LTR41B LTR ERVL 493 656 -102 8 1264 417 333 85 17 chr15 89038934 89039015 -14455959 + LTR41B LTR ERVL 657 743 -15 8 1264 253 321 28 90 chr15 89040683 89040827 -14454147 - LTR41 LTR ERVL -563 205 71 9 1264 226 263 39 13 chr15 89045732 89045809 -14449165 - RMER6B LTR ERVK -15 446 368 1 1264 1531 142 139 36 chr15 89047128 89047465 -14447509 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 1 1264 1434 148 226 88 chr15 89055143 89055611 -14439363 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 1 1264 307 309 322 79 chr15 89056321 89056703 -14438271 - MLT1G1 LTR MaLR 0 591 106 1 1264 244 321 98 82 chr15 89056851 89056879 -14438095 - MLT1G1 LTR MaLR -444 105 77 1 1264 410 278 21 0 chr15 89059740 89059837 -14435137 + MLT1A LTR MaLR 47 145 -229 1 1264 758 167 8 0 chr15 89064066 89064192 -14430782 - RLTR30 LTR ERV1 0 379 253 2 1264 684 166 166 0 chr15 89064224 89064322 -14430652 - RLTR30 LTR ERV1 -210 169 60 2 1264 684 166 166 0 chr15 89064497 89064537 -14430437 - RLTR30 LTR ERV1 -320 59 9 2 1264 1396 176 13 4 chr15 89065941 89066180 -14428794 - ORR1C1 LTR MaLR -11 367 127 2 1264 616 197 36 14 chr15 89066451 89066584 -14428390 - ORR1C1 LTR MaLR -236 138 1 2 1264 374 209 0 147 chr15 89067155 89067284 -14427690 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 2 1264 904 274 42 118 chr15 89067910 89068134 -14426840 - MTE-int LTR MaLR -2 1578 1359 2 1264 904 279 60 118 chr15 89068280 89068458 -14426516 - MTE-int LTR MaLR -222 1358 1030 2 1264 473 319 29 64 chr15 89068663 89068867 -14426107 - MTE-int LTR MaLR -351 1229 1033 2 1264 515 333 17 23 chr15 89069208 89069379 -14425595 - MTE-int LTR MaLR -540 1040 871 2 1264 930 206 142 32 chr15 89069362 89069608 -14425366 - MTC LTR MaLR -8 413 141 2 1264 296 319 198 50 chr15 89069587 89070042 -14424932 - MTE-int LTR MaLR -718 862 341 2 1264 692 359 34 17 chr15 89070912 89071204 -14423770 - MTE-int LTR MaLR -1239 341 45 2 1264 296 287 71 44 chr15 89071771 89071884 -14423090 - MTEa LTR MaLR -13 366 251 2 1264 539 283 40 85 chr15 89071955 89072156 -14422818 - MTEa LTR MaLR -170 209 18 2 1264 591 216 359 18 chr15 89072247 89072538 -14422436 + MTE2b LTR MaLR 8 417 -2 2 1264 378 245 192 6 chr15 89074806 89074962 -14420012 - MTE2b LTR MaLR -194 185 1 2 1264 308 194 178 30 chr15 89076095 89076196 -14418778 - MER34B-int LTR ERV1 -3290 2066 1951 2 1264 1796 158 145 11 chr15 89078647 89079005 -14415969 + MTD LTR MaLR 6 411 -8 2 1264 360 202 48 0 chr15 89079011 89079095 -14415879 + MTD-int LTR MaLR 5 92 -1166 2 1264 1078 142 71 0 chr15 89079096 89079278 -14415696 + MTB_Mm LTR MaLR 1 195 -212 2 1264 886 148 184 16 chr15 89079583 89079768 -14415206 + MTB_Mm LTR MaLR 196 411 -8 2 1264 1375 197 44 20 chr15 89079772 89080067 -14414907 + MTD-int LTR MaLR 89 390 -868 2 1264 589 247 158 31 chr15 89080296 89080492 -14414482 + MTB LTR MaLR 180 400 0 2 1264 1333 228 35 60 chr15 89090622 89090993 -14403981 - MT2B LTR ERVL 0 601 201 2 1264 286 229 205 27 chr15 89091007 89091119 -14403855 - MT2B LTR ERVL -401 132 1 2 1264 1109 231 147 23 chr15 89091363 89091669 -14403305 - ORR1D1 LTR MaLR -28 346 3 2 1264 444 302 152 46 chr15 89093260 89093562 -14401412 - MLT1F2 LTR MaLR -14 546 213 2 1264 259 299 69 0 chr15 89093785 89093872 -14401102 - MLT1F2 LTR MaLR -462 98 6 2 1264 373 298 86 27 chr15 89093920 89094106 -14400868 - MER21B LTR ERV1 -31 832 636 3 1264 3793 161 95 4 chr15 89100965 89101652 -14393322 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4642 5390 -371 3 1264 883 206 67 63 chr15 89101692 89101915 -14393059 - RMER4B LTR ERVK -133 452 229 3 1264 443 98 162 71 chr15 89102310 89102409 -14392565 - RMER4B LTR ERVK -358 108 1 3 1264 1266 109 16 0 chr15 89102409 89102601 -14392373 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5382 5576 -185 3 1264 229 242 0 31 chr15 89123473 89123537 -14371437 + MLT1A1 LTR MaLR 318 379 -29 3 1265 237 176 83 56 chr15 89131873 89131945 -14363029 + RLTR20A LTR ERVK 82 155 -386 3 1265 329 108 73 98 chr15 89149626 89149708 -14345266 + RLTR25B LTR ERVK 430 509 -519 3 1265 332 100 0 0 chr15 89157890 89157940 -14337034 - RLTR15 LTR ERVK -309 50 1 3 1265 547 178 8 48 chr15 89158405 89158529 -14336445 - RLTR18-int LTR ERVK -5 5356 5238 3 1265 930 267 79 75 chr15 89158814 89159308 -14335666 - RLTR18-int LTR ERVK -494 4867 4372 3 1265 792 219 73 50 chr15 89160226 89160295 -14334679 - RLTR18-int LTR ERVK -978 4383 4308 3 1265 792 219 73 50 chr15 89160485 89160674 -14334300 - RLTR18-int LTR ERVK -1054 4307 4119 3 1265 318 176 40 0 chr15 89161590 89161664 -14333310 - RLTR42-int LTR ERVK -3406 2116 2040 4 1265 430 231 12 96 chr15 89161822 89161871 -14333103 - MT2B LTR ERVL -428 156 116 4 1265 282 137 19 19 chr15 89161886 89161938 -14333036 - RLTR42-int LTR ERVK -3674 1848 1797 4 1265 529 188 23 99 chr15 89162886 89162915 -14332059 - RLTR18-int LTR ERVK -2027 3334 3315 3 1265 529 188 23 99 chr15 89163082 89163222 -14331752 - RLTR18-int LTR ERVK -2047 3314 3178 3 1265 906 219 16 10 chr15 89163216 89163410 -14331564 - RLTR18-int LTR ERVK -2359 3002 2808 3 1265 338 268 68 101 chr15 89163401 89163638 -14331336 - RLTR18-int LTR ERVK -2685 2676 2448 3 1265 1914 195 172 91 chr15 89164078 89164648 -14330326 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 1 4 1265 3490 37 107 0 chr15 89168583 89169012 -14325962 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 4 1265 349 250 88 40 chr15 89177469 89177594 -14317380 - MLT1D LTR MaLR -331 174 44 4 1265 982 237 256 9 chr15 89197573 89197913 -14297061 - RMER15-int LTR ERVL -3624 1375 952 5 1265 1681 274 91 18 chr15 89198150 89198976 -14295998 - RMER15-int LTR ERVL -4108 891 6 5 1265 857 242 125 21 chr15 89199041 89199328 -14295646 - RMER15 LTR ERVL -232 343 27 5 1265 601 151 58 12 chr15 89222275 89222397 -14272577 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 240 5 1265 520 323 74 10 chr15 89223217 89223420 -14271554 + MLT1F1 LTR MaLR 309 524 -45 5 1265 247 360 23 23 chr15 89223465 89223593 -14271381 + MLT1F1-int LTR MaLR 14 141 -1348 5 1265 356 269 109 18 chr15 89228254 89228364 -14266610 + MTD LTR MaLR 1 120 -299 5 1265 1103 214 88 48 chr15 89229104 89229354 -14265620 + MTD LTR MaLR 121 380 -39 5 1265 1088 253 117 63 chr15 89231025 89231375 -14263599 - MTE-int LTR MaLR -521 1059 691 5 1265 1160 239 131 17 chr15 89231380 89231678 -14263296 - MTE-int LTR MaLR -1174 406 75 5 1265 1048 198 33 269 chr15 89232768 89233258 -14261716 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 5 1265 2164 174 81 3 chr15 89234436 89234821 -14260153 + MTD LTR MaLR 2 416 -3 5 1265 1686 218 75 32 chr15 89236190 89236631 -14258343 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 460 -67 5 1265 2159 116 57 60 chr15 89237014 89237399 -14257575 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 5 1265 4221 201 148 75 chr15 89237399 89238374 -14256600 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 323 5 1265 4221 201 148 75 chr15 89238415 89238563 -14256411 - ORR1C2-int LTR MaLR -1048 322 167 5 1265 4221 201 148 75 chr15 89238760 89238907 -14256067 - ORR1C2-int LTR MaLR -1204 166 1 5 1265 1853 150 93 52 chr15 89238909 89239275 -14255699 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 2 5 1265 372 245 67 84 chr15 89239654 89239832 -14255142 + MT2B LTR ERVL 104 278 -323 6 1265 4335 167 72 41 chr15 89242941 89243873 -14251101 + RLTR25B LTR ERVK 68 1028 0 6 1265 505 245 87 47 chr15 89249908 89250108 -14244866 + RLTR9E LTR ERVK 200 383 0 6 1266 226 67 0 0 chr15 89264379 89264409 -14230565 + ORR1C2 LTR MaLR 1 30 -354 6 1266 420 120 0 0 chr15 89264604 89264672 -14230302 + ORR1C2 LTR MaLR 13 80 -298 6 1266 271 289 0 0 chr15 89265961 89266044 -14228930 + MYSERV6-int LTR ERVK 819 901 -8058 6 1266 1295 286 69 100 chr15 89266055 89266201 -14228773 + MYSERV-int LTR ERVK 3775 3906 -2644 6 1266 2065 181 126 26 chr15 89266201 89266655 -14228319 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 6 1266 1295 286 69 100 chr15 89266655 89266835 -14228139 + MYSERV-int LTR ERVK 3907 4080 -2470 6 1266 1295 286 69 100 chr15 89266982 89267412 -14227562 + MYSERV-int LTR ERVK 4081 4508 -2042 6 1266 562 300 57 57 chr15 89268819 89269187 -14225787 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 248 615 -1711 6 1266 1194 186 123 0 chr15 89269197 89269433 -14225541 + ORR1B1 LTR MaLR 1 265 -129 6 1266 3902 134 11 101 chr15 89269430 89270210 -14224764 + RMER6A LTR ERVK 47 756 0 6 1266 912 157 7 0 chr15 89270210 89270350 -14224624 + ORR1A4 LTR MaLR 189 329 0 6 1266 353 239 11 11 chr15 89270394 89270483 -14224491 + MYSERV16_I-int LTR ERVK 678 766 -1560 6 1266 226 302 0 16 chr15 89270492 89270556 -14224418 + RMER4B LTR ERVK 373 435 -150 6 1266 2428 186 40 61 chr15 89270594 89271121 -14223853 - RMER20A LTR ERVK 0 516 1 6 1266 418 313 56 88 chr15 89271121 89271313 -14223661 + RMER4A LTR ERVK 271 454 -12 6 1266 2586 199 118 51 chr15 89271314 89272179 -14222795 + MYSERV6-int LTR ERVK 7787 8709 -250 6 1266 1076 152 45 79 chr15 89272396 89272661 -14222313 + MYSERV6-int LTR ERVK 8704 8959 0 6 1266 270 262 79 20 chr15 89272662 89272814 -14222160 + RLTR15 LTR ERVK 1 161 -198 6 1266 507 287 25 83 chr15 89272781 89273058 -14221916 + RLTR15 LTR ERVK 78 338 -21 6 1266 479 325 121 29 chr15 89273258 89273578 -14221396 - RMER20B LTR ERVK -142 485 106 6 1266 1847 157 117 8 chr15 89274542 89274901 -14220073 + MTD LTR MaLR 14 411 -8 6 1266 558 343 72 34 chr15 89276588 89276881 -14218093 + ORR1E LTR MaLR 9 312 -47 6 1266 2657 63 68 5 chr15 89279221 89279604 -14215370 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1266 660 200 49 49 chr15 89281170 89281333 -14213641 + MTE2a LTR MaLR 197 359 -20 7 1266 2047 45 116 61 chr15 89295823 89296133 -14198841 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1266 1232 177 134 11 chr15 89296978 89297246 -14197728 - MTD LTR MaLR -106 313 13 7 1266 442 164 81 60 chr15 89299688 89299837 -14195137 - RMER17B LTR ERVK -495 463 312 7 1266 3043 213 49 70 chr15 89300562 89301010 -14193964 + RLTR13A LTR ERVK 1 452 -403 7 1266 3043 213 49 70 chr15 89301406 89301830 -14193144 + RLTR13A LTR ERVK 453 855 0 7 1266 2641 137 139 40 chr15 89312560 89313092 -14181882 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 7 1266 837 174 86 11 chr15 89313393 89313568 -14181406 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 183 7 1266 1308 198 195 120 chr15 89313568 89314044 -14180930 + RMER19B LTR ERVK 1 512 -390 7 1266 1105 270 87 20 chr15 89318514 89318681 -14176293 + MTD LTR MaLR 1 168 -251 7 1266 3514 136 113 5 chr15 89318681 89319302 -14175672 - RLTR17 LTR ERVK 0 692 5 7 1266 1105 270 87 20 chr15 89319302 89319527 -14175447 + MTD LTR MaLR 169 418 -1 7 1266 1118 202 69 59 chr15 89320535 89320905 -14174069 + RLTR20C LTR ERVK 1 479 -99 7 1266 616 199 109 7 chr15 89320951 89321034 -14173940 + RLTR20C LTR ERVK 480 576 -2 7 1266 1938 150 41 6 chr15 89323132 89323494 -14171480 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 4 7 1266 1946 194 34 39 chr15 89337518 89337787 -14157187 - MTD LTR MaLR -7 412 136 8 1266 1946 194 34 39 chr15 89337831 89337973 -14157001 - MTD LTR MaLR -284 135 3 8 1266 440 306 97 60 chr15 89342630 89343074 -14151900 - MER34B-int LTR ERV1 -944 3927 3686 8 1266 297 305 12 0 chr15 89343313 89343395 -14151579 - MER34B-int LTR ERV1 -785 4151 4069 8 1266 687 276 65 62 chr15 89343547 89343837 -14151137 - MER34B-int LTR ERV1 -1273 4083 3793 8 1266 422 336 65 44 chr15 89344802 89345141 -14149833 - MER34B-int LTR ERV1 -1686 3670 3325 8 1266 319 277 173 14 chr15 89353478 89353617 -14141357 - LTR50 LTR ERVL -631 164 4 8 1266 556 288 48 76 chr15 89371136 89371472 -14123502 - MTE2a LTR MaLR -8 371 1 8 1266 227 286 84 96 chr15 89386196 89386374 -14108600 - ORR1E LTR MaLR -40 319 144 9 1267 1927 182 55 26 chr15 89407292 89407675 -14087299 - MTD LTR MaLR -8 411 18 9 1267 255 226 58 23 chr15 89409293 89409379 -14085595 + RLTR42-int LTR ERVK 1520 1608 -3914 9 1267 425 220 11 11 chr15 89409896 89409988 -14084986 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 279 9 1267 2505 126 49 3 chr15 89409991 89410382 -14084592 + MTC LTR MaLR 1 409 -12 9 1267 1504 207 23 0 chr15 89410390 89410656 -14084318 - ORR1D1 LTR MaLR -98 276 5 9 1267 257 345 135 59 chr15 89411630 89411867 -14083107 + LTR16A1 LTR ERVL 107 361 -95 9 1267 1312 183 216 13 chr15 89412645 89412955 -14082019 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 9 1267 236 315 101 1 chr15 89415758 89415857 -14079117 + MLT1G3 LTR MaLR 183 290 -289 9 1267 301 294 0 0 chr15 89419464 89419532 -14075442 + MTE2a LTR MaLR 1 68 -311 9 1267 814 191 63 32 chr15 89423091 89423280 -14071694 - RMER10A LTR ERVL -247 195 1 9 1267 1738 159 53 16 chr15 89424707 89425119 -14069855 - RLTR20B3 LTR ERVK -106 471 1 9 1267 714 192 41 17 chr15 89427054 89427224 -14067750 + RMER19B LTR ERVK 1 149 -753 9 1267 1178 112 0 0 chr15 89427211 89427371 -14067603 - RMER19B LTR ERVK -648 254 95 9 1267 248 270 30 60 chr15 89435100 89435234 -14059740 + RMER17C LTR ERVK 180 309 -101 9 1267 2409 71 51 16 chr15 89435503 89435819 -14059155 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1267 601 171 97 8 chr15 89436234 89436358 -14058616 + MTC LTR MaLR 1 135 -286 9 1267 225 200 123 0 chr15 89436345 89436410 -14058564 + MTC LTR MaLR 311 383 -36 9 1267 233 259 75 134 chr15 89439663 89439697 -14055277 + MT2B2 LTR ERVL 126 151 -433 9 1267 869 207 28 142 chr15 89439961 89440214 -14054760 + MT2A LTR ERVL 1 224 -309 1 1267 799 205 37 37 chr15 89440611 89440829 -14054145 + MT2A LTR ERVL 316 533 0 1 1267 522 307 5 63 chr15 89441387 89441592 -14053382 - RLTR14-int LTR ERV1 -25 5292 5100 1 1267 622 255 127 15 chr15 89441824 89442087 -14052887 + RLTR10A LTR ERVK 104 411 0 1 1267 370 174 60 60 chr15 89442106 89442222 -14052752 + IAP-d-int LTR ERVK 318 433 -1554 1 1267 3162 290 55 48 chr15 89442461 89445516 -14049458 + IAP-d-int LTR ERVK 992 7042 -202 1 1267 526 253 146 14 chr15 89445798 89446018 -14048956 + RLTR10A LTR ERVK 140 388 -23 1 1267 3219 108 0 11 chr15 89457182 89457621 -14037353 - RLTR10C LTR ERVK -2 434 1 1 1267 417 365 58 11 chr15 89459079 89459270 -14035704 - MLT1I LTR MaLR -188 223 24 1 1267 2004 201 142 111 chr15 89460767 89461360 -14033614 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 1 1267 617 241 20 20 chr15 89463818 89463966 -14031008 - ORR1D1 LTR MaLR -224 150 3 1 1267 525 274 49 31 chr15 89467032 89467194 -14027780 - MER21B LTR ERV1 -50 813 649 1 1267 3211 128 192 24 chr15 89468295 89468957 -14026017 + MTB-int LTR MaLR 486 1258 0 1 1267 2797 90 5 15 chr15 89468957 89469351 -14025623 + MTB LTR MaLR 1 390 -10 1 1267 595 251 17 117 chr15 89469713 89469964 -14025010 - ORR1C1 LTR MaLR 0 384 160 1 1267 2416 205 16 155 chr15 89470178 89470767 -14024207 + RMER19C LTR ERVK 1 492 -119 1 1267 2568 121 0 3 chr15 89470767 89471114 -14023860 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 1 1267 2416 205 16 155 chr15 89471114 89471234 -14023740 + RMER19C LTR ERVK 493 611 0 1 1267 553 265 22 0 chr15 89471624 89471760 -14023214 + LTR40a LTR ERVL 9 147 -372 1 1267 270 322 78 0 chr15 89471794 89471909 -14023065 + LTR40a LTR ERVL 217 340 -122 1 1267 250 384 56 6 chr15 89473303 89473481 -14021493 + HERVL40-int LTR ERVL 50 236 -5294 1 1267 2222 161 50 11 chr15 89473631 89474008 -14020966 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 3 1 1267 1108 174 50 193 chr15 89477145 89477352 -14017622 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 183 1 1267 1108 174 50 193 chr15 89477419 89477458 -14017516 - ORR1C2 LTR MaLR -202 182 182 1 1267 1108 174 50 193 chr15 89477509 89477603 -14017371 - ORR1C2 LTR MaLR -202 182 92 1 1267 382 194 30 61 chr15 89477625 89477724 -14017250 + RLTR19C LTR ERVK 19 114 -392 1 1267 231 253 85 75 chr15 89477813 89477907 -14017067 + RLTR33 LTR ERVK 467 561 -117 1 1267 624 167 0 0 chr15 89478097 89478205 -14016769 - ORR1C2 LTR MaLR -270 108 1 1 1267 5812 204 67 32 chr15 89478206 89479529 -14015445 - ORR1C2-int LTR MaLR -1 1369 1 1 1267 2168 146 55 45 chr15 89479529 89479909 -14015065 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 1 1267 2528 211 134 75 chr15 89486685 89487537 -14007437 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 902 0 1 1267 1644 183 146 102 chr15 89497061 89497561 -13997413 + MT2A LTR ERVL 3 524 -9 1 1267 1483 227 111 11 chr15 89500000 89500370 -13994604 - MTD LTR MaLR 0 419 13 1 1267 1018 155 248 10 chr15 89500964 89501086 -13993888 - RMER17C LTR ERVK -46 364 218 3 1267 1018 155 248 10 chr15 89501141 89501312 -13993662 - RMER17C LTR ERVK -193 217 1 3 1267 384 145 29 0 chr15 89505970 89506039 -13988935 + MTD LTR MaLR 349 419 0 1 1267 1797 176 140 6 chr15 89506457 89506822 -13988152 + MTD LTR MaLR 1 414 -5 1 1267 1849 175 55 28 chr15 89507309 89507673 -13987301 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1267 2468 81 22 0 chr15 89508689 89509009 -13985965 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1267 332 246 0 0 chr15 89509010 89509071 -13985903 - ORR1D1 LTR MaLR -313 61 1 2 1267 590 78 0 13 chr15 89509298 89509404 -13985570 - ORR1A2 LTR MaLR -246 100 1 2 1267 1884 162 3 34 chr15 89509406 89509731 -13985243 + ORR1C1 LTR MaLR 64 378 0 2 1267 1038 270 12 27 chr15 89510871 89511130 -13983844 - ORR1D2 LTR MaLR -115 255 1 2 1267 385 280 57 73 chr15 89513255 89513550 -13981424 + RLTR15 LTR ERVK 57 275 -84 3 1267 1767 181 113 8 chr15 89515851 89516213 -13978761 - MTC LTR MaLR -7 414 15 3 1267 230 409 94 8 chr15 89517725 89517979 -13976995 + MLT1A0 LTR MaLR 17 292 -73 3 1268 411 258 31 0 chr15 89525375 89525472 -13969502 + ORR1E LTR MaLR 1 100 -259 3 1268 2480 80 6 0 chr15 89525728 89526053 -13968921 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1268 1267 149 24 30 chr15 89526402 89526638 -13968336 - ORR1B1 LTR MaLR -2 419 183 4 1268 343 263 42 10 chr15 89529342 89529437 -13965537 - RLTR40 LTR ERVK -37 780 683 4 1268 1049 141 6 6 chr15 89529437 89529601 -13965373 + RMER6D LTR ERVK 1 164 -556 4 1268 2186 133 82 0 chr15 89530128 89530480 -13964494 - ORR1B1-int LTR MaLR -332 1631 1251 4 1268 3090 70 2 5 chr15 89531185 89531585 -13963389 - MTB LTR MaLR 0 400 2 5 1268 262 198 0 157 chr15 89532974 89533082 -13961892 - RLTR25A LTR ERVK -491 612 522 5 1268 1968 140 23 3 chr15 89533277 89533621 -13961353 + RLTR15 LTR ERVK 1 351 -8 5 1268 2083 132 95 0 chr15 89538270 89538525 -13956449 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5276 5559 -202 6 1268 2083 132 95 0 chr15 89538557 89538679 -13956295 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5560 5688 -73 6 1268 248 243 41 41 chr15 89538688 89538761 -13956213 + ORR1A3-int LTR MaLR 567 639 -1324 6 1268 302 161 0 0 chr15 89538761 89538817 -13956157 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5706 5761 0 6 1268 239 216 39 0 chr15 89538852 89538903 -13956071 + MT2B LTR ERVL 52 104 -429 6 1268 1031 240 39 135 chr15 89540280 89540665 -13954309 + MT2B LTR ERVL 254 601 0 6 1268 2077 94 0 102 chr15 89540699 89541043 -13953931 + RLTR10E LTR ERVK 1 309 -2 7 1268 3015 119 0 5 chr15 89541227 89541664 -13953310 - RLTR10C LTR ERVK -1 435 1 7 1268 3992 96 6 6 chr15 89541664 89542602 -13952372 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7680 6718 7 1268 3474 66 0 8 chr15 89542600 89543076 -13951898 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4595 2986 2515 7 1268 357 111 0 0 chr15 89543075 89543138 -13951836 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5634 1947 1885 7 1268 418 161 123 0 chr15 89543129 89543210 -13951764 - MMERVK10C-int LTR ERVK -5109 1028 938 7 1268 1356 171 115 48 chr15 89543213 89543653 -13951321 - MMERVK10C-int LTR ERVK -4750 656 318 7 1268 391 155 0 72 chr15 89543749 89543888 -13951086 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6629 952 824 7 1268 4433 103 17 23 chr15 89543882 89544584 -13950390 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6662 919 222 7 1268 253 214 0 0 chr15 89544584 89544626 -13950348 - RLTR27 LTR ERVK -37 272 231 7 1268 564 130 10 20 chr15 89544626 89544728 -13950246 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7478 103 3 7 1268 3007 120 0 5 chr15 89544730 89545165 -13949809 - RLTR10C LTR ERVK -3 433 1 7 1268 353 229 17 76 chr15 89550341 89550459 -13944515 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 260 8 1268 2180 167 50 0 chr15 89552142 89552543 -13942431 - MTC LTR MaLR 0 421 1 9 1268 2239 115 62 3 chr15 89553633 89553972 -13941002 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 9 1268 906 229 58 10 chr15 89556255 89556463 -13938511 + MTD LTR MaLR 3 203 -193 9 1268 608 270 95 42 chr15 89556521 89556576 -13938398 + MTD LTR MaLR 124 182 -218 1 1268 962 222 77 0 chr15 89556616 89556823 -13938151 + MTD LTR MaLR 197 419 0 1 1268 853 276 39 74 chr15 89559722 89560031 -13934943 + ORR1E LTR MaLR 19 316 -43 1 1268 395 245 19 9 chr15 89566220 89566327 -13928647 + ORR1E LTR MaLR 271 378 -1 1 1268 464 300 161 37 chr15 89571266 89571539 -13923435 + ORR1E LTR MaLR 4 310 -49 1 1268 400 305 39 14 chr15 89574006 89574255 -13920719 + MURVY-int LTR ERV1 7156 7528 -78 1 1268 1664 170 29 104 chr15 89574369 89574716 -13920258 + RLTR41 LTR ERV1 62 382 -64 1 1268 555 239 61 77 chr15 89574864 89575045 -13919929 + MTE2b LTR MaLR 19 196 -183 1 1268 600 217 42 0 chr15 89575315 89575435 -13919539 + MTE2b LTR MaLR 216 340 -39 1 1268 259 219 15 59 chr15 89577688 89577756 -13917218 - ORR1E LTR MaLR -289 70 6 1 1268 3183 67 10 0 chr15 89589271 89589688 -13905286 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 1 1268 506 199 39 58 chr15 89589917 89590071 -13904903 + RLTR40 LTR ERVK 19 169 -648 1 1268 825 169 16 10 chr15 89590071 89590316 -13904658 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 70 1 1268 3308 33 5 5 chr15 89591024 89591420 -13903554 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1268 427 198 12 12 chr15 89594917 89594999 -13899975 + RLTR42-int LTR ERVK 1694 1775 -3747 1 1268 1184 30 0 0 chr15 89595751 89595919 -13899055 + RLTR45-int LTR ERVK 1010 1177 -6067 1 1268 979 46 0 101 chr15 89596097 89596265 -13898709 + RLTR45-int LTR ERVK 1176 1326 -5918 1 1268 3467 13 8 0 chr15 89598754 89599147 -13895827 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1268 1221 237 52 87 chr15 89599890 89600090 -13894884 + RLTR42-int LTR ERVK 4263 4474 -1048 1 1268 1221 237 52 87 chr15 89600226 89600464 -13894510 + RLTR42-int LTR ERVK 4475 4685 -837 1 1268 988 244 71 43 chr15 89600492 89600860 -13894114 + RLTR42-int LTR ERVK 4800 5177 -345 1 1268 493 286 91 15 chr15 89602539 89602738 -13892236 + RLTR42-int LTR ERVK 5193 5406 -116 1 1268 714 242 131 41 chr15 89605633 89605947 -13889027 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 1 1 1268 233 330 183 39 chr15 89613585 89613793 -13881181 + ORR1E LTR MaLR 4 241 -133 1 1268 319 298 12 14 chr15 89613881 89613989 -13880985 + ORR1E LTR MaLR 253 355 -15 1 1268 625 172 76 76 chr15 89614251 89614368 -13880606 + ORR1C2 LTR MaLR 228 350 -34 1 1268 625 172 76 76 chr15 89614516 89614555 -13880419 + ORR1C2 LTR MaLR 351 384 0 1 1268 656 273 70 26 chr15 89614899 89615170 -13879804 - RLTR15 LTR ERVK -76 283 1 1 1268 498 161 11 11 chr15 89631220 89631308 -13863666 + MT2A LTR ERVL 23 110 -423 2 1268 261 128 0 0 chr15 89631305 89631344 -13863630 + MT2A LTR ERVL 383 421 -112 2 1268 915 276 90 31 chr15 89631348 89631703 -13863271 + MERVL_2A-int LTR ERVL 726 1101 -4660 2 1268 6346 200 71 18 chr15 89631692 89633101 -13861873 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3725 5208 -553 2 1268 2333 81 18 59 chr15 89642148 89642489 -13852485 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1268 1480 254 34 3 chr15 89647569 89647921 -13847053 - MTD LTR MaLR -54 365 3 2 1268 752 244 168 4 chr15 89647928 89648148 -13846826 - MTD-int LTR MaLR -2 1256 998 2 1268 752 244 168 4 chr15 89648187 89648246 -13846728 - MTD-int LTR MaLR -261 997 932 2 1269 2725 48 37 67 chr15 89654532 89654908 -13840066 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 2 1269 242 218 0 18 chr15 89658075 89658131 -13836843 + MLT1A0 LTR MaLR 4 59 -315 2 1269 396 367 23 91 chr15 89658151 89658266 -13836708 + MTEa LTR MaLR 14 119 -260 2 1269 396 367 23 91 chr15 89658502 89658605 -13836369 + MTEa LTR MaLR 120 217 -162 2 1269 503 329 34 51 chr15 89658698 89658935 -13836039 + MLT1A0 LTR MaLR 72 304 -61 2 1269 360 284 57 6 chr15 89659195 89659326 -13835648 + MLT1A0 LTR MaLR 257 463 -4 2 1269 278 274 0 14 chr15 89660192 89660266 -13834708 + MLT1B LTR MaLR 18 90 -377 2 1269 460 265 207 41 chr15 89660342 89660395 -13834579 + MLT1B LTR MaLR 191 243 -147 2 1269 2519 157 2 19 chr15 89660395 89660823 -13834151 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1269 460 265 207 41 chr15 89660823 89660938 -13834036 + MLT1B LTR MaLR 244 387 -3 2 1269 304 245 77 19 chr15 89662043 89662147 -13832827 + MLT1A0 LTR MaLR 252 361 -4 2 1269 464 232 49 70 chr15 89673697 89673844 -13821130 - ORR1C1 LTR MaLR -267 127 1 2 1269 3234 43 15 2 chr15 89674801 89675196 -13819778 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1269 957 189 56 42 chr15 89687249 89687465 -13807509 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 166 2 1269 1149 252 72 25 chr15 89702584 89702902 -13792072 + ORR1D1 LTR MaLR 1 333 -41 3 1269 318 300 139 13 chr15 89704411 89704641 -13790333 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4657 1057 799 3 1269 578 323 68 15 chr15 89704659 89704983 -13789991 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4934 827 487 3 1269 725 364 47 53 chr15 89708516 89709363 -13785611 + ERVL-E-int LTR ERVL 372 1213 -4454 3 1269 286 245 124 67 chr15 89709538 89709643 -13785331 + ERVL-E-int LTR ERVL 1442 1552 -4115 3 1269 782 314 52 61 chr15 89711674 89712017 -13782957 - MTE2a LTR MaLR 0 379 40 3 1269 1876 163 50 12 chr15 89713328 89713670 -13781304 + ORR1D1 LTR MaLR 6 360 -14 3 1269 4764 91 42 23 chr15 89714783 89715517 -13779457 + RMER17A LTR ERVK 4 751 0 3 1269 5395 144 36 18 chr15 89717002 89717943 -13777031 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 3 1269 369 348 65 54 chr15 89717948 89718227 -13776747 - LTR41 LTR ERVL -486 282 1 3 1269 3584 10 2 0 chr15 89719156 89719551 -13775423 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1269 1823 171 45 42 chr15 89721844 89722198 -13772776 + ORR1B1 LTR MaLR 32 386 -8 3 1269 716 277 117 40 chr15 89725053 89725508 -13769466 + RMER5 LTR ERV1 45 534 0 3 1269 3692 153 81 8 chr15 89725645 89726309 -13768665 - RMER13B LTR ERVK -195 713 1 3 1269 1313 260 40 6 chr15 89731248 89731563 -13763411 + ORR1D1 LTR MaLR 3 328 -46 3 1269 720 259 143 89 chr15 89731563 89731922 -13763052 + MT2A LTR ERVL 1 495 -89 3 1269 437 384 19 19 chr15 89741044 89741259 -13753715 + MTC LTR MaLR 1 215 -206 3 1269 238 269 36 60 chr15 89744406 89744489 -13750485 - ORR1E LTR MaLR -261 98 18 3 1269 335 308 148 21 chr15 89744569 89744758 -13750216 - MLT1E3 LTR MaLR -13 611 399 3 1269 3249 38 2 5 chr15 89751115 89751512 -13743462 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1269 456 288 118 35 chr15 89753557 89753671 -13741303 - MTD LTR MaLR -177 242 114 3 1269 456 288 118 35 chr15 89753848 89753902 -13741072 - MTD LTR MaLR -306 113 60 3 1269 713 249 113 26 chr15 89755222 89755453 -13739521 + MTD LTR MaLR 1 251 -168 3 1269 2556 188 57 16 chr15 89755455 89756090 -13738884 - RLTR31_Mm LTR ERVK -2 559 1 3 1269 573 217 81 11 chr15 89756137 89756297 -13738677 + MTD LTR MaLR 219 419 0 3 1269 287 388 0 16 chr15 89756667 89756790 -13738184 - LTR40b LTR ERVL -210 252 132 3 1269 240 307 106 73 chr15 89756788 89756939 -13738035 - LTR40a LTR ERVL -278 241 86 3 1269 326 152 34 0 chr15 89762356 89762415 -13732559 + RLTR11A LTR ERVK 468 528 0 3 1269 344 321 57 68 chr15 89769774 89769951 -13725023 - RMER5 LTR ERV1 -296 238 64 3 1269 1107 268 19 21 chr15 89771082 89771459 -13723515 - MTE2a LTR MaLR -3 376 1 3 1269 3600 46 5 2 chr15 89773432 89773867 -13721107 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1269 41792 4 0 0 chr15 89773867 89781447 -13713527 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 7581 0 4 1269 3600 46 5 2 chr15 89781447 89781882 -13713092 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 4 1269 3247 105 38 71 chr15 89781903 89781935 -13713039 - RLTR31B_Mm LTR ERVK 0 557 534 4 1269 3247 105 38 71 chr15 89782074 89782615 -13712359 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -24 533 3 4 1270 1605 219 21 11 chr15 89784734 89785107 -13709867 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 151 4 1270 774 194 22 0 chr15 89785464 89785603 -13709371 - RMER5 LTR ERV1 -376 158 17 4 1270 349 172 31 0 chr15 89786350 89786414 -13708560 - RMER5 LTR ERV1 -61 473 408 4 1270 876 171 75 35 chr15 89787008 89787208 -13707766 + RMER5 LTR ERV1 316 523 -11 4 1270 1864 134 254 31 chr15 89791454 89791902 -13703072 - RLTR6_Mm LTR ERV1 -70 584 37 4 1270 1894 171 25 98 chr15 89795724 89795885 -13699089 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 234 4 1270 1894 171 25 98 chr15 89795922 89796168 -13698806 - RLTR14 LTR ERV1 -149 233 3 4 1270 1993 129 0 66 chr15 89798270 89798619 -13696355 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 1270 1626 199 274 16 chr15 89799149 89799573 -13695401 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 4 1270 2442 89 6 0 chr15 89818718 89819043 -13675931 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1270 3051 160 218 76 chr15 89819875 89820654 -13674320 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 4 1270 5947 60 10 30 chr15 89821127 89821947 -13673027 - RLTR13B4 LTR ERVK 0 803 1 4 1270 942 262 127 6 chr15 89822871 89823121 -13671853 + RLTR40 LTR ERVK 4 290 -527 4 1270 942 262 127 6 chr15 89823251 89823331 -13671643 + RLTR40 LTR ERVK 291 375 -442 4 1270 1732 325 61 21 chr15 89823333 89824368 -13670606 + MERVL_2A-int LTR ERVL 147 1286 -4475 4 1270 416 300 137 26 chr15 89825045 89825315 -13669659 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1221 1520 -4194 4 1270 522 395 19 30 chr15 89825387 89825859 -13669115 + MT2A LTR ERVL 2 468 -65 4 1270 625 242 33 0 chr15 89825873 89826026 -13668948 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3004 3161 -2553 4 1270 690 251 88 33 chr15 89826055 89826327 -13668647 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5202 5488 -273 4 1270 2979 22 0 118 chr15 89826388 89826802 -13668172 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 4 1270 317 299 184 71 chr15 89827656 89828103 -13666871 + MT2A LTR ERVL 2 508 -25 4 1270 2082 169 37 3 chr15 89828103 89828458 -13666516 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 4 1270 317 299 184 71 chr15 89828458 89828488 -13666486 + MT2A LTR ERVL 509 533 0 4 1270 1642 198 63 15 chr15 89831544 89831866 -13663108 + MTD LTR MaLR 26 363 -56 4 1270 608 203 200 13 chr15 89831866 89832016 -13662958 + ORR1C1 LTR MaLR 1 178 -200 4 1270 2441 185 112 21 chr15 89834667 89834695 -13660279 - RLTR40 LTR ERVK -133 684 659 4 1270 2985 83 0 10 chr15 89834695 89835095 -13659879 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1270 2441 185 112 21 chr15 89835095 89835690 -13659284 - RLTR40 LTR ERVK -159 658 4 4 1270 1183 223 119 15 chr15 89838469 89838806 -13656168 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 1 5 1270 4550 228 92 41 chr15 89838806 89838961 -13656013 - ORR1D1-int LTR MaLR 0 1370 1213 5 1270 4550 228 92 41 chr15 89838986 89840133 -13654841 - ORR1D1-int LTR MaLR -158 1212 4 5 1270 1435 189 152 0 chr15 89840133 89840455 -13654519 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 2 5 1270 678 294 90 80 chr15 89842480 89842857 -13652117 - MLT1B LTR MaLR 0 390 10 5 1270 3083 68 18 2 chr15 89845330 89845731 -13649243 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1270 313 286 179 76 chr15 89848017 89848264 -13646710 + MLT1E1A LTR MaLR 312 589 -65 5 1270 292 286 179 76 chr15 89848324 89848367 -13646607 + MLT1E1A LTR MaLR 590 651 -3 5 1270 1223 147 31 0 chr15 89848807 89848998 -13645976 + ORR1C1 LTR MaLR 182 378 0 5 1270 292 355 16 32 chr15 89849320 89849445 -13645529 - MTEa-int LTR MaLR -1181 399 277 5 1270 592 338 25 0 chr15 89849462 89849663 -13645311 - MTEa-int LTR MaLR -1374 206 1 5 1270 539 285 102 28 chr15 89849813 89849990 -13644984 - MTEa LTR MaLR -8 371 182 5 1270 635 292 22 6 chr15 89850680 89850859 -13644115 - MTEa LTR MaLR -197 182 1 5 1270 229 283 17 0 chr15 89857055 89857115 -13637859 + MER21B LTR ERV1 682 742 -121 5 1270 2080 127 6 60 chr15 89857373 89857708 -13637266 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 2 5 1270 523 317 38 103 chr15 89860546 89860943 -13634031 + MTEa LTR MaLR 5 375 -4 5 1270 632 191 66 7 chr15 89864717 89864854 -13630120 - MTD LTR MaLR 0 419 275 5 1270 1711 247 39 93 chr15 89864854 89865412 -13629562 - MTC-int LTR MaLR -730 528 1 5 1270 1247 215 94 33 chr15 89865414 89865809 -13629165 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1270 276 360 65 0 chr15 89872066 89872219 -13622755 + MLT2B3 LTR ERVL 4 166 -388 5 1270 262 340 49 141 chr15 89872219 89872251 -13622723 + MTEa LTR MaLR 4 171 -208 5 1270 452 286 145 16 chr15 89872830 89873079 -13621895 - RMER20B LTR ERVK -216 411 131 5 1270 374 215 12 5 chr15 89876864 89876984 -13617990 + ORR1D2 LTR MaLR 19 238 -132 5 1270 1949 192 8 26 chr15 89877013 89877322 -13617652 + ORR1B1 LTR MaLR 10 312 -82 5 1270 3413 30 8 0 chr15 89877322 89877715 -13617259 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1270 1949 192 8 26 chr15 89877715 89877789 -13617185 + ORR1B1 LTR MaLR 313 386 -8 5 1270 977 186 46 73 chr15 89879161 89879422 -13615552 - RMER5 LTR ERV1 -278 256 3 5 1270 1121 176 26 75 chr15 89885339 89885604 -13609370 + RMER5 LTR ERV1 267 518 -16 5 1270 1272 254 55 17 chr15 89888144 89888548 -13606426 - MTD LTR MaLR 0 419 1 5 1270 1153 235 108 57 chr15 89892116 89892295 -13602679 - RMER4B LTR ERVK -9 457 269 5 1270 1189 140 81 10 chr15 89892349 89892593 -13602381 - RMER4B LTR ERVK -198 268 12 5 1270 587 259 109 70 chr15 89895258 89895690 -13599284 - RMER20B LTR ERVK -23 604 96 5 1270 1579 133 189 13 chr15 89898292 89898604 -13596370 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1270 2627 143 14 7 chr15 89900173 89900587 -13594387 - MTC LTR MaLR 0 421 5 6 1270 1890 117 31 0 chr15 89903042 89903332 -13591642 - ORR1B1 LTR MaLR -95 299 1 6 1270 3188 63 2 2 chr15 89909116 89909516 -13585458 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1270 453 377 68 48 chr15 89911672 89912146 -13582828 + LTR40a LTR ERVL 37 519 0 6 158 2139 62 195 7 chr15 89915189 89915496 -13579478 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 6 1271 2991 41 2 97 chr15 89923995 89924426 -13570548 - RLTR10 LTR ERVK 0 390 1 6 1271 481 297 154 11 chr15 89927099 89927355 -13567619 - MLT2B4 LTR ERVL -124 290 1 6 1271 274 371 56 17 chr15 89927740 89927918 -13567056 + MLT1G3 LTR MaLR 288 472 -123 6 1271 239 250 129 45 chr15 89927937 89928026 -13566948 + RMER17C LTR ERVK 140 242 -168 6 1271 239 250 129 45 chr15 89928185 89928250 -13566724 + RMER17C LTR ERVK 243 307 -103 6 1271 253 253 66 44 chr15 89928763 89928854 -13566120 + MLT1J1 LTR MaLR 69 161 -283 6 1271 2382 141 18 38 chr15 89928924 89929321 -13565653 + ORR1B1 LTR MaLR 6 394 0 6 1271 1238 169 75 43 chr15 89932142 89932421 -13562553 + RMER10B LTR ERVL 1 288 -110 6 1271 235 377 88 0 chr15 89934719 89934878 -13560096 - LTR85b LTR Gypsy? -75 709 537 6 1271 334 247 10 58 chr15 89934941 89935044 -13559930 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 431 6 1271 271 320 0 0 chr15 89936424 89936502 -13558472 - RMER4A LTR ERVK -382 84 7 6 1271 641 275 13 0 chr15 89940264 89940413 -13554561 - MTE2a LTR MaLR 0 379 229 6 1271 1764 200 40 6 chr15 89940459 89940660 -13554314 - ORR1B2 LTR MaLR -3 364 159 6 1271 1764 200 40 6 chr15 89940756 89940906 -13554068 - ORR1B2 LTR MaLR -209 158 3 6 1271 530 253 88 65 chr15 89940913 89941198 -13553776 - ORR1D2 LTR MaLR -47 312 3 6 1271 621 325 50 58 chr15 89942894 89943257 -13551717 - LTR82A LTR ERVL -495 377 18 6 1271 2321 88 25 3 chr15 89951737 89952057 -13542917 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1271 2958 76 2 27 chr15 89957512 89957918 -13537056 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1271 1230 237 60 57 chr15 89961247 89961563 -13533411 + MTD LTR MaLR 44 363 -56 7 1271 1230 237 60 57 chr15 89961746 89961796 -13533178 + MTD LTR MaLR 364 411 -8 7 1271 641 177 0 0 chr15 89961867 89961980 -13532994 - RLTR12A LTR ERVK -455 113 1 7 1271 2308 246 56 53 chr15 89961980 89962606 -13532368 + MTC-int LTR MaLR 382 1009 -249 7 1271 973 142 117 27 chr15 89965364 89965552 -13529422 - RMER19A LTR ERVK 0 737 533 7 1271 599 251 20 85 chr15 89965554 89965754 -13529220 + RLTR9A LTR ERVK 182 368 0 7 1271 231 223 88 146 chr15 89966301 89966506 -13528468 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 376 7 1271 328 269 46 86 chr15 89966492 89966667 -13528307 - RLTR15 LTR ERVK -144 215 48 7 1271 2898 89 18 0 chr15 89967262 89967655 -13527319 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1271 1098 205 24 14 chr15 89968188 89968401 -13526573 - RLTR18B LTR ERVK -1 511 297 7 1271 782 183 53 12 chr15 89968429 89968600 -13526374 - MTC LTR MaLR 0 421 244 7 1271 231 152 0 61 chr15 89971568 89971617 -13523357 - MER34A LTR ERV1 -393 178 133 7 1271 461 322 34 0 chr15 89971618 89971767 -13523207 - MER34A LTR ERV1 -415 156 3 7 1271 1284 219 117 20 chr15 89977619 89977969 -13517005 - RMER5 LTR ERV1 -150 384 1 7 1271 1424 306 24 85 chr15 89979737 89980419 -13514555 + RMER15-int LTR ERVL 1270 1909 -3090 7 1271 506 294 151 18 chr15 89981684 89981909 -13513065 + RMER15 LTR ERVL 275 529 -46 7 1271 797 268 68 38 chr15 89984226 89984490 -13510484 - MTD LTR MaLR -28 391 120 7 1271 917 269 151 95 chr15 89986290 89986787 -13508187 - RMER4B LTR ERVK 0 585 61 7 1271 747 247 46 198 chr15 89988999 89989474 -13505500 - RLTR12B LTR ERVK -30 498 96 7 1271 1265 240 133 11 chr15 89990781 89991143 -13503831 + MTD LTR MaLR 1 406 -13 7 1271 295 292 139 30 chr15 89994224 89994425 -13500549 + RMER5 LTR ERV1 112 334 -200 7 1271 411 257 20 0 chr15 89994487 89994588 -13500386 + RMER5 LTR ERV1 1 103 -431 7 1271 261 240 51 39 chr15 89995434 89995512 -13499462 - MT2B LTR ERVL -3 598 520 7 1271 642 322 60 48 chr15 89995504 89995772 -13499202 + RMER15 LTR ERVL 292 562 -13 7 1271 2584 331 48 38 chr15 89995784 89997190 -13497784 + RMER15-int LTR ERVL 4 1423 -3576 7 1271 268 330 87 74 chr15 89998724 89998953 -13496021 + MTE-int LTR MaLR 271 502 -1078 7 1271 1674 252 16 46 chr15 90000068 90000286 -13494688 + MTD LTR MaLR 1 211 -208 1 1271 1674 252 16 46 chr15 90000631 90000844 -13494130 + MTD LTR MaLR 212 419 0 1 1271 641 230 209 69 chr15 90002663 90002685 -13492289 - RMER5 LTR ERV1 -8 526 509 7 1271 1736 224 8 58 chr15 90002685 90003079 -13491895 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 8 1271 641 230 209 69 chr15 90003079 90003420 -13491554 - RMER5 LTR ERV1 -26 508 112 7 1271 372 275 200 0 chr15 90003569 90003689 -13491285 - RMER15-int LTR ERVL -708 4291 4148 9 1271 1876 212 21 21 chr15 90012419 90012795 -13482179 - MTD LTR MaLR -2 417 42 1 1271 349 282 151 18 chr15 90013306 90013382 -13481592 - MTC-int LTR MaLR -156 1102 1008 2 1271 349 282 151 18 chr15 90013435 90013524 -13481450 - MTC-int LTR MaLR -251 1007 916 2 1271 2938 85 41 13 chr15 90013548 90013940 -13481034 + RLTR9D LTR ERVK 1 403 0 2 1271 1721 222 52 101 chr15 90016012 90016568 -13478406 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 2 3 1271 1966 144 178 28 chr15 90017930 90018330 -13476644 + RMER6B LTR ERVK 1 460 -1 3 1271 840 264 53 164 chr15 90019101 90019478 -13475496 + MTD LTR MaLR 46 380 -39 3 1271 1178 232 44 40 chr15 90021224 90021498 -13473476 + MTD LTR MaLR 1 275 -144 4 1271 393 221 61 88 chr15 90021820 90021934 -13473040 - ETnERV2-int LTR ERVK -213 7193 7083 4 1271 307 210 32 10 chr15 90021935 90022015 -13472959 + MTD LTR MaLR 250 333 -86 4 1271 352 268 2 13 chr15 90022691 90022795 -13472179 - MLT1D LTR MaLR -392 113 9 4 1271 458 328 51 68 chr15 90035658 90036132 -13458842 - MER52-int LTR ERV1 -3355 3736 3271 5 1271 1682 209 44 29 chr15 90036617 90037001 -13457973 - MTD LTR MaLR 0 419 30 5 1271 2465 102 9 0 chr15 90040343 90040667 -13454307 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1271 1309 256 85 11 chr15 90042604 90042621 -13452353 + MTD LTR MaLR 3 19 -400 6 1271 1309 251 73 12 chr15 90042659 90043030 -13451944 + MTD LTR MaLR 20 405 -14 6 1272 533 259 28 115 chr15 90048457 90048710 -13446264 + RLTR14 LTR ERV1 152 382 0 7 1272 573 119 175 0 chr15 90050147 90050182 -13444792 + RMER4A LTR ERVK 1 35 -431 7 1272 573 119 175 0 chr15 90050217 90050295 -13444679 + RMER4A LTR ERVK 36 135 -331 7 1272 1083 83 0 0 chr15 90050295 90050440 -13444534 - BGLII LTR ERVK 0 421 277 7 1272 1973 159 114 16 chr15 90050441 90050890 -13444084 - RMER3D-int LTR ERVK -1336 1506 1014 7 1272 473 116 42 70 chr15 90051030 90051150 -13443824 - RMER3D-int LTR ERVK -2250 592 489 7 1272 3282 75 19 0 chr15 90051555 90051968 -13443006 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 7 1272 1745 173 48 18 chr15 90051968 90052298 -13442676 + RMER4A LTR ERVK 127 466 0 7 1272 1660 241 46 3 chr15 90067004 90067068 -13427906 + MTD LTR MaLR 38 106 -313 9 1272 1725 157 162 23 chr15 90067068 90067414 -13427560 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 9 1272 1660 241 46 3 chr15 90067414 90067715 -13427259 + MTD LTR MaLR 107 418 -1 9 1272 1179 226 68 52 chr15 90069238 90069750 -13425224 - RMER2 LTR ERV1 -5 562 3 9 1272 408 317 23 63 chr15 90071623 90071798 -13423176 + MTEa LTR MaLR 5 172 -207 1 1272 2860 46 0 14 chr15 90072778 90073129 -13421845 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1272 1296 178 21 138 chr15 90077844 90078221 -13416753 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 46 1 1272 512 264 41 46 chr15 90081866 90082084 -13412890 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2751 3010 2794 1 1272 317 335 63 69 chr15 90082334 90082523 -13412451 - ORR1E LTR MaLR -168 191 4 1 1272 839 329 37 7 chr15 90083725 90084132 -13410842 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4434 1280 862 1 1272 677 295 102 63 chr15 90084877 90085290 -13409684 - MT2A LTR ERVL -2 531 103 1 1272 2038 96 8 88 chr15 90086574 90086868 -13408106 + ORR1A3 LTR MaLR 1 280 -46 1 1272 2038 96 8 88 chr15 90087252 90087310 -13407664 + ORR1A3 LTR MaLR 281 325 -1 1 1272 1118 268 27 24 chr15 90092282 90092576 -13402398 - MTD LTR MaLR -124 295 1 1 1272 313 356 80 52 chr15 90092859 90093072 -13401902 + LTR84a LTR ERVL 18 236 -521 1 1272 2238 101 25 0 chr15 90094065 90094383 -13400591 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1272 3228 95 11 13 chr15 90094737 90095205 -13399769 - RLTR31B_Mm LTR ERVK -90 467 1 1 1272 288 317 232 37 chr15 90098093 90098751 -13396223 - ERVL-B4-int LTR ERVL -3880 1877 1052 1 1272 379 330 79 44 chr15 90098756 90099073 -13395901 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4617 1097 770 1 1272 294 342 12 7 chr15 90099125 90099303 -13395671 - ERVL-B4-int LTR ERVL -5063 694 514 1 1272 392 305 31 43 chr15 90099581 90099742 -13395232 + RLTR14 LTR ERV1 224 382 0 1 1272 531 331 8 0 chr15 90102293 90102482 -13392492 + MLT1A0 LTR MaLR 8 198 -210 1 1272 864 84 27 47 chr15 90105029 90105179 -13389795 + RLTR11A2 LTR ERVK 381 527 0 1 1272 694 286 75 131 chr15 90106039 90106482 -13388492 - RLTR23 LTR ERV1 -5 425 8 1 1272 2658 31 75 0 chr15 90115352 90115674 -13379300 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 1 1272 609 156 9 0 chr15 90115743 90115852 -13379122 - RLTR42-int LTR ERVK -3282 2240 2131 1 1272 421 199 20 24 chr15 90117855 90117957 -13377017 + MTC LTR MaLR 1 106 -290 1 1272 3169 43 10 17 chr15 90120338 90120741 -13374233 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1272 2074 121 61 33 chr15 90121086 90121445 -13373529 + ORR1C1 LTR MaLR 1 369 -9 1 1272 274 315 42 36 chr15 90122224 90122392 -13372582 - MER89 LTR ERV1 0 559 391 1 1272 248 240 27 0 chr15 90122542 90122617 -13372357 - MER89 LTR ERV1 -482 77 1 1 1272 3930 54 6 12 chr15 90126162 90126668 -13368306 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 1 1272 2982 74 5 10 chr15 90130840 90131238 -13363736 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1272 6705 84 105 14 chr15 90131238 90132244 -13362730 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1272 3056 61 2 15 chr15 90132246 90132645 -13362329 + MTA_Mm LTR MaLR 3 396 0 1 1272 226 304 137 33 chr15 90134191 90134344 -13360630 - MLT1F2-int LTR MaLR -583 906 738 2 1272 307 303 96 26 chr15 90134369 90134525 -13360449 - MLT1F2-int LTR MaLR -849 640 474 2 1272 367 290 84 35 chr15 90134594 90134737 -13360237 - MLT1F2 LTR MaLR -29 531 382 2 1272 1943 233 76 135 chr15 90138112 90138832 -13356142 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 694 -1154 2 1272 1886 99 243 12 chr15 90138832 90139169 -13355805 - RLTR9F LTR ERVK 0 415 1 2 1272 1943 233 76 135 chr15 90139169 90139292 -13355682 + RLTR22_Mur LTR ERVK 695 794 -1054 2 1272 300 310 53 43 chr15 90139382 90139582 -13355392 + RMER12 LTR ERVK 994 1172 -150 2 1272 839 222 107 128 chr15 90139733 90140022 -13354952 + MT2A LTR ERVL 1 283 -250 2 1272 302 350 12 59 chr15 90140383 90140553 -13354421 + LTR40b LTR ERVL 51 212 -250 2 1272 406 330 133 67 chr15 90140662 90140977 -13353997 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 73 2 1272 330 104 21 0 chr15 90141822 90141870 -13353104 - RLTR11A2 LTR ERVK -462 65 17 2 1272 582 283 38 27 chr15 90142365 90142578 -13352396 - MTD LTR MaLR -209 210 8 2 1272 6779 85 60 6 chr15 90148439 90148592 -13346382 - RLTR13D5 LTR ERVK 0 1023 828 2 1272 6779 93 60 7 chr15 90149108 90149959 -13345015 - RLTR13D5 LTR ERVK -196 827 2 2 1272 289 343 0 48 chr15 90151175 90151279 -13343695 + RMER5 LTR ERV1 215 313 -221 2 1272 334 283 20 10 chr15 90151483 90151583 -13343391 - MLT2C1 LTR ERVL -291 106 6 2 1272 1231 145 15 10 chr15 90153022 90153264 -13341710 + MTC LTR MaLR 32 321 -100 2 1272 490 235 0 0 chr15 90153871 90153973 -13341001 + MTC LTR MaLR 317 418 -3 2 1272 547 283 86 24 chr15 90154476 90154541 -13340433 - RMER15 LTR ERVL -54 521 455 2 1272 547 283 86 24 chr15 90154591 90154735 -13340239 - RMER15 LTR ERVL -121 454 301 2 1272 2478 68 0 26 chr15 90168896 90169244 -13325730 + RLTR8 LTR ERVK 1 339 -26 2 1272 1007 255 119 26 chr15 90171555 90171857 -13323117 - MTD LTR MaLR -89 330 1 2 1272 448 317 136 50 chr15 90172672 90172969 -13322005 + MLT1A0 LTR MaLR 54 362 -3 2 1272 2820 194 25 2 chr15 90174778 90175300 -13319674 + RMER5 LTR ERV1 1 534 0 2 1273 1604 244 60 16 chr15 90178694 90179064 -13315910 - MTD LTR MaLR -9 410 25 2 1273 238 196 0 38 chr15 90179977 90180030 -13314944 + MT2B LTR ERVL 79 129 -472 2 1273 487 216 15 25 chr15 90180031 90180161 -13314813 - MT2B LTR ERVL -366 127 1 2 1273 426 303 0 0 chr15 90180972 90181081 -13313893 + MLT1B LTR MaLR 261 369 -21 2 1273 3142 54 23 0 chr15 90183769 90184156 -13310818 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 2 1273 1630 191 46 67 chr15 90186307 90186695 -13308279 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 3 2 1273 325 349 15 15 chr15 90190811 90190945 -13304029 - RMER12 LTR ERVK -472 850 717 2 1273 280 242 107 39 chr15 90191528 90191631 -13303343 + RLTR19-int LTR ERVK 780 889 -5248 2 1273 260 206 80 27 chr15 90191900 90191975 -13302999 + MTC-int LTR MaLR 964 1042 -216 3 1273 253 319 27 77 chr15 90192010 90192193 -13302781 + MTC-int LTR MaLR 1042 1215 -43 3 1273 294 237 10 31 chr15 90192379 90192475 -13302499 + RLTR19-int LTR ERVK 1871 1964 -3558 2 1273 1104 245 105 68 chr15 90192531 90192999 -13301975 + RLTR19-int LTR ERVK 2705 3189 -2948 2 1273 2941 169 52 120 chr15 90193124 90194047 -13300927 + RLTR19-int LTR ERVK 3459 4318 -1819 2 1273 1423 193 85 61 chr15 90194964 90195339 -13299635 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1273 830 276 93 9 chr15 90196287 90196630 -13298344 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 3 1273 582 154 15 100 chr15 90197375 90197505 -13297469 + ORR1C2 LTR MaLR 1 119 -265 3 1273 230 247 151 58 chr15 90198421 90198507 -13296467 + LTR48 LTR ERV1 64 157 -630 3 1273 1764 143 108 7 chr15 90201909 90202205 -13292769 - ORR1B1 LTR MaLR -63 331 6 3 1273 3258 36 10 0 chr15 90202372 90202763 -13292211 + MTA_Mm LTR MaLR 1 395 -1 3 1273 3046 84 2 12 chr15 90207237 90207645 -13287329 - MTB_Mm LTR MaLR -3 404 1 3 1273 298 244 36 24 chr15 90219618 90219702 -13275272 + MTEa LTR MaLR 293 377 -2 3 1273 644 292 76 78 chr15 90224791 90225073 -13269901 + MER31B LTR ERV1 9 311 -155 3 1273 2044 165 11 11 chr15 90225073 90225440 -13269534 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 1273 644 292 76 78 chr15 90225440 90225606 -13269368 + MER31B LTR ERV1 312 456 -10 3 1273 843 268 21 121 chr15 90227493 90227913 -13267061 - MTE2a LTR MaLR -1 378 1 3 1273 3314 166 75 28 chr15 90228183 90228326 -13266648 + RLTR19B LTR ERVK 4 142 -573 3 1273 3314 166 75 28 chr15 90228366 90228902 -13266072 + RLTR19B LTR ERVK 143 714 -1 3 1273 1653 203 81 8 chr15 90232492 90232850 -13262124 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1273 2050 136 34 164 chr15 90233006 90233500 -13261474 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 3 1273 345 133 0 77 chr15 90233881 90233946 -13261028 + RLTR23 LTR ERV1 1 60 -370 3 1273 1004 303 99 11 chr15 90235491 90235841 -13259133 + MTE2b LTR MaLR 3 377 -2 3 1273 6807 124 27 73 chr15 90237376 90238688 -13256286 + MYSERV6-int LTR ERVK 874 2125 -6834 3 1273 1616 81 101 0 chr15 90238750 90239008 -13255966 + MYSERV6-int LTR ERVK 4711 4994 -3965 3 1273 3203 154 47 55 chr15 90239167 90239542 -13255432 + MYSERV6-int LTR ERVK 6363 6733 -2226 3 1273 2315 161 66 11 chr15 90239542 90240014 -13254960 + RLTR19 LTR ERVK 2 499 0 3 1273 3203 154 47 55 chr15 90240014 90240345 -13254629 + MYSERV6-int LTR ERVK 6734 7063 -1896 3 1273 1235 145 15 15 chr15 90241394 90241653 -13253321 + MYSERV6-int LTR ERVK 7059 7317 -1642 3 1273 1370 184 54 57 chr15 90241851 90242202 -13252772 - RLTR19-int LTR ERVK -1767 4370 4021 3 1273 949 308 97 20 chr15 90248287 90248741 -13246233 - RMER5 LTR ERV1 -13 521 33 3 1273 357 174 90 80 chr15 90254882 90254981 -13239993 - RMER5 LTR ERV1 -139 395 296 3 1273 744 241 52 167 chr15 90254981 90255183 -13239791 + MTD LTR MaLR 2 206 -213 4 1273 744 241 52 167 chr15 90255312 90255433 -13239541 + MTD LTR MaLR 207 288 -131 4 1273 407 299 84 66 chr15 90255500 90255726 -13239248 - RMER5 LTR ERV1 -302 232 3 3 1273 655 324 123 8 chr15 90259147 90259408 -13235566 - MTE2b LTR MaLR -88 291 1 4 1273 1574 233 29 29 chr15 90259462 90259838 -13235136 + MTD LTR MaLR 33 408 -11 4 1273 350 202 112 0 chr15 90264799 90264888 -13230086 - MTD LTR MaLR -1 418 320 4 1273 802 295 34 70 chr15 90269447 90270132 -13224842 - RLTR18 LTR ERVK -10 502 1 4 1273 3680 157 68 49 chr15 90276580 90277377 -13217597 + RLTR40 LTR ERVK 1 812 -5 4 1273 298 336 70 8 chr15 90280302 90280431 -13214543 - MLT1J LTR MaLR -336 176 40 4 1273 700 226 146 19 chr15 90285315 90285469 -13209505 + ORR1B1 LTR MaLR 1 159 -235 4 1273 700 234 186 24 chr15 90286073 90286221 -13208753 + ORR1B1 LTR MaLR 160 352 -7 4 1273 2884 55 3 29 chr15 90287496 90287871 -13207103 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 4 1273 314 133 150 62 chr15 90289094 90289174 -13205800 - MLT1A0 LTR MaLR -54 311 225 4 1273 322 375 27 5 chr15 90289763 90289948 -13205026 - MLT1J-int LTR MaLR -671 716 528 4 1273 369 303 28 0 chr15 90290042 90290151 -13204823 + MLT1A1 LTR MaLR 15 126 -282 4 1273 340 292 8 34 chr15 90290177 90290294 -13204680 + MLT1A1 LTR MaLR 262 375 -33 4 1273 2516 251 46 68 chr15 90294209 90295115 -13199859 - MTD-int LTR MaLR -463 795 2 4 1273 1011 258 16 16 chr15 90295116 90295360 -13199614 - MTD LTR MaLR 0 419 176 4 1273 563 267 41 58 chr15 90296180 90296351 -13198623 - ORR1E LTR MaLR -5 354 187 4 1273 717 194 22 0 chr15 90296397 90296531 -13198443 - ORR1E LTR MaLR -218 141 5 4 1273 1919 141 26 67 chr15 90298117 90298460 -13196514 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1273 2388 50 63 0 chr15 90300628 90300946 -13194028 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 4 1273 13513 58 18 4 chr15 90300950 90302717 -13192257 + ORR1A1-int LTR MaLR 1 1792 0 4 1273 2615 48 42 6 chr15 90302717 90303051 -13191923 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 4 1273 1166 197 27 