#regionID	chrom	start	stop	RPM	fold	multi%	plus%	leftPlus%	peakPos	peakHeight	pValue
LTR__LTR90A	chr1	34491575	34491628	5	5	1	1	1	1	34491601	5	0
LTR__LTR90A	chr1	34491906	34492100	5	5	1	1	1	1	34492003	5	0
LTR__LTR90A	chr1	34492137	34492255	5	5	1	1	1	1	34492196	5	0
LTR__LTR90A	chr1	34622038	34622330	5	5	1	1	1	1	34622184	5	0
LTR__LTR90A	chr1	42409395	42409529	5	5	1	1	1	1	42409462	5	0
LTR__LTR90A	chr1	42409974	42410116	5	5	1	1	1	1	42410045	5	0
LTR__LTR90A	chr1	42416491	42416630	5	5	1	1	1	1	42416560	5	0
LTR__LTR90A	chr1	81348227	81348529	5	5	1	1	1	1	81348378	5	0
LTR__LTR90A	chr1	84744390	84744515	5	5	1	1	1	1	84744452	5	0
LTR__LTR90A	chr1	85229491	85229688	5	5	1	1	1	1	85229589	5	0
LTR__LTR90A	chr1	99659666	99659782	5	5	1	1	1	1	99659724	5	0
LTR__LTR90A	chr1	113771023	113771491	5	5	1	1	1	1	113771257	5	0
LTR__LTR90A	chr1	113780221	113780562	5	5	1	1	1	1	113780391	5	0
LTR__LTR90A	chr1	113780624	113780923	5	5	1	1	1	1	113780773	5	0
LTR__LTR90A	chr1	164717344	164717479	5	5	1	1	1	1	164717411	5	0
LTR__LTR90A	chr1	164717762	164717896	5	5	1	1	1	1	164717829	5	0
LTR__LTR90A	chr1	172512443	172512793	5	5	1	1	1	1	172512618	5	0
LTR__LTR90A	chr1	172513093	172513274	5	5	1	1	1	1	172513183	5	0
LTR__LTR90A	chr1	175695586	175695790	5	5	1	1	1	1	175695688	5	0
LTR__LTR90A	chr1	175695926	175696420	5	5	1	1	1	1	175696173	5	0
LTR__LTR90A	chr1	183784490	183784585	5	5	1	1	1	1	183784537	5	0
LTR__LTR90A	chr1	183785358	183785491	5	5	1	1	1	1	183785424	5	0
LTR__LTR90A	chr1	199625841	199625923	5	5	1	1	1	1	199625882	5	0
LTR__LTR90A	chr1	201151459	201151625	5	5	1	1	1	1	201151542	5	0
LTR__LTR90A	chr1	220674148	220674362	5	5	1	1	1	1	220674255	5	0
LTR__LTR90A	chr1	222397349	222397466	5	5	1	1	1	1	222397407	5	0
LTR__LTR90A	chr2	6512791	6513022	5	5	1	1	1	1	6512906	5	0
LTR__LTR90A	chr2	11892902	11893090	5	5	1	1	1	1	11892996	5	0
LTR__LTR90A	chr2	24720636	24720706	5	5	1	1	1	1	24720671	5	0
LTR__LTR90A	chr2	24720757	24721102	5	5	1	1	1	1	24720929	5	0
LTR__LTR90A	chr2	25286607	25286761	5	5	1	1	1	1	25286684	5	0
LTR__LTR90A	chr2	25286936	25287405	5	5	1	1	1	1	25287170	5	0
LTR__LTR90A	chr2	33383549	33383843	5	5	1	1	1	1	33383696	5	0
LTR__LTR90A	chr2	37701161	37701367	5	5	1	1	1	1	37701264	5	0
LTR__LTR90A	chr2	38030185	38030295	5	5	1	1	1	1	38030240	5	0
LTR__LTR90A	chr2	39409732	39409840	5	5	1	1	1	1	39409786	5	0
LTR__LTR90A	chr2	54626610	54626784	5	5	1	1	1	1	54626697	5	0
LTR__LTR90A	chr2	54626891	54627151	5	5	1	1	1	1	54627021	5	0
LTR__LTR90A	chr2	54628159	54628285	5	5	1	1	1	1	54628222	5	0
LTR__LTR90A	chr2	60124603	60124709	5	5	1	1	1	1	60124656	5	0
LTR__LTR90A	chr2	62480818	62481111	5	5	1	1	1	1	62480964	5	0
LTR__LTR90A	chr2	63968142	63968432	5	5	1	1	1	1	63968287	5	0
LTR__LTR90A	chr2	67592154	67592213	5	5	1	1	1	1	67592183	5	0
LTR__LTR90A	chr2	77212713	77212809	5	5	1	1	1	1	77212761	5	0
LTR__LTR90A	chr2	77213252	77213373	5	5	1	1	1	1	77213312	5	0
LTR__LTR90A	chr2	81311410	81311590	5	5	1	1	1	1	81311500	5	0
LTR__LTR90A	chr2	83463130	83463209	5	5	1	1	1	1	83463169	5	0
LTR__LTR90A	chr2	97628330	97628415	5	5	1	1	1	1	97628372	5	0
LTR__LTR90A	chr2	105008657	105008733	5	5	1	1	1	1	105008695	5	0
LTR__LTR90A	chr2	108122534	108122632	5	5	1	1	1	1	108122583	5	0
