##fileformat=VCFv4.2
##ALT=<ID=CNV,Description="Copy number variable region">
##ALT=<ID=DEL,Description="Deletion">
##ALT=<ID=DUP:TANDEM,Description="Duplication">
##ALT=<ID=DUP:TANDEM:TANDEM,Description="Tandem duplication">
##ALT=<ID=INS,Description="Insertion of novel sequence">
##ALT=<ID=INV,Description="Inversion">
##FILTER=<ID=LowSRSUPE,Description="PE < 2">
##FILTER=<ID=SmallLen,Description="SVLEN < 50">
##FORMAT=<ID=BD,Number=1,Type=Integer,Description="Amount of BED evidence supporting the variant">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=PE,Number=1,Type=Integer,Description="Number of paired-end reads supporting the variant">
##FORMAT=<ID=SR,Number=1,Type=Integer,Description="Number of split reads supporting the variant">
##FORMAT=<ID=SU,Number=1,Type=Integer,Description="Number of pieces of evidence supporting the variant">
##GATKCommandLine.SelectVariants.2=<ID=SelectVariants,Version=3.6-0-g89b7209,Date="Thu Jul 13 10:08:31 PDT 2017",Epoch=1499965711121,CommandLineOptions="analysis_type=SelectVariants input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/srv/gsfs0/projects/levinson/sg_b/GATK/hg19/hg19.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 static_quantized_quals=null round_down_quantized=false disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 reference_window_stop=0 phone_home= gatk_key=null tag=NA logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=filtered/LUMPY.filtered3.vcf) discordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) concordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=/srv/gsfs0/projects/levinson/steve/circos/K562.raw.vcfs/LUMPY.final.vcf sample_name=[] sample_expressions=null sample_file=null exclude_sample_name=[] exclude_sample_file=[] exclude_sample_expressions=[] selectexpressions=[] invertselect=false excludeNonVariants=false excludeFiltered=true preserveAlleles=false removeUnusedAlternates=false restrictAllelesTo=ALL keepOriginalAC=false keepOriginalDP=false mendelianViolation=false invertMendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_fraction=0.0 remove_fraction_genotypes=0.0 selectTypeToInclude=[] selectTypeToExclude=[] keepIDs=null excludeIDs=null fullyDecode=false justRead=false maxIndelSize=2147483647 minIndelSize=0 maxFilteredGenotypes=2147483647 minFilteredGenotypes=0 maxFractionFilteredGenotypes=1.0 minFractionFilteredGenotypes=0.0 maxNOCALLnumber=2147483647 maxNOCALLfraction=1.0 setFilteredGtToNocall=false ALLOW_NONOVERLAPPING_COMMAND_LINE_SAMPLES=false forceValidOutput=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##GATKCommandLine.SelectVariants=<ID=SelectVariants,Version=3.6-0-g89b7209,Date="Wed Jul 12 18:05:08 PDT 2017",Epoch=1499907908364,CommandLineOptions="analysis_type=SelectVariants input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/srv/gsfs0/projects/levinson/sg_b/GATK/hg19/hg19.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 static_quantized_quals=null round_down_quantized=false disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 reference_window_stop=0 phone_home= gatk_key=null tag=NA logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=svlen50/LUMPY.svlen.less.50.vcf) discordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) concordance=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=/srv/gsfs0/projects/levinson/steve/K562.raw.vcfs/svlen50/LUMPY.svlen.less.50.filtered.vcf sample_name=[] sample_expressions=null sample_file=null exclude_sample_name=[] exclude_sample_file=[] exclude_sample_expressions=[] selectexpressions=[] invertselect=false excludeNonVariants=false excludeFiltered=true preserveAlleles=false removeUnusedAlternates=false restrictAllelesTo=ALL keepOriginalAC=false keepOriginalDP=false mendelianViolation=false invertMendelianViolation=false mendelianViolationQualThreshold=0.0 select_random_fraction=0.0 remove_fraction_genotypes=0.0 selectTypeToInclude=[] selectTypeToExclude=[] keepIDs=null excludeIDs=null fullyDecode=false justRead=false maxIndelSize=2147483647 minIndelSize=0 maxFilteredGenotypes=2147483647 minFilteredGenotypes=0 maxFractionFilteredGenotypes=1.0 minFractionFilteredGenotypes=0.0 maxNOCALLnumber=2147483647 maxNOCALLfraction=1.0 setFilteredGtToNocall=false ALLOW_NONOVERLAPPING_COMMAND_LINE_SAMPLES=false forceValidOutput=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##GATKCommandLine.VariantFiltration.2=<ID=VariantFiltration,Version=3.6-0-g89b7209,Date="Thu Jul 13 09:32:36 PDT 2017",Epoch=1499963556655,CommandLineOptions="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/srv/gsfs0/projects/levinson/sg_b/GATK/hg19/hg19.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 static_quantized_quals=null round_down_quantized=false disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 reference_window_stop=0 phone_home= gatk_key=null tag=NA logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=chr1-22/LUMPY.sorted.vcf) mask=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=/srv/gsfs0/projects/levinson/steve/circos/K562.raw.vcfs/filtered/LUMPY.filtered1.vcf filterExpression=[SR < 2] filterName=[LowSRSUPE] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskExtension=0 maskName=Mask filterNotInMask=false missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false invalidatePreviousFilters=false invertFilterExpression=false invertGenotypeFilterExpression=false setFilteredGtToNocall=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##GATKCommandLine.VariantFiltration.3=<ID=VariantFiltration,Version=3.6-0-g89b7209,Date="Thu Jul 13 09:40:16 PDT 2017",Epoch=1499964016211,CommandLineOptions="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/srv/gsfs0/projects/levinson/sg_b/GATK/hg19/hg19.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 static_quantized_quals=null round_down_quantized=false disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 reference_window_stop=0 phone_home= gatk_key=null tag=NA logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=filtered/LUMPY.filtered1.vcf) mask=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=/srv/gsfs0/projects/levinson/steve/circos/K562.raw.vcfs/filtered/LUMPY.filtered2.vcf filterExpression=[SU < 5] filterName=[LowSRSUPE] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskExtension=0 maskName=Mask filterNotInMask=false missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false invalidatePreviousFilters=false invertFilterExpression=false invertGenotypeFilterExpression=false setFilteredGtToNocall=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##GATKCommandLine.VariantFiltration.4=<ID=VariantFiltration,Version=3.6-0-g89b7209,Date="Thu Jul 13 09:47:14 PDT 2017",Epoch=1499964434884,CommandLineOptions="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/srv/gsfs0/projects/levinson/sg_b/GATK/hg19/hg19.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 static_quantized_quals=null round_down_quantized=false disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 reference_window_stop=0 phone_home= gatk_key=null tag=NA logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=filtered/LUMPY.filtered2.vcf) mask=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=/srv/gsfs0/projects/levinson/steve/circos/K562.raw.vcfs/filtered/LUMPY.filtered3.vcf filterExpression=[PE < 2] filterName=[LowSRSUPE] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskExtension=0 maskName=Mask filterNotInMask=false missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false invalidatePreviousFilters=false invertFilterExpression=false invertGenotypeFilterExpression=false setFilteredGtToNocall=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##GATKCommandLine.VariantFiltration=<ID=VariantFiltration,Version=3.6-0-g89b7209,Date="Wed Jul 12 17:49:06 PDT 2017",Epoch=1499906946098,CommandLineOptions="analysis_type=VariantFiltration input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/srv/gsfs0/projects/levinson/sg_b/GATK/hg19/hg19.fa nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=1000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 static_quantized_quals=null round_down_quantized=false disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=1 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 reference_window_stop=0 phone_home= gatk_key=null tag=NA logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=(RodBinding name=variant source=LUMPY.vcf) mask=(RodBinding name= source=UNBOUND) out=/srv/gsfs0/projects/levinson/steve/K562.raw.vcfs/svlen50/LUMPY.svlen.less.50.vcf filterExpression=[SVLEN < 50] filterName=[SmallLen] genotypeFilterExpression=[] genotypeFilterName=[] clusterSize=3 clusterWindowSize=0 maskExtension=0 maskName=Mask filterNotInMask=false missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing=false invalidatePreviousFilters=false invertFilterExpression=false invertGenotypeFilterExpression=false setFilteredGtToNocall=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##INFO=<ID=AC,Number=A,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
##INFO=<ID=CIEND,Number=2,Type=Integer,Description="Confidence interval around END for imprecise variants">
##INFO=<ID=CIEND95,Number=2,Type=Integer,Description="Confidence interval (95%) around END for imprecise variants">
##INFO=<ID=CIPOS,Number=2,Type=Integer,Description="Confidence interval around POS for imprecise variants">
##INFO=<ID=CIPOS95,Number=2,Type=Integer,Description="Confidence interval (95%) around POS for imprecise variants">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=END,Number=1,Type=Integer,Description="End position of the variant described in this record">
##INFO=<ID=EV,Number=.,Type=String,Description="Type of LUMPY evidence contributing to the variant call">
##INFO=<ID=EVENT,Number=1,Type=String,Description="ID of event associated to breakend">
##INFO=<ID=IMPRECISE,Number=0,Type=Flag,Description="Imprecise structural variation">
##INFO=<ID=MATEID,Number=.,Type=String,Description="ID of mate breakends">
##INFO=<ID=PE,Number=.,Type=Integer,Description="Number of paired-end reads supporting the variant across all samples">
##INFO=<ID=PREND,Number=.,Type=String,Description="LUMPY probability curve of the END breakend">
##INFO=<ID=PRPOS,Number=.,Type=String,Description="LUMPY probability curve of the POS breakend">
##INFO=<ID=SECONDARY,Number=0,Type=Flag,Description="Secondary breakend in a multi-line variants">
##INFO=<ID=SR,Number=.,Type=Integer,Description="Number of split reads supporting the variant across all samples">
##INFO=<ID=STRANDS,Number=.,Type=String,Description="Strand orientation of the adjacency in BEDPE format (DEL:+-, DUP:TANDEM:-+, INV:++/--)">
##INFO=<ID=SU,Number=.,Type=Integer,Description="Number of pieces of evidence supporting the variant across all samples">
##INFO=<ID=SVLEN,Number=.,Type=Integer,Description="Difference in length between REF and ALT alleles">
##INFO=<ID=SVTYPE,Number=1,Type=String,Description="Type of structural variant">
##contig=<ID=chrM,length=16571,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr1,length=249250621,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr2,length=243199373,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr3,length=198022430,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr4,length=191154276,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr5,length=180915260,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr6,length=171115067,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr7,length=159138663,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr8,length=146364022,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr9,length=141213431,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr10,length=135534747,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr11,length=135006516,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr12,length=133851895,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr13,length=115169878,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr14,length=107349540,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr15,length=102531392,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr16,length=90354753,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr17,length=81195210,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr18,length=78077248,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr19,length=59128983,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr20,length=63025520,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr21,length=48129895,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr22,length=51304566,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrX,length=155270560,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrY,length=59373566,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr1_gl000191_random,length=106433,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr1_gl000192_random,length=547496,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr4_ctg9_hap1,length=590426,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr4_gl000193_random,length=189789,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr4_gl000194_random,length=191469,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr6_apd_hap1,length=4622290,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr6_cox_hap2,length=4795371,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr6_dbb_hap3,length=4610396,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr6_mann_hap4,length=4683263,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr6_mcf_hap5,length=4833398,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr6_qbl_hap6,length=4611984,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr6_ssto_hap7,length=4928567,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr7_gl000195_random,length=182896,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr8_gl000196_random,length=38914,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr8_gl000197_random,length=37175,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr9_gl000198_random,length=90085,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr9_gl000199_random,length=169874,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr9_gl000200_random,length=187035,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr9_gl000201_random,length=36148,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr11_gl000202_random,length=40103,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr17_ctg5_hap1,length=1680828,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr17_gl000203_random,length=37498,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr17_gl000204_random,length=81310,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr17_gl000205_random,length=174588,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr17_gl000206_random,length=41001,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr18_gl000207_random,length=4262,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr19_gl000208_random,length=92689,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr19_gl000209_random,length=159169,assembly=hg19>
##contig=<ID=chr21_gl000210_random,length=27682,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000211,length=166566,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000212,length=186858,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000213,length=164239,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000214,length=137718,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000215,length=172545,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000216,length=172294,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000217,length=172149,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000218,length=161147,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000219,length=179198,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000220,length=161802,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000221,length=155397,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000222,length=186861,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000223,length=180455,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000224,length=179693,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000225,length=211173,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000226,length=15008,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000227,length=128374,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000228,length=129120,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000229,length=19913,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000230,length=43691,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000231,length=27386,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000232,length=40652,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000233,length=45941,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000234,length=40531,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000235,length=34474,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000236,length=41934,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000237,length=45867,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000238,length=39939,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000239,length=33824,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000240,length=41933,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000241,length=42152,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000242,length=43523,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000243,length=43341,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000244,length=39929,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000245,length=36651,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000246,length=38154,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000247,length=36422,assembly=hg19>
##contig=<ID=chrUn_gl000248,length=39786,assembly=hg19>
##reference=file:///srv/gsfs0/projects/levinson/sg_b/GATK/hg19/hg19.fa
##source=LUMPY
##source=SelectVariants
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	K562WGS
chr1	6452077	38	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-9,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,7;CIPOS95=0,0;END=6618841;PE=13;SR=4;STRANDS=-+:17;SU=17;SVLEN=166764;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:17:13:4
chr1	14437074	59	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=14438939;IMPRECISE;PE=3;SR=3;STRANDS=+-:6;SU=6;SVLEN=-1865;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:6:3:3
chr1	25158703	80	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-7,10;CIPOS95=-1,1;END=25161509;IMPRECISE;PE=87;SR=3;STRANDS=+-:90;SU=90;SVLEN=-2806;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:90:87:3
chr1	29277818	94	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,2;CIPOS95=-9,0;END=29281139;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3321;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr1	30738623	95	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=30739931;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=+-:6;SU=6;SVLEN=-1308;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr1	36733250	131	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=36734642;PE=3;SR=5;STRANDS=++:6,--:2;SU=8;SVLEN=1392;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:8:3:5
chr1	38241383	4633_1	N	]CHR19:11422016]N	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4633;IMPRECISE;MATEID=4633_2;PE=6;SR=2;STRANDS=-+:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:6:2
