Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
Database contains 27201 sequences, 13600500 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
SMGGAA 6 CAGGAA
BTTATCW 7 CTTATCT
DAAATR 6 AAAATG
SYGGGA 6 CTGGGA
CYCCDCCC 8 CCCCGCCC
CAABATGG 8 CAAGATGG
TGACTCAB 8 TGACTCAG
CCDCMGCC 8 CCGCCGCC
AMACAS 6 ACACAG
GTSACD 6 GTGACT
CWGCWGC 7 CAGCAGC
SAGAWA 6 GAGAAA
KTCCCCR 7 GTCCCCA
GCSTGTAA 8 GCCTGTAA
CAGCCTGG 8 CAGCCTGG
AAAWAAAA 8 AAAAAAAA
ACGTGD 6 ACGTGG
RGAMGGAA 8 GGAAGGAA
ATGGCGDC 8 ATGGCGGC
AGGCBGAG 8 AGGCTGAG
RGGAAR 6 GGGAAG
RRACTACA 8 GAACTACA
GAACCAGA 8 GAACCAGA
CSCRGCC 7 CCCGGCC
AAAATTAK 8 AAAATTAG
CTCACTGC 8 CTCACTGC
CACCAYG 7 CACCATG
CTGTCTCH 8 CTGTCTCC
GCGCGYGY 8 GCGCGCGC
GCCACTGY 8 GCCACTGC
ACGGAAST 8 ACGGAAGT
CCVAGTAG 8 CCCAGTAG
CRSCTCC 7 CGGCTCC
CTGACSTC 8 CTGACCTC
TTTAWAA 7 TTTAAAA
CRTCTCTA 8 CATCTCTA
ARCCACA 7 AGCCACA
TAATAATR 8 TAATAATA
ARATA 5 AGATA
CTCTGACA 8 CTCTGACA
ATCRCTTG 8 ATCACTTG
ACCCGGA 7 ACCCGGA
CASATG 6 CAGATG
GGSCTGGA 8 GGGCTGGA
CACTTTGG 8 CACTTTGG
ACGGAGTC 8 ACGGAGTC
GTAAACA 7 GTAAACA
TCCGGGCW 8 TCCGGGCT
CTCCCTCC 8 CTCCCTCC
GSCTGATA 8 GGCTGATA
GGTTYCAC 8 GGTTCCAC
CDCCGC 6 CGCCGC
CGCATGCG 8 CGCATGCG
CGCTGTCC 8 CGCTGTCC

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.221 C 0.279 G 0.279 T 0.221

