Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information



FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]


DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF704.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF704.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
Database contains 600 sequences, 300000 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/MotifData/motif_databases/CIS-BP/Homo_sapiens.meme (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
M0085_1.02 10 TCGCCTGAGG
M0104_1.02 11 ATATTAATTAA
M0105_1.02 9 TTTTAATTG
M0108_1.02 11 GATAATATTGA
M0177_1.02 10 GCCATATGTT
M0178_1.02 10 GACAGCTGTC
M0189_1.02 8 GCACGTGA
M0195_1.02 10 ACCATATGGT
M0196_1.02 10 GGCACGTGTC
M0198_1.02 10 AGCCCGTGCG
M0199_1.02 13 TAACGACACGTGC
M0211_1.02 8 GCACGTGT
M0212_1.02 10 GGCACGTGCC
M0214_1.02 9 AACATATGG
M0216_1.02 10 CGCAGCTGTG
M0217_1.02 10 ACCATATGGT
M0300_1.02 10 AATGACGTCA
M0305_1.02 9 GCCACGTGT
M0307_1.02 8 ATACGTTG
M0395_1.02 8 GTACTAAT
M0396_1.02 10 AACGGTAGCA
M0398_1.02 11 AGGAAGTGCAA
M0404_1.02 10 AAGGGGGGCA
M0405_1.02 10 TGGGCGTGGC
M0408_1.02 10 ATGTGCACAT
M0413_1.02 10 GGTGCGGGAC
M0415_1.02 8 ATAACGGT
M0422_1.02 10 CCGGGGGGTC
M0424_1.02 10 TTTGACAGCT
M0428_1.02 8 AGGAGCAC
M0431_1.02 9 ACGGTAGCA
M0432_1.02 9 CGCGCGCAC
M0433_1.02 10 ATCTAGAACA
M0436_1.02 10 TTGTTTATTG
M0437_1.02 9 TATATATAT
M0442_1.02 9 AATGCAGTG
M0443_1.02 10 TGGGCGTGGC
M0594_1.02 9 ATTTGAATT
M0603_1.02 7 TTAGCGG
M0607_1.02 9 GCGTAAATA
M0608_1.02 10 GGGGGCGTAA
M0609_1.02 10 CCCCGCGGCC
M0610_1.02 9 ATCGCGTTA
M0629_1.02 11 AATGTATCAAT
M0630_1.02 10 AATGTATCAA
M0632_1.02 10 AATGTATCAA
M0633_1.02 10 TAATGTATTA
M0635_1.02 13 AACATGTATAAAA
M0714_1.02 10 AACCGGAAGT
M0718_1.02 10 ATGTAAACAA
M0719_1.02 8 GTAAACAA
M0728_1.02 12 AGTAAACAAACA
M0736_1.02 8 GTAAACAA
M0737_1.02 10 TATGTAAACA
M0747_1.02 10 AATGTAAACA
M0756_1.02 9 GTAAACAAA
M0887_1.02 9 CCTAATGAG
M0890_1.02 8 GTAATCAA
M0891_1.02 10 TTAATTGGTT
M0892_1.02 10 CCTAATTACC
M0893_1.02 10 GTTAATTAAC
M0894_1.02 8 TTAATTAG
M0896_1.02 8 TTAATTAG
M0897_1.02 10 TTTTATGGGC
M0898_1.02 8 TTACGTAA
M0900_1.02 8 TTAATTGG
M0901_1.02 8 CTTGTCAA
M0905_1.02 9 TTAATGACC
M0906_1.02 10 AATTAATTAG
M0931_1.02 9 TAATTAATT
M0937_1.02 7 TGATACC
M0942_1.02 8 TTGTAATG
M0943_1.02 8 GCTAATTA
M0949_1.02 7 TTAATGA
M0952_1.02 8 TGATACCC
M0958_1.02 7 CTAATTA
M0961_1.02 9 CTAATTGGT
M0969_1.02 9 CCAATCAGC
M0975_1.02 9 TAATTAATT
M0994_1.02 9 ATGATACCC
M0996_1.02 7 GAAATCA
M0999_1.02 9 ATTAATTAC
M1007_1.02 9 TTTATGACC
M1012_1.02 9 TTAATGACC
M1016_1.02 7 GTGATAC
M1018_1.02 7 TAATTAA
M1025_1.02 8 GCCAATTA
M1027_1.02 9 TTAATTACC
M1030_1.02 9 GCCACTTAA
M1034_1.02 7 GCAATTA
M1039_1.02 9 GCTAATTGG
M1049_1.02 10 ATGATACCCC
M1070_1.02 9 TTAATGACC
M1071_1.02 8 TTAATGAC
M1073_1.02 9 TTAATGACC
M1110_1.02 10 GGGCAATAGA
M1125_1.02 10 GCTAATTGGC
M1157_1.02 10 TTTTATGACC
M1163_1.02 9 ATTAATTAC
M1266_1.02 10 GACCGAAACC
M1281_1.02 9 CTTACGCAA
M1358_1.02 9 TAACCCTAG
M1359_1.02 10 GTTTGCGCCA
M1418_1.02 8 TGGTACCA
M1432_1.02 10 ATTGACCTCT
M1458_1.02 10 ACTGACCTCG
M1507_1.02 10 AATTTTGGCT
M1528_1.02 10 CCATGGCAAC
M1529_1.02 10 CCATAGCAAC
M1545_1.02 9 CGTACGTCA
M1581_1.02 10 TTTGCTGACT
M1582_1.02 11 ATATATAATAA
M1583_1.02 8 TTCATTGA
M1589_1.02 10 GCAGAACAAT
M1592_1.02 8 AAAACAAT
M1594_1.02 10 CATTGTTCTT
M1601_1.02 9 ATTGTTCTC
M1605_1.02 10 ATTCATCTTT
M1628_1.02 11 AGGTGTGAAGA
M1668_1.02 12 TCCAAACGAGAT
M1838_1.02 15 CATTGCCTCAGGGCA
M1841_1.02 15 GAACACTCTGTTCTT
M1863_1.02 8 GTAAACAT
M1868_1.02 14 ACAGATAAGAATCT
M1871_1.02 10 TGGGTGGGGC
M1882_1.02 21 AAAGTGAAAGTGAAAGTAAAA
M1884_1.02 15 AGCTAAAAATAGCAT
M1889_1.02 10 AAGCACATGG
M1890_1.02 18 AGAGTGCTGATTGGTCCA
M1906_1.02 11 GGGGGCGGGGC
M1915_1.02 20 GCAAGGCATGATGGGAAATC
M1917_1.02 11 GGTCACGTGGC
M1919_1.02 12 CAAGATGGCGGC
M1925_1.02 11 TATTGTGCAAT
M1926_1.02 9 CAGGTGAGG
M1927_1.02 8 GCCACGTG
M1928_1.02 11 GGGAATTTCCC
M1929_1.02 15 CATGTCTGGGCATGT
M1934_1.02 20 AGGTCAGGGTGACCTGGGCC
M1950_1.02 6 GTGGAT
M1955_1.02 11 TTTCCAGGAAA
M1963_1.02 14 GGGGCCGAGGCCTG
M1968_1.02 11 TCCCTGGGGAC
M1970_1.02 6 TGCCAA
M2065_1.02 15 AGGTCAGGGTGACCT
M2264_1.02 8 GCCATCTG
M2267_1.02 11 TTTTATGGCTT
M2268_1.02 11 TATTGCACAAT
M2270_1.02 11 TAATCTAATCA
M2273_1.02 11 GGGCGGGAAGG
M2275_1.02 13 GAACCAGGAAGTG
M2277_1.02 11 ACAGGAAGTGG
M2278_1.02 11 TGTGACTCATT
M2281_1.02 11 TCCAATCCACA
M2283_1.02 15 CAAAAGTAAACAAAG
M2286_1.02 15 TGGACTTTGGACTCT
M2287_1.02 13 GGCCATAAATCAC
M2289_1.02 13 AAGATGATGTCAT
M2292_1.02 11 GGTGACTCATC
M2296_1.02 15 CTGAGTCAGCAATTT
M2299_1.02 13 AGGGACAGCTGCA
M2301_1.02 15 AAATGGACCAATCAG
M2303_1.02 15 TGACCTCTGACCCCG
M2305_1.02 11 TGCGCAGGCGC
M2306_1.02 13 TTCATTTGCATAT
M2307_1.02 15 AGAAAGTGAAAGTGA
M2310_1.02 15 CAAACCACAAACCCC
M2313_1.02 10 CCATTGTTTT
M2314_1.02 15 GGGAGGGGGCGGGGC
M2319_1.02 14 TTCCTTTGATCTTT
M2321_1.02 20 AGACATGCCCAGACATGCCC
M2323_1.02 15 CAGATCTCGCGAGAG
M2385_1.02 11 AAGTAAACAGA
M2387_1.02 10 GTGGGGTGAT
M2388_1.02 10 ATGGGGTGAT
M2390_1.02 8 CAGGAAGG
M2391_1.02 10 GGGGCGGGGC
M2392_1.02 19 GTTGCCATGGCAACCGCGG
M4344_1.02 8 GGTTGCCA
M4427_1.02 21 GTGGCCACCAGGGGGCGCTGT
M4428_1.02 14 GGAACATTCTGTTC
