601 4874 0 0 0 chr2L 2112167 2112685 -20898859 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 7 601 4874 0 0 0 chr2L 2119254 2119772 -20891772 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 7 620 4806 4 0 0 chr2L 4661879 4662397 -18349147 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 1 620 4806 7 0 0 chr2L 4668884 4669422 -18342122 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 1 665 4816 2 0 0 chr2L 10592896 10593414 -12418130 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 4 665 4816 2 0 0 chr2L 10599983 10600501 -12411043 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 4 699 4493 4 0 0 chr2L 14984452 14984970 -8026574 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 7 699 4493 4 0 0 chr2L 14991457 14991975 -8019569 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 7 715 4527 0 0 0 chr2L 17144384 17144902 -5866642 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 8 715 4527 0 0 0 chr2L 17151477 17151995 -5859549 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 8 734 4800 0 0 0 chr2L 19657679 19658197 -3353347 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 9 735 4800 0 0 0 chr2L 19664770 19665288 -3346256 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 9 601 4817 2 0 0 chr2RHet 2204719 2205237 -1083524 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 2 601 4817 2 0 0 chr2RHet 2211812 2212330 -1076431 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 2 594 4777 2 0 0 chr2R 1267561 1268079 -19878629 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 594 4777 2 0 0 chr2R 1274651 1275169 -19871539 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 606 4806 6 0 0 chr2R 2839711 2840243 -18306465 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 606 4806 4 0 0 chr2R 2846730 2847248 -18299460 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 640 4506 2 0 0 chr2R 7303077 7303595 -13843113 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 640 3475 7 0 0 chr2R 7305764 7306169 -13840539 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 114 518 0 1 658 4729 6 2 0 chr2R 9615693 9616210 -11530498 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 658 4729 6 2 0 chr2R 9622776 9623293 -11523415 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 706 3420 27 16 3 chr2R 15956803 15957284 -5189424 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 2 706 3420 27 16 3 chr2R 15958895 15959376 -5187332 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 2 714 3790 7 0 0 chr2R 17038672 17039081 -4107627 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 110 518 0 2 715 3763 5 0 0 chr2R 17040847 17041252 -4105456 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 114 518 0 2 585 4527 2 0 0 chr3LHet 85725 86257 -2469234 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 4 585 337 0 0 23 chr3LHet 102425 102468 -2453023 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 477 4 585 2592 8 3 0 chr3LHet 108676 109005 -2446486 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -206 312 1 4 585 4739 0 0 0 chr3LHet 125137 125655 -2429836 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 4 586 4697 4 0 0 chr3LHet 151472 151990 -2403501 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 4 702 3506 14 0 0 chr3L 15416905 15417320 -9126237 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 104 518 0 3 702 4495 4 0 0 chr3L 15419184 15419702 -9123855 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 3 721 4416 6 2 0 chr3L 17911526 17912043 -6631514 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 3 721 4416 6 2 0 chr3L 17913755 17914272 -6629285 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 3 758 4480 4 0 0 chr3L 22796867 22797385 -1746172 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 3 758 4480 4 0 0 chr3L 22803956 22804474 -1739083 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 3 763 4792 4 0 0 chr3L 23365306 23365824 -1177733 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 3 763 3739 5 0 0 chr3L 23372408 23372813 -1170744 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 114 518 0 3 763 4792 4 0 0 chr3L 23378273 23378791 -1164766 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 3 763 4792 6 1 0 chr3L 23385373 23385905 -1157652 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 3 770 4691 4 0 0 chr3L 24265247 24265765 -277792 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 4 770 4691 4 0 0 chr3L 24272339 24272857 -270700 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 4 690 4790 4 0 0 chr3R 13858554 13859072 -14045981 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 5 690 4790 4 0 0 chr3R 13865652 13866170 -14038883 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 5 709 4792 4 0 0 chr3R 16338780 16339298 -11565755 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 5 709 4792 4 0 0 chr3R 16340908 16341426 -11563627 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 5 735 4711 4 2 0 chr3R 19676834 19677351 -8227702 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 5 735 4711 4 2 0 chr3R 19683927 19684444 -8220609 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 5 590 4841 0 0 0 chrUextra 773829 774347 -28230309 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 7 594 3739 5 0 0 chrUextra 1189740 1190145 -27814511 