chr1	38241383	4633_1	N	]CHR19:11422016]N	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4633;IMPRECISE;MATEID=4633_2;PE=6;SR=2;STRANDS=-+:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:6:2
chr1	55092274	157	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=55095966;IMPRECISE;PE=68;SR=2;STRANDS=+-:70;SU=70;SVLEN=-3692;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:70:68:2
chr1	56831124	111	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=56834961;IMPRECISE;PE=21;SR=3;STRANDS=+-:24;SU=24;SVLEN=-3837;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:24:21:3
chr1	63705366	169	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,3;CIPOS95=0,0;END=63708146;PE=50;SR=7;STRANDS=+-:57;SU=57;SVLEN=-2780;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:57:50:7
chr1	72766324	172	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=-1,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;END=72811839;IMPRECISE;PE=51;SR=4;STRANDS=+-:55;SU=55;SVLEN=-45515;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:55:51:4
chr1	80120392	208	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=80123456;IMPRECISE;PE=2;SR=3;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3064;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr1	81404772	210	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,6;CIPOS95=0,0;END=81410948;PE=48;SR=5;STRANDS=+-:53;SU=53;SVLEN=-6176;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:53:48:5
chr1	81660351	211	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=81661558;IMPRECISE;PE=5;SR=2;STRANDS=++:5,--:2;SU=7;SVLEN=1207;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:7:5:2
chr1	84668501	215	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2984;CIEND95=0,1840;CIPOS=-2636,12;CIPOS95=-1883,2;END=84669854;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=1353;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr1	118872414	249	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,1;END=118875519;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3105;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr1	118953981	251	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=118956887;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2906;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr1	121484052	190	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-1,6;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,6;CIPOS95=0,0;END=121485433;PE=11880;SR=9;STRANDS=-+:11889;SU=11889;SVLEN=1381;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:11889:11880:9
chr1	121484655	288	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-4,9;CIPOS95=-2,6;END=121484973;IMPRECISE;PE=19;SR=2;STRANDS=++:7,--:14;SU=21;SVLEN=318;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:21:19:2
chr1	121485186	187	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;END=121485416;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=++:4,--:1;SU=5;SVLEN=230;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr1	121485422	4574_1	N	N[CHR2:33141296[	.	PASS	CIEND=-2500,8;CIEND95=-1853,1;CIPOS=-10,1728;CIPOS95=-1,758;EVENT=4574;IMPRECISE;MATEID=4574_2;PE=87;SR=4;STRANDS=+-:91;SU=91;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:91:87:4
chr1	121485422	4574_1	N	N[CHR2:33141296[	.	PASS	CIEND=-2500,8;CIEND95=-1853,1;CIPOS=-10,1728;CIPOS95=-1,758;EVENT=4574;IMPRECISE;MATEID=4574_2;PE=87;SR=4;STRANDS=+-:91;SU=91;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:91:87:4
chr1	142537205	4626_1	N	N]CHR16:33887750]	.	PASS	CIEND=-10,3587;CIEND95=0,2522;CIPOS=-10,2751;CIPOS95=0,1635;EVENT=4626;IMPRECISE;MATEID=4626_2;PE=3;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr1	142537205	4626_1	N	N]CHR16:33887750]	.	PASS	CIEND=-10,3587;CIEND95=0,2522;CIPOS=-10,2751;CIPOS95=0,1635;EVENT=4626;IMPRECISE;MATEID=4626_2;PE=3;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr1	145092948	293	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,6;CIEND95=-1,0;CIPOS=-5,10;CIPOS95=-1,1;END=145097081;IMPRECISE;PE=172;SR=2;STRANDS=+-:174;SU=174;SVLEN=-4133;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:174:172:2
chr1	156526723	355	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=156528935;IMPRECISE;PE=62;SR=2;STRANDS=+-:64;SU=64;SVLEN=-2212;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:64:62:2
chr1	158867533	358	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=158869981;IMPRECISE;PE=86;SR=6;STRANDS=+-:92;SU=92;SVLEN=-2448;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:92:86:6
chr1	159648708	359	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=159649657;PE=2;SR=7;STRANDS=+-:9;SU=9;SVLEN=-949;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:9:2:7
chr1	162349682	4642_1	N	[CHRUN_GL000220:142687[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4642;IMPRECISE;MATEID=4642_2;PE=15;SR=2;STRANDS=--:17;SU=17;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:17:15:2
chr1	162349682	4642_1	N	[CHRUN_GL000220:142687[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4642;IMPRECISE;MATEID=4642_2;PE=15;SR=2;STRANDS=--:17;SU=17;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:17:15:2
chr1	184814743	394	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=184820784;PE=96;SR=4;STRANDS=+-:100;SU=100;SVLEN=-6041;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:100:96:4
chr1	186288080	398	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=187041109;IMPRECISE;PE=26;SR=3;STRANDS=-+:29;SU=29;SVLEN=753029;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:29:26:3
chr1	187464828	399_1	N	N]CHR1:187466727]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,2;CIPOS95=0,0;EVENT=399;MATEID=399_2;PE=10;SR=9;STRANDS=++:19;SU=19;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:19:10:9
chr1	187464828	399_1	N	N]CHR1:187466727]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,2;CIPOS95=0,0;EVENT=399;MATEID=399_2;PE=10;SR=9;STRANDS=++:19;SU=19;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:19:10:9
chr1	187466727	399_2	N	N]CHR1:187464828]	.	PASS	CIEND=-4,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;EVENT=399;MATEID=399_1;PE=10;SECONDARY;SR=9;STRANDS=++:19;SU=19;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:19:10:9
chr1	187466727	399_2	N	N]CHR1:187464828]	.	PASS	CIEND=-4,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;EVENT=399;MATEID=399_1;PE=10;SECONDARY;SR=9;STRANDS=++:19;SU=19;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:19:10:9
chr1	187716106	401	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=187722532;IMPRECISE;PE=81;SR=3;STRANDS=+-:84;SU=84;SVLEN=-6426;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:84:81:3
chr1	193338835	411	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=193342261;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3426;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr1	194638618	414	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-2,10;CIEND95=-1,3;CIPOS=-2,1;CIPOS95=-1,1;END=194638693;IMPRECISE;PE=17;SR=2;STRANDS=++:6,--:13;SU=19;SVLEN=75;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:19:17:2
chr1	197500520	421	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=197503271;PE=131;SR=5;STRANDS=+-:136;SU=136;SVLEN=-2751;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:136:131:5
chr1	197756788	423	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-2,0;CIPOS=-7,4;CIPOS95=0,0;END=197757986;IMPRECISE;PE=37;SR=4;STRANDS=++:24,--:17;SU=41;SVLEN=1198;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:41:37:4
chr1	199438743	426	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,3;CIPOS95=0,0;END=199440233;PE=61;SR=7;STRANDS=+-:68;SU=68;SVLEN=-1490;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:68:61:7
chr1	210078055	435	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=210085977;IMPRECISE;PE=14;SR=3;STRANDS=+-:17;SU=17;SVLEN=-7922;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:17:14:3
chr1	213002371	443	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-7,10;CIPOS95=-1,1;END=213013665;IMPRECISE;PE=26;SR=2;STRANDS=+-:28;SU=28;SVLEN=-11294;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:28:26:2
chr1	217691477	445	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,3835;CIEND95=0,2522;CIPOS=-3345,21;CIPOS95=-2578,11;END=217692066;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=589;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr1	218182502	448	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=218188594;PE=84;SR=9;STRANDS=+-:93;SU=93;SVLEN=-6092;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:93:84:9
chr1	229812537	330	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=229820836;IMPRECISE;PE=76;SR=3;STRANDS=+-:79;SU=79;SVLEN=-8299;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:79:76:3
chr1	236029478	487	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-9,673;CIEND95=-3,159;CIPOS=-444,10;CIPOS95=-255,3;END=236033333;IMPRECISE;PE=3;SR=3;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3855;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:3:3
chr1	236549103	333	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=236551329;PE=101;SR=6;STRANDS=+-:107;SU=107;SVLEN=-2226;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:107:101:6
chr1	237566103	335	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-7,8;CIEND95=-2,1;CIPOS=-2,3;CIPOS95=0,0;END=237566206;IMPRECISE;PE=11;SR=8;STRANDS=++:11,--:8;SU=19;SVLEN=103;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:19:11:8
chr1	243782745	504	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-9,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=-1,0;END=243783763;IMPRECISE;PE=3;SR=4;STRANDS=+-:7;SU=7;SVLEN=-1018;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:7:3:4
chr1	247850475	300	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-9,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=247856508;PE=73;SR=10;STRANDS=+-:83;SU=83;SVLEN=-6033;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:83:73:10
chr1	248051492	514	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,6;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=248057638;IMPRECISE;PE=81;SR=2;STRANDS=+-:83;SU=83;SVLEN=-6146;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:83:81:2
chr2	4781310	526	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;END=4787356;IMPRECISE;PE=104;SR=4;STRANDS=+-:108;SU=108;SVLEN=-6046;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:108:104:4
chr2	6400508	528	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=6402193;IMPRECISE;PE=15;SR=3;STRANDS=+-:18;SU=18;SVLEN=-1685;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:18:15:3
chr2	11930018	4652_1	N	N]CHR4:162053250]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-5,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4652;IMPRECISE;MATEID=4652_2;PE=3;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	11930018	4652_1	N	N]CHR4:162053250]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-5,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4652;IMPRECISE;MATEID=4652_2;PE=3;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	26923726	547	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,3064;CIEND95=0,1912;CIPOS=-2554,10;CIPOS95=-1805,0;END=26925090;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=1364;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	33141296	4574_2	N	]CHR1:121485422]N	.	PASS	CIEND=-10,1728;CIEND95=-1,758;CIPOS=-2500,8;CIPOS95=-1853,1;EVENT=4574;IMPRECISE;MATEID=4574_1;PE=87;SECONDARY;SR=4;STRANDS=-+:91;SU=91;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:91:87:4
chr2	33141296	4574_2	N	]CHR1:121485422]N	.	PASS	CIEND=-10,1728;CIEND95=-1,758;CIPOS=-2500,8;CIPOS95=-1853,1;EVENT=4574;IMPRECISE;MATEID=4574_1;PE=87;SECONDARY;SR=4;STRANDS=-+:91;SU=91;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:91:87:4
chr2	33141305	4667_1	N	[CHR7:126378773[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-1,4;CIPOS95=-1,4;EVENT=4667;IMPRECISE;MATEID=4667_2;PE=3;SR=2;STRANDS=--:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	33141305	4667_1	N	[CHR7:126378773[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-1,4;CIPOS95=-1,4;EVENT=4667;IMPRECISE;MATEID=4667_2;PE=3;SR=2;STRANDS=--:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	33141311	4560_2	N	]CHRM:13754]N	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,2;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;EVENT=4560;IMPRECISE;MATEID=4560_1;PE=4;SECONDARY;SR=6;STRANDS=-+:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:4:6
chr2	33141311	4560_2	N	]CHRM:13754]N	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,2;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;EVENT=4560;IMPRECISE;MATEID=4560_1;PE=4;SECONDARY;SR=6;STRANDS=-+:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:4:6
chr2	33224462	555	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,7;CIPOS95=0,0;END=33227292;PE=60;SR=4;STRANDS=+-:64;SU=64;SVLEN=-2830;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:64:60:4
chr2	34523656	568	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=34525719;PE=85;SR=4;STRANDS=+-:89;SU=89;SVLEN=-2063;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:89:85:4
chr2	40479958	580	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=40480063;PE=8;SR=4;STRANDS=++:10,--:2;SU=12;SVLEN=105;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:12:8:4
chr2	41973156	560	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-4,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,3;CIPOS95=0,0;END=41975865;PE=79;SR=7;STRANDS=+-:86;SU=86;SVLEN=-2709;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:86:79:7
chr2	54565493	589	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,6;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,6;CIPOS95=0,0;END=54567473;PE=7;SR=5;STRANDS=+-:12;SU=12;SVLEN=-1980;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:12:7:5
chr2	74545388	602	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,3391;CIEND95=0,2264;CIPOS=-2942,10;CIPOS95=-2234,0;END=74546385;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=997;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr2	74819340	621	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,5;END=74819466;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=++:2,--:3;SU=5;SVLEN=126;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	76526512	603	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=-1,1;END=76528893;IMPRECISE;PE=67;SR=3;STRANDS=+-:70;SU=70;SVLEN=-2381;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:70:67:3
chr2	89029246	605	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,6;CIPOS95=0,0;END=89032282;PE=83;SR=5;STRANDS=+-:88;SU=88;SVLEN=-3036;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:88:83:5
chr2	102162592	638	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,1;END=102165623;IMPRECISE;PE=5;SR=2;STRANDS=-+:7;SU=7;SVLEN=3031;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:7:5:2
chr2	108368855	647	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,3405;CIEND95=0,2217;CIPOS=-2798,15;CIPOS95=-2095,5;END=108369855;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=1000;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	113707388	655	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,7;CIPOS95=-1,0;END=113875314;IMPRECISE;PE=26;SR=2;STRANDS=-+:28;SU=28;SVLEN=167926;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:28:26:2
chr2	126443251	610	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=126451831;IMPRECISE;PE=81;SR=3;STRANDS=+-:84;SU=84;SVLEN=-8580;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:84:81:3
chr2	127674758	668	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;END=127677272;PE=70;SR=4;STRANDS=+-:74;SU=74;SVLEN=-2514;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:74:70:4
chr2	151265423	712	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=151268354;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=2931;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr2	153795990	717	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=153799743;IMPRECISE;PE=42;SR=2;STRANDS=+-:44;SU=44;SVLEN=-3753;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:44:42:2
chr2	154895771	723	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,7;CIPOS95=0,0;END=154899178;PE=49;SR=4;STRANDS=+-:53;SU=53;SVLEN=-3407;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:53:49:4
chr2	156231491	727	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2492;CIEND95=-1,1371;CIPOS=-2064,10;CIPOS95=-1368,1;END=156233281;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=1790;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	156833709	731	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,2;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=156835505;IMPRECISE;PE=55;SR=3;STRANDS=+-:58;SU=58;SVLEN=-1796;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:58:55:3
chr2	160149126	743	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,3;CIPOS95=0,0;END=160151648;PE=99;SR=7;STRANDS=+-:106;SU=106;SVLEN=-2522;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:106:99:7
chr2	162332271	745	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=162334041;IMPRECISE;PE=14;SR=2;STRANDS=+-:16;SU=16;SVLEN=-1770;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:16:14:2
chr2	163561912	746	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2196;CIEND95=-1,1155;CIPOS=-1644,10;CIPOS95=-1058,1;END=163564050;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2138;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	166014695	749	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=166016744;IMPRECISE;PE=37;SR=2;STRANDS=+-:39;SU=39;SVLEN=-2049;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:39:37:2
chr2	166307253	751	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,1;END=166310711;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3458;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	170301123	761	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=170304384;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3261;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr2	170641518	763	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,4;CIPOS95=0,0;END=170643951;PE=104;SR=6;STRANDS=+-:110;SU=110;SVLEN=-2433;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:110:104:6
chr2	172454302	678	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2454;CIEND95=-1,1375;CIPOS=-2075,11;CIPOS95=-1434,1;END=172456138;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=1836;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	173441618	775	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,5;CIPOS95=-5,1;END=173444840;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3222;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr2	176346682	777	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=176352721;IMPRECISE;PE=118;SR=3;STRANDS=+-:121;SU=121;SVLEN=-6039;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:121:118:3
chr2	177265645	781	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=-1,1;END=177272040;IMPRECISE;PE=64;SR=3;STRANDS=+-:67;SU=67;SVLEN=-6395;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:67:64:3
chr2	177373679	784_1	N	N]CHR2:177386668]	.	PASS	CIEND=-9,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;EVENT=784;MATEID=784_2;PE=6;SR=4;STRANDS=++:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:6:4
chr2	177373679	784_1	N	N]CHR2:177386668]	.	PASS	CIEND=-9,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;EVENT=784;MATEID=784_2;PE=6;SR=4;STRANDS=++:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:6:4