M4438_1.02 15 AGGTCACGGTGACCT
M4444_1.02 14 AGGGGATTTCCCAG
M4451_1.02 11 GGTCACGTGAC
M4452_1.02 15 TCTCGATATGACTCA
M4453_1.02 15 AAGAGGAAGTGAAAC
M4454_1.02 15 AAATCTCGCGAGAAC
M4459_1.02 20 GTGCGGGGGCGGGGGGGGGG
M4461_1.02 21 GCCTTCTGGGAATTGTAGTTC
M4462_1.02 11 CGCCGGAAGTG
M4463_1.02 18 AATGTGGAAATGAGTCAG
M4467_1.02 15 GTGCCAAAAATAGCA
M4469_1.02 14 TCCATGGTGCTGAA
M4471_1.02 15 GCAGCCAAGCGTGAC
M4473_1.02 15 GCCGGCCAATCAGAG
M4476_1.02 15 TCACCTGTTGCTAGG
M4477_1.02 19 CCATGGCCATATAAGGCAA
M4478_1.02 20 CAGGTGATTTCCGGGAAATG
M4479_1.02 11 GCAGCAGCTGT
M4481_1.02 15 GGTCACGTGGCCCGG
M4484_1.02 15 CTGGGAATTGTAGTC
M4509_1.02 17 ATTTGCATAACAAAGGA
M4511_1.02 8 TGACCTCT
M4522_1.02 10 CCGGAAGTGG
M4525_1.02 15 AGCCTCAGGGCATGG
M4526_1.02 15 GGGGGGTGACTCAGC
M4527_1.02 21 GGACTACAACTCCCAGCAGGC
M4532_1.02 10 CCACGTGCTC
M4536_1.02 15 GGGGAGGGCGCGCGG
M4537_1.02 15 GGCGGGAAATTTGAA
M4543_1.02 11 GGAACCACGTG
M4545_1.02 15 AGAAAGTGAAAGTGA
M4551_1.02 17 TTCATACTGGAGAGAAA
M4553_1.02 10 GGTCACGTGC
M4565_1.02 14 CAGGATGAGTCACC
M4567_1.02 15 GCAAAGTAAACAGAG
M4569_1.02 18 GTCCCGGGTTCGAATCCC
M4572_1.02 15 TGCTGACTCAGCAAA
M4600_1.02 11 GCAGATAAGGA
M4604_1.02 21 GGGGAGGAGGGAGGGGAGGAG
M4612_1.02 15 CCGCCAGGGGGCGCC
M4619_1.02 11 GGGTGACTCAT
M4623_1.02 15 CGGTGACTCATCCTT
M4629_1.02 17 CATGACTCAGCAATTTT
M4635_1.02 15 GAAAATGAAACTGAA
M4636_1.02 21 CTGCCCTCATCCAAGATGGCG
M4640_1.02 15 GGGCGGGGGTCTCGG
M4665_1.02 15 CAGATAAGAATCTGT
M4680_1.02 8 GTCACGTG
M4681_1.02 10 TGCTGAGTCA
M4692_1.02 10 ACTACAACTC
M4698_1.02 15 CTGGACTTTGGCCTC
M4702_1.02 8 TGACCTTT
M4708_1.02 10 TATGCAAATA
M4840_1.02 11 AAATGCGCAAC
M4850_1.02 21 TGTTGTGTCCGTGCCATCTGG
M4930_1.02 11 AAATCGTGACT
M4971_1.02 10 GTAACAGCTG
M5116_1.02 9 ACCACCTGT
M5209_1.02 11 GTGGGCGTGGC
M5234_1.02 10 GGTCACGTAC
M5284_1.02 10 GCTAATTAGC
M5287_1.02 13 CTAATTAAATTAA
M5291_1.02 13 TTAATTTAATTAA
M5292_1.02 13 GGATGATGCAATA
M5293_1.02 14 CGATGACGTCATCG
M5294_1.02 10 GTTAAACGGT
M5300_1.02 17 TAATCGGTATTTAATTG
M5302_1.02 14 TGATGACGTCATCA
M5303_1.02 17 TGCTTTCTAGGAATTCA
M5304_1.02 10 ACCATATGGT
M5307_1.02 12 AAACATATGTTT
M5308_1.02 10 ACCATATGTT
M5310_1.02 8 TTAATTGG
M5320_1.02 15 CCCGCATACAACGAA
M5321_1.02 10 AACACGTGTT
M5322_1.02 8 TTTTTATT
M5323_1.02 14 TGATGACGTCACCG
M5325_1.02 14 TGATGACGTGGCAT
M5335_1.02 18 ATCGATAATTTTATCGAT
M5339_1.02 10 GATAATTAGG
M5342_1.02 8 GTAATTGG
M5343_1.02 8 ATAATTAC
M5344_1.02 8 GTAATTGG
M5345_1.02 10 GTTAATCCGC
M5346_1.02 10 GCTAATCCGT
M5348_1.02 13 CTAATCTAATTAA
M5349_1.02 13 CTAATTTAATCAA
M5363_1.02 12 TTTCCCGCCAAA
M5377_1.02 12 AACCCGGAAGTG
M5388_1.02 10 GCTAATTAGC
M5390_1.02 10 GCTAATTGGG
M5394_1.02 10 GTTAATTGGA
M5398_1.02 10 ACCGGAAGTG
M5414_1.02 10 GTTAATTGGG
M5420_1.02 10 ACCGGAAGTA
M5421_1.02 11 AACCGGAAATA
M5422_1.02 10 ACCGGAAGTG
M5425_1.02 15 CCGGAAGCGGAAGTG
M5427_1.02 10 GCTAATTACC
M5428_1.02 10 GCTAATTACC
M5430_1.02 10 ACCACCTGTT
M5435_1.02 14 TCGCTGTGTCATTC
M5445_1.02 14 AGTAAATATTTTTT
M5446_1.02 7 GTAAACA
M5460_1.02 7 GTAAACA
M5471_1.02 14 GTAAACATGTTTAC
M5480_1.02 10 GCTAATTGGT
M5481_1.02 10 GCTAATTGGT
M5487_1.02 10 TATGCGGGTA
M5490_1.02 16 GCTTCGTGGGGGGTCT
M5491_1.02 14 CTTCGCGGGGGGTC
M5493_1.02 8 GTACGTAA
M5497_1.02 17 AACCGGTTTAACCGGTT
M5500_1.02 10 GCTAATCCCC
M5501_1.02 10 CCTAATCCGC
M5502_1.02 10 TTTAATTAGG
M5503_1.02 10 TTTAATTAGT
M5504_1.02 12 TGGCACGTGCCG
M5506_1.02 12 TGGCACGTGCCA
M5509_1.02 10 GGCACGTGTC
M5512_1.02 9 GGTGGGCAT
M5517_1.02 10 ACTAGTTAAC
M5518_1.02 11 TTTTAATTGCT
M5519_1.02 11 TTTTAATTGGT
M5520_1.02 11 TGTTAATTGCT
M5530_1.02 12 TATAATCGTTTT
M5541_1.02 10 GTTAATTACT
M5542_1.02 10 GCTAATTAGT
M5543_1.02 10 CTTAATTAGT
M5544_1.02 10 TTTTTATGGG
M5547_1.02 11 GGTCGTAAAAT
M5551_1.02 9 TTTTATTAC
M5553_1.02 10 CCAATAAAAA
M5555_1.02 10 GTCGTAAAAA
M5557_1.02 9 GTAATAAAA
M5563_1.02 10 GCTAATTAGC
M5567_1.02 13 GAACGTTCTAGAA
M5568_1.02 15 TTCGAAACGTTCGAA
M5571_1.02 10 GACAGGTGTA
M5581_1.02 12 CATGTCATGTAC
M5582_1.02 12 CATGTCATGTAA
M5583_1.02 8 TTAAGTGC
M5584_1.02 13 TTAATCTAATTAA
M5587_1.02 9 ATGACTCAT
M5591_1.02 18 CAAAAAGGGGCGTGGCAT
M5592_1.02 14 AAGGGGGCGTGGCC
M5593_1.02 11 GGGGGCGTGGC
M5594_1.02 13 CTCGACCTAATTA
M5602_1.02 8 TTAATTGG
M5604_1.02 8 TTAATTAA
M5605_1.02 8 TTAATTAA
M5616_1.02 12 GCTATAAATAGC
M5621_1.02 8 CCTGTCAA
M5623_1.02 10 GCTAATTAAC
M5624_1.02 10 AGTAATTAAC
M5627_1.02 10 CGCAGGTGTT
M5628_1.02 8 AGGTGTGA
M5631_1.02 10 GTTAATTAGA
M5632_1.02 10 ATCACGTGAT
M5634_1.02 10 ACCACGTGCC
M5635_1.02 10 TTTAATTACC
M5636_1.02 10 AACAGCTGTT
M5637_1.02 18 TAATTGGTTTTTAATTGC
M5643_1.02 12 ACCGTTAAACGG
M5652_1.02 10 GCCATATGGT
M5653_1.02 10 GACATATGTT
M5660_1.02 15 TTGGCACGGTGCCAA
M5662_1.02 15 TTGGCACCGTGCCAG
M5664_1.02 15 TTGGCACCGTGCCAA
M5672_1.02 10 GCTAATTAGC
M5689_1.02 11 AATTTGCTGAC
M5690_1.02 10 AACATATGTT
M5691_1.02 10 ACCATATGTT
M5693_1.02 10 ACCATATGTT
M5697_1.02 14 ATTATTGATTTTTT
M5702_1.02 17 TGCAGTCATGCGTGACG
M5704_1.02 10 TAATCGATTA
M5705_1.02 8 CTAATTAG
M5709_1.02 10 TAATCGATTA
M5711_1.02 17 TGCAGTCATGCGTGACG
M5714_1.02 11 TAATTTAATTA
M5715_1.02 11 TAATTTAATTA
M5717_1.02 9 CTTAATCCC
M5720_1.02 9 CTTAATCCC
M5722_1.02 12 TGACACCTGTCA
M5729_1.02 9 ATTTGCATA
M5735_1.02 13 AAATTAGCATAAT
