Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information



FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

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If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]


DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
Database contains 600 sequences, 300000 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
TAAATAAA 8 TAAATAAA
RTCTCAA 7 GTCTCAA
GAGTCTY 7 GAGTCTC
GGYRACA 7 GGCGACA
DCTC 4 TCTC
CWGSC 5 CAGCC
CCCRCC 6 CCCACC
ACAYACAC 8 ACACACAC

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/background):
A 0.280 C 0.220 G 0.220 T 0.280


SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES

Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
RTCTCAA DREME-2 chr22_KI270733v1_random - 136582 136588 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 1939347 1939353 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 2484509 2484515 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr19 - 5689661 5689667 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 6404702 6404708 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 7449838 7449844 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 7450032 7450038 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 8093858 8093864 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 9255322 9255328 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 - 10798845 10798851 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 - 12062174 12062180 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 + 12062371 12062377 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 12113884 12113890 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 13673167 13673173 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 14997255 14997261 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr10 - 15018544 15018550 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 15575772 15575778 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 16493244 16493250 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 16493444 16493450 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr22 + 18020908 18020914 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 19188013 19188019 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 19255516 19255522 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 19255637 19255643 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX - 19760181 19760187 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 - 21572711 21572717 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 - 21821025 21821031 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 - 22295531 22295537 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr8 - 22450851 22450857 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX + 23771947 23771953 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chrX + 23880693 23880699 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chrX - 24144215 24144221 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 24593909 24593915 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 24594106 24594112 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr6 - 25947460 25947466 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 25947660 25947666 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr10 - 27970759 27970765 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr8 + 28291544 28291550 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr6 - 28894788 28894794 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 28894997 28895003 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 29505920 29505926 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr16 + 30052691 30052697 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr7 - 30295157 30295163 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 - 30570768 30570774 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 + 30642382 30642388 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr16 - 30642521 30642527 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 + 30642708 30642714 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 31105862 31105868 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 31361330 31361336 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr6 - 31755167 31755173 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 - 31755377 31755383 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr20 - 32118651 32118657 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr20 + 32118843 32118849 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 32157972 32157978 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 32158085 32158091 6.55e-05 0.14 GTCTCAa
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 32176588 32176594 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 32326142 32326148 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 - 32367229 32367235 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 32398575 32398581 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr21 - 32493815 32493821 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 32609117 32609123 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr21 - 32695862 32695868 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 32699903 32699909 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 33123066 33123072 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr19 - 33159251 33159257 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 33378134 33378140 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr9 + 33474670 33474676 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 35380343 35380349 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr19 - 35386173 35386179 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr10 - 35406405 35406411 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 35421203 35421209 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr19 - 35461887 35461893 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr19 - 35461901 35461907 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 35860386 35860392 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 35860705 35860711 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr22 - 36088736 36088742 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr21 - 36123009 36123015 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr21 + 36123182 36123188 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 36159072 36159078 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 36644006 36644012 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr20 - 37059968 37059974 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr20 + 37060167 37060173 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 37160336 37160342 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr21 - 37275043 37275049 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr8 - 37892469 37892475 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr8 + 37892652 37892658 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 37918865 37918871 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 38045303 38045309 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 38318842 38318848 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 38667233 38667239 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 40103771 40103777 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr19 - 40301356 40301362 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 40301556 40301562 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 40325046 40325052 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 40346437 40346443 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 40567291 40567297 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr22 - 40625573 40625579 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 41191798 41191804 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr8 - 41847980 41847986 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr22 - 42473887 42473893 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr22 - 42474094 42474100 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr22 + 43019236 43019242 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr22 + 43019411 43019417 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 43576320 43576326 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr19 - 43709422 43709428 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr19 + 43709683 43709689 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr21 - 43905207 43905213 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX - 45011801 45011807 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX + 45011865 45011871 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 45093859 45093865 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 45094072 45094078 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr11 - 45672818 45672824 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr11 + 45673025 45673031 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 46380633 46380639 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 - 46830128 46830134 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 47544729 47544735 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr18 - 48873780 48873786 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr18 + 48873980 48873986 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr18 - 49515228 49515234 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 50718035 50718041 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 50795368 50795374 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 51873526 51873532 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr20 + 52000684 52000690 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 52848085 52848091 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 52879980 52879986 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 53550318 53550324 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 53779845 53779851 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 54312896 54312902 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 54313110 54313116 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 55463630 55463636 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 56219810 56219816 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 56220011 56220017 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr3 + 56995687 56995693 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr3 - 56995695 56995701 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 59442781 59442787 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 59594535 59594541 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr3 + 61732703 61732709 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 62218011 62218017 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr17 - 63255120 63255126 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr15 - 64346472 64346478 