LTR__LTR90A	chr2	121415021	121415120	5	5	1	1	1	1	121415070	5	0
LTR__LTR90A	chr2	126251928	126252035	5	5	1	1	1	1	126251981	5	0
LTR__LTR90A	chr2	139519164	139519376	5	5	1	1	1	1	139519270	5	0
LTR__LTR90A	chr2	139519755	139519953	5	5	1	1	1	1	139519854	5	0
LTR__LTR90A	chr2	140941368	140941666	5	5	1	1	1	1	140941517	5	0
LTR__LTR90A	chr2	141853628	141853831	5	5	1	1	1	1	141853729	5	0
LTR__LTR90A	chr2	142370116	142370236	5	5	1	1	1	1	142370176	5	0
LTR__LTR90A	chr2	149921733	149921932	5	5	1	1	1	1	149921832	5	0
LTR__LTR90A	chr2	149924347	149924489	5	5	1	1	1	1	149924418	5	0
LTR__LTR90A	chr2	150979359	150979740	5	5	1	1	1	1	150979549	5	0
LTR__LTR90A	chr2	152835800	152836031	5	5	1	1	1	1	152835915	5	0
LTR__LTR90A	chr2	159149034	159149250	5	5	1	1	1	1	159149142	5	0
LTR__LTR90A	chr2	161364500	161364631	5	5	1	1	1	1	161364565	5	0
LTR__LTR90A	chr2	161442629	161442710	5	5	1	1	1	1	161442669	5	0
LTR__LTR90A	chr2	162501745	162501842	5	5	1	1	1	1	162501793	5	0
LTR__LTR90A	chr2	164861889	164862172	5	5	1	1	1	1	164862030	5	0
LTR__LTR90A	chr2	169586522	169586695	5	5	1	1	1	1	169586608	5	0
LTR__LTR90A	chr2	173243302	173243743	5	5	1	1	1	1	173243522	5	0
LTR__LTR90A	chr2	178856601	178856679	5	5	1	1	1	1	178856640	5	0
LTR__LTR90A	chr2	180847439	180847534	5	5	1	1	1	1	180847486	5	0
LTR__LTR90A	chr2	191747856	191747928	5	5	1	1	1	1	191747892	5	0
LTR__LTR90A	chr2	197001202	197001570	5	5	1	1	1	1	197001386	5	0
LTR__LTR90A	chr2	208897129	208897203	5	5	1	1	1	1	208897166	5	0
LTR__LTR90A	chr2	228794435	228794605	5	5	1	1	1	1	228794520	5	0
LTR__LTR90A	chr3	19825183	19825362	5	5	1	1	1	1	19825272	5	0
LTR__LTR90A	chr3	28604070	28604202	5	5	1	1	1	1	28604136	5	0
LTR__LTR90A	chr3	31662952	31663124	5	5	1	1	1	1	31663038	5	0
LTR__LTR90A	chr3	41433870	41434043	5	5	1	1	1	1	41433956	5	0
LTR__LTR90A	chr3	59231568	59232211	5	5	1	1	1	1	59231889	5	0
LTR__LTR90A	chr3	59232915	59232998	5	5	1	1	1	1	59232956	5	0
LTR__LTR90A	chr3	68397589	68397767	5	5	1	1	1	1	68397678	5	0
LTR__LTR90A	chr3	74816275	74816608	5	5	1	1	1	1	74816441	5	0
LTR__LTR90A	chr3	78269283	78269385	5	5	1	1	1	1	78269334	5	0
LTR__LTR90A	chr3	87881953	87882243	5	5	1	1	1	1	87882098	5	0
LTR__LTR90A	chr3	99222052	99222177	5	5	1	1	1	1	99222114	5	0
LTR__LTR90A	chr3	99222656	99222713	5	5	1	1	1	1	99222684	5	0
LTR__LTR90A	chr3	101053626	101053760	5	5	1	1	1	1	101053693	5	0
LTR__LTR90A	chr3	115634923	115634996	5	5	1	1	1	1	115634959	5	0
LTR__LTR90A	chr3	117479538	117479865	5	5	1	1	1	1	117479701	5	0
LTR__LTR90A	chr3	117480217	117480393	5	5	1	1	1	1	117480305	5	0
LTR__LTR90A	chr3	119816867	119816985	5	5	1	1	1	1	119816926	5	0
LTR__LTR90A	chr3	124182595	124182742	5	5	1	1	1	1	124182668	5	0
LTR__LTR90A	chr3	126680122	126680198	5	5	1	1	1	1	126680160	5	0
LTR__LTR90A	chr3	136474591	136474696	5	5	1	1	1	1	136474643	5	0
LTR__LTR90A	chr3	136474969	136475037	5	5	1	1	1	1	136475003	5	0
LTR__LTR90A	chr3	137046034	137046174	5	5	1	1	1	1	137046104	5	0
LTR__LTR90A	chr3	137046616	137046732	5	5	1	1	1	1	137046674	5	0
LTR__LTR90A	chr3	142689963	142690140	5	5	1	1	1	1	142690051	5	0
LTR__LTR90A	chr3	166689121	166689201	5	5	1	1	1	1	166689161	5	0
LTR__LTR90A	chr3	185931841	185931907	5	5	1	1	1	1	185931874	5	0