M5738_1.02 9 ATTTGCATA
M5740_1.02 14 ATGAATAATTAATG
M5743_1.02 16 ATGCATAATTAATGAG
M5744_1.02 9 ATTTGCATA
M5746_1.02 10 ATAATGAGCT
M5750_1.02 13 GGGGGCCTTGAAA
M5753_1.02 12 CAAGACGCCTTA
M5771_1.02 10 GTTAATTGGC
M5772_1.02 8 TTAATTGG
M5777_1.02 16 CGTTGCCATGGCAACG
M5782_1.02 9 GGATAATCC
M5804_1.02 15 GAGCAACAGGTGGTT
M5805_1.02 13 ATGCAACAGGTGG
M5807_1.02 8 CTAATTGG
M5815_1.02 12 ACAATAACATTG
M5825_1.02 15 AACACTACCATTGTT
M5835_1.02 16 AACAATGTTCATTGTT
M5838_1.02 16 AACAATGTGCAGTGTT
M5856_1.02 12 AGTGGGCGTGGC
M5857_1.02 11 ACCCGGATGTA
M5865_1.02 14 AAAAAGAGGAAGTA
M5873_1.02 10 AGGTGTGAAA
M5875_1.02 20 AGGTGTGAAAAAAGGTGTGA
M5880_1.02 19 AGGTGTGAAATTCACACCT
M5882_1.02 20 TTTCACACCTAGGTGTGAAA
M5883_1.02 16 TCACACCTTCACACCT
M5889_1.02 16 GGTGTGAATTCACACC
M5896_1.02 8 AGGTGTGA
M5903_1.02 12 AAAGATCAAAGG
M5932_1.02 10 GTCACGTGAT
M5934_1.02 12 TGACAGCTGTCA
M5935_1.02 12 TGACAGCTGTCA
M5941_1.02 13 CTAATTTAATTAG
M5944_1.02 8 CTAATTAC
M5945_1.02 8 CTAATTAC
M5949_1.02 8 CTAATTAG
M5955_1.02 11 TAATGGCGGAC
M5958_1.02 13 TATGTCGCGATAG
M5959_1.02 17 TTTCGCCTGGCACGTCA
M5962_1.02 12 TTCGGTGGTCGC
M5965_1.02 15 GCACAGCGGGGGGTC
M5967_1.02 19 ATGTTAAATGTAGATTAAG
M5970_1.02 17 GTCGTGTTGTGGGAAAG
M5971_1.02 14 TCGAGGCTAGCCCA
M5972_1.02 17 GAGTATTATGGGATGGA
M5973_1.02 18 AGGTGTTCTGTTAACACT
M5974_1.02 12 GGGTTCGAGGGT
M5976_1.02 17 TTCGTGGCATTTTTCTA
M5977_1.02 10 GTGGGGGGGG
M5979_1.02 12 TGTGGGAAAAGC
M5980_1.02 10 AGGTAGGTAC
M5981_1.02 15 TTTTCAGTGTGTGCA
M5998_1.02 12 GGTGACGTCATT
M6037_1.02 12 TTTGTCATGTAG
M6111_1.02 13 AGAAAGGGTTAAT
M6114_1.02 10 AAAGCAAACA
M6115_1.02 15 CATGTCTGGGCATGT
M6119_1.02 15 AAAAAGAGGAAGTGG
M6123_1.02 15 GGGGTGGGGGAGGGG
M6131_1.02 21 CCGGTTCAAACCGGTTCTGGC
M6139_1.02 9 GCACGCAAC
M6140_1.02 18 ATTGGTTTTATTGGTTAA
M6141_1.02 12 TAATCCAATTAT
M6144_1.02 10 GCCCCCGGGC
M6146_1.02 14 ACGCGCCTCGGGCG
M6147_1.02 22 TTTAATTTGATTTCGATTAATT
M6149_1.02 13 GGTTGGTATTGTG
M6150_1.02 12 GCCTCCCACGCC
M6151_1.02 8 TCACGTGC
M6152_1.02 10 GTGACGTCAC
M6154_1.02 12 TAAGGAAGAAGG
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M6157_1.02 10 TCATTAATTG
M6159_1.02 16 TTCCTAGAAAGCTTTT
M6161_1.02 20 ACCGGGCCACGTGCAGAGGG
M6162_1.02 14 GGGTCACGTGTCCA
M6163_1.02 12 TTTGTTGTGTTC
M6164_1.02 25 ACATAGTGACACCTAGGTGTGAAAT
M6166_1.02 15 ATTATGTTAAATCCC
M6167_1.02 8 ACATAAAT
M6171_1.02 11 AATTGTGCAAT
M6172_1.02 12 AAGATTGCGCAA
M6173_1.02 13 CAGATTGCAAAAT
M6174_1.02 11 AGCCAATCAGC
M6176_1.02 12 TGACCTTTGACC
M6180_1.02 9 GTGACGTCA
M6181_1.02 11 CACTGACGTCA
M6182_1.02 8 CTAATCCC
M6184_1.02 14 AGGGGGATCGATGG
M6185_1.02 7 CGTTGGC
M6186_1.02 11 TGTTACATAAC
M6187_1.02 13 GGGGATTGCATTC
M6188_1.02 8 ATAATTAT
M6189_1.02 10 GCTAATTACA
M6191_1.02 10 GGCGCGAAAC
M6192_1.02 10 CGCGCGAAAC
M6194_1.02 10 CGCGCCAAAC
M6196_1.02 13 TAGGGCGCGAAAC
M6197_1.02 9 CGTGACGTC
M6199_1.02 11 GGCGTGGGCGG
M6200_1.02 11 AGAGTGGGTGT
M6201_1.02 11 GGCGGCAGGGC
M6204_1.02 15 TAGCAGGAAGTGAGT
M6205_1.02 14 GGCAAACAGGAAAT
M6206_1.02 11 ATAAGGAAGTA
M6207_1.02 9 ACCGGAAGT
M6208_1.02 12 CCCAGGAAGTGC
M6210_1.02 13 TGCCCACGTGGTG
M6211_1.02 14 CGGGGATACGAAAT
M6212_1.02 13 CCCACGTACGCAC
M6213_1.02 11 ACCGGAAATCC
M6215_1.02 9 TGACCTTGA
M6216_1.02 9 TGACCTTGA
M6221_1.02 11 GCGGGAAGTGG
M6222_1.02 8 CAGGAAGT
M6223_1.02 13 GACAGGAAGTAAC
M6224_1.02 17 GCCACAGGAAGTAACAC
M6225_1.02 16 AAGATAAGATAAGATA
M6226_1.02 10 CAGGAAATAA
M6228_1.02 10 CTGACTCATC
M6234_1.02 13 GCAAAGCAAACAA
M6235_1.02 15 CTTAAGTAAACAACG
M6236_1.02 15 TCTGGCAAAACAAAC
M6237_1.02 9 AAACAAACA
M6238_1.02 11 AAAATAAACAT
M6239_1.02 11 AAAAGTAAACA
M6240_1.02 12 GGCCAATCAGAG
M6241_1.02 10 TAAATAAACA
M6242_1.02 13 TAAACAAAAACAA
M6244_1.02 13 AAAAACAAACAAC
M6245_1.02 16 AAAAAGTAAACAAACC
M6246_1.02 13 AGGTAAACAAACA
M6247_1.02 9 AATAAACAA
M6249_1.02 9 AAACAAATT
M6250_1.02 12 AAATAAACAATG
M6251_1.02 12 TTGTGTTTTTTT
M6256_1.02 9 ACAGATAAC
M6257_1.02 17 TAAGAGATAACTTAGAT
M6258_1.02 7 AAGATAA
M6259_1.02 14 CACATGCGGGTACT
M6262_1.02 11 TGCAGTGATTT
M6263_1.02 10 GCTGTGATTT
M6264_1.02 11 CTGGGTGGTCT
M6265_1.02 11 GTGGGTGGTCT
M6266_1.02 11 CTGGGTGGTCC
M6267_1.02 10 GTGGGGGGTC
M6268_1.02 12 AATGCCAGACGC
M6269_1.02 9 ACTCATTGA
M6270_1.02 20 AGGGACGCAGCTGCTCCCCA
M6271_1.02 13 GGGCTCGTGGCGG
M6272_1.02 16 AGGCCACGTGCCGGAT
M6273_1.02 17 GGGGGCACGTGGCATTA
M6274_1.02 9 GGGTTGCCC
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M6276_1.02 16 GCGCTAGCGGACGTTA
M6277_1.02 13 CTGTTACGTAATC
M6278_1.02 12 TAGGGCTGCAAA
M6279_1.02 7 AAAATAC
M6280_1.02 15 AATAATCGCGAATAT
M6281_1.02 15 GGTTAATTATTAACC
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M6287_1.02 14 AGAATGTTCTAGAA
M6289_1.02 12 TCATAAATCATC
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M6291_1.02 10 CATCCATCAA
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M6295_1.02 10 CCATCCATCA
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M6299_1.02 15 AAAGTAATAAATCAT
M6300_1.02 14 GGGCATCAATCAAA
M6301_1.02 10 AATTAAAGCA
M6302_1.02 11 TCCCTAATAAA
M6303_1.02 8 TTAATTGA
M6304_1.02 10 CCATTAAACT
M6306_1.02 12 TGTCAGGGGGCA
M6308_1.02 14 GGAAAGTGAAAGCA
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M6311_1.02 20 TAAAGGAAAGCCAAAAGTGA