chr2	177386668	784_2	N	N]CHR2:177373679]	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;EVENT=784;MATEID=784_1;PE=6;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:6:4
chr2	177386668	784_2	N	N]CHR2:177373679]	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;EVENT=784;MATEID=784_1;PE=6;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:6:4
chr2	194689502	811	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=194698765;PE=34;SR=6;STRANDS=+-:40;SU=40;SVLEN=-9263;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:40:34:6
chr2	202146658	816	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,6;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=202149440;PE=24;SR=6;STRANDS=+-:30;SU=30;SVLEN=-2782;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:30:24:6
chr2	217089943	826	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,6;CIPOS95=0,0;END=217092498;PE=48;SR=5;STRANDS=+-:53;SU=53;SVLEN=-2555;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:53:48:5
chr2	223760191	831	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,4;CIEND95=-1,0;CIPOS=-7,9;CIPOS95=-1,1;END=223762671;IMPRECISE;PE=69;SR=3;STRANDS=+-:72;SU=72;SVLEN=-2480;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:72:69:3
chr3	2305514	844	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,5;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=2312433;IMPRECISE;PE=21;SR=2;STRANDS=+-:23;SU=23;SVLEN=-6919;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:23:21:2
chr3	2305530	846	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,3;CIPOS95=0,0;END=2312774;PE=15;SR=9;STRANDS=-+:24;SU=24;SVLEN=7244;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:24:15:9
chr3	4066937	854	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=4069555;PE=42;SR=10;STRANDS=+-:52;SU=52;SVLEN=-2618;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:52:42:10
chr3	8325639	867	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,6;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,6;CIPOS95=0,0;END=8326811;PE=4;SR=5;STRANDS=+-:9;SU=9;SVLEN=-1172;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:9:4:5
chr3	25030887	889	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=25032249;PE=39;SR=6;STRANDS=+-:45;SU=45;SVLEN=-1362;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:45:39:6
chr3	32102052	905	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,5;CIEND95=-1,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=-1,1;END=32107883;IMPRECISE;PE=79;SR=2;STRANDS=+-:81;SU=81;SVLEN=-5831;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:81:79:2
chr3	37337136	916	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=37340309;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3173;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr3	42838373	925	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=42840810;IMPRECISE;PE=99;SR=2;STRANDS=+-:101;SU=101;SVLEN=-2437;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:101:99:2
chr3	48228179	4722_1	N	N]CHR10:87849333]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4722;MATEID=4722_2;PE=46;SR=4;STRANDS=++:50;SU=50;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:50:46:4
chr3	48228179	4722_1	N	N]CHR10:87849333]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4722;MATEID=4722_2;PE=46;SR=4;STRANDS=++:50;SU=50;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:50:46:4
chr3	59743332	936	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=60075919;IMPRECISE;PE=33;SR=3;STRANDS=+-:36;SU=36;SVLEN=-332587;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:36:33:3
chr3	60482929	939	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,7;CIPOS95=0,0;END=60542511;PE=64;SR=4;STRANDS=-+:68;SU=68;SVLEN=59582;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:68:64:4
chr3	60548487	940	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=60583287;IMPRECISE;PE=36;SR=2;STRANDS=+-:38;SU=38;SVLEN=-34800;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:38:36:2
chr3	68634773	949	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=68640253;IMPRECISE;PE=45;SR=3;STRANDS=+-:48;SU=48;SVLEN=-5480;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:48:45:3
chr3	68739682	942	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-2,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=68747863;IMPRECISE;PE=67;SR=2;STRANDS=+-:69;SU=69;SVLEN=-8181;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:69:67:2
chr3	72993379	952	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=72996611;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3232;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr3	75276889	954	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=75278910;PE=14;SR=6;STRANDS=+-:20;SU=20;SVLEN=-2021;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:20:14:6
chr3	80062866	957	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=80065278;IMPRECISE;PE=10;SR=3;STRANDS=++:3,--:10;SU=13;SVLEN=2412;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:13:10:3
chr3	80925314	958	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,2;CIPOS95=0,0;END=80926604;PE=8;SR=11;STRANDS=+-:19;SU=19;SVLEN=-1290;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:19:8:11
chr3	83853128	943	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,5;CIPOS95=0,0;END=83855349;PE=60;SR=6;STRANDS=+-:66;SU=66;SVLEN=-2221;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:66:60:6
chr3	98899063	970	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,7;CIPOS95=0,0;END=98902389;PE=61;SR=4;STRANDS=+-:65;SU=65;SVLEN=-3326;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:65:61:4
chr3	111274086	4720_1	N	[CHR8:128533830[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=4720;IMPRECISE;MATEID=4720_2;PE=5;SR=3;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr3	111274086	4720_1	N	[CHR8:128533830[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=4720;IMPRECISE;MATEID=4720_2;PE=5;SR=3;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr3	123275266	984	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=123278778;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3512;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr3	130347573	986	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,9;CIPOS95=-1,4;END=130353108;IMPRECISE;PE=59;SR=2;STRANDS=+-:61;SU=61;SVLEN=-5535;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:61:59:2
chr3	131989125	998	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,7;CIPOS95=0,0;END=131995050;PE=46;SR=4;STRANDS=+-:50;SU=50;SVLEN=-5925;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:50:46:4
chr3	134299269	4715_1	N	N]CHR6:36913755]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,4;CIPOS95=0,0;EVENT=4715;MATEID=4715_2;PE=10;SR=6;STRANDS=++:16;SU=16;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:16:10:6
chr3	134299269	4715_1	N	N]CHR6:36913755]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,4;CIPOS95=0,0;EVENT=4715;MATEID=4715_2;PE=10;SR=6;STRANDS=++:16;SU=16;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:16:10:6
chr3	136021013	999	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;END=136026199;IMPRECISE;PE=53;SR=2;STRANDS=+-:55;SU=55;SVLEN=-5186;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:55:53:2
chr3	137072366	1000	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=137073446;PE=4;SR=7;STRANDS=+-:11;SU=11;SVLEN=-1080;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:11:4:7
chr3	146390404	1012	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-8,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=146395165;IMPRECISE;PE=13;SR=3;STRANDS=-+:16;SU=16;SVLEN=4761;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:16:13:3
chr3	148281440	1013	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,7;CIEND95=0,1;CIPOS=-5,3;CIPOS95=-1,0;END=148285419;IMPRECISE;PE=55;SR=5;STRANDS=+-:60;SU=60;SVLEN=-3979;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:60:55:5
chr3	152311738	1015	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=152313155;IMPRECISE;PE=19;SR=2;STRANDS=+-:21;SU=21;SVLEN=-1417;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:21:19:2
chr3	160363843	1028	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,7;CIPOS95=-1,0;END=160700716;IMPRECISE;PE=19;SR=2;STRANDS=-+:21;SU=21;SVLEN=336873;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:21:19:2
chr3	162525742	1031_1	N	N]CHR3:162547643]	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1031;IMPRECISE;MATEID=1031_2;PE=52;SR=2;STRANDS=++:54;SU=54;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:54:52:2
chr3	162525742	1031_1	N	N]CHR3:162547643]	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1031;IMPRECISE;MATEID=1031_2;PE=52;SR=2;STRANDS=++:54;SU=54;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:54:52:2
chr3	162547643	1031_2	N	N]CHR3:162525742]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1031;IMPRECISE;MATEID=1031_1;PE=52;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:54;SU=54;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:54:52:2
chr3	162547643	1031_2	N	N]CHR3:162525742]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1031;IMPRECISE;MATEID=1031_1;PE=52;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:54;SU=54;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:54:52:2
chr3	163919285	4723_1	N	N[CHR10:36760446[	.	PASS	CIEND=-8,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,5;CIPOS95=0,0;EVENT=4723;MATEID=4723_2;PE=19;SR=5;STRANDS=+-:24;SU=24;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:24:19:5
chr3	163919285	4723_1	N	N[CHR10:36760446[	.	PASS	CIEND=-8,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,5;CIPOS95=0,0;EVENT=4723;MATEID=4723_2;PE=19;SR=5;STRANDS=+-:24;SU=24;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:24:19:5
chr3	172330928	1043	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2224;CIEND95=-1,1172;CIPOS=-1828,10;CIPOS95=-1167,1;END=172332981;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2053;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr3	174249216	1046	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=174255562;PE=43;SR=4;STRANDS=+-:47;SU=47;SVLEN=-6346;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:47:43:4
chr3	186581033	1059	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;END=186585284;PE=86;SR=5;STRANDS=+-:91;SU=91;SVLEN=-4251;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:91:86:5
chr3	189737348	1062	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;END=189740524;PE=70;SR=4;STRANDS=+-:74;SU=74;SVLEN=-3176;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:74:70:4
chr3	191064685	993	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=191071667;IMPRECISE;PE=86;SR=3;STRANDS=+-:89;SU=89;SVLEN=-6982;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:89:86:3
chr3	192875332	1065	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=192885405;PE=33;SR=4;STRANDS=+-:37;SU=37;SVLEN=-10073;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:37:33:4
chr4	7995809	1086	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,5;CIPOS95=0,0;END=7996893;PE=2;SR=6;STRANDS=+-:8;SU=8;SVLEN=-1084;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:8:2:6
chr4	10392430	1088	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,6;CIPOS95=0,0;END=10402181;PE=37;SR=5;STRANDS=+-:42;SU=42;SVLEN=-9751;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:42:37:5
chr4	19079465	1101	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-9,10;CIPOS95=-1,1;END=19085550;IMPRECISE;PE=35;SR=2;STRANDS=+-:37;SU=37;SVLEN=-6085;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:37:35:2
chr4	22360528	1104	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=22362558;IMPRECISE;PE=46;SR=2;STRANDS=+-:48;SU=48;SVLEN=-2030;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:48:46:2
chr4	26290469	1098	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-7,9;CIPOS95=-1,1;END=26295385;IMPRECISE;PE=37;SR=3;STRANDS=+-:40;SU=40;SVLEN=-4916;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:40:37:3
chr4	33092344	1111	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=33096787;IMPRECISE;PE=20;SR=2;STRANDS=-+:22;SU=22;SVLEN=4443;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:22:20:2
chr4	34345622	1120	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=34347687;IMPRECISE;PE=56;SR=2;STRANDS=+-:58;SU=58;SVLEN=-2065;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:58:56:2
chr4	46056004	1135	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,5;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=46058195;IMPRECISE;PE=42;SR=2;STRANDS=+-:44;SU=44;SVLEN=-2191;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:44:42:2
chr4	46202797	1112	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=46205026;IMPRECISE;PE=50;SR=3;STRANDS=+-:53;SU=53;SVLEN=-2229;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:53:50:3
chr4	55036120	4767_1	N	[CHR14:78559026[N	.	PASS	CIEND=-10,6;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4767;IMPRECISE;MATEID=4767_2;PE=2;SR=3;STRANDS=--:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr4	55036120	4767_1	N	[CHR14:78559026[N	.	PASS	CIEND=-10,6;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4767;IMPRECISE;MATEID=4767_2;PE=2;SR=3;STRANDS=--:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr4	59439926	1114	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,8;CIPOS95=-1,0;END=59540659;IMPRECISE;PE=31;SR=3;STRANDS=-+:34;SU=34;SVLEN=100733;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:34:31:3
chr4	61939191	1152	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=61942243;PE=79;SR=7;STRANDS=+-:86;SU=86;SVLEN=-3052;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:86:79:7
chr4	64694328	1175	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,5;CIPOS95=0,0;END=64714382;PE=41;SR=5;STRANDS=+-:46;SU=46;SVLEN=-20054;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:46:41:5
chr4	71194624	1185	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=71200088;IMPRECISE;PE=67;SR=2;STRANDS=+-:69;SU=69;SVLEN=-5464;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:69:67:2
chr4	72550775	1187	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,7;CIPOS95=-1,1;END=72550900;IMPRECISE;PE=8;SR=2;STRANDS=++:3,--:7;SU=10;SVLEN=125;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:10:8:2
chr4	79269134	1190	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=79275195;PE=85;SR=6;STRANDS=+-:91;SU=91;SVLEN=-6061;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:91:85:6
chr4	80121309	1192	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,1;END=80124796;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3487;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr4	80888062	1194	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=80894091;IMPRECISE;PE=28;SR=2;STRANDS=+-:30;SU=30;SVLEN=-6029;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:30:28:2
chr4	86976377	1200	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=86979951;IMPRECISE;PE=60;SR=2;STRANDS=+-:62;SU=62;SVLEN=-3574;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:62:60:2
chr4	87561946	1201	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,1;END=87564894;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2948;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr4	88483900	1203	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,6;CIPOS95=-1,0;END=88486312;IMPRECISE;PE=90;SR=4;STRANDS=+-:94;SU=94;SVLEN=-2412;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:94:90:4
chr4	91596798	1165	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=91602908;PE=110;SR=4;STRANDS=+-:114;SU=114;SVLEN=-6110;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:114:110:4
chr4	91933591	1208_1	N	[CHR4:91936102[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=1208;MATEID=1208_2;PE=3;SR=5;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:3:5
chr4	91933591	1208_1	N	[CHR4:91936102[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=1208;MATEID=1208_2;PE=3;SR=5;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:3:5
chr4	91936102	1208_2	N	[CHR4:91933591[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=1208;MATEID=1208_1;PE=3;SECONDARY;SR=5;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:3:5
chr4	91936102	1208_2	N	[CHR4:91933591[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=1208;MATEID=1208_1;PE=3;SECONDARY;SR=5;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:3:5
chr4	95518746	4753_1	N	N[CHR7:46904659[	.	PASS	CIEND=-9,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;EVENT=4753;MATEID=4753_2;PE=2;SR=4;STRANDS=+-:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr4	95518746	4753_1	N	N[CHR7:46904659[	.	PASS	CIEND=-9,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;EVENT=4753;MATEID=4753_2;PE=2;SR=4;STRANDS=+-:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr4	108127828	1228	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;END=108131714;PE=66;SR=4;STRANDS=+-:70;SU=70;SVLEN=-3886;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:70:66:4
chr4	108276701	1229	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=108279504;IMPRECISE;PE=28;SR=2;STRANDS=+-:30;SU=30;SVLEN=-2803;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:30:28:2
chr4	124877536	1243	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,5;CIPOS95=-5,1;END=124880787;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3251;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr4	135433002	1270	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;END=135435701;IMPRECISE;PE=32;SR=2;STRANDS=+-:34;SU=34;SVLEN=-2699;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:34:32:2
chr4	146438813	1251	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=146440450;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=+-:6;SU=6;SVLEN=-1637;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr4	149990582	1284	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,4;CIPOS95=0,0;END=149992577;PE=46;SR=6;STRANDS=+-:52;SU=52;SVLEN=-1995;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:52:46:6
chr4	150789806	4769_1	N	]CHR14:96048906]N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,6;CIPOS95=-1,0;EVENT=4769;IMPRECISE;MATEID=4769_2;PE=2;SR=3;STRANDS=-+:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr4	150789806	4769_1	N	]CHR14:96048906]N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,6;CIPOS95=-1,0;EVENT=4769;IMPRECISE;MATEID=4769_2;PE=2;SR=3;STRANDS=-+:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr4	160491340	1302	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=163616700;IMPRECISE;PE=62;SR=3;STRANDS=+-:65;SU=65;SVLEN=-3125360;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:65:62:3
chr4	162053250	4652_2	N	N]CHR2:11930018]	.	PASS	CIEND=-5,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4652;IMPRECISE;MATEID=4652_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr4	162053250	4652_2	N	N]CHR2:11930018]	.	PASS	CIEND=-5,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4652;IMPRECISE;MATEID=4652_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr4	172374403	1311	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,6;CIEND95=-1,0;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;END=172379425;IMPRECISE;PE=60;SR=3;STRANDS=+-:63;SU=63;SVLEN=-5022;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:63:60:3
chr4	172988639	1312	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=172992931;IMPRECISE;PE=28;SR=3;STRANDS=+-:31;SU=31;SVLEN=-4292;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:31:28:3
