Database and Motifs | High-scoring Motif Occurences | Debugging Information |
FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)
For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net
If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble,
"FIMO: Scanning for occurrences of a given motif",
Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011.
[full text]
DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZBTB10.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/ZBTB10.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.fa
Database contains 600 sequences, 300000 residues
MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZBTB10.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/meme_out/meme.xml (DNA)
MOTIF | WIDTH | BEST POSSIBLE MATCH |
---|---|---|
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT | 22 | GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT |
DGDGGGDGHTGGGGKG | 16 | GGGGGGAGATGGGGTG |
ACAGTGATGTTGGGGTGATGATGATGATGG | 30 | ACAGTGATGTTGGGGTGATGATGATGATGG |
WBTTGGGGTGYHGRDG | 16 | TGTTGGGGTGCAGGTG |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | 49 | TTCCCCCCTGTTTCCCTCAGGTTCCCCCAGTTTCCCTCTGGTTCCCTCT |
CBCYBCCBCCTCCYKCNCCCCC | 22 | CCCCTCCCCCTCCCTCTCCCCC |
TTGWTTTTYTTTYHWT | 16 | TTGTTTTTCTTTCTAT |
GTGTGTGTGTGT | 12 | GTGTGTGTGTGT |
GRTGACGTCAC | 11 | GATGACGTCAC |
GGYAYSMTGGGAVHTGKRGTCC | 22 | GGTACCCTGGGAATTGGAGTCC |
Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZBTB10.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/background):
A 0.179 C 0.321 G 0.321 T 0.179
Motif ID | Alt ID | Sequence Name | Strand | Start | End | p-value | q-value | Matched Sequence |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360281 | 82360329 | 2.61e-28 | 4.36e-23 | tttcccccagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360837 | 82360885 | 2.61e-28 | 4.36e-23 | tttcccccagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360837 | 82360885 | 2.61e-28 | 4.36e-23 | tttcccccagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359927 | 82359975 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359927 | 82359975 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359978 | 82360026 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359978 | 82360026 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360069 | 82360117 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360069 | 82360117 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360120 | 82360168 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360120 | 82360168 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360221 | 82360269 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360453 | 82360501 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360665 | 82360713 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360665 | 82360713 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360898 | 82360946 | 3.3e-27 | 1.04e-22 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360988 | 82361036 | 2.47e-26 | 7.3e-22 | ttttccccagtttccctcaggttccctcagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360412 | 82360460 | 1.95e-25 | 5.16e-21 | gttccctcagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360938 | 82360986 | 1.95e-25 | 5.16e-21 | gttccctcagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360574 | 82360622 | 2.34e-25 | 5.34e-21 | gttcccccagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360787 | 82360835 | 2.34e-25 | 5.34e-21 | gttcccccagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360787 | 82360835 | 2.34e-25 | 5.34e-21 | gttcccccagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360614 | 82360662 | 1.72e-24 | 3.59e-20 | gttccctcagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctcg |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360614 | 82360662 | 1.72e-24 | 3.59e-20 | gttccctcagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctcg |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82361038 | 82361086 | 1.17e-22 | 2.35e-18 | tttcccccagtttccctcaggttcccccagtttccctcagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359733 | 82359781 | 2.2e-22 | 4.24e-18 | tttccctcaggttccctcagtttcccccagcttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360554 | 82360602 | 8.93e-22 | 1.44e-17 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360716 | 82360764 | 8.93e-22 | 1.44e-17 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360716 | 82360764 | 8.93e-22 | 1.44e-17 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360767 | 82360815 | 8.93e-22 | 1.44e-17 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360767 | 82360815 | 8.93e-22 | 1.44e-17 | ttccctcaagtttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359886 | 82359934 | 2.89e-21 | 4.39e-17 | gttcccccagtttccctcaggttcccccagtttccctcagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359886 | 82359934 | 2.89e-21 | 4.39e-17 | gttcccccagtttccctcaggttcccccagtttccctcagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360140 | 82360188 | 6.77e-21 | 8.71e-17 | gttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360301 | 82360349 | 6.77e-21 | 8.71e-17 | gttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360392 | 82360440 | 6.77e-21 | 8.71e-17 | gttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360594 | 82360642 | 6.77e-21 | 8.71e-17 | gttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360594 | 82360642 | 6.77e-21 | 8.71e-17 | gttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360918 | 82360966 | 6.77e-21 | 8.71e-17 | gttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctcaggttccccca |
