585	760	22	0	0	chr2LHet	50699	50789	-318083	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-338	90	1	1
586	3766	0	0	0	chr2LHet	197941	198369	-170503	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
586	3742	2	0	0	chr2LHet	214648	215076	-153796	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
586	3705	7	0	0	chr2LHet	260879	261307	-107565	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
587	3917	2	0	0	chr2LHet	269564	269992	-98880	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
587	1145	37	98	0	chr2LHet	347657	347821	-21051	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	180	-248	1
587	2583	23	0	0	chr2LHet	359296	359606	-9266	+	ROO_LTR	LTR	Pao	119	428	0	1
590	3974	5	0	0	chr2L	686973	687401	-22324143	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
590	3974	5	0	0	chr2L	695527	695955	-22315589	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
592	3968	5	0	0	chr2L	976934	977362	-22034182	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
592	3968	5	0	0	chr2L	984084	984512	-22027032	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
592	3968	5	0	0	chr2L	996779	997207	-22014337	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
592	3968	5	0	0	chr2L	1005388	1005816	-22005728	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
601	3964	2	0	2	chr2L	2100429	2100858	-20910686	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
601	3964	2	0	2	chr2L	2109093	2109522	-20902022	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
629	3742	2	0	0	chr2L	5827762	5828190	-17183354	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
629	3999	2	0	0	chr2L	5836284	5836712	-17174832	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
634	4017	0	0	0	chr2L	6426910	6427338	-16584206	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
634	4017	0	0	0	chr2L	6431563	6431991	-16579553	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
634	4001	2	0	0	chr2L	6436013	6436441	-16575103	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
634	4005	0	0	0	chr2L	6444684	6445112	-16566432	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
641	4017	0	0	0	chr2L	7343380	7343808	-15667736	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
641	4017	0	0	0	chr2L	7350010	7350438	-15661106	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
649	3987	0	0	2	chr2L	8452475	8452904	-14558640	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
649	3987	0	0	2	chr2L	8461159	8461588	-14549956	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
653	3766	0	0	0	chr2L	9000334	9000762	-14010782	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
653	3766	0	0	0	chr2L	9007358	9007786	-14003758	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
668	3766	0	0	0	chr2L	10946998	10947426	-12064118	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
668	3766	0	0	0	chr2L	10955727	10956155	-12055389	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
690	3726	5	0	0	chr2L	13853139	13853567	-9157977	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
690	3699	5	0	2	chr2L	13861802	13862231	-9149313	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
696	3766	0	0	0	chr2L	14642625	14643053	-8368491	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
696	3766	0	0	0	chr2L	14651302	14651730	-8359814	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
722	3766	0	0	0	chr2L	18051930	18052358	-4959186	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	8
722	3644	0	0	0	chr2L	18060605	18061019	-4950525	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	414	-14	8
734	3999	2	0	0	chr2L	19652627	19653055	-3358489	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	9
735	3999	2	0	0	chr2L	19673575	19674003	-3337541	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	9
735	3982	5	0	0	chr2L	19703591	19704019	-3307525	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	9
735	3982	5	0	0	chr2L	19712241	19712669	-3298875	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	9
748	3889	0	0	7	chr2L	21403090	21403521	-1608023	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
748	3931	0	0	0	chr2L	21441095	21441523	-1570021	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
748	3766	0	0	0	chr2L	21449802	21450230	-1561314	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
749	3917	2	0	0	chr2L	21560792	21561220	-1450324	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
749	3917	2	0	0	chr2L	21569795	21570223	-1441321	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
749	3893	5	0	0	chr2L	21597084	21597512	-1414032	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
749	3907	2	0	0	chr2L	21604342	21604770	-1406774	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
752	3766	0	0	0	chr2L	21981737	21982165	-1029379	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
752	3766	0	0	0	chr2L	21990415	21990843	-1020701	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
756	3729	5	0	0	chr2L	22498397	22498825	-512719	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
756	3994	2	0	0	chr2L	22507055	22507483	-504061	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
758	717	12	12	0	chr2L	22804416	22804502	-207042	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	87	-341	1
759	3746	19	2	0	chr2L	22811567	22811994	-199550	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
760	3931	0	0	0	chr2L	22985271	22985699	-25845	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
594	3871	5	0	0	chr2RHet	1269702	1270130	-2018631	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
594	3974	5	0	0	chr2RHet	1278363	1278791	-2009970	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
594	3157	35	0	29	chr2RHet	1297244	1297629	-1991132	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	55	2
595	3439	20	49	0	chr2RHet	1341706	1342114	-1946647	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
595	3643	30	2	0	chr2RHet	1358943	1359370	-1929391	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
595	3729	21	2	0	chr2RHet	1362492	1362919	-1925842	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
595	3726	21	2	0	chr2RHet	1364446	1364873	-1923888	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
597	3509	33	7	7	chr2RHet	1573367	1573795	-1714966	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
604	914	0	0	0	chr2RHet	2610989	2611093	-677668	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-324	104	1	2
604	3530	17	39	0	chr2RHet	2618382	2618794	-669967	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
607	3348	24	35	46	chr2RHet	2883814	2884247	-404514	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
607	3901	0	0	2	chr2RHet	2935915	2936344	-352417	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
610	3931	0	0	0	chr2RHet	3279579	3280007	-8754	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
610	3931	0	0	0	chr2RHet	3288265	3288693	-68	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
585	3766	0	0	0	chr2R	1938	2366	-21144342	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
588	3799	23	0	2	chr2R	438508	438937	-20707771	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
