Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
Database contains 600 sequences, 300000 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
GAATABTA 8 GAATACTA
CYTTTTY 7 CCTTTTT
AYGGCTG 7 ATGGCTG
ACATGRAT 8 ACATGGAT
CTRCAAAG 8 CTGCAAAG
ATGAGWTC 8 ATGAGTTC
AYATAYAC 8 ATATACAC
CCAGCTBC 8 CCAGCTTC
AAATGTGG 8 AAATGTGG
AARCCATC 8 AAACCATC
CTTWATCC 8 CTTTATCC
ATYCTCAG 8 ATTCTCAG
AYGTC 5 ATGTC
ACACMATG 8 ACACCATG
AAACTAWC 8 AAACTAAC
AACRAGAT 8 AACAAGAT
CCTGYAAA 8 CCTGCAAA
AAAAYGT 7 AAAATGT

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.283 C 0.217 G 0.217 T 0.283

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 829844 829851 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 1642557 1642564 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr12 - 1733981 1733988 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr12 - 2102957 2102964 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chrX - 2390860 2390867 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 2614396 2614403 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 2660626 2660633 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 - 2880308 2880315 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 2990115 2990122 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 3898637 3898644 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 3910326 3910333 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 6085120 6085127 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 - 6238942 6238949 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 9640618 9640625 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 11957033 11957040 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr16 - 12042700 12042707 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 - 13331207 13331214 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr16 - 14063849 14063856 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 15699565 15699572 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 16628839 16628846 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 17138273 17138280 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 17163853 17163860 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 17307693 17307700 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr8 - 17534137 17534144 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr16 - 21376451 21376458 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chrX - 21950819 21950826 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr22 - 22051336 22051343 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 22105250 22105257 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr16 - 22351235 22351242 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr14 - 22616010 22616017 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr16 - 22718820 22718827 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr2 - 24480483 24480490 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr16 - 28816616 28816623 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 29210732 29210739 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 29250012 29250019 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 29301956 29301963 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 29916094 29916101 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr8 - 30157311 30157318 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 30291061 30291068 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 30346718 30346725 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 30398789 30398796 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 30486474 30486481 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr16 - 30944563 30944570 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr8 - 31055092 31055099 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 31646520 31646527 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 31816703 31816710 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 - 32148050 32148057 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 32214603 32214610 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 - 32978665 32978672 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr21 - 33040455 33040462 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 33154578 33154585 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 33479795 33479802 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 34330022 34330029 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr14 - 34381542 34381549 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 34493191 34493198 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr20 - 35071655 35071662 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 35239822 35239829 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr21 - 36313695 36313702 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 36580112 36580119 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 37076746 37076753 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 37197353 37197360 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr21 - 37549907 37549914 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 38905118 38905125 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 39599314 39599321 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 40547402 40547409 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 40829412 40829419 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 40964582 40964589 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 42369437 42369444 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 43186892 43186899 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr7 - 43947558 43947565 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 44220153 44220160 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr21 - 45626394 45626401 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr13 - 46460459 46460466 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr21 - 46631174 46631181 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr21 - 46676782 46676789 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 46839899 46839906 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 47004093 47004100 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr19 - 47647163 47647170 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 47691575 47691582 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr18 - 48772708 48772715 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 50040724 50040731 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 - 52637114 52637121 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 53346283 53346290 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr20 - 54129629 54129636 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 54393212 54393219 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 55991112 55991119 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 56562961 56562968 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 58794786 58794793 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr18 - 63191075 63191082 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 65199874 65199881 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr15 - 69307195 69307202 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 70419196 70419203 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 75410771 75410778 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr15 - 75586668 75586675 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 76050300 76050307 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chrX - 77822216 77822223 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 78047074 78047081 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 78666040 78666047 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr17 - 78862935 78862942 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 81714280 81714287 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr12 - 85628793 85628800 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr9 - 85718051 85718058 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr11 - 86522753 86522760 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 86989940 86989947 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr9 - 87094026 87094033 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr9 - 87210892 87210899 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 - 87590918 87590925 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 93221003 93221010 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 93911105 93911112 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr4 - 93923823 93923830 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr13 - 95574093 95574100 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr14 - 100702816 100702823 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr7 - 100940980 100940987 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 101098853 101098860 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr15 - 101287557 101287564 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 - 102724225 102724232 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr12 - 105104999 105105006 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr7 - 107912207 107912214 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr12 - 108990347 108990354 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 109461332 109461339 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr13 - 111593719 111593726 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 113078108 113078115 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 - 114720246 114720253 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr7 - 117414855 117414862 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr7 - 121005302 121005309 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr11 - 126143728 126143735 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr4 - 127899924 127899931 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 134373857 134373864 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr11 - 135011552 135011559 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 135165482 135165489 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 138674692 138674699 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 140199179 140199186 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 143851946 143851953 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 150248708 150248715 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 150928967 150928974 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 151336141 151336148 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chrX - 152835672 152835679 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr6 - 154811911 154811918 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 158494273 158494280 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 161539173 161539180 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 161620627 161620634 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 163089327 163089334 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr2 - 169582785 169582792 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr3 - 171814883 171814890 