M6312_1.02 10 GAAAGTGAAA
M6313_1.02 15 GAGAAAGTGAAACTG
M6314_1.02 12 GAAAGCGAAACT
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M6321_1.02 17 GGCGGGGAGGTGGGGGC
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M6324_1.02 10 TGGGCGGGGC
M6325_1.02 8 GGGGGCGG
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M6327_1.02 7 CTTTGAT
M6328_1.02 13 CACTTTTAATTAG
M6329_1.02 13 AAAATTAATTAAT
M6330_1.02 21 GTGCTGACCCCGCAGCCTTCG
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M6332_1.02 8 TTGCTGAC
M6333_1.02 7 CATGACT
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M6344_1.02 13 TGACAGCTGTCAA
M6345_1.02 10 ATCACATGAC
M6346_1.02 19 CCACGGCGGTGTCACATGC
M6347_1.02 7 TAATTGT
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M6349_1.02 10 TCAACCTGCA
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M6353_1.02 7 GCAGCTG
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M6359_1.02 7 AATGACT
M6360_1.02 12 CATGACTCAGCA
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M6370_1.02 11 GGAATCTCCCT
M6373_1.02 14 CAGCCAATCAGCGC
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M6375_1.02 12 AAACCACTTAAA
M6376_1.02 7 TCAAGTG
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M6378_1.02 13 AATAAGTATATAA
M6379_1.02 11 AGTTAAGTGGA
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M6383_1.02 19 CGTTGACCTTTGACCTTTA
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M6385_1.02 19 CTGAACTTTCTTGACCTCA
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M6393_1.02 9 GTGACCTTT
M6394_1.02 9 GTGACCTTT
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M6400_1.02 8 CTAATCCT
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M6429_1.02 13 CATAATTTATGCA
M6430_1.02 7 TGACCTT
M6432_1.02 14 TGACCTTTGTCCTA
M6433_1.02 18 GTGACCTTTGACCTACTT
M6436_1.02 13 TACAGACTGTTCT
M6438_1.02 15 GAGTAATTAATATAA
M6439_1.02 7 TAATCTG
M6440_1.02 7 TTAATTG
M6441_1.02 21 GGACAGCTGTTCTGTTTCCTG
M6442_1.02 17 CCCTGCCCCCCCCTTCC
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M6454_1.02 12 TGACCTAGTTTT
M6455_1.02 13 CTGACCTACTTTT
M6456_1.02 22 GGGGGGGGGGGTGGTTTGGGGT
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M6557_1.02 12 GGAAAAAGTCGG
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M6559_1.02 16 CCCACGGTTACTGCCG

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF704.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.197 C 0.303 G 0.303 T 0.197


SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES

Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
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M6510_1.02 TEF chr19 + 31204483 31204496 1.92e-06 0.0178 AAATTATGTAAATT
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M6510_1.02 TEF chr16 - 30052731 30052744 4.44e-06 0.0178 TATTTATATTTATT
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M6510_1.02 TEF chr10 + 72580455 72580468 5.12e-06 0.0178 tatttatttaatta
M6510_1.02 TEF chrX + 23772231 23772244 5.15e-06 0.0178 tgattatgtcacaT
M6510_1.02 TEF chr15 + 101945993 101946006 6.02e-06 0.0178 ttttgatgtatctg
M6510_1.02 TEF chr19 - 1886549 1886562 6.59e-06 0.0178 TATTTATTTATCTG
M6510_1.02 TEF chr19 - 31095617 31095630 6.59e-06 0.0178 TGTTTGTGTATCTG
M6510_1.02 TEF chr19 - 31893418 31893431 6.59e-06 0.0178 TGTTTGTTTAACTT
M6510_1.02 TEF chr5 + 157669520 157669533 6.59e-06 0.0178 tatttatttatctg
M6510_1.02 TEF chr10 + 114649457 114649470 6.88e-06 0.0178 tgttgatatcaaag
M6510_1.02 TEF chr6 - 30162803 30162816 7.63e-06 0.0178 TTTTTATATTACTA
M6510_1.02 TEF chr16 + 27663434 27663447 7.71e-06 0.0178 tgtttatttattta
M6510_1.02 TEF chr19 + 43709578 43709591 7.71e-06 0.0178 tgtttatttattta
M6510_1.02 TEF chrX + 45011758 45011771 7.71e-06 0.0178 TGtttatttattta
M6510_1.02 TEF chr9 + 84860889 84860902 7.71e-06 0.0178 TGtttatttattta
M6510_1.02 TEF chr12 + 122919879 122919892 7.71e-06 0.0178 TGtttatttattta
M6510_1.02 TEF chr15 + 101946059 101946072 8.02e-06 0.0178 tttttaaataattt
M6510_1.02 TEF chr1 - 205975024 205975037 8.12e-06 0.0178 TGTGTATGTAAGTG
M6510_1.02 TEF chr19 - 35289815 35289828 8.43e-06 0.0178 TATTTATTTATGTT
M6510_1.02 TEF chrX + 115644690 115644703 8.65e-06 0.0178 TGATAACATCAGTT
M6510_1.02 TEF chr2 + 191020144 191020157 8.75e-06 0.0178 tgttaatgtgtctg
M6510_1.02 TEF chr5 + 78738148 78738161 9.28e-06 0.0178 tattgatatatttt
M6510_1.02 TEF chr2 + 191020170 191020183 9.42e-06 0.0178 tgtctatgtaattt
M6510_1.02 TEF chr5 - 43042651 43042664 9.52e-06 0.0178 TGTTTGTGTCAACT
M6510_1.02 TEF chrX - 63439989 63440002 9.88e-06 0.0178 TTTTTATGTGTATG
M6510_1.02 TEF chr5 - 55464050 55464063 9.93e-06 0.0178 TTTTAATTTATATT
M6510_1.02 TEF chr15 + 101946113 101946126 1.08e-05 0.0178 tatttattttactt
M6510_1.02 TEF chr1 + 7500126 7500139 1.12e-05 0.0178 TGTGTATGTATATG
M6510_1.02 TEF chr1 + 7500205 7500218 1.12e-05 0.0178 TGTGTATGTATATG
M6510_1.02 TEF chr1 + 7500355 7500368 1.12e-05 0.0178 TGTGTATGTATATG
M6510_1.02 TEF chr16 - 22295293 22295306 1.13e-05 0.0178 CACTTATATAAATG
M6510_1.02 TEF chr19 - 31095533 31095546 1.14e-05 0.0178 TTTTTATGTGAGTA
M6510_1.02 TEF chr19 - 30701293 30701306 1.16e-05 0.0178 TGTTTGTGTATGTG
