#NaNs	Total_Count	Fraction	Read1/2	Base	0	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28
0	113632604	0.55798198583	R1	A	0.184370271054	0.178095927468	0.196420509733	0.137690605066	0.343244144964	0.342999048055	0.280492498438	0.287216052886	0.0971003269449	0.25963099464	0.197255815769	0.235438703842	0.18641097057	0.189458652202	0.273083955728	0.257278676814	0.25743210109	0.257363863632	0.246084328051	0.250253175576	0.247197925694	0.245853311608	0.248242124241	0.251473679156	0.247693232481	0.24719872652	0.249240772481	0.245630048221	0.247396125851
0	113632604	0.55798198583	R1	C	0.272322809746	0.305526625087	0.323894548786	0.382153646677	0.165654595049	0.148045846067	0.208382851105	0.241869499004	0.462048277975	0.24528605364	0.205242467206	0.263781396755	0.268163484135	0.342076399129	0.258078464874	0.254379324089	0.250265777593	0.252116241215	0.252462717479	0.248835008656	0.258562744897	0.253888030235	0.250253853199	0.253830933946	0.25119933888	0.256819336816	0.257109588019	0.25175640611	0.249608087834
0	113632604	0.55798198583	R1	G	0.462288006706	0.228371850037	0.200288695311	0.140752331963	0.154206322685	0.374181348515	0.321878833297	0.296497702367	0.25900474832	0.145453007484	0.397825398774	0.22771424828	0.328604728622	0.227697386923	0.270347786802	0.264782060262	0.247072495144	0.246780422281	0.252571673883	0.253755445048	0.253533897718	0.249839465089	0.255097929464	0.251579687464	0.25608466211	0.248690692682	0.246971758211	0.248790760793	0.251724003438
0	113632604	0.55798198583	R1	T	0.0806573613327	0.287998935587	0.279394046096	0.339401805841	0.336894118875	0.134678863823	0.189245421147	0.174416376131	0.181846118742	0.349629477821	0.19967598384	0.273064841496	0.21682072867	0.240767297738	0.198488833363	0.223559199611	0.245227989319	0.24373036457	0.248879494128	0.247152789001	0.240702659599	0.250414907327	0.246403576213	0.243111897709	0.24501824318	0.247289255116	0.246674774786	0.253820699207	0.251268192358
0	113632604	0.55798198583	R1	N	0.000361551161848	6.661820405e-06	2.20007278897e-06	1.61045328152e-06	8.18427077496e-07	9.48935395338e-05	3.96013102014e-07	3.69612228547e-07	5.28017469352e-07	4.66415431261e-07	3.34411063923e-07	8.0962678634e-07	8.80029115587e-08	2.64008734676e-07	9.5923173599e-07	7.39224457093e-07	1.63685415499e-06	9.10830134633e-06	1.78645910464e-06	3.58171850044e-06	2.7720917141e-06	4.28574179291e-06	2.51688327058e-06	3.80172577934e-06	4.52334965412e-06	1.98886580123e-06	3.10650277802e-06	2.08566900394e-06	3.5905187916e-06
0	113632604	0.55798198583	R2	A	0.18039191463	0.174655612046	0.192819324989	0.13528356703	0.34057148774	0.339377957052	0.278793259019	0.285494988745	0.0990416623736	0.258221540008	0.194282311791	0.232518881641	0.184486364494	0.18740207696	0.268551004956	0.253166159952	0.254060718348	0.253598852667	0.24307293882	0.246836770545	0.245011361352	0.243123258884	0.245941402522	0.24919207167	0.245382742439	0.246060567265	0.248398329409	0.245743915188	0.247865638985
0	113632604	0.55798198583	R2	C	0.267181987663	0.3009508873	0.320840592547	0.377630921844	0.161949065252	0.149190781547	0.208236044648	0.241247362421	0.455331006935	0.244947339234	0.204569957756	0.262815943213	0.265843128967	0.339620431474	0.258428408452	0.254534798833	0.249969594994	0.251513553276	0.252267087006	0.248754213183	0.257332842606	0.253534654543	0.25034699548	0.254233441663	0.250401425281	0.257502705826	0.258618424339	0.252138479551	0.249793800378
