#NaNs	Total_Count	Fraction	Read1/2	Base	0	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28
0	125795947	0.661907634222	R1	A	0.180483310802	0.177996895242	0.19441492022	0.137193959039	0.343027840158	0.340515120094	0.279244727972	0.286414418423	0.0972988660756	0.260593085722	0.19570036704	0.234781562557	0.185668350666	0.188533713252	0.270389251889	0.255632369459	0.256013264084	0.255212506966	0.243983297808	0.247902955093	0.245069922642	0.243596767072	0.246244650474	0.249375744991	0.245601267265	0.244024229175	0.245874988325	0.243110566988	0.244761852304
0	125795947	0.661907634222	R1	C	0.272767086844	0.305738204745	0.324930071078	0.383125380025	0.167147300859	0.147960029269	0.209567912391	0.242306169053	0.460669507898	0.245897795101	0.205141092503	0.265610926241	0.268842938159	0.344308867121	0.26059516051	0.256447522908	0.251946702226	0.253979899686	0.255587670086	0.252060783803	0.261218646416	0.256470099152	0.253681297061	0.256852710843	0.254388052741	0.260327759208	0.259544602021	0.254450320248	0.252660834931
0	125795947	0.661907634222	R1	G	0.467301851943	0.231519080658	0.204222644788	0.143671401432	0.157572604466	0.378755549255	0.324640538697	0.299360638384	0.26135090028	0.147640321035	0.403193959818	0.230541640582	0.332298949186	0.229650244614	0.274314298854	0.267584415895	0.250327723198	0.250551832167	0.255535124673	0.257661337849	0.257338290875	0.253153076545	0.257980720158	0.254436925539	0.258694463344	0.252259144724	0.250830942908	0.25174466074	0.254046928873
0	125795947	0.661907634222	R1	T	0.0790571654904	0.28473765534	0.276428897983	0.336006874689	0.332251395985	0.13267921104	0.186546471167	0.171918321025	0.180680081847	0.345868273483	0.19596405598	0.269065131327	0.213189658646	0.237506626505	0.194700334821	0.22033488885	0.241710490084	0.240244647946	0.244891848543	0.242370654438	0.236369602591	0.2467753035	0.242090414884	0.239330413404	0.241310636184	0.243386378736	0.243745794131	0.250692472628	0.248526719227
0	125795947	0.661907634222	R1	N	0.000390584920832	8.16401501393e-06	3.46593042461e-06	2.38481451235e-06	8.58533224445e-07	9.00903428948e-05	3.49772795144e-07	4.53114757346e-07	6.43899918334e-07	5.24659192716e-07	5.24659192716e-07	7.39292498827e-07	1.03341962202e-07	5.4850733784e-07	9.53925804939e-07	8.0288755249e-07	1.82040841109e-06	1.11132356275e-05	2.05888986233e-06	4.2688179771e-06	3.53747485998e-06	4.75373026128e-06	2.91742308677e-06	4.20522292344e-06	5.58046595889e-06	2.48815647455e-06	3.67261434901e-06	1.97939604525e-06	3.66466496731e-06
0	125795947	0.661907634222	R2	A	0.176668593305	0.172949610213	0.189776813716	0.133633478668	0.337338483568	0.335628452322	0.276227230119	0.282189918249	0.0977984211208	0.255626025853	0.192101785282	0.229972973613	0.182110994403	0.184841614969	0.265352420297	0.250629259145	0.251355800835	0.251249199626	0.240092218551	0.243207676635	0.240990745115	0.239959567219	0.242225665665	0.245782274686	0.241939416379	0.242371036008	0.244070462779	0.241683462187	0.243254840317
0	125795947	0.661907634222	R2	C	0.267960954259	0.303219784974	0.324724118496	0.382289462792	0.164776103637	0.150373620543	0.210564256096	0.242741508993	0.457992855684	0.248784795904	0.205688916194	0.265626483181	0.2680812761	0.343254556524	0.260360804788	0.256384468412	0.252011211458	0.253421384077	0.254853584432	0.251278930314	0.260639359073	0.255760871215	0.252861008312	0.256290403378	0.253474986758	0.259907944411	0.260799714	0.254463555968	0.252389912053
