#Query ID Target ID Optimal offset p-value E-value q-value Overlap Query consensus Target consensus Orientation 1 1 0 0 0 0 24 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG ATGGATGGATGGATGGATGGATGG + 1 3 -13 3.52428e-09 5.99128e-08 5.99128e-08 9 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG TGGATGGAT + 1 11 -2 1.12426e-07 1.91124e-06 9.70944e-07 22 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG + 1 2 -12 1.14229e-07 1.94189e-06 9.70944e-07 9 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG ATGGATGGA - 1 8 -8 6.41304e-07 1.09022e-05 4.36086e-06 12 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG ATGGATGGATGG + 1 5 -12 2.25351e-06 3.83097e-05 1.27699e-05 9 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG ATGGATGGA + 1 4 -11 3.97851e-06 6.76347e-05 1.93242e-05 9 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG GATGGATGG - 1 13 -13 6.81382e-06 0.000115835 2.89587e-05 8 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG TGGATGGA - 1 12 -13 0.000678142 0.0115284 0.00256187 8 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG TGGATGAA + 1 15 -13 0.00144655 0.0245914 0.00491828 8 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG TGGGTGGA - 1 10 -13 0.00223377 0.0379741 0.00690439 7 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG TAGATGG - 1 6 -3 0.00301533 0.0512607 0.00854344 21 ATGGATGGATGGATGGATGGATGG GAGGGAGAGAGAGAGGGAGGGA - 2 2 0 4.04531e-17 6.87703e-16 1.37541e-15 9 TCCATCCAT TCCATCCAT + 2 13 0 1.36145e-07 2.31447e-06 2.31447e-06 8 TCCATCCAT TCCATCCA + 2 5 0 1.30508e-06 2.21864e-05 1.47909e-05 9 TCCATCCAT TCCATCCAT - 2 1 3 3.02515e-06 5.14276e-05 2.57138e-05 9 TCCATCCAT CCATCCATCCATCCATCCATCCAT - 2 3 1 3.97679e-06 6.76053e-05 2.70421e-05 8 TCCATCCAT ATCCATCCA - 2 12 0 6.04284e-05 0.00102728 0.000342427 8 TCCATCCAT TTCATCCA - 2 4 -1 7.26375e-05 0.00123484 0.000352811 8 TCCATCCAT CCATCCATC + 2 8 3 0.000378798 0.00643957 0.00160989 9 TCCATCCAT CCATCCATCCAT - 2 15 0 0.00052048 0.00884816 0.00196626 8 TCCATCCAT TCCACCCA + 2 10 -1 0.00195735 0.0332749 0.00665499 7 TCCATCCAT CCATCTA + 2 11 7 0.0263155 0.447363 0.0813387 9 TCCATCCAT CCACCCACTCACCCACCCACCC - 3 3 0 8.42773e-19 1.43271e-17 2.86543e-17 9 TGGATGGAT TGGATGGAT + 3 1 13 6.3914e-07 1.08654e-05 9.18319e-06 9 TGGATGGAT ATGGATGGATGGATGGATGGATGG + 3 13 0 8.10281e-07 1.37748e-05 9.18319e-06 8 TGGATGGAT TGGATGGA - 3 2 1 3.98301e-06 6.77112e-05 3.38556e-05 8 TGGATGGAT ATGGATGGA - 3 5 1 4.21246e-05 0.000716118 0.000286447 8 TGGATGGAT ATGGATGGA + 3 8 1 0.000118729 0.0020184 0.000623505 9 TGGATGGAT ATGGATGGATGG + 3 12 0 0.000128369 0.00218227 0.000623505 8 TGGATGGAT TGGATGAA + 3 15 0 0.000344644 0.00585894 0.00146474 8 TGGATGGAT TGGGTGGA - 3 4 -2 0.00051672 0.00878424 0.00195205 7 TGGATGGAT GATGGATGG - 3 10 0 0.000898209 0.0152696 0.00305391 7 TGGATGGAT TAGATGG - 3 11 11 0.0057065 0.0970104 0.0176383 9 TGGATGGAT GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG + 4 4 0 8.42773e-19 1.43271e-17 2.86543e-17 9 CCATCCATC CCATCCATC + 4 1 12 1.33455e-06 2.26874e-05 2.26874e-05 9 CCATCCATC CCATCCATCCATCCATCCATCCAT - 4 5 1 5.3589e-05 0.000911013 0.000570569 8 CCATCCATC TCCATCCAT - 4 2 1 6.71258e-05 0.00114114 0.000570569 8 CCATCCATC TCCATCCAT + 4 8 0 0.000197527 