601	372	0	0	0	chr2R	2181669	2181712	-18964996	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	43	-385	1
601	2121	17	4	0	chr2R	2208197	2208433	-18938275	+	ROO_LTR	LTR	Pao	192	428	0	1
608	3928	5	0	2	chr2R	3097400	3097829	-18048879	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
608	3938	5	0	2	chr2R	3104661	3105090	-18041618	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
617	4017	0	0	0	chr2R	4218422	4218850	-16927858	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
623	4005	0	0	0	chr2R	5100253	5100681	-16046027	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
624	3964	2	0	2	chr2R	5239784	5240213	-15906495	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
625	3964	2	0	2	chr2R	5248446	5248875	-15897833	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
625	3991	2	0	0	chr2R	5367636	5368064	-15778644	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
626	3965	5	0	0	chr2R	5377681	5378109	-15768599	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
628	3099	38	24	3	chr2R	5755404	5755777	-15390931	+	ROO_LTR	LTR	Pao	48	428	0	1
628	1147	37	0	0	chr2R	5756667	5756803	-15389905	+	ROO_LTR	LTR	Pao	293	428	0	1
628	4017	0	0	0	chr2R	5758600	5759028	-15387680	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
631	3766	0	0	0	chr2R	6064439	6064867	-15081841	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
631	3742	2	0	0	chr2R	6073120	6073548	-15073160	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
637	3976	5	0	0	chr2R	6897374	6897802	-14248906	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
637	3976	5	0	0	chr2R	6906062	6906490	-14240218	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
648	3948	2	0	2	chr2R	8368696	8369125	-12777583	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
648	3948	2	0	2	chr2R	8370013	8370442	-12776266	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
650	3986	5	0	0	chr2R	8595075	8595503	-12551205	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
650	3986	5	0	0	chr2R	8602955	8603383	-12543325	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
651	4022	0	0	0	chr2R	8676854	8677282	-12469426	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
651	4022	0	0	0	chr2R	8684731	8685159	-12461549	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
661	4017	0	0	0	chr2R	9980994	9981422	-11165286	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
661	4017	0	0	0	chr2R	9996659	9997087	-11149621	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
664	4022	0	0	0	chr2R	10354853	10355281	-10791427	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
664	4022	0	0	0	chr2R	10363519	10363947	-10782761	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
693	3766	0	0	0	chr2R	14249642	14250070	-6896638	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
693	3766	0	0	0	chr2R	14258326	14258754	-6887954	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
695	3970	2	0	2	chr2R	14478427	14478856	-6667852	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
695	3970	2	0	2	chr2R	14487092	14487521	-6659187	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
709	4006	2	0	0	chr2R	16256071	16256499	-4890209	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
709	4006	2	0	0	chr2R	16264748	16265176	-4881532	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
719	3766	0	0	0	chr2R	17625837	17626265	-3520443	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
719	3749	2	0	0	chr2R	17634511	17634939	-3511769	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
719	3728	5	0	0	chr2R	17640643	17641071	-3505637	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
720	3963	7	0	0	chr2R	17697084	17697512	-3449196	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
720	3979	5	0	0	chr2R	17704838	17705266	-3441442	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
739	3975	0	0	2	chr2R	20241006	20241435	-905273	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
739	4005	0	0	0	chr2R	20248882	20249310	-897398	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
745	3879	2	0	0	chr2R	21029228	21029652	-117056	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	424	-4	2
745	3820	14	0	0	chr2R	21036865	21037293	-109415	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
745	3915	2	0	0	chr2R	21046432	21046860	-99848	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
587	4022	0	0	0	chr3LHet	341988	342416	-2213075	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
589	3443	24	41	12	chr3LHet	533766	534182	-2021309	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
589	3338	21	21	16	chr3LHet	577885	578311	-1977180	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
594	3730	28	5	0	chr3LHet	1212351	1212777	-1342714	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
594	3498	29	39	0	chr3LHet	1220259	1220671	-1334820	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
594	3237	39	29	0	chr3LHet	1297512	1297928	-1257563	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
594	3261	39	29	0	chr3LHet	1304615	1305031	-1250460	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
597	3454	24	9	0	chr3LHet	1581419	1581843	-973648	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
597	3505	28	2	0	chr3LHet	1589712	1590139	-965352	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
601	3680	26	2	0	chr3LHet	2136843	2137270	-418221	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
601	3743	19	2	0	chr3LHet	2145326	2145753	-409738	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
603	3674	28	2	0	chr3LHet	2383327	2383754	-171737	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
603	3736	19	2	0	chr3LHet	2425674	2426101	-129390	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
585	3931	0	0	0	chr3L	110266	110694	-24432863	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
585	3766	0	0	0	chr3L	118947	119375	-24424182	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
591	4017	0	0	0	chr3L	789968	790396	-23753161	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
593	3964	2	0	2	chr3L	1154184	1154613	-23388944	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
593	3964	2	0	2	chr3L	1162848	1163277	-23380280	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
603	3986	5	0	0	chr3L	2447559	2447987	-22095570	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
603	3969	7	0	0	chr3L	2456229	2456657	-22086900	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
623	3999	2	0	0	chr3L	5034213	5034641	-19508916	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
623	3999	2	0	0	chr3L	5042879	5043307	-19500250	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	2
632	3971	5	0	0	chr3L	6214069	6214497	-18329060	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
632	3994	2	0	0	chr3L	6222735	6223163	-18320394	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
633	3931	0	0	0	chr3L	6398813	6399241	-18144316	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
633	3874	7	0	0	chr3L	6407485	6407913	-18135644	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
