Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
Database contains 600 sequences, 300000 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
GGAGGGRR 8 GGAGGGAG
CCSCCAC 7 CCCCCAC
STGASTCA 8 CTGAGTCA
RCGCGS 6 GCGCGG
CCDCCTCC 8 CCTCCTCC

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/background):
A 0.186 C 0.314 G 0.314 T 0.186

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
STGASTCA DREME-3 chr17 - 3890212 3890219 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 3890337 3890344 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 4014016 4014023 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 - 4943228 4943235 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 6336345 6336352 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr21 - 26796289 26796296 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 - 31777361 31777368 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr20 - 32484112 32484119 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 39403614 39403621 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 39403649 39403656 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 47743280 47743287 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 51122058 51122065 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 52874452 52874459 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr11 - 62881661 62881668 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 - 73685389 73685396 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr7 - 100478591 100478598 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 - 102806616 102806623 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 112704964 112704971 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr4 - 143184996 143185003 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 153566731 153566738 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chrX - 154369735 154369742 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 3435244 3435251 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 4065313 4065320 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 7441006 7441013 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 10249604 10249611 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 + 30065475 30065482 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr20 + 32681562 32681569 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr20 + 36154266 36154273 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr20 + 36154280 36154287 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 40715788 40715795 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 40831915 40831922 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 41862455 41862462 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr21 + 43728528 43728535 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 51121973 51121980 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 57112277 57112284 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 68292203 68292210 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 123251086 123251093 1.16e-05 0.139 ctgagtca
STGASTCA DREME-3 chr5 + 134511264 134511271 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 + 149576412 149576419 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 150640673 150640680 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 154682983 154682990 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 155001105 155001112 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 155017289 155017296 1.16e-05 0.139 CTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 182617933 182617940 1.16e-05 0.139 ctgagtca
STGASTCA DREME-3 chr4 + 185560010 185560017 1.16e-05 0.139 ctgagtca
STGASTCA DREME-3 chr19 - 4065314 4065321 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 - 4978919 4978926 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 - 4978919 4978926 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 6336419 6336426 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 6764784 6764791 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 7441007 7441014 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 - 16826191 16826198 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 27011182 27011189 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr20 - 32681563 32681570 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr20 - 36154281 36154288 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 40715789 40715796 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 44087007 44087014 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 68292204 68292211 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 - 70508005 70508012 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr10 - 97542357 97542364 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 - 101080776 101080783 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr9 - 126651257 126651264 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr7 - 143380988 143380995 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 156660318 156660325 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 177496862 177496869 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 3890336 3890343 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 + 4943227 4943234 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr10 + 21518493 21518500 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 + 23629858 23629865 2.32e-05 0.139 ctgactca
STGASTCA DREME-3 chr1 + 27599334 27599341 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 32747131 32747138 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 39403648 39403655 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 40715909 40715916 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 52874451 52874458 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 + 74225095 74225102 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 + 75579353 75579360 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr7 + 100478590 100478597 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 107542677 107542684 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 111593152 111593159 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr4 + 143184995 143185002 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 155017570 155017577 2.32e-05 0.139 ctgactca
STGASTCA DREME-3 chr1 + 224708009 224708016 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 224708286 224708293 2.32e-05 0.139 CTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 1111420 1111427 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 1747345 1747352 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 - 3021121 3021128 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 9075760 9075767 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 17711043 17711050 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr10 - 21518494 21518501 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 - 24238416 24238423 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 27599335 27599342 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 35694343 35694350 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr9 - 35907963 35907970 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr22 - 37677200 37677207 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 38827726 38827733 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 - 39152825 39152832 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 - 39152908 39152915 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 40715910 40715917 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr18 - 45016834 45016841 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 47232773 47232780 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 49403636 49403643 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 56080056 56080063 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 - 74178062 74178069 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 - 74225096 74225103 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 - 75579354 75579361 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 153566693 153566700 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 155017571 155017578 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 156114233 156114240 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 172903990 172903997 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 183234685 183234692 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 224708010 224708017 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 224708287 224708294 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 1747473 1747480 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 1950916 1950923 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 1951010 1951017 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr4 + 2330247 2330254 3.49e-05 0.139 gtgagtca
