Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
Database contains 599 sequences, 299500 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
AATAAATA 8 AATAAATA
GTBTCA 6 GTCTCA
CTCY 4 CTCT
CTGGGH 6 CTGGGC
GAGA 4 GAGA
GCCACCR 7 GCCACCA
CCYGGCTA 8 CCTGGCTA
CCTGTA 6 CCTGTA
GTGATCY 7 GTGATCC
CTYAGC 6 CTCAGC
AGTGAGY 7 AGTGAGC
ARTGGCG 7 AATGGCG

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.264 C 0.236 G 0.236 T 0.264

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
GCCACCR DREME-6 chr12 + 798475 798481 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr10 - 922936 922942 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 - 1209444 1209450 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr20 + 3554484 3554490 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr20 - 3814463 3814469 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 + 5689612 5689618 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 - 6404569 6404575 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 - 7449905 7449911 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 - 7808864 7808870 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 - 8094014 8094020 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 + 11533408 11533414 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 - 13658335 13658341 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 - 13658470 13658476 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 - 16590901 16590907 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chrX - 16603278 16603284 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr10 + 17600609 17600615 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr17 - 18956055 18956061 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr16 - 19020729 19020735 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 - 19255676 19255682 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr8 - 19269079 19269085 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 + 20132888 20132894 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr16 - 21572405 21572411 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr16 + 21821157 21821163 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr8 - 21954495 21954501 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr16 + 22295664 22295670 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr16 + 23594029 23594035 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chrX - 23772106 23772112 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr2 - 23781526 23781532 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 27220508 27220514 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 - 27840632 27840638 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr10 - 27970833 27970839 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 + 28894573 28894579 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 + 28894708 28894714 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr17 + 29272389 29272395 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 + 30163051 30163057 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr16 + 30500234 30500240 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr19 + 30765185 30765191 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr19 - 30944289 30944295 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr16 + 31263984 31263990 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 - 32171674 32171680 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 32194982 32194988 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 32367296 32367302 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 - 32377310 32377316 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 - 32699772 32699778 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 + 32766898 32766904 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 + 32989044 32989050 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chrX - 33073693 33073699 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 - 33123261 33123267 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 + 33534628 33534634 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr19 + 33945513 33945519 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 34182302 34182308 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 - 34182349 34182355 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 34182723 34182729 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr19 + 34214457 34214463 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr19 + 34235044 34235050 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr14 + 34486753 34486759 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr14 + 34487106 34487112 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr17 - 35143025 35143031 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 - 35331648 35331654 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 + 35331743 35331749 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr19 - 35462057 35462063 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr14 - 35535505 35535511 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 - 35844600 35844606 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 - 35844906 35844912 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 - 35844960 35844966 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 36241443 36241449 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 36643855 36643861 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr10 - 36739939 36739945 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr21 - 36868013 36868019 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 36896747 36896753 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 36992891 36992897 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr19 + 37318670 37318676 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 37416728 37416734 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr8 + 37892272 37892278 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr8 + 37892595 37892601 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr17 - 38667100 38667106 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 - 40325112 40325118 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chrX - 41282322 41282328 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 43014522 43014528 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr19 + 43709752 43709758 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr7 + 43728123 43728129 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr19 + 44110897 44110903 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr17 - 44819519 44819525 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr13 + 44823908 44823914 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr14 + 44968408 44968414 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chrX + 45011934 45011940 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr13 + 45064242 45064248 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 45172998 45173004 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr17 - 46074628 46074634 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 - 46114220 46114226 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 + 47544321 47544327 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr18 + 48873914 48873920 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr17 - 49368249 49368255 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 - 50882847 50882853 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr13 - 51411074 51411080 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr13 - 51411414 51411420 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 - 53779712 53779718 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr13 - 54077181 54077187 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 55463667 55463673 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 55537351 55537357 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr16 - 57323878 57323884 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr16 - 57324187 57324193 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr10 - 61632092 61632098 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr17 + 61838343 61838349 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr20 + 63498109 63498115 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr11 + 64169522 64169528 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 66151994 66152000 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr11 + 67122475 67122481 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr15 - 69128539 69128545 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 - 69248973 69248979 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr15 + 70866295 70866301 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr10 + 72580625 72580631 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr15 - 72689594 72689600 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr15 + 72689959 72689965 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr10 + 73829443 73829449 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr10 - 74485323 74485329 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 - 77854988 77854994 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 78738173 78738179 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 78759133 78759139 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr3 - 78916112 78916118 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 - 82243102 82243108 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr7 - 82387003 82387009 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 - 84907209 84907215 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 - 85592867 85592873 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 - 85592875 85592881 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 87285216 87285222 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 + 90454230 90454236 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr15 - 90664793 90664799 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 92086746 92086752 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr10 + 92601349 92601355 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr10 + 92601492 92601498 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr13 - 94601969 94601975 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 - 95138405 95138411 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 - 96428651 96428657 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr14 + 96506052 96506058 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr10 - 98867923 98867929 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr15 - 98972214 98972220 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 + 99613279 99613285 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr7 - 100757947 100757953 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chrX - 101367497 101367503 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 + 101572995 101573001 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr10 - 101751835 101751841 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr10 - 102892841 102892847 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr10 - 103000097 103000103 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr14 + 103370446 103370452 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 - 104857818 104857824 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 + 104961549 104961555 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr7 - 105023263 105023269 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr7 - 105302935 105302941 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chrX - 106544760 106544766 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chrX - 107810083 107810089 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 + 109801555 109801561 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr12 - 110364432 110364438 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 - 110364676 110364682 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 + 111191480 111191486 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr10 + 113077839 113077845 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr7 - 114500076 114500082 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr7 - 115740065 115740071 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 - 116271455 116271461 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr12 - 116271667 116271673 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 - 118648603 118648609 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 122696711 122696717 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 122697110 122697116 5.1e-05 0.126 gCCACCA
GCCACCR DREME-6 chrX - 123770243 123770249 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr11 + 124072512 124072518 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 - 125753559 125753565 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 126798311 126798317 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 127944292 127944298 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 127944427 127944433 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr9 + 130700302 130700308 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr9 + 132967929 132967935 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr9 + 132968262 132968268 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 - 136315567 136315573 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr9 - 137038467 137038473 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chrX + 137246927 137246933 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 - 137302438 137302444 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 138703809 138703815 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 139303250 139303256 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 139370319 139370325 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 - 142629023 142629029 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr8 + 143347133 143347139 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr6 + 146544036 146544042 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chrX - 148666446 148666452 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr7 - 148864988 148864994 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 149556342 149556348 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 149556536 149556542 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 149963258 149963264 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr7 - 150366733 150366739 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 151324291 151324297 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 154188773 154188779 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 - 154301368 154301374 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 - 154928938 154928944 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 - 155489619 155489625 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr7 - 155519382 155519388 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr7 - 155519629 155519635 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 + 156913864 156913870 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 - 157826361 157826367 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr6 + 158839146 158839152 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 - 160008705 160008711 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 160243502 160243508 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 163455625 163455631 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr3 + 165808132 165808138 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 - 168286900 168286906 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr3 - 169341601 169341607 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr3 + 169482483 169482489 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr3 + 169768676 169768682 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr2 - 172253620 172253626 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr2 - 172253743 172253749 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 175559467 175559473 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 176320517 176320523 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 - 176592024 176592030 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 176592066 176592072 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 + 177345916 177345922 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 178001427 178001433 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 + 178192008 178192014 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr5 - 179677471 179677477 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr5 - 179677637 179677643 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr3 - 195398498 195398504 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 + 196145505 196145511 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr3 - 197190871 197190877 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 + 212041653 212041659 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 + 223186954 223186960 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 + 225657404 225657410 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 - 225791400 225791406 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 + 226221693 226221699 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 - 226252144 226252150 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 + 229919856 229919862 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr2 + 232753272 232753278 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 - 235256035 235256041 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 + 235268677 235268683 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 + 235282929 235282935 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 + 235364534 235364540 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 - 237000249 237000255 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 - 237000566 237000572 5.1e-05 0.126 GCCACCA