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 114 518 0 7 602 2724 0 0 0 chrUextra 2333209 2333521 -26671135 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 207 518 0 7 603 4800 0 0 0 chrUextra 2478573 2479091 -26525565 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 7 604 3733 5 0 0 chrUextra 2498634 2499041 -26505615 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 112 7 604 3897 2 0 0 chrUextra 2521715 2522136 -26482520 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -97 421 1 7 605 3405 3 0 0 chrUextra 2694355 2694731 -26309925 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 143 518 0 7 609 4265 0 2 0 chrUextra 3269539 3270031 -25734625 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 26 518 0 7 609 227 0 0 0 chrUextra 3270031 3270057 -25734599 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 493 518 0 7 610 4493 4 0 0 chrUextra 3295163 3295681 -25708975 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 7 615 3761 2 0 0 chrUextra 4039747 4040160 -24964496 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 106 518 0 7 616 4527 0 0 0 chrUextra 4160588 4161106 -24843550 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 7 620 3062 0 0 0 chrUextra 4665798 4666155 -24338501 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -161 357 1 7 623 4800 0 0 0 chrUextra 4992636 4993154 -24011502 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 7 626 4800 0 0 0 chrUextra 5411477 5411995 -23592661 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 7 628 4800 0 0 0 chrUextra 5643054 5643572 -23361084 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 7 628 3455 3 3 0 chrUextra 5655617 5656000 -23348656 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -134 384 1 7 629 2972 6 0 0 chrUextra 5778829 5779175 -23225481 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 173 518 0 7 631 3879 2 0 0 chrUextra 6106894 6107340 -22897316 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 73 518 0 8 631 4715 2 0 0 chrUextra 6150985 6151503 -22853153 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 8 632 4527 0 0 0 chrUextra 6205512 6206030 -22798626 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 8 633 4527 0 0 0 chrUextra 6370674 6371192 -22633464 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 8 636 4034 7 0 0 chrUextra 6807155 6807602 -22197054 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 72 8 641 3739 0 0 0 chrUextra 7468248 7468648 -21536008 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 119 518 0 8 642 2068 0 4 0 chrUextra 7524946 7525192 -21479464 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -271 247 1 8 646 3768 7 0 0 chrUextra 8062289 8062698 -20941958 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 110 8 647 3039 3 0 0 chrUextra 8204682 8205039 -20799617 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 357 -161 8 648 2677 3 0 0 chrUextra 8262562 8262863 -20741793 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -217 301 1 8 648 3367 5 0 0 chrUextra 8313639 8314030 -20690626 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -14 504 114 8 649 837 0 0 0 chrUextra 8395953 8396053 -20608603 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -418 100 1 8 652 4605 0 0 0 chrUextra 8891966 8892464 -20112192 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 21 518 0 8 655 4623 0 0 0 chrUextra 9263693 9264193 -19740463 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 19 518 0 8 657 3663 0 0 0 chrUextra 9502794 9503189 -19501467 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 124 518 0 8 658 4777 2 0 0 chrUextra 9686068 9686586 -19318070 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 8 663 3448 10 0 0 chrUextra 10261718 10262123 -18742533 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 114 518 0 8 669 2982 6 3 0 chrUextra 11048848 11049199 -17955457 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 167 518 0 8 673 4527 0 0 0 chrUextra 11607252 11607770 -17396886 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 8 676 4709 8 0 0 chrUextra 11935776 11936294 -17068362 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 9 676 3522 5 5 0 chrUextra 11981195 11981606 -17023050 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 106 518 0 9 682 4709 0 0 2 chrUextra 12811037 12811556 -16193100 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 9 688 4497 2 0 2 chrUextra 13599494 13600027 -15404629 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 9 696 1556 6 0 0 chrUextra 14601476 14601644 -14403012 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 351 518 0 9 705 1039 52 34 6 chrUextra 15813373 15813602 -13191054 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 266 -252 9 708 741 12 0 0 chrUextra 16239904 16239990 -12764666 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 433 518 0 9 718 2352 4 0 0 chrUextra 17442395 17442668 -11561988 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 246 9 718 4631 4 0 0 chrUextra 17502673 17503177 -11501479 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 15 518 0 9 719 3310 0 0 0 chrUextra 17675793 17676156 -11328500 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 156 518 0 1 723 767 0 0 0 chrUextra 18093576 18093669 -10910987 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -425 93 1 1 724 1795 5 