633	3907	2	0	0	chr3L	6416141	6416569	-18126988	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
634	3931	0	0	0	chr3L	6424791	6425219	-18118338	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
637	3960	2	0	2	chr3L	6880672	6881101	-17662456	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
637	3975	5	0	0	chr3L	6887678	6888106	-17655451	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	2
645	4022	0	0	0	chr3L	7909983	7910411	-16633146	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
645	4022	0	0	0	chr3L	7918668	7919096	-16624461	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
649	4017	0	0	0	chr3L	8474927	8475355	-16068202	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
649	4017	0	0	0	chr3L	8483600	8484028	-16059529	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
655	4017	0	0	0	chr3L	9263772	9264200	-15279357	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
655	4017	0	0	0	chr3L	9271041	9271469	-15272088	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
657	4017	0	0	0	chr3L	9494855	9495283	-15048274	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
660	3722	2	0	2	chr3L	9922822	9923251	-14620306	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
660	3752	2	0	0	chr3L	9931115	9931543	-14612014	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
672	3766	0	0	0	chr3L	11492211	11492639	-13050918	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
672	4006	2	0	0	chr3L	11500884	11501312	-13042245	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
688	3975	5	0	0	chr3L	13518311	13518739	-11024818	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
688	3975	5	0	0	chr3L	13525621	13526049	-11017508	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
690	3861	5	0	2	chr3L	13797700	13798129	-10745428	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
690	3907	2	0	0	chr3L	13804334	13804762	-10738795	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
690	3885	2	0	2	chr3L	13813023	13813452	-10730105	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
690	3831	5	0	5	chr3L	13815498	13815928	-10727629	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
694	3698	9	0	0	chr3L	14289137	14289565	-10253992	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
706	3891	5	0	0	chr3L	15922351	15922779	-8620778	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
706	3891	5	0	0	chr3L	15931012	15931440	-8612117	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
714	3964	2	0	2	chr3L	16938882	16939311	-7604246	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
714	3964	2	0	2	chr3L	16947548	16947977	-7595580	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
715	3969	2	0	2	chr3L	17078159	17078588	-7464969	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
715	3969	2	0	2	chr3L	17086821	17087250	-7456307	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
722	3907	2	0	0	chr3L	18040862	18041290	-6502267	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
722	3907	2	0	0	chr3L	18049433	18049861	-6493696	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
726	3741	2	0	0	chr3L	18521782	18522210	-6021347	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
726	3736	0	0	2	chr3L	18530456	18530885	-6012672	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
728	3931	0	0	0	chr3L	18765563	18765991	-5777566	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
728	3917	2	0	0	chr3L	18773758	18774186	-5769371	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
736	4017	0	0	0	chr3L	19841656	19842084	-4701473	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
736	4017	0	0	0	chr3L	19850360	19850788	-4692769	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
738	3972	2	0	2	chr3L	20106812	20107241	-4436316	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
738	4002	2	0	0	chr3L	20115583	20116011	-4427546	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	3
747	3990	2	0	0	chr3L	21299302	21299730	-3243827	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
747	3958	7	0	0	chr3L	21307975	21308403	-3235154	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
752	2591	25	164	0	chr3L	21951868	21952236	-2591321	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
752	2591	25	164	0	chr3L	21954330	21954698	-2588859	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
765	3378	19	34	0	chr3L	23592995	23593409	-950148	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
765	3457	24	9	0	chr3L	23648592	23649016	-894541	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	3
768	3766	0	0	0	chr3L	24005560	24005988	-537569	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
768	3766	0	0	0	chr3L	24013415	24013843	-529714	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
592	3467	33	2	0	chr3RHet	1030771	1031198	-1486309	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
592	3464	33	2	0	chr3RHet	1038380	1038807	-1478700	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
597	1051	30	0	0	chr3RHet	1611427	1611558	-905949	+	ROO_LTR	LTR	Pao	298	428	0	5
586	4022	0	0	0	chr3R	192534	192962	-27712091	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
586	4022	0	0	0	chr3R	200431	200859	-27704194	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
617	4017	0	0	0	chr3R	4228784	4229212	-23675841	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
617	4017	0	0	0	chr3R	4237464	4237892	-23667161	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
618	3766	0	0	0	chr3R	4427543	4427971	-23477082	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
618	3766	0	0	0	chr3R	4436210	4436638	-23468415	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
639	3968	5	0	0	chr3R	7205012	7205440	-20699613	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
640	3938	5	0	2	chr3R	7213680	7214109	-20690944	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	4
651	3742	2	0	0	chr3R	8690338	8690766	-19214287	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
661	3994	2	0	0	chr3R	10020204	10020632	-17884421	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
661	3994	2	0	0	chr3R	10028868	10029296	-17875757	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	4
687	3985	5	0	0	chr3R	13464094	13464522	-14440531	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
688	4017	0	0	0	chr3R	13588939	13589367	-14315686	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
701	3711	7	0	0	chr3R	15267282	15267710	-12637343	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
701	3752	2	0	0	chr3R	15275952	15276380	-12628673	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
706	3742	2	0	0	chr3R	15982467	15982895	-11922158	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
707	3742	2	0	0	chr3R	15991151	15991579	-11913474	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
708	3990	2	0	0	chr3R	16156775	16157203	-11747850	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
722	4022	0	0	0	chr3R	18065268	18065696	-9839357	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
722	4022	0	0	0	chr3R	18073842	18074270	-9830783	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
