Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
Database contains 599 sequences, 299500 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
AGTRGGG 7 AGTGGGG
GTACCARD 8 GTACCAGG
CAKTTYCA 8 CATTTTCA
CTAATAYA 8 CTAATACA
AAAGATAH 8 AAAGATAC
GYTGCTD 7 GCTGCTG
AAGTSRCT 8 AAGTCACT
AAAATRTG 8 AAAATGTG
CCTGWTAC 8 CCTGTTAC
CAATTTWC 8 CAATTTAC
YACTGCTR 8 CACTGCTA
AACCTCTG 8 AACCTCTG
ARAACAGA 8 AAAACAGA
ATAAAGAC 8 ATAAAGAC
TTACTGTR 8 TTACTGTA

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.273 C 0.227 G 0.227 T 0.273

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
GYTGCTD DREME-6 chr2 + 337154 337160 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr10 + 796426 796432 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr7 + 1855880 1855886 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr9 + 1903519 1903525 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 3781797 3781803 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 4395984 4395990 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr18 + 9866026 9866032 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 13997779 13997785 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr4 + 17862153 17862159 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr20 + 18180586 18180592 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr22 + 19153757 19153763 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr20 + 20946439 20946445 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 + 21817262 21817268 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr2 + 21993247 21993253 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr14 + 22332912 22332918 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 22778624 22778630 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr3 + 26097323 26097329 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr12 + 27547510 27547516 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 27681824 27681830 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr16 + 30377662 30377668 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 30435177 30435183 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 30435180 30435186 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 30435470 30435476 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 30435473 30435479 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 30435476 30435482 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr16 + 31082027 31082033 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr20 + 32915968 32915974 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr8 + 33651265 33651271 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 34511129 34511135 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 34553787 34553793 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr20 + 36993154 36993160 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 38100176 38100182 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 38659130 38659136 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr8 + 38907053 38907059 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr21 + 43000284 43000290 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr17 + 44307930 44307936 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 44865424 44865430 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 47541909 47541915 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr13 + 47874238 47874244 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr17 + 50056771 50056777 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 51872334 51872340 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr12 + 57111999 57112005 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr17 + 62030452 62030458 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 + 66760356 66760362 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr12 + 68443934 68443940 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr16 + 69637434 69637440 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr15 + 69708665 69708671 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr2 + 70799942 70799948 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr17 + 70985126 70985132 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr13 + 76899269 76899275 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr4 + 78011212 78011218 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chrX + 78147357 78147363 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr7 + 79019915 79019921 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr9 + 82783945 82783951 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 83051945 83051951 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr4 + 83622160 83622166 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr14 + 91806289 91806295 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr14 + 94154619 94154625 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr7 + 94321364 94321370 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr15 + 96267852 96267858 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr8 + 96680655 96680661 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr2 + 98320396 98320402 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr13 + 100689370 100689376 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr10 + 106327986 106327992 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr10 + 110048355 110048361 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr4 + 110219166 110219172 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr8 + 112400033 112400039 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 115365976 115365982 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 115495425 115495431 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr8 + 116720554 116720560 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chrX + 118306050 118306056 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 118377400 118377406 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr11 + 120617800 120617806 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr11 + 121122519 121122525 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr10 + 121757476 121757482 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr8 + 122240498 122240504 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr3 + 124559509 124559515 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr7 + 129661873 129661879 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr9 + 134895949 134895955 4.51e-05 0.126 gctGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr9 + 137176764 137176770 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chrX + 137934437 137934443 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr8 + 138991759 138991765 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 139718601 139718607 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chrX + 140172015 140172021 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 143786577 143786583 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr8 + 144317072 144317078 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 145158651 145158657 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 145158842 145158848 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 149731286 149731292 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 + 153866963 153866969 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 158086168 158086174 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 158086242 158086248 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 165079054 165079060 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 165079057 165079063 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 169324332 169324338 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr2 + 171311795 171311801 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 174498165 174498171 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 175983576 175983582 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr3 + 180008554 180008560 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr3 + 192774368 192774374 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr3 + 197359671 197359677 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 217039337 217039343 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 226922271 226922277 4.51e-05 0.126 gctgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 - 1635270 1635276 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr19 - 1635291 1635297 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr19 - 3791309 3791315 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 4396124 4396130 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 - 5222206 5222212 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 8426668 8426674 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr18 - 9865976 9865982 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 10210382 10210388 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 - 10646072 10646078 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 - 10756384 10756390 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 13997732 13997738 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 14606002 14606008 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 16122810 16122816 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr3 - 16884022 16884028 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr3 - 16884117 16884123 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr3 - 16884233 16884239 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 17069124 17069130 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 - 17862103 17862109 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 17868599 17868605 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr19 - 18304633 18304639 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr8 - 22562202 22562208 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr21 - 24419820 24419826 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 - 29879537 29879543 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr13 - 31315113 31315119 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 33434633 33434639 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr20 - 34483769 34483775 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr19 - 35154747 35154753 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr19 - 35234699 35234705 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 36096024 36096030 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr22 - 36372074 36372080 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr19 - 36850446 36850452 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr20 - 36993103 36993109 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 38659078 38659084 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr21 - 39313827 39313833 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr21 - 39313928 39313934 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr2 - 39360532 39360538 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 41262730 41262736 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 42468611 42468617 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 44865374 44865380 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr21 - 46316852 46316858 