Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
Database contains 12309 sequences, 6154500 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
CAANATGG 8 CAAGATGG
CVGCCKCC 8 CCGCCTCC
TARTCCCA 8 TAATCCCA
AAAATDAG 8 AAAATTAG
HTTCCY 6 CTTCCT
TAAAAATA 8 TAAAAATA
GCCRCCAY 8 GCCACCAC
GGTTCAMR 8 GGTTCAAA
CTSCWGCC 8 CTCCAGCC
GTAGAGAY 8 GTAGAGAC
GTGAKCCR 8 GTGAGCCA
TGTCAGAR 8 TGTCAGAG
AGGTCAGD 8 AGGTCAGG
CMCAGC 6 CCCAGC
AGTYRCTC 8 AGTCGCTC
AAAYAMA 7 AAACAAA
ACCAKCCT 8 ACCAGCCT
CRGYGGC 7 CAGCGGC
GGGTTTCA 8 GGGTTTCA
AGGTTGCA 8 AGGTTGCA
CAAAGTGC 8 CAAAGTGC
ATGGCG 6 ATGGCG
CCSAGTAG 8 CCCAGTAG
GCDTTTCC 8 GCTTTTCC
GWGACRGA 8 GAGACAGA
CACDCAC 7 CACACAC
CCWCCWCC 8 CCTCCTCC
GCTGAGDC 8 GCTGAGAC
AGWTCGAG 8 AGATCGAG
CAGSCATG 8 CAGGCATG
AGGCATTS 8 AGGCATTG
AVAGAAA 7 AAAGAAA
ARATTATA 8 AGATTATA
CCRTGTTA 8 CCGTGTTA
CCTRGAAA 8 CCTGGAAA
GAGATKAA 8 GAGATGAA
TTAWAAAA 8 TTAAAAAA
AGACAGTG 8 AGACAGTG
CNGCAGC 7 CAGCAGC
CCATYTTA 8 CCATCTTA
AGGCHGAG 8 AGGCAGAG
CTGTCSCC 8 CTGTCCCC
AYTGTTAC 8 ACTGTTAC
AGGTACYG 8 AGGTACCG
CACCGTSC 8 CACCGTCC
ACYTCCGG 8 ACTTCCGG
STGGGKA 7 GTGGGGA
AATACTGC 8 AATACTGC
AGYGAGAC 8 AGCGAGAC
AATAGGR 7 AATAGGG
CTCCCACC 8 CTCCCACC
CATTTTM 7 CATTTTC
CTGTAYC 7 CTGTACC
GCAGTGAS 8 GCAGTGAG
GGAGGTTA 8 GGAGGTTA
TAATCCTA 8 TAATCCTA
CGAGTAGC 8 CGAGTAGC
CAGMACCG 8 CAGAACCG
AAGCAGGG 8 AAGCAGGG
GGAGTTCM 8 GGAGTTCC

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.221 C 0.279 G 0.279 T 0.221

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
CTSCWGCC DREME-9 chrUn_GL000224v1 + 52313 52320 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 52731 52738 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr4 + 124515 124522 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chrUn_KI270744v1 - 146741 146748 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 158161 158168 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 159044 159051 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22_KI270736v1_random + 172417 172424 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chrUn_KI270442v1 + 233112 233119 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr20 - 266871 266878 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr11 - 268546 268553 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr20 + 367176 367183 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 396853 396860 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 - 471510 471517 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 535650 535657 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chrX - 542653 542660 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 555890 555897 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 555973 555980 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 571009 571016 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 572351 572358 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 611451 611458 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr4 + 687568 687575 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 720753 720760 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr11 - 842258 842265 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 1157988 1157995 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 1157988 1157995 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 1186132 1186139 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 1194181 1194188 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 1309261 1309268 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 1407293 1407300 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 1407293 1407300 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 1421232 1421239 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 - 1463025 1463032 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 - 1570381 1570388 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 1611779 1611786 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr5 + 1634487 1634494 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 1706154 1706161 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 - 1718161 1718168 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 + 1742102 1742109 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr5 + 1801580 1801587 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 1856729 1856736 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 1909656 1909663 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 1971274 1971281 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr9 + 2017342 2017349 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 2061650 2061657 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 2095788 2095795 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 2215673 2215680 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr4 + 2242002 2242009 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 2303702 2303709 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chrX + 2318315 2318322 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chrX - 2319872 2319879 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 2856472 2856479 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 2868150 2868157 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 2945781 2945788 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 2988658 2988665 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3014137 3014144 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3014426 3014433 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 3048967 3048974 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 3053570 3053577 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3247146 3247153 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 3305758 3305765 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 3377653 3377660 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 3451464 3451471 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 3556548 3556555 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3595144 3595151 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 3606881 3606888 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3610023 3610030 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3615745 3615752 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3615745 3615752 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3623865 3623872 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 3639258 3639265 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3639321 3639328 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3651031 3651038 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 3655048 3655055 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr10 + 3665972 3665979 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr10 - 3668490 3668497 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 3668652 3668659 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chrX + 3815488 3815495 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr20 - 3820836 3820843 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr20 - 3888971 3888978 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 4143491 4143498 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 4271357 4271364 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 4308440 4308447 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 4425291 4425298 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr3 - 4505236 4505243 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 4767639 4767646 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr3 + 4901841 4901848 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 4967028 4967035 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 5191925 5191932 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 5237932 5237939 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr21 - 5243847 5243854 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr11 + 5269814 5269821 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr5 - 5421844 5421851 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 5486134 5486141 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr10 - 5486984 5486991 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 - 5575333 5575340 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 - 5575333 5575340 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 + 5575700 5575707 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 5690200 5690207 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 5791443 5791450 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 + 6349478 6349485 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 6352782 6352789 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 