LTR__LTR90A	chr4	11722963	11723121	5	5	1	1	1	1	11723042	5	0
LTR__LTR90A	chr4	20448734	20448871	5	5	1	1	1	1	20448802	5	0
LTR__LTR90A	chr4	20562091	20562313	5	5	1	1	1	1	20562202	5	0
LTR__LTR90A	chr4	39582637	39582826	5	5	1	1	1	1	39582731	5	0
LTR__LTR90A	chr4	58858157	58858228	5	5	1	1	1	1	58858192	5	0
LTR__LTR90A	chr4	61454521	61454676	5	5	1	1	1	1	61454598	5	0
LTR__LTR90A	chr4	68174620	68174869	5	5	1	1	1	1	68174744	5	0
LTR__LTR90A	chr4	68174913	68175100	5	5	1	1	1	1	68175006	5	0
LTR__LTR90A	chr4	73474226	73474438	5	5	1	1	1	1	73474332	5	0
LTR__LTR90A	chr4	79222175	79222465	5	5	1	1	1	1	79222320	5	0
LTR__LTR90A	chr4	92700133	92700241	5	5	1	1	1	1	92700187	5	0
LTR__LTR90A	chr4	105579848	105579974	5	5	1	1	1	1	105579911	5	0
LTR__LTR90A	chr4	114927095	114927199	5	5	1	1	1	1	114927147	5	0
LTR__LTR90A	chr4	134964031	134964233	5	5	1	1	1	1	134964132	5	0
LTR__LTR90A	chr4	146246819	146247011	5	5	1	1	1	1	146246915	5	0
LTR__LTR90A	chr4	146247036	146247139	5	5	1	1	1	1	146247087	5	0
LTR__LTR90A	chr4	154970828	154971082	5	5	1	1	1	1	154970955	5	0
LTR__LTR90A	chr4	181476407	181476495	5	5	1	1	1	1	181476451	5	0
LTR__LTR90A	chr4	184508984	184509050	5	5	1	1	1	1	184509017	5	0
LTR__LTR90A	chr5	6261798	6261938	5	5	1	1	1	1	6261868	5	0
LTR__LTR90A	chr5	12092634	12092797	5	5	1	1	1	1	12092715	5	0
LTR__LTR90A	chr5	16559425	16559530	5	5	1	1	1	1	16559477	5	0
LTR__LTR90A	chr5	16559578	16559642	5	5	1	1	1	1	16559610	5	0
LTR__LTR90A	chr5	28865145	28865225	5	5	1	1	1	1	28865185	5	0
LTR__LTR90A	chr5	38295763	38295932	5	5	1	1	1	1	38295847	5	0
LTR__LTR90A	chr5	38297454	38297601	5	5	1	1	1	1	38297527	5	0
LTR__LTR90A	chr5	39854981	39855134	5	5	1	1	1	1	39855057	5	0
LTR__LTR90A	chr5	42008170	42008378	5	5	1	1	1	1	42008274	5	0
LTR__LTR90A	chr5	54286943	54287156	5	5	1	1	1	1	54287049	5	0
LTR__LTR90A	chr5	54289052	54289306	5	5	1	1	1	1	54289179	5	0
LTR__LTR90A	chr5	58097454	58097653	5	5	1	1	1	1	58097553	5	0
LTR__LTR90A	chr5	67196920	67197115	5	5	1	1	1	1	67197017	5	0
LTR__LTR90A	chr5	75314350	75314524	5	5	1	1	1	1	75314437	5	0
LTR__LTR90A	chr5	82186074	82186152	5	5	1	1	1	1	82186113	5	0
LTR__LTR90A	chr5	89518702	89518787	5	5	1	1	1	1	89518744	5	0
LTR__LTR90A	chr5	95449449	95449580	5	5	1	1	1	1	95449514	5	0
LTR__LTR90A	chr5	95479876	95479958	5	5	1	1	1	1	95479917	5	0
LTR__LTR90A	chr5	95480732	95481039	5	5	1	1	1	1	95480885	5	0
LTR__LTR90A	chr5	103380665	103380767	5	5	1	1	1	1	103380716	5	0
LTR__LTR90A	chr5	108637776	108638036	5	5	1	1	1	1	108637906	5	0
LTR__LTR90A	chr5	121897802	121897960	5	5	1	1	1	1	121897881	5	0
LTR__LTR90A	chr5	121898964	121899070	5	5	1	1	1	1	121899017	5	0
LTR__LTR90A	chr5	122252267	122252596	5	5	1	1	1	1	122252431	5	0
LTR__LTR90A	chr5	125445659	125445716	5	5	1	1	1	1	125445687	5	0
LTR__LTR90A	chr5	140427717	140427780	5	5	1	1	1	1	140427748	5	0
LTR__LTR90A	chr6	2549191	2549541	5	5	1	1	1	1	2549366	5	0
LTR__LTR90A	chr6	5137817	5138132	5	5	1	1	1	1	5137974	5	0
LTR__LTR90A	chr6	13496083	13496161	5	5	1	1	1	1	13496122	5	0
LTR__LTR90A	chr6	13505056	13505137	5	5	1	1	1	1	13505096	5	0
LTR__LTR90A	chr6	21241577	21241873	5	5	1	1	1	1	21241725	5	0
LTR__LTR90A	chr6	21724902	21724998	5	5	1	1	1	1	21724950	5	0
LTR__LTR90A	chr6	22452551	22452850	5	5	1	1	1	1	22452700	5	0