GCCACCR DREME-6 chr1 + 242539985 242539991 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chr1 + 245044715 245044721 5.1e-05 0.126 gccacca
GCCACCR DREME-6 chrX + 1360811 1360817 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr12 + 4321243 4321249 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr8 - 9634904 9634910 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr8 - 9635031 9635037 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr19 + 19375703 19375709 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr18 - 23690383 23690389 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr8 - 28934652 28934658 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr8 - 28934788 28934794 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr16 + 30642451 30642457 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr5 - 32194847 32194853 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr5 + 32436434 32436440 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr19 - 32676343 32676349 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr19 + 32719694 32719700 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr13 + 33016797 33016803 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr19 - 33123126 33123132 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr5 + 34684010 34684016 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr21 - 36867859 36867865 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr19 + 37318804 37318810 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr19 - 37466356 37466362 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr17 - 40545010 40545016 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr19 + 44110764 44110770 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr14 + 44968531 44968537 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr15 - 49046485 49046491 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr19 - 50500282 50500288 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr1 - 50882712 50882718 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr6 + 53323857 53323863 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr5 - 55537638 55537644 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr20 + 59939261 59939267 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr20 + 59939269 59939275 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr18 - 62324879 62324885 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr20 + 63498270 63498276 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr6 + 63670417 63670423 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr6 + 63670569 63670575 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr11 + 65477384 65477390 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr11 + 67122606 67122612 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr6 + 70567834 70567840 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr6 + 70567968 70567974 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr15 - 70713212 70713218 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chrX - 72210091 72210097 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr5 + 74640684 74640690 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr10 - 75398819 75398825 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr15 - 78405254 78405260 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr3 - 78915978 78915984 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr7 + 81153276 81153282 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr6 + 82242893 82242899 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr6 - 82242968 82242974 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr9 - 83369437 83369443 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr12 - 84907076 84907082 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr6 - 85592716 85592722 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr1 - 86156924 86156930 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr1 + 86157143 86157149 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr5 - 92086650 92086656 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr10 + 92601141 92601147 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr12 - 95548940 95548946 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr10 + 96572799 96572805 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr13 - 97243111 97243117 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr13 - 99969233 99969239 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr6 + 100609045 100609051 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr15 - 101746391 101746397 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr15 - 101746525 101746531 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr15 + 101746620 101746626 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr6 - 104857682 104857688 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr6 + 104961683 104961689 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr7 - 114499942 114499948 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr7 + 114643094 114643100 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr7 + 114922434 114922440 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr7 + 114922526 114922532 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr6 - 118648468 118648474 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr7 - 125643325 125643331 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr5 - 126798176 126798182 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chrX + 131721662 131721668 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr5 + 139370454 139370460 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr7 + 149107620 149107626 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr5 - 149963163 149963169 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr5 + 155187868 155187874 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr1 + 155575591 155575597 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr5 + 157669468 157669474 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr3 - 169341468 169341474 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr3 + 169482617 169482623 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr3 + 169768811 169768817 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr5 - 177464668 177464674 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr5 + 178001562 178001568 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr5 - 179677338 179677344 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr3 - 194427525 194427531 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr3 - 197190737 197190743 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr1 + 212558426 212558432 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr1 - 212558486 212558492 9.66e-05 0.172 GCCACCG
GCCACCR DREME-6 chr1 + 225657538 225657544 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr1 + 226252237 226252243 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr1 + 235283059 235283065 9.66e-05 0.172 gccaccg
GCCACCR DREME-6 chr1 + 235308390 235308396 9.66e-05 0.172 gccaccg
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_34 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif GCCACCR /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_34
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF202.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

Go to top