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr2 - 173163628 173163635 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr5 - 177439898 177439905 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr3 - 195695488 195695495 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 212476043 212476050 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 223865220 223865227 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 224005184 224005191 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 224566741 224566748 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 225310820 225310827 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 225645411 225645418 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 231637177 231637184 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 231645885 231645892 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr2 - 231962955 231962962 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 234762351 234762358 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 236186710 236186717 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 237152227 237152234 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 240275462 240275469 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 241425353 241425360 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 244563107 244563114 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr1 - 244762831 244762838 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chrX + 511276 511283 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 852377 852384 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr12 + 1341443 1341450 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chrX + 2447662 2447669 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chrX + 2470029 2470036 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chrX + 2480146 2480153 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chrX + 2534811 2534818 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 2653051 2653058 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 2884142 2884149 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr16 + 3942316 3942323 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr16 + 4156692 4156699 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr4 + 4257846 4257853 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 4633811 4633818 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 5777916 5777923 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 6358008 6358015 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 7031113 7031120 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 7299930 7299937 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr19 + 7882048 7882055 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 8244926 8244933 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 9566903 9566910 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr8 + 11058468 11058475 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr8 + 11432844 11432851 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr19 + 11631977 11631984 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 16225507 16225514 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 16611037 16611044 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 17195233 17195240 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 17219891 17219898 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr8 + 17604366 17604373 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr16 + 19188115 19188122 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr22 + 20639941 20639948 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr20 + 25583755 25583762 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr8 + 27813099 27813106 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr16 + 28926452 28926459 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr21 + 33069388 33069395 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr19 + 33312956 33312963 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr21 + 33507178 33507185 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr19 + 34050615 34050622 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr20 + 34612138 34612145 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr20 + 35164667 35164674 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr21 + 35595063 35595070 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 35703460 35703467 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 36121246 36121253 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr20 + 36850739 36850746 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr8 + 37485721 37485728 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 37694479 37694486 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr20 + 38505207 38505214 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 38516838 38516845 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 38845256 38845263 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr19 + 40080460 40080467 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr19 + 40091869 40091876 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 41229371 41229378 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr21 + 41949769 41949776 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chrX + 41974827 41974834 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 43060205 43060212 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 43883221 43883228 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 44527270 44527277 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 44956145 44956152 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr21 + 45622083 45622090 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 46922114 46922121 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr20 + 49269137 49269144 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr12 + 49714148 49714155 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr13 + 50257063 50257070 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 50419810 50419817 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 51411988 51411995 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 53317425 53317432 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 58308532 58308539 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 59015905 59015912 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 59021408 59021415 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr15 + 66691043 66691050 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr15 + 67028581 67028588 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr12 + 67072422 67072429 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 68720185 68720192 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 68757993 68758000 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 70192595 70192602 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr15 + 70373522 70373529 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr15 + 70746764 70746771 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chrX + 72176415 72176422 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 73212839 73212846 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr7 + 73495661 73495668 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 75784058 75784065 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr9 + 75901252 75901259 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr15 + 77400438 77400445 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr7 + 77836607 77836614 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 79398822 79398829 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr17 + 79751084 79751091 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr15 + 80965584 80965591 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 82530091 82530098 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 87709199 87709206 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 88663299 88663306 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr5 + 92552465 92552472 1.86e-05 0.0378 AAATGTGG
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 101980840 101980847 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr14 + 102866059 102866066 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr7 + 105303095 105303102 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr12 + 108855115 108855122 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr7 + 114510986 114510993 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr12 + 116862345 116862352 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr12 + 121277507 121277514 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chrX + 123722348 123722355 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 126172888 126172895 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 126379322 126379329 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr10 + 133150389 133150396 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 136401412 136401419 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 143448028 143448035 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr7 + 148430724 148430731 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr2 + 152198052 152198059 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr6 + 158036396 158036403 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr4 + 159068291 159068298 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 162054120 162054127 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr3 + 169039357 169039364 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr2 + 169817562 169817569 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 183066586 183066593 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr3 + 194258405 194258412 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr3 + 195792762 195792769 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr3 + 196018304 196018311 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 203314560 203314567 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 205281208 205281215 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 205720889 205720896 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 207320296 207320303 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 220789692 220789699 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 224497003 224497010 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 226432095 226432102 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 226854686 226854693 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 226999730 226999737 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 229394653 229394660 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 232156199 232156206 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 232158716 232158723 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
AAATGTGG DREME-9 chr1 + 235580042 235580049 1.86e-05 0.0378 aaatgtgg
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_10 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif AAATGTGG /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_10
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZNF146.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

Go to top