733	3959	7	0	0	chr3R	19510473	19510901	-8394152	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
735	4017	0	0	0	chr3R	19661180	19661608	-8243445	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
735	4022	0	0	0	chr3R	19669845	19670273	-8234780	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
749	3999	2	0	0	chr3R	21551605	21552033	-6353020	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
749	3742	2	0	0	chr3R	21560279	21560707	-6344346	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
750	3766	0	0	0	chr3R	21658467	21658895	-6246158	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
750	3766	0	0	0	chr3R	21667163	21667591	-6237462	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
754	3736	0	0	2	chr3R	22202101	22202530	-5702523	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
754	3736	0	0	2	chr3R	22210774	22211203	-5693850	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
755	3749	2	0	0	chr3R	22336278	22336706	-5568347	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
755	3766	0	0	0	chr3R	22344853	22345281	-5559772	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
757	4017	0	0	0	chr3R	22636329	22636757	-5268296	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
759	3977	5	0	0	chr3R	22833181	22833609	-5071444	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
759	3977	5	0	0	chr3R	22841830	22842258	-5062795	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
763	4017	0	0	0	chr3R	23346934	23347362	-4557691	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
763	4017	0	0	0	chr3R	23355657	23356085	-4548968	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
772	3961	7	0	0	chr3R	24584062	24584490	-3320563	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
772	3961	7	0	0	chr3R	24589193	24589621	-3315432	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
781	3990	2	0	0	chr3R	25707796	25708224	-2196829	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
781	3990	2	0	0	chr3R	25716467	25716895	-2188158	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
784	3712	2	0	2	chr3R	26143102	26143531	-1761522	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
784	3712	2	0	2	chr3R	26150207	26150636	-1754417	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
785	4017	0	0	0	chr3R	26221994	26222422	-1682631	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
785	4017	0	0	0	chr3R	26229774	26230202	-1674851	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	5
796	3994	2	0	0	chr3R	27714616	27715044	-190009	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
796	3994	2	0	0	chr3R	27721950	27722378	-182675	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	5
585	2687	7	0	0	chrUextra	112781	113089	-28891567	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-120	308	1	7
586	3478	45	2	30	chrUextra	260857	261297	-28743359	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
587	2924	23	3	0	chrUextra	284719	285071	-28719585	+	ROO_LTR	LTR	Pao	76	428	0	7
587	2609	13	3	6	chrUextra	307394	307709	-28696947	+	ROO_LTR	LTR	Pao	115	428	0	7
587	2588	25	164	0	chrUextra	365006	365374	-28639282	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
595	3999	2	0	0	chrUextra	1397318	1397746	-27606910	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
596	760	0	0	0	chrUextra	1447050	1447132	-27557524	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-346	82	1	7
597	1439	41	0	0	chrUextra	1648901	1649072	-27355584	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	171	-257	7
599	3979	5	0	0	chrUextra	1871087	1871515	-27133141	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
599	3766	0	0	0	chrUextra	1891013	1891441	-27113215	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
600	3752	2	0	0	chrUextra	1970659	1971087	-27033569	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
602	3468	33	0	2	chrUextra	2301672	2302101	-26702555	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
604	836	0	0	0	chrUextra	2563466	2563560	-26441096	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	335	7
604	808	41	0	0	chrUextra	2589889	2589986	-26414670	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	97	-331	7
608	1131	8	0	0	chrUextra	3138664	3138789	-25865867	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	304	7
610	3742	2	0	0	chrUextra	3313386	3313814	-25690842	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	7
610	607	0	0	0	chrUextra	3370791	3370864	-25633792	+	ROO_LTR	LTR	Pao	356	428	0	7
616	680	0	0	0	chrUextra	4133641	4133720	-24870936	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-349	79	1	7
616	3766	0	0	0	chrUextra	4168821	4169249	-24835407	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
617	3385	38	0	2	chrUextra	4194788	4195212	-24809444	+	ROO_LTR	LTR	Pao	6	428	0	7
617	3606	0	0	0	chrUextra	4209761	4210171	-24794485	+	ROO_LTR	LTR	Pao	19	428	0	7
617	3893	5	0	0	chrUextra	4279761	4280189	-24724467	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	7
617	2533	0	0	4	chrUextra	4280559	4280838	-24723818	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-150	278	1	7
617	2975	6	0	0	chrUextra	4313320	4313647	-24691009	+	ROO_LTR	LTR	Pao	98	424	-4	7
618	3706	2	0	5	chrUextra	4407592	4408022	-24596634	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
618	3057	0	0	0	chrUextra	4426647	4426993	-24577663	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-82	346	1	7
618	3722	2	0	2	chrUextra	4429878	4430307	-24574349	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	7
619	3955	0	0	2	chrUextra	4535677	4536102	-24468554	+	ROO_LTR	LTR	Pao	5	428	0	7
620	3742	2	0	0	chrUextra	4627481	4627909	-24376747	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	7
620	1384	0	0	0	chrUextra	4685958	4686119	-24318537	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-267	161	1	7
620	3741	2	0	0	chrUextra	4694176	4694604	-24310052	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	7
620	3668	9	0	2	chrUextra	4708317	4708746	-24295910	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	7
621	3766	0	0	0	chrUextra	4755619	4756047	-24248609	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
621	3699	5	0	2	chrUextra	4767629	4768058	-24236598	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
621	3742	2	0	0	chrUextra	4822816	4823244	-24181412	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
622	2785	0	6	0	chrUextra	4870652	4870974	-24133682	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-100	328	5	7
622	3292	3	0	0	chrUextra	4910641	4911001	-24093655	+	ROO_LTR	LTR	Pao	69	428	0	7
625	3999	2	0	0	chrUextra	5275874	5276302	-23728354	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	7
626	3145	22	54	0	chrUextra	5398770	5399138	-23605518	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	388	-40	7
626	3999	2	0	0	chrUextra	5440021	5440449	-23564207	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	7
627	3574	36	17	2	chrUextra	5505877	5506299	-23498357	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
630	2830	27	60	0	chrUextra	6017366	6017702	-22986954	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	73	8