86 chr15 90305717 90306126 -13188848 - MTC-int LTR MaLR -791 467 17 4 1273 2443 160 30 2 chr15 90306141 90306548 -13188426 - MTC LTR MaLR -3 418 1 4 1273 964 252 86 14 chr15 90306841 90307191 -13187783 - MTEb LTR MaLR -4 375 1 4 1274 1728 202 57 11 chr15 90309544 90309915 -13185059 - MTD LTR MaLR -31 388 1 4 1274 2413 131 5 33 chr15 90311464 90311883 -13183091 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1274 936 228 55 55 chr15 90312958 90313399 -13181575 + RMER2 LTR ERV1 1 540 -27 4 1274 647 259 202 104 chr15 90319838 90320165 -13174809 + MTD LTR MaLR 9 367 -12 5 1274 2589 146 105 8 chr15 90340926 90341404 -13153570 + RLTR11A LTR ERVK 5 528 0 5 1274 262 313 78 45 chr15 90341422 90341576 -13153398 - MLT1F LTR MaLR -47 522 364 5 1274 295 263 126 0 chr15 90341583 90341678 -13153296 - MLT1F LTR MaLR -286 262 156 5 1274 1168 240 122 24 chr15 90342283 90342620 -13152354 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 5 1274 402 364 105 38 chr15 90345502 90345816 -13149158 + MLT1H1 LTR MaLR 10 344 -211 5 1274 1479 129 76 32 chr15 90347422 90347750 -13147224 - RMER17A LTR ERVK 0 889 442 5 1274 1072 99 0 24 chr15 90347737 90347902 -13147072 - RMER17A LTR ERVK -590 161 1 5 1274 1051 205 24 5 chr15 90350414 90350620 -13144354 + MTC LTR MaLR 1 210 -211 5 1274 1337 181 0 4 chr15 90350789 90351016 -13143958 + MTC LTR MaLR 196 421 0 5 1274 229 256 125 23 chr15 90352061 90352149 -13142825 + LTR89 LTR ERVL? 614 710 -169 5 1274 1631 176 131 70 chr15 90369613 90370010 -13124964 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1274 366 244 88 88 chr15 90372406 90372577 -13122397 + RLTR14 LTR ERV1 212 382 0 5 1274 350 365 36 79 chr15 90372577 90372854 -13122120 + RMER5 LTR ERV1 79 343 -191 5 1274 602 235 77 57 chr15 90373108 90373302 -13121672 + RMER5 LTR ERV1 329 526 -8 5 1274 227 373 30 60 chr15 90375270 90375404 -13119570 + RMER15 LTR ERVL 423 552 -23 5 1274 992 242 81 141 chr15 90378149 90378616 -13116358 - RLTR12B LTR ERVK -42 486 48 5 1274 1286 229 26 83 chr15 90382776 90383161 -13111813 + MTE2a LTR MaLR 17 379 0 6 1274 243 241 92 46 chr15 90387832 90387919 -13107055 + MTEa LTR MaLR 258 348 -31 6 1274 1355 209 85 4 chr15 90388382 90388680 -13106294 + ORR1D2 LTR MaLR 44 401 -6 6 1274 2209 167 12 19 chr15 90405494 90405915 -13089059 + MTC LTR MaLR 1 418 -3 6 1274 289 305 42 73 chr15 90418034 90418225 -13076749 - MLT1E1A LTR MaLR -16 664 480 6 1274 1236 261 86 35 chr15 90419268 90419724 -13075250 + RMER5 LTR ERV1 16 494 -40 6 1274 1716 183 39 91 chr15 90421544 90421960 -13073014 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1274 880 275 117 34 chr15 90424838 90425162 -13069812 - MTE2a LTR MaLR -1 378 28 6 1274 1644 189 7 116 chr15 90426400 90426813 -13068161 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 5 6 1274 257 237 237 0 chr15 90431736 90431854 -13063120 + RMER15 LTR ERVL 408 553 -22 6 1275 506 325 138 25 chr15 90444579 90444898 -13050076 + ORR1E LTR MaLR 5 359 0 6 1275 382 306 154 31 chr15 90446567 90446891 -13048083 + MTEa LTR MaLR 1 364 -15 6 1275 227 286 26 18 chr15 90451276 90451390 -13043584 + ORR1C2 LTR MaLR 31 145 -239 6 1275 337 296 10 10 chr15 90451570 90451669 -13043305 + MTE-int LTR MaLR 29 127 -1453 6 1275 541 301 37 119 chr15 90451834 90452127 -13042847 + MTE-int LTR MaLR 121 389 -1191 6 1275 3105 148 118 59 chr15 90452132 90452334 -13042640 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 171 -1677 6 1275 3105 148 118 59 chr15 90452391 90452948 -13042026 + RLTR22_Mur LTR ERVK 172 805 -1043 6 1275 720 170 41 35 chr15 90453513 90453684 -13041290 + RLTR22_Mur LTR ERVK 822 993 -855 6 1275 1150 170 63 8 chr15 90453852 90454089 -13040885 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1599 1848 0 6 1275 228 226 81 23 chr15 90455435 90455521 -13039453 + MLT1A1 LTR MaLR 317 407 -1 6 1275 3000 24 0 0 chr15 90459664 90459996 -13034978 + IAPEY3_LTR LTR ERVK 1 332 0 6 1275 282 331 118 0 chr15 90462512 90462617 -13032357 + MLT2C2 LTR ERVL 345 450 -83 7 1275 284 185 38 0 chr15 90462650 90462713 -13032261 + MLT2C2 LTR ERVL 451 559 0 7 1275 1928 187 13 28 chr15 90463551 90463948 -13031026 + RMER3D-int LTR ERVK 2450 2840 -2 7 1275 1784 214 187 23 chr15 90463950 90464432 -13030542 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 7 1275 3168 56 2 17 chr15 90464462 90464864 -13030110 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1275 2214 87 60 17 chr15 90466898 90467250 -13027724 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 1275 56223 29 6 5 chr15 90467252 90473690 -13021284 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 34 7 1275 2214 87 60 17 chr15 90473700 90474052 -13020922 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 7 1275 553 325 56 20 chr15 90476771 90477022 -13017952 + MTE-int LTR MaLR 189 448 -1132 7 1275 248 371 69 23 chr15 90477532 90477750 -13017224 + MTE-int LTR MaLR 1070 1297 -283 7 1275 614 208 12 25 chr15 90485556 90485719 -13009255 + RMER4B LTR ERVK 17 177 -408 7 1275 384 224 81 124 chr15 90486034 90486243 -13008731 + RMER19C LTR ERVK 389 588 -23 7 1275 1352 180 134 23 chr15 90488444 90488786 -13006188 - MTD LTR MaLR -1 418 39 7 1275 248 260 57 64 chr15 90488917 90489057 -13005917 + MLT1D LTR MaLR 15 153 -352 7 1275 259 240 173 39 chr15 90490868 90491024 -13003950 - RMER15 LTR ERVL -15 560 384 7 1275 2069 139 144 21 chr15 90506956 90507330 -12987644 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 1 1275 2139 102 48 3 chr15 90512955 90513268 -12981706 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1275 4958 159 64 40 chr15 90513574 90513746 -12981228 - RLTR25A LTR ERVK 0 1103 892 2 1275 4958 159 64 40 chr15 90513795 90514699 -12980275 - RLTR25A LTR ERVK -212 891 1 2 1275 245 321 51 92 chr15 90516145 90516437 -12978537 - MLT1H2 LTR MaLR -9 480 201 2 1275 1313 198 112 11 chr15 90518529 90518877 -12976097 - MTD LTR MaLR 0 419 37 2 1275 550 279 8 0 chr15 90522595 90522724 -12972250 - MTE-int LTR MaLR -288 1292 1163 3 1275 639 246 78 10 chr15 90522722 90522927 -12972047 + MTE2b-int LTR MaLR 1361 1579 -1 3 1275 912 298 96 4 chr15 90522972 90523252 -12971722 + MTE2b LTR MaLR 1 306 -73 3 1275 1415 214 113 13 chr15 90524992 90525371 -12969603 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 1275 1008 193 76 91 chr15 90530063 90530460 -12964514 - MT2A LTR ERVL -70 531 1 5 1275 255 240 36 91 chr15 90531159 90531269 -12963705 - ERVL-int LTR ERVL -742 5015 4912 5 1275 357 271 30 30 chr15 90532055 90532188 -12962786 + MamGypLTR2b LTR Gypsy 764 896 -26 5 1275 525 214 226 21 chr15 90535733 90535919 -12959055 + MTD LTR MaLR 196 419 0 6 1275 1962 123 37 29 chr15 90536065 90536415 -12958559 + RLTR15 LTR ERVK 1 353 -6 6 1275 4092 37 5 89 chr15 90537630 90538189 -12956785 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 6 1275 330 155 0 0 chr15 90542140 90542198 -12952776 - RLTR20A LTR ERVK -101 440 383 6 1275 348 277 96 89 chr15 90542169 90542450 -12952524 - RLTR16 LTR ERVK -220 285 3 6 1275 2217 228 42 33 chr15 90547067 90547693 -12947281 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2343 3048 -2713 8 1275 2370 109 9 6 chr15 90548024 90548366 -12946608 - ORR1A1 LTR MaLR -3 343 1 8 1275 2621 242 46 14 chr15 90548669 90549302 -12945672 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3336 3988 -1773 8 1275 2029 256 38 112 chr15 90549710 90550520 -12944454 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4841 5590 -171 8 1275 250 305 94 9 chr15 90551087 90551193 -12943781 - ORR1E LTR MaLR -221 138 24 8 1275 329 293 97 26 chr15 90551674 90551828 -12943146 - ERVL-E-int LTR ERVL -1247 4420 4256 8 1275 2105 149 29 42 chr15 90556343 90556729 -12938245 + RLTR20B1 LTR ERVK 77 457 -106 9 1275 440 217 31 42 chr15 90556998 90557094 -12937880 + RLTR20B1 LTR ERVK 466 560 -3 9 1275 1146 252 58 14 chr15 90560688 90561050 -12933924 - MTEb LTR MaLR -1 378 1 1 1275 1190 292 42 14 chr15 90561050 90561512 -12933462 - MTEb-int LTR MaLR 0 1580 1069 1 1275 1373 270 50 18 chr15 90561512 90561851 -12933123 + ORR1E LTR MaLR 1 350 -9 1 1275 1562 315 64 15 chr15 90561943 90562472 -12932502 - MTEb-int LTR MaLR -511 1069 515 1 1275 3074 64 18 0 chr15 90569599 90569992 -12924982 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1276 284 266 0 0 chr15 90575170 90575234 -12919740 + RMER15 LTR ERVL 403 466 -109 1 1276 2936 139 37 10 chr15 90576533 90577019 -12917955 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 1 1276 1142 212 154 4 chr15 90577702 90577981 -12916993 - MTD LTR MaLR -14 405 85 1 1276 233 306 134 64 chr15 90583123 90583377 -12911597 + MLT1E2 LTR MaLR 1 265 -362 1 1276 505 325 46 0 chr15 90583426 90583577 -12911397 + MTEa LTR MaLR 3 160 -219 1 1276 370 362 35 35 chr15 90583577 90583626 -12911348 + MT2A LTR ERVL 3 207 -326 1 1276 457 277 112 19 chr15 90583661 90583823 -12911151 + MT2A LTR ERVL 208 423 -110 1 1276 516 300 59 56 chr15 90583924 90584204 -12910770 - ORR1E LTR MaLR -15 364 68 1 1276 4287 151 76 71 chr15 90584204 90585090 -12909884 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 1 1276 549 131 232 65 chr15 90585258 90585413 -12909561 + RMER19C LTR ERVK 309 489 -413 1 1276 1051 189 97 22 chr15 90585400 90585627 -12909347 + RMER19C LTR ERVK 368 611 0 1 1276 3339 31 10 2 chr15 90589569 90589962 -12905012 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1276 1447 221 17 0 chr15 90591192 90591482 -12903492 + RLTR14 LTR ERV1 88 382 0 1 1276 703 310 50 87 chr15 90592221 90592602 -12902372 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 1 1276 642 202 0 0 chr15 90593667 90593786 -12901188 + ORR1A4-int LTR MaLR 1841 1959 -4 1 1276 1365 164 45 87 chr15 90593790 90594078 -12900896 + ORR1A4 LTR MaLR 1 276 -53 1 1276 2285 85 84 47 chr15 90594272 90594654 -12900320 - RLTR13C1 LTR ERVK 0 983 588 1 1276 3689 110 86 11 chr15 90595176 90595842 -12899132 - RLTR13D3 LTR ERVK -314 719 1 1 1276 434 295 63 57 chr15 90596966 90597332 -12897642 - ORR1E LTR MaLR -1 373 7 1 1276 1864 156 21 38 chr15 90601100 90601473 -12893501 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 1 1276 1695 180 94 21 chr15 90602104 90602434 -12892540 - MTC LTR MaLR 0 421 68 1 1276 403 212 12 0 chr15 90602648 90602728 -12892246 - MTC LTR MaLR -340 81 1 1 1276 251 125 34 51 chr15 90612340 90612399 -12882575 + RLTR12A LTR ERVK 260 317 -251 1 1276 473 354 45 75 chr15 90614723 90614989 -12879985 - MER21B LTR ERV1 -597 266 9 2 1276 1269 263 76 0 chr15 90619378 90619720 -12875254 + MTEb LTR MaLR 6 373 -6 2 1276 448 183 343 12 chr15 90629154 90629320 -12865654 - MTD LTR MaLR -3 416 196 2 1276 988 266 20 92 chr15 90635643 90635699 -12859275 - MTE2b LTR MaLR -95 284 233 2 1276 1674 224 21 34 chr15 90635699 90636078 -12858896 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1276 988 266 20 92 chr15 90636078 90636327 -12858647 - MTE2b LTR MaLR -147 232 1 2 1276 4027 171 49 28 chr15 90640356 90640587 -12854387 - RLTR40 LTR ERVK -4 813 569 2 1276 4027 171 49 28 chr15 90640679 90641242 -12853732 - RLTR40 LTR ERVK -249 568 4 2 1276 346 336 0 0 chr15 90643061 90643180 -12851794 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1331 3732 3614 2 1276 1706 209 23 80 chr15 90643402 90643839 -12851135 - MTD LTR MaLR -7 412 1 2 1276 276 333 0 0 chr15 90647294 90647390 -12847584 - MuRRS4-int LTR ERV1 -4096 2580 2485 2 1276 270 370 24 0 chr15 90647975 90648102 -12846872 - MuRRS4-int LTR ERV1 -5330 1875 1746 2 1276 1485 244 76 63 chr15 90652561 90653085 -12841889 - RMER5 LTR ERV1 -3 531 1 2 1276 836 320 71 9 chr15 90653504 90653841 -12841133 + MLT1A0 LTR MaLR 1 358 -7 2 1276 1492 190 157 52 chr15 90660206 90660701 -12834273 + RMER19B LTR ERVK 25 715 -187 2 1276 2448 201 6 166 chr15 90661333 90662061 -12832913 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 2 1276 1486 199 141 124 chr15 90664943 90665396 -12829578 - RMER6B LTR ERVK 0 461 1 2 1276 3042 146 14 4 chr15 90667720 90668208 -12826766 - RLTR19 LTR ERVK -6 493 1 2 1276 1428 223 16 69 chr15 90669303 90669491 -12825483 + RMER10B LTR ERVL 32 200 -198 2 1276 1428 223 16 69 chr15 90669538 90669725 -12825249 + RMER10B LTR ERVL 201 387 -11 2 1276 2786 69 39 101 chr15 90670357 90670791 -12824183 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1276 1580 59 5 0 chr15 90671665 90671869 -12823105 - MTB LTR MaLR -195 205 1 2 1276 1031 200 170 61 chr15 90673135 90673623 -12821351 + RLTR19-int LTR ERVK 3551 3963 -2174 2 1276 267 224 14 56 chr15 90673846 90673917 -12821057 + RLTR19-int LTR ERVK 4039 4106 -2031 2 1276 428 263 37 22 chr15 90674440 90674576 -12820398 + RLTR19-int LTR ERVK 4238 4375 -1762 2 1276 2638 86 3 0 chr15 90676550 90676876 -12818098 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1276 444 214 106 7 chr15 90679157 90679298 -12815676 + LTR82A LTR ERVL 1 155 -717 2 1276 2000 231 29 60 chr15 90681712 90682224 -12812750 + RMER20A LTR ERVK 21 516 0 2 1276 1082 135 53 86 chr15 90682907 90683151 -12811823 + RMER17C LTR ERVK 144 379 -31 2 1276 528 200 0 167 chr15 90684007 90684169 -12810805 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 135 -318 2 1276 1658 206 50 21 chr15 90685063 90685444 -12809530 + RLTR11A2 LTR ERVK 136 527 0 2 1276 336 318 185 62 chr15 90686475 90686800 -12808174 + MLT1J1 LTR MaLR 68 432 -16 3 1276 673 304 152 30 chr15 90686833 90687334 -12807640 - LTR82A LTR ERVL -92 780 219 3 1276 2442 151 50 23 chr15 90687463 90688243 -12806731 - RMER6A LTR ERVK 0 756 57 3 1276 1665 221 170 25 chr15 90688430 90688866 -12806108 + RLTR19 LTR ERVK 1 499 0 3 1276 380 278 0 53 chr15 90691387 90691501 -12803473 + RLTR42-int LTR ERVK 2867 2974 -2548 3 1276 270 321 36 14 chr15 90691763 90691902 -12803072 + RLTR42-int LTR ERVK 4095 4236 -1286 3 1276 778 355 66 39 chr15 90692149 90692635 -12802339 - MLT2B3 LTR ERVL -55 499 1 3 1276 381 370 49 31 chr15 90692893 90693116 -12801858 - MamGypLTR2 LTR Gypsy -648 541 315 3 1276 265 310 110 31 chr15 90693525 90693688 -12801286 + LTR37A LTR ERV1 237 412 -14 3 1276 1269 249 50 47 chr15 90694049 90694321 -12800653 - MTE2b LTR MaLR 0 379 107 3 1276 2168 199 22 5 chr15 90694321 90694731 -12800243 + MTD LTR MaLR 3 419 0 3 1276 1269 249 50 47 chr15 90694731 90694821 -12800153 - MTE2b LTR MaLR -273 106 16 3 1276 537 255 107 21 chr15 90695055 90695287 -12799687 - MLT1E1 LTR MaLR -2 652 302 3 1276 1795 214 79 15 chr15 90696810 90697204 -12797770 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1276 1141 218 178 9 chr15 90698098 90698413 -12796561 + ORR1D1 LTR MaLR 1 368 -6 3 1277 2295 129 9 3 chr15 90710462 90710789 -12784185 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1277 1537 241 65 16 chr15 90710885 90711268 -12783706 - MTD LTR MaLR -14 405 4 3 1277 679 193 84 6 chr15 90712109 90712276 -12782698 + RMER5 LTR ERV1 348 527 -7 3 1277 236 370 0 0 chr15 90718829 90718910 -12776064 + RMER15 LTR ERVL 346 426 -149 3 1277 2676 217 77 26 chr15 90718905 90719634 -12775340 - RLTR40 LTR ERVK -37 780 15 3 1277 981 254 51 128 chr15 90719710 90720203 -12774771 - RLTR12B LTR ERVK -32 496 42 3 1277 3464 10 0 15 chr15 90720860 90721272 -12773702 - MT2_Mm LTR ERVL -87 406 1 3 1277 1024 270 110 3 chr15 90724259 90724541 -12770433 + MTD LTR MaLR 1 312 -107 3 1277 930 270 45 57 chr15 90732610 90732963 -12762011 + MLT1B LTR MaLR 1 349 -41 3 1277 486 215 60 23 chr15 90736598 90736731 -12758243 - RMER5 LTR ERV1 -364 170 33 3 1277 1220 278 77 3 chr15 90737586 90737939 -12757035 + MTE2b LTR MaLR 1 379 0 3 1277 489 224 121 15 chr15 90738185 90738355 -12756619 + MT2A LTR ERVL 225 458 -75 3 1277 309 27 176 0 chr15 90738840 90738914 -12756060 + MT2A LTR ERVL 447 533 0 3 1277 340 247 41 224 chr15 90742175 90742420 -12752554 + RLTR42-int LTR ERVK 1669 1868 -3654 3 1277 1604 204 138 8 chr15 90742804 90743165 -12751809 - MTD LTR MaLR 0 419 12 3 1277 1086 241 134 101 chr15 90745683 90746211 -12748763 - RMER4B LTR ERVK -24 561 3 3 1277 3063 72 40 15 chr15 90746217 90746614 -12748360 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1277 2779 220 8 77 chr15 90748345 90749005 -12745969 - RLTR18 LTR ERVK 0 616 3 3 1277 698 296 82 31 chr15 90750609 90751011 -12743963 + MLT2B4 LTR ERVL 228 682 -35 3 1277 2810 28 68 0 chr15 90752941 90753265 -12741709 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 3 1277 1177 202 26 4 chr15 90753281 90753515 -12741459 - RLTR42 LTR ERVK 0 239 1 3 1277 1281 280 50 25 chr15 90753605 90754045 -12740929 - RMER5 LTR ERV1 -15 519 69 4 1277 1962 176 56 36 chr15 90755194 90755390 -12739584 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 166 4 1277 1962 176 56 36 chr15 90755415 90755578 -12739396 - ORR1B2 LTR MaLR -202 165 3 4 1277 586 317 78 38 chr15 90756251 90756727 -12738247 - MER52-int LTR ERV1 -973 6118 5624 4 1277 663 336 103 37 chr15 90757168 90757820 -12737154 - MER52-int LTR ERV1 -2002 5089 4395 4 1277 2495 105 12 0 chr15 90757947 90758270 -12736704 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1277 2419 82 3 0 chr15 90758982 90759299 -12735675 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 2 4 1277 749 223 69 53 chr15 90760851 90761097 -12733877 - RLTR40 LTR ERVK -567 250 1 4 1277 2008 120 3 73 chr15 90761501 90761842 -12733132 + ORR1A3 LTR MaLR 2 318 -8 4 1277 239 125 25 0 chr15 90762730 90762770 -12732204 - RMER19B LTR ERVK 0 902 862 4 1277 948 232 168 86 chr15 90768260 90768646 -12726328 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 4 1277 837 221 30 45 chr15 90791343 90791542 -12703432 + ORR1D2 LTR MaLR 1 196 -174 4 1277 402 338 89 50 chr15 90792427 90792927 -12702047 + MER68 LTR ERVL 1 569 -38 4 1277 1493 225 177 30 chr15 90797952 90798443 -12696531 + RMER2 LTR ERV1 1 563 -4 4 1277 2147 152 9 3 chr15 90809537 90809861 -12685113 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 4 1277 353 164 0 15 chr15 90814679 90814747 -12680227 - RLTR40 LTR ERVK -574 243 177 5 1278 320 323 74 45 chr15 90834328 90834683 -12660291 + LTR40b LTR ERVL 111 461 -1 5 1278 323 303 188 10 chr15 90837241 90837438 -12657536 + MLT1D LTR MaLR 273 504 -1 5 1278 385 285 128 11 chr15 90840708 90840896 -12654078 - MLT1E1A LTR MaLR -127 553 344 5 1278 266 371 87 24 chr15 90842185 90842392 -12652582 + MLT1J LTR MaLR 292 511 -1 5 1278 702 321 109 17 chr15 90842546 90843006 -12651968 - RMER5 LTR ERV1 0 534 33 5 1278 2245 147 68 12 chr15 90843060 90843459 -12651515 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1278 272 276 0 65 chr15 90845760 90845853 -12649121 + MT2B LTR ERVL 178 264 -337 5 1278 366 242 23 70 chr15 90846263 90846283 -12648691 + MT2B LTR ERVL 147 160 -441 5 1278 275 297 135 0 chr15 90848592 90848703 -12646271 + LTR16D LTR ERVL 526 651 0 5 1278 622 229 135 39 chr15 90851923 90852182 -12642792 + RMER10A LTR ERVL 131 414 -28 5 1278 809 165 18 64 chr15 90853475 90853679 -12641295 + RMER17C LTR ERVK 1 195 -215 5 1278 809 165 18 64 chr15 90853736 90853751 -12641223 + RMER17C LTR ERVK 196 210 -200 5 1278 1148 226 67 14 chr15 90855891 90856174 -12638800 - MTD LTR MaLR -121 298 1 5 1278 2140 113 9 20 chr15 90857750 90858094 -12636880 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 27 5 1278 263 257 26 39 chr15 90858095 90858172 -12636802 - ORR1B2 LTR MaLR -265 102 27 5 1278 375 224 20 30 chr15 90858173 90858274 -12636700 - ORR1B2 LTR MaLR -265 102 3 5 1278 1396 197 85 37 chr15 90860274 90860627 -12634347 + ORR1D1 LTR MaLR 5 374 0 5 1278 460 297 25 25 chr15 90860930 90861092 -12633882 + ORR1E LTR MaLR 31 192 -167 5 1278 2678 139 9 5 chr15 90861175 90861594 -12633380 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1278 988 53 8 0 chr15 90865952 90866085 -12628889 + BGLII LTR ERVK 1 134 -287 5 1278 1934 74 20 0 chr15 90866266 90866565 -12628409 + BGLII LTR ERVK 117 421 0 5 1278 1319 60 63 24 chr15 90867808 90868013 -12626961 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 134 5 1278 2542 174 58 75 chr15 90868263 90868834 -12626140 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 561 0 5 1278 361 232 12 0 chr15 90870033 90870115 -12624859 + ORR1D1 LTR MaLR 3 85 -289 6 1278 636 200 124 45 chr15 90870216 90870263 -12624711 + ORR1D1 LTR MaLR 183 245 -129 6 1278 636 200 124 45 chr15 90870290 90870420 -12624554 + ORR1D1 LTR MaLR 246 374 0 6 1278 705 202 263 3 chr15 90877029 90877362 -12617612 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1278 2112 181 89 84 chr15 90883131 90883657 -12611317 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 6 1278 238 243 93 13 chr15 90884714 90884789 -12610185 - MLT1A1 LTR MaLR -46 362 282 6 1278 226 345 16 109 chr15 90888988 90889048 -12605926 + MLT1A LTR MaLR 192 249 -125 6 1278 2907 82 20 2 chr15 90889048 90889441 -12605533 + MTB LTR MaLR 1 400 0 6 1278 226 345 16 109 chr15 90889441 90889501 -12605473 + MLT1A LTR MaLR 250 308 -66 6 1278 226 345 16 109 chr15 90889681 90889751 -12605223 + MLT1A LTR MaLR 309 365 -9 6 1278 290 274 53 0 chr15 90890128 90890241 -12604733 + MLT-int LTR MaLR 1413 1531 -204 6 1278 2797 61 15 12 chr15 90891608 90892009 -12602965 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 6 6 1278 414 313 84 30 chr15 90897395 90897632 -12597342 + MLT2C1 LTR ERVL 143 392 -5 6 1278 521 307 99 65 chr15 90897795 90898167 -12596807 + MLT1A1 LTR MaLR 23 407 -1 6 1278 2526 164 49 5 chr15 90899981 90900389 -12594585 - RMER4A LTR ERVK 0 466 40 6 1278 2526 164 49 5 chr15 90900410 90900447 -12594527 - RMER4A LTR ERVK -427 39 1 6 1278 2175 131 16 0 chr15 90901107 90901428 -12593546 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 6 1278 1318 139 0 5 chr15 90902362 90902586 -12592388 - RMER4A LTR ERVK -243 223 1 6 1278 1168 217 140 92 chr15 90904072 90904580 -12590394 + RLTR20C LTR ERVK 1 532 -2 6 1278 2952 130 80 8 chr15 90909193 90909682 -12585292 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 6 1278 332 275 103 27 chr15 90923396 90923542 -12571432 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 209 6 1278 1639 181 78 26 chr15 90924863 90925210 -12569764 - ORR1B2 LTR MaLR -2 365 1 6 1278 1596 218 29 50 chr15 90927068 90927450 -12567524 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 6 1278 280 174 0 0 chr15 90931609 90931655 -12563319 + MTE2a LTR MaLR 1 46 -333 7 1278 2236 138 114 5 chr15 90932288 90932666 -12562308 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 7 1278 1513 210 59 47 chr15 90933200 90933609 -12561365 - MTD LTR MaLR -5 414 1 7 1278 467 213 15 42 chr15 90937828 90937964 -12557010 - MTD LTR MaLR -7 414 277 7 1278 1306 265 41 77 chr15 90940763 90941090 -12553884 + RMER5 LTR ERV1 23 329 -205 7 1278 1306 265 41 77 chr15 90941275 90941478 -12553496 + RMER5 LTR ERV1 330 534 0 7 1278 796 239 78 101 chr15 90941538 90941975 -12552999 + RMER10A LTR ERVL 12 438 -4 7 1278 3720 35 5 2 chr15 90945288 90945723 -12549251 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 1278 2629 61 0 0 chr15 90945723 90946066 -12548908 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1 343 -7238 7 1278 675 194 12 66 chr15 90946064 90946356 -12548618 + MMERVK10C-int LTR ERVK 729 952 -6629 7 1278 597 235 131 53 chr15 90946446 90946816 -12548158 + MMERVK10C-int LTR ERVK 312 668 -5469 7 1278 306 155 17 0 chr15 90946816 90946874 -12548100 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1721 1779 -5627 7 1278 367 95 0 0 chr15 90946881 90946944 -12548030 + MMERVK10C-int LTR ERVK 1885 1947 -5634 7 1278 42424 17 5 0 chr15 90946950 90951956 -12543018 + MMERVK10C-int LTR ERVK 2552 7581 0 7 1278 3720 35 5 2 chr15 90951956 90952391 -12542583 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 1278 1284 262 19 58 chr15 90952845 90953222 -12541752 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 5 7 1278 1529 238 10 102 chr15 90957219 90957459 -12537515 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 163 7 1278 1529 238 10 102 chr15 90957550 90957721 -12537253 - ORR1D1 LTR MaLR -212 162 1 7 1279 519 235 49 21 chr15 90965528 90965673 -12529301 + MTE2b LTR MaLR 216 377 -2 7 1279 2199 156 31 8 chr15 90967591 90968092 -12526882 + RLTR20D LTR ERVK 1 568 0 7 1279 466 301 8 0 chr15 90971216 90971339 -12523635 + MTD LTR MaLR 1 124 -295 7 1279 919 261 201 0 chr15 90971725 90972009 -12522965 + MTD LTR MaLR 79 419 0 7 1279 2146 139 70 6 chr15 90972751 90973106 -12521868 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1279 1461 172 77 83 chr15 90974648 90974922 -12520052 + RMER17C LTR ERVK 16 410 -548 7 1279 1461 163 101 75 chr15 90974971 90975155 -12519819 + RMER17C LTR ERVK 232 409 -1 7 1279 1237 218 82 39 chr15 90975378 90975708 -12519266 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 31 7 1279 1785 170 146 89 chr15 90993874 90994346 -12500628 + MT2A LTR ERVL 1 499 -34 7 1279 371 315 149 93 chr15 91007614 91007957 -12487017 + ORR1E LTR MaLR 8 369 -1 9 1279 1742 193 54 44 chr15 91011180 91011587 -12483387 - MTD LTR MaLR -8 411 1 1 1279 1924 156 89 9 chr15 91026038 91026375 -12468599 + ORR1C1 LTR MaLR 15 378 0 3 1279 2227 157 164 58 chr15 91031206 91031726 -12463248 - RMER15 LTR ERVL 0 575 1 5 1279 387 293 83 0 chr15 91040363 91040520 -12454454 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 205 6 1279 226 252 76 93 chr15 91040575 91040693 -12454281 + LTR86A1 LTR ERVL 43 158 -355 6 1279 254 340 28 0 chr15 91041743 91041849 -12453125 - HUERS-P3b-int LTR ERV1 -5532 1886 1778 6 1279 420 328 39 29 chr15 91048672 91048879 -12446095 + RMER15 LTR ERVL 325 533 -42 7 1279 538 307 13 10 chr15 91052920 91053111 -12441863 - MT2A LTR ERVL -88 513 318 8 1279 307 189 0 0 chr15 91054700 91054753 -12440221 - MT2A LTR ERVL -386 147 95 8 1279 666 208 33 46 chr15 91054738 91054889 -12440085 - MT2A LTR ERVL -384 149 1 8 1279 273 161 18 0 chr15 91054889 91054945 -12440029 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5705 8 1279 227 292 40 40 chr15 91054948 91055048 -12439926 - ORR1A3-int LTR MaLR -1329 634 535 8 1279 8440 168 76 8 chr15 91055051 91056045 -12438929 - MERVL_2A-int LTR ERVL -111 5650 4575 8 1279 2441 146 11 6 chr15 91056045 91056410 -12438564 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 8 1279 21196 180 33 16 chr15 91056410 91059265 -12435709 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1187 4574 1682 8 1279 2277 41 0 154 chr15 91059265 91059610 -12435364 - RLTR10B LTR ERVK 0 292 1 8 1279 21196 180 33 16 chr15 91059610 91059881 -12435093 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4080 1681 1410 8 1279 2293 184 44 24 chr15 91059876 91060333 -12434641 - MERVL_2A-int LTR ERVL -4723 1038 573 8 1279 469 304 118 24 chr15 91060334 91060580 -12434394 + MLT1A0 LTR MaLR 43 311 -54 8 1279 410 232 142 55 chr15 91061060 91061247 -12433727 - LTR48 LTR ERV1 -466 178 1 9 1279 293 266 84 11 chr15 91067468 91067563 -12427411 - MER34 LTR ERV1 -69 473 372 1 1279 974 182 69 5 chr15 91079317 91079521 -12415453 + MTC LTR MaLR 1 217 -204 1 1279 439 161 24 12 chr15 91079496 91079578 -12415396 + MTC LTR MaLR 331 413 -8 1 1279 319 336 13 77 chr15 91080258 91080413 -12414561 + MTD LTR MaLR 1 145 -274 1 1279 258 312 49 12 chr15 91080975 91081056 -12413918 + MLT1J2 LTR MaLR 257 340 -108 1 1279 1182 227 101 15 chr15 91082151 91082477 -12412497 + ORR1D1 LTR MaLR 21 374 0 1 1279 918 189 19 56 chr15 91086174 91086378 -12408596 - ORR1D1 LTR MaLR -92 282 87 1 1279 1649 157 125 23 chr15 91086378 91086723 -12408251 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 5 1 1279 1326 248 68 38 chr15 91088513 91088911 -12406063 - MTD LTR MaLR -7 412 3 1 1279 235 327 74 66 chr15 91090571 91090692 -12404282 - LTR78 LTR ERV1 -307 997 876 1 1279 2648 50 92 0 chr15 91091502 91091860 -12403114 - MTB_Mm LTR MaLR -16 391 1 1 1280 879 192 62 0 chr15 91097590 91097783 -12397191 + RLTR11A2 LTR ERVK 323 527 0 1 1280 722 193 16 60 chr15 91107359 91107541 -12387433 - ORR1D1 LTR MaLR -204 180 7 1 1280 3307 237 92 26 chr15 91107543 91108424 -12386550 - ORR1D1-int LTR MaLR -39 1331 393 1 1280 1622 254 5 23 chr15 91109004 91109402 -12385572 - ORR1D1-int LTR MaLR -1118 391 1 1 1280 949 232 221 47 chr15 91109402 91109728 -12385246 - ORR1D1 LTR MaLR 0 384 2 1 1280 4074 107 51 26 chr15 91109874 91110460 -12384514 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 1 1280 3023 44 9 0 chr15 91111604 91111946 -12383028 + ORR1A1 LTR MaLR 2 346 0 1 1280 4857 148 18 63 chr15 91112873 91113103 -12381871 + RMER19B LTR ERVK 2 230 -672 1 1280 4857 148 18 63 chr15 91113152 91113833 -12381141 + RMER19B LTR ERVK 231 876 -26 1 1280 4857 148 18 63 chr15 91114573 91114600 -12380374 + RMER19B LTR ERVK 877 899 -3 1 1280 4562 40 29 0 chr15 91117190 91117734 -12377240 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 1 1280 558 289 29 19 chr15 91120232 91120440 -12374534 + RMER15 LTR ERVL 351 560 -15 1 1280 1163 201 232 19 chr15 91123886 91124196 -12370778 + MTEb LTR MaLR 1 376 -3 1 1280 380 336 26 18 chr15 91135676 91135903 -12359071 + MT2A LTR ERVL 3 231 -302 1 1280 432 246 54 14 chr15 91136146 91136294 -12358680 + MT2A LTR ERVL 279 432 -101 1 1280 398 284 42 32 chr15 91140600 91140816 -12354158 + ORR1E LTR MaLR 107 332 -38 1 1280 2866 223 78 41 chr15 91142988 91143774 -12351200 + RLTR40 LTR ERVK 3 817 0 2 1280 324 273 45 0 chr15 91144926 91145014 -12349960 - MLT1I LTR MaLR -219 192 101 2 1280 1571 191 58 71 chr15 91161891 91162006 -12332968 + ORR1C1 LTR MaLR 1 114 -264 2 1280 2240 99 48 0 chr15 91162006 91162318 -12332656 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1280 1571 191 58 71 chr15 91162318 91162584 -12332390 + ORR1C1 LTR MaLR 115 377 -1 2 1280 6015 178 132 21 chr15 91162585 91163944 -12331030 + ORR1C1-int LTR MaLR 1 1509 0 2 1280 1263 139 302 47 chr15 91163944 91164245 -12330729 + ORR1C1 LTR MaLR 1 378 0 2 1280 602 228 218 21 chr15 91169707 91169895 -12325079 + ORR1C2 LTR MaLR 160 384 0 2 1280 1758 252 30 5 chr15 91170168 91170575 -12324399 + MTC LTR MaLR 5 421 0 2 1280 1630 64 0 22 chr15 91172418 91172642 -12322332 - MTB LTR MaLR 0 400 182 2 1280 1331 77 44 0 chr15 91172881 91173064 -12321910 - MTB LTR MaLR -209 191 1 2 1280 1801 181 86 3 chr15 91177026 91177374 -12317600 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 6 2 1280 484 341 150 9 chr15 91178176 91178496 -12316478 + MT2A LTR ERVL 153 517 -16 2 1280 310 265 114 63 chr15 91191629 91191907 -12303067 + MLT1D LTR MaLR 117 441 -64 2 1280 4196 259 55 44 chr15 91195694 91197067 -12297907 - MYSERV6-int LTR ERVK -6687 2272 884 2 1280 465 321 55 37 chr15 91202432 91202649 -12292325 - MER68 LTR ERVL -230 333 113 2 1280 1024 279 35 36 chr15 91211060 91211501 -12283473 - RMER15 LTR ERVL -12 563 1 2 1280 843 291 65 72 chr15 91211524 91211927 -12283047 - RMER15-int LTR ERVL -67 4932 4533 2 1280 1133 276 147 43 chr15 91211973 91212725 -12282249 + RMER12B LTR ERVK 1 974 -430 2 1280 305 158 105 0 chr15 91212809 91212866 -12282108 + RMER12B LTR ERVK 1342 1404 0 2 1280 420 283 101 44 chr15 91212866 91213025 -12281949 - RMER15-int LTR ERVL -517 4482 4315 2 1280 715 336 41 86 chr15 91213025 91213491 -12281483 - RMER15-int LTR ERVL -2833 2166 1722 2 1280 1786 318 71 54 chr15 91213730 91213914 -12281060 - RMER15-int LTR ERVL -3967 1032 851 2 1280 696 292 57 92 chr15 91213914 91214303 -12280671 + MTE2a LTR MaLR 1 375 -4 2 1280 1786 318 71 54 chr15 91214303 91215133 -12279841 - RMER15-int LTR ERVL -4149 850 2 2 1280 417 335 103 11 chr15 91215190 91215374 -12279600 - RMER15 LTR ERVL -91 484 284 2 1280 1987 132 127 14 chr15 91215440 91215794 -12279180 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 2 1280 1553 218 70 38 chr15 91219379 91219751 -12275223 - RLTR41 LTR ERV1 -62 384 1 3 1280 432 292 29 17 chr15 91219888 91220062 -12274912 - MURVY-int LTR ERV1 -93 7359 7184 3 1280 859 152 63 58 chr15 91220864 91221038 -12273936 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 272 3 1280 252 271 0 0 chr15 91225181 91225240 -12269734 + RMER15 LTR ERVL 1 59 -516 3 1280 1680 244 58 72 chr15 91225526 91225896 -12269078 + RMER15 LTR ERVL 83 457 -118 3 1281 1680 244 58 72 chr15 91226531 91226542 -12268432 + RMER15 LTR ERVL 458 458 -117 3 1281 1680 244 58 72 chr15 91226570 91226687 -12268287 + RMER15 LTR ERVL 458 575 0 3 1281 2402 195 105 10 chr15 91228999 91229591 -12265383 + RLTR40 LTR ERVK 1 648 -169 3 1281 1675 190 91 13 chr15 91229599 91229993 -12264981 + RMER10A LTR ERVL 1 425 -17 3 1281 853 220 42 16 chr15 91230052 91230241 -12264733 + RLTR40 LTR ERVK 620 813 -4 3 1281 1713 232 119 44 chr15 91234253 91234314 -12260660 - RMER2 LTR ERV1 0 567 504 3 1281 1713 232 119 44 chr15 91234742 91235207 -12259767 - RMER2 LTR ERV1 -64 503 1 3 1281 239 226 92 35 chr15 91247192 91247279 -12247695 + RMER10A LTR ERVL 318 409 -33 3 1281 2619 101 63 25 chr15 91249914 91250310 -12244664 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 1281 1073 114 10 83 chr15 91250378 91250570 -12244404 + IAPEz-int LTR ERVK 18 195 -6286 3 1281 228 321 0 0 chr15 91250570 91250623 -12244351 + RLTR27 LTR ERVK 223 275 -34 3 1281 291 81 0 0 chr15 91250623 91250660 -12244314 + IAPEz-int LTR ERVK 145 181 -7400 3 1281 231 273 0 0 chr15 91250660 91250704 -12244270 + RLTR27 LTR ERVK 232 275 -34 3 1281 3914 61 2 18 chr15 91250704 91251207 -12243767 + IAPEz-int LTR ERVK 168 662 -5819 3 1281 2258 58 0 4 chr15 91251207 91251486 -12243488 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 3 1281 6377 28 4 12 chr15 91251485 91252235 -12242739 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 3 1281 2619 101 63 25 chr15 91252237 91252633 -12242341 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 3 1281 3336 58 5 2 chr15 91253990 91254385 -12240589 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1281 229 241 71 60 chr15 91258590 91258674 -12236300 + RMER15 LTR ERVL 71 155 -420 3 1281 568 298 81 31 chr15 91258719 91258941 -12236033 + RMER15 LTR ERVL 340 572 -3 3 1281 2878 165 27 69 chr15 91259219 91259771 -12235203 + RLTR24 LTR ERV1 1 529 0 3 1281 891 153 25 13 chr15 91261734 91261893 -12233081 + ORR1B2 LTR MaLR 207 367 0 3 1281 2231 194 21 57 chr15 91261960 91262397 -12232577 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1281 4283 167 58 53 chr15 91265569 91266542 -12228432 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 977 -871 3 1281 231 85 104 119 chr15 91266603 91266670 -12228304 + RLTR22_Mur LTR ERVK 822 887 -961 3 1281 765 165 309 9 chr15 91266757 91266977 -12227997 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1563 1848 0 3 1281 1465 206 14 10 chr15 91267790 91268085 -12226889 + RLTR40 LTR ERVK 1 296 -521 3 1281 1824 241 58 22 chr15 91268149 91268653 -12226321 + RLTR40 LTR ERVK 285 806 -11 3 1281 244 200 16 32 chr15 91271374 91271436 -12223538 - MT2A LTR ERVL 0 584 524 3 1281 497 234 0 0 chr15 91271535 91271629 -12223345 - MT2A LTR ERVL -71 462 369 3 1281 1603 192 3 69 chr15 91271636 91271971 -12223003 - MERVL_2A-int LTR ERVL -1261 4500 4188 3 1281 303 257 130 28 chr15 91273700 91273808 -12221166 + MTD LTR MaLR 301 419 0 3 1281 3424 164 146 8 chr15 91278053 91278661 -12216313 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 4 1281 451 303 96 53 chr15 91286505 91286693 -12208281 - ORR1D2 LTR MaLR -168 202 7 4 1281 258 241 36 60 chr15 91289915 91289999 -12204975 + RMER4B LTR ERVK 333 414 -171 4 1281 782 264 18 36 chr15 91292778 91292998 -12201976 + MTD LTR MaLR 3 218 -201 4 1281 611 314 119 43 chr15 91293470 91293773 -12201201 - MLT1B LTR MaLR -12 378 53 4 1281 3150 120 24 15 chr15 91297786 91298242 -12196732 + RMER6B LTR ERVK 2 461 0 4 1281 1437 224 35 124 chr15 91300151 91300554 -12194420 + ORR1D1 LTR MaLR 8 374 0 4 1281 5657 221 32 41 chr15 91300582 91301925 -12193049 + ORR1D1-int LTR MaLR 40 1370 0 4 1281 1159 234 25 98 chr15 91301925 91302207 -12192767 + ORR1D1 LTR MaLR 1 258 -116 4 1281 1989 214 76 39 chr15 91302207 91302633 -12192341 + RLTR20C LTR ERVK 1 432 -102 4 1281 1989 214 76 39 chr15 91302705 91302793 -12192181 + RLTR20C LTR ERVK 433 533 -1 4 1281 590 179 59 17 chr15 91302793 91302904 -12192070 + ORR1D1 LTR MaLR 269 384 0 4 1281 2519 113 37 73 chr15 91303880 91304289 -12190685 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 4 1281 514 309 39 72 chr15 91305542 91305821 -12189153 + MLT1E2 LTR MaLR 64 333 -294 4 1281 301 321 0 45 chr15 91308144 91308255 -12186719 - MTE2b LTR MaLR -87 292 187 4 1281 262 194 119 0 chr15 91310008 91310075 -12184899 + MER34 LTR ERV1 378 452 -90 4 1281 2714 168 55 59 chr15 91311845 91312407 -12182567 + RLTR31_Mm LTR ERVK 2 561 0 4 1281 1130 212 232 4 chr15 91318239 91318576 -12176398 - MTD LTR MaLR -14 405 3 4 1281 788 207 43 29 chr15 91324777 91324986 -12169988 - RLTR15 LTR ERVK -131 228 17 4 1281 1834 301 94 33 chr15 91335331 91336203 -12158771 + MTE-int LTR MaLR 595 1519 -61 4 1281 2707 51 43 3 chr15 91336463 91336836 -12158138 + MTB LTR MaLR 13 400 0 4 1282 593 346 53 31 chr15 91357213 91357631 -12137343 + MT2A LTR ERVL 2 428 -105 5 1282 1331 208 154 22 chr15 91357750 91358119 -12136855 + MTD LTR MaLR 2 419 0 5 1282 329 323 10 0 chr15 91358677 91358776 -12136198 + LTR40b LTR ERVL 363 462 0 5 1282 460 325 34 58 chr15 91359157 91359453 -12135521 + ORR1D2 LTR MaLR 88 366 -4 5 1282 3316 61 0 12 chr15 91360928 91361340 -12133634 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1282 877 211 22 11 chr15 91364670 91364852 -12130122 + MERVL_2A-int LTR ERVL 2908 3091 -2670 5 1282 8821 226 54 34 chr15 91364859 91366989 -12127985 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3411 5582 -179 5 1282 230 311 28 37 chr15 91366989 91367096 -12127878 + ORR1D2-int LTR MaLR 519 624 -1339 5 1282 249 246 0 42 chr15 91367106 91367178 -12127796 + ORR1D2-int LTR MaLR 569 637 -1326 5 1282 1724 191 134 63 chr15 91367242 91367718 -12127256 + MT2A LTR ERVL 2 511 -22 5 1282 1118 271 17 3 chr15 91367752 91368045 -12126929 + ORR1D2 LTR MaLR 72 368 -2 5 1282 635 252 154 13 chr15 91373514 91373747 -12121227 + ORR1D2 LTR MaLR 1 266 -104 5 1282 1150 221 178 3 chr15 91374588 91374942 -12120032 + MTD LTR MaLR 2 417 -2 5 1282 1873 285 52 14 chr15 91376159 91376828 -12118146 - ERVL-B4-int LTR ERVL -82 5632 4938 5 1282 242 333 76 25 chr15 91384774 91384931 -12110043 + ORR1E LTR MaLR 32 196 -163 5 1282 236 307 59 94 chr15 91385307 91385562 -12109412 + ORR1E LTR MaLR 101 346 -13 5 1282 1155 223 74 40 chr15 91390579 91390972 -12104002 + RLTR11A LTR ERVK 35 483 -45 5 1282 2033 82 53 0 chr15 91391588 91391891 -12103083 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1282 728 274 62 24 chr15 91396449 91396789 -12098185 + ORR1E LTR MaLR 4 356 -3 5 1282 1124 212 161 16 chr15 91406098 91406233 -12088741 + ORR1D1 LTR MaLR 1 135 -239 5 1282 1124 212 161 16 chr15 91406305 91406484 -12088490 + ORR1D1 LTR MaLR 136 360 -14 5 1282 323 213 30 0 chr15 91406751 91406842 -12088132 + ORR1D1 LTR MaLR 11 107 -252 6 1282 1153 233 148 21 chr15 91406975 91407135 -12087839 + ORR1C2 LTR MaLR 5 170 -214 6 1282 1153 233 148 21 chr15 91407175 91407351 -12087623 + ORR1C2 LTR MaLR 171 383 -1 6 1282 1772 148 87 23 chr15 91409117 91409462 -12085512 - MTC LTR MaLR 0 421 55 6 1282 1910 131 13 0 chr15 91409464 91409778 -12085196 + RMER6A LTR ERVK 3 320 -436 6 1282 729 169 89 11 chr15 91410877 91411056 -12083918 + RMER6A LTR ERVK 309 501 -255 6 1282 1317 168 26 8 chr15 91411134 91411398 -12083576 + RMER6A LTR ERVK 488 756 0 6 1282 337 148 0 32 chr15 91411398 91411460 -12083514 - MTC LTR MaLR -361 60 1 6 1282 1222 171 75 4 chr15 91413018 91413258 -12081716 - MTC LTR MaLR 0 421 165 6 1282 1280 209 54 49 chr15 91417848 91418216 -12076758 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 6 1282 1017 149 2 255 chr15 91421035 91421529 -12073445 - RMER17C LTR ERVK -41 369 1 6 1282 327 329 41 55 chr15 91423666 91423885 -12071089 + ORR1E LTR MaLR 1 216 -143 6 1282 463 271 100 17 chr15 91424069 91424249 -12070725 - RMER20B LTR ERVK -292 335 141 6 1282 262 202 54 71 chr15 91424819 91424931 -12070043 - RMER2 LTR ERV1 0 567 458 6 1282 585 164 0 96 chr15 91424951 91425086 -12069888 - RMER2 LTR ERV1 -233 334 213 6 1282 445 209 0 0 chr15 91425107 91425193 -12069781 - RMER2 LTR ERV1 -481 86 1 6 1282 1120 228 83 39 chr15 91427866 91428247 -12066727 + RLTR16 LTR ERVK 17 400 -105 6 1282 461 266 89 37 chr15 91428334 91428365 -12066609 + RLTR16 LTR ERVK 465 510 -58 6 1282 266 119 0 0 chr15 91428344 91428386 -12066588 + RLTR16 LTR ERVK 464 505 0 6 1282 511 264 22 149 chr15 91429481 91429703 -12065271 + MTE2a LTR MaLR 14 207 -172 6 1282 573 285 164 16 chr15 91435249 91435541 -12059433 + MTD LTR MaLR 1 360 -59 6 1282 1736 53 0 0 chr15 91442130 91442357 -12052617 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 181 6 1282 1446 50 5 15 chr15 91443270 91443474 -12051500 - MTB_Mm LTR MaLR -203 204 3 6 1282 2964 81 15 2 chr15 91445437 91445832 -12049142 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1282 2733 105 17 12 chr15 91451648 91452053 -12042921 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 6 1282 1232 103 20 0 chr15 91456788 91456983 -12037991 - RLTR11B LTR ERVK -254 199 1 6 1282 296 299 62 0 chr15 91458147 91458244 -12036730 + MLT1F LTR MaLR 220 322 -226 6 1282 1202 178 105 23 chr15 91458804 91459109 -12035865 + RLTR15 LTR ERVK 6 335 -24 6 1282 1883 167 152 11 chr15 91460619 91461078 -12033896 + RLTR28 LTR ERVL 1 524 0 7 1282 2001 167 16 27 chr15 91461412 91461788 -12033186 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 7 1282 1266 158 11 44 chr15 91463862 91464134 -12030840 - BGLII LTR ERVK 0 421 159 7 1282 1635 87 0 12 chr15 91464118 91464374 -12030600 - BGLII LTR ERVK -168 253 1 7 1282 391 319 143 25 chr15 91465824 91466104 -12028870 - MLT1C LTR MaLR -46 421 109 7 1282 282 281 11 33 chr15 91468121 91468213 -12026761 + MER57A-int LTR ERV1 5806 5895 -292 7 1282 1248 220 92 113 chr15 91468526 91469038 -12025936 + RLTR11A LTR ERVK 1 501 -27 7 1282 415 277 123 0 chr15 91474631 91474786 -12020188 + MTEa LTR MaLR 206 379 0 7 1282 2104 199 116 43 chr15 91474894 91475430 -12019544 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 7 1282 3552 144 80 108 chr15 91480388 91481255 -12013719 + RMER21B LTR ERV1 1 842 0 7 1282 1032 251 89 36 chr15 91483537 91483665 -12011309 + MTD LTR MaLR 41 181 -238 7 1282 2890 52 0 42 chr15 91483665 91484046 -12010928 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 7 1282 1032 251 89 36 chr15 91484046 91484277 -12010697 + MTD LTR MaLR 182 419 0 7 1282 395 193 179 32 chr15 91484567 91484690 -12010284 - MTD LTR MaLR -278 141 1 7 1282 852 200 26 58 chr15 91485564 91485755 -12009219 + MTD LTR MaLR 201 385 -34 7 1282 3378 35 15 0 chr15 91485785 91486179 -12008795 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1282 1200 223 144 12 chr15 91487111 91487438 -12007536 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 3 7 1283 318 316 106 11 chr15 91488392 91488571 -12006403 - MLT1A1 LTR MaLR -49 359 164 7 1283 441 224 106 50 chr15 91492352 91492493 -12002481 + MLT1A1 LTR MaLR 189 337 -71 7 1283 495 323 10 24 chr15 91492724 91492930 -12002044 + MT2A LTR ERVL 287 489 -44 7 1283 433 126 50 2 chr15 91497197 91497284 -11997690 + MTC LTR MaLR 270 421 0 7 1283 1344 255 65 15 chr15 91497452 91497850 -11997124 - MTD LTR MaLR -1 418 1 7 1283 1500 238 89 8 chr15 91508542 91508924 -11986050 + MTD LTR MaLR 3 415 -4 1 1283 1812 165 232 3 chr15 91522560 91522901 -11972073 + MTC LTR MaLR 3 421 0 4 1283 5596 189 58 39 chr15 91522901 91523905 -11971069 + MTC-int LTR MaLR 1 1021 -237 4 1283 5596 189 58 39 chr15 91523946 91524175 -11970799 + MTC-int LTR MaLR 1022 1258 0 4 1283 1983 219 73 8 chr15 91524175 91524570 -11970404 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1283 1148 191 52 0 chr15 91536619 91536850 -11958124 - RMER15 LTR ERVL -62 513 271 5 1283 543 297 20 40 chr15 91537986 91538235 -11956739 - RMER15 LTR ERVL -310 265 22 5 1283 313 325 49 41 chr15 91545657 91545779 -11949195 + MLT1I LTR MaLR 281 403 -8 7 1283 3789 10 2 0 chr15 91551274 91551669 -11943305 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1283 9847 19 19 1 chr15 91551669 91552747 -11942227 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 8 1283 3778 10 2 0 chr15 91552747 91553142 -11941832 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1283 3238 82 7 15 chr15 91553701 91554111 -11940863 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 8 1283 480 292 149 10 chr15 91558220 91558414 -11936560 - RMER15 LTR ERVL -56 519 299 9 1283 2342 148 26 28 chr15 91558642 91559094 -11935880 - RMER19C LTR ERVK -94 517 1 9 1283 1414 234 3 14 chr15 91561160 91561446 -11933528 - MTC LTR MaLR -138 283 1 9 1283 1221 226 136 21 chr15 91567828 91568347 -11926627 - RLTR40 LTR ERVK -5 812 154 1 1283 675 229 13 7 chr15 91568538 91568692 -11926282 - RLTR40 LTR ERVK -662 155 1 1 1283 1971 157 9 137 chr15 91576528 91576972 -11918002 - ORR1B1 LTR MaLR -7 387 1 1 1283 266 292 11 11 chr15 91582093 91582193 -11912781 - MLT1A1 LTR MaLR -16 392 250 1 1283 1589 229 54 52 chr15 91590260 91590777 -11904197 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 10 1 1283 490 269 25 31 chr15 91591774 91591935 -11903039 - RMER13A LTR ERVK -603 257 98 1 1283 1136 263 68 37 chr15 91604646 91605001 -11889973 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 3 1 1283 645 269 245 3 chr15 91607638 91607951 -11887023 - MTD LTR MaLR -26 393 6 1 1283 926 194 179 34 chr15 91612356 91612713 -11882261 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 1 1283 745 223 41 14 chr15 91612713 91612931 -11882043 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 4621 1 1283 475 264 82 92 chr15 91618390 91618782 -11876192 - RMER10A LTR ERVL -4 438 51 1 1284 363 256 139 8 chr15 91621850 91621972 -11873002 - MLT1A1 LTR MaLR -270 138 1 1 1284 2332 203 16 18 chr15 91625327 91625833 -11869141 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 1 1 1284 1204 142 58 241 chr15 91628436 91628616 -11866358 + RMER17C LTR ERVK 3 179 -231 1 1284 1204 142 58 241 chr15 91628791 91629109 -11865865 + RMER17C LTR ERVK 180 410 0 1 1284 248 252 64 150 chr15 91632597 91632737 -11862237 + RMER12 LTR ERVK 724 851 -471 2 1284 428 328 32 75 chr15 91634994 91635182 -11859792 - MER67D LTR ERV1 -106 408 229 2 1284 1831 207 67 13 chr15 91648051 91648437 -11846537 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 2 1284 1555 194 53 13 chr15 91651150 91651453 -11843521 - ORR1B2 LTR MaLR -52 315 1 2 1284 6954 192 43 17 chr15 91651453 91652887 -11842087 - ORR1B2-int LTR MaLR 0 1509 39 2 1284 2055 180 0 44 chr15 91655207 91655591 -11839383 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1284 1758 127 20 27 chr15 91658369 91658668 -11836306 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 103 2 1284 1074 201 116 60 chr15 91659871 91659942 -11835032 - RMER2 LTR ERV1 -231 336 266 2 1284 1074 201 116 60 chr15 91659979 91660225 -11834749 - RMER2 LTR ERV1 -302 265 2 2 1284 4417 160 51 26 chr15 91694354 91695234 -11799740 - RLTR13D6 LTR ERVK 0 902 1 2 1284 1001 127 13 0 chr15 91714800 91714957 -11780017 + RLTR40 LTR ERVK 24 182 -635 3 1284 1059 123 257 14 chr15 91718983 91719197 -11775777 - RLTR22_Mur LTR ERVK 0 1848 1543 3 1284 5543 92 19 16 chr15 91719566 91719675 -11775299 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1016 832 721 3 1284 5543 92 19 16 chr15 91719695 91720414 -11774560 - RLTR22_Mur LTR ERVK -1128 720 1 3 1284 3363 55 5 2 chr15 91725644 91726043 -11768931 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1284 2468 150 62 25 chr15 91726940 91727344 -11767630 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 3 1284 2748 96 56 10 chr15 91742495 91742886 -11752088 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 3 1284 402 311 203 8 chr15 91745398 91745644 -11749330 - MER67C LTR ERV1 0 711 418 3 1285 1989 196 10 26 chr15 91761924 91762312 -11732662 - MTD LTR MaLR -13 406 25 3 1285 267 355 45 9 chr15 91766158 91766269 -11728705 + LTR16A LTR ERVL 11 125 -326 3 1285 281 333 97 40 chr15 91766360 91766535 -11728439 + LTR16A LTR ERVL 262 446 -5 3 1285 1376 259 36 17 chr15 91767658 91768015 -11726959 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 7 3 1285 980 249 49 74 chr15 91768918 91769332 -11725642 + RLTR11B LTR ERVK 1 412 -29 3 1285 1218 291 46 32 chr15 91769419 91769708 -11725266 + MTE2a LTR MaLR 6 301 -78 3 1285 2290 167 49 20 chr15 91769708 91769932 -11725042 - MTC LTR MaLR 0 421 203 3 1285 2290 167 49 20 chr15 91769957 91770141 -11724833 - MTC LTR MaLR -219 202 2 3 1285 1218 291 46 32 chr15 91770141 91770220 -11724754 + MTE2a LTR MaLR 302 379 0 3 1285 911 149 22 40 chr15 91774263 91774489 -11720485 + MTB_Mm LTR MaLR 2 227 -169 3 1285 307 315 17 92 chr15 91775624 91775743 -11719231 + MLT1H LTR MaLR 188 297 -252 3 1285 489 191 85 48 chr15 91776438 91776603 -11718371 + RLTR15 LTR ERVK 1 171 -188 3 1285 366 271 40 23 chr15 91776645 91776819 -11718155 + RLTR15 LTR ERVK 165 341 -18 3 1285 234 333 42 56 chr15 91777368 91777511 -11717463 + MER57E1 LTR ERV1 86 226 -146 3 1285 995 323 41 39 chr15 91777931 91778392 -11716582 - MT2A LTR ERVL -71 462 1 3 1285 243 280 108 49 chr15 91778432 91778635 -11716339 + MTEb LTR MaLR 163 377 -2 3 1285 3044 75 19 2 chr15 91779760 91780172 -11714802 + BGLII LTR ERVK 3 421 0 4 1285 1585 120 24 230 chr15 91780814 91781322 -11713652 + RLTR23 LTR ERV1 1 403 -27 4 1285 261 235 14 14 chr15 91781834 91781903 -11713071 - MER73 LTR ERVL -15 629 561 4 1285 259 333 91 23 chr15 91783516 91783691 -11711283 + MLT1D LTR MaLR 1 187 -318 4 1285 782 243 10 10 chr15 91783926 91784130 -11710844 - ORR1D1 LTR MaLR -170 204 1 4 1285 846 225 135 39 chr15 91784501 91784783 -11710191 - RLTR40 LTR ERVK -490 327 19 4 1285 1918 111 19 19 chr15 91788811 91789124 -11705850 + ORR1A2 LTR MaLR 3 315 -12 4 1285 2488 172 102 73 chr15 91791712 91792594 -11702380 + RLTR25A LTR ERVK 1 1028 0 4 1285 2539 147 8 47 chr15 91796260 91796730 -11698244 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 2 4 1285 1527 229 41 82 chr15 91804608 91805045 -11689929 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1285 3637 171 127 49 chr15 91806183 91807137 -11687837 + RLTR25B LTR ERVK 1 1028 0 4 1285 1004 260 40 100 chr15 91808177 91808578 -11686396 - MTE2b LTR MaLR -2 377 1 4 1285 325 212 62 68 chr15 91813018 91813180 -11681794 - RMER10A LTR ERVL -158 284 124 4 1285 359 288 88 66 chr15 91813245 91813472 -11681502 + RMER5 LTR ERV1 17 248 -286 4 1285 782 314 53 32 chr15 91829107 91829482 -11665492 - RMER5 LTR ERV1 0 534 152 4 1285 688 308 55 51 chr15 91832565 91832839 -11662135 + MTE2b LTR MaLR 62 336 -43 4 1285 365 303 68 60 chr15 91835141 91835376 -11659598 + LTR33A LTR ERVL 262 498 -22 4 1285 2419 96 12 15 chr15 91836106 91836434 -11658540 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1285 2067 143 120 11 chr15 91839685 91840053 -11654921 + MTC LTR MaLR 6 413 -8 4 1285 241 289 204 34 chr15 91852570 91852717 -11642257 + MT2A LTR ERVL 356 527 -6 4 1285 2328 131 16 0 chr15 91853969 91854290 -11640684 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 4 1285 285 143 0 0 chr15 91858036 91858085 -11636889 + RMER10B LTR ERVL 350 398 0 4 1285 948 281 122 27 chr15 91858800 91859170 -11635804 + MTD LTR MaLR 1 405 -14 4 1285 960 210 5 11 chr15 91859754 91859942 -11635032 + ORR1C2 LTR MaLR 198 384 0 5 1285 594 240 70 62 chr15 91859946 91860204 -11634770 + RLTR42-int LTR ERVK 5263 5522 0 5 1285 252 224 17 0 chr15 91860204 91860262 -11634712 + RLTR42 LTR ERVK 1 59 -180 5 1285 238 245 0 0 chr15 91860220 91860273 -11634701 + MLT1J LTR MaLR 100 152 -360 5 1285 320 282 172 77 chr15 91860311 91860480 -11634494 + RLTR42 LTR ERVK 55 239 0 5 1285 3570 167 30 27 chr15 91860870 91861467 -11633507 - MT2B LTR ERVL 0 601 3 5 1285 805 153 116 6 chr15 91861468 91861632 -11633342 - MERVL_2A-int LTR ERVL 0 5761 5580 5 1285 9851 162 11 6 chr15 91861631 91863212 -11631762 - MERVL_2A-int LTR ERVL -289 5472 3883 5 1285 265 136 50 17 chr15 91864105 91864165 -11630809 + RLTR19-int LTR ERVK 1124 1185 -4337 5 1285 320 209 50 65 chr15 91864336 91864525 -11630449 - MYSERV6-int LTR ERVK -997 7962 7814 5 1285 429 268 55 59 chr15 91864680 91864882 -11630092 + RLTR19-int LTR ERVK 1134 1334 -1904 5 1285 4969 184 65 110 chr15 91865012 91866591 -11628383 + RLTR19-int LTR ERVK 1895 3676 -2461 5 1285 2305 230 54 57 chr15 91866804 91867432 -11627542 + RLTR19-int LTR ERVK 2613 3238 0 5 1285 369 293 61 113 chr15 91867503 91867849 -11627125 + RMER17C LTR ERVK 34 361 -49 5 1285 422 207 15 0 chr15 91873554 91873647 -11621327 + MTC LTR MaLR 1 97 -322 5 1285 1130 194 100 30 chr15 91873932 91874273 -11620701 - RMER16 LTR ERVK 0 533 1 5 1285 1522 189 21 11 