Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/AWRI1631--ACE2.fa
Database contains 484 sequences, 161033 residues

MOTIFS /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/meme_out/meme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
NNSSCYYWAMCCACTRVGCCA 21 GACGCTTTAACCACTAGGCCA
TCGAACCSVKGAYCYYHYGRT 21 TCGAACCCGGGACCTCCCGAT
WRATGTAYGGRTGTW 15 AGATGTATGGGTGTA

Random model letter frequencies (/srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/background):
A 0.307 C 0.193 G 0.193 T 0.307

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 932265 932279 1.02e-08 0.00172 AGATGTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 932273 932287 1.81e-08 0.00172 GGATGTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX + 157603 157617 2.58e-08 0.00172 AAGTGTACGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 296964 296978 2.66e-08 0.00172 AGATGTATGGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX + 157586 157600 2.98e-08 0.00172 AGATGTATGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 1355837 1355851 3.36e-08 0.00172 AAATGTATGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 222133 222147 4.15e-08 0.00183 GGGTGTACGGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 229652 229666 8.83e-08 0.00216 TGATGTACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 682055 682069 9.35e-08 0.00216 GGGTGTATGGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII + 89799 89813 9.68e-08 0.00216 GGGTGTATGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrI + 82108 82122 9.73e-08 0.00216 AGGTGCACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVI + 65165 65179 1.01e-07 0.00216 ATATGTACGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 79946 79960 1.01e-07 0.00216 ATATGTACGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII - 126100 126114 1.06e-07 0.00216 AGGTGTACGGATGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 225543 225557 1.14e-07 0.00216 GAATGTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII + 415681 415695 1.19e-07 0.00216 AAATGCATGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII + 593083 593097 1.25e-07 0.00216 AGATGTATGGATGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 396377 396391 1.26e-07 0.00216 AAGTGTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 108919 108933 1.45e-07 0.00223 AAATGTACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 262963 262977 1.45e-07 0.00223 AAATGTATGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII - 555508 555522 1.53e-07 0.00225 TAATGCACGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 146082 146096 1.61e-07 0.00225 TGGTGTATGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIX - 68348 68362 1.8e-07 0.00236 TAATGTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 241805 241819 1.93e-07 0.00236 ATATGTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 679008 679022 1.93e-07 0.00236 ATATGTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 794653 794667 1.99e-07 0.00236 ATATGTATGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI + 378838 378852 2.17e-07 0.00248 GAATGTACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 1028905 1028919 2.38e-07 0.00261 AAATGTACGGATGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIII - 58869 58883 2.46e-07 0.00261 TGGTGCACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 404704 404718 2.64e-07 0.00271 TGATGCATGGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 305983 305997 2.76e-07 0.00271 AAATGTGTGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVI + 224055 224069 2.82e-07 0.00271 GTATGTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX + 703449 703463 2.94e-07 0.00271 GGATGCATGGGTGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 614301 614315 3.05e-07 0.00271 TGGTGTGCGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 93110 93124 3.08e-07 0.00271 ATGTGTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 1359594 1359608 3.3e-07 0.00282 TAATGTACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 818997 819011 3.47e-07 0.00283 ATATGTACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 45168 45182 3.56e-07 0.00283 GAATGTACGGATGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII + 383099 383113 3.58e-07 0.00283 TGATGTATGGGTGTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 1355861 1355875 3.79e-07 0.00292 GAATGTATGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 431492 431506 3.89e-07 0.00292 TTGTGTATGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII + 551526 551540 4.05e-07 0.00297 AAATGTATGGGTGCG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII + 505999 506013 4.15e-07 0.00298 AAATGTATGGATGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI + 76541 76555 4.37e-07 0.00306 GGATGTACGGGTGAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 254345 254359 4.55e-07 0.00311 ATATGCACGGGTGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX - 607994 608008 4.74e-07 0.00311 GGATGTATGGATGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 932298 932312 4.74e-07 0.00311 TAATGCACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 181493 181507 5.22e-07 0.00324 TAATGTATGGGTGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 149316 149330 5.29e-07 0.00324 GGGTGTATGGATGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 282655 282669 5.59e-07 0.00324 AGATGTACAGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 605914 605928 5.59e-07 0.00324 AGATGTACAGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 713370 713384 5.59e-07 0.00324 ATATGTACGGATGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 341441 341455 5.68e-07 0.00324 AAATGTACGGATGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 732102 732116 5.68e-07 0.00324 AAAGGTATGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 535002 535016 5.94e-07 0.00327 AAATGCACGGATGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 781654 781668 5.94e-07 0.00327 AAATGCACGGATGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 922343 922357 6.14e-07 0.00332 ATATGTACGGGTGTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 710731 710745 6.3e-07 0.00335 AGATGCGTGGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 732204 732218 6.85e-07 0.00358 CGATGTGCGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII - 254326 254340 7.16e-07 0.00362 AGATGTATGGGTTCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 477232 477246 7.16e-07 0.00362 AAATGTGTGGGTGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 130747 130761 7.59e-07 0.00377 AAATGTGCGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 225530 225544 7.76e-07 0.00379 TAATGCACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVI + 221918 221932 8.63e-07 0.00416 AAATGTACGGGTGAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 366235 366249 9.6e-07 0.00455 ATATGTGTGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 522301 522315 1.01e-06 0.00473 TTGTGTACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 788527 788541 1.07e-06 0.00488 GTATGCACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV - 330948 330962 1.09e-06 0.00488 AGATGTAAGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII + 754570 754584 1.09e-06 0.00488 GGATGTATGGGGGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 358247 358261 1.12e-06 0.00493 TAATGTATGGGTGGT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 217312 217326 1.15e-06 0.00501 AAATGTACGGGTTCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 794635 794649 1.21e-06 0.00515 AGATGTTCGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 172930 172944 1.22e-06 0.00515 AAATGTACGGATTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 932257 932271 1.38e-06 0.00576 AGATGTACAGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 406369 406383 1.41e-06 0.00576 AAAGGTACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII - 371353 371367 1.44e-06 0.00576 AGGTGCATGGGTGCC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 438756 438770 1.44e-06 0.00576 AAATGTATGGATGGT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVI + 95634 95648 1.49e-06 0.00585 CGGTGTGTGGGTGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII - 277225 277239 1.5e-06 0.00585 GGGTGTATGGGTCTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 229628 229642 1.52e-06 0.00585 ATATGTATGGGTTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII - 726585 726599 1.57e-06 0.00588 TAGGGTATGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII - 726602 726616 1.57e-06 0.00588 TAGGGTATGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 85298 85312 1.58e-06 0.00588 AGGGGTATGGGTGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 281764 281778 1.62e-06 0.00595 AAGTGTAAGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 302827 302841 1.68e-06 0.00601 GGATGTCTGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV + 444619 444633 1.68e-06 0.00601 AGAGGTACGGATGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI + 378813 378827 1.79e-06 0.00632 AAATGTATGGGTTCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 423270 423284 1.8e-06 0.00632 AGGTGTACGGAGGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 48901 48915 1.84e-06 0.00639 AGATGTACGGATCTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV + 63316 63330 1.88e-06 0.00645 AAATGTTCGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV + 140673 140687 2.05e-06 0.00694 AAAGGTATGGGTGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 332523 332537 2.07e-06 0.00694 AATTGTATGGGTGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 1301107 1301121 2.11e-06 0.00697 CAGTGCACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 551617 551631 2.13e-06 0.00697 TAATGTATGGGTGCC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII + 124511 124525 2.21e-06 0.00701 TAATGTACGGATTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 241826 241840 2.21e-06 0.00701 GAATGCATGGGTTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV + 444603 444617 2.21e-06 0.00701 TAATGTACGGATTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIX + 254356 254370 2.25e-06 0.00702 GAATGTGTGGGTGCG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 93084 93098 2.3e-06 0.00702 AAATGTACGGGTTGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 149304 149318 2.3e-06 0.00702 GTATGTATGGGTGGG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 796632 796646 2.3e-06 0.00702 GGAGGCACGGATGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 168186 168200 2.35e-06 0.0071 ATAGGCACGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 161244 161258 2.59e-06 0.00775 CGATGTATGGGTTTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIII + 163645 163659 2.76e-06 0.00811 GGGTGCGTGGGTGCG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 1401431 1401445 2.76e-06 0.00811 ATATGTGTGGGTGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 1004245 1004259 2.82e-06 0.00821 GGGTGCAAGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII + 149080 149094 2.94e-06 0.00848 TGGTGCATGGGTGAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI + 135624 135638 3e-06 0.00849 GGGTGCACGGATTTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII + 45186 45200 3.03e-06 0.00849 GTATGTTTGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 649147 649161 3.03e-06 0.00849 CGTTGTACGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV + 53733 53747 3.07e-06 0.00853 TGGTGTTCGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 321797 321811 3.17e-06 0.00865 TGGTGTACGGAGGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII - 75151 75165 3.2e-06 0.00865 AAATGTACAGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 382303 382317 3.2e-06 0.00865 TGATGTCCGGATGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 498671 498685 3.34e-06 0.00896 GGATGCACGGAGGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI + 619009 619023 3.38e-06 0.00897 AGAGGCACGGATGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 188788 188802 3.52e-06 0.00909 CGATGCATGGGTTTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 866754 866768 3.52e-06 0.00909 GTTTGTATGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 298716 298730 3.55e-06 0.00909 TAATGTCTGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 1025874 1025888 3.55e-06 0.00909 TGATGAATGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 53717 53731 3.57e-06 0.00909 ATATGTGTGGGTGTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX + 75516 75530 3.79e-06 0.00958 TGAGGTGTGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 477213 477227 3.82e-06 0.00958 GAATGTACGGAGGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII + 61071 61085 3.86e-06 0.00958 GGGTGTACAGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 1451081 1451095 3.95e-06 0.00973 ATATGTACAGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX + 75558 75572 3.99e-06 0.00977 TGATGTATGGGCGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 217417 217431 4.03e-06 0.00977 AAATGTTTGGGTGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 674052 674066 4.06e-06 0.00977 TGGTGCATGGGTCTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 553071 553085 4.35e-06 0.0103 AGATGTATGGGTCTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 1028396 1028410 4.35e-06 0.0103 TGGTGCATGGGTGAT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 216449 216463 4.43e-06 0.0104 GGGTGCTCGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 308222 308236 4.64e-06 0.0107 ATATGTAAGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIX - 316350 316364 4.64e-06 0.0107 TAATGTATGGGTTCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 649132 649146 4.64e-06 0.0107 TAATGTATGGGTTCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIII + 178470 178484 4.76e-06 0.0108 AAATGTACAGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII + 89779 89793 4.79e-06 0.0108 AAGTGCAAGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 270485 270499 4.79e-06 0.0108 GTATGTATGGGTGAT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 505317 505331 4.95e-06 0.0111 ATATGTTTGGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 94633 94647 5.07e-06 0.0112 TATTGCATGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII - 310684 310698 5.11e-06 0.0113 TGGTGTACAGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX - 73580 73594 5.4e-06 0.0118 TGGTGCAAGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII + 383116 383130 5.52e-06 0.012 GGATGTTCGGATGTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIX + 99808 99822 5.67e-06 0.0122 AAATGTACTGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 168205 168219 5.91e-06 0.0126 TGATGTGTGGGTGGC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 411433 411447 6.14e-06 0.013 CGGGGTGTGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 313494 313508 6.4e-06 0.0135 AGGTGTGCAGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 438733 438747 6.5e-06 0.0136 TGGTGCACAGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 604299 604313 6.67e-06 0.0139 AAATGTACAGATGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 866736 866750 6.88e-06 0.0142 GAATGCTTGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 366217 366231 7e-06 0.0143 AAAGGTACGGATTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 897859 897873 7e-06 0.0143 GGAGGTACAGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 117368 117382 7.04e-06 0.0143 ATATGTATGGGTCTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII - 175180 175194 7.23e-06 0.0146 TGATGTATGGGTCTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 505292 505306 7.64e-06 0.0153 TTGTGTATGGGTTTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 522276 522290 7.8e-06 0.0155 TAATGTACAGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX + 545555 545569 8.12e-06 0.016 CGGTGCATGGGTGGC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV + 495376 495390 8.62e-06 0.0169 GGAGGTTTGGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII - 291794 291808 8.81e-06 0.0172 TGGTGTGTGGGTTCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX - 391992 392006 8.95e-06 0.0172 GGAGGTCTGGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 779863 779877 8.95e-06 0.0172 GATTGTATGGGTTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 281748 281762 9.09e-06 0.0173 AGAGGTAAGGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 