LTR__LTR90A	chr6	33827062	33827243	5	5	1	1	1	1	33827152	5	0
LTR__LTR90A	chr6	56122913	56123018	5	5	1	1	1	1	56122965	5	0
LTR__LTR90A	chr6	62850023	62850084	5	5	1	1	1	1	62850053	5	0
LTR__LTR90A	chr6	65596013	65596103	5	5	1	1	1	1	65596058	5	0
LTR__LTR90A	chr6	69774056	69774149	5	5	1	1	1	1	69774102	5	0
LTR__LTR90A	chr6	73158584	73158735	5	5	1	1	1	1	73158659	5	0
LTR__LTR90A	chr6	73570932	73571024	5	5	1	1	1	1	73570978	5	0
LTR__LTR90A	chr6	79400518	79400905	5	5	1	1	1	1	79400711	5	0
LTR__LTR90A	chr6	83406897	83407176	5	5	1	1	1	1	83407036	5	0
LTR__LTR90A	chr6	83407457	83407646	5	5	1	1	1	1	83407551	5	0
LTR__LTR90A	chr6	88596998	88597090	5	5	1	1	1	1	88597044	5	0
LTR__LTR90A	chr6	109267049	109267095	5	5	1	1	1	1	109267072	5	0
LTR__LTR90A	chr6	113687827	113687950	5	5	1	1	1	1	113687888	5	0
LTR__LTR90A	chr6	113747068	113747350	5	5	1	1	1	1	113747209	5	0
LTR__LTR90A	chr6	129811792	129811841	5	5	1	1	1	1	129811816	5	0
LTR__LTR90A	chr6	130314462	130314628	5	5	1	1	1	1	130314545	5	0
LTR__LTR90A	chr6	130317453	130317566	5	5	1	1	1	1	130317509	5	0
LTR__LTR90A	chr6	135333965	135334003	5	5	1	1	1	1	135333984	5	0
LTR__LTR90A	chr6	136155008	136155123	5	5	1	1	1	1	136155065	5	0
LTR__LTR90A	chr6	147628390	147628635	5	5	1	1	1	1	147628512	5	0
LTR__LTR90A	chr6	148024659	148024794	5	5	1	1	1	1	148024726	5	0
LTR__LTR90A	chr6	149546992	149547167	5	5	1	1	1	1	149547079	5	0
LTR__LTR90A	chr6	150582457	150582539	5	5	1	1	1	1	150582498	5	0
LTR__LTR90A	chr6	154910104	154910201	5	5	1	1	1	1	154910152	5	0
LTR__LTR90A	chr6	154911121	154911492	5	5	1	1	1	1	154911306	5	0
LTR__LTR90A	chr6	157953700	157953862	5	5	1	1	1	1	157953781	5	0
LTR__LTR90A	chr6	157955475	157955560	5	5	1	1	1	1	157955517	5	0
LTR__LTR90A	chr6	157955903	157955981	5	5	1	1	1	1	157955942	5	0
LTR__LTR90A	chr7	7634408	7634579	5	5	1	1	1	1	7634493	5	0
LTR__LTR90A	chr7	8364039	8364081	5	5	1	1	1	1	8364060	5	0
LTR__LTR90A	chr7	17499764	17499869	5	5	1	1	1	1	17499816	5	0
LTR__LTR90A	chr7	27888370	27888530	5	5	1	1	1	1	27888450	5	0
LTR__LTR90A	chr7	32229310	32229408	5	5	1	1	1	1	32229359	5	0
LTR__LTR90A	chr7	32240885	32240970	5	5	1	1	1	1	32240927	5	0
LTR__LTR90A	chr7	40577995	40578279	5	5	1	1	1	1	40578137	5	0
LTR__LTR90A	chr7	50425999	50426094	5	5	1	1	1	1	50426046	5	0
LTR__LTR90A	chr7	53692427	53692537	5	5	1	1	1	1	53692482	5	0
LTR__LTR90A	chr7	64906064	64906375	5	5	1	1	1	1	64906219	5	0
LTR__LTR90A	chr7	64906856	64907213	5	5	1	1	1	1	64907034	5	0
LTR__LTR90A	chr7	79935785	79935893	5	5	1	1	1	1	79935839	5	0
LTR__LTR90A	chr7	85639528	85639616	5	5	1	1	1	1	85639572	5	0
LTR__LTR90A	chr7	85639889	85640114	5	5	1	1	1	1	85640001	5	0
LTR__LTR90A	chr7	88763579	88763683	5	5	1	1	1	1	88763631	5	0
LTR__LTR90A	chr7	92570375	92570474	5	5	1	1	1	1	92570424	5	0
LTR__LTR90A	chr7	93664268	93664384	5	5	1	1	1	1	93664326	5	0
LTR__LTR90A	chr7	110901009	110901263	5	5	1	1	1	1	110901136	5	0
LTR__LTR90A	chr7	112853752	112853931	5	5	1	1	1	1	112853841	5	0
LTR__LTR90A	chr7	113105272	113105497	5	5	1	1	1	1	113105384	5	0
LTR__LTR90A	chr7	113106057	113106306	5	5	1	1	1	1	113106181	5	0
LTR__LTR90A	chr7	113226156	113226390	5	5	1	1	1	1	113226273	5	0
LTR__LTR90A	chr7	133794072	133794324	5	5	1	1	1	1	133794198	5	0