chr4	181876802	1257	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-4,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=181878288;PE=48;SR=8;STRANDS=+-:56;SU=56;SVLEN=-1486;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:56:48:8
chr4	186441637	1331	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,6;CIPOS95=0,0;END=186444073;PE=96;SR=4;STRANDS=+-:100;SU=100;SVLEN=-2436;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:100:96:4
chr4	190191603	1342	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=190200462;IMPRECISE;PE=56;SR=2;STRANDS=+-:58;SU=58;SVLEN=-8859;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:58:56:2
chr4	190585813	1258	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-4,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=190613116;PE=227;SR=8;STRANDS=++:123,--:112;SU=235;SVLEN=27303;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:235:227:8
chr5	6992594	1365	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,1309;CIEND95=-2,479;CIPOS=-955,10;CIPOS95=-474,2;END=6995617;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3023;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr5	7960007	1366	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,1879;CIEND95=-1,894;CIPOS=-1630,10;CIPOS95=-1003,1;END=7962524;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2517;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr5	12811019	1385	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=12820523;IMPRECISE;PE=53;SR=3;STRANDS=+-:56;SU=56;SVLEN=-9504;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:56:53:3
chr5	13416607	1386	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=13422853;IMPRECISE;PE=39;SR=2;STRANDS=+-:41;SU=41;SVLEN=-6246;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:41:39:2
chr5	15719465	1387	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=15720950;IMPRECISE;PE=29;SR=2;STRANDS=+-:31;SU=31;SVLEN=-1485;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:31:29:2
chr5	18873312	1389	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;END=18874847;PE=33;SR=4;STRANDS=+-:37;SU=37;SVLEN=-1535;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:37:33:4
chr5	19375269	1399	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;END=19376396;PE=3;SR=4;STRANDS=+-:7;SU=7;SVLEN=-1127;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:7:3:4
chr5	21573432	4778_1	N	N]CHR6:57575919]	.	PASS	CIEND=-6,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;EVENT=4778;MATEID=4778_2;PE=53;SR=4;STRANDS=++:57;SU=57;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:57:53:4
chr5	21573432	4778_1	N	N]CHR6:57575919]	.	PASS	CIEND=-6,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;EVENT=4778;MATEID=4778_2;PE=53;SR=4;STRANDS=++:57;SU=57;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:57:53:4
chr5	22405362	1407	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,4;CIPOS95=-1,0;END=22450658;IMPRECISE;PE=68;SR=3;STRANDS=-+:71;SU=71;SVLEN=45296;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:71:68:3
chr5	24370542	1412	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,3;CIPOS95=0,0;END=24373436;PE=79;SR=8;STRANDS=+-:87;SU=87;SVLEN=-2894;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:87:79:8
chr5	25945711	1416	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=0,0;CIEND95=0,1;CIPOS=-8,5;CIPOS95=-1,0;END=25954140;IMPRECISE;PE=49;SR=3;STRANDS=-+:52;SU=52;SVLEN=8429;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:52:49:3
chr5	26796701	1418	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=26801896;PE=90;SR=6;STRANDS=+-:96;SU=96;SVLEN=-5195;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:96:90:6
chr5	28932651	1423	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=28935059;IMPRECISE;PE=11;SR=2;STRANDS=++:2,--:11;SU=13;SVLEN=2408;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:13:11:2
chr5	30863844	1392	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=30865675;IMPRECISE;PE=4;SR=3;STRANDS=-+:7;SU=7;SVLEN=1831;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:7:4:3
chr5	32338583	4566_2	N	N[CHRM:14832[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4566;IMPRECISE;MATEID=4566_1;PE=6;SECONDARY;SR=3;STRANDS=+-:9;SU=9;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:9:6:3
chr5	32338583	4566_2	N	N[CHRM:14832[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4566;IMPRECISE;MATEID=4566_1;PE=6;SECONDARY;SR=3;STRANDS=+-:9;SU=9;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:9:6:3
chr5	38230417	1448	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=38233663;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3246;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr5	42165941	1455	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,7;CIPOS95=0,0;END=42167769;PE=128;SR=9;STRANDS=+-:137;SU=137;SVLEN=-1828;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:137:128:9
chr5	53460924	1435	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=53561892;IMPRECISE;PE=29;SR=2;STRANDS=+-:31;SU=31;SVLEN=-100968;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:31:29:2
chr5	53643052	1463	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2635;CIEND95=0,1452;CIPOS=-2186,11;CIPOS95=-1474,2;END=53644738;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=1686;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr5	57680001	1468	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=57686095;IMPRECISE;PE=28;SR=2;STRANDS=+-:30;SU=30;SVLEN=-6094;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:30:28:2
chr5	60001709	1471	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,4;CIPOS95=0,0;END=60003665;PE=72;SR=6;STRANDS=+-:78;SU=78;SVLEN=-1956;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:78:72:6
chr5	79733976	1497_1	N	N]CHR5:79737774]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1497;IMPRECISE;MATEID=1497_2;PE=4;SR=2;STRANDS=++:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr5	79733976	1497_1	N	N]CHR5:79737774]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1497;IMPRECISE;MATEID=1497_2;PE=4;SR=2;STRANDS=++:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr5	79737774	1497_2	N	N]CHR5:79733976]	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1497;IMPRECISE;MATEID=1497_1;PE=4;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr5	79737774	1497_2	N	N]CHR5:79733976]	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1497;IMPRECISE;MATEID=1497_1;PE=4;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr5	89896157	1482	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-5,10;CIEND95=-1,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=89899238;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3081;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr5	90499775	1513	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-4,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,2;CIPOS95=0,0;END=90502095;PE=72;SR=8;STRANDS=+-:80;SU=80;SVLEN=-2320;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:80:72:8
chr5	97721405	1518	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=97724311;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2906;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr5	103854288	1484	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,2;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=103860326;IMPRECISE;PE=99;SR=5;STRANDS=+-:104;SU=104;SVLEN=-6038;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:104:99:5
chr5	106092579	1485_1	N	[CHR5:106102995[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1485;IMPRECISE;MATEID=1485_2;PE=36;SR=3;STRANDS=--:39;SU=39;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:39:36:3
chr5	106092579	1485_1	N	[CHR5:106102995[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1485;IMPRECISE;MATEID=1485_2;PE=36;SR=3;STRANDS=--:39;SU=39;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:39:36:3
chr5	106102995	1485_2	N	[CHR5:106092579[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=1485;IMPRECISE;MATEID=1485_1;PE=36;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:39;SU=39;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:39:36:3
chr5	106102995	1485_2	N	[CHR5:106092579[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=1485;IMPRECISE;MATEID=1485_1;PE=36;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:39;SU=39;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:39:36:3
chr5	106324751	1533	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=106326443;IMPRECISE;PE=61;SR=2;STRANDS=+-:63;SU=63;SVLEN=-1692;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:63:61:2
chr5	108595089	1537	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,6;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=108601121;IMPRECISE;PE=67;SR=2;STRANDS=+-:69;SU=69;SVLEN=-6032;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:69:67:2
chr5	114756515	1545	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=114757889;IMPRECISE;PE=31;SR=3;STRANDS=+-:34;SU=34;SVLEN=-1374;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:34:31:3
chr5	115346739	1546_1	N	[CHR5:115350905[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1546;IMPRECISE;MATEID=1546_2;PE=3;SR=3;STRANDS=--:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:3:3
chr5	115346739	1546_1	N	[CHR5:115350905[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1546;IMPRECISE;MATEID=1546_2;PE=3;SR=3;STRANDS=--:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:3:3
chr5	115350905	1546_2	N	[CHR5:115346739[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=1546;IMPRECISE;MATEID=1546_1;PE=3;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:3:3
chr5	115350905	1546_2	N	[CHR5:115346739[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=1546;IMPRECISE;MATEID=1546_1;PE=3;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:3:3
chr5	119380146	1550	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,4;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=119382680;IMPRECISE;PE=84;SR=3;STRANDS=+-:87;SU=87;SVLEN=-2534;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:87:84:3
chr5	121576131	1554	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;END=121580808;PE=47;SR=4;STRANDS=+-:51;SU=51;SVLEN=-4677;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:51:47:4
chr5	137022578	1582	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=0,7;CIEND95=0,3;CIPOS=-9,4;CIPOS95=-3,1;END=137023889;IMPRECISE;PE=6;SR=3;STRANDS=+-:9;SU=9;SVLEN=-1311;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:9:6:3
chr5	147553039	1588_1	N	N]CHR5:147554606]	.	PASS	CIEND=-4,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;EVENT=1588;MATEID=1588_2;PE=10;SR=6;STRANDS=++:16;SU=16;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:16:10:6
chr5	147553039	1588_1	N	N]CHR5:147554606]	.	PASS	CIEND=-4,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;EVENT=1588;MATEID=1588_2;PE=10;SR=6;STRANDS=++:16;SU=16;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:16:10:6
chr5	147554606	1588_2	N	N]CHR5:147553039]	.	PASS	CIEND=-6,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,4;CIPOS95=0,0;EVENT=1588;MATEID=1588_1;PE=10;SECONDARY;SR=6;STRANDS=++:16;SU=16;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:16:10:6
chr5	147554606	1588_2	N	N]CHR5:147553039]	.	PASS	CIEND=-6,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,4;CIPOS95=0,0;EVENT=1588;MATEID=1588_1;PE=10;SECONDARY;SR=6;STRANDS=++:16;SU=16;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:16:10:6
chr5	151510753	1592	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=151514696;PE=6;SR=4;STRANDS=-+:10;SU=10;SVLEN=3943;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:10:6:4
chr5	155418879	1593	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=155421811;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2932;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr5	156421851	1596	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=156426959;IMPRECISE;PE=20;SR=2;STRANDS=+-:22;SU=22;SVLEN=-5108;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:22:20:2
chr5	163469885	1599	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2122;CIEND95=-1,1094;CIPOS=-1621,10;CIPOS95=-995,1;END=163472198;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2313;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr6	12413391	1649	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2358;CIEND95=-1,1293;CIPOS=-2103,11;CIPOS95=-1403,2;END=12415296;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=1905;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr6	13825117	1640	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,1764;CIEND95=-1,801;CIPOS=-1442,10;CIPOS95=-850,1;END=13827670;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2553;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr6	14839472	1652	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,5;CIPOS95=0,0;END=14842000;PE=40;SR=5;STRANDS=+-:45;SU=45;SVLEN=-2528;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:45:40:5
chr6	16774472	1721_1	N	N]CHR6:51735713]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-7,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1721;IMPRECISE;MATEID=1721_2;PE=26;SR=3;STRANDS=++:29;SU=29;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:29:26:3
chr6	16774472	1721_1	N	N]CHR6:51735713]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-7,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1721;IMPRECISE;MATEID=1721_2;PE=26;SR=3;STRANDS=++:29;SU=29;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:29:26:3
chr6	18314719	1654	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=18317796;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3077;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr6	24683988	4821_1	N	]CHR22:32928560]N	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4821;MATEID=4821_2;PE=14;SR=6;STRANDS=-+:20;SU=20;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:20:14:6
chr6	24683988	4821_1	N	]CHR22:32928560]N	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4821;MATEID=4821_2;PE=14;SR=6;STRANDS=-+:20;SU=20;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:20:14:6
chr6	24811887	1674	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=24817950;PE=90;SR=6;STRANDS=+-:96;SU=96;SVLEN=-6063;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:96:90:6
chr6	35626434	1701	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-3,1;CIEND95=0,0;CIPOS=-3,2;CIPOS95=0,0;END=35629744;PE=108;SR=9;STRANDS=+-:117;SU=117;SVLEN=-3310;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:117:108:9
chr6	35754560	1688	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,3;CIPOS95=0,0;END=35766788;PE=60;SR=6;STRANDS=-+:66;SU=66;SVLEN=12228;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:66:60:6
chr6	36913755	4715_2	N	N]CHR3:134299269]	.	PASS	CIEND=-4,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4715;MATEID=4715_1;PE=10;SECONDARY;SR=6;STRANDS=++:16;SU=16;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:16:10:6
chr6	36913755	4715_2	N	N]CHR3:134299269]	.	PASS	CIEND=-4,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4715;MATEID=4715_1;PE=10;SECONDARY;SR=6;STRANDS=++:16;SU=16;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:16:10:6
chr6	38107296	4810_1	N	[CHR16:78260008[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4810;IMPRECISE;MATEID=4810_2;PE=26;SR=2;STRANDS=--:28;SU=28;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:28:26:2
chr6	38107296	4810_1	N	[CHR16:78260008[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4810;IMPRECISE;MATEID=4810_2;PE=26;SR=2;STRANDS=--:28;SU=28;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:28:26:2
chr6	44558094	1685	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=44564331;IMPRECISE;PE=16;SR=2;STRANDS=+-:18;SU=18;SVLEN=-6237;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:18:16:2
chr6	47564730	1714	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;END=47566910;PE=43;SR=4;STRANDS=+-:47;SU=47;SVLEN=-2180;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:47:43:4
chr6	51735713	1721_2	N	N]CHR6:16774472]	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=1721;IMPRECISE;MATEID=1721_1;PE=26;SECONDARY;SR=3;STRANDS=++:29;SU=29;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:29:26:3
chr6	51735713	1721_2	N	N]CHR6:16774472]	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=1721;IMPRECISE;MATEID=1721_1;PE=26;SECONDARY;SR=3;STRANDS=++:29;SU=29;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:29:26:3
chr6	55825957	1725	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;END=55846712;PE=62;SR=4;STRANDS=+-:66;SU=66;SVLEN=-20755;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:66:62:4
chr6	57284911	1728	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;END=57289356;IMPRECISE;PE=64;SR=2;STRANDS=+-:66;SU=66;SVLEN=-4445;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:66:64:2
chr6	57297190	1729	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=57301246;IMPRECISE;PE=86;SR=3;STRANDS=+-:89;SU=89;SVLEN=-4056;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:89:86:3
chr6	57423086	1731	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-2,0;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=57429120;PE=133;SR=18;STRANDS=+-:151;SU=151;SVLEN=-6034;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:151:133:18
chr6	57575919	4778_2	N	N]CHR5:21573432]	.	PASS	CIEND=-9,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;EVENT=4778;MATEID=4778_1;PE=53;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:57;SU=57;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:57:53:4
chr6	57575919	4778_2	N	N]CHR5:21573432]	.	PASS	CIEND=-9,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;EVENT=4778;MATEID=4778_1;PE=53;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:57;SU=57;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:57:53:4
chr6	57583689	1695	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;END=57590265;IMPRECISE;PE=27;SR=2;STRANDS=+-:29;SU=29;SVLEN=-6576;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:29:27:2
chr6	66260039	1749	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;END=66262021;PE=58;SR=4;STRANDS=+-:62;SU=62;SVLEN=-1982;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:62:58:4
chr6	67492486	1751	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-9,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=67492725;PE=4;SR=4;STRANDS=++:1,--:7;SU=8;SVLEN=239;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr6	69500145	1754	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=69535729;IMPRECISE;PE=17;SR=2;STRANDS=-+:19;SU=19;SVLEN=35584;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:19:17:2
chr6	74865448	1759	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-3,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=74866584;PE=7;SR=9;STRANDS=+-:16;SU=16;SVLEN=-1136;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:16:7:9
chr6	77097496	1736	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,7;CIPOS95=0,0;END=77102641;PE=87;SR=4;STRANDS=+-:91;SU=91;SVLEN=-5145;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:91:87:4
chr6	85318158	1764	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=85324220;PE=64;SR=5;STRANDS=+-:69;SU=69;SVLEN=-6062;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:69:64:5
