#NaNs Total_Count Fraction Read1/2 Base 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 0 12968424 0.80921067287 R1 A 0.000917073655211 0.00391998287533 0.00372643584139 0.000491347290928 0.00246066908361 0.00130331950899 0.0137661291765 0.997561538704 0.997754237523 0.982130288152 0.00384487737292 0.0186462132947 0.975766369144 0.00535061160863 0.0226941222773 0.995661539135 0.997047752294 0.977658966116 0.0253930624107 0.971026857234 0.00548339566936 0.00264766173592 0.00443029931779 0.0901506613294 0.0890887743954 0.00469748675706 0.0115843683087 0.228913012098 0.371549310849 0.0124078299722 0.233780527225 0.318571477922 0.249424679514 0.428842471529 0.295865095096 0.10495377079 0.328331414827 0.27047110736 0.195083689429 0.520084167513 0.240913776416 0.172272822048 0.00791699901237 0.00799727090971 0.00742912168819 0.00870236815206 0.011299059932 0.0370838430329 0.93844186464 0 12968424 0.80921067287 R1 C 0.994325987491 0.000469062393395 0.000254001565649 0.000682426792955 0.000235649297093 0.00047145281493 0.00103960203645 6.1456966552e-05 6.80884585513e-05 0.000144273506172 0.000650580209284 0.00199091269687 0.0194015093893 0.974382623517 0.00351029546844 0.000670551795654 0.00199191513171 0.0217598530091 0.973952964524 0.0278515724039 0.991953686894 0.973873078178 0.0109113489812 0.155108053222 0.462418872178 0.101174205902 0.339416956139 0.56501491623 0.410832881467 0.497031404895 0.28351872209 0.087994269774 0.17388334928 0.239097827153 0.364021179443 0.154760670996 0.263005204025 0.152234535206 0.255608545803 0.0167196106481 0.388674444944 0.014829558318 0.307603684149 0.0067666664816 0.00359172402136 0.00770270928835 0.0328029836162 0.933268606887 0.0234323769797 0 12968424 0.80921067287 R1 G 0.00152516604948 0.000645568035098 0.00630253915202 0.989652250728 0.012295248829 0.996832691467 0.984744946649 0.00204088021798 0.00160374151863 0.0173552314452 0.995208361479 0.978991047794 0.00447756797588 0.0198571545779 0.973345257681 0.00332924031478 0.000400819714099 0.000383315659636 0.000243206113557 0.000744886194344 0.00220759284243 0.0224395809391 0.977469660153 0.576690968772 0.292762559275 0.453389247606 0.218882880449 0.19709418816 0.100104299489 0.340980060492 0.299557525263 0.355249951729 0.425385227997 0.245124619615 0.171179551193 0.732551465005 0.271758079471 0.440362452677 0.404374116701 0.45735457138 0.354955312997 0.389797094851 0.562476751223 0.944779411901 0.0111393643514 0.00400364762904 0.00440978795881 0.00739164604735 0.033249529781 0 12968424 0.80921067287 R1 T 0.00300198389565 0.994963921599 0.989716098116 0.00917374385662 0.985007199024 0.00136022696358 0.000449090807025 0.000333887911129 0.000573778278687 0.000370206896382 0.00029618093918 0.000371517772707 0.000353782387127 0.000409610296517 0.000450324572978 0.000338437423082 0.000559512859851 0.000197710994027 0.00041007295875 0.000374987739451 0.000353705276755 0.00103304765483 0.00718630112649 0.178022479833 0.155661320142 0.440685468026 0.430113327572 0.00897472198626 0.117512891312 0.149578159998 0.183138290358 0.238181910153 0.15130473834 0.0869305321911 0.16893247784 0.0077323967816 0.136902911256 0.136930902321 0.144933570957 0.00584057091286 0.0154552318771 0.423099368127 0.122001794513 0.0404542602864 0.977834931986 0.979587727853 0.951469276452 0.0222506605274 0.00487561171658 0 12968424 