chr15 91874331 91874614 -11620360 + MTC LTR MaLR 116 401 -20 5 1285 323 267 9 71 chr15 91874698 91874811 -11620163 - MLT1A1 LTR MaLR -3 405 300 5 1285 686 265 98 76 chr15 91876446 91876855 -11618119 - MLT1D LTR MaLR -44 461 44 5 1285 1190 291 81 0 chr15 91877262 91877606 -11617368 + MTE2b LTR MaLR 1 372 -7 5 1286 530 332 43 30 chr15 91884022 91884104 -11610870 + MTD LTR MaLR 3 81 -338 5 1286 3236 62 36 3 chr15 91884104 91884491 -11610483 - MTB LTR MaLR 0 400 1 5 1286 530 332 43 30 chr15 91884491 91884638 -11610336 + MTD LTR MaLR 82 235 -184 5 1286 1768 140 95 3 chr15 91888455 91888791 -11606183 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1286 955 219 246 6 chr15 91895363 91895693 -11599281 + MTD LTR MaLR 10 418 -1 5 1286 267 230 67 22 chr15 91896954 91897043 -11597931 + MTE2a LTR MaLR 14 106 -313 5 1286 1595 235 23 2 chr15 91897304 91897719 -11597255 - MT2A LTR ERVL -74 459 1 5 1286 885 250 29 73 chr15 91897721 91897993 -11596981 + MTE2a LTR MaLR 116 375 -4 5 1286 424 263 93 43 chr15 91899452 91899554 -11595420 - MTE2a LTR MaLR -67 312 202 5 1286 424 263 93 43 chr15 91899624 91899660 -11595314 - MTE2a LTR MaLR -178 201 167 5 1286 607 245 81 6 chr15 91920199 91920359 -11574615 - RMER5 LTR ERV1 -17 517 346 5 1286 1167 170 16 29 chr15 91927074 91927318 -11567656 - RMER19C LTR ERVK -238 664 384 5 1286 486 295 170 38 chr15 91931644 91931961 -11563013 - ORR1E LTR MaLR 0 359 1 5 1286 3015 67 21 3 chr15 91935982 91936371 -11558603 - MTB LTR MaLR 0 400 5 6 1286 1468 154 0 8 chr15 91939391 91939626 -11555348 + ORR1B2 LTR MaLR 1 233 -134 6 1286 2770 125 40 38 chr15 91940012 91940486 -11554488 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 6 1286 2234 106 48 0 chr15 91940503 91940815 -11554159 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1286 771 312 75 60 chr15 91946828 91947230 -11547744 - MT2A LTR ERVL -1 532 125 6 1286 248 322 105 24 chr15 91949787 91949911 -11545063 + RLTR14 LTR ERV1 224 357 -25 6 1286 1206 264 55 103 chr15 91950247 91950644 -11544330 + MTE2b LTR MaLR 2 379 0 6 1286 396 303 147 35 chr15 91960028 91960527 -11534447 - MLT1E3 LTR MaLR -547 942 224 6 1286 240 236 0 0 chr15 91964011 91964066 -11530908 + ORR1C1 LTR MaLR 1 55 -323 6 1286 1202 207 107 144 chr15 91966127 91966584 -11528390 + RLTR20B3 LTR ERVK 9 448 -129 6 1286 289 227 136 98 chr15 91968323 91968455 -11526519 + MT2B LTR ERVL 120 256 -345 6 1286 564 309 127 19 chr15 91968767 91969074 -11525900 + MLT2C1 LTR ERVL 8 347 -50 6 1286 1644 254 22 19 chr15 91975374 91975735 -11519239 - MTD LTR MaLR -14 405 44 6 1286 3882 252 73 50 chr15 91975763 91976981 -11517993 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 13 6 1286 1307 217 111 16 chr15 91976982 91977327 -11517647 - MTD LTR MaLR 0 419 16 6 1286 1885 161 111 9 chr15 91979961 91980294 -11514680 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1286 2462 124 12 26 chr15 91983958 91984373 -11510601 - RLTR9E LTR ERVK 0 409 1 6 1286 323 325 112 0 chr15 91995632 91995820 -11499154 + MER74A LTR ERVL 126 334 -224 6 1286 1509 209 16 20 chr15 92000187 92000525 -11494449 + MT2A LTR ERVL 1 488 -113 2 1286 401 324 104 59 chr15 92004787 92005144 -11489830 - MTEa LTR MaLR 0 379 7 9 1286 4342 170 51 49 chr15 92007746 92008645 -11486329 - RMER19B LTR ERVK -1 901 1 1 1287 562 373 5 16 chr15 92013620 92013993 -11480981 - MERVL_2A-int LTR ERVL -3748 2013 1645 2 1287 845 315 65 12 chr15 92014094 92014733 -11480241 - MERVL_2A-int LTR ERVL -5014 747 7 2 1287 530 319 77 73 chr15 92014738 92015269 -11479705 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 2 1287 983 173 43 123 chr15 92017115 92017465 -11477509 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 2 1287 770 275 50 60 chr15 92044143 92044470 -11450504 - MTE2a LTR MaLR -73 346 6 6 1287 256 299 73 18 chr15 92052675 92052784 -11442190 - MLT1B LTR MaLR -1 389 275 8 1287 542 265 104 36 chr15 92065085 92065277 -11429697 - RMER15 LTR ERVL 0 575 371 9 1287 1772 172 3 13 chr15 92071702 92072003 -11422971 - MTC LTR MaLR 0 421 124 1 1287 508 318 103 63 chr15 92085582 92085981 -11408993 - LTR16B LTR ERVL -18 445 31 1 1287 3991 137 69 17 chr15 92088352 92089066 -11405908 - RMER6A LTR ERVK -4 752 2 1 1287 885 75 17 0 chr15 92090177 92090297 -11404677 - ORR1A2 LTR MaLR -205 122 1 1 1287 407 331 24 12 chr15 92107613 92107778 -11387196 + MLT1F1 LTR MaLR 403 569 0 1 1287 1083 270 108 43 chr15 92110624 92110976 -11383998 - MTE2b LTR MaLR -4 375 1 1 1287 550 238 73 18 chr15 92124997 92125215 -11369759 - RMER17C LTR ERVK -136 274 45 1 1287 2960 75 2 63 chr15 92128423 92128616 -11366358 + MTB LTR MaLR 2 195 -205 1 1287 2960 75 2 63 chr15 92128814 92129043 -11365931 + MTB LTR MaLR 196 400 0 1 1287 276 260 78 68 chr15 92139864 92140083 -11354891 + RLTR21 LTR ERVK 1086 1306 -266 2 1287 1975 157 42 109 chr15 92142729 92143180 -11351794 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1288 1991 147 57 9 chr15 92151158 92151494 -11343480 - MTC LTR MaLR -1 420 69 2 1288 453 244 0 51 chr15 92154126 92154264 -11340710 + BGLII_B LTR ERVK 1 131 -310 2 1288 921 281 53 16 chr15 92165475 92165793 -11329181 - RLTR14-int LTR ERV1 -4890 427 98 2 1288 638 252 0 0 chr15 92165806 92165933 -11329041 + RLTR14 LTR ERV1 3 129 -253 2 1288 1680 220 68 0 chr15 92166037 92166391 -11328583 - RLTR14 LTR ERV1 -2 380 3 2 1288 504 331 139 34 chr15 92168343 92168686 -11326288 + ORR1E LTR MaLR 1 379 0 2 1288 778 288 55 64 chr15 92174719 92175270 -11319704 + RLTR17 LTR ERVK 125 553 0 2 1288 246 309 84 28 chr15 92176884 92177027 -11317947 - MLT1H2 LTR MaLR -281 208 58 2 1288 447 317 85 40 chr15 92177872 92178190 -11316784 + MLT1F1 LTR MaLR 180 541 -28 2 1288 3240 50 2 5 chr15 92178922 92179323 -11315651 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1288 3492 15 5 0 chr15 92181819 92182213 -11312761 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1288 1046 16 0 0 chr15 92182213 92182337 -11312637 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 124 -974 2 1288 379 321 32 13 chr15 92182343 92182501 -11312473 - MLT1D LTR MaLR 0 505 345 2 1288 360 336 151 35 chr15 92182984 92183119 -11311855 + MT2A LTR ERVL 96 254 -279 2 1288 360 336 151 35 chr15 92183173 92183321 -11311653 + MT2A LTR ERVL 255 411 -122 2 1288 1999 190 0 51 chr15 92183672 92184066 -11310908 - MTC LTR MaLR -45 376 3 2 1288 381 51 0 33 chr15 92186235 92186296 -11308678 + ETnERV2-int LTR ERVK 1893 1951 -5455 2 1288 5208 148 30 65 chr15 92186289 92186527 -11308447 + ETnERV2-int LTR ERVK 2167 2384 -5022 2 1288 5208 148 30 65 chr15 92186550 92187441 -11307533 + ETnERV2-int LTR ERVK 2385 3256 -4150 2 1288 372 293 48 105 chr15 92190092 92190302 -11304672 - MTEa LTR MaLR 0 379 182 2 1288 2213 54 30 20 chr15 92192322 92192626 -11302348 - IAPLTR2b LTR ERVK -20 307 1 2 1288 926 207 6 75 chr15 92195417 92195905 -11299069 - RMER17C LTR ERVK -14 396 3 2 1288 305 263 184 8 chr15 92201350 92201490 -11293484 - MLT2B1 LTR ERVL -74 488 330 2 1288 1762 148 132 3 chr15 92201492 92201810 -11293164 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 2 1288 239 239 104 78 chr15 92201912 92202066 -11292908 - MLT2B1 LTR ERVL -362 158 1 2 1288 596 235 22 7 chr15 92203544 92203681 -11291293 + MTD LTR MaLR 3 141 -278 2 1288 875 272 47 80 chr15 92203750 92204113 -11290861 - MTC-int LTR MaLR -385 873 523 3 1288 718 255 55 97 chr15 92204132 92204489 -11290485 + RMER4B LTR ERVK 308 574 -11 3 1288 679 291 118 37 chr15 92207529 92207850 -11287124 - ORR1E LTR MaLR -10 349 3 3 1288 1296 243 127 11 chr15 92209632 92209994 -11284980 - MTD LTR MaLR -14 405 2 3 1288 1971 170 119 5 chr15 92221687 92222065 -11272909 - MTC LTR MaLR 0 421 1 3 1288 1953 200 192 19 chr15 92224101 92224564 -11270410 + MT2B LTR ERVL 1 543 -58 3 1288 2163 191 189 21 chr15 92225185 92225708 -11269266 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 3 1288 598 308 109 16 chr15 92244444 92244701 -11250273 - MLT1B LTR MaLR -7 383 103 3 1288 241 356 76 8 chr15 92245260 92245379 -11249595 + MLT1J2 LTR MaLR 38 164 -284 3 1288 799 267 72 82 chr15 92245561 92245977 -11248997 - RMER15-int LTR ERVL -4136 863 452 3 1288 268 353 60 8 chr15 92245979 92246096 -11248878 + RMER15 LTR ERVL 452 574 -1 3 1288 284 300 74 16 chr15 92246177 92246299 -11248675 - RMER15 LTR ERVL -446 129 1 3 1288 1749 160 65 75 chr15 92258921 92259292 -11235682 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 3 1288 241 247 54 120 chr15 92262206 92262298 -11232676 - RLTR25A LTR ERVK -521 582 497 3 1288 1836 164 22 10 chr15 92267657 92267971 -11227003 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 224 541 -16 3 1289 2478 138 103 14 chr15 92277113 92277598 -11217376 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 4 1289 1029 252 45 102 chr15 92286030 92286502 -11208472 - RMER19C LTR ERVK -287 450 1 4 1289 1051 282 52 47 chr15 92286574 92286654 -11208320 - MTEa LTR MaLR -11 368 297 4 1289 1051 282 52 47 chr15 92286868 92287151 -11207823 - MTEa LTR MaLR -83 296 3 4 1289 251 320 73 112 chr15 92289242 92289474 -11205500 - MLT1J1 LTR MaLR -129 315 93 4 1289 1454 263 88 35 chr15 92290489 92290978 -11203996 - MT2A LTR ERVL -18 515 1 4 1289 1080 165 19 42 chr15 92300360 92300575 -11194399 - ORR1A4 LTR MaLR -119 210 1 4 1289 2934 30 0 0 chr15 92300641 92300978 -11193996 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1289 18685 19 2 1 chr15 92300978 92303187 -11191787 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 4270 4 1289 15327 33 46 7 chr15 92303183 92305151 -11189823 - IAPEz-int LTR ERVK -4428 2053 8 4 1289 2934 30 0 0 chr15 92305151 92305488 -11189486 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 0 337 1 4 1289 716 246 74 74 chr15 92305578 92305929 -11189045 + RLTR15 LTR ERVK 1 351 -8 4 1289 228 292 61 17 chr15 92313584 92313699 -11181275 + RMER12 LTR ERVK 737 856 -466 4 1289 1179 240 37 56 chr15 92319151 92319526 -11175448 + ORR1D2 LTR MaLR 1 368 -2 4 1289 480 288 47 55 chr15 92322277 92322586 -11172388 + ORR1E LTR MaLR 9 378 -1 4 1289 2106 127 15 9 chr15 92323496 92323823 -11171151 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 4 1289 285 188 0 104 chr15 92324064 92324141 -11170833 - MT2B LTR ERVL -359 242 174 4 1289 932 240 116 12 chr15 92334745 92335082 -11159892 + ORR1D1 LTR MaLR 2 373 -1 4 1289 235 289 136 32 chr15 92342225 92342350 -11152624 + MLT1N2 LTR MaLR 32 169 -393 4 1289 248 389 34 57 chr15 92342419 92342681 -11152293 + MLT1N2 LTR MaLR 295 550 -12 4 1289 3734 135 39 96 chr15 92348591 92349384 -11145590 + RMER6A LTR ERVK 3 750 -6 4 1289 3344 28 8 2 chr15 92349644 92350038 -11144936 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 4 1289 237 303 79 20 chr15 92357323 92357424 -11137550 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -243 596 490 5 1289 245 330 68 113 chr15 92358776 92359042 -11135932 + ORR1E LTR MaLR 96 349 -10 5 1289 1460 158 21 35 chr15 92364244 92364527 -11130447 + RLTR46 LTR ERVK 42 320 0 5 1289 1408 259 42 33 chr15 92368081 92368440 -11126534 + MTE2a LTR MaLR 16 377 -2 5 1289 592 302 161 20 chr15 92369877 92370156 -11124818 - MTE2a LTR MaLR -81 298 11 5 1289 2871 45 55 18 chr15 92372884 92373267 -11121707 - MTB LTR MaLR -3 397 1 5 1289 402 260 55 119 chr15 92374983 92375184 -11119790 - RLTR11B LTR ERVK -13 440 253 5 1289 464 277 26 108 chr15 92375181 92375412 -11119562 - RLTR11B LTR ERVK -139 314 103 5 1289 1149 164 9 44 chr15 92377650 92377983 -11116991 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 5 1289 2876 158 37 2 chr15 92381120 92381629 -11113345 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 2 5 1289 454 338 105 32 chr15 92383295 92383543 -11111431 - MLT1A0 LTR MaLR -6 359 94 5 1289 408 308 128 92 chr15 92383691 92383995 -11110979 - MLT1F1 LTR MaLR -8 561 247 5 1289 409 332 0 6 chr15 92385037 92385169 -11109805 - MLT1F1 LTR MaLR -406 149 24 5 1289 354 368 127 30 chr15 92385184 92385313 -11109661 - MLT1F1-int LTR MaLR 0 1489 1357 5 1289 876 209 139 75 chr15 92385313 92385659 -11109315 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 5 1289 354 368 127 30 chr15 92385659 92385829 -11109145 - MLT1F1-int LTR MaLR -133 1356 1161 5 1289 465 354 67 29 chr15 92385900 92386246 -11108728 - MLT1F1-int LTR MaLR -462 1027 669 5 1289 260 300 0 0 chr15 92386373 92386443 -11108531 - MLT1F1-int LTR MaLR -999 490 421 5 1289 1147 266 41 46 chr15 92389460 92389827 -11105147 + ORR1D2 LTR MaLR 6 370 0 5 1289 1363 253 74 11 chr15 92390881 92391260 -11103714 + MTD LTR MaLR 6 408 -11 5 1289 1849 182 127 16 chr15 92397085 92397464 -11097510 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1289 4619 195 59 43 chr15 92397470 92398605 -11096369 - MTC-int LTR MaLR -13 1245 93 5 1289 408 129 139 79 chr15 92399176 92399277 -11095697 - MTC-int LTR MaLR -1150 108 2 5 1289 1822 198 68 18 chr15 92399276 92399671 -11095303 - MTC LTR MaLR 0 421 7 5 1289 264 250 125 0 chr15 92404543 92404615 -11090359 - MLT1C LTR MaLR -317 150 70 5 1290 3203 76 2 20 chr15 92418136 92418541 -11076433 - MTB LTR MaLR 0 400 3 6 1290 570 323 106 26 chr15 92434694 92434996 -11059978 + LTR16A LTR ERVL 19 344 -107 6 1290 589 291 57 18 chr15 92437523 92437777 -11057197 - RLTR16 LTR ERVK -234 271 31 6 1290 2350 122 39 11 chr15 92444197 92444553 -11050421 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK -1 366 1 6 1290 9398 31 2 5 chr15 92444555 92445638 -11049336 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 5400 6 1290 20978 44 32 20 chr15 92445613 92448241 -11046733 - IAPEz-int LTR ERVK -3807 2674 17 6 1290 322 119 56 69 chr15 92448240 92448312 -11046662 - IAPEz-int LTR ERVK -1914 73 3 6 1290 2389 119 39 11 chr15 92448314 92448671 -11046303 - IAPLTR1_Mm LTR ERVK 0 367 1 6 1290 247 341 0 21 chr15 92450997 92451090 -11043884 + MLT1A1 LTR MaLR 315 405 -3 6 1290 2461 144 109 113 chr15 92461878 92462409 -11032565 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 6 1290 1722 176 49 32 chr15 92474244 92474591 -11020383 + ORR1B1 LTR MaLR 42 394 0 6 1290 1630 185 170 19 chr15 92477329 92477693 -11017281 + MTD LTR MaLR 1 419 0 6 1290 1039 237 196 13 chr15 92486045 92486361 -11008613 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1290 230 304 109 51 chr15 92492009 92492165 -11002809 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1311 1475 -373 6 1290 2308 138 42 55 chr15 92499349 92499732 -10995242 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 7 1290 1764 127 18 63 chr15 92500340 92500675 -10994299 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 2 1 1290 2291 105 9 0 chr15 92509192 92509516 -10985458 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1290 924 243 161 52 chr15 92513570 92513900 -10981074 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 1 1 1290 2881 68 15 15 chr15 92522253 92522653 -10972321 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1290 1641 200 9 12 chr15 92524694 92525033 -10969941 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 3 1290 659 309 52 45 chr15 92525555 92525948 -10969026 - RLTR26 LTR ERVK -225 417 2 3 1290 555 250 204 73 chr15 92530021 92530379 -10964595 + MTE2a LTR MaLR 13 417 -2 3 1290 4714 93 17 48 chr15 92531588 92532363 -10962611 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 4 1290 1560 175 18 72 chr15 92535790 92536266 -10958708 + RMER17C LTR ERVK 16 439 -519 4 1291 2586 130 45 38 chr15 92553131 92553603 -10941371 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 1291 43643 7 0 4 chr15 92553603 92560123 -10934851 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 7 1291 2584 130 45 38 chr15 92560123 92560595 -10934379 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 7 1291 1689 283 81 44 chr15 92570008 92570785 -10924189 - RLTR40 LTR ERVK -11 806 1 7 1291 522 335 57 15 chr15 92572543 92572879 -10922095 - MLT1A0 LTR MaLR 0 365 16 8 1291 1042 224 128 21 chr15 92586028 92586101 -10908873 - MTD LTR MaLR 0 419 349 9 1291 1042 224 128 21 chr15 92586146 92586409 -10908565 - MTD LTR MaLR -71 348 48 9 1291 1848 172 35 9 chr15 92591440 92591827 -10903147 - MTC LTR MaLR -2 419 24 1 1291 1703 121 38 7 chr15 92598521 92598813 -10896161 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 175 1 1291 1556 189 116 23 chr15 92599154 92599500 -10895474 + RLTR30 LTR ERV1 1 378 -1 1 1291 951 204 181 42 chr15 92603793 92604139 -10890835 - MTD LTR MaLR -15 404 6 1 1291 694 281 25 59 chr15 92614404 92614673 -10880301 - MTE2a LTR MaLR -114 265 18 1 1291 354 329 44 73 chr15 92614765 92615037 -10879937 + RMER13A LTR ERVK 16 279 -581 1 1291 1235 224 190 75 chr15 92623054 92623571 -10871403 - RMER4B LTR ERVK -9 576 1 1 1291 2866 57 17 84 chr15 92626583 92627001 -10867973 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1291 4460 32 0 3 chr15 92627001 92627627 -10867347 + RLTR10-int LTR ERVK 302 998 -989 1 1291 374 271 31 8 chr15 92627691 92627821 -10867153 + RLTR10-int LTR ERVK 1462 1594 -5987 1 1291 8940 17 2 0 chr15 92627903 92628898 -10866076 + RLTR10-int LTR ERVK 990 1986 -1 1 1291 2848 60 17 84 chr15 92628898 92629316 -10865658 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 1 1291 8597 151 98 24 chr15 92631801 92631966 -10863008 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 177 -1671 1 1291 8597 151 98 24 chr15 92632013 92633062 -10861912 + RLTR22_Mur LTR ERVK 178 1307 -541 1 1291 8597 151 98 24 chr15 92633107 92633611 -10861363 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1308 1847 -1 1 1291 2318 93 89 14 chr15 92642183 92642544 -10852430 + MTC LTR MaLR 12 399 -22 1 1291 359 275 115 0 chr15 92643198 92643336 -10851638 + RMER20B LTR ERVK 1 160 -356 1 1291 4598 152 106 9 chr15 92653161 92653976 -10840998 - RMER19B LTR ERVK 0 902 9 1 1291 2537 70 35 6 chr15 92662189 92662507 -10832467 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1292 327 290 113 15 chr15 92671328 92671461 -10823513 + MLT1A LTR MaLR 224 369 -5 2 1292 378 360 105 53 chr15 92671574 92671673 -10823301 - MLT2B3 LTR ERVL -63 491 392 2 1292 378 360 105 53 chr15 92671842 92672209 -10822765 - MLT2B3 LTR ERVL -163 391 1 2 1292 2179 144 45 11 chr15 92672401 92672760 -10822214 + ORR1C2 LTR MaLR 14 384 0 2 1292 769 326 64 51 chr15 92673947 92674399 -10820575 + MLT1C LTR MaLR 2 459 -8 2 1292 4450 98 5 8 chr15 92688416 92689002 -10805972 + MT2B2 LTR ERVL 1 584 0 2 1292 528 207 35 35 chr15 92697640 92697755 -10797219 + RMER20B LTR ERVK 1 115 -512 2 1292 2272 196 44 5 chr15 92698992 92699397 -10795577 - MTC LTR MaLR 0 421 1 2 1292 4400 98 19 2 chr15 92704228 92704802 -10790172 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 2 1292 353 206 0 0 chr15 92706710 92706778 -10788196 + ORR1D1 LTR MaLR 306 373 -1 2 1292 1879 194 63 12 chr15 92706859 92707271 -10787703 + ORR1D1-int LTR MaLR 24 456 -914 2 1292 756 351 72 43 chr15 92707446 92707863 -10787111 + MT2A LTR ERVL 5 433 -100 2 1292 432 343 46 17 chr15 92722389 92722564 -10772410 - MER21B LTR ERV1 -48 815 636 2 1292 1300 186 160 5 chr15 92722578 92722867 -10772107 + MTD LTR MaLR 85 405 -14 2 1292 436 377 38 19 chr15 92722869 92723080 -10771894 - MER21B LTR ERV1 -239 624 410 2 1292 1921 116 156 3 chr15 92723102 92723430 -10771544 + RLTR44A LTR ERVK 28 405 0 2 1292 342 309 0 0 chr15 92723685 92723769 -10771205 - MER21B LTR ERV1 -779 84 1 2 1292 760 294 9 103 chr15 92729859 92730147 -10764827 - MTC-int LTR MaLR -157 1101 847 2 1292 837 214 87 64 chr15 92730147 92730412 -10764562 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 271 -306 2 1292 625 207 44 7 chr15 92730379 92730515 -10764459 + RLTR20B3 LTR ERVK 392 532 -45 2 1292 1431 247 77 52 chr15 92730538 92731147 -10763827 - MTC-int LTR MaLR -478 620 1 2 1292 1400 251 34 20 chr15 92731151 92731500 -10763474 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 15 2 1292 314 276 91 43 chr15 92740012 92740183 -10754791 + MLT1B LTR MaLR 25 185 -223 3 1292 1111 254 99 35 chr15 92741436 92741778 -10753196 + ORR1D2 LTR MaLR 3 366 -4 3 1292 3819 43 65 0 chr15 92744225 92744671 -10750303 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 3 1292 367 218 58 0 chr15 92755143 92755230 -10739744 + ORR1D1 LTR MaLR 4 95 -279 3 1292 1485 228 14 24 chr15 92758892 92758982 -10735992 + ORR1D1 LTR MaLR 82 166 -208 3 1292 2422 86 45 3 chr15 92758982 92759296 -10735678 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1292 1485 228 14 24 chr15 92759296 92759501 -10735473 + ORR1D1 LTR MaLR 167 374 0 3 1292 479 319 30 103 chr15 92763779 92764146 -10730828 + MT2A LTR ERVL 190 529 -4 3 1292 305 299 73 22 chr15 92764392 92764581 -10730393 + MamGypLTR1b LTR Gypsy 565 768 -35 3 1292 4871 152 101 18 chr15 92765140 92765973 -10729001 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 3 1292 452 249 160 36 chr15 92773886 92774136 -10720838 + RMER10A LTR ERVL 162 442 0 3 1292 533 278 22 44 chr15 92774141 92774322 -10720652 - MLT1D LTR MaLR -145 360 184 3 1292 275 373 80 0 chr15 92774484 92774634 -10720340 - MLT1D LTR MaLR -340 165 4 3 1292 597 327 56 34 chr15 92775846 92776112 -10718862 - LTR52-int LTR ERVL -3150 2535 2264 3 1292 322 311 9 9 chr15 92776497 92776604 -10718370 - LTR52-int LTR ERVL -3628 2057 1951 3 1292 503 304 69 22 chr15 92776605 92776837 -10718137 - LTR52-int LTR ERVL -1723 1833 1591 3 1292 305 351 62 11 chr15 92776899 92777149 -10717825 - LTR52-int LTR ERVL -2076 1480 1276 3 1292 525 299 35 110 chr15 92777455 92777813 -10717161 + ORR1D1 LTR MaLR 1 332 -42 3 1292 443 321 78 60 chr15 92777827 92778264 -10716710 - LTR52-int LTR ERVL -2726 830 386 3 1292 680 314 55 10 chr15 92778277 92778570 -10716404 - LTR52-int LTR ERVL -3196 360 55 3 1292 237 236 144 11 chr15 92779514 92779604 -10715370 - LTR52 LTR ERVL -309 112 11 3 1292 1605 223 63 99 chr15 92781892 92782419 -10712555 + RLTR18B LTR ERVK 1 508 -4 3 1292 1749 216 82 15 chr15 92782449 92782853 -10712121 + RLTR18-int LTR ERVK 3 433 -4928 3 1292 642 301 51 11 chr15 92782920 92783098 -10711876 + RLTR18-int LTR ERVK 2111 2295 -3066 3 1292 1799 204 33 45 chr15 92783650 92784077 -10710897 + RLTR18-int LTR ERVK 2376 2797 -2564 3 1292 1649 181 192 84 chr15 92784080 92784605 -10710369 - RLTR18 LTR ERVK -3 613 32 3 1292 2021 206 14 16 chr15 92784608 92785038 -10709936 + RLTR18-int LTR ERVK 3040 3468 -1893 3 1292 267 266 16 0 chr15 92785039 92785103 -10709871 + RLTR18B LTR ERVK 448 512 0 3 1292 1318 268 11 25 chr15 92785219 92785579 -10709395 + RMER15 LTR ERVL 203 557 -18 3 1292 686 281 11 11 chr15 92785594 92785781 -10709193 + RMER15-int LTR ERVL 1 187 -4812 3 1292 411 329 88 71 chr15 92786145 92786384 -10708590 + RMER15-int LTR ERVL 286 528 -4471 3 1292 2709 83 35 17 chr15 92788993 92789397 -10705577 - RLTR10A LTR ERVK 0 411 1 3 1292 321 321 63 19 chr15 92791362 92791521 -10703453 + MLT1B LTR MaLR 210 375 -15 3 1292 1554 221 64 27 chr15 92794548 92794952 -10700022 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1292 3855 246 73 39 chr15 92794952 92796169 -10698805 - MTD-int LTR MaLR 0 1258 1 3 1292 787 294 24 92 chr15 92796209 92796384 -10698590 - MTD LTR MaLR -105 314 136 3 1292 2070 97 26 56 chr15 92796384 92796723 -10698251 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 3 1292 787 294 24 92 chr15 92796723 92796786 -10698188 - MTD LTR MaLR -284 135 89 3 1292 787 294 24 92 chr15 92796933 92797030 -10697944 - MTD LTR MaLR -331 88 1 3 1292 269 333 98 0 chr15 92797480 92797582 -10697392 - MTEb LTR MaLR 0 379 268 3 161 3220 48 10 2 chr15 92798609 92799006 -10695968 - MTB LTR MaLR 0 400 1 3 1293 1033 97 0 41 chr15 92799006 92799200 -10695774 - MTB-int LTR MaLR 0 1098 913 3 1293 3331 134 84 9 chr15 92801831 92802470 -10692504 - MTB-int LTR MaLR -191 1067 381 4 1293 2533 100 0 3 chr15 92803391 92803781 -10691193 - MTB-int LTR MaLR -709 389 1 4 1293 2640 43 137 17 chr15 92803781 92804138 -10690836 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1293 760 144 36 36 chr15 92806059 92806158 -10688816 - RMER2 LTR ERV1 0 567 468 4 1293 760 144 36 36 chr15 92806189 92806226 -10688748 - RMER2 LTR ERV1 -100 467 431 4 1293 2183 91 3 16 chr15 92816495 92816818 -10678156 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1293 344 294 40 32 chr15 92817814 92818017 -10676957 + MER31A LTR ERV1 109 312 -154 4 1293 786 231 119 85 chr15 92818526 92818880 -10676094 + ORR1D2 LTR MaLR 5 370 0 4 1293 328 335 42 37 chr15 92819328 92819517 -10675457 - MLT1D LTR MaLR -28 477 288 4 1293 2835 67 0 0 chr15 92821333 92821679 -10673295 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1293 14045 55 8 3 chr15 92821679 92823462 -10671512 - ORR1A1-int LTR MaLR 0 1792 1 4 1293 2842 61 0 0 chr15 92823462 92823808 -10671166 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 4 1293 320 83 0 0 chr15 92823808 92823856 -10671118 - ORR1A2 LTR MaLR -279 48 1 4 1293 303 317 100 62 chr15 92826038 92826378 -10668596 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 4 1293 1890 109 104 71 chr15 92826386 92826781 -10668193 - RMER17C LTR ERVK 0 410 3 4 1293 3339 49 2 2 chr15 92831509 92831916 -10663058 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1293 436 276 94 6 chr15 92831985 92832156 -10662818 + MLT1D LTR MaLR 301 486 -19 4 1293 480 305 68 104 chr15 92836987 92837313 -10657661 + MLT1B LTR MaLR 22 335 -55 4 1293 2182 92 3 144 chr15 92838459 92838840 -10656134 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 4 1293 4604 6 0 0 chr15 92844531 92845024 -10649950 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 4 1293 245 303 58 39 chr15 92847917 92848020 -10646954 + MT2B LTR ERVL 159 263 -338 4 1293 395 186 61 10 chr15 92849276 92849374 -10645600 + MT2A LTR ERVL 1 103 -430 4 1293 358 268 130 0 chr15 92858464 92858602 -10636372 + MLT1D LTR MaLR 350 505 0 4 1293 1301 143 247 3 chr15 92859724 92860011 -10634963 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 3 4 1293 468 292 12 58 chr15 92861387 92861558 -10633416 - MTEa LTR MaLR -12 367 205 4 1293 3081 129 88 22 chr15 92862171 92862719 -10632255 + RMER4B LTR ERVK 2 585 0 4 1293 709 283 43 96 chr15 92862978 92863376 -10631598 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 4 1293 1545 233 47 61 chr15 92863768 92864176 -10630798 - RMER19C LTR ERVK 0 611 203 4 1293 1545 233 47 61 chr15 92864993 92865077 -10629897 - RMER19C LTR ERVK -409 202 126 4 1293 954 249 118 82 chr15 92865118 92865482 -10629492 - MTEa LTR MaLR 0 379 3 4 1293 816 244 147 11 chr15 92865484 92865757 -10629217 - MTEa-int LTR MaLR 0 1580 1271 4 1293 2818 126 34 1 chr15 92865761 92866330 -10628644 + ORR1A3-int LTR MaLR 1001 1771 -192 5 1293 2913 46 3 0 chr15 92868733 92869078 -10625896 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 5 1293 2286 115 9 0 chr15 92884014 92884337 -10610637 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1293 1676 129 157 35 chr15 92895539 92895908 -10599066 - MTD LTR MaLR 0 419 6 5 1293 277 260 232 16 chr15 92897392 92897517 -10597457 - RMER15 LTR ERVL -70 505 354 5 1293 1553 198 132 15 chr15 92903567 92903900 -10591074 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 3 5 1293 628 301 136 69 chr15 92908559 92908919 -10586055 + MT2A LTR ERVL 1 384 -149 5 1293 676 254 52 30 chr15 92909635 92909866 -10585108 + RMER20B LTR ERVK 234 469 -158 5 1293 831 229 198 3 chr15 92912202 92912505 -10582469 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 3 5 1293 449 319 78 0 chr15 92920861 92921052 -10573922 - MLT1A0 LTR MaLR -9 356 151 5 1293 291 233 82 49 chr15 92921514 92921636 -10573338 - MLT1A0 LTR MaLR -239 126 1 5 1293 293 200 67 39 chr15 92924003 92924107 -10570867 + RMER13B LTR ERVK 802 908 0 5 1293 1387 165 102 10 chr15 92928242 92928415 -10566559 + ORR1C2 LTR MaLR 1 190 -194 5 1293 1387 165 102 10 chr15 92928469 92928589 -10566385 + ORR1C2 LTR MaLR 191 321 -63 5 1294 1129 267 59 33 chr15 92933438 92933775 -10561199 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 25 5 1294 1576 135 74 16 chr15 92934550 92934595 -10560379 - MT2B LTR ERVL 0 601 545 5 1294 1576 156 138 29 chr15 92934628 92935076 -10559898 - MT2B LTR ERVL -57 544 2 5 1294 3211 61 5 0 chr15 92937135 92937529 -10557445 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1294 1882 177 8 52 chr15 92939324 92939675 -10555299 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 21 6 1294 1882 177 8 52 chr15 92939695 92939725 -10555249 - ORR1B2 LTR MaLR -347 20 2 6 1294 1701 182 36 111 chr15 92944826 92945460 -10549514 - RMER4A LTR ERVK 0 585 1 6 1294 1517 175 50 0 chr15 92949033 92949313 -10545661 + MTC LTR MaLR 120 413 -8 6 1294 1133 212 223 14 chr15 92949347 92949692 -10545282 + MTD LTR MaLR 1 417 -2 6 1294 250 317 78 10 chr15 92951433 92951535 -10543439 + MLT1J LTR MaLR 389 497 -15 6 1294 2277 82 69 0 chr15 92951537 92951843 -10543131 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1294 622 276 45 22 chr15 92954473 92954651 -10540323 + MLT1A LTR MaLR 189 370 -4 6 1294 2074 236 65 10 chr15 92959101 92959561 -10535413 + MT2A LTR ERVL 1 488 -45 6 1294 2074 236 65 10 chr15 92959599 92959643 -10535331 + MT2A LTR ERVL 489 532 -1 6 1294 1128 267 118 24 chr15 92965761 92966144 -10528830 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1294 608 283 164 41 chr15 92967512 92967829 -10527145 - MLT1F2 LTR MaLR 0 560 205 6 1294 2374 66 122 11 chr15 92968002 92968353 -10526621 + RLTR10 LTR ERVK 1 390 0 6 1294 3260 58 10 0 chr15 92970490 92970886 -10524088 - MTB LTR MaLR 0 400 1 6 1294 1504 269 34 120 chr15 92973061 92973128 -10521846 - MLT2B3 LTR ERVL -6 509 455 6 1294 1575 269 34 120 chr15 92973676 92974165 -10520809 - MLT2B3 LTR ERVL -50 504 1 6 1294 394 274 128 99 chr15 92974538 92974850 -10520124 - MLT2B4 LTR ERVL -53 503 183 6 1294 1006 244 90 38 chr15 92981100 92981390 -10513584 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 66 6 1294 1700 144 97 89 chr15 92981391 92981741 -10513233 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 41 6 1294 2619 143 24 12 chr15 92982056 92982472 -10512502 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1294 1938 157 103 3 chr15 92983543 92983894 -10511080 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 1 6 1294 2173 80 60 0 chr15 92989774 92990075 -10504899 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 7 1294 2211 111 9 0 chr15 92990936 92991252 -10503722 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 7 1294 2019 139 56 20 chr15 92993120 92993320 -10501654 + RMER17C LTR ERVK 1 206 -204 7 1294 2019 139 56 20 chr15 92993456 92993651 -10501323 + RMER17C LTR ERVK 207 410 0 7 1294 280 181 37 13 chr15 92996674 92996745 -10498229 + MER77 LTR ERVL 260 354 -253 7 1294 1032 246 104 68 chr15 92998866 92999040 -10495934 + MTEb LTR MaLR 1 179 -200 7 1294 1621 212 44 68 chr15 92999040 92999469 -10495505 + MTD LTR MaLR 1 419 0 7 1294 1032 246 104 68 chr15 92999469 92999660 -10495314 + MTEb LTR MaLR 180 378 -1 7 1294 457 178 20 10 chr15 93009502 93009604 -10485370 + ORR1D2 LTR MaLR 206 308 -62 3 1294 2917 22 0 145 chr15 93013778 93014205 -10480769 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 1 1294 2744 154 48 39 chr15 93017510 93018029 -10476945 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 1 1 1294 1359 168 152 19 chr15 93023721 93024033 -10470941 - ORR1C2 LTR MaLR 0 374 21 2 1294 959 186 4 112 chr15 93024033 93024293 -10470681 - ORR1C2-int LTR MaLR 0 1370 1139 2 1294 1790 173 71 16 chr15 93024584 93024691 -10470283 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 281 2 1294 1911 222 59 135 chr15 93024691 93025351 -10469623 - RMER19C LTR ERVK 0 611 2 2 1294 1790 173 71 16 chr15 93025351 93025607 -10469367 - ORR1C2 LTR MaLR -104 280 1 2 1294 1018 276 46 56 chr15 93031030 93031421 -10463553 + MLT1B LTR MaLR 1 387 -3 3 1294 458 312 86 43 chr15 93034535 93034707 -10460267 - ORR1E LTR MaLR -20 339 161 4 1294 458 312 86 43 chr15 93034828 93034980 -10459994 - ORR1E LTR MaLR -199 160 3 4 1294 245 287 170 32 chr15 93037823 93038001 -10456973 - MLT1H1 LTR MaLR -300 295 54 4 1294 591 194 132 8 chr15 93038831 93038994 -10455980 - MTD LTR MaLR -14 405 236 5 1294 607 211 63 7 chr15 93039101 93039244 -10455730 - MTD LTR MaLR -230 189 39 5 1294 1621 187 6 39 chr15 93048290 93048647 -10446327 - ORR1D1 LTR MaLR -29 345 1 6 1294 302 256 171 37 chr15 93050722 93050909 -10444065 + MLT1A LTR MaLR 88 299 -75 7 1294 2187 75 51 16 chr15 93056253 93056566 -10438408 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 3 8 1294 230 284 0 47 chr15 93057706 93057791 -10437183 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 327 8 1295 231 230 122 81 chr15 93061600 93061723 -10433251 + LTR33 LTR ERVL 1 128 -387 9 1295 787 158 21 7 chr15 93063395 93063535 -10431439 + ORR1D1 LTR MaLR 1 142 -232 9 1295 1114 178 37 5 chr15 93065944 93066159 -10428815 + ORR1D1 LTR MaLR 145 366 -8 9 1295 3097 82 71 7 chr15 93066981 93067147 -10427827 + RLTR44C LTR ERVK 1 167 -335 1 1295 3097 82 71 7 chr15 93067192 93067490 -10427484 + RLTR44C LTR ERVK 168 494 -8 1 1295 342 261 45 136 chr15 93080450 93080627 -10414347 + RMER15 LTR ERVL 347 507 -68 1 1295 626 233 52 84 chr15 93082539 93083005 -10411969 + MT2A LTR ERVL 1 558 -43 1 1295 2225 179 134 17 chr15 93086151 93086628 -10408346 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 1 1295 1638 193 102 6 chr15 93089078 93089422 -10405552 + ORR1C1 LTR MaLR 1 377 -1 1 1295 338 343 38 9 chr15 93091786 93091892 -10403082 + MLT1J LTR MaLR 200 308 -204 1 1295 647 238 187 43 chr15 93095708 93096013 -10398961 + MTC LTR MaLR 17 395 -26 1 1295 276 152 0 0 chr15 93100664 93100710 -10394264 + RMER19B LTR ERVK 3 48 -854 1 1295 294 264 182 51 chr15 93102739 93102915 -10392059 + MLT1A0 LTR MaLR 6 204 -161 1 1295 505 313 122 17 chr15 93106463 93106819 -10388155 + RMER5 LTR ERV1 97 521 -13 1 1295 917 196 132 5 chr15 93119146 93119366 -10375608 - RMER15 LTR ERVL -1 574 327 2 1295 2526 198 242 0 chr15 93119396 93119731 -10375243 + RMER21A LTR ERV1 50 471 -476 2 1295 2526 198 242 0 chr15 93119906 93120288 -10374686 + RMER21A LTR ERV1 472 940 -7 2 1295 1408 157 62 31 chr15 93120299 93120621 -10374353 - RMER15 LTR ERVL -243 332 1 2 1295 305 293 111 0 chr15 93122747 93122846 -10372128 + ORR1E LTR MaLR 36 145 -214 2 1295 542 242 120 6 chr15 93126182 93126365 -10368609 + MLT1F LTR MaLR 186 389 -159 2 1295 1684 146 212 81 chr15 93140754 93140990 -10353984 - MTC LTR MaLR 0 421 210 2 1295 1684 146 212 81 chr15 93141144 93141279 -10353695 - MTC LTR MaLR -212 209 1 2 1295 2122 129 90 13 chr15 93155371 93155749 -10339225 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 2 1295 395 308 155 49 chr15 93157597 93157881 -10337093 + RMER15-int LTR ERVL 1518 1831 -3168 2 1295 915 212 45 5 chr15 93157964 93158187 -10336787 + MTD LTR MaLR 52 283 -136 2 1295 457 304 61 24 chr15 93158411 93158623 -10336351 + RMER15-int LTR ERVL 2336 2555 -2444 2 1295 754 308 57 31 chr15 93158742 93159091 -10335883 + RMER15-int LTR ERVL 4352 4709 -290 2 1295 277 300 75 0 chr15 93159596 93159716 -10335258 + RMER15 LTR ERVL 432 560 -15 2 1295 694 230 53 155 chr15 93168749 93169012 -10325962 - MLT1B LTR MaLR -27 363 130 3 1295 694 230 53 155 chr15 93169384 93169419 -10325555 - MLT1B LTR MaLR -261 129 91 3 1295 1196 171 252 18 chr15 93169709 93170042 -10324932 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 3 1295 519 347 87 24 chr15 93170078 93170492 -10324482 - ERVL-E-int LTR ERVL -540 5127 4688 3 1295 1037 326 107 34 chr15 93171461 93172217 -10322757 - ERVL-E-int LTR ERVL -1301 4366 3556 3 1295 2935 151 12 136 chr15 93176995 93177649 -10317325 + RMER15 LTR ERVL 3 575 0 3 1295 361 254 40 88 chr15 93178112 93178237 -10316737 - RMER10B LTR ERVL -10 388 270 3 1295 2051 116 27 39 chr15 93179210 93179541 -10315433 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1295 2052 115 9 26 chr15 93179596 93179987 -10314987 - RLTR31_Mm LTR ERVK -169 384 1 3 1295 3270 202 109 33 chr15 93179989 93181205 -10313769 - RMER3D-int LTR ERVK -2 2840 1532 3 1295 644 142 35 26 chr15 93181237 93181353 -10313621 - RMER3D-int LTR ERVK -1310 1532 1416 3 1295 242 228 10 61 chr15 93181354 93181452 -10313522 - RLTR31_Mm LTR ERVK -371 190 98 3 1295 4235 56 0 2 chr15 93183426 93183930 -10311044 + RLTR1C LTR ERV1 1 503 0 3 1295 493 301 217 0 chr15 93189083 93189281 -10305693 - MTE2b LTR MaLR -138 241 1 3 1295 1670 184 58 19 chr15 93189979 93190339 -10304635 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1295 233 211 171 86 chr15 93190711 93190851 -10304123 - MT2A LTR ERVL -112 421 270 3 1296 465 296 162 15 chr15 93196091 93196362 -10298612 - MLT1F2 LTR MaLR -86 474 164 3 1296 596 245 0 55 chr15 93197770 93197934 -10297040 - RLTR20C LTR ERVK -2 576 422 3 1296 821 194 208 31 chr15 93197936 93198196 -10296778 - RLTR20C LTR ERVK -228 306 1 3 1296 1912 243 138 81 chr15 93199224 93200038 -10294936 + RMER13A LTR ERVK 1 860 0 3 1296 1907 144 20 12 chr15 93201480 93201824 -10293150 - ORR1B1 LTR MaLR -1 393 47 3 1296 1459 176 21 219 chr15 93206230 93206393 -10288581 + ORR1C2 LTR MaLR 1 165 -219 4 1296 1459 176 21 219 chr15 93206556 93206870 -10288104 + ORR1C2 LTR MaLR 166 383 -1 4 1296 1097 205 316 64 chr15 93208300 93208753 -10286221 + RMER2 LTR ERV1 1 567 0 4 1296 1666 125 138 25 chr15 93211065 93211392 -10283582 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 23 4 1296 2310 136 198 27 chr15 93211723 93212073 -10282901 + RMER2 LTR ERV1 1 398 -169 4 1296 2310 136 198 27 chr15 93212093 93212226 -10282748 + RMER2 LTR ERV1 399 566 -1 4 1296 255 311 0 86 chr15 93219462 93219578 -10275396 + MT2B LTR ERVL 155 260 -341 4 1296 1367 213 22 44 chr15 93220241 93220605 -10274369 + ORR1D1 LTR MaLR 11 366 -8 4 1296 252 268 20 49 chr15 93227304 93227406 -10267568 + MT2B LTR ERVL 167 265 -336 4 1296 981 264 49 107 chr15 93231632 93231758 -10263216 - RMER5 LTR ERV1 -47 487 385 4 1296 981 264 49 107 chr15 93231887 93232248 -10262726 - RMER5 LTR ERV1 -150 384 28 4 1296 1526 165 25 47 chr15 93236456 93236633 -10258341 - MTC LTR MaLR -38 383 211 4 1296 1526 165 25 47 chr15 93236811 93236948 -10258026 - MTC LTR MaLR -211 210 73 4 1296 1074 213 212 69 chr15 93238064 93238554 -10256420 - RMER4B LTR ERVK -9 576 17 4 1296 2142 151 97 13 chr15 93239269 93239652 -10255322 - MTC LTR MaLR -3 418 4 5 1296 476 279 84 50 chr15 93245058 93245379 -10249595 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 11 5 1296 412 210 193 0 chr15 93245552 93245671 -10249303 - ORR1D2 LTR MaLR -34 336 195 5 1296 729 116 37 37 chr15 93245695 93245856 -10249118 - RMER17B LTR ERVK -502 456 296 5 1296 644 308 77 28 chr15 93245798 93246045 -10248929 - ORR1D2 LTR MaLR -111 259 1 5 1296 532 128 0 11 chr15 93247163 93247258 -10247716 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 301 5 1296 620 317 65 53 chr15 93255122 93255459 -10239515 + MTE-int LTR MaLR 751 1091 -489 5 1296 482 198 49 16 chr15 93255890 93256013 -10238961 + MTE-int LTR MaLR 1326 1452 -128 5 1296 232 314 71 0 chr15 93256153 93256223 -10238751 + MTE-int LTR MaLR 1461 1535 -45 5 1296 253 284 27 0 chr15 93256358 93256432 -10238542 + MTEa LTR MaLR 289 364 -15 5 1296 400 350 52 56 chr15 93262036 93262287 -10232687 + MLT1A0 LTR MaLR 43 292 -73 5 1296 302 309 91 32 chr15 93262595 93262749 -10232225 + LTR40c LTR ERVL 303 465 0 5 1296 731 126 131 6 chr15 93262826 93262986 -10231988 - ORR1D1 LTR MaLR -192 182 3 5 1296 361 235 221 29 chr15 93268939 93269075 -10225899 + MTD LTR MaLR 204 365 -54 5 1296 530 56 98 16 chr15 93273088 93273210 -10221764 + ORR1B1 LTR MaLR 41 172 -154 5 1296 2909 93 80 0 chr15 93275166 93275606 -10219368 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1296 700 283 50 121 chr15 93276019 93276417 -10218557 - MTE2a LTR MaLR -3 376 7 5 1296 235 293 188 36 chr15 93281853 93281991 -10212983 - LTR48 LTR ERV1 -16 771 613 6 1296 330 252 120 10 chr15 93288501 93288601 -10206373 - MTEa LTR MaLR -265 114 4 6 1296 822 193 219 23 chr15 93294041 93294306 -10200668 + MTD LTR MaLR 103 419 0 6 1296 333 330 0 0 chr15 93302611 93302705 -10192269 - RMER15 LTR ERVL -105 470 377 6 1296 288 198 89 44 chr15 93313854 93313944 -10181030 + MTEb LTR MaLR 154 247 -132 6 1296 348 301 20 20 chr15 93320322 93320471 -10174503 + RLTR15 LTR ERVK 186 334 -25 6 1296 287 257 41 99 chr15 93323009 93323130 -10171844 - MTEb LTR MaLR -250 129 16 6 1297 2555 83 3 0 chr15 93337978 93338304 -10156670 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1297 354 284 29 49 chr15 93340879 93341083 -10153891 - RMER17D2 LTR ERVK -376 433 234 7 1297 251 233 0 118 chr15 93342485 93342553 -10152421 + MT2B LTR ERVL 168 227 -374 7 1297 368 214 0 0 chr15 93385640 93385710 -10109264 + MTD LTR MaLR 1 70 -349 8 1297 1182 249 99 19 chr15 93385770 93386093 -10108881 + MTD LTR MaLR 71 419 0 8 1297 529 323 50 82 chr15 93389474 93389754 -10105220 + MLT1A0 LTR MaLR 95 365 0 8 1297 552 257 29 0 chr15 93429196 93429336 -10065638 + MLT1B LTR MaLR 18 161 -229 8 1297 329 353 7 0 chr15 93429600 93429736 -10065238 + MLT1B LTR MaLR 328 464 -3 8 1297 2566 60 3 0 chr15 93438904 93439222 -10055752 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 8 1297 2009 119 8 116 chr15 93439362 93439724 -10055250 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 3 8 1297 2111 168 85 3 chr15 93445414 93445801 -10049173 - MTC LTR MaLR 0 421 3 9 1297 758 140 106 19 chr15 93451173 93451333 -10043641 - ORR1D1 LTR MaLR -3 371 198 9 1298 390 295 210 77 chr15 93469449 93469721 -10025253 - MLT1D LTR MaLR 0 505 192 9 1298 2987 109 12 5 chr15 93469721 93470152 -10024822 + RLTR10C LTR ERVK 1 434 -2 9 1298 390 295 210 77 chr15 93470152 93470217 -10024757 - MLT1D LTR MaLR -314 191 124 9 1298 1724 132 65 65 chr15 93471424 93471749 -10023225 + ORR1A4 LTR MaLR 5 329 0 9 1298 373 309 75 83 chr15 93483251 93483558 -10011416 - RLTR25A LTR ERVK -716 312 8 9 1298 923 164 0 0 chr15 93484411 93484570 -10010404 - ORR1B1 LTR MaLR -231 163 5 9 1298 705 152 22 22 chr15 93484851 93484986 -10009988 - MTC LTR MaLR -5 416 282 9 1298 603 294 54 140 chr15 93484964 93485427 -10009547 + RLTR23 LTR ERV1 8 430 0 9 1298 833 78 0 0 chr15 93485429 93485544 -10009430 - MTC LTR MaLR -107 314 200 9 1298 3355 169 138 77 chr15 93490006 93490856 -10004118 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 9 1298 1547 142 54 122 chr15 93492430 93492783 -10002191 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 9 1298 460 299 57 6 chr15 93494545 93494720 -10000254 + MLT1F-int LTR MaLR 125 308 -1181 9 1298 456 336 61 35 chr15 93495367 93495734 -9999240 + MLT1F-int LTR MaLR 1028 1479 -10 9 1298 372 324 126 70 chr15 93501641 93501983 -9992991 + MLT1G3 LTR MaLR 218 578 -17 2 1298 624 294 73 52 chr15 93505542 93505872 -9989102 - MLT1E1A LTR MaLR 0 680 344 7 1298 501 274 98 15 chr15 93505896 93506100 -9988874 - MLT1E1A LTR MaLR -424 229 9 7 1298 1200 215 138 20 chr15 93508038 93508385 -9986589 + MTD LTR MaLR 18 405 -14 1 1298 374 274 62 56 chr15 93511658 93511968 -9983006 + ORR1E LTR MaLR 75 359 -11 1 1298 1923 192 48 5 chr15 93514633 93515030 -9979944 + MTD LTR MaLR 6 419 0 1 1298 360 327 46 36 chr15 93515083 93515302 -9979672 - MLT1A0 LTR MaLR -143 222 2 2 1298 2254 145 10 55 chr15 93517453 93517870 -9977104 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 2 1298 327 339 62 0 chr15 93546063 93546288 -9948686 - MLT1G3 LTR MaLR -16 563 229 4 1298 254 378 56 7 chr15 93546373 93546517 -9948457 - MLT1G3 LTR MaLR -398 193 43 4 1298 1964 108 68 62 chr15 93554031 93554356 -9940618 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1298 369 308 139 6 chr15 93556771 93556944 -9938030 - MLT1D LTR MaLR -50 455 260 5 1298 230 356 17 8 chr15 93557006 93557125 -9937849 - MLT1D LTR MaLR -378 127 8 5 1298 2117 122 21 54 chr15 93566510 93566934 -9928040 - RMER17C LTR ERVK 0 410 1 6 1298 229 339 8 24 chr15 93570457 93570581 -9924393 + MTEb LTR MaLR 250 371 -8 7 1298 939 272 76 92 chr15 93579513 93579685 -9915289 - MTE2a LTR MaLR 0 379 191 8 1298 939 272 76 92 chr15 93579739 93579947 -9915027 - MTE2a LTR MaLR -189 190 5 8 1298 646 285 104 58 chr15 93579951 93580454 -9914520 + MT2A LTR ERVL 4 543 -19 8 1299 1341 240 109 3 chr15 93586031 93586399 -9908575 + MTD LTR MaLR 13 419 0 1 1299 558 302 119 25 chr15 93586408 93586693 -9908281 + MTEa LTR MaLR 55 366 -13 1 1299 366 363 70 73 chr15 93589183 93589510 -9905464 - MLT1J1 LTR MaLR -7 437 112 1 1299 355 200 32 32 chr15 93591554 93591647 -9903327 - MTC LTR MaLR -328 93 1 1 1299 479 284 98 22 chr15 93595656 93595973 -9899001 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 1 1 1299 771 321 44 24 chr15 93598291 93598629 -9896345 - LTR53 LTR ERVL -166 353 9 1 1299 347 352 15 35 chr15 93599299 93599499 -9895475 + MLT1E1 LTR MaLR 450 645 -9 1 1299 2115 194 42 5 chr15 93604159 93604564 -9890410 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 1 1299 2056 180 2 82 chr15 93606387 93606877 -9888097 + RMER4A LTR ERVK 16 466 0 1 1299 747 275 75 50 chr15 93608082 93608450 -9886524 - MTD LTR MaLR -6 373 1 1 1299 381 257 19 45 chr15 93615768 93615905 -9879069 + MTEa LTR MaLR 233 377 -2 1 1299 280 255 39 10 chr15 93615956 93616059 -9878915 + MLT1L LTR MaLR 143 248 -362 1 1299 318 306 124 34 chr15 93616254 93616545 -9878429 + MLT1L LTR MaLR 255 571 -39 1 1299 254 245 51 74 chr15 93624602 93624753 -9870221 + RLTR15 LTR ERVK 50 278 -250 1 1299 2012 123 37 3 chr15 93624938 93625265 -9869709 + ORR1A1 LTR MaLR 1 338 -8 1 1299 597 279 99 34 chr15 93625273 93625596 -9869378 + MTEa LTR MaLR 36 379 0 1 1299 898 250 50 120 chr15 93626389 93626771 -9868203 + ORR1E LTR MaLR 1 355 -4 1 1299 400 306 0 16 chr15 93627101 93627224 -9867750 + MTE-int LTR MaLR 135 255 -1325 1 1299 1404 259 50 17 chr15 93630066 93630424 -9864550 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 1 1299 794 219 66 0 chr15 93630535 93630718 -9864256 - MTD LTR MaLR -223 196 2 1 1299 247 133 44 0 chr15 93630936 93630981 -9863993 + MTD LTR MaLR 359 405 -14 1 1299 2884 80 27 35 chr15 93637306 93637709 -9857265 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1299 576 294 31 84 chr15 93638252 93638575 -9856399 + RLTR18 LTR ERVK 5 310 -306 1 1299 643 316 49 21 chr15 93638622 93638910 -9856064 + RLTR18B LTR ERVK 187 482 -30 1 1299 1808 229 12 17 chr15 93643146 93643559 -9851415 - MTD LTR MaLR -8 411 1 1 1299 495 198 0 10 chr15 93645676 93645773 -9849201 + MTC LTR MaLR 6 101 -306 2 1299 1970 233 15 21 chr15 93645812 93646289 -9848685 + RMER19C LTR ERVK 138 611 0 2 1299 1903 162 0 22 chr15 93646289 93646601 -9848373 + MTC LTR MaLR 109 413 -8 2 1299 3444 185 92 73 chr15 93647274 93648148 -9846826 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 2 1299 2368 92 6 3 chr15 93660071 93660397 -9834577 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1299 1933 166 92 18 chr15 93664359 93664595 -9830379 + MTC LTR MaLR 1 253 -168 2 1299 3379 35 5 0 chr15 93664595 93664989 -9829985 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1299 1933 166 92 18 chr15 93664989 93665144 -9829830 + MTC LTR MaLR 254 421 0 2 1299 230 298 28 46 chr15 93666580 93666689 -9828285 - MLT1I LTR MaLR 0 411 305 2 1299 859 234 67 107 chr15 93669824 93670284 -9824690 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 2 1299 369 200 8 167 chr15 93670683 93670761 -9824213 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 315 2 1299 369 200 8 167 chr15 93670813 93670860 -9824114 - ORR1D1 LTR MaLR -60 314 269 2 1299 466 241 98 42 chr15 93670873 93670953 -9824021 - RLTR20C LTR ERVK -12 566 490 2 1299 466 241 98 42 chr15 93670984 93671046 -9823928 - RLTR20C LTR ERVK -89 489 417 2 1299 887 177 141 65 chr15 93671038 93671328 -9823646 - RLTR20C LTR ERVK -222 312 1 2 1299 353 279 14 65 chr15 93671328 93671430 -9823544 - ORR1D1 LTR MaLR -114 260 166 2 1299 514 206 20 10 chr15 93671604 93671702 -9823272 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 83 2 1299 1564 194 118 5 chr15 93671911 93672285 -9822689 - MTD LTR MaLR -3 416 1 2 1299 950 275 103 33 chr15 93672479 93672810 -9822164 - MTE2b LTR MaLR -21 358 5 2 1299 1979 158 0 30 chr15 93672901 93673272 -9821702 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 35 2 1299 413 314 47 147 chr15 93678000 93678163 -9816811 - MTEa LTR MaLR -147 232 82 2 1299 413 314 47 147 chr15 93678309 93678331 -9816643 - MTEa LTR MaLR -298 81 65 2 1299 2181 157 3 3 chr15 93678331 93678677 -9816297 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 2 1299 413 314 47 147 chr15 93678677 93678748 -9816226 - MTEa LTR MaLR -315 64 1 2 1299 346 280 58 106 chr15 93682158 93682366 -9812608 + MLT1C LTR MaLR 76 273 -194 2 1299 572 264 134 10 chr15 93683918 93684158 -9810816 - MLT1D LTR MaLR -9 496 200 2 1299 1038 178 1 1 chr15 93685077 93685275 -9809699 - ORR1C2 LTR MaLR 0 394 197 2 1299 288 139 150 12 chr15 93685282 93685362 -9809612 - ORR1C2 LTR MaLR -292 92 2 2 1299 503 251 184 0 chr15 93687189 93687352 -9807622 + MTD LTR MaLR 3 195 -224 2 1299 1871 169 9 89 chr15 93712062 93712311 -9782663 + RMER10B LTR ERVL 4 230 -168 2 1299 1871 169 9 89 chr15 93712649 93712826 -9782148 + RMER10B LTR ERVL 231 396 -2 2 1299 510 290 130 45 chr15 93713281 93713635 -9781339 + MLT1B LTR MaLR 5 388 -2 2 1299 433 325 36 36 chr15 93714847 93715067 -9779907 + MLT1A0 LTR MaLR 146 365 0 3 1299 1628 187 18 15 chr15 93715234 93715565 -9779409 + RLTR12A LTR ERVK 233 564 -4 3 1300 758 237 26 56 chr15 93716584 93716852 -9778122 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 260 -267 3 1300 413 271 47 108 chr15 93716886 93717118 -9777856 + RLTR11A2 LTR ERVK 214 431 -22 3 1300 3519 23 2 0 chr15 93717295 93717690 -9777284 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 3 1300 737 174 61 75 chr15 93721941 93722136 -9772838 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 182 3 1300 737 174 61 75 chr15 93722167 93722183 -9772791 - ORR1D1 LTR MaLR -193 181 166 3 1300 818 198 23 22 chr15 93722256 93722498 -9772476 - ORR1D1 LTR MaLR -135 243 1 3 1300 374 246 87 0 chr15 93728155 93728281 -9766693 - MTD LTR MaLR 0 419 283 3 1300 1849 225 99 54 chr15 93728342 93728916 -9766058 - RMER13A LTR ERVK -242 618 19 3 1300 1248 171 36 75 chr15 93728983 93729318 -9765656 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1300 537 338 57 24 chr15 93731715 93732048 -9762926 - MER34A LTR ERV1 -227 344 1 3 1300 245 307 34 34 chr15 93744817 93744935 -9750039 + ORR1E LTR MaLR 8 125 -234 3 1300 955 191 100 67 chr15 93756286 93756644 -9738330 + RLTR20C LTR ERVK 1 489 -89 3 1300 500 252 65 22 chr15 93756699 93756778 -9738196 + RLTR20C LTR ERVK 490 566 -12 3 1300 415 287 138 50 chr15 93761082 93761379 -9733595 + MTEb LTR MaLR 3 325 -54 3 1300 539 300 62 23 chr15 93765723 93765979 -9728995 - ERVL-E-int LTR ERVL -5381 286 21 3 1300 1697 195 37 3 chr15 93766040 93766394 -9728580 - MTC LTR MaLR -55 366 1 3 1300 3055 54 30 15 chr15 93769873 93770267 -9724707 + MTB LTR MaLR 1 400 0 3 1300 2358 174 17 21 chr15 93771177 93771595 -9723379 + MTD LTR MaLR 4 419 0 3 1300 724 359 48 33 chr15 93773245 93773764 -9721210 - MER74B LTR ERVL -31 591 65 3 1300 1148 286 70 17 chr15 93781053 93781398 -9713576 - MTD LTR MaLR -39 380 18 3 1300 396 273 87 41 chr15 93783745 93783963 -9711011 + MLT1A0 LTR MaLR 80 307 -58 3 1300 4361 50 87 0 chr15 93786385 93786904 -9708070 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 4 1300 695 116 0 0 chr15 93791419 93791547 -9703427 + RMER19A LTR ERVK 2 189 -548 4 1300 1567 180 87 69 chr15 93793982 93794316 -9700658 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 47 4 1300 234 308 128 0 chr15 93799193 93799271 -9695703 + MT2B LTR ERVL 154 241 -360 4 1300 390 344 154 51 chr15 93801071 93801344 -9693630 - MLT1A1 LTR MaLR -7 401 101 4 1300 1797 215 40 5 chr15 93805238 93805608 -9689366 + MTD LTR MaLR 26 408 -11 4 1300 1613 187 65 12 chr15 93807947 93808272 -9686702 - ORR1C1 LTR MaLR -35 343 2 4 1300 3625 168 32 185 chr15 93808804 93809914 -9685060 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 4 1300 754 239 59 36 chr15 93813852 93814073 -9680901 + MTE2b LTR MaLR 151 376 -3 4 1300 1080 268 58 39 chr15 93814218 93814529 -9680445 + MTEa LTR MaLR 2 318 -61 4 1300 1026 259 49 114 chr15 93814641 93815046 -9679928 - MTE2a LTR MaLR 0 379 1 4 1300 2300 213 72 6 chr15 93815337 93815847 -9679127 - RMER15 LTR ERVL -5 570 27 4 1300 355 316 171 33 chr15 93818018 93818352 -9676622 - MLT2C2 LTR ERVL -41 423 44 4 1300 816 259 110 33 chr15 93821246 93821536 -9673438 - MTE2a LTR MaLR -22 397 125 4 1300 3058 73 67 13 chr15 93822363 93822749 -9672225 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1300 1099 231 69 33 chr15 93823272 93823577 -9671397 - MTE2a LTR MaLR 0 