Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
Database contains 17409 sequences, 8704500 residues

MOTIFS /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
SMGGAAR 7 CAGGAAG
GGAARTR 7 GGAAGTG
GGAYTACA 8 GGATTACA
CMGCCKCC 8 CAGCCTCC
CYCCDCCC 8 CCCCTCCC
AGTAGCTG 8 AGTAGCTG
AGGCDGGA 8 AGGCAGGA
CMGGAA 6 CAGGAA
ACGTSAY 7 ACGTGAC
RTGAGYCA 8 GTGAGCCA
ARATAA 6 AAATAA
AANATGGC 8 AAGATGGC
TCACTGCA 8 TCACTGCA
AAWACAAA 8 AAAACAAA
ATCTCGGC 8 ATCTCGGC
CTGAGTCA 8 CTGAGTCA
MGGAAR 6 AGGAAG
GSYGGGA 7 GCTGGGA
TCTACTAA 8 TCTACTAA
CATGTGAC 8 CATGTGAC
ATCRCTTG 8 ATCGCTTG
CCACHGCA 8 CCACTGCA
GCGCAKGC 8 GCGCAGGC
CACGTGK 7 CACGTGG
GAGRCRGA 8 GAGACAGA
CAKCCTGG 8 CAGCCTGG
AAATAY 6 AAATAT
ATTRGCCR 8 ATTGGCCA
GCYTCCCA 8 GCCTCCCA
AATGGCGT 8 AATGGCGT
CHGCAGC 7 CAGCAGC
CRCRCGCA 8 CACACGCA
CACMKCC 7 CACCGCC
RKAAA 5 AGAAA
CCACCAYG 8 CCACCACG
AAGTGCTG 8 AAGTGCTG
ACACABAC 8 ACACACAC
GAAYTACA 8 GAACTACA
RCCAATCA 8 ACCAATCA
GGGTTTCA 8 GGGTTTCA
TGAGRTCA 8 TGAGGTCA
GATCACGA 8 GATCACGA
AGYGAGAC 8 AGTGAGAC
CTCCCTCC 8 CTCCCTCC
CCRCGCCC 8 CCGCGCCC
GAGWTCGA 8 GAGTTCGA
ATGGCGVC 8 ATGGCGGC
CYGGGAA 7 CTGGGAA
CAACATGG 8 CAACATGG
GGTGACR 7 GGTGACA
ACAGCGSC 8 ACAGCGCC
ATTGGCTG 8 ATTGGCTG

Random model letter frequencies (/srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background):
A 0.227 C 0.273 G 0.273 T 0.227