0	113632604	0.55798198583	R2	G	0.470991116247	0.237593912747	0.208591312402	0.14858576153	0.160940437482	0.375248867834	0.322963240374	0.29782197018	0.261091974976	0.148901542378	0.39501493779	0.225859877329	0.326508921682	0.225529074384	0.268907698357	0.261813774856	0.244543141861	0.244657228835	0.249734046401	0.251295059647	0.250887289356	0.247210158099	0.252277805761	0.248046951384	0.254329628845	0.2497612217	0.246884828935	0.248830194897	0.251164067313
0	113632604	0.55798198583	R2	T	0.0809370521862	0.286447215449	0.277604348484	0.338468024547	0.336532664516	0.136181047123	0.190007438358	0.175435678654	0.184535153309	0.34792834634	0.206130592589	0.278803581761	0.223154483021	0.247443163408	0.2040997582	0.23047018266	0.251410193856	0.250214832708	0.25489772284	0.253087432547	0.246740072946	0.256109329326	0.251411874712	0.248494094177	0.249860207375	0.246646402647	0.246071110013	0.253244007327	0.251138388063
0	113632604	0.55798198583	R2	N	0.00049792927389	0.000352372458172	0.000144421578159	3.17250496169e-05	6.34500992338e-06	1.34644454685e-06	1.76005823117e-08	0.0	2.02406696585e-07	1.23204076182e-06	2.20007278897e-06	1.7160567754e-06	7.10183496279e-06	5.25377382006e-06	1.31300344046e-05	1.50836990412e-05	1.63509409676e-05	1.55325138901e-05	2.82049331546e-05	2.65240775438e-05	2.84337407246e-05	2.25991476883e-05	2.19215252693e-05	3.34411063923e-05	2.59960600744e-05	2.91025628525e-05	2.73073034567e-05	4.34030359808e-05	3.81052607049e-05
1	48200330	0.236683090102	R1	A	0.181099755956	0.1843153356	0.201496815478	0.144688345495	0.350248348922	0.340451403548	0.278904584263	0.287375542865	0.0987646142672	0.261080971852	0.195511213305	0.234601879282	0.18461193108	0.188169292617	0.268615256369	0.253776084106	0.255499951971	0.25480412686	0.242746574557	0.246922541817	0.243433457821	0.242282054915	0.245067264062	0.248189690817	0.244145195686	0.24363818671	0.24541748988	0.241838779942	0.244753324303
1	48200330	0.236683090102	R1	C	0.273759308287	0.304644843718	0.323058908518	0.378802344299	0.169873691736	0.146506756282	0.209574913699	0.2424734229	0.461543852501	0.249526382911	0.205769130626	0.268438494093	0.269997466822	0.34800440163	0.263021954414	0.25895127689	0.255014498863	0.256099242474	0.258017922284	0.255227899892	0.265028538186	0.259195237875	0.256830274813	0.259000322197	0.257217595813	0.2624163569	0.262438493678	0.256955481425	0.254973358066
1	48200330	0.236683090102	R1	G	0.464950136234	0.232375566723	0.205284258427	0.146218106805	0.160121704561	0.382780449843	0.328640198107	0.302269445043	0.262812536761	0.149340616548	0.406265123081	0.232942741263	0.33573228648	0.231292109411	0.276445161268	0.270637379454	0.252606714518	0.25325644036	0.258378355501	0.259856893096	0.259560712551	0.255458126531	0.260185812006	0.256811250047	0.261349331011	0.254468651978	0.252309102448	0.253973406406	0.255802688488