LTR__LTR90A	chr7	133794643	133795113	5	5	1	1	1	1	133794878	5	0
LTR__LTR90A	chr7	136191628	136191776	5	5	1	1	1	1	136191702	5	0
LTR__LTR90A	chr7	139143833	139143947	5	5	1	1	1	1	139143890	5	0
LTR__LTR90A	chr7	141926321	141926466	5	5	1	1	1	1	141926393	5	0
LTR__LTR90A	chr7	143076038	143076417	5	5	1	1	1	1	143076227	5	0
LTR__LTR90A	chr7	147035408	147035666	5	5	1	1	1	1	147035537	5	0
LTR__LTR90A	chr7	154530420	154530545	5	5	1	1	1	1	154530482	5	0
LTR__LTR90A	chrX	21824965	21825092	5	5	1	1	1	1	21825028	5	0
LTR__LTR90A	chrX	22341379	22341440	5	5	1	1	1	1	22341409	5	0
LTR__LTR90A	chrX	29628586	29628720	5	5	1	1	1	1	29628653	5	0
LTR__LTR90A	chrX	33090623	33090776	5	5	1	1	1	1	33090699	5	0
LTR__LTR90A	chrX	37879843	37879941	5	5	1	1	1	1	37879892	5	0
LTR__LTR90A	chrX	42183969	42184152	5	5	1	1	1	1	42184060	5	0
LTR__LTR90A	chrX	76190432	76190524	5	5	1	1	1	1	76190478	5	0
LTR__LTR90A	chrX	76227918	76228068	5	5	1	1	1	1	76227993	5	0
LTR__LTR90A	chrX	78642254	78642682	5	5	1	1	1	1	78642468	5	0
LTR__LTR90A	chrX	106470657	106470868	5	5	1	1	1	1	106470762	5	0
LTR__LTR90A	chrX	109093334	109093649	5	5	1	1	1	1	109093491	5	0
LTR__LTR90A	chrX	110363536	110363727	5	5	1	1	1	1	110363631	5	0
LTR__LTR90A	chrX	110363863	110364010	5	5	1	1	1	1	110363936	5	0
LTR__LTR90A	chrX	110453231	110453530	5	5	1	1	1	1	110453380	5	0
LTR__LTR90A	chrX	113109968	113110328	5	5	1	1	1	1	113110148	5	0
LTR__LTR90A	chrX	113110842	113111017	5	5	1	1	1	1	113110929	5	0
LTR__LTR90A	chrX	113849321	113849371	5	5	1	1	1	1	113849346	5	0
LTR__LTR90A	chrX	116855355	116855654	5	5	1	1	1	1	116855504	5	0
LTR__LTR90A	chrX	116856342	116856687	5	5	1	1	1	1	116856514	5	0
LTR__LTR90A	chrX	117301733	117301865	5	5	1	1	1	1	117301799	5	0
LTR__LTR90A	chrX	128263959	128264083	5	5	1	1	1	1	128264021	5	0
LTR__LTR90A	chrX	130398593	130398781	5	5	1	1	1	1	130398687	5	0
LTR__LTR90A	chrX	130399059	130399226	5	5	1	1	1	1	130399142	5	0
LTR__LTR90A	chrX	131299706	131299781	5	5	1	1	1	1	131299743	5	0
LTR__LTR90A	chrX	131303702	131303827	5	5	1	1	1	1	131303764	5	0
LTR__LTR90A	chrX	133143676	133144033	5	5	1	1	1	1	133143854	5	0
LTR__LTR90A	chrX	133144509	133144830	5	5	1	1	1	1	133144669	5	0
LTR__LTR90A	chrX	136997056	136997277	5	5	1	1	1	1	136997166	5	0
LTR__LTR90A	chrX	137652641	137652809	5	5	1	1	1	1	137652725	5	0
LTR__LTR90A	chrX	142530946	142531062	5	5	1	1	1	1	142531004	5	0
LTR__LTR90A	chrX	146796912	146796993	5	5	1	1	1	1	146796952	5	0
LTR__LTR90A	chrX	147976004	147976049	5	5	1	1	1	1	147976026	5	0
LTR__LTR90A	chrX	150447712	150447867	5	5	1	1	1	1	150447789	5	0
LTR__LTR90A	chrX	150448283	150448486	5	5	1	1	1	1	150448384	5	0
LTR__LTR90A	chr8	10987396	10987520	5	5	1	1	1	1	10987458	5	0
LTR__LTR90A	chr8	34487948	34488032	5	5	1	1	1	1	34487990	5	0
LTR__LTR90A	chr8	55623917	55624081	5	5	1	1	1	1	55623999	5	0
LTR__LTR90A	chr8	55625119	55625479	5	5	1	1	1	1	55625299	5	0
LTR__LTR90A	chr8	64286704	64286844	5	5	1	1	1	1	64286774	5	0
LTR__LTR90A	chr8	64818716	64818922	5	5	1	1	1	1	64818819	5	0
LTR__LTR90A	chr8	72180248	72180399	5	5	1	1	1	1	72180323	5	0
LTR__LTR90A	chr8	72180825	72180918	5	5	1	1	1	1	72180871	5	0
LTR__LTR90A	chr8	90428013	90428062	5	5	1	1	1	1	90428037	5	0
LTR__LTR90A	chr8	91849300	91849486	5	5	1	1	1	1	91849393	5	0