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
TCACTGCA DREME-13 chr17_GL000205v2_random - 88814 88821 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 207597 207604 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr18 - 323163 323170 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr18 + 372489 372496 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr12 + 576566 576573 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr5 - 614500 614507 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 616101 616108 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr4 + 646929 646936 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr18 - 703040 703047 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr12 - 755912 755919 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 - 769834 769841 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 771280 771287 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 808364 808371 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr18 + 831233 831240 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 841799 841806 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 863846 863853 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr1 + 899098 899105 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr12 + 949430 949437 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr12 - 953241 953248 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 + 1118717 1118724 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 1151199 1151206 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr20 + 1187826 1187833 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 1192288 1192295 1.47e-05 0.166 Tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 1254378 1254385 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 1337509 1337516 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr18 - 1406507 1406514 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr18 - 1407265 1407272 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 - 1437299 1437306 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 + 1457340 1457347 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 1480444 1480451 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 1487858 1487865 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 1507270 1507277 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 1510854 1510861 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 1512617 1512624 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 + 1567081 1567088 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 1611751 1611758 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chrX + 1648973 1648980 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 1772734 1772741 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 1901043 1901050 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 2060310 2060317 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 2074624 2074631 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 2095796 2095803 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 2095796 2095803 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 2095816 2095823 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 2095816 2095823 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 2159062 2159069 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 2314895 2314902 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 2314971 2314978 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 2315003 2315010 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chrX + 2361182 2361189 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 2385788 2385795 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 2387432 2387439 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 2387682 2387689 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr4 + 2402816 2402823 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 2402865 2402872 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 - 2509023 2509030 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 2548072 2548079 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 2548751 2548758 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 2622151 2622158 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr8 + 2623709 2623716 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr18 - 2854731 2854738 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr18 - 2854731 2854738 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 2901592 2901599 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 2981491 2981498 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 2984508 2984515 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 2987816 2987823 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 3022051 3022058 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 3022051 3022058 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 3022379 3022386 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr4 - 3037852 3037859 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 3054237 3054244 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 3156720 3156727 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 3159686 3159693 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr20 - 3160283 3160290 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 3189258 3189265 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 3316753 3316760 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 3407702 3407709 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr18 + 3469287 3469294 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 3506214 3506221 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr4 + 3586081 3586088 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 3656113 3656120 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 3763849 3763856 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 + 3765110 3765117 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 3798401 3798408 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 3839368 3839375 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 3839368 3839375 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 3861305 3861312 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 3866498 3866505 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 3953069 3953076 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 3953089 3953096 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 3990579 3990586 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 3990579 3990586 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 + 4002683 4002690 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 4010754 4010761 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 4014993 4015000 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr20 - 4016016 4016023 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr4 - 4027047 4027054 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 4104131 4104138 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 4183473 4183480 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 4183473 4183480 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 4253361 4253368 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 4253361 4253368 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 4253381 4253388 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 4253381 4253388 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 4308157 4308164 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 4308157 4308164 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 4458345 4458352 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 4576267 4576274 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 4623500 4623507 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 4827013 4827020 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 + 4866712 4866719 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 4984467 4984474 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 5072053 5072060 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 5166213 5166220 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 + 5192272 5192279 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 + 5232782 5232789 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 5262350 5262357 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 5281184 5281191 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 + 5488100 5488107 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 5574068 5574075 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 5596449 5596456 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 + 5823617 5823624 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 5898450 5898457 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 6093357 6093364 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 6111269 6111276 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 6123004 6123011 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 6166175 6166182 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 6166388 6166395 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 6374025 6374032 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 6394146 6394153 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 6448152 6448159 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 6448283 6448290 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 6575566 6575573 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr1 + 6609932 6609939 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 + 6609932 6609939 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 6674897 6674904 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr12 - 6724649 6724656 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 6729490 6729497 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr1 + 6758436 6758443 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 6826547 6826554 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 6826547 6826554 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr5 + 6846374 6846381 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr5 + 6846449 6846456 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr5 + 6846524 6846531 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 6880669 6880676 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr10 - 6921200 6921207 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 6957759 6957766 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr11 + 9364484 9364491 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr6 - 11930985 11930992 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 11930985 11930992 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 12059334 12059341 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 12124767 12124774 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr3 - 13418886 13418893 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr3 - 13418886 13418893 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 + 13638912 13638919 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr6 - 13678758 13678765 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 13678758 13678765 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr18 + 13724845 13724852 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr21 - 14550361 14550368 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr10 - 15021377 15021384 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr19 - 17317776 17317783 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 17327523 17327530 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 - 17663125 17663132 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr22 - 18002135 18002142 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr22 - 18002135 18002142 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 18006545 18006552 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr19 - 18373421 18373428 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 18697796 18697803 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 18756980 18756987 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 19067989 19067996 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr1 - 19207566 19207573 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr16 - 19448093 19448100 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 19448113 19448120 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 19501026 19501033 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr22 - 19701604 19701611 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 19712733 19712740 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr22 + 19815654 19815661 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 19902025 19902032 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr22 + 20027679 20027686 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr22 - 20058579 20058586 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr14 - 20177345 20177352 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 20206158 20206165 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr22 - 20254366 20254373 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr22 + 20677173 20677180 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 20747107 20747114 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr22 - 21056439 21056446 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 - 21322893 21322900 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr18 - 22110338 22110345 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr15 - 22794296 22794303 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr14 - 22930467 22930474 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr7 + 23570758 23570765 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr16 - 23848330 23848337 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr6 + 24667976 24667983 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 24668270 24668277 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 24668270 24668277 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 24668290 24668297 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr6 - 24774305 24774312 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 24774305 24774312 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr6 - 26593971 26593978 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr6 + 27115458 27115465 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr6 - 27215015 27215022 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr1 - 27499798 27499805 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr6 - 28796404 28796411 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 - 29707090 29707097 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr19 - 29887822 29887829 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 29943360 29943367 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr6 - 30219415 30219422 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr16 + 30492322 