1	48200330	0.236683090102	R1	T	0.0797321719582	0.278654088053	0.270155723	0.330288298856	0.319754657281	0.13015769809	0.182878104776	0.167881112017	0.176877274492	0.340049788041	0.192453848345	0.264013731856	0.209657008572	0.232533594687	0.19191590597	0.216627334294	0.2368718015	0.235820356417	0.240851421557	0.237987063574	0.23195944924	0.243055742564	0.23790758279	0.235990251519	0.237276757234	0.239469874999	0.23982447838	0.247223743074	0.244456023434
1	48200330	0.236683090102	R1	N	0.000458627565413	1.01659055031e-05	4.29457640643e-06	2.90454442947e-06	1.59749943621e-06	0.000103692236132	2.19915506803e-06	4.7717515627e-07	1.72197991176e-06	2.24064855988e-06	6.84642615517e-07	3.15350538056e-06	1.30704499326e-06	6.01655631818e-07	1.72197991176e-06	7.92525694326e-06	7.0331468685e-06	1.98338891041e-05	5.72610187524e-06	5.60162139969e-06	1.78422014953e-05	8.83811376395e-06	9.06632796912e-06	8.48541908323e-06	1.11202558157e-05	6.92941313887e-06	1.04356132002e-05	8.58915281285e-06	1.4605709131e-05
1	48200330	0.236683090102	R2	A	0.175411309425	0.173134374806	0.189713016488	0.13502025816	0.336837963558	0.333657113966	0.275564918331	0.281453633201	0.0991894661302	0.256390485293	0.191629808344	0.230995576171	0.182046263999	0.18528213396	0.2644300983	0.249880612851	0.250720565606	0.250703988956	0.240016862955	0.243348188695	0.241505296748	0.240316757167	0.242766180232	0.246409225829	0.24235751083	0.243137899678	0.245261868539	0.243340387919	0.245384834502
1	48200330	0.236683090102	R2	C	0.268321855888	0.304662914134	0.326159136255	0.383792247895	0.166171580153	0.151406971695	0.211268200861	0.244634341715	0.458899140317	0.249719763329	0.206984060068	0.267026449819	0.268953843262	0.344294634497	0.262564488666	0.258658000889	0.254409585992	0.255761464704	0.256744777474	0.253116233852	0.262055695469	0.25738427517	0.254577385674	0.258114290919	0.254944499343	0.262104554056	0.262945876097	0.256556023579	0.254093405585
1	48200330	0.236683090102	R2	G	0.476632711851	0.241771270031	0.211979876486	0.150626956288	0.166022452543	0.38139919374	0.328528373146	0.302113222046	0.262264158772	0.151742446577	0.398551358466	0.228822271549	0.330220643718	0.228038936663	0.27279153483	0.264638063681	0.247879838167	0.248253860503	0.253343078771	0.255372898899	0.254776160246	0.250099096832	0.255551403901	0.251603775327	0.258009250144	0.253445816657	0.251019899656	0.251877756854	0.254101102627
1	48200330	0.236683090102	R2	T	0.0788963478051	0.279910946668	0.271940378831	0.330512674913	0.330955389725	0.133533691574	0.184635561624	0.171795774012	0.179642421535	0.342142429315	0.202822096861	0.273152217008	0.218764622566	0.242375083324	0.200192695776	0.22679819827	0.246960736576	0.245251785621	0.249854928379	0.248118280518	0.241609943334	0.252159829611	0.247066109298	0.243825654306	0.244647349925	0.241256398037	0.240727065562	0.248160686867	0.246352649453
1	48200330	0.236683090102	R2	N	0.000737775031831	0.000520494361761	0.000207591939723	4.78627428484e-05	1.26140215223e-05	3.02902490502e-06	2.94603792132e-06	3.02902490502e-06	4.81324505455e-06	4.87548529232e-06	1.267626176e-05	3.48545331536e-06	1.4626455877e-05	9.2115551906e-06	2.11824275892e-05	2.51243093149e-05	2.92736584998e-05	2.89002170732e-05	4.03524208237e-05	4.4398036279e-05	5.29042021082e-05	4.00412196348e-05	3.89208953549e-05	4.70536197574e-05	4.13897581199e-05	5.53315713814e-05	4.52901463538e-05	6.51447822038e-05	6.80078331414e-05