379 64 4 1300 373 348 96 60 chr15 93824500 93824833 -9670141 + ORR1E LTR MaLR 5 349 -10 4 1300 234 295 139 37 chr15 93828648 93828863 -9666111 + MLT1J-int LTR MaLR 507 743 -644 4 1300 242 370 30 10 chr15 93828910 93829011 -9665963 + MLT1J-int LTR MaLR 839 941 -446 4 1300 236 346 36 45 chr15 93829019 93829131 -9665843 - MLT2B1 LTR ERVL -65 502 392 4 1300 3515 57 77 0 chr15 93844144 93844585 -9650389 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 1 4 1301 1783 164 32 90 chr15 93849809 93849880 -9645094 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 325 4 1301 1783 164 32 90 chr15 93850052 93850381 -9644593 - ORR1C1 LTR MaLR -54 324 1 4 1301 2679 150 0 12 chr15 93850408 93850832 -9644142 - MTC LTR MaLR -2 419 1 4 1301 1605 147 97 59 chr15 93854834 93855174 -9639800 + ORR1C1 LTR MaLR 1 353 -25 4 1301 1235 267 75 9 chr15 93859491 93859824 -9635150 + MTE2b LTR MaLR 1 355 -24 4 1301 523 314 86 5 chr15 93859847 93860052 -9634922 - MLT2B1 LTR ERVL -70 450 218 5 1301 292 337 114 45 chr15 93860132 93860255 -9634719 - MLT2B1 LTR ERVL -339 217 74 5 1301 531 285 79 24 chr15 93861833 93862085 -9632889 - ERVL-E-int LTR ERVL -68 5689 5424 5 1301 333 281 188 6 chr15 93862322 93862487 -9632487 - ERVL-E-int LTR ERVL -541 5173 4979 5 1301 883 220 94 111 chr15 93862920 93863318 -9631656 - MT2A LTR ERVL -78 523 1 5 1301 2048 292 82 35 chr15 93863496 93864357 -9630617 - ERVL-E-int LTR ERVL -964 4703 3802 5 1301 453 271 30 8 chr15 93864450 93864584 -9630390 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4087 1627 1491 5 1301 778 243 81 90 chr15 93865241 93865562 -9629412 - ERVL-B4-int LTR ERVL -4550 1164 847 5 1301 2533 191 138 29 chr15 93872184 93872735 -9622239 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 5 1301 335 242 57 57 chr15 93873958 93874063 -9620911 - MTE-int LTR MaLR -316 1264 1160 5 1301 258 400 14 51 chr15 93874202 93874418 -9620556 - MTE-int LTR MaLR -522 1058 851 5 1301 228 301 98 43 chr15 93875119 93875282 -9619692 - MTE-int LTR MaLR -773 807 636 5 1301 773 320 34 22 chr15 93875450 93875859 -9619115 - MTE-int LTR MaLR -1165 415 2 5 1301 2138 127 21 52 chr15 93881132 93881555 -9613419 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 5 1301 889 230 46 4 chr15 93886782 93887017 -9607957 + MTD LTR MaLR 180 421 0 5 1301 1280 201 146 67 chr15 93887250 93887592 -9607382 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 10 5 1301 2285 119 50 45 chr15 93887876 93888341 -9606633 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 467 -8 5 1301 5307 53 0 31 chr15 93888342 93889025 -9605949 + IAPEz-int LTR ERVK 1 662 -5819 5 1301 454 66 0 32 chr15 93889025 93889088 -9605886 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 5 1301 1827 119 4 4 chr15 93889077 93889339 -9605635 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 5 1301 953 80 24 0 chr15 93889334 93889459 -9605515 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 5 1301 26770 16 4 0 chr15 93889459 93892405 -9602569 + IAPEz-int LTR ERVK 3525 6481 0 5 1301 2283 119 50 45 chr15 93892405 93892870 -9602104 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 467 -8 5 1301 250 216 66 26 chr15 93895341 93895417 -9599557 - MTD LTR MaLR -14 407 329 5 1301 476 230 7 86 chr15 93895395 93895547 -9599427 - MTD LTR MaLR -267 152 13 5 1301 462 213 32 0 chr15 93895902 93895996 -9598978 - RMER17C-int LTR ERVK -141 3097 3001 5 1301 338 194 0 16 chr15 93895996 93896059 -9598915 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 369 5 1301 2017 146 70 39 chr15 93896156 93896542 -9598432 + RMER10B LTR ERVL 1 398 0 5 1301 253 352 71 14 chr15 93897987 93898128 -9596846 - MLT1H1 LTR MaLR -2 553 405 5 1301 1882 132 116 9 chr15 93900859 93901187 -9593787 + ORR1B2 LTR MaLR 1 363 -4 5 1301 1341 264 15 6 chr15 93902300 93902643 -9592331 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 25 5 1301 427 345 160 66 chr15 93908301 93908788 -9586186 - MLT1G LTR MaLR -39 552 20 5 1301 235 198 33 55 chr15 93908986 93909077 -9585897 - MTEb LTR MaLR -15 364 276 5 1301 2651 65 98 19 chr15 93912234 93912611 -9582363 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1301 230 197 55 27 chr15 93916378 93916451 -9578523 + MTEb LTR MaLR 288 362 -17 5 1301 1861 128 76 3 chr15 93918553 93918882 -9576092 + RMER6D LTR ERVK 1 353 -367 5 1301 3368 143 26 7 chr15 93920008 93920592 -9574382 + RLTR17 LTR ERVK 98 692 0 5 1301 906 135 38 13 chr15 93920599 93920757 -9574217 + RMER6D LTR ERVK 362 523 -197 5 1301 613 308 91 64 chr15 93925574 93925927 -9569047 + MER34A LTR ERV1 28 395 -176 5 1301 613 308 91 64 chr15 93926134 93926252 -9568722 + MER34A LTR ERV1 396 511 -60 5 1301 270 240 41 16 chr15 93927231 93927312 -9567662 + MTEa LTR MaLR 281 361 -18 5 1301 2052 113 15 6 chr15 93928659 93928988 -9565986 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 5 1301 280 53 0 0 chr15 93928992 93929030 -9565944 + IAPEz-int LTR ERVK 3 40 -1947 5 1301 3650 80 19 31 chr15 93929030 93929854 -9565120 + IAPEz-int LTR ERVK 10 662 -5819 5 1301 2262 68 0 0 chr15 93929854 93930132 -9564842 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 5 1301 6141 48 3 21 chr15 93930131 93930891 -9564083 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6481 0 5 1301 2040 116 15 6 chr15 93930891 93931220 -9563754 + IAPLTR1a_Mm LTR ERVK 1 332 -5 5 1301 4659 112 18 8 chr15 93932206 93932936 -9562038 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 1301 287 289 0 22 chr15 93936633 93936725 -9558249 + MER57-int LTR ERV1 7155 7244 -293 5 1301 303 321 161 36 chr15 93940259 93940427 -9554547 - ORR1E LTR MaLR -167 192 4 6 1301 1740 165 130 19 chr15 93942403 93942565 -9552409 - MTC LTR MaLR -3 418 260 6 1301 1740 165 130 19 chr15 93942755 93942968 -9552006 - MTC LTR MaLR -162 259 1 6 1301 4139 192 256 14 chr15 93942969 93943979 -9550995 - MTC-int LTR MaLR -2 1256 2 6 1301 2074 188 54 27 chr15 93943979 93944388 -9550586 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1301 6302 102 65 9 chr15 93945934 93946841 -9548133 - RMER17B LTR ERVK 0 958 1 6 1301 334 326 0 48 chr15 93948060 93948163 -9546811 - MT2B LTR ERVL -337 264 167 6 1301 330 271 100 67 chr15 93955513 93955663 -9539311 + RMER15 LTR ERVL 3 157 -418 6 1301 585 302 81 78 chr15 93955660 93955944 -9539030 + RMER15 LTR ERVL 273 557 -18 6 1301 1855 167 127 0 chr15 93956017 93956340 -9538634 + ORR1B2 LTR MaLR 3 366 -1 6 1301 1856 184 27 27 chr15 93956979 93957348 -9537626 - ORR1C2 LTR MaLR -2 382 14 6 1301 920 209 137 54 chr15 93961536 93961914 -9533060 - MT2A LTR ERVL -71 462 1 6 1301 1939 142 153 6 chr15 93962513 93962833 -9532141 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1301 2671 144 10 3 chr15 93963061 93963450 -9531524 + ORR1B1 LTR MaLR 3 394 0 6 1301 335 296 89 54 chr15 93965672 93965840 -9529134 + MLT1A LTR MaLR 20 193 -181 6 1301 1165 271 124 16 chr15 93971205 93971569 -9523405 + MTD LTR MaLR 5 407 -12 6 1301 2307 193 7 7 chr15 93971745 93972157 -9522817 + MTC LTR MaLR 10 421 0 6 1302 639 324 99 37 chr15 93994209 93994613 -9500361 - MER89 LTR ERV1 -30 529 101 6 1302 2211 167 66 20 chr15 93994629 93995470 -9499504 - RMER6A LTR ERVK -2 754 3 6 1302 1716 206 178 75 chr15 94002078 94002561 -9492413 + MT2A LTR ERVL 1 533 0 6 1302 1329 237 64 39 chr15 94003373 94003457 -9491517 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 292 8 1302 1806 159 103 21 chr15 94003457 94003836 -9491138 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 9 1302 1329 237 64 39 chr15 94003836 94004111 -9490863 - ORR1D2 LTR MaLR -79 291 2 8 1302 2261 131 101 0 chr15 94014551 94014909 -9480065 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 2 1302 448 296 77 46 chr15 94015681 94015876 -9479098 - ERVL-E-int LTR ERVL -1005 4662 4462 2 1302 1824 249 33 62 chr15 94016239 94016542 -9478432 - RMER15 LTR ERVL -46 529 233 3 1302 1824 249 33 62 chr15 94016728 94016941 -9478033 - RMER15 LTR ERVL -343 232 28 3 1302 230 279 0 56 chr15 94021908 94021980 -9472994 + MER34A LTR ERV1 71 138 -433 3 1302 3108 27 0 121 chr15 94032546 94032961 -9462013 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 5 1302 359 299 116 7 chr15 94038095 94038233 -9456741 - MER74B LTR ERVL -375 247 95 6 1302 1459 222 98 11 chr15 94039161 94039529 -9455445 - MTD LTR MaLR -14 405 6 6 1302 553 317 26 36 chr15 94039711 94039904 -9455070 + MLT1K LTR MaLR 383 573 -22 6 1302 691 348 48 45 chr15 94041348 94041616 -9453358 - MTEb LTR MaLR -65 314 46 6 1302 1990 298 69 19 chr15 94041612 94042238 -9452736 - MTEb-int LTR MaLR -923 657 1 6 1302 902 293 50 53 chr15 94042238 94042269 -9452705 - MTEb LTR MaLR 0 379 348 6 1302 902 293 50 53 chr15 94042318 94042664 -9452310 - MTEb LTR MaLR -32 347 4 6 1302 3454 50 2 2 chr15 94046576 94046976 -9447998 - MTB LTR MaLR 0 400 1 7 1302 797 184 0 26 chr15 94054722 94054873 -9440101 - RMER15 LTR ERVL 0 575 429 8 1302 1140 169 136 0 chr15 94054902 94055115 -9439859 - ORR1B1 LTR MaLR -152 242 1 8 1302 1372 236 82 21 chr15 94055115 94055230 -9439744 - RMER15 LTR ERVL -177 398 276 8 1302 1357 200 73 81 chr15 94055230 94055611 -9439363 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 8 1302 1372 236 82 21 chr15 94055611 94055870 -9439104 - RMER15 LTR ERVL -300 275 2 8 1302 923 227 181 31 chr15 94055870 94056291 -9438683 - RMER15-int LTR ERVL -26 4973 4490 8 1302 2751 215 60 19 chr15 94056282 94056917 -9438057 - RMER15-int LTR ERVL -3657 1342 686 8 1302 2184 258 72 26 chr15 94056931 94057541 -9437433 - RMER15-int LTR ERVL -4361 638 1 8 1302 288 170 0 0 chr15 94057541 94057588 -9437386 - RMER15 LTR ERVL 0 575 529 8 1302 944 167 12 0 chr15 94057603 94057765 -9437209 - ORR1B2 LTR MaLR -8 359 196 8 1302 497 167 0 0 chr15 94057772 94057862 -9437112 - ORR1B2 LTR MaLR -277 90 1 8 1302 1147 195 64 19 chr15 94057862 94058299 -9436675 - RMER15 LTR ERVL -62 513 1 8 1302 450 322 53 0 chr15 94060319 94060471 -9434503 - LTR31 LTR ERV1 -291 328 169 9 1302 372 317 38 32 chr15 94060558 94060744 -9434230 + ORR1E LTR MaLR 6 192 -167 9 1302 259 317 33 8 chr15 94060783 94060904 -9434070 + ORR1E LTR MaLR 256 379 0 9 1302 454 260 277 0 chr15 94063319 94063561 -9431413 + MER57C2 LTR ERV1 8 316 -118 9 1302 524 296 95 8 chr15 94066741 94066993 -9427981 + MER90a LTR ERV1 97 370 -244 9 1302 315 309 31 67 chr15 94072896 94073090 -9421884 + RLTR23 LTR ERV1 244 430 0 1 1302 1340 251 35 30 chr15 94073091 94073457 -9421517 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 1 1302 519 304 55 44 chr15 94087869 94088162 -9406812 - MT2A LTR ERVL -160 373 78 1 1302 315 318 101 0 chr15 94088094 94088223 -9406751 - MTE2a LTR MaLR -231 148 7 1 1302 1374 216 78 33 chr15 94090675 94091034 -9403940 + ORR1C1 LTR MaLR 2 376 -2 1 1302 1848 108 0 0 chr15 94091945 94092214 -9402760 + ORR1A2 LTR MaLR 1 269 -58 1 1302 485 62 0 0 chr15 94092386 94092451 -9402523 + ORR1A2 LTR MaLR 263 327 0 1 1302 652 340 32 42 chr15 94092867 94093180 -9401794 + MTE2b LTR MaLR 1 310 -69 1 1302 3261 60 8 0 chr15 94097227 94097627 -9397347 + MTB_Mm LTR MaLR 5 407 0 1 1302 346 175 161 12 chr15 94098372 94098453 -9396521 + RLTR23 LTR ERV1 8 100 -330 1 1302 330 209 11 42 chr15 94098618 94098713 -9396261 + RLTR23 LTR ERV1 339 430 0 1 1302 291 323 40 8 chr15 94099205 94099330 -9395644 + MTE2b LTR MaLR 2 130 -249 1 1303 235 128 0 0 chr15 94116020 94116059 -9378915 + MTE2b LTR MaLR 339 377 -2 1 1303 443 221 90 35 chr15 94117545 94117690 -9377284 - MLT-int LTR MaLR -1532 203 51 1 1303 447 337 83 28 chr15 94117735 94117972 -9377002 - MLT1A0 LTR MaLR -9 399 105 1 1303 407 212 123 78 chr15 94125229 94125408 -9369566 + RLTR15 LTR ERVK 1 187 -172 1 1303 286 235 132 16 chr15 94125432 94125553 -9369421 + RLTR15 LTR ERVK 161 295 -64 1 1303 345 194 151 56 chr15 94139339 94139545 -9355429 - MTC LTR MaLR -125 294 26 1 1303 1063 311 62 6 chr15 94140896 94141236 -9353738 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 1 1303 3153 138 77 117 chr15 94154028 94154757 -9340217 + RMER6A LTR ERVK 57 756 0 2 1303 3807 10 0 2 chr15 94163574 94163971 -9331003 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1303 772 186 25 6 chr15 94167695 94167857 -9327117 + MTD LTR MaLR 1 165 -254 2 1303 280 151 19 0 chr15 94167857 94167910 -9327064 + MTD LTR MaLR 357 410 -9 2 1303 1010 275 31 84 chr15 94170079 94170460 -9324514 + MTE2b LTR MaLR 18 378 -1 2 1303 6441 58 30 19 chr15 94189696 94190542 -9304432 + RLTR13A LTR ERVK 1 855 0 2 1303 324 237 26 0 chr15 94219753 94219829 -9275145 + ORR1D1 LTR MaLR 66 143 -231 2 1303 413 179 48 0 chr15 94219954 94220038 -9274936 + ORR1D1 LTR MaLR 287 374 0 2 1303 267 295 144 21 chr15 94229393 94229490 -9265484 + LTR16B2 LTR ERVL 354 462 0 3 1303 1375 216 43 103 chr15 94232028 94232446 -9262528 - MTD LTR MaLR -8 411 19 3 1303 2439 167 31 16 chr15 94239055 94239454 -9255520 + RLTR16 LTR ERVK 1 403 -102 3 1303 2439 167 31 16 chr15 94239532 94239617 -9255357 + RLTR16 LTR ERVK 404 492 -13 3 1303 252 257 29 0 chr15 94239618 94239688 -9255286 + RLTR16 LTR ERVK 434 505 0 3 1303 566 160 0 29 chr15 94239816 94239919 -9255055 - MTC LTR MaLR -321 100 1 3 162 3647 195 157 13 chr15 94239920 94240849 -9254125 - MTC-int LTR MaLR -1 1257 195 3 1304 279 321 62 41 chr15 94254562 94254708 -9240266 - MLT1A1 LTR MaLR -1 407 259 3 1304 282 253 217 43 chr15 94257582 94257817 -9237157 + LTR52 LTR ERVL 56 331 -90 3 1304 731 341 83 72 chr15 94258198 94258725 -9236249 + MLT1F2 LTR MaLR 27 559 -1 3 1304 823 294 41 41 chr15 94265152 94265468 -9229506 - MLT1A0 LTR MaLR -10 355 40 3 1304 2256 124 3 0 chr15 94278578 94278901 -9216073 - ORR1A2 LTR MaLR -3 324 1 3 1304 2109 142 50 36 chr15 94280660 94281178 -9213796 - RLTR31_Mm LTR ERVK -88 604 2 3 1304 270 238 16 0 chr15 94284826 94284889 -9210085 + MLT1C LTR MaLR 320 383 -84 4 1304 2263 85 3 0 chr15 94289615 94289933 -9205041 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1304 1414 179 103 3 chr15 94294517 94294837 -9200137 + RLTR15 LTR ERVK 4 355 -4 4 1304 719 221 101 75 chr15 94295773 94296206 -9198768 - RMER2 LTR ERV1 -54 513 28 4 1304 1310 191 84 38 chr15 94302114 94302464 -9192510 - RMER19B LTR ERVK -346 391 3 4 1304 402 327 65 74 chr15 94303536 94303889 -9191085 - MLT1A0 LTR MaLR -15 350 1 4 1304 897 230 132 0 chr15 94311269 94311504 -9183470 + MTD LTR MaLR 141 406 -13 4 1304 338 287 56 39 chr15 94315753 94315878 -9179096 - RMER15 LTR ERVL -15 560 433 4 1304 338 287 56 39 chr15 94316025 94316077 -9178897 - RMER15 LTR ERVL -143 432 380 4 1304 285 264 139 26 chr15 94316514 94316708 -9178266 + RLTR15 LTR ERVK 71 286 -73 4 1304 425 246 77 66 chr15 94316769 94316952 -9178022 + MTD LTR MaLR 235 419 0 4 1304 3994 60 28 2 chr15 94317799 94318298 -9176676 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 4 1304 6624 46 23 0 chr15 94318311 94319101 -9175873 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 808 0 4 1304 260 274 16 45 chr15 94320462 94320559 -9174415 + MTE2a LTR MaLR 265 362 -17 4 1304 2566 131 42 7 chr15 94321334 94321741 -9173233 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1304 596 214 56 31 chr15 94322286 94322480 -9172494 + RLTR31B_Mm LTR ERVK 364 561 0 4 1304 2579 70 0 105 chr15 94323322 94323723 -9171251 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 1304 1279 238 119 8 chr15 94327817 94328194 -9166780 - MTD LTR MaLR 0 419 1 4 1304 2150 78 36 0 chr15 94329096 94329404 -9165570 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1304 310 275 70 66 chr15 94333221 94333572 -9161402 - RLTR12B LTR ERVK -257 271 1 4 1304 491 165 0 0 chr15 94336857 94336937 -9158037 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 295 4 1304 2434 207 50 170 chr15 94336937 94337977 -9156997 + RMER17B LTR ERVK 1 915 -43 4 1304 1259 140 128 4 chr15 94337995 94338260 -9156714 - ORR1D1 LTR MaLR -74 300 3 4 1304 3077 64 5 58 chr15 94338596 94338827 -9156147 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 184 4 1304 3077 64 5 58 chr15 94338974 94339172 -9155802 - MTB_Mm LTR MaLR -224 183 1 4 1304 280 314 79 36 chr15 94340867 94341006 -9153968 - MLT2B1 LTR ERVL -1 566 422 4 1304 263 283 77 15 chr15 94341339 94341474 -9153500 - LTR16B LTR ERVL -22 458 319 4 1304 1724 90 0 0 chr15 94343048 94343293 -9151681 + MTB_Mm LTR MaLR 161 405 -2 5 1304 483 260 114 96 chr15 94346383 94346715 -9148259 - RLTR14 LTR ERV1 -44 338 1 5 1304 1977 159 43 0 chr15 94350123 94350494 -9144480 + MTC LTR MaLR 1 387 -34 5 1304 1223 257 52 16 chr15 94351442 94351806 -9143168 + MTE2b LTR MaLR 1 377 -2 5 1304 1810 213 26 13 chr15 94361097 94361298 -9133676 + MTD LTR MaLR 2 198 -221 5 1304 1810 213 26 13 chr15 94361329 94361507 -9133467 + MTD LTR MaLR 199 386 -33 5 1304 273 242 63 24 chr15 94367331 94367458 -9127516 + RLTR15 LTR ERVK 31 162 -197 5 1305 312 273 38 90 chr15 94371860 94371993 -9122981 + MT2B LTR ERVL 153 278 -323 5 1305 836 124 7 16 chr15 94374873 94375014 -9119960 + ORR1A4 LTR MaLR 213 379 0 5 1305 1152 214 88 147 chr15 94375331 94375956 -9119018 - RLTR42-int LTR ERVK -517 5005 4418 5 1305 829 222 91 30 chr15 94376016 94376248 -9118726 - RLTR42-int LTR ERVK -1066 4456 4211 5 1305 1732 147 106 24 chr15 94379086 94379463 -9115511 - RMER17C LTR ERVK 0 410 3 5 1305 3384 136 35 152 chr15 94380577 94381358 -9113616 - RMER6C LTR ERVK 0 690 2 5 1305 1955 146 39 22 chr15 94383845 94384202 -9110772 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 5 1305 1939 107 9 59 chr15 94392342 94392681 -9102293 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 5 1305 254 256 206 8 chr15 94395957 94396083 -9098891 - MLT1C LTR MaLR -35 432 282 6 1305 1104 266 50 27 chr15 94396270 94396617 -9098357 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 23 6 1305 450 136 52 104 chr15 94397854 94397969 -9097005 - MT2B LTR ERVL -337 264 156 6 1305 450 272 9 144 chr15 94397989 94398204 -9096770 + RMER15 LTR ERVL 367 552 -23 6 1305 677 338 45 58 chr15 94398238 94398568 -9096406 + RMER15-int LTR ERVL 18 343 -4656 6 1305 2989 199 87 43 chr15 94398945 94399715 -9095259 + RLTR40 LTR ERVK 2 805 -12 6 1305 3136 47 13 3 chr15 94399959 94400340 -9094634 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 6 1305 1427 277 68 0 chr15 94400367 94400764 -9094210 + RMER15-int LTR ERVL 906 1329 -3670 6 1305 740 290 81 87 chr15 94401582 94402088 -9092886 + RMER15-int LTR ERVL 1349 1851 -3148 6 1305 301 256 76 88 chr15 94402271 94402442 -9092532 - RMER15-int LTR ERVL -3434 1565 1397 6 1305 2742 144 16 31 chr15 94405276 94405791 -9089183 - RMER15 LTR ERVL 0 575 69 6 1305 3025 171 70 24 chr15 94411884 94412586 -9082388 + RMER12 LTR ERVK 1 734 -588 6 1305 941 251 106 33 chr15 94412623 94412982 -9081992 + RMER12 LTR ERVK 938 1322 0 6 1305 649 254 62 78 chr15 94420812 94421120 -9073854 - RMER5 LTR ERV1 -10 524 222 6 1305 244 30 0 0 chr15 94424022 94424055 -9070919 - RMER19C LTR ERVK -578 33 1 6 1305 1186 234 76 0 chr15 94429562 94429904 -9065070 + MTD LTR MaLR 52 419 0 6 1305 962 278 94 30 chr15 94438612 94438983 -9055991 + MTD LTR MaLR 8 402 -17 6 1305 2006 97 25 48 chr15 94439065 94439421 -9055553 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 18 6 1305 320 24 0 0 chr15 94439471 94439513 -9055461 - RLTR10B2 LTR ERVK -250 42 1 6 1305 7703 48 2 28 chr15 94439513 94440469 -9054505 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6651 6 1305 36639 39 1 0 chr15 94440460 94445402 -9049572 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 6 1305 1462 103 20 16 chr15 94445400 94445713 -9049261 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 6 1305 2044 75 87 39 chr15 94445713 94446045 -9048929 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 18 6 1305 259 29 0 0 chr15 94446095 94446129 -9048845 - RLTR10B2 LTR ERVK -250 42 9 6 1305 292 0 50 0 chr15 94446137 94446177 -9048797 - RLTR10B LTR ERVK -250 42 1 6 1305 3986 143 54 26 chr15 94446534 94447199 -9047775 - RMER19B LTR ERVK -194 708 25 6 1305 1027 213 162 64 chr15 94447765 94448212 -9046762 - RMER4B LTR ERVK -24 561 17 6 1305 466 308 123 41 chr15 94448399 94448643 -9046331 + MLT1C LTR MaLR 146 409 -58 6 1305 475 305 82 102 chr15 94448685 94449087 -9045887 + RLTR11A2 LTR ERVK 116 509 -18 6 1305 1667 173 138 0 chr15 94452466 94452807 -9042167 - MTD LTR MaLR -14 405 18 6 1305 2397 132 5 14 chr15 94453110 94453479 -9041495 - ORR1B2 LTR MaLR -1 366 1 6 1305 3042 81 2 5 chr15 94454340 94454737 -9040237 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1305 259 357 67 40 chr15 94454746 94454895 -9040079 - MT2A LTR ERVL -76 457 305 6 1305 421 172 19 123 chr15 94467044 94467150 -9027824 + MT2B LTR ERVL 166 260 -341 7 1305 255 245 28 122 chr15 94467778 94467885 -9027089 - MT2B2 LTR ERVL -332 252 156 7 1305 2207 128 49 111 chr15 94474038 94474291 -9020683 - MTC LTR MaLR 0 421 202 7 1305 2207 128 49 111 chr15 94474464 94474659 -9020315 - MTC LTR MaLR -220 201 1 7 1305 763 274 143 71 chr15 94496257 94496556 -8998418 - ORR1E LTR MaLR 0 359 36 7 1305 763 274 143 71 chr15 94496783 94496805 -8998169 - ORR1E LTR MaLR -324 35 15 7 1305 300 311 134 58 chr15 94496790 94497132 -8997842 - LTR16A LTR ERVL -20 431 64 7 1305 762 315 76 86 chr15 94498495 94499064 -8995910 - MER68 LTR ERVL 0 563 1 7 1305 237 265 115 19 chr15 94499223 94499327 -8995647 - RMER4B LTR ERVK -32 553 440 7 1305 263 321 76 8 chr15 94500798 94500930 -8994044 + MLT1M LTR MaLR 58 198 -474 4 1306 1940 159 32 0 chr15 94505520 94505866 -8989108 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 22 1 1306 3105 74 5 0 chr15 94511862 94512256 -8982718 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1306 2433 70 41 0 chr15 94513050 94513364 -8981610 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1306 1845 156 21 6 chr15 94515508 94515843 -8979131 - ORR1B1 LTR MaLR -11 383 44 2 1306 2458 98 108 62 chr15 94516282 94516715 -8978259 - RLTR11B LTR ERVK 0 453 1 2 1306 1335 207 102 35 chr15 94517685 94518056 -8976918 + MTD LTR MaLR 42 402 -17 3 1306 828 280 98 7 chr15 94529128 94529423 -8965551 + MTE2b LTR MaLR 13 334 -45 3 1306 3300 41 20 0 chr15 94529894 94530286 -8964688 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1306 1179 249 55 86 chr15 94532553 94533062 -8961912 + RLTR42-int LTR ERVK 2323 2851 -2671 4 1306 3278 194 57 71 chr15 94537599 94538467 -8956507 - RLTR13A LTR ERVK 0 855 1 4 1306 296 269 10 51 chr15 94540540 94540638 -8954336 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 315 5 1306 2961 89 8 5 chr15 94541209 94541606 -8953368 + MTB LTR MaLR 1 398 -2 5 1306 2508 158 22 2 chr15 94549151 94549564 -8945410 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1306 2475 46 26 0 chr15 94550194 94550497 -8944477 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 6 1306 1258 315 9 6 chr15 94560411 94560750 -8934224 + MTE2b LTR MaLR 1 340 -39 8 1306 2595 140 34 5 chr15 94564012 94564421 -8930553 - MTC LTR MaLR 0 421 1 8 1306 4762 129 48 103 chr15 94569612 94570286 -8924688 - RMER12 LTR ERVK 0 1404 376 9 1306 4762 109 17 55 chr15 94570475 94570852 -8924122 - RMER12 LTR ERVK -947 375 1 9 1306 2811 172 22 104 chr15 94575173 94575796 -8919178 - RMER15 LTR ERVL 0 575 4 1 1306 314 353 17 0 chr15 94579143 94579262 -8915712 + ORR1E LTR MaLR 9 129 -230 1 1306 268 298 37 82 chr15 94579388 94579523 -8915451 + ORR1E LTR MaLR 251 379 0 1 1306 618 286 103 21 chr15 94584742 94585071 -8909903 + MLT1B LTR MaLR 25 380 -10 1 1306 2287 185 252 5 chr15 94592977 94593568 -8901406 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 1306 2063 78 18 61 chr15 94594405 94594472 -8900502 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 258 1 1306 2063 78 18 61 chr15 94595186 94595460 -8899514 - ORR1A2 LTR MaLR -70 257 2 1 1306 1726 129 76 84 chr15 94599826 94600206 -8894768 + ORR1B1 LTR MaLR 18 394 0 1 1306 251 332 60 81 chr15 94606156 94606490 -8888484 + LTR55 LTR ERV 96 422 -126 1 1306 395 330 74 19 chr15 94611229 94611460 -8883514 + MLT2B1 LTR ERVL 311 548 -19 1 1306 6627 70 42 6 chr15 94614933 94615795 -8879179 - RLTR13B1 LTR ERVK 0 893 1 1 1306 2557 83 0 0 chr15 94616928 94617255 -8877719 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1306 1290 243 85 46 chr15 94618505 94619109 -8875865 - RLTR40 LTR ERVK -47 770 59 1 1306 257 242 90 15 chr15 94621530 94621597 -8873377 - ORR1E LTR MaLR -5 354 283 1 1306 2533 156 47 25 chr15 94622288 94622735 -8872239 + RMER6B LTR ERVK 1 457 -4 1 1306 2095 147 49 10 chr15 94623383 94623774 -8871200 - MTC LTR MaLR -8 413 8 1 1306 796 302 23 36 chr15 94624057 94624359 -8870615 - ORR1E LTR MaLR -5 354 57 1 1306 537 276 38 38 chr15 94624826 94625063 -8869911 - RMER15 LTR ERVL -14 561 325 1 1307 459 222 211 50 chr15 94638469 94638616 -8856358 - MTEa LTR MaLR -156 223 47 2 1307 459 222 211 50 chr15 94638805 94638818 -8856156 - MTEa LTR MaLR -333 46 37 2 1307 343 247 31 31 chr15 94638838 94638934 -8856040 + MTEa LTR MaLR 283 378 -1 2 1307 1892 153 56 51 chr15 94639256 94639590 -8855384 + ORR1B1 LTR MaLR 1 339 -55 2 1307 1892 153 56 51 chr15 94640180 94640237 -8854737 + ORR1B1 LTR MaLR 340 394 0 2 1307 1468 246 35 30 chr15 94640277 94640680 -8854294 - MTD LTR MaLR -14 405 1 2 1307 4354 144 55 68 chr15 94644555 94645464 -8849510 + RMER19B LTR ERVK 1 897 -5 2 1307 495 301 133 15 chr15 94645502 94645840 -8849134 - MTEb LTR MaLR -1 378 1 2 1307 713 259 207 3 chr15 94649499 94649794 -8845180 - MTD LTR MaLR -12 407 53 2 1307 1469 149 44 138 chr15 94649885 94650336 -8844638 - RMER17C LTR ERVK -1 409 1 2 1307 339 274 69 26 chr15 94671612 94671728 -8823246 - MLT1A0 LTR MaLR -89 276 156 2 1307 354 297 52 41 chr15 94671914 94672086 -8822888 - MLT1A0 LTR MaLR -191 174 1 2 1307 3194 154 93 22 chr15 94673778 94674040 -8820934 - RMER6C LTR ERVK 0 690 405 2 1307 3194 154 93 22 chr15 94674299 94674679 -8820295 - RMER6C LTR ERVK -286 404 2 2 1307 1894 183 212 30 chr15 94675658 94676153 -8818821 - RMER19B LTR ERVK 0 902 318 2 1307 3235 38 0 11 chr15 94676310 94676679 -8818295 - RLTR10B2 LTR ERVK 0 365 1 2 1307 1056 234 154 6 chr15 94678831 94679150 -8815824 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 8 2 1307 412 295 0 0 chr15 94680634 94680739 -8814235 + MTD LTR MaLR 4 108 -311 2 1307 1124 225 58 37 chr15 94680770 94681065 -8813909 + MTD LTR MaLR 74 374 -45 2 1307 2226 128 0 0 chr15 94683322 94683641 -8811333 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 2 1307 2400 144 70 41 chr15 94683927 94684413 -8810561 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 11 2 1307 231 118 0 0 chr15 94686024 94686058 -8808916 - RMER15 LTR ERVL 0 575 542 2 1307 284 330 49 33 chr15 94686335 94686457 -8808517 + RMER10B LTR ERVL 244 367 -31 2 1307 1842 173 50 123 chr15 94686499 94686961 -8808013 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 3 2 1307 1572 161 179 120 chr15 94686969 94687427 -8807547 - RMER15 LTR ERVL -90 485 1 2 1307 435 237 26 26 chr15 94688318 94688435 -8806539 - RLTR23 LTR ERV1 0 430 314 2 1307 3467 50 2 2 chr15 94689628 94690028 -8804946 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1307 777 316 36 77 chr15 94693574 94693965 -8801009 + MLT2C1 LTR ERVL 13 541 -15 2 1307 250 362 8 49 chr15 94695034 94695156 -8799818 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -7 832 716 2 1307 261 289 72 102 chr15 94697104 94697270 -8797704 - MTEb LTR MaLR -18 361 201 2 1307 566 325 60 10 chr15 94697400 94697599 -8797375 - MTE-int LTR MaLR -45 1535 1327 2 1307 4236 193 143 24 chr15 94703254 94704319 -8790655 + RMER12 LTR ERVK 1 1191 -131 2 1307 1435 202 16 42 chr15 94713248 94713558 -8781416 - ORR1B2 LTR MaLR -65 302 1 3 1307 1107 251 60 12 chr15 94722311 94722620 -8772354 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 39 3 1307 4417 171 58 36 chr15 94732549 94733166 -8761808 - RMER19B LTR ERVK 0 902 248 3 1307 4417 171 58 36 chr15 94733200 94733465 -8761509 - RMER19B LTR ERVK -655 247 2 3 1307 603 331 118 99 chr15 94738118 94738695 -8756279 + MLT1E2 LTR MaLR 6 595 -32 3 1307 1254 219 104 72 chr15 94739228 94739455 -8755519 - RMER13A LTR ERVK -400 460 220 3 1307 3468 168 232 51 chr15 94739455 94740219 -8754755 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 3 1307 1254 219 104 72 chr15 94740219 94740424 -8754550 - RMER13A LTR ERVK -641 219 14 3 1307 3105 55 47 13 chr15 94748002 94748387 -8746587 + MTB LTR MaLR 3 400 0 3 1307 267 162 51 10 chr15 94755837 94755896 -8739078 - MTC LTR MaLR -301 78 21 3 1307 2112 151 101 0 chr15 94755991 94756349 -8738625 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1307 273 253 67 0 chr15 94759948 94760023 -8734951 - RMER15-int LTR ERVL -33 4966 4887 3 1307 2386 183 9 9 chr15 94760413 94760833 -8734141 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 3 1308 2609 148 35 0 chr15 94777506 94777911 -8717063 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 4 1308 764 255 113 25 chr15 94781732 94782006 -8712968 + MLT1B LTR MaLR 16 313 -77 4 1308 1975 199 26 42 chr15 94783549 94783973 -8711001 - MTC LTR MaLR -1 420 4 4 1308 386 259 52 26 chr15 94784293 94784408 -8710566 + ORR1C2 LTR MaLR 267 384 0 4 1308 2040 161 20 14 chr15 94784621 94784967 -8710007 + ORR1B1 LTR MaLR 47 394 0 4 1308 1743 118 14 3 chr15 94790493 94790754 -8704220 - ORR1A2 LTR MaLR -65 302 4 4 1308 2035 166 31 6 chr15 94797813 94797959 -8697015 + ORR1B2 LTR MaLR 1 155 -212 4 1308 2035 166 31 6 chr15 94797986 94798197 -8696777 + ORR1B2 LTR MaLR 156 367 0 4 1308 1029 255 55 46 chr15 94798531 94798860 -8696114 - ORR1E LTR MaLR -17 342 11 4 1308 879 197 274 125 chr15 94804942 94805351 -8689623 + MT2A LTR ERVL 1 458 -75 4 1308 879 197 274 125 chr15 94805440 94805493 -8689481 + MT2A LTR ERVL 459 532 -1 4 1308 3201 153 84 19 chr15 94811702 94812276 -8682698 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 4 1308 1499 212 166 38 chr15 94813055 94813477 -8681497 - RMER19C LTR ERVK 0 611 136 4 1308 436 288 86 7 chr15 94814800 94814940 -8680034 - RMER5 LTR ERV1 -1 533 383 4 1308 2422 57 3 59 chr15 94818280 94818618 -8676356 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 4 1308 238 360 35 26 chr15 94820272 94820386 -8674588 + RMER12 LTR ERVK 736 850 -472 4 1308 1531 201 14 166 chr15 94823522 94824000 -8670974 - MTD LTR MaLR 0 419 17 4 1308 1531 201 14 166 chr15 94824024 94824039 -8670935 - MTD LTR MaLR -403 16 2 4 1308 2318 73 13 0 chr15 94827646 94827960 -8667014 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 2 5 1308 506 335 86 28 chr15 94827967 94828382 -8666592 - MLT1E1 LTR MaLR -204 423 52 5 1308 1004 206 91 173 chr15 94829731 94830148 -8664826 + ORR1C2 LTR MaLR 2 384 0 5 1308 1871 118 0 0 chr15 94838128 94838399 -8656575 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 314 5 1308 331 71 0 0 chr15 94838682 94838724 -8656250 - ORR1A2 LTR MaLR -3 391 350 5 1308 2052 94 31 0 chr15 94839826 94840114 -8654860 - ORR1A2 LTR MaLR -30 297 1 5 1308 2231 82 26 3 chr15 94840786 94841091 -8653883 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 16 5 1308 663 216 145 9 chr15 94851718 94852013 -8642961 + MTD LTR MaLR 34 419 0 5 1308 1506 198 90 71 chr15 94855263 94855635 -8639339 - MTD LTR MaLR -12 407 44 5 1308 235 243 99 14 chr15 94865018 94865089 -8629885 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 332 5 1308 2152 123 111 32 chr15 94871044 94871207 -8623767 - MTC LTR MaLR -8 413 224 5 1308 2502 82 28 0 chr15 94871207 94871525 -8623449 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1308 2152 123 111 32 chr15 94871525 94871740 -8623234 - MTC LTR MaLR -198 223 5 5 1308 774 258 12 73 chr15 94876047 94876306 -8618668 - RMER15 LTR ERVL -39 536 294 5 1308 328 274 66 92 chr15 94880864 94881137 -8613837 - RLTR12B LTR ERVK -25 503 238 5 1308 783 256 36 36 chr15 94881114 94881365 -8613609 - RLTR12B LTR ERVK -230 298 48 5 1308 730 252 45 56 chr15 94884148 94884417 -8610557 + RLTR15 LTR ERVK 1 266 -93 5 1308 1848 159 19 112 chr15 94886211 94886630 -8608344 - ORR1C2 LTR MaLR -4 380 1 5 1308 578 314 84 84 chr15 94887524 94887871 -8607103 + ORR1E LTR MaLR 9 355 -4 6 1308 261 302 67 51 chr15 94888981 94889159 -8605815 + MLT2B2 LTR ERVL 380 560 -2 6 1308 242 232 0 35 chr15 94889339 94889397 -8605577 + MTEa LTR MaLR 275 330 -49 6 1308 1602 261 68 8 chr15 94892582 94893080 -8601894 - MT2A LTR ERVL -4 529 2 6 1308 930 220 199 23 chr15 94893341 94893648 -8601326 - MTD LTR MaLR -14 405 45 6 1309 262 120 18 193 chr15 94898472 94898586 -8596388 - MT2A LTR ERVL -7 526 433 6 1309 1087 91 16 178 chr15 94898583 94898825 -8596149 - MT2A LTR ERVL -327 206 4 6 1309 245 126 33 244 chr15 94901847 94902089 -8592885 + RMER17C LTR ERVK 78 268 -142 6 1309 742 252 83 83 chr15 94908203 94908481 -8586493 + MTC-int LTR MaLR 813 1321 -259 6 1309 1118 277 47 6 chr15 94908493 94908834 -8586140 + ORR1D2 LTR MaLR 6 360 -10 6 1309 1965 211 34 15 chr15 94908841 94909249 -8585725 + MTC LTR MaLR 5 420 -1 6 1309 2638 251 40 50 chr15 94909295 94910112 -8584862 + ORR1D2-int LTR MaLR 562 1370 0 6 1309 943 280 77 40 chr15 94910112 94910465 -8584509 + ORR1D2 LTR MaLR 1 366 -4 6 1309 265 264 136 11 chr15 94910473 94910561 -8584413 + MTE2a-int LTR MaLR 1478 1576 -4 6 1309 686 266 78 149 chr15 94910571 94910968 -8584006 + MTE2a LTR MaLR 11 379 0 6 1309 302 246 47 74 chr15 94935420 94935579 -8559395 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1995 2258 -3503 6 1309 1857 98 81 0 chr15 94935582 94935879 -8559095 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 6 1309 473 264 78 128 chr15 94939774 94940150 -8554824 + ORR1E LTR MaLR 1 374 -5 6 1309 494 289 63 59 chr15 94942597 94942836 -8552138 + LTR82A LTR ERVL 13 252 -620 6 1309 334 352 29 42 chr15 94942868 94943108 -8551866 + LTR82A LTR ERVL 383 619 -253 6 1309 681 171 0 8 chr15 94944606 94944724 -8550250 + MTC LTR MaLR 3 119 -302 6 1309 689 274 104 34 chr15 94945361 94945779 -8549195 - RMER15 LTR ERVL -3 572 1 6 1309 1647 283 50 13 chr15 94946045 94946521 -8548453 - RMER15-int LTR ERVL -345 4654 4161 6 1309 453 292 72 14 chr15 94946670 94946809 -8548165 - RMER15-int LTR ERVL -2775 2224 2078 6 1309 1927 298 65 52 chr15 94947290 94948058 -8546916 - RMER15-int LTR ERVL -3365 1634 852 6 1309 4701 132 44 28 chr15 94948058 94948783 -8546191 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 6 1309 1927 298 65 52 chr15 94948783 94948848 -8546126 - RMER15-int LTR ERVL -4148 851 790 6 1309 507 344 53 38 chr15 94948849 94949112 -8545862 + RMER15 LTR ERVL 309 575 0 6 1309 359 387 47 4 chr15 94949478 94949714 -8545260 + RMER15-int LTR ERVL 431 676 -4323 6 1309 432 248 38 46 chr15 94949746 94949877 -8545097 - RMER15 LTR ERVL -445 130 1 6 1309 461 283 46 42 chr15 94951312 94951552 -8543422 + RLTR15 LTR ERVK 102 342 -17 6 1309 535 326 20 40 chr15 94952132 94952333 -8542641 - MLT1B LTR MaLR -2 388 192 6 1309 730 312 33 77 chr15 94952492 94952884 -8542090 - MTEa LTR MaLR -4 375 1 6 1309 1292 183 191 111 chr15 94953910 94954298 -8540676 - MT2A LTR ERVL -114 419 1 6 1309 1121 268 142 22 chr15 94954354 94954719 -8540255 - MTD LTR MaLR 0 421 18 6 1309 654 268 76 57 chr15 94954910 94955202 -8539772 + RLTR12B LTR ERVK 21 315 -253 6 1309 2729 173 82 19 chr15 94958627 94959163 -8535811 + RLTR26 LTR ERVK 1 570 -72 6 1309 1426 290 40 81 chr15 94962634 94962808 -8532166 + RLTR18 LTR ERVK 1 161 -455 6 1309 1426 290 40 81 chr15 94963462 94963929 -8531045 + RLTR18 LTR ERVK 162 616 0 6 1309 2798 149 68 21 chr15 94965687 94966214 -8528760 - RMER15 LTR ERVL -3 572 21 6 1309 227 291 15 107 chr15 94967347 94967478 -8527496 + LTR16D1 LTR ERVL 374 492 -183 7 1309 847 262 71 68 chr15 94967898 94968265 -8526709 + MLT2B4 LTR ERVL 1 358 -56 7 1309 929 278 59 94 chr15 94968352 94968693 -8526281 + MTEa LTR MaLR 51 379 0 7 1309 1105 222 110 61 chr15 94971764 94972090 -8522884 + RLTR14 LTR ERV1 7 348 -34 7 1309 4186 184 82 31 chr15 94973557 94974460 -8520514 + RMER19B LTR ERVK 17 902 0 7 1309 1250 173 23 78 chr15 94976087 94976344 -8518630 + ORR1D1 LTR MaLR 5 247 -127 7 1309 3620 186 21 37 chr15 94976370 94977103 -8517871 + ORR1D1-int LTR MaLR 799 1506 -3 7 1309 687 184 73 0 chr15 94977110 94977246 -8517728 + ORR1D1 LTR MaLR 1 146 -228 7 1309 417 149 0 63 chr15 94984477 94984556 -8510418 - RLTR9A2 LTR ERVK 0 383 310 7 1309 1413 71 0 0 chr15 94984555 94984739 -8510235 - RLTR9A2 LTR ERVK -199 184 1 7 1309 728 250 56 114 chr15 94984994 94985184 -8509790 - RLTR11B LTR ERVK -65 388 221 7 1309 3271 72 0 17 chr15 94985184 94985591 -8509383 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1309 728 250 56 114 chr15 94985731 94985944 -8509030 - RLTR11B LTR ERVK -239 214 2 7 1309 520 320 7 7 chr15 94989479 94989627 -8505347 - MTEa LTR MaLR -231 148 1 7 1309 3295 58 13 0 chr15 94990614 94990994 -8503980 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 7 1309 1343 231 104 54 chr15 94992522 94993050 -8501924 - RMER19B LTR ERVK 0 902 189 7 1309 732 277 57 27 chr15 94995734 94996068 -8498906 - RLTR15 LTR ERVK -15 344 1 7 1309 407 377 125 35 chr15 94999316 94999747 -8495227 + LTR88b LTR Gypsy? 2 471 -366 7 1309 2376 173 9 9 chr15 95000487 95000931 -8494043 + MT2A LTR ERVL 1 444 -89 1 1309 303 155 35 0 chr15 95012421 95012479 -8482495 - MTD LTR MaLR 0 419 360 1 1309 507 97 104 41 chr15 95012481 95012558 -8482416 - MTD LTR MaLR -15 404 304 1 1309 2232 128 53 0 chr15 95012558 95012917 -8482057 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 1 1309 507 159 14 131 chr15 95012917 95013001 -8481973 - MTD LTR MaLR -57 362 277 1 1309 974 261 108 15 chr15 95016224 95016559 -8478415 + MTEb LTR MaLR 1 366 -13 2 1309 587 270 154 33 chr15 95018445 95018744 -8476230 + MLT1A0 LTR MaLR 28 362 -3 2 1309 1963 96 13 168 chr15 95019702 95020015 -8474959 + ORR1A2 LTR MaLR 1 272 -55 3 1309 1963 96 13 168 chr15 95020161 95020234 -8474740 + ORR1A2 LTR MaLR 273 327 0 3 1309 594 302 255 0 chr15 95021522 95021820 -8473154 + MTEa LTR MaLR 1 374 -5 3 1309 253 316 213 33 chr15 95026741 95027013 -8467961 - LTR52 LTR ERVL -34 387 67 5 1310 1819 115 34 123 chr15 95029536 95029893 -8465081 + ORR1A4 LTR MaLR 1 325 -4 5 1310 1072 234 108 9 chr15 95031066 95031389 -8463585 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 20 6 1310 2275 132 8 20 chr15 95036294 95036696 -8458278 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 11 7 1310 226 372 43 30 chr15 95038913 95039143 -8455831 + MLT1J-int LTR MaLR 126 358 -1029 7 1310 431 308 68 104 chr15 95044261 95044616 -8450358 - ORR1E LTR MaLR 0 359 18 8 1310 2268 84 55 0 chr15 95048071 95048381 -8446593 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1310 500 336 117 52 chr15 95049245 95049672 -8445302 - LTR33 LTR ERVL -7 508 54 9 1310 1128 263 67 32 chr15 95068413 95068755 -8426219 - MTE2b LTR MaLR -7 372 19 1 1310 2285 107 0 60 chr15 95070427 95070774 -8424200 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 1 1310 451 314 85 18 chr15 95072494 95072718 -8422256 + MLT1I LTR MaLR 139 377 -34 1 1310 1947 138 3 71 chr15 95081449 95081799 -8413175 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1310 373 287 32 8 chr15 95086268 95086391 -8408583 + MLT1A1 LTR MaLR 19 144 -264 1 1310 934 232 31 9 chr15 95090518 95090740 -8404234 + MTE2b LTR MaLR 1 227 -152 1 1310 3835 9 121 0 chr15 95136407 95136847 -8358127 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1310 321 0 0 0 chr15 95136847 95136885 -8358089 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 2 1310 324 157 58 46 chr15 95136885 95136972 -8358002 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 2 1310 48655 18 0 0 chr15 95136976 95142331 -8352643 - MERVL-int LTR ERVL -130 5355 1 2 1310 3846 9 121 0 chr15 95142331 95142771 -8352203 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 2 1310 316 169 50 75 chr15 95146468 95146572 -8348402 - RMER19B LTR ERVK -6 896 806 2 1310 611 265 101 89 chr15 95148613 95148961 -8346013 + ORR1E LTR MaLR 8 359 0 2 163 681 116 16 47 chr15 95158217 95158344 -8336630 + ORR1C2 LTR MaLR 63 185 -199 2 1311 876 155 52 37 chr15 95158425 95158653 -8336321 + ORR1C2 LTR MaLR 188 394 0 2 1311 433 290 98 49 chr15 95161424 95161794 -8333180 - MLT1E2 LTR MaLR -38 467 52 2 1311 238 183 233 0 chr15 95163634 95163694 -8331280 + RLTR20D LTR ERVK 3 76 -458 2 1311 475 195 66 44 chr15 95163691 95163881 -8331093 + RLTR20D LTR ERVK 195 430 -104 2 1311 286 261 179 48 chr15 95163916 95163995 -8330979 + RLTR20D LTR ERVK 431 533 -1 2 1311 611 316 133 23 chr15 95164251 95164598 -8330376 + MLT1F2 LTR MaLR 45 429 -131 2 1311 650 352 100 35 chr15 95174579 95174979 -8319995 + RMER15-int LTR ERVL 94 519 -4480 2 1311 899 318 64 44 chr15 95175699 95176196 -8318778 + RMER15-int LTR ERVL 4187 4693 -306 2 1311 317 354 61 33 chr15 95176797 95177010 -8317964 + RMER15 LTR ERVL 353 571 -4 2 1311 1547 224 70 23 chr15 95188981 95189379 -8305595 - MTD LTR MaLR 0 419 3 2 1311 1808 247 27 98 chr15 95189945 95190601 -8304373 + RMER19C LTR ERVK 2 611 0 2 1311 1265 185 4 4 chr15 95195213 95195452 -8299522 + RLTR42 LTR ERVK 1 239 0 2 1311 1495 199 68 6 chr15 95196344 95196682 -8298292 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 2 1311 264 322 18 73 chr15 95196764 95196928 -8298046 + MLT2B4 LTR ERVL 353 507 -49 2 1311 1272 257 13 11 chr15 95199273 95199604 -8295370 + MTD LTR MaLR 12 342 -58 2 1311 280 217 29 0 chr15 95199643 95199712 -8295262 + MTD LTR MaLR 345 415 -4 2 1311 1379 227 76 74 chr15 95200933 95201404 -8293570 - RLTR28B LTR ERVL -6 475 4 2 1311 373 300 43 27 chr15 95201405 95201590 -8293384 + ORR1E LTR MaLR 50 237 -122 2 1311 240 291 105 0 chr15 95208813 95208899 -8286075 + MLT1K LTR MaLR 175 269 -326 3 1311 1679 149 81 21 chr15 95209107 95209442 -8285532 + ORR1B1 LTR MaLR 40 394 0 3 1311 588 298 88 78 chr15 95210952 95211338 -8283636 - MTD LTR MaLR -12 407 18 3 1311 333 287 52 44 chr15 95211380 95211515 -8283459 + MLT1H1 LTR MaLR 78 213 -382 3 1311 390 367 47 14 chr15 95211568 95211847 -8283127 + MLT1H1 LTR MaLR 261 548 -7 3 1311 1114 214 121 26 chr15 95230871 95231124 -8263850 - ORR1D1 LTR MaLR -9 365 79 3 1311 1914 157 49 37 chr15 95231124 95231449 -8263525 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 3 1311 1114 214 121 26 chr15 95231449 95231502 -8263472 - ORR1D1 LTR MaLR -296 78 30 3 1311 541 259 14 22 chr15 95243851 95243989 -8250985 + MT2A LTR ERVL 1 137 -396 3 1311 1012 255 70 57 chr15 95244006 95244322 -8250652 + MT2A LTR ERVL 207 526 -7 3 1311 1206 212 239 13 chr15 95247629 95247930 -8247044 + ORR1D1 LTR MaLR 5 373 -1 3 1311 2712 168 7 2 chr15 95248367 95248786 -8246188 + MTC LTR MaLR 1 421 0 3 1311 2614 108 14 6 chr15 95250040 95250402 -8244572 + RLTR9A LTR ERVK 1 365 -3 3 1311 231 231 0 0 chr15 95261011 95261063 -8233911 - RLTR22_Mur LTR ERVK -487 1361 1310 3 1311 2379 191 15 67 chr15 95271295 95271833 -8223141 - RLTR28 LTR ERVL -14 510 1 3 1311 2078 153 68 22 chr15 95272776 95273163 -8221811 - MTC LTR MaLR -19 402 3 3 1311 352 211 106 35 chr15 95273340 95273381 -8221593 + RLTR15 LTR ERVK 1 52 -307 3 1311 352 211 106 35 chr15 95273401 95273472 -8221502 + RLTR15 LTR ERVK 53 120 -239 3 1311 954 269 39 32 chr15 95286904 95287215 -8207759 + MTE-int LTR MaLR 31 343 -1237 3 1311 414 289 38 30 chr15 95287274 95287406 -8207568 + MTE2b LTR MaLR 247 379 0 3 1311 2479 102 6 3 chr15 95288392 95288718 -8206256 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1312 353 284 37 0 chr15 95307493 95307602 -8187372 - MER67D LTR ERV1 -401 113 1 4 1312 348 263 122 115 chr15 95309600 95309853 -8185121 - MTEa LTR MaLR -8 371 103 4 1312 365 294 102 76 chr15 95310191 95310427 -8184547 + MLT1J LTR MaLR 2 243 -269 4 1312 843 283 91 38 chr15 95311065 95311351 -8183623 + MTEa LTR MaLR 20 314 -65 4 1312 843 283 91 38 chr15 95311373 95311428 -8183546 + MTEa LTR MaLR 315 379 0 4 1312 2244 289 66 81 chr15 95311511 95312093 -8182881 + MTD-int LTR MaLR 163 720 -860 4 1312 2478 147 26 0 chr15 95312093 95312473 -8182501 + ORR1B1 LTR MaLR 2 391 -3 4 1312 2244 289 66 81 chr15 95312473 95312839 -8182135 + MTD-int LTR MaLR 721 1097 -483 4 1312 1480 273 12 5 chr15 95312876 95313277 -8181697 + MERVL_2A-int LTR ERVL 3722 4125 -1636 4 1312 1218 297 31 31 chr15 95313282 95313737 -8181237 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4765 5219 -542 4 1312 1026 200 36 69 chr15 95313782 95314029 -8180945 + MERVL_2A-int LTR ERVL 5319 5557 -204 4 1312 3720 15 2 0 chr15 95315155 95315550 -8179424 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1312 415 304 14 21 chr15 95315660 95315801 -8179173 + MTD-int LTR MaLR 1124 1263 -317 4 1312 254 316 21 21 chr15 95315929 95316026 -8178948 + MTD-int LTR MaLR 1484 1580 0 4 1312 276 257 65 65 chr15 95316032 95316140 -8178834 + MTD LTR MaLR 8 115 -304 4 1312 1426 226 132 65 chr15 95320098 95320148 -8174826 + RMER4B LTR ERVK 1 52 -533 4 1312 2237 94 18 48 chr15 95320148 95320482 -8174492 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 3 4 1312 1426 226 128 62 chr15 95320482 95320946 -8174028 + RMER4B LTR ERVK 53 588 -23 4 1312 672 249 80 38 chr15 95323141 95323354 -8171620 + MTE2a LTR MaLR 15 236 -143 4 1312 699 210 22 7 chr15 95323426 95323565 -8171409 + MTE2a LTR MaLR 224 364 -15 4 1312 2566 145 17 5 chr15 95323635 95324043 -8170931 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 4 1312 383 314 70 76 chr15 95348752 95349211 -8145763 - MLT1D LTR MaLR -12 493 1 4 1312 1677 242 46 15 chr15 95349833 95350223 -8144751 - MTD LTR MaLR 0 419 18 4 1312 735 266 162 59 chr15 95351386 95351774 -8143200 + MTE-int LTR MaLR 74 501 -1079 4 1312 352 284 169 36 chr15 95352499 95352718 -8142256 + MLT1A0 LTR MaLR 1 248 -117 4 1312 324 243 102 0 chr15 95353389 95353499 -8141475 - MLT1D-int LTR MaLR -1287 122 2 4 1312 233 245 57 0 chr15 95353574 95353627 -8141347 - MLT1D LTR MaLR -64 441 386 4 1312 795 275 86 99 chr15 95353867 95354251 -8140723 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 4 1312 427 340 154 60 chr15 95361457 95361776 -8133198 - MLT1D LTR MaLR -133 372 24 5 1312 1164 196 163 109 chr15 95365518 95365910 -8129064 + RLTR20A2 LTR ERVK 31 476 -102 5 1312 1164 232 86 36 chr15 95365979 95366070 -8128904 + RLTR20A2 LTR ERVK 477 573 -5 5 1312 234 193 148 66 chr15 95368846 95368968 -8126006 - MamGypLTR2c LTR Gypsy 0 1068 937 5 1312 421 277 54 47 chr15 95373058 95373206 -8121768 - MLT1A0 LTR MaLR -216 149 1 5 1312 1260 82 21 16 chr15 95378148 95378334 -8116640 + RLTR9A LTR ERVK 1 187 -181 5 1312 4836 50 9 4 chr15 95379700 95380257 -8114717 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 5 5 1312 323 231 114 9 chr15 95388197 95388302 -8106672 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 291 5 1312 383 341 68 42 chr15 95388691 95389000 -8105974 - MLT-int LTR MaLR -1081 654 338 5 1312 1536 204 70 22 chr15 95389497 95389689 -8105285 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 177 5 1312 1536 204 70 22 chr15 95389758 95389922 -8105052 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 3 5 1312 321 336 55 115 chr15 95394030 95394389 -8100585 + MLT1E1A LTR MaLR 219 675 -5 5 1312 321 264 55 122 chr15 95396793 95397030 -8097944 + MLT1B LTR MaLR 103 323 -67 5 1312 332 264 142 38 chr15 95398108 95398348 -8096626 + MLT1C LTR MaLR 98 362 -105 5 1312 911 228 45 96 chr15 95406256 95406591 -8088383 - MTEa LTR MaLR 0 379 62 5 1312 247 289 142 99 chr15 95406427 95406638 -8088336 - MLT2B1 LTR ERVL -280 240 21 5 1312 432 305 48 63 chr15 95407409 95407741 -8087233 + RodERV21-int LTR ERV1 8 334 -4657 5 1312 1531 278 96 34 chr15 95407953 95408435 -8086539 + RodERV21-int LTR ERV1 689 1208 -3783 5 1312 1531 278 96 34 chr15 95408517 95408704 -8086270 + RodERV21-int LTR ERV1 1209 1399 -3592 5 1312 3597 321 49 51 chr15 95408783 95408884 -8086090 + RodERV21-int LTR ERV1 2762 2862 -2129 5 1312 4468 148 65 64 chr15 95408884 95409785 -8085189 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 1312 3597 321 49 51 chr15 95409785 95411666 -8083308 + RodERV21-int LTR ERV1 2863 4740 -251 5 1312 3597 321 49 51 chr15 95411695 95411813 -8083161 + RodERV21-int LTR ERV1 4741 4857 -134 5 1312 1554 39 5 9 chr15 95418609 95418819 -8076155 + MTA_Mm LTR MaLR 1 209 -187 5 1312 1336 57 65 19 chr15 95418789 95419004 -8075970 - ORR1A1 LTR MaLR -121 225 1 5 1313 2140 119 3 6 chr15 95421605 95421917 -8073057 - RLTR10E LTR ERVK 0 311 1 5 1313 646 346 69 15 chr15 95423285 95423433 -8071541 - MLT1A0 LTR MaLR -13 352 194 5 1313 2012 101 104 3 chr15 95423433 95423730 -8071244 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 5 1313 646 346 69 15 chr15 95423730 95423915 -8071059 - MLT1A0 LTR MaLR -172 193 1 5 1313 300 276 67 50 chr15 95423933 95424112 -8070862 + MLT1E2 LTR MaLR 44 225 -402 5 1313 332 281 68 40 chr15 95424199 95424427 -8070547 + MTEa LTR MaLR 86 372 -7 5 1313 2456 41 0 6 chr15 95425073 95425393 -8069581 - MTB LTR MaLR -2 398 81 5 1313 1046 258 131 18 chr15 95426060 95426458 -8068516 - MER67C LTR ERV1 -264 447 5 5 1313 2475 140 28 61 chr15 95427224 95427377 -8067597 - RMER6B LTR ERVK -1 460 298 6 1313 2475 140 28 61 chr15 95427405 95427724 -8067250 - RMER6B LTR ERVK -164 297 4 6 1313 322 70 140 0 chr15 95432411 95432468 -8062506 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 262 6 1313 1766 124 14 14 chr15 95432622 95432908 -8062066 - ORR1A2 LTR MaLR -41 286 1 6 1313 4440 123 54 8 chr15 95435633 95436352 -8058622 + RMER6A LTR ERVK 1 752 -4 6 1313 2427 93 12 0 chr15 95440775 95441098 -8053876 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1313 2444 98 3 0 chr15 95444375 95444701 -8050273 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1313 520 159 47 111 chr15 95445653 95445803 -8049171 - MTE2a LTR MaLR -2 405 248 6 1313 2519 214 85 66 chr15 95445803 95446677 -8048297 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 6 1313 445 299 22 169 chr15 95446698 95446976 -8047998 - MTE2a LTR MaLR -137 242 6 6 1313 338 288 90 8 chr15 95449622 95449755 -8045219 + MLT1D LTR MaLR 49 192 -313 6 1313 1899 106 12 62 chr15 95460644 95460967 -8034007 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 21 6 1313 468 259 125 56 chr15 95462143 95462462 -8032512 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 1 6 1313 3031 81 65 49 chr15 95463250 95463744 -8031230 + RLTR44C LTR ERVK 1 502 0 6 1313 358 128 0 0 chr15 95463744 95463791 -8031183 + RLTR44-int LTR ERVK 1 47 -2765 6 1313 633 110 111 4 chr15 95463791 95463925 -8031049 + RLTR44C LTR ERVK 313 502 0 6 1313 390 320 63 93 chr15 95477320 95477620 -8017354 + MLT1G3 LTR MaLR 83 373 -222 6 1313 256 247 20 70 chr15 95477664 95477764 -8017210 + MLT1G3 LTR MaLR 372 466 -23 6 1313 316 224 23 12 chr15 95488156 95488242 -8006732 + MLT1A1 LTR MaLR 300 386 -22 6 1313 469 211 129 8 chr15 95489018 95489142 -8005832 - RMER15 LTR ERVL -34 541 403 6 1313 4397 144 134 48 chr15 95492067 95492898 -8002076 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 6 1313 649 273 134 0 chr15 95496782 95496998 -7997976 - MTE2a LTR MaLR -72 307 63 6 1313 1043 218 84 54 chr15 95499134 95499423 -7995551 - MTD LTR MaLR -119 300 2 6 1313 2481 155 38 57 chr15 95511189 95511278 -7983696 - RLTR20C LTR ERVK 0 534 446 1 1313 2481 155 38 57 chr15 95511306 95511649 -7983325 - RLTR20C LTR ERVK -89 445 93 1 1313 2481 155 38 57 chr15 95512020 95512093 -7982881 - RLTR20C LTR ERVK -442 92 40 1 1313 660 254 47 112 chr15 95512398 95512977 -7981997 - RLTR19-int LTR ERVK -3181 2956 2583 2 1313 2354 99 38 14 chr15 95514108 95514477 -7980497 - MTB_Mm LTR MaLR -27 380 3 2 1313 5801 173 65 26 chr15 95514479 95515688 -7979286 - MTB_Mm-int LTR MaLR 0 1258 2 2 1313 1680 125 45 57 chr15 95515691 95516005 -7978969 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 90 2 1313 907 330 45 38 chr15 95519524 95519554 -7975420 + RMER15-int LTR ERVL 4187 4211 -788 2 1313 1645 169 81 89 chr15 95519554 95519924 -7975050 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1313 907 330 45 38 chr15 95519924 95520318 -7974656 + RMER15-int LTR ERVL 4212 4614 -385 2 1313 235 383 47 8 chr15 95520318 95520447 -7974527 - MLT1J LTR MaLR -273 239 106 2 1313 961 223 151 55 chr15 95536796 95537110 -7957864 - MT2A LTR ERVL -50 534 127 5 1313 343 284 35 12 chr15 95537112 95537255 -7957719 - MLT1C LTR MaLR -319 148 2 5 1313 1046 208 189 13 chr15 95550374 95550520 -7944454 - ORR1D1 LTR MaLR -2 372 211 8 1313 1046 208 189 13 chr15 95550542 95550707 -7944267 - ORR1D1 LTR MaLR -164 210 6 8 1314 4368 187 125 29 chr15 95566409 95567565 -7927409 - RMER12 LTR ERVK 0 1322 1 1 1314 278 225 10 110 chr15 95569554 95569654 -7925320 + MT2B LTR ERVL 150 239 -362 1 1314 1642 216 45 3 chr15 95570185 95570565 -7924409 - MTD LTR MaLR -1 418 23 1 1314 1943 149 7 84 chr15 95573514 95573919 -7921055 + ORR1B1 LTR MaLR 2 394 