chr6	88217546	4818_1	N	N]CHR20:52021643]	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;EVENT=4818;MATEID=4818_2;PE=4;SR=4;STRANDS=++:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr6	88217546	4818_1	N	N]CHR20:52021643]	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;EVENT=4818;MATEID=4818_2;PE=4;SR=4;STRANDS=++:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr6	88217551	4817_1	N	[CHR20:52021438[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4817;IMPRECISE;MATEID=4817_2;PE=5;SR=3;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr6	88217551	4817_1	N	[CHR20:52021438[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4817;IMPRECISE;MATEID=4817_2;PE=5;SR=3;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr6	89923634	1771	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,6;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,2;CIPOS95=0,0;END=89923949;PE=17;SR=8;STRANDS=++:13,--:12;SU=25;SVLEN=315;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:25:17:8
chr6	94741074	1776_1	N	N]CHR6:94741417]	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;EVENT=1776;IMPRECISE;MATEID=1776_2;PE=6;SR=2;STRANDS=++:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:6:2
chr6	94741074	1776_1	N	N]CHR6:94741417]	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;EVENT=1776;IMPRECISE;MATEID=1776_2;PE=6;SR=2;STRANDS=++:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:6:2
chr6	94741417	1776_2	N	N]CHR6:94741074]	.	PASS	CIEND=0,0;CIEND95=0,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1776;IMPRECISE;MATEID=1776_1;PE=6;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:6:2
chr6	94741417	1776_2	N	N]CHR6:94741074]	.	PASS	CIEND=0,0;CIEND95=0,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=1776;IMPRECISE;MATEID=1776_1;PE=6;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:6:2
chr6	103249833	1741	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;END=103250555;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=++:2,--:3;SU=5;SVLEN=722;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr6	108031342	1791	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;END=108032402;PE=4;SR=4;STRANDS=+-:8;SU=8;SVLEN=-1060;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr6	110476741	1793	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=-2,0;END=110479767;IMPRECISE;PE=68;SR=3;STRANDS=+-:71;SU=71;SVLEN=-3026;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:71:68:3
chr6	119961115	1743	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,3580;CIEND95=0,2349;CIPOS=-3051,16;CIPOS95=-2307,6;END=119961854;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=739;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr6	133341834	1836	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=133347885;IMPRECISE;PE=30;SR=2;STRANDS=+-:32;SU=32;SVLEN=-6051;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:32:30:2
chr6	141548624	1852	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,1;CIPOS95=0,0;END=141550030;PE=9;SR=13;STRANDS=+-:22;SU=22;SVLEN=-1406;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:22:9:13
chr6	143869379	1854	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=143872447;IMPRECISE;PE=18;SR=3;STRANDS=+-:21;SU=21;SVLEN=-3068;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:21:18:3
chr6	153029990	1867	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=153033789;PE=157;SR=6;STRANDS=+-:163;SU=163;SVLEN=-3799;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:163:157:6
chr6	164543447	1895	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=164547190;IMPRECISE;PE=103;SR=3;STRANDS=+-:106;SU=106;SVLEN=-3743;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:106:103:3
chr7	8826500	1926	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=8866251;PE=62;SR=4;STRANDS=+-:66;SU=66;SVLEN=-39751;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:66:62:4
chr7	22804808	1944	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,6;CIEND95=-2,2;CIPOS=-10,8;CIPOS95=-3,1;END=22807599;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2791;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	24038165	1948	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=24040070;IMPRECISE;PE=15;SR=3;STRANDS=+-:18;SU=18;SVLEN=-1905;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:18:15:3
chr7	25057461	1951	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,6;CIPOS95=0,0;END=25059853;PE=47;SR=5;STRANDS=+-:52;SU=52;SVLEN=-2392;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:52:47:5
chr7	38873683	1965	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=38877087;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3404;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	43601177	1975	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,1;END=43604417;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3240;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	46904659	4753_2	N	]CHR4:95518746]N	.	PASS	CIEND=-6,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4753;MATEID=4753_1;PE=2;SECONDARY;SR=4;STRANDS=-+:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr7	46904659	4753_2	N	]CHR4:95518746]N	.	PASS	CIEND=-6,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4753;MATEID=4753_1;PE=2;SECONDARY;SR=4;STRANDS=-+:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr7	52730070	1982	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,10;CIPOS95=0,1;END=52745255;IMPRECISE;PE=38;SR=4;STRANDS=-+:42;SU=42;SVLEN=15185;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:42:38:4
chr7	53338692	1984	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=53342438;IMPRECISE;PE=12;SR=2;STRANDS=+-:14;SU=14;SVLEN=-3746;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:14:12:2
chr7	61891240	4850_1	N	[CHR16:32543549[N	.	PASS	CIEND=-8,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4850;IMPRECISE;MATEID=4850_2;PE=3;SR=4;STRANDS=--:7;SU=7;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:7:3:4
chr7	61891240	4850_1	N	[CHR16:32543549[N	.	PASS	CIEND=-8,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4850;IMPRECISE;MATEID=4850_2;PE=3;SR=4;STRANDS=--:7;SU=7;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:7:3:4
chr7	61967539	2030	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-2,439;CIEND95=0,90;CIPOS=-82,10;CIPOS95=-31,3;END=61970512;IMPRECISE;PE=10381;SR=2;STRANDS=-+:10383;SU=10383;SVLEN=2973;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:10383:10381:2
chr7	61970847	4831_1	N	N]CHR10:42532607]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;EVENT=4831;IMPRECISE;MATEID=4831_2;PE=3;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	61970847	4831_1	N	N]CHR10:42532607]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;EVENT=4831;IMPRECISE;MATEID=4831_2;PE=3;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	64315824	2056	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;END=64318058;PE=91;SR=5;STRANDS=+-:96;SU=96;SVLEN=-2234;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:96:91:5
chr7	70420969	2062_1	N	N]CHR7:70438887]	.	PASS	CIEND=-9,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;EVENT=2062;MATEID=2062_2;PE=44;SR=4;STRANDS=++:48;SU=48;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:48:44:4
chr7	70420969	2062_1	N	N]CHR7:70438887]	.	PASS	CIEND=-9,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;EVENT=2062;MATEID=2062_2;PE=44;SR=4;STRANDS=++:48;SU=48;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:48:44:4
chr7	70426185	2063_1	N	[CHR7:70438880[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=2063;IMPRECISE;MATEID=2063_2;PE=30;SR=2;STRANDS=--:32;SU=32;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:32:30:2
chr7	70426185	2063_1	N	[CHR7:70438880[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=2063;IMPRECISE;MATEID=2063_2;PE=30;SR=2;STRANDS=--:32;SU=32;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:32:30:2
chr7	70438880	2063_2	N	[CHR7:70426185[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=2063;IMPRECISE;MATEID=2063_1;PE=30;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:32;SU=32;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:32:30:2
chr7	70438880	2063_2	N	[CHR7:70426185[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=2063;IMPRECISE;MATEID=2063_1;PE=30;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:32;SU=32;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:32:30:2
chr7	70438887	2062_2	N	N]CHR7:70420969]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;EVENT=2062;MATEID=2062_1;PE=44;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:48;SU=48;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:48:44:4
chr7	70438887	2062_2	N	N]CHR7:70420969]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;EVENT=2062;MATEID=2062_1;PE=44;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:48;SU=48;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:48:44:4
chr7	70881491	2066	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=70883995;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=2504;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr7	71317285	2068	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=71320279;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2994;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	82379692	2086	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,1274;CIEND95=-2,430;CIPOS=-1052,10;CIPOS95=-545,2;END=82382741;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3049;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	96475901	2110	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=96481994;IMPRECISE;PE=100;SR=3;STRANDS=+-:103;SU=103;SVLEN=-6093;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:103:100:3
chr7	97866398	2113	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=97913327;PE=22;SR=7;STRANDS=+-:29;SU=29;SVLEN=-46929;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:29:22:7
chr7	104632266	2130	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2847;CIEND95=0,1717;CIPOS=-1880,10;CIPOS95=-1275,0;END=104633937;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=1671;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr7	107829249	4838_1	N	]CHR11:85211624]N	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4838;MATEID=4838_2;PE=4;SR=4;STRANDS=-+:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr7	107829249	4838_1	N	]CHR11:85211624]N	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4838;MATEID=4838_2;PE=4;SR=4;STRANDS=-+:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr7	111116906	2149	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=111413350;PE=51;SR=7;STRANDS=-+:58;SU=58;SVLEN=296444;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:58:51:7
chr7	113416176	2152	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-2,1;CIPOS95=0,0;END=113422207;PE=138;SR=14;STRANDS=+-:152;SU=152;SVLEN=-6031;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:152:138:14
chr7	119119998	2166	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,1;END=119123173;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3175;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	119439146	2168	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;END=119445070;IMPRECISE;PE=21;SR=2;STRANDS=-+:23;SU=23;SVLEN=5924;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:23:21:2
chr7	119440343	2170	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=119448499;IMPRECISE;PE=9;SR=2;STRANDS=+-:11;SU=11;SVLEN=-8156;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:11:9:2
chr7	122611304	2176	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=122614575;IMPRECISE;PE=5;SR=2;STRANDS=-+:7;SU=7;SVLEN=3271;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:7:5:2
chr7	125028668	2179	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,1;END=125032015;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3347;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	126378773	4667_2	N	[CHR2:33141305[N	.	PASS	CIEND=-1,4;CIEND95=-1,4;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4667;IMPRECISE;MATEID=4667_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	126378773	4667_2	N	[CHR2:33141305[N	.	PASS	CIEND=-1,4;CIEND95=-1,4;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4667;IMPRECISE;MATEID=4667_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	128816330	2202	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,1;END=128819250;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2920;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	136584419	2215	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=136587358;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2939;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	144974663	2236	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=144977713;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3050;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr7	148072866	2249	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,5;CIPOS95=0,0;END=148076323;PE=112;SR=5;STRANDS=+-:117;SU=117;SVLEN=-3457;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:117:112:5
chr7	152113751	4864_1	N	N[CHRUN_GL000237:11[	.	PASS	CIEND=0,0;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4864;IMPRECISE;MATEID=4864_2;PE=99;SR=7;STRANDS=+-:106;SU=106;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:106:99:7
chr7	152113751	4864_1	N	N[CHRUN_GL000237:11[	.	PASS	CIEND=0,0;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4864;IMPRECISE;MATEID=4864_2;PE=99;SR=7;STRANDS=+-:106;SU=106;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:106:99:7
chr7	152281703	2259	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,6;CIEND95=-3,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=152284308;IMPRECISE;PE=44;SR=2;STRANDS=+-:46;SU=46;SVLEN=-2605;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:46:44:2
chr7	154153823	2267	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,5;CIPOS95=0,0;END=154155070;PE=29;SR=6;STRANDS=+-:35;SU=35;SVLEN=-1247;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:35:29:6
chr7	154876999	2270	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=154880627;IMPRECISE;PE=6;SR=3;STRANDS=+-:9;SU=9;SVLEN=-3628;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:9:6:3
chr7	159117444	2186	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=159122725;IMPRECISE;PE=42;SR=2;STRANDS=+-:44;SU=44;SVLEN=-5281;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:44:42:2
chr8	1893562	2289	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=1897028;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3466;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr8	4122884	2294	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-5,10;CIPOS95=-1,1;END=4124972;IMPRECISE;PE=61;SR=2;STRANDS=+-:63;SU=63;SVLEN=-2088;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:63:61:2
chr8	15289364	4870_1	N	N]CHR13:74314062]	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4870;MATEID=4870_2;PE=2;SR=4;STRANDS=++:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr8	15289364	4870_1	N	N]CHR13:74314062]	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4870;MATEID=4870_2;PE=2;SR=4;STRANDS=++:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr8	21727041	2315	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=21729981;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2940;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr8	24972434	2318	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-7,9;CIPOS95=-1,1;END=24990943;IMPRECISE;PE=47;SR=3;STRANDS=+-:50;SU=50;SVLEN=-18509;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:50:47:3
chr8	25066685	2319	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,7;CIPOS95=0,0;END=25070652;PE=89;SR=4;STRANDS=+-:93;SU=93;SVLEN=-3967;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:93:89:4
chr8	25912362	2320	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=25912443;IMPRECISE;PE=9;SR=3;STRANDS=++:5,--:7;SU=12;SVLEN=81;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:12:9:3
chr8	30145623	4873_1	N	N[CHR17:7167890[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4873;MATEID=4873_2;PE=3;SR=5;STRANDS=+-:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:3:5
chr8	30145623	4873_1	N	N[CHR17:7167890[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4873;MATEID=4873_2;PE=3;SR=5;STRANDS=+-:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:3:5
chr8	34893412	2330	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=34896813;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3401;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr8	43092873	2348	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2899;CIEND95=0,2111;CIPOS=-3244,11;CIPOS95=-2199,1;END=43093542;IMPRECISE;PE=35;SR=2;STRANDS=-+:37;SU=37;SVLEN=669;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:37:35:2
chr8	43093313	2349_1	N	N]CHR8:43096749]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=2349;IMPRECISE;MATEID=2349_2;PE=20;SR=6;STRANDS=++:26;SU=26;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:26:20:6
chr8	43093313	2349_1	N	N]CHR8:43096749]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=2349;IMPRECISE;MATEID=2349_2;PE=20;SR=6;STRANDS=++:26;SU=26;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:26:20:6
chr8	43096749	2349_2	N	N]CHR8:43093313]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=2349;IMPRECISE;MATEID=2349_1;PE=20;SECONDARY;SR=6;STRANDS=++:26;SU=26;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:26:20:6
chr8	43096749	2349_2	N	N]CHR8:43093313]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=2349;IMPRECISE;MATEID=2349_1;PE=20;SECONDARY;SR=6;STRANDS=++:26;SU=26;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:26:20:6
chr8	50324882	2352	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,1;END=50327881;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=2999;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr8	50721076	2328	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=50724498;IMPRECISE;PE=9;SR=3;STRANDS=+-:12;SU=12;SVLEN=-3422;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:12:9:3
chr8	67912434	2376	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,1;END=67915454;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3020;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr8	73023618	2383	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,1;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,0;END=73023864;IMPRECISE;PE=20;SR=4;STRANDS=++:13,--:11;SU=24;SVLEN=246;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:24:20:4
chr8	73787775	2365	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-6,9;CIPOS95=-1,1;END=73793823;IMPRECISE;PE=44;SR=3;STRANDS=+-:47;SU=47;SVLEN=-6048;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:47:44:3
chr8	75362871	2366	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=75366962;IMPRECISE;PE=25;SR=3;STRANDS=+-:28;SU=28;SVLEN=-4091;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:28:25:3
chr8	77337385	2387	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,6;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,6;CIPOS95=0,0;END=77338426;PE=7;SR=5;STRANDS=+-:12;SU=12;SVLEN=-1041;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:12:7:5
chr8	115079315	2367	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=115080676;IMPRECISE;PE=18;SR=3;STRANDS=+-:21;SU=21;SVLEN=-1361;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:21:18:3
chr8	128533830	4720_2	N	[CHR3:111274086[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4720;IMPRECISE;MATEID=4720_1;PE=5;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr8	128533830	4720_2	N	[CHR3:111274086[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4720;IMPRECISE;MATEID=4720_1;PE=5;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr8	129465168	2443	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;END=129471266;PE=60;SR=5;STRANDS=+-:65;SU=65;SVLEN=-6098;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:65:60:5