0.80921067287 R1 N 0.000229788908814 1.46509706962e-06 9.25324465024e-07 2.31331116256e-07 1.23376595336e-06 3.23092459037e-05 2.31331116256e-07 2.23620079047e-06 1.54220744171e-07 0.0 0.0 3.08441488341e-07 7.71103720853e-07 0.0 0.0 2.31331116256e-07 0.0 1.54220744171e-07 6.93993348768e-07 1.69642818588e-06 1.61931781379e-06 6.63149199934e-06 2.39042153464e-06 2.78368443228e-05 6.84740104118e-05 5.35917085993e-05 2.46753190673e-06 3.1615252555e-06 6.16882976682e-07 2.54464227882e-06 4.93506381346e-06 2.39042153464e-06 2.00486967422e-06 4.54951195303e-06 1.69642818588e-06 1.69642818588e-06 2.39042153464e-06 1.00243483711e-06 7.71103720853e-08 1.07954520919e-06 1.23376595336e-06 1.15665558128e-06 7.71103720853e-07 2.39042153464e-06 4.85795344137e-06 3.54707711592e-06 1.88920411609e-05 5.2435053018e-06 6.16882976682e-07 0 12968424 0.80921067287 R2 A 0.266166112397 0.293435655713 0.271166103144 0.273213075081 0.277152566881 0.235399767929 0.277524393095 0.271154536588 0.265850268313 0.259702643899 0 12968424 0.80921067287 R2 C 0.161431874837 0.163682880819 0.162477568593 0.166597807104 0.163329715315 0.170191073333 0.155047752911 0.159140925682 0.163537219326 0.185588935093 0 12968424 0.80921067287 R2 G 0.283383007835 0.296308711066 0.296165979767 0.282697959289 0.286047171191 0.308492612518 0.301581980972 0.312721499544 0.303816254003 0.23374413113 0 12968424 0.80921067287 R2 T 0.288452089475 0.246216965145 0.270046614762 0.277471109828 0.27345311967 0.285903283236 0.265837390881 0.25697363072 0.26678422914 0.32095010157 0 12968424 0.80921067287 R2 N 0.000566915455571 0.000355787256802 0.000143733733567 2.00486967422e-05 1.74269440913e-05 1.32629839987e-05 8.48214092938e-06 9.40746539441e-06 1.20292180453e-05 1.41883084637e-05 1 1485576 0.0926977676362 R1 A 0.00326472694766 0.0135227009591 0.00983928119463 0.000640828877149 0.0077478365294 0.00158524370345 0.0140968890181 0.997123674588 0.996601318277 0.981223444644 0.00389545873116 0.0187227041902 0.974327129679 0.0068788133357 0.0226962471122 0.994361109765 0.995060501785 0.97545463847 0.0265856475872 0.968779786426 0.00703969369457 0.00846944215577 0.00622923364405 0.0956538070082 0.0951159684863 0.00980562421579 0.0222674572018 0.243760669262 0.387408654959 0.0196294232002 0.235946865054 0.322894957915 0.254531575631 0.426047539809 0.291336155134 0.113249002407 0.336576519815 0.271163508296 0.205218716511 0.517882625998 0.243931646715 0.174595577742 0.0178395450653 0.0171771757217 0.0187893450083 0.0196906789017 0.0214361298244 0.0477895442576 0.932055983672 1 1485576 0.0926977676362 R1 C 0.985394217462 0.000488026193207 0.000267236412005 0.00220116641626 0.000245695945546 0.00144523067147 0.00249330899261 0.000179728267016 0.000111741169755 0.000362149092339 0.0017844930182 0.00320212496702 0.0206808672192 0.9727984297 0.00419702526158 0.00181613057831 0.00258889481252 0.0232913024982 0.97244907026 0.029439759393 0.990030129727 0.96765968217 0.0136815618992 0.154335422759 0.449972266649 0.105798693571 0.343907009806 0.557537951609 0.395068983344 0.490936175598 0.290095558894 0.0860467589676 0.176346413782 0.242159270209 0.367503917672 0.154027797972 0.258091137714 0.150759032187 0.245494003673 0.0230503185296 0.391412489162 0.0187509760524 0.302654997119 0.0107991782312 0.00504585426797 0.00939904791138 0.0341954905033 0.920938410421 