Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information


FIMO - Motif search tool

FIMO version 4.12.0, (Release date: Tue Jun 27 16:22:50 2017 -0700)

For further information on how to interpret these results or to get a copy of the FIMO software please access http://meme.nbcr.net

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]

DATABASE AND MOTIFS

DATABASE memeout_tam/tam.fa
Database contains 5269 sequences, 1034516 residues

MOTIFS memeout_tam/dreme_out/dreme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
RKGTCA 6 AGGTCA
RYAAAYA 7 GCAAACA
AGGGCR 6 AGGGCA
TTATCW 6 TTATCT
CCTSRGGC 8 CCTGGGGC
CCHGGGM 7 CCTGGGC
GGTSAC 6 GGTGAC
CWGGAA 6 CAGGAA
AGRTTA 6 AGGTTA
AGGTCG 6 AGGTCG
ACAGGHT 7 ACAGGCT
CCNGGC 6 CCTGGC
RCACACAS 8 ACACACAC
CYGGGGCA 8 CTGGGGCA
AAAGTCAM 8 AAAGTCAA
ARGAATGY 8 AGGAATGT
ARATA 5 AGATA
TCTGGGMA 8 TCTGGGCA
GAYCTTGC 8 GACCTTGC
CTGTAAW 7 CTGTAAA

Random model letter frequencies (memeout_tam/background):
A 0.247 C 0.253 G 0.253 T 0.247

SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES
Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 260897 260903 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr6 + 474250 474256 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr6 + 617635 617641 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr11 + 705017 705023 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr20 + 822792 822798 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr11 + 2505053 2505059 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr6 + 4257215 4257221 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr4 + 6705763 6705769 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr19 + 7469227 7469233 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr19 + 7844854 7844860 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr11 + 7923185 7923191 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr17 + 8236227 8236233 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 11678082 11678088 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 14695924 14695930 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 16459076 16459082 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr11 + 16915307 16915313 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr22 + 19542526 19542532 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chrX + 19874725 19874731 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 20311852 20311858 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr6 + 21022797 21022803 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr18 + 21631334 21631340 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 24496879 24496885 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr4 + 24689034 24689040 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 24955790 24955796 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr12 + 27776912 27776918 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 30679105 30679111 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 32152283 32152289 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr6 + 32530856 32530862 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr6 + 33685224 33685230 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 34090915 34090921 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr14 + 35801407 35801413 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr22 + 38173374 38173380 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 39404221 39404227 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr21 + 40817876 40817882 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 + 42244303 42244309 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 43016306 43016312 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr5 + 43227986 43227992 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr18 + 43693965 43693971 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr21 + 43796545 43796551 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr11 + 44611032 44611038 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 44669105 44669111 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr18 + 45660321 45660327 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 + 45763885 45763891 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 50642677 50642683 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr13 + 51218859 51218865 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr19 + 52310762 52310768 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr18 + 55248899 55248905 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr18 + 57721199 57721205 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 58310978 58310984 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 + 59413555 59413561 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 + 60803321 60803327 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr14 + 61787852 61787858 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr11 + 62420993 62420999 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 63062325 63062331 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 + 63287475 63287481 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 + 65974802 65974808 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 + 69700247 69700253 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr15 + 70613735 70613741 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr6 + 73738224 73738230 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 + 74002652 74002658 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr17 + 75931627 75931633 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr11 + 76484953 76484959 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr5 + 77157560 77157566 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 77493214 77493220 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr11 + 78023196 78023202 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 + 80543118 80543124 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 80653989 80653995 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 81209061 81209067 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 81931122 81931128 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 + 82105620 82105626 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 83980555 83980561 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 84758306 84758312 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 85181027 85181033 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 86004437 86004443 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr16 + 87033811 87033817 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr4 + 89332940 89332946 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 98602956 98602962 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 100684524 100684530 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr15 + 101707621 101707627 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr14 + 101874917 101874923 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 102390041 102390047 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr7 + 104210269 104210275 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr5 + 106892885 106892891 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr4 + 108788801 108788807 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr7 + 112063024 112063030 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 112549714 112549720 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 + 112852070 112852076 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 + 112914110 112914116 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr8 + 113757146 113757152 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr4 + 115108935 115108941 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 + 117670504 117670510 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr6 + 119462438 119462444 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 121794039 121794045 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 122077727 122077733 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr9 + 123469698 123469704 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 124782037 124782043 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 126028595 126028601 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 129064135 129064141 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr8 + 129165444 129165450 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 + 129707135 129707141 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 + 133802202 133802208 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 + 134362433 134362439 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr8 + 134819179 134819185 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 136062848 136062854 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 + 140010338 140010344 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 140630796 140630802 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 140646707 140646713 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 + 147778142 147778148 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 + 152308153 152308159 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr1 + 152467660 152467666 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 + 155660517 155660523 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr1 + 156441547 156441553 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 157038818 157038824 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr6 + 159362493 159362499 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 169667045 169667051 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 169820818 169820824 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 + 172600121 172600127 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr1 + 176020734 176020740 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr4 + 186558908 186558914 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 + 187526851 187526857 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 + 198624873 198624879 5.87e-05 0.476 ctgtaaa
CTGTAAW DREME-20 chr2 + 231190050 231190056 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 1556430 1556436 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr18 - 3595982 3595988 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr19 - 4715948 4715954 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 - 4728987 4728993 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr12 - 6174656 6174662 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 6218074 6218080 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 - 6343865 6343871 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr4 - 6995263 6995269 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chrX - 7050491 7050497 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 9110285 9110291 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr12 - 13036477 13036483 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 - 14269535 14269541 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 15556561 15556567 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr6 - 16755232 16755238 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 16945030 16945036 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 - 17213369 17213375 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr4 - 17546593 17546599 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr19 - 18140819 18140825 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr19 - 18140843 18140849 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr11 - 20053422 20053428 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr18 - 20837900 20837906 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 - 22922027 22922033 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 23230728 23230734 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 23912336 23912342 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr20 - 24999174 24999180 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 - 27644761 27644767 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 - 27656064 27656070 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr16 - 28633227 28633233 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr22 - 29214885 29214891 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr22 - 31976200 31976206 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr22 - 32957337 32957343 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 - 33360168 33360174 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 35971823 35971829 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 37859770 37859776 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 - 38024323 38024329 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr19 - 38789767 38789773 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 - 39404190 39404196 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 - 39566327 39566333 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 - 41369882 41369888 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 42618047 42618053 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 42909151 42909157 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr18 - 43693982 43693988 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr18 - 46074786 46074792 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr20 - 46135319 46135325 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr18 - 46509504 46509510 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr13 - 47234070 47234076 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr16 - 48199579 48199585 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 - 53698966 53698972 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr12 - 54198487 54198493 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr20 - 55497727 55497733 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 55977331 55977337 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr14 - 57533368 57533374 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 57915380 57915386 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr19 - 58325473 58325479 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 59492325 59492331 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr14 - 60705824 60705830 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 61830310 61830316 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 61847603 61847609 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 - 63085533 63085539 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 - 63766407 63766413 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr11 - 64035968 64035974 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 - 64814339 64814345 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr15 - 69886992 69886998 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr14 - 70315898 70315904 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 70680396 70680402 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 72121673 72121679 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 72756887 72756893 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr14 - 75987960 75987966 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr4 - 77491455 77491461 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr17 - 80061783 80061789 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 80241420 80241426 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 85763685 85763691 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr16 - 85925335 85925341 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr16 - 87966237 87966243 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 - 90711365 90711371 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr8 - 91900010 91900016 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr8 - 91900062 91900068 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 - 92050516 92050522 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 - 93182161 93182167 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr13 - 96090715 96090721 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr14 - 97041384 97041390 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 - 97713540 97713546 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 - 101558706 101558712 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chrX - 104217586 104217592 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr12 - 104682462 104682468 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 105712721 105712727 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 105713016 105713022 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 106083797 106083803 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr4 - 109636250 109636256 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr11 - 111205552 111205558 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr12 - 112263425 112263431 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 - 112852120 112852126 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 114576755 114576761 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 - 115902015 115902021 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr11 - 116679174 116679180 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 116843246 116843252 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 117161912 117161918 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr12 - 119609155 119609161 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 - 121793934 121793940 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 - 123005626 123005632 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr9 - 124031558 124031564 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 - 125503620 125503626 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr10 - 127390325 127390331 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 130579216 130579222 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr12 - 132345606 132345612 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chrX - 133852488 133852494 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr4 - 135123879 135123885 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr7 - 137878921 137878927 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr4 - 141612704 141612710 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 - 142562768 142562774 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr4 - 144252190 144252196 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 - 145361627 145361633 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 - 149955520 149955526 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 - 154080925 154080931 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr6 - 154488935 154488941 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 - 156490934 156490940 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 - 158022045 158022051 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr3 - 169667068 169667074 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr5 - 176450700 176450706 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 182615543 182615549 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 215655760 215655766 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr2 - 217957521 217957527 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 223973679 223973685 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 234588511 234588517 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
CTGTAAW DREME-20 chr1 - 245420698 245420704 5.87e-05 0.476 CTGTAAA
DEBUGGING INFORMATION

Command line: 

/software/meme/4.12.0/bin/fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc memeout_tam/fimo_out_18 --bgfile memeout_tam/background --motif CTGTAAW memeout_tam/dreme_out/dreme.xml memeout_tam/tam.fa

Settings: 


  

    output_directory = memeout_tam/fimo_out_18
    MEME file name = memeout_tam/dreme_out/dreme.xml
    sequence file name = memeout_tam/tam.fa
  
  

    background file name = memeout_tam/background
    alphabet = DNA
    max stored scores = 100000
  
  

    allow clobber = true
    compute q-values = true
    parse genomic coord. = true
  

  

    text only = false
    scan both strands = true
    max strand = false
  

  

    threshold type = p-value
    output theshold = 0.0001
    pseudocount = 0.1
  

  

    alpha = 1
    verbosity = 1

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