#seq1	seq2	Ka	Ks	Ka/Ks	Length	S-Sites	N-Sites	Substitutions	S-Substitutions	N-Substitutions
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	0.026087	0.290011	0.0899518	423	110.969	312.031	33	25	8
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	NA	0.0402414	-0	423	102.091	320.909	4	4	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	0.0756282	1.24004	0.0609886	414	87.8669	326.133	67	43.5606	23.4394
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	0.0756282	1.24004	0.0609886	414	87.8669	326.133	67	43.5606	23.4394
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	NA	0.0402414	-0	423	102.091	320.909	4	4	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	NA	0.030172	-0	423	101.443	321.557	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0395169	0.18277	0.216211	423	160.689	262.311	35	25	10
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0250326	0.208781	0.119899	423	133.188	289.812	30	22.865	7.13502
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	0.030172	-0	423	101.443	321.557	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_137	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.026087	0.290011	0.0899518	423	110.969	312.031	33	25	8
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	0.0251982	0.332968	0.0756775	423	100.154	322.846	33	25	8
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	0.0701791	0.956394	0.0733788	414	82.8023	331.198	61	38.8302	22.1698
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	0.0701791	0.956394	0.0733788	414	82.8023	331.198	61	38.8302	22.1698
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	0.0251982	0.332968	0.0756775	423	100.154	322.846	33	25	8
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	0.0260815	0.30615	0.085192	423	110.905	312.095	34	26	8
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.014318	0.0143823	0.995528	423	140.398	282.602	6	2	4
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0239786	0.187215	0.128081	423	126.381	296.619	27	20	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0260815	0.30615	0.085192	423	110.905	312.095	34	26	8
rpS3|P.sexaurelia-Sample_126	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	NA	NA	NA	423	103.784	319.216	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	0.0754157	1.17324	0.0642798	414	86.8672	327.133	66	42.551	23.449
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	0.0754157	1.17324	0.0642798	414	86.8672	327.133	66	42.551	23.449
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	NA	NA	NA	423	102.781	320.219	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	NA	0.0299539	-0	423	102.167	320.833	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0396503	0.181569	0.218376	423	161.537	261.463	35	25	10
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0239278	0.210884	0.113464	423	120.511	302.489	28	20.8763	7.12366
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	0.0299539	-0	423	102.167	320.833	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_127	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0251982	0.332968	0.0756775	423	100.154	322.846	33	25	8
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	NA	NA	NA	414	97.1301	316.87	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	0.0754157	1.17324	0.0642798	414	86.8672	327.133	66	42.551	23.449
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	0.075684	1.12619	0.0672038	414	87.8805	326.12	66	42.5452	23.4548
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0848192	0.771455	0.109947	414	94.978	319.022	66	40.4434	25.5566
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0787348	0.826934	0.095213	414	99.1174	314.883	66	42.4927	23.5073
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.075684	1.12619	0.0672038	414	87.8805	326.12	66	42.5452	23.4548
rpS3|P.sexaurelia-Sample_133	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0701791	0.956394	0.0733788	414	82.8023	331.198	61	38.8302	22.1698
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	0.0754157	1.17324	0.0642798	414	86.8672	327.133	66	42.551	23.449
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	0.075684	1.12619	0.0672038	414	87.8805	326.12	66	42.5452	23.4548
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0848192	0.771455	0.109947	414	94.978	319.022	66	40.4434	25.5566
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0787348	0.826934	0.095213	414	99.1174	314.883	66	42.4927	23.5073
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.075684	1.12619	0.0672038	414	87.8805	326.12	66	42.5452	23.4548
rpS3|P.sexaurelia-Sample_132	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0701791	0.956394	0.0733788	414	82.8023	331.198	61	38.8302	22.1698
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	NA	0.0299539	-0	423	102.167	320.833	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0396503	0.181569	0.218376	423	161.537	261.463	35	25	10
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0239278	0.210884	0.113464	423	120.511	302.489	28	20.8763	7.12366
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	0.0299539	-0	423	102.167	320.833	3	3	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_131	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0251982	0.332968	0.0756775	423	100.154	322.846	33	25	8
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	0.0395118	0.191689	0.206125	423	160.656	262.344	36	26	10
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0250608	0.197251	0.127051	423	133.313	289.687	29	21.8602	7.13984
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	NA	NA	NA	423	101.519	321.481	0	NA	NA
rpS3|P.sexaurelia-Sample_130	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0260815	0.30615	0.085192	423	110.905	312.095	34	26	8
rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	0.0266748	0.131104	0.203463	423	154.37	268.63	25	18	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0395118	0.191689	0.206125	423	160.656	262.344	36	26	10
rpS3|P.sexaurelia-Sample_128	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.014318	0.0143823	0.995528	423	140.398	282.602	6	2	4
rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	0.0250608	0.197251	0.127051	423	133.313	289.687	29	21.8602	7.13984
rpS3|P.sexaurelia-Sample_Moz13BIII	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0239786	0.187215	0.128081	423	126.381	296.619	27	20	7
rpS3|P.sexaurelia-Sample_134	rpS3|P.sexaurelia-Sample_Indo1-7I	0.0260815	0.30615	0.085192	423	110.905	312.095	34	26	8
#Average Ks: 0.565704269767
#Average Ka: 0.0475556116279
#Average KaKs: 0.146324451163