LTR__LTR90A	chr8	91850076	91850284	5	5	1	1	1	1	91850180	5	0
LTR__LTR90A	chr8	96087110	96087294	5	5	1	1	1	1	96087202	5	0
LTR__LTR90A	chr8	96088261	96088460	5	5	1	1	1	1	96088360	5	0
LTR__LTR90A	chr8	97971968	97972081	5	5	1	1	1	1	97972024	5	0
LTR__LTR90A	chr8	97972168	97972331	5	5	1	1	1	1	97972249	5	0
LTR__LTR90A	chr8	106498635	106498842	5	5	1	1	1	1	106498738	5	0
LTR__LTR90A	chr8	111106060	111106302	5	5	1	1	1	1	111106181	5	0
LTR__LTR90A	chr8	118961070	118961218	5	5	1	1	1	1	118961144	5	0
LTR__LTR90A	chr8	141260932	141261053	5	5	1	1	1	1	141260992	5	0
LTR__LTR90A	chr9	10555437	10555623	5	5	1	1	1	1	10555530	5	0
LTR__LTR90A	chr9	73920968	73921190	5	5	1	1	1	1	73921079	5	0
LTR__LTR90A	chr9	83053130	83053484	5	5	1	1	1	1	83053307	5	0
LTR__LTR90A	chr9	83297861	83298124	5	5	1	1	1	1	83297992	5	0
LTR__LTR90A	chr9	83790010	83790240	5	5	1	1	1	1	83790125	5	0
LTR__LTR90A	chr9	93593212	93593274	5	5	1	1	1	1	93593243	5	0
LTR__LTR90A	chr9	103827723	103827772	5	5	1	1	1	1	103827747	5	0
LTR__LTR90A	chr9	108116703	108116848	5	5	1	1	1	1	108116775	5	0
LTR__LTR90A	chr9	113633735	113633850	5	5	1	1	1	1	113633792	5	0
LTR__LTR90A	chr10	22284328	22284681	5	5	1	1	1	1	22284504	5	0
LTR__LTR90A	chr10	32455629	32455745	5	5	1	1	1	1	32455687	5	0
LTR__LTR90A	chr10	62072989	62073079	5	5	1	1	1	1	62073034	5	0
LTR__LTR90A	chr10	67982591	67982781	5	5	1	1	1	1	67982686	5	0
LTR__LTR90A	chr10	78967797	78967999	5	5	1	1	1	1	78967898	5	0
LTR__LTR90A	chr10	84096198	84096251	5	5	1	1	1	1	84096224	5	0
LTR__LTR90A	chr10	89764339	89764446	5	5	1	1	1	1	89764392	5	0
LTR__LTR90A	chr10	94149722	94149898	5	5	1	1	1	1	94149810	5	0
LTR__LTR90A	chr10	95889902	95890043	5	5	1	1	1	1	95889972	5	0
LTR__LTR90A	chr10	95890979	95891067	5	5	1	1	1	1	95891023	5	0
LTR__LTR90A	chr10	97762966	97763174	5	5	1	1	1	1	97763070	5	0
LTR__LTR90A	chr10	99544069	99544266	5	5	1	1	1	1	99544167	5	0
LTR__LTR90A	chr10	103794055	103794111	5	5	1	1	1	1	103794083	5	0
LTR__LTR90A	chr10	103794419	103794500	5	5	1	1	1	1	103794459	5	0
LTR__LTR90A	chr10	128096041	128096127	5	5	1	1	1	1	128096084	5	0
LTR__LTR90A	chr10	130577082	130577449	5	5	1	1	1	1	130577265	5	0
LTR__LTR90A	chr10	131073757	131073936	5	5	1	1	1	1	131073846	5	0
LTR__LTR90A	chr10	131979803	131979948	5	5	1	1	1	1	131979875	5	0
LTR__LTR90A	chr11	11517741	11517862	5	5	1	1	1	1	11517801	5	0
LTR__LTR90A	chr11	13913317	13913450	5	5	1	1	1	1	13913383	5	0
LTR__LTR90A	chr11	28372464	28372661	5	5	1	1	1	1	28372562	5	0
LTR__LTR90A	chr11	42654580	42654722	5	5	1	1	1	1	42654651	5	0
LTR__LTR90A	chr11	43307176	43307349	5	5	1	1	1	1	43307262	5	0
LTR__LTR90A	chr11	79540041	79540232	5	5	1	1	1	1	79540136	5	0
LTR__LTR90A	chr11	94874451	94874621	5	5	1	1	1	1	94874536	5	0
LTR__LTR90A	chr11	106719654	106719755	5	5	1	1	1	1	106719704	5	0
LTR__LTR90A	chr11	106720250	106720362	5	5	1	1	1	1	106720306	5	0
LTR__LTR90A	chr11	107157110	107157329	5	5	1	1	1	1	107157219	5	0
LTR__LTR90A	chr11	110708581	110708800	5	5	1	1	1	1	110708690	5	0
LTR__LTR90A	chr11	110709027	110709075	5	5	1	1	1	1	110709051	5	0
LTR__LTR90A	chr11	127927928	127928112	5	5	1	1	1	1	127928020	5	0
LTR__LTR90A	chr12	3761436	3761547	5	5	1	1	1	1	3761491	5	0
LTR__LTR90A	chr12	4307400	4307579	5	5	1	1	1	1	4307489	5	0