6361380 6361387 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 - 6448254 6448261 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 + 6577362 6577369 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 + 6577678 6577685 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 - 6586519 6586526 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 6602987 6602994 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 6613600 6613607 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 6614259 6614266 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 6614298 6614305 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 6655555 6655562 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 6662770 6662777 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 6663047 6663054 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 6675076 6675083 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 - 6826519 6826526 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 6852238 6852245 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 - 6996261 6996268 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr7 - 7103748 7103755 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 - 7483331 7483338 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr10 - 7818660 7818667 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr11 + 7987476 7987483 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 8081880 8081887 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 8112806 8112813 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr4 + 8252757 8252764 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr8 + 8346578 8346585 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 8514471 8514478 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 8526292 8526299 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr2 - 8837707 8837714 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 8877847 8877854 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 9005211 9005218 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 9012033 9012040 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 9016474 9016481 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 9091094 9091101 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr8 - 9150447 9150454 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chrX + 9353787 9353794 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 9541197 9541204 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr8 + 9555990 9555997 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 - 9630697 9630704 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr3 + 9642632 9642639 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 9719626 9719633 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 9758973 9758980 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 9819094 9819101 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 9843466 9843473 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr3 + 9844039 9844046 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 + 9874701 9874708 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr3 + 9978796 9978803 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr3 + 9987179 9987186 2.32e-05 0.15 ctccagcc
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CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 13272756 13272763 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr10 + 14953852 14953859 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr17 - 17237866 17237873 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr22 + 19417165 19417172 2.32e-05 0.15 ctccagcc
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CTSCWGCC DREME-9 chr14 - 20455367 20455374 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 20525214 20525221 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 20539142 20539149 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr17 - 20868607 20868614 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 - 20868674 20868681 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 + 20877681 20877688 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 20936392 20936399 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 + 20954685 20954692 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 20956782 20956789 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 + 20956845 20956852 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 20970504 20970511 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 20970504 20970511 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 + 20982303 20982310 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 21105500 21105507 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 21582397 21582404 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 21582397 21582404 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 21589189 21589196 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr10 - 22816668 22816675 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr22 + 23095321 23095328 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr22 + 23095321 23095328 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 23095518 23095525 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr20 + 23152558 23152565 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr20 + 23152558 23152565 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr20 + 23152713 23152720 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr20 + 23152713 23152720 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr8 - 23163143 23163150 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 23260623 23260630 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 23368124 23368131 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 23368802 23368809 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr14 - 23469787 23469794 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 23528923 23528930 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 23559954 23559961 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr14 + 23567726 23567733 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 23767637 23767644 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 23948447 23948454 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 23959266 23959273 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 24011585 24011592 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 24123369 24123376 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr22 - 24556122 24556129 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 24705088 24705095 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 24756955 24756962 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 24765855 24765862 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 24861445 24861452 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr13 - 24933768 24933775 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr10 - 24959013 24959020 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 25036435 25036442 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr20 - 25241010 25241017 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 25247844 25247851 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 25338500 25338507 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 25858912 25858919 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 26005324 26005331 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 26011683 26011690 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 26026315 26026322 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 26215279 26215286 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 26215279 26215286 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr7 + 26252319 26252326 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr14 - 26281466 26281473 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 26285672 26285679 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 26285672 26285679 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 26306539 26306546 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 26318419 26318426 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 26319796 26319803 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 26336513 26336520 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 26408505 26408512 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 26412333 26412340 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 26472748 26472755 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 26550433 26550440 2.32e-05 0.15 ctccagcc