0 1 1314 418 259 77 31 chr15 95573934 95574148 -7920826 + MLT1A1 LTR MaLR 153 400 -8 1 1314 268 248 39 177 chr15 95574718 95574899 -7920075 + RMER15 LTR ERVL 5 160 -415 1 1314 686 237 112 41 chr15 95574893 95575135 -7919839 + RMER15 LTR ERVL 273 531 -44 1 1314 1442 111 17 25 chr15 95578343 95578629 -7916345 + ORR1A4 LTR MaLR 93 394 0 1 1314 439 308 72 80 chr15 95578640 95579002 -7915972 + ORR1E LTR MaLR 1 375 -4 1 1314 492 285 135 60 chr15 95580761 95581251 -7913723 + MER34 LTR ERV1 11 571 0 1 1314 2427 99 72 18 chr15 95583746 95584136 -7910838 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 1314 332 161 0 0 chr15 95590171 95590233 -7904741 + MLT1A1 LTR MaLR 347 408 0 1 1314 266 295 47 9 chr15 95596357 95596463 -7898511 + MLT1A1 LTR MaLR 24 133 -275 1 1314 820 294 83 81 chr15 95599502 95599957 -7895017 - MT2A LTR ERVL -71 462 7 1 1314 1064 282 46 36 chr15 95600267 95600670 -7894304 - MTE2a LTR MaLR -17 402 7 1 1314 1521 203 99 5 chr15 95602889 95603261 -7891713 - MTD LTR MaLR 0 419 13 1 1314 2460 176 77 16 chr15 95605581 95606078 -7888896 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 1 1 1314 761 308 132 25 chr15 95606975 95607301 -7887673 - MTE-int LTR MaLR -306 1274 914 1 1314 3693 166 128 12 chr15 95607523 95608321 -7886653 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 1 1314 2576 75 12 0 chr15 95610354 95610676 -7884298 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 1 1314 267 185 0 18 chr15 95610789 95610844 -7884130 - MTEa LTR MaLR -38 341 288 1 1314 304 346 56 25 chr15 95611357 95611517 -7883457 - MTEa LTR MaLR -162 217 53 1 1314 1163 183 18 32 chr15 95611820 95611888 -7883086 - ORR1D2 LTR MaLR -23 398 285 1 1314 2146 173 131 41 chr15 95611888 95612377 -7882597 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 1 1314 1163 269 59 50 chr15 95612377 95612652 -7882322 - ORR1D2 LTR MaLR -86 284 1 1 1314 400 243 265 0 chr15 95613778 95613818 -7881156 - MT2A LTR ERVL -7 594 553 1 1314 400 243 265 0 chr15 95613893 95613988 -7880986 - MT2A LTR ERVL -49 552 424 1 1314 451 209 56 150 chr15 95614483 95614658 -7880316 - MT2A LTR ERVL -165 436 279 1 1314 255 324 42 0 chr15 95614630 95614701 -7880273 - MT2A LTR ERVL -471 130 57 1 1314 507 197 129 16 chr15 95614669 95614793 -7880181 - MT2A LTR ERVL -394 139 2 1 1314 1056 229 63 60 chr15 95614818 95615134 -7879840 - ORR1D2 LTR MaLR -53 317 1 1 1314 1899 151 31 61 chr15 95616256 95616630 -7878344 + ORR1A0 LTR MaLR 1 338 -8 1 1314 350 279 124 72 chr15 95617676 95618053 -7876921 + RMER15 LTR ERVL 6 500 -75 1 1314 2268 148 8 14 chr15 95628708 95629077 -7865897 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 2 1314 873 241 19 96 chr15 95636308 95636342 -7858632 - MTE2a LTR MaLR -10 369 342 2 1314 873 241 19 96 chr15 95636536 95636762 -7858212 - MTE2a LTR MaLR -38 341 129 2 1314 567 193 62 156 chr15 95636800 95636960 -7858014 - MTE2a LTR MaLR -231 148 4 2 1314 468 302 50 0 chr15 95641230 95641369 -7853605 - MLT1A LTR MaLR -224 150 5 2 1314 2056 101 30 57 chr15 95642080 95642416 -7852558 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 2 1314 331 149 141 51 chr15 95643326 95643404 -7851570 + RMER20B LTR ERVK 180 264 -363 2 1314 325 286 102 73 chr15 95643666 95643976 -7850998 - ORR1E LTR MaLR -29 341 24 2 1314 1369 226 136 122 chr15 95649851 95650381 -7844593 + RMER17B LTR ERVK 1 497 -409 2 1314 1369 197 162 105 chr15 95650531 95650866 -7844108 + RMER17B LTR ERVK 448 811 -147 2 1314 2413 81 3 0 chr15 95651736 95652057 -7842917 + ORR1A2 LTR MaLR 1 322 -5 2 1314 558 315 122 27 chr15 95658103 95658439 -7836535 - MLT1B LTR MaLR -2 388 21 2 1314 3582 89 55 56 chr15 95669526 95670094 -7824880 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 2 1314 3076 65 2 45 chr15 95674535 95674953 -7820021 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1314 3428 38 10 0 chr15 95681408 95681804 -7813170 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1315 1309 210 128 59 chr15 95686588 95686978 -7807996 - MTD LTR MaLR -2 417 1 3 1315 3357 251 87 67 chr15 95687056 95688241 -7806733 - MTD-int LTR MaLR -33 1225 17 3 1315 231 250 0 0 chr15 95696526 95696574 -7798400 + LTR45 LTR ERV1 30 77 -448 3 1315 732 263 138 72 chr15 95696595 95696972 -7798002 + MTB_Mm LTR MaLR 1 402 -5 3 1315 1134 214 199 10 chr15 95700787 95701094 -7793880 + ORR1D1 LTR MaLR 10 374 0 3 1315 2137 164 107 39 chr15 95706781 95707275 -7787699 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 3 1315 3277 34 40 0 chr15 95709919 95710298 -7784676 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 3 1315 3320 24 39 0 chr15 95714418 95714799 -7780175 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1315 655 239 30 55 chr15 95720168 95720332 -7774642 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 215 3 1315 586 183 12 19 chr15 95720476 95720632 -7774342 - ORR1D1 LTR MaLR -255 139 1 3 1315 371 289 36 29 chr15 95727058 95727197 -7767777 - MLT1J1 LTR MaLR -118 326 187 3 1315 250 281 99 43 chr15 95728582 95728723 -7766251 - MLT1L LTR MaLR -3 607 459 3 1315 1150 248 119 63 chr15 95729076 95729472 -7765502 + MTD LTR MaLR 2 419 0 3 1315 524 320 153 26 chr15 95737177 95737485 -7757489 + ORR1E LTR MaLR 9 355 -4 4 1315 272 152 22 0 chr15 95737622 95737664 -7757310 - MTD LTR MaLR 0 421 379 4 1315 3463 154 84 15 chr15 95737664 95738270 -7756704 - RMER19B LTR ERVK -2 900 253 4 1315 461 129 0 0 chr15 95738268 95738338 -7756636 - RMER19B LTR ERVK -831 71 2 4 1315 1425 249 41 22 chr15 95738338 95738647 -7756327 - MTD LTR MaLR -83 336 21 4 1315 678 213 7 29 chr15 95739950 95740090 -7754884 - ORR1D1 LTR MaLR -237 137 1 4 1315 1453 241 72 65 chr15 95741045 95741489 -7753485 - RLTR16 LTR ERVK -58 447 1 4 1315 365 276 67 0 chr15 95741742 95741847 -7753127 - MTD LTR MaLR -14 405 294 4 1315 2507 65 16 6 chr15 95749564 95749887 -7745087 - ORR1A2 LTR MaLR -1 326 1 4 1315 2585 236 42 46 chr15 95752464 95753135 -7741839 + ORR1D2-int LTR MaLR 703 1370 0 4 1315 1675 188 88 0 chr15 95753135 95753475 -7741499 + ORR1D2 LTR MaLR 1 370 0 4 1315 2162 120 9 0 chr15 95754098 95754414 -7740560 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1315 2174 112 48 0 chr15 95761185 95761497 -7733477 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1315 1801 161 28 31 chr15 95764502 95764862 -7730112 + RLTR15 LTR ERVK 1 359 0 4 1315 1623 189 71 11 chr15 95769751 95769931 -7725043 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 177 4 1315 1623 189 71 11 chr15 95769982 95770154 -7724820 - ORR1D1 LTR MaLR -198 176 1 4 1315 431 204 0 112 chr15 95774655 95774771 -7720203 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 4 1315 471 271 101 29 chr15 95781791 95782000 -7712974 - MLT1D LTR MaLR 0 505 282 4 1315 2347 69 69 0 chr15 95785718 95786024 -7708950 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1315 1340 220 87 23 chr15 95788860 95789204 -7705770 - MTE2a LTR MaLR -13 366 1 4 1315 531 308 51 15 chr15 95807041 95807234 -7687740 + ORR1E LTR MaLR 3 185 -185 5 1315 1272 173 122 28 chr15 95807392 95807564 -7687410 - RMER17C LTR ERVK -14 396 200 5 1315 1272 173 122 28 chr15 95807600 95807789 -7687185 - RMER17C LTR ERVK -211 199 2 5 1315 272 333 12 0 chr15 95808659 95808743 -7686231 + MLT2B2 LTR ERVL 2 86 -429 5 1315 741 246 230 16 chr15 95808853 95808941 -7686033 - MTD LTR MaLR 0 419 313 5 1315 741 246 230 16 chr15 95808992 95809221 -7685753 - MTD LTR MaLR -107 312 34 5 1315 1517 180 125 41 chr15 95809423 95809910 -7685064 + RLTR31_Mm LTR ERVK 34 561 0 5 1316 1183 281 114 20 chr15 95820035 95820533 -7674441 + MER89 LTR ERV1 3 547 -12 5 1316 2511 163 87 48 chr15 95820848 95821410 -7673564 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 5 1316 1326 134 188 10 chr15 95823921 95824214 -7670760 + IAPLTR4 LTR ERVK 1 345 0 5 1316 3187 68 0 2 chr15 95824363 95824760 -7670214 - MTB LTR MaLR 0 400 5 5 1316 870 188 75 128 chr15 95829635 95829916 -7665058 - MT2A LTR ERVL -266 267 2 5 1316 715 226 156 49 chr15 95831125 95831413 -7663561 + ORR1D2 LTR MaLR 1 319 -51 5 1316 2163 152 35 10 chr15 95834776 95835175 -7659799 + MTC LTR MaLR 5 413 -8 5 1316 2013 169 56 15 chr15 95835328 95835724 -7659250 + MTC LTR MaLR 2 413 -8 5 1316 631 276 127 23 chr15 95837715 95837975 -7656999 + RMER19C LTR ERVK 2 288 -323 5 1316 270 268 26 53 chr15 95838917 95839095 -7655879 + MLT1L LTR MaLR 268 407 -105 5 1316 551 144 44 81 chr15 95842582 95842718 -7652256 - ORR1D2 LTR MaLR -239 131 1 5 1316 3567 40 28 5 chr15 95846300 95846726 -7648248 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 5 1316 1442 155 96 79 chr15 95846782 95847377 -7647597 - RMER6C LTR ERVK -12 708 215 5 1316 678 158 0 9 chr15 95847374 95847489 -7647485 - RLTR25B LTR ERVK -888 140 27 5 1316 4002 165 105 72 chr15 95849808 95850681 -7644293 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 5 1316 322 322 0 69 chr15 95850683 95850813 -7644161 - MLT2B1 LTR ERVL -69 498 378 5 1316 1754 242 52 18 chr15 95853521 95854017 -7640957 + RMER15 LTR ERVL 24 536 -39 5 1316 432 284 23 58 chr15 95854966 95855102 -7639872 - RLTR11B LTR ERVK -15 438 305 5 1316 3285 47 12 2 chr15 95855102 95855505 -7639469 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1316 432 284 23 58 chr15 95855505 95855540 -7639434 - RLTR11B LTR ERVK -149 304 273 5 1316 536 261 105 61 chr15 95855577 95855859 -7639115 - RLTR11B LTR ERVK -151 294 1 5 1316 5763 46 11 69 chr15 95857290 95857392 -7637582 + RLTR13C2 LTR ERVK 1 102 -706 6 1316 4897 55 3 0 chr15 95857392 95857977 -7636997 - LTRIS_Mus LTR ERV1 0 587 1 6 1316 5763 46 11 69 chr15 95857977 95858732 -7636242 + RLTR13C2 LTR ERVK 103 808 0 6 1316 422 176 169 173 chr15 95860968 95861216 -7633758 + RMER4B LTR ERVK 1 247 -338 6 1316 372 254 16 69 chr15 95861274 95861470 -7633504 + RMER4B LTR ERVK 415 561 -24 6 1316 358 320 34 34 chr15 95864754 95864932 -7630042 - MLT1C LTR MaLR 0 467 290 6 1316 471 296 78 49 chr15 95874948 95875254 -7619720 + MER74A LTR ERVL 120 434 -124 6 1316 737 252 120 70 chr15 95881032 95881374 -7613600 + MLT2D LTR ERVL 6 364 -50 6 1316 1565 136 61 107 chr15 95885087 95885450 -7609524 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 41 6 1316 291 289 67 121 chr15 95889855 95890079 -7604895 + LTR85c LTR Gypsy? 410 621 -202 6 1316 397 296 52 109 chr15 95892501 95892694 -7602280 - MLT1E2 LTR MaLR -445 182 1 6 1316 238 319 108 7 chr15 95900716 95900729 -7594245 + MT2C_Mm LTR ERVL 97 244 -226 6 1316 538 312 52 66 chr15 95901290 95901578 -7593396 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 245 6 1316 701 270 43 93 chr15 95901833 95902123 -7592851 - RLTR11B LTR ERVK -159 286 1 6 1316 355 373 35 16 chr15 95908825 95909081 -7585893 - HERV16-int LTR ERVL -3981 1015 755 6 1316 1347 244 153 3 chr15 95909713 95910079 -7584895 - MTC LTR MaLR 0 421 1 6 1316 1197 188 31 4 chr15 95911879 95912104 -7582870 + RLTR42-int LTR ERVK 1114 1344 -4178 6 1316 814 174 42 73 chr15 95912190 95912382 -7582592 + RLTR42-int LTR ERVK 1340 1525 -3997 6 1316 2136 128 65 6 chr15 95915439 95915778 -7579196 + ORR1B2 LTR MaLR 1 359 -8 7 1316 322 295 0 110 chr15 95918574 95918692 -7576282 + MT2B LTR ERVL 155 259 -342 7 1316 5293 124 82 12 chr15 95919608 95920451 -7574523 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 7 1316 1570 237 108 58 chr15 95921930 95922449 -7572525 - RLTR20B3 LTR ERVK -12 565 21 7 1316 3304 190 68 43 chr15 95923088 95923642 -7571332 + RLTR40 LTR ERVK 11 580 -237 7 1316 3304 190 68 43 chr15 95923666 95923852 -7571122 + RLTR40 LTR ERVK 581 768 -49 7 1316 2359 94 41 33 chr15 95931367 95931731 -7563243 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 7 1316 273 333 0 45 chr15 95932050 95932138 -7562836 + MLT1I LTR MaLR 326 409 -2 7 1316 306 316 67 55 chr15 95934783 95934947 -7560027 - RMER15 LTR ERVL -7 568 403 7 1316 287 323 71 0 chr15 95936085 95936184 -7558790 - LTR33C LTR ERVL -322 307 202 7 1316 494 272 23 2 chr15 95936391 95936535 -7558439 - LTR33C LTR ERVL -482 147 1 7 1316 1311 291 14 19 chr15 95939635 95939999 -7554975 + ORR1D2 LTR MaLR 5 366 -4 7 1316 4982 219 66 70 chr15 95940003 95940296 -7554678 + ORR1D2-int LTR MaLR 1 299 -1071 7 1316 4982 219 66 70 chr15 95940477 95941503 -7553471 + ORR1D2-int LTR MaLR 300 1315 -55 7 1316 1153 117 15 78 chr15 95942950 95943154 -7551820 + RMER15 LTR ERVL 52 242 -333 7 1317 2038 140 24 41 chr15 95948759 95949176 -7545798 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 7 1317 365 252 29 66 chr15 95949896 95950032 -7544942 + RMER15 LTR ERVL 1 131 -444 7 1317 1433 183 158 3 chr15 95950036 95950359 -7544615 - ORR1D1 LTR MaLR -1 373 1 7 1317 1179 250 14 7 chr15 95950392 95950674 -7544300 + RMER15 LTR ERVL 276 559 -16 7 1317 433 302 129 57 chr15 95951457 95951931 -7543043 - RLTR12B LTR ERVK -20 508 1 7 1317 733 268 94 49 chr15 95956965 95957232 -7537742 + ERVL-int LTR ERVL 3377 3655 -2059 7 1317 5281 265 47 42 chr15 95957246 95959133 -7535841 + ERVL-int LTR ERVL 3909 5756 -1 7 1317 395 274 231 27 chr15 95959140 95959365 -7535609 + MLT2B2 LTR ERVL 16 286 -229 7 1317 1625 138 4 0 chr15 95960496 95960750 -7534224 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 191 7 1317 478 149 0 11 chr15 95960739 95960827 -7534147 - RLTR41 LTR ERV1 -359 87 1 7 1317 1339 164 50 94 chr15 95962084 95962467 -7532507 - RMER10A LTR ERVL -76 366 1 7 1317 227 222 0 0 chr15 95963536 95963581 -7531393 - MLT1D LTR MaLR -8 497 453 7 1317 251 299 96 53 chr15 95964535 95964743 -7530231 - ORR1E LTR MaLR -142 217 1 8 1317 1431 218 122 146 chr15 95971223 95971259 -7523715 - MT2A LTR ERVL -3 530 496 8 1317 1431 218 122 146 chr15 95971438 95971944 -7523030 - MT2A LTR ERVL -38 495 1 8 1317 733 227 108 87 chr15 95971958 95972409 -7522565 - RMER2 LTR ERV1 -5 562 1 8 1317 1414 195 60 26 chr15 95972707 95973055 -7521919 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 19 8 1317 978 181 1 7 chr15 95973502 95973726 -7521248 + RLTR12A LTR ERVK 1 219 -309 8 1317 1829 161 2 143 chr15 95976388 95976808 -7518166 + ORR1B2 LTR MaLR 6 366 -1 8 1317 1502 205 27 88 chr15 95981045 95981456 -7513518 + MTD LTR MaLR 2 387 -32 8 1317 319 96 0 37 chr15 95981537 95981591 -7513383 + MTD LTR MaLR 368 419 0 8 1317 588 303 28 9 chr15 95982239 95982452 -7512522 - RMER15 LTR ERVL -3 572 356 8 1317 1775 151 26 11 chr15 95982759 95983134 -7511840 - ORR1A2 LTR MaLR 0 394 3 8 1317 2282 125 52 0 chr15 95983441 95983786 -7511188 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 5 8 1317 2221 220 45 9 chr15 95986622 95987159 -7507815 + RLTR12A LTR ERVK 1 556 -12 8 1317 1230 123 5 5 chr15 95987464 95987660 -7507314 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 172 8 1317 319 146 18 0 chr15 95987646 95987701 -7507273 - ORR1B2 LTR MaLR -312 58 3 8 1317 650 224 124 103 chr15 95987809 95988117 -7506857 + RLTR20D LTR ERVK 1 321 -247 8 1317 650 205 110 26 chr15 95988161 95988251 -7506723 + RLTR20D LTR ERVK 322 346 -222 8 1317 1141 187 68 231 chr15 95990605 95991009 -7503965 + ORR1C2 LTR MaLR 1 332 -52 8 1317 1141 187 68 231 chr15 95991181 95991234 -7503740 + ORR1C2 LTR MaLR 333 383 -1 8 1317 3071 161 126 22 chr15 95991399 95992026 -7502948 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 8 1317 1117 241 143 3 chr15 95996270 95996578 -7498396 + MTE2b LTR MaLR 29 379 0 8 1317 2075 158 37 31 chr15 96005011 96005536 -7489438 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -35 522 1 1 1317 2367 68 3 121 chr15 96007030 96007098 -7487876 + ORR1A2 LTR MaLR 1 57 -270 1 1317 2367 68 3 121 chr15 96007244 96007546 -7487428 + ORR1A2 LTR MaLR 58 327 0 1 1317 3948 151 53 9 chr15 96010068 96010731 -7484243 + RLTR17 LTR ERVK 1 692 0 1 1317 295 340 51 6 chr15 96010912 96011069 -7483905 - RMER15 LTR ERVL -11 564 401 2 1317 423 301 58 105 chr15 96011750 96012045 -7482929 - ORR1E LTR MaLR -7 372 75 2 1317 494 168 29 58 chr15 96012887 96013026 -7481948 + RLTR15 LTR ERVK 33 167 -192 2 1317 384 277 80 28 chr15 96013063 96013275 -7481699 + RLTR15 LTR ERVK 119 341 -18 2 1317 775 229 5 31 chr15 96013552 96013746 -7481228 + ORR1E LTR MaLR 1 189 -170 2 1317 354 245 34 81 chr15 96013830 96013931 -7481043 + ORR1E LTR MaLR 242 353 -66 2 1317 395 185 12 0 chr15 96013931 96014012 -7480962 + MT2A LTR ERVL 1 82 -451 2 1317 1400 242 63 0 chr15 96014262 96014606 -7480368 + MT2A LTR ERVL 74 439 -94 2 1317 590 249 31 49 chr15 96016438 96016662 -7478312 + ORR1E LTR MaLR 1 220 -139 3 1317 3502 30 0 0 chr15 96018426 96018822 -7476152 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1317 1989 181 113 19 chr15 96019749 96020211 -7474763 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 4 1317 2179 205 5 80 chr15 96020310 96020887 -7474087 + RLTR20C LTR ERVK 1 534 0 4 1317 2082 182 16 28 chr15 96021847 96022271 -7472703 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1317 1655 155 107 19 chr15 96022860 96023450 -7471524 + RLTR26 LTR ERVK 1 642 0 4 1317 3191 183 161 28 chr15 96023538 96024369 -7470605 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 5 1317 2383 49 30 3 chr15 96024912 96025241 -7469733 - ORR1A1 LTR MaLR -8 338 1 5 1317 497 240 68 34 chr15 96027071 96027308 -7467666 + RLTR15 LTR ERVK 45 289 -70 5 1317 2410 185 19 25 chr15 96028183 96028714 -7466260 - RLTR12B LTR ERVK 0 528 1 5 1317 2103 144 3 19 chr15 96041032 96041401 -7453573 - RLTR17 LTR ERVK -232 460 98 7 1317 975 234 128 78 chr15 96042844 96043243 -7451731 - MTD LTR MaLR 0 419 1 8 1317 885 308 109 45 chr15 96047470 96047957 -7447017 - MER21B LTR ERV1 -49 814 297 9 1317 3318 148 33 7 chr15 96048483 96049063 -7445911 + RLTR17 LTR ERVK 98 692 0 9 1317 351 141 0 15 chr15 96049079 96049144 -7445830 + ORR1D2 LTR MaLR 6 69 -301 9 1317 270 143 20 0 chr15 96049508 96049557 -7445417 + ORR1D2 LTR MaLR 321 370 0 9 1317 2102 160 78 5 chr15 96053999 96054395 -7440579 + RMER19B LTR ERVK 478 902 0 1 1317 243 307 78 26 chr15 96057241 96057395 -7437579 + MER67C LTR ERV1 279 440 -271 1 1317 3400 41 89 2 chr15 96059113 96059550 -7435424 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1317 2586 165 167 21 chr15 96059669 96060033 -7434941 + RMER19B LTR ERVK 61 466 -436 1 1317 2586 157 61 44 chr15 96060589 96061006 -7433968 + RMER19B LTR ERVK 467 902 0 1 1317 341 299 55 79 chr15 96062528 96062782 -7432192 + RLTR12B LTR ERVK 19 266 -262 1 1317 2263 147 68 0 chr15 96064959 96065023 -7429951 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 468 1 1317 2263 141 132 0 chr15 96065076 96065495 -7429479 - RLTR20D LTR ERVK -101 467 3 1 1317 352 236 36 121 chr15 96065936 96066076 -7428898 - MTE2b LTR MaLR -2 377 250 1 1317 335 313 0 0 chr15 96066219 96066318 -7428656 - MTE2b LTR MaLR -108 271 173 1 1317 962 274 34 50 chr15 96066572 96066894 -7428080 + MTEa LTR MaLR 51 367 -12 1 1317 270 103 0 0 chr15 96067457 96067496 -7427478 + ORR1A2 LTR MaLR 3 41 -286 1 1317 1366 109 149 25 chr15 96067618 96067918 -7427056 + ORR1A2 LTR MaLR 17 346 0 1 1317 418 256 128 104 chr15 96068043 96068388 -7426586 + ORR1E LTR MaLR 1 353 -6 1 1317 434 317 56 0 chr15 96068409 96068551 -7426423 + ORR1E-int LTR MaLR 15 164 -1416 1 1317 1082 321 78 52 chr15 96069019 96069075 -7425899 + ORR1E-int LTR MaLR 151 204 -1376 1 1317 3426 36 2 0 chr15 96069075 96069468 -7425506 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 3 1 1317 1082 321 78 52 chr15 96069468 96070062 -7424912 + ORR1E-int LTR MaLR 205 818 -762 1 1317 310 262 12 12 chr15 96070071 96070156 -7424818 + ORR1E-int LTR MaLR 1446 1530 -50 1 1317 311 230 21 103 chr15 96070150 96070213 -7424761 + ORR1E LTR MaLR 12 72 -287 1 1317 2313 81 12 12 chr15 96070213 96070540 -7424434 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1317 311 230 21 103 chr15 96070540 96070573 -7424401 + ORR1E LTR MaLR 73 100 -259 1 1317 3139 43 27 0 chr15 96072103 96072478 -7422496 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 1 1317 579 288 130 5 chr15 96073542 96073758 -7421216 - MLT1F2 LTR MaLR -2 558 316 1 1317 1624 158 136 11 chr15 96075217 96075570 -7419404 + RLTR9D LTR ERVK 1 397 -6 1 1318 2538 91 0 0 chr15 96077362 96077723 -7417251 - MTB LTR MaLR 0 400 40 1 1318 2297 92 35 3 chr15 96078347 96078664 -7416310 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1318 756 100 0 0 chr15 96079660 96079770 -7415204 + RMER19A LTR ERVK 1 110 -627 1 1318 3515 83 146 12 chr15 96080520 96081035 -7413939 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 1 1318 2070 140 35 177 chr15 96082281 96082801 -7412173 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 1 1318 2681 144 31 42 chr15 96083335 96083858 -7411116 + RLTR28 LTR ERVL 1 517 -7 1 1318 490 222 121 18 chr15 96084297 96084462 -7410512 + MTEa LTR MaLR 3 184 -195 1 1318 333 193 97 44 chr15 96084484 96084598 -7410376 + MTEa LTR MaLR 223 342 -37 1 1318 1196 205 153 24 chr15 96088142 96088521 -7406453 - RMER10A LTR ERVL -14 428 1 1 1318 4207 110 73 33 chr15 96090668 96090952 -7404022 - RMER6A LTR ERVK -4 752 451 1 1318 4207 110 73 33 chr15 96091143 96091580 -7403394 - RMER6A LTR ERVK -306 450 2 1 1318 3418 38 2 0 chr15 96091748 96092142 -7402832 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 2 1 1318 2641 168 109 71 chr15 96097276 96097865 -7397109 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1318 1085 247 126 3 chr15 96100627 96100952 -7394022 - ORR1D1 LTR MaLR -6 368 4 1 1318 269 248 113 89 chr15 96107853 96108021 -7386953 - MLT1A0 LTR MaLR -182 183 12 2 1318 429 258 107 67 chr15 96109353 96109623 -7385351 + RLTR15 LTR ERVK 14 294 -65 2 1318 3563 166 91 57 chr15 96109858 96110756 -7384218 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 2 1318 1533 168 146 16 chr15 96111826 96112189 -7382785 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 2 1318 3322 153 75 31 chr15 96133042 96133776 -7361198 - RMER19B LTR ERVK -12 890 20 2 1318 440 270 67 43 chr15 96134504 96134713 -7360261 - RLTR12B LTR ERVK -312 216 3 2 1318 1066 204 136 0 chr15 96138780 96139060 -7355914 + MTD LTR MaLR 1 318 -101 2 1318 2586 109 47 2 chr15 96143726 96144129 -7350845 - BGLII LTR ERVK 0 421 1 2 1318 3319 190 40 61 chr15 96144136 96145066 -7349908 - RMER3D-int LTR ERVK -5 2837 1928 2 1318 2094 178 65 82 chr15 96145064 96145615 -7349359 - RMER3D-int LTR ERVK -1148 1694 1153 2 1318 265 152 22 0 chr15 96145659 96145705 -7349269 - BGLII LTR ERVK -115 306 260 2 1318 708 219 89 116 chr15 96155213 96155471 -7339503 - RMER20B LTR ERVK 0 627 377 2 1318 2331 158 97 18 chr15 96155524 96156020 -7338954 - RMER19B LTR ERVK -12 890 356 2 1318 735 198 61 9 chr15 96156040 96156297 -7338677 - RMER19B LTR ERVK -675 227 1 2 1318 1291 196 8 15 chr15 96156336 96156601 -7338373 - RMER20B LTR ERVK -364 263 1 2 1318 349 285 61 85 chr15 96157099 96157429 -7337545 + RLTR15 LTR ERVK 1 322 -37 2 1318 2430 80 9 0 chr15 96173177 96173501 -7321473 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1318 1517 152 102 2 chr15 96179691 96180017 -7314957 - MTC LTR MaLR -53 366 1 3 1318 462 226 54 39 chr15 96181587 96181716 -7313258 + MTD LTR MaLR 283 413 -6 3 1318 3465 152 146 58 chr15 96182864 96183693 -7311281 + RMER19B LTR ERVK 1 902 0 3 1318 1215 55 11 32 chr15 96194961 96195148 -7299826 - MTA_Mm LTR MaLR -7 389 207 3 1318 2049 52 78 44 chr15 96195144 96195463 -7299511 - MT2C_Mm LTR ERVL -145 330 1 3 1318 250 23 85 85 chr15 96205175 96205222 -7289752 + RMER17C-int LTR ERVK 2875 2921 -317 3 1319 651 152 8 0 chr15 96214627 96214745 -7280229 + MTC LTR MaLR 294 412 -7 3 1319 6241 145 91 29 chr15 96214745 96215725 -7279249 + MTC-int LTR MaLR 2 1044 -214 3 1319 6241 145 91 29 chr15 96215912 96216113 -7278861 + MTC-int LTR MaLR 1045 1256 -2 3 1319 1572 157 73 7 chr15 96216119 96216421 -7278553 + MTC LTR MaLR 92 413 -8 3 1319 1095 189 33 33 chr15 96224669 96224943 -7270031 - RMER17C LTR ERVK 0 410 137 4 1319 253 312 53 21 chr15 96260268 96260363 -7234611 + RLTR20B2 LTR ERVK 102 199 -361 4 1319 1608 131 111 12 chr15 96260368 96260692 -7234282 + RLTR15 LTR ERVK 4 359 0 4 1319 1914 110 9 56 chr15 96272042 96272380 -7222594 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 4 1319 445 279 40 32 chr15 96277374 96277500 -7217474 + MTEa LTR MaLR 17 143 -236 4 1319 461 281 22 45 chr15 96277527 96277706 -7217268 + MTEa LTR MaLR 205 379 0 4 1319 3592 154 73 184 chr15 96278903 96279916 -7215058 + RMER19B LTR ERVK 1 901 -1 5 1319 339 219 17 125 chr15 96288861 96288883 -7206091 + MT2B LTR ERVL 162 204 -397 5 1319 3664 26 28 7 chr15 96294599 96295026 -7199948 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 5 1319 2620 141 89 184 chr15 96296894 96297605 -7197369 - RMER19B LTR ERVK -259 643 1 5 1319 225 227 104 85 chr15 96300061 96300167 -7194807 - LTR81C LTR ERV1? -125 1028 921 5 1319 978 244 62 121 chr15 96300107 96300454 -7194520 - MT2A LTR ERVL -146 455 1 5 1319 2479 68 3 58 chr15 96302926 96303268 -7191706 - ORR1A2 LTR MaLR -4 323 1 5 1319 2106 154 28 14 chr15 96306259 96306621 -7188353 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1319 401 229 93 67 chr15 96306766 96306916 -7188058 - RMER15 LTR ERVL -75 500 347 5 1319 508 328 100 60 chr15 96308502 96308882 -7186092 + MLT1A1 LTR MaLR 1 395 -13 5 1319 231 320 65 65 chr15 96311477 96311584 -7183390 - LTR81B LTR ERV1? -237 1156 1050 5 1319 2460 206 76 108 chr15 96311733 96312535 -7182439 + RMER17B LTR ERVK 1 776 -182 5 1319 1949 142 199 3 chr15 96312770 96313122 -7181852 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1319 2336 114 6 0 chr15 96313626 96313950 -7181024 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 5 1319 805 163 145 0 chr15 96320328 96320555 -7174419 - RMER17C LTR ERVK 0 410 151 5 1319 2175 156 83 28 chr15 96321700 96322123 -7172851 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 1319 1541 145 91 58 chr15 96324184 96324579 -7170395 + RMER17C LTR ERVK 3 410 0 6 1319 4018 80 46 4 chr15 96325719 96326260 -7168714 - LTRIS2 LTR ERV1 0 564 1 6 1319 1247 205 67 70 chr15 96327134 96327187 -7167787 + ORR1D2 LTR MaLR 5 60 -310 6 1319 6096 124 31 24 chr15 96327187 96328163 -7166811 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 6 1319 1247 205 67 70 chr15 96328163 96328232 -7166742 + ORR1D2 LTR MaLR 61 122 -248 6 1319 1247 205 67 70 chr15 96328256 96328473 -7166501 + ORR1D2 LTR MaLR 123 343 -27 6 1319 265 372 16 32 chr15 96329055 96329180 -7165794 + MER21B LTR ERV1 345 467 -396 6 1319 285 344 93 6 chr15 96329666 96329827 -7165147 + MER21B LTR ERV1 487 661 -202 6 1319 4944 99 59 6 chr15 96329900 96330598 -7164376 + RMER19A LTR ERVK 1 735 -2 6 1319 653 327 96 21 chr15 96330663 96330944 -7164030 + RMER5 LTR ERV1 233 534 0 6 1319 1027 276 121 17 chr15 96331498 96331904 -7163070 + RLTR20A2 LTR ERVK 115 562 -16 6 1319 281 239 41 61 chr15 96333435 96333533 -7161441 + RLTR9E LTR ERVK 1 96 -272 6 1319 334 172 66 44 chr15 96333522 96333613 -7161361 - RLTR9A LTR ERVK -275 93 1 6 1319 291 191 116 108 chr15 96333717 96333846 -7161128 - RMER16-int LTR ERVK -27 5379 5250 6 1319 313 206 54 117 chr15 96333849 96333982 -7160992 + RLTR9E LTR ERVK 280 437 0 6 1319 387 303 57 78 chr15 96334613 96334806 -7160168 + ORR1E LTR MaLR 159 347 -12 6 1319 301 164 0 0 chr15 96336221 96336276 -7158698 + RLTR15 LTR ERVK 1 55 -304 6 1319 346 198 20 30 chr15 96337661 96337760 -7157214 - RLTR15 LTR ERVK -229 130 33 6 1320 1916 128 78 39 chr15 96342587 96342919 -7152055 + ORR1B2 LTR MaLR 15 359 -8 6 1320 474 210 1 0 chr15 96343529 96343623 -7151351 - MTE2a LTR MaLR -8 411 278 6 1320 309 320 86 43 chr15 96343665 96343685 -7151289 - MTE2a LTR MaLR -66 313 289 6 1320 374 311 63 49 chr15 96343831 96343973 -7151001 - MTE2a LTR MaLR -92 287 144 6 1320 444 314 27 23 chr15 96344000 96344180 -7150794 - MTE2a LTR MaLR -237 182 1 6 1320 2932 115 27 13 chr15 96345017 96345465 -7149509 - RMER19B LTR ERVK 0 902 449 6 1320 2437 192 39 51 chr15 96345576 96346150 -7148824 - RMER19B LTR ERVK -452 450 1 6 1320 826 258 26 96 chr15 96347475 96348059 -7146915 + RLTR11B LTR ERVK 1 453 0 6 1320 469 249 64 46 chr15 96354851 96355024 -7139950 - LTR80B LTR ERVL -390 194 19 6 1320 334 305 74 39 chr15 96355898 96356127 -7138847 + RLTR15 LTR ERVK 105 341 -18 6 1320 334 209 105 79 chr15 96359102 96359216 -7135758 - MTEa LTR MaLR -4 375 259 6 1320 582 276 58 81 chr15 96359207 96359515 -7135459 - MTEa LTR MaLR -75 304 4 6 1320 1580 132 36 63 chr15 96359580 96359911 -7135063 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 322 0 6 1320 688 276 40 142 chr15 96362569 96362757 -7132217 - MTEa LTR MaLR -17 362 192 6 1320 1345 246 194 54 chr15 96362757 96363293 -7131681 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 6 1320 688 276 40 142 chr15 96363293 96363378 -7131596 - MTEa LTR MaLR -188 191 115 6 1320 688 276 40 142 chr15 96363422 96363548 -7131426 - MTEa LTR MaLR -265 114 3 6 1320 1127 197 48 106 chr15 96368601 96369099 -7125875 + RMER10A LTR ERVL 2 401 -41 6 1320 501 263 58 75 chr15 96375962 96376188 -7118786 - RMER15 LTR ERVL -2 573 352 7 1320 1970 161 29 0 chr15 96380563 96380912 -7114062 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 1 7 1320 3275 148 161 29 chr15 96381636 96382387 -7112587 - RMER17B LTR ERVK -107 851 2 7 1320 4536 12 0 0 chr15 96383455 96383948 -7111026 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1320 319 0 0 0 chr15 96383948 96383986 -7110988 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 7 1320 384 179 46 35 chr15 96383986 96384073 -7110901 - ORR1A3-int LTR MaLR -1323 640 553 7 1320 47768 13 10 0 chr15 96384073 96389399 -7105575 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 7 1320 4536 12 0 0 chr15 96389399 96389892 -7105082 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 7 1320 3361 41 0 145 chr15 96391968 96392478 -7102496 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 1320 999 235 93 39 chr15 96392948 96393282 -7101692 - MTB_Mm LTR MaLR -59 362 2 7 1320 2948 122 9 114 chr15 96394363 96394607 -7100367 + RLTR28 LTR ERVL 1 211 -313 7 1320 2948 122 9 114 chr15 96394937 96395269 -7099705 + RLTR28 LTR ERVL 212 520 -4 7 1320 2656 62 6 0 chr15 96395454 96395779 -7099195 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 7 1320 2475 118 25 18 chr15 96396278 96396674 -7098300 + MTB_Mm LTR MaLR 1 399 -8 7 1320 744 167 91 0 chr15 96397729 96397861 -7097113 + RMER10B LTR ERVL 1 144 -254 7 1320 395 285 84 19 chr15 96399448 96399602 -7095372 + LTR37A LTR ERV1 77 240 -186 7 1320 2789 93 27 12 chr15 96409954 96410355 -7084619 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1320 1094 212 127 46 chr15 96411070 96411377 -7083597 - IAPEY3_LTR LTR ERVK 0 332 1 7 1320 1467 189 55 15 chr15 96411377 96411720 -7083254 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 6125 7 1320 1602 120 95 32 chr15 96411737 96412054 -7082920 - IAPEY3-int LTR ERVK -342 7338 6965 7 1320 1435 124 107 0 chr15 96412054 96412279 -7082695 - IAPEz-int LTR ERVK -1287 5255 5007 7 1320 386 140 0 0 chr15 96412279 96412336 -7082638 - IAPEz-int LTR ERVK -6039 503 447 7 1320 297 260 49 20 chr15 96412353 96412455 -7082519 - RMER16-int LTR ERVK -6015 1566 1462 7 1320 759 202 129 0 chr15 96412598 96412761 -7082213 - RMER16-int LTR ERVK -4903 503 320 7 1320 844 110 8 0 chr15 96412774 96412901 -7082073 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6746 835 708 7 1320 1212 159 0 10 chr15 96413000 96413203 -7081771 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7155 426 226 7 1320 239 278 0 36 chr15 96413203 96413259 -7081715 - RLTR27 LTR ERVK -35 274 221 7 1320 900 158 28 39 chr15 96413259 96413437 -7081537 - MMERVK10C-int LTR ERVK -6288 193 18 7 1320 354 58 19 0 chr15 96413437 96413489 -7081485 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1932 55 3 7 1320 1099 195 119 52 chr15 96413500 96413798 -7081176 - IAPEY3_LTR LTR ERVK -6 305 1 7 1320 503 137 84 112 chr15 96423092 96423306 -7071668 + RMER17C LTR ERVK 68 275 -135 7 1320 572 235 159 18 chr15 96432341 96432643 -7062331 + ORR1D2 LTR MaLR 2 359 0 7 1320 355 293 42 76 chr15 96435653 96435711 -7059263 + MT2B2 LTR ERVL 106 158 -426 8 1320 2203 166 11 78 chr15 96448099 96448180 -7046794 + MTC LTR MaLR 1 81 -340 8 1320 2203 166 11 78 chr15 96448372 96448741 -7046233 + MTC LTR MaLR 82 421 0 8 1320 1068 194 78 153 chr15 96463560 96463660 -7031314 - MTD LTR MaLR 0 419 364 8 1320 2719 148 13 19 chr15 96463660 96464122 -7030852 - RMER6B LTR ERVK -2 459 1 8 1320 1068 194 78 153 chr15 96464122 96464355 -7030619 - MTD LTR MaLR -56 363 111 8 1320 1868 108 17 103 chr15 96464364 96464713 -7030261 + ORR1A4 LTR MaLR 2 320 -9 8 1320 225 289 0 0 chr15 96464905 96464957 -7030017 - MTD LTR MaLR -300 119 68 8 1321 383 247 22 22 chr15 96478987 96479078 -7015896 - MTEb LTR MaLR -2 377 287 9 1321 277 292 14 91 chr15 96479087 96479230 -7015744 - RMER12 LTR ERVK -464 858 727 9 1321 941 261 58 76 chr15 96485224 96485558 -7009416 + ORR1E LTR MaLR 1 351 -28 9 1321 880 255 67 31 chr15 96485950 96486205 -7008769 + ORR1D2 LTR MaLR 1 264 -106 9 1321 491 245 47 65 chr15 96486259 96486429 -7008545 + ORR1D2 LTR MaLR 204 370 0 9 1321 329 340 38 38 chr15 96490447 96490478 -7004496 + RLTR14 LTR ERV1 224 252 -130 9 1321 329 340 38 38 chr15 96490670 96490797 -7004177 + RLTR14 LTR ERV1 253 381 -1 9 1321 368 182 40 111 chr15 96494677 96494776 -7000198 + MTEa LTR MaLR 278 369 -10 9 1321 1135 213 151 67 chr15 96504002 96504138 -6990836 + MTD LTR MaLR 1 116 -303 7 1321 1135 213 151 67 chr15 96504164 96504399 -6990575 + MTD LTR MaLR 117 402 -17 7 1321 370 353 103 45 chr15 96506810 96507208 -6987766 + MLT1J-int LTR MaLR 633 1053 -334 1 1321 1685 317 118 144 chr15 96507958 96508130 -6986844 - MTE-int LTR MaLR -2 1578 1393 1 1321 1685 317 118 144 chr15 96508249 96509346 -6985628 - MTE-int LTR MaLR -188 1392 358 1 1321 1685 317 118 144 chr15 96509457 96509804 -6985170 - MTE-int LTR MaLR -1223 357 3 1 1321 2562 171 97 78 chr15 96516045 96516635 -6978339 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 3 1321 405 317 83 0 chr15 96534398 96534543 -6960431 + MLT1F2 LTR MaLR 402 558 -2 5 1321 228 153 157 132 chr15 96534729 96534812 -6960162 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 425 6 1321 579 291 242 8 chr15 96537754 96538121 -6956853 - MLT1F1 LTR MaLR -3 566 114 6 1321 1483 213 103 36 chr15 96550893 96551282 -6943692 - MTD LTR MaLR -2 417 3 9 1321 1170 274 134 3 chr15 96552801 96553174 -6941800 + BGLII_Mus LTR ERVK 1 422 0 9 1321 2753 164 4 21 chr15 96554503 96554977 -6939997 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 1 1321 324 284 156 17 chr15 96560364 96560543 -6934431 - MLT1H2 LTR MaLR -8 481 278 1 1321 621 307 107 10 chr15 96560765 96561046 -6933928 + MLT1A LTR MaLR 49 408 0 1 1321 1279 266 53 9 chr15 96567137 96567474 -6927500 + ORR1D2 LTR MaLR 11 362 -8 1 1321 1232 169 28 45 chr15 96570213 96570466 -6924508 - MTC LTR MaLR -156 223 1 1 1321 228 331 113 64 chr15 96581940 96582143 -6912831 + MLT1I LTR MaLR 98 310 -101 1 1321 454 244 52 9 chr15 96593012 96593128 -6901846 - MLT1F1 LTR MaLR -6 563 443 1 1321 1506 222 106 5 chr15 96594875 96595242 -6899732 - MTD LTR MaLR -15 404 1 1 1321 264 306 59 0 chr15 96597669 96597754 -6897220 + MTEa LTR MaLR 288 377 -2 2 1322 1936 162 98 8 chr15 96610422 96610808 -6884166 + MTC LTR MaLR 1 421 0 2 1322 851 249 184 3 chr15 96618071 96618353 -6876621 + MTD LTR MaLR 38 370 -49 2 1322 433 184 9 52 chr15 96618400 96618515 -6876459 + ORR1B1 LTR MaLR 32 141 -253 2 1322 288 195 0 25 chr15 96618516 96618595 -6876379 + ORR1A4 LTR MaLR 65 141 -253 2 1322 1731 139 20 10 chr15 96618582 96618988 -6875986 + ORR1A4 LTR MaLR 8 391 -3 2 1322 246 306 31 39 chr15 96621089 96621218 -6873756 + MLT1A0 LTR MaLR 1 128 -237 2 1322 407 290 6 49 chr15 96624020 96624183 -6870791 - MER57A-int LTR ERV1 -5946 241 86 2 1322 1188 218 125 3 chr15 96632508 96632835 -6862139 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 2 1322 760 243 149 0 chr15 96634516 96634751 -6860223 + ORR1D2 LTR MaLR 6 275 -95 2 1322 1745 133 7 14 chr15 96634782 96635072 -6859902 + ORR1A2 LTR MaLR 1 288 -39 2 1322 296 160 0 0 chr15 96641794 96641844 -6853130 + ORR1A2 LTR MaLR 269 318 -8 2 1322 530 158 10 10 chr15 96642127 96642229 -6852745 + ORR1D2 LTR MaLR 267 368 -2 2 1322 2201 136 2 148 chr15 96643047 96643521 -6851453 + RMER19B LTR ERVK 1 405 -497 2 1322 1442 212 75 23 chr15 96645412 96645538 -6849436 + ORR1D2 LTR MaLR 5 154 -216 2 1322 2286 81 52 0 chr15 96645538 96645848 -6849126 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 2 1322 1442 212 75 23 chr15 96645848 96646068 -6848906 + ORR1D2 LTR MaLR 155 369 -1 2 1322 1666 193 96 21 chr15 96647500 96647886 -6847088 - MTD LTR MaLR 0 419 5 2 1322 252 205 176 90 chr15 96648301 96648489 -6846485 + RMER10A LTR ERVL 18 221 -221 2 1322 1728 194 16 68 chr15 96651072 96651514 -6843460 - MTC LTR MaLR -2 419 1 2 1322 1260 221 95 30 chr15 96655725 96656094 -6838880 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 2 1322 442 190 20 0 chr15 96658409 96658509 -6836465 - MTC LTR MaLR -316 105 4 2 1322 3062 80 2 10 chr15 96658774 96659177 -6835797 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1322 2242 144 39 32 chr15 96664471 96664910 -6830064 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 3 1322 2575 36 0 9 chr15 96668738 96669076 -6825898 + ORR1A0 LTR MaLR 1 335 -11 3 1322 717 269 97 56 chr15 96670800 96671256 -6823718 - RLTR12B LTR ERVK -34 494 1 3 1322 2111 138 57 79 chr15 96681607 96682010 -6812964 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 3 1322 2177 128 113 0 chr15 96686561 96686906 -6808068 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 3 1322 2213 139 70 3 chr15 96695256 96695625 -6799349 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 3 1322 3078 26 0 0 chr15 96695968 96696314 -6798660 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 3 1322 1171 227 133 0 chr15 96697772 96698102 -6796872 - MTD LTR MaLR 0 419 46 3 1322 1196 215 99 11 chr15 96710850 96711203 -6783771 - MTD LTR MaLR -14 405 22 3 1322 2182 100 3 12 chr15 96719400 96719735 -6775239 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 3 1322 41790 18 10 12 chr15 96719737 96726236 -6768738 - IAPEz-int LTR ERVK -2 6479 6 3 1322 2174 103 3 12 chr15 96726236 96726571 -6768403 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -5 332 1 3 1323 253 309 0 30 chr15 96737637 96737737 -6757237 + MLT1A LTR MaLR 65 161 -213 3 1323 2119 192 181 38 chr15 96754237 96754763 -6740211 - MT2B LTR ERVL 0 601 1 4 1323 947 231 75 34 chr15 96772112 96772407 -6722567 + ORR1E LTR MaLR 1 307 -52 4 1323 307 242 71 40 chr15 96773947 96774046 -6720928 - MT2B LTR ERVL -344 257 156 4 1323 226 133 22 0 chr15 96790054 96790099 -6704875 - MLT2D LTR ERVL -2 558 513 4 1323 254 299 183 45 chr15 96790313 96790525 -6704449 - MT2A LTR ERVL -154 379 1 4 1323 319 283 91 8 chr15 96790525 96790646 -6704328 - MTE2a LTR MaLR -248 131 1 4 1323 2771 144 98 78 chr15 96792385 96793062 -6701912 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 4 1323 2522 95 3 0 chr15 96795947 96796273 -6698701 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 4 1323 402 310 39 7 chr15 96798558 96798773 -6696201 + MLT1H2 LTR MaLR 1 186 -303 5 1323 480 307 96 60 chr15 96799159 96799512 -6695462 - MLT1F2 LTR MaLR -92 468 53 5 1323 608 264 90 158 chr15 96800233 96800890 -6694084 - RLTR18 LTR ERVK -4 612 1 5 1323 1277 251 72 99 chr15 96801025 96801612 -6693362 + RMER4B LTR ERVK 15 585 0 5 1323 1742 160 55 80 chr15 96802372 96802772 -6692202 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 5 1323 2330 114 0 15 chr15 96807025 96807355 -6687619 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 2 5 1323 3121 11 43 0 chr15 96808504 96808856 -6686118 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1323 22809 32 25 14 chr15 96808856 96811571 -6683403 + IAPEz-int LTR ERVK 8 2751 -3730 5 1323 10835 7 0 0 chr15 96811563 96812735 -6682239 + IAPEz-int LTR ERVK 3244 4415 -2066 5 1323 6987 30 4 2 chr15 96812713 96813520 -6681454 + IAPEz-int LTR ERVK 5674 6481 0 5 1323 3121 11 43 0 chr15 96813520 96813872 -6681102 + IAPLTR1_Mm LTR ERVK 1 367 0 5 1323 274 156 66 4 chr15 96813957 96814043 -6680931 + MTEa LTR MaLR 3 97 -322 5 1323 480 332 72 41 chr15 96815087 96815432 -6679542 + MTEa LTR MaLR 24 379 0 5 1323 1377 142 7 84 chr15 96819038 96819451 -6675523 + ORR1B1 LTR MaLR 4 393 -1 5 1323 273 301 58 52 chr15 96819451 96819586 -6675388 - ORR1E LTR MaLR -223 136 1 5 1323 572 258 91 61 chr15 96824749 96824916 -6670058 + MLT1D LTR MaLR 258 436 -69 5 1323 572 258 91 61 chr15 96825025 96825088 -6669886 + MLT1D LTR MaLR 437 495 -10 5 1323 1065 241 116 14 chr15 96833325 96833754 -6661220 + RLTR16 LTR ERVK 1 473 -32 5 1323 1075 134 11 5 chr15 96852771 96852958 -6642016 + RMER10B LTR ERVL 1 188 -210 5 1323 229 264 0 65 chr15 96854988 96855081 -6639893 + MLT2B2 LTR ERVL 38 124 -391 5 1323 552 297 112 95 chr15 96855083 96855492 -6639482 + MLT2B2 LTR ERVL 33 448 -67 5 1323 1238 120 71 60 chr15 96858661 96858927 -6636047 + RMER10A LTR ERVL 18 286 -156 5 1324 315 225 37 12 chr15 96868497 96868578 -6626396 + MTEa LTR MaLR 290 372 -7 6 1324 419 305 86 68 chr15 96881759 96882051 -6612923 + RMER15 LTR ERVL 265 561 -14 6 1324 794 240 67 15 chr15 96891524 96891719 -6603255 + RLTR18B LTR ERVK 1 205 -307 6 1324 460 252 70 31 chr15 96891824 96891980 -6602994 + RLTR18B LTR ERVK 296 511 -105 6 1324 479 260 10 0 chr15 96892178 96892282 -6602692 + RLTR18B LTR ERVK 402 506 -6 6 1324 304 213 82 41 chr15 96897438 96897536 -6597438 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 307 6 1324 230 333 0 0 chr15 96897610 96897664 -6597310 + RMER15 LTR ERVL 1 54 -521 6 1324 1045 256 77 29 chr15 96897791 96898101 -6596873 + RMER15 LTR ERVL 34 358 -217 6 1324 290 290 101 18 chr15 96900271 96900380 -6594594 - MTE2a LTR MaLR -242 137 20 6 1324 513 335 88 77 chr15 96900452 96900931 -6594043 - MT2A LTR ERVL -13 520 37 6 1324 1491 288 168 15 chr15 96903142 96903755 -6591219 - MTE-int LTR MaLR -317 1263 557 6 1324 468 285 65 29 chr15 96903777 96903947 -6591027 - MTE-int LTR MaLR -1179 401 226 6 1324 884 154 123 50 chr15 96903943 96904162 -6590812 + RLTR28 LTR ERVL 274 508 -16 6 1324 443 257 44 9 chr15 96904189 96904303 -6590671 - MTE-int LTR MaLR -1425 155 38 6 1324 917 238 73 84 chr15 96904322 96904693 -6590281 + RMER17C LTR ERVK 44 410 0 6 1324 291 184 41 0 chr15 96904693 96904742 -6590232 - MTE-int LTR MaLR -1529 51 1 6 1324 688 335 0 5 chr15 96904922 96905111 -6589863 - MTE2a LTR MaLR -133 246 59 6 1324 242 178 135 14 chr15 96905395 96905469 -6589505 - MTE2a LTR MaLR -272 107 25 6 1324 1603 164 38 76 chr15 96906577 96907000 -6587974 + RMER17C LTR ERVK 3 409 -1 6 1324 248 291 49 106 chr15 96907869 96907992 -6586982 - MTEa LTR MaLR -1 378 263 6 1324 1159 213 104 46 chr15 96908517 96908862 -6586112 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 2 6 1324 2946 156 59 30 chr15 96910361 96910618 -6584356 - RMER4B LTR ERVK 0 585 323 6 1324 2946 156 59 30 chr15 96910657 96910956 -6584018 - RMER4B LTR ERVK -263 322 13 6 1324 5594 100 71 7 chr15 96915037 96915910 -6579064 + RMER17B LTR ERVK 30 958 0 6 1324 1254 242 113 18 chr15 96916002 96916092 -6578882 - RLTR20D LTR ERVK 0 505 414 6 1324 2032 142 48 47 chr15 96916136 96916554 -6578420 - RLTR20D LTR ERVK -92 413 1 6 1324 768 250 35 57 chr15 96923783 96924012 -6570962 + ORR1E LTR MaLR 15 238 -121 7 1324 427 221 0 0 chr15 96924076 96924162 -6570812 - MTEa LTR MaLR 0 379 294 7 1324 599 272 11 69 chr15 96924229 96924403 -6570571 + MTE-int LTR MaLR 19 182 -1398 7 1324 5019 148 65 13 chr15 96924816 96925662 -6569312 + RMER19B LTR ERVK 1 890 -12 7 1324 258 340 30 55 chr15 96928633 96928798 -6566176 - LTR16B2 LTR ERVL -301 161 1 7 1324 779 306 122 27 chr15 96929289 96929585 -6565389 + MTD LTR MaLR 11 334 -85 7 1324 340 164 32 16 chr15 96929660 96929722 -6565252 + MTD LTR MaLR 344 406 -15 7 1324 225 241 21 94 chr15 96931982 96932078 -6562896 + ORR1D-int LTR MaLR 514 602 -768 7 1324 2572 170 47 24 chr15 96935317 96935811 -6559163 + RLTR16 LTR ERVK 1 505 0 7 1324 534 203 101 68 chr15 96942068 96942216 -6552758 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 256 7 1324 241 242 45 0 chr15 96944594 96944660 -6550314 - MTE-int LTR MaLR -931 649 581 7 1324 939 125 19 13 chr15 96948701 96948855 -6546119 + RMER6C LTR ERVK 535 689 -1 7 1324 368 297 241 53 chr15 96949890 96950163 -6544811 + MLT1A0 LTR MaLR 10 365 0 7 1324 596 262 61 50 chr15 96950165 96950423 -6544551 + MLT1A0-int LTR MaLR 2 236 -1135 7 1324 776 294 76 30 chr15 96950680 96950982 -6543992 + MLT1A0-int LTR MaLR 1397 1712 -23 7 1324 624 305 118 30 chr15 96950993 96951297 -6543677 + MLT1A0 LTR MaLR 26 356 -9 7 1324 903 225 102 123 chr15 96951722 96952103 -6542871 + RMER4B LTR ERVK 15 387 -198 7 1324 999 258 66 7 chr15 96956225 96956473 -6538501 - ORR1D2 LTR MaLR -80 314 37 7 1324 1755 211 59 31 chr15 96956473 96956962 -6538012 - RLTR16 LTR ERVK -2 503 1 7 1324 999 249 57 4 chr15 96956962 96956998 -6537976 - ORR1D2 LTR MaLR -332 38 2 7 1324 681 237 45 0 chr15 96959216 96959393 -6535581 + RMER15 LTR ERVL 377 561 -14 7 1324 2752 162 39 26 chr15 96961903 96962410 -6532564 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -70 514 1 7 1324 721 289 69 52 chr15 96966766 96967209 -6527765 - RLTR15 LTR ERVK -195 333 1 7 1324 3380 124 138 8 chr15 96967894 96968505 -6526469 - RMER6C LTR ERVK 0 690 1 7 1324 1933 141 73 75 chr15 96968613 96968998 -6525976 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 1 7 1324 2020 156 23 23 chr15 96970379 96970733 -6524241 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 41 7 1324 243 286 12 23 chr15 96978241 96978327 -6516647 + LTR16B2 LTR ERVL 287 371 -91 8 1324 1950 133 59 78 chr15 96978394 96978642 -6516332 + ORR1B2 LTR MaLR 1 248 -119 8 1324 2213 212 32 88 chr15 96978642 96979289 -6515685 - RMER19C LTR ERVK 0 611 1 8 1324 1950 133 59 78 chr15 96979289 96979414 -6515560 + ORR1B2 LTR MaLR 249 367 0 8 1324 1024 265 142 12 chr15 96980803 96981128 -6513846 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 1 8 1324 675 391 67 26 chr15 96984054 96984622 -6510352 - MLT-int LTR MaLR -1140 595 5 8 1324 237 279 16 0 chr15 96987826 96987887 -6507087 - MLT1L LTR MaLR -221 389 328 8 1324 2911 165 23 4 chr15 96990695 96991207 -6503767 + RLTR11A LTR ERVK 1 522 -6 8 1324 332 214 122 37 chr15 96992192 96992299 -6502675 + MTD LTR MaLR 4 119 -300 8 1324 250 302 47 0 chr15 96992316 96992402 -6502572 + MTE2b LTR MaLR 48 137 -242 8 1324 590 264 95 6 chr15 96992496 96992664 -6502310 + MT2A LTR ERVL 346 528 -5 8 1325 239 250 15 59 chr15 96993610 96993678 -6501296 + MLT1A0 LTR MaLR 172 236 -129 8 1325 2449 160 136 17 chr15 96997267 96997789 -6497185 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 584 1 8 1325 776 101 9 0 chr15 97001117 97001226 -6493748 + RMER10A LTR ERVL 1 110 -332 1 1325 1427 226 80 20 chr15 97002247 97002664 -6492310 + RLTR20A LTR ERVK 36 468 -109 3 1325 1427 252 89 35 chr15 97002686 97002769 -6492205 + RLTR20A LTR ERVK 444 544 -7 3 1325 1423 153 135 55 chr15 97003074 97003385 -6491589 + RLTR12B LTR ERVK 1 336 -192 5 1325 1529 246 46 104 chr15 97009850 97010159 -6484815 + RMER5 LTR ERV1 1 267 -267 1 1325 1529 246 46 104 chr15 97010370 97010622 -6484352 + RMER5 LTR ERV1 268 526 -8 1 1325 392 318 99 86 chr15 97012484 97012869 -6482105 + MLT1B LTR MaLR 1 390 0 1 1325 3020 26 6 0 chr15 97015167 97015511 -6479463 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 2 1325 1201 205 140 12 chr15 97016138 97016255 -6478719 - RMER16 LTR ERVK 0 533 414 2 1325 1201 179 100 47 chr15 97016292 97016545 -6478429 - RMER16 LTR ERVK -120 413 1 2 1325 281 271 72 90 chr15 97016766 97017064 -6477910 - MLT1J2 LTR MaLR -41 407 75 2 1325 225 236 62 111 chr15 97019095 97019176 -6475798 + MER54B LTR ERVL 143 219 -574 3 1325 231 227 75 15 chr15 97022624 97022691 -6472283 - ORR1D2 LTR MaLR -98 272 202 3 1325 232 362 9 54 chr15 97023028 97023139 -6471835 + RMER12 LTR ERVK 746 851 -471 3 1325 254 299 189 53 chr15 97025107 97025351 -6469623 + MER110A LTR ERV1 144 420 -48 4 1325 245 286 111 14 chr15 97027049 97027133 -6467841 + LTR85a LTR Gypsy? 