LTR__LTR90A	chr12	16154858	16154915	5	5	1	1	1	1	16154886	5	0
LTR__LTR90A	chr12	22745133	22745245	5	5	1	1	1	1	22745189	5	0
LTR__LTR90A	chr12	48611912	48612265	5	5	1	1	1	1	48612088	5	0
LTR__LTR90A	chr12	59166658	59166772	5	5	1	1	1	1	59166715	5	0
LTR__LTR90A	chr12	59167152	59167235	5	5	1	1	1	1	59167193	5	0
LTR__LTR90A	chr12	64947176	64947295	5	5	1	1	1	1	64947235	5	0
LTR__LTR90A	chr12	67724579	67724654	5	5	1	1	1	1	67724616	5	0
LTR__LTR90A	chr12	68304309	68304415	5	5	1	1	1	1	68304362	5	0
LTR__LTR90A	chr12	76256945	76257255	5	5	1	1	1	1	76257100	5	0
LTR__LTR90A	chr12	81449184	81449328	5	5	1	1	1	1	81449256	5	0
LTR__LTR90A	chr12	101418441	101418511	5	5	1	1	1	1	101418476	5	0
LTR__LTR90A	chr12	102605400	102605470	5	5	1	1	1	1	102605435	5	0
LTR__LTR90A	chr12	102605744	102605808	5	5	1	1	1	1	102605776	5	0
LTR__LTR90A	chr12	102606913	102607230	5	5	1	1	1	1	102607071	5	0
LTR__LTR90A	chr12	105453851	105453985	5	5	1	1	1	1	105453918	5	0
LTR__LTR90A	chr12	106131079	106131376	5	5	1	1	1	1	106131227	5	0
LTR__LTR90A	chr12	121429723	121429797	5	5	1	1	1	1	121429760	5	0
LTR__LTR90A	chr12	125808664	125808733	5	5	1	1	1	1	125808698	5	0
LTR__LTR90A	chr12	125810066	125810136	5	5	1	1	1	1	125810101	5	0
LTR__LTR90A	chr13	21988213	21988344	5	5	1	1	1	1	21988278	5	0
LTR__LTR90A	chr13	24010099	24010243	5	5	1	1	1	1	24010171	5	0
LTR__LTR90A	chr13	24010821	24010943	5	5	1	1	1	1	24010882	5	0
LTR__LTR90A	chr13	25270063	25270170	5	5	1	1	1	1	25270116	5	0
LTR__LTR90A	chr13	35199588	35199858	5	5	1	1	1	1	35199723	5	0
LTR__LTR90A	chr13	37761807	37761910	5	5	1	1	1	1	37761858	5	0
LTR__LTR90A	chr13	43767618	43767687	5	5	1	1	1	1	43767652	5	0
LTR__LTR90A	chr13	43768705	43768900	5	5	1	1	1	1	43768802	5	0
LTR__LTR90A	chr13	44328989	44329129	5	5	1	1	1	1	44329059	5	0
LTR__LTR90A	chr13	46187844	46187961	5	5	1	1	1	1	46187902	5	0
LTR__LTR90A	chr13	48849019	48849106	5	5	1	1	1	1	48849062	5	0
LTR__LTR90A	chr13	48849772	48849928	5	5	1	1	1	1	48849850	5	0
LTR__LTR90A	chr13	50942438	50942655	5	5	1	1	1	1	50942546	5	0
LTR__LTR90A	chr13	50945048	50945148	5	5	1	1	1	1	50945098	5	0
LTR__LTR90A	chr13	59115649	59115992	5	5	1	1	1	1	59115820	5	0
LTR__LTR90A	chr13	64194070	64194223	5	5	1	1	1	1	64194146	5	0
LTR__LTR90A	chr13	66521136	66521221	5	5	1	1	1	1	66521178	5	0
LTR__LTR90A	chr13	66948828	66948960	5	5	1	1	1	1	66948894	5	0
LTR__LTR90A	chr13	75434177	75434329	5	5	1	1	1	1	75434253	5	0
LTR__LTR90A	chr13	76860365	76860692	5	5	1	1	1	1	76860528	5	0
LTR__LTR90A	chr13	78626744	78626838	5	5	1	1	1	1	78626791	5	0
LTR__LTR90A	chr13	93206030	93206110	5	5	1	1	1	1	93206070	5	0
LTR__LTR90A	chr13	95217070	95217260	5	5	1	1	1	1	95217165	5	0
LTR__LTR90A	chr14	26600652	26600773	5	5	1	1	1	1	26600712	5	0
LTR__LTR90A	chr14	32275497	32275661	5	5	1	1	1	1	32275579	5	0
LTR__LTR90A	chr14	35902110	35902230	5	5	1	1	1	1	35902170	5	0
LTR__LTR90A	chr14	51144634	51144741	5	5	1	1	1	1	51144687	5	0
LTR__LTR90A	chr14	66789723	66789762	5	5	1	1	1	1	66789742	5	0
LTR__LTR90A	chr14	79872101	79872184	5	5	1	1	1	1	79872142	5	0
LTR__LTR90A	chr14	93129046	93129178	5	5	1	1	1	1	93129112	5	0
LTR__LTR90A	chr14	97515371	97515620	5	5	1	1	1	1	97515495	5	0