631	2555	32	0	3	chrUextra	6070107	6070423	-22934233	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	114	8
632	1369	18	0	0	chrUextra	6250169	6250334	-22754322	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	165	-263	8
633	2708	27	24	0	chrUextra	6342228	6342563	-22662093	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	343	-85	8
634	3552	2	0	0	chrUextra	6473112	6473518	-22531138	+	ROO_LTR	LTR	Pao	2	407	-21	8
635	3325	0	0	0	chrUextra	6628940	6629317	-22375339	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-51	377	1	8
636	3766	0	0	0	chrUextra	6718173	6718601	-22286055	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	8
637	3307	17	49	0	chrUextra	6836760	6837168	-22167488	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
638	2132	45	4	0	chrUextra	7058928	7059197	-21945459	+	ROO_LTR	LTR	Pao	159	428	0	8
638	3328	36	17	2	chrUextra	7062407	7062829	-21941827	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
639	3357	8	0	0	chrUextra	7206443	7206831	-21797825	+	ROO_LTR	LTR	Pao	41	428	0	8
642	3204	28	2	2	chrUextra	7572430	7572824	-21431832	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-34	394	1	8
643	3668	2	0	2	chrUextra	7648104	7648528	-21356128	+	ROO_LTR	LTR	Pao	6	428	0	8
643	3742	2	0	0	chrUextra	7667342	7667770	-21336886	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
645	3699	5	0	2	chrUextra	7888980	7889409	-21115247	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	8
646	2680	3	0	6	chrUextra	7999055	7999369	-21005287	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-116	312	1	8
646	3274	0	0	0	chrUextra	8004467	8004838	-20999818	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-57	371	1	8
646	1480	43	0	0	chrUextra	8035736	8035924	-20968732	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	188	-240	8
647	3742	2	0	0	chrUextra	8220538	8220966	-20783690	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	8
648	3668	5	0	0	chrUextra	8289447	8289869	-20714787	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-6	422	1	8
648	2624	3	0	0	chrUextra	8313240	8313539	-20691117	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	130	8
649	2000	4	0	0	chrUextra	8409354	8409583	-20595073	+	ROO_LTR	LTR	Pao	200	428	0	8
649	3742	2	0	0	chrUextra	8426505	8426933	-20577723	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
649	3711	2	0	2	chrUextra	8477515	8477944	-20526712	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
652	861	9	9	0	chrUextra	8817425	8817533	-20187123	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	109	-319	8
652	3580	19	2	0	chrUextra	8822196	8822623	-20182033	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	8
653	4022	0	0	0	chrUextra	8919675	8920103	-20084553	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
654	1910	14	0	0	chrUextra	9051721	9051944	-19952712	+	ROO_LTR	LTR	Pao	206	428	0	8
654	3917	2	0	0	chrUextra	9164605	9165033	-19839623	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
654	1597	0	5	0	chrUextra	9174080	9174267	-19830389	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-240	188	1	8
655	2933	0	0	0	chrUextra	9182870	9183202	-19821454	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-96	332	1	8
656	3742	2	0	0	chrUextra	9311092	9311520	-19693136	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
656	3742	2	0	0	chrUextra	9328607	9329035	-19675621	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
656	3741	2	0	0	chrUextra	9362921	9363349	-19641307	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
657	3429	37	0	2	chrUextra	9496750	9497179	-19507477	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
657	3982	5	0	0	chrUextra	9501262	9501690	-19502966	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
658	3766	0	0	0	chrUextra	9616510	9616938	-19387718	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
658	1391	0	0	0	chrUextra	9624141	9624303	-19380353	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-266	162	1	8
658	2227	0	0	0	chrUextra	9658149	9658401	-19346255	+	ROO_LTR	LTR	Pao	177	428	0	8
658	2349	4	0	0	chrUextra	9683931	9684183	-19320473	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	177	8
658	3289	3	0	3	chrUextra	9694279	9694635	-19310021	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	74	8
659	4002	2	0	0	chrUextra	9790773	9791201	-19213455	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
659	1572	0	0	0	chrUextra	9791341	9791512	-19213144	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-257	171	1	8
659	3955	2	0	5	chrUextra	9824468	9824898	-19179758	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
660	3220	3	5	0	chrUextra	9898183	9898558	-19106098	+	ROO_LTR	LTR	Pao	52	428	0	8
660	991	16	16	0	chrUextra	9919015	9919141	-19085515	+	ROO_LTR	LTR	Pao	301	428	0	8
661	4017	0	0	0	chrUextra	10077020	10077448	-18927208	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
664	671	64	0	0	chrUextra	10398602	10398696	-18605960	+	ROO_LTR	LTR	Pao	335	428	0	8
664	767	0	0	0	chrUextra	10400134	10400224	-18604432	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	90	-338	8
664	278	54	0	0	chrUextra	10415685	10415722	-18588934	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	392	8
665	3906	2	0	0	chrUextra	10569090	10569518	-18435138	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	8
665	3046	0	0	0	chrUextra	10574837	10575167	-18429489	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-98	330	1	8
666	2299	0	0	0	chrUextra	10625968	10626217	-18378439	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	180	8
666	730	0	0	0	chrUextra	10747172	10747260	-18257396	+	ROO_LTR	LTR	Pao	341	428	0	8
668	3999	2	0	0	chrUextra	10891043	10891471	-18113185	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
668	3990	2	0	0	chrUextra	10926905	10927332	-18077324	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	427	-1	8
668	1281	7	0	0	chrUextra	10996818	10996967	-18007689	+	ROO_LTR	LTR	Pao	280	428	0	8
669	1055	8	0	0	chrUextra	11057380	11057506	-17947150	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-302	126	1	8
670	2744	3	0	0	chrUextra	11162632	11162944	-17841712	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	312	-116	8
671	2720	0	0	0	chrUextra	11339945	11340253	-17664403	+	ROO_LTR	LTR	Pao	121	428	0	8
672	1834	0	0	0	chrUextra	11498644	11498843	-17505813	+	ROO_LTR	LTR	Pao	230	428	0	8
673	3548	3	0	0	chrUextra	11552886	11553274	-17451382	+	ROO_LTR	LTR	Pao	41	428	0	8
674	3766	0	0	0	chrUextra	11665658	11666086	-17338570	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	8
674	2609	0	0	3	chrUextra	11675617	11675904	-17328752	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-142	286	1	8
675	3652	0	0	0	chrUextra	11871933	11872321	-17132335	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	41	9
675	2098	0	0	0	chrUextra	11878005	11878229	-17126427	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	224	-204	9
675	2500	4	0	0	chrUextra	11881337	11881605	-17123051	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	161	9
675	3999	2	0	0	chrUextra	11909635	11910063	-17094593	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	9