0.00335795 0.00134318 9 CCATCCATC CCATCCATCCAT - 4 3 -2 0.000258783 0.0043993 0.00146643 7 CCATCCATC ATCCATCCA - 4 13 1 0.00126629 0.0215269 0.00615055 7 CCATCCATC TCCATCCA + 4 12 1 0.00266493 0.0453038 0.011326 7 CCATCCATC TTCATCCA - 4 10 0 0.00311551 0.0529636 0.0117697 7 CCATCCATC CCATCTA + 4 11 8 0.00451549 0.0767633 0.0153527 9 CCATCCATC CCACCCACTCACCCACCCACCC - 4 15 1 0.0253571 0.431071 0.0783765 7 CCATCCATC TCCACCCA + 5 5 0 6.08482e-17 1.03442e-15 2.06884e-15 9 ATGGATGGA ATGGATGGA + 5 2 0 5.80545e-07 9.86926e-06 9.86926e-06 9 ATGGATGGA ATGGATGGA - 5 1 8 1.29668e-06 2.20436e-05 1.46957e-05 9 ATGGATGGA ATGGATGGATGGATGGATGGATGG + 5 13 -1 1.07682e-05 0.00018306 9.153e-05 8 ATGGATGGA TGGATGGA - 5 3 -1 1.88627e-05 0.000320666 0.000128266 8 ATGGATGGA TGGATGGAT + 5 8 0 4.03841e-05 0.00068653 0.000228843 9 ATGGATGGA ATGGATGGATGG + 5 4 1 5.51691e-05 0.000937875 0.000267964 8 ATGGATGGA GATGGATGG - 5 12 -1 9.84559e-05 0.00167375 0.000418438 8 ATGGATGGA TGGATGAA + 5 15 -1 0.000443576 0.0075408 0.00167573 8 ATGGATGGA TGGGTGGA - 5 10 -1 0.00284643 0.0483893 0.00967786 7 ATGGATGGA TAGATGG - 5 11 6 0.00821147 0.139595 0.0253809 9 ATGGATGGA GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG + 6 6 0 0 0 0 22 TCCCTCCCTCTCTCTCTCCCTC TCCCTCCCTCTCTCTCTCCCTC + 6 11 0 0.000130219 0.00221373 0.00221373 22 TCCCTCCCTCTCTCTCTCCCTC CCACCCACTCACCCACCCACCC - 6 1 -1 0.00717179 0.12192 0.0812803 21 TCCCTCCCTCTCTCTCTCCCTC CCATCCATCCATCCATCCATCCAT - 7 7 0 0 0 0 28 CGCGGGGCATGCTGGGAATTGTAGTCCA CGCGGGGCATGCTGGGAATTGTAGTCCA + 7 16 -19 6.04787e-07 1.02814e-05 1.02814e-05 7 CGCGGGGCATGCTGGGAATTGTAGTCCA TGTAGTC - 8 8 0 1.40319e-24 2.38542e-23 4.77084e-23 12 ATGGATGGATGG ATGGATGGATGG + 8 1 4 2.16597e-08 3.68215e-07 3.68215e-07 12 ATGGATGGATGG ATGGATGGATGGATGGATGGATGG + 8 5 0 1.25151e-05 0.000212757 0.000141838 9 ATGGATGGATGG ATGGATGGA + 8 3 -1 2.41436e-05 0.000410441 0.000205221 9 ATGGATGGATGG TGGATGGAT + 8 4 -3 5.41698e-05 0.000920887 0.000368355 9 ATGGATGGATGG GATGGATGG - 8 10 -5 0.000147064 0.00250008 0.000833361 7 ATGGATGGATGG TAGATGG - 8 2 0 0.00021103 0.00358751 0.001025 9 ATGGATGGATGG ATGGATGGA - 8 11 10 0.00029432 0.00500343 0.00125086 12 ATGGATGGATGG GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG + 8 13 -5 0.00172626 0.0293465 0.00652144 7 ATGGATGGATGG TGGATGGA - 8 15 -1 0.00994954 0.169142 0.0338284 8 ATGGATGGATGG TGGGTGGA - 8 12 -1 0.0130273 0.221464 0.0402663 8 ATGGATGGATGG TGGATGAA + 8 6 1 0.0265609 0.451535 0.0752558 12 ATGGATGGATGG GAGGGAGAGAGAGAGGGAGGGA - 9 9 0 8.63765e-28 1.4684e-26 2.9368e-26 12 CGAGCGCCGAGC CGAGCGCCGAGC + 9 14 -2 0.000207144 0.00352145 0.00352145 8 CGAGCGCCGAGC AGCGCCGA + 10 10 0 2.00884e-12 3.41502e-11 6.83005e-11 7 CCATCTA CCATCTA + 10 3 2 0.000633042 0.0107617 0.00975116 7 CCATCTA ATCCATCCA - 10 8 0 0.0010657 0.0181169 0.00975116 7 CCATCTA CCATCCATCCAT - 10 13 1 0.0011472 0.0195023 0.00975116 7 CCATCTA TCCATCCA + 10 2 1 0.00144719 0.0246023 0.00984092 7 CCATCTA TCCATCCAT + 10 4 0 0.00188932 0.0321184 0.0107061 7 CCATCTA CCATCCATC + 10 5 1 0.00227697 0.0387084 0.0110596 7 CCATCTA TCCATCCAT - 10 1 4 0.00397055 0.0674994 0.0168748 7 CCATCTA CCATCCATCCATCCATCCATCCAT - 10 15 1 0.0117836 0.20032 0.0445156 7 CCATCTA TCCACCCA + 10 12 1 0.0205366 0.349122 0.0698244 7 