Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
Database contains 22558 sequences, 11279000 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
VGCGGGAR 8 GGCGGGAG
CACGTG 6 CACGTG
CNGGRA 6 CTGGGA
ARATAH 6 AAATAA
CAAVATGG 8 CAAGATGG
GGGMGGGR 8 GGGCGGGG
GCCRCYGC 8 GCCGCCGC
RGRAA 5 AGAAA
CVGCCTC 7 CAGCCTC
GCCTGTAR 8 GCCTGTAA
CAGCCTGG 8 CAGCCTGG
ASWCAC 6 ACACAC
GASGTCAS 8 GAGGTCAG
AAAAMAAA 8 AAAAAAAA
AYGTG 5 ATGTG
CDSCTCC 7 CTGCTCC
TTTWAAAW 8 TTTAAAAA
RAACCAGA 8 GAACCAGA
ACASAGC 7 ACAGAGC
AAATTASC 8 AAATTAGC
GCRCGCGS 8 GCGCGCGG
BTTATCA 7 TTTATCA
CCACCAYG 8 CCACCACG
CTCTGACA 8 CTCTGACA
MTGAGTCA 8 CTGAGTCA
ATTGGCYG 8 ATTGGCTG
CAGTGAS 7 CAGTGAG
AGGCAGGA 8 AGGCAGGA
GAGACRGA 8 GAGACAGA
CRCCATGK 8 CGCCATGG
CCMCACCC 8 CCCCACCC
AAACCCHG 8 AAACCCAG
CAGCCCHG 8 CAGCCCAG
TCTACTAA 8 TCTACTAA
CATTTHA 7 CATTTTA
CGCATGCG 8 CGCATGCG
AGATSGAG 8 AGATGGAG
CAYTTTGG 8 CACTTTGG
ATAYATRC 8 ATACATAC
SGCGGGA 7 CGCGGGA
CTSCAGCY 8 CTGCAGCC
CTGTR 5 CTGTG
CCCAGGM 7 CCCAGGC
ACTTCCGY 8 ACTTCCGC
CCAATCAG 8 CCAATCAG
AGCGATTC 8 AGCGATTC
ATGGCKGC 8 ATGGCGGC
GARGCCA 7 GAGGCCA
GCTGGGTA 8 GCTGGGTA
GRACTACA 8 GGACTACA
AGGTCWCA 8 AGGTCTCA

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.221 C 0.279 G 0.279 T 0.221