0.0243158209341 1 1485576 0.0926977676362 R1 G 0.00691516287285 0.00267034470131 0.00714739602686 0.986786270107 0.0142261318169 0.994793938513 0.982190073076 0.00217424083319 0.00175756743512 0.0176093313301 0.993206002251 0.977070173455 0.00455446237688 0.0199262777535 0.972017587791 0.00339598916515 0.000601113642116 0.000699392020334 0.0004853336349 0.000961916455301 0.00250071352795 0.0224424734918 0.971394933682 0.569866502959 0.30125284738 0.458796453362 0.223437912298 0.187593229831 0.106837347938 0.341513998611 0.28665043054 0.348188850655 0.41707458925 0.247942885453 0.174195059694 0.722263283736 0.261334324195 0.432844903256 0.404807293602 0.449855140363 0.346244150417 0.377047017453 0.563407728719 0.928710479975 0.0129713996457 0.00746646418628 0.0073903994141 0.00896083404686 0.0344082026096 1 1485576 0.0926977676362 R1 T 0.00310317344922 0.983295368261 0.982730604156 0.0103717345999 0.977778316289 0.0019675869831 0.00121838263408 0.000512259217973 0.00152533428111 0.000796997258976 0.00110125634771 0.00100163169033 0.000434848166637 0.000396479210757 0.00108913983532 0.000425424212561 0.0017494897602 0.000554667011314 0.000471197703786 0.000814498887973 0.0004213853751 0.00141022741347 0.00867003774967 0.179949056797 0.153004625815 0.424733571355 0.41023481801 0.0110886282492 0.110670204688 0.147894150148 0.187220983645 0.242830390367 0.151970010286 0.0837466410335 0.166924479125 0.0104195275099 0.143931377459 0.145206303818 0.14447056226 0.00920181801537 0.0183868075413 0.429588253984 0.116072822932 0.0432007517623 0.963043290952 0.962980015832 0.936606407212 0.0221880267317 0.00920787627156 1 1485576 0.0926977676362 R1 N 0.00132271926849 2.35598851893e-05 1.54822102673e-05 0.0 2.01941873051e-06 0.000208000129243 1.34627915368e-06 1.00970936526e-05 4.03883746103e-06 8.07767492205e-06 1.27896519599e-05 3.36569788419e-06 2.69255830735e-06 0.0 0.0 1.34627915368e-06 0.0 0.0 8.75081449889e-06 4.03883746103e-06 8.07767492205e-06 1.81747685746e-05 2.42330247662e-05 0.000195210477283 0.000654291668686 0.000865657495813 0.000152802683942 1.95210477283e-05 1.48090706904e-05 2.62524434967e-05 8.61618658352e-05 3.90420954566e-05 7.74110513363e-05 0.000103663494833 4.03883746103e-05 4.03883746103e-05 6.66408181069e-05 2.62524434967e-05 9.42395407573e-06 1.00970936526e-05 2.4906164343e-05 1.81747685746e-05 2.4906164343e-05 0.000112414309332 0.000150110125635 0.000463793168441 0.000371573046414 0.000123184542561 1.21165123831e-05 1 1485576 0.0926977676362 R2 A 0.27452920618 0.288286832851 0.273804907995 0.278777390049 0.27394088219 0.234004857375 0.276121181279 0.26525536223 0.262262583671 0.248872491209 1 1485576 0.0926977676362 R2 C 0.156041158446 0.164047480573 0.158593703722 0.159657264253 0.162558495829 0.170459808182 0.158195205092 0.157146453631 0.165725617538 0.179741056668 1 1485576 0.0926977676362 R2 G 0.277974334534 0.29980559729 0.296155834505 0.286756786593 0.29266425952 0.310504477724 0.30400531511 0.321921598087 0.301971760448 0.234014954469 1 1485576 0.0926977676362 R2 T 0.289130949881 0.246004243472 0.270054174273 0.274137438946 0.270712504779 0.28496488904 0.261641948981 0.255636197677 0.269982148338 0.337319665907 1 1485576 0.0926977676362 R2 N 0.00232435095882 0.00185584581334 0.00139137950532 0.000671120158107 0.000123857682138 6.59676785301e-05 3.63495371492e-05 