LTR__LTR90A	chr14	97515747	97515864	5	5	1	1	1	1	97515805	5	0
LTR__LTR90A	chr15	35320069	35320157	5	5	1	1	1	1	35320113	5	0
LTR__LTR90A	chr15	51375364	51375416	5	5	1	1	1	1	51375390	5	0
LTR__LTR90A	chr15	53447773	53447887	5	5	1	1	1	1	53447830	5	0
LTR__LTR90A	chr15	55937743	55937935	5	5	1	1	1	1	55937839	5	0
LTR__LTR90A	chr15	56060852	56060939	5	5	1	1	1	1	56060895	5	0
LTR__LTR90A	chr15	58599897	58600154	5	5	1	1	1	1	58600025	5	0
LTR__LTR90A	chr15	71288169	71288279	5	5	1	1	1	1	71288224	5	0
LTR__LTR90A	chr15	71288330	71288455	5	5	1	1	1	1	71288392	5	0
LTR__LTR90A	chr15	79933134	79933191	5	5	1	1	1	1	79933162	5	0
LTR__LTR90A	chr15	81342334	81342493	5	5	1	1	1	1	81342413	5	0
LTR__LTR90A	chr15	90552119	90552291	5	5	1	1	1	1	90552205	5	0
LTR__LTR90A	chr16	23212618	23212813	5	5	1	1	1	1	23212715	5	0
LTR__LTR90A	chr16	48104314	48104506	5	5	1	1	1	1	48104410	5	0
LTR__LTR90A	chr16	54154623	54154891	5	5	1	1	1	1	54154757	5	0
LTR__LTR90A	chr16	62278065	62278159	5	5	1	1	1	1	62278112	5	0
LTR__LTR90A	chr16	74541731	74541854	5	5	1	1	1	1	74541792	5	0
LTR__LTR90A	chr16	74542025	74542215	5	5	1	1	1	1	74542120	5	0
LTR__LTR90A	chr16	80156752	80156875	5	5	1	1	1	1	80156813	5	0
LTR__LTR90A	chr17	9695041	9695257	5	5	1	1	1	1	9695149	5	0
LTR__LTR90A	chr17	10528857	10528931	5	5	1	1	1	1	10528894	5	0
LTR__LTR90A	chr17	15623907	15624083	5	5	1	1	1	1	15623995	5	0
LTR__LTR90A	chr17	17950538	17950725	5	5	1	1	1	1	17950631	5	0
LTR__LTR90A	chr17	18561760	18561936	5	5	1	1	1	1	18561848	5	0
LTR__LTR90A	chr17	30941347	30941587	5	5	1	1	1	1	30941467	5	0
LTR__LTR90A	chr17	31289241	31289989	5	5	1	1	1	1	31289615	5	0
LTR__LTR90A	chr17	57337539	57337620	5	5	1	1	1	1	57337579	5	0
LTR__LTR90A	chr17	57337911	57338101	5	5	1	1	1	1	57338006	5	0
LTR__LTR90A	chr17	64821584	64821669	5	5	1	1	1	1	64821626	5	0
LTR__LTR90A	chr17	67408938	67409129	5	5	1	1	1	1	67409033	5	0
LTR__LTR90A	chr17	72176205	72176326	5	5	1	1	1	1	72176265	5	0
LTR__LTR90A	chr18	2418949	2419277	5	5	1	1	1	1	2419113	5	0
LTR__LTR90A	chr18	9828690	9828794	5	5	1	1	1	1	9828742	5	0
LTR__LTR90A	chr18	10768599	10768737	5	5	1	1	1	1	10768668	5	0
LTR__LTR90A	chr18	11136266	11136387	5	5	1	1	1	1	11136326	5	0
LTR__LTR90A	chr18	39886301	39886487	5	5	1	1	1	1	39886394	5	0
LTR__LTR90A	chr18	59596545	59596705	5	5	1	1	1	1	59596625	5	0
LTR__LTR90A	chr18	68135394	68135476	5	5	1	1	1	1	68135435	5	0
LTR__LTR90A	chr18	68135653	68135781	5	5	1	1	1	1	68135717	5	0
LTR__LTR90A	chr20	14725763	14725892	5	5	1	1	1	1	14725827	5	0
LTR__LTR90A	chr20	31442909	31442982	5	5	1	1	1	1	31442945	5	0
LTR__LTR90A	chr19	32401228	32401298	5	5	1	1	1	1	32401263	5	0
LTR__LTR90A	chr22	24287799	24287970	5	5	1	1	1	1	24287884	5	0
LTR__LTR90A	chr22	29325089	29325280	5	5	1	1	1	1	29325184	5	0
LTR__LTR90A	chr22	30053663	30053732	5	5	1	1	1	1	30053697	5	0
LTR__LTR90A	chr22	38580040	38580317	5	5	1	1	1	1	38580178	5	0
LTR__LTR90A	chr22	38580625	38580710	5	5	1	1	1	1	38580667	5	0
LTR__LTR90A	chr21	16245541	16245712	5	5	1	1	1	1	16245626	5	0
LTR__LTR90A	chr21	16246043	16246251	5	5	1	1	1	1	16246147	5	0
LTR__LTR90A	chr21	22744993	22745145	5	5	1	1	1	1	22745069	5	0
LTR__LTR90A	chr21	27444040	27444199	5	5	1	1	1	1	27444119	5	0
LTR__LTR90A	chr21	27596881	27596982	5	5	1	1	1	1	27596931	5	0