0	125795947	0.661907634222	R2	G	0.475542880567	0.239542415464	0.210404370182	0.149636577719	0.164435703163	0.379508323905	0.326102247157	0.301217613951	0.262319572188	0.150689449478	0.398774707742	0.228455985152	0.329376295406	0.22784787335	0.272111811361	0.26513471853	0.248019421484	0.248329280434	0.253709127847	0.255535848067	0.254948635189	0.250635539156	0.25620925609	0.252735980437	0.258822042971	0.254277802766	0.252475431502	0.252802818838	0.255331835135
0	125795947	0.661907634222	R2	T	0.0792874352303	0.283893144824	0.274934199589	0.334405416098	0.333442221314	0.134487663581	0.187106266627	0.173850958807	0.181888896627	0.344898345572	0.2034324365	0.275942745596	0.220423460861	0.244050342894	0.202160893149	0.227836370595	0.248596697634	0.246984133758	0.251316308307	0.249950071921	0.24339133915	0.253620436595	0.248681040574	0.245156618599	0.245736359058	0.243412929671	0.242626982251	0.251005598773	0.248984699006
0	125795947	0.661907634222	R2	N	0.000540136638901	0.00039504452397	0.000160498016681	3.50647227132e-05	7.48831756877e-06	1.93964913671e-06	0.0	0.0	2.5438021465e-07	1.38319241716e-06	2.15428244282e-06	1.81245902938e-06	7.97322985295e-06	5.61226348572e-06	1.40704056228e-05	1.51833190619e-05	1.6868587984e-05	1.60021053778e-05	2.87608630189e-05	2.74730631822e-05	2.99214727482e-05	2.35858155271e-05	2.30293588076e-05	3.47228992998e-05	2.71948348225e-05	3.02871443068e-05	2.74094681286e-05	4.45642338541e-05	3.87134889171e-05
1	32220773	0.169537859827	R1	A	0.183656332516	0.187298920482	0.202489524382	0.147149697495	0.351086362826	0.342719741702	0.280736126349	0.288460428929	0.098391432136	0.261992255741	0.197053404026	0.236793170667	0.186854176341	0.189975609834	0.271259289776	0.257837420598	0.258472321567	0.257792294431	0.246737190321	0.250660063308	0.247495583051	0.247561192899	0.249773399291	0.253653380693	0.249223350414	0.24814938487	0.250116221606	0.247583011121	0.249644848682
1	32220773	0.169537859827	R1	C	0.27823510007	0.308824775867	0.326429567658	0.382155387768	0.170126179158	0.148634919466	0.210947949635	0.243328116306	0.463885146393	0.245998629518	0.207138419677	0.264431613729	0.269512807778	0.344276811733	0.260795760549	0.255866797485	0.252188797581	0.252429884286	0.255083824339	0.250671143116	0.26033819859	0.254589950402	0.252242924153	0.25413505753	0.252982447069	0.257979906317	0.257725660399	0.252476313961	0.251223954186
1	32220773	0.169537859827	R1	G	0.457211470377	0.224511063096	0.198671428522	0.140342877559	0.15447838573	0.375915624371	0.322347542686	0.296577831947	0.258819085439	0.145445579471	0.398786832333	0.228588587865	0.329255725801	0.227076612966	0.271805862634	0.264388380751	0.247280814771	0.24856883477	0.252349315145	0.254542558616	0.254073140952	0.249188341943	0.254693082627	0.251534747475	0.255909875284	0.249544044148	0.247475533874	0.24836114267	0.249839443641