STGASTCA DREME-3 chr16 + 3020975 3020982 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 + 3912080 3912087 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 6764783 6764790 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 10115244 10115251 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 11694205 11694212 3.49e-05 0.139 gtgagtca
STGASTCA DREME-3 chr1 + 27011181 27011188 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr22 + 37145743 37145750 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 52244252 52244259 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 + 67175059 67175066 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr10 + 72260629 72260636 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 89524587 89524594 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr10 + 97542337 97542344 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 + 101080755 101080762 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 + 101080775 101080782 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr10 + 113681018 113681025 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 + 125430281 125430288 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr7 + 143380987 143380994 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chrX + 155026609 155026616 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 156114284 156114291 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 156660317 156660324 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 177496861 177496868 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 203650426 203650433 3.49e-05 0.139 GTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 - 3020976 3020983 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 3435245 3435252 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 - 3912081 3912088 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 10115245 10115252 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 10249605 10249612 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr2 - 11830065 11830072 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 - 30065476 30065483 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 30727993 30728000 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 - 35726501 35726508 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr20 - 36154267 36154274 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr21 - 43728529 43728536 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 44086934 44086941 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 52244253 52244260 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 - 67175060 67175067 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr10 - 72260630 72260637 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 89524588 89524595 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr10 - 97542338 97542345 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 - 101080756 101080763 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 111592925 111592932 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr10 - 113681019 113681026 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 - 125430282 125430289 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 155001106 155001113 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 156114285 156114292 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 159924637 159924644 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 1111419 1111426 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 1747344 1747351 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 + 3021120 3021127 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 + 4943498 4943505 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 6336344 6336351 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr2 + 11830409 11830416 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 + 23629823 23629830 4.65e-05 0.139 gtgactca
STGASTCA DREME-3 chr3 + 24238415 24238422 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr21 + 26796166 26796173 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr2 + 28392860 28392867 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 28718258 28718265 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 + 31777360 31777367 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr20 + 32484111 32484118 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 35694342 35694349 4.65e-05 0.139 gtgactca
STGASTCA DREME-3 chr9 + 35907962 35907969 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr22 + 37677199 37677206 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 38827725 38827732 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 + 39152824 39152831 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 + 39152907 39152914 4.65e-05 0.139 gtgactca
STGASTCA DREME-3 chr18 + 45016833 45016840 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 47232772 47232779 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 47743256 47743263 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 47743279 47743286 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr18 + 49017286 49017293 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 51122057 51122064 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 52874366 52874373 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 56080055 56080062 4.65e-05 0.139 GTGActca
STGASTCA DREME-3 chr11 + 62881660 62881667 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 112704963 112704970 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 153566692 153566699 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 153566730 153566737 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 156114232 156114239 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 235504968 235504975 4.65e-05 0.139 GTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 1592566 1592573 6.03e-05 0.161 CTGATTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 - 32190473 32190480 6.03e-05 0.161 CTGATTCA