406489 406503 9.09e-06 0.0173 TAAGGTATGGATGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 618981 618995 9.72e-06 0.0184 AGTTGTCTGGGTGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 282672 282686 1.03e-05 0.0192 AAATGTACGGAGGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 321823 321837 1.03e-05 0.0192 AAAGGTATGGGGGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 216457 216471 1.04e-05 0.0193 GAAGGCGCGGGTGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII - 297055 297069 1.05e-05 0.0194 TGATGTACTGGTGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV + 495393 495407 1.07e-05 0.0195 TAGTGTACGGATTGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV + 499431 499445 1.07e-05 0.0196 TGGTGCACTGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 262943 262957 1.1e-05 0.02 AAATGTACTGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIX - 257503 257517 1.13e-05 0.0203 TGTTGTTTGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 362348 362362 1.14e-05 0.0204 TATTGTATGGGTTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 555524 555538 1.16e-05 0.0207 AAGTGTTTGGGTTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 932249 932263 1.19e-05 0.021 TTGTGTACAGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 158398 158412 1.23e-05 0.0217 GTGTGCACGGGTTGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 604283 604297 1.29e-05 0.0225 AAATGTACGGATTAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII + 505986 506000 1.35e-05 0.0235 AAATGTCTGGGTGAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 835949 835963 1.46e-05 0.0253 CGGGGCGTGGGTGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 819038 819052 1.47e-05 0.0253 TAATGTATGGGTTAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX - 608012 608026 1.5e-05 0.0255 ATATGTATGGGTTAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX - 651444 651458 1.5e-05 0.0255 ATATGTATGGGTTAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 270524 270538 1.55e-05 0.0263 GGATGTAAAGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 396395 396409 1.59e-05 0.0267 AAATGTTTGGGTTCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIII + 163675 163689 1.63e-05 0.0273 TATGGTATGGGTGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 774511 774525 1.65e-05 0.0275 CAAGGTGTGGGTGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 579224 579238 1.67e-05 0.0276 AAATGTTTGGGTCTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 297809 297823 1.7e-05 0.028 AGTTGCGCGGGTTTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 551601 551615 1.74e-05 0.0285 ATATGTACTGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 836179 836193 1.76e-05 0.0288 AGAGGTGTGGGTTCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 67911 67925 1.83e-05 0.0297 CGGTGCACGGATTTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 424306 424320 1.88e-05 0.0302 CAATGTACGTGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 781636 781650 1.88e-05 0.0302 AATTGTGTGGGTTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV + 140710 140724 1.91e-05 0.0305 TGGGGTATGGGGGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 700725 700739 1.95e-05 0.031 GGAGGCGCGGGTTCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 168033 168047 1.99e-05 0.0314 ATATGTCTGGGTTTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 968267 968281 2.04e-05 0.0321 GGGTGCGTGGGCGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII - 146112 146126 2.08e-05 0.0324 TAGTGTACTGGTGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 700258 700272 2.08e-05 0.0324 CTGTGCTTGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 253976 253990 2.1e-05 0.0325 CGGTGTACGGATTAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 1301123 1301137 2.3e-05 0.0355 GGATGTTTGGGTTGT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 1028411 1028425 2.37e-05 0.0363 AAATGTATGGGTCAT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV + 355027 355041 2.4e-05 0.0366 GTATGTATGGGGTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 85269 85283 2.44e-05 0.0371 CAAGGTCTGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 856862 856876 2.64e-05 0.0397 CGGTGTATGGGCGGG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 382359 382373 2.64e-05 0.0397 GGAGGAATGGGTGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 978936 978950 2.68e-05 0.0401 GGATGAATGGGTTCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 922317 922331 2.69e-05 0.0401 TGAGGTATGGGTTCC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 165255 165269 2.78e-05 0.0412 CGGTGTATGGGTTAG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX - 90245 90259 2.84e-05 0.0417 GAATGTTCAGGTGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 491129 491143 2.84e-05 0.0417 GAATGATTGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrX + 617988 618002 2.89e-05 0.0418 GGATGCAAGGGTTCG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 732159 732173 2.89e-05 0.0418 GGATGCAAGGGTTCG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII - 592534 592548 2.89e-05 0.0418 GGATGCAAGGGTTCG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 980674 980688 2.93e-05 0.0421 AATTGTATGGGCGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII - 126114 126128 3.06e-05 0.0438 AAATGTAAAGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 1401416 1401430 3.12e-05 0.0445 AAATGATTGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIII - 178488 178502 