M6510_1.02 TEF chrX + 70582752 70582765 1.16e-05 0.0178 tatttatttatGTg
M6510_1.02 TEF chrX - 24144066 24144079 1.17e-05 0.0178 TTGTAATGTTAATT
M6510_1.02 TEF chr6 + 21565612 21565625 1.25e-05 0.0178 taattatttaatta
M6510_1.02 TEF chr6 + 21565633 21565646 1.25e-05 0.0178 taattatttaatta
M6510_1.02 TEF chrX + 24144085 24144098 1.25e-05 0.0178 tgtttatatgagca
M6510_1.02 TEF chr20 + 45349225 45349238 1.3e-05 0.0178 tttttaaagaaatt
M6510_1.02 TEF chr16 - 46743 46756 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr3 - 9939139 9939152 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr16 - 12062376 12062389 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr11 - 13200711 13200724 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr16 - 14297668 14297681 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr6 - 17217016 17217029 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr6 + 17217147 17217160 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr6 + 17217210 17217223 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr19 + 18106573 18106586 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr16 - 21572543 21572556 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr16 + 21821008 21821021 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr1 + 22980343 22980356 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chrX - 23772042 23772055 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chrX + 24144201 24144214 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr16 + 27663446 27663459 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr19 - 29505926 29505939 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr16 - 30052697 30052710 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr6 - 30162930 30162943 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr16 + 30570755 30570768 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr5 - 32157977 32157990 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr5 - 32158090 32158103 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr19 - 33123072 33123085 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr19 - 33159334 33159347 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr9 + 33474460 33474473 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttT
M6510_1.02 TEF chr19 + 33821499 33821512 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr1 + 35380303 35380316 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr1 + 35380328 35380341 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr17 - 35567516 35567529 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr10 + 35686087 35686100 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr17 - 35763896 35763909 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr19 - 35882171 35882184 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr22 + 36088907 36088920 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr21 - 36123190 36123203 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr1 + 36159060 36159073 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr5 - 36644013 36644026 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr19 - 37160342 37160355 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr17 - 38667239 38667252 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr17 - 39182699 39182712 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr19 - 40567297 40567310 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chrX + 45011770 45011783 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chrX + 45011787 45011800 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr20 - 45349385 45349398 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr12 + 48866616 48866629 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr18 + 48873768 48873781 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr18 - 49506610 49506623 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr18 + 49506696 49506709 1.34e-05 0.0178 tgttaaaataacca
M6510_1.02 TEF chr18 + 49515215 49515228 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr12 - 56220017 56220030 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chrX - 63439752 63439765 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr10 + 69304308 69304321 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttT
M6510_1.02 TEF chr15 + 70866150 70866163 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr10 + 72580480 72580493 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr15 + 75217783 75217796 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr15 - 78404989 78405002 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr9 + 84860921 84860934 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttT
M6510_1.02 TEF chr13 + 100861927 100861940 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr10 - 101751972 101751985 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr15 + 101946109 101946122 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr1 + 113113566 113113579 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr10 - 114649399 114649412 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chrX - 115644598 115644611 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr7 - 115740201 115740214 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr12 + 122919911 122919924 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chrX - 130516287 130516300 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr9 - 137038607 137038620 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr4 - 141686296 141686309 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chrX - 153937196 153937209 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008850 160008863 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112105 190112118 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr3 - 193970590 193970603 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr1 - 225654925 225654938 1.34e-05 0.0178 TATTTATTTATTTT
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626496 230626509 1.34e-05 0.0178 tatttatttatttt
M6510_1.02 TEF chr16 + 5034035 5034048 1.38e-05 0.0178 TGGTGATGTTAACt
M6510_1.02 TEF chr17 - 50707977 50707990 1.39e-05 0.0178 TAGTTACATAAACA
M6510_1.02 TEF chr17 - 78478043 78478056 1.4e-05 0.0178 TGATAATGGTAATG
M6510_1.02 TEF chr10 - 22719879 22719892 1.41e-05 0.0178 TGATTATGCCACTG
M6510_1.02 TEF chr22 - 36088770 36088783 1.41e-05 0.0178 TGATTATGCCACTG
M6510_1.02 TEF chr9 + 33474200 33474213 1.44e-05 0.0178 TGTTTACAGCAGTT
M6510_1.02 TEF chr15 - 78405129 78405142 1.46e-05 0.0178 GGTTTATATATGTG
M6510_1.02 TEF chrX - 130516232 130516245 1.54e-05 0.0178 TGGTAATATCACCG
M6510_1.02 TEF chr17 - 39182868 39182881 1.62e-05 0.0178 TTTTTATTGAACTT
M6510_1.02 TEF chr19 + 30425196 30425209 1.68e-05 0.0178 tatttatgttacca
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626384 230626397 1.69e-05 0.0178 TGTTTACATCTTTG
M6510_1.02 TEF chr17 - 35143251 35143264 1.71e-05 0.0178 TGATTGTAGAAATG
M6510_1.02 TEF chr19 - 29305597 29305610 1.82e-05 0.0178 TTTTTATCTAACTA
M6510_1.02 TEF chr4 + 49510674 49510687 1.82e-05 0.0178 TGTTATTGTAACTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 1917590 1917603 1.82e-05 0.0178 TATTTATTTATTTG
M6510_1.02 TEF chr1 - 6404706 6404719 1.82e-05 0.0178 TATTTATTTATTTG
M6510_1.02 TEF chr16 + 22295520 22295533 1.82e-05 0.0178 tatttatttatttg
M6510_1.02 TEF chr16 + 27663422 27663435 1.82e-05 0.0178 tatttatttatttg
M6510_1.02 TEF chr19 - 30701363 30701376 1.82e-05 0.0178 TGTTTGTGTATTTG
M6510_1.02 TEF chr5 - 34182473 34182486 1.82e-05 0.0178 TATTTATTTATTTG
M6510_1.02 TEF chr19 - 40346441 40346454 1.82e-05 0.0178 TATTTATTTATTTG
M6510_1.02 TEF chr12 - 96428777 96428790 1.82e-05 0.0178 TATTTATTTATTTG
M6510_1.02 TEF chr12 - 110364651 110364664 1.82e-05 0.0178 TATTTATTTATTTG
M6510_1.02 TEF chr5 - 122696848 122696861 1.82e-05 0.0178 TATTTATTTATTTG
M6510_1.02 TEF chr6 + 21565603 21565616 1.87e-05 0.0178 tagttattttaatt
M6510_1.02 TEF chrX - 63439813 63439826 1.89e-05 0.0178 TTTTGATGTAGTTT
M6510_1.02 TEF chrX + 130516361 130516374 1.96e-05 0.0178 TGGTAATATCTGTT
M6510_1.02 TEF chr1 + 23562636 23562649 1.98e-05 0.0178 TGATAATGTTGCTT
M6510_1.02 TEF chr10 - 72580459 72580472 1.98e-05 0.0178 TAATTAATTAAATA
M6510_1.02 TEF chr1 - 113113498 113113511 1.98e-05 0.0178 TGGTTATACAAGTA
M6510_1.02 TEF chr17 - 26603891 26603904 2.05e-05 0.0178 TTTTTATGTGAAGA
M6510_1.02 TEF chrX - 63439650 63439663 2.08e-05 0.0178 TGTTGATGTAGGCA
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M6510_1.02 TEF chr5 + 157669500 157669513 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr5 + 157669504 157669517 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr5 + 157669508 157669521 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr5 + 157669512 157669525 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr5 + 157669516 157669529 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008854 160008867 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008858 160008871 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008862 160008875 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008866 160008879 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008870 160008883 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008874 160008887 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008878 160008891 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008882 160008895 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008886 160008899 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr5 - 160008890 160008903 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112109 190112122 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112113 190112126 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112117 190112130 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112121 190112134 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112125 190112138 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112129 190112142 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112133 190112146 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112137 190112150 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr3 - 193970594 193970607 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr3 - 193970598 193970611 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr3 - 193970602 193970615 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr3 - 193970606 193970619 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr3 - 193970610 193970623 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr3 - 193970614 193970627 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr3 - 193970618 193970631 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr3 - 193970622 193970635 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr1 + 204720721 204720734 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 204720725 204720738 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 204720729 204720742 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 204720733 204720746 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 204720737 204720750 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 204720741 204720754 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 204720745 204720758 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 223186980 223186993 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 223186984 223186997 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 223186988 223187001 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 223186992 223187005 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 223186996 223187009 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 223187000 223187013 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 223187004 223187017 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 - 225654929 225654942 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr1 - 225654933 225654946 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr1 - 225654937 225654950 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr1 - 225654941 225654954 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr1 - 225654945 225654958 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr1 - 225654949 225654962 2.83e-05 0.0178 TATTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626468 230626481 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626472 230626485 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626476 230626489 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626480 230626493 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626484 230626497 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626488 230626501 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626492 230626505 2.83e-05 0.0178 tatttatttattta
M6510_1.02 TEF chr16 - 46739 46752 2.86e-05 0.0179 TATTTATTTTATTT
M6510_1.02 TEF chr19 - 3985465 3985478 2.86e-05 0.0179 TGTTGACGTCAGCG
M6510_1.02 TEF chr1 + 35380307 35380320 2.86e-05 0.0179 tatttattttattt
M6510_1.02 TEF chrX + 45011774 45011787 2.86e-05 0.0179 tatttattttattt
M6510_1.02 TEF chr12 - 108982761 108982774 2.89e-05 0.018 TGGTGATGTTGATG
M6510_1.02 TEF chr12 + 113059434 113059447 2.89e-05 0.018 TGGTGATGTTGATG
M6510_1.02 TEF chr19 - 31095476 31095489 2.97e-05 0.0185 TGTTTACATGTCTA
M6510_1.02 TEF chr16 - 14297704 14297717 3.05e-05 0.0189 TGGTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chrX - 130516143 130516156 3.14e-05 0.0195 TGATAGAATAAATT
M6510_1.02 TEF chr3 + 9939290 9939303 3.15e-05 0.0195 tgtttactgatatg
M6510_1.02 TEF chr1 + 204720749 204720762 3.21e-05 0.0199 tatttatttataga
M6510_1.02 TEF chr1 + 223187008 223187021 3.21e-05 0.0199 tatttatttataga
M6510_1.02 TEF chrX + 63439532 63439545 3.23e-05 0.0199 tatttaggtcaata
M6510_1.02 TEF chr12 - 108983112 108983125 3.23e-05 0.0199 TGATTATGGTGATT
M6510_1.02 TEF chr19 - 31204483 31204496 3.29e-05 0.0203 AATTTACATAATTT
M6510_1.02 TEF chr22 - 45979870 45979883 3.32e-05 0.0205 TGTTTGTGTGATTT
M6510_1.02 TEF chr8 + 10839886 10839899 3.35e-05 0.0206 TGGTGACGTCAGTA
M6510_1.02 TEF chr6 - 21565872 21565885 3.35e-05 0.0206 AGTTTATAGCAATA
M6510_1.02 TEF chr16 + 30045670 30045683 3.38e-05 0.0208 tgttgatgtgtttg
M6510_1.02 TEF chr19 - 57240488 57240501 3.4e-05 0.0209 AGTTAATGTAGTTT
M6510_1.02 TEF chr19 - 29305381 29305394 3.53e-05 0.0216 TGTTTATCTATCCT
M6510_1.02 TEF chr1 + 223187012 223187025 3.67e-05 0.0224 tatttatagatagg
M6510_1.02 TEF chr8 + 22451016 22451029 3.68e-05 0.0225 ttttaatagagatg
M6510_1.02 TEF chr10 + 35686260 35686273 3.72e-05 0.0227 ttttaatagaaaca
M6510_1.02 TEF chr15 + 101946133 101946146 3.82e-05 0.0233 tatttgtgttactt
M6510_1.02 TEF chr5 - 2531465 2531478 3.89e-05 0.0237 TGTTTGTGTGTATG
M6510_1.02 TEF chr5 - 2531679 2531692 3.89e-05 0.0237 TGTTTGTGTGTATG
M6510_1.02 TEF chr18 - 49506742 49506755 3.93e-05 0.0238 TTTTGATAGAGATT
M6510_1.02 TEF chrX - 153937024 153937037 3.93e-05 0.0238 TTTTTGTATAGATG
M6510_1.02 TEF chr1 - 213015718 213015731 3.93e-05 0.0238 CGATTATAGAGATT
M6510_1.02 TEF chr1 + 204720563 204720576 4.14e-05 0.0251 tgataatatctatc
M6510_1.02 TEF chr1 - 22650373 22650386 4.21e-05 0.0254 TGTGTATGTATGTG
M6510_1.02 TEF chr19 - 31095234 31095247 4.21e-05 0.0254 TGTCTATGTATGTG