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
TTTAWAA DREME-35 chr17_GL000205v2_random + 53650 53656 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr17_GL000205v2_random + 53650 53656 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr17_GL000205v2_random - 53649 53655 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr17_GL000205v2_random - 53649 53655 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 143336 143342 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 157786 157792 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr5 + 218043 218049 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr11 + 269014 269020 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr9 + 272696 272702 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr9 + 272696 272702 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr9 - 272695 272701 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr9 - 272695 272701 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr11 - 353150 353156 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 - 481942 481948 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr4 + 499040 499046 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr4 - 499039 499045 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 516921 516927 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 516920 516926 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr7 - 524061 524067 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 572110 572116 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 633701 633707 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 636679 636685 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 636679 636685 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr12 - 751378 751384 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 755895 755901 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 755894 755900 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 + 833312 833318 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 - 833311 833317 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 903925 903931 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 967821 967827 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 980879 980885 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 987132 987138 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 987629 987635 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 1002922 1002928 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 1049714 1049720 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 1049713 1049719 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 1049869 1049875 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 1049936 1049942 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 1049936 1049942 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 + 1214906 1214912 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr20 - 1214905 1214911 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr1 + 1231055 1231061 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr20 - 1255541 1255547 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 + 1255563 1255569 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr20 - 1255562 1255568 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 - 1255581 1255587 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 1296998 1297004 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 1297223 1297229 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 1297223 1297229 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 1298358 1298364 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr12 + 1304216 1304222 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr12 - 1304215 1304221 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 + 1434911 1434917 2.55e-05 0.117 tttaAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 - 1434910 1434916 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr7 + 1463011 1463017 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr7 + 1463011 1463017 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chrX + 1478218 1478224 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chrX - 1478217 1478223 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 + 1515602 1515608 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 - 1515601 1515607 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr17 - 1716645 1716651 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr4 + 1727699 1727705 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr4 - 1727698 1727704 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 1848918 1848924 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr4 + 1883325 1883331 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 1897626 1897632 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr12 + 1916367 1916373 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr8 + 1957765 1957771 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr8 - 1957764 1957770 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 2062779 2062785 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 2164534 2164540 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 2237262 2237268 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 2237261 2237267 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 + 2253916 2253922 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 + 2253916 2253922 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 2262099 2262105 2.55e-05 0.117 ttTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 2262098 2262104 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 2302508 2302514 2.55e-05 0.117 tTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 2302507 2302513 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 2302949 2302955 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 2346366 2346372 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 2402083 2402089 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 2402083 2402089 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 2402082 2402088 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 2402082 2402088 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr4 - 2468974 2468980 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 2474541 2474547 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chrX + 2503159 2503165 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 2648524 2648530 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 2648544 2648550 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 2648543 2648549 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 2663762 2663768 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 2663761 2663767 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 2672454 2672460 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 2672469 2672475 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 2672481 2672487 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 2672541 2672547 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr7 + 2717857 2717863 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr7 - 2717856 2717862 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 + 2733612 2733618 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 - 2733611 2733617 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 + 2751841 2751847 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 - 2751840 2751846 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr12 + 2812317 2812323 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr12 - 2812316 2812322 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 2894641 2894647 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 2894640 2894646 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr7 - 2956502 2956508 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr17 + 2975396 2975402 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr6 + 2987579 2987585 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 - 2990607 2990613 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 3013512 3013518 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 3013511 3013517 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr10 - 3045557 3045563 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr10 + 3045586 3045592 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr10 - 3045585 3045591 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr10 + 3068381 3068387 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr10 + 3068381 3068387 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr10 - 3068380 3068386 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr10 - 3068380 3068386 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr8 - 3152446 3152452 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 - 3158293 3158299 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 - 3161808 3161814 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 - 3161937 3161943 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 3185690 3185696 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 3185690 3185696 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr3 + 3192234 3192240 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr3 - 3192233 3192239 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 + 3220196 3220202 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 3282714 3282720 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr17 + 3318429 3318435 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 - 3355945 3355951 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr11 + 3379627 3379633 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr11 - 3379626 3379632 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr6 - 3393390 3393396 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 + 3494027 3494033 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 - 3494026 3494032 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 + 3494271 3494277 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 - 3494270 3494276 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 - 3502979 3502985 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 - 3574985 3574991 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 - 3577626 3577632 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 3624733 3624739 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 3624733 3624739 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 3627364 3627370 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr19 + 3627364 3627370 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr3 - 11480240 11480246 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr3 + 11509031 11509037 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr3 + 11509031 11509037 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr1 + 11908283 11908289 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr1 + 11909843 11909849 2.55e-05 0.117 tttaaaa
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TTTAWAA DREME-35 chr1 - 12075765 12075771 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr2 - 12279836 12279842 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr18 + 12492601 12492607 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr6 - 13980420 13980426 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr17 - 17538684 17538690 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr17 + 17539056 17539062 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr16 - 17592410 17592416 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
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TTTAWAA DREME-35 chr11 - 22829260 22829266 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 + 22834252 22834258 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr20 + 22834252 22834258 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr15 - 22838368 22838374 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr8 + 22901014 22901020 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 - 22929080 22929086 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr14 + 23020805 23020811 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr10 - 23053741 23053747 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr1 + 23114491 23114497 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr1 - 23114490 23114496 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr1 + 23119444 23119450 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr1 - 23119524 23119530 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr14 + 23120692 23120698 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr14 - 23120691 23120697 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 + 23133094 23133100 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr20 - 23133093 23133099 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 23227869 23227875 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr18 - 23227869 23227875 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr1 + 23343217 23343223 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr1 + 23343315 23343321 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr1 + 23343482 23343488 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr1 - 23343481 23343487 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr12 - 23425482 23425488 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr8 + 23519027 23519033 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr8 + 23519027 23519033 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr8 - 23519026 23519032 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr8 - 23519026 23519032 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr15 + 23562768 23562774 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr15 + 23563060 23563066 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 23667260 23667266 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 23667259 23667265 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 23678799 23678805 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr3 + 23739617 23739623 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr3 + 23739692 23739698 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr3 - 23739691 23739697 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr3 + 23739895 23739901 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 23785243 23785249 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 23785243 23785249 2.55e-05 0.117 tttaaaa
TTTAWAA DREME-35 chrX - 23884453 23884459 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 - 23901552 23901558 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 + 23925633 23925639 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr2 - 23926002 23926008 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 23952408 23952414 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr16 + 23952408 23952414 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chr1 - 23980685 23980691 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
TTTAWAA DREME-35 chrX + 24026812 24026818 2.55e-05 0.117 TTTAAAA
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_40 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif TTTAWAA /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_40
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ZBTB11.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

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