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 - 66760127 66760133 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr11 - 67122691 67122697 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 67536898 67536904 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 67537279 67537285 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr16 + 67555247 67555253 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr16 - 67555484 67555490 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 67698977 67698983 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 67699178 67699184 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chrX + 68078978 68078984 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 68235395 68235401 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr7 - 69413121 69413127 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 69982966 69982972 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chrX + 71116778 71116784 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr10 - 72580492 72580498 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX - 72720026 72720032 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX + 72720225 72720231 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr13 - 73934991 73934997 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr10 + 74485456 74485462 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 75888150 75888156 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr17 + 75888347 75888353 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 - 76779271 76779277 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX - 78028038 78028044 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX - 78028203 78028209 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX + 78081845 78081851 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr15 + 78404983 78404989 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr13 - 80358341 80358347 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr15 + 80382906 80382912 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 82260194 82260200 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chrX - 83164028 83164034 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX + 83164227 83164233 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 84620428 84620434 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 84892207 84892213 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr2 - 85238835 85238841 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr10 - 86796592 86796598 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 87555093 87555099 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr10 - 88419800 88419806 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 89778880 89778886 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr15 - 90182641 90182647 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 95944374 95944380 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 95944417 95944423 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 96428773 96428779 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 96818752 96818758 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 - 96818941 96818947 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 96819140 96819146 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr2 - 96889474 96889480 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr2 + 96889672 96889678 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 100011934 100011940 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr10 + 101751966 101751972 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr10 - 101752213 101752219 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr14 - 102639280 102639286 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr10 + 103000231 103000237 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr10 - 103000469 103000475 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr10 + 103359647 103359653 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr6 - 105985060 105985066 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX + 107810214 107810220 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 110265613 110265619 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 110265797 110265803 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 110387440 110387446 6.55e-05 0.14 GTCTCaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 112328154 112328160 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 113113578 113113584 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr7 + 115740196 115740202 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 115971933 115971939 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 116124258 116124264 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 117200315 117200321 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 117203962 117203968 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX - 120664763 120664769 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 121177933 121177939 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr12 - 121912059 121912065 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr12 + 122513189 122513195 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 122696844 122696850 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 - 125579999 125580005 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 - 126819505 126819511 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 126819702 126819708 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 127023725 127023731 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr2 + 128228019 128228025 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 128430844 128430850 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr9 - 128838978 128838984 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX - 129554747 129554753 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX - 130362153 130362159 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr9 + 130700233 130700239 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr9 - 130700374 130700380 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr9 - 130827690 130827696 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr9 + 130827888 130827894 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chrX - 133750869 133750875 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX + 133751067 133751073 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr9 + 135985307 135985313 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chrX - 136122293 136122299 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX - 136777020 136777026 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr9 + 137038601 137038607 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chrX - 137246794 137246800 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chrX + 137246993 137246999 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr6 - 138177105 138177111 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 138525522 138525528 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr4 - 139240599 139240605 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr8 + 140473012 140473018 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 147541401 147541407 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 148280180 148280186 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr7 + 149108086 149108092 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr7 - 150367072 150367078 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr6 + 152421920 152421926 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chrX + 153937190 153937196 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 155225048 155225054 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 155225327 155225333 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 155225527 155225533 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr7 - 155519315 155519321 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr7 + 155519515 155519521 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 155575658 155575664 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 155575839 155575845 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 155576036 155576042 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 160008844 160008850 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 - 160243037 160243043 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 - 168286833 168286839 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 168287033 168287039 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr3 - 172143704 172143710 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr3 + 172143737 172143743 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr3 - 172144006 172144012 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr5 + 175559109 175559115 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr5 - 177345785 177345791 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr4 + 190112100 190112106 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr2 + 190365820 190365826 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 196145372 196145378 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 196145570 196145576 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 199999848 199999854 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr2 + 216518696 216518702 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr2 - 216518920 216518926 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 226221759 226221765 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 226252100 226252106 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 226748003 226748009 6.55e-05 0.14 gtctcaa
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 227253391 227253397 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 229919724 229919730 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 + 233783355 233783361 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 240620910 240620916 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 245044516 245044522 6.55e-05 0.14 GTCTCAA
RTCTCAA DREME-2 chr1 - 245044593 245044599 6.55e-05 0.14 GTCTCAA

DEBUGGING INFORMATION

Command line:

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/fimo_out_12 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/background --motif RTCTCAA /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa

Settings:

output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/fimo_out_12 MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/dreme_out/dreme.xml sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF596.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/background alphabet = DNA max stored scores = 100000
allow clobber = true compute q-values = true parse genomic coord. = true
text only = false scan both strands = true max strand = false
threshold type = p-value output theshold = 0.0001 pseudocount = 0.1
alpha = 1 verbosity = 1

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