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 47541859 47541865 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr13 - 47874188 47874194 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr17 - 50056631 50056637 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr10 - 51455942 51455948 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr20 - 52972629 52972635 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 - 53985115 53985121 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 55031280 55031286 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 - 55570865 55570871 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr16 - 56380963 56380969 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 - 59613011 59613017 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr18 - 63759941 63759947 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr17 - 67863007 67863013 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr18 - 69359931 69359937 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr15 - 69708785 69708791 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr2 - 70800062 70800068 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 - 71409142 71409148 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 74099602 74099608 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 76630582 76630588 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr18 - 77054490 77054496 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 77730923 77730929 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 - 79659639 79659645 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 83052065 83052071 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr7 - 87205894 87205900 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 89038083 89038089 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 - 90939422 90939428 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr10 - 91098205 91098211 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 - 91806239 91806245 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 93314591 93314597 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 - 93632502 93632508 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 - 94154760 94154766 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr7 - 94843706 94843712 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr8 - 96680604 96680610 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr8 - 105318924 105318930 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr10 - 110048305 110048311 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 - 110219287 110219293 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr10 - 111649246 111649252 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 113766964 113766970 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 115572875 115572881 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chrX - 116997231 116997237 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chrX - 118306000 118306006 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chrX - 118306190 118306196 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 120001209 120001215 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 121564661 121564667 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr7 - 123215776 123215782 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr3 - 124559353 124559359 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 126112351 126112357 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr7 - 129661823 129661829 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr9 - 137176428 137176434 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr9 - 137176511 137176517 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chrX - 137934387 137934393 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 146728903 146728909 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 148055338 148055344 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 148529606 148529612 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chrX - 148669366 148669372 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 149731690 149731696 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 151540066 151540072 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 152076428 152076434 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 - 158952530 158952536 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr3 - 173195008 173195014 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 - 173842841 173842847 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 174498115 174498121 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 174533213 174533219 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr2 - 175796578 175796584 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 178130455 178130461 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 222064569 222064575 4.51e-05 0.126 GCTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr9 - 1903469 1903475 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 4395934 4395940 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr19 + 6914497 6914503 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 8426719 8426725 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr16 - 9154153 9154159 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 10198464 10198470 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr3 - 11408472 11408478 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr17 + 17497556 17497562 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr20 - 18180536 18180542 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 21804721 21804727 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 - 21817212 21817218 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr21 + 25167121 25167127 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr16 - 26017105 26017111 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 27681774 27681780 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr16 + 28567258 28567264 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr21 - 29254041 29254047 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 + 29879587 29879593 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr13 + 31315163 31315169 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr19 - 34511079 34511085 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr7 - 34884031 34884037 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr18 + 35279312 35279318 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 35602903 35602909 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr21 - 43000234 43000240 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr21 + 46317112 46317118 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 + 49779543 49779549 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr18 - 50193901 50193907 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 + 53985165 53985171 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr10 + 57031537 57031543 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr15 - 60296091 60296097 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr18 + 63759991 63759997 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr7 - 65750853 65750859 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 - 66760307 66760313 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 - 68443884 68443890 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr18 + 69359980 69359986 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr16 - 69637384 69637390 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr15 - 69708615 69708621 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr2 - 70799892 70799898 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 70889832 70889838 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 70890004 70890010 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 + 71409192 71409198 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 76630815 76630821 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr11 + 77730973 77730979 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr17 + 80604517 80604523 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 80850354 80850360 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 83051895 83051901 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr10 + 83750809 83750815 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 85637638 85637644 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr16 + 86165582 86165588 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr2 + 88758914 88758920 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr7 - 91681768 91681774 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr7 - 94321314 94321320 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr7 + 94843756 94843762 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr15 - 95701527 95701533 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr15 + 96267849 96267855 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr9 + 102416456 102416462 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr13 - 103093822 103093828 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr14 - 103611142 103611148 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr4 - 106091016 106091022 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 107236960 107236966 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr9 - 107520369 107520375 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr12 - 111373423 111373429 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 113767017 113767023 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr4 + 116097557 116097563 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr11 - 117406082 117406088 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 121564711 121564717 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 125254454 125254460 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr3 + 130203865 130203871 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 130452960 130452966 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 - 141506266 141506272 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 146728953 146728959 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 152076478 152076484 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr4 - 152146441 152146447 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr6 + 159944393 159944399 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr5 - 164127728 164127734 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr5 + 168748351 168748357 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr3 + 179347775 179347781 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr3 + 192774539 192774545 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 214576394 214576400 9.93e-05 0.2 gttgctg
GYTGCTD DREME-6 chr1 - 217039287 217039293 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr2 - 224663501 224663507 9.93e-05 0.2 GTTGCTG
GYTGCTD DREME-6 chr1 + 236161938 236161944 9.93e-05 0.2 gttgctg
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_13 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif GYTGCTD /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_13
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF707.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

Go to top