Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

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If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
Database contains 12309 sequences, 6154500 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
CAANATGG 8 CAAGATGG
CVGCCKCC 8 CCGCCTCC
TARTCCCA 8 TAATCCCA
AAAATDAG 8 AAAATTAG
HTTCCY 6 CTTCCT
TAAAAATA 8 TAAAAATA
GCCRCCAY 8 GCCACCAC
GGTTCAMR 8 GGTTCAAA
CTSCWGCC 8 CTCCAGCC
GTAGAGAY 8 GTAGAGAC
GTGAKCCR 8 GTGAGCCA
TGTCAGAR 8 TGTCAGAG
AGGTCAGD 8 AGGTCAGG
CMCAGC 6 CCCAGC
AGTYRCTC 8 AGTCGCTC
AAAYAMA 7 AAACAAA
ACCAKCCT 8 ACCAGCCT
CRGYGGC 7 CAGCGGC
GGGTTTCA 8 GGGTTTCA
AGGTTGCA 8 AGGTTGCA
CAAAGTGC 8 CAAAGTGC
ATGGCG 6 ATGGCG
CCSAGTAG 8 CCCAGTAG
GCDTTTCC 8 GCTTTTCC
GWGACRGA 8 GAGACAGA
CACDCAC 7 CACACAC
CCWCCWCC 8 CCTCCTCC
GCTGAGDC 8 GCTGAGAC
AGWTCGAG 8 AGATCGAG
CAGSCATG 8 CAGGCATG
AGGCATTS 8 AGGCATTG
AVAGAAA 7 AAAGAAA
ARATTATA 8 AGATTATA
CCRTGTTA 8 CCGTGTTA
CCTRGAAA 8 CCTGGAAA
GAGATKAA 8 GAGATGAA
TTAWAAAA 8 TTAAAAAA
AGACAGTG 8 AGACAGTG
CNGCAGC 7 CAGCAGC
CCATYTTA 8 CCATCTTA
AGGCHGAG 8 AGGCAGAG
CTGTCSCC 8 CTGTCCCC
AYTGTTAC 8 ACTGTTAC
AGGTACYG 8 AGGTACCG
CACCGTSC 8 CACCGTCC
ACYTCCGG 8 ACTTCCGG
STGGGKA 7 GTGGGGA
AATACTGC 8 AATACTGC
AGYGAGAC 8 AGCGAGAC
AATAGGR 7 AATAGGG
CTCCCACC 8 CTCCCACC
CATTTTM 7 CATTTTC
CTGTAYC 7 CTGTACC
GCAGTGAS 8 GCAGTGAG
GGAGGTTA 8 GGAGGTTA
TAATCCTA 8 TAATCCTA
CGAGTAGC 8 CGAGTAGC
CAGMACCG 8 CAGAACCG
AAGCAGGG 8 AAGCAGGG
GGAGTTCM 8 GGAGTTCC

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.221 C 0.279 G 0.279 T 0.221

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
AYTGTTAC DREME-43 chrUn_KI270442v1 - 391323 391330 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr18 + 1553342 1553349 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 5422161 5422168 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 6183276 6183283 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 6577355 6577362 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 10613201 10613208 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 12065149 12065156 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 12868554 12868561 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 12994845 12994852 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 14272867 14272874 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 17715200 17715207 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 - 19431000 19431007 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 + 19452557 19452564 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr22 - 20820613 20820620 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr19 - 21621207 21621214 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 - 21657778 21657785 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 - 21798139 21798146 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 - 22156810 22156817 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 + 22198510 22198517 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr17 - 22304932 22304939 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr10 + 22631739 22631746 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr22 + 23536086 23536093 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr16 + 23640873 23640880 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 - 24631378 24631385 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 25927637 25927644 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 26637285 26637292 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 26864979 26864986 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 27602679 27602686 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 27792408 27792415 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 28747212 28747219 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 28897269 28897276 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr19 + 29811032 29811039 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr16 - 29974209 29974216 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 33515803 33515810 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 34512816 34512823 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr20 - 35412159 35412166 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 36489901 36489908 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 - 39108905 39108912 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr13 - 41263309 41263316 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr19 + 41364693 41364700 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr20 + 41693821 41693828 1.14e-05 0.994 ACtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr17 - 42679394 42679401 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 42811211 42811218 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 43288778 43288785 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 45444711 45444718 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 - 46549136 46549143 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr19 - 47211366 47211373 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 47642945 47642952 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 48147506 48147513 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 - 48235842 48235849 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chrX - 48521441 48521448 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 48877913 48877920 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 49323707 49323714 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 50960575 50960582 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr17 + 51435180 51435187 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr13 - 52194410 52194417 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr19 - 52724515 52724522 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 53366281 53366288 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 55460322 55460329 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 - 56040878 56040885 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 56157021 56157028 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 58579626 58579633 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 58751017 58751024 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr20 + 59011699 59011706 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr10 - 61774349 61774356 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 62369422 62369429 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr16 - 66549487 66549494 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 69734274 69734281 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 + 70190494 70190501 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 70205829 70205836 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 70258962 70258969 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 70461366 70461373 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 70985815 70985822 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 72116214 72116221 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr16 - 72627232 72627239 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 72848340 72848347 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr10 - 73246652 73246659 