30492329 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr6 - 30497345 30497352 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr8 - 30654026 30654033 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr8 - 30654026 30654033 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr8 + 30658606 30658613 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 + 30698561 30698568 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr16 - 30747934 30747941 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 + 30968457 30968464 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 31172231 31172238 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 31197522 31197529 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 31220774 31220781 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr22 - 31228356 31228363 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr22 - 31290326 31290333 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 31478331 31478338 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 31563097 31563104 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 31793443 31793450 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr1 - 31928634 31928641 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 31929655 31929662 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 31929655 31929662 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 31929949 31929956 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr1 - 32814442 32814449 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr1 + 32814462 32814469 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr1 + 32883109 32883116 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr6 - 34791487 34791494 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr20 + 35120347 35120354 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr20 - 35542317 35542324 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 - 35542317 35542324 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 35567451 35567458 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr9 + 35730055 35730062 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 - 36722134 36722141 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr20 - 37379661 37379668 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr8 - 37900215 37900222 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 - 38625053 38625060 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 - 39301665 39301672 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 - 39650532 39650539 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 39650532 39650539 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 39650751 39650758 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr15 + 40695946 40695953 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr4 - 40722706 40722713 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 - 42116664 42116671 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr10 - 46049284 46049291 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 46049284 46049291 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr19 - 50650128 50650135 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 50743156 50743163 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr1 - 51621443 51621450 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr3 + 52288284 52288291 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 + 52330333 52330340 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 52402834 52402841 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 52671221 52671228 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chrX - 53093851 53093858 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 53188201 53188208 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 53197503 53197510 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 - 53393038 53393045 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 + 53591771 53591778 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 - 53654898 53654905 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 + 53654918 53654925 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 53769456 53769463 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 + 53769456 53769463 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr8 - 53945824 53945831 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 53977883 53977890 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr12 + 53995504 53995511 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr12 - 54220677 54220684 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr18 - 54269234 54269241 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr14 + 54344743 54344750 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 54448866 54448873 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 54448866 54448873 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr12 - 54474072 54474079 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr19 - 55026823 55026830 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr19 - 55477699 55477706 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr4 + 55642094 55642101 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr15 + 55759043 55759050 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr12 - 55829382 55829389 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr8 - 55847728 55847735 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr8 + 55847748 55847755 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr8 + 55847748 55847755 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr8 - 55851614 55851621 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr7 + 56107511 56107518 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr19 - 56162221 56162228 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr12 + 56690464 56690471 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr12 + 56690464 56690471 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr4 - 56978121 56978128 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr4 - 56978121 56978128 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr20 + 57432864 57432871 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr12 + 57517898 57517905 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 57690957 57690964 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr3 - 57998326 57998333 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr19 - 58381571 58381578 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr17 + 59291028 59291035 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 + 59729757 59729764 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 59844606 59844613 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr1 - 61264588 61264595 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr11 - 61288094 61288101 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 61288192 61288199 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 61359729 61359736 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 61359958 61359965 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr11 - 62556409 62556416 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr8 - 62728927 62728934 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr8 - 62728927 62728934 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 63225716 63225723 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr11 + 64147137 64147144 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr15 - 65028352 65028359 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr2 + 65129916 65129923 1.47e-05 0.166 TCACTgca
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TCACTGCA DREME-13 chr11 - 66382164 66382171 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr8 - 66926086 66926093 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr8 - 66926086 66926093 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr8 + 66926480 66926487 1.47e-05 0.166 tcactgca
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TCACTGCA DREME-13 chr14 - 67600536 67600543 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr15 - 68228847 68228854 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr11 - 68458833 68458840 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr10 - 68805390 68805397 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 68805578 68805585 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 68805578 68805585 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 69043978 69043985 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 69043978 69043985 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 69067493 69067500 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 69089833 69089840 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr12 - 69518651 69518658 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr2 + 69651574 69651581 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr2 + 69651574 69651581 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 69969884 69969891 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 70092370 70092377 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
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TCACTGCA DREME-13 chr6 + 70242069 70242076 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr2 + 70294018 70294025 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr9 + 70398560 70398567 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 + 70524752 70524759 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 70559166 70559173 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr12 + 70933834 70933841 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 71716542 71716549 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 71753671 71753678 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 72245630 72245637 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 + 72266445 72266452 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 72816050 72816057 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 72907427 72907434 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr2 - 73069275 73069282 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr3 - 73073678 73073685 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr9 + 73154507 73154514 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr4 - 73259164 73259171 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr4 - 73259164 73259171 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr18 - 73264523 73264530 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr8 + 73383197 73383204 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 73425012 73425019 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 73425036 73425043 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 73463095 73463102 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 + 73495535 73495542 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 73562476 73562483 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 73577715 73577722 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 73597723 73597730 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 + 73654562 73654569 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 73660889 73660896 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 73715359 73715366 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 73734751 73734758 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr2 + 73737786 73737793 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr15 + 73781575 73781582 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 73827312 73827319 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr14 + 73852897 73852904 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 73879678 73879685 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr15 + 73920931 73920938 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 + 73957717 73957724 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 + 73958037 73958044 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 + 73958037 73958044 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr8 - 73977233 73977240 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr8 + 73977253 73977260 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 73982512 73982519 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr15 + 73995826 73995833 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 + 74176702 74176709 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr2 + 74179307 74179314 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 74209595 74209602 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 74271828 74271835 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 74272131 74272138 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 74272131 74272138 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 74288710 74288717 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr4 + 74333755 74333762 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr2 - 74465614 74465621 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 74479558 74479565 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 74542609 74542616 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 74542609 74542616 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr15 + 74616075 74616082 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr2 - 74824253 74824260 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr10 - 74827434 74827441 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr16 - 74985671 74985678 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr14 + 75025286 75025293 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr14 + 75025286 75025293 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 75033420 75033427 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 75035770 75035777 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 + 75074132 75074139 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr10 + 75121763 75121770 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr17 - 75295075 75295082 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 - 75337303 75337310 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr7 - 75409913 75409920 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr6 - 75605010 75605017 1.47e-05 0.166 TCACTGCA
TCACTGCA DREME-13 chr11 + 75723033 75723040 1.47e-05 0.166 tcactgca
TCACTGCA DREME-13 chr1 + 75726876 75726883 1.47e-05 0.166 tcactgca
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_18 --bgfile /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background --motif TCACTGCA /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/fimo_out_18
    MEME file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeaksummitPlusMinus250bp.fa
  
  

    background file name = /srv/scratch/shared/surya/imk1/TFBindingPredictionProject/EncodeK562eGFPComparisons/ELF1-Antibody.IDR0.05.filt.narrowPeak.summitPlusMinus250bp.MemeChipResultsDefaultMax/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

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