2	16707538	0.0820407603399	R1	A	0.177422550229	0.190367306063	0.207057197775	0.154312263123	0.350800578757	0.338593513898	0.279058111375	0.288743380383	0.103388183226	0.264675980387	0.195377200399	0.236943468272	0.185107883639	0.189360455143	0.267085910563	0.252339512859	0.255428657412	0.254370811546	0.241939955486	0.246358559831	0.243034850497	0.242339775017	0.244638258491	0.247792942323	0.243562516512	0.243254152706	0.245312564903	0.241384457722	0.245012640402
2	16707538	0.0820407603399	R1	C	0.275202306887	0.302893101306	0.322638679619	0.375665044126	0.174440602799	0.146706115527	0.210914738006	0.243493625452	0.460974202183	0.252552590334	0.207091613378	0.271820061101	0.271846935198	0.352908070597	0.266598286354	0.262688015434	0.258496135098	0.259256630151	0.262206496253	0.25976023517	0.26957364993	0.262642287571	0.26174478849	0.26263540445	0.261595275139	0.266212472478	0.265909435609	0.261314324109	0.258776727008
2	16707538	0.0820407603399	R1	G	0.467811834395	0.237793264334	0.209941045772	0.15171984047	0.168243878901	0.387238083792	0.332500695195	0.305400831649	0.263968275876	0.153017039375	0.410497584982	0.236283706193	0.339106216607	0.232840350266	0.280406125666	0.274653871803	0.256519661963	0.258104874578	0.262512884903	0.263687683966	0.26300475869	0.259046485485	0.262907497203	0.25984935662	0.264265207716	0.257929205368	0.25542434798	0.256962336402	0.258196330303
2	16707538	0.0820407603399	R1	T	0.0791202749322	0.268935554718	0.260356792246	0.318299380794	0.306514041746	0.127363768378	0.177522804377	0.162361623837	0.171666944585	0.329746249866	0.187033182268	0.254946419993	0.203935792335	0.224890525462	0.185907462847	0.210290648449	0.229542317965	0.228228659423	0.233331805081	0.230185261287	0.224345322453	0.235960259375	0.230682521865	0.229705238438	0.230557608189	0.232588009077	0.233329291246	0.240315658716	0.237964624112
2	16707538	0.0820407603399	R1	N	0.000443033557667	1.07735801648e-05	6.28458842949e-06	3.471486942e-06	8.97798347069e-07	9.85184052851e-05	3.65104661142e-06	5.38679008242e-07	2.39412892552e-06	8.14003834676e-06	4.18972561966e-07	6.34444165262e-06	3.17222082631e-06	5.9853223138e-07	2.2145692561e-06	2.79514552054e-05	1.32275623135e-05	3.9024301486e-05	8.85827702442e-06	8.25974479304e-06	4.14184304115e-05	1.11925527268e-05	2.69339504121e-05	1.70581685943e-05	1.93924442967e-05	1.61603702473e-05	2.43602618172e-05	2.32230505775e-05	4.96781752045e-05
2	16707538	0.0820407603399	R2	A	0.173261494303	0.176606631091	0.192689491414	0.140638195765	0.337930579598	0.331277235461	0.275899537083	0.281660948489	0.103770346056	0.259280032761	0.192518550609	0.233705768019	0.182927729986	0.187868015024	0.263420678738	0.250607240875	0.251700220583	0.251737449288	0.241363509094	0.243762486131	0.242710146761	0.24076790967	0.242888629073	0.248140809256	0.242937888275	0.244029251946	0.246089040767	0.24406701933	0.246041816574
2	16707538	0.0820407603399	R2	C	0.270556080734	0.306999032413	0.328491666456	0.386562161343	0.168604374864	0.153408898427	0.213084237785	0.246585882372	0.460896572553	0.252885673521	0.208657194136	0.26906316179	0.271226436833	0.346914727951	0.265651408364	0.260594289835	0.256231408841	0.25800072997	0.259689069688	0.255890963708	0.264779346903	0.25955577656	0.25705552787	0.259947934878	0.257710441838	0.265746156017	0.265452695663	0.258408749392	0.257844812324