573 651 -51 4 1325 1700 205 85 5 chr15 97032383 97032771 -6462203 - MTD LTR MaLR 0 419 1 6 1325 274 259 89 57 chr15 97039060 97039183 -6455791 - MER77 LTR ERVL -417 190 64 7 1325 3369 50 2 2 chr15 97044336 97044734 -6450240 - MTB LTR MaLR 0 400 3 9 1325 362 284 39 189 chr15 97045231 97045299 -6449675 - MLT1C LTR MaLR 0 467 409 9 1325 362 284 39 189 chr15 97045467 97045684 -6449290 - MLT1C LTR MaLR -59 408 225 9 1325 2163 149 117 0 chr15 97046942 97047317 -6447657 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 1 1325 2060 158 136 158 chr15 97047387 97048012 -6446962 + RMER19C LTR ERVK 1 611 0 1 1325 362 349 102 37 chr15 97048798 97049042 -6445932 - MLT1A1 LTR MaLR -55 353 94 1 1325 1591 135 88 20 chr15 97049377 97049672 -6445302 + ORR1B2 LTR MaLR 53 367 0 1 1325 479 287 144 32 chr15 97049870 97050099 -6444875 - ORR1E LTR MaLR -2 377 100 1 1325 479 315 79 57 chr15 97050146 97050240 -6444734 - ORR1E LTR MaLR -260 99 2 1 1325 765 298 106 61 chr15 97050843 97051336 -6443638 + LTR40a LTR ERVL 1 515 -4 1 1325 2888 141 138 43 chr15 97052919 97053549 -6441425 + RMER6C LTR ERVK 1 690 0 1 1325 1716 220 85 5 chr15 97055419 97055807 -6439167 + MTD LTR MaLR 1 419 0 1 1325 354 159 79 0 chr15 97057962 97058025 -6436949 - MER57A-int LTR ERV1 -294 5893 5826 1 1325 2475 62 6 58 chr15 97058813 97059158 -6435816 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1325 1666 157 54 66 chr15 97060890 97061225 -6433749 + ORR1B2 LTR MaLR 1 331 -36 1 1325 3014 128 69 14 chr15 97061226 97061731 -6433243 + RMER19A LTR ERVK 1 533 -204 1 1325 225 208 167 0 chr15 97061698 97061746 -6433228 + RMER19A LTR ERVK 403 458 -153 1 1325 2403 93 12 3 chr15 97062565 97062889 -6432085 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1325 1564 125 152 0 chr15 97063175 97063431 -6431543 - RMER6D LTR ERVK -425 295 1 1 1325 898 136 256 0 chr15 97065993 97066169 -6428805 + RMER19B LTR ERVK 1 221 -681 1 1325 2407 139 123 22 chr15 97066197 97066661 -6428313 + RMER19B LTR ERVK 392 902 0 1 1325 779 212 168 40 chr15 97067560 97067786 -6427188 + MTD LTR MaLR 153 407 -12 1 1325 848 192 73 34 chr15 97068348 97068526 -6426448 + ORR1D1 LTR MaLR 2 186 -188 1 1325 422 238 155 22 chr15 97068637 97068798 -6426176 + ORR1D1 LTR MaLR 205 374 0 1 1325 706 271 228 6 chr15 97069863 97070205 -6424769 + MTD LTR MaLR 1 418 -1 1 1325 307 240 51 20 chr15 97079594 97079692 -6415282 - MLT1A1 LTR MaLR -4 370 270 1 1325 341 252 39 155 chr15 97079865 97080020 -6414954 - MLT1A1 LTR MaLR -271 137 1 1 1325 264 331 71 14 chr15 97080218 97080359 -6414615 + MLT1K LTR MaLR 438 586 -9 1 1325 1117 266 176 9 chr15 97080960 97081267 -6413707 - MT2A LTR ERVL -16 517 137 1 1325 1117 266 176 9 chr15 97081296 97081431 -6413543 - MT2A LTR ERVL -397 136 1 1 1325 377 216 196 9 chr15 97083017 97083129 -6411845 + ORR1E LTR MaLR 11 143 -216 1 1325 287 341 23 23 chr15 97083123 97083252 -6411722 + ORR1E LTR MaLR 246 374 -5 1 1325 587 236 109 60 chr15 97089677 97089925 -6405049 - RMER2 LTR ERV1 0 567 308 1 1325 2316 172 103 14 chr15 97092404 97092889 -6402085 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 1 1325 1920 192 97 15 chr15 97094518 97094930 -6400044 - MT2A LTR ERVL -77 456 11 1 1325 383 187 128 18 chr15 97095150 97095259 -6399715 - MERVL_2A-int LTR ERVL -33 5728 5608 1 1325 430 226 52 7 chr15 97096268 97096408 -6398566 - MLT1A LTR MaLR 0 390 245 1 1325 1018 241 77 98 chr15 97096862 97097239 -6397735 - MTE2a LTR MaLR 0 379 11 1 1325 292 350 0 10 chr15 97097247 97097345 -6397629 - MLT1A LTR MaLR -268 97 1 1 1325 231 262 43 120 chr15 97099529 97099646 -6395328 - LTR86A1 LTR ERVL -399 114 7 1 1325 1672 205 80 31 chr15 97100657 97101044 -6393930 - MTD LTR MaLR 0 419 14 2 1325 403 301 85 81 chr15 97107924 97108195 -6386779 - ORR1E LTR MaLR -5 354 83 2 1325 2131 84 78 3 chr15 97108467 97108800 -6386174 - ORR1A3 LTR MaLR -8 386 1 2 1325 344 311 72 13 chr15 97110822 97110975 -6383999 + ORR1E LTR MaLR 28 189 -170 2 1325 253 304 63 0 chr15 97111032 97111111 -6383863 + ORR1E LTR MaLR 283 366 -13 2 1325 1366 244 60 0 chr15 97113855 97114171 -6380803 - MTE2b LTR MaLR -44 335 1 2 1325 1937 87 134 10 chr15 97117824 97118114 -6376860 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 1 2 1325 1833 223 20 24 chr15 97119868 97119884 -6375090 - MTD LTR MaLR -12 407 394 2 1325 2917 57 29 51 chr15 97119884 97120293 -6374681 - MTB LTR MaLR 0 400 1 2 1325 1833 223 20 24 chr15 97120293 97120685 -6374289 - MTD LTR MaLR -26 393 1 2 1325 2359 65 3 124 chr15 97122561 97122933 -6372041 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1326 325 255 110 20 chr15 97127412 97127512 -6367462 - RMER12 LTR ERVK -471 851 743 2 1326 2443 149 7 26 chr15 97135510 97135938 -6359036 - MTC LTR MaLR 0 421 2 2 1326 831 292 78 38 chr15 97143336 97143706 -6351268 - MER77 LTR ERVL -2 605 221 2 1326 290 295 26 0 chr15 97143803 97143881 -6351093 - MER77 LTR ERVL -506 101 22 2 1326 293 263 30 59 chr15 97144267 97144350 -6350624 - MLT1L LTR MaLR -317 293 214 2 1326 302 298 24 12 chr15 97146957 97147042 -6347932 + LTR40a LTR ERVL 1 86 -433 2 1326 1028 205 259 14 chr15 97148225 97148522 -6346452 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 1 2 1326 540 314 55 38 chr15 97151288 97151523 -6343451 - MTEb LTR MaLR -135 244 6 2 1326 2890 99 12 15 chr15 97156167 97156575 -6338399 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1326 502 309 37 11 chr15 97157621 97157811 -6337163 - RMER5 LTR ERV1 0 534 340 3 1326 274 258 124 0 chr15 97157871 97157968 -6337006 - RMER5 LTR ERV1 -333 201 93 3 1326 397 312 74 53 chr15 97159155 97159399 -6335575 - MER34 LTR ERV1 -3 539 291 3 1326 1886 146 153 52 chr15 97162890 97163295 -6331679 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 3 1326 231 261 193 0 chr15 97163886 97163974 -6331000 + MER21B LTR ERV1 71 175 -688 3 1326 556 175 19 10 chr15 97164098 97164202 -6330772 - MTD LTR MaLR -21 398 294 3 1326 576 152 11 0 chr15 97164205 97164297 -6330677 - MTD LTR MaLR -324 95 3 3 1326 347 362 21 14 chr15 97164302 97164439 -6330535 + MER21B LTR ERV1 342 479 -384 3 1326 2836 56 6 0 chr15 97166477 97166835 -6328139 + MTB LTR MaLR 41 400 0 3 1326 1824 152 37 56 chr15 97168185 97168595 -6326379 - RMER17C LTR ERVK -8 402 1 3 1326 2118 142 192 7 chr15 97169355 97169772 -6325202 - RLTR28 LTR ERVL -30 494 1 3 1326 301 286 88 98 chr15 97169772 97169964 -6325010 - MTEa LTR MaLR -171 208 19 3 1326 838 278 75 109 chr15 97171167 97171542 -6323432 + MTC LTR MaLR 40 401 -20 3 1326 2349 71 55 6 chr15 97172311 97172623 -6322351 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1326 854 249 24 60 chr15 97173365 97173646 -6321328 + MTD LTR MaLR 1 270 -130 3 1326 682 179 108 20 chr15 97175539 97175628 -6319346 - RLTR16 LTR ERVK -1 504 401 3 1326 682 215 55 72 chr15 97175681 97175807 -6319167 - RLTR16 LTR ERVK -105 400 210 3 1326 511 239 39 71 chr15 97176006 97176252 -6318722 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 244 3 1326 689 178 89 35 chr15 97176399 97176568 -6318406 - RLTR16 LTR ERVK -327 178 1 3 1326 477 51 0 0 chr15 97194285 97194344 -6300630 - ORR1A2 LTR MaLR 0 326 268 4 1326 2004 89 4 4 chr15 97194716 97194986 -6299988 - ORR1A2 LTR MaLR -57 270 1 4 1326 2073 201 62 83 chr15 97196632 97196691 -6298283 - RLTR20C LTR ERVK -14 520 445 4 1326 2073 201 62 83 chr15 97196729 97197200 -6297774 - RLTR20C LTR ERVK -90 444 1 4 1326 288 200 15 0 chr15 97200406 97200471 -6294503 + RLTR12A LTR ERVK 500 565 -3 4 1326 2079 164 169 33 chr15 97202862 97203346 -6291628 + RMER4B LTR ERVK 25 574 -11 4 1326 251 209 176 55 chr15 97212271 97212362 -6282612 - MT2B LTR ERVL -361 240 139 4 1326 450 198 7 104 chr15 97212971 97213106 -6281868 - MT2B LTR ERVL -325 276 155 4 1326 327 262 0 0 chr15 97217772 97217833 -6277141 + MT2A LTR ERVL 1 61 -472 4 1326 451 105 0 34 chr15 97217828 97217917 -6277057 + MT2A LTR ERVL 403 488 -45 4 1326 243 158 66 0 chr15 97217953 97218029 -6276945 + MT2A LTR ERVL 453 533 0 4 1326 611 153 13 105 chr15 97218029 97218081 -6276893 + MERVL_2A-int LTR ERVL 1 40 -5721 4 1326 611 153 13 105 chr15 97218227 97218327 -6276647 + MERVL_2A-int LTR ERVL 41 139 -5622 4 1326 867 104 36 15 chr15 97218328 97218465 -6276509 - ORR1A2 LTR MaLR -187 140 1 4 1326 2445 99 16 0 chr15 97219709 97220031 -6274943 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1326 2296 98 6 12 chr15 97222313 97222634 -6272340 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 5 1326 600 182 23 5 chr15 97222691 97222824 -6272150 - MTC LTR MaLR -159 220 77 5 1326 780 143 0 0 chr15 97223194 97223313 -6271661 - MTC LTR MaLR -302 119 1 5 1326 1245 207 38 42 chr15 97224423 97224862 -6270112 - RLTR28 LTR ERVL 0 524 2 5 1326 600 221 38 0 chr15 97226993 97227124 -6267850 - RMER15 LTR ERVL 0 575 440 5 1326 1909 182 66 3 chr15 97227125 97227472 -6267502 + ORR1C1 LTR MaLR 2 370 -8 5 1326 1545 214 102 23 chr15 97227439 97227832 -6267142 - RMER15 LTR ERVL -123 452 29 5 1326 285 300 0 0 chr15 97227907 97227967 -6267007 - RMER15 LTR ERVL -515 60 1 5 1326 3304 51 5 0 chr15 97228012 97228406 -6266568 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 5 1326 3495 131 175 14 chr15 97231326 97231961 -6263013 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 5 1326 1496 269 107 71 chr15 97233011 97233599 -6261375 + RLTR18 LTR ERVK 5 613 -3 5 1326 998 141 57 127 chr15 97236316 97236600 -6258374 - RMER4B LTR ERVK -1 465 248 5 1326 315 141 105 105 chr15 97236594 97236689 -6258285 - RMER4B LTR ERVK -490 95 1 5 1326 2187 77 36 16 chr15 97241462 97241767 -6253207 - ORR1A2 LTR MaLR -16 311 1 5 1326 1556 195 5 168 chr15 97243229 97243653 -6251321 + ORR1D2 LTR MaLR 14 368 -2 5 1326 681 317 73 46 chr15 97243653 97243907 -6251067 - MER34A LTR ERV1 -308 263 3 5 1326 1539 238 57 0 chr15 97247963 97248312 -6246662 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 1 5 1326 607 271 10 62 chr15 97248637 97248830 -6246144 + MTE-int LTR MaLR 645 827 -753 5 1326 1220 281 174 14 chr15 97248851 97249363 -6245611 - MTEa-int LTR MaLR -967 613 20 5 1326 749 224 145 5 chr15 97249363 97249556 -6245418 - MTEa LTR MaLR 0 379 160 5 1326 458 285 101 131 chr15 97249743 97249950 -6245024 - MTD LTR MaLR -15 364 132 5 1326 458 278 24 188 chr15 97250139 97250282 -6244692 - MTD LTR MaLR -288 131 1 5 1326 3036 166 2 8 chr15 97250705 97251197 -6243777 + RLTR19 LTR ERVK 11 499 0 5 1326 1099 208 80 132 chr15 97251254 97251692 -6243282 - MT2A LTR ERVL -48 553 1 5 1326 2528 138 6 131 chr15 97251758 97252268 -6242706 - RLTR41 LTR ERV1 0 446 1 5 1326 717 306 0 16 chr15 97252295 97252478 -6242496 - MTE2b LTR MaLR -199 180 1 5 1326 879 252 105 34 chr15 97253768 97254167 -6240807 + RLTR11B LTR ERVK 7 424 -17 5 1327 580 274 19 25 chr15 97255677 97255847 -6239127 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 170 -275 5 1327 1840 132 83 14 chr15 97256161 97256523 -6238451 + RLTR11A2 LTR ERVK 141 527 0 5 1327 2100 168 8 8 chr15 97258732 97259099 -6235875 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 5 1327 1675 173 67 72 chr15 97260087 97260504 -6234470 + RLTR31A_Mm LTR ERVK 1 415 -169 5 1327 393 331 129 25 chr15 97261135 97261596 -6233378 + MER90 LTR ERV1 30 511 -64 6 1327 393 278 142 126 chr15 97262821 97263138 -6231836 + MER77 LTR ERVL 53 374 -233 6 1327 627 173 4 260 chr15 97263210 97263316 -6231658 - ORR1D1 LTR MaLR -205 169 111 6 1327 1682 171 47 131 chr15 97263316 97263513 -6231461 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 211 6 1327 1682 171 47 131 chr15 97263585 97263831 -6231143 - MTB_Mm LTR MaLR -197 210 1 6 1327 627 173 4 260 chr15 97263831 97263951 -6231023 - ORR1D1 LTR MaLR -264 110 1 6 1327 955 136 13 0 chr15 97263997 97264235 -6230739 + RMER6A LTR ERVK 1 287 -469 6 1327 884 161 7 0 chr15 97264223 97264366 -6230608 + RMER6A LTR ERVK 613 756 0 6 1327 1967 202 138 96 chr15 97266207 97266775 -6228199 + RMER19C LTR ERVK 1 588 -23 6 1327 1967 202 138 96 chr15 97266799 97266816 -6228158 + RMER19C LTR ERVK 589 610 -1 6 1327 1711 222 90 4 chr15 97269126 97269210 -6225764 - MTD LTR MaLR -14 405 285 6 1327 3827 130 157 3 chr15 97269210 97269849 -6225125 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 6 1327 1711 218 96 3 chr15 97269849 97270141 -6224833 - MTD LTR MaLR -87 332 9 6 1327 2415 169 29 2 chr15 97271104 97271514 -6223460 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1327 884 194 142 15 chr15 97271705 97271909 -6223065 - MTEb LTR MaLR -149 230 1 6 1327 2706 41 73 3 chr15 97273334 97273675 -6221299 + RLTR10B2 LTR ERVK 1 365 0 6 1327 324 279 94 75 chr15 97274187 97274297 -6220677 + MER34A LTR ERV1 1 120 -451 6 1327 324 291 89 79 chr15 97274526 97274601 -6220373 + MER34A LTR ERV1 120 185 -357 6 1327 306 304 139 20 chr15 97274718 97274869 -6220105 + MER34A LTR ERV1 403 571 0 6 1327 2606 38 3 6 chr15 97275039 97275368 -6219606 + MT-int LTR MaLR 721 1349 -21 6 1327 338 335 105 28 chr15 97277832 97278013 -6216961 + MLT1H LTR MaLR 113 307 -242 6 1327 3438 28 13 0 chr15 97278197 97278588 -6216386 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 6 1327 267 200 33 0 chr15 97278782 97278842 -6216132 - MTA_Mm LTR MaLR -155 241 180 6 1327 2366 83 3 27 chr15 97284778 97285113 -6209861 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1327 287 127 18 0 chr15 97289698 97289718 -6205256 + RMER19B LTR ERVK 2 21 -881 6 1327 287 173 16 16 chr15 97289752 97289810 -6205164 + RMER19B LTR ERVK 22 77 -660 6 1327 239 315 21 78 chr15 97290299 97290440 -6204534 + MLT1J2 LTR MaLR 316 448 0 6 1327 2565 159 67 30 chr15 97291555 97292048 -6202926 + RLTR11A2 LTR ERVK 17 527 0 6 1327 303 189 105 26 chr15 97292171 97292247 -6202727 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 428 6 1327 2105 107 7 3 chr15 97294377 97294678 -6200296 + ORR1A3 LTR MaLR 3 304 -22 6 1327 581 232 39 62 chr15 97294685 97294922 -6200052 - LTRIS5 LTR ERV1 -8 439 238 6 1327 1901 176 82 64 chr15 97297357 97297795 -6197179 + RLTR41 LTR ERV1 1 446 0 6 1327 509 277 217 18 chr15 97297835 97298052 -6196922 + MER21B LTR ERV1 40 299 -564 6 1327 654 279 120 68 chr15 97298181 97298489 -6196485 + MER21B LTR ERV1 466 789 -74 6 1327 1259 228 64 92 chr15 97301958 97302093 -6192881 - RMER10A LTR ERVL 0 442 335 6 1327 1489 130 185 20 chr15 97302093 97302445 -6192529 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 6 1327 1259 228 64 92 chr15 97302445 97302764 -6192210 - RMER10A LTR ERVL -108 334 1 6 1327 4520 14 0 0 chr15 97303343 97303836 -6191138 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 1327 39266 18 0 0 chr15 97303842 97308161 -6186813 + MERVL-int LTR ERVL 1041 5360 -125 6 1327 376 179 46 35 chr15 97308161 97308248 -6186726 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 6 1327 314 26 0 0 chr15 97308248 97308286 -6186688 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 6 1327 4501 10 0 12 chr15 97308286 97308785 -6186189 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 6 1327 2338 106 39 22 chr15 97309292 97309648 -6185326 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 33 7 1327 3455 41 0 128 chr15 97310462 97310962 -6184012 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 1327 8247 34 0 0 chr15 97310962 97311893 -6183081 - MMERVK10C-int LTR ERVK 0 7581 6651 7 1327 42549 41 0 1 chr15 97311884 97316828 -6178146 - MMERVK10C-int LTR ERVK -1771 5810 870 7 1327 1965 94 155 105 chr15 97316826 97317206 -6177768 - MMERVK10C-int LTR ERVK -7182 399 1 7 1327 3425 46 0 128 chr15 97317206 97317706 -6177268 - RLTR10C LTR ERVK 0 436 1 7 1327 606 211 16 31 chr15 97318842 97318969 -6176005 - RMER20B LTR ERVK -502 125 1 7 1327 1667 219 42 75 chr15 97320416 97320840 -6174134 + MTC LTR MaLR 1 410 -11 7 1327 3520 189 130 26 chr15 97320846 97321806 -6173168 + MTC-int LTR MaLR 86 1254 -4 7 1327 2460 117 45 30 chr15 97321810 97322082 -6172892 + MTC LTR MaLR 1 284 -137 7 1327 2786 75 85 3 chr15 97322082 97322470 -6172504 - RLTR9B2 LTR ERVK 0 420 1 7 1327 2460 117 45 30 chr15 97322470 97322595 -6172379 + MTC LTR MaLR 285 404 -17 7 1327 4497 59 12 14 chr15 97322614 97323179 -6171795 + LTRIS2 LTR ERV1 1 564 0 7 1327 347 381 65 19 chr15 97323491 97323705 -6171269 - MER34A LTR ERV1 -192 379 156 7 1327 2033 144 10 3 chr15 97324709 97325016 -6169958 - RLTR27 LTR ERVK 0 309 1 7 1327 2934 155 22 53 chr15 97325165 97325709 -6169265 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 527 0 7 1327 1037 193 31 0 chr15 97325709 97325901 -6169073 + RLTR33 LTR ERVK 479 676 -2 7 1327 1724 155 63 39 chr15 97326362 97326775 -6168199 - ORR1B2 LTR MaLR 0 378 6 7 1327 1806 190 54 10 chr15 97327877 97328265 -6166709 - MTD LTR MaLR -14 405 1 7 1327 498 294 62 6 chr15 97328316 97328477 -6166497 - MTE2b LTR MaLR -208 171 2 7 1327 763 248 93 23 chr15 97328478 97328693 -6166281 + MLT1D LTR MaLR 17 246 -259 7 1327 552 281 39 6 chr15 97329659 97329838 -6165136 - MER57E1 LTR ERV1 0 372 188 7 1327 2172 166 13 26 chr15 97333261 97333461 -6161513 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 175 7 1327 2162 136 175 53 chr15 97333461 97333936 -6161038 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 7 1327 2172 166 13 26 chr15 97333936 97334118 -6160856 - ORR1C1 LTR MaLR -204 174 1 7 1327 255 290 142 74 chr15 97334718 97334738 -6160236 - MT2B LTR ERVL -262 339 274 7 1327 255 290 142 74 chr15 97334870 97334908 -6160066 - MT2B LTR ERVL -262 273 137 7 1327 471 298 54 33 chr15 97335330 97335514 -6159460 - ORR1E LTR MaLR -171 188 1 7 1327 2043 153 223 108 chr15 97335521 97336135 -6158839 + RMER12 LTR ERVK 533 1217 -105 7 1327 680 176 40 0 chr15 97337037 97337162 -6157812 + ORR1E LTR MaLR 24 153 -206 7 1327 369 293 61 68 chr15 97337306 97337505 -6157469 + ORR1E LTR MaLR 140 358 -21 7 1327 514 177 21 10 chr15 97339302 97339399 -6155575 - MT2A LTR ERVL -350 183 86 7 1327 691 195 31 8 chr15 97339385 97339514 -6155460 - MT2A LTR ERVL -400 133 2 7 1327 3402 168 91 27 chr15 97340660 97341317 -6153657 + RLTR25B LTR ERVK 1 699 -329 7 1327 277 294 251 55 chr15 97341994 97342376 -6152598 + MLT1H2 LTR MaLR 20 476 -13 7 1327 2668 52 25 33 chr15 97342825 97343011 -6151963 + MTB LTR MaLR 43 224 -176 7 1327 2573 64 0 0 chr15 97343011 97343322 -6151652 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 7 1327 2668 52 25 33 chr15 97343322 97343496 -6151478 + MTB LTR MaLR 225 400 0 7 1327 380 349 20 20 chr15 97348169 97348318 -6146656 + MLT1A0 LTR MaLR 1 149 -216 7 1327 361 255 98 0 chr15 97350487 97350589 -6144385 + ORR1E LTR MaLR 256 367 -12 7 1327 3408 296 126 41 chr15 97350594 97351433 -6143541 + ORR1E-int LTR MaLR 1 891 -689 7 1327 3510 25 10 2 chr15 97351433 97351830 -6143144 + MTB LTR MaLR 1 400 0 7 1327 3408 296 126 41 chr15 97351830 97351890 -6143084 + ORR1E-int LTR MaLR 892 946 -634 7 1327 3408 296 126 41 chr15 97352291 97352797 -6142177 + ORR1E-int LTR MaLR 947 1528 -52 7 1327 568 306 76 30 chr15 97352797 97353033 -6141941 + ORR1E LTR MaLR 4 250 -109 7 1327 2451 69 7 5 chr15 97353529 97353853 -6141121 + ORR1A2 LTR MaLR 1 377 -2 7 1327 272 343 81 15 chr15 97354067 97354203 -6140771 - MLT1J LTR MaLR -67 445 301 7 1327 1762 216 24 47 chr15 97354428 97354641 -6140333 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 165 7 1327 1762 216 24 47 chr15 97354716 97354859 -6140115 - ORR1D1 LTR MaLR -210 164 26 7 1327 3250 69 2 2 chr15 97354859 97355266 -6139708 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 7 1327 1762 216 24 47 chr15 97355266 97355291 -6139683 - ORR1D1 LTR MaLR -349 25 1 7 1327 343 263 105 23 chr15 97355404 97355533 -6139441 - MLT1J LTR MaLR -365 184 53 7 1327 2095 122 64 91 chr15 97355658 97355710 -6139264 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 350 7 1327 2095 122 64 91 chr15 97355903 97356255 -6138719 - ORR1B1 LTR MaLR -45 349 1 7 1327 284 302 100 36 chr15 97359386 97359496 -6135478 + ORR1E LTR MaLR 57 173 -186 7 1327 1748 308 77 81 chr15 97359694 97360509 -6134465 + ORR1E-int LTR MaLR 1 812 -768 7 1327 317 292 123 49 chr15 97360488 97360650 -6134324 - RLTR9E LTR ERVK -6 409 236 7 1327 1706 285 122 48 chr15 97361023 97361727 -6133247 + ORR1E-int LTR MaLR 770 1527 -53 7 1327 278 292 174 15 chr15 97361727 97361859 -6133115 + ORR1E LTR MaLR 1 153 -206 7 1327 481 282 205 46 chr15 97369584 97369832 -6125142 + MLT1J2 LTR MaLR 37 333 -115 8 1327 1669 158 139 23 chr15 97369832 97370002 -6124972 + ORR1C2 LTR MaLR 1 167 -217 8 1327 1669 158 139 23 chr15 97370049 97370222 -6124752 + ORR1C2 LTR MaLR 168 383 -1 8 1327 481 282 205 46 chr15 97370222 97370300 -6124674 + MLT1J2 LTR MaLR 334 415 -33 8 1327 305 295 0 31 chr15 97371858 97371956 -6123018 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 312 8 1327 1332 248 104 9 chr15 97373071 97373397 -6121577 - MTEa LTR MaLR -8 371 15 8 1327 993 284 78 31 chr15 97373560 97373775 -6121199 - MTD LTR MaLR -41 378 146 8 1327 2571 147 95 8 chr15 97373775 97374261 -6120713 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 8 1327 993 284 78 31 chr15 97374261 97374404 -6120570 - MTD LTR MaLR -274 145 3 8 1327 664 146 15 24 chr15 97375327 97375467 -6119507 - RLTR1B LTR ERV1 -72 552 355 8 1327 550 337 44 132 chr15 97376856 97377464 -6117510 - MER77 LTR ERVL -9 598 44 8 1327 666 168 51 45 chr15 97380403 97380559 -6114415 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 166 8 1327 2723 108 70 37 chr15 97380559 97381019 -6113955 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 8 165 59209 12 2 5 chr15 97381019 97387514 -6107460 - IAPEz-int LTR ERVK 0 6481 8 8 1328 2708 108 70 37 chr15 97387514 97387974 -6107000 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 8 1328 353 179 94 116 chr15 97387975 97388141 -6106833 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -148 261 35 8 1328 2073 174 118 4 chr15 97389571 97390027 -6104947 + RLTR28 LTR ERVL 3 510 -14 8 1328 3994 99 50 7 chr15 97390724 97391284 -6103690 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 1 8 1328 341 292 147 59 chr15 97392860 97393064 -6101910 + RLTR14 LTR ERV1 161 382 0 8 1328 4133 111 39 55 chr15 97393452 97394215 -6100759 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 8 1328 281 273 104 71 chr15 97394436 97394585 -6100389 - MLT1A1 LTR MaLR -2 406 207 8 1328 1722 215 80 6 chr15 97399092 97399473 -6095501 + MTD LTR MaLR 1 399 -20 8 1328 274 287 41 57 chr15 97404030 97404152 -6090822 - MLT1K LTR MaLR -22 573 454 8 1328 442 234 6 99 chr15 97404416 97404577 -6090397 + MTEb LTR MaLR 1 146 -233 8 1328 225 281 40 176 chr15 97405552 97405751 -6089223 + ORR1E LTR MaLR 26 197 -162 8 1328 1919 187 39 0 chr15 97409947 97410311 -6084663 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 1 8 1328 517 121 9 108 chr15 97410977 97411088 -6083886 - RLTR9A LTR ERVK -268 100 1 8 1328 1401 188 76 73 chr15 97411517 97411678 -6083296 + MTD LTR MaLR 41 203 -216 8 1328 1401 188 76 73 chr15 97411854 97412043 -6082931 + MTD LTR MaLR 204 397 -22 8 1328 268 200 149 50 chr15 97412086 97412106 -6082868 + ORR1E LTR MaLR 341 356 -3 8 1328 345 225 0 14 chr15 97412106 97412170 -6082804 - LTR33B LTR ERVL -401 102 40 8 1328 1751 180 120 152 chr15 97415331 97415889 -6079085 + RMER19C LTR ERVK 72 611 0 8 1328 235 241 62 25 chr15 97418491 97418572 -6076402 + RLTR14 LTR ERV1 299 382 0 9 1328 1055 147 35 148 chr15 97423751 97424007 -6070967 + RMER10B LTR ERVL 172 398 0 9 1328 1907 128 61 23 chr15 97425542 97425934 -6069040 - RMER17C LTR ERVK -3 407 1 9 1328 1678 208 14 27 chr15 97426301 97426545 -6068429 - RMER5 LTR ERV1 -7 527 287 9 1328 3271 109 43 95 chr15 97426545 97427143 -6067831 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 9 1328 1678 208 14 27 chr15 97427143 97427264 -6067710 - RMER5 LTR ERV1 -248 286 167 9 1328 1082 193 9 42 chr15 97427260 97427476 -6067498 - RMER5 LTR ERV1 -313 221 13 9 1328 1490 157 105 56 chr15 97427751 97427772 -6067202 - RMER17C LTR ERVK 0 410 390 9 1328 1490 157 105 56 chr15 97427818 97428187 -6066787 - RMER17C LTR ERVK -21 389 3 9 1328 2173 165 21 24 chr15 97429538 97429959 -6065015 - RMER10A LTR ERVL -22 420 1 9 1328 1204 256 70 31 chr15 97431037 97431364 -6063610 - MTD LTR MaLR -47 372 33 9 1328 1521 214 34 6 chr15 97431510 97431830 -6063144 + MT2A LTR ERVL 205 533 0 9 1328 2844 235 28 59 chr15 97431835 97432266 -6062708 + MTC-int LTR MaLR 21 444 -814 9 1328 2844 235 28 59 chr15 97432403 97432716 -6062258 + MTC-int LTR MaLR 445 741 -517 9 1328 263 282 70 12 chr15 97432803 97432889 -6062085 + MLT1A1 LTR MaLR 318 408 0 9 1328 2528 62 6 58 chr15 97433128 97433473 -6061501 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 9 1328 234 326 120 30 chr15 97433878 97434011 -6060963 - MLT1B LTR MaLR -72 477 333 9 1328 689 250 109 38 chr15 97435504 97435770 -6059204 - MLT1B LTR MaLR -29 361 77 9 1328 443 302 119 10 chr15 97439227 97439421 -6055553 - MLT1H LTR MaLR 0 549 335 9 1328 2553 38 47 0 chr15 97439362 97439680 -6055294 + IAPEY_LTR LTR ERVK 53 385 0 9 1328 3012 53 47 13 chr15 97440884 97441268 -6053706 - MTB LTR MaLR -3 397 1 9 1328 298 309 45 9 chr15 97443885 97443996 -6050978 - MLT1A1 LTR MaLR -266 142 28 9 1328 1623 153 75 31 chr15 97444249 97444633 -6050341 + RMER17C LTR ERVK 1 401 -9 9 1328 1540 125 350 30 chr15 97445529 97445866 -6049108 - RLTR41 LTR ERV1 -1 445 1 9 1328 601 276 135 10 chr15 97445997 97446246 -6048728 - MuRRS4-int LTR ERV1 -230 4833 4594 9 1328 601 283 88 41 chr15 97446387 97446567 -6048407 - MuRRS4-int LTR ERV1 -470 4593 4545 9 1328 337 320 16 8 chr15 97446754 97446880 -6048094 - MMERGLN-int LTR ERV1 -2016 5540 5414 9 1328 1821 240 70 18 chr15 97447019 97447477 -6047497 - MuRRS4-int LTR ERV1 -1049 4014 3533 9 1328 620 278 65 80 chr15 97447665 97448079 -6046895 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -3207 4394 3987 9 1328 252 357 14 14 chr15 97448483 97448625 -6046349 - RLTR4_MM-int LTR ERV1 -4212 3344 3203 9 1328 316 197 0 15 chr15 97448635 97448702 -6046272 - RLTR14-int LTR ERV1 -3810 1507 1442 9 1328 370 319 50 13 chr15 97448799 97448958 -6046016 - RLTR6-int LTR ERV1 -6069 1709 1545 9 1328 274 284 31 31 chr15 97449597 97449695 -6045279 - RLTR6-int LTR ERV1 -6856 700 603 9 1328 348 111 238 0 chr15 97450162 97450225 -6044749 + RLTR23 LTR ERV1 20 97 -333 9 1328 898 241 136 16 chr15 97454434 97454691 -6040283 + MTD LTR MaLR 132 419 0 9 1328 625 244 53 0 chr15 97455822 97456003 -6038971 + ORR1D2 LTR MaLR 1 207 -152 9 1328 3174 45 24 0 chr15 97456027 97456403 -6038571 + IAPEY_LTR LTR ERVK 1 385 0 9 1328 59505 65 5 6 chr15 97456403 97463926 -6031048 + IAPEy-int LTR ERVK 1 7513 0 9 1328 2643 49 12 3 chr15 97463926 97464254 -6030720 + IAPEY_LTR LTR ERVK 55 385 0 9 1328 613 230 187 13 chr15 97466924 97467195 -6027779 + MTE2b LTR MaLR 1 369 -10 9 1328 1802 128 11 4 chr15 97468280 97468554 -6026420 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 92 9 1328 2229 117 63 17 chr15 97470209 97470556 -6024418 + ORR1B1 LTR MaLR 24 386 -8 9 1328 230 267 99 55 chr15 97473525 97473616 -6021358 - MLT1A1 LTR MaLR 0 408 314 1 1328 738 260 45 5 chr15 97474159 97474360 -6020614 - RMER15-int LTR ERVL -3326 1673 1465 1 1328 2998 152 83 8 chr15 97474536 97475054 -6019920 - RMER15 LTR ERVL -18 557 1 1 1328 243 310 103 0 chr15 97475055 97475142 -6019832 - MLT1A1-int LTR MaLR -1271 100 5 1 1328 1704 166 92 12 chr15 97475193 97475529 -6019445 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 12 1 1328 2303 140 26 16 chr15 97478233 97478611 -6016363 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 1 1328 287 290 84 0 chr15 97479386 97479493 -6015481 - MamGypLTR1c LTR Gypsy -3 800 685 1 1328 463 229 49 67 chr15 97479692 97479926 -6015048 + LTRIS5 LTR ERV1 238 439 -8 1 1328 1537 198 159 116 chr15 97482248 97482283 -6012691 - MT2A LTR ERVL -2 531 486 1 1328 1537 198 159 116 chr15 97482329 97482709 -6012265 - MT2A LTR ERVL -48 485 75 1 1328 1537 198 159 116 chr15 97482782 97482798 -6012176 - MT2A LTR ERVL -459 74 70 1 1328 1537 198 159 116 chr15 97482883 97482958 -6012016 - MT2A LTR ERVL -464 69 2 1 1328 340 156 4 23 chr15 97485823 97485904 -6009070 - RMER19B LTR ERVK 0 902 847 1 1328 1708 178 95 55 chr15 97489415 97489787 -6005187 - MTD LTR MaLR -15 404 20 1 1328 1708 176 98 57 chr15 97489826 97489852 -6005122 - MTD LTR MaLR -400 19 3 1 1328 3384 62 0 2 chr15 97491907 97492315 -6002659 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1328 368 217 46 77 chr15 97493607 97493737 -6001237 - MT2B LTR ERVL -323 278 153 1 1328 422 260 71 24 chr15 97494193 97494319 -6000655 - MLT1A0 LTR MaLR -86 279 148 1 1328 615 253 220 34 chr15 97494337 97494632 -6000342 - ORR1E LTR MaLR -9 350 1 1 1328 458 191 24 0 chr15 97497274 97497358 -5997616 + MT2A LTR ERVL 3 88 -445 1 1328 1058 196 174 0 chr15 97497573 97497794 -5997180 + MT2A LTR ERVL 74 333 -200 1 1328 2018 99 59 7 chr15 97498860 97499166 -5995808 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1328 229 331 170 52 chr15 97499718 97499871 -5995103 - MLT1B LTR MaLR -215 175 5 1 1328 293 203 125 7 chr15 97500022 97500112 -5994862 - MTC-int LTR MaLR -1003 95 3 1 1328 2158 159 99 3 chr15 97500112 97500496 -5994478 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1328 726 234 40 23 chr15 97501118 97501293 -5993681 - MTE2a LTR MaLR -200 179 2 2 1328 230 257 26 39 chr15 97503173 97503250 -5991724 + RLTR20B3 LTR ERVK 56 131 -446 6 1328 2060 114 38 3 chr15 97504601 97504917 -5990057 + ORR1A4 LTR MaLR 1 327 -2 9 1328 2218 114 15 9 chr15 97507833 97508160 -5986814 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 1 1328 1273 240 60 9 chr15 97515973 97516309 -5978665 - MTD LTR MaLR 0 419 67 2 1329 3619 69 28 0 chr15 97520130 97520592 -5974382 + MT2C_Mm LTR ERVL 1 475 0 4 1329 238 294 110 58 chr15 97524042 97524197 -5970777 - LTR79 LTR ERVL -362 165 3 5 1329 226 273 108 29 chr15 97525185 97525287 -5969687 + RLTR25B LTR ERVK 403 512 -516 5 1329 854 215 50 11 chr15 97531006 97531185 -5963789 + MTD LTR MaLR 1 186 -233 7 1329 230 246 53 0 chr15 97531181 97531238 -5963736 + MTD LTR MaLR 360 419 0 7 1329 280 309 69 128 chr15 97539337 97539426 -5955548 - MLT1J LTR MaLR -76 436 350 1 1329 280 309 69 128 chr15 97539606 97539720 -5955254 - MLT1J LTR MaLR -163 349 245 1 1329 1231 246 160 16 chr15 97546323 97546551 -5948423 + MTD LTR MaLR 5 275 -144 1 1329 1231 246 160 16 chr15 97546584 97546718 -5948256 + MTD LTR MaLR 276 419 0 1 1329 242 316 103 17 chr15 97547466 97547582 -5947392 - MLT1A1 LTR MaLR -14 394 269 1 1329 2129 105 9 61 chr15 97553358 97553702 -5941272 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1329 1779 176 171 8 chr15 97562480 97562836 -5932138 + MTD LTR MaLR 5 418 -1 1 1329 3319 37 9 31 chr15 97564463 97564883 -5930091 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 1329 3316 95 30 34 chr15 97564884 97565693 -5929281 + IAPEz-int LTR ERVK 9 662 -5819 1 1329 2142 72 0 0 chr15 97565693 97565971 -5929003 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1636 -4845 1 1329 5535 61 13 20 chr15 97565970 97566719 -5928255 + IAPEz-int LTR ERVK 5736 6479 -2 1 1329 3321 37 9 31 chr15 97566721 97567141 -5927833 + IAPLTR2a LTR ERVK 1 411 0 1 1329 2491 92 6 0 chr15 97567758 97568083 -5926891 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1329 1389 211 110 24 chr15 97582994 97583274 -5911700 + MTD LTR MaLR 5 322 -97 1 1329 1389 211 110 24 chr15 97583445 97583536 -5911438 + MTD LTR MaLR 323 408 -11 1 1329 2075 154 311 22 chr15 97599811 97600489 -5894485 - RMER19B LTR ERVK -27 875 1 1 1329 894 235 150 59 chr15 97600693 97601032 -5893942 + MTEa LTR MaLR 1 370 -9 1 1329 2644 151 44 113 chr15 97607781 97608349 -5886625 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 2 1329 2326 123 67 19 chr15 97609961 97610335 -5884639 - ORR1B1 LTR MaLR -2 392 1 2 1329 313 362 65 35 chr15 97612870 97613099 -5881875 + MLT1D LTR MaLR 267 502 -3 2 1329 253 161 15 75 chr15 97616825 97616892 -5878082 + RLTR25B LTR ERVK 429 491 -537 2 1329 1396 266 50 63 chr15 97633493 97633729 -5861245 + RLTR20B3 LTR ERVK 1 241 -336 2 1329 1396 277 51 74 chr15 97633909 97634254 -5860720 + RLTR20B3 LTR ERVK 212 534 0 2 1329 3375 33 8 2 chr15 97634812 97635206 -5859768 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 2 1329 1090 237 53 117 chr15 97646619 97646723 -5848251 + MTD LTR MaLR 10 116 -303 2 1329 1090 237 53 117 chr15 97646747 97647077 -5847897 + MTD LTR MaLR 117 416 -3 2 1330 2773 153 112 6 chr15 97676548 97677068 -5817906 + RMER15 LTR ERVL 1 575 0 3 1330 452 312 70 5 chr15 97681327 97681514 -5813460 + LTR16A LTR ERVL 147 345 -106 3 1330 1382 160 70 103 chr15 97690418 97690815 -5804159 + ORR1C2 LTR MaLR 1 384 0 3 1330 229 295 10 83 chr15 97703521 97703617 -5791357 - MT2B LTR ERVL -344 257 169 3 1330 1437 164 46 114 chr15 97742810 97743222 -5751752 - RMER10A LTR ERVL -17 425 42 4 1330 1694 176 59 63 chr15 97745242 97745686 -5749288 - RMER10A LTR ERVL 0 442 1 4 1330 1458 207 172 8 chr15 97753100 97753460 -5741514 + MTD LTR MaLR 1 419 0 4 1330 236 350 68 0 chr15 97754434 97754537 -5740437 - LTR16D LTR ERVL -325 326 217 4 1330 344 280 189 65 chr15 97755752 97756107 -5738867 - RMER10A LTR ERVL -25 417 19 4 1330 232 304 126 10 chr15 97759932 97760035 -5734939 + MLT1E2 LTR MaLR 156 270 -357 4 1330 451 287 124 75 chr15 97760055 97760281 -5734693 + MLT1E2 LTR MaLR 322 558 -69 4 1330 2295 135 25 122 chr15 97763956 97764472 -5730502 + RMER4A LTR ERVK 1 466 0 4 1330 3368 23 2 0 chr15 97768041 97768436 -5726538 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1330 2067 175 81 71 chr15 97770513 97771035 -5723939 + RLTR11A LTR ERVK 1 527 -1 4 1330 232 362 64 75 chr15 97771236 97771502 -5723472 - LTR85c LTR Gypsy? -157 666 404 4 1330 1457 187 72 72 chr15 97771838 97772014 -5722960 + ORR1C1 LTR MaLR 8 171 -207 4 1330 1457 187 72 72 chr15 97772046 97772232 -5722742 + ORR1C1 LTR MaLR 172 369 -9 4 1330 1372 201 101 0 chr15 97772286 97772584 -5722390 - MT2A LTR ERVL -65 468 141 4 1330 1770 151 2 146 chr15 97772603 97772844 -5722130 + RMER19B LTR ERVK 1 242 -660 4 1330 1770 151 2 146 chr15 97772870 97773025 -5721949 + RMER19B LTR ERVK 243 340 -562 4 1330 748 248 200 21 chr15 97773092 97773372 -5721602 - MTEa LTR MaLR -49 330 1 4 1331 610 323 54 44 chr15 97787294 97787589 -5707385 - BGLII_B LTR ERVK -8 433 136 5 1331 1172 190 125 68 chr15 97787598 97787751 -5707223 + RLTR11A LTR ERVK 7 187 -341 5 1331 3501 33 2 0 chr15 97787751 97788146 -5706828 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1331 1172 190 125 68 chr15 97788146 97788343 -5706631 + RLTR11A LTR ERVK 188 377 -151 5 1331 692 208 25 12 chr15 97788753 97788914 -5706060 + RLTR11A LTR ERVK 366 528 0 5 1331 497 219 78 35 chr15 97788915 97789057 -5705917 - RLTR11A2 LTR ERVK -379 148 1 5 1331 228 313 133 20 chr15 97793518 97793668 -5701306 - MLT1J LTR MaLR -144 368 202 5 1331 1186 270 31 19 chr15 97795656 97795973 -5699001 - MTE2a LTR MaLR 0 379 59 5 1331 3384 45 8 0 chr15 97801996 97802393 -5692581 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1331 233 240 12 74 chr15 97805713 97805794 -5689180 + MTEb LTR MaLR 288 363 -16 5 1331 299 226 109 34 chr15 97841168 97841287 -5653687 + MLT1A1 LTR MaLR 281 408 0 5 1331 2037 134 0 60 chr15 97846445 97846779 -5648195 + ORR1A2 LTR MaLR 6 319 -8 5 1331 1010 139 39 34 chr15 97848469 97848648 -5646326 + ORR1B2 LTR MaLR 3 182 -185 5 1331 2231 162 86 25 chr15 97848644 97849087 -5645887 + ORR1B2-int LTR MaLR 153 622 -887 5 1331 235 301 130 50 chr15 97870078 97870239 -5624735 - MLT-int LTR MaLR -830 905 732 6 1331 2987 120 14 119 chr15 97890843 97891570 -5603404 + RMER6A LTR ERVK 63 756 0 6 1331 1428 124 60 8 chr15 97906553 97906821 -5588153 + RMER4A LTR ERVK 1 282 -184 6 1332 3105 184 85 10 chr15 97913711 97914500 -5580474 + ORR1A3-int LTR MaLR 153 1000 -963 6 1332 717 103 70 23 chr15 97914779 97914908 -5580066 - ORR1A2-int LTR MaLR -1828 135 1 6 1332 2660 65 9 0 chr15 97914908 97915232 -5579742 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 6 1332 2066 83 9 62 chr15 97918360 97918696 -5576278 - ORR1A2 LTR MaLR -9 318 1 6 1332 7259 97 24 7 chr15 97918696 97919859 -5575115 - ORR1A2-int LTR MaLR 0 1963 781 6 1332 419 165 58 12 chr15 97919814 97919900 -5575074 - MT2B LTR ERVL -344 257 168 6 1332 273 309 62 61 chr15 97926654 97926982 -5567992 - ORR1E LTR MaLR -9 370 56 7 1332 254 292 43 70 chr15 97928854 97929112 -5565862 - RLTR15 LTR ERVK -5 354 104 7 1332 318 186 11 44 chr15 97929147 97929237 -5565737 - RLTR15 LTR ERVK -238 121 35 7 1332 3833 142 26 51 chr15 97932139 97932903 -5562071 + RMER6A LTR ERVK 1 745 -11 7 1332 1458 218 85 14 chr15 97933380 97933743 -5561231 - MTD LTR MaLR -2 417 29 7 1332 1732 171 32 25 chr15 97936187 97936698 -5558276 - RLTR20D LTR ERVK 0 568 1 7 1332 227 247 49 88 chr15 97958011 97958113 -5536861 - MLT-int LTR MaLR -938 797 700 7 1332 2217 146 21 34 chr15 97960401 97960784 -5534190 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 7 7 1332 1405 194 148 45 chr15 97967386 97967743 -5527231 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1332 6076 203 55 144 chr15 97967743 97968831 -5526143 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 935 7 1332 6076 203 55 144 chr15 97968973 97970040 -5524934 - ORR1B1-int LTR MaLR -1029 934 1 7 1332 2025 153 97 8 chr15 97970040 97970402 -5524572 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 7 1332 4171 67 44 9 chr15 97976858 97977399 -5517575 + LTRIS2 LTR ERV1 5 564 0 7 1332 246 329 0 26 chr15 97978846 97978924 -5516050 + LTR78 LTR ERV1 737 812 -492 7 1332 225 343 77 123 chr15 97979049 97979375 -5515599 + LTR78 LTR ERV1 980 1290 -14 7 1332 423 143 114 25 chr15 97980636 97980715 -5514259 + MTC LTR MaLR 35 120 -301 7 1332 891 268 113 38 chr15 97981306 97981483 -5513491 + RLTR16 LTR ERVK 1 176 -329 7 1332 891 268 113 38 chr15 97981531 97981732 -5513242 + RLTR16 LTR ERVK 177 411 -94 7 1332 891 268 113 38 chr15 97981775 97981865 -5513109 + RLTR16 LTR ERVK 412 503 -2 7 1332 579 227 198 11 chr15 97983148 97983335 -5511639 + MTC LTR MaLR 199 420 -1 7 1332 1688 169 106 80 chr15 97984674 97985099 -5509875 - RMER6C LTR ERVK -243 447 12 7 1332 2046 98 115 142 chr15 97986435 97986877 -5508097 + RLTR23 LTR ERV1 1 430 0 7 1332 1431 261 69 68 chr15 97987604 97988249 -5506725 - RLTR18B LTR ERVK -25 591 1 8 1332 794 171 81 27 chr15 97989020 97989262 -5505712 - RMER4B LTR ERVK 0 585 279 8 1332 365 235 71 0 chr15 97990986 97991071 -5503903 + MTC LTR MaLR 331 421 0 8 1332 290 241 79 22 chr15 97993614 97993703 -5501271 + MT2B2 LTR ERVL 161 254 -330 8 1332 1012 228 167 40 chr15 97993911 97994282 -5500692 - MTD-int LTR MaLR -811 447 30 8 1332 955 259 71 117 chr15 97994343 97994572 -5500402 - MTD LTR MaLR -2 417 210 8 1332 955 259 71 117 chr15 97994718 97994778 -5500196 - MTD LTR MaLR -210 209 152 8 1332 2441 76 38 0 chr15 97994778 97995093 -5499881 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 8 1332 955 259 71 117 chr15 97995093 97995239 -5499735 - MTD LTR MaLR -268 151 1 8 1332 599 257 60 40 chr15 98003385 98003636 -5491338 - RMER15 LTR ERVL -21 554 299 6 1332 355 118 294 0 chr15 98007075 98007143 -5487831 + RLTR25A LTR ERVK 1016 1103 0 1 1332 664 251 74 92 chr15 98013764 98014058 -5480916 + MER67C LTR ERV1 16 328 -383 2 1332 664 273 120 38 chr15 98014243 98014316 -5480658 + MER67C LTR ERV1 329 409 -302 2 1332 452 336 63 97 chr15 98016400 98016784 -5478190 - MTEa LTR MaLR -4 375 23 3 1332 237 313 96 0 chr15 98017126 98017241 -5477733 - IAPLTR1a_Mm LTR ERVK -28 309 184 3 1332 3691 92 98 47 chr15 98018320 98018892 -5476082 + MT2B LTR ERVL 1 601 0 3 1332 3184 61 36 0 chr15 98027319 98027712 -5467262 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 5 1332 499 156 121 45 chr15 98029467 98029653 -5465321 - RMER4A LTR ERVK 0 466 240 6 1332 2398 147 33 2 chr15 98029658 98030055 -5464919 - RMER4A LTR ERVK 0 466 33 6 1332 1472 159 123 7 chr15 98030115 98030145 -5464829 - RMER4A LTR ERVK -553 32 2 6 1332 804 136 2 2 chr15 98033817 98033968 -5461006 + MTB_Mm LTR MaLR 1 162 -259 7 1332 1279 233 53 13 chr15 98035227 98035527 -5459447 + MTD LTR MaLR 108 419 0 7 1332 1384 265 104 96 chr15 98036769 98037270 -5457704 + RLTR18B LTR ERVK 3 507 -5 7 1332 1915 107 20 94 chr15 98037348 98037700 -5457274 - ORR1A4 LTR MaLR -3 326 1 7 1332 600 208 184 0 chr15 98040931 98041160 -5453814 - MT2A LTR ERVL -73 460 190 8 166 1830 130 122 79 chr15 98041607 98042049 -5452925 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 8 1333 2116 200 54 60 chr15 98042255 98042770 -5452204 + RLTR18B LTR ERVK 1 512 0 8 1333 1508 181 30 51 chr15 98044259 98044591 -5450383 + RMER5 LTR ERV1 17 341 -193 8 1333 2196 121 29 15 chr15 98044598 98044941 -5450033 - MTC LTR MaLR -18 403 56 8 1333 277 114 45 0 chr15 98046975 98047019 -5447955 + RLTR6-int LTR ERV1 5002 5047 -2731 9 1333 1850 131 35 77 chr15 98052163 98052503 -5442471 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 1 1333 1631 173 88 70 chr15 98052928 98053314 -5441660 + MTD LTR MaLR 13 405 -14 1 1333 1054 192 102 4 chr15 98056564 98056789 -5438185 + ORR1B2 LTR MaLR 118 364 -3 1 1333 814 304 183 15 chr15 98058134 98058479 -5436495 - MTD LTR MaLR -16 403 1 1 1333 457 129 116 21 chr15 98059737 98059832 -5435142 - MTD LTR MaLR -315 104 1 1 1333 2509 143 34 2 chr15 98069239 98069647 -5425327 - MTC LTR MaLR 0 421 1 1 1333 6056 155 27 31 chr15 98070565 98070741 -5424233 - MTC-int LTR MaLR -44 1214 1052 1 1333 6056 155 27 31 chr15 98070774 98070812 -5424162 - MTC-int LTR MaLR -207 1051 1014 1 1333 6056 155 27 31 chr15 98070858 98071861 -5423113 - MTC-int LTR MaLR -245 1013 1 1 1333 2190 154 3 3 chr15 98071884 98072249 -5422725 - MTC LTR MaLR -52 369 5 1 1333 3199 49 15 5 chr15 98072721 98073113 -5421861 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1333 9168 45 4 0 chr15 98073113 98074207 -5420767 - MTA_Mm-int LTR MaLR 0 1098 1 1 1333 3474 15 8 5 chr15 98074207 98074602 -5420372 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1333 1331 189 143 6 chr15 98076757 98077071 -5417903 + ORR1D1 LTR MaLR 17 373 -1 1 1333 3993 82 7 70 chr15 98079551 98080154 -5414820 - RMER2 LTR ERV1 -2 565 1 1 1333 802 222 88 1 chr15 98082797 98083042 -5411932 + ORR1D2 LTR MaLR 85 365 -9 1 1333 258 159 28 113 chr15 98083254 98083325 -5411649 + RMER15 LTR ERVL 4 68 -507 1 1333 298 172 83 83 chr15 98083349 98083457 -5411517 + RMER15 LTR ERVL 22 129 -446 1 1333 1721 192 59 8 chr15 98083457 98083814 -5411160 + ORR1C1 LTR MaLR 3 377 -1 1 1333 4186 132 80 10 chr15 98084904 98085213 -5409761 + RMER6A LTR ERVK 3 358 -398 1 1333 4186 132 80 10 chr15 98085251 98085642 -5409332 + RMER6A LTR ERVK 359 752 -4 1 1333 3091 61 193 2 chr15 98088414 98088844 -5406130 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 1 1333 1001 266 100 6 chr15 98090464 98090793 -5404181 + MTE2a LTR MaLR 1 360 -19 1 1333 783 93 8 0 chr15 98091863 98091981 -5402993 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 209 1 1333 401 310 82 27 chr15 98092312 98092531 -5402443 + MER90 LTR ERV1 147 377 -198 1 1333 2393 93 19 0 chr15 98093137 98093458 -5401516 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1333 3848 150 45 46 chr15 98094678 98095524 -5399450 + RLTR22_Mur LTR ERVK 17 861 -987 1 1333 1068 171 30 89 chr15 98095805 98096075 -5398899 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1590 1843 -5 1 1333 334 227 0 0 chr15 98098621 98098696 -5396278 + RLTR24 LTR ERV1 1 75 -454 2 1333 477 260 116 32 chr15 98099391 98099546 -5395428 + RLTR19-int LTR ERVK 1142 1309 -4213 2 1333 331 216 91 0 chr15 98099647 98099735 -5395239 + RLTR14-int LTR ERV1 1284 1379 -3938 2 1333 1138 268 99 20 chr15 98099792 98100182 -5394792 + MTC-int LTR MaLR 469 990 -268 2 1333 539 250 7 35 chr15 98100182 98100323 -5394651 + RLTR14 LTR ERV1 1 137 -245 2 1333 392 280 53 88 chr15 98100351 98100692 -5394282 + RLTR15 LTR ERVK 1 329 -30 2 1333 1371 216 91 202 chr15 98100801 98101016 -5393958 + RLTR19-int LTR ERVK 2183 2330 -3807 2 1333 1371 216 91 202 chr15 98101543 98102273 -5392701 + RLTR19-int LTR ERVK 2331 3023 -3114 2 1333 823 243 24 92 chr15 98102708 98103002 -5391972 + RLTR19-int LTR ERVK 3774 4047 -2503 2 1333 2160 156 20 70 chr15 98104565 98104757 -5390217 + MTC LTR MaLR 2 197 -224 2 1333 3208 46 15 15 chr15 98104757 98105157 -5389817 + MTB LTR MaLR 1 400 0 2 1333 2160 156 20 70 chr15 98105157 98105405 -5389569 + MTC LTR MaLR 198 420 -1 2 1333 6614 144 56 17 chr15 98105405 98106612 -5388362 + MTC-int LTR MaLR 2 1256 -2 2 1333 2288 99 15 9 chr15 98108557 98108884 -5386090 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1333 228 149 64 0 chr15 98114316 98114363 -5380611 - MT2B LTR ERVL -233 368 319 2 1333 3099 101 2 19 chr15 98132875 98133387 -5361587 - RLTR1C LTR ERV1 0 605 1 2 1333 291 244 45 68 chr15 98133581 98133713 -5361261 + RLTR13D3 LTR ERVK 944 1072 -42 2 1333 7796 185 42 62 chr15 98135824 98138040 -5356934 + RMER3D-int LTR ERVK 163 2814 -28 2 1333 7796 180 41 58 chr15 98138064 98138081 -5356893 + RMER3D-int LTR ERVK 2815 2836 -6 2 1333 2488 165 21 21 chr15 98138088 98138608 -5356366 + RLTR31_Mm LTR ERVK 3 522 -39 2 1333 2246 132 2 79 chr15 98138929 98139358 -5355616 + RMER2 LTR ERV1 172 567 0 2 1333 614 303 102 100 chr15 98140499 98140910 -5354064 + MER67D LTR ERV1 96 507 -7 2 1333 2135 140 14 36 chr15 98152140 98152502 -5342472 - IAPEY2_LTR LTR ERVK -3 354 1 2 1333 21004 73 3 6 chr15 98152502 98155220 -5339754 - IAPEy-int LTR ERVK 0 7513 4804 2 1333 3538 158 34 2 chr15 98155220 98155837 -5339137 - IAPEY3-int LTR ERVK -6630 1050 414 2 1333 2293 125 0 9 chr15 98156273 98156619 -5338355 - IAPEY3-int LTR ERVK -7081 432 90 2 1333 2907 99 74 5 chr15 98159532 98159976 -5334998 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 2 1333 505 151 94 0 chr15 98162548 98162654 -5332320 - MTD LTR MaLR -12 407 292 2 1333 290 296 66 60 chr15 98162717 98162868 -5332106 + ORR1E LTR MaLR 1 152 -207 2 1333 1500 244 79 100 chr15 98163399 98163958 -5331016 - RMER15 LTR ERVL 0 575 29 2 1333 1391 180 24 108 chr15 98168492 98168872 -5326102 - RMER19B LTR ERVK -247 655 308 2 1333 565 333 87 46 chr15 98169236 98169673 -5325301 - MLT1E2 LTR MaLR -58 569 115 2 1334 370 321 28 14 chr15 98173832 98173974 -5321000 + MLT1B LTR MaLR 210 353 -37 2 1334 446 272 162 103 chr15 98178501 98178821 -5316153 + ORR1E LTR MaLR 1 339 -20 2 1334 1764 120 14 10 chr15 98178927 98179221 -5315753 + RMER4B LTR ERVK 1 295 -290 2 1334 425 239 88 0 chr15 98179379 98179492 -5315482 + RMER4B LTR ERVK 463 585 0 2 1334 1257 172 232 10 chr15 98179595 98179901 -5315073 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 3 1334 1191 236 168 26 chr15 98180351 98180757 -5314217 + RMER15 LTR ERVL 27 491 -84 3 1334 1891 112 89 6 chr15 98180757 98181072 -5313902 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 54 3 1334 336 227 79 11 chr15 98181104 98181193 -5313781 + RMER15 LTR ERVL 481 575 0 3 1334 2403 93 6 0 chr15 98182388 98182709 -5312265 + ORR1A2 LTR MaLR 5 327 0 3 1334 1132 298 14 107 chr15 98183538 98183915 -5311059 + MTE-int LTR MaLR 1 336 -1244 3 1334 2006 101 104 10 chr15 98183915 98184214 -5310760 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 3 1334 1132 298 14 107 chr15 98184214 98184321 -5310653 + MTE-int LTR MaLR 337 440 -1140 3 1334 2563 121 29 3 chr15 98184321 98184701 -5310273 + ORR1B1 LTR MaLR 5 394 0 3 1334 942 131 0 0 chr15 98184701 98184846 -5310128 - MTC LTR MaLR -276 145 1 3 1334 406 278 50 34 chr15 98185123 98185302 -5309672 + MTEa LTR MaLR 1 182 -197 3 1334 577 276 83 5 chr15 98185384 98185588 -5309386 + MTEa LTR MaLR 160 379 0 3 1334 4074 78 89 5 chr15 98188724 98189277 -5305697 - MT2B LTR ERVL -2 599 1 3 1334 2144 104 6 5 chr15 98191528 98191889 -5303085 - MTB_Mm-int LTR MaLR -808 450 1 3 1334 441 65 0 0 chr15 98191889 98191951 -5303023 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 346 3 1334 2230 85 0 9 chr15 98191951 98192273 -5302701 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 3 1334 1323 87 0 0 chr15 98192277 98192461 -5302513 - MTB_Mm LTR MaLR -57 350 167 3 1334 792 175 90 0 chr15 98193903 98194069 -5300905 + MT2A LTR ERVL 347 527 -6 3 1334 985 223 68 5 chr15 98197925 98198132 -5296842 - MTD LTR MaLR 0 419 200 3 1334 643 239 94 6 chr15 98198628 98198788 -5296186 - MTD LTR MaLR -247 174 1 3 1334 2532 58 12 0 chr15 98199756 98200098 -5294876 - ORR1A1 LTR MaLR 0 346 1 3 1334 243 247 21 86 chr15 98212608 98212701 -5282273 + MLT1E2 LTR MaLR 42 128 -499 3 1334 264 270 39 110 chr15 98213430 98213584 -5281390 + RLTR28B LTR ERVL 1 143 -338 3 1334 1033 220 205 10 chr15 98213916 98214219 -5280755 - ORR1D2 LTR MaLR -4 366 5 3 1334 2161 112 57 23 chr15 98218133 98218517 -5276457 + RLTR17 LTR ERVK 1 397 -295 3 1334 644 164 44 122 chr15 98218560 98218741 -5276233 - ORR1D2 LTR MaLR -203 167 1 3 1334 1417 201 72 21 chr15 98219386 98219773 -5275201 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 121 3 1334 445 229 146 8 chr15 98223488 98223611 -5271363 + MT2A LTR ERVL 318 457 -76 3 1334 240 59 39 0 chr15 98223891 98223942 -5271032 + MT2A LTR ERVL 481 533 0 3 1334 6065 110 50 20 chr15 98224314 98225244 -5269730 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 3 1334 3467 38 0 0 chr15 98226243 98226639 -5268335 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 3 1334 355 299 39 16 chr15 98227033 98227162 -5267812 + MLT1C LTR MaLR 284 415 -52 3 1334 8256 138 13 8 chr15 98234811 98236099 -5258875 + MurERV4-int LTR ERVK 3966 5260 0 4 1334 2291 114 55 49 chr15 98236110 98236561 -5258413 + RMER4A LTR ERVK 13 466 0 4 1334 236 230 66 26 chr15 98236563 98236639 -5258335 + RMER4A LTR ERVK 308 386 -80 4 1334 1080 158 30 0 chr15 98236682 98236884 -5258090 + ORR1D1 LTR MaLR 167 374 0 4 1334 346 152 68 0 chr15 98236954 98237013 -5257961 + ORR1D1 LTR MaLR 1 63 -311 4 1334 403 168 18 2 chr15 98240262 98240346 -5254628 - MLT1A0 LTR MaLR -35 330 258 4 1334 534 243 25 16 chr15 98240411 98240558 -5254416 - MLT1A0 LTR MaLR -214 160 2 4 1334 3345 42 0 17 chr15 98251625 98252032 -5242942 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1334 1870 185 47 8 chr15 98252065 98252430 -5242544 - RLTR14 LTR ERV1 -3 379 1 4 1334 264 216 40 0 chr15 98254443 98254517 -5240457 + RMER13A LTR ERVK 746 822 -38 4 1334 267 237 0 0 chr15 98254534 98254593 -5240381 + RMER13A LTR ERVK 802 860 0 4 1334 2266 129 159 17 chr15 98272949 98273352 -5221622 + RMER6B LTR ERVK 2 461 0 4 1334 5695 142 57 9 chr15 98273352 98273678 -5221296 + MYSERV6-int LTR ERVK 2 367 -8592 4 1334 5397 141 46 32 chr15 98273678 98274647 -5220327 + RLTR13C1 LTR ERVK 1 983 0 4 1334 5695 142 57 9 chr15 98274647 98275265 -5219709 + MYSERV6-int LTR ERVK 368 991 -7968 4 1334 3254 127 20 62 chr15 98275272 98275869 -5219105 + MYSERV6-int LTR ERVK 5630 6201 -2758 4 1334 710 159 131 24 chr15 98275869 98276005 -5218969 - RMER6D LTR ERVK -199 521 364 4 1334 710 159 131 24 chr15 98276052 98276083 -5218891 - RMER6D LTR ERVK -357 363 337 4 1334 1373 138 153 21 chr15 98276084 98276372 -5218602 - ORR1B1 LTR MaLR -68 326 1 4 1334 2227 107 0 0 chr15 98276797 98277116 -5217858 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 4 1334 1113 230 95 0 chr15 98277327 98277610 -5217364 + ORR1D2 LTR MaLR 21 330 -40 4 1334 378 114 0 6 chr15 98278115 98278175 -5216799 + ORR1D2 LTR MaLR 317 378 -6 4 1334 2220 169 60 5 chr15 98280045 98280444 -5214530 - MTC LTR MaLR 0 421 1 4 1334 1538 123 20 20 chr15 98288163 98288412 -5206562 + MTC LTR MaLR 173 421 0 5 1334 6338 152 91 14 chr15 98288412 98289577 -5205397 + MTC-int LTR MaLR 1 1255 -3 5 1334 2216 145 108 3 chr15 98289580 98289961 -5205013 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1334 231 242 115 75 chr15 98291648 98291822 -5203152 - RLTR21 LTR ERVK -317 1255 1075 5 1334 315 281 103 10 chr15 98292568 98292665 -5202309 - MER21B LTR ERV1 -660 203 98 5 1334 5202 125 80 20 chr15 98294729 98295627 -5199347 - MTC-int LTR MaLR -192 1066 115 5 1334 426 73 0 0 chr15 98297205 98297260 -5197714 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 272 5 1334 2290 172 272 2 chr15 98298254 98298732 -5196242 - RMER19C LTR ERVK -2 609 3 5 1335 1274 268 42 15 chr15 98308740 98309077 -5185897 + MTEa LTR MaLR 10 355 -24 5 1335 292 270 11 63 chr15 98315917 98316012 -5178962 - MT2B LTR ERVL -360 241 152 5 1335 3209 58 22 10 chr15 98316016 98316418 -5178556 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 5 1335 3935 22 32 4 chr15 98317436 98317898 -5177076 - IAPLTR2_Mm LTR ERVK 0 475 1 5 1335 1526 226 60 51 chr15 98318363 98318469 -5176505 + MTD LTR MaLR 1 94 -325 5 1335 1526 226 60 51 chr15 98318651 98318959 -5176015 + MTD LTR MaLR 95 419 0 5 1335 1844 110 75 160 chr15 98319298 98319699 -5175275 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 5 1335 423 250 42 77 chr15 98324310 98324397 -5170577 - MT2B LTR ERVL -344 257 180 6 1335 423 250 42 77 chr15 98324431 98324486 -5170488 - MT2B LTR ERVL -422 179 120 6 1335 2014 102 7 0 chr15 98332629 98332912 -5162062 + ORR1A2 LTR MaLR 1 285 -42 6 1335 396 59 0 0 chr15 98333137 98333188 -5161786 + ORR1A2 LTR MaLR 296 346 0 6 1335 374 60 40 0 chr15 98336061 98336111 -5158863 + ORR1C1 LTR MaLR 327 378 0 6 1335 446 111 11 53 chr15 98337839 98337934 -5157040 + RLTR15 LTR ERVK 34 124 -235 6 1335 2461 88 120 14 chr15 98338549 98338917 -5156057 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 6 1335 5097 134 37 13 chr15 98338917 98339774 -5155200 + MTB_Mm-int LTR MaLR 3 880 -378 6 1335 520 335 74 62 chr15 98342701 98343086 -5151888 + MT2A LTR ERVL 1 397 -136 6 1335 520 335 74 62 chr15 98343123 98343157 -5151817 + MT2A LTR ERVL 398 425 -108 6 1335 4036 62 71 6 chr15 98344109 98344641 -5150333 - RMER2 LTR ERV1 0 567 1 6 1335 3788 132 17 36 chr15 98345282 98345950 -5149024 - RMER6A LTR ERVK 0 756 57 6 1335 302 300 96 39 chr15 98346000 98346208 -5148766 + RLTR12B LTR ERVK 267 486 -42 6 1335 458 270 143 22 chr15 98348051 98348233 -5146741 - RMER15 LTR ERVL -64 511 308 6 1335 627 286 73 5 chr15 98348517 98348735 -5146239 + ORR1D2 LTR MaLR 1 233 -137 6 1335 428 294 119 0 chr15 98349021 98349164 -5145810 - RMER15-int LTR ERVL -3642 1357 1198 6 1335 555 206 147 22 chr15 98350407 98350605 -5144369 + MTD LTR MaLR 177 399 -22 6 1335 232 190 32 168 chr15 98360952 98361047 -5133927 + RMER17A LTR ERVK 670 751 0 7 1335 252 182 23 0 chr15 98366178 98366222 -5128752 + ORR1B2 LTR MaLR 312 356 -11 7 1335 655 257 198 19 chr15 98381925 98382183 -5112791 - MTE2b LTR MaLR -74 305 2 7 1335 239 202 28 75 chr15 98384219 98384237 -5110737 + ORR1E-int LTR MaLR 632 644 -865 7 1335 2275 135 94 7 chr15 98385770 98386174 -5108800 + RLTR11B LTR ERVK 13 451 -2 7 1335 956 322 12 30 chr15 98387176 98387506 -5107468 + MurERV4-int LTR ERVK 4544 4867 -393 7 1335 226 250 0 0 chr15 98387512 98387556 -5107418 + ORR1E LTR MaLR 1 44 -315 7 1335 284 239 5 33 chr15 98387936 98388016 -5106958 + MTEa LTR MaLR 287 365 -14 7 1335 1981 132 133 11 chr15 98402872 98403240 -5091734 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 8 1336 3226 79 2 0 chr15 98448913 98449319 -5045655 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 9 1336 1353 192 218 3 chr15 98449752 98450060 -5044914 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 9 1336 641 318 61 31 chr15 98454039 98454351 -5040623 + MLT1F2 LTR MaLR 29 342 -227 9 1336 3136 127 90 40 chr15 98454385 98454692 -5040282 + RMER4B LTR ERVK 1 329 -256 9 1336 3136 127 90 40 chr15 98454737 98454986 -5039988 + RMER4B LTR ERVK 330 584 -1 9 1336 625 204 70 145 chr15 98487445 98487686 -5007288 + MT2A LTR ERVL 1 223 -310 1 1336 2317 84 62 0 chr15 98498407 98498715 -4996259 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 1 1336 327 149 0 130 chr15 98501332 98501409 -4993565 - RMER19C LTR ERVK -417 194 128 3 1336 331 297 106 69 chr15 98513146 98513363 -4981611 - MER90a LTR ERV1 0 614 390 3 1336 830 305 49 4 chr15 98513376 98513639 -4981335 - MER90a LTR ERV1 -271 343 69 3 1336 1463 221 128 79 chr15 98515826 98516382 -4978592 - RMER4B LTR ERVK 0 585 3 4 1336 281 243 0 114 chr15 98518790 98518869 -4976105 - ORR1D2 LTR MaLR 0 370 301 6 1336 1713 159 15 201 chr15 98519301 98519764 -4975210 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 2 6 1336 2194 103 111 8 chr15 98520767 98521129 -4973845 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 6 1336 942 62 43 9 chr15 98524507 98524661 -4970313 - MT2_Mm LTR ERVL 0 601 374 7 1336 2783 128 17 2 chr15 98525352 98525767 -4969207 - MTC LTR MaLR 0 421 1 7 1336 293 130 0 0 chr15 98528493 98528547 -4966427 - MT2A LTR ERVL -1 532 479 9 1336 796 283 58 30 chr15 98529076 98529403 -4965571 - MT2B LTR ERVL -59 542 94 9 1336 1037 281 69 45 chr15 98534282 98534675 -4960299 + ERVL-int LTR ERVL 4909 5316 -441 1 1336 3833 123 172 17 chr15 98534675 98535310 -4959664 - RMER19A LTR ERVK 0 737 5 1 1336 1037 281 69 45 chr15 98535310 98535378 -4959596 + ERVL-int LTR ERVL 5317 5381 -376 1 1336 3515 28 2 0 chr15 98542657 98543052 -4951922 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1336 362 227 114 35 chr15 98544320 98544434 -4950540 - MLT1G3 LTR MaLR 0 489 367 1 1336 375 215 62 45 chr15 98544542 98544654 -4950320 + RMER15 LTR ERVL 88 201 -374 1 1336 424 285 86 115 chr15 98544870 98545148 -4949826 - MLT1G3 LTR MaLR -212 383 114 1 1336 460 251 68 34 chr15 98552158 98552335 -4942639 + RLTR42-int LTR ERVK 4253 4435 -1087 1 1336 228 276 9 117 chr15 98561724 98561835 -4933139 + MT2B LTR ERVL 156 254 -347 2 1337 1485 223 83 11 chr15 98583745 98584108 -4910866 + MTD LTR MaLR 18 406 -13 2 1337 1311 201 155 21 chr15 98595544 98595879 -4899095 + MTD LTR MaLR 1 380 -39 3 1337 926 223 26 225 chr15 98595877 98596273 -4898701 + MTD-int LTR MaLR 10 375 -723 3 1337 1460 272 75 119 chr15 98596310 98596904 -4898070 + MTD-int LTR MaLR 313 1092 -166 3 1337 1460 247 82 100 chr15 98597095 98597278 -4897696 + MTD-int LTR MaLR 955 1256 -2 3 1337 1739 198 37 81 chr15 98597279 98597465 -4897509 + MTD LTR MaLR 1 181 -238 3 1337 1739 198 37 81 chr15 98597668 98597705 -4897269 + MTD LTR MaLR 182 209 -210 3 1337 1739 198 37 81 chr15 98597856 98598061 -4896913 + MTD LTR MaLR 210 411 -8 3 1337 1961 87 29 181 chr15 98613933 98613996 -4880978 - ORR1A3 LTR MaLR -1 325 279 3 1337 1961 87 29 181 chr15 98614143 98614172 -4880802 - ORR1A3 LTR MaLR -48 278 270 3 1337 1961 87 29 181 chr15 98614561 98614838 -4880136 - ORR1A3 LTR MaLR -57 269 3 3 1337 271 283 31 77 chr15 98625818 98625948 -4869026 + RMER12 LTR ERVK 733 856 -466 3 1337 1777 192 64 47 chr15 98652770 98653131 -4841843 + ORR1B2 LTR MaLR 1 367 0 4 1337 226 321 45 97 chr15 98654159 98654314 -4840660 - RLTR12B LTR ERVK -335 193 47 4 1337 1576 181 127 19 chr15 98654904 98655275 -4839699 - MTC LTR MaLR -9 412 2 4 1337 266 211 0 17 chr15 98658353 98658411 -4836563 - MTE2a LTR MaLR -1 369 313 4 1337 274 260 26 80 chr15 98658450 98658563 -4836411 + RLTR25B LTR ERVK 441 547 -481 4 1337 485 317 66 145 chr15 98658542 98658845 -4836129 - MTE2a LTR MaLR -82 297 19 4 1337 333 193 33 98 chr15 98668332 98668424 -4826550 + MT2B LTR ERVL 172 257 -344 4 1338 268 219 59 118 chr15 98712334 98712453 -4782521 + MT2B LTR ERVL 153 264 -337 5 1338 400 225 42 75 chr15 98713579 98713699 -4781275 + MT2B LTR ERVL 142 257 -344 5 1338 233 339 80 32 chr15 98717999 98718124 -4776850 - MLT1A LTR MaLR -53 321 191 5 1338 4379 32 0 0 chr15 98719975 98720468 -4774506 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 5 1338 1021 224 149 77 chr15 98730890 98730994 -4763980 - MTD LTR MaLR -30 389 293 6 1338 1021 224 149 77 chr15 98731222 98731480 -4763494 - MTD LTR MaLR -127 292 1 6 1338 275 226 95 114 chr15 98733519 98733624 -4761350 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 6 1338 248 246 59 110 chr15 98736367 98736467 -4758507 + MT2B LTR ERVL 62 250 -334 6 1338 1624 167 64 15 chr15 98752144 98752473 -4742501 + ORR1D1 LTR MaLR 28 372 -2 6 1338 1568 204 187 26 chr15 98752641 98753069 -4741905 + ORR1D1-int LTR MaLR 3 499 -871 6 1338 2212 213 35 12 chr15 98753060 98753575 -4741399 + ORR1D1-int LTR MaLR 846 1533 -47 6 1338 1478 107 99 78 chr15 98753597 98753891 -4741083 + ORR1D1 LTR MaLR 75 374 0 6 1338 3516 44 5 2 chr15 98756154 98756589 -4738385 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 6 1338 241 282 11 114 chr15 98767319 98767407 -4727567 + MT2B2 LTR ERVL 177 255 -329 7 1338 791 204 148 23 chr15 98769860 98770273 -4724701 - RLTR40 LTR ERVK -12 805 297 7 1338 538 231 204 0 chr15 98770339 98770525 -4724449 - RLTR40 LTR ERVK -593 224 1 7 1338 389 296 38 43 chr15 98771282 98771466 -4723508 - MLT1H LTR MaLR -249 300 118 7 1338 3020 92 86 47 chr15 98773587 98773989 -4720985 + RMER2 LTR ERV1 10 435 -132 7 1338 3020 92 86 47 chr15 98774019 98774153 -4720821 + RMER2 LTR ERV1 436 566 -1 7 1338 1613 94 150 0 chr15 98774551 98774818 -4720156 - MT2C_Mm LTR ERVL 0 475 169 7 1338 1424 201 85 30 chr15 98775151 98775477 -4719497 - ORR1B1 LTR MaLR -43 351 8 7 1338 310 43 21 42 chr15 98775481 98775529 -4719445 - ORR1A3 LTR MaLR -8 318 272 7 1338 719 209 98 84 chr15 98775751 98775965 -4719009 - RLTR26 LTR ERVK -112 530 314 7 1338 1530 160 108 7 chr15 98776294 98776590 -4718384 - RLTR26 LTR ERVK -316 326 1 7 1338 849 242 118 22 chr15 98779910 98780196 -4714778 + MTD LTR MaLR 18 339 -57 7 1338 624 206 150 7 chr15 98787593 98787740 -4707234 - ORR1C1 LTR MaLR -208 170 3 7 1338 1198 282 62 58 chr15 98789322 98789789 -4705185 + MTC-int LTR MaLR 620 1088 -170 7 1338 234 223 82 41 chr15 98789875 98789938 -4705036 + MTC-int LTR MaLR 1010 1077 -181 7 1338 234 223 82 41 chr15 98789987 98790021 -4704953 + MTC-int LTR MaLR 1078 1110 -148 7 1338 743 282 11 23 chr15 98790085 98790298 -4704676 + MTD LTR MaLR 1 209 -210 7 1338 2714 36 8 186 chr15 98794992 98795464 -4699510 + RLTR10 LTR ERVK 1 388 -2 8 1338 1538 176 26 15 chr15 98796139 98796405 -4698569 - RLTR14 LTR ERV1 -113 269 1 8 1338 4871 119 19 9 chr15 98798201 98798949 -4696025 + RMER6A LTR ERVK 2 756 0 8 1338 987 186 170 86 chr15 98800082 98800418 -4694556 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 1 8 1338 3113 58 33 2 chr15 98802354 98802753 -4692221 + RLTR10A LTR ERVK 1 411 0 8 1338 226 261 14 0 chr15 98802962 98803031 -4691943 - RLTR22_Mur LTR ERVK -471 1377 1308 8 1338 2338 52 56 138 chr15 98805308 98805685 -4689289 + ORR1A1 LTR MaLR 1 346 0 8 1338 1675 173 26 68 chr15 98811566 98811994 -4682980 + RMER17C LTR ERVK 1 410 0 8 1338 1868 154 95 11 chr15 98818511 98818878 -4676096 - RMER10B LTR ERVL 0 398 1 8 1338 896 165 32 16 chr15 98819848 98820033 -4674941 - RMER17C LTR ERVK 0 410 223 8 1338 878 215 13 39 chr15 98820167 98820399 -4674575 - RMER17C LTR ERVK -184 226 1 8 1338 2445 119 32 3 chr15 98827591 98827962 -4667012 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 9 1339 604 271 104 37 chr15 98828409 98828677 -4666297 + MTE2a LTR MaLR 1 286 -93 9 1339 1587 214 132 21 chr15 98828677 98829101 -4665873 - RLTR18B LTR ERVK 0 512 42 9 1339 237 133 89 0 chr15 98829284 98829329 -4665645 - RLTR18B LTR ERVK -463 49 1 9 1339 404 160 9 130 chr15 98829329 98829425 -4665549 + MTE2a LTR MaLR 297 379 0 9 1339 389 282 8 60 chr15 98830418 98830431 -4664543 + MT2B LTR ERVL 143 153 -448 9 1339 389 282 8 60 chr15 98830623 98830635 -4664339 + MT2B LTR ERVL 154 253 -348 9 1339 234 286 97 21 chr15 98831846 98831939 -4663035 - RMER15 LTR ERVL -24 551 452 9 1339 1147 159 261 4 chr15 98832497 98832769 -4662205 + ORR1D-int LTR MaLR 916 1257 -113 9 1339 4041 128 243 7 chr15 98832862 98833637 -4661337 + RMER17B LTR ERVK 1 958 0 9 1339 245 57 0 0 chr15 98843466 98843501 -4651473 - MTC-int LTR MaLR -282 976 942 9 1339 411 235 26 154 chr15 98843594 98843612 -4651362 + MT2B LTR ERVL 153 200 -401 9 1339 411 235 26 154 chr15 98843720 98843750 -4651224 + MT2B LTR ERVL 201 288 -313 9 1339 262 309 82 0 chr15 98844310 98844407 -4650567 + MER21B LTR ERV1 4 108 -755 9 1339 1067 134 107 10 chr15 98844487 98844682 -4650292 + MTC LTR MaLR 1 214 -207 9 1339 861 210 144 5 chr15 98845014 98845201 -4649773 + MTC LTR MaLR 209 421 0 9 1339 3542 208 78 66 chr15 98845200 98846160 -4648814 + MTC-int LTR MaLR 2 978 -120 9 1339 2389 123 68 32 chr15 98846672 98847084 -4647890 - RMER6B LTR ERVK -32 429 3 9 1339 845 238 136 91 chr15 98851729 98852090 -4642884 + MTE2a LTR MaLR 1 377 -2 1 1339 345 284 32 57 chr15 98861613 98861736 -4633238 - MT2B LTR ERVL -345 256 137 1 1339 986 307 108 42 chr15 98875342 98875794 -4619180 + MLT1L LTR MaLR 50 531 -79 1 1339 701 245 124 46 chr15 98879577 98879930 -4615044 - RLTR12B LTR ERVK -179 348 1 1 1339 229 265 123 68 chr15 98881199 98881345 -4613629 + LTR85a LTR Gypsy? 