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
GCCRCYGC DREME-7 chrUn_GL000219v1 - 99920 99927 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr4 - 124935 124942 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr4 - 124935 124942 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 135135 135142 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 135522 135529 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 135525 135532 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 135528 135535 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr18 + 158578 158585 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr18 + 158607 158614 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr18 + 158610 158617 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr18 + 158672 158679 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 181613 181620 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 234847 234854 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr2 - 264233 264240 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr18 - 268000 268007 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr18 - 268000 268007 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 - 297596 297603 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 - 297596 297603 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 + 297759 297766 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 - 297782 297789 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 355810 355817 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 355810 355817 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chrX + 386998 387005 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 425608 425615 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 425611 425618 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr5 - 473047 473054 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr5 + 473099 473106 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr4 - 473872 473879 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr4 + 473910 473917 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 507523 507530 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 507523 507530 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 572409 572416 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 572584 572591 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 572587 572594 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 576494 576501 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 576506 576513 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 576509 576516 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 576546 576553 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 576598 576605 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 + 610045 610052 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr20 + 610048 610055 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr20 + 610051 610058 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 636273 636280 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr2 - 637082 637089 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 642085 642092 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 642088 642095 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr12 + 642993 643000 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr18 + 657566 657573 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 663122 663129 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 - 675735 675742 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 - 675764 675771 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 - 675767 675774 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 694775 694782 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 694775 694782 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 694961 694968 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 694961 694968 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 694964 694971 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 694964 694971 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 694994 695001 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 695161 695168 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 715897 715904 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 740997 741004 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 747242 747249 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 747446 747453 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 747446 747453 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 747449 747456 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 747449 747456 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 747452 747459 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 747452 747459 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 747455 747462 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 747455 747462 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 788457 788464 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 788634 788641 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 788637 788644 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 798134 798141 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 798223 798230 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 798226 798233 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 798229 798236 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 832967 832974 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 832988 832995 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 832991 832998 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 833459 833466 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 - 833525 833532 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 842829 842836 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 842903 842910 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 843842 843849 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 + 876165 876172 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 + 876168 876175 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 876648 876655 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 876648 876655 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 876651 876658 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 876651 876658 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 876654 876661 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 876654 876661 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 876703 876710 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 876703 876710 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr5 - 892952 892959 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 904630 904637 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 904712 904719 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 904797 904804 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 925859 925866 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 941950 941957 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr4 - 986987 986994 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr12 + 991084 991091 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr12 - 991245 991252 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr12 - 991248 991255 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr12 - 991251 991258 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr17 - 997145 997152 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 1000131 1000138 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 1002023 1002030 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr4 - 1011309 1011316 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 1019907 1019914 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 1116605 1116612 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 1174233 1174240 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1205650 1205657 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1205754 1205761 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 1208026 1208033 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 1232301 1232308 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 1232440 1232447 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 1232807 1232814 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 1232810 1232817 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 1232921 1232928 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr4 + 1249001 1249008 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr4 + 1249070 1249077 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1249722 1249729 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1269462 1269469 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 1269621 1269628 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 1269621 1269628 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 1273804 1273811 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 1273807 1273814 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 1273810 1273817 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 1275569 1275576 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 1308319 1308326 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 1308319 1308326 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 1309310 1309317 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 1309496 1309503 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 - 1309504 1309511 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 1309601 1309608 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 1309604 1309611 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 1309627 1309634 3.69e-05 0.109 Gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 1309705 1309712 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 1309708 1309715 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 1309711 1309718 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr5 + 1344944 1344951 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 1354945 1354952 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1354984 1354991 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1354987 1354994 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1354990 1354997 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1354993 1355000 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1354996 1355003 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 1354999 1355006 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 1379623 1379630 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 1379623 1379630 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 + 1379663 1379670 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 1826997 1827004 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 2164030 2164037 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 2164033 2164040 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 2164036 2164043 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 2164039 2164046 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 2164042 2164049 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 2164045 2164052 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 2270217 2270224 3.69e-05 0.109 gccgccgc
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GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 3301200 3301207 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 3301278 3301285 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 3301281 3301288 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 3301281 3301288 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 3301284 3301291 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 3301284 3301291 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 3301287 3301294 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 3301287 3301294 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 3305692 3305699 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 3454442 3454449 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 3454445 3454452 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 3454445 3454452 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 3454651 3454658 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 3454651 3454658 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 3457975 3457982 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 3717466 3717473 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr17 - 3724006 3724013 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr17 - 3724006 3724013 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr17 - 3724165 3724172 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr12 + 6534467 6534474 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 6602647 6602654 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr1 + 6613804 6613811 3.69e-05 0.109 gccgccgc
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GCCRCYGC DREME-7 chr4 - 6674201 6674208 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr12 - 6689112 6689119 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr8 - 6708562 6708569 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 6784861 6784868 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr12 + 6868080 6868087 3.69e-05 0.109 gccGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr12 + 6891520 6891527 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr4 - 6909686 6909693 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chrX + 7147882 7147889 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chrX + 7147882 7147889 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chrX - 7148030 7148037 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chrX - 7148030 7148037 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 7182520 7182527 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 - 7182520 7182527 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 + 7182646 7182653 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 + 7182646 7182653 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr7 + 7182649 7182656 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr11 + 9461124 9461131 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 10420090 10420097 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr20 - 10435248 10435255 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr2 - 10448294 10448301 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr2 - 10448294 10448301 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr2 - 10448297 10448304 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr2 - 10448297 10448304 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr2 - 10448300 10448307 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr2 - 10448303 10448310 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr2 - 10448303 10448310 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr4 + 10461326 10461333 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 10961062 10961069 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr6 + 11094247 11094254 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 11345474 11345481 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 11482822 11482829 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr1 - 11664347 11664354 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 11668460 11668467 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 11797170 11797177 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 11797193 11797200 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 11797196 11797203 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 11797199 11797206 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 11797199 11797206 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 11797244 11797251 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr16 - 11797247 11797254 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr18 - 11908886 11908893 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr18 + 12308807 12308814 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr18 + 12377083 12377090 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr18 + 12377083 12377090 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr3 - 12557114 12557121 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr3 - 12557114 12557121 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr12 + 12562212 12562219 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr7 + 12686679 12686686 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr12 + 12717307 12717314 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 12722492 12722499 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr8 - 12754719 12754726 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr8 - 12754866 12754873 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr8 - 12754879 12754886 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr8 - 12754985 12754992 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr8 + 12755199 12755206 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chr8 + 12755437 12755444 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr8 + 12755440 12755447 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr12 - 12786856 12786863 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
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GCCRCYGC DREME-7 chrX + 12791462 12791469 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 12945885 12945892 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 - 12945885 12945892 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 12945923 12945930 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 12945923 12945930 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 12965494 12965501 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 12965494 12965501 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 12965514 12965521 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 12965514 12965521 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chrX - 12975572 12975579 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chrX - 12975679 12975686 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chrX + 12975761 12975768 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chrX + 12975761 12975768 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 13153982 13153989 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr19 + 13153982 13153989 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 13299914 13299921 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 13299914 13299921 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 13300019 13300026 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr6 + 13328520 13328527 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr6 + 13328523 13328530 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr10 + 13347664 13347671 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr10 + 13347667 13347674 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr10 + 13347670 13347677 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr10 + 13347673 13347680 3.69e-05 0.109 gccgccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr10 + 13347720 13347727 3.69e-05 0.109 GCCGCCGc
GCCRCYGC DREME-7 chr10 + 13347723 13347730 3.69e-05 0.109 GCCGccgc
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 13347780 13347787 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 13347783 13347790 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 13347786 13347793 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 - 13347789 13347796 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr10 + 13347926 13347933 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr3 + 13420356 13420363 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
GCCRCYGC DREME-7 chr3 + 13420356 13420363 3.69e-05 0.109 GCCGCCGC
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_10 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif GCCRCYGC /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_10
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TFDP1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

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