2	16707538	0.0820407603399	R2	G	0.477815821816	0.243280847244	0.212937477682	0.151828893042	0.170128477338	0.383722544878	0.331031897099	0.303718297693	0.261355981953	0.153660641083	0.39833762461	0.229635808699	0.330429833528	0.228212379346	0.273730216864	0.265489086423	0.249132038485	0.250036660099	0.254591191114	0.256876985705	0.255696500586	0.250951696175	0.25666630236	0.252810856992	0.260286165442	0.255087075068	0.253139391333	0.253796100898	0.254976107192
2	16707538	0.0820407603399	R2	T	0.0774499510341	0.272478626115	0.265638120949	0.320917480481	0.323316637077	0.131585036646	0.179975110636	0.168022900801	0.173958604793	0.334149651493	0.200444912949	0.267577664645	0.215376436672	0.236966930735	0.197150172575	0.223250367589	0.242873486207	0.240160638869	0.244278480767	0.243373919006	0.236693102239	0.248624961978	0.243297606146	0.23901750216	0.238981889492	0.235005001934	0.235213829829	0.243603815236	0.241003611663
2	16707538	0.0820407603399	R2	N	0.000916652112358	0.000634863137824	0.000243243498833	5.32693685928e-05	1.99311233049e-05	6.28458842949e-06	9.21739636325e-06	1.19706446276e-05	1.84946459496e-05	2.40011424783e-05	4.17176965272e-05	1.75968476026e-05	3.95629804942e-05	3.79469434695e-05	4.75234591715e-05	5.9015278014e-05	6.28458842949e-05	6.45217745427e-05	7.77493368562e-05	9.56454505745e-05	0.000120903510739	9.96556165247e-05	9.19345507399e-05	8.28967140461e-05	8.36149527237e-05	0.000132515036027	0.000105042406607	0.000124315144458	0.000133652247267
3	25108762	0.123294163729	R1	A	0.218588714171	0.188623995082	0.273187662538	0.157877795807	0.305896125026	0.315847631197	0.275571491737	0.304926344039	0.161332804859	0.243491455294	0.176962567888	0.259120541268	0.215148241877	0.208142042208	0.29859986725	0.243497747918	0.278232395528	0.224247256794	0.216971430133	0.248331717828	0.228657749036	0.232575026997	0.228003754227	0.244019438314	0.236667542589	0.236601748824	0.242404822667	0.234951249289	0.303098336748
3	25108762	0.123294163729	R1	C	0.312884641624	0.29947948051	0.282766868394	0.435034789847	0.17602365262	0.200309119183	0.210861531126	0.215850307554	0.447941280418	0.280846144465	0.267835268023	0.255392480123	0.236317186805	0.35881259299	0.272762233359	0.254085486174	0.219766629673	0.242833159198	0.258838249373	0.216557829494	0.237920531486	0.231651883116	0.242878840462	0.222203069988	0.236341122673	0.240328137245	0.242410836504	0.287608046944	0.246207957206
3	25108762	0.123294163729	R1	G	0.394655419491	0.272153282587	0.190477571136	0.136329102964	0.16737081661	0.346174494784	0.351473601128	0.325243673902	0.234803332797	0.135478403913	0.379531177204	0.247093225863	0.300168721978	0.207981381161	0.223918447274	0.255060444637	0.265006733506	0.284389489215	0.295192570625	0.264831655181	0.262398361178	0.285410128942	0.295281742684	0.28641917909	0.265373219118	0.257053414262	0.246454325386	0.229630078934	0.222077575947