CCATCTA TTCATCCA - 11 11 0 0 0 0 22 GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG + 11 1 2 4.21762e-09 7.16996e-08 7.16996e-08 22 GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG ATGGATGGATGGATGGATGGATGG + 11 8 -10 0.000129716 0.00220517 0.00139078 12 GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG ATGGATGGATGG + 11 6 0 0.000163621 0.00278156 0.00139078 22 GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG GAGGGAGAGAGAGAGGGAGGGA - 11 3 -11 0.000773027 0.0131415 0.00525659 9 GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG TGGATGGAT + 11 4 -5 0.00269858 0.0458758 0.0152919 9 GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG GATGGATGG - 11 5 -6 0.00670822 0.11404 0.0325828 9 GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG ATGGATGGA + 11 15 -11 0.0134176 0.228099 0.0570247 8 GGGTGGGTGGGTGAGTGGGTGG TGGGTGGA - 12 12 0 3.48231e-10 5.91993e-09 1.18399e-08 8 TGGATGAA TGGATGAA + 12 13 0 4.79328e-05 0.000814858 0.00066016 8 TGGATGAA TGGATGGA - 12 2 1 5.82494e-05 0.00099024 0.00066016 8 TGGATGAA ATGGATGGA - 12 3 0 0.000132523 0.00225288 0.00112644 8 TGGATGAA TGGATGGAT + 12 5 1 0.000165683 0.00281661 0.00112664 8 TGGATGAA ATGGATGGA + 12 1 13 0.00156538 0.0266115 0.00887049 8 TGGATGAA ATGGATGGATGGATGGATGGATGG + 12 4 2 0.00187522 0.0318787 0.00910821 7 TGGATGAA GATGGATGG - 12 15 0 0.00868675 0.147675 0.0361884 8 TGGATGAA TGGGTGGA - 12 8 1 0.00957929 0.162848 0.0361884 8 TGGATGAA ATGGATGGATGG + 12 10 0 0.0210426 0.357724 0.0715448 7 TGGATGAA TAGATGG - 13 13 0 1.1665e-11 1.98305e-10 3.9661e-10 8 TCCATCCA TCCATCCA + 13 2 0 2.46874e-07 4.19686e-06 4.19686e-06 8 TCCATCCA TCCATCCAT + 13 3 1 1.6201e-06 2.75416e-05 1.83611e-05 8 TCCATCCA ATCCATCCA - 13 5 0 1.98651e-05 0.000337707 0.000168853 8 TCCATCCA TCCATCCAT - 13 1 3 4.68954e-05 0.000797221 0.000316949 8 TCCATCCA CCATCCATCCATCCATCCATCCAT - 13 12 0 5.59321e-05 0.000950846 0.000316949 8 TCCATCCA TTCATCCA - 13 15 0 0.000152712 0.00259611 0.000741745 8 TCCATCCA TCCACCCA + 13 4 -1 0.000845694 0.0143768 0.0035942 7 TCCATCCA CCATCCATC + 13 10 -1 0.00116434 0.0197937 0.00439861 7 TCCATCCA CCATCTA + 13 8 3 0.00238678 0.0405752 0.00811505 8 TCCATCCA CCATCCATCCAT - 14 14 0 9.28861e-13 1.57906e-11 3.15813e-11 8 AGCGCCGA AGCGCCGA + 14 9 2 0.000283925 0.00482672 0.00482672 8 AGCGCCGA CGAGCGCCGAGC + 15 15 0 2.46945e-10 4.19807e-09 8.39613e-09 8 TCCACCCA TCCACCCA + 15 13 0 0.000115548 0.00196432 0.00196432 8 TCCACCCA TCCATCCA + 15 3 1 0.000263462 0.00447886 0.00298591 8 TCCACCCA ATCCATCCA - 15 2 0 0.000423747 0.0072037 0.00328309 8 TCCACCCA TCCATCCAT + 15 5 0 0.000482807 0.00820772 0.00328309 8 TCCACCCA TCCATCCAT - 15 1 11 0.00234397 0.0398475 0.0132825 8 TCCACCCA CCATCCATCCATCCATCCATCCAT - 15 8 3 0.00696411 0.11839 0.0338257 8 TCCACCCA CCATCCATCCAT - 15 12 0 0.00935915 0.159106 0.0397764 8 TCCACCCA TTCATCCA - 15 10 -1 0.0123774 0.210417 0.0467593 7 TCCACCCA CCATCTA + 15 4 -1 0.016823 0.28599 0.0571981 7 TCCACCCA CCATCCATC + 15 11 3 0.0240444 0.408755 0.0743192 8 TCCACCCA CCACCCACTCACCCACCCACCC - 16 16 0 8.41672e-10 1.43084e-08 2.86168e-08 7 GACTACA GACTACA + 16 7 2 3.03126e-05 0.000515314 0.000515314 7 GACTACA TGGACTACAATTCCCAGCATGCCCCGCG - 17 17 0 1.66119e-10 2.82403e-09 5.64806e-09 7 ACTTCCG ACTTCCG +