1	32220773	0.169537859827	R1	T	0.08037122511	0.279352857239	0.272404668876	0.330348902554	0.32430724117	0.132616712827	0.185964594952	0.17163315728	0.178902039377	0.346559624749	0.19702069221	0.270181475783	0.214374310635	0.238670748216	0.196136976602	0.221891138366	0.242047482846	0.241183537093	0.245823090588	0.244118165632	0.238067069341	0.24864903148	0.243274082841	0.240665579314	0.241868778257	0.244316360753	0.244666600643	0.251564635026	0.249267793793
1	32220773	0.169537859827	R1	N	0.000525871927405	1.2383315571e-05	4.81056118672e-06	3.13462374103e-06	1.83111683882e-06	0.00011300163407	3.78637719213e-06	4.6553817936e-07	2.29665501818e-06	3.91052070663e-06	6.51753451104e-07	5.15195585159e-06	2.97944434791e-06	2.17251150368e-07	2.11043974643e-06	1.6262800399e-05	1.05832346108e-05	2.54494204717e-05	6.57960626829e-06	8.06932844224e-06	2.60080662869e-05	1.14832750909e-05	1.6511087428e-05	1.12349880619e-05	1.55489751906e-05	1.03039117032e-05	1.59834774914e-05	1.48972217395e-05	2.39596982977e-05
1	32220773	0.169537859827	R2	A	0.176579748723	0.175658541774	0.19237620401	0.137212257446	0.339170633802	0.336709333448	0.2784269018	0.284682617639	0.101197230743	0.259070196733	0.194096026188	0.233466683124	0.184976009111	0.188673406439	0.267929698645	0.253976340046	0.254522416331	0.254687992743	0.243451297708	0.24677899565	0.244426972624	0.243403657634	0.245752049462	0.249806762861	0.245267548361	0.245783706058	0.247703306187	0.245904342518	0.24786112363
1	32220773	0.169537859827	R2	C	0.265955227083	0.30037482341	0.321191952782	0.378155483731	0.162333845932	0.148306684014	0.207965929309	0.239175764033	0.453002539697	0.244407109662	0.203922916437	0.260789863732	0.264631267537	0.338045986668	0.256822237008	0.252468461883	0.248385133404	0.24915485423	0.25143177043	0.247070391514	0.25646392779	0.251641324682	0.248732052456	0.251735146143	0.249443860332	0.255895381529	0.256985640909	0.250367798439	0.248574203977
1	32220773	0.169537859827	R2	G	0.477615046666	0.241072490719	0.212212009935	0.151000939673	0.166518134124	0.380428520445	0.327081259037	0.302612013684	0.263952326656	0.151716564963	0.397796849877	0.22884978582	0.329387628286	0.22816699649	0.2722675834	0.264550605288	0.247781361422	0.247893245764	0.253042346315	0.255375375383	0.25505859217	0.249867344896	0.255876418607	0.252028714519	0.258983389381	0.254672133409	0.252264121658	0.252499994336	0.254742833141
1	32220773	0.169537859827	R2	T	0.078994783893	0.282302569215	0.2739901057	0.333581568636	0.331963233781	0.134552141254	0.186521409651	0.1735254148	0.181840050827	0.344799114534	0.2041614582	0.276888949871	0.220986256289	0.245101940912	0.202954317701	0.228973122402	0.249271828457	0.248224802055	0.252025517824	0.250716207212	0.243983035416	0.255035222153	0.2495901945	0.246371929066	0.246251447785	0.243574448074	0.242988428614	0.251144657516	0.248730935164
1	32220773	0.169537859827	R2	N	0.000855193635485	0.000591574882452	0.000229727573575	4.97505134343e-05	1.41523606526e-05	3.32083901277e-06	4.50020240048e-06	4.18984361424e-06	7.85207729188e-06	7.01410856903e-06	2.27492990314e-05	4.71745355085e-06	1.88387783248e-05	1.16694903626e-05	2.616324568e-05	3.14703809248e-05	3.92603864594e-05	3.91052070663e-05	4.90677241046e-05	5.90302411429e-05	6.74720001286e-05	5.24506348746e-05	4.92849752549e-05	5.74474113331e-05	5.37541417768e-05	7.43309293045e-05	5.85026312063e-05	8.3207190591e-05	9.09040884897e-05