chr8	135082929	2448	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=135089015;PE=94;SR=6;STRANDS=+-:100;SU=100;SVLEN=-6086;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:100:94:6
chr8	137160197	2451	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=137163898;PE=63;SR=9;STRANDS=+-:72;SU=72;SVLEN=-3701;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:72:63:9
chr8	138125855	2453	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;END=138127581;PE=18;SR=4;STRANDS=+-:22;SU=22;SVLEN=-1726;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:22:18:4
chr8	138130968	2436	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,10;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=138131565;IMPRECISE;PE=31;SR=3;STRANDS=++:21,--:13;SU=34;SVLEN=597;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:34:31:3
chr8	141411974	2461	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=141414032;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2058;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr9	12556849	2483	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,5;CIPOS95=0,0;END=12559646;PE=48;SR=5;STRANDS=+-:53;SU=53;SVLEN=-2797;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:53:48:5
chr9	71738122	2510	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-5,10;CIPOS95=0,1;END=71743354;IMPRECISE;PE=49;SR=3;STRANDS=+-:52;SU=52;SVLEN=-5232;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:52:49:3
chr9	84324363	2516	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=84326926;IMPRECISE;PE=27;SR=2;STRANDS=+-:29;SU=29;SVLEN=-2563;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:29:27:2
chr9	90858996	2519	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-9,9;CIPOS95=-1,1;END=90860963;IMPRECISE;PE=14;SR=3;STRANDS=+-:17;SU=17;SVLEN=-1967;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:17:14:3
chr9	101309048	2526	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=101311664;IMPRECISE;PE=59;SR=2;STRANDS=+-:61;SU=61;SVLEN=-2616;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:61:59:2
chr9	110537537	2534	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,4;CIPOS95=0,0;END=110540595;PE=70;SR=6;STRANDS=+-:76;SU=76;SVLEN=-3058;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:76:70:6
chr9	113024576	2538	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,2;CIEND95=-2,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=113037093;IMPRECISE;PE=9;SR=4;STRANDS=+-:13;SU=13;SVLEN=-12517;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:13:9:4
chr9	113029969	2537	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-5,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,6;CIPOS95=0,0;END=113037287;PE=7;SR=5;STRANDS=-+:12;SU=12;SVLEN=7318;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:12:7:5
chr9	123552749	2561	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-7,8;CIEND95=-2,2;CIPOS=-10,6;CIPOS95=-1,0;END=131103350;IMPRECISE;PE=44;SR=2;STRANDS=-+:46;SU=46;SVLEN=7550601;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:46:44:2
chr9	123564918	2580	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=132662320;IMPRECISE;PE=24;SR=2;STRANDS=-+:26;SU=26;SVLEN=9097402;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:26:24:2
chr9	128376992	2572	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=128380190;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3198;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr9	131068799	2559	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=131072062;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3263;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr9	132026700	2578	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=132028069;IMPRECISE;PE=20;SR=2;STRANDS=+-:22;SU=22;SVLEN=-1369;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:22:20:2
chr9	133607147	4884_1	N	]CHR22:23632742]N	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4884;MATEID=4884_2;PE=349;SR=20;STRANDS=-+:369;SU=369;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:369:349:20
chr9	133607147	4884_1	N	]CHR22:23632742]N	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4884;MATEID=4884_2;PE=349;SR=20;STRANDS=-+:369;SU=369;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:369:349:20
chr9	134155524	4878_1	N	N]CHR13:108661411]	.	PASS	CIEND=-2,0;CIEND95=0,0;CIPOS=-2,0;CIPOS95=0,0;EVENT=4878;MATEID=4878_2;PE=207;SR=19;STRANDS=++:226;SU=226;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:226:207:19
chr9	134155524	4878_1	N	N]CHR13:108661411]	.	PASS	CIEND=-2,0;CIEND95=0,0;CIPOS=-2,0;CIPOS95=0,0;EVENT=4878;MATEID=4878_2;PE=207;SR=19;STRANDS=++:226;SU=226;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:226:207:19
chr9	140773612	2639	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,7;CIEND95=0,1;CIPOS=-5,6;CIPOS95=0,0;END=140777194;IMPRECISE;PE=6;SR=5;STRANDS=+-:11;SU=11;SVLEN=-3582;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:11:6:5
chr10	2289402	2646	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=2292351;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2949;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr10	12455604	4891_1	N	N[CHR11:3228032[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4891;MATEID=4891_2;PE=2;SR=4;STRANDS=+-:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr10	12455604	4891_1	N	N[CHR11:3228032[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4891;MATEID=4891_2;PE=2;SR=4;STRANDS=+-:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr10	12560473	2665	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,3;CIPOS95=0,0;END=12562973;PE=61;SR=7;STRANDS=+-:68;SU=68;SVLEN=-2500;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:68:61:7
chr10	31246747	2685	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;END=31251769;IMPRECISE;PE=76;SR=2;STRANDS=+-:78;SU=78;SVLEN=-5022;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:78:76:2
chr10	32257895	2689	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=32260612;PE=29;SR=6;STRANDS=+-:35;SU=35;SVLEN=-2717;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:35:29:6
chr10	36760446	4723_2	N	]CHR3:163919285]N	.	PASS	CIEND=-7,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,5;CIPOS95=0,0;EVENT=4723;MATEID=4723_1;PE=19;SECONDARY;SR=5;STRANDS=-+:24;SU=24;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:24:19:5
chr10	36760446	4723_2	N	]CHR3:163919285]N	.	PASS	CIEND=-7,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,5;CIPOS95=0,0;EVENT=4723;MATEID=4723_1;PE=19;SECONDARY;SR=5;STRANDS=-+:24;SU=24;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:24:19:5
chr10	42354942	2707	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-9,10;CIPOS95=-3,3;END=42359268;IMPRECISE;PE=30;SR=2;STRANDS=-+:32;SU=32;SVLEN=4326;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:32:30:2
chr10	42361548	2708	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,3827;CIEND95=0,2516;CIPOS=-3201,10;CIPOS95=-2448,0;END=42362963;IMPRECISE;PE=5;SR=2;STRANDS=-+:7;SU=7;SVLEN=1415;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:7:5:2
chr10	42383522	2723	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-2,9;CIEND95=-1,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=42392775;IMPRECISE;PE=188;SR=5;STRANDS=-+:193;SU=193;SVLEN=9253;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:193:188:5
chr10	42390300	2721	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=42392881;IMPRECISE;PE=17;SR=4;STRANDS=-+:21;SU=21;SVLEN=2581;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:21:17:4
chr10	42532607	4831_2	N	N]CHR7:61970847]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;EVENT=4831;IMPRECISE;MATEID=4831_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr10	42532607	4831_2	N	N]CHR7:61970847]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;EVENT=4831;IMPRECISE;MATEID=4831_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr10	54105007	2766_1	N	N]CHR10:54105075]	.	PASS	CIEND=-5,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=2766;MATEID=2766_2;PE=5;SR=5;STRANDS=++:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:5:5
chr10	54105007	2766_1	N	N]CHR10:54105075]	.	PASS	CIEND=-5,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=2766;MATEID=2766_2;PE=5;SR=5;STRANDS=++:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:5:5
chr10	54105075	2766_2	N	N]CHR10:54105007]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,5;CIPOS95=0,0;EVENT=2766;MATEID=2766_1;PE=5;SECONDARY;SR=5;STRANDS=++:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:5:5
chr10	54105075	2766_2	N	N]CHR10:54105007]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,5;CIPOS95=0,0;EVENT=2766;MATEID=2766_1;PE=5;SECONDARY;SR=5;STRANDS=++:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:5:5
chr10	54783542	2688	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=54788829;IMPRECISE;PE=66;SR=3;STRANDS=+-:69;SU=69;SVLEN=-5287;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:69:66:3
chr10	56767189	2770	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=0,1;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,1;END=56773194;IMPRECISE;PE=101;SR=7;STRANDS=++:58,--:50;SU=108;SVLEN=6005;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:108:101:7
chr10	61361964	2775	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=61365008;IMPRECISE;PE=28;SR=2;STRANDS=+-:30;SU=30;SVLEN=-3044;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:30:28:2
chr10	65191038	2790	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=65194980;IMPRECISE;PE=17;SR=3;STRANDS=+-:20;SU=20;SVLEN=-3942;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:20:17:3
chr10	70080687	2798	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2802;CIEND95=0,1680;CIPOS=-2141,10;CIPOS95=-1436,1;END=70082389;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=1702;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr10	76298885	2813	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=76301792;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2907;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr10	82750298	2819	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=82752641;IMPRECISE;PE=32;SR=2;STRANDS=+-:34;SU=34;SVLEN=-2343;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:34:32:2
chr10	82879416	2821	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;END=82891376;PE=66;SR=5;STRANDS=+-:71;SU=71;SVLEN=-11960;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:71:66:5
chr10	83955298	2823	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=83957902;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2604;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr10	87849333	4722_2	N	N]CHR3:48228179]	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4722;MATEID=4722_1;PE=46;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:50;SU=50;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:50:46:4
chr10	87849333	4722_2	N	N]CHR3:48228179]	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4722;MATEID=4722_1;PE=46;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:50;SU=50;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:50:46:4
chr10	93633338	2786	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=93634562;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=+-:6;SU=6;SVLEN=-1224;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr10	94134599	2833	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;END=94137653;PE=43;SR=4;STRANDS=+-:47;SU=47;SVLEN=-3054;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:47:43:4
chr10	99034873	2836	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,1;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,3;CIPOS95=0,0;END=99037397;PE=36;SR=7;STRANDS=+-:43;SU=43;SVLEN=-2524;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:43:36:7
chr10	102158310	2840	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,4;CIPOS95=0,0;END=102159537;PE=7;SR=7;STRANDS=+-:14;SU=14;SVLEN=-1227;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:14:7:7
chr10	109464294	2844	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-2,2;CIEND95=-1,3;CIPOS=-10,7;CIPOS95=-3,1;END=109467605;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3311;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr10	110420345	2845	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;END=110420431;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=++:3,--:2;SU=5;SVLEN=86;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr10	114112183	2787	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=114116658;IMPRECISE;PE=41;SR=2;STRANDS=+-:43;SU=43;SVLEN=-4475;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:43:41:2
chr10	126641468	2789	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=126730718;IMPRECISE;PE=57;SR=2;STRANDS=+-:59;SU=59;SVLEN=-89250;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:59:57:2
chr11	3228032	4891_2	N	]CHR10:12455604]N	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4891;MATEID=4891_1;PE=2;SECONDARY;SR=4;STRANDS=-+:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr11	3228032	4891_2	N	]CHR10:12455604]N	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4891;MATEID=4891_1;PE=2;SECONDARY;SR=4;STRANDS=-+:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr11	45429849	2918	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=45431613;PE=51;SR=8;STRANDS=+-:59;SU=59;SVLEN=-1764;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:59:51:8
chr11	47057588	2938	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=47063711;IMPRECISE;PE=24;SR=2;STRANDS=+-:26;SU=26;SVLEN=-6123;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:26:24:2
chr11	48367528	2943	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;END=48373693;PE=43;SR=4;STRANDS=+-:47;SU=47;SVLEN=-6165;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:47:43:4
chr11	48749913	2945	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;END=48751588;IMPRECISE;PE=3;SR=3;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=1675;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:3:3
chr11	58594188	2956	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=58596019;PE=72;SR=6;STRANDS=+-:78;SU=78;SVLEN=-1831;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:78:72:6
chr11	63698906	2957	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-8,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=63701944;IMPRECISE;PE=4;SR=3;STRANDS=-+:7;SU=7;SVLEN=3038;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:7:4:3
chr11	66018698	2968	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,10;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=66019898;IMPRECISE;PE=12;SR=2;STRANDS=++:6,--:8;SU=14;SVLEN=1200;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:14:12:2
chr11	85211624	4838_2	N	N[CHR7:107829249[	.	PASS	CIEND=-9,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4838;MATEID=4838_1;PE=4;SECONDARY;SR=4;STRANDS=+-:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr11	85211624	4838_2	N	N[CHR7:107829249[	.	PASS	CIEND=-9,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4838;MATEID=4838_1;PE=4;SECONDARY;SR=4;STRANDS=+-:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr11	90193708	2961	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,4;CIPOS95=-3,1;END=90195997;IMPRECISE;PE=19;SR=3;STRANDS=+-:22;SU=22;SVLEN=-2289;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:22:19:3
chr11	95169380	2964	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=95175420;IMPRECISE;PE=20;SR=3;STRANDS=+-:23;SU=23;SVLEN=-6040;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:23:20:3
chr11	99690483	2996	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=99691307;IMPRECISE;PE=10;SR=2;STRANDS=++:6,--:6;SU=12;SVLEN=824;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:12:10:2
chr11	102303588	3000	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=102307485;IMPRECISE;PE=32;SR=2;STRANDS=+-:34;SU=34;SVLEN=-3897;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:34:32:2
chr11	104111277	3005	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=104111388;IMPRECISE;PE=5;SR=2;STRANDS=++:1,--:6;SU=7;SVLEN=111;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:7:5:2
chr11	114424906	3020	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=114431925;IMPRECISE;PE=47;SR=3;STRANDS=+-:50;SU=50;SVLEN=-7019;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:50:47:3
chr11	122347584	3027	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,3;CIPOS95=0,0;END=122349280;PE=71;SR=8;STRANDS=+-:79;SU=79;SVLEN=-1696;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:79:71:8
chr11	128710721	3032	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=128714098;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3377;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr12	17444827	3057	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=17445937;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=+-:6;SU=6;SVLEN=-1110;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr12	30237245	3054	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=30243566;IMPRECISE;PE=53;SR=3;STRANDS=+-:56;SU=56;SVLEN=-6321;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:56:53:3
chr12	30559347	3066	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=30562215;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2868;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr12	39577605	3082	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=39580359;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2754;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr12	43977460	3095	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=43979549;PE=50;SR=5;STRANDS=+-:55;SU=55;SVLEN=-2089;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:55:50:5
chr12	50683783	3101	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,3507;CIEND95=0,2293;CIPOS=-2786,14;CIPOS95=-2036,4;END=50684834;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=1051;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr12	53086339	3103	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=53087701;IMPRECISE;PE=9;SR=2;STRANDS=+-:11;SU=11;SVLEN=-1362;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:11:9:2
chr12	53229096	3076	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,2236;CIEND95=-1,1188;CIPOS=-1515,10;CIPOS95=-938,1;END=53231384;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2288;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr12	56990096	4933_1	N	N[CHR15:39994625[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4933;IMPRECISE;MATEID=4933_2;PE=5;SR=3;STRANDS=+-:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr12	56990096	4933_1	N	N[CHR15:39994625[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4933;IMPRECISE;MATEID=4933_2;PE=5;SR=3;STRANDS=+-:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr12	60521845	3109	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;END=60525035;PE=86;SR=6;STRANDS=+-:92;SU=92;SVLEN=-3190;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:92:86:6
chr12	64969763	3122	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,4004;CIEND95=0,2766;CIPOS=-3587,44;CIPOS95=-2732,34;END=64970158;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=395;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr12	71532792	3129	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;END=71533754;IMPRECISE;PE=22;SR=2;STRANDS=++:12,--:12;SU=24;SVLEN=962;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:24:22:2
