Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

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If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
Database contains 14436 sequences, 7218000 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
AATGARTK 8 AATGAATG
AGATAAV 7 AGATAAG
AASDAATG 8 AAGAAATG
AGGCHGR 7 AGGCTGG
CCATYTTR 8 CCATCTTG
ARTRAAT 7 AGTGAAT
CTGTAAYC 8 CTGTAATC
RTGACTCA 8 ATGACTCA
CYTCCY 6 CTTCCT
GCCACYGC 8 GCCACTGC
CCASSC 6 CCAGCC
RCCTACTR 8 ACCTACTG
AGTRAST 7 AGTGAGT
AAAGTGCT 8 AAAGTGCT
GAGACRGR 8 GAGACAGA
CAGAGCRA 8 CAGAGCAA
GTAAAATR 8 GTAAAATG
CTTATCAS 8 CTTATCAG
AMAAATAC 8 AAAAATAC
CCASCTAC 8 CCAGCTAC
CGGMTCAC 8 CGGCTCAC
CACGTR 6 CACGTG
CWGWGGC 7 CAGAGGC
AGGTCAGG 8 AGGTCAGG
AAYGAACG 8 AATGAACG
ATCRCTTG 8 ATCACTTG
AMACAS 6 ACACAC
TCACTGYA 8 TCACTGCA
AAAATTAG 8 AAAATTAG
ATKCAGCC 8 ATGCAGCC
GCGTGMGC 8 GCGTGAGC
AGCHCCTA 8 AGCACCTA
CCATGTKG 8 CCATGTTG
CCYGGS 6 CCTGGC
ARTAAACR 8 AATAAACA
AGWTCGAG 8 AGTTCGAG
AACAAAYA 8 AACAAACA
AGKCATTC 8 AGTCATTC
ATCTCTAM 8 ATCTCTAC
ATTAWYTC 8 ATTATTTC
ASTGAGAC 8 AGTGAGAC
ATCCATCC 8 ATCCATCC
GTTCAAAY 8 GTTCAAAT
TACAGGCR 8 TACAGGCA
GCCACCAY 8 GCCACCAT
MAGGAA 6 AAGGAA
ACAAAACA 8 ACAAAACA

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.262 C 0.238 G 0.238 T 0.262

