Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information



FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]


DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
Database contains 20358 sequences, 10179000 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
SMGGAAR 7 CAGGAAG
AYTTCCB 7 ACTTCCC
CCMCRCCC 8 CCCCGCCC
ARATAH 6 AAATAA
CAYGTGAY 8 CACGTGAC
CHGGRA 6 CTGGGA
CCDCCKCC 8 CCGCCGCC
RTGACKCA 8 GTGACTCA
AANATGGC 8 AAGATGGC
KACGTCA 7 GACGTCA
ACACASM 7 ACACAGA
CTSCAGCY 8 CTCCAGCC
CDCMGCC 7 CGCAGCC
AAAAVAAA 8 AAAAAAAA
CACGTR 6 CACGTG
GTTTMY 6 GTTTCT
TTATCAB 7 TTATCAG
GGCGGRA 7 GGCGGGA
CATTTH 6 CATTTT
GCABGCGC 8 GCAGGCGC
GGGAGGGR 8 GGGAGGGG
GCGGCMGC 8 GCGGCAGC
GRACTACA 8 GGACTACA
CTGTCWC 7 CTGTCTC
CWGCWG 6 CAGCTG
CTTCCK 6 CTTCCT
TACAGGCR 8 TACAGGCA
CCAATSAG 8 CCAATCAG
TTTTAWA 7 TTTTAAA
ACATCCGG 8 ACATCCGG
CTGCYTCC 8 CTGCCTCC
GTGGCTCA 8 GTGGCTCA
AARCCACA 8 AAACCACA
ASAGAAA 7 AGAGAAA
CTCACTGC 8 CTCACTGC
TCGCGAGA 8 TCGCGAGA
ACTCCRTC 8 ACTCCATC
KCTGGGTA 8 GCTGGGTA
AGGAGAAW 8 AGGAGAAA
CYGAGTCA 8 CTGAGTCA

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.226 C 0.274 G 0.274 T 0.226


SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES

Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 124515 124522 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 124515 124522 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 272883 272890 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 572351 572358 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 625533 625540 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 625681 625688 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 692998 693005 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 693018 693025 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 714757 714764 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 721397 721404 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 721397 721404 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 741476 741483 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 769862 769869 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 771308 771315 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 788305 788312 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 792477 792484 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 891542 891549 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 971134 971141 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 1137773 1137780 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 1157988 1157995 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 1248164 1248171 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 1276027 1276034 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 1337537 1337544 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1520690 1520697 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1520731 1520738 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1520772 1520779 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1520813 1520820 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1520854 1520861 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1520895 1520902 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1520936 1520943 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1520977 1520984 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1521018 1521025 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1521059 1521066 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1521100 1521107 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 1521141 1521148 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 1614980 1614987 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 1693944 1693951 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 1838282 1838289 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 1873404 1873411 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 1904856 1904863 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 1906816 1906823 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 2017342 2017349 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 2047685 2047692 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 2222987 2222994 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chrX + 2253247 2253254 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chrX + 2253397 2253404 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chrX + 2253497 2253504 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 2263307 2263314 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 2263603 2263610 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 2474645 2474652 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 2585715 2585722 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chrX + 2632750 2632757 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 2783527 2783534 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 2842472 2842479 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 2868150 2868157 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 2970045 2970052 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 2977078 2977085 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 3095966 3095973 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 3264465 3264472 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 3377653 3377660 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 3454660 3454667 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr10 + 3665972 3665979 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 3772700 3772707 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 3772700 3772707 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 3796380 3796387 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr10 + 3803570 3803577 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 3841057 3841064 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 3841057 3841064 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 4221357 4221364 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 4321405 4321412 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 4475904 4475911 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr10 + 4826085 4826092 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr10 + 4827041 4827048 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 4902805 4902812 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 4973849 4973856 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 5143230 5143237 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 5191925 5191932 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr18 + 5237932 5237939 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 5290870 5290877 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 5486134 5486141 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 5486134 5486141 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 5561918 5561925 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 5690200 5690207 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 5839127 5839134 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr10 + 5889896 5889903 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 5992952 5992959 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 6111297 6111304 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 6236516 6236523 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 6361380 6361387 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 6406508 6406515 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 6406508 6406515 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 6519046 6519053 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 6577362 6577369 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 6612023 6612030 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 6612302 6612309 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 6612302 6612309 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 6613934 6613941 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 6663047 6663054 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 6675076 6675083 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 6750016 6750023 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 6750023 6750030 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 6836187 6836194 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 6957786 6957793 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 7154293 7154300 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr10 + 7257057 7257064 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 7352052 7352059 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 7572621 7572628 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 7572621 7572628 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 8154214 8154221 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 8318972 8318979 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 8424073 8424080 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 8424073 8424080 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 8701428 8701435 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 8914504 8914511 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 8914504 8914511 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 9435597 9435604 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 9555710 9555717 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 9555710 9555717 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 9555990 9555997 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 9555990 9555997 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 9555990 9555997 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 9713306 9713313 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 9843466 9843473 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 9844039 9844046 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 9928831 9928838 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 10095377 10095384 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 10115178 10115185 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 10141523 10141530 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 10174065 10174072 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 10307818 10307825 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 10311616 10311623 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 10390654 10390661 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr18 + 10529718 10529725 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr18 + 10529718 10529725 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 10659554 10659561 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 10659554 10659561 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 10950922 10950929 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 10965788 10965795 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 11069679 11069686 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 11069679 11069686 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 11133838 11133845 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 11133838 11133845 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 11154810 11154817 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 11233415 11233422 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 11255805 11255812 2.15e-05 0.187 CTCCAGcc
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 11273156 11273163 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 11377086 11377093 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 11505550 11505557 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 11736057 11736064 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 11741097 11741104 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 11883029 11883036 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 11926409 11926416 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 11926409 11926416 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 11976574 11976581 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 12090077 12090084 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 12090077 12090084 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 12177236 12177243 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 12611671 12611678 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr18 + 12991323 12991330 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chrX + 13734806 13734813 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chrX + 13734806 13734813 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 13765494 13765501 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 14418086 14418093 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 14418086 14418093 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 14432493 14432500 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 15781323 15781330 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 15974799 15974806 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 16185068 16185075 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 17317482 17317489 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 17681570 17681577 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 17681570 17681577 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 17774384 17774391 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 17966350 17966357 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 17980704 17980711 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 18588685 18588692 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 18588685 18588692 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 18891993 18892000 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 19113299 19113306 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 19135995 19136002 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 19143825 19143832 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 19143825 19143832 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 19143939 19143946 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 19448121 19448128 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 19448121 19448128 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 19668922 19668929 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 