4.03883746103e-05 5.7890003608e-05 5.18317474165e-05 2 570183 0.0355785844979 R1 A 0.00423372846963 0.0177785026912 0.0121539926655 0.000645406825528 0.0107386575889 0.00184151404023 0.0127976456681 0.996948348162 0.996434478054 0.98265819921 0.00366373602861 0.0168980835977 0.976344436786 0.00782205011374 0.0204530826068 0.994400043495 0.994538595504 0.976961782445 0.025163850904 0.970939154622 0.00763789870971 0.010300201865 0.00534214453956 0.0906445825288 0.0930367969582 0.0133764072236 0.0374020270685 0.228970348116 0.397126887333 0.0264529107322 0.24515111815 0.311687651158 0.252701325715 0.417864089249 0.301901319401 0.119977270455 0.332289808711 0.285662673212 0.206014560238 0.53434423685 0.23744657417 0.190968513618 0.0223717648544 0.0183099110286 0.021489591938 0.0222910890013 0.0232591992395 0.0493683606842 0.931541277099 2 570183 0.0355785844979 R1 C 0.984624234676 0.000434948078073 0.000249042851155 0.00353044548855 0.0002700887259 0.00246762881391 0.00357078341515 0.000338487818823 0.0001543364148 0.00057525390971 0.00291134600646 0.00403028501376 0.018990394312 0.97391188443 0.00471953741167 0.00202391162136 0.00271842548796 0.0215579910309 0.973808408879 0.0271509322446 0.989568261418 0.968225990603 0.014377840097 0.148045452074 0.470666435162 0.0982193436142 0.340220595844 0.558678529525 0.389855537608 0.49634766382 0.284445520122 0.0980106386897 0.182401088773 0.231188934079 0.338503603229 0.146310921231 0.269538025511 0.14205263924 0.255700362866 0.0303744587264 0.399896173685 0.0236169791102 0.312590869949 0.0121399620823 0.00525620721768 0.0084148422524 0.0317424405849 0.919899400719 0.0280944889623 2 570183 0.0355785844979 R1 G 0.00786238804033 0.00381631862051 0.00705913715421 0.985683543704 0.0137604944378 0.99307064574 0.981700611909 0.00208704924559 0.00166437792779 0.0157247760807 0.991376452823 0.977352884951 0.00417409849119 0.0178697014818 0.972856083047 0.00313408151418 0.000699775335287 0.000741867084778 0.000585776847082 0.0010049405191 0.00239046060651 0.0204022217428 0.971247827452 0.56375760063 0.294247636285 0.469629925831 0.22357558889 0.200290082307 0.0986227228802 0.338475542063 0.287202529714 0.348423225526 0.409112513 0.255510949993 0.177590352571 0.720772102991 0.265644538683 0.435256750903 0.40151670604 0.420966601951 0.342837299604 0.3655493061 0.545340706405 0.925637909233 0.0127695845018 0.00669960346064 0.00678378695963 0.00696969218654 0.0323825859417 2 570183 0.0355785844979 R1 T 0.00270790255058 0.977943923267 0.980513273809 0.0101406039815 0.975227251602 0.00246061352233 0.00191868224763 0.000617345659201 0.00171874643755 0.00103650933121 0.0020449574961 0.00168717762543 0.000489316587832 0.000392856328582 0.0019695431116 0.00044020954676 0.00204320367321 0.000738359438987 0.000429686609387 0.000901464968265 0.000399871620164 0.00105930902886 0.00901815732844 0.197373474832 0.141658029089 0.418181531193 0.39868778971 0.0120329788857 0.114370298659 0.138673022521 0.183058772359 0.241776762899 0.1555237529 0.0952659058583 0.181888972488 0.0128414912405 0.13234873716 0.136956029906 0.136705233232 0.014209473099 0.0197708455005 0.419831878537 0.119608967647 0.0437456044814 0.960316249345 0.962387514184 0.937884854512 0.0235713797149 0.00795884829958 2 570183 0.0355785844979 R1 N 0.000571746263919 2.63073434318e-05 2.45535205364e-05 