2	9457338	0.0497622091244	R1	A	0.185652030201	0.198564226001	0.214397011083	0.161711889752	0.356728923086	0.347972124926	0.285412131828	0.295815482116	0.106045485527	0.270853912591	0.201700203588	0.243171598604	0.191857899126	0.196071135451	0.276792052901	0.262688507062	0.263725268146	0.263098981976	0.252791007364	0.256790018502	0.253377641785	0.253873553002	0.255157846743	0.261450949517	0.25524835847	0.254015664873	0.256690096093	0.252712232554	0.257028774905
2	9457338	0.0497622091244	R1	C	0.280198719767	0.304550498248	0.320618338903	0.374077356652	0.169534915639	0.147175135329	0.209473638354	0.24028918074	0.461024338984	0.243559445586	0.205833290509	0.262350568416	0.267078854536	0.342191534235	0.260301471725	0.254459130043	0.25240168005	0.250323082457	0.25358034153	0.248912854759	0.259959726511	0.253357128613	0.252145476877	0.251783429967	0.250869536438	0.256603073719	0.256155696243	0.251928713979	0.250482641098
2	9457338	0.0497622091244	R1	G	0.45260812292	0.223550221003	0.199541350854	0.142813442853	0.157446524593	0.373061531691	0.320133212961	0.295222820629	0.25601157535	0.14507464997	0.396427409066	0.227659516875	0.327305844414	0.225782350171	0.268739046865	0.263175959239	0.24570243762	0.24790591179	0.250402808909	0.253471748604	0.251366082084	0.246960085386	0.252862803465	0.249269614769	0.254185374362	0.249329673953	0.245039883316	0.246996036305	0.246722915053
2	9457338	0.0497622091244	R1	T	0.0810843389546	0.273324163734	0.265436531929	0.321393398438	0.316287733398	0.131691497121	0.184976998813	0.168672093564	0.176916696855	0.34049888034	0.196038462409	0.266812606253	0.213751057644	0.235954557191	0.194164996535	0.219627658438	0.238152321509	0.238610695737	0.24321410528	0.240815227287	0.235239979791	0.245795064108	0.239791154763	0.237467667963	0.239665538019	0.240026104597	0.24207509555	0.24832294246	0.245684039208
2	9457338	0.0497622091244	R1	N	0.000456788157513	1.08910139407e-05	6.76723196316e-06	3.9123059787e-06	1.90328398964e-06	9.97109334572e-05	4.01804397813e-06	4.22951997697e-07	1.90328398964e-06	1.31115119286e-05	6.34427996546e-07	5.70985196892e-06	6.34427996546e-06	4.22951997697e-07	2.43197398676e-06	4.87452177346e-05	1.82926739004e-05	6.13280396661e-05	1.17369179361e-05	1.01508479447e-05	5.6569829692e-05	1.41688919229e-05	4.27181517674e-05	2.83377838457e-05	3.11927098302e-05	2.54828578613e-05	3.92287977864e-05	4.00747017818e-05	8.16297355556e-05
2	9457338	0.0497622091244	R2	A	0.179921665061	0.183427514169	0.200939841634	0.147595866828	0.345583609257	0.338075365394	0.282722051385	0.289472048054	0.109265419085	0.267661259437	0.199394375034	0.240956598992	0.191116041322	0.196362443639	0.273375340926	0.260198271437	0.260250611747	0.260590030725	0.24984091718	0.252660103721	0.251793052125	0.248312157184	0.251776134045	0.256298865495	0.251914016397	0.252449050674	0.254062612545	0.251461563497	0.254408481541
2	9457338	0.0497622091244	R2	C	0.266015870428	0.298737763206	0.316883567025	0.373624798014	0.159402466106	0.14834047382	0.206148389748	0.237094730039	0.449730040314	0.240464705819	0.202274783877	0.255932906279	0.262796254083	0.333422470467	0.254416306153	0.249509322814	0.245283926619	0.246562087556	0.248461459239	0.244082954421	0.253937947444	0.24880288724	0.245846347038	0.249171384168	0.246845994084	0.253469422368	0.255020810296	0.248187386345	0.246276912171