677	1592	0	0	0	chrUextra	12063438	12063615	-16941041	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	177	-251	9
677	2993	0	0	0	chrUextra	12157488	12157827	-16846829	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	90	9
678	2575	0	0	0	chrUextra	12197060	12197333	-16807323	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	156	9
679	3160	0	0	0	chrUextra	12359836	12360179	-16644477	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	86	9
679	2905	3	0	0	chrUextra	12439479	12439790	-16564866	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	118	9
680	1011	39	0	0	chrUextra	12565215	12565343	-16439313	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	301	9
682	753	0	20	10	chrUextra	12738413	12738514	-16266142	+	ROO_LTR	LTR	Pao	327	428	0	9
683	2751	3	0	0	chrUextra	12941495	12941809	-16062847	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	115	9
684	3057	0	0	0	chrUextra	13017712	13018058	-15986598	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-82	346	1	9
684	3766	0	0	0	chrUextra	13041872	13042300	-15962356	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	9
685	3901	0	0	2	chrUextra	13116041	13116470	-15888186	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	9
685	287	29	0	0	chrUextra	13136546	13136581	-15868075	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	394	9
688	2369	0	0	0	chrUextra	13571337	13571605	-15433051	+	ROO_LTR	LTR	Pao	161	428	0	9
688	2085	0	0	0	chrUextra	13577133	13577369	-15427287	+	ROO_LTR	LTR	Pao	193	428	0	9
689	1594	0	0	5	chrUextra	13635570	13635758	-15368898	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	187	-241	9
689	2130	4	0	0	chrUextra	13713241	13713486	-15291170	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	245	-183	9
690	2045	0	0	5	chrUextra	13845730	13845951	-15158705	+	ROO_LTR	LTR	Pao	209	428	0	9
692	410	88	0	0	chrUextra	14129097	14129154	-14875502	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	372	9
693	2174	32	153	3	chrUextra	14191153	14191525	-14813131	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	9
693	1316	0	0	0	chrUextra	14226351	14226494	-14778162	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-285	143	1	9
695	4022	0	0	0	chrUextra	14506580	14507008	-14497648	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	9
697	2218	12	4	0	chrUextra	14707941	14708192	-14296464	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-176	252	1	9
697	3314	3	0	0	chrUextra	14722665	14723027	-14281629	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-66	362	1	9
698	2639	0	0	0	chrUextra	14815099	14815385	-14189271	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-142	286	1	9
699	1819	0	0	0	chrUextra	14992373	14992579	-14012077	+	ROO_LTR	LTR	Pao	223	428	0	9
700	3203	0	0	0	chrUextra	15085397	15085744	-13918912	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-81	347	1	9
700	895	0	0	0	chrUextra	15096612	15096714	-13907942	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	327	9
700	3766	0	0	0	chrUextra	15149107	15149535	-13855121	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	9
701	2412	0	0	0	chrUextra	15261833	15262106	-13742550	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	156	9
701	3766	0	0	0	chrUextra	15278536	15278964	-13725692	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	9
702	3719	2	0	2	chrUextra	15446172	15446601	-13558055	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	9
703	3380	0	0	0	chrUextra	15592635	15592994	-13411662	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	70	9
705	1631	0	0	0	chrUextra	15766425	15766606	-13238050	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	181	-247	9
705	3568	0	0	0	chrUextra	15822612	15822991	-13181665	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-49	379	1	9
708	3719	2	0	2	chrUextra	16123710	16124139	-12880517	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	9
709	402	0	0	0	chrUextra	16284946	16284993	-12719663	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	47	-381	9
709	3142	0	0	0	chrUextra	16288321	16288677	-12715979	+	ROO_LTR	LTR	Pao	73	428	0	9
709	1674	0	0	0	chrUextra	16310627	16310817	-12693839	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	239	9
710	2772	29	0	3	chrUextra	16439471	16439812	-12564844	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	89	9
710	2949	24	54	0	chrUextra	16445082	16445454	-12559202	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	37	9
710	1656	0	0	0	chrUextra	16500348	16500538	-12504118	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-238	190	1	9
710	3696	0	0	0	chrUextra	16506788	16507208	-12497448	+	ROO_LTR	LTR	Pao	9	428	0	9
711	860	0	0	0	chrUextra	16581653	16581755	-12422901	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-326	102	1	9
711	3005	17	3	0	chrUextra	16615006	16615363	-12389293	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	358	-70	9
713	1581	22	6	0	chrUextra	16818547	16818728	-12185928	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	182	-246	9
713	1603	0	0	0	chrUextra	16854963	16855134	-12149522	+	ROO_LTR	LTR	Pao	258	428	0	9
713	2008	0	0	0	chrUextra	16887573	16887786	-12116870	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	216	9
714	1175	8	0	8	chrUextra	16951265	16951399	-12053257	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-295	133	1	9
714	2495	0	0	0	chrUextra	16952869	16953134	-12051522	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-163	265	1	9
716	662	24	12	0	chrUextra	17207703	17207785	-11796871	+	ROO_LTR	LTR	Pao	346	428	0	9
720	3443	35	0	2	chrUextra	17792269	17792698	-11211958	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
721	2524	0	4	0	chrUextra	17846276	17846553	-11158103	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-150	278	1	1
721	1565	0	0	0	chrUextra	17890571	17890752	-11113904	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	181	-247	1
722	2906	3	3	0	chrUextra	17969976	17970289	-11034367	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	115	1
723	3533	0	0	0	chrUextra	18130393	18130794	-10873862	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	401	-27	1
724	709	0	0	0	chrUextra	18330020	18330102	-10674554	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-346	82	1	1
727	1423	45	0	0	chrUextra	18696889	18697068	-10307588	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	250	1
728	3901	0	0	2	chrUextra	18760411	18760840	-10243816	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
730	3984	5	0	0	chrUextra	19016776	19017204	-9987452	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
730	3466	0	0	2	chrUextra	19129990	19130388	-9874268	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-31	397	1	1
731	1097	0	0	0	chrUextra	19245359	19245487	-9759169	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	128	-300	1
732	3509	2	0	0	chrUextra	19313460	19313861	-9690795	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	401	-27	1
733	3766	0	0	0	chrUextra	19398842	19399270	-9605386	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