0.0 3.50764579091e-06 0.000159597883487 1.22767602682e-05 8.76911447728e-06 2.80611663273e-05 5.26146868637e-06 3.50764579091e-06 3.15688121182e-05 1.75382289546e-06 3.50764579091e-06 1.75382289546e-06 1.75382289546e-06 0.0 0.0 1.22767602682e-05 3.50764579091e-06 3.50764579091e-06 1.22767602682e-05 1.40305831637e-05 0.000178889935337 0.000391102505687 0.000592792138664 0.000113998488205 2.80611663273e-05 2.45535205364e-05 5.08608639682e-05 0.000142059654532 0.000101721727936 0.000261319611423 0.000170120820859 0.0001157523111 9.82140821456e-05 0.000178889935337 7.19067387137e-05 6.31376242364e-05 0.000105229373727 4.91070410728e-05 3.33226350137e-05 8.76911447728e-05 0.000166613175068 0.000168366997964 0.000206951101664 0.000329718704346 0.000191166695605 2.27996976409e-05 2 570183 0.0355785844979 R2 A 0.292362276673 0.292025542677 0.275737789447 0.277903760722 0.279366449017 0.247178537417 0.284250845781 0.279296296101 0.288012795892 0.294512463542 2 570183 0.0355785844979 R2 C 0.146724823434 0.160825559513 0.157186377005 0.163410694461 0.167497101808 0.162037451134 0.163047653122 0.159880248973 0.166116843189 0.156581308106 2 570183 0.0355785844979 R2 G 0.281229008932 0.312804836342 0.308765782214 0.270390383438 0.273848922188 0.304903864198 0.287704123062 0.309330513186 0.288661710363 0.217768681283 2 570183 0.0355785844979 R2 T 0.277838869275 0.233049740171 0.257448924293 0.287975965611 0.279166513207 0.285817009627 0.264958793931 0.251454357636 0.257161297338 0.331086686204 2 570183 0.0355785844979 R2 N 0.00184502168602 0.00129432129685 0.000861127041669 0.000319195766973 0.000121013779786 6.31376242364e-05 3.85841037e-05 3.85841037e-05 4.73532181773e-05 5.08608639682e-05 3 1001834 0.0625129749956 R1 A 0.00258326229695 0.00973115306528 0.00767192968097 0.000694725872749 0.00646514292787 0.00180868287561 0.0124511645642 0.997298953719 0.997104310694 0.983644995079 0.00367126689651 0.0164727889051 0.977933470016 0.00655098549261 0.0200162901239 0.995179840173 0.996090170627 0.979143251277 0.0235877400847 0.973244070375 0.00646414475851 0.00613674520929 0.00477224769772 0.0943998706373 0.0963472990535 0.0125070620482 0.0499364166119 0.220901865978 0.351427481998 0.0268517538834 0.240560811472 0.327933569833 0.241359346958 0.444550694027 0.341930898732 0.0979783077835 0.33340553425 0.27600979803 0.189797910632 0.495810683207 0.221314109922 0.156687634878 0.0195132127678 0.0212799725304 0.0166614429137 0.0157700776775 0.0194493299289 0.0446570988807 0.92792518521 3 1001834 0.0625129749956 R1 C 0.99055532154 0.000406254928461 0.00024155698449 0.00250440691771 0.000240558815133 0.00176077074645 0.00260422385345 0.00029945080722 0.000188654008548 0.000416236622035 0.00213308791676 0.00339377581516 0.0174829362948 0.975738495599 0.00433604768854 0.00131059636626 0.00220994695728 0.0198076727282 0.975594759212 0.0252267341695 0.990675101863 0.973261039254 0.0120479041438 0.15461743163 0.491528536664 0.111129189067 0.305612506663 0.569907789115 0.414292188127 0.506147725072 0.259299444818 0.0876262933779 0.179826198751 0.246768426705 0.342380074943 0.154738210123 0.264114613798 0.147036335361 0.283925281035 0.0342132528942 0.394431612423 0.0200422425272 0.294211416263 0.00891165602285 0.00446980238243 0.00788853243152 0.0396662520937 0.926937995716 0.0246128600147 3 1001834 0.0625129749956 