M6510_1.02 TEF chr21 - 45591820 45591833 4.21e-05 0.0254 TGTGTATGTATGTG
M6510_1.02 TEF chr1 - 205975063 205975076 4.21e-05 0.0254 TGTGTATGTATGTG
M6510_1.02 TEF chr1 + 27182132 27182145 4.25e-05 0.0256 tatttattgagatg
M6510_1.02 TEF chrX + 70582756 70582769 4.25e-05 0.0256 tatttatGTgatgg
M6510_1.02 TEF chr10 + 71886430 71886443 4.25e-05 0.0256 tatttattgagatg
M6510_1.02 TEF chr12 - 108983217 108983230 4.29e-05 0.0258 TGATTATGGTGATG
M6510_1.02 TEF chr19 - 35882154 35882167 4.33e-05 0.0259 TTTTTATTTTTATT
M6510_1.02 TEF chr19 - 35882160 35882173 4.33e-05 0.0259 TTTTTATTTTTATT
M6510_1.02 TEF chr19 - 40346486 40346499 4.33e-05 0.0259 TTTTTATTTTTATT
M6510_1.02 TEF chr10 + 69304263 69304276 4.33e-05 0.0259 tttttatttttatt
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626458 230626471 4.33e-05 0.0259 TTTTTATTtttatt
M6510_1.02 TEF chr19 + 12696652 12696665 4.35e-05 0.026 TGATGACGTTTATG
M6510_1.02 TEF chr17 + 7718061 7718074 4.39e-05 0.0262 TGCTGGTATAAATA
M6510_1.02 TEF chr5 - 2531459 2531472 4.75e-05 0.0283 TGTGTATGTCTATG
M6510_1.02 TEF chr3 - 196568286 196568299 4.75e-05 0.0283 TTTTTGTGTAGCTT
M6510_1.02 TEF chr19 + 35323728 35323741 4.77e-05 0.0284 tatttatttagaga
M6510_1.02 TEF chr6 - 17217024 17217037 4.86e-05 0.0285 TTTTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr16 + 22295484 22295497 4.86e-05 0.0285 tttttatttattta
M6510_1.02 TEF chr8 + 22450797 22450810 4.86e-05 0.0285 TTtttatttattta
M6510_1.02 TEF chrX + 24144169 24144182 4.86e-05 0.0285 tttttatttattta
M6510_1.02 TEF chr9 + 33474424 33474437 4.86e-05 0.0285 TTtttatttattta
M6510_1.02 TEF chr5 - 34182509 34182522 4.86e-05 0.0285 TTTTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr19 + 35323692 35323705 4.86e-05 0.0285 tttttatttattta
M6510_1.02 TEF chr10 + 71886390 71886403 4.86e-05 0.0285 TTtttatttattta
M6510_1.02 TEF chr1 + 84620191 84620204 4.86e-05 0.0285 TTtttatttattta
M6510_1.02 TEF chr9 - 137038639 137038652 4.86e-05 0.0285 TTTTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chrX - 153937232 153937245 4.86e-05 0.0285 TTTTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr4 - 190112141 190112154 4.86e-05 0.0285 TTTTTATTTATTTA
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626464 230626477 4.86e-05 0.0285 TTtttatttattta
M6510_1.02 TEF chr19 - 30701431 30701444 4.88e-05 0.0286 TGTTTGTGTCTGTG
M6510_1.02 TEF chr19 - 37160446 37160459 4.93e-05 0.0288 TGTTGATTTCTACT
M6510_1.02 TEF chr10 + 72580459 72580472 4.93e-05 0.0288 tatttaattaatta
M6510_1.02 TEF chr9 - 136308537 136308550 4.97e-05 0.0291 TGTTTGTATGAAGT
M6510_1.02 TEF chr6 + 21565842 21565855 5.04e-05 0.0294 tgtttatctgaagt
M6510_1.02 TEF chr19 - 29305349 29305362 5.09e-05 0.0297 TATTTATCTATCTA
M6510_1.02 TEF chr19 + 43709626 43709639 5.11e-05 0.0298 tatttacttatttt
M6510_1.02 TEF chr19 - 30408834 30408847 5.13e-05 0.0298 TGAATATATAGATG
M6510_1.02 TEF chr17 - 78477862 78477875 5.13e-05 0.0298 TGGTGATGGTAATA
M6510_1.02 TEF chr10 + 72580463 72580476 5.27e-05 0.0306 taattaattaattt
M6510_1.02 TEF chr10 - 22326030 22326043 5.35e-05 0.031 TTATTATAAAACTT
M6510_1.02 TEF chr16 + 22295452 22295465 5.38e-05 0.0312 TAATAATTTCTATT
M6510_1.02 TEF chr22 + 36088911 36088924 5.4e-05 0.0312 tatttatttttctt
M6510_1.02 TEF chr18 - 49506696 49506709 5.4e-05 0.0312 TGGTTATTTTAACA
M6510_1.02 TEF chr10 + 35685895 35685908 5.52e-05 0.0319 TTTTTAAATATTTG
M6510_1.02 TEF chr19 - 43709828 43709841 5.55e-05 0.032 TTTTTAAATATGTA
M6510_1.02 TEF chr1 - 22650121 22650134 5.57e-05 0.0321 TGTGTATATATGTG
M6510_1.02 TEF chr1 + 230626262 230626275 5.57e-05 0.0321 TTAAAATGTAAATT
M6510_1.02 TEF chr4 - 78704440 78704453 5.64e-05 0.0324 TATTTATTTCACTC
M6510_1.02 TEF chr4 - 78704534 78704547 5.64e-05 0.0324 TATTTATTTCACTC
M6510_1.02 TEF chr1 + 23562293 23562306 5.72e-05 0.0328 TTTTTATTTTTATG
M6510_1.02 TEF chr10 + 100987830 100987843 5.95e-05 0.0341 TGACTATAGAAATG
M6510_1.02 TEF chr3 + 9939095 9939108 5.98e-05 0.0343 tgatcatgtcattg
M6510_1.02 TEF chr9 - 134946567 134946580 6.03e-05 0.0346 TGTGAATGTATCTG
M6510_1.02 TEF chr12 - 103966314 103966327 6.06e-05 0.0347 TACTAATATATTTT
M6510_1.02 TEF chr5 - 6448198 6448211 6.09e-05 0.0348 TGTGTATGTAATGT
M6510_1.02 TEF chr5 + 157669692 157669705 6.11e-05 0.0349 ttttagtataaacg

DEBUGGING INFORMATION

Command line:

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Settings:

output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF704.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_16 MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/MotifData/motif_databases/CIS-BP/Homo_sapiens.meme sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF704.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF704.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF704.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background alphabet = DNA max stored scores = 100000
allow clobber = true compute q-values = true parse genomic coord. = true
text only = false scan both strands = true max strand = false
threshold type = p-value output theshold = 0.0001 pseudocount = 0.1
alpha = 1 verbosity = 1

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