549 702 0 1 1339 3149 51 15 12 chr15 98882249 98882648 -4612326 + MTB LTR MaLR 1 400 0 1 1339 1863 170 0 9 chr15 98889805 98890125 -4604849 + MTC LTR MaLR 104 420 -1 1 1339 482 284 67 76 chr15 98890469 98890679 -4604295 - RMER2 LTR ERV1 -26 541 334 1 1339 906 282 55 8 chr15 98891283 98891537 -4603437 - RMER15 LTR ERVL -24 551 286 1 1339 948 234 108 25 chr15 98895736 98896060 -4598914 - ORR1E LTR MaLR -4 355 5 1 1339 722 169 164 6 chr15 98896162 98896418 -4598556 + BGLII_B LTR ERVK 1 276 -416 1 1339 390 212 24 0 chr15 98898985 98899059 -4595915 - RLTR28 LTR ERVL -11 513 438 1 1339 2204 132 33 42 chr15 98899192 98899620 -4595354 - RLTR28 LTR ERVL -100 424 1 1 1339 1350 125 1 21 chr15 98900018 98900256 -4594718 + BGLII_B LTR ERVK 192 441 0 1 1339 506 250 114 17 chr15 98901566 98901741 -4593233 - RMER5 LTR ERV1 0 534 343 1 1339 479 261 144 132 chr15 98901888 98901915 -4593059 - RMER5 LTR ERV1 -178 356 331 1 1339 479 261 144 132 chr15 98902350 98902546 -4592428 - RMER5 LTR ERV1 -204 330 104 1 1339 479 261 144 132 chr15 98902740 98902802 -4592172 - RMER5 LTR ERV1 -431 103 54 1 1339 479 261 144 132 chr15 98902970 98903022 -4591952 - RMER5 LTR ERV1 -481 53 13 1 1339 922 255 66 56 chr15 98935693 98936013 -4558961 + MTE2b LTR MaLR 57 379 0 1 1339 3003 90 21 41 chr15 98936947 98937432 -4557542 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 1 1339 812 313 58 3 chr15 98938368 98938660 -4556314 + LTR48B LTR ERV1 303 610 -34 1 1339 608 245 26 39 chr15 98939813 98939966 -4555008 - RLTR20C LTR ERVK 0 578 428 1 1339 908 203 118 45 chr15 98939965 98940254 -4554720 - RLTR20C LTR ERVK -224 310 1 1 1339 244 306 70 70 chr15 98941365 98941431 -4553543 + MT2B2 LTR ERVL 107 235 -349 1 1339 272 206 51 76 chr15 98941431 98941510 -4553464 + RLTR25A LTR ERVK 497 573 -530 1 1339 244 306 70 70 chr15 98941510 98941523 -4553451 + MT2B2 LTR ERVL 236 264 -320 1 1339 4652 99 25 104 chr15 98950684 98951562 -4543412 + RMER17D2 LTR ERVK 1 809 0 1 1340 317 249 106 83 chr15 98962855 98962939 -4532035 - MT2B LTR ERVL -433 168 81 1 1340 1691 184 44 25 chr15 98972390 98972757 -4522217 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1340 1912 110 65 46 chr15 98976246 98976569 -4518405 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1340 2131 165 36 186 chr15 98976569 98977215 -4517759 - ORR1A4-int LTR MaLR 0 1792 1244 1 1340 3514 63 48 2 chr15 98985002 98985463 -4509511 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1340 54050 58 24 22 chr15 98985463 98987968 -4507006 - RLTR45-int LTR ERVK 0 7244 4768 1 1340 54050 58 24 22 chr15 98987997 98989835 -4505139 - RLTR45-int LTR ERVK -2477 4767 2919 1 1340 54050 58 24 22 chr15 98990026 98992912 -4502062 - RLTR45-int LTR ERVK -4326 2918 3 1 1340 3980 48 8 2 chr15 98992912 98993391 -4501583 - RLTR45 LTR ERVK 0 482 1 1 1340 265 246 44 51 chr15 98997006 98997143 -4497831 - ORR1B1-int LTR MaLR -755 754 619 1 1340 3414 35 5 2 chr15 99006308 99006703 -4488271 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1340 284 275 91 78 chr15 99017394 99017548 -4477426 - RLTR25B LTR ERVK 0 1028 873 5 1340 863 235 217 10 chr15 99021207 99021516 -4473458 - MTD LTR MaLR -1 418 46 5 1340 2172 222 62 35 chr15 99026843 99027412 -4467562 - RLTR40 LTR ERVK -231 586 3 7 1340 440 298 17 87 chr15 99028127 99028180 -4466794 + MT2B LTR ERVL 118 158 -443 8 1340 227 206 53 186 chr15 99028368 99028481 -4466493 + MT2B2 LTR ERVL 176 273 -311 8 1340 2530 191 99 42 chr15 99046455 99046908 -4448066 - RMER19C LTR ERVK 0 611 131 1 1340 2530 191 99 42 chr15 99047184 99047308 -4447666 - RMER19C LTR ERVK -481 130 2 1 1340 1073 231 160 31 chr15 99069458 99069776 -4425198 - ORR1D2 LTR MaLR -5 365 7 1 1340 707 167 7 34 chr15 99070845 99070994 -4423980 - RLTR16 LTR ERVK 0 505 361 1 1340 501 213 96 0 chr15 99083312 99083448 -4411526 + MTD LTR MaLR 1 149 -270 1 1340 586 201 13 120 chr15 99083449 99083518 -4411456 + MTD LTR MaLR 279 334 -85 1 1340 586 201 13 120 chr15 99083711 99083799 -4411175 + MTD LTR MaLR 335 419 0 1 1340 988 269 48 51 chr15 99084021 99084372 -4410602 - MTEb LTR MaLR -2 377 19 1 1340 2117 265 136 83 chr15 99085594 99086449 -4408525 - MTEb-int LTR MaLR -76 1504 605 1 1340 1137 256 129 36 chr15 99086441 99086581 -4408393 - MTEb-int LTR MaLR -1124 456 325 1 1340 4862 101 63 13 chr15 99086581 99087283 -4407691 + RMER19A LTR ERVK 1 737 0 1 1340 1137 256 129 36 chr15 99087283 99087559 -4407415 - MTEb-int LTR MaLR -1256 324 1 1 1340 766 260 110 37 chr15 99087559 99087858 -4407116 - MTEb LTR MaLR 0 379 59 1 1340 473 249 71 44 chr15 99087909 99088147 -4406827 - RMER10A LTR ERVL -174 224 1 2 1340 1417 154 114 17 chr15 99088149 99088439 -4406535 + RLTR24 LTR ERV1 212 529 0 2 1341 677 185 37 37 chr15 99092052 99092215 -4402759 + MTD LTR MaLR 10 172 -247 2 1341 891 235 50 9 chr15 99092261 99092480 -4402494 + MTD LTR MaLR 144 371 -48 2 1341 300 322 119 11 chr15 99106112 99106288 -4388686 - ORR1E LTR MaLR -164 195 1 2 1341 294 288 80 9 chr15 99117838 99117950 -4377024 + ORR1E LTR MaLR 1 120 -239 2 1341 1364 125 88 74 chr15 99119871 99120156 -4374818 - ORR1A4 LTR MaLR -40 289 1 2 1341 1151 190 50 41 chr15 99170720 99170960 -4324014 + MTD LTR MaLR 28 269 -150 3 1341 3236 130 117 15 chr15 99170960 99171354 -4323620 - RMER6A LTR ERVK 0 756 322 3 1341 3236 130 117 15 chr15 99171399 99171596 -4323378 - RMER6A LTR ERVK -435 321 105 3 1341 308 207 322 0 chr15 99171595 99171682 -4323292 + MTD LTR MaLR 298 412 -9 3 1341 277 339 91 48 chr15 99176422 99176608 -4318366 + MLT1J LTR MaLR 118 311 -201 3 1341 239 196 46 156 chr15 99194343 99194358 -4300616 + MT2B LTR ERVL 154 156 -445 4 1341 234 250 141 26 chr15 99202251 99202329 -4292645 + MLT1K LTR MaLR 2 88 -507 4 1341 466 300 84 52 chr15 99202372 99202622 -4292352 + MLT1K LTR MaLR 214 471 -124 4 1341 241 247 107 36 chr15 99205128 99205212 -4289762 - MT2B LTR ERVL -345 256 167 4 1341 462 160 344 0 chr15 99209050 99209181 -4285793 - ORR1D1 LTR MaLR 0 370 195 4 1341 922 225 40 10 chr15 99209293 99209495 -4285479 - ORR1D1 LTR MaLR -166 208 1 4 1341 259 280 55 83 chr15 99214396 99214505 -4280469 + MT2B LTR ERVL 155 260 -341 4 1341 302 120 100 0 chr15 99216533 99216583 -4278391 - ORR1A3 LTR MaLR -1 328 274 5 1341 1368 164 67 77 chr15 99216856 99217141 -4277833 - ORR1A3 LTR MaLR -44 282 1 5 1341 1843 282 95 25 chr15 99217493 99218126 -4276848 - ORR1E-int LTR MaLR -903 677 1 5 1341 356 267 39 77 chr15 99218169 99218279 -4276695 - ORR1E LTR MaLR 0 379 273 5 1341 2208 141 35 21 chr15 99218279 99218656 -4276318 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 5 1341 356 267 39 77 chr15 99218656 99218675 -4276299 - ORR1E LTR MaLR -107 272 255 5 1341 767 289 5 31 chr15 99218767 99218963 -4276011 - ORR1E LTR MaLR -168 191 1 5 1341 863 243 74 39 chr15 99219302 99219652 -4275322 + ORR1C2 LTR MaLR 17 378 -6 5 1341 2277 130 69 42 chr15 99219652 99219688 -4275286 + RMER6B LTR ERVK 1 41 -420 5 1341 2277 130 69 42 chr15 99219806 99220218 -4274756 + RMER6B LTR ERVK 42 461 0 5 1341 368 243 67 19 chr15 99220964 99221069 -4273905 - RMER4A LTR ERVK 0 466 357 5 1341 2466 139 58 10 chr15 99221060 99221474 -4273500 - RMER4B LTR ERVK -150 435 2 5 1342 293 243 148 70 chr15 99222129 99222244 -4272730 - MT2B LTR ERVL -343 258 135 5 1342 233 218 106 75 chr15 99237158 99237252 -4257722 - MT2B LTR ERVL -328 273 177 5 1342 294 294 130 22 chr15 99240866 99241050 -4253924 - ORR1D1 LTR MaLR -129 245 42 5 1342 2166 209 103 13 chr15 99274390 99274913 -4220061 + RMER15 LTR ERVL 6 575 0 6 1342 332 331 72 26 chr15 99280527 99280679 -4214295 + MLT1A0 LTR MaLR 1 159 -206 6 1342 1797 123 198 0 chr15 99306192 99306510 -4188464 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 1 7 1342 1120 213 17 10 chr15 99309909 99310175 -4184799 - ORR1C1 LTR MaLR 0 378 68 7 1342 750 212 17 34 chr15 99310296 99310472 -4184502 - ORR1C1 LTR MaLR -187 187 15 7 1342 1989 171 40 68 chr15 99311556 99311813 -4183161 - RLTR21 LTR ERVK -30 1542 1304 7 1342 1989 171 40 68 chr15 99311887 99312056 -4182918 - RLTR21 LTR ERVK -269 1303 1129 7 1342 6881 147 20 89 chr15 99312132 99312262 -4182712 - RLTR21 LTR ERVK -285 1287 1170 7 1342 6881 147 20 89 chr15 99312307 99312969 -4182005 - RLTR21 LTR ERVK -403 1169 563 7 1342 6881 147 20 89 chr15 99313166 99313304 -4181670 - RLTR21 LTR ERVK -1010 562 441 7 1342 6881 147 20 89 chr15 99313495 99313943 -4181031 - RLTR21 LTR ERVK -1132 440 2 7 1342 284 222 153 27 chr15 99315241 99315352 -4179622 - MLT1A1 LTR MaLR -30 378 254 7 1342 2137 225 43 57 chr15 99316028 99316589 -4178385 + RLTR20B3 LTR ERVK 12 564 -13 7 1342 2841 31 6 3 chr15 99317489 99317815 -4177159 + IAPLTR2b LTR ERVK 1 327 0 7 1342 4122 143 52 3 chr15 99319191 99319848 -4175126 - RLTR17 LTR ERVK -3 689 1 7 1342 307 264 10 94 chr15 99321429 99321525 -4173449 - MTE-int LTR MaLR -642 938 851 7 1342 376 304 133 13 chr15 99322995 99323145 -4171829 + MTE-int LTR MaLR 120 287 -1293 7 1342 429 315 109 97 chr15 99324376 99324706 -4170268 - MLT1H1 LTR MaLR -11 544 211 7 1342 232 316 0 37 chr15 99325354 99325436 -4169538 + MLT1E2 LTR MaLR 546 624 -3 7 1342 3405 47 5 12 chr15 99325521 99325931 -4169043 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1342 2271 115 102 46 chr15 99326355 99326661 -4168313 - MTC LTR MaLR -8 413 83 7 1342 2271 115 102 46 chr15 99326807 99326891 -4168083 - MTC LTR MaLR -339 82 1 7 1343 3103 67 15 5 chr15 99375425 99375817 -4119157 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1343 3419 43 0 2 chr15 99387592 99387989 -4106985 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 9 1343 718 161 7 7 chr15 99395954 99396092 -4098882 - ORR1A1 LTR MaLR -208 138 1 9 1343 2656 85 54 0 chr15 99396975 99397362 -4097612 - RMER19A LTR ERVK 0 737 330 9 1343 1026 87 116 0 chr15 99397361 99397533 -4097441 + ORR1A4 LTR MaLR 138 329 0 9 1343 496 161 47 31 chr15 99400577 99400679 -4094295 + RMER17C LTR ERVK 80 183 -227 9 1343 496 161 47 31 chr15 99400725 99400814 -4094160 + RMER17C LTR ERVK 184 274 -136 9 1343 1450 159 209 63 chr15 99400905 99401095 -4093879 + ORR1C2 LTR MaLR 1 171 -213 9 1343 1450 159 209 63 chr15 99401163 99401307 -4093667 + ORR1C2 LTR MaLR 172 383 -1 9 1343 2182 106 115 6 chr15 99403038 99403369 -4091605 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 9 1343 2198 184 83 75 chr15 99437169 99437262 -4057712 + RLTR18B LTR ERVK 1 95 -417 1 1343 2198 184 83 75 chr15 99437406 99437817 -4057157 + RLTR18B LTR ERVK 96 509 -3 1 1343 1492 239 27 32 chr15 99442900 99443276 -4051698 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 1 1343 251 189 132 0 chr15 99475700 99475753 -4019221 - MT2B LTR ERVL -366 235 176 1 1343 236 242 48 0 chr15 99475937 99475999 -4018975 + MLT1A0 LTR MaLR 15 79 -329 1 1343 385 300 153 0 chr15 99476011 99476161 -4018813 + MLT1A0 LTR MaLR 134 306 -59 1 1343 260 250 17 0 chr15 99476614 99476674 -4018300 + MLT1A0 LTR MaLR 340 400 -8 1 1343 369 269 136 96 chr15 99480413 99480557 -4014417 + RMER5 LTR ERV1 53 219 -315 1 1343 369 269 136 96 chr15 99480711 99480817 -4014157 + RMER5 LTR ERV1 220 313 -221 1 1343 270 281 157 7 chr15 99481263 99481403 -4013571 - RMER5 LTR ERV1 -4 530 370 1 1343 558 234 75 94 chr15 99481404 99481616 -4013358 - RMER5 LTR ERV1 -278 256 49 1 1344 2297 126 5 97 chr15 99489022 99489443 -4005531 + MTC LTR MaLR 40 421 0 1 1344 388 296 10 118 chr15 99489697 99489767 -4005207 - MLT1F2 LTR MaLR -1 559 500 1 1344 388 296 10 118 chr15 99489956 99490088 -4004886 - MLT1F2 LTR MaLR -61 499 379 1 1344 235 333 31 70 chr15 99491922 99492051 -4002923 - MT2B2 LTR ERVL -323 261 138 1 1344 347 195 0 94 chr15 99498485 99498570 -3996404 + MT2B LTR ERVL 188 264 -337 1 1344 238 287 29 96 chr15 99504793 99504897 -3990077 + MT2B2 LTR ERVL 155 251 -333 1 1344 3170 52 34 0 chr15 99510266 99510652 -3984322 - MTB LTR MaLR 0 400 2 2 1344 1726 167 70 20 chr15 99514145 99514359 -3980615 + ORR1D1 LTR MaLR 15 231 -143 4 1344 1726 167 70 20 chr15 99514383 99514511 -3980463 + ORR1D1 LTR MaLR 232 373 -1 4 1344 2930 140 2 12 chr15 99514532 99515023 -3979951 - MERVL_2A-int LTR ERVL -2422 3339 2854 4 1344 1680 168 79 101 chr15 99515024 99515402 -3979572 - ORR1D1 LTR MaLR -4 370 1 4 1344 439 264 83 0 chr15 99524809 99524930 -3970044 - LTR33 LTR ERVL -52 463 333 6 1344 293 200 62 62 chr15 99532107 99532203 -3962771 - RLTR25B LTR ERVK -492 536 441 7 1344 466 239 41 82 chr15 99532242 99532268 -3962706 - MT2B LTR ERVL -443 158 139 7 1344 1004 285 45 58 chr15 99542122 99542498 -3952476 - MLT1B LTR MaLR 0 390 20 8 1344 305 265 0 105 chr15 99545568 99545682 -3949292 + MT2B LTR ERVL 146 247 -354 9 1344 1499 186 66 71 chr15 99558726 99559055 -3935919 - ORR1D1 LTR MaLR -11 363 34 1 1344 1499 186 66 71 chr15 99559246 99559281 -3935693 - ORR1D1 LTR MaLR -341 33 1 1 1344 322 163 65 140 chr15 99560216 99560323 -3934651 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 411 1 1344 306 243 26 88 chr15 99561520 99561633 -3933341 + RLTR25B LTR ERVK 444 549 -479 1 1344 1811 175 166 3 chr15 99565266 99565621 -3929353 - MTC LTR MaLR -8 413 1 1 1344 601 297 63 75 chr15 99570708 99571043 -3923931 + ORR1E LTR MaLR 1 331 -28 1 1344 7831 144 29 156 chr15 99578424 99579775 -3915199 - ORR1B1-int LTR MaLR -14 1949 1 1 1344 7831 145 39 190 chr15 99579814 99581120 -3913854 - ORR1B1-int LTR MaLR -920 1043 1 1 1344 1086 99 86 0 chr15 99581124 99581338 -3913636 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 51 1 1344 492 157 0 105 chr15 99581480 99581594 -3913380 - ORR1B1 LTR MaLR -292 102 1 1 1344 1037 165 33 0 chr15 99583436 99583618 -3911356 + MTD LTR MaLR 225 412 -7 2 1344 263 212 109 100 chr15 99587162 99587272 -3907702 + RMER20B LTR ERVK 479 589 -38 2 1344 1755 160 107 18 chr15 99589041 99589378 -3905596 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 2 1344 1678 120 129 14 chr15 99593469 99593764 -3901210 + ORR1A4 LTR MaLR 1 329 0 2 1344 8746 155 67 86 chr15 99593764 99595620 -3899354 + ORR1A4-int LTR MaLR 1 1814 -149 2 1344 8746 155 67 86 chr15 99595801 99595945 -3899029 + ORR1A4-int LTR MaLR 1815 1963 0 2 1344 1442 131 60 15 chr15 99595945 99596220 -3898754 + ORR1A4 LTR MaLR 1 321 -8 2 1344 335 235 99 50 chr15 99596826 99596843 -3898131 + MT2B LTR ERVL 152 174 -427 2 1344 318 214 11 67 chr15 99597216 99597306 -3897668 + MT2B2 LTR ERVL 155 239 -345 2 1344 929 252 45 38 chr15 99609226 99609490 -3885484 + MTD LTR MaLR 154 419 0 2 1345 2226 152 60 12 chr15 99622024 99622425 -3872549 + MTC LTR MaLR 2 421 0 3 1345 1105 141 161 86 chr15 99644529 99644808 -3850166 + MTD LTR MaLR 120 419 0 4 1345 233 208 34 135 chr15 99653507 99653596 -3841378 - MT2B2 LTR ERVL -306 278 199 4 1345 3402 50 0 0 chr15 99659480 99659880 -3835094 - MTB LTR MaLR 0 400 1 4 1345 961 253 67 27 chr15 99661489 99661764 -3833210 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 281 4 1345 961 253 67 27 chr15 99661936 99661957 -3833017 - RLTR12A LTR ERVK -288 280 260 4 1345 1089 206 78 17 chr15 99661966 99662264 -3832710 - RLTR12A LTR ERVK -194 334 15 4 1345 2471 150 50 0 chr15 99662808 99663209 -3831765 + MTC LTR MaLR 1 421 0 4 1345 456 303 161 83 chr15 99670404 99670789 -3824185 + MLT1G3 LTR MaLR 27 441 -150 5 1345 1032 150 49 127 chr15 99671319 99671563 -3823411 - RMER4A LTR ERVK 0 466 242 5 1345 1385 140 58 21 chr15 99671789 99672029 -3822945 - RMER4A LTR ERVK -215 251 3 5 1345 285 276 13 0 chr15 99672262 99672338 -3822636 + RLTR20D LTR ERVK 369 445 -123 5 1345 257 256 193 60 chr15 99672338 99672421 -3822553 + RLTR16 LTR ERVK 412 505 0 5 1345 3148 51 18 10 chr15 99689007 99689404 -3805570 + MTB LTR MaLR 1 400 0 5 1345 565 189 119 32 chr15 99698919 99699045 -3795929 + MTC LTR MaLR 285 421 0 6 1345 298 345 58 44 chr15 99707249 99707455 -3787519 - MER57D LTR ERV1 -96 315 107 6 1345 1176 91 41 18 chr15 99707456 99707666 -3787308 - MTB LTR MaLR -204 203 1 6 1345 904 251 80 83 chr15 99712101 99712462 -3782512 + RLTR14 LTR ERV1 10 369 -13 6 1345 1847 211 109 143 chr15 99713290 99713920 -3781054 - RMER19C LTR ERVK -2 609 1 6 1345 2362 80 85 9 chr15 99716228 99716569 -3778405 - MTB LTR MaLR -33 367 1 6 1345 326 237 0 139 chr15 99717331 99717439 -3777535 - MT2B LTR ERVL -343 258 166 6 1345 3547 103 15 78 chr15 99717529 99717859 -3777115 + LTRIS2 LTR ERV1 1 296 -268 6 1345 3547 103 15 78 chr15 99717999 99718270 -3776704 + LTRIS2 LTR ERV1 297 564 0 6 1345 599 294 167 43 chr15 99723010 99723334 -3771640 + MTEa LTR MaLR 1 364 -15 6 1345 2134 157 31 28 chr15 99723513 99723726 -3771248 + RLTR14 LTR ERV1 22 234 -148 6 1345 2134 157 31 28 chr15 99723749 99723895 -3771079 + RLTR14 LTR ERV1 235 382 0 6 1345 3785 132 152 15 chr15 99724050 99724720 -3770254 - RMER13A LTR ERVK -98 762 1 6 1345 267 299 57 57 chr15 99727773 99727897 -3767077 + MLT1F1 LTR MaLR 276 399 -170 7 1345 3471 24 66 5 chr15 99729487 99729898 -3765076 + RLTR10C LTR ERVK 1 436 0 7 1345 1844 115 39 68 chr15 99731999 99732335 -3762639 + ORR1A3 LTR MaLR 1 326 0 7 1345 238 344 111 47 chr15 99733921 99734092 -3760882 - LTR16A LTR ERVL -165 286 105 7 1345 1121 223 38 47 chr15 99738413 99738854 -3756120 - MT2B LTR ERVL 0 601 12 7 1345 2604 74 3 0 chr15 99741633 99741958 -3753016 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 7 1345 3116 40 53 0 chr15 99744427 99744803 -3750171 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 7 1346 1346 222 24 45 chr15 99751564 99751894 -3743080 - ORR1D2-int LTR MaLR -1047 323 1 8 1346 1161 256 18 29 chr15 99752305 99752586 -3742388 - ORR1D2 LTR MaLR -57 313 36 8 1346 229 86 29 0 chr15 99752920 99752955 -3742019 - ORR1D2 LTR MaLR -334 36 1 8 1346 365 259 216 72 chr15 99754374 99754675 -3740299 - MTEa LTR MaLR -4 375 32 8 1346 266 330 247 34 chr15 99763134 99763434 -3731540 + MLT1C LTR MaLR 51 414 -53 8 1346 1884 120 128 74 chr15 99765062 99765413 -3729561 + ORR1B1 LTR MaLR 1 370 -24 8 1346 275 105 0 0 chr15 99766278 99766316 -3728658 + RMER6A LTR ERVK 1 38 -682 8 1346 3435 132 76 12 chr15 99766328 99766933 -3728041 + RMER6A LTR ERVK 113 756 0 8 1346 1815 168 110 54 chr15 99768059 99768468 -3726506 + RLTR20C LTR ERVK 1 432 -102 8 1346 459 234 105 49 chr15 99768522 99768594 -3726380 + RLTR20C LTR ERVK 440 519 -22 8 1346 3623 102 93 39 chr15 99779289 99779367 -3715607 - RLTR33 LTR ERVK 0 678 607 8 1346 5793 124 34 8 chr15 99779367 99780246 -3714728 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 8 1346 3623 102 93 39 chr15 99780246 99780624 -3714350 - RLTR33 LTR ERVK -72 606 200 8 1346 3623 102 93 39 chr15 99780800 99780984 -3713990 - RLTR33 LTR ERVK -479 199 2 8 1346 2973 53 53 8 chr15 99781377 99781756 -3713218 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 8 1346 367 289 63 54 chr15 99783950 99784195 -3710779 + RMER20B LTR ERVK 176 417 -225 9 1346 544 340 69 55 chr15 99787819 99788167 -3706807 - MTD LTR MaLR -8 411 59 9 1346 1311 199 80 26 chr15 99788082 99788433 -3706541 + MTD LTR MaLR 44 413 -6 9 1346 522 213 35 42 chr15 99790130 99790272 -3704702 - MT2B LTR ERVL -70 531 391 9 1346 484 152 0 0 chr15 99790485 99790564 -3704410 - MT2B LTR ERVL -454 79 1 9 1346 1383 175 77 3 chr15 99791414 99791700 -3703274 - MTC LTR MaLR -105 316 10 9 1346 701 219 216 32 chr15 99793816 99793938 -3701036 + ORR1D1 LTR MaLR 77 203 -171 9 1346 701 219 216 32 chr15 99794097 99794224 -3700750 + ORR1D1 LTR MaLR 204 372 -2 9 1346 4822 197 50 128 chr15 99794247 99794577 -3700397 + ORR1D1-int LTR MaLR 34 385 -985 9 1346 960 221 117 64 chr15 99794577 99794997 -3699977 + RMER10A LTR ERVL 1 442 0 9 1346 4822 197 50 128 chr15 99794997 99796115 -3698859 + ORR1D1-int LTR MaLR 386 1369 -1 9 1346 460 209 304 37 chr15 99796116 99796370 -3698604 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 9 1346 236 254 0 16 chr15 99800350 99800414 -3694560 - MT2C_Mm LTR ERVL -240 235 173 9 1346 3764 134 111 13 chr15 99800747 99801435 -3693539 - RMER6A LTR ERVK 0 756 2 9 1346 237 268 62 125 chr15 99812951 99812980 -3681994 - MT2B LTR ERVL -444 157 137 1 1346 226 200 49 24 chr15 99815579 99815661 -3679313 - MTEb LTR MaLR -2 377 294 1 1346 239 293 50 41 chr15 99830585 99830706 -3664268 - MT2B LTR ERVL -337 264 143 1 1346 549 311 161 13 chr15 99833415 99833570 -3661404 - MT2A LTR ERVL -77 456 267 1 1346 549 311 161 13 chr15 99833707 99833861 -3661113 - MT2A LTR ERVL -267 266 101 1 1346 534 198 6 105 chr15 99840945 99841126 -3653848 + RMER10B LTR ERVL 188 350 -48 1 1346 1494 240 52 92 chr15 99848959 99849492 -3645482 + RLTR18B LTR ERVK 1 512 0 1 1346 440 292 98 81 chr15 99852835 99853204 -3641770 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 2115 2503 -5275 1 1346 983 317 45 31 chr15 99853369 99853929 -3641045 + RLTR4_MM-int LTR ERV1 3338 3975 -3803 1 1346 2773 42 45 0 chr15 99853985 99854316 -3640658 - ORR1A0 LTR MaLR 0 346 1 1 1346 242 329 78 84 chr15 99854356 99854535 -3640439 - MLT1J-int LTR MaLR -50 1337 1160 1 1346 281 268 82 0 chr15 99855369 99855466 -3639508 - MLT1H LTR MaLR -15 534 430 1 1346 239 290 89 83 chr15 99855574 99855743 -3639231 - MLT1H LTR MaLR -251 238 69 1 1346 399 336 114 9 chr15 99856039 99856258 -3638716 - MLT1J-int LTR MaLR -488 899 658 1 1346 1039 195 41 20 chr15 99858640 99858886 -3636088 + MTD LTR MaLR 3 253 -166 1 1346 2929 149 48 36 chr15 99858986 99859509 -3635465 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 1 1346 422 288 40 40 chr15 99859838 99859990 -3634984 - RLTR19-int LTR ERVK -1758 4379 4228 1 1346 1031 279 46 86 chr15 99860137 99860639 -3634335 - RLTR19-int LTR ERVK -2028 4109 3628 1 1346 535 242 61 115 chr15 99860819 99861080 -3633894 - RLTR19-int LTR ERVK -2487 3650 3404 1 1346 308 246 70 116 chr15 99861380 99861509 -3633465 - RLTR19-int LTR ERVK -3114 3023 2901 1 1346 1054 254 131 44 chr15 99861596 99862094 -3632880 - RLTR19-int LTR ERVK -3254 2883 2343 1 1346 296 221 0 49 chr15 99862083 99862164 -3632810 - RLTR19-int LTR ERVK -3408 2114 2038 1 1346 410 168 5 171 chr15 99862195 99862417 -3632557 - RMER17C LTR ERVK -135 275 91 1 1346 666 188 31 119 chr15 99862425 99862471 -3632503 - RLTR19-int LTR ERVK -3471 2051 2024 1 1346 666 188 31 119 chr15 99862617 99862763 -3632211 - RLTR19-int LTR ERVK -3499 2023 1876 1 1346 618 130 10 0 chr15 99863021 99863121 -3631853 - RLTR14 LTR ERV1 -111 271 171 1 1346 2127 206 44 75 chr15 99863319 99863865 -3631109 - RLTR24 LTR ERV1 0 529 1 1 1346 3551 20 2 0 chr15 99864055 99864450 -3630524 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1346 674 203 82 6 chr15 99864884 99865043 -3629931 + RMER6C LTR ERVK 1 171 -519 1 1346 469 157 0 12 chr15 99865007 99865091 -3629883 + MT2B LTR ERVL 177 259 -342 1 1346 289 315 230 24 chr15 99865320 99865597 -3629377 - MLT1G LTR MaLR -2 589 220 1 1346 289 315 230 24 chr15 99865637 99865785 -3629189 - MLT1G LTR MaLR -372 219 76 1 1347 737 279 58 87 chr15 99877157 99877538 -3617436 + MTEa LTR MaLR 3 372 -7 1 1347 622 325 93 25 chr15 99877561 99877883 -3617091 - MLT1A0 LTR MaLR -21 344 1 1 1347 1011 259 74 101 chr15 99925834 99926160 -3568814 - MTE2a LTR MaLR 0 379 63 1 1347 440 255 149 87 chr15 99928435 99928716 -3566258 + RMER10A LTR ERVL 87 384 -58 1 1347 440 255 149 87 chr15 99928867 99928919 -3566055 + RMER10A LTR ERVL 385 441 -1 1 1347 3637 119 91 11 chr15 99929796 99930431 -3564543 - RMER6A LTR ERVK 0 756 71 1 1347 1867 232 72 52 chr15 99932116 99932656 -3562318 - RLTR20A1 LTR ERVK 0 551 1 1 1347 394 205 86 86 chr15 99932815 99932943 -3562031 + MT2B LTR ERVL 131 258 -343 1 1347 368 210 26 95 chr15 99939255 99939371 -3555603 + MT2B LTR ERVL 149 256 -345 1 1347 4143 178 127 10 chr15 99948144 99948941 -3546033 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 1 1347 867 271 117 52 chr15 99949066 99949409 -3545565 + MTE2a LTR MaLR 8 372 -7 1 1347 264 288 50 50 chr15 99953281 99953519 -3541455 + RMER17D LTR ERVK 214 451 -438 1 1347 409 213 13 0 chr15 99955806 99955881 -3539093 - MamGypLTR3 LTR Gypsy -83 756 681 1 1347 250 258 147 51 chr15 99958755 99958783 -3536191 - MT2B2 LTR ERVL -354 247 106 1 1347 2162 80 42 54 chr15 99960636 99960967 -3534007 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1347 1723 99 72 119 chr15 99965077 99965422 -3529552 - ORR1B1 LTR MaLR 0 329 1 1 1347 4999 193 72 137 chr15 99965422 99967168 -3527806 - ORR1B1-int LTR MaLR 0 1963 331 1 1347 539 68 0 0 chr15 99967166 99967239 -3527735 - ORR1B1-int LTR MaLR -1890 73 1 1 1347 1978 114 67 91 chr15 99967239 99967614 -3527360 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 29 1 1347 904 195 79 60 chr15 99968914 99968947 -3526027 - ORR1D1 LTR MaLR -102 272 243 1 1347 904 195 79 60 chr15 99968993 99969226 -3525748 - ORR1D1 LTR MaLR -132 242 1 1 1347 245 234 30 45 chr15 99971531 99971598 -3523376 - MLT1M LTR MaLR -379 293 228 1 1348 235 238 111 0 chr15 100010474 100010537 -3484437 - MLT1J LTR MaLR -335 177 108 3 1348 869 306 29 38 chr15 100027886 100028199 -3466775 - MTE2b LTR MaLR -19 360 51 8 1348 241 265 53 117 chr15 100028192 100028286 -3466688 - MTE2b LTR MaLR -281 98 11 8 1348 581 272 28 151 chr15 100033772 100033869 -3461105 - RLTR12B LTR ERVK -24 504 409 9 1348 581 276 35 140 chr15 100034052 100034458 -3460516 - RLTR12B LTR ERVK -120 408 11 9 1348 2064 143 87 20 chr15 100038759 100039116 -3455858 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 1 1 1348 2055 138 66 105 chr15 100053024 100053462 -3441512 + RLTR23 LTR ERV1 10 430 0 1 1348 282 296 79 8 chr15 100053997 100054123 -3440851 + RLTR6-int LTR ERV1 599 733 -6868 1 1348 361 333 23 6 chr15 100054468 100054643 -3440331 + RLTR6-int LTR ERV1 1290 1467 -6311 1 1348 269 349 20 50 chr15 100054668 100054870 -3440104 + RLTR6-int LTR ERV1 1647 1842 -5936 1 1348 284 294 22 89 chr15 100055101 100055280 -3439694 + RLTR6-int LTR ERV1 1812 1978 -2712 1 1348 360 307 15 0 chr15 100055941 100056078 -3438896 + RLTR6-int LTR ERV1 2720 2858 -4748 1 1348 369 264 134 81 chr15 100056329 100056696 -3438278 - RMER10A LTR ERVL -25 417 12 1 1348 263 194 28 56 chr15 100065175 100065246 -3429728 + MTE2a LTR MaLR 311 379 0 1 1348 288 240 103 10 chr15 100071402 100071499 -3423475 - LTR40a LTR ERVL -368 151 46 2 1348 2035 136 226 18 chr15 100076869 100077325 -3417649 + RMER4B LTR ERVK 17 567 -18 2 1348 287 191 93 28 chr15 100077388 100077496 -3417478 - RLTR17 LTR ERVK -105 587 473 2 1348 3096 140 38 19 chr15 100077510 100078042 -3416932 - RLTR17 LTR ERVK -137 555 14 2 1348 1302 143 153 70 chr15 100079237 100079537 -3415437 + ORR1A3 LTR MaLR 2 326 0 2 1348 3010 152 138 24 chr15 100088684 100089600 -3405374 - RLTR13D1 LTR ERVK 0 1023 1 2 1348 275 29 0 0 chr15 100094310 100094345 -3400629 + RLTRETN_Mm LTR ERVK 1 35 -287 2 1348 6588 92 14 52 chr15 100094345 100095412 -3399562 - MMETn-int LTR ERVK -1250 3594 2569 2 1348 473 255 9 18 chr15 100095515 100095627 -3399347 + MTD LTR MaLR 295 405 -14 2 1348 231 271 71 20 chr15 100095878 100095976 -3398998 + MLT2B2 LTR ERVL 457 559 -3 2 1348 1325 189 127 37 chr15 100096818 100097142 -3397832 - MTD LTR MaLR -8 411 59 2 1348 4433 37 2 8 chr15 100098383 100098897 -3396077 - LTRIS3 LTR ERV1 -1 511 1 2 1348 2172 149 16 29 chr15 100099395 100099688 -3395286 + MTC LTR MaLR 1 293 -128 2 1348 3778 98 50 11 chr15 100099688 100100233 -3394741 + RMER2 LTR ERV1 1 566 -1 2 1348 2172 149 16 29 chr15 100100233 100100296 -3394678 + MTC LTR MaLR 294 352 -69 2 1348 1928 90 82 16 chr15 100100296 100100611 -3394363 + RLTR9E LTR ERVK 1 336 -73 2 1348 355 171 32 153 chr15 100100625 100100749 -3394225 + ETnERV2-int LTR ERVK 2 110 -3204 2 1348 4536 147 92 33 chr15 100100766 100101900 -3393074 + ETnERV2-int LTR ERVK 108 2083 -5323 2 1348 3434 124 56 0 chr15 100102178 100102736 -3392238 + ETnERV2-int LTR ERVK 3442 4030 -3376 2 1348 270 250 0 27 chr15 100102730 100102804 -3392170 + ETnERV2-int LTR ERVK 4630 4701 -2543 2 1348 349 286 50 66 chr15 100102933 100103131 -3391843 + RLTR46 LTR ERVK 126 320 0 2 1348 3410 197 67 61 chr15 100103131 100103565 -3391409 + MMETn-int LTR ERVK 2310 2592 -2252 2 1348 3410 191 16 63 chr15 100103744 100104258 -3390716 + MMETn-int LTR ERVK 2593 3085 -1759 2 1348 1492 165 16 25 chr15 100104266 100104654 -3390320 + MMETn-int LTR ERVK 6222 6429 -977 2 1348 400 94 0 59 chr15 100104750 100104818 -3390156 + ETnERV2-int LTR ERVK 6009 6072 -1172 2 1348 1630 136 8 8 chr15 100104831 100105083 -3389891 + ETnERV3-int LTR ERVK 5529 5780 -28 2 1348 1970 187 142 8 chr15 100105090 100105574 -3389400 + RLTR13D6 LTR ERVK 1 549 -353 2 1348 378 68 0 92 chr15 100105574 100105639 -3389335 + ETnERV2-int LTR ERVK 7343 7401 -5 2 1348 1965 130 108 29 chr15 100105644 100106023 -3388951 + RLTR9E LTR ERVK 1 409 0 2 1348 238 167 129 32 chr15 100106023 100106079 -3388895 + MTD LTR MaLR 349 411 -8 2 1348 4190 53 14 4 chr15 100110034 100110541 -3384433 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 3 1348 473 211 28 19 chr15 100110563 100110669 -3384305 + RLTR23 LTR ERV1 324 430 0 3 1348 839 259 125 18 chr15 100114207 100114479 -3380495 + MTE2b LTR MaLR 67 367 -12 3 1348 3688 174 71 81 chr15 100125319 100125597 -3369377 + RMER17B LTR ERVK 1 297 -661 3 1348 3688 174 71 81 chr15 100125782 100126470 -3368504 + RMER17B LTR ERVK 298 958 0 3 1348 1549 171 42 112 chr15 100128475 100128876 -3366098 + ORR1D1 LTR MaLR 1 373 -1 3 1348 252 203 35 139 chr15 100129441 100129480 -3365494 + ORR1D2 LTR MaLR 26 59 -311 3 1348 3330 56 2 0 chr15 100129480 100129876 -3365098 - MTB LTR MaLR -3 397 1 3 1348 252 203 35 139 chr15 100129876 100129922 -3365052 + ORR1D2 LTR MaLR 60 102 -268 3 1348 762 226 50 43 chr15 100130044 100130280 -3364694 + ORR1D2 LTR MaLR 115 370 0 3 1349 2161 118 31 17 chr15 100139214 100139568 -3355406 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 359 -1489 4 1349 5467 172 95 9 chr15 100139716 100140119 -3354855 + RLTR22_Mur LTR ERVK 648 1116 -732 4 1349 5467 172 95 9 chr15 100140146 100140346 -3354628 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1117 1326 -522 4 1349 5467 172 95 9 chr15 100140379 100140878 -3354096 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1327 1846 -2 4 1349 846 267 92 60 chr15 100144909 100144942 -3350032 - ORR1E LTR MaLR -10 349 316 4 1349 2295 107 121 18 chr15 100144942 100145323 -3349651 + RLTR9B2 LTR ERVK 1 420 0 4 1349 846 267 92 60 chr15 100145323 100145624 -3349350 - ORR1E LTR MaLR -44 315 4 4 1349 532 209 81 50 chr15 100146285 100146506 -3348468 - RMER3D-int LTR ERVK -2033 809 582 4 1349 418 228 66 61 chr15 100146448 100146644 -3348330 + RMER3D-int LTR ERVK 387 583 -2259 4 1349 2975 147 86 4 chr15 100146645 100147156 -3347818 + RLTR17 LTR ERVK 140 692 0 4 1349 523 246 103 21 chr15 100147285 100147430 -3347544 + MER34 LTR ERV1 386 542 0 4 1349 232 333 69 0 chr15 100152948 100153050 -3341924 - RLTR47_MM LTR ERV1 -311 221 113 4 1349 3096 39 28 18 chr15 100155384 100155772 -3339202 - MTA_Mm LTR MaLR -4 392 1 4 1349 6246 112 45 24 chr15 100158139 100159150 -3335824 + RMER17A-int LTR ERVK 695 1726 -2 4 1349 2843 48 65 31 chr15 100159331 100159714 -3335260 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 4 1349 286 113 54 54 chr15 100163483 100163539 -3331435 + ERVL-E-int LTR ERVL 1777 1832 -3835 4 1349 373 288 93 0 chr15 100163941 100164080 -3330894 + ERVL-E-int LTR ERVL 2084 2235 -3432 4 1349 288 268 8 118 chr15 100170853 100170980 -3323994 - MT2B LTR ERVL -313 288 176 4 1349 3306 35 2 39 chr15 100172997 100173408 -3321566 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 5 1349 4241 119 16 70 chr15 100175920 100176714 -3318260 + RMER17A LTR ERVK 1 751 0 5 1349 7012 161 58 74 chr15 100176716 100176953 -3318021 + RMER17A-int LTR ERVK 3 248 -1480 5 1349 7012 161 58 74 chr15 100176974 100178488 -3316486 + RMER17A-int LTR ERVK 249 1726 -2 5 1349 2112 149 30 50 chr15 100178490 100178808 -3316166 + RMER17A LTR ERVK 1 407 -344 5 1349 2112 153 18 28 chr15 100178980 100179324 -3315650 + RMER17A LTR ERVK 408 751 0 5 1349 8349 162 45 104 chr15 100185897 100186695 -3308279 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1 653 -1195 5 1349 8349 162 45 104 chr15 100186891 100186940 -3308034 + RLTR22_Mur LTR ERVK 654 696 -1152 5 1349 8349 162 45 104 chr15 100187121 100187374 -3307600 + RLTR22_Mur LTR ERVK 697 999 -849 5 1349 8349 162 45 104 chr15 100187563 100188424 -3306550 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1000 1848 0 5 1349 844 282 90 48 chr15 100192396 100192728 -3302246 - ORR1E LTR MaLR -10 349 4 5 1349 281 297 0 106 chr15 100192904 100193036 -3301938 - MT2B LTR ERVL -313 288 171 5 1349 225 252 92 0 chr15 100198149 100198268 -3296706 + ORR1B1-int LTR MaLR 625 754 -755 5 1349 1391 228 160 50 chr15 100198582 100199057 -3295917 - RMER4B LTR ERVK -58 527 1 5 1349 316 297 116 67 chr15 100203486 100203847 -3291127 - MMTV-int LTR ERVK -2453 4800 4422 5 1349 1237 166 122 52 chr15 100203924 100204251 -3290723 - RMER12 LTR ERVK -34 1288 980 5 1349 1734 237 98 21 chr15 100204244 100204870 -3290104 - RMER12 LTR ERVK -546 858 1 5 1349 2269 144 114 5 chr15 100206331 100206709 -3288265 - MTC LTR MaLR 0 421 3 5 1349 225 301 0 57 chr15 100209291 100209379 -3285595 - LTR89 LTR ERVL? -726 153 71 6 1349 343 288 93 0 chr15 100209709 100209848 -3285126 + ERVL-E-int LTR ERVL 2084 2235 -3432 6 1349 282 314 8 68 chr15 100210688 100210821 -3284153 - MER21B LTR ERV1 -122 741 617 6 1349 2282 91 28 0 chr15 100227563 100227881 -3267093 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 6 1349 596 280 104 90 chr15 100229144 100229509 -3265465 + MTE2a LTR MaLR 1 370 -9 6 1349 1987 194 51 53 chr15 100230487 100230768 -3264206 + RLTR16 LTR ERVK 1 301 -204 6 1349 1987 194 51 53 chr15 100230914 100231138 -3263836 + RLTR16 LTR ERVK 302 505 0 6 1349 229 284 107 25 chr15 100234737 100234896 -3260078 + MTEb LTR MaLR 206 377 -2 6 1349 942 191 276 3 chr15 100238926 100239220 -3255754 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 6 1349 269 259 15 145 chr15 100246508 100246639 -3248335 + MT2B LTR ERVL 145 258 -343 6 1349 356 209 46 122 chr15 100258329 100258343 -3236631 + MT2B LTR ERVL 198 274 -327 7 1349 254 222 14 100 chr15 100258916 100258986 -3235988 + LTR16A LTR ERVL 45 108 -343 7 1349 297 269 86 0 chr15 100259019 100259112 -3235862 + LTR16A LTR ERVL 297 397 -54 7 1349 749 200 191 20 chr15 100261049 100261343 -3233631 - MTD LTR MaLR -8 411 1 7 1349 242 202 91 45 chr15 100262851 100262939 -3232035 - MT2C_Mm LTR ERVL -230 245 154 7 1349 300 225 41 98 chr15 100264231 100264354 -3230620 + MT2B LTR ERVL 163 278 -323 7 1349 984 243 276 28 chr15 100264585 100265012 -3229962 - MT2A LTR ERVL 0 533 1 7 1349 333 136 0 63 chr15 100265813 100265869 -3229105 - MTB_Mm LTR MaLR -5 414 362 7 1349 1210 165 95 34 chr15 100266113 100266377 -3228597 - MTB_Mm LTR MaLR -106 301 22 7 1349 1542 173 137 23 chr15 100267529 100267777 -3227197 - MTC LTR MaLR 0 421 173 7 1349 1542 173 137 23 chr15 100267922 100268016 -3226958 - MTC LTR MaLR -249 172 41 7 1350 540 282 128 9 chr15 100271320 100271538 -3223436 - ORR1D2 LTR MaLR -6 364 121 7 1350 453 265 62 97 chr15 100273528 100273754 -3221220 - ERVL-E-int LTR ERVL -5397 270 53 7 1350 237 330 50 20 chr15 100273811 100273910 -3221064 - MLT2F LTR ERVL 0 563 462 7 1350 228 338 0 42 chr15 100274248 100274319 -3220655 - ORR1D2 LTR MaLR -244 135 68 7 1350 978 41 8 0 chr15 100276240 100276361 -3218613 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 273 7 1350 250 103 0 25 chr15 100276354 100276394 -3218580 - ORR1B1 LTR MaLR -355 39 1 7 1350 470 192 91 97 chr15 100277680 100277830 -3217144 - RMER12 LTR ERVK -190 1132 994 8 1350 1873 222 165 69 chr15 100277919 100278640 -3216334 - RMER12 LTR ERVK -532 790 1 8 1350 894 225 85 23 chr15 100279431 100279690 -3215284 + ORR1D1 LTR MaLR 1 275 -99 8 1350 382 134 30 0 chr15 100279824 100279891 -3215083 + ORR1D1 LTR MaLR 302 370 0 8 1350 379 137 129 59 chr15 100285325 100285426 -3209548 - MT2B LTR ERVL -345 256 149 8 1350 3616 64 115 4 chr15 100286749 100287254 -3207720 - RMER2 LTR ERV1 -4 563 3 8 1350 1162 208 218 102 chr15 100291128 100291540 -3203434 - RMER6B LTR ERVK 0 461 2 8 1350 447 241 138 54 chr15 100295300 100295467 -3199507 + MTE2a LTR MaLR 1 181 -198 8 1350 249 266 152 0 chr15 100295640 100295719 -3199255 + MTE2a LTR MaLR 241 331 -48 8 1350 1182 171 88 21 chr15 100295719 100295958 -3199016 + RLTR18 LTR ERVK 1 255 -361 8 1350 974 150 164 52 chr15 100295958 100296011 -3198963 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 285 8 1350 974 150 164 52 chr15 100296201 100296379 -3198595 - ORR1A4 LTR MaLR -45 284 72 8 1350 1325 219 107 46 chr15 100296617 100297178 -3197796 - RMER12 LTR ERVK -597 807 31 8 1350 251 357 42 67 chr15 100304610 100304706 -3190268 - MLT1H1 LTR MaLR -290 265 174 8 1350 251 357 42 67 chr15 100304803 100304871 -3190103 - MLT1H1 LTR MaLR -382 173 105 8 1350 242 288 14 107 chr15 100326668 100326808 -3168166 - RLTR25A LTR ERVK -531 572 446 9 1350 236 195 101 121 chr15 100328532 100328631 -3166343 + LTR78 LTR ERV1 363 459 -845 9 1350 2276 128 95 10 chr15 100329327 100329720 -3165254 + MTC LTR MaLR 1 413 -8 9 1350 4127 52 20 12 chr15 100329804 100330312 -3164662 - RLTR1B LTR ERV1 0 512 1 9 1350 2248 88 6 48 chr15 100330313 100330649 -3164325 + ORR1A2 LTR MaLR 6 327 0 9 1350 1622 176 89 58 chr15 100331456 100331817 -3163157 + ORR1D1 LTR MaLR 1 372 -2 9 1350 351 250 27 91 chr15 100333346 100333456 -3161518 + MT2B LTR ERVL 155 257 -344 9 1350 492 241 9 9 chr15 100350362 100350471 -3144503 + RLTR33 LTR ERVK 175 283 -395 1 1350 353 284 57 85 chr15 100350946 100351006 -3143968 + MT2B2 LTR ERVL 176 327 -257 1 1350 274 225 44 111 chr15 100354470 100354560 -3140414 + MT2B LTR ERVL 156 239 -362 1 1350 237 208 139 0 chr15 100359641 100359713 -3135261 + MLT1A1 LTR MaLR 315 396 -12 1 1350 1459 162 70 13 chr15 100360012 100360312 -3134662 + RLTR11A2 LTR ERVK 211 527 0 1 1350 1463 121 405 20 chr15 100365209 100365513 -3129461 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1350 243 305 30 117 chr15 100365864 100365963 -3129011 - RLTR25B LTR ERVK -407 621 528 1 1350 243 305 30 117 chr15 100365986 100366083 -3128891 - RLTR25B LTR ERVK -501 527 442 1 1350 398 274 28 99 chr15 100369132 100369274 -3125700 + MT2B LTR ERVL 126 257 -344 1 1350 7325 50 14 2 chr15 100371134 100372017 -3122957 + RLTR13B1 LTR ERVK 1 893 0 1 1350 2218 100 19 0 chr15 100372952 100373271 -3121703 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 33 357 0 1 1350 7913 122 23 8 chr15 100373271 100374465 -3120509 + IAPEY3-int LTR ERVK 1 1211 -6469 1 1350 9424 108 4 17 chr15 100374446 100375807 -3119167 + IAPEy-int LTR ERVK 6171 7513 0 1 1350 2261 82 85 0 chr15 100375807 100376136 -3118838 + IAPEY2_LTR LTR ERVK 1 357 0 1 1350 3292 34 37 0 chr15 100376898 100377280 -3117694 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1350 9145 40 8 0 chr15 100377280 100378369 -3116605 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 1 1350 3348 23 0 0 chr15 100378369 100378755 -3116219 + MTA_Mm LTR MaLR 1 386 -10 1 1350 1212 235 200 62 chr15 100384317 100384821 -3110153 - RMER4B LTR ERVK -11 574 1 1 1350 3320 64 28 12 chr15 100385392 100385820 -3109154 + RLTR10C LTR ERVK 1 435 -1 1 1350 390 333 38 44 chr15 100386605 100386972 -3108002 + MMERGLN-int LTR ERV1 1308 1672 -5884 1 1350 2365 96 12 3 chr15 100387982 100388306 -3106668 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1350 1445 179 3 126 chr15 100389033 100389390 -3105584 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 82 1 1350 4145 14 0 46 chr15 100389390 100389907 -3105067 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1350 301 0 0 0 chr15 100389907 100389945 -3105029 - MERVL-int LTR ERVL 0 5485 5448 1 1350 379 167 46 35 chr15 100389945 100390032 -3104942 - ORR1B1-int LTR MaLR -1323 640 553 1 1350 39450 16 14 0 chr15 100390032 100395319 -3099655 - MERVL-int LTR ERVL -125 5360 1 1 1350 4115 14 0 57 chr15 100395319 100395842 -3099132 - MT2_Mm LTR ERVL 0 493 1 1 1350 304 336 89 41 chr15 100395893 100396346 -3098628 + MMERGLN-int LTR ERV1 2783 3288 -4268 1 1350 1747 150 75 0 chr15 100396649 100396955 -3098019 - ORR1A4 LTR MaLR 0 329 1 1 1350 365 350 59 63 chr15 100397112 100397329 -3097645 + MuLV-int LTR ERV1 2223 2438 -2625 1 1350 295 350 60 65 chr15 100397519 100397723 -3097251 + MuLV-int LTR ERV1 3742 3943 -3613 1 1350 665 314 80 42 chr15 100397849 100398274 -3096700 + MuLV-int LTR ERV1 4036 4476 -3130 1 1350 721 332 102 38 chr15 100398597 100399129 -3095845 + RLTR14-int LTR ERV1 2877 3442 -1875 1 1350 363 318 95 74 chr15 100399525 100399851 -3095123 + RLTR14-int LTR ERV1 4983 5315 -2 1 1350 361 278 109 16 chr15 100400497 100400625 -3094349 + RLTR14 LTR ERV1 230 369 -13 1 1351 993 312 93 54 chr15 100401244 100401705 -3093269 - MT2A LTR ERVL 0 533 55 1 1351 267 239 107 27 chr15 100401670 100401782 -3093192 - MTD LTR MaLR -298 121 1 1 1351 226 256 24 16 chr15 100412746 100412873 -3082101 - ORR1B1-int LTR MaLR -750 759 632 1 1351 1814 178 116 31 chr15 100420862 100421286 -3073688 + RMER6B LTR ERVK 2 461 0 1 1351 299 320 47 31 chr15 100425771 100425964 -3069010 + MLT1A0 LTR MaLR 214 396 -12 1 1351 811 163 50 11 chr15 100432017 100432197 -3062777 + RMER17C LTR ERVK 1 187 -223 1 1351 437 174 8 135 chr15 100432431 100432557 -3062417 - MT2B LTR ERVL -337 264 155 1 1351 301 215 125 55 chr15 100433133 100433261 -3061713 + RLTR13D6 LTR ERVK 727 863 -39 1 1351 1029 162 24 14 chr15 100433465 100433678 -3061296 + RMER17C LTR ERVK 196 410 0 1 1351 335 230 13 13 chr15 100434260 100434335 -3060639 - MLT1A0 LTR MaLR -257 108 34 1 1351 266 203 51 0 chr15 100442074 100442133 -3052841 - MTE2a LTR MaLR -317 62 1 1 1351 281 191 73 153 chr15 100455029 100455043 -3039931 - MT2B LTR ERVL -301 300 187 1 1351 2335 125 72 8 chr15 100483849 100484235 -3010739 + MTC LTR MaLR 3 413 -8 1 1351 230 319 48 56 chr15 100492336 100492361 -3002613 - MT2B LTR ERVL -357 244 195 1 1351 230 319 48 56 chr15 100492427 100492462 -3002512 - MT2B LTR ERVL -357 194 120 1 1351 1875 168 74 41 chr15 100520448 100520815 -2974159 - RLTR30 LTR ERV1 0 379 1 4 1351 1352 211 124 82 chr15 100525987 100526331 -2968643 + MTD LTR MaLR 1 353 -66 6 1351 1352 211 124 82 chr15 100526471 100526528 -2968446 + MTD LTR MaLR 354 419 0 6 1352 382 113 141 0 chr15 100532660 100532731 -2962243 + MTC LTR MaLR 1 81 -340 6 1352 1491 132 19 60 chr15 100533028 100533295 -2961679 + MTC LTR MaLR 158 413 -8 6 1352 1483 198 73 116 chr15 100540559 100540982 -2953992 + MTD LTR MaLR 15 419 0 9 1352 402 282 37 92 chr15 100541007 100541171 -2953803 + MTC-int LTR MaLR 92 246 -1012 9 1352 3249 216 88 45 chr15 100541174 100542031 -2952943 + MTC-int LTR MaLR 153 1045 -213 9 1352 582 279 194 8 chr15 100542323 100542463 -2952511 + MTE2a LTR MaLR 61 222 -157 9 1352 582 279 194 8 chr15 100542705 100542801 -2952173 + MTE2a LTR MaLR 223 343 -36 9 1352 243 219 92 40 chr15 100557158 100557234 -2937740 - LTR88c LTR Genie? -545 317 238 1 1352 316 181 59 69 chr15 100560920 100561021 -2933953 - RMER19C LTR ERVK -18 593 494 1 1352 289 195 110 0 chr15 100560993 100561075 -2933899 - RMER4B LTR ERVK -133 452 362 1 1352 1804 162 65 27 chr15 100564182 100564550 -2930424 - RLTR14 LTR ERV1 0 382 1 1 1352 285 235 103 87 chr15 100565001 100565127 -2929847 + MT2B LTR ERVL 151 278 -323 1 1352 1161 254 109 26 chr15 100566453 100566666 -2928308 + MTD LTR MaLR 44 281 -138 1 1352 643 227 88 238 chr15 100566666 100566827 -2928147 - ORR1D2 LTR MaLR -1 369 261 1 1352 643 227 88 238 chr15 100566974 100567216 -2927758 - ORR1D2 LTR MaLR -110 260 28 1 1352 643 227 88 238 chr15 100567524 100567551 -2927423 - ORR1D2 LTR MaLR -343 27 3 1 1352 1161 254 109 26 chr15 100567551 100567684 -2927290 + MTD LTR MaLR 282 419 0 1 1352 1903 157 77 6 chr15 100570653 100570817 -2924157 + MurERV4-int LTR ERVK 1851 2038 -3222 1 1352 1903 157 77 6 chr15 100570854 100571054 -2923920 + MurERV4-int LTR ERVK 2039 2240 -3020 1 1352 1121 163 52 52 chr15 100571063 100571315 -2923659 + ORR1B1 LTR MaLR 12 263 -131 1 1352 11172 130 36 42 chr15 100571315 100571975 -2922999 + MurERV4-int LTR ERVK 3035 3673 -1587 1 1352 11172 130 36 42 chr15 100572165 100573349 -2921625 + MurERV4-int LTR ERVK 3674 4854 -406 1 1352 11172 130 36 42 chr15 100573538 100573764 -2921210 + MurERV4-int LTR ERVK 4855 5092 -168 1 1352 1952 165 10 82 chr15 100573764 100574167 -2920807 + ORR1B1 LTR MaLR 13 386 -8 1 1352 536 266 12 108 chr15 100574216 100574381 -2920593 + MYSERV-int LTR ERVK 4523 4680 -1870 1 1352 536 266 12 108 chr15 100574553 100574623 -2920351 + MYSERV-int LTR ERVK 4681 4739 -1811 1 1352 265 196 0 0 chr15 100574881 100574932 -2920042 + MYSERV-int LTR ERVK 5078 5128 -652 1 1352 1238 238 46 13 chr15 100575253 100575560 -2919414 + MYSERV-int LTR ERVK 4810 5126 -1424 1 1352 604 230 25 80 chr15 100575560 100575759 -2919215 + RMER4A LTR ERVK 250 437 -29 1 1352 4564 179 45 62 chr15 100575790 100576913 -2918061 + MYSERV6-int LTR ERVK 7856 8959 0 1 1352 991 245 189 39 chr15 100576921 100577373 -2917601 + RMER4B LTR ERVK 17 467 -118 1 1352 1354 186 84 17 chr15 100578226 100578582 -2916392 + RMER17C LTR ERVK 1 380 -30 1 1352 1079 293 75 102 chr15 100579271 100579536 -2915438 - RLTR18B LTR ERVK -3 509 234 1 1352 1079 293 75 102 chr15 