0 5 chrUextra 18246757 18246969 -10757687 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 308 518 0 1 724 4527 0 0 0 chrUextra 18305465 18305983 -10698673 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 1 742 976 0 0 0 chrUextra 20621858 20621969 -8382687 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 408 518 0 1 746 3864 2 0 0 chrUextra 21119352 21119797 -7884859 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 445 -73 1 749 4428 2 0 0 chrUextra 21556338 21556848 -7447808 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -8 510 1 1 751 4480 4 0 0 chrUextra 21832507 21833025 -7171631 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 1 752 4673 4 2 2 chrUextra 21909109 21909626 -7095030 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 517 -1 1 752 688 0 13 0 chrUextra 21914138 21914216 -7090440 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 440 1 754 3676 2 0 0 chrUextra 22180484 22180908 -6823748 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 424 -94 1 760 4456 6 0 0 chrUextra 22966707 22967225 -6037431 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 767 4490 0 0 0 chrUextra 23870322 23870836 -5133820 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 5 1 777 2694 0 0 0 chrUextra 25202350 25202665 -3801991 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -203 315 1 1 780 3434 0 0 0 chrUextra 25658007 25658378 -3346278 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 148 518 0 1 781 3914 0 0 0 chrUextra 25762238 25762658 -3241998 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 420 -98 1 784 1848 0 0 0 chrUextra 26148419 26148628 -2856028 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -309 209 1 1 789 3334 3 0 0 chrUextra 26816355 26816718 -2187938 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 156 1 797 937 0 0 0 chrUextra 27910946 27911051 -1093605 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 105 -413 1 798 1233 0 0 0 chrUextra 27930887 27931018 -1073638 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 388 1 800 2814 10 0 3 chrUextra 28306424 28306736 -697920 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 208 1 802 793 60 0 49 chrUextra 28468562 28468685 -535971 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 402 1 596 4751 4 0 0 chrU 1442881 1443399 -8605638 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 6 596 4751 4 0 0 chrU 1449972 1450490 -8598547 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 6 9 4480 4 0 0 chrU 2096638 2097156 -7951881 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 6 602 4815 6 0 0 chrU 2246520 2247038 -7801999 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 6 602 3079 6 0 0 chrU 2253619 2253957 -7795080 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 338 -180 6 606 4739 0 0 0 chrU 2783111 2783629 -7265408 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 6 606 4739 4 0 0 chrU 2789680 2790218 -7258819 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 6 610 4502 2 0 0 chrU 3313508 3314026 -6735011 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 6 624 3912 0 0 0 chrU 5215532 5215960 -4833077 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 428 -90 6 624 4841 0 0 0 chrU 5222891 5223409 -4825628 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 6 630 3059 0 3 0 chrU 6014298 6014632 -4034405 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 335 -183 6 631 4583 4 0 0 chrU 6085889 6086407 -3962630 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 6 650 4715 2 0 0 chrU 8520828 8521346 -1527691 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 6 651 4739 0 0 0 chrU 8673200 8673718 -1375319 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 6 653 2721 0 0 0 chrU 8915624 8915927 -1133110 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -215 303 1 6 653 4527 0 0 0 chrU 8964176 8964694 -1084343 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 6 653 4527 0 0 0 chrU 8986851 8987369 -1061668 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 6 655 4800 0 0 0 chrU 9203386 9203904 -845133 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 6 655 2922 12 0 0 chrU 9271795 9272119 -776918 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 195 518 0 6 657 1754 0 0 0 chrU 9454247 9454446 -594591 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 320 7 660 4585 0 0 0 chrU 9888165 9888667 -160370 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 17 518 0 7 660 3663 5 0 0 chrU 9896306 9896711 -152326 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 114 518 0 7 661 4393 0 0 0 chrU 10048036 10048524 -513 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 31 518 0 7 598 4592 2 2 0 chrX 1824624 1825141 -20597686 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 1 598 4592 2 2 0 chrX 1831621 1832138 -20590689 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 1 608 4711 4 2 0 chrX 3072555 3073072 -19349755 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 608 4711 4 2 0 chrX 3079644 3080161 -19342666 + NOMAD_LTR LTR Gypsy 1 518 0 1 695 4716 4 2 0 chrX 14445731 14446248 -7976579 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 1 695 4716 4 2 0 chrX 14452816 14453333 -7969494 - NOMAD_LTR LTR Gypsy 0 518 1 1 586 1678 0 0 0 chrYHet 134704 134894 -212144 - NOMAD_LTR LTR Gypsy -328 190 1 1