3	25108762	0.123294163729	R1	T	0.0734704084574	0.239733245311	0.253563716124	0.270755563337	0.350708449903	0.137581932554	0.162092021901	0.153979077105	0.155921108337	0.34017945608	0.175670469137	0.238392159677	0.248362981815	0.225063346413	0.204717779395	0.247338399241	0.236987032654	0.248500543356	0.228992532567	0.27027290314	0.271002967012	0.250354955772	0.233819532799	0.247347320429	0.261607720843	0.266007619173	0.268716713313	0.247785215376	0.22857439168
3	25108762	0.123294163729	R1	N	0.000400816256891	9.99651038152e-06	4.18180713171e-06	2.74804468655e-06	9.55841630105e-07	8.68222814012e-05	1.35410897598e-06	5.97401018816e-07	1.47358917975e-06	4.540247743e-06	5.1774754964e-07	1.59306938351e-06	2.86752489032e-06	6.37227753403e-07	1.67272285268e-06	1.79220305645e-05	7.20863896038e-06	2.95514370641e-05	5.21730223099e-06	5.89435671898e-06	2.03912881089e-05	8.00517365213e-06	1.6129827508e-05	1.09921787462e-05	1.03947777274e-05	9.080495486e-06	1.33021293523e-05	2.5409456667e-05	4.17384178479e-05
3	25108762	0.123294163729	R2	A	0.0796758119735	0.0824548418596	0.0897385542147	0.0675998681257	0.153488770175	0.148393656366	0.124830806075	0.127993168281	0.0492569486301	0.119859155143	0.0878503687279	0.107722395871	0.0844633837383	0.0877014565672	0.120159249588	0.114014462362	0.114340922105	0.114945014015	0.11061469299	0.111057406972	0.110986435731	0.109992838357	0.111510675038	0.113128596304	0.110748749779	0.111142476877	0.112224409949	0.111528836029	0.11196876214
3	25108762	0.123294163729	R2	C	0.123237577384	0.137174186445	0.147072165485	0.171740128008	0.0749191855815	0.0683436323941	0.0948768402042	0.110018845214	0.205869648213	0.111851631713	0.0936062877174	0.119153027138	0.12128045182	0.154098955576	0.117545620131	0.116284785367	0.113723488239	0.11478945079	0.1152643846	0.114470239512	0.117610378401	0.11588615958	0.113272968217	0.115855811609	0.115402145275	0.118193481622	0.117740213556	0.114759779873	0.114580957835
3	25108762	0.123294163729	R2	G	0.761523367819	0.657992178189	0.645341813348	0.617122381422	0.627838242284	0.723236056003	0.699233717696	0.686860347794	0.666874933937	0.620190752535	0.728759864783	0.653867801208	0.698101363978	0.653479291412	0.673946807891	0.670268609818	0.662733511115	0.663424704093	0.66513677576	0.666232130441	0.665765799206	0.66425923349	0.666572011794	0.66478307453	0.667507342656	0.665754966334	0.665824981733	0.665963618597	0.666338388169
3	25108762	0.123294163729	R2	T	0.0348606593985	0.121885300438	0.117652037165	0.143495007838	0.143738070399	0.0600215972416	0.0810540161239	0.0751119868037	0.0779703913717	0.148070581895	0.0897428156753	0.11923033083	0.0961093979862	0.104683576195	0.0882876662736	0.0993704906678	0.109138754033	0.106765996667	0.108909073255	0.108153759234	0.105532921137	0.109775105599	0.10856226205	0.106152386167	0.106247930503	0.104799790607	0.10411735951	0.107635334629	0.106995796925
3	25108762	0.123294163729	R2	N	0.000702583424862	0.000493493068276	0.000195429786622	4.26146060089e-05	1.57315601621e-05	5.05799529264e-06	4.61990121217e-06	1.5651906693e-05	2.80778478843e-05	2.78787142114e-05	4.06630960141e-05	2.64449517662e-05	4.540247743e-05	3.67202492899e-05	6.06561167771e-05	6.16517851418e-05	6.33245079945e-05	7.48344342903e-05	7.50733946978e-05	8.64638407899e-05	0.000104465524824	8.66629744629e-05	8.20828999853e-05	8.01313899905e-05	9.38317866886e-05	0.000109284559709	9.30352519969e-05	0.000112430871741	0.000116094931323