2	9457338	0.0497622091244	R2	G	0.47383629516	0.240697540894	0.212952312797	0.151675661798	0.169248365661	0.379587681016	0.325761963885	0.301627371254	0.262861494429	0.152713374525	0.393797493544	0.227626103667	0.326099691055	0.227194375415	0.271261109627	0.26302739735	0.246615379507	0.246935659908	0.251584959742	0.254198803088	0.252827486974	0.248589719433	0.2539074949	0.250145442618	0.256782299628	0.253700142683	0.251168669239	0.251545519469	0.252996244821
2	9457338	0.0497622091244	R2	T	0.0792365674146	0.276473464309	0.268973045058	0.327047949434	0.325741133499	0.133987280565	0.185350676903	0.171783751411	0.178109527226	0.33912047978	0.204467367033	0.275451823758	0.219922773195	0.242955998823	0.20086867996	0.227166777797	0.247756821211	0.245810924808	0.249989796283	0.248917612969	0.241262181811	0.254146251302	0.248331824452	0.24426588116	0.244328583794	0.24017974191	0.239589195184	0.248629159706	0.246113546962
2	9457338	0.0497622091244	R2	N	0.000989601936613	0.000663717422387	0.000251233486632	5.57239256966e-05	2.4425477867e-05	9.19920594992e-06	1.69180799079e-05	2.20992418797e-05	3.35189458175e-05	4.01804397813e-05	6.59805116408e-05	3.25673038227e-05	6.52403456448e-05	6.47116556477e-05	7.85633335723e-05	9.82306014652e-05	9.32609154923e-05	0.000101297003449	0.000122867555331	0.000140525801235	0.000179331647024	0.000148984841189	0.000138199565248	0.000118426559355	0.000129106097297	0.000201642364902	0.000158712737136	0.00017637098304	0.000204814504885
3	22576548	0.118792296826	R1	A	0.229738842271	0.190577009382	0.290187056055	0.159939686085	0.298229250991	0.315658930674	0.262476353781	0.300601225661	0.17048124452	0.243965950862	0.173268340226	0.26813421609	0.21291647421	0.212047430812	0.307772206805	0.246451450417	0.274017799355	0.218438620466	0.213478207563	0.249167056009	0.226623175518	0.232044642077	0.226177048856	0.241326663403	0.236282801073	0.235019410408	0.240143400134	0.230649078858	0.31132124362
3	22576548	0.118792296826	R1	C	0.316098236099	0.303014127758	0.28136520251	0.446465464959	0.17823065776	0.212749043831	0.213137234266	0.214062442141	0.445399447249	0.289716745005	0.271775472495	0.243033478812	0.231205674136	0.365976366272	0.281166412155	0.241403557355	0.214344061811	0.232064928615	0.257292611785	0.210058508502	0.233130281919	0.226888627969	0.235969998602	0.217908069914	0.232299685497	0.237976859881	0.240100125139	0.294985575297	0.246013163749
3	22576548	0.118792296826	R1	G	0.383358917404	0.270640267945	0.183805336405	0.128167158239	0.164651743925	0.330158224366	0.362904018807	0.332924369129	0.231038022288	0.12725537137	0.383289774858	0.253602366491	0.296596849084	0.194359562853	0.21514143792	0.25278182475	0.271508115413	0.296513532538	0.305437571767	0.266657329544	0.258521010387	0.288679518233	0.30368424792	0.291690651733	0.266230204901	0.254987830735	0.246169210634	0.225040338319	0.214056019547
3	22576548	0.118792296826	R1	T	0.0703978305275	0.23575920464	0.244638418593	0.265424634448	0.358887018511	0.141342556001	0.161481285802	0.152411475838	0.15308053295	0.339058300676	0.171665925189	0.235227768213	0.259278566413	0.227616418595	0.195918437132	0.259350543759	0.240122892127	0.25295350733	0.223787002335	0.274110993408	0.281707238857	0.252380169014	0.234153910509	0.249064028743	0.265177076673	0.27200743887	0.2735758806	0.24930073455	0.228569088596