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
AAAATTAG DREME-29 chrUn_GL000219v1 - 8279 8286 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1_KI270714v1_random + 10587 10594 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chrUn_GL000219v1 + 97675 97682 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chrUn_KI270742v1 - 105336 105343 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 402298 402305 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 516547 516554 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 570890 570897 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr12 + 580434 580441 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chrX + 829585 829592 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 - 968594 968601 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 1013158 1013165 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 1075407 1075414 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 1157789 1157796 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 1589679 1589686 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 1686902 1686909 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 1762603 1762610 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 1909537 1909544 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 2020155 2020162 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 2382005 2382012 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 2401348 2401355 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 2401564 2401571 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr4 + 2468037 2468044 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr4 - 2534776 2534783 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 2945662 2945669 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr20 - 2947817 2947824 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 3014314 3014321 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 3019931 3019938 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 3020112 3020119 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 - 3024561 3024568 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 3048077 3048084 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 3054104 3054111 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 3069857 3069864 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 3263530 3263537 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 - 3338489 3338496 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 - 3404086 3404093 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr18 - 3446346 3446353 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 + 3510044 3510051 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 - 3599781 3599788 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 3617883 3617890 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 3617883 3617890 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 - 3650205 3650212 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 3719030 3719037 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr11 - 3871035 3871042 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 - 3879118 3879125 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 + 3965853 3965860 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 4232570 4232577 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 + 4299796 4299803 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 4304557 4304564 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 4644522 4644529 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 4688498 4688505 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr10 + 4815201 4815208 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 4911324 4911331 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 4950745 4950752 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 4999058 4999065 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr3 + 5015018 5015025 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 5028285 5028292 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 5198210 5198217 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 - 5289174 5289181 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 5318187 5318194 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 + 5458544 5458551 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr10 + 5462620 5462627 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr10 + 5462620 5462627 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr9 - 5533268 5533275 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 5542018 5542025 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 5563986 5563993 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 5765658 5765665 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 5821465 5821472 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr10 + 5853956 5853963 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr10 + 6050487 6050494 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 6126391 6126398 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 + 6355636 6355643 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 6373798 6373805 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 - 6433340 6433347 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 6448370 6448377 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 6586638 6586645 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 6625814 6625821 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 6655114 6655121 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr9 + 6756563 6756570 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 6777571 6777578 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr6 - 6818043 6818050 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 8034064 8034071 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 8051211 8051218 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 + 8112686 8112693 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 8154058 8154065 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 8367999 8368006 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr17 - 8384266 8384273 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 8407459 8407466 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 8407800 8407807 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr2 + 8598655 8598662 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr4 - 8609279 8609286 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 8685020 8685027 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr8 - 8777513 8777520 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 8913596 8913603 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 - 9005330 9005337 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 9009495 9009502 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 9009495 9009502 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 9073987 9073994 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 9138359 9138366 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr8 - 9267987 9267994 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 9541143 9541150 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 9645696 9645703 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 9645991 9645998 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 9884647 9884654 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 9896039 9896046 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 9897984 9897991 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr3 + 9905302 9905309 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr3 + 9905666 9905673 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 9932389 9932396 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 9932389 9932396 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 10096945 10096952 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr3 + 10115059 10115066 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr2 + 10119913 10119920 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 10282410 10282417 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 10299408 10299415 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 10361987 10361994 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 10377782 10377789 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 10377782 10377789 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 + 10398150 10398157 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr5 - 10504503 10504510 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr5 + 10505919 10505926 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 10602067 10602074 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 - 10750560 10750567 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr16 + 10779935 10779942 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr6 - 10886575 10886582 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 - 11095514 11095521 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 11140219 11140226 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 11140219 11140226 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 11197704 11197711 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 11563693 11563700 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 11566035 11566042 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 11661634 11661641 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr8 + 11767637 11767644 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 11798906 11798913 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 11807005 11807012 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 11968641 11968648 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 11972414 11972421 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 12015299 12015306 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 12218515 12218522 2e-05 0.214 aaaATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr2 - 12278943 12278950 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 12408526 12408533 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 12408991 12408998 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 12436831 12436838 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 12528878 12528885 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 12552274 12552281 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 + 12611122 12611129 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr3 + 12648438 12648445 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 12682181 12682188 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr18 + 12701973 12701980 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr3 + 12721592 12721599 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 12883093 12883100 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 - 12884563 12884570 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 12890410 12890417 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr10 - 12989584 12989591 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 + 13058431 13058438 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 + 13147311 13147318 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 13158168 13158175 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr19 - 13158168 13158175 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr10 + 13404127 13404134 2e-05 0.214 aaaaTTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr12 - 47215416 47215423 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr7 - 75074223 75074230 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 + 75103621 75103628 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr10 - 75110978 75110985 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr17 - 75183632 75183639 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr17 + 75189121 75189128 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr17 - 75204845 75204852 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr17 - 75205011 75205018 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr17 - 75205011 75205018 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr2 - 75281670 75281677 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr12 - 75512124 75512131 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr9 - 76359337 76359344 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr17 - 78785020 78785027 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr17 - 78785478 78785485 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr5 - 79611847 79611854 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr5 - 79773997 79774004 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr2 + 80079660 80079667 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr17 - 80856307 80856314 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr17 + 81167130 81167137 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 81243631 81243638 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 81296530 81296537 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr17 + 82495126 82495133 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr11 - 82694807 82694814 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 - 83151646 83151653 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr16 - 84600475 84600482 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr16 + 84633248 84633255 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 84728961 84728968 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr16 - 85050478 85050485 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr16 + 85051005 85051012 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 85138466 85138473 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr16 + 85403648 85403655 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr2 - 85469289 85469296 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 85679949 85679956 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr8 - 85959149 85959156 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr2 + 85993852 85993859 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr2 - 86200829 86200836 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 - 86202762 86202769 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 + 86930636 86930643 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr9 - 87516567 87516574 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr16 - 87683769 87683776 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr9 + 87726888 87726895 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr16 + 88133941 88133948 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr15 - 88302865 88302872 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr16 - 88890876 88890883 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr6 + 89354021 89354028 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr15 - 89475405 89475412 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr8 + 90168237 90168244 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr6 + 90457320 90457327 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr5 - 90646936 90646943 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr1 - 90811551 90811558 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr15 - 90842376 90842383 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr14 - 90932286 90932293 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr8 - 90985915 90985922 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 + 91793420 91793427 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr12 + 92403842 92403849 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr12 - 92927615 92927622 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 93179208 93179215 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 93568032 93568039 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 93664282 93664289 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr9 + 94729416 94729423 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr8 - 94819754 94819761 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr8 - 95091803 95091810 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 + 95158770 95158777 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 95180280 95180287 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr12 - 95429132 95429139 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr11 + 95652465 95652472 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr5 - 96092080 96092087 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr2 + 96412630 96412637 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr10 - 96790199 96790206 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr9 - 97510393 97510400 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr8 + 97582738 97582745 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr9 - 98050603 98050610 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr9 - 98432058 98432065 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr4 + 98544026 98544033 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr3 - 98663132 98663139 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 99125241 99125248 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 99428036 99428043 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 + 99428587 99428594 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr10 - 99440969 99440976 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 - 99515937 99515944 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr13 - 99552766 99552773 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 + 100169151 100169158 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 100241570 100241577 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 - 100556278 100556285 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr9 - 100583809 100583816 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 + 100692009 100692016 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 + 100722296 100722303 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr8 + 100723207 100723214 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr1 + 100785819 100785826 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr14 + 100855686 100855693 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr8 + 100981586 100981593 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 100984419 100984426 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr8 + 101003381 101003388 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr8 - 101123623 101123630 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr8 - 101154325 101154332 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr15 + 101454791 101454798 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 101667191 101667198 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr14 - 101685210 101685217 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr2 + 102056551 102056558 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr10 + 102265534 102265541 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 + 102421391 102421398 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr10 - 102455448 102455455 2e-05 0.214 AAAATTAG
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AAAATTAG DREME-29 chr12 + 103681159 103681166 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr14 - 104600707 104600714 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 + 105232859 105232866 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 105401563 105401570 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr2 - 105477300 105477307 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr7 - 105477965 105477972 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr2 + 105488960 105488967 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr2 + 105602353 105602360 2e-05 0.214 aaaattag
AAAATTAG DREME-29 chr6 - 105926402 105926409 2e-05 0.214 AAAATTAG
AAAATTAG DREME-29 chr6 + 106887801 106887808 2e-05 0.214 aaaattag
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_35 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif AAAATTAG /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_35
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZNF24.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

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