19668922 19668929 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 19909171 19909178 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 20185458 20185465 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 20185458 20185465 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 20186121 20186128 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr18 + 21612209 21612216 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr14 + 23035281 23035288 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr14 + 23035281 23035288 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 23091730 23091737 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 23149555 23149562 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 23152558 23152565 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 23152558 23152565 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 23152713 23152720 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 23152713 23152720 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 23181768 23181775 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 23350482 23350489 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr14 + 23567726 23567733 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 23628942 23628949 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 23901577 23901584 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 23901577 23901584 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 23914546 23914553 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 24011585 24011592 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 24123369 24123376 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 24202269 24202276 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 24413778 24413785 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 24838695 24838702 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 24838695 24838702 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr13 + 24932441 24932448 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 25940982 25940989 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 25940982 25940989 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 26071058 26071065 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 26285672 26285679 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 26285672 26285679 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 26291739 26291746 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 26308232 26308239 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 26314186 26314193 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 26593999 26594006 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr10 + 26860383 26860390 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 26892324 26892331 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 27238260 27238267 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 27354248 27354255 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 27365792 27365799 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 27380535 27380542 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 27506719 27506726 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 27710736 27710743 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 27837935 27837942 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 28495023 28495030 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 28810560 28810567 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 28823043 28823050 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 28884346 28884353 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 28924539 28924546 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 28936616 28936623 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 28939807 28939814 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 28956023 28956030 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 28956023 28956030 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 29306641 29306648 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 29306641 29306648 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 34515653 34515660 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 36848884 36848891 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 38619235 38619242 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 38664538 38664545 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 38730470 38730477 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 38832066 38832073 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 39774448 39774455 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 39901811 39901818 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 39927394 39927401 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 40029387 40029394 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 40309803 40309810 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 40421416 40421423 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 42075716 42075723 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr15 + 42401828 42401835 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr22 + 42444255 42444262 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 43013956 43013963 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 43013956 43013963 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 44199786 44199793 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 45065296 45065303 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr1 + 46247929 46247936 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr20 + 46364308 46364315 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 47335737 47335744 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 47759313 47759320 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 47778525 47778532 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr17 + 48578504 48578511 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 49496383 49496390 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 51984284 51984291 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr19 + 52269420 52269427 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr14 + 67674665 67674672 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr16 + 89217540 89217547 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 100444851 100444858 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 112377315 112377322 2.15e-05 0.187 ctccagcc
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CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 113173953 113173960 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
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CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 118359399 118359406 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 118359452 118359459 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 118934948 118934955 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 119324240 119324247 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chrX + 119574631 119574638 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chrX + 119574914 119574921 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 119638605 119638612 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 120292567 120292574 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 120292778 120292785 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 120996249 120996256 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 121143817 121143824 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 121466678 121466685 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 121627010 121627017 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 122732849 122732856 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 122732849 122732856 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 123383798 123383805 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chrX + 123514424 123514431 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr10 + 124791942 124791949 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr11 + 124804771 124804778 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 124927089 124927096 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 126033806 126033813 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 127224206 127224213 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 127893897 127893904 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 128128090 128128097 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 128724323 128724330 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 129144603 129144610 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr2 + 129144603 129144610 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 129434330 129434337 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 129434330 129434337 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 129439812 129439819 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 129460340 129460347 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 129881613 129881620 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 130025836 130025843 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 130043543 130043550 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 130441227 130441234 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 130549070 130549077 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 131739966 131739973 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 131739966 131739973 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 132020873 132020880 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 132354893 132354900 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 132471497 132471504 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 132471497 132471504 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 132490450 132490457 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 132659866 132659873 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 132659866 132659873 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 132879992 132879999 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 132944581 132944588 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr12 + 133037088 133037095 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 133297752 133297759 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 133297752 133297759 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 133932669 133932676 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 135558153 135558160 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 135856007 135856014 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 136427229 136427236 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 136512306 136512313 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 136645425 136645432 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 136784071 136784078 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 136885733 136885740 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 137071048 137071055 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 137219388 137219395 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 137296878 137296885 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr9 + 137618458 137618465 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 138032211 138032218 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr6 + 138404354 138404361 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr3 + 138594372 138594379 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 139091433 139091440 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 139091495 139091502 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 139109670 139109677 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr4 + 139453372 139453379 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 139817482 139817489 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 139817482 139817489 2.15e-05 0.187 ctccagcc
CTSCAGCY DREME-12 chr7 + 140398439 140398446 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 140726233 140726240 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 140726233 140726240 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr8 + 141036345 141036352 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 141691622 141691629 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC
CTSCAGCY DREME-12 chr5 + 141923598 141923605 2.15e-05 0.187 CTCCAGCC

DEBUGGING INFORMATION

Command line:

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_19 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif CTSCAGCY /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa

Settings:

output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_19 MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background alphabet = DNA max stored scores = 100000
allow clobber = true compute q-values = true parse genomic coord. = true
text only = false scan both strands = true max strand = false
threshold type = p-value output theshold = 0.0001 pseudocount = 0.1
alpha = 1 verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.


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