3.16e-05 0.0449 CGGTGTACGGACTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 109898 109912 3.22e-05 0.0455 TGGTTTATGGGTGCA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVI + 65142 65156 3.58e-05 0.0504 TAATTTATGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIII + 551541 551555 3.6e-05 0.0504 TAATGTACAGATTTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII + 701141 701155 3.78e-05 0.0527 AGATGCAAGGATTGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 700132 700146 3.8e-05 0.0528 TGATGTAAGGATTCG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 158419 158433 4.06e-05 0.0559 TTATGTACAGATTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII + 593066 593080 4.06e-05 0.0559 AGATGTATGGAGTTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV - 305999 306013 4.17e-05 0.0571 GGATGTGTGGGCTTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV - 241561 241575 4.29e-05 0.0585 TGGTGTTTAGGTGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 520362 520376 4.34e-05 0.0589 CGAGGCCTGGGTGGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII - 75168 75182 4.47e-05 0.0602 ATGTTTACGGATGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 1019141 1019155 4.47e-05 0.0602 TAATGTTTGGGTTTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 780705 780719 4.53e-05 0.0607 TAATGTATAGGTTCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 253945 253959 4.59e-05 0.0612 TTATGTCTGGGCGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 411461 411475 4.78e-05 0.0634 GGTGGTGTGGGTGGG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 406385 406399 5.09e-05 0.0671 AAATGTTTGGAGGTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 779901 779915 5.09e-05 0.0671 TGGGGTATGGGGGGG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 682049 682063 5.27e-05 0.069 ATGGGTGTGGGTGGC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 308202 308216 5.46e-05 0.071 AAATGTATGGGTCAC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVII - 310699 310713 5.46e-05 0.071 TAATGTGTGGGTCCC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII - 103985 103999 5.65e-05 0.0731 ATATGTAAAGGTGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 108901 108915 5.68e-05 0.0732 ATGTGTTTGGATGAT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXVI - 700167 700181 5.77e-05 0.0741 TGGTGTGTGGGGGAT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 117384 117398 6.01e-05 0.0766 AAAGTTATGGGTGTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 981128 981142 6.01e-05 0.0766 AGTTGCATGTGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXI - 520454 520468 6.11e-05 0.0773 TGTTGTTTGGGTTTG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrV + 311847 311861 6.15e-05 0.0773 CAGTGAACGGATTTA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV + 585792 585806 6.15e-05 0.0773 CAGGGTACTGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 216473 216487 6.32e-05 0.0791 CGGTGCCTGGGTTGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV - 579204 579218 6.35e-05 0.0792 TGGTTTATGGGTGGT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII - 168050 168064 6.5e-05 0.0808 GGAGGTACTGGTGAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 796605 796619 6.64e-05 0.0822 TGGTGCAAGGATTGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 779850 779864 6.83e-05 0.0841 GTATGTATGGGCTGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 282131 282145 6.98e-05 0.0857 AGAGGAGTGGATGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII + 149094 149108 8.03e-05 0.0982 AAATGTATGGGCTAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIX - 257531 257545 8.3e-05 0.101 CGGTGTACAGATTTC
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 308139 308153 8.34e-05 0.101 ACATGTATGGGTGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrVIII - 104055 104069 8.47e-05 0.102 AAATGTGTGGGCTGA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIX - 316394 316408 8.52e-05 0.102 AATTGCTTGGGTTTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV + 1028879 1028893 8.52e-05 0.102 AAATGTGAAGATGTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXV - 594369 594383 8.94e-05 0.107 TGAGGCCCGGGTTCG
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrIV + 222109 222123 8.98e-05 0.107 AAAGGTACTGGTGAA
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXII + 199103 199117 9.32e-05 0.11 TGGGGTTCGGGGGCT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrXIV - 330968 330982 9.32e-05 0.11 AAATGTCTAGGTTTT
WRATGTAYGGRTGTW MEME-3 chrII + 415665 415679 9.86e-05 0.116 TAATGTCTGGATGAC
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/fimo_out_3 --bgfile /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/background --motif WRATGTAYGGRTGTW /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/meme_out/meme.xml /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/AWRI1631--ACE2.fa

Settings: 


  

    output_directory = /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/fimo_out_3
    MEME file name = /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/meme_out/meme.xml
    sequence file name = /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/AWRI1631--ACE2.fa
  
  

    background file name = /srv/www/kundaje/amr1/yeastvar/meme_results/results/aa_results/AWRI1631--ACE2/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

This information can be useful in the event you wish to report a problem with the FIMO software.

Go to top