3	22576548	0.118792296826	R1	N	0.000406173698477	9.39027525377e-06	3.98643760773e-06	3.0562688326e-06	1.32881253591e-06	9.12451274659e-05	1.10734377993e-06	4.87231263167e-07	7.5299377035e-07	3.63208759816e-06	4.87231263167e-07	2.17039380865e-06	2.43615631584e-06	2.21468755985e-07	1.5059875407e-06	1.26237190912e-05	7.13129394272e-06	2.94110507948e-05	4.60655012449e-06	6.11253766519e-06	1.82933192444e-05	7.04270644033e-06	1.47941128998e-05	1.05862065361e-05	1.02318565265e-05	8.46010647863e-06	1.13834940576e-05	2.4272975656e-05	4.04844885941e-05
3	22576548	0.118792296826	R2	A	0.0680262545009	0.0716375683298	0.0765701204631	0.058333541514	0.130635516112	0.126494803369	0.105986796564	0.108987122389	0.0424494036909	0.101781193476	0.075429334901	0.0918461936696	0.0723358593174	0.0748595843793	0.102577595122	0.0979015923958	0.0986781504418	0.0981650073342	0.0943609271001	0.0953280811575	0.0948255685502	0.0942839002668	0.0951749133659	0.0966044055982	0.0949090179774	0.0950554974126	0.0958798484162	0.0950339263558	0.0955308579505
3	22576548	0.118792296826	R2	C	0.101852727884	0.112414484269	0.120554081164	0.140490299934	0.0603569686561	0.0564729382012	0.0783873601934	0.0901778252371	0.170451213356	0.0904405757692	0.0762316276164	0.0971528951193	0.0996832642439	0.126532453057	0.0963687185481	0.0944791914158	0.0922392564178	0.0931612308489	0.0935627537035	0.0927067326679	0.0957068813177	0.0939337581636	0.0927217925433	0.0940546358106	0.0934853725202	0.0962794223457	0.0962008895248	0.0934103831994	0.0932613790204
3	22576548	0.118792296826	R2	G	0.799462521905	0.712648452722	0.702797212399	0.679615546185	0.687945827679	0.766999941709	0.746881454153	0.737200656185	0.721220533803	0.68205582182	0.772343096916	0.709446590329	0.746500749362	0.709479411999	0.726191045682	0.723397305912	0.717260982503	0.717648375651	0.719541224814	0.720180959463	0.719688235775	0.71845815401	0.72049017414	0.719182622605	0.721387521245	0.720256436015	0.718958584811	0.719811726753	0.720157483775
3	22576548	0.118792296826	R2	T	0.0299809784915	0.102826348829	0.099890293237	0.121521766747	0.121045520334	0.0500269128832	0.0687404469452	0.0636202664818	0.0658521400172	0.125696142741	0.0759590438715	0.101530756606	0.0814351689195	0.089091698164	0.074802135384	0.084162290887	0.0917603966736	0.0909495995579	0.0924573588487	0.0916984740094	0.0896763756798	0.0932372832197	0.0915300691674	0.0900768797781	0.0901234768043	0.0883012761738	0.0888693435329	0.0916333621951	0.0909363557263
3	22576548	0.118792296826	R2	N	0.00067751721831	0.000473145850287	0.000188292736339	3.88456197998e-05	1.61672191869e-05	5.40383764604e-06	3.94214385654e-06	1.41297066319e-05	2.67091319718e-05	2.62661944598e-05	3.68966947471e-05	2.35642756368e-05	4.4958157465e-05	3.68524009959e-05	6.05052641352e-05	5.96193891112e-05	6.12139641543e-05	7.57866082981e-05	7.77355333508e-05	8.57527023175e-05	0.000102938677782	8.69043398486e-05	8.30507834944e-05	8.14562084514e-05	9.46114525569e-05	0.000107368052902	9.13337149683e-05	0.000110601496739	0.000113923528079