chr12	71602361	3130	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,6;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=71604473;PE=4;SR=5;STRANDS=+-:9;SU=9;SVLEN=-2112;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:9:4:5
chr12	71709259	3131	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;END=71710318;IMPRECISE;PE=7;SR=2;STRANDS=++:3,--:6;SU=9;SVLEN=1059;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:9:7:2
chr12	73239572	4938_1	N	[CHR15:94886290[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4938;IMPRECISE;MATEID=4938_2;PE=15;SR=2;STRANDS=--:17;SU=17;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:17:15:2
chr12	73239572	4938_1	N	[CHR15:94886290[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4938;IMPRECISE;MATEID=4938_2;PE=15;SR=2;STRANDS=--:17;SU=17;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:17:15:2
chr12	78084473	3117	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,0;END=78084543;PE=7;SR=6;STRANDS=++:6,--:7;SU=13;SVLEN=70;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:13:7:6
chr12	78383878	3142_1	N	N]CHR12:78388277]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3142;IMPRECISE;MATEID=3142_2;PE=3;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr12	78383878	3142_1	N	N]CHR12:78388277]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3142;IMPRECISE;MATEID=3142_2;PE=3;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr12	78388277	3142_2	N	N]CHR12:78383878]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=3142;IMPRECISE;MATEID=3142_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr12	78388277	3142_2	N	N]CHR12:78383878]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=3142;IMPRECISE;MATEID=3142_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr12	80154889	3145	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,7;CIPOS95=-1,0;END=80162808;IMPRECISE;PE=111;SR=2;STRANDS=-+:113;SU=113;SVLEN=7919;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:113:111:2
chr12	88140457	3155	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,4;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=88143903;IMPRECISE;PE=12;SR=3;STRANDS=+-:15;SU=15;SVLEN=-3446;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:15:12:3
chr12	96340355	3166	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;END=96342954;PE=50;SR=4;STRANDS=+-:54;SU=54;SVLEN=-2599;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:54:50:4
chr12	98669929	3170	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-4,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,3;CIPOS95=0,0;END=98672090;PE=40;SR=7;STRANDS=+-:47;SU=47;SVLEN=-2161;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:47:40:7
chr12	104359630	3198_1	N	[CHR12:125801148[N	.	PASS	CIEND=-7,6;CIEND95=0,0;CIPOS=0,10;CIPOS95=0,0;EVENT=3198;MATEID=3198_2;PE=5;SR=5;STRANDS=--:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:5:5
chr12	104359630	3198_1	N	[CHR12:125801148[N	.	PASS	CIEND=-7,6;CIEND95=0,0;CIPOS=0,10;CIPOS95=0,0;EVENT=3198;MATEID=3198_2;PE=5;SR=5;STRANDS=--:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:5:5
chr12	117086884	3184	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=117088193;PE=10;SR=5;STRANDS=+-:15;SU=15;SVLEN=-1309;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:15:10:5
chr12	125801148	3198_2	N	[CHR12:104359630[N	.	PASS	CIEND=0,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,6;CIPOS95=0,0;EVENT=3198;MATEID=3198_1;PE=5;SECONDARY;SR=5;STRANDS=--:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:5:5
chr12	125801148	3198_2	N	[CHR12:104359630[N	.	PASS	CIEND=0,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,6;CIPOS95=0,0;EVENT=3198;MATEID=3198_1;PE=5;SECONDARY;SR=5;STRANDS=--:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:5:5
chr12	128391066	3200	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=128391944;PE=15;SR=4;STRANDS=++:12,--:7;SU=19;SVLEN=878;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:19:15:4
chr13	20825485	3209	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-9,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;END=20828792;PE=71;SR=4;STRANDS=+-:75;SU=75;SVLEN=-3307;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:75:71:4
chr13	30215837	3218	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=30221844;IMPRECISE;PE=65;SR=3;STRANDS=+-:68;SU=68;SVLEN=-6007;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:68:65:3
chr13	43539809	3226	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,8;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=43541447;IMPRECISE;PE=44;SR=2;STRANDS=+-:46;SU=46;SVLEN=-1638;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:46:44:2
chr13	72477265	3269	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-7,9;CIPOS95=-1,1;END=72480576;IMPRECISE;PE=39;SR=3;STRANDS=+-:42;SU=42;SVLEN=-3311;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:42:39:3
chr13	74314062	4870_2	N	N]CHR8:15289364]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4870;MATEID=4870_1;PE=2;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr13	74314062	4870_2	N	N]CHR8:15289364]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;EVENT=4870;MATEID=4870_1;PE=2;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:6;SU=6;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:6:2:4
chr13	81088033	3292_1	N	[CHR13:81469935[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-2,1;CIPOS95=0,0;EVENT=3292;MATEID=3292_2;PE=41;SR=12;STRANDS=--:53;SU=53;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:53:41:12
chr13	81088033	3292_1	N	[CHR13:81469935[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-2,1;CIPOS95=0,0;EVENT=3292;MATEID=3292_2;PE=41;SR=12;STRANDS=--:53;SU=53;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:53:41:12
chr13	81109414	3237	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,8;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;END=90438706;PE=259;SR=19;STRANDS=+-:278;SU=278;SVLEN=-9329292;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:278:259:19
chr13	81431687	3288	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=81434608;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=2921;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr13	81469935	3292_2	N	[CHR13:81088033[N	.	PASS	CIEND=-2,1;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=3292;MATEID=3292_1;PE=41;SECONDARY;SR=12;STRANDS=--:53;SU=53;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:53:41:12
chr13	81469935	3292_2	N	[CHR13:81088033[N	.	PASS	CIEND=-2,1;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=3292;MATEID=3292_1;PE=41;SECONDARY;SR=12;STRANDS=--:53;SU=53;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:53:41:12
chr13	82356872	3294	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-4,3;CIPOS95=-1,1;END=82356963;IMPRECISE;PE=3;SR=3;STRANDS=++:4,--:2;SU=6;SVLEN=91;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:6:3:3
chr13	87150300	3296	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,10;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=87151174;IMPRECISE;PE=3;SR=3;STRANDS=++:4,--:2;SU=6;SVLEN=874;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:6:3:3
chr13	90577680	3303	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=90581192;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3512;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr13	90862855	3313	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=90864806;PE=124;SR=31;STRANDS=+-:155;SU=155;SVLEN=-1951;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:155:124:31
chr13	90885969	3314	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=90888773;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=2804;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr13	91030815	3318	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=91034067;IMPRECISE;PE=5;SR=3;STRANDS=-+:8;SU=8;SVLEN=3252;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr13	91807306	3339	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,1760;CIEND95=-1,800;CIPOS=-1514,10;CIPOS95=-908,1;END=91809853;IMPRECISE;PE=4;SR=4;STRANDS=-+:8;SU=8;SVLEN=2547;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr13	92338027	3257	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=92341397;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3370;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr13	93349982	4954_1	N	N]CHRUN_GL000224:68385]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-5,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4954;IMPRECISE;MATEID=4954_2;PE=218;SR=2;STRANDS=++:220;SU=220;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:220:218:2
chr13	93349982	4954_1	N	N]CHRUN_GL000224:68385]	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-5,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4954;IMPRECISE;MATEID=4954_2;PE=218;SR=2;STRANDS=++:220;SU=220;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:220:218:2
chr13	94023408	3371	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=108500972;PE=380;SR=19;STRANDS=+-:399;SU=399;SVLEN=-14477564;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:399:380:19
chr13	108524432	3238	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=108527336;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=2904;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr13	108661411	4878_2	N	N]CHR9:134155524]	.	PASS	CIEND=-2,0;CIEND95=0,0;CIPOS=-2,0;CIPOS95=0,0;EVENT=4878;MATEID=4878_1;PE=207;SECONDARY;SR=19;STRANDS=++:226;SU=226;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:226:207:19
chr13	108661411	4878_2	N	N]CHR9:134155524]	.	PASS	CIEND=-2,0;CIEND95=0,0;CIPOS=-2,0;CIPOS95=0,0;EVENT=4878;MATEID=4878_1;PE=207;SECONDARY;SR=19;STRANDS=++:226;SU=226;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:226:207:19
chr14	48323968	3402	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=48325480;IMPRECISE;PE=11;SR=2;STRANDS=++:8,--:5;SU=13;SVLEN=1512;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:13:11:2
chr14	67035223	3414	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=0,0;END=67137184;PE=46;SR=6;STRANDS=+-:52;SU=52;SVLEN=-101961;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:52:46:6
chr14	67416369	3415	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=67653306;IMPRECISE;PE=51;SR=2;STRANDS=-+:53;SU=53;SVLEN=236937;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:53:51:2
chr14	70687834	3417	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-3,8;CIEND95=0,1;CIPOS=-5,4;CIPOS95=-1,0;END=70689453;IMPRECISE;PE=18;SR=4;STRANDS=+-:22;SU=22;SVLEN=-1619;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:22:18:4
chr14	78559026	4767_2	N	[CHR4:55036120[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,6;CIPOS95=-1,0;EVENT=4767;IMPRECISE;MATEID=4767_1;PE=2;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr14	78559026	4767_2	N	[CHR4:55036120[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,6;CIPOS95=-1,0;EVENT=4767;IMPRECISE;MATEID=4767_1;PE=2;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr14	85297116	3423	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,7;CIPOS95=0,0;END=85302155;PE=73;SR=4;STRANDS=+-:77;SU=77;SVLEN=-5039;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:77:73:4
chr14	95226638	3428	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=95229546;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2908;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr14	96048906	4769_2	N	N[CHR4:150789806[	.	PASS	CIEND=-10,6;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4769;IMPRECISE;MATEID=4769_1;PE=2;SECONDARY;SR=3;STRANDS=+-:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr14	96048906	4769_2	N	N[CHR4:150789806[	.	PASS	CIEND=-10,6;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4769;IMPRECISE;MATEID=4769_1;PE=2;SECONDARY;SR=3;STRANDS=+-:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr14	98784003	3430	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,1;END=98785087;IMPRECISE;PE=4;SR=4;STRANDS=+-:8;SU=8;SVLEN=-1084;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr15	39994625	4933_2	N	]CHR12:56990096]N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4933;IMPRECISE;MATEID=4933_1;PE=5;SECONDARY;SR=3;STRANDS=-+:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr15	39994625	4933_2	N	]CHR12:56990096]N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4933;IMPRECISE;MATEID=4933_1;PE=5;SECONDARY;SR=3;STRANDS=-+:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr15	55218230	3476	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=55224424;IMPRECISE;PE=75;SR=2;STRANDS=+-:77;SU=77;SVLEN=-6194;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:77:75:2
chr15	60368472	3482	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,1246;CIEND95=-2,439;CIPOS=-705,10;CIPOS95=-346,2;END=60371496;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3024;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr15	68426020	3502	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,10;CIPOS95=0,0;END=68428927;PE=124;SR=4;STRANDS=+-:128;SU=128;SVLEN=-2907;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:128:124:4
chr15	81325678	3491	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=81328450;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2772;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr15	91983460	3524	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-8,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=91989617;IMPRECISE;PE=8;SR=3;STRANDS=-+:11;SU=11;SVLEN=6157;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:11:8:3
chr15	94886290	4938_2	N	[CHR12:73239572[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4938;IMPRECISE;MATEID=4938_1;PE=15;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:17;SU=17;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:17:15:2
chr15	94886290	4938_2	N	[CHR12:73239572[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=4938;IMPRECISE;MATEID=4938_1;PE=15;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:17;SU=17;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:17:15:2
chr15	97899456	3533	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-7,6;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=97899564;PE=11;SR=5;STRANDS=++:6,--:10;SU=16;SVLEN=108;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:16:11:5
chr15	98760509	3495	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=98762224;IMPRECISE;PE=9;SR=3;STRANDS=+-:12;SU=12;SVLEN=-1715;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:12:9:3
chr16	16934378	3557	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,5;CIEND95=-1,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=-1,1;END=16940414;IMPRECISE;PE=56;SR=2;STRANDS=+-:58;SU=58;SVLEN=-6036;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:58:56:2
chr16	17243997	3560	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-2,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=17246975;IMPRECISE;PE=2;SR=3;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2978;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr16	18832544	3561	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,3;CIPOS95=0,0;END=18838376;PE=49;SR=9;STRANDS=+-:58;SU=58;SVLEN=-5832;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:58:49:9
chr16	21594442	3563_1	N	N]CHR16:22710751]	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,5;CIPOS95=0,0;EVENT=3563;MATEID=3563_2;PE=38;SR=5;STRANDS=++:43;SU=43;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:43:38:5
chr16	21594442	3563_1	N	N]CHR16:22710751]	.	PASS	CIEND=-7,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,5;CIPOS95=0,0;EVENT=3563;MATEID=3563_2;PE=38;SR=5;STRANDS=++:43;SU=43;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:43:38:5
chr16	22710751	3563_2	N	N]CHR16:21594442]	.	PASS	CIEND=-5,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;EVENT=3563;MATEID=3563_1;PE=38;SECONDARY;SR=5;STRANDS=++:43;SU=43;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:43:38:5
chr16	22710751	3563_2	N	N]CHR16:21594442]	.	PASS	CIEND=-5,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;EVENT=3563;MATEID=3563_1;PE=38;SECONDARY;SR=5;STRANDS=++:43;SU=43;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:43:38:5
chr16	23047775	3564	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,3;CIPOS95=0,0;END=23049531;PE=36;SR=7;STRANDS=+-:43;SU=43;SVLEN=-1756;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:43:36:7
chr16	32543549	4850_2	N	[CHR7:61891240[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=0,1;EVENT=4850;IMPRECISE;MATEID=4850_1;PE=3;SECONDARY;SR=4;STRANDS=--:7;SU=7;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:7:3:4
chr16	32543549	4850_2	N	[CHR7:61891240[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=0,1;EVENT=4850;IMPRECISE;MATEID=4850_1;PE=3;SECONDARY;SR=4;STRANDS=--:7;SU=7;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:7:3:4
chr16	33887750	4626_2	N	N]CHR1:142537205]	.	PASS	CIEND=-10,2751;CIEND95=0,1635;CIPOS=-10,3587;CIPOS95=0,2522;EVENT=4626;IMPRECISE;MATEID=4626_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr16	33887750	4626_2	N	N]CHR1:142537205]	.	PASS	CIEND=-10,2751;CIEND95=0,1635;CIPOS=-10,3587;CIPOS95=0,2522;EVENT=4626;IMPRECISE;MATEID=4626_1;PE=3;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:5;SU=5;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr16	46426907	3633	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-5,9;CIEND95=-1,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=46427777;IMPRECISE;PE=9;SR=2;STRANDS=-+:11;SU=11;SVLEN=870;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:11:9:2
chr16	46726793	3642_1	N	[CHR16:46851326[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3642;IMPRECISE;MATEID=3642_2;PE=13;SR=2;STRANDS=--:15;SU=15;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:15:13:2
chr16	46726793	3642_1	N	[CHR16:46851326[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3642;IMPRECISE;MATEID=3642_2;PE=13;SR=2;STRANDS=--:15;SU=15;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:15:13:2
chr16	46851326	3642_2	N	[CHR16:46726793[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3642;IMPRECISE;MATEID=3642_1;PE=13;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:15;SU=15;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:15:13:2
chr16	46851326	3642_2	N	[CHR16:46726793[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3642;IMPRECISE;MATEID=3642_1;PE=13;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:15;SU=15;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:15:13:2
chr16	61067253	3656_1	N	N]CHR16:61083738]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=3656;IMPRECISE;MATEID=3656_2;PE=16;SR=3;STRANDS=++:19;SU=19;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:19:16:3
chr16	61067253	3656_1	N	N]CHR16:61083738]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=3656;IMPRECISE;MATEID=3656_2;PE=16;SR=3;STRANDS=++:19;SU=19;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:19:16:3
chr16	61083738	3656_2	N	N]CHR16:61067253]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3656;IMPRECISE;MATEID=3656_1;PE=16;SECONDARY;SR=3;STRANDS=++:19;SU=19;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:19:16:3
chr16	61083738	3656_2	N	N]CHR16:61067253]	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3656;IMPRECISE;MATEID=3656_1;PE=16;SECONDARY;SR=3;STRANDS=++:19;SU=19;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:19:16:3
chr16	78260008	4810_2	N	[CHR6:38107296[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4810;IMPRECISE;MATEID=4810_1;PE=26;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:28;SU=28;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:28:26:2