R1 G 0.00381899596141 0.00208817029568 0.00630144315326 0.987585767702 0.0119071622644 0.994262522534 0.983543181805 0.00193944306143 0.00163400323806 0.0152600131359 0.992790222732 0.978897701615 0.00412543395413 0.0173132475041 0.974257212273 0.00311428839508 0.000591914428937 0.000607885138656 0.000438196347898 0.00088637438937 0.00222891217507 0.0196988722683 0.976602910263 0.583921088723 0.265752609714 0.411996398605 0.201448543371 0.197653503475 0.107270266332 0.322710149586 0.327077140524 0.350643919052 0.439728537862 0.223654817066 0.16027206104 0.731051252004 0.281652449408 0.440625892114 0.384531768736 0.447315623147 0.369106059487 0.422646865648 0.549155848174 0.929111010407 0.0119800286275 0.0146191884085 0.00634336626627 0.00838761711022 0.0391721582617 3 1001834 0.0625129749956 R1 T 0.00265213598261 0.987772425372 0.985773092149 0.0092150995075 0.981386137823 0.00207219958596 0.00139044991486 0.000460156073761 0.00107103572049 0.000675760654959 0.00140242794714 0.00122275746281 0.000458159735046 0.000397271404245 0.00138745540678 0.000390284218743 0.00110796798671 0.00044119085597 0.000374313509024 0.000642821066165 0.000628846695161 0.000897354252301 0.00657294521847 0.166985748138 0.146202863948 0.464130784142 0.442970591934 0.011528856078 0.12700008185 0.144261424547 0.173007703871 0.233749303777 0.139011053727 0.084962179363 0.155368054987 0.0161813234528 0.120752539842 0.136292040398 0.141724078041 0.0226374828564 0.0151422291517 0.400610280745 0.137104550255 0.0406584324349 0.966839815778 0.961626377224 0.934425264066 0.0199743670109 0.00828580383577 3 1001834 0.0625129749956 R1 N 0.000390284218743 1.9963387148e-06 1.19780322888e-05 0.0 9.98169357399e-07 9.58242583103e-05 1.09798629314e-05 1.9963387148e-06 1.9963387148e-06 2.9945080722e-06 2.9945080722e-06 1.29762016462e-05 0.0 0.0 2.9945080722e-06 4.99084678699e-06 0.0 0.0 4.99084678699e-06 0.0 2.9945080722e-06 5.98901614439e-06 3.99267742959e-06 7.58608711623e-05 0.0001686906214 0.000236566137703 3.19414194368e-05 7.98535485919e-06 9.98169357399e-06 2.89469113646e-05 5.48993146569e-05 4.69139597977e-05 7.48627018049e-05 6.38828388735e-05 4.89102985125e-05 5.09066372273e-05 7.48627018049e-05 3.59340968663e-05 2.09615565054e-05 2.29578952202e-05 5.98901614439e-06 1.29762016462e-05 1.4972540361e-05 3.89286049385e-05 4.89102985125e-05 9.58242583103e-05 0.000115787645458 4.29212823681e-05 3.99267742959e-06 3 1001834 0.0625129749956 R2 A 0.250897853337 0.276500897354 0.26443802067 0.272892515127 0.267382620274 0.23173998886 0.275183313802 0.251788220404 0.274059375106 0.243272837616 3 1001834 0.0625129749956 R2 C 0.139841530633 0.153016367981 0.138675668823 0.142913895915 0.138424130145 0.145240628687 0.136325978156 0.140457401126 0.138409157605 0.147458560999 3 1001834 0.0625129749956 R2 G 0.349162635726 0.36604167956 0.357387551231 0.361471062072 0.346000435202 0.373317336006 0.364834892807 0.383225165047 0.36469015825 0.309029240373 3 1001834 0.0625129749956 R2 T 0.258983025132 0.203698417103 0.239076533637 0.222577792329 0.248146898588 0.24968108489 0.223636850017 0.224512244544 0.222821345652 0.300212410439 3 1001834 0.0625129749956 R2 N 0.00111495517221 0.000742638001905 0.00042222563818 0.000144734556823 4.59157904403e-05 2.09615565054e-05 1.89652177906e-05 1.69688790758e-05 1.9963387148e-05 2.69505726498e-05