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 73524100 73524107 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr17 + 75154880 75154887 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 79235551 79235558 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr16 + 81578258 81578265 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 81759806 81759813 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr16 - 85010472 85010479 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 + 86000240 86000247 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr4 + 87390852 87390859 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 92804628 92804635 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 92820677 92820684 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 96703132 96703139 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 + 97232160 97232167 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 101014644 101014651 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 103855782 103855789 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 105797635 105797642 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 108222409 108222416 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 109308322 109308329 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 112795416 112795423 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 117822130 117822137 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 118979937 118979944 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chrX + 120560485 120560492 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 121076440 121076447 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 121294942 121294949 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 124920865 124920872 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr2 + 128474843 128474850 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 129483551 129483558 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chrX + 134459773 134459780 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 136781267 136781274 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 136789747 136789754 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 139043860 139043867 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 141652441 141652448 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 146887058 146887065 1.14e-05 0.994 ACtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 149943431 149943438 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 150293758 150293765 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 151254998 151255005 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 152876196 152876203 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 156620353 156620360 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 158869959 158869966 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 159077585 159077592 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 159716839 159716846 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 160652163 160652170 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 160652163 160652170 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 170264217 170264224 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 172456316 172456323 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 172592106 172592113 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 172631191 172631198 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 173474449 173474456 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 173824799 173824806 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 179882992 179882999 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 183357885 183357892 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 183521317 183521324 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr4 - 190111011 190111018 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 200889956 200889963 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 203026006 203026013 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 204647326 204647333 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 211223067 211223074 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 211613327 211613334 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 230642944 230642951 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 231072703 231072710 1.14e-05 0.994 actgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 244865015 244865022 1.14e-05 0.994 ACTGTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 30896330 30896337 2.04e-05 0.994 ATTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr16 - 31074422 31074429 2.04e-05 0.994 ATTGTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 67432201 67432208 2.04e-05 0.994 ATTGTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 73580906 73580913 2.04e-05 0.994 ATTGTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 129489213 129489220 2.04e-05 0.994 ATTGTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr9 + 136788665 136788672 2.04e-05 0.994 attgttac
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AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 19288780 19288787 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 + 19939652 19939659 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 20323873 20323880 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 20519931 20519938 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 21022699 21022706 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr10 + 21097936 21097943 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 - 21105214 21105221 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 + 21455366 21455373 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 24075959 24075966 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr10 - 24681872 24681879 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 25569095 25569102 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 25857320 25857327 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 26408574 26408581 4.08e-05 1 AGTGTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr11 + 26597148 26597155 4.08e-05 1 AAtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 26956081 26956088 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 27617582 27617589 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 27617582 27617589 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 27811243 27811250 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 27824499 27824506 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 28648563 28648570 4.08e-05 1 AGTGTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr10 + 30584235 30584242 4.08e-05 1 AATGTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr19 + 32628422 32628429 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 32684962 32684969 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr19 + 32693182 32693189 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr19 + 32693313 32693320 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr19 + 32693416 32693423 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr10 - 33050613 33050620 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 33249754 33249761 