chr16	78260008	4810_2	N	[CHR6:38107296[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4810;IMPRECISE;MATEID=4810_1;PE=26;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:28;SU=28;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:28:26:2
chr16	78371638	3684	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-6,7;CIPOS95=0,0;END=78384898;PE=45;SR=4;STRANDS=+-:49;SU=49;SVLEN=-13260;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:49:45:4
chr16	85302493	3702	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=85304390;IMPRECISE;PE=14;SR=3;STRANDS=+-:17;SU=17;SVLEN=-1897;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:17:14:3
chr16	89896057	3666	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=89898390;IMPRECISE;PE=8;SR=2;STRANDS=+-:10;SU=10;SVLEN=-2333;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:10:8:2
chr17	7167890	4873_2	N	]CHR8:30145623]N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4873;MATEID=4873_1;PE=3;SECONDARY;SR=5;STRANDS=-+:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:3:5
chr17	7167890	4873_2	N	]CHR8:30145623]N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4873;MATEID=4873_1;PE=3;SECONDARY;SR=5;STRANDS=-+:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:3:5
chr17	12345662	3730	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=12347206;IMPRECISE;PE=33;SR=3;STRANDS=+-:36;SU=36;SVLEN=-1544;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:36:33:3
chr17	12353146	3731	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,4;CIEND95=-1,0;CIPOS=-6,9;CIPOS95=-1,1;END=12359254;IMPRECISE;PE=59;SR=3;STRANDS=+-:62;SU=62;SVLEN=-6108;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:62:59:3
chr17	14189911	3733	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=14191555;IMPRECISE;PE=32;SR=3;STRANDS=+-:35;SU=35;SVLEN=-1644;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:35:32:3
chr17	22020694	4567_2	N	]CHRM:16571]N	.	PASS	CIEND=0,0;CIEND95=0,0;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,0;EVENT=4567;MATEID=4567_1;PE=5;SECONDARY;SR=53;STRANDS=-+:58;SU=58;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:58:5:53
chr17	22020694	4567_2	N	]CHRM:16571]N	.	PASS	CIEND=0,0;CIEND95=0,0;CIPOS=0,0;CIPOS95=0,0;EVENT=4567;MATEID=4567_1;PE=5;SECONDARY;SR=53;STRANDS=-+:58;SU=58;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:58:5:53
chr17	26780387	3742	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=26783491;IMPRECISE;PE=9;SR=2;STRANDS=+-:11;SU=11;SVLEN=-3104;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:11:9:2
chr17	53972746	3783	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,5;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=53992739;IMPRECISE;PE=28;SR=3;STRANDS=+-:31;SU=31;SVLEN=-19993;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:31:28:3
chr17	64350258	3800	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=64499223;IMPRECISE;PE=21;SR=2;STRANDS=+-:23;SU=23;SVLEN=-148965;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:23:21:2
chr17	68167669	3794	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=68172509;IMPRECISE;PE=26;SR=2;STRANDS=+-:28;SU=28;SVLEN=-4840;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:28:26:2
chr17	69031876	3805	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,5;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=69038365;IMPRECISE;PE=8;SR=2;STRANDS=+-:10;SU=10;SVLEN=-6489;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:10:8:2
chr18	478331	3825_1	N	[CHR18:3473279[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=3825;IMPRECISE;MATEID=3825_2;PE=34;SR=2;STRANDS=--:36;SU=36;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:36:34:2
chr18	478331	3825_1	N	[CHR18:3473279[N	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=3825;IMPRECISE;MATEID=3825_2;PE=34;SR=2;STRANDS=--:36;SU=36;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:36:34:2
chr18	481781	3858	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=19500698;IMPRECISE;PE=29;SR=2;STRANDS=+-:31;SU=31;SVLEN=-19018917;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:31:29:2
chr18	3473279	3825_2	N	[CHR18:478331[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3825;IMPRECISE;MATEID=3825_1;PE=34;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:36;SU=36;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:36:34:2
chr18	3473279	3825_2	N	[CHR18:478331[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3825;IMPRECISE;MATEID=3825_1;PE=34;SECONDARY;SR=2;STRANDS=--:36;SU=36;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:36:34:2
chr18	8110155	3873_1	N	N]CHR18:24356260]	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3873;IMPRECISE;MATEID=3873_2;PE=23;SR=2;STRANDS=++:25;SU=25;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:25:23:2
chr18	8110155	3873_1	N	N]CHR18:24356260]	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;EVENT=3873;IMPRECISE;MATEID=3873_2;PE=23;SR=2;STRANDS=++:25;SU=25;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:25:23:2
chr18	8242408	3839	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-9,648;CIEND95=-3,158;CIPOS=-588,10;CIPOS95=-169,3;END=8246080;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=3672;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr18	11509274	3851	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=11511469;IMPRECISE;PE=12;SR=2;STRANDS=++:8,--:6;SU=14;SVLEN=2195;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:14:12:2
chr18	11509708	3852	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=11511474;IMPRECISE;PE=8;SR=3;STRANDS=+-:11;SU=11;SVLEN=-1766;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:11:8:3
chr18	12972218	3854	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,4004;CIEND95=0,2766;CIPOS=-3587,44;CIPOS95=-2732,34;END=12972700;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=482;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr18	21713803	3864	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,3;END=21716826;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3023;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr18	21990742	3865	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,8;CIPOS95=0,0;END=21992047;PE=11;SR=4;STRANDS=+-:15;SU=15;SVLEN=-1305;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:15:11:4
chr18	24356260	3873_2	N	N]CHR18:8110155]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=3873;IMPRECISE;MATEID=3873_1;PE=23;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:25;SU=25;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:25:23:2
chr18	24356260	3873_2	N	N]CHR18:8110155]	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-6,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=3873;IMPRECISE;MATEID=3873_1;PE=23;SECONDARY;SR=2;STRANDS=++:25;SU=25;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:25:23:2
chr18	25534090	3874	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=25535388;IMPRECISE;PE=2;SR=3;STRANDS=+-:5;SU=5;SVLEN=-1298;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr18	38259893	3900	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,4;CIPOS95=0,0;END=38266749;PE=69;SR=6;STRANDS=+-:75;SU=75;SVLEN=-6856;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:75:69:6
chr18	38864779	3901	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=38868343;PE=118;SR=5;STRANDS=+-:123;SU=123;SVLEN=-3564;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:123:118:5
chr18	39424735	3905	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,3;END=39427552;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2817;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr18	39561449	3906_1	N	N]CHR18:39587090]	.	PASS	CIEND=-9,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;EVENT=3906;MATEID=3906_2;PE=49;SR=4;STRANDS=++:53;SU=53;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:53:49:4
chr18	39561449	3906_1	N	N]CHR18:39587090]	.	PASS	CIEND=-9,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;EVENT=3906;MATEID=3906_2;PE=49;SR=4;STRANDS=++:53;SU=53;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:53:49:4
chr18	39587090	3906_2	N	N]CHR18:39561449]	.	PASS	CIEND=-9,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;EVENT=3906;MATEID=3906_1;PE=49;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:53;SU=53;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:53:49:4
chr18	39587090	3906_2	N	N]CHR18:39561449]	.	PASS	CIEND=-9,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;EVENT=3906;MATEID=3906_1;PE=49;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:53;SU=53;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:53:49:4
chr19	9042204	3961	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-7,9;CIEND95=0,3;CIPOS=-6,8;CIPOS95=-1,1;END=9284363;IMPRECISE;PE=2;SR=3;STRANDS=+-:5;SU=5;SVLEN=-242159;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:5:2:3
chr19	11422016	4633_2	N	N[CHR1:38241383[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4633;IMPRECISE;MATEID=4633_1;PE=6;SECONDARY;SR=2;STRANDS=+-:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:6:2
chr19	11422016	4633_2	N	N[CHR1:38241383[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4633;IMPRECISE;MATEID=4633_1;PE=6;SECONDARY;SR=2;STRANDS=+-:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:6:2
chr19	12298517	3964	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,1;END=12301205;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2688;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr19	14732345	3968	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,10;CIPOS95=0,0;END=14734126;PE=73;SR=4;STRANDS=+-:77;SU=77;SVLEN=-1781;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:77:73:4
chr19	15046392	3970	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,3;CIPOS95=0,0;END=15049477;PE=84;SR=8;STRANDS=+-:92;SU=92;SVLEN=-3085;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:92:84:8
chr19	29950197	3993	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=29956167;IMPRECISE;PE=41;SR=2;STRANDS=+-:43;SU=43;SVLEN=-5970;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:43:41:2
chr19	36840753	3995	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-9,10;CIPOS95=-1,1;END=36847072;IMPRECISE;PE=30;SR=2;STRANDS=+-:32;SU=32;SVLEN=-6319;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:32:30:2
chr19	51098228	3997	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,1;END=51101090;IMPRECISE;PE=3;SR=2;STRANDS=-+:5;SU=5;SVLEN=2862;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:5:3:2
chr19	52175937	4018	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-5,10;CIPOS95=-1,1;END=52177513;IMPRECISE;PE=59;SR=2;STRANDS=+-:61;SU=61;SVLEN=-1576;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:61:59:2
chr19	53422210	4021	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-9,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-5,10;CIPOS95=-1,4;END=53424207;IMPRECISE;PE=59;SR=2;STRANDS=+-:61;SU=61;SVLEN=-1997;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:61:59:2
chr19	53689186	3998	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-9,7;CIPOS95=0,0;END=53691951;PE=28;SR=4;STRANDS=+-:32;SU=32;SVLEN=-2765;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:32:28:4
chr19	54555554	3999	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,2;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=54560642;IMPRECISE;PE=65;SR=4;STRANDS=+-:69;SU=69;SVLEN=-5088;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:69:65:4
chr20	7096793	4034	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=7102846;PE=56;SR=5;STRANDS=+-:61;SU=61;SVLEN=-6053;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:61:56:5
chr20	7398707	4035	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=7403594;IMPRECISE;PE=52;SR=2;STRANDS=+-:54;SU=54;SVLEN=-4887;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:54:52:2
chr20	11281584	4994_1	N	[CHRX:81651235[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4994;MATEID=4994_2;PE=3;SR=7;STRANDS=--:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:3:7
chr20	11281584	4994_1	N	[CHRX:81651235[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4994;MATEID=4994_2;PE=3;SR=7;STRANDS=--:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:3:7
chr20	11647434	4036	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,5;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=11648670;PE=7;SR=6;STRANDS=+-:13;SU=13;SVLEN=-1236;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:13:7:6
chr20	15301734	4037	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-9,10;CIEND95=0,1;CIPOS=-6,6;CIPOS95=-1,0;END=15303768;IMPRECISE;PE=57;SR=4;STRANDS=+-:61;SU=61;SVLEN=-2034;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:61:57:4
chr20	31310881	4051	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,4;CIEND95=-3,0;CIPOS=-8,10;CIPOS95=-1,1;END=31312778;IMPRECISE;PE=24;SR=2;STRANDS=+-:26;SU=26;SVLEN=-1897;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:26:24:2
chr20	32815938	4052	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,4;CIPOS95=0,0;END=32819225;PE=56;SR=6;STRANDS=+-:62;SU=62;SVLEN=-3287;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:62:56:6
chr20	42024612	4065	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-8,9;CIEND95=0,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=42025792;IMPRECISE;PE=4;SR=4;STRANDS=+-:8;SU=8;SVLEN=-1180;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr20	52021438	4817_2	N	[CHR6:88217551[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=4817;IMPRECISE;MATEID=4817_1;PE=5;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr20	52021438	4817_2	N	[CHR6:88217551[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,0;EVENT=4817;IMPRECISE;MATEID=4817_1;PE=5;SECONDARY;SR=3;STRANDS=--:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:5:3
chr20	52021643	4818_2	N	N]CHR6:88217546]	.	PASS	CIEND=-9,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4818;MATEID=4818_1;PE=4;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr20	52021643	4818_2	N	N]CHR6:88217546]	.	PASS	CIEND=-9,7;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4818;MATEID=4818_1;PE=4;SECONDARY;SR=4;STRANDS=++:8;SU=8;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:8:4:4
chr21	16588380	4128	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-6,3;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=16591452;PE=61;SR=5;STRANDS=+-:66;SU=66;SVLEN=-3072;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:66:61:5
chr21	18612332	4124	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=18613633;IMPRECISE;PE=7;SR=3;STRANDS=+-:10;SU=10;SVLEN=-1301;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:10:7:3
chr21	25295983	4134	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-5,10;CIPOS95=-1,1;END=25299697;IMPRECISE;PE=16;SR=2;STRANDS=+-:18;SU=18;SVLEN=-3714;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:18:16:2
chr21	27374158	4136	N	<INV>	.	PASS	CIEND=0,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-4,2;CIPOS95=0,0;END=27374706;PE=23;SR=11;STRANDS=++:19,--:15;SU=34;SVLEN=548;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:34:23:11
chr21	28020682	4139	N	<INV>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=28021725;IMPRECISE;PE=32;SR=2;STRANDS=++:26,--:8;SU=34;SVLEN=1043;SVTYPE=INV	GT:SU:PE:SR	./.:34:32:2
chr21	31136207	4145	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,4;CIPOS95=0,0;END=31139186;PE=64;SR=6;STRANDS=+-:70;SU=70;SVLEN=-2979;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:70:64:6
chr21	44970368	4152	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-4,2;CIEND95=0,0;CIPOS=-5,3;CIPOS95=0,0;END=44973300;PE=90;SR=8;STRANDS=+-:98;SU=98;SVLEN=-2932;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:98:90:8
chr22	19277142	4218	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-3,1;END=19280499;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3357;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr22	20950623	4245	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=20953839;PE=195;SR=6;STRANDS=+-:201;SU=201;SVLEN=-3216;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:201:195:6
chr22	21933847	4996_1	N	]CHRUN_GL000220:119468]N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4996;IMPRECISE;MATEID=4996_2;PE=15;SR=2;STRANDS=-+:17;SU=17;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:17:15:2
chr22	21933847	4996_1	N	]CHRUN_GL000220:119468]N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;EVENT=4996;IMPRECISE;MATEID=4996_2;PE=15;SR=2;STRANDS=-+:17;SU=17;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:17:15:2
chr22	22490279	4284	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-3,3;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-3,1;END=22493718;IMPRECISE;PE=4;SR=2;STRANDS=-+:6;SU=6;SVLEN=3439;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:6:4:2
chr22	23632742	4884_2	N	N[CHR9:133607147[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4884;MATEID=4884_1;PE=349;SECONDARY;SR=20;STRANDS=+-:369;SU=369;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:369:349:20
chr22	23632742	4884_2	N	N[CHR9:133607147[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4884;MATEID=4884_1;PE=349;SECONDARY;SR=20;STRANDS=+-:369;SU=369;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:369:349:20
chr22	24195941	4206	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=24198505;IMPRECISE;PE=48;SR=2;STRANDS=+-:50;SU=50;SVLEN=-2564;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:50:48:2
chr22	27168076	4325	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=27169792;PE=37;SR=6;STRANDS=+-:43;SU=43;SVLEN=-1716;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:43:37:6
chr22	32928560	4821_2	N	N[CHR6:24683988[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4821;MATEID=4821_1;PE=14;SECONDARY;SR=6;STRANDS=+-:20;SU=20;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:20:14:6
chr22	32928560	4821_2	N	N[CHR6:24683988[	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-7,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4821;MATEID=4821_1;PE=14;SECONDARY;SR=6;STRANDS=+-:20;SU=20;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:20:14:6
chrX	17287844	4347	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-5,4;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;END=17289055;PE=2;SR=7;STRANDS=+-:9;SU=9;SVLEN=-1211;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:9:2:7
chrX	81651235	4994_2	N	[CHR20:11281584[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4994;MATEID=4994_1;PE=3;SECONDARY;SR=7;STRANDS=--:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:3:7
chrX	81651235	4994_2	N	[CHR20:11281584[N	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=0,0;CIPOS=-10,10;CIPOS95=0,0;EVENT=4994;MATEID=4994_1;PE=3;SECONDARY;SR=7;STRANDS=--:10;SU=10;SVTYPE=BND	GT:SU:PE:SR	./.:10:3:7
chrX	113177912	4399	N	<DUP:TANDEM>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=114399008;IMPRECISE;PE=34;SR=2;STRANDS=-+:36;SU=36;SVLEN=1221096;SVTYPE=DUP:TANDEM	GT:SU:PE:SR	./.:36:34:2
chrX	126597763	4404	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,9;CIEND95=-1,1;CIPOS=-8,9;CIPOS95=-1,1;END=126602396;IMPRECISE;PE=54;SR=3;STRANDS=+-:57;SU=57;SVLEN=-4633;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:57:54:3
chrX	143406976	4406	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,7;CIEND95=-1,0;CIPOS=-10,9;CIPOS95=-1,1;END=143409968;IMPRECISE;PE=34;SR=3;STRANDS=+-:37;SU=37;SVLEN=-2992;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:37:34:3
chrX	144422077	4407	N	<DEL>	.	PASS	CIEND=-10,10;CIEND95=-1,1;CIPOS=-10,10;CIPOS95=-1,1;END=144424505;IMPRECISE;PE=27;SR=2;STRANDS=+-:29;SU=29;SVLEN=-2428;SVTYPE=DEL	GT:SU:PE:SR	./.:29:27:2