734	3642	12	0	2	chrUextra	19636438	19636867	-9367789	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
735	1565	0	0	0	chrUextra	19716881	19717062	-9287594	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-247	181	1	1
735	3126	0	0	0	chrUextra	19744251	19744605	-9260051	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-74	354	1	1
736	3931	0	0	0	chrUextra	19888191	19888619	-9116037	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
736	1721	48	0	0	chrUextra	19892437	19892644	-9112012	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	222	1
738	3982	5	0	0	chrUextra	20140180	20140608	-8864048	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
741	3712	2	0	2	chrUextra	20557734	20558163	-8446493	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
742	3766	0	0	0	chrUextra	20615778	20616206	-8388450	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
746	3766	0	0	0	chrUextra	21217903	21218331	-7786325	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
747	2990	0	0	0	chrUextra	21343358	21343682	-7660974	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-104	324	1	1
748	3965	2	0	0	chrUextra	21475150	21475574	-7529082	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	424	-4	1
749	1546	22	0	0	chrUextra	21556057	21556238	-7448418	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	181	-247	1
749	1644	0	0	5	chrUextra	21600882	21601075	-7403581	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-236	192	1	1
749	3692	0	0	2	chrUextra	21621601	21622007	-7382649	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-23	405	1	1
749	3182	32	0	3	chrUextra	21623426	21623802	-7380854	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	54	1
750	3406	0	0	3	chrUextra	21753788	21754179	-7250477	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	390	-38	1
754	3738	5	0	0	chrUextra	22207017	22207445	-6797211	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
754	2188	26	0	4	chrUextra	22243574	22243841	-6760815	+	ROO_LTR	LTR	Pao	163	428	0	1
755	1252	0	0	0	chrUextra	22285279	22285424	-6719232	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	284	1
756	3704	2	0	2	chrUextra	22491881	22492309	-6512347	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-1	427	1	1
757	833	0	0	0	chrUextra	22560300	22560396	-6444260	+	ROO_LTR	LTR	Pao	333	428	0	1
757	928	9	0	0	chrUextra	22589732	22589840	-6414816	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	108	-320	1
758	332	24	0	0	chrUextra	22727208	22727249	-6277407	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	388	1
758	3026	6	0	0	chrUextra	22764493	22764841	-6239815	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-80	348	1	1
761	3297	3	0	0	chrUextra	23155732	23156109	-5848547	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	52	1
763	3043	0	0	0	chrUextra	23358077	23358422	-5646234	+	ROO_LTR	LTR	Pao	84	428	0	1
764	3766	0	0	0	chrUextra	23507824	23508252	-5496404	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
764	402	0	0	0	chrUextra	23524905	23524952	-5479704	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-381	47	1	1
764	3429	37	0	2	chrUextra	23551979	23552408	-5452248	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
765	1984	5	0	0	chrUextra	23610879	23611092	-5393564	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	216	1
766	3877	2	0	2	chrUextra	23781339	23781768	-5222888	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
767	2420	17	7	0	chrUextra	23878760	23879053	-5125603	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	295	-133	1
767	3742	2	0	0	chrUextra	23920270	23920698	-5083958	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
769	3877	2	0	2	chrUextra	24189380	24189809	-4814847	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
769	3931	0	0	0	chrUextra	24234712	24235140	-4769516	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
772	3303	0	0	0	chrUextra	24545950	24546308	-4458348	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-70	358	1	1
772	457	0	0	0	chrUextra	24566642	24566695	-4437961	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-375	53	1	1
775	3693	0	0	2	chrUextra	24945407	24945831	-4058825	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-5	423	1	1
776	1274	0	0	0	chrUextra	25059446	25059593	-3945063	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	282	1
776	3736	0	0	2	chrUextra	25124213	25124642	-3880014	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
779	3766	0	0	0	chrUextra	25517648	25518076	-3486580	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
780	461	0	0	0	chrUextra	25647171	25647221	-3357435	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-378	50	1	1
781	2379	4	0	0	chrUextra	25744352	25744608	-3260048	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	256	-172	1
782	3557	0	0	0	chrUextra	25871058	25871462	-3133194	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	25	1
783	3683	0	0	2	chrUextra	26027662	26028085	-2976571	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	7	1
784	482	0	0	0	chrUextra	26186982	26187038	-2817618	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-372	56	1	1
787	3999	2	0	0	chrUextra	26491891	26492319	-2512337	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
787	3879	14	0	2	chrUextra	26583823	26584252	-2420404	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
789	4017	0	0	0	chrUextra	26854601	26855029	-2149627	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
791	4017	0	0	0	chrUextra	27031093	27031521	-1973135	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
793	2504	4	0	0	chrUextra	27363353	27363621	-1641035	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	161	1
797	757	0	0	0	chrUextra	27808623	27808709	-1195947	+	ROO_LTR	LTR	Pao	343	428	0	1
598	3638	30	2	2	chrU	1827138	1827566	-8221471	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
602	4005	0	0	0	chrU	2245313	2245741	-7803296	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
605	2933	38	68	0	chrU	2704582	2704949	-7344088	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	392	-36	6
605	3302	30	62	0	chrU	2714357	2714760	-7334277	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
608	3549	21	2	0	chrU	3037963	3038390	-7010647	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
609	3029	40	70	2	chrU	3194748	3195149	-6853888	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
610	3672	28	2	0	chrU	3353550	3353977	-6695060	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
611	3741	26	2	0	chrU	3497061	3497487	-6551550	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	427	-1	6
611	3738	30	2	0	chrU	3501852	3502279	-6546758	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
617	2806	50	75	2	chrU	4262807	4263206	-5785831	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
627	3931	0	0	0	chrU	5578184	5578612	-4470425	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
629	3519	29	31	0	chrU	5823032	5823447	-4225590	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
631	3345	37	49	0	chrU	6040371	6040779	-4008258	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