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CTSCWGCC DREME-9 chr10 + 26675824 26675831 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 26687649 26687656 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 26695926 26695933 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr10 + 26861019 26861026 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 26938463 26938470 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 27056961 27056968 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 27089095 27089102 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 27089160 27089167 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr17 - 27089631 27089638 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 - 27089737 27089744 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 27134657 27134664 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 27176817 27176824 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 27214230 27214237 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr5 - 27220403 27220410 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 27235670 27235677 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 27473610 27473617 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 27500405 27500412 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr11 + 27506719 27506726 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr11 + 27506719 27506726 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 - 27582773 27582780 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 27601787 27601794 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 27602013 27602020 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 27604323 27604330 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 27710736 27710743 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 - 27753249 27753256 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr8 - 27774220 27774227 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 27837935 27837942 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 27865014 27865021 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 27867854 27867861 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 27891953 27891960 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 27892111 27892118 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 28089055 28089062 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 28104822 28104829 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 - 28104822 28104829 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 28212548 28212555 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 28235843 28235850 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 28247892 28247899 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr1 + 28314131 28314138 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 28329330 28329337 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 28346097 28346104 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 28352020 28352027 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 28354800 28354807 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 28486883 28486890 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 28539472 28539479 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 28549804 28549811 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 28599374 28599381 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr13 - 28659205 28659212 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr13 - 28659205 28659212 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 32020949 32020956 2.32e-05 0.15 ctccagcc
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CTSCWGCC DREME-9 chr11 + 34916158 34916165 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr21 - 37018736 37018743 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr8 - 41828683 41828690 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr3 + 42013173 42013180 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr10 - 45249976 45249983 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr10 - 45249976 45249983 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr6 + 49463279 49463286 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 49496383 49496390 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 50658799 50658806 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 50748300 50748307 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 52726464 52726471 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr3 - 53270152 53270159 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr3 - 53270152 53270159 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr4 + 53363792 53363799 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 53370272 53370279 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr8 - 54022764 54022771 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr5 - 54310897 54310904 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 54464756 54464763 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr2 - 55050300 55050307 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
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CTSCWGCC DREME-9 chr2 - 55223839 55223846 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 - 55223839 55223846 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 55259395 55259402 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr15 + 55397179 55397186 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 55408729 55408736 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr19 + 55408809 55408816 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 55419692 55419699 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 55419816 55419823 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 55576923 55576930 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr2 + 55615823 55615830 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr8 - 55773198 55773205 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr8 + 55879912 55879919 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr4 - 55949023 55949030 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr4 - 55949045 55949052 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 55974022 55974029 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 55974390 55974397 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 56080025 56080032 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 56104892 56104899 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 56128273 56128280 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 56315695 56315702 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 56645695 56645702 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 56842646 56842653 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 56932334 56932341 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr4 + 56978149 56978156 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 56985798 56985805 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 57111436 57111443 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr15 - 57321405 57321412 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr15 - 57321405 57321412 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 + 57447369 57447376 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr16 - 57447544 57447551 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr18 - 57622305 57622312 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 57646169 57646176 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 - 57694407 57694414 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr12 + 57751914 57751921 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr3 - 57756471 57756478 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 58304570 58304577 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr19 - 58327147 58327154 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 58332236 58332243 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr17 + 58339246 58339253 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr15 - 58521552 58521559 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr8 + 58672748 58672755 2.32e-05 0.15 ctccagcc
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 58783830 58783837 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
CTSCWGCC DREME-9 chr1 - 58784602 58784609 2.32e-05 0.15 CTCCAGCC
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_11 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif CTSCWGCC /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_11
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/TAF7.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

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