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr4 + 34335133 34335140 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr4 + 34335235 34335242 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr17 - 34961732 34961739 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 36104838 36104845 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 36398611 36398618 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 36557981 36557988 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 + 36619973 36619980 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr4 + 37073288 37073295 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 37231428 37231435 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 37289588 37289595 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 + 38252662 38252669 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 38433969 38433976 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chrX + 38804141 38804148 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr14 + 39267540 39267547 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 40841526 40841533 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr13 + 41061850 41061857 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 41592229 41592236 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 43065249 43065256 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr22 + 43125552 43125559 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 43302521 43302528 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 44058704 44058711 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 + 44066804 44066811 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr19 - 44093975 44093982 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 44885671 44885678 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 45054291 45054298 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 45064650 45064657 4.08e-05 1 AAtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 45198546 45198553 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr19 - 45507490 45507497 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 45547170 45547177 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr20 + 45972390 45972397 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 47313959 47313966 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 48087451 48087458 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 48087898 48087905 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 48146902 48146909 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr4 - 48173648 48173655 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 48314080 48314087 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 48877837 48877844 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr10 + 49183840 49183847 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 - 49567871 49567878 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 49940558 49940565 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 50687206 50687213 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 - 51047704 51047711 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 - 51681226 51681233 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 52771287 52771294 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 53015005 53015012 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 53768147 53768154 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr8 - 54102420 54102427 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr16 + 57462476 57462483 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 58706467 58706474 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 58770597 58770604 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr13 + 61557924 61557931 4.08e-05 1 AGtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 65712091 65712098 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 68121887 68121894 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 68236923 68236930 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 68421467 68421474 4.08e-05 1 AGtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr16 + 69131929 69131936 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr14 + 69132943 69132950 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr13 - 69222411 69222418 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr10 - 69315290 69315297 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 + 73151989 73151996 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 73586130 73586137 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr10 + 74246907 74246914 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr4 + 74398408 74398415 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr17 + 75155101 75155108 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr16 - 75560056 75560063 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 75872455 75872462 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr17 + 76558025 76558032 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr17 - 76602157 76602164 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr13 - 78659094 78659101 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr16 - 81181767 81181774 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 + 81481774 81481781 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 84765144 84765151 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 85504092 85504099 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 87129559 87129566 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 88420972 88420979 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr13 + 90312408 90312415 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr12 - 91635245 91635252 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr13 + 92381223 92381230 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 93940262 93940269 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 94558289 94558296 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr8 + 95269860 95269867 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr11 - 95650769 95650776 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr10 - 96065786 96065793 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 96135531 96135538 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr15 + 96135631 96135638 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr2 - 96306151 96306158 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 96358507 96358514 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 96703127 96703134 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr13 - 97222673 97222680 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr4 - 99563324 99563331 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr4 + 99735016 99735023 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr8 + 100150379 100150386 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 101398420 101398427 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr14 - 102362795 102362802 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 102441289 102441296 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 104963953 104963960 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 105064348 105064355 