STGASTCA DREME-3 chr22 - 37432568 37432575 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr8 - 37452902 37452909 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr22 - 37563482 37563489 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 48372986 48372993 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr11 - 62881759 62881766 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr3 - 173395945 173395952 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 183234741 183234748 6.03e-05 0.161 CTGATTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 224708271 224708278 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 234723962 234723969 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 1592565 1592572 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr18 + 3448428 3448435 6.03e-05 0.161 CTGATTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 6764394 6764401 6.03e-05 0.161 CTGATTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 + 32190472 32190479 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr20 + 36455352 36455359 6.03e-05 0.161 ctGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 38846013 38846020 6.03e-05 0.161 CTGATTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 48372985 48372992 6.03e-05 0.161 ctgattca
STGASTCA DREME-3 chr17 + 58417455 58417462 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 76697842 76697849 6.03e-05 0.161 CTGATTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 + 89489183 89489190 6.03e-05 0.161 CTGAATCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 122887569 122887576 6.03e-05 0.161 ctgaatca
STGASTCA DREME-3 chr1 + 174799741 174799748 6.03e-05 0.161 CTGATTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 234544325 234544332 6.03e-05 0.161 CTGATTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 1747690 1747697 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr16 - 4943499 4943506 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr2 - 11830410 11830417 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 - 23629824 23629831 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 - 23629859 23629866 7.4e-05 0.168 TTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr21 - 26796167 26796174 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr2 - 28392861 28392868 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 28718259 28718266 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 32747132 32747139 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 - 42782673 42782680 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 47743257 47743264 7.4e-05 0.168 TTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr18 - 49017287 49017294 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 52874367 52874374 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 54419265 54419272 7.4e-05 0.168 TTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 55831636 55831643 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 75390746 75390753 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr14 - 92511646 92511653 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 107542678 107542685 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 111593153 111593160 7.4e-05 0.168 TTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 235504969 235504976 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr18 + 2846787 2846794 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 + 4978918 4978925 7.4e-05 0.168 TTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 + 4978918 4978925 7.4e-05 0.168 TTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 6336418 6336425 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr2 + 11830064 11830071 7.4e-05 0.168 TTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 + 16826190 16826197 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 30727992 30727999 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 + 35726500 35726507 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr22 + 37432457 37432464 7.4e-05 0.168 atgagtca
STGASTCA DREME-3 chr17 + 44086933 44086940 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 44087006 44087013 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 47820747 47820754 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 + 70508004 70508011 7.4e-05 0.168 atgagtca
STGASTCA DREME-3 chr10 + 97542356 97542363 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 111592924 111592931 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 122887583 122887590 7.4e-05 0.168 atgagtca
STGASTCA DREME-3 chr9 + 126651256 126651263 7.4e-05 0.168 TTGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 + 159924636 159924643 7.4e-05 0.168 ATGAGTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 1747474 1747481 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 1950917 1950924 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 1951011 1951018 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr4 - 2330248 2330255 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr18 - 2846788 2846795 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 11694206 11694213 8.78e-05 0.171 TTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr22 - 37145744 37145751 8.78e-05 0.171 TTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr22 - 37432458 37432465 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 - 40831916 40831923 8.78e-05 0.171 TTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 41862456 41862463 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 47820748 47820755 8.78e-05 0.171 TTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 - 51121974 51121981 8.78e-05 0.171 TTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 57112278 57112285 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 122887584 122887591 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 - 123251087 123251094 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 134511265 134511272 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr3 - 149576413 149576420 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 150640674 150640681 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 - 154682984 154682991 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 155017290 155017297 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chrX - 155026610 155026617 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 182617934 182617941 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr4 - 185560011 185560018 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr1 - 203650427 203650434 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 1747689 1747696 8.78e-05 0.171 ttgactca
STGASTCA DREME-3 chr17 + 3890211 3890218 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 4014015 4014022 8.78e-05 0.171 ATGACTca
STGASTCA DREME-3 chr19 + 9075759 9075766 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr17 + 17711042 17711049 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr21 + 26796288 26796295 8.78e-05 0.171 TTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 39403613 39403620 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr6 + 42782672 42782679 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr19 + 49403635 49403642 8.78e-05 0.171 TTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 54419264 54419271 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 55831635 55831642 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 + 73685388 73685395 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr15 + 74178061 74178068 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr12 + 75390745 75390752 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr14 + 92511645 92511652 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr8 + 102806615 102806622 8.78e-05 0.171 TTGACTCA
STGASTCA DREME-3 chrX + 154369734 154369741 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
STGASTCA DREME-3 chr5 + 172903989 172903996 8.78e-05 0.171 ttgactca
STGASTCA DREME-3 chr1 + 183234684 183234691 8.78e-05 0.171 ATGACTCA
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/fimo_out_10 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/background --motif STGASTCA /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/fimo_out_10
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF398.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

Go to top