100579702 100579956 -2915018 - RLTR18B LTR ERVK -279 233 4 1 1352 1349 209 51 134 chr15 100580857 100581222 -2913752 - MTD LTR MaLR -12 407 72 1 1352 1349 230 40 128 chr15 100581378 100581468 -2913506 - MTD LTR MaLR -326 81 1 1 1352 973 189 118 43 chr15 100584549 100584804 -2910170 - MTD LTR MaLR -132 287 14 2 1352 1724 77 139 0 chr15 100589001 100589260 -2905714 + ORR1A2 LTR MaLR 1 295 -32 2 1352 235 272 9 132 chr15 100598188 100598294 -2896680 - MT2B2 LTR ERVL -337 247 155 2 1352 1289 258 57 64 chr15 100609938 100610361 -2884613 + MTC LTR MaLR 1 420 -1 2 1352 1953 182 141 11 chr15 100623174 100623248 -2871726 - RLTR20C LTR ERVK -12 522 446 2 1352 1953 182 141 11 chr15 100623281 100623668 -2871306 - RLTR20C LTR ERVK -89 445 2 2 1352 1956 180 80 10 chr15 100634513 100634928 -2860046 + RMER4A LTR ERVK 23 466 0 3 1352 241 274 15 114 chr15 100634928 100635058 -2859916 + MT2B LTR ERVL 153 269 -332 3 1352 501 246 242 34 chr15 100638293 100638623 -2856351 - MTD LTR MaLR 0 419 1 3 1352 2026 143 88 16 chr15 100642499 100642875 -2852099 + MTC LTR MaLR 2 404 -17 3 1352 2360 136 50 77 chr15 100649125 100649603 -2845371 - RMER4A LTR ERVK 0 466 2 3 1352 1450 122 57 0 chr15 100649605 100649850 -2845124 - MurERV4-int LTR ERVK -1 5259 5001 3 1352 556 261 78 53 chr15 100649863 100650183 -2844791 - RLTR15 LTR ERVK -17 342 15 3 1352 896 154 95 11 chr15 100650183 100650373 -2844601 - MurERV4-int LTR ERVK -263 4997 4792 3 1352 459 167 0 12 chr15 100650353 100650438 -2844536 - MurERV4-int LTR ERVK -2771 2489 2406 3 1352 4578 184 44 22 chr15 100650468 100651813 -2843161 - MurERV4-int LTR ERVK -2821 2439 975 3 1352 4462 211 128 6 chr15 100651897 100652949 -2842025 - RMER12B LTR ERVK -201 1203 23 3 1352 469 172 0 41 chr15 100653051 100653148 -2841826 - RMER12B LTR ERVK -1310 94 2 3 1352 507 120 56 9 chr15 100656604 100656725 -2838249 - ORR1B1 LTR MaLR -83 311 158 3 1352 411 183 104 19 chr15 100656873 100656979 -2837995 + MTD LTR MaLR 3 117 -302 3 1352 794 251 181 9 chr15 100657774 100658066 -2836908 + MTD LTR MaLR 32 405 -14 3 1353 508 286 49 80 chr15 100664933 100665321 -2829653 - RMER17C LTR ERVK -34 376 1 3 1353 3617 137 160 111 chr15 100667813 100668661 -2826313 - RMER19B LTR ERVK -12 890 1 3 1353 2127 78 11 0 chr15 100671014 100671296 -2823678 + ORR1A2 LTR MaLR 1 285 -42 3 1353 380 43 0 0 chr15 100671445 100671491 -2823483 + ORR1A2 LTR MaLR 273 318 -8 3 1353 228 277 0 30 chr15 100672113 100672180 -2822794 - MLT1A1 LTR MaLR -4 404 340 3 1353 892 273 112 12 chr15 100672208 100672531 -2822443 - MTE2b LTR MaLR -6 373 19 3 1353 683 267 144 79 chr15 100672539 100672942 -2822032 - MT2A LTR ERVL -11 522 94 3 1353 353 252 20 29 chr15 100673146 100673248 -2821726 - MT2A LTR ERVL -432 101 1 3 1353 1211 131 18 72 chr15 100674100 100674322 -2820652 - ORR1C2 LTR MaLR -3 381 172 3 1353 755 240 35 35 chr15 100674584 100674832 -2820142 - ORR1D1 LTR MaLR -133 245 2 3 1353 497 257 38 167 chr15 100679302 100679512 -2815462 + RMER15 LTR ERVL 375 557 -18 4 1353 2443 96 8 63 chr15 100682471 100682851 -2812123 - RLTR10D LTR ERVK 0 359 1 4 1353 249 295 94 91 chr15 100683108 100683373 -2811601 + ORR1E LTR MaLR 55 320 -39 4 1353 976 173 299 4 chr15 100684713 100684974 -2810000 - MTD LTR MaLR -58 361 24 4 1353 2966 63 47 3 chr15 100686862 100687245 -2807729 + MTB LTR MaLR 1 400 0 4 1353 971 223 69 62 chr15 100688272 100688592 -2806382 - ORR1D2 LTR MaLR -7 363 42 4 1353 3117 61 2 39 chr15 100689246 100689455 -2805519 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 194 4 1353 3117 61 2 39 chr15 100689931 100690125 -2804849 - MTA_Mm LTR MaLR -203 193 2 4 1353 1354 224 16 74 chr15 100696072 100696438 -2798536 - ORR1D1 LTR MaLR -29 345 1 4 1353 2356 127 32 11 chr15 100717133 100717506 -2777468 - ORR1C2 LTR MaLR 0 384 4 4 1353 857 220 73 36 chr15 100719939 100720198 -2774776 + MTD LTR MaLR 75 405 -14 4 1353 2351 219 133 115 chr15 100720202 100721211 -2773763 + MTD-int LTR MaLR 1 1098 -160 4 1353 459 224 155 7 chr15 100721391 100721539 -2773435 + MTD-int LTR MaLR 1086 1255 -3 4 1353 484 151 194 0 chr15 100721608 100721701 -2773273 + MTD LTR MaLR 308 418 -1 4 1353 227 242 48 0 chr15 100722391 100722453 -2772521 - RMER15 LTR ERVL -108 467 403 5 1353 1433 158 113 0 chr15 100730358 100730624 -2764350 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 79 5 1353 2333 83 10 0 chr15 100730625 100730939 -2764035 + ORR1A3 LTR MaLR 2 318 -8 5 1353 438 144 0 98 chr15 100730943 100731035 -2763939 - ORR1D1 LTR MaLR -291 83 1 5 1353 950 254 95 84 chr15 100733359 100733411 -2761563 + MTE2a LTR MaLR 4 60 -319 5 1353 950 254 95 84 chr15 100733597 100733911 -2761063 + MTE2a LTR MaLR 61 375 -4 5 1353 316 206 0 0 chr15 100734311 100734374 -2760600 - MER74A LTR ERVL -249 309 247 5 1353 1175 223 160 14 chr15 100743103 100743453 -2751521 - MER31A LTR ERV1 -82 403 3 5 1353 290 286 80 75 chr15 100746330 100746530 -2748444 + RLTR21 LTR ERVK 1056 1256 -316 5 1353 2516 80 6 0 chr15 100758194 100758519 -2736455 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 5 1353 1960 175 33 18 chr15 100763137 100763532 -2731442 - RMER17C LTR ERVK -9 401 1 5 1353 1452 141 256 20 chr15 100770844 100771141 -2723833 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 6 1353 2284 183 81 19 chr15 100771543 100771597 -2723377 - RLTR20A1 LTR ERVK -41 510 448 6 1353 2284 183 81 19 chr15 100771639 100772064 -2722910 - RLTR20A1 LTR ERVK -104 447 2 6 1353 2240 114 6 0 chr15 100777698 100778015 -2716959 - ORR1A2 LTR MaLR -8 319 1 6 1353 1072 254 89 39 chr15 100778308 100778669 -2716305 - MTEb LTR MaLR 0 379 1 6 1353 928 332 86 79 chr15 100778676 100779311 -2715663 - MTEb-int LTR MaLR -24 1556 912 6 1353 928 332 86 79 chr15 100779452 100779664 -2715310 - MTEb-int LTR MaLR -669 911 703 6 1353 590 287 31 0 chr15 100779692 100779821 -2715153 - MTEb LTR MaLR -246 133 1 6 1353 339 264 36 194 chr15 100781137 100781466 -2713508 - ORR1E LTR MaLR -6 353 77 6 1353 1011 285 64 31 chr15 100792428 100792786 -2702188 - MTEb LTR MaLR -2 377 8 6 1354 302 359 127 45 chr15 100821122 100821312 -2673662 + MER89 LTR ERV1 244 449 -110 7 1354 2003 109 44 6 chr15 100821312 100821627 -2673347 + ORR1A2 LTR MaLR 1 327 0 7 1354 302 359 127 45 chr15 100821627 100821704 -2673270 + MER89 LTR ERV1 450 533 -26 7 1354 259 297 56 138 chr15 100828441 100828490 -2666484 - MT2B LTR ERVL -455 146 111 7 1354 254 323 71 0 chr15 100834538 100834637 -2660337 - RMER12 LTR ERVK -471 851 746 7 1354 242 224 26 89 chr15 100836841 100837032 -2657942 - RMER17C LTR ERVK -161 249 71 7 1354 1093 261 96 26 chr15 100849899 100850292 -2644682 - MT2B LTR ERVL 0 601 56 7 1354 301 174 119 97 chr15 100850277 100850411 -2644563 - MT2B LTR ERVL -456 145 9 7 1354 282 281 78 17 chr15 100864436 100864552 -2630422 - MTEa LTR MaLR -112 267 145 7 1354 2391 140 78 3 chr15 100866575 100866962 -2628012 - MTC LTR MaLR -1 420 5 7 1354 405 184 0 112 chr15 100868212 100868328 -2626646 + MT2B LTR ERVL 156 258 -343 7 1354 2305 182 62 24 chr15 100879713 100880248 -2614726 + RLTR31_Mm LTR ERVK 1 555 -6 7 1354 595 270 235 17 chr15 100917363 100917657 -2577317 - MLT1F1 LTR MaLR -2 567 210 8 1354 1709 217 34 43 chr15 100917735 100918150 -2576824 - MTC LTR MaLR -10 411 1 8 1354 412 339 67 110 chr15 100918537 100918911 -2576063 - ORR1E LTR MaLR 0 359 2 8 1354 226 385 15 44 chr15 100920532 100920668 -2574306 + MLT1L LTR MaLR 299 430 -180 8 1355 495 283 85 66 chr15 100930600 100930812 -2564162 - MT2B LTR ERVL -88 513 298 8 1355 610 251 73 90 chr15 100938307 100938775 -2556199 - RMER4B LTR ERVK -14 452 17 9 1355 234 285 170 2 chr15 100940812 100940969 -2554005 - MLT1A LTR MaLR -84 290 100 9 1355 318 290 60 87 chr15 100941885 100942070 -2552904 - MLT1A LTR MaLR -86 288 109 9 1355 375 258 43 0 chr15 100942952 100943045 -2551929 + MTE2b LTR MaLR 239 335 -44 9 1355 3303 41 28 0 chr15 100945534 100945923 -2549051 + MTB LTR MaLR 1 400 0 9 1355 300 336 124 0 chr15 100950479 100950616 -2544358 + MTEa LTR MaLR 2 155 -224 9 1355 729 129 0 119 chr15 100952783 100952942 -2542032 + ORR1A4 LTR MaLR 1 140 -189 9 1355 1683 180 141 9 chr15 100955285 100955611 -2539363 + ORR1D1 LTR MaLR 4 372 -2 9 1355 231 164 36 18 chr15 100960655 100960711 -2534263 - RLTR13D3 LTR ERVK -48 1066 1010 9 1355 328 281 65 16 chr15 100960743 100960866 -2534108 - ETnERV2-int LTR ERVK -7218 188 60 9 1355 1586 173 166 3 chr15 100987021 100987340 -2507634 + ORR1D1 LTR MaLR 3 373 -1 1 1355 322 277 56 93 chr15 100991528 100991631 -2503343 + MT2B LTR ERVL 63 157 -444 1 1355 425 270 225 13 chr15 100998102 100998338 -2496636 - RMER15 LTR ERVL -14 561 276 1 1355 2272 102 9 18 chr15 101000079 101000409 -2494565 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1355 233 200 37 206 chr15 101001700 101001807 -2493167 + MT2B LTR ERVL 152 240 -361 5 1355 431 339 63 47 chr15 101010838 101011171 -2483803 + MLT1E1A LTR MaLR 223 529 -151 2 1355 390 144 0 108 chr15 101031587 101031680 -2463294 + MT2B LTR ERVL 166 248 -353 6 1355 569 264 122 20 chr15 101032050 101032247 -2462727 - ORR1D1 LTR MaLR -157 217 1 6 1355 2749 179 34 58 chr15 101036311 101036893 -2458081 - RLTR12A LTR ERVK 0 568 1 7 1355 395 302 113 52 chr15 101046136 101046349 -2448625 - MLT2C1 LTR ERVL -20 377 152 8 1355 228 279 70 81 chr15 101046349 101046435 -2448539 + ORR1E LTR MaLR 1 85 -274 8 1355 654 277 152 98 chr15 101046597 101046933 -2448041 - MTE2b LTR MaLR -25 354 1 8 1355 2222 86 13 0 chr15 101049304 101049619 -2445355 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1355 468 311 100 0 chr15 101049842 101050022 -2444952 - MLT1A0 LTR MaLR -42 323 126 1 1355 2230 142 11 60 chr15 101050019 101050370 -2444604 - MTC LTR MaLR -8 413 82 1 1355 2230 142 11 60 chr15 101050511 101050593 -2444381 - MTC LTR MaLR -340 81 1 1 1355 275 289 30 91 chr15 101050593 101050692 -2444282 - MLT1A0 LTR MaLR -270 138 46 1 1356 1231 187 26 30 chr15 101073911 101074176 -2420798 + MTD LTR MaLR 2 265 -154 1 1356 2262 146 100 18 chr15 101079876 101080315 -2414659 + RMER15 LTR ERVL 1 475 -100 1 1356 718 146 53 15 chr15 101080482 101080614 -2414360 + RMER15 LTR ERVL 439 575 0 1 1356 4790 255 58 22 chr15 101080614 101082089 -2412885 + RMER15-int LTR ERVL 1 1690 -3309 1 1356 2431 107 3 3 chr15 101082089 101082416 -2412558 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 1 1356 4790 259 37 26 chr15 101082416 101082779 -2412195 + RMER15-int LTR ERVL 1691 2038 -2961 1 1356 790 231 156 11 chr15 101082749 101083115 -2411859 + RMER15-int LTR ERVL 4539 4957 -42 1 1356 2701 155 50 27 chr15 101083125 101083649 -2411325 + RMER15 LTR ERVL 1 536 -39 1 1356 426 287 106 52 chr15 101112630 101112998 -2381976 - MLT2B4 LTR ERVL -19 548 78 2 1356 716 174 148 6 chr15 101118988 101119185 -2375789 - ORR1D1-int LTR MaLR -128 1452 1068 2 1356 1776 180 79 37 chr15 101119273 101119677 -2375297 - ORR1D1-int LTR MaLR -949 421 1 2 1356 1151 201 84 84 chr15 101119681 101119980 -2374994 - ORR1D1 LTR MaLR -8 366 68 2 1356 404 277 78 37 chr15 101127229 101127473 -2367501 + RMER12 LTR ERVK 735 988 -334 2 1356 1364 211 72 47 chr15 101127809 101128168 -2366806 - ORR1D2 LTR MaLR -2 368 1 2 1356 1713 171 50 20 chr15 101128210 101128303 -2366671 + ORR1D1 LTR MaLR 7 104 -270 2 1356 1713 171 50 20 chr15 101128353 101128616 -2366358 + ORR1D1 LTR MaLR 105 372 -2 2 1356 263 309 93 22 chr15 101129761 101129900 -2365074 - MLT1K LTR MaLR -62 533 385 2 1356 2006 144 25 113 chr15 101133318 101133563 -2361411 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 166 2 1356 2006 144 25 113 chr15 101133744 101133906 -2361068 - ORR1D1 LTR MaLR -209 165 3 2 1356 429 62 31 0 chr15 101134824 101134888 -2360086 - MTB LTR MaLR 0 400 335 2 1356 1594 198 137 56 chr15 101134888 101134922 -2360052 - RLTR31A_Mm LTR ERVK 0 561 521 2 1356 2146 149 44 40 chr15 101135067 101135551 -2359423 - RLTR31A_Mm LTR ERVK -41 520 1 2 1356 2361 86 9 0 chr15 101135551 101135888 -2359086 - MTB LTR MaLR -60 340 1 2 1356 592 272 5 61 chr15 101142307 101142419 -2352555 + MT2A LTR ERVL 8 108 -425 2 1356 1903 191 65 5 chr15 101142419 101142803 -2352171 - MTD LTR MaLR 0 419 13 2 1356 1378 229 92 16 chr15 101142819 101143188 -2351786 + MT2A LTR ERVL 137 533 0 2 1356 302 234 0 49 chr15 101144050 101144131 -2350843 + MLT1A1 LTR MaLR 331 407 -1 2 1356 2465 72 15 42 chr15 101144676 101144779 -2350195 + ORR1A2 LTR MaLR 5 96 -231 2 1356 2465 72 15 42 chr15 101144969 101145196 -2349778 + ORR1A2 LTR MaLR 97 326 -1 2 1356 1183 185 19 57 chr15 101145654 101145918 -2349056 - MTC LTR MaLR -54 367 114 2 1356 499 254 165 25 chr15 101147290 101147411 -2347563 + MTB_Mm LTR MaLR 1 151 -256 2 1356 1509 201 104 23 chr15 101147411 101147757 -2347217 - ORR1D1 LTR MaLR 0 374 1 2 1356 499 254 165 25 chr15 101147757 101147877 -2347097 + MTB_Mm LTR MaLR 152 276 -131 2 1356 246 279 15 0 chr15 101148332 101148400 -2346574 - MLT1J LTR MaLR -335 177 109 2 1356 262 281 125 44 chr15 101153346 101153506 -2341468 + MLT1F1 LTR MaLR 166 338 -231 3 1356 441 260 95 14 chr15 101153517 101153665 -2341309 + MLT1F1 LTR MaLR 402 561 -8 3 1356 279 305 81 24 chr15 101155569 101155731 -2339243 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2288 2499 -3258 3 1356 1476 211 66 44 chr15 101155873 101156038 -2338936 + ORR1D1 LTR MaLR 1 167 -207 3 1356 1476 211 66 44 chr15 101156076 101156276 -2338698 + ORR1D1 LTR MaLR 168 373 -1 3 1356 435 251 152 34 chr15 101156933 101157110 -2337864 - MLT1D LTR MaLR -6 499 302 3 1356 229 330 136 83 chr15 101170633 101170861 -2324113 - LTR84b LTR ERVL -348 413 174 3 169 638 182 0 81 chr15 101187509 101187655 -2307319 + ORR1C1 LTR MaLR 1 131 -247 3 1357 454 211 11 0 chr15 101187657 101187752 -2307222 + ORR1C1 LTR MaLR 263 358 -26 3 1357 410 260 7 136 chr15 101208022 101208169 -2286805 + MLT1D LTR MaLR 370 497 -8 3 1357 1800 222 47 2 chr15 101222282 101222678 -2272296 - MTD LTR MaLR -14 405 1 4 1357 1100 83 13 0 chr15 101223485 101223641 -2271333 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 237 4 1357 279 333 102 0 chr15 101223699 101223807 -2271167 - MER21B LTR ERV1 -291 572 454 4 1357 267 221 43 14 chr15 101224178 101224247 -2270727 - MER21B LTR ERV1 -775 88 18 4 1357 3130 143 214 2 chr15 101228607 101229215 -2265759 - RMER19A LTR ERVK 0 737 1 4 1357 339 262 78 54 chr15 101230759 101231017 -2263957 + RMER17C LTR ERVK 133 396 -14 4 1357 348 74 0 0 chr15 101237087 101237141 -2257833 + ORR1A4 LTR MaLR 1 54 -275 4 1357 1661 222 25 40 chr15 101237421 101237825 -2257149 - MTD LTR MaLR -14 405 8 4 1357 1162 176 194 7 chr15 101238371 101238680 -2256294 + ORR1D2 LTR MaLR 1 367 -3 4 1357 291 196 0 0 chr15 101247517 101247568 -2247406 + MTEa LTR MaLR 1 51 -328 4 1357 364 319 25 33 chr15 101247741 101247861 -2247113 + MTEa LTR MaLR 65 183 -196 4 1357 230 343 42 21 chr15 101252528 101252671 -2242303 - ORR1E LTR MaLR -210 149 4 4 1357 505 252 117 48 chr15 101254723 101255020 -2239954 - RLTR9B LTR ERVK -19 418 8 4 1357 858 146 84 18 chr15 101259674 101259841 -2235133 - MTC-int LTR MaLR -1080 178 1 4 1357 1932 188 64 101 chr15 101259854 101260483 -2234491 + MTC-int LTR MaLR 469 1098 -160 4 1357 937 288 68 120 chr15 101260660 101260862 -2234112 + MTC-int LTR MaLR 1068 1257 -1 4 1357 1988 144 113 11 chr15 101260863 101261243 -2233731 + MTC LTR MaLR 1 419 -2 4 1357 1991 93 27 63 chr15 101274313 101274646 -2220328 - ORR1A3 LTR MaLR 0 326 6 4 1357 616 325 110 58 chr15 101275147 101275701 -2219273 - MER54B LTR ERVL -29 764 112 4 1357 1320 206 146 15 chr15 101276719 101277054 -2217920 + MTEb LTR MaLR 1 379 0 5 1357 1507 232 102 29 chr15 101277095 101277575 -2217399 - RLTR20B1 LTR ERVK 0 563 49 5 1357 1832 137 0 67 chr15 101280058 101280402 -2214572 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 1 5 1357 3325 117 22 40 chr15 101281543 101282096 -2212878 - MT2B2 LTR ERVL 0 584 42 5 1357 741 345 97 29 chr15 101287577 101287998 -2206976 - MT2A LTR ERVL -82 451 2 5 1357 504 290 46 64 chr15 101311682 101311855 -2183119 + MTEa LTR MaLR 10 179 -200 5 1357 317 278 130 65 chr15 101311697 101311897 -2183077 + MLT2B2 LTR ERVL 25 237 -278 5 1357 546 290 90 78 chr15 101316712 101317056 -2177918 + ORR1E LTR MaLR 9 356 -3 5 1358 332 319 55 66 chr15 101319149 101319330 -2175644 + RLTR22_Mur LTR ERVK 1306 1484 -364 5 1358 346 313 119 81 chr15 101325929 101326273 -2168701 - ORR1E LTR MaLR -2 357 1 5 1358 234 333 21 10 chr15 101326576 101326673 -2168301 + MLT1A1 LTR MaLR 291 391 -17 5 1358 1641 139 88 110 chr15 101328385 101328511 -2166463 - RMER17C LTR ERVK 0 410 285 5 1358 1641 139 88 110 chr15 101328543 101328835 -2166139 - RMER17C LTR ERVK -126 284 2 5 1358 403 300 117 43 chr15 101328893 101329228 -2165746 + ORR1E LTR MaLR 1 376 -3 5 1358 3076 171 108 63 chr15 101329511 101330212 -2164762 + RMER19A LTR ERVK 1 733 -4 5 1358 712 206 12 0 chr15 101330797 101330957 -2164017 - RMER17C LTR ERVK -248 162 1 5 1358 1429 153 268 12 chr15 101333734 101334059 -2160915 - RMER17C LTR ERVK -2 408 1 5 1358 2496 93 48 47 chr15 101339479 101339927 -2155047 + RMER16 LTR ERVK 1 533 0 5 1358 1623 238 77 0 chr15 101341784 101342162 -2152812 - MTD LTR MaLR -1 418 12 5 1358 377 174 60 27 chr15 101342526 101342638 -2152336 - ORR1D1 LTR MaLR -86 292 158 5 1358 526 275 27 7 chr15 101342720 101342870 -2152104 - ORR1D1 LTR MaLR -188 186 34 5 1358 1950 116 3 22 chr15 101342898 101343216 -2151758 + ORR1A3 LTR MaLR 15 326 0 5 1358 4441 140 79 0 chr15 101343725 101344405 -2150569 - RMER19A LTR ERVK -3 734 1 5 1358 349 184 26 0 chr15 101345642 101345718 -2149256 + MTC-int LTR MaLR 1181 1258 0 5 1358 2260 169 47 15 chr15 101345718 101346126 -2148848 + MTC LTR MaLR 1 421 0 5 1358 491 233 197 33 chr15 101354047 101354275 -2140699 - RMER12 LTR ERVK -133 1189 975 6 1358 1873 148 178 6 chr15 101386239 101386598 -2108376 + MTC LTR MaLR 1 421 0 6 1358 327 290 112 99 chr15 101416050 101416211 -2078763 + MTEa LTR MaLR 3 165 -214 6 1358 252 352 120 30 chr15 101416227 101416394 -2078580 + MT2A LTR ERVL 208 389 -144 6 1358 467 289 93 89 chr15 101416420 101416667 -2078307 + MTEa LTR MaLR 132 379 0 6 1358 2318 190 49 4 chr15 101419708 101419972 -2075002 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -534 1792 1524 6 1358 2318 190 49 4 chr15 101420012 101420218 -2074756 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -803 1523 1303 6 1358 1331 157 104 44 chr15 101420229 101420666 -2074308 - RLTR1B LTR ERV1 -76 436 1 6 1358 4855 38 57 0 chr15 101420666 101421245 -2073729 - RLTR1B-int LTR ERV1 0 3299 2688 6 1358 9641 75 43 87 chr15 101421243 101422723 -2072251 - RLTR1B-int LTR ERV1 -765 2534 1119 6 1358 1559 131 14 21 chr15 101422719 101423008 -2071966 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1007 1319 1033 6 1358 312 295 93 28 chr15 101423008 101423116 -2071858 - RMER4A LTR ERVK -42 424 310 6 1358 4739 174 21 40 chr15 101423120 101424088 -2070886 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -1474 1368 1 6 1358 1744 218 48 50 chr15 101424955 101425433 -2069541 - RLTR11A LTR ERVK -28 500 24 6 1358 712 333 65 68 chr15 101429745 101429951 -2065023 - MLT2B4 LTR ERVL 0 397 217 6 1358 712 297 81 42 chr15 101430003 101430197 -2064777 - MLT2B4 LTR ERVL -333 223 13 6 1358 668 291 114 88 chr15 101430738 101431134 -2063840 + MLT2D LTR ERVL 9 414 0 6 1358 618 139 107 57 chr15 101431241 101431363 -2063611 + RMER4B LTR ERVK 458 585 0 6 1358 3566 151 17 14 chr15 101431363 101431942 -2063032 - MurERV4-int LTR ERVK -2665 2595 2015 6 1358 4818 153 17 27 chr15 101432370 101433196 -2061778 - MurERV4-int LTR ERVK -3374 1886 1069 6 1358 2015 213 16 26 chr15 101442451 101442879 -2052095 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 104 7 1358 1226 197 4 21 chr15 101442881 101443119 -2051855 + RMER19B LTR ERVK 669 902 0 7 1358 3161 136 49 0 chr15 101443130 101443617 -2051357 + MurERV4_19-int LTR ERVK 717 1227 -4553 7 1358 5064 124 46 1 chr15 101443614 101444413 -2050561 + MurERV4_19-int LTR ERVK 3000 3834 -1946 7 1358 2101 168 48 0 chr15 101444545 101444902 -2050072 - MurERV4-int LTR ERVK -3346 1914 1541 7 1358 1502 143 51 4 chr15 101444894 101445147 -2049827 - MurERV4-int LTR ERVK -4949 311 47 7 1358 2496 192 86 36 chr15 101445151 101445708 -2049266 - RMER4B LTR ERVK 0 585 1 7 1359 672 141 8 30 chr15 101451216 101451348 -2043626 - MTC-int LTR MaLR -1000 258 130 7 1359 11646 80 50 33 chr15 101452468 101452751 -2042223 + RLTR22_Mus LTR ERVK 1 303 -1505 7 1359 11646 80 50 33 chr15 101452897 101454391 -2040583 + RLTR22_Mus LTR ERVK 304 1808 0 7 1359 823 114 0 8 chr15 101459988 101460112 -2034862 - RMER19B LTR ERVK 0 902 780 7 1359 4739 170 16 27 chr15 101460653 101461457 -2033517 - RMER19B LTR ERVK -107 795 1 7 1359 5803 118 58 98 chr15 101461457 101461895 -2033079 - MurERV4_19-int LTR ERVK 0 5780 5429 7 1359 5803 161 53 61 chr15 101461973 101463263 -2031711 - MurERV4_19-int LTR ERVK -161 5619 4339 7 1359 1292 174 13 4 chr15 101466165 101466402 -2028572 - RLTR11A2 LTR ERVK 0 527 289 7 1359 257 287 57 103 chr15 101470745 101470939 -2024035 - RMER20A LTR ERVK -276 240 56 7 1359 666 152 9 0 chr15 101470994 101471106 -2023868 + MurERV4-int LTR ERVK 1016 1128 -4132 7 1359 2286 283 33 91 chr15 101480467 101480753 -2014221 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -675 1651 1378 7 1359 2286 286 60 78 chr15 101481341 101482747 -2012227 - MYSERV16_I-int LTR ERVK -949 1377 2 7 1359 2068 238 22 10 chr15 101483985 101484477 -2010497 - RLTR11A2 LTR ERVK -7 520 23 7 1359 2209 246 12 76 chr15 101484599 101484721 -2010253 + RMER19C LTR ERVK 3 125 -486 7 1359 2209 246 12 76 chr15 101484741 101485266 -2009708 + RMER19C LTR ERVK 126 609 -2 7 1359 894 194 37 36 chr15 101496581 101496882 -1998092 + RMER4B LTR ERVK 250 585 0 7 1359 2013 171 175 17 chr15 101496883 101497594 -1997380 + MurERV4-int LTR ERVK 2 923 -4337 7 1359 2237 167 22 27 chr15 101497603 101497731 -1997243 + MurERV4-int LTR ERVK 617 751 -4509 7 1359 790 276 65 68 chr15 101497731 101498100 -1996874 - RLTR9A LTR ERVK 0 368 1 7 1359 2237 167 22 27 chr15 101498100 101498378 -1996596 + MurERV4-int LTR ERVK 752 1021 -4239 7 1359 527 239 138 30 chr15 101498519 101498752 -1996222 - RMER20B LTR ERVK -228 399 134 7 1359 5007 185 14 7 chr15 101498905 101499792 -1995182 + MurERV4-int LTR ERVK 1016 1908 -3352 7 1359 517 265 82 72 chr15 101500001 101500270 -1994704 + MurERV4_19-int LTR ERVK 4943 5371 -409 1 1359 283 333 24 67 chr15 101500270 101500434 -1994540 + RMER4A LTR ERVK 261 417 -49 2 1359 2836 276 43 38 chr15 101500435 101500635 -1994339 + MYSERV-int LTR ERVK 1037 1238 -1088 3 1359 3348 237 70 23 chr15 101501000 101502080 -1992894 + MYSERV-int LTR ERVK 5415 6548 -2 3 1359 361 155 0 0 chr15 101502081 101502139 -1992835 + RLTR11A2 LTR ERVK 1 58 -469 3 1359 4303 155 99 81 chr15 101516648 101517534 -1977440 - RMER19B LTR ERVK 0 902 1 1 1359 274 248 38 23 chr15 101534011 101534042 -1960932 + ORR1B1-int LTR MaLR 614 646 -863 3 1359 420 382 67 14 chr15 101535179 101535535 -1959439 + LTR52-int LTR ERVL 127 501 -3055 3 1359 322 308 11 40 chr15 101535934 101536110 -1958864 + LTR52-int LTR ERVL 1067 1237 -2319 3 1359 299 292 93 85 chr15 101536226 101536473 -1958501 + LTR52-int LTR ERVL 1492 1740 -3945 3 1359 387 317 23 23 chr15 101536888 101537059 -1957915 + LTR52-int LTR ERVL 2301 2471 -1085 3 1359 790 317 78 67 chr15 101549208 101549381 -1945593 + MLT2B3 LTR ERVL 3 182 -372 4 1359 2184 150 67 26 chr15 101549381 101549772 -1945202 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 4 1359 790 317 78 67 chr15 101549772 101550058 -1944916 + MLT2B3 LTR ERVL 183 466 -88 4 1359 938 309 68 58 chr15 101552991 101553476 -1941498 + MLT1D LTR MaLR 3 492 -13 5 1359 1613 208 101 21 chr15 101556735 101557123 -1937851 + MTD LTR MaLR 1 419 0 5 1359 417 300 89 62 chr15 101557690 101558028 -1936946 - ORR1E LTR MaLR -5 354 8 6 1359 2569 123 46 15 chr15 101570140 101570535 -1924439 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 7 1360 694 282 22 59 chr15 101582905 101583176 -1911798 + RMER15 LTR ERVL 299 559 -16 9 1360 267 309 19 67 chr15 101583193 101583297 -1911677 + MT2B2 LTR ERVL 155 253 -331 9 1360 910 244 171 11 chr15 101587296 101587590 -1907384 + MTE2b LTR MaLR 13 353 -26 9 1360 530 291 83 94 chr15 101592014 101592375 -1902599 + ORR1E LTR MaLR 1 357 -2 9 1360 3158 47 37 3 chr15 101598314 101598697 -1896277 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1360 1720 123 0 22 chr15 101599018 101599292 -1895682 + MTB_Mm LTR MaLR 1 268 -139 1 1360 261 207 97 65 chr15 101606152 101606245 -1888729 + MLT1A1 LTR MaLR 267 362 -46 1 1360 610 289 133 40 chr15 101606230 101606554 -1888420 - ORR1E LTR MaLR -5 354 1 1 1360 3212 19 67 8 chr15 101609162 101609536 -1885438 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1360 494 277 70 37 chr15 101619901 101620145 -1874829 + RLTR42-int LTR ERVK 1147 1398 -4124 1 1360 262 292 14 0 chr15 101621129 101621201 -1873773 + MLT1J1 LTR MaLR 356 428 -16 1 1360 1135 237 144 30 chr15 101622260 101622599 -1872375 + MTEa LTR MaLR 2 379 0 1 1360 1165 204 55 32 chr15 101672722 101673205 -1821769 + RMER17C LTR ERVK 45 410 0 2 1360 1058 173 10 60 chr15 101674850 101675151 -1819823 - RMER17C LTR ERVK -41 369 84 2 1360 807 153 11 90 chr15 101675329 101675629 -1819345 - RMER17C LTR ERVK -519 439 16 2 1360 225 271 79 45 chr15 101692211 101692300 -1802674 - RLTR13D6 LTR ERVK -790 112 21 2 1360 1646 113 16 16 chr15 101707030 101707282 -1787692 + MTC LTR MaLR 170 421 0 2 1360 1038 151 89 21 chr15 101708932 101709148 -1785826 - RMER13A LTR ERVK -643 265 1 2 1361 250 342 129 81 chr15 101712487 101712697 -1782277 - LTR16A LTR ERVL -15 436 217 2 1361 538 332 148 8 chr15 101712978 101713221 -1781753 - RMER15 LTR ERVL 0 575 299 2 1361 2641 157 99 50 chr15 101724225 101724783 -1770191 + RMER4B LTR ERVK 1 585 0 2 1361 1951 167 30 61 chr15 101727442 101727837 -1767137 + RLTR12A LTR ERVK 1 383 -185 2 1361 1940 95 10 26 chr15 101727847 101728160 -1766814 - RLTR15 LTR ERVK -51 308 1 2 1361 1961 196 16 196 chr15 101736172 101736915 -1758059 - RMER19C LTR ERVK -1 610 2 2 1361 2240 86 6 27 chr15 101738046 101738379 -1756595 + ORR1A2 LTR MaLR 1 326 -1 2 1361 1716 140 21 54 chr15 101793128 101793461 -1701513 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 3 1361 281 220 17 0 chr15 101794121 101794180 -1700794 + MLT1A1 LTR MaLR 293 352 -56 3 1361 295 251 25 153 chr15 101810860 101811062 -1683912 - RLTR21 LTR ERVK -318 1254 1079 3 1361 1267 156 22 19 chr15 101818728 101818998 -1675976 - MTB_Mm LTR MaLR -136 285 1 4 1361 1416 123 62 0 chr15 101819692 101819935 -1675039 + MTB_Mm LTR MaLR 10 267 -140 4 1361 235 61 0 0 chr15 101819931 101819964 -1675010 + MTB_Mm LTR MaLR 385 417 -2 4 1361 424 132 0 0 chr15 101820405 101820473 -1674501 + RLTR11B LTR ERVK 67 134 -319 4 1361 667 275 92 58 chr15 101820614 101820678 -1674296 + RLTR11B LTR ERVK 118 233 -220 4 1361 667 275 92 58 chr15 101820820 101820939 -1674035 + RLTR11B LTR ERVK 234 453 0 4 1361 1009 279 73 16 chr15 101821302 101821615 -1673359 - MTD LTR MaLR -86 333 3 4 1361 1369 216 122 6 chr15 101821878 101822214 -1672760 - MTD LTR MaLR -1 418 44 4 1361 346 252 32 40 chr15 101822364 101822399 -1672575 + MT2B LTR ERVL 135 168 -433 4 1361 1351 231 85 57 chr15 101823236 101823658 -1671316 + RMER10A LTR ERVL 1 434 -8 4 1361 575 287 141 33 chr15 101841132 101841402 -1653572 - MLT1K LTR MaLR -295 300 2 4 1362 2081 196 33 30 chr15 101850001 101850400 -1644574 + MTD LTR MaLR 15 414 -5 4 1362 1781 169 18 86 chr15 101853260 101853715 -1641259 + RMER17C LTR ERVK 1 706 -397 4 1362 564 264 68 47 chr15 101868910 101869101 -1625873 - MLT1D LTR MaLR -296 209 15 5 1362 281 289 88 82 chr15 101870264 101870434 -1624540 - RLTR25A LTR ERVK -411 692 522 5 1362 2202 116 3 6 chr15 101871757 101872069 -1622905 + RLTR10E LTR ERVK 1 311 0 5 1362 330 132 100 50 chr15 101873727 101873807 -1621167 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 426 5 1362 491 219 28 28 chr15 101874716 101874824 -1620150 + MTC LTR MaLR 1 108 -313 5 1362 519 310 97 58 chr15 101875688 101876017 -1618957 + ERVL-E-int LTR ERVL 3739 4080 -1587 5 1362 328 304 63 28 chr15 101876166 101876308 -1618666 + MLT1D LTR MaLR 350 496 -9 5 1362 1994 185 96 8 chr15 101879453 101879840 -1615134 - MTC LTR MaLR 0 421 1 5 1362 2585 80 28 28 chr15 101881166 101881528 -1613446 + RLTR8 LTR ERVK 1 362 -3 5 1362 2318 112 59 3 chr15 101895557 101895914 -1599060 + MTC LTR MaLR 1 377 -44 6 1362 269 312 18 27 chr15 101899665 101899777 -1595197 + RMER15 LTR ERVL 355 465 -110 6 1362 799 248 31 139 chr15 101900770 101901256 -1593718 - RLTR11B LTR ERVK -65 462 1 6 1362 1915 162 101 27 chr15 101901542 101901909 -1593065 + ORR1B1 LTR MaLR 1 394 0 6 1362 236 161 35 184 chr15 101918158 101918272 -1576702 + RLTR25B LTR ERVK 447 543 -485 7 1362 1294 244 139 22 chr15 101938643 101939053 -1555921 - MLT1C LTR MaLR -5 462 5 7 1362 809 60 23 100 chr15 101940308 101940354 -1554620 - ORR1A2 LTR MaLR -8 318 285 7 1362 882 130 109 31 chr15 101940545 101940779 -1554195 - ORR1A2 LTR MaLR -42 284 1 7 1362 1805 39 4 0 chr15 101953908 101954141 -1540833 + MERVL-int LTR ERVL 5132 5365 -120 7 1362 388 152 12 37 chr15 101954141 101954223 -1540751 + ORR1A3-int LTR MaLR 561 640 -1323 7 1362 297 0 0 0 chr15 101954223 101954261 -1540713 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 7 1362 4543 14 0 0 chr15 101954261 101954754 -1540220 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 7 1362 257 191 80 110 chr15 101965606 101965706 -1529268 - MT2B LTR ERVL -366 235 139 7 1362 301 297 52 91 chr15 101969501 101969714 -1525260 - MT2B LTR ERVL -327 257 46 8 1362 1181 233 20 77 chr15 101972990 101973380 -1521594 + RMER10B LTR ERVL 1 368 -30 8 1363 287 309 92 67 chr15 101976292 101976531 -1518443 - RMER12 LTR ERVK -332 990 746 8 1363 420 338 25 29 chr15 101986115 101986389 -1508585 - RLTR15 LTR ERVK -12 347 75 8 1363 297 272 75 60 chr15 101986453 101986586 -1508388 - RLTR15 LTR ERVK -222 137 3 8 1363 649 222 40 17 chr15 101994915 101995089 -1499885 + MTE2b LTR MaLR 198 375 -4 8 1363 481 156 452 15 chr15 101995693 101995830 -1499144 + MTD LTR MaLR 14 210 -209 8 1363 760 173 138 21 chr15 101995968 101996157 -1498817 + MTD LTR MaLR 196 406 -13 8 1363 2708 96 115 10 chr15 101999024 101999423 -1495551 - BGLII_B LTR ERVK 0 441 1 9 1363 1319 144 175 0 chr15 101999468 101999725 -1495249 + MTC LTR MaLR 10 311 -110 9 1363 1603 28 23 9 chr15 101999785 102000000 -1494974 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 179 9 1363 1407 34 0 0 chr15 102000000 102000178 -1494796 - MTA_Mm LTR MaLR -218 178 1 1 1363 311 257 6 191 chr15 102000838 102000905 -1494069 + MTD LTR MaLR 1 64 -355 4 1363 311 257 6 191 chr15 102001033 102001107 -1493867 + MTD LTR MaLR 65 115 -304 4 1363 311 257 6 191 chr15 102001309 102001339 -1493635 + MTD LTR MaLR 116 141 -278 4 1363 362 391 73 0 chr15 102003893 102003917 -1491057 - MLT2B2 LTR ERVL -21 533 510 1 1363 534 308 74 14 chr15 102004101 102004318 -1490656 - MLT2B2 LTR ERVL -57 458 229 1 1363 523 200 79 8 chr15 102004534 102004660 -1490314 - MLT2B2 LTR ERVL -378 137 3 1 1363 249 277 55 63 chr15 102005498 102005625 -1489349 - RLTR25B LTR ERVK -467 561 436 2 1363 299 278 130 86 chr15 102013557 102013912 -1481062 + MLT1A1 LTR MaLR 25 404 -4 5 1363 322 251 89 221 chr15 102028387 102028524 -1466450 - MTE2a LTR MaLR -20 359 213 9 1363 322 269 89 209 chr15 102028719 102028915 -1466059 - MTE2a LTR MaLR -167 212 57 9 1363 391 282 34 0 chr15 102056840 102056957 -1438017 + MLT1A LTR MaLR 38 158 -216 1 1363 247 353 19 10 chr15 102057448 102057551 -1437423 + MLT1A LTR MaLR 205 308 -57 1 1363 295 132 74 62 chr15 102091533 102091614 -1403360 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 428 2 1364 1502 234 131 24 chr15 102119059 102119510 -1375464 - RLTR19 LTR ERVK 0 499 1 3 1364 2069 178 48 28 chr15 102122266 102122665 -1372309 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 3 1364 1886 140 48 22 chr15 102135712 102136069 -1358905 + RMER4A LTR ERVK 101 466 0 4 1364 1790 27 20 1 chr15 102137466 102137701 -1357273 - ORR1A0 LTR MaLR 0 367 121 4 1364 4140 25 0 0 chr15 102155924 102156412 -1338562 - MERVL-int LTR ERVL -191 5294 4807 4 1364 1811 115 8 120 chr15 102158078 102158148 -1336826 - ORR1A4 LTR MaLR -8 321 283 4 1364 1811 115 8 120 chr15 102158294 102158580 -1336394 - ORR1A4 LTR MaLR -47 282 5 4 1364 812 273 77 68 chr15 102163144 102163510 -1331464 + MTE2a LTR MaLR 3 371 -8 4 1364 1685 160 31 31 chr15 102164900 102165217 -1329757 - ORR1C1 LTR MaLR -1 377 61 5 1364 326 174 64 156 chr15 102175694 102175726 -1319248 + MT2B LTR ERVL 138 159 -442 5 1364 521 187 310 0 chr15 102176219 102176390 -1318584 - MTD LTR MaLR 0 419 196 5 1364 264 281 11 104 chr15 102176411 102176428 -1318546 - RLTR25B LTR ERVK -531 572 522 5 1364 264 281 11 104 chr15 102176561 102176584 -1318390 - RLTR25B LTR ERVK -531 521 444 5 1364 265 289 39 178 chr15 102176575 102176806 -1318168 - MTD LTR MaLR -211 210 12 5 1364 227 282 20 162 chr15 102182970 102183118 -1311856 - MT2B LTR ERVL -323 278 152 5 1364 479 221 6 125 chr15 102190990 102191034 -1303940 + MT2B LTR ERVL 125 149 -452 5 1364 235 174 141 115 chr15 102209010 102209088 -1285886 - MT2B LTR ERVL -366 235 156 6 1364 266 261 142 71 chr15 102217068 102217336 -1277638 - RMER10A LTR ERVL -72 370 84 6 1364 530 238 41 20 chr15 102219089 102219235 -1275739 - ORR1D2 LTR MaLR -3 367 219 6 1364 388 238 105 0 chr15 102219261 102219366 -1275608 - ORR1D2 LTR MaLR -111 259 144 6 1364 1235 220 75 58 chr15 102219615 102219977 -1274997 + ORR1D2 LTR MaLR 3 370 0 6 1364 861 236 10 19 chr15 102220588 102220795 -1274179 - RMER10B LTR ERVL 0 398 194 7 1364 452 279 17 130 chr15 102221031 102221143 -1273831 - MT2B LTR ERVL -456 145 60 7 1364 377 85 0 48 chr15 102224682 102224744 -1270230 - LTRIS2 LTR ERV1 -505 59 1 7 1364 269 246 0 179 chr15 102231519 102231653 -1263321 - MT2B LTR ERVL -344 257 148 7 1364 367 240 14 144 chr15 102234487 102234633 -1260341 + MT2B LTR ERVL 175 301 -300 7 1364 297 297 0 90 chr15 102235135 102235257 -1259717 - MT2B LTR ERVL -344 257 147 7 1365 330 197 61 0 chr15 102254411 102254477 -1240497 + MTD LTR MaLR 91 160 -259 8 1365 319 198 196 9 chr15 102254523 102254613 -1240361 + MTD LTR MaLR 267 366 -53 8 1365 319 198 196 9 chr15 102254646 102254667 -1240307 + MTD LTR MaLR 367 398 -21 8 1365 1008 175 80 138 chr15 102257551 102257795 -1237179 - RMER6A LTR ERVK 0 690 428 8 1365 1008 166 88 137 chr15 102257941 102257967 -1237007 - RMER6A LTR ERVK -329 427 416 8 1365 1008 179 75 139 chr15 102258129 102258247 -1236727 - RMER6A LTR ERVK -247 443 339 8 1365 322 100 0 20 chr15 102258248 102258299 -1236675 - MT2B LTR ERVL -371 230 181 8 1365 561 160 90 67 chr15 102258286 102258420 -1236554 - RMER6A LTR ERVK -550 140 4 8 1365 706 96 81 0 chr15 102260837 102260973 -1234001 + RMER17B LTR ERVK 317 463 -495 8 1365 226 194 59 88 chr15 102271786 102271854 -1223120 - MT2B LTR ERVL -314 287 222 9 1365 2835 64 58 21 chr15 102278769 102279151 -1215823 - MTB LTR MaLR -4 396 1 9 1365 236 214 14 54 chr15 102285711 102285785 -1209189 - RLTR25B LTR ERVK -530 498 428 9 1365 769 261 79 65 chr15 102287591 102287882 -1207092 - MT2B LTR ERVL -54 547 253 9 1365 2017 116 9 51 chr15 102309310 102309646 -1185328 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 1 1 1365 449 239 35 17 chr15 102350272 102350387 -1144587 - MTD LTR MaLR -14 405 289 1 1365 265 62 0 0 chr15 102350427 102350459 -1144515 + MERVL_2A-int LTR ERVL 4574 4605 -1156 1 1365 698 279 43 89 chr15 102350459 102350739 -1144235 - MTD LTR MaLR -148 271 5 1 1366 2392 67 9 0 chr15 102371393 102371709 -1123265 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1366 1696 176 109 17 chr15 102372748 102373106 -1121868 - RMER10B LTR ERVL -7 391 1 1 1366 3088 55 0 70 chr15 102379167 102379364 -1115610 + MTA_Mm LTR MaLR 1 191 -205 1 1366 3088 55 0 70 chr15 102379506 102379734 -1115240 + MTA_Mm LTR MaLR 192 396 0 1 1366 7798 63 17 75 chr15 102379734 102380775 -1114199 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 959 -139 1 1366 7798 63 17 75 chr15 102380963 102381087 -1113887 + MTA_Mm-int LTR MaLR 960 1097 -1 1 1366 3268 48 5 8 chr15 102381087 102381484 -1113490 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 1 1366 1114 226 117 91 chr15 102382692 102382965 -1112009 + ORR1B1 LTR MaLR 1 256 -138 1 1366 1114 226 117 91 chr15 102383164 102383274 -1111700 + ORR1B1 LTR MaLR 257 393 -1 1 1366 273 230 52 139 chr15 102387819 102387864 -1107110 + MT2B2 LTR ERVL 194 324 -260 1 1366 4571 110 25 36 chr15 102398112 102398860 -1096114 - RMER6A LTR ERVK 0 756 17 1 1366 240 351 34 59 chr15 102405224 102405342 -1089632 - MT2B LTR ERVL -344 257 143 1 1366 297 226 9 54 chr15 102406392 102406504 -1088470 - RMER17A LTR ERVK -290 461 355 1 1366 1067 201 188 17 chr15 102406547 102406835 -1088139 + ORR1D1 LTR MaLR 37 373 -1 1 1366 416 280 24 48 chr15 102410687 102410811 -1084163 - MLT1C LTR MaLR -8 459 339 1 1366 4442 14 0 0 chr15 102427219 102427712 -1067262 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1366 38760 16 14 0 chr15 102427712 102432999 -1061975 + MERVL-int LTR ERVL 1 5360 -125 1 1366 390 167 46 35 chr15 102432999 102433086 -1061888 + ORR1A3-int LTR MaLR 553 640 -1323 1 1366 302 0 0 0 chr15 102433086 102433124 -1061850 + MERVL-int LTR ERVL 5448 5485 0 1 1366 4442 14 0 0 chr15 102433124 102433617 -1061357 + MT2_Mm LTR ERVL 1 493 0 1 1366 404 319 82 77 chr15 102438950 102439010 -1055964 + MTD LTR MaLR 1 56 -363 1 1366 404 319 82 77 chr15 102439161 102439307 -1055667 + MTD LTR MaLR 57 208 -211 1 1366 1455 221 80 71 chr15 102459907 102460562 -1034412 + RMER19C LTR ERVK 1 599 -12 1 1366 1512 179 37 37 chr15 102464096 102464444 -1030530 - RLTR15 LTR ERVK 0 359 12 1 1366 263 214 21 106 chr15 102464731 102464825 -1030149 - MT2B LTR ERVL -361 240 155 1 1366 918 206 90 19 chr15 102467988 102468206 -1026768 - MT2A LTR ERVL -3 530 258 1 1366 3078 85 80 37 chr15 102468206 102468668 -1026306 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 1 1 1366 633 204 186 19 chr15 102468668 102468822 -1026152 - MT2A LTR ERVL -276 257 74 1 1366 2452 130 19 29 chr15 102468886 102469020 -1025954 + MurERV4-int LTR ERVK 2088 2220 -3040 1 1366 3078 32 0 0 chr15 102469020 102469366 -1025608 + ORR1A0 LTR MaLR 1 346 0 1 1366 2452 130 19 29 chr15 102469366 102469650 -1025324 + MurERV4-int LTR ERVK 2221 2502 -2758 1 1366 867 141 56 0 chr15 102469642 102469784 -1025190 + MurERV4-int LTR ERVK 2788 2937 -2323 1 1366 488 142 57 9 chr15 102469780 102469884 -1025090 + MurERV4-int LTR ERVK 4782 4872 -388 1 1366 1656 170 30 58 chr15 102470041 102470371 -1024603 + MurERV4-int LTR ERVK 4856 5176 -84 1 1366 385 69 52 0 chr15 102473398 102473456 -1021518 - ORR1A2 LTR MaLR -266 61 1 1 1366 2636 104 23 13 chr15 102473952 102474342 -1020632 - ORR1B1 LTR MaLR 0 394 1 1 1366 1272 225 127 73 chr15 102475328 102475391 -1019583 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1596 1640 -4074 1 1366 1272 225 127 73 chr15 102475532 102475894 -1019080 + ERVL-B4-int LTR ERVL 1641 2044 -3670 1 1366 367 307 43 14 chr15 102475894 102476033 -1018941 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2006 2148 -3566 1 1366 256 188 21 0 chr15 102476161 102476209 -1018765 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2675 2723 -3034 1 1366 1128 268 21 10 chr15 102476352 102476642 -1018332 + ERVL-B4-int LTR ERVL 2713 3005 -2709 1 1366 1515 236 52 64 chr15 102476648 102476793 -1018181 + ERVL-int LTR ERVL 4921 5060 -697 1 1366 3540 18 5 0 chr15 102476793 102477187 -1017787 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 1 1366 1515 236 52 64 chr15 102477187 102477362 -1017612 + ERVL-int LTR ERVL 5061 5239 -518 1 1366 1515 236 52 64 chr15 102477639 102477814 -1017160 + ERVL-int LTR ERVL 5240 5411 -346 1 1366 251 204 0 0 chr15 102478427 102478481 -1016493 + ERVL-int LTR ERVL 5481 5534 -180 1 1366 512 234 144 12 chr15 102478518 102478678 -1016296 + ERVL-int LTR ERVL 5528 5708 -6 1 1366 749 278 20 0 chr15 102478688 102478886 -1016088 + MLT2B4 LTR ERVL 5 206 -350 1 1366 522 270 8 6 chr15 102479129 102479254 -1015720 + MLT2B4 LTR ERVL 378 487 -80 1 1366 501 287 18 12 chr15 102479264 102479433 -1015541 - RMER15 LTR ERVL 0 575 406 1 1366 811 268 29 39 chr15 102479563 102479843 -1015131 - MTEb LTR MaLR -2 377 101 1 1366 249 304 212 12 chr15 102489462 102489622 -1005352 - MLT1E2 LTR MaLR -293 334 143 1 1366 1950 107 32 3 chr15 102490563 102490873 -1004101 + ORR1A2 LTR MaLR 1 319 -8 1 1366 241 164 0 127 chr15 102491000 102491063 -1003911 - RLTR25A LTR ERVK -548 555 501 1 1367 3179 53 27 20 chr15 102507237 102507641 -987333 - MTB_Mm LTR MaLR 0 407 1 1 1367 383 168 53 114 chr15 102511751 102511865 -983109 + MT2B LTR ERVL 172 278 -323 4 1367 227 183 89 79 chr15 102512540 102512641 -982333 + RLTR25B LTR ERVK 397 498 -530 5 1367 387 47 0 99 chr15 102514836 102514907 -980067 + RMER4A LTR ERVK 3 66 -519 6 1367 2239 144 49 39 chr15 102515106 102515517 -979457 + RMER4A LTR ERVK 52 466 0 6 1367 3147 56 5 39 chr15 102559293 102559349 -935625 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 353 1 1367 3147 56 5 39 chr15 102559566 102559919 -935055 - MTA_Mm LTR MaLR -44 352 1 1 1367 852 261 69 154 chr15 102560614 102560798 -934176 - MTE2b LTR MaLR -1 378 193 1 1367 852 261 69 154 chr15 102560845 102561050 -933924 - MTE2b LTR MaLR -187 192 22 1 1367 236 236 17 52 chr15 102561155 102561213 -933761 - ORR1E LTR MaLR -32 364 309 1 1367 234 250 31 0 chr15 102561391 102561455 -933519 - MLT1A1 LTR MaLR -271 137 72 1 1367 341 291 23 50 chr15 102563553 102563724 -931250 - ORR1E LTR MaLR -193 166 1 1 1367 1699 122 102 63 chr15 102580007 102580029 -914945 - RMER17C LTR ERVK 0 410 378 2 1367 1699 122 102 63 chr15 102580061 102580411 -914563 - RMER17C LTR ERVK -33 377 23 2 1367 1699 122 102 63 chr15 102580459 102580479 -914495 - RMER17C LTR ERVK -388 22 3 2 1367 2222 87 18 45 chr15 102589030 102589366 -905608 - ORR1A2 LTR MaLR 0 327 1 2 1367 228 333 10 40 chr15 102609083 102609183 -885791 - LTR79 LTR ERVL -208 319 223 2 1367 1743 193 60 35 chr15 102623606 102623997 -870977 + MTD LTR MaLR 18 418 -1 3 1368 438 176 64 54 chr15 102634926 102635130 -859844 - RMER17C LTR ERVK -135 275 70 3 1368 233 337 0 38 chr15 102647578 102647683 -847291 + RMER12 LTR ERVK 750 850 -472 3 1368 308 250 122 20 chr15 102656899 102656997 -837977 + MLT1A LTR MaLR 263 370 -4 3 1368 618 312 138 10 chr15 102666928 102667239 -827735 - ORR1E LTR MaLR -5 354 4 3 1368 1654 192 55 43 chr15 102672550 102672951 -822023 - MTD LTR MaLR -14 405 8 3 1368 254 256 39 118 chr15 102691398 102691500 -803474 + MT2B LTR ERVL 147 240 -361 4 1368 3015 63 0 0 chr15 102700568 102700967 -794007 - MTB_Mm LTR MaLR -8 399 1 4 1368 295 374 9 0 chr15 102702029 102702136 -792838 + LTR16D2 LTR ERVL 465 572 0 4 1368 2240 119 50 19 chr15 102703524 102703900 -791074 - MTC LTR MaLR 0 421 34 4 1368 1917 128 38 89 chr15 102704296 102704689 -790285 - ORR1C1 LTR MaLR -5 373 1 4 1368 1521 191 102 67 chr15 102716178 102716506 -778468 - MTD LTR MaLR -2 417 63 4 1368 1521 191 102 67 chr15 102716675 102716749 -778225 - MTD LTR MaLR -357 62 1 4 1368 825 214 237 90 chr15 102723960 102724315 -770659 + MTB_Mm LTR MaLR 1 407 0 4 1368 284 307 0 152 chr15 102734250 102734268 -760706 + MT2B LTR ERVL 153 182 -419 5 1368 284 307 0 152 chr15 102734354 102734415 -760559 + MT2B LTR ERVL 183 292 -309 5 1368 319 368 61 35 chr15 102739053 102739250 -755724 - MLT1J2 LTR MaLR 0 448 247 5 1369 229 286 89 67 chr15 102832069 102832204 -662770 + RMER21A LTR ERV1 468 605 -342 6 1369 951 251 135 17 chr15 102879474 102879822 -615152 - MLT1B LTR MaLR 0 390 2 6 1370 1406 221 113 29 chr15 102909027 102909372 -585602 + ORR1D1 LTR MaLR 1 374 0 7 1370 1823 201 41 11 chr15 102919305 102919667 -575307 + MTEb LTR MaLR 7 379 0 7 1370 582 218 22 8 chr15 102957778 102957912 -537062 - ORR1E LTR MaLR -223 136 1 8 1370 436 288 27 9 chr15 102962546 102962655 -532319 + ORR1E LTR MaLR 6 116 -243 8 1370 315 277 154 55 chr15 102962961 102963218 -531756 + ORR1E LTR MaLR 88 378 -1 8 1370 758 266 91 72 chr15 102982302 102982675 -512299 + MLT1B LTR MaLR 1 380 -10 8 1370 324 301 58 7 chr15 102982861 102982998 -511976 + ORR1E LTR MaLR 1 144 -215 8 1370 268 231 345 25 chr15 102983583 102983783 -511191 - MER21B LTR ERV1 -154 709 446 8 1370 300 283 105 35 chr15 102984003 102984146 -510828 - MER21B LTR ERV1 -570 293 141 8 1370 1841 169 13 32 chr15 102987557 102988006 -506968 + RMER17C LTR ERVK 21 437 -521 8 1370 508 237 167 0 chr15 102988557 102988713 -506261 - MTEb LTR MaLR -4 375 194 8 1370 1965 160 58 25 chr15 102988917 102989315 -505659 + MTD LTR MaLR 1 411 -8 8 1370 601 261 19 6 chr15 102989319 102989477 -505497 - MTEb LTR MaLR -219 160 1 8 1370 303 327 29 142 chr15 102991316 102991626 -503348 + ORR1E LTR MaLR 44 318 -41 8 1370 259 249 83 70 chr15 102994267 102994408 -500566 - MLT2B3 LTR ERVL 0 554 409 8 1370 315 314 66 44 chr15 102994413 102994596 -500378 - MLT2B3 LTR ERVL -339 215 29 8 1371 237 327 9 70 chr15 103023372 103023487 -471487 - MTE-int LTR MaLR -236 1344 1237 4 1371 250 324 13 13 chr15 103039612 103039687 -455287 + MTC-int LTR MaLR 180 254 -1004 9 1371 626 281 122 62 chr15 103039873 103040283 -454691 + MTC-int LTR MaLR 407 949 -309 9 1371 2287 173 113 18 chr15 103040711 103040724 -454250 + RLTR20A LTR ERVK 1 13 -528 1 1371 2287 173 113 18 chr15 103040948 103041107 -453867 + RLTR20A LTR ERVK 14 190 -351 1 1371 2287 173 113 18 chr15 103041129 103041367 -453607 + RLTR20A LTR ERVK 191 449 -92 1 1371 2287 173 113 18 chr15 103041395 103041476 -453498 + RLTR20A LTR ERVK 450 539 -2 1 1371 1338 181 91 61 chr15 103046387 103046781 -448193 - RMER17C LTR ERVK -4 406 1 1 1371 254 269 0 82 chr15 103048013 103048098 -446876 + MT2B LTR ERVL 170 247 -354 1 1371 417 246 34 128 chr15 103049173 103049190 -445784 - MT2B LTR ERVL -314 246 153 1 1371 293 276 0 87 chr15 103056440 103056453 -438521 + MT2B2 LTR ERVL 152 256 -328 1 1371 255 232 9 112 chr15 103067867 103067974 -427000 + MT2B LTR ERVL 156 251 -350 2 1371 312 250 56 0 chr15 103090320 103090392 -404582 + MTEa LTR MaLR 193 268 -111 2 1371 515 161 35 35 chr15 103094656 103094778 -400196 - RLTR13C2 LTR ERVK 0 808 695 2 1371 1146 230 89 3 chr15 103095587 103095877 -399097 + MTD LTR MaLR 105 419 0 2 1371 230 226 0 36 chr15 103097211 103097266 -397708 + RLTR25A LTR ERVK 522 574 -529 2 1371 1000 144 0 65 chr15 103101803 103101988 -392986 - MTC LTR MaLR -8 413 241 3 1371 577 145 42 25 chr15 103101991 103102111 -392863 - RMER12 LTR ERVK -4 1318 1197 3 1371 447 167 18 73 chr15 103110909 103110923 -384051 + MT2B LTR ERVL 154 161 -440 3 1372 1910 32 20 0 chr15 103191396 103191644 -303330 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 144 5 1372 246 242 65 0 chr15 103216784 103216846 -278128 + MLT1F1 LTR MaLR 406 471 -98 5 1372 226 258 140 0 chr15 103219889 103219982 -274992 - MER21B LTR ERV1 -85 778 673 5 1372 485 293 140 85 chr15 103220068 103220303 -274671 - MER21B LTR ERV1 -323 540 293 5 1372 273 234 31 0 chr15 103224345 103224409 -270565 + LTR33B LTR ERVL 435 500 -3 6 1372 532 139 16 107 chr15 103227912 103228033 -266941 + MT2B LTR ERVL 155 264 -337 6 1372 3326 42 39 3 chr15 103237046 103237428 -257546 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1372 8099 83 5 70 chr15 103237428 103238602 -256372 + MTA_Mm-int LTR MaLR 1 1098 0 6 1372 3323 42 39 3 chr15 103238602 103238984 -255990 + MTA_Mm LTR MaLR 1 396 0 6 1372 273 138 30 30 chr15 103240999 103241066 -253908 + RMER4A LTR ERVK 10 76 -509 6 1372 2265 148 51 5 chr15 103248981 103249375 -245599 + RMER4A LTR ERVK 52 463 -3 6 1372 3493 123 19 141 chr15 103265931 103266408 -228566 - RMER4B LTR ERVK -1 584 184 7 1372 3493 123 19 141 chr15 103266552 103266739 -228235 - RMER4B LTR ERVK -402 183 1 7 1372 241 292 10 128 chr15 103268094 103268196 -226778 + MT2B2 LTR ERVL 151 240 -344 7 1372 1562 177 195 0 chr15 103271987 103272331 -222643 - MTD LTR MaLR -8 411 1 7 1372 2118 114 66 6 chr15 103280168 103280503 -214471 - RLTR15 LTR ERVK -4 355 1 7 1372 298 278 16 80 chr15 103281071 103281137 -213837 + RLTR23 LTR ERV1 314 376 -54 7 1372 4324 132 99 1 chr15 103281137 103281806 -213168 + RMER19A LTR ERVK 4 737 0 7 1372 298 278 16 80 chr15 103281806 103281864 -213110 + RLTR23 LTR ERV1 377 430 0 7 1372 3405 154 14 19 chr15 103282162 103282737 -212237 + RMER15 LTR ERVL 1 572 -3 7 1373 430 213 42 76 chr15 103311160 103311409 -183565 - LTRIS_Mm LTR ERV1 0 482 238 8 1373 333 337 31 159 chr15 103373332 103373621 -121353 - MLT1B LTR MaLR -5 385 134 9 1373 2210 185 110 14 chr15 103374668 103375150 -119824 - RLTR11A LTR ERVK 0 528 1 9 1373 3332 61 0 2 chr15 103375186 103375583 -119391 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1373 301 140 0 34 chr15 103379516 103379575 -115399 - ORR1E LTR MaLR 0 379 323 9 1373 1148 262 15 74 chr15 103379955 103380281 -114693 - ORR1E LTR MaLR -42 317 11 9 1373 281 277 74 123 chr15 103381174 103381367 -113607 + MLT1D LTR MaLR 1 182 -445 9 1373 600 285 81 14 chr15 103381380 103381590 -113384 + MLT1D LTR MaLR 253 476 -29 9 1373 340 195 107 24 chr15 103382849 103382933 -112041 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 419 9 1373 2266 119 62 0 chr15 103385210 103385580 -109394 + RMER20A LTR ERVK 1 393 -123 9 1373 225 299 95 83 chr15 103399228 103399469 -95505 - MLT1A0 LTR MaLR -9 356 113 9 1373 1670 153 137 14 chr15 103408843 103409160 -85814 - ORR1B1 LTR MaLR -8 386 27 9 1373 1670 153 137 14 chr15 103409189 103409215 -85759 - ORR1B1 LTR MaLR -368 26 1 9 1373 1024 235 49 67 chr15 103409964 103410016 -84958 - MT2B LTR ERVL -6 595 545 9 1373 1024 212 91 102 chr15 103410148 103410566 -84408 - MT2B LTR ERVL -57 544 1 9 1373 1782 152 18 0 chr15 103410594 103410929 -84045 - RLTR15 LTR ERVK -18 341 1 9 1373 767 242 283 40 chr15 103411517 103411888 -83086 - RMER15 LTR ERVL -86 489 29 9 1373 3080 119 13 13 chr15 103413076 103413537 -81437 + RMER6B LTR ERVK 1 461 0 9 1373 3461 30 2 0 chr15 103413547 103413942 -81032 - MTA_Mm LTR MaLR 0 396 1 9 1373 1898 154 42 81 chr15 103414493 103414875 -80099 - ORR1B2 LTR MaLR 0 367 1 9 1373 944 256 120 18 chr15 103414900 103415226 -79748 + ORR1E LTR MaLR 1 359 0 9 171 6386 118 182 3 chr15 103415514 103416742 -78232 - ORR1B2-int LTR MaLR -122 1841 395 9 1374 680 260 101 75 chr15 103421252 103421764 -73210 + RMER4B LTR ERVK 17 576 -9 9 1374 1482 238 53 29 chr15 103421811 103422187 -72787 + MurERV4-int LTR ERVK 62 446 -4814 9 1374 2162 91 3 53 chr15 103425793 103426130 -68844 - RLTRETN_Mm LTR ERVK -2 320 1 9 1374 3770 114 10 22 chr15 103426130 103426720 -68254 - MMETn-int LTR ERVK 0 4844 4262 9 1374 465 299 51 0 chr15 103428449 103428586 -66388 + MurERV4-int LTR ERVK 1573 1716 -3544 9 1374 2264 250 47 25 chr15 103428719 103429310 -65664 + MYSERV-int LTR ERVK 4523 5126 -1424 9 1374 556 214 35 90 chr15 103429310 103429510 -65464 + RMER4A LTR ERVK 250 438 -28 9 1374 4046 165 48 82 chr15 103429574 103430544 -64430 + MYSERV6-int LTR ERVK 7856 8792 -167 9 1374 377 203 31 31 chr15 103430512 103430639 -64335 + MYSERV-int LTR ERVK 6417 6543 -7 9 1374 720 188 158 9 chr15 103430645 103430860 -64114 + RMER4B LTR ERVK 1 247 -338 9 1374 1856 234 97 28 chr15 103434045 103434613 -60361 - RLTR17 LTR ERVK -85 607 1 9 1374 2405 149 38 38 chr15 103437123 103437598 -57376 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 9 1374 4519 57 66 22 chr15 103437600 103438239 -56735 + IAPEz-int LTR ERVK 3 662 -5819 9 1374 454 66 0 32 chr15 103438239 103438302 -56672 + IAPEz-int LTR ERVK 1359 1419 -5062 9 1374 1853 115 4 4 chr15 103438291 103438553 -56421 + IAPEz-int LTR ERVK 2236 2497 -5183 9 1374 953 80 24 0 chr15 103438548 103438673 -56301 + IAPEz-int LTR ERVK 4783 4910 -2770 9 1374 21462 14 2 0 chr15 103438675 103441030 -53944 + IAPEz-int LTR ERVK 4123 6481 0 9 1374 2547 151 38 38 chr15 103441030 103441505 -53469 + IAPLTR2_Mm LTR ERVK 1 475 0 9 1374 326 250 137 23 chr15 103456705 103456836 -38138 - RLTR25B LTR ERVK -519 509 364 9 1374 2329 199 7 16 chr15 103466016 103466441 -28533 + MTC LTR MaLR 1 421 0 1 1374 3289 67 185 0 chr15 103482442 103482874 -12100 + RLTR1B LTR ERV1 1 512 0 1 1374 793 227 34 160 chr15 103483657 103484013 -10961 - RLTRETN_Mm LTR ERVK 0 322 12 1 1374 3500 97 2 4 chr15 103485398 103485886 -9088 - RLTR1C LTR ERV1 -16 487 1 1 1374 2031 226 26 24 chr15 103493173 103493639 -1335 - RMER19C LTR ERVK 0 611 145 1 1374 1729 175 33 21 chr15 103494621 103494953 -21 - RMER17D2 LTR ERVK -2 807 472 1