637	340	67	0	0	chrU	6889276	6889321	-3159716	+	ROO_LTR	LTR	Pao	384	428	0	6
638	3071	20	86	0	chrU	6983492	6983886	-3065151	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
642	3755	28	2	0	chrU	7513639	7514066	-2534971	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
642	2609	36	29	0	chrU	7525661	7525968	-2523069	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	113	6
642	512	17	0	0	chrU	7525988	7526046	-2522991	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-370	58	1	6
644	3590	37	0	2	chrU	7744620	7745049	-2303988	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
646	3892	5	0	0	chrU	8000071	8000499	-2048538	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
648	1366	13	0	0	chrU	8369330	8369484	-1679553	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	275	6
650	2623	23	3	0	chrU	8646854	8647156	-1401881	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-125	303	1	6
651	3901	0	0	2	chrU	8670415	8670844	-1378193	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
652	3742	2	0	0	chrU	8855690	8856118	-1192919	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	6
654	3391	25	49	0	chrU	9134077	9134485	-914552	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	6
655	731	11	11	0	chrU	9204575	9204662	-844375	+	ROO_LTR	LTR	Pao	341	428	0	6
655	461	0	0	0	chrU	9279862	9279912	-769125	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	50	-378	6
658	3493	3	0	0	chrU	9593802	9594184	-454853	+	ROO_LTR	LTR	Pao	47	428	0	7
660	3408	22	49	0	chrU	9854499	9854907	-194130	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	7
661	2074	56	12	20	chrU	10026637	10026981	-22056	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	386	-42	7
585	3919	0	0	0	chrX	57195	57623	-22365204	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
585	3902	2	0	0	chrX	63963	64391	-22358436	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
590	3959	5	0	0	chrX	721689	722117	-21700710	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
590	3969	5	0	0	chrX	728995	729423	-21693404	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
592	4017	0	0	0	chrX	957843	958271	-21464556	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
592	4017	0	0	0	chrX	966151	966579	-21456248	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
597	3819	0	0	0	chrX	1631198	1631626	-20791201	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
597	3819	0	0	0	chrX	1639877	1640305	-20782522	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
602	4001	2	0	0	chrX	2293925	2294353	-20128474	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
602	4001	2	0	0	chrX	2301792	2302220	-20120607	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
605	4017	0	0	0	chrX	2717875	2718303	-19704524	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
605	3766	0	0	0	chrX	2725937	2726365	-19696462	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
608	3915	2	0	0	chrX	3112593	3113021	-19309806	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
608	3915	2	0	0	chrX	3121256	3121684	-19301143	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
610	3742	2	0	0	chrX	3387179	3387607	-19035220	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
610	3742	2	0	0	chrX	3395852	3396280	-19026547	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
611	3766	0	0	0	chrX	3491638	3492066	-18930761	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
611	3766	0	0	0	chrX	3495546	3495974	-18926853	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
611	3931	0	0	0	chrX	3504204	3504632	-18918195	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
611	3931	0	0	0	chrX	3508114	3508542	-18914285	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
620	4017	0	0	0	chrX	4683600	4684028	-17738799	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
622	3729	5	0	0	chrX	4884131	4884559	-17538268	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
622	3893	5	0	0	chrX	4890859	4891287	-17531540	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
638	3962	7	0	0	chrX	7019333	7019761	-15403066	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
638	3996	2	0	0	chrX	7028006	7028434	-15394393	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
652	3931	0	0	0	chrX	8842846	8843274	-13579553	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
652	3931	0	0	0	chrX	8849870	8850298	-13572529	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
662	3726	5	0	0	chrX	10161390	10161818	-12261009	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
662	3692	9	0	0	chrX	10170054	10170482	-12252345	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
665	3994	2	0	0	chrX	10580138	10580566	-11842261	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
665	4002	2	0	0	chrX	10584789	10585217	-11837610	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
673	3994	2	0	0	chrX	11637654	11638082	-10784745	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
691	3969	2	0	2	chrX	13999110	13999539	-8423288	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
691	3712	2	0	2	chrX	14007774	14008203	-8414624	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
698	3742	2	0	0	chrX	14830947	14831375	-7591452	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
698	3742	2	0	0	chrX	14839718	14840146	-7582681	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
707	3766	0	0	0	chrX	16116865	16117293	-6305534	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
708	3732	5	0	0	chrX	16124729	16125157	-6297670	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
708	3766	0	0	0	chrX	16234755	16235183	-6187644	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
708	3766	0	0	0	chrX	16243426	16243854	-6178973	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
728	3766	0	0	0	chrX	18851157	18851585	-3571242	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
728	3766	0	0	0	chrX	18859334	18859762	-3563065	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
742	3742	2	0	0	chrX	20707807	20708235	-1714592	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
743	3709	7	0	0	chrX	20714924	20715352	-1707475	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
744	4002	2	0	0	chrX	20932945	20933373	-1489454	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
748	1948	77	17	10	chrX	21394785	21395075	-1027752	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	137	1
748	3749	2	0	0	chrX	21415299	21415727	-1007100	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
748	3766	0	0	0	chrX	21421391	21421819	-1001008	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	1	1
748	247	55	473	0	chrX	21424687	21424742	-998085	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	348	1
748	424	55	0	0	chrX	21424738	21424793	-998034	-	ROO_LTR	LTR	Pao	-373	55	1	1
755	3752	2	0	0	chrX	22398198	22398626	-24201	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
755	3736	5	0	0	chrX	22404946	22405374	-17453	+	ROO_LTR	LTR	Pao	1	428	0	1
585	3329	41	31	0	chrYHet	88486	88899	-258139	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	3	1
585	3329	41	31	0	chrYHet	93505	93918	-253120	-	ROO_LTR	LTR	Pao	0	428	3	1