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 105401811 105401818 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 106282864 106282871 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 106599426 106599433 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr2 + 107746690 107746697 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr2 + 107746825 107746832 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 108963717 108963724 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 109174335 109174342 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 109910336 109910343 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr4 + 110193920 110193927 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr8 + 111040175 111040182 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr8 + 111040273 111040280 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 114385774 114385781 4.08e-05 1 aatgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 117821818 117821825 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chrX + 119693193 119693200 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 119950505 119950512 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 119950709 119950716 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr2 + 124986789 124986796 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr2 + 124986891 124986898 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chrX + 125154798 125154805 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chrX + 125154900 125154907 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 126772225 126772232 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr9 - 127981559 127981566 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr4 - 128517803 128517810 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr4 + 132123974 132123981 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 134082975 134082982 4.08e-05 1 agtgttac
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 134586194 134586201 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 136284919 136284926 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chrX - 136421582 136421589 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chrX - 136421685 136421692 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 138257640 138257647 4.08e-05 1 AATGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 139503349 139503356 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 139503452 139503459 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 139503555 139503562 4.08e-05 1 AGTGTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 140665230 140665237 4.08e-05 1 AATGTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 28615986 28615993 9.96e-05 1 ACTTTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 28648738 28648745 9.96e-05 1 ACTGTTAT
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AYTGTTAC DREME-43 chr14 - 28830125 28830132 9.96e-05 1 ACTGTTAG
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AYTGTTAC DREME-43 chr21 - 34907670 34907677 9.96e-05 1 ACTTTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr10 - 43436935 43436942 9.96e-05 1 ACTCTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr10 - 43436935 43436942 9.96e-05 1 ACTCTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr19 + 45739732 45739739 9.96e-05 1 actgttaa
AYTGTTAC DREME-43 chr19 + 45739732 45739739 9.96e-05 1 actgttaa
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AYTGTTAC DREME-43 chr20 + 45935725 45935732 9.96e-05 1 ACTCTTAC
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AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 132179920 132179927 9.96e-05 1 ACTGTTAA
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 132813296 132813303 9.96e-05 1 ACTGTTAG
AYTGTTAC DREME-43 chr12 + 133081064 133081071 9.96e-05 1 ACTGTTAG
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 134225373 134225380 9.96e-05 1 ACTCTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 135148050 135148057 9.96e-05 1 ACTGTTAG
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 135498541 135498548 9.96e-05 1 ACTCTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 135498541 135498548 9.96e-05 1 ACTCTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr9 + 136781051 136781058 9.96e-05 1 acttttac
AYTGTTAC DREME-43 chr9 + 136789531 136789538 9.96e-05 1 acttttac
AYTGTTAC DREME-43 chr3 + 138862581 138862588 9.96e-05 1 ACTCTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 139092128 139092135 9.96e-05 1 actattac
AYTGTTAC DREME-43 chr4 - 139208583 139208590 9.96e-05 1 ACTATTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 139293820 139293827 9.96e-05 1 ACTCTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 139339821 139339828 9.96e-05 1 ACTATTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 139447508 139447515 9.96e-05 1 actgttat
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 140303448 140303455 9.96e-05 1 ACTCTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 140557312 140557319 9.96e-05 1 ACTGTTAG
AYTGTTAC DREME-43 chr5 - 140718580 140718587 9.96e-05 1 ACTTTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 141014988 141014995 9.96e-05 1 ACTATTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 141395489 141395496 9.96e-05 1 ACTGTTAA
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 141652465 141652472 9.96e-05 1 ACTGTTAG
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 142024826 142024833 9.96e-05 1 ACTGTTAA
AYTGTTAC DREME-43 chr8 - 143684478 143684485 9.96e-05 1 ACTTTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr8 + 144686324 144686331 9.96e-05 1 ACTTTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr7 + 145784483 145784490 9.96e-05 1 actgttaa
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 145927721 145927728 9.96e-05 1 ACTGTTAA
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 145964442 145964449 9.96e-05 1 ACTGTTAA
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 146857669 146857676 9.96e-05 1 ACTCTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 146934724 146934731 9.96e-05 1 acttttac
AYTGTTAC DREME-43 chr6 + 147126534 147126541 9.96e-05 1 ACTGTTAA
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 147165743 147165750 9.96e-05 1 ACTGTTAT
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 148334638 148334645 9.96e-05 1 actgttat
AYTGTTAC DREME-43 chr7 - 148941275 148941282 9.96e-05 1 ACTTTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr6 - 149749188 149749195 9.96e-05 1 ACTGTTAG
AYTGTTAC DREME-43 chr5 + 149943215 149943222 9.96e-05 1 acttttac
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 150363779 150363786 9.96e-05 1 ACTGTTAG
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 150765724 150765731 9.96e-05 1 ACTCTTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 - 151255122 151255129 9.96e-05 1 ACTATTAC
AYTGTTAC DREME-43 chr1 + 151328528 151328535 9.96e-05 1 actgttag
AYTGTTAC DREME-43 chr3 - 152241968 152241975 9.96e-05 1 ACTGTTAG
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_43 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif AYTGTTAC /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_43
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

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