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TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360968 | 82361016 | 1.48e-20 | 1.81e-16 | tttccctcaggttccctcagttttccccagtttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360817 | 82360865 | 3.01e-20 | 3.44e-16 | tttccctcaggttccctcagtttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360817 | 82360865 | 3.01e-20 | 3.44e-16 | tttccctcaggttccctcagtttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82361018 | 82361066 | 3.01e-20 | 3.44e-16 | tttccctcaggttccctcagtttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359784 | 82359832 | 8.1e-20 | 9.03e-16 | ttccctcaagttcccctcagtttcccccagtttccctcaggttccccca |
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TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360463 | 82360511 | 3.98e-19 | 4.25e-15 | tttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctcaggttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359866 | 82359914 | 9.52e-19 | 9.95e-15 | ttccctcaagtttccctcgggttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82361008 | 82361056 | 1.89e-18 | 1.94e-14 | gttccctcagtttccctcaggttccctcagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360807 | 82360855 | 2.03e-18 | 1.96e-14 | gttcccccagtttccctcaggttccctcagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360807 | 82360855 | 2.03e-18 | 1.96e-14 | gttcccccagtttccctcaggttccctcagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360857 | 82360905 | 2.03e-18 | 1.96e-14 | gttcccccagtttccctcaggttccctcagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360473 | 82360521 | 2.37e-18 | 2.24e-14 | gttcccccagtttccctcaggttccctcaggttccctcagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360251 | 82360299 | 2.42e-18 | 2.25e-14 | tttccctcaggttccctcaggttcccccagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360321 | 82360369 | 2.69e-18 | 2.41e-14 | gttccctcagtttccctcaggttcccccagtttccctcagtttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360503 | 82360551 | 2.69e-18 | 2.41e-14 | gttccctcagtttccctcaggttcccccagtttccctcagtttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360160 | 82360208 | 4.03e-18 | 3.54e-14 | gttccctcagtttccctcaggttcccccagtttcccccaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360261 | 82360309 | 4.21e-18 | 3.64e-14 | gttccctcaggttcccccagtttcccccagtttccctcaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360008 | 82360056 | 4.76e-18 | 3.98e-14 | tttccctcaggttccctcaggttcccccagtttcccccaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360008 | 82360056 | 4.76e-18 | 3.98e-14 | tttccctcaggttccctcaggttcccccagtttcccccaggttccccca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360028 | 82360076 | 2.18e-17 | 1.74e-13 | gttcccccagtttcccccaggttcccccagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360028 | 82360076 | 2.18e-17 | 1.74e-13 | gttcccccagtttcccccaggttcccccagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360180 | 82360228 | 2.18e-17 | 1.74e-13 | gttcccccagtttcccccaggttcccccagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359743 | 82359791 | 4.8e-17 | 3.76e-13 | gttccctcagtttcccccagcttccctcaggttccctcagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360331 | 82360379 | 5.36e-17 | 3.96e-13 | tttccctcaggttcccccagtttccctcagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360513 | 82360561 | 5.36e-17 | 3.96e-13 | tttccctcaggttcccccagtttccctcagtttcccccagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359937 | 82359985 | 6.13e-17 | 3.96e-13 | tttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82359937 | 82359985 | 6.13e-17 | 3.96e-13 | tttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360079 | 82360127 | 6.13e-17 | 3.96e-13 | tttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360079 | 82360127 | 6.13e-17 | 3.96e-13 | tttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctca |
TTYCCYYHWSTTTCCCTCASGTTCCCYCWBTTTCCCTCWGGTTCYCTCD | MEME-5 | chr17 | + | 82360130 | 82360178 | 6.13e-17 | 3.96e-13 | tttccctcaggttcccccagtttccctcaggttccctcagtttccctca |
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Command line:
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background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeOtherZnfData/Encode3Datahg38/ZBTB10.IDR0.05.filt.narrowPeak.top600.summitPlusMinus250bp.MemeChipResults/background | alphabet = DNA | max stored scores = 100000 |
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This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.